MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus agalactiae 515

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

<
 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2440424 2440425 SAL_1269 SAL_1270     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 2440425 2440426 SAL_1270 SAL_1271   ilvE TRUE 0.627 83.000 0.095 NA   NA
 2440426 2440427 SAL_1271 SAL_1272 ilvE parC TRUE 0.616 113.000 0.086 1.000 N NA
 2440427 2440428 SAL_1272 SAL_1273 parC parE TRUE 0.956 134.000 0.552 0.003 Y NA
 2440430 2440431 SAL_1275 SAL_1276 ung   FALSE 0.012 99.000 0.000 NA   NA
 2440431 2440432 SAL_1276 SAL_1277     FALSE 0.011 114.000 0.000 NA   NA
 2440432 2440433 SAL_1277 SAL_1278   pglB TRUE 0.815 11.000 0.013 1.000   NA
 2440433 2440434 SAL_1278 SAL_1279 pglB   TRUE 0.774 -3.000 0.013 1.000   NA
 2440434 2440435 SAL_1279 SAL_1280     TRUE 0.966 77.000 0.549 1.000 Y NA
 2440435 2440436 SAL_1280 SAL_1281     FALSE 0.252 0.000 0.000 1.000   NA
 2440436 2440437 SAL_1281 SAL_1282     TRUE 0.817 -3.000 0.033 1.000   NA
 2440437 2440438 SAL_1282 SAL_1283     FALSE 0.016 84.000 0.000 NA   NA
 2440438 2440439 SAL_1283 SAL_1284     TRUE 0.683 34.000 0.000 NA Y NA
 2440439 2440440 SAL_1284 SAL_1285     FALSE 0.060 0.000 0.000 NA   NA
 2440440 2440441 SAL_1285 SAL_1286   cpsG FALSE 0.013 96.000 0.000 NA   NA
 2440441 2440442 SAL_1286 SAL_1287 cpsG   TRUE 0.854 0.000 0.052 1.000   NA
 2440442 2440443 SAL_1287 SAL_1288     TRUE 0.768 24.000 0.020 1.000   NA
 2440443 2440444 SAL_1288 SAL_1289     TRUE 0.903 13.000 0.067 1.000 N NA
 2440444 2440445 SAL_1289 SAL_1290     TRUE 0.990 11.000 0.800 1.000 N NA
 2440445 2440446 SAL_1290 SAL_1291     TRUE 0.993 9.000 0.636 1.000 Y NA
 2440446 2440447 SAL_1291 SAL_1292     TRUE 0.986 6.000 0.583 1.000 N NA
 2440449 2440450 SAL_1294 SAL_1295   deoD TRUE 0.893 9.000 0.107 NA   NA
 2440450 2440451 SAL_1295 SAL_1296 deoD   TRUE 0.789 -16.000 0.027 1.000 N NA
 2440451 2440452 SAL_1296 SAL_1297     FALSE 0.187 86.000 0.000 1.000 N NA
 2440452 2440453 SAL_1297 SAL_1298   arsC TRUE 0.840 39.000 0.108 1.000 N NA
 2440453 2440454 SAL_1298 SAL_1299 arsC deoB TRUE 0.806 51.000 0.108 1.000 N NA
 2440454 2440455 SAL_1299 SAL_1300 deoB rpiA TRUE 0.824 57.000 0.018 1.000 Y NA
 2440457 2440458 SAL_1302 SAL_1303     TRUE 0.761 90.000 0.217 NA   NA
 2440458 2440459 SAL_1303 SAL_1304     TRUE 0.766 57.000 0.143 NA   NA
 2440459 2440460 SAL_1304 SAL_1305     FALSE 0.031 297.000 0.026 1.000   NA
 2440460 2440461 SAL_1305 SAL_1306   potA2 FALSE 0.168 -21.000 0.000 1.000   NA
 2440461 2440462 SAL_1306 SAL_1308 potA2   TRUE 0.990 0.000 0.895 1.000   NA
 2440466 2440467 SAL_1311 SAL_1312 budA   TRUE 0.887 14.000 0.044 1.000 N NA
 2440467 2440468 SAL_1312 SAL_1313     FALSE 0.441 110.000 0.022 1.000   NA
 2440468 2440469 SAL_1313 SAL_1314     TRUE 0.776 -10.000 0.048 NA   NA
 2440469 2440470 SAL_1314 SAL_1315     FALSE 0.014 92.000 0.000 NA   NA
 2440470 2440471 SAL_1315 SAL_1316     FALSE 0.343 -31.000 0.000 1.000 N NA
 2440473 2440474 SAL_1318 SAL_1319 rfbB   TRUE 0.760 52.000 0.100 1.000   NA
 2440474 2440475 SAL_1319 SAL_1320     TRUE 0.914 0.000 0.150 1.000   NA
 2440475 2440476 SAL_1320 SAL_1321   rfbA TRUE 0.963 0.000 0.149 1.000 Y NA
 2440476 2440477 SAL_1321 SAL_1322 rfbA   TRUE 0.733 59.000 0.059 1.000 N NA
 2440477 2440478 SAL_1322 SAL_1323     TRUE 0.812 9.000 0.021 NA   NA
 2440478 2440479 SAL_1323 SAL_1324     TRUE 0.929 -10.000 0.283 NA   NA
 2440479 2440480 SAL_1324 SAL_1325     FALSE 0.357 104.000 0.012 NA   NA
 2440480 2440481 SAL_1325 SAL_1326   apt FALSE 0.372 118.000 0.005 NA N NA
 2440481 2440482 SAL_1326 SAL_1327 apt   FALSE 0.089 123.000 0.000 NA N NA
 2440484 2440485 SAL_1329 SAL_1330 recJ   TRUE 0.788 -3.000 0.016 1.000   NA
 2440485 2440486 SAL_1330 SAL_1331     TRUE 0.874 2.000 0.074 1.000   NA
 2440486 2440487 SAL_1331 SAL_1332     TRUE 0.679 42.000 0.022 1.000   NA
 2440487 2440488 SAL_1332 SAL_1333     TRUE 0.754 -7.000 0.014 1.000   NA
 2440488 2440489 SAL_1333 SAL_1334   miaA FALSE 0.499 91.000 0.027 1.000   NA
 2440491 2440492 SAL_1336 SAL_1337     FALSE 0.016 84.000 0.000 NA   NA
 2440492 2440493 SAL_1337 SAL_1339     FALSE 0.013 93.000 0.000 NA   NA
 2440494 2440495 SAL_1338 SAL_1340     FALSE 0.000 3656.000 0.000 NA   NA
 2440496 2440497 SAL_1341 SAL_1342     FALSE 0.390 15.000 0.000 NA N NA
 2440497 2440498 SAL_1342 SAL_1343   pepV FALSE 0.517 97.000 0.031 NA N NA
 2440498 2440499 SAL_1343 SAL_1344 pepV   TRUE 0.876 47.000 0.179 1.000 N NA
 2440504 2440505 SAL_1988 SAL_1989     FALSE 0.457 178.000 0.286 1.000   NA
 2440505 2440506 SAL_1989 SAL_1990     FALSE 0.041 29.000 0.000 NA   NA
 2440506 2440507 SAL_1990 SAL_1991     FALSE 0.062 16.000 0.000 NA   NA
 2440508 2440509 SAL_1992 SAL_1993 cpdB nrdI FALSE 0.467 157.000 0.022 NA Y NA
 2440509 2440510 SAL_1993 SAL_1994 nrdI   TRUE 0.856 11.000 0.027 NA N NA
 2440510 2440511 SAL_1994 SAL_1995     TRUE 0.775 0.000 0.018 NA   NA
 2440512 2440513 SAL_1996 SAL_1997     TRUE 0.983 12.000 0.571 1.000   NA
 2440513 2440514 SAL_1997 SAL_1998     TRUE 0.985 4.000 0.500 0.020   NA
 2440514 2440515 SAL_1998 SAL_1999     TRUE 0.761 138.000 0.222 0.081 N NA
 2440515 2440516 SAL_1999 SAL_2000     TRUE 0.995 -3.000 0.778 0.029 Y NA
 2440516 2440517 SAL_2000 SAL_2001     TRUE 0.996 16.000 0.778 0.029 Y NA
 2440517 2440518 SAL_2001 SAL_2002     TRUE 0.996 18.000 0.786 0.019 Y NA
 2440518 2440519 SAL_2002 SAL_2003     FALSE 0.001 247.000 0.000 NA   NA
 2440521 2440522 SAL_2005 SAL_2006     TRUE 0.984 6.000 0.667 NA   NA
 2440522 2440523 SAL_2006 SAL_2007     FALSE 0.010 123.000 0.000 NA   NA
 2440523 2440524 SAL_2007 SAL_2008     TRUE 0.892 78.000 0.444 NA   NA
 2440524 2440525 SAL_2008 SAL_2009     FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000   NA
 2440525 2440526 SAL_2009 SAL_2010   ptsG TRUE 0.965 39.000 0.610 1.000   NA
 2440526 2440527 SAL_2010 SAL_2011 ptsG hpkA FALSE 0.064 158.000 0.000 1.000 N NA
 2440527 2440528 SAL_2011 SAL_2012 hpkA phoB TRUE 0.954 -7.000 0.075 0.066 Y NA
 2440528 2440529 SAL_2012 SAL_2013 phoB   TRUE 0.971 0.000 0.429 NA N NA
 2440529 2440530 SAL_2013 SAL_2014   pstB TRUE 0.967 -3.000 0.203 NA Y NA
 2440530 2440531 SAL_2014 SAL_2015 pstB pstA TRUE 0.989 -7.000 0.428 0.004 Y NA
 2440531 2440532 SAL_2015 SAL_2016 pstA pstC TRUE 0.985 2.000 0.219 0.004 Y NA
 2440532 2440533 SAL_2016 SAL_2017 pstC   FALSE 0.270 15.000 0.000 1.000   NA
 2440533 2440534 SAL_2017 SAL_2018     FALSE 0.002 201.000 0.000 NA   NA
 2440534 2440535 SAL_2018 SAL_2019     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2440535 2440536 SAL_2019 SAL_2020   prmA TRUE 0.937 0.000 0.227 NA   NA
 2440536 2440537 SAL_2020 SAL_2021 prmA   FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2440539 2440540 SAL_2023 SAL_2024     TRUE 0.759 -28.000 0.048 1.000   NA
 2440540 2440541 SAL_2024 SAL_2025     TRUE 0.767 -13.000 0.048 NA   NA
 2440541 2440542 SAL_2025 SAL_2026     TRUE 0.889 6.000 0.100 NA   NA
 2440543 2440544 SAL_2027 SAL_2028     TRUE 0.851 -7.000 0.047 1.000 N NA
 2440545 2440546 SAL_2029 SAL_2030     FALSE 0.026 50.000 0.000 NA   NA
 2440546 2440547 SAL_2030 SAL_2031     FALSE 0.002 193.000 0.000 NA   NA
 2440547 2440548 SAL_2031 SAL_2032     FALSE 0.017 76.000 0.000 NA   NA
 2440548 2440549 SAL_2032 SAL_2033     FALSE 0.001 223.000 0.000 NA   NA
 2440549 2440550 SAL_2033 SAL_2034     FALSE 0.012 102.000 0.000 NA   NA
 2440550 2440551 SAL_2034 SAL_2035     TRUE 0.914 2.000 0.161 NA   NA
 2440551 2440552 SAL_2035 SAL_2036     FALSE 0.065 96.000 0.000 1.000   NA
 2440552 2440553 SAL_2036 SAL_2037     TRUE 0.973 17.000 0.500 NA   NA
 2440553 2440554 SAL_2037 SAL_2038     TRUE 0.956 0.000 0.333 NA   NA
 2440554 2440555 SAL_2038 SAL_2039     FALSE 0.000 496.000 0.000 NA   NA
 2440555 2440556 SAL_2039 SAL_2040     TRUE 0.962 16.000 0.364 NA   NA
 2440556 2440557 SAL_2040 SAL_2041     TRUE 0.910 21.000 0.182 NA   NA
 2440557 2440558 SAL_2041 SAL_2042     TRUE 0.969 40.000 0.750 NA   NA
 2440558 2440559 SAL_2042 SAL_2043     TRUE 0.981 21.000 0.750 NA   NA
 2440559 2440560 SAL_2043 SAL_2044     FALSE 0.025 53.000 0.000 NA   NA
 2440560 2440561 SAL_2044 SAL_2045     TRUE 0.975 -7.000 0.615 NA   NA
 2440561 2440562 SAL_2045 SAL_2046     FALSE 0.007 145.000 0.000 NA   NA
 2440562 2440563 SAL_2046 SAL_2047     TRUE 0.976 4.000 0.500 NA   NA
 2440563 2440564 SAL_2047 SAL_2048     TRUE 0.913 53.000 0.400 NA   NA
 2440564 2440565 SAL_2048 SAL_2049     FALSE 0.008 132.000 0.000 NA   NA
 2440565 2440566 SAL_2049 SAL_2050     TRUE 0.863 -7.000 0.000 0.025 Y NA
 2440566 2440567 SAL_2050 SAL_2051     FALSE 0.041 -13.000 0.000 NA   NA
 2440567 2440568 SAL_2051 SAL_2052     TRUE 0.957 16.000 0.333 NA   NA
 2440568 2440569 SAL_2052 SAL_2053     FALSE 0.003 288.000 0.000 1.000   NA
 2440569 2440570 SAL_2053 SAL_2054     TRUE 0.937 77.000 0.667 NA   NA
 2440570 2440571 SAL_2054 SAL_2055     TRUE 0.988 22.000 1.000 NA   NA
 2440571 2440572 SAL_2055 SAL_2056     TRUE 0.835 60.000 0.222 NA   NA
 2440572 2440573 SAL_2056 SAL_2057     FALSE 0.336 89.000 0.000 0.013   NA
 2440573 2440574 SAL_2057 SAL_2058     FALSE 0.062 16.000 0.000 NA   NA
 2440574 2440575 SAL_2058 SAL_2059     FALSE 0.054 20.000 0.000 NA   NA
 2440575 2440576 SAL_2059 SAL_2060     TRUE 0.785 -15.000 0.065 NA   NA
 2440576 2440577 SAL_2060 SAL_2061     FALSE 0.049 -7.000 0.000 NA   NA
 2440578 2440579 SAL_2097 SAL_2098     FALSE 0.024 201.000 0.000 1.000 N NA
 2440580 2440581 SAL_2099 SAL_2100     FALSE 0.000 347.000 0.000 NA   NA
 2440581 2440582 SAL_2100 SAL_2101   metE TRUE 0.867 45.000 0.030 1.000 Y NA
 2440582 2440583 SAL_2101 SAL_2102 metE   FALSE 0.000 370.000 0.000 NA   NA
 2440583 2440584 SAL_2102 SAL_2103   azlC TRUE 0.942 -10.000 0.338 NA   NA
 2440585 2440586 SAL_2104 SAL_2105     FALSE 0.459 63.000 0.000 0.003   NA
 2440586 2440587 SAL_2105 SAL_2106     FALSE 0.005 233.000 0.000 1.000   NA
 2440587 2440588 SAL_2106 SAL_2107     TRUE 0.995 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 2440588 2440589 SAL_2107 SAL_2108     FALSE 0.511 93.000 0.049 NA   NA
 2440589 2440590 SAL_2108 SAL_2109     FALSE 0.034 -28.000 0.000 NA   NA
 2440594 2440595 SAL_2112 SAL_2114     FALSE 0.000 534.000 0.000 NA   NA
 2440595 2440596 SAL_2114 SAL_2115     TRUE 0.987 65.000 0.750 0.006 Y NA
 2440597 2440598 SAL_2116 SAL_2117 nusG   FALSE 0.008 206.000 0.000 1.000   NA
 2440598 2440599 SAL_2117 SAL_2118     FALSE 0.049 -7.000 0.000 NA   NA
 2440599 2440600 SAL_2118 SAL_2119     FALSE 0.000 312.000 0.000 NA   NA
 2440600 2440601 SAL_2119 SAL_2120     FALSE 0.013 237.000 0.000 1.000 N NA
 2440603 2440604 SAL_2122 SAL_2123   deoB FALSE 0.003 170.000 0.000 NA   NA
 2440604 2440605 SAL_2123 SAL_2124 deoB deoC FALSE 0.434 67.000 0.000 0.057 N NA
 2440605 2440606 SAL_2124 SAL_2125 deoC   TRUE 0.973 30.000 0.333 1.000 Y NA
 2440606 2440607 SAL_2125 SAL_2126     TRUE 0.962 33.000 0.333 0.001   NA
 2440607 2440608 SAL_2126 SAL_2127   udp TRUE 0.771 21.000 0.015 1.000   NA
 2440610 2440611 SAL_2129 SAL_2130   groES TRUE 0.832 96.000 0.032 0.006 Y NA
 2440611 2440612 SAL_2130 SAL_2131 groES   FALSE 0.163 175.000 0.020 1.000   NA
 2440612 2440613 SAL_2131 SAL_2132     TRUE 0.921 5.000 0.143 1.000   NA
 2440613 2440614 SAL_2132 SAL_2133     FALSE 0.062 16.000 0.000 NA   NA
 2440614 2440615 SAL_2133 SAL_2134     FALSE 0.000 465.000 0.000 NA   NA
 2440616 2440617 SAL_2135 SAL_2136     FALSE 0.401 82.000 0.007 NA   NA
 2440618 2440619 SAL_2137 SAL_2138 nrdG   TRUE 0.769 73.000 0.159 1.000   NA
 2440619 2440620 SAL_2138 SAL_2139     TRUE 0.863 9.000 0.041 1.000   NA
 2440620 2440621 SAL_2139 SAL_2140     TRUE 0.839 13.000 0.041 NA   NA
 2440621 2440622 SAL_2140 SAL_2141   nrdD TRUE 0.606 75.000 0.062 NA   NA
 2440622 2440623 SAL_2141 SAL_2142 nrdD   FALSE 0.446 126.000 0.057 NA   NA
 2440623 2440624 SAL_2142 SAL_2143     FALSE 0.039 31.000 0.000 NA   NA
 2440624 2440625 SAL_2143 SAL_2144     FALSE 0.016 82.000 0.000 NA   NA
 2440625 2440626 SAL_2144 SAL_2145     TRUE 0.974 26.000 0.651 NA   NA
 2440626 2440627 SAL_2145 SAL_2146     TRUE 0.979 9.000 0.537 NA   NA
 2440627 2440628 SAL_2146 SAL_2147     FALSE 0.100 200.000 0.032 NA   NA
 2440628 2440629 SAL_2147 SAL_2148   recA FALSE 0.051 216.000 0.004 1.000   NA
 2440630 2440631 SAL_1198 SAL_1199 pta rluD TRUE 0.854 26.000 0.067 1.000 N NA
 2440631 2440632 SAL_1199 SAL_1200 rluD   TRUE 0.923 -3.000 0.150 1.000 N NA
 2440632 2440633 SAL_1200 SAL_1201     TRUE 0.974 -25.000 0.725 1.000   NA
 2440634 2440635 SAL_1202 SAL_1203   prsA FALSE 0.303 177.000 0.145 1.000   NA
 2440635 2440636 SAL_1203 SAL_1204 prsA   TRUE 0.956 4.000 0.089 1.000 Y NA
 2440636 2440637 SAL_1204 SAL_1205     TRUE 0.916 2.000 0.166 NA   NA
 2440637 2440638 SAL_1205 SAL_1206     FALSE 0.279 161.000 0.083 NA   NA
 2440639 2440640 SAL_1207 SAL_1208     FALSE 0.495 96.000 0.046 NA   NA
 2440640 2440641 SAL_1208 SAL_1209     FALSE 0.014 91.000 0.000 NA   NA
 2440641 2440642 SAL_1209 SAL_1210     FALSE 0.054 163.000 0.000 1.000 N NA
 2440642 2440643 SAL_1210 SAL_1211     TRUE 0.558 101.000 0.071 1.000   NA
 2440644 2440645 SAL_1212 SAL_1213     FALSE 0.382 54.000 0.000 0.065   NA
 2440646 2440647 SAL_1214 SAL_1215     FALSE 0.534 109.000 0.033 1.000 N NA
 2440647 2440648 SAL_1215 SAL_1216   potC TRUE 0.981 -7.000 0.253 0.054 Y NA
 2440648 2440649 SAL_1216 SAL_1217 potC potB TRUE 0.991 -3.000 0.492 0.054 Y NA
 2440649 2440650 SAL_1217 SAL_1218 potB potA TRUE 0.995 -16.000 0.928 0.054 Y NA
 2440650 2440651 SAL_1218 SAL_1219 potA murB TRUE 0.742 49.000 0.041 1.000 N NA
 2440651 2440652 SAL_1219 SAL_1220 murB folK FALSE 0.324 144.000 0.010 1.000 N NA
 2440652 2440653 SAL_1220 SAL_1221 folK folB TRUE 0.959 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 2440653 2440654 SAL_1221 SAL_1222 folB folP TRUE 0.953 2.000 0.094 1.000 Y NA
 2440654 2440655 SAL_1222 SAL_1223 folP folE TRUE 0.954 4.000 0.073 1.000 Y NA
 2440655 2440656 SAL_1223 SAL_1224 folE folC TRUE 0.940 19.000 0.057 1.000 Y NA
 2440656 2440657 SAL_1224 SAL_1225 folC rarD FALSE 0.259 2.000 0.000 1.000   NA
 2440657 2440658 SAL_1225 SAL_1226 rarD thrB TRUE 0.661 -13.000 0.005 1.000   NA
 2440658 2440659 SAL_1226 SAL_1227 thrB   TRUE 0.938 2.000 0.036 1.000 Y NA
 2440661 2440662 SAL_1229 SAL_1230 opuD   FALSE 0.218 22.000 0.000 1.000   NA
 2440662 2440663 SAL_1230 SAL_1231     TRUE 0.973 33.000 0.750 NA   NA
 2440663 2440664 SAL_1231 SAL_1232     FALSE 0.069 5.000 0.000 NA   NA
 2440664 2440665 SAL_1232 SAL_1233   opuD FALSE 0.235 106.000 0.000 0.054   NA
 2440665 2440666 SAL_1233 SAL_1234 opuD   FALSE 0.070 10.000 0.000 NA   NA
 2440666 2440667 SAL_1234 SAL_1235     FALSE 0.007 143.000 0.000 NA   NA
 2440667 2440668 SAL_1235 SAL_1236     FALSE 0.018 74.000 0.000 NA   NA
