MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium tuberculosis F11

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3476593 3476594 TBFG_10001 TBFG_10002 dnaA   FALSE 0.072 528.000 0.328 1.000 Y NA
 3476594 3476595 TBFG_10002 TBFG_10003   recF TRUE 0.923 20.000 0.318 1.000 Y NA
 3476595 3476596 TBFG_10003 TBFG_10004 recF   TRUE 0.967 -3.000 0.099 NA   NA
 3476596 3476597 TBFG_10004 TBFG_10005   gyrB FALSE 0.089 126.000 0.022 NA   NA
 3476597 3476598 TBFG_10005 TBFG_10006 gyrB   TRUE 0.959 35.000 0.306 0.001 Y NA
 3476598 3476599 TBFG_10006 TBFG_10007     FALSE 0.136 96.000 0.009 NA   NA
 3476599 3476600 TBFG_10007 TBFG_14001     FALSE 0.143 59.000 0.000 NA   NA
 3476600 3476601 TBFG_14001 TBFG_14002     FALSE 0.029 149.000 0.000 NA   NA
 3476604 3476605 TBFG_10010 TBFG_10011     FALSE 0.103 156.000 0.181 NA   NA
 3476606 3476607 TBFG_10012 TBFG_10013     FALSE 0.426 37.000 0.098 NA   NA
 3476608 3476609 TBFG_10014 TBFG_10015     TRUE 0.999 -3.000 0.426 0.005 Y NA
 3476609 3476610 TBFG_10015 TBFG_10016     TRUE 0.992 -3.000 0.574 1.000 N NA
 3476610 3476611 TBFG_10016 TBFG_10017     TRUE 0.977 -3.000 0.250 1.000 N NA
 3476611 3476612 TBFG_10017 TBFG_10018     TRUE 0.962 -3.000 0.145 1.000 N NA
 3476612 3476613 TBFG_10018 TBFG_10019     TRUE 0.692 89.000 0.216 NA Y NA
 3476613 3476614 TBFG_10019 TBFG_10020     FALSE 0.127 124.000 0.069 NA   NA
 3476616 3476617 TBFG_10021 TBFG_10022     FALSE 0.051 142.000 0.000 1.000   NA
 3476618 3476619 TBFG_10023 TBFG_10024     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 3476619 3476620 TBFG_10024 TBFG_10025     TRUE 0.834 38.000 0.750 NA   NA
 3476620 3476621 TBFG_10025 TBFG_10026     TRUE 0.652 115.000 1.000 NA   NA
 3476621 3476622 TBFG_10026 TBFG_10027     FALSE 0.464 121.000 0.600 NA   NA
 3476622 3476623 TBFG_10027 TBFG_10028     TRUE 0.962 8.000 0.800 NA   NA
 3476623 3476624 TBFG_10028 TBFG_10029     FALSE 0.009 238.000 0.000 NA   NA
 3476624 3476625 TBFG_10029 TBFG_10030     TRUE 0.813 70.000 1.000 NA   NA
 3476625 3476626 TBFG_10030 TBFG_10031     FALSE 0.002 496.000 0.000 NA   NA
 3476626 3476627 TBFG_10031 TBFG_10032     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3476627 3476628 TBFG_10032 TBFG_10033     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476628 3476629 TBFG_10033 TBFG_10034     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476630 3476631 TBFG_10035 TBFG_10036     FALSE 0.457 48.000 0.174 NA   NA
 3476633 3476634 TBFG_10038 TBFG_10039     TRUE 0.764 82.000 0.875 NA   NA
 3476636 3476637 TBFG_10041 TBFG_10042     FALSE 0.407 159.000 0.000 0.035 Y NA
 3476637 3476638 TBFG_10042 TBFG_10043     FALSE 0.237 133.000 0.412 NA N NA
 3476638 3476639 TBFG_10043 TBFG_10044     TRUE 0.710 16.000 0.235 NA   NA
 3476639 3476640 TBFG_10044 TBFG_10045     FALSE 0.288 82.000 0.059 1.000   NA
 3476640 3476641 TBFG_10045 TBFG_10046     TRUE 0.664 61.000 0.608 NA N NA
 3476641 3476642 TBFG_10046 TBFG_10047     FALSE 0.232 101.000 0.122 NA   NA
 3476643 3476644 TBFG_10048 TBFG_10049     TRUE 0.870 -7.000 0.200 NA   NA
 3476644 3476645 TBFG_10049 TBFG_10050     TRUE 0.977 -3.000 0.204 NA   NA
 3476645 3476646 TBFG_10050 TBFG_10051     FALSE 0.400 32.000 0.061 NA   NA
 3476646 3476647 TBFG_10051 TBFG_10052   rpsF FALSE 0.017 219.000 0.002 NA   NA
 3476647 3476648 TBFG_10052 TBFG_10053 rpsF   FALSE 0.100 104.000 0.029 1.000 N NA
 3476648 3476649 TBFG_10053 TBFG_10054   rpsR FALSE 0.229 42.000 0.030 1.000 N NA
 3476649 3476650 TBFG_10054 TBFG_10055 rpsR rplI TRUE 0.962 33.000 0.499 0.020 Y NA
 3476650 3476651 TBFG_10055 TBFG_10056 rplI   FALSE 0.215 29.000 0.000 NA   NA
 3476651 3476652 TBFG_10056 TBFG_10057     FALSE 0.410 -21.000 0.000 NA   NA
 3476652 3476653 TBFG_10057 TBFG_10058     FALSE 0.019 180.000 0.000 NA   NA
 3476653 3476654 TBFG_10058 TBFG_10059     TRUE 0.762 17.000 0.317 NA   NA
 3476656 3476657 TBFG_10061 TBFG_10062     FALSE 0.004 229.000 0.000 1.000 N NA
 3476657 3476658 TBFG_10062 TBFG_10063     FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000   NA
 3476658 3476659 TBFG_10063 TBFG_10064     TRUE 0.762 -118.000 0.021 0.060   NA
 3476659 3476660 TBFG_10064 TBFG_10065     FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 3476661 3476662 TBFG_10066 TBFG_10067     FALSE 0.020 118.000 0.000 1.000 N NA
 3476664 3476665 TBFG_10069 TBFG_10070     TRUE 0.994 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 3476666 3476667 TBFG_10071 TBFG_10072     FALSE 0.001 431.000 0.000 1.000 N NA
 3476667 3476668 TBFG_10072 TBFG_10073     TRUE 0.989 3.000 1.000 1.000 N NA
 3476668 3476669 TBFG_10073 TBFG_10074     FALSE 0.043 80.000 0.000 1.000 N NA
 3476669 3476670 TBFG_10074 TBFG_10075     FALSE 0.169 13.000 0.000 1.000 N NA
 3476671 3476672 TBFG_10076 TBFG_10077     FALSE 0.133 64.000 0.000 NA   NA
 3476675 3476676 TBFG_10080 TBFG_10081     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476676 3476677 TBFG_10081 TBFG_10082     FALSE 0.131 95.000 0.000 1.000   NA
 3476677 3476678 TBFG_10082 TBFG_10083     TRUE 0.762 5.000 0.043 1.000 N NA
 3476678 3476679 TBFG_10083 TBFG_10084     TRUE 0.998 -3.000 0.085 0.007 Y NA
 3476679 3476680 TBFG_10084 TBFG_10085     TRUE 0.984 6.000 0.398 1.000 Y NA
 3476680 3476681 TBFG_10085 TBFG_10086     TRUE 0.978 11.000 0.679 NA Y NA
 3476681 3476682 TBFG_10086 TBFG_10087     TRUE 0.998 0.000 0.864 NA Y NA
 3476682 3476683 TBFG_10087 TBFG_10088     TRUE 0.999 -3.000 0.659 0.007 Y NA
 3476683 3476684 TBFG_10088 TBFG_10089     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3476684 3476685 TBFG_10089 TBFG_10090     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 3476685 3476686 TBFG_10090 TBFG_10091     FALSE 0.044 129.000 0.000 NA   NA
 3476686 3476687 TBFG_10091 TBFG_10092     FALSE 0.003 434.000 0.000 NA   NA
 3476687 3476688 TBFG_10092 TBFG_10093     FALSE 0.016 132.000 0.000 1.000 N NA
 3476689 3476690 TBFG_10094 TBFG_10095     FALSE 0.169 47.000 0.000 NA   NA
 3476690 3476691 TBFG_10095 TBFG_10096     FALSE 0.273 -229.000 0.000 NA   NA
 3476692 3476693 TBFG_10097 TBFG_10098     FALSE 0.453 19.000 0.167 NA N NA
 3476693 3476694 TBFG_10098 TBFG_10099     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3476694 3476695 TBFG_10099 TBFG_10100     TRUE 0.960 5.000 0.444 NA   NA
 3476695 3476696 TBFG_10100 TBFG_10101     TRUE 0.983 5.000 0.800 1.000   NA
 3476696 3476697 TBFG_10101 TBFG_10102     TRUE 0.955 -18.000 0.364 0.012   NA
 3476697 3476698 TBFG_10102 TBFG_10103     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 3476703 3476704 TBFG_10108 TBFG_10109     FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 3476705 3476706 TBFG_10110 TBFG_10111     FALSE 0.404 43.000 0.091 NA   NA
 3476706 3476707 TBFG_10111 TBFG_10112     FALSE 0.029 181.000 0.000 1.000   NA
 3476707 3476708 TBFG_10112 TBFG_10113     FALSE 0.002 282.000 0.000 1.000 N NA
 3476708 3476709 TBFG_10113 TBFG_10114     FALSE 0.047 74.000 0.000 1.000 N NA
 3476709 3476710 TBFG_10114 TBFG_10115     FALSE 0.083 32.000 0.000 1.000 N NA
 3476710 3476711 TBFG_10115 TBFG_10116     TRUE 0.911 0.000 0.000 1.000   NA
 3476716 3476717 TBFG_10121 TBFG_10122     FALSE 0.083 137.000 0.009 1.000   NA
 3476718 3476719 TBFG_10123 TBFG_10124     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476719 3476720 TBFG_10124 TBFG_10125     FALSE 0.007 267.000 0.000 NA   NA
 3476720 3476721 TBFG_10125 TBFG_10126     FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 3476721 3476722 TBFG_10126 TBFG_10127     FALSE 0.070 109.000 0.013 1.000 N NA
 3476722 3476723 TBFG_10127 TBFG_10128     TRUE 0.564 103.000 0.071 NA Y NA
 3476723 3476724 TBFG_10128 TBFG_10129     FALSE 0.348 68.000 0.136 NA   NA
 3476727 3476728 TBFG_10132 TBFG_10133     FALSE 0.491 42.000 0.286 NA N NA
 3476729 3476730 TBFG_10134 TBFG_10135     FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000   NA
 3476734 3476735 TBFG_10139 TBFG_10140     TRUE 0.986 1.000 0.538 NA   NA
 3476735 3476736 TBFG_10140 TBFG_10141     FALSE 0.263 61.000 0.034 NA   NA
 3476740 3476741 TBFG_10145 TBFG_10146     FALSE 0.536 89.000 0.571 NA N NA
 3476741 3476742 TBFG_10146 TBFG_10147     TRUE 0.915 43.000 0.556 NA Y NA
 3476742 3476743 TBFG_10147 TBFG_10148     FALSE 0.437 95.000 0.444 NA N NA
 3476743 3476744 TBFG_10148 TBFG_10149     TRUE 0.756 75.000 0.875 1.000 N NA
 3476744 3476745 TBFG_10149 TBFG_10150     TRUE 0.956 7.000 0.700 1.000 N NA
 3476746 3476747 TBFG_10151 TBFG_10152     FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 3476747 3476748 TBFG_10152 TBFG_10153     FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3476748 3476749 TBFG_10153 TBFG_10154     FALSE 0.009 235.000 0.000 NA   NA
 3476749 3476750 TBFG_10154 TBFG_10155     TRUE 0.947 2.000 0.226 1.000 N NA
 3476751 3476752 TBFG_10156 TBFG_10157     TRUE 0.998 1.000 0.829 0.001   NA
 3476752 3476753 TBFG_10157 TBFG_10158     TRUE 0.997 -3.000 0.321 0.001   NA
 3476753 3476754 TBFG_10158 TBFG_10159     FALSE 0.002 306.000 0.000 1.000 N NA
 3476755 3476756 TBFG_10160 TBFG_10161     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 3476759 3476760 TBFG_10164 TBFG_10165     FALSE 0.257 54.000 0.020 NA   NA
 3476762 3476763 TBFG_10167 TBFG_10168     FALSE 0.123 204.000 0.000 NA Y NA
 3476763 3476764 TBFG_10168 TBFG_10169     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA Y NA
 3476764 3476765 TBFG_10169 TBFG_10170     TRUE 0.995 5.000 1.000 NA Y NA
 3476765 3476766 TBFG_10170 TBFG_10171     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.010 Y NA
 3476766 3476767 TBFG_10171 TBFG_10172     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 3476767 3476768 TBFG_10172 TBFG_10173     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 3476768 3476769 TBFG_10173 TBFG_10174     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.010 Y NA
 3476769 3476770 TBFG_10174 TBFG_10175     TRUE 0.997 -6.000 0.800 0.010 Y NA
 3476770 3476771 TBFG_10175 TBFG_10176     TRUE 0.612 36.000 0.286 NA   NA
 3476771 3476772 TBFG_10176 TBFG_10177     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 3476772 3476773 TBFG_10177 TBFG_10178     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3476773 3476774 TBFG_10178 TBFG_10179     TRUE 0.941 -33.000 1.000 NA   NA
 3476775 3476776 TBFG_10180 TBFG_10181     FALSE 0.508 80.000 0.333 NA   NA
 3476776 3476777 TBFG_10181 TBFG_10182     FALSE 0.221 27.000 0.000 NA   NA
 3476777 3476778 TBFG_10182 TBFG_10183     FALSE 0.288 17.000 0.000 NA   NA
 3476779 3476780 TBFG_10184 TBFG_10185     FALSE 0.379 42.000 0.068 NA   NA
 3476780 3476781 TBFG_10185 TBFG_10186     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 3476781 3476782 TBFG_10186 TBFG_10187     TRUE 0.616 45.000 0.273 1.000   NA
 3476782 3476783 TBFG_10187 TBFG_10188     FALSE 0.005 367.000 0.000 1.000   NA
 3476783 3476784 TBFG_10188 TBFG_10189     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 3476786 3476787 TBFG_10191 TBFG_10192     FALSE 0.145 128.000 0.125 NA   NA
 3476787 3476788 TBFG_10192 TBFG_10193     TRUE 0.552 77.000 0.375 NA   NA
 3476788 3476789 TBFG_10193 TBFG_10194     FALSE 0.093 90.000 0.000 NA   NA
 3476791 3476792 TBFG_10196 TBFG_10197     FALSE 0.001 374.000 0.000 1.000 N NA
 3476792 3476793 TBFG_10197 TBFG_10198     FALSE 0.281 113.000 0.000 0.059   NA
 3476793 3476794 TBFG_10198 TBFG_10199     TRUE 0.986 -3.000 0.276 1.000   NA
 3476796 3476797 TBFG_10201 TBFG_10202     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3476798 3476799 TBFG_10203 TBFG_10204     TRUE 0.989 3.000 0.750 1.000   NA
 3476803 3476804 TBFG_10208 TBFG_10209     FALSE 0.433 66.000 0.217 NA   NA
 3476804 3476805 TBFG_10209 TBFG_10210   trmB TRUE 0.888 3.000 0.040 NA   NA
 3476806 3476807 TBFG_10211 TBFG_10212     TRUE 0.992 -3.000 0.529 NA   NA
 3476807 3476808 TBFG_10212 TBFG_10213     FALSE 0.036 184.000 0.026 NA   NA
 3476809 3476810 TBFG_10214 TBFG_10215     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3476815 3476816 TBFG_10220 TBFG_10221     TRUE 0.965 2.000 0.273 NA   NA
 3476816 3476817 TBFG_10221 TBFG_10222     TRUE 0.781 10.000 0.182 NA   NA
 3476817 3476818 TBFG_10222 TBFG_10223     TRUE 0.867 44.000 1.000 NA   NA
 3476818 3476819 TBFG_10223 TBFG_10224     TRUE 0.685 31.000 0.333 NA   NA
 3476820 3476821 TBFG_10225 TBFG_10226     FALSE 0.272 99.000 0.104 1.000   NA
 3476823 3476824 TBFG_10228 TBFG_10229     TRUE 0.838 10.000 0.265 NA   NA
 3476826 3476827 TBFG_10231 TBFG_10232     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476828 3476829 TBFG_10233 TBFG_10234     FALSE 0.159 135.000 0.250 1.000 N NA
 3476829 3476830 TBFG_10234 TBFG_10235     TRUE 0.985 -3.000 0.357 1.000 N NA
 3476831 3476832 TBFG_10236 TBFG_10237 gabD1   FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3476832 3476833 TBFG_10237 TBFG_10238     FALSE 0.369 35.000 0.053 NA   NA
 3476833 3476834 TBFG_10238 TBFG_10239     TRUE 0.745 47.000 0.526 NA   NA
 3476835 3476836 TBFG_10240 TBFG_10241     FALSE 0.303 76.000 0.185 1.000 N NA
 3476836 3476837 TBFG_10241 TBFG_10242     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 3476837 3476838 TBFG_10242 TBFG_10243     FALSE 0.515 8.000 0.000 NA   NA
 3476839 3476840 TBFG_10244 TBFG_10245   fabG TRUE 0.968 11.000 0.412 1.000 Y NA
 3476843 3476844 TBFG_10248 TBFG_10249     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 3476845 3476846 TBFG_10250 TBFG_10251   sdhA TRUE 0.999 1.000 0.826 0.004 Y NA
 3476846 3476847 TBFG_10251 TBFG_10252 sdhA   TRUE 0.875 31.000 0.860 NA   NA
 3476847 3476848 TBFG_10252 TBFG_10253     FALSE 0.337 80.000 0.171 NA   NA
 3476848 3476849 TBFG_10253 TBFG_10254     FALSE 0.092 145.000 0.091 NA   NA
 3476850 3476851 TBFG_10255 TBFG_10256     TRUE 0.869 26.000 0.286 0.001 N NA
 3476852 3476853 TBFG_10257 TBFG_10258     TRUE 0.826 25.000 0.031 1.000 Y NA
 3476853 3476854 TBFG_10258 TBFG_10259     FALSE 0.027 19.000 0.000 NA N NA
 3476856 3476857 TBFG_10261 TBFG_10262     FALSE 0.232 25.000 0.000 NA   NA
 3476857 3476858 TBFG_10262 TBFG_10263     FALSE 0.530 25.000 0.071 1.000   NA
 3476858 3476859 TBFG_10263 TBFG_10264     TRUE 0.979 -3.000 0.173 1.000   NA
 3476859 3476860 TBFG_10264 TBFG_10265     FALSE 0.007 100.000 0.000 NA N NA
 3476860 3476861 TBFG_10265 TBFG_10266     FALSE 0.033 141.000 0.000 NA   NA
 3476861 3476862 TBFG_10266 TBFG_10267     TRUE 0.731 10.000 0.101 NA   NA
 3476862 3476863 TBFG_10267 TBFG_10268     TRUE 0.953 17.000 0.551 NA Y NA
 3476863 3476864 TBFG_10268 TBFG_10269     FALSE 0.178 75.000 0.050 1.000 N NA
 3476864 3476865 TBFG_10269 TBFG_10270     FALSE 0.107 22.000 0.000 1.000 N NA
 3476867 3476868 TBFG_10272 TBFG_10273     FALSE 0.011 65.000 0.000 NA N NA
 3476870 3476871 TBFG_10275 TBFG_10276     FALSE 0.058 114.000 0.000 NA   NA
 3476871 3476872 TBFG_10276 TBFG_10277     TRUE 0.996 -3.000 0.833 NA   NA
 3476876 3476877 TBFG_10281 TBFG_10282     FALSE 0.237 24.000 0.000 NA   NA
 3476877 3476878 TBFG_10282 TBFG_10283     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3476878 3476879 TBFG_10283 TBFG_10284     FALSE 0.307 -63.000 0.000 NA   NA
 3476879 3476880 TBFG_10284 TBFG_10285     FALSE 0.007 264.000 0.000 NA   NA
 3476880 3476881 TBFG_10285 TBFG_10286     FALSE 0.010 229.000 0.000 NA   NA
 3476882 3476883 TBFG_10287 TBFG_10288     TRUE 0.813 24.000 0.667 NA N NA
 3476883 3476884 TBFG_10288 TBFG_10289     FALSE 0.011 224.000 0.000 NA   NA
 3476884 3476885 TBFG_10289 TBFG_10290     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3476885 3476886 TBFG_10290 TBFG_10291     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 3476886 3476887 TBFG_10291 TBFG_10292     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 3476887 3476888 TBFG_10292 TBFG_10293     TRUE 0.979 3.000 0.500 NA   NA
 3476888 3476889 TBFG_10293 TBFG_10294     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 3476889 3476890 TBFG_10294 TBFG_10295     FALSE 0.211 30.000 0.000 NA   NA
 3476890 3476891 TBFG_10295 TBFG_10296     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3476891 3476892 TBFG_10296 TBFG_10297     TRUE 0.837 47.000 0.818 NA   NA
 3476892 3476893 TBFG_10297 TBFG_10298     TRUE 0.993 -3.000 0.556 NA   NA
 3476893 3476894 TBFG_10298 TBFG_10299     TRUE 0.993 -3.000 0.556 NA   NA
 3476897 3476898 TBFG_10302 TBFG_10303     TRUE 0.741 10.000 0.118 NA   NA
 3476899 3476900 TBFG_10304 TBFG_10305     FALSE 0.050 143.000 0.000 1.000   NA
 3476900 3476901 TBFG_10305 TBFG_10306     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3476901 3476902 TBFG_10306 TBFG_10307     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 3476902 3476903 TBFG_10307 TBFG_10308     FALSE 0.038 136.000 0.000 NA   NA
 3476903 3476904 TBFG_10308 TBFG_10309     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3476908 3476909 TBFG_10313 TBFG_10314     FALSE 0.190 102.000 0.067 NA   NA
 3476911 3476912 TBFG_10316 TBFG_10317     FALSE 0.212 155.000 0.333 1.000   NA
 3476912 3476913 TBFG_10317 TBFG_10318     FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 3476915 3476916 TBFG_10320 TBFG_10321     FALSE 0.519 49.000 0.286 1.000 N NA
 3476917 3476918 TBFG_10322 TBFG_14004     FALSE 0.007 258.000 0.000 NA   NA
 3476918 3476919 TBFG_14004 TBFG_10323     FALSE 0.205 31.000 0.000 NA   NA
 3476920 3476921 TBFG_10324 TBFG_10325     FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 3476921 3476922 TBFG_10325 TBFG_10326   dcd FALSE 0.292 32.000 0.007 NA   NA
 3476922 3476923 TBFG_10326 TBFG_10327 dcd   FALSE 0.027 106.000 0.000 1.000 N NA
 3476925 3476926 TBFG_10329 TBFG_10330     TRUE 0.555 7.000 0.000 NA   NA
 3476926 3476927 TBFG_10330 TBFG_10331     FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3476930 3476931 TBFG_10334 TBFG_10335     FALSE 0.312 27.000 0.000 1.000   NA
 3476932 3476933 TBFG_10336 TBFG_10337     FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 3476933 3476934 TBFG_10337 TBFG_10338     TRUE 0.728 27.000 0.368 NA   NA
 3476934 3476935 TBFG_10338 TBFG_10339     TRUE 0.634 30.000 0.273 NA   NA
 3476938 3476939 TBFG_10342 TBFG_10343     FALSE 0.242 31.000 0.023 1.000 N NA
 3476939 3476940 TBFG_10343 TBFG_10344     FALSE 0.111 109.000 0.057 1.000 N NA
 3476941 3476942 TBFG_10345 TBFG_10346     FALSE 0.104 189.000 0.286 NA   NA
 3476942 3476943 TBFG_10346 TBFG_10347     TRUE 0.779 37.000 0.500 1.000   NA
 3476943 3476944 TBFG_10347 TBFG_10348     TRUE 0.998 -3.000 0.583 0.006   NA
 3476948 3476949 TBFG_10352 TBFG_10353     TRUE 0.775 3.000 0.000 NA   NA
 3476949 3476950 TBFG_10353 TBFG_10354     TRUE 0.775 3.000 0.000 NA   NA
 3476950 3476951 TBFG_10354 TBFG_10355     FALSE 0.010 227.000 0.000 NA   NA
 3476951 3476952 TBFG_10355 TBFG_10356     TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.005 Y NA
 3476952 3476953 TBFG_10356 TBFG_10357     TRUE 0.915 36.000 0.068 0.005 Y NA
 3476953 3476954 TBFG_10357 TBFG_10358     TRUE 0.930 0.000 0.074 1.000 N NA
 3476955 3476956 TBFG_10359 TBFG_10360     FALSE 0.103 83.000 0.000 NA   NA
 3476956 3476957 TBFG_10360 TBFG_10361     FALSE 0.028 151.000 0.000 NA   NA
 3476957 3476958 TBFG_10361 TBFG_10362     TRUE 0.605 12.000 0.052 NA   NA
 3476959 3476960 TBFG_10363 TBFG_10364     TRUE 0.578 11.000 0.020 NA   NA
 3476962 3476963 TBFG_10366 TBFG_10367     FALSE 0.011 222.000 0.000 NA   NA
 3476966 3476967 TBFG_10370 TBFG_10371     TRUE 0.656 25.000 0.000 0.056   NA
 3476967 3476968 TBFG_10371 TBFG_10372     FALSE 0.481 29.000 0.111 NA   NA
 3476968 3476969 TBFG_10372 TBFG_10373     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 3476969 3476970 TBFG_10373 TBFG_10374     TRUE 0.883 6.000 0.208 NA   NA
 3476970 3476971 TBFG_10374 TBFG_10375     TRUE 0.754 14.000 0.250 NA   NA
 3476971 3476972 TBFG_10375 TBFG_10376     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 3476972 3476973 TBFG_10376 TBFG_10377     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 3476973 3476974 TBFG_10377 TBFG_10378     TRUE 0.857 19.000 0.750 NA N NA
 3476974 3476975 TBFG_10378 TBFG_10379     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.001 Y NA
 3476975 3476976 TBFG_10379 TBFG_10380     TRUE 0.993 15.000 0.909 0.001 Y NA
 3476976 3476977 TBFG_10380 TBFG_10381     FALSE 0.470 34.000 0.250 NA N NA
 3476978 3476979 TBFG_10382 TBFG_10383     FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 3476979 3476980 TBFG_10383 TBFG_10384     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 3476981 3476982 TBFG_10385 TBFG_10386     TRUE 0.688 -15.000 0.055 NA   NA
 3476982 3476983 TBFG_10386 TBFG_10387   pyrE FALSE 0.402 18.000 0.012 NA   NA
 3476983 3476984 TBFG_10387 TBFG_10388 pyrE   FALSE 0.165 81.000 0.006 NA   NA
 3476984 3476985 TBFG_10388 TBFG_10389     FALSE 0.055 141.000 0.009 NA   NA
 3476986 3476987 TBFG_10390 TBFG_10391     FALSE 0.029 104.000 0.000 1.000 N NA
 3476989 3476990 TBFG_10393 TBFG_10394 purT   TRUE 0.850 -3.000 0.019 NA N NA
 3476990 3476991 TBFG_10394 TBFG_10395     TRUE 0.935 -3.000 0.092 NA N NA
 3476995 3476996 TBFG_10399 TBFG_10400     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 3476996 3476997 TBFG_10400 TBFG_10401     FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 3476997 3476998 TBFG_10401 TBFG_10402     FALSE 0.013 210.000 0.000 NA   NA
 3476999 3477000 TBFG_10403 TBFG_10404     TRUE 0.881 7.000 0.250 NA   NA
 3477000 3477001 TBFG_10404 TBFG_10405     FALSE 0.232 10.000 0.000 1.000 N NA
 3477003 3477004 TBFG_10407 TBFG_10408     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3477005 3477006 TBFG_10409 TBFG_10410     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3477008 3477009 TBFG_10412 TBFG_10413     TRUE 0.792 -7.000 0.021 1.000   NA
 3477009 3477010 TBFG_10413 TBFG_10414     TRUE 0.885 -7.000 0.185 1.000   NA
 3477011 3477012 TBFG_10415 TBFG_10416     TRUE 0.998 0.000 0.622 1.000 Y NA
 3477012 3477013 TBFG_10416 TBFG_10417     TRUE 0.995 0.000 0.895 NA   NA
 3477016 3477017 TBFG_10420 TBFG_10421     TRUE 0.992 -3.000 0.625 1.000 N NA
 3477017 3477018 TBFG_10421 TBFG_10422   thiG TRUE 0.965 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 3477018 3477019 TBFG_10422 TBFG_10423 thiG   FALSE 0.005 372.000 0.000 1.000   NA
 3477019 3477020 TBFG_10423 TBFG_10424     FALSE 0.423 88.000 0.000 0.032   NA
 3477021 3477022 TBFG_10425 TBFG_10426     FALSE 0.024 161.000 0.000 NA   NA
 3477022 3477023 TBFG_10426 TBFG_10427     TRUE 0.959 -3.000 0.059 NA   NA
 3477023 3477024 TBFG_10427 TBFG_10428     TRUE 0.917 27.000 0.015 0.006 Y NA
 3477024 3477025 TBFG_10428 TBFG_10429     FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 3477025 3477026 TBFG_10429 TBFG_10430     TRUE 0.721 50.000 0.500 NA   NA
 3477026 3477027 TBFG_10430 TBFG_10431     FALSE 0.519 52.000 0.250 NA   NA
 3477027 3477028 TBFG_10431 TBFG_10432     FALSE 0.209 69.000 0.015 NA   NA
 3477028 3477029 TBFG_10432 TBFG_10433     TRUE 0.915 3.000 0.088 NA   NA
 3477029 3477030 TBFG_10433 TBFG_10434   def TRUE 0.988 0.000 0.488 NA   NA
 3477031 3477032 TBFG_10435 TBFG_10436     FALSE 0.511 32.000 0.176 NA   NA
 3477032 3477033 TBFG_10436 TBFG_10437     TRUE 0.764 33.000 0.500 NA   NA
 3477033 3477034 TBFG_10437 TBFG_10438     TRUE 0.950 2.000 0.128 1.000   NA
 3477034 3477035 TBFG_10438 TBFG_10439     FALSE 0.282 60.000 0.010 1.000   NA
 3477036 3477037 TBFG_10440 TBFG_10441     TRUE 0.920 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3477037 3477038 TBFG_10441 TBFG_10442     TRUE 0.998 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 3477038 3477039 TBFG_10442 TBFG_10443     FALSE 0.157 61.000 0.018 1.000 N NA
 3477039 3477040 TBFG_10443 TBFG_10444     TRUE 0.664 19.000 0.188 1.000   NA
 3477042 3477043 TBFG_10446 TBFG_10447     FALSE 0.127 68.000 0.000 NA   NA
 3477045 3477046 TBFG_10449 TBFG_10450     FALSE 0.402 44.000 0.091 NA   NA
 3477046 3477047 TBFG_10450 TBFG_10451     FALSE 0.350 49.000 0.065 NA   NA
 3477047 3477048 TBFG_10451 TBFG_10452     FALSE 0.271 58.000 0.032 NA   NA
 3477048 3477049 TBFG_10452 TBFG_10453     TRUE 0.965 -3.000 0.081 NA   NA
 3477049 3477050 TBFG_10453 TBFG_10454     TRUE 0.961 -3.000 0.067 NA   NA
 3477050 3477051 TBFG_10454 TBFG_10455     TRUE 0.973 -6.000 0.722 NA   NA
 3477051 3477052 TBFG_10455 TBFG_10456     FALSE 0.339 40.000 0.007 1.000   NA
 3477052 3477053 TBFG_10456 TBFG_10457     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3477054 3477055 TBFG_10458 TBFG_10459     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 3477056 3477057 TBFG_10460 TBFG_10461     FALSE 0.008 253.000 0.000 NA   NA
 3477057 3477058 TBFG_10461 TBFG_10462     FALSE 0.251 68.000 0.039 NA   NA
 3477058 3477059 TBFG_10462 TBFG_10463     FALSE 0.010 273.000 0.000 1.000   NA
 3477059 3477060 TBFG_10463 TBFG_10464     FALSE 0.016 229.000 0.000 1.000   NA
 3477061 3477062 TBFG_10465 TBFG_10466     TRUE 0.927 0.000 0.021 NA   NA
 3477062 3477063 TBFG_10466 TBFG_10467     FALSE 0.442 21.000 0.042 NA   NA
 3477063 3477064 TBFG_10467 TBFG_10468     TRUE 0.874 38.000 1.000 NA   NA
 3477064 3477065 TBFG_10468 TBFG_10469     FALSE 0.227 64.000 0.017 NA   NA
 3477065 3477066 TBFG_10469 TBFG_10470     TRUE 0.692 8.000 0.028 NA   NA
 3477067 3477068 TBFG_10471 TBFG_10472     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 3477069 3477070 TBFG_10473 TBFG_10474     FALSE 0.002 275.000 0.000 1.000 N NA
 3477070 3477071 TBFG_10474 TBFG_10475     FALSE 0.146 82.000 0.036 1.000 N NA
 3477071 3477072 TBFG_10475 TBFG_10476     FALSE 0.138 115.000 0.130 1.000 N NA
 3477073 3477074 TBFG_10477 TBFG_10478     FALSE 0.050 143.000 0.000 1.000   NA
 3477074 3477075 TBFG_10478 TBFG_10479     FALSE 0.299 -69.000 0.000 NA   NA
 3477075 3477076 TBFG_10479 TBFG_10480     FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3477077 3477078 TBFG_10481 TBFG_10482     FALSE 0.205 87.000 0.047 NA   NA
 3477078 3477079 TBFG_10482 TBFG_10483     FALSE 0.024 354.000 0.282 NA   NA
 3477079 3477080 TBFG_10483 TBFG_10484     FALSE 0.292 112.000 0.270 NA   NA
 3477080 3477081 TBFG_10484 TBFG_10485     TRUE 0.886 5.000 0.143 NA   NA
 3477081 3477082 TBFG_10485 TBFG_10486     TRUE 0.933 0.000 0.030 NA   NA
 3477083 3477084 TBFG_10487 TBFG_10488     TRUE 0.966 -3.000 0.091 NA   NA
 3477084 3477085 TBFG_10488 TBFG_10489     FALSE 0.047 182.000 0.061 NA   NA
 3477086 3477087 TBFG_10490 TBFG_10491 murB   FALSE 0.261 62.000 0.036 NA   NA
 3477089 3477090 TBFG_10493 TBFG_10494     FALSE 0.234 48.000 0.082 NA N NA
 3477090 3477091 TBFG_10494 TBFG_10495     TRUE 0.992 -3.000 0.541 NA   NA
 3477091 3477092 TBFG_10495 TBFG_10496     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 3477092 3477093 TBFG_10496 TBFG_10497     FALSE 0.040 157.000 0.000 1.000   NA
 3477093 3477094 TBFG_10497 TBFG_10498     FALSE 0.068 174.000 0.196 1.000 N NA
 3477094 3477095 TBFG_10498 TBFG_10499     FALSE 0.381 204.000 0.437 1.000 Y NA
 3477096 3477097 TBFG_10500 TBFG_10501     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 3477097 3477098 TBFG_10501 TBFG_10502     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 3477101 3477102 TBFG_10505 TBFG_10506     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 3477102 3477103 TBFG_10506 TBFG_10507     TRUE 0.612 16.000 0.127 NA   NA
 3477103 3477104 TBFG_10507 TBFG_10508     TRUE 0.570 16.000 0.076 NA   NA
 3477104 3477105 TBFG_10508 TBFG_10509     TRUE 0.585 25.000 0.143 1.000   NA
 3477105 3477106 TBFG_10509 TBFG_10510     FALSE 0.158 141.000 0.186 1.000   NA
 3477106 3477107 TBFG_10510 TBFG_10511     FALSE 0.537 44.000 0.233 NA   NA
 3477107 3477108 TBFG_10511 TBFG_10512     FALSE 0.535 78.000 0.356 NA   NA
 3477108 3477109 TBFG_10512 TBFG_10513     TRUE 0.962 7.000 0.796 1.000 N NA
