MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae H36B

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2447331 2447332 SAI_0267 SAI_0268   glyQ FALSE 0.003 424.000 0.000 1.000   NA
 2447332 2447333 SAI_0268 SAI_0269 glyQ   FALSE 0.425 0.000 0.000 1.000 N NA
 2447333 2447334 SAI_0269 SAI_0270   glyS FALSE 0.482 4.000 0.000 1.000 N NA
 2447334 2447335 SAI_0270 SAI_0271 glyS   TRUE 0.796 12.000 0.020 NA   NA
 2447335 2447336 SAI_0271 SAI_0272     FALSE 0.134 32.000 0.000 NA   NA
 2447336 2447337 SAI_0272 SAI_0273   glpK FALSE 0.034 115.000 0.000 NA   NA
 2447337 2447338 SAI_0273 SAI_0274 glpK glpD TRUE 0.997 13.000 0.500 0.002 Y NA
 2447338 2447339 SAI_0274 SAI_0275 glpD   TRUE 0.984 12.000 0.500 1.000 N NA
 2447339 2447340 SAI_0275 SAI_0276     TRUE 0.697 145.000 0.364 1.000   NA
 2447340 2447341 SAI_0276 SAI_0277     TRUE 0.978 9.000 0.462 NA   NA
 2447341 2447342 SAI_0277 SAI_0278   tkt FALSE 0.004 239.000 0.000 NA   NA
 2447342 2447343 SAI_0278 SAI_0279 tkt   FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 2447343 2447344 SAI_0279 SAI_0280     TRUE 0.893 20.000 0.136 NA   NA
 2447344 2447345 SAI_0280 SAI_0281     TRUE 0.966 4.000 0.341 NA   NA
 2447347 2447348 SAI_0283 SAI_0284 proB proA TRUE 0.995 10.000 0.281 0.002 Y NA
 2447348 2447349 SAI_0284 SAI_0285 proA mraW FALSE 0.190 134.000 0.003 1.000 N NA
 2447349 2447350 SAI_0285 SAI_0286 mraW   TRUE 0.893 15.000 0.077 1.000 N NA
 2447350 2447351 SAI_0286 SAI_0287     TRUE 0.978 4.000 0.456 1.000 N NA
 2447351 2447352 SAI_0287 SAI_0288   mraY TRUE 0.909 2.000 0.038 1.000 Y NA
 2447352 2447353 SAI_0288 SAI_0289 mraY   FALSE 0.325 98.000 0.007 1.000 N NA
 2447353 2447354 SAI_0289 SAI_0290     FALSE 0.295 138.000 0.036 1.000 N NA
 2447354 2447355 SAI_0290 SAI_0291     TRUE 0.888 95.000 0.143 0.054 Y NA
 2447355 2447356 SAI_0291 SAI_0292     TRUE 0.992 0.000 0.310 0.009 Y NA
 2447356 2447357 SAI_0292 SAI_0293     TRUE 0.813 98.000 0.364 NA   NA
 2447357 2447358 SAI_0293 SAI_0294   trxB TRUE 0.637 69.000 0.117 NA   NA
 2447358 2447359 SAI_0294 SAI_0295 trxB   FALSE 0.172 158.000 0.017 1.000 N NA
 2447359 2447360 SAI_0295 SAI_0296   nadE TRUE 0.988 -3.000 0.194 0.004 Y NA
 2447360 2447361 SAI_0296 SAI_0297 nadE pepC FALSE 0.341 113.000 0.017 1.000 N NA
 2447362 2447363 SAI_0298 SAI_0299     FALSE 0.121 244.000 0.000 0.003   NA
 2447363 2447364 SAI_0299 SAI_0300     TRUE 0.933 -118.000 0.319 1.000   NA
 2447365 2447366 SAI_0301 SAI_0302     FALSE 0.135 -19.000 0.000 NA   NA
 2447366 2447367 SAI_0302 SAI_0303     FALSE 0.211 18.000 0.000 NA   NA
 2447367 2447368 SAI_0303 SAI_0304     FALSE 0.001 470.000 0.000 NA   NA
 2447368 2447369 SAI_0304 SAI_0305     TRUE 0.810 13.000 0.029 NA   NA
 2447371 2447372 SAI_0307 SAI_0308     FALSE 0.090 47.000 0.000 NA   NA
 2447372 2447373 SAI_0308 SAI_0309     FALSE 0.135 -19.000 0.000 NA   NA
 2447373 2447374 SAI_0309 SAI_0310     TRUE 0.853 -13.000 0.136 NA   NA
 2447374 2447375 SAI_0310 SAI_0311     TRUE 0.967 27.000 0.500 NA   NA
 2447375 2447376 SAI_0311 SAI_0312     TRUE 0.998 2.000 0.857 0.019 Y NA
 2447376 2447377 SAI_0312 SAI_0313     FALSE 0.083 50.000 0.000 NA   NA
 2447377 2447378 SAI_0313 SAI_0314     FALSE 0.012 167.000 0.000 NA   NA
 2447378 2447379 SAI_0314 SAI_0315     TRUE 0.972 23.000 0.471 1.000 N NA
 2447379 2447380 SAI_0315 SAI_0316   priA TRUE 0.740 74.000 0.032 0.077 N NA
 2447380 2447381 SAI_0316 SAI_0317 priA fmt TRUE 0.687 47.000 0.052 1.000 N NA
 2447381 2447382 SAI_0317 SAI_0318 fmt sun TRUE 0.968 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 2447382 2447383 SAI_0318 SAI_0319 sun   TRUE 0.764 38.000 0.074 1.000 N NA
 2447383 2447384 SAI_0319 SAI_0320     TRUE 0.970 66.000 0.704 1.000 Y NA
 2447386 2447387 SAI_0322 SAI_0323     TRUE 0.982 -3.000 0.679 NA   NA
 2447387 2447388 SAI_0323 SAI_0324   vraR TRUE 0.997 -7.000 0.853 0.019 Y NA
 2447388 2447389 SAI_0324 SAI_0325 vraR   TRUE 0.843 42.000 0.164 1.000   NA
 2447389 2447390 SAI_0325 SAI_0326     TRUE 0.877 -16.000 0.151 1.000   NA
 2447392 2447393 SAI_0328 SAI_0329     TRUE 0.895 119.000 0.188 0.045 Y NA
 2447393 2447394 SAI_0329 SAI_0330     FALSE 0.148 204.000 0.091 1.000 N NA
 2447394 2447395 SAI_0330 SAI_0331   celA TRUE 0.998 17.000 0.889 0.019 Y NA
 2447395 2447396 SAI_0331 SAI_0332 celA celB TRUE 0.998 2.000 0.889 0.019 Y NA
 2447396 2447397 SAI_0332 SAI_0333 celB   FALSE 0.252 181.000 0.132 1.000 N NA
 2447397 2447398 SAI_0333 SAI_0334     TRUE 0.976 10.000 0.368 1.000 N NA
 2447398 2447399 SAI_0334 SAI_0335   gldA TRUE 0.806 68.000 0.211 1.000 N NA
 2447400 2447401 SAI_2055 SAI_2054     FALSE 0.073 55.000 0.000 NA   NA
 2447401 2447402 SAI_2054 SAI_2053     FALSE 0.001 441.000 0.000 NA   NA
 2447403 2447404 SAI_2052 SAI_2051     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2447404 2447405 SAI_2051 SAI_2050     FALSE 0.036 107.000 0.000 NA   NA
 2447405 2447406 SAI_2050 SAI_2049     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447406 2447407 SAI_2049 SAI_2048     FALSE 0.161 -6.000 0.000 NA   NA
 2447407 2447408 SAI_2048 SAI_2047     FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 2447409 2447410 SAI_2046 SAI_2045     TRUE 0.795 -7.000 0.047 1.000 N NA
 2447411 2447412 SAI_2044 SAI_2043     TRUE 0.739 43.000 0.100 NA   NA
 2447412 2447413 SAI_2043 SAI_2042     TRUE 0.756 -7.000 0.048 NA   NA
 2447413 2447414 SAI_2042 SAI_2041     TRUE 0.749 -28.000 0.048 1.000   NA
 2447416 2447417 SAI_2039 SAI_2038   prmA FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447417 2447418 SAI_2038 SAI_2037 prmA   TRUE 0.934 0.000 0.227 NA   NA
 2447418 2447419 SAI_2037 SAI_2036     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447419 2447420 SAI_2036 SAI_2035     FALSE 0.025 131.000 0.000 NA   NA
 2447420 2447421 SAI_2035 SAI_2034   pstC FALSE 0.438 15.000 0.000 1.000   NA
 2447421 2447422 SAI_2034 SAI_2033 pstC pstA TRUE 0.990 2.000 0.219 0.005 Y NA
 2447422 2447423 SAI_2033 SAI_2032 pstA pstB TRUE 0.993 -7.000 0.428 0.005 Y NA
 2447423 2447424 SAI_2032 SAI_2031 pstB   TRUE 0.956 -3.000 0.203 NA Y NA
 2447424 2447425 SAI_2031 SAI_2030   drrA TRUE 0.967 0.000 0.429 NA N NA
 2447425 2447426 SAI_2030 SAI_2029 drrA hpkA TRUE 0.958 -7.000 0.075 0.067 Y NA
 2447426 2447427 SAI_2029 SAI_2028 hpkA ptsG FALSE 0.045 158.000 0.000 1.000 N NA
 2447427 2447428 SAI_2028 SAI_2027 ptsG   TRUE 0.966 39.000 0.610 1.000   NA
 2447428 2447429 SAI_2027 SAI_2026     FALSE 0.012 216.000 0.000 1.000   NA
 2447429 2447430 SAI_2026 SAI_2025   agrA FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 2447430 2447431 SAI_2025 SAI_2024 agrA   FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447433 2447434 SAI_2022 SAI_2021     FALSE 0.006 206.000 0.000 NA   NA
 2447434 2447435 SAI_2021 SAI_2020     TRUE 0.987 6.000 0.667 NA   NA
 2447435 2447436 SAI_2020 SAI_2019     FALSE 0.219 17.000 0.000 NA   NA
 2447438 2447439 SAI_2017 SAI_2016     FALSE 0.003 247.000 0.000 NA   NA
 2447439 2447440 SAI_2016 SAI_2015     TRUE 0.998 18.000 0.786 0.022 Y NA
 2447440 2447441 SAI_2015 SAI_2014     TRUE 0.998 16.000 0.778 0.028 Y NA
 2447441 2447442 SAI_2014 SAI_2013     TRUE 0.997 -3.000 0.778 0.028 Y NA
 2447442 2447443 SAI_2013 SAI_2012     TRUE 0.784 138.000 0.222 0.076 N NA
 2447443 2447444 SAI_2012 SAI_2011     TRUE 0.993 4.000 0.500 0.019   NA
 2447444 2447445 SAI_2011 SAI_2010     TRUE 0.987 12.000 0.571 1.000   NA
 2447446 2447447 SAI_2009 SAI_2008     TRUE 0.713 0.000 0.018 NA   NA
 2447447 2447448 SAI_2008 SAI_2007   nrdI FALSE 0.189 152.000 0.027 NA N NA
 2447448 2447449 SAI_2007 SAI_2006 nrdI cpdB FALSE 0.314 157.000 0.022 NA Y NA
 2447450 2447451 SAI_2005 SAI_2004 relA dtd TRUE 0.948 10.000 0.177 1.000 N NA
 2447451 2447452 SAI_2004 SAI_2003 dtd   FALSE 0.009 255.000 0.000 1.000 N NA
 2447452 2447453 SAI_2003 SAI_2002     FALSE 0.155 27.000 0.000 NA   NA
 2447455 2447456 SAI_2000 SAI_1999     TRUE 0.994 2.000 0.429 0.019 Y NA
 2447456 2447457 SAI_1999 SAI_1998     TRUE 0.870 40.000 0.000 0.022 Y NA
 2447457 2447458 SAI_1998 SAI_1997     FALSE 0.002 536.000 0.000 1.000   NA
 2447458 2447459 SAI_1997 SAI_1996   lacA FALSE 0.007 248.000 0.000 1.000   NA
 2447459 2447460 SAI_1996 SAI_1995 lacA lacB TRUE 0.957 21.000 0.000 0.001 Y NA
 2447460 2447461 SAI_1995 SAI_1994 lacB lacC TRUE 0.830 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2447461 2447462 SAI_1994 SAI_1993 lacC lacD TRUE 0.959 2.000 0.000 0.001 Y NA
 2447462 2447463 SAI_1993 SAI_1992 lacD   TRUE 0.539 54.000 0.000 1.000 Y NA
 2447463 2447464 SAI_1992 SAI_1991     FALSE 0.122 95.000 0.000 1.000 N NA
 2447464 2447465 SAI_1991 SAI_1990     TRUE 0.507 101.000 0.071 1.000 N NA
 2447465 2447466 SAI_1990 SAI_1989   malA TRUE 0.725 129.000 0.171 1.000 Y NA
 2447466 2447467 SAI_1989 SAI_1988 malA galE FALSE 0.131 88.000 0.000 1.000 N NA
 2447468 2447469 SAI_1987 SAI_1986     TRUE 0.956 2.000 0.154 1.000 Y NA
 2447470 2447471 SAI_1985 SAI_1984   mae TRUE 0.980 25.000 0.432 1.000 Y NA
 2447471 2447472 SAI_1984 SAI_1983 mae   FALSE 0.007 191.000 0.000 NA   NA
 2447472 2447473 SAI_1983 SAI_1982   yajC FALSE 0.297 77.000 0.006 NA   NA
 2447474 2447475 SAI_2148 SAI_2149   pbp4 TRUE 0.883 153.000 0.231 0.004 Y NA
 2447476 2447477 SAI_2150 SAI_2151   nifU TRUE 0.893 100.000 0.152 0.002 N NA
 2447477 2447478 SAI_2151 SAI_2152 nifU   TRUE 0.942 -13.000 0.292 1.000 N NA
 2447478 2447479 SAI_2152 SAI_2153     TRUE 0.984 2.000 0.606 1.000 N NA
 2447479 2447480 SAI_2153 SAI_2154     TRUE 0.908 37.000 0.139 1.000 Y NA
 2447480 2447481 SAI_2154 SAI_2155     FALSE 0.144 165.000 0.013 1.000 N NA
 2447481 2447482 SAI_2155 SAI_2156     TRUE 0.951 2.000 0.267 NA N NA
 2447482 2447483 SAI_2156 SAI_2157     FALSE 0.194 192.000 0.132 NA N NA
 2447483 2447484 SAI_2157 SAI_2158     TRUE 0.754 46.000 0.118 NA   NA
 2447484 2447485 SAI_2158 SAI_2159     TRUE 0.848 3.000 0.071 NA   NA
 2447486 2447487 SAI_2160 SAI_2161   glnP TRUE 0.972 -115.000 0.339 0.053   NA
 2447487 2447488 SAI_2161 SAI_2162 glnP glnQ TRUE 0.991 10.000 0.758 1.000   NA
 2447490 2447491 SAI_2164 SAI_2165     FALSE 0.038 101.000 0.000 NA   NA
 2447491 2447492 SAI_2165 SAI_2166     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2447493 2447494 SAI_2167 SAI_2168 ruvA   TRUE 0.706 2.000 0.005 1.000   NA
 2447494 2447495 SAI_2168 SAI_2169   hexB TRUE 0.610 32.000 0.006 1.000   NA
 2447495 2447496 SAI_2169 SAI_2170 hexB   FALSE 0.029 125.000 0.000 NA   NA
 2447498 2447499 SAI_2172 SAI_2173 mutS argR FALSE 0.472 57.000 0.008 1.000 N NA
 2447500 2447501 SAI_2174 SAI_2175 argS   FALSE 0.383 88.000 0.032 NA   NA
 2447502 2447503 SAI_2176 SAI_2177     FALSE 0.423 108.000 0.062 NA   NA
 2447503 2447504 SAI_2177 SAI_2178   aspS TRUE 0.649 -10.000 0.016 NA   NA
 2447504 2447505 SAI_2178 SAI_2179 aspS hisS TRUE 0.900 93.000 0.161 0.057 Y NA
 2447506 2447507 SAI_2180 SAI_2181 rpmF rpmG TRUE 0.964 16.000 0.012 0.035 Y NA
 2447507 2447508 SAI_2181 SAI_2182 rpmG   FALSE 0.004 293.000 0.000 NA N NA
 2447508 2447509 SAI_2182 SAI_2183     TRUE 0.993 12.000 0.875 NA N NA
 2447509 2447510 SAI_2183 SAI_2185     TRUE 0.951 51.000 0.571 1.000   NA
 2447512 2447513 SAI_2186 SAI_2187     FALSE 0.006 203.000 0.000 NA   NA
 2447513 2447514 SAI_2187 SAI_2188     TRUE 0.973 0.000 0.500 NA   NA
 2447514 2447515 SAI_2188 SAI_2189     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 2447515 2447516 SAI_2189 SAI_2190     FALSE 0.476 206.000 0.500 NA   NA
 2447516 2447517 SAI_2190 SAI_2191     TRUE 0.970 -7.000 0.500 1.000   NA
 2447517 2447518 SAI_2191 SAI_2192     TRUE 0.888 90.000 0.500 1.000   NA
 2447518 2447519 SAI_2192 SAI_2193     FALSE 0.003 359.000 0.000 1.000   NA
 2447519 2447520 SAI_2193 SAI_2194     FALSE 0.107 86.000 0.000 1.000   NA
 2447520 2447521 SAI_2194 SAI_2195     TRUE 0.979 -16.000 0.492 1.000 Y NA
 2447522 2447523 SAI_2196 SAI_2197   arcC FALSE 0.097 94.000 0.000 1.000   NA
 2447523 2447524 SAI_2197 SAI_2198 arcC argF TRUE 0.831 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2447525 2447526 SAI_2199 SAI_2200     FALSE 0.340 -3.000 0.000 1.000   NA
 2447526 2447527 SAI_2200 SAI_2201   proV FALSE 0.014 222.000 0.000 1.000 N NA
 2447527 2447528 SAI_2201 SAI_2202 proV proX TRUE 0.992 3.000 0.382 0.004 N NA
 2447529 2447530 SAI_2203 SAI_2204   est-1 TRUE 0.750 23.000 0.035 NA   NA
 2447530 2447531 SAI_2204 SAI_2205 est-1   FALSE 0.023 134.000 0.000 NA   NA
 2447531 2447532 SAI_2205 SAI_2206     FALSE 0.366 67.000 0.012 NA   NA
 2447534 2447535 SAI_2208 SAI_2209     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 2447535 2447536 SAI_2209 SAI_2210     TRUE 0.717 113.000 0.250 NA   NA
 2447538 2447539 SAI_2212 SAI_2213     TRUE 0.988 31.000 1.000 NA   NA
 2447539 2447540 SAI_2213 SAI_2214     FALSE 0.132 -25.000 0.000 NA   NA
 2447540 2447541 SAI_2214 SAI_2215     FALSE 0.001 964.000 0.000 NA   NA
 2447541 2447542 SAI_2215 SAI_2216     FALSE 0.049 81.000 0.000 NA   NA
 2447542 2447543 SAI_2216 SAI_2217     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2447543 2447544 SAI_2217 SAI_2218     FALSE 0.003 262.000 0.000 NA   NA
 2447544 2447545 SAI_2218 SAI_2219     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 2447545 2447546 SAI_2219 SAI_2220     TRUE 0.994 12.000 1.000 NA   NA
 2447546 2447547 SAI_2220 SAI_2221     TRUE 0.982 0.000 0.667 NA   NA
 2447547 2447548 SAI_2221 SAI_2222     TRUE 0.918 89.000 0.667 NA   NA
 2447549 2447550 SAI_1558 SAI_1559   secY TRUE 0.648 0.000 0.007 NA   NA
 2447550 2447551 SAI_1559 SAI_1560 secY   FALSE 0.031 123.000 0.000 NA   NA
 2447551 2447552 SAI_1560 SAI_1561     FALSE 0.066 61.000 0.000 NA   NA
 2447552 2447553 SAI_1561 SAI_1562     FALSE 0.135 -19.000 0.000 NA   NA
 2447553 2447554 SAI_1562 SAI_1563     TRUE 0.931 -10.000 0.000 0.004 Y NA
 2447554 2447555 SAI_1563 SAI_1564     TRUE 0.941 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 2447555 2447556 SAI_1564 SAI_1565     FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 2447556 2447557 SAI_1565 SAI_1566   sdrE FALSE 0.002 331.000 0.000 NA   NA
 2447559 2447560 SAI_1568 SAI_1569 uvrB   FALSE 0.066 61.000 0.000 NA   NA
 2447561 2447562 SAI_1570 SAI_1571   glnQ TRUE 0.976 0.000 0.326 1.000 Y NA
 2447562 2447563 SAI_1571 SAI_1572 glnQ   FALSE 0.018 149.000 0.000 NA   NA
 2447564 2447565 SAI_1573 SAI_1574   obg TRUE 0.622 26.000 0.009 NA   NA
 2447569 2447570 SAI_1578 SAI_1579   nylA TRUE 0.548 110.000 0.000 0.011   NA
 2447570 2447571 SAI_1579 SAI_1580 nylA rsuA FALSE 0.415 85.000 0.000 1.000 Y NA
 2447571 2447572 SAI_1580 SAI_1581 rsuA   FALSE 0.017 191.000 0.000 1.000   NA
 2447573 2447574 SAI_1582 SAI_1583   gloA FALSE 0.360 88.000 0.009 1.000 N NA
 2447574 2447575 SAI_1583 SAI_1584 gloA   FALSE 0.044 129.000 0.000 NA N NA
 2447575 2447576 SAI_1584 SAI_1585     FALSE 0.044 129.000 0.000 NA N NA
 2447577 2447578 SAI_1586 SAI_1587 smpB vacB TRUE 0.970 3.000 0.143 0.035 N NA
