MicrobesOnline Operon Predictions for Chlorobium phaeobacteroides BS1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6944098 6944099 Cphamn1_0001 Cphamn1_0002 dnaA   TRUE 0.794 297.000 0.328 1.000 Y NA
 6944099 6944100 Cphamn1_0002 Cphamn1_0003     TRUE 0.993 17.000 0.318 1.000 Y NA
 6944100 6944101 Cphamn1_0003 Cphamn1_0004     TRUE 0.618 104.000 0.089 NA   NA
 6944101 6944102 Cphamn1_0004 Cphamn1_0005     FALSE 0.166 146.000 0.000 NA   NA
 6944103 6944104 Cphamn1_0006 Cphamn1_0007     TRUE 0.752 123.000 0.209 1.000 N NA
 6944104 6944105 Cphamn1_0007 Cphamn1_0008     FALSE 0.404 74.000 0.011 1.000 N NA
 6944106 6944107 Cphamn1_0009 Cphamn1_0010     TRUE 0.988 15.000 0.667 NA   NA
 6944107 6944108 Cphamn1_0010 Cphamn1_0011   secD FALSE 0.156 287.000 0.019 NA   NA
 6944108 6944109 Cphamn1_0011 Cphamn1_0012 secD secF TRUE 0.992 24.000 0.130 0.001 Y NA
 6944109 6944110 Cphamn1_0012 Cphamn1_0013 secF   TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6944110 6944111 Cphamn1_0013 Cphamn1_0014     TRUE 0.978 34.000 0.530 NA   NA
 6944112 6944113 Cphamn1_0015 Cphamn1_0016     TRUE 0.685 27.000 0.000 NA   NA
 6944113 6944114 Cphamn1_0016 Cphamn1_0017     TRUE 0.550 44.000 0.000 NA   NA
 6944114 6944115 Cphamn1_0017 Cphamn1_0018     TRUE 0.985 14.000 0.111 1.000 Y NA
 6944116 6944117 Cphamn1_0019 Cphamn1_0020   dapD FALSE 0.228 251.000 0.026 1.000 N NA
 6944117 6944118 Cphamn1_0020 Cphamn1_0021 dapD   TRUE 0.818 41.000 0.026 1.000 N NA
 6944119 6944120 Cphamn1_0022 Cphamn1_0023     TRUE 0.963 1.000 0.108 NA   NA
 6944120 6944121 Cphamn1_0023 Cphamn1_0024     FALSE 0.438 102.000 0.021 1.000 N NA
 6944121 6944122 Cphamn1_0024 Cphamn1_0025     FALSE 0.117 185.000 0.000 NA   NA
 6944123 6944124 Cphamn1_0026 Cphamn1_0027     FALSE 0.059 358.000 0.000 NA   NA
 6944125 6944126 Cphamn1_0028 Cphamn1_0029     TRUE 0.680 354.000 0.692 NA   NA
 6944126 6944127 Cphamn1_0029 Cphamn1_0030     FALSE 0.370 84.000 0.012 NA N NA
 6944127 6944128 Cphamn1_0030 Cphamn1_0031     TRUE 0.998 15.000 0.837 0.005 Y NA
 6944128 6944129 Cphamn1_0031 Cphamn1_R0001     FALSE 0.223 95.000 0.000 NA   NA
 6944130 6944131 Cphamn1_0032 Cphamn1_0033     TRUE 0.563 91.000 0.043 1.000 N NA
 6944131 6944132 Cphamn1_0033 Cphamn1_0034     FALSE 0.054 415.000 0.000 NA   NA
 6944133 6944134 Cphamn1_0035 Cphamn1_0036     TRUE 0.696 24.000 0.000 NA   NA
 6944135 6944136 Cphamn1_0037 Cphamn1_0038     FALSE 0.259 83.000 0.000 NA   NA
 6944136 6944137 Cphamn1_0038 Cphamn1_0039     FALSE 0.113 192.000 0.000 NA   NA
 6944137 6944138 Cphamn1_0039 Cphamn1_0040     FALSE 0.209 102.000 0.000 NA   NA
 6944138 6944139 Cphamn1_0040 Cphamn1_0041     FALSE 0.126 195.000 0.000 1.000   NA
 6944139 6944140 Cphamn1_0041 Cphamn1_0042     TRUE 0.966 -7.000 0.105 NA   NA
 6944141 6944142 Cphamn1_0043 Cphamn1_0044     FALSE 0.097 211.000 0.000 NA   NA
 6944143 6944144 Cphamn1_0045 Cphamn1_0046     FALSE 0.467 50.000 0.000 NA   NA
 6944144 6944145 Cphamn1_0046 Cphamn1_0047     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 6944145 6944146 Cphamn1_0047 Cphamn1_0048     FALSE 0.212 99.000 0.000 NA   NA
 6944150 6944151 Cphamn1_0052 Cphamn1_0053     TRUE 0.996 18.000 0.615 1.000 Y NA
 6944152 6944153 Cphamn1_0054 Cphamn1_0055     FALSE 0.103 205.000 0.000 NA   NA
 6944153 6944154 Cphamn1_0055 Cphamn1_0056     FALSE 0.223 95.000 0.000 NA   NA
 6944154 6944155 Cphamn1_0056 Cphamn1_0057     TRUE 0.989 -3.000 0.462 NA   NA
 6944155 6944156 Cphamn1_0057 Cphamn1_0058     TRUE 0.696 24.000 0.000 NA   NA
 6944156 6944157 Cphamn1_0058 Cphamn1_0059     TRUE 0.746 9.000 0.000 NA   NA
 6944157 6944158 Cphamn1_0059 Cphamn1_0060     FALSE 0.157 153.000 0.000 NA   NA
 6944158 6944159 Cphamn1_0060 Cphamn1_0061     TRUE 0.798 -25.000 0.000 NA   NA
 6944160 6944161 Cphamn1_0062 Cphamn1_0063     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944162 6944163 Cphamn1_0064 Cphamn1_0065     FALSE 0.207 105.000 0.000 NA   NA
 6944164 6944165 Cphamn1_0066 Cphamn1_0067     FALSE 0.252 85.000 0.000 NA   NA
 6944165 6944166 Cphamn1_0067 Cphamn1_0068     FALSE 0.176 140.000 0.000 NA   NA
 6944166 6944167 Cphamn1_0068 Cphamn1_0069     TRUE 0.982 -3.000 0.250 NA   NA
 6944171 6944172 Cphamn1_0073 Cphamn1_0074     FALSE 0.184 148.000 0.000 1.000   NA
 6944172 6944173 Cphamn1_0074 Cphamn1_0075     TRUE 0.988 3.000 0.493 NA   NA
 6944173 6944174 Cphamn1_0075 Cphamn1_0076     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 6944174 6944175 Cphamn1_0076 Cphamn1_0077     TRUE 0.998 12.000 0.896 0.011 Y NA
 6944175 6944176 Cphamn1_0077 Cphamn1_0078     TRUE 0.998 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 6944176 6944177 Cphamn1_0078 Cphamn1_0079     TRUE 0.998 -3.000 0.644 0.068 Y NA
 6944177 6944178 Cphamn1_0079 Cphamn1_0080     TRUE 0.997 -7.000 0.614 1.000 Y NA
 6944178 6944179 Cphamn1_0080 Cphamn1_0081     FALSE 0.196 127.000 0.000 NA   NA
 6944179 6944180 Cphamn1_0081 Cphamn1_0082     FALSE 0.206 113.000 0.000 NA   NA
 6944181 6944182 Cphamn1_0083 Cphamn1_0084     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   NA
 6944183 6944184 Cphamn1_0085 Cphamn1_0086     TRUE 0.990 21.000 0.778 1.000   NA
 6944185 6944186 Cphamn1_0087 Cphamn1_0088   trkA TRUE 0.979 31.000 0.031 0.004 Y NA
 6944186 6944187 Cphamn1_0088 Cphamn1_0089 trkA   FALSE 0.157 153.000 0.000 NA   NA
 6944189 6944190 Cphamn1_0091 Cphamn1_0092     FALSE 0.208 104.000 0.000 NA   NA
 6944190 6944191 Cphamn1_0092 Cphamn1_0093     FALSE 0.389 59.000 0.000 NA   NA
 6944191 6944192 Cphamn1_0093 Cphamn1_0094     FALSE 0.085 235.000 0.000 NA   NA
 6944192 6944193 Cphamn1_0094 Cphamn1_0095     FALSE 0.211 100.000 0.000 NA   NA
 6944193 6944194 Cphamn1_0095 Cphamn1_0096   prfA FALSE 0.400 70.000 0.010 NA   NA
 6944194 6944195 Cphamn1_0096 Cphamn1_0097 prfA   TRUE 0.757 30.000 0.010 1.000 N NA
 6944195 6944196 Cphamn1_0097 Cphamn1_0098     TRUE 0.946 61.000 0.568 1.000 N NA
 6944198 6944199 Cphamn1_0099 Cphamn1_0100     TRUE 0.951 -16.000 0.054 1.000 N NA
 6944200 6944201 Cphamn1_0101 Cphamn1_0102     TRUE 0.762 43.000 0.017 1.000 N NA
 6944201 6944202 Cphamn1_0102 Cphamn1_0103     FALSE 0.104 231.000 0.006 1.000   NA
 6944202 6944203 Cphamn1_0103 Cphamn1_0104     TRUE 0.590 74.000 0.027 1.000   NA
 6944203 6944204 Cphamn1_0104 Cphamn1_0105     FALSE 0.389 64.000 0.000 1.000   NA
 6944206 6944207 Cphamn1_0107 Cphamn1_0108     TRUE 0.982 12.000 0.364 1.000 N NA
 6944207 6944208 Cphamn1_0108 Cphamn1_0109     FALSE 0.115 206.000 0.000 1.000 N NA
 6944210 6944211 Cphamn1_0111 Cphamn1_0112     TRUE 0.656 31.000 0.000 NA   NA
 6944211 6944212 Cphamn1_0112 Cphamn1_0113     FALSE 0.206 114.000 0.000 NA   NA
 6944212 6944213 Cphamn1_0113 Cphamn1_0114     FALSE 0.109 200.000 0.000 NA   NA
 6944213 6944214 Cphamn1_0114 Cphamn1_0115     TRUE 0.791 0.000 0.000 NA   NA
 6944214 6944215 Cphamn1_0115 Cphamn1_0116     FALSE 0.207 110.000 0.000 NA   NA
 6944215 6944216 Cphamn1_0116 Cphamn1_0117     FALSE 0.176 140.000 0.000 NA   NA
 6944216 6944217 Cphamn1_0117 Cphamn1_0118     TRUE 0.991 3.000 0.429 0.084   NA
 6944217 6944218 Cphamn1_0118 Cphamn1_0119     TRUE 0.496 48.000 0.000 NA   NA
 6944218 6944219 Cphamn1_0119 Cphamn1_0120     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944219 6944220 Cphamn1_0120 Cphamn1_0121     FALSE 0.197 126.000 0.000 NA   NA
 6944220 6944221 Cphamn1_0121 Cphamn1_0122     FALSE 0.110 236.000 0.010 NA   NA
 6944221 6944222 Cphamn1_0122 Cphamn1_0123     TRUE 0.602 189.000 0.217 NA   NA
 6944222 6944223 Cphamn1_0123 Cphamn1_0124     FALSE 0.085 280.000 0.008 NA   NA
 6944223 6944224 Cphamn1_0124 Cphamn1_0125     FALSE 0.265 90.000 0.008 NA   NA
 6944224 6944225 Cphamn1_0125 Cphamn1_0126     TRUE 0.685 27.000 0.000 NA   NA
 6944225 6944226 Cphamn1_0126 Cphamn1_0127   pyrG TRUE 0.646 33.000 0.000 NA   NA
 6944226 6944227 Cphamn1_0127 Cphamn1_R0003 pyrG   FALSE 0.048 528.000 0.000 NA   NA
 6944227 6944228 Cphamn1_R0003 Cphamn1_R0004     FALSE 0.137 167.000 0.000 NA   NA
 6944228 6944229 Cphamn1_R0004 Cphamn1_R0005     TRUE 0.622 36.000 0.000 NA   NA
 6944229 6944230 Cphamn1_R0005 Cphamn1_R0006     FALSE 0.157 153.000 0.000 NA   NA
 6944230 6944231 Cphamn1_R0006 Cphamn1_R0007     FALSE 0.208 104.000 0.000 NA   NA
 6944231 6944232 Cphamn1_R0007 Cphamn1_0128     FALSE 0.094 217.000 0.000 NA   NA
 6944232 6944233 Cphamn1_0128 Cphamn1_0129     FALSE 0.177 153.000 0.000 1.000   NA
 6944233 6944234 Cphamn1_0129 Cphamn1_0130     TRUE 0.622 36.000 0.000 NA   NA
 6944235 6944236 Cphamn1_0131 Cphamn1_0132     FALSE 0.106 218.000 0.000 1.000   NA
 6944237 6944238 Cphamn1_0133 Cphamn1_0134     FALSE 0.060 350.000 0.000 NA   NA
 6944238 6944239 Cphamn1_0134 Cphamn1_0135     TRUE 0.996 -7.000 0.444 1.000 Y NA
 6944239 6944240 Cphamn1_0135 Cphamn1_0136     FALSE 0.207 111.000 0.000 NA   NA
 6944240 6944241 Cphamn1_0136 Cphamn1_0137     FALSE 0.107 201.000 0.000 NA   NA
 6944241 6944242 Cphamn1_0137 Cphamn1_0138     TRUE 0.791 0.000 0.000 NA   NA
 6944244 6944245 Cphamn1_0140 Cphamn1_0141     TRUE 0.937 -12.000 0.037 NA   NA
 6944248 6944249 Cphamn1_0144 Cphamn1_0145     FALSE 0.113 192.000 0.000 NA   NA
 6944249 6944250 Cphamn1_0145 Cphamn1_0146     FALSE 0.042 1161.000 0.000 NA   NA
 6944250 6944251 Cphamn1_0146 Cphamn1_0147     FALSE 0.063 326.000 0.000 NA   NA
 6944251 6944252 Cphamn1_0147 Cphamn1_0148     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 6944252 6944253 Cphamn1_0148 Cphamn1_0149     FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 6944255 6944256 Cphamn1_0151 Cphamn1_0152     FALSE 0.061 339.000 0.000 NA   NA
 6944256 6944257 Cphamn1_0152 Cphamn1_0153     FALSE 0.454 271.000 0.018 1.000 Y NA
 6944258 6944259 Cphamn1_R0008 Cphamn1_R0009     FALSE 0.137 167.000 0.000 NA   NA
 6944259 6944260 Cphamn1_R0009 Cphamn1_R0010     TRUE 0.622 36.000 0.000 NA   NA
 6944260 6944261 Cphamn1_R0010 Cphamn1_R0011     FALSE 0.157 153.000 0.000 NA   NA
 6944261 6944262 Cphamn1_R0011 Cphamn1_R0012     FALSE 0.208 104.000 0.000 NA   NA
 6944262 6944263 Cphamn1_R0012 Cphamn1_0154     FALSE 0.079 256.000 0.000 NA   NA
 6944263 6944264 Cphamn1_0154 Cphamn1_0155     TRUE 0.677 28.000 0.000 NA   NA
 6944264 6944265 Cphamn1_0155 Cphamn1_0156     TRUE 0.640 34.000 0.000 NA   NA
 6944265 6944266 Cphamn1_0156 Cphamn1_0157     TRUE 0.697 23.000 0.000 NA   NA
 6944266 6944267 Cphamn1_0157 Cphamn1_0158     TRUE 0.537 45.000 0.000 NA   NA
 6944267 6944268 Cphamn1_0158 Cphamn1_0159     TRUE 0.741 10.000 0.000 NA   NA
 6944268 6944269 Cphamn1_0159 Cphamn1_0160     TRUE 0.810 1.000 0.000 1.000   NA
 6944269 6944270 Cphamn1_0160 Cphamn1_0161     TRUE 0.957 -3.000 0.067 1.000 N NA
 6944270 6944271 Cphamn1_0161 Cphamn1_0162   rpsF FALSE 0.104 214.000 0.004 1.000 N NA
 6944271 6944272 Cphamn1_0162 Cphamn1_0163 rpsF   TRUE 0.488 68.000 0.013 1.000 N NA
 6944272 6944273 Cphamn1_0163 Cphamn1_0164   rpsR TRUE 0.781 34.000 0.013 1.000 N NA
 6944273 6944274 Cphamn1_0164 Cphamn1_0165 rpsR rplI TRUE 0.990 50.000 0.499 0.024 Y NA
 6944274 6944275 Cphamn1_0165 Cphamn1_0166 rplI   FALSE 0.145 160.000 0.000 NA   NA
 6944275 6944276 Cphamn1_0166 Cphamn1_0167     FALSE 0.174 141.000 0.000 NA   NA
 6944277 6944278 Cphamn1_0168 Cphamn1_0169   rplT TRUE 0.988 24.000 0.202 1.000 Y NA
 6944278 6944279 Cphamn1_0169 Cphamn1_0170 rplT rpmI TRUE 0.997 35.000 0.928 0.024 Y NA
 6944279 6944280 Cphamn1_0170 Cphamn1_0171 rpmI infC TRUE 0.995 30.000 0.652 1.000 Y NA
 6944280 6944281 Cphamn1_0171 Cphamn1_0172 infC   TRUE 0.945 50.000 0.080 1.000 Y NA
 6944281 6944282 Cphamn1_0172 Cphamn1_0173     FALSE 0.193 285.000 0.023 1.000 N NA
 6944282 6944283 Cphamn1_0173 Cphamn1_0174     TRUE 0.770 94.000 0.192 1.000 N NA
 6944283 6944284 Cphamn1_0174 Cphamn1_0175     TRUE 0.607 90.000 0.055 1.000 N NA
 6944284 6944285 Cphamn1_0175 Cphamn1_0176     FALSE 0.086 234.000 0.000 NA   NA
 6944285 6944286 Cphamn1_0176 Cphamn1_0177     FALSE 0.079 261.000 0.000 NA   NA
 6944286 6944287 Cphamn1_0177 Cphamn1_0178     TRUE 0.815 25.000 0.013 1.000 N NA
 6944287 6944288 Cphamn1_0178 Cphamn1_0179     TRUE 0.901 49.000 0.016 1.000 Y NA
 6944288 6944289 Cphamn1_0179 Cphamn1_0180     TRUE 0.864 95.000 0.026 0.007 Y NA
 6944289 6944290 Cphamn1_0180 Cphamn1_0181     TRUE 0.976 31.000 0.024 0.007 Y NA
 6944290 6944291 Cphamn1_0181 Cphamn1_0182     TRUE 0.968 36.000 0.018 0.007 Y NA
 6944291 6944292 Cphamn1_0182 Cphamn1_0183     TRUE 0.826 98.000 0.016 0.007 Y NA
 6944292 6944293 Cphamn1_0183 Cphamn1_0184   rpmF TRUE 0.980 24.000 0.418 1.000 N NA
 6944293 6944294 Cphamn1_0184 Cphamn1_0185 rpmF   TRUE 0.981 33.000 0.599 NA   NA
 6944296 6944297 Cphamn1_0186 Cphamn1_0187     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6944297 6944298 Cphamn1_0187 Cphamn1_0188     FALSE 0.206 116.000 0.000 NA   NA
 6944298 6944299 Cphamn1_0188 Cphamn1_0189     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA   NA
 6944299 6944300 Cphamn1_0189 Cphamn1_0190     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6944301 6944302 Cphamn1_0191 Cphamn1_0192     TRUE 0.583 40.000 0.000 NA   NA
 6944302 6944303 Cphamn1_0192 Cphamn1_0193     FALSE 0.056 384.000 0.000 NA N NA
 6944303 6944304 Cphamn1_0193 Cphamn1_0194     FALSE 0.166 295.000 0.019 1.000 N NA
 6944304 6944305 Cphamn1_0194 Cphamn1_0195     TRUE 0.983 -3.000 0.040 1.000 Y NA
 6944305 6944306 Cphamn1_0195 Cphamn1_0196     TRUE 0.997 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 6944306 6944307 Cphamn1_0196 Cphamn1_0197     TRUE 0.993 38.000 0.616 1.000 Y NA
 6944307 6944308 Cphamn1_0197 Cphamn1_0198     FALSE 0.361 112.000 0.015 NA   NA
 6944308 6944309 Cphamn1_0198 Cphamn1_0199     FALSE 0.170 143.000 0.000 NA   NA
 6944309 6944310 Cphamn1_0199 Cphamn1_0200     TRUE 0.910 47.000 0.167 NA   NA
 6944310 6944311 Cphamn1_0200 Cphamn1_0201     TRUE 0.601 176.000 0.182 NA   NA
 6944312 6944313 Cphamn1_0202 Cphamn1_0203     FALSE 0.201 174.000 0.011 1.000 N NA
 6944316 6944317 Cphamn1_0206 Cphamn1_0207     TRUE 0.848 62.000 0.167 NA   NA
 6944317 6944318 Cphamn1_0207 Cphamn1_0208     FALSE 0.192 109.000 0.003 NA   NA
 6944318 6944319 Cphamn1_0208 Cphamn1_0209     FALSE 0.125 177.000 0.000 NA   NA
 6944319 6944320 Cphamn1_0209 Cphamn1_0210     FALSE 0.149 157.000 0.000 NA   NA
 6944320 6944321 Cphamn1_0210 Cphamn1_0211     FALSE 0.070 287.000 0.000 NA   NA
 6944321 6944322 Cphamn1_0211 Cphamn1_0212     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944322 6944323 Cphamn1_0212 Cphamn1_0213     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6944323 6944324 Cphamn1_0213 Cphamn1_0214     FALSE 0.416 55.000 0.000 NA   NA
 6944324 6944325 Cphamn1_0214 Cphamn1_0215     FALSE 0.206 115.000 0.000 NA   NA
 6944325 6944326 Cphamn1_0215 Cphamn1_0216     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA   NA
 6944326 6944327 Cphamn1_0216 Cphamn1_0217     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944327 6944328 Cphamn1_0217 Cphamn1_0218     FALSE 0.410 56.000 0.000 NA   NA
 6944328 6944329 Cphamn1_0218 Cphamn1_0219     FALSE 0.057 372.000 0.000 NA   NA
 6944329 6944330 Cphamn1_0219 Cphamn1_0220     FALSE 0.236 91.000 0.000 NA   NA
 6944330 6944331 Cphamn1_0220 Cphamn1_0221     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944331 6944332 Cphamn1_0221 Cphamn1_0222     FALSE 0.087 231.000 0.000 NA   NA
 6944332 6944333 Cphamn1_0222 Cphamn1_0223     FALSE 0.056 387.000 0.000 NA   NA
 6944333 6944334 Cphamn1_0223 Cphamn1_0224     TRUE 0.801 -15.000 0.000 NA   NA
 6944334 6944335 Cphamn1_0224 Cphamn1_0225     FALSE 0.113 192.000 0.000 NA   NA
 6944335 6944336 Cphamn1_0225 Cphamn1_0226     FALSE 0.410 56.000 0.000 NA   NA
 6944337 6944338 Cphamn1_0227 Cphamn1_0228     FALSE 0.062 328.000 0.000 NA   NA
 6944338 6944339 Cphamn1_0228 Cphamn1_0229     TRUE 0.939 -3.000 0.041 NA   NA
