MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli E24377A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3466964 3466965 EcE24377A_0001 EcE24377A_0002 thrA thrB TRUE 0.983 2.000 0.133 1.000 Y NA
 3466965 3466966 EcE24377A_0002 EcE24377A_0003 thrB thrC TRUE 0.989 1.000 0.233 1.000 Y NA
 3466969 3466970 EcE24377A_0006 EcE24377A_0007   agcS FALSE 0.174 70.000 0.028 NA   NA
 3466971 3466972 EcE24377A_0008 EcE24377A_0009 tal2 mog FALSE 0.264 115.000 0.042 1.000 N NA
 3466973 3466974 EcE24377A_0010 EcE24377A_0011     FALSE 0.084 149.000 0.043 NA   NA
 3466974 3466975 EcE24377A_0011 EcE24377A_0012     TRUE 0.934 26.000 0.500 NA   NA
 3466975 3466976 EcE24377A_0012 EcE24377A_0013     FALSE 0.086 135.000 0.000 NA   NA
 3466977 3466978 EcE24377A_0014 EcE24377A_0015 dnaK dnaJ TRUE 0.933 89.000 0.236 0.004 Y NA
 3466978 3466979 EcE24377A_0015 EcE24377A_0016 dnaJ nhaA FALSE 0.002 842.000 0.022 1.000 N NA
 3466979 3466980 EcE24377A_0016 EcE24377A_0017 nhaA nhaR TRUE 0.768 66.000 0.292 1.000 N NA
 3466981 3466982 EcE24377A_0018 EcE24377A_0019     TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3466982 3466983 EcE24377A_0019 EcE24377A_0020     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 3466985 3466986 EcE24377A_0022 EcE24377A_0023   rpsT FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 3466987 3466988 EcE24377A_0024 EcE24377A_0025   ribF TRUE 0.567 8.000 0.019 NA   NA
 3466988 3466989 EcE24377A_0025 EcE24377A_0026 ribF ileS TRUE 0.799 43.000 0.254 1.000 N NA
 3466989 3466990 EcE24377A_0026 EcE24377A_0027 ileS lspA TRUE 0.852 0.000 0.045 1.000 N NA
 3466990 3466991 EcE24377A_0027 EcE24377A_0028 lspA fkpB FALSE 0.512 105.000 0.154 1.000 N NA
 3466991 3466992 EcE24377A_0028 EcE24377A_0029 fkpB ispH TRUE 0.988 2.000 0.626 1.000 N NA
 3466992 3466993 EcE24377A_0029 EcE24377A_0030 ispH rihC FALSE 0.268 66.000 0.028 NA N NA
 3466993 3466994 EcE24377A_0030 EcE24377A_0031 rihC dapB FALSE 0.042 167.000 0.003 NA N NA
 3466996 3466997 EcE24377A_0033 EcE24377A_0034 carA carB TRUE 0.992 18.000 0.345 0.001 Y NA
 3467000 3467001 EcE24377A_0037 EcE24377A_0038 caiE caiD TRUE 0.753 6.000 0.000 1.000   NA
 3467001 3467002 EcE24377A_0038 EcE24377A_0039 caiD   TRUE 0.781 109.000 0.000 0.038 Y NA
 3467002 3467003 EcE24377A_0039 EcE24377A_0040   caiB TRUE 0.727 59.000 0.154 0.038 N NA
 3467003 3467004 EcE24377A_0040 EcE24377A_0041 caiB caiA TRUE 0.766 129.000 0.529 1.000 N NA
 3467004 3467005 EcE24377A_0041 EcE24377A_0042 caiA caiT TRUE 0.721 31.000 0.118 1.000 N NA
 3467006 3467007 EcE24377A_0043 EcE24377A_0044     FALSE 0.035 179.000 0.000 NA   NA
 3467007 3467008 EcE24377A_0044 EcE24377A_0045   etfB FALSE 0.508 69.000 0.154 NA   NA
 3467008 3467009 EcE24377A_0045 EcE24377A_0046 etfB fixB TRUE 0.989 15.000 0.231 0.022 Y NA
 3467009 3467010 EcE24377A_0046 EcE24377A_0047 fixB fixC TRUE 0.864 51.000 0.000 0.064 Y NA
 3467010 3467011 EcE24377A_0047 EcE24377A_0048 fixC fixX TRUE 0.987 -3.000 0.167 0.064 Y NA
 3467011 3467012 EcE24377A_0048 EcE24377A_0049 fixX   FALSE 0.352 58.000 0.000 1.000 N NA
 3467012 3467013 EcE24377A_0049 EcE24377A_0050   kefF FALSE 0.184 108.000 0.000 1.000   NA
 3467013 3467014 EcE24377A_0050 EcE24377A_0051 kefF kefC TRUE 0.971 -7.000 0.560 1.000   NA
 3467014 3467015 EcE24377A_0051 EcE24377A_0052 kefC folA FALSE 0.046 192.000 0.012 1.000 N NA
 3467016 3467017 EcE24377A_0053 EcE24377A_0054 apaH apaG TRUE 0.957 7.000 0.267 NA N NA
 3467017 3467018 EcE24377A_0054 EcE24377A_0055 apaG ksgA TRUE 0.869 3.000 0.078 NA N NA
 3467018 3467019 EcE24377A_0055 EcE24377A_0056 ksgA pdxA TRUE 0.938 -3.000 0.197 1.000 N NA
 3467019 3467020 EcE24377A_0056 EcE24377A_0057 pdxA surA TRUE 0.986 0.000 0.561 1.000 N NA
 3467020 3467021 EcE24377A_0057 EcE24377A_0058 surA imp TRUE 0.681 53.000 0.182 1.000 N NA
 3467023 3467024 EcE24377A_0060 EcE24377A_0061   rapA TRUE 0.962 12.000 0.294 1.000 N NA
 3467024 3467025 EcE24377A_0061 EcE24377A_0062 rapA polB TRUE 0.610 165.000 0.098 0.088 Y NA
 3467025 3467026 EcE24377A_0062 EcE24377A_0063 polB araD FALSE 0.281 75.000 0.018 1.000 N NA
 3467026 3467027 EcE24377A_0063 EcE24377A_0064 araD araA FALSE 0.385 169.000 0.017 1.000 Y NA
 3467027 3467028 EcE24377A_0064 EcE24377A_0065 araA araB TRUE 0.916 11.000 0.138 1.000 N NA
 3467029 3467030 EcE24377A_0066 EcE24377A_0067 araC   FALSE 0.496 86.000 0.167 NA   NA
 3467031 3467032 EcE24377A_0068 EcE24377A_0069 thiQ thiP TRUE 0.973 -16.000 0.522 0.018 N NA
 3467032 3467033 EcE24377A_0069 EcE24377A_0070 thiP thiB TRUE 0.979 -24.000 0.697 0.083 N NA
 3467033 3467034 EcE24377A_0070 EcE24377A_0071 thiB   FALSE 0.139 44.000 0.010 NA   NA
 3467034 3467035 EcE24377A_0071 EcE24377A_0072   sgrR TRUE 0.673 1.000 0.000 NA   NA
 3467037 3467038 EcE24377A_0074 EcE24377A_0075 leuD leuC TRUE 0.995 11.000 0.309 0.001 Y NA
 3467038 3467039 EcE24377A_0075 EcE24377A_0076 leuC leuB TRUE 0.995 3.000 0.275 0.001 Y NA
 3467039 3467040 EcE24377A_0076 EcE24377A_0077 leuB leuA TRUE 0.990 0.000 0.126 0.001 Y NA
 3467041 3467042 EcE24377A_0078 EcE24377A_0079 leuO ilvI FALSE 0.012 318.000 0.000 1.000 N NA
 3467042 3467043 EcE24377A_0079 EcE24377A_0080 ilvI ilvH TRUE 0.996 3.000 0.371 0.002 Y NA
 3467043 3467044 EcE24377A_0080 EcE24377A_0081 ilvH   FALSE 0.212 52.000 0.000 NA   NA
 3467044 3467045 EcE24377A_0081 EcE24377A_0082   fruR TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467045 3467046 EcE24377A_0082 EcE24377A_0083 fruR mraZ FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3467046 3467047 EcE24377A_0083 EcE24377A_0084 mraZ mraW TRUE 0.985 2.000 0.635 NA   NA
 3467047 3467048 EcE24377A_0084 EcE24377A_0085 mraW ftsL TRUE 0.948 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3467048 3467049 EcE24377A_0085 EcE24377A_0086 ftsL ftsI TRUE 0.874 16.000 0.124 1.000 N NA
 3467049 3467050 EcE24377A_0086 EcE24377A_0087 ftsI murE TRUE 0.942 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 3467050 3467051 EcE24377A_0087 EcE24377A_0088 murE murF TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 3467051 3467052 EcE24377A_0088 EcE24377A_0089 murF mraY TRUE 0.991 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 3467052 3467053 EcE24377A_0089 EcE24377A_0090 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 3467053 3467054 EcE24377A_0090 EcE24377A_0091 murD ftsW TRUE 0.981 0.000 0.297 0.003 N NA
 3467054 3467055 EcE24377A_0091 EcE24377A_0092 ftsW murG TRUE 0.987 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3467055 3467056 EcE24377A_0092 EcE24377A_0093 murG murC TRUE 0.932 54.000 0.283 1.000 Y NA
 3467056 3467057 EcE24377A_0093 EcE24377A_0094 murC ddlB TRUE 0.982 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 3467057 3467058 EcE24377A_0094 EcE24377A_0095 ddlB ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 3467058 3467059 EcE24377A_0095 EcE24377A_0096 ftsQ ftsA TRUE 0.970 -3.000 0.389 NA N NA
 3467059 3467060 EcE24377A_0096 EcE24377A_0097 ftsA ftsZ TRUE 0.956 61.000 0.460 1.000 Y NA
 3467060 3467061 EcE24377A_0097 EcE24377A_0098 ftsZ lpxC FALSE 0.498 101.000 0.134 1.000 N NA
 3467061 3467062 EcE24377A_0098 EcE24377A_0099 lpxC secM FALSE 0.078 156.000 0.000 1.000   NA
 3467062 3467063 EcE24377A_0099 EcE24377A_0100 secM secA FALSE 0.383 62.000 0.065 1.000   NA
 3467063 3467064 EcE24377A_0100 EcE24377A_0101 secA mutT TRUE 0.636 60.000 0.168 1.000 N NA
 3467065 3467066 EcE24377A_0102 EcE24377A_0103     FALSE 0.390 -28.000 0.000 NA   NA
 3467066 3467067 EcE24377A_0103 EcE24377A_0104     TRUE 0.964 10.000 0.356 NA   NA
 3467067 3467068 EcE24377A_0104 EcE24377A_0105   coaE TRUE 0.873 0.000 0.110 NA   NA
 3467070 3467071 EcE24377A_0108 EcE24377A_0109   hofB FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3467071 3467072 EcE24377A_0109 EcE24377A_0110 hofB pilA TRUE 0.995 10.000 0.556 NA Y NA
 3467072 3467073 EcE24377A_0110 EcE24377A_0111 pilA nadC FALSE 0.027 203.000 0.015 NA N NA
 3467074 3467075 EcE24377A_0112 EcE24377A_0113 ampD ampE TRUE 0.988 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 3467077 3467078 EcE24377A_0115 EcE24377A_0116   aceE FALSE 0.404 161.000 0.276 1.000 N NA
 3467078 3467079 EcE24377A_0116 EcE24377A_0117 aceE aceF TRUE 0.983 15.000 0.220 1.000 Y NA
 3467079 3467080 EcE24377A_0117 EcE24377A_0118 aceF lpdA FALSE 0.329 325.000 0.463 1.000 Y NA
 3467082 3467083 EcE24377A_0120 EcE24377A_0121 acnB   FALSE 0.079 175.000 0.068 NA   NA
 3467084 3467085 EcE24377A_0122 EcE24377A_0123 speD speE TRUE 0.975 16.000 0.162 1.000 Y NA
 3467085 3467086 EcE24377A_0123 EcE24377A_0124 speE   TRUE 0.687 106.000 0.354 NA   NA
 3467091 3467092 EcE24377A_0129 EcE24377A_0130     TRUE 0.997 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 3467092 3467093 EcE24377A_0130 EcE24377A_0131     FALSE 0.276 105.000 0.037 1.000 N NA
 3467093 3467094 EcE24377A_0131 EcE24377A_0132     TRUE 0.907 64.000 0.222 1.000 Y NA
 3467096 3467097 EcE24377A_0134 EcE24377A_0135     FALSE 0.122 112.000 0.000 NA   NA
 3467098 3467099 EcE24377A_0136 EcE24377A_0137 panC panB TRUE 0.996 12.000 0.395 0.001 Y NA
 3467099 3467100 EcE24377A_0137 EcE24377A_0138 panB   FALSE 0.237 113.000 0.000 1.000 N NA
 3467100 3467101 EcE24377A_0138 EcE24377A_0139     FALSE 0.527 53.000 0.000 0.010   NA
 3467101 3467102 EcE24377A_0139 EcE24377A_0140     TRUE 0.967 27.000 0.571 0.010   NA
 3467102 3467103 EcE24377A_0140 EcE24377A_0141     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3467103 3467104 EcE24377A_0141 EcE24377A_0142     FALSE 0.002 504.000 0.000 NA   NA
 3467104 3467105 EcE24377A_0142 EcE24377A_0143     TRUE 0.990 35.000 1.000 1.000 Y NA
 3467107 3467108 EcE24377A_0145 EcE24377A_0146   folK FALSE 0.008 370.000 0.000 1.000 N NA
 3467108 3467109 EcE24377A_0146 EcE24377A_0147 folK pcnB TRUE 0.950 -3.000 0.234 1.000 N NA
 3467109 3467110 EcE24377A_0147 EcE24377A_0148 pcnB gluQ TRUE 0.837 93.000 0.131 1.000 Y NA
 3467110 3467111 EcE24377A_0148 EcE24377A_0149 gluQ dksA TRUE 0.804 37.000 0.231 1.000 N NA
 3467111 3467112 EcE24377A_0149 EcE24377A_0150 dksA sfsA FALSE 0.143 178.000 0.151 NA   NA
 3467112 3467113 EcE24377A_0150 EcE24377A_0151 sfsA ligT TRUE 0.659 15.000 0.045 NA   NA
 3467114 3467115 EcE24377A_0152 EcE24377A_0153 hrpB mrcB FALSE 0.159 196.000 0.158 1.000 N NA
 3467117 3467118 EcE24377A_0155 EcE24377A_0156 fhuA fhuC TRUE 0.894 51.000 0.156 1.000 Y NA
 3467118 3467119 EcE24377A_0156 EcE24377A_0157 fhuC fhuD TRUE 0.971 0.000 0.031 1.000 Y NA
 3467119 3467120 EcE24377A_0157 EcE24377A_0158 fhuD fhuB TRUE 0.965 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3467122 3467123 EcE24377A_0160 EcE24377A_0161 clcA   FALSE 0.169 82.000 0.031 NA   NA
 3467124 3467125 EcE24377A_0162 EcE24377A_0163   btuF TRUE 0.716 38.000 0.213 NA   NA
 3467125 3467126 EcE24377A_0163 EcE24377A_0164 btuF mtnN TRUE 0.810 -7.000 0.073 1.000 N NA
 3467127 3467128 EcE24377A_0165 EcE24377A_0166 dgt degP FALSE 0.331 130.000 0.101 1.000 N NA
 3467128 3467129 EcE24377A_0166 EcE24377A_0167 degP cdaR FALSE 0.103 182.000 0.080 NA N NA
 3467130 3467131 EcE24377A_0168 EcE24377A_0169   dapD FALSE 0.006 315.000 0.035 NA   NA
 3467131 3467132 EcE24377A_0169 EcE24377A_0170 dapD glnD TRUE 0.695 31.000 0.097 1.000 N NA
 3467132 3467133 EcE24377A_0170 EcE24377A_0171 glnD map TRUE 0.725 62.000 0.243 1.000 N NA
 3467134 3467135 EcE24377A_0173 EcE24377A_0174 rpsB tsf TRUE 0.647 258.000 0.748 1.000 Y NA
 3467135 3467136 EcE24377A_0174 EcE24377A_0175 tsf pyrH TRUE 0.627 147.000 0.416 1.000 N NA
 3467136 3467137 EcE24377A_0175 EcE24377A_0176 pyrH frr FALSE 0.224 292.000 0.626 1.000 N NA
 3467137 3467138 EcE24377A_0176 EcE24377A_0177 frr dxr FALSE 0.299 92.000 0.032 1.000 N NA
 3467138 3467139 EcE24377A_0177 EcE24377A_0178 dxr uppS FALSE 0.319 189.000 0.025 1.000 Y NA
 3467139 3467140 EcE24377A_0178 EcE24377A_0179 uppS cdsA1 TRUE 0.992 13.000 0.400 1.000 Y NA
 3467140 3467141 EcE24377A_0179 EcE24377A_0180 cdsA1 rseP TRUE 0.875 12.000 0.080 1.000 N NA
 3467141 3467142 EcE24377A_0180 EcE24377A_0181 rseP yaeT TRUE 0.951 30.000 0.204 1.000 Y NA
 3467142 3467143 EcE24377A_0181 EcE24377A_0182 yaeT skp TRUE 0.895 122.000 0.354 1.000 Y NA
 3467143 3467144 EcE24377A_0182 EcE24377A_0183 skp lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 3467144 3467145 EcE24377A_0183 EcE24377A_0184 lpxD fabZ TRUE 0.899 105.000 0.796 1.000 N NA
 3467145 3467146 EcE24377A_0184 EcE24377A_0185 fabZ lpxA TRUE 0.992 4.000 0.850 1.000 N NA
 3467146 3467147 EcE24377A_0185 EcE24377A_0186 lpxA lpxB TRUE 0.991 0.000 0.289 1.000 Y NA
 3467147 3467148 EcE24377A_0186 EcE24377A_0187 lpxB rnhB TRUE 0.935 -3.000 0.186 1.000 N NA
 3467148 3467149 EcE24377A_0187 EcE24377A_0188 rnhB dnaE TRUE 0.903 37.000 0.104 1.000 Y NA
 3467149 3467150 EcE24377A_0188 EcE24377A_0189 dnaE accA TRUE 0.899 13.000 0.122 1.000 N NA
 3467150 3467151 EcE24377A_0189 EcE24377A_0190 accA ldcC FALSE 0.218 99.000 0.010 1.000 N NA
 3467151 3467152 EcE24377A_0190 EcE24377A_0191 ldcC   TRUE 0.785 57.000 0.039 NA Y NA
 3467152 3467153 EcE24377A_0191 EcE24377A_0192   tilS FALSE 0.216 65.000 0.015 NA N NA
 3467154 3467155 EcE24377A_0193 EcE24377A_0194 rof   TRUE 0.822 -13.000 0.179 NA   NA
 3467156 3467157 EcE24377A_0195 EcE24377A_0196     TRUE 0.733 -3.000 0.034 1.000   NA
 3467157 3467158 EcE24377A_0196 EcE24377A_0197   cutF TRUE 0.573 14.000 0.027 NA   NA
 3467158 3467159 EcE24377A_0197 EcE24377A_0198 cutF   FALSE 0.019 250.000 0.000 NA N NA
 3467159 3467160 EcE24377A_0198 EcE24377A_0200     FALSE 0.099 127.000 0.000 NA   NA
 3467161 3467162 EcE24377A_0199 EcE24377A_0201   proS TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467162 3467163 EcE24377A_0201 EcE24377A_0202 proS   FALSE 0.172 112.000 0.048 NA   NA
 3467163 3467164 EcE24377A_0202 EcE24377A_0203   rcsF TRUE 0.934 -3.000 0.247 NA   NA
 3467164 3467165 EcE24377A_0203 EcE24377A_0204 rcsF metQ TRUE 0.739 118.000 0.500 NA   NA
 3467165 3467166 EcE24377A_0204 EcE24377A_0205 metQ metI TRUE 0.975 40.000 0.411 0.070 Y NA
 3467166 3467167 EcE24377A_0205 EcE24377A_0206 metI metN TRUE 0.993 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 3467168 3467169 EcE24377A_0207 EcE24377A_5003   rrsA FALSE 0.004 362.000 0.000 NA   NA
 3467169 3467170 EcE24377A_5003 EcE24377A_5004 rrsA   FALSE 0.185 69.000 0.000 NA   NA
 3467170 3467171 EcE24377A_5004 EcE24377A_5005     FALSE 0.248 43.000 0.000 NA   NA
 3467171 3467172 EcE24377A_5005 EcE24377A_5006   rrlA FALSE 0.047 164.000 0.000 NA   NA
 3467172 3467173 EcE24377A_5006 EcE24377A_5007 rrlA rrfA FALSE 0.157 93.000 0.000 NA   NA
 3467173 3467174 EcE24377A_5007 EcE24377A_5008 rrfA   FALSE 0.028 192.000 0.000 NA   NA
 3467174 3467175 EcE24377A_5008 EcE24377A_0213   dkgB FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 3467177 3467178 EcE24377A_0214 EcE24377A_0215     FALSE 0.300 78.000 0.066 NA   NA
 3467179 3467180 EcE24377A_0216 EcE24377A_0217 mltD gloB TRUE 0.670 72.000 0.233 1.000   NA
 3467182 3467183 EcE24377A_0218 EcE24377A_0219   rnhA FALSE 0.003 428.000 0.000 NA   NA
 3467184 3467185 EcE24377A_0221 EcE24377A_5009 dnaQ   FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 3467185 3467186 EcE24377A_5009 EcE24377A_0223     TRUE 0.653 10.000 0.000 NA   NA
 3467186 3467187 EcE24377A_0223 EcE24377A_0224     FALSE 0.017 222.000 0.000 NA   NA
 3467188 3467189 EcE24377A_0225 EcE24377A_0226     TRUE 0.931 44.000 0.750 NA   NA
 3467189 3467190 EcE24377A_0226 EcE24377A_0227     TRUE 0.802 24.000 0.182 NA   NA
 3467190 3467191 EcE24377A_0227 EcE24377A_0228     TRUE 0.955 11.000 0.312 NA   NA
 3467191 3467192 EcE24377A_0228 EcE24377A_0229     TRUE 0.978 19.000 0.750 1.000   NA
 3467192 3467193 EcE24377A_0229 EcE24377A_0230     TRUE 0.988 5.000 0.711 NA   NA
 3467193 3467194 EcE24377A_0230 EcE24377A_0231     TRUE 0.679 -3.000 0.039 NA   NA
 3467194 3467195 EcE24377A_0231 EcE24377A_0232     TRUE 0.975 9.000 0.471 NA   NA
 3467195 3467196 EcE24377A_0232 EcE24377A_0233     TRUE 0.987 5.000 0.673 NA   NA
 3467196 3467197 EcE24377A_0233 EcE24377A_0234     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3467197 3467198 EcE24377A_0234 EcE24377A_0235     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467198 3467199 EcE24377A_0235 EcE24377A_0236     TRUE 0.940 25.000 0.510 NA   NA
 3467199 3467200 EcE24377A_0236 EcE24377A_0237     TRUE 0.968 -36.000 0.863 NA   NA
 3467200 3467201 EcE24377A_0237 EcE24377A_0238     TRUE 0.981 4.000 0.552 NA   NA
 3467201 3467202 EcE24377A_0238 EcE24377A_0239     TRUE 0.985 7.000 0.627 NA   NA
 3467202 3467203 EcE24377A_0239 EcE24377A_0240     FALSE 0.210 51.000 0.030 NA   NA
 3467203 3467204 EcE24377A_0240 EcE24377A_0241     FALSE 0.302 35.000 0.034 NA   NA
 3467205 3467206 EcE24377A_0242 EcE24377A_0243     FALSE 0.099 127.000 0.000 NA   NA
 3467206 3467207 EcE24377A_0243 EcE24377A_0244     FALSE 0.305 33.000 0.000 NA   NA
 3467207 3467208 EcE24377A_0244 EcE24377A_0245     FALSE 0.260 40.000 0.000 NA   NA
 3467208 3467209 EcE24377A_0245 EcE24377A_0246     TRUE 0.645 76.000 0.250 NA   NA
 3467209 3467210 EcE24377A_0246 EcE24377A_0247     FALSE 0.438 -16.000 0.000 NA   NA
 3467210 3467211 EcE24377A_0247 EcE24377A_0248     FALSE 0.034 181.000 0.000 NA   NA
 3467211 3467212 EcE24377A_0248 EcE24377A_0249     FALSE 0.245 44.000 0.000 NA   NA
 3467212 3467213 EcE24377A_0249 EcE24377A_0250     FALSE 0.013 239.000 0.000 NA   NA
 3467217 3467218 EcE24377A_0254 EcE24377A_0255 gmhA   FALSE 0.206 54.000 0.000 NA   NA
 3467218 3467219 EcE24377A_0255 EcE24377A_0257     FALSE 0.190 60.000 0.000 NA   NA
