MicrobesOnline Operon Predictions for Synechococcus sp. JA-2-3B'a(2-13)

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1221323 1221324 CYB_0001 CYB_0002 dnaA   FALSE 0.405 26.000 0.002 NA   NA
 1221325 1221326 CYB_0003 CYB_0004     TRUE 0.758 108.000 0.069 1.000 N NA
 1221326 1221327 CYB_0004 CYB_0005     TRUE 0.749 137.000 0.069 1.000   NA
 1221328 1221329 CYB_0006 CYB_0007     FALSE 0.214 108.000 0.000 NA   NA
 1221332 1221333 CYB_0009 CYB_0011     FALSE 0.349 141.000 0.000 1.000   NA
 1221333 1221334 CYB_0011 CYB_0012     FALSE 0.084 184.000 0.000 NA   NA
 1221336 1221337 CYB_0013 CYB_0015     FALSE 0.003 772.000 0.000 NA   NA
 1221339 1221340 CYB_0017 CYB_0018     FALSE 0.464 47.000 0.000 NA N NA
 1221340 1221341 CYB_0018 CYB_0019     TRUE 0.802 -145.000 0.000 NA Y NA
 1221341 1221342 CYB_0019 CYB_0020     TRUE 0.688 117.000 0.000 0.058   NA
 1221342 1221343 CYB_0020 CYB_0021   psaB FALSE 0.349 108.000 0.000 1.000   NA
 1221343 1221344 CYB_0021 CYB_0022 psaB psaA TRUE 0.961 22.000 0.154 0.003   NA
 1221345 1221346 CYB_0023 CYB_0024 ureC   TRUE 0.835 64.000 0.000 1.000 Y NA
 1221346 1221347 CYB_0024 CYB_0025     FALSE 0.465 68.000 0.000 1.000 N NA
 1221347 1221348 CYB_0025 CYB_0026     TRUE 0.978 -145.000 1.000 NA Y NA
 1221348 1221349 CYB_0026 CYB_0027     FALSE 0.331 60.000 0.000 NA   NA
 1221350 1221351 CYB_0028 CYB_0029     TRUE 0.892 19.000 0.087 1.000 N NA
 1221351 1221352 CYB_0029 CYB_0030     FALSE 0.036 226.000 0.000 NA   NA
 1221355 1221356 CYB_0033 CYB_0034   nirA FALSE 0.072 193.000 0.000 NA   NA
 1221356 1221357 CYB_0034 CYB_0035 nirA nrtA TRUE 0.941 62.000 0.128 NA Y NA
 1221357 1221358 CYB_0035 CYB_0036 nrtA ntrB-1 TRUE 0.960 146.000 0.915 NA Y NA
 1221358 1221359 CYB_0036 CYB_0037 ntrB-1 ntrC-1 TRUE 0.949 73.000 0.043 0.003 Y NA
 1221359 1221360 CYB_0037 CYB_0038 ntrC-1 ntrD TRUE 0.992 39.000 0.667 0.003 Y NA
 1221360 1221361 CYB_0038 CYB_0039 ntrD   TRUE 0.558 18.000 0.000 1.000   NA
 1221361 1221362 CYB_0039 CYB_0040   narB FALSE 0.348 87.000 0.000 1.000   NA
 1221362 1221363 CYB_0040 CYB_0042 narB   TRUE 0.790 25.000 0.048 NA   NA
 1221364 1221365 CYB_0041 CYB_0043   purD FALSE 0.006 461.000 0.000 NA N NA
 1221365 1221366 CYB_0043 CYB_0044 purD   FALSE 0.260 103.000 0.002 NA N NA
 1221366 1221367 CYB_0044 CYB_0045     FALSE 0.231 168.000 0.007 NA   NA
 1221369 1221370 CYB_0047 CYB_0048   dapA TRUE 0.548 220.000 0.605 1.000   NA
 1221374 1221375 CYB_0052 CYB_0053     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1221375 1221376 CYB_0053 CYB_0054     FALSE 0.040 219.000 0.000 NA   NA
 1221377 1221378 CYB_0055 CYB_0056     TRUE 0.779 83.000 0.143 NA   NA
 1221378 1221379 CYB_0056 CYB_0057     FALSE 0.018 343.000 0.000 1.000 N NA
 1221379 1221380 CYB_0057 CYB_0058   speE TRUE 0.927 120.000 0.125 1.000 Y NA
 1221380 1221381 CYB_0058 CYB_0060 speE   TRUE 0.556 93.000 0.014 1.000 N NA
 1221382 1221383 CYB_0059 CYB_0061     TRUE 0.835 58.000 0.087 NA   NA
 1221383 1221384 CYB_0061 CYB_0062     FALSE 0.003 597.000 0.000 NA   NA
 1221384 1221385 CYB_0062 CYB_0063     TRUE 0.892 43.000 0.149 NA   NA
 1221385 1221386 CYB_0063 CYB_0064   lepA TRUE 0.641 5.000 0.003 1.000 N NA
 1221386 1221387 CYB_0064 CYB_0065 lepA   FALSE 0.008 332.000 0.000 NA   NA
 1221387 1221388 CYB_0065 CYB_0066   glyQ FALSE 0.290 151.000 0.005 NA   NA
 1221388 1221389 CYB_0066 CYB_0067 glyQ   TRUE 0.631 53.000 0.003 1.000 N NA
 1221389 1221390 CYB_0067 CYB_0068     TRUE 0.701 49.000 0.012 1.000   NA
 1221391 1221392 CYB_0069 CYB_0070     FALSE 0.486 59.000 0.005 NA   NA
 1221392 1221393 CYB_0070 CYB_0071     TRUE 0.525 50.000 0.005 NA   NA
 1221393 1221394 CYB_0071 CYB_0072     FALSE 0.483 161.000 0.045 NA   NA
 1221394 1221395 CYB_0072 CYB_0073   hisD FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 1221395 1221396 CYB_0073 CYB_0074 hisD   FALSE 0.131 179.000 0.000 NA N NA
 1221396 1221397 CYB_0074 CYB_0075     FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1221397 1221398 CYB_0075 CYB_0076     FALSE 0.048 247.000 0.000 1.000   NA
 1221401 1221402 CYB_0079 CYB_0080 purA   FALSE 0.083 212.000 0.000 1.000   NA
 1221404 1221405 CYB_0082 CYB_0083 tig   FALSE 0.266 72.000 0.002 NA   NA
 1221405 1221406 CYB_0083 CYB_0084     FALSE 0.393 85.000 0.010 NA   NA
 1221409 1221410 CYB_0087 CYB_0088   xseA TRUE 0.857 35.000 0.000 NA Y NA
 1221410 1221411 CYB_0088 CYB_0089 xseA xseB TRUE 0.967 -19.000 0.412 0.001   NA
 1221411 1221412 CYB_0089 CYB_0090 xseB folD FALSE 0.371 93.000 0.002 1.000   NA
 1221413 1221414 CYB_0091 CYB_0092     FALSE 0.417 110.000 0.011 NA   NA
 1221414 1221415 CYB_0092 CYB_0093     TRUE 0.669 57.000 0.011 1.000   NA
 1221415 1221416 CYB_0093 CYB_0094     FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 1221417 1221418 CYB_0095 CYB_0096 murA   FALSE 0.129 194.000 0.000 1.000   NA
 1221418 1221419 CYB_0096 CYB_0097   sixA FALSE 0.338 144.000 0.000 1.000   NA
 1221422 1221423 CYB_0099 CYB_0101     FALSE 0.502 71.000 0.015 NA   NA
 1221423 1221424 CYB_0101 CYB_0102     TRUE 0.741 2.000 0.037 NA   NA
 1221425 1221426 CYB_0103 CYB_0104 psaK psbK TRUE 0.849 131.000 0.050 0.027   NA
 1221427 1221428 CYB_0105 CYB_0106     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 1221430 1221431 CYB_0108 CYB_0109   nucH FALSE 0.005 409.000 0.000 NA   NA
 1221431 1221432 CYB_0109 CYB_0110 nucH   FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1221433 1221434 CYB_0111 CYB_0112     FALSE 0.033 232.000 0.000 NA   NA
 1221434 1221435 CYB_0112 CYB_0113     FALSE 0.260 145.000 0.000 NA N NA
 1221436 1221437 CYB_0114 CYB_0115 scpB   FALSE 0.266 100.000 0.000 NA N NA
 1221438 1221439 CYB_0116 CYB_0117     FALSE 0.236 119.000 0.000 NA   NA
 1221441 1221442 CYB_0119 CYB_0120     FALSE 0.378 31.000 0.000 NA   NA
 1221442 1221443 CYB_0120 CYB_0121   ispG TRUE 0.541 50.000 0.000 1.000   NA
 1221445 1221446 CYB_0123 CYB_0124     FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1221447 1221448 CYB_0125 CYB_0126 grxC polA FALSE 0.392 93.000 0.002 1.000 N NA
 1221449 1221450 CYB_0127 CYB_0128     TRUE 0.842 65.000 0.133 NA N NA
 1221450 1221451 CYB_0128 CYB_0129   psbP FALSE 0.017 264.000 0.000 NA   NA
 1221451 1221452 CYB_0129 CYB_0131 psbP icc FALSE 0.019 316.000 0.000 1.000   NA
 1221453 1221454 CYB_0130 CYB_0132     TRUE 0.934 -3.000 0.084 0.037 N NA
 1221456 1221457 CYB_0134 CYB_0135     FALSE 0.232 78.000 0.000 NA   NA
 1221457 1221458 CYB_0135 CYB_0136   psbU FALSE 0.366 52.000 0.000 NA   NA
 1221459 1221460 CYB_0137 CYB_0138 gcvP   FALSE 0.380 34.000 0.000 NA   NA
 1221460 1221461 CYB_0138 CYB_0139     TRUE 0.859 3.000 0.095 NA   NA
 1221461 1221462 CYB_0139 CYB_0140     TRUE 0.884 38.000 0.130 NA   NA
 1221462 1221463 CYB_0140 CYB_0141     TRUE 0.730 46.000 0.030 NA   NA
 1221463 1221464 CYB_0141 CYB_0142     FALSE 0.002 2893.000 0.000 NA   NA
 11510482 1221460   CYB_0138     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11652845 1221460   CYB_0138     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11795237 1221460   CYB_0138     FALSE NA 2999.000 0.000 NA   NA
 11510483 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3035.000 0.000 NA   NA
 11652846 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3035.000 0.000 NA   NA
 11795238 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3035.000 0.000 NA   NA
 11510484 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11652847 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11795239 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3071.000 0.000 NA   NA
 11510485 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3107.000 0.000 NA   NA
 11652848 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3107.000 0.000 NA   NA
 11795240 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3107.000 0.000 NA   NA
 11510486 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3148.000 0.000 NA   NA
 11652849 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3148.000 0.000 NA   NA
 11795241 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3148.000 0.000 NA   NA
 11510487 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3184.000 0.000 NA   NA
 11652850 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3184.000 0.000 NA   NA
 11795242 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3184.000 0.000 NA   NA
 11510488 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11652851 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11795243 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11510489 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3259.000 0.000 NA   NA
 11652852 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3259.000 0.000 NA   NA
 11795244 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3259.000 0.000 NA   NA
 11510490 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3295.000 0.000 NA   NA
 11652853 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3295.000 0.000 NA   NA
 11795245 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3295.000 0.000 NA   NA
 11510491 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3331.000 0.000 NA   NA
 11652854 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3331.000 0.000 NA   NA
 11795246 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3331.000 0.000 NA   NA
 11510492 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3370.000 0.000 NA   NA
 11652855 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3370.000 0.000 NA   NA
 11795247 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3370.000 0.000 NA   NA
 11510493 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11652856 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11795248 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3406.000 0.000 NA   NA
 11510494 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11652857 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11795249 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11510495 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11652858 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11795250 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11510496 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3518.000 0.000 NA   NA
 11652859 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3518.000 0.000 NA   NA
 11795251 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3518.000 0.000 NA   NA
 11510497 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11652860 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11795252 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3554.000 0.000 NA   NA
 11510498 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11652861 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11795253 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3591.000 0.000 NA   NA
 11510499 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3627.000 0.000 NA   NA
 11652862 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3627.000 0.000 NA   NA
 11795254 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3627.000 0.000 NA   NA
 11510500 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3666.000 0.000 NA   NA
 11652863 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3666.000 0.000 NA   NA
 11795255 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3666.000 0.000 NA   NA
 11510501 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3702.000 0.000 NA   NA
 11652864 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3702.000 0.000 NA   NA
 11795256 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3702.000 0.000 NA   NA
 11510502 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3745.000 0.000 NA   NA
 11652865 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3745.000 0.000 NA   NA
 11795257 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3745.000 0.000 NA   NA
 11510503 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3781.000 0.000 NA   NA
 11652866 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3781.000 0.000 NA   NA
 11795258 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3781.000 0.000 NA   NA
 11510504 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3821.000 0.000 NA   NA
 11652867 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3821.000 0.000 NA   NA
 11795259 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3821.000 0.000 NA   NA
 11510505 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3857.000 0.000 NA   NA
 11652868 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3857.000 0.000 NA   NA
 11795260 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3857.000 0.000 NA   NA
 11510506 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3895.000 0.000 NA   NA
 11652869 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3895.000 0.000 NA   NA
 11795261 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3895.000 0.000 NA   NA
 11510507 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3931.000 0.000 NA   NA
 11652870 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3931.000 0.000 NA   NA
 11795262 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3931.000 0.000 NA   NA
 11510508 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3971.000 0.000 NA   NA
 11652871 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3971.000 0.000 NA   NA
 11795263 1221460   CYB_0138     FALSE NA 3971.000 0.000 NA   NA
 11510509 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4007.000 0.000 NA   NA
 11652872 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4007.000 0.000 NA   NA
 11795264 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4007.000 0.000 NA   NA
 11510510 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4042.000 0.000 NA   NA
 11652873 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4042.000 0.000 NA   NA
 11795265 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4042.000 0.000 NA   NA
 11510511 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4078.000 0.000 NA   NA
 11652874 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4078.000 0.000 NA   NA
 11795266 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4078.000 0.000 NA   NA
 11510512 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4116.000 0.000 NA   NA
 11652875 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4116.000 0.000 NA   NA
 11795267 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4116.000 0.000 NA   NA
 11510513 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4152.000 0.000 NA   NA
 11652876 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4152.000 0.000 NA   NA
 11795268 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4152.000 0.000 NA   NA
 11510514 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4189.000 0.000 NA   NA
 11652877 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4189.000 0.000 NA   NA
 11795269 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4189.000 0.000 NA   NA