 3477110 3477111 TBFG_10514 TBFG_10515     TRUE 0.853 -37.000 0.400 1.000   NA
 3477111 3477112 TBFG_10515 TBFG_10516     FALSE 0.102 162.000 0.145 1.000   NA
 3477113 3477114 TBFG_10517 TBFG_10518     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3477114 3477115 TBFG_10518 TBFG_10519     TRUE 0.703 -7.000 0.007 NA   NA
 3477115 3477116 TBFG_10519 TBFG_10520   hemA FALSE 0.255 50.000 0.012 NA   NA
 3477116 3477117 TBFG_10520 TBFG_10521 hemA hemC TRUE 0.982 10.000 0.178 0.002 Y NA
 3477117 3477118 TBFG_10521 TBFG_10522 hemC   TRUE 0.923 33.000 0.044 0.002 Y NA
 3477118 3477119 TBFG_10522 TBFG_10523     TRUE 0.931 86.000 0.429 0.002 Y NA
 3477119 3477120 TBFG_10523 TBFG_10524     TRUE 0.560 13.000 0.039 NA   NA
 3477120 3477121 TBFG_10524 TBFG_10525     TRUE 0.989 -3.000 0.389 NA   NA
 3477121 3477122 TBFG_10525 TBFG_10526     FALSE 0.030 147.000 0.000 NA   NA
 3477124 3477125 TBFG_10528 TBFG_10529     FALSE 0.228 132.000 0.333 1.000 N NA
 3477127 3477128 TBFG_10531 TBFG_10532     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 3477128 3477129 TBFG_10532 TBFG_10533     FALSE 0.039 135.000 0.000 NA   NA
 3477131 3477132 TBFG_10535 TBFG_10536     TRUE 0.949 0.000 0.204 NA N NA
 3477132 3477133 TBFG_10536 TBFG_10537     FALSE 0.292 15.000 0.035 NA N NA
 3477133 3477134 TBFG_10537 TBFG_10538     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3477134 3477135 TBFG_10538 TBFG_10539     TRUE 0.809 33.000 0.131 NA Y NA
 3477135 3477136 TBFG_10539 TBFG_10540     TRUE 0.993 -3.000 0.082 NA Y NA
 3477136 3477137 TBFG_10540 TBFG_10541     TRUE 0.571 42.000 0.308 1.000 N NA
 3477137 3477138 TBFG_10541 TBFG_10542     FALSE 0.013 205.000 0.000 NA   NA
 3477138 3477139 TBFG_10542 TBFG_10543     FALSE 0.030 147.000 0.000 NA   NA
 3477140 3477141 TBFG_10544 TBFG_10545     FALSE 0.107 82.000 0.011 1.000 N NA
 3477142 3477143 TBFG_10546 TBFG_10547     TRUE 0.895 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3477145 3477146 TBFG_10549 TBFG_10550     FALSE 0.296 57.000 0.048 NA   NA
 3477146 3477147 TBFG_10550 TBFG_10551     TRUE 0.968 -3.000 0.109 NA   NA
 3477148 3477149 TBFG_10552 TBFG_10553     FALSE 0.507 12.000 0.008 NA   NA
 3477149 3477150 TBFG_10553 TBFG_10554     FALSE 0.226 69.000 0.024 NA   NA
 3477150 3477151 TBFG_10554 TBFG_10555     FALSE 0.141 60.000 0.000 NA   NA
 3477151 3477152 TBFG_10555 TBFG_10556     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477152 3477153 TBFG_10556 TBFG_10557     FALSE 0.180 120.000 0.167 NA   NA
 3477153 3477154 TBFG_10557 TBFG_10558     FALSE 0.307 63.000 0.069 NA   NA
 3477154 3477155 TBFG_10558 TBFG_10559     FALSE 0.180 96.000 0.008 1.000   NA
 3477155 3477156 TBFG_10559 TBFG_10560     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3477156 3477157 TBFG_10560 TBFG_10561     FALSE 0.002 455.000 0.000 NA   NA
 3477158 3477159 TBFG_10562 TBFG_10563     TRUE 0.962 -3.000 0.028 1.000   NA
 3477159 3477160 TBFG_10563 TBFG_10564     TRUE 0.988 -3.000 0.038 0.054   NA
 3477160 3477161 TBFG_10564 TBFG_10565     FALSE 0.365 43.000 0.022 1.000   NA
 3477161 3477162 TBFG_10565 TBFG_10566     TRUE 0.958 -3.000 0.055 NA   NA
 3477162 3477163 TBFG_10566 TBFG_10567     FALSE 0.495 62.000 0.259 NA   NA
 3477163 3477164 TBFG_10567 TBFG_10568   ubiE FALSE 0.303 17.000 0.013 1.000 N NA
 3477165 3477166 TBFG_10569 TBFG_10570     TRUE 0.553 34.000 0.222 NA   NA
 3477166 3477167 TBFG_10570 TBFG_10571     FALSE 0.290 25.000 0.029 1.000 N NA
 3477168 3477169 TBFG_10572 TBFG_10573     FALSE 0.116 101.000 0.042 1.000 N NA
 3477170 3477171 TBFG_10574 TBFG_10575     FALSE 0.299 61.000 0.133 1.000 N NA
 3477171 3477172 TBFG_10575 TBFG_10576     FALSE 0.169 78.000 0.005 NA   NA
 3477173 3477174 TBFG_14005 TBFG_10577     FALSE 0.044 129.000 0.000 NA   NA
 3477174 3477175 TBFG_10577 TBFG_10578     FALSE 0.024 110.000 0.000 1.000 N NA
 3477175 3477176 TBFG_10578 TBFG_10579     FALSE 0.039 135.000 0.000 NA   NA
 3477176 3477177 TBFG_10579 TBFG_10580     TRUE 0.668 26.000 0.286 NA   NA
 3477178 3477179 TBFG_10581 TBFG_10582     FALSE 0.011 224.000 0.000 NA   NA
 3477179 3477180 TBFG_10582 TBFG_10583     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 3477180 3477181 TBFG_10583 TBFG_10584     FALSE 0.059 10.000 0.000 NA N NA
 3477181 3477182 TBFG_10584 TBFG_10585     FALSE 0.001 185.000 0.000 NA N NA
 3477183 3477184 TBFG_10586 TBFG_10587     TRUE 0.610 14.000 0.080 NA   NA
 3477186 3477187 TBFG_10589 TBFG_10590     FALSE 0.295 -72.000 0.000 NA   NA
 3477189 3477190 TBFG_10592 TBFG_10593     TRUE 0.975 -3.000 0.182 NA   NA
 3477194 3477195 TBFG_10597 TBFG_10598     TRUE 0.850 -3.000 0.019 NA N NA
 3477195 3477196 TBFG_10598 TBFG_10599     TRUE 0.993 2.000 0.333 NA Y NA
 3477196 3477197 TBFG_10599 TBFG_10600     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 3477197 3477198 TBFG_10600 TBFG_10601     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.009 Y NA
 3477198 3477199 TBFG_10601 TBFG_10602     FALSE 0.314 -51.000 0.000 NA   NA
 3477199 3477200 TBFG_10602 TBFG_10603     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477200 3477201 TBFG_10603 TBFG_10604     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.009 Y NA
 3477201 3477202 TBFG_10604 TBFG_10605     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.009 Y NA
 3477202 3477203 TBFG_10605 TBFG_10606     TRUE 0.996 5.000 0.500 0.009 Y NA
 3477204 3477205 TBFG_10607 TBFG_10608     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477205 3477206 TBFG_10608 TBFG_10609     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3477206 3477207 TBFG_10609 TBFG_10610     FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 3477207 3477208 TBFG_10610 TBFG_10611     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 3477208 3477209 TBFG_10611 TBFG_10612     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3477209 3477210 TBFG_10612 TBFG_10613     TRUE 0.981 1.000 0.364 1.000   NA
 3477211 3477212 TBFG_10614 TBFG_10615     FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 3477212 3477213 TBFG_10615 TBFG_10616     FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3477213 3477214 TBFG_10616 TBFG_10617     TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 3477214 3477215 TBFG_10617 TBFG_10618     FALSE 0.344 -30.000 0.000 NA   NA
 3477215 3477216 TBFG_10618 TBFG_10619     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 3477216 3477217 TBFG_10619 TBFG_10620     TRUE 0.983 -3.000 0.273 NA   NA
 3477218 3477219 TBFG_10621 TBFG_10622     FALSE 0.154 52.000 0.000 NA   NA
 3477222 3477223 TBFG_10625 TBFG_10626     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3477225 3477226 TBFG_10628 TBFG_10629     FALSE 0.044 129.000 0.000 NA   NA
 3477226 3477227 TBFG_10629 TBFG_10630     TRUE 0.815 18.000 0.000 0.001   NA
 3477227 3477228 TBFG_10630 TBFG_10631     TRUE 0.997 -3.000 0.370 0.001   NA
 3477228 3477229 TBFG_10631 TBFG_10632     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 3477229 3477230 TBFG_10632 TBFG_10633     FALSE 0.407 104.000 0.333 NA   NA
 3477230 3477231 TBFG_10633 TBFG_10634     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 3477231 3477232 TBFG_10634 TBFG_10635     TRUE 0.968 0.000 0.200 NA   NA
 3477234 3477235 TBFG_10637 TBFG_10638     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3477236 3477237 TBFG_10639 TBFG_10640     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 3477237 3477238 TBFG_10640 TBFG_10641     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 3477238 3477239 TBFG_10641 TBFG_10642     TRUE 0.999 0.000 0.542 0.001 Y NA
 3477239 3477240 TBFG_10642 TBFG_10643     FALSE 0.002 277.000 0.000 1.000 N NA
 3477240 3477241 TBFG_10643 TBFG_10644     FALSE 0.354 49.000 0.067 NA   NA
 3477241 3477242 TBFG_10644 TBFG_10645     FALSE 0.043 154.000 0.006 NA   NA
 3477243 3477244 TBFG_10646 TBFG_14006     FALSE 0.043 130.000 0.000 NA   NA
 3477244 3477245 TBFG_14006 TBFG_14007     FALSE 0.185 37.000 0.000 NA   NA
 3477245 3477246 TBFG_14007 TBFG_10647   rpmG FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3477246 3477247 TBFG_10647 TBFG_10648 rpmG   FALSE 0.361 51.000 0.079 NA   NA
 3477247 3477248 TBFG_10648 TBFG_10649     TRUE 0.959 -13.000 0.818 NA   NA
 3477248 3477249 TBFG_10649 TBFG_10650     TRUE 0.995 4.000 0.818 NA Y NA
 3477249 3477250 TBFG_10650 TBFG_14008     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 3477250 3477251 TBFG_14008 TBFG_10651   secE FALSE 0.033 141.000 0.000 NA   NA
 3477251 3477252 TBFG_10651 TBFG_10652 secE nusG FALSE 0.187 32.000 0.006 1.000 N NA
 3477252 3477253 TBFG_10652 TBFG_10653 nusG rplK TRUE 0.754 52.000 0.681 1.000 N NA
 3477253 3477254 TBFG_10653 TBFG_10654 rplK rplA TRUE 0.966 67.000 0.838 0.022 Y NA
 3477255 3477256 TBFG_10655 TBFG_10656     TRUE 0.914 74.000 0.286 0.004 Y NA
 3477256 3477257 TBFG_10656 TBFG_10657     TRUE 0.871 136.000 0.667 0.004 Y NA
 3477257 3477258 TBFG_10657 TBFG_10658     TRUE 0.854 119.000 0.400 0.004 Y NA
 3477258 3477259 TBFG_10658 TBFG_10659     TRUE 0.824 17.000 0.444 NA   NA
 3477259 3477260 TBFG_10659 TBFG_10660     TRUE 0.778 12.000 0.243 NA   NA
 3477261 3477262 TBFG_10661 TBFG_10662     TRUE 0.996 -3.000 0.857 1.000   NA
 3477262 3477263 TBFG_10662 TBFG_10663     TRUE 0.911 0.000 0.000 1.000   NA
 3477263 3477264 TBFG_10663 TBFG_10664   rplJ FALSE 0.002 331.000 0.000 1.000 N NA
 3477264 3477265 TBFG_10664 TBFG_10665 rplJ rplL TRUE 0.979 37.000 0.884 0.017 Y NA
 3477267 3477268 TBFG_10667 TBFG_10668     FALSE 0.355 12.000 0.038 NA N NA
 3477269 3477270 TBFG_10669 TBFG_10670     FALSE 0.087 95.000 0.000 NA   NA
 3477270 3477271 TBFG_10670 TBFG_10671     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 3477271 3477272 TBFG_10671 TBFG_10672     FALSE 0.006 276.000 0.000 NA   NA
 3477272 3477273 TBFG_10672 TBFG_10673     TRUE 0.594 -13.000 0.000 1.000   NA
 3477273 3477274 TBFG_10673 TBFG_10674     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 3477274 3477275 TBFG_10674 TBFG_10675     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477276 3477277 TBFG_10676 TBFG_10677     FALSE 0.199 32.000 0.000 NA   NA
 3477277 3477278 TBFG_10677 TBFG_10678     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477278 3477279 TBFG_10678 TBFG_10679     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477279 3477280 TBFG_10679 TBFG_10680     FALSE 0.462 -15.000 0.000 NA   NA
 3477280 3477281 TBFG_10680 TBFG_10681   rpoB FALSE 0.007 265.000 0.000 NA   NA
 3477281 3477282 TBFG_10681 TBFG_10682 rpoB   TRUE 0.983 45.000 0.851 0.001 Y NA
 3477284 3477285 TBFG_10684 TBFG_10685     FALSE 0.176 32.000 0.004 1.000 N NA
 3477285 3477286 TBFG_10685 TBFG_10686     FALSE 0.249 60.000 0.071 1.000 N NA
 3477286 3477287 TBFG_10686 TBFG_10687     TRUE 0.956 11.000 0.286 1.000 Y NA
 3477287 3477288 TBFG_10687 TBFG_10688     TRUE 0.941 3.000 0.292 NA N NA
 3477288 3477289 TBFG_10688 TBFG_10689     TRUE 0.932 -3.000 0.083 NA N NA
 3477290 3477291 TBFG_10690 TBFG_10691     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3477293 3477294 TBFG_10693 TBFG_10694     TRUE 0.990 2.000 0.778 NA   NA
 3477295 3477296 TBFG_10695 TBFG_10696   rpsL FALSE 0.003 249.000 0.000 1.000 N NA
 3477296 3477297 TBFG_10696 TBFG_10697 rpsL   TRUE 0.999 0.000 0.620 0.003 Y NA
 3477297 3477298 TBFG_10697 TBFG_10698     TRUE 0.876 81.000 0.579 1.000 Y NA
 3477298 3477299 TBFG_10698 TBFG_10699     TRUE 0.558 231.000 0.400 0.001 Y NA
 3477299 3477300 TBFG_10699 TBFG_10700     FALSE 0.036 138.000 0.000 NA   NA
 3477300 3477301 TBFG_10700 TBFG_10701   fabG FALSE 0.191 153.000 0.333 NA   NA
 3477301 3477302 TBFG_10701 TBFG_10702 fabG   TRUE 0.883 14.000 0.214 0.056   NA
 3477303 3477304 TBFG_10703 TBFG_10704     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 3477304 3477305 TBFG_10704 TBFG_10705     TRUE 0.965 -3.000 0.088 NA   NA
 3477306 3477307 TBFG_10706 TBFG_10707     TRUE 0.991 -3.000 0.484 NA   NA
 3477307 3477308 TBFG_10707 TBFG_10708     TRUE 0.983 3.000 0.548 1.000   NA
 3477308 3477309 TBFG_10708 TBFG_10709     FALSE 0.188 190.000 0.464 1.000   NA
 3477309 3477310 TBFG_10709 TBFG_10710     TRUE 0.693 49.000 0.440 NA   NA
 3477310 3477311 TBFG_10710 TBFG_10711     TRUE 0.988 2.000 0.667 NA   NA
 3477311 3477312 TBFG_10711 TBFG_10712     FALSE 0.002 461.000 0.000 NA   NA
 3477314 3477315 TBFG_10714 TBFG_10715 rpsJ rplC TRUE 0.976 17.000 0.467 0.022 Y NA
 3477315 3477316 TBFG_10715 TBFG_10716 rplC rplD TRUE 0.998 0.000 0.361 0.017 Y NA
 3477316 3477317 TBFG_10716 TBFG_10717 rplD rplW TRUE 0.999 0.000 0.513 0.017 Y NA
 3477317 3477318 TBFG_10717 TBFG_10718 rplW rplB TRUE 0.749 201.000 0.849 0.014 Y NA
 3477318 3477319 TBFG_10718 TBFG_10719 rplB rpsS TRUE 0.976 41.000 0.820 0.022 Y NA
 3477319 3477320 TBFG_10719 TBFG_10720 rpsS rplV TRUE 0.999 -3.000 0.769 0.022 Y NA
 3477320 3477321 TBFG_10720 TBFG_10721 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.022 Y NA
 3477321 3477322 TBFG_10721 TBFG_10722 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.022 Y NA
 3477322 3477323 TBFG_10722 TBFG_10723 rplP   TRUE 0.999 0.000 0.802 0.017 Y NA
 3477323 3477324 TBFG_10723 TBFG_10724   rpsQ TRUE 0.999 0.000 0.828 0.017 Y NA
 3477324 3477325 TBFG_10724 TBFG_10725 rpsQ   FALSE 0.019 169.000 0.005 1.000 N NA
 3477325 3477326 TBFG_10725 TBFG_10726     TRUE 0.544 48.000 0.250 NA   NA
 3477326 3477327 TBFG_10726 TBFG_10727     FALSE 0.077 301.000 0.600 NA   NA
 3477327 3477328 TBFG_10727 TBFG_10728   rplN FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 3477328 3477329 TBFG_10728 TBFG_10729 rplN rplX TRUE 0.999 1.000 0.810 0.022 Y NA
 3477329 3477330 TBFG_10729 TBFG_10730 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.017 Y NA
 3477330 3477331 TBFG_10730 TBFG_10731 rplE rpsN TRUE 0.995 5.000 0.496 0.017 Y NA
 3477331 3477332 TBFG_10731 TBFG_10732 rpsN rpsH TRUE 0.706 164.000 0.473 0.017 Y NA
 3477332 3477333 TBFG_10732 TBFG_10733 rpsH rplF TRUE 0.983 24.000 0.808 0.017 Y NA
 3477333 3477334 TBFG_10733 TBFG_10734 rplF rplR TRUE 0.998 3.000 0.815 0.017 Y NA
 3477334 3477335 TBFG_10734 TBFG_10735 rplR rpsE TRUE 0.985 20.000 0.814 0.022 Y NA
 3477335 3477336 TBFG_10735 TBFG_10736 rpsE rpmD TRUE 0.998 3.000 0.789 0.022 Y NA
 3477336 3477337 TBFG_10736 TBFG_10737 rpmD rplO TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 3477337 3477338 TBFG_10737 TBFG_10738 rplO   FALSE 0.081 33.000 0.000 1.000 N NA
 3477339 3477340 TBFG_10739 TBFG_10740     FALSE 0.500 93.000 0.000 NA Y NA
 3477340 3477341 TBFG_10740 TBFG_10741     FALSE 0.001 203.000 0.000 NA N NA
 3477341 3477342 TBFG_10741 TBFG_10742     TRUE 0.941 -3.000 0.058 1.000 N NA
 3477343 3477344 TBFG_10743 TBFG_10744     TRUE 0.592 13.000 0.018 1.000   NA
 3477346 3477347 TBFG_10746 TBFG_10747 secY adk TRUE 0.940 -3.000 0.057 1.000 N NA
 3477347 3477348 TBFG_10747 TBFG_10748 adk   TRUE 0.980 3.000 0.606 1.000 N NA
 3477348 3477349 TBFG_10748 TBFG_10749     FALSE 0.242 73.000 0.099 1.000 N NA
 3477349 3477350 TBFG_10749 TBFG_10750     TRUE 0.910 64.000 0.697 NA Y NA
 3477350 3477351 TBFG_10750 TBFG_10751     FALSE 0.067 315.000 0.065 NA Y NA
 3477351 3477352 TBFG_10751 TBFG_10752     FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 3477352 3477353 TBFG_10752 TBFG_10753     FALSE 0.008 248.000 0.000 NA   NA
 3477353 3477354 TBFG_10753 TBFG_10754     FALSE 0.191 34.000 0.000 NA   NA
 3477354 3477355 TBFG_10754 TBFG_10755     FALSE 0.010 231.000 0.000 NA   NA
 3477355 3477356 TBFG_10755 TBFG_10756     FALSE 0.033 142.000 0.000 NA   NA
 3477357 3477358 TBFG_10757 TBFG_10758     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477359 3477360 TBFG_10759 TBFG_10760     FALSE 0.259 20.000 0.000 NA   NA
 3477360 3477361 TBFG_10760 TBFG_10761     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 3477361 3477362 TBFG_10761 TBFG_10762     FALSE 0.138 91.000 0.000 1.000   NA
 3477362 3477363 TBFG_10762 TBFG_10763     FALSE 0.237 24.000 0.000 NA   NA
 3477363 3477364 TBFG_10763 TBFG_10764     FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 3477365 3477366 TBFG_10765 TBFG_10766     TRUE 0.921 11.000 0.051 1.000 Y NA
 3477366 3477367 TBFG_10766 TBFG_10767     TRUE 0.813 7.000 0.197 1.000 N NA
 3477369 3477370 TBFG_10769 TBFG_10770     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 3477370 3477371 TBFG_10770 TBFG_14009     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
 3477371 3477372 TBFG_14009 TBFG_10771     FALSE 0.218 28.000 0.000 NA   NA
 3477373 3477374 TBFG_10772 TBFG_10773     TRUE 0.973 45.000 0.824 0.049 Y NA
 3477375 3477376 TBFG_10774 TBFG_10775     FALSE 0.356 40.000 0.014 1.000   NA
 3477376 3477377 TBFG_10775 TBFG_10776     TRUE 0.934 13.000 0.750 1.000   NA
 3477377 3477378 TBFG_10776 TBFG_10777     FALSE 0.477 99.000 0.400 NA   NA
 3477378 3477379 TBFG_10777 TBFG_10778     TRUE 0.988 3.000 0.800 NA   NA
 3477379 3477380 TBFG_10778 TBFG_10779     TRUE 0.982 3.000 0.733 NA N NA
 3477380 3477381 TBFG_10779 TBFG_10780     TRUE 0.975 0.000 0.212 1.000   NA
 3477381 3477382 TBFG_10780 TBFG_10781     TRUE 0.977 0.000 0.231 1.000   NA
 3477382 3477383 TBFG_10781 TBFG_10782     TRUE 0.991 -3.000 0.571 1.000 N NA
 3477384 3477385 TBFG_10783 TBFG_10784     TRUE 0.845 31.000 0.812 1.000 N NA
 3477385 3477386 TBFG_10784 TBFG_10785     TRUE 0.815 98.000 0.480 1.000 Y NA
 3477386 3477387 TBFG_10785 TBFG_10786     TRUE 0.991 0.000 0.560 1.000   NA
 3477387 3477388 TBFG_10786 TBFG_10787     TRUE 0.573 12.000 0.003 1.000   NA
 3477389 3477390 TBFG_10788 TBFG_10789     FALSE 0.413 51.000 0.073 1.000   NA
 3477393 3477394 TBFG_10792 TBFG_10793     TRUE 0.651 5.000 0.006 1.000 N NA
 3477396 3477397 TBFG_10795 TBFG_10796     TRUE 0.928 -3.000 0.035 1.000 N NA
 3477398 3477399 TBFG_10797 TBFG_10798     FALSE 0.259 20.000 0.000 NA   NA
 3477400 3477401 TBFG_10799 TBFG_10800     TRUE 0.587 16.000 0.048 1.000   NA
 3477403 3477404 TBFG_10802 TBFG_10803     FALSE 0.071 106.000 0.000 NA   NA
 3477404 3477405 TBFG_10803 TBFG_10804     TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3477406 3477407 TBFG_10805 TBFG_10806     FALSE 0.247 22.000 0.000 NA   NA
 3477407 3477408 TBFG_10806 TBFG_10807     TRUE 0.962 -3.000 0.070 NA   NA
 3477408 3477409 TBFG_10807 TBFG_10808     TRUE 0.971 -3.000 0.250 NA N NA
 3477412 3477413 TBFG_10811 TBFG_10812     FALSE 0.247 22.000 0.000 NA   NA
 3477414 3477415 TBFG_10813 TBFG_10814     TRUE 0.983 -3.000 0.267 NA   NA
 3477416 3477417 TBFG_10815 TBFG_10816     TRUE 0.583 12.000 0.038 NA   NA
 3477419 3477420 TBFG_10818 TBFG_10819     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3477420 3477421 TBFG_10819 TBFG_10820     FALSE 0.078 121.000 0.000 1.000   NA
 3477423 3477424 TBFG_10822 TBFG_10823     FALSE 0.191 87.000 0.034 NA   NA
 3477424 3477425 TBFG_10823 TBFG_10824     TRUE 0.875 31.000 0.248 1.000 Y NA
 3477426 3477427 TBFG_10825 TBFG_10826     FALSE 0.055 147.000 0.017 NA   NA
 3477429 3477430 TBFG_10828 TBFG_10829     FALSE 0.053 163.000 0.043 NA   NA
 3477430 3477431 TBFG_10829 TBFG_10830     TRUE 0.987 2.000 0.557 1.000   NA
 3477431 3477432 TBFG_10830 TBFG_10831     FALSE 0.009 293.000 0.000 1.000   NA
 3477432 3477433 TBFG_10831 TBFG_10832     TRUE 0.988 -3.000 0.371 NA   NA
 3477434 3477435 TBFG_10833 TBFG_10834     TRUE 0.980 -3.000 0.196 1.000   NA
 3477435 3477436 TBFG_10834 TBFG_10835     FALSE 0.355 43.000 0.016 1.000   NA
 3477437 3477438 TBFG_10836 TBFG_10837     TRUE 0.659 58.000 0.579 NA N NA
 3477438 3477439 TBFG_10837 TBFG_10838     FALSE 0.008 166.000 0.005 NA N NA
 3477439 3477440 TBFG_10838 TBFG_10839     FALSE 0.190 88.000 0.004 1.000   NA
 3477440 3477441 TBFG_10839 TBFG_10840     FALSE 0.213 162.000 0.375 1.000   NA
 3477443 3477444 TBFG_10842 TBFG_10843     FALSE 0.058 58.000 0.000 1.000 N NA
 3477445 3477446 TBFG_10844 TBFG_10845     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 3477447 3477448 TBFG_10846 TBFG_14010     FALSE 0.091 91.000 0.000 NA   NA
 3477449 3477450 TBFG_14011 TBFG_14012     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3477450 3477451 TBFG_14012 TBFG_14013     FALSE 0.221 27.000 0.000 NA   NA
 3477451 3477452 TBFG_14013 TBFG_10847     FALSE 0.002 662.000 0.000 NA   NA
 3477452 3477453 TBFG_10847 TBFG_10848     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477456 3477457 TBFG_10851 TBFG_10852     FALSE 0.054 118.000 0.000 NA   NA
 3477457 3477458 TBFG_10852 TBFG_10853     TRUE 0.782 51.000 0.308 0.072   NA
 3477458 3477459 TBFG_10853 TBFG_10854     FALSE 0.044 129.000 0.000 NA   NA
 3477459 3477460 TBFG_10854 TBFG_10855     FALSE 0.388 -22.000 0.000 NA   NA
 3477461 3477462 TBFG_10856 TBFG_10857     FALSE 0.130 87.000 0.033 1.000 N NA
 3477464 3477465 TBFG_10859 TBFG_10860     TRUE 0.561 -16.000 0.000 1.000   NA
 3477469 3477470 TBFG_10864 TBFG_10865     FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3477470 3477471 TBFG_10865 TBFG_10866     TRUE 0.990 0.000 0.500 1.000   NA
 3477471 3477472 TBFG_10866 TBFG_10867     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477476 3477477 TBFG_10871 TBFG_10872     TRUE 0.929 6.000 0.333 NA   NA
 3477477 3477478 TBFG_10872 TBFG_10873     FALSE 0.102 84.000 0.000 NA   NA
 3477478 3477479 TBFG_10873 TBFG_10874     FALSE 0.218 28.000 0.000 NA   NA
 3477481 3477482 TBFG_10876 TBFG_10877     TRUE 0.994 5.000 0.750 1.000 Y NA
 3477483 3477484 TBFG_10878 TBFG_10879     FALSE 0.074 191.000 0.206 NA   NA
 3477485 3477486 TBFG_10880 TBFG_10881   moaC TRUE 0.592 10.000 0.012 NA   NA
 3477486 3477487 TBFG_10881 TBFG_10882 moaC   TRUE 0.997 -3.000 0.016 0.005 Y NA
 3477487 3477488 TBFG_10882 TBFG_10883     TRUE 0.997 -3.000 0.015 0.005 Y NA
 3477489 3477490 TBFG_10884 TBFG_10885     FALSE 0.004 448.000 0.000 1.000   NA
 3477490 3477491 TBFG_10885 TBFG_10886   moaA TRUE 0.991 4.000 0.410 1.000 Y NA
 3477491 3477492 TBFG_10886 TBFG_10887 moaA   TRUE 0.949 -3.000 0.026 NA   NA
 3477496 3477497 TBFG_10891 TBFG_10892     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3477497 3477498 TBFG_10892 TBFG_10893     TRUE 0.990 -3.000 0.432 NA   NA
 3477500 3477501 TBFG_10895 TBFG_10896     FALSE 0.006 278.000 0.000 NA   NA
 3477502 3477503 TBFG_10897 TBFG_10898     TRUE 0.924 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3477503 3477504 TBFG_10898 TBFG_10899     TRUE 0.964 -3.000 0.075 NA   NA
 3477505 3477506 TBFG_10900 TBFG_10901     FALSE 0.116 157.000 0.214 NA   NA
 3477507 3477508 TBFG_10902 TBFG_10903     TRUE 0.916 19.000 0.846 1.000   NA
 3477510 3477511 TBFG_10905 TBFG_10906     FALSE 0.035 139.000 0.000 NA   NA
 3477511 3477512 TBFG_10906 TBFG_10907     FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 3477513 3477514 TBFG_10908 TBFG_10909     FALSE 0.145 87.000 0.000 1.000   NA
 3477514 3477515 TBFG_10909 TBFG_10910     TRUE 0.871 2.000 0.000 1.000   NA
 3477518 3477519 TBFG_10913 TBFG_10914     FALSE 0.114 77.000 0.000 NA   NA
 3477519 3477520 TBFG_10914 TBFG_10915   gltA FALSE 0.021 173.000 0.000 NA   NA
 3477521 3477522 TBFG_10916 TBFG_10917     FALSE 0.482 26.000 0.091 NA   NA
 3477523 3477524 TBFG_10918 TBFG_10919     FALSE 0.022 165.000 0.000 NA   NA
 3477525 3477526 TBFG_10920 TBFG_10921     TRUE 0.962 11.000 0.333 1.000 Y NA
 3477526 3477527 TBFG_10921 TBFG_10922     FALSE 0.016 131.000 0.000 1.000 N NA
 3477528 3477529 TBFG_10923 TBFG_10924     TRUE 0.924 6.000 0.314 NA   NA
 3477529 3477530 TBFG_10924 TBFG_10925     TRUE 0.781 -15.000 0.171 NA   NA
 3477530 3477531 TBFG_10925 TBFG_10926     TRUE 0.958 -3.000 0.119 1.000 N NA
 3477531 3477532 TBFG_10926 TBFG_10927     FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 3477532 3477533 TBFG_10927 TBFG_10928     TRUE 0.870 6.000 0.182 NA   NA
 3477533 3477534 TBFG_10928 TBFG_10929     FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 3477534 3477535 TBFG_10929 TBFG_10930     FALSE 0.306 65.000 0.071 NA   NA
 3477536 3477537 TBFG_10931 TBFG_10932     TRUE 0.969 2.000 0.417 NA N NA
 3477537 3477538 TBFG_10932 TBFG_10933     FALSE 0.007 93.000 0.000 NA N NA
 3477538 3477539 TBFG_10933 TBFG_10934     FALSE 0.324 15.000 0.000 NA   NA
 3477540 3477541 TBFG_10935 TBFG_10936     FALSE 0.006 343.000 0.000 1.000   NA
 3477541 3477542 TBFG_10936 TBFG_10937     TRUE 0.973 -3.000 0.091 1.000   NA
 3477543 3477544 TBFG_14014 TBFG_10938     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3477545 3477546 TBFG_10939 TBFG_10940     TRUE 0.985 0.000 0.000 NA Y NA
 3477547 3477548 TBFG_10941 TBFG_10942     TRUE 0.911 1.000 0.029 NA   NA
 3477548 3477549 TBFG_10942 TBFG_10943     FALSE 0.334 29.000 0.014 NA   NA
 3477549 3477550 TBFG_10943 TBFG_10944     FALSE 0.198 77.000 0.018 NA   NA
 3477550 3477551 TBFG_10944 TBFG_10945     TRUE 0.733 54.000 0.500 1.000   NA
 3477552 3477553 TBFG_10946 TBFG_10947     TRUE 0.972 13.000 0.200 0.004 Y NA
 3477553 3477554 TBFG_10947 TBFG_10948     TRUE 0.997 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 3477555 3477556 TBFG_10949 TBFG_10950     TRUE 0.841 22.000 0.667 1.000 N NA
 3477557 3477558 TBFG_10951 TBFG_10952     TRUE 0.921 21.000 0.000 0.004 Y NA
 3477558 3477559 TBFG_10952 TBFG_10953     TRUE 0.977 60.000 1.000 0.004 Y NA
 3477559 3477560 TBFG_10953 TBFG_10954     TRUE 0.999 2.000 0.636 0.004 Y NA
 3477562 3477563 TBFG_10956 TBFG_10957     TRUE 0.933 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3477564 3477565 TBFG_10958 TBFG_10959     FALSE 0.325 85.000 0.182 NA   NA
 3477565 3477566 TBFG_10959 TBFG_10960     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 3477567 3477568 TBFG_10961 TBFG_10962     TRUE 0.859 6.000 0.082 1.000   NA
 3477569 3477570 TBFG_10963 TBFG_10964 pgi   FALSE 0.079 101.000 0.000 NA   NA
 3477570 3477571 TBFG_10964 TBFG_10965     FALSE 0.010 230.000 0.000 NA   NA
 3477571 3477572 TBFG_10965 TBFG_10966     FALSE 0.056 116.000 0.000 NA   NA
 3477575 3477576 TBFG_10969 TBFG_10970 sucC   TRUE 0.985 13.000 0.382 0.001 Y NA
 3477578 3477579 TBFG_10972 TBFG_10973     FALSE 0.528 40.000 0.218 NA   NA
 3477579 3477580 TBFG_10973 TBFG_10974   purN FALSE 0.124 116.000 0.044 NA   NA
 3477580 3477581 TBFG_10974 TBFG_10975 purN purH TRUE 0.996 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 3477581 3477582 TBFG_10975 TBFG_10976 purH   FALSE 0.058 107.000 0.002 1.000 N NA
 3477582 3477583 TBFG_10976 TBFG_10977     TRUE 0.967 -7.000 0.645 1.000   NA
 3477583 3477584 TBFG_10977 TBFG_10978     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3477584 3477585 TBFG_10978 TBFG_10979     FALSE 0.031 146.000 0.000 NA   NA
 3477586 3477587 TBFG_10980 TBFG_10981     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3477587 3477588 TBFG_10981 TBFG_10982     FALSE 0.307 -63.000 0.000 NA   NA
 3477588 3477589 TBFG_10982 TBFG_10983     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3477589 3477590 TBFG_10983 TBFG_10984     FALSE 0.187 36.000 0.000 NA   NA
 3477591 3477592 TBFG_10985 TBFG_10986     FALSE 0.235 57.000 0.012 NA   NA
 3477592 3477593 TBFG_10986 TBFG_10987     TRUE 0.934 -10.000 0.500 NA   NA
 3477593 3477594 TBFG_10987 TBFG_10988     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3477595 3477596 TBFG_10989 TBFG_10990     TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 3477596 3477597 TBFG_10990 TBFG_10991     TRUE 0.999 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 3477597 3477598 TBFG_10991 TBFG_10992     TRUE 0.997 6.000 0.875 0.003 Y NA
 3477598 3477599 TBFG_10992 TBFG_10993     TRUE 0.995 3.000 0.548 1.000 Y NA
 3477599 3477600 TBFG_10993 TBFG_10994     TRUE 0.993 -3.000 0.562 NA   NA
 3477605 3477606 TBFG_10999 TBFG_11000     TRUE 0.999 0.000 0.655 0.007 Y NA
 3477606 3477607 TBFG_11000 TBFG_11001     TRUE 0.655 44.000 0.424 1.000 N NA