 3467220 3467221 EcE24377A_0256 EcE24377A_0258     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 3467221 3467222 EcE24377A_0258 EcE24377A_0259     TRUE 0.911 3.000 0.167 NA   NA
 3467224 3467225 EcE24377A_0260 EcE24377A_0262     FALSE 0.001 709.000 0.000 NA   NA
 3467225 3467226 EcE24377A_0262 EcE24377A_0263   fhiA FALSE 0.005 376.000 0.000 1.000   NA
 3467227 3467228 EcE24377A_0264 EcE24377A_0265   dinB FALSE 0.336 71.000 0.000 1.000 N NA
 3467228 3467229 EcE24377A_0265 EcE24377A_0266 dinB   TRUE 0.627 -3.000 0.011 1.000   NA
 3467229 3467230 EcE24377A_0266 EcE24377A_0267     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 3467230 3467231 EcE24377A_0267 EcE24377A_0268     TRUE 0.950 -3.000 0.303 NA   NA
 3467233 3467234 EcE24377A_0270 EcE24377A_0271 gpt frsA FALSE 0.191 92.000 0.040 NA   NA
 3467234 3467235 EcE24377A_0271 EcE24377A_0272 frsA crl FALSE 0.262 58.000 0.048 NA   NA
 3467237 3467238 EcE24377A_0274 EcE24377A_0275 proB proA TRUE 0.980 12.000 0.026 0.001 Y NA
 3467238 3467239 EcE24377A_0275 EcE24377A_5010 proA   FALSE 0.119 115.000 0.000 NA   NA
 3467239 3467240 EcE24377A_5010 EcE24377A_0278     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 3467240 3467241 EcE24377A_0278 EcE24377A_0279     FALSE 0.108 122.000 0.000 NA   NA
 3467241 3467242 EcE24377A_0279 EcE24377A_0280     FALSE 0.132 107.000 0.000 NA   NA
 3467242 3467243 EcE24377A_0280 EcE24377A_0281     FALSE 0.456 -13.000 0.000 NA   NA
 3467244 3467245 EcE24377A_0282 EcE24377A_0283     TRUE 0.971 0.000 0.390 NA   NA
 3467245 3467246 EcE24377A_0283 EcE24377A_0284     TRUE 0.952 -24.000 0.579 NA   NA
 3467246 3467247 EcE24377A_0284 EcE24377A_0285     TRUE 0.888 14.000 0.171 NA   NA
 3467248 3467249 EcE24377A_0286 EcE24377A_0287     TRUE 0.976 -10.000 0.167 0.086 Y NA
 3467249 3467250 EcE24377A_0287 EcE24377A_0288     FALSE 0.525 -7.000 0.000 NA   NA
 3467250 3467251 EcE24377A_0288 EcE24377A_0289     TRUE 0.667 0.000 0.029 NA   NA
 3467251 3467252 EcE24377A_0289 EcE24377A_0290     FALSE 0.112 177.000 0.000 0.086   NA
 3467252 3467253 EcE24377A_0290 EcE24377A_0291     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467257 3467258 EcE24377A_0294 EcE24377A_0295     TRUE 0.890 10.000 0.111 NA N NA
 3467258 3467259 EcE24377A_0295 EcE24377A_0296     TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 3467259 3467260 EcE24377A_0296 EcE24377A_0297     TRUE 0.998 -3.000 0.705 0.062 Y NA
 3467262 3467263 EcE24377A_0299 EcE24377A_0300     TRUE 0.863 -31.000 0.286 NA   NA
 3467263 3467264 EcE24377A_0300 EcE24377A_0301     FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3467264 3467265 EcE24377A_0301 EcE24377A_0302     TRUE 0.879 26.000 0.308 NA   NA
 3467265 3467266 EcE24377A_0302 EcE24377A_0303   matB TRUE 0.793 58.000 0.385 NA   NA
 3467266 3467267 EcE24377A_0303 EcE24377A_0304 matB matA TRUE 0.781 75.000 0.400 NA   NA
 3467267 3467268 EcE24377A_0304 EcE24377A_0305 matA   FALSE 0.025 198.000 0.000 NA   NA
 3467268 3467269 EcE24377A_0305 EcE24377A_0306   rpmJ2 FALSE 0.001 744.000 0.000 NA   NA
 3467269 3467270 EcE24377A_0306 EcE24377A_0307 rpmJ2 rpmE1 TRUE 0.863 0.000 0.004 0.014   NA
 3467278 3467280 EcE24377A_0315 EcE24377A_0316     TRUE 0.702 12.000 0.043 NA   NA
 3467280 3467281 EcE24377A_0316 EcE24377A_0318     TRUE 0.839 109.000 0.667 NA   NA
 3467282 3467283 EcE24377A_0319 EcE24377A_0320     FALSE 0.206 54.000 0.000 NA   NA
 3467283 3467284 EcE24377A_0320 EcE24377A_0321     FALSE 0.003 527.000 0.000 NA N NA
 3467284 3467285 EcE24377A_0321 EcE24377A_0322     TRUE 0.989 11.000 0.286 NA Y NA
 3467285 3467286 EcE24377A_0322 EcE24377A_0323     TRUE 0.962 -7.000 0.286 0.001   NA
 3467287 3467288 EcE24377A_0324 EcE24377A_0325     FALSE 0.390 -28.000 0.000 NA   NA
 3467288 3467289 EcE24377A_0325 EcE24377A_0326   betA FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 3467289 3467290 EcE24377A_0326 EcE24377A_0327 betA betB TRUE 0.985 14.000 0.634 1.000 N NA
 3467290 3467291 EcE24377A_0327 EcE24377A_0328 betB betI TRUE 0.975 14.000 0.459 1.000 N NA
 3467292 3467293 EcE24377A_0329 EcE24377A_0330     TRUE 0.925 -81.000 0.000 0.020 Y NA
 3467293 3467294 EcE24377A_0330 EcE24377A_0331   betT FALSE 0.337 70.000 0.000 1.000 N NA
 3467294 3467295 EcE24377A_0331 EcE24377A_0332 betT   FALSE 0.026 573.000 0.000 1.000 Y NA
 3467295 3467296 EcE24377A_0332 EcE24377A_0333     FALSE 0.154 142.000 0.000 1.000 N NA
 3467297 3467298 EcE24377A_0334 EcE24377A_0335     FALSE 0.159 92.000 0.000 NA   NA
 3467299 3467300 EcE24377A_0336 EcE24377A_0337     FALSE 0.345 -52.000 0.000 NA   NA
 3467300 3467301 EcE24377A_0337 EcE24377A_0338     TRUE 0.926 40.000 0.667 NA   NA
 3467301 3467302 EcE24377A_0338 EcE24377A_0339     TRUE 0.945 -10.000 0.429 NA   NA
 3467302 3467303 EcE24377A_0339 EcE24377A_0340     TRUE 0.988 0.000 0.714 NA   NA
 3467303 3467304 EcE24377A_0340 EcE24377A_0341     FALSE 0.227 143.000 0.125 NA   NA
 3467304 3467305 EcE24377A_0341 EcE24377A_0342     FALSE 0.487 148.000 0.278 1.000 N NA
 3467305 3467306 EcE24377A_0342 EcE24377A_0343     FALSE 0.009 269.000 0.000 NA   NA
 3467308 3467309 EcE24377A_0345 EcE24377A_0346     TRUE 0.970 49.000 0.571 NA Y NA
 3467309 3467310 EcE24377A_0346 EcE24377A_0347     TRUE 0.994 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 3467310 3467311 EcE24377A_0347 EcE24377A_0348     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.068 Y NA
 3467311 3467312 EcE24377A_0348 EcE24377A_0349     FALSE 0.228 87.000 0.000 1.000   NA
 3467312 3467313 EcE24377A_0349 EcE24377A_0350     FALSE 0.013 243.000 0.000 NA   NA
 3467313 3467314 EcE24377A_0350 EcE24377A_5012     FALSE 0.005 342.000 0.000 NA   NA
 3467319 3467320 EcE24377A_0355 EcE24377A_0356   prpB FALSE 0.170 79.000 0.000 NA   NA
 3467320 3467321 EcE24377A_0356 EcE24377A_0357 prpB prpC TRUE 0.906 45.000 0.502 1.000 N NA
 3467321 3467322 EcE24377A_0357 EcE24377A_0358 prpC prpD TRUE 0.775 34.000 0.216 1.000   NA
 3467322 3467323 EcE24377A_0358 EcE24377A_0359 prpD prpE TRUE 0.664 40.000 0.038 0.001   NA
 3467323 3467324 EcE24377A_0359 EcE24377A_0360 prpE codB FALSE 0.031 237.000 0.000 1.000 N NA
 3467324 3467325 EcE24377A_0360 EcE24377A_0361 codB codA TRUE 0.978 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 3467327 3467328 EcE24377A_0363 EcE24377A_0364   cynT FALSE 0.159 92.000 0.000 NA   NA
 3467328 3467329 EcE24377A_0364 EcE24377A_0365 cynT cynS TRUE 0.911 31.000 0.075 1.000 Y NA
 3467329 3467330 EcE24377A_0365 EcE24377A_0366 cynS cynX TRUE 0.875 33.000 0.000 1.000 Y NA
 3467331 3467332 EcE24377A_0367 EcE24377A_0368 lacY lacZ TRUE 0.737 52.000 0.261 1.000   NA
 3467332 3467333 EcE24377A_0368 EcE24377A_0369 lacZ lacI FALSE 0.479 123.000 0.174 1.000 N NA
 3467333 3467334 EcE24377A_0369 EcE24377A_0370 lacI mhpR TRUE 0.844 68.000 0.000 0.054 Y NA
 3467335 3467336 EcE24377A_0371 EcE24377A_0372 mhpA mhpB TRUE 0.980 2.000 0.333 0.006   NA
 3467336 3467337 EcE24377A_0372 EcE24377A_0373 mhpB mhpC TRUE 0.978 3.000 0.300 0.006   NA
 3467337 3467338 EcE24377A_0373 EcE24377A_0374 mhpC mhpD TRUE 0.976 10.000 0.300 0.006   NA
 3467338 3467339 EcE24377A_0374 EcE24377A_0375 mhpD mhpF TRUE 0.994 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 3467339 3467340 EcE24377A_0375 EcE24377A_0376 mhpF mhpE TRUE 0.989 -3.000 0.750 1.000 N NA
 3467340 3467341 EcE24377A_0376 EcE24377A_0377 mhpE   TRUE 0.602 176.000 0.600 1.000 N NA
 3467341 3467342 EcE24377A_0377 EcE24377A_0378     FALSE 0.140 102.000 0.000 NA   NA
 3467342 3467343 EcE24377A_0378 EcE24377A_0379     FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 3467344 3467345 EcE24377A_0380 EcE24377A_0381 fghA1   TRUE 0.723 93.000 0.327 1.000   NA
 3467345 3467346 EcE24377A_0381 EcE24377A_0382     TRUE 0.908 35.000 0.531 NA   NA
 3467346 3467347 EcE24377A_0382 EcE24377A_0383     FALSE 0.031 186.000 0.000 NA   NA
 3467347 3467348 EcE24377A_0383 EcE24377A_0384     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3467348 3467349 EcE24377A_0384 EcE24377A_0385     FALSE 0.111 119.000 0.000 NA   NA
 3467349 3467350 EcE24377A_0385 EcE24377A_0386     TRUE 0.929 10.000 0.214 NA   NA
 3467353 3467354 EcE24377A_0389 EcE24377A_0390 tauA tauB TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3467354 3467355 EcE24377A_0390 EcE24377A_0391 tauB tauC TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467355 3467356 EcE24377A_0391 EcE24377A_0392 tauC tauD TRUE 0.943 -3.000 0.214 1.000 N NA
 3467357 3467358 EcE24377A_0393 EcE24377A_0394 hemB   FALSE 0.003 706.000 0.000 1.000 N NA
 3467358 3467359 EcE24377A_0394 EcE24377A_0395     TRUE 0.927 -42.000 0.000 0.085 Y NA
 3467360 3467361 EcE24377A_0396 EcE24377A_0397     TRUE 0.874 88.000 0.667 NA   NA
 3467362 3467363 EcE24377A_0398 EcE24377A_0399 ampH   FALSE 0.236 46.000 0.000 NA   NA
 3467364 3467365 EcE24377A_0400 EcE24377A_0401   smbA FALSE 0.474 20.000 0.000 NA   NA
 3467365 3467366 EcE24377A_0401 EcE24377A_0402 smbA   TRUE 0.709 13.000 0.000 1.000   NA
 3467367 3467368 EcE24377A_0403 EcE24377A_0404     FALSE 0.352 -46.000 0.000 NA   NA
 3467371 3467372 EcE24377A_0407 EcE24377A_0408     FALSE 0.431 23.000 0.000 NA   NA
 3467372 3467373 EcE24377A_0408 EcE24377A_0409     FALSE 0.236 46.000 0.000 NA   NA
 3467373 3467374 EcE24377A_0409 EcE24377A_0410   phoA FALSE 0.145 101.000 0.032 NA   NA
 3467374 3467375 EcE24377A_0410 EcE24377A_0411 phoA psiF FALSE 0.112 119.000 0.032 NA   NA
 3467375 3467376 EcE24377A_0411 EcE24377A_0412 psiF   TRUE 0.583 102.000 0.250 NA   NA
 3467378 3467379 EcE24377A_0414 EcE24377A_0415   aroL FALSE 0.015 183.000 0.007 NA   NA
 3467379 3467380 EcE24377A_0415 EcE24377A_0416 aroL   FALSE 0.282 50.000 0.044 NA   NA
 3467380 3467381 EcE24377A_0416 EcE24377A_0417   aroM FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 3467381 3467382 EcE24377A_0417 EcE24377A_0418 aroM   FALSE 0.251 72.000 0.049 NA   NA
 3467382 3467383 EcE24377A_0418 EcE24377A_0419     FALSE 0.021 208.000 0.000 NA   NA
 3467385 3467386 EcE24377A_0421 EcE24377A_0422 mak   FALSE 0.417 -21.000 0.000 NA   NA
 3467387 3467388 EcE24377A_0423 EcE24377A_0424 araJ sbcC FALSE 0.427 42.000 0.030 1.000 N NA
 3467388 3467389 EcE24377A_0424 EcE24377A_0425 sbcC sbcD TRUE 0.980 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 3467390 3467391 EcE24377A_0426 EcE24377A_0427   phoB FALSE 0.181 73.000 0.000 NA   NA
 3467391 3467392 EcE24377A_0427 EcE24377A_0428 phoB phoR TRUE 0.970 58.000 0.453 0.015 Y NA
 3467393 3467394 EcE24377A_0429 EcE24377A_0430     FALSE 0.159 92.000 0.000 NA   NA
 3467395 3467396 EcE24377A_0431 EcE24377A_0432 brnQ proY TRUE 0.951 76.000 0.348 0.098 Y NA
 3467396 3467397 EcE24377A_0432 EcE24377A_0433 proY malZ FALSE 0.238 156.000 0.123 1.000 N NA
 3467399 3467400 EcE24377A_0435 EcE24377A_0436 queA tgt TRUE 0.969 56.000 0.360 0.001 Y NA
 3467400 3467401 EcE24377A_0436 EcE24377A_0437 tgt yajC TRUE 0.916 23.000 0.325 NA N NA
 3467401 3467402 EcE24377A_0437 EcE24377A_0438 yajC secD TRUE 0.897 28.000 0.045 NA Y NA
 3467402 3467403 EcE24377A_0438 EcE24377A_0439 secD secF TRUE 0.992 11.000 0.206 0.001 Y NA
 3467403 3467404 EcE24377A_0439 EcE24377A_0440 secF   FALSE 0.100 129.000 0.015 1.000   NA
 3467404 3467405 EcE24377A_0440 EcE24377A_0441     TRUE 0.600 14.000 0.000 NA   NA
 3467406 3467407 EcE24377A_0442 EcE24377A_0443 tsx   FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 3467408 3467409 EcE24377A_0444 EcE24377A_0445 nrdR ribD TRUE 0.960 4.000 0.277 NA N NA
 3467409 3467410 EcE24377A_0445 EcE24377A_0446 ribD ribH TRUE 0.854 89.000 0.034 0.001 Y NA
 3467410 3467411 EcE24377A_0446 EcE24377A_0447 ribH nusB TRUE 0.943 20.000 0.347 1.000 N NA
 3467411 3467412 EcE24377A_0447 EcE24377A_0448 nusB thiL TRUE 0.683 78.000 0.225 1.000 N NA
 3467412 3467413 EcE24377A_0448 EcE24377A_0449 thiL pgpA TRUE 0.867 -22.000 0.206 1.000 N NA
 3467414 3467415 EcE24377A_0450 EcE24377A_0451   dxs FALSE 0.055 180.000 0.009 1.000 N NA
 3467415 3467416 EcE24377A_0451 EcE24377A_0452 dxs ispA TRUE 0.929 25.000 0.060 1.000 Y NA
 3467416 3467417 EcE24377A_0452 EcE24377A_0453 ispA xseB TRUE 0.831 0.000 0.035 1.000 N NA
 3467418 3467419 EcE24377A_0454 EcE24377A_0455   thiI FALSE 0.388 26.000 0.000 NA   NA
 3467420 3467421 EcE24377A_0456 EcE24377A_0457 thiJ panE TRUE 0.730 -37.000 0.155 NA   NA
 3467425 3467426 EcE24377A_0461 EcE24377A_0462     FALSE 0.541 -16.000 0.000 1.000   NA
 3467426 3467427 EcE24377A_0462 EcE24377A_0463   cyoE FALSE 0.120 137.000 0.000 1.000   NA
 3467427 3467428 EcE24377A_0463 EcE24377A_0464 cyoE cyoD TRUE 0.935 12.000 0.118 0.098 N NA
 3467428 3467429 EcE24377A_0464 EcE24377A_0465 cyoD cyoC TRUE 0.996 0.000 0.485 0.061 Y NA
 3467429 3467430 EcE24377A_0465 EcE24377A_0466 cyoC cyoB TRUE 0.995 -10.000 0.697 0.061 Y NA
 3467430 3467431 EcE24377A_0466 EcE24377A_0467 cyoB cyoA TRUE 0.958 22.000 0.041 0.004 Y NA
 3467431 3467432 EcE24377A_0467 EcE24377A_0468 cyoA   FALSE 0.007 461.000 0.000 0.098   NA
 3467432 3467433 EcE24377A_0468 EcE24377A_0469     TRUE 0.741 44.000 0.256 NA   NA
 3467434 3467435 EcE24377A_0470 EcE24377A_0471     TRUE 0.660 9.000 0.000 NA   NA
 3467435 3467436 EcE24377A_0471 EcE24377A_0472   tig FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 3467436 3467437 EcE24377A_0472 EcE24377A_0473 tig clpP FALSE 0.456 246.000 0.351 1.000 Y NA
 3467437 3467438 EcE24377A_0473 EcE24377A_0474 clpP clpX TRUE 0.887 126.000 0.352 1.000 Y NA
 3467438 3467439 EcE24377A_0474 EcE24377A_0475 clpX lon TRUE 0.614 188.000 0.201 0.099 Y NA
 3467439 3467440 EcE24377A_0475 EcE24377A_0476 lon hupB FALSE 0.045 209.000 0.000 1.000 N NA
 3467440 3467441 EcE24377A_0476 EcE24377A_0477 hupB ppiD FALSE 0.061 192.000 0.000 1.000 N NA
 3467441 3467442 EcE24377A_0477 EcE24377A_0478 ppiD   FALSE 0.128 151.000 0.033 1.000 N NA
 3467442 3467443 EcE24377A_0478 EcE24377A_0479     FALSE 0.203 94.000 0.027 1.000   NA
 3467444 3467445 EcE24377A_0480 EcE24377A_0481 queC   FALSE 0.211 65.000 0.019 1.000   NA
 3467446 3467447 EcE24377A_0482 EcE24377A_0483 cof   FALSE 0.067 153.000 0.020 1.000   NA
 3467447 3467448 EcE24377A_0483 EcE24377A_0484   mdlA TRUE 0.801 30.000 0.179 1.000 N NA
 3467448 3467449 EcE24377A_0484 EcE24377A_0485 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.001 Y NA
 3467449 3467450 EcE24377A_0485 EcE24377A_0486 mdlB glnK FALSE 0.070 181.000 0.028 1.000 N NA
 3467450 3467451 EcE24377A_0486 EcE24377A_0487 glnK amt TRUE 0.777 30.000 0.156 1.000 N NA
 3467456 3467457 EcE24377A_0492 EcE24377A_0493     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 3467457 3467458 EcE24377A_0493 EcE24377A_0494   maa FALSE 0.443 77.000 0.101 1.000   NA
 3467458 3467459 EcE24377A_0494 EcE24377A_0495 maa   FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 3467459 3467460 EcE24377A_0495 EcE24377A_0496     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 3467460 3467461 EcE24377A_0496 EcE24377A_0497   acrA TRUE 0.952 23.000 0.458 1.000 N NA
 3467462 3467463 EcE24377A_0498 EcE24377A_0499 acrR   FALSE 0.168 82.000 0.000 NA   NA
 3467463 3467464 EcE24377A_0499 EcE24377A_0500   kefA FALSE 0.320 -118.000 0.000 NA   NA
 3467464 3467465 EcE24377A_0500 EcE24377A_0501 kefA   FALSE 0.236 46.000 0.000 NA   NA
 3467466 3467467 EcE24377A_0502 EcE24377A_0503   priC TRUE 0.969 14.000 0.474 NA   NA
 3467468 3467469 EcE24377A_0504 EcE24377A_0505     FALSE 0.443 -25.000 0.038 NA   NA
 3467469 3467470 EcE24377A_0505 EcE24377A_0506   apt FALSE 0.080 68.000 0.002 NA   NA
 3467470 3467471 EcE24377A_0506 EcE24377A_0507 apt dnaX FALSE 0.316 129.000 0.088 1.000 N NA
 3467473 3467474 EcE24377A_0509 EcE24377A_0510   recR TRUE 0.984 0.000 0.604 NA   NA
 3467474 3467475 EcE24377A_0510 EcE24377A_0511 recR htpG FALSE 0.237 110.000 0.028 1.000 N NA
 3467475 3467476 EcE24377A_0511 EcE24377A_0513 htpG adk FALSE 0.133 181.000 0.035 0.099 N NA
 3467476 3467477 EcE24377A_0513 EcE24377A_0515 adk hemH FALSE 0.024 236.000 0.013 1.000 N NA
 3467480 3467481 EcE24377A_0517 EcE24377A_0518   fsr FALSE 0.055 238.000 0.000 0.097 N NA
 3467483 3467484 EcE24377A_0520 EcE24377A_0521     FALSE 0.017 204.000 0.022 NA   NA
 3467487 3467488 EcE24377A_0524 EcE24377A_0525 glsA1   TRUE 0.970 3.000 0.028 1.000 Y NA
 3467488 3467489 EcE24377A_0525 EcE24377A_0526   cueR FALSE 0.206 125.000 0.000 1.000 N NA
 3467490 3467491 EcE24377A_0527 EcE24377A_0528     TRUE 0.989 -3.000 0.313 NA Y NA
 3467492 3467493 EcE24377A_0529 EcE24377A_0530     TRUE 0.759 -13.000 0.127 NA   NA
 3467494 3467495 EcE24377A_0531 EcE24377A_0532 ybbN   FALSE 0.501 61.000 0.118 1.000   NA
 3467495 3467496 EcE24377A_0532 EcE24377A_0533   tesA TRUE 0.730 -10.000 0.072 1.000   NA
 3467497 3467498 EcE24377A_0534 EcE24377A_0535     TRUE 0.994 -3.000 0.535 NA Y NA
 3467498 3467499 EcE24377A_0535 EcE24377A_0536     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA N NA
 3467499 3467500 EcE24377A_0536 EcE24377A_0537     FALSE 0.260 40.000 0.000 NA   NA
 3467500 3467501 EcE24377A_0537 EcE24377A_0538     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467502 3467503 EcE24377A_0539 EcE24377A_0540   selU FALSE 0.118 116.000 0.000 NA   NA
 3467503 3467504 EcE24377A_0540 EcE24377A_0541 selU   FALSE 0.109 69.000 0.012 NA   NA
 3467505 3467506 EcE24377A_0542 EcE24377A_0543 allA allR TRUE 0.895 78.000 0.625 1.000 N NA
 3467506 3467507 EcE24377A_0543 EcE24377A_0544 allR gcl FALSE 0.301 90.000 0.054 1.000   NA
 3467507 3467508 EcE24377A_0544 EcE24377A_0545 gcl hyi TRUE 0.810 13.000 0.065 1.000   NA
 3467508 3467509 EcE24377A_0545 EcE24377A_0546 hyi   FALSE 0.532 100.000 0.154 1.000 N NA
