MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli E24377A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3466964	3466965	EcE24377A_0001	EcE24377A_0002	thrA	thrB	TRUE	0.983	2.000	0.133	1.000	Y	NA
3466965	3466966	EcE24377A_0002	EcE24377A_0003	thrB	thrC	TRUE	0.989	1.000	0.233	1.000	Y	NA
3466969	3466970	EcE24377A_0006	EcE24377A_0007		agcS	FALSE	0.174	70.000	0.028	NA		NA
3466971	3466972	EcE24377A_0008	EcE24377A_0009	tal2	mog	FALSE	0.264	115.000	0.042	1.000	N	NA
3466973	3466974	EcE24377A_0010	EcE24377A_0011			FALSE	0.084	149.000	0.043	NA		NA
3466974	3466975	EcE24377A_0011	EcE24377A_0012			TRUE	0.934	26.000	0.500	NA		NA
3466975	3466976	EcE24377A_0012	EcE24377A_0013			FALSE	0.086	135.000	0.000	NA		NA
3466977	3466978	EcE24377A_0014	EcE24377A_0015	dnaK	dnaJ	TRUE	0.933	89.000	0.236	0.004	Y	NA
3466978	3466979	EcE24377A_0015	EcE24377A_0016	dnaJ	nhaA	FALSE	0.002	842.000	0.022	1.000	N	NA
3466979	3466980	EcE24377A_0016	EcE24377A_0017	nhaA	nhaR	TRUE	0.768	66.000	0.292	1.000	N	NA
3466981	3466982	EcE24377A_0018	EcE24377A_0019			TRUE	0.617	13.000	0.000	NA		NA
3466982	3466983	EcE24377A_0019	EcE24377A_0020			FALSE	0.002	571.000	0.000	NA		NA
3466985	3466986	EcE24377A_0022	EcE24377A_0023		rpsT	FALSE	0.445	22.000	0.000	NA		NA
3466987	3466988	EcE24377A_0024	EcE24377A_0025		ribF	TRUE	0.567	8.000	0.019	NA		NA
3466988	3466989	EcE24377A_0025	EcE24377A_0026	ribF	ileS	TRUE	0.799	43.000	0.254	1.000	N	NA
3466989	3466990	EcE24377A_0026	EcE24377A_0027	ileS	lspA	TRUE	0.852	0.000	0.045	1.000	N	NA
3466990	3466991	EcE24377A_0027	EcE24377A_0028	lspA	fkpB	FALSE	0.512	105.000	0.154	1.000	N	NA
3466991	3466992	EcE24377A_0028	EcE24377A_0029	fkpB	ispH	TRUE	0.988	2.000	0.626	1.000	N	NA
3466992	3466993	EcE24377A_0029	EcE24377A_0030	ispH	rihC	FALSE	0.268	66.000	0.028	NA	N	NA
3466993	3466994	EcE24377A_0030	EcE24377A_0031	rihC	dapB	FALSE	0.042	167.000	0.003	NA	N	NA
3466996	3466997	EcE24377A_0033	EcE24377A_0034	carA	carB	TRUE	0.992	18.000	0.345	0.001	Y	NA
3467000	3467001	EcE24377A_0037	EcE24377A_0038	caiE	caiD	TRUE	0.753	6.000	0.000	1.000		NA
3467001	3467002	EcE24377A_0038	EcE24377A_0039	caiD		TRUE	0.781	109.000	0.000	0.038	Y	NA
3467002	3467003	EcE24377A_0039	EcE24377A_0040		caiB	TRUE	0.727	59.000	0.154	0.038	N	NA
3467003	3467004	EcE24377A_0040	EcE24377A_0041	caiB	caiA	TRUE	0.766	129.000	0.529	1.000	N	NA
3467004	3467005	EcE24377A_0041	EcE24377A_0042	caiA	caiT	TRUE	0.721	31.000	0.118	1.000	N	NA
3467006	3467007	EcE24377A_0043	EcE24377A_0044			FALSE	0.035	179.000	0.000	NA		NA
3467007	3467008	EcE24377A_0044	EcE24377A_0045		etfB	FALSE	0.508	69.000	0.154	NA		NA
3467008	3467009	EcE24377A_0045	EcE24377A_0046	etfB	fixB	TRUE	0.989	15.000	0.231	0.022	Y	NA
3467009	3467010	EcE24377A_0046	EcE24377A_0047	fixB	fixC	TRUE	0.864	51.000	0.000	0.064	Y	NA
3467010	3467011	EcE24377A_0047	EcE24377A_0048	fixC	fixX	TRUE	0.987	-3.000	0.167	0.064	Y	NA
3467011	3467012	EcE24377A_0048	EcE24377A_0049	fixX		FALSE	0.352	58.000	0.000	1.000	N	NA
3467012	3467013	EcE24377A_0049	EcE24377A_0050		kefF	FALSE	0.184	108.000	0.000	1.000		NA
3467013	3467014	EcE24377A_0050	EcE24377A_0051	kefF	kefC	TRUE	0.971	-7.000	0.560	1.000		NA
3467014	3467015	EcE24377A_0051	EcE24377A_0052	kefC	folA	FALSE	0.046	192.000	0.012	1.000	N	NA
3467016	3467017	EcE24377A_0053	EcE24377A_0054	apaH	apaG	TRUE	0.957	7.000	0.267	NA	N	NA
3467017	3467018	EcE24377A_0054	EcE24377A_0055	apaG	ksgA	TRUE	0.869	3.000	0.078	NA	N	NA
3467018	3467019	EcE24377A_0055	EcE24377A_0056	ksgA	pdxA	TRUE	0.938	-3.000	0.197	1.000	N	NA
3467019	3467020	EcE24377A_0056	EcE24377A_0057	pdxA	surA	TRUE	0.986	0.000	0.561	1.000	N	NA