 3477607 3477608 TBFG_11001 TBFG_11002     TRUE 0.983 0.000 0.423 1.000 N NA
 3477610 3477611 TBFG_11004 TBFG_11005     TRUE 0.972 -7.000 0.210 1.000 Y NA
 3477611 3477612 TBFG_11005 TBFG_11006     TRUE 0.856 7.000 0.152 1.000   NA
 3477613 3477614 TBFG_11007 TBFG_11008     FALSE 0.139 61.000 0.000 NA   NA
 3477614 3477615 TBFG_11008 TBFG_11009     FALSE 0.213 73.000 0.022 NA   NA
 3477615 3477616 TBFG_11009 TBFG_11010     FALSE 0.237 74.000 0.041 NA   NA
 3477617 3477618 TBFG_11011 TBFG_11012     FALSE 0.309 77.000 0.196 1.000 N NA
 3477618 3477619 TBFG_11012 TBFG_11013     TRUE 0.754 21.000 0.427 1.000 N NA
 3477619 3477620 TBFG_11013 TBFG_11014     FALSE 0.409 62.000 0.183 NA   NA
 3477620 3477621 TBFG_11014 TBFG_14015     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 3477621 3477622 TBFG_14015 TBFG_11015     FALSE 0.006 275.000 0.000 NA   NA
 3477622 3477623 TBFG_11015 TBFG_11016     FALSE 0.018 181.000 0.000 NA   NA
 3477623 3477624 TBFG_11016 TBFG_11017     FALSE 0.237 24.000 0.000 NA   NA
 3477624 3477625 TBFG_11017 TBFG_11018     FALSE 0.273 18.000 0.000 NA   NA
 3477630 3477631 TBFG_11023 TBFG_11024     FALSE 0.275 35.000 0.006 NA   NA
 3477634 3477635 TBFG_11027 TBFG_11028     FALSE 0.022 208.000 0.008 NA   NA
 3477635 3477636 TBFG_11028 TBFG_11029   ksgA TRUE 0.565 -27.000 0.008 1.000   NA
 3477636 3477637 TBFG_11029 TBFG_11030 ksgA   FALSE 0.175 86.000 0.068 1.000 N NA
 3477637 3477638 TBFG_11030 TBFG_11031     FALSE 0.027 514.000 0.000 1.000 Y NA
 3477639 3477640 TBFG_11032 TBFG_11033     TRUE 0.983 13.000 0.496 0.025 Y NA
 3477640 3477641 TBFG_11033 TBFG_11034     FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3477641 3477642 TBFG_11034 TBFG_11035     FALSE 0.187 36.000 0.000 NA   NA
 3477642 3477643 TBFG_11035 TBFG_11036     FALSE 0.115 92.000 0.026 1.000 N NA
 3477643 3477644 TBFG_11036 TBFG_14016     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3477645 3477646 TBFG_11037 TBFG_11038     TRUE 0.836 59.000 0.013 0.050 Y NA
 3477646 3477647 TBFG_11038 TBFG_11039     TRUE 0.948 0.000 0.026 1.000   NA
 3477647 3477648 TBFG_11039 TBFG_11040     FALSE 0.095 88.000 0.000 NA   NA
 3477648 3477649 TBFG_11040 TBFG_11041   eno FALSE 0.044 97.000 0.012 NA N NA
 3477649 3477650 TBFG_11041 TBFG_11042 eno   TRUE 0.763 5.000 0.043 1.000 N NA
 3477650 3477651 TBFG_11042 TBFG_11043     TRUE 0.897 -7.000 0.252 NA   NA
 3477651 3477652 TBFG_11043 TBFG_11044     TRUE 0.870 -9.000 0.243 NA   NA
 3477653 3477654 TBFG_11045 TBFG_11046     TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 3477655 3477656 TBFG_11047 TBFG_11048     TRUE 0.998 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 3477656 3477657 TBFG_11048 TBFG_11049     TRUE 0.997 0.000 0.015 0.001 Y NA
 3477658 3477659 TBFG_11050 TBFG_11051     TRUE 0.992 8.000 0.556 0.047 Y NA
 3477659 3477660 TBFG_11051 TBFG_11052     FALSE 0.065 182.000 0.000 0.070 N NA
 3477660 3477661 TBFG_11052 TBFG_11053     FALSE 0.334 -34.000 0.000 NA   NA
 3477661 3477662 TBFG_11053 TBFG_11054     FALSE 0.191 34.000 0.000 NA   NA
 3477662 3477663 TBFG_11054 TBFG_11055     FALSE 0.047 126.000 0.000 NA   NA
 3477663 3477664 TBFG_11055 TBFG_11056     FALSE 0.221 27.000 0.000 NA   NA
 3477664 3477665 TBFG_11056 TBFG_11057     FALSE 0.031 146.000 0.000 NA   NA
 3477665 3477666 TBFG_11057 TBFG_11058     TRUE 0.710 77.000 0.667 NA   NA
 3477666 3477667 TBFG_11058 TBFG_11059     FALSE 0.002 1196.000 0.000 NA   NA
 3477667 3477668 TBFG_11059 TBFG_11060     FALSE 0.406 83.000 0.250 NA   NA
 3477668 3477669 TBFG_11060 TBFG_11061     FALSE 0.006 283.000 0.000 NA   NA
 3477670 3477671 TBFG_11062 TBFG_11063     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477675 3477676 TBFG_11067 TBFG_11068     FALSE 0.239 49.000 0.000 1.000   NA
 3477677 3477678 TBFG_11069 TBFG_11070     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA   NA
 3477681 3477682 TBFG_11073 TBFG_14017     FALSE 0.027 154.000 0.000 NA   NA
 3477682 3477683 TBFG_14017 TBFG_11074     FALSE 0.025 159.000 0.000 NA   NA
 3477683 3477684 TBFG_11074 TBFG_11075     FALSE 0.002 953.000 0.000 NA   NA
 3477684 3477685 TBFG_11075 TBFG_11076     FALSE 0.210 107.000 0.125 NA   NA
 3477685 3477686 TBFG_11076 TBFG_11077     FALSE 0.515 76.000 0.286 1.000   NA
 3477686 3477687 TBFG_11077 TBFG_11078     TRUE 0.551 53.000 0.286 NA   NA
 3477687 3477688 TBFG_11078 TBFG_11079     TRUE 0.666 34.000 0.333 NA   NA
 3477688 3477689 TBFG_11079 TBFG_11080     TRUE 0.819 -22.000 0.250 1.000   NA
 3477690 3477691 TBFG_11081 TBFG_11082     FALSE 0.184 81.000 0.016 NA   NA
 3477692 3477693 TBFG_11083 TBFG_11084     TRUE 0.990 -3.000 0.429 NA   NA
 3477694 3477695 TBFG_11085 TBFG_11086     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 3477695 3477696 TBFG_11086 TBFG_11087     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA   NA
 3477696 3477697 TBFG_11087 TBFG_11088     TRUE 0.982 -3.000 0.259 NA   NA
 3477697 3477698 TBFG_11088 TBFG_11089     TRUE 0.969 12.000 0.128 0.007 Y NA
 3477699 3477700 TBFG_11090 TBFG_11091     FALSE 0.056 116.000 0.000 NA   NA
 3477701 3477702 TBFG_11092 TBFG_11093     FALSE 0.062 53.000 0.000 1.000 N NA
 3477703 3477704 TBFG_11094 TBFG_11095     FALSE 0.166 57.000 0.017 1.000 N NA
 3477704 3477705 TBFG_11095 TBFG_11096     FALSE 0.031 202.000 0.034 NA   NA
 3477705 3477706 TBFG_11096 TBFG_11097     FALSE 0.343 32.000 0.028 NA   NA
 3477707 3477708 TBFG_11098 TBFG_11099 greA   FALSE 0.093 186.000 0.250 NA   NA
 3477709 3477710 TBFG_11100 TBFG_11101     TRUE 0.967 -3.000 0.099 NA   NA
 3477710 3477711 TBFG_11101 TBFG_11102     TRUE 0.617 -13.000 0.011 NA   NA
 3477713 3477714 TBFG_11104 TBFG_11105     FALSE 0.036 138.000 0.000 NA   NA
 3477714 3477715 TBFG_11105 TBFG_11106     FALSE 0.020 177.000 0.000 NA   NA
 3477715 3477716 TBFG_11106 TBFG_11107     FALSE 0.027 153.000 0.000 NA   NA
 3477716 3477717 TBFG_11107 TBFG_11108     FALSE 0.279 -121.000 0.000 NA   NA
 3477717 3477718 TBFG_11108 TBFG_11109     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 3477718 3477719 TBFG_11109 TBFG_11110     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 3477719 3477720 TBFG_11110 TBFG_11111     TRUE 0.882 -22.000 0.000 0.001   NA
 3477720 3477721 TBFG_11111 TBFG_11112     FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 3477723 3477724 TBFG_11114 TBFG_11115 glyA   FALSE 0.269 105.000 0.143 1.000   NA
 3477724 3477725 TBFG_11115 TBFG_11116     FALSE 0.039 211.000 0.046 1.000   NA
 3477725 3477726 TBFG_11116 TBFG_11117     FALSE 0.204 87.000 0.108 1.000 N NA
 3477727 3477728 TBFG_11118 TBFG_11119   fumC TRUE 0.943 -3.000 0.014 NA   NA
 3477728 3477729 TBFG_11119 TBFG_11120 fumC glpX FALSE 0.343 31.000 0.071 1.000 N NA
 3477731 3477732 TBFG_11122 TBFG_11123     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
 3477732 3477733 TBFG_11123 TBFG_11124     TRUE 0.981 0.000 0.286 1.000   NA
 3477734 3477735 TBFG_11125 TBFG_11126     FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 3477735 3477736 TBFG_11126 TBFG_11127     FALSE 0.276 -151.000 0.000 NA   NA
 3477737 3477738 TBFG_11128 TBFG_11129     FALSE 0.448 10.000 0.009 1.000 N NA
 3477738 3477739 TBFG_11129 TBFG_11130   xseA TRUE 0.993 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 3477739 3477740 TBFG_11130 TBFG_11131 xseA   TRUE 0.948 -3.000 0.024 NA   NA
 3477743 3477744 TBFG_11134 TBFG_11135     FALSE 0.095 88.000 0.000 NA   NA
 3477744 3477745 TBFG_11135 TBFG_11136     TRUE 0.994 -3.000 0.689 NA   NA
 3477745 3477746 TBFG_11136 TBFG_11137     FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3477746 3477747 TBFG_11137 TBFG_11138     FALSE 0.054 118.000 0.000 NA   NA
 3477750 3477751 TBFG_11141 TBFG_11142     FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3477751 3477752 TBFG_11142 TBFG_11143     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.005   NA
 3477753 3477754 TBFG_11144 TBFG_11145     TRUE 0.851 22.000 0.062 1.000 Y NA
 3477756 3477757 TBFG_11147 TBFG_11148     TRUE 0.855 5.000 0.070 NA   NA
 3477758 3477759 TBFG_11149 TBFG_11150     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 3477759 3477760 TBFG_11150 TBFG_11151     FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 3477760 3477761 TBFG_11151 TBFG_11152     FALSE 0.078 102.000 0.000 NA   NA
 3477762 3477763 TBFG_11153 TBFG_11154     TRUE 0.982 -3.000 0.216 1.000   NA
 3477763 3477764 TBFG_11154 TBFG_11155     FALSE 0.380 12.000 0.000 NA   NA
 3477765 3477766 TBFG_11156 TBFG_11157     FALSE 0.000 821.000 0.000 NA N NA
 3477767 3477768 TBFG_11158 TBFG_11159     FALSE 0.235 50.000 0.000 1.000   NA
 3477768 3477769 TBFG_11159 TBFG_11160     FALSE 0.102 84.000 0.000 NA   NA
 3477770 3477771 TBFG_11161 TBFG_11162     TRUE 0.979 -3.000 0.176 1.000   NA
 3477773 3477774 TBFG_11164 TBFG_11165     FALSE 0.513 143.000 0.000 0.007 Y NA
 3477775 3477776 TBFG_11166 TBFG_11167     TRUE 0.901 12.000 0.636 1.000 N NA
 3477778 3477779 TBFG_11169 TBFG_11170     TRUE 0.737 -69.000 0.000 0.046   NA
 3477779 3477780 TBFG_11170 TBFG_11171     FALSE 0.140 133.000 0.080 1.000   NA
 3477780 3477781 TBFG_11171 TBFG_11172     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 3477786 3477787 TBFG_11177 TBFG_11178     TRUE 0.966 -3.000 0.091 NA   NA
 3477788 3477789 TBFG_11179 TBFG_11180     FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000   NA
 3477790 3477791 TBFG_11181 TBFG_11182     TRUE 0.848 8.000 0.222 NA   NA
 3477794 3477795 TBFG_11185 TBFG_11186     FALSE 0.002 308.000 0.000 1.000 N NA
 3477795 3477796 TBFG_11186 TBFG_11187     TRUE 0.947 39.000 0.227 0.001 Y NA
 3477796 3477797 TBFG_11187 TBFG_11188     TRUE 0.919 57.000 0.182 0.002 Y NA
 3477797 3477798 TBFG_11188 TBFG_11189     TRUE 0.994 3.000 0.059 0.002 Y NA
 3477798 3477799 TBFG_11189 TBFG_11190     FALSE 0.213 22.000 0.002 1.000 N NA
 3477799 3477800 TBFG_11190 TBFG_11191     FALSE 0.104 98.000 0.025 1.000 N NA
 3477801 3477802 TBFG_11192 TBFG_11193     FALSE 0.010 72.000 0.000 NA N NA
 3477802 3477803 TBFG_11193 TBFG_11194     FALSE 0.273 18.000 0.000 NA   NA
 3477804 3477805 TBFG_11195 TBFG_11196     FALSE 0.493 92.000 0.387 NA   NA
 3477808 3477809 TBFG_11199 TBFG_11200     FALSE 0.014 201.000 0.000 NA   NA
 3477809 3477810 TBFG_11200 TBFG_11201     TRUE 0.936 -3.000 0.093 NA N NA
 3477811 3477812 TBFG_11202 TBFG_11203     FALSE 0.247 33.000 0.029 1.000 N NA
 3477814 3477815 TBFG_11205 TBFG_11206     FALSE 0.515 53.000 0.250 NA   NA
 3477815 3477816 TBFG_11206 TBFG_11207     TRUE 0.821 67.000 1.000 NA   NA
 3477817 3477818 TBFG_11208 TBFG_11209     FALSE 0.022 165.000 0.000 NA   NA
 3477818 3477819 TBFG_11209 TBFG_11210     FALSE 0.170 177.000 0.000 NA Y NA
 3477820 3477821 TBFG_11211 TBFG_11212     TRUE 0.954 0.000 0.181 1.000 N NA
 3477821 3477822 TBFG_11212 TBFG_11213   sigI FALSE 0.041 82.000 0.000 1.000 N NA
 3477822 3477823 TBFG_11213 TBFG_11214 sigI   FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3477823 3477824 TBFG_11214 TBFG_11215     FALSE 0.120 73.000 0.000 NA   NA
 3477824 3477825 TBFG_11215 TBFG_11216     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 3477825 3477826 TBFG_11216 TBFG_11217     TRUE 0.587 40.000 0.000 0.049   NA
 3477828 3477829 TBFG_11219 TBFG_11220     FALSE 0.169 47.000 0.000 NA   NA
 3477829 3477830 TBFG_11220 TBFG_11221     FALSE 0.040 134.000 0.000 NA   NA
 3477830 3477831 TBFG_11221 TBFG_11222     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 3477836 3477837 TBFG_11227 TBFG_11228     FALSE 0.291 31.000 0.000 1.000   NA
 3477838 3477839 TBFG_11229 TBFG_11230     TRUE 0.609 50.000 0.324 NA   NA
 3477839 3477840 TBFG_11230 TBFG_11231     FALSE 0.320 66.000 0.172 1.000 N NA
 3477840 3477841 TBFG_11231 TBFG_11232     TRUE 0.970 -3.000 0.136 NA   NA
 3477841 3477842 TBFG_11232 TBFG_11233     FALSE 0.348 39.000 0.045 NA   NA
 3477842 3477843 TBFG_11233 TBFG_11234     TRUE 0.942 -3.000 0.013 NA   NA
 3477843 3477844 TBFG_11234 TBFG_11235     FALSE 0.128 107.000 0.021 NA   NA
 3477847 3477848 TBFG_11238 TBFG_11239     FALSE 0.040 134.000 0.000 NA   NA
 3477848 3477849 TBFG_11239 TBFG_11240     FALSE 0.519 28.000 0.080 1.000   NA
 3477849 3477850 TBFG_11240 TBFG_11241     TRUE 0.623 9.000 0.111 NA N NA
 3477850 3477851 TBFG_11241 TBFG_11242     TRUE 0.958 -3.000 0.185 NA N NA
 3477851 3477852 TBFG_11242 TBFG_11243     TRUE 0.627 -10.000 0.000 1.000   NA
 3477852 3477853 TBFG_11243 TBFG_11244     FALSE 0.051 142.000 0.000 1.000   NA
 3477854 3477855 TBFG_11245 TBFG_11246     FALSE 0.539 41.000 0.224 NA   NA
 3477855 3477856 TBFG_11246 TBFG_11247     TRUE 0.710 68.000 0.607 NA   NA
 3477856 3477857 TBFG_11247 TBFG_11248     TRUE 0.949 2.000 0.242 1.000 N NA
 3477858 3477859 TBFG_11249 TBFG_11250     FALSE 0.144 111.000 0.054 NA   NA
 3477859 3477860 TBFG_11250 TBFG_11251     TRUE 0.992 -3.000 0.542 NA   NA
 3477861 3477862 TBFG_11252 TBFG_11253     FALSE 0.154 52.000 0.000 NA   NA
 3477863 3477864 TBFG_11254 TBFG_11255     TRUE 0.554 13.000 0.089 1.000 N NA
 3477864 3477865 TBFG_11255 TBFG_11256     FALSE 0.156 125.000 0.139 NA   NA
 3477865 3477866 TBFG_11256 TBFG_11257     TRUE 0.995 -3.000 0.806 NA   NA
 3477866 3477867 TBFG_11257 TBFG_11258     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 3477868 3477869 TBFG_11259 TBFG_11260     TRUE 0.626 21.000 0.211 NA   NA
 3477869 3477870 TBFG_11260 TBFG_11261     TRUE 0.998 -3.000 0.252 0.022 Y NA
 3477870 3477871 TBFG_11261 TBFG_11262     TRUE 0.997 5.000 0.723 0.022 Y NA
 3477871 3477872 TBFG_11262 TBFG_11263     TRUE 0.991 5.000 0.191 0.022 Y NA
 3477874 3477875 TBFG_11265 TBFG_11266     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 3477875 3477876 TBFG_11266 TBFG_11267     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 3477877 3477878 TBFG_11268 TBFG_11269     FALSE 0.327 -37.000 0.000 NA   NA
 3477880 3477881 TBFG_11271 TBFG_11272     FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 3477881 3477882 TBFG_11272 TBFG_11273     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 3477882 3477883 TBFG_11273 TBFG_11274   kgd FALSE 0.005 113.000 0.000 NA N NA
 3477883 3477884 TBFG_11274 TBFG_11275 kgd   FALSE 0.057 142.000 0.013 NA   NA
 3477886 3477887 TBFG_11277 TBFG_11278     FALSE 0.387 56.000 0.133 NA   NA
 3477888 3477889 TBFG_11279 TBFG_11280     TRUE 0.890 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3477890 3477891 TBFG_11281 TBFG_11282     TRUE 0.993 0.000 0.833 1.000 N NA
 3477891 3477892 TBFG_11282 TBFG_11283     FALSE 0.409 114.000 0.500 1.000 N NA
 3477892 3477893 TBFG_11283 TBFG_11284     TRUE 0.976 -3.000 0.143 1.000   NA
 3477894 3477895 TBFG_11285 TBFG_11286     TRUE 0.710 2.000 0.016 NA N NA
 3477896 3477897 TBFG_11287 TBFG_11288     TRUE 0.883 5.000 0.136 NA   NA
 3477898 3477899 TBFG_11289 TBFG_11290     FALSE 0.046 75.000 0.000 1.000 N NA
 3477899 3477900 TBFG_11290 TBFG_11291     FALSE 0.021 173.000 0.000 NA   NA
 3477901 3477902 TBFG_11292 TBFG_11293     FALSE 0.045 341.000 0.000 1.000 Y NA
 3477902 3477903 TBFG_11293 TBFG_11294     FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000   NA
 3477903 3477904 TBFG_11294 TBFG_11295     FALSE 0.011 223.000 0.000 NA   NA
 3477904 3477905 TBFG_11295 TBFG_11296     TRUE 0.754 61.000 0.667 NA   NA
 3477905 3477906 TBFG_11296 TBFG_11297     FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 3477906 3477907 TBFG_11297 TBFG_11298     FALSE 0.068 108.000 0.000 NA   NA
 3477907 3477908 TBFG_11298 TBFG_11299     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 3477909 3477910 TBFG_11300 TBFG_11301     TRUE 0.994 -3.000 0.692 NA   NA
 3477912 3477913 TBFG_11303 TBFG_11304     TRUE 0.986 -3.000 0.312 NA   NA
 3477913 3477914 TBFG_11304 TBFG_11305     FALSE 0.391 21.000 0.017 NA   NA
 3477915 3477916 TBFG_11306 TBFG_11307     TRUE 0.975 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 3477916 3477917 TBFG_11307 TBFG_11308     TRUE 0.997 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 3477917 3477918 TBFG_11308 TBFG_11309     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.022 Y NA
 3477919 3477920 TBFG_11310 TBFG_11311     FALSE 0.205 94.000 0.136 1.000 N NA
 3477920 3477921 TBFG_11311 TBFG_11312     TRUE 0.996 0.000 0.483 0.001 N NA
 3477921 3477922 TBFG_11312 TBFG_11313     FALSE 0.201 54.000 0.073 NA N NA
 3477922 3477923 TBFG_11313 TBFG_11314     FALSE 0.145 58.000 0.000 NA   NA
 3477923 3477924 TBFG_11314 TBFG_11315     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 3477927 3477928 TBFG_11318 TBFG_14018     FALSE 0.004 356.000 0.000 NA   NA
 3477929 3477930 TBFG_11319 TBFG_11320 argS   TRUE 0.947 -3.000 0.071 1.000 N NA
 3477930 3477931 TBFG_11320 TBFG_11321     TRUE 0.980 4.000 0.071 1.000 Y NA
 3477931 3477932 TBFG_11321 TBFG_11322     TRUE 0.995 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 3477932 3477933 TBFG_11322 TBFG_11323     FALSE 0.226 218.000 0.221 1.000 Y NA
 3477933 3477934 TBFG_11323 TBFG_11324     FALSE 0.027 257.000 0.000 0.083 N NA
 3477934 3477935 TBFG_11324 TBFG_11325   rpmE FALSE 0.067 151.000 0.115 1.000 N NA
 3477935 3477936 TBFG_11325 TBFG_11326 rpmE prfA TRUE 0.665 90.000 0.110 1.000 Y NA
 3477936 3477937 TBFG_11326 TBFG_11327 prfA   TRUE 0.994 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 3477937 3477938 TBFG_11327 TBFG_11328     TRUE 0.959 16.000 0.583 NA Y NA
 3477938 3477939 TBFG_11328 TBFG_11329     FALSE 0.292 84.000 0.248 NA N NA
 3477939 3477940 TBFG_11329 TBFG_11330     FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000   NA
 3477940 3477941 TBFG_11330 TBFG_11331     TRUE 0.792 -7.000 0.021 1.000   NA
 3477941 3477942 TBFG_11331 TBFG_11332     TRUE 0.995 7.000 0.557 0.003 Y NA
 3477942 3477943 TBFG_11332 TBFG_11333     TRUE 0.917 31.000 0.012 0.003 Y NA
 3477943 3477944 TBFG_11333 TBFG_11334     TRUE 0.981 7.000 0.008 0.003 Y NA
 3477944 3477945 TBFG_11334 TBFG_11335     TRUE 0.981 45.000 0.864 0.003 Y NA
 3477945 3477946 TBFG_11335 TBFG_11336     TRUE 0.997 7.000 0.846 0.003 Y NA
 3477946 3477947 TBFG_11336 TBFG_11337     TRUE 0.977 40.000 0.724 0.003 Y NA
 3477947 3477948 TBFG_11337 TBFG_11338   atpC TRUE 0.992 14.000 0.837 0.003 Y NA
 3477948 3477949 TBFG_11338 TBFG_11339 atpC   TRUE 0.729 8.000 0.054 NA   NA
 3477950 3477951 TBFG_11340 TBFG_11341     FALSE 0.035 166.000 0.000 1.000   NA
 3477952 3477953 TBFG_11342 TBFG_14046     FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 3477953 3477954 TBFG_14046 TBFG_14047     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3477954 3477955 TBFG_14047 TBFG_14048     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3477956 3477957 TBFG_11343 TBFG_11344     TRUE 0.998 -3.000 0.093 0.001 Y NA
 3477957 3477958 TBFG_11344 TBFG_11345     FALSE 0.042 81.000 0.000 1.000 N NA
 3477958 3477959 TBFG_11345 TBFG_11346     TRUE 0.822 70.000 0.000 0.006 Y NA
 3477960 3477961 TBFG_11347 TBFG_11348     TRUE 0.634 99.000 0.308 0.067   NA
 3477962 3477963 TBFG_11349 TBFG_11350     TRUE 0.930 7.000 0.000 0.002   NA
 3477963 3477964 TBFG_11350 TBFG_11351     TRUE 0.955 13.000 0.000 0.002 Y NA
 3477965 3477966 TBFG_11352 TBFG_11353     FALSE 0.541 23.000 0.141 NA   NA
 3477968 3477969 TBFG_11355 TBFG_11356     FALSE 0.061 130.000 0.035 1.000 N NA
 3477970 3477971 TBFG_11357 TBFG_11358     FALSE 0.028 152.000 0.000 NA   NA
 3477971 3477972 TBFG_11358 TBFG_11359     TRUE 0.984 8.000 0.159 0.004 Y NA
 3477974 3477975 TBFG_11361 TBFG_11362     FALSE 0.400 24.000 0.080 1.000 N NA
 3477976 3477977 TBFG_11363 TBFG_11364 clpS   TRUE 0.924 -40.000 0.823 NA   NA
 3477977 3477978 TBFG_11364 TBFG_11365     TRUE 0.565 17.000 0.093 NA   NA
 3477978 3477979 TBFG_11365 TBFG_11366     FALSE 0.135 63.000 0.000 NA   NA
 3477979 3477980 TBFG_11366 TBFG_11367     TRUE 0.773 -9.000 0.032 1.000   NA
 3477980 3477981 TBFG_11367 TBFG_11368     TRUE 0.961 -3.000 0.024 1.000   NA
 3477981 3477982 TBFG_11368 TBFG_11369     FALSE 0.487 27.000 0.054 1.000   NA
 3477982 3477983 TBFG_11369 TBFG_11370   rph TRUE 0.572 17.000 0.053 1.000   NA
 3477983 3477984 TBFG_11370 TBFG_11371 rph   FALSE 0.523 39.000 0.262 1.000 N NA
 3477985 3477986 TBFG_11372 TBFG_11373     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 3477987 3477988 TBFG_11374 TBFG_11375     TRUE 0.978 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 3477988 3477989 TBFG_11375 TBFG_11376     TRUE 0.993 0.000 0.200 1.000 Y NA
 3477991 3477992 TBFG_14019 TBFG_11378     FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 3477992 3477993 TBFG_11378 TBFG_11379     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.003 Y NA
 3477993 3477994 TBFG_11379 TBFG_11380   fabG FALSE 0.017 129.000 0.000 1.000 N NA
 3477994 3477995 TBFG_11380 TBFG_11381 fabG   TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3477995 3477996 TBFG_11381 TBFG_11382     FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3477997 3477998 TBFG_11383 TBFG_11384     FALSE 0.114 20.000 0.000 1.000 N NA
 3477998 3477999 TBFG_11384 TBFG_11385     FALSE 0.256 9.000 0.000 1.000 N NA
 3477999 3478000 TBFG_11385 TBFG_11386     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 3478000 3478001 TBFG_11386 TBFG_11387     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 3478002 3478003 TBFG_11388 TBFG_11389     FALSE 0.392 -82.000 0.000 1.000   NA
 3478003 3478004 TBFG_11389 TBFG_11390     FALSE 0.158 82.000 0.000 1.000   NA
 3478004 3478005 TBFG_11390 TBFG_11391     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA N NA
 3478006 3478007 TBFG_11392 TBFG_11393     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 3478007 3478008 TBFG_11393 TBFG_11394     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478008 3478009 TBFG_11394 TBFG_11395     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 3478009 3478010 TBFG_11395 TBFG_11396     FALSE 0.303 139.000 0.000 1.000 Y NA
 3478013 3478014 TBFG_11399 TBFG_11400     FALSE 0.048 196.000 0.100 NA   NA
 3478014 3478015 TBFG_11400 TBFG_11401     TRUE 0.922 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3478015 3478016 TBFG_11401 TBFG_11402     TRUE 0.712 6.000 0.000 1.000   NA
 3478018 3478019 TBFG_11404 TBFG_11405     TRUE 0.983 -3.000 0.282 NA   NA
 3478020 3478021 TBFG_11406 TBFG_11407     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3478022 3478023 TBFG_11408 TBFG_11409   pyrB TRUE 0.996 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 3478023 3478024 TBFG_11409 TBFG_11410 pyrB pyrC TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3478024 3478025 TBFG_11410 TBFG_11411 pyrC   TRUE 0.959 -3.000 0.057 NA   NA
 3478025 3478026 TBFG_11411 TBFG_11412     TRUE 0.957 -3.000 0.050 NA   NA
 3478026 3478027 TBFG_11412 TBFG_11413   carB TRUE 0.999 0.000 0.345 0.001 Y NA
 3478027 3478028 TBFG_11413 TBFG_11414 carB pyrF TRUE 0.994 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3478028 3478029 TBFG_11414 TBFG_11415 pyrF   FALSE 0.016 195.000 0.000 NA   NA
 3478029 3478030 TBFG_11415 TBFG_11416     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3478030 3478031 TBFG_11416 TBFG_11417     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3478031 3478032 TBFG_11417 TBFG_11418   gmk FALSE 0.195 108.000 0.054 1.000   NA
 3478032 3478033 TBFG_11418 TBFG_11419 gmk   TRUE 0.606 66.000 0.471 1.000 N NA
 3478033 3478034 TBFG_11419 TBFG_11420     TRUE 0.555 19.000 0.192 1.000 N NA
 3478034 3478035 TBFG_11420 TBFG_11421     FALSE 0.450 128.000 0.059 1.000 Y NA
 3478036 3478037 TBFG_11422 TBFG_11423     TRUE 0.962 0.000 0.000 0.060 N NA
 3478039 3478040 TBFG_11425 TBFG_11426     FALSE 0.008 255.000 0.000 NA   NA
 3478040 3478041 TBFG_11426 TBFG_11427     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478041 3478042 TBFG_11427 TBFG_11428     FALSE 0.155 83.000 0.000 1.000   NA
 3478042 3478043 TBFG_11428 TBFG_11429     TRUE 0.947 25.000 0.250 0.023 Y NA
 3478044 3478045 TBFG_11430 TBFG_11431     FALSE 0.229 81.000 0.050 NA   NA
 3478049 3478050 TBFG_11435 TBFG_11436 fmt   TRUE 0.997 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3478050 3478051 TBFG_11436 TBFG_11437     FALSE 0.346 25.000 0.056 1.000 N NA
 3478051 3478052 TBFG_11437 TBFG_11438     TRUE 0.923 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3478053 3478054 TBFG_11439 TBFG_11440     TRUE 0.853 6.000 0.143 NA   NA
 3478055 3478056 TBFG_11441 TBFG_11442     FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 3478056 3478057 TBFG_11442 TBFG_11443     FALSE 0.513 -10.000 0.000 NA   NA
 3478057 3478058 TBFG_11443 TBFG_11444     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 3478058 3478059 TBFG_11444 TBFG_11445   ribH TRUE 0.998 -3.000 0.041 0.002 Y NA
 3478059 3478060 TBFG_11445 TBFG_11446 ribH   TRUE 0.942 -3.000 0.014 NA   NA
 3478060 3478061 TBFG_11446 TBFG_11447     FALSE 0.531 25.000 0.143 NA   NA
 3478061 3478062 TBFG_11447 TBFG_11448     FALSE 0.019 180.000 0.000 NA   NA
 3478062 3478063 TBFG_11448 TBFG_11449   uvrC FALSE 0.133 64.000 0.000 NA   NA
 3478063 3478064 TBFG_11449 TBFG_11450 uvrC   TRUE 0.963 -3.000 0.073 NA   NA
 3478064 3478065 TBFG_11450 TBFG_11451     TRUE 0.982 -3.000 0.259 NA   NA
 3478065 3478066 TBFG_11451 TBFG_11452     TRUE 0.991 -3.000 0.470 NA   NA
 3478069 3478070 TBFG_11455 TBFG_11456     TRUE 0.998 0.000 0.857 1.000 Y NA
 3478070 3478071 TBFG_11456 TBFG_11457     TRUE 0.992 4.000 0.429 1.000 Y NA
 3478072 3478073 TBFG_11458 TBFG_11459     FALSE 0.009 240.000 0.000 NA   NA
 3478073 3478074 TBFG_11459 TBFG_11460     FALSE 0.062 111.000 0.000 NA   NA
 3478074 3478075 TBFG_11460 TBFG_11461     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3478075 3478076 TBFG_11461 TBFG_11462     FALSE 0.023 164.000 0.000 NA   NA
 3478078 3478079 TBFG_11464 TBFG_11465   pgk TRUE 0.994 3.000 0.055 0.003 Y NA
 3478079 3478080 TBFG_11465 TBFG_11466 pgk tpiA TRUE 0.994 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3478085 3478086 TBFG_11471 TBFG_11472     FALSE 0.002 595.000 0.000 NA   NA
 3478086 3478087 TBFG_11472 TBFG_11473     FALSE 0.478 17.000 0.038 NA   NA
 3478087 3478088 TBFG_11473 TBFG_11474     TRUE 0.994 -3.000 0.179 NA Y NA
 3478088 3478089 TBFG_11474 TBFG_11475     TRUE 0.751 53.000 0.104 NA Y NA
 3478089 3478090 TBFG_11475 TBFG_11476     TRUE 0.994 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 3478090 3478091 TBFG_11476 TBFG_11477     TRUE 0.884 17.000 0.090 1.000 Y NA
 3478091 3478092 TBFG_11477 TBFG_11478     FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 3478098 3478099 TBFG_11484 TBFG_11485     FALSE 0.359 112.000 0.022 0.045   NA
 3478099 3478100 TBFG_11485 TBFG_11486     TRUE 0.980 -3.000 0.186 1.000   NA
 3478100 3478101 TBFG_11486 TBFG_11487     FALSE 0.196 156.000 0.357 NA   NA
 3478102 3478103 TBFG_11488 TBFG_11489     TRUE 0.955 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3478103 3478104 TBFG_11489 TBFG_11490     TRUE 0.995 -3.000 0.266 0.001 N NA
 3478104 3478105 TBFG_11490 TBFG_11491     TRUE 0.998 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3478105 3478106 TBFG_11491 TBFG_11492     TRUE 0.907 2.000 0.093 1.000 N NA
 3478106 3478107 TBFG_11492 TBFG_11493     TRUE 0.976 -3.000 0.249 1.000 N NA
 3478107 3478108 TBFG_11493 TBFG_11494     TRUE 0.688 -25.000 0.152 NA   NA
 3478109 3478110 TBFG_11495 TBFG_11496     FALSE 0.282 107.000 0.222 NA   NA
 3478111 3478112 TBFG_11497 TBFG_11498     FALSE 0.197 44.000 0.018 1.000 N NA
 3478112 3478113 TBFG_11498 TBFG_11499     TRUE 0.969 16.000 0.222 0.003 Y NA
 3478113 3478114 TBFG_11499 TBFG_11500     TRUE 0.830 22.000 0.636 1.000 N NA
 3478114 3478115 TBFG_11500 TBFG_11501     FALSE 0.479 36.000 0.090 1.000   NA
 3478115 3478116 TBFG_11501 TBFG_11502     FALSE 0.293 97.000 0.191 NA   NA
