MicrobesOnline Operon Predictions for Synechococcus sp. WH 7803

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3340551 3340552 SynWH7803_0001 SynWH7803_0002 dnaN   FALSE 0.425 4.000 0.022 NA   NA
 3340552 3340553 SynWH7803_0002 SynWH7803_0003   purL FALSE 0.165 91.000 0.039 NA   NA
 3340553 3340554 SynWH7803_0003 SynWH7803_0004 purL purF TRUE 0.874 39.000 0.223 1.000 Y NA
 3340555 3340556 SynWH7803_0005 SynWH7803_0006 gyrA   FALSE 0.493 90.000 0.314 1.000 N NA
 3340556 3340557 SynWH7803_0006 SynWH7803_0007     TRUE 0.594 16.000 0.102 1.000 N NA
 3340558 3340559 SynWH7803_0008 SynWH7803_0009     FALSE 0.375 17.000 0.043 NA   NA
 3340559 3340560 SynWH7803_0009 SynWH7803_0010   nusB FALSE 0.354 19.000 0.029 NA   NA
 3340560 3340561 SynWH7803_0010 SynWH7803_0011 nusB ftsY FALSE 0.499 6.000 0.013 1.000   NA
 3340561 3340562 SynWH7803_0011 SynWH7803_0012 ftsY rsbU FALSE 0.474 75.000 0.013 1.000 N NA
 3340562 3340563 SynWH7803_0012 SynWH7803_0013 rsbU argH FALSE 0.571 32.000 0.021 1.000 N NA
 3340563 3340564 SynWH7803_0013 SynWH7803_0014 argH   FALSE 0.102 120.000 0.019 1.000   NA
 3340566 3340567 SynWH7803_0016 SynWH7803_0017 msrB   FALSE 0.341 35.000 0.024 NA   NA
 3340568 3340569 SynWH7803_0018 SynWH7803_0019     FALSE 0.003 727.000 0.000 NA   NA
 3340569 3340570 SynWH7803_0019 SynWH7803_0020   pilT FALSE 0.214 201.000 0.218 1.000 Y NA
 3340570 3340571 SynWH7803_0020 SynWH7803_0021 pilT   TRUE 0.920 11.000 0.019 0.004 Y NA
 3340572 3340573 SynWH7803_0022 SynWH7803_0023 grpE   TRUE 0.917 51.000 0.168 0.013 Y NA
 3340573 3340574 SynWH7803_0023 SynWH7803_0024     FALSE 0.567 3.000 0.067 1.000   NA
 3340574 3340575 SynWH7803_0024 SynWH7803_0025   engC TRUE 0.636 -7.000 0.058 1.000   NA
 3340576 3340577 SynWH7803_0026 SynWH7803_0027   murB FALSE 0.347 25.000 0.030 NA   NA
 3340577 3340578 SynWH7803_0027 SynWH7803_0028 murB murC TRUE 0.948 -24.000 0.136 0.007 Y NA
 3340580 3340581 SynWH7803_0030 SynWH7803_0031 thiL   TRUE 0.646 7.000 0.031 1.000 N NA
 3340582 3340583 SynWH7803_0032 SynWH7803_0033 efp accB TRUE 0.696 3.000 0.120 1.000 N NA
 3340590 3340591 SynWH7803_0040 SynWH7803_0041     FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3340591 3340592 SynWH7803_0041 SynWH7803_0042     FALSE 0.313 64.000 0.091 NA   NA
 3340593 3340594 SynWH7803_0043 SynWH7803_0044     FALSE 0.249 123.000 0.471 NA   NA
 3340594 3340595 SynWH7803_0044 SynWH7803_0045     FALSE 0.161 165.000 0.588 NA   NA
 3340596 3340597 RNA_1 SynWH7803_0046     FALSE 0.156 60.000 0.000 NA   NA
 3340598 3340599 SynWH7803_0047 SynWH7803_0048 cbiD guaA TRUE 0.597 14.000 0.023 1.000 N NA
 3340599 3340600 SynWH7803_0048 SynWH7803_0049 guaA   FALSE 0.264 43.000 0.004 NA   NA
 3340600 3340601 SynWH7803_0049 SynWH7803_0050     TRUE 0.785 19.000 0.650 NA   NA
 3340601 3340602 SynWH7803_0050 SynWH7803_0051     FALSE 0.446 5.000 0.047 NA   NA
 3340603 3340604 SynWH7803_0052 SynWH7803_0053     TRUE 0.873 14.000 0.194 1.000 Y NA
 3340604 3340605 SynWH7803_0053 SynWH7803_0054     FALSE 0.318 59.000 0.079 NA   NA
 3340605 3340606 SynWH7803_0054 SynWH7803_0055   thiG FALSE 0.096 101.000 0.018 NA   NA
 3340608 3340609 SynWH7803_0057 SynWH7803_0058   rplT FALSE 0.399 35.000 0.002 1.000   NA
 3340609 3340610 SynWH7803_0058 SynWH7803_0059 rplT rpmI TRUE 0.969 44.000 0.928 0.029 Y NA
 3340611 3340612 SynWH7803_0060 SynWH7803_0061     TRUE 0.614 31.000 0.164 1.000 N NA
 3340613 3340614 SynWH7803_0062 SynWH7803_0063 dnaX   FALSE 0.250 28.000 0.005 NA   NA
 3340614 3340615 SynWH7803_0063 SynWH7803_0064   clpX FALSE 0.322 5.000 0.003 NA   NA
 3340616 3340617 SynWH7803_0065 SynWH7803_0066     FALSE 0.358 10.000 0.020 NA   NA
 3340617 3340618 SynWH7803_0066 SynWH7803_0067     FALSE 0.167 44.000 0.000 NA   NA
 3340621 3340622 SynWH7803_0070 SynWH7803_0071 clpP tig TRUE 0.848 47.000 0.025 1.000 Y NA
 3340623 3340624 SynWH7803_0072 SynWH7803_0073 asd dapA TRUE 0.874 7.000 0.052 1.000 Y NA
 3340624 3340625 SynWH7803_0073 SynWH7803_0074 dapA   TRUE 0.786 67.000 0.605 1.000   NA
 3340626 3340627 SynWH7803_0075 SynWH7803_0076   mesJ FALSE 0.327 6.000 0.007 NA   NA
 3340628 3340629 SynWH7803_0077 SynWH7803_0078     FALSE 0.310 63.000 0.086 NA   NA
 3340629 3340630 SynWH7803_0078 SynWH7803_0079     FALSE 0.278 -7.000 0.000 NA   NA
 3340630 3340631 SynWH7803_0079 SynWH7803_0080   uvrB FALSE 0.399 37.000 0.002 1.000   NA
 3340632 3340633 SynWH7803_0081 SynWH7803_0082 lysC holA FALSE 0.562 56.000 0.015 1.000 N NA
 3340635 3340636 SynWH7803_0084 SynWH7803_0085 mutS   FALSE 0.123 96.000 0.000 1.000   NA
 3340636 3340637 SynWH7803_0085 SynWH7803_0086     FALSE 0.160 23.000 0.000 NA   NA
 3340638 3340639 SynWH7803_0087 SynWH7803_0088 psbZ ribH FALSE 0.482 33.000 0.037 1.000   NA
 3340639 3340640 SynWH7803_0088 SynWH7803_0089 ribH   FALSE 0.024 124.000 0.000 NA   NA
 3340641 3340642 SynWH7803_0090 SynWH7803_0091     FALSE 0.454 1.000 0.000 1.000   NA
 3340642 3340643 SynWH7803_0091 SynWH7803_0092   galE FALSE 0.368 10.000 0.000 1.000   NA
 3340643 3340644 SynWH7803_0092 SynWH7803_0093 galE   FALSE 0.160 58.000 0.000 NA   NA
 3340644 3340645 SynWH7803_0093 SynWH7803_0094     FALSE 0.007 224.000 0.000 NA   NA
 3340645 3340646 SynWH7803_0094 SynWH7803_0095     FALSE 0.198 7.000 0.000 NA   NA
 3340646 3340647 SynWH7803_0095 SynWH7803_0096     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3340647 3340648 SynWH7803_0096 SynWH7803_0097     FALSE 0.003 725.000 0.000 NA   NA
 3340650 3340651 SynWH7803_0098 SynWH7803_0099     FALSE 0.465 29.000 0.053 1.000   NA
 3340652 3340653 SynWH7803_0100 SynWH7803_0101     FALSE 0.244 -54.000 0.000 NA   NA
 3340653 3340654 SynWH7803_0101 SynWH7803_0102     FALSE 0.326 59.000 0.000 1.000   NA
 3340654 3340655 SynWH7803_0102 SynWH7803_0103   rfbC TRUE 0.955 -10.000 0.450 1.000 Y NA
 3340655 3340656 SynWH7803_0103 SynWH7803_0104 rfbC rfbD TRUE 0.936 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 3340656 3340657 SynWH7803_0104 SynWH7803_0105 rfbD   TRUE 0.877 -7.000 0.000 NA Y NA
 3340657 3340658 SynWH7803_0105 SynWH7803_0106     FALSE 0.031 113.000 0.000 NA   NA
 3340658 3340659 SynWH7803_0106 SynWH7803_0107   rfbB FALSE 0.279 73.000 0.000 1.000   NA
 3340659 3340660 SynWH7803_0107 SynWH7803_0108 rfbB   FALSE 0.012 161.000 0.000 NA   NA
 3340661 3340662 SynWH7803_0109 SynWH7803_0110     FALSE 0.247 -37.000 0.000 NA   NA
 3340662 3340663 SynWH7803_0110 SynWH7803_0111     FALSE 0.007 214.000 0.000 NA   NA
 3340663 3340664 SynWH7803_0111 SynWH7803_0112     FALSE 0.003 684.000 0.000 NA   NA
 3340664 3340665 SynWH7803_0112 SynWH7803_0113   wcaG FALSE 0.004 311.000 0.000 NA   NA
 3340665 3340666 SynWH7803_0113 SynWH7803_0114 wcaG gmd TRUE 0.938 5.000 0.169 0.013 Y NA
 3340666 3340667 SynWH7803_0114 SynWH7803_0115 gmd   TRUE 0.815 34.000 0.000 1.000 Y NA
 3340667 3340668 SynWH7803_0115 SynWH7803_0116     FALSE 0.534 -3.000 0.000 1.000   NA
 3340669 3340670 SynWH7803_0117 SynWH7803_0118     TRUE 0.632 -7.000 0.200 NA   NA
 3340670 3340671 SynWH7803_0118 SynWH7803_0119     FALSE 0.358 12.000 0.000 1.000   NA
 3340671 3340672 SynWH7803_0119 SynWH7803_0120     FALSE 0.006 267.000 0.000 NA   NA
 3340672 3340673 SynWH7803_0120 SynWH7803_0121     TRUE 0.742 19.000 0.500 NA   NA
 3340673 3340674 SynWH7803_0121 SynWH7803_0122     TRUE 0.817 58.000 0.667 1.000   NA
 3340674 3340675 SynWH7803_0122 SynWH7803_0123     TRUE 0.770 -258.000 0.000 0.006   NA
 3340675 3340676 SynWH7803_0123 SynWH7803_0124     FALSE 0.057 126.000 0.000 1.000   NA
 3340678 3340679 SynWH7803_0126 SynWH7803_0127     FALSE 0.424 67.000 0.071 1.000   NA
 3340679 3340680 SynWH7803_0127 SynWH7803_0128     TRUE 0.912 -3.000 0.667 1.000   NA
 3340680 3340681 SynWH7803_0128 SynWH7803_0129     FALSE 0.533 98.000 0.000 1.000 Y NA
 3340684 3340685 SynWH7803_0132 SynWH7803_0133     FALSE 0.232 3.000 0.000 NA   NA
 3340686 3340687 SynWH7803_0134 SynWH7803_0135     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 3340687 3340688 SynWH7803_0135 SynWH7803_0136     TRUE 0.793 68.000 0.000 1.000 Y NA
 3340688 3340689 SynWH7803_0136 SynWH7803_0137     TRUE 0.958 0.000 0.625 NA Y NA
 3340689 3340690 SynWH7803_0137 SynWH7803_0138     TRUE 0.899 0.000 0.154 NA Y NA
 3340691 3340692 SynWH7803_0139 SynWH7803_0140     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3340694 3340695 SynWH7803_0142 SynWH7803_0143 cysE   TRUE 0.802 56.000 0.452 1.000 N NA
 3340697 3340698 SynWH7803_0145 SynWH7803_0146 infC miaA TRUE 0.838 58.000 0.020 1.000 Y NA
 3340699 3340700 SynWH7803_0147 SynWH7803_0148 gyrB   FALSE 0.468 0.000 0.020 NA   NA
 3340700 3340701 SynWH7803_0148 SynWH7803_0149     TRUE 0.907 -7.000 0.900 NA   NA
 3340701 3340702 SynWH7803_0149 SynWH7803_0150   crcB TRUE 0.979 -7.000 0.722 0.091 Y NA
 3340704 3340705 SynWH7803_0152 SynWH7803_0153 mgtE rpoD TRUE 0.592 53.000 0.054 1.000 N NA
 3340706 3340707 SynWH7803_0154 SynWH7803_0155     FALSE 0.569 -3.000 0.045 NA   NA
 3340707 3340708 SynWH7803_0155 SynWH7803_0156     TRUE 0.671 -10.000 0.136 NA N NA
 3340708 3340709 SynWH7803_0156 SynWH7803_0157     TRUE 0.890 8.000 1.000 NA N NA
 3340709 3340710 SynWH7803_0157 SynWH7803_0158     FALSE 0.028 118.000 0.000 NA   NA
 3340712 3340713 SynWH7803_0160 SynWH7803_0161     FALSE 0.007 216.000 0.000 NA   NA
 3340714 3340715 SynWH7803_0162 SynWH7803_0163   mutY FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3340717 3340718 SynWH7803_0165 SynWH7803_0166 csck xylB TRUE 0.873 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3340719 3340720 SynWH7803_0167 SynWH7803_0168 rbsK   FALSE 0.175 13.000 0.000 NA   NA
 3340721 3340722 SynWH7803_0169 SynWH7803_0170 ahcY   FALSE 0.328 61.000 0.024 NA   NA
 3340724 3340725 SynWH7803_0172 SynWH7803_0173 mreB mreC FALSE 0.558 6.000 0.043 1.000   NA
 3340725 3340726 SynWH7803_0173 SynWH7803_0174 mreC   FALSE 0.340 34.000 0.024 NA   NA
 3340726 3340727 SynWH7803_0174 SynWH7803_0175     TRUE 0.622 -3.000 0.169 NA   NA
 3340727 3340728 SynWH7803_0175 SynWH7803_0176     FALSE 0.233 112.000 0.185 1.000 N NA
 3340728 3340729 SynWH7803_0176 SynWH7803_0177   lysS TRUE 0.591 55.000 0.027 1.000 N NA
 3340729 3340730 SynWH7803_0177 SynWH7803_0178 lysS   FALSE 0.233 80.000 0.026 NA   NA
 3340731 3340732 SynWH7803_0179 SynWH7803_0180     TRUE 0.748 0.000 0.333 NA   NA
 3340732 3340733 SynWH7803_0180 SynWH7803_0181     TRUE 0.766 27.000 0.611 NA   NA
 3340733 3340734 SynWH7803_0181 SynWH7803_0182     FALSE 0.542 -3.000 0.097 NA   NA
 3340737 3340738 SynWH7803_0185 SynWH7803_0186 ruvB   TRUE 0.752 -3.000 0.019 1.000 N NA
 3340738 3340739 SynWH7803_0186 SynWH7803_0187     TRUE 0.845 -3.000 0.365 1.000   NA
 3340739 3340740 SynWH7803_0187 SynWH7803_0188     TRUE 0.807 -3.000 0.365 NA   NA
 3340740 3340741 SynWH7803_0188 SynWH7803_0189   nblB FALSE 0.471 5.000 0.143 NA   NA
 3340741 3340742 SynWH7803_0189 SynWH7803_0190 nblB thiC FALSE 0.029 190.000 0.003 1.000   NA
 3340743 3340744 SynWH7803_0191 SynWH7803_0192   rfbB FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 3340744 3340745 SynWH7803_0192 SynWH7803_0193 rfbB   TRUE 0.820 7.000 0.000 NA Y NA
 3340745 3340746 SynWH7803_0193 SynWH7803_0194     FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3340746 3340747 SynWH7803_0194 SynWH7803_0195     FALSE 0.024 179.000 0.000 1.000   NA
 3340747 3340748 SynWH7803_0195 SynWH7803_0196   fabF TRUE 0.583 51.000 0.062 1.000 N NA
 3340748 3340749 SynWH7803_0196 SynWH7803_0197 fabF acpP TRUE 0.909 12.000 0.346 1.000 Y NA
 3340750 3340751 SynWH7803_0198 SynWH7803_0199 psaC glmS FALSE 0.307 83.000 0.031 1.000   NA
 3340752 3340753 SynWH7803_0200 SynWH7803_0201 manC rimM FALSE 0.423 79.000 0.011 1.000 N NA
 3340754 3340755 SynWH7803_0202 SynWH7803_0203     FALSE 0.430 6.000 0.048 NA   NA
 3340756 3340757 SynWH7803_0204 RNA_3 rnc rnpB FALSE 0.160 32.000 0.000 NA   NA
 3340758 3340759 RNA_4 SynWH7803_0205     FALSE 0.051 96.000 0.000 NA   NA
 3340759 3340760 SynWH7803_0205 SynWH7803_0206     TRUE 0.838 38.000 0.950 NA   NA
 3340761 3340762 SynWH7803_0207 SynWH7803_0208 ackA   TRUE 0.671 11.000 0.190 1.000 N NA
 3340762 3340763 SynWH7803_0208 SynWH7803_0209     TRUE 0.852 57.000 0.143 1.000 Y NA
 3340766 3340767 SynWH7803_0212 SynWH7803_0213     TRUE 0.694 31.000 0.339 NA N NA
 3340770 3340771 SynWH7803_0216 SynWH7803_0217 glcF icd TRUE 0.832 34.000 0.008 1.000 Y NA
 3340774 3340775 SynWH7803_0220 SynWH7803_0221   ho1 TRUE 0.770 76.000 0.900 NA   NA
 3340775 3340776 SynWH7803_0221 SynWH7803_0222 ho1   TRUE 0.909 -3.000 0.478 1.000 N NA
 3340776 3340777 SynWH7803_0222 SynWH7803_0223     TRUE 0.689 80.000 0.435 1.000 N NA
 3340777 3340778 SynWH7803_0223 SynWH7803_0224     TRUE 0.906 -7.000 0.533 1.000 N NA
 3340778 3340779 SynWH7803_0224 SynWH7803_0225     TRUE 0.979 0.000 0.692 0.024 Y NA
 3340779 3340780 SynWH7803_0225 SynWH7803_0226     TRUE 0.979 -7.000 0.615 0.024 Y NA
 3340780 3340781 SynWH7803_0226 SynWH7803_0227     TRUE 0.961 -3.000 0.182 0.024 Y NA
 3340781 3340782 SynWH7803_0227 SynWH7803_0228     FALSE 0.562 -3.000 0.114 NA   NA
 3340783 3340784 SynWH7803_0229 SynWH7803_0230     TRUE 0.637 13.000 0.333 NA   NA
 3340784 3340785 SynWH7803_0230 SynWH7803_0231   kdsA FALSE 0.553 0.000 0.004 1.000   NA
 3340786 3340787 SynWH7803_0232 SynWH7803_0233   kdsB FALSE 0.392 6.000 0.020 NA   NA
 3340787 3340788 SynWH7803_0233 SynWH7803_0234 kdsB pcnB TRUE 0.643 3.000 0.005 1.000 N NA
 3340788 3340789 SynWH7803_0234 SynWH7803_0235 pcnB   FALSE 0.567 -3.000 0.036 NA   NA
 3340790 3340791 SynWH7803_0236 SynWH7803_0237     FALSE 0.504 -7.000 0.023 NA   NA
 3340791 3340792 SynWH7803_0237 SynWH7803_0238   kpsF TRUE 0.628 0.000 0.031 1.000   NA
 3340793 3340794 SynWH7803_0239 SynWH7803_0240   uvrD FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3340795 3340796 SynWH7803_0241 SynWH7803_0242   galE TRUE 0.772 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3340797 3340798 SynWH7803_0243 SynWH7803_0244 hisS ugd FALSE 0.546 36.000 0.008 1.000 N NA
 3340798 3340799 SynWH7803_0244 SynWH7803_0245 ugd   TRUE 0.931 -3.000 0.157 1.000 Y NA
 3340800 3340801 SynWH7803_0246 SynWH7803_0247 psbJ psbL TRUE 0.924 12.000 0.878 0.005   NA
 3340801 3340802 SynWH7803_0247 SynWH7803_0248 psbL psbF TRUE 0.916 19.000 0.872 0.005   NA
 3340802 3340803 SynWH7803_0248 SynWH7803_0249 psbF psbE TRUE 0.928 10.000 0.837 0.002   NA
 3340803 3340804 SynWH7803_0249 SynWH7803_0250 psbE   TRUE 0.581 88.000 0.625 NA   NA
 3340804 3340805 SynWH7803_0250 SynWH7803_0251   rub TRUE 0.747 23.000 0.521 NA   NA
 3340806 3340807 SynWH7803_0252 SynWH7803_0253 ndhC   TRUE 0.950 32.000 0.428 0.004 Y NA
 3340807 3340808 SynWH7803_0253 SynWH7803_0254   ndhJ TRUE 0.977 -3.000 0.406 0.004 Y NA
 3340810 3340811 SynWH7803_0256 SynWH7803_0257     TRUE 0.951 4.000 0.690 NA Y NA
 3340815 3340816 SynWH7803_0261 SynWH7803_0262   phr FALSE 0.502 15.000 0.038 1.000   NA
 3340817 3340818 SynWH7803_0263 SynWH7803_0264 degT   FALSE 0.500 11.000 0.057 1.000   NA
 3340820 3340821 SynWH7803_0266 SynWH7803_0267     TRUE 0.744 28.000 0.122 0.002   NA
 3340822 3340823 SynWH7803_0268 SynWH7803_0269 fabI hisB TRUE 0.582 41.000 0.021 1.000 N NA
 3340823 3340824 SynWH7803_0269 SynWH7803_0270 hisB   FALSE 0.575 56.000 0.020 1.000 N NA
 3340824 3340825 SynWH7803_0270 SynWH7803_0271     FALSE 0.126 107.000 0.171 NA   NA
 3340825 3340826 SynWH7803_0271 SynWH7803_0272     FALSE 0.460 58.000 0.200 NA   NA
 3340827 3340828 SynWH7803_0273 SynWH7803_0274   solA TRUE 0.701 36.000 0.265 1.000 N NA
 3340828 3340829 SynWH7803_0274 SynWH7803_0275 solA   TRUE 0.904 12.000 0.324 1.000 Y NA
 3340829 3340830 SynWH7803_0275 SynWH7803_0276     TRUE 0.840 0.000 0.500 NA   NA
 3340830 3340831 SynWH7803_0276 SynWH7803_0277     FALSE 0.193 77.000 0.007 NA   NA
 3340831 3340832 SynWH7803_0277 SynWH7803_0278     TRUE 0.754 -3.000 0.020 1.000 N NA
 3340834 3340835 SynWH7803_0280 SynWH7803_0281   pyrE TRUE 0.680 -3.000 0.034 1.000   NA
 3340836 3340837 SynWH7803_0282 RNA_5     FALSE 0.175 13.000 0.000 NA   NA
 3340837 3340838 RNA_5 SynWH7803_0283     FALSE 0.173 14.000 0.000 NA   NA
 3340838 3340839 SynWH7803_0283 SynWH7803_0284     FALSE 0.313 61.000 0.078 NA   NA
 3340842 3340843 SynWH7803_0287 SynWH7803_0288 psbK tgt FALSE 0.478 32.000 0.034 1.000   NA
 3340848 3340849 SynWH7803_0293 SynWH7803_0294 purH   FALSE 0.221 74.000 0.009 NA   NA
 3340850 3340851 SynWH7803_0295 SynWH7803_0296   lytB FALSE 0.411 61.000 0.175 NA   NA
 3340851 3340852 SynWH7803_0296 SynWH7803_0297 lytB amt1 FALSE 0.214 130.000 0.286 1.000 N NA
 3340852 3340853 SynWH7803_0297 SynWH7803_0298 amt1 sfsA FALSE 0.044 147.000 0.040 NA   NA
 3340855 3340856 SynWH7803_0300 SynWH7803_0301     TRUE 0.634 25.000 0.359 NA   NA
 3340856 3340857 SynWH7803_0301 SynWH7803_0302     TRUE 0.793 43.000 0.667 NA   NA
 3340858 3340859 RNA_6 SynWH7803_0303   glyA FALSE 0.061 91.000 0.000 NA   NA