 11510515 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11652878 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11795270 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11510516 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4270.000 0.000 NA   NA
 11652879 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4270.000 0.000 NA   NA
 11795271 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4270.000 0.000 NA   NA
 11510517 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4306.000 0.000 NA   NA
 11652880 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4306.000 0.000 NA   NA
 11795272 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4306.000 0.000 NA   NA
 11510518 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4342.000 0.000 NA   NA
 11652881 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4342.000 0.000 NA   NA
 11795273 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4342.000 0.000 NA   NA
 11510519 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4378.000 0.000 NA   NA
 11652882 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4378.000 0.000 NA   NA
 11795274 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4378.000 0.000 NA   NA
 11510520 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4417.000 0.000 NA   NA
 11652883 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4417.000 0.000 NA   NA
 11795275 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4417.000 0.000 NA   NA
 11510521 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11652884 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11795276 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4453.000 0.000 NA   NA
 11510522 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4494.000 0.000 NA   NA
 11652885 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4494.000 0.000 NA   NA
 11795277 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4494.000 0.000 NA   NA
 11510523 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11652886 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11795278 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11510524 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4577.000 0.000 NA   NA
 11652887 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4577.000 0.000 NA   NA
 11795279 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4577.000 0.000 NA   NA
 11510525 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4613.000 0.000 NA   NA
 11652888 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4613.000 0.000 NA   NA
 11795280 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4613.000 0.000 NA   NA
 11510526 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4650.000 0.000 NA   NA
 11652889 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4650.000 0.000 NA   NA
 11795281 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4650.000 0.000 NA   NA
 11510527 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4686.000 0.000 NA   NA
 11652890 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4686.000 0.000 NA   NA
 11795282 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4686.000 0.000 NA   NA
 11510528 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4728.000 0.000 NA   NA
 11652891 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4728.000 0.000 NA   NA
 11795283 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4728.000 0.000 NA   NA
 11510529 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4764.000 0.000 NA   NA
 11652892 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4764.000 0.000 NA   NA
 11795284 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4764.000 0.000 NA   NA
 11510530 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4804.000 0.000 NA   NA
 11652893 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4804.000 0.000 NA   NA
 11795285 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4804.000 0.000 NA   NA
 11510531 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4840.000 0.000 NA   NA
 11652894 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4840.000 0.000 NA   NA
 11795286 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4840.000 0.000 NA   NA
 11510532 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4879.000 0.000 NA   NA
 11652895 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4879.000 0.000 NA   NA
 11795287 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4879.000 0.000 NA   NA
 11510533 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4915.000 0.000 NA   NA
 11652896 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4915.000 0.000 NA   NA
 11795288 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4915.000 0.000 NA   NA
 11510534 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11652897 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11795289 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11510535 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11652898 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11795290 1221460   CYB_0138     FALSE NA 4994.000 0.000 NA   NA
 11510536 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5031.000 0.000 NA   NA
 11652899 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5031.000 0.000 NA   NA
 11795291 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5031.000 0.000 NA   NA
 11510537 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5067.000 0.000 NA   NA
 11652900 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5067.000 0.000 NA   NA
 11795292 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5067.000 0.000 NA   NA
 11510538 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5104.000 0.000 NA   NA
 11652901 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5104.000 0.000 NA   NA
 11795293 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5104.000 0.000 NA   NA
 11510539 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11652902 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11795294 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11510540 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5177.000 0.000 NA   NA
 11652903 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5177.000 0.000 NA   NA
 11795295 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5177.000 0.000 NA   NA
 11510541 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5213.000 0.000 NA   NA
 11652904 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5213.000 0.000 NA   NA
 11795296 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5213.000 0.000 NA   NA
 11510542 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5246.000 0.000 NA   NA
 11652905 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5246.000 0.000 NA   NA
 11795297 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5246.000 0.000 NA   NA
 11510543 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5282.000 0.000 NA   NA
 11652906 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5282.000 0.000 NA   NA
 11795298 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5282.000 0.000 NA   NA
 11510544 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11652907 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11795299 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11510545 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5359.000 0.000 NA   NA
 11652908 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5359.000 0.000 NA   NA
 11795300 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5359.000 0.000 NA   NA
 11510546 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5398.000 0.000 NA   NA
 11652909 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5398.000 0.000 NA   NA
 11795301 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5398.000 0.000 NA   NA
 11510547 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11652910 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11795302 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5434.000 0.000 NA   NA
 11510548 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5471.000 0.000 NA   NA
 11652911 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5471.000 0.000 NA   NA
 11795303 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5471.000 0.000 NA   NA
 11510549 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5507.000 0.000 NA   NA
 11652912 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5507.000 0.000 NA   NA
 11795304 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5507.000 0.000 NA   NA
 11510550 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 11652913 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 11795305 1221460   CYB_0138     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 1221464 1221465 CYB_0142 CYB_0143     FALSE 0.462 98.000 0.018 NA   NA
 1221465 1221466 CYB_0143 CYB_0144     TRUE 0.675 14.000 0.018 NA   NA
 1221466 1221467 CYB_0144 CYB_0145     TRUE 0.969 -3.000 0.339 1.000 Y NA
 1221467 1221468 CYB_0145 CYB_0147     TRUE 0.956 11.000 0.080 1.000 Y NA
 1221470 1221471 CYB_0148 CYB_0149 rpmF   FALSE 0.375 112.000 0.002 1.000   NA
 1221471 1221472 CYB_0149 CYB_0150     TRUE 0.901 128.000 0.744 NA   NA
 1221472 1221473 CYB_0150 CYB_0151     FALSE 0.516 8.000 0.004 NA   NA
 1221474 1221475 CYB_0152 CYB_0153     FALSE 0.396 43.000 0.000 NA   NA
 1221475 1221476 CYB_0153 CYB_0154   crcB FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 1221476 1221477 CYB_0154 CYB_0155 crcB   TRUE 0.578 53.000 0.000 1.000 N NA
 1221477 1221478 CYB_0155 CYB_0156     FALSE 0.009 328.000 0.000 NA   NA
 1221478 1221479 CYB_0156 CYB_0157   hisIE FALSE 0.430 8.000 0.002 NA   NA
 1221479 1221480 CYB_0157 CYB_0158 hisIE   FALSE 0.208 94.000 0.000 NA   NA
 1221481 1221482 CYB_0159 CYB_0160 phnC-1 phnD-1 TRUE 0.987 47.000 0.337 0.006 Y NA
 1221482 1221483 CYB_0160 CYB_0161 phnD-1 phnE-1 TRUE 0.982 -31.000 0.330 0.003 Y NA
 1221483 1221484 CYB_0161 CYB_0162 phnE-1   TRUE 0.909 10.000 0.024 0.006   NA
 1221484 1221485 CYB_0162 CYB_0163   phnH TRUE 0.984 9.000 0.967 0.006   NA
 1221485 1221486 CYB_0163 CYB_0164 phnH phnI TRUE 0.991 -15.000 0.960 0.006 Y NA
 1221486 1221487 CYB_0164 CYB_0165 phnI phnJ TRUE 0.981 -16.000 0.880 1.000 Y NA
 1221487 1221488 CYB_0165 CYB_0166 phnJ phnK TRUE 0.898 -7.000 0.016 1.000 Y NA
 1221488 1221489 CYB_0166 CYB_0167 phnK phnL TRUE 0.942 11.000 0.000 0.025 Y NA
 1221489 1221490 CYB_0167 CYB_0168 phnL   TRUE 0.952 -19.000 0.136 1.000 Y NA
 1221491 1221492 CYB_0169 CYB_0170     FALSE 0.009 450.000 0.000 1.000   NA
 1221502 1221503 CYB_0180 CYB_0181 sir   TRUE 0.563 154.000 0.036 1.000   NA
 1221503 1221504 CYB_0181 CYB_0182     FALSE 0.217 84.000 0.000 NA   NA
 1221504 1221505 CYB_0182 CYB_0183     FALSE 0.208 97.000 0.000 NA   NA
 1221505 1221506 CYB_0183 CYB_0184   rpsO TRUE 0.751 37.000 0.037 NA   NA
 1221508 1221509 CYB_0186 CYB_0187 apcD pilT-1 FALSE 0.471 192.000 0.077 1.000   NA
 1221509 1221510 CYB_0187 CYB_0188 pilT-1 folE FALSE 0.060 243.000 0.000 1.000 N NA
 1221510 1221511 CYB_0188 CYB_0189 folE   TRUE 0.870 113.000 0.391 1.000   NA
 1221512 1221513 CYB_0190 CYB_0191     FALSE 0.010 484.000 0.000 1.000 N NA
 1221513 1221514 CYB_0191 CYB_0192   trx-1 FALSE 0.006 673.000 0.000 1.000   NA
 1221514 1221515 CYB_0192 CYB_0193 trx-1   TRUE 0.584 115.000 0.036 NA   NA
 1221515 1221516 CYB_0193 CYB_0194   trpF FALSE 0.383 63.000 0.003 NA   NA
 1221517 1221518 CYB_0195 CYB_0196     FALSE 0.511 69.000 0.005 1.000   NA
 1221519 1221520 CYB_0197 CYB_0198     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1221521 1221522 CYB_0199 CYB_0200   rbfA FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 1221523 1221524 CYB_0201 CYB_0202   phrB-1 FALSE 0.235 123.000 0.000 NA   NA
 1221525 1221526 CYB_0203 CYB_0204     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1221529 1221530 CYB_0207 CYB_0208     TRUE 0.983 -7.000 0.306 0.009 Y NA
 1221530 1221531 CYB_0208 CYB_0209     TRUE 0.925 2.000 0.404 NA   NA
 1221531 1221532 CYB_0209 CYB_0210     TRUE 0.953 -3.000 0.913 NA   NA
 1221532 1221533 CYB_0210 CYB_0211     TRUE 0.942 20.000 0.605 NA   NA
 1221533 1221534 CYB_0211 CYB_0212     TRUE 0.941 10.000 0.605 NA   NA
 1221534 1221535 CYB_0212 CYB_0214     TRUE 0.970 -3.000 0.489 NA Y NA
 1221537 1221538 CYB_0215 CYB_0216 carB psbA-1 FALSE 0.013 357.000 0.000 1.000   NA
 1221539 1221540 CYB_0217 CYB_0218     TRUE 0.616 45.000 0.003 1.000   NA
 1221540 1221541 CYB_0218 CYB_0219     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 1221541 1221542 CYB_0219 CYB_0220     FALSE 0.175 153.000 0.000 NA   NA
 1221543 1221544 CYB_0221 CYB_0223     FALSE 0.129 167.000 0.000 NA   NA
 1221545 1221546 CYB_0222 CYB_0224     FALSE 0.378 33.000 0.000 NA   NA
 1221547 1221548 CYB_0225 CYB_0226 cobH-1   TRUE 0.945 7.000 0.667 NA   NA
 1221548 1221549 CYB_0226 CYB_0227   cbiE/cbiT TRUE 0.611 1.000 0.012 NA   NA
 1221551 1221552 CYB_0229 CYB_0230 sfsA   FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1221552 1221553 CYB_0230 CYB_0231   xth TRUE 0.605 13.000 0.000 1.000 N NA
 1221553 1221554 CYB_0231 CYB_0233 xth   FALSE 0.144 265.000 0.000 NA Y NA
 1221556 1221557 CYB_0234 CYB_0235   msrA FALSE 0.409 82.000 0.000 1.000 N NA
 1221558 1221559 CYB_0236 CYB_0237 cysW cysT TRUE 0.957 -10.000 0.156 0.001 N NA
 1221559 1221560 CYB_0237 CYB_0238 cysT cysA TRUE 0.718 7.000 0.010 1.000 N NA
 1221560 1221561 CYB_0238 CYB_0239 cysA sbp TRUE 0.838 175.000 0.010 0.001 Y NA
 1221561 1221562 CYB_0239 CYB_0240 sbp   FALSE 0.045 259.000 0.000 1.000 N NA
 1221562 1221563 CYB_0240 CYB_0241     TRUE 0.954 11.000 0.071 1.000 Y NA
 1221563 1221564 CYB_0241 CYB_0242     TRUE 0.596 93.000 0.022 1.000 N NA
 1221564 1221565 CYB_0242 CYB_0243   pflA TRUE 0.588 183.000 0.007 1.000 Y NA
 1221565 1221566 CYB_0243 CYB_0244 pflA   FALSE 0.036 226.000 0.000 NA   NA
 1221566 1221567 CYB_0244 CYB_0245   pflB TRUE 0.537 82.000 0.027 NA   NA
 1221570 1221571 CYB_0248 CYB_0249     FALSE 0.097 204.000 0.000 1.000   NA
 1221571 1221572 CYB_0249 CYB_0250     FALSE 0.351 85.000 0.000 1.000   NA
 1221572 1221573 CYB_0250 CYB_0251     FALSE 0.325 -13.000 0.000 NA   NA
 1221573 1221574 CYB_0251 CYB_0252     FALSE 0.325 -13.000 0.000 NA   NA
 1221578 1221579 CYB_0256 CYB_0257     FALSE 0.375 3.000 0.000 NA   NA
 1221579 1221580 CYB_0257 CYB_0258     FALSE 0.082 185.000 0.000 NA   NA
 1221580 1221581 CYB_0258 CYB_0259     FALSE 0.163 182.000 0.000 1.000   NA
 1221582 1221583 CYB_0260 CYB_0261 hisC   TRUE 0.594 49.000 0.000 1.000 N NA
 1221583 1221584 CYB_0261 CYB_0262   ffh TRUE 0.596 10.000 0.002 1.000 N NA
 1221587 1221588 CYB_0265 CYB_0266     TRUE 0.865 83.000 0.500 NA   NA
 1221588 1221589 CYB_0266 CYB_0267     TRUE 0.891 68.000 0.500 NA   NA
 1221589 1221590 CYB_0267 CYB_0268     TRUE 0.970 23.000 0.250 1.000 Y NA
 1221590 1221591 CYB_0268 CYB_0269     FALSE 0.190 149.000 0.000 NA   NA
 1221592 1221593 CYB_0270 CYB_0271 ndk   FALSE 0.277 88.000 0.002 NA N NA
 1221593 1221594 CYB_0271 CYB_0272     TRUE 0.780 51.000 0.048 NA   NA
 1221595 1221596 CYB_0273 CYB_0274     TRUE 0.537 108.000 0.011 1.000 N NA
 1221596 1221597 CYB_0274 CYB_0275     FALSE 0.006 358.000 0.000 NA   NA