 6944340 6944341 Cphamn1_0230 Cphamn1_0231     FALSE 0.131 171.000 0.000 NA   NA
 6944341 6944342 Cphamn1_0231 Cphamn1_0232     TRUE 0.946 -3.000 0.051 NA   NA
 6944343 6944344 Cphamn1_0233 Cphamn1_0234     FALSE 0.071 285.000 0.000 NA   NA
 6944344 6944345 Cphamn1_0234 Cphamn1_0235     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 6944345 6944346 Cphamn1_0235 Cphamn1_0236     TRUE 0.690 26.000 0.000 NA   NA
 6944346 6944347 Cphamn1_0236 Cphamn1_0237     TRUE 0.916 8.000 0.030 1.000   NA
 6944347 6944348 Cphamn1_0237 Cphamn1_0238     FALSE 0.299 95.000 0.010 1.000   NA
 6944349 6944350 Cphamn1_0239 Cphamn1_0240     TRUE 0.973 107.000 0.544 0.004 Y NA
 6944350 6944351 Cphamn1_0240 Cphamn1_0241     TRUE 0.651 41.000 0.009 1.000 N NA
 6944351 6944352 Cphamn1_0241 Cphamn1_0242     TRUE 0.939 -3.000 0.040 NA   NA
 6944354 6944355 Cphamn1_0244 Cphamn1_0245     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6944357 6944358 Cphamn1_0247 Cphamn1_0248   trmE TRUE 0.919 17.000 0.047 1.000   NA
 6944358 6944359 Cphamn1_0248 Cphamn1_0249 trmE   FALSE 0.059 353.000 0.000 NA   NA
 6944359 6944360 Cphamn1_0249 Cphamn1_0250     FALSE 0.438 53.000 0.000 NA   NA
 6944360 6944361 Cphamn1_0250 Cphamn1_0251     FALSE 0.227 90.000 0.003 NA   NA
 6944363 6944364 Cphamn1_0253 Cphamn1_0254     TRUE 0.668 141.000 0.167 NA   NA
 6944365 6944366 Cphamn1_0255 Cphamn1_0256     FALSE 0.149 157.000 0.000 NA   NA
 6944366 6944367 Cphamn1_0256 Cphamn1_0257     FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 6944369 6944370 Cphamn1_0259 Cphamn1_0260     FALSE 0.230 115.000 0.000 1.000   NA
 6944370 6944371 Cphamn1_0260 Cphamn1_0261     TRUE 0.679 104.000 0.118 1.000   NA
 6944371 6944372 Cphamn1_0261 Cphamn1_0262     TRUE 0.964 22.000 0.214 NA   NA
 6944372 6944373 Cphamn1_0262 Cphamn1_0263     FALSE 0.393 151.000 0.030 NA   NA
 6944373 6944374 Cphamn1_0263 Cphamn1_0264     TRUE 0.992 -3.000 0.642 NA   NA
 6944374 6944375 Cphamn1_0264 Cphamn1_0265     FALSE 0.195 128.000 0.000 NA   NA
 6944375 6944376 Cphamn1_0265 Cphamn1_0266     FALSE 0.118 184.000 0.000 NA   NA
 6944376 6944377 Cphamn1_0266 Cphamn1_0267     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6944378 6944379 Cphamn1_0268 Cphamn1_0269     TRUE 0.988 36.000 1.000 NA   NA
 6944379 6944380 Cphamn1_0269 Cphamn1_0270     FALSE 0.151 156.000 0.000 NA   NA
 6944384 6944385 Cphamn1_0274 Cphamn1_0275     FALSE 0.229 112.000 0.000 1.000 N NA
 6944385 6944386 Cphamn1_0275 Cphamn1_0276     TRUE 0.551 74.000 0.024 NA   NA
 6944386 6944387 Cphamn1_0276 Cphamn1_0277     TRUE 0.972 -3.000 0.143 NA   NA
 6944387 6944388 Cphamn1_0277 Cphamn1_0278     TRUE 0.921 43.000 0.164 NA   NA
 6944388 6944389 Cphamn1_0278 Cphamn1_0279     TRUE 0.948 30.000 0.164 NA   NA
 6944389 6944390 Cphamn1_0279 Cphamn1_0280     TRUE 0.928 14.000 0.063 NA   NA
 6944390 6944391 Cphamn1_0280 Cphamn1_0281     TRUE 0.908 31.000 0.070 NA   NA
 6944391 6944392 Cphamn1_0281 Cphamn1_0282     TRUE 0.898 5.000 0.020 NA   NA
 6944392 6944393 Cphamn1_0282 Cphamn1_0283     FALSE 0.075 481.000 0.010 1.000   NA
 6944393 6944394 Cphamn1_0283 Cphamn1_0284     TRUE 0.773 131.000 0.256 1.000   NA
 6944394 6944395 Cphamn1_0284 Cphamn1_0285     TRUE 0.948 126.000 0.256 0.004 Y NA
 6944395 6944396 Cphamn1_0285 Cphamn1_0286     TRUE 0.990 5.000 0.150 1.000 Y NA
 6944396 6944397 Cphamn1_0286 Cphamn1_0287   hemE FALSE 0.238 172.000 0.013 1.000 N NA
 6944397 6944398 Cphamn1_0287 Cphamn1_0288 hemE   FALSE 0.194 138.000 0.004 1.000   NA
 6944400 6944401 Cphamn1_0290 Cphamn1_0291     TRUE 0.743 38.000 0.012 1.000 N NA
 6944401 6944402 Cphamn1_0291 Cphamn1_0292     FALSE 0.207 109.000 0.000 NA   NA
 6944402 6944403 Cphamn1_0292 Cphamn1_0293     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944404 6944405 Cphamn1_0294 Cphamn1_0295     FALSE 0.450 88.000 0.017 1.000 N NA
 6944405 6944406 Cphamn1_0295 Cphamn1_0296     TRUE 0.991 12.000 0.233 1.000 Y NA
 6944407 6944408 Cphamn1_0297 Cphamn1_0298     TRUE 0.996 46.000 0.846 0.005 Y NA
 6944408 6944409 Cphamn1_0298 Cphamn1_0299   thrA FALSE 0.244 96.000 0.005 1.000 N NA
 6944409 6944410 Cphamn1_0299 Cphamn1_0300 thrA   TRUE 0.887 10.000 0.019 1.000   NA
 6944412 6944413 Cphamn1_0302 Cphamn1_R0014     TRUE 0.571 41.000 0.000 NA   NA
 6944414 6944415 Cphamn1_0303 Cphamn1_0304   dapF FALSE 0.071 328.000 0.000 1.000   NA
 6944416 6944417 Cphamn1_0305 Cphamn1_0306     TRUE 0.717 102.000 0.167 NA   NA
 6944417 6944418 Cphamn1_0306 Cphamn1_0307     FALSE 0.266 88.000 0.007 NA   NA
 6944420 6944421 Cphamn1_0309 Cphamn1_0310     FALSE 0.281 164.000 0.015 1.000   NA
 6944421 6944422 Cphamn1_0310 Cphamn1_0311     FALSE 0.368 106.000 0.014 1.000   NA
 6944422 6944423 Cphamn1_0311 Cphamn1_0312     TRUE 0.829 19.000 0.013 1.000   NA
 6944423 6944424 Cphamn1_0312 Cphamn1_R0015     FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 6944424 6944425 Cphamn1_R0015 Cphamn1_R0016     TRUE 0.703 20.000 0.000 NA   NA
 6944425 6944426 Cphamn1_R0016 Cphamn1_R0017     TRUE 0.700 21.000 0.000 NA   NA
 6944426 6944427 Cphamn1_R0017 Cphamn1_R0018     TRUE 0.696 24.000 0.000 NA   NA
 6944427 6944428 Cphamn1_R0018 Cphamn1_0313   secE FALSE 0.438 53.000 0.000 NA   NA
 6944428 6944429 Cphamn1_0313 Cphamn1_0314 secE   TRUE 0.991 25.000 0.843 1.000 N NA
 6944429 6944430 Cphamn1_0314 Cphamn1_0315   rplK TRUE 0.978 43.000 0.681 1.000 N NA
 6944430 6944431 Cphamn1_0315 Cphamn1_0316 rplK rplA TRUE 0.988 74.000 0.838 0.031 Y NA
 6944431 6944432 Cphamn1_0316 Cphamn1_0317 rplA rplJ TRUE 0.995 18.000 0.302 0.031 Y NA
 6944432 6944433 Cphamn1_0317 Cphamn1_0318 rplJ rplL TRUE 0.990 69.000 0.884 0.023 Y NA
 6944433 6944434 Cphamn1_0318 Cphamn1_0319 rplL rpoB TRUE 0.607 201.000 0.223 1.000   NA
 6944434 6944435 Cphamn1_0319 Cphamn1_0320 rpoB   TRUE 0.977 71.000 0.851 0.001   NA
 6944436 6944437 Cphamn1_0321 Cphamn1_0322     TRUE 0.990 19.000 0.101 0.002 Y NA
 6944437 6944438 Cphamn1_0322 Cphamn1_0323     TRUE 0.873 51.000 0.120 1.000 N NA
 6944439 6944440 Cphamn1_0324 Cphamn1_0325     FALSE 0.401 96.000 0.015 1.000 N NA
 6944441 6944442 Cphamn1_0326 Cphamn1_0327     TRUE 0.999 4.000 0.832 0.002 Y NA
 6944442 6944443 Cphamn1_0327 Cphamn1_0328     FALSE 0.415 132.000 0.025 NA   NA
 6944443 6944444 Cphamn1_0328 Cphamn1_0329     FALSE 0.096 213.000 0.000 NA   NA
 6944445 6944446 Cphamn1_0330 Cphamn1_0331 alaS   TRUE 0.731 13.000 0.005 NA   NA
 6944448 6944449 Cphamn1_0333 Cphamn1_0334     TRUE 0.991 -3.000 0.063 0.079 Y NA
 6944449 6944450 Cphamn1_0334 Cphamn1_0335     TRUE 0.907 -3.000 0.018 NA   NA
 6944450 6944451 Cphamn1_0335 Cphamn1_0336     TRUE 0.981 -7.000 0.237 NA   NA
 6944451 6944452 Cphamn1_0336 Cphamn1_0337     TRUE 0.750 15.000 0.000 1.000   NA
 6944452 6944453 Cphamn1_0337 Cphamn1_0338     TRUE 0.944 4.000 0.062 NA   NA
 6944453 6944454 Cphamn1_0338 Cphamn1_0339     FALSE 0.053 436.000 0.000 NA   NA
 6944454 6944455 Cphamn1_0339 Cphamn1_0340     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944456 6944457 Cphamn1_0341 Cphamn1_0342   guaA TRUE 0.823 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6944457 6944458 Cphamn1_0342 Cphamn1_0343 guaA   TRUE 0.787 26.000 0.011 1.000 N NA
 6944458 6944459 Cphamn1_0343 Cphamn1_0344     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6944460 6944461 Cphamn1_R0019 Cphamn1_0345     FALSE 0.397 58.000 0.000 NA   NA
 6944461 6944462 Cphamn1_0345 Cphamn1_0346     FALSE 0.272 275.000 0.057 NA N NA
 6944462 6944463 Cphamn1_0346 Cphamn1_0347     FALSE 0.251 202.000 0.020 1.000   NA
 6944463 6944464 Cphamn1_0347 Cphamn1_0348     FALSE 0.321 70.000 0.000 NA   NA
 6944464 6944465 Cphamn1_0348 Cphamn1_0349     FALSE 0.376 61.000 0.000 NA   NA
 6944465 6944466 Cphamn1_0349 Cphamn1_0350     TRUE 0.700 21.000 0.000 NA   NA
 6944466 6944467 Cphamn1_0350 Cphamn1_0351     TRUE 0.795 5.000 0.000 1.000   NA
 6944467 6944468 Cphamn1_0351 Cphamn1_0352     FALSE 0.241 97.000 0.000 1.000   NA
 6944468 6944469 Cphamn1_0352 Cphamn1_0353     TRUE 0.784 7.000 0.000 1.000   NA
 6944472 6944473 Cphamn1_0356 Cphamn1_R0020     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 6944478 6944479 Cphamn1_0361 Cphamn1_0362     TRUE 0.768 93.000 0.021 1.000 Y NA
 6944480 6944481 Cphamn1_0363 Cphamn1_0364     TRUE 0.792 73.000 0.139 1.000 N NA
 6944481 6944482 Cphamn1_0364 Cphamn1_0365     TRUE 0.924 52.000 0.044 1.000 Y NA
 6944482 6944483 Cphamn1_0365 Cphamn1_0366     FALSE 0.215 277.000 0.027 1.000 N NA
 6944483 6944484 Cphamn1_0366 Cphamn1_0367     FALSE 0.149 157.000 0.000 NA   NA
 6944484 6944485 Cphamn1_0367 Cphamn1_0368     FALSE 0.044 807.000 0.000 NA   NA
 6944486 6944487 Cphamn1_0369 Cphamn1_0370     FALSE 0.116 206.000 0.000 1.000   NA
 6944487 6944488 Cphamn1_0370 Cphamn1_0371     FALSE 0.215 131.000 0.000 1.000   NA
 6944490 6944491 Cphamn1_0373 Cphamn1_0374     TRUE 0.640 34.000 0.000 NA   NA
 6944491 6944492 Cphamn1_0374 Cphamn1_0375     FALSE 0.459 51.000 0.000 NA   NA
 6944492 6944493 Cphamn1_0375 Cphamn1_0376     FALSE 0.394 63.000 0.000 1.000   NA
 6944494 6944495 Cphamn1_0377 Cphamn1_0378     TRUE 0.791 0.000 0.000 NA   NA
 6944496 6944497 Cphamn1_0379 Cphamn1_0380     FALSE 0.206 115.000 0.000 NA   NA
 6944497 6944498 Cphamn1_0380 Cphamn1_0381     FALSE 0.449 52.000 0.000 NA   NA
 6944498 6944499 Cphamn1_0381 Cphamn1_0382     FALSE 0.136 168.000 0.000 NA   NA
 6944499 6944500 Cphamn1_0382 Cphamn1_0383     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944500 6944501 Cphamn1_0383 Cphamn1_0384     TRUE 0.990 0.000 0.128 NA Y NA
 6944503 6944504 Cphamn1_0386 Cphamn1_0387     FALSE 0.257 92.000 0.000 1.000 N NA
 6944507 6944508 Cphamn1_0390 Cphamn1_0391     TRUE 0.799 -21.000 0.000 NA   NA
 6944508 6944509 Cphamn1_0391 Cphamn1_0392     TRUE 0.960 -7.000 0.000 NA Y NA
 6944512 6944513 Cphamn1_0395 Cphamn1_0396     TRUE 0.823 103.000 0.316 1.000   NA
 6944513 6944514 Cphamn1_0396 Cphamn1_0397   hisS FALSE 0.160 298.000 0.018 1.000 N NA
 6944514 6944515 Cphamn1_0397 Cphamn1_0398 hisS   FALSE 0.429 69.000 0.011 NA   NA
 6944515 6944516 Cphamn1_0398 Cphamn1_0399     FALSE 0.116 187.000 0.000 NA   NA
 6944516 6944517 Cphamn1_0399 Cphamn1_0400     FALSE 0.178 139.000 0.000 NA   NA
 6944517 6944518 Cphamn1_0400 Cphamn1_0401   nusA TRUE 0.964 54.000 0.759 NA   NA
 6944518 6944519 Cphamn1_0401 Cphamn1_0402 nusA   TRUE 0.958 44.000 0.342 1.000 N NA
 6944519 6944520 Cphamn1_0402 Cphamn1_0403     TRUE 0.958 93.000 0.530 1.000 Y NA
 6944520 6944521 Cphamn1_0403 Cphamn1_0404     TRUE 0.865 103.000 0.111 1.000 Y NA
 6944521 6944522 Cphamn1_0404 Cphamn1_0405     TRUE 0.940 8.000 0.062 1.000 N NA
 6944522 6944523 Cphamn1_0405 Cphamn1_0406   rpsO TRUE 0.691 47.000 0.014 1.000 N NA
 6944523 6944524 Cphamn1_0406 Cphamn1_0407 rpsO   FALSE 0.316 90.000 0.011 NA   NA
 6944524 6944525 Cphamn1_0407 Cphamn1_0408   gmk TRUE 0.693 168.000 0.276 NA   NA
 6944525 6944526 Cphamn1_0408 Cphamn1_0409 gmk   TRUE 0.813 15.000 0.011 1.000   NA
 6944526 6944527 Cphamn1_0409 Cphamn1_0410     TRUE 0.964 -19.000 0.101 NA   NA
 6944528 6944529 Cphamn1_0411 Cphamn1_0412     FALSE 0.352 155.000 0.021 1.000   NA
 6944529 6944530 Cphamn1_0412 Cphamn1_0413     FALSE 0.408 98.000 0.020 NA   NA
 6944530 6944531 Cphamn1_0413 Cphamn1_0414     TRUE 0.949 18.000 0.116 NA   NA
 6944531 6944532 Cphamn1_0414 Cphamn1_0415     FALSE 0.109 205.000 0.003 1.000 N NA
 6944532 6944533 Cphamn1_0415 Cphamn1_0416     TRUE 0.873 -10.000 0.011 1.000 N NA
 6944533 6944534 Cphamn1_0416 Cphamn1_0417     TRUE 0.971 8.000 0.071 0.003 N NA
 6944536 6944537 Cphamn1_0419 Cphamn1_0420     TRUE 0.905 37.000 0.081 1.000 N NA
 6944538 6944539 Cphamn1_0421 Cphamn1_0422 rpsT ruvA FALSE 0.334 109.000 0.013 1.000 N NA
 6944539 6944540 Cphamn1_0422 Cphamn1_0423 ruvA   TRUE 0.888 -28.000 0.013 1.000 N NA
 6944540 6944541 Cphamn1_0423 Cphamn1_0424   rho FALSE 0.063 388.000 0.000 1.000 N NA
 6944543 6944544 Cphamn1_R0021 Cphamn1_R0022     TRUE 0.613 37.000 0.000 NA   NA
 6944544 6944545 Cphamn1_R0022 Cphamn1_0426     FALSE 0.281 76.000 0.000 NA   NA
 6944545 6944546 Cphamn1_0426 Cphamn1_0427     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   NA
 6944548 6944549 Cphamn1_0429 Cphamn1_0430     TRUE 0.996 1.000 0.509 NA Y NA
 6944549 6944550 Cphamn1_0430 Cphamn1_0431     TRUE 0.489 199.000 0.125 NA   NA
 6944551 6944552 Cphamn1_0432 Cphamn1_0433     FALSE 0.178 303.000 0.000 0.007   NA
 6944552 6944553 Cphamn1_0433 Cphamn1_0434     TRUE 0.544 151.000 0.005 1.000 Y NA
 6944553 6944554 Cphamn1_0434 Cphamn1_0435     TRUE 0.944 7.000 0.065 1.000 N NA
 6944555 6944556 Cphamn1_0436 Cphamn1_0437 gatA   FALSE 0.461 75.000 0.014 1.000 N NA
 6944558 6944559 Cphamn1_0439 Cphamn1_0440     TRUE 0.928 31.000 0.104 NA   NA
 6944560 6944561 Cphamn1_0441 Cphamn1_0442     TRUE 0.983 -3.000 0.273 NA   NA
 6944561 6944562 Cphamn1_0442 Cphamn1_0443     TRUE 0.875 100.000 0.545 NA   NA
 6944562 6944563 Cphamn1_0443 Cphamn1_0444     TRUE 0.788 138.000 0.323 NA   NA
 6944563 6944564 Cphamn1_0444 Cphamn1_0445     TRUE 0.498 134.000 0.044 1.000 N NA
 6944564 6944565 Cphamn1_0445 Cphamn1_0446     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   NA
 6944565 6944566 Cphamn1_0446 Cphamn1_0447     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 6944567 6944568 Cphamn1_0448 Cphamn1_0449     TRUE 0.506 60.000 0.012 NA   NA
 6944568 6944569 Cphamn1_0449 Cphamn1_0450     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6944569 6944570 Cphamn1_0450 Cphamn1_0451     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944570 6944571 Cphamn1_0451 Cphamn1_0452     TRUE 0.966 -3.000 0.098 1.000   NA
 6944571 6944572 Cphamn1_0452 Cphamn1_0453     TRUE 0.971 -3.000 0.122 1.000   NA
 6944572 6944573 Cphamn1_0453 Cphamn1_0454     TRUE 0.994 5.000 0.286 1.000 Y NA
 6944574 6944575 Cphamn1_0455 Cphamn1_0456   ispH TRUE 0.910 28.000 0.054 1.000 N NA
 6944575 6944576 Cphamn1_0456 Cphamn1_0457 ispH   FALSE 0.372 75.000 0.011 NA   NA
 6944576 6944577 Cphamn1_0457 Cphamn1_0458     TRUE 0.995 -16.000 0.917 NA   NA
 6944577 6944578 Cphamn1_0458 Cphamn1_0459     TRUE 0.932 97.000 1.000 NA   NA
 6944578 6944579 Cphamn1_0459 Cphamn1_0460     TRUE 0.907 115.000 0.769 NA   NA
 6944580 6944581 Cphamn1_0461 Cphamn1_0462     TRUE 0.965 10.000 0.167 NA N NA
 6944581 6944582 Cphamn1_0462 Cphamn1_0463     TRUE 0.707 18.000 0.004 NA N NA
 6944582 6944583 Cphamn1_0463 Cphamn1_0464     FALSE 0.083 238.000 0.004 NA   NA
 6944584 6944585 Cphamn1_0465 Cphamn1_0466   hisI TRUE 0.894 -16.000 0.013 1.000 N NA
 6944586 6944587 Cphamn1_0467 Cphamn1_0468     FALSE 0.259 83.000 0.000 NA   NA
 6944587 6944588 Cphamn1_0468 Cphamn1_0469     TRUE 0.729 13.000 0.000 NA   NA
 6944588 6944589 Cphamn1_0469 Cphamn1_0470     FALSE 0.208 104.000 0.000 NA   NA
 6944589 6944590 Cphamn1_0470 Cphamn1_0471     FALSE 0.087 231.000 0.000 NA   NA
 6944590 6944591 Cphamn1_0471 Cphamn1_0472     TRUE 0.996 -3.000 0.203 0.009 Y NA
 6944591 6944592 Cphamn1_0472 Cphamn1_0473     TRUE 0.624 57.000 0.000 0.063 N NA
 6944592 6944593 Cphamn1_0473 Cphamn1_0474   hisH TRUE 0.936 21.000 0.000 1.000 Y NA
 6944593 6944594 Cphamn1_0474 Cphamn1_0475 hisH   TRUE 0.982 23.000 0.031 0.006 Y NA
 6944594 6944595 Cphamn1_0475 Cphamn1_0476     TRUE 0.568 54.000 0.013 NA N NA
 6944595 6944596 Cphamn1_0476 Cphamn1_0477     TRUE 0.931 -19.000 0.031 NA N NA
 6944596 6944597 Cphamn1_0477 Cphamn1_0478     TRUE 0.927 35.000 0.116 NA   NA
 6944597 6944598 Cphamn1_0478 Cphamn1_0479     FALSE 0.185 135.000 0.000 NA   NA
 6944598 6944599 Cphamn1_0479 Cphamn1_0480     TRUE 0.717 17.000 0.000 NA   NA
 6944600 6944601 Cphamn1_0481 Cphamn1_0482     FALSE 0.281 76.000 0.000 NA   NA
 6944602 6944603 Cphamn1_0483 Cphamn1_0484     FALSE 0.426 54.000 0.000 NA   NA
 6944603 6944604 Cphamn1_0484 Cphamn1_0485     FALSE 0.051 674.000 0.000 1.000   NA
