MicrobesOnline Operon Predictions for Psychrobacter cryohalolentis K5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1899667 1899668 Pcryo_0001 Pcryo_0002     TRUE 0.923 201.000 0.787 1.000   NA
 1899669 1899670 Pcryo_0003 Pcryo_0004     TRUE 0.960 161.000 0.328 1.000 Y NA
 1899670 1899671 Pcryo_0004 Pcryo_0005     TRUE 0.955 167.000 0.318 1.000 Y NA
 1899671 1899672 Pcryo_0005 Pcryo_0006     TRUE 0.876 500.000 0.249 0.008 Y NA
 1899672 1899673 Pcryo_0006 Pcryo_0007     FALSE 0.299 113.000 0.000 NA   NA
 1899674 1899675 Pcryo_0008 Pcryo_0009     TRUE 0.724 15.000 0.000 1.000   NA
 1899679 1899680 Pcryo_0013 Pcryo_0014     TRUE 0.925 180.000 0.365 0.002 N NA
 1899680 1899681 Pcryo_0014 Pcryo_0015     TRUE 0.918 231.000 0.352 1.000 Y NA
 1899683 1899684 Pcryo_0017 Pcryo_0018     FALSE 0.130 202.000 0.000 1.000   NA
 1899684 1899685 Pcryo_0018 Pcryo_0019     TRUE 0.895 87.000 0.000 0.024 Y NA
 1899685 1899686 Pcryo_0019 Pcryo_0020     FALSE 0.257 140.000 0.000 NA   NA
 1899691 1899692 Pcryo_0025 Pcryo_0026     TRUE 0.940 -10.000 0.000 NA   NA
 1899693 1899694 Pcryo_0027 Pcryo_0028     FALSE 0.091 246.000 0.000 NA   NA
 1899694 1899695 Pcryo_0028 Pcryo_0029     TRUE 0.703 53.000 0.008 NA   NA
 1899695 1899696 Pcryo_0029 Pcryo_0030     TRUE 0.522 120.000 0.006 NA   NA
 1899697 1899698 Pcryo_0031 Pcryo_0032     FALSE 0.059 368.000 0.000 NA   NA
 1899700 1899701 Pcryo_0034 Pcryo_0035     TRUE 0.588 171.000 0.041 1.000 N NA
 1899701 1899702 Pcryo_0035 Pcryo_0036     FALSE 0.306 102.000 0.000 1.000   NA
 1899703 1899704 Pcryo_0037 Pcryo_0038     FALSE 0.081 244.000 0.000 1.000 N NA
 1899704 1899705 Pcryo_0038 Pcryo_0039     FALSE 0.097 236.000 0.000 1.000   NA
 1899705 1899706 Pcryo_0039 Pcryo_0040     FALSE 0.067 315.000 0.000 1.000   NA
 1899706 1899707 Pcryo_0040 Pcryo_0041     FALSE 0.073 290.000 0.000 NA   NA
 1899707 1899708 Pcryo_0041 Pcryo_0042     FALSE 0.142 194.000 0.000 NA   NA
 1899708 1899709 Pcryo_0042 Pcryo_0043     TRUE 0.811 56.000 0.036 1.000 N NA
 1899709 1899710 Pcryo_0043 Pcryo_0044     FALSE 0.056 396.000 0.000 NA   NA
 1899713 1899714 Pcryo_0047 Pcryo_0048     TRUE 0.862 86.000 0.154 NA   NA
 1899715 1899716 Pcryo_0049 Pcryo_0050     FALSE 0.124 195.000 0.000 1.000 N NA
 1899716 1899717 Pcryo_0050 Pcryo_0051     TRUE 0.973 50.000 0.494 1.000   NA
 1899717 1899718 Pcryo_0051 Pcryo_0052     FALSE 0.087 252.000 0.000 1.000   NA
 1899719 1899720 Pcryo_0053 Pcryo_0054     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.073   NA
