MicrobesOnline Operon Predictions for Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5414066	5414067	CMS_0001	CMS_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.517	508.000	0.328	1.000	Y	NA
5414069	5414070	CMS_0004	CMS_0005			TRUE	0.609	8.000	0.009	1.000	N	NA
5414070	5414071	CMS_0005	CMS_0006			TRUE	0.961	-3.000	0.099	NA		NA
5414071	5414072	CMS_0006	CMS_0007			FALSE	0.067	241.000	0.022	NA		NA
5414072	5414073	CMS_0007	CMS_0008			TRUE	0.895	83.000	0.306	0.003	Y	NA
5414073	5414074	CMS_0008	CMS_0009			TRUE	0.904	-7.000	0.053	NA		NA
5414074	5414075	CMS_0009	CMS_r021			FALSE	0.183	49.000	0.000	NA		NA
5414075	5414076	CMS_r021	CMS_r007			FALSE	0.148	84.000	0.000	NA		NA
5414078	5414079	CMS_0011	CMS_0012	cypB	yggP	TRUE	0.966	0.000	0.182	1.000		NA
5414081	5414082	CMS_0014	CMS_0015	srtA		TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5414082	5414083	CMS_0015	CMS_0016			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414084	5414085	CMS_0017	CMS_0018		pknA	TRUE	0.875	135.000	0.368	0.002	Y	NA
5414085	5414086	CMS_0018	CMS_0019	pknA		TRUE	0.978	-3.000	0.162	0.005	N	NA
5414086	5414087	CMS_0019	CMS_0020			TRUE	0.959	-3.000	0.070	1.000	N	NA
5414087	5414088	CMS_0020	CMS_0021			TRUE	0.734	65.000	0.180	1.000	N	NA
5414088	5414089	CMS_0021	CMS_0022			TRUE	0.984	5.000	0.267	NA	Y	NA
5414089	5414090	CMS_0022	CMS_0023			TRUE	0.993	-3.000	0.629	NA		NA
5414091	5414092	CMS_r032	CMS_0024			FALSE	0.110	120.000	0.000	NA		NA
5414094	5414095	CMS_0026	CMS_0027			TRUE	0.782	14.000	0.000	0.020	Y	NA
5414096	5414097	CMS_0028	CMS_0029			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
5414098	5414099	CMS_0030	CMS_0031		recQ	FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5414101	5414102	CMS_0033	CMS_0034			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414104	5414105	CMS_0036	CMS_0037			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5414106	5414107	CMS_0038	CMS_0039		mscL	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5414107	5414108	CMS_0039	CMS_0040	mscL		TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414108	5414109	CMS_0040	CMS_0041			FALSE	0.113	99.000	0.000	NA		NA
5414110	5414111	CMS_0042	CMS_0043	galU		FALSE	0.398	58.000	0.024	1.000	N	NA
5414111	5414112	CMS_0043	CMS_0044			FALSE	0.229	99.000	0.037	NA		NA
5414112	5414113	CMS_0044	CMS_r008			FALSE	0.108	114.000	0.000	NA		NA
5414113	5414114	CMS_r008	CMS_0045		celB	FALSE	0.055	211.000	0.000	NA		NA
5414114	5414115	CMS_0045	CMS_0047	celB		FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5414115	5414116	CMS_0047	CMS_0048			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
5414118	5414119	CMS_0050	CMS_0051			TRUE	0.798	116.000	0.500	1.000	N	NA
5414119	5414120	CMS_0051	CMS_0052			TRUE	0.963	96.000	1.000	0.063	Y	NA
5414120	5414121	CMS_0052	CMS_0053			TRUE	0.995	-3.000	0.333	0.063	Y	NA
5414121	5414122	CMS_0053	CMS_0054		abfA	TRUE	0.898	83.000	0.333	1.000	Y	NA
5414122	5414123	CMS_0054	CMS_0055	abfA		FALSE	0.137	165.000	0.000	1.000	N	NA
5414123	5414124	CMS_0055	CMS_0056			TRUE	0.639	37.000	0.000	1.000	Y	NA
5414124	5414125	CMS_0056	CMS_0057			FALSE	0.026	415.000	0.000	1.000		NA
5414125	5414126	CMS_0057	CMS_0058			FALSE	0.039	273.000	0.000	1.000		NA
5414126	5414127	CMS_0058	CMS_0059			TRUE	0.997	4.000	0.857	0.063	Y	NA
5414127	5414128	CMS_0059	CMS_0060			TRUE	0.997	-3.000	0.571	0.063	Y	NA
5414128	5414129	CMS_0060	CMS_0061			TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5414129	5414130	CMS_0061	CMS_0062			TRUE	0.833	-3.000	0.000	0.003		NA
5414130	5414131	CMS_0062	CMS_0063		pip	TRUE	0.843	-3.000	0.015	1.000		NA
5414131	5414132	CMS_0063	CMS_0064	pip		TRUE	0.829	-3.000	0.000	0.030		NA
5414132	5414133	CMS_0064	CMS_0065			TRUE	0.730	20.000	0.000	1.000	Y	NA
5414133	5414134	CMS_0065	CMS_0066			FALSE	0.253	143.000	0.054	NA		NA
5414134	5414135	CMS_0066	CMS_0067			TRUE	0.929	-3.000	0.053	NA		NA
5414135	5414136	CMS_0067	CMS_0068			TRUE	0.891	8.000	0.018	1.000	Y	NA
5414136	5414137	CMS_0068	CMS_0069			FALSE	0.342	27.000	0.000	1.000	N	NA
5414137	5414138	CMS_0069	CMS_0070			FALSE	0.080	227.000	0.000	1.000	N	NA
5414139	5414140	CMS_0071	CMS_0072			FALSE	0.085	165.000	0.000	NA		NA
5414140	5414141	CMS_0072	CMS_0073			FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5414141	5414142	CMS_0073	CMS_0074			TRUE	0.782	-6.000	0.000	0.095		NA
5414142	5414143	CMS_0074	CMS_0075			FALSE	0.179	71.000	0.000	1.000		NA
5414146	5414147	CMS_0078	CMS_0079			FALSE	0.029	353.000	0.000	NA		NA
5414147	5414148	CMS_0079	CMS_0080			FALSE	0.030	347.000	0.000	NA		NA
5414148	5414149	CMS_0080	CMS_0081			TRUE	0.955	0.000	0.000	NA	Y	NA
5414149	5414150	CMS_0081	CMS_0082			TRUE	0.987	-3.000	0.333	1.000		NA
5414150	5414151	CMS_0082	CMS_0083			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5414151	5414152	CMS_0083	CMS_0084			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5414152	5414153	CMS_0084	CMS_0086			FALSE	0.111	103.000	0.000	NA		NA
5414157	5414158	CMS_0090	CMS_0091			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414161	5414162	CMS_r041	CMS_r015			FALSE	0.170	73.000	0.000	NA		NA
5414162	5414163	CMS_r015	CMS_r016			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5414164	5414165	CMS_0094	CMS_0095			TRUE	0.806	2.000	0.000	NA	N	NA
5414167	5414168	CMS_0097	CMS_0098			TRUE	0.958	2.000	0.137	0.044	N	NA
5414168	5414169	CMS_0098	CMS_0099			TRUE	0.525	158.000	0.180	1.000	N	NA
5414169	5414170	CMS_0099	CMS_0100			TRUE	0.639	6.000	0.006	1.000	N	NA
5414170	5414171	CMS_0100	CMS_0101			TRUE	0.974	-3.000	0.023	1.000	Y	NA
5414171	5414172	CMS_0101	CMS_0102			TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5414172	5414173	CMS_0102	CMS_0103			TRUE	0.764	-6.000	0.000	NA		NA
5414173	5414174	CMS_0103	CMS_0104			TRUE	0.954	-3.000	0.081	NA		NA
5414174	5414175	CMS_0104	CMS_0105			TRUE	0.647	51.000	0.163	NA		NA
5414175	5414176	CMS_0105	CMS_0106			TRUE	0.992	-3.000	0.577	NA		NA
5414176	5414177	CMS_0106	CMS_0107			TRUE	0.939	-3.000	0.062	NA		NA
5414177	5414178	CMS_0107	CMS_0108			TRUE	0.482	43.000	0.067	NA		NA
5414178	5414179	CMS_0108	CMS_0109			FALSE	0.158	116.000	0.009	1.000	N	NA
5414179	5414180	CMS_0109	CMS_0110			FALSE	0.337	13.000	0.000	NA		NA
5414180	5414181	CMS_0110	CMS_0111			FALSE	0.265	22.000	0.000	NA		NA
5414181	5414182	CMS_0111	CMS_0112			FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5414182	5414183	CMS_0112	CMS_0113		galE	FALSE	0.142	161.000	0.000	1.000	N	NA
5414183	5414184	CMS_0113	CMS_0114	galE		TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5414184	5414185	CMS_0114	CMS_0115			FALSE	0.063	272.000	0.000	1.000	N	NA
5414185	5414186	CMS_0115	CMS_0116			TRUE	0.973	75.000	0.884	0.020	Y	NA
5414188	5414189	CMS_0118	CMS_0119			TRUE	0.571	93.000	0.145	1.000	N	NA
5414191	5414192	CMS_0121	CMS_0122			TRUE	0.932	136.000	0.670	0.063	Y	NA
5414192	5414193	CMS_0122	CMS_0123			TRUE	0.998	-3.000	0.693	0.063	Y	NA
5414193	5414194	CMS_0123	CMS_0124			FALSE	0.064	283.000	0.000	0.074	N	NA
5414195	5414196	CMS_0125	CMS_0126			TRUE	0.931	3.000	0.111	NA		NA
5414197	5414198	CMS_0127	CMS_0128			TRUE	0.811	50.000	0.087	0.017	Y	NA
5414200	5414201	CMS_0130	CMS_0131		araB	FALSE	0.106	188.000	0.000	1.000	N	NA
5414201	5414202	CMS_0131	CMS_0132	araB		TRUE	0.983	-3.000	0.217	1.000	N	NA
5414202	5414203	CMS_0132	CMS_0133		araA	TRUE	0.990	-3.000	0.138	1.000	Y	NA
5414203	5414204	CMS_0133	CMS_0134	araA		TRUE	0.673	75.000	0.034	NA	Y	NA
5414204	5414205	CMS_0134	CMS_0135			TRUE	0.676	180.000	0.176	NA	Y	NA
5414205	5414206	CMS_0135	CMS_0136			TRUE	0.995	6.000	0.800	1.000	Y	NA
5414206	5414207	CMS_0136	CMS_0137			FALSE	0.104	137.000	0.000	NA		NA
5414210	5414211	CMS_0140	CMS_0141		xylA	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5414212	5414213	CMS_0142	CMS_0143			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5414214	5414215	CMS_0144	CMS_0145			TRUE	0.463	136.000	0.000	0.070	Y	NA
5414216	5414217	CMS_0146	CMS_0147			FALSE	0.222	86.000	0.000	1.000	N	NA
5414217	5414218	CMS_0147	CMS_0148			FALSE	0.109	110.000	0.000	NA		NA
5414219	5414220	CMS_0149	CMS_0150			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414220	5414221	CMS_0150	CMS_r044			FALSE	0.058	204.000	0.000	NA		NA
5414221	5414222	CMS_r044	CMS_0151			FALSE	0.187	46.000	0.000	NA		NA
5414222	5414223	CMS_0151	CMS_0152			FALSE	0.027	399.000	0.000	1.000		NA
5414224	5414225	CMS_0153	CMS_0154			TRUE	0.698	55.000	0.185	1.000		NA
5414225	5414226	CMS_0154	CMS_0155			FALSE	0.036	304.000	0.000	1.000		NA
5414226	5414227	CMS_0155	CMS_0156			FALSE	0.050	220.000	0.000	NA		NA