3467020	3467021	EcE24377A_0057	EcE24377A_0058	surA	imp	TRUE	0.681	53.000	0.182	1.000	N	NA
3467023	3467024	EcE24377A_0060	EcE24377A_0061		rapA	TRUE	0.962	12.000	0.294	1.000	N	NA
3467024	3467025	EcE24377A_0061	EcE24377A_0062	rapA	polB	TRUE	0.610	165.000	0.098	0.088	Y	NA
3467025	3467026	EcE24377A_0062	EcE24377A_0063	polB	araD	FALSE	0.281	75.000	0.018	1.000	N	NA
3467026	3467027	EcE24377A_0063	EcE24377A_0064	araD	araA	FALSE	0.385	169.000	0.017	1.000	Y	NA
3467027	3467028	EcE24377A_0064	EcE24377A_0065	araA	araB	TRUE	0.916	11.000	0.138	1.000	N	NA
3467029	3467030	EcE24377A_0066	EcE24377A_0067	araC		FALSE	0.496	86.000	0.167	NA		NA
3467031	3467032	EcE24377A_0068	EcE24377A_0069	thiQ	thiP	TRUE	0.973	-16.000	0.522	0.018	N	NA
3467032	3467033	EcE24377A_0069	EcE24377A_0070	thiP	thiB	TRUE	0.979	-24.000	0.697	0.083	N	NA
3467033	3467034	EcE24377A_0070	EcE24377A_0071	thiB		FALSE	0.139	44.000	0.010	NA		NA
3467034	3467035	EcE24377A_0071	EcE24377A_0072		sgrR	TRUE	0.673	1.000	0.000	NA		NA
3467037	3467038	EcE24377A_0074	EcE24377A_0075	leuD	leuC	TRUE	0.995	11.000	0.309	0.001	Y	NA
3467038	3467039	EcE24377A_0075	EcE24377A_0076	leuC	leuB	TRUE	0.995	3.000	0.275	0.001	Y	NA
3467039	3467040	EcE24377A_0076	EcE24377A_0077	leuB	leuA	TRUE	0.990	0.000	0.126	0.001	Y	NA
3467041	3467042	EcE24377A_0078	EcE24377A_0079	leuO	ilvI	FALSE	0.012	318.000	0.000	1.000	N	NA
3467042	3467043	EcE24377A_0079	EcE24377A_0080	ilvI	ilvH	TRUE	0.996	3.000	0.371	0.002	Y	NA
3467043	3467044	EcE24377A_0080	EcE24377A_0081	ilvH		FALSE	0.212	52.000	0.000	NA		NA
3467044	3467045	EcE24377A_0081	EcE24377A_0082		fruR	TRUE	0.633	-3.000	0.000	NA		NA
3467045	3467046	EcE24377A_0082	EcE24377A_0083	fruR	mraZ	FALSE	0.002	602.000	0.000	NA		NA
3467046	3467047	EcE24377A_0083	EcE24377A_0084	mraZ	mraW	TRUE	0.985	2.000	0.635	NA		NA
3467047	3467048	EcE24377A_0084	EcE24377A_0085	mraW	ftsL	TRUE	0.948	-3.000	0.227	1.000	N	NA
3467048	3467049	EcE24377A_0085	EcE24377A_0086	ftsL	ftsI	TRUE	0.874	16.000	0.124	1.000	N	NA
3467049	3467050	EcE24377A_0086	EcE24377A_0087	ftsI	murE	TRUE	0.942	-13.000	0.059	1.000	Y	NA
3467050	3467051	EcE24377A_0087	EcE24377A_0088	murE	murF	TRUE	0.997	-3.000	0.569	0.002	Y	NA
3467051	3467052	EcE24377A_0088	EcE24377A_0089	murF	mraY	TRUE	0.991	-6.000	0.309	0.004	Y	NA
3467052	3467053	EcE24377A_0089	EcE24377A_0090	mraY	murD	TRUE	0.998	3.000	0.647	0.004	Y	NA
3467053	3467054	EcE24377A_0090	EcE24377A_0091	murD	ftsW	TRUE	0.981	0.000	0.297	0.003	N	NA
3467054	3467055	EcE24377A_0091	EcE24377A_0092	ftsW	murG	TRUE	0.987	-3.000	0.647	1.000	N	NA
3467055	3467056	EcE24377A_0092	EcE24377A_0093	murG	murC	TRUE	0.932	54.000	0.283	1.000	Y	NA
3467056	3467057	EcE24377A_0093	EcE24377A_0094	murC	ddlB	TRUE	0.982	-7.000	0.153	0.004	Y	NA
3467057	3467058	EcE24377A_0094	EcE24377A_0095	ddlB	ftsQ	TRUE	0.993	2.000	0.372	NA	Y	NA
3467058	3467059	EcE24377A_0095	EcE24377A_0096	ftsQ	ftsA	TRUE	0.970	-3.000	0.389	NA	N	NA
3467059	3467060	EcE24377A_0096	EcE24377A_0097	ftsA	ftsZ	TRUE	0.956	61.000	0.460	1.000	Y	NA
3467060	3467061	EcE24377A_0097	EcE24377A_0098	ftsZ	lpxC	FALSE	0.498	101.000	0.134	1.000	N	NA
3467061	3467062	EcE24377A_0098	EcE24377A_0099	lpxC	secM	FALSE	0.078	156.000	0.000	1.000		NA
3467062	3467063	EcE24377A_0099	EcE24377A_0100	secM	secA	FALSE	0.383	62.000	0.065	1.000		NA
3467063	3467064	EcE24377A_0100	EcE24377A_0101	secA	mutT	TRUE	0.636	60.000	0.168	1.000	N	NA
3467065	3467066	EcE24377A_0102	EcE24377A_0103			FALSE	0.390	-28.000	0.000	NA		NA
3467066	3467067	EcE24377A_0103	EcE24377A_0104			TRUE	0.964	10.000	0.356	NA		NA
3467067	3467068	EcE24377A_0104	EcE24377A_0105		coaE	TRUE	0.873	0.000	0.110	NA		NA
