MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudoalteromonas atlantica T6c

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3499794 3499795 Patl_0001 Patl_0002     TRUE 0.990 21.000 0.328 1.000 Y NA
 3499795 3499796 Patl_0002 Patl_0003     TRUE 0.988 23.000 0.318 1.000 Y NA
 3499796 3499797 Patl_0003 Patl_0004     TRUE 0.998 5.000 0.249 0.005 Y NA
 3499797 3499798 Patl_0004 Patl_0005     FALSE 0.101 115.000 0.000 1.000 N NA
 3499799 3499800 Patl_0006 Patl_0007     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3499800 3499801 Patl_0007 Patl_0008     TRUE 0.541 37.000 0.009 NA   NA
 3499801 3499802 Patl_0008 Patl_0009   glyQ TRUE 0.999 4.000 0.651 0.001 Y NA
 3499804 3499805 Patl_0011 Patl_0012     TRUE 0.997 9.000 0.679 NA   NA
 3499805 3499806 Patl_0012 Patl_0013     FALSE 0.003 478.000 0.000 NA   NA
 3499810 3499811 Patl_0017 Patl_0018     TRUE 0.902 41.000 0.231 NA   NA
 3499811 3499812 Patl_0018 Patl_0019     FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 3499812 3499813 Patl_0019 Patl_0020   trkA FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3499813 3499814 Patl_0020 Patl_0021 trkA   TRUE 0.782 48.000 0.122 1.000 N NA
 3499814 3499815 Patl_0021 Patl_0022     TRUE 0.999 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3499815 3499816 Patl_0022 Patl_0023     TRUE 0.992 10.000 0.105 0.023 Y NA
 3499817 3499818 Patl_0024 Patl_0025     TRUE 0.519 25.000 0.000 1.000   NA
 3499818 3499819 Patl_0025 Patl_0026     TRUE 0.988 2.000 0.124 NA   NA
 3499819 3499820 Patl_0026 Patl_0027     TRUE 0.915 57.000 0.331 NA   NA
 3499820 3499821 Patl_0027 Patl_0028     TRUE 0.752 69.000 0.137 NA N NA
 3499821 3499822 Patl_0028 Patl_0029     TRUE 0.964 4.000 0.058 NA N NA
 3499822 3499823 Patl_0029 Patl_0030     FALSE 0.017 203.000 0.000 1.000 N NA
 3499823 3499824 Patl_0030 Patl_0031     FALSE 0.051 147.000 0.000 1.000 N NA
 3499824 3499825 Patl_0031 Patl_0032     TRUE 0.986 -3.000 0.078 NA   NA
 3499827 3499828 Patl_R0001 Patl_R0002     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3499828 3499829 Patl_R0002 Patl_R0003     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3499829 3499830 Patl_R0003 Patl_R0004     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3499830 3499831 Patl_R0004 Patl_R0005     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3499832 3499833 Patl_0034 Patl_0035     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3499833 3499834 Patl_0035 Patl_0036     TRUE 0.970 10.000 0.111 1.000   NA
 3499836 3499837 Patl_0038 Patl_0039     TRUE 0.976 22.000 0.429 NA   NA
 3499837 3499838 Patl_0039 Patl_0040     FALSE 0.014 244.000 0.000 NA   NA
 3499838 3499839 Patl_0040 Patl_0041     TRUE 0.624 48.000 0.038 NA   NA
 3499840 3499841 Patl_0042 Patl_0043     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 3499842 3499843 Patl_0044 Patl_0045 slmA   FALSE 0.422 63.000 0.016 1.000 N NA
 3499844 3499845 Patl_0046 Patl_0047     FALSE 0.074 128.000 0.000 NA N NA
 3499845 3499846 Patl_0047 Patl_0048     FALSE 0.054 140.000 0.000 NA N NA
 3499846 3499847 Patl_0048 Patl_0049     TRUE 0.996 13.000 0.332 0.015 Y NA
 3499847 3499848 Patl_0049 Patl_0050     FALSE 0.093 151.000 0.003 NA   NA
 3499848 3499849 Patl_0050 Patl_0051     TRUE 0.520 41.000 0.010 NA   NA
 3499850 3499851 Patl_0052 Patl_0053   coaD FALSE 0.121 105.000 0.000 1.000 N NA
 3499851 3499852 Patl_0053 Patl_0054 coaD   FALSE 0.327 49.000 0.000 NA   NA
 3499852 3499853 Patl_0054 Patl_0055     FALSE 0.113 127.000 0.000 NA   NA
 3499856 3499857 Patl_0058 Patl_0059     TRUE 0.997 2.000 0.458 NA   NA
 3499857 3499858 Patl_0059 Patl_0060     TRUE 0.986 3.000 0.125 1.000   NA
 3499858 3499859 Patl_0060 Patl_0061     FALSE 0.094 147.000 0.007 1.000 N NA
 3499859 3499860 Patl_0061 Patl_0062   tdh TRUE 0.998 -3.000 0.547 1.000 N NA
 3499860 3499861 Patl_0062 Patl_0063 tdh   TRUE 0.908 16.000 0.089 1.000 N NA
 3499861 3499862 Patl_0063 Patl_0064     TRUE 0.996 4.000 0.405 1.000   NA
 3499864 3499865 Patl_0066 Patl_0067     TRUE 0.968 41.000 0.248 NA Y NA
 3499865 3499866 Patl_0067 Patl_0068     FALSE 0.299 38.000 0.000 1.000 N NA
 3499869 3499870 Patl_0071 Patl_0072     FALSE 0.258 137.000 0.053 1.000 N NA
 3499870 3499871 Patl_0072 Patl_0073     FALSE 0.142 98.000 0.000 1.000 N NA
 3499871 3499872 Patl_0073 Patl_0074     FALSE 0.013 255.000 0.000 1.000   NA
 3499872 3499873 Patl_0074 Patl_R0006     FALSE 0.002 757.000 0.000 NA   NA
 3499873 3499874 Patl_R0006 Patl_0075     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3499874 3499875 Patl_0075 Patl_0076     TRUE 0.590 114.000 0.150 NA N NA
 3499876 3499877 Patl_0077 Patl_0078     FALSE 0.346 81.000 0.004 1.000   NA
 3499877 3499878 Patl_0078 Patl_0079     TRUE 0.958 0.000 0.010 1.000   NA
 3499878 3499879 Patl_0079 Patl_0080   glgA FALSE 0.174 119.000 0.008 1.000 N NA
 3499879 3499880 Patl_0080 Patl_0081 glgA   FALSE 0.002 509.000 0.000 1.000 N NA
 3499880 3499881 Patl_0081 Patl_0082     FALSE 0.135 217.000 0.000 1.000 Y NA
 3499883 3499884 Patl_0084 Patl_0085 dipZ   FALSE 0.245 47.000 0.000 NA N NA
 3499885 3499886 Patl_0086 Patl_0087     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3499887 3499888 Patl_0088 Patl_0089     TRUE 0.874 60.000 0.254 1.000 N NA
 3499888 3499889 Patl_0089 Patl_0090     TRUE 0.994 15.000 0.275 0.001 Y NA
 3499893 3499894 Patl_0094 Patl_0095     FALSE 0.009 285.000 0.000 NA   NA
 3499895 3499896 Patl_0096 Patl_0097     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3499896 3499897 Patl_0097 Patl_0098     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 3499900 3499901 Patl_0101 Patl_0102     FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000   NA
 3499901 3499902 Patl_0102 Patl_0103     TRUE 0.999 1.000 0.674 NA   NA
 3499904 3499905 Patl_0105 Patl_0106     TRUE 0.995 3.000 0.065 0.006 Y NA
 3499906 3499907 Patl_0107 Patl_0108     FALSE 0.002 457.000 0.000 1.000 N NA
 3499908 3499909 Patl_0109 Patl_0110     TRUE 0.876 13.000 0.024 NA   NA
 3499911 3499912 Patl_0112 Patl_0113     FALSE 0.383 40.000 0.000 1.000   NA
 3499915 3499916 Patl_0116 Patl_0117     TRUE 0.996 -3.000 0.061 0.046 Y NA
 3499916 3499917 Patl_0117 Patl_0118     TRUE 0.969 13.000 0.017 1.000 Y NA
 3499917 3499918 Patl_0118 Patl_0119     TRUE 0.729 80.000 0.000 1.000 Y NA
 3499918 3499919 Patl_0119 Patl_0120     TRUE 0.976 57.000 0.400 1.000 Y NA
 3499920 3499921 Patl_0121 Patl_0122     FALSE 0.006 293.000 0.000 1.000 N NA
 3499921 3499922 Patl_0122 Patl_0123     TRUE 0.888 70.000 0.286 1.000   NA
 3499922 3499923 Patl_0123 Patl_0124     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3499923 3499924 Patl_0124 Patl_0125     TRUE 0.525 41.000 0.021 NA N NA
 3499924 3499925 Patl_0125 Patl_0126     TRUE 0.962 -3.000 0.021 NA N NA
 3499925 3499926 Patl_0126 Patl_0127     TRUE 0.882 0.000 0.000 NA N NA
 3499926 3499927 Patl_0127 Patl_0128     FALSE 0.227 59.000 0.000 1.000 N NA
 3499927 3499928 Patl_0128 Patl_0129     TRUE 0.981 3.000 0.105 1.000 N NA
 3499928 3499929 Patl_0129 Patl_0130     TRUE 0.977 33.000 0.667 1.000 N NA
 3499929 3499930 Patl_0130 Patl_0131     FALSE 0.210 67.000 0.000 1.000 N NA
 3499930 3499931 Patl_0131 Patl_0132     FALSE 0.005 370.000 0.000 NA   NA
 3499931 3499932 Patl_0132 Patl_0133     TRUE 0.993 15.000 0.667 NA   NA
 3499932 3499933 Patl_0133 Patl_0134     FALSE 0.028 194.000 0.000 NA   NA
 3499933 3499934 Patl_0134 Patl_0135     TRUE 0.953 21.000 0.222 NA   NA
 3499935 3499936 Patl_0136 Patl_0137     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499936 3499937 Patl_0137 Patl_0138   nudE TRUE 0.997 0.000 0.373 1.000   NA
 3499938 3499939 Patl_0139 Patl_0140     FALSE 0.050 167.000 0.000 1.000   NA
 3499939 3499940 Patl_0140 Patl_0141     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3499940 3499941 Patl_0141 Patl_0142     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499941 3499942 Patl_0142 Patl_0143     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3499943 3499944 Patl_0144 Patl_0145     TRUE 0.985 -7.000 0.077 NA   NA
 3499944 3499945 Patl_0145 Patl_0146     TRUE 0.716 17.000 0.004 NA   NA
 3499946 3499947 Patl_0147 Patl_0148     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 3499947 3499948 Patl_0148 Patl_0149     FALSE 0.002 593.000 0.000 1.000 N NA
 3499948 3499949 Patl_0149 Patl_0150     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3499950 3499951 Patl_0151 Patl_0152     TRUE 0.997 -7.000 0.062 0.001 Y NA
 3499951 3499952 Patl_0152 Patl_0153     FALSE 0.055 143.000 0.000 1.000 N NA
 3499952 3499953 Patl_0153 Patl_0154     TRUE 0.816 11.000 0.000 0.081 N NA
 3499953 3499954 Patl_0154 Patl_0155     FALSE 0.402 26.000 0.000 1.000 N NA
 3499954 3499955 Patl_0155 Patl_0156     FALSE 0.426 34.000 0.000 1.000   NA
 3499955 3499956 Patl_0156 Patl_0157     TRUE 0.781 15.000 0.000 0.061   NA
 3499956 3499957 Patl_0157 Patl_0158     TRUE 0.995 15.000 0.824 1.000   NA
 3499957 3499958 Patl_0158 Patl_0159     TRUE 0.854 7.000 0.000 1.000   NA
 3499958 3499959 Patl_0159 Patl_0160     TRUE 0.932 5.000 0.000 0.001   NA
 3499962 3499963 Patl_0163 Patl_0164 argD   TRUE 0.999 6.000 0.640 1.000 Y NA
 3499963 3499964 Patl_0164 Patl_0165     TRUE 0.505 71.000 0.027 NA   NA
 3499964 3499965 Patl_0165 Patl_0166     FALSE 0.012 253.000 0.000 NA   NA
 3499965 3499966 Patl_0166 Patl_0167     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3499966 3499967 Patl_0167 Patl_0168     TRUE 0.992 -3.000 0.148 NA   NA
 3499967 3499968 Patl_0168 Patl_0169     TRUE 0.986 2.000 0.115 NA   NA
 3499968 3499969 Patl_0169 Patl_0170     TRUE 0.988 -10.000 0.102 NA   NA
 3499969 3499970 Patl_0170 Patl_0171     TRUE 0.999 5.000 0.846 1.000 Y NA
 3499970 3499971 Patl_0171 Patl_0172     TRUE 0.984 -3.000 0.062 1.000   NA
 3499971 3499972 Patl_0172 Patl_0173     TRUE 0.985 -3.000 0.066 1.000   NA
 3499972 3499973 Patl_0173 Patl_0174     TRUE 1.000 -7.000 0.740 1.000 Y NA
 3499973 3499974 Patl_0174 Patl_0175     TRUE 0.951 4.000 0.026 NA   NA
 3499974 3499975 Patl_0175 Patl_0176     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3499975 3499976 Patl_0176 Patl_0177     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3499976 3499977 Patl_0177 Patl_0178     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3499977 3499978 Patl_0178 Patl_0179     TRUE 0.994 -10.000 0.200 1.000   NA
 3499978 3499979 Patl_0179 Patl_0180     TRUE 0.999 0.000 0.871 NA   NA
 3499979 3499980 Patl_0180 Patl_0181     TRUE 0.998 -10.000 0.548 NA   NA
 3499980 3499981 Patl_0181 Patl_0182     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3499981 3499982 Patl_0182 Patl_0183     FALSE 0.011 266.000 0.000 NA   NA
 3499982 3499983 Patl_0183 Patl_0184     TRUE 0.967 51.000 0.689 1.000 N NA
 3499983 3499984 Patl_0184 Patl_0185     TRUE 1.000 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3499984 3499985 Patl_0185 Patl_0186     TRUE 0.945 20.000 0.206 NA N NA
 3499985 3499986 Patl_0186 Patl_0187     TRUE 0.997 -10.000 0.417 NA N NA
 3499986 3499987 Patl_0187 Patl_0188     TRUE 0.996 -3.000 0.296 NA   NA
 3499987 3499988 Patl_0188 Patl_0189     TRUE 0.997 -7.000 0.358 NA   NA
 3499988 3499989 Patl_0189 Patl_0190     TRUE 0.996 -7.000 0.259 NA   NA
 3499990 3499991 Patl_0191 Patl_0192     TRUE 0.963 6.000 0.058 NA   NA
 3499993 3499994 Patl_0194 Patl_0195     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3499996 3499997 Patl_0197 Patl_0198     TRUE 0.993 -19.000 0.022 NA Y NA
 3499997 3499998 Patl_0198 Patl_0199     FALSE 0.063 135.000 0.000 NA N NA
 3499998 3499999 Patl_0199 Patl_0200     FALSE 0.400 96.000 0.024 1.000   NA
 3500000 3500001 Patl_0201 Patl_0202 fadB fadA TRUE 0.995 22.000 0.607 1.000 Y NA
 3500003 3500004 Patl_0204 Patl_0205     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3500005 3500006 Patl_0206 Patl_0207     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 3500006 3500007 Patl_0207 Patl_0208     FALSE 0.012 230.000 0.000 1.000 N NA
 3500008 3500009 Patl_0209 Patl_0210     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 3500010 3500011 Patl_0211 Patl_0212     FALSE 0.014 244.000 0.000 1.000   NA
 3500013 3500014 Patl_0214 Patl_0215     FALSE 0.164 124.000 0.003 NA   NA
 3500014 3500015 Patl_0215 Patl_0216     TRUE 0.574 82.000 0.051 NA   NA
 3500015 3500016 Patl_0216 Patl_0217     FALSE 0.305 57.000 0.000 NA   NA
 3500016 3500017 Patl_0217 Patl_0218     TRUE 0.999 0.000 0.566 1.000 Y NA
 3500017 3500018 Patl_0218 Patl_0219     TRUE 0.557 106.000 0.094 1.000   NA
 3500018 3500019 Patl_0219 Patl_0220     TRUE 0.996 11.000 0.556 0.001   NA
 3500019 3500020 Patl_0220 Patl_0221     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3500022 3500023 Patl_0223 Patl_0224     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500024 3500025 Patl_0225 Patl_0226 ompR envZ TRUE 0.993 26.000 0.584 1.000 Y NA
 3500026 3500027 Patl_0227 Patl_0228 hslO   FALSE 0.449 33.000 0.003 1.000 N NA
 3500028 3500029 Patl_0229 Patl_0230     FALSE 0.079 145.000 0.000 1.000   NA
 3500029 3500030 Patl_0230 Patl_0231     TRUE 0.999 6.000 0.575 0.007 Y NA
 3500030 3500031 Patl_0231 Patl_0232     TRUE 1.000 3.000 0.776 0.007 Y NA
 3500031 3500032 Patl_0232 Patl_0233     TRUE 1.000 2.000 0.653 0.007 Y NA
 3500032 3500033 Patl_0233 Patl_0234     TRUE 1.000 0.000 0.599 0.007 Y NA
 3500033 3500034 Patl_0234 Patl_0235     TRUE 0.957 43.000 0.425 0.007   NA
 3500034 3500035 Patl_0235 Patl_0236     TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.007   NA
 3500035 3500036 Patl_0236 Patl_0237     TRUE 0.999 -13.000 0.569 0.007   NA
 3500036 3500037 Patl_0237 Patl_0238     TRUE 0.999 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 3500037 3500038 Patl_0238 Patl_0239     TRUE 0.982 80.000 0.537 0.066 Y NA
 3500038 3500039 Patl_0239 Patl_0240     TRUE 1.000 2.000 0.811 1.000 Y NA
 3500039 3500040 Patl_0240 Patl_0241     TRUE 0.999 -3.000 0.649 1.000   NA
 3500042 3500043 Patl_0243 Patl_0244     FALSE 0.308 60.000 0.000 1.000   NA
 3500044 3500045 Patl_0245 Patl_0246     FALSE 0.036 252.000 0.040 1.000 N NA
 3500046 3500047 Patl_0247 Patl_0248     TRUE 0.756 50.000 0.112 NA N NA
 3500047 3500048 Patl_0248 Patl_0249     TRUE 0.956 -10.000 0.009 NA   NA
 3500048 3500049 Patl_0249 Patl_0250     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3500050 3500051 Patl_0251 Patl_0252     TRUE 0.585 110.000 0.000 1.000 Y NA
 3500053 3500054 Patl_0254 Patl_0255     TRUE 0.998 0.000 0.619 NA   NA
 3500054 3500055 Patl_0255 Patl_0256     TRUE 0.994 -10.000 0.209 NA   NA
 3500055 3500056 Patl_0256 Patl_0257     TRUE 0.996 1.000 0.333 1.000   NA
 3500057 3500058 Patl_0258 Patl_0259     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3500058 3500059 Patl_0259 Patl_0260     TRUE 0.511 124.000 0.000 NA Y NA
 3500059 3500060 Patl_0260 Patl_0261     TRUE 0.998 -3.000 0.575 NA   NA
 3500060 3500061 Patl_0261 Patl_0262     FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 3500061 3500062 Patl_0262 Patl_0263     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3500062 3500063 Patl_0263 Patl_0264     FALSE 0.046 169.000 0.000 NA   NA
 3500063 3500064 Patl_0264 Patl_0265     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500065 3500066 Patl_0266 Patl_0267     FALSE 0.268 102.000 0.007 NA   NA
 3500066 3500067 Patl_0267 Patl_0268     FALSE 0.092 158.000 0.006 NA   NA
 3500067 3500068 Patl_0268 Patl_0269     TRUE 0.582 100.000 0.101 1.000 N NA
 3500068 3500069 Patl_0269 Patl_0270     TRUE 0.886 30.000 0.161 1.000 N NA