 1221597 1221598 CYB_0275 CYB_0276     TRUE 0.786 52.000 0.049 NA   NA
 1221598 1221599 CYB_0276 CYB_0277     TRUE 0.662 77.000 0.049 NA   NA
 1221599 1221600 CYB_0277 CYB_0278   thiC FALSE 0.040 219.000 0.000 NA   NA
 1221600 1221601 CYB_0278 CYB_0279 thiC   FALSE 0.102 211.000 0.000 1.000 N NA
 1221603 1221604 CYB_0281 CYB_0282 psbB psbT TRUE 0.936 107.000 0.651 0.090   NA
 1221604 1221605 CYB_0282 CYB_0283 psbT   FALSE 0.010 400.000 0.000 1.000   NA
 1221606 1221607 CYB_0284 CYB_0285 purQ purS TRUE 0.983 116.000 0.656 0.001 Y NA
 1221608 1221609 CYB_0286 CYB_0287   comB FALSE 0.390 17.000 0.000 NA   NA
 1221611 1221612 CYB_0289 CYB_0290 argC   FALSE 0.367 -66.000 0.003 NA   NA
 1221614 1221615 CYB_0292 CYB_0293 murD   TRUE 0.609 -91.000 0.006 1.000 N NA
 1221615 1221616 CYB_0293 CYB_0294     FALSE 0.388 12.000 0.000 NA   NA
 1221617 1221618 CYB_0295 CYB_0296     FALSE 0.209 91.000 0.000 NA   NA
 1221620 1221621 CYB_0298 CYB_0299     FALSE 0.209 254.000 0.000 1.000 Y NA
 1221622 1221623 CYB_0300 CYB_0301 cdsA valS FALSE 0.005 824.000 0.000 1.000   NA
 1221623 1221624 CYB_0301 CYB_0302 valS   FALSE 0.048 247.000 0.000 1.000   NA
 1221625 1221626 CYB_0303 CYB_0304     FALSE 0.311 -30.000 0.000 NA   NA
 1221626 1221627 CYB_0304 CYB_0305     FALSE 0.327 -12.000 0.000 NA   NA
 1221627 1221628 CYB_0305 CYB_0306     FALSE 0.232 125.000 0.000 NA   NA
 1221628 1221629 CYB_0306 CYB_0307     FALSE 0.143 161.000 0.000 NA   NA
 1221629 1221630 CYB_0307 CYB_0308     FALSE 0.295 -153.000 0.000 NA   NA
 1221630 1221631 CYB_0308 CYB_0309     FALSE 0.218 168.000 0.000 1.000   NA
 1221631 1221632 CYB_0309 CYB_0310     TRUE 0.818 44.000 0.000 0.089   NA
 1221632 1221633 CYB_0310 CYB_0311     FALSE 0.006 359.000 0.000 NA   NA
 1221633 1221634 CYB_0311 CYB_0312   ftsY FALSE 0.208 97.000 0.000 NA   NA
 1221634 1221635 CYB_0312 CYB_0313 ftsY   FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1221635 1221636 CYB_0313 CYB_0314     FALSE 0.259 69.000 0.000 NA   NA
 1221636 1221637 CYB_0314 CYB_0315     FALSE 0.003 813.000 0.000 NA   NA
 1221638 1221639 CYB_0316 CYB_0317 minC minD TRUE 0.970 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 1221639 1221640 CYB_0317 CYB_0318 minD minE TRUE 0.928 92.000 0.347 NA Y NA
 1221640 1221641 CYB_0318 CYB_0320 minE   FALSE 0.007 398.000 0.000 NA N NA
 1221642 1221643 CYB_0319 CYB_0321     TRUE 0.711 43.000 0.024 NA   NA
 1221643 1221644 CYB_0321 CYB_0322   gyrB FALSE 0.083 212.000 0.000 1.000   NA
 1221644 1221645 CYB_0322 CYB_0323 gyrB rimM FALSE 0.124 202.000 0.000 1.000 N NA
 1221645 1221646 CYB_0323 CYB_0324 rimM   TRUE 0.625 13.000 0.002 1.000 N NA
 1221647 1221648 CYB_0325 CYB_0326     TRUE 0.880 72.000 0.333 1.000 N NA
 1221648 1221649 CYB_0326 CYB_0327   leuC FALSE 0.166 190.000 0.000 1.000 N NA
 1221650 1221651 CYB_0328 CYB_0329     FALSE 0.090 182.000 0.000 NA   NA
 1221651 1221652 CYB_0329 CYB_0330     FALSE 0.318 71.000 0.000 NA N NA
 1221652 1221653 CYB_0330 CYB_0331     FALSE 0.269 89.000 0.000 NA N NA
 1221654 1221655 CYB_0332 CYB_0333     TRUE 0.741 114.000 0.051 1.000 N NA
 1221657 1221658 CYB_0335 CYB_0336     FALSE 0.230 128.000 0.000 NA   NA
 1221658 1221659 CYB_0336 CYB_0337     FALSE 0.036 261.000 0.000 1.000   NA
 1221662 1221663 CYB_0340 CYB_0341     TRUE 0.901 23.000 0.222 NA   NA
 1221663 1221664 CYB_0341 CYB_0342     FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 1221664 1221665 CYB_0342 CYB_0343   pyrF FALSE 0.519 48.000 0.005 NA   NA
 1221665 1221666 CYB_0343 CYB_0344 pyrF   FALSE 0.440 -3.000 0.003 NA   NA
 1221666 1221667 CYB_0344 CYB_0345     FALSE 0.003 597.000 0.000 NA   NA
 1221667 1221668 CYB_0345 CYB_0346     FALSE 0.418 -3.000 0.003 NA   NA
 1221670 1221671 CYB_0348 CYB_0349 gcvH   FALSE 0.477 82.000 0.006 1.000   NA
 1221674 1221675 CYB_0352 CYB_0353     FALSE 0.273 141.000 0.000 NA N NA
 1221677 1221678 CYB_0355 CYB_0356     FALSE 0.397 41.000 0.000 NA   NA
 1221681 1221682 CYB_0359 CYB_0360 murI   TRUE 0.545 183.000 0.002 1.000 Y NA
 1221683 1221684 CYB_0361 CYB_0362   cbiT FALSE 0.007 354.000 0.000 NA   NA
 1221684 1221685 CYB_0362 CYB_0363 cbiT   FALSE 0.386 198.000 0.087 NA   NA
 1221687 1221688 CYB_0365 CYB_0366     FALSE 0.020 258.000 0.000 NA   NA
 1221688 1221689 CYB_0366 CYB_0367   cobU FALSE 0.003 695.000 0.000 NA   NA
 1221689 1221690 CYB_0367 CYB_0368 cobU   TRUE 0.565 38.000 0.006 NA   NA
 1221690 1221691 CYB_0368 CYB_0370     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1221692 1221693 CYB_0369 CYB_0371   psbA-2 FALSE 0.006 371.000 0.000 NA   NA
 1221693 1221694 CYB_0371 CYB_0372 psbA-2   FALSE 0.499 108.000 0.011 1.000   NA
 1221694 1221695 CYB_0372 CYB_0373     TRUE 0.692 5.000 0.011 1.000   NA
 1221695 1221696 CYB_0373 CYB_0374     TRUE 0.585 109.000 0.039 NA   NA
 1221697 1221698 CYB_0375 CYB_0376     TRUE 0.745 78.000 0.000 NA Y NA
 1221698 1221699 CYB_0376 CYB_0377     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 1221699 1221700 CYB_0377 CYB_0378     FALSE 0.296 85.000 0.003 NA   NA
 1221700 1221701 CYB_0378 CYB_0379   cobH-2 FALSE 0.456 85.000 0.003 1.000 N NA
 1221701 1221702 CYB_0379 CYB_0380 cobH-2   FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 1221703 1221704 CYB_0381 CYB_0382     FALSE 0.405 116.000 0.002 1.000   NA
 1221706 1221707 CYB_0384 CYB_0385     TRUE 0.881 52.000 0.154 NA   NA
 1221707 1221708 CYB_0385 CYB_0386     TRUE 0.880 -3.000 0.195 NA   NA
 1221708 1221709 CYB_0386 CYB_0387     TRUE 0.775 -3.000 0.049 NA   NA
 1221709 1221710 CYB_0387 CYB_0388     TRUE 0.705 67.000 0.049 NA   NA
 1221710 1221711 CYB_0388 CYB_0389     TRUE 0.981 7.000 0.976 0.031   NA
 1221711 1221712 CYB_0389 CYB_0390     TRUE 0.953 -10.000 0.864 1.000   NA
 1221712 1221713 CYB_0390 CYB_0391     TRUE 0.930 -28.000 0.591 1.000   NA
 1221715 1221716 CYB_0392 CYB_0394     FALSE 0.386 32.000 0.002 NA   NA
 1221716 1221717 CYB_0394 CYB_0395     TRUE 0.564 45.000 0.002 1.000   NA
 1221717 1221718 CYB_0395 CYB_0396     TRUE 0.594 60.000 0.015 NA   NA
 1221720 1221721 CYB_0398 CYB_0399 modB modA TRUE 0.962 38.000 0.103 0.001 N NA
 1221721 1221722 CYB_0399 CYB_0400 modA   FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1221724 1221725 CYB_0402 CYB_0403     FALSE 0.008 343.000 0.000 NA   NA
 1221725 1221726 CYB_0403 CYB_0404     TRUE 0.803 100.000 0.250 NA   NA
 1221726 1221727 CYB_0404 CYB_0405     TRUE 0.920 29.000 0.250 1.000   NA
 1221727 1221728 CYB_0405 CYB_0406   nifW TRUE 0.766 43.000 0.022 1.000   NA
 1221728 1221729 CYB_0406 CYB_0407 nifW   TRUE 0.818 -3.000 0.067 NA   NA
 1221729 1221730 CYB_0407 CYB_0408     TRUE 0.832 67.000 0.179 NA   NA
 1221730 1221731 CYB_0408 CYB_0409   nifX TRUE 0.894 3.000 0.210 NA   NA
 1221731 1221732 CYB_0409 CYB_0410 nifX nifN TRUE 0.952 82.000 0.663 0.006   NA
 1221732 1221733 CYB_0410 CYB_0411 nifN nifE TRUE 0.989 0.000 0.475 0.003 Y NA
 1221733 1221734 CYB_0411 CYB_0412 nifE   TRUE 0.574 -9.000 0.013 NA   NA
 1221734 1221735 CYB_0412 CYB_0413     TRUE 0.827 4.000 0.061 NA   NA
 1221735 1221736 CYB_0413 CYB_0414   dpsA TRUE 0.866 43.000 0.091 NA   NA
 1221736 1221737 CYB_0414 CYB_0415 dpsA   TRUE 0.891 55.000 0.231 NA   NA
 1221737 1221738 CYB_0415 CYB_0416     FALSE 0.004 487.000 0.000 NA   NA
 1221739 1221740 CYB_0417 CYB_0418 nifB   TRUE 0.761 26.000 0.024 1.000   NA
 1221740 1221741 CYB_0418 CYB_0419   nifS TRUE 0.767 44.000 0.023 1.000   NA
 1221741 1221742 CYB_0419 CYB_0420 nifS nifU TRUE 0.953 57.000 0.716 1.000 N NA
 1221742 1221743 CYB_0420 CYB_0421 nifU nifH FALSE 0.035 278.000 0.000 1.000 N NA
 1221743 1221744 CYB_0421 CYB_0422 nifH nifD TRUE 0.895 96.000 0.065 0.001 N NA
 1221744 1221745 CYB_0422 CYB_0423 nifD nifK TRUE 0.990 66.000 0.902 0.001 Y NA
 1221745 1221746 CYB_0423 CYB_0424 nifK nifV FALSE 0.051 254.000 0.000 1.000 N NA
 1221746 1221747 CYB_0424 CYB_0425 nifV   FALSE 0.329 -10.000 0.000 NA   NA
 1221747 1221748 CYB_0425 CYB_0426   nifZ FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1221748 1221749 CYB_0426 CYB_0427 nifZ   TRUE 0.964 -3.000 0.354 0.006   NA
 1221749 1221750 CYB_0427 CYB_0428     FALSE 0.478 153.000 0.011 1.000 N NA
 1221750 1221751 CYB_0428 CYB_0429     FALSE 0.210 142.000 0.000 NA   NA
 1221754 1221755 CYB_0432 CYB_0433 ruvB psbA-3 FALSE 0.359 141.000 0.002 1.000   NA
 1221756 1221757 CYB_0434 CYB_0435   efp TRUE 0.604 37.000 0.002 1.000 N NA
 1221757 1221758 CYB_0435 CYB_0436 efp accB TRUE 0.838 70.000 0.120 1.000 N NA
 1221758 1221759 CYB_0436 CYB_0437 accB   FALSE 0.011 395.000 0.000 1.000   NA
 1221759 1221760 CYB_0437 CYB_0438   cysH FALSE 0.378 77.000 0.000 1.000   NA
 1221760 1221761 CYB_0438 CYB_0439 cysH   TRUE 0.607 4.000 0.003 1.000   NA
 1221761 1221762 CYB_0439 CYB_0440     FALSE 0.233 116.000 0.000 NA   NA
 1221764 1221765 CYB_0442 CYB_0443     FALSE 0.023 250.000 0.000 NA   NA
 1221766 1221767 CYB_0444 CYB_0445 cysQ hisF TRUE 0.625 16.000 0.002 1.000 N NA
 1221767 1221768 CYB_0445 CYB_0446 hisF   TRUE 0.543 62.000 0.002 1.000 N NA
 1221768 1221769 CYB_0446 CYB_0447     FALSE 0.393 -3.000 0.002 NA   NA
 1221769 1221770 CYB_0447 CYB_0448   rpsP TRUE 0.528 53.000 0.006 NA   NA
 1221777 1221778 CYB_0455 CYB_0456 pdxJ   FALSE 0.508 15.000 0.004 NA   NA
 1221778 1221779 CYB_0456 CYB_0457     TRUE 0.552 13.000 0.005 NA   NA
 1221779 1221780 CYB_0457 CYB_0458     TRUE 0.778 27.000 0.030 1.000   NA
 1221780 1221781 CYB_0458 CYB_0459     FALSE 0.217 84.000 0.000 NA   NA
 1221783 1221784 CYB_0461 CYB_0462     FALSE 0.345 106.000 0.006 NA   NA
 1221785 1221786 CYB_0463 CYB_0464     FALSE 0.446 65.000 0.000 1.000   NA
 1221786 1221787 CYB_0464 CYB_0465     TRUE 0.884 46.000 0.000 1.000 Y NA
 1221789 1221790 CYB_0467 CYB_0468     FALSE 0.023 252.000 0.000 NA   NA
 1221790 1221791 CYB_0468 CYB_0469     FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 1221791 1221792 CYB_0469 CYB_0470     FALSE 0.379 30.000 0.000 NA   NA
 1221793 1221794 CYB_0471 CYB_0472     FALSE 0.003 633.000 0.000 NA   NA
 1221794 1221795 CYB_0472 CYB_0473     FALSE 0.382 27.000 0.000 NA   NA
 1221795 1221796 CYB_0473 CYB_0474     TRUE 0.949 -27.000 1.000 NA   NA
 1221798 1221799 CYB_0476 CYB_0477     FALSE 0.381 5.000 0.000 NA   NA
 1221800 1221801 CYB_0478 CYB_0479   ilvE TRUE 0.681 66.000 0.027 1.000   NA
 1221802 1221803 CYB_0480 CYB_0481     FALSE 0.017 266.000 0.000 NA   NA
 1221806 1221807 CYB_0484 CYB_0485     FALSE 0.214 263.000 0.240 NA   NA
 1221807 1221808 CYB_0485 CYB_0486   pilN TRUE 0.948 0.000 0.760 NA   NA
 1221808 1221809 CYB_0486 CYB_0487 pilN pilM TRUE 0.934 61.000 0.087 NA Y NA
 1221809 1221810 CYB_0487 CYB_0488 pilM kaiC FALSE 0.089 220.000 0.000 1.000 N NA
 1221810 1221811 CYB_0488 CYB_0489 kaiC kaiB TRUE 0.965 29.000 0.927 1.000   NA
 1221811 1221812 CYB_0489 CYB_0490 kaiB kaiA TRUE 0.956 3.000 0.732 1.000   NA
 1221813 1221814 CYB_0491 CYB_0492   pgsA FALSE 0.419 79.000 0.000 1.000 N NA
 1221814 1221815 CYB_0492 CYB_0493 pgsA ruvC FALSE 0.022 320.000 0.000 1.000 N NA
 1221815 1221816 CYB_0493 CYB_0494 ruvC   FALSE 0.378 96.000 0.002 1.000   NA
 1221818 1221819 CYB_0496 CYB_0497     TRUE 0.850 7.000 0.080 NA   NA
 1221819 1221820 CYB_0497 CYB_0498     FALSE 0.034 230.000 0.000 NA   NA
 1221820 1221821 CYB_0498 CYB_0499     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1221821 1221822 CYB_0499 CYB_0500   rumA FALSE 0.397 42.000 0.000 NA   NA
 1221822 1221823 CYB_0500 CYB_0501 rumA   FALSE 0.210 107.000 0.000 NA   NA
 1221824 1221825 CYB_0502 CYB_0503     TRUE 0.801 4.000 0.050 NA   NA
 11510551 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4298.000 0.000 NA   NA
 11652914 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4298.000 0.000 NA   NA
 11795306 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4298.000 0.000 NA   NA
 11510552 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4334.000 0.000 NA   NA
 11652915 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4334.000 0.000 NA   NA
 11795307 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4334.000 0.000 NA   NA
 11510553 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11652916 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11795308 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4373.000 0.000 NA   NA
 11510554 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4409.000 0.000 NA   NA
 11652917 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4409.000 0.000 NA   NA
 11795309 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4409.000 0.000 NA   NA
 11510555 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4448.000 0.000 NA   NA
 11652918 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4448.000 0.000 NA   NA
 11795310 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4448.000 0.000 NA   NA
 11510556 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4484.000 0.000 NA   NA
 11652919 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4484.000 0.000 NA   NA
 11795311 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4484.000 0.000 NA   NA
 11510557 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4524.000 0.000 NA   NA
 11652920 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4524.000 0.000 NA   NA
 11795312 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4524.000 0.000 NA   NA
 11510558 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4560.000 0.000 NA   NA
 11652921 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4560.000 0.000 NA   NA
 11795313 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4560.000 0.000 NA   NA
 11510559 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4596.000 0.000 NA   NA
 11652922 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4596.000 0.000 NA   NA
 11795314 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4596.000 0.000 NA   NA
 11510560 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4632.000 0.000 NA   NA
 11652923 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4632.000 0.000 NA   NA
 11795315 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4632.000 0.000 NA   NA
 11510561 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4669.000 0.000 NA   NA
 11652924 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4669.000 0.000 NA   NA
 11795316 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4669.000 0.000 NA   NA
 11510562 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11652925 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11795317 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11510563 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4743.000 0.000 NA   NA
 11652926 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4743.000 0.000 NA   NA
 11795318 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4743.000 0.000 NA   NA
 11510564 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4779.000 0.000 NA   NA
 11652927 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4779.000 0.000 NA   NA
 11795319 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4779.000 0.000 NA   NA