3467070	3467071	EcE24377A_0108	EcE24377A_0109		hofB	FALSE	0.483	-10.000	0.000	NA		NA
3467071	3467072	EcE24377A_0109	EcE24377A_0110	hofB	pilA	TRUE	0.995	10.000	0.556	NA	Y	NA
3467072	3467073	EcE24377A_0110	EcE24377A_0111	pilA	nadC	FALSE	0.027	203.000	0.015	NA	N	NA
3467074	3467075	EcE24377A_0112	EcE24377A_0113	ampD	ampE	TRUE	0.988	-3.000	0.249	1.000	Y	NA
3467077	3467078	EcE24377A_0115	EcE24377A_0116		aceE	FALSE	0.404	161.000	0.276	1.000	N	NA
3467078	3467079	EcE24377A_0116	EcE24377A_0117	aceE	aceF	TRUE	0.983	15.000	0.220	1.000	Y	NA
3467079	3467080	EcE24377A_0117	EcE24377A_0118	aceF	lpdA	FALSE	0.329	325.000	0.463	1.000	Y	NA
3467082	3467083	EcE24377A_0120	EcE24377A_0121	acnB		FALSE	0.079	175.000	0.068	NA		NA
3467084	3467085	EcE24377A_0122	EcE24377A_0123	speD	speE	TRUE	0.975	16.000	0.162	1.000	Y	NA
3467085	3467086	EcE24377A_0123	EcE24377A_0124	speE		TRUE	0.687	106.000	0.354	NA		NA
3467091	3467092	EcE24377A_0129	EcE24377A_0130			TRUE	0.997	-3.000	0.688	1.000	Y	NA
3467092	3467093	EcE24377A_0130	EcE24377A_0131			FALSE	0.276	105.000	0.037	1.000	N	NA
3467093	3467094	EcE24377A_0131	EcE24377A_0132			TRUE	0.907	64.000	0.222	1.000	Y	NA
3467096	3467097	EcE24377A_0134	EcE24377A_0135			FALSE	0.122	112.000	0.000	NA		NA
3467098	3467099	EcE24377A_0136	EcE24377A_0137	panC	panB	TRUE	0.996	12.000	0.395	0.001	Y	NA
3467099	3467100	EcE24377A_0137	EcE24377A_0138	panB		FALSE	0.237	113.000	0.000	1.000	N	NA
3467100	3467101	EcE24377A_0138	EcE24377A_0139			FALSE	0.527	53.000	0.000	0.010		NA
3467101	3467102	EcE24377A_0139	EcE24377A_0140			TRUE	0.967	27.000	0.571	0.010		NA
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3467697	3467698	EcE24377A_0736	EcE24377A_0737			TRUE	0.988	-6.000	0.379	NA	Y	NA
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3467987	3467988	EcE24377A_1029	EcE24377A_1030	ompF	asnS	FALSE	0.004	602.000	0.000	1.000	N	NA
3467988	3467989	EcE24377A_1030	EcE24377A_1031	asnS	pncB	FALSE	0.092	169.000	0.034	1.000	N	NA
3467990	3467991	EcE24377A_1032	EcE24377A_1033		pepN	FALSE	0.281	36.000	0.000	NA		NA
3467991	3467992	EcE24377A_1033	EcE24377A_1034	pepN		FALSE	0.552	16.000	0.000	NA		NA
3467993	3467994	EcE24377A_1035	EcE24377A_1036	ssuB		TRUE	0.994	-3.000	0.472	1.000	Y	NA
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3467997	3467998	EcE24377A_1039	EcE24377A_1040			TRUE	0.671	3.000	0.000	NA		NA
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3468000	3468001	EcE24377A_1042	EcE24377A_1043			TRUE	0.675	0.000	0.000	NA		NA
3468001	3468002	EcE24377A_1043	EcE24377A_1044			TRUE	0.939	-9.000	0.375	NA		NA
3468002	3468003	EcE24377A_1044	EcE24377A_1045			TRUE	0.969	1.000	0.375	NA		NA
3468003	3468004	EcE24377A_1045	EcE24377A_1046			TRUE	0.985	-3.000	0.692	NA		NA
3468004	3468005	EcE24377A_1046	EcE24377A_1047			TRUE	0.897	-12.000	0.281	NA		NA
3468005	3468006	EcE24377A_1047	EcE24377A_1048			FALSE	0.525	-7.000	0.000	NA		NA
3468006	3468007	EcE24377A_1048	EcE24377A_1049			FALSE	0.266	39.000	0.000	NA		NA
3468009	3468010	EcE24377A_1051	EcE24377A_1052			TRUE	0.766	-49.000	0.169	1.000		NA
3468011	3468012	EcE24377A_1053	EcE24377A_1054			TRUE	0.954	83.000	0.500	1.000	Y	NA
3468012	3468013	EcE24377A_1054	EcE24377A_1055		fimD2	TRUE	0.991	25.000	0.667	1.000	Y	NA
3468013	3468014	EcE24377A_1055	EcE24377A_1056	fimD2		TRUE	0.941	-9.000	0.000	1.000	Y	NA
3468014	3468015	EcE24377A_1056	EcE24377A_1057			TRUE	0.978	12.000	0.000	0.009	Y	NA
3468015	3468016	EcE24377A_1057	EcE24377A_1058			TRUE	0.998	8.000	0.667	0.009	Y	NA
3468016	3468017	EcE24377A_1058	EcE24377A_1059			TRUE	0.984	-34.000	0.500	1.000	Y	NA