 3500069 3500070 Patl_0270 Patl_0271     FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 3500073 3500074 Patl_0274 Patl_0275     FALSE 0.155 112.000 0.000 1.000   NA
 3500074 3500075 Patl_0275 Patl_0276     FALSE 0.060 179.000 0.000 0.080   NA
 3500075 3500076 Patl_0276 Patl_0277     FALSE 0.443 31.000 0.000 NA   NA
 3500076 3500077 Patl_0277 Patl_0278     FALSE 0.002 838.000 0.000 NA   NA
 3500077 3500078 Patl_0278 Patl_0279     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3500078 3500079 Patl_0279 Patl_0280     FALSE 0.082 143.000 0.000 1.000   NA
 3500079 3500080 Patl_0280 Patl_0281     TRUE 0.494 26.000 0.000 NA   NA
 3500080 3500081 Patl_0281 Patl_0282     FALSE 0.005 367.000 0.000 NA   NA
 3500081 3500082 Patl_0282 Patl_0283     TRUE 0.999 -7.000 0.351 1.000 Y NA
 3500082 3500083 Patl_0283 Patl_0284     TRUE 0.999 0.000 0.714 1.000 N NA
 3500084 3500085 Patl_0285 Patl_0286     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3500085 3500086 Patl_0286 Patl_0287     FALSE 0.264 45.000 0.000 1.000 N NA
 3500086 3500087 Patl_0287 Patl_0288     FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 3500087 3500088 Patl_0288 Patl_0289     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500088 3500089 Patl_0289 Patl_0290     TRUE 0.769 12.000 0.000 1.000   NA
 3500089 3500090 Patl_0290 Patl_0291     TRUE 0.590 52.000 0.031 1.000   NA
 3500092 3500093 Patl_0293 Patl_0294     FALSE 0.003 451.000 0.000 NA   NA
 3500093 3500094 Patl_0294 Patl_0295     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3500095 3500096 Patl_0296 Patl_0297     TRUE 0.962 3.000 0.031 NA   NA
 3500096 3500097 Patl_0297 Patl_0298     TRUE 0.984 8.000 0.172 NA   NA
 3500097 3500098 Patl_0298 Patl_0299     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3500098 3500099 Patl_0299 Patl_0300     TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA   NA
 3500099 3500100 Patl_0300 Patl_0301     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3500100 3500101 Patl_0301 Patl_0302     TRUE 0.920 -16.000 0.000 NA   NA
 3500102 3500103 Patl_0303 Patl_0304     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3500103 3500104 Patl_0304 Patl_0305     TRUE 0.984 1.000 0.087 NA   NA
 3500105 3500106 Patl_0306 Patl_0307     TRUE 0.991 -6.000 0.145 NA N NA
 3500107 3500108 Patl_0308 Patl_0309     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 3500111 3500112 Patl_0312 Patl_0313     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500114 3500115 Patl_0315 Patl_0316     FALSE 0.245 106.000 0.000 0.060   NA
 3500115 3500116 Patl_0316 Patl_0317     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3500116 3500117 Patl_0317 Patl_0318     TRUE 0.848 85.000 0.061 1.000 Y NA
 3500117 3500118 Patl_0318 Patl_0319     TRUE 0.990 43.000 0.600 0.080 Y NA
 3500118 3500119 Patl_0319 Patl_0320     TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 3500119 3500120 Patl_0320 Patl_0321     TRUE 0.861 74.000 0.239 NA   NA
 3500120 3500121 Patl_0321 Patl_0322     TRUE 0.875 33.000 0.000 0.080 Y NA
 3500123 3500124 Patl_0324 Patl_0325     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 3500125 3500126 Patl_0326 Patl_0327     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3500126 3500127 Patl_0327 Patl_0328     TRUE 0.921 -13.000 0.000 NA   NA
 3500127 3500128 Patl_0328 Patl_0329     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500128 3500129 Patl_0329 Patl_R0007     FALSE 0.020 215.000 0.000 NA   NA
 3500130 3500131 Patl_0330 Patl_0331     FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3500132 3500133 Patl_0332 Patl_0333     TRUE 0.866 13.000 0.017 1.000   NA
 3500134 3500135 Patl_0334 Patl_0335     TRUE 0.533 153.000 0.200 0.063   NA
 3500135 3500136 Patl_0335 Patl_0336     TRUE 0.984 10.000 0.200 1.000   NA
 3500136 3500137 Patl_0336 Patl_0337     TRUE 0.983 110.000 1.000 NA Y NA
 3500138 3500139 Patl_0338 Patl_0339     TRUE 0.867 2.000 0.000 1.000 N NA
 3500139 3500140 Patl_0339 Patl_0340     TRUE 1.000 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 3500140 3500141 Patl_0340 Patl_0341     TRUE 0.999 1.000 0.600 1.000 Y NA
 3500141 3500142 Patl_0341 Patl_0342     TRUE 0.998 4.000 0.205 0.002 Y NA
 3500142 3500143 Patl_0342 Patl_0343     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3500143 3500144 Patl_0343 Patl_0344     TRUE 0.466 28.000 0.000 NA   NA
 3500144 3500145 Patl_0344 Patl_0345     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3500145 3500146 Patl_0345 Patl_0346     TRUE 0.599 47.000 0.030 NA   NA
 3500147 3500148 Patl_0347 Patl_0348     TRUE 0.875 105.000 0.471 1.000 N NA
 3500148 3500149 Patl_0348 Patl_0349     TRUE 0.849 141.000 0.291 1.000 Y NA
 3500149 3500150 Patl_0349 Patl_0350     TRUE 0.942 22.000 0.215 NA N NA
 3500150 3500151 Patl_0350 Patl_0351     FALSE 0.330 194.000 0.057 NA Y NA
 3500151 3500152 Patl_0351 Patl_0352     FALSE 0.305 37.000 0.000 1.000 N NA
 3500152 3500153 Patl_0352 Patl_0353     FALSE 0.017 203.000 0.000 1.000 N NA
 3500153 3500154 Patl_0353 Patl_0354     TRUE 0.955 -7.000 0.007 NA   NA
 3500154 3500155 Patl_0354 Patl_0355     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 3500155 3500156 Patl_0355 Patl_0356     FALSE 0.290 37.000 0.000 NA N NA
 3500157 3500158 Patl_0357 Patl_0358     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA   NA
 3500162 3500163 Patl_0362 Patl_0363     FALSE 0.327 49.000 0.000 NA   NA
 3500163 3500164 Patl_0363 Patl_0364     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500164 3500165 Patl_0364 Patl_0365     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500165 3500166 Patl_0365 Patl_0366     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500166 3500167 Patl_0366 Patl_0367     TRUE 0.480 27.000 0.000 NA   NA
 3500167 3500168 Patl_0367 Patl_0368     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3500169 3500170 Patl_0369 Patl_0370     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500170 3500171 Patl_0370 Patl_0371     FALSE 0.009 285.000 0.000 NA   NA
 3500171 3500172 Patl_0371 Patl_0372     FALSE 0.104 132.000 0.000 NA   NA
 3500172 3500173 Patl_0372 Patl_0373     FALSE 0.131 102.000 0.000 1.000 N NA
 3500177 3500178 Patl_0377 Patl_0378     TRUE 0.468 133.000 0.000 1.000 Y NA
 3500178 3500179 Patl_0378 Patl_0379     FALSE 0.329 67.000 0.000 0.056 N NA
 3500179 3500180 Patl_0379 Patl_0380     FALSE 0.428 56.000 0.000 0.059   NA
 3500180 3500181 Patl_0380 Patl_0381     FALSE 0.184 103.000 0.000 1.000   NA
 3500181 3500182 Patl_0381 Patl_0382     TRUE 0.604 14.000 0.000 NA N NA
 3500182 3500183 Patl_0382 Patl_0383     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA N NA
 3500183 3500184 Patl_0383 Patl_0384     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 3500184 3500185 Patl_0384 Patl_0385     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3500190 3500191 Patl_0390 Patl_0391     FALSE 0.225 60.000 0.000 1.000 N NA
 3500191 3500192 Patl_0391 Patl_0392     TRUE 0.924 -16.000 0.000 1.000   NA
 3500192 3500193 Patl_0392 Patl_0393     TRUE 0.999 -24.000 0.627 0.062   NA
 3500193 3500194 Patl_0393 Patl_0394     TRUE 0.594 83.000 0.060 NA   NA
 3500194 3500195 Patl_0394 Patl_0395     TRUE 0.626 96.000 0.098 NA   NA
 3500195 3500196 Patl_0395 Patl_0396     TRUE 0.784 22.000 0.041 1.000 N NA
 3500199 3500200 Patl_R0008 Patl_R0009     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3500200 3500201 Patl_R0009 Patl_R0010     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500201 3500202 Patl_R0010 Patl_R0011     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3500202 3500203 Patl_R0011 Patl_R0012     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3500203 3500204 Patl_R0012 Patl_0399     FALSE 0.002 1115.000 0.000 NA   NA
 3500205 3500206 Patl_0400 Patl_0401     FALSE 0.004 400.000 0.000 NA   NA
 3500206 3500207 Patl_0401 Patl_0402     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3500207 3500208 Patl_0402 Patl_0403     FALSE 0.010 239.000 0.000 NA N NA
 3500208 3500209 Patl_0403 Patl_0404     TRUE 0.760 9.000 0.000 NA N NA
 3500210 3500211 Patl_0405 Patl_0406     FALSE 0.271 72.000 0.000 NA   NA
 3500211 3500212 Patl_0406 Patl_0407     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 3500212 3500213 Patl_0407 Patl_0408     FALSE 0.122 123.000 0.000 NA   NA
 3500215 3500216 Patl_0410 Patl_0411     TRUE 0.748 69.000 0.000 1.000 Y NA
 3500218 3500219 Patl_0413 Patl_0414     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 3500219 3500220 Patl_0414 Patl_0415     FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 3500220 3500221 Patl_0415 Patl_0416     FALSE 0.027 200.000 0.000 1.000   NA
 3500222 3500223 Patl_0417 Patl_0418     FALSE 0.015 244.000 0.004 1.000 N NA
 3500225 3500226 Patl_0420 Patl_0421     TRUE 0.915 1.000 0.000 1.000   NA
 3500227 3500228 Patl_0422 Patl_0423     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3500228 3500229 Patl_0423 Patl_0424     FALSE 0.173 209.000 0.000 0.096 Y NA
 3500229 3500230 Patl_0424 Patl_0425     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 3500230 3500231 Patl_0425 Patl_0426     TRUE 0.538 139.000 0.185 NA   NA
 3500232 3500233 Patl_0427 Patl_0428     FALSE 0.042 157.000 0.000 1.000 N NA
 3500236 3500237 Patl_0431 Patl_0432     TRUE 0.997 -16.000 0.443 NA   NA
 3500237 3500238 Patl_0432 Patl_0433     TRUE 0.985 16.000 0.433 NA   NA
 3500238 3500239 Patl_0433 Patl_0434     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500239 3500240 Patl_0434 Patl_0435     FALSE 0.238 85.000 0.000 NA   NA
 3500240 3500241 Patl_0435 Patl_0436     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3500242 3500243 Patl_0437 Patl_0438     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500246 3500247 Patl_0441 Patl_0442     TRUE 0.905 70.000 0.082 0.039 Y NA
 3500247 3500248 Patl_0442 Patl_0443     FALSE 0.177 85.000 0.000 1.000 N NA
 3500248 3500249 Patl_0443 Patl_0444     FALSE 0.122 123.000 0.000 NA   NA
 3500249 3500250 Patl_0444 Patl_0445     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3500251 3500252 Patl_0446 Patl_0447     TRUE 0.856 14.000 0.030 1.000 N NA
 3500253 3500254 Patl_0448 Patl_0449     TRUE 0.478 46.000 0.017 NA N NA
 3500254 3500255 Patl_0449 Patl_0450     FALSE 0.194 98.000 0.000 NA   NA
 3500255 3500256 Patl_0450 Patl_0451     FALSE 0.201 96.000 0.000 NA   NA
 3500256 3500257 Patl_0451 Patl_0452     FALSE 0.003 445.000 0.000 NA   NA
 3500257 3500258 Patl_0452 Patl_0453     TRUE 0.995 4.000 0.083 0.002 Y NA
 3500258 3500259 Patl_0453 Patl_0454     TRUE 0.999 -10.000 0.324 0.002 Y NA
 3500259 3500260 Patl_0454 Patl_0455     TRUE 0.996 12.000 0.312 0.002 Y NA
 3500260 3500261 Patl_0455 Patl_0456     TRUE 0.992 5.000 0.038 0.002 Y NA
 3500261 3500262 Patl_0456 Patl_0457     TRUE 0.972 25.000 0.116 0.002 Y NA
 3500262 3500263 Patl_0457 Patl_0458     TRUE 0.922 88.000 0.519 1.000 N NA
 3500263 3500264 Patl_0458 Patl_0459     TRUE 0.964 35.000 0.481 NA   NA
 3500264 3500265 Patl_0459 Patl_0460     TRUE 0.537 96.000 0.063 NA   NA
 3500265 3500266 Patl_0460 Patl_0461     FALSE 0.270 106.000 0.011 NA   NA
 3500266 3500267 Patl_0461 Patl_0462     FALSE 0.428 79.000 0.014 NA   NA
 3500268 3500269 Patl_0463 Patl_0464     FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000   NA
 3500269 3500270 Patl_0464 Patl_0465     FALSE 0.007 274.000 0.000 1.000 N NA
 3500270 3500271 Patl_0465 Patl_0466     FALSE 0.051 147.000 0.000 1.000 N NA
 3500271 3500272 Patl_0466 Patl_0467     FALSE 0.044 155.000 0.000 1.000 N NA
 3500273 3500274 Patl_0468 Patl_0469     TRUE 0.992 19.000 0.307 0.018 Y NA
 3500274 3500275 Patl_0469 Patl_0470   rplD TRUE 0.995 19.000 0.486 0.014 Y NA
 3500275 3500276 Patl_0470 Patl_0471 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3500276 3500277 Patl_0471 Patl_0472 rplW rplB TRUE 0.998 15.000 0.849 1.000 Y NA
 3500277 3500278 Patl_0472 Patl_0473 rplB   TRUE 0.998 16.000 0.820 0.018 Y NA
 3500278 3500279 Patl_0473 Patl_0474   rplV TRUE 0.999 11.000 0.769 0.018 Y NA
 3500279 3500280 Patl_0474 Patl_0475 rplV rpsC TRUE 0.999 10.000 0.719 0.018 Y NA
 3500280 3500281 Patl_0475 Patl_0476 rpsC rplP TRUE 1.000 3.000 0.828 0.018 Y NA
 3500281 3500282 Patl_0476 Patl_0477 rplP   TRUE 0.995 0.000 0.029 0.014 Y NA
 3500282 3500283 Patl_0477 Patl_0478     TRUE 0.995 0.000 0.029 0.014 Y NA
 3500285 3500286 Patl_0480 Patl_0481     FALSE 0.072 133.000 0.000 1.000 N NA
 3500287 3500288 Patl_0482 Patl_0483     FALSE 0.309 55.000 0.000 NA   NA
 3500288 3500289 Patl_0483 Patl_0484     TRUE 0.996 2.000 0.385 NA   NA
 3500291 3500292 Patl_0486 Patl_0487     FALSE 0.126 104.000 0.000 1.000 N NA
 3500293 3500294 Patl_0488 Patl_0489     TRUE 0.531 130.000 0.158 1.000 N NA
 3500296 3500297 Patl_0491 Patl_0492     TRUE 0.968 21.000 0.339 1.000 N NA
 3500297 3500298 Patl_0492 Patl_0493     FALSE 0.058 301.000 0.000 NA Y NA
 3500299 3500300 Patl_0494 Patl_0495     FALSE 0.415 45.000 0.008 1.000 N NA
 3500300 3500301 Patl_0495 Patl_0496     TRUE 0.470 55.000 0.021 1.000 N NA
 3500303 3500304 Patl_0498 Patl_0499     FALSE 0.020 221.000 0.000 1.000   NA
 3500304 3500305 Patl_0499 Patl_0500     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 3500307 3500308 Patl_0502 Patl_0503     FALSE 0.180 102.000 0.000 NA   NA
 3500308 3500309 Patl_0503 Patl_0504     FALSE 0.007 309.000 0.000 NA   NA
 3500309 3500310 Patl_0504 Patl_0505     TRUE 0.922 -12.000 0.000 NA   NA
 3500313 3500314 Patl_0508 Patl_0509     FALSE 0.284 83.000 0.005 1.000 N NA
 3500314 3500315 Patl_0509 Patl_0510     FALSE 0.216 63.000 0.000 1.000 N NA
 3500315 3500316 Patl_0510 Patl_0511     TRUE 0.839 9.000 0.000 1.000   NA
 3500317 3500318 Patl_0512 Patl_0513     FALSE 0.018 227.000 0.000 1.000   NA
 3500320 3500321 Patl_0515 Patl_0516     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500321 3500322 Patl_0516 Patl_0517     FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 3500322 3500323 Patl_0517 Patl_0518     TRUE 0.696 82.000 0.117 1.000 N NA
 3500323 3500324 Patl_0518 Patl_0519     FALSE 0.014 246.000 0.000 1.000   NA
 3500324 3500325 Patl_0519 Patl_0520     FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000   NA
 3500326 3500327 Patl_0521 Patl_0522     TRUE 0.992 20.000 0.909 1.000 N NA
 3500329 3500330 Patl_0524 Patl_0525     TRUE 0.997 11.000 0.916 NA   NA
 3500330 3500331 Patl_0525 Patl_0526     FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 3500331 3500332 Patl_0526 Patl_0527     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500332 3500333 Patl_0527 Patl_0528     FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 Y NA
 3500333 3500334 Patl_0528 Patl_0529     TRUE 0.893 33.000 0.184 1.000 N NA
 3500334 3500335 Patl_0529 Patl_0530     FALSE 0.070 151.000 0.000 1.000   NA
 3500336 3500337 Patl_0531 Patl_0532     TRUE 0.500 67.000 0.023 1.000   NA
 3500337 3500338 Patl_0532 Patl_0533     TRUE 0.855 46.000 0.017 1.000 Y NA
 3500338 3500339 Patl_0533 Patl_0534     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 3500339 3500340 Patl_0534 Patl_0535     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3500341 3500342 Patl_0536 Patl_0537     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3500345 3500346 Patl_0540 Patl_0541     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3500348 3500349 Patl_0543 Patl_0544     FALSE 0.007 310.000 0.000 NA   NA
 3500349 3500350 Patl_0544 Patl_0545     FALSE 0.218 115.000 0.007 NA   NA