 1899723 1899724 Pcryo_0057 Pcryo_0058     FALSE 0.271 109.000 0.000 1.000 N NA
 1899724 1899725 Pcryo_0058 Pcryo_0059     FALSE 0.308 71.000 0.000 1.000 N NA
 1899725 1899726 Pcryo_0059 Pcryo_0060     FALSE 0.396 59.000 0.000 NA   NA
 1899726 1899727 Pcryo_0060 Pcryo_0061     FALSE 0.197 222.000 0.003 NA   NA
 1899727 1899728 Pcryo_0061 Pcryo_0062     TRUE 0.947 51.000 0.263 NA N NA
 1899728 1899729 Pcryo_0062 Pcryo_0063     TRUE 0.506 131.000 0.007 NA N NA
 1899730 1899731 Pcryo_0064 Pcryo_0065     FALSE 0.245 205.000 0.004 NA   NA
 1899732 1899733 Pcryo_0066 Pcryo_0067     TRUE 0.843 84.000 0.122 1.000 N NA
 1899733 1899734 Pcryo_0067 Pcryo_0068     TRUE 0.996 26.000 0.454 1.000 Y NA
 1899734 1899735 Pcryo_0068 Pcryo_0069     TRUE 0.952 238.000 0.362 0.016 Y NA
 1899736 1899737 Pcryo_0070 Pcryo_0071     FALSE 0.263 229.000 0.009 1.000 N NA
 1899737 1554301 Pcryo_0071 Pcryo_R0001     FALSE 0.208 160.000 0.000 NA   NA
 1554301 1554302 Pcryo_R0001 Pcryo_R0002     FALSE 0.289 125.000 0.000 NA   NA
 1554302 1899738 Pcryo_R0002 Pcryo_0072     FALSE 0.052 459.000 0.000 NA   NA
 1899738 1899739 Pcryo_0072 Pcryo_0073     TRUE 0.966 134.000 0.759 NA   NA
 1899739 1899740 Pcryo_0073 Pcryo_0074     TRUE 0.895 150.000 0.342 1.000 N NA
 1899740 1899741 Pcryo_0074 Pcryo_0075     TRUE 0.958 199.000 0.530 1.000 Y NA
 1899741 1899742 Pcryo_0075 Pcryo_0076     TRUE 0.995 17.000 0.318 1.000 Y NA
 1899742 1899743 Pcryo_0076 Pcryo_0077     FALSE 0.056 390.000 0.000 1.000   NA
 1899743 1899744 Pcryo_0077 Pcryo_0078     FALSE 0.084 263.000 0.000 NA   NA
 1899744 1899745 Pcryo_0078 Pcryo_0079     FALSE 0.061 353.000 0.000 NA   NA
 1899745 1899746 Pcryo_0079 Pcryo_0080     TRUE 0.827 603.000 0.335 1.000 Y NA
 1899747 1899748 Pcryo_0081 Pcryo_0082     TRUE 0.535 44.000 0.000 NA   NA
 1899748 1899749 Pcryo_0082 Pcryo_0083     TRUE 0.594 148.000 0.020 NA   NA
 1899749 1899750 Pcryo_0083 Pcryo_0084     TRUE 0.989 1.000 0.173 NA   NA
 1899751 1899752 Pcryo_0085 Pcryo_0086     FALSE 0.130 203.000 0.000 NA   NA
 1899752 1899753 Pcryo_0086 Pcryo_0087     FALSE 0.388 60.000 0.000 NA   NA
 1899754 1899755 Pcryo_0088 Pcryo_0089     TRUE 0.778 9.000 0.000 NA   NA
 1899755 1899756 Pcryo_0089 Pcryo_0090     TRUE 0.476 50.000 0.000 1.000   NA
 1899757 1899758 Pcryo_0091 Pcryo_0092     FALSE 0.177 174.000 0.000 NA   NA
 1899759 1554325 Pcryo_0093 Pcryo_R0003     FALSE 0.094 242.000 0.000 NA   NA