 3340859 3340860 SynWH7803_0303 SynWH7803_0304 glyA   FALSE 0.355 90.000 0.137 1.000 N NA
 3340860 3340861 SynWH7803_0304 SynWH7803_0305   cinA TRUE 0.647 -7.000 0.032 1.000   NA
 3340861 3340862 SynWH7803_0305 SynWH7803_0306 cinA leuC FALSE 0.479 34.000 0.032 1.000   NA
 3340862 3340863 SynWH7803_0306 SynWH7803_0307 leuC leuD TRUE 0.965 0.000 0.268 0.001 Y NA
 3340863 3340864 SynWH7803_0307 SynWH7803_0308 leuD   FALSE 0.337 53.000 0.064 NA   NA
 3340865 3340866 SynWH7803_0309 SynWH7803_0310   psbI FALSE 0.224 110.000 0.324 NA   NA
 3340869 3340870 SynWH7803_0313 SynWH7803_0314 psbH   TRUE 0.624 36.000 0.262 1.000   NA
 3340870 3340871 SynWH7803_0314 SynWH7803_0315   pth TRUE 0.655 3.000 0.011 1.000 N NA
 3340871 3340872 SynWH7803_0315 SynWH7803_0316 pth   FALSE 0.479 0.000 0.022 NA   NA
 3340873 3340874 SynWH7803_0317 SynWH7803_0318     FALSE 0.566 -3.000 0.047 NA   NA
 3340874 3340875 SynWH7803_0318 SynWH7803_0319   ntcA TRUE 0.772 58.000 0.612 NA   NA
 3340875 3340876 SynWH7803_0319 SynWH7803_0320 ntcA rph FALSE 0.463 76.000 0.015 1.000 N NA
 3340877 3340878 SynWH7803_0321 SynWH7803_0322 cobA dcd TRUE 0.715 0.000 0.091 1.000 N NA
 3340879 3340880 SynWH7803_0323 SynWH7803_0324 thyX   FALSE 0.558 69.000 0.039 1.000 N NA
 3340883 3340884 SynWH7803_0327 SynWH7803_0328     FALSE 0.114 89.000 0.004 NA   NA
 3340885 3340886 SynWH7803_0329 SynWH7803_0330   ictB TRUE 0.833 -3.000 0.324 NA N NA
 3340886 3340887 SynWH7803_0330 SynWH7803_0331 ictB trmB TRUE 0.663 -7.000 0.226 NA   NA
 3340887 3340888 SynWH7803_0331 SynWH7803_0332 trmB   TRUE 0.626 0.000 0.106 1.000   NA
 3340889 3340890 SynWH7803_0333 SynWH7803_0334     TRUE 0.853 0.000 0.561 NA   NA
 3340891 3340892 SynWH7803_0335 SynWH7803_0336 ileS   FALSE 0.338 23.000 0.025 NA   NA
 3340893 3340894 RNA_7 SynWH7803_0337   crtR FALSE 0.095 81.000 0.000 NA   NA
 3340895 3340896 SynWH7803_0338 SynWH7803_0339 gatC   FALSE 0.495 -3.000 0.015 NA   NA
 3340896 3340897 SynWH7803_0339 SynWH7803_0340     FALSE 0.355 33.000 0.111 NA   NA
 3340897 3340898 SynWH7803_0340 SynWH7803_0341     FALSE 0.392 6.000 0.074 NA   NA
 3340898 3340899 SynWH7803_0341 SynWH7803_0342     FALSE 0.005 292.000 0.000 NA   NA
 3340900 3340901 SynWH7803_0343 SynWH7803_0344   pyrB TRUE 0.750 -3.000 0.019 1.000 N NA
 3340902 3340903 SynWH7803_0345 SynWH7803_0346     FALSE 0.467 96.000 0.556 NA   NA
 3340903 3340904 SynWH7803_0346 SynWH7803_0347     FALSE 0.045 224.000 0.278 NA   NA
 3340904 3340905 SynWH7803_0347 SynWH7803_0348     FALSE 0.344 66.000 0.125 NA   NA
 3340905 3340906 SynWH7803_0348 SynWH7803_0349     TRUE 0.720 -3.000 0.250 NA   NA
 3340906 3340907 SynWH7803_0349 RNA_8     FALSE 0.161 22.000 0.000 NA   NA
 3340908 3340909 SynWH7803_0350 SynWH7803_0351   dfp FALSE 0.447 4.000 0.030 NA   NA
 3340911 3340912 SynWH7803_0353 SynWH7803_0354 psbO cysD FALSE 0.150 106.000 0.064 1.000   NA
 3340912 3340913 SynWH7803_0354 SynWH7803_0355 cysD ftsH TRUE 0.586 46.000 0.061 1.000 N NA
 3340913 3340914 SynWH7803_0355 SynWH7803_0356 ftsH kdgA TRUE 0.783 26.000 0.415 1.000 N NA
 3340915 3340916 SynWH7803_0357 SynWH7803_0358   aroC FALSE 0.165 39.000 0.000 NA   NA
 3340916 3340917 SynWH7803_0358 SynWH7803_0359 aroC   FALSE 0.259 31.000 0.006 NA   NA
 3340917 3340918 SynWH7803_0359 SynWH7803_0360     FALSE 0.487 0.000 0.059 NA   NA
 3340918 3340919 SynWH7803_0360 SynWH7803_0361     TRUE 0.805 6.000 0.191 0.013   NA
 3340920 3340921 SynWH7803_0362 SynWH7803_0363 proV proW TRUE 0.975 0.000 0.600 0.087 Y NA
 3340921 3340922 SynWH7803_0363 SynWH7803_0364 proW proX TRUE 0.959 -3.000 0.188 0.038 Y NA
 3340923 3340924 SynWH7803_0365 SynWH7803_0366 nctP psbA FALSE 0.141 130.000 0.000 0.087   NA
 3340926 3340927 SynWH7803_0368 SynWH7803_0369   clpS FALSE 0.544 69.000 0.289 NA   NA
 3340927 3340928 SynWH7803_0369 SynWH7803_0370 clpS   FALSE 0.363 46.000 0.110 NA   NA
 3340929 3340930 SynWH7803_0371 SynWH7803_0372   cafA FALSE 0.483 22.000 0.000 1.000 N NA
 3340930 3340931 SynWH7803_0372 SynWH7803_0373 cafA rnhB TRUE 0.880 -3.000 0.033 0.028 N NA
 3340934 3340935 SynWH7803_0376 SynWH7803_0377     TRUE 0.633 0.000 0.047 1.000   NA
 3340935 3340936 SynWH7803_0377 SynWH7803_0378   rpsJ FALSE 0.469 57.000 0.025 1.000   NA
 3340936 3340937 SynWH7803_0378 SynWH7803_0379 rpsJ tuf FALSE 0.389 149.000 0.318 1.000 Y NA
 3340937 3340938 SynWH7803_0379 SynWH7803_0380 tuf fusA TRUE 0.953 43.000 0.400 0.002 Y NA
 3340938 3340939 SynWH7803_0380 SynWH7803_0381 fusA rpsG TRUE 0.852 87.000 0.579 1.000 Y NA
 3340939 3340940 SynWH7803_0381 SynWH7803_0382 rpsG rpsL TRUE 0.928 82.000 0.620 0.005 Y NA
 3340940 3340941 SynWH7803_0382 SynWH7803_0383 rpsL   FALSE 0.207 78.000 0.014 NA   NA
 3340941 3340942 SynWH7803_0383 SynWH7803_0384     TRUE 0.768 44.000 0.571 NA   NA
 3340943 3340944 SynWH7803_0385 SynWH7803_0386 gltS   FALSE 0.343 15.000 0.086 NA   NA
 3340947 3340948 SynWH7803_0388 SynWH7803_0389     FALSE 0.095 121.000 0.184 NA   NA
 3340949 3340950 SynWH7803_0390 SynWH7803_0391   psaA FALSE 0.479 -49.000 0.051 NA   NA
 3340950 3340951 SynWH7803_0391 SynWH7803_0392 psaA psaB TRUE 0.881 23.000 0.513 0.004   NA
 3340954 3340955 SynWH7803_0395 SynWH7803_0396   psaL FALSE 0.241 111.000 0.278 1.000   NA
 3340955 3340956 SynWH7803_0396 SynWH7803_0397 psaL psaI TRUE 0.873 59.000 0.583 0.030   NA
 3340958 3340959 SynWH7803_0399 SynWH7803_0400     FALSE 0.272 73.000 0.077 NA   NA
 3340959 3340960 SynWH7803_0400 SynWH7803_0401     FALSE 0.300 52.000 0.014 NA   NA
 3340962 3340963 RNA_10 SynWH7803_0403   alr FALSE 0.163 35.000 0.000 NA   NA
 3340965 3340966 SynWH7803_0405 SynWH7803_0406 prfA rpmE FALSE 0.469 114.000 0.110 1.000 Y NA
 3340966 3340967 SynWH7803_0406 SynWH7803_0407 rpmE rpsI TRUE 0.917 9.000 0.062 0.026 Y NA
 3340967 3340968 SynWH7803_0407 SynWH7803_0408 rpsI rplM TRUE 0.981 -3.000 0.601 0.026 Y NA
 3340968 3340969 SynWH7803_0408 SynWH7803_0409 rplM truA FALSE 0.228 168.000 0.058 1.000 Y NA
 3340969 3340970 SynWH7803_0409 SynWH7803_0410 truA rplQ TRUE 0.925 -3.000 0.102 1.000 Y NA
 3340970 3340971 SynWH7803_0410 SynWH7803_0411 rplQ rpoA TRUE 0.878 37.000 0.873 1.000 N NA
 3340971 3340972 SynWH7803_0411 SynWH7803_0412 rpoA rpsK TRUE 0.735 46.000 0.308 1.000 N NA
 3340972 3340973 SynWH7803_0412 SynWH7803_0413 rpsK rpsM TRUE 0.965 58.000 0.810 0.026 Y NA
 3340973 3340974 SynWH7803_0413 SynWH7803_0414 rpsM rpmJ TRUE 0.668 76.000 0.194 0.026   NA
 3340974 3340975 SynWH7803_0414 SynWH7803_0415 rpmJ adk FALSE 0.485 48.000 0.050 1.000   NA
 3340975 3340976 SynWH7803_0415 SynWH7803_0416 adk secY FALSE 0.372 85.000 0.019 1.000 N NA
 3340976 3340977 SynWH7803_0416 SynWH7803_0417 secY rplO FALSE 0.547 107.000 0.730 1.000 N NA
 3340977 3340978 SynWH7803_0417 SynWH7803_0418 rplO rpsE TRUE 0.928 6.000 0.148 0.034 Y NA
 3340978 3340979 SynWH7803_0418 SynWH7803_0419 rpsE rplR TRUE 0.967 14.000 0.814 0.034 Y NA
 3340979 3340980 SynWH7803_0419 SynWH7803_0420 rplR rplF TRUE 0.965 34.000 0.815 0.026 Y NA
 3340980 3340981 SynWH7803_0420 SynWH7803_0421 rplF rpsH TRUE 0.966 16.000 0.808 0.026 Y NA
 3340981 3340982 SynWH7803_0421 SynWH7803_0422 rpsH rplE TRUE 0.904 20.000 0.059 0.026 Y NA
 3340982 3340983 SynWH7803_0422 SynWH7803_0423 rplE rplX TRUE 0.964 50.000 0.758 0.026 Y NA
 3340983 3340984 SynWH7803_0423 SynWH7803_0424 rplX rplN TRUE 0.977 3.000 0.810 0.034 Y NA
 3340984 3340985 SynWH7803_0424 SynWH7803_0425 rplN rpsQ TRUE 0.984 -3.000 0.791 0.034 Y NA
 3340985 3340986 SynWH7803_0425 SynWH7803_0426 rpsQ rpmC TRUE 0.966 18.000 0.828 0.026 Y NA
 3340986 3340987 SynWH7803_0426 SynWH7803_0427 rpmC rplP TRUE 0.977 3.000 0.802 0.026 Y NA
 3340987 3340988 SynWH7803_0427 SynWH7803_0428 rplP rpsC TRUE 0.966 17.000 0.828 0.034 Y NA
 3340988 3340989 SynWH7803_0428 SynWH7803_0429 rpsC rplV TRUE 0.961 20.000 0.719 0.034 Y NA
 3340989 3340990 SynWH7803_0429 SynWH7803_0430 rplV rpsS TRUE 0.973 5.000 0.769 0.034 Y NA
 3340990 3340991 SynWH7803_0430 SynWH7803_0431 rpsS rplB TRUE 0.965 36.000 0.820 0.034 Y NA
 3340991 3340992 SynWH7803_0431 SynWH7803_0432 rplB rplW TRUE 0.967 16.000 0.849 0.028 Y NA
 3340992 3340993 SynWH7803_0432 SynWH7803_0433 rplW rplD TRUE 0.977 -7.000 0.513 0.026 Y NA
 3340993 3340994 SynWH7803_0433 SynWH7803_0434 rplD rplC TRUE 0.966 0.000 0.361 0.026 Y NA
 3340995 3340996 SynWH7803_0435 SynWH7803_0436     TRUE 0.789 63.000 0.595 1.000   NA
 3340996 3340997 SynWH7803_0436 SynWH7803_0437     TRUE 0.700 73.000 0.189 0.022   NA
 3340997 3340998 SynWH7803_0437 RNA_11     FALSE 0.040 105.000 0.000 NA   NA
 3340998 3340999 RNA_11 SynWH7803_0438     FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 3340999 3341000 SynWH7803_0438 SynWH7803_0439   recA FALSE 0.053 153.000 0.019 1.000   NA
 3341001 3341002 SynWH7803_0440 SynWH7803_0441     FALSE 0.318 75.000 0.146 NA   NA
 3341002 3341003 SynWH7803_0441 SynWH7803_0442     FALSE 0.329 38.000 0.072 NA   NA
 3341008 3341009 SynWH7803_0447 SynWH7803_0448   moeB FALSE 0.522 -7.000 0.108 NA   NA
 3341012 3341013 SynWH7803_0451 SynWH7803_0452 speH recF FALSE 0.142 126.000 0.024 1.000 N NA
 3341015 3341016 SynWH7803_0453 SynWH7803_0454     TRUE 0.825 1.000 0.500 NA   NA
 3341016 3341017 SynWH7803_0454 SynWH7803_0455     TRUE 0.878 -3.000 0.457 1.000   NA
 3341017 3341018 SynWH7803_0455 SynWH7803_0456   trpE TRUE 0.666 -3.000 0.059 1.000   NA
 3341018 3341019 SynWH7803_0456 SynWH7803_0457 trpE psaD FALSE 0.329 80.000 0.091 1.000   NA
 3341019 3341020 SynWH7803_0457 SynWH7803_0458 psaD   FALSE 0.421 95.000 0.381 1.000   NA
 3341020 3341021 SynWH7803_0458 SynWH7803_0459   rodA TRUE 0.760 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3341021 3341022 SynWH7803_0459 SynWH7803_0460 rodA mrp TRUE 0.897 3.000 0.041 1.000 Y NA
 3341024 3341025 SynWH7803_0462 SynWH7803_0463     FALSE 0.513 18.000 0.238 NA   NA
 3341025 3341026 SynWH7803_0463 SynWH7803_0464   pex TRUE 0.610 31.000 0.333 NA   NA
 3341028 3341029 SynWH7803_0466 SynWH7803_0467     TRUE 0.793 45.000 0.667 NA   NA
 3341031 3341032 SynWH7803_0468 SynWH7803_0469     TRUE 0.620 28.000 0.346 NA   NA
 3341034 3341035 SynWH7803_0471 SynWH7803_0472   purM FALSE 0.046 130.000 0.018 NA   NA
 3341036 3341037 SynWH7803_0473 SynWH7803_0474 rlpA   FALSE 0.181 81.000 0.012 NA   NA
 3341038 3341039 SynWH7803_0475 SynWH7803_0476   rpcF FALSE 0.534 -3.000 0.000 1.000   NA
 3341039 3341040 SynWH7803_0476 SynWH7803_0477 rpcF rpcE TRUE 0.776 0.000 0.000 0.023   NA
 3341040 3341041 SynWH7803_0477 SynWH7803_0478 rpcE   FALSE 0.465 0.000 0.019 NA   NA
 3341041 3341042 SynWH7803_0478 SynWH7803_0479   rpcA FALSE 0.514 81.000 0.385 NA   NA
 3341042 3341043 SynWH7803_0479 SynWH7803_0480 rpcA rpcB TRUE 0.894 45.000 0.615 0.007   NA
 3341043 3341044 SynWH7803_0480 SynWH7803_0481 rpcB pebB FALSE 0.126 151.000 0.308 1.000   NA
 3341044 3341045 SynWH7803_0481 SynWH7803_0482 pebB pebA TRUE 0.961 -3.000 0.808 0.001   NA
 3341045 3341046 SynWH7803_0482 SynWH7803_0483 pebA   TRUE 0.832 0.000 0.400 1.000   NA
 3341046 3341047 SynWH7803_0483 SynWH7803_0484     TRUE 0.788 10.000 0.571 NA   NA
 3341048 3341049 SynWH7803_0485 SynWH7803_0486 cpeB cpeA TRUE 0.882 57.000 0.542 0.007   NA
 3341049 3341050 SynWH7803_0486 SynWH7803_0487 cpeA mpeE FALSE 0.048 287.000 0.000 0.012   NA
 3341050 3341051 SynWH7803_0487 SynWH7803_0488 mpeE cpeZ FALSE 0.017 231.000 0.000 1.000   NA
 3341053 3341054 SynWH7803_0490 SynWH7803_0491   cpeY FALSE 0.003 433.000 0.000 NA   NA
 3341055 3341056 SynWH7803_0492 SynWH7803_0493 mpeA mpeB TRUE 0.917 40.000 0.900 0.007   NA
 3341056 3341057 SynWH7803_0493 SynWH7803_0494 mpeB   FALSE 0.035 152.000 0.000 1.000   NA
 3341058 3341059 SynWH7803_0495 SynWH7803_0496     TRUE 0.859 3.000 0.714 NA   NA
 3341060 3341061 SynWH7803_0497 SynWH7803_0498 cpeR cpeT TRUE 0.744 27.000 0.533 NA   NA
 3341061 3341062 SynWH7803_0498 SynWH7803_0499 cpeT cpeS TRUE 0.761 15.000 0.444 1.000   NA
 3341062 3341063 SynWH7803_0499 SynWH7803_0500 cpeS   FALSE 0.526 -3.000 0.074 NA   NA
 3341063 3341064 SynWH7803_0500 SynWH7803_0501   cpeE FALSE 0.166 118.000 0.286 NA   NA
 3341064 3341065 SynWH7803_0501 SynWH7803_0502 cpeE mpeD TRUE 0.719 99.000 0.875 0.012   NA
 3341065 3341066 SynWH7803_0502 SynWH7803_0503 mpeD cpeC FALSE 0.523 112.000 0.467 0.012   NA
 3341066 3341067 SynWH7803_0503 SynWH7803_0504 cpeC   FALSE 0.066 145.000 0.200 NA   NA
 3341067 3341068 SynWH7803_0504 SynWH7803_0505   cpcG2 FALSE 0.481 26.000 0.222 NA   NA
 3341068 3341069 SynWH7803_0505 SynWH7803_0506 cpcG2   TRUE 0.833 47.000 0.353 0.012   NA
 3341069 3341070 SynWH7803_0506 SynWH7803_0507     TRUE 0.835 -3.000 0.412 NA   NA
 3341072 3341073 SynWH7803_0509 RNA_14     FALSE 0.167 17.000 0.000 NA   NA
 3341073 3341074 RNA_14 SynWH7803_0510     FALSE 0.159 31.000 0.000 NA   NA
 3341074 3341075 SynWH7803_0510 SynWH7803_0511     FALSE 0.281 22.000 0.011 NA   NA
 3341075 3341076 SynWH7803_0511 SynWH7803_0512     FALSE 0.033 165.000 0.041 NA   NA
 3341076 3341077 SynWH7803_0512 SynWH7803_0513   metK TRUE 0.591 18.000 0.028 1.000 N NA
 3341077 3341078 SynWH7803_0513 SynWH7803_0514 metK   FALSE 0.484 47.000 0.030 1.000   NA
 3341078 3341079 SynWH7803_0514 SynWH7803_0515   rpsA FALSE 0.494 15.000 0.112 1.000   NA
 3341079 3341080 SynWH7803_0515 SynWH7803_0516 rpsA   FALSE 0.101 105.000 0.025 NA   NA
 3341080 3341081 SynWH7803_0516 SynWH7803_0517   psbT FALSE 0.036 153.000 0.028 NA   NA
 3341081 3341082 SynWH7803_0517 SynWH7803_0518 psbT psbB TRUE 0.878 22.000 0.651 0.084   NA
 3341083 3341084 SynWH7803_0519 SynWH7803_0520   psbM TRUE 0.758 59.000 0.472 1.000   NA
 3341086 3341087 SynWH7803_0522 SynWH7803_0523   smf FALSE 0.311 12.000 0.012 NA   NA
 3341087 3341088 SynWH7803_0523 SynWH7803_0524 smf hemK TRUE 0.587 10.000 0.011 1.000 N NA
 3341088 3341089 SynWH7803_0524 SynWH7803_0525 hemK   TRUE 0.903 21.000 0.444 NA Y NA
 3341089 3341090 SynWH7803_0525 SynWH7803_0526     FALSE 0.421 5.000 0.059 NA   NA
 3341091 3341092 RNA_15 SynWH7803_0527     FALSE 0.272 -9.000 0.000 NA   NA
 3341092 3341093 SynWH7803_0527 SynWH7803_0528   minE FALSE 0.436 36.000 0.005 NA N NA
 3341093 3341094 SynWH7803_0528 SynWH7803_0529 minE minD TRUE 0.910 6.000 0.347 NA Y NA
 3341094 3341095 SynWH7803_0529 SynWH7803_0530 minD minC TRUE 0.904 34.000 0.368 1.000 Y NA
 3341095 3341096 SynWH7803_0530 SynWH7803_0531 minC   FALSE 0.524 10.000 0.038 1.000   NA
 3341096 3341097 SynWH7803_0531 SynWH7803_0532   ctp TRUE 0.607 0.000 0.071 1.000   NA
 3341098 3341099 SynWH7803_0533 SynWH7803_0534 petB petD TRUE 0.800 75.000 0.471 0.084   NA
 3341099 3341100 SynWH7803_0534 SynWH7803_0535 petD arsB FALSE 0.024 182.000 0.000 1.000   NA
 3341102 3341103 RNA_16 RNA_17     FALSE 0.010 176.000 0.000 NA   NA
 3341103 3341104 RNA_17 RNA_18     FALSE 0.184 10.000 0.000 NA   NA
 3341104 3341105 RNA_18 RNA_19     FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 3341105 3341106 RNA_19 RNA_20     FALSE 0.030 114.000 0.000 NA   NA
 3341107 3341108 SynWH7803_0537 SynWH7803_0538 masA   TRUE 0.795 -3.000 0.174 1.000 N NA
 3341108 3341109 SynWH7803_0538 SynWH7803_0539   mutM TRUE 0.643 4.000 0.010 1.000 N NA
 3341109 3341110 SynWH7803_0539 SynWH7803_0540 mutM psaE FALSE 0.559 6.000 0.040 1.000   NA
 3341111 3341112 SynWH7803_0541 SynWH7803_0542   recQ FALSE 0.566 43.000 0.273 NA   NA
 3341113 3341114 SynWH7803_0543 SynWH7803_0544     TRUE 0.704 79.000 0.571 1.000   NA
 3341116 3341117 SynWH7803_0546 SynWH7803_0547   glpK TRUE 0.973 -7.000 0.370 0.001 Y NA
 3341119 3341120 RNA_21 RNA_22     FALSE 0.180 11.000 0.000 NA   NA
 3341121 3341122 SynWH7803_0549 SynWH7803_0550 aroQ miaE TRUE 0.772 -3.000 0.039 1.000 N NA
 3341122 3341123 SynWH7803_0550 SynWH7803_0551 miaE   FALSE 0.003 570.000 0.000 NA   NA
 3341124 3341125 SynWH7803_0552 SynWH7803_0553     FALSE 0.162 34.000 0.000 NA   NA
 3341125 3341126 SynWH7803_0553 SynWH7803_0554     FALSE 0.166 50.000 0.000 NA   NA
 3341126 3341127 SynWH7803_0554 SynWH7803_0555     FALSE 0.050 97.000 0.000 NA   NA
 3341127 3341128 SynWH7803_0555 SynWH7803_0556     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3341128 3341129 SynWH7803_0556 SynWH7803_0557     TRUE 0.950 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 3341129 3341130 SynWH7803_0557 SynWH7803_0558     FALSE 0.400 6.000 0.000 1.000   NA
 3341133 3341134 SynWH7803_0561 SynWH7803_0562 cobI   FALSE 0.289 27.000 0.015 NA   NA
 3341135 3341136 SynWH7803_0563 SynWH7803_0564   dus TRUE 0.729 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3341136 3341137 SynWH7803_0564 SynWH7803_0565 dus   FALSE 0.409 52.000 0.004 1.000   NA
 3341140 3341141 SynWH7803_0568 SynWH7803_0569 engA cbiQ FALSE 0.546 6.000 0.029 1.000   NA
 3341141 3341142 SynWH7803_0569 SynWH7803_0570 cbiQ   TRUE 0.709 18.000 0.447 NA   NA
 3341142 3341143 SynWH7803_0570 SynWH7803_0571     FALSE 0.326 23.000 0.065 NA   NA
 3341143 3341144 SynWH7803_0571 SynWH7803_0572     FALSE 0.349 77.000 0.194 NA   NA