 6944604 6944605 Cphamn1_0485 Cphamn1_0486     FALSE 0.243 89.000 0.000 NA   NA
 6944606 6944607 Cphamn1_0487 Cphamn1_0488     TRUE 0.952 46.000 0.345 NA N NA
 6944608 6944609 Cphamn1_0489 Cphamn1_0490     TRUE 0.939 -10.000 0.033 1.000 N NA
 6944609 6944610 Cphamn1_0490 Cphamn1_0491     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944610 6944611 Cphamn1_0491 Cphamn1_0492     TRUE 0.605 38.000 0.000 NA   NA
 6944612 6944613 Cphamn1_0493 Cphamn1_0494     TRUE 0.798 -25.000 0.000 NA   NA
 6944613 6944614 Cphamn1_0494 Cphamn1_0495     FALSE 0.111 194.000 0.000 NA   NA
 6944614 6944615 Cphamn1_0495 Cphamn1_0496     TRUE 0.817 14.000 0.011 1.000   NA
 6944615 6944616 Cphamn1_0496 Cphamn1_0497     TRUE 0.851 19.000 0.015 1.000   NA
 6944616 6944617 Cphamn1_0497 Cphamn1_0498     TRUE 0.906 -7.000 0.015 1.000   NA
 6944617 6944618 Cphamn1_0498 Cphamn1_0499     FALSE 0.336 128.000 0.013 1.000 N NA
 6944618 6944619 Cphamn1_0499 Cphamn1_0500     FALSE 0.372 75.000 0.009 1.000   NA
 6944619 6944620 Cphamn1_0500 Cphamn1_0501     TRUE 0.974 16.000 0.263 1.000   NA
 6944620 6944621 Cphamn1_0501 Cphamn1_0502     TRUE 0.955 47.000 0.368 1.000   NA
 6944622 6944623 Cphamn1_0503 Cphamn1_0504     TRUE 0.988 -28.000 0.435 NA N NA
 6944623 6944624 Cphamn1_0504 Cphamn1_0505     FALSE 0.430 203.000 0.087 1.000   NA
 6944624 6944625 Cphamn1_0505 Cphamn1_0506     TRUE 0.801 4.000 0.000 1.000   NA
 6944626 6944627 Cphamn1_0507 Cphamn1_0508     TRUE 0.942 20.000 0.107 NA   NA
 6944627 6944628 Cphamn1_0508 Cphamn1_0509     TRUE 0.896 56.000 0.226 NA   NA
 6944629 6944630 Cphamn1_0510 Cphamn1_0511     FALSE 0.094 217.000 0.000 NA   NA
 6944630 6944631 Cphamn1_0511 Cphamn1_0512     FALSE 0.063 324.000 0.000 NA   NA
 6944631 6944632 Cphamn1_0512 Cphamn1_0513     TRUE 0.676 53.000 0.021 NA   NA
 6944634 6944635 Cphamn1_0515 Cphamn1_0516     TRUE 0.668 29.000 0.000 NA N NA
 6944635 6944636 Cphamn1_0516 Cphamn1_0517     TRUE 0.763 6.000 0.000 NA N NA
 6944636 6944637 Cphamn1_0517 Cphamn1_0518     TRUE 0.732 78.000 0.111 NA   NA
 6944637 6944638 Cphamn1_0518 Cphamn1_0519     FALSE 0.409 125.000 0.022 NA   NA
 6944638 6944639 Cphamn1_0519 Cphamn1_0520     TRUE 0.740 35.000 0.012 NA   NA
 6944645 6944646 Cphamn1_0526 Cphamn1_0527     FALSE 0.404 57.000 0.000 NA   NA
 6944649 6944650 Cphamn1_0530 Cphamn1_0531     TRUE 0.920 -7.000 0.022 NA   NA
 6944651 6944652 Cphamn1_0532 Cphamn1_0533     TRUE 0.752 17.000 0.008 NA   NA
 6944652 6944653 Cphamn1_0533 Cphamn1_0534     FALSE 0.414 84.000 0.014 NA   NA
 6944653 6944654 Cphamn1_0534 Cphamn1_0535   trpC TRUE 0.973 2.000 0.016 1.000 Y NA
 6944655 6944656 Cphamn1_0536 Cphamn1_0537     TRUE 0.532 73.000 0.018 1.000 N NA
 6944656 6944657 Cphamn1_0537 Cphamn1_0538     TRUE 0.869 49.000 0.111 NA   NA
 6944657 6944658 Cphamn1_0538 Cphamn1_0539     TRUE 0.693 25.000 0.000 NA   NA
 6944658 6944659 Cphamn1_0539 Cphamn1_0540     FALSE 0.266 90.000 0.000 1.000   NA
 6944659 6944660 Cphamn1_0540 Cphamn1_0541     TRUE 0.870 -16.000 0.011 1.000 N NA
 6944661 6944662 Cphamn1_0542 Cphamn1_0543     TRUE 0.970 25.000 0.277 NA   NA
 6944662 6944663 Cphamn1_0543 Cphamn1_0544     TRUE 0.727 26.000 0.006 1.000 N NA
 6944664 6944665 Cphamn1_0545 Cphamn1_0546     FALSE 0.079 1305.000 0.013 1.000 N NA
 6944666 6944667 Cphamn1_0547 Cphamn1_0548     FALSE 0.207 112.000 0.000 NA   NA
 6944668 6944669 Cphamn1_0549 Cphamn1_0550     FALSE 0.442 124.000 0.027 NA   NA
 6944669 6944670 Cphamn1_0550 Cphamn1_0551   leuS FALSE 0.086 286.000 0.007 1.000 N NA
 6944670 6944671 Cphamn1_0551 Cphamn1_0552 leuS   FALSE 0.298 358.000 0.009 1.000 Y NA
 6944671 6944672 Cphamn1_0552 Cphamn1_0553     FALSE 0.238 138.000 0.009 1.000 N NA
 6944672 6944673 Cphamn1_0553 Cphamn1_0554     TRUE 0.712 48.000 0.016 1.000   NA
 6944674 6944675 Cphamn1_0555 Cphamn1_0556     FALSE 0.147 158.000 0.000 NA   NA
 6944675 6944676 Cphamn1_0556 Cphamn1_0557     FALSE 0.223 95.000 0.000 NA   NA
 6944676 6944677 Cphamn1_0557 Cphamn1_0558     FALSE 0.376 61.000 0.000 NA   NA
 6944677 6944678 Cphamn1_0558 Cphamn1_0559     FALSE 0.181 138.000 0.000 NA   NA
 6944678 6944679 Cphamn1_0559 Cphamn1_0560     TRUE 0.648 62.000 0.024 1.000 N NA
 6944681 6944682 Cphamn1_0562 Cphamn1_0563     TRUE 0.753 14.000 0.000 1.000   NA
 6944683 6944684 Cphamn1_0564 Cphamn1_0565     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6944684 6944685 Cphamn1_0565 Cphamn1_0566     TRUE 0.543 144.000 0.085 NA   NA
 6944685 6944686 Cphamn1_0566 Cphamn1_0567     TRUE 0.915 27.000 0.064 NA   NA
 6944687 6944688 Cphamn1_0568 Cphamn1_0569     FALSE 0.314 71.000 0.000 NA   NA
 6944688 6944689 Cphamn1_0569 Cphamn1_0570     TRUE 0.980 10.000 0.333 NA   NA
 6944689 6944690 Cphamn1_0570 Cphamn1_0571     FALSE 0.107 201.000 0.000 NA   NA
 6944690 6944691 Cphamn1_0571 Cphamn1_0572     FALSE 0.207 110.000 0.000 NA   NA
 6944692 6944693 Cphamn1_0573 Cphamn1_0574     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6944695 6944696 Cphamn1_0576 Cphamn1_0577     FALSE 0.264 81.000 0.000 NA   NA
 6944699 6944700 Cphamn1_0580 Cphamn1_0581     TRUE 0.994 -7.000 0.833 NA   NA
 6944700 6944701 Cphamn1_0581 Cphamn1_0582     TRUE 0.904 9.000 0.028 NA   NA
 6944701 6944702 Cphamn1_0582 Cphamn1_0583     TRUE 0.596 72.000 0.030 NA N NA
 6944702 6944703 Cphamn1_0583 Cphamn1_0584     TRUE 0.628 71.000 0.039 NA N NA
 6944703 6944704 Cphamn1_0584 Cphamn1_0585     TRUE 0.943 -7.000 0.039 1.000 N NA
 6944704 6944705 Cphamn1_0585 Cphamn1_0586     TRUE 0.756 319.000 0.147 0.022 Y NA
 6944705 6944706 Cphamn1_0586 Cphamn1_0587   ruvB TRUE 0.631 48.000 0.011 1.000 N NA
 6944706 6944707 Cphamn1_0587 Cphamn1_0588 ruvB   FALSE 0.079 274.000 0.003 1.000 N NA
 6944709 6944710 Cphamn1_0590 Cphamn1_0591     FALSE 0.259 141.000 0.011 1.000 N NA
 6944710 6944711 Cphamn1_0591 Cphamn1_0592     TRUE 0.980 9.000 0.054 1.000 Y NA
 6944712 6944713 Cphamn1_0593 Cphamn1_0594     FALSE 0.207 138.000 0.006 1.000 N NA
 6944713 6944714 Cphamn1_0594 Cphamn1_0595     TRUE 0.583 40.000 0.000 NA   NA
 6944714 6944715 Cphamn1_0595 Cphamn1_0596     FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 6944715 6944716 Cphamn1_0596 Cphamn1_0597     FALSE 0.459 126.000 0.028 1.000 N NA
 6944718 6944719 Cphamn1_0599 Cphamn1_0600   rnhA TRUE 0.882 8.000 0.019 NA   NA
 6944719 6944720 Cphamn1_0600 Cphamn1_0601 rnhA rpmB FALSE 0.351 95.000 0.012 1.000 N NA
 6944720 6944721 Cphamn1_0601 Cphamn1_0602 rpmB   FALSE 0.360 88.000 0.011 1.000 N NA
 6944721 6944722 Cphamn1_0602 Cphamn1_0603   trpD FALSE 0.394 81.000 0.012 1.000 N NA
 6944723 6944724 Cphamn1_0604 Cphamn1_0605     FALSE 0.379 133.000 0.018 1.000 N NA
 6944725 6944726 Cphamn1_0606 Cphamn1_0607     FALSE 0.415 106.000 0.019 1.000 N NA
 6944726 6944727 Cphamn1_0607 Cphamn1_0608     TRUE 0.884 28.000 0.030 1.000 N NA
 6944730 6944731 Cphamn1_0611 Cphamn1_0612     FALSE 0.069 292.000 0.000 NA   NA
 6944731 6944732 Cphamn1_0612 Cphamn1_0613     FALSE 0.205 118.000 0.000 NA   NA
 6944733 6944734 Cphamn1_0614 Cphamn1_0615     FALSE 0.446 116.000 0.023 1.000 N NA
 6944736 6944737 Cphamn1_0617 Cphamn1_0618     FALSE 0.206 114.000 0.000 NA   NA
 6944737 6944738 Cphamn1_0618 Cphamn1_0619     TRUE 0.685 27.000 0.000 NA   NA
 6944739 6944740 Cphamn1_0620 Cphamn1_0621     TRUE 0.725 24.000 0.000 1.000   NA
 6944740 6944741 Cphamn1_0621 Cphamn1_0622     TRUE 0.991 -3.000 0.049 0.011 Y NA
 6944741 6944742 Cphamn1_0622 Cphamn1_0623     TRUE 0.990 0.000 0.122 1.000 Y NA
 6944742 6944743 Cphamn1_0623 Cphamn1_0624     TRUE 0.698 79.000 0.091 NA   NA
 6944745 6944746 Cphamn1_0626 Cphamn1_0627     TRUE 0.741 10.000 0.000 NA   NA
 6944748 6944749 Cphamn1_0629 Cphamn1_0630   glyA FALSE 0.286 301.000 0.070 1.000 N NA
 6944751 6944752 Cphamn1_0632 Cphamn1_0633     TRUE 0.729 13.000 0.000 NA   NA
 6944752 6944753 Cphamn1_0633 Cphamn1_0634     TRUE 0.999 6.000 0.980 0.032 Y NA
 6944753 6944754 Cphamn1_0634 Cphamn1_0635     TRUE 0.996 2.000 0.275 0.022 Y NA
 6944754 6944755 Cphamn1_0635 Cphamn1_0636     TRUE 0.809 34.000 0.000 0.074 N NA
 6944756 6944757 Cphamn1_0637 Cphamn1_0638     TRUE 0.968 -25.000 0.122 NA   NA
 6944757 6944758 Cphamn1_0638 Cphamn1_0639     TRUE 0.549 103.000 0.056 NA   NA
 6944758 6944759 Cphamn1_0639 Cphamn1_0640     TRUE 0.980 29.000 0.500 NA   NA
 6944760 6944761 Cphamn1_0641 Cphamn1_0642     TRUE 0.700 20.000 0.000 NA N NA
 6944761 6944762 Cphamn1_0642 Cphamn1_0643     FALSE 0.355 69.000 0.000 1.000 N NA
 6944762 6944763 Cphamn1_0643 Cphamn1_0644     TRUE 0.964 -3.000 0.091 1.000 N NA
 6944763 6944764 Cphamn1_0644 Cphamn1_0645     TRUE 0.946 -3.000 0.044 1.000 N NA
 6944764 6944765 Cphamn1_0645 Cphamn1_0646     TRUE 0.943 22.000 0.109 NA   NA
 6944765 6944766 Cphamn1_0646 Cphamn1_0647     TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 6944766 6944767 Cphamn1_0647 Cphamn1_0648     TRUE 0.948 19.000 0.118 NA   NA
 6944769 6944770 Cphamn1_0650 Cphamn1_0651     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6944770 6944771 Cphamn1_0651 Cphamn1_0652     FALSE 0.088 230.000 0.000 NA   NA
 6944771 6944772 Cphamn1_0652 Cphamn1_0653     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944775 6944776 Cphamn1_0656 Cphamn1_0657     TRUE 0.861 -13.000 0.011 NA   NA
 6944777 6944778 Cphamn1_0658 Cphamn1_0659     FALSE 0.108 213.000 0.000 1.000 N NA
 6944778 6944779 Cphamn1_0659 Cphamn1_0660     TRUE 0.820 -19.000 0.000 1.000 N NA
 6944781 6944782 Cphamn1_0662 Cphamn1_0663     TRUE 0.950 11.000 0.104 NA   NA
 6944782 6944783 Cphamn1_0663 Cphamn1_0664     FALSE 0.207 109.000 0.000 NA   NA
 6944783 6944784 Cphamn1_0664 Cphamn1_0665     TRUE 0.798 -25.000 0.000 NA   NA
 6944784 6944785 Cphamn1_0665 Cphamn1_0666     TRUE 0.945 2.000 0.059 NA   NA
 6944788 6944789 Cphamn1_0669 Cphamn1_0670     FALSE 0.171 415.000 0.036 NA   NA
 6944790 6944791 Cphamn1_0671 Cphamn1_0672     FALSE 0.476 122.000 0.029 1.000 N NA
 6944791 6944792 Cphamn1_0672 Cphamn1_0673   gltD TRUE 0.989 44.000 0.222 0.001 Y NA
 6944792 6944793 Cphamn1_0673 Cphamn1_0674 gltD   TRUE 0.490 88.000 0.024 NA   NA
 6944793 6944794 Cphamn1_0674 Cphamn1_0675   clpX TRUE 0.669 39.000 0.010 NA   NA
 6944794 6944795 Cphamn1_0675 Cphamn1_R0023 clpX   FALSE 0.389 59.000 0.000 NA   NA
 6944795 6944796 Cphamn1_R0023 Cphamn1_0676     FALSE 0.140 165.000 0.000 NA   NA
 6944796 6944797 Cphamn1_0676 Cphamn1_0677     TRUE 0.800 -19.000 0.000 NA   NA
 6944798 6944799 Cphamn1_0678 Cphamn1_0679     TRUE 0.978 26.000 0.400 NA   NA
 6944800 6944801 Cphamn1_0680 Cphamn1_0681     TRUE 0.783 91.000 0.200 1.000   NA
 6944801 6944802 Cphamn1_0681 Cphamn1_0682     TRUE 0.824 -3.000 0.000 1.000   NA
 6944802 6944803 Cphamn1_0682 Cphamn1_0683     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA   NA
 6944803 6944804 Cphamn1_0683 Cphamn1_0684     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 6944804 6944805 Cphamn1_0684 Cphamn1_0685     TRUE 0.515 154.000 0.000 NA Y NA
 6944805 6944806 Cphamn1_0685 Cphamn1_0686     TRUE 0.951 5.000 0.000 NA Y NA
 6944806 6944807 Cphamn1_0686 Cphamn1_0687     TRUE 0.824 -3.000 0.000 1.000   NA
 6944807 6944808 Cphamn1_0687 Cphamn1_0688     FALSE 0.217 129.000 0.000 1.000   NA
 6944809 6944810 Cphamn1_0689 Cphamn1_0690     TRUE 0.798 -28.000 0.000 NA   NA
 6944810 6944811 Cphamn1_0690 Cphamn1_0691     FALSE 0.192 131.000 0.000 NA   NA
 6944814 6944815 Cphamn1_0694 Cphamn1_0695     FALSE 0.166 146.000 0.000 NA   NA
 6944815 6944816 Cphamn1_0695 Cphamn1_0696     FALSE 0.240 90.000 0.000 NA   NA
 6944816 6944817 Cphamn1_0696 Cphamn1_0697     FALSE 0.107 201.000 0.000 NA   NA
 6944817 6944818 Cphamn1_0697 Cphamn1_0698     TRUE 0.998 24.000 0.778 0.022 Y NA
 6944818 6944819 Cphamn1_0698 Cphamn1_0699     TRUE 0.997 4.000 0.556 1.000 Y NA
 6944819 6944820 Cphamn1_0699 Cphamn1_0700     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.013 Y NA
 6944820 6944821 Cphamn1_0700 Cphamn1_0701     TRUE 0.943 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6944823 6944824 Cphamn1_0703 Cphamn1_0704     FALSE 0.206 116.000 0.000 NA   NA
 6944824 6944825 Cphamn1_0704 Cphamn1_0705     FALSE 0.079 262.000 0.000 NA   NA
 6944825 6944826 Cphamn1_0705 Cphamn1_0706     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944826 6944827 Cphamn1_0706 Cphamn1_0707     TRUE 0.802 -13.000 0.000 NA   NA
 6944827 6944828 Cphamn1_0707 Cphamn1_0708     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944828 6944829 Cphamn1_0708 Cphamn1_0709     TRUE 0.981 -3.000 0.230 NA   NA
 6944831 6944832 Cphamn1_0711 Cphamn1_0712     FALSE 0.233 92.000 0.000 NA   NA
 6944832 6944833 Cphamn1_0712 Cphamn1_0713     FALSE 0.048 541.000 0.000 NA   NA
 6944833 6944834 Cphamn1_0713 Cphamn1_0714     FALSE 0.048 540.000 0.000 NA   NA
 6944834 6944835 Cphamn1_0714 Cphamn1_0715     TRUE 0.993 -3.000 0.676 NA   NA
 6944837 6944838 Cphamn1_0717 Cphamn1_0718     FALSE 0.122 179.000 0.000 NA   NA
 6944840 6944841 Cphamn1_0720 Cphamn1_0721     TRUE 0.990 -19.000 0.500 NA   NA
 6944842 6944843 Cphamn1_0722 Cphamn1_0723     FALSE 0.082 247.000 0.000 NA   NA
 6944843 6944844 Cphamn1_0723 Cphamn1_0724     TRUE 0.958 -3.000 0.077 NA   NA
 6944845 6944846 Cphamn1_0725 Cphamn1_0726     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 6944846 6944847 Cphamn1_0726 Cphamn1_0727     FALSE 0.204 121.000 0.000 NA   NA
 6944848 6944849 Cphamn1_0728 Cphamn1_0729     TRUE 0.987 -3.000 0.378 NA   NA
 6944850 6944851 Cphamn1_0730 Cphamn1_0731     FALSE 0.147 158.000 0.000 NA   NA
 6944851 6944852 Cphamn1_0731 Cphamn1_0732     FALSE 0.088 229.000 0.000 NA   NA
 6944852 6944853 Cphamn1_0732 Cphamn1_0733     TRUE 0.966 -3.000 0.108 NA   NA
 6944854 6944855 Cphamn1_0734 Cphamn1_0735     TRUE 0.988 -3.000 0.405 NA   NA
 6944855 6944856 Cphamn1_0735 Cphamn1_0736     TRUE 0.993 -7.000 0.722 NA   NA
 6944856 6944857 Cphamn1_0736 Cphamn1_0737     TRUE 0.988 -3.000 0.426 NA   NA
 6944857 6944858 Cphamn1_0737 Cphamn1_0738     FALSE 0.256 84.000 0.000 NA   NA
 6944859 6944860 Cphamn1_0739 Cphamn1_0740     FALSE 0.176 140.000 0.000 NA   NA
 6944860 6944861 Cphamn1_0740 Cphamn1_0741     FALSE 0.099 209.000 0.000 NA   NA
 6944861 6944862 Cphamn1_0741 Cphamn1_0742     FALSE 0.125 198.000 0.000 1.000   NA
 6944862 6944863 Cphamn1_0742 Cphamn1_0743     TRUE 0.990 -9.000 0.500 1.000   NA
 6944863 6944864 Cphamn1_0743 Cphamn1_0744     FALSE 0.062 327.000 0.000 NA N NA
 6944865 6944866 Cphamn1_0745 Cphamn1_0746     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6944866 6944867 Cphamn1_0746 Cphamn1_0747     TRUE 0.496 48.000 0.000 NA   NA
 6944867 6944868 Cphamn1_0747 Cphamn1_0748     TRUE 0.908 -3.000 0.000 0.072   NA
 6944868 6944869 Cphamn1_0748 Cphamn1_0749     FALSE 0.276 168.000 0.000 0.072   NA
 6944869 6944870 Cphamn1_0749 Cphamn1_0750     TRUE 0.991 3.000 0.054 0.003 Y NA
 6944870 6944871 Cphamn1_0750 Cphamn1_0751     TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.072 Y NA
 6944872 6944873 Cphamn1_0752 Cphamn1_0753     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944874 6944875 Cphamn1_0754 Cphamn1_0755     TRUE 0.640 34.000 0.000 NA   NA
 6944876 6944877 Cphamn1_0756 Cphamn1_0757     FALSE 0.278 77.000 0.000 NA   NA
 6944877 6944878 Cphamn1_0757 Cphamn1_0758     FALSE 0.084 240.000 0.000 NA   NA
 6944878 6944879 Cphamn1_0758 Cphamn1_0759     FALSE 0.110 198.000 0.000 NA   NA
 6944879 6944880 Cphamn1_0759 Cphamn1_0760     TRUE 0.784 7.000 0.000 1.000   NA
 6944880 6944881 Cphamn1_0760 Cphamn1_0761     FALSE 0.208 103.000 0.000 NA   NA
 6944881 6944882 Cphamn1_0761 Cphamn1_0762     FALSE 0.250 86.000 0.000 NA   NA
 6944882 6944883 Cphamn1_0762 Cphamn1_0763     FALSE 0.153 155.000 0.000 NA   NA
 6944883 6944884 Cphamn1_0763 Cphamn1_0764     TRUE 0.652 36.000 0.000 1.000 N NA
 6944884 6944885 Cphamn1_0764 Cphamn1_0765     FALSE 0.191 257.000 0.000 0.019 N NA