3468017	3468018	EcE24377A_1059	EcE24377A_1060		pyrD	FALSE	0.242	111.000	0.000	1.000	N	NA
3468018	3468019	EcE24377A_1060	EcE24377A_1062	pyrD		FALSE	0.181	138.000	0.081	NA		NA
3468021	3468022	EcE24377A_1063	EcE24377A_1064		uup	TRUE	0.814	12.000	0.061	1.000		NA
3468022	3468023	EcE24377A_1064	EcE24377A_1065	uup	pqiA	FALSE	0.146	130.000	0.054	NA		NA
3468023	3468024	EcE24377A_1065	EcE24377A_1066	pqiA	pqiB	TRUE	0.990	5.000	0.819	NA		NA
3468024	3468025	EcE24377A_1066	EcE24377A_1067	pqiB		TRUE	0.977	-3.000	0.531	NA		NA
3468026	3468027	EcE24377A_1068	EcE24377A_1069	fabA		TRUE	0.763	69.000	0.290	1.000	N	NA
3468033	3468034	EcE24377A_1074	EcE24377A_1076			TRUE	0.841	10.000	0.090	NA		NA
3468036	3468037	EcE24377A_1078	EcE24377A_1079	mgsA		FALSE	0.232	96.000	0.055	NA		NA
3468039	3468040	EcE24377A_1081	EcE24377A_1082			FALSE	0.410	58.000	0.094	NA		NA
3468040	3468041	EcE24377A_1082	EcE24377A_1083		tusE	FALSE	0.004	370.000	0.000	NA		NA
3468041	3468042	EcE24377A_1083	EcE24377A_1084	tusE		FALSE	0.437	91.000	0.140	NA		NA
3468042	3468043	EcE24377A_1084	EcE24377A_5026			FALSE	0.021	207.000	0.000	NA		NA
3468044	3468045	EcE24377A_1087	EcE24377A_1088	hyaA	hyaB	TRUE	0.981	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
3468045	3468046	EcE24377A_1088	EcE24377A_1089	hyaB	hyaC	TRUE	0.990	19.000	0.355	0.057	Y	NA
3468046	3468047	EcE24377A_1089	EcE24377A_1090	hyaC	hyaD	TRUE	0.983	-3.000	0.177	1.000	Y	NA
3468047	3468048	EcE24377A_1090	EcE24377A_1091	hyaD	hyaE	TRUE	0.835	-3.000	0.096	NA		NA
3468048	3468049	EcE24377A_1091	EcE24377A_1092	hyaE	hyaF	TRUE	0.987	-3.000	0.769	NA		NA
3468049	3468050	EcE24377A_1092	EcE24377A_1093	hyaF	appC	FALSE	0.154	134.000	0.061	NA		NA
3468050	3468051	EcE24377A_1093	EcE24377A_1094	appC	appB	TRUE	0.987	12.000	0.158	0.057	Y	NA
3468051	3468052	EcE24377A_1094	EcE24377A_1095	appB		TRUE	0.837	13.000	0.105	NA		NA
3468052	3468053	EcE24377A_1095	EcE24377A_1096		appA	FALSE	0.169	80.000	0.000	NA		NA
3468054	3468055	EcE24377A_1097	EcE24377A_1098	etk		TRUE	0.985	20.000	1.000	1.000	N	NA
3468055	3468056	EcE24377A_1098	EcE24377A_1099		yccZ	TRUE	0.979	-12.000	0.750	1.000	N	NA
3468056	3468057	EcE24377A_1099	EcE24377A_1100	yccZ		FALSE	0.402	25.000	0.000	NA		NA
3468057	3468058	EcE24377A_1100	EcE24377A_1101			TRUE	0.798	0.000	0.060	NA		NA
3468058	3468059	EcE24377A_1101	EcE24377A_1102		ymcC	TRUE	0.981	-3.000	0.600	NA		NA
3468059	3468060	EcE24377A_1102	EcE24377A_1103	ymcC		FALSE	0.132	107.000	0.000	NA		NA
3468060	3468061	EcE24377A_1103	EcE24377A_1104			FALSE	0.003	424.000	0.000	NA		NA
3468062	3468063	EcE24377A_1105	EcE24377A_1107			FALSE	0.003	394.000	0.000	NA		NA
3468064	3468065	EcE24377A_1106	EcE24377A_1108			FALSE	0.305	33.000	0.000	NA		NA
3468065	3468066	EcE24377A_1108	EcE24377A_1109			FALSE	0.319	-126.000	0.000	NA		NA
3468066	3468067	EcE24377A_1109	EcE24377A_1110		torS	FALSE	0.296	34.000	0.000	NA		NA
3468070	3468071	EcE24377A_1113	EcE24377A_1114	torC	torA	TRUE	0.993	0.000	0.263	0.057	Y	NA
3468071	3468072	EcE24377A_1114	EcE24377A_1116	torA	torD	TRUE	0.907	-3.000	0.077	0.057		NA
3468073	3468074	EcE24377A_1115	EcE24377A_1117		cbpM	TRUE	0.671	4.000	0.000	NA		NA
3468074	3468075	EcE24377A_1117	EcE24377A_1118	cbpM	cbpA	TRUE	0.980	0.000	0.512	NA		NA
3468076	3468077	EcE24377A_1119	EcE24377A_1120		agp	FALSE	0.007	291.000	0.000	NA		NA
3468078	3468079	EcE24377A_1121	EcE24377A_1122		wrbA	TRUE	0.899	21.000	0.290	NA		NA
3468081	3468082	EcE24377A_1124	EcE24377A_1125			TRUE	0.959	21.000	0.533	1.000		NA
3468082	3468083	EcE24377A_1125	EcE24377A_1126			TRUE	0.989	11.000	0.625	0.046		NA
3468083	3468084	EcE24377A_1126	EcE24377A_1127			TRUE	0.943	10.000	0.256	NA		NA