 3467509 3467510 EcE24377A_0546 EcE24377A_0547     FALSE 0.089 169.000 0.000 1.000 N NA
 3467510 3467511 EcE24377A_0547 EcE24377A_0548   allB TRUE 0.882 60.000 0.161 1.000 Y NA
 3467511 3467512 EcE24377A_0548 EcE24377A_0550 allB   TRUE 0.886 57.000 0.161 1.000 Y NA
 3467514 3467515 EcE24377A_0551 EcE24377A_0552     FALSE 0.192 59.000 0.000 NA   NA
 3467516 3467517 EcE24377A_0553 EcE24377A_0554   allC TRUE 0.771 11.000 0.059 NA   NA
 3467517 3467518 EcE24377A_0554 EcE24377A_0555 allC allD TRUE 0.861 22.000 0.174 1.000 N NA
 3467519 3467520 EcE24377A_0556 EcE24377A_0557     TRUE 0.970 10.000 0.412 NA   NA
 3467520 3467521 EcE24377A_0557 EcE24377A_0558     TRUE 0.944 11.000 0.265 NA   NA
 3467521 3467522 EcE24377A_0558 EcE24377A_0559   arcC TRUE 0.964 -3.000 0.375 NA   NA
 3467522 3467523 EcE24377A_0559 EcE24377A_0561 arcC   FALSE 0.274 37.000 0.000 NA   NA
 3467524 3467525 EcE24377A_0560 EcE24377A_0562 purK purE TRUE 0.989 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 3467525 3467526 EcE24377A_0562 EcE24377A_0563 purE lpxH FALSE 0.123 118.000 0.016 1.000   NA
 3467526 3467527 EcE24377A_0563 EcE24377A_0564 lpxH ppiB TRUE 0.950 3.000 0.237 1.000   NA
 3467529 3467530 EcE24377A_0567 EcE24377A_0569     FALSE 0.071 108.000 0.011 NA   NA
 3467530 3467531 EcE24377A_0569 EcE24377A_0570   folD TRUE 0.824 2.000 0.055 1.000   NA
 3467532 3467533 EcE24377A_0571 EcE24377A_0572     FALSE 0.151 96.000 0.000 NA   NA
 3467533 3467534 EcE24377A_0572 EcE24377A_0573   fimC FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3467534 3467535 EcE24377A_0573 EcE24377A_0574 fimC   FALSE 0.325 31.000 0.000 NA   NA
 3467535 3467536 EcE24377A_0574 EcE24377A_0575     FALSE 0.318 -145.000 0.000 NA   NA
 3467536 3467537 EcE24377A_0575 EcE24377A_0576     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467540 3467541 EcE24377A_0579 EcE24377A_0580     FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 3467541 3467542 EcE24377A_0580 EcE24377A_0581     TRUE 0.979 1.000 0.500 NA   NA
 3467542 3467543 EcE24377A_0581 EcE24377A_0582   nfrB FALSE 0.456 -13.000 0.000 NA   NA
 3467543 3467544 EcE24377A_0582 EcE24377A_0583 nfrB   FALSE 0.009 269.000 0.000 NA   NA
 3467544 3467545 EcE24377A_0583 EcE24377A_0584     FALSE 0.137 104.000 0.000 NA   NA
 3467545 3467546 EcE24377A_0584 EcE24377A_0585     FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 3467546 3467547 EcE24377A_0585 EcE24377A_0586     FALSE 0.169 80.000 0.000 NA   NA
 3467547 3467548 EcE24377A_0586 EcE24377A_0587     TRUE 0.827 28.000 0.250 NA   NA
 3467548 3467549 EcE24377A_0587 EcE24377A_0588   cusS FALSE 0.001 737.000 0.000 NA   NA
 3467549 3467550 EcE24377A_0588 EcE24377A_0589 cusS cusR TRUE 0.995 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 3467551 3467552 EcE24377A_0590 EcE24377A_0591 cusC cusF TRUE 0.941 24.000 0.500 NA   NA
 3467552 3467553 EcE24377A_0591 EcE24377A_0592 cusF cusB FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3467553 3467554 EcE24377A_0592 EcE24377A_0593 cusB cusA TRUE 0.980 12.000 0.500 1.000 N NA
 3467554 3467555 EcE24377A_0593 EcE24377A_0594 cusA pheP FALSE 0.406 102.000 0.000 0.097 N NA
 3467556 3467557 EcE24377A_0595 EcE24377A_0596 ybdG nfnB FALSE 0.145 108.000 0.012 NA N NA
 3467557 3467558 EcE24377A_0596 EcE24377A_0597 nfnB   FALSE 0.228 48.000 0.000 NA   NA
 3467558 3467559 EcE24377A_0597 EcE24377A_0598     FALSE 0.352 -46.000 0.000 NA   NA
 3467559 3467560 EcE24377A_0598 EcE24377A_0599     FALSE 0.187 65.000 0.000 NA   NA
 3467560 3467561 EcE24377A_0599 EcE24377A_0600     FALSE 0.187 66.000 0.000 NA   NA
 3467561 3467562 EcE24377A_0600 EcE24377A_0601   entD FALSE 0.001 1230.000 0.000 1.000   NA
 3467562 3467563 EcE24377A_0601 EcE24377A_0602 entD   FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 3467563 3467564 EcE24377A_0602 EcE24377A_0603   fepA FALSE 0.402 25.000 0.000 NA   NA
 3467565 3467566 EcE24377A_0604 EcE24377A_0605 fes   TRUE 0.961 3.000 0.320 NA   NA
 3467566 3467567 EcE24377A_0605 EcE24377A_0606   entF TRUE 0.809 -3.000 0.080 NA   NA
 3467567 3467568 EcE24377A_0606 EcE24377A_0608 entF fepE FALSE 0.041 216.000 0.000 1.000 N NA
 3467569 3467570 EcE24377A_0607 EcE24377A_0609 fepC fepG TRUE 0.967 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 3467570 3467571 EcE24377A_0609 EcE24377A_0610 fepG fepD TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.066 Y NA
 3467574 3467575 EcE24377A_0613 EcE24377A_0614 entC entE TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3467575 3467576 EcE24377A_0614 EcE24377A_0615 entE entB TRUE 0.996 14.000 0.667 1.000 Y NA
 3467576 3467577 EcE24377A_0615 EcE24377A_0616 entB entA TRUE 0.969 0.000 0.024 1.000 Y NA
 3467577 3467578 EcE24377A_0616 EcE24377A_0617 entA   TRUE 0.973 3.000 0.065 NA Y NA
 3467578 3467579 EcE24377A_0617 EcE24377A_0618   cstA FALSE 0.240 181.000 0.222 NA N NA
 3467579 3467580 EcE24377A_0618 EcE24377A_0619 cstA   FALSE 0.307 182.000 0.333 NA   NA
 3467583 3467584 EcE24377A_0622 EcE24377A_0623     FALSE 0.549 -15.000 0.000 1.000   NA
 3467584 3467585 EcE24377A_0623 EcE24377A_0624     FALSE 0.517 147.000 0.333 1.000   NA
 3467585 3467586 EcE24377A_0624 EcE24377A_0625   dsbG FALSE 0.058 209.000 0.067 NA N NA
 3467587 3467588 EcE24377A_0626 EcE24377A_0627 ahpC ahpF TRUE 0.693 215.000 0.551 1.000 Y NA
 3467590 3467591 EcE24377A_0629 EcE24377A_0630     FALSE 0.245 119.000 0.083 NA   NA
 3467592 3467593 EcE24377A_0631 EcE24377A_0632   rnk FALSE 0.146 99.000 0.000 NA   NA
 3467593 3467594 EcE24377A_0632 EcE24377A_0633 rnk rna FALSE 0.027 230.000 0.018 1.000 N NA
 3467594 3467595 EcE24377A_0633 EcE24377A_0634 rna citT FALSE 0.214 114.000 0.024 1.000 N NA
 3467595 3467596 EcE24377A_0634 EcE24377A_0635 citT citG TRUE 0.704 51.000 0.194 1.000 N NA
 3467596 3467597 EcE24377A_0635 EcE24377A_0636 citG citX TRUE 0.982 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 3467597 3467598 EcE24377A_0636 EcE24377A_0637 citX citF TRUE 0.821 4.000 0.000 1.000 N NA
 3467598 3467599 EcE24377A_0637 EcE24377A_0638 citF citE TRUE 0.921 11.000 0.000 0.001 N NA
 3467599 3467600 EcE24377A_0638 EcE24377A_0639 citE citD TRUE 0.990 -3.000 0.537 0.001 N NA
 3467600 3467601 EcE24377A_0639 EcE24377A_0640 citD   FALSE 0.228 48.000 0.000 NA   NA
 3467602 3467603 EcE24377A_0641 EcE24377A_0642   dpiB FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 3467603 3467604 EcE24377A_0642 EcE24377A_0643 dpiB dpiA TRUE 0.932 -31.000 0.000 0.082 Y NA
 3467605 3467606 EcE24377A_0644 EcE24377A_0645 dcuC   FALSE 0.241 45.000 0.000 NA   NA
 3467607 3467608 EcE24377A_0646 EcE24377A_0647   pagP FALSE 0.106 123.000 0.000 NA   NA
 3467608 3467609 EcE24377A_0647 EcE24377A_0648 pagP cspE FALSE 0.370 175.000 0.333 1.000   NA
 3467611 3467612 EcE24377A_0650 EcE24377A_0651     FALSE 0.429 129.000 0.196 1.000   NA
 3467613 3467614 EcE24377A_0652 EcE24377A_0653 lipA   FALSE 0.146 99.000 0.000 NA   NA
 3467614 3467615 EcE24377A_0653 EcE24377A_0654     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467615 3467616 EcE24377A_0654 EcE24377A_0655   lipB FALSE 0.022 260.000 0.000 1.000 N NA
 3467616 3467617 EcE24377A_0655 EcE24377A_0656 lipB   FALSE 0.544 101.000 0.219 NA   NA
 3467617 3467618 EcE24377A_0656 EcE24377A_0657   dacA FALSE 0.265 110.000 0.081 NA   NA
 3467620 3467621 EcE24377A_0658 EcE24377A_0660 rlpA mrdB TRUE 0.763 11.000 0.035 NA N NA
 3467621 3467622 EcE24377A_0660 EcE24377A_0661 mrdB mrdA TRUE 0.851 3.000 0.046 1.000 N NA
 3467622 3467623 EcE24377A_0661 EcE24377A_0662 mrdA   FALSE 0.323 31.000 0.031 NA   NA
 3467623 3467624 EcE24377A_0662 EcE24377A_0663     TRUE 0.959 4.000 0.307 NA   NA
 3467624 3467625 EcE24377A_0663 EcE24377A_0664   cobC FALSE 0.010 260.000 0.000 NA   NA
 3467625 3467626 EcE24377A_0664 EcE24377A_0665 cobC nadD TRUE 0.698 24.000 0.057 1.000 N NA
 3467626 3467627 EcE24377A_0665 EcE24377A_0666 nadD holA TRUE 0.850 2.000 0.045 1.000 N NA
 3467627 3467628 EcE24377A_0666 EcE24377A_0667 holA   TRUE 0.940 0.000 0.199 NA N NA
 3467628 3467629 EcE24377A_0667 EcE24377A_0668   leuS TRUE 0.906 15.000 0.182 NA N NA
 3467631 3467632 EcE24377A_0670 EcE24377A_0671     FALSE 0.345 -52.000 0.000 NA   NA
 3467633 3467634 EcE24377A_0672 EcE24377A_0673     FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 3467634 3467635 EcE24377A_0673 EcE24377A_0674     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467637 3467638 EcE24377A_0676 EcE24377A_0677     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467639 3467640 EcE24377A_0678 EcE24377A_0679 hscC   FALSE 0.250 84.000 0.000 NA N NA
 3467640 3467641 EcE24377A_0679 EcE24377A_0680   gltL FALSE 0.490 118.000 0.195 NA N NA
 3467641 3467642 EcE24377A_0680 EcE24377A_0681 gltL gltK TRUE 0.994 0.000 0.379 1.000 Y NA
 3467642 3467643 EcE24377A_0681 EcE24377A_0682 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 3467643 3467644 EcE24377A_0682 EcE24377A_0683 gltJ gltI FALSE 0.494 170.000 0.000 0.066 Y NA
 3467645 3467646 EcE24377A_0684 EcE24377A_0685     FALSE 0.025 198.000 0.000 NA   NA
 3467647 3467648 EcE24377A_0686 EcE24377A_0687 lnt corC TRUE 0.959 25.000 0.557 1.000 N NA
 3467648 3467649 EcE24377A_0687 EcE24377A_0688 corC   FALSE 0.458 90.000 0.150 NA   NA
 3467649 3467650 EcE24377A_0688 EcE24377A_0689     TRUE 0.971 -3.000 0.457 NA   NA
 3467654 3467655 EcE24377A_5014 EcE24377A_5015     FALSE 0.224 49.000 0.000 NA   NA
 3467655 3467656 EcE24377A_5015 EcE24377A_5016     FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3467656 3467657 EcE24377A_5016 EcE24377A_5017     FALSE 0.287 35.000 0.000 NA   NA
 3467657 3467658 EcE24377A_5017 EcE24377A_5018     FALSE 0.417 24.000 0.000 NA   NA
 3467658 3467659 EcE24377A_5018 EcE24377A_5019     TRUE 0.660 9.000 0.000 NA   NA
 3467659 3467660 EcE24377A_5019 EcE24377A_0699   asnB FALSE 0.003 381.000 0.000 NA   NA
 3467660 3467661 EcE24377A_0699 EcE24377A_0700 asnB nagD FALSE 0.023 257.000 0.000 1.000 N NA
 3467661 3467662 EcE24377A_0700 EcE24377A_0701 nagD nagC TRUE 0.860 48.000 0.070 1.000 Y NA
 3467662 3467663 EcE24377A_0701 EcE24377A_0702 nagC nagA1 TRUE 0.996 9.000 0.571 1.000 Y NA
 3467663 3467664 EcE24377A_0702 EcE24377A_0703 nagA1 nagB TRUE 0.980 60.000 0.557 0.001 Y NA
 3467668 3467669 EcE24377A_0707 EcE24377A_0708     FALSE 0.369 -37.000 0.000 NA   NA
 3467670 3467671 EcE24377A_0709 EcE24377A_0710 oprD   FALSE 0.220 50.000 0.000 NA   NA
 3467672 3467673 EcE24377A_0711 EcE24377A_0712 fur fldA FALSE 0.048 289.000 0.156 1.000 N NA
 3467673 3467674 EcE24377A_0712 EcE24377A_0713 fldA   TRUE 0.946 23.000 0.473 1.000   NA
 3467674 3467675 EcE24377A_0713 EcE24377A_0714     FALSE 0.448 140.000 0.276 NA   NA
 3467676 3467677 EcE24377A_0715 EcE24377A_0716 seqA pgm TRUE 0.807 26.000 0.151 1.000 N NA
 3467678 3467679 EcE24377A_0717 EcE24377A_0718 potE speF TRUE 0.975 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 3467681 3467682 EcE24377A_0720 EcE24377A_0721 kdpE kdpD TRUE 0.993 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 3467682 3467683 EcE24377A_0721 EcE24377A_0722 kdpD kdpC TRUE 0.842 -7.000 0.100 1.000 N NA
 3467683 3467684 EcE24377A_0722 EcE24377A_0723 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 3467684 3467685 EcE24377A_0723 EcE24377A_0724 kdpB kdpA TRUE 0.981 23.000 0.201 0.001 Y NA
 3467685 3467686 EcE24377A_0724 EcE24377A_0725 kdpA kdpF TRUE 0.908 0.000 0.022 0.001   NA
 3467687 3467688 EcE24377A_0726 EcE24377A_0727     FALSE 0.013 243.000 0.000 NA   NA
 3467688 3467689 EcE24377A_0727 EcE24377A_0728     FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 3467689 3467690 EcE24377A_0728 EcE24377A_0729     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467690 3467691 EcE24377A_0729 EcE24377A_0730     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 3467691 3467692 EcE24377A_0730 EcE24377A_0731     FALSE 0.101 126.000 0.000 NA   NA
 3467692 3467693 EcE24377A_0731 EcE24377A_0732     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 3467693 3467694 EcE24377A_0732 EcE24377A_0733   phrB FALSE 0.539 -3.000 0.019 NA   NA
 3467696 3467697 EcE24377A_0735 EcE24377A_0736     FALSE 0.540 23.000 0.050 NA   NA
 3467697 3467698 EcE24377A_0736 EcE24377A_0737     TRUE 0.988 -6.000 0.379 NA Y NA
 3467698 3467699 EcE24377A_0737 EcE24377A_0738     TRUE 0.863 -10.000 0.211 NA   NA
 3467699 3467700 EcE24377A_0738 EcE24377A_0740   nei FALSE 0.397 36.000 0.037 1.000   NA
 3467701 3467702 EcE24377A_0741 EcE24377A_0742 abrB   FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 3467702 3467703 EcE24377A_0742 EcE24377A_0743     TRUE 0.723 -3.000 0.000 1.000   NA
 3467703 3467704 EcE24377A_0743 EcE24377A_0744     TRUE 0.957 15.000 0.000 1.000 Y NA
 3467704 3467705 EcE24377A_0744 EcE24377A_0745     TRUE 0.969 9.000 0.000 1.000 Y NA
 3467705 3467706 EcE24377A_0745 EcE24377A_0746     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 3467706 3467707 EcE24377A_0746 EcE24377A_0747   gltA FALSE 0.029 191.000 0.000 NA   NA
 3467708 3467709 EcE24377A_0748 EcE24377A_0749 sdhC sdhD TRUE 0.995 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3467709 3467710 EcE24377A_0749 EcE24377A_0750 sdhD sdhA TRUE 0.998 0.000 0.705 0.002 Y NA
 3467710 3467711 EcE24377A_0750 EcE24377A_0751 sdhA sdhB TRUE 0.996 16.000 0.604 0.002 Y NA
 3467711 3467712 EcE24377A_0751 EcE24377A_0752 sdhB sucA FALSE 0.333 201.000 0.067 1.000 Y NA
 3467712 3467713 EcE24377A_0752 EcE24377A_0753 sucA sucB TRUE 0.995 15.000 0.667 1.000 Y NA
 3467713 3467714 EcE24377A_0753 EcE24377A_0754 sucB sucC TRUE 0.838 94.000 0.136 1.000 Y NA
 3467714 3467715 EcE24377A_0754 EcE24377A_0755 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 3467717 3467718 EcE24377A_0757 EcE24377A_0758     TRUE 0.945 18.000 0.036 1.000 Y NA
 3467718 3467719 EcE24377A_0758 EcE24377A_0759     FALSE 0.402 25.000 0.000 NA   NA
 3467721 3467722 EcE24377A_0761 EcE24377A_0762 cydA cydB TRUE 0.967 16.000 0.000 0.059 Y NA
 3467722 3467723 EcE24377A_0762 EcE24377A_0763 cydB   TRUE 0.858 15.000 0.149 NA   NA
 3467723 3467724 EcE24377A_0763 EcE24377A_0764     TRUE 0.960 0.000 0.310 NA   NA
 3467724 3467725 EcE24377A_0764 EcE24377A_0765   ybgC FALSE 0.160 150.000 0.095 NA   NA
 3467725 3467726 EcE24377A_0765 EcE24377A_0766 ybgC tolQ TRUE 0.983 -3.000 0.593 1.000   NA
 3467726 3467727 EcE24377A_0766 EcE24377A_0767 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.077 Y NA
 3467727 3467728 EcE24377A_0767 EcE24377A_0768 tolR tolA FALSE 0.502 65.000 0.114 NA N NA
 3467728 3467729 EcE24377A_0768 EcE24377A_0769 tolA tolB FALSE 0.185 133.000 0.051 NA N NA
 3467729 3467730 EcE24377A_0769 EcE24377A_0770 tolB pal TRUE 0.938 35.000 0.592 1.000 N NA
 3467730 3467731 EcE24377A_0770 EcE24377A_0771 pal ygbF TRUE 0.867 10.000 0.088 1.000   NA
 3467731 3467732 EcE24377A_0771 EcE24377A_5020 ygbF   FALSE 0.045 165.000 0.000 NA   NA
 3467732 3467733 EcE24377A_5020 EcE24377A_5021     FALSE 0.085 136.000 0.000 NA   NA
 3467733 3467734 EcE24377A_5021 EcE24377A_5022     TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 3467734 3467735 EcE24377A_5022 EcE24377A_5023     FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 3467735 3467736 EcE24377A_5023 EcE24377A_5024     FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 3467736 3467737 EcE24377A_5024 EcE24377A_0777   nadA FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 3467737 3467738 EcE24377A_0777 EcE24377A_0779 nadA pnuC TRUE 0.799 53.000 0.023 1.000 Y NA
 3467739 3467740 EcE24377A_0778 EcE24377A_0780 zitB   FALSE 0.247 114.000 0.057 1.000   NA
 3467742 3467743 EcE24377A_0782 EcE24377A_0783 gpmA galM FALSE 0.249 202.000 0.009 1.000 Y NA
 3467743 3467744 EcE24377A_0783 EcE24377A_0784 galM galK TRUE 0.980 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 3467744 3467745 EcE24377A_0784 EcE24377A_0785 galK galT TRUE 0.987 4.000 0.370 0.001 N NA
 3467745 3467746 EcE24377A_0785 EcE24377A_0786 galT galE TRUE 0.936 10.000 0.053 0.001 N NA
 3467746 3467747 EcE24377A_0786 EcE24377A_0787 galE modF FALSE 0.012 261.000 0.023 1.000   NA
 3467747 3467748 EcE24377A_0787 EcE24377A_0788 modF modE FALSE 0.360 68.000 0.009 0.097   NA
 3467749 3467750 EcE24377A_0789 EcE24377A_0790   modA FALSE 0.094 166.000 0.072 NA   NA
 3467750 3467751 EcE24377A_0790 EcE24377A_0791 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 3467751 3467752 EcE24377A_0791 EcE24377A_0792 modB modC TRUE 0.997 3.000 0.537 0.001 Y NA
 3467756 3467757 EcE24377A_0796 EcE24377A_0797     FALSE 0.175 76.000 0.000 NA   NA
 3467757 3467758 EcE24377A_0797 EcE24377A_0798     FALSE 0.439 159.000 0.300 1.000 N NA
 3467759 3467760 EcE24377A_0799 EcE24377A_0800     FALSE 0.455 135.000 0.200 1.000 N NA
 3467760 3467761 EcE24377A_0800 EcE24377A_0801     FALSE 0.002 1459.000 0.000 1.000 N NA
 3467761 3467762 EcE24377A_0801 EcE24377A_0802     TRUE 0.667 7.000 0.000 NA   NA
 3467762 3467763 EcE24377A_0802 EcE24377A_0803     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3467763 3467764 EcE24377A_0803 EcE24377A_0804   exo FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 3467764 3467765 EcE24377A_0804 EcE24377A_0805 exo bet TRUE 0.850 -3.000 0.000 0.082   NA
 3467765 3467766 EcE24377A_0805 EcE24377A_0806 bet gam TRUE 0.717 6.000 0.040 NA   NA
 3467766 3467767 EcE24377A_0806 EcE24377A_0807 gam kiL FALSE 0.175 76.000 0.000 NA   NA
 3467767 3467768 EcE24377A_0807 EcE24377A_0808 kiL   FALSE 0.002 598.000 0.000 NA   NA