 3500351 3500352 Patl_0546 Patl_0547     TRUE 0.772 40.000 0.085 NA   NA
 3500352 3500353 Patl_0547 Patl_0548     FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 3500353 3500354 Patl_0548 Patl_0549     FALSE 0.011 231.000 0.000 1.000 N NA
 3500355 3500356 Patl_0550 Patl_0551     FALSE 0.330 108.000 0.026 NA   NA
 3500357 3500358 Patl_0552 Patl_0553     FALSE 0.426 94.000 0.029 NA   NA
 3500358 3500359 Patl_0553 Patl_0554     FALSE 0.297 178.000 0.000 0.002 Y NA
 3500360 3500361 Patl_0555 Patl_0556     TRUE 0.860 70.000 0.258 NA N NA
 3500361 3500362 Patl_0556 Patl_0557     TRUE 0.969 28.000 0.453 NA   NA
 3500362 3500363 Patl_0557 Patl_0558     TRUE 0.971 1.000 0.035 NA   NA
 3500363 3500364 Patl_0558 Patl_0559     TRUE 0.650 32.000 0.021 NA   NA
 3500364 3500365 Patl_0559 Patl_0560     TRUE 0.991 14.000 0.562 NA   NA
 3500365 3500366 Patl_0560 Patl_0561     TRUE 0.999 1.000 0.530 NA Y NA
 3500367 3500368 Patl_0562 Patl_0563     TRUE 0.988 7.000 0.226 1.000 N NA
 3500368 3500369 Patl_0563 Patl_0564     TRUE 0.961 0.000 0.013 1.000   NA
 3500369 3500370 Patl_0564 Patl_0565     TRUE 0.963 -3.000 0.012 NA   NA
 3500370 3500371 Patl_0565 Patl_0566     TRUE 0.955 41.000 0.459 NA   NA
 3500371 3500372 Patl_0566 Patl_0567     TRUE 0.998 0.000 0.543 NA   NA
 3500372 3500373 Patl_0567 Patl_0568     TRUE 0.604 123.000 0.163 1.000   NA
 3500373 3500374 Patl_0568 Patl_0569     TRUE 0.988 26.000 0.820 NA N NA
 3500374 3500375 Patl_0569 Patl_0570     TRUE 0.992 16.000 0.728 NA N NA
 3500375 3500376 Patl_0570 Patl_0571     TRUE 0.991 3.000 0.186 NA   NA
 3500376 3500377 Patl_0571 Patl_0572     TRUE 0.994 -3.000 0.182 NA   NA
 3500378 3500379 Patl_0573 Patl_0574     FALSE 0.065 136.000 0.000 1.000 N NA
 3500379 3500380 Patl_0574 Patl_0575     TRUE 0.789 146.000 0.543 NA   NA
 3500380 3500381 Patl_0575 Patl_0576     TRUE 0.998 -9.000 0.568 NA   NA
 3500381 3500382 Patl_0576 Patl_0577     TRUE 0.997 5.000 0.541 NA   NA
 3500385 3500386 Patl_0580 Patl_0581     FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 3500386 3500387 Patl_0581 Patl_0582     FALSE 0.115 126.000 0.000 NA   NA
 3500389 3500390 Patl_0584 Patl_0585     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3500390 3500391 Patl_0585 Patl_0586     TRUE 0.825 52.000 0.000 0.010 Y NA
 3500391 3500392 Patl_0586 Patl_0587     FALSE 0.212 65.000 0.000 1.000 N NA
 3500392 3500393 Patl_0587 Patl_0588     FALSE 0.365 29.000 0.000 1.000 N NA
 3500395 3500396 Patl_0590 Patl_0591     FALSE 0.422 23.000 0.000 NA N NA
 3500396 3500397 Patl_0591 Patl_R0013     FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 3500397 3500398 Patl_R0013 Patl_0592     FALSE 0.012 256.000 0.000 NA   NA
 3500398 3500399 Patl_0592 Patl_0593     TRUE 0.999 3.000 0.843 1.000 N NA
 3500399 3500400 Patl_0593 Patl_0594     FALSE 0.202 402.000 0.681 1.000 N NA
 3500400 3500401 Patl_0594 Patl_0595   rplA TRUE 1.000 4.000 0.838 0.018 Y NA
 3500401 3500402 Patl_0595 Patl_0596 rplA rplJ FALSE 0.260 365.000 0.302 1.000 Y NA
 3500402 3500403 Patl_0596 Patl_0597 rplJ rplL TRUE 0.992 56.000 0.884 1.000 Y NA
 3500403 3500404 Patl_0597 Patl_0598 rplL   FALSE 0.123 278.000 0.223 1.000 N NA
 3500404 3500405 Patl_0598 Patl_0599     TRUE 0.990 91.000 0.851 0.001 Y NA
 3500405 3500406 Patl_0599 Patl_0600   rpsL FALSE 0.137 210.000 0.122 1.000 N NA
 3500406 3500407 Patl_0600 Patl_0601 rpsL   TRUE 0.987 77.000 0.620 0.003 Y NA
 3500407 3500408 Patl_0601 Patl_0602     TRUE 0.998 13.000 0.579 1.000 Y NA
 3500408 3500409 Patl_0602 Patl_0603     TRUE 0.979 64.000 0.400 0.001 Y NA
 3500409 3500410 Patl_0603 Patl_0604     FALSE 0.001 887.000 0.000 1.000 N NA
 3500411 3500412 Patl_0605 Patl_0606     FALSE 0.016 233.000 0.000 NA   NA
 3500413 3500414 Patl_0607 Patl_0608     FALSE 0.018 198.000 0.000 1.000 N NA
 3500416 3500417 Patl_0610 Patl_0611     FALSE 0.061 158.000 0.000 1.000   NA
 3500420 3500421 Patl_0614 Patl_0615     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3500422 3500423 Patl_0616 Patl_0617     FALSE 0.024 207.000 0.000 1.000   NA
 3500423 3500424 Patl_0617 Patl_0618     FALSE 0.004 413.000 0.000 1.000   NA
 3500424 3500425 Patl_0618 Patl_0619     TRUE 0.996 0.000 0.300 NA N NA
 3500425 3500426 Patl_0619 Patl_0620     FALSE 0.045 150.000 0.000 NA N NA
 3500426 3500427 Patl_0620 Patl_0621     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500427 3500428 Patl_0621 Patl_0622     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500428 3500429 Patl_0622 Patl_0623     FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 3500429 3500430 Patl_0623 Patl_0624     FALSE 0.019 221.000 0.000 NA   NA
 3500430 3500431 Patl_0624 Patl_0625     TRUE 0.999 0.000 0.371 0.001 Y NA
 3500432 3500433 Patl_0626 Patl_0627     FALSE 0.167 111.000 0.004 1.000 N NA
 3500433 3500434 Patl_0627 Patl_0628     FALSE 0.079 128.000 0.000 1.000 N NA
 3500434 3500435 Patl_0628 Patl_0629     TRUE 0.891 10.000 0.018 1.000 N NA
 3500435 3500436 Patl_0629 Patl_0630     FALSE 0.169 106.000 0.000 1.000   NA
 3500436 3500437 Patl_0630 Patl_0631     FALSE 0.123 125.000 0.000 1.000   NA
 3500437 3500438 Patl_0631 Patl_0632     FALSE 0.195 100.000 0.000 1.000   NA
 3500438 3500439 Patl_0632 Patl_0633     TRUE 0.580 78.000 0.049 NA   NA
 3500439 3500440 Patl_0633 Patl_0634     TRUE 0.971 1.000 0.035 NA   NA
 3500440 3500441 Patl_0634 Patl_0635     TRUE 0.992 2.000 0.198 1.000   NA
 3500444 3500445 Patl_0638 Patl_0639     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 3500446 3500447 Patl_0640 Patl_0641     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA   NA
 3500447 3500448 Patl_0641 Patl_0642     TRUE 0.988 -10.000 0.100 NA   NA
 3500448 3500449 Patl_0642 Patl_0643     TRUE 0.991 -13.000 0.143 NA   NA
 3500449 3500450 Patl_0643 Patl_0644     TRUE 0.986 99.000 0.875 1.000 Y NA
 3500451 3500452 Patl_0645 Patl_0646     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500453 3500454 Patl_0647 Patl_0648     TRUE 0.995 5.000 0.370 0.001 N NA
 3500454 3500455 Patl_0648 Patl_0649     FALSE 0.176 198.000 0.000 1.000 Y NA
 3500455 3500456 Patl_0649 Patl_0650     TRUE 0.994 4.000 0.333 1.000 N NA
 3500456 3500457 Patl_0650 Patl_0651   argD TRUE 0.992 22.000 0.429 1.000 Y NA
 3500457 3500458 Patl_0651 Patl_0652 argD   FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 3500458 3500459 Patl_0652 Patl_0653     FALSE 0.410 80.000 0.013 NA   NA
 3500460 3500461 Patl_0654 Patl_0655     TRUE 0.993 26.000 0.500 0.020 Y NA
 3500461 3500462 Patl_0655 Patl_0656     TRUE 0.643 21.000 0.000 0.016 N NA
 3500462 3500463 Patl_0656 Patl_0657     FALSE 0.029 175.000 0.000 1.000 N NA
 3500464 3500465 Patl_0658 Patl_0659     TRUE 0.685 24.000 0.022 1.000 N NA
 3500466 3500467 Patl_0660 Patl_0661     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 3500467 3500468 Patl_0661 Patl_0662     TRUE 0.994 6.000 0.346 NA   NA
 3500469 3500470 Patl_0663 Patl_0664     FALSE 0.210 93.000 0.000 NA   NA
 3500470 3500471 Patl_0664 Patl_0665     FALSE 0.045 187.000 0.002 NA   NA
 3500471 3500472 Patl_0665 Patl_0666     TRUE 0.971 33.000 0.208 1.000 Y NA
 3500472 3500473 Patl_0666 Patl_0667     FALSE 0.255 235.000 0.319 1.000 N NA
 3500473 3500474 Patl_0667 Patl_0668     TRUE 1.000 -7.000 0.668 NA Y NA
 3500474 3500475 Patl_0668 Patl_0669     TRUE 1.000 -3.000 0.680 NA Y NA
 3500475 3500476 Patl_0669 Patl_0670     TRUE 1.000 1.000 0.770 NA Y NA
 3500476 3500477 Patl_0670 Patl_0671     TRUE 0.999 -12.000 0.616 NA Y NA
 3500479 3500480 Patl_0673 Patl_0674     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3500480 3500481 Patl_0674 Patl_0675     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 3500481 3500482 Patl_0675 Patl_0676     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 3500482 3500483 Patl_0676 Patl_0677     FALSE 0.156 108.000 0.000 NA   NA
 3500483 3500484 Patl_0677 Patl_0678     TRUE 0.680 15.000 0.000 NA   NA
 3500485 3500486 Patl_0679 Patl_0680     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500486 3500487 Patl_0680 Patl_0681     FALSE 0.277 68.000 0.000 NA   NA
 3500487 3500488 Patl_0681 Patl_0682     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500488 3500489 Patl_0682 Patl_0683     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3500489 3500490 Patl_0683 Patl_0684     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500490 3500491 Patl_0684 Patl_0685     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 3500491 3500492 Patl_0685 Patl_0686     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500492 3500493 Patl_0686 Patl_0687     TRUE 0.993 -3.000 0.167 NA   NA
 3500493 3500494 Patl_0687 Patl_0688     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3500496 3500497 Patl_0690 Patl_0691     FALSE 0.294 61.000 0.000 NA   NA
 3500500 3500501 Patl_0694 Patl_0695     TRUE 0.998 1.000 0.636 NA   NA
 3500502 3500503 Patl_0696 Patl_0697     FALSE 0.321 55.000 0.000 1.000   NA
 3500503 3500504 Patl_0697 Patl_0698     TRUE 0.706 95.000 0.138 1.000   NA
 3500504 3500505 Patl_0698 Patl_0699     TRUE 0.921 110.000 0.568 0.001   NA
 3500505 3500506 Patl_0699 Patl_0700     TRUE 0.999 0.000 0.659 NA   NA
 3500506 3500507 Patl_0700 Patl_0701     TRUE 0.999 -7.000 0.848 NA   NA
 3500507 3500508 Patl_0701 Patl_0702     TRUE 0.995 16.000 0.848 NA   NA
 3500508 3500509 Patl_0702 Patl_0703     TRUE 0.999 4.000 0.939 NA   NA
 3500509 3500510 Patl_0703 Patl_0704     TRUE 0.985 1.000 0.094 NA   NA
 3500510 3500511 Patl_0704 Patl_0705     TRUE 0.998 -3.000 0.429 NA   NA
 3500511 3500512 Patl_0705 Patl_0706     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500512 3500513 Patl_0706 Patl_0707     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3500513 3500514 Patl_0707 Patl_0708     TRUE 0.972 21.000 0.344 NA   NA
 3500514 3500515 Patl_0708 Patl_0709     FALSE 0.284 64.000 0.000 NA   NA
 3500515 3500516 Patl_0709 Patl_0710     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500516 3500517 Patl_0710 Patl_0711     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3500517 3500518 Patl_0711 Patl_0712     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3500518 3500519 Patl_0712 Patl_0713     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500519 3500520 Patl_0713 Patl_0714     TRUE 0.999 -7.000 0.738 NA   NA
 3500520 3500521 Patl_0714 Patl_0715     TRUE 0.999 -3.000 0.738 NA   NA
 3500521 3500522 Patl_0715 Patl_0716     TRUE 0.993 -10.000 0.182 NA   NA
 3500522 3500523 Patl_0716 Patl_0717     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500523 3500524 Patl_0717 Patl_0718     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3500524 3500525 Patl_0718 Patl_0719     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500525 3500526 Patl_0719 Patl_0720     TRUE 0.998 0.000 0.529 NA   NA
 3500526 3500527 Patl_0720 Patl_0721     TRUE 0.998 -10.000 0.588 NA   NA
 3500527 3500528 Patl_0721 Patl_0722     TRUE 0.996 -6.000 0.250 NA   NA
 3500528 3500529 Patl_0722 Patl_0723     FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 3500529 3500530 Patl_0723 Patl_0724     FALSE 0.276 190.000 0.200 1.000 N NA
 3500530 3500531 Patl_0724 Patl_R0014   rnpB FALSE 0.016 235.000 0.000 NA   NA
 3500531 3500532 Patl_R0014 Patl_0725 rnpB   FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3500532 3500533 Patl_0725 Patl_0726     FALSE 0.018 226.000 0.000 1.000   NA
 3500534 3500535 Patl_0727 Patl_0728     FALSE 0.002 708.000 0.000 NA   NA
 3500535 3500536 Patl_0728 Patl_0729     TRUE 0.940 18.000 0.152 NA   NA
 3500536 3500537 Patl_0729 Patl_0730     TRUE 0.990 -3.000 0.130 1.000 N NA
 3500537 3500538 Patl_0730 Patl_0731     TRUE 0.560 151.000 0.250 NA   NA
 3500539 3500540 Patl_0732 Patl_0733     FALSE 0.011 269.000 0.000 1.000   NA
 3500540 3500541 Patl_0733 Patl_0734     TRUE 0.921 -13.000 0.000 NA   NA
 3500541 3500542 Patl_0734 Patl_0735     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 3500545 3500546 Patl_0738 Patl_0739     TRUE 0.930 13.000 0.080 1.000 N NA
 3500546 3500547 Patl_0739 Patl_0740     FALSE 0.006 347.000 0.000 NA   NA
 3500549 3500550 Patl_0742 Patl_0743     FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 3500551 3500552 Patl_0744 Patl_0745     FALSE 0.441 105.000 0.048 1.000   NA
 3500552 3500553 Patl_0745 Patl_0746     FALSE 0.051 165.000 0.000 1.000   NA
 3500554 3500555 Patl_0747 Patl_0748     TRUE 0.959 100.000 0.444 NA Y NA
 3500557 3500558 Patl_0750 Patl_0751     TRUE 0.936 51.000 0.143 NA Y NA
 3500558 3500559 Patl_0751 Patl_0752     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500559 3500560 Patl_0752 Patl_0753     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3500560 3500561 Patl_0753 Patl_0754     FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000 N NA
 3500561 3500562 Patl_0754 Patl_0755     FALSE 0.136 97.000 0.000 NA N NA
 3500563 3500564 Patl_0756 Patl_0757     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500566 3500567 Patl_0759 Patl_0760     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 3500569 3500570 Patl_0762 Patl_0763     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA   NA
 3500572 3500573 Patl_0765 Patl_0766     FALSE 0.004 431.000 0.000 1.000   NA
 3500573 3500574 Patl_0766 Patl_0767     FALSE 0.022 507.000 0.000 1.000 Y NA
 3500574 3500575 Patl_0767 Patl_0768     TRUE 0.604 120.000 0.154 1.000   NA
 3500577 3500578 Patl_0770 Patl_0771     TRUE 0.997 3.000 0.176 NA Y NA
 3500578 3500579 Patl_0771 Patl_0772     TRUE 0.996 3.000 0.143 NA Y NA
 3500579 3500580 Patl_0772 Patl_0773     FALSE 0.174 86.000 0.000 1.000 N NA
 3500580 3500581 Patl_0773 Patl_0774     TRUE 0.792 112.000 0.300 NA   NA
 3500581 3500582 Patl_0774 Patl_0775     FALSE 0.006 343.000 0.000 NA   NA
 3500584 3500585 Patl_0777 Patl_0778     FALSE 0.003 510.000 0.000 NA   NA
 3500585 3500586 Patl_0778 Patl_0779     TRUE 0.995 10.000 0.615 NA N NA
 3500589 3500590 Patl_0782 Patl_0783     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3500590 3500591 Patl_0783 Patl_0784     FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 3500591 3500592 Patl_0784 Patl_0785     FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 3500592 3500593 Patl_0785 Patl_0786     FALSE 0.263 171.000 0.000 NA Y NA
 3500593 3500594 Patl_0786 Patl_0787     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA N NA
 3500594 3500595 Patl_0787 Patl_0788     FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 3500595 3500596 Patl_0788 Patl_0789     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 3500596 3500597 Patl_0789 Patl_0790     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 3500598 3500599 Patl_0791 Patl_0792     TRUE 0.756 40.000 0.047 0.015   NA
 3500599 3500600 Patl_0792 Patl_0793     FALSE 0.195 100.000 0.000 1.000   NA
 3500600 3500601 Patl_0793 Patl_0794     FALSE 0.152 113.000 0.000 1.000   NA
 3500601 3500602 Patl_0794 Patl_R0015     FALSE 0.002 617.000 0.000 NA   NA
 3500604 3500605 Patl_0796 Patl_0797     FALSE 0.002 592.000 0.000 1.000 N NA
 3500605 3500606 Patl_0797 Patl_0798     TRUE 0.976 0.000 0.040 1.000   NA
 3500606 3500607 Patl_0798 Patl_0799     TRUE 0.793 11.000 0.000 1.000   NA
 3500609 3500610 Patl_0801 Patl_0802     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 3500610 3500611 Patl_0802 Patl_0803     TRUE 0.919 -22.000 0.000 NA   NA
 3500611 3500612 Patl_0803 Patl_0804     FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 3500612 3500613 Patl_0804 Patl_0805     TRUE 0.838 13.000 0.000 0.009   NA