5414227	5414228	CMS_0156	CMS_0157			TRUE	0.993	-3.000	0.600	NA		NA
5414228	5414229	CMS_0157	CMS_0158			FALSE	0.250	25.000	0.000	1.000		NA
5414229	5414230	CMS_0158	CMS_0159		recR	TRUE	0.920	7.000	0.028	0.009	Y	NA
5414230	5414231	CMS_0159	CMS_0160	recR		FALSE	0.163	113.000	0.010	1.000	N	NA
5414231	5414232	CMS_0160	CMS_0161			TRUE	0.848	62.000	0.119	1.000	Y	NA
5414232	5414233	CMS_0161	CMS_0162			FALSE	0.085	88.000	0.003	1.000		NA
5414233	5414234	CMS_0162	CMS_0164			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5414234	5414235	CMS_0164	CMS_0165			FALSE	0.096	150.000	0.000	NA		NA
5414235	5414236	CMS_0165	CMS_0166			TRUE	0.817	1.000	0.000	1.000	N	NA
5414236	5414237	CMS_0166	CMS_0167			FALSE	0.045	377.000	0.000	1.000	N	NA
5414237	5414238	CMS_0167	CMS_0168			FALSE	0.028	363.000	0.000	NA		NA
5414238	5414239	CMS_0168	CMS_0169			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414239	5414240	CMS_0169	CMS_0170			FALSE	0.301	17.000	0.000	NA		NA
5414240	5414241	CMS_0170	CMS_0171			FALSE	0.033	320.000	0.000	NA		NA
5414243	5414244	CMS_0173	CMS_0174			FALSE	0.178	126.000	0.000	1.000	N	NA
5414244	5414245	CMS_0174	CMS_0175			FALSE	0.148	155.000	0.000	1.000	N	NA
5414245	5414246	CMS_0175	CMS_0176			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5414247	5414248	CMS_r046	CMS_0177			FALSE	0.200	64.000	0.000	NA		NA
5414248	5414249	CMS_0177	CMS_0178			TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
5414250	5414251	CMS_0179	CMS_0180			TRUE	0.944	0.000	0.094	NA		NA
5414253	5414254	CMS_0182	CMS_0183			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414254	5414255	CMS_0183	CMS_0184			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414255	5414256	CMS_0184	CMS_0185			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414256	5414257	CMS_0185	CMS_0186			TRUE	0.745	-10.000	0.000	NA		NA
5414257	5414258	CMS_0186	CMS_0187			FALSE	0.054	214.000	0.000	NA		NA
5414258	5414259	CMS_0187	CMS_0188			TRUE	0.896	-3.000	0.015	1.000	N	NA
5414259	5414260	CMS_0188	CMS_0189			TRUE	0.936	-3.000	0.037	1.000	N	NA
5414260	5414261	CMS_0189	CMS_0190			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414261	5414262	CMS_0190	CMS_r031			FALSE	0.108	115.000	0.000	NA		NA
5414262	5414263	CMS_r031	CMS_0191			FALSE	0.035	287.000	0.000	NA		NA
5414263	5414264	CMS_0191	CMS_0192			FALSE	0.297	65.000	0.000	1.000	N	NA
5414264	5414265	CMS_0192	CMS_0193			FALSE	0.250	80.000	0.000	0.078	N	NA
5414265	5414266	CMS_0193	CMS_0194			TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5414266	5414267	CMS_0194	CMS_0195			FALSE	0.110	120.000	0.000	NA		NA
5414269	5414270	CMS_0197	CMS_0198			TRUE	0.995	-3.000	0.313	1.000	Y	NA
5414270	5414271	CMS_0198	CMS_0199			TRUE	0.984	-3.000	0.255	0.006		NA
5414273	5414274	CMS_0201	CMS_0202			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5414277	5414278	CMS_0205	CMS_0206			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5414280	5414281	CMS_0208	CMS_0209			FALSE	0.109	165.000	0.015	0.059		NA
5414283	5414284	CMS_0211	CMS_0212			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
5414284	5414285	CMS_0212	CMS_0213			FALSE	0.100	142.000	0.000	NA		NA
5414285	5414286	CMS_0213	CMS_0214			TRUE	0.476	9.000	0.000	1.000		NA
5414287	5414288	CMS_0215	CMS_0216			TRUE	0.742	-12.000	0.000	NA		NA
5414289	5414290	CMS_0217	CMS_0218			FALSE	0.030	343.000	0.000	NA		NA
5414290	5414291	CMS_0218	CMS_0219			FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5414291	5414292	CMS_0219	CMS_0220			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5414295	5414296	CMS_0223	CMS_0224			FALSE	0.096	150.000	0.000	NA		NA
5414297	5414298	CMS_0225	CMS_0226			FALSE	0.060	197.000	0.000	NA		NA
5414298	5414299	CMS_0226	CMS_0227			FALSE	0.041	258.000	0.000	NA		NA
5414299	5414300	CMS_0227	CMS_0228			FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5414300	5414301	CMS_0228	CMS_0229			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414301	5414302	CMS_0229	CMS_0230			TRUE	0.948	-3.000	0.071	NA		NA
5414303	5414304	CMS_0231	CMS_0232			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5414304	5414305	CMS_0232	CMS_0233		pyrE	FALSE	0.288	67.000	0.000	1.000	N	NA
5414305	5414306	CMS_0233	CMS_0234	pyrE		TRUE	0.685	0.000	0.006	NA		NA
5414306	5414307	CMS_0234	CMS_0235			FALSE	0.112	125.000	0.000	NA		NA
5414307	5414308	CMS_0235	CMS_0236			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414308	5414309	CMS_0236	CMS_0237			FALSE	0.170	73.000	0.000	NA		NA
5414309	5414310	CMS_0237	CMS_0238			FALSE	0.204	58.000	0.000	NA		NA
5414314	5414315	CMS_0242	CMS_0243			FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5414317	5414318	CMS_0245	CMS_0246			FALSE	0.094	153.000	0.000	NA		NA
5414318	5414319	CMS_0246	CMS_0247			FALSE	0.157	79.000	0.000	NA		NA
5414321	5414322	CMS_0249	CMS_0250			TRUE	0.995	-3.000	0.667	1.000	N	NA
5414322	5414323	CMS_0250	CMS_0251			FALSE	0.100	142.000	0.000	NA		NA
5414323	5414324	CMS_0251	CMS_0252			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5414324	5414325	CMS_0252	CMS_0253			TRUE	0.733	0.000	0.010	NA		NA
5414325	5414326	CMS_0253	CMS_0254			TRUE	0.958	-3.000	0.089	NA		NA
5414326	5414327	CMS_0254	CMS_0255			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5414327	5414328	CMS_0255	CMS_0256			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414329	5414330	CMS_0257	CMS_0258			FALSE	0.044	246.000	0.000	NA		NA
5414330	5414331	CMS_0258	CMS_0261			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414331	5414332	CMS_0261	CMS_0262			FALSE	0.036	285.000	0.000	NA		NA
5414334	5414335	CMS_0264	CMS_0265			FALSE	0.091	209.000	0.000	NA	N	NA
5414335	5414336	CMS_0265	CMS_0266			FALSE	0.102	140.000	0.000	NA		NA
5414336	5414337	CMS_0266	CMS_0267			FALSE	0.194	66.000	0.000	NA		NA
5414337	5414338	CMS_0267	CMS_0268			FALSE	0.103	141.000	0.000	1.000		NA
5414339	5414340	CMS_0269	CMS_0270	rpoB	rpoC	TRUE	0.975	49.000	0.851	0.001	Y	NA
5414340	5414341	CMS_0270	CMS_0271	rpoC		FALSE	0.180	70.000	0.000	NA		NA
5414341	5414342	CMS_0271	CMS_0272			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5414342	5414343	CMS_0272	CMS_0273			TRUE	0.955	45.000	0.594	0.061	Y	NA
5414343	5414344	CMS_0273	CMS_0274			TRUE	0.898	131.000	0.481	1.000	Y	NA
5414344	5414345	CMS_0274	CMS_0275			FALSE	0.168	74.000	0.000	NA		NA
5414345	5414346	CMS_0275	CMS_0276			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5414346	5414347	CMS_0276	CMS_0277			FALSE	0.039	265.000	0.000	NA		NA
5414347	5414348	CMS_0277	CMS_0278			TRUE	0.997	0.000	0.620	0.004	Y	NA
5414348	5414349	CMS_0278	CMS_0279			TRUE	0.951	48.000	0.579	1.000	Y	NA
5414349	5414350	CMS_0279	CMS_0280			TRUE	0.885	115.000	0.400	0.001	Y	NA
5414350	5414351	CMS_0280	CMS_0281			FALSE	0.154	150.000	0.000	1.000	N	NA
5414351	5414352	CMS_0281	CMS_0282			FALSE	0.040	440.000	0.000	1.000	N	NA
5414352	5414353	CMS_0282	CMS_0283			TRUE	0.985	9.000	0.467	0.026	Y	NA
5414353	5414354	CMS_0283	CMS_0284			TRUE	0.992	3.000	0.361	0.019	Y	NA
5414354	5414355	CMS_0284	CMS_0285		rplW	TRUE	0.997	-3.000	0.513	1.000	Y	NA
5414355	5414356	CMS_0285	CMS_0286	rplW		TRUE	0.983	23.000	0.849	1.000	Y	NA
5414356	5414357	CMS_0286	CMS_0287			TRUE	0.988	13.000	0.820	0.026	Y	NA
5414357	5414358	CMS_0287	CMS_0288			TRUE	0.977	26.000	0.769	0.026	Y	NA
5414358	5414359	CMS_0288	CMS_0289			TRUE	0.997	0.000	0.719	0.026	Y	NA
5414359	5414360	CMS_0289	CMS_0290			TRUE	0.997	3.000	0.828	0.026	Y	NA
5414360	5414361	CMS_0290	CMS_0291		rpmC	TRUE	0.998	0.000	0.802	0.019	Y	NA
5414361	5414362	CMS_0291	CMS_0292	rpmC		TRUE	0.999	-3.000	0.828	0.019	Y	NA
5414362	5414363	CMS_0292	CMS_0293			TRUE	0.988	11.000	0.791	0.026	Y	NA
5414363	5414364	CMS_0293	CMS_0294			TRUE	0.997	3.000	0.810	0.026	Y	NA
5414364	5414365	CMS_0294	CMS_0295			TRUE	0.997	3.000	0.758	0.019	Y	NA
5414365	5414366	CMS_0295	CMS_0296			TRUE	0.562	166.000	0.059	0.019	Y	NA
5414366	5414367	CMS_0296	CMS_0297			TRUE	0.996	5.000	0.808	0.019	Y	NA
5414367	5414368	CMS_0297	CMS_0298			TRUE	0.998	-3.000	0.815	0.019	Y	NA
5414368	5414369	CMS_0298	CMS_0299			TRUE	0.973	42.000	0.814	0.026	Y	NA
5414369	5414370	CMS_0299	CMS_0300			TRUE	0.998	0.000	0.789	0.026	Y	NA
5414370	5414371	CMS_0300	CMS_0301		rplO	TRUE	0.966	33.000	0.653	0.003	Y	NA
5414371	5414372	CMS_0301	CMS_0302	rplO		TRUE	0.872	126.000	0.730	1.000	N	NA
5414372	5414373	CMS_0302	CMS_0303			TRUE	0.951	-3.000	0.057	1.000	N	NA
5414373	5414374	CMS_0303	CMS_0304			TRUE	0.984	5.000	0.606	1.000	N	NA
5414376	5414377	CMS_0306	CMS_0307		ptsH	TRUE	0.473	112.000	0.000	0.007	Y	NA
