MicrobesOnline Operon Predictions for Psychrobacter cryohalolentis K5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
1899667	1899668	Pcryo_0001	Pcryo_0002			TRUE	0.923	201.000	0.787	1.000		NA
1899669	1899670	Pcryo_0003	Pcryo_0004			TRUE	0.960	161.000	0.328	1.000	Y	NA
1899670	1899671	Pcryo_0004	Pcryo_0005			TRUE	0.955	167.000	0.318	1.000	Y	NA
1899671	1899672	Pcryo_0005	Pcryo_0006			TRUE	0.876	500.000	0.249	0.008	Y	NA
1899672	1899673	Pcryo_0006	Pcryo_0007			FALSE	0.299	113.000	0.000	NA		NA
1899674	1899675	Pcryo_0008	Pcryo_0009			TRUE	0.724	15.000	0.000	1.000		NA
1899679	1899680	Pcryo_0013	Pcryo_0014			TRUE	0.925	180.000	0.365	0.002	N	NA
1899680	1899681	Pcryo_0014	Pcryo_0015			TRUE	0.918	231.000	0.352	1.000	Y	NA
1899683	1899684	Pcryo_0017	Pcryo_0018			FALSE	0.130	202.000	0.000	1.000		NA
1899684	1899685	Pcryo_0018	Pcryo_0019			TRUE	0.895	87.000	0.000	0.024	Y	NA
1899685	1899686	Pcryo_0019	Pcryo_0020			FALSE	0.257	140.000	0.000	NA		NA
1899691	1899692	Pcryo_0025	Pcryo_0026			TRUE	0.940	-10.000	0.000	NA		NA
1899693	1899694	Pcryo_0027	Pcryo_0028			FALSE	0.091	246.000	0.000	NA		NA
1899694	1899695	Pcryo_0028	Pcryo_0029			TRUE	0.703	53.000	0.008	NA		NA
1899695	1899696	Pcryo_0029	Pcryo_0030			TRUE	0.522	120.000	0.006	NA		NA
1899697	1899698	Pcryo_0031	Pcryo_0032			FALSE	0.059	368.000	0.000	NA		NA
1899700	1899701	Pcryo_0034	Pcryo_0035			TRUE	0.588	171.000	0.041	1.000	N	NA
1899701	1899702	Pcryo_0035	Pcryo_0036			FALSE	0.306	102.000	0.000	1.000		NA
1899703	1899704	Pcryo_0037	Pcryo_0038			FALSE	0.081	244.000	0.000	1.000	N	NA
1899704	1899705	Pcryo_0038	Pcryo_0039			FALSE	0.097	236.000	0.000	1.000		NA
1899705	1899706	Pcryo_0039	Pcryo_0040			FALSE	0.067	315.000	0.000	1.000		NA
1899706	1899707	Pcryo_0040	Pcryo_0041			FALSE	0.073	290.000	0.000	NA		NA
1899707	1899708	Pcryo_0041	Pcryo_0042			FALSE	0.142	194.000	0.000	NA		NA
1899708	1899709	Pcryo_0042	Pcryo_0043			TRUE	0.811	56.000	0.036	1.000	N	NA
1899709	1899710	Pcryo_0043	Pcryo_0044			FALSE	0.056	396.000	0.000	NA		NA
1899713	1899714	Pcryo_0047	Pcryo_0048			TRUE	0.862	86.000	0.154	NA		NA
1899715	1899716	Pcryo_0049	Pcryo_0050			FALSE	0.124	195.000	0.000	1.000	N	NA
1899716	1899717	Pcryo_0050	Pcryo_0051			TRUE	0.973	50.000	0.494	1.000		NA
1899717	1899718	Pcryo_0051	Pcryo_0052			FALSE	0.087	252.000	0.000	1.000		NA
1899719	1899720	Pcryo_0053	Pcryo_0054			TRUE	0.998	0.000	0.631	0.073		NA
1899723	1899724	Pcryo_0057	Pcryo_0058			FALSE	0.271	109.000	0.000	1.000	N	NA
1899724	1899725	Pcryo_0058	Pcryo_0059			FALSE	0.308	71.000	0.000	1.000	N	NA
1899725	1899726	Pcryo_0059	Pcryo_0060			FALSE	0.396	59.000	0.000	NA		NA
1899726	1899727	Pcryo_0060	Pcryo_0061			FALSE	0.197	222.000	0.003	NA		NA
1899727	1899728	Pcryo_0061	Pcryo_0062			TRUE	0.947	51.000	0.263	NA	N	NA
1899728	1899729	Pcryo_0062	Pcryo_0063			TRUE	0.506	131.000	0.007	NA	N	NA
1899730	1899731	Pcryo_0064	Pcryo_0065			FALSE	0.245	205.000	0.004	NA		NA
1899732	1899733	Pcryo_0066	Pcryo_0067			TRUE	0.843	84.000	0.122	1.000	N	NA