 3500614 3500615 Patl_0806 Patl_0807     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 3500615 3500616 Patl_0807 Patl_0808     FALSE 0.216 91.000 0.000 NA   NA
 3500616 3500617 Patl_0808 Patl_0809     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3500618 3500619 Patl_0810 Patl_0811     FALSE 0.343 45.000 0.000 NA   NA
 3500619 3500620 Patl_0811 Patl_0812     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500620 3500621 Patl_0812 Patl_0813     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500622 3500623 Patl_0814 Patl_0815     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3500623 3500624 Patl_0815 Patl_0816     TRUE 0.832 9.000 0.000 NA   NA
 3500624 3500625 Patl_0816 Patl_0817     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3500627 3500628 Patl_0819 Patl_0820     TRUE 0.951 16.000 0.000 0.005 Y NA
 3500628 3500629 Patl_0820 Patl_0821     TRUE 0.853 3.000 0.000 1.000 N NA
 3500630 3500631 Patl_0822 Patl_0823     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 3500631 3500632 Patl_0823 Patl_0824     TRUE 0.498 42.000 0.000 0.026   NA
 3500634 3500635 Patl_0826 Patl_0827     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3500635 3500636 Patl_0827 Patl_0828     TRUE 0.818 5.000 0.000 1.000 N NA
 3500636 3500637 Patl_0828 Patl_0829     FALSE 0.262 46.000 0.000 1.000 N NA
 3500638 3500639 Patl_0830 Patl_0831     FALSE 0.332 51.000 0.000 1.000   NA
 3500640 3500641 Patl_0832 Patl_0833     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3500641 3500642 Patl_0833 Patl_0834     TRUE 0.867 5.000 0.000 NA   NA
 3500642 3500643 Patl_0834 Patl_0835     TRUE 0.743 13.000 0.000 1.000   NA
 3500643 3500644 Patl_0835 Patl_0836     TRUE 0.546 23.000 0.000 1.000   NA
 3500644 3500645 Patl_0836 Patl_0837     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3500650 3500651 Patl_0842 Patl_0843     TRUE 0.592 122.000 0.000 0.009 Y NA
 3500651 3500652 Patl_0843 Patl_0844     FALSE 0.002 645.000 0.000 1.000 N NA
 3500655 3500656 Patl_0847 Patl_0848     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 3500656 3500657 Patl_0848 Patl_0849     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 3500657 3500658 Patl_0849 Patl_0850     FALSE 0.018 199.000 0.000 1.000 N NA
 3500662 3500663 Patl_0854 Patl_0855     TRUE 0.980 0.000 0.053 NA   NA
 3500663 3500664 Patl_0855 Patl_0856     TRUE 0.541 57.000 0.027 NA   NA
 3500664 3500665 Patl_0856 Patl_0857     TRUE 0.994 11.000 0.526 NA   NA
 3500665 3500666 Patl_0857 Patl_0858     TRUE 0.998 6.000 0.737 NA   NA
 3500666 3500667 Patl_0858 Patl_0859     TRUE 0.998 -3.000 0.529 0.053 N NA
 3500667 3500668 Patl_0859 Patl_0860     FALSE 0.002 623.000 0.000 NA   NA
 3500668 3500669 Patl_0860 Patl_0861     FALSE 0.197 97.000 0.000 NA   NA
 3500670 3500671 Patl_0862 Patl_0863     FALSE 0.012 328.000 0.000 0.008   NA
 3500672 3500673 Patl_0864 Patl_0865     FALSE 0.002 1407.000 0.000 NA   NA
 3500675 3500676 Patl_0867 Patl_0868     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 3500676 3500677 Patl_0868 Patl_0869     FALSE 0.340 46.000 0.000 NA   NA
 3500677 3500678 Patl_0869 Patl_0870     FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 3500679 3500680 Patl_0871 Patl_0872     FALSE 0.372 27.000 0.000 NA N NA
 3500681 3500682 Patl_0873 Patl_0874     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3500684 3500685 Patl_0876 Patl_0877     FALSE 0.004 399.000 0.000 NA   NA
 3500685 3500686 Patl_0877 Patl_0878     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 3500686 3500687 Patl_0878 Patl_0879     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3500687 3500688 Patl_0879 Patl_0880     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 3500688 3500689 Patl_0880 Patl_0881     TRUE 0.546 23.000 0.000 1.000   NA
 3500689 3500690 Patl_0881 Patl_0882     FALSE 0.003 470.000 0.000 NA   NA
 3500690 3500691 Patl_0882 Patl_0883     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 3500692 3500693 Patl_0884 Patl_0885     FALSE 0.029 193.000 0.000 NA   NA
 3500693 3500694 Patl_0885 Patl_0886     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3500694 3500695 Patl_0886 Patl_0887     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 3500696 3500697 Patl_0888 Patl_0889     TRUE 0.787 76.000 0.000 0.005 Y NA
 3500697 3500698 Patl_0889 Patl_0890     FALSE 0.071 148.000 0.000 NA   NA
 3500698 3500699 Patl_0890 Patl_0891     FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 3500699 3500700 Patl_0891 Patl_0892     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000   NA
 3500700 3500701 Patl_0892 Patl_0893     TRUE 0.998 0.000 0.600 NA   NA
 3500701 3500702 Patl_0893 Patl_0894     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 3500702 3500703 Patl_0894 Patl_0895     FALSE 0.238 54.000 0.000 1.000 N NA
 3500703 3500704 Patl_0895 Patl_0896     FALSE 0.005 415.000 0.000 0.074 N NA
 3500704 3500705 Patl_0896 Patl_0897     TRUE 0.990 0.000 0.118 0.074 N NA
 3500705 3500706 Patl_0897 Patl_0898     TRUE 0.804 6.000 0.000 1.000 N NA
 3500706 3500707 Patl_0898 Patl_0899     TRUE 0.882 67.000 0.072 1.000 Y NA
 3500707 3500708 Patl_0899 Patl_0900     FALSE 0.111 131.000 0.000 1.000   NA
 3500708 3500709 Patl_0900 Patl_0901     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000   NA
 3500710 3500711 Patl_0902 Patl_0903     FALSE 0.007 321.000 0.000 NA   NA
 3500711 3500712 Patl_0903 Patl_0904     TRUE 0.652 16.000 0.000 NA   NA
 3500713 3500714 Patl_0905 Patl_0906     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3500714 3500715 Patl_0906 Patl_0907     FALSE 0.039 180.000 0.000 1.000   NA
 3500716 3500717 Patl_0908 Patl_0909     FALSE 0.069 149.000 0.000 NA   NA
 3500718 3500719 Patl_0910 Patl_0911     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3500722 3500723 Patl_0914 Patl_0915     FALSE 0.274 70.000 0.000 NA   NA
 3500724 3500725 Patl_0916 Patl_0917     FALSE 0.002 688.000 0.000 NA   NA
 3500725 3500726 Patl_0917 Patl_0918     TRUE 0.985 -7.000 0.077 NA   NA
 3500726 3500727 Patl_0918 Patl_0919     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3500727 3500728 Patl_0919 Patl_0920     FALSE 0.002 1330.000 0.000 NA   NA
 3500728 3500729 Patl_0920 Patl_0921     TRUE 0.908 130.000 0.775 NA   NA
 3500731 3500732 Patl_0923 Patl_0924     FALSE 0.006 345.000 0.000 NA   NA
 3500732 3500733 Patl_0924 Patl_0925     FALSE 0.002 433.000 0.000 1.000 N NA
 3500733 3500734 Patl_0925 Patl_0926     TRUE 0.962 101.000 0.466 1.000 Y NA
 3500734 3500735 Patl_0926 Patl_0927     TRUE 0.999 0.000 0.618 NA Y NA
 3500736 3500737 Patl_0928 Patl_0929     FALSE 0.234 86.000 0.000 NA   NA
 3500739 3500740 Patl_0931 Patl_0932     FALSE 0.043 174.000 0.000 NA   NA
 3500740 3500741 Patl_0932 Patl_0933     FALSE 0.002 843.000 0.000 NA   NA
 3500741 3500742 Patl_0933 Patl_0934     FALSE 0.343 167.000 0.159 NA   NA
 3500742 3500743 Patl_0934 Patl_0935     FALSE 0.052 188.000 0.000 0.058   NA
 3500743 3500744 Patl_0935 Patl_0936     TRUE 0.549 117.000 0.000 1.000 Y NA
 3500744 3500745 Patl_0936 Patl_0937     TRUE 0.998 3.000 0.667 1.000 N NA
 3500745 3500746 Patl_0937 Patl_0938     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 3500746 3500747 Patl_0938 Patl_0939     FALSE 0.031 189.000 0.000 NA   NA
 3500748 3500749 Patl_0940 Patl_0941     TRUE 0.994 6.000 0.385 1.000 N NA
 3500752 3500753 Patl_0944 Patl_0945     TRUE 0.979 8.000 0.133 NA   NA
 3500756 3500757 Patl_0948 Patl_0949     TRUE 0.973 12.000 0.185 1.000 N NA
 3500757 3500758 Patl_0949 Patl_0950     TRUE 0.811 94.000 0.051 1.000 Y NA
 3500758 3500759 Patl_0950 Patl_0951     TRUE 0.999 3.000 0.687 1.000 Y NA
 3500759 3500760 Patl_0951 Patl_0952   fabG TRUE 0.965 60.000 0.293 1.000 Y NA
 3500760 3500761 Patl_0952 Patl_0953 fabG   FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 3500761 3500762 Patl_0953 Patl_0954     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3500763 3500764 Patl_0955 Patl_0956     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 3500765 3500766 Patl_0957 Patl_0958     FALSE 0.009 281.000 0.000 NA   NA
 3500766 3500767 Patl_0958 Patl_0959     TRUE 0.925 0.000 0.000 1.000   NA
 3500767 3500768 Patl_0959 Patl_0960     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3500772 3500773 Patl_0964 Patl_0965     FALSE 0.343 93.000 0.011 NA   NA
 3500774 3500775 Patl_0966 Patl_0967     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 3500775 3500776 Patl_0967 Patl_0968     FALSE 0.002 457.000 0.000 1.000 N NA
 3500776 3500777 Patl_0968 Patl_0969     FALSE 0.030 313.000 0.071 1.000 N NA
 3500778 3500779 Patl_0970 Patl_0971     TRUE 0.997 2.000 0.163 1.000 Y NA
 3500779 3500780 Patl_0971 Patl_0972     TRUE 0.995 10.000 0.202 1.000 Y NA
 3500780 3500781 Patl_0972 Patl_0973     TRUE 0.989 3.000 0.012 1.000 Y NA
 3500781 3500782 Patl_0973 Patl_0974     TRUE 0.985 6.000 0.013 1.000 Y NA
 3500783 3500784 Patl_0975 Patl_0976     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 3500784 3500785 Patl_0976 Patl_0977     FALSE 0.261 78.000 0.000 NA   NA
 3500785 3500786 Patl_0977 Patl_0978     TRUE 0.909 24.000 0.004 1.000 Y NA
 3500786 3500787 Patl_0978 Patl_0979     TRUE 0.999 0.000 0.278 1.000 Y NA
 3500787 3500788 Patl_0979 Patl_0980     TRUE 0.891 36.000 0.025 1.000 Y NA
 3500788 3500789 Patl_0980 Patl_0981     TRUE 0.994 10.000 0.171 1.000 Y NA
 3500789 3500790 Patl_0981 Patl_0982   argC TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.002 Y NA
 3500791 3500792 Patl_0983 Patl_0984     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3500792 3500793 Patl_0984 Patl_0985   mgsA FALSE 0.286 63.000 0.000 NA   NA
 3500795 3500796 Patl_0987 Patl_0988     TRUE 0.995 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 3500796 3500797 Patl_0988 Patl_0989     FALSE 0.017 202.000 0.000 1.000 N NA
 3500797 3500798 Patl_0989 Patl_0990     FALSE 0.211 66.000 0.000 1.000 N NA
 3500800 3500801 Patl_0992 Patl_0993     FALSE 0.282 71.000 0.000 1.000   NA
 3500801 3500802 Patl_0993 Patl_0994     FALSE 0.178 140.000 0.019 1.000   NA
 3500802 3500803 Patl_0994 Patl_0995     TRUE 0.989 3.000 0.147 0.017 N NA
 3500805 3500806 Patl_0997 Patl_0998     FALSE 0.036 163.000 0.000 1.000 N NA
 3500806 3500807 Patl_0998 Patl_0999     FALSE 0.002 534.000 0.000 1.000 N NA
 3500807 3500808 Patl_0999 Patl_1000   rplX TRUE 0.999 13.000 0.810 0.017 Y NA
 3500808 3500809 Patl_1000 Patl_1001 rplX rplE TRUE 0.998 16.000 0.758 0.013 Y NA
 3500809 3500810 Patl_1001 Patl_1002 rplE   TRUE 0.998 11.000 0.496 0.013 Y NA
 3500810 3500811 Patl_1002 Patl_1003   rpsH TRUE 0.997 13.000 0.473 0.013 Y NA
 3500811 3500812 Patl_1003 Patl_1004 rpsH rplF TRUE 0.999 11.000 0.808 0.013 Y NA
 3500812 3500813 Patl_1004 Patl_1005 rplF   TRUE 0.999 13.000 0.815 0.013 Y NA
 3500813 3500814 Patl_1005 Patl_1006   rpsE TRUE 0.999 10.000 0.814 0.017 Y NA
 3500814 3500815 Patl_1006 Patl_1007 rpsE   TRUE 1.000 1.000 0.789 0.017 Y NA
 3500815 3500816 Patl_1007 Patl_1008   rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 3500816 3500817 Patl_1008 Patl_1009 rplO secY TRUE 0.998 6.000 0.730 1.000 N NA
 3500817 3500818 Patl_1009 Patl_1010 secY   TRUE 0.862 25.000 0.089 1.000   NA
 3500818 3500819 Patl_1010 Patl_1011   rpsM TRUE 0.688 126.000 0.194 0.013   NA
 3500819 3500820 Patl_1011 Patl_1012 rpsM   TRUE 0.999 13.000 0.810 0.013 Y NA
 3500820 3500821 Patl_1012 Patl_1013   rpsD TRUE 0.994 25.000 0.509 0.017 Y NA
 3500821 3500822 Patl_1013 Patl_1014 rpsD   TRUE 0.980 23.000 0.549 1.000 N NA
 3500822 3500823 Patl_1014 Patl_1015   rplQ TRUE 0.983 38.000 0.873 1.000 N NA
 3500825 3500826 Patl_R0016 Patl_R0017     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3500826 3500827 Patl_R0017 Patl_R0018     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3500827 3500828 Patl_R0018 Patl_R0019     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3500828 3500829 Patl_R0019 Patl_R0020     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3500829 3500830 Patl_R0020 Patl_1017     FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 3500831 3500832 Patl_1018 Patl_1019     TRUE 0.940 -16.000 0.008 1.000 N NA
 3500833 3500834 Patl_1020 Patl_1021     TRUE 0.982 -16.000 0.077 1.000 N NA
 3500834 3500835 Patl_1021 Patl_1022     TRUE 0.999 3.000 0.315 0.001 Y NA
 3500835 3500836 Patl_1022 Patl_1023     FALSE 0.144 97.000 0.000 1.000 N NA
 3500838 3500839 Patl_1025 Patl_1026 glnA   FALSE 0.146 170.000 0.044 NA   NA
 3500839 3500840 Patl_1026 Patl_1027     TRUE 0.806 84.000 0.188 NA   NA
 3500840 3500841 Patl_1027 Patl_1028     TRUE 1.000 -3.000 0.587 0.089 Y NA
 3500843 3500844 Patl_1030 Patl_1031     TRUE 0.857 33.000 0.121 NA   NA
 3500844 3500845 Patl_1031 Patl_1032     FALSE 0.260 122.000 0.022 NA   NA
 3500845 3500846 Patl_1032 Patl_1033     FALSE 0.003 450.000 0.000 NA   NA
 3500846 3500847 Patl_1033 Patl_1034     TRUE 0.971 38.000 0.500 0.001   NA
 3500847 3500848 Patl_1034 Patl_1035     FALSE 0.004 422.000 0.000 1.000   NA
 3500848 3500849 Patl_1035 Patl_1036     FALSE 0.005 375.000 0.000 1.000   NA
 3500849 3500850 Patl_1036 Patl_1037     TRUE 0.997 6.000 0.680 NA N NA
 3500851 3500852 Patl_1038 Patl_1039     TRUE 0.612 146.000 0.299 1.000 N NA
 3500852 3500853 Patl_1039 Patl_1040     FALSE 0.382 155.000 0.137 1.000   NA
 3500853 3500854 Patl_1040 Patl_1041   rpsU TRUE 0.821 85.000 0.173 0.020   NA
 3500857 3500858 Patl_1044 Patl_1045     TRUE 0.994 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 3500858 3500859 Patl_1045 Patl_1046     TRUE 0.990 -3.000 0.125 1.000 N NA
 3500859 3500860 Patl_1046 Patl_1047     TRUE 0.548 25.000 0.005 1.000 N NA
 3500861 3500862 Patl_1048 Patl_1049     FALSE 0.376 41.000 0.000 1.000   NA
 3500864 3500865 Patl_1051 Patl_1052 rdgC   TRUE 0.943 100.000 0.750 1.000 N NA
 3500866 3500867 Patl_1053 Patl_1054     TRUE 0.980 62.000 0.453 0.089 Y NA
 3500867 3500868 Patl_1054 Patl_1055     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 3500868 3500869 Patl_1055 Patl_1056     TRUE 0.917 68.000 0.373 NA   NA
 3500873 3500874 Patl_1060 Patl_1061     TRUE 0.998 8.000 0.933 NA   NA
 3500874 3500875 Patl_1061 Patl_1062     TRUE 0.993 12.000 0.455 0.017   NA
 3500875 3500876 Patl_1062 Patl_1063     TRUE 0.960 31.000 0.333 0.068   NA
 3500876 3500877 Patl_1063 Patl_1064     TRUE 0.998 4.000 0.786 1.000 N NA
 3500877 3500878 Patl_1064 Patl_1065     TRUE 0.968 12.000 0.143 1.000   NA
 3500878 3500879 Patl_1065 Patl_1066     FALSE 0.008 305.000 0.000 1.000   NA
 3500879 3500880 Patl_1066 Patl_1067     TRUE 0.536 120.000 0.000 1.000 Y NA
 3500880 3500881 Patl_1067 Patl_1068     FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 3500881 3500882 Patl_1068 Patl_1069     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500884 3500885 Patl_1071 Patl_1072     TRUE 0.977 24.000 0.474 1.000   NA
 3500885 3500886 Patl_1072 Patl_1073     TRUE 0.996 18.000 0.581 1.000 Y NA
 3500886 3500887 Patl_1073 Patl_1074     TRUE 0.996 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 3500887 3500888 Patl_1074 Patl_1075     TRUE 0.971 -9.000 0.027 1.000   NA
 3500889 3500890 Patl_1076 Patl_1077     TRUE 0.982 -3.000 0.051 NA   NA
 3500890 3500891 Patl_1077 Patl_1078     FALSE 0.020 215.000 0.000 NA   NA
 3500891 3500892 Patl_1078 Patl_1079     FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 3500892 3500893 Patl_1079 Patl_1080     TRUE 0.774 22.000 0.029 NA   NA