 3478117 3478118 TBFG_11503 TBFG_11504     TRUE 0.773 11.000 0.256 1.000 N NA
 3478119 3478120 TBFG_11505 TBFG_11506     FALSE 0.010 226.000 0.000 NA   NA
 3478120 3478121 TBFG_11506 TBFG_11507     TRUE 0.773 -25.000 0.250 NA   NA
 3478121 3478122 TBFG_11507 TBFG_11508     FALSE 0.113 139.000 0.120 NA   NA
 3478122 3478123 TBFG_11508 TBFG_11509     TRUE 0.996 -3.000 0.920 NA   NA
 3478123 3478124 TBFG_11509 TBFG_11510     TRUE 0.942 11.000 0.760 NA   NA
 3478126 3478127 TBFG_11512 TBFG_11513     TRUE 0.869 19.000 0.078 1.000 Y NA
 3478127 3478128 TBFG_11513 TBFG_11514   hemH TRUE 0.697 6.000 0.038 1.000 N NA
 3478130 3478131 TBFG_11516 TBFG_11517     TRUE 0.891 22.000 0.259 NA Y NA
 3478131 3478132 TBFG_11517 TBFG_11518     TRUE 0.669 10.000 0.049 NA   NA
 3478132 3478133 TBFG_11518 TBFG_11519     FALSE 0.191 34.000 0.000 NA   NA
 3478133 3478134 TBFG_11519 TBFG_11520     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 3478136 3478137 TBFG_11522 TBFG_11523     TRUE 0.997 1.000 0.115 0.001 Y NA
 3478137 3478138 TBFG_11523 TBFG_11524     FALSE 0.340 14.000 0.000 NA   NA
 3478138 3478139 TBFG_11524 TBFG_11525     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478139 3478140 TBFG_11525 TBFG_11526     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3478140 3478141 TBFG_11526 TBFG_11527     FALSE 0.152 56.000 0.011 1.000 N NA
 3478142 3478143 TBFG_11528 TBFG_11529     FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 3478144 3478145 TBFG_11530 TBFG_11531     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 3478145 3478146 TBFG_11531 TBFG_11532     TRUE 0.583 12.000 0.167 NA N NA
 3478146 3478147 TBFG_11532 TBFG_11533     FALSE 0.040 213.000 0.105 NA   NA
 3478148 3478149 TBFG_11534 TBFG_11535     TRUE 0.906 7.000 0.000 0.015   NA
 3478149 3478150 TBFG_11535 TBFG_11536     FALSE 0.097 137.000 0.027 1.000   NA
 3478150 3478151 TBFG_11536 TBFG_11537     TRUE 0.952 -3.000 0.004 1.000   NA
 3478151 3478152 TBFG_11537 TBFG_11538     FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   NA
 3478155 3478156 TBFG_11541 TBFG_11542     FALSE 0.445 -16.000 0.000 NA   NA
 3478156 3478157 TBFG_11542 TBFG_11543     FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   NA
 3478157 3478158 TBFG_11543 TBFG_11544     TRUE 0.729 4.000 0.000 NA   NA
 3478158 3478159 TBFG_11544 TBFG_11545     FALSE 0.145 58.000 0.000 NA   NA
 3478159 3478160 TBFG_11545 TBFG_11546     TRUE 0.998 -3.000 0.160 0.003 Y NA
 3478160 3478161 TBFG_11546 TBFG_11547     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478162 3478163 TBFG_11548 TBFG_11549     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3478163 3478164 TBFG_11549 TBFG_11550     TRUE 0.775 3.000 0.000 NA   NA
 3478165 3478166 TBFG_11551 TBFG_11552     FALSE 0.484 9.000 0.000 NA   NA
 3478166 3478167 TBFG_11552 TBFG_11553     FALSE 0.030 392.000 0.000 NA Y NA
 3478167 3478168 TBFG_11553 TBFG_11554     FALSE 0.001 234.000 0.000 NA N NA
 3478170 3478171 TBFG_11556 TBFG_11557     FALSE 0.089 30.000 0.000 1.000 N NA
 3478171 3478172 TBFG_11557 TBFG_11558     FALSE 0.169 47.000 0.000 NA   NA
 3478173 3478174 TBFG_11559 TBFG_11560     FALSE 0.104 23.000 0.000 1.000 N NA
 3478174 3478175 TBFG_11560 TBFG_11561     FALSE 0.002 544.000 0.000 NA   NA
 3478176 3478177 TBFG_11562 TBFG_11563     FALSE 0.021 117.000 0.000 1.000 N NA
 3478177 3478178 TBFG_11563 TBFG_11564     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 3478180 3478181 TBFG_11566 TBFG_11567     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3478181 3478182 TBFG_11567 TBFG_11568     FALSE 0.002 565.000 0.000 NA   NA
 3478182 3478183 TBFG_11568 TBFG_11569   ileS FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 3478183 3478184 TBFG_11569 TBFG_11570 ileS   FALSE 0.014 212.000 0.014 1.000 N NA
 3478186 3478187 TBFG_11572 TBFG_11573 lspA   TRUE 0.746 -7.000 0.073 1.000 N NA
 3478188 3478189 TBFG_11574 TBFG_11575     FALSE 0.303 55.000 0.050 NA   NA
 3478190 3478191 TBFG_11576 TBFG_11577     TRUE 0.991 5.000 0.750 0.050   NA
 3478191 3478192 TBFG_11577 TBFG_11578     FALSE 0.247 22.000 0.000 NA   NA
 3478192 3478193 TBFG_11578 TBFG_11579     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 3478193 3478194 TBFG_11579 TBFG_11580   dnaE FALSE 0.185 68.000 0.003 NA   NA
 3478196 3478197 TBFG_11582 TBFG_11583     TRUE 0.949 14.000 0.333 1.000 Y NA
 3478197 3478198 TBFG_11583 TBFG_11584     FALSE 0.001 371.000 0.000 1.000 N NA
 3478198 3478199 TBFG_11584 TBFG_11585     TRUE 0.995 6.000 0.470 0.003 Y NA
 3478199 3478200 TBFG_11585 TBFG_11586     TRUE 0.999 -3.000 0.454 0.003 Y NA
 3478200 3478201 TBFG_11586 TBFG_11587     TRUE 0.999 -3.000 0.787 0.003 Y NA
 3478201 3478202 TBFG_11587 TBFG_11588     FALSE 0.051 68.000 0.000 1.000 N NA
 3478202 3478203 TBFG_11588 TBFG_11589     FALSE 0.055 139.000 0.000 1.000   NA
 3478203 3478204 TBFG_11589 TBFG_11590     FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3478204 3478205 TBFG_11590 TBFG_11591     FALSE 0.338 35.000 0.033 NA   NA
 3478205 3478206 TBFG_11591 TBFG_11592     FALSE 0.017 38.000 0.000 NA N NA
 3478206 3478207 TBFG_11592 TBFG_11593     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 3478208 3478209 TBFG_11594 TBFG_11595     TRUE 0.991 -7.000 0.263 0.004 Y NA
 3478209 3478210 TBFG_11595 TBFG_11596     TRUE 0.992 4.000 0.061 0.004 Y NA
 3478210 3478211 TBFG_11596 TBFG_11597     FALSE 0.314 39.000 0.073 1.000 N NA
 3478211 3478212 TBFG_11597 TBFG_11598     FALSE 0.388 99.000 0.400 NA N NA
 3478212 3478213 TBFG_11598 TBFG_11599     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3478214 3478215 TBFG_11600 TBFG_11601     TRUE 0.998 -3.000 0.033 0.001 Y NA
 3478215 3478216 TBFG_11601 TBFG_11602   bioD TRUE 0.999 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 3478216 3478217 TBFG_11602 TBFG_11603 bioD   TRUE 0.950 0.000 0.036 1.000   NA
 3478218 3478219 TBFG_11604 TBFG_11605     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 3478220 3478221 TBFG_11606 TBFG_11607     FALSE 0.009 237.000 0.000 NA   NA
 3478222 3478223 TBFG_11608 TBFG_11609     FALSE 0.047 257.000 0.273 NA   NA
 3478224 3478225 TBFG_11610 TBFG_11611     TRUE 0.998 0.000 0.210 0.003 Y NA
 3478225 3478226 TBFG_11611 TBFG_11612     TRUE 0.998 0.000 0.223 0.003 Y NA
 3478226 3478227 TBFG_11612 TBFG_11613     FALSE 0.239 49.000 0.000 1.000   NA
 3478229 3478230 TBFG_11615 TBFG_11616 hisD   TRUE 0.998 -3.000 0.112 0.003 Y NA
 3478230 3478231 TBFG_11616 TBFG_11617   hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 3478231 3478232 TBFG_11617 TBFG_11618 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 3478232 3478233 TBFG_11618 TBFG_11619 hisH   TRUE 0.986 13.000 0.491 0.003 Y NA
 3478233 3478234 TBFG_11619 TBFG_11620     TRUE 0.842 8.000 0.266 1.000 N NA
 3478234 3478235 TBFG_11620 TBFG_11621     TRUE 0.837 2.000 0.021 1.000 N NA
 3478235 3478236 TBFG_11621 TBFG_11622   hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 3478236 3478237 TBFG_11622 TBFG_11623 hisI   FALSE 0.015 181.000 0.002 1.000 N NA
 3478239 3478240 TBFG_11625 TBFG_11626     TRUE 0.955 -10.000 0.690 NA   NA
 3478240 3478241 TBFG_11626 TBFG_11627   trpC FALSE 0.319 60.000 0.070 NA   NA
 3478241 3478242 TBFG_11627 TBFG_11628 trpC   TRUE 0.892 69.000 0.070 0.001 Y NA
 3478242 3478243 TBFG_11628 TBFG_11629   trpA TRUE 0.998 0.000 0.153 0.001 Y NA
 3478243 3478244 TBFG_11629 TBFG_11630 trpA   TRUE 0.868 0.000 0.011 1.000 N NA
 3478244 3478245 TBFG_11630 TBFG_11631     FALSE 0.002 676.000 0.000 NA   NA
 3478245 3478246 TBFG_11631 TBFG_11632     TRUE 0.781 -10.000 0.111 NA   NA
 3478246 3478247 TBFG_11632 TBFG_11633     FALSE 0.222 108.000 0.083 1.000   NA
 3478247 3478248 TBFG_11633 TBFG_11634     TRUE 0.888 8.000 0.361 1.000 N NA
 3478248 3478249 TBFG_11634 TBFG_11635     FALSE 0.460 58.000 0.214 NA   NA
 3478250 3478251 TBFG_11636 TBFG_11637     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 3478251 3478252 TBFG_11637 TBFG_11638     TRUE 0.691 87.000 0.151 1.000 Y NA
 3478252 3478253 TBFG_11638 TBFG_11639     TRUE 0.981 30.000 0.925 0.044 Y NA
 3478253 3478254 TBFG_11639 TBFG_11640     FALSE 0.180 111.000 0.104 NA   NA
 3478254 3478255 TBFG_11640 TBFG_11641     FALSE 0.536 29.000 0.176 NA   NA
 3478255 3478256 TBFG_11641 TBFG_14020     FALSE 0.129 67.000 0.000 NA   NA
 3478258 3478259 TBFG_11643 TBFG_11644     TRUE 0.996 -3.000 0.850 NA   NA
 3478260 3478261 TBFG_11645 TBFG_11646   rpsA FALSE 0.021 163.000 0.005 1.000 N NA
 3478261 3478262 TBFG_11646 TBFG_11647 rpsA coaE FALSE 0.268 26.000 0.024 1.000 N NA
 3478264 3478265 TBFG_11649 TBFG_11650     TRUE 0.953 -3.000 0.006 1.000   NA
 3478270 3478271 TBFG_11655 TBFG_11656     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3478271 3478272 TBFG_11656 TBFG_11657   lysS FALSE 0.303 59.000 0.057 NA   NA
 3478273 3478274 TBFG_11658 TBFG_11659 infC rpmI TRUE 0.928 50.000 0.652 1.000 Y NA
 3478274 3478275 TBFG_11659 TBFG_11660 rpmI rplT TRUE 0.972 62.000 0.928 0.015 Y NA
 3478275 3478276 TBFG_11660 TBFG_11661 rplT   TRUE 0.908 33.000 0.057 0.012 Y NA
 3478278 3478279 TBFG_11663 TBFG_11664     FALSE 0.322 78.000 0.143 NA   NA
 3478279 3478280 TBFG_11664 TBFG_11665     TRUE 0.862 7.000 0.214 NA   NA
 3478280 3478281 TBFG_11665 TBFG_11666   pheS FALSE 0.023 196.000 0.002 NA   NA
 3478281 3478282 TBFG_11666 TBFG_11667 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.001 Y NA
 3478283 3478284 TBFG_11668 TBFG_11669     FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 3478285 3478286 TBFG_11670 TBFG_11671 argC argJ TRUE 0.999 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 3478286 3478287 TBFG_11671 TBFG_11672 argJ   TRUE 0.999 -3.000 0.239 0.002 Y NA
 3478287 3478288 TBFG_11672 TBFG_11673   argD TRUE 0.994 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 3478288 3478289 TBFG_11673 TBFG_11674 argD   TRUE 0.994 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 3478289 3478290 TBFG_11674 TBFG_11675     TRUE 0.608 -21.000 0.088 1.000 N NA
 3478290 3478291 TBFG_11675 TBFG_11676     TRUE 0.616 9.000 0.054 1.000 N NA
 3478291 3478292 TBFG_11676 TBFG_11677     TRUE 0.785 80.000 0.278 1.000 Y NA
 3478292 3478293 TBFG_11677 TBFG_11678     FALSE 0.056 109.000 0.003 1.000 N NA
 3478293 3478294 TBFG_11678 TBFG_11679     TRUE 0.963 83.000 1.000 0.018 Y NA
 3478294 3478295 TBFG_11679 TBFG_11680     TRUE 0.988 20.000 1.000 0.009 Y NA
 3478295 3478296 TBFG_11680 TBFG_11681     TRUE 0.995 0.000 0.000 0.009 Y NA
 3478296 3478297 TBFG_11681 TBFG_11682     TRUE 0.981 6.000 0.000 0.005 Y NA
 3478297 3478298 TBFG_11682 TBFG_11683     TRUE 0.838 147.000 0.750 0.018 Y NA
 3478299 3478300 TBFG_11684 TBFG_11685     FALSE 0.531 15.000 0.008 1.000   NA
 3478301 3478302 TBFG_11686 TBFG_11687     FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3478302 3478303 TBFG_11687 TBFG_11688     FALSE 0.515 8.000 0.000 NA   NA
 3478304 3478305 TBFG_11689 TBFG_11690     FALSE 0.007 93.000 0.000 NA N NA
 3478305 3478306 TBFG_11690 TBFG_11691     FALSE 0.021 28.000 0.000 NA N NA
 3478306 3478307 TBFG_11691 TBFG_11692     FALSE 0.020 325.000 0.000 0.027 N NA
 3478308 3478309 TBFG_11693 TBFG_11694     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.003   NA
 3478309 3478310 TBFG_11694 TBFG_11695     FALSE 0.079 101.000 0.000 NA   NA
 3478310 3478311 TBFG_11695 TBFG_11696     TRUE 0.936 0.000 0.037 NA   NA
 3478311 3478312 TBFG_11696 TBFG_11697     TRUE 0.751 9.000 0.222 NA N NA
 3478312 3478313 TBFG_11697 TBFG_11698     TRUE 0.956 -3.000 0.047 NA   NA
 3478313 3478314 TBFG_11698 TBFG_11699     FALSE 0.024 161.000 0.000 NA   NA
 3478314 3478315 TBFG_11699 TBFG_11700     FALSE 0.006 274.000 0.000 NA   NA
 3478316 3478317 TBFG_11701 TBFG_11702     TRUE 0.981 2.000 0.400 1.000   NA
 3478317 3478318 TBFG_11702 TBFG_11703     TRUE 0.832 72.000 0.089 0.080 Y NA
 3478319 3478320 TBFG_11704 TBFG_11705     TRUE 0.542 12.000 0.067 1.000 N NA
 3478320 3478321 TBFG_11705 TBFG_11706     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 3478321 3478322 TBFG_11706 TBFG_11707     FALSE 0.182 39.000 0.000 NA   NA
 3478322 3478323 TBFG_11707 TBFG_11708     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   NA
 3478323 3478324 TBFG_11708 TBFG_11709     FALSE 0.022 181.000 0.019 1.000 N NA
 3478324 3478325 TBFG_11709 TBFG_11710   ppnK TRUE 0.943 0.000 0.120 1.000 N NA
 3478325 3478326 TBFG_11710 TBFG_11711 ppnK   TRUE 0.544 14.000 0.094 1.000 N NA
 3478326 3478327 TBFG_11711 TBFG_11712     FALSE 0.445 96.000 0.049 0.080   NA
 3478327 3478328 TBFG_11712 TBFG_11713     TRUE 0.887 22.000 0.798 NA   NA
 3478328 3478329 TBFG_11713 TBFG_11714     FALSE 0.061 140.000 0.014 NA   NA
 3478329 3478330 TBFG_11714 TBFG_11715     TRUE 0.827 -7.000 0.055 1.000   NA
 3478330 3478331 TBFG_11715 TBFG_11716   xerD TRUE 0.969 -3.000 0.063 1.000   NA
 3478332 3478333 TBFG_11717 TBFG_11718     FALSE 0.002 556.000 0.000 NA   NA
 3478333 3478334 TBFG_11718 TBFG_11719     FALSE 0.427 -46.000 0.000 1.000   NA
 3478334 3478335 TBFG_11719 TBFG_11720     FALSE 0.016 41.000 0.000 NA N NA
 3478335 3478336 TBFG_11720 TBFG_11721     TRUE 0.692 40.000 0.000 NA Y NA
 3478337 3478338 TBFG_11722 TBFG_11723     FALSE 0.121 18.000 0.000 1.000 N NA
 3478338 3478339 TBFG_11723 TBFG_11724     TRUE 0.961 -3.000 0.065 NA   NA
 3478339 3478340 TBFG_11724 TBFG_11725     TRUE 0.993 -3.000 0.570 NA   NA
 3478340 3478341 TBFG_11725 TBFG_11726     TRUE 0.967 -3.000 0.224 NA N NA
 3478341 3478342 TBFG_11726 TBFG_11727   cmk TRUE 0.932 -3.000 0.042 1.000 N NA
 3478342 3478343 TBFG_11727 TBFG_11728 cmk engA TRUE 0.991 -3.000 0.060 0.014   NA
 3478343 3478344 TBFG_11728 TBFG_11729 engA   FALSE 0.032 174.000 0.000 1.000   NA
 3478344 3478345 TBFG_11729 TBFG_11730     TRUE 0.955 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 3478345 3478346 TBFG_11730 TBFG_11731     TRUE 0.920 3.000 0.105 NA   NA
 3478346 3478347 TBFG_11731 TBFG_11732     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3478347 3478348 TBFG_11732 TBFG_11733     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 3478348 3478349 TBFG_11733 TBFG_11734     FALSE 0.451 14.000 0.000 1.000   NA
 3478349 3478350 TBFG_11734 TBFG_14021     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 3478352 3478353 TBFG_11736 TBFG_11737     TRUE 0.958 -3.000 0.121 1.000 N NA
 3478354 3478355 TBFG_11738 TBFG_11739     FALSE 0.266 -1058.000 0.000 NA   NA
 3478355 3478356 TBFG_11739 TBFG_11740     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478356 3478357 TBFG_11740 TBFG_11742     FALSE 0.007 332.000 0.000 1.000   NA
 3478358 3478359 TBFG_11743 TBFG_11744     FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3478360 3478361 TBFG_11745 TBFG_11746     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478361 3478362 TBFG_11746 TBFG_11747     FALSE 0.001 237.000 0.000 NA N NA
 3478364 3478365 TBFG_11749 TBFG_11750     FALSE 0.133 64.000 0.000 NA   NA
 3478365 3478366 TBFG_11750 TBFG_11751     FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 3478366 3478367 TBFG_11751 TBFG_11752     FALSE 0.010 275.000 0.000 1.000   NA
 3478367 3478368 TBFG_11752 TBFG_11753     TRUE 0.958 3.000 0.000 0.046   NA
 3478368 3478369 TBFG_11753 TBFG_11754     FALSE 0.125 99.000 0.000 1.000   NA
 3478369 3478370 TBFG_11754 TBFG_11755     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3478373 3478374 TBFG_11758 TBFG_11759     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3478374 3478375 TBFG_11759 TBFG_11760     FALSE 0.515 8.000 0.000 NA   NA
 3478375 3478376 TBFG_11760 TBFG_11761     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 3478377 3478378 TBFG_11762 TBFG_11763     FALSE 0.513 -10.000 0.000 NA   NA
 3478379 3478380 TBFG_11764 TBFG_11765     FALSE 0.348 68.000 0.000 0.079 N NA
 3478380 3478381 TBFG_11765 TBFG_11766     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 3478382 3478383 TBFG_11767 TBFG_11768     FALSE 0.102 84.000 0.000 NA   NA
 3478384 3478385 TBFG_11769 TBFG_11770     FALSE 0.046 127.000 0.000 NA   NA
 3478386 3478387 TBFG_11771 TBFG_11772     FALSE 0.014 204.000 0.000 NA   NA
 3478387 3478388 TBFG_11772 TBFG_11773     FALSE 0.019 178.000 0.000 NA   NA
 3478388 3478389 TBFG_11773 TBFG_11774     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478389 3478390 TBFG_11774 TBFG_11775     FALSE 0.009 283.000 0.000 1.000   NA
 3478390 3478391 TBFG_11775 TBFG_11776     FALSE 0.357 129.000 0.000 1.000 Y NA
 3478392 3478393 TBFG_11777 TBFG_11778     FALSE 0.023 201.000 0.000 1.000   NA
 3478393 3478394 TBFG_11778 TBFG_11779     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 3478395 3478396 TBFG_11780 TBFG_11781     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478396 3478397 TBFG_11781 TBFG_11783     FALSE 0.002 805.000 0.000 NA   NA
 3478398 3478399 TBFG_11784 TBFG_11785     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478399 3478400 TBFG_11785 TBFG_11786     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 3478401 3478402 TBFG_11787 TBFG_11788     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 3478402 3478403 TBFG_11788 TBFG_11789     FALSE 0.034 140.000 0.000 NA   NA
 3478403 3478404 TBFG_11789 TBFG_11790     FALSE 0.003 411.000 0.000 NA   NA
 3478405 3478406 TBFG_11791 TBFG_11792     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478408 3478409 TBFG_11794 TBFG_11795     FALSE 0.127 68.000 0.000 NA   NA
 3478409 3478410 TBFG_11795 TBFG_11796     FALSE 0.055 181.000 0.087 NA   NA
 3478410 3478411 TBFG_11796 TBFG_11797     FALSE 0.045 165.000 0.025 NA   NA
 3478411 3478412 TBFG_11797 TBFG_11798     TRUE 0.666 8.000 0.016 NA   NA
 3478412 3478413 TBFG_11798 TBFG_11799     TRUE 0.958 -3.000 0.016 1.000   NA
 3478413 3478414 TBFG_11799 TBFG_11800     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 3478416 3478417 TBFG_11802 TBFG_11803     TRUE 0.951 0.000 0.080 NA   NA
 3478420 3478421 TBFG_11806 TBFG_11807     TRUE 0.785 51.000 0.308 0.064   NA
 3478421 3478422 TBFG_11807 TBFG_11809     FALSE 0.002 1211.000 0.000 NA   NA
 3478422 3478423 TBFG_11809 TBFG_11810     FALSE 0.082 99.000 0.000 NA   NA
 3478426 3478427 TBFG_11813 TBFG_11814     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3478429 3478430 TBFG_11816 TBFG_11817     FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 3478430 3478431 TBFG_11817 TBFG_11818     FALSE 0.111 79.000 0.000 NA   NA
 3478431 3478432 TBFG_11818 TBFG_11819     TRUE 0.908 14.000 0.667 NA   NA
 3478432 3478433 TBFG_11819 TBFG_11820     FALSE 0.025 454.000 0.000 NA Y NA
 3478433 3478434 TBFG_11820 TBFG_11821     FALSE 0.003 409.000 0.000 NA   NA
 3478434 3478435 TBFG_11821 TBFG_11822     FALSE 0.032 143.000 0.000 NA   NA
 3478435 3478436 TBFG_11822 TBFG_11824     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 3478436 3478437 TBFG_11824 TBFG_11825     FALSE 0.537 88.000 0.429 NA   NA
 3478437 3478438 TBFG_11825 TBFG_11826     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3478438 3478439 TBFG_11826 TBFG_11827     TRUE 0.951 -22.000 1.000 NA   NA
 3478439 3478440 TBFG_11827 TBFG_11828     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3478440 3478441 TBFG_11828 TBFG_11829     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3478441 3478442 TBFG_11829 TBFG_11830     FALSE 0.002 627.000 0.000 NA   NA
 3478442 3478443 TBFG_11830 TBFG_11831     FALSE 0.077 103.000 0.000 NA   NA
 3478443 3478444 TBFG_11831 TBFG_11832     FALSE 0.021 581.000 0.000 NA Y NA
 3478444 3478445 TBFG_11832 TBFG_11833     FALSE 0.397 112.000 0.000 NA Y NA
 3478446 3478447 TBFG_11834 TBFG_11835     FALSE 0.029 148.000 0.000 NA   NA
 3478448 3478449 TBFG_11836 TBFG_11837     FALSE 0.324 15.000 0.000 NA   NA
 3478449 3478450 TBFG_11837 TBFG_11838     FALSE 0.044 324.000 0.000 NA Y NA
 3478450 3478451 TBFG_11838 TBFG_11839     TRUE 0.753 126.000 0.667 NA Y NA
 3478451 3478452 TBFG_11839 TBFG_11840     FALSE 0.206 245.000 1.000 NA   NA
 3478452 3478453 TBFG_11840 TBFG_11841     FALSE 0.048 154.000 0.014 NA   NA
 3478454 3478455 TBFG_11842 TBFG_11843     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 3478456 3478457 TBFG_11844 TBFG_11845     FALSE 0.158 105.000 0.045 NA   NA
 3478457 3478458 TBFG_11845 TBFG_11846     FALSE 0.199 63.000 0.000 1.000   NA
 3478458 3478459 TBFG_11846 TBFG_11847     FALSE 0.001 635.000 0.000 1.000 N NA
 3478460 3478461 TBFG_11848 TBFG_11849     FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 3478462 3478463 TBFG_11850 TBFG_11851     FALSE 0.510 15.000 0.082 1.000 N NA
 3478463 3478464 TBFG_11851 TBFG_11852     FALSE 0.022 197.000 0.038 1.000 N NA
 3478464 3478465 TBFG_11852 TBFG_11853     TRUE 0.830 -7.000 0.114 NA   NA
 3478465 3478466 TBFG_11853 TBFG_11854     TRUE 0.742 29.000 0.409 NA   NA
 3478466 3478467 TBFG_11854 TBFG_11855     TRUE 0.809 17.000 0.409 NA   NA
 3478467 3478468 TBFG_11855 TBFG_11856     TRUE 0.718 38.000 0.434 NA   NA
 3478468 3478469 TBFG_11856 TBFG_11857     FALSE 0.030 240.000 0.242 NA N NA
 3478469 3478470 TBFG_11857 TBFG_11858     TRUE 0.993 -3.000 0.707 NA N NA
 3478470 3478471 TBFG_11858 TBFG_11859     FALSE 0.167 119.000 0.133 NA   NA
 3478471 3478472 TBFG_11859 TBFG_11860     FALSE 0.009 348.000 0.043 NA   NA
 3478472 3478473 TBFG_11860 TBFG_11861     FALSE 0.003 359.000 0.002 1.000 N NA
 3478476 3478477 TBFG_11864 TBFG_11865     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3478477 3478478 TBFG_11865 TBFG_11866     FALSE 0.145 120.000 0.089 NA   NA
 3478478 3478479 TBFG_11866 TBFG_11867     FALSE 0.005 294.000 0.000 NA   NA
 3478479 3478480 TBFG_11867 TBFG_11868     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 3478480 3478481 TBFG_11868 TBFG_11869     FALSE 0.023 163.000 0.000 NA   NA
 11437379 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11579742 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11722134 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3645.000 0.000 NA   NA
 11437380 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3665.000 0.000 NA   NA
 11579743 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3665.000 0.000 NA   NA
 11722135 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3665.000 0.000 NA   NA
 11437381 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3714.000 0.000 NA   NA
 11579744 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3714.000 0.000 NA   NA
 11722136 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3714.000 0.000 NA   NA
 11437382 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11579745 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11722137 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3734.000 0.000 NA   NA
 11437383 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3753.000 0.000 NA   NA
 11579746 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3753.000 0.000 NA   NA
 11722138 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3753.000 0.000 NA   NA
 11437384 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3773.000 0.000 NA   NA
 11579747 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3773.000 0.000 NA   NA
 11722139 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3773.000 0.000 NA   NA
 11437385 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3804.000 0.000 NA   NA
 11579748 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3804.000 0.000 NA   NA
 11722140 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3804.000 0.000 NA   NA
 11437386 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3824.000 0.000 NA   NA
 11579749 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3824.000 0.000 NA   NA
 11722141 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3824.000 0.000 NA   NA
 11437387 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3843.000 0.000 NA   NA
 11579750 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3843.000 0.000 NA   NA
 11722142 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3843.000 0.000 NA   NA
 11437388 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3863.000 0.000 NA   NA
 11579751 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3863.000 0.000 NA   NA
 11722143 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3863.000 0.000 NA   NA
 11437389 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3888.000 0.000 NA   NA
 11579752 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3888.000 0.000 NA   NA
 11722144 3478477   TBFG_11865     FALSE NA 3888.000 0.000 NA   NA
 3478481 3478482 TBFG_11869 TBFG_11870     TRUE 0.997 0.000 0.815 0.045   NA
 3478482 3478483 TBFG_11870 TBFG_11871     FALSE 0.146 174.000 0.038 0.096   NA
 3478483 3478484 TBFG_11871 TBFG_11872     FALSE 0.222 36.000 0.023 1.000 N NA
 3478484 3478485 TBFG_11872 TBFG_11873     FALSE 0.250 30.000 0.023 1.000 N NA
 3478485 3478486 TBFG_11873 TBFG_11874     TRUE 0.916 15.000 0.850 1.000 N NA
 3478487 3478488 TBFG_11875 TBFG_11876   ureA FALSE 0.388 49.000 0.222 NA N NA
 3478488 3478489 TBFG_11876 TBFG_11877 ureA ureB TRUE 0.998 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 3478489 3478490 TBFG_11877 TBFG_11878 ureB ureC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.001 Y NA
 3478490 3478491 TBFG_11878 TBFG_11879 ureC   TRUE 0.987 0.000 0.061 0.002 N NA
 3478491 3478492 TBFG_11879 TBFG_11880     TRUE 0.989 11.000 0.439 0.002 Y NA
 3478492 3478493 TBFG_11880 TBFG_11881     TRUE 0.938 -10.000 0.032 0.002   NA
 3478494 3478495 TBFG_11882 TBFG_11883     TRUE 0.636 142.000 0.500 1.000 Y NA
 3478495 3478496 TBFG_11883 TBFG_11884     TRUE 0.743 39.000 0.571 1.000 N NA
 3478497 3478498 TBFG_11885 TBFG_11886     TRUE 0.998 3.000 0.578 0.001 Y NA
 3478498 3478499 TBFG_11886 TBFG_11887     TRUE 0.949 7.000 0.018 1.000 Y NA
 3478499 3478500 TBFG_11887 TBFG_11888     FALSE 0.370 53.000 0.052 1.000   NA
 3478500 3478501 TBFG_11888 TBFG_11889     FALSE 0.017 452.000 0.238 1.000   NA
 3478501 3478502 TBFG_11889 TBFG_11890     FALSE 0.420 75.000 0.189 1.000   NA
 3478503 3478504 TBFG_11891 TBFG_11892     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 3478504 3478505 TBFG_11892 TBFG_11893     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3478506 3478507 TBFG_11894 TBFG_11895     FALSE 0.015 288.000 0.143 1.000 N NA
 3478507 3478508 TBFG_11895 TBFG_11896     FALSE 0.257 99.000 0.214 1.000 N NA
 3478509 3478510 TBFG_11897 TBFG_11898     FALSE 0.122 100.000 0.000 1.000   NA
 3478510 3478511 TBFG_11898 TBFG_11899     FALSE 0.132 65.000 0.000 NA   NA
 3478511 3478512 TBFG_11899 TBFG_11900     FALSE 0.242 23.000 0.000 NA   NA
 3478513 3478514 TBFG_11901 TBFG_11902     FALSE 0.150 55.000 0.000 NA   NA
 3478514 3478515 TBFG_11902 TBFG_11903     TRUE 0.758 11.000 0.188 NA   NA
 3478515 3478516 TBFG_11903 TBFG_11904     FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000   NA
 3478516 3478517 TBFG_11904 TBFG_11905     FALSE 0.229 85.000 0.135 1.000 N NA
 3478517 3478518 TBFG_11905 TBFG_11906     FALSE 0.061 55.000 0.000 1.000 N NA
 3478518 3478519 TBFG_11906 TBFG_11907     TRUE 0.974 3.000 0.364 1.000   NA
 3478520 3478521 TBFG_11908 TBFG_11909     TRUE 0.555 50.000 0.273 NA   NA
 3478521 3478522 TBFG_11909 TBFG_11910     FALSE 0.383 41.000 0.070 NA   NA
 3478522 3478523 TBFG_11910 TBFG_11911     FALSE 0.472 28.000 0.093 NA   NA
 3478523 3478524 TBFG_11911 TBFG_11912     TRUE 0.680 39.000 0.375 NA   NA
 3478524 3478525 TBFG_11912 TBFG_11913     TRUE 0.615 12.000 0.018 1.000   NA
 3478525 3478526 TBFG_11913 TBFG_11914     FALSE 0.418 18.000 0.018 NA   NA
 3478528 3478529 TBFG_11916 TBFG_11917     FALSE 0.002 582.000 0.000 NA   NA
 3478529 3478530 TBFG_11917 TBFG_11918     FALSE 0.143 59.000 0.000 NA   NA
 3478531 3478532 TBFG_11919 TBFG_11920     TRUE 0.773 17.000 0.333 NA   NA