 2447578 2447579 SAI_1587 SAI_1588 vacB   FALSE 0.471 113.000 0.064 1.000 N NA
 2447579 2447580 SAI_1588 SAI_1589     FALSE 0.488 133.000 0.007 0.074 N NA
 2447580 2447581 SAI_1589 SAI_1590     FALSE 0.007 196.000 0.000 NA   NA
 2447581 2447582 SAI_1590 SAI_1591   natA TRUE 0.950 -10.000 0.385 NA   NA
 2447582 2447583 SAI_1591 SAI_1592 natA   FALSE 0.088 125.000 0.000 1.000 N NA
 2447583 2447584 SAI_1592 SAI_1593   mutM TRUE 0.816 -9.000 0.066 1.000 N NA
 2447584 2447585 SAI_1593 SAI_1594 mutM   FALSE 0.113 149.000 0.004 NA   NA
 2447585 2447586 SAI_1594 SAI_1595     FALSE 0.134 -22.000 0.000 NA   NA
 2447587 2447588 SAI_1596 SAI_1597     FALSE 0.115 36.000 0.000 NA   NA
 2447589 2447590 SAI_1598 SAI_1599     FALSE 0.003 255.000 0.000 NA   NA
 2447590 2447591 SAI_1599 SAI_1600     FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 2447591 2447592 SAI_1600 SAI_1601   era FALSE 0.001 1356.000 0.000 NA   NA
 2447592 2447593 SAI_1601 SAI_1602 era   TRUE 0.721 42.000 0.063 1.000   NA
 2447593 2447594 SAI_1602 SAI_1603     TRUE 0.688 -19.000 0.035 NA   NA
 2447594 2447595 SAI_1603 SAI_1604     FALSE 0.001 394.000 0.000 NA   NA
 2447595 2447596 SAI_1604 SAI_1605     FALSE 0.003 323.000 0.000 NA N NA
 2447598 2447599 SAI_1607 SAI_1608     FALSE 0.174 124.000 0.004 NA   NA
 2447599 2447600 SAI_1608 SAI_1609     FALSE 0.015 157.000 0.000 NA   NA
 2447600 2447601 SAI_1609 SAI_1610   msrA TRUE 0.840 -3.000 0.080 1.000   NA
 2447601 2447602 SAI_1610 SAI_1611 msrA   FALSE 0.225 138.000 0.016 1.000   NA
 2447602 2447603 SAI_1611 SAI_1612   frr FALSE 0.282 118.000 0.012 1.000   NA
 2447603 2447604 SAI_1612 SAI_1613 frr   TRUE 0.988 15.000 0.626 1.000 N NA
 2447604 2447605 SAI_1613 SAI_1614     FALSE 0.096 121.000 0.000 1.000 N NA
 2447605 2447606 SAI_1614 SAI_1615     TRUE 0.966 108.000 0.500 0.038 Y NA
 2447606 2447607 SAI_1615 SAI_1616     TRUE 0.925 69.000 0.353 1.000 Y NA
 2447607 2447608 SAI_1616 SAI_1617     TRUE 0.994 0.000 0.353 0.002 Y NA
 2447608 2447609 SAI_1617 SAI_1618     TRUE 0.985 -13.000 0.167 0.002 Y NA
 2447609 2447610 SAI_1618 SAI_1619   rplA FALSE 0.003 431.000 0.000 1.000 N NA
 2447610 2447611 SAI_1619 SAI_1620 rplA rplK TRUE 0.985 104.000 0.838 0.034 Y NA
 2447611 2447612 SAI_1620 SAI_1621 rplK   FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 2447613 2447614 SAI_0001 SAI_0002 oppB oppC-1 TRUE 0.970 10.000 0.134 0.051   NA
 2447614 2447615 SAI_0002 SAI_0003 oppC-1   TRUE 0.968 13.000 0.286 1.000   NA
 2447615 2447616 SAI_0003 SAI_0004   oppF TRUE 0.997 0.000 0.619 0.001 Y NA
 2447616 2447617 SAI_0004 SAI_0005 oppF   FALSE 0.001 7065.000 0.000 NA   NA
 2447617 2447618 SAI_0005 SAI_0006   prsA FALSE 0.455 124.000 0.107 NA   NA
 2447618 2447619 SAI_0006 SAI_0007 prsA aspB-3 TRUE 0.623 108.000 0.048 1.000 Y NA
 2447619 2447620 SAI_0007 SAI_0008 aspB-3 recO TRUE 0.757 20.000 0.012 1.000 N NA
 2447620 2447621 SAI_0008 SAI_0009 recO   FALSE 0.043 90.000 0.000 NA   NA
 2447621 2447622 SAI_0009 SAI_0010   plsX FALSE 0.051 78.000 0.000 NA   NA
 2447622 2447623 SAI_0010 SAI_0011 plsX   TRUE 0.976 11.000 0.017 0.009 Y NA
 2447623 2447624 SAI_0011 SAI_0012   purC FALSE 0.308 124.000 0.017 1.000 N NA
 2447624 2447625 SAI_0012 SAI_0013 purC   FALSE 0.098 268.000 0.043 1.000 Y NA
 2447625 2447626 SAI_0013 SAI_0014   purF FALSE 0.125 234.000 0.024 1.000 Y NA
 2447626 2447627 SAI_0014 SAI_0015 purF purM TRUE 0.962 28.000 0.248 1.000 Y NA
 2447627 2447628 SAI_0015 SAI_0016 purM purN TRUE 0.867 168.000 0.238 0.002 Y NA
 2447628 2447629 SAI_0016 SAI_0017 purN   TRUE 0.675 20.000 0.003 1.000   NA
 2447629 2447630 SAI_0017 SAI_0018   purH TRUE 0.667 20.000 0.002 1.000   NA
 2447630 2447631 SAI_0018 SAI_0019 purH   FALSE 0.017 193.000 0.000 1.000   NA
 2447631 2447632 SAI_0019 SAI_0020     FALSE 0.045 147.000 0.000 1.000   NA
 2447634 2447635 SAI_0022 SAI_0023     TRUE 0.591 47.000 0.000 1.000 Y NA
 2447635 2447636 SAI_0023 SAI_0024     TRUE 0.688 88.000 0.000 0.051 Y NA
 2447636 2447637 SAI_0024 SAI_0025     TRUE 0.999 10.000 1.000 0.051 Y NA
 2447637 2447638 SAI_0025 SAI_0026     TRUE 0.978 13.000 0.250 NA Y NA
 2447638 2447639 SAI_0026 SAI_0027     FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 2447639 2447640 SAI_0027 SAI_0028     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447640 2447641 SAI_0028 SAI_0029   xylR-2 FALSE 0.478 17.000 0.000 1.000 N NA
 2447641 2447642 SAI_0029 SAI_0030 xylR-2   TRUE 0.914 8.000 0.105 1.000 N NA
 2447644 2447645 SAI_0032 SAI_0033 purD purE FALSE 0.239 190.000 0.044 1.000 Y NA
 2447645 2447646 SAI_0033 SAI_0034 purE purK TRUE 0.942 -13.000 0.000 0.001 Y NA
 2447646 2447647 SAI_0034 SAI_0035 purK   FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 2447647 2447648 SAI_0035 SAI_0036   purB FALSE 0.179 22.000 0.000 NA   NA
 2447648 2447649 SAI_0036 SAI_0037 purB   FALSE 0.128 155.000 0.005 1.000   NA
 2447649 2447650 SAI_0037 SAI_0038   ruvB FALSE 0.051 199.000 0.002 1.000   NA
 2447650 2447651 SAI_0038 SAI_0039 ruvB   FALSE 0.155 152.000 0.005 1.000 N NA
 2447651 2447652 SAI_0039 SAI_0040     TRUE 0.784 7.000 0.019 NA   NA
 2447653 2447654 SAI_0555 SAI_0556   glnP FALSE 0.252 141.000 0.044 NA   NA
 2447654 2447655 SAI_0556 SAI_0557 glnP glnQ TRUE 0.996 -7.000 0.640 0.008 Y NA
 2447655 2447656 SAI_0557 SAI_0558 glnQ manB FALSE 0.007 287.000 0.000 1.000 N NA
 2447656 2447657 SAI_0558 SAI_0559 manB folD FALSE 0.225 139.000 0.013 1.000 N NA
 2447657 2447658 SAI_0559 SAI_0560 folD   FALSE 0.321 120.000 0.030 NA N NA
 2447658 2447659 SAI_0560 SAI_0561   xseA FALSE 0.195 126.000 0.005 NA N NA
 2447659 2447660 SAI_0561 SAI_0562 xseA xseB TRUE 0.993 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 2447660 2447661 SAI_0562 SAI_0563 xseB ispA TRUE 0.878 0.000 0.100 1.000 N NA
 2447661 2447662 SAI_0563 SAI_0564 ispA   TRUE 0.813 -7.000 0.058 1.000 N NA
 2447662 2447663 SAI_0564 SAI_0565     TRUE 0.781 -13.000 0.048 1.000 N NA
 2447663 2447664 SAI_0565 SAI_0566   recN TRUE 0.864 12.000 0.037 1.000 N NA
 2447664 2447665 SAI_0566 SAI_0567 recN   FALSE 0.219 113.000 0.006 NA   NA
 2447665 2447666 SAI_0567 SAI_0568     TRUE 0.893 -25.000 0.203 NA   NA
 2447666 2447667 SAI_0568 SAI_0569     TRUE 0.982 -25.000 0.828 NA   NA
 2447667 2447668 SAI_0569 SAI_0570     TRUE 0.613 103.000 0.156 NA   NA
 2447669 2447670 SAI_0571 SAI_0572 int   FALSE 0.034 115.000 0.000 NA   NA
 2447670 2447671 SAI_0572 SAI_0573     FALSE 0.211 18.000 0.000 NA   NA
 2447671 2447672 SAI_0573 SAI_0574     TRUE 0.981 4.000 0.500 1.000   NA
 2447675 2447676 SAI_0577 SAI_0578     TRUE 0.851 80.000 0.375 NA   NA
 2447676 2447677 SAI_0578 SAI_0579     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2447677 2447678 SAI_0579 SAI_0580     FALSE 0.161 -6.000 0.000 NA   NA
 2447678 2447679 SAI_0580 SAI_0581     FALSE 0.139 -16.000 0.000 NA   NA
 2447681 2447682 SAI_0583 SAI_0584     TRUE 0.940 15.000 0.188 NA   NA
 2447682 2447683 SAI_0584 SAI_0585     TRUE 0.766 96.000 0.281 NA   NA
 2447683 2447684 SAI_0585 SAI_0586     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2447684 2447685 SAI_0586 SAI_0587     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447685 2447686 SAI_0587 SAI_0588     FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 2447688 2447689 SAI_0590 SAI_0591     FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   NA
 2447689 2447690 SAI_0591 SAI_0592     TRUE 0.635 -19.000 0.018 NA   NA
 2447690 2447691 SAI_0592 SAI_0593     TRUE 0.751 -3.000 0.037 NA   NA
 2447691 2447692 SAI_0593 SAI_0594     FALSE 0.125 -81.000 0.000 NA   NA
 2447692 2447693 SAI_0594 SAI_0595     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 2447693 2447694 SAI_0595 SAI_0596     FALSE 0.051 78.000 0.000 NA   NA
 2447694 2447695 SAI_0596 SAI_0597     TRUE 0.600 121.000 0.176 NA   NA
 2447695 2447696 SAI_0597 SAI_0598     TRUE 0.976 -10.000 0.176 0.001   NA
 2447696 2447697 SAI_0598 SAI_0599     TRUE 0.975 15.000 0.429 NA   NA
 2447697 2447698 SAI_0599 SAI_0600     TRUE 0.913 -34.000 0.250 NA   NA
 2447698 2447699 SAI_0600 SAI_0601     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 2447699 2447700 SAI_0601 SAI_0602     FALSE 0.020 143.000 0.000 NA   NA
 2447700 2447701 SAI_0602 SAI_0603     TRUE 0.928 19.000 0.192 NA   NA
 2447701 2447702 SAI_0603 SAI_0604     TRUE 0.980 6.000 0.500 NA   NA
 2447702 2447703 SAI_0604 SAI_0605     FALSE 0.002 304.000 0.000 NA   NA
 2447703 2447704 SAI_0605 SAI_0606     TRUE 0.989 4.000 0.800 NA   NA
 2447704 2447705 SAI_0606 SAI_0607     TRUE 0.839 12.000 0.041 NA   NA
 2447705 2447706 SAI_0607 SAI_0608     TRUE 0.632 51.000 0.062 NA   NA
 2447706 2447707 SAI_0608 SAI_0609     TRUE 0.785 75.000 0.235 NA   NA
 2447707 2447708 SAI_0609 SAI_0611     FALSE 0.201 19.000 0.000 NA   NA
 2447710 2447711 SAI_0612 SAI_0613     TRUE 0.986 13.000 0.600 NA   NA
 2447714 2447715 SAI_0192 SAI_0193     TRUE 0.634 113.000 0.000 0.050 Y NA
 2447715 2447716 SAI_0193 SAI_0194   dppC TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.050 Y NA
 2447716 2447717 SAI_0194 SAI_0195 dppC   TRUE 0.985 12.000 0.333 1.000 Y NA
 2447717 2447718 SAI_0195 SAI_0196     TRUE 0.995 -16.000 0.750 0.037 Y NA
 2447718 2447719 SAI_0196 SAI_0197     FALSE 0.007 283.000 0.000 1.000 N NA
 2447719 2447720 SAI_0197 SAI_0198     TRUE 0.671 222.000 0.650 1.000 Y NA
 2447720 2447721 SAI_0198 SAI_0199     FALSE 0.015 216.000 0.000 1.000 N NA
 2447721 2447722 SAI_0199 SAI_0200     TRUE 0.977 3.000 0.156 0.017 N NA
 2447722 2447723 SAI_0200 SAI_0201     TRUE 0.981 13.000 0.182 0.021   NA
 2447723 2447724 SAI_0201 SAI_0202   tkt TRUE 0.966 3.000 0.333 1.000   NA
 2447724 2447725 SAI_0202 SAI_0203 tkt   TRUE 0.997 -3.000 0.742 0.003 Y NA
 2447725 2447726 SAI_0203 SAI_0204     FALSE 0.108 109.000 0.000 1.000 N NA
 2447726 2447727 SAI_0204 SAI_0205   rpsO FALSE 0.131 88.000 0.000 1.000 N NA
 2447727 2447728 SAI_0205 SAI_0206 rpsO pnp FALSE 0.200 381.000 0.335 1.000 Y NA
 2447728 2447729 SAI_0206 SAI_0207 pnp   TRUE 0.682 2.000 0.009 NA   NA
 2447729 2447730 SAI_0207 SAI_0208   cysE TRUE 0.892 9.000 0.097 NA   NA
 2447730 2447731 SAI_0208 SAI_0209 cysE   FALSE 0.249 10.000 0.000 NA   NA
 2447731 2447732 SAI_0209 SAI_0210   cysS FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447732 2447733 SAI_0210 SAI_0211 cysS   TRUE 0.871 -7.000 0.129 1.000   NA
 2447733 2447734 SAI_0211 SAI_0212     TRUE 0.854 103.000 0.150 0.008   NA
 2447734 2447735 SAI_0212 SAI_0213     TRUE 0.852 -3.000 0.109 NA   NA
 2447735 2447736 SAI_0213 SAI_0214     FALSE 0.384 93.000 0.036 NA   NA
 2447736 2447737 SAI_0214 SAI_0215     FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 2447737 2447738 SAI_0215 SAI_0216   rplM FALSE 0.001 417.000 0.000 NA   NA
 2447738 2447739 SAI_0216 SAI_0217 rplM rpsI TRUE 0.996 21.000 0.601 0.024 Y NA
 2447740 2447741 SAI_0218 SAI_0219     FALSE 0.129 69.000 0.000 1.000   NA
 2447742 2447743 SAI_0220 SAI_0221     TRUE 0.769 141.000 0.500 NA   NA
 2447743 2447744 SAI_0221 SAI_0222     FALSE 0.238 6.000 0.000 NA   NA
 2447744 2447745 SAI_0222 SAI_0223     FALSE 0.222 4.000 0.000 NA   NA
 2447745 2447746 SAI_0223 SAI_0224     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 2447746 2447747 SAI_0224 SAI_0225     FALSE 0.115 36.000 0.000 NA   NA
 2447747 2447748 SAI_0225 SAI_0226   pre FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 2447748 2447749 SAI_0226 SAI_0227 pre   TRUE 0.861 168.000 1.000 NA   NA
 2447750 2447751 SAI_0228 SAI_0229     TRUE 0.965 -10.000 0.500 NA   NA
 2447752 2447753 SAI_0230 SAI_0231     FALSE 0.049 81.000 0.000 NA   NA
 2447753 2447754 SAI_0231 SAI_0232     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 2447754 2447755 SAI_0232 SAI_0233     FALSE 0.131 -27.000 0.000 NA   NA
 2447755 2447756 SAI_0233 SAI_0234     FALSE 0.011 171.000 0.000 NA   NA
 2447756 2447757 SAI_0234 SAI_0235     FALSE 0.141 -15.000 0.000 NA   NA
 2447757 2447758 SAI_0235 SAI_0236     FALSE 0.122 34.000 0.000 NA   NA
 2447758 2447759 SAI_0236 SAI_0237     FALSE 0.042 91.000 0.000 NA   NA
 2447759 2447760 SAI_0237 SAI_0238     FALSE 0.001 428.000 0.000 NA   NA
 2447760 2447761 SAI_0238 SAI_0239     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447761 2447762 SAI_0239 SAI_0240     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2447762 2447763 SAI_0240 SAI_0241     TRUE 0.774 73.000 0.200 1.000   NA
 2447764 2447765 SAI_0242 SAI_0243     TRUE 0.995 1.000 0.619 0.004 N NA
 2447765 2447766 SAI_0243 SAI_0244     TRUE 0.996 3.000 0.650 0.004 N NA
 2447766 2447767 SAI_0244 SAI_0245   proV TRUE 0.995 0.000 0.450 0.004 Y NA
 2447768 2447769 SAI_1279 SAI_1280     FALSE 0.030 296.000 0.026 1.000   NA
 2447769 2447770 SAI_1280 SAI_1281     TRUE 0.991 0.000 0.895 1.000   NA
 2447770 2447771 SAI_1281 SAI_1282     TRUE 0.973 13.000 0.368 NA   NA
 2447773 2447774 SAI_1284 SAI_1285 budA   TRUE 0.870 14.000 0.044 1.000 N NA
 2447774 2447775 SAI_1285 SAI_1286     FALSE 0.345 110.000 0.022 1.000   NA
 2447775 2447776 SAI_1286 SAI_1287     TRUE 0.742 -10.000 0.048 NA   NA
 2447776 2447777 SAI_1287 SAI_1288     FALSE 0.042 92.000 0.000 NA   NA
 2447777 2447778 SAI_1288 SAI_1289     FALSE 0.326 -31.000 0.000 1.000 N NA
 2447780 2447781 SAI_1291 SAI_1292 rfbB   TRUE 0.532 207.000 0.350 1.000 Y NA
 2447781 2447782 SAI_1292 SAI_1293   rfbA TRUE 0.950 0.000 0.149 1.000 Y NA
 2447782 2447783 SAI_1293 SAI_1294 rfbA   TRUE 0.635 59.000 0.059 1.000 N NA
 2447783 2447784 SAI_1294 SAI_1295     TRUE 0.793 9.000 0.021 NA   NA
 2447784 2447785 SAI_1295 SAI_1296     TRUE 0.932 -10.000 0.283 NA   NA
 2447785 2447786 SAI_1296 SAI_1297     FALSE 0.265 104.000 0.012 NA   NA
 2447786 2447787 SAI_1297 SAI_1298   apt FALSE 0.221 118.000 0.005 NA N NA
 2447787 2447788 SAI_1298 SAI_1299 apt   FALSE 0.051 123.000 0.000 NA N NA
 2447788 2447789 SAI_1299 SAI_1300   recJ FALSE 0.028 152.000 0.000 NA N NA
 2447789 2447790 SAI_1300 SAI_1301 recJ   TRUE 0.730 -3.000 0.016 1.000   NA
 2447790 2447791 SAI_1301 SAI_1302     TRUE 0.859 2.000 0.074 1.000   NA
 2447791 2447792 SAI_1302 SAI_1303     TRUE 0.616 42.000 0.022 1.000   NA
 2447792 2447793 SAI_1303 SAI_1304     TRUE 0.698 -7.000 0.014 1.000   NA
 2447793 2447794 SAI_1304 SAI_1305   miaA FALSE 0.401 91.000 0.027 1.000   NA
 2447796 2447797 SAI_1307 SAI_1308     FALSE 0.073 134.000 0.000 1.000 N NA
 2447797 2447798 SAI_1308 SAI_1309     FALSE 0.037 169.000 0.000 1.000 N NA
 2447798 2447799 SAI_1309 SAI_1310     FALSE 0.345 15.000 0.000 NA N NA
 2447799 2447800 SAI_1310 SAI_1311   pepV FALSE 0.377 97.000 0.031 NA N NA
 2447800 2447801 SAI_1311 SAI_1312 pepV   TRUE 0.849 47.000 0.179 1.000 N NA
 2447806 2447807 SAI_0614 SAI_0615     FALSE 0.041 94.000 0.000 NA   NA
 2447807 2447808 SAI_0615 SAI_0616     FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 2447808 2447809 SAI_0616 SAI_0617     FALSE 0.251 11.000 0.000 NA   NA