 3500894 3500895 Patl_1081 Patl_1082     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 3500898 3500899 Patl_1085 Patl_1086     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3500900 3500901 Patl_1087 Patl_1088     FALSE 0.094 247.000 0.000 1.000 Y NA
 3500901 3500902 Patl_1088 Patl_1089     TRUE 0.990 10.000 0.070 0.014 Y NA
 3500902 3500903 Patl_1089 Patl_1090     TRUE 0.999 4.000 0.667 0.014 Y NA
 3500903 3500904 Patl_1090 Patl_1091     TRUE 0.982 15.000 0.333 NA   NA
 3500904 3500905 Patl_1091 Patl_1092     TRUE 0.992 -3.000 0.143 NA   NA
 3500907 3500908 Patl_1094 Patl_1095     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3500909 3500910 Patl_1096 Patl_1097     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3500911 3500912 Patl_1098 Patl_1099     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 3500912 3500913 Patl_1099 Patl_1100     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3500913 3500914 Patl_1100 Patl_1101     FALSE 0.004 432.000 0.000 NA   NA
 3500914 3500915 Patl_1101 Patl_1102     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 3500916 3500917 Patl_1103 Patl_1104     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 3500917 3500918 Patl_1104 Patl_1105     FALSE 0.068 150.000 0.000 NA   NA
 3500918 3500919 Patl_1105 Patl_1106     FALSE 0.141 115.000 0.000 NA   NA
 3500920 3500921 Patl_1107 Patl_1108     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3500921 3500922 Patl_1108 Patl_1109     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 3500923 3500924 Patl_1110 Patl_1111     FALSE 0.002 919.000 0.000 1.000   NA
 3500924 3500925 Patl_1111 Patl_1112     FALSE 0.010 283.000 0.000 1.000   NA
 3500927 3500928 Patl_1114 Patl_1115     TRUE 0.991 3.000 0.013 0.073 Y NA
 3500929 3500930 Patl_1116 Patl_1117     FALSE 0.003 516.000 0.000 1.000   NA
 3500930 3500931 Patl_1117 Patl_1118     FALSE 0.007 276.000 0.000 1.000 N NA
 3500931 3500932 Patl_1118 Patl_1119     TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 3500932 3500933 Patl_1119 Patl_1120     TRUE 0.989 21.000 0.689 NA   NA
 3500933 3500934 Patl_1120 Patl_1121     FALSE 0.013 250.000 0.000 NA   NA
 3500935 3500936 Patl_1122 Patl_1123     FALSE 0.004 333.000 0.000 1.000 N NA
 3500936 3500937 Patl_1123 Patl_1124     TRUE 0.577 66.000 0.051 1.000 N NA
 3500937 3500938 Patl_1124 Patl_1125     TRUE 0.933 74.000 0.175 1.000 Y NA
 3500938 3500939 Patl_1125 Patl_1126     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 3500939 3500940 Patl_1126 Patl_1127     TRUE 0.569 109.000 0.108 NA   NA
 3500940 3500941 Patl_1127 Patl_1128     TRUE 0.687 94.000 0.143 1.000 N NA
 3500943 3500944 Patl_1130 Patl_1131     TRUE 0.793 140.000 0.463 0.005 N NA
 3500944 3500945 Patl_1131 Patl_1132     TRUE 0.736 23.000 0.029 1.000 N NA
 3500945 3500946 Patl_1132 Patl_1133     TRUE 0.594 15.000 0.000 1.000 N NA
 3500946 3500947 Patl_1133 Patl_1134     TRUE 0.953 0.000 0.014 1.000 N NA
 3500947 3500948 Patl_1134 Patl_1135     TRUE 0.994 5.000 0.078 0.005 Y NA
 3500948 3500949 Patl_1135 Patl_1136     TRUE 0.936 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3500949 3500950 Patl_1136 Patl_1137     TRUE 0.837 42.000 0.155 1.000 N NA
 3500950 3500951 Patl_1137 Patl_1138     TRUE 0.822 86.000 0.043 1.000 Y NA
 3500951 3500952 Patl_1138 Patl_1139     TRUE 0.931 36.000 0.049 0.005 Y NA
 3500952 3500953 Patl_1139 Patl_1140     FALSE 0.010 239.000 0.000 1.000 N NA
 3500953 3500954 Patl_1140 Patl_1141     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3500954 3500955 Patl_1141 Patl_R0021     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 3500956 3500957 Patl_1142 Patl_1143     TRUE 0.581 147.000 0.250 NA   NA
 3500958 3500959 Patl_1144 Patl_R0022     FALSE 0.004 394.000 0.000 NA   NA
 3500962 3500963 Patl_1147 Patl_1148     FALSE 0.011 270.000 0.000 1.000   NA
 3500963 3500964 Patl_1148 Patl_1149     FALSE 0.004 439.000 0.000 1.000   NA
 3500964 3500965 Patl_1149 Patl_1150     TRUE 0.896 28.000 0.000 0.027 Y NA
 3500965 3500966 Patl_1150 Patl_1151     TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.027 Y NA
 3500966 3500967 Patl_1151 Patl_1152     FALSE 0.011 233.000 0.000 1.000 N NA
 3500967 3500968 Patl_1152 Patl_1153     TRUE 0.988 -10.000 0.120 NA N NA
 3500968 3500969 Patl_1153 Patl_1154     TRUE 0.845 83.000 0.263 NA N NA
 3500969 3500970 Patl_1154 Patl_1155     FALSE 0.003 391.000 0.000 1.000 N NA
 3500970 3500971 Patl_1155 Patl_1156     FALSE 0.069 134.000 0.000 1.000 N NA
 3500978 3500979 Patl_1163 Patl_1164     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 3500979 3500980 Patl_1164 Patl_1165     FALSE 0.017 228.000 0.000 NA   NA
 3500982 3500983 Patl_1167 Patl_1168     TRUE 0.981 0.000 0.057 1.000   NA
 3500983 3500984 Patl_1168 Patl_1169     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3500984 3500985 Patl_1169 Patl_1170     TRUE 0.993 30.000 0.633 1.000 Y NA
 3500986 3500987 Patl_1171 Patl_1172     TRUE 0.950 3.000 0.029 NA N NA
 3500987 3500988 Patl_1172 Patl_1173     TRUE 0.817 22.000 0.043 1.000   NA
 3500988 3500989 Patl_1173 Patl_1174     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3500989 3500990 Patl_1174 Patl_1175     TRUE 0.611 18.000 0.000 NA   NA
 3500991 3500992 Patl_1176 Patl_1177     TRUE 0.690 29.000 0.026 NA   NA
 3500992 3500993 Patl_1177 Patl_1178     TRUE 0.967 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3500994 3500995 Patl_1179 Patl_1180     FALSE 0.101 133.000 0.000 NA   NA
 3500995 3500996 Patl_1180 Patl_1181     FALSE 0.424 33.000 0.000 NA   NA
 3500997 3500998 Patl_1182 Patl_1183     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3500998 3500999 Patl_1183 Patl_1184     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3500999 3501000 Patl_1184 Patl_1185     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA N NA
 3501000 3501001 Patl_1185 Patl_1186     FALSE 0.051 144.000 0.000 NA N NA
 3501001 3501002 Patl_1186 Patl_1187     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3501002 3501003 Patl_1187 Patl_1188     TRUE 0.986 -3.000 0.077 1.000   NA
 3501003 3501004 Patl_1188 Patl_1189     FALSE 0.347 44.000 0.000 NA   NA
 3501004 3501005 Patl_1189 Patl_1190     FALSE 0.204 95.000 0.000 NA   NA
 3501005 3501006 Patl_1190 Patl_1191     TRUE 0.939 26.000 0.222 1.000   NA
 3501006 3501007 Patl_1191 Patl_1192     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501007 3501008 Patl_1192 Patl_1193     TRUE 0.997 4.000 0.500 1.000   NA
 3501008 3501009 Patl_1193 Patl_1194     TRUE 0.979 14.000 0.300 1.000 N NA
 3501009 3501010 Patl_1194 Patl_1195     TRUE 0.552 74.000 0.036 1.000   NA
 3501010 3501011 Patl_1195 Patl_1196     TRUE 0.978 -3.000 0.036 1.000   NA
 3501011 3501012 Patl_1196 Patl_1197     TRUE 0.988 0.000 0.100 1.000   NA
 3501012 3501013 Patl_1197 Patl_1198     TRUE 0.995 4.000 0.120 NA Y NA
 3501013 3501014 Patl_1198 Patl_1199     TRUE 0.934 31.000 0.250 NA   NA
 3501014 3501015 Patl_1199 Patl_1200     TRUE 0.980 8.000 0.143 NA   NA
 3501015 3501016 Patl_1200 Patl_1201     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3501016 3501017 Patl_1201 Patl_1202     FALSE 0.068 152.000 0.000 1.000   NA
 3501017 3501018 Patl_1202 Patl_1203     FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 3501018 3501019 Patl_1203 Patl_1204     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 3501019 3501020 Patl_1204 Patl_1205     FALSE 0.447 32.000 0.000 1.000   NA
 3501020 3501021 Patl_1205 Patl_1206     FALSE 0.213 92.000 0.000 NA   NA
 3501021 3501022 Patl_1206 Patl_1207     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501023 3501024 Patl_1208 Patl_1209     FALSE 0.077 144.000 0.000 NA   NA
 3501024 3501025 Patl_1209 Patl_1210     TRUE 0.911 1.000 0.000 NA   NA
 3501025 3501026 Patl_1210 Patl_1211     TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 3501026 3501027 Patl_1211 Patl_1212     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501028 3501029 Patl_1213 Patl_1214     TRUE 0.793 99.000 0.250 1.000 N NA
 3501029 3501030 Patl_1214 Patl_1215     FALSE 0.008 264.000 0.000 1.000 N NA
 3501032 3501033 Patl_1217 Patl_1218     FALSE 0.245 116.000 0.013 NA   NA
 3501033 3501034 Patl_1218 Patl_1219     FALSE 0.438 68.000 0.013 NA   NA
 3501034 3501035 Patl_1219 Patl_1220     TRUE 0.964 9.000 0.079 NA   NA
 3501035 3501036 Patl_1220 Patl_1221     TRUE 0.949 9.000 0.045 NA   NA
 3501036 3501037 Patl_1221 Patl_1222     TRUE 0.965 27.000 0.379 NA   NA
 3501037 3501038 Patl_1222 Patl_1223     TRUE 0.997 2.000 0.455 NA   NA
 3501038 3501039 Patl_1223 Patl_1224     FALSE 0.274 178.000 0.143 NA   NA
 3501039 3501040 Patl_1224 Patl_1225     TRUE 0.995 16.000 0.911 NA   NA
 3501041 3501042 Patl_1226 Patl_1227     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 3501042 3501043 Patl_1227 Patl_1228     TRUE 0.802 181.000 0.360 0.001 Y NA
 3501043 3501044 Patl_1228 Patl_1229   yajC TRUE 0.945 31.000 0.325 NA N NA
 3501044 3501045 Patl_1229 Patl_1230 yajC secD TRUE 0.779 78.000 0.009 NA Y NA
 3501045 3501046 Patl_1230 Patl_1231 secD   TRUE 0.987 11.000 0.045 0.001 Y NA
 3501048 3501049 Patl_1233 Patl_1234     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 3501049 3501050 Patl_1234 Patl_1235     FALSE 0.434 32.000 0.000 NA   NA
 3501050 3501051 Patl_1235 Patl_1236     TRUE 0.991 3.000 0.208 1.000 N NA
 3501051 3501052 Patl_1236 Patl_1237     TRUE 0.694 126.000 0.271 1.000 N NA
 3501052 3501053 Patl_1237 Patl_1238     TRUE 0.980 17.000 0.424 1.000 N NA
 3501053 3501054 Patl_1238 Patl_1239     TRUE 0.927 64.000 0.448 1.000 N NA
 3501054 3501055 Patl_1239 Patl_1240     TRUE 0.973 26.000 0.359 0.001   NA
 3501055 3501056 Patl_1240 Patl_1241   hscB TRUE 0.817 135.000 0.500 1.000   NA
 3501056 3501057 Patl_1241 Patl_1242 hscB   TRUE 0.996 21.000 0.634 1.000 Y NA
 3501057 3501058 Patl_1242 Patl_1243     TRUE 0.975 47.000 0.794 1.000 N NA
 3501058 3501059 Patl_1243 Patl_1244     FALSE 0.084 139.000 0.000 NA   NA
 3501060 3501061 Patl_1245 Patl_1246     FALSE 0.405 111.000 0.046 1.000   NA
 3501061 3501062 Patl_1246 Patl_1247     FALSE 0.097 136.000 0.000 1.000   NA
 3501062 3501063 Patl_1247 Patl_1248     TRUE 0.542 148.000 0.243 1.000 N NA
 3501064 3501065 Patl_1249 Patl_1250   tsf TRUE 0.962 133.000 0.748 1.000 Y NA
 3501065 3501066 Patl_1250 Patl_1251 tsf pyrH FALSE 0.244 268.000 0.416 1.000 N NA
 3501066 3501067 Patl_1251 Patl_1252 pyrH   TRUE 0.990 16.000 0.626 1.000 N NA
 3501067 3501068 Patl_1252 Patl_1253     TRUE 0.984 15.000 0.409 1.000 N NA
 3501068 3501069 Patl_1253 Patl_1254     TRUE 0.978 50.000 0.400 1.000 Y NA
 3501069 3501070 Patl_1254 Patl_1255     TRUE 0.999 0.000 0.372 1.000 Y NA
 3501070 3501071 Patl_1255 Patl_1256     TRUE 0.998 0.000 0.568 1.000 N NA
 3501071 3501072 Patl_1256 Patl_1257     TRUE 0.835 62.000 0.026 1.000 Y NA
 3501072 3501073 Patl_1257 Patl_1258     TRUE 0.917 55.000 0.104 1.000 Y NA
 3501073 3501074 Patl_1258 Patl_1259     TRUE 0.993 43.000 0.814 1.000 Y NA
 3501074 3501075 Patl_1259 Patl_1260     TRUE 0.978 42.000 0.796 1.000 N NA
 3501075 3501076 Patl_1260 Patl_1261     TRUE 0.999 2.000 0.850 1.000 N NA
 3501076 3501077 Patl_1261 Patl_1262     TRUE 0.998 4.000 0.289 1.000 Y NA
 3501077 3501078 Patl_1262 Patl_1263     TRUE 0.992 1.000 0.186 1.000 N NA
 3501078 3501079 Patl_1263 Patl_1264     TRUE 0.996 1.000 0.104 1.000 Y NA
 3501079 3501080 Patl_1264 Patl_1265     TRUE 0.781 49.000 0.122 1.000 N NA
 3501080 3501081 Patl_1265 Patl_1266     TRUE 0.645 97.000 0.123 1.000 N NA
 3501081 3501082 Patl_1266 Patl_1267     FALSE 0.039 160.000 0.000 1.000 N NA
 3501083 3501084 Patl_1268 Patl_1269     FALSE 0.009 298.000 0.000 1.000   NA
 3501085 3501086 Patl_1270 Patl_1271     FALSE 0.111 109.000 0.000 1.000 N NA
 3501086 3501087 Patl_1271 Patl_1272     FALSE 0.204 72.000 0.000 1.000 N NA
 3501087 3501088 Patl_1272 Patl_1273     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3501089 3501090 Patl_1274 Patl_1275     TRUE 0.493 27.000 0.000 1.000   NA
 3501090 3501091 Patl_1275 Patl_1276     FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000   NA
 3501091 3501092 Patl_1276 Patl_1277     TRUE 0.499 95.000 0.048 NA   NA
 3501095 3501096 Patl_1280 Patl_1281     FALSE 0.035 186.000 0.000 1.000   NA
 3501096 3501097 Patl_1281 Patl_1282     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3501097 3501098 Patl_1282 Patl_1283     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501099 3501100 Patl_1284 Patl_1285     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501100 3501101 Patl_1285 Patl_1286     FALSE 0.003 549.000 0.000 1.000   NA
 3501101 3501102 Patl_1286 Patl_1287     FALSE 0.200 136.000 0.020 1.000   NA
 3501102 3501103 Patl_1287 Patl_1288     FALSE 0.399 81.000 0.020 1.000 N NA
 3501104 3501105 Patl_1289 Patl_1290     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3501105 3501106 Patl_1290 Patl_1291     TRUE 0.999 3.000 0.480 0.003 Y NA
 3501106 3501107 Patl_1291 Patl_1292     TRUE 0.999 -3.000 0.258 0.003 Y NA
 3501107 3501108 Patl_1292 Patl_1293     TRUE 0.999 0.000 0.273 0.054 Y NA
 3501108 3501109 Patl_1293 Patl_1294     TRUE 0.925 14.000 0.064 0.059 N NA
 3501110 3501111 Patl_1295 Patl_1296     FALSE 0.066 175.000 0.000 0.093   NA
 3501112 3501113 Patl_1297 Patl_1298     TRUE 0.531 24.000 0.000 1.000   NA
 3501113 3501114 Patl_1298 Patl_1299     FALSE 0.011 270.000 0.000 1.000   NA
 3501114 3501115 Patl_1299 Patl_1300     FALSE 0.005 379.000 0.000 NA   NA
 3501116 3501117 Patl_1301 Patl_1302     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501117 3501118 Patl_1302 Patl_1303     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3501118 3501119 Patl_1303 Patl_1304     TRUE 0.705 14.000 0.000 NA   NA
 3501119 3501120 Patl_1304 Patl_1305     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501120 3501121 Patl_1305 Patl_1306     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3501121 3501122 Patl_1306 Patl_1307     TRUE 0.785 11.000 0.000 NA   NA
 3501122 3501123 Patl_1307 Patl_1308     FALSE 0.002 933.000 0.000 NA   NA
 3501123 3501124 Patl_1308 Patl_1309     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3501125 3501126 Patl_1310 Patl_1311     TRUE 0.883 59.000 0.277 NA N NA
 3501126 3501127 Patl_1311 Patl_1312     TRUE 0.900 144.000 0.456 1.000 Y NA
 3501127 3501128 Patl_1312 Patl_1313     TRUE 0.822 96.000 0.065 1.000 Y NA
 3501128 3501129 Patl_1313 Patl_1314     FALSE 0.213 250.000 0.049 0.001 Y NA
 3501129 3501130 Patl_1314 Patl_1315     TRUE 0.996 1.000 0.347 1.000 N NA
 3501130 3501131 Patl_1315 Patl_1316     TRUE 0.840 73.000 0.225 1.000 N NA
 3501131 3501132 Patl_1316 Patl_1317     TRUE 0.993 0.000 0.206 1.000 N NA
 3501132 3501133 Patl_1317 Patl_1318     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501134 3501135 Patl_1319 Patl_1320     TRUE 0.965 46.000 0.246 1.000 Y NA
 3501135 3501136 Patl_1320 Patl_1321     TRUE 0.992 0.000 0.177 1.000 N NA
 3501137 3501138 Patl_1322 Patl_1323   motB TRUE 0.999 4.000 0.566 1.000 Y NA
 3501139 3501140 Patl_1324 Patl_1325     TRUE 0.993 9.000 0.395 NA   NA
 3501140 3501141 Patl_1325 Patl_1326     TRUE 0.958 4.000 0.032 NA   NA
 3501141 3501142 Patl_1326 Patl_1327     TRUE 0.995 2.000 0.311 NA   NA
 3501142 3501143 Patl_1327 Patl_1328     TRUE 0.999 0.000 0.722 NA   NA
 3501143 3501144 Patl_1328 Patl_1329     TRUE 0.969 17.000 0.217 0.051   NA
 3501144 3501145 Patl_1329 Patl_1330     TRUE 0.998 -3.000 0.533 NA   NA
 3501146 3501147 Patl_1331 Patl_1332     TRUE 0.704 56.000 0.077 1.000   NA
 3501147 3501148 Patl_1332 Patl_1333     TRUE 0.999 -7.000 0.898 NA N NA