3468084	3468085	EcE24377A_1127	EcE24377A_1128			TRUE	0.967	8.000	0.365	NA		NA
3468085	3468086	EcE24377A_1128	EcE24377A_1129			TRUE	0.974	12.000	0.442	NA	N	NA
3468086	3468087	EcE24377A_1129	EcE24377A_1130			TRUE	0.984	-3.000	0.621	NA	N	NA
3468092	3468093	EcE24377A_1135	EcE24377A_1136	putP		FALSE	0.003	542.000	0.000	NA	N	NA
3468093	3468094	EcE24377A_1136	EcE24377A_1137			TRUE	0.939	58.000	0.356	NA	Y	NA
3468094	3468095	EcE24377A_1137	EcE24377A_1138			TRUE	0.993	6.000	0.378	NA	Y	NA
3468098	3468099	EcE24377A_1141	EcE24377A_1142	pgaD	pgaC	TRUE	0.976	2.000	0.462	NA		NA
3468099	3468100	EcE24377A_1142	EcE24377A_1143	pgaC	pgaB	TRUE	0.965	-7.000	0.435	1.000	N	NA
3468100	3468101	EcE24377A_1143	EcE24377A_1144	pgaB	pgaA	TRUE	0.988	9.000	0.696	1.000		NA
3468103	3468104	EcE24377A_1146	EcE24377A_1147			TRUE	0.850	-3.000	0.000	0.079		NA
3468105	3468106	EcE24377A_1148	EcE24377A_1149			FALSE	0.483	-10.000	0.000	NA		NA
3468107	3468108	EcE24377A_5027	EcE24377A_1151			FALSE	0.145	100.000	0.000	NA		NA
3468109	3468110	EcE24377A_1152	EcE24377A_1153			FALSE	0.203	55.000	0.000	NA		NA
3468110	3468111	EcE24377A_1153	EcE24377A_1154			TRUE	0.934	24.000	0.417	1.000		NA
3468111	3468112	EcE24377A_1154	EcE24377A_1155			FALSE	0.413	102.000	0.145	NA		NA
3468113	3468114	EcE24377A_1156	EcE24377A_1157	csgG	csgF	FALSE	0.444	27.000	0.043	NA		NA
3468114	3468115	EcE24377A_1157	EcE24377A_1158	csgF	csgE	TRUE	0.964	25.000	0.723	NA		NA
3468115	3468116	EcE24377A_1158	EcE24377A_1159	csgE	csgD	TRUE	0.917	5.000	0.176	NA		NA
3468116	3468117	EcE24377A_1159	EcE24377A_1160	csgD		FALSE	0.003	412.000	0.000	NA		NA
3468118	3468119	EcE24377A_1161	EcE24377A_1162	csgB		TRUE	0.893	41.000	0.333	0.009		NA
3468119	3468120	EcE24377A_1162	EcE24377A_1163		csgC	TRUE	0.894	59.000	0.667	NA		NA
3468120	3468121	EcE24377A_1163	EcE24377A_1164	csgC		TRUE	0.691	121.000	0.429	NA		NA
3468121	3468122	EcE24377A_1164	EcE24377A_1165			FALSE	0.140	95.000	0.028	NA		NA
3468122	3468123	EcE24377A_1165	EcE24377A_1166			TRUE	0.614	-7.000	0.046	NA		NA
3468124	3468125	EcE24377A_1167	EcE24377A_1168	mdoC		FALSE	0.241	45.000	0.000	NA		NA
3468126	3468127	EcE24377A_1169	EcE24377A_1170	mdoG	mdoH	TRUE	0.967	-7.000	0.469	1.000	N	NA
3468127	3468128	EcE24377A_1170	EcE24377A_1171	mdoH		TRUE	0.660	9.000	0.000	NA		NA
3468128	3468129	EcE24377A_1171	EcE24377A_1172			FALSE	0.502	-9.000	0.000	NA		NA
3468130	3468131	EcE24377A_1173	EcE24377A_1174	msyB	mdtG	TRUE	0.721	83.000	0.333	NA		NA
3468135	3468136	EcE24377A_1178	EcE24377A_1179	yceI		TRUE	0.988	4.000	0.676	1.000		NA
3468138	3468139	EcE24377A_1181	EcE24377A_1182		solA	TRUE	0.737	48.000	0.269	NA		NA
3468139	3468140	EcE24377A_1182	EcE24377A_1183	solA		TRUE	0.707	115.000	0.423	NA		NA
3468140	3468141	EcE24377A_1183	EcE24377A_1184		dinI	FALSE	0.007	287.000	0.000	NA		NA
3468141	3468142	EcE24377A_1184	EcE24377A_1185	dinI	pyrC	FALSE	0.177	74.000	0.031	NA		NA
3468142	3468143	EcE24377A_1185	EcE24377A_1186	pyrC		FALSE	0.103	106.000	0.022	NA		NA
3468143	3468144	EcE24377A_1186	EcE24377A_1187		grxB	FALSE	0.187	134.000	0.078	NA		NA
3468144	3468145	EcE24377A_1187	EcE24377A_1188	grxB	mdtH	FALSE	0.530	64.000	0.103	1.000	N	NA
3468146	3468147	EcE24377A_1189	EcE24377A_1190	rimJ		TRUE	0.861	11.000	0.116	NA		NA
3468147	3468148	EcE24377A_1190	EcE24377A_1191			TRUE	0.864	2.000	0.103	NA		NA
3468148	3468149	EcE24377A_1191	EcE24377A_1192		mviN	FALSE	0.152	110.000	0.022	1.000		NA
3468150	3468151	EcE24377A_1193	EcE24377A_1194	flgN	flgM	TRUE	0.996	5.000	0.361	0.002	Y	NA
3468151	3468152	EcE24377A_1194	EcE24377A_1195	flgM	flgA	TRUE	0.923	76.000	0.330	NA	Y	NA
