MicrobesOnline Operon Predictions for Ralstonia solanacearum UW551

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2514338 2514339 RRSL_04591 RRSL_04592     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 2514340 2514341 RRSL_04593 RRSL_04594     FALSE 0.072 79.000 0.000 NA   NA
 2514343 2514344 RRSL_04596 RRSL_04597     TRUE 0.987 30.000 0.686 0.025 Y NA
 2514344 2514345 RRSL_04597 RRSL_04598     FALSE 0.557 30.000 0.048 1.000 N NA
 2514345 2514346 RRSL_04598 RRSL_04599     TRUE 0.699 14.000 0.048 1.000 N NA
 2514346 2514347 RRSL_04599 RRSL_04600     TRUE 0.990 18.000 0.375 0.002 Y NA
 2514347 2514348 RRSL_04600 RRSL_04601     TRUE 0.905 15.000 0.000 0.002   NA
 2514348 2514349 RRSL_04601 RRSL_04602     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 2514349 2514350 RRSL_04602 RRSL_04603     FALSE 0.150 41.000 0.000 NA   NA
 2514352 2514353 RRSL_04605 RRSL_04606     FALSE 0.082 67.000 0.000 NA   NA
 2514353 2514354 RRSL_04606 RRSL_04607     TRUE 0.933 70.000 0.458 0.073 Y NA
 2514355 2514356 RRSL_04608 RRSL_04609     FALSE 0.376 136.000 0.122 1.000 N NA
 2514356 2514357 RRSL_04609 RRSL_04610     TRUE 0.580 5.000 0.010 1.000 N NA
 2514358 2514359 RRSL_04611 RRSL_04612     TRUE 0.741 29.000 0.106 NA   NA
 2514359 2514360 RRSL_04612 RRSL_04613     TRUE 0.952 -3.000 0.235 1.000 N NA
 2514360 2514361 RRSL_04613 RRSL_04614     TRUE 0.993 28.000 0.948 0.003 Y NA
 2514362 2514363 RRSL_04615 RRSL_04616     FALSE 0.398 58.000 0.070 1.000 N NA
 2514363 2514364 RRSL_04616 RRSL_04617     TRUE 0.972 -10.000 0.167 1.000 Y NA
 2514364 2514365 RRSL_04617 RRSL_04618     TRUE 0.741 78.000 0.111 NA Y NA
 2514365 2514366 RRSL_04618 RRSL_04619     FALSE 0.251 45.000 0.010 NA   NA
 2514366 2514367 RRSL_04619 RRSL_04620     FALSE 0.017 206.000 0.000 1.000   NA
 2514367 2514368 RRSL_04620 RRSL_04621     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 2514369 2514370 RRSL_04622 RRSL_04624     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 2514372 2514373 RRSL_04625 RRSL_04627     TRUE 0.802 -3.000 0.037 NA N NA
 2514374 2514375 RRSL_04626 RRSL_04628     FALSE 0.370 108.000 0.073 NA   NA
 2514376 2514377 RRSL_04629 RRSL_04630     FALSE 0.398 109.000 0.083 NA   NA
 2514377 2514378 RRSL_04630 RRSL_04631     TRUE 0.915 -3.000 0.100 NA   NA
 2514378 2514379 RRSL_04631 RRSL_04632     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 2514380 2514381 RRSL_04633 RRSL_04634     FALSE 0.011 232.000 0.000 1.000   NA
 2514381 2514382 RRSL_04634 RRSL_04635     FALSE 0.075 86.000 0.000 NA   NA
 2514382 2514383 RRSL_04635 RRSL_04636     TRUE 0.937 -67.000 0.417 NA   NA
 2514386 2514387 RRSL_04639 RRSL_04640     FALSE 0.002 535.000 0.000 NA   NA
 2514387 2514388 RRSL_04640 RRSL_04641   sefC TRUE 0.981 -3.000 0.667 NA   NA
 2514388 2514389 RRSL_04641 RRSL_04642 sefC ecpD TRUE 0.990 0.000 0.500 NA Y NA
 2514389 2514390 RRSL_04642 RRSL_04643 ecpD   TRUE 0.585 51.000 0.125 NA   NA
 2514390 2514391 RRSL_04643 RRSL_04644     FALSE 0.002 530.000 0.000 NA   NA
 2514391 2514392 RRSL_04644 RRSL_04645     FALSE 0.028 443.000 0.143 1.000   NA
 2514393 2514394 RRSL_04647 RRSL_04648     FALSE 0.074 92.000 0.000 NA   NA
 2514395 2514396 RRSL_04649 RRSL_04650     FALSE 0.004 346.000 0.000 1.000   NA
 2514396 2514397 RRSL_04650 RRSL_04651     TRUE 0.956 18.000 0.750 NA   NA
 2514397 2514398 RRSL_04651 RRSL_04652     FALSE 0.447 5.000 0.000 NA   NA
 2514398 2514399 RRSL_04652 RRSL_04653     FALSE 0.073 75.000 0.000 NA   NA
 2514399 2514400 RRSL_04653 RRSL_04654     FALSE 0.001 891.000 0.000 1.000   NA
 2514400 2514401 RRSL_04654 RRSL_04656     FALSE 0.016 202.000 0.000 NA   NA
 2514402 2514403 RRSL_04655 RRSL_04657     FALSE 0.369 124.000 0.083 NA   NA
 2514403 2514404 RRSL_04657 RRSL_04658     TRUE 0.929 -3.000 0.125 NA   NA
 2514405 2514406 RRSL_04659 RRSL_04661     FALSE 0.147 42.000 0.000 NA   NA
 2514408 2514409 RRSL_04662 RRSL_04663     FALSE 0.003 409.000 0.000 1.000   NA
 2514412 2514413 RRSL_04666 RRSL_04667     TRUE 0.982 -10.000 0.091 0.072 Y NA
 2514414 2514415 RRSL_04668 RRSL_04669     FALSE 0.077 107.000 0.000 NA   NA
 2514415 2514416 RRSL_04669 RRSL_04670     FALSE 0.136 45.000 0.000 NA   NA
 2514418 2514419 RRSL_04672 RRSL_04673     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 2514419 2514420 RRSL_04673 RRSL_04675     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000   NA
 2514420 2514421 RRSL_04675 RRSL_04676     TRUE 0.963 3.000 0.429 1.000 N NA
 2514421 2514422 RRSL_04676 RRSL_04677     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 2514422 2514423 RRSL_04677 RRSL_04678     TRUE 0.667 68.000 0.350 1.000 N NA
 2514424 2514425 RRSL_04679 RRSL_04680 ompR   TRUE 0.910 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 2514425 2514426 RRSL_04680 RRSL_04681     FALSE 0.445 130.000 0.136 NA   NA
 2514427 2514428 RRSL_04682 RRSL_04683     TRUE 0.710 136.000 0.667 1.000 N NA
 2514430 2514431 RRSL_04685 RRSL_04687     FALSE 0.434 106.000 0.111 NA N NA
 2514431 2514432 RRSL_04687 RRSL_04688     TRUE 0.876 40.000 0.654 NA N NA
 2514432 2514433 RRSL_04688 RRSL_04689     TRUE 0.972 2.000 0.558 1.000 N NA
 2514434 2514435 RRSL_04690 RRSL_04691     TRUE 0.792 11.000 0.070 1.000 N NA
 2514436 2514437 RRSL_04692 RRSL_04693     TRUE 0.988 -3.000 0.545 0.072 N NA
 2514437 2514438 RRSL_04693 RRSL_04694     TRUE 0.980 -7.000 0.467 0.084 N NA
 2514439 2514440 RRSL_04695 RRSL_04696     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 2514440 2514441 RRSL_04696 RRSL_04697     FALSE 0.121 49.000 0.000 NA   NA
 2514441 2514442 RRSL_04697 RRSL_04698     FALSE 0.086 64.000 0.000 NA   NA
 2514442 2514443 RRSL_04698 RRSL_04699     FALSE 0.169 37.000 0.000 NA   NA
 2514443 2514444 RRSL_04699 RRSL_04700     FALSE 0.169 37.000 0.000 NA   NA
 2514444 2514445 RRSL_04700 RRSL_04701     FALSE 0.086 64.000 0.000 NA   NA
 2514445 2514446 RRSL_04701 RRSL_04702     FALSE 0.268 25.000 0.000 NA   NA
 2514446 2514447 RRSL_04702 RRSL_04703     FALSE 0.427 7.000 0.000 NA   NA
 2514448 2514449 RRSL_04705 RRSL_04706     FALSE 0.124 146.000 0.017 1.000   NA
 2514449 2514450 RRSL_04706 RRSL_04708     FALSE 0.002 582.000 0.000 NA   NA
 2514453 2514454 RRSL_04711 RRSL_04712     FALSE 0.315 111.000 0.052 1.000   NA
 2514455 2514456 RRSL_04713 RRSL_04714     TRUE 0.907 -3.000 0.088 NA   NA
 2514457 2514458 RRSL_04715 RRSL_04716     TRUE 0.699 112.000 0.400 NA   NA
 2514458 2514459 RRSL_04716 RRSL_04717     FALSE 0.230 56.000 0.017 NA   NA
 2514459 2514460 RRSL_04717 RRSL_04718     TRUE 0.980 -94.000 0.591 1.000 Y NA
 2514460 2514461 RRSL_04718 RRSL_04719     TRUE 0.587 135.000 0.042 NA Y NA
 2514462 2514463 RRSL_04720 RRSL_04721     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 2514463 2514464 RRSL_04721 RRSL_04722     TRUE 0.667 -25.000 0.023 NA   NA
 2514464 2514465 RRSL_04722 RRSL_04723     FALSE 0.314 57.000 0.040 NA   NA
 2514465 2514466 RRSL_04723 RRSL_04724     TRUE 0.916 27.000 0.500 NA   NA
 2514467 2514468 RRSL_04726 RRSL_04727     FALSE 0.304 19.000 0.000 NA   NA
 2514468 2514469 RRSL_04727 RRSL_04728     FALSE 0.467 105.000 0.120 NA   NA
 2514469 2514470 RRSL_04728 RRSL_04729     FALSE 0.442 95.000 0.111 NA   NA
 2514471 2514472 RRSL_04730 RRSL_04731 modC modB TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2514472 2514473 RRSL_04731 RRSL_04732 modB   FALSE 0.150 61.000 0.011 1.000 N NA
 2514474 2514475 RRSL_04733 RRSL_04734     TRUE 0.956 70.000 0.667 0.023 Y NA
 2514475 2514476 RRSL_04734 RRSL_04735     FALSE 0.010 205.000 0.000 1.000 N NA
 2514477 2514478 RRSL_04736 RRSL_04737     FALSE 0.005 323.000 0.000 1.000   NA
 2514480 2514481 RRSL_04739 RRSL_04740     TRUE 0.864 20.000 0.042 0.071 N NA
 2514481 2514482 RRSL_04740 RRSL_04741     FALSE 0.443 37.000 0.042 1.000 N NA
 2514482 2514483 RRSL_04741 RRSL_04742     FALSE 0.003 309.000 0.000 1.000 N NA
 2514487 2514488 RRSL_04747 RRSL_04748     TRUE 0.815 44.000 0.429 1.000 N NA
 2514488 2514489 RRSL_04748 RRSL_04749     FALSE 0.532 157.000 0.429 1.000 N NA
 2514489 2514490 RRSL_04749 RRSL_04750     TRUE 0.708 57.000 0.333 1.000 N NA
 2514490 2514491 RRSL_04750 RRSL_04751     TRUE 0.989 -3.000 0.016 0.001 Y NA
 2514491 2514492 RRSL_04751 RRSL_04752     FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 2514492 2514493 RRSL_04752 RRSL_04753     FALSE 0.007 265.000 0.000 NA   NA
 2514494 2514495 RRSL_04754 RRSL_04755     FALSE 0.346 103.000 0.074 1.000 N NA
 2514495 2514496 RRSL_04755 RRSL_04756     FALSE 0.217 93.000 0.037 1.000 N NA
 2514496 2514497 RRSL_04756 RRSL_04757     TRUE 0.885 137.000 0.750 1.000 Y NA
 2514498 2514499 RRSL_04758 RRSL_04759     FALSE 0.003 390.000 0.000 1.000   NA
 2514499 2514500 RRSL_04759 RRSL_04760     FALSE 0.002 399.000 0.000 1.000 N NA
 2514503 2514504 RRSL_04763 RRSL_04764     FALSE 0.002 488.000 0.000 1.000   NA
 2514505 2514506 RRSL_04765 RRSL_04767     TRUE 0.996 -3.000 0.440 0.005 Y NA
 2514506 2514507 RRSL_04767 RRSL_04768     TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.005 Y NA
 2514507 2514508 RRSL_04768 RRSL_04769     TRUE 0.991 13.000 0.344 0.005 Y NA
 2514508 2514509 RRSL_04769 RRSL_04770     FALSE 0.047 229.000 0.043 NA   NA
 2514509 2514510 RRSL_04770 RRSL_04771     TRUE 0.756 -49.000 0.055 NA   NA
 2514513 2514514 RRSL_04774 RRSL_04775     TRUE 0.952 0.000 0.011 1.000 Y NA
 2514514 2514515 RRSL_04775 RRSL_04776     TRUE 0.963 -19.000 0.117 1.000 Y NA
 2514515 2514516 RRSL_04776 RRSL_04777     FALSE 0.001 1182.000 0.000 1.000   NA
 2514516 2514517 RRSL_04777 RRSL_04779     TRUE 0.757 17.000 0.069 1.000   NA
 2514517 2514518 RRSL_04779 RRSL_04780     TRUE 0.989 7.000 0.724 1.000 Y NA
 2514518 2514519 RRSL_04780 RRSL_04782     FALSE 0.314 165.000 0.185 1.000 N NA
 2514519 2514520 RRSL_04782 RRSL_04783     FALSE 0.001 606.000 0.000 1.000 N NA
 2514520 2514521 RRSL_04783 RRSL_04784     FALSE 0.081 86.000 0.000 1.000   NA
 2514521 2514522 RRSL_04784 RRSL_04785     FALSE 0.130 131.000 0.011 1.000   NA
 2514524 2514525 RRSL_04787 RRSL_04788     FALSE 0.002 485.000 0.000 NA   NA
 2514525 2514526 RRSL_04788 RRSL_04789     TRUE 0.618 97.000 0.286 NA   NA
 2514526 2514527 RRSL_04789 RRSL_04790     FALSE 0.542 162.000 0.500 NA   NA
 2514528 2514529 RRSL_04791 RRSL_04792     FALSE 0.007 263.000 0.000 NA   NA
 2514531 2514532 RRSL_04388 RRSL_04389     TRUE 0.944 36.000 0.044 0.003 Y NA
 2514532 2514533 RRSL_04389 RRSL_04390   rbsC TRUE 0.994 -79.000 0.750 0.003 Y NA
 2514533 2514534 RRSL_04390 RRSL_04391 rbsC   TRUE 0.782 19.000 0.097 1.000 N NA
 2514534 2514535 RRSL_04391 RRSL_04392     TRUE 0.859 37.000 0.484 1.000 N NA
 2514536 2514537 RRSL_04393 RRSL_04394     TRUE 0.861 24.000 0.003 NA Y NA
 2514538 2514539 RRSL_04395 RRSL_04396   phaZ FALSE 0.048 223.000 0.046 1.000 N NA
 2514544 2514545 RRSL_04402 RRSL_04403     FALSE 0.003 311.000 0.000 NA N NA
 2514545 2514546 RRSL_04403 RRSL_04404     TRUE 0.994 12.000 0.688 0.015 Y NA
 2514547 2514548 RRSL_04405 RRSL_04406     TRUE 0.761 14.000 0.061 NA   NA
 2514548 2514549 RRSL_04406 RRSL_04407     TRUE 0.771 17.000 0.077 NA   NA
 2514550 2514551 RRSL_04408 RRSL_04409     TRUE 0.840 -42.000 0.096 1.000   NA
 2514552 2514553 RRSL_04410 RRSL_04411     TRUE 0.844 12.000 0.111 1.000 N NA
 2514554 2514555 RRSL_04412 RRSL_04413   htpG FALSE 0.464 -55.000 0.010 NA N NA
 2514555 2514556 RRSL_04413 RRSL_04414 htpG   FALSE 0.169 130.000 0.028 1.000 N NA
 2514557 2514558 RRSL_04415 RRSL_04416     FALSE 0.003 400.000 0.000 1.000   NA
 2514558 2514559 RRSL_04416 RRSL_04417     FALSE 0.485 50.000 0.082 1.000 N NA
 2514559 2514560 RRSL_04417 RRSL_04418     TRUE 0.625 20.000 0.037 NA   NA
 2514560 2514561 RRSL_04418 RRSL_04419     FALSE 0.327 124.000 0.067 NA   NA
 2514564 2514565 RRSL_04422 RRSL_04423     TRUE 0.992 -72.000 0.357 0.001 Y NA
 2514565 2514566 RRSL_04423 RRSL_04424     FALSE 0.530 6.000 0.007 1.000 N NA
 2514566 2514567 RRSL_04424 RRSL_04425     FALSE 0.290 50.000 0.023 NA   NA
 2514567 2514568 RRSL_04425 RRSL_04426     FALSE 0.369 51.000 0.043 NA   NA
 2514571 2514572 RRSL_04429 RRSL_04430     FALSE 0.002 504.000 0.000 NA   NA
 2514573 2514574 RRSL_04431 RRSL_04432     FALSE 0.010 235.000 0.000 NA   NA
 2514575 2514576 RRSL_04433 RRSL_RNA039     FALSE 0.073 80.000 0.000 NA   NA
 2514576 2514577 RRSL_RNA039 RRSL_04434     FALSE 0.026 175.000 0.000 NA   NA
 2514578 2514579 RRSL_04435 RRSL_04436     TRUE 0.935 11.000 0.333 NA   NA
 2514579 2514580 RRSL_04436 RRSL_04437     TRUE 0.972 -7.000 0.667 NA   NA
 2514580 2514581 RRSL_04437 RRSL_04440     FALSE 0.001 656.000 0.000 NA   NA
 2514581 2514582 RRSL_04440 RRSL_04441     TRUE 0.972 12.000 1.000 NA   NA
 2514582 2514583 RRSL_04441 RRSL_04443     FALSE 0.001 966.000 0.000 NA   NA
 2514583 2514584 RRSL_04443 RRSL_04444     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2514584 2514585 RRSL_04444 RRSL_04445     TRUE 0.853 41.000 0.500 NA   NA
 2514585 2514586 RRSL_04445 RRSL_04446     FALSE 0.001 604.000 0.000 NA   NA
 2514590 2514591 RRSL_04450 RRSL_04451     FALSE 0.401 82.000 0.091 NA   NA
 2514594 2514595 RRSL_04453 RRSL_04455     TRUE 0.928 -3.000 0.134 1.000 N NA
 2514597 2514598 RRSL_04457 RRSL_04458     TRUE 0.925 -3.000 0.117 NA   NA
 2514600 2514601 RRSL_04459 RRSL_04461     TRUE 0.853 -3.000 0.046 1.000   NA
 2514601 2514602 RRSL_04461 RRSL_04462     FALSE 0.424 25.000 0.009 NA   NA
 2514603 2514604 RRSL_04463 RRSL_04464     TRUE 0.879 24.000 0.254 1.000   NA
 2514604 2514605 RRSL_04464 RRSL_04465     FALSE 0.228 112.000 0.027 1.000   NA
 2514605 2514606 RRSL_04465 RRSL_04466     TRUE 0.981 -76.000 0.567 1.000 Y NA
 2514606 2514607 RRSL_04466 RRSL_04467   rimM TRUE 0.978 24.000 0.672 1.000 Y NA
 2514608 2514609 RRSL_04468 RRSL_04470     FALSE 0.109 185.000 0.054 NA   NA
 2514609 2514610 RRSL_04470 RRSL_04471     TRUE 0.745 136.000 0.750 NA   NA
 2514610 2514611 RRSL_04471 RRSL_04472     FALSE 0.186 154.000 0.050 NA   NA
 2514612 2514613 RRSL_04473 RRSL_04474     FALSE 0.304 86.000 0.060 1.000 N NA
 2514615 2514616 RRSL_04476 RRSL_04477     FALSE 0.317 145.000 0.000 0.071 N NA
 2514616 2514617 RRSL_04477 RRSL_04478     FALSE 0.218 177.000 0.133 NA N NA
 2514617 2514618 RRSL_04478 RRSL_04479     TRUE 0.943 36.000 0.400 NA Y NA
 2514618 2514619 RRSL_04479 RRSL_04480     TRUE 0.992 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 2514621 2514622 RRSL_04482 RRSL_04484     FALSE 0.049 330.000 0.000 0.017 N NA
 2514623 2514624 RRSL_04485 RRSL_04486     FALSE 0.391 -25.000 0.000 NA   NA
 2514624 2514625 RRSL_04486 RRSL_04487     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 2514625 2514626 RRSL_04487 RRSL_04489     FALSE 0.212 164.000 0.083 1.000   NA
 2514626 2514627 RRSL_04489 RRSL_04490     TRUE 0.972 6.000 0.696 1.000   NA
 2514627 2514628 RRSL_04490 RRSL_04491     TRUE 0.960 4.000 0.435 1.000 N NA
 2514628 2514629 RRSL_04491 RRSL_04492     TRUE 0.967 -3.000 0.364 NA   NA
 2514630 2514631 RRSL_04493 RRSL_04494     TRUE 0.958 -28.000 0.106 1.000 Y NA
 2514631 2514632 RRSL_04494 RRSL_04495     TRUE 0.989 -3.000 0.426 0.009 N NA
 2514635 2514636 RRSL_04497 RRSL_04499     TRUE 0.990 2.000 0.500 1.000 Y NA
 2514636 2514637 RRSL_04499 RRSL_04500     TRUE 0.972 -7.000 0.667 NA   NA
 2514637 2514638 RRSL_04500 RRSL_04501     TRUE 0.970 -10.000 0.667 NA   NA
 2514638 2514639 RRSL_04501 RRSL_04502     FALSE 0.001 1079.000 0.000 NA   NA