 3501150 3501151 Patl_1335 Patl_1336     TRUE 0.984 7.000 0.168 NA   NA
 3501151 3501152 Patl_1336 Patl_1337     TRUE 0.513 121.000 0.108 NA   NA
 3501153 3501154 Patl_1338 Patl_1339     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 3501155 3501156 Patl_1340 Patl_R0023     FALSE 0.002 871.000 0.000 NA   NA
 3501156 3501157 Patl_R0023 Patl_R0024     FALSE 0.167 105.000 0.000 NA   NA
 3501157 3501158 Patl_R0024 Patl_R0025     TRUE 0.594 19.000 0.000 NA   NA
 3501158 3501159 Patl_R0025 Patl_R0026     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 3501159 3501160 Patl_R0026 Patl_R0027     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3501162 3501163 Patl_1342 Patl_1343     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501163 3501164 Patl_1343 Patl_R0028     FALSE 0.230 87.000 0.000 NA   NA
 3501164 3501165 Patl_R0028 Patl_1344     FALSE 0.266 75.000 0.000 NA   NA
 3501165 3501166 Patl_1344 Patl_1345     TRUE 0.955 16.000 0.171 NA   NA
 3501166 3501167 Patl_1345 Patl_1346     TRUE 0.993 0.000 0.186 NA   NA
 3501167 3501168 Patl_1346 Patl_1347     TRUE 0.987 -22.000 0.118 NA N NA
 3501168 3501169 Patl_1347 Patl_R0029     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501169 3501170 Patl_R0029 Patl_1348     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3501170 3501171 Patl_1348 Patl_1349     TRUE 0.990 -7.000 0.121 1.000   NA
 3501172 3501173 Patl_1350 Patl_1351     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 3501173 3501174 Patl_1351 Patl_1352     FALSE 0.254 81.000 0.000 NA   NA
 3501174 3501175 Patl_1352 Patl_1353     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501177 3501178 Patl_1355 Patl_1356     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 3501179 3501180 Patl_1357 Patl_1358   prfC FALSE 0.004 353.000 0.000 1.000 N NA
 3501180 3501181 Patl_1358 Patl_1359 prfC   TRUE 0.810 76.000 0.006 0.035 Y NA
 3501181 3501182 Patl_1359 Patl_1360     FALSE 0.127 240.000 0.000 0.035 Y NA
 3501182 3501183 Patl_1360 Patl_1361   lysS TRUE 0.957 44.000 0.162 0.035 Y NA
 3501184 3501185 Patl_1362 Patl_1363     TRUE 0.713 18.000 0.011 1.000 N NA
 3501185 3501186 Patl_1363 Patl_1364     TRUE 0.978 -7.000 0.042 NA   NA
 3501187 3501188 Patl_1365 Patl_1366     TRUE 0.703 92.000 0.127 1.000   NA
 3501188 3501189 Patl_1366 Patl_1367     FALSE 0.012 2741.000 0.103 NA   NA
 3501189 3501190 Patl_1367 Patl_1368     FALSE 0.002 680.000 0.000 NA   NA
 3501192 3501193 Patl_1370 Patl_1371     TRUE 0.688 32.000 0.024 0.071 N NA
 3501195 3501196 Patl_1373 Patl_1374     FALSE 0.376 88.000 0.012 1.000   NA
 3501196 3501197 Patl_1374 Patl_1375     FALSE 0.284 70.000 0.000 1.000   NA
 3501199 3501200 Patl_1377 Patl_1378     FALSE 0.073 149.000 0.000 1.000   NA
 3501201 3501202 Patl_1379 Patl_1380     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 3501203 3501204 Patl_1381 Patl_1382     FALSE 0.258 79.000 0.000 NA   NA
 3501204 3501205 Patl_1382 Patl_1383     FALSE 0.003 491.000 0.000 NA   NA
 3501206 3501207 Patl_1384 Patl_1385     FALSE 0.004 1104.000 0.000 0.007   NA
 3501211 3501212 Patl_1389 Patl_1390     TRUE 0.549 22.000 0.000 NA   NA
 3501212 3501213 Patl_1390 Patl_1391     TRUE 0.743 20.000 0.013 NA   NA
 3501213 3501214 Patl_1391 Patl_1392     FALSE 0.279 67.000 0.000 NA   NA
 3501214 3501215 Patl_1392 Patl_1393     TRUE 0.998 4.000 0.761 NA   NA
 3501215 3501216 Patl_1393 Patl_1394     TRUE 0.969 54.000 0.683 NA   NA
 3501216 3501217 Patl_1394 Patl_1395     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA N NA
 3501223 3501224 Patl_1401 Patl_1402 glpQ   TRUE 0.483 37.000 0.009 1.000 N NA
 3501224 3501225 Patl_1402 Patl_1403     FALSE 0.128 103.000 0.000 1.000 N NA
 3501225 3501226 Patl_1403 Patl_1404     FALSE 0.003 423.000 0.000 1.000 N NA
 3501226 3501227 Patl_1404 Patl_1405     FALSE 0.002 842.000 0.000 1.000   NA
 3501227 3501228 Patl_1405 Patl_1406     FALSE 0.007 404.000 0.000 0.050   NA
 3501228 3501229 Patl_1406 Patl_1407     FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 3501231 3501232 Patl_1409 Patl_1410     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3501232 3501233 Patl_1410 Patl_1411     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 3501233 3501234 Patl_1411 Patl_1412     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3501234 3501235 Patl_1412 Patl_1413     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 3501235 3501236 Patl_1413 Patl_1414     TRUE 0.840 8.000 0.000 NA   NA
 3501236 3501237 Patl_1414 Patl_1415     FALSE 0.002 1423.000 0.000 NA   NA
 3501237 3501238 Patl_1415 Patl_1416     FALSE 0.313 54.000 0.000 NA   NA
 3501238 3501239 Patl_1416 Patl_1417     FALSE 0.009 284.000 0.000 NA   NA
 3501240 3501241 Patl_1418 Patl_1419   prpB TRUE 0.609 105.000 0.130 1.000 N NA
 3501241 3501242 Patl_1419 Patl_1420 prpB   TRUE 0.864 116.000 0.502 1.000 N NA
 3501242 3501243 Patl_1420 Patl_1421     TRUE 0.877 133.000 0.289 1.000 Y NA
 3501243 3501244 Patl_1421 Patl_1422     TRUE 0.997 10.000 0.733 NA   NA
 3501244 3501245 Patl_1422 Patl_1423     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 3501245 3501246 Patl_1423 Patl_1424     FALSE 0.020 193.000 0.000 1.000 N NA
 3501246 3501247 Patl_1424 Patl_1425     FALSE 0.002 495.000 0.000 1.000 N NA
 3501247 3501248 Patl_1425 Patl_1426     FALSE 0.041 178.000 0.000 1.000   NA
 3501248 3501249 Patl_1426 Patl_1427     FALSE 0.002 684.000 0.000 1.000   NA
 3501249 3501250 Patl_1427 Patl_1428     TRUE 1.000 0.000 0.859 0.001 Y NA
 3501251 3501252 Patl_1429 Patl_1430     FALSE 0.009 281.000 0.000 NA   NA
 3501252 3501253 Patl_1430 Patl_1431     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3501253 3501254 Patl_1431 Patl_1432     FALSE 0.046 173.000 0.000 1.000   NA
 3501256 3501257 Patl_1434 Patl_1435     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 3501257 3501258 Patl_1435 Patl_1436     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 3501259 3501260 Patl_1437 Patl_1438     FALSE 0.328 145.000 0.100 1.000 N NA
 3501260 3501261 Patl_1438 Patl_1439     FALSE 0.125 124.000 0.000 1.000   NA
 3501265 3501266 Patl_1443 Patl_1444     FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000   NA
 3501269 3501270 Patl_1447 Patl_1448     FALSE 0.022 188.000 0.000 1.000 N NA
 3501271 3501272 Patl_1449 Patl_1450     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501274 3501275 Patl_1452 Patl_1453     TRUE 1.000 -3.000 0.714 0.053 Y NA
 3501275 3501276 Patl_1453 Patl_1454     TRUE 0.707 42.000 0.057 NA   NA
 3501276 3501277 Patl_1454 Patl_1455     TRUE 0.809 26.000 0.057 NA   NA
 3501277 3501278 Patl_1455 Patl_1456     TRUE 0.997 -7.000 0.075 0.003 Y NA
 3501278 3501279 Patl_1456 Patl_1457     FALSE 0.056 306.000 0.000 1.000 Y NA
 3501279 3501280 Patl_1457 Patl_1458     FALSE 0.055 160.000 0.000 NA   NA
 3501280 3501281 Patl_1458 Patl_1459     FALSE 0.109 129.000 0.000 NA   NA
 3501281 3501282 Patl_1459 Patl_1460     FALSE 0.002 821.000 0.000 NA   NA
 3501283 3501284 Patl_1461 Patl_1462     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501284 3501285 Patl_1462 Patl_1463     FALSE 0.288 40.000 0.000 1.000 N NA
 3501286 3501287 Patl_1464 Patl_1465     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3501289 3501290 Patl_1467 Patl_1468     TRUE 0.655 59.000 0.059 NA   NA
 3501290 3501291 Patl_1468 Patl_1469     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA   NA
 3501291 3501292 Patl_1469 Patl_1470     FALSE 0.003 476.000 0.000 NA   NA
 3501292 3501293 Patl_1470 Patl_1471     TRUE 0.997 2.000 0.492 NA   NA
 3501294 3501295 Patl_1472 Patl_1473     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 3501295 3501296 Patl_1473 Patl_1474     TRUE 0.729 60.000 0.094 NA   NA
 3501296 3501297 Patl_1474 Patl_1475     FALSE 0.004 404.000 0.000 NA   NA
 3501297 3501298 Patl_1475 Patl_1476     FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 3501298 3501299 Patl_1476 Patl_1477     FALSE 0.002 836.000 0.000 NA   NA
 3501299 3501300 Patl_1477 Patl_1478     FALSE 0.202 64.000 0.000 NA N NA
 3501300 3501301 Patl_1478 Patl_1479     FALSE 0.028 428.000 0.000 1.000 Y NA
 3501303 3501304 Patl_1481 Patl_1482     FALSE 0.008 306.000 0.000 1.000   NA
 3501304 3501305 Patl_1482 Patl_1483     FALSE 0.305 61.000 0.000 1.000   NA
 3501305 3501306 Patl_1483 Patl_1484     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 3501306 3501307 Patl_1484 Patl_1485     TRUE 0.564 21.000 0.000 NA   NA
 3501308 3501309 Patl_1486 Patl_1487     TRUE 0.951 29.000 0.314 NA   NA
 3501309 3501310 Patl_1487 Patl_1488     FALSE 0.098 160.000 0.010 NA   NA
 3501310 3501311 Patl_1488 Patl_1489     TRUE 1.000 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 3501311 3501312 Patl_1489 Patl_1490     TRUE 0.997 6.000 0.292 1.000 Y NA
 3501312 3501313 Patl_1490 Patl_1491     TRUE 0.908 34.000 0.034 1.000 Y NA
 3501315 3501316 Patl_1493 Patl_1494     FALSE 0.008 298.000 0.000 NA   NA
 3501317 3501318 Patl_1495 Patl_1496     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 3501323 3501324 Patl_1501 Patl_1502     FALSE 0.139 118.000 0.000 1.000   NA
 3501326 3501327 Patl_1504 Patl_1505     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 3501327 3501328 Patl_1505 Patl_1506     TRUE 0.997 -7.000 0.368 1.000   NA
 3501329 3501330 Patl_1507 Patl_1508     FALSE 0.243 84.000 0.000 NA   NA
 3501330 3501331 Patl_1508 Patl_1509     TRUE 0.760 12.000 0.000 NA   NA
 3501332 3501333 Patl_1510 Patl_1511     TRUE 0.979 4.000 0.059 0.001   NA
 3501333 3501334 Patl_1511 Patl_1512     TRUE 0.566 122.000 0.133 1.000   NA
 3501334 3501335 Patl_1512 Patl_1513     TRUE 0.964 0.000 0.027 1.000 N NA
 3501336 3501337 Patl_1514 Patl_1515     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501339 3501340 Patl_1517 Patl_1518     FALSE 0.044 175.000 0.000 1.000   NA
 3501340 3501341 Patl_1518 Patl_1519     FALSE 0.432 59.000 0.000 0.034   NA
 3501341 3501342 Patl_1519 Patl_1520     TRUE 0.649 47.000 0.043 1.000   NA
 3501342 3501343 Patl_1520 Patl_1521     TRUE 0.697 87.000 0.000 NA Y NA
 3501343 3501344 Patl_1521 Patl_1522     TRUE 0.893 -3.000 0.000 NA N NA
 3501345 3501346 Patl_1523 Patl_1524     FALSE 0.019 223.000 0.000 1.000   NA
 3501347 3501348 Patl_1525 Patl_1526     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501348 3501349 Patl_1526 Patl_1527     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501349 3501350 Patl_1527 Patl_1528     TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 3501351 3501352 Patl_1529 Patl_1530     FALSE 0.134 117.000 0.000 NA   NA
 3501354 3501355 Patl_1532 Patl_1533     TRUE 0.968 -7.000 0.019 1.000   NA
 3501356 3501357 Patl_1534 Patl_1535     TRUE 0.968 38.000 0.222 1.000 Y NA
 3501357 3501358 Patl_1535 Patl_1536     TRUE 0.808 39.000 0.118 1.000 N NA
 3501358 3501359 Patl_1536 Patl_1537     TRUE 0.582 75.000 0.059 1.000 N NA
 3501362 3501363 Patl_1540 Patl_1541     TRUE 0.645 71.000 0.081 1.000 N NA
 3501363 3501364 Patl_1541 Patl_1542     TRUE 0.669 51.000 0.055 1.000   NA
 3501364 3501365 Patl_1542 Patl_1543     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000   NA
 3501366 3501367 Patl_1544 Patl_1545 ansA   FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501367 3501368 Patl_1545 Patl_1546     TRUE 0.848 7.000 0.000 NA   NA
 3501369 3501370 Patl_1547 Patl_1548     FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 3501370 3501371 Patl_1548 Patl_1549     FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 3501372 3501373 Patl_1550 Patl_1551     FALSE 0.031 188.000 0.000 NA   NA
 3501373 3501374 Patl_1551 Patl_1552     FALSE 0.187 100.000 0.000 NA   NA
 3501374 3501375 Patl_1552 Patl_1553     FALSE 0.002 563.000 0.000 1.000 N NA
 3501375 3501376 Patl_1553 Patl_1554     TRUE 0.999 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 3501376 3501377 Patl_1554 Patl_1555     TRUE 0.862 62.000 0.219 NA   NA
 3501377 3501378 Patl_1555 Patl_1556     TRUE 0.767 21.000 0.024 NA   NA
 3501378 3501379 Patl_1556 Patl_1557     FALSE 0.457 177.000 0.080 NA Y NA
 3501379 3501380 Patl_1557 Patl_1558     TRUE 0.999 -10.000 0.298 NA Y NA
 3501380 3501381 Patl_1558 Patl_1559     TRUE 0.726 51.000 0.096 NA N NA
 3501381 3501382 Patl_1559 Patl_1560     TRUE 0.756 16.000 0.013 1.000 N NA
 3501382 3501383 Patl_1560 Patl_1561     TRUE 0.944 3.000 0.012 NA   NA
 3501383 3501384 Patl_1561 Patl_1562     TRUE 0.919 47.000 0.307 NA   NA
 3501384 3501385 Patl_1562 Patl_1563     TRUE 0.649 39.000 0.032 NA   NA
 3501385 3501386 Patl_1563 Patl_1564     TRUE 0.976 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3501386 3501387 Patl_1564 Patl_1565     TRUE 0.993 0.000 0.199 NA N NA
 3501387 3501388 Patl_1565 Patl_1566   leuS TRUE 0.953 16.000 0.182 NA N NA
 3501389 3501390 Patl_1567 Patl_1568     TRUE 0.710 85.000 0.000 1.000 Y NA
 3501392 3501393 Patl_1570 Patl_1571     TRUE 0.801 53.000 0.152 NA N NA
 3501393 3501394 Patl_1571 Patl_1572     TRUE 0.871 86.000 0.325 1.000 N NA
 3501394 3501395 Patl_1572 Patl_1573     TRUE 0.993 3.000 0.260 1.000 N NA
 3501395 3501396 Patl_1573 Patl_1574     TRUE 0.716 130.000 0.082 1.000 Y NA
 3501396 3501397 Patl_1574 Patl_1575   secG TRUE 0.980 10.000 0.184 1.000 N NA
 3501397 3501398 Patl_1575 Patl_R0030 secG   TRUE 0.733 13.000 0.000 NA   NA
 3501398 3501399 Patl_R0030 Patl_1576     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501399 3501400 Patl_1576 Patl_1577   rpsP FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 3501400 3501401 Patl_1577 Patl_1578 rpsP   TRUE 0.987 31.000 0.342 0.012 Y NA
 3501401 3501402 Patl_1578 Patl_1579     TRUE 1.000 0.000 0.672 1.000 Y NA
 3501402 3501403 Patl_1579 Patl_1580   rplS TRUE 0.999 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 3501405 3501406 Patl_1582 Patl_1583     FALSE 0.411 36.000 0.000 1.000   NA
 3501406 3501407 Patl_1583 Patl_1584     FALSE 0.047 171.000 0.000 1.000   NA
 3501407 3501408 Patl_1584 Patl_1585     FALSE 0.359 44.000 0.000 1.000   NA
 3501410 3501411 Patl_1587 Patl_1588   tyrA TRUE 0.980 12.000 0.045 1.000 Y NA
 3501411 3501412 Patl_1588 Patl_1589 tyrA   FALSE 0.450 30.000 0.000 NA   NA
 3501413 3501414 Patl_1590 Patl_1591     FALSE 0.015 209.000 0.000 1.000 N NA
 3501414 3501415 Patl_1591 Patl_1592     TRUE 0.476 33.000 0.006 1.000 N NA
 3501416 3501417 Patl_1593 Patl_1594     TRUE 0.989 34.000 0.524 NA Y NA
 3501417 3501418 Patl_1594 Patl_1595     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501418 3501419 Patl_1595 Patl_1596     FALSE 0.369 42.000 0.000 1.000   NA
 3501419 3501420 Patl_1596 Patl_1597     TRUE 0.865 100.000 0.096 0.055 Y NA
 3501420 3501421 Patl_1597 Patl_1598     TRUE 0.995 -7.000 0.197 0.055 N NA
 3501421 3501422 Patl_1598 Patl_1599     FALSE 0.201 96.000 0.000 NA   NA
 3501422 3501423 Patl_1599 Patl_1600     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 3501423 3501424 Patl_1600 Patl_1601     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501424 3501425 Patl_1601 Patl_1602     TRUE 0.972 0.000 0.029 NA   NA
 3501425 3501426 Patl_1602 Patl_1603     TRUE 0.974 -3.000 0.029 NA   NA
 3501426 3501427 Patl_1603 Patl_1604     FALSE 0.020 194.000 0.000 1.000 N NA
 3501427 3501428 Patl_1604 Patl_1605     FALSE 0.225 138.000 0.044 1.000 N NA
 3501428 3501429 Patl_1605 Patl_1606     TRUE 0.981 16.000 0.383 1.000 N NA
 3501429 3501430 Patl_1606 Patl_1607     TRUE 0.995 -3.000 0.216 NA   NA
 3501430 3501431 Patl_1607 Patl_1608     FALSE 0.418 138.000 0.116 NA   NA