 3467769 3467770 EcE24377A_0809 EcE24377A_0810     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 3467770 3467771 EcE24377A_0810 EcE24377A_0811     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467771 3467772 EcE24377A_0811 EcE24377A_0812     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467772 3467773 EcE24377A_0812 EcE24377A_0813   emrE FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 3467773 3467774 EcE24377A_0813 EcE24377A_0814 emrE   FALSE 0.001 1081.000 0.000 NA   NA
 3467775 3467776 EcE24377A_0815 EcE24377A_0816     TRUE 0.798 50.000 0.000 NA Y NA
 3467776 3467777 EcE24377A_0816 EcE24377A_0817     TRUE 0.960 -3.000 0.000 NA Y NA
 3467778 3467779 EcE24377A_0818 EcE24377A_0819     FALSE 0.028 193.000 0.000 NA   NA
 3467779 3467780 EcE24377A_0819 EcE24377A_0820     FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 3467780 3467781 EcE24377A_0820 EcE24377A_0821   rusA TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467781 3467782 EcE24377A_0821 EcE24377A_0822 rusA   TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467782 3467783 EcE24377A_0822 EcE24377A_0823     FALSE 0.165 86.000 0.000 NA   NA
 3467784 3467785 EcE24377A_0824 EcE24377A_0825     FALSE 0.338 -73.000 0.000 NA   NA
 3467786 3467787 EcE24377A_0826 EcE24377A_0827     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467787 3467788 EcE24377A_0827 EcE24377A_0828     TRUE 0.723 -3.000 0.000 1.000   NA
 3467788 3467789 EcE24377A_0828 EcE24377A_0829     FALSE 0.022 205.000 0.000 NA   NA
 3467789 3467790 EcE24377A_0829 EcE24377A_0830     FALSE 0.001 1156.000 0.000 NA   NA
 3467790 3467791 EcE24377A_0830 EcE24377A_0831     FALSE 0.077 140.000 0.000 NA   NA
 3467791 3467792 EcE24377A_0831 EcE24377A_0832     FALSE 0.403 -25.000 0.000 NA   NA
 3467792 3467793 EcE24377A_0832 EcE24377A_0833     TRUE 0.669 6.000 0.000 NA   NA
 3467793 3467794 EcE24377A_0833 EcE24377A_0834     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3467795 3467796 EcE24377A_0835 EcE24377A_0836     FALSE 0.001 746.000 0.000 NA   NA
 3467796 3467797 EcE24377A_0836 EcE24377A_0837   bioA FALSE 0.085 59.000 0.003 NA   NA
 3467798 3467799 EcE24377A_0838 EcE24377A_0839 bioB bioF TRUE 0.990 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 3467799 3467800 EcE24377A_0839 EcE24377A_0840 bioF bioC TRUE 0.975 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 3467800 3467801 EcE24377A_0840 EcE24377A_0841 bioC bioD TRUE 0.973 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 3467801 3467802 EcE24377A_0841 EcE24377A_0842 bioD uvrB FALSE 0.007 579.000 0.000 0.096 N NA
 3467804 3467805 EcE24377A_0844 EcE24377A_0845 moaA moaB TRUE 0.971 22.000 0.108 0.003 Y NA
 3467805 3467806 EcE24377A_0845 EcE24377A_0846 moaB moaC TRUE 0.988 3.000 0.109 0.003 Y NA
 3467806 3467807 EcE24377A_0846 EcE24377A_0847 moaC moaD TRUE 0.984 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 3467807 3467808 EcE24377A_0847 EcE24377A_0848 moaD moaE TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 3467808 3467809 EcE24377A_0848 EcE24377A_0849 moaE   FALSE 0.070 137.000 0.025 NA   NA
 3467812 3467813 EcE24377A_0852 EcE24377A_0853     TRUE 0.823 0.000 0.071 NA   NA
 3467817 3467818 EcE24377A_0856 EcE24377A_0858     TRUE 0.997 11.000 0.609 0.005 Y NA
 3467818 3467819 EcE24377A_0858 EcE24377A_0859     TRUE 0.977 -7.000 0.547 0.096   NA
 3467819 3467820 EcE24377A_0859 EcE24377A_0860     TRUE 0.969 -7.000 0.545 1.000   NA
 3467820 3467821 EcE24377A_0860 EcE24377A_0861     TRUE 0.958 3.000 0.236 1.000 N NA
 3467826 3467827 EcE24377A_0866 EcE24377A_0867     TRUE 0.595 28.000 0.041 1.000 N NA
 3467830 3467831 EcE24377A_0870 EcE24377A_0871     FALSE 0.008 265.000 0.027 NA   NA
 3467831 3467832 EcE24377A_0871 EcE24377A_0872     FALSE 0.248 74.000 0.000 1.000   NA
 3467832 3467833 EcE24377A_0872 EcE24377A_0873   fiu TRUE 0.677 42.000 0.171 1.000   NA
 3467837 3467838 EcE24377A_0876 EcE24377A_0878   glnQ FALSE 0.179 117.000 0.000 NA N NA
 3467838 3467839 EcE24377A_0878 EcE24377A_0879 glnQ glnP TRUE 0.967 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 3467839 3467840 EcE24377A_0879 EcE24377A_0880 glnP glnH TRUE 0.687 139.000 0.051 0.076 Y NA
 3467840 3467841 EcE24377A_0880 EcE24377A_0881 glnH dps FALSE 0.006 404.000 0.000 1.000 N NA
 3467841 3467842 EcE24377A_0881 EcE24377A_0882 dps   FALSE 0.041 170.000 0.000 NA   NA
 3467842 3467843 EcE24377A_0882 EcE24377A_0883   rhtA FALSE 0.325 31.000 0.000 NA   NA
 3467845 3467846 EcE24377A_0885 EcE24377A_0886     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3467847 3467848 EcE24377A_0887 EcE24377A_0888 mntR   TRUE 0.749 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3467850 3467851 EcE24377A_0890 EcE24377A_0891     FALSE 0.012 279.000 0.000 1.000   NA
 3467852 3467853 EcE24377A_0892 EcE24377A_0893   supH FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 3467853 3467854 EcE24377A_0893 EcE24377A_0894 supH   FALSE 0.102 146.000 0.000 1.000   NA
 3467854 3467855 EcE24377A_0894 EcE24377A_0895     TRUE 0.982 6.000 0.316 0.003 N NA
 3467857 3467858 EcE24377A_0897 EcE24377A_0898 moeB moeA TRUE 0.995 0.000 0.323 0.003 Y NA
 3467859 3467860 EcE24377A_0899 EcE24377A_0900   gsiA TRUE 0.765 -13.000 0.104 1.000   NA
 3467860 3467861 EcE24377A_0900 EcE24377A_0901 gsiA gsiB TRUE 0.747 20.000 0.083 1.000   NA
 3467861 3467862 EcE24377A_0901 EcE24377A_0902 gsiB gsiC TRUE 0.996 18.000 0.803 0.065 Y NA
 3467862 3467863 EcE24377A_0902 EcE24377A_0903 gsiC gsiD TRUE 0.998 3.000 0.689 0.065 Y NA
 3467863 3467864 EcE24377A_0903 EcE24377A_0904 gsiD   FALSE 0.059 178.000 0.000 NA N NA
 3467864 3467865 EcE24377A_0904 EcE24377A_0905     TRUE 0.965 8.000 0.000 NA Y NA
 3467867 3467868 EcE24377A_0907 EcE24377A_0909 bssR yliI FALSE 0.172 111.000 0.047 NA   NA
 3467871 3467872 EcE24377A_0911 EcE24377A_0912 deoR   TRUE 0.690 58.000 0.235 1.000   NA
 3467873 3467874 EcE24377A_0913 EcE24377A_0914   mdfA FALSE 0.446 -15.000 0.000 NA   NA
 3467875 3467876 EcE24377A_0915 EcE24377A_0916   ybjI FALSE 0.159 92.000 0.000 NA   NA
 3467876 3467877 EcE24377A_0916 EcE24377A_0917 ybjI   TRUE 0.759 0.000 0.000 1.000   NA
 3467882 3467883 EcE24377A_0922 EcE24377A_0923   nfsA TRUE 0.788 -16.000 0.159 NA   NA
 3467883 3467884 EcE24377A_0923 EcE24377A_0924 nfsA rimK FALSE 0.345 61.000 0.000 1.000 N NA
 3467884 3467885 EcE24377A_0924 EcE24377A_0925 rimK   FALSE 0.415 40.000 0.065 NA   NA
 3467885 3467886 EcE24377A_0925 EcE24377A_0926   potF FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3467886 3467887 EcE24377A_0926 EcE24377A_0927 potF potG TRUE 0.967 95.000 0.679 1.000 Y NA
 3467887 3467888 EcE24377A_0927 EcE24377A_0928 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 3467888 3467889 EcE24377A_0928 EcE24377A_0929 potH potI TRUE 0.996 -3.000 0.528 0.064 Y NA
 3467889 3467890 EcE24377A_0929 EcE24377A_0930 potI   TRUE 0.684 60.000 0.264 NA   NA
 3467890 3467891 EcE24377A_0930 EcE24377A_0931   rumB TRUE 0.723 41.000 0.226 NA   NA
 3467891 3467892 EcE24377A_0931 EcE24377A_0933 rumB   TRUE 0.633 12.000 0.000 NA   NA
 3467893 3467894 EcE24377A_0932 EcE24377A_0934 artJ artM FALSE 0.221 291.000 0.143 0.076 Y NA
 3467894 3467895 EcE24377A_0934 EcE24377A_0935 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.016 Y NA
 3467895 3467896 EcE24377A_0935 EcE24377A_0936 artQ artI TRUE 0.993 7.000 0.260 0.064 Y NA
 3467896 3467897 EcE24377A_0936 EcE24377A_0937 artI artP TRUE 0.985 18.000 0.323 1.000 Y NA
 3467897 3467898 EcE24377A_0937 EcE24377A_0938 artP   FALSE 0.055 218.000 0.081 1.000   NA
 3467899 3467900 EcE24377A_0939 EcE24377A_0941   amiD TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467901 3467902 EcE24377A_0940 EcE24377A_0942     TRUE 0.857 63.000 0.022 0.003 Y NA
 3467902 3467903 EcE24377A_0942 EcE24377A_0943   ltaE TRUE 0.875 11.000 0.074 1.000 N NA
 3467903 3467904 EcE24377A_0943 EcE24377A_0944 ltaE poxB TRUE 0.867 37.000 0.041 1.000 Y NA
 3467904 3467905 EcE24377A_0944 EcE24377A_0945 poxB hcr FALSE 0.167 133.000 0.025 1.000 N NA
 3467905 3467906 EcE24377A_0945 EcE24377A_0946 hcr hcp TRUE 0.977 12.000 0.000 0.019 Y NA
 3467906 3467907 EcE24377A_0946 EcE24377A_0947 hcp   FALSE 0.106 144.000 0.000 1.000   NA
 3467907 3467908 EcE24377A_0947 EcE24377A_0948   aqpZ FALSE 0.003 457.000 0.025 1.000   NA
 3467911 3467912 EcE24377A_0951 EcE24377A_0952 macA macB TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3467914 3467915 EcE24377A_0954 EcE24377A_0955 clpS clpA TRUE 0.934 31.000 0.596 NA   NA
 3467916 3467917 EcE24377A_5025 EcE24377A_0957   infA FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 3467917 3467918 EcE24377A_0957 EcE24377A_0958 infA aat FALSE 0.014 285.000 0.020 1.000 N NA
 3467918 3467919 EcE24377A_0958 EcE24377A_0959 aat cudC TRUE 0.859 42.000 0.049 1.000 Y NA
 3467919 3467920 EcE24377A_0959 EcE24377A_0960 cudC cydD TRUE 0.998 1.000 0.631 0.005 Y NA
 3467923 3467924 EcE24377A_0963 EcE24377A_0964   lrp FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 3467924 3467925 EcE24377A_0964 EcE24377A_0965 lrp ftsK TRUE 0.631 135.000 0.345 1.000 N NA
 3467925 3467926 EcE24377A_0965 EcE24377A_0966 ftsK lolA FALSE 0.466 155.000 0.305 1.000 N NA
 3467926 3467927 EcE24377A_0966 EcE24377A_0967 lolA   TRUE 0.931 11.000 0.167 1.000 N NA
 3467927 3467928 EcE24377A_0967 EcE24377A_0968   serS TRUE 0.554 91.000 0.078 0.095 N NA
 3467928 3467929 EcE24377A_0968 EcE24377A_0969 serS dmsA FALSE 0.030 239.000 0.000 1.000 N NA
 3467929 3467930 EcE24377A_0969 EcE24377A_0971 dmsA dmsB1 TRUE 0.989 11.000 0.172 0.058 Y NA
 3467933 3467934 EcE24377A_0973 EcE24377A_0974     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 3467935 3467936 EcE24377A_0975 EcE24377A_0976     TRUE 0.702 18.000 0.000 1.000 N NA
 3467938 3467939 EcE24377A_0978 EcE24377A_0979     FALSE 0.001 892.000 0.000 NA   NA
 3467940 3467941 EcE24377A_0980 EcE24377A_0981 pflA   FALSE 0.508 32.000 0.000 1.000 N NA
 3467942 3467943 EcE24377A_0982 EcE24377A_0983 cox   FALSE 0.036 178.000 0.000 NA   NA
 3467943 3467944 EcE24377A_0983 EcE24377A_0984     FALSE 0.325 31.000 0.000 NA   NA
 3467944 3467945 EcE24377A_0984 EcE24377A_0985     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 3467945 3467946 EcE24377A_0985 EcE24377A_0986     TRUE 0.912 0.000 0.167 NA   NA
 3467946 3467947 EcE24377A_0986 EcE24377A_0987     TRUE 0.896 -3.000 0.167 NA   NA
 3467947 3467948 EcE24377A_0987 EcE24377A_0988   gpA FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3467948 3467949 EcE24377A_0988 EcE24377A_0989 gpA   FALSE 0.001 1114.000 0.000 NA   NA
 3467951 3467952 EcE24377A_0992 EcE24377A_0993     FALSE 0.525 -7.000 0.000 NA   NA
 3467952 3467953 EcE24377A_0993 EcE24377A_0994     FALSE 0.179 74.000 0.000 NA   NA
 3467953 3467954 EcE24377A_0994 EcE24377A_0995     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000 Y NA
 3467954 3467955 EcE24377A_0995 EcE24377A_0996     FALSE 0.182 72.000 0.000 NA   NA
 3467955 3467956 EcE24377A_0996 EcE24377A_0997   gpU TRUE 0.978 15.000 0.625 NA   NA
 3467956 3467957 EcE24377A_0997 EcE24377A_0998 gpU   TRUE 0.972 0.000 0.400 NA   NA
 3467957 3467958 EcE24377A_0998 EcE24377A_0999     TRUE 0.877 82.000 0.667 NA   NA
 3467959 3467960 EcE24377A_1000 EcE24377A_1001 pflB2   TRUE 0.822 55.000 0.345 1.000 N NA
 3467960 3467961 EcE24377A_1001 EcE24377A_1002     FALSE 0.003 406.000 0.000 NA   NA
 3467962 3467963 EcE24377A_1003 EcE24377A_1004   serC FALSE 0.014 199.000 0.014 NA   NA
 3467963 3467964 EcE24377A_1004 EcE24377A_1005 serC aroA TRUE 0.783 71.000 0.033 1.000 Y NA
 3467964 3467965 EcE24377A_1005 EcE24377A_1006 aroA   FALSE 0.060 169.000 0.003 1.000 N NA
 3467965 3467966 EcE24377A_1006 EcE24377A_1007   cmk FALSE 0.058 173.000 0.004 1.000 N NA
 3467966 3467967 EcE24377A_1007 EcE24377A_1008 cmk rpsA TRUE 0.658 111.000 0.281 1.000 N NA
 3467967 3467968 EcE24377A_1008 EcE24377A_1009 rpsA ihfB FALSE 0.426 160.000 0.292 1.000 N NA
 3467968 3467969 EcE24377A_1009 EcE24377A_1011 ihfB   FALSE 0.018 207.000 0.003 1.000   NA
 3467969 3467970 EcE24377A_1011 EcE24377A_1012   msbA TRUE 0.662 37.000 0.075 0.093   NA
 3467970 3467971 EcE24377A_1012 EcE24377A_1013 msbA lpxK TRUE 0.940 -3.000 0.205 1.000 N NA
 3467971 3467972 EcE24377A_1013 EcE24377A_1014 lpxK   FALSE 0.192 37.000 0.017 NA   NA
 3467972 3467973 EcE24377A_1014 EcE24377A_1015     FALSE 0.143 52.000 0.016 NA   NA
 3467973 3467974 EcE24377A_1015 EcE24377A_1016   kdsB TRUE 0.941 -3.000 0.265 NA   NA
 3467974 3467975 EcE24377A_1016 EcE24377A_1018 kdsB   FALSE 0.043 154.000 0.023 NA   NA
 3467976 3467977 EcE24377A_1017 EcE24377A_1019     FALSE 0.351 -97.000 0.036 NA   NA
 3467978 3467979 EcE24377A_1020 EcE24377A_1021 smtA mukF TRUE 0.962 -3.000 0.325 NA N NA
 3467979 3467980 EcE24377A_1021 EcE24377A_1022 mukF mukE TRUE 0.914 -19.000 0.036 NA Y NA
 3467980 3467981 EcE24377A_1022 EcE24377A_1023 mukE mukB TRUE 0.984 0.000 0.000 0.001 Y NA
 3467981 3467982 EcE24377A_1023 EcE24377A_1024 mukB   FALSE 0.014 261.000 0.000 1.000   NA
 3467982 3467983 EcE24377A_1024 EcE24377A_1025     FALSE 0.348 181.000 0.372 NA   NA
 3467983 3467984 EcE24377A_1025 EcE24377A_1026     TRUE 0.625 27.000 0.089 NA   NA
 3467985 3467986 EcE24377A_1027 EcE24377A_1028 aspC   FALSE 0.179 74.000 0.000 NA   NA
 3467986 3467987 EcE24377A_1028 EcE24377A_1029   ompF TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3467987 3467988 EcE24377A_1029 EcE24377A_1030 ompF asnS FALSE 0.004 602.000 0.000 1.000 N NA
 3467988 3467989 EcE24377A_1030 EcE24377A_1031 asnS pncB FALSE 0.092 169.000 0.034 1.000 N NA
 3467990 3467991 EcE24377A_1032 EcE24377A_1033   pepN FALSE 0.281 36.000 0.000 NA   NA
 3467991 3467992 EcE24377A_1033 EcE24377A_1034 pepN   FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3467993 3467994 EcE24377A_1035 EcE24377A_1036 ssuB   TRUE 0.994 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 3467994 3467995 EcE24377A_1036 EcE24377A_1037   ssuD TRUE 0.950 11.000 0.226 1.000 N NA
 3467995 3467996 EcE24377A_1037 EcE24377A_1038 ssuD   FALSE 0.014 238.000 0.000 NA   NA
 3467997 3467998 EcE24377A_1039 EcE24377A_1040     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3467999 3468000 EcE24377A_1041 EcE24377A_1042 gpG   TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3468000 3468001 EcE24377A_1042 EcE24377A_1043     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3468001 3468002 EcE24377A_1043 EcE24377A_1044     TRUE 0.939 -9.000 0.375 NA   NA
 3468002 3468003 EcE24377A_1044 EcE24377A_1045     TRUE 0.969 1.000 0.375 NA   NA
 3468003 3468004 EcE24377A_1045 EcE24377A_1046     TRUE 0.985 -3.000 0.692 NA   NA
 3468004 3468005 EcE24377A_1046 EcE24377A_1047     TRUE 0.897 -12.000 0.281 NA   NA
 3468005 3468006 EcE24377A_1047 EcE24377A_1048     FALSE 0.525 -7.000 0.000 NA   NA
 3468006 3468007 EcE24377A_1048 EcE24377A_1049     FALSE 0.266 39.000 0.000 NA   NA
 3468009 3468010 EcE24377A_1051 EcE24377A_1052     TRUE 0.766 -49.000 0.169 1.000   NA
 3468011 3468012 EcE24377A_1053 EcE24377A_1054     TRUE 0.954 83.000 0.500 1.000 Y NA
 3468012 3468013 EcE24377A_1054 EcE24377A_1055   fimD2 TRUE 0.991 25.000 0.667 1.000 Y NA
 3468013 3468014 EcE24377A_1055 EcE24377A_1056 fimD2   TRUE 0.941 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 3468014 3468015 EcE24377A_1056 EcE24377A_1057     TRUE 0.978 12.000 0.000 0.009 Y NA
 3468015 3468016 EcE24377A_1057 EcE24377A_1058     TRUE 0.998 8.000 0.667 0.009 Y NA
 3468016 3468017 EcE24377A_1058 EcE24377A_1059     TRUE 0.984 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 3468017 3468018 EcE24377A_1059 EcE24377A_1060   pyrD FALSE 0.242 111.000 0.000 1.000 N NA
 3468018 3468019 EcE24377A_1060 EcE24377A_1062 pyrD   FALSE 0.181 138.000 0.081 NA   NA
 3468021 3468022 EcE24377A_1063 EcE24377A_1064   uup TRUE 0.814 12.000 0.061 1.000   NA
 3468022 3468023 EcE24377A_1064 EcE24377A_1065 uup pqiA FALSE 0.146 130.000 0.054 NA   NA
 3468023 3468024 EcE24377A_1065 EcE24377A_1066 pqiA pqiB TRUE 0.990 5.000 0.819 NA   NA
 3468024 3468025 EcE24377A_1066 EcE24377A_1067 pqiB   TRUE 0.977 -3.000 0.531 NA   NA
 3468026 3468027 EcE24377A_1068 EcE24377A_1069 fabA   TRUE 0.763 69.000 0.290 1.000 N NA
 3468033 3468034 EcE24377A_1074 EcE24377A_1076     TRUE 0.841 10.000 0.090 NA   NA
 3468036 3468037 EcE24377A_1078 EcE24377A_1079 mgsA   FALSE 0.232 96.000 0.055 NA   NA
 3468039 3468040 EcE24377A_1081 EcE24377A_1082     FALSE 0.410 58.000 0.094 NA   NA
 3468040 3468041 EcE24377A_1082 EcE24377A_1083   tusE FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 3468041 3468042 EcE24377A_1083 EcE24377A_1084 tusE   FALSE 0.437 91.000 0.140 NA   NA
 3468042 3468043 EcE24377A_1084 EcE24377A_5026     FALSE 0.021 207.000 0.000 NA   NA
 3468044 3468045 EcE24377A_1087 EcE24377A_1088 hyaA hyaB TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3468045 3468046 EcE24377A_1088 EcE24377A_1089 hyaB hyaC TRUE 0.990 19.000 0.355 0.057 Y NA
 3468046 3468047 EcE24377A_1089 EcE24377A_1090 hyaC hyaD TRUE 0.983 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 3468047 3468048 EcE24377A_1090 EcE24377A_1091 hyaD hyaE TRUE 0.835 -3.000 0.096 NA   NA
 3468048 3468049 EcE24377A_1091 EcE24377A_1092 hyaE hyaF TRUE 0.987 -3.000 0.769 NA   NA
 3468049 3468050 EcE24377A_1092 EcE24377A_1093 hyaF appC FALSE 0.154 134.000 0.061 NA   NA
 3468050 3468051 EcE24377A_1093 EcE24377A_1094 appC appB TRUE 0.987 12.000 0.158 0.057 Y NA
 3468051 3468052 EcE24377A_1094 EcE24377A_1095 appB   TRUE 0.837 13.000 0.105 NA   NA
 3468052 3468053 EcE24377A_1095 EcE24377A_1096   appA FALSE 0.169 80.000 0.000 NA   NA
 3468054 3468055 EcE24377A_1097 EcE24377A_1098 etk   TRUE 0.985 20.000 1.000 1.000 N NA