 3341144 3341145 SynWH7803_0572 SynWH7803_0573   proC FALSE 0.532 10.000 0.224 NA   NA
 3341146 3341147 SynWH7803_0574 SynWH7803_0575     TRUE 0.652 28.000 0.216 1.000 N NA
 3341147 3341148 SynWH7803_0575 SynWH7803_0576   recO TRUE 0.592 10.000 0.013 1.000 N NA
 3341148 3341149 SynWH7803_0576 SynWH7803_0577 recO deoC TRUE 0.744 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3341149 3341150 SynWH7803_0577 SynWH7803_0578 deoC lrtA FALSE 0.512 35.000 0.039 NA N NA
 3341151 3341152 SynWH7803_0579 SynWH7803_0580 lipB fadD TRUE 0.578 29.000 0.029 1.000 N NA
 3341152 3341153 SynWH7803_0580 SynWH7803_0581 fadD   TRUE 0.610 72.000 0.388 NA   NA
 3341153 3341154 SynWH7803_0581 SynWH7803_0582   pdhC FALSE 0.390 69.000 0.176 NA   NA
 3341154 3341155 SynWH7803_0582 SynWH7803_0583 pdhC   FALSE 0.542 71.000 0.048 1.000 N NA
 3341155 3341156 SynWH7803_0583 SynWH7803_0584   queA FALSE 0.544 37.000 0.007 1.000 N NA
 3341157 3341158 SynWH7803_0585 SynWH7803_0586 cysK metB TRUE 0.848 80.000 0.095 0.017 Y NA
 3341158 3341159 SynWH7803_0586 SynWH7803_0587 metB   TRUE 0.970 -3.000 0.250 0.001 Y NA
 3341164 3341165 SynWH7803_0592 SynWH7803_0593     FALSE 0.341 22.000 0.025 NA   NA
 3341165 3341166 SynWH7803_0593 SynWH7803_0594   murE FALSE 0.349 27.000 0.049 NA   NA
 3341167 3341168 SynWH7803_0595 SynWH7803_0596     FALSE 0.444 55.000 0.016 1.000   NA
 3341168 3341169 SynWH7803_0596 SynWH7803_0597     FALSE 0.162 34.000 0.000 NA   NA
 3341171 3341172 SynWH7803_0599 SynWH7803_0600     TRUE 0.688 -3.000 0.222 NA   NA
 3341172 3341173 SynWH7803_0600 SynWH7803_0601     FALSE 0.167 46.000 0.000 NA   NA
 3341175 3341176 SynWH7803_0603 SynWH7803_0604     FALSE 0.190 85.000 0.100 NA   NA
 3341180 3341181 SynWH7803_0608 SynWH7803_0609   hemC FALSE 0.537 3.000 0.002 NA N NA
 3341185 3341186 SynWH7803_0613 SynWH7803_0614   argB FALSE 0.430 4.000 0.023 NA   NA
 3341186 3341187 SynWH7803_0614 SynWH7803_0615 argB   FALSE 0.495 -13.000 0.027 NA   NA
 3341191 3341192 SynWH7803_0619 SynWH7803_0620   purA FALSE 0.524 71.000 0.021 1.000 N NA
 3341192 3341193 SynWH7803_0620 SynWH7803_0621 purA psb27 FALSE 0.077 113.000 0.022 NA   NA
 3341193 3341194 SynWH7803_0621 SynWH7803_0622 psb27 proS FALSE 0.345 45.000 0.023 NA   NA
 3341195 3341196 SynWH7803_0623 SynWH7803_0624   ppa FALSE 0.005 288.000 0.000 NA   NA
 3341196 3341197 SynWH7803_0624 SynWH7803_0625 ppa   TRUE 0.621 94.000 0.055 1.000 Y NA
 3341197 3341198 SynWH7803_0625 SynWH7803_0626     TRUE 0.705 62.000 0.006 0.066 N NA
 3341201 3341202 SynWH7803_0629 SynWH7803_0630 pyrC gmpB FALSE 0.566 19.000 0.017 1.000 N NA
 3341203 3341204 SynWH7803_0631 SynWH7803_0632     FALSE 0.342 84.000 0.250 NA   NA
 3341204 3341205 SynWH7803_0632 SynWH7803_0633   ftsI FALSE 0.454 4.000 0.033 NA   NA
 3341205 3341206 SynWH7803_0633 SynWH7803_0634 ftsI tal FALSE 0.322 92.000 0.131 1.000 N NA
 3341206 3341207 SynWH7803_0634 SynWH7803_0635 tal   TRUE 0.645 68.000 0.400 NA   NA
 3341207 3341208 SynWH7803_0635 SynWH7803_0636   phr FALSE 0.371 49.000 0.045 NA   NA
 3341209 3341210 SynWH7803_0637 SynWH7803_0638   frr TRUE 0.757 -3.000 0.022 1.000 N NA
 3341210 3341211 SynWH7803_0638 SynWH7803_0639 frr pyrH TRUE 0.869 9.000 0.626 1.000 N NA
 3341213 3341214 SynWH7803_0641 SynWH7803_0642 cobO   TRUE 0.926 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 3341214 3341215 SynWH7803_0642 SynWH7803_0643     TRUE 0.717 15.000 0.367 1.000   NA
 3341216 3341217 SynWH7803_0644 SynWH7803_0645 hemH ilvB TRUE 0.727 83.000 0.031 1.000 Y NA
 3341217 3341218 SynWH7803_0645 SynWH7803_0646 ilvB   TRUE 0.629 0.000 0.050 1.000   NA
 3341218 3341219 SynWH7803_0646 SynWH7803_0647     TRUE 0.646 2.000 0.250 NA   NA
 3341219 3341220 SynWH7803_0647 SynWH7803_0648     TRUE 0.678 35.000 0.400 NA   NA
 3341220 3341221 SynWH7803_0648 SynWH7803_0649     FALSE 0.295 35.000 0.013 NA   NA
 3341222 3341223 SynWH7803_0650 SynWH7803_0651     FALSE 0.431 3.000 0.020 NA   NA
 3341223 3341224 SynWH7803_0651 SynWH7803_0652   rpsA TRUE 0.872 -3.000 0.513 NA   NA
 3341225 3341226 SynWH7803_0653 SynWH7803_0654     TRUE 0.765 50.000 0.465 1.000   NA
 3341226 3341227 SynWH7803_0654 SynWH7803_0655     FALSE 0.413 139.000 0.659 0.041   NA
 3341227 3341228 SynWH7803_0655 SynWH7803_0656   accA FALSE 0.481 21.000 0.033 1.000   NA
 3341228 3341229 SynWH7803_0656 SynWH7803_0657 accA   FALSE 0.474 25.000 0.033 1.000   NA
 3341229 3341230 SynWH7803_0657 SynWH7803_0658   folE TRUE 0.711 13.000 0.348 1.000   NA
 3341231 3341232 SynWH7803_0659 SynWH7803_0660   trpF FALSE 0.286 13.000 0.007 NA   NA
 3341236 3341237 SynWH7803_0664 SynWH7803_0665     FALSE 0.283 106.000 0.375 NA   NA
 3341237 3341238 SynWH7803_0665 SynWH7803_0666     FALSE 0.533 -3.000 0.062 NA   NA
 3341239 3341240 SynWH7803_0667 SynWH7803_0668 psaM   TRUE 0.667 22.000 0.395 NA   NA
 3341240 3341241 SynWH7803_0668 SynWH7803_0669   por FALSE 0.520 69.000 0.274 NA   NA
 3341242 3341243 SynWH7803_0670 SynWH7803_0671 chlL chlB FALSE 0.260 152.000 0.226 0.002 N NA
 3341243 3341244 SynWH7803_0671 SynWH7803_0672 chlB chlN TRUE 0.973 5.000 0.591 0.002 Y NA
 3341249 3341250 SynWH7803_0677 SynWH7803_0678 csoS1/ccmK1 rbcL TRUE 0.672 72.000 0.373 NA N NA
 3341250 3341251 SynWH7803_0678 SynWH7803_0679 rbcL   TRUE 0.877 60.000 0.392 0.001 N NA
 3341251 3341252 SynWH7803_0679 SynWH7803_0680   csoS2 FALSE 0.373 102.000 0.474 NA   NA
 3341252 3341253 SynWH7803_0680 SynWH7803_0681 csoS2 csoS3 TRUE 0.861 8.000 0.925 NA   NA
 3341253 3341254 SynWH7803_0681 SynWH7803_0682 csoS3   TRUE 0.887 3.000 0.925 NA   NA
 3341254 3341255 SynWH7803_0682 SynWH7803_0683     TRUE 0.966 0.000 0.868 NA Y NA
 3341255 3341256 SynWH7803_0683 SynWH7803_0684   csoS1/ccmK2 FALSE 0.092 134.000 0.235 NA   NA
 3341256 3341257 SynWH7803_0684 SynWH7803_0685 csoS1/ccmK2 ndhF FALSE 0.364 82.000 0.250 NA   NA
 3341257 3341258 SynWH7803_0685 SynWH7803_0686 ndhF ndhD TRUE 0.975 8.000 0.875 0.004 Y NA
 3341258 3341259 SynWH7803_0686 SynWH7803_0687 ndhD chpX TRUE 0.889 -3.000 0.625 NA   NA
 3341259 3341260 SynWH7803_0687 SynWH7803_0688 chpX   FALSE 0.501 28.000 0.241 NA   NA
 3341260 3341261 SynWH7803_0688 SynWH7803_0689   cbbX FALSE 0.563 -16.000 0.170 NA   NA
 3341262 3341263 SynWH7803_0690 SynWH7803_0691     TRUE 0.683 43.000 0.400 NA   NA
 3341263 3341264 SynWH7803_0691 SynWH7803_0692     FALSE 0.104 107.000 0.041 NA   NA
 3341267 3341268 SynWH7803_0695 SynWH7803_0696 hisG   TRUE 0.714 0.000 0.021 1.000 N NA
 3341271 3341272 SynWH7803_0699 SynWH7803_0700     TRUE 0.582 -3.000 0.135 NA   NA
 3341272 3341273 SynWH7803_0700 SynWH7803_0701     FALSE 0.545 -3.000 0.057 NA   NA
 3341275 3341276 SynWH7803_0703 SynWH7803_0704     FALSE 0.098 135.000 0.250 NA   NA
 3341276 3341277 SynWH7803_0704 SynWH7803_0705     TRUE 0.671 7.000 0.333 NA   NA
 3341278 3341279 SynWH7803_0706 SynWH7803_0707 gor   FALSE 0.318 88.000 0.006 1.000 N NA
 3341279 3341280 SynWH7803_0707 SynWH7803_0708     FALSE 0.009 183.000 0.000 NA   NA
 3341280 3341281 SynWH7803_0708 SynWH7803_0709     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341281 3341282 SynWH7803_0709 SynWH7803_0710     TRUE 0.899 -37.000 1.000 NA   NA
 3341282 3341283 SynWH7803_0710 SynWH7803_0711     TRUE 0.748 66.000 0.600 NA   NA
 3341284 3341285 SynWH7803_0712 SynWH7803_0713     TRUE 0.908 40.000 0.714 0.064 N NA
 3341285 3341286 SynWH7803_0713 SynWH7803_0714     TRUE 0.975 4.000 0.625 0.003 Y NA
 3341286 3341287 SynWH7803_0714 SynWH7803_0715     TRUE 0.977 6.000 0.833 0.003 Y NA
 3341287 3341288 SynWH7803_0715 SynWH7803_0716     TRUE 0.920 -3.000 0.917 NA   NA
 3341288 3341289 SynWH7803_0716 SynWH7803_0717     TRUE 0.892 -3.000 0.647 NA   NA
 3341289 3341290 SynWH7803_0717 SynWH7803_0718     FALSE 0.236 115.000 0.318 1.000   NA
 3341291 3341292 SynWH7803_0719 SynWH7803_0720   pyrC TRUE 0.657 4.000 0.018 1.000 N NA
 3341292 3341293 SynWH7803_0720 SynWH7803_0721 pyrC   FALSE 0.160 32.000 0.000 NA   NA
 3341293 3341294 SynWH7803_0721 SynWH7803_0722     FALSE 0.128 90.000 0.012 NA   NA
 3341294 3341295 SynWH7803_0722 SynWH7803_0723     FALSE 0.167 17.000 0.000 NA   NA
 3341295 3341296 SynWH7803_0723 SynWH7803_0724     TRUE 0.839 5.000 0.667 NA   NA
 3341298 3341299 SynWH7803_0726 SynWH7803_0727     FALSE 0.027 119.000 0.000 NA   NA
 3341300 3341301 SynWH7803_0728 SynWH7803_0729     FALSE 0.387 89.000 0.267 1.000   NA
 3341301 3341302 SynWH7803_0729 RNA_23     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 3341303 3341304 SynWH7803_0730 SynWH7803_0731 ictA   TRUE 0.835 20.000 0.925 NA   NA
 3341304 3341305 SynWH7803_0731 SynWH7803_0732   trpA TRUE 0.651 32.000 0.375 NA   NA
 3341308 3341309 SynWH7803_0735 SynWH7803_0736 petJ   FALSE 0.523 24.000 0.250 NA   NA
 3341311 3341312 SynWH7803_0738 SynWH7803_0739     FALSE 0.441 6.000 0.126 NA   NA
 3341312 3341313 SynWH7803_0739 SynWH7803_0740     TRUE 0.796 42.000 0.688 NA   NA
 3341313 3341314 SynWH7803_0740 SynWH7803_0741     TRUE 0.899 -3.000 0.714 NA   NA
 3341314 3341315 SynWH7803_0741 SynWH7803_0742   rpoD TRUE 0.591 95.000 0.905 NA   NA
 3341316 3341317 SynWH7803_0743 SynWH7803_0744     FALSE 0.389 13.000 0.123 NA   NA
 3341317 3341318 SynWH7803_0744 SynWH7803_0745     FALSE 0.048 131.000 0.071 NA   NA
 3341321 3341322 SynWH7803_0748 SynWH7803_0749 clpB   FALSE 0.458 -40.000 0.000 1.000   NA
 3341324 3341325 SynWH7803_0751 SynWH7803_0752   petJ TRUE 0.664 -3.000 0.200 NA   NA
 3341325 3341326 SynWH7803_0752 SynWH7803_0753 petJ petE FALSE 0.501 134.000 0.043 0.017 Y NA
 3341326 3341327 SynWH7803_0753 SynWH7803_0754 petE   TRUE 0.786 35.000 0.404 1.000 N NA
 3341327 3341328 SynWH7803_0754 SynWH7803_0755   hemE TRUE 0.620 11.000 0.032 1.000 N NA
 3341328 3341329 SynWH7803_0755 SynWH7803_0756 hemE   FALSE 0.162 120.000 0.024 1.000 N NA
 3341329 3341330 SynWH7803_0756 SynWH7803_0757     FALSE 0.379 79.000 0.146 1.000   NA
 3341330 3341331 SynWH7803_0757 SynWH7803_0758     TRUE 0.611 15.000 0.240 1.000   NA
 3341331 3341332 SynWH7803_0758 SynWH7803_0759     TRUE 0.886 -10.000 0.760 NA   NA
 3341332 3341333 SynWH7803_0759 SynWH7803_0760     FALSE 0.068 121.000 0.105 NA   NA
 3341333 3341334 SynWH7803_0760 SynWH7803_0761     FALSE 0.562 -3.000 0.049 NA   NA
 3341335 3341336 SynWH7803_0762 SynWH7803_0763     FALSE 0.430 4.000 0.023 NA   NA
 3341336 3341337 SynWH7803_0763 SynWH7803_0764   proA FALSE 0.501 71.000 0.012 1.000 N NA
 3341337 3341338 SynWH7803_0764 SynWH7803_0765 proA folB TRUE 0.717 0.000 0.023 1.000 N NA
 3341338 3341339 SynWH7803_0765 SynWH7803_0766 folB   TRUE 0.603 2.000 0.047 1.000   NA
 3341339 3341340 SynWH7803_0766 SynWH7803_0767     FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3341340 3341341 SynWH7803_0767 SynWH7803_0768     FALSE 0.459 8.000 0.162 NA   NA
 3341341 3341342 SynWH7803_0768 SynWH7803_0769     TRUE 0.893 0.000 0.833 NA   NA
 3341343 3341344 SynWH7803_0770 SynWH7803_0771   prlC FALSE 0.357 21.000 0.111 NA   NA
 3341344 3341345 SynWH7803_0771 SynWH7803_0772 prlC ndhD TRUE 0.833 7.000 0.444 1.000 N NA
 3341345 3341346 SynWH7803_0772 SynWH7803_0773 ndhD thrB TRUE 0.591 57.000 0.031 1.000 N NA
 3341346 3341347 SynWH7803_0773 SynWH7803_0774 thrB glk TRUE 0.588 15.000 0.020 1.000 N NA
 3341347 3341348 SynWH7803_0774 SynWH7803_0775 glk   FALSE 0.178 90.000 0.132 NA   NA
 3341348 3341349 SynWH7803_0775 SynWH7803_0776   thrS FALSE 0.510 0.000 0.048 NA   NA
 3341350 3341351 SynWH7803_0777 SynWH7803_0778     FALSE 0.550 -3.000 0.103 NA   NA
 3341352 3341353 SynWH7803_0779 SynWH7803_0780   trpS FALSE 0.021 316.000 0.000 1.000 N NA
 3341353 3341354 SynWH7803_0780 SynWH7803_0781 trpS   FALSE 0.457 4.000 0.034 NA   NA
 3341354 3341355 SynWH7803_0781 SynWH7803_0782     FALSE 0.098 105.000 0.094 NA   NA
 3341356 3341357 SynWH7803_0783 SynWH7803_0784   psbA FALSE 0.132 165.000 0.474 NA   NA
 3341359 3341360 SynWH7803_0786 SynWH7803_0787     FALSE 0.245 -46.000 0.000 NA   NA
 3341360 3341361 SynWH7803_0787 SynWH7803_0788     FALSE 0.481 0.000 0.000 1.000   NA
 3341363 3341364 SynWH7803_0790 SynWH7803_0791 psbA   FALSE 0.074 114.000 0.000 1.000   NA
 3341365 3341366 SynWH7803_0792 SynWH7803_0793 katG   FALSE 0.037 107.000 0.000 NA   NA
 3341366 3341367 SynWH7803_0793 SynWH7803_0794   rbsK FALSE 0.157 26.000 0.000 NA   NA
 3341367 3341368 SynWH7803_0794 SynWH7803_0795 rbsK   FALSE 0.409 5.000 0.065 NA   NA
 3341368 3341369 SynWH7803_0795 SynWH7803_0796     FALSE 0.301 80.000 0.176 NA   NA
 3341369 3341370 SynWH7803_0796 SynWH7803_0797   hli FALSE 0.508 55.000 0.235 NA   NA
 3341370 3341371 SynWH7803_0797 SynWH7803_0798 hli nth FALSE 0.254 58.000 0.004 NA   NA
 3341375 3341376 SynWH7803_0802 SynWH7803_0803     FALSE 0.547 -3.000 0.026 NA   NA
 3341377 3341378 SynWH7803_0804 SynWH7803_0805     FALSE 0.274 74.000 0.000 1.000   NA
 3341380 3341381 SynWH7803_0807 SynWH7803_0808     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341381 3341382 SynWH7803_0808 SynWH7803_0809     FALSE 0.174 86.000 0.077 NA   NA
 3341383 3341384 SynWH7803_0810 SynWH7803_0811     FALSE 0.521 25.000 0.250 NA   NA
 3341385 3341386 SynWH7803_0812 SynWH7803_0813     FALSE 0.419 24.000 0.174 NA   NA
 3341388 3341389 SynWH7803_0815 SynWH7803_0816     FALSE 0.359 36.000 0.032 NA   NA
 3341389 3341390 SynWH7803_0816 SynWH7803_0817     FALSE 0.488 -10.000 0.022 NA   NA
 3341392 3341393 SynWH7803_0819 SynWH7803_0820     FALSE 0.322 67.000 0.054 NA   NA
 3341393 3341394 SynWH7803_0820 SynWH7803_0821     FALSE 0.493 49.000 0.038 1.000   NA
 3341394 3341395 SynWH7803_0821 SynWH7803_0822     FALSE 0.481 0.000 0.000 1.000   NA
 3341397 3341398 SynWH7803_0824 SynWH7803_0825     FALSE 0.005 278.000 0.000 NA   NA
 3341398 3341399 SynWH7803_0825 SynWH7803_0826     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 3341401 3341402 SynWH7803_0828 SynWH7803_0829     FALSE 0.306 69.000 0.024 NA   NA
 3341403 3341404 SynWH7803_0830 SynWH7803_0831     FALSE 0.011 167.000 0.000 NA   NA
 3341404 3341405 SynWH7803_0831 SynWH7803_0832     FALSE 0.458 9.000 0.167 NA   NA
 3341405 3341406 SynWH7803_0832 SynWH7803_0833     FALSE 0.511 4.000 0.167 NA   NA
 3341407 3341408 SynWH7803_0834 SynWH7803_0835     FALSE 0.365 15.000 0.105 NA   NA
 3341408 3341409 SynWH7803_0835 SynWH7803_0836     TRUE 0.867 -3.000 0.500 NA   NA
 3341409 3341410 SynWH7803_0836 SynWH7803_0837     FALSE 0.045 99.000 0.000 NA   NA
 3341412 3341413 SynWH7803_0839 SynWH7803_0840     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 3341418 3341419 SynWH7803_0845 SynWH7803_0846 mtnA   FALSE 0.065 90.000 0.000 NA   NA
 3341419 3341420 SynWH7803_0846 SynWH7803_0847     TRUE 0.757 -3.000 0.286 NA   NA
 3341421 3341422 SynWH7803_0848 SynWH7803_0849     FALSE 0.453 27.000 0.200 NA   NA
 3341423 3341424 SynWH7803_0850 SynWH7803_0851     FALSE 0.167 44.000 0.000 NA   NA
 3341424 3341425 SynWH7803_0851 SynWH7803_0852     FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3341427 3341428 SynWH7803_0854 SynWH7803_0855     TRUE 0.618 -3.000 0.167 NA   NA
 3341429 3341430 SynWH7803_0856 SynWH7803_0857     FALSE 0.475 17.000 0.099 1.000   NA
 3341431 3341432 SynWH7803_0858 SynWH7803_0859     FALSE 0.167 17.000 0.000 NA   NA
 3341437 3341438 SynWH7803_0864 SynWH7803_0865     FALSE 0.184 10.000 0.000 NA   NA
 3341440 3341441 SynWH7803_0867 SynWH7803_0868     FALSE 0.493 11.000 0.061 1.000   NA
 3341441 3341442 SynWH7803_0868 SynWH7803_0869   pdc FALSE 0.476 22.000 0.111 1.000   NA
 3341442 3341443 SynWH7803_0869 SynWH7803_0870 pdc   FALSE 0.017 141.000 0.000 NA   NA
 3341444 3341445 SynWH7803_0871 SynWH7803_0872     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341449 3341450 SynWH7803_0876 SynWH7803_0877   adhC FALSE 0.454 24.000 0.091 1.000   NA
 3341453 3341454 SynWH7803_0880 SynWH7803_0881     FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3341454 3341455 SynWH7803_0881 SynWH7803_0882     FALSE 0.024 123.000 0.000 NA   NA
 3341460 3341461 SynWH7803_0887 SynWH7803_0888     TRUE 0.819 57.000 0.833 NA   NA
 3341463 3341464 SynWH7803_0890 SynWH7803_0891     TRUE 0.624 17.000 0.333 NA   NA
 3341467 3341468 SynWH7803_0894 SynWH7803_0895     FALSE 0.068 89.000 0.000 NA   NA
 3341469 3341470 SynWH7803_0896 SynWH7803_0897     FALSE 0.005 286.000 0.000 NA   NA
 3341470 3341471 SynWH7803_0897 SynWH7803_0898     FALSE 0.144 68.000 0.000 NA   NA
 3341474 3341475 SynWH7803_0901 SynWH7803_0902     FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 3341476 3341477 SynWH7803_0903 SynWH7803_0904     TRUE 0.777 16.000 0.600 NA   NA
 3341477 3341478 SynWH7803_0904 SynWH7803_0905     FALSE 0.003 1430.000 0.000 NA   NA
 3341478 3341479 SynWH7803_0905 SynWH7803_0906     FALSE 0.036 108.000 0.000 NA   NA
 3341479 3341480 SynWH7803_0906 SynWH7803_0907     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 3341480 3341481 SynWH7803_0907 SynWH7803_0908     FALSE 0.258 -15.000 0.000 NA   NA