 3478532 3478533 TBFG_11920 TBFG_11921     TRUE 0.888 10.000 0.375 NA   NA
 3478535 3478536 TBFG_11923 TBFG_11924     FALSE 0.029 148.000 0.000 NA   NA
 3478537 3478538 TBFG_11925 TBFG_11926     FALSE 0.420 5.000 0.004 NA N NA
 3478540 3478541 TBFG_11928 TBFG_11929     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3478544 3478545 TBFG_11932 TBFG_11933     FALSE 0.017 186.000 0.000 NA   NA
 3478546 3478547 TBFG_11934 TBFG_11935     FALSE 0.500 30.000 0.143 NA   NA
 3478547 3478548 TBFG_11935 TBFG_11936     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 3478548 3478549 TBFG_11936 TBFG_11937     TRUE 0.555 7.000 0.000 NA   NA
 3478549 3478550 TBFG_11937 TBFG_11938     TRUE 0.793 38.000 0.057 1.000 Y NA
 3478550 3478551 TBFG_11938 TBFG_11939     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 3478551 3478552 TBFG_11939 TBFG_11940     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 3478552 3478553 TBFG_11940 TBFG_11941     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3478556 3478557 TBFG_11944 TBFG_11945     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.001   NA
 3478558 3478559 TBFG_11946 TBFG_11947     FALSE 0.040 338.000 0.000 NA Y NA
 3478559 3478560 TBFG_11947 TBFG_11948     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 3478563 3478564 TBFG_11951 TBFG_11952     TRUE 0.991 -9.000 0.333 0.004 Y NA
 3478569 3478570 TBFG_11957 TBFG_11958     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 3478570 3478571 TBFG_11958 TBFG_11959     FALSE 0.380 12.000 0.000 NA   NA
 3478571 3478572 TBFG_11959 TBFG_11960     FALSE 0.273 18.000 0.000 NA   NA
 3478574 3478575 TBFG_11962 TBFG_11963     TRUE 0.999 2.000 0.800 0.010 Y NA
 3478575 3478576 TBFG_11963 TBFG_11964     TRUE 0.967 15.000 0.600 1.000 Y NA
 3478577 3478578 TBFG_11965 TBFG_11966     TRUE 0.994 3.000 0.500 NA Y NA
 3478578 3478579 TBFG_11966 TBFG_11967     TRUE 0.955 12.000 1.000 1.000   NA
 3478579 3478580 TBFG_11967 TBFG_11968     TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000   NA
 3478580 3478581 TBFG_11968 TBFG_11969     TRUE 0.964 -3.000 0.036 1.000   NA
 3478581 3478582 TBFG_11969 TBFG_11970     TRUE 0.928 -3.000 0.036 1.000 N NA
 3478583 3478584 TBFG_11971 TBFG_11972     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 3478584 3478585 TBFG_11972 TBFG_11973     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478589 3478590 TBFG_11977 TBFG_11978     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3478590 3478591 TBFG_11978 TBFG_11979     FALSE 0.253 21.000 0.000 NA   NA
 3478591 3478592 TBFG_11979 TBFG_11980     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3478593 3478594 TBFG_11981 TBFG_11982     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478594 3478595 TBFG_11982 TBFG_11983     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 3478595 3478596 TBFG_11983 TBFG_11984     FALSE 0.177 42.000 0.000 NA   NA
 3478596 3478597 TBFG_11984 TBFG_11985     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3478598 3478599 TBFG_11986 TBFG_11987     FALSE 0.164 49.000 0.000 NA   NA
 3478599 3478600 TBFG_11987 TBFG_11988     TRUE 0.989 -3.000 0.385 NA   NA
 3478602 3478603 TBFG_11990 TBFG_11991     TRUE 0.949 4.000 0.286 NA   NA
 3478603 3478604 TBFG_11991 TBFG_11992     FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3478604 3478605 TBFG_11992 TBFG_11993     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 3478606 3478607 TBFG_11994 TBFG_11995     FALSE 0.445 -16.000 0.000 NA   NA
 3478607 3478608 TBFG_11995 TBFG_11996     TRUE 0.962 10.000 1.000 NA   NA
 3478608 3478609 TBFG_11996 TBFG_11997     TRUE 0.993 5.000 0.750 NA Y NA
 3478609 3478610 TBFG_11997 TBFG_11998     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3478610 3478611 TBFG_11998 TBFG_11999     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3478611 3478612 TBFG_11999 TBFG_12000     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3478612 3478613 TBFG_12000 TBFG_12001     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 3478613 3478614 TBFG_12001 TBFG_12002     TRUE 0.998 1.000 0.400 0.007 Y NA
 3478614 3478615 TBFG_12002 TBFG_12003     TRUE 0.770 22.000 0.400 NA   NA
 3478615 3478616 TBFG_12003 TBFG_12004     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3478616 3478617 TBFG_12004 TBFG_12005     FALSE 0.357 13.000 0.000 NA   NA
 3478617 3478618 TBFG_12005 TBFG_12006     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3478620 3478621 TBFG_12008 TBFG_12009     FALSE 0.026 108.000 0.000 1.000 N NA
 3478622 3478623 TBFG_12010 TBFG_12011     FALSE 0.019 179.000 0.000 NA   NA
 3478623 3478624 TBFG_12011 TBFG_12012   nrdF FALSE 0.016 191.000 0.000 NA   NA
 3478624 3478625 TBFG_12012 TBFG_12013 nrdF   FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 3478627 3478628 TBFG_12015 TBFG_12016     FALSE 0.004 430.000 0.000 1.000   NA
 3478629 3478630 TBFG_12017 TBFG_12018     FALSE 0.004 416.000 0.000 1.000   NA
 3478630 3478631 TBFG_12018 TBFG_12019     FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000   NA
 3478632 3478633 TBFG_12020 TBFG_12021     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3478633 3478634 TBFG_12021 TBFG_12022     FALSE 0.008 244.000 0.000 NA   NA
 3478634 3478635 TBFG_12022 TBFG_12023     FALSE 0.093 89.000 0.000 NA   NA
 3478635 3478636 TBFG_12023 TBFG_12024     FALSE 0.001 342.000 0.000 1.000 N NA
 3478636 3478637 TBFG_12024 TBFG_12025     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478637 3478638 TBFG_12025 TBFG_12026     FALSE 0.152 53.000 0.000 NA   NA
 3478639 3478640 TBFG_12027 TBFG_12028     FALSE 0.085 96.000 0.000 NA   NA
 3478640 3478641 TBFG_12028 TBFG_12029     FALSE 0.005 202.000 0.000 1.000 N NA
 3478642 3478643 TBFG_12030 TBFG_12031     FALSE 0.034 95.000 0.000 1.000 N NA
 3478644 3478645 TBFG_12032 TBFG_12033     TRUE 0.741 10.000 0.118 NA   NA
 3478645 3478646 TBFG_12033 TBFG_12034     TRUE 0.608 76.000 0.000 1.000 Y NA
 3478647 3478648 TBFG_12035 TBFG_12036     FALSE 0.213 58.000 0.000 1.000   NA
 3478648 3478649 TBFG_12036 TBFG_12037     FALSE 0.343 22.000 0.000 1.000   NA
 3478651 3478652 TBFG_12039 TBFG_12040     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 3478653 3478654 TBFG_12041 TBFG_12042     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3478656 3478657 TBFG_12044 TBFG_12045     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 3478657 3478658 TBFG_12045 TBFG_12046     TRUE 0.787 -46.000 0.000 0.013   NA
 3478659 3478660 TBFG_12047 TBFG_12048     FALSE 0.260 -1298.000 0.000 NA   NA
 3478660 3478661 TBFG_12048 TBFG_12049     TRUE 0.786 51.000 0.308 0.061   NA
 3478662 3478663 TBFG_12051 TBFG_12052     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478663 3478664 TBFG_12052 TBFG_12053     FALSE 0.009 242.000 0.000 NA   NA
 3478664 3478665 TBFG_12053 TBFG_12054     TRUE 0.554 56.000 0.294 NA   NA
 3478666 3478667 TBFG_12055 TBFG_12056     FALSE 0.268 -689.000 0.000 NA   NA
 3478667 3478668 TBFG_12056 TBFG_12057     TRUE 0.900 9.000 0.375 NA   NA
 3478668 3478669 TBFG_12057 TBFG_12058     FALSE 0.232 25.000 0.000 NA   NA
 3478669 3478670 TBFG_12058 TBFG_12059     FALSE 0.024 160.000 0.000 NA   NA
 3478670 3478671 TBFG_12059 TBFG_12060     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 3478671 3478672 TBFG_12060 TBFG_12062     FALSE 0.002 5514.000 0.000 NA   NA
 3478672 3478673 TBFG_12062 TBFG_12063     FALSE 0.022 115.000 0.000 1.000 N NA
 3478673 3478674 TBFG_12063 TBFG_12064     TRUE 0.724 40.000 0.000 1.000 Y NA
 3478674 3478675 TBFG_12064 TBFG_12065     TRUE 0.658 61.000 0.000 1.000 Y NA
 3478675 3478676 TBFG_12065 TBFG_12066     TRUE 0.765 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3478676 3478677 TBFG_12066 TBFG_12067     TRUE 0.566 17.000 0.050 1.000   NA
 3478677 3478678 TBFG_12067 TBFG_12068     TRUE 0.816 12.000 0.300 NA   NA
 3478681 3478682 TBFG_12071 TBFG_12072     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 3478682 3478683 TBFG_12072 TBFG_12073     TRUE 0.971 -3.000 0.150 NA   NA
 3478684 3478685 TBFG_12074 TBFG_12075     TRUE 0.983 2.000 0.444 1.000   NA
 3478685 3478686 TBFG_12075 TBFG_12076     TRUE 0.995 3.000 0.211 0.020 Y NA
 3478686 3478687 TBFG_12076 TBFG_12077     TRUE 0.980 -13.000 0.211 0.020 Y NA
 3478687 3478688 TBFG_12077 TBFG_12078     TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.020 Y NA
 3478688 3478689 TBFG_12078 TBFG_12079     TRUE 0.738 38.000 0.118 0.026   NA
 3478689 3478690 TBFG_12079 TBFG_12080     TRUE 0.936 0.000 0.005 1.000   NA
 3478690 3478691 TBFG_12080 TBFG_12081     FALSE 0.179 41.000 0.000 NA   NA
 3478691 3478692 TBFG_12081 TBFG_12082     FALSE 0.152 53.000 0.000 NA   NA
 3478694 3478695 TBFG_12084 TBFG_12085     TRUE 0.982 5.000 1.000 1.000 N NA
 3478695 3478696 TBFG_12085 TBFG_12086     FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 3478698 3478699 TBFG_12088 TBFG_12089     FALSE 0.262 158.000 0.041 0.003   NA
 3478699 3478700 TBFG_12089 TBFG_12090   fxsA TRUE 0.861 5.000 0.037 1.000   NA
 3478702 3478703 TBFG_12092 TBFG_12093   rpsN TRUE 0.994 1.000 0.024 0.014 Y NA
 3478703 3478704 TBFG_12093 TBFG_12094 rpsN rpmG TRUE 0.994 2.000 0.052 0.014 Y NA
 3478704 3478705 TBFG_12094 TBFG_12095 rpmG rpmB TRUE 0.998 0.000 0.332 0.014 Y NA
 3478707 3478708 TBFG_12097 TBFG_12098   cobN FALSE 0.263 84.000 0.045 1.000   NA
 3478709 3478710 TBFG_12099 TBFG_12100     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000   NA
 3478710 3478711 TBFG_12100 TBFG_12101   cobH TRUE 0.799 10.000 0.255 1.000 N NA
 3478711 3478712 TBFG_12101 TBFG_12102 cobH   TRUE 0.998 -3.000 0.096 0.008 Y NA
 3478713 3478714 TBFG_12103 TBFG_12104     FALSE 0.414 16.000 0.000 1.000   NA
 3478716 3478717 TBFG_12106 TBFG_12107     TRUE 0.998 -3.000 0.076 0.008 Y NA
 3478717 3478718 TBFG_12107 TBFG_12108     TRUE 0.997 -3.000 0.065 0.008 Y NA
 3478718 3478719 TBFG_12108 TBFG_12109     TRUE 0.613 68.000 0.364 1.000   NA
 3478721 3478722 TBFG_12111 TBFG_12112     FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 3478723 3478724 TBFG_12113 TBFG_12114     TRUE 0.786 51.000 0.308 0.061   NA
 3478726 3478727 TBFG_12116 TBFG_12117     FALSE 0.422 -19.000 0.000 NA   NA
 3478729 3478730 TBFG_12119 TBFG_12120     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478730 3478731 TBFG_12120 TBFG_12121     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 3478731 3478732 TBFG_12121 TBFG_12122     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 3478732 3478733 TBFG_12122 TBFG_12123     FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 3478736 3478737 TBFG_12126 TBFG_12127     FALSE 0.418 42.000 0.105 NA   NA
 3478737 3478738 TBFG_12127 TBFG_12128     FALSE 0.116 117.000 0.166 NA N NA
 3478738 3478739 TBFG_12128 TBFG_12129   tatA TRUE 0.846 17.000 0.031 NA Y NA
 3478739 3478740 TBFG_12129 TBFG_12130 tatA   FALSE 0.485 -28.000 0.110 NA N NA
 3478740 3478741 TBFG_12130 TBFG_12131     TRUE 0.998 -3.000 0.767 NA Y NA
 3478741 3478742 TBFG_12131 TBFG_12132     TRUE 0.808 9.000 0.188 NA   NA
 3478742 3478743 TBFG_12132 TBFG_12133     FALSE 0.154 52.000 0.000 NA   NA
 3478744 3478745 TBFG_12134 TBFG_12135     FALSE 0.023 199.000 0.000 1.000   NA
 3478745 3478746 TBFG_12135 TBFG_12136     TRUE 0.901 -7.000 0.222 1.000   NA
 3478747 3478748 TBFG_12137 TBFG_12138     TRUE 0.960 7.000 0.667 NA   NA
 3478748 3478749 TBFG_12138 TBFG_12139     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3478751 3478752 TBFG_12141 TBFG_12142     TRUE 1.000 -3.000 0.797 0.001 Y NA
 3478752 3478753 TBFG_12142 TBFG_12143     TRUE 0.992 -3.000 0.512 NA   NA
 3478753 3478754 TBFG_12143 TBFG_12144     TRUE 0.563 113.000 0.706 NA   NA
 3478755 3478756 TBFG_12145 TBFG_12146     TRUE 0.767 11.000 0.200 NA   NA
 3478758 3478759 TBFG_12148 TBFG_12149     TRUE 0.695 8.000 0.030 NA   NA
 3478762 3478763 TBFG_12152 TBFG_12153   hisG FALSE 0.225 79.000 0.006 1.000   NA
 3478763 3478764 TBFG_12153 TBFG_12154 hisG hisE TRUE 0.995 3.000 0.081 0.003 Y NA
 3478770 3478771 TBFG_12160 TBFG_12161     TRUE 0.546 26.000 0.096 1.000   NA
 3478771 3478772 TBFG_12161 TBFG_12162     FALSE 0.269 58.000 0.082 1.000 N NA
 3478772 3478773 TBFG_12162 TBFG_12163     FALSE 0.010 531.000 0.119 1.000   NA
 3478773 3478774 TBFG_12163 TBFG_12164     TRUE 0.945 11.000 0.810 NA   NA
 3478774 3478775 TBFG_12164 TBFG_12165     TRUE 0.722 64.000 0.608 NA   NA
 3478775 3478776 TBFG_12165 TBFG_12166     TRUE 0.924 -3.000 0.071 NA N NA
 3478776 3478777 TBFG_12166 TBFG_12167     FALSE 0.242 64.000 0.026 NA   NA
 3478778 3478779 TBFG_12168 TBFG_12169     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 3478780 3478781 TBFG_12170 TBFG_12171     FALSE 0.518 48.000 0.224 NA   NA
 3478785 3478786 TBFG_12174 TBFG_12175     FALSE 0.266 95.000 0.149 NA   NA
 3478786 3478787 TBFG_12175 TBFG_12176     FALSE 0.023 268.000 0.114 NA   NA
 3478787 3478788 TBFG_12176 TBFG_12177     FALSE 0.089 162.000 0.165 NA   NA
 3478788 3478789 TBFG_12177 TBFG_12178     TRUE 0.993 -3.000 0.581 NA   NA
 3478789 3478790 TBFG_12178 TBFG_12179     TRUE 0.806 6.000 0.061 NA   NA
 3478790 3478791 TBFG_12179 TBFG_12180     TRUE 0.684 11.000 0.082 NA   NA
 3478791 3478792 TBFG_12180 TBFG_12181     FALSE 0.039 173.000 0.067 1.000 N NA
 3478792 3478793 TBFG_12181 TBFG_12182   murC TRUE 0.995 -3.000 0.134 1.000 Y NA
 3478793 3478794 TBFG_12182 TBFG_12183 murC murG TRUE 0.996 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 3478794 3478795 TBFG_12183 TBFG_12184 murG   TRUE 0.964 -3.000 0.167 1.000 N NA
 3478795 3478796 TBFG_12184 TBFG_12185   murD TRUE 0.869 12.000 0.081 0.004 N NA
 3478796 3478797 TBFG_12185 TBFG_12186 murD mraY TRUE 0.999 2.000 0.647 0.004 Y NA
 3478797 3478798 TBFG_12186 TBFG_12187 mraY   TRUE 0.998 -3.000 0.071 0.004 Y NA
 3478798 3478799 TBFG_12187 TBFG_12188   murE TRUE 0.999 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 3478799 3478800 TBFG_12188 TBFG_12189 murE   FALSE 0.242 23.000 0.000 NA   NA
 3478800 3478801 TBFG_12189 TBFG_12190     FALSE 0.388 -22.000 0.000 NA   NA
 3478801 3478802 TBFG_12190 TBFG_12191     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 3478802 3478803 TBFG_12191 TBFG_12192     FALSE 0.077 103.000 0.000 NA   NA
 3478803 3478804 TBFG_12192 TBFG_12193     FALSE 0.013 210.000 0.000 NA   NA
 3478804 3478805 TBFG_12193 TBFG_12194     TRUE 0.971 -3.000 0.144 NA   NA
 3478805 3478806 TBFG_12194 TBFG_12195   mraW TRUE 0.950 -3.000 0.028 NA   NA
 3478806 3478807 TBFG_12195 TBFG_12196 mraW   TRUE 0.987 2.000 0.635 NA   NA
 3478807 3478808 TBFG_12196 TBFG_12197     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3478809 3478810 TBFG_12198 TBFG_12199     FALSE 0.356 96.000 0.250 NA   NA
 3478812 3478813 TBFG_12201 TBFG_12202     TRUE 0.951 4.000 0.298 NA   NA
 3478816 3478817 TBFG_12205 TBFG_12206     FALSE 0.005 385.000 0.000 1.000   NA
 3478817 3478818 TBFG_12206 TBFG_12207     FALSE 0.467 91.000 0.301 1.000   NA
 3478818 3478819 TBFG_12207 TBFG_12208     TRUE 0.748 10.000 0.132 NA   NA
 3478821 3478822 TBFG_12210 TBFG_12211     FALSE 0.538 86.000 0.417 NA   NA
 3478822 3478823 TBFG_12211 TBFG_12212     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3478823 3478824 TBFG_12212 TBFG_12213     FALSE 0.204 117.000 0.184 NA   NA
 3478824 3478825 TBFG_12213 TBFG_12214     FALSE 0.239 105.000 0.164 NA   NA
 3478827 3478828 TBFG_12216 TBFG_12217     FALSE 0.361 97.000 0.258 NA   NA
 3478828 3478829 TBFG_12217 TBFG_12218     FALSE 0.539 95.000 0.471 NA   NA
 3478832 3478833 TBFG_12221 TBFG_12222     TRUE 0.892 41.000 0.088 0.054 Y NA
 3478833 3478834 TBFG_12222 TBFG_12223     TRUE 0.999 -3.000 0.421 0.054 Y NA
 3478834 3478835 TBFG_12223 TBFG_12224     TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.041 Y NA
 3478836 3478837 TBFG_12225 TBFG_12226     TRUE 0.995 0.000 0.900 NA   NA
 3478837 3478838 TBFG_12226 TBFG_12227     FALSE 0.053 186.000 0.092 NA   NA
 3478838 3478839 TBFG_12227 TBFG_12228     TRUE 0.904 8.000 0.342 NA   NA
 3478843 3478844 TBFG_12232 TBFG_12233     FALSE 0.140 100.000 0.016 NA   NA
 3478845 3478846 TBFG_12234 TBFG_12235   cobT FALSE 0.288 79.000 0.095 NA   NA
 3478846 3478847 TBFG_12235 TBFG_12236 cobT cobS TRUE 0.997 -3.000 0.039 0.008 Y NA
 3478847 3478848 TBFG_12236 TBFG_12237 cobS   FALSE 0.038 158.000 0.003 NA   NA
 3478849 3478850 TBFG_12238 TBFG_12239   gcvT TRUE 0.679 72.000 0.025 1.000 Y NA
 3478851 3478852 TBFG_12240 TBFG_12241     FALSE 0.482 12.000 0.041 1.000 N NA
 3478854 3478855 TBFG_12243 TBFG_12244     TRUE 0.985 0.000 0.333 1.000   NA
 3478855 3478856 TBFG_12244 TBFG_12245   lipB TRUE 0.608 53.000 0.019 0.043   NA
 3478856 3478857 TBFG_12245 TBFG_12246 lipB   TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 3478857 3478858 TBFG_12246 TBFG_12247     FALSE 0.430 27.000 0.059 NA   NA
 3478861 3478862 TBFG_12250 TBFG_12251     FALSE 0.239 49.000 0.046 1.000 N NA
 3478862 3478863 TBFG_12251 TBFG_12252     FALSE 0.181 95.000 0.042 NA   NA
 3478863 3478864 TBFG_12252 TBFG_12253     TRUE 0.736 62.000 0.636 NA   NA
 3478865 3478866 TBFG_12254 TBFG_12255 panB   FALSE 0.013 245.000 0.000 1.000   NA
 3478866 3478867 TBFG_12255 TBFG_12256     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 3478868 3478869 TBFG_12257 TBFG_12258     TRUE 0.990 -3.000 0.422 NA   NA
 3478869 3478870 TBFG_12258 TBFG_12259     TRUE 0.991 -3.000 0.468 NA   NA
 3478870 3478871 TBFG_12259 TBFG_12260     TRUE 0.969 -3.000 0.121 NA   NA
 3478871 3478872 TBFG_12260 TBFG_12261     FALSE 0.185 37.000 0.000 NA   NA
 3478873 3478874 TBFG_12262 TBFG_12263     TRUE 0.804 -7.000 0.029 1.000   NA
 3478874 3478875 TBFG_12263 TBFG_12264     TRUE 0.921 0.000 0.013 NA   NA
 3478878 3478879 TBFG_14023 TBFG_12267     FALSE 0.171 46.000 0.000 NA   NA
 3478879 3478880 TBFG_12267 TBFG_12268     TRUE 0.990 0.000 0.575 NA   NA
 3478880 3478881 TBFG_12268 TBFG_12269     FALSE 0.434 38.000 0.113 NA   NA
 3478882 3478883 TBFG_12270 TBFG_12271 aceE   FALSE 0.276 60.000 0.169 NA N NA
 3478883 3478884 TBFG_12271 TBFG_12272     FALSE 0.067 239.000 0.441 NA N NA
 3478884 3478885 TBFG_12272 TBFG_12273   acpP TRUE 0.724 76.000 0.127 1.000 Y NA
 3478885 3478886 TBFG_12273 TBFG_12274 acpP   TRUE 0.994 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 3478886 3478887 TBFG_12274 TBFG_12275     TRUE 0.959 31.000 0.400 0.017 Y NA
 3478887 3478888 TBFG_12275 TBFG_12276     TRUE 0.868 31.000 0.222 1.000 Y NA
 3478888 3478889 TBFG_12276 TBFG_12277     FALSE 0.179 124.000 0.111 1.000   NA
 3478890 3478891 TBFG_12278 TBFG_12279     TRUE 0.969 -6.000 0.727 1.000 N NA
 3478892 3478893 TBFG_12280 TBFG_12281     TRUE 0.970 -3.000 0.204 1.000 N NA
 3478893 3478894 TBFG_12281 TBFG_12282     FALSE 0.262 66.000 0.043 NA   NA
 3478895 3478896 TBFG_12283 TBFG_12284     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 3478896 3478897 TBFG_12284 TBFG_12285     FALSE 0.174 130.000 0.200 NA   NA
 3478897 3478898 TBFG_12285 TBFG_12286     TRUE 0.605 14.000 0.163 1.000 N NA
 3478899 3478900 TBFG_12287 TBFG_12288     TRUE 0.991 0.000 0.538 1.000   NA
 3478904 3478905 TBFG_12292 TBFG_12293     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 3478906 3478907 TBFG_12294 TBFG_12295     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3478908 3478909 TBFG_12296 TBFG_12297     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 3478909 3478910 TBFG_12297 TBFG_12298     FALSE 0.071 106.000 0.000 NA   NA
 3478910 3478911 TBFG_12298 TBFG_12299     TRUE 0.976 -3.000 0.190 NA   NA
 3478911 3478912 TBFG_12299 TBFG_12300     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 3478912 3478913 TBFG_12300 TBFG_12301     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478915 3478916 TBFG_12303 TBFG_12304     FALSE 0.003 234.000 0.000 1.000 N NA
 3478918 3478919 TBFG_12306 TBFG_12307     FALSE 0.194 33.000 0.000 NA   NA
 3478921 3478922 TBFG_12309 TBFG_12310     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3478922 3478923 TBFG_12310 TBFG_12311     FALSE 0.284 -96.000 0.000 NA   NA
 3478923 3478924 TBFG_12311 TBFG_12313     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 3478924 3478925 TBFG_12313 TBFG_12314     FALSE 0.141 60.000 0.000 NA   NA
 3478926 3478927 TBFG_12315 TBFG_12316     TRUE 0.677 39.000 0.000 0.004   NA
 3478928 3478929 TBFG_12317 TBFG_12318     FALSE 0.011 222.000 0.000 NA   NA
 3478929 3478930 TBFG_12318 TBFG_12319     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 3478930 3478931 TBFG_12319 TBFG_12320     FALSE 0.199 32.000 0.000 NA   NA
 3478931 3478932 TBFG_12320 TBFG_12321     FALSE 0.016 192.000 0.000 NA   NA
 3478933 3478934 TBFG_12322 TBFG_12323     FALSE 0.176 74.000 0.000 1.000   NA
 3478935 3478936 TBFG_12324 TBFG_12325     FALSE 0.071 106.000 0.000 NA   NA
 3478939 3478940 TBFG_12328 TBFG_12329     FALSE 0.205 31.000 0.000 NA   NA
 3478940 3478941 TBFG_12329 TBFG_12330     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 3478941 3478942 TBFG_12330 TBFG_12331     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 3478944 3478945 TBFG_14024 TBFG_12333     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 3478946 3478947 TBFG_12334 TBFG_12335     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 3478948 3478949 TBFG_12336 TBFG_12337     TRUE 0.712 11.000 0.121 NA   NA
 3478949 3478950 TBFG_12337 TBFG_12338     TRUE 0.996 -3.000 0.914 NA   NA
 3478951 3478952 TBFG_12339 TBFG_12340     TRUE 0.994 -13.000 0.818 0.019 Y NA
 3478952 3478953 TBFG_12340 TBFG_12341     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.019 Y NA
 3478954 3478955 TBFG_12342 TBFG_12343     TRUE 0.988 -3.000 0.444 1.000 N NA
 3478955 3478956 TBFG_12343 TBFG_12344     FALSE 0.531 16.000 0.015 1.000   NA
 3478956 3478957 TBFG_12344 TBFG_12345     TRUE 0.954 -6.000 0.000 0.001   NA
 3478957 3478958 TBFG_12345 TBFG_12346     TRUE 0.625 -27.000 0.038 1.000   NA
 3478960 3478961 TBFG_12348 TBFG_12349     TRUE 0.984 -3.000 0.240 1.000   NA
 3478962 3478963 TBFG_12350 TBFG_12351     FALSE 0.013 252.000 0.000 1.000   NA
 3478964 3478965 TBFG_12352 TBFG_12353     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 3478966 3478967 TBFG_12354 TBFG_12355     FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 3478967 3478968 TBFG_12355 TBFG_12356     FALSE 0.211 30.000 0.000 NA   NA
 3478970 3478971 TBFG_12358 TBFG_12359     TRUE 0.994 4.000 0.133 0.001 Y NA
 3478971 3478972 TBFG_12359 TBFG_12360     FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 3478973 3478974 TBFG_12361 TBFG_12362     FALSE 0.051 120.000 0.000 NA   NA
 3478976 3478977 TBFG_12364 TBFG_14025     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 3478978 3478979 TBFG_12365 TBFG_12366     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 3478980 3478981 TBFG_12367 TBFG_12368 dnaG   TRUE 0.752 5.000 0.037 1.000 N NA
 3478983 3478984 TBFG_12370 TBFG_12371     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 3478984 3478985 TBFG_12371 TBFG_12372     FALSE 0.039 135.000 0.000 NA   NA
 3478985 3478986 TBFG_12372 TBFG_12373     FALSE 0.012 216.000 0.000 NA   NA
 3478986 3478987 TBFG_12373 TBFG_12374     TRUE 0.872 59.000 0.000 0.001 Y NA
 3478987 3478988 TBFG_12374 TBFG_12375     FALSE 0.402 191.000 0.000 0.001 Y NA
 3478988 3478989 TBFG_12375 TBFG_12376     FALSE 0.000 824.000 0.000 NA N NA
 3478990 3478991 TBFG_12377 TBFG_12378     TRUE 0.788 51.000 0.308 0.059   NA
 3478993 3478994 TBFG_12380 TBFG_12381     TRUE 0.788 51.000 0.308 0.059   NA
 3478995 3478996 TBFG_12382 TBFG_12383     FALSE 0.003 138.000 0.000 NA N NA
 3478997 3478998 TBFG_12384 TBFG_12385     TRUE 0.982 -3.000 0.021 0.042 N NA
 3478999 3479000 TBFG_12386 TBFG_12387     TRUE 0.924 0.000 0.017 NA   NA
 3479000 3479001 TBFG_12387 TBFG_12388   recO TRUE 0.750 -7.000 0.076 1.000 N NA
 3479003 3479004 TBFG_12390 TBFG_12391 era   FALSE 0.209 74.000 0.021 NA   NA
 3479004 3479005 TBFG_12391 TBFG_12392     FALSE 0.542 -25.000 0.025 NA   NA
 3479005 3479006 TBFG_12392 TBFG_12393     TRUE 0.979 -3.000 0.222 NA   NA
 3479006 3479007 TBFG_12393 TBFG_12394     TRUE 0.970 4.000 0.457 NA   NA
 3479007 3479008 TBFG_12394 TBFG_12395     FALSE 0.065 271.000 0.000 NA Y NA
 3479010 3479011 TBFG_12397 TBFG_12398     TRUE 0.602 14.000 0.073 NA   NA
 3479011 3479012 TBFG_12398 TBFG_12399   hrcA FALSE 0.199 75.000 0.064 1.000 N NA
 3479014 3479015 TBFG_12401 TBFG_12402     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3479015 3479016 TBFG_12402 TBFG_12403     FALSE 0.388 -22.000 0.000 NA   NA
 3479016 3479017 TBFG_12403 TBFG_12404     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3479017 3479018 TBFG_12404 TBFG_12405     TRUE 0.990 -18.000 0.462 0.003 Y NA
 3479018 3479019 TBFG_12405 TBFG_12406     TRUE 0.979 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 3479019 3479020 TBFG_12406 TBFG_12407     TRUE 0.980 0.000 0.000 0.016   NA
 3479020 3479021 TBFG_12407 TBFG_12408     TRUE 0.890 -10.000 0.000 0.016   NA
 3479022 3479023 TBFG_12409 TBFG_12410     FALSE 0.394 96.000 0.095 0.090 N NA
 3479026 3479027 TBFG_12413 TBFG_12414     FALSE 0.204 61.000 0.000 1.000   NA
 3479027 3479028 TBFG_12414 TBFG_12415     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479028 3479029 TBFG_12415 TBFG_12416     FALSE 0.263 -1250.000 0.000 NA   NA
 3479029 3479030 TBFG_12416 TBFG_12417     TRUE 0.788 51.000 0.308 0.059   NA
 3479031 3479032 TBFG_12419 TBFG_12420     TRUE 0.931 -3.000 0.041 1.000 N NA
 3479032 3479033 TBFG_12420 TBFG_12421     TRUE 0.955 -3.000 0.010 1.000   NA
 3479033 3479034 TBFG_12421 TBFG_12422     FALSE 0.454 37.000 0.069 1.000   NA
 3479034 3479035 TBFG_12422 TBFG_12423     FALSE 0.086 131.000 0.029 NA   NA
 3479035 3479036 TBFG_12423 TBFG_12424     FALSE 0.002 661.000 0.000 NA   NA
 3479037 3479038 TBFG_12425 TBFG_12426     TRUE 0.883 17.000 0.087 1.000 Y NA
 3479038 3479039 TBFG_12426 TBFG_12427     TRUE 0.993 -3.000 0.177 0.001 N NA
 3479039 3479040 TBFG_12427 TBFG_12428     TRUE 0.992 -3.000 0.188 0.003 N NA
 3479040 3479041 TBFG_12428 TBFG_12429     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 3479043 3479044 TBFG_12431 TBFG_12432     TRUE 0.933 -3.000 0.004 NA   NA
 3479047 3479048 TBFG_12435 TBFG_12436     FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 3479049 3479050 TBFG_12437 TBFG_12438     TRUE 0.953 0.000 0.089 NA   NA
 3479050 3479051 TBFG_12438 TBFG_12439     TRUE 0.939 0.000 0.044 NA   NA
 3479053 3479054 TBFG_12441 TBFG_12442     TRUE 0.689 13.000 0.163 NA   NA
 3479054 3479055 TBFG_12442 TBFG_12443     TRUE 0.632 15.000 0.130 NA   NA
 3479055 3479056 TBFG_12443 TBFG_12444     FALSE 0.006 340.000 0.000 1.000   NA
 3479056 3479057 TBFG_12444 TBFG_12445     FALSE 0.034 140.000 0.000 NA   NA
 3479057 3479058 TBFG_12445 TBFG_12446     TRUE 0.601 81.000 0.484 NA   NA
 3479058 3479059 TBFG_12446 TBFG_12447     TRUE 0.879 -10.000 0.245 1.000   NA
 3479059 3479060 TBFG_12447 TBFG_12448     TRUE 0.955 -3.000 0.045 NA   NA
 3479060 3479061 TBFG_12448 TBFG_12449   nadD TRUE 0.979 -3.000 0.221 NA   NA
 3479062 3479063 TBFG_12450 TBFG_12451     FALSE 0.009 242.000 0.000 NA   NA
 3479064 3479065 TBFG_12452 TBFG_12453     FALSE 0.093 89.000 0.000 NA   NA
 3479065 3479066 TBFG_12453 TBFG_12454     TRUE 0.994 0.000 0.862 NA   NA
 3479066 3479067 TBFG_12454 TBFG_12455   proA FALSE 0.351 47.000 0.019 1.000   NA
 3479068 3479069 TBFG_12456 TBFG_12457     TRUE 0.545 26.000 0.095 1.000   NA
 3479070 3479071 TBFG_12458 TBFG_12459     FALSE 0.169 47.000 0.000 NA   NA
 3479071 3479072 TBFG_12459 TBFG_12460     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 3479072 3479073 TBFG_12460 TBFG_12461     FALSE 0.007 268.000 0.000 NA   NA