 3468055 3468056 EcE24377A_1098 EcE24377A_1099   yccZ TRUE 0.979 -12.000 0.750 1.000 N NA
 3468056 3468057 EcE24377A_1099 EcE24377A_1100 yccZ   FALSE 0.402 25.000 0.000 NA   NA
 3468057 3468058 EcE24377A_1100 EcE24377A_1101     TRUE 0.798 0.000 0.060 NA   NA
 3468058 3468059 EcE24377A_1101 EcE24377A_1102   ymcC TRUE 0.981 -3.000 0.600 NA   NA
 3468059 3468060 EcE24377A_1102 EcE24377A_1103 ymcC   FALSE 0.132 107.000 0.000 NA   NA
 3468060 3468061 EcE24377A_1103 EcE24377A_1104     FALSE 0.003 424.000 0.000 NA   NA
 3468062 3468063 EcE24377A_1105 EcE24377A_1107     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 3468064 3468065 EcE24377A_1106 EcE24377A_1108     FALSE 0.305 33.000 0.000 NA   NA
 3468065 3468066 EcE24377A_1108 EcE24377A_1109     FALSE 0.319 -126.000 0.000 NA   NA
 3468066 3468067 EcE24377A_1109 EcE24377A_1110   torS FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 3468070 3468071 EcE24377A_1113 EcE24377A_1114 torC torA TRUE 0.993 0.000 0.263 0.057 Y NA
 3468071 3468072 EcE24377A_1114 EcE24377A_1116 torA torD TRUE 0.907 -3.000 0.077 0.057   NA
 3468073 3468074 EcE24377A_1115 EcE24377A_1117   cbpM TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 3468074 3468075 EcE24377A_1117 EcE24377A_1118 cbpM cbpA TRUE 0.980 0.000 0.512 NA   NA
 3468076 3468077 EcE24377A_1119 EcE24377A_1120   agp FALSE 0.007 291.000 0.000 NA   NA
 3468078 3468079 EcE24377A_1121 EcE24377A_1122   wrbA TRUE 0.899 21.000 0.290 NA   NA
 3468081 3468082 EcE24377A_1124 EcE24377A_1125     TRUE 0.959 21.000 0.533 1.000   NA
 3468082 3468083 EcE24377A_1125 EcE24377A_1126     TRUE 0.989 11.000 0.625 0.046   NA
 3468083 3468084 EcE24377A_1126 EcE24377A_1127     TRUE 0.943 10.000 0.256 NA   NA
 3468084 3468085 EcE24377A_1127 EcE24377A_1128     TRUE 0.967 8.000 0.365 NA   NA
 3468085 3468086 EcE24377A_1128 EcE24377A_1129     TRUE 0.974 12.000 0.442 NA N NA
 3468086 3468087 EcE24377A_1129 EcE24377A_1130     TRUE 0.984 -3.000 0.621 NA N NA
 3468092 3468093 EcE24377A_1135 EcE24377A_1136 putP   FALSE 0.003 542.000 0.000 NA N NA
 3468093 3468094 EcE24377A_1136 EcE24377A_1137     TRUE 0.939 58.000 0.356 NA Y NA
 3468094 3468095 EcE24377A_1137 EcE24377A_1138     TRUE 0.993 6.000 0.378 NA Y NA
 3468098 3468099 EcE24377A_1141 EcE24377A_1142 pgaD pgaC TRUE 0.976 2.000 0.462 NA   NA
 3468099 3468100 EcE24377A_1142 EcE24377A_1143 pgaC pgaB TRUE 0.965 -7.000 0.435 1.000 N NA
 3468100 3468101 EcE24377A_1143 EcE24377A_1144 pgaB pgaA TRUE 0.988 9.000 0.696 1.000   NA
 3468103 3468104 EcE24377A_1146 EcE24377A_1147     TRUE 0.850 -3.000 0.000 0.079   NA
 3468105 3468106 EcE24377A_1148 EcE24377A_1149     FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3468107 3468108 EcE24377A_5027 EcE24377A_1151     FALSE 0.145 100.000 0.000 NA   NA
 3468109 3468110 EcE24377A_1152 EcE24377A_1153     FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 3468110 3468111 EcE24377A_1153 EcE24377A_1154     TRUE 0.934 24.000 0.417 1.000   NA
 3468111 3468112 EcE24377A_1154 EcE24377A_1155     FALSE 0.413 102.000 0.145 NA   NA
 3468113 3468114 EcE24377A_1156 EcE24377A_1157 csgG csgF FALSE 0.444 27.000 0.043 NA   NA
 3468114 3468115 EcE24377A_1157 EcE24377A_1158 csgF csgE TRUE 0.964 25.000 0.723 NA   NA
 3468115 3468116 EcE24377A_1158 EcE24377A_1159 csgE csgD TRUE 0.917 5.000 0.176 NA   NA
 3468116 3468117 EcE24377A_1159 EcE24377A_1160 csgD   FALSE 0.003 412.000 0.000 NA   NA
 3468118 3468119 EcE24377A_1161 EcE24377A_1162 csgB   TRUE 0.893 41.000 0.333 0.009   NA
 3468119 3468120 EcE24377A_1162 EcE24377A_1163   csgC TRUE 0.894 59.000 0.667 NA   NA
 3468120 3468121 EcE24377A_1163 EcE24377A_1164 csgC   TRUE 0.691 121.000 0.429 NA   NA
 3468121 3468122 EcE24377A_1164 EcE24377A_1165     FALSE 0.140 95.000 0.028 NA   NA
 3468122 3468123 EcE24377A_1165 EcE24377A_1166     TRUE 0.614 -7.000 0.046 NA   NA
 3468124 3468125 EcE24377A_1167 EcE24377A_1168 mdoC   FALSE 0.241 45.000 0.000 NA   NA
 3468126 3468127 EcE24377A_1169 EcE24377A_1170 mdoG mdoH TRUE 0.967 -7.000 0.469 1.000 N NA
 3468127 3468128 EcE24377A_1170 EcE24377A_1171 mdoH   TRUE 0.660 9.000 0.000 NA   NA
 3468128 3468129 EcE24377A_1171 EcE24377A_1172     FALSE 0.502 -9.000 0.000 NA   NA
 3468130 3468131 EcE24377A_1173 EcE24377A_1174 msyB mdtG TRUE 0.721 83.000 0.333 NA   NA
 3468135 3468136 EcE24377A_1178 EcE24377A_1179 yceI   TRUE 0.988 4.000 0.676 1.000   NA
 3468138 3468139 EcE24377A_1181 EcE24377A_1182   solA TRUE 0.737 48.000 0.269 NA   NA
 3468139 3468140 EcE24377A_1182 EcE24377A_1183 solA   TRUE 0.707 115.000 0.423 NA   NA
 3468140 3468141 EcE24377A_1183 EcE24377A_1184   dinI FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 3468141 3468142 EcE24377A_1184 EcE24377A_1185 dinI pyrC FALSE 0.177 74.000 0.031 NA   NA
 3468142 3468143 EcE24377A_1185 EcE24377A_1186 pyrC   FALSE 0.103 106.000 0.022 NA   NA
 3468143 3468144 EcE24377A_1186 EcE24377A_1187   grxB FALSE 0.187 134.000 0.078 NA   NA
 3468144 3468145 EcE24377A_1187 EcE24377A_1188 grxB mdtH FALSE 0.530 64.000 0.103 1.000 N NA
 3468146 3468147 EcE24377A_1189 EcE24377A_1190 rimJ   TRUE 0.861 11.000 0.116 NA   NA
 3468147 3468148 EcE24377A_1190 EcE24377A_1191     TRUE 0.864 2.000 0.103 NA   NA
 3468148 3468149 EcE24377A_1191 EcE24377A_1192   mviN FALSE 0.152 110.000 0.022 1.000   NA
 3468150 3468151 EcE24377A_1193 EcE24377A_1194 flgN flgM TRUE 0.996 5.000 0.361 0.002 Y NA
 3468151 3468152 EcE24377A_1194 EcE24377A_1195 flgM flgA TRUE 0.923 76.000 0.330 NA Y NA
 3468153 3468154 EcE24377A_1196 EcE24377A_1197 flgB flgC TRUE 0.998 4.000 0.824 0.003 Y NA
 3468154 3468155 EcE24377A_1197 EcE24377A_1198 flgC flgD TRUE 0.982 12.000 0.186 NA Y NA
 3468155 3468156 EcE24377A_1198 EcE24377A_1199 flgD flgE TRUE 0.939 25.000 0.116 NA Y NA
 3468156 3468157 EcE24377A_1199 EcE24377A_1200 flgE flgF TRUE 0.993 20.000 0.476 0.004 Y NA
 3468157 3468158 EcE24377A_1200 EcE24377A_1201 flgF flgG TRUE 0.927 138.000 0.420 0.001 Y NA
 3468158 3468159 EcE24377A_1201 EcE24377A_1202 flgG flgH TRUE 0.955 53.000 0.268 0.005 Y NA
 3468159 3468160 EcE24377A_1202 EcE24377A_1203 flgH flgI TRUE 0.984 12.000 0.073 0.006 Y NA
 3468160 3468161 EcE24377A_1203 EcE24377A_1204 flgI flgJ TRUE 0.983 0.000 0.036 0.006 Y NA
 3468161 3468162 EcE24377A_1204 EcE24377A_1205 flgJ flgK TRUE 0.985 66.000 0.705 0.002 Y NA
 3468162 3468163 EcE24377A_1205 EcE24377A_1206 flgK flgL TRUE 0.989 12.000 0.142 0.001 Y NA
 3468167 3468168 EcE24377A_1210 EcE24377A_1211   plsX FALSE 0.009 306.000 0.044 NA   NA
 3468168 3468169 EcE24377A_1211 EcE24377A_1212 plsX fabH TRUE 0.965 68.000 0.380 0.004 Y NA
 3468169 3468170 EcE24377A_1212 EcE24377A_1213 fabH fabD TRUE 0.986 16.000 0.182 0.004 Y NA
 3468170 3468171 EcE24377A_1213 EcE24377A_1214 fabD fabG TRUE 0.996 13.000 0.432 0.004 Y NA
 3468171 3468172 EcE24377A_1214 EcE24377A_1215 fabG acpP TRUE 0.667 211.000 0.321 0.004 Y NA
 3468172 3468173 EcE24377A_1215 EcE24377A_1216 acpP fabF TRUE 0.930 88.000 0.346 1.000 Y NA
 3468173 3468174 EcE24377A_1216 EcE24377A_1217 fabF pabC TRUE 0.628 120.000 0.187 0.033 N NA
 3468174 3468175 EcE24377A_1217 EcE24377A_1218 pabC   TRUE 0.929 3.000 0.204 NA   NA
 3468175 3468176 EcE24377A_1218 EcE24377A_1219   tmk TRUE 0.861 -10.000 0.209 NA   NA
 3468176 3468177 EcE24377A_1219 EcE24377A_1220 tmk holB TRUE 0.942 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3468177 3468178 EcE24377A_1220 EcE24377A_1221 holB   TRUE 0.976 11.000 0.110 NA Y NA
 3468178 3468179 EcE24377A_1221 EcE24377A_1222   ptsG FALSE 0.007 295.000 0.004 NA N NA
 3468180 3468181 EcE24377A_1223 EcE24377A_1224 fhuE   FALSE 0.305 33.000 0.000 NA   NA
 3468182 3468183 EcE24377A_1225 EcE24377A_1226 hinT   TRUE 0.765 3.000 0.051 NA   NA
 3468183 3468184 EcE24377A_1226 EcE24377A_1227     TRUE 0.972 14.000 0.516 NA   NA
 3468184 3468185 EcE24377A_1227 EcE24377A_1228   thiK TRUE 0.894 -19.000 0.310 NA   NA
 3468185 3468186 EcE24377A_1228 EcE24377A_1229 thiK nagZ TRUE 0.870 11.000 0.069 1.000 N NA
 3468186 3468187 EcE24377A_1229 EcE24377A_1230 nagZ   TRUE 0.681 23.000 0.091 NA   NA
 3468187 3468188 EcE24377A_1230 EcE24377A_1231   ndh FALSE 0.005 408.000 0.057 NA   NA
 3468188 3468189 EcE24377A_1231 EcE24377A_1232 ndh   FALSE 0.045 227.000 0.071 1.000   NA
 3468192 3468193 EcE24377A_1235 EcE24377A_1236   mfd FALSE 0.065 144.000 0.006 1.000   NA
 3468193 3468194 EcE24377A_1236 EcE24377A_1237 mfd   FALSE 0.082 128.000 0.003 1.000   NA
 3468195 3468196 EcE24377A_1238 EcE24377A_1239 lolC lolD TRUE 0.928 -7.000 0.175 0.073 N NA
 3468196 3468197 EcE24377A_1239 EcE24377A_1240 lolD lolE TRUE 0.948 0.000 0.125 0.073 N NA
 3468197 3468198 EcE24377A_1240 EcE24377A_1241 lolE nagK TRUE 0.847 29.000 0.225 1.000 N NA
 3468198 3468199 EcE24377A_1241 EcE24377A_1242 nagK npdA FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3468200 3468201 EcE24377A_1243 EcE24377A_1244     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468203 3468204 EcE24377A_1246 EcE24377A_1247 potD potC TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.062 Y NA
 3468204 3468205 EcE24377A_1247 EcE24377A_1248 potC   FALSE 0.001 1034.000 0.000 1.000   NA
 3468205 3468206 EcE24377A_1248 EcE24377A_1249     TRUE 0.960 -31.000 0.500 0.011   NA
 3468206 3468207 EcE24377A_1249 EcE24377A_1250     FALSE 0.261 62.000 0.000 1.000   NA
 3468207 3468208 EcE24377A_1250 EcE24377A_1251     FALSE 0.172 78.000 0.000 NA   NA
 3468208 3468209 EcE24377A_1251 EcE24377A_1252     FALSE 0.155 94.000 0.000 NA   NA
 3468209 3468210 EcE24377A_1252 EcE24377A_1253     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468212 3468213 EcE24377A_1255 EcE24377A_1256     TRUE 0.633 12.000 0.000 NA   NA
 3468213 3468214 EcE24377A_1256 EcE24377A_1257     FALSE 0.002 491.000 0.000 NA   NA
 3468215 3468216 EcE24377A_1258 EcE24377A_1259     FALSE 0.417 24.000 0.000 NA   NA
 3468216 3468217 EcE24377A_1259 EcE24377A_1260     TRUE 0.752 7.000 0.000 1.000   NA
 3468217 3468218 EcE24377A_1260 EcE24377A_1261     FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 3468218 3468219 EcE24377A_1261 EcE24377A_1262     FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3468219 3468220 EcE24377A_1262 EcE24377A_1263     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3468222 3468223 EcE24377A_1265 EcE24377A_1266     FALSE 0.001 894.000 0.000 NA   NA
 3468223 3468224 EcE24377A_1266 EcE24377A_1267     TRUE 0.673 1.000 0.000 NA   NA
 3468224 3468225 EcE24377A_1267 EcE24377A_1268     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468225 3468226 EcE24377A_1268 EcE24377A_1269     FALSE 0.071 145.000 0.000 NA   NA
 3468226 3468227 EcE24377A_1269 EcE24377A_1270     TRUE 0.982 -3.000 0.571 1.000   NA
 3468227 3468228 EcE24377A_1270 EcE24377A_1271     FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 3468228 3468229 EcE24377A_1271 EcE24377A_1272     FALSE 0.060 151.000 0.000 NA   NA
 3468229 3468230 EcE24377A_1272 EcE24377A_5028     FALSE 0.220 50.000 0.000 NA   NA
 3468230 3468231 EcE24377A_5028 EcE24377A_5029     FALSE 0.168 81.000 0.000 NA   NA
 3468231 3468232 EcE24377A_5029 EcE24377A_5030     TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 3468232 3468233 EcE24377A_5030 EcE24377A_1276     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 3468233 3468234 EcE24377A_1276 EcE24377A_1277     TRUE 0.906 -10.000 0.286 NA   NA
 3468234 3468235 EcE24377A_1277 EcE24377A_1278     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3468235 3468236 EcE24377A_1278 EcE24377A_1279     TRUE 0.664 8.000 0.000 NA   NA
 3468236 3468237 EcE24377A_1279 EcE24377A_1280     FALSE 0.001 985.000 0.000 NA   NA
 3468237 3468238 EcE24377A_1280 EcE24377A_1281     FALSE 0.168 82.000 0.000 NA   NA
 3468238 3468239 EcE24377A_1281 EcE24377A_1282     FALSE 0.449 -48.000 0.000 1.000   NA
 3468239 3468240 EcE24377A_1282 EcE24377A_1284     FALSE 0.258 65.000 0.000 1.000   NA
 3468240 3468241 EcE24377A_1284 EcE24377A_1285     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3468244 3468245 EcE24377A_1288 EcE24377A_1289 potB potA TRUE 0.993 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 3468247 3468248 EcE24377A_1291 EcE24377A_1292   phoQ TRUE 0.785 76.000 0.408 NA   NA
 3468248 3468249 EcE24377A_1292 EcE24377A_1293 phoQ phoP TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 3468249 3468250 EcE24377A_1293 EcE24377A_1294 phoP purB FALSE 0.068 168.000 0.011 1.000 N NA
 3468250 3468251 EcE24377A_1294 EcE24377A_1295 purB   TRUE 0.854 4.000 0.093 NA   NA
 3468251 3468252 EcE24377A_1295 EcE24377A_1296   trmU TRUE 0.684 36.000 0.180 NA   NA
 3468252 3468253 EcE24377A_1296 EcE24377A_1297 trmU   TRUE 0.645 54.000 0.158 1.000 N NA
 3468253 3468254 EcE24377A_1297 EcE24377A_1298   rluE TRUE 0.939 10.000 0.182 1.000 N NA
 3468256 3468257 EcE24377A_1300 EcE24377A_1301     FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 3468257 3468258 EcE24377A_1301 EcE24377A_1302     FALSE 0.326 -90.000 0.000 NA   NA
 3468258 3468259 EcE24377A_1302 EcE24377A_1303     FALSE 0.074 143.000 0.000 NA   NA
 3468260 3468261 EcE24377A_1304 EcE24377A_1305     FALSE 0.347 29.000 0.000 NA   NA
 3468261 3468262 EcE24377A_1305 EcE24377A_1306     FALSE 0.121 113.000 0.000 NA   NA
 3468262 3468263 EcE24377A_1306 EcE24377A_1307     FALSE 0.007 290.000 0.000 NA   NA
 3468263 3468264 EcE24377A_1307 EcE24377A_1308     FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 3468264 3468265 EcE24377A_1308 EcE24377A_1309     FALSE 0.157 93.000 0.000 NA   NA
 3468265 3468266 EcE24377A_1309 EcE24377A_1310     FALSE 0.047 164.000 0.000 NA   NA
 3468266 3468267 EcE24377A_1310 EcE24377A_1311     FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 3468267 3468268 EcE24377A_1311 EcE24377A_1312     FALSE 0.001 1122.000 0.000 NA   NA
 3468269 3468270 EcE24377A_1313 EcE24377A_1314     TRUE 0.653 10.000 0.000 NA   NA
 3468270 3468271 EcE24377A_1314 EcE24377A_1315     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3468272 3468273 EcE24377A_1316 EcE24377A_1317     FALSE 0.380 -31.000 0.000 NA   NA
 3468274 3468275 EcE24377A_1318 EcE24377A_1319 minE minD TRUE 0.996 4.000 0.618 NA Y NA
 3468275 3468276 EcE24377A_1319 EcE24377A_1320 minD minC TRUE 0.985 24.000 0.466 1.000 Y NA
 3468279 3468280 EcE24377A_1323 EcE24377A_1324     FALSE 0.282 72.000 0.056 NA   NA
 3468280 3468281 EcE24377A_1324 EcE24377A_1325     FALSE 0.364 77.000 0.088 NA   NA
 3468282 3468283 EcE24377A_1326 EcE24377A_1327     FALSE 0.083 137.000 0.000 NA   NA
 3468284 3468285 EcE24377A_1328 EcE24377A_1329 umuD umuC TRUE 0.824 0.000 0.000 1.000 N NA
 3468286 3468287 EcE24377A_1330 EcE24377A_1331 dsbB nhaB TRUE 0.793 146.000 0.723 1.000 N NA
 3468290 3468291 EcE24377A_1334 EcE24377A_1335 dadA alr1 TRUE 0.934 10.000 0.168 1.000 N NA
 3468292 3468293 EcE24377A_1336 EcE24377A_1337 cvrA ldcA FALSE 0.424 95.000 0.103 NA N NA
 3468299 3468300 EcE24377A_1343 EcE24377A_1344 treA dhaM FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000   NA
 3468300 3468301 EcE24377A_1344 EcE24377A_1345 dhaM   TRUE 0.885 11.000 0.118 1.000   NA
 3468301 3468302 EcE24377A_1345 EcE24377A_1346   dhaK TRUE 0.993 11.000 0.226 0.001 Y NA
 3468306 3468307 EcE24377A_1350 EcE24377A_1351 engD pth TRUE 0.823 117.000 0.184 1.000 Y NA
 3468309 3468310 EcE24377A_1353 EcE24377A_1354 ychM   FALSE 0.185 -67.000 0.007 NA   NA
 3468310 3468311 EcE24377A_1354 EcE24377A_1355   prs FALSE 0.077 97.000 0.009 NA   NA
 3468311 3468312 EcE24377A_1355 EcE24377A_1356 prs ispE FALSE 0.162 151.000 0.053 1.000 N NA
 3468312 3468313 EcE24377A_1356 EcE24377A_1357 ispE lolB TRUE 0.935 0.000 0.157 1.000 N NA
 3468314 3468315 EcE24377A_1358 EcE24377A_1359 hemA prfA TRUE 0.806 42.000 0.171 0.048 N NA
 3468315 3468316 EcE24377A_1359 EcE24377A_1360 prfA hemK TRUE 0.992 0.000 0.229 0.048 Y NA
 3468316 3468317 EcE24377A_1360 EcE24377A_1361 hemK   TRUE 0.850 -3.000 0.109 NA   NA
 3468317 3468318 EcE24377A_1361 EcE24377A_1362   sirB1 TRUE 0.926 4.000 0.195 NA   NA
 3468318 3468319 EcE24377A_1362 EcE24377A_1363 sirB1 kdsA TRUE 0.577 36.000 0.089 1.000   NA
 3468320 3468321 EcE24377A_1364 EcE24377A_1365     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 3468321 3468322 EcE24377A_1365 EcE24377A_1366     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 3468323 3468324 EcE24377A_1367 EcE24377A_1368     FALSE 0.268 137.000 0.140 NA   NA
 3468327 3468328 EcE24377A_1371 EcE24377A_1372 narL narX TRUE 0.994 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 3468329 3468330 EcE24377A_1373 EcE24377A_1374   narK FALSE 0.153 95.000 0.000 NA   NA
 3468330 3468331 EcE24377A_1374 EcE24377A_1375 narK narG FALSE 0.004 521.000 0.000 1.000 N NA
 3468331 3468332 EcE24377A_1375 EcE24377A_1376 narG narH TRUE 0.996 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 3468332 3468333 EcE24377A_1376 EcE24377A_1377 narH narJ TRUE 0.997 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 3468333 3468334 EcE24377A_1377 EcE24377A_1378 narJ narI1 TRUE 0.997 0.000 0.500 0.003 Y NA
 3468335 3468336 EcE24377A_5031 EcE24377A_5032     FALSE 0.296 34.000 0.000 NA   NA
 3468336 3468337 EcE24377A_5032 EcE24377A_1381   purU FALSE 0.049 160.000 0.000 NA   NA
 3468337 3468338 EcE24377A_1381 EcE24377A_1382 purU   TRUE 0.638 50.000 0.200 NA   NA
 3468339 3468340 EcE24377A_1383 EcE24377A_1384     FALSE 0.278 92.000 0.048 1.000   NA
 3468340 3468341 EcE24377A_1384 EcE24377A_1385   galU FALSE 0.210 202.000 0.235 1.000 N NA
 3468344 3468345 EcE24377A_1388 EcE24377A_1389   adhE FALSE 0.013 241.000 0.000 NA   NA
 3468346 3468347 EcE24377A_1390 EcE24377A_1391   oppA FALSE 0.002 738.000 0.000 NA N NA