 3341481 3341482 SynWH7803_0908 SynWH7803_0909     FALSE 0.005 271.000 0.000 NA   NA
 3341482 3341483 SynWH7803_0909 SynWH7803_0910     FALSE 0.180 11.000 0.000 NA   NA
 3341483 3341484 SynWH7803_0910 SynWH7803_0911     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341484 3341485 SynWH7803_0911 SynWH7803_0912     FALSE 0.065 90.000 0.000 NA   NA
 3341490 3341491 SynWH7803_0917 SynWH7803_0918     FALSE 0.123 75.000 0.000 NA   NA
 3341491 3341492 SynWH7803_0918 SynWH7803_0919     FALSE 0.119 144.000 0.000 0.063   NA
 3341492 3341493 SynWH7803_0919 SynWH7803_0920     TRUE 0.679 56.000 0.400 NA   NA
 3341493 3341494 SynWH7803_0920 SynWH7803_0921     FALSE 0.240 2.000 0.000 NA   NA
 3341494 3341495 SynWH7803_0921 SynWH7803_0922     FALSE 0.003 624.000 0.000 NA   NA
 3341495 3341496 SynWH7803_0922 SynWH7803_0923     FALSE 0.521 25.000 0.250 NA   NA
 3341497 3341498 SynWH7803_0924 SynWH7803_0925     FALSE 0.016 144.000 0.000 NA   NA
 3341498 3341499 SynWH7803_0925 SynWH7803_0926     FALSE 0.156 60.000 0.000 NA   NA
 3341499 3341500 SynWH7803_0926 SynWH7803_0927     FALSE 0.004 356.000 0.000 NA   NA
 3341500 3341501 SynWH7803_0927 SynWH7803_0928     FALSE 0.494 46.000 0.219 NA   NA
 3341501 3341502 SynWH7803_0928 SynWH7803_0929     TRUE 0.694 -10.000 0.188 1.000   NA
 3341502 3341503 SynWH7803_0929 SynWH7803_0930     FALSE 0.100 104.000 0.000 1.000   NA
 3341503 3341504 SynWH7803_0930 SynWH7803_0931   hli FALSE 0.333 21.000 0.000 1.000   NA
 3341506 3341507 SynWH7803_0933 SynWH7803_0934     FALSE 0.011 166.000 0.000 NA   NA
 3341508 3341509 SynWH7803_0935 SynWH7803_0936     FALSE 0.265 -12.000 0.000 NA   NA
 3341510 3341511 SynWH7803_0937 SynWH7803_0938 hli   TRUE 0.663 62.000 0.333 1.000   NA
 3341514 3341515 SynWH7803_0941 SynWH7803_0942     FALSE 0.333 51.000 0.020 NA   NA
 3341515 3341516 SynWH7803_0942 SynWH7803_0943     FALSE 0.321 31.000 0.020 NA   NA
 3341516 3341517 SynWH7803_0943 SynWH7803_0944     FALSE 0.167 46.000 0.000 NA   NA
 3341519 3341520 SynWH7803_0946 SynWH7803_0947     FALSE 0.024 200.000 0.043 NA   NA
 3341520 3341521 SynWH7803_0947 SynWH7803_0948     FALSE 0.027 119.000 0.000 NA   NA
 3341521 3341522 SynWH7803_0948 SynWH7803_0949   dcd FALSE 0.019 351.000 0.000 1.000 N NA
 3341523 3341524 SynWH7803_0950 SynWH7803_0951   sodC FALSE 0.537 4.000 0.016 1.000   NA
 3341525 3341526 SynWH7803_0952 SynWH7803_0953     FALSE 0.317 14.000 0.015 NA   NA
 3341528 3341529 SynWH7803_0955 SynWH7803_0956     FALSE 0.130 73.000 0.000 NA   NA
 3341530 3341531 SynWH7803_0957 SynWH7803_0958     FALSE 0.447 -13.000 0.017 NA   NA
 3341531 3341532 SynWH7803_0958 SynWH7803_0959     TRUE 0.600 -3.000 0.150 NA   NA
 3341533 3341534 SynWH7803_0960 SynWH7803_0961     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 3341534 3341535 SynWH7803_0961 SynWH7803_0962     FALSE 0.538 44.000 0.250 NA   NA
 3341536 3341537 SynWH7803_0963 SynWH7803_0964     FALSE 0.240 2.000 0.000 NA   NA
 3341537 3341538 SynWH7803_0964 SynWH7803_0965     FALSE 0.297 89.000 0.250 NA   NA
 3341538 3341539 SynWH7803_0965 SynWH7803_0966     FALSE 0.058 92.000 0.000 NA   NA
 3341539 3341540 SynWH7803_0966 SynWH7803_0967     TRUE 0.864 -3.000 0.489 NA   NA
 3341540 3341541 SynWH7803_0967 SynWH7803_0968     TRUE 0.865 -10.000 0.605 NA   NA
 3341541 3341542 SynWH7803_0968 SynWH7803_0969     TRUE 0.886 -3.000 0.605 NA   NA
 3341542 3341543 SynWH7803_0969 SynWH7803_0970     TRUE 0.919 -3.000 0.913 NA   NA
 3341543 3341544 SynWH7803_0970 SynWH7803_0971     TRUE 0.832 -3.000 0.404 NA   NA
 3341544 3341545 SynWH7803_0971 SynWH7803_0972     TRUE 0.964 0.000 0.306 0.009 Y NA
 3341545 3341546 SynWH7803_0972 SynWH7803_0973     FALSE 0.243 1.000 0.000 NA   NA
 3341547 3341548 SynWH7803_0974 SynWH7803_0975     FALSE 0.157 28.000 0.000 NA   NA
 3341548 3341549 SynWH7803_0975 SynWH7803_0976     FALSE 0.003 655.000 0.000 NA   NA
 3341549 3341550 SynWH7803_0976 SynWH7803_0977     FALSE 0.205 85.000 0.045 NA   NA
 3341550 3341551 SynWH7803_0977 SynWH7803_0978     FALSE 0.166 41.000 0.000 NA   NA
 3341551 3341552 SynWH7803_0978 SynWH7803_0979     TRUE 0.977 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 3341552 3341553 SynWH7803_0979 SynWH7803_0980     TRUE 0.954 11.000 0.857 1.000 Y NA
 3341555 3341556 SynWH7803_0982 SynWH7803_0983     FALSE 0.091 110.000 0.054 NA   NA
 3341556 3341557 SynWH7803_0983 SynWH7803_0984   petJ FALSE 0.352 91.000 0.333 NA   NA
 3341557 3341558 SynWH7803_0984 SynWH7803_0985 petJ   FALSE 0.352 91.000 0.333 NA   NA
 3341558 3341559 SynWH7803_0985 SynWH7803_0986     FALSE 0.433 16.000 0.172 NA   NA
 3341559 3341560 SynWH7803_0986 SynWH7803_0987     TRUE 0.626 -3.000 0.172 NA   NA
 3341560 3341561 SynWH7803_0987 SynWH7803_0988     FALSE 0.358 40.000 0.107 NA   NA
 3341561 3341562 SynWH7803_0988 SynWH7803_0989   znuC TRUE 0.941 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 3341562 3341563 SynWH7803_0989 SynWH7803_0990 znuC   FALSE 0.459 118.000 0.148 1.000 Y NA
 3341566 3341567 SynWH7803_0993 SynWH7803_0994   hupE FALSE 0.079 121.000 0.143 NA   NA
 3341567 3341568 SynWH7803_0994 SynWH7803_0995 hupE   FALSE 0.017 141.000 0.000 NA   NA
 3341569 3341570 SynWH7803_0996 SynWH7803_0997     FALSE 0.303 45.000 0.014 NA   NA
 3341571 3341572 SynWH7803_0998 SynWH7803_0999     TRUE 0.840 23.000 0.022 1.000 Y NA
 3341572 3341573 SynWH7803_0999 SynWH7803_1000     FALSE 0.410 7.000 0.107 NA   NA
 3341574 3341575 SynWH7803_1001 SynWH7803_1002     TRUE 0.849 0.000 0.350 1.000 N NA
 3341575 3341576 SynWH7803_1002 SynWH7803_1003     TRUE 0.717 0.000 0.093 1.000 N NA
 3341576 3341577 SynWH7803_1003 SynWH7803_1004     FALSE 0.302 61.000 0.019 NA   NA
 3341577 3341578 SynWH7803_1004 SynWH7803_1005     TRUE 0.790 18.000 0.667 NA   NA
 3341580 3341581 SynWH7803_1007 SynWH7803_1008     TRUE 0.880 -3.000 0.571 NA   NA
 3341582 3341583 SynWH7803_1009 SynWH7803_1010     TRUE 0.916 -3.000 0.875 NA   NA
 3341583 3341584 SynWH7803_1010 SynWH7803_1011     TRUE 0.754 6.000 0.429 NA   NA
 3341585 3341586 SynWH7803_1012 SynWH7803_1013     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 3341586 3341587 SynWH7803_1013 SynWH7803_1014     FALSE 0.018 137.000 0.000 NA   NA
 3341587 3341588 SynWH7803_1014 SynWH7803_1015     FALSE 0.005 272.000 0.000 NA   NA
 3341588 3341589 SynWH7803_1015 SynWH7803_1016     FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 3341589 3341590 SynWH7803_1016 SynWH7803_1017     FALSE 0.023 125.000 0.000 NA   NA
 3341590 3341591 SynWH7803_1017 SynWH7803_1018     FALSE 0.020 130.000 0.000 NA   NA
 3341592 3341593 SynWH7803_1019 SynWH7803_1020   lepB TRUE 0.707 15.000 0.423 NA   NA
 3341594 3341595 SynWH7803_1021 SynWH7803_1022 menD menB TRUE 0.924 15.000 0.147 0.002 Y NA
 3341595 3341596 SynWH7803_1022 SynWH7803_1023 menB   FALSE 0.354 40.000 0.027 NA   NA
 3341596 3341597 SynWH7803_1023 SynWH7803_1024     FALSE 0.166 49.000 0.000 NA   NA
 3341597 3341598 SynWH7803_1024 SynWH7803_1025     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 3341598 3341599 SynWH7803_1025 SynWH7803_1026   glgA FALSE 0.032 112.000 0.000 NA   NA
 3341599 3341600 SynWH7803_1026 SynWH7803_1027 glgA   FALSE 0.401 7.000 0.055 NA   NA
 3341600 3341601 SynWH7803_1027 SynWH7803_1028   murF TRUE 0.703 -3.000 0.238 NA   NA
 3341602 3341603 SynWH7803_1029 SynWH7803_1030   glmU FALSE 0.016 185.000 0.005 NA   NA
 3341603 3341604 SynWH7803_1030 SynWH7803_1031 glmU   FALSE 0.342 15.000 0.021 NA   NA
 3341604 3341605 SynWH7803_1031 SynWH7803_1032   aroA FALSE 0.435 -25.000 0.017 NA   NA
 3341605 3341606 SynWH7803_1032 SynWH7803_1033 aroA ubiD FALSE 0.515 6.000 0.009 NA N NA
 3341607 3341608 SynWH7803_1034 SynWH7803_1035 comB   FALSE 0.473 32.000 0.051 1.000   NA
 3341608 3341609 SynWH7803_1035 SynWH7803_1036   amiC FALSE 0.522 9.000 0.051 1.000   NA
 3341609 3341610 SynWH7803_1036 SynWH7803_1037 amiC murI TRUE 0.924 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 3341610 3341611 SynWH7803_1037 SynWH7803_1038 murI preA FALSE 0.576 23.000 0.024 1.000 N NA
 3341614 3341615 SynWH7803_1041 SynWH7803_1042     TRUE 0.650 -3.000 0.190 NA   NA
 3341616 3341617 SynWH7803_1043 SynWH7803_1044 dnaQ   FALSE 0.388 71.000 0.183 NA   NA
 3341617 3341618 SynWH7803_1044 SynWH7803_1045   pstSII FALSE 0.301 92.000 0.286 NA   NA
 3341618 3341619 SynWH7803_1045 SynWH7803_1046 pstSII ptrA FALSE 0.187 131.000 0.250 1.000 N NA
 3341619 3341620 SynWH7803_1046 SynWH7803_1047 ptrA   FALSE 0.095 81.000 0.000 NA   NA
 3341620 3341621 SynWH7803_1047 SynWH7803_1048     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341621 3341622 SynWH7803_1048 SynWH7803_1049     FALSE 0.232 3.000 0.000 NA   NA
 3341622 3341623 SynWH7803_1049 SynWH7803_1050     TRUE 0.864 6.000 0.875 NA   NA
 3341623 3341624 SynWH7803_1050 SynWH7803_1051     FALSE 0.566 10.000 0.250 NA   NA
 3341624 3341625 SynWH7803_1051 SynWH7803_1052     TRUE 0.610 -3.000 0.005 1.000   NA
 3341625 3341626 SynWH7803_1052 SynWH7803_1053     FALSE 0.449 2.000 0.000 1.000   NA
 3341627 3341628 RNA_24 SynWH7803_1054     FALSE 0.171 15.000 0.000 NA   NA
 3341628 3341629 SynWH7803_1054 SynWH7803_1055     TRUE 0.595 74.000 0.385 NA   NA
 3341629 3341630 SynWH7803_1055 SynWH7803_1056   msrA FALSE 0.499 -3.000 0.016 NA   NA
 3341630 3341631 SynWH7803_1056 SynWH7803_1057 msrA   FALSE 0.361 25.000 0.038 NA   NA
 3341631 3341632 SynWH7803_1057 SynWH7803_1058     FALSE 0.408 73.000 0.206 NA   NA
 3341633 3341634 SynWH7803_1059 SynWH7803_1060   trpD FALSE 0.031 148.000 0.014 NA   NA
 3341634 3341635 SynWH7803_1060 SynWH7803_1061 trpD carA TRUE 0.843 35.000 0.021 1.000 Y NA
 3341635 3341636 SynWH7803_1061 SynWH7803_1062 carA spoIIAA FALSE 0.120 132.000 0.020 1.000 N NA
 3341636 3341637 SynWH7803_1062 SynWH7803_1063 spoIIAA   TRUE 0.679 -3.000 0.113 1.000   NA
 3341637 3341638 SynWH7803_1063 SynWH7803_1064     TRUE 0.763 12.000 0.150 0.006   NA
 3341638 3341639 SynWH7803_1064 SynWH7803_1065     FALSE 0.263 77.000 0.031 NA   NA
 3341639 3341640 SynWH7803_1065 SynWH7803_1066   gatA FALSE 0.325 59.000 0.022 NA   NA
 3341640 3341641 SynWH7803_1066 SynWH7803_1067 gatA dnaE FALSE 0.522 70.000 0.019 1.000 N NA
 3341642 3341643 SynWH7803_1068 SynWH7803_1069   rpsO FALSE 0.356 27.000 0.037 NA   NA
 3341643 3341644 SynWH7803_1069 SynWH7803_1070 rpsO ruvA TRUE 0.581 55.000 0.021 1.000 N NA
 3341649 3341650 SynWH7803_1075 SynWH7803_1076 arsB   FALSE 0.486 2.000 0.044 NA   NA
 3341650 3341651 SynWH7803_1076 SynWH7803_1077     TRUE 0.840 0.000 0.500 NA   NA
 3341654 3341655 SynWH7803_1080 SynWH7803_1081 umuC umuD TRUE 0.879 6.000 0.625 1.000 N NA
 3341655 3341656 SynWH7803_1081 SynWH7803_1082 umuD   TRUE 0.585 46.000 0.062 1.000 N NA
 3341657 3341658 SynWH7803_1083 SynWH7803_1084     FALSE 0.026 120.000 0.000 NA   NA
 3341659 3341660 SynWH7803_1085 SynWH7803_1086     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341660 3341661 SynWH7803_1086 SynWH7803_1087     FALSE 0.261 -13.000 0.000 NA   NA
 3341661 3341662 SynWH7803_1087 SynWH7803_1088     TRUE 0.632 0.000 0.214 NA   NA
 3341662 3341663 SynWH7803_1088 SynWH7803_1089     FALSE 0.215 151.000 0.667 NA   NA
 3341665 3341666 SynWH7803_1091 SynWH7803_1092     FALSE 0.017 141.000 0.000 NA   NA
 3341666 3341667 SynWH7803_1092 SynWH7803_1093     FALSE 0.006 264.000 0.000 NA   NA
 3341668 3341669 SynWH7803_1094 SynWH7803_1095     TRUE 0.595 4.000 0.229 NA   NA
 3341669 3341670 SynWH7803_1095 SynWH7803_1096     FALSE 0.372 24.000 0.133 NA   NA
 3341670 3341671 SynWH7803_1096 SynWH7803_1097     FALSE 0.408 11.000 0.133 NA   NA
 3341671 3341672 SynWH7803_1097 SynWH7803_1098   rhlE FALSE 0.214 116.000 0.364 NA   NA
 3341673 3341674 SynWH7803_1099 SynWH7803_1100 fmt pmbA FALSE 0.304 28.000 0.018 NA   NA
 3341674 3341675 SynWH7803_1100 SynWH7803_1101 pmbA tldD FALSE 0.501 3.000 0.146 NA   NA
 3341675 3341676 SynWH7803_1101 SynWH7803_1102 tldD acsF FALSE 0.512 0.000 0.034 NA   NA
 3341676 3341677 SynWH7803_1102 SynWH7803_1103 acsF   FALSE 0.378 72.000 0.181 NA   NA
 3341677 3341678 SynWH7803_1103 SynWH7803_1104     TRUE 0.604 60.000 0.333 NA   NA
 3341678 3341679 SynWH7803_1104 SynWH7803_1105     TRUE 0.583 -3.000 0.135 NA   NA
 3341679 3341680 SynWH7803_1105 SynWH7803_1106   vacB TRUE 0.803 -3.000 0.188 1.000 N NA
 3341680 3341681 SynWH7803_1106 SynWH7803_1107 vacB   FALSE 0.258 127.000 0.439 1.000   NA
 3341681 3341682 SynWH7803_1107 SynWH7803_1108     TRUE 0.689 49.000 0.055 0.071   NA
 3341682 3341683 SynWH7803_1108 SynWH7803_1109     FALSE 0.549 -3.000 0.055 NA   NA
 3341683 3341684 SynWH7803_1109 SynWH7803_1110     FALSE 0.017 237.000 0.058 NA   NA
 3341684 3341685 SynWH7803_1110 SynWH7803_1111   recJ TRUE 0.732 -3.000 0.009 1.000 N NA
 3341686 3341687 SynWH7803_1112 SynWH7803_1113     FALSE 0.541 -3.000 0.059 NA   NA
 3341687 3341688 SynWH7803_1113 SynWH7803_1114     TRUE 0.666 -10.000 0.243 NA   NA
 3341690 3341691 SynWH7803_1116 SynWH7803_1117 ftsH   TRUE 0.699 54.000 0.048 0.059   NA
 3341693 3341694 SynWH7803_1119 RNA_25     FALSE 0.166 49.000 0.000 NA   NA
 3341695 3341696 SynWH7803_1120 SynWH7803_1121     FALSE 0.187 110.000 0.011 1.000 N NA
 3341696 3341697 SynWH7803_1121 SynWH7803_1122   cobU TRUE 0.772 -3.000 0.039 1.000 N NA
 3341697 3341698 SynWH7803_1122 SynWH7803_1123 cobU pcxA TRUE 0.630 -13.000 0.035 1.000   NA
 3341698 3341699 SynWH7803_1123 SynWH7803_1124 pcxA   TRUE 0.684 8.000 0.357 NA   NA
 3341699 3341700 SynWH7803_1124 SynWH7803_1125     TRUE 0.632 31.000 0.357 NA   NA
 3341702 3341703 SynWH7803_1127 SynWH7803_1128   metG FALSE 0.454 0.000 0.018 NA   NA
 3341704 3341705 SynWH7803_1129 SynWH7803_1130     TRUE 0.594 0.000 0.185 NA   NA
 3341706 3341707 SynWH7803_1131 SynWH7803_1132 ilvD   FALSE 0.417 54.000 0.165 NA   NA
 3341707 3341708 SynWH7803_1132 SynWH7803_1133   upp FALSE 0.329 25.000 0.023 NA   NA
 3341709 3341710 SynWH7803_1134 SynWH7803_1135   cobW FALSE 0.444 -9.000 0.013 NA   NA
 3341711 3341712 SynWH7803_1136 SynWH7803_1137     TRUE 0.659 39.000 0.375 NA   NA
 3341712 3341713 SynWH7803_1137 SynWH7803_1138     FALSE 0.319 70.000 0.048 NA   NA
 3341716 3341717 SynWH7803_1141 SynWH7803_1142 purS purQ TRUE 0.985 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3341717 3341718 SynWH7803_1142 SynWH7803_1143 purQ   FALSE 0.560 4.000 0.015 NA N NA
 3341718 3341719 SynWH7803_1143 SynWH7803_1144     TRUE 0.623 10.000 0.300 NA   NA
 3341720 3341721 SynWH7803_1145 SynWH7803_1146   mviM FALSE 0.317 87.000 0.169 1.000   NA
 3341721 3341722 SynWH7803_1146 SynWH7803_1147 mviM   FALSE 0.416 33.000 0.169 NA   NA
 3341722 3341723 SynWH7803_1147 SynWH7803_1148   accD FALSE 0.446 0.000 0.016 NA   NA
 3341723 3341724 SynWH7803_1148 SynWH7803_1149 accD   FALSE 0.557 37.000 0.013 1.000 N NA
 3341724 3341725 SynWH7803_1149 SynWH7803_1150     FALSE 0.543 -3.000 0.025 NA   NA
 3341725 3341726 SynWH7803_1150 SynWH7803_1151   prk FALSE 0.157 91.000 0.051 NA   NA
 3341726 3341727 SynWH7803_1151 SynWH7803_1152 prk leuB TRUE 0.784 76.000 0.074 1.000 Y NA
 3341727 3341728 SynWH7803_1152 SynWH7803_1153 leuB lpxD TRUE 0.580 30.000 0.052 1.000 N NA
 3341728 3341729 SynWH7803_1153 SynWH7803_1154 lpxD proB TRUE 0.668 5.000 0.029 1.000 N NA
 3341729 3341730 SynWH7803_1154 SynWH7803_1155 proB   FALSE 0.544 -3.000 0.025 NA   NA
 3341730 3341731 SynWH7803_1155 SynWH7803_1156     TRUE 0.689 0.000 0.264 NA   NA
 3341731 3341732 SynWH7803_1156 SynWH7803_1157     FALSE 0.570 -3.000 0.038 NA   NA
 3341732 3341733 SynWH7803_1157 SynWH7803_1158     FALSE 0.363 24.000 0.042 NA   NA
 3341733 3341734 SynWH7803_1158 SynWH7803_1159     TRUE 0.723 52.000 0.467 NA   NA
 3341734 3341735 SynWH7803_1159 SynWH7803_1160     FALSE 0.386 62.000 0.156 NA   NA
 3341735 3341736 SynWH7803_1160 SynWH7803_1161     FALSE 0.513 61.000 0.250 NA   NA
 3341736 3341737 SynWH7803_1161 SynWH7803_1162   fur TRUE 0.711 46.000 0.444 NA   NA
 3341737 3341738 SynWH7803_1162 SynWH7803_1163 fur hisA FALSE 0.562 55.000 0.014 1.000 N NA
 3341743 3341744 SynWH7803_1168 SynWH7803_1169     TRUE 0.781 18.000 0.625 NA   NA
 3341745 3341746 SynWH7803_1170 SynWH7803_1171     FALSE 0.346 63.000 0.044 NA   NA
 3341747 3341748 SynWH7803_1172 SynWH7803_1173     FALSE 0.090 82.000 0.000 NA   NA
 3341750 3341751 SynWH7803_1175 SynWH7803_1176     TRUE 0.580 -3.000 0.132 NA   NA
 3341752 3341753 SynWH7803_1177 SynWH7803_1178     FALSE 0.240 85.000 0.167 NA   NA
 3341753 3341754 SynWH7803_1178 SynWH7803_1179     FALSE 0.483 39.000 0.032 1.000   NA
 3341756 3341757 SynWH7803_1181 SynWH7803_1182     FALSE 0.407 8.000 0.032 NA   NA
 3341757 3341758 SynWH7803_1182 SynWH7803_1183     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 3341758 3341759 SynWH7803_1183 SynWH7803_1184     FALSE 0.451 5.000 0.043 NA   NA
 3341761 3341762 SynWH7803_1186 SynWH7803_1187   chrA FALSE 0.571 -3.000 0.038 NA   NA