 3479073 3479074 TBFG_12461 TBFG_12462     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.040 N NA
 3479075 3479076 TBFG_12463 TBFG_12464     FALSE 0.004 232.000 0.000 1.000 N NA
 3479077 3479078 TBFG_12465 TBFG_12466 nadE   FALSE 0.025 109.000 0.000 1.000 N NA
 3479078 3479079 TBFG_12466 TBFG_12467   obgE TRUE 0.974 0.000 0.206 1.000   NA
 3479079 3479080 TBFG_12467 TBFG_12468 obgE rpmA FALSE 0.527 86.000 0.335 1.000   NA
 3479080 3479081 TBFG_12468 TBFG_12469 rpmA rplU TRUE 0.987 15.000 0.667 0.014 Y NA
 3479083 3479084 TBFG_12471 TBFG_12472   ndk FALSE 0.002 330.000 0.000 1.000 N NA
 3479084 3479085 TBFG_12472 TBFG_12473 ndk   FALSE 0.013 411.000 0.004 0.072 N NA
 3479085 3479086 TBFG_12473 TBFG_12474   valS TRUE 0.989 -3.000 0.208 0.072 N NA
 3479086 3479087 TBFG_12474 TBFG_12475 valS   FALSE 0.195 88.000 0.041 NA   NA
 3479087 3479088 TBFG_12475 TBFG_12476     FALSE 0.463 90.000 0.333 NA   NA
 3479090 3479091 TBFG_12478 TBFG_12479     TRUE 0.878 2.000 0.053 1.000 N NA
 3479091 3479092 TBFG_12479 TBFG_12480     TRUE 1.000 -3.000 0.832 0.001 Y NA
 3479092 3479093 TBFG_12480 TBFG_12481     FALSE 0.004 232.000 0.000 1.000 N NA
 3479093 3479094 TBFG_12481 TBFG_12482   clpX FALSE 0.266 16.000 0.002 1.000 N NA
 3479095 3479096 TBFG_12483 TBFG_12484 mmuM   FALSE 0.019 122.000 0.000 1.000 N NA
 3479097 3479098 TBFG_12485 TBFG_12486   clpP TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.001 Y NA
 3479098 3479099 TBFG_12486 TBFG_12487 clpP tig FALSE 0.466 117.000 0.018 1.000 Y NA
 3479099 3479100 TBFG_12487 TBFG_14026 tig   FALSE 0.185 37.000 0.000 NA   NA
 3479101 3479102 TBFG_14027 TBFG_12488     FALSE 0.174 44.000 0.000 NA   NA
 3479103 3479104 TBFG_12489 TBFG_12490     TRUE 0.927 6.000 0.398 1.000 N NA
 3479104 3479105 TBFG_12490 TBFG_12491     FALSE 0.309 102.000 0.182 1.000   NA
 3479107 3479108 TBFG_12493 TBFG_12494     FALSE 0.011 220.000 0.000 NA   NA
 3479109 3479110 TBFG_12495 TBFG_12496     TRUE 0.956 0.000 0.055 1.000   NA
 3479110 3479111 TBFG_12496 TBFG_12497     FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 3479112 3479113 TBFG_12498 TBFG_12499     TRUE 0.921 6.000 0.305 NA   NA
 3479113 3479114 TBFG_12499 TBFG_12500     TRUE 0.972 -3.000 0.153 NA   NA
 3479114 3479115 TBFG_12500 TBFG_12501     FALSE 0.176 104.000 0.018 1.000   NA
 3479115 3479116 TBFG_12501 TBFG_12502     FALSE 0.284 81.000 0.053 1.000   NA
 3479116 3479117 TBFG_12502 TBFG_12503     FALSE 0.001 927.000 0.000 1.000 N NA
 3479117 3479118 TBFG_12503 TBFG_12504     TRUE 0.996 -3.000 0.044 0.089 Y NA
 3479118 3479119 TBFG_12504 TBFG_12505     TRUE 0.955 -3.000 0.044 NA   NA
 3479119 3479120 TBFG_12505 TBFG_12506     FALSE 0.061 223.000 0.250 NA   NA
 3479121 3479122 TBFG_14028 TBFG_12507     FALSE 0.079 101.000 0.000 NA   NA
 3479123 3479124 TBFG_12508 TBFG_12509     FALSE 0.215 29.000 0.000 NA   NA
 3479124 3479125 TBFG_12509 TBFG_12510     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 3479125 3479126 TBFG_12510 TBFG_12511     FALSE 0.334 -34.000 0.000 NA   NA
 3479126 3479127 TBFG_12511 TBFG_12512     FALSE 0.066 109.000 0.000 NA   NA
 3479127 3479128 TBFG_12512 TBFG_12513     FALSE 0.288 -82.000 0.000 NA   NA
 3479129 3479130 TBFG_12514 TBFG_12515     FALSE 0.513 -10.000 0.000 NA   NA
 3479130 3479131 TBFG_12515 TBFG_12516     FALSE 0.006 280.000 0.000 NA   NA
 3479132 3479133 TBFG_12517 TBFG_12518     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.089 Y NA
 3479133 3479134 TBFG_12518 TBFG_12519     TRUE 0.995 11.000 1.000 0.001 Y NA
 3479134 3479135 TBFG_12519 TBFG_12520     FALSE 0.016 259.000 0.083 1.000 N NA
 3479135 3479136 TBFG_12520 TBFG_12521     TRUE 0.983 -3.000 0.326 1.000 N NA
 3479136 3479137 TBFG_12521 TBFG_12522     TRUE 0.994 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 3479137 3479138 TBFG_12522 TBFG_12523     TRUE 0.980 5.000 0.190 1.000 Y NA
 3479138 3479139 TBFG_12523 TBFG_12524     TRUE 0.977 5.000 0.136 1.000 Y NA
 3479139 3479140 TBFG_12524 TBFG_12525     TRUE 0.992 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 3479140 3479141 TBFG_12525 TBFG_12526     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 3479141 3479142 TBFG_12526 TBFG_12527     TRUE 0.789 83.000 0.054 0.089 Y NA
 3479143 3479144 TBFG_12528 TBFG_12529     FALSE 0.337 79.000 0.167 NA   NA
 3479148 3479149 TBFG_12533 TBFG_14029     FALSE 0.162 50.000 0.000 NA   NA
 3479152 3479153 TBFG_12536 TBFG_12537     TRUE 0.970 6.000 0.726 NA   NA
 3479153 3479154 TBFG_12537 TBFG_12538     FALSE 0.081 119.000 0.000 1.000   NA
 3479154 3479155 TBFG_12538 TBFG_12539     FALSE 0.002 596.000 0.000 NA   NA
 3479156 3479157 TBFG_14030 TBFG_12540     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 3479160 3479161 TBFG_12543 TBFG_12544   acpS TRUE 0.928 -3.000 0.036 1.000 N NA
 3479161 3479162 TBFG_12544 TBFG_12545 acpS   FALSE 0.481 193.000 0.138 0.003 Y NA
 3479162 3479163 TBFG_12545 TBFG_12546     FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 3479167 3479168 TBFG_12550 TBFG_12551     FALSE 0.008 252.000 0.000 NA   NA
 3479168 3479169 TBFG_12551 TBFG_12552     FALSE 0.341 72.000 0.143 NA   NA
 3479169 3479170 TBFG_12552 TBFG_12553   nusB TRUE 0.911 0.000 0.004 NA   NA
 3479170 3479171 TBFG_12553 TBFG_12554 nusB   TRUE 0.880 3.000 0.078 1.000 N NA
 3479171 3479172 TBFG_12554 TBFG_12555     TRUE 0.707 10.000 0.160 1.000 N NA
 3479174 3479175 TBFG_12557 TBFG_12558   aroB TRUE 0.998 -3.000 0.052 0.002 Y NA
 3479175 3479176 TBFG_12558 TBFG_12559 aroB aroK TRUE 0.995 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 3479176 3479177 TBFG_12559 TBFG_12560 aroK   TRUE 0.977 4.000 0.041 1.000 Y NA
 3479178 3479179 TBFG_12561 TBFG_12562     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 3479179 3479180 TBFG_12562 TBFG_12563     FALSE 0.046 127.000 0.000 NA   NA
 3479180 3479181 TBFG_12563 TBFG_12564     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479181 3479182 TBFG_12564 TBFG_12565     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479182 3479183 TBFG_12565 TBFG_12566     FALSE 0.089 93.000 0.000 NA   NA
 3479183 3479184 TBFG_12566 TBFG_12567     FALSE 0.182 39.000 0.000 NA   NA
 3479184 3479185 TBFG_12567 TBFG_12568     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479186 3479187 TBFG_12569 TBFG_12570     FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3479187 3479188 TBFG_12570 TBFG_12571     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479188 3479189 TBFG_12571 TBFG_12572     FALSE 0.005 411.000 0.000 1.000   NA
 3479189 3479190 TBFG_12572 TBFG_12573   aroE TRUE 0.623 12.000 0.022 1.000   NA
 3479190 3479191 TBFG_12573 TBFG_12574 aroE   TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3479191 3479192 TBFG_12574 TBFG_12575     TRUE 0.766 -7.000 0.039 NA   NA
 3479192 3479193 TBFG_12575 TBFG_12576   alaS TRUE 0.920 1.000 0.103 1.000 N NA
 3479193 3479194 TBFG_12576 TBFG_12577 alaS   FALSE 0.150 91.000 0.011 NA   NA
 3479195 3479196 TBFG_12578 TBFG_12579     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 3479198 3479199 TBFG_12581 TBFG_12582     FALSE 0.004 357.000 0.000 NA   NA
 3479199 3479200 TBFG_12582 TBFG_12583     FALSE 0.032 143.000 0.000 NA   NA
 3479200 3479201 TBFG_12583 TBFG_12584     TRUE 0.557 3.000 0.000 1.000 N NA
 3479201 3479202 TBFG_12584 TBFG_12585     FALSE 0.010 277.000 0.000 1.000   NA
 3479202 3479203 TBFG_12585 TBFG_12586     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3479203 3479204 TBFG_12586 TBFG_12587     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 3479205 3479206 TBFG_12588 TBFG_12589     TRUE 0.775 -7.000 0.046 NA   NA
 3479208 3479209 TBFG_12591 TBFG_12592   aspS FALSE 0.152 53.000 0.000 NA   NA
 3479210 3479211 TBFG_12593 TBFG_12594     FALSE 0.510 23.000 0.098 NA   NA
 3479211 3479212 TBFG_12594 TBFG_12595     FALSE 0.346 30.000 0.021 NA   NA
 3479217 3479218 TBFG_12600 TBFG_12601 hisS   TRUE 0.967 -3.000 0.051 1.000   NA
 3479220 3479221 TBFG_12603 TBFG_12604     FALSE 0.301 31.000 0.051 1.000 N NA
 3479221 3479222 TBFG_12604 TBFG_12605     FALSE 0.092 104.000 0.023 1.000 N NA
 3479222 3479223 TBFG_12605 TBFG_12606   secF TRUE 0.772 6.000 0.083 1.000 N NA
 3479223 3479224 TBFG_12606 TBFG_12607 secF secD TRUE 0.997 4.000 0.336 0.001 Y NA
 3479224 3479225 TBFG_12607 TBFG_12608 secD yajC FALSE 0.507 110.000 0.062 NA Y NA
 3479226 3479227 TBFG_12609 TBFG_12610     FALSE 0.189 162.000 0.444 1.000 N NA
 3479227 3479228 TBFG_12610 TBFG_12611     FALSE 0.021 174.000 0.000 NA   NA
 3479229 3479230 TBFG_12612 TBFG_12613 ruvB ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 3479230 3479231 TBFG_12613 TBFG_12614 ruvA ruvC TRUE 0.999 -3.000 0.451 0.008 Y NA
 3479232 3479233 TBFG_12615 TBFG_12616     FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3479233 3479234 TBFG_12616 TBFG_12617     TRUE 0.893 11.000 0.455 NA   NA
 3479234 3479235 TBFG_12617 TBFG_12618     TRUE 0.981 -3.000 0.242 NA   NA
 3479235 3479236 TBFG_12618 TBFG_12619     TRUE 0.577 82.000 0.444 NA   NA
 3479236 3479237 TBFG_12619 TBFG_12620     TRUE 0.961 -3.000 0.065 NA   NA
 3479237 3479238 TBFG_12620 TBFG_12621     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 3479239 3479240 TBFG_12622 TBFG_12623     FALSE 0.098 133.000 0.055 NA   NA
 3479240 3479241 TBFG_12623 TBFG_12624     FALSE 0.446 8.000 0.027 NA N NA
 3479241 3479242 TBFG_12624 TBFG_12625     FALSE 0.230 29.000 0.014 1.000 N NA
 3479243 3479244 TBFG_12626 TBFG_12627     FALSE 0.002 174.000 0.000 NA N NA
 3479245 3479246 TBFG_12628 TBFG_12629     TRUE 0.865 0.000 0.010 1.000 N NA
 3479246 3479247 TBFG_12629 TBFG_12630     TRUE 0.985 11.000 0.831 1.000 Y NA
 3479247 3479248 TBFG_12630 TBFG_12631     TRUE 0.994 -3.000 0.737 1.000 N NA
 3479248 3479249 TBFG_12631 TBFG_12632     TRUE 0.960 -3.000 0.140 1.000 N NA
 3479249 3479250 TBFG_12632 TBFG_12633   thrS TRUE 0.843 -7.000 0.208 1.000 N NA
 3479250 3479251 TBFG_12633 TBFG_12634 thrS   FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 3479255 3479256 TBFG_12638 TBFG_12639     TRUE 0.636 13.000 0.090 NA   NA
 3479256 3479257 TBFG_12639 TBFG_12640     TRUE 0.970 -3.000 0.129 NA   NA
 3479258 3479259 TBFG_12641 TBFG_12642     FALSE 0.089 136.000 0.013 1.000   NA
 3479260 3479261 TBFG_12643 TBFG_12644     FALSE 0.433 15.000 0.000 1.000   NA
 3479261 3479262 TBFG_12644 TBFG_12645     FALSE 0.209 59.000 0.000 1.000   NA
 3479262 3479263 TBFG_12645 TBFG_12646     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 3479264 3479265 TBFG_12647 TBFG_12648     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 3479265 3479266 TBFG_12648 TBFG_12649     TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 3479266 3479267 TBFG_12649 TBFG_12650     FALSE 0.190 140.000 0.279 NA   NA
 3479268 3479269 TBFG_12651 TBFG_12652     FALSE 0.031 145.000 0.000 NA   NA
 3479269 3479270 TBFG_12652 TBFG_12653     FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 3479271 3479272 TBFG_12654 TBFG_12655     FALSE 0.015 196.000 0.000 NA   NA
 3479272 3479273 TBFG_12655 TBFG_12656     FALSE 0.023 163.000 0.000 NA   NA
 3479274 3479275 TBFG_12657 TBFG_12658     FALSE 0.079 120.000 0.000 1.000   NA
 3479276 3479277 TBFG_12659 TBFG_12660     FALSE 0.286 136.000 0.400 NA   NA
 3479277 3479278 TBFG_12660 TBFG_12661     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 N NA
 3479278 3479279 TBFG_12661 TBFG_12662     TRUE 0.729 4.000 0.000 NA   NA
 3479281 3479282 TBFG_14032 TBFG_14033     FALSE 0.221 27.000 0.000 NA   NA
 3479282 3479283 TBFG_14033 TBFG_14034     FALSE 0.340 14.000 0.000 NA   NA
 3479283 3479284 TBFG_14034 TBFG_12663     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 3479284 3479285 TBFG_12663 TBFG_12664     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479285 3479286 TBFG_12664 TBFG_12665     TRUE 0.764 14.000 0.000 0.057   NA
 3479287 3479288 TBFG_12666 TBFG_12667     FALSE 0.515 8.000 0.000 NA   NA
 3479288 3479289 TBFG_12667 TBFG_12668     FALSE 0.027 153.000 0.000 NA   NA
 3479289 3479290 TBFG_12668 TBFG_12669     FALSE 0.022 167.000 0.000 NA   NA
 3479290 3479291 TBFG_12669 TBFG_12670     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 3479291 3479292 TBFG_12670 TBFG_12671     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479292 3479293 TBFG_12671 TBFG_12672     TRUE 0.983 2.000 0.500 NA   NA
 3479293 3479294 TBFG_12672 TBFG_12673     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479294 3479295 TBFG_12673 TBFG_12674     FALSE 0.288 17.000 0.000 NA   NA
 3479295 3479296 TBFG_12674 TBFG_12675     TRUE 0.775 3.000 0.000 NA   NA
 3479296 3479297 TBFG_12675 TBFG_12676     FALSE 0.031 145.000 0.000 NA   NA
 3479297 3479298 TBFG_12676 TBFG_12677     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479299 3479300 TBFG_12678 TBFG_12679     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3479300 3479301 TBFG_12679 TBFG_12680     FALSE 0.004 348.000 0.000 NA   NA
 3479301 3479302 TBFG_12680 TBFG_12681     FALSE 0.091 91.000 0.000 NA   NA
 3479302 3479303 TBFG_12681 TBFG_12682     FALSE 0.343 22.000 0.000 1.000   NA
 3479303 3479304 TBFG_12682 TBFG_12683     FALSE 0.323 79.000 0.150 NA   NA
 3479304 3479305 TBFG_12683 TBFG_12684     FALSE 0.405 29.000 0.051 NA   NA
 3479307 3479308 TBFG_12686 TBFG_12687     FALSE 0.461 76.000 0.275 NA   NA
 3479308 3479309 TBFG_12687 TBFG_12688     TRUE 0.787 23.000 0.444 NA   NA
 3479309 3479310 TBFG_12688 TBFG_12689     FALSE 0.458 59.000 0.217 NA   NA
 3479311 3479312 TBFG_12690 TBFG_12691     TRUE 0.942 -3.000 0.014 NA   NA
 3479312 3479313 TBFG_12691 TBFG_12692     TRUE 0.859 6.000 0.158 NA   NA
 3479313 3479314 TBFG_12692 TBFG_12693   hemE TRUE 0.998 -3.000 0.049 0.001 Y NA
 3479315 3479316 TBFG_12694 TBFG_12695     FALSE 0.279 58.000 0.038 NA   NA
 3479316 3479317 TBFG_12695 TBFG_12696     TRUE 0.935 2.000 0.115 NA   NA
 3479319 3479320 TBFG_12698 TBFG_12699     TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 3479320 3479321 TBFG_12699 TBFG_12700     TRUE 0.834 80.000 0.000 0.001 Y NA
 3479322 3479323 TBFG_12701 TBFG_12702     TRUE 0.974 -3.000 0.176 NA   NA
 3479323 3479324 TBFG_12702 TBFG_12703     TRUE 0.979 -3.000 0.222 NA   NA
 3479324 3479325 TBFG_12703 TBFG_12704     FALSE 0.005 195.000 0.004 NA N NA
 3479325 3479326 TBFG_12704 TBFG_12705     FALSE 0.031 174.000 0.082 NA N NA
 3479327 3479328 TBFG_12706 TBFG_12707     TRUE 0.998 -3.000 0.162 0.002 Y NA
 3479329 3479330 TBFG_12708 TBFG_12709     FALSE 0.495 31.000 0.145 NA   NA
 3479332 3479333 TBFG_12711 TBFG_12712   dut FALSE 0.285 75.000 0.078 NA   NA
 3479338 3479339 TBFG_12717 TBFG_12718     FALSE 0.259 180.000 0.075 1.000 Y NA
 3479339 3479340 TBFG_12718 TBFG_12719     FALSE 0.140 37.000 0.024 NA N NA
 3479344 3479345 TBFG_12723 TBFG_12724     FALSE 0.335 110.000 0.303 NA   NA
 3479345 3479346 TBFG_12724 TBFG_12725     TRUE 0.643 133.000 0.134 0.040 Y NA
 3479348 3479349 TBFG_12727 TBFG_12728     FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000   NA
 3479349 3479350 TBFG_12728 TBFG_12729     TRUE 0.735 59.000 0.538 1.000   NA
 3479350 3479351 TBFG_12729 TBFG_12730     TRUE 0.788 49.000 0.280 0.041   NA
 3479352 3479353 TBFG_12731 TBFG_12732     FALSE 0.226 52.000 0.005 NA   NA
 3479353 3479354 TBFG_12732 TBFG_12733     FALSE 0.040 163.000 0.012 NA   NA
 3479358 3479359 TBFG_12737 TBFG_12738     FALSE 0.080 136.000 0.003 1.000   NA
 3479359 3479360 TBFG_12738 TBFG_12739   dapF FALSE 0.527 17.000 0.025 1.000   NA
 3479360 3479361 TBFG_12739 TBFG_12740 dapF miaA FALSE 0.358 25.000 0.062 1.000 N NA
 3479361 3479362 TBFG_12740 TBFG_12741 miaA   TRUE 0.954 -3.000 0.043 NA   NA
 3479362 3479363 TBFG_12741 TBFG_12742     FALSE 0.066 109.000 0.000 NA   NA
 3479364 3479365 TBFG_12743 TBFG_12744     FALSE 0.515 8.000 0.000 NA   NA
 3479366 3479367 TBFG_12745 TBFG_12746     TRUE 0.948 -3.000 0.024 NA   NA
 3479369 3479370 TBFG_12748 TBFG_12749   recX FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3479370 3479371 TBFG_12749 TBFG_12750 recX recA TRUE 0.809 -34.000 0.296 1.000   NA
 3479374 3479375 TBFG_12753 TBFG_12754     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
 3479376 3479377 TBFG_12755 TBFG_12756     FALSE 0.359 72.000 0.167 NA   NA
 3479377 3479378 TBFG_12756 TBFG_12757     TRUE 0.730 19.000 0.306 NA   NA
 3479378 3479379 TBFG_12757 TBFG_12758     FALSE 0.219 130.000 0.260 NA   NA
 3479379 3479380 TBFG_12758 TBFG_12759     FALSE 0.243 71.000 0.006 1.000   NA
 3479383 3479384 TBFG_12762 TBFG_12763     TRUE 0.994 -3.000 0.250 0.043   NA
 3479384 3479385 TBFG_12763 TBFG_12764     TRUE 0.993 4.000 0.600 NA Y NA
 3479386 3479387 TBFG_12765 TBFG_12766     TRUE 0.816 31.000 0.550 1.000   NA
 3479387 3479388 TBFG_12766 TBFG_12767   thyX FALSE 0.174 69.000 0.037 1.000 N NA
 3479388 3479389 TBFG_12767 TBFG_12768 thyX   FALSE 0.013 244.000 0.000 1.000   NA
 3479389 3479390 TBFG_12768 TBFG_12769     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.056   NA
 3479390 3479391 TBFG_12769 TBFG_12770     FALSE 0.096 87.000 0.000 NA   NA
 3479391 3479392 TBFG_12770 TBFG_12771     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479392 3479393 TBFG_12771 TBFG_12772     FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3479393 3479394 TBFG_12772 TBFG_12773     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 3479394 3479395 TBFG_12773 TBFG_12774     FALSE 0.452 10.000 0.000 NA   NA
 3479395 3479396 TBFG_12774 TBFG_12775     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479396 3479397 TBFG_12775 TBFG_12776     FALSE 0.193 74.000 0.012 NA   NA
 3479397 3479398 TBFG_12776 TBFG_12777   thyA FALSE 0.444 71.000 0.295 1.000 N NA
 3479400 3479401 TBFG_12779 TBFG_12780 fabG   FALSE 0.010 233.000 0.000 NA   NA
 3479401 3479402 TBFG_12780 TBFG_12781     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3479402 3479403 TBFG_12781 TBFG_12782     TRUE 0.790 80.000 1.000 NA   NA
 3479403 3479404 TBFG_12782 TBFG_12783     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3479404 3479405 TBFG_12783 TBFG_12784     FALSE 0.049 124.000 0.000 NA   NA
 3479405 3479406 TBFG_12784 TBFG_12785     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3479406 3479407 TBFG_12785 TBFG_12786     TRUE 0.633 12.000 0.027 1.000   NA
 3479407 3479408 TBFG_12786 TBFG_12787     FALSE 0.413 11.000 0.000 NA   NA
 3479410 3479411 TBFG_12789 TBFG_12790     FALSE 0.259 20.000 0.000 NA   NA
 3479411 3479412 TBFG_12790 TBFG_12791     FALSE 0.221 158.000 0.429 NA   NA
 3479412 3479413 TBFG_12791 TBFG_12792     FALSE 0.423 32.000 0.074 NA   NA
 3479415 3479416 TBFG_12794 TBFG_12795     FALSE 0.279 61.000 0.010 1.000   NA
 3479416 3479417 TBFG_12795 TBFG_12796     TRUE 0.764 -22.000 0.171 1.000   NA
 3479417 3479418 TBFG_12796 TBFG_12797     FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 3479418 3479419 TBFG_12797 TBFG_12798   rpsO FALSE 0.466 13.000 0.004 NA   NA
 3479419 3479420 TBFG_12798 TBFG_12799 rpsO   FALSE 0.062 157.000 0.119 1.000 N NA
 3479421 3479422 TBFG_12800 TBFG_12801     FALSE 0.039 85.000 0.000 1.000 N NA
 3479423 3479424 TBFG_12802 TBFG_12803     TRUE 0.807 26.000 0.011 1.000 Y NA
 3479424 3479425 TBFG_12803 TBFG_12804     FALSE 0.018 33.000 0.000 NA N NA
 3479425 3479426 TBFG_12804 TBFG_12805     TRUE 0.985 0.000 0.000 NA Y NA
 3479426 3479427 TBFG_12805 TBFG_12806   truB FALSE 0.005 202.000 0.000 1.000 N NA
 3479427 3479428 TBFG_12806 TBFG_12807 truB   TRUE 0.927 -3.000 0.034 1.000 N NA
 3479428 3479429 TBFG_12807 TBFG_12808     TRUE 0.981 -3.000 0.203 1.000   NA
 3479429 3479430 TBFG_12808 TBFG_12809     FALSE 0.098 145.000 0.111 NA   NA
 3479430 3479431 TBFG_12809 TBFG_12810     TRUE 0.913 0.000 0.006 NA   NA
 3479431 3479432 TBFG_12810 TBFG_12811     TRUE 0.815 4.000 0.006 NA   NA
 3479433 3479434 TBFG_12812 TBFG_12813     TRUE 0.776 19.000 0.375 NA   NA
 3479435 3479436 TBFG_12814 TBFG_12815     TRUE 0.910 -16.000 0.167 0.056   NA
 3479436 3479437 TBFG_12815 TBFG_12816     FALSE 0.176 43.000 0.000 NA   NA
 3479438 3479439 TBFG_12817 TBFG_12818     FALSE 0.034 140.000 0.000 NA   NA
 3479439 3479440 TBFG_12818 TBFG_12819     FALSE 0.171 46.000 0.000 NA   NA
 3479440 3479441 TBFG_12819 TBFG_12820     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479441 3479442 TBFG_12820 TBFG_12821     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 3479442 3479443 TBFG_12821 TBFG_12822     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 3479443 3479444 TBFG_12822 TBFG_12823     FALSE 0.073 105.000 0.000 NA   NA
 3479446 3479447 TBFG_12825 TBFG_12826     TRUE 0.695 71.000 0.600 NA   NA
 3479447 3479448 TBFG_12826 TBFG_12827     TRUE 0.975 -3.000 0.125 1.000   NA
 3479449 3479450 TBFG_12828 TBFG_12829     TRUE 0.791 51.000 0.308 0.054   NA
 3479450 3479451 TBFG_12829 TBFG_12830     FALSE 0.003 1472.000 0.000 1.000   NA
 3479451 3479452 TBFG_12830 TBFG_12831     TRUE 0.992 1.000 0.280 NA Y NA
 3479452 3479453 TBFG_12831 TBFG_12832     FALSE 0.357 13.000 0.000 NA   NA
 3479453 3479454 TBFG_12832 TBFG_12833     TRUE 0.957 -3.000 0.052 NA   NA
 3479454 3479455 TBFG_12833 TBFG_12834     TRUE 0.998 -3.000 0.597 NA Y NA
 3479455 3479456 TBFG_12834 TBFG_12835     TRUE 0.973 -19.000 0.547 NA Y NA
 3479456 3479457 TBFG_12835 TBFG_12836     TRUE 0.907 10.000 0.453 NA   NA
 3479457 3479458 TBFG_12836 TBFG_12837     TRUE 0.988 -3.000 0.347 NA   NA
 3479458 3479459 TBFG_12837 TBFG_12838     TRUE 0.967 -3.000 0.102 NA   NA
 3479459 3479460 TBFG_12838 TBFG_12839     FALSE 0.019 178.000 0.000 NA   NA
 3479460 3479461 TBFG_12839 TBFG_12840     FALSE 0.114 77.000 0.000 NA   NA
 3479461 3479462 TBFG_12840 TBFG_12841     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479462 3479463 TBFG_12841 TBFG_12842     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 3479463 3479464 TBFG_12842 TBFG_12843     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479464 3479465 TBFG_12843 TBFG_12844     FALSE 0.253 21.000 0.000 NA   NA
 3479465 3479466 TBFG_12844 TBFG_12845     FALSE 0.462 -15.000 0.000 NA   NA
 3479468 3479469 TBFG_12847 TBFG_12848     TRUE 0.993 -7.000 0.467 0.017 Y NA
 3479469 3479470 TBFG_12848 TBFG_12849     TRUE 0.997 3.000 0.467 0.017 Y NA
 3479470 3479471 TBFG_12849 TBFG_12850     TRUE 0.999 -3.000 0.389 0.017 Y NA
 3479471 3479472 TBFG_12850 TBFG_12851     FALSE 0.372 87.000 0.006 0.036 N NA
 3479472 3479473 TBFG_12851 TBFG_12852     TRUE 0.597 16.000 0.054 1.000   NA
 3479473 3479474 TBFG_12852 TBFG_12853   rbfA TRUE 0.748 -25.000 0.173 1.000   NA
 3479474 3479475 TBFG_12853 TBFG_12854 rbfA infB TRUE 0.997 0.000 0.530 1.000 Y NA
 3479475 3479476 TBFG_12854 TBFG_12855 infB   FALSE 0.205 86.000 0.171 NA N NA
 3479476 3479477 TBFG_12855 TBFG_12856   nusA TRUE 0.596 127.000 0.323 NA Y NA
 3479477 3479478 TBFG_12856 TBFG_12857 nusA   TRUE 0.995 -3.000 0.759 NA   NA
 3479479 3479480 TBFG_12858 TBFG_12859     TRUE 0.970 -3.000 0.139 NA   NA
 3479481 3479482 TBFG_12860 TBFG_12861     FALSE 0.186 89.000 0.004 1.000   NA
 3479482 3479483 TBFG_12861 TBFG_12862     TRUE 0.819 23.000 0.156 0.017   NA
 3479483 3479484 TBFG_12862 TBFG_12863     FALSE 0.114 277.000 0.145 1.000 Y NA
 3479484 3479485 TBFG_12863 TBFG_12864     TRUE 0.997 0.000 0.114 0.007 Y NA
 3479485 3479486 TBFG_12864 TBFG_12865     TRUE 0.920 21.000 0.057 0.065 Y NA
 3479486 3479487 TBFG_12865 TBFG_12866     TRUE 0.988 -3.000 0.314 1.000   NA
 3479487 3479488 TBFG_12866 TBFG_12867     FALSE 0.421 59.000 0.119 1.000   NA
 3479489 3479490 TBFG_12868 TBFG_12869     FALSE 0.185 37.000 0.000 NA   NA
 3479490 3479491 TBFG_12869 TBFG_12870     TRUE 0.769 13.000 0.341 NA N NA
 3479491 3479492 TBFG_12870 TBFG_12871     FALSE 0.107 100.000 0.030 1.000 N NA
 3479492 3479493 TBFG_12871 TBFG_12872     FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 3479494 3479495 TBFG_12873 TBFG_12874     TRUE 0.998 -3.000 0.839 0.040 N NA
 3479495 3479496 TBFG_12874 TBFG_12875     TRUE 0.991 -3.000 0.419 1.000   NA
 3479496 3479497 TBFG_12875 TBFG_12876     TRUE 0.779 -19.000 0.157 1.000   NA
 3479497 3479498 TBFG_12876 TBFG_12877     FALSE 0.009 160.000 0.000 1.000 N NA
 3479498 3479499 TBFG_12877 TBFG_12878     FALSE 0.334 42.000 0.042 NA   NA
 3479502 3479503 TBFG_12881 TBFG_12882     TRUE 0.965 4.000 0.000 NA Y NA
 3479504 3479505 TBFG_12883 TBFG_12884   ispG FALSE 0.313 56.000 0.018 1.000   NA
 3479505 3479506 TBFG_12884 TBFG_12885 ispG   FALSE 0.452 17.000 0.072 1.000 N NA
 3479506 3479507 TBFG_12885 TBFG_12886     TRUE 0.702 8.000 0.088 1.000 N NA
 3479508 3479509 TBFG_12887 TBFG_12888     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 3479509 3479510 TBFG_12888 TBFG_12889     FALSE 0.002 280.000 0.000 1.000 N NA
 3479510 3479511 TBFG_12889 TBFG_12890     FALSE 0.033 96.000 0.000 1.000 N NA
 3479511 3479512 TBFG_12890 TBFG_12891     FALSE 0.154 52.000 0.000 NA   NA
 3479513 3479514 TBFG_12892 TBFG_12893     TRUE 0.996 5.000 1.000 1.000 Y NA
 3479514 3479515 TBFG_12893 TBFG_12894     FALSE 0.037 186.000 0.003 1.000   NA
 3479515 3479516 TBFG_12894 TBFG_12895     FALSE 0.483 23.000 0.033 1.000   NA
 3479516 3479517 TBFG_12895 TBFG_12896   frr FALSE 0.400 23.000 0.076 1.000 N NA
 3479517 3479518 TBFG_12896 TBFG_12897 frr pyrH FALSE 0.240 172.000 0.626 1.000 N NA
 3479520 3479521 TBFG_12899 TBFG_12900     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 3479523 3479524 TBFG_12902 TBFG_12903   tsf TRUE 0.946 7.000 0.006 1.000 Y NA
 3479524 3479525 TBFG_12903 TBFG_12904 tsf rpsB TRUE 0.980 12.000 0.748 1.000 Y NA
 3479529 3479530 TBFG_12908 TBFG_12909 xerC   FALSE 0.041 91.000 0.008 NA N NA
 3479530 3479531 TBFG_12909 TBFG_12910     FALSE 0.090 33.000 0.007 NA N NA
 3479531 3479532 TBFG_12910 TBFG_12911     TRUE 0.938 -3.000 0.053 1.000 N NA
 3479532 3479533 TBFG_12911 TBFG_12912     TRUE 0.914 0.000 0.050 1.000 N NA
 3479533 3479534 TBFG_12912 TBFG_12913     FALSE 0.011 209.000 0.003 1.000 N NA
 3479534 3479535 TBFG_12913 TBFG_12914     TRUE 0.998 0.000 0.261 0.001 Y NA
 3479535 3479536 TBFG_12914 TBFG_12915     FALSE 0.145 58.000 0.000 NA   NA
 3479536 3479537 TBFG_12915 TBFG_12916   rnhB FALSE 0.329 54.000 0.067 NA   NA
 3479537 3479538 TBFG_12916 TBFG_12917 rnhB   FALSE 0.395 14.000 0.024 1.000 N NA
 3479538 3479539 TBFG_12917 TBFG_12918   rplS FALSE 0.165 58.000 0.018 1.000 N NA
 3479541 3479542 TBFG_12920 TBFG_12921 trmD rimM TRUE 0.995 4.000 0.672 1.000 Y NA
 3479542 3479543 TBFG_12921 TBFG_12922 rimM   TRUE 0.831 14.000 0.324 1.000   NA
 3479543 3479544 TBFG_12922 TBFG_12923   rpsP TRUE 0.924 8.000 0.385 1.000   NA
 3479544 3479545 TBFG_12923 TBFG_12924 rpsP   FALSE 0.026 184.000 0.002 NA   NA
 3479547 3479548 TBFG_12926 TBFG_12927     TRUE 0.971 2.000 0.278 1.000   NA
 3479548 3479549 TBFG_12927 TBFG_12928     FALSE 0.050 69.000 0.000 1.000 N NA
 3479549 3479550 TBFG_12928 TBFG_12929     FALSE 0.072 44.000 0.000 1.000 N NA
 3479550 3479551 TBFG_12929 TBFG_12930     FALSE 0.266 28.000 0.025 1.000 N NA
 3479553 3479554 TBFG_12932 TBFG_12933     FALSE 0.227 58.000 0.055 1.000 N NA
 3479554 3479555 TBFG_12933 TBFG_12934     TRUE 0.989 -3.000 0.467 1.000 N NA
 3479555 3479556 TBFG_12934 TBFG_12935     FALSE 0.026 309.000 0.004 0.035 N NA
 3479556 3479557 TBFG_12935 TBFG_12936     TRUE 0.680 50.000 0.165 0.011 N NA
 3479557 3479558 TBFG_12936 TBFG_12937     FALSE 0.425 12.000 0.021 1.000 N NA
 3479558 3479559 TBFG_12937 TBFG_12938     TRUE 0.552 -13.000 0.028 1.000 N NA
 3479559 3479560 TBFG_12938 TBFG_12939     FALSE 0.078 102.000 0.010 1.000 N NA
 3479560 3479561 TBFG_12939 TBFG_12940   rnc FALSE 0.007 359.000 0.068 1.000 N NA
 3479561 3479562 TBFG_12940 TBFG_12941 rnc   TRUE 0.949 -3.000 0.026 NA   NA
 3479562 3479563 TBFG_12941 TBFG_12942     FALSE 0.286 51.000 0.029 NA   NA