 2447809 2447810 SAI_0617 SAI_0618     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2447810 2447811 SAI_0618 SAI_0619     FALSE 0.249 10.000 0.000 NA   NA
 2447811 2447812 SAI_0619 SAI_0620     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2447812 2447813 SAI_0620 SAI_0621     FALSE 0.132 -25.000 0.000 NA   NA
 2447813 2447814 SAI_0621 SAI_0622     FALSE 0.002 314.000 0.000 NA   NA
 2447816 2447817 SAI_0624 SAI_0625     FALSE 0.048 83.000 0.000 NA   NA
 2447817 2447818 SAI_0625 SAI_0626     FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   NA
 2447818 2447819 SAI_0626 SAI_0627   speM FALSE 0.130 -28.000 0.000 NA   NA
 2447819 2447820 SAI_0627 SAI_0628 speM   FALSE 0.034 114.000 0.000 NA   NA
 2447820 2447821 SAI_0628 SAI_0629     FALSE 0.001 394.000 0.000 NA   NA
 2447822 2447823 SAI_0630 SAI_0631     FALSE 0.025 187.000 0.000 1.000 N NA
 2447823 2447824 SAI_0631 SAI_0632     TRUE 0.995 19.000 0.467 0.010 Y NA
 2447824 2447825 SAI_0632 SAI_0633     TRUE 0.991 13.000 0.133 0.001 Y NA
 2447825 2447826 SAI_0633 SAI_0634     TRUE 0.854 -15.000 0.125 1.000   NA
 2447826 2447827 SAI_0634 SAI_0635     FALSE 0.497 71.000 0.035 1.000   NA
 2447828 2447829 SAI_0636 SAI_0637     FALSE 0.001 344.000 0.000 NA   NA
 2447831 2447832 SAI_0639 SAI_0640 fbp   FALSE 0.400 90.000 0.018 1.000 N NA
 2447832 2447833 SAI_0640 SAI_0641   prfB FALSE 0.081 187.000 0.006 1.000 N NA
 2447833 2447834 SAI_0641 SAI_0642 prfB ftsE TRUE 0.956 19.000 0.053 0.015 N NA
 2447834 2447835 SAI_0642 SAI_0643 ftsE ftsX TRUE 0.976 -16.000 0.431 1.000 Y NA
 2447836 2447837 SAI_0644 SAI_0645     TRUE 0.593 -3.000 0.004 NA   NA
 2447838 2447839 SAI_0646 SAI_0647 fabG   FALSE 0.109 108.000 0.000 1.000 N NA
 2447839 2447840 SAI_0647 SAI_0648     FALSE 0.442 86.000 0.028 1.000 N NA
 2447840 2447841 SAI_0648 SAI_0649   asnS TRUE 0.854 21.000 0.068 1.000 N NA
 2447842 2447843 SAI_0650 SAI_0651     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447843 2447844 SAI_0651 SAI_0652     FALSE 0.010 246.000 0.000 1.000 N NA
 2447845 2447846 SAI_0653 SAI_0654     TRUE 0.924 -3.000 0.214 NA   NA
 2447846 2447847 SAI_0654 SAI_0655     TRUE 0.966 -3.000 0.470 NA   NA
 2447847 2447848 SAI_0655 SAI_0656     TRUE 0.801 15.000 0.015 1.000   NA
 2447848 2447849 SAI_0656 SAI_0657     TRUE 0.981 -3.000 0.200 0.002   NA
 2447849 2447850 SAI_0657 SAI_0658     TRUE 0.617 142.000 0.250 1.000   NA
 2447851 2447852 SAI_0659 SAI_0660 rpmE   FALSE 0.403 85.000 0.020 1.000   NA
 2447853 2447854 SAI_0661 SAI_0662 add   FALSE 0.154 59.000 0.000 1.000   NA
 2447856 2447857 SAI_1173 SAI_1172     FALSE 0.234 161.000 0.083 NA   NA
 2447857 2447858 SAI_1172 SAI_1171     TRUE 0.912 2.000 0.166 NA   NA
 2447858 2447859 SAI_1171 SAI_1170   prsA TRUE 0.942 4.000 0.089 1.000 Y NA
 2447859 2447860 SAI_1170 SAI_1169 prsA   FALSE 0.285 177.000 0.145 1.000   NA
 2447861 2447862 SAI_1168 SAI_1167     TRUE 0.979 -25.000 0.725 1.000   NA
 2447862 2447863 SAI_1167 SAI_1166   rluD TRUE 0.904 -3.000 0.150 1.000 N NA
 2447863 2447864 SAI_1166 SAI_1165 rluD pta TRUE 0.827 26.000 0.067 1.000 N NA
 2447864 2447865 SAI_1165 SAI_1164 pta   TRUE 0.768 62.000 0.031 0.064   NA
 2447865 2447866 SAI_1164 SAI_1163     FALSE 0.055 135.000 0.000 1.000   NA
 2447866 2447867 SAI_1163 SAI_1162     FALSE 0.053 75.000 0.000 NA   NA
 2447869 2447870 SAI_1160 SAI_1159   guaC FALSE 0.015 203.000 0.000 1.000   NA
 2447870 2447871 SAI_1159 SAI_1158 guaC xpt FALSE 0.076 255.000 0.009 1.000 Y NA
 2447871 2447872 SAI_1158 SAI_1157 xpt pbuX TRUE 0.908 0.000 0.046 1.000 Y NA
 2447873 2447874 SAI_1156 SAI_1155     FALSE 0.039 99.000 0.000 NA   NA
 2447874 2447875 SAI_1155 SAI_1154     TRUE 0.977 24.000 0.588 NA   NA
 2447875 2447876 SAI_1154 SAI_1153   apbE TRUE 0.948 18.000 0.243 NA   NA
 2447876 2447877 SAI_1153 SAI_1152 apbE   TRUE 0.506 149.000 0.189 1.000   NA
 2447878 2447879 SAI_1151 SAI_1150   prfA TRUE 0.767 35.000 0.062 1.000 N NA
 2447879 2447880 SAI_1150 SAI_1149 prfA hemK TRUE 0.968 0.000 0.084 0.053 Y NA
 2447880 2447881 SAI_1149 SAI_1148 hemK   TRUE 0.857 -7.000 0.029 NA Y NA
 2447881 2447882 SAI_1148 SAI_1147   glyA FALSE 0.332 92.000 0.015 NA N NA
 2447882 2447883 SAI_1147 SAI_1146 glyA   TRUE 0.887 5.000 0.103 NA   NA
 2447883 2447884 SAI_1146 SAI_1145     TRUE 0.886 2.000 0.128 NA   NA
 2447884 2447885 SAI_1145 SAI_1144     TRUE 0.857 12.000 0.053 NA   NA
 2447885 2447886 SAI_1144 SAI_1143     TRUE 0.998 1.000 0.895 0.007 Y NA
 2447887 2447888 SAI_1142 SAI_1141 manB   FALSE 0.481 110.000 0.098 NA   NA
 2447888 2447889 SAI_1141 SAI_1140     TRUE 0.535 46.000 0.019 NA   NA
 2447889 2447890 SAI_1140 SAI_1139   dfp TRUE 0.695 -7.000 0.013 1.000   NA
 2447891 2447892 SAI_1138 SAI_1137   noxB-2 TRUE 0.755 -3.000 0.019 1.000 N NA
 2447892 2447893 SAI_1137 SAI_1136 noxB-2   TRUE 0.927 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 2447893 2447894 SAI_1136 SAI_1135   gcvH TRUE 0.975 29.000 0.571 1.000 N NA
 2447894 2447895 SAI_1135 SAI_1134 gcvH   TRUE 0.834 -7.000 0.107 NA   NA
 2447895 2447896 SAI_1134 SAI_1133     TRUE 0.923 -31.000 0.286 NA   NA
 2447896 2447897 SAI_1133 SAI_1132     TRUE 0.938 27.000 0.250 1.000 N NA
 2447897 2447898 SAI_1132 SAI_1131   fhs TRUE 0.742 89.000 0.200 1.000 N NA
 2447898 2447899 SAI_1131 SAI_1130 fhs cls FALSE 0.502 119.000 0.094 1.000 N NA
 2447900 2447901 SAI_0932 SAI_0931     TRUE 0.891 4.000 0.088 1.000 N NA
 2447901 2447902 SAI_0931 SAI_0930   ligA TRUE 0.818 12.000 0.013 1.000 N NA
 2447902 2447903 SAI_0930 SAI_0929 ligA   FALSE 0.132 152.000 0.010 NA   NA
 2447905 2447906 SAI_0927 SAI_0926   map TRUE 0.967 2.000 0.373 1.000   NA
 2447906 2447907 SAI_0926 SAI_0925 map   TRUE 0.666 131.000 0.235 1.000 N NA
 2447907 2447908 SAI_0925 SAI_0924     TRUE 0.948 -7.000 0.342 NA   NA
 2447908 2447909 SAI_0924 SAI_0923     FALSE 0.159 26.000 0.000 NA   NA
 2447909 2447910 SAI_0923 SAI_0922   murA FALSE 0.466 84.000 0.052 NA   NA
 2447910 2447911 SAI_0922 SAI_0921 murA thiE FALSE 0.084 127.000 0.000 1.000 N NA
 2447911 2447912 SAI_0921 SAI_0920 thiE thiM TRUE 0.985 14.000 0.061 0.003 Y NA
 2447912 2447913 SAI_0920 SAI_0919 thiM thiD TRUE 0.976 2.000 0.032 0.003 Y NA
 2447913 2447914 SAI_0919 SAI_0918 thiD   TRUE 0.976 2.000 0.478 1.000 N NA
 2447914 2447915 SAI_0918 SAI_0917     FALSE 0.111 84.000 0.000 1.000   NA
 2447915 2447916 SAI_0917 SAI_0916     FALSE 0.124 -253.000 0.000 NA   NA
 2447916 2447917 SAI_0916 SAI_0915     FALSE 0.033 116.000 0.000 NA   NA
 2447917 2447918 SAI_0915 SAI_0914     FALSE 0.222 4.000 0.000 NA   NA
 2447918 2447919 SAI_0914 SAI_0913     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447919 2447920 SAI_0913 SAI_0912     FALSE 0.001 396.000 0.000 NA   NA
 2447920 2447921 SAI_0912 SAI_0911     FALSE 0.059 67.000 0.000 NA   NA
 2447921 2447922 SAI_0911 SAI_0910   metK FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 2447924 2447925 SAI_0908 SAI_0907   dnaX FALSE 0.478 89.000 0.067 NA   NA
 2447925 2447926 SAI_0907 SAI_0906 dnaX   TRUE 0.764 0.000 0.030 NA N NA
 2447926 2447927 SAI_0906 SAI_0905   udk FALSE 0.073 87.000 0.000 NA N NA
 2447929 2447930 SAI_0903 SAI_0902     FALSE 0.262 140.000 0.028 1.000 N NA
 2447930 2447931 SAI_0902 SAI_0901   ptsI FALSE 0.244 150.000 0.035 1.000 N NA
 2447931 2447932 SAI_0901 SAI_0900 ptsI   TRUE 0.992 14.000 0.240 0.017 Y NA
 2447933 2447934 SAI_0899 SAI_0898 nrdH   TRUE 0.922 78.000 0.562 1.000 N NA
 2447934 2447935 SAI_0898 SAI_0897     TRUE 0.878 203.000 0.500 0.002 Y NA
 2447935 2447936 SAI_0897 SAI_0896     FALSE 0.003 241.000 0.000 NA   NA
 2447937 2447938 SAI_0895 SAI_0894     TRUE 0.869 0.000 0.115 NA   NA
 2447938 2447939 SAI_0894 SAI_0893     TRUE 0.944 45.000 0.500 NA   NA
 2447939 2447940 SAI_0893 SAI_0892     FALSE 0.001 428.000 0.000 NA   NA
 2447940 2447941 SAI_0892 SAI_0891     FALSE 0.044 88.000 0.000 NA   NA
 2447941 2447942 SAI_0891 SAI_0890   alaS FALSE 0.049 82.000 0.000 NA   NA
 2447943 2447944 SAI_0512 SAI_0513 asnA   TRUE 0.953 0.000 0.022 0.002   NA
 2447946 2447947 SAI_0515 SAI_0516     FALSE 0.252 12.000 0.000 NA   NA
 2447947 2447948 SAI_0516 SAI_0517   coaD FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2447948 2447949 SAI_0517 SAI_0518 coaD   TRUE 0.795 -10.000 0.052 1.000 N NA
 2447949 2447950 SAI_0518 SAI_0519     FALSE 0.448 75.000 0.023 1.000   NA
 2447950 2447951 SAI_0519 SAI_0520     TRUE 0.779 57.000 0.000 0.002   NA
 2447951 2447952 SAI_0520 SAI_0521     TRUE 0.827 86.000 0.347 NA   NA
 2447952 2447953 SAI_0521 SAI_0522     FALSE 0.481 51.000 0.016 NA   NA
 2447953 2447954 SAI_0522 SAI_0523     TRUE 0.682 0.000 0.012 NA   NA
 2447954 2447955 SAI_0523 SAI_0524     FALSE 0.255 179.000 0.045 NA Y NA
 2447955 2447956 SAI_0524 SAI_0525     TRUE 0.998 -10.000 0.911 0.007 Y NA
 2447956 2447957 SAI_0525 SAI_0526   trpG FALSE 0.083 128.000 0.000 1.000 N NA
 2447958 2447959 SAI_0527 SAI_0528   bioB FALSE 0.191 1.000 0.000 NA   NA
 2447960 2447961 SAI_0529 SAI_0530   atoB TRUE 0.861 10.000 0.058 NA   NA
 2447961 2447962 SAI_0530 SAI_0531 atoB   TRUE 0.986 -7.000 0.576 1.000 Y NA
 2447962 2447963 SAI_0531 SAI_0532   nth FALSE 0.105 113.000 0.000 1.000 N NA
 2447965 2447966 SAI_0534 SAI_0535     TRUE 0.968 -3.000 0.496 NA   NA
 2447966 2447967 SAI_0535 SAI_0536     TRUE 0.878 12.000 0.064 NA N NA
 2447967 2447968 SAI_0536 SAI_0537   typA FALSE 0.031 232.000 0.003 NA N NA
 2447968 2447969 SAI_0537 SAI_0538 typA   TRUE 0.519 45.000 0.015 NA   NA
 2447969 2447970 SAI_0538 SAI_0539   murD FALSE 0.174 130.000 0.006 NA   NA
 2447970 2447971 SAI_0539 SAI_0540 murD   TRUE 0.929 3.000 0.060 1.000 Y NA
 2447971 2447972 SAI_0540 SAI_0541     TRUE 0.930 4.000 0.072 NA Y NA
 2447972 2447973 SAI_0541 SAI_0542   ftsA FALSE 0.226 272.000 0.389 NA N NA
 2447973 2447974 SAI_0542 SAI_0543 ftsA   TRUE 0.983 22.000 0.460 1.000 Y NA
 2447974 2447975 SAI_0543 SAI_0544     TRUE 0.662 6.000 0.002 NA   NA
 2447975 2447976 SAI_0544 SAI_0545     TRUE 0.682 12.000 0.002 NA   NA
 2447976 2447977 SAI_0545 SAI_0546     FALSE 0.035 259.000 0.031 NA   NA
 2447977 2447978 SAI_0546 SAI_0547     TRUE 0.985 10.000 0.579 NA   NA
 2447978 2447979 SAI_0547 SAI_0548   ileS FALSE 0.023 285.000 0.012 NA N NA
 2447980 2447981 SAI_0549 SAI_0550     TRUE 0.657 64.000 0.114 NA   NA
 2447981 2447982 SAI_0550 SAI_0551     FALSE 0.176 186.000 0.079 1.000 N NA
 2447983 2447984 SAI_2256 SAI_2257 guaB   FALSE 0.178 157.000 0.000 1.000 Y NA
 2447984 2447985 SAI_2257 SAI_2258     TRUE 0.896 10.000 0.000 0.040 N NA
 2447986 2447987 SAI_2259 SAI_2260     FALSE 0.201 19.000 0.000 NA   NA
 2447987 2447988 SAI_2260 SAI_2261   arcA FALSE 0.003 267.000 0.000 NA   NA
 2447988 2447989 SAI_2261 SAI_2262 arcA   TRUE 0.871 6.000 0.056 1.000   NA
 2447989 2447990 SAI_2262 SAI_2263   argF TRUE 0.899 16.000 0.104 1.000   NA
 2447990 2447991 SAI_2263 SAI_2264 argF arcD TRUE 0.741 63.000 0.042 1.000 Y NA
 2447991 2447992 SAI_2264 SAI_2265 arcD arcC TRUE 0.929 21.000 0.091 1.000 Y NA
 2447993 2447994 SAI_2266 SAI_2267 trpS   FALSE 0.033 173.000 0.000 1.000 N NA
 2447994 2447995 SAI_2267 SAI_2268     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2447995 2447996 SAI_2268 SAI_2269     FALSE 0.115 36.000 0.000 NA   NA
 2447997 2447998 SAI_2270 SAI_2271     FALSE 0.445 66.000 0.027 NA   NA
 2447998 2447999 SAI_2271 SAI_2272     FALSE 0.324 123.000 0.040 NA   NA
 2448001 2448002 SAI_2274 SAI_2275 htrA   FALSE 0.363 98.000 0.015 1.000 N NA
 2448002 2448003 SAI_2275 SAI_2276   dnaA FALSE 0.048 209.000 0.002 1.000 N NA
 2448003 2448004 SAI_2276 SAI_2277 dnaA dnaN TRUE 0.742 155.000 0.328 1.000 Y NA
 2448004 2448005 SAI_2277 SAI_2278 dnaN   FALSE 0.366 70.000 0.003 1.000 N NA
 2448005 2448006 SAI_2278 SAI_2279     TRUE 0.774 10.000 0.015 NA   NA
 2448006 2448007 SAI_2279 SAI_2280     FALSE 0.006 201.000 0.000 NA   NA
 2448007 2448008 SAI_2280 SAI_2281   ychF FALSE 0.019 244.000 0.002 NA   NA
 2448008 2448009 SAI_2281 SAI_2282 ychF pth TRUE 0.840 84.000 0.184 1.000 Y NA
 2448009 2448010 SAI_2282 SAI_2283 pth   TRUE 0.897 -3.000 0.137 1.000 N NA
 2448010 2448011 SAI_2283 SAI_2284     FALSE 0.013 161.000 0.000 NA   NA
 2448011 2448012 SAI_2284 SAI_2285     FALSE 0.186 21.000 0.000 NA   NA
 2448012 2448013 SAI_2285 SAI_2286     TRUE 0.791 -13.000 0.053 1.000 N NA
 2448013 2448014 SAI_2286 SAI_2287     TRUE 0.697 3.000 0.009 NA   NA
 2448014 2448015 SAI_2287 SAI_2288     TRUE 0.858 0.000 0.105 NA   NA
 2448015 2448016 SAI_2288 SAI_2289     TRUE 0.769 2.000 0.014 1.000 N NA
 2448016 2448017 SAI_2289 SAI_2290   hpt TRUE 0.955 5.000 0.067 0.051 N NA
 2448017 2448018 SAI_2290 SAI_2291 hpt ftsH TRUE 0.928 23.000 0.192 1.000 N NA
 2448019 2448020 SAI_1947 SAI_1948     TRUE 0.986 -3.000 0.818 NA   NA
 2448020 2448021 SAI_1948 SAI_1949     FALSE 0.035 140.000 0.000 NA N NA
 2448021 2448022 SAI_1949 SAI_1950     TRUE 0.745 -16.000 0.034 1.000 N NA
 2448022 2448023 SAI_1950 SAI_1951   dck FALSE 0.262 121.000 0.005 1.000 N NA
 2448023 2448024 SAI_1951 SAI_1952 dck   TRUE 0.514 14.000 0.000 1.000 N NA
 2448025 2448026 SAI_1953 SAI_1954 clpC-1   TRUE 0.917 -3.000 0.188 NA N NA
 2448028 2448029 SAI_1956 SAI_1957 tsf rpsB TRUE 0.959 94.000 0.748 1.000 Y NA
 2448030 2448031 SAI_1958 SAI_1959 ahpC   TRUE 0.990 18.000 0.551 1.000 Y NA
 2448032 2448033 SAI_1960 SAI_1961     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2448037 2448038 SAI_1965 SAI_1966     FALSE 0.125 -91.000 0.000 NA   NA
 2448039 2448040 SAI_1967 SAI_1968   def TRUE 0.537 66.000 0.034 1.000 N NA
 2448041 2448042 SAI_1969 SAI_1970     TRUE 0.909 80.000 0.562 NA   NA
 2448044 2448045 SAI_1972 SAI_1973     FALSE 0.058 133.000 0.000 1.000   NA
 2448045 2448046 SAI_1973 SAI_1974   polC FALSE 0.300 127.000 0.020 1.000 N NA
 2448046 2448047 SAI_1974 SAI_1975 polC   FALSE 0.093 123.000 0.000 1.000 N NA
 2448047 2448048 SAI_1975 SAI_1976   proS FALSE 0.088 125.000 0.000 1.000 N NA
 2448048 2448049 SAI_1976 SAI_1977 proS   TRUE 0.571 92.000 0.095 1.000 N NA
 2448049 2448050 SAI_1977 SAI_1978   cdsA TRUE 0.758 31.000 0.040 1.000 N NA
 2448050 2448051 SAI_1978 SAI_1979 cdsA uppS TRUE 0.954 15.000 0.113 1.000 Y NA
 2448052 2448053 SAI_1069 SAI_1068     TRUE 0.850 13.000 0.049 NA   NA
 2448053 2448054 SAI_1068 SAI_1067   truB FALSE 0.061 131.000 0.000 1.000   NA
 2448054 2448055 SAI_1067 SAI_1066 truB ribF TRUE 0.971 13.000 0.308 1.000 N NA
 2448055 2448056 SAI_1066 SAI_1065 ribF   TRUE 0.612 43.000 0.017 1.000 N NA
 2448056 2448057 SAI_1065 SAI_1064     TRUE 0.870 -28.000 0.169 NA   NA
 2448057 2448058 SAI_1064 SAI_1063     TRUE 0.954 23.000 0.337 NA   NA
 2448058 2448059 SAI_1063 SAI_1062     TRUE 0.802 68.000 0.229 NA N NA
 2448059 2448060 SAI_1062 SAI_1061     FALSE 0.405 185.000 0.303 NA   NA
 2448060 2448061 SAI_1061 SAI_1060     TRUE 0.826 -3.000 0.087 NA   NA
 2448061 2448062 SAI_1060 SAI_1059     TRUE 0.878 6.000 0.087 NA   NA
 2448062 2448063 SAI_1059 SAI_1058   pstC TRUE 0.851 46.000 0.206 NA   NA