 3341762 3341763 SynWH7803_1187 SynWH7803_1188 chrA   FALSE 0.404 28.000 0.008 1.000   NA
 3341763 3341764 SynWH7803_1188 SynWH7803_1189     FALSE 0.277 54.000 0.008 NA   NA
 3341765 3341766 SynWH7803_1190 SynWH7803_1191     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3341766 3341767 SynWH7803_1191 SynWH7803_1192   speE FALSE 0.157 27.000 0.000 NA   NA
 3341767 3341768 SynWH7803_1192 SynWH7803_1193 speE   FALSE 0.104 99.000 0.019 NA   NA
 3341769 3341770 SynWH7803_1194 SynWH7803_1195 lig   FALSE 0.307 26.000 0.019 NA   NA
 3341770 3341771 SynWH7803_1195 SynWH7803_1196     FALSE 0.303 29.000 0.018 NA   NA
 3341774 3341775 SynWH7803_1199 SynWH7803_1200     FALSE 0.517 0.000 0.123 NA   NA
 3341775 3341776 SynWH7803_1200 SynWH7803_1201     FALSE 0.007 225.000 0.000 NA   NA
 3341780 3341781 SynWH7803_1205 SynWH7803_1206   purK TRUE 0.604 17.000 0.040 1.000 N NA
 3341784 3341785 SynWH7803_1209 SynWH7803_1210   clpS FALSE 0.335 36.000 0.091 NA   NA
 3341786 3341787 SynWH7803_1211 SynWH7803_1212 petN   FALSE 0.043 141.000 0.061 NA   NA
 3341790 3341791 SynWH7803_1215 SynWH7803_1216   ftsH FALSE 0.409 43.000 0.154 NA   NA
 3341791 3341792 SynWH7803_1216 SynWH7803_1217 ftsH   TRUE 0.693 64.000 0.282 1.000 N NA
 3341792 3341793 SynWH7803_1217 SynWH7803_1218   pykF TRUE 0.820 15.000 0.476 1.000 N NA
 3341795 3341796 SynWH7803_1220 SynWH7803_1221     FALSE 0.467 25.000 0.029 1.000   NA
 3341796 3341797 SynWH7803_1221 SynWH7803_1222   ilvA TRUE 0.591 55.000 0.028 1.000 N NA
 3341799 3341800 SynWH7803_1224 SynWH7803_1225 psaK   TRUE 0.605 68.000 0.357 NA   NA
 3341800 3341801 SynWH7803_1225 SynWH7803_1226     TRUE 0.866 0.000 0.625 NA   NA
 3341803 3341804 SynWH7803_1228 SynWH7803_1229 sphX corA TRUE 0.826 60.000 0.010 1.000 Y NA
 3341804 3341805 SynWH7803_1229 SynWH7803_1230 corA   FALSE 0.239 78.000 0.000 1.000   NA
 3341805 3341806 SynWH7803_1230 SynWH7803_1231   malK FALSE 0.451 24.000 0.083 1.000   NA
 3341806 3341807 SynWH7803_1231 SynWH7803_1232 malK ugpE TRUE 0.875 -3.000 0.092 0.030 N NA
 3341807 3341808 SynWH7803_1232 SynWH7803_1233 ugpE ugpA TRUE 0.954 -3.000 0.064 0.030 Y NA
 3341808 3341809 SynWH7803_1233 SynWH7803_1234 ugpA ugpB TRUE 0.983 -3.000 0.692 0.030 Y NA
 3341809 3341810 SynWH7803_1234 SynWH7803_1235 ugpB   TRUE 0.912 6.000 0.281 1.000 Y NA
 3341810 3341811 SynWH7803_1235 SynWH7803_1236   ccp TRUE 0.587 62.000 0.140 1.000 N NA
 3341811 3341812 SynWH7803_1236 SynWH7803_1237 ccp rpmB FALSE 0.574 17.000 0.018 1.000 N NA
 3341812 3341813 SynWH7803_1237 SynWH7803_1238 rpmB htpG FALSE 0.566 58.000 0.019 1.000 N NA
 3341813 3341814 SynWH7803_1238 SynWH7803_1239 htpG   FALSE 0.181 111.000 0.011 1.000 N NA
 3341814 3341815 SynWH7803_1239 SynWH7803_1240   hisZ FALSE 0.574 25.000 0.024 1.000 N NA
 3341815 3341816 SynWH7803_1240 SynWH7803_1241 hisZ suhB TRUE 0.588 22.000 0.032 1.000 N NA
 3341816 3341817 SynWH7803_1241 SynWH7803_1242 suhB petF TRUE 0.732 0.000 0.042 1.000 N NA
 3341819 3341820 SynWH7803_1243 SynWH7803_1244 pstB pstA TRUE 0.973 39.000 0.952 0.002 Y NA
 3341820 3341821 SynWH7803_1244 SynWH7803_1245 pstA pstC TRUE 0.974 3.000 0.541 0.002 Y NA
 3341822 3341823 SynWH7803_1246 SynWH7803_1247 dnaK dnaJ TRUE 0.974 -16.000 0.488 0.006 Y NA
 3341823 3341824 SynWH7803_1247 SynWH7803_1248 dnaJ   TRUE 0.738 41.000 0.488 NA   NA
 3341824 3341825 SynWH7803_1248 SynWH7803_1249   murQ TRUE 0.891 -3.000 0.634 NA   NA
 3341831 3341832 SynWH7803_1255 SynWH7803_1256     FALSE 0.513 0.000 0.047 NA   NA
 3341832 3341833 SynWH7803_1256 SynWH7803_1257     TRUE 0.595 -18.000 0.020 1.000   NA
 3341836 3341837 SynWH7803_1260 SynWH7803_1261 leuS   FALSE 0.282 55.000 0.009 NA   NA
 3341838 3341839 SynWH7803_1262 SynWH7803_1263 dapF nifS TRUE 0.907 -13.000 0.021 1.000 Y NA
 3341839 3341840 SynWH7803_1263 SynWH7803_1264 nifS   TRUE 0.615 45.000 0.324 NA   NA
 3341840 3341841 SynWH7803_1264 SynWH7803_1265     FALSE 0.560 46.000 0.268 NA   NA
 3341841 3341842 SynWH7803_1265 SynWH7803_1266   dacB FALSE 0.528 -3.000 0.083 NA   NA
 3341843 3341844 SynWH7803_1267 SynWH7803_1268   coaD FALSE 0.537 -3.000 0.023 NA   NA
 3341845 3341846 SynWH7803_1269 SynWH7803_1270 uvrC   FALSE 0.455 -3.000 0.007 NA   NA
 3341846 3341847 SynWH7803_1270 SynWH7803_1271     FALSE 0.470 3.000 0.034 NA   NA
 3341847 3341848 SynWH7803_1271 SynWH7803_1272     FALSE 0.367 37.000 0.036 NA   NA
 3341848 3341849 SynWH7803_1272 SynWH7803_1273     FALSE 0.361 24.000 0.044 NA   NA
 3341849 3341850 SynWH7803_1273 SynWH7803_1274     FALSE 0.363 28.000 0.130 NA   NA
 3341852 3341853 SynWH7803_1276 SynWH7803_1277 ilvE metH TRUE 0.729 83.000 0.036 1.000 Y NA
 3341853 3341854 SynWH7803_1277 SynWH7803_1278 metH   FALSE 0.324 46.000 0.019 NA   NA
 3341858 3341859 SynWH7803_1282 SynWH7803_1283     TRUE 0.716 -10.000 0.212 1.000   NA
 3341859 3341860 SynWH7803_1283 SynWH7803_1284     TRUE 0.722 2.000 0.154 1.000 N NA
 3341862 3341863 SynWH7803_1286 SynWH7803_1287     TRUE 0.694 36.000 0.417 NA   NA
 3341867 3341868 SynWH7803_1291 SynWH7803_1292 rpmG rpsR TRUE 0.911 51.000 0.037 0.021 Y NA
 3341868 3341869 SynWH7803_1292 SynWH7803_1293 rpsR   FALSE 0.196 112.000 0.027 1.000 N NA
 3341870 3341871 SynWH7803_1294 SynWH7803_1295     TRUE 0.743 2.000 0.358 NA   NA
 3341871 3341872 SynWH7803_1295 SynWH7803_1296   pgl TRUE 0.776 -3.000 0.321 NA   NA
 3341872 3341873 SynWH7803_1296 SynWH7803_1297 pgl gnd TRUE 0.925 11.000 0.046 0.003 Y NA
 3341873 3341874 SynWH7803_1297 SynWH7803_1298 gnd glgC TRUE 0.689 88.000 0.042 1.000 Y NA
 3341874 3341875 SynWH7803_1298 SynWH7803_1299 glgC hemA FALSE 0.292 95.000 0.027 1.000 N NA
 3341875 3341876 SynWH7803_1299 SynWH7803_1300 hemA glpX TRUE 0.592 32.000 0.038 1.000 N NA
 3341877 3341878 SynWH7803_1301 SynWH7803_1302     FALSE 0.004 371.000 0.000 NA   NA
 3341881 3341882 SynWH7803_1305 SynWH7803_1306     FALSE 0.232 3.000 0.000 NA   NA
 3341884 3341885 SynWH7803_1308 SynWH7803_1309     FALSE 0.037 146.000 0.020 NA   NA
 3341885 3341886 SynWH7803_1309 SynWH7803_1310     FALSE 0.008 195.000 0.000 NA   NA
 3341886 3341887 SynWH7803_1310 SynWH7803_1311     TRUE 0.670 -3.000 0.026 1.000   NA
 3341887 3341888 SynWH7803_1311 SynWH7803_1312     FALSE 0.200 84.000 0.027 NA   NA
 3341888 3341889 SynWH7803_1312 SynWH7803_1313     FALSE 0.220 80.000 0.066 NA   NA
 3341889 3341890 SynWH7803_1313 SynWH7803_1314   typA FALSE 0.516 -3.000 0.019 NA   NA
 3341890 3341891 SynWH7803_1314 SynWH7803_1315 typA   FALSE 0.516 65.000 0.008 1.000 N NA
 3341891 3341892 SynWH7803_1315 SynWH7803_1316     TRUE 0.857 3.000 0.045 0.003 N NA
 3341896 3341897 SynWH7803_1320 SynWH7803_1321 ddpX recG TRUE 0.600 41.000 0.036 1.000 N NA
 3341898 3341899 SynWH7803_1322 SynWH7803_1323     FALSE 0.014 152.000 0.000 NA   NA
 3341901 3341902 SynWH7803_1325 SynWH7803_1326 proA proA TRUE 0.720 28.000 0.006 0.001   NA
 3341903 3341904 SynWH7803_1327 SynWH7803_1328   tsf FALSE 0.301 51.000 0.014 NA   NA
 3341904 3341905 SynWH7803_1328 SynWH7803_1329 tsf rpsB TRUE 0.660 88.000 0.748 1.000   NA
 3341905 3341906 SynWH7803_1329 SynWH7803_1330 rpsB   FALSE 0.042 134.000 0.017 NA   NA
 3341906 3341907 SynWH7803_1330 SynWH7803_1331     FALSE 0.296 87.000 0.234 NA   NA
 3341907 3341908 SynWH7803_1331 SynWH7803_1332   devA TRUE 0.811 36.000 0.800 NA   NA
 3341908 3341909 SynWH7803_1332 SynWH7803_1333 devA devC TRUE 0.968 0.000 0.769 1.000 Y NA
 3341909 3341910 SynWH7803_1333 SynWH7803_1334 devC devB TRUE 0.970 -3.000 0.769 NA Y NA
 3341910 3341911 SynWH7803_1334 SynWH7803_1335 devB pcyA TRUE 0.820 0.000 0.455 NA   NA
 3341912 3341913 SynWH7803_1336 SynWH7803_1337     TRUE 0.919 -3.000 0.352 0.006   NA
 3341915 3341916 SynWH7803_1339 SynWH7803_1340   lspA TRUE 0.877 -3.000 0.554 NA   NA
 3341916 3341917 SynWH7803_1340 SynWH7803_1341 lspA   TRUE 0.912 -13.000 0.138 1.000 Y NA
 3341917 3341918 SynWH7803_1341 SynWH7803_1342     TRUE 0.598 8.000 0.189 1.000   NA
 3341921 3341922 SynWH7803_1345 SynWH7803_1346   apcE FALSE 0.188 98.000 0.054 1.000   NA
 3341925 3341926 SynWH7803_1349 SynWH7803_1350     FALSE 0.421 68.000 0.196 NA   NA
 3341926 3341927 SynWH7803_1350 SynWH7803_1351     FALSE 0.006 270.000 0.000 NA   NA
 3341928 3341929 SynWH7803_1352 SynWH7803_1353 rsbW   FALSE 0.286 83.000 0.194 NA   NA
 3341930 3341931 SynWH7803_1354 SynWH7803_1355   psb28 FALSE 0.318 29.000 0.077 NA   NA
 3341931 3341932 SynWH7803_1355 SynWH7803_1356 psb28   TRUE 0.863 -3.000 0.488 NA   NA
 3341932 3341933 SynWH7803_1356 SynWH7803_1357     TRUE 0.876 -3.000 0.550 NA   NA
 3341936 3341937 SynWH7803_1360 SynWH7803_1361   secF FALSE 0.461 -19.000 0.069 NA   NA
 3341937 3341938 SynWH7803_1361 SynWH7803_1362 secF secD TRUE 0.973 4.000 0.516 0.001 Y NA
 3341938 3341939 SynWH7803_1362 SynWH7803_1363 secD pdhB TRUE 0.668 4.000 0.091 1.000 N NA
 3341939 3341940 SynWH7803_1363 SynWH7803_1364 pdhB   FALSE 0.024 183.000 0.024 NA   NA
 3341940 3341941 SynWH7803_1364 SynWH7803_1365   ispE TRUE 0.863 -3.000 0.488 NA   NA
 3341941 3341942 SynWH7803_1365 SynWH7803_1366 ispE ksgA TRUE 0.746 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3341944 3341945 SynWH7803_1368 SynWH7803_1369     FALSE 0.164 19.000 0.000 NA   NA
 3341945 3341946 SynWH7803_1369 SynWH7803_1370     FALSE 0.354 39.000 0.054 NA   NA
 3341946 3341947 SynWH7803_1370 SynWH7803_1371   pdxJ FALSE 0.472 3.000 0.046 NA   NA
 3341948 3341949 SynWH7803_1372 SynWH7803_1373 plsC   TRUE 0.753 26.000 0.459 1.000   NA
 3341949 3341950 SynWH7803_1373 SynWH7803_1374     FALSE 0.337 56.000 0.092 NA   NA
 3341950 3341951 SynWH7803_1374 SynWH7803_1375     TRUE 0.586 28.000 0.220 NA N NA
 3341954 3341955 SynWH7803_1378 SynWH7803_1379     TRUE 0.656 4.000 0.278 NA   NA
 3341955 3341956 SynWH7803_1379 SynWH7803_1380   crtH FALSE 0.429 55.000 0.173 NA   NA
 3341956 3341957 SynWH7803_1380 SynWH7803_1381 crtH   TRUE 0.589 58.000 0.115 1.000 N NA
 3341957 3341958 SynWH7803_1381 SynWH7803_1382     FALSE 0.568 38.000 0.018 1.000 N NA
 3341958 3341959 SynWH7803_1382 SynWH7803_1383   pbsY FALSE 0.399 74.000 0.026 1.000   NA
 3341959 3341960 SynWH7803_1383 SynWH7803_1384 pbsY   FALSE 0.440 63.000 0.093 1.000   NA
 3341961 3341962 RNA_27 SynWH7803_1385     FALSE 0.142 69.000 0.000 NA   NA
 3341963 3341964 SynWH7803_1386 SynWH7803_1387     TRUE 0.915 -10.000 0.400 0.005   NA
 3341965 3341966 RNA_28 SynWH7803_1388     FALSE 0.005 290.000 0.000 NA   NA
 3341967 3341968 SynWH7803_1389 SynWH7803_1390     FALSE 0.314 34.000 0.018 NA   NA
 3341968 3341969 SynWH7803_1390 SynWH7803_1391     FALSE 0.375 9.000 0.000 1.000   NA
 3341973 3341974 SynWH7803_1395 SynWH7803_1396     FALSE 0.281 33.000 0.011 NA   NA
 3341978 3341979 SynWH7803_1400 SynWH7803_1401 sbcC sbcD TRUE 0.931 -9.000 0.312 NA Y NA
 3341980 3341981 SynWH7803_1402 SynWH7803_1403     FALSE 0.478 2.000 0.114 NA   NA
 3341981 3341982 SynWH7803_1403 SynWH7803_1404     TRUE 0.720 -3.000 0.250 NA   NA
 3341982 3341983 SynWH7803_1404 SynWH7803_1405     FALSE 0.373 48.000 0.000 NA N NA
 3341983 3341984 SynWH7803_1405 SynWH7803_1406     FALSE 0.184 10.000 0.000 NA   NA
 3341984 3341985 SynWH7803_1406 SynWH7803_1407   cysD FALSE 0.400 53.000 0.149 NA   NA
 3341985 3341986 SynWH7803_1407 SynWH7803_1408 cysD metA TRUE 0.849 18.000 0.048 1.000 Y NA
 3341986 3341987 SynWH7803_1408 SynWH7803_1409 metA   FALSE 0.263 20.000 0.005 NA   NA
 3341992 3341993 SynWH7803_1414 SynWH7803_1415     TRUE 0.884 -3.000 0.382 1.000 N NA
 3341993 3341994 SynWH7803_1415 SynWH7803_1416     FALSE 0.327 58.000 0.088 NA   NA
 3341994 3341995 SynWH7803_1416 SynWH7803_1417     FALSE 0.339 25.000 0.102 NA   NA
 3341995 3341996 SynWH7803_1417 SynWH7803_1418     TRUE 0.976 -3.000 0.424 0.029 Y NA
 3341998 3341999 SynWH7803_1420 SynWH7803_1421     TRUE 0.864 31.000 0.800 1.000 N NA
 3342000 3342001 SynWH7803_1422 SynWH7803_1423 cbiX   FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 3342002 3342003 SynWH7803_1424 RNA_29 betA   FALSE 0.010 172.000 0.000 NA   NA
 3342003 3342004 RNA_29 SynWH7803_1425     FALSE 0.166 54.000 0.000 NA   NA
 3342004 3342005 SynWH7803_1425 SynWH7803_1426     TRUE 0.811 23.000 0.810 NA   NA
 3342005 3342006 SynWH7803_1426 SynWH7803_1427     FALSE 0.402 9.000 0.033 NA   NA
 3342006 3342007 SynWH7803_1427 SynWH7803_1428     FALSE 0.494 -7.000 0.021 NA   NA
 3342008 3342009 SynWH7803_1429 SynWH7803_1430 carB   FALSE 0.267 26.000 0.009 NA   NA
 3342009 3342010 SynWH7803_1430 SynWH7803_1431   alsT FALSE 0.474 0.000 0.068 NA   NA
 3342011 3342012 SynWH7803_1432 SynWH7803_1433   mdlB FALSE 0.369 37.000 0.037 NA   NA
 3342013 3342014 SynWH7803_1434 SynWH7803_1435   tpiA FALSE 0.487 34.000 0.042 1.000   NA
 3342014 3342015 SynWH7803_1435 SynWH7803_1436 tpiA folP TRUE 0.646 8.000 0.039 1.000 N NA
 3342015 3342016 SynWH7803_1436 SynWH7803_1437 folP   FALSE 0.273 44.000 0.006 NA   NA
 3342018 3342019 SynWH7803_1439 SynWH7803_1440 dapB   FALSE 0.404 7.000 0.027 NA   NA
 3342019 3342020 SynWH7803_1440 SynWH7803_1441   hli FALSE 0.371 65.000 0.150 NA   NA
 3342020 3342021 SynWH7803_1441 SynWH7803_1442 hli ubiH FALSE 0.536 17.000 0.250 NA   NA
 3342021 3342022 SynWH7803_1442 SynWH7803_1443 ubiH   TRUE 0.832 -13.000 0.485 NA   NA
 3342024 3342025 SynWH7803_1445 SynWH7803_1446     FALSE 0.457 6.000 0.143 NA   NA
 3342025 3342026 SynWH7803_1446 SynWH7803_1447     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 3342028 3342029 SynWH7803_1449 SynWH7803_1450     TRUE 0.956 10.000 0.900 1.000 Y NA
 3342029 3342030 SynWH7803_1450 SynWH7803_1451     FALSE 0.412 70.000 0.066 1.000   NA
 3342030 3342031 SynWH7803_1451 SynWH7803_1452     FALSE 0.300 20.000 0.015 NA   NA
 3342031 3342032 SynWH7803_1452 SynWH7803_1453     FALSE 0.180 11.000 0.000 NA   NA
 3342033 3342034 SynWH7803_1454 SynWH7803_1455     FALSE 0.576 21.000 0.286 NA   NA
 3342034 3342035 SynWH7803_1455 SynWH7803_1456     FALSE 0.255 77.000 0.055 NA   NA
 3342035 3342036 SynWH7803_1456 SynWH7803_1457     FALSE 0.458 0.000 0.018 NA   NA
 3342036 3342037 SynWH7803_1457 SynWH7803_1458   glnN FALSE 0.067 124.000 0.038 NA   NA
 3342037 3342038 SynWH7803_1458 SynWH7803_1459 glnN proP FALSE 0.305 48.000 0.015 NA   NA
 3342038 3342039 SynWH7803_1459 SynWH7803_1460 proP gap3 TRUE 0.897 -3.000 0.689 NA   NA
 3342040 3342041 SynWH7803_1461 SynWH7803_1462 arsR   FALSE 0.406 6.000 0.024 NA   NA
 3342041 3342042 SynWH7803_1462 SynWH7803_1463     FALSE 0.168 16.000 0.000 NA   NA
 3342042 3342043 SynWH7803_1463 SynWH7803_1464     FALSE 0.024 123.000 0.000 NA   NA
 3342043 3342044 SynWH7803_1464 SynWH7803_1465     TRUE 0.852 -3.000 0.462 NA   NA
 3342045 3342046 SynWH7803_1466 SynWH7803_1467     FALSE 0.177 12.000 0.000 NA   NA
 3342046 3342047 SynWH7803_1467 SynWH7803_1468   tesA FALSE 0.346 36.000 0.100 NA   NA
 3342047 3342048 SynWH7803_1468 SynWH7803_1469 tesA phnC TRUE 0.691 26.000 0.264 1.000 N NA
 3342048 3342049 SynWH7803_1469 SynWH7803_1470 phnC phnE TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3342049 3342050 SynWH7803_1470 SynWH7803_1471 phnE phnD TRUE 0.811 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3342050 3342051 SynWH7803_1471 SynWH7803_1472 phnD aspC TRUE 0.684 44.000 0.238 1.000 N NA
 3342052 3342053 SynWH7803_1473 SynWH7803_1474     FALSE 0.538 -3.000 0.094 NA   NA
 3342053 3342054 SynWH7803_1474 SynWH7803_1475   ispG TRUE 0.580 37.000 0.022 1.000 N NA
 3342054 3342055 SynWH7803_1475 SynWH7803_1476 ispG ctpA TRUE 0.586 37.000 0.026 1.000 N NA
 3342056 3342057 SynWH7803_1477 SynWH7803_1478     TRUE 0.717 66.000 0.500 NA   NA
 3342057 3342058 SynWH7803_1478 SynWH7803_1479     FALSE 0.068 89.000 0.000 NA   NA
 3342058 3342059 SynWH7803_1479 SynWH7803_1480   mfd FALSE 0.058 92.000 0.000 NA   NA
 3342060 3342061 SynWH7803_1481 SynWH7803_1482     FALSE 0.363 43.000 0.031 NA   NA
 3342061 3342062 SynWH7803_1482 SynWH7803_1483     FALSE 0.029 115.000 0.000 NA   NA
 3342064 3342065 SynWH7803_1485 SynWH7803_1486     FALSE 0.490 21.000 0.222 NA   NA
 3342066 3342067 SynWH7803_1487 SynWH7803_1488     TRUE 0.715 7.000 0.388 NA   NA
 3342068 3342069 SynWH7803_1489 SynWH7803_1490   hslO FALSE 0.546 22.000 0.010 1.000 N NA
 3342070 3342071 SynWH7803_1491 SynWH7803_1492     FALSE 0.421 77.000 0.250 NA   NA
 3342071 3342072 SynWH7803_1492 SynWH7803_1493   prfC FALSE 0.012 260.000 0.009 NA   NA
 3342072 3342073 SynWH7803_1493 SynWH7803_1494 prfC   TRUE 0.757 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3342073 3342074 SynWH7803_1494 SynWH7803_1495   mscS TRUE 0.756 -3.000 0.065 1.000 N NA
 3342075 3342076 SynWH7803_1496 SynWH7803_1497     FALSE 0.117 76.000 0.000 NA   NA
 3342078 3342079 RNA_30 SynWH7803_1499     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 3342079 3342080 SynWH7803_1499 SynWH7803_1500     FALSE 0.003 784.000 0.000 NA   NA
 3342080 3342081 SynWH7803_1500 SynWH7803_1501     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 3342084 3342085 SynWH7803_1504 SynWH7803_1505     FALSE 0.164 19.000 0.000 NA   NA