 3479564 3479565 TBFG_12943 TBFG_12944     FALSE 0.024 585.000 0.000 1.000 Y NA
 3479565 3479566 TBFG_12944 TBFG_12945     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3479566 3479567 TBFG_12945 TBFG_12946     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.007 Y NA
 3479567 3479568 TBFG_12946 TBFG_12947     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 3479568 3479569 TBFG_12947 TBFG_12948     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.004 Y NA
 3479569 3479570 TBFG_12948 TBFG_12949     TRUE 0.994 6.000 0.417 0.007 Y NA
 3479570 3479571 TBFG_12949 TBFG_12950     TRUE 0.887 11.000 0.500 1.000 N NA
 3479571 3479572 TBFG_12950 TBFG_12951     TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000   NA
 3479572 3479573 TBFG_12951 TBFG_12952     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001   NA
 3479573 3479574 TBFG_12952 TBFG_12953     TRUE 0.654 47.000 0.364 NA   NA
 3479576 3479577 TBFG_12955 TBFG_12956     TRUE 0.964 -7.000 0.600 1.000   NA
 3479577 3479578 TBFG_12956 TBFG_12957     FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000   NA
 3479578 3479579 TBFG_12957 TBFG_12958     TRUE 0.571 85.000 0.000 1.000 Y NA
 3479580 3479581 TBFG_12959 TBFG_12960     FALSE 0.210 178.000 0.500 NA   NA
 3479581 3479582 TBFG_12960 TBFG_12961     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.007   NA
 3479582 3479583 TBFG_12961 TBFG_12962     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.007   NA
 3479583 3479584 TBFG_12962 TBFG_12963     FALSE 0.157 17.000 0.010 NA N NA
 3479584 3479585 TBFG_12963 TBFG_12964     FALSE 0.119 26.000 0.010 NA N NA
 3479585 3479586 TBFG_12964 TBFG_12965     FALSE 0.000 648.000 0.000 NA N NA
 3479587 3479588 TBFG_12966 TBFG_12967     FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3479589 3479590 TBFG_12968 TBFG_12969     FALSE 0.017 189.000 0.000 NA   NA
 3479591 3479592 TBFG_12970 TBFG_12971     FALSE 0.289 71.000 0.071 NA   NA
 3479593 3479594 TBFG_12972 TBFG_12973     FALSE 0.030 101.000 0.000 1.000 N NA
 3479594 3479595 TBFG_12973 TBFG_12974     FALSE 0.057 115.000 0.000 NA   NA
 3479598 3479599 TBFG_12977 TBFG_12978     FALSE 0.196 73.000 0.012 NA   NA
 3479599 3479600 TBFG_12978 TBFG_12979     TRUE 0.608 6.000 0.000 NA   NA
 3479601 3479602 TBFG_12980 TBFG_12981 coaD   FALSE 0.455 86.000 0.367 1.000 N NA
 3479602 3479603 TBFG_12981 TBFG_12982     FALSE 0.017 196.000 0.014 1.000 N NA
 3479603 3479604 TBFG_12982 TBFG_12983     FALSE 0.374 25.000 0.021 NA   NA
 3479604 3479605 TBFG_12983 TBFG_12984     TRUE 0.905 6.000 0.257 NA   NA
 3479605 3479606 TBFG_12984 TBFG_12985     FALSE 0.409 97.000 0.421 NA N NA
 3479608 3479609 TBFG_12987 TBFG_12988     TRUE 0.945 -3.000 0.018 NA   NA
 3479609 3479610 TBFG_12988 TBFG_12989     TRUE 0.913 3.000 0.040 1.000   NA
 3479612 3479613 TBFG_12991 TBFG_12992     FALSE 0.244 33.000 0.028 1.000 N NA
 3479613 3479614 TBFG_12992 TBFG_12993     FALSE 0.404 -3.000 0.000 NA N NA
 3479614 3479615 TBFG_12993 TBFG_12994     TRUE 0.985 0.000 0.000 NA Y NA
 3479617 3479618 TBFG_12996 TBFG_12997 ddl gpsA FALSE 0.221 78.000 0.088 1.000 N NA
 3479619 3479620 TBFG_12998 TBFG_12999     FALSE 0.165 95.000 0.026 NA   NA
 3479620 3479621 TBFG_12999 TBFG_13000     FALSE 0.168 83.000 0.056 1.000 N NA
 3479622 3479623 TBFG_13001 TBFG_13002   leuD FALSE 0.023 213.000 0.066 1.000 N NA
 3479623 3479624 TBFG_13002 TBFG_13003 leuD   TRUE 0.978 25.000 0.477 0.001 Y NA
 3479628 3479629 TBFG_14035 TBFG_14036     FALSE 0.180 40.000 0.000 NA   NA
 3479629 3479630 TBFG_14036 TBFG_13007   gltX FALSE 0.117 75.000 0.000 NA   NA
 3479630 3479631 TBFG_13007 TBFG_13008 gltX   TRUE 0.947 -3.000 0.070 1.000 N NA
 3479633 3479634 TBFG_13010 TBFG_13011     TRUE 0.885 15.000 0.039 1.000 Y NA
 3479635 3479636 TBFG_13012 TBFG_13013     FALSE 0.006 274.000 0.000 NA   NA
 3479636 3479637 TBFG_13013 TBFG_13014     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 3479637 3479638 TBFG_13014 TBFG_13015     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 3479639 3479640 TBFG_13016 TBFG_13017   ilvH TRUE 0.929 38.000 0.071 0.001 Y NA
 3479640 3479641 TBFG_13017 TBFG_13018 ilvH   TRUE 0.999 0.000 0.380 0.001 Y NA
 3479647 3479648 TBFG_13024 TBFG_13025 gatB   FALSE 0.213 30.000 0.011 1.000 N NA
 3479648 3479649 TBFG_13025 TBFG_13026   gatA FALSE 0.081 96.000 0.007 1.000 N NA
 3479649 3479650 TBFG_13026 TBFG_13027 gatA gatC TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 3479652 3479653 TBFG_13029 TBFG_13030 ligA   FALSE 0.200 31.000 0.009 1.000 N NA
 3479655 3479656 TBFG_13032 TBFG_13033     FALSE 0.096 87.000 0.000 NA   NA
 3479656 3479657 TBFG_13033 TBFG_13034     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3479657 3479658 TBFG_13034 TBFG_13035     FALSE 0.019 179.000 0.000 NA   NA
 3479658 3479659 TBFG_13035 TBFG_13036     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3479659 3479660 TBFG_13036 TBFG_13037     FALSE 0.169 47.000 0.000 NA   NA
 3479660 3479661 TBFG_13037 TBFG_13038     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479661 3479662 TBFG_13038 TBFG_13039     FALSE 0.006 283.000 0.000 NA   NA
 3479662 3479663 TBFG_13039 TBFG_13040   trmU FALSE 0.009 163.000 0.000 1.000 N NA
 3479663 3479664 TBFG_13040 TBFG_13041 trmU   TRUE 0.954 -3.000 0.094 1.000 N NA
 3479664 3479665 TBFG_13041 TBFG_13042     FALSE 0.347 97.000 0.045 0.079 N NA
 3479665 3479666 TBFG_13042 TBFG_13043     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 3479666 3479667 TBFG_13043 TBFG_13044     FALSE 0.020 261.000 0.062 NA   NA
 3479667 3479668 TBFG_13044 TBFG_13045     TRUE 0.980 39.000 0.877 0.008 Y NA
 3479669 3479670 TBFG_13046 TBFG_13047     TRUE 0.959 -3.000 0.019 1.000   NA
 3479670 3479671 TBFG_13047 TBFG_13048     FALSE 0.492 32.000 0.082 1.000   NA
 3479671 3479672 TBFG_13048 TBFG_13049     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3479675 3479676 TBFG_13052 TBFG_13053     FALSE 0.231 73.000 0.034 NA   NA
 3479676 3479677 TBFG_13053 TBFG_13054     FALSE 0.121 135.000 0.112 NA   NA
 3479677 3479678 TBFG_13054 TBFG_13055     TRUE 0.926 11.000 0.292 0.079   NA
 3479678 3479679 TBFG_13055 TBFG_13056     TRUE 0.744 9.000 0.043 1.000   NA
 3479679 3479680 TBFG_13056 TBFG_13057     TRUE 0.961 -3.000 0.024 1.000   NA
 3479680 3479681 TBFG_13057 TBFG_13058     FALSE 0.342 15.000 0.014 1.000 N NA
 3479681 3479682 TBFG_13058 TBFG_13059     FALSE 0.174 38.000 0.007 1.000 N NA
 3479683 3479684 TBFG_13060 TBFG_13061     FALSE 0.339 70.000 0.068 1.000   NA
 3479685 3479686 TBFG_13062 TBFG_13063     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 3479686 3479687 TBFG_13063 TBFG_13064   nrdF FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 3479687 3479688 TBFG_13064 TBFG_13065 nrdF   FALSE 0.078 131.000 0.067 1.000 N NA
 3479688 3479689 TBFG_13065 TBFG_13066     FALSE 0.258 134.000 0.400 1.000 N NA
 3479689 3479690 TBFG_13066 TBFG_13067     FALSE 0.101 128.000 0.100 1.000 N NA
 3479690 3479691 TBFG_13067 TBFG_13068   nrdI TRUE 0.937 -30.000 0.300 NA Y NA
 3479691 3479692 TBFG_13068 TBFG_13069 nrdI   TRUE 0.690 35.000 0.500 NA N NA
 3479692 3479693 TBFG_13069 TBFG_13070     TRUE 0.662 -22.000 0.083 NA   NA
 3479693 3479694 TBFG_13070 TBFG_13071     FALSE 0.267 81.000 0.080 NA   NA
 3479695 3479696 TBFG_13072 TBFG_13073     TRUE 0.740 10.000 0.060 1.000   NA
 3479697 3479698 TBFG_13074 TBFG_13075     TRUE 0.589 64.000 0.316 1.000   NA
 3479700 3479701 TBFG_13077 TBFG_13078     FALSE 0.021 117.000 0.000 1.000 N NA
 3479702 3479703 TBFG_13079 TBFG_13080 ligB   FALSE 0.060 136.000 0.049 1.000 N NA
 3479705 3479706 TBFG_13082 TBFG_13083     TRUE 0.976 -3.000 0.143 1.000   NA
 3479706 3479707 TBFG_13083 TBFG_13084     FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 3479708 3479709 TBFG_14037 TBFG_13085     FALSE 0.129 67.000 0.000 NA   NA
 3479710 3479711 TBFG_13086 TBFG_13087     TRUE 0.998 -3.000 0.290 0.035 Y NA
 3479711 3479712 TBFG_13087 TBFG_13088     TRUE 0.980 -3.000 0.226 NA   NA
 3479713 3479714 TBFG_13089 TBFG_13090     FALSE 0.307 16.000 0.000 NA   NA
 3479717 3479718 TBFG_13093 TBFG_13094     TRUE 0.923 -7.000 0.333 NA   NA
 3479718 3479719 TBFG_13094 TBFG_13095     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3479720 3479721 TBFG_13096 TBFG_13097     FALSE 0.143 59.000 0.000 NA   NA
 3479724 3479725 TBFG_13100 TBFG_13101     TRUE 0.766 6.000 0.077 1.000 N NA
 3479725 3479726 TBFG_13101 TBFG_13102     TRUE 0.989 -3.000 0.077 0.079   NA
 3479726 3479727 TBFG_13102 TBFG_13103     TRUE 0.636 31.000 0.000 0.039   NA
 3479727 3479728 TBFG_13103 TBFG_13104     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3479728 3479729 TBFG_13104 TBFG_13105     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 3479729 3479730 TBFG_13105 TBFG_13106     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3479730 3479731 TBFG_13106 TBFG_13107     FALSE 0.000 939.000 0.000 NA N NA
 3479731 3479732 TBFG_13107 TBFG_13108     FALSE 0.273 18.000 0.000 NA   NA
 3479733 3479734 TBFG_13109 TBFG_13110     FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3479734 3479735 TBFG_13110 TBFG_13111     TRUE 0.968 -3.000 0.231 NA N NA
 3479736 3479737 TBFG_13112 TBFG_13113     FALSE 0.083 98.000 0.000 NA   NA
 3479738 3479739 TBFG_13114 TBFG_13115     FALSE 0.053 119.000 0.000 NA   NA
 3479739 3479740 TBFG_13115 TBFG_13116     FALSE 0.002 751.000 0.000 NA   NA
 3479740 3479741 TBFG_13116 TBFG_13117   smpB FALSE 0.185 37.000 0.000 NA   NA
 3479741 3479742 TBFG_13117 TBFG_13118 smpB   TRUE 0.837 3.000 0.038 1.000 N NA
 3479742 3479743 TBFG_13118 TBFG_13119     TRUE 0.995 1.000 0.431 1.000 Y NA
 3479743 3479744 TBFG_13119 TBFG_13120     TRUE 0.615 44.000 0.010 0.063   NA
 3479744 3479745 TBFG_13120 TBFG_13121     TRUE 0.946 2.000 0.096 1.000   NA
 3479745 3479746 TBFG_13121 TBFG_13122   prfB FALSE 0.528 -10.000 0.013 1.000 N NA
 3479749 3479750 TBFG_13125 TBFG_13126     FALSE 0.029 149.000 0.000 NA   NA
 3479750 3479751 TBFG_13126 TBFG_13127     TRUE 0.690 51.000 0.000 1.000 Y NA
 3479751 3479752 TBFG_13127 TBFG_13128   moaC TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3479752 3479753 TBFG_13128 TBFG_13129 moaC   TRUE 0.960 17.000 0.175 0.004 Y NA
 3479753 3479754 TBFG_13129 TBFG_13130     FALSE 0.049 123.000 0.000 NA   NA
 3479754 3479755 TBFG_13130 TBFG_13131     FALSE 0.271 -677.000 0.000 NA   NA
 3479755 3479756 TBFG_13131 TBFG_13132     TRUE 0.792 51.000 0.308 0.051   NA
 3479756 3479757 TBFG_13132 TBFG_13134     FALSE 0.001 431.000 0.000 1.000 N NA
 3479757 3479758 TBFG_13134 TBFG_13135     FALSE 0.032 99.000 0.000 1.000 N NA
 3479758 3479759 TBFG_13135 TBFG_13136     FALSE 0.044 78.000 0.000 1.000 N NA
 3479759 3479760 TBFG_13136 TBFG_13137     FALSE 0.091 29.000 0.000 1.000 N NA
 3479760 3479761 TBFG_13137 TBFG_13138     TRUE 0.987 2.000 0.557 1.000   NA
 3479761 3479762 TBFG_13138 TBFG_13139     FALSE 0.351 21.000 0.000 1.000   NA
 3479762 3479763 TBFG_13139 TBFG_13140     TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000   NA
 3479763 3479764 TBFG_13140 TBFG_13141     FALSE 0.006 335.000 0.000 1.000   NA
 3479764 3479765 TBFG_13141 TBFG_13142     FALSE 0.003 378.000 0.000 NA   NA
 3479765 3479766 TBFG_13142 TBFG_13143     FALSE 0.232 25.000 0.000 NA   NA
 3479766 3479767 TBFG_13143 TBFG_13144     FALSE 0.003 419.000 0.000 NA   NA
 3479768 3479769 TBFG_13145 TBFG_13146     FALSE 0.026 157.000 0.000 NA   NA
 3479771 3479772 TBFG_13148 TBFG_13149     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 3479776 3479777 TBFG_13153 TBFG_13154     TRUE 0.998 -3.000 0.091 0.005 Y NA
 3479777 3479778 TBFG_13154 TBFG_13155     TRUE 0.968 28.000 1.000 1.000 Y NA
 3479779 3479780 TBFG_13156 TBFG_13157     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 3479780 3479781 TBFG_13157 TBFG_13158     FALSE 0.000 457.000 0.000 NA N NA
 3479781 3479782 TBFG_13158 TBFG_13159     FALSE 0.114 20.000 0.000 1.000 N NA
 3479782 3479783 TBFG_13159 TBFG_13160     FALSE 0.043 80.000 0.000 1.000 N NA
 3479783 3479784 TBFG_13160 TBFG_13161     TRUE 0.979 21.000 0.604 0.009 Y NA
 3479784 3479785 TBFG_13161 TBFG_13162     FALSE 0.134 100.000 0.057 1.000 N NA
 3479789 3479790 TBFG_13166 TBFG_13167     TRUE 0.992 9.000 0.498 0.002 Y NA
 3479790 3479791 TBFG_13167 TBFG_13168     TRUE 0.999 -3.000 0.691 0.002 Y NA
 3479791 3479792 TBFG_13168 TBFG_13169     TRUE 0.998 0.000 0.299 0.004 Y NA
 3479792 3479793 TBFG_13169 TBFG_13170     TRUE 0.998 -3.000 0.161 0.004 Y NA
 3479793 3479794 TBFG_13170 TBFG_13171     TRUE 0.998 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 3479794 3479795 TBFG_13171 TBFG_13172     TRUE 0.999 -3.000 0.753 0.004 Y NA
 3479795 3479796 TBFG_13172 TBFG_13173     TRUE 0.808 107.000 0.151 0.004 Y NA
 3479796 3479797 TBFG_13173 TBFG_13174     TRUE 0.973 -28.000 0.221 0.004 Y NA
 3479797 3479798 TBFG_13174 TBFG_13175     TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.004 Y NA
 3479798 3479799 TBFG_13175 TBFG_13176     TRUE 0.999 -3.000 0.306 0.002 Y NA
 3479799 3479800 TBFG_13176 TBFG_13177     TRUE 0.993 11.000 0.790 0.004 Y NA
 3479800 3479801 TBFG_13177 TBFG_13178     TRUE 0.999 -3.000 0.373 0.001 Y NA
 3479801 3479802 TBFG_13178 TBFG_13179     TRUE 0.999 -3.000 0.257 0.001 Y NA
 3479803 3479804 TBFG_13180 TBFG_13181     FALSE 0.002 175.000 0.000 NA N NA
 3479804 3479805 TBFG_13181 TBFG_13182     FALSE 0.205 11.000 0.000 1.000 N NA
 3479805 3479806 TBFG_13182 TBFG_13183     FALSE 0.124 70.000 0.000 NA   NA
 3479806 3479807 TBFG_13183 TBFG_13184     TRUE 0.978 -3.000 0.212 NA   NA
 3479807 3479808 TBFG_13184 TBFG_13185     TRUE 0.853 30.000 0.744 NA   NA
 3479808 3479809 TBFG_13185 TBFG_13186     TRUE 0.853 8.000 0.231 NA   NA
 3479809 3479810 TBFG_13186 TBFG_13187     TRUE 0.988 -3.000 0.345 NA   NA
 3479810 3479811 TBFG_13187 TBFG_13188     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 3479812 3479813 TBFG_13189 TBFG_13190     TRUE 0.987 0.000 0.444 NA   NA
 3479813 3479814 TBFG_13190 TBFG_13191     FALSE 0.048 125.000 0.000 NA   NA
 3479815 3479816 TBFG_13192 TBFG_13193     FALSE 0.037 137.000 0.000 NA   NA
 3479816 3479817 TBFG_13193 TBFG_13194     FALSE 0.111 79.000 0.000 NA   NA
 3479818 3479819 TBFG_13195 TBFG_13196     FALSE 0.433 15.000 0.000 1.000   NA
 3479821 3479822 TBFG_13198 TBFG_13199     FALSE 0.042 131.000 0.000 NA   NA
 3479822 3479823 TBFG_13199 TBFG_13200     FALSE 0.009 240.000 0.000 NA   NA
 3479823 3479824 TBFG_13200 TBFG_13201     FALSE 0.012 213.000 0.000 NA   NA
 3479825 3479826 TBFG_13202 TBFG_13203     TRUE 0.959 3.000 0.286 NA   NA
 3479827 3479828 TBFG_13204 TBFG_13205     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479829 3479830 TBFG_13206 TBFG_13207     TRUE 0.792 51.000 0.308 0.051   NA
 3479831 3479832 TBFG_13208 TBFG_13209     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479833 3479834 TBFG_13210 TBFG_13211     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 3479834 3479835 TBFG_13211 TBFG_14038     FALSE 0.002 872.000 0.000 NA   NA
 3479837 3479838 TBFG_13213 TBFG_13214     FALSE 0.265 92.000 0.069 1.000   NA
 3479839 3479840 TBFG_13215 TBFG_13216     TRUE 0.820 6.000 0.072 NA   NA
 3479843 3479844 TBFG_13219 TBFG_13220     FALSE 0.004 430.000 0.000 1.000   NA
 3479846 3479847 TBFG_13222 TBFG_13223 nudC   FALSE 0.212 59.000 0.048 1.000 N NA
 3479847 3479848 TBFG_13223 TBFG_13224     FALSE 0.278 62.000 0.110 1.000 N NA
 3479848 3479849 TBFG_13224 TBFG_13225     TRUE 0.999 -3.000 0.493 0.002 Y NA
 3479850 3479851 TBFG_13226 TBFG_13227     FALSE 0.469 31.000 0.115 NA   NA
 3479851 3479852 TBFG_13227 TBFG_13228     TRUE 0.936 3.000 0.111 1.000   NA
 3479853 3479854 TBFG_13229 TBFG_13230     TRUE 0.648 27.000 0.273 NA   NA
 3479854 3479855 TBFG_13230 TBFG_13231     FALSE 0.403 91.000 0.236 1.000   NA
 3479857 3479858 TBFG_13233 TBFG_13234     FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 3479861 3479862 TBFG_13237 TBFG_13238     TRUE 0.643 13.000 0.096 NA   NA
 3479864 3479865 TBFG_13240 TBFG_13241     TRUE 0.964 -3.000 0.167 1.000 N NA
 3479865 3479866 TBFG_13241 TBFG_13242     FALSE 0.133 148.000 0.170 1.000   NA
 3479868 3479869 TBFG_13244 TBFG_13245     FALSE 0.009 293.000 0.000 1.000   NA
 3479870 3479871 TBFG_13246 TBFG_13247     TRUE 0.571 17.000 0.102 NA   NA
 3479871 3479872 TBFG_13247 TBFG_13248     FALSE 0.017 261.000 0.046 NA   NA
 3479872 3479873 TBFG_13248 TBFG_13249     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479873 3479874 TBFG_13249 TBFG_13250     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479875 3479876 TBFG_13251 TBFG_13252     FALSE 0.303 -64.000 0.000 NA   NA
 3479876 3479877 TBFG_13252 TBFG_13253     FALSE 0.388 -22.000 0.000 NA   NA
 3479878 3479879 TBFG_13254 TBFG_13255     FALSE 0.049 124.000 0.000 NA   NA
 3479880 3479881 TBFG_13256 TBFG_13257     TRUE 0.969 -3.000 0.063 1.000   NA
 3479882 3479883 TBFG_13258 TBFG_13259     TRUE 0.629 78.000 0.583 1.000 N NA
 3479883 3479884 TBFG_13259 TBFG_13260     FALSE 0.249 110.000 0.208 NA   NA
 3479884 3479885 TBFG_13260 TBFG_13261     TRUE 0.950 -3.000 0.029 NA   NA
 3479885 3479886 TBFG_13261 TBFG_13262     FALSE 0.383 24.000 0.022 NA   NA
 3479886 3479887 TBFG_13262 TBFG_13263     FALSE 0.538 -9.000 0.000 NA   NA
 3479889 3479890 TBFG_13265 TBFG_13266     TRUE 0.995 5.000 0.889 1.000 Y NA
 3479890 3479891 TBFG_13266 TBFG_13267     FALSE 0.241 61.000 0.136 NA N NA
 3479891 3479892 TBFG_13267 TBFG_13268     FALSE 0.210 59.000 0.091 NA N NA
 3479892 3479893 TBFG_13268 TBFG_13269     FALSE 0.130 79.000 0.020 1.000 N NA
 3479893 3479894 TBFG_13269 TBFG_13270     FALSE 0.170 79.000 0.094 NA N NA
 3479894 3479895 TBFG_13270 TBFG_13271     FALSE 0.013 316.000 0.072 NA   NA
 3479895 3479896 TBFG_13271 TBFG_13272     FALSE 0.308 38.000 0.022 NA   NA
 3479896 3479897 TBFG_13272 TBFG_13273     FALSE 0.281 68.000 0.061 NA   NA
 3479897 3479898 TBFG_13273 TBFG_13274     TRUE 0.986 0.000 0.418 NA   NA
 3479898 3479899 TBFG_13274 TBFG_13275     TRUE 0.941 50.000 0.772 1.000 Y NA
 3479899 3479900 TBFG_13275 TBFG_13276     FALSE 0.147 70.000 0.021 1.000 N NA
 3479900 3479901 TBFG_13276 TBFG_13277     FALSE 0.094 97.000 0.016 1.000 N NA
 3479901 3479902 TBFG_13277 TBFG_13278     FALSE 0.076 105.000 0.012 1.000 N NA
 3479902 3479903 TBFG_13278 TBFG_13279     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 N NA
 3479903 3479904 TBFG_13279 TBFG_13280     TRUE 0.997 5.000 0.750 0.007 Y NA
 3479904 3479905 TBFG_13280 TBFG_13281     TRUE 0.994 0.000 0.778 1.000   NA
 3479905 3479906 TBFG_13281 TBFG_13282     TRUE 0.653 109.000 0.778 1.000   NA
 3479908 3479909 TBFG_13284 TBFG_13285     TRUE 0.829 8.000 0.198 NA   NA
 3479909 3479910 TBFG_13285 TBFG_13286   manB TRUE 0.970 -3.000 0.138 NA   NA
 3479910 3479911 TBFG_13286 TBFG_13287 manB   FALSE 0.502 102.000 0.460 NA   NA
 3479914 3479915 TBFG_13290 TBFG_13291     TRUE 0.988 -3.000 0.371 NA   NA
 3479915 3479916 TBFG_13291 TBFG_13292     FALSE 0.014 296.000 0.018 1.000   NA
 3479917 3479918 TBFG_13293 TBFG_13294     TRUE 0.942 2.000 0.151 NA   NA
 3479918 3479919 TBFG_13294 TBFG_13295     TRUE 0.864 11.000 0.354 NA   NA
 3479920 3479921 TBFG_13296 TBFG_13297     TRUE 0.759 39.000 0.517 NA   NA
 3479921 3479922 TBFG_13297 TBFG_13298     FALSE 0.142 125.000 0.103 NA   NA
 3479922 3479923 TBFG_13298 TBFG_13299     TRUE 0.904 11.000 0.500 NA   NA
 3479925 3479926 TBFG_13301 TBFG_13302     FALSE 0.431 5.000 0.000 1.000 N NA
 3479927 3479928 TBFG_13303 TBFG_13304     FALSE 0.229 25.000 0.009 1.000 N NA
 3479928 3479929 TBFG_13304 TBFG_13305     TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.000 Y NA
 3479931 3479932 TBFG_13307 TBFG_13308     FALSE 0.287 43.000 0.016 NA   NA
 3479933 3479934 TBFG_13309 TBFG_13310     TRUE 0.936 -19.000 0.692 NA   NA
 3479934 3479935 TBFG_13310 TBFG_13311     TRUE 0.943 -3.000 0.015 NA   NA
 3479935 3479936 TBFG_13311 TBFG_13312     FALSE 0.095 41.000 0.011 NA N NA
 3479936 3479937 TBFG_13312 TBFG_13313     TRUE 0.988 -3.000 0.351 NA   NA
 3479937 3479938 TBFG_13313 TBFG_13314     FALSE 0.148 108.000 0.045 NA   NA
 3479939 3479940 TBFG_13315 TBFG_13316     TRUE 0.991 -3.000 0.636 NA N NA
 3479940 3479941 TBFG_13316 TBFG_13317     FALSE 0.484 9.000 0.000 NA   NA
 3479941 3479942 TBFG_13317 TBFG_13318     TRUE 0.662 35.000 0.333 NA   NA
 3479942 3479943 TBFG_13318 TBFG_13319     FALSE 0.422 34.000 0.083 NA   NA
 3479943 3479944 TBFG_13319 TBFG_13320     FALSE 0.439 51.000 0.224 1.000 N NA
 3479945 3479946 TBFG_13321 TBFG_13322     FALSE 0.485 27.000 0.103 NA   NA
 3479948 3479949 TBFG_13324 TBFG_13325     FALSE 0.392 44.000 0.040 1.000   NA
 3479949 3479950 TBFG_13325 TBFG_13326     TRUE 0.966 4.000 0.352 1.000   NA
 3479951 3479952 TBFG_13327 TBFG_13328     FALSE 0.094 27.000 0.000 1.000 N NA
 3479952 3479953 TBFG_13328 TBFG_13329     FALSE 0.280 20.000 0.015 1.000 N NA
 3479953 3479954 TBFG_13329 TBFG_13330     FALSE 0.045 12.000 0.000 NA N NA
 3479954 3479955 TBFG_13330 TBFG_13331     FALSE 0.005 108.000 0.000 NA N NA
 3479955 3479956 TBFG_13331 TBFG_13332     TRUE 0.819 81.000 0.071 0.045 Y NA
 3479958 3479959 TBFG_13334 TBFG_13335     TRUE 0.994 -3.000 0.132 0.003   NA
 3479960 3479961 TBFG_13336 TBFG_13337     TRUE 0.920 4.000 0.235 1.000 N NA
 3479963 3479964 TBFG_13339 TBFG_13340     FALSE 0.505 24.000 0.100 NA   NA
 3479965 3479966 TBFG_13341 TBFG_13342     FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3479966 3479967 TBFG_13342 TBFG_13343     FALSE 0.019 179.000 0.000 NA   NA
 3479967 3479968 TBFG_13343 TBFG_13344     FALSE 0.123 71.000 0.000 NA   NA
 3479968 3479969 TBFG_13344 TBFG_13345   deoA TRUE 0.991 0.000 0.062 1.000 Y NA
 3479969 3479970 TBFG_13345 TBFG_13346 deoA   TRUE 0.996 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 3479971 3479972 TBFG_13347 TBFG_13348     TRUE 0.998 -3.000 0.157 0.000 Y NA
 3479972 3479973 TBFG_13348 TBFG_13349   sdhA TRUE 0.904 129.000 0.705 0.002 Y NA
 3479973 3479974 TBFG_13349 TBFG_13350 sdhA sdhB TRUE 0.999 0.000 0.604 0.002 Y NA
 3479975 3479976 TBFG_13351 TBFG_13352     TRUE 0.729 4.000 0.000 NA   NA
 3479976 3479977 TBFG_13352 TBFG_13353     FALSE 0.050 122.000 0.000 NA   NA
 3479977 3479978 TBFG_13353 TBFG_13354     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3479978 3479979 TBFG_13354 TBFG_13355   moaC TRUE 0.995 1.000 0.025 0.004 Y NA
 3479979 3479980 TBFG_13355 TBFG_13356 moaC   TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3479980 3479981 TBFG_13356 TBFG_13357     FALSE 0.056 61.000 0.000 1.000 N NA
 3479981 3479982 TBFG_13357 TBFG_13358     TRUE 0.792 51.000 0.308 0.050   NA
 3479985 3479986 TBFG_13361 TBFG_13362     FALSE 0.232 69.000 0.077 1.000 N NA
 3479986 3479987 TBFG_13362 TBFG_13363     FALSE 0.162 96.000 0.074 1.000 N NA
 3479987 3479988 TBFG_13363 TBFG_13364     TRUE 0.993 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 3479990 3479991 TBFG_13366 TBFG_13367     FALSE 0.266 19.000 0.000 NA   NA
 3479992 3479993 TBFG_13368 TBFG_13369     FALSE 0.517 21.000 0.045 1.000   NA
 3479995 3479996 TBFG_13371 TBFG_13372     FALSE 0.180 40.000 0.000 NA   NA
 3479997 3479998 TBFG_13373 TBFG_13374   metX TRUE 0.972 12.000 0.542 1.000 Y NA
 3479998 3479999 TBFG_13374 TBFG_13375 metX   TRUE 0.960 -3.000 0.136 1.000 N NA
 3480000 3480001 TBFG_13376 TBFG_13377     FALSE 0.133 64.000 0.000 NA   NA
 3480001 3480002 TBFG_13377 TBFG_13378     FALSE 0.025 158.000 0.000 NA   NA
 3480002 3480003 TBFG_13378 TBFG_13379     FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 3480003 3480004 TBFG_13379 TBFG_13380     FALSE 0.008 256.000 0.000 NA   NA
 3480004 3480005 TBFG_13380 TBFG_13381     TRUE 0.568 77.000 0.000 NA Y NA
 3480005 3480006 TBFG_13381 TBFG_13382     FALSE 0.118 74.000 0.000 NA   NA
 3480008 3480009 TBFG_13384 TBFG_13385     FALSE 0.303 91.000 0.182 NA   NA
 3480009 3480010 TBFG_13385 TBFG_13386     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 3480010 3480011 TBFG_13386 TBFG_13387     FALSE 0.205 31.000 0.000 NA   NA
 3480011 3480012 TBFG_13387 TBFG_13388     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 3480012 3480013 TBFG_13388 TBFG_13389     FALSE 0.032 143.000 0.000 NA   NA
 3480015 3480016 TBFG_13391 TBFG_13392     TRUE 0.991 -3.000 0.453 NA   NA
 3480017 3480018 TBFG_13393 TBFG_13394     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3480018 3480019 TBFG_13394 TBFG_13395     FALSE 0.177 42.000 0.000 NA   NA
 3480019 3480020 TBFG_13395 TBFG_13396     FALSE 0.055 117.000 0.000 NA   NA
 3480021 3480022 TBFG_13397 TBFG_13398     TRUE 0.930 7.000 0.412 NA   NA
 3480022 3480023 TBFG_13398 TBFG_13399     TRUE 0.913 -19.000 0.529 NA   NA
 3480023 3480024 TBFG_13399 TBFG_13400     TRUE 0.941 -22.000 0.818 NA   NA
 3480024 3480025 TBFG_13400 TBFG_13401     TRUE 0.994 -3.000 0.636 NA   NA
 3480026 3480027 TBFG_13402 TBFG_13403     FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 3480031 3480032 TBFG_13407 TBFG_13408     FALSE 0.288 42.000 0.016 NA   NA
 3480032 3480033 TBFG_13408 TBFG_13409     FALSE 0.003 237.000 0.000 1.000 N NA
 3480033 3480034 TBFG_13409 TBFG_13410     TRUE 0.978 1.000 0.000 0.005   NA
 3480034 3480035 TBFG_13410 TBFG_13411     TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 3480035 3480036 TBFG_13411 TBFG_13412     FALSE 0.104 108.000 0.000 1.000   NA
 3480037 3480038 TBFG_13413 TBFG_13414     TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 3480038 3480039 TBFG_13414 TBFG_13415     TRUE 0.845 9.000 0.000 0.077   NA
 3480039 3480040 TBFG_13415 TBFG_13416     FALSE 0.280 223.000 0.333 1.000 Y NA
 3480040 3480041 TBFG_13416 TBFG_13417     FALSE 0.392 -6.000 0.000 1.000 N NA
 3480041 3480042 TBFG_13417 TBFG_13418     FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 3480042 3480043 TBFG_13418 TBFG_13419     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 3480044 3480045 TBFG_13420 TBFG_13421     TRUE 0.915 -10.000 0.000 NA Y NA
 3480045 3480046 TBFG_13421 TBFG_13422     FALSE 0.016 190.000 0.000 NA   NA
 3480048 3480049 TBFG_13424 TBFG_13425     FALSE 0.231 46.000 0.077 NA N NA
 3480052 3480053 TBFG_13428 TBFG_13429     TRUE 0.994 -3.000 0.636 NA   NA
 3480055 3480056 TBFG_13431 TBFG_13432 guaA   FALSE 0.183 12.000 0.000 1.000 N NA
 3480056 3480057 TBFG_13432 TBFG_13433     FALSE 0.091 29.000 0.000 1.000 N NA
 3480058 3480059 TBFG_13434 TBFG_13435     FALSE 0.133 64.000 0.000 NA   NA
 3480059 3480060 TBFG_13435 TBFG_13436     TRUE 0.904 15.000 0.286 0.036   NA
 3480061 3480062 TBFG_13437 TBFG_13438     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 3480062 3480063 TBFG_13438 TBFG_13439     FALSE 0.288 17.000 0.000 NA   NA
 3480063 3480064 TBFG_13439 TBFG_13440     FALSE 0.083 118.000 0.000 1.000   NA
 3480065 3480066 TBFG_13441 TBFG_13442     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 3480067 3480068 TBFG_13443 TBFG_13444     FALSE 0.238 56.000 0.057 1.000 N NA
 3480068 3480069 TBFG_13444 TBFG_13445     TRUE 0.951 20.000 0.056 0.001 Y NA
 3480071 3480072 TBFG_13447 TBFG_13448     TRUE 0.960 -7.000 0.615 NA   NA
 3480072 3480073 TBFG_13448 TBFG_13449     TRUE 0.898 18.000 0.706 1.000   NA
 3480075 3480076 TBFG_13451 TBFG_13452 groEL groES TRUE 0.937 95.000 0.592 0.003 Y NA
 3480076 3480077 TBFG_13452 TBFG_13453 groES   FALSE 0.089 267.000 0.004 1.000 Y NA
 3480077 3480078 TBFG_13453 TBFG_13454     TRUE 0.968 -3.000 0.056 1.000   NA
 3480078 3480079 TBFG_13454 TBFG_13455     TRUE 0.969 -3.000 0.062 1.000   NA
 3480079 3480080 TBFG_13455 TBFG_13456     TRUE 0.813 -15.000 0.217 NA   NA
 3480080 3480081 TBFG_13456 TBFG_13457   alr TRUE 0.949 -3.000 0.028 NA   NA
 3480082 3480083 TBFG_13458 TBFG_13459     FALSE 0.006 276.000 0.000 NA   NA