 2440668 2440669 SAL_1236 SAL_1237     FALSE 0.012 108.000 0.000 NA   NA
 2440670 2440671 SAL_1238 SAL_1239     FALSE 0.031 -93.000 0.000 NA   NA
 2440671 2440672 SAL_1239 SAL_1240     FALSE 0.004 164.000 0.000 NA   NA
 2440672 2440673 SAL_1240 SAL_1241     FALSE 0.002 197.000 0.000 NA   NA
 2440673 2440674 SAL_1241 SAL_1242     TRUE 0.575 100.000 0.105 NA   NA
 2440675 2440676 SAL_1243 SAL_1244     FALSE 0.144 73.000 0.000 NA N NA
 2440676 2440677 SAL_1244 SAL_1245     FALSE 0.060 0.000 0.000 NA   NA
 2440677 2440678 SAL_1245 SAL_1246     FALSE 0.008 131.000 0.000 NA   NA
 2440678 2440679 SAL_1246 SAL_1247     FALSE 0.069 5.000 0.000 NA   NA
 2440679 2440680 SAL_1247 SAL_1248     FALSE 0.478 164.000 0.238 NA   NA
 2440680 2440681 SAL_1248 SAL_1249     FALSE 0.050 22.000 0.000 NA   NA
 2440681 2440682 SAL_1249 SAL_1250     FALSE 0.028 47.000 0.000 NA   NA
 2440682 2440683 SAL_1250 SAL_1251     TRUE 0.665 56.000 0.060 NA   NA
 2440683 2440684 SAL_1251 SAL_1252     TRUE 0.914 10.000 0.143 NA   NA
 2440684 2440685 SAL_1252 SAL_1253     FALSE 0.065 15.000 0.000 NA   NA
 2440685 2440686 SAL_1253 SAL_1254     FALSE 0.407 48.000 0.000 0.077   NA
 2440686 2440687 SAL_1254 SAL_1255   pcrA FALSE 0.002 318.000 0.000 1.000   NA
 2440687 2440688 SAL_1255 SAL_1256 pcrA   FALSE 0.097 106.000 0.000 NA N NA
 2440688 2440689 SAL_1256 SAL_1257   uraA FALSE 0.070 133.000 0.000 NA N NA
 2440690 2440691 SAL_0816 SAL_0815 tuf ftsW FALSE 0.005 344.000 0.000 1.000 N NA
 2440691 2440692 SAL_0815 SAL_0814 ftsW ppc FALSE 0.521 106.000 0.028 1.000 N NA
 2440694 2440695 SAL_0812 SAL_0811     TRUE 0.914 -16.000 0.250 NA   NA
 2440698 2440699 SAL_0808 SAL_0807     TRUE 0.741 22.000 0.018 NA   NA
 2440702 2440703 SAL_0804 SAL_0803 ribH ribA TRUE 0.970 15.000 0.054 0.002 Y NA
 2440703 2440704 SAL_0803 SAL_0802 ribA ribE TRUE 0.940 18.000 0.051 1.000 Y NA
 2440704 2440705 SAL_0802 SAL_0801 ribE ribD TRUE 0.989 5.000 0.456 1.000 Y NA
 2440707 2440708 SAL_0799 SAL_0798     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 2440708 2440709 SAL_0798 SAL_0797     FALSE 0.009 127.000 0.000 NA   NA
 2440709 2440710 SAL_0797 SAL_0796     TRUE 0.872 130.000 0.156 0.002 Y NA
 2440712 2440713 SAL_0794 SAL_0793     TRUE 0.925 -3.000 0.206 NA   NA
 2440713 2440714 SAL_0793 SAL_0792   lgt TRUE 0.865 15.000 0.079 NA   NA
 2440714 2440715 SAL_0792 SAL_0791 lgt hprK TRUE 0.973 -7.000 0.494 1.000 N NA
 2440715 2440716 SAL_0791 SAL_0790 hprK   FALSE 0.011 116.000 0.000 NA   NA
 2440716 2440717 SAL_0790 SAL_0789     FALSE 0.036 -22.000 0.000 NA   NA
 2440717 2440718 SAL_0789 SAL_0788     TRUE 0.570 81.000 0.051 NA   NA
 2440718 2440719 SAL_0788 SAL_0787   tex TRUE 0.881 -55.000 0.215 NA   NA
 2440719 2440720 SAL_0787 SAL_0786 tex   FALSE 0.346 -28.000 0.000 1.000 N NA
 2440721 2440722 SAL_0785 SAL_0784     TRUE 0.896 6.000 0.114 NA   NA
 2440722 2440723 SAL_0784 SAL_0783     TRUE 0.987 0.000 0.841 NA   NA
 2440724 2440725 SAL_0782 SAL_0781 ftsY   TRUE 0.760 0.000 0.007 1.000   NA
 2440725 2440726 SAL_0781 SAL_0780     TRUE 0.966 0.000 0.250 0.024   NA
 2440726 2440727 SAL_0780 SAL_0779     FALSE 0.070 91.000 0.000 1.000   NA
 2440727 2440728 SAL_0779 SAL_0778     FALSE 0.278 188.000 0.120 1.000 N NA
 2440728 2440729 SAL_0778 SAL_0777     FALSE 0.088 175.000 0.002 NA   NA
 2440729 2440730 SAL_0777 SAL_0776     TRUE 0.759 3.000 0.011 NA   NA
 2440730 2440731 SAL_0776 SAL_0775     TRUE 0.853 4.000 0.038 1.000   NA
 2440731 2440732 SAL_0775 SAL_0774   drrA TRUE 0.993 -7.000 0.597 0.019 Y NA
 2440733 2440734 SAL_0904 SAL_0903   map TRUE 0.966 2.000 0.373 1.000   NA
 2440734 2440735 SAL_0903 SAL_0902 map   TRUE 0.736 131.000 0.235 1.000 N NA
 2440735 2440736 SAL_0902 SAL_0901     TRUE 0.961 -7.000 0.342 1.000 N NA
 2440736 2440737 SAL_0901 SAL_0900   murA TRUE 0.651 84.000 0.052 1.000 N NA
 2440737 2440738 SAL_0900 SAL_0899 murA thiE FALSE 0.123 127.000 0.000 1.000 N NA
 2440738 2440739 SAL_0899 SAL_0898 thiE thiM TRUE 0.971 14.000 0.061 0.003 Y NA
 2440739 2440740 SAL_0898 SAL_0897 thiM thiD TRUE 0.963 2.000 0.032 0.003 Y NA
 2440740 2440741 SAL_0897 SAL_0896 thiD   TRUE 0.970 25.000 0.478 1.000 N NA
 2440741 2440742 SAL_0896 SAL_0895     FALSE 0.079 84.000 0.000 1.000   NA
 2440742 2440743 SAL_0895 SAL_0894     FALSE 0.154 -40.000 0.000 1.000   NA
 2440743 2440744 SAL_0894 SAL_0893     FALSE 0.067 4.000 0.000 NA   NA
 2440744 2440745 SAL_0893 SAL_0892     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2440745 2440746 SAL_0892 SAL_0891     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 2440746 2440747 SAL_0891 SAL_0890     FALSE 0.004 160.000 0.000 NA   NA
 2440747 2440748 SAL_0890 SAL_0889     FALSE 0.019 67.000 0.000 NA   NA
 2440748 2440749 SAL_0889 SAL_0888   metK FALSE 0.000 521.000 0.000 NA   NA
 2440751 2440752 SAL_0886 SAL_0885   dnaX TRUE 0.562 89.000 0.067 NA   NA
 2440752 2440753 SAL_0885 SAL_0884 dnaX   TRUE 0.839 0.000 0.030 NA N NA
 2440753 2440754 SAL_0884 SAL_0883   udk FALSE 0.122 87.000 0.000 NA N NA
 2440756 2440757 SAL_0881 SAL_0880     FALSE 0.393 140.000 0.028 1.000 N NA
 2440757 2440758 SAL_0880 SAL_0879   ptsI FALSE 0.366 150.000 0.035 1.000 N NA
 2440758 2440759 SAL_0879 SAL_0878 ptsI   TRUE 0.971 5.000 0.240 0.016   NA
 2440759 2440760 SAL_0878 SAL_0877     TRUE 0.808 35.000 0.015 0.016   NA
 2440761 2440762 SAL_0876 SAL_0875 nrdH   TRUE 0.938 78.000 0.562 1.000 N NA
 2440762 2440763 SAL_0875 SAL_0874     TRUE 0.791 203.000 0.500 0.002 Y NA
 2440763 2440764 SAL_0874 SAL_0873     FALSE 0.002 196.000 0.000 NA   NA
 2440764 2440765 SAL_0873 SAL_0872     TRUE 0.654 -28.000 0.016 NA   NA
 2440766 2440767 SAL_0871 SAL_0870     TRUE 0.889 3.000 0.115 NA   NA
 2440767 2440768 SAL_0870 SAL_0869     TRUE 0.945 45.000 0.500 NA   NA
 2440768 2440769 SAL_0869 SAL_0868     FALSE 0.032 -70.000 0.000 NA   NA
 2440769 2440770 SAL_0868 SAL_0867     FALSE 0.000 446.000 0.000 NA   NA
 2440770 2440771 SAL_0867 SAL_0866     FALSE 0.015 88.000 0.000 NA   NA
 2440771 2440772 SAL_0866 SAL_0865   alaS FALSE 0.016 82.000 0.000 NA   NA
 2440772 2440773 SAL_0865 SAL_0864 alaS   TRUE 0.722 16.000 0.006 NA   NA
 2440773 2440774 SAL_0864 SAL_0863     FALSE 0.001 242.000 0.000 NA   NA
 2440774 2440775 SAL_0863 SAL_0862     FALSE 0.524 61.000 0.008 1.000   NA
 2440775 2440776 SAL_0862 SAL_0861     FALSE 0.393 110.000 0.012 1.000   NA
 2440776 2440777 SAL_0861 SAL_0860   pepF FALSE 0.010 195.000 0.000 1.000   NA
 2440777 2440778 SAL_0860 SAL_0859 pepF   TRUE 0.932 16.000 0.204 NA   NA
 2440778 2440779 SAL_0859 SAL_0858     TRUE 0.678 52.000 0.056 NA   NA
 2440782 2440783 SAL_0935 SAL_0936     TRUE 0.948 -10.000 0.070 0.066 Y NA
 2440783 2440784 SAL_0936 SAL_0937     FALSE 0.522 13.000 0.000 1.000 N NA
 2440786 2440787 SAL_0939 SAL_0940   pdhA FALSE 0.031 149.000 0.000 1.000   NA
 2440787 2440788 SAL_0940 SAL_0941 pdhA   TRUE 0.846 213.000 0.769 0.001 Y NA
 2440788 2440789 SAL_0941 SAL_0942   aceF TRUE 0.775 127.000 0.051 0.062 Y NA
 2440789 2440790 SAL_0942 SAL_0943 aceF   TRUE 0.871 60.000 0.091 1.000 Y NA
 2440790 2440791 SAL_0943 SAL_0944     TRUE 0.777 98.000 0.200 1.000 N NA
 2440792 2440793 SAL_0945 SAL_0946     TRUE 0.986 0.000 0.796 1.000   NA
 2440796 2440797 SAL_0949 SAL_0950   glmM TRUE 0.784 54.000 0.150 NA   NA
 2440797 2440798 SAL_0950 SAL_0951 glmM   FALSE 0.010 123.000 0.000 NA   NA
 2440798 2440799 SAL_0951 SAL_0952     TRUE 0.869 25.000 0.143 NA   NA
 2440799 2440800 SAL_0952 SAL_0953     FALSE 0.014 92.000 0.000 NA   NA
 2440800 2440801 SAL_0953 SAL_0954     TRUE 0.898 4.000 0.060 1.000 N NA
 2440801 2440802 SAL_0954 SAL_0955     TRUE 0.885 1.000 0.055 1.000 N NA
 2440802 2440803 SAL_0955 SAL_0956     TRUE 0.923 -25.000 0.330 NA   NA
 2440803 2440804 SAL_0956 SAL_0957     FALSE 0.000 389.000 0.000 NA   NA
 2440804 2440805 SAL_0957 SAL_0958   cas1 TRUE 0.977 2.000 0.546 NA   NA
 2440805 2440806 SAL_0958 SAL_0959 cas1 cas2 TRUE 0.990 12.000 0.876 NA   NA
 2440806 2440807 SAL_0959 SAL_0960 cas2   TRUE 0.920 -13.000 0.253 NA   NA
 11483814 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1962.000 0.000 NA   NA
 11626177 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1962.000 0.000 NA   NA
 11768569 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1962.000 0.000 NA   NA
 11483815 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1998.000 0.000 NA   NA
 11626178 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1998.000 0.000 NA   NA
 11768570 2440804   SAL_0957     FALSE NA 1998.000 0.000 NA   NA
 11483816 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11626179 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11768571 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2028.000 0.000 NA   NA
 11483817 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11626180 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11768572 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2064.000 0.000 NA   NA
 11483818 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2094.000 0.000 NA   NA
 11626181 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2094.000 0.000 NA   NA
 11768573 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2094.000 0.000 NA   NA
 11483819 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11626182 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11768574 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11483820 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11626183 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11768575 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2160.000 0.000 NA   NA
 11483821 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2196.000 0.000 NA   NA
 11626184 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2196.000 0.000 NA   NA
 11768576 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2196.000 0.000 NA   NA
 2440808 2440809 SAL_0961 SAL_0962     FALSE 0.031 -211.000 0.000 NA   NA
 11483822 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11626185 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11768577 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11483823 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11626186 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11768578 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2262.000 0.000 NA   NA
 11483824 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2292.000 0.000 NA   NA
 11626187 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2292.000 0.000 NA   NA
 11768579 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2292.000 0.000 NA   NA
 11483825 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11626188 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11768580 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11483826 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2358.000 0.000 NA   NA
 11626189 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2358.000 0.000 NA   NA
 11768581 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2358.000 0.000 NA   NA
 11483827 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2394.000 0.000 NA   NA
 11626190 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2394.000 0.000 NA   NA
 11768582 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2394.000 0.000 NA   NA
 11483828 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2424.000 0.000 NA   NA
 11626191 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2424.000 0.000 NA   NA
 11768583 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2424.000 0.000 NA   NA
 11483829 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11626192 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11768584 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11483830 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2490.000 0.000 NA   NA
 11626193 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2490.000 0.000 NA   NA
 11768585 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2490.000 0.000 NA   NA
 11483831 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11626194 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11768586 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11483832 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11626195 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11768587 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11483833 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11626196 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11768588 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11483834 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11626197 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11768589 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2622.000 0.000 NA   NA
 11483835 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2658.000 0.000 NA   NA
 11626198 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2658.000 0.000 NA   NA
 11768590 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2658.000 0.000 NA   NA
 11483836 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11626199 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11768591 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11483837 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2724.000 0.000 NA   NA
 11626200 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2724.000 0.000 NA   NA
 11768592 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2724.000 0.000 NA   NA
 11483838 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11626201 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11768593 2440804   SAL_0957     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 2440810 2440811 SAL_0963 SAL_0964     FALSE 0.004 159.000 0.000 NA   NA
 2440811 2440812 SAL_0964 SAL_0965   lepA FALSE 0.309 136.000 0.003 1.000 N NA
 2440812 2440813 SAL_0965 SAL_0966 lepA   FALSE 0.004 246.000 0.000 1.000   NA
 2440814 2440815 SAL_2151 SAL_2152     FALSE 0.000 321.000 0.000 NA   NA
 2440815 2440816 SAL_2152 SAL_2153     FALSE 0.002 202.000 0.000 NA   NA
 2440816 2440817 SAL_2153 SAL_2154     TRUE 0.973 0.000 0.500 NA   NA
 2440817 2440818 SAL_2154 SAL_2155     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 2440818 2440819 SAL_2155 SAL_2156     FALSE 0.455 206.000 0.500 NA   NA
 2440819 2440820 SAL_2156 SAL_2157     TRUE 0.970 -7.000 0.500 1.000   NA
 2440820 2440821 SAL_2157 SAL_2158     TRUE 0.844 90.000 0.333 1.000   NA
 2440821 2440822 SAL_2158 SAL_2159     FALSE 0.002 348.000 0.000 1.000   NA
 2440822 2440823 SAL_2159 SAL_2160     FALSE 0.077 85.000 0.000 1.000   NA
 2440823 2440824 SAL_2160 SAL_2161     TRUE 0.982 -16.000 0.492 1.000 Y NA
 2440825 2440826 SAL_2162 SAL_2163   arcC FALSE 0.067 94.000 0.000 1.000   NA