 2514639 2514640 RRSL_04502 RRSL_04503     FALSE 0.236 30.000 0.000 1.000   NA
 2514640 2514641 RRSL_04503 RRSL_04504     TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.076 Y NA
 2514642 2514643 RRSL_04505 RRSL_04506     FALSE 0.002 449.000 0.000 NA   NA
 2514644 2514645 RRSL_04507 RRSL_04508     FALSE 0.008 253.000 0.000 NA   NA
 2514649 2514650 RRSL_04512 RRSL_04513     FALSE 0.138 134.000 0.016 NA   NA
 2514650 2514651 RRSL_04513 RRSL_04514     FALSE 0.010 202.000 0.000 1.000 N NA
 2514653 2514654 RRSL_04516 RRSL_04517     FALSE 0.007 261.000 0.000 NA   NA
 2514655 2514656 RRSL_04518 RRSL_04519     TRUE 0.872 -90.000 0.020 0.048 N NA
 2514658 2514659 RRSL_04521 RRSL_04522     TRUE 0.647 111.000 0.318 1.000 N NA
 2514659 2514660 RRSL_04522 RRSL_04523     TRUE 0.678 92.000 0.404 1.000 N NA
 2514660 2514661 RRSL_04523 RRSL_04524     TRUE 0.927 45.000 0.088 0.024 Y NA
 2514662 2514663 RRSL_04525 RRSL_04526     TRUE 0.603 156.000 0.101 1.000 Y NA
 2514663 2514664 RRSL_04526 RRSL_04527     FALSE 0.250 91.000 0.044 1.000 N NA
 2514664 2514665 RRSL_04527 RRSL_04528     FALSE 0.328 55.000 0.046 1.000 N NA
 2514666 2514667 RRSL_04529 RRSL_04530     FALSE 0.095 59.000 0.000 NA   NA
 2514668 2514669 RRSL_04531 RRSL_04532     FALSE 0.003 610.000 0.011 NA   NA
 2514669 2514670 RRSL_04532 RRSL_04533     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 2514670 2514671 RRSL_04533 RRSL_04534     FALSE 0.002 430.000 0.000 1.000 N NA
 2514673 2514674 RRSL_04536 RRSL_04537     TRUE 0.966 40.000 0.923 1.000 Y NA
 2514674 2514675 RRSL_04537 RRSL_04538     TRUE 0.954 -3.000 0.231 NA   NA
 2514675 2514676 RRSL_04538 RRSL_04539     FALSE 0.421 59.000 0.073 NA   NA
 2514677 2514678 RRSL_04541 RRSL_04542     TRUE 0.978 -13.000 0.285 1.000 Y NA
 2514678 2514679 RRSL_04542 RRSL_04543     FALSE 0.539 35.000 0.058 1.000 N NA
 2514679 2514680 RRSL_04543 RRSL_RNA043     FALSE 0.035 162.000 0.000 NA   NA
 2514683 2514684 RRSL_04546 RRSL_04547     FALSE 0.012 218.000 0.000 NA   NA
 2514685 2514686 RRSL_04548 RRSL_04550     FALSE 0.042 190.000 0.010 NA   NA
 2514689 2514690 RRSL_04551 RRSL_04553     TRUE 0.907 -16.000 0.168 1.000   NA
 2514692 2514693 RRSL_04555 RRSL_04556   phbA TRUE 0.864 80.000 0.420 1.000 Y NA
 2514693 2514694 RRSL_04556 RRSL_04557 phbA   TRUE 0.870 124.000 0.491 1.000 Y NA
 2514694 2514695 RRSL_04557 RRSL_04558     TRUE 0.844 16.000 0.130 NA   NA
 2514695 2514696 RRSL_04558 RRSL_04559     FALSE 0.138 103.000 0.008 NA   NA
 2514696 2514697 RRSL_04559 RRSL_04560     TRUE 0.615 68.000 0.013 1.000 Y NA
 2514697 2514698 RRSL_04560 RRSL_04561     FALSE 0.124 96.000 0.011 1.000 N NA
 2514698 2514699 RRSL_04561 RRSL_04562     TRUE 0.933 -25.000 0.300 NA   NA
 2514699 2514700 RRSL_04562 RRSL_04563     TRUE 0.915 -106.000 0.348 NA   NA
 2514701 2514702 RRSL_04564 RRSL_04565     FALSE 0.310 30.000 0.003 NA   NA
 2514702 2514703 RRSL_04565 RRSL_04566     FALSE 0.573 121.000 0.005 1.000 Y NA
 2514703 2514704 RRSL_04566 RRSL_04568     FALSE 0.281 37.000 0.013 1.000 N NA
 2514706 2514707 RRSL_04570 RRSL_04571     FALSE 0.317 89.000 0.058 NA   NA
 2514707 2514708 RRSL_04571 RRSL_04573     FALSE 0.028 233.000 0.027 1.000 N NA
 2514708 2514709 RRSL_04573 RRSL_04574     TRUE 0.911 40.000 0.241 1.000 Y NA
 2514710 2514711 RRSL_04575 RRSL_04576     FALSE 0.309 73.000 0.056 NA   NA
 2514711 2514712 RRSL_04576 RRSL_04577     TRUE 0.905 25.000 0.389 NA   NA
 2514714 2514715 RRSL_04579 RRSL_04580     TRUE 0.755 68.000 0.583 NA N NA
 2514715 2514716 RRSL_04580 RRSL_RNA040     FALSE 0.076 104.000 0.000 NA   NA
 2514716 2514717 RRSL_RNA040 RRSL_04581     FALSE 0.016 202.000 0.000 NA   NA
 2514717 2514718 RRSL_04581 RRSL_04582     FALSE 0.078 116.000 0.000 NA   NA
 2514718 2514719 RRSL_04582 RRSL_04583     FALSE 0.115 74.000 0.004 NA   NA
 2514719 2514720 RRSL_04583 RRSL_04584     FALSE 0.085 76.000 0.003 1.000 N NA
 2514720 2514721 RRSL_04584 RRSL_04585     TRUE 0.953 30.000 0.351 1.000 Y NA
 2514721 2514722 RRSL_04585 RRSL_04586   clpX TRUE 0.700 166.000 0.352 1.000 Y NA
 2514722 2514723 RRSL_04586 RRSL_04587 clpX   TRUE 0.732 172.000 0.201 0.098 Y NA
 2514723 2514724 RRSL_04587 RRSL_04588     FALSE 0.203 80.000 0.033 1.000 N NA
 2514724 2514725 RRSL_04588 RRSL_RNA041     FALSE 0.077 70.000 0.000 NA   NA
 2514725 2514726 RRSL_RNA041 RRSL_RNA042     FALSE 0.136 45.000 0.000 NA   NA
 2514726 2514727 RRSL_RNA042 RRSL_04589     FALSE 0.042 155.000 0.000 NA   NA
 2514728 2514729 RRSL_04277 RRSL_04278     FALSE 0.008 252.000 0.000 NA   NA
 2514730 2514731 RRSL_04279 RRSL_04280     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 2514733 2514734 RRSL_04282 RRSL_04283     TRUE 0.802 -97.000 0.095 1.000   NA
 2514734 2514735 RRSL_04283 RRSL_04285     FALSE 0.001 15466.000 0.000 NA   NA
 2514735 2514736 RRSL_04285 RRSL_04286     TRUE 0.683 31.000 0.087 NA   NA
 2514737 2514738 RRSL_04287 RRSL_04288     FALSE 0.553 140.000 0.333 1.000 N NA
 2514738 2514739 RRSL_04288 RRSL_04289     FALSE 0.007 225.000 0.000 1.000 N NA
 2514740 2514741 RRSL_04290 RRSL_04292     FALSE 0.291 21.000 0.000 NA   NA
 2514741 2514742 RRSL_04292 RRSL_04294     FALSE 0.001 1544.000 0.000 NA   NA
 2514743 2514744 RRSL_04295 RRSL_04296     TRUE 0.597 107.000 0.009 1.000 Y NA
 2514744 2514745 RRSL_04296 RRSL_04297     FALSE 0.114 130.000 0.014 NA N NA
 2514746 2514747 RRSL_04298 RRSL_04299     FALSE 0.092 266.000 0.000 1.000 Y NA
 2514747 2514748 RRSL_04299 RRSL_04300     TRUE 0.925 4.000 0.192 1.000 N NA
 2514748 2514749 RRSL_04300 RRSL_04301     FALSE 0.009 212.000 0.000 1.000 N NA
 2514749 2514750 RRSL_04301 RRSL_04302     TRUE 0.943 14.000 0.500 1.000 N NA
 2514750 2514751 RRSL_04302 RRSL_04303     TRUE 0.972 -3.000 0.429 1.000   NA
 2514752 2514753 RRSL_04304 RRSL_04305 oprM   TRUE 0.937 8.000 0.085 0.081 N NA
 2514753 2514754 RRSL_04305 RRSL_04306     TRUE 0.990 -3.000 0.671 0.097 N NA
 2514754 2514755 RRSL_04306 RRSL_04307     TRUE 0.994 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 2514755 2514756 RRSL_04307 RRSL_04308     TRUE 0.841 -127.000 0.149 1.000   NA
 2514759 2514760 RRSL_04311 RRSL_04312     TRUE 0.770 42.000 0.019 1.000 Y NA
 2514765 2514766 RRSL_04318 RRSL_04319     FALSE 0.143 74.000 0.010 NA   NA
 2514767 2514768 RRSL_04320 RRSL_04321     TRUE 0.931 26.000 0.600 NA   NA
 2514768 2514769 RRSL_04321 RRSL_04322     TRUE 0.686 86.000 0.400 NA   NA
 2514769 2514770 RRSL_04322 RRSL_04323     TRUE 0.713 37.000 0.143 NA   NA
 2514770 2514771 RRSL_04323 RRSL_04324     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 2514771 2514772 RRSL_04324 RRSL_04325     FALSE 0.253 193.000 0.250 NA N NA
 2514773 2514774 RRSL_04326 RRSL_04327     FALSE 0.316 -91.000 0.000 NA   NA
 2514774 2514775 RRSL_04327 RRSL_04328     FALSE 0.438 36.000 0.032 NA   NA
 2514777 2514778 RRSL_04331 RRSL_04332     FALSE 0.180 55.000 0.007 1.000   NA
 2514778 2514779 RRSL_04332 RRSL_04333     FALSE 0.252 34.000 0.007 1.000 N NA
 2514779 2514780 RRSL_04333 RRSL_04334     TRUE 0.976 23.000 0.064 0.001 Y NA
 2514787 2514788 RRSL_04342 RRSL_04343     FALSE 0.174 283.000 0.000 0.073 Y NA
 2514788 2514789 RRSL_04343 RRSL_04344     FALSE 0.015 213.000 0.000 1.000   NA
 2514789 2514790 RRSL_04344 RRSL_04345     FALSE 0.011 230.000 0.000 NA   NA
 2514791 2514792 RRSL_04346 RRSL_04347     TRUE 0.971 -7.000 0.636 NA   NA
 2514793 2514794 RRSL_04348 RRSL_04349     TRUE 0.956 2.000 0.000 0.001   NA
 2514795 2514796 RRSL_04350 RRSL_04351     FALSE 0.002 378.000 0.000 1.000 N NA
 2514796 2514797 RRSL_04351 RRSL_04352     FALSE 0.342 96.000 0.067 1.000   NA
 2514797 2514798 RRSL_04352 RRSL_04353     FALSE 0.291 21.000 0.000 NA   NA
 2514798 2514799 RRSL_04353 RRSL_04354     FALSE 0.088 63.000 0.000 NA   NA
 2514799 2514800 RRSL_04354 RRSL_04355     TRUE 0.940 16.000 0.500 NA   NA
 2514800 2514801 RRSL_04355 RRSL_04356     TRUE 0.911 10.000 0.200 NA   NA
 2514804 2514805 RRSL_04359 RRSL_04360 thiC   TRUE 0.697 13.000 0.044 1.000 N NA
 2514805 2514806 RRSL_04360 RRSL_04362   thiG FALSE 0.018 222.000 0.008 1.000 N NA
 2514806 2514807 RRSL_04362 RRSL_04365 thiG   FALSE 0.001 1289.000 0.000 1.000   NA
 2514808 2514809 RRSL_04366 RRSL_04367     FALSE 0.258 26.000 0.000 NA   NA
 2514809 2514810 RRSL_04367 RRSL_04368     FALSE 0.381 68.000 0.074 NA   NA
 2514810 2514811 RRSL_04368 RRSL_04369     TRUE 0.881 27.000 0.316 NA   NA
 2514811 2514812 RRSL_04369 RRSL_04370     TRUE 0.989 20.000 0.300 0.001 Y NA
 2514813 2514814 RRSL_04371 RRSL_04372     FALSE 0.295 64.000 0.042 NA   NA
 2514814 2514815 RRSL_04372 RRSL_04373     TRUE 0.831 15.000 0.109 NA   NA
 2514815 2514816 RRSL_04373 RRSL_04374     TRUE 0.620 9.000 0.020 NA N NA
 2514817 2514818 RRSL_04375 RRSL_04377     FALSE 0.138 61.000 0.002 1.000   NA
 2514819 2514820 RRSL_04376 RRSL_04378     FALSE 0.526 168.000 0.110 1.000 Y NA
 2514822 2514823 RRSL_04380 RRSL_04381     FALSE 0.544 -99.000 0.023 1.000 N NA
 2514824 2514825 RRSL_04382 RRSL_04383     FALSE 0.295 84.000 0.050 1.000   NA
 2514825 2514826 RRSL_04383 RRSL_04384     TRUE 0.964 -3.000 0.310 1.000   NA
 2514826 2514827 RRSL_04384 RRSL_04385     TRUE 0.832 31.000 0.268 1.000 N NA
 2514827 2514828 RRSL_04385 RRSL_04386     FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 2514828 2514829 RRSL_04386 RRSL_04387     FALSE 0.006 280.000 0.000 NA   NA
 2514830 2514831 RRSL_04046 RRSL_04047     FALSE 0.411 153.000 0.000 1.000 Y NA
 2514831 2514832 RRSL_04047 RRSL_04048     FALSE 0.002 505.000 0.000 1.000   NA
 2514832 2514833 RRSL_04048 RRSL_04049     TRUE 0.832 -168.000 0.000 0.030   NA
 2514835 2514836 RRSL_04052 RRSL_04053     FALSE 0.386 149.000 0.154 NA   NA
 2514836 2514837 RRSL_04053 RRSL_04054     FALSE 0.036 160.000 0.000 NA   NA
 2514837 2514838 RRSL_04054 RRSL_04058     FALSE 0.027 1861.000 0.000 0.030 Y NA
 2514838 2514839 RRSL_04058 RRSL_04059     FALSE 0.369 -42.000 0.000 NA   NA
 2514840 2514841 RRSL_04060 RRSL_04061     TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.074 Y NA
 2514842 2514843 RRSL_04062 RRSL_04063     FALSE 0.002 441.000 0.000 NA   NA
 2514843 2514844 RRSL_04063 RRSL_04064     FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 2514844 2514845 RRSL_04064 RRSL_04065     FALSE 0.067 127.000 0.000 NA   NA
 2514848 2514849 RRSL_04068 RRSL_04069     FALSE 0.386 12.000 0.000 1.000   NA
 2514851 2514852 RRSL_04071 RRSL_04073     FALSE 0.163 187.000 0.098 NA   NA
 2514852 2514853 RRSL_04073 RRSL_04074     TRUE 0.970 -3.000 0.400 NA   NA
 2514853 2514854 RRSL_04074 RRSL_04075     TRUE 0.969 -3.000 0.391 NA   NA
 2514858 2514859 RRSL_04079 RRSL_04080     FALSE 0.079 112.000 0.000 NA   NA
 2514860 2514861 RRSL_04081 RRSL_04082     TRUE 0.617 79.000 0.286 NA   NA
 2514861 2514862 RRSL_04082 RRSL_04083     TRUE 0.765 108.000 0.600 NA   NA
 2514862 2514863 RRSL_04083 RRSL_04084     FALSE 0.003 409.000 0.000 NA   NA
 2514865 2514866 RRSL_04086 RRSL_04088     FALSE 0.361 96.000 0.083 1.000 N NA
 2514869 2514870 RRSL_04090 RRSL_04091     TRUE 0.844 18.000 0.137 1.000   NA
 2514871 2514872 RRSL_04092 RRSL_04093     TRUE 0.733 70.000 0.500 NA   NA
 2514872 2514873 RRSL_04093 RRSL_04094   mosC FALSE 0.311 187.000 0.286 NA   NA
 2514874 2514875 RRSL_04095 RRSL_04096     TRUE 0.609 -3.000 0.005 1.000 N NA
 2514875 2514876 RRSL_04096 RRSL_04097     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 2514876 2514877 RRSL_04097 RRSL_04098     TRUE 0.845 20.000 0.154 NA   NA
 2514878 2514879 RRSL_04099 RRSL_04100     FALSE 0.502 129.000 0.200 NA N NA
 2514879 2514880 RRSL_04100 RRSL_04101     TRUE 0.620 19.000 0.041 NA N NA
 2514880 2514881 RRSL_04101 RRSL_04102     TRUE 0.988 -85.000 0.201 0.001 Y NA
 2514881 2514882 RRSL_04102 RRSL_04103     TRUE 0.922 14.000 0.038 1.000 Y NA
 2514882 2514883 RRSL_04103 RRSL_04104     FALSE 0.409 49.000 0.055 1.000 N NA
 2514883 2514884 RRSL_04104 RRSL_04105     TRUE 0.923 73.000 0.218 0.004 Y NA
 2514884 2514885 RRSL_04105 RRSL_04106     TRUE 0.874 61.000 0.032 0.004 Y NA
 2514885 2514886 RRSL_04106 RRSL_04107   rarD FALSE 0.093 131.000 0.003 NA   NA
 2514886 2514887 RRSL_04107 RRSL_04108 rarD   TRUE 0.652 3.000 0.009 NA   NA
 2514887 2514888 RRSL_04108 RRSL_04109     TRUE 0.941 -54.000 0.434 NA   NA
 2514889 2514890 RRSL_04110 RRSL_04111     TRUE 0.865 25.000 0.223 1.000   NA
 2514890 2514891 RRSL_04111 RRSL_04112     TRUE 0.617 50.000 0.138 1.000   NA
 2514891 2514892 RRSL_04112 RRSL_04113     TRUE 0.597 40.000 0.088 NA   NA
 2514892 2514893 RRSL_04113 RRSL_04114     FALSE 0.567 40.000 0.075 NA   NA
 2514893 2514894 RRSL_04114 RRSL_04115     TRUE 0.857 -70.000 0.131 NA   NA
 2514897 2514898 RRSL_04118 RRSL_04119   pilA FALSE 0.042 75.000 0.000 NA N NA
 2514898 2514899 RRSL_04119 RRSL_04120 pilA plpA FALSE 0.294 268.000 0.000 0.001 Y NA
 2514899 2514900 RRSL_04120 RRSL_04121 plpA   FALSE 0.469 124.000 0.150 1.000 N NA
 2514900 2514901 RRSL_04121 RRSL_04122     FALSE 0.382 159.000 0.220 1.000 N NA
 2514901 2514902 RRSL_04122 RRSL_04123     TRUE 0.921 79.000 0.151 0.001 Y NA
 2514902 2514903 RRSL_04123 RRSL_04124     FALSE 0.381 69.000 0.076 NA   NA
 2514903 2514904 RRSL_04124 RRSL_04126     FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 2514905 2514906 RRSL_04127 RRSL_04128     TRUE 0.812 -3.000 0.031 NA   NA
 2514906 2514907 RRSL_04128 RRSL_04129     FALSE 0.034 198.000 0.009 NA   NA
 2514907 2514908 RRSL_04129 RRSL_RNA036     FALSE 0.113 51.000 0.000 NA   NA
 2514911 2514912 RRSL_04133 RRSL_04135     FALSE 0.367 199.000 0.000 0.096 Y NA
 2514914 2514915 RRSL_04137 RRSL_04138     TRUE 0.729 6.000 0.029 NA   NA
 2514916 2514917 RRSL_04139 RRSL_04140     FALSE 0.434 88.000 0.112 1.000 N NA
 2514917 2514918 RRSL_04140 RRSL_04141     TRUE 0.947 16.000 0.113 1.000 Y NA
 2514918 2514919 RRSL_04141 RRSL_04142     TRUE 0.924 11.000 0.263 1.000   NA
 2514919 2514920 RRSL_04142 RRSL_04144     TRUE 0.748 6.000 0.034 1.000   NA
 2514920 2514921 RRSL_04144 RRSL_04146     TRUE 0.661 87.000 0.045 1.000 Y NA
 2514921 2514922 RRSL_04146 RRSL_04147     FALSE 0.001 1087.000 0.000 1.000 N NA
 2514922 2514923 RRSL_04147 RRSL_04148     FALSE 0.191 112.000 0.017 1.000   NA
 2514923 2514924 RRSL_04148 RRSL_04149     FALSE 0.208 91.000 0.026 NA   NA
 2514924 2514925 RRSL_04149 RRSL_04150     FALSE 0.127 69.000 0.005 NA   NA
 2514925 2514926 RRSL_04150 RRSL_04151     TRUE 0.864 22.000 0.220 1.000 N NA
 2514926 2514927 RRSL_04151 RRSL_04152     TRUE 0.966 3.000 0.457 NA   NA
 2514927 2514928 RRSL_04152 RRSL_04153     FALSE 0.039 158.000 0.000 NA   NA
 2514928 2514929 RRSL_04153 RRSL_04155   corC FALSE 0.001 764.000 0.000 1.000   NA
 2514929 2514930 RRSL_04155 RRSL_04156 corC   FALSE 0.191 80.000 0.029 1.000 N NA
 2514930 2514931 RRSL_04156 RRSL_04157     FALSE 0.055 154.000 0.005 1.000 N NA
 2514931 2514932 RRSL_04157 RRSL_04158     TRUE 0.711 -3.000 0.010 NA   NA
 2514932 2514933 RRSL_04158 RRSL_04159     FALSE 0.162 64.000 0.009 NA   NA
 2514933 2514934 RRSL_04159 RRSL_04160     TRUE 0.802 22.000 0.123 1.000 N NA
 2514934 2514935 RRSL_04160 RRSL_04161     TRUE 0.958 -3.000 0.279 1.000 N NA
 2514935 2514936 RRSL_04161 RRSL_04162     TRUE 0.914 -3.000 0.099 NA   NA
 2514938 2514939 RRSL_04164 RRSL_04165     TRUE 0.648 197.000 0.143 0.018 Y NA
 2514940 2514941 RRSL_04167 RRSL_04168     TRUE 0.879 30.000 0.054 NA Y NA
 2514944 2514945 RRSL_04171 RRSL_04172     TRUE 0.972 -16.000 0.200 1.000 Y NA
 2514946 2514947 RRSL_04173 RRSL_04174     FALSE 0.272 63.000 0.036 NA   NA