 6944886 6944887 Cphamn1_0766 Cphamn1_0767     TRUE 0.727 21.000 0.000 1.000 N NA
 6944887 6944888 Cphamn1_0767 Cphamn1_0768     TRUE 0.970 14.000 0.212 1.000 N NA
 6944888 6944889 Cphamn1_0768 Cphamn1_0769     TRUE 0.725 14.000 0.000 NA   NA
 6944889 6944890 Cphamn1_0769 Cphamn1_0770     TRUE 0.796 -1859.000 0.000 NA   NA
 6944892 6944893 Cphamn1_0772 Cphamn1_0773     TRUE 0.973 24.000 0.167 0.072   NA
 6944895 6944896 Cphamn1_0775 Cphamn1_R0024     TRUE 0.677 28.000 0.000 NA   NA
 6944896 6944897 Cphamn1_R0024 Cphamn1_R0025     FALSE 0.075 272.000 0.000 NA   NA
 6944897 6944898 Cphamn1_R0025 Cphamn1_0776     FALSE 0.073 279.000 0.000 NA   NA
 6944901 6944902 Cphamn1_0779 Cphamn1_0780     FALSE 0.416 170.000 0.058 NA N NA
 6944904 6944905 Cphamn1_0782 Cphamn1_0783 groES groEL TRUE 0.990 51.000 0.774 1.000 Y NA
 6944905 6944906 Cphamn1_0783 Cphamn1_0784 groEL   FALSE 0.192 165.000 0.011 NA   NA
 6944906 6944907 Cphamn1_0784 Cphamn1_0785     FALSE 0.461 78.000 0.016 NA   NA
 6944907 6944908 Cphamn1_0785 Cphamn1_0786   trpA TRUE 0.876 19.000 0.024 NA   NA
 6944908 6944909 Cphamn1_0786 Cphamn1_0787 trpA   TRUE 0.900 10.000 0.026 NA   NA
 6944910 6944911 Cphamn1_0788 Cphamn1_0789     TRUE 0.902 56.000 0.250 NA   NA
 6944911 6944912 Cphamn1_0789 Cphamn1_0790     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6944912 6944913 Cphamn1_0790 Cphamn1_0791     TRUE 0.736 11.000 0.000 NA   NA
 6944913 6944914 Cphamn1_0791 Cphamn1_0792     FALSE 0.171 142.000 0.000 NA   NA
 6944915 6944916 Cphamn1_0793 Cphamn1_0794     FALSE 0.058 454.000 0.000 1.000 N NA
 6944916 6944917 Cphamn1_0794 Cphamn1_0795     FALSE 0.454 170.000 0.076 NA N NA
 6944917 6944918 Cphamn1_0795 Cphamn1_0796   aat TRUE 0.670 28.000 0.004 NA N NA
 6944918 6944919 Cphamn1_0796 Cphamn1_0797 aat   FALSE 0.426 98.000 0.019 1.000 N NA
 6944919 6944920 Cphamn1_0797 Cphamn1_0798     TRUE 0.604 124.000 0.083 1.000 N NA
 6944920 6944921 Cphamn1_0798 Cphamn1_0799     FALSE 0.108 213.000 0.000 1.000 N NA
 6944921 6944922 Cphamn1_0799 Cphamn1_0800     FALSE 0.085 271.000 0.000 1.000 N NA
 6944922 6944923 Cphamn1_0800 Cphamn1_0801     FALSE 0.051 456.000 0.000 NA   NA
 6944923 6944924 Cphamn1_0801 Cphamn1_0802     FALSE 0.047 542.000 0.000 NA   NA
 6944924 6944925 Cphamn1_0802 Cphamn1_0803     TRUE 0.797 -36.000 0.000 NA   NA
 6944925 6944926 Cphamn1_0803 Cphamn1_0804     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6944926 6944927 Cphamn1_0804 Cphamn1_0805     FALSE 0.051 454.000 0.000 NA   NA
 6944927 6944928 Cphamn1_0805 Cphamn1_0806     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 6944929 6944930 Cphamn1_0807 Cphamn1_0808     FALSE 0.350 140.000 0.017 1.000 N NA
 6944930 6944931 Cphamn1_0808 Cphamn1_0809     TRUE 0.940 14.000 0.086 NA   NA
 6944931 6944932 Cphamn1_0809 Cphamn1_0810     TRUE 0.830 38.000 0.028 NA   NA
 6944933 6944934 Cphamn1_0811 Cphamn1_0812     FALSE 0.056 395.000 0.000 NA   NA
 6944934 6944935 Cphamn1_0812 Cphamn1_0813     FALSE 0.198 109.000 0.004 NA   NA
 6944935 6944936 Cphamn1_0813 Cphamn1_0814     TRUE 0.869 27.000 0.025 NA   NA
 6944936 6944937 Cphamn1_0814 Cphamn1_0815     FALSE 0.074 276.000 0.000 NA   NA
 6944937 6944938 Cphamn1_0815 Cphamn1_0816     TRUE 0.878 34.000 0.045 NA   NA
 6944939 6944940 Cphamn1_0817 Cphamn1_0818     TRUE 0.856 17.000 0.015 1.000 N NA
 6944941 6944942 Cphamn1_0819 Cphamn1_0820     TRUE 0.933 85.000 0.241 1.000 Y NA
 6944942 6944943 Cphamn1_0820 Cphamn1_0821     FALSE 0.060 346.000 0.000 NA   NA
 6944943 6944944 Cphamn1_0821 Cphamn1_0822     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944945 6944946 Cphamn1_0823 Cphamn1_0824     FALSE 0.171 142.000 0.000 NA   NA
 6944946 6944947 Cphamn1_0824 Cphamn1_0825     FALSE 0.162 163.000 0.000 1.000   NA
 6944947 6944948 Cphamn1_0825 Cphamn1_0826     TRUE 0.849 21.000 0.015 1.000   NA
 6944948 6944949 Cphamn1_0826 Cphamn1_0827     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6944949 6944950 Cphamn1_0827 Cphamn1_0828     FALSE 0.264 81.000 0.000 NA   NA
 6944951 6944952 Cphamn1_0829 Cphamn1_0830     FALSE 0.289 161.000 0.000 0.070 N NA
 6944953 6944954 Cphamn1_0831 Cphamn1_0832 radC   FALSE 0.066 360.000 0.000 1.000 N NA
 6944954 6944955 Cphamn1_0832 Cphamn1_0833   rpmA FALSE 0.195 150.000 0.007 1.000 N NA
 6944955 6944956 Cphamn1_0833 Cphamn1_0834 rpmA rplU TRUE 0.996 40.000 0.667 0.021 Y NA
 6944956 6944957 Cphamn1_0834 Cphamn1_0835 rplU   FALSE 0.182 157.000 0.009 NA   NA
 6944958 6944959 Cphamn1_0836 Cphamn1_0837     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944959 6944960 Cphamn1_0837 Cphamn1_0838     TRUE 0.928 83.000 0.727 1.000 N NA
 6944965 6944966 Cphamn1_0843 Cphamn1_0844     TRUE 0.905 45.000 0.133 NA   NA
 6944968 6944969 Cphamn1_0846 Cphamn1_0847     TRUE 0.966 16.000 0.180 1.000   NA
 6944971 6944972 Cphamn1_0849 Cphamn1_0850     TRUE 0.658 54.000 0.020 NA   NA
 6944973 6944974 Cphamn1_0851 Cphamn1_0852     FALSE 0.234 173.000 0.013 1.000 N NA
 6944974 6944975 Cphamn1_0852 Cphamn1_0853     TRUE 0.920 54.000 0.286 1.000 N NA
 6944975 6944976 Cphamn1_0853 Cphamn1_0854     TRUE 0.982 48.000 0.168 0.006 Y NA
 6944977 6944978 Cphamn1_0855 Cphamn1_0856     FALSE 0.201 123.000 0.000 NA   NA
 6944978 6944979 Cphamn1_0856 Cphamn1_0857     FALSE 0.119 182.000 0.000 NA   NA
 6944979 6944980 Cphamn1_0857 Cphamn1_0858     TRUE 0.596 78.000 0.036 1.000 N NA
 6944980 6944981 Cphamn1_0858 Cphamn1_0859     TRUE 0.564 47.000 0.007 1.000 N NA
 6944981 6944982 Cphamn1_0859 Cphamn1_0860     TRUE 0.843 97.000 0.364 1.000 N NA
 6944982 6944983 Cphamn1_0860 Cphamn1_0861     FALSE 0.134 210.000 0.009 1.000 N NA
 6944983 6944984 Cphamn1_0861 Cphamn1_0862     TRUE 0.677 28.000 0.000 NA   NA
 6944985 6944986 Cphamn1_0863 Cphamn1_0864     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6944986 6944987 Cphamn1_0864 Cphamn1_0865     TRUE 0.732 12.000 0.000 NA   NA
 6944987 6944988 Cphamn1_0865 Cphamn1_0866     FALSE 0.045 671.000 0.000 NA   NA
 6944988 6944989 Cphamn1_0866 Cphamn1_0867     TRUE 0.560 43.000 0.000 NA   NA
 6944989 6944990 Cphamn1_0867 Cphamn1_0868     FALSE 0.286 75.000 0.000 NA   NA
 6944990 6944991 Cphamn1_0868 Cphamn1_0869     FALSE 0.046 656.000 0.000 NA   NA
 6944991 6944992 Cphamn1_0869 Cphamn1_0870     TRUE 0.981 0.000 0.263 NA   NA
 6944992 6944993 Cphamn1_0870 Cphamn1_0871     FALSE 0.052 672.000 0.000 1.000   NA
 6944993 6944994 Cphamn1_0871 Cphamn1_0872     TRUE 0.962 -13.000 0.091 NA   NA
 6944994 6944995 Cphamn1_0872 Cphamn1_0873     FALSE 0.050 464.000 0.000 NA   NA
 6944995 6944996 Cphamn1_0873 Cphamn1_0874     TRUE 0.972 2.000 0.167 NA   NA
 6944998 6944999 Cphamn1_0876 Cphamn1_0877     TRUE 0.802 -13.000 0.000 NA   NA
 6944999 6945000 Cphamn1_0877 Cphamn1_0878     FALSE 0.438 53.000 0.000 NA   NA
 6945000 6945001 Cphamn1_0878 Cphamn1_0879     TRUE 0.973 24.000 0.167 0.070   NA
 6945001 6945002 Cphamn1_0879 Cphamn1_0880     FALSE 0.183 137.000 0.000 NA   NA
 6945002 6945003 Cphamn1_0880 Cphamn1_0881     FALSE 0.043 959.000 0.000 NA   NA
 6945003 6945004 Cphamn1_0881 Cphamn1_0882     TRUE 0.703 20.000 0.000 NA   NA
 6945005 6945006 Cphamn1_0883 Cphamn1_0884     FALSE 0.107 201.000 0.000 NA   NA
 6945006 6945007 Cphamn1_0884 Cphamn1_0885     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945007 6945008 Cphamn1_0885 Cphamn1_0886     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945009 6945010 Cphamn1_0887 Cphamn1_0888     FALSE 0.115 190.000 0.000 NA   NA
 6945010 6945011 Cphamn1_0888 Cphamn1_0889     TRUE 0.983 33.000 0.667 NA   NA
 6945012 6945013 Cphamn1_0890 Cphamn1_0891     FALSE 0.043 851.000 0.000 NA   NA
 6945014 6945015 Cphamn1_0892 Cphamn1_0893     FALSE 0.207 112.000 0.000 NA   NA
 6945016 6945017 Cphamn1_0894 Cphamn1_0895     FALSE 0.094 243.000 0.000 1.000 N NA
 6945017 6945018 Cphamn1_0895 Cphamn1_0896     TRUE 0.641 95.000 0.000 1.000 Y NA
 6945018 6945019 Cphamn1_0896 Cphamn1_0897     TRUE 0.865 62.000 0.182 1.000 N NA
 6945020 6945021 Cphamn1_0898 Cphamn1_0899     TRUE 0.971 16.000 0.012 0.033 Y NA
 6945021 6945022 Cphamn1_0899 Cphamn1_0900     FALSE 0.428 122.000 0.009 0.033 N NA
 6945022 6945023 Cphamn1_0900 Cphamn1_0901     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6945023 6945024 Cphamn1_0901 Cphamn1_0902     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 6945026 6945027 Cphamn1_0904 Cphamn1_0905     TRUE 0.601 76.000 0.035 1.000 N NA
 6945027 6945028 Cphamn1_0905 Cphamn1_0906     FALSE 0.341 141.000 0.016 1.000 N NA
 6945028 6945029 Cphamn1_0906 Cphamn1_0907     TRUE 0.853 24.000 0.020 NA   NA
 6945029 6945030 Cphamn1_0907 Cphamn1_0908   tpiA TRUE 0.961 6.000 0.117 NA   NA
 6945032 6945033 Cphamn1_0910 Cphamn1_0911     FALSE 0.196 127.000 0.000 NA   NA
 6945033 6945034 Cphamn1_0911 Cphamn1_0912     FALSE 0.224 302.000 0.046 NA N NA
 6945036 6945037 Cphamn1_0914 Cphamn1_0915     FALSE 0.043 902.000 0.000 NA   NA
 6945037 6945038 Cphamn1_0915 Cphamn1_0916     FALSE 0.211 100.000 0.000 NA   NA
 6945038 6945039 Cphamn1_0916 Cphamn1_0917     FALSE 0.162 150.000 0.000 NA   NA
 6945041 6945042 Cphamn1_0919 Cphamn1_0920     TRUE 0.972 15.000 0.235 1.000 N NA
 6945042 6945043 Cphamn1_0920 Cphamn1_0921     FALSE 0.104 221.000 0.000 1.000 N NA
 6945044 6945045 Cphamn1_0922 Cphamn1_0923     FALSE 0.400 71.000 0.009 1.000 N NA
 6945046 6945047 Cphamn1_0924 Cphamn1_0925     FALSE 0.051 450.000 0.000 NA   NA
 6945047 6945048 Cphamn1_0925 Cphamn1_0926     TRUE 0.991 -3.000 0.545 NA   NA
 6945048 6945049 Cphamn1_0926 Cphamn1_0927     TRUE 0.978 -3.000 0.182 1.000 N NA
 6945049 6945050 Cphamn1_0927 Cphamn1_0928     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 6945050 6945051 Cphamn1_0928 Cphamn1_0929     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6945051 6945052 Cphamn1_0929 Cphamn1_0930     FALSE 0.423 54.000 0.004 NA   NA
 6945052 6945053 Cphamn1_0930 Cphamn1_0931     TRUE 0.693 25.000 0.000 NA   NA
 6945054 6945055 Cphamn1_0932 Cphamn1_0933   hemC TRUE 0.996 0.000 0.205 0.003 Y NA
 6945055 6945056 Cphamn1_0933 Cphamn1_0934 hemC hemA TRUE 0.992 29.000 0.178 0.003 Y NA
 6945056 6945057 Cphamn1_0934 Cphamn1_0935 hemA   TRUE 0.668 118.000 0.112 1.000   NA
 6945059 6945060 Cphamn1_0937 Cphamn1_0938     TRUE 0.992 38.000 0.882 0.005 N NA
 6945060 6945061 Cphamn1_0938 Cphamn1_0939     TRUE 0.985 8.000 0.216 0.005   NA
 6945061 6945062 Cphamn1_0939 Cphamn1_0940     TRUE 0.887 101.000 0.583 1.000   NA
 6945066 6945067 Cphamn1_0944 Cphamn1_0945     TRUE 0.863 102.000 0.500 NA   NA
 6945067 6945068 Cphamn1_0945 Cphamn1_0946     FALSE 0.178 139.000 0.000 NA   NA
 6945068 6945069 Cphamn1_0946 Cphamn1_0947     FALSE 0.205 119.000 0.000 NA   NA
 6945069 6945070 Cphamn1_0947 Cphamn1_0948     TRUE 0.940 -3.000 0.041 NA   NA
 6945070 6945071 Cphamn1_0948 Cphamn1_0949     FALSE 0.214 219.000 0.021 NA   NA
 6945071 6945072 Cphamn1_0949 Cphamn1_0950     TRUE 0.715 104.000 0.167 NA   NA
 6945073 6945074 Cphamn1_0951 Cphamn1_0952     TRUE 0.690 26.000 0.000 NA   NA
 6945074 6945075 Cphamn1_0952 Cphamn1_0953     TRUE 0.892 56.000 0.203 1.000   NA
 6945076 6945077 Cphamn1_0954 Cphamn1_0955     TRUE 0.736 11.000 0.000 NA   NA
 6945077 6945078 Cphamn1_0955 Cphamn1_0956     FALSE 0.058 363.000 0.000 NA   NA
 6945079 6945080 Cphamn1_0957 Cphamn1_0958     TRUE 0.825 27.000 0.015 NA   NA
 6945081 6945082 Cphamn1_0959 Cphamn1_0960 aroB aroK TRUE 0.974 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 6945083 6945084 Cphamn1_0961 Cphamn1_0962     TRUE 0.596 39.000 0.000 NA   NA
 6945085 6945086 Cphamn1_0963 Cphamn1_0964     TRUE 0.989 -19.000 0.107 1.000 Y NA
 6945087 6945088 Cphamn1_0965 Cphamn1_0966     TRUE 0.911 28.000 0.055 1.000 N NA
 6945089 6945090 Cphamn1_0967 Cphamn1_0968   lysS TRUE 0.637 35.000 0.005 NA   NA
 6945090 6945091 Cphamn1_0968 Cphamn1_0969 lysS   TRUE 0.584 61.000 0.015 1.000 N NA
 6945092 6945093 Cphamn1_0970 Cphamn1_0971     TRUE 0.867 -10.000 0.011 NA   NA
 6945093 6945094 Cphamn1_0971 Cphamn1_0972     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6945094 6945095 Cphamn1_0972 Cphamn1_0973     TRUE 0.741 10.000 0.000 NA   NA
 6945096 6945097 Cphamn1_R0026 Cphamn1_0974     FALSE 0.116 187.000 0.000 NA   NA
 6945097 6945098 Cphamn1_0974 Cphamn1_R0027     FALSE 0.161 151.000 0.000 NA   NA
 6945098 6945099 Cphamn1_R0027 Cphamn1_0975   rpmG FALSE 0.314 71.000 0.000 NA   NA
 6945102 6945103 Cphamn1_0978 Cphamn1_0979     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945103 6945104 Cphamn1_0979 Cphamn1_0980     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945105 6945106 Cphamn1_0981 Cphamn1_0982     TRUE 0.951 19.000 0.131 NA   NA
 6945106 6945107 Cphamn1_0982 Cphamn1_0983     TRUE 0.971 3.000 0.148 1.000   NA
 6945107 6945108 Cphamn1_0983 Cphamn1_0984     FALSE 0.323 94.000 0.011 1.000 N NA
 6945108 6945109 Cphamn1_0984 Cphamn1_0985     TRUE 0.954 2.000 0.074 1.000 N NA
 6945112 6945113 Cphamn1_0988 Cphamn1_0989     FALSE 0.349 65.000 0.000 NA   NA
 6945113 6945114 Cphamn1_0989 Cphamn1_0990     TRUE 0.732 12.000 0.000 NA   NA
 6945114 6945115 Cphamn1_0990 Cphamn1_0991     TRUE 0.988 5.000 0.115 1.000 Y NA
 6945115 6945116 Cphamn1_0991 Cphamn1_0992     TRUE 0.598 96.000 0.071 NA   NA
 6945116 6945117 Cphamn1_0992 Cphamn1_0993     TRUE 0.978 7.000 0.267 NA   NA
 6945117 6945118 Cphamn1_0993 Cphamn1_0994     FALSE 0.445 99.000 0.000 0.009   NA
 6945121 6945122 Cphamn1_0997 Cphamn1_0998     TRUE 0.814 40.000 0.023 1.000   NA
 6945122 6945123 Cphamn1_0998 Cphamn1_0999     TRUE 0.897 200.000 0.293 0.068 Y NA
 6945123 6945124 Cphamn1_0999 Cphamn1_1000     TRUE 0.940 71.000 0.186 1.000 Y NA
 6945124 6945125 Cphamn1_1000 Cphamn1_1001     TRUE 0.981 7.000 0.291 1.000 N NA
 6945125 6945126 Cphamn1_1001 Cphamn1_1002     TRUE 0.720 16.000 0.000 NA   NA
 6945126 6945127 Cphamn1_1002 Cphamn1_1003     FALSE 0.190 132.000 0.000 NA   NA
 6945127 6945128 Cphamn1_1003 Cphamn1_1004   ddl FALSE 0.293 87.000 0.007 1.000   NA
 6945128 6945129 Cphamn1_1004 Cphamn1_1005 ddl   FALSE 0.394 93.000 0.015 NA   NA
 6945130 6945131 Cphamn1_1006 Cphamn1_1007     FALSE 0.106 202.000 0.000 NA   NA
 6945131 6945132 Cphamn1_1007 Cphamn1_1008   panB TRUE 0.610 147.000 0.011 1.000 Y NA
 6945132 6945133 Cphamn1_1008 Cphamn1_1009 panB   FALSE 0.321 78.000 0.007 1.000 N NA
 6945133 6945134 Cphamn1_1009 Cphamn1_1010     FALSE 0.332 198.000 0.040 1.000 N NA
 6945134 6945135 Cphamn1_1010 Cphamn1_1011     TRUE 0.998 13.000 0.656 0.002 Y NA
 6945135 6945136 Cphamn1_1011 Cphamn1_1012     TRUE 0.623 57.000 0.018 NA   NA
 6945136 6945137 Cphamn1_1012 Cphamn1_1013     FALSE 0.135 373.000 0.020 NA   NA
 6945137 6945138 Cphamn1_1013 Cphamn1_1014     FALSE 0.461 75.000 0.014 1.000   NA
 6945138 6945139 Cphamn1_1014 Cphamn1_1015     FALSE 0.267 123.000 0.011 NA   NA
 6945139 6945140 Cphamn1_1015 Cphamn1_1016   aspS FALSE 0.259 85.000 0.006 NA   NA
 6945140 6945141 Cphamn1_1016 Cphamn1_1017 aspS   FALSE 0.045 673.000 0.000 NA   NA
 6945141 6945142 Cphamn1_1017 Cphamn1_1018     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945142 6945143 Cphamn1_1018 Cphamn1_1019     FALSE 0.054 541.000 0.000 1.000   NA
 6945143 6945144 Cphamn1_1019 Cphamn1_1020     FALSE 0.051 707.000 0.000 1.000   NA
 6945145 6945146 Cphamn1_1021 Cphamn1_1022     TRUE 0.911 -3.000 0.000 0.050 N NA
 6945146 6945147 Cphamn1_1022 Cphamn1_1023     FALSE 0.135 355.000 0.000 0.050 N NA
 6945147 6945148 Cphamn1_1023 Cphamn1_1024     TRUE 0.693 140.000 0.188 NA N NA
 6945148 6945149 Cphamn1_1024 Cphamn1_R0028     FALSE 0.426 54.000 0.000 NA   NA
 6945149 6945150 Cphamn1_R0028 Cphamn1_R0029     FALSE 0.122 179.000 0.000 NA   NA
 6945150 6945151 Cphamn1_R0029 Cphamn1_1025     FALSE 0.271 79.000 0.000 NA   NA
 6945151 6945152 Cphamn1_1025 Cphamn1_1026     FALSE 0.378 98.000 0.014 1.000 N NA