 3342086 3342087 SynWH7803_1506 SynWH7803_1507   recC TRUE 0.642 -6.000 0.025 1.000   NA
 3342087 3342088 SynWH7803_1507 SynWH7803_1508 recC recB TRUE 0.960 -3.000 0.076 0.002 Y NA
 3342088 3342089 SynWH7803_1508 SynWH7803_1509 recB recD TRUE 0.874 -3.000 0.120 0.002   NA
 3342089 3342090 SynWH7803_1509 SynWH7803_1510 recD   FALSE 0.482 34.000 0.034 1.000   NA
 3342090 3342091 SynWH7803_1510 SynWH7803_1511     FALSE 0.233 103.000 0.021 1.000 N NA
 3342091 3342092 SynWH7803_1511 SynWH7803_1512     FALSE 0.495 0.000 0.026 NA   NA
 3342096 3342097 SynWH7803_1516 SynWH7803_1517     TRUE 0.752 34.000 0.111 0.055 N NA
 3342097 3342098 SynWH7803_1517 SynWH7803_1518     TRUE 0.596 55.000 0.212 NA N NA
 3342098 3342099 SynWH7803_1518 SynWH7803_1519     FALSE 0.338 49.000 0.091 NA   NA
 3342099 3342100 SynWH7803_1519 SynWH7803_1520     FALSE 0.515 0.000 0.120 NA   NA
 3342100 3342101 SynWH7803_1520 SynWH7803_1521     TRUE 0.689 15.000 0.400 NA   NA
 3342102 3342103 SynWH7803_1522 SynWH7803_1523     TRUE 0.840 8.000 0.800 NA   NA
 3342103 3342104 SynWH7803_1523 SynWH7803_1524   psbP FALSE 0.284 71.000 0.085 NA   NA
 3342105 3342106 SynWH7803_1525 SynWH7803_1526 recR lipA TRUE 0.643 6.000 0.021 1.000 N NA
 3342107 3342108 SynWH7803_1527 SynWH7803_1528     TRUE 0.772 5.000 0.450 NA   NA
 3342108 3342109 SynWH7803_1528 SynWH7803_1529     FALSE 0.557 -3.000 0.030 NA   NA
 3342109 3342110 SynWH7803_1529 SynWH7803_1530   bioB FALSE 0.540 -3.000 0.024 NA   NA
 3342110 3342111 SynWH7803_1530 SynWH7803_1531 bioB uppS FALSE 0.565 27.000 0.021 1.000 N NA
 3342111 3342112 SynWH7803_1531 SynWH7803_1532 uppS   FALSE 0.571 -3.000 0.043 NA   NA
 3342112 3342113 SynWH7803_1532 SynWH7803_1533   lysA FALSE 0.377 17.000 0.040 NA   NA
 3342114 3342115 SynWH7803_1534 SynWH7803_1535   clpA FALSE 0.055 158.000 0.032 1.000   NA
 3342115 3342116 SynWH7803_1535 SynWH7803_1536 clpA gldA TRUE 0.681 48.000 0.237 1.000 N NA
 3342116 3342117 SynWH7803_1536 SynWH7803_1537 gldA   TRUE 0.782 -3.000 0.250 1.000   NA
 3342117 3342118 SynWH7803_1537 SynWH7803_1538     TRUE 0.783 4.000 0.371 1.000   NA
 3342119 3342120 SynWH7803_1539 SynWH7803_1540 cdsA   FALSE 0.568 21.000 0.019 1.000 N NA
 3342121 3342122 SynWH7803_1541 SynWH7803_1542   aarF FALSE 0.177 12.000 0.000 NA   NA
 3342122 3342123 SynWH7803_1542 SynWH7803_1543 aarF   TRUE 0.700 72.000 0.512 NA   NA
 3342125 3342126 SynWH7803_1545 SynWH7803_1546 phoB phoR TRUE 0.878 6.000 0.099 1.000 Y NA
 3342126 3342127 SynWH7803_1546 SynWH7803_1547 phoR rsuA TRUE 0.578 14.000 0.015 1.000 N NA
 3342127 3342128 SynWH7803_1547 SynWH7803_1548 rsuA   FALSE 0.528 8.000 0.030 1.000   NA
 3342129 3342130 SynWH7803_1549 SynWH7803_1550 malQ frhB TRUE 0.624 55.000 0.162 1.000 N NA
 3342133 3342134 SynWH7803_1553 SynWH7803_1554 prs   FALSE 0.529 7.000 0.101 1.000   NA
 3342135 3342136 SynWH7803_1555 SynWH7803_1556 pepN   FALSE 0.129 97.000 0.031 NA   NA
 3342136 3342137 SynWH7803_1556 SynWH7803_1557     FALSE 0.379 122.000 0.850 NA   NA
 3342138 3342139 SynWH7803_1558 RNA_31 sasA   FALSE 0.166 42.000 0.000 NA   NA
 3342141 3342142 SynWH7803_1560 SynWH7803_1561 petH zwf FALSE 0.046 175.000 0.117 1.000   NA
 3342142 3342143 SynWH7803_1561 SynWH7803_1562 zwf   TRUE 0.924 53.000 0.583 NA Y NA
 3342143 3342144 SynWH7803_1562 SynWH7803_1563   cobB FALSE 0.552 46.000 0.167 NA N NA
 3342144 3342145 SynWH7803_1563 SynWH7803_1564 cobB   TRUE 0.764 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3342145 3342146 SynWH7803_1564 SynWH7803_1565     FALSE 0.348 82.000 0.041 NA N NA
 3342146 3342147 SynWH7803_1565 SynWH7803_1566     FALSE 0.566 0.000 0.167 NA   NA
 3342148 3342149 SynWH7803_1567 SynWH7803_1568     FALSE 0.527 -3.000 0.069 NA   NA
 3342149 3342150 SynWH7803_1568 SynWH7803_1569   crtE TRUE 0.591 3.000 0.214 NA   NA
 3342150 3342151 SynWH7803_1569 SynWH7803_1570 crtE folD TRUE 0.881 54.000 0.250 1.000 Y NA
 3342153 3342154 SynWH7803_1572 SynWH7803_1573 RluA   TRUE 0.598 62.000 0.333 NA   NA
 3342154 3342155 SynWH7803_1573 SynWH7803_1574     FALSE 0.166 49.000 0.000 NA   NA
 3342155 3342156 SynWH7803_1574 SynWH7803_1575     FALSE 0.252 -22.000 0.000 NA   NA
 3342156 3342157 SynWH7803_1575 SynWH7803_1576     FALSE 0.309 68.000 0.024 NA   NA
 3342157 3342158 SynWH7803_1576 SynWH7803_1577     FALSE 0.049 128.000 0.018 NA   NA
 3342159 3342160 SynWH7803_1578 SynWH7803_1579     FALSE 0.450 69.000 0.222 NA   NA
 3342161 3342162 SynWH7803_1580 SynWH7803_1581 petF   FALSE 0.342 84.000 0.250 NA   NA
 3342162 3342163 SynWH7803_1581 SynWH7803_1582     FALSE 0.166 91.000 0.125 NA   NA
 3342164 3342165 SynWH7803_1583 SynWH7803_1584     TRUE 0.683 17.000 0.400 NA   NA
 3342166 3342167 SynWH7803_1585 SynWH7803_1586   leuA TRUE 0.647 5.000 0.018 1.000 N NA
 3342169 3342170 SynWH7803_1588 SynWH7803_1589 crtL gyrA FALSE 0.577 15.000 0.017 1.000 N NA
 3342171 3342172 SynWH7803_1590 SynWH7803_1591   guaB FALSE 0.318 59.000 0.076 NA   NA
 3342172 3342173 SynWH7803_1591 SynWH7803_1592 guaB trxA FALSE 0.034 220.000 0.038 1.000   NA
 3342173 3342174 SynWH7803_1592 SynWH7803_1593 trxA hisH FALSE 0.501 9.000 0.069 1.000   NA
 3342174 3342175 SynWH7803_1593 SynWH7803_1594 hisH   TRUE 0.756 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3342177 3342178 SynWH7803_1596 SynWH7803_1597 cytM   TRUE 0.603 51.000 0.041 1.000 N NA
 3342178 3342179 SynWH7803_1597 SynWH7803_1598     TRUE 0.587 25.000 0.046 1.000 N NA
 3342179 3342180 SynWH7803_1598 SynWH7803_1599     TRUE 0.821 -3.000 0.393 NA   NA
 3342180 3342181 SynWH7803_1599 SynWH7803_1600   chlI FALSE 0.560 -3.000 0.111 NA   NA
 3342181 3342182 SynWH7803_1600 SynWH7803_1601 chlI ruvC TRUE 0.581 22.000 0.026 1.000 N NA
 3342182 3342183 SynWH7803_1601 SynWH7803_1602 ruvC   TRUE 0.618 7.000 0.016 1.000 N NA
 3342183 3342184 SynWH7803_1602 SynWH7803_1603     FALSE 0.253 48.000 0.002 NA   NA
 3342184 3342185 SynWH7803_1603 SynWH7803_1604     TRUE 0.841 56.000 1.000 NA   NA
 3342185 3342186 SynWH7803_1604 SynWH7803_1605     FALSE 0.358 8.000 0.018 NA   NA
 3342186 3342187 SynWH7803_1605 SynWH7803_1606   thrA FALSE 0.435 36.000 0.180 NA   NA
 3342187 3342188 SynWH7803_1606 SynWH7803_1607 thrA   FALSE 0.147 91.000 0.095 NA   NA
 3342188 3342189 SynWH7803_1607 SynWH7803_1608     FALSE 0.349 41.000 0.100 NA   NA
 3342189 3342190 SynWH7803_1608 SynWH7803_1609     TRUE 0.966 -3.000 0.267 0.028 Y NA
 3342192 3342193 SynWH7803_1611 SynWH7803_1612     FALSE 0.383 23.000 0.143 NA   NA
 3342197 3342198 SynWH7803_1616 SynWH7803_1617   polA FALSE 0.556 25.000 0.017 1.000 N NA
 3342198 3342199 SynWH7803_1617 SynWH7803_1618 polA cysS FALSE 0.548 59.000 0.014 1.000 N NA
 3342205 3342206 SynWH7803_1624 SynWH7803_1625     FALSE 0.023 308.000 0.030 NA N NA
 3342207 3342208 SynWH7803_1626 SynWH7803_1627   pntB TRUE 0.632 23.000 0.354 NA   NA
 3342208 3342209 SynWH7803_1627 SynWH7803_1628 pntB pntAB TRUE 0.844 0.000 0.072 0.001   NA
 3342209 3342210 SynWH7803_1628 SynWH7803_1629 pntAB pntAA TRUE 0.953 0.000 0.829 0.001   NA
 3342213 3342214 SynWH7803_1632 SynWH7803_1633     FALSE 0.116 97.000 0.083 NA   NA
 3342214 3342215 SynWH7803_1633 SynWH7803_1634   trxB FALSE 0.043 128.000 0.011 NA   NA
 3342217 3342218 SynWH7803_1636 SynWH7803_1637     FALSE 0.103 99.000 0.019 NA   NA
 3342219 3342220 SynWH7803_1638 SynWH7803_1639     TRUE 0.647 0.000 0.229 NA   NA
 3342220 3342221 SynWH7803_1639 SynWH7803_1640     FALSE 0.545 79.000 0.392 NA   NA
 3342221 3342222 SynWH7803_1640 SynWH7803_1641   petM TRUE 0.725 55.000 0.392 1.000   NA
 3342222 3342223 SynWH7803_1641 SynWH7803_1642 petM trm1 FALSE 0.484 40.000 0.050 1.000   NA
 3342224 3342225 SynWH7803_1643 SynWH7803_1644 mhpC ilvH TRUE 0.756 -3.000 0.065 1.000 N NA
 3342226 3342227 SynWH7803_1645 SynWH7803_1646 ppiB   TRUE 0.710 8.000 0.317 1.000   NA
 3342228 3342229 SynWH7803_1647 SynWH7803_1648 psbD psbC TRUE 0.952 -16.000 0.878 0.004   NA
 3342231 3342232 SynWH7803_1650 SynWH7803_1651     FALSE 0.003 613.000 0.000 NA   NA
 3342232 3342233 SynWH7803_1651 SynWH7803_1652     FALSE 0.350 12.000 0.079 NA   NA
 3342233 3342234 SynWH7803_1652 SynWH7803_1653     FALSE 0.348 23.000 0.053 NA   NA
 3342235 3342236 SynWH7803_1654 SynWH7803_1655     TRUE 0.681 50.000 0.400 NA   NA
 3342236 3342237 SynWH7803_1655 SynWH7803_1656     FALSE 0.200 75.000 0.004 NA   NA
 3342238 3342239 SynWH7803_1657 SynWH7803_1658   cobQ FALSE 0.154 92.000 0.036 NA   NA
 3342239 3342240 SynWH7803_1658 SynWH7803_1659 cobQ   FALSE 0.515 9.000 0.026 1.000   NA
 3342240 3342241 SynWH7803_1659 SynWH7803_1660     TRUE 0.668 -3.000 0.057 1.000   NA
 3342241 3342242 SynWH7803_1660 SynWH7803_1661     TRUE 0.789 1.000 0.043 0.064   NA
 3342244 3342245 SynWH7803_1663 SynWH7803_1664     FALSE 0.255 28.000 0.005 NA   NA
 3342245 3342246 SynWH7803_1664 SynWH7803_1665   proP FALSE 0.449 -3.000 0.005 NA   NA
 3342246 3342247 SynWH7803_1665 SynWH7803_1666 proP   FALSE 0.031 157.000 0.087 NA   NA
 3342251 3342252 SynWH7803_1670 SynWH7803_1671     FALSE 0.163 20.000 0.000 NA   NA
 3342253 3342254 SynWH7803_1672 SynWH7803_1673     FALSE 0.254 -19.000 0.000 NA   NA
 3342254 3342255 SynWH7803_1673 SynWH7803_1674     FALSE 0.014 151.000 0.000 NA   NA
 3342258 3342259 SynWH7803_1677 SynWH7803_1678     FALSE 0.003 695.000 0.000 NA   NA
 3342259 3342260 SynWH7803_1678 SynWH7803_1679     FALSE 0.117 76.000 0.000 NA   NA
 3342261 3342262 RNA_32 SynWH7803_1680   lexA FALSE 0.117 76.000 0.000 NA   NA
 3342262 3342263 SynWH7803_1680 SynWH7803_1681 lexA   FALSE 0.312 54.000 0.017 NA   NA
 3342263 3342264 SynWH7803_1681 SynWH7803_1682     TRUE 0.714 9.000 0.400 NA   NA
 3342264 3342265 SynWH7803_1682 SynWH7803_1683     TRUE 0.765 -3.000 0.300 NA   NA
 3342266 3342267 SynWH7803_1684 SynWH7803_1685     FALSE 0.152 62.000 0.000 NA   NA
 3342267 3342268 SynWH7803_1685 SynWH7803_1686     FALSE 0.173 14.000 0.000 NA   NA
 3342269 3342270 SynWH7803_1687 SynWH7803_1688   argF FALSE 0.493 5.000 0.006 1.000   NA
 3342270 3342271 SynWH7803_1688 SynWH7803_1689 argF ftsH TRUE 0.584 53.000 0.022 1.000 N NA
 3342272 3342273 SynWH7803_1690 SynWH7803_1691     TRUE 0.622 50.000 0.333 NA   NA
 3342274 3342275 SynWH7803_1692 SynWH7803_1693 ribD   FALSE 0.530 -3.000 0.021 NA   NA
 3342277 3342278 SynWH7803_1695 SynWH7803_1696     FALSE 0.219 88.000 0.167 NA   NA
 3342278 3342279 SynWH7803_1696 SynWH7803_1697     FALSE 0.497 -13.000 0.105 NA   NA
 3342280 3342281 SynWH7803_1698 SynWH7803_1699     TRUE 0.889 -3.000 0.625 NA   NA
 3342282 3342283 SynWH7803_1700 SynWH7803_1701     FALSE 0.246 -40.000 0.000 NA   NA
 3342287 3342288 SynWH7803_1705 SynWH7803_1706     FALSE 0.157 192.000 0.800 NA   NA
 3342290 3342291 SynWH7803_1708 SynWH7803_1709     FALSE 0.475 0.000 0.066 NA   NA
 3342291 3342292 SynWH7803_1709 SynWH7803_1710   ppnK TRUE 0.872 -3.000 0.341 1.000 N NA
 3342292 3342293 SynWH7803_1710 SynWH7803_1711 ppnK   FALSE 0.340 79.000 0.061 1.000   NA
 3342293 3342294 SynWH7803_1711 SynWH7803_1712   pheS FALSE 0.303 99.000 0.003 0.086   NA
 3342297 3342298 SynWH7803_1715 SynWH7803_1716 ribF thiE FALSE 0.323 137.000 0.012 1.000 Y NA
 3342298 3342299 SynWH7803_1716 SynWH7803_1717 thiE thiS TRUE 0.923 15.000 0.452 1.000 Y NA
 3342299 3342300 SynWH7803_1717 SynWH7803_1718 thiS   TRUE 0.586 26.000 0.310 NA   NA
 3342300 3342301 SynWH7803_1718 SynWH7803_1719     FALSE 0.359 97.000 0.400 NA   NA
 3342301 3342302 SynWH7803_1719 SynWH7803_1720     TRUE 0.667 78.000 0.571 NA   NA
 3342303 3342304 SynWH7803_1721 SynWH7803_1722 cpmA   TRUE 0.657 -3.000 0.070 1.000   NA
 3342304 3342305 SynWH7803_1722 SynWH7803_1723   ispF TRUE 0.640 -3.000 0.016 1.000   NA
 3342305 3342306 SynWH7803_1723 SynWH7803_1724 ispF trmD TRUE 0.663 1.000 0.008 1.000 N NA
 3342306 3342307 SynWH7803_1724 SynWH7803_1725 trmD   FALSE 0.479 7.000 0.010 1.000   NA
 3342307 3342308 SynWH7803_1725 SynWH7803_1726   era FALSE 0.425 25.000 0.014 1.000   NA
 3342310 3342311 SynWH7803_1728 SynWH7803_1729     FALSE 0.347 53.000 0.024 NA   NA
 3342311 3342312 SynWH7803_1729 SynWH7803_1730   rpsP TRUE 0.613 9.000 0.019 1.000 N NA
 3342312 3342313 SynWH7803_1730 SynWH7803_1731 rpsP ffh TRUE 0.682 76.000 0.361 1.000 N NA
 3342317 3342318 SynWH7803_1735 SynWH7803_1736   rpoD FALSE 0.467 38.000 0.016 NA N NA
 3342318 3342319 SynWH7803_1736 SynWH7803_1737 rpoD   FALSE 0.055 158.000 0.021 NA N NA
 3342322 3342323 SynWH7803_1740 SynWH7803_1741   fkpA FALSE 0.395 36.000 0.148 NA   NA
 3342323 3342324 SynWH7803_1741 SynWH7803_1742 fkpA sodB FALSE 0.498 71.000 0.011 1.000 N NA
 3342325 3342326 SynWH7803_1743 SynWH7803_1744 trpC lpdA TRUE 0.579 23.000 0.057 1.000 N NA
 3342326 3342327 SynWH7803_1744 SynWH7803_1745 lpdA spoU TRUE 0.769 -3.000 0.115 1.000 N NA
 3342327 3342328 SynWH7803_1745 RNA_33 spoU   FALSE 0.005 284.000 0.000 NA   NA
 3342329 3342330 SynWH7803_1746 RNA_34 murA   FALSE 0.165 39.000 0.000 NA   NA
 3342330 3342331 RNA_34 SynWH7803_1747   argD FALSE 0.090 82.000 0.000 NA   NA
 3342331 3342332 SynWH7803_1747 SynWH7803_1748 argD folC TRUE 0.798 -3.000 0.181 1.000 N NA
 3342332 3342333 SynWH7803_1748 SynWH7803_1749 folC   FALSE 0.359 23.000 0.034 NA   NA
 3342334 3342335 SynWH7803_1750 SynWH7803_1751   codA TRUE 0.673 28.000 0.246 1.000 N NA
 3342335 3342336 SynWH7803_1751 SynWH7803_1752 codA   TRUE 0.801 -3.000 0.357 NA   NA
 3342338 3342339 SynWH7803_1753 SynWH7803_1754     TRUE 0.685 0.000 0.258 NA   NA
 3342340 3342341 SynWH7803_1755 SynWH7803_1756 miaB ddl FALSE 0.577 39.000 0.020 1.000 N NA
 3342341 3342342 SynWH7803_1756 SynWH7803_1757 ddl   FALSE 0.356 29.000 0.046 NA   NA
 3342342 3342343 SynWH7803_1757 SynWH7803_1758   ftsQ FALSE 0.488 0.000 0.024 NA   NA
 3342343 3342344 SynWH7803_1758 SynWH7803_1759 ftsQ ftsZ FALSE 0.156 107.000 0.067 NA N NA
 3342348 3342349 SynWH7803_1762 SynWH7803_1763   clpP FALSE 0.322 31.000 0.084 NA   NA
 3342349 3342350 SynWH7803_1763 SynWH7803_1764 clpP clpP TRUE 0.968 46.000 0.745 0.002 Y NA
 3342350 3342351 SynWH7803_1764 SynWH7803_1765 clpP ilvC FALSE 0.568 57.000 0.019 1.000 N NA
 3342351 3342352 SynWH7803_1765 SynWH7803_1766 ilvC cobD/cbiB TRUE 0.833 29.000 0.017 1.000 Y NA
 3342355 3342356 RNA_37 SynWH7803_1769     FALSE 0.157 26.000 0.000 NA   NA
 3342356 3342357 SynWH7803_1769 SynWH7803_1770   glyQ FALSE 0.279 54.000 0.009 NA   NA
 3342357 3342358 SynWH7803_1770 SynWH7803_1771 glyQ   FALSE 0.263 50.000 0.005 NA   NA
 3342358 3342359 SynWH7803_1771 SynWH7803_1772   ubiE FALSE 0.140 87.000 0.010 NA   NA
 3342359 3342360 SynWH7803_1772 SynWH7803_1773 ubiE   FALSE 0.464 -3.000 0.009 NA   NA
 3342360 3342361 SynWH7803_1773 SynWH7803_1774   hisF FALSE 0.328 58.000 0.021 NA   NA
 3342362 3342363 SynWH7803_1775 SynWH7803_1776   chlG FALSE 0.569 12.000 0.262 NA   NA
 3342363 3342364 SynWH7803_1776 SynWH7803_1777 chlG   TRUE 0.902 -3.000 0.452 1.000 N NA
 3342367 3342368 SynWH7803_1780 SynWH7803_1781     FALSE 0.481 0.000 0.000 1.000   NA
 3342369 3342370 SynWH7803_1782 SynWH7803_1783 spoU   FALSE 0.563 51.000 0.014 1.000 N NA
 3342371 3342372 SynWH7803_1784 SynWH7803_1785   dppC FALSE 0.367 21.000 0.043 NA   NA
 3342373 3342374 SynWH7803_1786 SynWH7803_1787     TRUE 0.896 0.000 0.857 NA   NA
 3342375 3342376 SynWH7803_1788 SynWH7803_1789     FALSE 0.327 94.000 0.333 NA   NA
 3342376 3342377 SynWH7803_1789 SynWH7803_1790     TRUE 0.777 8.000 0.500 NA   NA
 3342377 3342378 SynWH7803_1790 SynWH7803_1791     TRUE 0.902 -3.000 0.750 NA   NA
 3342378 3342379 SynWH7803_1791 SynWH7803_1792     TRUE 0.896 0.000 0.857 NA   NA
 3342382 3342383 SynWH7803_1795 SynWH7803_1796     FALSE 0.004 369.000 0.000 NA   NA
 3342383 3342384 SynWH7803_1796 SynWH7803_1797     FALSE 0.171 15.000 0.000 NA   NA
 3342384 3342385 SynWH7803_1797 SynWH7803_1798     FALSE 0.367 129.000 1.000 NA   NA
 3342385 3342386 SynWH7803_1798 SynWH7803_1799     TRUE 0.867 -3.000 0.500 NA   NA
 3342386 3342387 SynWH7803_1799 SynWH7803_1800     FALSE 0.017 140.000 0.000 NA   NA
 3342390 3342391 SynWH7803_1803 SynWH7803_1804     FALSE 0.192 8.000 0.000 NA   NA
 3342392 3342393 SynWH7803_1805 SynWH7803_1806     FALSE 0.367 38.000 0.035 NA   NA
 3342393 3342394 SynWH7803_1806 SynWH7803_1807     FALSE 0.166 53.000 0.000 NA   NA
 3342394 3342395 SynWH7803_1807 SynWH7803_1808   futA FALSE 0.018 135.000 0.000 NA   NA
 3342395 3342396 SynWH7803_1808 SynWH7803_1809 futA futB TRUE 0.921 8.000 0.052 0.027 Y NA
 3342397 3342398 SynWH7803_1810 SynWH7803_1811     TRUE 0.600 3.000 0.222 NA   NA
 3342398 3342399 SynWH7803_1811 SynWH7803_1812     TRUE 0.610 2.000 0.222 NA   NA
 3342399 3342400 SynWH7803_1812 SynWH7803_1813     FALSE 0.063 147.000 0.200 NA   NA
 3342400 3342401 SynWH7803_1813 SynWH7803_1814     FALSE 0.539 -6.000 0.047 NA   NA
 3342401 3342402 SynWH7803_1814 SynWH7803_1815     FALSE 0.556 -3.000 0.052 NA   NA