 3468347 3468348 EcE24377A_1391 EcE24377A_1392 oppA oppB TRUE 0.894 86.000 0.151 0.061 Y NA
 3468348 3468349 EcE24377A_1392 EcE24377A_1393 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.061 Y NA
 3468349 3468350 EcE24377A_1393 EcE24377A_1394 oppC oppD TRUE 0.995 12.000 0.554 1.000 Y NA
 3468350 3468351 EcE24377A_1394 EcE24377A_1395 oppD oppF TRUE 0.996 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 3468352 3468353 EcE24377A_1396 EcE24377A_1397   cls TRUE 0.758 35.000 0.231 NA   NA
 3468353 3468354 EcE24377A_1397 EcE24377A_1398 cls kch FALSE 0.008 371.000 0.000 1.000 N NA
 3468354 3468355 EcE24377A_1398 EcE24377A_1399 kch   FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 3468356 3468357 EcE24377A_1400 EcE24377A_1401     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 3468357 3468358 EcE24377A_1401 EcE24377A_1402     FALSE 0.001 1133.000 0.000 NA   NA
 3468358 3468359 EcE24377A_1402 EcE24377A_1403     FALSE 0.001 987.000 0.000 NA   NA
 3468359 3468360 EcE24377A_1403 EcE24377A_1404     FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 3468360 3468361 EcE24377A_1404 EcE24377A_1405     FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 3468361 3468362 EcE24377A_1405 EcE24377A_1406     TRUE 0.960 -3.000 0.000 NA Y NA
 3468362 3468363 EcE24377A_1406 EcE24377A_1407     TRUE 0.798 50.000 0.000 NA Y NA
 3468363 3468364 EcE24377A_1407 EcE24377A_1408     FALSE 0.431 23.000 0.000 NA   NA
 3468367 3468368 EcE24377A_1411 EcE24377A_1412 yciA ispZ FALSE 0.493 105.000 0.167 NA N NA
 3468368 3468369 EcE24377A_1412 EcE24377A_1413 ispZ   FALSE 0.494 30.000 0.061 NA   NA
 3468371 3468372 EcE24377A_1415 EcE24377A_1416     FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000   NA
 3468374 3468375 EcE24377A_1418 EcE24377A_1419     FALSE 0.026 196.000 0.000 NA   NA
 3468375 3468376 EcE24377A_1419 EcE24377A_1420     FALSE 0.001 1288.000 0.000 NA   NA
 3468376 3468377 EcE24377A_1420 EcE24377A_1421     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3468378 3468379 EcE24377A_1422 EcE24377A_1423     FALSE 0.438 -16.000 0.000 NA   NA
 3468379 3468380 EcE24377A_1423 EcE24377A_1424     FALSE 0.390 -28.000 0.000 NA   NA
 3468380 3468381 EcE24377A_1424 EcE24377A_1425     FALSE 0.316 -211.000 0.000 NA   NA
 3468381 3468382 EcE24377A_1425 EcE24377A_1426     TRUE 0.894 30.000 0.400 NA   NA
 3468382 3468383 EcE24377A_1426 EcE24377A_1427     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3468383 3468384 EcE24377A_1427 EcE24377A_1428     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468384 3468385 EcE24377A_1428 EcE24377A_1429     FALSE 0.036 178.000 0.000 NA   NA
 3468387 3468388 EcE24377A_1431 EcE24377A_1433     FALSE 0.187 65.000 0.000 NA   NA
 3468388 3468389 EcE24377A_1433 EcE24377A_1434     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 3468389 3468390 EcE24377A_1434 EcE24377A_1435     TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3468390 3468391 EcE24377A_1435 EcE24377A_1436     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468391 3468392 EcE24377A_1436 EcE24377A_1437     FALSE 0.184 70.000 0.000 NA   NA
 3468392 3468393 EcE24377A_1437 EcE24377A_1438     TRUE 0.982 -3.000 0.571 1.000   NA
 3468393 3468394 EcE24377A_1438 EcE24377A_1439     FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 3468394 3468395 EcE24377A_1439 EcE24377A_1440     FALSE 0.060 151.000 0.000 NA   NA
 3468395 3468396 EcE24377A_1440 EcE24377A_5033     FALSE 0.043 167.000 0.000 NA   NA
 3468396 3468397 EcE24377A_5033 EcE24377A_5034     TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 3468397 3468398 EcE24377A_5034 EcE24377A_1443     FALSE 0.001 1181.000 0.000 NA   NA
 3468398 3468399 EcE24377A_1443 EcE24377A_1444     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468399 3468400 EcE24377A_1444 EcE24377A_1445     TRUE 0.969 9.000 0.350 1.000   NA
 3468400 3468401 EcE24377A_1445 EcE24377A_1446     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468401 3468402 EcE24377A_1446 EcE24377A_1447     FALSE 0.390 -28.000 0.000 NA   NA
 3468402 3468403 EcE24377A_1447 EcE24377A_1448     FALSE 0.438 -16.000 0.000 NA   NA
 3468403 3468404 EcE24377A_1448 EcE24377A_1449     FALSE 0.064 149.000 0.000 NA   NA
 3468404 3468405 EcE24377A_1449 EcE24377A_1450     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468405 3468406 EcE24377A_1450 EcE24377A_1451     FALSE 0.232 47.000 0.000 NA   NA
 3468406 3468407 EcE24377A_1451 EcE24377A_1452     TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3468410 3468411 EcE24377A_1455 EcE24377A_1456   yciF TRUE 0.739 46.000 0.115 0.002   NA
 3468411 3468412 EcE24377A_1456 EcE24377A_1457 yciF   TRUE 0.843 58.000 0.500 NA   NA
 3468412 3468413 EcE24377A_1457 EcE24377A_1458     FALSE 0.317 -166.000 0.000 NA   NA
 3468413 3468414 EcE24377A_1458 EcE24377A_1459   trpA FALSE 0.003 381.000 0.000 NA   NA
 3468414 3468415 EcE24377A_1459 EcE24377A_1460 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 3468415 3468416 EcE24377A_1460 EcE24377A_1461 trpB trpC TRUE 0.992 12.000 0.221 0.001 Y NA
 3468416 3468417 EcE24377A_1461 EcE24377A_1462 trpC trpD TRUE 0.991 4.000 0.293 1.000 Y NA
 3468420 3468421 EcE24377A_1465 EcE24377A_1466     TRUE 0.945 -3.000 0.281 NA   NA
 3468421 3468422 EcE24377A_1466 EcE24377A_1467   rluB TRUE 0.759 101.000 0.075 NA Y NA
 3468423 3468424 EcE24377A_1468 EcE24377A_1470 btuR   TRUE 0.835 -3.000 0.050 1.000 N NA
 3468425 3468426 EcE24377A_1471 EcE24377A_1473 sohB   FALSE 0.385 -30.000 0.000 NA   NA
 3468428 3468429 EcE24377A_1474 EcE24377A_1475 topA cysB FALSE 0.032 210.000 0.008 1.000 N NA
 3468429 3468430 EcE24377A_1475 EcE24377A_1476 cysB   FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 3468430 3468431 EcE24377A_1476 EcE24377A_1477     TRUE 0.964 -9.000 0.556 NA   NA
 3468431 3468432 EcE24377A_1477 EcE24377A_1478   acnA FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 3468434 3468435 EcE24377A_1480 EcE24377A_1481 pgpB   FALSE 0.223 149.000 0.143 NA   NA
 3468435 3468436 EcE24377A_1481 EcE24377A_1482     TRUE 0.983 7.000 0.576 NA   NA
 3468438 3468439 EcE24377A_1484 EcE24377A_1485 pyrF   TRUE 0.853 0.000 0.045 1.000 N NA
 3468440 3468441 EcE24377A_1486 EcE24377A_1487     FALSE 0.009 269.000 0.000 NA   NA
 3468441 3468442 EcE24377A_1487 EcE24377A_1488     FALSE 0.453 90.000 0.146 NA   NA
 3468442 3468443 EcE24377A_1488 EcE24377A_1489     FALSE 0.185 138.000 0.083 NA   NA
 3468443 3468444 EcE24377A_1489 EcE24377A_1490     FALSE 0.137 104.000 0.000 NA   NA
 3468444 3468445 EcE24377A_1490 EcE24377A_1491   rnb FALSE 0.417 24.000 0.000 NA   NA
 3468445 3468446 EcE24377A_1491 EcE24377A_1492 rnb   FALSE 0.421 68.000 0.105 NA   NA
 3468446 3468447 EcE24377A_1492 EcE24377A_1493     FALSE 0.347 -49.000 0.000 NA   NA
 3468447 3468448 EcE24377A_1493 EcE24377A_1494   fabI TRUE 0.660 9.000 0.000 NA   NA
 3468450 3468451 EcE24377A_1496 EcE24377A_1497   sapF FALSE 0.253 71.000 0.000 1.000   NA
 3468451 3468452 EcE24377A_1497 EcE24377A_1498 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.019 Y NA
 3468452 3468453 EcE24377A_1498 EcE24377A_1499 sapD sapC TRUE 0.997 0.000 0.667 1.000 Y NA
 3468453 3468454 EcE24377A_1499 EcE24377A_1500 sapC sapB TRUE 0.984 -13.000 0.284 0.060 Y NA
 3468454 3468455 EcE24377A_1500 EcE24377A_1501 sapB sapA TRUE 0.970 -3.000 0.264 0.060 N NA
 3468457 3468458 EcE24377A_1502 EcE24377A_1504     FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3468458 3468459 EcE24377A_1504 EcE24377A_1505     TRUE 0.664 8.000 0.000 NA   NA
 3468459 3468460 EcE24377A_1505 EcE24377A_1506   puuA FALSE 0.092 303.000 0.000 1.000 Y NA
 3468460 3468461 EcE24377A_1506 EcE24377A_1507 puuA   FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 3468462 3468463 EcE24377A_1508 EcE24377A_1509 puuD puuR FALSE 0.544 27.000 0.046 1.000   NA
 3468463 3468464 EcE24377A_1509 EcE24377A_1510 puuR puuC FALSE 0.145 150.000 0.040 1.000 N NA
 3468464 3468465 EcE24377A_1510 EcE24377A_1511 puuC puuB TRUE 0.989 2.000 0.500 0.044 N NA
 3468465 3468466 EcE24377A_1511 EcE24377A_1512 puuB gabT1 TRUE 0.900 38.000 0.100 1.000 Y NA
 3468468 3468469 EcE24377A_1514 EcE24377A_1515 pspA pspB TRUE 0.914 54.000 0.739 NA   NA
 3468469 3468470 EcE24377A_1515 EcE24377A_1516 pspB pspC TRUE 0.991 0.000 0.913 NA   NA
 3468470 3468471 EcE24377A_1516 EcE24377A_1517 pspC pspD TRUE 0.907 9.000 0.167 NA   NA
 3468471 3468472 EcE24377A_1517 EcE24377A_1518 pspD pspE FALSE 0.458 75.000 0.133 NA   NA
 3468472 3468473 EcE24377A_1518 EcE24377A_1519 pspE   FALSE 0.043 213.000 0.000 1.000 N NA
 3468473 3468474 EcE24377A_1519 EcE24377A_1520     TRUE 0.991 14.000 0.360 1.000 Y NA
 3468474 3468475 EcE24377A_1520 EcE24377A_1521     TRUE 0.994 21.000 0.620 0.060 Y NA
 3468475 3468476 EcE24377A_1521 EcE24377A_1522     TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.060 Y NA
 3468476 3468477 EcE24377A_1522 EcE24377A_1523     TRUE 0.815 31.000 0.205 1.000 N NA
 3468477 3468478 EcE24377A_1523 EcE24377A_1524     TRUE 0.913 19.000 0.261 NA N NA
 3468478 3468479 EcE24377A_1524 EcE24377A_1525     TRUE 0.963 10.000 0.347 NA   NA
 3468479 3468480 EcE24377A_1525 EcE24377A_1527     TRUE 0.723 -3.000 0.000 1.000   NA
 3468482 3468483 EcE24377A_1528 EcE24377A_1529 pgmB   TRUE 0.851 14.000 0.103 1.000   NA
 3468483 3468484 EcE24377A_1529 EcE24377A_1530   ompG TRUE 0.731 45.000 0.222 1.000   NA
 3468486 3468487 EcE24377A_1532 EcE24377A_1533     TRUE 0.987 -3.000 0.791 NA   NA
 3468487 3468488 EcE24377A_1533 EcE24377A_1534   tyrR FALSE 0.222 148.000 0.137 NA   NA
 3468491 3468492 EcE24377A_1536 EcE24377A_1538     FALSE 0.013 310.000 0.000 1.000 N NA
 3468492 3468493 EcE24377A_1538 EcE24377A_1539     TRUE 0.613 18.000 0.000 1.000   NA
 3468493 3468494 EcE24377A_1539 EcE24377A_1540     TRUE 0.759 0.000 0.000 1.000   NA
 3468495 3468496 EcE24377A_1541 EcE24377A_1542   mppA FALSE 0.011 337.000 0.000 1.000 N NA
 3468499 3468500 EcE24377A_1545 EcE24377A_1546 uspE fnr TRUE 0.896 152.000 0.619 1.000 Y NA
 3468500 3468501 EcE24377A_1546 EcE24377A_1547 fnr   FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 3468501 3468502 EcE24377A_1547 EcE24377A_1548   abgT TRUE 0.644 11.000 0.000 NA   NA
 3468502 3468503 EcE24377A_1548 EcE24377A_1549 abgT abgB FALSE 0.482 37.000 0.080 NA   NA
 3468503 3468504 EcE24377A_1549 EcE24377A_1550 abgB abgA TRUE 0.952 0.000 0.128 0.003   NA
 3468504 3468505 EcE24377A_1550 EcE24377A_1551 abgA   FALSE 0.403 -25.000 0.000 NA   NA
 3468505 3468506 EcE24377A_1551 EcE24377A_1552     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468507 3468508 EcE24377A_1553 EcE24377A_1554     FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 3468510 3468511 EcE24377A_1556 EcE24377A_1557 zntB dbpA FALSE 0.005 478.000 0.000 1.000 N NA
 3468512 3468513 EcE24377A_1558 EcE24377A_1559   uspF FALSE 0.062 176.000 0.000 NA N NA
 3468513 3468514 EcE24377A_1559 EcE24377A_1560 uspF ompN FALSE 0.156 141.000 0.000 1.000 N NA
 3468514 3468515 EcE24377A_1560 EcE24377A_1561 ompN ydbK FALSE 0.009 367.000 0.000 1.000 N NA
 3468515 3468516 EcE24377A_1561 EcE24377A_1562 ydbK   TRUE 0.653 10.000 0.000 NA   NA
 3468518 3468519 EcE24377A_1563 EcE24377A_1565 hslJ idhA FALSE 0.191 111.000 0.000 NA N NA
 3468520 3468521 EcE24377A_1566 EcE24377A_1567     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468521 3468522 EcE24377A_1567 EcE24377A_1568     TRUE 0.988 8.000 0.726 NA   NA
 3468525 3468526 EcE24377A_1571 EcE24377A_1572 tynA paaN FALSE 0.026 248.000 0.000 1.000 N NA
 3468527 3468528 EcE24377A_1573 EcE24377A_1574 paaG paaH TRUE 0.989 12.000 0.920 NA   NA
 3468528 3468529 EcE24377A_1574 EcE24377A_1575 paaH paaI TRUE 0.991 9.000 0.943 NA   NA
 3468529 3468530 EcE24377A_1575 EcE24377A_1576 paaI paaJ TRUE 0.987 15.000 0.919 NA   NA
 3468530 3468531 EcE24377A_1576 EcE24377A_1577 paaJ paaK TRUE 0.982 8.000 0.571 NA   NA
 3468531 3468532 EcE24377A_1577 EcE24377A_1578 paaK   TRUE 0.888 -3.000 0.093 1.000 N NA
 3468532 3468533 EcE24377A_1578 EcE24377A_1579   paaB TRUE 0.993 0.000 0.215 0.001 Y NA
 3468533 3468534 EcE24377A_1579 EcE24377A_1580 paaB paaC TRUE 0.974 2.000 0.051 1.000 Y NA
 3468534 3468535 EcE24377A_1580 EcE24377A_1581 paaC paaD FALSE 0.523 -10.000 0.013 NA N NA
 3468535 3468536 EcE24377A_1581 EcE24377A_1582 paaD pcaF TRUE 0.843 0.000 0.058 NA N NA
 3468536 3468537 EcE24377A_1582 EcE24377A_1584 pcaF paaF TRUE 0.896 27.000 0.293 1.000 N NA
 3468539 3468540 EcE24377A_1585 EcE24377A_1586 paaX paaY TRUE 0.723 -18.000 0.118 NA   NA
 3468540 3468541 EcE24377A_1586 EcE24377A_1587 paaY   FALSE 0.022 232.000 0.000 1.000   NA
 3468541 3468542 EcE24377A_1587 EcE24377A_1588     FALSE 0.188 64.000 0.000 NA   NA
 3468542 3468543 EcE24377A_1588 EcE24377A_1589     FALSE 0.040 171.000 0.000 NA   NA
 3468543 3468544 EcE24377A_1589 EcE24377A_1590   cdsA2 TRUE 0.964 0.000 0.179 0.002   NA
 3468544 3468545 EcE24377A_1590 EcE24377A_1591 cdsA2   FALSE 0.552 16.000 0.000 NA   NA
 3468545 3468546 EcE24377A_1591 EcE24377A_1592     TRUE 0.986 14.000 0.285 NA Y NA
 3468548 3468549 EcE24377A_1594 EcE24377A_1595 hrpA   FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3468549 3468550 EcE24377A_1595 EcE24377A_1596   aldA FALSE 0.032 197.000 0.040 NA   NA
 3468552 3468553 EcE24377A_1598 EcE24377A_1599     FALSE 0.012 245.000 0.000 NA   NA
 3468553 3468554 EcE24377A_1599 EcE24377A_1600     FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 3468556 3468557 EcE24377A_1602 EcE24377A_1603     FALSE 0.017 225.000 0.000 NA   NA
 3468557 3468558 EcE24377A_1603 EcE24377A_1604     FALSE 0.066 140.000 0.026 NA   NA
 3468558 3468559 EcE24377A_1604 EcE24377A_1606   rimL FALSE 0.165 63.000 0.026 NA   NA
 3468561 3468562 EcE24377A_1607 EcE24377A_1608 tehA tehB TRUE 0.917 -3.000 0.175 1.000   NA
 3468562 3468563 EcE24377A_1608 EcE24377A_1609 tehB   FALSE 0.017 304.000 0.088 NA   NA
 3468567 3468568 EcE24377A_1613 EcE24377A_1614     FALSE 0.422 31.000 0.000 1.000   NA
 3468569 3468570 EcE24377A_1615 EcE24377A_1616     FALSE 0.197 57.000 0.000 NA   NA
 3468571 3468572 EcE24377A_1617 EcE24377A_1618     FALSE 0.237 79.000 0.000 1.000   NA
 3468572 3468573 EcE24377A_1618 EcE24377A_1619   ydcS FALSE 0.164 245.000 0.000 1.000 Y NA
 3468573 3468574 EcE24377A_1619 EcE24377A_1620 ydcS ydcT TRUE 0.995 18.000 0.609 0.060 Y NA
 3468574 3468575 EcE24377A_1620 EcE24377A_1621 ydcT ydcU TRUE 0.998 1.000 0.643 0.060 Y NA
 3468575 3468576 EcE24377A_1621 EcE24377A_1622 ydcU ydcV TRUE 0.996 -10.000 0.821 0.060 Y NA
 3468576 3468577 EcE24377A_1622 EcE24377A_1624 ydcV ydcW TRUE 0.887 22.000 0.216 1.000 N NA
 3468579 3468580 EcE24377A_1625 EcE24377A_1626     FALSE 0.356 -45.000 0.000 NA   NA
 3468580 3468581 EcE24377A_1626 EcE24377A_1627     FALSE 0.375 27.000 0.000 NA   NA
 3468582 3468583 EcE24377A_1628 EcE24377A_1629     TRUE 0.792 -3.000 0.070 NA   NA
 3468584 3468585 EcE24377A_1630 EcE24377A_1631     FALSE 0.038 198.000 0.000 1.000   NA
 3468587 3468588 EcE24377A_1633 EcE24377A_1634     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 3468592 3468593 EcE24377A_1638 EcE24377A_1639     TRUE 0.661 68.000 0.250 NA   NA
 3468593 3468594 EcE24377A_1639 EcE24377A_1640     FALSE 0.026 197.000 0.000 NA   NA
 3468594 3468595 EcE24377A_1640 EcE24377A_1641     FALSE 0.002 508.000 0.000 NA   NA
 3468595 3468596 EcE24377A_1641 EcE24377A_1642     FALSE 0.146 99.000 0.000 NA   NA
 3468599 3468600 EcE24377A_1645 EcE24377A_1646   narI2 FALSE 0.237 79.000 0.000 1.000   NA
 3468600 3468601 EcE24377A_1646 EcE24377A_1647 narI2 narW TRUE 0.996 -3.000 0.429 0.003 Y NA
 3468601 3468602 EcE24377A_1647 EcE24377A_1648 narW narY TRUE 0.998 0.000 0.714 0.003 Y NA
 3468602 3468603 EcE24377A_1648 EcE24377A_1649 narY narZ TRUE 0.995 -34.000 0.833 0.001 Y NA
 3468603 3468604 EcE24377A_1649 EcE24377A_1650 narZ narU TRUE 0.873 82.000 0.556 1.000 N NA
 3468604 3468605 EcE24377A_1650 EcE24377A_1651 narU   FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 3468605 3468606 EcE24377A_1651 EcE24377A_1652     FALSE 0.520 24.000 0.000 1.000   NA
 3468606 3468607 EcE24377A_1652 EcE24377A_1653     FALSE 0.031 259.000 0.000 0.095   NA
 3468608 3468609 EcE24377A_1654 EcE24377A_1655 fdoG fdnG FALSE 0.224 49.000 0.000 NA   NA
 3468609 3468610 EcE24377A_1655 EcE24377A_1657 fdnG fdnH TRUE 0.984 13.000 0.429 0.001   NA
 3468610 3468611 EcE24377A_1657 EcE24377A_1658 fdnH fdnI TRUE 0.987 -25.000 0.333 0.001 Y NA
 3468612 3468613 EcE24377A_1659 EcE24377A_1660     FALSE 0.100 147.000 0.000 1.000   NA
 3468613 3468614 EcE24377A_1660 EcE24377A_1661   sfcA FALSE 0.126 134.000 0.000 1.000   NA
 3468614 3468615 EcE24377A_1661 EcE24377A_1662 sfcA   TRUE 0.715 157.000 0.750 1.000   NA
 3468615 3468616 EcE24377A_1662 EcE24377A_1663     TRUE 0.819 102.000 0.571 NA   NA
 3468618 3468619 EcE24377A_1665 EcE24377A_1666 bdhA   TRUE 0.961 12.000 0.288 1.000 N NA
 3468619 3468620 EcE24377A_1666 EcE24377A_1667     FALSE 0.505 46.000 0.058 1.000 N NA
 3468620 3468621 EcE24377A_1667 EcE24377A_1668     TRUE 0.980 -10.000 0.273 1.000 Y NA
 3468621 3468622 EcE24377A_1668 EcE24377A_1669     TRUE 0.967 10.000 0.028 1.000 Y NA
 3468622 3468623 EcE24377A_1669 EcE24377A_1670   pcaI TRUE 0.996 3.000 0.352 0.001 Y NA
 3468625 3468626 EcE24377A_1672 EcE24377A_1673     TRUE 0.987 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 3468626 3468627 EcE24377A_1673 EcE24377A_1674     TRUE 0.991 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 3468627 3468628 EcE24377A_1674 EcE24377A_1675     TRUE 0.986 -3.000 0.143 0.059 Y NA