 6945152 6945153 Cphamn1_1026 Cphamn1_1027     FALSE 0.294 144.000 0.013 1.000 N NA
 6945153 6945154 Cphamn1_1027 Cphamn1_1028     TRUE 0.951 35.000 0.208 NA   NA
 6945154 6945155 Cphamn1_1028 Cphamn1_1029     FALSE 0.308 117.000 0.012 NA   NA
 6945155 6945156 Cphamn1_1029 Cphamn1_1030     TRUE 0.762 17.000 0.007 1.000   NA
 6945156 6945157 Cphamn1_1030 Cphamn1_1031     FALSE 0.217 627.000 0.071 1.000   NA
 6945158 6945159 Cphamn1_1032 Cphamn1_1033     TRUE 0.513 47.000 0.000 NA   NA
 6945159 6945160 Cphamn1_1033 Cphamn1_1034     TRUE 0.999 2.000 0.724 0.002 Y NA
 6945161 6945162 Cphamn1_1035 Cphamn1_1036     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945164 6945165 Cphamn1_1038 Cphamn1_1039     FALSE 0.261 82.000 0.000 NA   NA
 6945167 6945168 Cphamn1_1041 Cphamn1_1042     FALSE 0.098 210.000 0.000 NA   NA
 6945168 6945169 Cphamn1_1042 Cphamn1_1043     FALSE 0.072 282.000 0.000 NA   NA
 6945169 6945170 Cphamn1_1043 Cphamn1_1044     FALSE 0.075 264.000 0.004 NA   NA
 6945171 6945172 Cphamn1_1045 Cphamn1_1046     FALSE 0.135 461.000 0.021 1.000 N NA
 6945172 6945173 Cphamn1_1046 Cphamn1_1047     TRUE 0.998 0.000 0.465 0.003 Y NA
 6945173 6945174 Cphamn1_1047 Cphamn1_1048     TRUE 0.824 166.000 0.051 0.003 Y NA
 6945176 6945177 Cphamn1_R0030 Cphamn1_R0031     FALSE 0.056 388.000 0.000 NA   NA
 6945177 6945178 Cphamn1_R0031 Cphamn1_R0032     FALSE 0.093 218.000 0.000 NA   NA
 6945178 6945179 Cphamn1_R0032 Cphamn1_1050     FALSE 0.049 488.000 0.000 NA   NA
 6945180 6945181 Cphamn1_1051 Cphamn1_1052     TRUE 0.984 -40.000 0.300 NA   NA
 6945183 6945184 Cphamn1_1054 Cphamn1_1055     TRUE 0.985 -3.000 0.300 NA   NA
 6945185 6945186 Cphamn1_1056 Cphamn1_1057     TRUE 0.571 41.000 0.000 NA   NA
 6945186 6945187 Cphamn1_1057 Cphamn1_1058     FALSE 0.063 325.000 0.000 NA   NA
 6945187 6945188 Cphamn1_1058 Cphamn1_1059     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945188 6945189 Cphamn1_1059 Cphamn1_1060     TRUE 0.537 45.000 0.000 NA   NA
 6945192 6945193 Cphamn1_1063 Cphamn1_1064     FALSE 0.066 304.000 0.000 NA   NA
 6945194 6945195 Cphamn1_1065 Cphamn1_1066     FALSE 0.113 192.000 0.000 NA   NA
 6945195 6945196 Cphamn1_1066 Cphamn1_1067     FALSE 0.159 151.000 0.000 NA N NA
 6945196 6945197 Cphamn1_1067 Cphamn1_1068     TRUE 0.990 24.000 0.833 1.000 N NA
 6945197 6945198 Cphamn1_1068 Cphamn1_1069     TRUE 0.997 -16.000 0.833 0.020 N NA
 6945198 6945199 Cphamn1_1069 Cphamn1_1070     FALSE 0.252 85.000 0.000 NA   NA
 6945199 6945200 Cphamn1_1070 Cphamn1_1071     TRUE 0.566 42.000 0.000 NA   NA
 6945202 6945203 Cphamn1_1073 Cphamn1_1074     FALSE 0.467 50.000 0.000 NA   NA
 6945207 6945208 Cphamn1_1078 Cphamn1_1079     FALSE 0.073 279.000 0.000 NA   NA
 6945209 6945210 Cphamn1_1080 Cphamn1_1081     TRUE 0.733 81.000 0.111 1.000   NA
 6945211 6945212 Cphamn1_1082 Cphamn1_1083     FALSE 0.069 295.000 0.000 NA   NA
 6945212 6945213 Cphamn1_1083 Cphamn1_1084     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6945214 6945215 Cphamn1_1085 Cphamn1_1086     TRUE 0.640 91.000 0.083 NA   NA
 6945215 6945216 Cphamn1_1086 Cphamn1_1087     TRUE 0.781 209.000 0.667 NA   NA
 6945216 6945217 Cphamn1_1087 Cphamn1_1088     TRUE 0.915 18.000 0.051 NA   NA
 6945217 6945218 Cphamn1_1088 Cphamn1_1089     TRUE 0.946 -3.000 0.051 NA   NA
 6945220 6945221 Cphamn1_1091 Cphamn1_1092     FALSE 0.136 168.000 0.000 NA   NA
 6945221 6945222 Cphamn1_1092 Cphamn1_1093     FALSE 0.210 147.000 0.010 NA   NA
 6945222 6945223 Cphamn1_1093 Cphamn1_1094     TRUE 0.843 21.000 0.015 1.000 N NA
 6945223 6945224 Cphamn1_1094 Cphamn1_1095     FALSE 0.172 283.000 0.019 1.000   NA
 6945225 6945226 Cphamn1_1096 Cphamn1_1097     TRUE 0.921 0.000 0.023 1.000 N NA
 6945226 6945227 Cphamn1_1097 Cphamn1_1098     TRUE 0.897 40.000 0.085 1.000   NA
 6945228 6945229 Cphamn1_1099 Cphamn1_1100     FALSE 0.145 160.000 0.000 NA   NA
 6945229 6945230 Cphamn1_1100 Cphamn1_1101   hppA FALSE 0.206 113.000 0.000 NA   NA
 6945230 6945231 Cphamn1_1101 Cphamn1_1102 hppA   FALSE 0.086 233.000 0.000 NA   NA
 6945234 6945235 Cphamn1_1105 Cphamn1_1106     TRUE 0.860 27.000 0.023 NA   NA
 6945235 6945236 Cphamn1_1106 Cphamn1_1107     FALSE 0.403 295.000 0.163 NA   NA
 6945236 6945237 Cphamn1_1107 Cphamn1_1108     TRUE 0.868 9.000 0.014 1.000 N NA
 6945237 6945238 Cphamn1_1108 Cphamn1_1109   coaD TRUE 0.806 141.000 0.367 1.000 N NA
 6945238 6945239 Cphamn1_1109 Cphamn1_1110 coaD   TRUE 0.825 23.000 0.013 1.000 N NA
 6945239 6945240 Cphamn1_1110 Cphamn1_1111     TRUE 0.666 101.000 0.109 1.000   NA
 6945240 6945241 Cphamn1_1111 Cphamn1_1112     FALSE 0.436 94.000 0.020 NA   NA
 6945241 6945242 Cphamn1_1112 Cphamn1_1113   metG TRUE 0.843 31.000 0.023 NA   NA
 6945242 6945243 Cphamn1_1113 Cphamn1_R0033 metG   TRUE 0.513 47.000 0.000 NA   NA
 6945243 6945244 Cphamn1_R0033 Cphamn1_1114     FALSE 0.174 141.000 0.000 NA   NA
 6945245 6945246 Cphamn1_1115 Cphamn1_1116     TRUE 0.649 96.000 0.100 NA N NA
 6945246 6945247 Cphamn1_1116 Cphamn1_1117     FALSE 0.351 193.000 0.051 NA N NA
 6945247 6945248 Cphamn1_1117 Cphamn1_1118     FALSE 0.428 112.000 0.023 NA N NA
 6945248 6945249 Cphamn1_1118 Cphamn1_1119     TRUE 0.915 0.000 0.023 NA N NA
 6945249 6945250 Cphamn1_1119 Cphamn1_1120     TRUE 0.929 -18.000 0.029 NA N NA
 6945250 6945251 Cphamn1_1120 Cphamn1_1121     TRUE 0.934 27.000 0.098 NA N NA
 6945251 6945252 Cphamn1_1121 Cphamn1_1122     TRUE 0.896 40.000 0.008 NA Y NA
 6945253 6945254 Cphamn1_1123 Cphamn1_1124 truA   FALSE 0.253 179.000 0.016 1.000 N NA
 6945254 6945255 Cphamn1_1124 Cphamn1_1125     FALSE 0.306 224.000 0.047 1.000 N NA
 6945255 6945256 Cphamn1_1125 Cphamn1_1126     TRUE 0.607 154.000 0.128 1.000 N NA
 6945256 6945257 Cphamn1_1126 Cphamn1_1127     TRUE 0.768 59.000 0.070 NA   NA
 6945257 6945258 Cphamn1_1127 Cphamn1_1128     TRUE 0.898 23.000 0.042 NA   NA
 6945258 6945259 Cphamn1_1128 Cphamn1_1129     TRUE 0.583 40.000 0.000 NA   NA
 6945260 6945261 Cphamn1_1130 Cphamn1_1131     TRUE 0.994 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 6945261 6945262 Cphamn1_1131 Cphamn1_1132     TRUE 0.957 -10.000 0.075 NA   NA
 6945262 6945263 Cphamn1_1132 Cphamn1_1133     TRUE 0.976 -3.000 0.175 NA   NA
 6945263 6945264 Cphamn1_1133 Cphamn1_1134     TRUE 0.995 0.000 0.388 NA Y NA
 6945264 6945265 Cphamn1_1134 Cphamn1_1135     TRUE 0.818 35.000 0.021 NA N NA
 6945265 6945266 Cphamn1_1135 Cphamn1_1136     FALSE 0.086 234.000 0.000 NA   NA
 6945266 6945267 Cphamn1_1136 Cphamn1_1137     TRUE 0.623 89.000 0.069 NA   NA
 6945267 6945268 Cphamn1_1137 Cphamn1_1138     TRUE 0.972 23.000 0.276 1.000 N NA
 6945269 6945270 Cphamn1_1139 Cphamn1_1140     FALSE 0.245 501.000 0.086 1.000 N NA
 6945272 6945273 Cphamn1_1142 Cphamn1_1143     TRUE 0.583 40.000 0.000 NA   NA
 6945274 6945275 Cphamn1_1144 Cphamn1_1145     TRUE 0.718 26.000 0.000 1.000 N NA
 6945276 6945277 Cphamn1_1146 Cphamn1_1147     TRUE 0.984 24.000 0.565 NA   NA
 6945277 6945278 Cphamn1_1147 Cphamn1_1148     TRUE 0.965 26.000 0.227 NA   NA
 6945278 6945279 Cphamn1_1148 Cphamn1_1149     TRUE 0.899 2.000 0.000 0.066 N NA
 6945279 6945280 Cphamn1_1149 Cphamn1_1150     FALSE 0.099 209.000 0.000 NA   NA
 6945280 6945281 Cphamn1_1150 Cphamn1_1151     FALSE 0.259 83.000 0.000 NA   NA
 6945281 6945282 Cphamn1_1151 Cphamn1_1152     FALSE 0.065 312.000 0.000 NA   NA
 6945283 6945284 Cphamn1_1153 Cphamn1_1154     TRUE 0.985 -13.000 0.304 NA   NA
 6945287 6945288 Cphamn1_1157 Cphamn1_1158     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945288 6945289 Cphamn1_1158 Cphamn1_1159     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA   NA
 6945289 6945290 Cphamn1_1159 Cphamn1_1160     FALSE 0.048 532.000 0.000 NA   NA
 6945290 6945291 Cphamn1_1160 Cphamn1_1161     TRUE 0.990 -7.000 0.500 NA   NA
 6945291 6945292 Cphamn1_1161 Cphamn1_1162     FALSE 0.176 140.000 0.000 NA   NA
 6945292 6945293 Cphamn1_1162 Cphamn1_1163     TRUE 0.707 19.000 0.000 NA   NA
 6945293 6945294 Cphamn1_1163 Cphamn1_1164     TRUE 0.707 19.000 0.000 NA   NA
 6945295 6945296 Cphamn1_1165 Cphamn1_1166     FALSE 0.067 300.000 0.000 NA   NA
 6945296 6945297 Cphamn1_1166 Cphamn1_1167     TRUE 0.946 13.000 0.089 1.000   NA
 6945297 6945298 Cphamn1_1167 Cphamn1_1168     FALSE 0.046 644.000 0.000 NA   NA
 6945299 6945300 Cphamn1_1169 Cphamn1_1170     TRUE 0.984 0.000 0.052 1.000 Y NA
 6945300 6945301 Cphamn1_1170 Cphamn1_1171     TRUE 0.766 49.000 0.029 1.000 N NA
 6945302 6945303 Cphamn1_1172 Cphamn1_1173     TRUE 0.973 33.000 0.366 1.000 N NA
 6945303 6945304 Cphamn1_1173 Cphamn1_1174     TRUE 0.937 24.000 0.007 1.000 Y NA
 6945304 6945305 Cphamn1_1174 Cphamn1_1175     TRUE 0.890 17.000 0.024 1.000   NA
 6945305 6945306 Cphamn1_1175 Cphamn1_1176     TRUE 0.925 -3.000 0.022 1.000   NA
 6945306 6945307 Cphamn1_1176 Cphamn1_1177   ksgA FALSE 0.125 185.000 0.003 1.000 N NA
 6945308 6945309 Cphamn1_1178 Cphamn1_1179     FALSE 0.341 88.000 0.011 NA   NA
 6945309 6945310 Cphamn1_1179 Cphamn1_1180   recR TRUE 0.988 9.000 0.604 NA   NA
 6945310 6945311 Cphamn1_1180 Cphamn1_1181 recR   FALSE 0.452 71.000 0.011 1.000   NA
 6945311 6945312 Cphamn1_1181 Cphamn1_R0034     FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 6945312 6945313 Cphamn1_R0034 Cphamn1_R0035     TRUE 0.685 27.000 0.000 NA   NA
 6945313 6945314 Cphamn1_R0035 Cphamn1_1182     FALSE 0.101 207.000 0.000 NA   NA
 6945314 6945315 Cphamn1_1182 Cphamn1_1183     FALSE 0.111 195.000 0.000 NA   NA
 6945316 6945317 Cphamn1_1184 Cphamn1_1185     FALSE 0.458 166.000 0.063 1.000 N NA
 6945317 6945318 Cphamn1_1185 Cphamn1_1186     FALSE 0.234 100.000 0.000 1.000 N NA
 6945319 6945320 Cphamn1_1187 Cphamn1_1188     FALSE 0.103 223.000 0.000 1.000 N NA
 6945320 6945321 Cphamn1_1188 Cphamn1_1189     TRUE 0.657 91.000 0.000 1.000 Y NA
 6945321 6945322 Cphamn1_1189 Cphamn1_1190     FALSE 0.151 176.000 0.009 NA   NA
 6945322 6945323 Cphamn1_1190 Cphamn1_1191     FALSE 0.055 409.000 0.000 NA   NA
 6945323 6945324 Cphamn1_1191 Cphamn1_1192     TRUE 0.978 -3.000 0.178 1.000 N NA
 6945326 6945327 Cphamn1_1194 Cphamn1_1195     FALSE 0.149 170.000 0.000 1.000   NA
 6945327 6945328 Cphamn1_1195 Cphamn1_1196     TRUE 0.641 54.000 0.015 1.000   NA
 6945330 6945331 Cphamn1_1198 Cphamn1_1199     TRUE 0.936 45.000 0.222 1.000 N NA
 6945331 6945332 Cphamn1_1199 Cphamn1_1200     TRUE 0.932 72.000 0.050 0.001 Y NA
 6945332 6945333 Cphamn1_1200 Cphamn1_1201     TRUE 0.956 144.000 0.350 0.001 Y NA
 6945335 6945336 Cphamn1_1203 Cphamn1_1204     TRUE 0.982 -40.000 0.240 1.000 N NA
 6945336 6945337 Cphamn1_1204 Cphamn1_1205     FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 6945337 6945338 Cphamn1_1205 Cphamn1_1206     FALSE 0.236 91.000 0.000 NA   NA
 6945338 6945339 Cphamn1_1206 Cphamn1_1207     TRUE 0.691 100.000 0.012 1.000 Y NA
 6945341 6945342 Cphamn1_1209 Cphamn1_1210     TRUE 0.583 40.000 0.000 NA   NA
 6945346 6945347 Cphamn1_1214 Cphamn1_1215     FALSE 0.159 152.000 0.000 NA   NA
 6945347 6945348 Cphamn1_1215 Cphamn1_1216     FALSE 0.065 307.000 0.000 NA   NA
 6945348 6945349 Cphamn1_1216 Cphamn1_1217     FALSE 0.157 153.000 0.000 NA   NA
 6945349 6945350 Cphamn1_1217 Cphamn1_1218     TRUE 0.718 144.000 0.222 1.000 N NA
 6945351 6945352 Cphamn1_1219 Cphamn1_1220     FALSE 0.275 78.000 0.000 NA   NA
 6945354 6945355 Cphamn1_1222 Cphamn1_1223     TRUE 0.962 -3.000 0.029 0.048   NA
 6945355 6945356 Cphamn1_1223 Cphamn1_1224     FALSE 0.438 57.000 0.000 1.000   NA
 6945357 6945358 Cphamn1_1225 Cphamn1_1226     TRUE 0.996 -12.000 0.818 0.048   NA
 6945358 6945359 Cphamn1_1226 Cphamn1_1227     TRUE 0.928 68.000 0.545 NA   NA
 6945359 6945360 Cphamn1_1227 Cphamn1_1228     TRUE 0.779 173.000 0.500 NA   NA
 6945360 6945361 Cphamn1_1228 Cphamn1_1229     TRUE 0.870 176.000 0.900 NA   NA
 6945361 6945362 Cphamn1_1229 Cphamn1_1230     TRUE 0.589 125.000 0.000 NA Y NA
 6945362 6945363 Cphamn1_1230 Cphamn1_1231     TRUE 0.683 154.000 0.026 NA Y NA
 6945363 6945364 Cphamn1_1231 Cphamn1_1232     TRUE 0.965 24.000 0.000 0.003 Y NA
 6945364 6945365 Cphamn1_1232 Cphamn1_1233     TRUE 0.998 -7.000 0.485 0.003 Y NA
 6945365 6945366 Cphamn1_1233 Cphamn1_1234     TRUE 0.781 134.000 0.012 0.003 Y NA
 6945366 6945367 Cphamn1_1234 Cphamn1_1235     TRUE 0.997 25.000 0.489 0.003 Y NA
 6945367 6945368 Cphamn1_1235 Cphamn1_1236     TRUE 0.992 6.000 0.081 0.003 Y NA
 6945368 6945369 Cphamn1_1236 Cphamn1_1237     TRUE 0.991 33.000 0.435 NA Y NA
 6945369 6945370 Cphamn1_1237 Cphamn1_1238     TRUE 0.892 250.000 0.667 NA Y NA
 6945370 6945371 Cphamn1_1238 Cphamn1_1239     TRUE 0.524 151.000 0.083 NA   NA
 6945371 6945372 Cphamn1_1239 Cphamn1_1240     TRUE 0.979 -13.000 0.208 NA   NA
 6945372 6945373 Cphamn1_1240 Cphamn1_1241     TRUE 0.977 -3.000 0.182 NA   NA
 6945373 6945374 Cphamn1_1241 Cphamn1_1242     TRUE 0.687 116.000 0.143 NA   NA
 6945374 6945375 Cphamn1_1242 Cphamn1_1243     FALSE 0.080 253.000 0.000 NA   NA
 6945375 6945376 Cphamn1_1243 Cphamn1_1244     TRUE 0.924 49.000 0.250 NA   NA
 6945376 6945377 Cphamn1_1244 Cphamn1_1245     FALSE 0.052 438.000 0.000 NA   NA
 6945377 6945378 Cphamn1_1245 Cphamn1_1246     TRUE 0.741 10.000 0.000 NA   NA
 6945378 6945379 Cphamn1_1246 Cphamn1_1247     TRUE 0.992 -40.000 0.412 0.065   NA
 6945379 6945380 Cphamn1_1247 Cphamn1_1248     FALSE 0.042 1307.000 0.000 NA   NA
 11402076 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11544439 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11686831 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2206.000 0.000 NA   NA
 11402077 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11544440 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11686832 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2241.000 0.000 NA   NA
 11402078 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2281.000 0.000 NA   NA
 11544441 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2281.000 0.000 NA   NA
 11686833 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2281.000 0.000 NA   NA
 11402079 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2316.000 0.000 NA   NA
 11544442 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2316.000 0.000 NA   NA
 11686834 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2316.000 0.000 NA   NA
 11402080 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2356.000 0.000 NA   NA
 11544443 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2356.000 0.000 NA   NA
 11686835 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2356.000 0.000 NA   NA
 11402081 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2391.000 0.000 NA   NA
 11544444 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2391.000 0.000 NA   NA
 11686836 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2391.000 0.000 NA   NA
 11402082 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11544445 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11686837 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11402083 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11544446 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11686838 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2464.000 0.000 NA   NA
 11402084 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11544447 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11686839 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2502.000 0.000 NA   NA
 11402085 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11544448 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11686840 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11402086 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2579.000 0.000 NA   NA
 11544449 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2579.000 0.000 NA   NA
 11686841 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2579.000 0.000 NA   NA