1899733	1899734	Pcryo_0067	Pcryo_0068			TRUE	0.996	26.000	0.454	1.000	Y	NA
1899734	1899735	Pcryo_0068	Pcryo_0069			TRUE	0.952	238.000	0.362	0.016	Y	NA
1899736	1899737	Pcryo_0070	Pcryo_0071			FALSE	0.263	229.000	0.009	1.000	N	NA
1899737	1554301	Pcryo_0071	Pcryo_R0001			FALSE	0.208	160.000	0.000	NA		NA
1554301	1554302	Pcryo_R0001	Pcryo_R0002			FALSE	0.289	125.000	0.000	NA		NA
1554302	1899738	Pcryo_R0002	Pcryo_0072			FALSE	0.052	459.000	0.000	NA		NA
1899738	1899739	Pcryo_0072	Pcryo_0073			TRUE	0.966	134.000	0.759	NA		NA
1899739	1899740	Pcryo_0073	Pcryo_0074			TRUE	0.895	150.000	0.342	1.000	N	NA
1899740	1899741	Pcryo_0074	Pcryo_0075			TRUE	0.958	199.000	0.530	1.000	Y	NA
1899741	1899742	Pcryo_0075	Pcryo_0076			TRUE	0.995	17.000	0.318	1.000	Y	NA
1899742	1899743	Pcryo_0076	Pcryo_0077			FALSE	0.056	390.000	0.000	1.000		NA
1899743	1899744	Pcryo_0077	Pcryo_0078			FALSE	0.084	263.000	0.000	NA		NA
1899744	1899745	Pcryo_0078	Pcryo_0079			FALSE	0.061	353.000	0.000	NA		NA
1899745	1899746	Pcryo_0079	Pcryo_0080			TRUE	0.827	603.000	0.335	1.000	Y	NA
1899747	1899748	Pcryo_0081	Pcryo_0082			TRUE	0.535	44.000	0.000	NA		NA
1899748	1899749	Pcryo_0082	Pcryo_0083			TRUE	0.594	148.000	0.020	NA		NA
1899749	1899750	Pcryo_0083	Pcryo_0084			TRUE	0.989	1.000	0.173	NA		NA
1899751	1899752	Pcryo_0085	Pcryo_0086			FALSE	0.130	203.000	0.000	NA		NA
1899752	1899753	Pcryo_0086	Pcryo_0087			FALSE	0.388	60.000	0.000	NA		NA
1899754	1899755	Pcryo_0088	Pcryo_0089			TRUE	0.778	9.000	0.000	NA		NA
1899755	1899756	Pcryo_0089	Pcryo_0090			TRUE	0.476	50.000	0.000	1.000		NA
1899757	1899758	Pcryo_0091	Pcryo_0092			FALSE	0.177	174.000	0.000	NA		NA
1899759	1554325	Pcryo_0093	Pcryo_R0003			FALSE	0.094	242.000	0.000	NA		NA
1554325	1899760	Pcryo_R0003	Pcryo_0094			FALSE	0.318	80.000	0.000	NA		NA
1899760	1899761	Pcryo_0094	Pcryo_0095			TRUE	0.450	146.000	0.006	NA	N	NA
1899762	1899763	Pcryo_0096	Pcryo_0097			TRUE	0.958	196.000	0.775	0.013		NA
1899763	1899764	Pcryo_0097	Pcryo_0098			TRUE	0.504	184.000	0.032	1.000	N	NA
1899764	1899765	Pcryo_0098	Pcryo_0099			TRUE	0.981	113.000	0.205	0.003	Y	NA
1899765	1899766	Pcryo_0099	Pcryo_0100			FALSE	0.279	130.000	0.000	NA		NA
1899766	1899767	Pcryo_0100	Pcryo_0101			FALSE	0.323	75.000	0.000	NA		NA
1899768	1899769	Pcryo_0102	Pcryo_0103			FALSE	0.059	313.000	0.000	1.000	N	NA
1899770	1899771	Pcryo_0104	Pcryo_0105			FALSE	0.308	101.000	0.000	NA		NA
1899773	1899774	Pcryo_0107	Pcryo_0108			TRUE	1.000	0.000	0.453	0.001	Y	NA
1899774	1899775	Pcryo_0108	Pcryo_0109			TRUE	0.990	179.000	0.705	0.002	Y	NA
1899775	1899776	Pcryo_0109	Pcryo_0110			TRUE	0.981	208.000	0.604	0.002	Y	NA
1899776	1899777	Pcryo_0110	Pcryo_0111			TRUE	0.627	803.000	0.067	1.000	Y	NA
1899777	1899778	Pcryo_0111	Pcryo_0112			TRUE	0.983	156.000	0.667	1.000	Y	NA
1899778	1899779	Pcryo_0112	Pcryo_0113			TRUE	0.864	272.000	0.253	1.000	Y	NA
1899779	1899780	Pcryo_0113	Pcryo_0114			TRUE	0.862	188.000	0.069	1.000	Y	NA
1899780	1899781	Pcryo_0114	Pcryo_0115			TRUE	0.996	105.000	0.806	0.001	Y	NA
1899781	1899782	Pcryo_0115	Pcryo_0116			TRUE	0.457	48.000	0.000	1.000	N	NA