 3468628 3468629 EcE24377A_1675 EcE24377A_1676     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3468629 3468630 EcE24377A_1676 EcE24377A_1677   ddpX FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 3468630 3468631 EcE24377A_1677 EcE24377A_1678 ddpX dos FALSE 0.022 258.000 0.000 1.000 N NA
 3468631 3468632 EcE24377A_1678 EcE24377A_1679 dos   TRUE 0.989 1.000 0.130 0.005 Y NA
 3468632 3468633 EcE24377A_1679 EcE24377A_1680     FALSE 0.005 372.000 0.000 1.000   NA
 3468633 3468634 EcE24377A_1680 EcE24377A_1681   gadC FALSE 0.132 131.000 0.000 1.000   NA
 3468634 3468635 EcE24377A_1681 EcE24377A_1682 gadC gadB TRUE 0.579 156.000 0.103 1.000 Y NA
 3468635 3468636 EcE24377A_1682 EcE24377A_1683 gadB   FALSE 0.111 119.000 0.000 NA   NA
 3468636 3468637 EcE24377A_1683 EcE24377A_1684   pqqL FALSE 0.093 130.000 0.000 NA   NA
 3468637 3468638 EcE24377A_1684 EcE24377A_1685 pqqL   TRUE 0.593 57.000 0.167 1.000   NA
 3468638 3468639 EcE24377A_1685 EcE24377A_1686   yddA TRUE 0.554 38.000 0.000 0.070   NA
 3468639 3468640 EcE24377A_1686 EcE24377A_1687 yddA   FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000   NA
 3468640 3468641 EcE24377A_1687 EcE24377A_1688     FALSE 0.212 52.000 0.000 NA   NA
 3468641 3468642 EcE24377A_1688 EcE24377A_1689     FALSE 0.003 402.000 0.000 NA   NA
 3468642 3468643 EcE24377A_1689 EcE24377A_1690     FALSE 0.004 520.000 0.000 1.000 N NA
 3468643 3468644 EcE24377A_1690 EcE24377A_1691     FALSE 0.007 334.000 0.000 1.000   NA
 3468644 3468645 EcE24377A_1691 EcE24377A_1692     FALSE 0.503 59.000 0.000 0.009   NA
 3468645 3468646 EcE24377A_1692 EcE24377A_1693     TRUE 0.977 13.000 0.000 0.009 Y NA
 3468646 3468647 EcE24377A_1693 EcE24377A_1694     FALSE 0.260 40.000 0.000 NA   NA
 3468647 3468648 EcE24377A_1694 EcE24377A_1695     FALSE 0.252 42.000 0.000 NA   NA
 3468649 3468650 EcE24377A_1696 EcE24377A_1697     FALSE 0.001 826.000 0.000 NA   NA
 3468651 3468652 EcE24377A_1698 EcE24377A_1699     TRUE 0.653 10.000 0.000 NA   NA
 3468652 3468653 EcE24377A_1699 EcE24377A_1700     TRUE 0.664 8.000 0.000 NA   NA
 3468655 3468656 EcE24377A_1701 EcE24377A_1703     FALSE 0.200 56.000 0.000 NA   NA
 3468656 3468657 EcE24377A_1703 EcE24377A_1704     FALSE 0.007 294.000 0.000 NA   NA
 3468657 3468658 EcE24377A_1704 EcE24377A_1705     TRUE 0.740 10.000 0.000 1.000   NA
 3468658 3468659 EcE24377A_1705 EcE24377A_1706     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3468661 3468662 EcE24377A_1708 EcE24377A_1709   hipB FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 3468662 3468663 EcE24377A_1709 EcE24377A_1710 hipB   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 3468663 3468664 EcE24377A_1710 EcE24377A_1711     FALSE 0.359 28.000 0.000 NA   NA
 3468664 3468665 EcE24377A_1711 EcE24377A_1712   lsrK FALSE 0.004 531.000 0.000 1.000 N NA
 3468665 3468666 EcE24377A_1712 EcE24377A_1713 lsrK lsrR FALSE 0.316 79.000 0.000 1.000 N NA
 3468667 3468668 EcE24377A_1714 EcE24377A_1715 lsrA   TRUE 0.723 -3.000 0.000 1.000   NA
 3468668 3468669 EcE24377A_1715 EcE24377A_1716   lsrB TRUE 0.988 12.000 0.844 NA   NA
 3468669 3468670 EcE24377A_1716 EcE24377A_1717 lsrB lsrF TRUE 0.894 27.000 0.000 NA Y NA
 3468670 3468671 EcE24377A_1717 EcE24377A_1718 lsrF   FALSE 0.417 24.000 0.000 NA   NA
 3468671 3468672 EcE24377A_1718 EcE24377A_1719   tam FALSE 0.197 57.000 0.000 NA   NA
 3468673 3468674 EcE24377A_1720 EcE24377A_1721   uxaB FALSE 0.190 156.000 0.143 NA   NA
 3468674 3468675 EcE24377A_1721 EcE24377A_1722 uxaB   FALSE 0.035 227.000 0.000 1.000 N NA
 3468675 3468676 EcE24377A_1722 EcE24377A_1723     FALSE 0.203 139.000 0.098 NA   NA
 3468676 3468677 EcE24377A_1723 EcE24377A_1724   glsA2 TRUE 0.708 0.000 0.037 NA   NA
 3468677 3468678 EcE24377A_1724 EcE24377A_1725 glsA2   FALSE 0.342 64.000 0.000 1.000 N NA
 3468679 3468680 EcE24377A_1726 EcE24377A_1727     FALSE 0.173 77.000 0.000 NA   NA
 3468684 3468685 EcE24377A_1732 EcE24377A_1733 marR marA TRUE 0.995 20.000 0.667 0.046 Y NA
 3468685 3468686 EcE24377A_1733 EcE24377A_1734 marA marB FALSE 0.315 32.000 0.000 NA   NA
 3468687 3468688 EcE24377A_1735 EcE24377A_1736     TRUE 0.915 25.000 0.000 1.000 Y NA
 3468688 3468689 EcE24377A_1736 EcE24377A_1737     TRUE 0.947 56.000 0.250 0.012 Y NA
 3468689 3468690 EcE24377A_1737 EcE24377A_1738     TRUE 0.956 28.000 0.105 0.011 Y NA
 3468690 3468691 EcE24377A_1738 EcE24377A_1739     TRUE 0.971 124.000 0.789 0.011 Y NA
 3468694 3468695 EcE24377A_1742 EcE24377A_1743 ydeE   FALSE 0.206 127.000 0.077 NA   NA
 3468696 3468697 EcE24377A_1744 EcE24377A_1745     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 3468700 3468701 EcE24377A_1748 EcE24377A_1749     FALSE 0.227 89.000 0.000 1.000   NA
 3468701 3468702 EcE24377A_1749 EcE24377A_1750     FALSE 0.036 178.000 0.000 NA   NA
 3468703 3468704 EcE24377A_1751 EcE24377A_1752   ydfJ TRUE 0.755 89.000 0.000 1.000 Y NA
 3468705 3468706 EcE24377A_1753 EcE24377A_1754   pinR FALSE 0.006 317.000 0.000 NA   NA
 3468707 3468708 EcE24377A_1755 EcE24377A_1756     FALSE 0.001 725.000 0.000 NA   NA
 3468708 3468709 EcE24377A_1756 EcE24377A_1757     FALSE 0.148 98.000 0.000 NA   NA
 3468709 3468710 EcE24377A_1757 EcE24377A_1758     TRUE 0.927 20.000 0.000 NA Y NA
 3468710 3468711 EcE24377A_1758 EcE24377A_1759     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3468711 3468712 EcE24377A_1759 EcE24377A_1760     FALSE 0.431 23.000 0.000 NA   NA
 3468712 3468713 EcE24377A_1760 EcE24377A_1761     TRUE 0.798 50.000 0.000 NA Y NA
 3468713 3468714 EcE24377A_1761 EcE24377A_1762     TRUE 0.960 -3.000 0.000 NA Y NA
 3468714 3468715 EcE24377A_1762 EcE24377A_1763     FALSE 0.266 39.000 0.000 NA   NA
 3468715 3468716 EcE24377A_1763 EcE24377A_1764     FALSE 0.004 374.000 0.000 NA   NA
 3468716 3468717 EcE24377A_1764 EcE24377A_1765     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3468717 3468718 EcE24377A_1765 EcE24377A_1766     FALSE 0.004 676.000 0.000 0.073   NA
 3468718 3468719 EcE24377A_1766 EcE24377A_1767     TRUE 0.600 14.000 0.000 NA   NA
 3468719 3468720 EcE24377A_1767 EcE24377A_1768     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 3468720 3468721 EcE24377A_1768 EcE24377A_1770     FALSE 0.187 65.000 0.000 NA   NA
 3468721 3468722 EcE24377A_1770 EcE24377A_1771     FALSE 0.001 873.000 0.000 NA   NA
 3468723 3468724 EcE24377A_1772 EcE24377A_1773     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468725 3468726 EcE24377A_1774 EcE24377A_1775     FALSE 0.256 41.000 0.000 NA   NA
 3468726 3468727 EcE24377A_1775 EcE24377A_1776     FALSE 0.422 -19.000 0.000 NA   NA
 3468727 3468728 EcE24377A_1776 EcE24377A_1777   dicC FALSE 0.438 -16.000 0.000 NA   NA
 3468728 3468729 EcE24377A_1777 EcE24377A_1778 dicC   FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 3468732 3468733 EcE24377A_1781 EcE24377A_1782 dicB   TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3468733 3468734 EcE24377A_1782 EcE24377A_1784     FALSE 0.155 94.000 0.000 NA   NA
 3468736 3468737 EcE24377A_1785 EcE24377A_1786     FALSE 0.287 35.000 0.000 NA   NA
 3468738 3468739 EcE24377A_1787 EcE24377A_1788 rspB rspA1 TRUE 0.833 12.000 0.049 1.000 N NA
 3468739 3468740 EcE24377A_1788 EcE24377A_1789 rspA1   FALSE 0.025 206.000 0.020 1.000   NA
 3468741 3468742 EcE24377A_1790 EcE24377A_1791   speG FALSE 0.407 35.000 0.055 NA   NA
 3468744 3468745 EcE24377A_1793 EcE24377A_1794   ynfE FALSE 0.220 199.000 0.304 NA   NA
 3468745 3468746 EcE24377A_1794 EcE24377A_1795 ynfE   TRUE 0.947 61.000 0.231 0.001 Y NA
 3468746 3468747 EcE24377A_1795 EcE24377A_1796   dmsB2 TRUE 0.998 11.000 0.667 0.053 Y NA
 3468747 3468748 EcE24377A_1796 EcE24377A_1797 dmsB2 dmsC2 TRUE 0.968 2.000 0.333 1.000   NA
 3468748 3468749 EcE24377A_1797 EcE24377A_1798 dmsC2 dmsD TRUE 0.597 43.000 0.125 1.000   NA
 3468749 3468750 EcE24377A_1798 EcE24377A_1800 dmsD   FALSE 0.077 196.000 0.079 1.000   NA
 3468751 3468752 EcE24377A_1799 EcE24377A_1801   mic TRUE 0.724 125.000 0.455 NA N NA
 3468752 3468753 EcE24377A_1801 EcE24377A_1802 mic   TRUE 0.874 135.000 0.408 NA Y NA
 3468754 3468755 EcE24377A_1803 EcE24377A_1804 ynfM   FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 3468755 3468756 EcE24377A_1804 EcE24377A_1805     FALSE 0.008 276.000 0.000 NA   NA
 3468757 3468758 EcE24377A_1806 EcE24377A_1807 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.085 Y NA
 3468760 3468761 EcE24377A_1809 EcE24377A_1810   pntA TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 3468762 3468763 EcE24377A_1811 EcE24377A_1812   ydgH FALSE 0.483 -10.000 0.000 NA   NA
 3468763 3468764 EcE24377A_1812 EcE24377A_1813 ydgH arcD FALSE 0.118 186.000 0.143 NA   NA
 3468764 3468765 EcE24377A_1813 EcE24377A_1815 arcD   TRUE 0.698 37.000 0.140 1.000 N NA
 3468767 3468768 EcE24377A_1816 EcE24377A_1817 rstA rstB TRUE 0.986 4.000 0.181 1.000 Y NA
 3468768 3468769 EcE24377A_1817 EcE24377A_1819 rstB tus TRUE 0.609 76.000 0.200 1.000   NA
 3468770 3468771 EcE24377A_1818 EcE24377A_1820 fumC fumA TRUE 0.705 142.000 0.000 0.001 Y NA
 3468772 3468773 EcE24377A_1821 EcE24377A_1822 manA   TRUE 0.877 101.000 0.778 NA   NA
 3468774 3468775 EcE24377A_1823 EcE24377A_1824 uidC uidB TRUE 0.863 39.000 0.375 1.000   NA
 3468775 3468776 EcE24377A_1824 EcE24377A_1825 uidB uidA TRUE 0.987 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 3468776 3468777 EcE24377A_1825 EcE24377A_1826 uidA uidR FALSE 0.007 389.000 0.000 1.000 N NA
 3468777 3468778 EcE24377A_1826 EcE24377A_1827 uidR   FALSE 0.034 229.000 0.000 1.000 N NA
 3468778 3468779 EcE24377A_1827 EcE24377A_1828   malI FALSE 0.239 112.000 0.000 1.000 N NA
 3468780 3468781 EcE24377A_1829 EcE24377A_1830 malX malY TRUE 0.984 10.000 0.531 1.000 N NA
 3468781 3468782 EcE24377A_1830 EcE24377A_1831 malY add FALSE 0.483 104.000 0.132 1.000 N NA
 3468784 3468785 EcE24377A_1833 EcE24377A_1834     FALSE 0.411 86.000 0.120 NA   NA
 3468785 3468786 EcE24377A_1834 EcE24377A_1835   rnfA FALSE 0.479 77.000 0.148 NA   NA
 3468786 3468787 EcE24377A_1835 EcE24377A_1836 rnfA rnfB TRUE 0.997 0.000 0.564 0.053 Y NA
 3468787 3468788 EcE24377A_1836 EcE24377A_1837 rnfB rnfC TRUE 0.995 -7.000 0.537 0.018 Y NA
 3468788 3468789 EcE24377A_1837 EcE24377A_1838 rnfC rnfD TRUE 0.998 1.000 0.814 0.053 Y NA
 3468789 3468790 EcE24377A_1838 EcE24377A_1839 rnfD rnfG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.053 Y NA
 3468790 3468791 EcE24377A_1839 EcE24377A_1841 rnfG rnfE TRUE 0.998 4.000 0.908 0.053 Y NA
 3468795 3468796 EcE24377A_1844 EcE24377A_1845 tppB   TRUE 0.736 106.000 0.344 1.000 N NA
 3468797 3468798 EcE24377A_1846 EcE24377A_1847 pdxY tyrS FALSE 0.381 62.000 0.041 1.000 N NA
 3468798 3468799 EcE24377A_1847 EcE24377A_1848 tyrS pdxH FALSE 0.244 129.000 0.054 1.000 N NA
 3468799 3468800 EcE24377A_1848 EcE24377A_1849 pdxH   FALSE 0.202 59.000 0.034 NA   NA
 3468800 3468801 EcE24377A_1849 EcE24377A_1850     FALSE 0.146 104.000 0.034 NA   NA
 3468803 3468804 EcE24377A_1852 EcE24377A_1853     FALSE 0.402 25.000 0.000 NA   NA
 3468805 3468806 EcE24377A_1854 EcE24377A_1855     TRUE 0.973 3.000 0.412 NA   NA
 3468806 3468807 EcE24377A_1855 EcE24377A_1856     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3468808 3468809 EcE24377A_1857 EcE24377A_1858 sodC ydhF FALSE 0.240 81.000 0.033 1.000   NA
 3468810 3468811 EcE24377A_1859 EcE24377A_1860     FALSE 0.020 212.000 0.000 NA   NA
 3468811 3468812 EcE24377A_1860 EcE24377A_1861   nemA TRUE 0.880 37.000 0.362 1.000 N NA
 3468812 3468813 EcE24377A_1861 EcE24377A_1862 nemA gloA FALSE 0.395 81.000 0.057 1.000 N NA
 3468813 3468814 EcE24377A_1862 EcE24377A_1863 gloA rnt FALSE 0.491 103.000 0.136 1.000 N NA
 3468817 3468818 EcE24377A_1866 EcE24377A_1867     FALSE 0.168 82.000 0.000 NA   NA
 3468819 3468820 EcE24377A_1868 EcE24377A_1869   sodB FALSE 0.157 128.000 0.015 1.000 N NA
 3468821 3468822 EcE24377A_1870 EcE24377A_1871     FALSE 0.044 166.000 0.000 NA   NA
 3468825 3468826 EcE24377A_1874 EcE24377A_1875 ydhC cfa FALSE 0.016 291.000 0.000 1.000 N NA
 3468829 3468830 EcE24377A_1878 EcE24377A_1879     FALSE 0.023 202.000 0.000 NA   NA
 3468831 3468832 EcE24377A_5035 EcE24377A_5036     TRUE 0.670 5.000 0.000 NA   NA
 3468832 3468833 EcE24377A_5036 EcE24377A_1882     FALSE 0.130 108.000 0.000 NA   NA
 3468833 3468834 EcE24377A_1882 EcE24377A_1883     FALSE 0.101 126.000 0.000 NA   NA
 3468835 3468836 EcE24377A_1884 EcE24377A_1885     TRUE 0.938 4.000 0.222 NA   NA
 3468836 3468837 EcE24377A_1885 EcE24377A_1886     TRUE 0.995 -3.000 0.444 0.053 Y NA
 3468837 3468838 EcE24377A_1886 EcE24377A_1887     TRUE 0.928 13.000 0.235 NA   NA
 3468838 3468839 EcE24377A_1887 EcE24377A_1888     TRUE 0.976 4.000 0.458 NA   NA
 3468839 3468840 EcE24377A_1888 EcE24377A_1889     TRUE 0.994 21.000 0.600 0.017 Y NA
 3468843 3468844 EcE24377A_1892 EcE24377A_1893 pykF lpp FALSE 0.013 311.000 0.000 1.000 N NA
 3468845 3468846 EcE24377A_1894 EcE24377A_1895   sufE FALSE 0.128 149.000 0.069 NA   NA
 3468846 3468847 EcE24377A_1895 EcE24377A_1896 sufE sufS TRUE 0.902 13.000 0.183 NA   NA
 3468847 3468848 EcE24377A_1896 EcE24377A_1897 sufS sufD TRUE 0.937 -3.000 0.193 1.000 N NA
 3468848 3468849 EcE24377A_1897 EcE24377A_1898 sufD sufC TRUE 0.985 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 3468849 3468850 EcE24377A_1898 EcE24377A_1899 sufC sufB TRUE 0.994 10.000 0.466 1.000 Y NA
 3468850 3468851 EcE24377A_1899 EcE24377A_1900 sufB sufA TRUE 0.717 9.000 0.041 NA   NA
 3468851 3468852 EcE24377A_1900 EcE24377A_1901 sufA   FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 3468852 3468853 EcE24377A_1901 EcE24377A_1902   ydiL FALSE 0.499 19.000 0.032 NA   NA
 3468853 3468854 EcE24377A_1902 EcE24377A_1903 ydiL   TRUE 0.894 -3.000 0.129 NA N NA
 3468855 3468856 EcE24377A_1904 EcE24377A_1905 ydiK   FALSE 0.003 402.000 0.000 NA   NA
 3468856 3468857 EcE24377A_1905 EcE24377A_1906   ydiM FALSE 0.381 100.000 0.095 1.000   NA
 3468857 3468858 EcE24377A_1906 EcE24377A_1907 ydiM   FALSE 0.292 221.000 0.000 0.058 Y NA
 3468858 3468859 EcE24377A_1907 EcE24377A_1908     TRUE 0.878 12.000 0.082 1.000 N NA
 3468859 3468860 EcE24377A_1908 EcE24377A_1909   aroD TRUE 0.925 31.000 0.113 1.000 Y NA
 3468860 3468861 EcE24377A_1909 EcE24377A_1910 aroD   FALSE 0.125 144.000 0.019 1.000 N NA
 3468861 3468862 EcE24377A_1910 EcE24377A_1911     TRUE 0.994 14.000 0.500 1.000 Y NA
 3468863 3468864 EcE24377A_1912 EcE24377A_1913     FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 3468865 3468866 EcE24377A_1914 EcE24377A_1915 fixA   TRUE 0.997 20.000 1.000 0.018 Y NA
 3468866 3468867 EcE24377A_1915 EcE24377A_1916     TRUE 0.989 56.000 1.000 0.052 Y NA
 3468867 3468868 EcE24377A_1916 EcE24377A_1917     TRUE 0.995 -3.000 0.400 0.052 Y NA
 3468868 3468869 EcE24377A_1917 EcE24377A_1918   fadK FALSE 0.501 57.000 0.080 1.000 N NA
 3468870 3468871 EcE24377A_1919 EcE24377A_1920 ppsA   FALSE 0.206 54.000 0.000 NA   NA
 3468872 3468873 EcE24377A_1921 EcE24377A_1922   aroH FALSE 0.239 157.000 0.165 1.000   NA
 3468873 3468874 EcE24377A_1922 EcE24377A_1923 aroH   FALSE 0.195 132.000 0.054 NA N NA
 3468877 3468878 EcE24377A_1926 EcE24377A_1927     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA N NA
 3468878 3468879 EcE24377A_1927 EcE24377A_1928   btuD FALSE 0.257 78.000 0.000 NA N NA
 3468879 3468880 EcE24377A_1928 EcE24377A_1929 btuD btuE TRUE 0.824 0.000 0.000 1.000 N NA
 3468880 3468881 EcE24377A_1929 EcE24377A_1930 btuE btuC FALSE 0.501 63.000 0.084 1.000 N NA
 3468881 3468882 EcE24377A_1930 EcE24377A_1931 btuC ihfA FALSE 0.249 101.000 0.023 1.000 N NA
 3468882 3468883 EcE24377A_1931 EcE24377A_1932 ihfA pheT TRUE 0.950 5.000 0.208 1.000 N NA
 3468883 3468884 EcE24377A_1932 EcE24377A_1933 pheT pheS TRUE 0.997 15.000 0.574 0.001 Y NA
 3468884 3468885 EcE24377A_1933 EcE24377A_1934 pheS   FALSE 0.120 114.000 0.000 NA   NA
 3468885 3468886 EcE24377A_1934 EcE24377A_1935   rplT FALSE 0.013 242.000 0.000 NA   NA
 3468886 3468887 EcE24377A_1935 EcE24377A_1936 rplT infC FALSE 0.067 347.000 0.000 1.000 Y NA
 3468887 3468888 EcE24377A_1936 EcE24377A_1937 infC thrS TRUE 0.833 112.000 0.186 1.000 Y NA
 3468889 3468890 EcE24377A_1938 EcE24377A_1940     FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 3468891 3468892 EcE24377A_1939 EcE24377A_1941     FALSE 0.015 231.000 0.000 NA   NA
 3468893 3468894 EcE24377A_1942 EcE24377A_1943   pfkB FALSE 0.266 39.000 0.000 NA   NA
 3468894 3468895 EcE24377A_1943 EcE24377A_1944 pfkB   FALSE 0.143 101.000 0.000 NA   NA
 3468895 3468896 EcE24377A_1944 EcE24377A_1945     FALSE 0.133 106.000 0.000 NA   NA
 3468898 3468899 EcE24377A_1947 EcE24377A_1949     FALSE 0.097 163.000 0.068 NA   NA
 3468901 3468902 EcE24377A_1950 EcE24377A_1951     FALSE 0.121 113.000 0.000 NA   NA
 3468905 3468906 EcE24377A_1954 EcE24377A_1955   chbF TRUE 0.981 13.000 0.429 0.019   NA
 3468906 3468907 EcE24377A_1955 EcE24377A_1956 chbF chbR TRUE 0.865 105.000 0.625 1.000 N NA
 3468907 3468908 EcE24377A_1956 EcE24377A_1957 chbR chbA TRUE 0.989 11.000 0.727 1.000 N NA
 3468908 3468909 EcE24377A_1957 EcE24377A_1958 chbA chbC TRUE 0.989 51.000 0.833 0.011 Y NA
 3468909 3468910 EcE24377A_1958 EcE24377A_1959 chbC chbB TRUE 0.969 85.000 0.500 0.011 Y NA
 3468910 3468911 EcE24377A_1959 EcE24377A_1960 chbB osmE FALSE 0.010 299.000 0.000 1.000   NA
 3468912 3468913 EcE24377A_1961 EcE24377A_1963 nadE cho FALSE 0.024 230.000 0.010 1.000 N NA
 3468914 3468915 EcE24377A_1962 EcE24377A_1964   spy FALSE 0.021 203.000 0.028 NA   NA