 3501431 3501432 Patl_1608 Patl_1609     TRUE 0.946 27.000 0.262 1.000   NA
 3501434 3501435 Patl_1611 Patl_1612     TRUE 0.997 0.000 0.375 1.000   NA
 3501435 3501436 Patl_1612 Patl_1613     TRUE 0.992 4.000 0.182 0.003   NA
 3501436 3501437 Patl_1613 Patl_1614     FALSE 0.025 182.000 0.000 1.000 N NA
 3501439 3501440 Patl_1616 Patl_1617     FALSE 0.367 116.000 0.044 NA   NA
 3501441 3501442 Patl_1618 Patl_1619     FALSE 0.152 94.000 0.000 1.000 N NA
 3501442 3501443 Patl_1619 Patl_1620     TRUE 0.998 10.000 0.352 0.001 Y NA
 3501445 3501446 Patl_1622 Patl_1623     TRUE 0.900 51.000 0.269 NA   NA
 3501448 3501449 Patl_1625 Patl_1626     FALSE 0.066 238.000 0.061 1.000   NA
 3501449 3501450 Patl_1626 Patl_1627     TRUE 0.987 5.000 0.169 1.000   NA
 3501451 3501452 Patl_1628 Patl_1629     FALSE 0.032 214.000 0.006 NA   NA
 3501452 3501453 Patl_1629 Patl_1630     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501453 3501454 Patl_1630 Patl_1631     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA   NA
 3501454 3501455 Patl_1631 Patl_1632     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 3501456 3501457 Patl_1633 Patl_1634     TRUE 0.924 77.000 0.154 1.000 Y NA
 3501458 3501459 Patl_1635 Patl_1636 malQ   TRUE 0.968 51.000 0.235 0.008 Y NA
 3501459 3501460 Patl_1636 Patl_1637     TRUE 0.995 4.000 0.098 0.008 Y NA
 3501460 3501461 Patl_1637 Patl_1638     FALSE 0.260 129.000 0.039 1.000 N NA
 3501463 3501464 Patl_1640 Patl_1641     FALSE 0.019 293.000 0.028 1.000 N NA
 3501464 3501465 Patl_1641 Patl_1642     TRUE 0.837 88.000 0.060 1.000 Y NA
 3501465 3501466 Patl_1642 Patl_1643     TRUE 0.806 95.000 0.231 NA   NA
 3501466 3501467 Patl_1643 Patl_1644     TRUE 0.979 0.000 0.049 NA   NA
 3501467 3501468 Patl_1644 Patl_1645     TRUE 0.979 -10.000 0.049 NA   NA
 3501468 3501469 Patl_1645 Patl_1646     FALSE 0.258 79.000 0.000 NA   NA
 3501470 3501471 Patl_1647 Patl_1648     TRUE 0.986 19.000 0.214 1.000 Y NA
 3501471 3501472 Patl_1648 Patl_1649     TRUE 0.993 3.000 0.056 1.000 Y NA
 3501472 3501473 Patl_1649 Patl_1650     TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3501473 3501474 Patl_1650 Patl_1651     TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 3501474 3501475 Patl_1651 Patl_1652     FALSE 0.069 132.000 0.000 NA N NA
 3501475 3501476 Patl_1652 Patl_1653     FALSE 0.453 21.000 0.000 NA N NA
 3501478 3501479 Patl_1655 Patl_1656     TRUE 0.999 -7.000 0.946 NA   NA
 3501479 3501480 Patl_1656 Patl_1657     TRUE 0.529 187.000 0.432 NA   NA
 3501480 3501481 Patl_1657 Patl_1658     TRUE 0.985 5.000 0.152 NA   NA
 3501481 3501482 Patl_1658 Patl_1659     TRUE 0.986 -7.000 0.082 NA   NA
 3501482 3501483 Patl_1659 Patl_1660     TRUE 0.995 -7.000 0.233 NA   NA
 3501483 3501484 Patl_1660 Patl_1661     TRUE 0.992 -3.000 0.143 NA   NA
 3501484 3501485 Patl_1661 Patl_1662     TRUE 0.993 12.000 0.500 NA   NA
 3501486 3501487 Patl_1663 Patl_1664 fadI fadJ TRUE 0.997 11.000 0.430 1.000 Y NA
 3501488 3501489 Patl_1665 Patl_1666     FALSE 0.021 190.000 0.000 1.000 N NA
 3501491 3501492 Patl_1668 Patl_1669     TRUE 0.852 104.000 0.349 1.000   NA
 3501493 3501494 Patl_1670 Patl_1671     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA N NA
 3501494 3501495 Patl_1671 Patl_1672     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3501498 3501499 Patl_1675 Patl_1676     FALSE 0.402 103.000 0.033 NA   NA
 3501499 3501500 Patl_1676 Patl_1677     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501505 3501506 Patl_1682 Patl_1683     FALSE 0.294 61.000 0.000 NA   NA
 3501508 3501509 Patl_1685 Patl_1686     TRUE 0.975 49.000 0.800 1.000 N NA
 3501509 3501510 Patl_1686 Patl_1687     FALSE 0.010 303.000 0.000 0.069 N NA
 3501511 3501512 Patl_1688 Patl_1689     FALSE 0.006 281.000 0.000 1.000 N NA
 3501513 3501514 Patl_1690 Patl_1691     FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000   NA
 3501514 3501515 Patl_1691 Patl_1692     FALSE 0.115 151.000 0.008 1.000   NA
 3501515 3501516 Patl_1692 Patl_R0031     FALSE 0.027 196.000 0.000 NA   NA
 3501516 3501517 Patl_R0031 Patl_1693     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 3501517 3501518 Patl_1693 Patl_1694     TRUE 0.975 49.000 0.759 NA   NA
 3501518 3501519 Patl_1694 Patl_1695     TRUE 0.963 24.000 0.342 1.000 N NA
 3501519 3501520 Patl_1695 Patl_1696     TRUE 0.961 108.000 0.530 1.000 Y NA
 3501520 3501521 Patl_1696 Patl_1697     TRUE 0.998 4.000 0.318 1.000 Y NA
 3501521 3501522 Patl_1697 Patl_R0032     FALSE 0.321 51.000 0.000 NA   NA
 3501522 3501523 Patl_R0032 Patl_1698     TRUE 0.918 -56.000 0.000 NA   NA
 3501524 3501525 Patl_1699 Patl_1700     TRUE 0.958 0.000 0.011 NA   NA
 3501525 3501526 Patl_1700 Patl_1701     TRUE 0.961 -7.000 0.011 NA   NA
 3501526 3501527 Patl_1701 Patl_1702     FALSE 0.425 24.000 0.000 1.000 N NA
 3501527 3501528 Patl_1702 Patl_1703     TRUE 0.953 23.000 0.250 NA   NA
 3501528 3501529 Patl_1703 Patl_1704     TRUE 0.984 2.000 0.099 NA   NA
 3501529 3501530 Patl_1704 Patl_1705     TRUE 0.999 3.000 0.819 NA   NA
 3501531 3501532 Patl_1706 Patl_1707     FALSE 0.005 301.000 0.000 1.000 N NA
 3501532 3501533 Patl_1707 Patl_1708     FALSE 0.211 66.000 0.000 1.000 N NA
 3501533 3501534 Patl_1708 Patl_1709     TRUE 0.806 76.000 0.019 1.000 Y NA
 3501537 3501538 Patl_1712 Patl_1713     FALSE 0.003 467.000 0.000 1.000   NA
 3501538 3501539 Patl_1713 Patl_1714     FALSE 0.358 114.000 0.049 1.000 N NA
 3501539 3501540 Patl_1714 Patl_1715     TRUE 0.728 93.000 0.170 1.000 N NA
 3501541 3501542 Patl_1716 Patl_1717     FALSE 0.164 117.000 0.006 1.000 N NA
 3501542 3501543 Patl_1717 Patl_1718     FALSE 0.011 268.000 0.000 NA   NA
 3501545 3501546 Patl_1720 Patl_1721     TRUE 0.939 -10.000 0.000 0.052 N NA
 3501546 3501547 Patl_1721 Patl_1722     TRUE 0.484 19.000 0.000 NA N NA
 3501547 3501548 Patl_1722 Patl_1723     FALSE 0.118 104.000 0.000 NA N NA
 3501549 3501550 Patl_1724 Patl_1725     TRUE 0.983 0.000 0.071 NA   NA
 3501550 3501551 Patl_1725 Patl_1726     TRUE 0.953 6.000 0.039 NA   NA
 3501552 3501553 Patl_1727 Patl_1728     FALSE 0.119 156.000 0.012 1.000   NA
 3501555 3501556 Patl_1730 Patl_1731     FALSE 0.011 264.000 0.000 NA   NA
 3501556 3501557 Patl_1731 Patl_1732     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   NA
 3501558 3501559 Patl_1733 Patl_1734     TRUE 0.999 -18.000 0.833 NA   NA
 3501559 3501560 Patl_1734 Patl_1735     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 3501561 3501562 Patl_1736 Patl_1737     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 3501566 3501567 Patl_1740 Patl_1741     TRUE 0.991 -3.000 0.124 NA   NA
 3501568 3501569 Patl_1742 Patl_1743     FALSE 0.027 198.000 0.000 NA   NA
 3501574 3501575 Patl_1748 Patl_1749     TRUE 0.993 3.000 0.278 NA N NA
 3501579 3501580 Patl_1753 Patl_1754     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 3501580 3501581 Patl_1754 Patl_1755     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 3501581 3501582 Patl_1755 Patl_1756     FALSE 0.011 232.000 0.000 1.000 N NA
 3501582 3501583 Patl_1756 Patl_1757     TRUE 1.000 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 3501583 3501584 Patl_1757 Patl_1758     TRUE 1.000 -6.000 0.688 0.001 Y NA
 3501586 3501587 Patl_1760 Patl_1761     FALSE 0.128 120.000 0.000 NA   NA
 3501587 3501588 Patl_1761 Patl_1762     FALSE 0.133 118.000 0.000 NA   NA
 3501592 3501593 Patl_1766 Patl_1767     TRUE 0.997 0.000 0.412 NA   NA
 3501594 3501595 Patl_1768 Patl_1769     FALSE 0.207 94.000 0.000 NA   NA
 3501595 3501596 Patl_1769 Patl_1770     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA N NA
 3501596 3501597 Patl_1770 Patl_1771     TRUE 0.807 5.000 0.000 NA N NA
 3501600 3501601 Patl_1774 Patl_1775     TRUE 0.971 25.000 0.115 0.009 Y NA
 3501601 3501602 Patl_1775 Patl_1776     TRUE 0.749 51.000 0.106 1.000 N NA
 3501602 3501603 Patl_1776 Patl_1777     TRUE 0.913 4.000 0.003 NA   NA
 3501605 3501606 Patl_1779 Patl_1780     TRUE 0.628 96.000 0.075 0.056   NA
 3501606 3501607 Patl_1780 Patl_1781     TRUE 0.836 63.000 0.205 1.000 N NA
 3501607 3501608 Patl_1781 Patl_1782     TRUE 0.989 9.000 0.263 NA   NA
 3501608 3501609 Patl_1782 Patl_1783     TRUE 0.981 13.000 0.265 NA   NA
 3501609 3501610 Patl_1783 Patl_1784     FALSE 0.232 57.000 0.000 1.000 N NA
 3501610 3501611 Patl_1784 Patl_1785     FALSE 0.040 159.000 0.000 1.000 N NA
 3501611 3501612 Patl_1785 Patl_1786     TRUE 0.873 5.000 0.000 1.000   NA
 3501612 3501613 Patl_1786 Patl_1787     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 3501614 3501615 Patl_1788 Patl_1789     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501618 3501619 Patl_1792 Patl_1793     TRUE 0.827 29.000 0.095 1.000 N NA
 3501621 3501622 Patl_1795 Patl_1796     TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3501622 3501623 Patl_1796 Patl_1797   sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.001 Y NA
 3501623 3501624 Patl_1797 Patl_1798 sdhA   TRUE 0.998 15.000 0.604 0.001 Y NA
 3501624 3501625 Patl_1798 Patl_1799   kgd FALSE 0.428 178.000 0.067 1.000 Y NA
 3501625 3501626 Patl_1799 Patl_1800 kgd   TRUE 0.999 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3501626 3501627 Patl_1800 Patl_1801   sucC TRUE 0.807 124.000 0.136 1.000 Y NA
 3501627 3501628 Patl_1801 Patl_1802 sucC   TRUE 1.000 -3.000 0.806 0.001 Y NA
 3501629 3501630 Patl_1803 Patl_1804     FALSE 0.208 68.000 0.000 1.000 N NA
 3501632 3501633 Patl_1806 Patl_1807     FALSE 0.005 307.000 0.000 1.000 N NA
 3501633 3501634 Patl_1807 Patl_1808     FALSE 0.065 134.000 0.000 NA N NA
 3501634 3501635 Patl_1808 Patl_1809     FALSE 0.114 105.000 0.000 NA N NA
 3501635 3501636 Patl_1809 Patl_1810     FALSE 0.055 143.000 0.000 1.000 N NA
 3501637 3501638 Patl_1811 Patl_1812     TRUE 0.971 16.000 0.278 NA N NA
 3501638 3501639 Patl_1812 Patl_1813     TRUE 0.962 15.000 0.176 1.000   NA
 3501639 3501640 Patl_1813 Patl_1814     TRUE 0.595 58.000 0.037 1.000   NA
 3501641 3501642 Patl_1815 Patl_1816     FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 3501649 3501650 Patl_1823 Patl_1824     TRUE 0.723 102.000 0.190 1.000 N NA
 3501650 3501651 Patl_1824 Patl_1825     TRUE 0.995 5.000 0.143 1.000 Y NA
 3501654 3501655 Patl_1828 Patl_1829     TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000   NA
 3501655 3501656 Patl_1829 Patl_1830     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3501656 3501657 Patl_1830 Patl_1831     FALSE 0.137 116.000 0.000 NA   NA
 3501657 3501658 Patl_1831 Patl_1832     TRUE 0.929 58.000 0.333 0.068   NA
 3501658 3501659 Patl_1832 Patl_1833     FALSE 0.264 76.000 0.000 NA   NA
 3501659 3501660 Patl_1833 Patl_1834     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 3501660 3501661 Patl_1834 Patl_1835     FALSE 0.006 339.000 0.000 1.000   NA
 3501661 3501662 Patl_1835 Patl_1836     FALSE 0.004 421.000 0.000 1.000   NA
 3501662 3501663 Patl_1836 Patl_1837     FALSE 0.003 419.000 0.000 1.000 N NA
 3501664 3501665 Patl_1838 Patl_1839     FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 3501665 3501666 Patl_1839 Patl_1840     FALSE 0.003 593.000 0.000 1.000   NA
 3501666 3501667 Patl_1840 Patl_1841     FALSE 0.318 56.000 0.000 1.000   NA
 3501667 3501668 Patl_1841 Patl_1842     TRUE 0.782 79.000 0.000 0.005 Y NA
 3501671 3501672 Patl_1845 Patl_1846     FALSE 0.012 329.000 0.000 0.007   NA
 3501674 3501675 Patl_1848 Patl_1849     FALSE 0.359 44.000 0.000 1.000   NA
 3501676 3501677 Patl_1850 Patl_1851     FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 3501678 3501679 Patl_1852 Patl_1853     FALSE 0.095 135.000 0.000 NA   NA
 3501679 3501680 Patl_1853 Patl_1854     FALSE 0.272 71.000 0.000 NA   NA
 3501680 3501681 Patl_1854 Patl_1855     FALSE 0.007 312.000 0.000 NA   NA
 3501681 3501682 Patl_1855 Patl_1856     FALSE 0.201 198.000 0.119 0.009 N NA
 3501682 3501683 Patl_1856 Patl_1857     TRUE 0.999 -13.000 0.786 1.000 N NA
 3501684 3501685 Patl_1858 Patl_1859     TRUE 0.981 27.000 0.615 NA   NA
 3501685 3501686 Patl_1859 Patl_1860     TRUE 0.994 -3.000 0.189 1.000   NA
 3501686 3501687 Patl_1860 Patl_1861     TRUE 0.999 -3.000 0.635 0.088   NA
 3501687 3501688 Patl_1861 Patl_1862     FALSE 0.045 196.000 0.000 0.063   NA
 3501688 3501689 Patl_1862 Patl_1863     TRUE 0.999 0.000 0.222 0.023 Y NA
 3501689 3501690 Patl_1863 Patl_1864     TRUE 0.668 94.000 0.000 NA Y NA
 3501690 3501691 Patl_1864 Patl_1865     TRUE 0.987 53.000 0.628 NA Y NA
 3501691 3501692 Patl_1865 Patl_1866     TRUE 1.000 -7.000 0.756 1.000 Y NA
 3501692 3501693 Patl_1866 Patl_1867     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 3501693 3501694 Patl_1867 Patl_1868     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 3501694 3501695 Patl_1868 Patl_1869     FALSE 0.390 37.000 0.000 NA   NA
 3501695 3501696 Patl_1869 Patl_1870     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA   NA
 3501697 3501698 Patl_1871 Patl_1872     TRUE 0.998 -3.000 0.562 NA   NA
 3501698 3501699 Patl_1872 Patl_1873     FALSE 0.020 214.000 0.000 NA   NA
 3501699 3501700 Patl_1873 Patl_1874     TRUE 0.947 67.000 0.571 1.000 N NA
 3501700 3501701 Patl_1874 Patl_1875     FALSE 0.006 296.000 0.000 1.000 N NA
 3501702 3501703 Patl_1876 Patl_1877     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 3501704 3501705 Patl_1878 Patl_1879   asnC FALSE 0.010 238.000 0.000 1.000 N NA
 3501706 3501707 Patl_1880 Patl_1881     FALSE 0.030 190.000 0.000 NA   NA
 3501709 3501710 Patl_1883 Patl_1884     FALSE 0.034 166.000 0.000 1.000 N NA
 3501710 3501711 Patl_1884 Patl_1885     TRUE 0.536 105.000 0.097 1.000 N NA
 3501712 3501713 Patl_1886 Patl_1887     TRUE 0.886 54.000 0.237 1.000   NA
 3501714 3501715 Patl_1888 Patl_1889 cysS   FALSE 0.003 533.000 0.000 1.000   NA
 3501716 3501717 Patl_1890 Patl_1891     TRUE 0.936 79.000 0.500 NA   NA
 3501717 3501718 Patl_1891 Patl_1892     TRUE 0.882 110.000 0.500 NA   NA
 3501720 3501721 Patl_1894 Patl_1895     TRUE 0.933 29.000 0.233 1.000   NA
 3501724 3501725 Patl_1898 Patl_1899     FALSE 0.293 106.000 0.025 1.000 N NA
 3501727 3501728 Patl_1901 Patl_R0034     FALSE 0.003 556.000 0.000 NA   NA
 3501729 3501730 Patl_1902 Patl_1903     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501733 3501734 Patl_1906 Patl_1907     FALSE 0.001 1026.000 0.000 1.000 N NA
 3501734 3501735 Patl_1907 Patl_1908     FALSE 0.292 65.000 0.000 1.000   NA
 3501737 3501738 Patl_1910 Patl_1911     FALSE 0.006 278.000 0.000 NA N NA
 3501739 3501740 Patl_1912 Patl_1913     FALSE 0.011 237.000 0.000 1.000 N NA
 3501740 3501741 Patl_1913 Patl_1914     TRUE 0.771 78.000 0.000 0.067 Y NA
 3501741 3501742 Patl_1914 Patl_1915     TRUE 0.691 15.000 0.000 1.000   NA
 3501743 3501744 Patl_1916 Patl_1917     TRUE 0.990 32.000 0.500 1.000 Y NA
 3501744 3501745 Patl_1917 Patl_1918     TRUE 0.965 48.000 0.250 1.000 Y NA
 3501745 3501746 Patl_1918 Patl_1919     FALSE 0.260 82.000 0.000 1.000   NA
 3501747 3501748 Patl_1920 Patl_1921     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 3501748 3501749 Patl_1921 Patl_1922     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   NA
 3501750 3501751 Patl_1923 Patl_1924     FALSE 0.010 242.000 0.000 1.000 N NA
 3501751 3501752 Patl_1924 Patl_1925     FALSE 0.220 89.000 0.000 NA   NA
 3501752 3501753 Patl_1925 Patl_1926     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 3501754 3501755 Patl_1927 Patl_1928     FALSE 0.084 125.000 0.000 1.000 N NA
 3501755 3501756 Patl_1928 Patl_1929     FALSE 0.157 92.000 0.000 1.000 N NA