3468153	3468154	EcE24377A_1196	EcE24377A_1197	flgB	flgC	TRUE	0.998	4.000	0.824	0.003	Y	NA
3468154	3468155	EcE24377A_1197	EcE24377A_1198	flgC	flgD	TRUE	0.982	12.000	0.186	NA	Y	NA
3468155	3468156	EcE24377A_1198	EcE24377A_1199	flgD	flgE	TRUE	0.939	25.000	0.116	NA	Y	NA
3468156	3468157	EcE24377A_1199	EcE24377A_1200	flgE	flgF	TRUE	0.993	20.000	0.476	0.004	Y	NA
3468157	3468158	EcE24377A_1200	EcE24377A_1201	flgF	flgG	TRUE	0.927	138.000	0.420	0.001	Y	NA
3468158	3468159	EcE24377A_1201	EcE24377A_1202	flgG	flgH	TRUE	0.955	53.000	0.268	0.005	Y	NA
3468159	3468160	EcE24377A_1202	EcE24377A_1203	flgH	flgI	TRUE	0.984	12.000	0.073	0.006	Y	NA
3468160	3468161	EcE24377A_1203	EcE24377A_1204	flgI	flgJ	TRUE	0.983	0.000	0.036	0.006	Y	NA
3468161	3468162	EcE24377A_1204	EcE24377A_1205	flgJ	flgK	TRUE	0.985	66.000	0.705	0.002	Y	NA
3468162	3468163	EcE24377A_1205	EcE24377A_1206	flgK	flgL	TRUE	0.989	12.000	0.142	0.001	Y	NA
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3468320	3468321	EcE24377A_1364	EcE24377A_1365			FALSE	0.003	401.000	0.000	NA		NA
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3468327	3468328	EcE24377A_1371	EcE24377A_1372	narL	narX	TRUE	0.994	-7.000	0.521	0.014	Y	NA
3468329	3468330	EcE24377A_1373	EcE24377A_1374		narK	FALSE	0.153	95.000	0.000	NA		NA
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3468336	3468337	EcE24377A_5032	EcE24377A_1381		purU	FALSE	0.049	160.000	0.000	NA		NA
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3468340	3468341	EcE24377A_1384	EcE24377A_1385		galU	FALSE	0.210	202.000	0.235	1.000	N	NA
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3468346	3468347	EcE24377A_1390	EcE24377A_1391		oppA	FALSE	0.002	738.000	0.000	NA	N	NA
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3468350	3468351	EcE24377A_1394	EcE24377A_1395	oppD	oppF	TRUE	0.996	-3.000	0.420	0.002	Y	NA
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3468353	3468354	EcE24377A_1397	EcE24377A_1398	cls	kch	FALSE	0.008	371.000	0.000	1.000	N	NA
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3468413	3468414	EcE24377A_1458	EcE24377A_1459		trpA	FALSE	0.003	381.000	0.000	NA		NA
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3468428	3468429	EcE24377A_1474	EcE24377A_1475	topA	cysB	FALSE	0.032	210.000	0.008	1.000	N	NA
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3468454	3468455	EcE24377A_1500	EcE24377A_1501	sapB	sapA	TRUE	0.970	-3.000	0.264	0.060	N	NA
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3468458	3468459	EcE24377A_1504	EcE24377A_1505			TRUE	0.664	8.000	0.000	NA		NA
3468459	3468460	EcE24377A_1505	EcE24377A_1506		puuA	FALSE	0.092	303.000	0.000	1.000	Y	NA
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3468465	3468466	EcE24377A_1511	EcE24377A_1512	puuB	gabT1	TRUE	0.900	38.000	0.100	1.000	Y	NA
3468468	3468469	EcE24377A_1514	EcE24377A_1515	pspA	pspB	TRUE	0.914	54.000	0.739	NA		NA
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3468472	3468473	EcE24377A_1518	EcE24377A_1519	pspE		FALSE	0.043	213.000	0.000	1.000	N	NA
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3468487	3468488	EcE24377A_1533	EcE24377A_1534		tyrR	FALSE	0.222	148.000	0.137	NA		NA
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3468504	3468505	EcE24377A_1550	EcE24377A_1551	abgA		FALSE	0.403	-25.000	0.000	NA		NA
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3468510	3468511	EcE24377A_1556	EcE24377A_1557	zntB	dbpA	FALSE	0.005	478.000	0.000	1.000	N	NA
3468512	3468513	EcE24377A_1558	EcE24377A_1559		uspF	FALSE	0.062	176.000	0.000	NA	N	NA