 11402087 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11544450 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11686842 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11402088 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11544451 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11686843 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2654.000 0.000 NA   NA
 11402089 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2689.000 0.000 NA   NA
 11544452 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2689.000 0.000 NA   NA
 11686844 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2689.000 0.000 NA   NA
 11402090 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2730.000 0.000 NA   NA
 11544453 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2730.000 0.000 NA   NA
 11686845 6945377   Cphamn1_1245     FALSE NA 2730.000 0.000 NA   NA
 6945380 6945381 Cphamn1_1248 Cphamn1_1249     TRUE 0.537 45.000 0.000 NA   NA
 6945381 6945382 Cphamn1_1249 Cphamn1_1250     FALSE 0.088 229.000 0.000 NA   NA
 6945383 6945384 Cphamn1_1251 Cphamn1_1252     TRUE 0.566 42.000 0.000 NA   NA
 6945385 6945386 Cphamn1_1253 Cphamn1_1254     TRUE 0.987 3.000 0.453 NA   NA
 6945386 6945387 Cphamn1_1254 Cphamn1_1255     TRUE 0.995 11.000 0.547 NA Y NA
 6945387 6945388 Cphamn1_1255 Cphamn1_1256     TRUE 0.996 9.000 0.597 NA Y NA
 6945388 6945389 Cphamn1_1256 Cphamn1_1257     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   NA
 11402091 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2276.000 0.000 NA   NA
 11544454 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2276.000 0.000 NA   NA
 11686846 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2276.000 0.000 NA   NA
 11402092 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11544455 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11686847 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2313.000 0.000 NA   NA
 11402093 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2352.000 0.000 NA   NA
 11544456 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2352.000 0.000 NA   NA
 11686848 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2352.000 0.000 NA   NA
 11402094 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11544457 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11686849 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2389.000 0.000 NA   NA
 11402095 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11544458 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11686850 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2429.000 0.000 NA   NA
 11402096 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11544459 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11686851 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2466.000 0.000 NA   NA
 11402097 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2505.000 0.000 NA   NA
 11544460 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2505.000 0.000 NA   NA
 11686852 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2505.000 0.000 NA   NA
 11402098 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11544461 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11686853 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2542.000 0.000 NA   NA
 11402099 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2581.000 0.000 NA   NA
 11544462 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2581.000 0.000 NA   NA
 11686854 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2581.000 0.000 NA   NA
 11402100 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2618.000 0.000 NA   NA
 11544463 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2618.000 0.000 NA   NA
 11686855 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2618.000 0.000 NA   NA
 11402101 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2657.000 0.000 NA   NA
 11544464 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2657.000 0.000 NA   NA
 11686856 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2657.000 0.000 NA   NA
 11402102 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11544465 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11686857 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2694.000 0.000 NA   NA
 11402103 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2733.000 0.000 NA   NA
 11544466 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2733.000 0.000 NA   NA
 11686858 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2733.000 0.000 NA   NA
 11402104 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2770.000 0.000 NA   NA
 11544467 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2770.000 0.000 NA   NA
 11686859 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2770.000 0.000 NA   NA
 11402105 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2810.000 0.000 NA   NA
 11544468 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2810.000 0.000 NA   NA
 11686860 6945387   Cphamn1_1255     FALSE NA 2810.000 0.000 NA   NA
 6945391 6945392 Cphamn1_1259 Cphamn1_1260     TRUE 0.972 -19.000 0.154 NA   NA
 6945393 6945394 Cphamn1_1261 Cphamn1_1262     TRUE 0.955 -3.000 0.069 NA   NA
 6945395 6945396 Cphamn1_1263 Cphamn1_1264     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 6945396 6945397 Cphamn1_1264 Cphamn1_1265     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6945397 6945398 Cphamn1_1265 Cphamn1_1266     TRUE 0.814 86.000 0.250 NA   NA
 6945398 6945399 Cphamn1_1266 Cphamn1_1267     FALSE 0.082 282.000 0.000 1.000   NA
 6945399 6945400 Cphamn1_1267 Cphamn1_1268     TRUE 0.804 -9.000 0.000 NA   NA
 6945402 6945403 Cphamn1_1270 Cphamn1_1271     FALSE 0.083 243.000 0.000 NA   NA
 6945404 6945405 Cphamn1_1272 Cphamn1_1273     TRUE 0.864 7.000 0.014 NA N NA
 6945405 6945406 Cphamn1_1273 Cphamn1_1274   secA TRUE 0.558 72.000 0.020 1.000 N NA
 6945407 6945408 Cphamn1_1275 Cphamn1_1276     FALSE 0.252 85.000 0.000 NA   NA
 6945408 6945409 Cphamn1_1276 Cphamn1_1277     TRUE 0.717 17.000 0.000 NA   NA
 6945409 6945410 Cphamn1_1277 Cphamn1_1278     TRUE 0.981 -18.000 0.250 NA   NA
 6945413 6945414 Cphamn1_1281 Cphamn1_1282     TRUE 0.980 -12.000 0.000 0.004 Y NA
 6945414 6945415 Cphamn1_1282 Cphamn1_1283     TRUE 0.982 -3.000 0.006 0.001 Y NA
 6945415 6945416 Cphamn1_1283 Cphamn1_1284     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945419 6945420 Cphamn1_1287 Cphamn1_1288     TRUE 0.957 66.000 0.833 NA   NA
 6945420 6945421 Cphamn1_1288 Cphamn1_1289     TRUE 0.949 79.000 1.000 NA   NA
 6945423 6945424 Cphamn1_1291 Cphamn1_1292   rpsP TRUE 0.968 37.000 0.361 1.000 N NA
 6945424 6945425 Cphamn1_1292 Cphamn1_1293 rpsP   TRUE 0.996 9.000 0.342 0.018 Y NA
 6945425 6945426 Cphamn1_1293 Cphamn1_1294   trmD TRUE 0.959 133.000 0.672 1.000 Y NA
 6945426 6945427 Cphamn1_1294 Cphamn1_1295 trmD rplS TRUE 0.995 25.000 0.567 1.000 Y NA
 6945427 6945428 Cphamn1_1295 Cphamn1_1296 rplS   FALSE 0.066 352.000 0.004 1.000 N NA
 6945428 6945429 Cphamn1_1296 Cphamn1_1297     FALSE 0.206 113.000 0.000 NA   NA
 6945429 6945430 Cphamn1_1297 Cphamn1_1298     TRUE 0.527 46.000 0.000 NA   NA
 6945431 6945432 Cphamn1_1299 Cphamn1_R0036     FALSE 0.077 268.000 0.000 NA   NA
 6945432 6945433 Cphamn1_R0036 Cphamn1_1300     FALSE 0.321 70.000 0.000 NA   NA
 6945433 6945434 Cphamn1_1300 Cphamn1_1301     TRUE 0.985 -3.000 0.308 NA   NA
 6945435 6945436 Cphamn1_1302 Cphamn1_1303     TRUE 0.835 135.000 0.435 1.000   NA
 6945436 6945437 Cphamn1_1303 Cphamn1_1304     TRUE 0.975 12.000 0.259 1.000 N NA
 6945437 6945438 Cphamn1_1304 Cphamn1_1305     TRUE 0.989 -7.000 0.431 1.000 N NA
 6945439 6945440 Cphamn1_1306 Cphamn1_1307     TRUE 0.745 101.000 0.200 NA   NA
 6945441 6945442 Cphamn1_1308 Cphamn1_1309     TRUE 0.935 1.000 0.043 NA   NA
 6945442 6945443 Cphamn1_1309 Cphamn1_1310     FALSE 0.171 142.000 0.000 NA   NA
 6945443 6945444 Cphamn1_1310 Cphamn1_1311     FALSE 0.216 130.000 0.000 1.000   NA
 6945444 6945445 Cphamn1_1311 Cphamn1_1312     FALSE 0.057 369.000 0.000 NA   NA
 6945446 6945447 Cphamn1_1313 Cphamn1_1314     TRUE 0.927 -3.000 0.026 NA   NA
 6945447 6945448 Cphamn1_1314 Cphamn1_1315     FALSE 0.064 321.000 0.000 NA   NA
 6945448 6945449 Cphamn1_1315 Cphamn1_1316     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945449 6945450 Cphamn1_1316 Cphamn1_1317   pyrC FALSE 0.058 362.000 0.000 NA   NA
 6945450 6945451 Cphamn1_1317 Cphamn1_1318 pyrC   TRUE 0.805 26.000 0.012 1.000 N NA
 6945451 6945452 Cphamn1_1318 Cphamn1_1319     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945453 6945454 Cphamn1_1320 Cphamn1_1321     TRUE 0.806 26.000 0.012 1.000 N NA
 6945454 6945455 Cphamn1_1321 Cphamn1_1322     TRUE 0.902 8.000 0.022 1.000 N NA
 6945455 6945456 Cphamn1_1322 Cphamn1_1323     FALSE 0.183 137.000 0.000 NA   NA
 6945456 6945457 Cphamn1_1323 Cphamn1_1324     FALSE 0.397 58.000 0.000 NA   NA
 6945460 6945461 Cphamn1_1327 Cphamn1_1328     FALSE 0.104 204.000 0.000 NA   NA
 6945461 6945462 Cphamn1_1328 Cphamn1_1329     TRUE 0.990 -22.000 0.500 NA   NA
 6945462 6945463 Cphamn1_1329 Cphamn1_1330     TRUE 0.990 -10.000 0.500 NA   NA
 6945463 6945464 Cphamn1_1330 Cphamn1_1331     FALSE 0.122 179.000 0.000 NA   NA
 6945464 6945465 Cphamn1_1331 Cphamn1_1332     FALSE 0.050 467.000 0.000 NA   NA
 6945465 6945466 Cphamn1_1332 Cphamn1_1333     TRUE 0.833 13.000 0.012 1.000 N NA
 6945466 6945467 Cphamn1_1333 Cphamn1_1334     TRUE 0.971 21.000 0.255 1.000 N NA
 6945467 6945468 Cphamn1_1334 Cphamn1_1335     TRUE 0.958 22.000 0.016 1.000 Y NA
 6945468 6945469 Cphamn1_1335 Cphamn1_1336   argJ TRUE 0.993 29.000 0.239 0.003 Y NA
 6945469 6945470 Cphamn1_1336 Cphamn1_1337 argJ argC TRUE 0.869 289.000 0.303 0.003 Y NA
 6945471 6945472 Cphamn1_1338 Cphamn1_1339     TRUE 0.907 48.000 0.172 NA N NA
 6945472 6945473 Cphamn1_1339 Cphamn1_1340     TRUE 0.906 38.000 0.085 1.000 N NA
 6945473 6945474 Cphamn1_1340 Cphamn1_1341     TRUE 0.675 318.000 0.082 0.061 Y NA
 6945475 6945476 Cphamn1_1342 Cphamn1_1343     FALSE 0.217 129.000 0.000 1.000   NA
 6945477 6945478 Cphamn1_1344 Cphamn1_1345     TRUE 0.913 7.000 0.025 1.000   NA
 6945480 6945481 Cphamn1_1347 Cphamn1_1348     TRUE 0.947 -3.000 0.053 NA   NA
 6945483 6945484 Cphamn1_1350 Cphamn1_1351     TRUE 0.986 61.000 0.371 0.001 Y NA
 6945484 6945485 Cphamn1_1351 Cphamn1_1352     FALSE 0.081 251.000 0.000 NA   NA
 6945485 6945486 Cphamn1_1352 Cphamn1_1353     TRUE 0.605 38.000 0.000 NA   NA
 6945486 6945487 Cphamn1_1353 Cphamn1_1354     FALSE 0.056 496.000 0.000 1.000   NA
 6945487 6945488 Cphamn1_1354 Cphamn1_1355     TRUE 0.763 11.000 0.000 1.000   NA
 6945488 6945489 Cphamn1_1355 Cphamn1_1356     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 6945490 6945491 Cphamn1_1357 Cphamn1_1358     FALSE 0.060 346.000 0.000 NA   NA
 6945492 6945493 Cphamn1_1359 Cphamn1_1360     FALSE 0.142 164.000 0.000 NA   NA
 6945494 6945495 Cphamn1_1361 Cphamn1_1362     FALSE 0.149 157.000 0.000 NA   NA
 6945496 6945497 Cphamn1_1363 Cphamn1_1364     TRUE 0.996 -7.000 0.444 1.000 Y NA
 6945497 6945498 Cphamn1_1364 Cphamn1_1365     FALSE 0.095 215.000 0.000 NA   NA
 6945498 6945499 Cphamn1_1365 Cphamn1_1366     FALSE 0.070 291.000 0.000 NA   NA
 6945499 6945500 Cphamn1_1366 Cphamn1_1367     TRUE 0.995 -28.000 1.000 NA   NA
 6945500 6945501 Cphamn1_1367 Cphamn1_1368     TRUE 0.907 148.000 1.000 NA   NA
 6945503 6945504 Cphamn1_1370 Cphamn1_1371     TRUE 0.676 27.000 0.004 NA   NA
 6945504 6945505 Cphamn1_1371 Cphamn1_1372     TRUE 0.772 130.000 0.273 NA   NA
 6945506 6945507 Cphamn1_1373 Cphamn1_1374     FALSE 0.179 152.000 0.000 1.000   NA
 6945507 6945508 Cphamn1_1374 Cphamn1_1375     FALSE 0.207 110.000 0.000 NA   NA
 6945513 6945514 Cphamn1_1380 Cphamn1_1381     TRUE 0.974 23.000 0.286 1.000   NA
 6945516 6945517 Cphamn1_1383 Cphamn1_1384     TRUE 0.802 -13.000 0.000 NA   NA
 6945517 6945518 Cphamn1_1384 Cphamn1_1385     TRUE 0.916 -3.000 0.000 0.024   NA
 6945518 6945519 Cphamn1_1385 Cphamn1_1386     TRUE 0.671 29.000 0.000 NA   NA
 6945522 6945523 Cphamn1_1389 Cphamn1_1390     FALSE 0.360 63.000 0.000 NA   NA
 6945523 6945524 Cphamn1_1390 Cphamn1_1391     TRUE 0.938 50.000 0.333 NA   NA
 6945524 6945525 Cphamn1_1391 Cphamn1_1392     FALSE 0.188 145.000 0.000 1.000   NA
 6945527 6945528 Cphamn1_1394 Cphamn1_1395     FALSE 0.214 98.000 0.000 NA   NA
 6945528 6945529 Cphamn1_1395 Cphamn1_1396     FALSE 0.389 59.000 0.000 NA   NA
 6945529 6945530 Cphamn1_1396 Cphamn1_1397     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6945530 6945531 Cphamn1_1397 Cphamn1_1398     FALSE 0.093 220.000 0.000 NA   NA
 6945531 6945532 Cphamn1_1398 Cphamn1_1399     FALSE 0.209 133.000 0.000 1.000 N NA
 6945532 6945533 Cphamn1_1399 Cphamn1_1400     TRUE 0.533 141.000 0.074 NA   NA
 6945533 6945534 Cphamn1_1400 Cphamn1_1401     FALSE 0.185 135.000 0.000 NA   NA
 6945534 6945535 Cphamn1_1401 Cphamn1_1402     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 6945536 6945537 Cphamn1_1403 Cphamn1_1404     FALSE 0.062 329.000 0.000 NA   NA
 6945537 6945538 Cphamn1_1404 Cphamn1_1405     FALSE 0.074 275.000 0.000 NA N NA
 6945538 6945539 Cphamn1_1405 Cphamn1_1406     TRUE 0.724 23.000 0.000 1.000 N NA
 6945539 6945540 Cphamn1_1406 Cphamn1_1407     FALSE 0.090 252.000 0.000 1.000 N NA
 6945540 6945541 Cphamn1_1407 Cphamn1_1408     FALSE 0.048 926.000 0.000 1.000 N NA
 6945541 6945542 Cphamn1_1408 Cphamn1_1409     FALSE 0.356 64.000 0.000 NA   NA
 6945542 6945543 Cphamn1_1409 Cphamn1_1410     FALSE 0.068 296.000 0.000 NA   NA
 6945544 6945545 Cphamn1_1411 Cphamn1_1412     FALSE 0.055 494.000 0.000 1.000 N NA
 6945545 6945546 Cphamn1_1412 Cphamn1_1413     TRUE 0.909 95.000 0.103 0.060 Y NA
 6945546 6945547 Cphamn1_1413 Cphamn1_1414     TRUE 0.507 106.000 0.043 NA   NA
 6945547 6945548 Cphamn1_1414 Cphamn1_1415     TRUE 0.991 15.000 0.821 NA   NA
 6945548 6945549 Cphamn1_1415 Cphamn1_1416     TRUE 0.943 -7.000 0.045 NA   NA
 6945549 6945550 Cphamn1_1416 Cphamn1_1417     TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 6945550 6945551 Cphamn1_1417 Cphamn1_1418     TRUE 0.782 3.000 0.000 NA   NA
 6945551 6945552 Cphamn1_1418 Cphamn1_1419     FALSE 0.051 460.000 0.000 NA   NA
 6945552 6945553 Cphamn1_1419 Cphamn1_1420     TRUE 0.925 -3.000 0.025 NA   NA
 6945553 6945554 Cphamn1_1420 Cphamn1_1421     FALSE 0.314 71.000 0.000 NA   NA
 6945556 6945557 Cphamn1_1423 Cphamn1_1424     FALSE 0.087 231.000 0.000 NA   NA
 6945560 6945561 Cphamn1_1427 Cphamn1_1428     TRUE 0.816 21.000 0.013 NA   NA
 6945561 6945562 Cphamn1_1428 Cphamn1_1429     TRUE 0.905 21.000 0.046 NA   NA
 6945562 6945563 Cphamn1_1429 Cphamn1_1430     TRUE 0.637 65.000 0.011 0.086 N NA
 6945564 6945565 Cphamn1_1431 Cphamn1_1432     FALSE 0.340 66.000 0.000 NA   NA
 6945566 6945567 Cphamn1_1433 Cphamn1_1434     TRUE 0.661 211.000 0.357 NA   NA
 6945568 6945569 Cphamn1_1435 Cphamn1_1436     FALSE 0.152 165.000 0.004 1.000 N NA
 6945569 6945570 Cphamn1_1436 Cphamn1_1437     TRUE 0.785 0.000 0.004 NA   NA
 6945570 6945571 Cphamn1_1437 Cphamn1_1438   hslU FALSE 0.052 388.000 0.003 NA   NA
 6945571 6945572 Cphamn1_1438 Cphamn1_1439 hslU   TRUE 0.974 85.000 0.752 1.000 Y NA
 6945572 6945573 Cphamn1_1439 Cphamn1_1440     TRUE 0.515 82.000 0.022 1.000 N NA
 6945573 6945574 Cphamn1_1440 Cphamn1_1441     TRUE 0.962 -13.000 0.092 NA   NA
 6945575 6945576 Cphamn1_1442 Cphamn1_1443     TRUE 0.832 6.000 0.010 1.000 N NA
 6945576 6945577 Cphamn1_1443 Cphamn1_1444     FALSE 0.314 92.000 0.011 NA   NA
 6945577 6945578 Cphamn1_1444 Cphamn1_1445     TRUE 0.914 34.000 0.086 NA   NA
 6945578 6945579 Cphamn1_1445 Cphamn1_1446     TRUE 0.968 5.000 0.143 1.000   NA
 6945579 6945580 Cphamn1_1446 Cphamn1_1447     TRUE 0.968 13.000 0.184 1.000   NA