 3480085 3480086 TBFG_13461 TBFG_13462     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3480086 3480087 TBFG_13462 TBFG_13463     FALSE 0.091 91.000 0.000 NA   NA
 3480090 3480091 TBFG_13466 TBFG_13467     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 3480091 3480092 TBFG_13467 TBFG_13468     FALSE 0.071 106.000 0.000 NA   NA
 3480092 3480093 TBFG_13468 TBFG_13469     FALSE 0.004 233.000 0.000 1.000 N NA
 3480093 3480094 TBFG_13469 TBFG_13470     FALSE 0.092 38.000 0.009 NA N NA
 3480094 3480095 TBFG_13470 TBFG_13471     TRUE 0.869 2.000 0.004 NA   NA
 3480095 3480096 TBFG_13471 TBFG_13472     FALSE 0.062 237.000 0.300 NA   NA
 3480096 3480097 TBFG_13472 TBFG_13473     FALSE 0.056 138.000 0.005 NA   NA
 3480098 3480099 TBFG_13474 TBFG_13475     TRUE 0.728 10.000 0.095 NA   NA
 3480100 3480101 TBFG_13476 TBFG_13477     TRUE 0.990 3.000 0.875 NA   NA
 3480101 3480102 TBFG_13477 TBFG_13478     FALSE 0.254 48.000 0.009 NA   NA
 3480102 3480103 TBFG_13478 TBFG_13479   rpsI FALSE 0.089 125.000 0.068 1.000 N NA
 3480103 3480104 TBFG_13479 TBFG_13480 rpsI rplM TRUE 0.999 -3.000 0.601 0.012 Y NA
 3480104 3480105 TBFG_13480 TBFG_13481 rplM   FALSE 0.010 233.000 0.000 NA   NA
 3480105 3480106 TBFG_13481 TBFG_13482     TRUE 0.604 21.000 0.190 NA   NA
 3480106 3480107 TBFG_13482 TBFG_13483     TRUE 0.918 -7.000 0.310 NA   NA
 3480107 3480108 TBFG_13483 TBFG_13484     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 3480109 3480110 TBFG_13485 TBFG_13486     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 3480112 3480113 TBFG_13488 TBFG_13489     TRUE 0.883 32.000 0.500 0.076   NA
 3480113 3480114 TBFG_13489 TBFG_13490     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3480114 3480115 TBFG_13490 TBFG_13491     FALSE 0.242 23.000 0.000 NA   NA
 3480116 3480117 TBFG_13492 TBFG_13493 truA rplQ TRUE 0.897 -55.000 0.102 1.000 Y NA
 3480117 3480118 TBFG_13493 TBFG_13494 rplQ   TRUE 0.853 32.000 0.873 1.000 N NA
 3480118 3480119 TBFG_13494 TBFG_13495   rpsD FALSE 0.263 152.000 0.549 1.000 N NA
 3480119 3480120 TBFG_13495 TBFG_13496 rpsD   TRUE 0.991 9.000 0.509 0.015 Y NA
 3480120 3480121 TBFG_13496 TBFG_13497   rpsM TRUE 0.998 4.000 0.810 0.012 Y NA
 3480121 3480122 TBFG_13497 TBFG_13498 rpsM rpmJ FALSE 0.348 216.000 0.086 0.012 Y NA
 3480122 3480123 TBFG_13498 TBFG_13499 rpmJ   TRUE 0.810 33.000 0.067 1.000 Y NA
 3480124 3480125 TBFG_13500 TBFG_13501     FALSE 0.010 73.000 0.000 NA N NA
 3480125 3480126 TBFG_13501 TBFG_13502     TRUE 0.992 2.000 0.250 1.000 Y NA
 3480126 3480127 TBFG_13502 TBFG_13503     FALSE 0.103 83.000 0.000 NA   NA
 3480127 3480128 TBFG_13503 TBFG_13504     TRUE 0.674 5.000 0.000 NA   NA
 3480129 3480130 TBFG_13505 TBFG_13506     TRUE 0.923 4.000 0.000 0.036 N NA
 3480130 3480131 TBFG_13506 TBFG_13507     TRUE 0.658 61.000 0.000 1.000 Y NA
 3480131 3480132 TBFG_13507 TBFG_13508     FALSE 0.362 6.000 0.000 1.000 N NA
 3480134 3480135 TBFG_13510 TBFG_13511     FALSE 0.024 196.000 0.000 1.000   NA
 3480136 3480137 TBFG_13512 TBFG_13513     TRUE 0.871 40.000 1.000 NA   NA
 3480137 3480138 TBFG_13513 TBFG_13514     FALSE 0.018 183.000 0.000 NA   NA
 3480139 3480140 TBFG_13515 TBFG_13516     FALSE 0.091 91.000 0.000 NA   NA
 3480140 3480141 TBFG_13516 TBFG_13517     FALSE 0.051 121.000 0.000 NA   NA
 3480141 3480142 TBFG_13517 TBFG_13518     TRUE 0.867 44.000 1.000 NA   NA
 3480147 3480148 TBFG_13523 TBFG_13524     FALSE 0.003 246.000 0.000 1.000 N NA
 3480148 3480149 TBFG_13524 TBFG_13525     FALSE 0.118 152.000 0.200 NA   NA
 3480150 3480151 TBFG_13526 TBFG_13527     TRUE 0.994 0.000 0.800 NA   NA
 3480151 3480152 TBFG_13527 TBFG_13528     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 3480152 3480153 TBFG_13528 TBFG_13529     TRUE 0.991 11.000 0.667 0.006 Y NA
 3480153 3480154 TBFG_13529 TBFG_13530     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.006 Y NA
 3480154 3480155 TBFG_13530 TBFG_13531     TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.006 Y NA
 3480155 3480156 TBFG_13531 TBFG_13532     TRUE 0.994 -10.000 0.667 0.006 Y NA
 3480156 3480157 TBFG_13532 TBFG_13533     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.006 Y NA
 3480157 3480158 TBFG_13533 TBFG_13534     TRUE 0.971 20.000 1.000 NA Y NA
 3480158 3480159 TBFG_13534 TBFG_13535     TRUE 0.957 35.000 1.000 NA Y NA
 3480159 3480160 TBFG_13535 TBFG_13536   fabG FALSE 0.097 226.000 0.000 NA Y NA
 3480160 3480161 TBFG_13536 TBFG_13537 fabG   TRUE 0.735 25.000 0.429 1.000 N NA
 3480162 3480163 TBFG_13538 TBFG_13539     TRUE 0.985 25.000 0.882 0.008 Y NA
 3480163 3480164 TBFG_13539 TBFG_13540     TRUE 0.903 71.000 0.647 1.000 Y NA
 3480164 3480165 TBFG_13540 TBFG_13541     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 3480165 3480166 TBFG_13541 TBFG_13542     FALSE 0.008 252.000 0.000 NA   NA
 3480167 3480168 TBFG_13543 TBFG_13544     TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.036   NA
 3480173 3480174 TBFG_13549 TBFG_13550     FALSE 0.278 96.000 0.097 1.000   NA
 3480178 3480179 TBFG_13554 TBFG_13555     TRUE 0.925 16.000 0.880 NA   NA
 3480179 3480180 TBFG_13555 TBFG_13556     TRUE 0.972 17.000 0.880 NA Y NA
 3480180 3480181 TBFG_13556 TBFG_13557     FALSE 0.255 42.000 0.000 1.000   NA
 3480183 3480184 TBFG_13559 TBFG_13560     TRUE 0.971 6.000 0.727 NA   NA
 3480185 3480186 TBFG_13561 TBFG_13562     FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 3480186 3480187 TBFG_13562 TBFG_13563     TRUE 0.992 0.000 0.625 1.000   NA
 3480187 3480188 TBFG_13563 TBFG_13564     TRUE 0.983 -3.000 0.273 NA   NA
 3480190 3480191 TBFG_13566 TBFG_13567     FALSE 0.007 99.000 0.000 NA N NA
 3480191 3480192 TBFG_13567 TBFG_13568     TRUE 0.984 -3.000 0.333 1.000 N NA
 3480192 3480193 TBFG_13568 TBFG_13569     TRUE 0.948 11.000 0.231 1.000 Y NA
 3480194 3480195 TBFG_13570 TBFG_13571     TRUE 0.993 2.000 0.625 0.037 N NA
 3480195 3480196 TBFG_13571 TBFG_13572     FALSE 0.003 137.000 0.000 NA N NA
 3480197 3480198 TBFG_13573 TBFG_13574     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 3480198 3480199 TBFG_13574 TBFG_13575     TRUE 0.996 -3.000 0.889 NA   NA
 3480199 3480200 TBFG_13575 TBFG_13576     TRUE 0.994 -3.000 0.652 NA   NA
 3480200 3480201 TBFG_13576 TBFG_13577     TRUE 0.993 -15.000 0.696 0.008 Y NA
 3480201 3480202 TBFG_13577 TBFG_13578     TRUE 0.935 -18.000 0.381 0.043 N NA
 3480203 3480204 TBFG_13579 TBFG_13580     FALSE 0.093 112.000 0.000 1.000   NA
 3480205 3480206 TBFG_13581 TBFG_13582     TRUE 0.972 23.000 0.515 0.037 Y NA
 3480207 3480208 TBFG_13583 TBFG_13584     TRUE 0.999 0.000 0.647 0.074 Y NA
 3480208 3480209 TBFG_13584 TBFG_13585     TRUE 0.999 -3.000 0.912 NA Y NA
 3480209 3480210 TBFG_13585 TBFG_13586     TRUE 0.582 98.000 0.561 NA   NA
 3480210 3480211 TBFG_13586 TBFG_13587     TRUE 0.988 -3.000 0.037 0.043   NA
 3480212 3480213 TBFG_13588 TBFG_13589     FALSE 0.112 105.000 0.000 1.000   NA
 3480213 3480214 TBFG_13589 TBFG_13590     TRUE 0.577 65.000 0.423 1.000 N NA
 3480216 3480217 TBFG_13592 TBFG_13593     TRUE 0.998 -3.000 0.629 1.000 Y NA
 3480218 3480219 TBFG_13594 TBFG_13595     TRUE 0.992 1.000 0.242 1.000 Y NA
 3480219 3480220 TBFG_13595 TBFG_13596     TRUE 0.999 -3.000 0.879 0.008   NA
 3480220 3480221 TBFG_13596 TBFG_13597     TRUE 0.997 -3.000 0.484 0.008   NA
 3480221 3480222 TBFG_13597 TBFG_13598     TRUE 0.919 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3480223 3480224 TBFG_13599 TBFG_13600     TRUE 0.957 0.000 0.059 1.000   NA
 3480224 3480225 TBFG_13600 TBFG_13601     TRUE 0.887 15.000 0.520 1.000   NA
 3480225 3480226 TBFG_13601 TBFG_13602     TRUE 0.998 -3.000 0.733 0.007   NA
 3480226 3480227 TBFG_13602 TBFG_13603     TRUE 0.922 15.000 0.733 1.000   NA
 3480228 3480229 TBFG_13604 TBFG_13605     TRUE 0.888 18.000 0.727 NA   NA
 3480233 3480234 TBFG_13609 TBFG_13610     FALSE 0.037 137.000 0.000 NA   NA
 3480234 3480235 TBFG_13610 TBFG_13611     TRUE 0.609 14.000 0.078 NA   NA
 3480236 3480237 TBFG_13612 TBFG_13613   cysS TRUE 0.989 1.000 0.088 1.000 Y NA
 3480237 3480238 TBFG_13613 TBFG_13614 cysS ispF FALSE 0.181 65.000 0.037 1.000 N NA
 3480238 3480239 TBFG_13614 TBFG_13615 ispF ispD TRUE 0.997 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 3480239 3480240 TBFG_13615 TBFG_13616 ispD   FALSE 0.442 17.000 0.068 1.000 N NA
 3480241 3480242 TBFG_13617 TBFG_13618     FALSE 0.275 66.000 0.014 1.000   NA
 3480242 3480243 TBFG_13618 TBFG_13619     TRUE 0.880 5.000 0.126 NA   NA
 3480244 3480245 TBFG_13620 TBFG_13621     FALSE 0.485 85.000 0.333 NA   NA
 3480247 3480248 TBFG_13623 TBFG_13624     FALSE 0.062 111.000 0.000 NA   NA
 3480249 3480250 TBFG_13625 TBFG_13626     TRUE 0.714 -22.000 0.160 NA   NA
 3480250 3480251 TBFG_13626 TBFG_13627     FALSE 0.030 147.000 0.000 NA   NA
 3480252 3480253 TBFG_13628 TBFG_13629     FALSE 0.068 108.000 0.000 NA   NA
 3480253 3480254 TBFG_13629 TBFG_13630     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 3480254 3480255 TBFG_13630 TBFG_13631   lysS FALSE 0.319 104.000 0.247 NA   NA
 3480255 3480256 TBFG_13631 TBFG_13632 lysS   FALSE 0.087 101.000 0.015 1.000 N NA
 3480256 3480257 TBFG_13632 TBFG_13633     TRUE 0.826 3.000 0.030 1.000 N NA
 3480257 3480258 TBFG_13633 TBFG_13634   panC TRUE 0.996 0.000 0.342 1.000 Y NA
 3480258 3480259 TBFG_13634 TBFG_13635 panC   TRUE 0.970 -3.000 0.067 1.000   NA
 3480259 3480260 TBFG_13635 TBFG_13636     FALSE 0.118 122.000 0.054 NA   NA
 3480260 3480261 TBFG_13636 TBFG_13637     FALSE 0.069 209.000 0.237 NA   NA
 3480261 3480262 TBFG_13637 TBFG_13638     TRUE 0.952 0.000 0.081 NA   NA
 3480262 3480263 TBFG_13638 TBFG_13639     TRUE 0.994 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3480263 3480264 TBFG_13639 TBFG_13640     TRUE 0.986 -7.000 0.471 1.000 Y NA
 3480264 3480265 TBFG_13640 TBFG_13641   folE TRUE 0.998 -3.000 0.609 1.000 Y NA
 3480265 3480266 TBFG_13641 TBFG_13642 folE   TRUE 0.630 16.000 0.212 1.000 N NA
 3480268 3480269 TBFG_13644 TBFG_13645     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA   NA
 3480269 3480270 TBFG_13645 TBFG_13646     TRUE 0.648 116.000 1.000 NA   NA
 3480270 3480271 TBFG_13646 TBFG_13647     TRUE 0.805 74.000 1.000 NA   NA
 3480272 3480273 TBFG_13648 TBFG_13649     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3480274 3480275 TBFG_13650 TBFG_13651     FALSE 0.221 27.000 0.000 NA   NA
 3480275 3480276 TBFG_13651 TBFG_13652     FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 3480276 3480277 TBFG_13652 TBFG_13653     TRUE 0.940 10.000 0.667 NA   NA
 3480279 3480280 TBFG_13655 TBFG_13656     TRUE 0.988 -3.000 0.137 0.024 N NA
 3480280 3480281 TBFG_13656 TBFG_13657     TRUE 0.633 -21.000 0.050 NA   NA
 3480281 3480282 TBFG_13657 TBFG_13658     TRUE 0.928 -12.000 0.500 NA   NA
 3480285 3480286 TBFG_13661 TBFG_13662     FALSE 0.149 56.000 0.000 NA   NA
 3480286 3480287 TBFG_13662 TBFG_13663     TRUE 0.965 -3.000 0.081 NA   NA
 3480287 3480288 TBFG_13663 TBFG_13664     FALSE 0.013 211.000 0.000 NA   NA
 3480290 3480291 TBFG_13666 TBFG_13667     FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 3480291 3480292 TBFG_13667 TBFG_13668     FALSE 0.003 385.000 0.000 NA   NA
 3480292 3480293 TBFG_13668 TBFG_13669     TRUE 0.985 0.000 0.000 NA Y NA
 3480294 3480295 TBFG_13670 TBFG_13671     FALSE 0.124 70.000 0.000 NA   NA
 3480295 3480296 TBFG_13671 TBFG_13672     FALSE 0.007 176.000 0.000 1.000 N NA
 3480296 3480297 TBFG_13672 TBFG_14039     FALSE 0.002 802.000 0.000 NA   NA
 3480297 3480298 TBFG_14039 TBFG_13673     FALSE 0.111 79.000 0.000 NA   NA
 3480300 3480301 TBFG_13675 TBFG_13676     FALSE 0.006 353.000 0.008 NA   NA
 3480301 3480302 TBFG_13676 TBFG_13677     FALSE 0.375 140.000 0.611 NA   NA
 3480303 3480304 TBFG_13678 TBFG_13679     FALSE 0.037 137.000 0.000 NA   NA
 3480304 3480305 TBFG_13679 TBFG_13680     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3480307 3480308 TBFG_13682 TBFG_13683     TRUE 0.638 -6.000 0.000 NA   NA
 3480309 3480310 TBFG_13684 TBFG_13685     FALSE 0.462 32.000 0.118 NA   NA
 3480310 3480311 TBFG_13685 TBFG_13686     FALSE 0.237 24.000 0.000 NA   NA
 3480311 3480312 TBFG_13686 TBFG_13687     TRUE 0.715 10.000 0.080 NA   NA
 3480312 3480313 TBFG_13687 TBFG_13688     TRUE 0.914 24.000 0.323 0.001   NA
 3480313 3480314 TBFG_13688 TBFG_13689     TRUE 0.998 -3.000 0.659 1.000 Y NA
 3480314 3480315 TBFG_13689 TBFG_13690     TRUE 0.593 102.000 0.776 NA N NA
 3480317 3480318 TBFG_13692 TBFG_13693     TRUE 0.974 -3.000 0.104 1.000   NA
 3480318 3480319 TBFG_13693 TBFG_13694     TRUE 0.995 -3.000 0.725 1.000   NA
 3480319 3480320 TBFG_13694 TBFG_13695     TRUE 0.971 56.000 0.811 0.015 Y NA
 3480320 3480321 TBFG_13695 TBFG_13696     TRUE 0.995 2.000 0.147 0.015 Y NA
 3480322 3480323 TBFG_13697 TBFG_13698     FALSE 0.049 123.000 0.000 NA   NA
 3480325 3480326 TBFG_13700 TBFG_13701     TRUE 0.984 1.000 0.494 NA   NA
 3480327 3480328 TBFG_13702 TBFG_13703     TRUE 0.944 6.000 0.367 1.000   NA
 3480328 3480329 TBFG_13703 TBFG_13704     FALSE 0.205 132.000 0.304 1.000 N NA
 3480329 3480330 TBFG_13704 TBFG_13705     TRUE 0.889 0.000 0.022 1.000 N NA
 3480331 3480332 TBFG_13706 TBFG_13707     FALSE 0.235 99.000 0.116 NA   NA
 3480333 3480334 TBFG_13708 TBFG_13709     TRUE 0.741 7.000 0.039 NA   NA
 3480335 3480336 TBFG_13710 TBFG_13711     TRUE 0.999 -3.000 0.709 0.001 Y NA
 3480338 3480339 TBFG_13713 TBFG_13714     FALSE 0.350 69.000 0.072 1.000   NA
 3480339 3480340 TBFG_13714 TBFG_13715     TRUE 0.968 -3.000 0.057 1.000   NA
 3480340 3480341 TBFG_13715 TBFG_14040     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 3480342 3480343 TBFG_13716 TBFG_13717     FALSE 0.226 26.000 0.000 NA   NA
 3480343 3480344 TBFG_13717 TBFG_13718     FALSE 0.009 234.000 0.000 NA   NA
 3480344 3480345 TBFG_13718 TBFG_13719     FALSE 0.022 202.000 0.000 1.000   NA
 3480346 3480347 TBFG_13720 TBFG_13721     TRUE 0.831 27.000 0.628 NA   NA
 3480347 3480348 TBFG_13721 TBFG_13722     TRUE 0.841 48.000 0.841 NA   NA
 3480348 3480349 TBFG_13722 TBFG_13723     TRUE 0.985 -3.000 0.302 NA   NA
 3480349 3480350 TBFG_13723 TBFG_13724     TRUE 0.641 92.000 0.648 NA   NA
 3480353 3480354 TBFG_13727 TBFG_13728 glpK   FALSE 0.162 50.000 0.000 NA   NA
 3480355 3480356 TBFG_13729 TBFG_13730     TRUE 0.606 22.000 0.200 NA   NA
 3480357 3480358 TBFG_13731 TBFG_13732     FALSE 0.436 31.000 0.077 NA   NA
 3480358 3480359 TBFG_13732 TBFG_13733     TRUE 0.986 -3.000 0.316 NA   NA
 3480359 3480360 TBFG_13733 TBFG_13734     TRUE 0.990 0.000 0.597 NA   NA
 3480360 3480361 TBFG_13734 TBFG_13735     TRUE 0.987 -3.000 0.337 NA   NA
 3480361 3480362 TBFG_13735 TBFG_13736     FALSE 0.105 132.000 0.063 NA   NA
 3480362 3480363 TBFG_13736 TBFG_13737     FALSE 0.196 129.000 0.222 NA   NA
 3480363 3480364 TBFG_13737 TBFG_13738     TRUE 0.558 111.000 0.667 NA   NA
 3480364 3480365 TBFG_13738 TBFG_13739     FALSE 0.226 119.000 0.222 NA   NA
 3480365 3480366 TBFG_13739 TBFG_13740     FALSE 0.060 140.000 0.012 NA   NA
 3480366 3480367 TBFG_13740 TBFG_13741     TRUE 0.990 1.000 0.119 1.000 Y NA
 3480370 3480371 TBFG_13744 TBFG_13745     TRUE 0.982 5.000 0.796 1.000   NA
 3480372 3480373 TBFG_13746 TBFG_13747   recR FALSE 0.244 68.000 0.003 1.000   NA
 3480373 3480374 TBFG_13747 TBFG_13748 recR   TRUE 0.911 12.000 0.604 NA   NA
 3480377 3480378 TBFG_13751 TBFG_13752     TRUE 0.846 18.000 0.633 1.000 N NA
 3480379 3480380 TBFG_13753 TBFG_13754     FALSE 0.157 90.000 0.061 1.000 N NA
 3480381 3480382 TBFG_14041 TBFG_13755     FALSE 0.077 103.000 0.000 NA   NA
 3480382 3480383 TBFG_13755 TBFG_13756     FALSE 0.008 246.000 0.000 NA   NA
 3480383 3480384 TBFG_13756 TBFG_13757     FALSE 0.249 45.000 0.000 1.000   NA
 3480384 3480385 TBFG_13757 TBFG_13758     FALSE 0.002 278.000 0.000 1.000 N NA
 3480385 3480386 TBFG_13758 TBFG_13759     FALSE 0.027 341.000 0.000 0.036   NA
 3480386 3480387 TBFG_13759 TBFG_13760     FALSE 0.169 110.000 0.036 1.000   NA
 3480387 3480388 TBFG_13760 TBFG_13761     FALSE 0.019 215.000 0.000 1.000   NA
 3480390 3480391 TBFG_13763 TBFG_13764 ligC   FALSE 0.080 100.000 0.000 NA   NA
 3480392 3480393 TBFG_13765 TBFG_13766     FALSE 0.525 14.000 0.029 NA   NA
 3480394 3480395 TBFG_13767 TBFG_13768     FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 3480395 3480396 TBFG_13768 TBFG_13769     TRUE 0.729 4.000 0.000 NA   NA
 3480397 3480398 TBFG_13770 TBFG_13771     FALSE 0.154 52.000 0.000 NA   NA
 3480398 3480399 TBFG_13771 TBFG_13772     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 3480399 3480400 TBFG_13772 TBFG_13773     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3480400 3480401 TBFG_13773 TBFG_13774     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3480401 3480402 TBFG_13774 TBFG_13775     FALSE 0.048 146.000 0.000 1.000   NA
 3480404 3480405 TBFG_13777 TBFG_13778     FALSE 0.194 73.000 0.012 NA   NA
 3480406 3480407 TBFG_13779 TBFG_13780     FALSE 0.043 130.000 0.000 NA   NA
 3480408 3480409 TBFG_13781 TBFG_13782     FALSE 0.189 68.000 0.000 1.000   NA
 3480411 3480412 TBFG_14042 TBFG_13784     FALSE 0.211 30.000 0.000 NA   NA
 3480412 3480413 TBFG_13784 TBFG_13785     FALSE 0.528 16.000 0.053 NA   NA
 3480415 3480416 TBFG_13787 TBFG_13788     TRUE 0.849 6.000 0.136 NA   NA
 3480416 3480417 TBFG_13788 TBFG_13789     TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.015 Y NA
 3480417 3480418 TBFG_13789 TBFG_13790     TRUE 0.986 -12.000 0.694 1.000 Y NA
 3480418 3480419 TBFG_13790 TBFG_13791     TRUE 0.674 9.000 0.085 1.000 N NA
 3480421 3480422 TBFG_13793 TBFG_13794     FALSE 0.111 79.000 0.000 NA   NA
 3480424 3480425 TBFG_13796 TBFG_13797     TRUE 0.990 -22.000 0.742 0.032 Y NA
 3480428 3480429 TBFG_13800 TBFG_13801     FALSE 0.017 186.000 0.000 NA   NA
 3480430 3480431 TBFG_13802 TBFG_13803     FALSE 0.071 106.000 0.000 NA   NA
 3480431 3480432 TBFG_13803 TBFG_13804     FALSE 0.324 15.000 0.000 NA   NA
 3480432 3480433 TBFG_13804 TBFG_13805     FALSE 0.039 135.000 0.000 NA   NA
 3480433 3480434 TBFG_13805 TBFG_14043     FALSE 0.039 135.000 0.000 NA   NA
 3480434 3480435 TBFG_14043 TBFG_14044     FALSE 0.205 31.000 0.000 NA   NA
 3480438 3480439 TBFG_13808 TBFG_13809     TRUE 0.633 12.000 0.148 1.000 N NA
 3480439 3480440 TBFG_13809 TBFG_13810     FALSE 0.040 157.000 0.000 1.000   NA
 3480444 3480445 TBFG_13813 TBFG_13814     TRUE 0.896 4.000 0.093 NA   NA
 3480445 3480446 TBFG_13814 TBFG_13815     TRUE 0.908 4.000 0.136 NA   NA
 3480446 3480447 TBFG_13815 TBFG_13816     TRUE 0.985 -3.000 0.303 NA   NA
 3480447 3480448 TBFG_13816 TBFG_13817     TRUE 0.979 -3.000 0.220 NA   NA
 3480448 3480449 TBFG_13817 TBFG_13818     FALSE 0.216 156.000 0.000 NA Y NA
 3480449 3480450 TBFG_13818 TBFG_13819     FALSE 0.102 84.000 0.000 NA   NA
 3480451 3480452 TBFG_13820 TBFG_13821     FALSE 0.041 13.000 0.000 NA N NA
 3480453 3480454 TBFG_13822 TBFG_13823     FALSE 0.377 109.000 0.300 1.000   NA
 3480454 3480455 TBFG_13823 TBFG_13824     FALSE 0.392 40.000 0.033 1.000   NA
 3480455 3480456 TBFG_13824 TBFG_13825     TRUE 0.970 1.000 0.242 1.000   NA
 3480456 3480457 TBFG_13825 TBFG_13826     TRUE 0.981 3.000 0.543 NA   NA
 3480457 3480458 TBFG_13826 TBFG_13827     TRUE 0.983 0.000 0.360 NA   NA
 3480458 3480459 TBFG_13827 TBFG_13828     TRUE 0.834 86.000 0.455 0.001   NA
 3480459 3480460 TBFG_13828 TBFG_13829     TRUE 0.895 45.000 0.400 0.001   NA
 3480460 3480461 TBFG_13829 TBFG_13830     FALSE 0.437 68.000 0.182 1.000   NA
 3480461 3480462 TBFG_13830 TBFG_13831     FALSE 0.115 104.000 0.000 1.000   NA
 3480462 3480463 TBFG_13831 TBFG_13832     FALSE 0.017 127.000 0.000 1.000 N NA
 3480464 3480465 TBFG_13833 TBFG_13834     TRUE 0.995 -3.000 0.800 1.000 N NA
 3480465 3480466 TBFG_13834 TBFG_13835     TRUE 0.985 7.000 0.520 1.000 Y NA
 3480466 3480467 TBFG_13835 TBFG_13836     FALSE 0.054 289.000 0.091 0.072   NA
 3480467 3480468 TBFG_13836 TBFG_13837     FALSE 0.065 198.000 0.136 1.000   NA
 3480468 3480469 TBFG_13837 TBFG_13838     FALSE 0.139 147.000 0.222 NA   NA
 3480469 3480470 TBFG_13838 TBFG_13839     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA   NA
 3480470 3480471 TBFG_13839 TBFG_13840     FALSE 0.243 89.000 0.086 NA   NA
 3480471 3480472 TBFG_13840 TBFG_13841     TRUE 0.851 7.000 0.136 1.000   NA
 3480472 3480473 TBFG_13841 TBFG_13842     TRUE 0.797 26.000 0.500 NA   NA
 3480473 3480474 TBFG_13842 TBFG_13843     TRUE 0.967 -3.000 0.105 NA   NA
 3480475 3480476 TBFG_13844 TBFG_13845     FALSE 0.079 205.000 0.269 NA   NA
 3480476 3480477 TBFG_13845 TBFG_13846     FALSE 0.027 154.000 0.000 NA   NA
 3480478 3480479 TBFG_13847 TBFG_13848     TRUE 0.848 15.000 0.154 0.072   NA
 3480479 3480480 TBFG_13848 TBFG_13849     TRUE 0.987 18.000 0.750 0.004 Y NA
 3480480 3480481 TBFG_13849 TBFG_13850     TRUE 0.995 4.000 0.267 0.004 Y NA
 3480482 3480483 TBFG_13851 TBFG_13852     FALSE 0.431 47.000 0.071 1.000   NA
 3480483 3480484 TBFG_13852 TBFG_13853     TRUE 0.979 0.000 0.250 1.000   NA
 3480486 3480487 TBFG_13855 TBFG_13856     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 3480488 3480489 TBFG_13857 TBFG_13858     FALSE 0.064 110.000 0.000 NA   NA
 3480489 3480490 TBFG_13858 TBFG_13859     FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 3480492 3480493 TBFG_13861 TBFG_13862     TRUE 0.985 0.000 0.000 NA Y NA
 3480493 3480494 TBFG_13862 TBFG_13863     TRUE 0.638 1.000 0.000 1.000 N NA
 3480494 3480495 TBFG_13863 TBFG_13864     TRUE 0.841 48.000 1.000 1.000 N NA
 3480500 3480501 TBFG_13869 TBFG_13870     TRUE 0.799 17.000 0.387 NA   NA
 3480502 3480503 TBFG_13871 TBFG_13872     TRUE 0.929 -3.000 0.079 NA N NA
 3480504 3480505 TBFG_13873 TBFG_13874     FALSE 0.416 26.000 0.048 NA   NA
 3480505 3480506 TBFG_13874 TBFG_13875     FALSE 0.034 198.000 0.042 NA   NA
 3480507 3480508 TBFG_13876 TBFG_13877     TRUE 0.829 6.000 0.087 NA   NA
 3480508 3480509 TBFG_13877 TBFG_13878     FALSE 0.002 1089.000 0.000 NA   NA
 3480509 3480510 TBFG_13878 TBFG_13879     FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 3480511 3480512 TBFG_13880 TBFG_13881     FALSE 0.324 15.000 0.000 NA   NA
 3480512 3480513 TBFG_13881 TBFG_13882     FALSE 0.002 1064.000 0.000 NA   NA
 3480513 3480514 TBFG_13882 TBFG_13883     FALSE 0.013 211.000 0.000 NA   NA
 3480514 3480515 TBFG_13883 TBFG_13884     FALSE 0.013 255.000 0.008 NA   NA
 3480515 3480516 TBFG_13884 TBFG_13885     FALSE 0.011 265.000 0.000 1.000   NA
 3480516 3480517 TBFG_13885 TBFG_13886     FALSE 0.179 118.000 0.148 NA   NA
 3480517 3480518 TBFG_13886 TBFG_13887     FALSE 0.380 12.000 0.000 NA   NA
 3480518 3480519 TBFG_13887 TBFG_13888     FALSE 0.070 107.000 0.000 NA   NA
 3480519 3480520 TBFG_13888 TBFG_13889     FALSE 0.511 17.000 0.056 NA   NA
 3480523 3480524 TBFG_13892 TBFG_13893     FALSE 0.484 9.000 0.000 NA   NA
 3480524 3480525 TBFG_13893 TBFG_13894   gltD FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 3480525 3480526 TBFG_13894 TBFG_13895 gltD   TRUE 0.988 -7.000 0.043 0.000 Y NA
 3480529 3480530 TBFG_13898 TBFG_13899     FALSE 0.009 243.000 0.000 NA   NA
 3480530 3480531 TBFG_13899 TBFG_13900     TRUE 0.763 88.000 1.000 NA   NA
 3480531 3480532 TBFG_13900 TBFG_13901     TRUE 0.942 3.000 0.200 NA   NA
 3480532 3480533 TBFG_13901 TBFG_13902     FALSE 0.510 39.000 0.200 NA   NA
 3480533 3480534 TBFG_13902 TBFG_13903     TRUE 0.950 -7.000 0.500 NA   NA
 3480534 3480535 TBFG_13903 TBFG_13904     TRUE 0.729 4.000 0.000 NA   NA
 3480535 3480536 TBFG_13904 TBFG_13905     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 3480536 3480537 TBFG_13905 TBFG_13906     TRUE 0.892 103.000 1.000 0.002   NA
 3480537 3480538 TBFG_13906 TBFG_13907     FALSE 0.184 143.000 0.286 NA   NA
 3480538 3480539 TBFG_13907 TBFG_13908     TRUE 0.818 34.000 0.667 NA   NA
 3480539 3480540 TBFG_13908 TBFG_13909     FALSE 0.367 93.000 0.250 NA   NA
 3480540 3480541 TBFG_13909 TBFG_13910     TRUE 0.670 33.000 0.333 NA   NA
 3480541 3480542 TBFG_13910 TBFG_13911     FALSE 0.268 114.000 0.250 NA   NA
 3480542 3480543 TBFG_13911 TBFG_13912     FALSE 0.520 93.000 0.429 NA   NA
 3480543 3480544 TBFG_13912 TBFG_13913     FALSE 0.311 151.000 0.571 NA   NA
 3480545 3480546 TBFG_13914 TBFG_13915     FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 3480546 3480547 TBFG_13915 TBFG_13916     TRUE 0.931 -3.000 0.002 NA   NA
 3480547 3480548 TBFG_13916 TBFG_13917     FALSE 0.339 107.000 0.286 NA   NA
 3480548 3480549 TBFG_13917 TBFG_13918     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3480549 3480550 TBFG_13918 TBFG_13919     FALSE 0.025 192.000 0.000 1.000   NA
 3480550 3480551 TBFG_13919 TBFG_13920     TRUE 0.655 70.000 0.500 NA   NA
 3480551 3480552 TBFG_13920 TBFG_13921     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3480552 3480553 TBFG_13921 TBFG_13922     TRUE 0.927 -81.000 1.000 NA   NA
 3480553 3480554 TBFG_13922 TBFG_13923     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 3480554 3480555 TBFG_13923 TBFG_13924     TRUE 0.647 94.000 0.667 NA   NA
 3480555 3480556 TBFG_13924 TBFG_13925     TRUE 0.742 96.000 1.000 NA   NA
 3480556 3480557 TBFG_13925 TBFG_13926     TRUE 0.701 36.000 0.400 NA   NA
 3480557 3480558 TBFG_13926 TBFG_13927     FALSE 0.060 112.000 0.000 NA   NA
 3480558 3480559 TBFG_13927 TBFG_13928     TRUE 0.794 79.000 1.000 NA   NA
 3480559 3480560 TBFG_13928 TBFG_13929     FALSE 0.007 267.000 0.000 NA   NA
 3480560 3480561 TBFG_13929 TBFG_13930     TRUE 0.985 1.000 0.500 NA   NA
 3480561 3480562 TBFG_13930 TBFG_13931     TRUE 0.972 3.000 0.400 NA   NA
 3480562 3480563 TBFG_13931 TBFG_13932     FALSE 0.029 150.000 0.000 NA   NA
 3480563 3480564 TBFG_13932 TBFG_13933     FALSE 0.357 13.000 0.000 NA   NA
 3480564 3480565 TBFG_13933 TBFG_13934     FALSE 0.427 162.000 1.000 NA   NA
 3480565 3480566 TBFG_13934 TBFG_13935     FALSE 0.041 132.000 0.000 NA   NA
 3480566 3480567 TBFG_13935 TBFG_13936     FALSE 0.147 57.000 0.000 NA   NA
 3480567 3480568 TBFG_13936 TBFG_13937     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 3480568 3480569 TBFG_13937 TBFG_13938     TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA   NA
 3480569 3480570 TBFG_13938 TBFG_13939     TRUE 0.958 5.000 0.429 NA   NA
 3480570 3480571 TBFG_13939 TBFG_13940     TRUE 0.886 11.000 0.429 NA   NA
 3480571 3480572 TBFG_13940 TBFG_13941     FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 3480572 3480573 TBFG_13941 TBFG_13942     FALSE 0.477 25.000 0.078 NA   NA
 3480574 3480575 TBFG_13943 TBFG_13944     TRUE 0.988 -3.000 0.351 NA   NA
 3480575 3480576 TBFG_13944 TBFG_13945     TRUE 0.989 -3.000 0.411 NA   NA
 3480576 3480577 TBFG_13945 TBFG_13946     TRUE 0.674 35.000 0.306 1.000   NA
 3480577 3480578 TBFG_13946 TBFG_13947     FALSE 0.381 93.000 0.265 NA   NA
 3480578 3480579 TBFG_13947 TBFG_13948     FALSE 0.152 94.000 0.015 NA   NA
 3480579 3480580 TBFG_13948 TBFG_13949     TRUE 0.993 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 3480580 3480581 TBFG_13949 TBFG_13950     FALSE 0.229 110.000 0.237 1.000 N NA
 3480582 3480583 TBFG_13951 TBFG_13952     FALSE 0.010 290.000 0.013 NA   NA
 3480583 3480584 TBFG_13952 TBFG_13953     TRUE 0.995 -3.000 0.827 1.000 N NA
 3480584 3480585 TBFG_13953 TBFG_13954   gidB TRUE 0.985 -3.000 0.339 1.000 N NA
 3480585 3480586 TBFG_13954 TBFG_13955 gidB   FALSE 0.137 132.000 0.070 1.000   NA
 3480586 3480587 TBFG_13955 TBFG_13956     FALSE 0.274 72.000 0.024 1.000   NA
 3480587 3480588 TBFG_13956 TBFG_13957     TRUE 0.579 -16.000 0.010 NA   NA
 3480588 3480589 TBFG_13957 TBFG_13958   rnpA TRUE 0.992 -3.000 0.540 NA   NA
 3480589 3480590 TBFG_13958 TBFG_13959 rnpA rpmH TRUE 0.996 -3.000 0.787 1.000   NA