 2448063 2448064 SAI_1058 SAI_1057 pstC pstA TRUE 0.998 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 2448064 2448065 SAI_1057 SAI_1056 pstA pstB TRUE 0.997 12.000 0.490 0.004 Y NA
 2448065 2448066 SAI_1056 SAI_1055 pstB pstB TRUE 0.870 213.000 0.542 0.002 Y NA
 2448066 2448067 SAI_1055 SAI_1054 pstB   TRUE 0.968 34.000 0.413 NA Y NA
 2448067 2448068 SAI_1054 SAI_1053     FALSE 0.296 146.000 0.067 NA N NA
 2448070 2448071 SAI_1051 SAI_1050     TRUE 0.985 -16.000 0.606 1.000 Y NA
 2448071 2448072 SAI_1050 SAI_1049     FALSE 0.082 113.000 0.000 1.000   NA
 2448072 2448073 SAI_1049 SAI_1048   ffh TRUE 0.922 18.000 0.151 1.000   NA
 2448075 2448076 SAI_1046 SAI_1045     TRUE 0.924 -10.000 0.250 NA   NA
 2448079 2448080 SAI_1042 SAI_1041     FALSE 0.126 91.000 0.000 1.000 N NA
 2448080 2448081 SAI_1041 SAI_1040     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2448081 2448082 SAI_1040 SAI_1039     FALSE 0.003 241.000 0.000 NA   NA
 2448082 2448083 SAI_1039 SAI_1038     TRUE 0.507 110.000 0.094 1.000   NA
 2448083 2448084 SAI_1038 SAI_1037     TRUE 0.991 2.000 0.855 1.000   NA
 2448084 2448085 SAI_1037 SAI_1036     TRUE 0.757 26.000 0.033 1.000   NA
 2448087 2448088 SAI_1034 SAI_1033     FALSE 0.024 133.000 0.000 NA   NA
 2448088 2448089 SAI_1033 SAI_1032   gid FALSE 0.118 78.000 0.000 1.000   NA
 2448089 2448090 SAI_1032 SAI_1031 gid   FALSE 0.103 114.000 0.000 1.000 N NA
 2448092 2448093 SAI_1029 SAI_1028     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2448095 2448096 SAI_0995 SAI_0994     FALSE 0.362 0.000 0.000 1.000   NA
 2448096 2448097 SAI_0994 SAI_0993     FALSE 0.053 152.000 0.000 1.000 N NA
 2448097 2448098 SAI_0993 SAI_0992     FALSE 0.362 0.000 0.000 1.000   NA
 2448098 2448099 SAI_0992 SAI_0991     TRUE 0.787 9.000 0.010 1.000   NA
 2448099 2448100 SAI_0991 SAI_0990     FALSE 0.079 117.000 0.000 1.000   NA
 2448100 2448101 SAI_0990 SAI_0989   lepA FALSE 0.007 247.000 0.000 1.000   NA
 2448101 2448102 SAI_0989 SAI_0988 lepA   FALSE 0.181 136.000 0.003 1.000 N NA
 11489468 2448102   SAI_0988     FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11631831 2448102   SAI_0988     FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11774223 2448102   SAI_0988     FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11489469 2448102   SAI_0988     FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11631832 2448102   SAI_0988     FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11774224 2448102   SAI_0988     FALSE NA 594.000 0.000 NA   NA
 11489470 2448102   SAI_0988     FALSE NA 624.000 0.000 NA   NA
 11631833 2448102   SAI_0988     FALSE NA 624.000 0.000 NA   NA
 11774225 2448102   SAI_0988     FALSE NA 624.000 0.000 NA   NA
 11489471 2448102   SAI_0988     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11631834 2448102   SAI_0988     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11774226 2448102   SAI_0988     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11489472 2448102   SAI_0988     FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11631835 2448102   SAI_0988     FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11774227 2448102   SAI_0988     FALSE NA 690.000 0.000 NA   NA
 11489473 2448102   SAI_0988     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11631836 2448102   SAI_0988     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11774228 2448102   SAI_0988     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11489474 2448102   SAI_0988     FALSE NA 756.000 0.000 NA   NA
 11631837 2448102   SAI_0988     FALSE NA 756.000 0.000 NA   NA
 11774229 2448102   SAI_0988     FALSE NA 756.000 0.000 NA   NA
 11489475 2448102   SAI_0988     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11631838 2448102   SAI_0988     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11774230 2448102   SAI_0988     FALSE NA 792.000 0.000 NA   NA
 11489476 2448102   SAI_0988     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11631839 2448102   SAI_0988     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11774231 2448102   SAI_0988     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11489477 2448102   SAI_0988     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11631840 2448102   SAI_0988     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11774232 2448102   SAI_0988     FALSE NA 858.000 0.000 NA   NA
 11489478 2448102   SAI_0988     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11631841 2448102   SAI_0988     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11774233 2448102   SAI_0988     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11489479 2448102   SAI_0988     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11631842 2448102   SAI_0988     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11774234 2448102   SAI_0988     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11489480 2448102   SAI_0988     FALSE NA 954.000 0.000 NA   NA
 11631843 2448102   SAI_0988     FALSE NA 954.000 0.000 NA   NA
 11774235 2448102   SAI_0988     FALSE NA 954.000 0.000 NA   NA
 11489481 2448102   SAI_0988     FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11631844 2448102   SAI_0988     FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11774236 2448102   SAI_0988     FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11489482 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11631845 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11774237 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11489483 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11631846 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11774238 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1056.000 0.000 NA   NA
 11489484 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1086.000 0.000 NA   NA
 11631847 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1086.000 0.000 NA   NA
 11774239 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1086.000 0.000 NA   NA
 11489485 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1122.000 0.000 NA   NA
 11631848 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1122.000 0.000 NA   NA
 11774240 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1122.000 0.000 NA   NA
 11489486 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11631849 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11774241 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11489487 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11631850 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11774242 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1188.000 0.000 NA   NA
 11489488 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1218.000 0.000 NA   NA
 11631851 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1218.000 0.000 NA   NA
 11774243 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1218.000 0.000 NA   NA
 11489489 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11631852 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11774244 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11489490 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1284.000 0.000 NA   NA
 11631853 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1284.000 0.000 NA   NA
 11774245 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1284.000 0.000 NA   NA
 11489491 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1320.000 0.000 NA   NA
 11631854 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1320.000 0.000 NA   NA
 11774246 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1320.000 0.000 NA   NA
 11489492 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1349.000 0.000 NA   NA
 11631855 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1349.000 0.000 NA   NA
 11774247 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1349.000 0.000 NA   NA
 11489493 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11631856 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11774248 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1385.000 0.000 NA   NA
 11489494 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11631857 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11774249 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11489495 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11631858 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11774250 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1451.000 0.000 NA   NA
 11489496 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 11631859 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 11774251 2448102   SAI_0988     FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 2448104 2448105 SAI_0986 SAI_0985   cas2 TRUE 0.924 -13.000 0.253 NA   NA
 2448105 2448106 SAI_0985 SAI_0984 cas2 cas1 TRUE 0.993 12.000 0.876 NA   NA
 2448106 2448107 SAI_0984 SAI_0983 cas1   TRUE 0.978 2.000 0.546 NA   NA
 2448107 2448108 SAI_0983 SAI_0982     FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   NA
 2448108 2448109 SAI_0982 SAI_0981     TRUE 0.933 -25.000 0.330 NA   NA
 2448109 2448110 SAI_0981 SAI_0980     TRUE 0.844 1.000 0.055 1.000 N NA
 2448110 2448111 SAI_0980 SAI_0979     TRUE 0.873 4.000 0.060 1.000 N NA
 2448111 2448112 SAI_0979 SAI_0978     FALSE 0.042 92.000 0.000 NA   NA
 2448112 2448113 SAI_0978 SAI_0977     TRUE 0.876 25.000 0.143 NA   NA
 2448113 2448114 SAI_0977 SAI_0976   glmM FALSE 0.031 123.000 0.000 NA   NA
 2448114 2448115 SAI_0976 SAI_0975 glmM   TRUE 0.755 54.000 0.150 NA   NA
 2448115 2448116 SAI_0975 SAI_0974     TRUE 0.979 3.000 0.502 NA   NA
 2448117 2448118 SAI_0973 SAI_0972     TRUE 0.988 0.000 0.796 1.000   NA
 2448119 2448120 SAI_0971 SAI_0970     TRUE 0.724 98.000 0.200 1.000 N NA
 2448120 2448121 SAI_0970 SAI_0969   aceF TRUE 0.804 60.000 0.091 1.000 Y NA
 2448121 2448122 SAI_0969 SAI_0968 aceF   TRUE 0.756 127.000 0.051 0.058 Y NA
 2448122 2448123 SAI_0968 SAI_0967   pdhA TRUE 0.922 213.000 0.769 0.001 Y NA
 2448125 2448126 SAI_1492 SAI_1493   pepT TRUE 0.750 29.000 0.051 NA   NA
 2448126 2448127 SAI_1493 SAI_1494 pepT   FALSE 0.055 135.000 0.000 1.000   NA
 2448128 2448129 SAI_1495 SAI_1496 murE   FALSE 0.273 156.000 0.062 1.000 N NA
 2448129 2448130 SAI_1496 SAI_1497     TRUE 0.994 24.000 0.889 1.000 Y NA
 2448130 2448131 SAI_1497 SAI_1498     TRUE 0.968 16.000 0.179 1.000 Y NA
 2448131 2448132 SAI_1498 SAI_1499     TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.044 Y NA
 2448133 2448134 SAI_1500 SAI_1501     FALSE 0.428 60.000 0.015 NA   NA
 2448134 2448135 SAI_1501 SAI_1502     FALSE 0.352 117.000 0.023 1.000 N NA
 2448135 2448136 SAI_1502 SAI_1503     FALSE 0.435 68.000 0.028 NA   NA
 2448136 2448137 SAI_1503 SAI_1504     FALSE 0.094 180.000 0.023 NA   NA
 2448137 2448138 SAI_1504 SAI_1505     TRUE 0.981 -7.000 0.408 0.058   NA
 2448138 2448139 SAI_1505 SAI_1506     FALSE 0.468 93.000 0.050 1.000   NA
 2448139 2448140 SAI_1506 SAI_1507     TRUE 0.971 -19.000 0.600 NA   NA
 2448140 2448141 SAI_1507 SAI_1508     FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 2448141 2448142 SAI_1508 SAI_1509     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448142 2448143 SAI_1509 SAI_1510     TRUE 0.994 0.000 0.909 NA Y NA
 2448143 2448144 SAI_1510 SAI_1511     FALSE 0.083 112.000 0.000 1.000   NA
 2448144 2448145 SAI_1511 SAI_1512     TRUE 0.547 119.000 0.000 0.006   NA
 2448147 2448148 SAI_1514 SAI_1515     FALSE 0.302 -10.000 0.000 1.000   NA
 2448148 2448149 SAI_1515 SAI_1516     FALSE 0.340 -3.000 0.000 1.000   NA
 2448149 2448150 SAI_1516 SAI_1517     FALSE 0.035 110.000 0.000 NA   NA
 2448150 2448151 SAI_1517 SAI_1518     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2448151 2448152 SAI_1518 SAI_1519     TRUE 0.911 30.000 0.222 NA   NA
 2448152 2448153 SAI_1519 SAI_1520     TRUE 0.746 2.000 0.000 NA Y NA
 2448153 2448154 SAI_1520 SAI_1521     FALSE 0.425 0.000 0.000 1.000 N NA
 2448154 2448155 SAI_1521 SAI_1522     FALSE 0.311 3.000 0.000 NA N NA
 2448155 2448156 SAI_1522 SAI_1523     FALSE 0.055 70.000 0.000 NA   NA
 2448157 2448158 SAI_1709 SAI_1710     TRUE 0.653 62.000 0.107 NA   NA
 2448158 2448159 SAI_1710 SAI_1711     FALSE 0.057 68.000 0.000 NA   NA
 2448159 2448160 SAI_1711 SAI_1712     FALSE 0.374 146.000 0.123 NA   NA
 2448160 2448161 SAI_1712 SAI_1713     TRUE 0.695 38.000 0.043 1.000   NA
 2448162 2448163 SAI_1714 SAI_1715     FALSE 0.183 217.000 0.154 1.000 N NA
 2448164 2448165 SAI_1716 SAI_1717     TRUE 0.973 24.000 0.125 0.044 Y NA
 2448165 2448166 SAI_1717 SAI_1718   nylA FALSE 0.043 161.000 0.000 1.000 N NA
 2448166 2448167 SAI_1718 SAI_1719 nylA   FALSE 0.111 104.000 0.000 1.000 N NA
 2448167 2448168 SAI_1719 SAI_1720     TRUE 0.591 73.000 0.079 1.000   NA
 2448168 2448169 SAI_1720 SAI_1721     TRUE 0.621 87.000 0.120 1.000   NA
 2448169 2448170 SAI_1721 SAI_1722   murC FALSE 0.373 86.000 0.014 1.000   NA
 2448170 2448171 SAI_1722 SAI_1723 murC   TRUE 0.763 10.000 0.013 NA   NA
 2448171 2448172 SAI_1723 SAI_1724     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2448172 2448173 SAI_1724 SAI_1726     FALSE 0.065 62.000 0.000 NA   NA
 2448175 2448176 SAI_1727 SAI_1728     FALSE 0.505 48.000 0.008 1.000   NA
 2448176 2448177 SAI_1728 SAI_1729     TRUE 0.992 -3.000 0.817 NA Y NA
 2448177 2448178 SAI_1729 SAI_1730     TRUE 0.871 0.000 0.109 NA N NA
 2448178 2448179 SAI_1730 SAI_1731     FALSE 0.140 149.000 0.007 NA N NA
 2448179 2448180 SAI_1731 SAI_1732     TRUE 0.989 -10.000 0.438 0.088 Y NA
 2448180 2448181 SAI_1732 SAI_1733     FALSE 0.037 235.000 0.014 NA   NA
 2448181 2448182 SAI_1733 SAI_1734     FALSE 0.053 180.000 0.002 NA   NA
 2448182 2448183 SAI_1734 SAI_1735     TRUE 0.932 21.000 0.222 NA   NA
 2448184 2448185 SAI_1736 SAI_1737 gidB ktrB TRUE 0.777 15.000 0.006 1.000 N NA
 2448185 2448186 SAI_1737 SAI_1738 ktrB ktrA TRUE 0.997 13.000 0.490 0.004 Y NA
 2448187 2448188 SAI_1739 SAI_1740     TRUE 0.984 -7.000 0.530 1.000 Y NA
 2448188 2448189 SAI_1740 SAI_1741     TRUE 0.901 49.000 0.017 0.033 Y NA
 2448189 2448190 SAI_1741 SAI_1742     TRUE 0.973 17.000 0.435 NA   NA
 2448190 2448191 SAI_1742 SAI_1743     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448191 2448192 SAI_1743 SAI_1744     FALSE 0.050 79.000 0.000 NA   NA
 2448193 2448194 SAI_1178 SAI_1179     FALSE 0.042 91.000 0.000 NA   NA
 2448194 2448195 SAI_1179 SAI_1180     FALSE 0.041 163.000 0.000 1.000 N NA
 2448195 2448196 SAI_1180 SAI_1181     FALSE 0.490 101.000 0.071 1.000   NA
 2448198 2448199 SAI_1183 SAI_1184     TRUE 0.651 109.000 0.033 0.088 N NA
 2448199 2448200 SAI_1184 SAI_1185   potC TRUE 0.985 -7.000 0.253 0.044 Y NA
 2448200 2448201 SAI_1185 SAI_1186 potC potB TRUE 0.993 -3.000 0.492 0.044 Y NA
 2448201 2448202 SAI_1186 SAI_1187 potB potA TRUE 0.997 -16.000 0.928 0.044 Y NA