 2440826 2440827 SAL_2163 SAL_2164 arcC argF TRUE 0.840 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2440828 2440829 SAL_2165 SAL_2166     FALSE 0.238 -3.000 0.000 1.000   NA
 2440829 2440830 SAL_2166 SAL_2167   proV FALSE 0.016 222.000 0.000 1.000 N NA
 2440830 2440831 SAL_2167 SAL_2168 proV proX TRUE 0.984 3.000 0.382 0.004 N NA
 2440832 2440833 SAL_2169 SAL_2170   est TRUE 0.773 23.000 0.035 NA   NA
 2440833 2440834 SAL_2170 SAL_2171 est   FALSE 0.008 134.000 0.000 NA   NA
 2440834 2440835 SAL_2171 SAL_2172     FALSE 0.477 67.000 0.012 NA   NA
 2440837 2440838 SAL_2174 SAL_2175   rpsD FALSE 0.001 244.000 0.000 NA   NA
 2440838 2440839 SAL_2175 SAL_2176 rpsD   FALSE 0.000 330.000 0.000 NA   NA
 2440839 2440840 SAL_2176 SAL_2177   dnaC TRUE 0.858 12.000 0.053 NA   NA
 2440840 2440841 SAL_2177 SAL_2178 dnaC rplI TRUE 0.823 43.000 0.100 1.000 N NA
 2440841 2440842 SAL_2178 SAL_2179 rplI   TRUE 0.927 6.000 0.119 1.000 N NA
 2440842 2440843 SAL_2179 SAL_2180   gidA TRUE 0.590 67.000 0.011 1.000 N NA
 2440843 2440844 SAL_2180 SAL_2181 gidA   FALSE 0.029 170.000 0.000 NA N NA
 2440844 2440845 SAL_2181 SAL_2182   trmU TRUE 0.666 32.000 0.005 NA N NA
 2440846 2440847 SAL_2183 SAL_2184 sdhB sdhA TRUE 0.987 15.000 0.221 0.001 Y NA
 2440848 2440849 SAL_2185 SAL_2186   lytN FALSE 0.042 133.000 0.000 1.000   NA
 2440849 2440850 SAL_2186 SAL_2187 lytN   FALSE 0.006 216.000 0.000 1.000   NA
 2440850 2440851 SAL_2187 SAL_2188     TRUE 0.953 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 2440851 2440852 SAL_2188 SAL_2189     TRUE 0.992 -24.000 0.713 0.034 Y NA
 2440852 2440853 SAL_2189 SAL_2190   pgsA TRUE 0.837 0.000 0.015 1.000 N NA
 2440853 2440854 SAL_2190 SAL_2191 pgsA   FALSE 0.053 123.000 0.000 1.000   NA
 2440854 2440855 SAL_2191 SAL_2192     TRUE 0.990 2.000 0.872 1.000   NA
 2440856 2440857 SAL_0984 SAL_0985     FALSE 0.062 100.000 0.000 1.000   NA
 2440857 2440858 SAL_0985 SAL_0986     TRUE 0.803 9.000 0.010 1.000   NA
 2440858 2440859 SAL_0986 SAL_0987     FALSE 0.252 0.000 0.000 1.000   NA
 2440859 2440860 SAL_0987 SAL_0988     FALSE 0.077 152.000 0.000 1.000 N NA
 2440860 2440861 SAL_0988 SAL_0989     FALSE 0.252 0.000 0.000 1.000   NA
 2440864 2440865 SAL_0992 SAL_0993     TRUE 0.974 12.000 0.471 NA   NA
 2440865 2440866 SAL_0993 SAL_0994     TRUE 0.973 1.000 0.412 1.000 N NA
 2440867 2440868 SAL_0995 SAL_0996 dnaE   TRUE 0.717 81.000 0.098 1.000 N NA
 2440868 2440869 SAL_0996 SAL_0997   pyk FALSE 0.434 253.000 0.261 0.006 Y NA
 2440869 2440870 SAL_0997 SAL_0998 pyk   FALSE 0.245 171.000 0.072 1.000   NA
 2440870 2440871 SAL_0998 SAL_0999     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 2440871 2440872 SAL_0999 SAL_1000   glmS FALSE 0.012 109.000 0.000 NA   NA
 2440872 2440873 SAL_1000 SAL_1001 glmS phnA FALSE 0.210 162.000 0.008 1.000 N NA
 2440873 2440874 SAL_1001 SAL_1002 phnA glnP FALSE 0.399 135.000 0.018 1.000 N NA
 2440874 2440875 SAL_1002 SAL_1003 glnP   TRUE 0.966 11.000 0.130 1.000 Y NA
 2440875 2440876 SAL_1003 SAL_1004     TRUE 0.936 -58.000 0.154 1.000 Y NA
 2440877 2440878 SAL_1005 SAL_1006 rpsT   TRUE 0.635 60.000 0.014 1.000 N NA
 2440879 2440880 SAL_1007 SAL_1008   cdd FALSE 0.007 299.000 0.000 1.000 N NA
 2440880 2440881 SAL_1008 SAL_1009 cdd tmbC TRUE 0.874 65.000 0.300 1.000   NA
 2440881 2440882 SAL_1009 SAL_1010 tmbC rbsA1 FALSE 0.342 145.000 0.036 1.000   NA
 2440882 2440883 SAL_1010 SAL_1011 rbsA1 rbsC1 TRUE 0.964 -7.000 0.438 1.000   NA
 2440883 2440884 SAL_1011 SAL_1012 rbsC1 rbsC2 TRUE 0.989 2.000 0.720 0.050   NA
 2440884 2440885 SAL_1012 SAL_1013 rbsC2   FALSE 0.008 206.000 0.000 1.000   NA
 2440887 2440888 SAL_1015 SAL_1016 gyrA   TRUE 0.831 7.000 0.013 NA N NA
 2440888 2440889 SAL_1016 SAL_1017     TRUE 0.857 16.000 0.039 NA N NA
 2440889 2440890 SAL_1017 SAL_1018     FALSE 0.234 154.000 0.024 NA   NA
 2440892 2440893 SAL_1193 SAL_1192     FALSE 0.040 135.000 0.000 1.000   NA
 2440895 2440896 SAL_1190 SAL_1189   guaC FALSE 0.008 203.000 0.000 1.000   NA
 2440896 2440897 SAL_1189 SAL_1188 guaC xpt FALSE 0.101 255.000 0.009 1.000 Y NA
 2440897 2440898 SAL_1188 SAL_1187 xpt pbuX TRUE 0.940 0.000 0.046 1.000 Y NA
 2440899 2440900 SAL_1186 SAL_1185     FALSE 0.012 99.000 0.000 NA   NA
 2440900 2440901 SAL_1185 SAL_1184     TRUE 0.973 24.000 0.588 NA   NA
 2440901 2440902 SAL_1184 SAL_1183   apbE TRUE 0.939 18.000 0.243 NA   NA
 2440902 2440903 SAL_1183 SAL_1182 apbE   FALSE 0.375 176.000 0.189 1.000   NA
 2440904 2440905 SAL_1181 SAL_1180   prfA TRUE 0.814 35.000 0.062 1.000 N NA
 2440905 2440906 SAL_1180 SAL_1179 prfA hemK TRUE 0.965 0.000 0.084 0.052 Y NA
 2440906 2440907 SAL_1179 SAL_1178 hemK   TRUE 0.908 -7.000 0.029 NA Y NA
 2440907 2440908 SAL_1178 SAL_1177   glyA FALSE 0.486 92.000 0.015 NA N NA
 2440908 2440909 SAL_1177 SAL_1176 glyA   TRUE 0.888 5.000 0.103 NA   NA
 2440909 2440910 SAL_1176 SAL_1175     TRUE 0.892 2.000 0.128 NA   NA
 2440910 2440911 SAL_1175 SAL_1174     TRUE 0.857 12.000 0.053 NA   NA
 2440911 2440912 SAL_1174 SAL_1173     TRUE 0.997 1.000 0.895 0.009 Y NA
 2440913 2440914 SAL_1172 SAL_1171 manB   FALSE 0.547 110.000 0.098 NA   NA
 2440914 2440915 SAL_1171 SAL_1170     TRUE 0.618 46.000 0.019 NA   NA
 2440915 2440916 SAL_1170 SAL_1169   dfp TRUE 0.874 -7.000 0.013 0.001   NA
 2440917 2440918 SAL_1168 SAL_1167   noxB2 TRUE 0.814 -7.000 0.019 1.000 N NA
 2440918 2440919 SAL_1167 SAL_1166 noxB2   TRUE 0.950 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 2440919 2440920 SAL_1166 SAL_1165   gcvH TRUE 0.975 29.000 0.571 1.000 N NA
 2440920 2440921 SAL_1165 SAL_1164 gcvH   TRUE 0.850 -7.000 0.107 NA   NA
 2440921 2440922 SAL_1164 SAL_1163     TRUE 0.910 -31.000 0.286 NA   NA
 2440922 2440923 SAL_1163 SAL_1162     TRUE 0.933 27.000 0.250 NA N NA
 2440923 2440924 SAL_1162 SAL_1161   fhs TRUE 0.799 89.000 0.200 1.000 N NA
 2440924 2440925 SAL_1161 SAL_1160 fhs cls TRUE 0.616 119.000 0.094 1.000 N NA
 2440925 2440926 SAL_1160 SAL_1159 cls   FALSE 0.001 743.000 0.000 1.000   NA
 2440927 2440928 SAL_0345 SAL_0346     TRUE 0.817 13.000 0.029 NA   NA
 2440930 2440931 SAL_0348 SAL_0349     FALSE 0.028 47.000 0.000 NA   NA
 2440931 2440932 SAL_0349 SAL_0350     FALSE 0.037 -19.000 0.000 NA   NA
 2440932 2440933 SAL_0350 SAL_0351     FALSE 0.368 -19.000 0.000 1.000 N NA
 2440933 2440934 SAL_0351 SAL_0352     TRUE 0.997 2.000 0.857 0.018 Y NA
 2440934 2440935 SAL_0352 SAL_0353     FALSE 0.026 50.000 0.000 NA   NA
 2440935 2440936 SAL_0353 SAL_0354     FALSE 0.004 167.000 0.000 NA   NA
 2440936 2440937 SAL_0354 SAL_0355     TRUE 0.972 23.000 0.471 1.000 N NA
 2440937 2440938 SAL_0355 SAL_0356   priA TRUE 0.731 74.000 0.032 0.062 N NA
 2440938 2440939 SAL_0356 SAL_0357 priA fmt TRUE 0.767 47.000 0.052 1.000 N NA
 2440939 2440940 SAL_0357 SAL_0358 fmt sun TRUE 0.969 32.000 0.305 1.000 Y NA
 2440940 2440941 SAL_0358 SAL_0359 sun   TRUE 0.815 38.000 0.074 1.000 N NA
 2440941 2440942 SAL_0359 SAL_0360     TRUE 0.978 66.000 0.704 1.000 Y NA
 2440944 2440945 SAL_0362 SAL_0363     TRUE 0.981 -3.000 0.679 NA   NA
 2440945 2440946 SAL_0363 SAL_0364   vraR TRUE 0.996 -7.000 0.853 0.017 Y NA
 2440946 2440947 SAL_0364 SAL_0365 vraR   TRUE 0.853 42.000 0.164 1.000   NA
 2440947 2440948 SAL_0365 SAL_0366     TRUE 0.874 -16.000 0.151 1.000   NA
 2440950 2440951 SAL_0368 SAL_0369     TRUE 0.894 119.000 0.188 0.040 Y NA
 2440951 2440952 SAL_0369 SAL_0370     FALSE 0.179 204.000 0.091 1.000 N NA
 2440952 2440953 SAL_0370 SAL_0371   celA TRUE 0.997 17.000 0.889 0.015 Y NA
 2440953 2440954 SAL_0371 SAL_0372 celA celB TRUE 0.997 2.000 0.889 0.015 Y NA
 2440954 2440955 SAL_0372 SAL_0373 celB   FALSE 0.309 181.000 0.132 1.000 N NA
 2440955 2440956 SAL_0373 SAL_0374     TRUE 0.975 10.000 0.368 1.000 N NA
 2440956 2440957 SAL_0374 SAL_0375   gldA TRUE 0.849 68.000 0.211 1.000 N NA
 2440958 2440959 SAL_0376 SAL_0377 cysK   FALSE 0.518 91.000 0.033 1.000   NA
 2440960 2440961 SAL_0378 SAL_0379 comFA   TRUE 0.902 0.000 0.130 1.000   NA
 2440961 2440962 SAL_0379 SAL_0380     TRUE 0.621 77.000 0.080 NA   NA
 2440963 2440964 SAL_1500 SAL_1499     FALSE 0.049 -7.000 0.000 NA   NA
 2440964 2440965 SAL_1499 SAL_1498     FALSE 0.018 70.000 0.000 NA   NA
 2440965 2440966 SAL_1498 SAL_1497     FALSE 0.387 3.000 0.000 NA N NA
 2440966 2440967 SAL_1497 SAL_1496     FALSE 0.507 3.000 0.000 1.000 N NA
 2440967 2440968 SAL_1496 SAL_1495     TRUE 0.797 2.000 0.000 NA Y NA
 2440968 2440969 SAL_1495 SAL_1494     TRUE 0.905 30.000 0.222 NA   NA
 2440969 2440970 SAL_1494 SAL_1492     FALSE 0.062 2.000 0.000 NA   NA
 2440972 2440973 SAL_1491 SAL_1490     FALSE 0.238 -3.000 0.000 1.000   NA
 2440973 2440974 SAL_1490 SAL_1489     FALSE 0.196 -10.000 0.000 1.000   NA
 2440976 2440977 SAL_1487 SAL_1486     FALSE 0.240 130.000 0.000 0.008   NA
 2440979 2440980 SAL_1484 SAL_1483     TRUE 0.995 0.000 0.909 NA Y NA
 2440980 2440981 SAL_1483 SAL_1482     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2440981 2440982 SAL_1482 SAL_1481     FALSE 0.000 302.000 0.000 NA   NA
 2440982 2440983 SAL_1481 SAL_1480     TRUE 0.966 -19.000 0.600 NA   NA
 2440983 2440984 SAL_1480 SAL_1479     FALSE 0.551 93.000 0.050 1.000   NA
 2440984 2440985 SAL_1479 SAL_1478     TRUE 0.959 -7.000 0.408 1.000   NA
 2440985 2440986 SAL_1478 SAL_1477     FALSE 0.127 180.000 0.023 NA   NA
 2440986 2440987 SAL_1477 SAL_1476     FALSE 0.540 68.000 0.028 NA   NA
 2440987 2440988 SAL_1476 SAL_1475     FALSE 0.502 117.000 0.023 1.000 N NA
 2440988 2440989 SAL_1475 SAL_1474     FALSE 0.535 60.000 0.015 NA   NA
 2440990 2440991 SAL_1473 SAL_1472     TRUE 0.996 -3.000 0.857 0.049 Y NA
 2440991 2440992 SAL_1472 SAL_1471     TRUE 0.971 16.000 0.179 1.000 Y NA
 2440992 2440993 SAL_1471 SAL_1470     TRUE 0.994 24.000 0.889 1.000 Y NA
 2440993 2440994 SAL_1470 SAL_1469   murE FALSE 0.387 155.000 0.062 1.000 N NA
 2440995 2440996 SAL_1468 SAL_1467   pepT FALSE 0.039 136.000 0.000 1.000   NA
 2440997 2440998 SAL_0220 SAL_0219     FALSE 0.179 -16.000 0.000 1.000   NA
 2440998 2440999 SAL_0219 SAL_0218   dppC TRUE 0.985 12.000 0.333 1.000 Y NA
 2440999 2441000 SAL_0218 SAL_0217 dppC   TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.049 Y NA
 2441000 2441001 SAL_0217 SAL_0216     TRUE 0.577 113.000 0.000 0.049 Y NA
 2441003 2441004 SAL_0214 SAL_0213     TRUE 0.989 2.000 0.869 1.000   NA
 2441004 2441005 SAL_0213 SAL_0212     FALSE 0.397 170.000 0.178 1.000   NA
 2441005 2441006 SAL_0212 SAL_0211     TRUE 0.989 -19.000 0.538 0.017 Y NA
 2441006 2441007 SAL_0211 SAL_0210     FALSE 0.191 27.000 0.000 1.000   NA
 2441007 2441008 SAL_0210 SAL_0209   ssbB FALSE 0.053 123.000 0.000 1.000   NA
 2441010 2441011 SAL_0207 SAL_0206 pheT   TRUE 0.912 33.000 0.239 1.000   NA
 2441011 2441012 SAL_0206 SAL_0205     TRUE 0.891 -3.000 0.140 NA   NA
 2441013 2441014 SAL_0204 SAL_0203     FALSE 0.002 185.000 0.000 NA   NA
 2441014 2441015 SAL_0203 SAL_0202   proC TRUE 0.665 70.000 0.041 1.000 N NA
 2441016 2441017 SAL_0201 SAL_0200     FALSE 0.019 69.000 0.000 NA   NA
 2441017 2441018 SAL_0200 SAL_0199     FALSE 0.031 41.000 0.000 NA   NA
 2441018 2441019 SAL_0199 SAL_0198     FALSE 0.022 59.000 0.000 NA   NA
 2441019 2441020 SAL_0198 SAL_0197   ackA FALSE 0.450 151.000 0.094 1.000 N NA
 2441020 2441021 SAL_0197 SAL_0196 ackA   TRUE 0.874 32.000 0.130 1.000 N NA
 2441021 2441022 SAL_0196 SAL_0195     FALSE 0.526 115.000 0.087 NA   NA
 2441022 2441023 SAL_0195 SAL_0194     TRUE 0.900 -22.000 0.232 NA   NA
 2441023 2441024 SAL_0194 SAL_0193     TRUE 0.810 83.000 0.250 NA   NA
 2441024 2441025 SAL_0193 SAL_0192     TRUE 0.973 -28.000 0.786 NA   NA
 2441025 2441026 SAL_0192 SAL_0191     TRUE 0.778 -3.000 0.000 NA Y NA
 2441026 2441027 SAL_0191 SAL_0190   gspE TRUE 0.927 89.000 0.639 1.000   NA
 2441027 2441028 SAL_0190 SAL_0189 gspE   FALSE 0.223 173.000 0.083 NA   NA
 2441028 2441029 SAL_0189 SAL_0188     FALSE 0.319 114.000 0.007 NA   NA
 2441029 2441030 SAL_0188 SAL_0187   rpoB TRUE 0.987 87.000 0.851 0.002 Y NA
 2441030 2441031 SAL_0187 SAL_0186 rpoB   FALSE 0.003 524.000 0.000 1.000 N NA
 2441034 2441035 SAL_1619 SAL_1620     TRUE 0.844 10.000 0.041 NA   NA
 2441035 2441036 SAL_1620 SAL_1621     TRUE 0.657 -93.000 0.025 NA   NA
 2441036 2441037 SAL_1621 SAL_1622   glmU TRUE 0.815 21.000 0.015 1.000 N NA
 2441037 2441038 SAL_1622 SAL_1623 glmU   FALSE 0.001 244.000 0.000 NA   NA
 2441038 2441039 SAL_1623 SAL_1624     TRUE 0.977 13.000 0.500 NA   NA
 2441039 2441040 SAL_1624 SAL_1625     FALSE 0.072 89.000 0.000 1.000   NA
 2441040 2441041 SAL_1625 SAL_1626     TRUE 0.812 -3.000 0.043 NA   NA
 2441041 2441042 SAL_1626 SAL_1627     FALSE 0.033 -39.000 0.000 NA   NA
 2441042 2441043 SAL_1627 SAL_1628     FALSE 0.046 239.000 0.022 NA   NA
 2441043 2441044 SAL_1628 SAL_1629     TRUE 0.978 -7.000 0.710 NA   NA
 2441044 2441045 SAL_1629 SAL_1630     FALSE 0.014 90.000 0.000 NA   NA
 2441045 2441046 SAL_1630 SAL_1631     FALSE 0.002 198.000 0.000 NA   NA
 2441046 2441047 SAL_1631 SAL_1632     FALSE 0.001 240.000 0.000 NA   NA
 2441047 2441048 SAL_1632 SAL_1633     FALSE 0.070 10.000 0.000 NA   NA
 2441048 2441049 SAL_1633 SAL_1634     FALSE 0.475 140.000 0.131 NA   NA
 2441049 2441050 SAL_1634 SAL_1635     TRUE 0.927 7.000 0.167 NA   NA
 2441050 2441051 SAL_1635 SAL_1636     TRUE 0.989 5.000 0.857 NA   NA
 2441051 2441052 SAL_1636 SAL_1637     TRUE 0.920 52.000 0.429 NA   NA
 2441052 2441053 SAL_1637 SAL_1638   brnQ FALSE 0.000 447.000 0.000 NA   NA
 2441053 2441054 SAL_1638 SAL_1639 brnQ metS FALSE 0.030 190.000 0.000 1.000 N NA
 2441057 2441058 SAL_1642 SAL_1643     TRUE 0.976 -16.000 0.714 1.000   NA
 2441058 2441059 SAL_1643 SAL_1644   xth FALSE 0.085 77.000 0.000 1.000   NA
 2441060 2441061 SAL_1645 SAL_1646   ogt TRUE 0.882 2.000 0.050 1.000 N NA
 2441061 2441062 SAL_1646 SAL_1647 ogt serA TRUE 0.625 56.000 0.009 1.000 N NA
 2441062 2441063 SAL_1647 SAL_1648 serA   TRUE 0.678 62.000 0.013 0.057   NA
 2441063 2441064 SAL_1648 SAL_1649   serC FALSE 0.517 69.000 0.012 1.000   NA
 2441066 2441067 SAL_1651 SAL_1652     FALSE 0.386 83.000 0.005 NA   NA
 2441067 2441068 SAL_1652 SAL_1653     TRUE 0.845 6.000 0.043 NA   NA
 2441068 2441069 SAL_1653 SAL_1654   dnaZX TRUE 0.736 31.000 0.038 NA   NA
 2441069 2441070 SAL_1654 SAL_1655 dnaZX tmk TRUE 0.953 20.000 0.254 1.000 N NA
 2441071 2441072 SAL_0650 SAL_0651     TRUE 0.835 -16.000 0.125 NA   NA
 2441072 2441073 SAL_0651 SAL_0652     FALSE 0.018 75.000 0.000 NA   NA
 2441073 2441074 SAL_0652 SAL_0653     FALSE 0.034 35.000 0.000 NA   NA
 2441074 2441075 SAL_0653 SAL_0654     FALSE 0.018 72.000 0.000 NA   NA
 2441075 2441076 SAL_0654 SAL_0655     TRUE 0.930 -19.000 0.333 NA   NA
 2441076 2441077 SAL_0655 SAL_0656     TRUE 0.961 22.000 0.444 NA   NA