5414377	5414378	CMS_0307	CMS_0308	ptsH	ptsI	TRUE	0.919	63.000	0.286	0.007	Y	NA
5414378	5414379	CMS_0308	CMS_0309	ptsI	mtlA	TRUE	0.504	130.000	0.016	0.007	Y	NA
5414379	5414380	CMS_0309	CMS_0310	mtlA	mtlF	TRUE	0.537	110.000	0.025	0.004	Y	NA
5414380	5414381	CMS_0310	CMS_0311	mtlF	mtlD	TRUE	0.972	-3.000	0.019	1.000	Y	NA
5414381	5414382	CMS_0311	CMS_0312	mtlD	infA	FALSE	0.069	253.000	0.000	1.000	N	NA
5414382	5414383	CMS_0312	CMS_0313	infA		TRUE	0.734	73.000	0.257	1.000		NA
5414383	5414384	CMS_0313	CMS_0314			TRUE	0.510	156.000	0.194	0.019		NA
5414384	5414385	CMS_0314	CMS_0315			TRUE	0.972	46.000	0.810	0.019	Y	NA
5414385	5414386	CMS_0315	CMS_0316			TRUE	0.649	162.000	0.308	1.000	N	NA
5414386	5414387	CMS_0316	CMS_0317			TRUE	0.947	53.000	0.873	1.000	N	NA
5414387	5414388	CMS_0317	CMS_0318			FALSE	0.113	120.000	0.000	1.000		NA
5414388	5414389	CMS_0318	CMS_0319			FALSE	0.227	30.000	0.000	1.000		NA
5414389	5414390	CMS_0319	CMS_0320			TRUE	0.715	79.000	0.058	1.000	Y	NA
5414390	5414391	CMS_0320	CMS_0321			TRUE	0.956	51.000	0.601	0.019	Y	NA
5414391	5414392	CMS_0321	CMS_0322			TRUE	0.644	24.000	0.068	1.000	N	NA
5414394	5414395	CMS_0324	CMS_0325			FALSE	0.191	67.000	0.000	NA		NA
5414396	5414397	CMS_0326	CMS_0327			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5414397	5414398	CMS_0327	CMS_0328			FALSE	0.111	129.000	0.000	NA		NA
5414398	5414399	CMS_0328	CMS_0329			FALSE	0.022	498.000	0.000	1.000		NA
5414399	5414400	CMS_0329	CMS_0330			FALSE	0.120	95.000	0.000	NA		NA
5414400	5414401	CMS_0330	CMS_0331			FALSE	0.065	187.000	0.000	NA		NA
5414402	5414403	CMS_0332	CMS_0333			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414403	5414404	CMS_0333	CMS_0334			FALSE	0.051	219.000	0.000	NA		NA
5414404	5414405	CMS_0334	CMS_0335			FALSE	0.223	31.000	0.000	1.000		NA
5414405	5414406	CMS_0335	CMS_0336			TRUE	0.997	-3.000	0.577	1.000	Y	NA
5414406	5414407	CMS_0336	CMS_0337			TRUE	0.967	15.000	0.448	1.000	Y	NA
5414407	5414408	CMS_0337	CMS_0338			FALSE	0.032	999.000	0.000	1.000	N	NA
5414408	5414409	CMS_0338	CMS_0339			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.019	Y	NA
5414411	5414412	CMS_0341	CMS_0342			FALSE	0.183	49.000	0.000	NA		NA
5414413	5414414	CMS_0343	CMS_0344			FALSE	0.215	32.000	0.000	NA		NA
5414414	5414415	CMS_0344	CMS_0345			FALSE	0.187	46.000	0.000	NA		NA
5414419	5414420	CMS_0349	CMS_0350			FALSE	0.030	349.000	0.000	NA		NA
5414421	5414422	CMS_0351	CMS_0352			TRUE	0.794	12.000	0.000	1.000	Y	NA
5414422	5414423	CMS_0352	CMS_0353			TRUE	0.536	87.000	0.000	1.000	Y	NA
5414423	5414424	CMS_0353	CMS_0354			FALSE	0.162	78.000	0.000	1.000		NA
5414426	5414427	CMS_0356	CMS_0357			FALSE	0.122	95.000	0.000	1.000		NA
5414427	5414428	CMS_0357	CMS_0358			TRUE	0.993	-7.000	0.750	1.000		NA
5414429	5414430	CMS_0359	CMS_0360			FALSE	0.112	100.000	0.000	NA		NA
5414431	5414432	CMS_0361	CMS_0362			TRUE	0.991	-3.000	0.500	NA		NA
5414432	5414433	CMS_0362	CMS_0363			TRUE	0.671	55.000	0.167	NA		NA
5414433	5414434	CMS_0363	CMS_0364			TRUE	0.867	52.000	0.171	0.060	Y	NA
5414434	5414435	CMS_0364	CMS_0365			TRUE	0.992	-3.000	0.171	0.060	Y	NA
5414436	5414437	CMS_0366	CMS_0367			TRUE	0.985	3.000	0.556	NA		NA
5414437	5414438	CMS_0367	CMS_0368			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5414438	5414439	CMS_0368	CMS_0369			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5414439	5414440	CMS_0369	CMS_0370			FALSE	0.094	153.000	0.000	NA		NA
5414442	5414443	CMS_0372	CMS_0373			FALSE	0.024	431.000	0.000	NA		NA
5414443	5414444	CMS_0373	CMS_0374			TRUE	0.990	-7.000	0.200	0.060	Y	NA
5414444	5414445	CMS_0374	CMS_0375			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414446	5414447	CMS_0376	CMS_0377			TRUE	0.806	2.000	0.000	NA	N	NA
5414447	5414448	CMS_0377	CMS_0378			TRUE	0.970	-3.000	0.000	0.003	Y	NA
5414448	5414449	CMS_0378	CMS_0379			FALSE	0.327	189.000	0.000	1.000	Y	NA
5414449	5414450	CMS_0379	CMS_0380			FALSE	0.032	327.000	0.000	NA		NA
5414450	5414451	CMS_0380	CMS_0381			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5414452	5414453	CMS_0382	CMS_0383			FALSE	0.054	214.000	0.000	NA		NA
5414453	5414454	CMS_0383	CMS_0384			FALSE	0.110	107.000	0.000	NA		NA
5414454	5414455	CMS_0384	CMS_0385			TRUE	0.931	9.000	0.295	NA		NA
5414455	5414456	CMS_0385	CMS_0386			FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
5414456	5414457	CMS_0386	CMS_0387			FALSE	0.155	80.000	0.000	NA		NA
5414459	5414460	CMS_0389	CMS_0390			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5414461	5414462	CMS_0391	CMS_0392			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5414468	5414469	CMS_0398	CMS_0399			FALSE	0.298	18.000	0.000	1.000		NA
5414470	5414471	CMS_0400	CMS_0401			FALSE	0.175	125.000	0.000	NA	N	NA
5414475	5414476	CMS_0405	CMS_0406			TRUE	0.845	28.000	0.352	1.000		NA
5414478	5414479	CMS_0408	CMS_0410			FALSE	0.073	179.000	0.000	1.000		NA
5414479	5414480	CMS_0410	CMS_0411			FALSE	0.044	239.000	0.000	NA		NA
5414480	5414481	CMS_0411	CMS_0412			FALSE	0.195	54.000	0.000	NA		NA
5414482	5414483	CMS_0413	CMS_0414			TRUE	0.736	-16.000	0.000	NA		NA
5414483	5414484	CMS_0414	CMS_0415			FALSE	0.108	114.000	0.000	NA		NA
5414485	5414486	CMS_0416	CMS_0417			TRUE	0.973	-3.000	0.167	NA		NA
5414486	5414487	CMS_0417	CMS_0418			FALSE	0.198	55.000	0.000	NA		NA
5414487	5414488	CMS_0418	CMS_0419			FALSE	0.386	11.000	0.000	1.000		NA
5414488	5414489	CMS_0419	CMS_0420			FALSE	0.295	47.000	0.000	0.039	N	NA
5414489	5414490	CMS_0420	CMS_0421			FALSE	0.160	79.000	0.000	1.000		NA
5414494	5414495	CMS_0425	CMS_0426		pgm	FALSE	0.150	83.000	0.000	NA		NA
5414498	5414499	CMS_0429	CMS_0430			TRUE	0.956	-3.000	0.084	1.000		NA
5414499	5414500	CMS_0430	CMS_r037			FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5414500	5414501	CMS_r037	CMS_0431			FALSE	0.301	17.000	0.000	NA		NA
5414501	5414502	CMS_0431	CMS_r038			FALSE	0.025	421.000	0.000	NA		NA
5414502	5414503	CMS_r038	CMS_0432			FALSE	0.197	65.000	0.000	NA		NA
5414503	5414504	CMS_0432	CMS_0433			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5414504	5414505	CMS_0433	CMS_0434			FALSE	0.164	77.000	0.000	1.000		NA
5414505	5414506	CMS_0434	CMS_0435			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5414506	5414507	CMS_0435	CMS_0436			TRUE	0.945	18.000	0.688	NA		NA
5414507	5414508	CMS_0436	CMS_0437			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5414511	5414512	CMS_0439	CMS_0440			TRUE	0.727	-87.000	0.000	NA		NA
5414512	5414513	CMS_0440	CMS_0441			TRUE	0.995	-3.000	0.692	NA		NA
5414514	5414515	CMS_0442	CMS_0443			FALSE	0.111	104.000	0.000	NA		NA
5414515	5414516	CMS_0443	CMS_0444			FALSE	0.109	110.000	0.000	NA		NA
5414516	5414517	CMS_0444	CMS_0445			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5414519	5414520	CMS_0447	CMS_0448			FALSE	0.095	204.000	0.000	1.000	N	NA
5414525	5414526	CMS_0453	CMS_0454			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5414526	5414527	CMS_0454	CMS_0455			FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5414527	5414528	CMS_0455	CMS_0456			FALSE	0.233	27.000	0.000	NA		NA
5414528	5414529	CMS_0456	CMS_0457			FALSE	0.191	43.000	0.000	NA		NA
5414529	5414530	CMS_0457	CMS_0458			FALSE	0.107	187.000	0.000	1.000	N	NA
5414530	5414531	CMS_0458	CMS_0459			TRUE	0.997	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
5414531	5414532	CMS_0459	CMS_0460			FALSE	0.105	172.000	0.006	0.085	N	NA
5414532	5414533	CMS_0460	CMS_0461		kdpB	TRUE	0.980	33.000	0.877	0.001	Y	NA
5414533	5414534	CMS_0461	CMS_0462	kdpB		TRUE	0.990	-3.000	0.124	0.001	Y	NA
5414534	5414535	CMS_0462	CMS_0463			FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
5414535	5414536	CMS_0463	CMS_0464			FALSE	0.111	104.000	0.000	NA		NA
5414536	5414537	CMS_0464	CMS_0465			FALSE	0.120	95.000	0.000	NA		NA
5414537	5414538	CMS_0465	CMS_0466			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5414538	5414539	CMS_0466	CMS_0467			FALSE	0.162	78.000	0.000	1.000		NA
5414539	5414540	CMS_0467	CMS_0468			TRUE	0.512	8.000	0.000	1.000		NA
5414541	5414542	CMS_0469	CMS_0470			TRUE	0.851	51.000	0.474	NA		NA
5414544	5414545	CMS_0472	CMS_r039			FALSE	0.204	58.000	0.000	NA		NA
5414546	5414547	CMS_0473	CMS_0474			TRUE	0.991	-3.000	0.143	0.019	Y	NA
5414548	5414549	CMS_0475	CMS_0476			TRUE	0.979	-3.000	0.174	1.000	N	NA
5414550	5414551	CMS_0477	CMS_0478			FALSE	0.112	100.000	0.000	NA		NA
5414551	5414552	CMS_0478	CMS_0479			TRUE	0.947	-16.000	0.118	NA		NA