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3468514	3468515	EcE24377A_1560	EcE24377A_1561	ompN	ydbK	FALSE	0.009	367.000	0.000	1.000	N	NA
3468515	3468516	EcE24377A_1561	EcE24377A_1562	ydbK		TRUE	0.653	10.000	0.000	NA		NA
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3468527	3468528	EcE24377A_1573	EcE24377A_1574	paaG	paaH	TRUE	0.989	12.000	0.920	NA		NA
3468528	3468529	EcE24377A_1574	EcE24377A_1575	paaH	paaI	TRUE	0.991	9.000	0.943	NA		NA
3468529	3468530	EcE24377A_1575	EcE24377A_1576	paaI	paaJ	TRUE	0.987	15.000	0.919	NA		NA
3468530	3468531	EcE24377A_1576	EcE24377A_1577	paaJ	paaK	TRUE	0.982	8.000	0.571	NA		NA
3468531	3468532	EcE24377A_1577	EcE24377A_1578	paaK		TRUE	0.888	-3.000	0.093	1.000	N	NA
3468532	3468533	EcE24377A_1578	EcE24377A_1579		paaB	TRUE	0.993	0.000	0.215	0.001	Y	NA
3468533	3468534	EcE24377A_1579	EcE24377A_1580	paaB	paaC	TRUE	0.974	2.000	0.051	1.000	Y	NA
3468534	3468535	EcE24377A_1580	EcE24377A_1581	paaC	paaD	FALSE	0.523	-10.000	0.013	NA	N	NA
3468535	3468536	EcE24377A_1581	EcE24377A_1582	paaD	pcaF	TRUE	0.843	0.000	0.058	NA	N	NA
3468536	3468537	EcE24377A_1582	EcE24377A_1584	pcaF	paaF	TRUE	0.896	27.000	0.293	1.000	N	NA
3468539	3468540	EcE24377A_1585	EcE24377A_1586	paaX	paaY	TRUE	0.723	-18.000	0.118	NA		NA
3468540	3468541	EcE24377A_1586	EcE24377A_1587	paaY		FALSE	0.022	232.000	0.000	1.000		NA
3468541	3468542	EcE24377A_1587	EcE24377A_1588			FALSE	0.188	64.000	0.000	NA		NA
3468542	3468543	EcE24377A_1588	EcE24377A_1589			FALSE	0.040	171.000	0.000	NA		NA
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3468544	3468545	EcE24377A_1590	EcE24377A_1591	cdsA2		FALSE	0.552	16.000	0.000	NA		NA
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3468549	3468550	EcE24377A_1595	EcE24377A_1596		aldA	FALSE	0.032	197.000	0.040	NA		NA
3468552	3468553	EcE24377A_1598	EcE24377A_1599			FALSE	0.012	245.000	0.000	NA		NA
3468553	3468554	EcE24377A_1599	EcE24377A_1600			FALSE	0.001	620.000	0.000	NA		NA
3468556	3468557	EcE24377A_1602	EcE24377A_1603			FALSE	0.017	225.000	0.000	NA		NA
3468557	3468558	EcE24377A_1603	EcE24377A_1604			FALSE	0.066	140.000	0.026	NA		NA
3468558	3468559	EcE24377A_1604	EcE24377A_1606		rimL	FALSE	0.165	63.000	0.026	NA		NA
3468561	3468562	EcE24377A_1607	EcE24377A_1608	tehA	tehB	TRUE	0.917	-3.000	0.175	1.000		NA
3468562	3468563	EcE24377A_1608	EcE24377A_1609	tehB		FALSE	0.017	304.000	0.088	NA		NA
3468567	3468568	EcE24377A_1613	EcE24377A_1614			FALSE	0.422	31.000	0.000	1.000		NA
3468569	3468570	EcE24377A_1615	EcE24377A_1616			FALSE	0.197	57.000	0.000	NA		NA
3468571	3468572	EcE24377A_1617	EcE24377A_1618			FALSE	0.237	79.000	0.000	1.000		NA
3468572	3468573	EcE24377A_1618	EcE24377A_1619		ydcS	FALSE	0.164	245.000	0.000	1.000	Y	NA
3468573	3468574	EcE24377A_1619	EcE24377A_1620	ydcS	ydcT	TRUE	0.995	18.000	0.609	0.060	Y	NA
3468574	3468575	EcE24377A_1620	EcE24377A_1621	ydcT	ydcU	TRUE	0.998	1.000	0.643	0.060	Y	NA
3468575	3468576	EcE24377A_1621	EcE24377A_1622	ydcU	ydcV	TRUE	0.996	-10.000	0.821	0.060	Y	NA
3468576	3468577	EcE24377A_1622	EcE24377A_1624	ydcV	ydcW	TRUE	0.887	22.000	0.216	1.000	N	NA
3468579	3468580	EcE24377A_1625	EcE24377A_1626			FALSE	0.356	-45.000	0.000	NA		NA
3468580	3468581	EcE24377A_1626	EcE24377A_1627			FALSE	0.375	27.000	0.000	NA		NA
3468582	3468583	EcE24377A_1628	EcE24377A_1629			TRUE	0.792	-3.000	0.070	NA		NA
3468584	3468585	EcE24377A_1630	EcE24377A_1631			FALSE	0.038	198.000	0.000	1.000		NA
3468587	3468588	EcE24377A_1633	EcE24377A_1634			FALSE	0.066	148.000	0.000	NA		NA
3468592	3468593	EcE24377A_1638	EcE24377A_1639			TRUE	0.661	68.000	0.250	NA		NA
3468593	3468594	EcE24377A_1639	EcE24377A_1640			FALSE	0.026	197.000	0.000	NA		NA