 2441077 2441078 SAL_0656 SAL_0657     FALSE 0.067 4.000 0.000 NA   NA
 2441078 2441079 SAL_0657 SAL_0658     FALSE 0.031 -115.000 0.000 NA   NA
 2441079 2441080 SAL_0658 SAL_0659     FALSE 0.032 -91.000 0.000 NA   NA
 2441080 2441081 SAL_0659 SAL_0660     TRUE 0.920 46.000 0.375 NA   NA
 2441081 2441082 SAL_0660 SAL_0661     TRUE 0.956 -10.000 0.444 NA   NA
 2441082 2441083 SAL_0661 SAL_0662     TRUE 0.981 15.000 0.615 NA   NA
 2441083 2441084 SAL_0662 SAL_0663     TRUE 0.947 11.000 0.231 NA   NA
 2441084 2441085 SAL_0663 SAL_0664     FALSE 0.016 84.000 0.000 NA   NA
 2441085 2441086 SAL_0664 SAL_0665     FALSE 0.033 36.000 0.000 NA   NA
 2441086 2441087 SAL_0665 SAL_0666     FALSE 0.070 12.000 0.000 NA   NA
 2441087 2441088 SAL_0666 SAL_0667     TRUE 0.942 -9.000 0.333 NA   NA
 2441088 2441089 SAL_0667 SAL_0668     FALSE 0.061 1.000 0.000 NA   NA
 2441089 2441090 SAL_0668 SAL_0669     FALSE 0.031 41.000 0.000 NA   NA
 2441090 2441091 SAL_0669 SAL_0670     FALSE 0.035 -25.000 0.000 NA   NA
 2441091 2441092 SAL_0670 SAL_0671     FALSE 0.068 13.000 0.000 NA   NA
 2441092 2441093 SAL_0671 SAL_0672     FALSE 0.062 2.000 0.000 NA   NA
 2441093 2441094 SAL_0672 SAL_0673     FALSE 0.035 -25.000 0.000 NA   NA
 2441094 2441095 SAL_0673 SAL_0674     FALSE 0.000 333.000 0.000 NA   NA
 2441095 2441096 SAL_0674 SAL_0675     FALSE 0.012 104.000 0.000 NA   NA
 2441100 2441101 SAL_0679 SAL_0680     FALSE 0.004 162.000 0.000 NA   NA
 2441101 2441102 SAL_0680 SAL_0681     FALSE 0.050 22.000 0.000 NA   NA
 2441102 2441103 SAL_0681 SAL_0682     FALSE 0.255 126.000 0.000 0.011   NA
 2441105 2441106 SAL_0684 SAL_0685     TRUE 0.993 10.000 0.917 1.000 N NA
 2441106 2441107 SAL_0685 SAL_0686     TRUE 0.981 0.000 0.542 1.000 N NA
 2441107 2441108 SAL_0686 SAL_0687   rrp2 TRUE 0.859 97.000 0.409 1.000   NA
 2441110 2441111 SAL_0769 SAL_0768 glnP glnP TRUE 0.998 12.000 0.947 0.011 Y NA
 2441112 2441113 SAL_0767 SAL_0766     FALSE 0.004 167.000 0.000 NA   NA
 2441113 2441114 SAL_0766 SAL_0765     FALSE 0.013 98.000 0.000 NA   NA
 2441114 2441115 SAL_0765 SAL_0764   thrS FALSE 0.012 240.000 0.000 1.000 N NA
 2441115 2441116 SAL_0764 SAL_0763 thrS   FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 2441116 2441117 SAL_0763 SAL_0762     TRUE 0.991 2.000 0.413 0.010 Y NA
 2441117 2441118 SAL_0762 SAL_0761     TRUE 0.756 45.000 0.037 1.000 N NA
 2441118 2441119 SAL_0761 SAL_0760   ccpA FALSE 0.477 131.000 0.041 1.000 N NA
 2441121 2441122 SAL_0758 SAL_0757     TRUE 0.786 16.000 0.012 1.000   NA
 2441122 2441123 SAL_0757 SAL_0756     FALSE 0.404 153.000 0.035 0.056   NA
 2441123 2441124 SAL_0756 SAL_0755     TRUE 0.838 124.000 0.364 1.000 N NA
 2441124 2441125 SAL_0755 SAL_0754   uxaC TRUE 0.994 18.000 0.533 0.001 Y NA
 2441125 2441126 SAL_0754 SAL_0753 uxaC   TRUE 0.988 17.000 0.467 1.000 Y NA
 2441126 2441127 SAL_0753 SAL_0752     TRUE 0.913 117.000 0.583 1.000 N NA
 2441127 2441128 SAL_0752 SAL_0751     TRUE 0.951 29.000 0.333 1.000 N NA
 2441128 2441129 SAL_0751 SAL_0750     TRUE 0.816 17.000 0.000 1.000 Y NA
 2441129 2441130 SAL_0750 SAL_0749     FALSE 0.540 67.000 0.000 NA Y NA
 2441130 2441131 SAL_0749 SAL_0748     FALSE 0.022 58.000 0.000 NA   NA
 2441131 2441132 SAL_0748 SAL_0747     FALSE 0.001 206.000 0.000 NA   NA
 2441132 2441133 SAL_0747 SAL_0746     TRUE 0.928 14.000 0.158 1.000   NA
 2441134 2441135 SAL_0745 SAL_0744     FALSE 0.032 -81.000 0.000 NA   NA
 2441136 2441137 SAL_0743 SAL_0742     FALSE 0.004 164.000 0.000 NA   NA
 2441137 2441138 SAL_0742 SAL_0741     TRUE 0.880 -3.000 0.127 NA   NA
 2441140 2441141 SAL_1515 SAL_1516   malQ TRUE 0.989 12.000 0.289 0.019 Y NA
 2441141 2441142 SAL_1516 SAL_1517 malQ   TRUE 0.899 121.000 0.538 1.000 N NA
 2441143 2441144 SAL_1518 SAL_1519   malF TRUE 0.975 98.000 0.690 0.047 Y NA
 2441144 2441145 SAL_1519 SAL_1520 malF malG TRUE 0.996 0.000 0.793 0.047 Y NA
 2441145 2441146 SAL_1520 SAL_1521 malG   FALSE 0.040 231.000 0.000 0.047 N NA
 2441147 2441148 SAL_1522 SAL_1523     FALSE 0.016 84.000 0.000 NA   NA
 2441148 2441149 SAL_1523 SAL_1524     FALSE 0.070 11.000 0.000 NA   NA
 2441149 2441150 SAL_1524 SAL_1525     TRUE 0.911 -7.000 0.200 NA   NA
 2441150 2441151 SAL_1525 SAL_1526   secA FALSE 0.516 14.000 0.000 1.000 N NA
 2441151 2441152 SAL_1526 SAL_1527 secA   FALSE 0.041 -13.000 0.000 NA   NA
 2441152 2441153 SAL_1527 SAL_1528     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441153 2441154 SAL_1528 SAL_1529     FALSE 0.070 7.000 0.000 NA   NA
 2441154 2441155 SAL_1529 SAL_1530   secY TRUE 0.721 0.000 0.007 NA   NA
 2441155 2441156 SAL_1530 SAL_1531 secY   FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 2441156 2441157 SAL_1531 SAL_1532     FALSE 0.021 61.000 0.000 NA   NA
 2441157 2441158 SAL_1532 SAL_1533     FALSE 0.037 -19.000 0.000 NA   NA
 2441158 2441159 SAL_1533 SAL_1534     TRUE 0.865 -10.000 0.000 0.005 Y NA
 2441159 2441160 SAL_1534 SAL_1535     TRUE 0.892 -3.000 0.000 0.005 Y NA
 2441160 2441161 SAL_1535 SAL_1536     FALSE 0.071 9.000 0.000 NA   NA
 2441161 2441162 SAL_1536 SAL_1537     FALSE 0.000 331.000 0.000 NA   NA
 2441164 2441165 SAL_0548 SAL_0547     TRUE 0.713 12.000 0.002 NA   NA
 2441165 2441166 SAL_0547 SAL_0546     TRUE 0.710 6.000 0.002 NA   NA
 2441166 2441167 SAL_0546 SAL_0545   ftsA TRUE 0.985 22.000 0.460 1.000 Y NA
 2441167 2441168 SAL_0545 SAL_0544 ftsA   FALSE 0.210 273.000 0.389 NA N NA
 2441168 2441169 SAL_0544 SAL_0543     TRUE 0.948 4.000 0.072 NA Y NA
 2441169 2441170 SAL_0543 SAL_0542   murD TRUE 0.949 3.000 0.060 1.000 Y NA
 2441170 2441171 SAL_0542 SAL_0541 murD   FALSE 0.259 130.000 0.006 NA   NA
 2441171 2441172 SAL_0541 SAL_0540   typA TRUE 0.603 45.000 0.015 NA   NA
 2441172 2441173 SAL_0540 SAL_0539 typA   FALSE 0.046 232.000 0.003 NA N NA
 2441173 2441174 SAL_0539 SAL_0538     TRUE 0.892 12.000 0.064 NA N NA
 2441174 2441175 SAL_0538 SAL_0537     TRUE 0.969 -3.000 0.496 NA   NA
 2441177 2441178 SAL_0535 SAL_0534 nth   FALSE 0.147 113.000 0.000 1.000 N NA
 2441180 2441181 SAL_0532 SAL_0531 atoB   TRUE 0.792 -10.000 0.058 NA   NA
 2441182 2441183 SAL_0530 SAL_0529 bioB   FALSE 0.061 1.000 0.000 NA   NA
 2441184 2441185 SAL_0528 SAL_0527 trpG   FALSE 0.121 128.000 0.000 1.000 N NA
 2441185 2441186 SAL_0527 SAL_0526     TRUE 0.996 -10.000 0.911 0.008 Y NA
 2441186 2441187 SAL_0526 SAL_0525     FALSE 0.291 196.000 0.045 NA Y NA
 2441187 2441188 SAL_0525 SAL_0524     TRUE 0.751 0.000 0.012 NA   NA
 2441188 2441189 SAL_0524 SAL_0523     TRUE 0.579 51.000 0.016 NA   NA
 2441189 2441190 SAL_0523 SAL_0522     TRUE 0.873 69.000 0.347 NA   NA
 2441190 2441191 SAL_0522 SAL_0521     TRUE 0.615 75.000 0.023 1.000 N NA
 2441191 2441192 SAL_0521 SAL_0520   coaD TRUE 0.843 -10.000 0.052 1.000 N NA
 2441192 2441193 SAL_0520 SAL_0519 coaD   FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441193 2441194 SAL_0519 SAL_0518     FALSE 0.070 12.000 0.000 NA   NA
 2441197 2441198 SAL_0856 SAL_0855     FALSE 0.373 84.000 0.005 NA   NA
 2441200 2441201 SAL_0853 SAL_0852 nagB   FALSE 0.338 151.000 0.071 NA   NA
 2441202 2441203 SAL_0851 SAL_0850 queA   FALSE 0.202 81.000 0.000 1.000 N NA
 2441204 2441205 SAL_0849 SAL_0848   gntP FALSE 0.061 101.000 0.000 1.000   NA
 2441205 2441206 SAL_0848 SAL_0847 gntP   TRUE 0.937 25.000 0.095 1.000 Y NA
 2441208 2441209 SAL_0845 SAL_0844     TRUE 0.981 17.000 0.318 1.000 Y NA
 2441209 2441210 SAL_0844 SAL_0843     TRUE 0.939 -7.000 0.259 1.000   NA
 2441210 2441211 SAL_0843 SAL_0842     FALSE 0.002 338.000 0.000 1.000   NA
 2441211 2441212 SAL_0842 SAL_0841     TRUE 0.563 80.000 0.012 1.000 N NA
 2441212 2441213 SAL_0841 SAL_0840     FALSE 0.085 147.000 0.000 1.000 N NA
 2441215 2441216 SAL_0838 SAL_0837     TRUE 0.944 11.000 0.200 1.000   NA
 2441216 2441217 SAL_0837 SAL_0836     FALSE 0.231 126.000 0.000 0.021   NA
 2441217 2441218 SAL_0836 SAL_0835   comEA TRUE 0.881 -7.000 0.130 1.000   NA
 2441218 2441219 SAL_0835 SAL_0834 comEA   FALSE 0.499 98.000 0.014 1.000 N NA
 2441220 2441221 SAL_0833 SAL_0832     TRUE 0.924 -7.000 0.209 1.000   NA
 2441222 2441223 SAL_0831 SAL_0830     FALSE 0.008 235.000 0.000 NA N NA
 2441223 2441224 SAL_0830 SAL_0829     TRUE 0.984 16.000 0.400 NA Y NA
 2441225 2441226 SAL_1062 SAL_1061   pstC TRUE 0.858 46.000 0.206 NA   NA
 2441226 2441227 SAL_1061 SAL_1060 pstC pstA TRUE 0.996 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 2441227 2441228 SAL_1060 SAL_1059 pstA pstB TRUE 0.994 12.000 0.490 0.004 Y NA
 2441228 2441229 SAL_1059 SAL_1058 pstB pstB TRUE 0.776 213.000 0.542 0.002 Y NA
 2441229 2441230 SAL_1058 SAL_1057 pstB   TRUE 0.973 34.000 0.413 NA Y NA
 2441230 2441231 SAL_1057 SAL_1056     FALSE 0.417 146.000 0.067 NA N NA
 2441231 2441232 SAL_1056 SAL_1055     FALSE 0.327 162.000 0.061 1.000 N NA
 2441232 2441233 SAL_1055 SAL_1054     TRUE 0.987 -16.000 0.606 1.000 Y NA
 2441233 2441234 SAL_1054 SAL_1053     FALSE 0.058 113.000 0.000 1.000   NA
 2441234 2441235 SAL_1053 SAL_1052   ffh TRUE 0.912 18.000 0.151 1.000   NA
 2441235 2441236 SAL_1052 SAL_1051 ffh   FALSE 0.385 67.000 0.002 NA   NA
 2441236 2441237 SAL_1051 SAL_1050     TRUE 0.922 -10.000 0.250 NA   NA
 2441238 2441239 SAL_1049 SAL_1048     TRUE 0.621 -3.000 0.000 0.046   NA
 2441241 2441242 SAL_1046 SAL_1045     TRUE 0.994 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 2441242 2441243 SAL_1045 SAL_1044     TRUE 0.573 110.000 0.094 1.000   NA
 2441243 2441244 SAL_1044 SAL_1043     TRUE 0.989 2.000 0.855 1.000   NA
 2441244 2441245 SAL_1043 SAL_1042     TRUE 0.776 26.000 0.033 1.000   NA
 2441247 2441248 SAL_1040 SAL_1039     FALSE 0.008 133.000 0.000 NA   NA
 2441248 2441249 SAL_1039 SAL_1038   gid FALSE 0.085 78.000 0.000 1.000   NA
 2441249 2441250 SAL_1038 SAL_1037 gid   FALSE 0.147 114.000 0.000 1.000 N NA
 2441253 2441254 SAL_2194 SAL_2195   recF TRUE 0.942 3.000 0.209 1.000   NA
 2441255 2441256 SAL_2196 SAL_2197     FALSE 0.007 215.000 0.000 1.000   NA
 2441256 2441257 SAL_2197 SAL_2198   guaB FALSE 0.087 75.000 0.000 1.000   NA
 2441257 2441258 SAL_2198 SAL_2199 guaB   FALSE 0.067 157.000 0.000 1.000 N NA
 2441258 2441259 SAL_2199 SAL_2200     TRUE 0.761 10.000 0.000 0.039 N NA
 2441260 2441261 SAL_2201 SAL_2202   arcA FALSE 0.001 267.000 0.000 NA   NA
 2441261 2441262 SAL_2202 SAL_2203 arcA   TRUE 0.877 6.000 0.056 1.000   NA
 2441262 2441263 SAL_2203 SAL_2204   argF TRUE 0.891 16.000 0.104 1.000   NA
 2441263 2441264 SAL_2204 SAL_2205 argF arcD TRUE 0.835 63.000 0.042 1.000 Y NA
 2441264 2441265 SAL_2205 SAL_2206 arcD arcC TRUE 0.944 21.000 0.091 1.000 Y NA
 2441266 2441267 SAL_2207 SAL_2208 trpS   FALSE 0.058 108.000 0.000 1.000   NA
 2441268 2441269 SAL_2209 SAL_2210     FALSE 0.548 66.000 0.027 NA   NA
 2441269 2441270 SAL_2210 SAL_2211     FALSE 0.428 123.000 0.040 NA   NA
 2441272 2441273 SAL_2213 SAL_2214 htrA   FALSE 0.504 98.000 0.015 1.000 N NA
 2441273 2441274 SAL_2214 SAL_2215   dnaA FALSE 0.090 199.000 0.002 1.000 N NA
 2441274 2441275 SAL_2215 SAL_2216 dnaA dnaN TRUE 0.809 155.000 0.328 1.000 Y NA
 2441275 2441276 SAL_2216 SAL_2217 dnaN   TRUE 0.671 25.000 0.003 1.000   NA
 2441278 2441279 SAL_1835 SAL_1834 ispB   FALSE 0.028 46.000 0.000 NA   NA
 2441279 2441280 SAL_1834 SAL_1833     TRUE 0.853 4.000 0.054 NA   NA
 2441280 2441281 SAL_1833 SAL_1832     TRUE 0.842 24.000 0.081 1.000   NA
 2441282 2441283 SAL_1831 SAL_1830     TRUE 0.869 18.000 0.043 1.000 N NA
 2441283 2441284 SAL_1830 SAL_1829     FALSE 0.168 190.000 0.031 1.000 N NA
 2441286 2441287 SAL_1827 SAL_1826     TRUE 0.927 -18.000 0.326 NA   NA
 2441288 2441289 SAL_1825 SAL_1824   pfl FALSE 0.061 101.000 0.000 1.000   NA
 2441291 2441292 SAL_1822 SAL_1821     FALSE 0.469 114.000 0.050 NA   NA
 2441292 2441293 SAL_1821 SAL_1820     TRUE 0.576 129.000 0.099 1.000 N NA
 2441293 2441294 SAL_1820 SAL_1819   rnhC TRUE 0.899 16.000 0.080 1.000 N NA
 2441295 2441296 SAL_1818 SAL_1817   cvpA TRUE 0.792 3.000 0.019 NA   NA
 2441296 2441297 SAL_1817 SAL_1816 cvpA mutS2 TRUE 0.647 76.000 0.070 1.000   NA
 2441297 2441298 SAL_1816 SAL_1815 mutS2   TRUE 0.771 4.000 0.005 1.000   NA
 2441298 2441299 SAL_1815 SAL_1814   trx TRUE 0.610 81.000 0.053 1.000   NA
 2441300 2441301 SAL_1813 SAL_1812   mutY FALSE 0.133 177.000 0.002 1.000 N NA
 2441302 2441303 SAL_1811 SAL_1810 rpsF   TRUE 0.847 12.000 0.012 1.000 N NA
 2441303 2441304 SAL_1810 SAL_1809   rpsR TRUE 0.628 45.000 0.012 1.000   NA
 2441307 2441308 SAL_0584 SAL_0585 fbp   FALSE 0.550 90.000 0.018 1.000 N NA
 2441308 2441309 SAL_0585 SAL_0586   prfB FALSE 0.132 187.000 0.006 1.000 N NA
 2441309 2441310 SAL_0586 SAL_0587 prfB ftsE TRUE 0.923 19.000 0.053 0.015 N NA
 2441310 2441311 SAL_0587 SAL_0588 ftsE ftsX TRUE 0.979 -16.000 0.431 1.000 Y NA
 2441312 2441313 SAL_0589 SAL_0590     TRUE 0.680 -3.000 0.004 NA   NA
 2441314 2441315 SAL_0591 SAL_0592 fabG   FALSE 0.149 108.000 0.000 1.000 N NA
 2441315 2441316 SAL_0592 SAL_0593     TRUE 0.587 86.000 0.028 1.000 N NA
 2441316 2441317 SAL_0593 SAL_0594   asnS TRUE 0.876 21.000 0.068 1.000 N NA
 2441318 2441319 SAL_0595 SAL_0596     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441319 2441320 SAL_0596 SAL_0597     FALSE 0.011 246.000 0.000 1.000 N NA
 2441321 2441322 SAL_0598 SAL_0599     TRUE 0.928 -3.000 0.214 NA   NA
 2441322 2441323 SAL_0599 SAL_0600     TRUE 0.967 -3.000 0.470 NA   NA
 2441323 2441324 SAL_0600 SAL_0601     TRUE 0.812 15.000 0.015 1.000   NA
 2441324 2441325 SAL_0601 SAL_0602     TRUE 0.703 142.000 0.250 1.000 N NA
 2441326 2441327 SAL_0603 SAL_0604 rpmE   FALSE 0.510 85.000 0.020 1.000   NA
 2441328 2441329 SAL_0605 SAL_0606 add   FALSE 0.252 59.000 0.000 1.000 N NA
 2441330 2441331 SAL_0263 SAL_0264     FALSE 0.011 113.000 0.000 NA   NA
 2441331 2441332 SAL_0264 SAL_0265     FALSE 0.000 781.000 0.000 NA   NA
 2441332 2441333 SAL_0265 SAL_0266     FALSE 0.012 102.000 0.000 NA   NA
 2441333 2441334 SAL_0266 SAL_0267     TRUE 0.990 0.000 1.000 NA   NA
 2441334 2441335 SAL_0267 SAL_0268     FALSE 0.033 -54.000 0.000 NA   NA
 2441335 2441336 SAL_0268 SAL_0269     FALSE 0.001 266.000 0.000 NA   NA
 2441336 2441337 SAL_0269 SAL_0270     FALSE 0.040 -15.000 0.000 NA   NA
 2441337 2441338 SAL_0270 SAL_0271     FALSE 0.035 34.000 0.000 NA   NA
 2441338 2441339 SAL_0271 SAL_0272     FALSE 0.014 91.000 0.000 NA   NA
 2441339 2441340 SAL_0272 SAL_0273     FALSE 0.000 428.000 0.000 NA   NA
 2441340 2441341 SAL_0273 SAL_0274     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441341 2441342 SAL_0274 SAL_0275     FALSE 0.060 0.000 0.000 NA   NA
 2441342 2441343 SAL_0275 SAL_0276     TRUE 0.805 73.000 0.200 1.000   NA
 2441343 2441344 SAL_0276 SAL_0277     TRUE 0.859 66.000 0.300 NA   NA
 2441344 2441345 SAL_0277 SAL_0278     TRUE 0.941 22.000 0.300 NA   NA