 6945582 6945583 Cphamn1_1449 Cphamn1_1450     FALSE 0.349 65.000 0.000 NA   NA
 6945583 6945584 Cphamn1_1450 Cphamn1_1451     TRUE 0.807 75.000 0.182 NA   NA
 6945587 6945588 Cphamn1_1454 Cphamn1_1455     FALSE 0.061 343.000 0.000 NA   NA
 6945588 6945589 Cphamn1_1455 Cphamn1_1456     TRUE 0.796 -1993.000 0.000 NA   NA
 6945589 6945590 Cphamn1_1456 Cphamn1_1457     TRUE 0.791 0.000 0.000 NA   NA
 6945590 6945591 Cphamn1_1457 Cphamn1_1458     FALSE 0.044 749.000 0.000 NA   NA
 6945593 6945594 Cphamn1_1460 Cphamn1_1461     TRUE 0.828 -7.000 0.008 NA   NA
 6945598 6945599 Cphamn1_1465 Cphamn1_1466     FALSE 0.066 306.000 0.000 NA   NA
 6945599 6945600 Cphamn1_1466 Cphamn1_1467     TRUE 0.935 59.000 0.467 NA   NA
 6945600 6945601 Cphamn1_1467 Cphamn1_1468     FALSE 0.449 52.000 0.000 NA   NA
 6945602 6945603 Cphamn1_1469 Cphamn1_1470     TRUE 0.831 47.000 0.057 NA   NA
 6945603 6945604 Cphamn1_1470 Cphamn1_1471     TRUE 0.989 16.000 0.726 NA   NA
 6945604 6945605 Cphamn1_1471 Cphamn1_1472     TRUE 0.910 37.000 0.094 NA   NA
 6945605 6945606 Cphamn1_1472 Cphamn1_1473     FALSE 0.340 66.000 0.000 NA   NA
 6945606 6945607 Cphamn1_1473 Cphamn1_1474     FALSE 0.178 139.000 0.000 NA   NA
 6945607 6945608 Cphamn1_1474 Cphamn1_1475     FALSE 0.096 214.000 0.000 NA   NA
 6945609 6945610 Cphamn1_1476 Cphamn1_1477     FALSE 0.318 278.000 0.086 NA   NA
 6945610 6945611 Cphamn1_1477 Cphamn1_1478     TRUE 0.953 208.000 0.819 0.059 Y NA
 6945611 6945612 Cphamn1_1478 Cphamn1_1479     TRUE 0.993 8.000 0.849 1.000 N NA
 6945613 6945614 Cphamn1_1480 Cphamn1_1481     TRUE 0.924 -3.000 0.024 NA   NA
 6945614 6945615 Cphamn1_1481 Cphamn1_1482     TRUE 0.576 74.000 0.024 1.000   NA
 6945616 6945617 Cphamn1_1483 Cphamn1_1484     TRUE 0.769 150.000 0.333 NA   NA
 6945617 6945618 Cphamn1_1484 Cphamn1_1485     TRUE 0.725 14.000 0.000 NA   NA
 6945618 6945619 Cphamn1_1485 Cphamn1_1486     TRUE 0.717 17.000 0.000 NA   NA
 6945619 6945620 Cphamn1_1486 Cphamn1_1487     TRUE 0.974 5.000 0.200 NA   NA
 6945620 6945621 Cphamn1_1487 Cphamn1_1488     FALSE 0.352 299.000 0.109 1.000   NA
 6945621 6945622 Cphamn1_1488 Cphamn1_1489     TRUE 0.705 72.000 0.066 1.000 N NA
 6945622 6945623 Cphamn1_1489 Cphamn1_1490     FALSE 0.313 93.000 0.010 1.000 N NA
 6945623 6945624 Cphamn1_1490 Cphamn1_1491     TRUE 0.844 -3.000 0.008 1.000   NA
 6945624 6945625 Cphamn1_1491 Cphamn1_1492   cobT TRUE 0.704 133.000 0.167 1.000   NA
 6945625 6945626 Cphamn1_1492 Cphamn1_1493 cobT   FALSE 0.362 706.000 0.025 1.000 Y NA
 6945627 6945628 Cphamn1_1494 Cphamn1_1495     FALSE 0.271 79.000 0.000 NA   NA
 6945628 6945629 Cphamn1_1495 Cphamn1_1496     TRUE 0.596 39.000 0.000 NA   NA
 6945629 6945630 Cphamn1_1496 Cphamn1_1497     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 6945630 6945631 Cphamn1_1497 Cphamn1_1498     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945634 6945635 Cphamn1_1501 Cphamn1_1502     FALSE 0.467 50.000 0.000 NA   NA
 6945636 6945637 Cphamn1_1503 Cphamn1_1504     FALSE 0.120 181.000 0.000 NA   NA
 6945637 6945638 Cphamn1_1504 Cphamn1_1505     FALSE 0.053 632.000 0.000 1.000   NA
 6945639 6945640 Cphamn1_1506 Cphamn1_1507     FALSE 0.233 92.000 0.000 NA   NA
 6945640 6945641 Cphamn1_1507 Cphamn1_1508     FALSE 0.174 141.000 0.000 NA   NA
 6945641 6945642 Cphamn1_1508 Cphamn1_1509     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 6945642 6945643 Cphamn1_1509 Cphamn1_1510     FALSE 0.231 109.000 0.000 1.000   NA
 6945643 6945644 Cphamn1_1510 Cphamn1_1511     TRUE 0.715 27.000 0.000 1.000   NA
 6945644 6945645 Cphamn1_1511 Cphamn1_1512     FALSE 0.301 155.000 0.000 0.085   NA
 6945645 6945646 Cphamn1_1512 Cphamn1_1513     TRUE 0.978 52.000 0.333 1.000 Y NA
 6945646 6945647 Cphamn1_1513 Cphamn1_1514   cobD TRUE 0.848 -3.000 0.009 1.000 N NA
 6945647 6945648 Cphamn1_1514 Cphamn1_1515 cobD   TRUE 0.983 -3.000 0.112 0.008 N NA
 6945648 6945649 Cphamn1_1515 Cphamn1_1516     FALSE 0.283 325.000 0.021 0.008 N NA
 6945649 6945650 Cphamn1_1516 Cphamn1_1517     TRUE 0.929 -3.000 0.024 1.000 N NA
 6945650 6945651 Cphamn1_1517 Cphamn1_1518     TRUE 0.835 -3.000 0.009 NA N NA
 6945651 6945652 Cphamn1_1518 Cphamn1_1519     TRUE 0.959 -3.000 0.000 NA Y NA
 6945652 6945653 Cphamn1_1519 Cphamn1_1520     FALSE 0.048 508.000 0.000 NA   NA
 6945654 6945655 Cphamn1_1521 Cphamn1_1522     FALSE 0.062 330.000 0.000 NA   NA
 6945655 6945656 Cphamn1_1522 Cphamn1_1523     TRUE 0.983 -25.000 0.267 1.000 N NA
 6945656 6945657 Cphamn1_1523 Cphamn1_1524     TRUE 0.542 157.000 0.094 1.000 N NA
 6945657 6945658 Cphamn1_1524 Cphamn1_1525     TRUE 0.787 42.000 0.020 1.000 N NA
 6945658 6945659 Cphamn1_1525 Cphamn1_1526     FALSE 0.270 117.000 0.009 1.000 N NA
 6945659 6945660 Cphamn1_1526 Cphamn1_1527     FALSE 0.104 200.000 0.004 NA   NA
 6945660 6945661 Cphamn1_1527 Cphamn1_1528     TRUE 0.956 7.000 0.104 NA   NA
 6945661 6945662 Cphamn1_1528 Cphamn1_1529     TRUE 0.995 1.000 0.215 0.049 Y NA
 6945662 6945663 Cphamn1_1529 Cphamn1_1530     TRUE 0.996 19.000 0.538 0.049 Y NA
 6945663 6945664 Cphamn1_1530 Cphamn1_1531     TRUE 0.994 -3.000 0.141 0.049 Y NA
 6945664 6945665 Cphamn1_1531 Cphamn1_1532     TRUE 0.997 -3.000 0.364 0.049 Y NA
 6945665 6945666 Cphamn1_1532 Cphamn1_1533     TRUE 0.997 -3.000 0.425 0.049 Y NA
 6945668 6945669 Cphamn1_1535 Cphamn1_1536     TRUE 0.732 90.000 0.150 NA N NA
 6945669 6945670 Cphamn1_1536 Cphamn1_1537     FALSE 0.059 354.000 0.000 NA   NA
 6945671 6945672 Cphamn1_1538 Cphamn1_1539     FALSE 0.114 191.000 0.000 NA   NA
 6945672 6945673 Cphamn1_1539 Cphamn1_1540     FALSE 0.171 142.000 0.000 NA   NA
 6945673 6945674 Cphamn1_1540 Cphamn1_1541     FALSE 0.105 203.000 0.000 NA   NA
 6945674 6945675 Cphamn1_1541 Cphamn1_1542     TRUE 0.513 47.000 0.000 NA   NA
 6945675 6945676 Cphamn1_1542 Cphamn1_1543     FALSE 0.065 309.000 0.000 NA   NA
 6945677 6945678 Cphamn1_1544 Cphamn1_1545     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 6945679 6945680 Cphamn1_1546 Cphamn1_1547     FALSE 0.190 132.000 0.000 NA   NA
 6945680 6945681 Cphamn1_1547 Cphamn1_1548     FALSE 0.263 91.000 0.000 1.000   NA
 6945681 6945682 Cphamn1_1548 Cphamn1_1549     FALSE 0.243 89.000 0.000 NA   NA
 6945687 6945688 Cphamn1_1554 Cphamn1_1555     FALSE 0.045 657.000 0.000 NA   NA
 6945688 6945689 Cphamn1_1555 Cphamn1_1556   thiG TRUE 0.950 28.000 0.014 1.000 Y NA
 6945689 6945690 Cphamn1_1556 Cphamn1_1557 thiG thiH TRUE 0.995 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 6945691 6945692 Cphamn1_1558 Cphamn1_1559     TRUE 0.717 17.000 0.000 NA   NA
 6945692 6945693 Cphamn1_1559 Cphamn1_1560     FALSE 0.139 166.000 0.000 NA   NA
 6945693 6945694 Cphamn1_1560 Cphamn1_1561     TRUE 0.971 -3.000 0.136 NA   NA
 6945698 6945699 Cphamn1_1565 Cphamn1_1566     FALSE 0.188 133.000 0.000 NA   NA
 6945699 6945700 Cphamn1_1566 Cphamn1_1567     TRUE 0.824 -13.000 0.000 1.000   NA
 6945701 6945702 Cphamn1_1568 Cphamn1_1569     TRUE 0.991 13.000 0.238 1.000 Y NA
 6945702 6945703 Cphamn1_1569 Cphamn1_1570     FALSE 0.375 134.000 0.000 0.043   NA
 6945704 6945705 Cphamn1_1571 Cphamn1_1572     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945705 6945706 Cphamn1_1572 Cphamn1_1573     FALSE 0.206 113.000 0.000 NA   NA
 6945706 6945707 Cphamn1_1573 Cphamn1_1574     FALSE 0.200 124.000 0.000 NA   NA
 6945707 6945708 Cphamn1_1574 Cphamn1_1575     TRUE 0.974 12.000 0.266 NA   NA
 6945708 6945709 Cphamn1_1575 Cphamn1_1576     TRUE 0.892 266.000 0.713 NA Y NA
 6945709 6945710 Cphamn1_1576 Cphamn1_1577     TRUE 0.833 -13.000 0.009 NA   NA
 6945710 6945711 Cphamn1_1577 Cphamn1_1578     TRUE 0.875 30.000 0.034 NA   NA
 6945711 6945712 Cphamn1_1578 Cphamn1_1579     FALSE 0.043 817.000 0.000 NA   NA
 6945712 6945713 Cphamn1_1579 Cphamn1_1580     FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 6945713 6945714 Cphamn1_1580 Cphamn1_1581     FALSE 0.114 191.000 0.000 NA   NA
 6945714 6945715 Cphamn1_1581 Cphamn1_1582     FALSE 0.107 201.000 0.000 NA   NA
 6945715 6945716 Cphamn1_1582 Cphamn1_1583     TRUE 0.994 13.000 0.417 NA Y NA
 6945716 6945717 Cphamn1_1583 Cphamn1_1584     TRUE 0.984 -7.000 0.286 NA   NA
 6945717 6945718 Cphamn1_1584 Cphamn1_1585     TRUE 0.906 -3.000 0.018 NA   NA
 6945718 6945719 Cphamn1_1585 Cphamn1_1586     TRUE 0.983 -3.000 0.088 0.001 N NA
 6945720 6945721 Cphamn1_1587 Cphamn1_1588   folE TRUE 0.991 -40.000 0.155 1.000 Y NA
 6945721 6945722 Cphamn1_1588 Cphamn1_1589 folE   FALSE 0.162 176.000 0.010 NA   NA
 6945723 6945724 Cphamn1_1590 Cphamn1_1591     TRUE 0.684 331.000 0.177 1.000 Y NA
 6945724 6945725 Cphamn1_1591 Cphamn1_1592     TRUE 0.996 13.000 0.355 0.048 Y NA
 6945725 6945726 Cphamn1_1592 Cphamn1_1593     TRUE 0.976 53.000 0.125 0.001 Y NA
 6945728 6945729 Cphamn1_1595 Cphamn1_1596     TRUE 0.720 16.000 0.000 NA   NA
 6945729 6945730 Cphamn1_1596 Cphamn1_1597     FALSE 0.170 143.000 0.000 NA   NA
 6945730 6945731 Cphamn1_1597 Cphamn1_1598     TRUE 0.997 20.000 0.456 0.002 Y NA
 6945731 6945732 Cphamn1_1598 Cphamn1_1599     TRUE 0.971 60.000 0.151 0.002 Y NA
 6945732 6945733 Cphamn1_1599 Cphamn1_1600     TRUE 0.942 52.000 0.022 0.008 Y NA
 6945733 6945734 Cphamn1_1600 Cphamn1_1601     TRUE 0.989 8.000 0.051 0.003 Y NA
 6945734 6945735 Cphamn1_1601 Cphamn1_1602     TRUE 0.992 30.000 0.223 0.008 Y NA
 6945735 6945736 Cphamn1_1602 Cphamn1_1603     TRUE 0.993 16.000 0.166 0.008 Y NA
 6945736 6945737 Cphamn1_1603 Cphamn1_1604     TRUE 0.994 -3.000 0.105 0.008 Y NA
 6945737 6945738 Cphamn1_1604 Cphamn1_1605     TRUE 0.994 45.000 0.618 0.008 Y NA
 6945738 6945739 Cphamn1_1605 Cphamn1_1606     TRUE 0.996 24.000 0.465 0.003 Y NA
 6945739 6945740 Cphamn1_1606 Cphamn1_1607     TRUE 0.992 27.000 0.168 0.003 Y NA
 6945740 6945741 Cphamn1_1607 Cphamn1_1608     FALSE 0.101 208.000 0.000 NA   NA
 6945741 6945742 Cphamn1_1608 Cphamn1_1609     TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 6945742 6945743 Cphamn1_1609 Cphamn1_1610     TRUE 0.805 -7.000 0.000 NA   NA
 6945743 6945744 Cphamn1_1610 Cphamn1_1611     TRUE 0.803 -3.000 0.000 NA   NA
 6945745 6945746 Cphamn1_R0037 Cphamn1_R0038     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 6945746 6945747 Cphamn1_R0038 Cphamn1_1612     TRUE 0.685 27.000 0.000 NA   NA
 6945747 6945748 Cphamn1_1612 Cphamn1_1613     FALSE 0.226 296.000 0.038 1.000   NA
 6945748 6945749 Cphamn1_1613 Cphamn1_1614     FALSE 0.118 204.000 0.000 1.000   NA
 6945749 6945750 Cphamn1_1614 Cphamn1_1615     TRUE 0.877 40.000 0.059 1.000 N NA
 6945750 6945751 Cphamn1_1615 Cphamn1_1616     FALSE 0.228 115.000 0.000 1.000 N NA
 6945752 6945753 Cphamn1_1617 Cphamn1_1618     TRUE 0.524 63.000 0.013 1.000 N NA
 6945753 6945754 Cphamn1_1618 Cphamn1_1619     FALSE 0.282 146.000 0.013 1.000 N NA
 6945754 6945755 Cphamn1_1619 Cphamn1_1620   tpx TRUE 0.794 7.000 0.006 1.000 N NA
 6945755 6945756 Cphamn1_1620 Cphamn1_1621 tpx   FALSE 0.070 286.000 0.004 NA   NA
 6945756 6945757 Cphamn1_1621 Cphamn1_1622     FALSE 0.142 164.000 0.000 NA   NA
 6945757 6945758 Cphamn1_1622 Cphamn1_1623     FALSE 0.059 445.000 0.000 1.000 N NA
 6945758 6945759 Cphamn1_1623 Cphamn1_1624     TRUE 0.943 19.000 0.028 0.009 N NA
 6945760 6945761 Cphamn1_1625 Cphamn1_1626     TRUE 0.869 16.000 0.020 NA N NA
 6945762 6945763 Cphamn1_1627 Cphamn1_R0039     FALSE 0.153 155.000 0.000 NA   NA
 6945763 6945764 Cphamn1_R0039 Cphamn1_1628   secG TRUE 0.656 31.000 0.000 NA   NA
 6945766 6945767 Cphamn1_1630 Cphamn1_1631     FALSE 0.257 315.000 0.064 NA   NA
 6945767 6945768 Cphamn1_1631 Cphamn1_1632     TRUE 0.874 8.000 0.017 NA   NA
 6945768 6945769 Cphamn1_1632 Cphamn1_1633     TRUE 0.796 12.000 0.010 NA   NA
 6945769 6945770 Cphamn1_1633 Cphamn1_R0040     FALSE 0.151 156.000 0.000 NA   NA
 6945770 6945771 Cphamn1_R0040 Cphamn1_R0041     TRUE 0.765 6.000 0.000 NA   NA
 6945771 6945772 Cphamn1_R0041 Cphamn1_R0042     TRUE 0.707 19.000 0.000 NA   NA
 6945772 6945773 Cphamn1_R0042 Cphamn1_R0043     TRUE 0.656 31.000 0.000 NA   NA
 6945773 6945774 Cphamn1_R0043 Cphamn1_1634     FALSE 0.052 447.000 0.000 NA   NA
 6945774 6945775 Cphamn1_1634 Cphamn1_1635     FALSE 0.408 202.000 0.075 1.000 N NA
 6945775 6945776 Cphamn1_1635 Cphamn1_1636     TRUE 0.874 115.000 0.318 0.057 N NA
 6945776 6945777 Cphamn1_1636 Cphamn1_1637     TRUE 0.959 13.000 0.136 1.000 N NA
 6945777 6945778 Cphamn1_1637 Cphamn1_1638     TRUE 0.638 122.000 0.095 1.000   NA
 6945779 6945780 Cphamn1_1639 Cphamn1_1640     FALSE 0.101 227.000 0.000 1.000 N NA
 6945780 6945781 Cphamn1_1640 Cphamn1_1641     TRUE 0.960 68.000 0.114 0.001 Y NA
 6945785 6945786 Cphamn1_1644 Cphamn1_1645     FALSE 0.166 146.000 0.000 NA   NA
 6945787 6945788 Cphamn1_1646 Cphamn1_1647     TRUE 0.766 76.000 0.125 1.000   NA
 6945789 6945790 Cphamn1_1648 Cphamn1_1649     TRUE 0.948 -43.000 0.052 1.000 N NA
 6945790 6945791 Cphamn1_1649 Cphamn1_1650     TRUE 0.976 10.000 0.041 1.000 Y NA
 6945791 6945792 Cphamn1_1650 Cphamn1_1651     TRUE 0.929 6.000 0.039 1.000   NA
 6945792 6945793 Cphamn1_1651 Cphamn1_1652     FALSE 0.175 154.000 0.000 1.000   NA
 6945798 6945799 Cphamn1_1657 Cphamn1_1658     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6945800 6945801 Cphamn1_1659 Cphamn1_1660     FALSE 0.102 206.000 0.000 NA   NA
 6945802 6945803 Cphamn1_1661 Cphamn1_1662     TRUE 0.725 14.000 0.000 NA   NA
 6945803 6945804 Cphamn1_1662 Cphamn1_1663     TRUE 0.489 79.000 0.000 0.046 N NA
 6945804 6945805 Cphamn1_1663 Cphamn1_1664     TRUE 0.996 -3.000 0.223 0.046 Y NA
 6945805 6945806 Cphamn1_1664 Cphamn1_1665     TRUE 0.875 39.000 0.053 1.000 N NA
 6945806 6945807 Cphamn1_1665 Cphamn1_1666     TRUE 0.636 123.000 0.107 NA   NA
 6945809 6945810 Cphamn1_1668 Cphamn1_1669     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 6945810 6945811 Cphamn1_1669 Cphamn1_1670     FALSE 0.047 567.000 0.000 NA   NA
 6945811 6945812 Cphamn1_1670 Cphamn1_1671     TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 6945812 6945813 Cphamn1_1671 Cphamn1_1672     TRUE 0.994 -7.000 0.833 NA   NA
 6945813 6945814 Cphamn1_1672 Cphamn1_1673     TRUE 0.995 -6.000 0.844 NA   NA
 6945814 6945815 Cphamn1_1673 Cphamn1_1674     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6945815 6945816 Cphamn1_1674 Cphamn1_1675     TRUE 0.580 40.000 0.000 NA N NA
 6945816 6945817 Cphamn1_1675 Cphamn1_1676     TRUE 0.986 15.000 0.564 NA   NA
 6945817 6945818 Cphamn1_1676 Cphamn1_1677     TRUE 0.979 13.000 0.310 1.000   NA
 6945818 6945819 Cphamn1_1677 Cphamn1_1678     TRUE 0.920 5.000 0.031 NA   NA
 6945819 6945820 Cphamn1_1678 Cphamn1_1679     TRUE 0.813 -3.000 0.006 NA   NA
 6945820 6945821 Cphamn1_1679 Cphamn1_1680     TRUE 0.813 -3.000 0.006 NA   NA
 6945821 6945822 Cphamn1_1680 Cphamn1_1681     TRUE 0.990 15.000 0.779 NA   NA
 6945822 6945823 Cphamn1_1681 Cphamn1_1682     TRUE 0.989 18.000 0.740 NA   NA
 6945823 6945824 Cphamn1_1682 Cphamn1_1683     TRUE 0.759 7.000 0.000 NA   NA
 6945824 6945825 Cphamn1_1683 Cphamn1_1684     FALSE 0.352 119.000 0.015 NA   NA
 6945825 6945826 Cphamn1_1684 Cphamn1_1685     TRUE 0.912 -3.000 0.020 NA   NA
 6945826 6945827 Cphamn1_1685 Cphamn1_1686     TRUE 0.801 -15.000 0.000 NA   NA
 6945827 6945828 Cphamn1_1686 Cphamn1_R0045     FALSE 0.207 111.000 0.000 NA   NA
 6945830 6945831 Cphamn1_1688 Cphamn1_1689     TRUE 0.864 4.000 0.013 NA N NA
 6945832 6945833 Cphamn1_1690 Cphamn1_1691     FALSE 0.228 120.000 0.000 1.000   NA
 6945834 6945835 Cphamn1_1692 Cphamn1_1693     FALSE 0.326 148.000 0.000 0.057 N NA
 6945835 6945836 Cphamn1_1693 Cphamn1_1694     TRUE 0.977 -13.000 0.000 0.022 Y NA
 6945836 6945837 Cphamn1_1694 Cphamn1_1695     FALSE 0.252 268.000 0.041 1.000 N NA
 6945838 6945839 Cphamn1_1696 Cphamn1_1697     FALSE 0.200 124.000 0.000 NA   NA