5414552	5414553	CMS_0479	CMS_0480			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414553	5414554	CMS_0480	CMS_0481			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5414554	5414555	CMS_0481	CMS_0482			FALSE	0.145	85.000	0.000	NA		NA
5414555	5414556	CMS_0482	CMS_0483			FALSE	0.111	105.000	0.000	NA		NA
5414558	5414559	CMS_0485	CMS_0486			FALSE	0.041	257.000	0.000	NA		NA
5414560	5414561	CMS_0487	CMS_0488			TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5414561	5414562	CMS_0488	CMS_0489			FALSE	0.019	783.000	0.000	NA		NA
5414562	5414563	CMS_0489	CMS_0490			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
5414564	5414565	CMS_0491	CMS_0492			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414565	5414566	CMS_0492	CMS_0493			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414567	5414568	CMS_0494	CMS_0495			FALSE	0.204	37.000	0.000	1.000		NA
5414568	5414569	CMS_0495	CMS_0496			FALSE	0.082	167.000	0.000	NA		NA
5414569	5414570	CMS_0496	CMS_0497			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5414570	5414571	CMS_0497	CMS_0498			FALSE	0.035	289.000	0.000	NA		NA
5414571	5414572	CMS_0498	CMS_0499			FALSE	0.054	214.000	0.000	NA		NA
5414572	5414573	CMS_0499	CMS_0500			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5414574	5414575	CMS_0501	CMS_0502			TRUE	0.998	-3.000	0.611	0.018	Y	NA
5414575	5414576	CMS_0502	CMS_0503			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5414576	5414577	CMS_0503	CMS_0504			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5414579	5414580	CMS_0506	CMS_0508			FALSE	0.154	81.000	0.000	NA		NA
5414580	5414581	CMS_0508	CMS_0509			TRUE	0.620	45.000	0.000	NA	Y	NA
5414581	5414582	CMS_0509	CMS_0510			FALSE	0.215	32.000	0.000	NA		NA
5414582	5414583	CMS_0510	CMS_0511			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5414584	5414585	CMS_0512	CMS_0513		cysE	TRUE	0.994	3.000	0.483	0.001	Y	NA
5414585	5414586	CMS_0513	CMS_0514	cysE	spoU	TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5414586	5414587	CMS_0514	CMS_0515	spoU		FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
5414588	5414589	CMS_0516	CMS_0517		coaA	FALSE	0.065	190.000	0.000	1.000		NA
5414590	5414591	CMS_0518	CMS_0519	glmS	acpS	TRUE	0.708	11.000	0.048	1.000	N	NA
5414591	5414592	CMS_0519	CMS_0520	acpS	alr	TRUE	0.907	-3.000	0.021	1.000	N	NA
5414592	5414593	CMS_0520	CMS_0521	alr	alr*	TRUE	0.970	-3.000	0.000	0.001	Y	NA
5414593	5414594	CMS_0521	CMS_0522	alr*		TRUE	0.468	10.000	0.003	1.000	N	NA
5414594	5414595	CMS_0522	CMS_0523			TRUE	0.970	-3.000	0.012	0.001	Y	NA
5414595	5414596	CMS_0523	CMS_0524			FALSE	0.054	105.000	0.002	NA		NA
5414598	5414599	CMS_0526	CMS_0527			FALSE	0.111	133.000	0.000	1.000		NA
5414599	5414600	CMS_0527	CMS_0528			FALSE	0.071	179.000	0.000	NA		NA
5414601	5414602	CMS_0529	CMS_0530			TRUE	0.944	78.000	0.582	0.025	Y	NA
5414602	5414603	CMS_0530	CMS_0531			TRUE	0.994	-7.000	0.361	1.000	Y	NA
5414603	5414604	CMS_0531	CMS_0532			TRUE	0.990	7.000	0.528	0.058	Y	NA
5414605	5414606	CMS_0533	CMS_0534			FALSE	0.081	168.000	0.000	NA		NA
5414606	5414607	CMS_0534	CMS_0535			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5414607	5414608	CMS_0535	CMS_0536			FALSE	0.177	102.000	0.000	1.000	N	NA
5414608	5414609	CMS_0536	CMS_0537			TRUE	0.987	4.000	0.286	1.000	Y	NA
5414609	5414610	CMS_0537	CMS_0538			TRUE	0.915	0.000	0.061	NA		NA
5414610	5414611	CMS_0538	CMS_0539			TRUE	0.881	10.000	0.198	NA		NA
5414611	5414612	CMS_0539	CMS_0540			TRUE	0.818	-3.000	0.013	NA		NA
5414615	5414616	CMS_0543	CMS_0544			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5414617	5414618	CMS_0544A	CMS_0545			FALSE	0.380	11.000	0.000	NA		NA
5414618	5414619	CMS_0545	CMS_0546			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414619	5414620	CMS_0546	CMS_0547			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5414620	5414621	CMS_0547	CMS_0548			TRUE	0.761	-7.000	0.000	1.000		NA
5414621	5414622	CMS_0548	CMS_0549			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414622	5414623	CMS_0549	CMS_0550			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5414623	5414624	CMS_0550	CMS_0551			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414624	5414625	CMS_0551	CMS_0552			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5414625	5414626	CMS_0552	CMS_0553			FALSE	0.232	83.000	0.000	1.000	N	NA
5414626	5414627	CMS_0553	CMS_0554			TRUE	0.671	102.000	0.074	1.000	Y	NA
5414627	5414628	CMS_0554	CMS_0555			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5414628	5414629	CMS_0555	CMS_0556			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5414629	5414630	CMS_0556	CMS_0557			FALSE	0.097	103.000	0.009	NA		NA
5414630	5414631	CMS_0557	CMS_0558			FALSE	0.110	118.000	0.000	NA		NA
5414631	5414632	CMS_0558	CMS_0559			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5414633	5414634	CMS_0560	CMS_0561			FALSE	0.193	52.000	0.000	1.000		NA
5414635	5414636	CMS_0562	CMS_0563			FALSE	0.248	66.000	0.019	NA		NA
5414636	5414637	CMS_0563	CMS_0564			FALSE	0.065	187.000	0.000	NA		NA
5414637	5414638	CMS_0564	CMS_0565			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5414639	5414640	CMS_0566	CMS_0567			TRUE	0.963	21.000	1.000	NA		NA
5414640	5414641	CMS_0567	CMS_0568			FALSE	0.020	565.000	0.000	NA		NA
5414645	5414646	CMS_0571	CMS_0572			FALSE	0.039	264.000	0.000	NA		NA
5414648	5414649	CMS_0574	CMS_0575			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414651	5414652	CMS_0577	CMS_0578			FALSE	0.155	80.000	0.000	NA		NA
5414652	5414653	CMS_0578	CMS_0579			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5414653	5414654	CMS_0579	CMS_0580			TRUE	0.813	11.000	0.000	1.000	Y	NA
5414655	5414656	CMS_0581	CMS_0582			TRUE	0.991	-3.000	0.370	0.001	N	NA
5414656	5414657	CMS_0582	CMS_0583			FALSE	0.274	21.000	0.000	1.000		NA
5414657	5414658	CMS_0583	CMS_0584			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5414659	5414660	CMS_0585	CMS_0586			TRUE	0.981	-3.000	0.187	1.000	N	NA
5414661	5414662	CMS_0587	CMS_0588			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5414667	5414668	CMS_0593	CMS_0594			FALSE	0.054	213.000	0.000	NA		NA
5414668	5414669	CMS_0594	CMS_0595			FALSE	0.099	144.000	0.000	NA		NA
5414671	5414672	CMS_0597	CMS_0598			FALSE	0.039	311.000	0.000	0.001		NA
5414672	5414673	CMS_0598	CMS_0599			FALSE	0.045	246.000	0.000	1.000		NA
5414676	5414677	CMS_0602	CMS_0603			TRUE	0.992	-3.000	0.182	0.004	Y	NA
5414678	5414679	CMS_0604	CMS_0605			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414679	5414680	CMS_0605	CMS_0606			FALSE	0.268	71.000	0.000	1.000	N	NA
5414680	5414681	CMS_0606	CMS_0607		punA	TRUE	0.985	-3.000	0.235	1.000	N	NA
5414686	5414687	CMS_0612	CMS_0613			FALSE	0.282	45.000	0.000	NA	N	NA
5414687	5414688	CMS_0613	CMS_0615			TRUE	0.745	-10.000	0.000	NA		NA
5414691	5414692	CMS_0617	CMS_0618			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414693	5414694	CMS_0619	CMS_0620	birA		TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
5414696	5414697	CMS_0622	CMS_0623			TRUE	0.787	91.000	0.141	0.001	Y	NA
5414697	5414698	CMS_0623	CMS_0624			FALSE	0.215	75.000	0.007	NA	N	NA
5414699	5414700	CMS_0625	CMS_0626			TRUE	0.507	92.000	0.000	1.000	Y	NA
5414700	5414701	CMS_0626	CMS_0627			TRUE	0.963	26.000	0.548	1.000	Y	NA
5414701	5414702	CMS_0627	CMS_0628			TRUE	0.487	96.000	0.000	1.000	Y	NA
5414702	5414703	CMS_0628	CMS_0629			TRUE	0.988	-3.000	0.083	0.007	Y	NA
5414704	5414705	CMS_0630	CMS_0631			FALSE	0.243	26.000	0.000	1.000		NA
5414705	5414706	CMS_0631	CMS_0632			TRUE	0.983	4.000	0.200	1.000	Y	NA
5414708	5414709	CMS_0634	CMS_0635		TTHA0885	TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414710	5414711	CMS_0636	CMS_0637			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5414712	5414713	CMS_0638	CMS_0639		glf	TRUE	0.617	68.000	0.012	NA	Y	NA
5414713	5414714	CMS_0639	CMS_0640	glf		TRUE	0.948	0.000	0.105	NA		NA
5414714	5414715	CMS_0640	CMS_0641			FALSE	0.157	79.000	0.000	NA		NA
5414715	5414716	CMS_0641	CMS_0642			FALSE	0.103	138.000	0.000	NA		NA
5414717	5414718	CMS_0642A	CMS_0642B			TRUE	0.960	49.000	0.667	NA	Y	NA
5414718	5414719	CMS_0642B	CMS_0642C			FALSE	0.190	94.000	0.000	NA	N	NA
5414720	5414721	CMS_0643	CMS_0644	manA		FALSE	0.208	35.000	0.000	1.000		NA
5414723	5414724	CMS_0646	CMS_0647			TRUE	0.480	94.000	0.125	NA		NA
5414724	5414725	CMS_0647	CMS_0648			TRUE	0.990	-13.000	0.606	NA		NA
5414727	5414728	CMS_0650	CMS_0651		manB	TRUE	0.864	33.000	0.460	NA		NA
5414728	5414729	CMS_0651	CMS_0652	manB		FALSE	0.108	134.000	0.000	NA		NA