 2441346 2441347 SAL_0279 SAL_0280     TRUE 0.991 1.000 0.619 0.004 N NA
 2441347 2441348 SAL_0280 SAL_0281     TRUE 0.992 3.000 0.650 0.004 N NA
 2441348 2441349 SAL_0281 SAL_0282   proV TRUE 0.992 0.000 0.450 0.004 Y NA
 2441349 2441350 SAL_0282 SAL_0283 proV   FALSE 0.001 6043.000 0.000 NA N NA
 2441350 2441351 SAL_0283 SAL_0284     FALSE 0.486 84.000 0.025 NA   NA
 2441352 2441353 SAL_0285 SAL_0286     FALSE 0.009 268.000 0.000 1.000 N NA
 2441353 2441354 SAL_0286 SAL_0287     FALSE 0.161 34.000 0.000 1.000   NA
 2441354 2441355 SAL_0287 SAL_0288     FALSE 0.011 189.000 0.000 1.000   NA
 2441355 2441356 SAL_0288 SAL_0289     FALSE 0.126 49.000 0.000 1.000   NA
 2441357 2441358 SAL_1110 SAL_1111   rnhB FALSE 0.226 21.000 0.000 1.000   NA
 2441358 2441359 SAL_1111 SAL_1112 rnhB   TRUE 0.875 -13.000 0.148 1.000   NA
 2441359 2441360 SAL_1112 SAL_1113     FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 2441360 2441361 SAL_1113 SAL_1114     FALSE 0.002 201.000 0.000 NA   NA
 2441361 2441362 SAL_1114 SAL_1115     TRUE 0.554 156.000 0.050 1.000 Y NA
 2441362 2441363 SAL_1115 SAL_1116     TRUE 0.994 12.000 0.538 0.016 Y NA
 2441363 2441364 SAL_1116 SAL_1117     FALSE 0.000 536.000 0.000 NA   NA
 2441364 2441365 SAL_1117 SAL_1118     FALSE 0.000 524.000 0.000 NA   NA
 2441365 2441366 SAL_1118 SAL_1119     FALSE 0.001 244.000 0.000 NA   NA
 2441366 2441367 SAL_1119 SAL_1120     FALSE 0.015 86.000 0.000 NA   NA
 2441367 2441368 SAL_1120 SAL_1121     FALSE 0.000 348.000 0.000 NA   NA
 2441368 2441369 SAL_1121 SAL_1122     FALSE 0.070 12.000 0.000 NA   NA
 2441369 2441370 SAL_1122 SAL_1123     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441370 2441371 SAL_1123 SAL_1124     FALSE 0.069 5.000 0.000 NA   NA
 2441371 2441372 SAL_1124 SAL_1125     FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 2441372 2441373 SAL_1125 SAL_1126     FALSE 0.049 -7.000 0.000 NA   NA
 2441373 2441374 SAL_1126 SAL_1127     FALSE 0.070 6.000 0.000 NA   NA
 2441374 2441375 SAL_1127 SAL_1128     FALSE 0.009 127.000 0.000 NA   NA
 2441375 2441376 SAL_1128 SAL_1129     FALSE 0.052 21.000 0.000 NA   NA
 2441376 2441377 SAL_1129 SAL_1130     FALSE 0.067 14.000 0.000 NA   NA
 2441377 2441378 SAL_1130 SAL_1131     FALSE 0.009 129.000 0.000 NA   NA
 2441378 2441379 SAL_1131 SAL_1132     FALSE 0.064 3.000 0.000 NA   NA
 2441379 2441380 SAL_1132 SAL_1133     FALSE 0.070 12.000 0.000 NA   NA
 2441382 2441383 SAL_1135 SAL_1136     FALSE 0.070 12.000 0.000 NA   NA
 2441383 2441384 SAL_1136 SAL_1137     TRUE 0.983 7.000 0.623 NA   NA
 2441384 2441385 SAL_1137 SAL_1138     TRUE 0.987 0.000 0.833 NA   NA
 2441385 2441386 SAL_1138 SAL_1139     TRUE 0.867 -16.000 0.158 NA   NA
 2441386 2441387 SAL_1139 SAL_1140     TRUE 0.878 -3.000 0.122 NA   NA
 2441387 2441388 SAL_1140 SAL_1141     TRUE 0.830 3.000 0.041 NA   NA
 2441388 2441389 SAL_1141 SAL_1142     TRUE 0.587 82.000 0.061 NA   NA
 2441390 2441391 SAL_0231 SAL_0232     TRUE 0.953 3.000 0.156 0.014   NA
 2441391 2441392 SAL_0232 SAL_0233     TRUE 0.961 13.000 0.182 0.016   NA
 2441392 2441393 SAL_0233 SAL_0234   tkt TRUE 0.963 3.000 0.333 1.000   NA
 2441393 2441394 SAL_0234 SAL_0235 tkt   TRUE 0.996 -3.000 0.742 0.002 Y NA
 2441394 2441395 SAL_0235 SAL_0236     FALSE 0.148 109.000 0.000 1.000 N NA
 2441395 2441396 SAL_0236 SAL_0237   rpsO FALSE 0.182 88.000 0.000 1.000 N NA
 2441396 2441397 SAL_0237 SAL_0238 rpsO pnp FALSE 0.193 381.000 0.335 1.000 Y NA
 2441399 2441400 SAL_0240 SAL_0241   cysE TRUE 0.887 9.000 0.097 NA   NA
 2441400 2441401 SAL_0241 SAL_0242 cysE   FALSE 0.070 10.000 0.000 NA   NA
 2441401 2441402 SAL_0242 SAL_0243   cysS FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441402 2441403 SAL_0243 SAL_0244 cysS   TRUE 0.880 -7.000 0.129 1.000   NA
 2441403 2441404 SAL_0244 SAL_0245     TRUE 0.776 103.000 0.150 0.005   NA
 2441404 2441405 SAL_0245 SAL_0246     TRUE 0.869 -3.000 0.109 NA   NA
 2441405 2441406 SAL_0246 SAL_0247     FALSE 0.480 93.000 0.036 NA   NA
 2441406 2441407 SAL_0247 SAL_0248     FALSE 0.000 346.000 0.000 NA   NA
 2441407 2441408 SAL_0248 SAL_0249     FALSE 0.018 73.000 0.000 NA   NA
 2441410 2441411 SAL_0251 SAL_0252 rplM rpsI TRUE 0.993 21.000 0.601 0.021 Y NA
 2441412 2441413 SAL_0253 SAL_0254     FALSE 0.113 55.000 0.000 1.000   NA
 2441414 2441415 SAL_0255 SAL_0256     TRUE 0.923 12.000 0.158 NA   NA
 2441415 2441416 SAL_0256 SAL_0257     FALSE 0.070 11.000 0.000 NA   NA
 2441416 2441417 SAL_0257 SAL_0258     TRUE 0.967 -7.000 0.500 NA   NA
 2441417 2441418 SAL_0258 SAL_0259     TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 2441418 2441419 SAL_0259 SAL_0260     FALSE 0.000 344.000 0.000 NA   NA
 2441419 2441420 SAL_0260 SAL_0261     TRUE 0.994 13.000 0.564 0.057 Y NA
 2441420 2441421 SAL_0261 SAL_0262     FALSE 0.060 0.000 0.000 NA   NA
 2441422 2441423 SAL_0736 SAL_0735     FALSE 0.015 85.000 0.000 NA   NA
 2441424 2441425 SAL_0734 SAL_0733     FALSE 0.001 212.000 0.000 NA   NA
 2441425 2441426 SAL_0733 SAL_0732     FALSE 0.071 9.000 0.000 NA   NA
 2441426 2441427 SAL_0732 SAL_0731     TRUE 0.651 10.000 0.000 0.086   NA
 2441427 2441428 SAL_0731 SAL_0730     FALSE 0.004 161.000 0.000 NA   NA
 2441428 2441429 SAL_0730 SAL_0729     FALSE 0.034 -31.000 0.000 NA   NA
 2441429 2441430 SAL_0729 SAL_0728     FALSE 0.524 5.000 0.000 1.000 N NA
 2441430 2441431 SAL_0728 SAL_0727     FALSE 0.468 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2441431 2441432 SAL_0727 SAL_0726     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441432 2441433 SAL_0726 SAL_0725     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441433 2441434 SAL_0725 SAL_0724     TRUE 0.984 -7.000 0.849 NA   NA
 2441434 2441435 SAL_0724 SAL_0723   fabZ FALSE 0.296 -10.000 0.000 NA N NA
 2441435 2441436 SAL_0723 SAL_0722 fabZ acpP1 TRUE 0.874 -16.000 0.167 NA   NA
 2441436 2441437 SAL_0722 SAL_0721 acpP1 fabG FALSE 0.214 -7.000 0.000 1.000   NA
 2441437 2441438 SAL_0721 SAL_0720 fabG   TRUE 0.872 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 2441438 2441439 SAL_0720 SAL_0719     FALSE 0.000 930.000 0.000 NA   NA
 2441439 2441440 SAL_0719 SAL_0718     FALSE 0.062 2.000 0.000 NA   NA
 2441440 2441441 SAL_0718 SAL_0717     FALSE 0.064 3.000 0.000 NA   NA
 2441441 2441442 SAL_0717 SAL_0716     FALSE 0.009 200.000 0.000 1.000   NA
 2441442 2441443 SAL_0716 SAL_0715     FALSE 0.021 61.000 0.000 NA   NA
 2441443 2441444 SAL_0715 SAL_0714     FALSE 0.000 1119.000 0.000 NA   NA
 2441444 2441445 SAL_0714 SAL_0713     FALSE 0.011 122.000 0.000 NA   NA
 2441447 2441448 SAL_0711 SAL_0710     FALSE 0.000 521.000 0.000 NA   NA
 2441448 2441449 SAL_0710 SAL_0709     TRUE 0.605 101.000 0.093 NA N NA
 2441453 2441454 SAL_2069 SAL_2070     TRUE 0.977 7.000 0.500 NA   NA
 2441455 2441456 SAL_2071 SAL_2072     TRUE 0.818 4.000 0.031 NA   NA
 2441456 2441457 SAL_2072 SAL_2073     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441457 2441458 SAL_2073 SAL_2074     FALSE 0.000 534.000 0.000 NA   NA
 2441458 2441459 SAL_2074 SAL_2075     FALSE 0.000 297.000 0.000 NA   NA
 2441459 2441460 SAL_2075 SAL_2076   carB FALSE 0.060 160.000 0.000 1.000 N NA
 2441460 2441461 SAL_2076 SAL_2077 carB   TRUE 0.908 29.000 0.051 0.001 N NA
 2441463 2441464 SAL_2079 SAL_2080     FALSE 0.067 4.000 0.000 NA   NA
 2441464 2441465 SAL_2080 SAL_2081     FALSE 0.022 58.000 0.000 NA   NA
 2441465 2441466 SAL_2081 SAL_2082     FALSE 0.000 519.000 0.000 NA   NA
 2441466 2441467 SAL_2082 SAL_2083     FALSE 0.003 179.000 0.000 NA   NA
 2441467 2441468 SAL_2083 SAL_2084     FALSE 0.000 850.000 0.000 NA   NA
 2441468 2441469 SAL_2084 SAL_2085     FALSE 0.001 522.000 0.000 1.000   NA
 2441469 2441470 SAL_2085 SAL_2086     FALSE 0.012 106.000 0.000 NA   NA
 2441470 2441471 SAL_2086 SAL_2087     TRUE 0.979 15.000 0.569 NA   NA
 2441471 2441472 SAL_2087 SAL_2088     TRUE 0.656 84.000 0.118 NA   NA
 2441472 2441473 SAL_2088 SAL_2089     TRUE 0.917 2.000 0.167 NA   NA
 2441473 2441474 SAL_2089 SAL_2090     FALSE 0.004 249.000 0.000 1.000   NA
 2441475 2441476 SAL_2091 SAL_2092     TRUE 0.872 17.000 0.104 NA   NA
 2441476 2441477 SAL_2092 SAL_2093     FALSE 0.000 305.000 0.000 NA   NA
 2441478 2441479 SAL_2094 SAL_2095     FALSE 0.003 173.000 0.000 NA   NA
 2441480 2441481 SAL_0056 SAL_0055   ruvB FALSE 0.261 152.000 0.005 1.000 N NA
 2441481 2441482 SAL_0055 SAL_0054 ruvB   FALSE 0.015 331.000 0.002 1.000   NA
 2441482 2441483 SAL_0054 SAL_0053   purB FALSE 0.196 153.000 0.005 1.000   NA
 2441483 2441484 SAL_0053 SAL_0052 purB   FALSE 0.015 86.000 0.000 NA   NA
 2441484 2441485 SAL_0052 SAL_0051     FALSE 0.000 366.000 0.000 NA   NA
 2441485 2441486 SAL_0051 SAL_0050   purK FALSE 0.070 10.000 0.000 NA   NA
 2441486 2441487 SAL_0050 SAL_0049 purK   TRUE 0.925 -13.000 0.002 0.001 Y NA
 2441487 2441488 SAL_0049 SAL_0048   purD FALSE 0.500 161.000 0.044 1.000 Y NA
 2441490 2441491 SAL_0046 SAL_0045   xylR2 TRUE 0.921 8.000 0.105 1.000 N NA
 2441491 2441492 SAL_0045 SAL_0044 xylR2   FALSE 0.485 17.000 0.000 1.000 N NA
 2441492 2441493 SAL_0044 SAL_0043     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441493 2441494 SAL_0043 SAL_0042     FALSE 0.054 20.000 0.000 NA   NA
 2441494 2441495 SAL_0042 SAL_0041     TRUE 0.979 13.000 0.250 NA Y NA
 2441495 2441496 SAL_0041 SAL_0040     TRUE 0.998 10.000 1.000 0.044 Y NA
 2441496 2441497 SAL_0040 SAL_0039     TRUE 0.640 88.000 0.000 0.044 Y NA
 2441497 2441498 SAL_0039 SAL_0038     TRUE 0.666 47.000 0.000 1.000 Y NA
 2441498 2441499 SAL_0038 SAL_0036     FALSE 0.002 355.000 0.000 1.000   NA
 2441501 2441502 SAL_0035 SAL_0034   purH FALSE 0.010 193.000 0.000 1.000   NA
 2441502 2441503 SAL_0034 SAL_0033 purH   FALSE 0.056 19.000 0.000 NA   NA
 2441503 2441504 SAL_0033 SAL_0032   purN FALSE 0.056 19.000 0.000 NA   NA
 2441505 2441506 SAL_1885 SAL_1886     FALSE 0.004 247.000 0.000 1.000   NA
 2441506 2441507 SAL_1886 SAL_1887     TRUE 0.912 19.000 0.177 NA   NA
 2441507 2441508 SAL_1887 SAL_1888     TRUE 0.640 54.000 0.042 NA   NA
 2441510 2441511 SAL_1890 SAL_1891 xfp   FALSE 0.014 90.000 0.000 NA   NA
 2441511 2441512 SAL_1891 SAL_1893     FALSE 0.088 317.000 0.231 NA   NA
 2441514 2441515 SAL_1894 SAL_1895   gntK TRUE 0.791 20.000 0.035 NA   NA
 2441515 2441516 SAL_1895 SAL_1896 gntK   FALSE 0.097 66.000 0.000 1.000   NA
 2441516 2441517 SAL_1896 SAL_1897     TRUE 0.901 22.000 0.154 1.000   NA
 2441517 2441518 SAL_1897 SAL_1898     TRUE 0.702 98.000 0.133 1.000 N NA
 2441518 2441519 SAL_1898 SAL_1899     TRUE 0.898 19.000 0.133 1.000   NA
 2441519 2441520 SAL_1899 SAL_1900     FALSE 0.005 235.000 0.000 1.000   NA
 2441520 2441521 SAL_1900 SAL_1901     FALSE 0.053 164.000 0.000 1.000 N NA
 2441521 2441522 SAL_1901 SAL_1902     TRUE 0.841 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2441522 2441523 SAL_1902 SAL_1903     TRUE 0.993 2.000 0.700 1.000 Y NA
 2441523 2441524 SAL_1903 SAL_1904     TRUE 0.991 4.000 0.536 1.000 Y NA
 2441524 2441525 SAL_1904 SAL_1905     TRUE 0.907 113.000 0.328 1.000 Y NA
 2441525 2441526 SAL_1905 SAL_1906     TRUE 0.958 67.000 0.279 0.013 Y NA
 2441526 2441527 SAL_1906 SAL_1907     FALSE 0.042 28.000 0.000 NA   NA
 2441528 2441529 SAL_1786 SAL_1787 cscA   TRUE 0.983 2.000 0.571 1.000 N NA
 2441530 2441531 SAL_1788 SAL_1789 nusB   TRUE 0.933 -7.000 0.265 NA   NA
 2441531 2441532 SAL_1789 SAL_1790   efp FALSE 0.481 89.000 0.031 NA   NA
 2441532 2441533 SAL_1790 SAL_1791 efp   FALSE 0.014 91.000 0.000 NA   NA
 2441533 2441534 SAL_1791 SAL_1792     FALSE 0.000 957.000 0.000 NA   NA
 2441534 2441535 SAL_1792 SAL_1793     TRUE 0.909 5.000 0.118 1.000   NA
 2441535 2441536 SAL_1793 SAL_1794     FALSE 0.160 -27.000 0.000 1.000   NA
 2441536 2441537 SAL_1794 SAL_1795     FALSE 0.226 21.000 0.000 1.000   NA
 2441537 2441538 SAL_1795 SAL_1796     FALSE 0.214 -7.000 0.000 1.000   NA
 2441538 2441539 SAL_1796 SAL_1797     TRUE 0.989 0.000 0.917 NA   NA
 2441539 2441540 SAL_1797 SAL_1798     FALSE 0.000 457.000 0.000 NA   NA
 2441540 2441541 SAL_1798 SAL_1799     FALSE 0.067 14.000 0.000 NA   NA
 2441541 2441542 SAL_1799 SAL_1800   mbtA FALSE 0.275 100.000 0.000 0.022   NA
 2441542 2441543 SAL_1800 SAL_1801 mbtA   FALSE 0.006 217.000 0.000 1.000   NA
 2441543 2441544 SAL_1801 SAL_1802     FALSE 0.292 48.000 0.000 1.000 N NA
 2441544 2441545 SAL_1802 SAL_1803   pepQ TRUE 0.864 12.000 0.018 1.000 N NA
 2441545 2441546 SAL_1803 SAL_1804 pepQ   FALSE 0.012 100.000 0.000 NA   NA
 2441546 2441547 SAL_1804 SAL_1805     TRUE 0.974 2.000 0.500 NA   NA
 2441547 2441548 SAL_1805 SAL_1806   uvrA FALSE 0.005 336.000 0.000 1.000 N NA
 2441548 2441549 SAL_1806 SAL_1807 uvrA   FALSE 0.006 147.000 0.000 NA   NA
 2441549 2441550 SAL_1807 SAL_1808     TRUE 0.811 25.000 0.072 NA   NA
 2441551 2441552 SAL_0463 SAL_0462     TRUE 0.873 0.000 0.013 0.020   NA
 2441552 2441553 SAL_0462 SAL_0461   bioY FALSE 0.354 139.000 0.033 1.000   NA
 2441553 2441554 SAL_0461 SAL_0460 bioY   TRUE 0.861 7.000 0.039 1.000   NA
 2441554 2441555 SAL_0460 SAL_0459   tgt FALSE 0.339 106.000 0.004 1.000   NA
 2441557 2441558 SAL_0457 SAL_0456     TRUE 0.989 2.000 0.500 1.000 Y NA
 2441558 2441559 SAL_0456 SAL_0455     TRUE 0.814 113.000 0.333 1.000   NA
 2441559 2441560 SAL_0455 SAL_0454   fur3 FALSE 0.028 153.000 0.000 1.000   NA
 2441560 2441561 SAL_0454 SAL_0453 fur3   FALSE 0.469 82.000 0.010 1.000   NA
 2441561 2441562 SAL_0453 SAL_0452     TRUE 0.658 30.000 0.005 1.000   NA
 2441562 2441563 SAL_0452 SAL_0451     FALSE 0.058 113.000 0.000 1.000   NA
 2441563 2441564 SAL_0451 SAL_0450     TRUE 0.839 15.000 0.047 NA   NA
 2441564 2441565 SAL_0450 SAL_0449     FALSE 0.011 110.000 0.000 NA   NA
 2441565 2441566 SAL_0449 SAL_0448     TRUE 0.934 41.000 0.048 0.003 Y NA
 2441566 2441567 SAL_0448 SAL_0447     TRUE 0.902 13.000 0.064 1.000 N NA
 2441569 2441570 SAL_0445 SAL_0444 rbfA   TRUE 0.946 109.000 0.530 1.000 Y NA
 2441570 2441571 SAL_0444 SAL_0443     FALSE 0.543 117.000 0.010 0.018   NA
 2441571 2441572 SAL_0443 SAL_0442   infB TRUE 0.784 -57.000 0.010 0.014   NA
 2441572 2441573 SAL_0442 SAL_0441 infB   TRUE 0.802 77.000 0.223 NA   NA
 2441573 2441574 SAL_0441 SAL_0440     TRUE 0.962 -7.000 0.408 NA N NA
 2441575 2441576 SAL_1579 SAL_1580     FALSE 0.033 36.000 0.000 NA   NA
 2441577 2441578 SAL_1581 SAL_1582     FALSE 0.001 233.000 0.000 NA   NA
 2441578 2441579 SAL_1582 SAL_1583     FALSE 0.056 19.000 0.000 NA   NA
 2441579 2441580 SAL_1583 SAL_1584     FALSE 0.012 102.000 0.000 NA   NA
 2441580 2441581 SAL_1584 SAL_1585     FALSE 0.004 164.000 0.000 NA   NA
 2441581 2441582 SAL_1585 SAL_1586   era FALSE 0.001 237.000 0.000 NA   NA
 2441582 2441583 SAL_1586 SAL_1587 era   TRUE 0.757 42.000 0.063 1.000   NA
 2441583 2441584 SAL_1587 SAL_1588     TRUE 0.720 -19.000 0.035 NA   NA