1899782	1899783	Pcryo_0116	Pcryo_0117			TRUE	0.878	54.000	0.000	1.000	Y	NA
1899783	1899784	Pcryo_0117	Pcryo_0118			TRUE	0.982	4.000	0.125	1.000	N	NA
1899784	1899785	Pcryo_0118	Pcryo_0119			TRUE	0.946	38.000	0.125	1.000	N	NA
1899787	1899788	Pcryo_0121	Pcryo_0122			TRUE	0.980	-13.000	0.007	1.000		NA
1899788	1899789	Pcryo_0122	Pcryo_0123			FALSE	0.423	165.000	0.008	1.000		NA
1899789	1899790	Pcryo_0123	Pcryo_0124			TRUE	0.967	35.000	0.234	1.000	N	NA
1899790	1899791	Pcryo_0124	Pcryo_0125			TRUE	0.960	68.000	0.117	1.000	Y	NA
1899791	1899792	Pcryo_0125	Pcryo_0126			TRUE	0.995	52.000	0.395	0.001	Y	NA
1899792	1899793	Pcryo_0126	Pcryo_0127			TRUE	0.638	60.000	0.007	NA		NA
1899793	1899794	Pcryo_0127	Pcryo_0128			TRUE	0.535	69.000	0.004	NA		NA
1899796	1899797	Pcryo_0130	Pcryo_0131			TRUE	0.971	35.000	0.259	1.000		NA
1899797	1899798	Pcryo_0131	Pcryo_0132			TRUE	0.885	117.000	0.098	0.081		NA
1899798	1899799	Pcryo_0132	Pcryo_0133			FALSE	0.261	124.000	0.000	1.000	N	NA
1899800	1899801	Pcryo_0134	Pcryo_0135			TRUE	0.535	44.000	0.000	NA		NA
1899803	1899804	Pcryo_0137	Pcryo_0138			FALSE	0.052	448.000	0.000	NA		NA
1899806	1899807	Pcryo_0140	Pcryo_0141			FALSE	0.070	305.000	0.000	1.000		NA
1899807	1899808	Pcryo_0141	Pcryo_0142			FALSE	0.155	184.000	0.000	1.000		NA
1899808	1899809	Pcryo_0142	Pcryo_0143			TRUE	0.898	130.000	0.294	1.000	N	NA
1899812	1899813	Pcryo_0146	Pcryo_0147			TRUE	0.505	82.000	0.004	1.000		NA
1899817	1899818	Pcryo_0151	Pcryo_0152			TRUE	0.930	4.000	0.008	NA		NA
1899820	1899821	Pcryo_0154	Pcryo_0155			TRUE	0.880	112.000	0.209	NA		NA
1899823	1899824	Pcryo_0157	Pcryo_0158			FALSE	0.043	537.000	0.000	1.000	N	NA
1899824	1899825	Pcryo_0158	Pcryo_0159			TRUE	0.725	15.000	0.000	NA		NA
1899825	1899826	Pcryo_0159	Pcryo_0160			FALSE	0.279	130.000	0.000	NA		NA
1899828	1899829	Pcryo_0162	Pcryo_0163			TRUE	0.532	86.000	0.005	NA		NA
1899830	1899831	Pcryo_0164	Pcryo_0165			FALSE	0.129	204.000	0.000	NA		NA
1899831	1899832	Pcryo_0165	Pcryo_0166			FALSE	0.045	904.000	0.000	NA		NA
1899834	1899835	Pcryo_0168	Pcryo_0169			TRUE	0.435	53.000	0.000	1.000		NA
1899836	1899837	Pcryo_0170	Pcryo_0171			FALSE	0.278	99.000	0.000	1.000	N	NA
1899839	1899840	Pcryo_0173	Pcryo_0174			FALSE	0.230	229.000	0.007	1.000	N	NA
1899840	1899841	Pcryo_0174	Pcryo_0175			TRUE	0.799	142.000	0.123	1.000	N	NA
1899843	1899844	Pcryo_0177	Pcryo_0178			TRUE	0.681	122.000	0.025	NA		NA
1554412	1554413	Pcryo_R0004	Pcryo_R0005			FALSE	0.156	184.000	0.000	NA		NA
1554413	1899846	Pcryo_R0005	Pcryo_0180			FALSE	0.175	175.000	0.000	NA		NA
1899847	1899848	Pcryo_0181	Pcryo_0182			FALSE	0.105	211.000	0.000	1.000	N	NA
1899848	1899849	Pcryo_0182	Pcryo_0183			TRUE	0.511	100.000	0.006	1.000	N	NA
1899849	1899850	Pcryo_0183	Pcryo_0184			TRUE	0.984	160.000	0.496	0.034	Y	NA
1899850	1899851	Pcryo_0184	Pcryo_0185			FALSE	0.395	433.000	0.122	1.000	N	NA
1899851	1554420	Pcryo_0185	Pcryo_R0006			FALSE	0.301	111.000	0.000	NA		NA
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