 2514947 2514948 RRSL_04174 RRSL_04175     TRUE 0.652 -24.000 0.020 NA   NA
 2514948 2514949 RRSL_04175 RRSL_04176     FALSE 0.162 118.000 0.020 NA N NA
 2514950 2514951 RRSL_04177 RRSL_04178     FALSE 0.074 73.000 0.000 NA   NA
 2514952 2514953 RRSL_04180 RRSL_04181     FALSE 0.002 528.000 0.000 NA   NA
 2514955 2514956 RRSL_04183 RRSL_04184     FALSE 0.447 101.000 0.111 NA   NA
 2514956 2514957 RRSL_04184 RRSL_04185     TRUE 0.985 -24.000 0.560 1.000 Y NA
 2514957 2514958 RRSL_04185 RRSL_04186     TRUE 0.625 35.000 0.080 NA   NA
 2514960 2514961 RRSL_04188 RRSL_04189     TRUE 0.985 -3.000 0.233 1.000 Y NA
 2514961 2514962 RRSL_04189 RRSL_04190     TRUE 0.994 -3.000 0.867 1.000 Y NA
 2514962 2514963 RRSL_04190 RRSL_04191     TRUE 0.991 14.000 0.633 0.068 Y NA
 2514965 2514966 RRSL_04193 RRSL_04194     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 2514967 2514968 RRSL_04195 RRSL_04196     FALSE 0.009 885.000 0.000 0.073   NA
 2514969 2514970 RRSL_04197 RRSL_04198     FALSE 0.398 10.000 0.000 NA   NA
 2514970 2514971 RRSL_04198 RRSL_04200     FALSE 0.001 1300.000 0.000 NA   NA
 2514971 2514972 RRSL_04200 RRSL_04201     FALSE 0.043 88.000 0.000 NA N NA
 2514974 2514975 RRSL_04203 RRSL_RNA038     FALSE 0.110 52.000 0.000 NA   NA
 2514975 2514976 RRSL_RNA038 RRSL_04204     FALSE 0.088 63.000 0.000 NA   NA
 2514976 2514977 RRSL_04204 RRSL_04205     FALSE 0.522 18.000 0.014 NA   NA
 2514977 2514978 RRSL_04205 RRSL_04206     FALSE 0.077 161.000 0.011 1.000   NA
 2514978 2514979 RRSL_04206 RRSL_04207     FALSE 0.420 145.000 0.167 1.000   NA
 2514979 2514980 RRSL_04207 RRSL_04208     TRUE 0.930 25.000 0.592 1.000 N NA
 2514980 2514981 RRSL_04208 RRSL_04209     TRUE 0.842 58.000 0.215 0.009 N NA
 2514981 2514982 RRSL_04209 RRSL_04210     TRUE 0.849 38.000 0.460 1.000 N NA
 2514982 2514983 RRSL_04210 RRSL_04211     TRUE 0.990 13.000 0.556 0.079 Y NA
 2514983 2514984 RRSL_04211 RRSL_04212     TRUE 0.952 -75.000 0.593 1.000   NA
 2514985 2514986 RRSL_04213 RRSL_04215     FALSE 0.333 117.000 0.069 NA N NA
 2514986 2514987 RRSL_04215 RRSL_04216     FALSE 0.032 176.000 0.005 NA N NA
 2514987 2514988 RRSL_04216 RRSL_04217     TRUE 0.943 0.000 0.000 NA Y NA
 2514988 2514989 RRSL_04217 RRSL_04218     TRUE 0.922 -9.000 0.000 NA Y NA
 2514989 2514990 RRSL_04218 RRSL_04219     TRUE 0.774 75.000 0.154 NA Y NA
 2514990 2514991 RRSL_04219 RRSL_04220     TRUE 0.921 14.000 0.038 NA Y NA
 2514991 2514992 RRSL_04220 RRSL_04221     TRUE 0.986 6.000 0.500 NA Y NA
 2514992 2514993 RRSL_04221 RRSL_04222     TRUE 0.711 124.000 0.500 NA   NA
 2514993 2514994 RRSL_04222 RRSL_04223     TRUE 0.906 2.000 0.103 NA   NA
 2514994 2514995 RRSL_04223 RRSL_04223_5     TRUE 0.978 -6.000 0.207 NA Y NA
 2514995 2514996 RRSL_04223_5 RRSL_04224     TRUE 0.990 -3.000 0.455 NA Y NA
 2514996 2514997 RRSL_04224 RRSL_04225     TRUE 0.990 0.000 0.455 NA Y NA
 2514997 2514998 RRSL_04225 RRSL_04226     TRUE 0.982 -3.000 0.176 NA Y NA
 2514998 2514999 RRSL_04226 RRSL_04227     FALSE 0.327 28.000 0.009 NA N NA
 2514999 2515000 RRSL_04227 RRSL_04229     FALSE 0.057 776.000 0.000 0.002 Y NA
 2515000 2515001 RRSL_04229 RRSL_04230     TRUE 0.875 88.000 0.051 0.002 Y NA
 2515001 2515002 RRSL_04230 RRSL_04231     TRUE 0.893 25.000 0.347 1.000 N NA
 2515002 2515003 RRSL_04231 RRSL_04232     FALSE 0.361 48.000 0.042 1.000 N NA
 2515005 2515006 RRSL_04234 RRSL_04235     FALSE 0.111 63.000 0.006 NA N NA
 2515006 2515007 RRSL_04235 RRSL_04236     FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 2515007 2515008 RRSL_04236 RRSL_04237     FALSE 0.327 109.000 0.057 NA   NA
 2515008 2515009 RRSL_04237 RRSL_04238     FALSE 0.369 51.000 0.043 NA   NA
 2515009 2515010 RRSL_04238 RRSL_04239     FALSE 0.338 56.000 0.043 NA   NA
 2515010 2515011 RRSL_04239 RRSL_RNA037     FALSE 0.010 234.000 0.000 NA   NA
 2515011 2515012 RRSL_RNA037 RRSL_04240     FALSE 0.072 78.000 0.000 NA   NA
 2515013 2515014 RRSL_04241 RRSL_04242     FALSE 0.171 113.000 0.020 1.000 N NA
 2515014 2515015 RRSL_04242 RRSL_04243     FALSE 0.546 61.000 0.140 NA   NA
 2515015 2515016 RRSL_04243 RRSL_04244   nhaC TRUE 0.677 15.000 0.040 NA   NA
 2515017 2515018 RRSL_04245 RRSL_04246     TRUE 0.838 -3.000 0.047 1.000 N NA
 2515018 2515019 RRSL_04246 RRSL_04247     TRUE 0.821 28.000 0.200 1.000 N NA
 2515019 2515020 RRSL_04247 RRSL_04248     FALSE 0.512 70.000 0.165 1.000 N NA
 2515021 2515022 RRSL_04249 RRSL_04250     FALSE 0.159 103.000 0.020 NA N NA
 2515022 2515023 RRSL_04250 RRSL_04251     TRUE 0.961 0.000 0.036 1.000 Y NA
 2515023 2515024 RRSL_04251 RRSL_04252     FALSE 0.512 41.000 0.067 1.000 N NA
 2515024 2515025 RRSL_04252 RRSL_04253     FALSE 0.132 81.000 0.007 1.000   NA
 2515025 2515026 RRSL_04253 RRSL_04254     TRUE 0.962 -10.000 0.500 1.000   NA
 2515026 2515027 RRSL_04254 RRSL_04255     FALSE 0.557 23.000 0.025 NA   NA
 2515027 2515028 RRSL_04255 RRSL_04256     FALSE 0.078 116.000 0.000 NA   NA
 2515028 2515029 RRSL_04256 RRSL_04257     FALSE 0.571 39.000 0.074 NA   NA
 2515029 2515030 RRSL_04257 RRSL_04258     FALSE 0.244 154.000 0.074 1.000   NA
 2515030 2515031 RRSL_04258 RRSL_04259     TRUE 0.992 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 2515031 2515032 RRSL_04259 RRSL_04260     FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 2515032 2515033 RRSL_04260 RRSL_04261     FALSE 0.012 219.000 0.000 NA   NA
 2515035 2515036 RRSL_04263 RRSL_04264     TRUE 0.763 -13.000 0.047 1.000 N NA
 2515036 2515037 RRSL_04264 RRSL_04265     TRUE 0.995 9.000 0.452 0.001 Y NA
 2515037 2515038 RRSL_04265 RRSL_04266   pyrR TRUE 0.822 89.000 0.247 1.000 Y NA
 2515038 2515039 RRSL_04266 RRSL_04267 pyrR   FALSE 0.013 184.000 0.000 NA N NA
 2515039 2515040 RRSL_04267 RRSL_04269     FALSE 0.126 84.000 0.012 NA N NA
 2515042 2515043 RRSL_04270 RRSL_04271   pilJ TRUE 0.951 79.000 0.554 0.009 Y NA
 2515043 2515044 RRSL_04271 RRSL_04272 pilJ pilI TRUE 0.744 248.000 0.795 0.009 Y NA
 2515044 2515045 RRSL_04272 RRSL_04273 pilI pilH TRUE 0.889 59.000 0.392 1.000 Y NA
 2515045 2515046 RRSL_04273 RRSL_04274 pilH pilG TRUE 0.975 32.000 0.296 0.018 Y NA
 2515046 2515047 RRSL_04274 RRSL_04275 pilG   FALSE 0.159 201.000 0.141 1.000 N NA
 2515048 2515049 RRSL_03825 RRSL_03826     TRUE 0.612 22.000 0.035 1.000   NA
 2515049 2515050 RRSL_03826 RRSL_RNA034     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2515050 2515051 RRSL_RNA034 RRSL_03828     FALSE 0.073 76.000 0.000 NA   NA
 2515051 2515052 RRSL_03828 RRSL_03829     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 2515052 2515053 RRSL_03829 RRSL_03830     FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 2515054 2515055 RRSL_03831 RRSL_03832     TRUE 0.765 13.000 0.059 NA   NA
 2515055 2515056 RRSL_03832 RRSL_03833     TRUE 0.804 -3.000 0.029 NA   NA
 2515056 2515057 RRSL_03833 RRSL_03834     TRUE 0.906 -3.000 0.099 NA N NA
 2515060 2515061 RRSL_03837 RRSL_03838     TRUE 0.606 111.000 0.254 1.000 N NA
 2515061 2515062 RRSL_03838 RRSL_03839     TRUE 0.874 0.000 0.071 1.000 N NA
 2515062 2515063 RRSL_03839 RRSL_03840     FALSE 0.006 469.000 0.024 1.000 N NA
 2515063 2515064 RRSL_03840 RRSL_03842     TRUE 0.646 -3.000 0.008 1.000 N NA
 2515064 2515065 RRSL_03842 RRSL_03843     TRUE 0.663 -3.000 0.009 1.000 N NA
 2515066 2515067 RRSL_03844 RRSL_03845     TRUE 0.978 -3.000 0.596 NA   NA
 2515068 2515069 RRSL_03846 RRSL_03847     FALSE 0.001 634.000 0.000 NA   NA
 2515070 2515071 RRSL_03849 RRSL_03850     FALSE 0.005 293.000 0.000 NA   NA
 2515071 2515072 RRSL_03850 RRSL_03852     FALSE 0.001 692.000 0.000 NA   NA
 2515074 2515075 RRSL_03854 RRSL_03855 rdgC   FALSE 0.008 253.000 0.000 NA   NA
 2515075 2515076 RRSL_03855 RRSL_03856     FALSE 0.007 258.000 0.000 NA   NA
 2515079 2515080 RRSL_03859 RRSL_03860     FALSE 0.268 25.000 0.000 NA   NA
 2515080 2515081 RRSL_03860 RRSL_03861     TRUE 0.605 12.000 0.017 NA   NA
 2515081 2515082 RRSL_03861 RRSL_03862     TRUE 0.783 24.000 0.102 1.000   NA
 2515082 2515083 RRSL_03862 RRSL_03863     TRUE 0.628 -117.000 0.035 1.000   NA
 2515084 2515085 RRSL_03865 RRSL_03866     FALSE 0.220 130.000 0.039 NA   NA
 2515085 2515086 RRSL_03866 RRSL_03868     FALSE 0.001 1274.000 0.000 NA   NA
 2515086 2515087 RRSL_03868 RRSL_03869     TRUE 0.609 87.000 0.255 1.000   NA
 2515087 2515088 RRSL_03869 RRSL_03870     FALSE 0.060 137.000 0.000 1.000   NA
 2515088 2515089 RRSL_03870 RRSL_03871     FALSE 0.202 32.000 0.000 NA   NA
 2515089 2515090 RRSL_03871 RRSL_03872     FALSE 0.278 103.000 0.045 NA   NA
 2515090 2515091 RRSL_03872 RRSL_03873     TRUE 0.953 11.000 0.500 NA   NA
 2515091 2515092 RRSL_03873 RRSL_03874     TRUE 0.898 -3.000 0.078 NA   NA
 2515093 2515094 RRSL_03875 RRSL_03876     TRUE 0.996 0.000 0.371 0.001 Y NA
 2515094 2515095 RRSL_03876 RRSL_03877     TRUE 0.930 56.000 0.092 0.001 Y NA
 2515095 2515096 RRSL_03877 RRSL_03878     FALSE 0.157 156.000 0.046 1.000 N NA
 2515096 2515097 RRSL_03878 RRSL_03879     TRUE 0.979 14.000 0.466 1.000 Y NA
 2515097 2515098 RRSL_03879 RRSL_03880     FALSE 0.025 341.000 0.073 1.000 N NA
 2515100 2515101 RRSL_03882 RRSL_03884     FALSE 0.076 163.000 0.020 NA N NA
 2515101 2515102 RRSL_03884 RRSL_03885     FALSE 0.258 308.000 0.335 1.000 Y NA
 2515102 2515103 RRSL_03885 RRSL_03886     FALSE 0.112 92.000 0.003 NA   NA
 2515103 2515104 RRSL_03886 RRSL_03887     TRUE 0.667 14.000 0.035 NA   NA
 2515104 2515105 RRSL_03887 RRSL_03888     FALSE 0.399 101.000 0.099 1.000 N NA
 2515105 2515106 RRSL_03888 RRSL_03889     FALSE 0.558 65.000 0.184 1.000 N NA
 2515106 2515107 RRSL_03889 RRSL_RNA035     FALSE 0.024 182.000 0.000 NA   NA
 2515107 2515108 RRSL_RNA035 RRSL_03890     FALSE 0.029 168.000 0.000 NA   NA
 2515108 2515109 RRSL_03890 RRSL_03891     TRUE 0.995 7.000 0.507 0.002 Y NA
 2515109 2515110 RRSL_03891 RRSL_03892     TRUE 0.995 2.000 0.328 0.002 Y NA
 2515110 2515111 RRSL_03892 RRSL_03893     TRUE 0.992 14.000 0.483 0.005 Y NA
 2515111 2515112 RRSL_03893 RRSL_03894     TRUE 0.940 102.000 0.355 0.005 Y NA
 2515112 2515113 RRSL_03894 RRSL_03895     TRUE 0.995 1.000 0.343 0.005 Y NA
 2515113 2515114 RRSL_03895 RRSL_03896     TRUE 0.991 13.000 0.395 0.005 Y NA
 2515114 2515115 RRSL_03896 RRSL_03897     TRUE 0.994 9.000 0.515 0.005 Y NA
 2515115 2515116 RRSL_03897 RRSL_03898     TRUE 0.990 21.000 0.500 0.005 Y NA
 2515116 2515117 RRSL_03898 RRSL_03899     TRUE 0.909 154.000 0.442 0.005 Y NA
 2515117 2515118 RRSL_03899 RRSL_03900     TRUE 0.992 18.000 0.484 0.002 Y NA
 2515118 2515119 RRSL_03900 RRSL_03901     TRUE 0.986 28.000 0.451 0.005 Y NA
 2515119 2515120 RRSL_03901 RRSL_03902     TRUE 0.988 14.000 0.175 0.001 Y NA
 2515120 2515121 RRSL_03902 RRSL_03903     TRUE 0.990 20.000 0.340 0.001 Y NA
 2515121 2515122 RRSL_03903 RRSL_03904     TRUE 0.880 17.000 0.202 NA   NA
 2515122 2515123 RRSL_03904 RRSL_03905     FALSE 0.491 43.000 0.058 NA   NA
 2515123 2515124 RRSL_03905 RRSL_03906     FALSE 0.158 159.000 0.046 NA   NA
 2515124 2515125 RRSL_03906 RRSL_03907     FALSE 0.510 84.000 0.155 NA   NA
 2515125 2515126 RRSL_03907 RRSL_03908     TRUE 0.985 25.000 0.304 0.005 Y NA
 2515126 2515127 RRSL_03908 RRSL_03909     TRUE 0.727 88.000 0.090 1.000 Y NA
 2515127 2515128 RRSL_03909 RRSL_03910     TRUE 0.965 26.000 0.090 0.049 Y NA
 2515128 2515129 RRSL_03910 RRSL_03911     FALSE 0.004 258.000 0.000 NA N NA
 2515129 2515130 RRSL_03911 RRSL_03912     TRUE 0.953 40.000 0.654 NA Y NA
 2515130 2515131 RRSL_03912 RRSL_03913     TRUE 0.996 2.000 0.758 0.067 Y NA
 2515131 2515132 RRSL_03913 RRSL_03914     TRUE 0.985 -3.000 0.823 1.000   NA
 2515132 2515133 RRSL_03914 RRSL_03915     TRUE 0.992 2.000 0.731 0.021   NA
 2515133 2515134 RRSL_03915 RRSL_03916   ureD FALSE 0.575 109.000 0.221 1.000 N NA
 2515135 2515136 RRSL_03917 RRSL_03919     FALSE 0.001 924.000 0.000 1.000 N NA
 2515137 2515138 RRSL_03920 RRSL_03921     FALSE 0.229 29.000 0.000 NA   NA
 2515138 2515139 RRSL_03921 RRSL_03922     FALSE 0.429 -12.000 0.000 NA   NA
 2515139 2515140 RRSL_03922 RRSL_03923     FALSE 0.117 50.000 0.000 NA   NA
 2515143 2515144 RRSL_03926 RRSL_03927     TRUE 0.915 14.000 0.286 NA   NA
 2515144 2515145 RRSL_03927 RRSL_03928     TRUE 0.854 22.000 0.184 NA   NA
 2515147 2515148 RRSL_03930 RRSL_03931     FALSE 0.002 526.000 0.000 1.000   NA
 2515148 2515149 RRSL_03931 RRSL_03932     TRUE 0.995 -3.000 0.400 0.072 Y NA
 2515150 2515151 RRSL_03933 RRSL_03934     FALSE 0.003 381.000 0.000 NA   NA
 2515151 2515152 RRSL_03934 RRSL_03935     FALSE 0.078 108.000 0.000 NA   NA
 2515153 2515154 RRSL_03936 RRSL_03937     TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.072 Y NA
 2515157 2515158 RRSL_03940 RRSL_03941     FALSE 0.078 69.000 0.000 NA   NA
 2515158 2515159 RRSL_03941 RRSL_03942     FALSE 0.001 617.000 0.000 NA   NA
 2515160 2515161 RRSL_03943 RRSL_03944     FALSE 0.007 268.000 0.000 NA   NA
 2515163 2515164 RRSL_03946 RRSL_03947     TRUE 0.876 19.000 0.000 0.005   NA
 2515164 2515165 RRSL_03947 RRSL_03948     TRUE 0.897 12.000 0.188 1.000   NA
 2515165 2515166 RRSL_03948 RRSL_03949     TRUE 0.976 -3.000 0.188 0.068 N NA
 2515166 2515167 RRSL_03949 RRSL_03950     TRUE 0.878 14.000 0.188 NA N NA
 2515167 2515168 RRSL_03950 RRSL_03951     FALSE 0.547 95.000 0.214 NA N NA
 2515168 2515169 RRSL_03951 RRSL_03952     FALSE 0.065 194.000 0.032 NA   NA
 2515169 2515170 RRSL_03952 RRSL_03953     FALSE 0.001 1170.000 0.000 NA   NA
 2515170 2515171 RRSL_03953 RRSL_03954     FALSE 0.074 93.000 0.000 NA   NA
 2515171 2515172 RRSL_03954 RRSL_03955     FALSE 0.001 1124.000 0.000 NA   NA
 2515172 2515173 RRSL_03955 RRSL_03956     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 2515176 2515177 RRSL_03959 RRSL_03960     TRUE 0.774 120.000 0.667 NA   NA
 2515177 2515178 RRSL_03960 RRSL_03961     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 2515180 2515181 RRSL_03963 RRSL_03964     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 2515181 2515182 RRSL_03964 RRSL_03965     TRUE 0.829 47.000 0.500 NA   NA
 2515184 2515185 RRSL_03967 RRSL_03968     FALSE 0.005 319.000 0.000 1.000   NA
 2515185 2515186 RRSL_03968 RRSL_03970     FALSE 0.454 121.000 0.115 1.000   NA
 2515187 2515188 RRSL_03971 RRSL_03972     FALSE 0.263 106.000 0.041 NA   NA
 2515188 2515189 RRSL_03972 RRSL_03973     FALSE 0.136 104.000 0.014 NA N NA
 2515189 2515190 RRSL_03973 RRSL_03974     FALSE 0.352 90.000 0.077 1.000 N NA
 2515190 2515191 RRSL_03974 RRSL_03975     FALSE 0.113 104.000 0.008 1.000 N NA
 2515191 2515192 RRSL_03975 RRSL_03976     FALSE 0.167 62.000 0.008 1.000   NA
 2515192 2515193 RRSL_03976 RRSL_03977     FALSE 0.175 67.000 0.012 1.000   NA
 2515194 2515195 RRSL_03978 RRSL_03979     FALSE 0.140 92.000 0.015 1.000 N NA
 2515195 2515196 RRSL_03979 RRSL_03980     TRUE 0.997 9.000 0.859 0.001 Y NA
 2515196 2515197 RRSL_03980 RRSL_03981     FALSE 0.363 28.000 0.011 1.000 N NA
 2515198 2515199 RRSL_03982 RRSL_03983     FALSE 0.004 360.000 0.000 1.000   NA
 2515201 2515202 RRSL_03985 RRSL_03986     FALSE 0.286 22.000 0.000 NA   NA
 2515202 2515203 RRSL_03986 RRSL_03987     FALSE 0.023 183.000 0.000 NA   NA
 2515203 2515204 RRSL_03987 RRSL_03988   gspF FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 2515204 2515205 RRSL_03988 RRSL_03989 gspF   FALSE 0.334 17.000 0.000 1.000   NA
 2515205 2515206 RRSL_03989 RRSL_03990   gspE FALSE 0.079 97.000 0.000 1.000   NA