 2448202 2448203 SAI_1187 SAI_1188 potA murB TRUE 0.648 49.000 0.041 1.000 N NA
 2448203 2448204 SAI_1188 SAI_1189 murB folK FALSE 0.199 144.000 0.010 1.000 N NA
 2448204 2448205 SAI_1189 SAI_1190 folK folB TRUE 0.943 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 2448205 2448206 SAI_1190 SAI_1191 folB folP TRUE 0.935 2.000 0.094 1.000 Y NA
 2448206 2448207 SAI_1191 SAI_1192 folP folE TRUE 0.938 4.000 0.073 1.000 Y NA
 2448207 2448208 SAI_1192 SAI_1193 folE folC TRUE 0.923 19.000 0.057 1.000 Y NA
 2448208 2448209 SAI_1193 SAI_1194 folC rarD FALSE 0.380 2.000 0.000 1.000   NA
 2448209 2448210 SAI_1194 SAI_1195 rarD thrB TRUE 0.610 -13.000 0.005 1.000   NA
 2448210 2448211 SAI_1195 SAI_1196 thrB   TRUE 0.907 2.000 0.036 1.000 Y NA
 2448213 2448214 SAI_1198 SAI_1199 opuD opuD TRUE 0.770 -57.000 0.000 0.044   NA
 2448214 2448215 SAI_1199 SAI_1200 opuD   FALSE 0.354 22.000 0.000 1.000   NA
 2448215 2448216 SAI_1200 SAI_1201     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2448216 2448217 SAI_1201 SAI_1202     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2448217 2448218 SAI_1202 SAI_1203   opuD FALSE 0.466 106.000 0.000 0.044   NA
 2448218 2448219 SAI_1203 SAI_1204 opuD   FALSE 0.191 1.000 0.000 NA   NA
 2448219 2448220 SAI_1204 SAI_1205     FALSE 0.020 143.000 0.000 NA   NA
 2448220 2448221 SAI_1205 SAI_1206     FALSE 0.053 74.000 0.000 NA   NA
 2448221 2448222 SAI_1206 SAI_1207     FALSE 0.036 108.000 0.000 NA   NA
 2448223 2448224 SAI_1208 SAI_1209     FALSE 0.124 -93.000 0.000 NA   NA
 2448224 2448225 SAI_1209 SAI_1210     FALSE 0.013 164.000 0.000 NA   NA
 2448225 2448226 SAI_1210 SAI_1211     FALSE 0.015 155.000 0.000 NA   NA
 2448226 2448227 SAI_1211 SAI_1212     TRUE 0.517 100.000 0.105 NA   NA
 2448228 2448229 SAI_1213 SAI_1214     FALSE 0.088 73.000 0.000 NA N NA
 2448229 2448230 SAI_1214 SAI_1215     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448230 2448231 SAI_1215 SAI_1216     FALSE 0.025 131.000 0.000 NA   NA
 2448231 2448232 SAI_1216 SAI_1217     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2448233 2448234 SAI_0717 SAI_0718     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2448234 2448235 SAI_0718 SAI_0719     FALSE 0.001 930.000 0.000 NA   NA
 2448235 2448236 SAI_0719 SAI_0720   fabG TRUE 0.905 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 2448236 2448237 SAI_0720 SAI_0721 fabG acpP-1 FALSE 0.316 -7.000 0.000 1.000   NA
 2448237 2448238 SAI_0721 SAI_0722 acpP-1 fabZ TRUE 0.875 -16.000 0.167 NA   NA
 2448238 2448239 SAI_0722 SAI_0723 fabZ drrA FALSE 0.226 -10.000 0.000 NA N NA
 2448239 2448240 SAI_0723 SAI_0724 drrA   TRUE 0.986 -7.000 0.849 NA   NA
 2448240 2448241 SAI_0724 SAI_0725     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448241 2448242 SAI_0725 SAI_0726     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448242 2448243 SAI_0726 SAI_0727     FALSE 0.402 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2448243 2448244 SAI_0727 SAI_0728     FALSE 0.495 5.000 0.000 1.000 N NA
 2448244 2448245 SAI_0728 SAI_0729     FALSE 0.129 -31.000 0.000 NA   NA
 2448245 2448246 SAI_0729 SAI_0730     FALSE 0.002 343.000 0.000 NA   NA
 2448246 2448247 SAI_0730 SAI_0731     FALSE 0.122 34.000 0.000 NA   NA
 2448247 2448248 SAI_0731 SAI_0732     FALSE 0.040 97.000 0.000 NA   NA
 2448248 2448249 SAI_0732 SAI_0733     FALSE 0.204 46.000 0.000 1.000   NA
 2448249 2448250 SAI_0733 SAI_0734     FALSE 0.008 184.000 0.000 NA   NA
 2448250 2448251 SAI_0734 SAI_0735     FALSE 0.009 177.000 0.000 NA   NA
 2448251 2448252 SAI_0735 SAI_0736   pepO TRUE 0.907 21.000 0.000 0.003   NA
 2448252 2448253 SAI_0736 SAI_0737 pepO pepO TRUE 0.898 -3.000 0.000 0.003   NA
 2448253 2448254 SAI_0737 SAI_0738 pepO   FALSE 0.134 32.000 0.000 NA   NA
 2448254 2448255 SAI_0738 SAI_0739     FALSE 0.211 18.000 0.000 NA   NA
 2448255 2448256 SAI_0739 SAI_0740     FALSE 0.118 35.000 0.000 NA   NA
 2448256 2448257 SAI_0740 SAI_0741     FALSE 0.118 35.000 0.000 NA   NA
 2448257 2448258 SAI_0741 SAI_0742     FALSE 0.030 124.000 0.000 NA   NA
 2448258 2448259 SAI_0742 SAI_0743     FALSE 0.002 296.000 0.000 NA   NA
 2448259 2448260 SAI_0743 SAI_0744     FALSE 0.118 35.000 0.000 NA   NA
 2448260 2448261 SAI_0744 SAI_0745     FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 2448261 2448262 SAI_0745 SAI_0746     FALSE 0.005 212.000 0.000 NA   NA
 2448264 2448265 SAI_1243 SAI_1244 ilvE parC FALSE 0.006 201.000 0.000 NA   NA
 2448265 2448266 SAI_1244 SAI_1245 parC parE TRUE 0.969 134.000 0.552 0.003 Y NA
 2448268 2448269 SAI_1247 SAI_1248 ung   FALSE 0.039 99.000 0.000 NA   NA
 2448269 2448270 SAI_1248 SAI_1249     FALSE 0.034 114.000 0.000 NA   NA
 2448270 2448271 SAI_1249 SAI_1250     TRUE 0.803 11.000 0.013 1.000   NA
 2448271 2448272 SAI_1250 SAI_1251     TRUE 0.715 -3.000 0.013 1.000   NA
 2448272 2448273 SAI_1251 SAI_1252     TRUE 0.952 77.000 0.549 1.000 Y NA
 2448273 2448274 SAI_1252 SAI_1253     FALSE 0.362 0.000 0.000 1.000   NA
 2448274 2448275 SAI_1253 SAI_1254     TRUE 0.772 -3.000 0.033 1.000   NA
 2448275 2448276 SAI_1254 SAI_1255     FALSE 0.155 -7.000 0.000 NA   NA
 2448276 2448277 SAI_1255 SAI_1256     FALSE 0.497 53.000 0.000 NA Y NA
 2448277 2448278 SAI_1256 SAI_1257     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448278 2448279 SAI_1257 SAI_1258     FALSE 0.040 96.000 0.000 NA   NA
 2448279 2448280 SAI_1258 SAI_1259     TRUE 0.825 0.000 0.052 1.000   NA
 2448280 2448281 SAI_1259 SAI_1260     TRUE 0.741 24.000 0.020 1.000   NA
 2448281 2448282 SAI_1260 SAI_1261     TRUE 0.894 13.000 0.067 1.000 N NA
 2448282 2448283 SAI_1261 SAI_1262     TRUE 0.992 11.000 0.800 1.000 N NA
 2448283 2448284 SAI_1262 SAI_1263     TRUE 0.993 9.000 0.636 1.000 Y NA
 2448284 2448285 SAI_1263 SAI_1264     TRUE 0.987 6.000 0.583 1.000 N NA
 2448287 2448288 SAI_1266 SAI_1267   deoD TRUE 0.898 9.000 0.107 NA   NA
 2448288 2448289 SAI_1267 SAI_1268 deoD   TRUE 0.726 -16.000 0.027 1.000 N NA
 2448289 2448290 SAI_1268 SAI_1269     FALSE 0.135 86.000 0.000 1.000 N NA
 2448290 2448291 SAI_1269 SAI_1270   arsC TRUE 0.801 39.000 0.108 1.000 N NA
 2448291 2448292 SAI_1270 SAI_1271 arsC deoB TRUE 0.749 51.000 0.108 1.000 N NA
 2448292 2448293 SAI_1271 SAI_1272 deoB rpiA TRUE 0.719 57.000 0.018 1.000 Y NA
 2448293 2448294 SAI_1272 SAI_1273 rpiA   FALSE 0.009 238.000 0.000 1.000   NA
 2448298 2448299 SAI_0780 SAI_0779     FALSE 0.012 168.000 0.000 NA   NA
 2448299 2448300 SAI_0779 SAI_0778     FALSE 0.040 98.000 0.000 NA   NA
 2448300 2448301 SAI_0778 SAI_0777   thrS FALSE 0.011 240.000 0.000 1.000 N NA
 2448301 2448302 SAI_0777 SAI_0776 thrS   FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 2448302 2448303 SAI_0776 SAI_0775     TRUE 0.994 2.000 0.413 0.013 Y NA
 2448303 2448304 SAI_0775 SAI_0774     TRUE 0.667 45.000 0.037 1.000 N NA
 2448304 2448305 SAI_0774 SAI_0773   ccpA FALSE 0.335 132.000 0.041 1.000 N NA
 2448307 2448308 SAI_0771 SAI_0770     TRUE 0.773 16.000 0.012 1.000   NA
 2448308 2448309 SAI_0770 SAI_0769     FALSE 0.457 153.000 0.035 0.057   NA
 2448309 2448310 SAI_0769 SAI_0768     TRUE 0.790 124.000 0.364 1.000 N NA
 2448310 2448311 SAI_0768 SAI_0767   uxaC TRUE 0.997 18.000 0.533 0.001 Y NA
 2448311 2448312 SAI_0767 SAI_0766 uxaC   TRUE 0.987 17.000 0.467 1.000 Y NA
 2448312 2448313 SAI_0766 SAI_0765     TRUE 0.891 117.000 0.583 1.000 N NA
 2448313 2448314 SAI_0765 SAI_0764     TRUE 0.950 29.000 0.333 1.000 N NA
 2448314 2448315 SAI_0764 SAI_0763     TRUE 0.804 17.000 0.000 1.000 Y NA
 2448315 2448316 SAI_0763 SAI_0762     FALSE 0.428 67.000 0.000 NA Y NA
 2448316 2448317 SAI_0762 SAI_0761     FALSE 0.009 206.000 0.000 NA N NA
 2448317 2448318 SAI_0761 SAI_0760     TRUE 0.938 14.000 0.158 1.000   NA
 2448319 2448320 SAI_0759 SAI_0758     FALSE 0.125 -81.000 0.000 NA   NA
 2448320 2448321 SAI_0758 SAI_0757     FALSE 0.245 14.000 0.000 NA   NA
 2448322 2448323 SAI_0756 SAI_0755     FALSE 0.013 164.000 0.000 NA   NA
 2448323 2448324 SAI_0755 SAI_0754     TRUE 0.577 -3.000 0.003 NA   NA
 2448324 2448325 SAI_0754 SAI_0753     FALSE 0.231 5.000 0.000 NA   NA
 2448326 2448327 SAI_1827 SAI_1828 mutY   FALSE 0.082 177.000 0.002 1.000 N NA
 2448328 2448329 SAI_1829 SAI_1830 trx   TRUE 0.521 81.000 0.053 1.000   NA
 2448329 2448330 SAI_1830 SAI_1831   mutS2 TRUE 0.736 4.000 0.005 1.000   NA
 2448330 2448331 SAI_1831 SAI_1832 mutS2 cvpA TRUE 0.571 76.000 0.070 1.000   NA
 2448331 2448332 SAI_1832 SAI_1833 cvpA   TRUE 0.749 3.000 0.019 NA   NA
 2448333 2448334 SAI_1834 SAI_1835 rnhC   TRUE 0.889 16.000 0.080 1.000 N NA
 2448334 2448335 SAI_1835 SAI_1836     FALSE 0.462 129.000 0.099 1.000 N NA
 2448335 2448336 SAI_1836 SAI_1837     FALSE 0.375 114.000 0.050 NA   NA
 2448338 2448339 SAI_1839 SAI_1840 pfl   FALSE 0.005 294.000 0.000 1.000   NA
 2448340 2448341 SAI_1841 SAI_1842     TRUE 0.934 -18.000 0.326 NA   NA
 2448343 2448344 SAI_1844 SAI_1845     FALSE 0.113 190.000 0.031 1.000 N NA
 2448344 2448345 SAI_1845 SAI_1846     TRUE 0.845 18.000 0.043 1.000 N NA
 2448346 2448347 SAI_1847 SAI_1848     TRUE 0.839 24.000 0.081 1.000   NA
 2448347 2448348 SAI_1848 SAI_1849     TRUE 0.837 4.000 0.054 NA   NA
 2448348 2448349 SAI_1849 SAI_1850   ispB FALSE 0.093 46.000 0.000 NA   NA
 2448350 2448351 SAI_1851 SAI_1852     TRUE 0.755 -7.000 0.034 1.000   NA
 2448352 2448353 SAI_0836 SAI_0835 ftsW ppc FALSE 0.387 106.000 0.028 1.000 N NA
 2448355 2448356 SAI_0833 SAI_0832     TRUE 0.919 -16.000 0.250 NA   NA
 2448359 2448360 SAI_0829 SAI_0828     TRUE 0.706 22.000 0.018 NA   NA
 2448363 2448364 SAI_0825 SAI_0824 ribH ribBA TRUE 0.985 15.000 0.054 0.002 Y NA
 2448364 2448365 SAI_0824 SAI_0823 ribBA ribE TRUE 0.924 18.000 0.051 1.000 Y NA
 2448365 2448366 SAI_0823 SAI_0822 ribE ribD TRUE 0.988 5.000 0.456 1.000 Y NA
 2448368 2448369 SAI_0820 SAI_0819     FALSE 0.030 124.000 0.000 NA   NA
 2448369 2448370 SAI_0819 SAI_0818     FALSE 0.027 127.000 0.000 NA   NA
 2448370 2448371 SAI_0818 SAI_0817     TRUE 0.906 130.000 0.156 0.002 Y NA
 2448373 2448374 SAI_0815 SAI_0814     TRUE 0.920 -3.000 0.206 NA   NA
 2448374 2448375 SAI_0814 SAI_0813   lgt TRUE 0.870 15.000 0.079 NA   NA
 2448375 2448376 SAI_0813 SAI_0812 lgt hprK TRUE 0.969 -7.000 0.494 1.000 N NA
 2448376 2448377 SAI_0812 SAI_0811 hprK   FALSE 0.033 116.000 0.000 NA   NA
 2448377 2448378 SAI_0811 SAI_0810     FALSE 0.125 -73.000 0.000 NA   NA
 2448378 2448379 SAI_0810 SAI_0809     FALSE 0.474 81.000 0.051 NA   NA
 2448379 2448380 SAI_0809 SAI_0808     TRUE 0.897 -37.000 0.215 NA   NA
 2448381 2448382 SAI_1359 SAI_1358     FALSE 0.002 425.000 0.000 NA N NA
 2448382 2448383 SAI_1358 SAI_1357     TRUE 0.751 -13.000 0.040 1.000   NA
 2448383 2448384 SAI_1357 SAI_1356   pacS FALSE 0.212 148.000 0.024 1.000   NA
 2448384 2448385 SAI_1356 SAI_1355 pacS   TRUE 0.874 139.000 0.286 0.004   NA
 2448387 2448388 SAI_1353 SAI_1352   smtB FALSE 0.001 556.000 0.000 NA   NA
 2448388 2448389 SAI_1352 SAI_1351 smtB   FALSE 0.375 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2448390 2448391 SAI_1350 SAI_1348     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448392 2448393 SAI_1349 SAI_1347     FALSE 0.001 640.000 0.000 NA   NA
 2448393 2448394 SAI_1347 SAI_1346   carB TRUE 0.902 29.000 0.000 0.001 N NA
 2448394 2448395 SAI_1346 SAI_1345 carB   FALSE 0.044 160.000 0.000 1.000 N NA
 2448395 2448396 SAI_1345 SAI_1343     FALSE 0.001 421.000 0.000 NA   NA
 2448398 2448399 SAI_1342 SAI_1341     FALSE 0.143 -13.000 0.000 NA   NA
 2448399 2448400 SAI_1341 SAI_1340     FALSE 0.009 178.000 0.000 NA   NA
 2448400 2448401 SAI_1340 SAI_1339     FALSE 0.002 279.000 0.000 NA   NA
 2448401 2448402 SAI_1339 SAI_1338     TRUE 0.928 23.000 0.222 NA   NA
 2448402 2448403 SAI_1338 SAI_1337     FALSE 0.038 301.000 0.000 0.061   NA
 2448403 2448404 SAI_1337 SAI_1336     TRUE 0.974 14.000 0.400 NA   NA
 2448404 2448405 SAI_1336 SAI_1335     TRUE 0.932 52.000 0.500 NA   NA
 2448405 2448406 SAI_1335 SAI_1334     FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 2448406 2448407 SAI_1334 SAI_1333     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448407 2448408 SAI_1333 SAI_1332     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 2448409 2448410 SAI_0447 SAI_0448     FALSE 0.378 84.000 0.025 NA   NA
 2448411 2448412 SAI_0449 SAI_0450     FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000 N NA
 2448412 2448413 SAI_0450 SAI_0451     FALSE 0.258 34.000 0.000 1.000   NA
 2448413 2448414 SAI_0451 SAI_0452     FALSE 0.022 179.000 0.000 1.000   NA
 2448414 2448415 SAI_0452 SAI_0453     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 2448415 2448416 SAI_0453 SAI_0454     FALSE 0.001 555.000 0.000 NA   NA
 2448416 2448417 SAI_0454 SAI_0455   nrdI TRUE 0.990 1.000 0.643 NA Y NA
 2448417 2448418 SAI_0455 SAI_0456 nrdI   TRUE 0.995 2.000 1.000 NA Y NA
 2448418 2448419 SAI_0456 SAI_0457     FALSE 0.063 63.000 0.000 NA   NA
 2448419 2448420 SAI_0457 SAI_0458     TRUE 0.947 13.000 0.200 NA   NA
 2448421 2448422 SAI_0459 SAI_0460     FALSE 0.004 239.000 0.000 NA   NA
 2448422 2448423 SAI_0460 SAI_0461     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448423 2448424 SAI_0461 SAI_0462     FALSE 0.045 87.000 0.000 NA   NA
 2448424 2448425 SAI_0462 SAI_0463     TRUE 0.909 24.000 0.167 1.000   NA
 2448425 2448426 SAI_0463 SAI_0464     TRUE 0.962 10.000 0.095 0.053   NA
 2448426 2448427 SAI_0464 SAI_0465     TRUE 0.894 16.000 0.095 1.000   NA
 2448427 2448428 SAI_0465 SAI_0466     TRUE 0.870 0.000 0.000 0.019   NA
 2448428 2448429 SAI_0466 SAI_0467     FALSE 0.499 110.000 0.000 0.023   NA
 2448429 2448430 SAI_0467 SAI_0468     FALSE 0.108 85.000 0.000 1.000   NA
 2448433 2448434 SAI_0471 SAI_0472     FALSE 0.072 56.000 0.000 NA   NA
 2448435 2448436 SAI_1378 SAI_1379     TRUE 0.897 49.000 0.333 NA   NA
 2448436 2448437 SAI_1379 SAI_1380     FALSE 0.139 -16.000 0.000 NA   NA
 2448437 2448438 SAI_1380 SAI_1381     FALSE 0.191 1.000 0.000 NA   NA
 2448439 2448440 SAI_1382 SAI_1383     TRUE 0.800 -3.000 0.061 NA   NA
 2448441 2448442 SAI_1384 SAI_1385     TRUE 0.984 2.000 0.667 NA   NA
 2448442 2448443 SAI_1385 SAI_1386     FALSE 0.134 -22.000 0.000 NA   NA
 2448443 2448444 SAI_1386 SAI_1387     TRUE 0.987 -49.000 1.000 NA   NA
 2448444 2448445 SAI_1387 SAI_1388     FALSE 0.201 19.000 0.000 NA   NA
 2448445 2448446 SAI_1388 SAI_1389     FALSE 0.211 18.000 0.000 NA   NA
 2448446 2448447 SAI_1389 SAI_1390     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448447 2448448 SAI_1390 SAI_1391     FALSE 0.052 77.000 0.000 NA   NA
 2448448 2448449 SAI_1391 SAI_1392     TRUE 0.985 3.000 0.667 NA   NA
 2448449 2448450 SAI_1392 SAI_1393     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 2448450 2448451 SAI_1393 SAI_1394     TRUE 0.973 -64.000 0.667 NA   NA