 2441584 2441585 SAL_1588 SAL_1589     FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 2441585 2441586 SAL_1589 SAL_1590     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 2441586 2441587 SAL_1590 SAL_1591     FALSE 0.005 158.000 0.000 NA   NA
 2441589 2441590 SAL_1593 SAL_1594     FALSE 0.264 124.000 0.004 NA   NA
 2441592 2441593 SAL_1596 SAL_1597   msrA TRUE 0.863 -3.000 0.080 1.000   NA
 2441593 2441594 SAL_1597 SAL_1598 msrA   FALSE 0.314 138.000 0.016 1.000   NA
 2441594 2441595 SAL_1598 SAL_1599   frr FALSE 0.383 118.000 0.012 1.000   NA
 2441595 2441596 SAL_1599 SAL_1600 frr   TRUE 0.985 16.000 0.626 1.000 N NA
 2441596 2441597 SAL_1600 SAL_1601     FALSE 0.140 121.000 0.000 1.000 N NA
 2441597 2441598 SAL_1601 SAL_1602     TRUE 0.989 -13.000 0.500 0.029 Y NA
 2441598 2441599 SAL_1602 SAL_1603     TRUE 0.948 69.000 0.353 1.000 Y NA
 2441599 2441600 SAL_1603 SAL_1604     TRUE 0.990 0.000 0.353 0.002 Y NA
 2441600 2441601 SAL_1604 SAL_1605     TRUE 0.973 -13.000 0.167 0.002 Y NA
 2441601 2441602 SAL_1605 SAL_1606   rplA FALSE 0.003 429.000 0.000 1.000 N NA
 2441602 2441603 SAL_1606 SAL_1607 rplA rplK TRUE 0.980 104.000 0.838 0.026 Y NA
 2441603 2441604 SAL_1607 SAL_1608 rplK   FALSE 0.001 211.000 0.000 NA   NA
 2441605 2441606 SAL_0560 SAL_0561 manB folD FALSE 0.354 139.000 0.013 1.000 N NA
 2441606 2441607 SAL_0561 SAL_0562 folD   FALSE 0.473 120.000 0.030 NA N NA
 2441607 2441608 SAL_0562 SAL_0563   xseA FALSE 0.340 126.000 0.005 NA N NA
 2441608 2441609 SAL_0563 SAL_0564 xseA xseB TRUE 0.986 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 2441609 2441610 SAL_0564 SAL_0565 xseB ispA TRUE 0.906 0.000 0.100 1.000 N NA
 2441610 2441611 SAL_0565 SAL_0566 ispA   TRUE 0.861 -7.000 0.058 1.000 N NA
 2441611 2441612 SAL_0566 SAL_0567     TRUE 0.829 -13.000 0.048 1.000 N NA
 2441612 2441613 SAL_0567 SAL_0568   recN TRUE 0.885 12.000 0.037 1.000 N NA
 2441613 2441614 SAL_0568 SAL_0569 recN   FALSE 0.312 113.000 0.006 NA   NA
 2441614 2441615 SAL_0569 SAL_0570     TRUE 0.882 -25.000 0.203 NA   NA
 2441615 2441616 SAL_0570 SAL_0571     TRUE 0.977 -25.000 0.828 NA   NA
 2441616 2441617 SAL_0571 SAL_0572     TRUE 0.653 103.000 0.156 NA   NA
 2441617 2441618 SAL_0572 SAL_0573     FALSE 0.002 185.000 0.000 NA   NA
 2441619 2441620 SAL_0574 SAL_0575     FALSE 0.033 187.000 0.000 1.000 N NA
 2441620 2441621 SAL_0575 SAL_0576     TRUE 0.991 19.000 0.467 0.009 Y NA
 2441621 2441622 SAL_0576 SAL_0577     TRUE 0.981 13.000 0.133 0.001 Y NA
 2441622 2441623 SAL_0577 SAL_0578     TRUE 0.899 0.000 0.125 1.000   NA
 2441623 2441624 SAL_0578 SAL_0579     TRUE 0.593 71.000 0.035 1.000   NA
 2441625 2441626 SAL_0580 SAL_0581     FALSE 0.000 344.000 0.000 NA   NA
 2441627 2441628 SAL_1079 SAL_1080     TRUE 0.989 12.000 0.438 1.000 Y NA
 2441628 2441629 SAL_1080 SAL_1081   topA FALSE 0.101 137.000 0.000 1.000 N NA
 2441630 2441631 SAL_1082 SAL_1083 hisS aspS TRUE 0.901 93.000 0.161 0.046 Y NA
 2441631 2441632 SAL_1083 SAL_1084 aspS   TRUE 0.709 -10.000 0.016 NA   NA
 2441632 2441633 SAL_1084 SAL_1085     FALSE 0.500 108.000 0.062 NA   NA
 2441634 2441635 SAL_1086 SAL_1087   argS FALSE 0.486 88.000 0.032 NA   NA
 2441636 2441637 SAL_1088 SAL_1089 argR mutS TRUE 0.613 57.000 0.008 1.000 N NA
 2441639 2441640 SAL_1091 SAL_1092   hexB FALSE 0.010 125.000 0.000 NA   NA
 2441640 2441641 SAL_1092 SAL_1093 hexB   TRUE 0.651 32.000 0.006 1.000   NA
 2441641 2441642 SAL_1093 SAL_1094   ruvA TRUE 0.758 2.000 0.005 1.000   NA
 2441642 2441643 SAL_1094 SAL_1095 ruvA   TRUE 0.902 23.000 0.012 1.000 Y NA
 2441643 2441644 SAL_1095 SAL_1096     FALSE 0.443 89.000 0.011 1.000   NA
 2441644 2441645 SAL_1096 SAL_1097     TRUE 0.574 110.000 0.005 0.001   NA
 2441645 2441646 SAL_1097 SAL_1098   recA FALSE 0.461 74.000 0.005 1.000   NA
 2441647 2441648 SAL_0304 SAL_0305   glyQ FALSE 0.001 424.000 0.000 1.000   NA
 2441648 2441649 SAL_0305 SAL_0306 glyQ   FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 2441649 2441650 SAL_0306 SAL_0307   glyS FALSE 0.517 4.000 0.000 1.000 N NA
 2441650 2441651 SAL_0307 SAL_0308 glyS   TRUE 0.809 12.000 0.020 NA   NA
 2441651 2441652 SAL_0308 SAL_0309     FALSE 0.037 32.000 0.000 NA   NA
 2441652 2441653 SAL_0309 SAL_0310   glpK FALSE 0.011 114.000 0.000 NA   NA
 2441653 2441654 SAL_0310 SAL_0311 glpK glpD TRUE 0.994 13.000 0.500 0.001 Y NA
 2441654 2441655 SAL_0311 SAL_0312 glpD   TRUE 0.982 12.000 0.500 1.000 N NA
 2441655 2441656 SAL_0312 SAL_0313     TRUE 0.735 145.000 0.364 1.000   NA
 2441656 2441657 SAL_0313 SAL_0314     TRUE 0.974 9.000 0.462 NA   NA
 2441657 2441658 SAL_0314 SAL_0315   tkt FALSE 0.001 239.000 0.000 NA   NA
 2441658 2441659 SAL_0315 SAL_0316 tkt   FALSE 0.001 213.000 0.000 NA   NA
 2441659 2441660 SAL_0316 SAL_0317     TRUE 0.886 20.000 0.136 NA   NA
 2441660 2441661 SAL_0317 SAL_0318     TRUE 0.963 4.000 0.341 NA   NA
 2441663 2441664 SAL_0320 SAL_0321 proB proA TRUE 0.990 10.000 0.281 0.002 Y NA
 2441665 2441666 SAL_1398 SAL_1397   mvk FALSE 0.146 116.000 0.000 1.000 N NA
 2441666 2441667 SAL_1397 SAL_1396 mvk mvaD TRUE 0.980 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 2441667 2441668 SAL_1396 SAL_1395 mvaD   TRUE 0.986 -7.000 0.312 0.004 Y NA
 2441668 2441669 SAL_1395 SAL_1394     TRUE 0.897 -3.000 0.097 1.000 N NA
 2441669 2441670 SAL_1394 SAL_1393     FALSE 0.019 68.000 0.000 NA   NA
 2441671 2441672 SAL_1392 SAL_1391     FALSE 0.101 101.000 0.000 NA N NA
 2441672 2441673 SAL_1391 SAL_1390     TRUE 0.698 87.000 0.135 1.000   NA
 2441673 2441674 SAL_1390 SAL_1389     TRUE 0.688 86.000 0.146 NA   NA
 2441674 2441675 SAL_1389 SAL_1388     FALSE 0.437 92.000 0.020 NA   NA
 2441675 2441676 SAL_1388 SAL_1387     TRUE 0.971 2.000 0.183 1.000 Y NA
 2441677 2441678 SAL_1386 SAL_1385 thyA folA TRUE 0.872 80.000 0.295 1.000 N NA
 2441678 2441679 SAL_1385 SAL_1384 folA   TRUE 0.790 18.000 0.030 NA   NA
 2441679 2441680 SAL_1384 SAL_1383   clpX TRUE 0.660 30.000 0.012 NA   NA
 2441680 2441681 SAL_1383 SAL_1382 clpX   TRUE 0.865 11.000 0.043 1.000   NA
 2441683 2441684 SAL_1380 SAL_1379     FALSE 0.025 52.000 0.000 NA   NA
 2441684 2441685 SAL_1379 SAL_1378     FALSE 0.005 158.000 0.000 NA   NA
 2441685 2441686 SAL_1378 SAL_1377     FALSE 0.009 130.000 0.000 NA   NA
 2441686 2441687 SAL_1377 SAL_1376     TRUE 0.908 -106.000 0.093 1.000 Y NA
 2441689 2441690 SAL_0924 SAL_0923     TRUE 0.855 63.000 0.279 NA   NA
 2441690 2441691 SAL_0923 SAL_0922   atpC TRUE 0.589 65.000 0.039 NA   NA
 2441691 2441692 SAL_0922 SAL_0921 atpC atpD TRUE 0.997 13.000 0.837 0.004 Y NA
 2441692 2441693 SAL_0921 SAL_0920 atpD atpG TRUE 0.985 74.000 0.724 0.004 Y NA
 2441693 2441694 SAL_0920 SAL_0919 atpG atpA TRUE 0.997 16.000 0.846 0.004 Y NA
 2441694 2441695 SAL_0919 SAL_0918 atpA atpH TRUE 0.997 16.000 0.864 0.004 Y NA
 2441695 2441696 SAL_0918 SAL_0917 atpH atpF TRUE 0.985 0.000 0.222 0.004 Y NA
 2441696 2441697 SAL_0917 SAL_0916 atpF atpB TRUE 0.959 18.000 0.032 0.004 Y NA
 2441697 2441698 SAL_0916 SAL_0915 atpB   TRUE 0.934 33.000 0.189 0.004   NA
 2441698 2441699 SAL_0915 SAL_0914     FALSE 0.002 332.000 0.000 1.000   NA
 2441699 2441700 SAL_0914 SAL_0913   glgD TRUE 0.984 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 2441700 2441701 SAL_0913 SAL_0912 glgD glgC TRUE 0.995 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 2441701 2441702 SAL_0912 SAL_0911 glgC glgB TRUE 0.978 42.000 0.317 0.001 Y NA
 2441702 2441703 SAL_0911 SAL_0910 glgB   FALSE 0.408 206.000 0.067 0.005 Y NA
 2441703 2441704 SAL_0910 SAL_0909     TRUE 0.909 4.000 0.088 1.000 N NA
 2441704 2441705 SAL_0909 SAL_0908   ligA TRUE 0.852 12.000 0.013 1.000 N NA
 2441705 2441706 SAL_0908 SAL_0907 ligA   FALSE 0.197 152.000 0.010 NA   NA
 2441710 2441711 SAL_1541 SAL_1543     FALSE 0.000 2248.000 0.000 NA   NA
 2441712 2441713 SAL_1544 SAL_1545 uvrB   FALSE 0.021 61.000 0.000 NA   NA
 2441714 2441715 SAL_1546 SAL_1547   glnQ TRUE 0.982 0.000 0.326 1.000 Y NA
 2441715 2441716 SAL_1547 SAL_1548 glnQ   FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 2441717 2441718 SAL_1549 SAL_1550   obg TRUE 0.665 26.000 0.009 NA   NA
 2441718 2441719 SAL_1550 SAL_1551 obg   FALSE 0.497 61.000 0.011 NA   NA
 2441723 2441724 SAL_1555 SAL_1556 nylA rsuA FALSE 0.524 85.000 0.000 1.000 Y NA
 2441724 2441725 SAL_1556 SAL_1557 rsuA   FALSE 0.011 191.000 0.000 1.000   NA
 2441726 2441727 SAL_1558 SAL_1559   gloA FALSE 0.513 88.000 0.009 1.000 N NA
 2441728 2441729 SAL_0476 SAL_0477     FALSE 0.001 210.000 0.000 NA   NA
 2441729 2441730 SAL_0477 SAL_0478     FALSE 0.001 553.000 0.000 NA N NA
 2441730 2441731 SAL_0478 SAL_0479   nrdI TRUE 0.991 1.000 0.643 NA Y NA
 2441731 2441732 SAL_0479 SAL_0480 nrdI   TRUE 0.996 2.000 1.000 NA Y NA
 2441732 2441733 SAL_0480 SAL_0481     FALSE 0.021 63.000 0.000 NA   NA
 2441733 2441734 SAL_0481 SAL_0482     TRUE 0.936 13.000 0.200 NA   NA
 2441735 2441736 SAL_0483 SAL_0484     FALSE 0.001 239.000 0.000 NA   NA
 2441736 2441737 SAL_0484 SAL_0485     FALSE 0.015 87.000 0.000 NA   NA
 2441737 2441738 SAL_0485 SAL_0486     TRUE 0.904 24.000 0.167 1.000   NA
 2441738 2441739 SAL_0486 SAL_0487     TRUE 0.933 10.000 0.095 0.051   NA
 2441739 2441740 SAL_0487 SAL_0488     TRUE 0.907 16.000 0.095 1.000 N NA
 2441740 2441741 SAL_0488 SAL_0489     FALSE 0.508 -150.000 0.000 0.018   NA
 2441741 2441742 SAL_0489 SAL_0490     FALSE 0.272 110.000 0.000 0.018   NA
 2441742 2441743 SAL_0490 SAL_0491     FALSE 0.122 160.000 0.000 0.018   NA
 2441743 2441744 SAL_0491 SAL_0492     FALSE 0.077 85.000 0.000 1.000   NA
 2441748 2441749 SAL_1860 SAL_1861 rpsG rpsL TRUE 0.980 22.000 0.224 0.026 Y NA
 2441749 2441750 SAL_1861 SAL_1862 rpsL purR FALSE 0.017 219.000 0.000 1.000 N NA
 2441750 2441751 SAL_1862 SAL_1863 purR   FALSE 0.544 97.000 0.052 1.000   NA
 2441751 2441752 SAL_1863 SAL_1864     TRUE 0.741 -10.000 0.030 NA   NA
 2441752 2441753 SAL_1864 SAL_1865     TRUE 0.804 2.000 0.030 NA   NA
 2441753 2441754 SAL_1865 SAL_1866   rpe TRUE 0.921 -7.000 0.166 1.000 N NA
 2441754 2441755 SAL_1866 SAL_1867 rpe   TRUE 0.948 7.000 0.213 1.000   NA
 2441755 2441756 SAL_1867 SAL_1868     FALSE 0.009 198.000 0.000 1.000   NA
 2441756 2441757 SAL_1868 SAL_1869   ksgA FALSE 0.276 4.000 0.000 1.000   NA
 2441757 2441758 SAL_1869 SAL_1870 ksgA   TRUE 0.711 27.000 0.002 1.000 N NA
 2441758 2441759 SAL_1870 SAL_1871     FALSE 0.375 31.000 0.000 1.000 N NA
 2441759 2441760 SAL_1871 SAL_1872     TRUE 0.912 -13.000 0.058 NA Y NA
 2441760 2441761 SAL_1872 SAL_1873     FALSE 0.011 110.000 0.000 NA   NA
 2441761 2441762 SAL_1873 SAL_1874     FALSE 0.070 10.000 0.000 NA   NA
 2441762 2441763 SAL_1874 SAL_1875     FALSE 0.046 -9.000 0.000 NA   NA
 2441763 2441764 SAL_1875 SAL_1876     FALSE 0.060 0.000 0.000 NA   NA
 2441764 2441765 SAL_1876 SAL_1877   dltD FALSE 0.003 175.000 0.000 NA   NA
 2441765 2441766 SAL_1877 SAL_1878 dltD dltC TRUE 0.956 -7.000 0.409 NA   NA
 2441766 2441767 SAL_1878 SAL_1879 dltC   TRUE 0.966 15.000 0.387 NA   NA
 2441767 2441768 SAL_1879 SAL_1880   dltA TRUE 0.970 -3.000 0.435 NA N NA
 2441768 2441769 SAL_1880 SAL_1881 dltA   FALSE 0.087 146.000 0.000 1.000 N NA
 2441771 2441772 SAL_1883 SAL_1884   rpmH FALSE 0.002 356.000 0.000 1.000   NA
 2441773 2441774 SAL_1724 SAL_1725 brnQ   FALSE 0.447 114.000 0.000 1.000 Y NA
 2441775 2441776 SAL_1726 SAL_1727     TRUE 0.995 -3.000 0.938 1.000 Y NA
 2441776 2441777 SAL_1727 SAL_1728     FALSE 0.433 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2441777 2441778 SAL_1728 SAL_1729     FALSE 0.069 134.000 0.000 NA N NA
 2441778 2441779 SAL_1729 SAL_1730     FALSE 0.059 141.000 0.000 NA N NA
 2441779 2441780 SAL_1730 SAL_1731     FALSE 0.060 102.000 0.000 1.000   NA
 2441780 2441781 SAL_1731 SAL_1732     FALSE 0.052 -6.000 0.000 NA   NA
 2441781 2441782 SAL_1732 SAL_1733     FALSE 0.027 48.000 0.000 NA   NA
 2441782 2441783 SAL_1733 SAL_1734     FALSE 0.056 118.000 0.000 1.000   NA
 2441783 2441784 SAL_1734 SAL_1735     TRUE 0.985 10.000 0.625 1.000   NA
 2441785 2441786 SAL_1736 SAL_1737     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441786 2441787 SAL_1737 SAL_1738     TRUE 0.979 38.000 0.316 0.002 Y NA
 2441787 2441788 SAL_1738 SAL_1739     TRUE 0.884 0.000 0.099 1.000   NA
 2441788 2441789 SAL_1739 SAL_1740     TRUE 0.993 10.000 0.857 0.062   NA
 2441790 2441791 SAL_1741 SAL_1742     FALSE 0.350 94.000 0.000 0.051 N NA
 2441791 2441792 SAL_1742 SAL_1743     FALSE 0.441 93.000 0.023 NA   NA
 2441792 2441793 SAL_1743 SAL_1744     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441793 2441794 SAL_1744 SAL_1745     FALSE 0.048 23.000 0.000 NA   NA
 2441794 2441795 SAL_1745 SAL_1746     FALSE 0.334 106.000 0.009 NA   NA
 2441795 2441796 SAL_1746 SAL_1747     TRUE 0.660 66.000 0.085 NA   NA
 2441796 2441797 SAL_1747 SAL_1748     TRUE 0.731 2.000 0.008 NA   NA
 2441798 2441799 SAL_1928 SAL_1929 ahpC   TRUE 0.990 18.000 0.551 1.000 Y NA
 2441800 2441801 SAL_1930 SAL_1931     FALSE 0.062 2.000 0.000 NA   NA
 2441805 2441806 SAL_1935 SAL_1936     FALSE 0.032 -91.000 0.000 NA   NA
 2441807 2441808 SAL_1937 SAL_1938   def TRUE 0.634 66.000 0.034 NA N NA
 2441809 2441810 SAL_1939 SAL_1940     TRUE 0.919 80.000 0.562 NA   NA
 2441810 2441811 SAL_1940 SAL_1941     TRUE 0.870 80.000 0.375 NA   NA
 2441811 2441812 SAL_1941 SAL_1942     TRUE 0.996 -13.000 0.933 0.015 Y NA
 2441812 2441813 SAL_1942 SAL_1943     TRUE 0.995 36.000 0.933 0.015 Y NA
 2441813 2441814 SAL_1943 SAL_1944     TRUE 0.880 55.000 0.267 1.000   NA
 2441814 2441815 SAL_1944 SAL_1945     TRUE 0.926 3.000 0.160 1.000   NA
 2441816 2441817 SAL_1698 SAL_1699 nylA   FALSE 0.150 104.000 0.000 1.000 N NA
 2441817 2441818 SAL_1699 SAL_1700     TRUE 0.661 73.000 0.079 1.000   NA
 2441818 2441819 SAL_1700 SAL_1701     TRUE 0.676 87.000 0.120 1.000   NA
 2441819 2441820 SAL_1701 SAL_1702   murC FALSE 0.479 86.000 0.014 1.000   NA
 2441820 2441821 SAL_1702 SAL_1703 murC   TRUE 0.785 10.000 0.013 NA   NA
 2441821 2441822 SAL_1703 SAL_1704     FALSE 0.069 5.000 0.000 NA   NA
 2441822 2441823 SAL_1704 SAL_1705     FALSE 0.021 62.000 0.000 NA   NA
 2441823 2441824 SAL_1705 SAL_1706     FALSE 0.177 156.000 0.004 1.000   NA
 2441824 2441825 SAL_1706 SAL_1707     TRUE 0.584 48.000 0.008 1.000   NA
 2441825 2441826 SAL_1707 SAL_1708     TRUE 0.993 -3.000 0.817 NA Y NA
 2441826 2441827 SAL_1708 SAL_1709     TRUE 0.899 0.000 0.109 NA N NA
 2441827 2441828 SAL_1709 SAL_1710     FALSE 0.249 149.000 0.007 NA N NA
 2441828 2441829 SAL_1710 SAL_1711     TRUE 0.987 -10.000 0.438 0.081 Y NA
 2441829 2441830 SAL_1711 SAL_1712     FALSE 0.043 235.000 0.014 NA   NA
 2441830 2441831 SAL_1712 SAL_1713     FALSE 0.078 180.000 0.002 NA   NA