5414729	5414730	CMS_0652	CMS_0653			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5414730	5414731	CMS_0653	CMS_0654			TRUE	0.948	2.000	0.000	0.002	Y	NA
5414731	5414732	CMS_0654	CMS_0655			FALSE	0.303	63.000	0.000	1.000	N	NA
5414734	5414735	CMS_0659	CMS_0660			TRUE	0.995	-3.000	0.286	1.000	Y	NA
5414737	5414738	CMS_0662	CMS_0663			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5414738	5414739	CMS_0663	CMS_0664			FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
5414739	5414740	CMS_0664	CMS_0665			TRUE	0.985	-3.000	0.302	NA		NA
5414740	5414741	CMS_0665	CMS_0666			TRUE	0.996	-3.000	0.841	NA		NA
5414741	5414742	CMS_0666	CMS_0667			TRUE	0.993	-3.000	0.628	NA		NA
5414743	5414744	CMS_0668	CMS_0669			TRUE	0.981	20.000	0.772	1.000	Y	NA
5414744	5414745	CMS_0669	CMS_0670			TRUE	0.727	119.000	0.418	NA		NA
5414745	5414746	CMS_0670	CMS_0671			TRUE	0.674	62.000	0.163	NA		NA
5414746	5414747	CMS_0671	CMS_0672			FALSE	0.334	137.000	0.072	NA		NA
5414747	5414748	CMS_0672	CMS_0673		secA	FALSE	0.306	200.000	0.094	NA	N	NA
5414750	5414751	CMS_0675	CMS_0676			FALSE	0.180	70.000	0.000	NA		NA
5414751	5414752	CMS_0676	CMS_0677			FALSE	0.202	36.000	0.000	NA		NA
5414752	5414753	CMS_0677	CMS_0678			TRUE	0.558	10.000	0.000	1.000	N	NA
5414757	5414758	CMS_r050	CMS_0684			FALSE	0.037	282.000	0.000	NA		NA
5414758	5414759	CMS_0684	CMS_0685			FALSE	0.112	125.000	0.000	NA		NA
5414759	5414760	CMS_0685	CMS_0686			FALSE	0.053	216.000	0.000	NA		NA
5414760	5414761	CMS_0686	CMS_0687			FALSE	0.093	154.000	0.000	NA		NA
5414764	5414765	CMS_0690	CMS_0691			TRUE	0.983	-3.000	0.208	NA	N	NA
5414766	5414767	CMS_0692	CMS_0693			FALSE	0.202	57.000	0.000	NA		NA
5414768	5414769	CMS_0694	CMS_0695		qcrB	FALSE	0.112	118.000	0.000	1.000		NA
5414769	5414770	CMS_0695	CMS_0696	qcrB	qcrA	TRUE	0.995	-16.000	0.457	NA	Y	NA
5414770	5414771	CMS_0696	CMS_0697	qcrA	qcrC	TRUE	0.617	46.000	0.000	NA	Y	NA
5414771	5414772	CMS_0697	CMS_0698	qcrC	ctaE	TRUE	0.691	27.000	0.000	0.030	Y	NA
5414773	5414774	CMS_0699	CMS_0700	trpD		FALSE	0.184	48.000	0.000	NA		NA
5414775	5414776	CMS_0701	CMS_0702			FALSE	0.223	30.000	0.000	NA		NA
5414777	5414778	CMS_0703	CMS_0704		dak2	TRUE	0.960	4.000	0.242	0.001		NA
5414778	5414779	CMS_0704	CMS_0705	dak2		TRUE	0.990	-3.000	0.442	1.000		NA
5414782	5414783	CMS_0708	CMS_0709			FALSE	0.282	68.000	0.000	1.000	N	NA
5414786	5414787	CMS_r020	CMS_r017			FALSE	0.197	65.000	0.000	NA		NA
5414787	5414788	CMS_r017	CMS_r018			FALSE	0.327	14.000	0.000	NA		NA
5414788	5414789	CMS_r018	CMS_0711			FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5414789	5414790	CMS_0711	CMS_0712			TRUE	0.967	3.000	0.208	1.000	N	NA
5414790	5414791	CMS_0712	CMS_0713			TRUE	0.472	14.000	0.000	0.037	N	NA
5414791	5414792	CMS_0713	CMS_0714			TRUE	0.966	-10.000	0.030	NA	Y	NA
5414792	5414793	CMS_0714	CMS_0715			FALSE	0.375	77.000	0.055	NA		NA
5414793	5414794	CMS_0715	CMS_0716		ruvC	TRUE	0.766	52.000	0.277	NA		NA
5414794	5414795	CMS_0716	CMS_0717	ruvC	ruvA	TRUE	0.966	18.000	0.451	0.008	Y	NA
5414795	5414796	CMS_0717	CMS_0718	ruvA	ruvB	TRUE	0.997	-3.000	0.549	0.002	Y	NA
5414796	5414797	CMS_0718	CMS_0719	ruvB		TRUE	0.547	38.000	0.063	NA	N	NA
5414797	5414798	CMS_0719	CMS_0720		secD	TRUE	0.637	127.000	0.062	NA	Y	NA
5414798	5414799	CMS_0720	CMS_0721	secD	secF	TRUE	0.994	0.000	0.336	0.001	Y	NA
5414799	5414800	CMS_0721	CMS_0722	secF		TRUE	0.868	-3.000	0.009	NA	N	NA
5414800	5414801	CMS_0722	CMS_0723		relA	FALSE	0.234	131.000	0.024	NA	N	NA
5414802	5414803	CMS_0724	CMS_0725			FALSE	0.450	94.000	0.103	NA		NA
5414804	5414805	CMS_0726	CMS_0727			FALSE	0.053	249.000	0.005	1.000	N	NA
5414805	5414806	CMS_0727	CMS_0728			FALSE	0.074	174.000	0.000	NA		NA
5414806	5414807	CMS_0728	CMS_0729			TRUE	0.682	6.000	0.023	NA		NA
5414807	5414808	CMS_0729	CMS_0730			TRUE	0.959	0.000	0.103	1.000	N	NA
5414808	5414809	CMS_0730	CMS_0731			FALSE	0.051	518.000	0.039	NA		NA
5414809	5414810	CMS_0731	CMS_0732			TRUE	0.894	-7.000	0.045	NA		NA
5414810	5414811	CMS_0732	CMS_0733			TRUE	0.938	4.000	0.021	1.000	Y	NA
5414811	5414812	CMS_0733	CMS_0734			TRUE	0.960	3.000	0.041	1.000	Y	NA
5414812	5414813	CMS_0734	CMS_0735			TRUE	0.991	-3.000	0.147	1.000	Y	NA
5414813	5414814	CMS_0735	CMS_0736			TRUE	0.886	-3.000	0.000	0.070	N	NA
5414814	5414815	CMS_0736	CMS_0737			FALSE	0.112	108.000	0.000	1.000		NA
5414817	5414818	CMS_0739	CMS_0740			TRUE	0.990	5.000	0.867	NA		NA
5414818	5414819	CMS_0740	CMS_0741			TRUE	0.789	196.000	0.837	NA		NA
5414819	5414820	CMS_0741	CMS_0742		recG	TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5414820	5414821	CMS_0742	CMS_0743	recG	coaD	FALSE	0.266	26.000	0.002	1.000	N	NA
5414821	5414822	CMS_0743	CMS_0744	coaD		FALSE	0.307	20.000	0.014	NA		NA
5414822	5414823	CMS_0744	CMS_0745		rpmF	TRUE	0.983	4.000	0.599	NA		NA
5414823	5414824	CMS_0745	CMS_0746	rpmF		FALSE	0.461	26.000	0.044	1.000		NA
5414824	5414825	CMS_0746	CMS_0747			TRUE	0.861	7.000	0.068	1.000	N	NA
5414827	5414828	CMS_0749	CMS_0750		ftsY	TRUE	0.797	21.000	0.165	0.015	N	NA
5414828	5414829	CMS_0750	CMS_0751	ftsY	ffh	TRUE	0.677	49.000	0.024	0.001	Y	NA
5414829	5414830	CMS_0751	CMS_0752	ffh		FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5414831	5414832	CMS_0753	CMS_0754			FALSE	0.197	41.000	0.000	1.000		NA
5414833	5414834	CMS_0755	CMS_0756	rpsP		TRUE	0.974	4.000	0.385	1.000		NA
5414834	5414835	CMS_0756	CMS_0757		rimM	TRUE	0.978	-22.000	0.324	1.000		NA
5414835	5414836	CMS_0757	CMS_0758	rimM	trmD	TRUE	0.996	2.000	0.672	1.000	Y	NA
5414838	5414839	CMS_0760	CMS_0761		rplS	FALSE	0.078	171.000	0.000	NA		NA
5414839	5414840	CMS_0761	CMS_0762	rplS	sipU	FALSE	0.288	67.000	0.000	1.000	N	NA
5414840	5414841	CMS_0762	CMS_0763	sipU	rnhB	TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5414841	5414842	CMS_0763	CMS_0764	rnhB		FALSE	0.323	107.000	0.067	NA		NA
5414842	5414843	CMS_0764	CMS_0765			FALSE	0.131	106.000	0.015	NA		NA
5414843	5414844	CMS_0765	CMS_0766			TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5414844	5414845	CMS_0766	CMS_0767		smf	TRUE	0.837	-3.000	0.003	1.000	N	NA
5414845	5414846	CMS_0767	CMS_0768	smf	xerC	FALSE	0.371	217.000	0.037	1.000	Y	NA
5414848	5414849	CMS_0770	CMS_0771		rpsB	FALSE	0.045	239.000	0.000	1.000		NA
5414849	5414850	CMS_0771	CMS_0772	rpsB	tsf	TRUE	0.939	111.000	0.748	1.000	Y	NA
5414850	5414851	CMS_0772	CMS_0773	tsf	pyrH	TRUE	0.717	160.000	0.416	1.000	N	NA
5414851	5414852	CMS_0773	CMS_0774	pyrH	frr	TRUE	0.836	114.000	0.626	1.000	N	NA
5414852	5414853	CMS_0774	CMS_0775	frr	cdsA	FALSE	0.364	124.000	0.076	1.000		NA
5414853	5414854	CMS_0775	CMS_0776	cdsA		TRUE	0.929	2.000	0.090	NA		NA
5414854	5414855	CMS_0776	CMS_0777			FALSE	0.272	193.000	0.095	NA		NA
5414855	5414856	CMS_0777	CMS_0778			FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5414856	5414857	CMS_0778	CMS_0779			FALSE	0.202	36.000	0.000	NA		NA
5414857	5414858	CMS_0779	CMS_0780			TRUE	0.959	-3.000	0.092	NA		NA
5414859	5414860	CMS_0781	CMS_0782			TRUE	0.583	27.000	0.077	NA		NA
5414861	5414862	CMS_0783	CMS_0784			FALSE	0.091	180.000	0.017	NA		NA
5414863	5414864	CMS_0785	CMS_0786			TRUE	0.991	-3.000	0.159	0.011	Y	NA
5414867	5414868	CMS_0790	CMS_0791			FALSE	0.120	95.000	0.000	NA		NA
5414868	5414869	CMS_0791	CMS_0792			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5414869	5414870	CMS_0792	CMS_0793			FALSE	0.046	233.000	0.000	NA		NA
5414871	5414872	CMS_0794	CMS_0795			FALSE	0.110	108.000	0.000	NA		NA
5414872	5414873	CMS_0795	CMS_0796			FALSE	0.288	67.000	0.000	1.000	N	NA
5414873	5414874	CMS_0796	CMS_0797			TRUE	0.989	-3.000	0.429	1.000		NA
5414874	5414875	CMS_0797	CMS_0798			TRUE	0.984	-3.000	0.286	1.000		NA
5414875	5414876	CMS_0798	CMS_0798A			TRUE	0.994	-3.000	0.636	1.000		NA
5414876	5414877	CMS_0798A	CMS_0799			TRUE	0.998	-3.000	0.818	0.055	Y	NA
5414877	5414878	CMS_0799	CMS_0800			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414878	5414879	CMS_0800	CMS_0802			FALSE	0.112	125.000	0.000	NA		NA
5414881	10691938	CMS_0804	CMS_0809			TRUE	0.726	-929.000	0.000	NA		NA
10691938	5414882	CMS_0809	CMS_0810			FALSE	0.021	526.000	0.000	NA		NA
5414884	5414885	CMS_0812	CMS_0813			FALSE	0.032	326.000	0.000	NA		NA
5414887	5414888	CMS_0815	CMS_0816			TRUE	0.470	9.000	0.000	NA		NA
5414888	5414889	CMS_0816	CMS_0817			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5414889	5414890	CMS_0817	CMS_0818			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5414890	5414891	CMS_0818	CMS_0819			TRUE	0.995	-3.000	0.680	1.000	N	NA
5414892	5414893	CMS_0820	CMS_0821			FALSE	0.039	270.000	0.000	1.000		NA