 11510565 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4823.000 0.000 NA   NA
 11652928 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4823.000 0.000 NA   NA
 11795320 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4823.000 0.000 NA   NA
 11510566 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11652929 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11795321 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4859.000 0.000 NA   NA
 11510567 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4903.000 0.000 NA   NA
 11652930 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4903.000 0.000 NA   NA
 11795322 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4903.000 0.000 NA   NA
 11510568 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4939.000 0.000 NA   NA
 11652931 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4939.000 0.000 NA   NA
 11795323 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4939.000 0.000 NA   NA
 11510569 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4975.000 0.000 NA   NA
 11652932 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4975.000 0.000 NA   NA
 11795324 1221821   CYB_0499     FALSE NA 4975.000 0.000 NA   NA
 11510570 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5011.000 0.000 NA   NA
 11652933 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5011.000 0.000 NA   NA
 11795325 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5011.000 0.000 NA   NA
 11510571 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11652934 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11795326 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11510572 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5087.000 0.000 NA   NA
 11652935 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5087.000 0.000 NA   NA
 11795327 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5087.000 0.000 NA   NA
 11510573 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5129.000 0.000 NA   NA
 11652936 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5129.000 0.000 NA   NA
 11795328 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5129.000 0.000 NA   NA
 11510574 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5165.000 0.000 NA   NA
 11652937 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5165.000 0.000 NA   NA
 11795329 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5165.000 0.000 NA   NA
 11510575 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5203.000 0.000 NA   NA
 11652938 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5203.000 0.000 NA   NA
 11795330 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5203.000 0.000 NA   NA
 11510576 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11652939 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11795331 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11510577 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5281.000 0.000 NA   NA
 11652940 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5281.000 0.000 NA   NA
 11795332 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5281.000 0.000 NA   NA
 11510578 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5317.000 0.000 NA   NA
 11652941 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5317.000 0.000 NA   NA
 11795333 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5317.000 0.000 NA   NA
 11510579 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11652942 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11795334 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11510580 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5393.000 0.000 NA   NA
 11652943 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5393.000 0.000 NA   NA
 11795335 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5393.000 0.000 NA   NA
 11510581 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11652944 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11795336 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5429.000 0.000 NA   NA
 11510582 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5465.000 0.000 NA   NA
 11652945 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5465.000 0.000 NA   NA
 11795337 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5465.000 0.000 NA   NA
 11510583 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5502.000 0.000 NA   NA
 11652946 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5502.000 0.000 NA   NA
 11795338 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5502.000 0.000 NA   NA
 11510584 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11652947 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11795339 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11510585 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 11652948 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 11795340 1221821   CYB_0499     FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 1221826 1221827 CYB_0504 CYB_0505     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1221827 1221828 CYB_0505 CYB_0506     TRUE 0.954 63.000 1.000 1.000   NA
 1221832 1221833 CYB_0510 CYB_0511   tgt FALSE 0.375 3.000 0.000 NA   NA
 1221833 1221834 CYB_0511 CYB_0512 tgt   FALSE 0.295 120.000 0.003 NA   NA
 1221834 1221835 CYB_0512 CYB_0513     TRUE 0.915 95.000 1.000 NA   NA
 1221835 1221836 CYB_0513 CYB_0514     TRUE 0.967 7.000 1.000 1.000   NA
 1221839 1221840 CYB_0517 CYB_0518     FALSE 0.007 447.000 0.000 NA N NA
 1221844 1221845 CYB_0522 CYB_0523   bcp-1 FALSE 0.247 175.000 0.002 1.000 N NA
 1221845 1221846 CYB_0523 CYB_0524 bcp-1 infC TRUE 0.608 16.000 0.002 1.000 N NA
 1221847 1221848 CYB_0525 CYB_0526     TRUE 0.847 42.000 0.069 NA   NA
 1221848 1221849 CYB_0526 CYB_0527     TRUE 0.565 41.000 0.000 1.000   NA
 1221849 1221850 CYB_0527 CYB_0528     FALSE 0.368 80.000 0.000 1.000   NA
 1221852 1221853 CYB_0530 CYB_0531     FALSE 0.241 75.000 0.000 NA   NA
 1221854 1221855 CYB_0532 CYB_0533   chlG FALSE 0.112 174.000 0.000 NA   NA
 1221855 1221856 CYB_0533 CYB_0534 chlG   FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 1221856 1221857 CYB_0534 CYB_0535   trpE TRUE 0.559 16.000 0.006 NA   NA
 1221858 1221859 CYB_0536 CYB_0537     FALSE 0.016 272.000 0.000 NA   NA
 1221861 1221862 CYB_0539 CYB_0540     FALSE 0.385 47.000 0.000 NA   NA
 1221863 1221864 CYB_0541 CYB_0542 lspA   FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1221866 1221867 CYB_0544 CYB_0545     FALSE 0.367 0.000 0.000 NA   NA
 1221868 1221869 CYB_0546 CYB_0547 ruvA nadD TRUE 0.585 -3.000 0.002 1.000 N NA
 1221869 1221870 CYB_0547 CYB_0548 nadD   FALSE 0.371 147.000 0.000 1.000 N NA
 1221873 1221874 CYB_0551 CYB_0552     TRUE 0.740 4.000 0.036 NA   NA
 1221874 1221875 CYB_0552 CYB_0553     FALSE 0.255 136.000 0.002 NA   NA
 1221875 1221876 CYB_0553 CYB_0554     FALSE 0.484 138.000 0.019 NA   NA
 1221876 1221877 CYB_0554 CYB_0555     TRUE 0.856 58.000 0.118 NA   NA
 1221879 1221880 CYB_0557 CYB_0558     FALSE 0.226 81.000 0.000 NA   NA
 1221883 1221884 CYB_0561 CYB_0562     TRUE 0.549 161.000 0.038 1.000 N NA
 1221884 1221885 CYB_0562 CYB_0563     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1221885 1221886 CYB_0563 CYB_0564     FALSE 0.214 108.000 0.000 NA   NA
 1221887 1221888 CYB_0565 CYB_0566 menB cobA/hemD TRUE 0.817 118.000 0.005 1.000 Y NA
 1221888 1221889 CYB_0566 CYB_0567 cobA/hemD   FALSE 0.221 136.000 0.000 NA   NA
 1221894 1221895 CYB_0572 CYB_0573     FALSE 0.331 60.000 0.000 NA   NA
 1221895 1221896 CYB_0573 CYB_0574     FALSE 0.313 62.000 0.000 NA   NA
 1221896 1221897 CYB_0574 CYB_0575     TRUE 0.852 25.000 0.000 0.008   NA
 1221897 1221898 CYB_0575 CYB_0576     TRUE 0.735 189.000 0.667 1.000   NA
 1221900 1221901 CYB_0578 CYB_0579     FALSE 0.017 353.000 0.000 1.000 N NA
 1221901 1221902 CYB_0579 CYB_0580     TRUE 0.926 27.000 0.250 1.000 N NA
 1221902 1221903 CYB_0580 CYB_0581     TRUE 0.981 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 1221903 1221904 CYB_0581 CYB_0582     TRUE 0.815 126.000 0.111 1.000 N NA
 1221904 1221905 CYB_0582 CYB_0584     FALSE 0.003 938.000 0.000 NA   NA
 1221906 1221907 CYB_0585 CYB_0586     TRUE 0.903 50.000 0.250 NA   NA
 1221907 1221908 CYB_0586 CYB_0587     TRUE 0.907 11.000 0.250 NA   NA
 1221908 1221909 CYB_0587 CYB_0588     TRUE 0.911 3.000 0.333 NA   NA
 1221909 1221910 CYB_0588 CYB_0589     TRUE 0.942 -3.000 0.714 NA   NA
 1221910 1221911 CYB_0589 CYB_0590     TRUE 0.839 167.000 0.130 NA Y NA
 1221911 1221912 CYB_0590 CYB_0591     FALSE 0.388 20.000 0.000 NA   NA
 1221912 1221913 CYB_0591 CYB_0592     FALSE 0.378 4.000 0.000 NA   NA
 1221913 1221914 CYB_0592 CYB_0593   csx10 TRUE 0.931 -3.000 0.600 NA   NA
 1221914 1221915 CYB_0593 CYB_0594 csx10   TRUE 0.935 0.000 0.600 NA   NA
 1221915 1221916 CYB_0594 CYB_0595   crm2-1 TRUE 0.937 0.000 0.625 NA   NA
 1221917 1221918 CYB_0596 CYB_0598 cas6   FALSE 0.002 1195.000 0.000 NA   NA
 1221920 1221921 CYB_0599 CYB_0600 csx3   FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1221922 1221923 CYB_0601 CYB_0602   ntrC-2 TRUE 0.972 72.000 0.200 0.003 Y NA
 1221923 1221924 CYB_0602 CYB_0603 ntrC-2 ntrB-2 TRUE 0.988 69.000 0.867 0.003 Y NA
 1221924 1221925 CYB_0603 CYB_0604 ntrB-2   FALSE 0.247 522.000 0.867 NA Y NA
 1221926 1221927 CYB_0605 CYB_0606     FALSE 0.105 176.000 0.000 NA   NA
 1221927 1221928 CYB_0606 CYB_0607   clpC FALSE 0.236 119.000 0.000 NA   NA
 1221928 1221929 CYB_0607 CYB_0608 clpC clpP-1 TRUE 0.873 128.000 0.039 1.000 Y NA
 1221929 1221930 CYB_0608 CYB_0609 clpP-1   FALSE 0.390 18.000 0.000 NA   NA
 1221930 1221931 CYB_0609 CYB_0610   clpP FALSE 0.300 -52.000 0.000 NA   NA
 1221931 1221932 CYB_0610 CYB_0611 clpP   TRUE 0.621 108.000 0.048 NA   NA
 1221935 1221936 CYB_0614 CYB_0615     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1221937 1221938 CYB_0616 CYB_0618     FALSE 0.007 349.000 0.000 NA   NA
 1221941 1221942 CYB_0619 CYB_0621     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 1221945 1221946 CYB_0624 CYB_0625 tyrA   FALSE 0.457 69.000 0.000 1.000 N NA
 1221946 1221947 CYB_0625 CYB_0626     TRUE 0.936 112.000 0.371 NA Y NA
 1221947 1221948 CYB_0626 CYB_0628     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 1221950 1221951 CYB_0629 CYB_0630     FALSE 0.253 71.000 0.000 NA   NA
 1221951 1221952 CYB_0630 CYB_0631   hflB FALSE 0.268 142.000 0.000 NA N NA
 1221953 1221954 CYB_0632 CYB_0633     FALSE 0.009 499.000 0.000 1.000 N NA
 1221954 1221955 CYB_0633 CYB_0634     FALSE 0.382 35.000 0.000 NA   NA
 1221955 1221956 CYB_0634 CYB_0635     FALSE 0.229 129.000 0.000 NA   NA
 1221957 1221958 CYB_0636 CYB_0637     FALSE 0.465 68.000 0.000 1.000 N NA
 1221958 1221959 CYB_0637 CYB_0638     FALSE 0.003 532.000 0.000 NA   NA
 1221959 1221960 CYB_0638 CYB_0639     FALSE 0.003 676.000 0.000 NA   NA
 1221960 1221961 CYB_0639 CYB_0640     FALSE 0.016 269.000 0.000 NA   NA
 1221961 1221962 CYB_0640 CYB_0641     FALSE 0.306 -42.000 0.000 NA   NA
 1221962 1221963 CYB_0641 CYB_0642     FALSE 0.034 263.000 0.000 1.000   NA
 1221965 1221966 CYB_0644 CYB_0645     TRUE 0.668 81.000 0.051 NA   NA
 1221966 1221967 CYB_0645 CYB_0646   glgA-1 FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1221967 1221968 CYB_0646 CYB_0647 glgA-1   FALSE 0.478 160.000 0.025 1.000   NA
 1221970 1221971 CYB_0649 CYB_0650     FALSE 0.486 110.000 0.007 1.000   NA
 1221974 1221975 CYB_0653 CYB_0654     TRUE 0.566 14.000 0.006 NA   NA
 1221975 1221976 CYB_0654 CYB_0655   alr FALSE 0.084 184.000 0.000 NA   NA
 1221976 1221977 CYB_0655 CYB_0656 alr sppA-1 TRUE 0.739 45.000 0.012 1.000 N NA
 1221979 1221980 CYB_0658 CYB_0659     FALSE 0.388 20.000 0.000 NA   NA
 1221980 1221981 CYB_0659 CYB_0660   cyoE FALSE 0.005 451.000 0.000 NA   NA
 1221981 1221982 CYB_0660 CYB_0661 cyoE   TRUE 0.952 54.000 0.090 1.000 Y NA
 1221982 1221983 CYB_0661 CYB_0662     FALSE 0.007 650.000 0.000 1.000 N NA
 1221984 1221985 CYB_0663 CYB_0664     FALSE 0.009 331.000 0.000 NA   NA
 1221986 1221987 CYB_0665 CYB_0666     FALSE 0.397 42.000 0.000 NA   NA
 1221987 1221988 CYB_0666 CYB_0667     TRUE 0.801 10.000 0.031 1.000 N NA
 1221988 1221989 CYB_0667 CYB_0668     FALSE 0.086 222.000 0.000 1.000 N NA
 1221989 1221990 CYB_0668 CYB_0669   recQ TRUE 0.707 148.000 0.054 1.000 N NA
 1221991 1221992 CYB_0670 CYB_0671   hisB FALSE 0.386 36.000 0.000 NA   NA
 1221992 1221993 CYB_0671 CYB_0672 hisB   FALSE 0.375 3.000 0.000 NA   NA
 1221993 1221994 CYB_0672 CYB_0673   psbY FALSE 0.194 148.000 0.000 NA   NA
 1221994 1221995 CYB_0673 CYB_0674 psbY   TRUE 0.737 35.000 0.017 1.000   NA
 1221995 1221996 CYB_0674 CYB_0675     FALSE 0.181 178.000 0.000 1.000   NA
 1221996 1221997 CYB_0675 CYB_0676     TRUE 0.752 11.000 0.037 NA   NA
 1221997 1221998 CYB_0676 CYB_0677     FALSE 0.235 123.000 0.000 NA   NA
 1221998 1221999 CYB_0677 CYB_0679     TRUE 0.588 48.000 0.009 NA   NA
 1222001 1222002 CYB_0680 CYB_0681     TRUE 0.879 -7.000 0.222 NA   NA
 1222003 1222004 CYB_0682 CYB_0683   clpS-1 TRUE 0.922 16.000 0.378 NA   NA
 1222005 1222006 CYB_0684 CYB_0685 phoD   FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 1222007 1222008 CYB_0686 CYB_0687     FALSE 0.215 85.000 0.000 NA   NA
 1222008 1222009 CYB_0687 CYB_0688     TRUE 0.866 149.000 0.667 NA   NA
 1222010 1222011 CYB_0689 CYB_0690     TRUE 0.914 -3.000 0.400 NA   NA
 1222011 1222012 CYB_0690 CYB_0691     TRUE 0.839 95.000 0.400 NA   NA
 1222012 1222013 CYB_0691 CYB_0692     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 1222014 1222015 CYB_0693 CYB_0694   hisS TRUE 0.624 -6.000 0.018 NA   NA
 1222015 1222016 CYB_0694 CYB_0695 hisS   FALSE 0.390 95.000 0.003 1.000   NA
 1222016 1222017 CYB_0695 CYB_0696   prmA FALSE 0.514 -63.000 0.003 1.000   NA
 1222018 1222019 CYB_0697 CYB_0699     FALSE 0.213 141.000 0.000 NA   NA
 1222020 1222021 CYB_0698 CYB_0700 pcyA   FALSE 0.133 166.000 0.000 NA   NA
 1222021 1222022 CYB_0700 CYB_0700     FALSE 0.298 -86.000 0.000 NA   NA
 1222026 1222027 CYB_0703 CYB_0705     TRUE 0.786 30.000 0.048 NA   NA
 1222027 1222028 CYB_0705 CYB_0706     TRUE 0.654 76.000 0.048 NA   NA
 1222028 1222029 CYB_0706 CYB_0707     FALSE 0.304 63.000 0.000 NA   NA
 1222031 1222032 CYB_0708 CYB_0710 gatB   FALSE 0.383 148.000 0.002 1.000 N NA
 1222032 1222033 CYB_0710 CYB_0711     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 1222033 1222034 CYB_0711 CYB_0712     FALSE 0.003 572.000 0.000 NA   NA
 1222034 1222035 CYB_0712 CYB_0713     FALSE 0.003 567.000 0.000 NA   NA
 1222035 1222036 CYB_0713 CYB_0714   chlD FALSE 0.231 126.000 0.000 NA   NA
 1222036 1222037 CYB_0714 CYB_0715 chlD   FALSE 0.033 280.000 0.000 1.000 N NA
 1222038 1222039 CYB_0716 CYB_0717     FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 1222039 1222040 CYB_0717 CYB_0718     TRUE 0.941 62.000 0.667 1.000 N NA
 1222041 1222042 CYB_0719 CYB_0720     FALSE 0.070 194.000 0.000 NA   NA
 1222042 1222043 CYB_0720 CYB_0721     FALSE 0.229 129.000 0.000 NA   NA
 1222043 1222044 CYB_0721 CYB_0722     TRUE 0.789 35.000 0.048 NA   NA