 2515206 2515207 RRSL_03990 RRSL_03991 gspE gspD TRUE 0.987 35.000 0.776 0.006 Y NA
 2515207 2515208 RRSL_03991 RRSL_03992 gspD gspN TRUE 0.870 34.000 0.062 0.006   NA
 2515208 2515209 RRSL_03992 RRSL_03993 gspN gspM TRUE 0.973 4.000 0.649 1.000   NA
 2515209 2515210 RRSL_03993 RRSL_03994 gspM gspL TRUE 0.676 16.000 0.041 1.000   NA
 2515210 2515211 RRSL_03994 RRSL_03995 gspL gspK FALSE 0.493 142.000 0.051 0.067   NA
 2515211 2515212 RRSL_03995 RRSL_03996 gspK gspJ TRUE 0.973 2.000 0.102 NA Y NA
 2515212 2515213 RRSL_03996 RRSL_03997 gspJ gspI TRUE 0.982 -76.000 0.625 NA Y NA
 2515213 2515214 RRSL_03997 RRSL_03998 gspI gspH TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.006 Y NA
 2515214 2515215 RRSL_03998 RRSL_03999 gspH gspG TRUE 0.975 -28.000 0.019 0.006 Y NA
 2515216 2515217 RRSL_04000 RRSL_04001 gspC   FALSE 0.511 129.000 0.190 NA   NA
 2515219 2515220 RRSL_04003 RRSL_04004     FALSE 0.001 1034.000 0.000 1.000 N NA
 2515221 2515222 RRSL_04005 RRSL_04006     FALSE 0.353 118.000 0.069 NA   NA
 2515222 2515223 RRSL_04006 RRSL_04007     FALSE 0.015 212.000 0.000 1.000   NA
 2515224 2515225 RRSL_04008 RRSL_04009 kefC   FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2515228 2515229 RRSL_04013 RRSL_04014     TRUE 0.733 153.000 1.000 NA   NA
 2515230 2515231 RRSL_04015 RRSL_04016     TRUE 0.939 10.000 0.333 NA   NA
 2515231 2515232 RRSL_04016 RRSL_04017     TRUE 0.978 2.000 0.667 NA   NA
 2515232 2515233 RRSL_04017 RRSL_04018     TRUE 0.915 -3.000 0.100 NA   NA
 2515233 2515234 RRSL_04018 RRSL_04019     TRUE 0.968 -6.000 0.100 NA Y NA
 2515234 2515235 RRSL_04019 RRSL_04020     TRUE 0.980 -13.000 0.333 NA Y NA
 2515235 2515236 RRSL_04020 RRSL_04021     TRUE 0.983 4.000 0.333 NA Y NA
 2515238 2515239 RRSL_04023 RRSL_04024     FALSE 0.005 303.000 0.000 NA   NA
 2515239 2515240 RRSL_04024 RRSL_04025     FALSE 0.075 88.000 0.000 NA   NA
 2515240 2515241 RRSL_04025 RRSL_04026     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 2515241 2515242 RRSL_04026 RRSL_04027     TRUE 0.649 11.000 0.022 NA   NA
 2515242 2515243 RRSL_04027 RRSL_04028     TRUE 0.930 -3.000 0.011 0.068 N NA
 2515243 2515244 RRSL_04028 RRSL_04029     FALSE 0.006 269.000 0.000 NA   NA
 2515244 2515245 RRSL_04029 RRSL_04030     FALSE 0.079 110.000 0.000 NA   NA
 2515245 2515246 RRSL_04030 RRSL_04031     TRUE 0.832 31.000 0.250 NA   NA
 2515247 2515248 RRSL_04032 RRSL_04033     FALSE 0.039 160.000 0.000 1.000   NA
 2515249 2515250 RRSL_04034 RRSL_04035     TRUE 0.882 11.000 0.140 1.000   NA
 2515250 2515251 RRSL_04035 RRSL_04037     TRUE 0.912 11.000 0.214 1.000   NA
 2515251 2515252 RRSL_04037 RRSL_04038     TRUE 0.672 54.000 0.250 1.000 N NA
 2515252 2515253 RRSL_04038 RRSL_04040     FALSE 0.001 1127.000 0.000 NA   NA
 2515253 2515254 RRSL_04040 RRSL_04041     FALSE 0.516 14.000 0.009 NA   NA
 2515254 2515255 RRSL_04041 RRSL_04042     FALSE 0.451 -204.000 0.015 1.000 N NA
 2515255 2515256 RRSL_04042 RRSL_04044     FALSE 0.001 559.000 0.000 1.000 N NA
 2515257 2515258 RRSL_03441 RRSL_03442     TRUE 0.865 61.000 0.291 1.000 Y NA
 2515258 2515259 RRSL_03442 RRSL_03443     TRUE 0.659 132.000 0.471 1.000 N NA
 2515259 2515260 RRSL_03443 RRSL_03445   yicC TRUE 0.900 18.000 0.276 NA   NA
 2515261 2515262 RRSL_03444 RRSL_03446     TRUE 0.978 28.000 0.829 1.000 Y NA
 2515262 2515263 RRSL_03446 RRSL_03447     FALSE 0.228 95.000 0.040 1.000 N NA
 2515263 2515264 RRSL_03447 RRSL_03448     TRUE 0.914 12.000 0.262 1.000 N NA
 2515264 2515265 RRSL_03448 RRSL_03449     TRUE 0.921 7.000 0.218 1.000 N NA
 2515265 2515266 RRSL_03449 RRSL_RNA030     FALSE 0.074 91.000 0.000 NA   NA
 2515266 2515267 RRSL_RNA030 RRSL_03450     FALSE 0.078 109.000 0.000 NA   NA
 2515268 2515269 RRSL_03451 RRSL_03452     FALSE 0.134 89.000 0.013 1.000 N NA
 2515269 2515270 RRSL_03452 RRSL_03453     FALSE 0.212 103.000 0.026 NA   NA
 2515270 2515271 RRSL_03453 RRSL_03454     TRUE 0.978 6.000 0.939 NA   NA
 2515271 2515272 RRSL_03454 RRSL_03455     FALSE 0.578 62.000 0.173 NA   NA
 2515272 2515273 RRSL_03455 RRSL_03456     TRUE 0.713 19.000 0.055 1.000   NA
 2515273 2515274 RRSL_03456 RRSL_03457   kipI TRUE 0.993 -3.000 0.103 0.001 Y NA
 2515274 2515275 RRSL_03457 RRSL_03459 kipI   FALSE 0.005 262.000 0.000 1.000 N NA
 2515276 2515277 RRSL_03460 RRSL_03461     TRUE 0.969 -7.000 0.590 1.000   NA
 2515277 2515278 RRSL_03461 RRSL_03462     TRUE 0.967 14.000 0.359 0.066   NA
 2515278 2515279 RRSL_03462 RRSL_03463     FALSE 0.560 66.000 0.172 1.000   NA
 2515280 2515281 RRSL_03464 RRSL_03465     TRUE 0.932 -3.000 0.133 NA   NA
 2515281 2515282 RRSL_03465 RRSL_03467     FALSE 0.001 1106.000 0.000 NA   NA
 2515282 2515283 RRSL_03467 RRSL_03468     TRUE 0.881 5.000 0.100 NA   NA
 2515285 2515286 RRSL_03470 RRSL_03471     TRUE 0.791 -3.000 0.032 1.000 N NA
 2515286 2515287 RRSL_03471 RRSL_03472     FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 2515287 2515288 RRSL_03472 RRSL_03473     FALSE 0.004 341.000 0.000 NA   NA
 2515291 2515292 RRSL_03476 RRSL_03477     FALSE 0.235 84.000 0.034 1.000   NA
 2515292 2515293 RRSL_03477 RRSL_03478     FALSE 0.167 148.000 0.043 1.000 N NA
 2515293 2515294 RRSL_03478 RRSL_03479     TRUE 0.971 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 2515294 2515295 RRSL_03479 RRSL_03480     TRUE 0.731 -40.000 0.044 NA   NA
 2515295 2515296 RRSL_03480 RRSL_03481     FALSE 0.366 177.000 0.307 NA   NA
 2515296 2515297 RRSL_03481 RRSL_03482     TRUE 0.869 3.000 0.074 NA   NA
 2515297 2515298 RRSL_03482 RRSL_03483     TRUE 0.600 139.000 0.417 NA N NA
 2515298 2515299 RRSL_03483 RRSL_03484     FALSE 0.001 637.000 0.000 NA   NA
 2515300 2515301 RRSL_03485 RRSL_03486     FALSE 0.267 53.000 0.021 1.000   NA
 2515301 2515302 RRSL_03486 RRSL_03487     FALSE 0.215 49.000 0.009 NA   NA
 2515304 2515305 RRSL_03489 RRSL_03490     TRUE 0.719 6.000 0.026 NA   NA
 2515305 2515306 RRSL_03490 RRSL_03491     FALSE 0.339 -84.000 0.002 NA N NA
 2515308 2515309 RRSL_03494 RRSL_03495     FALSE 0.401 91.000 0.089 NA   NA
 2515310 2515311 RRSL_03496 RRSL_03497     FALSE 0.112 58.000 0.003 1.000 N NA
 2515314 2515315 RRSL_03500 RRSL_03501     TRUE 0.814 -52.000 0.083 1.000   NA
 2515315 2515316 RRSL_03501 RRSL_RNA031     FALSE 0.009 240.000 0.000 NA   NA
 2515316 2515317 RRSL_RNA031 RRSL_03502   rpoD FALSE 0.068 126.000 0.000 NA   NA
 2515317 2515318 RRSL_03502 RRSL_03503 rpoD   TRUE 0.891 -69.000 0.000 0.007   NA
 2515318 2515319 RRSL_03503 RRSL_03504     FALSE 0.031 170.000 0.000 1.000   NA
 2515319 2515320 RRSL_03504 RRSL_03505     TRUE 0.679 41.000 0.137 1.000   NA
 2515320 2515321 RRSL_03505 RRSL_03506     FALSE 0.135 115.000 0.006 1.000   NA
 2515325 2515326 RRSL_03510 RRSL_03511     TRUE 0.862 57.000 0.246 1.000 Y NA
 2515326 2515327 RRSL_03511 RRSL_03512     TRUE 0.941 -3.000 0.177 1.000 N NA
 2515328 2515329 RRSL_03513 RRSL_03514     FALSE 0.335 113.000 0.068 NA N NA
 2515329 2515330 RRSL_03514 RRSL_03515     FALSE 0.375 32.000 0.021 NA N NA
 2515331 2515332 RRSL_03516 RRSL_03518     FALSE 0.001 826.000 0.000 1.000 N NA
 2515332 2515333 RRSL_03518 RRSL_03520     FALSE 0.029 186.000 0.005 1.000 N NA
 2515334 2515335 RRSL_03519 RRSL_03521     FALSE 0.168 83.000 0.016 NA   NA
 2515335 2515336 RRSL_03521 RRSL_03522     FALSE 0.434 86.000 0.104 NA   NA
 2515336 2515337 RRSL_03522 RRSL_03523     TRUE 0.927 -9.000 0.209 NA   NA
 2515337 2515338 RRSL_03523 RRSL_03524     FALSE 0.001 2558.000 0.000 NA   NA
 2515338 2515339 RRSL_03524 RRSL_03526     FALSE 0.196 42.000 0.006 1.000 N NA
 2515340 2515341 RRSL_03527 RRSL_03528     FALSE 0.003 438.000 0.000 1.000   NA
 2515341 2515342 RRSL_03528 RRSL_03529     FALSE 0.169 37.000 0.000 NA   NA
 2515342 2515343 RRSL_03529 RRSL_03530     FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 2515344 2515345 RRSL_03531 RRSL_03532     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 2515347 2515348 RRSL_03534 RRSL_03535     TRUE 0.834 -109.000 0.143 1.000 N NA
 2515349 2515350 RRSL_03536 RRSL_03537 livF livG TRUE 0.996 -7.000 0.913 0.020 Y NA
 2515350 2515351 RRSL_03537 RRSL_03538 livG livM TRUE 0.995 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 2515351 2515352 RRSL_03538 RRSL_03539 livM livH TRUE 0.997 -3.000 0.913 0.066 Y NA
 2515352 2515353 RRSL_03539 RRSL_03540 livH   FALSE 0.340 95.000 0.065 1.000   NA
 2515353 2515354 RRSL_03540 RRSL_03541     TRUE 0.844 -7.000 0.065 1.000   NA
 2515354 2515355 RRSL_03541 RRSL_03542     FALSE 0.356 40.000 0.021 1.000   NA
 2515355 2515356 RRSL_03542 RRSL_03543     TRUE 0.591 12.000 0.021 1.000 N NA
 2515356 2515357 RRSL_03543 RRSL_03544     FALSE 0.464 4.000 0.000 NA   NA
 2515357 2515358 RRSL_03544 RRSL_03545     TRUE 0.928 23.000 0.500 NA   NA
 2515358 2515359 RRSL_03545 RRSL_03546     TRUE 0.992 -3.000 0.077 0.001 Y NA
 2515360 2515361 RRSL_03547 RRSL_03548     FALSE 0.388 70.000 0.081 NA   NA
 2515361 2515362 RRSL_03548 RRSL_03550     FALSE 0.002 478.000 0.000 NA   NA
 2515362 2515363 RRSL_03550 RRSL_03551   glnP TRUE 0.956 72.000 0.778 0.066 Y NA
 2515363 2515364 RRSL_03551 RRSL_03552 glnP   TRUE 0.997 3.000 0.857 0.011 Y NA
 2515364 2515365 RRSL_03552 RRSL_03553   glnQ TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 2515366 2515367 RRSL_RNA033 RRSL_03728     FALSE 0.113 51.000 0.000 NA   NA
 2515367 2515368 RRSL_03728 RRSL_03729   lolB TRUE 0.843 19.000 0.157 1.000 N NA
 2515368 2515369 RRSL_03729 RRSL_03730 lolB   TRUE 0.630 -138.000 0.038 1.000   NA
 2515370 2515371 RRSL_03731 RRSL_03732     FALSE 0.013 219.000 0.000 1.000   NA
 2515371 2515372 RRSL_03732 RRSL_03733     FALSE 0.123 117.000 0.003 1.000   NA
 2515373 2515374 RRSL_03734 RRSL_03735     FALSE 0.275 78.000 0.047 NA   NA
 2515374 2515375 RRSL_03735 RRSL_03736     FALSE 0.131 94.000 0.007 NA   NA
 2515375 2515376 RRSL_03736 RRSL_03737     FALSE 0.184 107.000 0.018 NA   NA
 2515376 2515377 RRSL_03737 RRSL_03738     TRUE 0.796 71.000 0.177 1.000 Y NA
 2515377 2515378 RRSL_03738 RRSL_03739     FALSE 0.071 351.000 0.309 NA N NA
 2515378 2515379 RRSL_03739 RRSL_03740   rpoN TRUE 0.812 52.000 0.574 NA N NA
 2515379 2515380 RRSL_03740 RRSL_03741 rpoN   FALSE 0.365 98.000 0.075 1.000   NA
 2515380 2515381 RRSL_03741 RRSL_03742     TRUE 0.891 34.000 0.543 NA   NA
 2515381 2515382 RRSL_03742 RRSL_03743     TRUE 0.946 -43.000 0.459 NA   NA
 2515382 2515383 RRSL_03743 RRSL_03744     TRUE 0.976 2.000 0.617 NA   NA
 2515387 2515388 RRSL_03750 RRSL_03752     FALSE 0.115 85.000 0.004 NA   NA
 2515389 2515390 RRSL_03752_1 RRSL_03753     FALSE 0.214 50.000 0.015 1.000 N NA
 2515390 2515391 RRSL_03753 RRSL_03754     FALSE 0.001 444.000 0.000 1.000 N NA
 2515391 2515392 RRSL_03754 RRSL_03755     FALSE 0.022 223.000 0.014 1.000 N NA
 2515393 2515394 RRSL_03756 RRSL_03758     FALSE 0.001 963.000 0.000 NA   NA
 2515394 2515395 RRSL_03758 RRSL_03759     TRUE 0.963 -3.000 0.303 NA   NA
 2515395 2515396 RRSL_03759 RRSL_03760     TRUE 0.841 7.000 0.083 1.000 N NA
 2515396 2515397 RRSL_03760 RRSL_03761     TRUE 0.952 -3.000 0.217 NA   NA
 2515397 2515398 RRSL_03761 RRSL_03762     TRUE 0.976 4.000 0.727 NA   NA
 2515398 2515399 RRSL_03762 RRSL_03763     TRUE 0.930 4.000 0.196 1.000   NA
 2515399 2515400 RRSL_03763 RRSL_03764     TRUE 0.863 -3.000 0.051 1.000   NA
 2515400 2515401 RRSL_03764 RRSL_03765     FALSE 0.544 68.000 0.168 NA   NA
 2515401 2515402 RRSL_03765 RRSL_03766     FALSE 0.140 44.000 0.000 NA   NA
 2515403 2515404 RRSL_03767 RRSL_03768     TRUE 0.623 101.000 0.027 NA Y NA
 2515405 2515406 RRSL_03770 RRSL_03771     TRUE 0.923 2.000 0.135 NA   NA
 2515407 2515408 RRSL_03772 RRSL_03773     TRUE 0.728 52.000 0.300 NA   NA
 2515410 2515411 RRSL_03775 RRSL_03776     FALSE 0.001 708.000 0.000 NA   NA
 2515411 2515412 RRSL_03776 RRSL_03777     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 2515412 2515413 RRSL_03777 RRSL_03778     TRUE 0.929 22.000 0.500 NA   NA
 2515413 2515414 RRSL_03778 RRSL_03779     TRUE 0.752 26.000 0.095 NA   NA
 2515415 2515416 RRSL_03780 RRSL_03781     FALSE 0.012 228.000 0.000 1.000   NA
 2515416 2515417 RRSL_03781 RRSL_03782     TRUE 0.733 19.000 0.062 1.000   NA
 2515417 2515418 RRSL_03782 RRSL_03783     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 2515419 2515420 RRSL_03785 RRSL_03786     FALSE 0.194 58.000 0.012 NA   NA
 2515420 2515421 RRSL_03786 RRSL_03787     FALSE 0.173 147.000 0.039 NA   NA
 2515421 2515422 RRSL_03787 RRSL_03789     FALSE 0.002 549.000 0.000 1.000   NA
 2515422 2515423 RRSL_03789 RRSL_03790     TRUE 0.594 26.000 0.038 1.000   NA
 2515423 2515424 RRSL_03790 RRSL_03791     FALSE 0.473 52.000 0.074 1.000   NA
 2515424 2515425 RRSL_03791 RRSL_03792     FALSE 0.283 117.000 0.044 1.000   NA
 2515425 2515426 RRSL_03792 RRSL_03793     FALSE 0.452 129.000 0.135 1.000   NA
 2515426 2515427 RRSL_03793 RRSL_03794   ubiB FALSE 0.030 748.000 0.432 NA   NA
 2515429 2515430 RRSL_03796 RRSL_03797     FALSE 0.026 235.000 0.018 NA   NA
 2515430 2515431 RRSL_03797 RRSL_03798     TRUE 0.816 29.000 0.190 NA   NA
 2515431 2515432 RRSL_03798 RRSL_03799     FALSE 0.463 46.000 0.057 NA   NA
 2515432 2515433 RRSL_03799 RRSL_03800     FALSE 0.004 1136.000 0.050 1.000 N NA
 2515433 2515434 RRSL_03800 RRSL_03801     TRUE 0.898 2.000 0.093 NA   NA
 2515434 2515435 RRSL_03801 RRSL_03802     TRUE 0.962 -3.000 0.294 NA   NA
 2515435 2515436 RRSL_03802 RRSL_03803     TRUE 0.917 39.000 0.059 0.067 Y NA
 2515436 2515437 RRSL_03803 RRSL_03804     FALSE 0.003 379.000 0.000 1.000   NA
 2515437 2515438 RRSL_03804 RRSL_03805     TRUE 0.858 53.000 0.767 1.000   NA
 2515438 2515439 RRSL_03805 RRSL_03806     TRUE 0.740 77.000 0.108 1.000 Y NA
 2515439 2515440 RRSL_03806 RRSL_03807     TRUE 0.960 34.000 0.588 1.000 Y NA
 2515440 2515441 RRSL_03807 RRSL_03808     TRUE 0.735 86.000 0.100 1.000 Y NA
 2515441 2515442 RRSL_03808 RRSL_03809     FALSE 0.001 590.000 0.000 1.000 N NA
 2515442 2515443 RRSL_03809 RRSL_03811     FALSE 0.109 200.000 0.085 1.000 N NA
 2515443 2515444 RRSL_03811 RRSL_03812   gdhA FALSE 0.247 172.000 0.147 1.000 N NA
 2515444 2515445 RRSL_03812 RRSL_03813 gdhA   FALSE 0.026 528.000 0.000 1.000 Y NA
 2515445 2515446 RRSL_03813 RRSL_03814   gltJ TRUE 0.854 97.000 0.100 0.065 Y NA
 2515446 2515447 RRSL_03814 RRSL_03815 gltJ gltK TRUE 0.994 21.000 0.933 0.011 Y NA
 2515447 2515448 RRSL_03815 RRSL_03816 gltK gltL TRUE 0.989 -3.000 0.034 0.002 Y NA
 2515450 2515451 RRSL_03818 RRSL_03819     FALSE 0.564 -3.000 0.000 1.000   NA
 2515451 2515452 RRSL_03819 RRSL_03820     FALSE 0.324 36.000 0.018 1.000 N NA
 2515452 2515453 RRSL_03820 RRSL_03821     TRUE 0.701 -87.000 0.048 NA   NA
 2515455 2515456 RRSL_03555 RRSL_03556     FALSE 0.343 124.000 0.073 NA   NA
 2515456 2515457 RRSL_03556 RRSL_03557     FALSE 0.001 687.000 0.000 NA   NA
 2515460 2515461 RRSL_03560 RRSL_03561     TRUE 0.997 -3.000 0.692 0.065 Y NA
 2515461 2515462 RRSL_03561 RRSL_03562     TRUE 0.994 -3.000 0.395 0.076 Y NA
 2515462 2515463 RRSL_03562 RRSL_03563     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2515463 2515464 RRSL_03563 RRSL_03564     FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 2515465 2515466 RRSL_03565 RRSL_03566     FALSE 0.037 180.000 0.008 1.000 N NA
 2515466 2515467 RRSL_03566 RRSL_03567     TRUE 0.994 -3.000 0.198 0.003 Y NA
 2515468 2515469 RRSL_03568 RRSL_03569     FALSE 0.089 157.000 0.019 1.000 N NA
 2515469 2515470 RRSL_03569 RRSL_03570     TRUE 0.989 14.000 0.332 0.013 Y NA