5414893	5414894	CMS_0821	CMS_0822			FALSE	0.075	176.000	0.000	1.000		NA
5414894	5414895	CMS_0822	CMS_0823			FALSE	0.186	51.000	0.000	NA		NA
5414895	5414896	CMS_0823	CMS_0824			FALSE	0.075	173.000	0.000	NA		NA
5414896	5414897	CMS_0824	CMS_0825			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414898	5414899	CMS_0826	CMS_0827			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5414899	5414900	CMS_0827	CMS_0828			FALSE	0.186	51.000	0.000	NA		NA
5414900	5414901	CMS_0828	CMS_0829			FALSE	0.082	167.000	0.000	NA		NA
5414901	5414902	CMS_0829	CMS_0829A			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5414903	5414904	CMS_0830	CMS_0831			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.079	Y	NA
5414904	5414905	CMS_0831	CMS_0832			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5414905	5414906	CMS_0832	CMS_0833			FALSE	0.430	10.000	0.000	1.000		NA
5414910	5414911	CMS_0837	CMS_0838			TRUE	0.969	75.000	0.833	0.055	Y	NA
5414911	5414912	CMS_0838	CMS_0839			TRUE	0.998	-7.000	0.833	0.055	Y	NA
5414912	5414913	CMS_0839	CMS_0840			TRUE	0.933	80.000	0.500	NA	Y	NA
5414913	5414914	CMS_0840	CMS_0841			TRUE	0.982	-3.000	0.240	NA		NA
5414914	5414915	CMS_0841	CMS_0842			FALSE	0.274	21.000	0.000	1.000		NA
5414915	5414916	CMS_0842	CMS_0843			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5414919	5414920	CMS_0846	CMS_0847			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5414920	5414921	CMS_0847	CMS_0848			FALSE	0.045	235.000	0.000	NA		NA
5414923	5414924	CMS_0850	CMS_0851			FALSE	0.143	86.000	0.000	NA		NA
5414925	5414926	CMS_0852	CMS_0853			FALSE	0.204	56.000	0.000	1.000		NA
5414926	5414927	CMS_0853	CMS_0854			FALSE	0.111	103.000	0.000	NA		NA
5414928	5414929	CMS_0855	CMS_0856			FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5414930	5414931	CMS_0857	CMS_0858			FALSE	0.113	129.000	0.000	1.000		NA
5414931	5414932	CMS_0858	CMS_0859			TRUE	0.995	-3.000	0.697	NA		NA
5414932	5414933	CMS_0859	CMS_0860			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5414933	5414934	CMS_0860	CMS_0861			FALSE	0.233	27.000	0.000	NA		NA
5414934	5414935	CMS_0861	CMS_0862			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5414937	5414938	CMS_0864	CMS_0865			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5414939	5414940	CMS_0866	CMS_0867			FALSE	0.258	24.000	0.000	1.000		NA
5414941	5414942	CMS_0868	CMS_0869			FALSE	0.346	184.000	0.000	0.055	Y	NA
5414942	5414943	CMS_0869	CMS_0870			TRUE	0.999	-3.000	0.833	0.055	Y	NA
5414943	5414944	CMS_0870	CMS_0871			TRUE	0.989	-3.000	0.119	1.000	Y	NA
5414945	5414946	CMS_0872	CMS_0873			FALSE	0.044	240.000	0.000	NA		NA
5414947	5414948	CMS_0874	CMS_0875			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
5414948	5414949	CMS_0875	CMS_0876			FALSE	0.208	34.000	0.000	NA		NA
5414951	5414952	CMS_0878	CMS_0879			FALSE	0.171	74.000	0.000	1.000		NA
5414956	5414957	CMS_0883	CMS_0884			FALSE	0.020	578.000	0.000	NA		NA
5414957	5414958	CMS_0884	CMS_0885			TRUE	0.631	66.000	0.000	1.000	Y	NA
5414959	5414960	CMS_0886	CMS_0887			TRUE	0.899	19.000	0.444	NA		NA
5414960	5414961	CMS_0887	CMS_0888			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5414961	10691939	CMS_0888	CMS_0889			TRUE	0.726	-767.000	0.000	NA		NA
10691939	5414962	CMS_0889	CMS_0890			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5414962	5414963	CMS_0890	CMS_0891		rafA	FALSE	0.040	263.000	0.000	NA		NA
5414963	5414964	CMS_0891	CMS_0892	rafA		FALSE	0.143	86.000	0.000	NA		NA
5414965	5414966	CMS_0893	CMS_0894			TRUE	0.638	8.000	0.000	1.000	N	NA
5414966	5414967	CMS_0894	CMS_0895			FALSE	0.193	45.000	0.000	1.000		NA
5414968	5414969	CMS_0896	CMS_0897			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5414969	5414970	CMS_0897	CMS_0898			FALSE	0.200	37.000	0.000	NA		NA
5414970	5414971	CMS_0898	CMS_0899			FALSE	0.045	235.000	0.000	NA		NA
5414971	5414972	CMS_0899	CMS_0900			FALSE	0.047	231.000	0.000	NA		NA
5414972	5414973	CMS_0900	CMS_0901			FALSE	0.069	181.000	0.000	NA		NA
5414973	5414974	CMS_0901	CMS_0902			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
5414974	5414975	CMS_0902	CMS_0903			FALSE	0.233	27.000	0.000	NA		NA
5414975	5414976	CMS_0903	CMS_0904			TRUE	0.878	-3.000	0.024	NA		NA
5414976	5414977	CMS_0904	CMS_0905			TRUE	0.878	-3.000	0.024	NA		NA
5414977	5414978	CMS_0905	CMS_0906			FALSE	0.109	117.000	0.000	NA		NA
5414978	5414979	CMS_0906	CMS_0907			FALSE	0.089	162.000	0.000	1.000		NA
5414984	5414985	CMS_0912	CMS_0913			FALSE	0.201	319.000	0.000	0.004	Y	NA
5414985	5414986	CMS_0913	CMS_0914		nagA	TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5414987	5414988	CMS_0916	CMS_0917			TRUE	0.855	67.000	0.154	1.000	Y	NA
5414988	5414989	CMS_0917	CMS_0918			TRUE	0.719	90.000	0.077	1.000	Y	NA
5414990	5414991	CMS_0919	CMS_0920			TRUE	0.548	84.000	0.000	NA	Y	NA
5414991	5414992	CMS_0920	CMS_0921			TRUE	0.999	-3.000	0.882	0.054	Y	NA
5414992	5414993	CMS_0921	CMS_0922			TRUE	0.961	120.000	1.000	0.054	Y	NA
5414993	5414994	CMS_0922	CMS_0923			TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5414994	5414995	CMS_0923	CMS_0924		lacZ1	TRUE	0.483	97.000	0.000	1.000	Y	NA
5414997	5414998	CMS_0926	CMS_0927			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5414998	5414999	CMS_0927	CMS_0928			FALSE	0.083	166.000	0.000	NA		NA
5414999	5415000	CMS_0928	CMS_0929			TRUE	0.974	75.000	1.000	1.000	Y	NA
5415000	5415001	CMS_0929	CMS_0930			TRUE	0.998	-3.000	0.667	1.000	Y	NA
5415001	5415002	CMS_0930	CMS_0931			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5415006	5415007	CMS_0935	CMS_0936			TRUE	0.976	70.000	0.900	0.054	Y	NA
5415007	5415008	CMS_0936	CMS_0937			TRUE	0.951	150.000	0.900	0.054	Y	NA
5415008	5415009	CMS_0937	CMS_0938			TRUE	0.939	6.000	0.222	1.000		NA
5415009	5415010	CMS_0938	CMS_0939			TRUE	0.912	62.000	0.667	0.023		NA
5415010	5415011	CMS_0939	CMS_0940			FALSE	0.028	358.000	0.000	NA		NA
5415011	5415012	CMS_0940	CMS_0941			FALSE	0.048	224.000	0.000	NA		NA
5415012	5415013	CMS_0941	CMS_0942			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5415014	5415015	CMS_0943	CMS_0945			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5415015	5415016	CMS_0945	CMS_0946			FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5415016	5415017	CMS_0946	CMS_0947			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415017	5415018	CMS_0947	CMS_0948			TRUE	0.985	-3.000	0.292	NA		NA
5415020	5415021	CMS_0950	CMS_0951			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5415027	5415028	CMS_0957	CMS_0958			TRUE	0.998	-3.000	0.786	0.017	Y	NA
5415028	5415029	CMS_0958	CMS_0959			FALSE	0.183	49.000	0.000	NA		NA
5415029	5415030	CMS_0959	CMS_0960			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415031	5415032	CMS_0961	CMS_0962			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415035	5415036	CMS_0965	CMS_0966	crtI	crtE	TRUE	0.956	-3.000	0.065	1.000	N	NA
5415039	5415040	CMS_0969	CMS_0970			FALSE	0.042	251.000	0.000	NA		NA
5415040	5415041	CMS_0970	CMS_0971			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5415043	5415044	CMS_0973	CMS_0974			TRUE	0.823	61.000	0.286	1.000	N	NA
5415044	5415045	CMS_0974	CMS_0975			TRUE	0.879	0.000	0.037	NA		NA
5415046	5415047	CMS_0976	CMS_0977			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415048	5415049	CMS_0978	CMS_0979			FALSE	0.138	88.000	0.000	NA		NA
5415050	5415051	CMS_0980	CMS_0981			FALSE	0.104	137.000	0.000	NA		NA
5415051	5415052	CMS_0981	CMS_0982			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415052	5415053	CMS_0982	CMS_0983		lip	FALSE	0.183	49.000	0.000	NA		NA
5415053	5415054	CMS_0983	CMS_0984	lip		FALSE	0.115	180.000	0.000	1.000	N	NA
5415054	5415055	CMS_0984	CMS_0985			FALSE	0.075	184.000	0.000	0.044		NA
5415055	5415056	CMS_0985	CMS_0986			FALSE	0.112	125.000	0.000	NA		NA
5415056	5415057	CMS_0986	CMS_0987			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5415058	5415059	CMS_0988	CMS_0989			FALSE	0.133	90.000	0.000	NA		NA
5415061	5415062	CMS_0991	CMS_0992			TRUE	0.996	-3.000	0.400	1.000	Y	NA
5415062	5415063	CMS_0992	CMS_0993			TRUE	0.977	4.000	0.375	1.000	N	NA
5415063	5415064	CMS_0993	CMS_0994			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.017	Y	NA
5415064	5415065	CMS_0994	CMS_0995			FALSE	0.057	309.000	0.000	NA	N	NA
5415065	5415066	CMS_0995	CMS_0996			TRUE	0.468	123.000	0.000	NA	Y	NA
5415066	5415067	CMS_0996	CMS_0997			TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5415067	5415068	CMS_0997	CMS_0998			FALSE	0.191	67.000	0.000	NA		NA
5415069	5415070	CMS_0999	CMS_1000			FALSE	0.239	26.000	0.000	NA		NA