 3342402 3342403 SynWH7803_1815 SynWH7803_1816     TRUE 0.724 0.000 0.300 NA   NA
 3342408 3342409 SynWH7803_1821 SynWH7803_1822   oprB FALSE 0.572 42.000 0.018 1.000 N NA
 3342410 3342411 SynWH7803_1823 SynWH7803_1824     FALSE 0.157 26.000 0.000 NA   NA
 3342415 3342416 SynWH7803_1828 SynWH7803_1829     FALSE 0.393 37.000 0.145 NA   NA
 3342416 3342417 SynWH7803_1829 SynWH7803_1830     FALSE 0.331 27.000 0.097 NA   NA
 3342420 3342421 SynWH7803_1833 SynWH7803_1834   rplS FALSE 0.290 33.000 0.013 NA   NA
 3342421 3342422 SynWH7803_1834 RNA_38 rplS   FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 3342422 3342423 RNA_38 SynWH7803_1835     FALSE 0.164 37.000 0.000 NA   NA
 3342423 3342424 SynWH7803_1835 RNA_39     FALSE 0.009 191.000 0.000 NA   NA
 3342424 3342425 RNA_39 SynWH7803_1836   gltX FALSE 0.161 22.000 0.000 NA   NA
 3342426 3342427 SynWH7803_1837 SynWH7803_1838     FALSE 0.503 -10.000 0.054 NA   NA
 3342427 3342428 SynWH7803_1838 SynWH7803_1839     FALSE 0.472 0.000 0.073 NA   NA
 3342428 3342429 SynWH7803_1839 SynWH7803_1840   nfrC FALSE 0.445 -55.000 0.073 NA   NA
 3342431 3342432 SynWH7803_1842 SynWH7803_1843 hli gcp FALSE 0.301 37.000 0.015 NA   NA
 3342433 3342434 SynWH7803_1844 SynWH7803_1845 psaF psaJ TRUE 0.860 39.000 0.455 0.021   NA
 3342436 3342437 SynWH7803_1847 SynWH7803_1848   tatC FALSE 0.389 78.000 0.033 NA N NA
 3342439 3342440 SynWH7803_1850 SynWH7803_1851 petC petA TRUE 0.908 42.000 0.881 0.049   NA
 3342440 3342441 SynWH7803_1851 SynWH7803_1852 petA lgt TRUE 0.884 -3.000 0.476 1.000   NA
 3342441 3342442 SynWH7803_1852 SynWH7803_1853 lgt cobM TRUE 0.759 -3.000 0.061 1.000 N NA
 3342442 3342443 SynWH7803_1853 RNA_40 cobM   FALSE 0.161 33.000 0.000 NA   NA
 3342443 3342444 RNA_40 SynWH7803_1854     FALSE 0.011 165.000 0.000 NA   NA
 3342446 3342447 SynWH7803_1856 SynWH7803_1857 ubiA   TRUE 0.658 0.000 0.043 NA N NA
 3342449 3342450 SynWH7803_1859 SynWH7803_1860     TRUE 0.670 0.000 0.143 NA N NA
 3342450 3342451 SynWH7803_1860 SynWH7803_1861   fabG TRUE 0.623 48.000 0.156 1.000 N NA
 3342454 3342455 SynWH7803_1864 SynWH7803_1865   nanE FALSE 0.532 19.000 0.250 NA   NA
 3342455 3342456 SynWH7803_1865 SynWH7803_1866 nanE   TRUE 0.674 0.000 0.250 NA   NA
 3342456 3342457 SynWH7803_1866 SynWH7803_1867     FALSE 0.215 5.000 0.000 NA   NA
 3342457 3342458 SynWH7803_1867 SynWH7803_1868     TRUE 0.943 38.000 0.414 0.083 Y NA
 3342458 3342459 SynWH7803_1868 SynWH7803_1869   ctaB FALSE 0.561 31.000 0.019 1.000 N NA
 3342459 3342460 SynWH7803_1869 SynWH7803_1870 ctaB   TRUE 0.914 -7.000 0.090 1.000 Y NA
 3342461 3342462 SynWH7803_1871 SynWH7803_1872     TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 3342462 3342463 SynWH7803_1872 SynWH7803_1873     TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 3342463 3342464 SynWH7803_1873 SynWH7803_1874     TRUE 0.594 96.000 1.000 NA   NA
 3342465 3342466 SynWH7803_1875 SynWH7803_1876   ribE FALSE 0.220 74.000 0.009 NA   NA
 3342467 3342468 SynWH7803_1877 SynWH7803_1878     FALSE 0.550 -3.000 0.054 NA   NA
 3342469 3342470 SynWH7803_1879 SynWH7803_1880     FALSE 0.409 10.000 0.130 NA   NA
 3342470 3342471 SynWH7803_1880 SynWH7803_1881     FALSE 0.536 -28.000 0.155 NA   NA
 3342471 3342472 SynWH7803_1881 SynWH7803_1882     FALSE 0.497 0.000 0.105 NA   NA
 3342472 3342473 SynWH7803_1882 SynWH7803_1883   topA FALSE 0.469 0.000 0.020 NA   NA
 3342474 3342475 SynWH7803_1884 SynWH7803_1885 ndhB   TRUE 0.751 -7.000 0.134 1.000 N NA
 3342475 3342476 SynWH7803_1885 SynWH7803_1886     TRUE 0.634 32.000 0.185 1.000 N NA
 3342477 3342478 SynWH7803_1887 SynWH7803_1888   birA TRUE 0.582 31.000 0.030 1.000 N NA
 3342478 3342479 SynWH7803_1888 SynWH7803_1889 birA   TRUE 0.723 0.000 0.027 1.000 N NA
 3342479 3342480 SynWH7803_1889 SynWH7803_1890   trxA TRUE 0.888 -13.000 0.477 1.000 N NA
 3342480 3342481 SynWH7803_1890 SynWH7803_1891 trxA pspA TRUE 0.786 55.000 0.486 NA N NA
 3342483 3342484 SynWH7803_1893 SynWH7803_1894     TRUE 0.788 -3.000 0.000 0.061   NA
 3342485 3342486 SynWH7803_1895 SynWH7803_1896 sppA aroH TRUE 0.813 -3.000 0.207 1.000 N NA
 3342486 3342487 SynWH7803_1896 SynWH7803_1897 aroH   FALSE 0.121 99.000 0.114 NA   NA
 3342487 3342488 SynWH7803_1897 SynWH7803_1898   rpmH FALSE 0.353 55.000 0.027 NA   NA
 3342488 3342489 SynWH7803_1898 SynWH7803_1899 rpmH rnpA TRUE 0.832 25.000 0.787 1.000   NA
 3342489 3342490 SynWH7803_1899 SynWH7803_1900 rnpA   FALSE 0.573 -3.000 0.041 NA   NA
 3342490 3342491 SynWH7803_1900 SynWH7803_1901   yidC FALSE 0.285 76.000 0.043 NA   NA
 3342491 3342492 SynWH7803_1901 SynWH7803_1902 yidC   FALSE 0.488 -3.000 0.014 NA   NA
 3342492 3342493 SynWH7803_1902 SynWH7803_1903     FALSE 0.454 -7.000 0.014 NA   NA
 3342493 3342494 SynWH7803_1903 SynWH7803_1904     TRUE 0.672 73.000 0.476 NA   NA
 3342494 3342495 SynWH7803_1904 SynWH7803_1905   serS FALSE 0.272 59.000 0.010 NA   NA
 3342495 3342496 SynWH7803_1905 SynWH7803_1906 serS   TRUE 0.581 20.000 0.024 1.000 N NA
 3342496 3342497 SynWH7803_1906 SynWH7803_1907   rpsN TRUE 0.580 44.000 0.020 1.000 N NA
 3342497 3342498 SynWH7803_1907 SynWH7803_1908 rpsN pnp FALSE 0.240 162.000 0.019 1.000 Y NA
 3342500 3342501 SynWH7803_1910 SynWH7803_1911     FALSE 0.320 11.000 0.013 NA   NA
 3342504 3342505 SynWH7803_1913 SynWH7803_1914     FALSE 0.003 1017.000 0.000 NA   NA
 3342505 3342506 SynWH7803_1914 SynWH7803_1915     FALSE 0.004 393.000 0.000 NA   NA
 3342507 3342508 SynWH7803_1916 SynWH7803_1917     FALSE 0.164 37.000 0.000 NA   NA
 3342509 3342510 SynWH7803_1918 SynWH7803_1919     FALSE 0.010 169.000 0.000 NA   NA
 3342510 3342511 SynWH7803_1919 SynWH7803_1920     FALSE 0.004 381.000 0.000 NA   NA
 3342511 3342512 SynWH7803_1920 SynWH7803_1921     FALSE 0.108 78.000 0.000 NA   NA
 3342512 3342513 SynWH7803_1921 SynWH7803_1922     FALSE 0.177 12.000 0.000 NA   NA
 3342515 3342516 SynWH7803_1924 SynWH7803_1925     FALSE 0.503 83.000 0.400 NA   NA
 3342516 3342517 SynWH7803_1925 SynWH7803_1926     FALSE 0.015 147.000 0.000 NA   NA
 3342517 3342518 SynWH7803_1926 SynWH7803_1927     FALSE 0.231 79.000 0.000 1.000   NA
 3342518 3342519 SynWH7803_1927 SynWH7803_1928   hup FALSE 0.487 20.000 0.000 1.000 N NA
 3342519 3342520 SynWH7803_1928 SynWH7803_1929 hup   FALSE 0.121 155.000 0.400 NA   NA
 3342523 3342524 SynWH7803_1931 SynWH7803_1932     TRUE 0.929 -3.000 0.833 NA N NA
 3342524 3342525 SynWH7803_1932 SynWH7803_1933     TRUE 0.726 13.000 0.452 NA   NA
 3342525 3342526 SynWH7803_1933 SynWH7803_1934     FALSE 0.490 100.000 0.762 NA   NA
 3342526 3342527 SynWH7803_1934 SynWH7803_1935     TRUE 0.774 0.000 0.369 NA   NA
 3342529 3342530 SynWH7803_1937 SynWH7803_1938     FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 3342532 3342533 SynWH7803_1940 SynWH7803_1941     FALSE 0.177 12.000 0.000 NA   NA
 3342535 3342536 SynWH7803_1943 SynWH7803_1944     FALSE 0.024 123.000 0.000 NA   NA
 3342536 3342537 SynWH7803_1944 SynWH7803_1945     TRUE 0.862 0.000 0.605 NA   NA
 3342538 3342539 SynWH7803_1946 SynWH7803_1947 tyrS   FALSE 0.490 42.000 0.034 1.000   NA
 3342540 3342541 SynWH7803_1948 SynWH7803_1949     FALSE 0.561 35.000 0.200 1.000   NA
 3342541 3342542 SynWH7803_1949 SynWH7803_1950     FALSE 0.406 5.000 0.077 NA   NA
 3342542 3342543 SynWH7803_1950 SynWH7803_1951   pepA FALSE 0.431 38.000 0.176 NA   NA
 3342543 3342544 SynWH7803_1951 SynWH7803_1952 pepA   FALSE 0.320 25.000 0.074 NA   NA
 3342545 3342546 SynWH7803_1953 SynWH7803_1954   msrA FALSE 0.035 157.000 0.114 NA   NA
 3342546 3342547 SynWH7803_1954 SynWH7803_1955 msrA lpxB TRUE 0.729 0.000 0.034 1.000 N NA
 3342547 3342548 SynWH7803_1955 SynWH7803_1956 lpxB lpxA TRUE 0.908 0.000 0.062 1.000 Y NA
 3342548 3342549 SynWH7803_1956 SynWH7803_1957 lpxA fabZ FALSE 0.565 30.000 0.071 1.000 N NA
 3342549 3342550 SynWH7803_1957 SynWH7803_1958 fabZ lpxC FALSE 0.572 33.000 0.083 1.000 N NA
 3342550 3342551 SynWH7803_1958 SynWH7803_1959 lpxC   TRUE 0.910 0.000 0.052 1.000 Y NA
 3342551 3342552 SynWH7803_1959 SynWH7803_1960   purC TRUE 0.588 47.000 0.058 1.000 N NA
 3342552 3342553 SynWH7803_1960 SynWH7803_1961 purC   FALSE 0.529 -3.000 0.021 NA   NA
 3342554 3342555 SynWH7803_1962 SynWH7803_1963 purD nblS TRUE 0.735 25.000 0.025 0.082 N NA
 3342556 3342557 SynWH7803_1964 SynWH7803_1965 kaiC kaiB TRUE 0.843 67.000 0.927 1.000   NA
 3342557 3342558 SynWH7803_1965 SynWH7803_1966 kaiB kaiA TRUE 0.917 -3.000 0.732 1.000   NA
 3342559 3342560 SynWH7803_1967 SynWH7803_1968 rplU rpmA TRUE 0.964 44.000 0.667 0.018 Y NA
 3342561 3342562 SynWH7803_1969 SynWH7803_1970     FALSE 0.393 9.000 0.029 NA   NA
 3342563 3342564 SynWH7803_1971 SynWH7803_1972 truB   FALSE 0.292 54.000 0.012 NA   NA
 3342565 3342566 SynWH7803_1973 SynWH7803_1974   nagB TRUE 0.769 -3.000 0.048 1.000 N NA
 3342566 3342567 SynWH7803_1974 SynWH7803_1975 nagB   TRUE 0.905 -9.000 0.550 1.000 N NA
 3342568 3342569 SynWH7803_1976 SynWH7803_1977 rnz psbV FALSE 0.258 87.000 0.020 1.000   NA
 3342570 3342571 SynWH7803_1978 SynWH7803_1979   petF FALSE 0.393 102.000 0.500 NA   NA
 3342571 3342572 SynWH7803_1979 SynWH7803_1980 petF prmA FALSE 0.107 142.000 0.027 1.000 N NA
 3342572 3342573 SynWH7803_1980 SynWH7803_1981 prmA serA TRUE 0.724 0.000 0.053 1.000 N NA
 3342574 3342575 SynWH7803_1982 SynWH7803_1983     TRUE 0.843 -3.000 0.442 NA   NA
 3342575 3342576 SynWH7803_1983 RNA_43     FALSE 0.123 75.000 0.000 NA   NA
 3342576 3342577 RNA_43 SynWH7803_1984   murD FALSE 0.157 29.000 0.000 NA   NA
 3342577 3342578 SynWH7803_1984 SynWH7803_1985 murD   FALSE 0.270 58.000 0.008 NA   NA
 3342578 3342579 SynWH7803_1985 SynWH7803_1986     FALSE 0.440 -16.000 0.016 NA   NA
 3342580 3342581 SynWH7803_1987 SynWH7803_1988     FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 3342581 3342582 SynWH7803_1988 SynWH7803_1989   rpoZ TRUE 0.847 -3.000 0.024 0.025   NA
 3342582 3342583 SynWH7803_1989 SynWH7803_1990 rpoZ   FALSE 0.285 26.000 0.013 NA   NA
 3342584 3342585 SynWH7803_1991 SynWH7803_1992 dnaK   FALSE 0.418 70.000 0.200 NA   NA
 3342585 3342586 SynWH7803_1992 SynWH7803_1993   ftrV TRUE 0.595 29.000 0.323 NA   NA
 3342588 3342589 SynWH7803_1995 SynWH7803_1996 gpmI secG TRUE 0.595 22.000 0.041 1.000 N NA
 3342590 3342591 SynWH7803_1997 SynWH7803_1998 mscL groEL FALSE 0.099 139.000 0.007 1.000 N NA
 3342591 3342592 SynWH7803_1998 SynWH7803_1999 groEL groES TRUE 0.970 54.000 0.905 0.008 Y NA
 3342593 3342594 SynWH7803_2000 SynWH7803_2001 atpB atpC TRUE 0.938 83.000 0.837 0.004 Y NA
 3342596 3342597 SynWH7803_2003 SynWH7803_2004 gph   FALSE 0.394 76.000 0.042 1.000   NA
 3342599 3342600 SynWH7803_2006 SynWH7803_2007     FALSE 0.442 -3.000 0.004 NA   NA
 3342600 3342601 SynWH7803_2007 SynWH7803_2008   nadD TRUE 0.602 -3.000 0.002 1.000   NA
 3342601 3342602 SynWH7803_2008 SynWH7803_2009 nadD nadE TRUE 0.930 7.000 0.023 0.003 Y NA
 3342602 3342603 SynWH7803_2009 SynWH7803_2010 nadE ald TRUE 0.586 30.000 0.036 1.000 N NA
 3342604 3342605 SynWH7803_2011 SynWH7803_2012     FALSE 0.115 104.000 0.125 NA   NA
 3342605 3342606 SynWH7803_2012 SynWH7803_2013     FALSE 0.453 5.000 0.125 NA   NA
 3342606 3342607 SynWH7803_2013 SynWH7803_2014   petF TRUE 0.720 -3.000 0.250 NA   NA
 3342607 3342608 SynWH7803_2014 SynWH7803_2015 petF   TRUE 0.802 34.000 0.750 NA   NA
 3342608 3342609 SynWH7803_2015 SynWH7803_2016   atpC FALSE 0.125 89.000 0.009 NA   NA
 3342609 3342610 SynWH7803_2016 SynWH7803_2017 atpC atpA TRUE 0.972 12.000 0.846 0.004 Y NA
 3342610 3342611 SynWH7803_2017 SynWH7803_2018 atpA atpD TRUE 0.968 61.000 0.864 0.004 Y NA
 3342611 3342612 SynWH7803_2018 SynWH7803_2019 atpD atpF TRUE 0.952 0.000 0.132 0.004 Y NA
 3342612 3342613 SynWH7803_2019 SynWH7803_2020 atpF atpG TRUE 0.966 9.000 0.569 0.004 Y NA
 3342613 3342614 SynWH7803_2020 SynWH7803_2021 atpG atpH TRUE 0.903 81.000 0.368 0.004 Y NA
 3342614 3342615 SynWH7803_2021 SynWH7803_2022 atpH atpI TRUE 0.642 155.000 0.679 0.004 Y NA
 3342615 3342616 SynWH7803_2022 SynWH7803_2023 atpI   FALSE 0.565 22.000 0.208 1.000   NA
 3342616 3342617 SynWH7803_2023 SynWH7803_2024     FALSE 0.331 87.000 0.184 1.000   NA
 3342618 3342619 SynWH7803_2025 SynWH7803_2026 apcE apcA FALSE 0.038 381.000 0.000 0.005   NA
 3342619 3342620 SynWH7803_2026 SynWH7803_2027 apcA apcB TRUE 0.920 40.000 0.906 0.005   NA
 3342620 3342621 SynWH7803_2027 SynWH7803_2028 apcB apcC TRUE 0.906 6.000 0.531 0.009   NA
 3342621 3342622 SynWH7803_2028 SynWH7803_2029 apcC ftsW FALSE 0.092 128.000 0.103 1.000   NA
 3342622 3342623 SynWH7803_2029 SynWH7803_2030 ftsW ccdA TRUE 0.760 -49.000 0.202 1.000 N NA
 3342623 3342624 SynWH7803_2030 SynWH7803_2031 ccdA resB TRUE 0.926 3.000 0.371 NA Y NA
 3342626 3342627 SynWH7803_2033 SynWH7803_2034     TRUE 0.612 70.000 0.375 NA   NA
 3342627 3342628 SynWH7803_2034 SynWH7803_2035   glnB TRUE 0.796 42.000 0.682 NA   NA
 3342630 3342631 SynWH7803_2037 SynWH7803_2038   purB FALSE 0.281 50.000 0.009 NA   NA
 3342631 3342632 SynWH7803_2038 SynWH7803_2039 purB fumC FALSE 0.128 126.000 0.011 1.000 N NA
 3342633 3342634 SynWH7803_2040 SynWH7803_2041     FALSE 0.501 10.000 0.023 1.000   NA
 3342635 3342636 SynWH7803_2042 SynWH7803_2043 bioF   FALSE 0.554 -3.000 0.053 NA   NA
 3342636 3342637 SynWH7803_2043 SynWH7803_2044     FALSE 0.546 -3.000 0.056 NA   NA
 3342637 3342638 SynWH7803_2044 SynWH7803_2045   bioD TRUE 0.763 -3.000 0.055 1.000 N NA
 3342638 3342639 SynWH7803_2045 SynWH7803_2046 bioD   FALSE 0.483 0.000 0.061 NA   NA
 3342642 3342643 SynWH7803_2049 SynWH7803_2050     TRUE 0.879 -13.000 0.744 NA   NA
 3342645 3342646 SynWH7803_2052 SynWH7803_2053     FALSE 0.400 6.000 0.000 1.000   NA
 3342646 3342647 SynWH7803_2053 SynWH7803_2054     FALSE 0.167 17.000 0.000 NA   NA
 3342647 3342648 SynWH7803_2054 SynWH7803_2055     TRUE 0.906 0.000 1.000 NA   NA
 3342648 3342649 SynWH7803_2055 SynWH7803_2056     FALSE 0.371 72.000 0.175 NA   NA
 3342649 3342650 SynWH7803_2056 SynWH7803_2057     FALSE 0.040 192.000 0.000 1.000 N NA
 3342650 3342651 SynWH7803_2057 SynWH7803_2058     FALSE 0.418 31.000 0.011 1.000   NA
 3342651 3342652 SynWH7803_2058 SynWH7803_2059   hli FALSE 0.534 -3.000 0.022 NA   NA
 3342652 3342653 SynWH7803_2059 SynWH7803_2060 hli rpoC2 TRUE 0.693 69.000 0.476 NA   NA
 3342653 3342654 SynWH7803_2060 SynWH7803_2061 rpoC2 rpoC1 TRUE 0.920 52.000 0.031 0.001 Y NA
 3342654 3342655 SynWH7803_2061 SynWH7803_2062 rpoC1 rpoB TRUE 0.972 49.000 0.851 0.001 Y NA
 3342655 3342656 SynWH7803_2062 SynWH7803_2063 rpoB tatD FALSE 0.024 268.000 0.012 NA N NA
 3342656 3342657 SynWH7803_2063 SynWH7803_2064 tatD rpsT FALSE 0.486 62.000 0.034 NA N NA
 3342659 3342660 SynWH7803_2066 SynWH7803_2067   degQ TRUE 0.591 37.000 0.030 1.000 N NA
 3342660 3342661 SynWH7803_2067 SynWH7803_2068 degQ   FALSE 0.577 36.000 0.087 1.000 N NA
 3342661 3342662 SynWH7803_2068 SynWH7803_2069     FALSE 0.058 286.000 0.000 0.001   NA
 3342662 3342663 SynWH7803_2069 SynWH7803_2070     FALSE 0.012 289.000 0.000 1.000   NA
 3342664 3342665 SynWH7803_2071 SynWH7803_2072     FALSE 0.086 114.000 0.125 NA   NA
 3342665 3342666 SynWH7803_2072 SynWH7803_2073     TRUE 0.803 35.000 0.750 NA   NA
 3342666 3342667 SynWH7803_2073 SynWH7803_2074   aslB TRUE 0.827 -3.000 0.400 NA   NA
 3342667 3342668 SynWH7803_2074 SynWH7803_2075 aslB   TRUE 0.684 44.000 0.400 NA   NA
 3342668 3342669 SynWH7803_2075 SynWH7803_2076     FALSE 0.027 145.000 0.003 NA   NA
 3342669 3342670 SynWH7803_2076 SynWH7803_2077   nusA TRUE 0.807 49.000 0.759 NA   NA
 3342670 3342671 SynWH7803_2077 SynWH7803_2078 nusA   TRUE 0.942 -3.000 0.323 NA Y NA
 3342671 3342672 SynWH7803_2078 SynWH7803_2079   infB FALSE 0.524 64.000 0.171 NA N NA
 3342672 3342673 SynWH7803_2079 SynWH7803_2080 infB   FALSE 0.402 0.000 0.007 NA   NA
 3342673 3342674 SynWH7803_2080 RNA_44     FALSE 0.037 107.000 0.000 NA   NA
 3342674 3342675 RNA_44 SynWH7803_2081     FALSE 0.083 84.000 0.000 NA   NA
 3342679 3342680 SynWH7803_2085 SynWH7803_2086     TRUE 0.877 -7.000 0.636 NA   NA
 3342680 3342681 SynWH7803_2086 SynWH7803_2087     TRUE 0.699 75.000 0.571 NA   NA
 3342683 3342684 SynWH7803_2089 SynWH7803_2090     TRUE 0.734 -3.000 0.265 NA   NA
 3342684 3342685 SynWH7803_2090 SynWH7803_2091   uup FALSE 0.552 -3.000 0.028 NA   NA
 3342688 3342689 SynWH7803_2094 SynWH7803_2095   obgE FALSE 0.088 95.000 0.002 NA   NA
 3342691 3342692 SynWH7803_2097 SynWH7803_2098     TRUE 0.731 0.000 0.044 1.000 N NA
 3342692 3342693 SynWH7803_2098 SynWH7803_2099   hemB FALSE 0.030 341.000 0.033 1.000 N NA
 3342693 3342694 SynWH7803_2099 SynWH7803_2100 hemB dnaJ FALSE 0.569 52.000 0.017 1.000 N NA
 3342695 3342696 SynWH7803_2101 SynWH7803_2102     TRUE 0.737 5.000 0.389 NA   NA
 3342697 3342698 SynWH7803_2103 SynWH7803_2104     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 3342699 3342700 SynWH7803_2105 SynWH7803_2106     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342701 3342702 SynWH7803_2107 SynWH7803_2108     FALSE 0.007 236.000 0.000 NA   NA