 2515471 2515472 RRSL_03571 RRSL_03573     TRUE 0.977 0.000 0.626 1.000 N NA
 2515472 2515473 RRSL_03573 RRSL_03574     FALSE 0.001 454.000 0.000 1.000 N NA
 2515473 2515474 RRSL_03574 RRSL_03575   livH FALSE 0.179 211.000 0.000 1.000 Y NA
 2515474 2515475 RRSL_03575 RRSL_03576 livH livM TRUE 0.993 14.000 0.857 0.065 Y NA
 2515475 2515476 RRSL_03576 RRSL_03577 livM livG TRUE 0.950 14.000 0.105 1.000 Y NA
 2515476 2515477 RRSL_03577 RRSL_03578 livG livF TRUE 0.965 28.000 0.105 0.020 Y NA
 2515478 2515479 RRSL_03579 RRSL_03580     FALSE 0.284 80.000 0.048 1.000   NA
 2515479 2515480 RRSL_03580 RRSL_03582     FALSE 0.117 263.000 0.040 0.017 N NA
 2515481 2515482 RRSL_03581 RRSL_03583     TRUE 0.595 2.000 0.007 1.000 N NA
 2515483 2515484 RRSL_03584 RRSL_03585     TRUE 0.760 11.000 0.057 1.000 N NA
 2515484 2515485 RRSL_03585 RRSL_03586     FALSE 0.072 122.000 0.000 NA   NA
 2515485 2515486 RRSL_03586 RRSL_RNA032     FALSE 0.382 -29.000 0.000 NA   NA
 2515486 2515487 RRSL_RNA032 RRSL_03587     FALSE 0.083 66.000 0.000 NA   NA
 2515487 2515488 RRSL_03587 RRSL_03588     TRUE 0.905 14.000 0.261 NA N NA
 2515488 2515489 RRSL_03588 RRSL_03589     TRUE 0.749 50.000 0.341 NA N NA
 2515490 2515491 RRSL_03590 RRSL_03591     FALSE 0.415 136.000 0.135 1.000   NA
 2515491 2515492 RRSL_03591 RRSL_03592     TRUE 0.932 -19.000 0.273 NA   NA
 2515492 2515493 RRSL_03592 RRSL_03593     TRUE 0.934 -3.000 0.139 NA   NA
 2515493 2515494 RRSL_03593 RRSL_03594     TRUE 0.919 -28.000 0.011 1.000 Y NA
 2515494 2515495 RRSL_03594 RRSL_03595     TRUE 0.982 3.000 0.182 0.001 N NA
 2515495 2515496 RRSL_03595 RRSL_03596     TRUE 0.751 55.000 0.411 1.000 N NA
 2515496 2515497 RRSL_03596 RRSL_03597     FALSE 0.012 298.000 0.019 1.000 N NA
 2515498 2515499 RRSL_03598 RRSL_03599     TRUE 0.870 0.000 0.059 1.000   NA
 2515499 2515500 RRSL_03599 RRSL_03600     TRUE 0.990 -3.000 0.631 0.065   NA
 2515501 2515502 RRSL_03601 RRSL_03602     TRUE 0.913 26.000 0.494 1.000 N NA
 2515502 2515503 RRSL_03602 RRSL_03603     TRUE 0.765 -3.000 0.019 NA   NA
 2515505 2515506 RRSL_03605 RRSL_03606     FALSE 0.454 15.000 0.010 1.000 N NA
 2515507 2515508 RRSL_03607 RRSL_03608     FALSE 0.194 136.000 0.038 NA   NA
 2515508 2515509 RRSL_03608 RRSL_03609     FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 2515510 2515511 RRSL_03610 RRSL_03611   fecD TRUE 0.973 -3.000 0.143 0.065 N NA
 2515511 2515512 RRSL_03611 RRSL_03612 fecD   TRUE 0.980 -3.000 0.130 1.000 Y NA
 2515512 2515513 RRSL_03612 RRSL_03613     TRUE 0.657 91.000 0.043 1.000 Y NA
 2515513 2515514 RRSL_03613 RRSL_03614     TRUE 0.985 -3.000 0.010 0.007 Y NA
 2515514 2515515 RRSL_03614 RRSL_03615     FALSE 0.544 -15.000 0.010 1.000 N NA
 2515516 2515517 RRSL_03617 RRSL_03618     TRUE 0.990 -3.000 0.463 0.007 N NA
 2515517 2515518 RRSL_03618 RRSL_03619     TRUE 0.983 -3.000 0.191 1.000 Y NA
 2515519 2515520 RRSL_03620 RRSL_03621     TRUE 0.702 52.000 0.009 0.003 N NA
 2515521 2515522 RRSL_03622 RRSL_03623     FALSE 0.214 61.000 0.018 NA   NA
 2515523 2515524 RRSL_03624 RRSL_03625     TRUE 0.954 13.000 0.575 NA   NA
 2515524 2515525 RRSL_03625 RRSL_03626     FALSE 0.209 78.000 0.028 NA   NA
 2515526 2515527 RRSL_03627 RRSL_03628     FALSE 0.007 232.000 0.000 1.000 N NA
 2515528 2515529 RRSL_03629 RRSL_03631     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 2515529 2515530 RRSL_03631 RRSL_03632     FALSE 0.570 83.000 0.218 NA   NA
 2515530 2515531 RRSL_03632 RRSL_03633     TRUE 0.931 27.000 0.221 0.065   NA
 2515531 2515532 RRSL_03633 RRSL_03634     FALSE 0.045 258.000 0.063 NA   NA
 2515532 2515533 RRSL_03634 RRSL_03635     TRUE 0.641 62.000 0.243 NA   NA
 2515533 2515534 RRSL_03635 RRSL_03636     TRUE 0.991 16.000 0.350 0.001 Y NA
 2515534 2515535 RRSL_03636 RRSL_03637     TRUE 0.957 3.000 0.333 NA   NA
 2515535 2515536 RRSL_03637 RRSL_03638     TRUE 0.879 22.000 0.241 NA   NA
 2515536 2515537 RRSL_03638 RRSL_03639     TRUE 0.848 26.000 0.205 NA   NA
 2515537 2515538 RRSL_03639 RRSL_03640     FALSE 0.514 79.000 0.167 NA   NA
 2515538 2515539 RRSL_03640 RRSL_03641     FALSE 0.217 95.000 0.037 1.000 N NA
 2515539 2515540 RRSL_03641 RRSL_03642     FALSE 0.082 168.000 0.028 1.000 N NA
 2515540 2515541 RRSL_03642 RRSL_03643     FALSE 0.413 82.000 0.105 1.000 N NA
 2515542 2515543 RRSL_03645 RRSL_03647     FALSE 0.001 819.000 0.000 1.000 N NA
 2515547 2515548 RRSL_00715 RRSL_00716     FALSE 0.374 122.000 0.083 NA   NA
 2515548 2515549 RRSL_00716 RRSL_00717     TRUE 0.946 78.000 0.332 0.001 Y NA
 2515550 2515551 RRSL_00718 RRSL_00719     FALSE 0.457 74.000 0.120 NA   NA
 2515551 2515552 RRSL_00719 RRSL_00720     FALSE 0.403 97.000 0.093 NA   NA
 2515552 2515553 RRSL_00720 RRSL_00722     FALSE 0.005 247.000 0.000 1.000 N NA
 2515553 2515554 RRSL_00722 RRSL_00723     FALSE 0.001 745.000 0.000 1.000 N NA
 2515554 2515555 RRSL_00723 RRSL_00724     FALSE 0.168 92.000 0.021 1.000 N NA
 2515555 2515556 RRSL_00724 RRSL_00725     TRUE 0.936 -3.000 0.158 1.000 N NA
 2515556 2515557 RRSL_00725 RRSL_00726     FALSE 0.120 84.000 0.010 1.000 N NA
 2515558 2515559 RRSL_00727 RRSL_00727_1     TRUE 0.986 -3.000 0.880 1.000   NA
 2515560 2515561 RRSL_00728 RRSL_00729     TRUE 0.851 3.000 0.061 NA   NA
 2515562 2515563 RRSL_00730 RRSL_00731     FALSE 0.419 -106.000 0.009 1.000 N NA
 2515563 2515564 RRSL_00731 RRSL_00732     FALSE 0.150 70.000 0.009 1.000   NA
 2515564 2515565 RRSL_00732 RRSL_00733   pntB TRUE 0.975 -3.000 0.058 0.002   NA
 2515565 2515566 RRSL_00733 RRSL_00734 pntB   FALSE 0.188 168.000 0.080 1.000   NA
 2515566 2515567 RRSL_00734 RRSL_00736   phcB FALSE 0.001 610.000 0.000 NA   NA
 2515567 2515568 RRSL_00736 RRSL_00737 phcB phcS TRUE 0.928 10.000 0.267 NA   NA
 2515568 2515569 RRSL_00737 RRSL_00738 phcS phcR TRUE 0.994 9.000 0.500 0.012 Y NA
 2515570 2515571 RRSL_02708 RRSL_02707     TRUE 0.622 16.000 0.029 NA   NA
 2515571 2515572 RRSL_02707 RRSL_02706     FALSE 0.234 67.000 0.028 NA   NA
 2515572 2515573 RRSL_02706 RRSL_02705     FALSE 0.257 82.000 0.047 1.000 N NA
 2515573 2515574 RRSL_02705 RRSL_02704     TRUE 0.839 25.000 0.199 NA N NA
 2515574 2515575 RRSL_02704 RRSL_02703     TRUE 0.709 40.000 0.182 NA N NA
 2515575 2515576 RRSL_02703 RRSL_02702   dapB FALSE 0.254 178.000 0.009 0.037 N NA
 2515576 2515577 RRSL_02702 RRSL_02701 dapB   FALSE 0.273 104.000 0.049 1.000 N NA
 2515579 2515580 RRSL_02699 RRSL_02698 phcA   FALSE 0.007 261.000 0.000 NA   NA
 2515580 2515581 RRSL_02698 RRSL_02697     FALSE 0.357 -51.000 0.000 NA   NA
 2515581 2515582 RRSL_02697 RRSL_02696     TRUE 0.618 76.000 0.026 1.000 Y NA
 2515583 2515584 RRSL_02695 RRSL_02694     TRUE 0.770 21.000 0.087 NA   NA
 2515584 2515585 RRSL_02694 RRSL_02693     FALSE 0.260 58.000 0.026 NA   NA
 2515586 2515587 RRSL_02692 RRSL_02691     TRUE 0.968 -3.000 0.381 NA   NA
 2515587 2515588 RRSL_02691 RRSL_02689     FALSE 0.017 469.000 0.098 1.000 N NA
 2515589 2515590 RRSL_02688 RRSL_02686     FALSE 0.001 597.000 0.000 NA   NA
 2515591 2515592 RRSL_02685 RRSL_02684 czcD   FALSE 0.470 9.000 0.004 1.000 N NA
 2515594 2515595 RRSL_02682 RRSL_02681     FALSE 0.133 86.000 0.006 1.000   NA
 2515595 2515596 RRSL_02681 RRSL_02680     TRUE 0.800 -163.000 0.107 1.000   NA
 2515596 2515597 RRSL_02680 RRSL_02679     TRUE 0.853 -3.000 0.054 1.000 N NA
 2515597 2515598 RRSL_02679 RRSL_02678     TRUE 0.606 64.000 0.225 1.000 N NA
 2515598 2515599 RRSL_02678 RRSL_02677     FALSE 0.101 148.000 0.019 NA N NA
 2515599 2515600 RRSL_02677 RRSL_02676     TRUE 0.653 12.000 0.025 NA   NA
 2515600 2515601 RRSL_02676 RRSL_02674     TRUE 0.840 7.000 0.072 1.000   NA
 2515602 2515603 RRSL_02675 RRSL_02673     TRUE 0.611 76.000 0.280 NA   NA
 2515603 2515604 RRSL_02673 RRSL_02672     FALSE 0.082 183.000 0.041 1.000 N NA
 2515604 2515605 RRSL_02672 RRSL_02671     FALSE 0.513 137.000 0.254 1.000 N NA
 2515605 2515606 RRSL_02671 RRSL_02670     TRUE 0.922 137.000 0.275 0.001 Y NA
 2515606 2515607 RRSL_02670 RRSL_02669     TRUE 0.857 15.000 0.152 1.000 N NA
 2515607 2515608 RRSL_02669 RRSL_02668     FALSE 0.123 87.000 0.004 1.000   NA
 2515608 2515609 RRSL_02668 RRSL_02667     FALSE 0.281 37.000 0.007 1.000   NA
 2515609 2515610 RRSL_02667 RRSL_02666     FALSE 0.252 86.000 0.045 1.000 N NA
 2515610 2515611 RRSL_02666 RRSL_02665     TRUE 0.628 10.000 0.022 1.000 N NA
 2515613 2515614 RRSL_02661 RRSL_02660     TRUE 0.728 141.000 0.750 NA   NA
 2515614 2515615 RRSL_02660 RRSL_02659     FALSE 0.236 66.000 0.028 NA   NA
 2515615 2515616 RRSL_02659 RRSL_02658     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 2515616 2515617 RRSL_02658 RRSL_02657     TRUE 0.807 115.000 0.750 1.000   NA
 2515617 2515618 RRSL_02657 RRSL_02656     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 2515619 2515620 RRSL_02654 RRSL_02653     FALSE 0.184 102.000 0.019 NA   NA
 2515620 2515621 RRSL_02653 RRSL_02651     TRUE 0.935 154.000 0.564 0.001 Y NA
 2515621 2515622 RRSL_02651 RRSL_02650     FALSE 0.002 437.000 0.000 1.000 N NA
 2515622 2515623 RRSL_02650 RRSL_02649   pehR TRUE 0.877 -7.000 0.100 1.000 N NA
 2515623 2515624 RRSL_02649 RRSL_02648 pehR   TRUE 0.995 -3.000 0.556 0.090 Y NA
 2515624 2515625 RRSL_02648 RRSL_02646     FALSE 0.006 295.000 0.000 1.000   NA
 2515626 2515627 RRSL_02645 RRSL_02643     FALSE 0.241 49.000 0.018 1.000 N NA
 2515628 2515629 RRSL_02642 RRSL_02641 marC   FALSE 0.463 31.000 0.025 NA   NA
 2515629 2515630 RRSL_02641 RRSL_02640     FALSE 0.490 65.000 0.118 NA   NA
 2515630 2515631 RRSL_02640 RRSL_02639     TRUE 0.702 15.000 0.053 NA N NA
 2515632 2515633 RRSL_02638 RRSL_02637     TRUE 0.848 6.000 0.075 NA   NA
 2515634 2515635 RRSL_02636 RRSL_02635     TRUE 0.776 36.000 0.206 1.000   NA
 2515635 2515636 RRSL_02635 RRSL_02634     FALSE 0.291 199.000 0.335 1.000   NA
 2515636 2515637 RRSL_02634 RRSL_02633     TRUE 0.982 38.000 0.667 0.013 Y NA
 2515638 2515639 RRSL_03267 RRSL_03268     TRUE 0.946 115.000 0.496 0.020 Y NA
 2515639 2515640 RRSL_03268 RRSL_03269     FALSE 0.326 28.000 0.003 NA   NA
 2515641 2515642 RRSL_03270 RRSL_03272     FALSE 0.516 51.000 0.088 1.000   NA
 2515642 2515643 RRSL_03272 RRSL_03273     FALSE 0.302 196.000 0.367 1.000 N NA
 2515643 2515644 RRSL_03273 RRSL_03274     FALSE 0.351 79.000 0.070 1.000   NA
 2515644 2515645 RRSL_03274 RRSL_03275     TRUE 0.992 0.000 0.598 0.004   NA
 2515647 2515648 RRSL_03278 RRSL_03279     TRUE 0.810 4.000 0.054 1.000 N NA
 2515649 2515650 RRSL_03280 RRSL_03281   nrtB TRUE 0.927 50.000 0.514 NA Y NA
 2515650 2515651 RRSL_03281 RRSL_03282 nrtB nrtC TRUE 0.994 11.000 0.396 0.001 Y NA
 2515651 2515652 RRSL_03282 RRSL_03283 nrtC   FALSE 0.201 85.000 0.031 1.000 N NA
 2515653 2515654 RRSL_03284 RRSL_03286     TRUE 0.628 11.000 0.019 NA   NA
 2515655 2515656 RRSL_03285 RRSL_03287     FALSE 0.009 210.000 0.000 1.000 N NA
 2515657 2515658 RRSL_03288 RRSL_03289     TRUE 0.634 -34.000 0.019 1.000   NA
 2515658 2515659 RRSL_03289 RRSL_03290     TRUE 0.978 10.000 0.321 1.000 Y NA
 2515659 2515660 RRSL_03290 RRSL_03291     TRUE 0.833 4.000 0.056 1.000   NA
 2515660 2515661 RRSL_03291 RRSL_03292     TRUE 0.644 53.000 0.195 NA   NA
 2515663 2515664 RRSL_03294 RRSL_03295     FALSE 0.501 82.000 0.152 NA   NA
 2515664 2515665 RRSL_03295 RRSL_03296   ctaG TRUE 0.901 5.000 0.129 NA   NA
 2515665 2515666 RRSL_03296 RRSL_03297 ctaG   FALSE 0.386 31.000 0.013 NA   NA
 2515666 2515667 RRSL_03297 RRSL_03298     FALSE 0.234 53.000 0.016 NA   NA
 2515667 2515668 RRSL_03298 RRSL_03299     TRUE 0.982 45.000 0.741 0.004 Y NA
 2515668 2515669 RRSL_03299 RRSL_03300     FALSE 0.557 48.000 0.095 1.000   NA
 2515669 2515670 RRSL_03300 RRSL_03302   bioC FALSE 0.067 178.000 0.018 1.000   NA
 2515671 2515672 RRSL_03301 RRSL_03303     FALSE 0.277 100.000 0.045 1.000   NA
 2515673 2515674 RRSL_03304 RRSL_03305     FALSE 0.398 88.000 0.097 1.000 N NA
 2515674 2515675 RRSL_03305 RRSL_03306     FALSE 0.429 152.000 0.221 1.000 N NA
 2515675 2515676 RRSL_03306 RRSL_03307     TRUE 0.912 13.000 0.269 1.000 N NA
 2515677 2515678 RRSL_03308 RRSL_03309     FALSE 0.214 94.000 0.036 1.000 N NA
 2515678 2515679 RRSL_03309 RRSL_03310     FALSE 0.367 71.000 0.082 1.000 N NA
 2515680 2515681 RRSL_03311 RRSL_03312     FALSE 0.578 139.000 0.046 NA Y NA
 2515681 2515682 RRSL_03312 RRSL_03313     FALSE 0.111 142.000 0.020 NA N NA
 2515682 2515683 RRSL_03313 RRSL_03314     TRUE 0.950 52.000 0.205 0.003 Y NA
 2515683 2515684 RRSL_03314 RRSL_03315     TRUE 0.991 -31.000 0.261 0.002 Y NA
 2515684 2515685 RRSL_03315 RRSL_03316     TRUE 0.690 -79.000 0.048 1.000 N NA
 2515685 2515686 RRSL_03316 RRSL_03317     TRUE 0.770 28.000 0.120 1.000   NA
 2515686 2515687 RRSL_03317 RRSL_03319     FALSE 0.008 429.000 0.020 1.000   NA
 2515687 2515688 RRSL_03319 RRSL_03320     FALSE 0.520 33.000 0.048 1.000 N NA
 2515688 2515689 RRSL_03320 RRSL_03321     FALSE 0.124 48.000 0.000 NA   NA
 2515690 2515691 RRSL_03322 RRSL_03323     FALSE 0.008 255.000 0.000 NA   NA
 2515691 2515692 RRSL_03323 RRSL_03324     FALSE 0.012 218.000 0.000 NA   NA
 2515692 2515693 RRSL_03324 RRSL_03325     TRUE 0.922 0.000 0.118 1.000   NA
 2515693 2515694 RRSL_03325 RRSL_03326     TRUE 0.605 50.000 0.133 NA   NA
 2515696 2515697 RRSL_03328 RRSL_03329     FALSE 0.230 104.000 0.029 1.000   NA
 2515697 2515698 RRSL_03329 RRSL_03330     FALSE 0.002 450.000 0.000 1.000   NA
 2515699 2515700 RRSL_03331 RRSL_03332 dctD   TRUE 0.978 -319.000 0.261 0.090 Y NA
 2515700 2515701 RRSL_03332 RRSL_03333     TRUE 0.595 101.000 0.261 1.000 N NA
 2515702 2515703 RRSL_03334 RRSL_03335     FALSE 0.001 761.000 0.000 1.000 N NA
 2515703 2515704 RRSL_03335 RRSL_03336     TRUE 0.674 20.000 0.047 NA   NA
 2515706 2515707 RRSL_03338 RRSL_03339     FALSE 0.208 79.000 0.028 NA   NA
 2515707 2515708 RRSL_03339 RRSL_03340     TRUE 0.961 56.000 0.319 0.001 Y NA
 2515708 2515709 RRSL_03340 RRSL_03341     FALSE 0.141 58.000 0.003 NA   NA
 2515709 2515710 RRSL_03341 RRSL_03342     FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 2515712 2515713 RRSL_03344 RRSL_03345     TRUE 0.844 66.000 1.000 NA   NA
 2515713 2515714 RRSL_03345 RRSL_03346     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 2515714 2515715 RRSL_03346 RRSL_03347     FALSE 0.008 254.000 0.000 NA   NA
 2515715 2515716 RRSL_03347 RRSL_03348     FALSE 0.073 75.000 0.000 NA   NA
 2515716 2515717 RRSL_03348 RRSL_03349     FALSE 0.355 13.000 0.000 NA   NA
 2515717 2515718 RRSL_03349 RRSL_03350     FALSE 0.447 5.000 0.000 NA   NA
 2515721 2515722 RRSL_03353 RRSL_RNA029     FALSE 0.107 53.000 0.000 NA   NA
 2515722 2515723 RRSL_RNA029 RRSL_03354     FALSE 0.073 82.000 0.000 NA   NA
 2515723 2515724 RRSL_03354 RRSL_03355     FALSE 0.375 67.000 0.078 1.000 N NA
 2515725 2515726 RRSL_03357 RRSL_03359     FALSE 0.001 1188.000 0.000 NA   NA
 2515726 2515727 RRSL_03359 RRSL_03360     TRUE 0.985 -7.000 0.434 0.010   NA
 2515727 2515728 RRSL_03360 RRSL_03361     TRUE 0.978 3.000 0.727 NA   NA
 2515728 2515729 RRSL_03361 RRSL_03362     FALSE 0.001 1336.000 0.000 NA   NA
 2515730 2515731 RRSL_03652 RRSL_03653   gcvP TRUE 0.946 65.000 0.249 0.001 Y NA
 2515731 2515732 RRSL_03653 RRSL_03654 gcvP   FALSE 0.496 138.000 0.006 1.000 Y NA
 2515733 2515734 RRSL_03655 RRSL_03656     TRUE 0.805 -22.000 0.062 NA   NA
 2515734 2515735 RRSL_03656 RRSL_03657     FALSE 0.331 93.000 0.062 NA   NA