 6945839 6945840 Cphamn1_1697 Cphamn1_1698     FALSE 0.184 136.000 0.000 NA   NA
 6945840 6945841 Cphamn1_1698 Cphamn1_1699     TRUE 0.830 73.000 0.006 0.014 Y NA
 6945841 6945842 Cphamn1_1699 Cphamn1_1700     TRUE 0.601 63.000 0.006 0.047 N NA
 6945844 6945845 Cphamn1_1702 Cphamn1_1703     TRUE 0.671 29.000 0.000 NA   NA
 6945845 6945846 Cphamn1_1703 Cphamn1_1704     FALSE 0.124 178.000 0.000 NA   NA
 6945848 6945849 Cphamn1_1706 Cphamn1_1707   dnaK TRUE 0.718 77.000 0.009 NA Y NA
 6945849 6945850 Cphamn1_1707 Cphamn1_1708 dnaK   TRUE 0.648 38.000 0.008 NA   NA
 6945851 6945852 Cphamn1_1709 Cphamn1_1710     TRUE 0.882 59.000 0.200 1.000   NA
 6945852 6945853 Cphamn1_1710 Cphamn1_1711     FALSE 0.053 609.000 0.000 1.000 N NA
 6945853 6945854 Cphamn1_1711 Cphamn1_1712     FALSE 0.358 170.000 0.039 NA N NA
 6945854 6945855 Cphamn1_1712 Cphamn1_1713     TRUE 0.957 45.000 0.389 NA N NA
 6945855 6945856 Cphamn1_1713 Cphamn1_1714     TRUE 0.993 -13.000 0.102 0.025 Y NA
 6945856 6945857 Cphamn1_1714 Cphamn1_1715     TRUE 0.843 36.000 0.028 NA   NA
 6945858 6945859 Cphamn1_1716 Cphamn1_1717     TRUE 0.989 25.000 0.089 0.002 Y NA
 6945859 6945860 Cphamn1_1717 Cphamn1_1718   ilvH TRUE 0.990 9.000 0.057 0.001 Y NA
 6945860 6945861 Cphamn1_1718 Cphamn1_1719 ilvH   TRUE 0.965 44.000 0.023 0.002 Y NA
 6945861 6945862 Cphamn1_1719 Cphamn1_1720     TRUE 0.961 11.000 0.013 1.000 Y NA
 6945862 6945863 Cphamn1_1720 Cphamn1_1721     TRUE 0.981 18.000 0.018 0.002 Y NA
 6945863 6945864 Cphamn1_1721 Cphamn1_1722     TRUE 0.984 8.000 0.018 0.002 Y NA
 6945864 6945865 Cphamn1_1722 Cphamn1_1723     TRUE 0.993 45.000 0.444 0.001 Y NA
 6945865 6945866 Cphamn1_1723 Cphamn1_1724     TRUE 0.960 36.000 0.042 1.000 Y NA
 6945866 6945867 Cphamn1_1724 Cphamn1_1725     FALSE 0.227 118.000 0.000 1.000 N NA
 6945867 6945868 Cphamn1_1725 Cphamn1_1726     TRUE 0.627 39.000 0.000 1.000 N NA
 6945869 6945870 Cphamn1_1727 Cphamn1_1728     TRUE 0.928 6.000 0.037 1.000 N NA
 6945870 6945871 Cphamn1_1728 Cphamn1_1729     FALSE 0.047 569.000 0.000 NA   NA
 6945871 6945872 Cphamn1_1729 Cphamn1_1730     FALSE 0.376 61.000 0.000 NA   NA
 6945872 6945873 Cphamn1_1730 Cphamn1_1731     TRUE 0.549 47.000 0.000 1.000   NA
 6945873 6945874 Cphamn1_1731 Cphamn1_1732     TRUE 0.935 5.000 0.044 1.000   NA
 6945874 6945875 Cphamn1_1732 Cphamn1_1733     TRUE 0.943 -3.000 0.040 1.000 N NA
 6945875 6945876 Cphamn1_1733 Cphamn1_1734     TRUE 0.985 40.000 0.917 NA   NA
 6945878 6945879 Cphamn1_1736 Cphamn1_1737     FALSE 0.134 169.000 0.000 NA   NA
 6945881 6945882 Cphamn1_1739 Cphamn1_1740     TRUE 0.826 55.000 0.010 NA Y NA
 6945882 6945883 Cphamn1_1740 Cphamn1_1741     TRUE 0.669 48.000 0.014 NA   NA
 6945883 6945884 Cphamn1_1741 Cphamn1_1742     FALSE 0.047 564.000 0.000 NA   NA
 6945884 6945885 Cphamn1_1742 Cphamn1_1743     FALSE 0.063 324.000 0.000 NA   NA
 6945886 6945887 Cphamn1_1744 Cphamn1_1745     TRUE 0.720 16.000 0.000 NA   NA
 6945887 6945888 Cphamn1_1745 Cphamn1_1746     TRUE 0.943 15.000 0.006 1.000 Y NA
 6945888 6945889 Cphamn1_1746 Cphamn1_1747     FALSE 0.076 298.000 0.000 1.000 N NA
 6945889 6945890 Cphamn1_1747 Cphamn1_1748     TRUE 0.973 -3.000 0.140 1.000 N NA
 6945891 6945892 Cphamn1_1749 Cphamn1_1750     FALSE 0.404 57.000 0.000 NA   NA
 6945893 6945894 Cphamn1_1751 Cphamn1_1752 nifH   TRUE 0.986 19.000 0.580 1.000 N NA
 6945894 6945895 Cphamn1_1752 Cphamn1_1753     TRUE 0.999 0.000 0.860 0.002 Y NA
 6945895 6945896 Cphamn1_1753 Cphamn1_1754     TRUE 0.974 25.000 0.294 1.000 N NA
 6945896 6945897 Cphamn1_1754 Cphamn1_1755     TRUE 0.996 48.000 0.902 0.003 Y NA
 6945897 6945898 Cphamn1_1755 Cphamn1_1756     TRUE 0.948 159.000 0.380 0.003 Y NA
 6945898 6945899 Cphamn1_1756 Cphamn1_1757     TRUE 0.998 -3.000 0.342 0.003 Y NA
 6945899 6945900 Cphamn1_1757 Cphamn1_1758     TRUE 0.978 12.000 0.131 0.003   NA
 6945900 6945901 Cphamn1_1758 Cphamn1_1759     TRUE 0.538 151.000 0.082 1.000   NA
 6945902 6945903 Cphamn1_1760 Cphamn1_1761     FALSE 0.220 125.000 0.000 1.000 N NA
 6945903 6945904 Cphamn1_1761 Cphamn1_1762     TRUE 0.979 -9.000 0.021 1.000 Y NA
 6945904 6945905 Cphamn1_1762 Cphamn1_1763     TRUE 0.839 89.000 0.060 NA Y NA
 6945905 6945906 Cphamn1_1763 Cphamn1_1764     TRUE 0.740 246.000 0.181 NA Y NA
 6945906 6945907 Cphamn1_1764 Cphamn1_1765     TRUE 0.981 -39.000 0.033 1.000 Y NA
 6945907 6945908 Cphamn1_1765 Cphamn1_1766     TRUE 0.719 643.000 0.550 0.002   NA
 6945909 6945910 Cphamn1_1767 Cphamn1_1768 pyrB   FALSE 0.246 115.000 0.009 NA   NA
 6945910 6945911 Cphamn1_1768 Cphamn1_1769     FALSE 0.075 275.000 0.000 NA   NA
 6945911 6945912 Cphamn1_1769 Cphamn1_1770     FALSE 0.093 220.000 0.000 NA   NA
 6945912 6945913 Cphamn1_1770 Cphamn1_1771     TRUE 0.979 48.000 0.916 NA   NA
 6945913 6945914 Cphamn1_1771 Cphamn1_1772     FALSE 0.184 145.000 0.004 1.000   NA
 6945914 6945915 Cphamn1_1772 Cphamn1_1773     FALSE 0.150 167.000 0.004 1.000 N NA
 6945915 6945916 Cphamn1_1773 Cphamn1_1774     TRUE 0.909 19.000 0.042 1.000 N NA
 6945916 6945917 Cphamn1_1774 Cphamn1_1775     TRUE 0.550 156.000 0.095 1.000 N NA
 6945917 6945918 Cphamn1_1775 Cphamn1_1776     TRUE 0.963 25.000 0.218 NA N NA
 6945918 6945919 Cphamn1_1776 Cphamn1_1777     FALSE 0.058 364.000 0.000 NA   NA
 6945919 6945920 Cphamn1_1777 Cphamn1_1778     FALSE 0.070 331.000 0.000 1.000   NA
 6945920 6945921 Cphamn1_1778 Cphamn1_1779     TRUE 0.993 8.000 1.000 NA   NA
 6945921 6945922 Cphamn1_1779 Cphamn1_1780     TRUE 0.677 28.000 0.000 NA   NA
 6945922 6945923 Cphamn1_1780 Cphamn1_1781     FALSE 0.081 250.000 0.000 NA   NA
 6945923 6945924 Cphamn1_1781 Cphamn1_1782     TRUE 0.685 40.000 0.010 1.000 N NA
 6945924 6945925 Cphamn1_1782 Cphamn1_1783     TRUE 0.810 37.000 0.019 1.000 N NA
 6945927 6945928 Cphamn1_1785 Cphamn1_1786     FALSE 0.077 266.000 0.000 NA   NA
 6945928 6945929 Cphamn1_1786 Cphamn1_1787     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.004 Y NA
 6945930 6945931 Cphamn1_1788 Cphamn1_1789   purU TRUE 0.619 68.000 0.025 1.000 N NA
 6945932 6945933 Cphamn1_1790 Cphamn1_1791     TRUE 0.884 8.000 0.000 0.056   NA
 6945933 6945934 Cphamn1_1791 Cphamn1_1792     TRUE 0.981 -7.000 0.226 NA   NA
 6945934 6945935 Cphamn1_1792 Cphamn1_1793     TRUE 0.987 11.000 0.146 NA Y NA
 6945935 6945936 Cphamn1_1793 Cphamn1_1794     TRUE 0.973 -22.000 0.160 NA   NA
 6945940 6945941 Cphamn1_1798 Cphamn1_1799     TRUE 0.811 2.000 0.008 NA   NA
 6945942 6945943 Cphamn1_1800 Cphamn1_1801     FALSE 0.408 90.000 0.014 1.000 N NA
 6945944 6945945 Cphamn1_1802 Cphamn1_1803     TRUE 0.699 26.000 0.003 1.000 N NA
 6945945 6945946 Cphamn1_1803 Cphamn1_1804     TRUE 0.572 111.000 0.014 0.003   NA
 6945946 6945947 Cphamn1_1804 Cphamn1_1805     TRUE 0.930 7.000 0.043 1.000   NA
 6945947 6945948 Cphamn1_1805 Cphamn1_1806     TRUE 0.947 -3.000 0.047 1.000 N NA
 6945948 6945949 Cphamn1_1806 Cphamn1_1807   smpB TRUE 0.798 11.000 0.009 1.000 N NA
 6945949 6945950 Cphamn1_1807 Cphamn1_1808 smpB   TRUE 0.725 62.000 0.014 0.015 N NA
 6945950 6945951 Cphamn1_1808 Cphamn1_1809     FALSE 0.278 82.000 0.003 1.000   NA
 6945951 6945952 Cphamn1_1809 Cphamn1_1810     TRUE 0.883 59.000 0.222 NA   NA
 6945952 6945953 Cphamn1_1810 Cphamn1_1811     TRUE 0.886 23.000 0.030 NA   NA
 6945953 6945954 Cphamn1_1811 Cphamn1_1812     TRUE 0.859 21.000 0.020 NA   NA
 6945955 6945956 Cphamn1_1813 Cphamn1_1814     TRUE 0.643 37.000 0.005 1.000 N NA
 6945957 6945958 Cphamn1_1815 Cphamn1_R0046     FALSE 0.151 156.000 0.000 NA   NA
 6945958 6945959 Cphamn1_R0046 Cphamn1_R0047     TRUE 0.698 22.000 0.000 NA   NA
 6945959 6945960 Cphamn1_R0047 Cphamn1_R0048     TRUE 0.697 23.000 0.000 NA   NA
 6945960 6945961 Cphamn1_R0048 Cphamn1_R0049     FALSE 0.045 692.000 0.000 NA   NA
 6945962 6945963 Cphamn1_1816 Cphamn1_1817     FALSE 0.159 152.000 0.000 NA   NA
 6945963 6945964 Cphamn1_1817 Cphamn1_1818     FALSE 0.056 486.000 0.000 1.000 N NA
 6945964 6945965 Cphamn1_1818 Cphamn1_1819   hisD FALSE 0.344 122.000 0.013 1.000 N NA
 6945968 6945969 Cphamn1_1822 Cphamn1_1823     FALSE 0.383 156.000 0.033 NA N NA
 6945971 6945972 Cphamn1_1825 Cphamn1_1826     FALSE 0.112 227.000 0.009 NA   NA
 6945973 6945974 Cphamn1_1827 Cphamn1_1828     TRUE 0.969 17.000 0.025 1.000 Y NA
 6945974 6945975 Cphamn1_1828 Cphamn1_1829     FALSE 0.156 191.000 0.009 1.000 N NA
 6945979 6945980 Cphamn1_1833 Cphamn1_1834     TRUE 0.480 49.000 0.000 NA   NA
 6945980 6945981 Cphamn1_1834 Cphamn1_1835     TRUE 0.619 108.000 0.084 1.000   NA
 6945981 6945982 Cphamn1_1835 Cphamn1_1836     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA   NA
 6945982 6945983 Cphamn1_1836 Cphamn1_1837     FALSE 0.168 144.000 0.000 NA   NA
 6945983 6945984 Cphamn1_1837 Cphamn1_1838     TRUE 0.998 30.000 0.925 0.001 Y NA
 6945984 6945985 Cphamn1_1838 Cphamn1_1839   sat FALSE 0.406 134.000 0.021 1.000 N NA
 6945985 6945986 Cphamn1_1839 Cphamn1_1840 sat   FALSE 0.065 313.000 0.000 NA   NA
 6945986 6945987 Cphamn1_1840 Cphamn1_1841     TRUE 0.847 75.000 0.261 NA   NA
 6945987 6945988 Cphamn1_1841 Cphamn1_1842     TRUE 0.995 -3.000 0.957 NA   NA
 6945988 6945989 Cphamn1_1842 Cphamn1_1843     FALSE 0.143 176.000 0.000 1.000   NA
 6945989 6945990 Cphamn1_1843 Cphamn1_1844     TRUE 0.666 512.000 0.086 0.002 Y NA
 6945990 6945991 Cphamn1_1844 Cphamn1_1845     FALSE 0.272 247.000 0.050 NA N NA
 6945991 6945992 Cphamn1_1845 Cphamn1_1846     TRUE 0.996 10.000 0.613 NA Y NA
 6945992 6945993 Cphamn1_1846 Cphamn1_1847     TRUE 0.741 10.000 0.000 NA   NA
 6945993 6945994 Cphamn1_1847 Cphamn1_1848     TRUE 0.804 -10.000 0.000 NA   NA
 6945994 6945995 Cphamn1_1848 Cphamn1_1849     TRUE 0.997 4.000 0.766 1.000 Y NA
 6945995 6945996 Cphamn1_1849 Cphamn1_1850     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 6945996 6945997 Cphamn1_1850 Cphamn1_1851     TRUE 0.629 80.000 0.056 NA   NA
 6945997 6945998 Cphamn1_1851 Cphamn1_1852     TRUE 0.982 70.000 0.804 NA Y NA
 6945998 6945999 Cphamn1_1852 Cphamn1_1853     TRUE 0.996 18.000 0.790 NA Y NA
 6945999 6946000 Cphamn1_1853 Cphamn1_1854     TRUE 0.797 47.000 0.039 NA   NA
 6946000 6946001 Cphamn1_1854 Cphamn1_1855     TRUE 0.971 0.000 0.150 NA   NA
 6946001 6946002 Cphamn1_1855 Cphamn1_1856     TRUE 0.973 21.000 0.161 0.046 N NA
 6946002 6946003 Cphamn1_1856 Cphamn1_1857     TRUE 0.991 74.000 0.879 0.001 Y NA
 6946003 6946004 Cphamn1_1857 Cphamn1_1858     TRUE 0.798 56.000 0.083 NA N NA
 6946004 6946005 Cphamn1_1858 Cphamn1_1859     FALSE 0.051 448.000 0.000 NA N NA
 6946005 6946006 Cphamn1_1859 Cphamn1_1860     TRUE 0.501 148.000 0.060 1.000 N NA
 6946006 6946007 Cphamn1_1860 Cphamn1_1861     FALSE 0.146 159.000 0.000 NA   NA
 6946007 6946008 Cphamn1_1861 Cphamn1_1862     FALSE 0.053 419.000 0.000 NA   NA
 6946009 6946010 Cphamn1_1863 Cphamn1_1864     TRUE 0.963 171.000 0.769 0.046 Y NA
 6946010 6946011 Cphamn1_1864 Cphamn1_1865     TRUE 0.866 138.000 0.615 NA N NA
 6946011 6946012 Cphamn1_1865 Cphamn1_1866     TRUE 0.648 272.000 0.471 NA   NA
 6946012 6946013 Cphamn1_1866 Cphamn1_1867     FALSE 0.222 125.000 0.000 1.000   NA
 6946013 6946014 Cphamn1_1867 Cphamn1_1868     FALSE 0.091 338.000 0.010 1.000 N NA
 6946014 6946015 Cphamn1_1868 Cphamn1_1869     TRUE 0.863 -3.000 0.010 1.000 N NA
 6946015 6946016 Cphamn1_1869 Cphamn1_1870     FALSE 0.120 240.000 0.010 1.000   NA
 6946016 6946017 Cphamn1_1870 Cphamn1_1871     TRUE 0.906 8.000 0.026 NA   NA
 6946017 6946018 Cphamn1_1871 Cphamn1_1872     TRUE 0.995 27.000 0.710 NA Y NA
 6946018 6946019 Cphamn1_1872 Cphamn1_1873     TRUE 0.992 27.000 0.414 NA Y NA
 6946019 6946020 Cphamn1_1873 Cphamn1_1874     TRUE 0.976 32.000 0.458 NA N NA
 6946024 6946025 Cphamn1_1878 Cphamn1_1879     TRUE 0.912 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6946025 6946026 Cphamn1_1879 Cphamn1_1880     FALSE 0.135 253.000 0.013 NA N NA
 6946033 6946034 Cphamn1_1886 Cphamn1_1887   ileS FALSE 0.324 442.000 0.135 1.000 N NA
 6946034 6946035 Cphamn1_1887 Cphamn1_1888 ileS   FALSE 0.124 319.000 0.014 NA   NA
 6946035 6946036 Cphamn1_1888 Cphamn1_1889     FALSE 0.044 708.000 0.000 NA   NA
 6946036 6946037 Cphamn1_1889 Cphamn1_1890     FALSE 0.090 227.000 0.000 NA   NA
 6946037 6946038 Cphamn1_1890 Cphamn1_1891     FALSE 0.042 1187.000 0.000 NA   NA
 6946038 6946039 Cphamn1_1891 Cphamn1_1892     TRUE 0.668 377.000 0.179 1.000 Y NA
 6946039 6946040 Cphamn1_1892 Cphamn1_1893     FALSE 0.449 52.000 0.000 NA   NA
 6946040 6946041 Cphamn1_1893 Cphamn1_1894     FALSE 0.083 242.000 0.000 NA   NA
 6946045 6946046 Cphamn1_1898 Cphamn1_1899     FALSE 0.048 1103.000 0.000 1.000 N NA
 6946046 6946047 Cphamn1_1899 Cphamn1_1900     FALSE 0.239 527.000 0.000 1.000 Y NA
 6946049 6946050 Cphamn1_1902 Cphamn1_1903     FALSE 0.128 174.000 0.000 NA   NA
 6946050 6946051 Cphamn1_1903 Cphamn1_1904     FALSE 0.046 618.000 0.000 NA   NA
 6946051 6946052 Cphamn1_1904 Cphamn1_1905     TRUE 0.982 -10.000 0.250 NA   NA
 6946053 6946054 Cphamn1_1906 Cphamn1_1907     TRUE 0.632 35.000 0.000 NA   NA
 6946055 6946056 Cphamn1_1908 Cphamn1_1909     FALSE 0.207 112.000 0.000 NA   NA
 6946056 6946057 Cphamn1_1909 Cphamn1_1910     FALSE 0.054 416.000 0.000 NA   NA
 6946057 6946058 Cphamn1_1910 Cphamn1_1911     FALSE 0.206 115.000 0.000 NA   NA
 6946058 6946059 Cphamn1_1911 Cphamn1_1912     FALSE 0.090 227.000 0.000 NA   NA
 6946059 6946060 Cphamn1_1912 Cphamn1_1913     FALSE 0.076 269.000 0.000 NA   NA
 6946060 6946061 Cphamn1_1913 Cphamn1_1914     TRUE 0.965 55.000 0.222 1.000 Y NA
 6946063 6946064 Cphamn1_1916 Cphamn1_1917     TRUE 0.955 33.000 0.000 0.006 Y NA
 6946064 6946065 Cphamn1_1917 Cphamn1_1918     TRUE 0.988 0.000 0.095 1.000 Y NA
 6946065 6946066 Cphamn1_1918 Cphamn1_1919     TRUE 0.962 58.000 0.222 1.000 Y NA
 6946068 6946069 Cphamn1_1921 Cphamn1_1922     FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 6946069 6946070 Cphamn1_1922 Cphamn1_1923     FALSE 0.228 93.000 0.000 NA N NA
 6946070 6946071 Cphamn1_1923 Cphamn1_1924     FALSE 0.305 166.000 0.021 NA   NA
 6946071 6946072 Cphamn1_1924 Cphamn1_1925     TRUE 0.942 5.000 0.061 NA   NA
 6946072 6946073 Cphamn1_1925 Cphamn1_1926     FALSE 0.043 835.000 0.000 NA   NA
 6946073 6946074 Cphamn1_1926 Cphamn1_1927     FALSE 0.207 111.000 0.000 NA   NA
 6946074 6946075 Cphamn1_1927 Cphamn1_1928     FALSE 0.084 239.000 0.000 NA   NA
 6946075 6946076 Cphamn1_1928 Cphamn1_1929     TRUE 0.698 22.000 0.000 NA   NA
 6946076 6946077 Cphamn1_1929 Cphamn1_1930     TRUE 0.688 31.000 0.000 1.000   NA
 6946077 6946078 Cphamn1_1930 Cphamn1_1931     TRUE 0.989 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 6946078 6946079 Cphamn1_1931 Cphamn1_1932     TRUE 0.933 44.000 0.000 0.008 Y NA
 6946079 6946080 Cphamn1_1932 Cphamn1_1933     FALSE 0.382 60.000 0.000 NA   NA
 6946080 6946081 Cphamn1_1933 Cphamn1_1934     FALSE 0.105 203.000 0.000 NA   NA
 6946081 6946082 Cphamn1_1934 Cphamn1_1935     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 6946082 6946083 Cphamn1_1935 Cphamn1_1936     FALSE 0.076 270.000 0.000 NA   NA
 6946083 6946084 Cphamn1_1936 Cphamn1_1937     TRUE 0.990 0.000 0.538 NA   NA
 6946084 6946085 Cphamn1_1937 Cphamn1_1938     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 6946085 6946086 Cphamn1_1938 Cphamn1_1939     FALSE 0.125 177.000 0.000 NA   NA
 6946086 6946087 Cphamn1_1939 Cphamn1_1940     FALSE 0.051 461.000 0.000 NA   NA
 6946087 6946088 Cphamn1_1940 Cphamn1_1941     FALSE 0.050 462.000 0.000 NA   NA
 6946088 6946089 Cphamn1_1941 Cphamn1_1942     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA   NA
 6946089 6946090 Cphamn1_1942 Cphamn1_1943     FALSE 0.098 210.000 0.000 NA   NA
 6946090 6946091 Cphamn1_1943 Cphamn1_1944     TRUE 0.796 -425.000 0.000 NA   NA
 6946091 6946092 Cphamn1_1944 Cphamn1_1945     FALSE 0.055 404.000 0.000 NA   NA
 6946092 6946093 Cphamn1_1945 Cphamn1_1946