 1222046 1222047 CYB_0724 CYB_0725   pth FALSE 0.029 293.000 0.000 1.000 N NA
 1222048 1222049 CYB_0726 CYB_0727     FALSE 0.026 283.000 0.000 1.000   NA
 1222052 1222053 CYB_0729 CYB_0731 menC   FALSE 0.012 365.000 0.000 1.000   NA
 1222053 1222054 CYB_0731 CYB_0732     TRUE 0.953 61.000 0.259 0.009   NA
 1222054 1222055 CYB_0732 CYB_0733     TRUE 0.611 195.000 0.050 0.009   NA
 1222056 1222057 CYB_0734 CYB_0735 nrdJ pheS FALSE 0.411 134.000 0.000 1.000 N NA
 1222058 1222059 CYB_0736 CYB_0737     FALSE 0.324 192.000 0.048 NA   NA
 1222059 1222060 CYB_0737 CYB_0738     FALSE 0.346 197.000 0.061 NA   NA
 1222060 1222061 CYB_0738 CYB_0739     TRUE 0.856 55.000 0.061 1.000 N NA
 1222061 1222062 CYB_0739 CYB_0740     FALSE 0.047 257.000 0.000 1.000 N NA
 1222062 1222063 CYB_0740 CYB_0741   rpmA FALSE 0.059 245.000 0.000 1.000 N NA
 1222063 1222064 CYB_0741 CYB_0742 rpmA rplU TRUE 0.981 77.000 0.667 0.017 Y NA
 1222064 1222065 CYB_0742 CYB_0743 rplU   FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 1222065 1222066 CYB_0743 CYB_0744     TRUE 0.946 37.000 0.667 NA   NA
 1222066 1222067 CYB_0744 CYB_0745     TRUE 0.925 -3.000 0.500 NA   NA
 1222067 1222068 CYB_0745 CYB_0746     TRUE 0.814 157.000 0.500 NA   NA
 1222068 1222069 CYB_0746 CYB_0747     FALSE 0.019 259.000 0.000 NA   NA
 1222069 1222070 CYB_0747 CYB_0748     TRUE 0.673 -3.000 0.012 1.000   NA
 1222071 1222072 CYB_0749 CYB_0750 lpdA   TRUE 0.618 109.000 0.024 1.000 N NA
 1222072 1222073 CYB_0750 CYB_0751     FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 1222073 1222074 CYB_0751 CYB_0752   mutY FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 1222074 1222075 CYB_0752 CYB_0753 mutY   FALSE 0.212 88.000 0.000 NA   NA
 1222077 1222078 CYB_0755 CYB_0756 rnc   FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222079 1222080 CYB_0757 CYB_0758     TRUE 0.683 160.000 0.143 NA   NA
 1222080 1222081 CYB_0758 CYB_0759     FALSE 0.379 120.000 0.000 1.000   NA
 1222083 1222084 CYB_0760 CYB_0762     FALSE 0.008 346.000 0.000 NA   NA
 1222084 1222085 CYB_0762 CYB_0763     TRUE 0.885 140.000 0.667 NA   NA
 1222085 1222086 CYB_0763 CYB_0764     FALSE 0.378 31.000 0.000 NA   NA
 1222086 1222087 CYB_0764 CYB_0765     FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 1222087 1222088 CYB_0765 CYB_0766     FALSE 0.056 350.000 0.000 0.041 N NA
 1222088 1222089 CYB_0766 CYB_0767     FALSE 0.370 51.000 0.000 NA   NA
 1222091 1222092 CYB_0768 CYB_0770     TRUE 0.601 66.000 0.026 NA   NA
 1222092 1222093 CYB_0770 CYB_0771     FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1222093 1222094 CYB_0771 CYB_0772     FALSE 0.004 511.000 0.000 NA   NA
 1222094 1222095 CYB_0772 CYB_0773     FALSE 0.229 114.000 0.000 NA   NA
 1222096 1222097 CYB_0774 CYB_0775     TRUE 0.987 -3.000 0.582 0.021 Y NA
 1222098 1222099 CYB_0776 CYB_0777 recN   FALSE 0.121 196.000 0.000 1.000   NA
 1222099 1222100 CYB_0777 CYB_0778     FALSE 0.468 235.000 0.552 1.000   NA
 1222100 1222101 CYB_0778 CYB_0779     FALSE 0.249 72.000 0.000 NA   NA
 1222104 1222105 CYB_0782 CYB_0783   ispF FALSE 0.007 352.000 0.000 NA   NA
 1222105 1222106 CYB_0783 CYB_0784 ispF   FALSE 0.279 183.000 0.009 1.000 N NA
 1222107 1222108 CYB_0785 CYB_0786     TRUE 0.841 132.000 0.200 1.000 N NA
 1222108 1222109 CYB_0786 CYB_0787     FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1222109 1222110 CYB_0787 CYB_0788     FALSE 0.234 124.000 0.000 NA   NA
 1222110 1222111 CYB_0788 CYB_0789     FALSE 0.378 31.000 0.000 NA   NA
 1222111 1222112 CYB_0789 CYB_0790     TRUE 0.566 83.000 0.035 NA   NA
 1222112 1222113 CYB_0790 CYB_0791     TRUE 0.761 0.000 0.044 NA   NA
 1222113 1222114 CYB_0791 CYB_0792     TRUE 0.953 60.000 1.000 NA   NA
 1222114 1222115 CYB_0792 CYB_0793     TRUE 0.925 115.000 1.000 NA   NA
 1222115 1222116 CYB_0793 CYB_0794     FALSE 0.232 125.000 0.000 NA   NA
 1222117 1222118 CYB_0795 CYB_0796     FALSE 0.389 19.000 0.000 NA   NA
 1222118 1222119 CYB_0796 CYB_0797     TRUE 0.834 35.000 0.000 0.041 N NA
 1222119 1222120 CYB_0797 CYB_0798     TRUE 0.864 57.000 0.071 1.000 N NA
 1222120 1222121 CYB_0798 CYB_0800     FALSE 0.002 1132.000 0.000 NA   NA
 1222122 1222123 CYB_0801 CYB_0802 mrr   FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1222123 1222124 CYB_0802 CYB_0803   phrB-2 FALSE 0.208 100.000 0.000 NA   NA
 1222124 1222125 CYB_0803 CYB_0804 phrB-2 hup-1 TRUE 0.922 13.000 0.020 1.000 Y NA
 1222128 1222129 CYB_0807 CYB_0808 uvrB   FALSE 0.352 86.000 0.002 1.000   NA
 1222129 1222130 CYB_0808 CYB_0809     TRUE 0.659 34.000 0.017 NA   NA
 1222131 1222132 CYB_0810 CYB_0811     TRUE 0.535 181.000 0.077 1.000   NA
 1222132 1222133 CYB_0811 CYB_0812   psbX FALSE 0.039 257.000 0.000 1.000   NA
 1222133 1222134 CYB_0812 CYB_0813 psbX   TRUE 0.689 105.000 0.050 1.000   NA
 1222134 1222135 CYB_0813 CYB_0814     FALSE 0.006 485.000 0.000 NA N NA
 1222136 1222137 CYB_0815 CYB_0816     TRUE 0.523 96.000 0.010 1.000 N NA
 1222138 1222139 CYB_0817 CYB_0818     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222140 1222141 CYB_0819 CYB_0820   sll1405 TRUE 0.982 4.000 0.235 0.036 Y NA
 1222142 1222143 CYB_0821 CYB_0822 argF prc-1 FALSE 0.270 178.000 0.004 1.000 N NA
 1222144 1222145 CYB_0823 CYB_0824 proA   FALSE 0.042 254.000 0.000 1.000   NA
 1222145 1222146 CYB_0824 CYB_0825     TRUE 0.723 92.000 0.061 1.000   NA
 1222147 1222148 CYB_0826 CYB_0827     FALSE 0.008 334.000 0.000 NA   NA
 1222149 1222150 CYB_0828 CYB_0829 recJ-1   TRUE 0.531 -10.000 0.002 1.000   NA
 1222150 1222151 CYB_0829 CYB_0830   rdgB FALSE 0.497 59.000 0.002 1.000   NA
 1222151 1222152 CYB_0830 CYB_0831 rdgB   FALSE 0.217 112.000 0.002 NA   NA
 1222152 1222153 CYB_0831 CYB_0832   tmk FALSE 0.428 23.000 0.002 NA   NA
 1222153 1222154 CYB_0832 CYB_0833 tmk   FALSE 0.004 477.000 0.000 NA   NA
 1222155 1222156 CYB_0834 CYB_0835 cas2 cas1 TRUE 0.963 0.000 0.280 NA Y NA
 1222156 1222157 CYB_0835 CYB_0836 cas1   FALSE 0.367 0.000 0.000 NA   NA
 1222157 1222158 CYB_0836 CYB_0837     TRUE 0.923 30.000 0.400 NA   NA
 1222158 1222159 CYB_0837 CYB_0838     TRUE 0.923 31.000 0.400 NA   NA
 1222159 1222160 CYB_0838 CYB_0839     TRUE 0.920 0.000 0.400 NA   NA
 1222160 1222161 CYB_0839 CYB_0840   cmr4 TRUE 0.955 25.000 0.833 NA   NA
 1222161 1222162 CYB_0840 CYB_0841 cmr4   TRUE 0.956 48.000 0.130 NA Y NA
 1222162 1222163 CYB_0841 CYB_0842   crm2-2 TRUE 0.890 -3.000 0.233 NA   NA
 1222163 1222164 CYB_0842 CYB_0843 crm2-2   FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1222165 1222166 CYB_0844 CYB_0845     FALSE 0.314 -25.000 0.000 NA   NA
 1222167 1222168 CYB_0846 CYB_0847     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 1222168 1222169 CYB_0847 CYB_0848     FALSE 0.232 78.000 0.000 NA   NA
 1222173 1222174 CYB_0852 CYB_0853 cobW psbC TRUE 0.533 137.000 0.013 1.000   NA
 1222174 1222175 CYB_0853 CYB_0854 psbC psbD-1 TRUE 0.873 149.000 0.073 0.003   NA
 1222176 1222177 CYB_0855 CYB_0856 petM panE-1 TRUE 0.645 114.000 0.034 1.000   NA
 1222177 1222178 CYB_0856 CYB_0857 panE-1   FALSE 0.129 194.000 0.000 1.000   NA
 1222178 1222179 CYB_0857 CYB_0858     TRUE 0.611 73.000 0.020 1.000   NA
 1222179 1222180 CYB_0858 CYB_0859     TRUE 0.652 155.000 0.050 1.000 N NA
 1222180 1222181 CYB_0859 CYB_0860     FALSE 0.170 264.000 0.125 NA   NA
 1222184 1222185 CYB_0863 CYB_0864     FALSE 0.387 22.000 0.000 NA   NA
 1222186 1222187 CYB_0865 CYB_0866     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222190 1222191 CYB_0869 CYB_0870     TRUE 0.986 39.000 0.242 0.007 Y NA
 1222191 1222192 CYB_0870 CYB_0871     FALSE 0.458 117.000 0.013 NA   NA
 1222192 1222193 CYB_0871 CYB_0872     TRUE 0.596 30.000 0.010 NA   NA
 1222195 1222196 CYB_0874 CYB_0875     TRUE 0.877 144.000 0.667 NA   NA
 1222196 1222197 CYB_0875 CYB_0876     FALSE 0.312 -28.000 0.000 NA   NA
 1222198 1222199 CYB_0877 CYB_0878 ureG ureD TRUE 0.970 18.000 0.030 0.003 Y NA
 1222199 1222200 CYB_0878 CYB_0879 ureD   TRUE 0.601 52.000 0.012 NA   NA
 1222200 1222201 CYB_0879 CYB_0880     FALSE 0.339 59.000 0.000 NA   NA
 1222201 1222202 CYB_0880 CYB_0882     FALSE 0.051 205.000 0.000 NA   NA
 1222203 1222204 CYB_0881 CYB_0883     TRUE 0.761 31.000 0.025 1.000   NA
 1222206 1222207 CYB_0885 CYB_0886     TRUE 0.896 33.000 0.214 NA   NA
 1222207 1222208 CYB_0886 CYB_0887     FALSE 0.389 13.000 0.000 NA   NA
 1222208 1222209 CYB_0887 CYB_0888     FALSE 0.082 185.000 0.000 NA   NA
 1222209 1222210 CYB_0888 CYB_0889   hisH TRUE 0.526 7.000 0.005 NA   NA
 1222213 1222214 CYB_0892 CYB_0894     TRUE 0.798 129.000 0.182 NA   NA
 1222216 1222217 CYB_0895 CYB_0896   hup-2 FALSE 0.023 316.000 0.000 1.000 N NA
 1222217 1222218 CYB_0896 CYB_0897 hup-2 cobD-1 TRUE 0.860 36.000 0.052 1.000 N NA
 1222218 1222219 CYB_0897 CYB_0898 cobD-1   TRUE 0.708 26.000 0.026 NA   NA
 1222219 1222220 CYB_0898 CYB_0899     FALSE 0.013 283.000 0.000 NA   NA
 1222221 1222222 CYB_0900 CYB_0901   purN FALSE 0.469 27.000 0.003 NA   NA
 1222222 1222223 CYB_0901 CYB_0902 purN   FALSE 0.378 31.000 0.000 NA   NA
 1222224 1222225 CYB_0903 CYB_0904     FALSE 0.378 49.000 0.000 NA   NA
 1222225 1222226 CYB_0904 CYB_0905   aat TRUE 0.644 18.000 0.004 1.000   NA
 1222226 1222227 CYB_0905 CYB_0906 aat   FALSE 0.404 138.000 0.000 1.000 N NA
 1222230 1222231 CYB_0909 CYB_0910 gspO   TRUE 0.547 141.000 0.033 NA   NA
 1222231 1222232 CYB_0910 CYB_0911   cphA FALSE 0.006 361.000 0.000 NA   NA
 1222235 1222236 CYB_0914 CYB_0915     TRUE 0.979 81.000 0.750 0.072 Y NA
 1222236 1222237 CYB_0915 CYB_0917     FALSE 0.153 194.000 0.000 1.000 N NA
 1222239 1222240 CYB_0918 CYB_0919 rpsL rpsG TRUE 0.980 84.000 0.620 0.003 Y NA
 1222240 1222241 CYB_0919 CYB_0920 rpsG fusA TRUE 0.941 153.000 0.579 1.000 Y NA
 1222241 1222242 CYB_0920 CYB_0921 fusA tuf TRUE 0.990 32.000 0.400 0.001 Y NA
 1222242 1222243 CYB_0921 CYB_0922 tuf rpsJ TRUE 0.943 125.000 0.318 1.000 Y NA
 1222243 1222244 CYB_0922 CYB_0924 rpsJ dapB FALSE 0.426 122.000 0.002 1.000 N NA
 1222245 1222246 CYB_0923 CYB_0925     TRUE 0.554 78.000 0.029 NA   NA
 1222246 1222247 CYB_0925 CYB_0926     FALSE 0.036 225.000 0.000 NA   NA
 1222247 1222248 CYB_0926 CYB_0927     FALSE 0.038 221.000 0.000 NA   NA
 1222248 1222249 CYB_0927 CYB_0928     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 1222249 1222250 CYB_0928 CYB_0929   tatC FALSE 0.329 -10.000 0.000 NA   NA
 1222250 1222251 CYB_0929 CYB_0930 tatC   FALSE 0.299 163.000 0.008 NA N NA
 1222251 1222252 CYB_0930 CYB_0931     TRUE 0.969 4.000 0.356 0.008 N NA
 1222252 1222253 CYB_0931 CYB_0932     TRUE 0.918 99.000 0.034 0.026 Y NA
 1222256 1222257 CYB_0935 CYB_0936     FALSE 0.217 140.000 0.000 NA   NA
 1222257 1222258 CYB_0936 CYB_0937   trpA TRUE 0.845 62.000 0.000 1.000 Y NA
 1222260 1222261 CYB_0939 CYB_0940 cpcB-1 cpcA-1 TRUE 0.948 146.000 0.667 0.005   NA
 1222261 1222262 CYB_0940 CYB_0941 cpcA-1 cpcD FALSE 0.083 316.000 0.000 0.007   NA
 1222262 1222263 CYB_0941 CYB_0942 cpcD cpcE-1 FALSE 0.342 92.000 0.000 1.000   NA
 1222263 1222264 CYB_0942 CYB_0943 cpcE-1 cpcF TRUE 0.964 17.000 0.333 0.017   NA
 1222264 1222265 CYB_0943 CYB_0944 cpcF cpcG1 TRUE 0.933 59.000 0.500 1.000   NA
 1222265 1222266 CYB_0944 CYB_0945 cpcG1   TRUE 0.767 142.000 0.143 NA   NA
 1222266 1222267 CYB_0945 CYB_0946     TRUE 0.937 30.000 0.591 NA   NA
 1222267 1222268 CYB_0946 CYB_0947     TRUE 0.938 0.000 0.483 1.000   NA
 1222270 1222271 CYB_0949 CYB_0950     TRUE 0.875 4.000 0.069 1.000 N NA
 1222272 1222273 CYB_0951 CYB_0952     FALSE 0.322 -16.000 0.000 NA   NA
 1222273 1222274 CYB_0952 CYB_0953     FALSE 0.394 44.000 0.000 NA   NA
 1222274 1222275 CYB_0953 CYB_0954     FALSE 0.002 1213.000 0.000 NA   NA
 1222276 1222277 CYB_0955 CYB_0956   pip TRUE 0.745 28.000 0.020 1.000   NA
 1222277 1222278 CYB_0956 CYB_0957 pip   FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222278 1222279 CYB_0957 CYB_0958     FALSE 0.297 -97.000 0.000 NA   NA
 1222279 1222280 CYB_0958 CYB_0959     TRUE 0.961 32.000 1.000 NA   NA
 1222280 1222281 CYB_0959 CYB_0961     TRUE 0.874 11.000 0.111 NA   NA
 1222282 1222283 CYB_0960 CYB_0962 trx-2   TRUE 0.832 -49.000 0.124 NA   NA
 1222284 1222285 CYB_0963 CYB_0964     FALSE 0.034 230.000 0.000 NA   NA
 1222286 1222287 CYB_0965 CYB_0966     TRUE 0.663 121.000 0.037 1.000   NA
 1222287 1222288 CYB_0966 CYB_0967     FALSE 0.482 157.000 0.037 NA   NA
 1222289 1222290 CYB_0968 CYB_0969     FALSE 0.379 30.000 0.000 NA   NA
 1222290 1222291 CYB_0969 CYB_0970     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222291 1222292 CYB_0970 CYB_0971   ilvN FALSE 0.275 165.000 0.000 1.000 N NA
 1222292 1222293 CYB_0971 CYB_0972 ilvN   TRUE 0.556 18.000 0.006 NA   NA
 1222295 1222296 CYB_0974 CYB_0975 glk   FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222296 1222297 CYB_0975 CYB_0976     FALSE 0.384 8.000 0.000 NA   NA
 1222297 1222298 CYB_0976 CYB_0978     TRUE 0.949 14.000 0.056 1.000 Y NA
 1222301 1222302 CYB_0980 CYB_0981     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 1222302 1222303 CYB_0981 CYB_0982     FALSE 0.231 127.000 0.000 NA   NA
 1222305 1222306 CYB_0984 CYB_0985 sppA-2   TRUE 0.582 75.000 0.012 1.000 N NA
 1222306 1222307 CYB_0985 CYB_0986   ksgA FALSE 0.382 106.000 0.002 1.000 N NA
 1222307 1222308 CYB_0986 CYB_0987 ksgA   TRUE 0.601 45.000 0.002 1.000 N NA
 1222308 1222309 CYB_0987 CYB_0988     TRUE 0.583 27.000 0.008 NA   NA
 1222310 1222311 CYB_0989 CYB_0990     FALSE 0.447 133.000 0.002 1.000 N NA
 1222311 1222312 CYB_0990 CYB_0991   nth TRUE 0.764 7.000 0.018 1.000 N NA
 1222312 1222313 CYB_0991 CYB_0992 nth   FALSE 0.248 111.000 0.002 NA   NA
 1222313 1222314 CYB_0992 CYB_0993     TRUE 0.876 -7.000 0.214 NA   NA
 1222315 1222316 CYB_0994 CYB_0995     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 1222318 1222319 CYB_0997 CYB_0998     FALSE 0.277 175.000 0.006 1.000   NA
 1222319 1222320 CYB_0998 CYB_0999     TRUE 0.542 67.000 0.006 1.000   NA
 1222320 1222321 CYB_0999 CYB_1000     FALSE 0.068 236.000 0.000 1.000 N NA
 1222322 1222323 CYB_1001 CYB_1003   htpG FALSE 0.329 108.000 0.003 NA N NA
 1222325 1222326 CYB_1004 CYB_1005   glnA-1 FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222327 1222328 CYB_1006 CYB_1007 aroE   TRUE 0.607 63.000 0.021 NA   NA
 1222328 1222329 CYB_1007 CYB_1008     TRUE 0.924 48.000 0.400 NA   NA
 1222329 1222330 CYB_1008 CYB_1009     FALSE 0.023 250.000 0.000 NA   NA
 1222331 1222332 CYB_1010 CYB_1011     FALSE 0.339 59.000 0.000 NA   NA
 1222332 1222333 CYB_1011 CYB_1012   hemL FALSE 0.223 82.000 0.000 NA   NA
 1222333 1222334 CYB_1012 CYB_1014 hemL   TRUE 0.603 39.000 0.009 NA   NA
 1222335 1222336 CYB_1013 CYB_1015 chlN   TRUE 0.923 42.000 0.019 0.002 N NA
 1222336 1222337 CYB_1015 CYB_1016   chlL TRUE 0.893 159.000 0.198 0.002 N NA
 1222337 1222338 CYB_1016 CYB_1017 chlL   FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 1222338 1222339 CYB_1017 CYB_1018     FALSE 0.387 22.000 0.000 NA   NA
 1222339 1222340 CYB_1018 CYB_1019     FALSE 0.315 -24.000 0.000 NA   NA