 2515737 2515738 RRSL_03659 RRSL_03660     TRUE 0.978 6.000 0.907 1.000   NA
 2515738 2515739 RRSL_03660 RRSL_03661     FALSE 0.009 206.000 0.000 NA N NA
 2515739 2515740 RRSL_03661 RRSL_03662     FALSE 0.386 130.000 0.111 NA N NA
 2515740 2515741 RRSL_03662 RRSL_03663     FALSE 0.047 162.000 0.006 1.000 N NA
 2515741 2515742 RRSL_03663 RRSL_03665     FALSE 0.001 584.000 0.000 1.000 N NA
 2515742 2515743 RRSL_03665 RRSL_03666     FALSE 0.080 146.000 0.004 1.000   NA
 2515744 2515745 RRSL_03667 RRSL_03668     FALSE 0.518 29.000 0.031 NA   NA
 2515749 2515750 RRSL_03672 RRSL_03673     FALSE 0.003 298.000 0.000 1.000 N NA
 2515750 2515751 RRSL_03673 RRSL_03674     FALSE 0.409 163.000 0.273 NA   NA
 2515752 2515753 RRSL_03675 RRSL_03676     FALSE 0.149 69.000 0.010 NA   NA
 2515753 2515754 RRSL_03676 RRSL_03677     FALSE 0.406 23.000 0.006 NA   NA
 2515756 2515757 RRSL_03679 RRSL_03680     TRUE 0.968 99.000 0.837 0.004 Y NA
 2515757 2515758 RRSL_03680 RRSL_03681     TRUE 0.986 37.000 0.724 0.004 Y NA
 2515758 2515759 RRSL_03681 RRSL_03682     TRUE 0.973 65.000 0.846 0.004 Y NA
 2515759 2515760 RRSL_03682 RRSL_03683     TRUE 0.975 63.000 0.864 0.004 Y NA
 2515760 2515761 RRSL_03683 RRSL_03684     TRUE 0.993 3.000 0.242 0.004 Y NA
 2515761 2515762 RRSL_03684 RRSL_03685     TRUE 0.961 119.000 0.666 0.004 Y NA
 2515762 2515763 RRSL_03685 RRSL_03686     TRUE 0.955 81.000 0.557 0.004 Y NA
 2515763 2515764 RRSL_03686 RRSL_03687     TRUE 0.647 232.000 0.291 0.004 Y NA
 2515764 2515765 RRSL_03687 RRSL_03688   parB FALSE 0.018 350.000 0.056 1.000 N NA
 2515765 2515766 RRSL_03688 RRSL_03689 parB parA TRUE 0.945 27.000 0.827 1.000 N NA
 2515766 2515767 RRSL_03689 RRSL_03690 parA   TRUE 0.795 42.000 0.339 1.000 N NA
 2515767 2515768 RRSL_03690 RRSL_03691     TRUE 0.970 0.000 0.466 1.000 N NA
 2515768 2515769 RRSL_03691 RRSL_03692     FALSE 0.005 244.000 0.000 NA N NA
 2515769 2515770 RRSL_03692 RRSL_03693     FALSE 0.002 320.000 0.000 NA N NA
 2515771 2515772 RRSL_03694 RRSL_03695     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2515774 2515775 RRSL_03696 RRSL_03698     FALSE 0.289 -142.000 0.000 NA   NA
 2515775 2515776 RRSL_03698 RRSL_03699     FALSE 0.018 196.000 0.000 NA   NA
 2515776 2515777 RRSL_03699 RRSL_03700     TRUE 0.832 27.000 0.000 NA Y NA
 2515778 2515779 RRSL_03702 RRSL_03703     FALSE 0.016 625.000 0.000 0.027   NA
 2515779 2515780 RRSL_03703 RRSL_03704     FALSE 0.001 869.000 0.000 1.000 N NA
 2515783 2515784 RRSL_03707 RRSL_03708     TRUE 0.966 12.000 0.128 0.001 N NA
 2515786 2515787 RRSL_03710 RRSL_03711     TRUE 0.617 104.000 0.069 0.065 N NA
 2515787 2515788 RRSL_03711 RRSL_03712     FALSE 0.001 851.000 0.000 NA   NA
 2515788 2515789 RRSL_03712 RRSL_03713     FALSE 0.464 4.000 0.000 NA   NA
 2515791 2515792 RRSL_03715 RRSL_03716     TRUE 0.779 129.000 0.286 0.047 N NA
 2515792 2515793 RRSL_03716 RRSL_03718     FALSE 0.540 126.000 0.227 NA N NA
 2515793 2515794 RRSL_03718 RRSL_03719     TRUE 0.812 18.000 0.118 NA N NA
 2515795 2515796 RRSL_03720 RRSL_03721     FALSE 0.464 114.000 0.000 0.065   NA
 2515796 2515797 RRSL_03721 RRSL_03722     TRUE 0.700 44.000 0.176 1.000   NA
 2515797 2515798 RRSL_03722 RRSL_03723     FALSE 0.568 126.000 0.011 1.000 Y NA
 2515798 2515799 RRSL_03723 RRSL_03724     FALSE 0.073 80.000 0.000 NA   NA
 2515799 2515800 RRSL_03724 RRSL_03725     FALSE 0.014 211.000 0.000 NA   NA
 2515800 2515801 RRSL_03725 RRSL_03726   glgX TRUE 0.992 -3.000 0.107 0.003 Y NA
 2515803 2515804 RRSL_03365 RRSL_03367     FALSE 0.002 424.000 0.000 1.000 N NA
 2515804 2515805 RRSL_03367 RRSL_03368     TRUE 0.862 56.000 0.235 1.000 Y NA
 2515805 2515806 RRSL_03368 RRSL_03369     TRUE 0.731 42.000 0.200 1.000   NA
 2515806 2515807 RRSL_03369 RRSL_03371     FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 2515807 2515808 RRSL_03371 RRSL_03372     FALSE 0.001 1170.000 0.000 NA   NA
 2515809 2515810 RRSL_03374 RRSL_03375     FALSE 0.009 242.000 0.000 NA   NA
 2515810 2515811 RRSL_03375 RRSL_03376     FALSE 0.001 596.000 0.000 NA   NA
 2515811 2515812 RRSL_03376 RRSL_03377     TRUE 0.943 59.000 0.222 0.003 Y NA
 2515812 2515813 RRSL_03377 RRSL_03378     FALSE 0.077 383.000 0.057 1.000 Y NA
 2515813 2515814 RRSL_03378 RRSL_03379     TRUE 0.986 -7.000 0.475 1.000 Y NA
 2515814 2515815 RRSL_03379 RRSL_03380     FALSE 0.449 114.000 0.113 1.000 N NA
 2515815 2515816 RRSL_03380 RRSL_03381     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 2515817 2515818 RRSL_03383 RRSL_03384     FALSE 0.088 46.000 0.000 1.000 N NA
 2515819 2515820 RRSL_03385 RRSL_03386     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 2515820 2515821 RRSL_03386 RRSL_03387     FALSE 0.001 718.000 0.000 NA   NA
 2515822 2515823 RRSL_03388 RRSL_03389     FALSE 0.001 747.000 0.000 NA   NA
 2515823 2515824 RRSL_03389 RRSL_03390     FALSE 0.002 583.000 0.000 NA   NA
 2515824 2515825 RRSL_03390 RRSL_03391   yafQ TRUE 0.832 -55.000 0.100 NA   NA
 2515826 2515827 RRSL_03392 RRSL_03393     TRUE 0.979 -3.000 0.600 NA   NA
 2515827 2515828 RRSL_03393 RRSL_03394     FALSE 0.113 51.000 0.000 NA   NA
 2515829 2515830 RRSL_03395 RRSL_03396     FALSE 0.274 38.000 0.013 1.000 N NA
 2515830 2515831 RRSL_03396 RRSL_03397     TRUE 0.845 110.000 0.289 1.000 Y NA
 2515831 2515832 RRSL_03397 RRSL_03398     TRUE 0.982 -3.000 0.733 NA   NA
 2515833 2515834 RRSL_03399 RRSL_03400     FALSE 0.001 613.000 0.000 NA   NA
 2515834 2515835 RRSL_03400 RRSL_03401     TRUE 0.582 50.000 0.118 NA   NA
 2515835 2515836 RRSL_03401 RRSL_03402     FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 2515836 2515837 RRSL_03402 RRSL_03403     TRUE 0.948 129.000 0.500 0.003 Y NA
 2515837 2515838 RRSL_03403 RRSL_03404     FALSE 0.001 490.000 0.000 NA N NA
 2515838 2515839 RRSL_03404 RRSL_03406     TRUE 0.982 -3.000 0.727 NA   NA
 2515839 2515840 RRSL_03406 RRSL_03407     TRUE 0.971 8.000 0.739 NA   NA
 2515840 2515841 RRSL_03407 RRSL_03408     FALSE 0.557 60.000 0.019 0.089   NA
 2515843 2515844 RRSL_03410 RRSL_03411     FALSE 0.007 260.000 0.000 NA   NA
 2515845 2515846 RRSL_03412 RRSL_03413     TRUE 0.972 5.000 0.667 1.000   NA
 2515846 2515847 RRSL_03413 RRSL_03414     TRUE 0.949 -3.000 0.200 NA   NA
 2515847 2515848 RRSL_03414 RRSL_03415     TRUE 0.731 61.000 0.400 NA   NA
 2515851 2515852 RRSL_03418 RRSL_03419     FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000   NA
 2515852 2515853 RRSL_03419 RRSL_03420     FALSE 0.111 222.000 0.118 NA   NA
 2515853 2515854 RRSL_03420 RRSL_03422     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 2515855 2515856 RRSL_03423 RRSL_03424     FALSE 0.350 128.000 0.088 1.000 N NA
 2515856 2515857 RRSL_03424 RRSL_03425     FALSE 0.316 76.000 0.059 NA   NA
 2515857 2515858 RRSL_03425 RRSL_03426     TRUE 0.977 -3.000 0.545 NA   NA
 2515858 2515859 RRSL_03426 RRSL_03427     FALSE 0.009 211.000 0.000 1.000 N NA
 2515860 2515861 RRSL_03428 RRSL_03429     TRUE 0.607 30.000 0.054 NA   NA
 2515861 2515862 RRSL_03429 RRSL_03430     TRUE 0.859 -3.000 0.049 1.000   NA
 2515862 2515863 RRSL_03430 RRSL_03431     TRUE 0.961 27.000 0.378 1.000 Y NA
 2515863 2515864 RRSL_03431 RRSL_03432     TRUE 0.992 2.000 0.742 1.000 Y NA
 2515864 2515865 RRSL_03432 RRSL_03433     TRUE 0.973 -3.000 0.484 1.000 N NA
 2515865 2515866 RRSL_03433 RRSL_03434     TRUE 0.949 -3.000 0.220 1.000 N NA
 2515866 2515867 RRSL_03434 RRSL_03435     TRUE 0.885 2.000 0.087 1.000 N NA
 2515869 2515870 RRSL_03437 RRSL_03438     FALSE 0.064 134.000 0.000 1.000   NA
 2515873 2515874 RRSL_03015 RRSL_03016     FALSE 0.229 29.000 0.000 NA   NA
 2515874 2515875 RRSL_03016 RRSL_03018     FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 2515875 2515876 RRSL_03018 RRSL_03020     FALSE 0.001 638.000 0.000 NA   NA
 2515878 2515879 RRSL_03024 RRSL_03025     FALSE 0.007 231.000 0.000 1.000 N NA
 2515879 2515880 RRSL_03025 RRSL_03026     FALSE 0.381 97.000 0.091 1.000 N NA
 2515880 2515881 RRSL_03026 RRSL_03027     TRUE 0.985 3.000 0.333 1.000 Y NA
 2515881 2515882 RRSL_03027 RRSL_03028     TRUE 0.939 -3.000 0.171 1.000 N NA
 2515882 2515883 RRSL_03028 RRSL_03029     TRUE 0.939 -3.000 0.171 1.000 N NA
 2515883 2515884 RRSL_03029 RRSL_03030     TRUE 0.936 6.000 0.278 1.000 N NA
 2515884 2515885 RRSL_03030 RRSL_03031     TRUE 0.995 -3.000 0.172 0.001 Y NA
 2515885 2515886 RRSL_03031 RRSL_03032     TRUE 0.965 -3.000 0.355 1.000 N NA
 2515886 2515887 RRSL_03032 RRSL_03033   ssd TRUE 0.942 -3.000 0.185 1.000 N NA
 2515888 2515889 RRSL_03034 RRSL_03035     TRUE 0.747 25.000 0.087 NA   NA
 2515889 2515890 RRSL_03035 RRSL_03036     FALSE 0.003 413.000 0.000 NA   NA
 2515893 2515894 RRSL_03040 RRSL_03041     FALSE 0.260 60.000 0.036 1.000 N NA
 2515894 2515895 RRSL_03041 RRSL_03042   xylG TRUE 0.981 39.000 0.518 0.003 Y NA
 2515895 2515896 RRSL_03042 RRSL_03043 xylG xylH TRUE 0.995 6.000 0.469 0.003 Y NA
 2515896 2515897 RRSL_03043 RRSL_03044 xylH   TRUE 0.606 127.000 0.031 1.000 Y NA
 2515898 2515899 RRSL_03045 RRSL_03046     TRUE 0.787 101.000 0.750 NA N NA
 2515900 2515901 RRSL_03047 RRSL_03048     FALSE 0.046 150.000 0.000 NA   NA
 2515902 2515903 RRSL_03049 RRSL_03050     FALSE 0.003 324.000 0.000 1.000 N NA
 2515904 2515905 RRSL_03051 RRSL_03052     FALSE 0.181 35.000 0.000 NA   NA
 2515905 2515906 RRSL_03052 RRSL_03053     FALSE 0.084 65.000 0.000 NA   NA
 2515906 2515907 RRSL_03053 RRSL_03054     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 2515907 2515908 RRSL_03054 RRSL_03055     FALSE 0.024 181.000 0.000 NA   NA
 2515908 2515909 RRSL_03055 RRSL_03056     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2515909 2515910 RRSL_03056 RRSL_03057     TRUE 0.728 72.000 0.500 NA   NA
 2515910 2515911 RRSL_03057 RRSL_03058     TRUE 0.994 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 2515911 2515912 RRSL_03058 RRSL_03059     TRUE 0.978 -3.000 0.600 1.000 N NA
 2515912 2515913 RRSL_03059 RRSL_03060     TRUE 0.979 -3.000 0.600 NA   NA
 2515913 2515914 RRSL_03060 RRSL_03061     FALSE 0.082 67.000 0.000 NA   NA
 2515914 2515915 RRSL_03061 RRSL_03062     TRUE 0.975 -3.000 0.500 NA   NA
 2515915 2515916 RRSL_03062 RRSL_03063     TRUE 0.881 14.000 0.176 NA   NA
 2515916 2515917 RRSL_03063 RRSL_03065     FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 2515917 2515918 RRSL_03065 RRSL_03066     FALSE 0.004 356.000 0.000 NA   NA
 2515918 2515919 RRSL_03066 RRSL_03067     TRUE 0.617 53.000 0.162 1.000   NA
 2515919 2515920 RRSL_03067 RRSL_03068     FALSE 0.502 50.000 0.081 NA   NA
 2515923 2515924 RRSL_03071 RRSL_03073 pilK   FALSE 0.001 524.000 0.000 NA N NA
 2515924 2515925 RRSL_03073 RRSL_03074     TRUE 0.988 -13.000 0.659 NA Y NA
 2515926 2515927 RRSL_03075 RRSL_03076     TRUE 0.939 3.000 0.205 1.000   NA
 2515931 2515932 RRSL_03080 RRSL_03082     TRUE 0.955 15.000 0.667 NA   NA
 2515933 2515934 RRSL_03083 RRSL_03084     FALSE 0.483 109.000 0.125 NA   NA
 2515934 2515935 RRSL_03084 RRSL_03085     TRUE 0.764 53.000 0.400 NA   NA
 2515935 2515936 RRSL_03085 RRSL_03086     FALSE 0.371 99.000 0.079 NA   NA
 2515939 2515940 RRSL_03090 RRSL_03091 rpoN   FALSE 0.144 139.000 0.020 1.000   NA
 2515941 2515942 RRSL_03092 RRSL_03093     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 2515942 2515943 RRSL_03093 RRSL_03094     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 2515943 2515944 RRSL_03094 RRSL_03096     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 2515947 2515948 RRSL_02927 RRSL_02928     TRUE 0.982 28.000 0.787 0.001   NA
 2515948 2515949 RRSL_02928 RRSL_02929     TRUE 0.976 -3.000 0.540 NA   NA
 2515949 2515950 RRSL_02929 RRSL_02930     TRUE 0.958 7.000 0.461 NA   NA
 2515950 2515951 RRSL_02930 RRSL_02931     TRUE 0.764 99.000 0.221 0.063   NA
 2515951 2515952 RRSL_02931 RRSL_02932     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 2515952 2515953 RRSL_02932 RRSL_02934     FALSE 0.001 1368.000 0.000 NA   NA
 2515953 2515954 RRSL_02934 RRSL_02935     FALSE 0.085 110.000 0.000 1.000   NA
 2515957 2515958 RRSL_02939 RRSL_02940     FALSE 0.002 456.000 0.000 1.000   NA
 2515958 2515959 RRSL_02940 RRSL_02941     TRUE 0.981 3.000 0.368 0.063 N NA
 2515959 2515960 RRSL_02941 RRSL_02942     TRUE 0.959 16.000 0.789 1.000 N NA
 2515961 2515962 RRSL_02943 RRSL_02944     TRUE 0.891 -3.000 0.070 1.000   NA
 2515962 2515963 RRSL_02944 RRSL_02945     FALSE 0.191 72.000 0.019 1.000   NA
 2515963 2515964 RRSL_02945 RRSL_02946     FALSE 0.352 155.000 0.010 0.063   NA
 2515966 2515967 RRSL_02948 RRSL_02949   phoB FALSE 0.003 295.000 0.000 1.000 N NA
 2515967 2515968 RRSL_02949 RRSL_02950 phoB   FALSE 0.131 122.000 0.008 NA   NA
 2515969 2515970 RRSL_02951 RRSL_02952     FALSE 0.048 76.000 0.000 1.000 N NA
 2515970 2515971 RRSL_02952 RRSL_02953     TRUE 0.988 -3.000 0.062 0.021 Y NA
 2515972 2515973 RRSL_02954 RRSL_02955     FALSE 0.547 60.000 0.136 NA   NA
 2515974 2515975 RRSL_02956 RRSL_02957     FALSE 0.190 168.000 0.083 NA   NA
 2515975 2515976 RRSL_02957 RRSL_02958     FALSE 0.010 232.000 0.000 NA   NA
 2515976 2515977 RRSL_02958 RRSL_02960     TRUE 0.976 -3.000 0.509 NA   NA
 2515977 2515978 RRSL_02960 RRSL_02961     FALSE 0.009 211.000 0.000 1.000 N NA
 2515978 2515979 RRSL_02961 RRSL_02962     TRUE 0.943 5.000 0.300 1.000 N NA
 2515980 2515981 RRSL_02963 RRSL_02964     FALSE 0.004 364.000 0.000 1.000   NA
 2515981 2515982 RRSL_02964 RRSL_02965     FALSE 0.073 75.000 0.000 NA   NA
 2515982 2515983 RRSL_02965 RRSL_02966     FALSE 0.268 25.000 0.000 NA   NA
 2515984 2515985 RRSL_02967 RRSL_02968     TRUE 0.673 39.000 0.122 1.000   NA
 2515985 2515986 RRSL_02968 RRSL_02970     TRUE 0.883 0.000 0.069 1.000   NA
 2515987 2515988 RRSL_02969 RRSL_02971     TRUE 0.911 16.000 0.298 NA   NA
 2515989 2515990 RRSL_02972 RRSL_02973     TRUE 0.671 52.000 0.214 NA   NA
 2515991 2515992 RRSL_02974 RRSL_02975   prrA TRUE 0.931 56.000 0.682 1.000 Y NA
 2515992 2515993 RRSL_02975 RRSL_02976 prrA   FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 2515993 2515994 RRSL_02976 RRSL_02977     FALSE 0.072 77.000 0.000 NA   NA
 2515995 2515996 RRSL_02978 RRSL_02979     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 2515996 2515997 RRSL_02979 RRSL_02980     FALSE 0.060 133.000 0.000 NA   NA
 2515997 2515998 RRSL_02980 RRSL_02981     FALSE 0.076 71.000 0.000 NA   NA
 2515998 2515999 RRSL_02981 RRSL_02983     FALSE 0.210 31.000 0.000 NA   NA
 2516002 2516003 RRSL_02985 RRSL_02986     TRUE 0.957 -3.000 0.273 1.000 N NA
 2516004 2516005 RRSL_02988 RRSL_02989     TRUE 0.986 3.000 0.054 0.007 Y NA
 2516005 2516006 RRSL_02989 RRSL_02990     FALSE 0.134 65.000 0.005 NA   NA
 2516006 2516007 RRSL_02990 RRSL_02991     TRUE 0.680 5.000 0.017 NA   NA
 2516007 2516008 RRSL_02991 RRSL_02992     TRUE 0.996 -3.000 0.352 0.007 Y NA
 2516008 2516009 RRSL_02992 RRSL_02993     TRUE 0.996 -3.000 0.397 0.007 Y NA
 2516009 2516010 RRSL_02993 RRSL_02994     TRUE 0.995 -3.000 0.291 0.007 Y NA
 2516010 2516011 RRSL_02994 RRSL_02995     TRUE 0.989 -3.000 0.056 0.007 Y NA
 2516011 2516012 RRSL_02995 RRSL_02996     TRUE 0.948 3.000 0.016 0.007   NA
 2516012 2516013 RRSL_02996 RRSL_02997     TRUE 0.924 -117.000 0.065 0.007   NA
 2516013 2516014 RRSL_02997 RRSL_02998     TRUE 0.644 53.000 0.000 1.000 Y NA
 2516014 2516015 RRSL_02998 RRSL_02999     TRUE 0.981 -3.000 0.086 0.001   NA
 2516015 2516016 RRSL_02999 RRSL_03000     TRUE 0.848 -3.000 0.045 NA   NA