 1554325 1899760 Pcryo_R0003 Pcryo_0094     FALSE 0.318 80.000 0.000 NA   NA
 1899760 1899761 Pcryo_0094 Pcryo_0095     TRUE 0.450 146.000 0.006 NA N NA
 1899762 1899763 Pcryo_0096 Pcryo_0097     TRUE 0.958 196.000 0.775 0.013   NA
 1899763 1899764 Pcryo_0097 Pcryo_0098     TRUE 0.504 184.000 0.032 1.000 N NA
 1899764 1899765 Pcryo_0098 Pcryo_0099     TRUE 0.981 113.000 0.205 0.003 Y NA
 1899765 1899766 Pcryo_0099 Pcryo_0100     FALSE 0.279 130.000 0.000 NA   NA
 1899766 1899767 Pcryo_0100 Pcryo_0101     FALSE 0.323 75.000 0.000 NA   NA
 1899768 1899769 Pcryo_0102 Pcryo_0103     FALSE 0.059 313.000 0.000 1.000 N NA
 1899770 1899771 Pcryo_0104 Pcryo_0105     FALSE 0.308 101.000 0.000 NA   NA
 1899773 1899774 Pcryo_0107 Pcryo_0108     TRUE 1.000 0.000 0.453 0.001 Y NA
 1899774 1899775 Pcryo_0108 Pcryo_0109     TRUE 0.990 179.000 0.705 0.002 Y NA
 1899775 1899776 Pcryo_0109 Pcryo_0110     TRUE 0.981 208.000 0.604 0.002 Y NA
 1899776 1899777 Pcryo_0110 Pcryo_0111     TRUE 0.627 803.000 0.067 1.000 Y NA
 1899777 1899778 Pcryo_0111 Pcryo_0112     TRUE 0.983 156.000 0.667 1.000 Y NA
 1899778 1899779 Pcryo_0112 Pcryo_0113     TRUE 0.864 272.000 0.253 1.000 Y NA
 1899779 1899780 Pcryo_0113 Pcryo_0114     TRUE 0.862 188.000 0.069 1.000 Y NA
 1899780 1899781 Pcryo_0114 Pcryo_0115     TRUE 0.996 105.000 0.806 0.001 Y NA
 1899781 1899782 Pcryo_0115 Pcryo_0116     TRUE 0.457 48.000 0.000 1.000 N NA
 1899782 1899783 Pcryo_0116 Pcryo_0117     TRUE 0.878 54.000 0.000 1.000 Y NA
 1899783 1899784 Pcryo_0117 Pcryo_0118     TRUE 0.982 4.000 0.125 1.000 N NA
 1899784 1899785 Pcryo_0118 Pcryo_0119     TRUE 0.946 38.000 0.125 1.000 N NA
 1899787 1899788 Pcryo_0121 Pcryo_0122     TRUE 0.980 -13.000 0.007 1.000   NA
 1899788 1899789 Pcryo_0122 Pcryo_0123     FALSE 0.423 165.000 0.008 1.000   NA
 1899789 1899790 Pcryo_0123 Pcryo_0124     TRUE 0.967 35.000 0.234 1.000 N NA
 1899790 1899791 Pcryo_0124 Pcryo_0125     TRUE 0.960 68.000 0.117 1.000 Y NA
 1899791 1899792 Pcryo_0125 Pcryo_0126     TRUE 0.995 52.000 0.395 0.001 Y NA
 1899792 1899793 Pcryo_0126 Pcryo_0127     TRUE 0.638 60.000 0.007 NA   NA
 1899793 1899794 Pcryo_0127 Pcryo_0128     TRUE 0.535 69.000 0.004 NA   NA
 1899796 1899797 Pcryo_0130 Pcryo_0131     TRUE 0.971 35.000 0.259 1.000   NA
 1899797 1899798 Pcryo_0131 Pcryo_0132     TRUE 0.885 117.000 0.098 0.081   NA
 1899798 1899799 Pcryo_0132 Pcryo_0133     FALSE 0.261 124.000 0.000 1.000 N NA