 3468917 3468918 EcE24377A_1966 EcE24377A_1967 astE astB TRUE 0.968 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 3468918 3468919 EcE24377A_1967 EcE24377A_1968 astB astD TRUE 0.963 -3.000 0.306 1.000 N NA
 3468919 3468920 EcE24377A_1968 EcE24377A_1969 astD astA TRUE 0.932 -3.000 0.179 1.000 N NA
 3468920 3468921 EcE24377A_1969 EcE24377A_1970 astA astC TRUE 0.996 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 3468922 3468923 EcE24377A_1971 EcE24377A_1972   xth TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3468923 3468924 EcE24377A_1972 EcE24377A_1973 xth   FALSE 0.027 167.000 0.016 NA   NA
 3468924 3468925 EcE24377A_1973 EcE24377A_1974     FALSE 0.547 -157.000 0.083 NA   NA
 3468925 3468926 EcE24377A_1974 EcE24377A_1975     TRUE 0.881 15.000 0.174 NA   NA
 3468926 3468927 EcE24377A_1975 EcE24377A_1976     TRUE 0.848 0.000 0.087 NA   NA
 3468927 3468928 EcE24377A_1976 EcE24377A_1977     TRUE 0.655 10.000 0.032 NA   NA
 3468928 3468929 EcE24377A_1977 EcE24377A_1978   ynjC TRUE 0.971 -27.000 0.627 0.058   NA
 3468929 3468930 EcE24377A_1978 EcE24377A_1979 ynjC   TRUE 0.986 0.000 0.602 1.000   NA
 3468930 3468931 EcE24377A_1979 EcE24377A_1980     FALSE 0.483 67.000 0.111 1.000   NA
 3468936 3468937 EcE24377A_1985 EcE24377A_1986   topB FALSE 0.096 128.000 0.000 NA   NA
 3468937 3468938 EcE24377A_1986 EcE24377A_1987 topB selD TRUE 0.842 5.000 0.041 1.000 N NA
 3468938 3468939 EcE24377A_1987 EcE24377A_1988 selD   FALSE 0.233 117.000 0.033 1.000 N NA
 3468940 3468941 EcE24377A_1989 EcE24377A_1990   sppA FALSE 0.342 -57.000 0.000 NA   NA
 3468941 3468942 EcE24377A_1990 EcE24377A_1991 sppA ansA FALSE 0.190 167.000 0.113 1.000 N NA
 3468942 3468943 EcE24377A_1991 EcE24377A_1992 ansA pncA TRUE 0.822 11.000 0.040 1.000 N NA
 3468944 3468945 EcE24377A_1993 EcE24377A_1994 ydjE   TRUE 0.779 117.000 0.125 1.000 Y NA
 3468945 3468946 EcE24377A_1994 EcE24377A_1995     FALSE 0.539 137.000 0.269 1.000 N NA
 3468946 3468947 EcE24377A_1995 EcE24377A_1996     TRUE 0.961 10.000 0.269 1.000 N NA
 3468947 3468948 EcE24377A_1996 EcE24377A_1997     TRUE 0.993 5.000 0.368 1.000 Y NA
 3468948 3468949 EcE24377A_1997 EcE24377A_1998   gutB TRUE 0.924 21.000 0.194 0.017 N NA
 3468949 3468950 EcE24377A_1998 EcE24377A_1999 gutB ydjK TRUE 0.891 17.000 0.167 1.000 N NA
 3468950 3468951 EcE24377A_1999 EcE24377A_2000 ydjK   TRUE 0.876 27.000 0.250 1.000 N NA
 3468951 3468952 EcE24377A_2000 EcE24377A_2001     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 3468952 3468953 EcE24377A_2001 EcE24377A_2002   msrB TRUE 0.702 42.000 0.216 NA   NA
 3468954 3468955 EcE24377A_2003 EcE24377A_2004 gapA   TRUE 0.877 63.000 0.154 1.000 Y NA
 3468956 3468957 EcE24377A_2005 EcE24377A_2006   mipA FALSE 0.288 90.000 0.067 NA   NA
 3468958 3468959 EcE24377A_2007 EcE24377A_2008     TRUE 0.837 113.000 0.683 NA   NA
 3468959 3468960 EcE24377A_2008 EcE24377A_2009     FALSE 0.068 147.000 0.000 NA   NA
 3468960 3468961 EcE24377A_2009 EcE24377A_2010     FALSE 0.486 181.000 0.000 0.005 Y NA
 3468961 3468962 EcE24377A_2010 EcE24377A_2011     FALSE 0.461 43.000 0.083 NA   NA
 3468966 3468967 EcE24377A_2015 EcE24377A_2016 yeaN   FALSE 0.102 55.000 0.007 NA   NA
 3468969 3468970 EcE24377A_2018 EcE24377A_2019     TRUE 0.885 18.000 0.222 NA   NA
 3468971 3468972 EcE24377A_2020 EcE24377A_2021     TRUE 0.633 12.000 0.000 NA   NA
 3468972 3468973 EcE24377A_2021 EcE24377A_2022     FALSE 0.190 60.000 0.000 NA   NA
 3468975 3468976 EcE24377A_2024 EcE24377A_2025     FALSE 0.198 127.000 0.000 1.000 N NA
 3468977 3468978 EcE24377A_2026 EcE24377A_2027 ttuC   FALSE 0.162 251.000 0.333 1.000 N NA
 3468978 3468979 EcE24377A_2027 EcE24377A_2028     FALSE 0.508 32.000 0.000 1.000 N NA
 3468979 3468980 EcE24377A_2028 EcE24377A_2029     TRUE 0.572 56.000 0.043 0.052 N NA
 3468981 3468982 EcE24377A_2030 EcE24377A_2031 rnd fadD FALSE 0.544 70.000 0.115 1.000 N NA
 3468982 3468983 EcE24377A_2031 EcE24377A_2032 fadD slp FALSE 0.146 205.000 0.169 1.000 N NA
 3468983 3468984 EcE24377A_2032 EcE24377A_2033 slp   FALSE 0.413 40.000 0.024 1.000 N NA
 3468984 3468985 EcE24377A_2033 EcE24377A_2034     FALSE 0.503 58.000 0.082 1.000 N NA
 3468985 3468986 EcE24377A_2034 EcE24377A_2035     FALSE 0.305 33.000 0.000 NA   NA
 3468991 3468992 EcE24377A_2040 EcE24377A_2041 pabB   TRUE 0.896 4.000 0.116 1.000   NA
 3468992 3468993 EcE24377A_2041 EcE24377A_2042   sdaA FALSE 0.390 184.000 0.409 1.000   NA
 3468993 3468994 EcE24377A_2042 EcE24377A_2043 sdaA   FALSE 0.002 454.000 0.000 NA   NA
 3468996 3468997 EcE24377A_2045 EcE24377A_2046 manX manY TRUE 0.853 63.000 0.000 0.015 Y NA
 3468997 3468998 EcE24377A_2046 EcE24377A_2047 manY manZ TRUE 0.998 13.000 0.939 0.015 Y NA
 3468998 3468999 EcE24377A_2047 EcE24377A_2048 manZ   TRUE 0.914 55.000 0.755 NA   NA
 3468999 3469000 EcE24377A_2048 EcE24377A_2050     FALSE 0.002 430.000 0.000 NA   NA
 3469001 3469002 EcE24377A_2049 EcE24377A_2051 rrmA cspC FALSE 0.074 166.000 0.038 1.000   NA
 3469002 3469003 EcE24377A_2051 EcE24377A_2052 cspC   TRUE 0.918 13.000 0.214 NA   NA
 3469003 3469004 EcE24377A_2052 EcE24377A_2053     FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 3469004 3469005 EcE24377A_2053 EcE24377A_2054     TRUE 0.827 75.000 0.500 NA   NA
 3469009 3469010 EcE24377A_2058 EcE24377A_2059   prc FALSE 0.137 192.000 0.042 0.021 N NA
 3469010 3469011 EcE24377A_2059 EcE24377A_2060 prc proQ TRUE 0.923 20.000 0.304 NA N NA
 3469011 3469012 EcE24377A_2060 EcE24377A_2061 proQ   TRUE 0.775 97.000 0.081 NA Y NA
 3469013 3469014 EcE24377A_2062 EcE24377A_2063     TRUE 0.966 -37.000 0.840 NA   NA
 3469014 3469015 EcE24377A_2063 EcE24377A_2064     TRUE 0.795 74.000 0.420 NA   NA
 3469015 3469016 EcE24377A_2064 EcE24377A_2065     FALSE 0.313 118.000 0.121 NA   NA
 3469016 3469017 EcE24377A_2065 EcE24377A_2066     TRUE 0.923 21.000 0.353 NA   NA
 3469018 3469019 EcE24377A_2067 EcE24377A_2068 pphA   FALSE 0.003 396.000 0.000 NA   NA
 3469019 3469020 EcE24377A_2068 EcE24377A_2069     TRUE 0.984 13.000 0.704 NA   NA
 3469020 3469021 EcE24377A_2069 EcE24377A_2070     TRUE 0.986 4.000 0.613 1.000   NA
 3469022 3469023 EcE24377A_2071 EcE24377A_2072 holE   TRUE 0.583 102.000 0.222 1.000   NA
 3469023 3469024 EcE24377A_2072 EcE24377A_2074   exoX TRUE 0.947 24.000 0.500 1.000   NA
 3469025 3469026 EcE24377A_2073 EcE24377A_2075 prtB   FALSE 0.056 209.000 0.092 NA   NA
 3469028 3469029 EcE24377A_2077 EcE24377A_2078     FALSE 0.167 67.000 0.027 NA   NA
 3469031 3469032 EcE24377A_2080 EcE24377A_2081 eda edd TRUE 0.976 37.000 0.523 1.000 Y NA
 3469032 3469033 EcE24377A_2081 EcE24377A_2082 edd zwf FALSE 0.199 235.000 0.041 1.000 Y NA
 3469034 3469035 EcE24377A_2083 EcE24377A_2084   pykA FALSE 0.287 128.000 0.071 1.000 N NA
 3469036 3469037 EcE24377A_2085 EcE24377A_2086 msbB1   TRUE 0.874 120.000 0.299 1.000 Y NA
 3469037 3469038 EcE24377A_2086 EcE24377A_2087   znuA TRUE 0.879 16.000 0.131 1.000 N NA
 3469039 3469040 EcE24377A_2088 EcE24377A_2089 znuC znuB TRUE 0.998 -3.000 0.755 0.084 Y NA
 3469041 3469042 EcE24377A_2090 EcE24377A_2091 ruvB ruvA TRUE 0.997 9.000 0.549 0.001 Y NA
 3469044 3469045 EcE24377A_2093 EcE24377A_2094 ruvC   TRUE 0.798 35.000 0.277 NA   NA
 3469045 3469046 EcE24377A_2094 EcE24377A_2095   nudB FALSE 0.367 29.000 0.035 NA   NA
 3469046 3469047 EcE24377A_2095 EcE24377A_2096 nudB aspS FALSE 0.274 118.000 0.050 1.000 N NA
 3469047 3469048 EcE24377A_2096 EcE24377A_2097 aspS   FALSE 0.029 190.000 0.000 NA   NA
 3469049 3469050 EcE24377A_2098 EcE24377A_2099     TRUE 0.827 -3.000 0.089 NA   NA
 3469050 3469051 EcE24377A_2099 EcE24377A_2100     FALSE 0.497 53.000 0.126 NA   NA
 3469051 3469052 EcE24377A_2100 EcE24377A_2101     FALSE 0.488 41.000 0.089 NA   NA
 3469052 3469053 EcE24377A_2101 EcE24377A_2102     TRUE 0.953 -3.000 0.315 NA   NA
 3469053 3469054 EcE24377A_2102 EcE24377A_2104     FALSE 0.359 28.000 0.000 NA   NA
 3469055 3469056 EcE24377A_2103 EcE24377A_2105 torZ torY TRUE 0.997 7.000 0.481 0.001 Y NA
 3469056 3469057 EcE24377A_2105 EcE24377A_2106 torY cutC FALSE 0.007 388.000 0.000 1.000 N NA
 3469057 3469058 EcE24377A_2106 EcE24377A_2107 cutC   TRUE 0.727 14.000 0.057 NA   NA
 3469059 3469060 EcE24377A_2108 EcE24377A_2109 argS   FALSE 0.037 177.000 0.000 NA   NA
 3469061 3469062 EcE24377A_2110 EcE24377A_2111 flhE flhA TRUE 0.960 0.000 0.158 0.002   NA
 3469062 3469063 EcE24377A_2111 EcE24377A_2112 flhA flhB TRUE 0.989 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 3469065 3469066 EcE24377A_2114 EcE24377A_2115 cheZ cheY TRUE 0.966 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3469066 3469067 EcE24377A_2115 EcE24377A_2116 cheY cheB TRUE 0.973 15.000 0.000 0.010 Y NA
 3469067 3469068 EcE24377A_2116 EcE24377A_2117 cheB cheR TRUE 0.969 3.000 0.025 1.000 Y NA
 3469068 3469069 EcE24377A_2117 EcE24377A_2118 cheR   TRUE 0.972 19.000 0.188 1.000 Y NA
 3469069 3469070 EcE24377A_2118 EcE24377A_2119   cheM TRUE 0.960 46.000 0.235 0.001 Y NA
 3469070 3469071 EcE24377A_2119 EcE24377A_2120 cheM cheW TRUE 0.694 145.000 0.043 0.003 Y NA
 3469071 3469072 EcE24377A_2120 EcE24377A_2121 cheW cheA TRUE 0.992 21.000 0.447 0.003 Y NA
 3469072 3469073 EcE24377A_2121 EcE24377A_2122 cheA motB TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 3469073 3469074 EcE24377A_2122 EcE24377A_2123 motB motA TRUE 0.993 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 3469074 3469075 EcE24377A_2123 EcE24377A_2124 motA flhC TRUE 0.680 127.000 0.408 1.000   NA
 3469075 3469076 EcE24377A_2124 EcE24377A_2125 flhC flhD TRUE 0.914 3.000 0.000 0.001   NA
 3469076 3469077 EcE24377A_2125 EcE24377A_2126 flhD   FALSE 0.325 31.000 0.000 NA   NA
 3469079 3469080 EcE24377A_2128 EcE24377A_2129 otsA otsB TRUE 0.963 -25.000 0.068 0.000 Y NA
 3469080 3469081 EcE24377A_2129 EcE24377A_2130 otsB araH FALSE 0.427 167.000 0.037 1.000 Y NA
 3469081 3469082 EcE24377A_2130 EcE24377A_2131 araH araG TRUE 0.995 15.000 0.451 0.002 Y NA
 3469082 3469083 EcE24377A_2131 EcE24377A_2132 araG araF TRUE 0.989 70.000 0.917 0.002 Y NA
 3469084 3469086 EcE24377A_2133 EcE24377A_2135     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 3469086 3469087 EcE24377A_2135 EcE24377A_2136     FALSE 0.022 206.000 0.000 NA   NA
 3469092 3469093 EcE24377A_2141 EcE24377A_5037     FALSE 0.026 196.000 0.000 NA   NA
 3469093 3469094 EcE24377A_5037 EcE24377A_5038     TRUE 0.617 13.000 0.000 NA   NA
 3469094 3469095 EcE24377A_5038 EcE24377A_5039     FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 3469095 3469096 EcE24377A_5039 EcE24377A_2145   pgsA FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 3469096 3469097 EcE24377A_2145 EcE24377A_2146 pgsA uvrC TRUE 0.722 57.000 0.227 1.000 N NA
 3469097 3469098 EcE24377A_2146 EcE24377A_2147 uvrC uvrY TRUE 0.932 -3.000 0.086 0.021 N NA
 3469098 3469099 EcE24377A_2147 EcE24377A_2148 uvrY   FALSE 0.013 239.000 0.000 NA   NA
 3469101 3469102 EcE24377A_2150 EcE24377A_2151 sdiA yecC FALSE 0.055 230.000 0.071 1.000 N NA
 3469102 3469103 EcE24377A_2151 EcE24377A_2152 yecC   TRUE 0.981 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 3469103 3469104 EcE24377A_2152 EcE24377A_2153   dcyD TRUE 0.921 -28.000 0.050 1.000 Y NA
 3469104 3469105 EcE24377A_2153 EcE24377A_2154 dcyD fliY TRUE 0.937 105.000 0.469 1.000 Y NA
 3469105 3469106 EcE24377A_2154 EcE24377A_2155 fliY   TRUE 0.571 124.000 0.280 1.000   NA
 3469106 3469107 EcE24377A_2155 EcE24377A_2156   fliA TRUE 0.554 46.000 0.108 1.000   NA
 3469107 3469108 EcE24377A_2156 EcE24377A_2157 fliA   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 3469108 3469109 EcE24377A_2157 EcE24377A_2158   fliC FALSE 0.224 49.000 0.000 NA   NA
 3469110 3469111 EcE24377A_2159 EcE24377A_2160 fliD fliS TRUE 0.984 25.000 0.284 0.002 Y NA
 3469111 3469112 EcE24377A_2160 EcE24377A_2161 fliS fliT TRUE 0.967 0.000 0.324 1.000   NA
 3469112 3469113 EcE24377A_2161 EcE24377A_2162 fliT amyA FALSE 0.464 78.000 0.115 1.000   NA
 3469115 3469116 EcE24377A_2164 EcE24377A_2165     TRUE 0.988 -3.000 0.844 NA   NA
 3469116 3469117 EcE24377A_2165 EcE24377A_2167     FALSE 0.128 109.000 0.000 NA   NA
 3469120 3469121 EcE24377A_2169 EcE24377A_2170   fliE FALSE 0.002 1396.000 0.000 1.000 N NA
 3469122 3469123 EcE24377A_2171 EcE24377A_2172 fliF fliG TRUE 0.987 -7.000 0.220 0.004 Y NA
 3469123 3469124 EcE24377A_2172 EcE24377A_2173 fliG fliH TRUE 0.968 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 3469124 3469125 EcE24377A_2173 EcE24377A_2174 fliH fliI TRUE 0.983 0.000 0.000 0.003 Y NA
 3469125 3469126 EcE24377A_2174 EcE24377A_2175 fliI fliJ TRUE 0.957 19.000 0.006 0.005 Y NA
 3469126 3469127 EcE24377A_2175 EcE24377A_2176 fliJ fliK TRUE 0.994 -3.000 0.317 0.004 Y NA
 3469127 3469128 EcE24377A_2176 EcE24377A_2177 fliK fliL TRUE 0.804 105.000 0.119 1.000 Y NA
 3469128 3469129 EcE24377A_2177 EcE24377A_2178 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 3469129 3469130 EcE24377A_2178 EcE24377A_2179 fliM fliN TRUE 0.989 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 3469130 3469131 EcE24377A_2179 EcE24377A_2180 fliN fliO TRUE 0.995 3.000 0.443 1.000 Y NA
 3469131 3469132 EcE24377A_2180 EcE24377A_2181 fliO fliP TRUE 0.988 0.000 0.203 1.000 Y NA
 3469132 3469133 EcE24377A_2181 EcE24377A_2182 fliP fliQ TRUE 0.998 10.000 0.827 0.008 Y NA
 3469133 3469134 EcE24377A_2182 EcE24377A_2183 fliQ fliR TRUE 0.982 9.000 0.000 0.002 Y NA
 3469134 3469135 EcE24377A_2183 EcE24377A_2184 fliR rcsA FALSE 0.016 290.000 0.000 1.000 N NA
 3469137 3469138 EcE24377A_2186 EcE24377A_2188     FALSE 0.007 298.000 0.000 NA   NA
 3469139 3469140 EcE24377A_2187 EcE24377A_2189     FALSE 0.168 189.000 0.208 NA   NA
 3469140 3469141 EcE24377A_2189 EcE24377A_2190     FALSE 0.147 79.000 0.025 NA   NA
 3469143 3469144 EcE24377A_2191 EcE24377A_2193 vsr dcm TRUE 0.949 -19.000 0.048 0.071 Y NA
 3469144 3469145 EcE24377A_2193 EcE24377A_2194 dcm   FALSE 0.403 67.000 0.074 1.000   NA
 3469145 3469146 EcE24377A_2194 EcE24377A_2195     FALSE 0.406 40.000 0.062 NA   NA
 3469147 3469148 EcE24377A_2196 EcE24377A_2197     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 3469148 3469149 EcE24377A_2197 EcE24377A_2198   hchA FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3469150 3469151 EcE24377A_2199 EcE24377A_2200     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 3469152 3469153 EcE24377A_2201 EcE24377A_2202     FALSE 0.181 109.000 0.000 1.000   NA
 3469153 3469154 EcE24377A_2202 EcE24377A_2203     TRUE 0.993 1.000 0.790 0.051   NA
 3469154 3469155 EcE24377A_2203 EcE24377A_2204     FALSE 0.015 257.000 0.000 1.000   NA
 3469155 3469156 EcE24377A_2204 EcE24377A_2205     FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 3469157 3469158 EcE24377A_2206 EcE24377A_2207     FALSE 0.080 138.000 0.000 NA   NA
 3469158 3469159 EcE24377A_2207 EcE24377A_2208     TRUE 0.669 6.000 0.000 NA   NA
 3469159 3469160 EcE24377A_2208 EcE24377A_2209     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3469160 3469161 EcE24377A_2209 EcE24377A_2210     FALSE 0.001 790.000 0.000 NA   NA
 3469161 3469162 EcE24377A_2210 EcE24377A_2211     TRUE 0.839 109.000 0.667 NA   NA
 3469162 3469163 EcE24377A_2211 EcE24377A_2212     TRUE 0.793 13.000 0.077 NA   NA
 3469163 3469164 EcE24377A_2212 EcE24377A_2213     TRUE 0.713 18.000 0.077 NA   NA
 3469164 3469165 EcE24377A_2213 EcE24377A_2214     TRUE 0.633 12.000 0.000 NA   NA
 3469165 3469166 EcE24377A_2214 EcE24377A_2215     FALSE 0.525 -7.000 0.000 NA   NA
 3469166 3469167 EcE24377A_2215 EcE24377A_2216     TRUE 0.841 3.000 0.083 NA   NA
 3469167 3469168 EcE24377A_2216 EcE24377A_2217     FALSE 0.375 27.000 0.000 NA   NA
 3469168 3469169 EcE24377A_2217 EcE24377A_2218     TRUE 0.671 3.000 0.000 NA   NA
 3469169 3469170 EcE24377A_2218 EcE24377A_2219     FALSE 0.422 -19.000 0.000 NA   NA
 3469170 3469171 EcE24377A_2219 EcE24377A_2220     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3469171 3469172 EcE24377A_2220 EcE24377A_2221     FALSE 0.192 59.000 0.000 NA   NA
 3469172 3469173 EcE24377A_2221 EcE24377A_2222     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3469173 3469174 EcE24377A_2222 EcE24377A_2223     FALSE 0.287 35.000 0.000 NA   NA
 3469174 3469175 EcE24377A_2223 EcE24377A_2224     FALSE 0.189 62.000 0.000 NA   NA
 3469175 3469176 EcE24377A_2224 EcE24377A_2225     TRUE 0.759 0.000 0.000 1.000   NA
 3469176 3469177 EcE24377A_2225 EcE24377A_2226     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3469177 3469178 EcE24377A_2226 EcE24377A_2227     FALSE 0.037 177.000 0.000 NA   NA
 3469178 3469179 EcE24377A_2227 EcE24377A_2228     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000 Y NA
 3469179 3469180 EcE24377A_2228 EcE24377A_2229     FALSE 0.179 74.000 0.000 NA   NA
 3469180 3469181 EcE24377A_2229 EcE24377A_2230     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 3469183 3469184 EcE24377A_2232 EcE24377A_2233     FALSE 0.001 680.000 0.000 NA   NA
 3469184 3469185 EcE24377A_2233 EcE24377A_2234     TRUE 0.675 0.000 0.000 NA   NA
 3469185 3469186 EcE24377A_2234 EcE24377A_2235     TRUE 0.633 -3.000 0.000 NA   NA
 3469186 3469187 EcE24377A_2235 EcE24377A_2236     FALSE 0.003 409.000 0.000 NA   NA
 3469190 3469191 EcE24377A_2239 EcE24377A_2240     FALSE 0.374 -34.000 0.000 NA   NA
 3469191 3469192 EcE24377A_2240 EcE24377A_2241     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 3469192 3469193 EcE24377A_2241 EcE24377A_2242     FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 3469193 3469194