 2516016 2516017 RRSL_03000 RRSL_03001   hupN TRUE 0.829 -3.000 0.045 NA N NA
 2516017 2516018 RRSL_03001 RRSL_03003 hupN   FALSE 0.003 337.000 0.000 1.000 N NA
 2516018 2516019 RRSL_03003 RRSL_03004     TRUE 0.990 -13.000 0.789 1.000 Y NA
 2516019 2516020 RRSL_03004 RRSL_03006     FALSE 0.036 790.000 0.000 0.062 Y NA
 2516020 2516021 RRSL_03006 RRSL_03008     FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 2516024 2516025 RRSL_03188 RRSL_03189 dnaJ dnaK TRUE 0.798 134.000 0.236 0.003   NA
 2516025 2516026 RRSL_03189 RRSL_03190 dnaK   FALSE 0.002 384.000 0.000 1.000 N NA
 2516026 2516027 RRSL_03190 RRSL_03191     FALSE 0.007 270.000 0.000 1.000   NA
 2516027 2516028 RRSL_03191 RRSL_03192     TRUE 0.904 22.000 0.333 1.000   NA
 2516029 2516030 RRSL_03193 RRSL_03194     TRUE 0.752 47.000 0.286 NA   NA
 2516031 2516032 RRSL_03195 RRSL_03196     TRUE 0.801 -3.000 0.035 1.000 N NA
 2516032 2516033 RRSL_03196 RRSL_03197     FALSE 0.138 59.000 0.008 1.000 N NA
 2516033 2516034 RRSL_03197 RRSL_03198     TRUE 0.915 -7.000 0.171 1.000 N NA
 2516034 2516035 RRSL_03198 RRSL_03199     TRUE 0.987 3.000 0.022 0.001 Y NA
 2516035 2516036 RRSL_03199 RRSL_03200     TRUE 0.990 19.000 0.315 0.001 Y NA
 2516039 2516040 RRSL_03204 RRSL_03205 recN   FALSE 0.131 82.000 0.007 NA   NA
 2516040 2516041 RRSL_03205 RRSL_03206     FALSE 0.473 193.000 0.714 NA   NA
 2516041 2516042 RRSL_03206 RRSL_03207     FALSE 0.226 213.000 0.000 0.001   NA
 2516043 2516044 RRSL_03208 RRSL_03210     TRUE 0.771 -3.000 0.018 1.000   NA
 2516045 2516046 RRSL_03209 RRSL_03211     TRUE 0.950 6.000 0.358 NA   NA
 2516046 2516047 RRSL_03211 RRSL_03212     TRUE 0.857 28.000 0.259 NA   NA
 2516047 2516048 RRSL_03212 RRSL_03213     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 2516052 2516053 RRSL_03217 RRSL_03219     TRUE 0.736 171.000 0.070 0.002 Y NA
 2516053 2516054 RRSL_03219 RRSL_03221     FALSE 0.042 1173.000 0.000 0.002 Y NA
 2516054 2516055 RRSL_03221 RRSL_03222     FALSE 0.288 53.000 0.026 1.000   NA
 2516055 2516056 RRSL_03222 RRSL_03223     TRUE 0.975 -3.000 0.500 NA   NA
 2516056 2516057 RRSL_03223 RRSL_03224     FALSE 0.198 164.000 0.077 NA   NA
 2516057 2516058 RRSL_03224 RRSL_03225     FALSE 0.467 66.000 0.107 NA   NA
 2516058 2516059 RRSL_03225 RRSL_03226     FALSE 0.532 44.000 0.071 1.000   NA
 2516060 2516061 RRSL_03227 RRSL_03228     FALSE 0.269 45.000 0.020 NA N NA
 2516061 2516062 RRSL_03228 RRSL_03229     TRUE 0.937 32.000 0.929 NA   NA
 2516062 2516063 RRSL_03229 RRSL_03230     TRUE 0.946 4.000 0.283 NA   NA
 2516063 2516064 RRSL_03230 RRSL_03231     TRUE 0.992 -3.000 0.630 NA Y NA
 2516064 2516065 RRSL_03231 RRSL_03232     TRUE 0.983 -3.000 0.188 NA Y NA
 2516065 2516066 RRSL_03232 RRSL_03233   pilE TRUE 0.975 4.000 0.171 NA Y NA
 2516066 2516067 RRSL_03233 RRSL_03234 pilE pilU FALSE 0.367 196.000 0.086 1.000 Y NA
 2516067 2516068 RRSL_03234 RRSL_03235 pilU   TRUE 0.914 50.000 0.079 0.015 Y NA
 2516069 2516070 RRSL_03236 RRSL_03237     TRUE 0.845 35.000 0.357 NA   NA
 2516071 2516072 RRSL_03239 RRSL_03240     FALSE 0.186 74.000 0.027 1.000 N NA
 2516072 2516073 RRSL_03240 RRSL_03241     FALSE 0.102 159.000 0.021 NA   NA
 2516073 2516074 RRSL_03241 RRSL_03242     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 2516074 2516075 RRSL_03242 RRSL_03243     FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 2516077 2516078 RRSL_03245 RRSL_03246     FALSE 0.015 173.000 0.000 NA N NA
 2516078 2516079 RRSL_03246 RRSL_03247     FALSE 0.151 75.000 0.019 NA N NA
 2516079 2516080 RRSL_03247 RRSL_03248     TRUE 0.990 0.000 0.690 0.064 N NA
 2516080 2516081 RRSL_03248 RRSL_03249     TRUE 0.600 62.000 0.208 1.000 N NA
 2516081 2516082 RRSL_03249 RRSL_03250     TRUE 0.764 125.000 0.714 1.000 N NA
 2516082 2516083 RRSL_03250 RRSL_03251     FALSE 0.310 18.000 0.000 NA   NA
 2516084 2516085 RRSL_03252 RRSL_03253     FALSE 0.005 310.000 0.000 1.000   NA
 2516087 2516088 RRSL_03255 RRSL_03256     TRUE 0.969 21.000 0.382 1.000 Y NA
 2516090 2516091 RRSL_03258 RRSL_03260     FALSE 0.001 545.000 0.000 NA N NA
 2516093 2516094 RRSL_03263 RRSL_03264     TRUE 0.995 -6.000 0.360 0.001 Y NA
 2516094 2516095 RRSL_03264 RRSL_03265     TRUE 0.654 106.000 0.325 NA   NA
 2516097 2516098 RRSL_02238 RRSL_02239     FALSE 0.001 9040.000 0.000 NA   NA
 2516099 2516100 RRSL_02240 RRSL_02241     TRUE 0.959 -52.000 0.667 NA   NA
 2516103 2516104 RRSL_02244 RRSL_02245     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.004 Y NA
 2516104 2516105 RRSL_02245 RRSL_02246     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 2516105 2516106 RRSL_02246 RRSL_02247     TRUE 0.976 22.000 0.429 0.001 N NA
 2516106 2516107 RRSL_02247 RRSL_02248     TRUE 0.809 95.000 0.857 1.000 N NA
 2516108 2516109 RRSL_02249 RRSL_02250     FALSE 0.001 471.000 0.000 1.000 N NA
 2516110 2516111 RRSL_02251 RRSL_02252     TRUE 0.878 -7.000 0.095 NA   NA
 2516112 2516113 RRSL_02253 RRSL_02254     FALSE 0.461 180.000 0.553 1.000 N NA
 2516113 2516114 RRSL_02254 RRSL_02255   corA TRUE 0.743 20.000 0.079 1.000 N NA
 2516114 2516115 RRSL_02255 RRSL_02256 corA   FALSE 0.347 23.000 0.006 1.000 N NA
 2516116 2516117 RRSL_02257 RRSL_02258     FALSE 0.160 103.000 0.012 1.000   NA
 2516118 2516119 RRSL_02259 RRSL_02260   oprM FALSE 0.137 189.000 0.080 NA   NA
 2516119 2516120 RRSL_02260 RRSL_02262 oprM   FALSE 0.000 1133.000 0.000 NA N NA
 2516120 2516121 RRSL_02262 RRSL_02263     FALSE 0.345 35.000 0.021 NA N NA
 2516123 2516124 RRSL_02265 RRSL_02266     TRUE 0.965 9.000 0.625 NA   NA
 2516124 2516125 RRSL_02266 RRSL_02267     TRUE 0.981 0.000 0.740 NA   NA
 2516128 2516129 RRSL_02270 RRSL_02271     FALSE 0.520 4.000 0.004 1.000 N NA
 2516129 2516130 RRSL_02271 RRSL_02272     FALSE 0.437 153.000 0.005 1.000 Y NA
 2516130 2516131 RRSL_02272 RRSL_02273     TRUE 0.904 47.000 0.293 1.000 Y NA
 2516131 2516132 RRSL_02273 RRSL_02274     FALSE 0.485 -7.000 0.002 1.000 N NA
 2516132 2516133 RRSL_02274 RRSL_02275     FALSE 0.002 553.000 0.000 NA   NA
 2516133 2516134 RRSL_02275 RRSL_02276     TRUE 0.696 47.000 0.200 NA   NA
 2516135 2516136 RRSL_02277 RRSL_02278     FALSE 0.003 315.000 0.000 1.000 N NA
 2516136 2516137 RRSL_02278 RRSL_02279     FALSE 0.261 73.000 0.042 NA   NA
 2516137 2516138 RRSL_02279 RRSL_02280     FALSE 0.151 133.000 0.019 NA   NA
 2516139 2516140 RRSL_02281 RRSL_02282     TRUE 0.882 56.000 0.316 1.000 Y NA
 2516142 2516143 RRSL_02285 RRSL_02287     FALSE 0.002 507.000 0.000 NA   NA
 2516143 2516144 RRSL_02287 RRSL_02288     TRUE 0.658 67.000 0.297 1.000   NA
 2516146 2516147 RRSL_02858 RRSL_02859     TRUE 0.869 19.000 0.000 1.000 Y NA
 2516147 2516148 RRSL_02859 RRSL_02860     FALSE 0.329 18.000 0.000 1.000   NA
 2516148 2516149 RRSL_02860 RRSL_02861     TRUE 0.877 22.000 0.000 0.003   NA
 2516149 2516150 RRSL_02861 RRSL_02862     TRUE 0.919 -25.000 0.000 0.003   NA
 2516150 2516151 RRSL_02862 RRSL_02863     TRUE 0.971 -34.000 0.000 0.003 Y NA
 2516151 2516152 RRSL_02863 RRSL_02864     TRUE 0.956 16.000 0.000 0.014 Y NA
 2516154 2516155 RRSL_02867 RRSL_02868     TRUE 0.665 14.000 0.034 NA   NA
 2516155 2516156 RRSL_02868 RRSL_02870     FALSE 0.175 110.000 0.015 NA   NA
 2516160 2516161 RRSL_02876 RRSL_02877     FALSE 0.049 86.000 0.000 1.000 N NA
 2516162 2516163 RRSL_02878 RRSL_02879     FALSE 0.190 25.000 0.000 1.000 N NA
 2516163 2516164 RRSL_02879 RRSL_02882     FALSE 0.001 929.000 0.000 1.000 N NA
 2516165 2516166 RRSL_02881 RRSL_02883     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 2516166 2516167 RRSL_02883 RRSL_02884     FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 2516167 2516168 RRSL_02884 RRSL_02885     FALSE 0.026 177.000 0.000 NA   NA
 2516168 2516169 RRSL_02885 RRSL_02886     FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 2516171 2516172 RRSL_02888 RRSL_02889     FALSE 0.422 -13.000 0.000 NA   NA
 2516174 2516175 RRSL_02890 RRSL_02891     FALSE 0.278 174.000 0.176 NA   NA
 2516176 2516177 RRSL_02892 RRSL_02893     TRUE 0.929 -3.000 0.125 NA   NA
 2516179 2516180 RRSL_02895 RRSL_02896     TRUE 0.879 -3.000 0.062 NA   NA
 2516180 2516181 RRSL_02896 RRSL_02897     TRUE 0.749 16.000 0.062 1.000   NA
 2516181 2516182 RRSL_02897 RRSL_02898     TRUE 0.732 68.000 0.475 1.000   NA
 2516182 2516183 RRSL_02898 RRSL_02899     FALSE 0.026 157.000 0.000 1.000 N NA
 2516183 2516184 RRSL_02899 RRSL_02900     TRUE 0.987 15.000 0.286 0.017 Y NA
 2516187 2516188 RRSL_02903 RRSL_02904     TRUE 0.877 47.000 0.750 NA   NA
 2516188 2516189 RRSL_02904 RRSL_02905     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 2516189 2516190 RRSL_02905 RRSL_02906     TRUE 0.853 53.000 0.750 NA   NA
 2516190 2516191 RRSL_02906 RRSL_02907     FALSE 0.001 985.000 0.000 NA   NA
 2516191 2516192 RRSL_02907 RRSL_02908     FALSE 0.135 98.000 0.014 1.000 N NA
 2516194 2516195 RRSL_02911 RRSL_02912     TRUE 0.989 7.000 0.688 1.000 Y NA
 2516198 2516199 RRSL_02915 RRSL_02917     FALSE 0.053 586.000 0.000 0.062 Y NA
 2516199 2516200 RRSL_02917 RRSL_02918     TRUE 0.977 8.000 0.250 1.000 Y NA
 2516201 2516202 RRSL_02919 RRSL_02920     FALSE 0.324 58.000 0.050 NA N NA
 2516202 2516203 RRSL_02920 RRSL_02921     TRUE 0.974 -13.000 0.800 NA   NA
 2516210 2516211 RRSL_02787 RRSL_02788     FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 2516211 2516212 RRSL_02788 RRSL_02789   aidA FALSE 0.077 106.000 0.000 NA   NA
 2516212 2516213 RRSL_02789 RRSL_02790 aidA   TRUE 0.805 109.000 0.750 NA   NA
 2516218 2516219 RRSL_02795 RRSL_02796     TRUE 0.820 107.000 0.222 1.000 Y NA
 2516219 2516220 RRSL_02796 RRSL_02797     FALSE 0.562 83.000 0.222 1.000 N NA
 2516220 2516221 RRSL_02797 RRSL_02798     FALSE 0.412 159.000 0.254 1.000 N NA
 2516221 2516222 RRSL_02798 RRSL_02799     TRUE 0.876 35.000 0.495 1.000   NA
 2516223 2516224 RRSL_02800 RRSL_02801     FALSE 0.288 116.000 0.054 NA N NA
 2516224 2516225 RRSL_02801 RRSL_02802     TRUE 0.867 -22.000 0.108 NA   NA
 2516226 2516227 RRSL_02803 RRSL_02805     FALSE 0.482 -88.000 0.007 1.000   NA
 2516227 2516228 RRSL_02805 RRSL_02806     TRUE 0.853 -43.000 0.122 1.000 N NA
 2516229 2516230 RRSL_02807 RRSL_02808     TRUE 0.994 -3.000 0.895 1.000 Y NA
 2516230 2516231 RRSL_02808 RRSL_02809     TRUE 0.798 20.000 0.111 1.000 N NA
 2516234 2516235 RRSL_02812 RRSL_02813     FALSE 0.006 275.000 0.000 NA   NA
 2516235 2516236 RRSL_02813 RRSL_02814     TRUE 0.849 -3.000 0.044 1.000   NA
 2516239 2516240 RRSL_02817 RRSL_02819     FALSE 0.194 124.000 0.025 NA   NA
 2516240 2516241 RRSL_02819 RRSL_02820   soxF TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA Y NA
 2516241 2516242 RRSL_02820 RRSL_02821 soxF   FALSE 0.391 124.000 0.092 NA   NA
 2516242 2516243 RRSL_02821 RRSL_02822     FALSE 0.161 159.000 0.046 1.000   NA
 2516243 2516244 RRSL_02822 RRSL_02823     TRUE 0.875 3.000 0.078 NA   NA
 2516244 2516245 RRSL_02823 RRSL_02824     TRUE 0.904 20.000 0.312 NA   NA
 2516245 2516246 RRSL_02824 RRSL_02825     TRUE 0.931 10.000 0.286 NA   NA
 2516246 2516247 RRSL_02825 RRSL_02826     TRUE 0.937 4.000 0.222 NA   NA
 2516247 2516248 RRSL_02826 RRSL_02827     TRUE 0.990 9.000 0.926 0.013   NA
 2516248 2516249 RRSL_02827 RRSL_02828   tlpA TRUE 0.968 11.000 0.222 0.016   NA
 2516249 2516250 RRSL_02828 RRSL_RNA027 tlpA   FALSE 0.001 1756.000 0.000 NA   NA
 2516250 2516251 RRSL_RNA027 RRSL_02831     FALSE 0.004 341.000 0.000 NA   NA
 2516251 2516252 RRSL_02831 RRSL_02832     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 2516252 2516253 RRSL_02832 RRSL_02834     FALSE 0.001 7547.000 0.000 NA   NA
 2516256 2516257 RRSL_02837 RRSL_02838     TRUE 0.841 14.000 0.110 1.000   NA
 2516257 2516258 RRSL_02838 RRSL_02839   livF FALSE 0.054 145.000 0.000 1.000   NA
 2516258 2516259 RRSL_02839 RRSL_02841 livF livM FALSE 0.016 743.000 0.000 1.000 Y NA
 2516259 2516260 RRSL_02841 RRSL_02842 livM livH TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.061 Y NA
 2516260 2516261 RRSL_02842 RRSL_02843 livH   TRUE 0.941 49.000 0.667 1.000 Y NA
 2516262 2516263 RRSL_02844 RRSL_02845     FALSE 0.395 84.000 0.088 NA   NA
 2516263 2516264 RRSL_02845 RRSL_02846     TRUE 0.949 -3.000 0.200 NA   NA
 2516264 2516265 RRSL_02846 RRSL_02847     TRUE 0.884 -3.000 0.065 NA   NA
 2516265 2516266 RRSL_02847 RRSL_02848     FALSE 0.001 755.000 0.000 NA N NA
 2516266 2516267 RRSL_02848 RRSL_02848_5   pilV TRUE 0.972 -3.000 0.071 NA Y NA
 2516267 2516268 RRSL_02848_5 RRSL_02849 pilV pilW TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA Y NA
 2516268 2516269 RRSL_02849 RRSL_02850 pilW pilX TRUE 0.979 -3.000 0.128 NA Y NA
 2516269 2516270 RRSL_02850 RRSL_02851 pilX   TRUE 0.980 0.000 0.154 NA Y NA
 2516270 2516271 RRSL_02851 RRSL_02852   pilE TRUE 0.966 3.000 0.077 NA Y NA
 2516274 2516275 RRSL_02855 RRSL_02856     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA   NA
 2516277 2516278 RRSL_02711 RRSL_02713     FALSE 0.015 578.000 0.000 0.062 N NA
 2516279 2516280 RRSL_02714 RRSL_02715     FALSE 0.319 70.000 0.063 NA N NA
 2516281 2516282 RRSL_02716 RRSL_02717     TRUE 0.948 -3.000 0.192 1.000   NA
 2516282 2516283 RRSL_02717 RRSL_02718     FALSE 0.055 378.000 0.233 1.000   NA
 2516283 2516284 RRSL_02718 RRSL_02719     TRUE 0.989 -84.000 0.230 0.001 Y NA
 2516284 2516285 RRSL_02719 RRSL_02720     TRUE 0.745 0.000 0.017 NA   NA
 2516285 2516286 RRSL_02720 RRSL_02721     FALSE 0.417 19.000 0.004 NA   NA
 2516286 2516287 RRSL_02721 RRSL_02722     TRUE 0.984 3.000 0.293 1.000 Y NA
 2516287 2516288 RRSL_02722 RRSL_02723     TRUE 0.827 4.000 0.054 1.000   NA
 2516288 2516289 RRSL_02723 RRSL_02724     TRUE 0.957 -3.000 0.250 1.000   NA
 2516290 2516291 RRSL_02725 RRSL_02726     TRUE 0.668 16.000 0.040 NA   NA
 2516291 2516292 RRSL_02726 RRSL_02727     TRUE 0.854 31.000 0.047 0.016   NA
 2516292 2516293 RRSL_02727 RRSL_02728     FALSE 0.433 80.000 0.118 1.000 N NA
 2516293 2516294 RRSL_02728 RRSL_02729     TRUE 0.925 33.000 0.814 1.000 N NA
 2516295 2516296 RRSL_02730 RRSL_02731     TRUE 0.969 11.000 0.778 NA   NA
 2516296 2516297 RRSL_02731 RRSL_02732     TRUE 0.944 27.000 0.778 NA   NA
 2516301 2516302 RRSL_02736 RRSL_02737     TRUE 0.814 54.000 0.171 0.035 N NA
 2516302 2516303 RRSL_02737 RRSL_02738     FALSE 0.033 186.000 0.002 NA   NA
 2516303 2516304 RRSL_02738 RRSL_02739     FALSE 0.154 60.000 0.006 NA   NA
 2516304 2516305 RRSL_02739 RRSL_02740     FALSE 0.010 202.000 0.000 1.000 N NA
 2516306 2516307 RRSL_02741 RRSL_02742     FALSE 0.072 122.000 0.000 NA   NA
 2516308 2516309 RRSL_02743 RRSL_02744     TRUE 0.949 -27.000 0.469 NA N NA
 2516309 2516310 RRSL_02744 RRSL_02745     FALSE 0.015 208.000 0.000 NA   NA
 2516310 2516311 RRSL_02745 RRSL_02746     FALSE 0.051 142.000 0.000 NA   NA
 2516311 2516312 RRSL_02746 RRSL_02747     TRUE 0.883 26.000 0.300 NA   NA
 2516313 2516314 RRSL_02748 RRSL_02749   cyoD FALSE 0.289 35.000 0.005 1.000   NA
 2516314 2516315 RRSL_02749 RRSL_02750 cyoD   TRUE 0.997 1.000 0.917 0.061 Y NA
 2516315 2516316 RRSL_02750 RRSL_02751     TRUE 0.990 4.000 0.240 0.061 Y NA
 2516316 2516317 RRSL_02751 RRSL_02752     TRUE 0.989 10.000 0.240 0.013 Y NA
 2516318 2516319 RRSL_02753 RRSL_02754     TRUE 0.974 3.000 0.667 NA N NA
 2516319 2516320 RRSL_02754 RRSL_02755     TRUE 0.881 87.000 0.500 NA Y NA