 3342703 3342704 SynWH7803_2109 SynWH7803_2110     FALSE 0.261 -13.000 0.000 NA   NA
 3342704 3342705 SynWH7803_2110 SynWH7803_2111     FALSE 0.017 141.000 0.000 NA   NA
 3342705 3342706 SynWH7803_2111 SynWH7803_2112     FALSE 0.003 753.000 0.000 NA   NA
 3342706 3342707 SynWH7803_2112 SynWH7803_2113     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342707 3342708 SynWH7803_2113 SynWH7803_2114     FALSE 0.164 36.000 0.000 NA   NA
 3342709 3342710 SynWH7803_2115 SynWH7803_2116     FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3342710 3342711 SynWH7803_2116 SynWH7803_2117     FALSE 0.232 3.000 0.000 NA   NA
 3342711 3342712 SynWH7803_2117 SynWH7803_2118     FALSE 0.232 3.000 0.000 NA   NA
 3342712 3342713 SynWH7803_2118 SynWH7803_2119     FALSE 0.167 43.000 0.000 NA   NA
 3342713 3342714 SynWH7803_2119 RNA_45   ssrA FALSE 0.248 -32.000 0.000 NA   NA
 3342716 3342717 SynWH7803_2121 SynWH7803_2122     TRUE 0.578 -3.000 0.130 NA   NA
 3342718 3342719 SynWH7803_2123 SynWH7803_2124   smc FALSE 0.293 78.000 0.150 NA   NA
 3342719 3342720 SynWH7803_2124 SynWH7803_2125 smc   FALSE 0.415 61.000 0.177 NA   NA
 3342721 3342722 SynWH7803_2126 SynWH7803_2127 msrB   FALSE 0.463 26.000 0.018 NA N NA
 3342722 3342723 SynWH7803_2127 RNA_46     FALSE 0.157 27.000 0.000 NA   NA
 3342726 3342727 SynWH7803_2130 SynWH7803_2131 psbX   TRUE 0.615 82.000 0.556 NA   NA
 3342727 3342728 SynWH7803_2131 SynWH7803_2132     FALSE 0.457 24.000 0.200 NA   NA
 3342728 3342729 SynWH7803_2132 SynWH7803_2133     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342730 3342731 SynWH7803_2134 SynWH7803_2135 hli   TRUE 0.827 9.000 0.576 1.000   NA
 3342731 3342732 SynWH7803_2135 SynWH7803_2136     FALSE 0.429 26.000 0.016 1.000   NA
 3342734 3342735 SynWH7803_2138 SynWH7803_2139 rpsU   TRUE 0.641 45.000 0.350 NA   NA
 3342735 3342736 SynWH7803_2139 SynWH7803_2140     TRUE 0.594 59.000 0.321 NA   NA
 3342736 3342737 SynWH7803_2140 SynWH7803_2141   def TRUE 0.805 5.000 0.511 NA   NA
 3342739 3342740 SynWH7803_2143 SynWH7803_2144 fucA mtnA TRUE 0.688 -13.000 0.009 1.000 N NA
 3342741 3342742 SynWH7803_2145 SynWH7803_2146 gltS   FALSE 0.326 66.000 0.053 NA   NA
 3342743 3342744 SynWH7803_2147 SynWH7803_2148 csd sufD TRUE 0.755 -3.000 0.081 1.000 N NA
 3342744 3342745 SynWH7803_2148 SynWH7803_2149 sufD sufC TRUE 0.949 3.000 0.482 1.000 Y NA
 3342745 3342746 SynWH7803_2149 SynWH7803_2150 sufC sufB TRUE 0.922 53.000 0.466 1.000 Y NA
 3342746 3342747 SynWH7803_2150 SynWH7803_2151 sufB ftrC TRUE 0.630 6.000 0.016 1.000 N NA
 3342748 3342749 SynWH7803_2152 SynWH7803_2153 fbaB   TRUE 0.620 42.000 0.152 1.000 N NA
 3342749 3342750 SynWH7803_2153 SynWH7803_2154     TRUE 0.678 -3.000 0.212 NA   NA
 3342750 3342751 SynWH7803_2154 SynWH7803_2155     FALSE 0.313 61.000 0.077 NA   NA
 3342751 3342752 SynWH7803_2155 SynWH7803_2156   cpcG1 FALSE 0.437 93.000 0.385 1.000   NA
 3342752 3342753 SynWH7803_2156 SynWH7803_2157 cpcG1   FALSE 0.168 159.000 0.474 1.000   NA
 3342753 3342754 SynWH7803_2157 SynWH7803_2158     TRUE 0.852 11.000 0.947 NA   NA
 3342754 3342755 SynWH7803_2158 SynWH7803_2159     FALSE 0.362 40.000 0.111 NA   NA
 3342755 3342756 SynWH7803_2159 SynWH7803_2160     FALSE 0.021 129.000 0.000 NA   NA
 3342756 3342757 SynWH7803_2160 SynWH7803_2161     FALSE 0.008 210.000 0.000 NA   NA
 3342757 3342758 SynWH7803_2161 SynWH7803_2162     FALSE 0.250 -25.000 0.000 NA   NA
 3342761 3342762 SynWH7803_2165 SynWH7803_2166     TRUE 0.923 -3.000 1.000 NA   NA
 3342762 3342763 SynWH7803_2166 SynWH7803_2167     TRUE 0.897 12.000 1.000 1.000 N NA
 3342765 3342766 SynWH7803_2169 SynWH7803_2170     FALSE 0.173 165.000 0.636 NA   NA
 3342766 3342767 SynWH7803_2170 SynWH7803_2171     TRUE 0.750 27.000 0.556 NA   NA
 3342769 3342770 SynWH7803_2173 SynWH7803_2174   cysH TRUE 0.665 5.000 0.026 1.000 N NA
 3342771 3342772 SynWH7803_2175 SynWH7803_2176 ndh hflX TRUE 0.626 -3.000 0.010 1.000   NA
 3342772 3342773 SynWH7803_2176 SynWH7803_2177 hflX citT TRUE 0.589 -7.000 0.009 1.000   NA
 3342773 3342774 SynWH7803_2177 SynWH7803_2178 citT ktrB/ntpJ TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 3342774 3342775 SynWH7803_2178 SynWH7803_2179 ktrB/ntpJ trkA TRUE 0.951 25.000 0.438 0.003 Y NA
 3342775 3342776 SynWH7803_2179 SynWH7803_2180 trkA anmK FALSE 0.487 14.000 0.017 NA N NA
 3342778 3342779 SynWH7803_2182 SynWH7803_2183     FALSE 0.510 99.000 0.800 NA   NA
 3342781 3342782 SynWH7803_2185 SynWH7803_2186 uup   FALSE 0.077 116.000 0.051 NA   NA
 3342784 3342785 SynWH7803_2188 SynWH7803_2189     FALSE 0.562 99.000 1.000 NA   NA
 3342785 3342786 SynWH7803_2189 SynWH7803_2190     FALSE 0.005 282.000 0.000 NA   NA
 3342786 3342787 SynWH7803_2190 SynWH7803_2191   hli FALSE 0.388 69.000 0.012 1.000   NA
 3342787 3342788 SynWH7803_2191 SynWH7803_2192 hli   FALSE 0.268 106.000 0.357 NA   NA
 3342788 3342789 SynWH7803_2192 SynWH7803_2193   xseA FALSE 0.440 -10.000 0.013 NA   NA
 3342789 3342790 SynWH7803_2193 SynWH7803_2194 xseA xseB TRUE 0.871 46.000 0.412 0.001   NA
 3342790 3342791 SynWH7803_2194 SynWH7803_2195 xseB   FALSE 0.445 -7.000 0.012 NA   NA
 3342792 3342793 SynWH7803_2196 SynWH7803_2197     TRUE 0.662 51.000 0.379 NA   NA
 3342793 3342794 SynWH7803_2197 RNA_47     FALSE 0.031 113.000 0.000 NA   NA
 3342794 3342795 RNA_47 RNA_48     FALSE 0.030 114.000 0.000 NA   NA
 3342795 3342796 RNA_48 RNA_49     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 3342796 3342797 RNA_49 RNA_50     FALSE 0.184 10.000 0.000 NA   NA
 3342797 3342798 RNA_50 RNA_51     FALSE 0.010 177.000 0.000 NA   NA
 3342798 3342799 RNA_51 SynWH7803_2198     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 3342799 3342800 SynWH7803_2198 SynWH7803_2199   tolC TRUE 0.595 15.000 0.096 1.000 N NA
 3342800 3342801 SynWH7803_2199 SynWH7803_2200 tolC   FALSE 0.322 91.000 0.103 1.000 N NA
 3342801 3342802 SynWH7803_2200 SynWH7803_2201   uppP TRUE 0.585 20.000 0.055 1.000 N NA
 3342803 3342804 SynWH7803_2202 SynWH7803_2203   psbU FALSE 0.159 115.000 0.268 NA   NA
 3342804 3342805 SynWH7803_2203 SynWH7803_2204 psbU nadB FALSE 0.490 54.000 0.036 1.000   NA
 3342807 3342808 SynWH7803_2206 SynWH7803_2207     TRUE 0.657 -3.000 0.020 1.000   NA
 3342808 3342809 SynWH7803_2207 SynWH7803_2208     FALSE 0.017 236.000 0.000 1.000   NA
 3342810 3342811 SynWH7803_2209 SynWH7803_2210     FALSE 0.500 25.000 0.238 NA   NA
 3342811 3342812 SynWH7803_2210 SynWH7803_2211   ribD FALSE 0.008 203.000 0.000 NA   NA
 3342812 3342813 SynWH7803_2211 SynWH7803_2212 ribD   TRUE 0.912 13.000 0.370 1.000 Y NA
 3342818 3342819 SynWH7803_2217 SynWH7803_2218   rbfA FALSE 0.470 2.000 0.030 NA   NA
 3342819 3342820 SynWH7803_2218 SynWH7803_2219 rbfA   TRUE 0.602 14.000 0.025 1.000 N NA
 3342820 3342821 SynWH7803_2219 SynWH7803_2220     FALSE 0.488 37.000 0.000 1.000 N NA
 3342821 3342822 SynWH7803_2220 SynWH7803_2221   hemD TRUE 0.684 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3342823 3342824 SynWH7803_2222 SynWH7803_2223     FALSE 0.025 215.000 0.156 NA   NA
 3342824 3342825 SynWH7803_2223 SynWH7803_2224     TRUE 0.857 5.000 0.800 NA   NA
 3342826 3342827 SynWH7803_2225 SynWH7803_2226     FALSE 0.322 64.000 0.100 NA   NA
 3342827 3342828 SynWH7803_2226 SynWH7803_2227     FALSE 0.535 2.000 0.167 NA   NA
 3342828 3342829 SynWH7803_2227 SynWH7803_2228     TRUE 0.905 -3.000 0.778 NA   NA
 3342830 3342831 SynWH7803_2229 SynWH7803_2230     FALSE 0.499 33.000 0.143 1.000   NA
 3342833 3342834 SynWH7803_2232 SynWH7803_2233   dnaJ TRUE 0.853 0.000 0.364 1.000 N NA
 3342834 3342835 SynWH7803_2233 SynWH7803_2234 dnaJ cysK TRUE 0.889 6.000 0.714 1.000 N NA
 3342835 3342836 SynWH7803_2234 SynWH7803_2235 cysK   FALSE 0.039 201.000 0.143 1.000   NA
 3342836 3342837 SynWH7803_2235 SynWH7803_2236     FALSE 0.195 189.000 0.400 0.025   NA
 3342838 3342839 SynWH7803_2237 SynWH7803_2238     FALSE 0.006 247.000 0.000 NA   NA
 3342841 3342842 SynWH7803_2240 SynWH7803_2241     FALSE 0.432 6.000 0.117 NA   NA
 3342842 3342843 SynWH7803_2241 RNA_52     FALSE 0.159 24.000 0.000 NA   NA
 3342843 3342844 RNA_52 SynWH7803_2242     FALSE 0.004 315.000 0.000 NA   NA
 3342845 3342846 SynWH7803_2243 SynWH7803_2244 holB tmk TRUE 0.772 4.000 0.254 1.000 N NA
 3342846 3342847 SynWH7803_2244 SynWH7803_2245 tmk copA TRUE 0.813 3.000 0.020 0.078 N NA
 3342850 3342851 SynWH7803_2248 SynWH7803_2249   plsX TRUE 0.712 -19.000 0.026 1.000 N NA
 3342851 3342852 SynWH7803_2249 SynWH7803_2250 plsX fabH TRUE 0.948 53.000 0.380 0.004 Y NA
 3342852 3342853 SynWH7803_2250 SynWH7803_2251 fabH fabD TRUE 0.911 28.000 0.043 0.004 Y NA
 3342853 3342854 SynWH7803_2251 SynWH7803_2252 fabD plsC TRUE 0.912 3.000 0.218 1.000 Y NA
 3342855 3342856 SynWH7803_2253 SynWH7803_2254     FALSE 0.435 0.000 0.014 NA   NA
 3342856 3342857 SynWH7803_2254 SynWH7803_2255     FALSE 0.537 -3.000 0.023 NA   NA
 3342858 3342859 SynWH7803_2256 SynWH7803_2257 pcnB   FALSE 0.524 65.000 0.191 1.000   NA
 3342861 3342862 SynWH7803_2259 SynWH7803_2260 devB devC TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 3342862 3342863 SynWH7803_2260 SynWH7803_2261 devC devA TRUE 0.854 6.000 0.000 1.000 Y NA
 3342863 3342864 SynWH7803_2261 SynWH7803_2262 devA mhpC FALSE 0.162 21.000 0.000 NA   NA
 3342864 3342865 SynWH7803_2262 SynWH7803_2263 mhpC   FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342866 3342867 SynWH7803_2264 SynWH7803_2265     FALSE 0.373 41.000 0.000 NA N NA
 3342867 3342868 SynWH7803_2265 SynWH7803_2266     FALSE 0.175 13.000 0.000 NA   NA
 3342868 3342869 SynWH7803_2266 SynWH7803_2267   minD FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342869 3342870 SynWH7803_2267 SynWH7803_2268 minD   FALSE 0.393 76.000 0.000 1.000 N NA
 3342870 3342871 SynWH7803_2268 SynWH7803_2269   crtB TRUE 0.684 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3342871 3342872 SynWH7803_2269 SynWH7803_2270 crtB   TRUE 0.596 3.000 0.000 1.000 N NA
 3342872 3342873 SynWH7803_2270 SynWH7803_2271     TRUE 0.950 0.000 0.105 0.006 Y NA
 3342873 3342874 SynWH7803_2271 SynWH7803_2272     TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 3342874 3342875 SynWH7803_2272 SynWH7803_2273     FALSE 0.400 6.000 0.000 1.000   NA
 3342876 3342877 SynWH7803_2274 SynWH7803_2275     TRUE 0.605 -3.000 0.154 NA   NA
 3342879 3342880 SynWH7803_2277 SynWH7803_2278   ndhF FALSE 0.371 35.000 0.041 NA   NA
 3342880 3342881 SynWH7803_2278 SynWH7803_2279 ndhF   FALSE 0.041 104.000 0.000 NA   NA
 3342881 3342882 SynWH7803_2279 SynWH7803_2280   ndhD FALSE 0.004 341.000 0.000 NA   NA
 3342882 3342883 SynWH7803_2280 SynWH7803_2281 ndhD   FALSE 0.281 54.000 0.009 NA   NA
 3342883 3342884 SynWH7803_2281 SynWH7803_2282     FALSE 0.369 47.000 0.034 NA   NA
 3342887 3342888 SynWH7803_2285 SynWH7803_2286     FALSE 0.304 67.000 0.090 NA   NA
 3342888 3342889 SynWH7803_2286 SynWH7803_2287   ppnK FALSE 0.521 8.000 0.101 1.000   NA
 3342889 3342890 SynWH7803_2287 SynWH7803_2288 ppnK ndhE TRUE 0.584 16.000 0.071 1.000 N NA
 3342890 3342891 SynWH7803_2288 SynWH7803_2289 ndhE ndhG TRUE 0.959 22.000 0.506 0.002 Y NA
 3342891 3342892 SynWH7803_2289 SynWH7803_2290 ndhG   TRUE 0.964 -3.000 0.192 0.007 Y NA
 3342892 3342893 SynWH7803_2290 SynWH7803_2291   ndhA TRUE 0.866 82.000 0.242 0.007 Y NA
 3342893 3342894 SynWH7803_2291 SynWH7803_2292 ndhA gltA TRUE 0.847 25.000 0.137 1.000 Y NA
 3342894 3342895 SynWH7803_2292 SynWH7803_2293 gltA sixA TRUE 0.617 26.000 0.171 1.000 N NA
 3342895 3342896 SynWH7803_2293 SynWH7803_2294 sixA   FALSE 0.457 -22.000 0.078 NA   NA
 3342897 3342898 SynWH7803_2295 SynWH7803_2296 pspE hcrA FALSE 0.227 95.000 0.031 NA N NA
 3342898 3342899 SynWH7803_2296 SynWH7803_2297 hcrA   FALSE 0.031 193.000 0.003 NA N NA
 3342900 3342901 SynWH7803_2298 SynWH7803_2299   trpB FALSE 0.352 57.000 0.105 NA   NA
 3342901 3342902 SynWH7803_2299 SynWH7803_2300 trpB   TRUE 0.627 39.000 0.263 1.000   NA
 3342903 3342904 SynWH7803_2301 SynWH7803_2302   cysC TRUE 0.598 39.000 0.047 1.000 N NA
 3342905 3342906 SynWH7803_2303 SynWH7803_2304   purE FALSE 0.456 -3.000 0.007 NA   NA
 3342907 3342908 SynWH7803_2305 SynWH7803_2306 nagA chlM TRUE 0.589 27.000 0.128 1.000 N NA
 3342909 3342910 SynWH7803_2307 SynWH7803_2308     FALSE 0.340 42.000 0.022 NA   NA
 3342910 3342911 SynWH7803_2308 SynWH7803_2309     TRUE 0.754 -3.000 0.074 1.000 N NA
 3342911 3342912 SynWH7803_2309 SynWH7803_2310     FALSE 0.515 34.000 0.244 NA   NA
 3342913 3342914 SynWH7803_2311 SynWH7803_2312     FALSE 0.163 88.000 0.086 NA   NA
 3342916 3342917 SynWH7803_2314 SynWH7803_2315 ndhH   TRUE 0.594 -10.000 0.182 NA   NA
 3342918 3342919 SynWH7803_2316 SynWH7803_2317 menE menC TRUE 0.851 -3.000 0.283 1.000 N NA
 3342919 3342920 SynWH7803_2317 SynWH7803_2318 menC menA TRUE 0.883 5.000 0.096 1.000 Y NA
 3342922 3342923 SynWH7803_2320 SynWH7803_2321   gshB FALSE 0.540 36.000 0.005 1.000 N NA
 3342923 3342924 SynWH7803_2321 SynWH7803_2322 gshB   FALSE 0.577 24.000 0.025 1.000 N NA
 3342925 3342926 SynWH7803_2323 SynWH7803_2324     FALSE 0.307 -3.000 0.000 NA   NA
 3342926 3342927 SynWH7803_2324 SynWH7803_2325   prfB FALSE 0.058 92.000 0.000 NA   NA
 3342927 3342928 SynWH7803_2325 SynWH7803_2326 prfB   FALSE 0.450 3.000 0.025 NA   NA
 3342928 3342929 SynWH7803_2326 SynWH7803_2327     FALSE 0.572 -3.000 0.039 NA   NA
 3342929 3342930 SynWH7803_2327 SynWH7803_2328   dgkA TRUE 0.622 -22.000 0.123 1.000   NA
 3342930 3342931 SynWH7803_2328 SynWH7803_2329 dgkA pabA TRUE 0.752 4.000 0.231 1.000 N NA
 3342931 3342932 SynWH7803_2329 SynWH7803_2330 pabA   FALSE 0.489 27.000 0.231 NA   NA
 3342933 3342934 SynWH7803_2331 SynWH7803_2332 hisC   FALSE 0.168 16.000 0.000 NA   NA
 3342936 3342937 SynWH7803_2334 SynWH7803_2335 yccC   FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3342937 3342938 SynWH7803_2335 SynWH7803_2336   argS FALSE 0.264 0.000 0.000 NA   NA
 3342938 3342939 SynWH7803_2336 SynWH7803_2337 argS nadC FALSE 0.550 31.000 0.014 1.000 N NA
 3342939 3342940 SynWH7803_2337 SynWH7803_2338 nadC   FALSE 0.386 0.000 0.004 NA   NA
 3342945 3342946 SynWH7803_2343 SynWH7803_2344     FALSE 0.414 5.000 0.000 1.000   NA
 3342946 3342947 SynWH7803_2344 SynWH7803_2345     FALSE 0.021 192.000 0.000 1.000   NA
 3342947 3342948 SynWH7803_2345 SynWH7803_2346     FALSE 0.256 76.000 0.000 1.000   NA
 3342948 3342949 SynWH7803_2346 SynWH7803_2347     FALSE 0.039 106.000 0.000 NA   NA
 3342950 3342951 SynWH7803_2348 SynWH7803_2349   rbgA TRUE 0.647 -3.000 0.018 1.000   NA
 3342951 3342952 SynWH7803_2349 SynWH7803_2350 rbgA usp TRUE 0.664 -3.000 0.023 1.000   NA
 3342954 3342955 SynWH7803_2352 SynWH7803_2353   hupE FALSE 0.401 24.000 0.160 NA   NA
 3342955 3342956 SynWH7803_2353 SynWH7803_2354 hupE   TRUE 0.680 2.000 0.280 NA   NA
 3342956 3342957 SynWH7803_2354 SynWH7803_2355     FALSE 0.535 6.000 0.200 NA   NA
 3342957 3342958 SynWH7803_2355 SynWH7803_2356     TRUE 0.674 0.000 0.250 NA   NA
 3342966 3342967 SynWH7803_2364 SynWH7803_2365 gspD   FALSE 0.141 91.000 0.080 NA   NA
 3342967 3342968 SynWH7803_2365 SynWH7803_2366     FALSE 0.526 -3.000 0.079 NA   NA
 3342968 3342969 SynWH7803_2366 SynWH7803_2367     FALSE 0.553 -3.000 0.105 NA   NA
 3342969 3342970 SynWH7803_2367 SynWH7803_2368   pyrD FALSE 0.284 46.000 0.009 NA   NA
 3342970 3342971 SynWH7803_2368 SynWH7803_2369 pyrD rnhA TRUE 0.604 15.000 0.031 1.000 N NA
 3342973 3342974 SynWH7803_2371 SynWH7803_2372 rplL rplJ TRUE 0.950 48.000 0.884 1.000 Y NA
 3342974 3342975 SynWH7803_2372 SynWH7803_2373 rplJ rplA FALSE 0.210 242.000 0.302 1.000 Y NA
 3342975 3342976 SynWH7803_2373 SynWH7803_2374 rplA rplK TRUE 0.941 81.000 0.838 0.023 Y NA
 3342976 3342977 SynWH7803_2374 SynWH7803_2375 rplK nusG FALSE 0.512 111.000 0.681 1.000 N NA
 3342977 3342978 SynWH7803_2375 SynWH7803_2376 nusG secE TRUE 0.863 64.000 0.843 1.000 N NA
 3342978 3342979 SynWH7803_2376 SynWH7803_2377 secE clpB FALSE 0.293 94.000 0.023 1.000 N NA
 3342979 3342980 SynWH7803_2377 SynWH7803_2378 clpB gloA TRUE 0.603 12.000 0.061 1.000 N NA
 3342982 3342983 SynWH7803_2380 SynWH7803_2381     TRUE 0.881 -3.000 0.576 NA   NA
 3342983 3342984 SynWH7803_2381 SynWH7803_2382     TRUE 0.769 40.000 0.579 NA   NA
 3342984 3342985 SynWH7803_2382 SynWH7803_2383   argJ FALSE 0.139 86.000 0.008 NA   NA
 3342989 3342990 SynWH7803_2387 SynWH7803_2388 glnAIII ndk FALSE 0.485 70.000 0.002 1.000 N NA
 3342991 3342992 SynWH7803_2389 SynWH7803_2390 speA   FALSE 0.536 4.000 0.006 NA N NA
 3342992 3342993 SynWH7803_2390 SynWH7803_2391     FALSE 0.364 58.000 0.000 NA N NA
 3342993 3342994 SynWH7803_2391 SynWH7803_2392     FALSE 0.022 212.000 0.000 NA N NA
 3342997 3342998 SynWH7803_2395 SynWH7803_2396     FALSE 0.136 71.000 0.000 NA