 3501756 3501757 Patl_1929 Patl_1930     FALSE 0.002 907.000 0.000 1.000   NA
 3501758 3501759 Patl_R0035 Patl_1931     FALSE 0.307 56.000 0.000 NA   NA
 3501759 3501760 Patl_1931 Patl_1932     TRUE 0.953 5.000 0.044 1.000 N NA
 3501760 3501761 Patl_1932 Patl_1933     TRUE 0.997 -6.000 0.342 1.000 N NA
 3501761 3501762 Patl_1933 Patl_1934   thiG TRUE 0.994 2.000 0.064 1.000 Y NA
 3501762 3501763 Patl_1934 Patl_1935 thiG   TRUE 0.992 3.000 0.012 0.003 Y NA
 3501763 3501764 Patl_1935 Patl_1936     TRUE 0.998 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 3501764 3501765 Patl_1936 Patl_1937     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 3501765 3501766 Patl_1937 Patl_1938     FALSE 0.002 811.000 0.000 NA   NA
 3501766 3501767 Patl_1938 Patl_1939     FALSE 0.086 138.000 0.000 NA   NA
 3501767 3501768 Patl_1939 Patl_1940     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 3501768 3501769 Patl_1940 Patl_1941     TRUE 0.624 96.000 0.113 1.000 N NA
 3501769 3501770 Patl_1941 Patl_1942     FALSE 0.002 919.000 0.000 NA   NA
 3501774 3501775 Patl_1946 Patl_1947     FALSE 0.225 88.000 0.000 NA   NA
 3501776 3501777 Patl_1948 Patl_1949     TRUE 0.508 43.000 0.000 0.007   NA
 3501777 3501778 Patl_1949 Patl_1950     FALSE 0.004 654.000 0.000 0.007   NA
 3501779 3501780 Patl_1951 Patl_1952     FALSE 0.247 83.000 0.000 NA   NA
 3501780 3501781 Patl_1952 Patl_1953     FALSE 0.002 837.000 0.000 NA   NA
 3501783 3501784 Patl_1955 Patl_1956     FALSE 0.176 103.000 0.000 NA   NA
 3501787 3501788 Patl_1959 Patl_1960     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 3501789 3501790 Patl_1961 Patl_1962     TRUE 0.999 1.000 1.000 NA   NA
 3501791 3501792 Patl_1963 Patl_1964     FALSE 0.316 53.000 0.000 NA   NA
 3501792 3501793 Patl_1964 Patl_1965     FALSE 0.071 148.000 0.000 NA   NA
 3501793 3501794 Patl_1965 Patl_1966     FALSE 0.268 74.000 0.000 NA   NA
 3501794 3501795 Patl_1966 Patl_1967     FALSE 0.002 878.000 0.000 1.000   NA
 3501795 3501796 Patl_1967 Patl_1968     FALSE 0.147 115.000 0.000 1.000   NA
 3501796 3501797 Patl_1968 Patl_1969     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 3501797 3501798 Patl_1969 Patl_1970     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 3501799 3501800 Patl_1971 Patl_1972     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 3501800 3501801 Patl_1972 Patl_1973     FALSE 0.065 152.000 0.000 NA   NA
 3501804 3501805 Patl_1976 Patl_1977     TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000   NA
 3501805 3501806 Patl_1977 Patl_1978     TRUE 0.493 27.000 0.000 1.000   NA
 3501806 3501807 Patl_1978 Patl_1979     TRUE 0.942 32.000 0.083 1.000 Y NA
 3501808 3501809 Patl_1980 Patl_1981     FALSE 0.102 310.000 0.241 1.000 N NA
 3501812 3501813 Patl_1984 Patl_1985     FALSE 0.005 373.000 0.000 1.000   NA
 3501814 3501815 Patl_1986 Patl_1987     TRUE 0.565 134.000 0.005 0.007 Y NA
 3501815 3501816 Patl_1987 Patl_1988     TRUE 0.632 200.000 0.236 0.003 Y NA
 3501816 3501817 Patl_1988 Patl_1989     FALSE 0.004 357.000 0.000 1.000 N NA
 3501817 3501818 Patl_1989 Patl_1990     FALSE 0.006 279.000 0.000 NA N NA
 3501818 3501819 Patl_1990 Patl_1991     TRUE 0.965 -3.000 0.014 NA   NA
 3501819 3501820 Patl_1991 Patl_1992     TRUE 0.825 23.000 0.053 NA   NA
 3501820 3501821 Patl_1992 Patl_1993     TRUE 0.992 5.000 0.304 NA N NA
 3501821 3501822 Patl_1993 Patl_1994     FALSE 0.045 202.000 0.008 1.000   NA
 3501822 3501823 Patl_1994 Patl_1995     TRUE 0.971 0.000 0.028 1.000   NA
 3501823 3501824 Patl_1995 Patl_1996     FALSE 0.370 100.000 0.031 1.000 N NA
 3501824 3501825 Patl_1996 Patl_1997     TRUE 0.987 0.000 0.099 NA   NA
 3501825 3501826 Patl_1997 Patl_1998     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 3501826 3501827 Patl_1998 Patl_1999     TRUE 0.996 11.000 0.710 NA   NA
 3501827 3501828 Patl_1999 Patl_2000     TRUE 0.947 59.000 0.500 NA   NA
 3501828 3501829 Patl_2000 Patl_2001     TRUE 0.995 7.000 0.455 NA   NA
 3501829 3501830 Patl_2001 Patl_2002     FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000   NA
 3501830 3501831 Patl_2002 Patl_2003     TRUE 0.543 71.000 0.045 1.000 N NA
 3501831 3501832 Patl_2003 Patl_2004     TRUE 0.470 116.000 0.081 NA   NA
 3501832 3501833 Patl_2004 Patl_2005     FALSE 0.161 136.000 0.010 NA   NA
 3501833 3501834 Patl_2005 Patl_2006     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3501834 3501835 Patl_2006 Patl_2007     TRUE 0.836 31.000 0.094 NA   NA
 3501835 3501836 Patl_2007 Patl_2008     FALSE 0.184 265.000 0.278 NA   NA
 3501839 3501840 Patl_2011 Patl_2012     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 3501840 3501841 Patl_2012 Patl_2013     FALSE 0.277 68.000 0.000 NA   NA
 3501841 3501842 Patl_2013 Patl_2014     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.050   NA
 3501842 3501843 Patl_2014 Patl_2015     FALSE 0.234 88.000 0.000 1.000   NA
 3501843 3501844 Patl_2015 Patl_2016     TRUE 0.564 21.000 0.000 NA   NA
 3501844 3501845 Patl_2016 Patl_2017     FALSE 0.107 130.000 0.000 NA   NA
 3501845 3501846 Patl_2017 Patl_2018     FALSE 0.017 232.000 0.000 1.000   NA
 3501846 3501847 Patl_2018 Patl_2019     FALSE 0.002 880.000 0.000 1.000   NA
 3501847 3501848 Patl_2019 Patl_2020     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000   NA
 3501848 3501849 Patl_2020 Patl_2021     TRUE 0.899 3.000 0.000 1.000   NA
 3501849 3501850 Patl_2021 Patl_2022     TRUE 0.930 -7.000 0.000 1.000   NA
 3501850 3501851 Patl_2022 Patl_2023     TRUE 0.997 0.000 0.333 NA   NA
 3501851 3501852 Patl_2023 Patl_2024     FALSE 0.002 865.000 0.000 NA   NA
 3501853 3501854 Patl_2025 Patl_2026     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501854 3501855 Patl_2026 Patl_2027     TRUE 0.998 -7.000 0.500 NA   NA
 3501855 3501856 Patl_2027 Patl_2028     TRUE 0.958 88.000 0.750 NA   NA
 3501856 3501857 Patl_2028 Patl_2029     TRUE 0.845 126.000 0.500 NA   NA
 3501857 3501858 Patl_2029 Patl_2030     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA N NA
 3501858 3501859 Patl_2030 Patl_2031     TRUE 0.957 54.000 0.600 NA N NA
 3501860 3501861 Patl_2032 Patl_2033     TRUE 0.940 3.000 0.010 NA   NA
 3501861 3501862 Patl_2033 Patl_2034     TRUE 0.989 -3.000 0.104 NA   NA
 3501863 3501864 Patl_2035 Patl_2036     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3501864 3501865 Patl_2036 Patl_2037     TRUE 1.000 -7.000 0.558 0.001 Y NA
 3501865 3501866 Patl_2037 Patl_2038     TRUE 0.981 24.000 0.188 0.066 Y NA
 3501866 3501867 Patl_2038 Patl_2039     FALSE 0.076 168.000 0.007 NA   NA
 3501867 3501868 Patl_2039 Patl_2040     TRUE 0.636 25.000 0.007 NA   NA
 3501868 3501869 Patl_2040 Patl_2041     FALSE 0.453 43.000 0.010 1.000 N NA
 3501869 3501870 Patl_2041 Patl_2042     TRUE 0.794 15.000 0.008 1.000   NA
 3501870 3501871 Patl_2042 Patl_2043     FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000   NA
 3501873 3501874 Patl_2045 Patl_2046     FALSE 0.280 73.000 0.000 1.000   NA
 3501874 3501875 Patl_2046 Patl_2047     FALSE 0.039 179.000 0.000 1.000   NA
 3501875 3501876 Patl_2047 Patl_2048     FALSE 0.055 162.000 0.000 1.000   NA
 3501876 3501877 Patl_2048 Patl_2049     FALSE 0.174 105.000 0.000 1.000   NA
 3501877 3501878 Patl_2049 Patl_2050     FALSE 0.402 37.000 0.000 1.000   NA
 3501879 3501880 Patl_2051 Patl_2052     TRUE 0.997 0.000 0.108 1.000 Y NA
 3501880 3501881 Patl_2052 Patl_2053     TRUE 0.629 64.000 0.054 1.000   NA
 3501881 3501882 Patl_2053 Patl_2054     TRUE 0.833 59.000 0.172 1.000   NA
 3501882 3501883 Patl_2054 Patl_2055     TRUE 0.973 3.000 0.069 1.000 N NA
 3501883 3501884 Patl_2055 Patl_2056   fumC FALSE 0.004 351.000 0.000 1.000 N NA
 3501884 3501885 Patl_2056 Patl_2057 fumC   FALSE 0.054 144.000 0.000 1.000 N NA
 3501886 3501887 Patl_2058 Patl_2059     TRUE 0.956 -9.000 0.015 1.000 N NA
 3501887 3501888 Patl_2059 Patl_2060     TRUE 0.562 104.000 0.091 NA   NA
 3501888 3501889 Patl_2060 Patl_2061     TRUE 0.997 -7.000 0.313 NA   NA
 3501889 3501890 Patl_2061 Patl_2062     TRUE 0.998 -3.000 0.448 NA   NA
 3501891 3501892 Patl_2063 Patl_2064     TRUE 0.863 11.000 0.007 NA   NA
 3501892 3501893 Patl_2064 Patl_2065     FALSE 0.028 354.000 0.091 NA N NA
 3501893 3501894 Patl_2065 Patl_2066     FALSE 0.094 163.000 0.011 NA   NA
 3501894 3501895 Patl_2066 Patl_2067     TRUE 0.995 -13.000 0.266 NA   NA
 3501895 3501896 Patl_2067 Patl_2068     TRUE 0.997 18.000 0.713 NA Y NA
 3501896 3501897 Patl_2068 Patl_2069     TRUE 0.994 0.000 0.197 NA   NA
 3501897 3501898 Patl_2069 Patl_2070     TRUE 0.921 72.000 0.404 NA   NA
 3501898 3501899 Patl_2070 Patl_2071     TRUE 0.999 -7.000 0.636 0.002   NA
 3501899 3501900 Patl_2071 Patl_2072     TRUE 0.999 2.000 0.667 0.002   NA
 3501900 3501901 Patl_2072 Patl_2073     TRUE 0.996 12.000 0.700 0.002 N NA
 3501903 3501904 Patl_2075 Patl_2076     TRUE 0.999 0.000 0.396 0.001 Y NA
 3501905 3501906 Patl_2077 Patl_2078     TRUE 0.929 -3.000 0.000 NA   NA
 3501906 3501907 Patl_2078 Patl_2079     TRUE 0.518 24.000 0.000 NA   NA
 3501907 3501908 Patl_2079 Patl_2080     FALSE 0.002 592.000 0.000 1.000 N NA
 3501908 3501909 Patl_2080 Patl_2081     FALSE 0.067 284.000 0.000 1.000 Y NA
 3501910 3501911 Patl_2082 Patl_2083     FALSE 0.125 122.000 0.000 NA   NA
 3501912 3501913 Patl_2084 Patl_2085     FALSE 0.015 208.000 0.000 1.000 N NA
 3501913 3501914 Patl_2085 Patl_2086     FALSE 0.210 61.000 0.000 NA N NA
 3501915 3501916 Patl_2087 Patl_2088     TRUE 0.886 -22.000 0.000 1.000 N NA
 3501917 3501918 Patl_2089 Patl_2090     FALSE 0.022 223.000 0.000 0.081 N NA
 3501918 3501919 Patl_2090 Patl_2091     TRUE 0.999 -10.000 0.667 1.000 N NA
 3501919 3501920 Patl_2091 Patl_2092     TRUE 0.953 36.000 0.400 NA   NA
 3501920 3501921 Patl_2092 Patl_2093     FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3501921 3501922 Patl_2093 Patl_2094     FALSE 0.371 40.000 0.000 NA   NA
 3501923 3501924 Patl_2095 Patl_2096     FALSE 0.146 138.000 0.000 0.023   NA
 3501924 3501925 Patl_2096 Patl_2097     TRUE 0.992 -10.000 0.000 0.025 Y NA
 3501927 3501928 Patl_2099 Patl_2100     TRUE 0.993 5.000 0.286 NA   NA
 3501928 3501929 Patl_2100 Patl_2101     FALSE 0.062 157.000 0.000 1.000   NA
 3501933 3501934 Patl_2105 Patl_2106     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 3501934 3501935 Patl_2106 Patl_2107     TRUE 0.921 0.000 0.000 NA   NA
 3501937 3501938 Patl_2109 Patl_2110     FALSE 0.002 608.000 0.000 1.000 N NA
 3501940 3501941 Patl_2112 Patl_2113     FALSE 0.079 293.000 0.000 0.008 Y NA
 3501943 3501944 Patl_2115 Patl_2116     TRUE 0.910 63.000 0.110 NA Y NA
 3501944 3501945 Patl_2116 Patl_2117     TRUE 0.993 2.000 0.211 0.086 N NA
 3501945 3501946 Patl_2117 Patl_2118     TRUE 0.847 68.000 0.209 NA   NA
 3501946 3501947 Patl_2118 Patl_2119     TRUE 0.814 85.000 0.204 NA   NA
 3501947 3501948 Patl_2119 Patl_2120     TRUE 0.614 133.000 0.187 0.037 N NA
 3501948 3501949 Patl_2120 Patl_2121     TRUE 0.966 79.000 0.346 1.000 Y NA
 3501949 3501950 Patl_2121 Patl_2122     TRUE 0.764 184.000 0.321 0.004 Y NA
 3501950 3501951 Patl_2122 Patl_2123     TRUE 0.996 15.000 0.432 0.004 Y NA
 3501951 3501952 Patl_2123 Patl_2124     TRUE 0.953 62.000 0.182 0.004 Y NA
 3501952 3501953 Patl_2124 Patl_2125     TRUE 0.999 4.000 0.380 0.004 Y NA
 3501953 3501954 Patl_2125 Patl_2126     TRUE 0.988 13.000 0.418 1.000 N NA
 3501954 3501955 Patl_2126 Patl_2127     TRUE 0.995 11.000 0.599 NA   NA
 3501957 3501958 Patl_2129 Patl_2130     TRUE 0.923 47.000 0.098 1.000 Y NA
 3501958 3501959 Patl_2130 Patl_2131     TRUE 0.955 28.000 0.100 1.000 Y NA
 3501959 3501960 Patl_2131 Patl_2132     TRUE 0.998 3.000 0.200 0.002 Y NA
 3501960 3501961 Patl_2132 Patl_2133     FALSE 0.243 52.000 0.000 1.000 N NA
 3501962 3501963 Patl_2134 Patl_2135     FALSE 0.222 183.000 0.000 1.000 Y NA
 3501963 3501964 Patl_2135 Patl_2136     FALSE 0.109 132.000 0.000 1.000   NA
 3501964 3501965 Patl_2136 Patl_2137     TRUE 0.964 3.000 0.034 NA   NA
 3501965 3501966 Patl_2137 Patl_2138     TRUE 0.813 10.000 0.000 NA   NA
 3501967 3501968 Patl_2139 Patl_2140     TRUE 0.949 28.000 0.062 0.047 Y NA
 3501968 3501969 Patl_2140 Patl_2141     TRUE 0.522 158.000 0.062 1.000 Y NA
 3501970 3501971 Patl_2142 Patl_2143     FALSE 0.003 581.000 0.000 1.000   NA
 3501972 3501973 Patl_2144 Patl_2145     FALSE 0.004 349.000 0.000 1.000 N NA
 3501973 3501974 Patl_2145 Patl_2146     TRUE 1.000 0.000 0.875 0.017 Y NA
 3501975 3501976 Patl_2147 Patl_2148     FALSE 0.068 182.000 0.010 1.000   NA
 3501976 3501977 Patl_2148 Patl_2149     FALSE 0.034 187.000 0.000 1.000   NA
 3501977 3501978 Patl_2149 Patl_2150     TRUE 0.578 62.000 0.038 NA   NA
 3501978 3501979 Patl_2150 Patl_2151     TRUE 0.848 55.000 0.183 NA   NA
 3501979 3501980 Patl_2151 Patl_2152   fur FALSE 0.147 223.000 0.156 1.000 N NA
 3501981 3501982 Patl_2153 Patl_2154     TRUE 1.000 -10.000 0.660 0.001 Y NA
 3501982 3501983 Patl_2154 Patl_2155     TRUE 0.966 -7.000 0.026 1.000 N NA
 3501983 3501984 Patl_2155 Patl_2156     TRUE 0.999 4.000 0.501 1.000 Y NA
 3501984 3501985 Patl_2156 Patl_2157     TRUE 0.998 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 3501985 3501986 Patl_2157 Patl_2158     TRUE 0.996 4.000 0.109 0.001 Y NA
 3501986 3501987 Patl_2158 Patl_2159     FALSE 0.141 115.000 0.000 NA   NA
 3501987 3501988 Patl_2159 Patl_2160   moaA TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 3501989 3501990 Patl_2161 Patl_2162     TRUE 0.985 -7.000 0.069 1.000   NA
 3501990 3501991 Patl_2162 Patl_2163     TRUE 0.900 62.000 0.302 NA   NA
 3501991 3501992 Patl_2163 Patl_2164     TRUE 0.958 26.000 0.318 NA   NA
 3501992 3501993 Patl_2164 Patl_2165     FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000   NA
 3501993 3501994 Patl_2165 Patl_2166     FALSE 0.249 112.000 0.000 0.007   NA
 3501997 3501998 Patl_2169 Patl_2170     FALSE 0.223 116.000 0.009 NA   NA
 3501998 3501999 Patl_2170 Patl_2171     FALSE 0.069 174.000 0.006 1.000   NA
 3502000 3502001 Patl_2172 Patl_2173     FALSE 0.430 151.000 0.011 1.000 Y NA
 3502002 3502003 Patl_2174 Patl_2175     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 3502005 3502006 Patl_2177 Patl_2178     TRUE 0.584 38.000 0.017 NA   NA
 3502006 3502007 Patl_2178 Patl_2179     FALSE 0.133 161.000 0.027 NA   NA
 3502007 3502008 Patl_2179 Patl_2180     FALSE 0.012 225.000 0.000 1.000 N NA
 3502008 3502009 Patl_2180 Patl_2181     FALSE 0.003 367.000 0.000 1.000 N NA
 3502009 3502010 Patl_2181 Patl_2182     TRUE 0.647 97.000 0.114 NA   NA
 3502014 3502015 Patl_2186 Patl_2187     TRUE 0.898 23.000 0.000 NA Y NA
 3502015 3502016 Patl_2187 Patl_2188     FALSE 0.003 361.000 0.000 NA N NA
 3502016 3502017 Patl_2188 Patl_2189     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000   NA
 3502017 3502018 Patl_2189 Patl_2190     FALSE 0.026 203.000 0.000 1.000   NA
 3502019 3502020 Patl_2191 Patl_2192     TRUE 0.996 -3.000 0.292 1.000 N NA
 3502020 3502021 Patl_2192 Patl_2193     TRUE 0.994 -3.000 0.163 0.032 N NA
 3502022 3502023 Patl_2194 Patl_2195     FALSE 0.134 117.000 0.000 NA   NA
 3502023 3502024 Patl_2195 Patl_2196     FALSE 0.121 105.000 0.000 1.000 N NA
 3502024 3502025 Patl_2196 Patl_2197     FALSE 0.037 162.000 0.000 1.000 N NA
 3502025 3502026 Patl_2197 Patl_2198     FALSE 0.127 253.000 0.005 0.023 Y NA
 3502026 3502027 Patl_2198 Patl_2199     TRUE 0.955 14.000 0.151 1.000 N NA
 3502027 3502028 Patl_2199 Patl_2200     FALSE 0.049 164.000 0.000 NA   NA
 3502028 3502029 Patl_2200 Patl_2201