 2441831 2441832 SAL_1713 SAL_1714     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 2441833 2441834 SAL_1961 SAL_1962     FALSE 0.017 77.000 0.000 NA   NA
 2441834 2441835 SAL_1962 SAL_1963   mae FALSE 0.002 191.000 0.000 NA   NA
 2441835 2441836 SAL_1963 SAL_1964 mae   TRUE 0.982 25.000 0.432 1.000 Y NA
 2441837 2441838 SAL_1965 SAL_1966     TRUE 0.966 2.000 0.154 1.000 Y NA
 2441839 2441840 SAL_1967 SAL_1968 galE malA FALSE 0.182 88.000 0.000 1.000 N NA
 2441840 2441841 SAL_1968 SAL_1969 malA   TRUE 0.816 128.000 0.171 1.000 Y NA
 2441841 2441842 SAL_1969 SAL_1970     TRUE 0.613 101.000 0.071 1.000 N NA
 2441842 2441843 SAL_1970 SAL_1971     FALSE 0.166 95.000 0.000 1.000 N NA
 2441843 2441844 SAL_1971 SAL_1973   lacD TRUE 0.633 54.000 0.000 1.000 Y NA
 2441846 2441847 SAL_1974 SAL_1975 lacC lacB TRUE 0.841 11.000 0.000 1.000 Y NA
 2441847 2441848 SAL_1975 SAL_1976 lacB lacA TRUE 0.895 21.000 0.000 0.001 Y NA
 2441848 2441849 SAL_1976 SAL_1977 lacA   FALSE 0.004 247.000 0.000 1.000   NA
 2441849 2441850 SAL_1977 SAL_1978     FALSE 0.004 239.000 0.000 1.000   NA
 2441850 2441851 SAL_1978 SAL_1979     FALSE 0.016 82.000 0.000 NA   NA
 2441853 2441854 SAL_1912 SAL_1913 purA   FALSE 0.002 371.000 0.000 NA N NA
 2441855 2441856 SAL_1914 SAL_1915     FALSE 0.003 170.000 0.000 NA   NA
 2441856 2441857 SAL_1915 SAL_1916     FALSE 0.010 124.000 0.000 NA   NA
 2441857 2441858 SAL_1916 SAL_1917     TRUE 0.985 -3.000 0.818 NA   NA
 2441858 2441859 SAL_1917 SAL_1918     FALSE 0.061 140.000 0.000 NA N NA
 2441859 2441860 SAL_1918 SAL_1919     TRUE 0.802 -16.000 0.034 1.000 N NA
 2441860 2441861 SAL_1919 SAL_1920   dck FALSE 0.411 121.000 0.005 1.000 N NA
 2441861 2441862 SAL_1920 SAL_1921 dck   FALSE 0.516 14.000 0.000 1.000 N NA
 2441863 2441864 SAL_1922 SAL_1923 clpC   TRUE 0.932 -3.000 0.188 NA N NA
 2441866 2441867 SAL_1925 SAL_1926 tsf rpsB TRUE 0.969 94.000 0.748 1.000 Y NA
 2441868 2441869 SAL_0689 SAL_0690     TRUE 0.846 97.000 0.409 NA   NA
 2441869 2441870 SAL_0690 SAL_0691     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 2441872 2441873 SAL_0693 SAL_0694     FALSE 0.030 42.000 0.000 NA   NA
 2441873 2441874 SAL_0694 SAL_0695   mreB2 FALSE 0.000 425.000 0.000 NA   NA
 2441874 2441875 SAL_0695 SAL_0696 mreB2 pgp TRUE 0.832 119.000 0.385 1.000   NA
 2441875 2441876 SAL_0696 SAL_0697 pgp gyrB TRUE 0.776 91.000 0.214 1.000   NA
 2441876 2441877 SAL_0697 SAL_0698 gyrB gyrB TRUE 0.980 -3.000 0.429 0.002   NA
 2441877 2441878 SAL_0698 SAL_0699 gyrB   FALSE 0.485 94.000 0.026 1.000   NA
 2441878 2441879 SAL_0699 SAL_0700   serB FALSE 0.482 94.000 0.009 1.000 N NA
 2441880 2441881 SAL_0701 SAL_0702     FALSE 0.068 13.000 0.000 NA   NA
 2441884 2441885 SAL_0705 SAL_0706 aroA aroK TRUE 0.904 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 2441885 2441886 SAL_0706 SAL_0707 aroK   TRUE 0.769 57.000 0.111 NA N NA
 2441887 2441888 SAL_0967 SAL_0968 dtd relA TRUE 0.948 10.000 0.177 1.000 N NA
 2441888 2441889 SAL_0968 SAL_0969 relA   FALSE 0.014 232.000 0.000 1.000 N NA
 2441889 2441890 SAL_0969 SAL_0970     FALSE 0.016 82.000 0.000 NA   NA
 2441890 2441891 SAL_0970 SAL_0971     FALSE 0.000 688.000 0.000 NA   NA
 2441893 2441894 SAL_0973 SAL_0974     FALSE 0.000 377.000 0.000 NA   NA
 2441894 2441895 SAL_0974 SAL_0975     FALSE 0.065 15.000 0.000 NA   NA
 2441895 2441896 SAL_0975 SAL_0976     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441896 2441897 SAL_0976 SAL_0977     FALSE 0.064 3.000 0.000 NA   NA
 2441897 2441898 SAL_0977 SAL_0978     FALSE 0.039 -16.000 0.000 NA   NA
 2441898 2441899 SAL_0978 SAL_0979     FALSE 0.035 -25.000 0.000 NA   NA
 2441901 2441902 SAL_0611 SAL_0612 int   FALSE 0.025 53.000 0.000 NA   NA
 2441902 2441903 SAL_0612 SAL_0614     FALSE 0.046 -9.000 0.000 NA   NA
 2441908 2441909 SAL_0618 SAL_0619     FALSE 0.039 31.000 0.000 NA   NA
 2441911 2441912 SAL_0621 SAL_0622     FALSE 0.001 232.000 0.000 NA   NA
 2441912 2441913 SAL_0622 SAL_0623     FALSE 0.024 54.000 0.000 NA   NA
 2441913 2441914 SAL_0623 SAL_0624     FALSE 0.049 -7.000 0.000 NA   NA
 2441914 2441915 SAL_0624 SAL_0625     FALSE 0.036 33.000 0.000 NA   NA
 2441915 2441916 SAL_0625 SAL_0626     FALSE 0.009 127.000 0.000 NA   NA
 2441918 2441919 SAL_0628 SAL_0629     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 2441919 2441920 SAL_0629 SAL_0630     FALSE 0.070 11.000 0.000 NA   NA
 2441920 2441921 SAL_0630 SAL_0631     TRUE 0.681 -19.000 0.018 NA   NA
 2441921 2441922 SAL_0631 SAL_0632     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441922 2441923 SAL_0632 SAL_0633     FALSE 0.001 268.000 0.000 NA   NA
 2441923 2441924 SAL_0633 SAL_0634     FALSE 0.061 1.000 0.000 NA   NA
 2441924 2441925 SAL_0634 SAL_0635     TRUE 0.854 7.000 0.051 NA   NA
 2441925 2441926 SAL_0635 SAL_0636     TRUE 0.771 -7.000 0.034 NA   NA
 2441926 2441927 SAL_0636 SAL_0637     FALSE 0.064 3.000 0.000 NA   NA
 2441927 2441928 SAL_0637 SAL_0638     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 2441928 2441929 SAL_0638 SAL_0639     FALSE 0.037 -19.000 0.000 NA   NA
 2441929 2441930 SAL_0639 SAL_0640     FALSE 0.000 562.000 0.000 NA   NA
 2441930 2441931 SAL_0640 SAL_0641     FALSE 0.036 -24.000 0.000 NA   NA
 2441931 2441932 SAL_0641 SAL_0642     FALSE 0.067 4.000 0.000 NA   NA
 2441932 2441933 SAL_0642 SAL_0643     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441933 2441934 SAL_0643 SAL_0644     FALSE 0.052 21.000 0.000 NA   NA
 2441934 2441935 SAL_0644 SAL_0645     FALSE 0.002 188.000 0.000 NA   NA
 2441935 2441936 SAL_0645 SAL_0646     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441936 2441937 SAL_0646 SAL_0647     FALSE 0.000 391.000 0.000 NA   NA
 2441940 2441941 SAL_1766 SAL_1765     FALSE 0.441 126.000 0.015 1.000 N NA
 2441941 2441942 SAL_1765 SAL_1764   entB TRUE 0.729 67.000 0.083 1.000 N NA
 2441944 2441945 SAL_1762 SAL_1761     TRUE 0.881 11.000 0.089 NA   NA
 2441945 2441946 SAL_1761 SAL_1760   ppdK TRUE 0.864 13.000 0.065 NA   NA
 2441946 2441947 SAL_1760 SAL_1759 ppdK gatC FALSE 0.296 138.000 0.002 1.000 N NA
 2441947 2441948 SAL_1759 SAL_1758 gatC gatA TRUE 0.995 0.000 0.643 0.001 Y NA
 2441948 2441949 SAL_1758 SAL_1757 gatA gatB TRUE 0.993 0.000 0.492 0.001 Y NA
 2441949 2441950 SAL_1757 SAL_1756 gatB   FALSE 0.163 157.000 0.002 1.000   NA
 2441950 2441951 SAL_1756 SAL_1755   yqeG FALSE 0.413 111.000 0.015 1.000   NA
 2441951 2441952 SAL_1755 SAL_1754 yqeG   TRUE 0.979 0.000 0.555 1.000   NA
 2441952 2441953 SAL_1754 SAL_1753     FALSE 0.548 93.000 0.068 NA   NA
 2441953 2441954 SAL_1753 SAL_1752     TRUE 0.566 130.000 0.150 NA   NA
 2441956 2441957 SAL_1673 SAL_1674 trkA trkH TRUE 0.979 17.000 0.163 0.005 Y NA
 2441958 2441959 SAL_1675 SAL_1676   rluB TRUE 0.793 0.000 0.014 1.000   NA
 2441959 2441960 SAL_1676 SAL_1677 rluB   TRUE 0.928 -10.000 0.224 NA N NA
 2441960 2441961 SAL_1677 SAL_1678     TRUE 0.976 -3.000 0.570 NA   NA
 2441961 2441962 SAL_1678 SAL_1679     TRUE 0.774 0.000 0.017 NA   NA
 2441962 2441963 SAL_1679 SAL_1680     TRUE 0.794 -49.000 0.111 NA   NA
 2441963 2441964 SAL_1680 SAL_1681     TRUE 0.796 -3.000 0.034 NA   NA
 2441964 2441965 SAL_1681 SAL_1682     TRUE 0.642 -18.000 0.005 1.000   NA
 2441965 2441966 SAL_1682 SAL_1683     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 2441966 2441967 SAL_1683 SAL_1684   murI FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441967 2441968 SAL_1684 SAL_1685 murI   FALSE 0.071 205.000 0.014 NA   NA
 2441968 2441969 SAL_1685 SAL_1686     FALSE 0.005 158.000 0.000 NA   NA
 2441971 2441972 SAL_1688 SAL_1689     FALSE 0.019 68.000 0.000 NA   NA
 2441972 2441973 SAL_1689 SAL_1690     FALSE 0.439 146.000 0.123 NA   NA
 2441976 2441977 SAL_1693 SAL_1694     FALSE 0.199 217.000 0.154 1.000 N NA
 2441978 2441979 SAL_1695 SAL_1696     FALSE 0.040 30.000 0.000 NA   NA
 2441979 2441980 SAL_1696 SAL_1697     FALSE 0.047 24.000 0.000 NA   NA
 2441982 2441983 SAL_0030 SAL_0029     FALSE 0.056 19.000 0.000 NA   NA
 2441983 2441984 SAL_0029 SAL_0028   purN FALSE 0.056 19.000 0.000 NA   NA
 2441984 2441985 SAL_0028 SAL_0027 purN purM TRUE 0.796 168.000 0.238 0.002 Y NA
 2441985 2441986 SAL_0027 SAL_0026 purM purF TRUE 0.967 28.000 0.248 1.000 Y NA
 2441986 2441987 SAL_0026 SAL_0025 purF   FALSE 0.046 412.000 0.024 1.000 Y NA
 2441987 2441988 SAL_0025 SAL_0024   purC TRUE 0.871 48.000 0.043 1.000 Y NA
 2441988 2441989 SAL_0024 SAL_0023 purC   FALSE 0.462 124.000 0.017 1.000 N NA
 2441989 2441990 SAL_0023 SAL_0022   plsX TRUE 0.962 11.000 0.017 0.008 Y NA
 2441990 2441991 SAL_0022 SAL_0021 plsX   FALSE 0.017 78.000 0.000 NA   NA
 2441991 2441992 SAL_0021 SAL_0020     FALSE 0.014 90.000 0.000 NA   NA
 2441992 2441993 SAL_0020 SAL_0019     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2441993 2441994 SAL_0019 SAL_0018   aspB3 FALSE 0.524 89.000 0.012 1.000 N NA
 2441994 2441995 SAL_0018 SAL_0017 aspB3 prsA TRUE 0.745 108.000 0.048 1.000 Y NA
 2441996 2441997 SAL_1840 SAL_1841     TRUE 0.976 -7.000 0.168 0.007 Y NA
 2441997 2441998 SAL_1841 SAL_1842   cydB TRUE 0.945 0.000 0.061 1.000 Y NA
 2441998 2441999 SAL_1842 SAL_1843 cydB appC TRUE 0.997 1.000 0.950 0.017 Y NA
 2441999 2442000 SAL_1843 SAL_1844 appC ndh TRUE 0.900 103.000 0.174 0.017 Y NA
 2442000 2442001 SAL_1844 SAL_1845 ndh   TRUE 0.964 13.000 0.261 1.000 N NA
 2442001 2442002 SAL_1845 SAL_1846     FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 2442002 2442003 SAL_1846 SAL_1847     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 2442004 2442005 SAL_1848 SAL_1849     FALSE 0.004 161.000 0.000 NA   NA
 2442006 2442007 SAL_1850 SAL_1851     TRUE 0.673 127.000 0.156 1.000 N NA
 2442007 2442008 SAL_1851 SAL_1852     TRUE 0.768 44.000 0.105 NA   NA
 2442009 2442010 SAL_1853 SAL_1854     TRUE 0.759 -10.000 0.037 NA   NA
 2442012 2442013 SAL_0384 SAL_0385   fad3 FALSE 0.326 176.000 0.083 0.048   NA
 2442013 2442014 SAL_0385 SAL_0386 fad3   TRUE 0.662 96.000 0.098 1.000 N NA
 2442014 2442015 SAL_0386 SAL_0387   fabH TRUE 0.892 0.000 0.070 1.000 N NA
 2442015 2442016 SAL_0387 SAL_0388 fabH   TRUE 0.963 10.000 0.019 0.007 Y NA
 2442016 2442017 SAL_0388 SAL_0389   fabK FALSE 0.352 154.000 0.072 1.000   NA
 2442017 2442018 SAL_0389 SAL_0390 fabK fabD TRUE 0.873 20.000 0.099 1.000   NA
 2442018 2442019 SAL_0390 SAL_0391 fabD fabG TRUE 0.993 9.000 0.432 0.007 Y NA
 2442019 2442020 SAL_0391 SAL_0392 fabG fabF TRUE 0.946 16.000 0.056 1.000 Y NA
 2442020 2442021 SAL_0392 SAL_0393 fabF accB TRUE 0.909 -34.000 0.074 1.000 Y NA
 2442021 2442022 SAL_0393 SAL_0394 accB fabZ TRUE 0.961 -3.000 0.047 0.007 Y NA
 2442022 2442023 SAL_0394 SAL_0395 fabZ accC TRUE 0.892 38.000 0.045 1.000 Y NA
 2442023 2442024 SAL_0395 SAL_0396 accC accD TRUE 0.976 9.000 0.090 0.003 Y NA
 2442024 2442025 SAL_0396 SAL_0397 accD accA TRUE 0.982 -7.000 0.234 0.003 Y NA
 2442025 2442026 SAL_0397 SAL_0398 accA   FALSE 0.000 470.000 0.000 NA   NA
 2442027 2442028 SAL_0436 SAL_0435 nusA   TRUE 0.965 48.000 0.759 NA   NA
 2442028 2442029 SAL_0435 SAL_0434     FALSE 0.005 582.000 0.004 NA   NA
 2442029 2442030 SAL_0434 SAL_0433     TRUE 0.876 -10.000 0.154 NA   NA
 2442030 2442031 SAL_0433 SAL_0432     TRUE 0.760 58.000 0.107 NA N NA
 2442031 2442032 SAL_0432 SAL_0431     FALSE 0.031 -469.000 0.000 NA   NA
 2442032 2442033 SAL_0431 SAL_0430     FALSE 0.000 322.000 0.000 NA   NA
 2442036 2442037 SAL_0427 SAL_0426 pkcI   TRUE 0.835 -3.000 0.063 NA   NA
 2442038 2442039 SAL_0425 SAL_0424     TRUE 0.956 9.000 0.283 NA   NA
 2442039 2442040 SAL_0424 SAL_0423     TRUE 0.688 -46.000 0.033 NA   NA
 2442040 2442041 SAL_0423 SAL_0422     FALSE 0.409 83.000 0.008 NA   NA
 2442041 2442042 SAL_0422 SAL_0421     FALSE 0.513 103.000 0.068 NA   NA
 2442042 2442043 SAL_0421 SAL_0420     TRUE 0.855 90.000 0.400 NA   NA
 2442044 2442045 SAL_0419 SAL_0418     FALSE 0.002 302.000 0.000 1.000   NA
 2442046 2442047 SAL_0001 SAL_0002 dnaN   TRUE 0.638 70.000 0.056 1.000   NA
 2442047 2442048 SAL_0002 SAL_0003     TRUE 0.796 10.000 0.015 NA   NA
 2442048 2442049 SAL_0003 SAL_0004     FALSE 0.002 202.000 0.000 NA   NA
 2442049 2442050 SAL_0004 SAL_0005   ychF FALSE 0.121 160.000 0.002 NA   NA
 2442050 2442051 SAL_0005 SAL_0006 ychF pth TRUE 0.892 84.000 0.184 1.000 Y NA
 2442051 2442052 SAL_0006 SAL_0007 pth   TRUE 0.918 -3.000 0.137 1.000 N NA
 2442052 2442053 SAL_0007 SAL_0008     FALSE 0.041 291.000 0.024 1.000 N NA
 2442053 2442054 SAL_0008 SAL_0009     TRUE 0.836 -13.000 0.053 1.000 N NA
 2442054 2442055 SAL_0009 SAL_0010     TRUE 0.746 3.000 0.009 NA   NA
 2442055 2442056 SAL_0010 SAL_0011     TRUE 0.874 0.000 0.105 NA   NA
 2442056 2442057 SAL_0011 SAL_0012     TRUE 0.838 2.000 0.014 1.000 N NA
 2442057 2442058 SAL_0012 SAL_0013   hpt TRUE 0.937 5.000 0.067 0.043 N NA
 2442058 2442059 SAL_0013 SAL_0014 hpt ftsH TRUE 0.930 23.000 0.192 1.000 N NA
 2442060 2442061 SAL_0344 SAL_0343     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2442061 2442062 SAL_0343 SAL_0342     FALSE 0.037 -19.000 0.000 NA   NA
 2442063 2442064 SAL_0341 SAL_0340     TRUE 0.910 47.000 0.319 1.000   NA
 2442065 2442066 SAL_0339 SAL_0338 pepC nadE FALSE 0.491 113.000 0.017 1.000 N NA
 2442066 2442067 SAL_0338 SAL_0337 nadE   TRUE 0.982 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 2442067 2442068 SAL_0337 SAL_0336   trxB FALSE 0.290 156.000 0.017 1.000 N NA
 2442068 2442069 SAL_0336 SAL_0335 trxB   TRUE 0.691 69.000 0.117 NA   NA
 2442069 2442070 SAL_0335 SAL_0334     TRUE 0.829 98.000 0.364 NA   NA
 2442070 2442071 SAL_0334 SAL_0333     TRUE 0.988 0.000 0.310 0.005 Y NA
 2442073 2442074 SAL_0331 SAL_0330     FALSE 0.428 138.000 0.036 1.000 N NA
 2442075 2442076 SAL_1145 SAL_1147     FALSE 0.011 117.000 0.000 NA   NA
 2442078 2442079 SAL_1148 SAL_1149   carB FALSE 0.009 127.000 0.000 NA   NA
 2442079 2442080 SAL_1149 SAL_1150 carB carA TRUE 0.961 31.000 0.117 0.002 Y NA
 2442080 2442081 SAL_1150 SAL_1151 carA pyrB TRUE 0.934 11.000 0.014 1.000 Y NA
 2442081 2442082 SAL_1151 SAL_1152 pyrB pyrC TRUE 0.815 165.000 0.452 1.000 Y NA
 2442082 2442083 SAL_1152 SAL_1153 pyrC pyrE TRUE 0.918 12.000 0.003 1.000 Y NA
 2442083 2442084 SAL_1153 SAL_1154 pyrE pyrF TRUE 0.965 13.000 0.133 1.000 Y NA
 2442084 2442085 SAL_1154 SAL_1155 pyrF   FALSE 0.001 213.000 0.000 NA   NA
 2442085 2442086 SAL_1155 SAL_1156     FALSE 0.031 40.000 0.000 NA   NA
 2442087 2442088 SAL_1411 SAL_1410     TRUE 0.637 72.000 0.083 NA   NA
 2442088 2442089 SAL_1410 SAL_1409     TRUE 0.838 0.000 0.056 NA   NA
 2442089 2442090 SAL_1409 SAL_1408   pcnA FALSE 0.002 185.000 0.000 NA   NA
 2442090 2442091 SAL_1408 SAL_1407 pcnA   TRUE 0.877 11.000 0.056 1.000   NA
 2442091 2442092 SAL_1407 SAL_1406     FALSE 0.034 35.000 0.000 NA   NA