 2448451 2448452 SAI_1394 SAI_1395     FALSE 0.078 52.000 0.000 NA   NA
 2448452 2448453 SAI_1395 SAI_1396     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2448454 2448455 SAI_0063 SAI_0064 rplB rpsS TRUE 0.985 99.000 0.820 0.028 Y NA
 2448457 2448458 SAI_0066 SAI_0067 rplV rpsC TRUE 0.993 40.000 0.719 0.028 Y NA
 2448458 2448459 SAI_0067 SAI_0068 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.028 Y NA
 2448461 2448462 SAI_0070 SAI_0071 rpmC rpsQ TRUE 0.997 26.000 0.828 0.020 Y NA
 2448462 2448463 SAI_0071 SAI_0072 rpsQ rplN TRUE 0.997 25.000 0.791 0.028 Y NA
 2448463 2448464 SAI_0072 SAI_0073 rplN rplX TRUE 0.988 80.000 0.810 0.028 Y NA
 2448464 2448465 SAI_0073 SAI_0074 rplX   TRUE 0.997 24.000 0.758 0.020 Y NA
 2448465 2448466 SAI_0074 SAI_0075   rpsH FALSE 0.169 358.000 0.059 0.020 Y NA
 2448466 2448467 SAI_0075 SAI_0076 rpsH rplF TRUE 0.984 110.000 0.808 0.020 Y NA
 2448467 2448468 SAI_0076 SAI_0077 rplF rplR TRUE 0.985 101.000 0.815 0.020 Y NA
 2448468 2448469 SAI_0077 SAI_0078 rplR rpsE TRUE 0.998 19.000 0.814 0.028 Y NA
 2448471 2448472 SAI_0080 SAI_0081 rpmD rplO TRUE 0.978 125.000 0.653 0.004 Y NA
 2448472 2448473 SAI_0081 SAI_0082 rplO   TRUE 0.987 21.000 0.730 1.000 N NA
 2448473 2448474 SAI_0082 SAI_0083     TRUE 0.774 95.000 0.241 1.000 N NA
 2448474 2448475 SAI_0083 SAI_0084   infA FALSE 0.452 116.000 0.059 1.000 N NA
 2448475 2448476 SAI_0084 SAI_0085 infA rpsM TRUE 0.676 160.000 0.075 0.028 Y NA
 2448476 2448477 SAI_0085 SAI_0086 rpsM rpsK TRUE 0.994 45.000 0.810 0.020 Y NA
 2448477 2448478 SAI_0086 SAI_0087 rpsK   TRUE 0.896 50.000 0.308 1.000   NA
 2448478 2448479 SAI_0087 SAI_0088     TRUE 0.793 66.000 0.004 0.004   NA
 2448479 2448480 SAI_0088 SAI_0089   rplQ TRUE 0.993 15.000 0.873 1.000   NA
 2448480 2448481 SAI_0089 SAI_0090 rplQ   FALSE 0.001 6851.000 0.000 NA   NA
 2448481 2448482 SAI_0090 SAI_0091     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 2448482 2448483 SAI_0091 SAI_0092     TRUE 0.992 19.000 1.000 NA   NA
 2448483 2448484 SAI_0092 SAI_0093     FALSE 0.249 10.000 0.000 NA   NA
 2448487 2448488 SAI_0693 SAI_0694     FALSE 0.101 42.000 0.000 NA   NA
 2448488 2448489 SAI_0694 SAI_0695   mreB-2 FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 2448489 2448490 SAI_0695 SAI_0696 mreB-2 pgp TRUE 0.805 119.000 0.385 1.000   NA
 2448490 2448491 SAI_0696 SAI_0697 pgp gyrB FALSE 0.350 91.000 0.013 1.000   NA
 2448491 2448492 SAI_0697 SAI_0698 gyrB   FALSE 0.352 94.000 0.011 1.000 N NA
 2448492 2448493 SAI_0698 SAI_0699   serB FALSE 0.340 94.000 0.009 1.000 N NA
 2448494 2448495 SAI_0700 SAI_0701     FALSE 0.250 13.000 0.000 NA   NA
 2448497 2448498 SAI_0703 SAI_0704     FALSE 0.238 6.000 0.000 NA   NA
 2448499 2448500 SAI_0705 SAI_0706 aroA aroK TRUE 0.850 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 2448500 2448501 SAI_0706 SAI_0707 aroK   TRUE 0.697 57.000 0.111 NA N NA
 2448501 2448502 SAI_0707 SAI_0708     TRUE 0.505 101.000 0.093 NA N NA
 2448502 2448503 SAI_0708 SAI_0709     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 2448505 2448506 SAI_0711 SAI_0712     FALSE 0.031 122.000 0.000 NA   NA
 2448506 2448507 SAI_0712 SAI_0713     FALSE 0.001 1119.000 0.000 NA   NA
 2448507 2448508 SAI_0713 SAI_0714     FALSE 0.066 61.000 0.000 NA   NA
 2448508 2448509 SAI_0714 SAI_0715   drrA FALSE 0.015 203.000 0.000 1.000   NA
 2448510 2448511 SAI_2100 SAI_2099 nusG   FALSE 0.025 174.000 0.000 1.000   NA
 2448514 2448515 SAI_2096 SAI_2095     FALSE 0.130 -28.000 0.000 NA   NA
 2448515 2448516 SAI_2095 SAI_2094     FALSE 0.424 93.000 0.049 NA   NA
 2448516 2448517 SAI_2094 SAI_2093     TRUE 0.994 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 2448517 2448518 SAI_2093 SAI_2092     FALSE 0.013 233.000 0.000 1.000 N NA
 2448521 2448522 SAI_2089 SAI_2088   metE FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 2448522 2448523 SAI_2088 SAI_2087 metE   TRUE 0.797 45.000 0.030 1.000 Y NA
 2448523 2448524 SAI_2087 SAI_2086     FALSE 0.001 347.000 0.000 NA   NA
 2448526 2448527 SAI_0508 SAI_0507     FALSE 0.013 161.000 0.000 NA   NA
 2448527 2448528 SAI_0507 SAI_0506   valS FALSE 0.027 171.000 0.000 1.000   NA
 2448528 2448529 SAI_0506 SAI_0505 valS   FALSE 0.063 63.000 0.000 NA   NA
 2448529 2448530 SAI_0505 SAI_0504     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448530 2448531 SAI_0504 SAI_0503     FALSE 0.006 268.000 0.000 1.000   NA
 2448531 2448532 SAI_0503 SAI_0502     FALSE 0.036 109.000 0.000 NA   NA
 2448532 2448533 SAI_0502 SAI_0501     FALSE 0.119 191.000 0.061 NA   NA
 2448533 2448534 SAI_0501 SAI_0500   galM TRUE 0.559 114.000 0.000 0.006   NA
 2448534 2448535 SAI_0500 SAI_0499 galM galE TRUE 0.518 126.000 0.120 1.000 N NA
 2448535 2448536 SAI_0499 SAI_0498 galE galT TRUE 0.985 2.000 0.204 0.002 N NA
 2448536 2448537 SAI_0498 SAI_0497 galT galK TRUE 0.989 10.000 0.107 0.002 Y NA
 2448537 2448538 SAI_0497 SAI_0496 galK   FALSE 0.396 90.000 0.000 1.000 Y NA
 2448538 2448539 SAI_0496 SAI_0495     TRUE 0.952 10.000 0.095 1.000 Y NA
 2448539 2448540 SAI_0495 SAI_0494     TRUE 0.998 14.000 0.800 0.041 Y NA
 2448540 2448541 SAI_0494 SAI_0493     TRUE 0.991 84.000 1.000 0.041 Y NA
 2448543 2448544 SAI_0491 SAI_0490     TRUE 0.994 2.000 0.444 0.017 Y NA
 2448544 2448545 SAI_0490 SAI_0489     TRUE 0.994 13.000 0.333 0.017 Y NA
 2448545 2448546 SAI_0489 SAI_0488     FALSE 0.255 135.000 0.000 1.000 Y NA
 2448546 2448547 SAI_0488 SAI_0487     FALSE 0.174 23.000 0.000 NA   NA
 2448549 2448550 SAI_1868 SAI_1869     FALSE 0.013 161.000 0.000 NA   NA
 2448551 2448552 SAI_1870 SAI_1871     TRUE 0.582 127.000 0.156 1.000 N NA
 2448552 2448553 SAI_1871 SAI_1872     TRUE 0.741 44.000 0.105 NA   NA
 2448557 2448558 SAI_1876 SAI_1877   gcp FALSE 0.099 119.000 0.000 1.000 N NA
 2448558 2448559 SAI_1877 SAI_1878 gcp rimI FALSE 0.465 76.000 0.030 1.000   NA
 2448559 2448560 SAI_1878 SAI_1879 rimI   TRUE 0.940 2.000 0.209 1.000   NA
 2448561 2448562 SAI_1880 SAI_1881     TRUE 0.941 54.000 0.576 NA   NA
 2448563 2448564 SAI_1882 SAI_1883   glnA FALSE 0.018 148.000 0.000 NA   NA
 2448564 2448565 SAI_1883 SAI_1884 glnA   TRUE 0.888 34.000 0.179 1.000 N NA
 2448565 2448566 SAI_1884 SAI_1885     TRUE 0.678 80.000 0.154 NA   NA
 2448566 2448567 SAI_1885 SAI_1886   pgk FALSE 0.016 263.000 0.002 NA   NA
 2448567 2448568 SAI_1886 SAI_1887 pgk   FALSE 0.167 135.000 0.003 1.000   NA
 2448568 2448569 SAI_1887 SAI_1888   gap FALSE 0.013 209.000 0.000 1.000   NA
 2448570 2448571 SAI_0118 SAI_0119 dut radA FALSE 0.169 162.000 0.028 1.000   NA
 2448571 2448572 SAI_0119 SAI_0120 radA   FALSE 0.217 136.000 0.009 1.000 N NA
 2448572 2448573 SAI_0120 SAI_0121     FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 2448576 2448577 SAI_0124 SAI_0125 rbsB rbsC TRUE 0.995 53.000 0.847 0.003 Y NA
 2448577 2448578 SAI_0125 SAI_0126 rbsC rbsA TRUE 0.996 14.000 0.358 0.003 Y NA
 2448578 2448579 SAI_0126 SAI_0127 rbsA rbsD TRUE 0.977 16.000 0.243 1.000 Y NA
 2448579 2448580 SAI_0127 SAI_0128 rbsD rbsK TRUE 0.941 -25.000 0.183 1.000 Y NA
 2448580 2448581 SAI_0128 SAI_0129 rbsK   TRUE 0.944 -7.000 0.281 1.000 N NA
 2448581 2448582 SAI_0129 SAI_0130     FALSE 0.069 58.000 0.000 NA   NA
 2448583 2448584 SAI_0131 SAI_0132     TRUE 0.982 0.000 0.591 1.000 N NA
 2448584 2448585 SAI_0132 SAI_0133     TRUE 0.867 31.000 0.133 1.000 N NA
 2448585 2448586 SAI_0133 SAI_0134     TRUE 0.983 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 2448586 2448587 SAI_0134 SAI_0135   argG FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 2448587 2448588 SAI_0135 SAI_0136 argG argH TRUE 0.975 19.000 0.278 1.000 Y NA
 2448588 2448589 SAI_0136 SAI_0137 argH fba FALSE 0.064 141.000 0.000 1.000 N NA
 2448590 2448591 SAI_1746 SAI_1747 brnQ   FALSE 0.340 114.000 0.000 1.000 Y NA
 2448592 2448593 SAI_1748 SAI_1749     TRUE 0.995 -3.000 0.938 1.000 Y NA
 2448593 2448594 SAI_1749 SAI_1750     FALSE 0.375 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2448594 2448595 SAI_1750 SAI_1751     FALSE 0.039 134.000 0.000 NA N NA
 2448595 2448596 SAI_1751 SAI_1752     FALSE 0.034 141.000 0.000 NA N NA
 2448596 2448597 SAI_1752 SAI_1753     FALSE 0.089 102.000 0.000 1.000   NA
 2448597 2448598 SAI_1753 SAI_1754     FALSE 0.117 155.000 0.002 1.000   NA
 2448598 2448599 SAI_1754 SAI_1755     FALSE 0.078 118.000 0.000 1.000   NA
 2448599 2448600 SAI_1755 SAI_1756     TRUE 0.988 10.000 0.625 1.000   NA
 2448601 2448602 SAI_1757 SAI_1758     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448602 2448603 SAI_1758 SAI_1759     TRUE 0.988 38.000 0.316 0.002 Y NA
 2448603 2448604 SAI_1759 SAI_1760     TRUE 0.870 0.000 0.099 1.000   NA
 2448604 2448605 SAI_1760 SAI_1761     TRUE 0.997 10.000 0.857 0.059   NA
 2448606 2448607 SAI_1762 SAI_1763     FALSE 0.339 139.000 0.000 0.051 N NA
 2448607 2448608 SAI_1763 SAI_1764     FALSE 0.341 93.000 0.023 NA   NA
 2448608 2448609 SAI_1764 SAI_1765     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448609 2448610 SAI_1765 SAI_1766     FALSE 0.174 23.000 0.000 NA   NA
 2448610 2448611 SAI_1766 SAI_1767     TRUE 0.594 66.000 0.085 NA   NA
 2448611 2448612 SAI_1767 SAI_1768     TRUE 0.671 2.000 0.008 NA   NA
 2448612 2448613 SAI_1768 SAI_1769     FALSE 0.450 63.000 0.024 NA   NA
 2448613 2448614 SAI_1769 SAI_1770     FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 2448614 2448615 SAI_1770 SAI_1771     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448616 2448617 SAI_1890 SAI_1891 rpsG rpsL TRUE 0.990 22.000 0.224 0.004 Y NA
 2448617 2448618 SAI_1891 SAI_1892 rpsL purR FALSE 0.015 219.000 0.000 1.000 N NA
 2448618 2448619 SAI_1892 SAI_1893 purR   FALSE 0.465 97.000 0.052 1.000   NA
 2448619 2448620 SAI_1893 SAI_1894     TRUE 0.695 -10.000 0.030 NA   NA
 2448620 2448621 SAI_1894 SAI_1895     TRUE 0.763 2.000 0.030 NA   NA
 2448621 2448622 SAI_1895 SAI_1896   rpe TRUE 0.904 -7.000 0.166 1.000 N NA
 2448622 2448623 SAI_1896 SAI_1897 rpe   TRUE 0.955 7.000 0.213 1.000   NA
 2448623 2448624 SAI_1897 SAI_1898     FALSE 0.016 198.000 0.000 1.000   NA
 2448624 2448625 SAI_1898 SAI_1899   ksgA FALSE 0.417 4.000 0.000 1.000   NA
 2448625 2448626 SAI_1899 SAI_1900 ksgA   TRUE 0.618 28.000 0.002 1.000 N NA
 2448626 2448627 SAI_1900 SAI_1901     FALSE 0.482 4.000 0.000 1.000 N NA
 2448627 2448628 SAI_1901 SAI_1902     TRUE 0.877 -13.000 0.058 NA Y NA
 2448628 2448629 SAI_1902 SAI_1903     FALSE 0.035 110.000 0.000 NA   NA
 2448629 2448630 SAI_1903 SAI_1904     FALSE 0.201 19.000 0.000 NA   NA
 2448630 2448631 SAI_1904 SAI_1905     FALSE 0.150 -9.000 0.000 NA   NA
 2448631 2448632 SAI_1905 SAI_1906     FALSE 0.185 0.000 0.000 NA   NA
 2448632 2448633 SAI_1906 SAI_1907   dltD FALSE 0.010 175.000 0.000 NA   NA
 2448633 2448634 SAI_1907 SAI_1908 dltD dltC TRUE 0.956 -7.000 0.409 NA   NA
 2448634 2448635 SAI_1908 SAI_1909 dltC   TRUE 0.972 15.000 0.387 NA   NA
 2448635 2448636 SAI_1909 SAI_1910   dltA TRUE 0.965 -3.000 0.435 NA N NA
 2448636 2448637 SAI_1910 SAI_1911 dltA   FALSE 0.059 146.000 0.000 1.000 N NA
 2448637 2448638 SAI_1911 SAI_1912     TRUE 0.768 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2448639 2448640 SAI_1442 SAI_1441     TRUE 0.805 0.000 0.056 NA   NA
 2448640 2448641 SAI_1441 SAI_1440   pcnA FALSE 0.008 185.000 0.000 NA   NA
 2448641 2448642 SAI_1440 SAI_1439 pcnA   TRUE 0.878 11.000 0.056 1.000   NA
 2448642 2448643 SAI_1439 SAI_1438     TRUE 0.670 -3.000 0.006 1.000   NA
 2448643 2448644 SAI_1438 SAI_1437     FALSE 0.457 67.000 0.013 1.000 N NA
 2448644 2448645 SAI_1437 SAI_1436     TRUE 0.998 5.000 0.846 0.006 Y NA
 2448647 2448648 SAI_1434 SAI_1433 gdhA def TRUE 0.577 70.000 0.056 1.000 N NA
 2448650 2448651 SAI_1431 SAI_1430     TRUE 0.906 47.000 0.296 1.000 N NA
 2448651 2448652 SAI_1430 SAI_1429     TRUE 0.998 -10.000 1.000 0.006 Y NA
 2448652 2448653 SAI_1429 SAI_1428     FALSE 0.086 108.000 0.000 1.000   NA
 2448653 2448654 SAI_1428 SAI_1427     TRUE 0.989 2.000 0.800 1.000   NA
 2448655 2448656 SAI_1109 SAI_1110     TRUE 0.986 7.000 0.623 NA   NA
 2448656 2448657 SAI_1110 SAI_1111     TRUE 0.988 0.000 0.833 NA   NA
 2448657 2448658 SAI_1111 SAI_1112     TRUE 0.914 -16.000 0.237 NA   NA
 2448658 2448659 SAI_1112 SAI_1114     TRUE 0.963 9.000 0.286 NA   NA
 2448661 2448662 SAI_1115 SAI_1116     FALSE 0.012 167.000 0.000 NA   NA
 2448662 2448663 SAI_1116 SAI_1117     FALSE 0.033 117.000 0.000 NA   NA
 2448663 2448664 SAI_1117 SAI_1118     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448664 2448665 SAI_1118 SAI_1119   carB FALSE 0.027 127.000 0.000 NA   NA
 2448665 2448666 SAI_1119 SAI_1120 carB carA TRUE 0.977 31.000 0.117 0.003 Y NA
 2448666 2448667 SAI_1120 SAI_1121 carA pyrB TRUE 0.912 14.000 0.014 1.000 Y NA
 2448667 2448668 SAI_1121 SAI_1122 pyrB pyrC TRUE 0.768 165.000 0.452 1.000 Y NA
 2448668 2448669 SAI_1122 SAI_1123 pyrC pyrE TRUE 0.894 12.000 0.003 1.000 Y NA
 2448669 2448670 SAI_1123 SAI_1124 pyrE pyrF TRUE 0.962 13.000 0.133 1.000 Y NA
 2448670 2448671 SAI_1124 SAI_1125 pyrF   FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 2448671 2448672 SAI_1125 SAI_1126     FALSE 0.078 52.000 0.000 NA   NA
 2448673 2448674 SAI_0094 SAI_0095     FALSE 0.055 70.000 0.000 NA   NA
 2448674 2448675 SAI_0095 SAI_0096     FALSE 0.001 916.000 0.000 NA   NA
 2448675 2448676 SAI_0096 SAI_0097     FALSE 0.005 220.000 0.000 NA   NA
 2448676 2448677 SAI_0097 SAI_0098     FALSE 0.003 245.000 0.000 NA   NA
 2448677 2448678 SAI_0098 SAI_0099     FALSE 0.075 122.000 0.000 1.000   NA
 2448678 2448679 SAI_0099 SAI_0100     TRUE 0.918 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2448679 2448680 SAI_0100 SAI_0101     TRUE 0.918 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2448680 2448681 SAI_0101 SAI_0102   hrcA FALSE 0.340 95.000 0.009 1.000 N NA
 2448681 2448682 SAI_0102 SAI_0103 hrcA grpE TRUE 0.854 3.000 0.051 1.000 N NA
 2448682 2448683 SAI_0103 SAI_0104 grpE   TRUE 0.536 181.000 0.026 0.006 Y NA
 2448683 2448684 SAI_0104 SAI_0105     FALSE 0.477 289.000 0.196 0.003 Y NA
 2448684 2448685 SAI_0105 SAI_0106     FALSE 0.103 114.000 0.000 1.000 N NA
 2448685 2448686 SAI_0106 SAI_0107   truA FALSE 0.159 71.000 0.000 1.000 N NA
 2448686 2448687 SAI_0107 SAI_0108 truA   TRUE 0.777 -37.000 0.058 1.000 N NA
 2448687 2448688 SAI_0108 SAI_0109     TRUE 0.962 10.000 0.276 NA   NA
 2448688 2448689 SAI_0109 SAI_0110     TRUE 0.885 -3.000 0.149 NA   NA
 2448691 2448692 SAI_0168 SAI_0167     FALSE 0.068 59.000 0.000 NA   NA
 2448692 2448693 SAI_0167 SAI_0166   ackA FALSE 0.339 152.000 0.094 1.000 N NA
 2448693 2448694 SAI_0166 SAI_0165 ackA   TRUE 0.860 32.000 0.130 1.000 N NA
 2448694 2448695 SAI_0165 SAI_0164     FALSE 0.446 115.000 0.087 NA   NA
 2448695 2448696 SAI_0164 SAI_0163     TRUE 0.908 -22.000 0.232 NA   NA
 2448696 2448697 SAI_0163 SAI_0162   pilC TRUE 0.712 -3.000 0.000 NA Y NA
 2448697 2448698 SAI_0162 SAI_0161 pilC gspE TRUE 0.920 89.000 0.639 1.000   NA