3468594	3468595	EcE24377A_1640	EcE24377A_1641			FALSE	0.002	508.000	0.000	NA		NA
3468595	3468596	EcE24377A_1641	EcE24377A_1642			FALSE	0.146	99.000	0.000	NA		NA
3468599	3468600	EcE24377A_1645	EcE24377A_1646		narI2	FALSE	0.237	79.000	0.000	1.000		NA
3468600	3468601	EcE24377A_1646	EcE24377A_1647	narI2	narW	TRUE	0.996	-3.000	0.429	0.003	Y	NA
3468601	3468602	EcE24377A_1647	EcE24377A_1648	narW	narY	TRUE	0.998	0.000	0.714	0.003	Y	NA
3468602	3468603	EcE24377A_1648	EcE24377A_1649	narY	narZ	TRUE	0.995	-34.000	0.833	0.001	Y	NA
3468603	3468604	EcE24377A_1649	EcE24377A_1650	narZ	narU	TRUE	0.873	82.000	0.556	1.000	N	NA
3468604	3468605	EcE24377A_1650	EcE24377A_1651	narU		FALSE	0.008	324.000	0.000	1.000		NA
3468605	3468606	EcE24377A_1651	EcE24377A_1652			FALSE	0.520	24.000	0.000	1.000		NA
3468606	3468607	EcE24377A_1652	EcE24377A_1653			FALSE	0.031	259.000	0.000	0.095		NA
3468608	3468609	EcE24377A_1654	EcE24377A_1655	fdoG	fdnG	FALSE	0.224	49.000	0.000	NA		NA
3468609	3468610	EcE24377A_1655	EcE24377A_1657	fdnG	fdnH	TRUE	0.984	13.000	0.429	0.001		NA
3468610	3468611	EcE24377A_1657	EcE24377A_1658	fdnH	fdnI	TRUE	0.987	-25.000	0.333	0.001	Y	NA
3468612	3468613	EcE24377A_1659	EcE24377A_1660			FALSE	0.100	147.000	0.000	1.000		NA
3468613	3468614	EcE24377A_1660	EcE24377A_1661		sfcA	FALSE	0.126	134.000	0.000	1.000		NA
3468614	3468615	EcE24377A_1661	EcE24377A_1662	sfcA		TRUE	0.715	157.000	0.750	1.000		NA
3468615	3468616	EcE24377A_1662	EcE24377A_1663			TRUE	0.819	102.000	0.571	NA		NA
3468618	3468619	EcE24377A_1665	EcE24377A_1666	bdhA		TRUE	0.961	12.000	0.288	1.000	N	NA
3468619	3468620	EcE24377A_1666	EcE24377A_1667			FALSE	0.505	46.000	0.058	1.000	N	NA
3468620	3468621	EcE24377A_1667	EcE24377A_1668			TRUE	0.980	-10.000	0.273	1.000	Y	NA
3468621	3468622	EcE24377A_1668	EcE24377A_1669			TRUE	0.967	10.000	0.028	1.000	Y	NA
3468622	3468623	EcE24377A_1669	EcE24377A_1670		pcaI	TRUE	0.996	3.000	0.352	0.001	Y	NA
3468625	3468626	EcE24377A_1672	EcE24377A_1673			TRUE	0.987	-7.000	0.219	0.002	Y	NA
3468626	3468627	EcE24377A_1673	EcE24377A_1674			TRUE	0.991	-3.000	0.333	1.000	Y	NA
3468627	3468628	EcE24377A_1674	EcE24377A_1675			TRUE	0.986	-3.000	0.143	0.059	Y	NA
3468628	3468629	EcE24377A_1675	EcE24377A_1676			TRUE	0.671	2.000	0.000	NA		NA
3468629	3468630	EcE24377A_1676	EcE24377A_1677		ddpX	FALSE	0.048	163.000	0.000	NA		NA
3468630	3468631	EcE24377A_1677	EcE24377A_1678	ddpX	dos	FALSE	0.022	258.000	0.000	1.000	N	NA
3468631	3468632	EcE24377A_1678	EcE24377A_1679	dos		TRUE	0.989	1.000	0.130	0.005	Y	NA
3468632	3468633	EcE24377A_1679	EcE24377A_1680			FALSE	0.005	372.000	0.000	1.000		NA
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3468776	3468777	EcE24377A_1825	EcE24377A_1826	uidA	uidR	FALSE	0.007	389.000	0.000	1.000	N	NA
3468777	3468778	EcE24377A_1826	EcE24377A_1827	uidR		FALSE	0.034	229.000	0.000	1.000	N	NA
3468778	3468779	EcE24377A_1827	EcE24377A_1828		malI	FALSE	0.239	112.000	0.000	1.000	N	NA
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3468781	3468782	EcE24377A_1830	EcE24377A_1831	malY	add	FALSE	0.483	104.000	0.132	1.000	N	NA
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3469095	3469096	EcE24377A_5039	EcE24377A_2145		pgsA	FALSE	0.058	152.000	0.000	NA		NA
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3469098	3469099	EcE24377A_2147	EcE24377A_2148	uvrY		FALSE	0.013	239.000	0.000	NA		NA
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3469120	3469121	EcE24377A_2169	EcE24377A_2170		fliE	FALSE	0.002	1396.000	0.000	1.000	N	NA
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3469193	3469194