5415070	5415071	CMS_1000	CMS_1001			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415071	5415072	CMS_1001	CMS_1002			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5415073	5415074	CMS_1003	CMS_1004			FALSE	0.190	98.000	0.000	0.077	N	NA
5415074	5415075	CMS_1004	CMS_1005			FALSE	0.178	125.000	0.000	1.000	N	NA
5415075	5415076	CMS_1005	CMS_1006			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5415077	5415078	CMS_1007	CMS_1008			FALSE	0.038	317.000	0.000	0.043		NA
5415078	5415079	CMS_1008	CMS_1009			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5415081	5415082	CMS_1011	CMS_1012			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415082	5415083	CMS_1012	CMS_1013			TRUE	0.466	131.000	0.000	1.000	Y	NA
5415083	5415084	CMS_1013	CMS_1014			TRUE	0.960	89.000	0.818	0.053	Y	NA
5415084	5415085	CMS_1014	CMS_1015			TRUE	0.976	45.000	0.857	0.053	Y	NA
5415085	5415086	CMS_1015	CMS_1016			TRUE	0.552	222.000	0.143	1.000	Y	NA
5415087	5415088	CMS_1017	CMS_1018		RS00183	TRUE	0.943	-3.000	0.065	NA		NA
5415088	5415089	CMS_1018	CMS_1019	RS00183		FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5415094	5415095	CMS_1024	CMS_1025			TRUE	0.976	-3.000	0.189	NA		NA
5415097	5415098	CMS_1027	CMS_1028	purC	purD	TRUE	0.973	-3.000	0.021	1.000	Y	NA
5415099	5415100	CMS_1029	CMS_1030			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5415105	5415106	CMS_1035	CMS_1036			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415106	5415107	CMS_1036	CMS_1037			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415107	5415108	CMS_1037	CMS_1038			FALSE	0.097	148.000	0.000	NA		NA
5415108	5415109	CMS_1038	CMS_1039			FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5415110	5415111	CMS_1040	CMS_1041			FALSE	0.187	49.000	0.000	1.000		NA
5415111	5415112	CMS_1041	CMS_1042			FALSE	0.111	110.000	0.000	1.000		NA
5415112	5415113	CMS_1042	CMS_1043			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5415113	5415114	CMS_1043	CMS_1044		glgP	FALSE	0.176	72.000	0.000	1.000		NA
5415115	5415116	CMS_1045	CMS_1046			FALSE	0.025	440.000	0.000	1.000		NA
5415117	5415118	CMS_1047	CMS_1048		trmU	TRUE	0.968	-3.000	0.094	1.000	N	NA
5415118	5415119	CMS_1048	CMS_1049	trmU	ligA	TRUE	0.575	8.000	0.005	1.000	N	NA
5415119	5415120	CMS_1049	CMS_1050	ligA		FALSE	0.079	170.000	0.000	NA		NA
5415122	5415123	CMS_1052	CMS_1053	gatC	gatA	TRUE	0.991	8.000	0.643	0.002	Y	NA
5415123	5415124	CMS_1053	CMS_1054	gatA	gatB	TRUE	0.996	0.000	0.492	0.002	Y	NA
5415124	5415125	CMS_1054	CMS_1055	gatB		TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415126	5415127	CMS_1056	CMS_1057			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5415127	5415128	CMS_1057	CMS_1058			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5415128	5415129	CMS_1058	CMS_1059		fadD	FALSE	0.119	97.000	0.000	1.000		NA
5415129	5415130	CMS_1059	CMS_1060	fadD		FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5415130	5415131	CMS_1060	CMS_1061			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5415131	5415132	CMS_1061	CMS_1062			TRUE	0.739	-15.000	0.000	NA		NA
5415132	5415133	CMS_1062	CMS_1063			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415133	5415134	CMS_1063	CMS_1064			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5415134	5415135	CMS_1064	CMS_1065			TRUE	0.991	-3.000	0.500	NA		NA
5415135	5415136	CMS_1065	CMS_1066			TRUE	0.745	-10.000	0.000	NA		NA
5415137	5415138	CMS_1067	CMS_1068			TRUE	0.939	19.000	0.667	NA		NA
5415138	5415139	CMS_1068	CMS_1069			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5415139	5415140	CMS_1069	CMS_1070			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415140	5415141	CMS_1070	CMS_1071			TRUE	0.733	-19.000	0.000	NA		NA
5415141	5415142	CMS_1071	CMS_1072			TRUE	0.709	33.000	0.182	NA		NA
5415142	5415143	CMS_1072	CMS_1073			FALSE	0.202	57.000	0.000	NA		NA
5415143	5415144	CMS_1073	CMS_1074			FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5415144	5415145	CMS_1074	CMS_1075			FALSE	0.219	31.000	0.000	NA		NA
5415145	5415146	CMS_1075	CMS_1076			FALSE	0.148	84.000	0.000	NA		NA
5415146	5415147	CMS_1076	CMS_1077			FALSE	0.112	102.000	0.000	NA		NA
5415147	5415148	CMS_1077	CMS_1078			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5415149	5415150	CMS_1079	CMS_1080			FALSE	0.454	10.000	0.000	0.042		NA
5415150	5415151	CMS_1080	CMS_1081			FALSE	0.124	99.000	0.000	0.066		NA
5415151	5415152	CMS_1081	CMS_1082			FALSE	0.386	11.000	0.000	1.000		NA
5415153	5415154	CMS_1083	CMS_1084			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415154	5415155	CMS_1084	CMS_1085			FALSE	0.119	97.000	0.000	1.000		NA
5415155	5415156	CMS_1085	CMS_1086			FALSE	0.208	58.000	0.000	1.000		NA
5415157	5415158	CMS_1087	CMS_1088			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5415159	5415160	CMS_1089	CMS_1090			FALSE	0.206	63.000	0.000	1.000		NA
5415163	5415164	CMS_1093	CMS_1094			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415165	5415166	CMS_1095	CMS_1096			FALSE	0.089	158.000	0.000	NA		NA
5415168	5415169	CMS_1098	CMS_1099			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5415170	5415171	CMS_1100	CMS_1100A			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5415171	5415172	CMS_1100A	CMS_1100B			FALSE	0.108	115.000	0.000	NA		NA
5415172	5415173	CMS_1100B	CMS_1100C			FALSE	0.110	107.000	0.000	NA		NA
5415173	5415174	CMS_1100C	CMS_1101			FALSE	0.186	51.000	0.000	NA		NA
5415174	5415175	CMS_1101	CMS_1101A			FALSE	0.108	115.000	0.000	NA		NA
5415175	5415176	CMS_1101A	CMS_1102		thiED	FALSE	0.074	174.000	0.000	NA		NA
5415176	5415177	CMS_1102	CMS_1103	thiED	thiM	TRUE	0.967	-3.000	0.007	0.003	Y	NA
5415178	5415179	CMS_1104	CMS_1105			FALSE	0.019	760.000	0.000	NA		NA
5415179	5415180	CMS_1105	CMS_1106			FALSE	0.037	277.000	0.000	NA		NA
5415181	5415182	CMS_1107	CMS_1108			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5415182	5415183	CMS_1108	CMS_1109			FALSE	0.168	74.000	0.000	NA		NA
5415183	5415184	CMS_1109	CMS_1110			FALSE	0.354	25.000	0.000	NA	N	NA
5415184	5415185	CMS_1110	CMS_1111		xyoA	FALSE	0.172	113.000	0.000	1.000	N	NA
5415185	5415186	CMS_1111	CMS_1112	xyoA	lacZ2	FALSE	0.171	135.000	0.000	1.000	N	NA
5415186	5415187	CMS_1112	CMS_1113	lacZ2		FALSE	0.450	137.000	0.000	1.000	Y	NA
5415187	5415188	CMS_1113	CMS_1114			TRUE	0.998	-3.000	0.667	0.052	Y	NA
5415188	5415189	CMS_1114	CMS_1115			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415189	5415190	CMS_1115	CMS_1117			FALSE	0.110	120.000	0.000	NA		NA
5415191	5415192	CMS_1118	CMS_1119			TRUE	0.737	32.000	0.200	NA		NA
5415192	5415193	CMS_1119	CMS_1120			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5415194	5415195	CMS_1122	CMS_1123			FALSE	0.024	443.000	0.000	NA		NA
5415195	5415196	CMS_1123	CMS_1124			FALSE	0.055	210.000	0.000	NA		NA
5415196	5415197	CMS_1124	CMS_1125			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5415198	5415199	CMS_1126	CMS_1127			FALSE	0.195	40.000	0.000	NA		NA
5415200	5415201	CMS_1128	CMS_1129			FALSE	0.185	47.000	0.000	NA		NA
5415201	5415202	CMS_1129	CMS_1130			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415202	5415203	CMS_1130	CMS_1131			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5415203	5415204	CMS_1131	CMS_1132			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5415205	5415206	CMS_1133	CMS_1134			TRUE	0.995	-3.000	0.667	NA	N	NA
5415206	5415207	CMS_1134	CMS_1135			TRUE	0.990	-3.000	0.143	NA	Y	NA
5415208	5415209	CMS_1136	CMS_1137			FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5415210	5415211	CMS_1138	CMS_1139			FALSE	0.173	116.000	0.000	1.000	N	NA
5415211	5415212	CMS_1139	CMS_1140		NCU06945.1	TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415212	5415213	CMS_1140	CMS_1141	NCU06945.1		FALSE	0.104	139.000	0.000	1.000		NA
5415215	5415216	CMS_1143	CMS_1144			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415216	5415217	CMS_1144	CMS_1145			FALSE	0.282	68.000	0.000	1.000	N	NA
5415217	5415218	CMS_1145	CMS_1146			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415218	5415219	CMS_1146	CMS_1147			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5415219	5415220	CMS_1147	CMS_1148			FALSE	0.131	96.000	0.000	0.052		NA
5415225	5415226	CMS_1153	CMS_1154			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5415226	5415227	CMS_1154	CMS_1155			FALSE	0.223	30.000	0.000	NA		NA
5415227	5415228	CMS_1155	CMS_1156			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415233	5415234	CMS_1162	CMS_1163			FALSE	0.098	145.000	0.000	NA		NA