 2448698 2448699 SAI_0161 SAI_0160 gspE   FALSE 0.189 173.000 0.083 NA   NA
 2448699 2448700 SAI_0160 SAI_0159     FALSE 0.224 114.000 0.007 NA   NA
 2448700 2448701 SAI_0159 SAI_0158   rpoB TRUE 0.992 87.000 0.851 0.002 Y NA
 2448701 2448702 SAI_0158 SAI_0157 rpoB   FALSE 0.003 524.000 0.000 1.000 N NA
 2448704 2448705 SAI_0393 SAI_0394     FALSE 0.005 303.000 0.000 1.000   NA
 2448706 2448707 SAI_0395 SAI_0396     TRUE 0.837 90.000 0.400 NA   NA
 2448707 2448708 SAI_0396 SAI_0397     FALSE 0.439 103.000 0.068 NA   NA
 2448708 2448709 SAI_0397 SAI_0398     FALSE 0.301 83.000 0.008 NA   NA
 2448709 2448710 SAI_0398 SAI_0399     TRUE 0.668 -46.000 0.033 NA   NA
 2448710 2448711 SAI_0399 SAI_0400     TRUE 0.963 9.000 0.283 NA   NA
 2448712 2448713 SAI_0401 SAI_0402   pkcI TRUE 0.802 -3.000 0.063 NA   NA
 2448716 2448717 SAI_0405 SAI_0406     TRUE 0.919 2.000 0.167 NA N NA
 2448717 2448718 SAI_0406 SAI_0407     TRUE 0.681 58.000 0.107 NA N NA
 2448718 2448719 SAI_0407 SAI_0408     TRUE 0.874 -10.000 0.154 NA   NA
 2448719 2448720 SAI_0408 SAI_0409     FALSE 0.005 583.000 0.004 NA   NA
 2448720 2448721 SAI_0409 SAI_0410   nusA TRUE 0.967 48.000 0.759 NA   NA
 2448721 2448722 SAI_0410 SAI_0411 nusA   TRUE 0.973 22.000 0.323 NA Y NA
 2448722 2448723 SAI_0411 SAI_0412     TRUE 0.958 -7.000 0.408 NA N NA
 2448723 2448724 SAI_0412 SAI_0413   infB TRUE 0.864 77.000 0.223 NA Y NA
 2448725 2448726 SAI_1460 SAI_1461 rpsP   FALSE 0.081 129.000 0.000 1.000 N NA
 2448726 2448727 SAI_1461 SAI_1462     TRUE 0.996 15.000 0.923 1.000 Y NA
 2448727 2448728 SAI_1462 SAI_1463     TRUE 0.993 3.000 0.923 1.000 N NA
 2448728 2448729 SAI_1463 SAI_1464     FALSE 0.015 202.000 0.000 1.000   NA
 2448729 2448730 SAI_1464 SAI_1465     TRUE 0.866 36.000 0.000 0.001   NA
 2448730 2448731 SAI_1465 SAI_1466   carA TRUE 0.855 56.000 0.013 0.003   NA
 2448731 2448732 SAI_1466 SAI_1467 carA   TRUE 0.575 49.000 0.000 1.000 Y NA
 2448732 2448733 SAI_1467 SAI_1468     FALSE 0.186 21.000 0.000 NA   NA
 2448733 2448734 SAI_1468 SAI_1469   rluD FALSE 0.263 140.000 0.048 NA   NA
 2448734 2448735 SAI_1469 SAI_1470 rluD lspA TRUE 0.817 -16.000 0.082 1.000 N NA
 2448735 2448736 SAI_1470 SAI_1471 lspA   TRUE 0.923 9.000 0.119 1.000 N NA
 2448736 2448737 SAI_1471 SAI_1472   rpmA FALSE 0.015 216.000 0.000 1.000 N NA
 2448737 2448738 SAI_1472 SAI_1473 rpmA   TRUE 0.958 22.000 0.203 NA Y NA
 2448738 2448739 SAI_1473 SAI_1474   rplU TRUE 0.972 7.000 0.208 NA Y NA
 2448739 2448740 SAI_1474 SAI_1475 rplU   FALSE 0.012 190.000 0.000 NA N NA
 2448740 2448741 SAI_1475 SAI_1476     FALSE 0.054 119.000 0.000 NA N NA
 2448741 2448742 SAI_1476 SAI_1477     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2448742 2448743 SAI_1477 SAI_1478   thiI FALSE 0.107 39.000 0.000 NA   NA
 2448743 2448744 SAI_1478 SAI_1479 thiI   TRUE 0.891 62.000 0.349 1.000 N NA
 2448749 2448750 SAI_0964 SAI_0963     TRUE 0.521 13.000 0.000 1.000 N NA
 2448750 2448751 SAI_0963 SAI_0962     TRUE 0.955 -10.000 0.070 0.058 Y NA
 2448753 2448754 SAI_0960 SAI_0959 pheT   FALSE 0.232 126.000 0.007 1.000   NA
 2448754 2448755 SAI_0959 SAI_0958   pheS FALSE 0.356 83.000 0.009 1.000   NA
 2448756 2448757 SAI_0805 SAI_0804     FALSE 0.130 -30.000 0.000 NA   NA
 2448757 2448758 SAI_0804 SAI_0803     FALSE 0.238 48.000 0.000 1.000 N NA
 2448759 2448760 SAI_0802 SAI_0801     TRUE 0.900 6.000 0.114 NA   NA
 2448760 2448761 SAI_0801 SAI_0800     TRUE 0.988 0.000 0.841 NA   NA
 2448762 2448763 SAI_0799 SAI_0798 ftsY   TRUE 0.889 0.000 0.007 0.080   NA
 2448763 2448764 SAI_0798 SAI_0797     TRUE 0.981 0.000 0.250 0.019   NA
 2448764 2448765 SAI_0797 SAI_0796     FALSE 0.100 91.000 0.000 1.000   NA
 2448765 2448766 SAI_0796 SAI_0795     FALSE 0.221 188.000 0.120 1.000 N NA
 2448766 2448767 SAI_0795 SAI_0794     FALSE 0.058 176.000 0.002 NA   NA
 2448767 2448768 SAI_0794 SAI_0793     TRUE 0.710 3.000 0.011 NA   NA
 2448768 2448769 SAI_0793 SAI_0792     TRUE 0.836 4.000 0.038 1.000   NA
 2448769 2448770 SAI_0792 SAI_0791     TRUE 0.797 69.000 0.016 0.007   NA
 2448770 2448771 SAI_0791 SAI_0790   drrA TRUE 0.995 -7.000 0.597 0.014 Y NA
 2448774 2448775 SAI_1793 SAI_1794 aroE   FALSE 0.094 98.000 0.000 1.000   NA
 2448775 2448776 SAI_1794 SAI_1795   recG FALSE 0.022 291.000 0.008 1.000   NA
 2448776 2448777 SAI_1795 SAI_1796 recG   FALSE 0.050 80.000 0.000 NA   NA
 2448777 2448778 SAI_1796 SAI_1797   alr FALSE 0.042 93.000 0.000 NA   NA
 2448778 2448779 SAI_1797 SAI_1798 alr acpS TRUE 0.859 -3.000 0.093 1.000 N NA
 2448779 2448780 SAI_1798 SAI_1799 acpS aroG FALSE 0.390 25.000 0.000 1.000 N NA
 2448780 2448781 SAI_1799 SAI_1800 aroG secA FALSE 0.086 126.000 0.000 1.000 N NA
 2448781 2448782 SAI_1800 SAI_1801 secA manA FALSE 0.426 109.000 0.042 1.000 N NA
 2448782 2448783 SAI_1801 SAI_1802 manA   TRUE 0.867 118.000 0.333 1.000 Y NA
 2448783 2448784 SAI_1802 SAI_1803     TRUE 0.816 68.000 0.235 1.000   NA
 2448785 2448786 SAI_0414 SAI_0415 infB rbfA TRUE 0.876 109.000 0.530 1.000   NA
 2448788 2448789 SAI_0417 SAI_0418     TRUE 0.893 13.000 0.064 1.000 N NA
 2448789 2448790 SAI_0418 SAI_0419   pacS TRUE 0.952 41.000 0.048 0.004 Y NA
 2448790 2448791 SAI_0419 SAI_0420 pacS   FALSE 0.035 110.000 0.000 NA   NA
 2448791 2448792 SAI_0420 SAI_0421     TRUE 0.837 15.000 0.047 NA   NA
 2448792 2448793 SAI_0421 SAI_0422     FALSE 0.082 113.000 0.000 1.000   NA
 2448793 2448794 SAI_0422 SAI_0423     TRUE 0.616 30.000 0.005 1.000   NA
 2448794 2448795 SAI_0423 SAI_0424   fur-3 FALSE 0.362 82.000 0.010 1.000   NA
 2448795 2448796 SAI_0424 SAI_0425 fur-3   FALSE 0.040 153.000 0.000 1.000   NA
 2448796 2448797 SAI_0425 SAI_0426     TRUE 0.790 113.000 0.333 1.000   NA
 2448797 2448798 SAI_0426 SAI_0427     TRUE 0.987 2.000 0.500 1.000 Y NA
 2448801 2448802 SAI_0952 SAI_0951     TRUE 0.787 75.000 0.237 NA   NA
 2448802 2448803 SAI_0951 SAI_0950   murA TRUE 0.829 -10.000 0.110 NA   NA
 2448803 2448804 SAI_0950 SAI_0949 murA atpC FALSE 0.005 358.000 0.000 1.000 N NA
 2448804 2448805 SAI_0949 SAI_0948 atpC atpD TRUE 0.999 13.000 0.837 0.004 Y NA
 2448805 2448806 SAI_0948 SAI_0947 atpD atpG TRUE 0.990 74.000 0.724 0.004 Y NA
 2448806 2448807 SAI_0947 SAI_0946 atpG atpA TRUE 0.999 16.000 0.846 0.004 Y NA
 2448807 2448808 SAI_0946 SAI_0945 atpA atpH TRUE 0.999 16.000 0.864 0.004 Y NA
 2448808 2448809 SAI_0945 SAI_0944 atpH atpF TRUE 0.990 0.000 0.222 0.004 Y NA
 2448809 2448810 SAI_0944 SAI_0943 atpF atpB TRUE 0.976 18.000 0.032 0.004 Y NA
 2448810 2448811 SAI_0943 SAI_0942 atpB   TRUE 0.969 33.000 0.189 0.004   NA
 2448811 2448812 SAI_0942 SAI_0941     FALSE 0.004 332.000 0.000 1.000   NA
 2448812 2448813 SAI_0941 SAI_0940   glgD TRUE 0.979 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 2448813 2448814 SAI_0940 SAI_0939 glgD glgC TRUE 0.985 -10.000 0.810 1.000   NA
 2448814 2448815 SAI_0939 SAI_0938 glgC   FALSE 0.111 37.000 0.000 NA   NA
 2448815 2448816 SAI_0938 SAI_0937   glgB FALSE 0.101 42.000 0.000 NA   NA
 2448819 2448820 SAI_1020 SAI_1019   rbsC-2 FALSE 0.014 205.000 0.000 1.000   NA
 2448820 2448821 SAI_1019 SAI_1018 rbsC-2 rbsC-1 TRUE 0.994 2.000 0.720 0.040   NA
 2448821 2448822 SAI_1018 SAI_1017 rbsC-1 rbsA-1 TRUE 0.964 -7.000 0.438 1.000   NA
 2448822 2448823 SAI_1017 SAI_1016 rbsA-1 tmbC FALSE 0.254 145.000 0.036 1.000   NA
 2448823 2448824 SAI_1016 SAI_1015 tmbC cdd TRUE 0.858 65.000 0.300 1.000   NA
 2448824 2448825 SAI_1015 SAI_1014 cdd   FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 2448826 2448827 SAI_1013 SAI_1012   rpsT FALSE 0.494 60.000 0.014 1.000 N NA
 2448828 2448829 SAI_1011 SAI_1010     TRUE 0.928 -58.000 0.154 1.000 Y NA
 2448829 2448830 SAI_1010 SAI_1009   glnP TRUE 0.961 10.000 0.130 1.000 Y NA
 2448830 2448831 SAI_1009 SAI_1008 glnP phnA FALSE 0.257 135.000 0.018 1.000 N NA
 2448831 2448832 SAI_1008 SAI_1007 phnA glmS FALSE 0.133 163.000 0.008 1.000 N NA
 2448835 2448836 SAI_1546 SAI_1547   malF TRUE 0.980 98.000 0.690 0.040 Y NA
 2448836 2448837 SAI_1547 SAI_1548 malF malG TRUE 0.997 0.000 0.793 0.040 Y NA
 2448837 2448838 SAI_1548 SAI_1549 malG   FALSE 0.099 231.000 0.000 0.040 N NA
 2448839 2448840 SAI_1550 SAI_1551     FALSE 0.047 84.000 0.000 NA   NA
 2448840 2448841 SAI_1551 SAI_1552     FALSE 0.251 11.000 0.000 NA   NA
 2448841 2448842 SAI_1552 SAI_1553     TRUE 0.908 -7.000 0.200 NA   NA
 2448842 2448843 SAI_1553 SAI_1554   secA TRUE 0.514 14.000 0.000 1.000 N NA
 2448843 2448844 SAI_1554 SAI_1555 secA   FALSE 0.143 -13.000 0.000 NA   NA
 2448844 2448845 SAI_1555 SAI_1556     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2448846 2448847 SAI_2255 SAI_2254 guaB guaB TRUE 0.805 53.000 0.000 0.001   NA
 2448847 2448848 SAI_2254 SAI_2253 guaB   FALSE 0.122 75.000 0.000 1.000   NA
 2448848 2448849 SAI_2253 SAI_2252     FALSE 0.107 86.000 0.000 1.000   NA
 2448850 2448851 SAI_2251 SAI_2250 recF   TRUE 0.945 3.000 0.209 1.000   NA
 2448852 2448853 SAI_2249 SAI_2248     TRUE 0.997 2.000 0.872 0.005   NA
 2448853 2448854 SAI_2248 SAI_2247   pgsA FALSE 0.073 123.000 0.000 1.000   NA
 2448854 2448855 SAI_2247 SAI_2246 pgsA   TRUE 0.760 0.000 0.015 1.000 N NA
 2448855 2448856 SAI_2246 SAI_2245     TRUE 0.995 -24.000 0.713 0.030 Y NA
 2448856 2448857 SAI_2245 SAI_2244     TRUE 0.935 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 2448857 2448858 SAI_2244 SAI_2243   lytN FALSE 0.012 216.000 0.000 1.000   NA
 2448858 2448859 SAI_2243 SAI_2242 lytN   FALSE 0.492 133.000 0.000 0.004   NA
 2448860 2448861 SAI_2241 SAI_2240 sdhA sdhB TRUE 0.963 84.000 0.221 0.001 Y NA
 2448862 2448863 SAI_2239 SAI_2238 trmU   TRUE 0.558 32.000 0.005 NA N NA
 2448864 2448865 SAI_1657 SAI_1658     TRUE 0.933 7.000 0.167 NA   NA
 2448865 2448866 SAI_1658 SAI_1659     TRUE 0.983 -46.000 0.857 NA   NA
 2448866 2448867 SAI_1659 SAI_1660     TRUE 0.916 51.000 0.429 NA   NA
 2448867 2448868 SAI_1660 SAI_1661   brnQ FALSE 0.001 448.000 0.000 NA   NA
 2448868 2448869 SAI_1661 SAI_1662 brnQ metS FALSE 0.025 186.000 0.000 1.000 N NA
 2448871 2448872 SAI_1664 SAI_1665     FALSE 0.237 15.000 0.000 NA   NA
 2448873 2448874 SAI_1666 SAI_1667     TRUE 0.980 -16.000 0.714 1.000   NA
 2448874 2448875 SAI_1667 SAI_1668   xth FALSE 0.120 77.000 0.000 1.000   NA
 2448877 2448878 SAI_0382 SAI_0381     TRUE 0.648 179.000 0.583 NA   NA
 2448881 2448882 SAI_0378 SAI_0377   accA FALSE 0.001 470.000 0.000 NA   NA
 2448882 2448883 SAI_0377 SAI_0376 accA accD TRUE 0.989 -7.000 0.234 0.003 Y NA
 2448883 2448884 SAI_0376 SAI_0375 accD accC TRUE 0.987 9.000 0.090 0.003 Y NA
 2448884 2448885 SAI_0375 SAI_0374 accC fabZ TRUE 0.842 38.000 0.045 1.000 Y NA
 2448885 2448886 SAI_0374 SAI_0373 fabZ accB TRUE 0.970 -3.000 0.047 0.007 Y NA
 2448886 2448887 SAI_0373 SAI_0372 accB fabF TRUE 0.886 -34.000 0.074 1.000 Y NA
 2448887 2448888 SAI_0372 SAI_0371 fabF fabG TRUE 0.933 16.000 0.056 1.000 Y NA
 2448888 2448889 SAI_0371 SAI_0370 fabG fabD TRUE 0.996 9.000 0.432 0.007 Y NA
 2448889 2448890 SAI_0370 SAI_0369 fabD fabK TRUE 0.877 20.000 0.099 1.000   NA
 2448890 2448891 SAI_0369 SAI_0368 fabK   FALSE 0.278 155.000 0.072 1.000   NA
 2448891 2448892 SAI_0368 SAI_0367   fabH TRUE 0.977 10.000 0.019 0.007 Y NA
 2448892 2448893 SAI_0367 SAI_0366 fabH   TRUE 0.854 0.000 0.070 1.000 N NA
 2448894 2448895 SAI_1855 SAI_1856 cydD cydB TRUE 0.918 0.000 0.061 1.000 Y NA
 2448895 2448896 SAI_1856 SAI_1857 cydB appC TRUE 0.998 1.000 0.950 0.020 Y NA
 2448896 2448897 SAI_1857 SAI_1858 appC ndh TRUE 0.913 103.000 0.174 0.020 Y NA
 2448897 2448898 SAI_1858 SAI_1859 ndh   TRUE 0.967 13.000 0.261 1.000 N NA
 2448898 2448899 SAI_1859 SAI_1860     FALSE 0.001 409.000 0.000 NA   NA
 2448904 2448905 SAI_0874 SAI_0875     FALSE 0.090 101.000 0.000 1.000   NA
 2448906 2448907 SAI_0876 SAI_0877   queA FALSE 0.024 189.000 0.000 1.000 N NA
 2448908 2448909 SAI_0878 SAI_0879   nagB FALSE 0.267 151.000 0.071 NA   NA
 2448911 2448912 SAI_0881 SAI_0882 rsuA   FALSE 0.467 73.000 0.020 1.000 N NA
 2448912 2448913 SAI_0882 SAI_0883     TRUE 0.609 52.000 0.056 NA   NA
 2448913 2448914 SAI_0883 SAI_0884   pepF TRUE 0.942 16.000 0.204 NA   NA
 2448914 2448915 SAI_0884 SAI_0885 pepF gph FALSE 0.017 195.000 0.000 1.000   NA
 2448915 2448916 SAI_0885 SAI_0886 gph   FALSE 0.298 110.000 0.012 1.000   NA
 2448919 2448920 SAI_1782 SAI_1781     TRUE 0.887 11.000 0.089 NA   NA
 2448920 2448921 SAI_1781 SAI_1780   ppdK TRUE 0.869 13.000 0.065 NA   NA
 2448921 2448922 SAI_1780 SAI_1779 ppdK gatC FALSE 0.175 138.000 0.002 1.000 N NA
 2448922 2448923 SAI_1779 SAI_1778 gatC gatA TRUE 0.998 0.000 0.643 0.001 Y NA
 2448923 2448924 SAI_1778 SAI_1777 gatA gatB TRUE 0.996 0.000 0.492 0.001 Y NA
 2448924 2448925 SAI_1777 SAI_1776 gatB   FALSE 0.110 157.000 0.002 1.000   NA
 2448925 2448926 SAI_1776 SAI_1775   yqeG FALSE 0.314 111.000 0.015 1.000   NA
 2448926 2448927 SAI_1775 SAI_1774 yqeG   TRUE 0.979 0.000 0.555 1.000   NA
 2448927 2448928 SAI_1774 SAI_1773     FALSE 0.471 93.000 0.068 NA   NA
 2448928 2448929 SAI_1773 SAI_1772     TRUE 0.506 130.000 0.150 NA   NA
 2448931 2448932 SAI_1807 SAI_1808 cscA   TRUE 0.982 2.000 0.571 1.000 N NA
 2448933 2448934 SAI_1809 SAI_1810 nusB   TRUE 0.933 -7.000 0.265 NA   NA
 2448934 2448935 SAI_1810 SAI_1811   efp FALSE 0.378 89.000 0.031 NA   NA
 2448935 2448936 SAI_1811 SAI_1812 efp   FALSE 0.001 729.000 0.000 NA   NA
 2448936 2448937 SAI_1812 SAI_1813     FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 2448937 2448938 SAI_1813 SAI_1814     FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 2448938 2448939 SAI_1814 SAI_1815     FALSE 0.002 273.000 0.000 NA   NA
 2448939 2448940 SAI_1815 SAI_1816     FALSE 0.001 636.000 0.000 NA   NA
 2448940 2448941 SAI_1816 SAI_1817     FALSE 0.251 11.000 0.000 NA   NA
 2448941 2448942 SAI_1817 SAI_1818     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 2448942 2448943 SAI_1818 SAI_1819     TRUE 0.820 12.000 0.018 1.000   NA
 2448943 2448944 SAI_1819 SAI_1820   pepQ TRUE 0.864 52.000 0.007 0.002   NA
 2448944 2448945 SAI_1820 SAI_1821 pepQ   FALSE 0.039 100.000 0.000 NA   NA
 2448945 2448946 SAI_1821 SAI_1822     TRUE 0.975 2.000 0.500 NA   NA
 2448947 2448948 SAI_2119 SAI_2120     FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 2448948 2448949 SAI_2120 SAI_2121     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 2448950 2448951 SAI_2122 SAI_2123     FALSE 0.291 82.000 0.007 NA   NA
 2448952 2448953 SAI_2124 SAI_2125 nrdG   TRUE 0.729 73.000 0.159 1.000   NA
 2448953 2448954 SAI_2125 SAI_2126     TRUE 0.857 9.000 0.041 1.000   NA
 2448954 2448955 SAI_2126 SAI_2127     TRUE 0.837 13.000 0.041 NA   NA
 2448955 2448956 SAI_2127 SAI_2128   nrdD TRUE 0.522 75.000 0.062 NA   NA
 2448956 2448957 SAI_2128 SAI_2129 nrdD   FALSE 0.356 125.000 0.057 NA   NA
 2448957 2448958 SAI_2129 SAI_2130     FALSE 0.139 31.000 0.000 NA   NA