 1222341 1222342 CYB_1020 CYB_1021     TRUE 0.592 3.000 0.000 1.000 N NA
 1222343 1222344 CYB_1022 CYB_1023 ileS   FALSE 0.006 464.000 0.000 NA N NA
 1222344 1222345 CYB_1023 CYB_1024     FALSE 0.007 352.000 0.000 NA   NA
 1222346 1222347 CYB_1025 CYB_1026     FALSE 0.495 158.000 0.035 NA N NA
 1222349 1222350 CYB_1028 CYB_1029     FALSE 0.314 -25.000 0.000 NA   NA
 1222350 1222351 CYB_1029 CYB_1030     FALSE 0.383 26.000 0.000 NA   NA
 1222351 1222352 CYB_1030 CYB_1031   purE FALSE 0.469 15.000 0.000 NA N NA
 1222352 1222353 CYB_1031 CYB_1032 purE   FALSE 0.283 67.000 0.002 NA   NA
 1222353 1222354 CYB_1032 CYB_1033     FALSE 0.009 325.000 0.000 NA   NA
 1222357 1222358 CYB_1036 CYB_1037     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222358 1222359 CYB_1037 CYB_1038     FALSE 0.387 11.000 0.000 NA   NA
 1222360 1222361 CYB_1039 CYB_1040   cobA TRUE 0.737 65.000 0.041 1.000   NA
 1222361 1222362 CYB_1040 CYB_1041 cobA   TRUE 0.664 -3.000 0.023 NA   NA
 1222362 1222363 CYB_1041 CYB_1042     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 1222363 1222364 CYB_1042 CYB_1044     FALSE 0.163 168.000 0.000 NA N NA
 1222368 1222369 CYB_1047 CYB_1048     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 1222372 1222373 CYB_1051 CYB_1052 rpmB   FALSE 0.400 25.000 0.002 NA   NA
 1222376 1222377 CYB_1055 CYB_1056     FALSE 0.007 356.000 0.000 NA   NA
 1222377 1222378 CYB_1056 CYB_1057     TRUE 0.599 71.000 0.016 1.000   NA
 1222378 1222379 CYB_1057 CYB_1058     TRUE 0.763 49.000 0.019 1.000 N NA
 1222381 1222382 CYB_1060 CYB_1061 zds   FALSE 0.014 353.000 0.000 1.000   NA
 1222382 1222383 CYB_1061 CYB_1062     TRUE 0.829 40.000 0.000 0.039   NA
 1222384 1222385 CYB_1063 CYB_1064     TRUE 0.751 75.000 0.057 1.000   NA
 1222385 1222386 CYB_1064 CYB_1065     FALSE 0.116 171.000 0.000 NA   NA
 1222386 1222387 CYB_1065 CYB_1066     FALSE 0.378 49.000 0.000 NA   NA
 1222387 1222388 CYB_1066 CYB_1067   glgC TRUE 0.575 136.000 0.020 1.000   NA
 1222389 1222390 CYB_1068 CYB_1069     FALSE 0.213 141.000 0.000 NA   NA
 1222390 1222391 CYB_1069 CYB_1070   sat FALSE 0.129 167.000 0.000 NA   NA
 1222392 1222393 CYB_1071 CYB_1072     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 1222393 1222394 CYB_1072 CYB_1073     TRUE 0.562 44.000 0.000 1.000   NA
 1222394 1222395 CYB_1073 CYB_1074   pstB-1 FALSE 0.444 96.000 0.003 1.000 N NA
 1222395 1222396 CYB_1074 CYB_1075 pstB-1 pstA-1 TRUE 0.981 83.000 0.667 0.004 Y NA
 1222396 1222397 CYB_1075 CYB_1076 pstA-1 pstC-1 TRUE 0.985 7.000 0.222 0.004 Y NA
 1222397 1222398 CYB_1076 CYB_1077 pstC-1 pstS-1 TRUE 0.985 34.000 0.222 0.004 Y NA
 1222398 1222399 CYB_1077 CYB_1078 pstS-1   FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 1222400 1222401 CYB_1079 CYB_1080   rplI FALSE 0.045 210.000 0.000 NA   NA
 1222401 1222402 CYB_1080 CYB_1081 rplI dnaB FALSE 0.490 179.000 0.048 1.000 N NA
 1222402 1222403 CYB_1081 CYB_1082 dnaB   FALSE 0.413 132.000 0.000 1.000 N NA
 1222403 1222404 CYB_1082 CYB_1083     TRUE 0.553 47.000 0.000 1.000   NA
 1222404 1222405 CYB_1083 CYB_1084     FALSE 0.036 261.000 0.000 1.000   NA
 1222407 1222408 CYB_1086 CYB_1087 mkl   TRUE 0.980 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1222408 1222409 CYB_1087 CYB_1089   glmS FALSE 0.255 177.000 0.003 1.000 N NA
 1222410 1222411 CYB_1088 CYB_1090     FALSE 0.371 128.000 0.000 1.000   NA
 1222411 1222412 CYB_1090 CYB_1091     FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1222413 1222414 CYB_1092 CYB_1093     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1222415 1222416 CYB_1094 CYB_1095 rpsD gmd FALSE 0.214 177.000 0.002 1.000 N NA
 1222416 1222417 CYB_1095 CYB_1096 gmd   TRUE 0.630 133.000 0.025 1.000 N NA
 1222417 1222418 CYB_1096 CYB_1097     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 1222419 1222420 CYB_1098 CYB_1100   hisZ TRUE 0.615 50.000 0.004 1.000   NA
 1222423 1222424 CYB_1101 CYB_1103     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 1222424 1222425 CYB_1103 CYB_1104     FALSE 0.385 25.000 0.000 NA   NA
 1222425 1222426 CYB_1104 CYB_1105     FALSE 0.003 992.000 0.000 NA   NA
 1222427 1222428 CYB_1106 CYB_1107 recJ-2   FALSE 0.409 135.000 0.000 1.000 N NA
 1222429 1222430 CYB_1108 CYB_1109     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1222430 1222431 CYB_1109 CYB_1110     TRUE 0.915 0.000 0.379 NA   NA
 1222431 1222432 CYB_1110 CYB_1111     TRUE 0.837 33.000 0.069 NA   NA
 1222432 1222433 CYB_1111 CYB_1112   tal TRUE 0.882 36.000 0.087 1.000   NA
 1222433 1222434 CYB_1112 CYB_1113 tal   FALSE 0.030 291.000 0.000 1.000 N NA
 1222435 1222436 CYB_1114 CYB_1115   ppsA FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1222436 1222437 CYB_1115 CYB_1116 ppsA   TRUE 0.525 82.000 0.007 1.000 N NA
 1222439 1222440 CYB_1118 CYB_1119   tkt FALSE 0.273 67.000 0.000 NA   NA
 1222442 1222443 CYB_1121 CYB_1122     FALSE 0.355 55.000 0.000 NA   NA
 1222443 1222444 CYB_1122 CYB_1123     FALSE 0.016 271.000 0.000 NA   NA
 1222445 1222446 CYB_1124 CYB_1125     TRUE 0.944 28.000 0.667 NA   NA
 1222446 1222447 CYB_1125 CYB_1126   proS FALSE 0.445 22.000 0.002 NA   NA
 1222447 1222448 CYB_1126 CYB_1127 proS infB FALSE 0.368 127.000 0.002 1.000   NA
 1222450 1222451 CYB_1129 CYB_1130     TRUE 0.883 45.000 0.005 NA Y NA
 1222451 1222452 CYB_1130 CYB_1131     FALSE 0.302 -43.000 0.000 NA   NA
 1222454 1222455 CYB_1133 CYB_1134     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 1222455 1222456 CYB_1134 CYB_1135     FALSE 0.224 134.000 0.000 NA   NA
 1222458 1222459 CYB_1137 CYB_1138     TRUE 0.640 19.000 0.013 NA   NA
 1222464 1222465 CYB_1143 CYB_1144     TRUE 0.817 105.000 0.333 NA   NA
 1222465 1222466 CYB_1144 CYB_1145     TRUE 0.733 112.000 0.057 1.000   NA
 1222466 1222467 CYB_1145 CYB_1146   mraY FALSE 0.357 149.000 0.002 1.000 N NA
 1222467 1222468 CYB_1146 CYB_1147 mraY   FALSE 0.027 296.000 0.000 1.000 N NA
 1222472 1222473 CYB_1151 CYB_1152     FALSE 0.040 236.000 0.000 NA N NA
 1222473 1222474 CYB_1152 CYB_1153     FALSE 0.235 118.000 0.000 NA   NA
 1222478 1222479 CYB_1157 CYB_1158     TRUE 0.808 -12.000 0.071 NA   NA
 1222480 1222481 CYB_1159 CYB_1160     TRUE 0.665 33.000 0.018 NA   NA
 1222481 1222482 CYB_1160 CYB_1161   aspS FALSE 0.089 220.000 0.000 1.000 N NA
 1222482 1222483 CYB_1161 CYB_1162 aspS   FALSE 0.439 73.000 0.002 1.000 N NA
 1222484 1222485 CYB_1163 CYB_1164     TRUE 0.987 25.000 0.500 0.093 Y NA
 1222486 1222487 CYB_1165 CYB_1166   gidB FALSE 0.118 197.000 0.000 1.000   NA
 1222487 1222488 CYB_1166 CYB_1167 gidB   FALSE 0.374 -3.000 0.002 NA   NA
 1222490 1222491 CYB_1169 CYB_1170     TRUE 0.949 3.000 0.750 NA   NA
 1222491 1222492 CYB_1170 CYB_1171     TRUE 0.865 110.000 0.500 NA   NA
 1222492 1222493 CYB_1171 CYB_1172     FALSE 0.005 419.000 0.000 NA   NA
 1222493 1222494 CYB_1172 CYB_1173     FALSE 0.319 -19.000 0.000 NA   NA
 1222495 1222496 CYB_1174 CYB_1175     TRUE 0.857 31.000 0.091 NA   NA
 1222496 1222497 CYB_1175 CYB_1176     TRUE 0.777 18.000 0.043 NA   NA
 1222497 1222498 CYB_1176 CYB_1177     FALSE 0.021 255.000 0.000 NA   NA
 1222498 1222499 CYB_1177 CYB_1178     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 1222499 1222500 CYB_1178 CYB_1179     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 1222500 1222501 CYB_1179 CYB_1180     FALSE 0.224 134.000 0.000 NA   NA
 1222501 1222502 CYB_1180 CYB_1181     TRUE 0.557 41.000 0.005 NA   NA
 1222502 1222503 CYB_1181 CYB_1182     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 1222505 1222506 CYB_1184 CYB_1185 selD   FALSE 0.205 144.000 0.000 NA   NA
 1222506 1222507 CYB_1185 CYB_1186     FALSE 0.385 47.000 0.000 NA   NA
 1222511 1222512 CYB_1190 CYB_1191   trmU FALSE 0.457 103.000 0.004 1.000 N NA
 1222513 1222514 CYB_1192 CYB_1193     TRUE 0.702 108.000 0.071 NA   NA
 1222514 1222515 CYB_1193 CYB_1194     FALSE 0.014 351.000 0.000 1.000   NA
 1222518 1222519 CYB_1197 CYB_1198     FALSE 0.032 248.000 0.000 NA N NA
 1222519 1222520 CYB_1198 CYB_1199     FALSE 0.385 9.000 0.000 NA   NA
 1222520 1222521 CYB_1199 CYB_1200     FALSE 0.032 233.000 0.000 NA   NA
 1222521 1222522 CYB_1200 CYB_1201     FALSE 0.280 83.000 0.000 NA N NA
 1222523 1222524 CYB_1202 CYB_1203     FALSE 0.226 81.000 0.000 NA   NA
 1222526 1222527 CYB_1205 CYB_1206     TRUE 0.934 0.000 0.571 NA   NA
 1222527 1222528 CYB_1206 CYB_1207   mfd TRUE 0.708 121.000 0.002 0.092 N NA
 1222529 1222530 CYB_1208 CYB_1209 cydA cydB TRUE 0.925 194.000 0.750 0.044 Y NA
 1222531 1222532 CYB_1210 CYB_1211     FALSE 0.321 -18.000 0.000 NA   NA
 1222532 1222533 CYB_1211 CYB_1212   rimI FALSE 0.006 395.000 0.000 NA   NA
 1222533 1222534 CYB_1212 CYB_1213 rimI   FALSE 0.383 7.000 0.000 NA   NA
 1222534 1222535 CYB_1213 CYB_1214   purK TRUE 0.538 -3.000 0.007 NA   NA
 1222536 1222537 CYB_1215 CYB_1216     FALSE 0.184 151.000 0.000 NA   NA
 1222537 1222538 CYB_1216 CYB_1217   trmD FALSE 0.387 6.000 0.002 NA   NA
 1222538 1222539 CYB_1217 CYB_1218 trmD   FALSE 0.383 4.000 0.002 NA   NA
 1222539 1222540 CYB_1218 CYB_1219   secE FALSE 0.237 104.000 0.002 NA   NA
 1222540 1222541 CYB_1219 CYB_1220 secE nusG TRUE 0.950 63.000 0.843 1.000 N NA
 1222541 1222542 CYB_1220 CYB_1221 nusG rplK TRUE 0.959 10.000 0.681 1.000 N NA
 1222542 1222543 CYB_1221 CYB_1222 rplK rplA TRUE 0.981 107.000 0.838 0.020 Y NA
 1222543 1222544 CYB_1222 CYB_1223 rplA rplJ TRUE 0.532 299.000 0.302 0.020 Y NA
 1222544 1222545 CYB_1223 CYB_1224 rplJ rplL TRUE 0.988 66.000 0.884 0.015 Y NA
 1222550 1222551 CYB_1229 CYB_1230 rpsU   FALSE 0.013 355.000 0.000 1.000   NA
 1222552 1222553 CYB_1231 CYB_1232     FALSE 0.516 -3.000 0.000 1.000   NA
 1222553 1222554 CYB_1232 CYB_1233   dxr FALSE 0.044 252.000 0.000 1.000   NA
 1222554 1222555 CYB_1233 CYB_1234 dxr   TRUE 0.575 60.000 0.002 1.000 N NA
 1222555 1222556 CYB_1234 CYB_1235   murE TRUE 0.810 61.000 0.004 0.092 N NA
 1222557 1222558 CYB_1236 CYB_1237 carA   FALSE 0.365 62.000 0.002 NA   NA
 1222558 1222559 CYB_1237 CYB_1238     TRUE 0.898 41.000 0.182 NA   NA
 1222559 1222560 CYB_1238 CYB_1239     TRUE 0.887 51.000 0.182 NA   NA
 1222560 1222561 CYB_1239 CYB_1240     TRUE 0.842 65.000 0.167 NA   NA
 1222561 1222562 CYB_1240 CYB_1241     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 1222562 1222563 CYB_1241 CYB_1242     FALSE 0.382 27.000 0.000 NA   NA
 1222563 1222564 CYB_1242 CYB_1243     FALSE 0.208 105.000 0.000 NA   NA
 1222564 1222565 CYB_1243 CYB_1244   mutM FALSE 0.213 87.000 0.000 NA   NA
 1222565 1222566 CYB_1244 CYB_1245 mutM psaE TRUE 0.808 47.000 0.040 1.000   NA
 1222567 1222568 CYB_1246 CYB_1247     FALSE 0.377 117.000 0.000 1.000   NA
 1222569 1222570 CYB_1248 CYB_1249 nadE   TRUE 0.820 50.000 0.000 0.092 N NA
 1222570 1222571 CYB_1249 CYB_1250     TRUE 0.585 209.000 0.000 0.008 Y NA
 1222571 1222572 CYB_1250 CYB_1251   uvrC FALSE 0.102 211.000 0.000 1.000 N NA
 1222573 1222574 CYB_1252 CYB_1253   gltS FALSE 0.005 408.000 0.000 NA   NA
 1222574 1222575 CYB_1253 CYB_1254 gltS acsF FALSE 0.484 105.000 0.010 1.000   NA
 1222575 1222576 CYB_1254 CYB_1255 acsF   TRUE 0.773 48.000 0.028 1.000   NA
 1222576 1222577 CYB_1255 CYB_1256     TRUE 0.565 42.000 0.000 1.000   NA
 1222577 1222578 CYB_1256 CYB_1257     FALSE 0.386 103.000 0.000 1.000 N NA
 1222584 1222585 CYB_1263 CYB_1264 engA smpB TRUE 0.651 24.000 0.005 1.000   NA
 1222585 1222586 CYB_1264 CYB_1265 smpB   FALSE 0.353 140.000 0.000 1.000   NA
 1222587 1222588 CYB_1266 CYB_1267     FALSE 0.388 99.000 0.000 1.000 N NA
 1222588 1222589 CYB_1267 CYB_1268   era FALSE 0.169 181.000 0.000 1.000   NA
 1222589 1222590 CYB_1268 CYB_1269 era   FALSE 0.026 283.000 0.000 1.000   NA
 1222591 1222592 CYB_1270 CYB_1271     FALSE 0.344 90.000 0.000 1.000   NA
 1222592 1222593 CYB_1271 CYB_1272     FALSE 0.011 463.000 0.000 1.000 N NA
 1222596 1222597 CYB_1275 CYB_1276     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1222599 1222600 CYB_1278 CYB_1279     TRUE 0.981 78.000 0.506 0.002 Y NA
 1222600 1222601 CYB_1279 CYB_1280     FALSE 0.236 120.000 0.000 NA   NA
 1222601 1222602 CYB_1280 CYB_1281     FALSE 0.119 170.000 0.000 NA   NA
 1222602 1222603 CYB_1281 CYB_1282     TRUE 0.837 18.000 0.063 NA   NA
 1222605 1222606 CYB_1284 CYB_1285     FALSE 0.020 305.000 0.000 1.000   NA
 1222607 1222608 CYB_1286 CYB_1287     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1222608 1222609 CYB_1287 CYB_1288     FALSE 0.273 67.000 0.000 NA   NA
 1222609 1222610 CYB_1288 CYB_1289   lpxD FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 1222612 1222613 CYB_1291 CYB_1292     FALSE 0.012 291.000 0.000 NA   NA
 1222614 1222615 CYB_1293 CYB_1294     FALSE 0.223 82.000 0.000 NA   NA
 1222615 1222616 CYB_1294 CYB_1295     TRUE 0.962 5.000 1.000 NA   NA
 1222616 1222617 CYB_1295 CYB_1296     FALSE 0.390 16.000 0.000 NA   NA
 1222617 1222618 CYB_1296 CYB_1297     FALSE 0.116 171.000 0.000 NA   NA
 1222618 1222619 CYB_1297 CYB_1298   crtH FALSE 0.015 301.000 0.000 NA N NA
 1222621 1222622 CYB_1299 CYB_1301 potB potA TRUE 0.982 -6.000 0.364 0.024 Y NA
 1222622 1222623 CYB_1301 CYB_1302 potA   FALSE 0.069 225.000 0.000 1.000   NA
 1222623 1222624 CYB_1302 CYB_1303     FALSE 0.035 227.000 0.000 NA   NA
 1222624 1222625 CYB_1303 CYB_1304   dnaX FALSE 0.392 45.000 0.000 NA   NA
 1222625 1222626 CYB_1304 CYB_1305 dnaX   TRUE 0.750 123.000 0.000 0.004   NA
 1222626 1222627 CYB_1305 CYB_1306   coaE FALSE 0.515 57.000 0.000 1.000   NA
 1222627 1222628 CYB_1306 CYB_1307 coaE   TRUE 0.601 18.000 0.002 1.000 N NA
 1222628 1222629 CYB_1307 CYB_1308     FALSE 0.503 -10.000 0.006 NA   NA
 1222630 1222631 CYB_1309 CYB_1310     FALSE 0.143 161.000 0.000 NA   NA
 1222631 1222632 CYB_1310 CYB_1311     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 1222633 1222634 CYB_1312 CYB_1313     TRUE 0.961 32.000 1.000 NA   NA
 1222634 1222635 CYB_1313 CYB_1314     TRUE 0.964 42.000 1.000 NA   NA
 1222635 1222636 CYB_1314 CYB_1315     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 1222636 1222637 CYB_1315 CYB_1316     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 1222637 1222638 CYB_1316 CYB_1317     FALSE 0.119 170.000 0.000 NA   NA
 1222638 1222639 CYB_1317 CYB_1318     FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 1222641 1222642 CYB_1320 CYB_1321     FALSE 0.498 107.000 0.011 1.000   NA
 1222642 1222643 CYB_1321 CYB_1322     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 1222643 1222644 CYB_1322 CYB_1323     FALSE 0.211 89.000 0.000 NA   NA
 1222646 1222647 CYB_1324 CYB_1326   aroA TRUE 0.553 36.000 0.002 1.000   NA
 1222648 1222649 CYB_1327 CYB_1328 mraW   FALSE 0.163 177.000 0.004 NA   NA
 1222649 1222650 CYB_1328 CYB_1329     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 1222650 1222651 CYB_1329 CYB_1330     FALSE 0.040 219.000 0.000 NA   NA
 1222651 1222652 CYB_1330 CYB_1331     TRUE 0.572 150.000 0.031 1.000   NA
 1222652 1222653 CYB_1331 CYB_1332     TRUE 0.733 12.000 0.031 NA   NA
 1222653 1222654 CYB_1332 CYB_1333     TRUE 0.905 5.000 0.250 NA   NA
 1222654 1222655 CYB_1333 CYB_1334     FALSE 0.487 105.000 0.022 NA   NA