 1899800 1899801 Pcryo_0134 Pcryo_0135     TRUE 0.535 44.000 0.000 NA   NA
 1899803 1899804 Pcryo_0137 Pcryo_0138     FALSE 0.052 448.000 0.000 NA   NA
 1899806 1899807 Pcryo_0140 Pcryo_0141     FALSE 0.070 305.000 0.000 1.000   NA
 1899807 1899808 Pcryo_0141 Pcryo_0142     FALSE 0.155 184.000 0.000 1.000   NA
 1899808 1899809 Pcryo_0142 Pcryo_0143     TRUE 0.898 130.000 0.294 1.000 N NA
 1899812 1899813 Pcryo_0146 Pcryo_0147     TRUE 0.505 82.000 0.004 1.000   NA
 1899817 1899818 Pcryo_0151 Pcryo_0152     TRUE 0.930 4.000 0.008 NA   NA
 1899820 1899821 Pcryo_0154 Pcryo_0155     TRUE 0.880 112.000 0.209 NA   NA
 1899823 1899824 Pcryo_0157 Pcryo_0158     FALSE 0.043 537.000 0.000 1.000 N NA
 1899824 1899825 Pcryo_0158 Pcryo_0159     TRUE 0.725 15.000 0.000 NA   NA
 1899825 1899826 Pcryo_0159 Pcryo_0160     FALSE 0.279 130.000 0.000 NA   NA
 1899828 1899829 Pcryo_0162 Pcryo_0163     TRUE 0.532 86.000 0.005 NA   NA
 1899830 1899831 Pcryo_0164 Pcryo_0165     FALSE 0.129 204.000 0.000 NA   NA
 1899831 1899832 Pcryo_0165 Pcryo_0166     FALSE 0.045 904.000 0.000 NA   NA
 1899834 1899835 Pcryo_0168 Pcryo_0169     TRUE 0.435 53.000 0.000 1.000   NA
 1899836 1899837 Pcryo_0170 Pcryo_0171     FALSE 0.278 99.000 0.000 1.000 N NA
 1899839 1899840 Pcryo_0173 Pcryo_0174     FALSE 0.230 229.000 0.007 1.000 N NA
 1899840 1899841 Pcryo_0174 Pcryo_0175     TRUE 0.799 142.000 0.123 1.000 N NA
 1899843 1899844 Pcryo_0177 Pcryo_0178     TRUE 0.681 122.000 0.025 NA   NA
 1554412 1554413 Pcryo_R0004 Pcryo_R0005     FALSE 0.156 184.000 0.000 NA   NA
 1554413 1899846 Pcryo_R0005 Pcryo_0180     FALSE 0.175 175.000 0.000 NA   NA
 1899847 1899848 Pcryo_0181 Pcryo_0182     FALSE 0.105 211.000 0.000 1.000 N NA
 1899848 1899849 Pcryo_0182 Pcryo_0183     TRUE 0.511 100.000 0.006 1.000 N NA
 1899849 1899850 Pcryo_0183 Pcryo_0184     TRUE 0.984 160.000 0.496 0.034 Y NA
 1899850 1899851 Pcryo_0184 Pcryo_0185     FALSE 0.395 433.000 0.122 1.000 N NA
 1899851 1554420 Pcryo_0185 Pcryo_R0006     FALSE 0.301 111.000 0.000 NA   NA
 1554420 1554421 Pcryo_R0006 Pcryo_R0007     FALSE 0.094 243.000 0.000 NA   NA
 1554421 1899852 Pcryo_R0007 Pcryo_0186     FALSE 0.187 168.000 0.000 NA   NA
 1899852 1899853 Pcryo_0186 Pcryo_0187     TRUE 0.854 96.000 0.157 1.000 N NA
 1899853 1899854 Pcryo_0187 Pcryo_0188     TRUE 0.629 185.000 0.072 1.000   NA
 1899855 1899856 Pcryo_0189 Pcryo_0190     FALSE 0.042 557.000 0.000 1.000 N NA
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