 2448958 2448959 SAI_2130 SAI_2131     FALSE 0.048 83.000 0.000 NA   NA
 2448959 2448960 SAI_2131 SAI_2132     TRUE 0.978 26.000 0.651 NA   NA
 2448960 2448961 SAI_2132 SAI_2133     TRUE 0.983 9.000 0.537 NA   NA
 2448963 2448964 SAI_1939 SAI_1938   purA FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 2448964 2448965 SAI_1938 SAI_1937 purA purA TRUE 0.939 -6.000 0.008 0.001   NA
 2448967 2448968 SAI_1935 SAI_1934     FALSE 0.012 168.000 0.000 NA   NA
 2448968 2448969 SAI_1934 SAI_1933     TRUE 0.986 28.000 0.431 0.016   NA
 2448969 2448970 SAI_1933 SAI_1932     TRUE 0.967 67.000 0.279 0.014 Y NA
 2448970 2448971 SAI_1932 SAI_1931     TRUE 0.868 113.000 0.328 1.000 Y NA
 2448971 2448972 SAI_1931 SAI_1930     TRUE 0.990 4.000 0.536 1.000 Y NA
 2448972 2448973 SAI_1930 SAI_1929     TRUE 0.992 2.000 0.700 1.000 Y NA
 2448973 2448974 SAI_1929 SAI_1928     TRUE 0.830 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2448974 2448975 SAI_1928 SAI_1927     FALSE 0.040 164.000 0.000 1.000 N NA
 2448975 2448976 SAI_1927 SAI_1926     FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 2448977 2448978 SAI_2103 SAI_2104     FALSE 0.005 312.000 0.000 1.000   NA
 2448978 2448979 SAI_2104 SAI_2105   rpmG TRUE 0.780 36.000 0.080 1.000 N NA
 2448979 2448980 SAI_2105 SAI_2106 rpmG   TRUE 0.763 49.000 0.111 1.000 N NA
 2448982 2448983 SAI_2108 SAI_2109   deoB FALSE 0.011 170.000 0.000 NA   NA
 2448983 2448984 SAI_2109 SAI_2110 deoB deoC TRUE 0.612 67.000 0.000 0.043 N NA
 2448984 2448985 SAI_2110 SAI_2111 deoC   TRUE 0.970 30.000 0.333 1.000 Y NA
 2448985 2448986 SAI_2111 SAI_2112     TRUE 0.770 21.000 0.000 1.000 Y NA
 2448987 2448988 SAI_1670 SAI_1671   ogt TRUE 0.842 2.000 0.050 1.000 N NA
 2448988 2448989 SAI_1671 SAI_1672 ogt serA FALSE 0.480 57.000 0.009 1.000 N NA
 2448989 2448990 SAI_1672 SAI_1673 serA   TRUE 0.741 63.000 0.013 0.052   NA
 2448990 2448991 SAI_1673 SAI_1674   serC FALSE 0.416 68.000 0.012 1.000   NA
 2448993 2448994 SAI_1676 SAI_1677     FALSE 0.196 122.000 0.005 NA   NA
 2448994 2448995 SAI_1677 SAI_1678     TRUE 0.831 6.000 0.043 NA   NA
 2448995 2448996 SAI_1678 SAI_1679   dnaZX TRUE 0.706 31.000 0.038 NA   NA
 2448996 2448997 SAI_1679 SAI_1680 dnaZX tmk TRUE 0.954 20.000 0.254 1.000 N NA
 2448997 2448998 SAI_1680 SAI_1681 tmk guaB-1 FALSE 0.310 89.000 0.006 1.000   NA
 2448998 2448999 SAI_1681 SAI_1682 guaB-1 livF TRUE 0.943 19.000 0.214 1.000   NA
 2448999 2449000 SAI_1682 SAI_1683 livF livG TRUE 0.978 0.000 0.128 0.029 Y NA
 2449000 2449001 SAI_1683 SAI_1684 livG livM TRUE 0.980 1.000 0.349 1.000 Y NA
 2449001 2449002 SAI_1684 SAI_1685 livM   TRUE 0.993 3.000 0.363 0.039 Y NA
 2449004 2449005 SAI_1238 SAI_1237     FALSE 0.001 393.000 0.000 NA   NA
 2449005 2449006 SAI_1237 SAI_1236     FALSE 0.073 55.000 0.000 NA   NA
 2449006 2449007 SAI_1236 SAI_1235     FALSE 0.137 -18.000 0.000 NA   NA
 2449007 2449008 SAI_1235 SAI_1234     FALSE 0.051 78.000 0.000 NA   NA
 2449008 2449009 SAI_1234 SAI_1233     FALSE 0.001 988.000 0.000 NA   NA
 2449009 2449010 SAI_1233 SAI_1232     FALSE 0.056 69.000 0.000 NA   NA
 2449010 2449011 SAI_1232 SAI_1231     TRUE 0.846 -19.000 0.121 1.000   NA
 2449011 2449012 SAI_1231 SAI_1230     FALSE 0.034 159.000 0.000 1.000   NA
 2449012 2449013 SAI_1230 SAI_1229   dagA TRUE 0.807 64.000 0.060 0.079 N NA
 2449014 2449015 SAI_1228 SAI_1227 uraA   FALSE 0.040 133.000 0.000 NA N NA
 2449016 2449017 SAI_1913 SAI_1914     FALSE 0.008 246.000 0.000 1.000   NA
 2449017 2449018 SAI_1914 SAI_1915     TRUE 0.982 19.000 0.177 0.078 Y NA
 2449018 2449019 SAI_1915 SAI_1916   xfp FALSE 0.004 376.000 0.000 1.000 N NA
 2449019 2449020 SAI_1916 SAI_1917 xfp   FALSE 0.043 90.000 0.000 NA   NA
 2449020 2449021 SAI_1917 SAI_1918     FALSE 0.101 317.000 0.231 NA   NA
 2449021 2449022 SAI_1918 SAI_1919     FALSE 0.060 66.000 0.000 NA   NA
 2449023 2449024 SAI_2082 SAI_2081     FALSE 0.010 173.000 0.000 NA   NA
 2449025 2449026 SAI_2080 SAI_2079     FALSE 0.002 305.000 0.000 NA   NA
 2449026 2449027 SAI_2079 SAI_2078     TRUE 0.844 -3.000 0.104 NA   NA
 2449028 2449029 SAI_2077 SAI_2076     FALSE 0.005 290.000 0.000 1.000   NA
 2449029 2449030 SAI_2076 SAI_2075     TRUE 0.914 2.000 0.167 NA   NA
 2449030 2449031 SAI_2075 SAI_2074     TRUE 0.596 84.000 0.118 NA   NA
 2449031 2449032 SAI_2074 SAI_2073     TRUE 0.984 15.000 0.569 NA   NA
 2449032 2449033 SAI_2073 SAI_2072     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 2449033 2449034 SAI_2072 SAI_2071     FALSE 0.002 529.000 0.000 1.000   NA
 2449034 2449035 SAI_2071 SAI_2070     TRUE 0.960 -13.000 0.486 NA   NA
 2449035 2449036 SAI_2070 SAI_2069     FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 2449036 2449037 SAI_2069 SAI_2068     FALSE 0.009 179.000 0.000 NA   NA
 2449038 2449039 SAI_1412 SAI_1411 folA   TRUE 0.776 18.000 0.030 NA   NA
 2449039 2449040 SAI_1411 SAI_1410   clpX TRUE 0.611 30.000 0.012 NA   NA
 2449040 2449041 SAI_1410 SAI_1409 clpX   TRUE 0.862 11.000 0.043 1.000   NA
 2449043 2449044 SAI_1407 SAI_1406     FALSE 0.128 -39.000 0.000 NA   NA
 2449044 2449045 SAI_1406 SAI_1405     FALSE 0.078 52.000 0.000 NA   NA
 2449045 2449046 SAI_1405 SAI_1404     FALSE 0.014 158.000 0.000 NA   NA
 2449046 2449047 SAI_1404 SAI_1403     FALSE 0.026 130.000 0.000 NA   NA
 2449047 2449048 SAI_1403 SAI_1402     TRUE 0.892 -106.000 0.093 1.000 Y NA
 2449050 2449051 SAI_1400 SAI_1399   rplL TRUE 0.993 64.000 0.884 0.019 Y NA
 2449051 2449052 SAI_1399 SAI_1398 rplL   FALSE 0.038 199.000 0.002 NA   NA
 2449053 2449054 SAI_2293 SAI_2294 tkt   FALSE 0.189 49.000 0.000 1.000   NA
 2449054 2449055 SAI_2294 SAI_2295     TRUE 0.942 18.000 0.000 0.019 Y NA
 2449055 2449056 SAI_2295 SAI_2296   fruA-2 TRUE 0.981 12.000 0.273 1.000 Y NA
 2449056 2449057 SAI_2296 SAI_2297 fruA-2   TRUE 0.956 13.000 0.000 0.014 Y NA
 2449057 2449058 SAI_2297 SAI_2298   fruA-1 TRUE 0.990 14.000 0.179 0.014 Y NA
 2449058 2449059 SAI_2298 SAI_2299 fruA-1   TRUE 0.917 14.000 0.000 0.014 N NA
 2449059 2449060 SAI_2299 SAI_2300     FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 2449060 2449061 SAI_2300 SAI_2301     FALSE 0.128 33.000 0.000 NA   NA
 2449062 2449063 SAI_2302 SAI_2303     FALSE 0.238 6.000 0.000 NA   NA
 2449063 2449064 SAI_2303 SAI_2304     FALSE 0.134 -22.000 0.000 NA   NA
 2449065 2449066 SAI_2305 SAI_2306     FALSE 0.101 42.000 0.000 NA   NA
 2449066 2449067 SAI_2306 SAI_2307     FALSE 0.085 109.000 0.000 1.000   NA
 2449068 2449069 SAI_0845 SAI_0844   oxlT-2 FALSE 0.026 129.000 0.000 NA   NA
 2449069 2449070 SAI_0844 SAI_0843 oxlT-2 murF FALSE 0.011 241.000 0.000 1.000 N NA
 2449070 2449071 SAI_0843 SAI_0842 murF   TRUE 0.744 147.000 0.046 0.008 Y NA
 2449071 2449072 SAI_0842 SAI_0841   recR FALSE 0.207 141.000 0.010 1.000 N NA
 2449072 2449073 SAI_0841 SAI_0840 recR   TRUE 0.804 15.000 0.013 1.000 N NA
 2449073 2449074 SAI_0840 SAI_0839     FALSE 0.081 129.000 0.000 1.000 N NA
 2449074 2449075 SAI_0839 SAI_0838   tpiA FALSE 0.122 177.000 0.000 1.000 Y NA
 2449075 2449076 SAI_0838 SAI_0837 tpiA tuf FALSE 0.014 355.000 0.003 1.000 N NA
 2449077 2449078 SAI_0666 SAI_0667     TRUE 0.728 77.000 0.167 1.000   NA
 2449078 2449079 SAI_0667 SAI_0668     TRUE 0.838 -7.000 0.094 1.000   NA
 2449079 2449080 SAI_0668 SAI_0669     TRUE 0.934 -33.000 0.031 0.002   NA
 2449080 2449081 SAI_0669 SAI_0670   rplS FALSE 0.008 580.000 0.006 1.000   NA
 2449083 2449084 SAI_0672 SAI_0673     FALSE 0.013 162.000 0.000 NA   NA
 2449084 2449085 SAI_0673 SAI_0674     FALSE 0.179 22.000 0.000 NA   NA
 2449085 2449086 SAI_0674 SAI_0675     FALSE 0.493 126.000 0.000 0.010   NA
 2449088 2449089 SAI_0677 SAI_0678     TRUE 0.994 10.000 0.917 1.000 N NA
 2449089 2449090 SAI_0678 SAI_0679     TRUE 0.976 0.000 0.542 NA   NA
 2449090 2449091 SAI_0679 SAI_0680     TRUE 0.880 15.000 0.091 NA   NA
 2449091 2449092 SAI_0680 SAI_0681     TRUE 0.845 97.000 0.409 1.000   NA
 2449092 2449093 SAI_0681 SAI_0682     TRUE 0.992 -3.000 1.000 1.000   NA
 2449095 2449096 SAI_0176 SAI_0177 proC   TRUE 0.535 70.000 0.041 1.000 N NA
 2449096 2449097 SAI_0177 SAI_0178     FALSE 0.008 185.000 0.000 NA   NA
 2449098 2449099 SAI_0179 SAI_0180     TRUE 0.879 -3.000 0.140 NA   NA
 2449099 2449100 SAI_0180 SAI_0181   pheT TRUE 0.917 33.000 0.239 1.000   NA
 2449102 2449103 SAI_0183 SAI_0184 ssbB   FALSE 0.226 40.000 0.000 1.000   NA
 2449103 2449104 SAI_0184 SAI_0185     FALSE 0.314 27.000 0.000 1.000   NA
 2449104 2449105 SAI_0185 SAI_0186     TRUE 0.994 -19.000 0.538 0.014 Y NA
 2449105 2449106 SAI_0186 SAI_0187     FALSE 0.375 170.000 0.178 1.000   NA
 2449106 2449107 SAI_0187 SAI_0188     TRUE 0.991 2.000 0.869 1.000   NA
 2449110 2449111 SAI_1107 SAI_1106     TRUE 0.832 13.000 0.038 NA   NA
 2449111 2449112 SAI_1106 SAI_1105     FALSE 0.246 9.000 0.000 NA   NA
 2449112 2449113 SAI_1105 SAI_1104     FALSE 0.171 -3.000 0.000 NA   NA
 2449113 2449114 SAI_1104 SAI_1103     FALSE 0.238 6.000 0.000 NA   NA
 2449114 2449115 SAI_1103 SAI_1102     FALSE 0.111 37.000 0.000 NA   NA
 2449115 2449116 SAI_1102 SAI_1101     FALSE 0.002 323.000 0.000 NA   NA
 2449116 2449117 SAI_1101 SAI_1100     FALSE 0.161 -6.000 0.000 NA   NA
 2449117 2449118 SAI_1100 SAI_1099     FALSE 0.197 2.000 0.000 NA   NA
 2449118 2449119 SAI_1099 SAI_1098     FALSE 0.031 123.000 0.000 NA   NA
 2449119 2449120 SAI_1098 SAI_1097     FALSE 0.139 -16.000 0.000 NA   NA
 2449120 2449121 SAI_1097 SAI_1096     FALSE 0.045 87.000 0.000 NA   NA
 2449121 2449122 SAI_1096 SAI_1095     FALSE 0.001 538.000 0.000 NA   NA
 2449124 2449125 SAI_1644 SAI_1645     TRUE 0.837 10.000 0.041 NA   NA
 2449125 2449126 SAI_1645 SAI_1646     TRUE 0.736 0.000 0.025 NA   NA
 2449126 2449127 SAI_1646 SAI_1647   glmU TRUE 0.761 21.000 0.015 1.000 N NA
 2449127 2449128 SAI_1647 SAI_1648 glmU   FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 2449128 2449129 SAI_1648 SAI_1649     TRUE 0.982 13.000 0.500 NA   NA
 2449129 2449130 SAI_1649 SAI_1650     FALSE 0.102 89.000 0.000 1.000   NA
 2449130 2449131 SAI_1650 SAI_1651     TRUE 0.767 -3.000 0.043 NA   NA
 2449131 2449132 SAI_1651 SAI_1652     FALSE 0.041 239.000 0.022 NA   NA
 2449132 2449133 SAI_1652 SAI_1653     TRUE 0.980 -7.000 0.710 NA   NA
 2449133 2449134 SAI_1653 SAI_1654     FALSE 0.043 90.000 0.000 NA   NA
 2449134 2449135 SAI_1654 SAI_1655     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 2449135 2449136 SAI_1655 SAI_1656     FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 2449137 2449138 SAI_0857 SAI_0856     FALSE 0.039 100.000 0.000 NA   NA
 2449139 2449140 SAI_0855 SAI_0854     TRUE 0.922 -7.000 0.209 1.000   NA
 2449141 2449142 SAI_0853 SAI_0852     FALSE 0.006 235.000 0.000 NA N NA
 2449142 2449143 SAI_0852 SAI_0851     TRUE 0.984 16.000 0.400 NA Y NA
 2449143 2449144 SAI_0851 SAI_0850     TRUE 0.903 -7.000 0.067 1.000 Y NA
 2449144 2449145 SAI_0850 SAI_0849     FALSE 0.032 121.000 0.000 NA   NA
 2449145 2449146 SAI_0849 SAI_0848   prfC FALSE 0.242 86.000 0.003 NA   NA
 2449146 2449147 SAI_0848 SAI_0847 prfC   FALSE 0.023 177.000 0.000 1.000   NA
 2449147 2449148 SAI_0847 SAI_0846     FALSE 0.292 -15.000 0.000 1.000   NA
 2449149 2449150 SAI_1455 SAI_1454     TRUE 0.562 -19.000 0.007 NA   NA
 2449150 2449151 SAI_1454 SAI_1453   pfoS/R FALSE 0.334 137.000 0.059 1.000   NA
 2449151 2449152 SAI_1453 SAI_1452 pfoS/R panE TRUE 0.972 13.000 0.333 1.000   NA
 2449152 2449153 SAI_1452 SAI_1451 panE   FALSE 0.013 212.000 0.000 1.000   NA
 2449153 2449154 SAI_1451 SAI_1450     FALSE 0.048 144.000 0.000 1.000   NA
 2449154 2449155 SAI_1450 SAI_1449   lacR FALSE 0.078 131.000 0.000 1.000 N NA
 2449155 2449156 SAI_1449 SAI_1448 lacR   TRUE 0.991 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 2449156 2449157 SAI_1448 SAI_1447   fruA-2 TRUE 0.989 36.000 0.816 1.000 Y NA
 2449159 2449160 SAI_1636 SAI_1637 pabB/C   FALSE 0.143 82.000 0.000 1.000 N NA
 2449162 2449163 SAI_1639 SAI_1640 psaC   TRUE 0.901 2.000 0.130 1.000   NA
 2449163 2449164 SAI_1640 SAI_1641     TRUE 0.796 -3.000 0.043 1.000   NA
 2449164 2449165 SAI_1641 SAI_1642     FALSE 0.296 171.000 0.135 1.000   NA
 2449167 2449168 SAI_0999 SAI_1000     TRUE 0.979 12.000 0.471 NA   NA
 2449168 2449169 SAI_1000 SAI_1001     TRUE 0.970 1.000 0.412 1.000 N NA
 2449170 2449171 SAI_1002 SAI_1003 dnaE   TRUE 0.619 81.000 0.098 1.000 N NA
 2449171 2449172 SAI_1003 SAI_1004   pyk TRUE 0.601 253.000 0.261 0.004 Y NA
 2449172 2449173 SAI_1004 SAI_1005 pyk   FALSE 0.210 171.000 0.072 1.000   NA
 2449174 2449175 SAI_1416 SAI_1417     FALSE 0.332 92.000 0.020 NA   NA
 2449175 2449176 SAI_1417 SAI_1418     TRUE 0.638 86.000 0.146 NA   NA
 2449176 2449177 SAI_1418 SAI_1419     TRUE 0.645 87.000 0.135 1.000   NA
 2449177 2449178 SAI_1419 SAI_1420     FALSE 0.063 101.000 0.000 NA N NA
 2449179 2449180 SAI_1421 SAI_1422     FALSE 0.057 68.000 0.000 NA   NA
 2449180 2449181 SAI_1422 SAI_1423     TRUE 0.865 -3.000 0.097 1.000 N NA
 2449181 2449182 SAI_1423 SAI_1424   mvaD TRUE 0.991 -7.000 0.312 0.004 Y NA
 2449182 2449183 SAI_1424 SAI_1425 mvaD mvk TRUE 0.989 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 2449183 2449184 SAI_1425 SAI_1426 mvk   FALSE 0.102 116.000 0.000 1.000 N NA
 2449185 2449186 SAI_1544 SAI_1543 malQ   TRUE 0.989 12.000 0.289 0.019   NA
 2449186 2449187 SAI_1543 SAI_1542     TRUE 0.939 29.000 0.079 0.019   NA
 2449187 2449188 SAI_1542 SAI_1541     FALSE 0.016 415.000 0.000 1.000 Y NA
 2449196 2449197 SAI_2228 SAI_2229     FALSE 0.002 333.000 0.000 NA   NA
 2449198 2449199 SAI_2230 SAI_2231 rpsD   FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 2449199 2449200 SAI_2231 SAI_2232   dnaC TRUE 0.858 12.000 0.053 NA   NA
 2449200 2449201 SAI_2232 SAI_2233 dnaC rplI TRUE 0.776 43.000 0.100 1.000 N NA
 2449201 2449202 SAI_2233 SAI_2234 rplI   TRUE 0.915 6.000 0.119 1.000   NA
 2449204 2449205 SAI_1697 SAI_1698 trkA trkH TRUE 0.989 17.000 0.163 0.004 Y NA
 2449206 2449207 SAI_1699 SAI_1700   rluB TRUE 0.740 0.000 0.014 1.000   NA
 2449207 2449208 SAI_1700 SAI_1701 rluB   TRUE 0.920 -10.000 0.224 NA N NA
 2449208 2449209 SAI_1701 SAI_1702     TRUE 0.976 -3.000 0.570 NA   NA
 2449209 2449210 SAI_1702 SAI_1703     TRUE 0.710 0.000 0.017 NA   NA
 2449210 2449211 SAI_1703 SAI_1704     TRUE 0.805 -49.000 0.111 NA   NA
 2449211 2449212 SAI_1704 SAI_1705     TRUE 0.743 -3.000 0.034 NA   NA
 2449212 2449213 SAI_1705 SAI_1706     TRUE 0.596 -18.000 0.005 1.000   NA
 2449214 2449215 SAI_2143 SAI_2142     FALSE 0.011 170.000 0.000 NA   NA
 2449215 2449216 SAI_2142 SAI_2141     TRUE 0.985 1.000 0.667 1.000   NA
 2449216 2449217 SAI_2141 SAI_2140     TRUE 0.984 66.000 1.000 1.000 Y NA
 2449217 2449218 SAI_2140 SAI_2139     FALSE 0.119 204.000 0.000 0.054 N NA
 2449218 2449219 SAI_2139 SAI_2138     TRUE 0.977 33.000 0.750 NA   NA
 2449220 2449221 SAI_2137 SAI_2136     FALSE 0.341 89.000 0.011 1.000   NA
 2449221