 1222655 1222656 CYB_1334 CYB_1335   ligA TRUE 0.595 33.000 0.000 1.000 N NA
 1222656 1222657 CYB_1335 CYB_1336 ligA clpX FALSE 0.009 813.000 0.004 1.000 N NA
 1222657 1222658 CYB_1336 CYB_1337 clpX   FALSE 0.453 71.000 0.002 1.000 N NA
 1222658 1222659 CYB_1337 CYB_1338     TRUE 0.985 12.000 0.179 0.002 Y NA
 1222659 1222660 CYB_1338 CYB_1339     TRUE 0.607 79.000 0.024 1.000   NA
 1222660 1222661 CYB_1339 CYB_1340   rnhA FALSE 0.008 497.000 0.000 1.000   NA
 1222664 1222665 CYB_1343 CYB_1344     TRUE 0.911 69.000 0.055 1.000 Y NA
 1222665 1222666 CYB_1344 CYB_1345     TRUE 0.891 110.000 0.000 0.008 Y NA
 1222666 1222667 CYB_1345 CYB_1346     FALSE 0.203 145.000 0.000 NA   NA
 1222667 1222668 CYB_1346 CYB_1347     FALSE 0.210 142.000 0.000 NA   NA
 1222668 1222669 CYB_1347 CYB_1348     FALSE 0.366 52.000 0.000 NA   NA
 1222670 1222671 CYB_1349 CYB_1350     FALSE 0.010 303.000 0.000 NA   NA
 1222672 1222673 CYB_1351 CYB_1352     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 1222674 1222675 CYB_1353 CYB_1354 rbsK   FALSE 0.049 255.000 0.000 1.000 N NA
 1222677 1222678 CYB_1356 CYB_1357     TRUE 0.733 109.000 0.091 NA   NA
 1222678 1222679 CYB_1357 CYB_1358   ald FALSE 0.005 1621.000 0.000 1.000   NA
 1222680 1222681 CYB_1359 CYB_1360     TRUE 0.971 77.000 0.875 1.000 Y NA
 1222681 1222682 CYB_1360 CYB_1361     FALSE 0.044 251.000 0.000 1.000   NA
 1222682 1222683 CYB_1361 CYB_1362   rpsN FALSE 0.510 58.000 0.000 1.000   NA
 1222685 1222686 CYB_1363 CYB_1365     TRUE 0.667 84.000 0.054 NA   NA
 1222686 1222687 CYB_1365 CYB_1366     FALSE 0.078 189.000 0.000 NA   NA
 1222690 1222691 CYB_1369 CYB_1370     FALSE 0.033 231.000 0.000 NA   NA
 1222692 1222693 CYB_1371 CYB_1372 dapF psbN TRUE 0.587 39.000 0.002 1.000   NA
 1222698 1222699 CYB_1377 CYB_1378 rrsA   FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 1222699 1222700 CYB_1378 CYB_1379     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 1222700 1222701 CYB_1379 CYB_1380   rrlA FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 1222701 1222702 CYB_1380 CYB_1381 rrlA rrfA FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 1222703 1222704 CYB_1382 CYB_1383 folC serA TRUE 0.811 77.000 0.004 1.000 Y NA
 1222705 1222706 CYB_1384 CYB_1385 ackA   TRUE 0.699 119.000 0.057 NA   NA
 1222706 1222707 CYB_1385 CYB_1386     FALSE 0.003 530.000 0.000 NA   NA
 1222709 1222710 CYB_1388 CYB_1389     FALSE 0.321 259.000 0.571 NA   NA
 1222710 1222711 CYB_1389 CYB_1390   ispE FALSE 0.236 122.000 0.000 NA   NA
 1222711 1222712 CYB_1390 CYB_1391 ispE accC TRUE 0.827 155.000 0.000 0.087 Y NA
 1222712 1222713 CYB_1391 CYB_1392 accC   TRUE 0.565 95.000 0.016 1.000 N NA
 1222714 1222715 CYB_1393 CYB_1394     TRUE 0.932 -9.000 0.667 NA   NA
 1222717 1222718 CYB_1396 CYB_1397     FALSE 0.373 2.000 0.000 NA   NA
 1222718 1222719 CYB_1397 CYB_1398     FALSE 0.390 16.000 0.000 NA   NA
 1222719 1222720 CYB_1398 CYB_1399     FALSE 0.373 2.000 0.000 NA   NA
 1222722 1222723 CYB_1401 CYB_1402   sufD FALSE 0.014 280.000 0.000 NA   NA
 1222723 1222724 CYB_1402 CYB_1403 sufD sufC TRUE 0.974 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 1222724 1222725 CYB_1403 CYB_1404 sufC mscL TRUE 0.687 98.000 0.000 0.030 N NA
 1222725 1222726 CYB_1404 CYB_1405 mscL sufB FALSE 0.417 129.000 0.000 1.000 N NA
 1222727 1222728 CYB_1406 CYB_1407 sufR   FALSE 0.030 290.000 0.000 1.000 N NA
 1222728 1222729 CYB_1407 CYB_1408   folB-1 FALSE 0.075 232.000 0.000 1.000 N NA
 1222729 1222730 CYB_1408 CYB_1409 folB-1 miaE TRUE 0.594 31.000 0.000 1.000 N NA
 1222730 1222731 CYB_1409 CYB_1410 miaE   TRUE 0.836 35.000 0.047 1.000 N NA
 1222734 1222735 CYB_1413 CYB_1414   lnt FALSE 0.273 67.000 0.000 NA   NA
 1222737 1222738 CYB_1416 CYB_1417   cysC FALSE 0.342 97.000 0.000 1.000   NA
 1222744 1222745 CYB_1423 CYB_1424   hemG TRUE 0.715 54.000 0.033 NA   NA
 1222745 1222746 CYB_1424 CYB_1425 hemG hom TRUE 0.557 158.000 0.033 1.000 N NA
 1222746 1222747 CYB_1425 CYB_1426 hom gvpW FALSE 0.095 205.000 0.000 1.000   NA
 1222751 1222752 CYB_1430 CYB_1431 ampG   FALSE 0.007 556.000 0.000 1.000   NA
 1222752 1222753 CYB_1431 CYB_1432     TRUE 0.560 175.000 0.100 NA   NA
 1222753 1222754 CYB_1432 CYB_1433     TRUE 0.880 -16.000 0.250 NA   NA
 1222754 1222755 CYB_1433 CYB_1434     TRUE 0.894 124.000 0.667 NA   NA
 1222757 1222758 CYB_1435 CYB_1437     FALSE 0.397 72.000 0.003 NA N NA
 1222759 1222760 CYB_1438 CYB_1439 apcA apcB-1 TRUE 0.918 64.000 0.062 0.004   NA
 1222760 1222761 CYB_1439 CYB_1440 apcB-1 apcC TRUE 0.903 167.000 0.531 0.006   NA
 1222761 1222762 CYB_1440 CYB_1441 apcC   TRUE 0.590 134.000 0.022 1.000   NA
 1222763 1222764 CYB_1442 CYB_1443 leuA   TRUE 0.604 60.000 0.003 1.000 N NA
 1222765 1222766 CYB_1444 CYB_1445 moaD pnpA TRUE 0.544 60.000 0.000 1.000 N NA
 1222766 1222767 CYB_1445 CYB_1446 pnpA   FALSE 0.237 176.000 0.002 1.000 N NA
 1222770 1222771 CYB_1449 CYB_1450     FALSE 0.210 107.000 0.000 NA   NA
 1222772 1222773 CYB_1451 CYB_1452     FALSE 0.081 215.000 0.000 1.000   NA
 1222773 1222774 CYB_1452 CYB_1453     FALSE 0.006 636.000 0.000 1.000   NA
 1222775 1222776 CYB_1454 CYB_1455     FALSE 0.011 395.000 0.000 1.000   NA
 1222776 1222777 CYB_1455 CYB_1456     FALSE 0.506 135.000 0.022 NA   NA
 1222777 1222778 CYB_1456 CYB_1457     FALSE 0.388 20.000 0.000 NA   NA
 1222779 1222780 CYB_1458 CYB_1459     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1222780 1222781 CYB_1459 CYB_1460     FALSE 0.386 36.000 0.000 NA   NA
 1222781 1222782 CYB_1460 CYB_1461     TRUE 0.729 66.000 0.051 NA   NA
 1222782 1222783 CYB_1461 CYB_1462     TRUE 0.812 25.000 0.051 NA   NA
 1222783 1222784 CYB_1462 CYB_1463   ycf4 FALSE 0.010 304.000 0.000 NA   NA
 1222784 1222785 CYB_1463 CYB_1464 ycf4   FALSE 0.083 212.000 0.000 1.000   NA
 1222785 1222786 CYB_1464 CYB_1465   phnD-2 FALSE 0.325 210.000 0.000 0.008 N NA
 1222786 1222787 CYB_1465 CYB_1466 phnD-2 phnD FALSE 0.193 350.000 0.000 0.002 Y NA
 1222787 1222788 CYB_1466 CYB_1467 phnD phnC-2 TRUE 0.980 142.000 0.667 0.004 Y NA
 1222788 1222789 CYB_1467 CYB_1468 phnC-2 phnE-2 TRUE 0.989 59.000 0.667 0.004 Y NA
 1222789 1222790 CYB_1468 CYB_1469 phnE-2 phnE-3 TRUE 0.993 0.000 0.915 0.001 Y NA
 1222790 1222791 CYB_1469 CYB_1470 phnE-3   FALSE 0.322 61.000 0.000 NA   NA
 1222792 1222793 CYB_1471 CYB_1472   gvpK TRUE 0.553 125.000 0.013 1.000   NA
 1222793 1222794 CYB_1472 CYB_1473 gvpK   TRUE 0.668 87.000 0.047 1.000   NA
 1222794 1222795 CYB_1473 CYB_1474     FALSE 0.072 222.000 0.000 1.000   NA
 1222795 1222796 CYB_1474 CYB_1475     FALSE 0.374 50.000 0.000 NA   NA
 1222797 1222798 CYB_1476 CYB_1477     FALSE 0.392 45.000 0.000 NA   NA
 1222799 1222800 CYB_1478 CYB_1479 pyrG   FALSE 0.312 61.000 0.002 NA   NA
 1222801 1222802 CYB_1480 CYB_1481     FALSE 0.248 169.000 0.000 1.000 N NA
 1222802 1222803 CYB_1481 CYB_1482     FALSE 0.014 279.000 0.000 NA   NA
 1222803 1222804 CYB_1482 CYB_1483     FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 1222804 1222805 CYB_1483 CYB_1484     TRUE 0.852 81.000 0.400 NA   NA
 1222805 1222806 CYB_1484 CYB_1485     TRUE 0.916 55.000 0.400 NA   NA
 1222806 1222807 CYB_1485 CYB_1486     FALSE 0.061 233.000 0.000 1.000   NA
 1222807 1222808 CYB_1486 CYB_1487   pyrE FALSE 0.110 200.000 0.000 1.000   NA
 1222808 1222809 CYB_1487 CYB_1488 pyrE   TRUE 0.613 41.000 0.000 1.000 N NA
 1222809 1222810 CYB_1488 CYB_1490   malQ TRUE 0.823 162.000 0.000 0.010 Y NA
 1222811 1222812 CYB_1489 CYB_1491     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 1222812 1222813 CYB_1491 CYB_1492   thrS FALSE 0.395 39.000 0.000 NA   NA
 1222816 1222817 CYB_1495 CYB_1496 psbE psbF TRUE 0.967 77.000 0.837 0.002   NA
 1222817 1222818 CYB_1496 CYB_1497 psbF psbL TRUE 0.983 6.000 0.872 0.003   NA
 1222818 1222819 CYB_1497 CYB_1498 psbL psbJ TRUE 0.963 142.000 0.878 0.003   NA
 1222819 1222820 CYB_1498 CYB_1499 psbJ psaL-1 FALSE 0.028 529.000 0.000 0.017   NA
 1222820 1222821 CYB_1499 CYB_1500 psaL-1 psaI TRUE 0.967 39.000 0.371 0.017   NA
 1222821 1222822 CYB_1500 CYB_1501 psaI   FALSE 0.011 302.000 0.000 NA   NA
 1222823 1222824 CYB_1502 CYB_1503     FALSE 0.019 341.000 0.000 1.000 N NA
 1222824 1222825 CYB_1503 CYB_1504     TRUE 0.868 0.000 0.080 1.000   NA
 1222825 1222826 CYB_1504 CYB_1505     TRUE 0.872 51.000 0.125 NA   NA
 1222826 1222827 CYB_1505 CYB_1506     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 1222827 1222828 CYB_1506 CYB_1507     FALSE 0.319 -19.000 0.000 NA   NA
 1222829 1222830 CYB_1508 CYB_1509 trpB   TRUE 0.581 38.000 0.007 NA   NA
 1222830 1222831 CYB_1509 CYB_1510     FALSE 0.405 -10.000 0.003 NA   NA
 1222831 1222832 CYB_1510 CYB_1511   aroC TRUE 0.572 54.000 0.002 1.000 N NA
 1222832 1222833 CYB_1511 CYB_1512 aroC radA TRUE 0.603 13.000 0.002 1.000 N NA
 1222833 1222834 CYB_1512 CYB_1513 radA   FALSE 0.036 261.000 0.000 1.000   NA
 1222834 1222835 CYB_1513 CYB_1514   lysS TRUE 0.537 51.000 0.000 1.000   NA
 1222836 1222837 CYB_1515 CYB_1516     TRUE 0.569 159.000 0.038 1.000 N NA
 1222837 1222838 CYB_1516 CYB_1517     TRUE 0.877 18.000 0.115 NA   NA
 1222838 1222839 CYB_1517 CYB_1518     TRUE 0.871 63.000 0.250 NA   NA
 1222839 1222840 CYB_1518 CYB_1519   petJ TRUE 0.936 48.000 0.400 1.000   NA
 1222845 1222846 CYB_1524 CYB_1525     FALSE 0.148 160.000 0.000 NA   NA
 1222846 1222847 CYB_1525 CYB_1526     FALSE 0.223 135.000 0.000 NA   NA
 1222847 1222848 CYB_1526 CYB_1527     TRUE 0.919 -3.000 0.417 NA   NA
 1222848 1222849 CYB_1527 CYB_1528     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 1222852 1222853 CYB_1531 CYB_1532     FALSE 0.394 44.000 0.000 NA   NA
 1222854 1222855 CYB_1533 CYB_1534   rpsB FALSE 0.387 22.000 0.000 NA   NA
 1222855 1222856 CYB_1534 CYB_1535 rpsB tsf TRUE 0.941 160.000 0.748 1.000 Y NA
 1222856 1222857 CYB_1535 CYB_1536 tsf   FALSE 0.085 223.000 0.000 1.000 N NA
 1222857 1222858 CYB_1536 CYB_1537     TRUE 0.732 57.000 0.017 1.000 N NA
 1222858 1222859 CYB_1537 CYB_1538     FALSE 0.099 203.000 0.000 1.000   NA
 1222860 1222861 CYB_1539 CYB_1540 dnaN   FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 1222863 1222864 CYB_1542 CYB_1543     FALSE 0.239 76.000 0.000 NA   NA
 1222864 1222865 CYB_1543 CYB_1544     FALSE 0.184 151.000 0.000 NA   NA
 1222865 1222866 CYB_1544 CYB_1545   pyk FALSE 0.218 139.000 0.000 NA   NA
 1222868 1222869 CYB_1547 CYB_1548     FALSE 0.205 144.000 0.000 NA   NA
 1222869 1222870 CYB_1548 CYB_1549     TRUE 0.721 -22.000 0.029 1.000   NA
 1222871 1222872 CYB_1550 CYB_1551 hisG psbO FALSE 0.369 109.000 0.002 1.000   NA
 1222877 1222878 CYB_1555 CYB_1557 devA devC FALSE 0.483 226.000 0.000 0.030 Y NA
 1222878 1222879 CYB_1557 CYB_1558 devC   TRUE 0.981 10.000 0.200 0.063 Y NA
 1222880 1222881 CYB_1559 CYB_1560 murC murB TRUE 0.977 62.000 0.136 0.004 Y NA
 1222881 1222882 CYB_1560 CYB_1561 murB   FALSE 0.388 21.000 0.000 NA   NA
 1222885 1222886 CYB_1563 CYB_1565 est   TRUE 0.852 42.000 0.051 1.000   NA
 1222886 1222887 CYB_1565 CYB_1566     FALSE 0.295 160.000 0.000 1.000 N NA
 1222887 1222888 CYB_1566 CYB_1567     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1222890 1222891 CYB_1568 CYB_1570 asd aroB TRUE 0.886 35.000 0.002 1.000 Y NA
 1222891 1222892 CYB_1570 CYB_1571 aroB   FALSE 0.341 101.000 0.000 1.000   NA
 1222893 1222894 CYB_1572 CYB_1573     TRUE 0.929 0.000 0.500 NA   NA
 1222894 1222895 CYB_1573 CYB_1574     TRUE 0.847 147.000 0.500 NA   NA
 1222896 1222897 CYB_1575 CYB_1576     TRUE 0.948 89.000 0.500 0.001   NA
 1222898 1222899 CYB_1577 CYB_1578 rpmJ rpsM TRUE 0.806 202.000 0.086 0.014 Y NA
 1222899 1222900 CYB_1578 CYB_1579 rpsM rpsK TRUE 0.981 85.000 0.810 0.014 Y NA
 1222900 1222901 CYB_1579 CYB_1580 rpsK rpoA TRUE 0.829 151.000 0.308 1.000 N NA
 1222901 1222902 CYB_1580 CYB_1581 rpoA rplQ TRUE 0.922 96.000 0.873 1.000 N NA
 1222902 1222903 CYB_1581 CYB_1582 rplQ truA TRUE 0.961 14.000 0.102 1.000 Y NA
 1222903 1222904 CYB_1582 CYB_1583 truA rplM TRUE 0.950 46.000 0.058 1.000 Y NA
 1222904 1222905 CYB_1583 CYB_1584 rplM rpsI TRUE 0.988 -3.000 0.601 0.014 Y NA
 1222905 1222906 CYB_1584 CYB_1585 rpsI rpmE TRUE 0.951 77.000 0.062 0.014 Y NA
 1222906 1222907 CYB_1585 CYB_1586 rpmE prfA TRUE 0.955 55.000 0.110 1.000 Y NA
 1222907 1222908 CYB_1586 CYB_1587 prfA acnB FALSE 0.384 103.000 0.002 1.000 N NA
 1222908 1222909 CYB_1587 CYB_1588 acnB   FALSE 0.429 68.000 0.007 NA   NA
 1222909 1222910 CYB_1588 CYB_1589     TRUE 0.752 179.000 0.667 NA   NA
 1222910 1222911 CYB_1589 CYB_1590     FALSE 0.019 280.000 0.000 NA N NA
 1222911 1222912 CYB_1590 CYB_1591     FALSE 0.517 89.000 0.020 NA N NA
 1222915 1222916 CYB_1594 CYB_1596     FALSE 0.002 1911.000 0.000 NA   NA
 1222916 1222917 CYB_1596 CYB_1597     FALSE 0.158 158.000 0.000 NA   NA
 1222918 1222919 CYB_1598 CYB_1599     FALSE 0.006 388.000 0.000 NA   NA
 1222919 1222920 CYB_1599 CYB_1600     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1222920 1222921 CYB_1600 CYB_1601     FALSE 0.331 60.000 0.000 NA   NA
 1222921 1222922 CYB_1601 CYB_1602     FALSE 0.332 -9.000 0.000 NA   NA
 1222922 1222923 CYB_1602 CYB_1603     FALSE 0.372 1.000 0.000 NA   NA
 1222923 1222924 CYB_1603 CYB_1604     FALSE 0.214 108.000 0.000 NA   NA
 1222924 1222925 CYB_1604 CYB_1605   gatA FALSE 0.143 167.000 0.002 NA   NA
 1222926 1222927 CYB_1606 CYB_1607 psbW   TRUE 0.804 32.000 0.040 1.000   NA
 1222927 1222928 CYB_1607 CYB_1608     TRUE 0.575 99.000 0.040 NA   NA
 1222928 1222929 CYB_1608 CYB_1609   gyrA FALSE 0.082 187.000 0.002 NA   NA
 1222930 1222931 CYB_1610 CYB_1611     FALSE 0.343 91.000 0.000 1.000   NA
 1222931 1222932 CYB_1611 CYB_1612     TRUE 0.695 70.000 0.050 NA   NA
 1222933 1222934 CYB_1613 CYB_1614     FALSE 0.043 215.000 0.000 NA   NA
 1222934 1222935 CYB_1614 CYB_1615     FALSE 0.296 -102.000 0.000 NA   NA
 1222935 1222936 CYB_1615 CYB_1616     FALSE 0.397 42.000 0.000 NA   NA
 1222936 1222937 CYB_1616 CYB_1617     FALSE 0.394 102.000 0.011 NA   NA
 1222937 1222938 CYB_1617 CYB_1618   groL-1 FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 1222938 1222939 CYB_1618 CYB_1619 groL-1 groS TRUE 0.937 91.000 0.048 0.008 Y NA
 1222941 1222942 CYB_1621 CYB_1622 petA petC TRUE 0.960 123.000 0.881 0.041   NA
 1222944 1222945 CYB_1624 CYB_1625     FALSE 0.203 145.000 0.000 NA   NA
 1222945 1222946 CYB_1625 CYB_1626     TRUE 0.842 17.000 0.000 0.015   NA
 1222949 1222950 CYB_1629 CYB_1630 petB petD TRUE 0.926 99.000 0.471 0.063   NA
 1222950 1222951 CYB_1630 CYB_1631 petD leuB FALSE 0.089 208.000 0.000 1.000   NA
 1222952 1222953 CYB_1632 CYB_1633   rpsR TRUE 0.885 17.000 0.002 1.000 Y NA
 1222953 1222954 CYB_1633 CYB_1634 rpsR rpmG TRUE 0.966 30.000 0.037 0.014 Y NA
 1222954 1222955 CYB_1634 CYB_1635 rpmG   FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 1222955 1222956 CYB_1635 CYB_1636   rnz FALSE 0.226 132.000 0.000 NA   NA
 1222957 1222958 CYB_1637 CYB_1638     FALSE 0.319 -19.000 0.000 NA   NA
 1222959 1222960 CYB_1639 CYB_1640     TRUE 0.983 35.000 0.143 0.007 Y NA