 2442092 2442093 SAL_1406 SAL_1405     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2442093 2442094 SAL_1405 SAL_1404     TRUE 0.605 67.000 0.013 1.000 N NA
 2442094 2442095 SAL_1404 SAL_1403     TRUE 0.997 5.000 0.846 0.007 Y NA
 2442097 2442098 SAL_1401 SAL_1400 gdhA def TRUE 0.693 70.000 0.056 1.000 N NA
 2442100 2442101 SAL_1778 SAL_1777 secA aroG FALSE 0.127 126.000 0.000 1.000 N NA
 2442101 2442102 SAL_1777 SAL_1776 aroG acpS FALSE 0.415 25.000 0.000 1.000 N NA
 2442102 2442103 SAL_1776 SAL_1775 acpS alr TRUE 0.893 -3.000 0.093 1.000 N NA
 2442103 2442104 SAL_1775 SAL_1774 alr   FALSE 0.013 93.000 0.000 NA   NA
 2442104 2442105 SAL_1774 SAL_1773   recG FALSE 0.017 80.000 0.000 NA   NA
 2442105 2442106 SAL_1773 SAL_1772 recG   FALSE 0.024 291.000 0.008 1.000   NA
 2442106 2442107 SAL_1772 SAL_1771   aroE FALSE 0.063 98.000 0.000 1.000   NA
 2442112 2442113 SAL_1022 SAL_1023   gcp FALSE 0.141 120.000 0.000 1.000 N NA
 2442113 2442114 SAL_1023 SAL_1024 gcp rimI TRUE 0.566 76.000 0.030 1.000   NA
 2442114 2442115 SAL_1024 SAL_1025 rimI   TRUE 0.940 2.000 0.209 1.000   NA
 2442116 2442117 SAL_1026 SAL_1027     TRUE 0.944 54.000 0.576 NA   NA
 2442118 2442119 SAL_1028 SAL_1029   glnA FALSE 0.006 148.000 0.000 NA   NA
 2442119 2442120 SAL_1029 SAL_1030 glnA   TRUE 0.900 34.000 0.179 1.000 N NA
 2442120 2442121 SAL_1030 SAL_1031     TRUE 0.725 80.000 0.154 NA   NA
 2442121 2442122 SAL_1031 SAL_1032   pgk FALSE 0.019 263.000 0.002 NA   NA
 2442122 2442123 SAL_1032 SAL_1033 pgk olpA FALSE 0.247 135.000 0.003 1.000   NA
 2442124 2442125 SAL_0133 SAL_0134     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2442125 2442126 SAL_0134 SAL_0135   rbsC TRUE 0.968 53.000 0.847 NA   NA
 2442126 2442127 SAL_0135 SAL_0136 rbsC rbsA TRUE 0.992 11.000 0.358 0.002 Y NA
 2442127 2442128 SAL_0136 SAL_0137 rbsA rbsD TRUE 0.978 16.000 0.243 1.000 Y NA
 2442128 2442129 SAL_0137 SAL_0138 rbsD rbsK TRUE 0.949 -25.000 0.183 1.000 Y NA
 2442129 2442130 SAL_0138 SAL_0139 rbsK   TRUE 0.951 -7.000 0.281 1.000 N NA
 2442130 2442131 SAL_0139 SAL_0140     FALSE 0.022 58.000 0.000 NA   NA
 2442132 2442133 SAL_0141 SAL_0142     TRUE 0.984 0.000 0.591 1.000 N NA
 2442133 2442134 SAL_0142 SAL_0143     TRUE 0.881 31.000 0.133 1.000 N NA
 2442134 2442135 SAL_0143 SAL_0144     TRUE 0.986 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 2442135 2442136 SAL_0144 SAL_0145   argG FALSE 0.072 154.000 0.000 1.000 N NA
 2442136 2442137 SAL_0145 SAL_0146 argG argH TRUE 0.977 19.000 0.278 1.000 Y NA
 2442137 2442138 SAL_0146 SAL_0147 argH   FALSE 0.035 141.000 0.000 1.000   NA
 2442139 2442140 SAL_0097 SAL_0096 rpsM infA TRUE 0.656 160.000 0.075 0.023 Y NA
 2442140 2442141 SAL_0096 SAL_0095 infA   TRUE 0.583 116.000 0.059 1.000 N NA
 2442141 2442142 SAL_0095 SAL_0094     TRUE 0.818 95.000 0.241 1.000 N NA
 2442142 2442143 SAL_0094 SAL_0093   rplO TRUE 0.985 21.000 0.730 1.000 N NA
 2442143 2442144 SAL_0093 SAL_0092 rplO rpmD TRUE 0.971 125.000 0.653 0.003 Y NA
 2442146 2442147 SAL_0090 SAL_0089 rpsE rplR TRUE 0.996 19.000 0.814 0.024 Y NA
 2442147 2442148 SAL_0089 SAL_0088 rplR rplF TRUE 0.980 101.000 0.815 0.018 Y NA
 2442148 2442149 SAL_0088 SAL_0087 rplF rpsH TRUE 0.978 110.000 0.808 0.018 Y NA
 2442149 2442150 SAL_0087 SAL_0086 rpsH rpsN TRUE 0.908 155.000 0.473 0.018 Y NA
 2442150 2442151 SAL_0086 SAL_0085 rpsN   TRUE 0.987 33.000 0.496 0.018 Y NA
 2442151 2442152 SAL_0085 SAL_0084   rplX TRUE 0.994 24.000 0.758 0.018 Y NA
 2442152 2442153 SAL_0084 SAL_0083 rplX rplN TRUE 0.985 80.000 0.810 0.024 Y NA
 2442153 2442154 SAL_0083 SAL_0082 rplN rpsQ TRUE 0.994 25.000 0.791 0.024 Y NA
 2442154 2442155 SAL_0082 SAL_0081 rpsQ rpmC TRUE 0.995 26.000 0.828 0.018 Y NA
 2442157 2442158 SAL_0079 SAL_0078 rplP rpsC TRUE 0.997 4.000 0.828 0.024 Y NA
 2442158 2442159 SAL_0078 SAL_0077 rpsC rplV TRUE 0.991 40.000 0.719 0.024 Y NA
 2442159 2442160 SAL_0077 SAL_0076 rplV rpsS TRUE 0.996 16.000 0.769 0.024 Y NA
 2442160 2442161 SAL_0076 SAL_0075 rpsS rplB TRUE 0.981 99.000 0.820 0.024 Y NA
 2442161 2442162 SAL_0075 SAL_0074 rplB rplW TRUE 0.996 18.000 0.849 0.023 Y NA
 2442162 2442163 SAL_0074 SAL_0073 rplW rplD TRUE 0.987 0.000 0.307 0.018 Y NA
 2442163 2442164 SAL_0073 SAL_0072 rplD rplC TRUE 0.992 24.000 0.544 0.018 Y NA
 2442165 2442166 SAL_1609 SAL_1610     FALSE 0.287 8.000 0.000 1.000   NA
 2442168 2442169 SAL_1612 SAL_1613 pabB/C   FALSE 0.200 82.000 0.000 1.000 N NA
 2442171 2442172 SAL_1615 SAL_1616 psaC   TRUE 0.961 2.000 0.130 1.000 Y NA
 2442172 2442173 SAL_1616 SAL_1617     FALSE 0.549 171.000 0.135 1.000 Y NA
 2442174 2442175 SAL_0505 SAL_0506     FALSE 0.003 269.000 0.000 1.000   NA
 2442175 2442176 SAL_0506 SAL_0507     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2442176 2442177 SAL_0507 SAL_0508   valS FALSE 0.050 22.000 0.000 NA   NA
 2442177 2442178 SAL_0508 SAL_0509 valS   FALSE 0.016 224.000 0.000 1.000 N NA
 2442178 2442179 SAL_0509 SAL_0510     FALSE 0.013 95.000 0.000 NA   NA
 2442179 2442180 SAL_0510 SAL_0511     FALSE 0.003 177.000 0.000 NA   NA
 2442180 2442181 SAL_0511 SAL_0512     FALSE 0.538 210.000 0.664 NA   NA
 2442181 2442182 SAL_0512 SAL_0513     FALSE 0.056 -3.000 0.000 NA   NA
 2442182 2442183 SAL_0513 SAL_0514     TRUE 0.640 161.000 0.375 1.000   NA
 2442183 2442184 SAL_0514 SAL_0515     FALSE 0.137 160.000 0.005 NA   NA
 2442185 2442186 SAL_1449 SAL_1448   thiI TRUE 0.912 62.000 0.349 1.000 N NA
 2442186 2442187 SAL_1448 SAL_1447 thiI   FALSE 0.485 102.000 0.014 1.000 N NA
 2442187 2442188 SAL_1447 SAL_1446   rplU FALSE 0.030 190.000 0.000 1.000 N NA
 2442188 2442189 SAL_1446 SAL_1445 rplU   TRUE 0.975 7.000 0.208 NA Y NA
 2442189 2442190 SAL_1445 SAL_1444   rpmA TRUE 0.963 22.000 0.203 NA Y NA
 2442190 2442191 SAL_1444 SAL_1443 rpmA   FALSE 0.018 216.000 0.000 1.000 N NA
 2442191 2442192 SAL_1443 SAL_1442   lspA TRUE 0.928 9.000 0.119 1.000 N NA
 2442192 2442193 SAL_1442 SAL_1441 lspA rluD TRUE 0.847 -16.000 0.082 1.000 N NA
 2442193 2442194 SAL_1441 SAL_1440 rluD   FALSE 0.159 176.000 0.008 1.000 N NA
 2442194 2442195 SAL_1440 SAL_1439   carA TRUE 0.655 49.000 0.000 1.000 Y NA
 2442195 2442196 SAL_1439 SAL_1438 carA   TRUE 0.756 56.000 0.013 0.002   NA
 2442196 2442197 SAL_1438 SAL_1437     FALSE 0.002 202.000 0.000 NA   NA
 2442198 2442199 SAL_1426 SAL_1425   trmD TRUE 0.976 -13.000 0.672 1.000   NA
 2442199 2442200 SAL_1425 SAL_1424 trmD   TRUE 0.722 -19.000 0.007 1.000 N NA
 2442200 2442201 SAL_1424 SAL_1423   pfoS/R FALSE 0.420 137.000 0.059 1.000   NA
 2442201 2442202 SAL_1423 SAL_1422 pfoS/R panE TRUE 0.965 13.000 0.333 1.000   NA
 2442202 2442203 SAL_1422 SAL_1421 panE   FALSE 0.007 212.000 0.000 1.000   NA
 2442203 2442204 SAL_1421 SAL_1419     FALSE 0.034 144.000 0.000 1.000   NA
 2442206 2442207 SAL_1418 SAL_1417 lacR   TRUE 0.992 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 2442207 2442208 SAL_1417 SAL_1416   fruA TRUE 0.989 36.000 0.816 1.000 Y NA
 2442209 2442210 SAL_0112 SAL_0113     FALSE 0.315 289.000 0.196 0.002 Y NA
 2442210 2442211 SAL_0113 SAL_0114     FALSE 0.144 118.000 0.000 1.000 N NA
 2442211 2442212 SAL_0114 SAL_0115   truA FALSE 0.217 71.000 0.000 1.000 N NA
 2442212 2442213 SAL_0115 SAL_0116 truA   TRUE 0.807 -37.000 0.058 1.000 N NA
 2442213 2442214 SAL_0116 SAL_0117     TRUE 0.954 10.000 0.276 NA   NA
 2442214 2442215 SAL_0117 SAL_0118     TRUE 0.895 -3.000 0.149 NA   NA
 2442217 2442218 SAL_0120 SAL_0121 tig   FALSE 0.093 189.000 0.005 1.000   NA
 2442219 2442220 SAL_0168 SAL_0167   nifU TRUE 0.830 100.000 0.152 0.001 N NA
 2442220 2442221 SAL_0167 SAL_0166 nifU   TRUE 0.945 -13.000 0.292 1.000 N NA
 2442221 2442222 SAL_0166 SAL_0165     TRUE 0.985 2.000 0.606 1.000 N NA
 2442222 2442223 SAL_0165 SAL_0164     TRUE 0.931 37.000 0.139 1.000 Y NA
 2442223 2442224 SAL_0164 SAL_0163     FALSE 0.218 165.000 0.013 1.000 N NA
 2442226 2442227 SAL_0161 SAL_0160     FALSE 0.244 192.000 0.132 NA N NA
 2442227 2442228 SAL_0160 SAL_0159     TRUE 0.777 46.000 0.118 NA   NA
 2442230 2442231 SAL_0102 SAL_0103     FALSE 0.001 256.000 0.000 NA   NA
 2442231 2442232 SAL_0103 SAL_0104     FALSE 0.000 790.000 0.000 NA   NA
 2442232 2442233 SAL_0104 SAL_0105     FALSE 0.001 220.000 0.000 NA   NA
 2442233 2442234 SAL_0105 SAL_0106     FALSE 0.001 245.000 0.000 NA   NA
 2442234 2442235 SAL_0106 SAL_0107     FALSE 0.054 122.000 0.000 1.000   NA
 2442235 2442236 SAL_0107 SAL_0108     TRUE 0.934 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2442236 2442237 SAL_0108 SAL_0109     TRUE 0.934 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2442237 2442238 SAL_0109 SAL_0110   hrcA FALSE 0.482 95.000 0.009 1.000 N NA
 2442238 2442239 SAL_0110 SAL_0111 hrcA grpE TRUE 0.887 3.000 0.051 1.000 N NA
 2442240 2442241 SAL_1946 SAL_1947     TRUE 0.944 17.000 0.197 1.000 N NA
 2442241 2442242 SAL_1947 SAL_1948     TRUE 0.934 26.000 0.094 1.000 Y NA
 2442242 2442243 SAL_1948 SAL_1949     TRUE 0.973 12.000 0.167 1.000 Y NA
 2442243 2442244 SAL_1949 SAL_1950     FALSE 0.000 1060.000 0.000 NA   NA
 2442245 2442246 SAL_1951 SAL_1952     FALSE 0.042 133.000 0.000 1.000   NA
 2442246 2442247 SAL_1952 SAL_1953     FALSE 0.385 127.000 0.020 1.000   NA
 2442249 2442250 SAL_0824 SAL_0823   oxlT2 FALSE 0.009 129.000 0.000 NA   NA
 2442250 2442251 SAL_0823 SAL_0822 oxlT2 murF FALSE 0.012 241.000 0.000 1.000 N NA
 2442251 2442252 SAL_0822 SAL_0821 murF   TRUE 0.720 147.000 0.046 0.008 Y NA
 2442252 2442253 SAL_0821 SAL_0820   recR FALSE 0.332 141.000 0.010 1.000 N NA
 2442253 2442254 SAL_0820 SAL_0819 recR   TRUE 0.841 15.000 0.013 1.000 N NA
 2442254 2442255 SAL_0819 SAL_0818     FALSE 0.119 129.000 0.000 1.000 N NA
 2442255 2442256 SAL_0818 SAL_0817   tpiA FALSE 0.159 177.000 0.000 1.000 Y NA
 2442257 2442258 SAL_0558 SAL_0557     FALSE 0.239 186.000 0.079 1.000 N NA
 2442258 2442259 SAL_0557 SAL_0556     TRUE 0.706 64.000 0.114 NA   NA
 2442262 2442263 SAL_0553 SAL_0552     TRUE 0.981 10.000 0.579 NA   NA
 2442263 2442264 SAL_0552 SAL_0551     FALSE 0.038 259.000 0.031 NA   NA
 2442265 2442266 SAL_1955 SAL_1956     FALSE 0.137 123.000 0.000 1.000 N NA
 2442266 2442267 SAL_1956 SAL_1957   proS FALSE 0.130 125.000 0.000 1.000 N NA
 2442267 2442268 SAL_1957 SAL_1958 proS   TRUE 0.669 92.000 0.095 1.000 N NA
 2442268 2442269 SAL_1958 SAL_1959   cdsA TRUE 0.808 31.000 0.040 1.000 N NA
 2442269 2442270 SAL_1959 SAL_1960 cdsA uppS TRUE 0.960 15.000 0.113 1.000 Y NA
 2442272 2442273 SAL_1370 SAL_1369   rplL TRUE 0.990 64.000 0.884 0.018 Y NA
 2442276 2442277 SAL_1366 SAL_1365     FALSE 0.398 54.000 0.000 0.050   NA
 2442278 2442279 SAL_1364 SAL_1363     FALSE 0.032 -75.000 0.000 NA   NA
 2442280 2442281 SAL_1715 SAL_1716     TRUE 0.925 21.000 0.222 NA   NA
 2442282 2442283 SAL_1717 SAL_1718 gidB ktrB TRUE 0.820 15.000 0.006 1.000 N NA
 2442283 2442284 SAL_1718 SAL_1719 ktrB ktrA TRUE 0.994 13.000 0.490 0.005 Y NA
 2442285 2442286 SAL_1720 SAL_1721     TRUE 0.972 -7.000 0.530 1.000   NA
 2442286 2442287 SAL_1721 SAL_1722     TRUE 0.967 17.000 0.435 NA   NA
 2442287 2442288 SAL_1722 SAL_1723     FALSE 0.017 79.000 0.000 NA   NA
 2442289 2442290 SAL_1462 SAL_1461 infC rpmI TRUE 0.985 40.000 0.652 1.000 Y NA
 2442290 2442291 SAL_1461 SAL_1460 rpmI rplT TRUE 0.992 58.000 0.928 0.018 Y NA
 2442292 2442293 SAL_1459 SAL_1458     FALSE 0.031 -972.000 0.000 NA   NA
 2442294 2442295 SAL_1457 SAL_1456   aroD TRUE 0.871 21.000 0.125 NA   NA
 2442295 2442296 SAL_1456 SAL_1455 aroD aroB TRUE 0.663 94.000 0.000 0.003 Y NA
 2442296 2442297 SAL_1455 SAL_1454 aroB aroC TRUE 0.974 1.000 0.110 0.003 Y NA
 2442300 2442301 SAL_1576 SAL_1575   mutM FALSE 0.209 149.000 0.004 1.000   NA
 2442301 2442302 SAL_1575 SAL_1574 mutM   TRUE 0.858 -9.000 0.066 1.000 N NA
 2442302 2442303 SAL_1574 SAL_1573   natA FALSE 0.133 124.000 0.000 1.000 N NA
 2442303 2442304 SAL_1573 SAL_1572 natA   TRUE 0.948 -10.000 0.385 NA   NA
 2442304 2442305 SAL_1572 SAL_1571     FALSE 0.002 196.000 0.000 NA   NA
 2442306 2442307 SAL_0468 SAL_0469     TRUE 0.792 -9.000 0.037 1.000   NA
 2442307 2442308 SAL_0469 SAL_0470   tmbC FALSE 0.043 132.000 0.000 1.000   NA
 2442309 2442310 SAL_0471 SAL_0472 galU   TRUE 0.765 37.000 0.032 1.000 N NA
 2442311 2442312 SAL_0473 SAL_0474 rnpA   TRUE 0.895 13.000 0.052 1.000 N NA
 2442312 2442313 SAL_0474 SAL_0475   jag TRUE 0.905 8.000 0.106 1.000   NA
 2442314 2442315 SAL_1078 SAL_1077     FALSE 0.012 107.000 0.000 NA   NA
 2442315 2442316 SAL_1077 SAL_1076     TRUE 0.700 34.000 0.033 NA   NA
 2442316 2442317 SAL_1076 SAL_1075     TRUE 0.849 13.000 0.049 NA   NA
 2442317 2442318 SAL_1075 SAL_1074   truB FALSE 0.043 131.000 0.000 1.000   NA
 2442318 2442319 SAL_1074 SAL_1073 truB ribF TRUE 0.968 13.000 0.308 1.000 N NA
 2442319 2442320 SAL_1073 SAL_1072 ribF   TRUE 0.720 43.000 0.017 1.000 N NA
 2442320 2442321 SAL_1072 SAL_1071     TRUE 0.846 -7.000 0.042 1.000 N NA
 2442321 2442322 SAL_1071 SAL_1070     TRUE 0.819 68.000 0.229 NA   NA
 2442322 2442323 SAL_1070 SAL_1069     TRUE 0.773 -36.000 0.091 NA   NA
 2442324 2442325 SAL_1360 SAL_1359     TRUE 0.987 13.000 0.800 NA   NA
 2442326 2442327 SAL_1358 SAL_1357     FALSE 0.010 350.000 0.000 0.009   NA
 2442327 2442328 SAL_1357 SAL_1356     FALSE 0.005 158.000 0.000 NA   NA
 2442328 2442329 SAL_1356 SAL_1355     FALSE 0.001 224.000 0.000 NA   NA
 2442329 2442330 SAL_1355 SAL_1354     TRUE 0.970 54.000 0.667 0.050   NA
 2442330 2442331 SAL_1354 SAL_1353     FALSE 0.002 189.000 0.000 NA   NA
 2442332 2442333 SAL_0297 SAL_0296     TRUE 0.873 24.000 0.085 1.000 N NA
 2442335 2442336 SAL_0294 SAL_0293     TRUE 0.953 -3.000 0.333 NA   NA
 2442337 2442338 SAL_0292 SAL_0291     TRUE 0.807 43.000 0.000 0.009 Y NA
 2442338 2442339 SAL_0291 SAL_0290     TRUE 0.628 100.000 0.000 0.009 Y NA
 2442340 2442341 SAL_1100 SAL_1101 topA dprA TRUE 0.897 95.000 0.238 1.000 Y NA
 2442341 2442342 SAL_1101 SAL_1102 dprA   FALSE 0.099 138.000 0.000 1.000 N NA
 2442342 2442343 SAL_1102 SAL_1103     TRUE 0.796 62.000 0.012 1.000 Y NA
 2442343 2442344 SAL_1103 SAL_1104     TRUE 0.995 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 2442344 2442345 SAL_1104 SAL_1105     TRUE 0.992 -3.000 0.870 0.039   NA
 2442346 2442347 SAL_0329 SAL_0328   mraY FALSE 0.390 98.000 0.007 1.000   NA
 2442347 2442348 SAL_0328 SAL_0327 mraY   TRUE 0.939 2.000 0.038 1.000 Y NA
 2442348 2442349 SAL_0327 SAL_0326     TRUE 0.979 4.000 0.456 1.000 N NA
 2442349 2442350 SAL_0326 SAL_0325   mraW TRUE 0.903 15.000 0.077 1.000 N NA
 2442350 2442351 SAL_0325 SAL_0324 mraW   FALSE 0.254 134.000 0.003 1.000   NA
 2442352 2442353 SAL_0171 SAL_0172   oppB TRUE 0.573 119.000 0.000 0.039 Y NA
 2442353 2442354 SAL_0172 SAL_0173 oppB oppC1 TRUE 0.947 10.000 0.134 0.039   NA
 2442354 2442355 SAL_0173 SAL_0174 oppC1