 2516323 2516324 RRSL_02758 RRSL_RNA026     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 2516324 2516325 RRSL_RNA026 RRSL_02759     FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 2516325 2516326 RRSL_02759 RRSL_02760     TRUE 0.983 1.000 0.831 NA   NA
 2516326 2516327 RRSL_02760 RRSL_02761     FALSE 0.548 147.000 0.370 1.000 N NA
 2516327 2516328 RRSL_02761 RRSL_02762     TRUE 0.991 27.000 0.630 0.001 Y NA
 2516328 2516329 RRSL_02762 RRSL_02763   petA TRUE 0.992 3.000 0.108 0.001 Y NA
 2516333 2516334 RRSL_02767 RRSL_02769     FALSE 0.038 337.000 0.000 0.061 N NA
 2516335 2516336 RRSL_02768 RRSL_02770     TRUE 0.994 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 2516336 2516337 RRSL_02770 RRSL_02771     FALSE 0.452 117.000 0.120 1.000 N NA
 2516337 2516338 RRSL_02771 RRSL_02772   sfuB TRUE 0.951 84.000 0.688 0.061 Y NA
 2516338 2516339 RRSL_02772 RRSL_02773 sfuB sfuC TRUE 0.984 -7.000 0.585 0.071 N NA
 2516340 2516341 RRSL_02774 RRSL_02775 tatC tatB TRUE 0.843 53.000 0.167 NA Y NA
 2516341 2516342 RRSL_02775 RRSL_02776 tatB tatA TRUE 0.989 20.000 0.402 0.008 Y NA
 2516342 2516343 RRSL_02776 RRSL_02777 tatA   FALSE 0.246 63.000 0.028 NA   NA
 2516343 2516344 RRSL_02777 RRSL_02778     FALSE 0.348 74.000 0.070 NA   NA
 2516346 2516347 RRSL_02780 RRSL_02781     TRUE 0.967 52.000 0.433 0.003 Y NA
 2516347 2516348 RRSL_02781 RRSL_02782     TRUE 0.901 79.000 0.120 0.003 Y NA
 2516348 2516349 RRSL_02782 RRSL_02783     TRUE 0.942 48.000 0.111 0.003 Y NA
 2516349 2516350 RRSL_02783 RRSL_02784     TRUE 0.966 -3.000 0.341 1.000   NA
 2516351 2516352 RRSL_02043 RRSL_02044     FALSE 0.021 189.000 0.000 NA   NA
 2516354 2516355 RRSL_02046 RRSL_02047     FALSE 0.549 0.000 0.000 1.000   NA
 2516355 2516356 RRSL_02047 RRSL_02048     FALSE 0.002 607.000 0.000 1.000   NA
 2516356 2516357 RRSL_02048 RRSL_02049     FALSE 0.008 254.000 0.000 1.000   NA
 2516357 2516358 RRSL_02049 RRSL_02050     TRUE 0.937 25.000 0.637 NA   NA
 2516358 2516359 RRSL_02050 RRSL_02051     FALSE 0.012 222.000 0.000 NA   NA
 2516359 2516360 RRSL_02051 RRSL_02052     TRUE 0.922 96.000 0.240 0.007 Y NA
 2516361 2516362 RRSL_02053 RRSL_02054 dnaK   FALSE 0.014 187.000 0.000 1.000 N NA
 2516363 2516364 RRSL_02055 RRSL_02056     TRUE 0.981 -3.000 0.667 NA   NA
 2516366 2516367 RRSL_02058 RRSL_02059     FALSE 0.074 120.000 0.000 NA   NA
 2516367 2516368 RRSL_02059 RRSL_02060     FALSE 0.095 59.000 0.000 NA   NA
 2516370 2516371 RRSL_02063 RRSL_02064     FALSE 0.001 713.000 0.000 NA   NA
 2516372 2516373 RRSL_02065 RRSL_02066 cbhA   FALSE 0.001 1286.000 0.000 NA   NA
 2516375 2516376 RRSL_02069 RRSL_02070     FALSE 0.074 92.000 0.000 NA   NA
 2516376 2516377 RRSL_02070 RRSL_02071     TRUE 0.613 69.000 0.250 NA   NA
 2516377 2516378 RRSL_02071 RRSL_02072     FALSE 0.003 396.000 0.000 1.000   NA
 2516378 2516379 RRSL_02072 RRSL_02074     FALSE 0.003 420.000 0.000 1.000   NA
 2516379 2516380 RRSL_02074 RRSL_02075     TRUE 0.965 15.000 0.833 NA   NA
 2516380 2516381 RRSL_02075 RRSL_02076     TRUE 0.964 13.000 0.750 NA   NA
 2516381 2516382 RRSL_02076 RRSL_02077     FALSE 0.079 82.000 0.000 1.000   NA
 2516382 2516383 RRSL_02077 RRSL_02078     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 2516383 2516384 RRSL_02078 RRSL_02079     FALSE 0.072 78.000 0.000 NA   NA
 2516387 2516388 RRSL_02082 RRSL_02083     FALSE 0.311 170.000 0.200 NA   NA
 2516388 2516389 RRSL_02083 RRSL_02084     TRUE 0.984 -19.000 0.464 1.000 Y NA
 2516389 2516390 RRSL_02084 RRSL_02085     FALSE 0.003 341.000 0.000 1.000 N NA
 2516390 2516391 RRSL_02085 RRSL_02086     FALSE 0.205 -157.000 0.000 1.000 N NA
 2516391 2516392 RRSL_02086 RRSL_02087     FALSE 0.056 65.000 0.000 1.000 N NA
 2516392 2516393 RRSL_02087 RRSL_02088     TRUE 0.901 26.000 0.382 1.000   NA
 2516394 2516395 RRSL_02089 RRSL_02091     FALSE 0.149 199.000 0.111 1.000   NA
 2516395 2516396 RRSL_02091 RRSL_02092     TRUE 0.961 10.000 0.571 1.000   NA
 2516397 2516398 RRSL_02093 RRSL_02094     FALSE 0.011 191.000 0.000 NA N NA
 2516398 2516399 RRSL_02094 RRSL_02096     FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 2516399 2516400 RRSL_02096 RRSL_02097     TRUE 0.697 86.000 0.429 NA   NA
 2516401 2516402 RRSL_02098 RRSL_02099     TRUE 0.914 75.000 0.600 0.001   NA
 2516402 2516403 RRSL_02099 RRSL_02100     FALSE 0.002 451.000 0.000 1.000   NA
 2516403 2516404 RRSL_02100 RRSL_02101     TRUE 0.878 78.000 0.500 1.000 Y NA
 2516404 2516405 RRSL_02101 RRSL_02102     TRUE 0.817 48.000 0.500 1.000 N NA
 2516405 2516406 RRSL_02102 RRSL_02103     TRUE 0.976 19.000 0.500 1.000 Y NA
 2516406 2516407 RRSL_02103 RRSL_02104     TRUE 0.943 82.000 0.429 0.008 Y NA
 2516407 2516408 RRSL_02104 RRSL_02105     TRUE 0.877 164.000 0.429 0.008 Y NA
 2516412 2516413 RRSL_02295 RRSL_02296     TRUE 0.958 11.000 0.571 NA   NA
 2516413 2516414 RRSL_02296 RRSL_02297     TRUE 0.951 3.000 0.286 NA   NA
 2516414 2516415 RRSL_02297 RRSL_02298     TRUE 0.875 -103.000 0.200 NA   NA
 2516416 2516417 RRSL_02299 RRSL_02300     FALSE 0.001 621.000 0.000 NA   NA
 2516417 2516418 RRSL_02300 RRSL_02301     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 2516419 2516420 RRSL_02302 RRSL_02303     FALSE 0.010 232.000 0.000 NA   NA
 2516421 2516422 RRSL_02304 RRSL_02305     FALSE 0.009 245.000 0.000 NA   NA
 2516423 2516424 RRSL_02306 RRSL_02307     FALSE 0.075 86.000 0.000 NA   NA
 2516424 2516425 RRSL_02307 RRSL_02308     FALSE 0.020 194.000 0.000 1.000   NA
 2516426 2516427 RRSL_02309 RRSL_02310 fliK fliI FALSE 0.082 579.000 0.000 0.002 Y NA
 2516427 2516428 RRSL_02310 RRSL_02311 fliI fliH TRUE 0.981 -10.000 0.024 0.004 Y NA
 2516428 2516429 RRSL_02311 RRSL_02312 fliH fliG TRUE 0.975 36.000 0.320 0.004 Y NA
 2516429 2516430 RRSL_02312 RRSL_02313 fliG fliF TRUE 0.994 -3.000 0.220 0.005 Y NA
 2516431 2516432 RRSL_02314 RRSL_02315 fliE   FALSE 0.375 104.000 0.087 NA N NA
 2516432 2516433 RRSL_02315 RRSL_02316     FALSE 0.436 6.000 0.000 NA   NA
 2516433 2516434 RRSL_02316 RRSL_02317     FALSE 0.011 232.000 0.000 1.000   NA
 2516435 2516436 RRSL_02318 RRSL_02319 fliT fliS FALSE 0.309 60.000 0.041 1.000   NA
 2516436 2516437 RRSL_02319 RRSL_02320 fliS fliD TRUE 0.947 57.000 0.216 0.002 Y NA
 2516437 2516438 RRSL_02320 RRSL_02321 fliD fliC FALSE 0.443 197.000 0.158 1.000 Y NA
 2516441 2516442 RRSL_02324 RRSL_02325 fliL fliM TRUE 0.991 2.000 0.076 0.001 Y NA
 2516442 2516443 RRSL_02325 RRSL_02326 fliM fliN TRUE 0.997 -10.000 0.741 0.001 Y NA
 2516443 2516444 RRSL_02326 RRSL_02327 fliN fliO TRUE 0.904 56.000 0.443 1.000 Y NA
 2516444 2516445 RRSL_02327 RRSL_02328 fliO fliP TRUE 0.983 0.000 0.203 1.000 Y NA
 2516445 2516446 RRSL_02328 RRSL_02329 fliP fliQ TRUE 0.995 11.000 0.827 0.012 Y NA
 2516446 2516447 RRSL_02329 RRSL_02330 fliQ fliR TRUE 0.950 34.000 0.042 0.002 Y NA
 2516448 2516449 RRSL_02333 RRSL_02334   flgL FALSE 0.495 73.000 0.143 NA   NA
 2516449 2516450 RRSL_02334 RRSL_02335 flgL flgK TRUE 0.909 79.000 0.108 0.001 Y NA
 2516450 2516451 RRSL_02335 RRSL_02336 flgK flgJ TRUE 0.967 118.000 0.705 0.002 Y NA
 2516451 2516452 RRSL_02336 RRSL_02337 flgJ flgI TRUE 0.972 28.000 0.131 0.006 Y NA
 2516452 2516453 RRSL_02337 RRSL_02338 flgI flgH TRUE 0.984 23.000 0.256 0.006 Y NA
 2516453 2516454 RRSL_02338 RRSL_02339 flgH flgG TRUE 0.983 33.000 0.463 0.005 Y NA
 2516454 2516455 RRSL_02339 RRSL_02340 flgG flgF TRUE 0.977 42.000 0.381 0.001 Y NA
 2516455 2516456 RRSL_02340 RRSL_02341 flgF flgE TRUE 0.993 14.000 0.520 0.003 Y NA
 2516456 2516457 RRSL_02341 RRSL_02342 flgE flgD TRUE 0.912 40.000 0.244 1.000 Y NA
 2516457 2516458 RRSL_02342 RRSL_02343 flgD flgC TRUE 0.899 30.000 0.081 1.000 Y NA
 2516458 2516459 RRSL_02343 RRSL_02344 flgC flgB TRUE 0.821 162.000 0.143 0.003 Y NA
 2516460 2516461 RRSL_02345 RRSL_02346 flgA flgM TRUE 0.846 103.000 0.330 NA Y NA
 2516461 2516462 RRSL_02346 RRSL_02347 flgM flgN TRUE 0.662 116.000 0.015 0.002   NA
 2516462 2516463 RRSL_02347 RRSL_02348 flgN narP FALSE 0.003 387.000 0.000 1.000   NA
 2516464 2516465 RRSL_02349 RRSL_02350     FALSE 0.004 274.000 0.000 1.000 N NA
 2516465 2516466 RRSL_02350 RRSL_02351     TRUE 0.948 44.000 0.750 0.041   NA
 2516467 2516468 RRSL_02352 RRSL_02353     FALSE 0.017 199.000 0.000 NA   NA
 2516469 2516470 RRSL_02354 RRSL_02355     TRUE 0.684 84.000 0.400 NA   NA
 2516470 2516471 RRSL_02355 RRSL_02356     FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 2516471 2516472 RRSL_02356 RRSL_02358     FALSE 0.001 1148.000 0.000 NA   NA
 2516472 2516473 RRSL_02358 RRSL_02359     TRUE 0.961 -3.000 0.286 NA   NA
 2516473 2516474 RRSL_02359 RRSL_02360     TRUE 0.964 11.000 0.238 0.060   NA
 2516474 2516475 RRSL_02360 RRSL_02362     FALSE 0.017 625.000 0.000 0.012 N NA
 2516475 2516476 RRSL_02362 RRSL_02363     FALSE 0.003 405.000 0.000 1.000   NA
 2516478 2516479 RRSL_02366 RRSL_02367     FALSE 0.304 42.000 0.016 NA   NA
 2516479 2516480 RRSL_02367 RRSL_02369     FALSE 0.003 622.000 0.006 1.000   NA
 2516480 2516481 RRSL_02369 RRSL_02370   tctA FALSE 0.034 163.000 0.000 NA   NA
 2516481 2516482 RRSL_02370 RRSL_02371 tctA   TRUE 0.968 11.000 0.750 NA   NA
 2516482 2516483 RRSL_02371 RRSL_02372     FALSE 0.012 219.000 0.000 NA   NA
 2516483 2516484 RRSL_02372 RRSL_02373     TRUE 0.641 34.000 0.082 NA   NA
 2516486 2516487 RRSL_02376 RRSL_02377     FALSE 0.073 94.000 0.000 NA   NA
 2516487 2516488 RRSL_02377 RRSL_02378     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2516489 2516490 RRSL_02379 RRSL_02380     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA Y NA
 2516490 2516491 RRSL_02380 RRSL_02381     FALSE 0.010 195.000 0.000 NA N NA
 2516491 2516492 RRSL_02381 RRSL_02382     FALSE 0.572 35.000 0.061 NA   NA
 2516493 2516494 RRSL_02383 RRSL_02384   nfeD TRUE 0.935 36.000 0.330 NA Y NA
 2516494 2516495 RRSL_02384 RRSL_02385 nfeD   FALSE 0.212 75.000 0.038 NA N NA
 2516496 2516497 RRSL_02386 RRSL_02387     TRUE 0.788 77.000 0.182 1.000 Y NA
 2516497 2516498 RRSL_02387 RRSL_02388     FALSE 0.245 -76.000 0.000 1.000 N NA
 2516498 2516499 RRSL_02388 RRSL_02389     FALSE 0.545 -133.000 0.027 1.000 N NA
 2516499 2516500 RRSL_02389 RRSL_02390     TRUE 0.664 39.000 0.129 1.000 N NA
 2516501 2516502 RRSL_02391 RRSL_02392     TRUE 0.954 11.000 0.153 0.060   NA
 2516502 2516503 RRSL_02392 RRSL_02393     FALSE 0.188 71.000 0.018 1.000   NA
 2516503 2516504 RRSL_02393 RRSL_02394     FALSE 0.039 134.000 0.000 1.000 N NA
 2516507 2516508 RRSL_02397 RRSL_02398     FALSE 0.006 234.000 0.000 NA N NA
 2516509 2516510 RRSL_02399 RRSL_02400     FALSE 0.163 38.000 0.000 NA   NA
 2516510 2516511 RRSL_02400 RRSL_02401     FALSE 0.497 49.000 0.075 NA   NA
 2516511 2516512 RRSL_02401 RRSL_02402     FALSE 0.001 719.000 0.000 NA   NA
 2516512 2516513 RRSL_02402 RRSL_02403     FALSE 0.453 -7.000 0.000 NA   NA
 2516513 2516514 RRSL_02403 RRSL_02404     TRUE 0.958 -13.000 0.485 NA   NA
 2516514 2516515 RRSL_02404 RRSL_02405     FALSE 0.464 4.000 0.000 NA   NA
 2516515 2516516 RRSL_02405 RRSL_02406     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2516516 2516517 RRSL_02406 RRSL_02408     FALSE 0.001 632.000 0.000 NA   NA
 2516517 2516518 RRSL_02408 RRSL_02409     FALSE 0.076 105.000 0.000 NA   NA
 2516519 2516520 RRSL_02410 RRSL_02411     TRUE 0.922 9.000 0.222 NA   NA
 2516520 2516521 RRSL_02411 RRSL_02412     TRUE 0.978 4.000 0.778 NA   NA
 2516521 2516522 RRSL_02412 RRSL_02413     TRUE 0.967 13.000 0.333 0.064   NA
 2516524 2516525 RRSL_02414 RRSL_02416     TRUE 0.972 -3.000 0.444 NA   NA
 2516525 2516526 RRSL_02416 RRSL_02417     FALSE 0.075 72.000 0.000 NA   NA
 2516526 2516527 RRSL_02417 RRSL_02418     FALSE 0.074 84.000 0.000 NA   NA
 2516527 2516528 RRSL_02418 RRSL_02419     FALSE 0.486 3.000 0.000 NA   NA
 2516528 2516529 RRSL_02419 RRSL_02420     FALSE 0.464 4.000 0.000 NA   NA
 2516529 2516530 RRSL_02420 RRSL_02422     FALSE 0.001 1142.000 0.000 NA   NA
 2516530 2516531 RRSL_02422 RRSL_02423     FALSE 0.080 68.000 0.000 NA   NA
 2516531 2516532 RRSL_02423 RRSL_02424     FALSE 0.075 90.000 0.000 NA   NA
 2516532 2516533 RRSL_02424 RRSL_02425     FALSE 0.527 0.000 0.000 NA   NA
 2516533 2516534 RRSL_02425 RRSL_02426     TRUE 0.941 -3.000 0.167 NA   NA
 2516534 2516535 RRSL_02426 RRSL_02427   gpl FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2516535 2516536 RRSL_02427 RRSL_02428 gpl   TRUE 0.856 51.000 0.720 NA   NA
 2516536 2516537 RRSL_02428 RRSL_02429     FALSE 0.398 10.000 0.000 NA   NA
 2516537 2516538 RRSL_02429 RRSL_02430     FALSE 0.210 31.000 0.000 NA   NA
 2516538 2516539 RRSL_02430 RRSL_02431     FALSE 0.011 230.000 0.000 NA   NA
 2516539 2516540 RRSL_02431 RRSL_02432     TRUE 0.942 0.000 0.185 NA   NA
 2516540 2516541 RRSL_02432 RRSL_02433     FALSE 0.453 -7.000 0.000 NA   NA
 2516541 2516542 RRSL_02433 RRSL_02434     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2516542 2516543 RRSL_02434 RRSL_02435     FALSE 0.506 2.000 0.000 NA   NA
 2516543 2516544 RRSL_02435 RRSL_02436     FALSE 0.543 -3.000 0.000 NA   NA
 2516544 2516545 RRSL_02436 RRSL_02437     FALSE 0.422 -13.000 0.000 NA   NA
 2516545 2516546 RRSL_02437 RRSL_02438     FALSE 0.464 4.000 0.000 NA   NA
 2516546 2516547 RRSL_02438 RRSL_02439     FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 2516547 2516548 RRSL_02439 RRSL_02440     FALSE 0.024 181.000 0.000 NA   NA
 2516550 2516551 RRSL_02170 RRSL_02171     FALSE 0.122 154.000 0.023 NA   NA
 2516554 2516555 RRSL_02174 RRSL_02175   phoB TRUE 0.873 86.000 0.453 1.000 Y NA
 2516555 2516556 RRSL_02175 RRSL_02176 phoB phoU TRUE 0.767 24.000 0.104 NA N NA
 2516556 2516557 RRSL_02176 RRSL_02177 phoU pstB TRUE 0.947 31.000 0.317 NA Y NA
 2516557 2516558 RRSL_02177 RRSL_02178 pstB pstA TRUE 0.997 -3.000 0.526 0.002 Y NA
 2516558 2516559 RRSL_02178 RRSL_02179 pstA pstC TRUE 0.982 39.000 0.537 0.002 Y NA
 2516559 2516560 RRSL_02179 RRSL_02180 pstC   TRUE 0.863 82.000 0.039 0.002 Y NA
 2516560 2516561 RRSL_02180 RRSL_02181     FALSE 0.055 152.000 0.004 1.000 N NA
 2516561 2516562 RRSL_02181 RRSL_02182     TRUE 0.605 107.000 0.260 1.000 N NA
 2516562 2516563 RRSL_02182 RRSL_02183     FALSE 0.564 136.000 0.325 1.000 N NA
 2516563 2516564 RRSL_02183 RRSL_02185     FALSE 0.326 135.000 0.095 NA N NA
 2516566 2516567 RRSL_02186 RRSL_02187     TRUE 0.773 21.000 0.089 NA   NA
 2516567 2516568 RRSL_02187 RRSL_02188     FALSE 0.227 199.000 0.241 1.000 N NA
 2516568 2516569 RRSL_02188 RRSL_02189     FALSE 0.523 146.000 0.030 1.000 Y NA
 2516569 2516570 RRSL_02189 RRSL_02190     TRUE 0.890 23.000 0.026 1.000 Y NA
 2516570 2516571 RRSL_02190 RRSL_02191     FALSE 0.003 316.000 0.000 1.000 N NA
 2516571 2516572 RRSL_02191 RRSL_02192     FALSE 0.148 152.000 0.031 1.000   NA
 2516572 2516573 RRSL_02192 RRSL_02194     FALSE 0.502 140.000 0.233 1.000   NA
 2516574 2516575 RRSL_02193 RRSL_02196     TRUE 0.605 46.000 0.111 1.000   NA
 2516575 2516576 RRSL_02196 RRSL_02197     FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000   NA
 2516578 2516579 RRSL_02199 RRSL_02200     FALSE 0.009 242.000 0.000 NA   NA
 2516579 2516580 RRSL_02200 RRSL_02201     TRUE 0.870 45.000 0.667 NA   NA
 2516580 2516581 RRSL_02201 RRSL_02202     TRUE 0.777 89.000 0.667 1.000   NA
 2516582 2516583 RRSL_02203 RRSL_02204     FALSE 0.418 10.000 0.000 1.000   NA
 2516583 2516584 RRSL_02204 RRSL_02205     FALSE 0.254 28.000 0.000 1.000   NA
 2516586 2516587 RRSL_02207 RRSL_02209     FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 2516588 2516589 RRSL_02208 RRSL_02210 &nb