 1222960 1222961 CYB_1640 CYB_1641     FALSE 0.176 242.000 0.000 0.063 N NA
 1222961 1222962 CYB_1641 CYB_1642     FALSE 0.223 135.000 0.000 NA   NA
 1222962 1222963 CYB_1642 CYB_1643     FALSE 0.385 9.000 0.000 NA   NA
 1222964 1222965 CYB_1644 CYB_1645 lysA   FALSE 0.179 219.000 0.040 NA   NA
 1222965 1222966 CYB_1645 CYB_1646   uppS TRUE 0.771 6.000 0.043 NA   NA
 1222967 1222968 CYB_1647 CYB_1648     TRUE 0.659 69.000 0.028 1.000   NA
 1222968 1222969 CYB_1648 CYB_1649     FALSE 0.416 130.000 0.000 1.000 N NA
 1222969 1222970 CYB_1649 CYB_1650     FALSE 0.285 91.000 0.003 NA   NA
 1222970 1222971 CYB_1650 CYB_1651     FALSE 0.226 132.000 0.000 NA   NA
 1222972 1222973 CYB_1652 CYB_1653 prs   FALSE 0.496 159.000 0.020 1.000 N NA
 1222973 1222974 CYB_1653 CYB_1654     TRUE 0.985 -3.000 0.400 0.013 Y NA
 1222976 1222977 CYB_1656 CYB_1657 purM   FALSE 0.095 216.000 0.000 1.000 N NA
 1222977 1222978 CYB_1657 CYB_1658     TRUE 0.941 -3.000 0.710 NA   NA
 1222978 1222979 CYB_1658 CYB_1659     TRUE 0.920 48.000 0.379 NA   NA
 1222979 1222980 CYB_1659 CYB_1660     FALSE 0.389 19.000 0.000 NA   NA
 1222981 1222982 CYB_1661 CYB_1662     TRUE 0.719 96.000 0.059 1.000   NA
 1222982 1222983 CYB_1662 CYB_1663     TRUE 0.534 166.000 0.047 1.000   NA
 1222983 1222984 CYB_1663 CYB_1664   rpsF FALSE 0.509 74.000 0.004 1.000 N NA
 1222985 1222986 CYB_1665 CYB_1666 acpP fabF TRUE 0.973 46.000 0.346 1.000 Y NA
 1222986 1222987 CYB_1666 CYB_1667 fabF   TRUE 0.528 13.000 0.005 NA   NA
 1222987 1222988 CYB_1667 CYB_1669     FALSE 0.313 62.000 0.000 NA   NA
 1222989 1222990 CYB_1668 CYB_1670 queA dcd FALSE 0.431 84.000 0.002 1.000 N NA
 1222990 1222991 CYB_1670 CYB_1671 dcd   TRUE 0.802 124.000 0.091 1.000 N NA
 1222991 1222992 CYB_1671 CYB_1672     FALSE 0.009 505.000 0.000 1.000 N NA
 1222992 1222993 CYB_1672 CYB_1673     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1222993 1222994 CYB_1673 CYB_1674     FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 1222994 1222995 CYB_1674 CYB_1675     FALSE 0.227 113.000 0.000 NA   NA
 1222995 1222996 CYB_1675 CYB_1676     TRUE 0.865 44.000 0.091 NA   NA
 1222998 1222999 CYB_1678 CYB_1679     FALSE 0.174 180.000 0.000 1.000   NA
 1222999 1223000 CYB_1679 CYB_1680   gltX FALSE 0.187 233.000 0.000 0.084   NA
 1223000 1223001 CYB_1680 CYB_1681 gltX   FALSE 0.236 121.000 0.000 NA   NA
 1223004 1223005 CYB_1684 CYB_1685     TRUE 0.937 -3.000 0.446 1.000 N NA
 1223005 1223006 CYB_1685 CYB_1687   argB TRUE 0.544 60.000 0.000 1.000 N NA
 1223008 1223009 CYB_1688 CYB_1689     FALSE 0.326 69.000 0.000 NA N NA
 1223009 1223010 CYB_1689 CYB_1690     FALSE 0.010 428.000 0.000 1.000   NA
 1223010 1223011 CYB_1690 CYB_1691     TRUE 0.613 199.000 0.404 1.000   NA
 1223011 1223012 CYB_1691 CYB_1692     TRUE 0.865 125.000 0.423 NA   NA
 1223014 1223015 CYB_1694 CYB_1695 pds crtB TRUE 0.871 157.000 0.691 1.000   NA
 1223015 1223016 CYB_1695 CYB_1697 crtB   TRUE 0.682 83.000 0.041 1.000 N NA
 1223017 1223018 CYB_1696 CYB_1698     FALSE 0.233 116.000 0.000 NA   NA
 1223018 1223019 CYB_1698 CYB_1699     TRUE 0.930 3.000 0.487 NA   NA
 1223019 1223020 CYB_1699 CYB_1700     TRUE 0.854 44.000 0.077 NA   NA
 1223020 1223021 CYB_1700 CYB_1701     TRUE 0.963 36.000 0.360 0.035   NA
 1223022 1223023 CYB_1702 CYB_1703     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1223023 1223024 CYB_1703 CYB_1704   gap-2 FALSE 0.334 -7.000 0.000 NA   NA
 1223027 1223028 CYB_1706 CYB_1708     FALSE 0.347 88.000 0.000 1.000   NA
 1223029 1223030 CYB_1709 CYB_1710     TRUE 0.939 30.000 0.000 0.033 Y NA
 1223030 1223031 CYB_1710 CYB_1711     TRUE 0.656 117.000 0.036 1.000   NA
 1223031 1223032 CYB_1711 CYB_1712   groL-2 FALSE 0.110 200.000 0.000 1.000   NA
 1223036 1223037 CYB_1716 CYB_1717     FALSE 0.213 87.000 0.000 NA   NA
 1223037 1223038 CYB_1717 CYB_1718     FALSE 0.253 71.000 0.000 NA   NA
 1223038 1223039 CYB_1718 CYB_1719     FALSE 0.200 146.000 0.000 NA   NA
 1223039 1223040 CYB_1719 CYB_1720     TRUE 0.918 63.000 0.636 NA   NA
 1223040 1223041 CYB_1720 CYB_1721     FALSE 0.395 39.000 0.000 NA   NA
 1223042 1223043 CYB_1722 CYB_1723     FALSE 0.235 77.000 0.000 NA   NA
 1223047 1223048 CYB_1728 CYB_1729     FALSE 0.349 195.000 0.000 0.034   NA
 1223049 1223050 CYB_1730 CYB_1731     TRUE 0.820 55.000 0.000 0.015   NA
 1223050 1223051 CYB_1731 CYB_1733     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 1223052 1223053 CYB_1732 CYB_1734   glgA-2 TRUE 0.822 46.000 0.045 1.000   NA
 1223054 1223055 CYB_1735 CYB_1736   psbD-2 FALSE 0.223 135.000 0.000 NA   NA
 1223056 1223057 CYB_1737 CYB_1738 aroK ribE TRUE 0.622 12.000 0.002 1.000 N NA
 1223057 1223058 CYB_1738 CYB_1739 ribE   TRUE 0.557 13.000 0.000 1.000   NA
 1223058 1223059 CYB_1739 CYB_1740     FALSE 0.006 605.000 0.000 1.000   NA
 1223059 1223060 CYB_1740 CYB_1741   rph FALSE 0.058 247.000 0.000 1.000 N NA
 1223060 1223061 CYB_1741 CYB_1742 rph   FALSE 0.085 224.000 0.000 1.000 N NA
 1223061 1223062 CYB_1742 CYB_1743     FALSE 0.040 256.000 0.000 1.000   NA
 1223063 1223064 CYB_1744 CYB_1745 speB   FALSE 0.440 73.000 0.000 1.000 N NA
 1223064 1223065 CYB_1745 CYB_1746     FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1223065 1223066 CYB_1746 CYB_1747     FALSE 0.042 579.000 0.194 NA   NA
 1223066 1223067 CYB_1747 CYB_1749   proC TRUE 0.901 6.000 0.224 NA   NA
 1223068 1223069 CYB_1748 CYB_1750     FALSE 0.396 141.000 0.000 1.000 N NA
 1223072 1223073 CYB_1753 CYB_1754     FALSE 0.207 103.000 0.000 NA   NA
 1223074 1223075 CYB_1755 CYB_1756     TRUE 0.810 -42.000 0.000 NA Y NA
 1223075 1223076 CYB_1756 CYB_1757   secF FALSE 0.439 53.000 0.000 NA N NA
 1223076 1223077 CYB_1757 CYB_1758 secF secD TRUE 0.989 -3.000 0.516 0.001 Y NA
 1223077 1223078 CYB_1758 CYB_1759 secD   FALSE 0.292 79.000 0.000 NA N NA
 1223080 1223081 CYB_1761 CYB_1762 chlP   FALSE 0.422 125.000 0.000 1.000 N NA
 1223081 1223082 CYB_1762 CYB_1763     FALSE 0.521 -28.000 0.003 1.000   NA
 1223082 1223083 CYB_1763 CYB_1764     TRUE 0.760 -3.000 0.047 NA   NA
 1223083 1223084 CYB_1764 CYB_1765     FALSE 0.209 106.000 0.000 NA   NA
 1223085 1223086 CYB_1766 CYB_1767 pdxA   FALSE 0.343 91.000 0.000 1.000   NA
 1223086 1223087 CYB_1767 CYB_1768     FALSE 0.212 88.000 0.000 NA   NA
 1223089 1223090 CYB_1770 CYB_1772     FALSE 0.026 243.000 0.000 NA   NA
 1223091 1223092 CYB_1771 CYB_1773     FALSE 0.416 68.000 0.000 1.000   NA
 1223092 1223093 CYB_1773 CYB_1774     FALSE 0.087 183.000 0.000 NA   NA
 1223093 1223094 CYB_1774 CYB_1775     TRUE 0.915 94.000 1.000 NA   NA
 1223094 1223095 CYB_1775 CYB_1776     FALSE 0.379 121.000 0.000 1.000   NA
 1223096 1223097 CYB_1777 CYB_1778     FALSE 0.380 28.000 0.000 NA   NA
 1223097 1223098 CYB_1778 CYB_1779     FALSE 0.005 450.000 0.000 NA   NA
 1223098 1223099 CYB_1779 CYB_1780     FALSE 0.065 196.000 0.000 NA   NA
 1223099 1223100 CYB_1780 CYB_1781   thyX FALSE 0.145 183.000 0.005 NA   NA
 1223100 1223101 CYB_1781 CYB_1782 thyX   TRUE 0.615 54.000 0.005 1.000   NA
 1223101 1223102 CYB_1782 CYB_1783     FALSE 0.007 354.000 0.000 NA   NA
 1223102 1223103 CYB_1783 CYB_1784   purC TRUE 0.565 11.000 0.004 NA N NA
 1223103 1223104 CYB_1784 CYB_1785 purC   FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 1223106 1223107 CYB_1787 CYB_1788     FALSE 0.214 188.000 0.016 NA   NA
 1223107 1223108 CYB_1788 CYB_1789   ilvC FALSE 0.517 64.000 0.002 1.000 N NA
 1223108 1223109 CYB_1789 CYB_1790 ilvC serS TRUE 0.608 34.000 0.002 1.000 N NA
 1223110 1223111 CYB_1791 CYB_1792     FALSE 0.028 239.000 0.000 NA   NA
 1223111 1223112 CYB_1792 CYB_1793     FALSE 0.378 33.000 0.000 NA   NA
 1223112 1223113 CYB_1793 CYB_1794   ccmM TRUE 0.845 91.000 0.037 0.002   NA
 1223113 1223114 CYB_1794 CYB_1795 ccmM ccmL TRUE 0.850 72.000 0.333 NA   NA
 1223114 1223115 CYB_1795 CYB_1796 ccmL ccmK-1 TRUE 0.980 0.000 0.818 NA Y NA
 1223115 1223116 CYB_1796 CYB_1797 ccmK-1 ccmK-2 TRUE 0.915 72.000 0.105 NA Y NA
 1223116 1223117 CYB_1797 CYB_1798 ccmK-2   FALSE 0.004 806.000 0.000 NA N NA
 1223117 1223118 CYB_1798 CYB_1799     FALSE 0.517 8.000 0.003 NA N NA
 1223118 1223119 CYB_1799 CYB_1800     FALSE 0.409 58.000 0.003 NA   NA
 1223119 1223120 CYB_1800 CYB_1801     TRUE 0.639 131.000 0.048 NA   NA
 1223120 1223121 CYB_1801 CYB_1802     FALSE 0.214 108.000 0.000 NA   NA
 1223122 1223123 CYB_1803 CYB_1804 petE   FALSE 0.084 184.000 0.000 NA   NA
 1223126 1223127 CYB_1807 CYB_1808     FALSE 0.493 99.000 0.011 1.000   NA
 1223127 1223128 CYB_1808 CYB_1809     FALSE 0.382 35.000 0.000 NA   NA
 1223128 1223129 CYB_1809 CYB_1810     FALSE 0.220 83.000 0.000 NA   NA
 1223129 1223130 CYB_1810 CYB_1811     TRUE 0.836 37.000 0.062 NA   NA
 1223130 1223131 CYB_1811 CYB_1812     TRUE 0.993 13.000 0.875 0.003 Y NA
 1223131 1223132 CYB_1812 CYB_1813     FALSE 0.229 129.000 0.000 NA   NA
 1223133 1223134 CYB_1814 CYB_1815   thiE TRUE 0.532 110.000 0.027 NA   NA
 1223134 1223135 CYB_1815 CYB_1816 thiE   FALSE 0.124 202.000 0.000 1.000 N NA
 1223136 1223137 CYB_1817 CYB_1818     FALSE 0.099 203.000 0.000 1.000   NA
 1223137 1223138 CYB_1818 CYB_1819     FALSE 0.223 82.000 0.000 NA   NA
 1223138 1223139 CYB_1819 CYB_1820     FALSE 0.467 93.000 0.019 NA   NA
 1223140 1223141 CYB_1821 CYB_1822 cysS   FALSE 0.339 153.000 0.000 1.000 N NA
 1223141 1223142 CYB_1822 CYB_1823     FALSE 0.007 767.000 0.000 1.000 N NA
 1223142 1223143 CYB_1823 CYB_1824   rnhB TRUE 0.916 36.000 0.033 0.014 N NA
 1223143 1223144 CYB_1824 CYB_1825 rnhB   FALSE 0.389 13.000 0.000 NA   NA
 1223144 1223145 CYB_1825 CYB_1826     FALSE 0.223 82.000 0.000 NA   NA
 1223146 1223147 CYB_1827 CYB_1828     FALSE 0.009 325.000 0.000 NA   NA
 1223147 1223148 CYB_1828 CYB_1829   gvpJ FALSE 0.241 75.000 0.000 NA   NA
 1223148 1223149 CYB_1829 CYB_1830 gvpJ gvpN TRUE 0.858 42.000 0.054 1.000   NA
 1223149 1223150 CYB_1830 CYB_1831 gvpN gvpC TRUE 0.891 80.000 0.054 0.001   NA
 1223153 1223154 CYB_1834 CYB_1835     FALSE 0.009 324.000 0.000 NA   NA
 1223154 1223155 CYB_1835 CYB_1836     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1223155 1223156 CYB_1836 CYB_1837     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 1223156 1223157 CYB_1837 CYB_1838     FALSE 0.386 270.000 0.800 1.000   NA
 1223157 1223158 CYB_1838 CYB_1839   aroH FALSE 0.503 104.000 0.012 1.000   NA
 1223164 1223165 CYB_1845 CYB_1846     FALSE 0.351 -3.000 0.000 NA   NA
 1223165 1223166 CYB_1846 CYB_1847   ribD FALSE 0.382 27.000 0.000 NA   NA
 1223166 1223167 CYB_1847 CYB_1848 ribD   FALSE 0.016 269.000 0.000 NA   NA
 1223168 1223169 CYB_1849 CYB_1850     FALSE 0.265 68.000 0.000 NA   NA
 1223172 1223173 CYB_1853 CYB_1854     FALSE 0.224 112.000 0.000 NA   NA
 1223173 1223174 CYB_1854 CYB_1855     FALSE 0.058 201.000 0.000 NA   NA
 1223175 1223176 CYB_1856 CYB_1857     TRUE 0.593 46.000 0.009 NA   NA
 1223176 1223177 CYB_1857 CYB_1858     TRUE 0.621 14.000 0.012 NA   NA
 1223177 1223178 CYB_1858 CYB_1859   crtE TRUE 0.853 71.000 0.214 1.000   NA
 1223178 1223179 CYB_1859 CYB_1860 crtE   FALSE 0.244 74.000 0.000 NA   NA
 1223180 1223181 CYB_1861 CYB_1863 hemE   FALSE 0.006 391.000 0.000 NA   NA
 1223184 1223185 CYB_1865 CYB_1866     TRUE 0.593 85.000 0.042 NA   NA
 1223185 1223186 CYB_1866 CYB_1867   thiL FALSE 0.056 202.000 0.000 NA   NA
 1223186 1223187 CYB_1867 CYB_1868 thiL   FALSE 0.372 115.000 0.000 1.000   NA
 1223189 1223190 CYB_1870 CYB_1871     TRUE 0.969 141.000 0.414 0.082 Y NA
 1223190 1223191 CYB_1871 CYB_1872     FALSE 0.299 121.000 0.000 NA N NA
 1223193 1223194 CYB_1874 CYB_1875 cefD prfC FALSE 0.037 271.000 0.000 1.000 N NA
 1223194 1223195 CYB_1875 CYB_1876 prfC   FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 1223195 1223196 CYB_1876 CYB_1877     FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1223196 1223197 CYB_1877 CYB_1878   aspC FALSE 0.304 159.000 0.000 1.000 N NA
 1223197 1223198 CYB_1878 CYB_1879 aspC   TRUE 0.591 76.000 0.035 NA   NA
 1223198 1223199 CYB_1879 CYB_1880     FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 1223199 1223200 CYB_1880 CYB_1881     TRUE 0.878 94.000 0.431 1.000 N NA
 1223200 1223201 CYB_1881 CYB_1882     TRUE 0.932 -13.000 0.003 0.017 Y NA
 1223201 1223202 CYB_1882 CYB_1883     TRUE 0.987 5.000 1.000 1.000 Y NA
 1223202 1223203 CYB_1883 CYB_1884     TRUE 0.985 -3.000 0.429 0.022 Y NA
 1223203 1223204 CYB_1884 CYB_1885     TRUE 0.990 -15.000 0.875 0.022 Y NA
 1223206 1223207 CYB_1887 CYB_1888 ftsE   FALSE 0.212 194.000 0.006 1.000 N NA
 1223208 1223209 CYB_1889 CYB_1890     FALSE 0.368 130.000 0.000 1.000   NA
 1223209 1223210 CYB_1890 CYB_1891     FALSE 0.386 10.000 0.000 NA   NA
 1223211 1223212 CYB_1892 CYB_1893     FALSE 0.489 -12.000 0.000 1.000   NA
 1223212 1223213 CYB_1893 CYB_1894     FALSE 0.420 127.000 0.000 1.000 N NA
 1223213 1223214 CYB_1894 CYB_1895   sasA FALSE 0.014 389.000 0.000 1.000 N NA
 1223214 1223215 CYB_1895 CYB_1896 sasA   FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 1223218 1223219 CYB_1899 CYB_1900 eda   FALSE 0.383 26.000 0.000 NA   NA
 1223219 1223220 CYB_1900 CYB_1901   dgkA TRUE 0.748 104.000 0.123 NA   NA
 1223222 1223223 CYB_1903 CYB_1904     FALSE 0.351 85.000 0.000 1.000   NA
 1223223 1223224 CYB_1904 CYB_1906     FALSE 0.381 5.000 0.000 NA   NA
 1223225 1223226 CYB_1905 CYB_1907     FALSE 0.016 269.000 0.000 NA   NA
 1223227 1223228 CYB_1908 CYB_1909     TRUE 0.592 80.000 0.038 NA   NA
 1223228 1223229 CYB_1909 CYB_1910     FALSE 0.007 356.000 0.000 NA   NA
 1223230 1223231 CYB_1911 CYB_1912   pstB-2 TRUE 0.648 113.000 0.029 1.000 N NA
 1223231 1223232 CYB_1912 CYB_1913 pstB-2 pstA-2 TRUE 0.981 71.000 0.429 0.003 Y NA
 1223232 1223233 CYB_1913 CYB_1914 pstA-2 pstC-2 TRUE 0.981 39.000 0.081 0.003 Y NA
 1223233 1223234 CYB_1914 CYB_1915 pstC-2 pstS-2 TRUE 0.941 149.000 0.054 0.003 Y NA
 1223236 1223237 CYB_1917 CYB_1918 pyrB purB TRUE 0.882 10.000 0.002 1.000 Y NA
 1223238 1223239 CYB_1919 CYB_1920     FALSE 0.008 472.000 0.000 1.000   NA
 1223240 1223241 CYB_1921 CYB_1922 lipB trx-3 TRUE 0.606 14.000 0.000 1.000 N NA
 1223243 1223244 CYB_1923 CYB_1925     TRUE 0.915 -3.000 0.042 NA Y NA
 1223244 1223245 CYB_1925 CYB_1926     TRUE 0.721 20.000 0.028 NA   NA
 1223245 1223246 CYB_1926 CYB_1927     FALSE 0.500 98.000 0.025 NA   NA
 1223248 1223249 CYB_1929 CYB_1930     TRUE 0.940 25.000 0.047 1.000 Y NA
 1223253 1223254 CYB_1934 CYB_1935     TRUE 0.931 192.000 0.524 0.002 Y NA
 1223254 1223255 CYB_1935 CYB_1936     TRUE 0.728 292.000 0.762 0.002 Y NA
 1223255 1223256 CYB_1936 CYB_1937     TRUE 0.918 116.000 0.095 1.000 Y NA
 1223256 1223257 CYB_1937 CYB_1938     TRUE 0.989 -3.000 0.667 0.010 Y NA
 1223257 1223258 CYB_1938 CYB_1939     TRUE 0.708 189.000 0.000 0.010 Y NA
 1223260 1223261 CYB_1941 CYB_1942     TRUE 0.933 173.000 0.304 0.012 Y NA
 1223261 1223262 CYB_1942 CYB_1943     FALSE 0.012 422.000 0.000 1.000 N NA
 1223264 1223265 CYB_1945 CYB_1946     TRUE 0.874 38.000 0.105 NA   NA
 1223268 1223269 CYB_1949 CYB_1950   nrdR FALSE 0.298 76.000 0.003 NA   NA
 1223269 1223270 CYB_1950 CYB_1951 nrdR   FALSE 0.006 393.000 0.000 NA   NA