5415234	5415235	CMS_1163	CMS_1164			FALSE	0.108	134.000	0.000	NA		NA
5415235	5415236	CMS_1164	CMS_1165			FALSE	0.138	88.000	0.000	NA		NA
5415236	5415237	CMS_1165	CMS_1166			FALSE	0.103	192.000	0.000	1.000	N	NA
5415238	5415239	CMS_1167	CMS_1168			TRUE	0.998	-3.000	0.750	0.016	Y	NA
5415239	5415240	CMS_1168	CMS_1169			FALSE	0.095	152.000	0.000	NA		NA
5415240	5415241	CMS_1169	CMS_1170			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415241	5415242	CMS_1170	CMS_1171			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5415243	5415244	CMS_1172	CMS_1173			FALSE	0.145	85.000	0.000	NA		NA
5415244	5415245	CMS_1173	CMS_1174			FALSE	0.270	21.000	0.000	NA		NA
5415245	5415246	CMS_1174	CMS_1175			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5415246	5415247	CMS_1175	CMS_1176			FALSE	0.265	23.000	0.000	1.000		NA
5415251	5415252	CMS_1180	CMS_1181			FALSE	0.112	124.000	0.000	NA		NA
5415252	5415253	CMS_1181	CMS_1182			FALSE	0.067	187.000	0.000	1.000		NA
5415254	5415255	CMS_1183	CMS_1184			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415256	5415257	CMS_1185	CMS_1186			FALSE	0.136	477.000	0.011	1.000	Y	NA
5415258	5415259	CMS_1187	CMS_1188			FALSE	0.260	23.000	0.000	NA		NA
5415260	5415261	CMS_1189	CMS_1190			FALSE	0.037	276.000	0.000	NA		NA
5415261	5415262	CMS_1190	CMS_1191			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415262	5415263	CMS_1191	CMS_1192			FALSE	0.198	55.000	0.000	NA		NA
5415263	5415264	CMS_1192	CMS_1193			FALSE	0.392	9.000	0.007	NA		NA
5415264	5415265	CMS_1193	CMS_1194			FALSE	0.303	59.000	0.000	NA	N	NA
5415265	5415266	CMS_1194	CMS_1195			TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
5415268	5415269	CMS_1197	CMS_1198			FALSE	0.306	35.000	0.000	1.000	N	NA
5415269	5415270	CMS_1198	CMS_1199			TRUE	0.734	60.000	0.206	1.000		NA
5415270	5415271	CMS_1199	CMS_1200			FALSE	0.058	204.000	0.000	NA		NA
5415271	5415272	CMS_1200	CMS_1201			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415272	5415273	CMS_1201	CMS_1202			TRUE	0.998	-3.000	0.800	1.000	Y	NA
5415273	5415274	CMS_1202	CMS_1203		ftsK	TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5415274	5415275	CMS_1203	CMS_1204	ftsK		TRUE	0.834	4.000	0.025	0.049	N	NA
5415275	5415276	CMS_1204	CMS_1205			TRUE	0.970	-3.000	0.151	NA		NA
5415276	5415277	CMS_1205	CMS_1206			FALSE	0.271	140.000	0.057	NA		NA
5415277	5415278	CMS_1206	CMS_1207			TRUE	0.626	77.000	0.177	NA		NA
5415278	5415279	CMS_1207	CMS_1208		recA	FALSE	0.131	138.000	0.017	NA		NA
5415279	5415280	CMS_1208	CMS_1209	recA	recX	FALSE	0.422	235.000	0.296	1.000		NA
5415280	5415281	CMS_1209	CMS_1210	recX		FALSE	0.229	51.000	0.016	1.000		NA
5415281	5415282	CMS_1210	CMS_1211			TRUE	0.976	-3.000	0.028	1.000	Y	NA
5415282	5415283	CMS_1211	CMS_1212			TRUE	0.779	10.000	0.062	1.000	N	NA
5415287	5415288	CMS_1215A	CMS_1216		hisB	FALSE	0.112	102.000	0.000	NA		NA
5415288	5415289	CMS_1216	CMS_1217	hisB	hisH	TRUE	0.981	-3.000	0.046	0.005	Y	NA
5415289	5415290	CMS_1217	CMS_1218	hisH	priA	TRUE	0.949	65.000	0.491	0.005	Y	NA
5415290	5415291	CMS_1218	CMS_1219	priA		TRUE	0.979	-3.000	0.215	NA		NA
5415293	5415294	CMS_1221	CMS_1222	infC	rpmI	TRUE	0.997	-7.000	0.652	1.000	Y	NA
5415294	5415295	CMS_1222	CMS_1223	rpmI	rplT	TRUE	0.978	47.000	0.928	0.016	Y	NA
5415295	5415296	CMS_1223	CMS_1224	rplT		TRUE	0.775	64.000	0.057	0.014	Y	NA
5415296	5415297	CMS_1224	CMS_1225			FALSE	0.152	152.000	0.000	1.000	N	NA
5415297	5415298	CMS_1225	CMS_1226			TRUE	0.761	92.000	0.121	1.000	Y	NA
5415298	5415299	CMS_1226	CMS_1227			TRUE	0.896	116.000	0.462	0.051	Y	NA
5415299	5415300	CMS_1227	CMS_1228			TRUE	0.996	-3.000	0.429	0.005	Y	NA
5415300	5415301	CMS_1228	CMS_1229		pheS	FALSE	0.253	75.000	0.000	1.000	N	NA
5415301	5415302	CMS_1229	CMS_1230	pheS	pheT	TRUE	0.995	3.000	0.574	0.001	Y	NA
5415302	5415303	CMS_1230	CMS_1231	pheT	argC	FALSE	0.183	117.000	0.014	1.000	N	NA
5415303	5415304	CMS_1231	CMS_1232	argC	argJ	TRUE	0.995	-3.000	0.303	0.002	Y	NA
5415304	5415305	CMS_1232	CMS_1233	argJ	argB	TRUE	0.992	0.000	0.239	0.002	Y	NA
5415305	5415306	CMS_1233	CMS_1234	argB	argD	TRUE	0.989	-3.000	0.105	1.000	Y	NA
5415306	5415307	CMS_1234	CMS_1235	argD	argF	TRUE	0.669	148.000	0.091	1.000	Y	NA
5415307	5415308	CMS_1235	CMS_1236	argF	argG	TRUE	0.805	49.000	0.088	1.000	Y	NA
5415308	5415309	CMS_1236	CMS_1237	argG	argH	TRUE	0.985	5.000	0.278	1.000	Y	NA
5415309	5415310	CMS_1237	CMS_1238	argH		TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415310	5415311	CMS_1238	CMS_1239			TRUE	0.506	8.000	0.000	NA		NA
5415312	5415313	CMS_1240	CMS_1241			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415314	5415315	CMS_1242	CMS_r001	tyrS		FALSE	0.021	563.000	0.000	NA		NA
5415315	5415316	CMS_r001	CMS_r002			FALSE	0.023	447.000	0.000	NA		NA
5415316	5415317	CMS_r002	CMS_r003			FALSE	0.079	170.000	0.000	NA		NA
5415317	5415318	CMS_r003	CMS_1243			FALSE	0.019	883.000	0.000	NA		NA
11501227	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	547.000	0.000	NA		NA
11643590	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	547.000	0.000	NA		NA
11785982	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	547.000	0.000	NA		NA
11501228	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	576.000	0.000	NA		NA
11643591	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	576.000	0.000	NA		NA
11785983	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	576.000	0.000	NA		NA
11501229	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	607.000	0.000	NA		NA
11643592	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	607.000	0.000	NA		NA
11785984	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	607.000	0.000	NA		NA
11501230	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	636.000	0.000	NA		NA
11643593	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	636.000	0.000	NA		NA
11785985	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	636.000	0.000	NA		NA
11501231	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	664.000	0.000	NA		NA
11643594	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	664.000	0.000	NA		NA
11785986	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	664.000	0.000	NA		NA
11501232	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	693.000	0.000	NA		NA
11643595	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	693.000	0.000	NA		NA
11785987	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	693.000	0.000	NA		NA
11501233	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	724.000	0.000	NA		NA
11643596	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	724.000	0.000	NA		NA
11785988	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	724.000	0.000	NA		NA
11501234	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	753.000	0.000	NA		NA
11643597	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	753.000	0.000	NA		NA
11785989	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	753.000	0.000	NA		NA
11501235	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	781.000	0.000	NA		NA
11643598	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	781.000	0.000	NA		NA
11785990	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	781.000	0.000	NA		NA
11501236	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	810.000	0.000	NA		NA
11643599	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	810.000	0.000	NA		NA
11785991	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	810.000	0.000	NA		NA
11501237	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	841.000	0.000	NA		NA
11643600	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	841.000	0.000	NA		NA
11785992	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	841.000	0.000	NA		NA
11501238	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
11643601	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
11785993	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
5415318	5415319	CMS_1243	CMS_1244			TRUE	0.987	-10.000	0.500	1.000		NA
11501239	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	901.000	0.000	NA		NA
11643602	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	901.000	0.000	NA		NA
11785994	5415317		CMS_r003			FALSE	NA	901.000	0.000	NA		NA
5415319	5415320	CMS_1244	CMS_1245			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5415320	5415321	CMS_1245	CMS_1246			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5415321	5415322	CMS_1246	CMS_1247		ppnK	TRUE	0.973	-3.000	0.120	1.000	N	NA
5415322	5415323	CMS_1247	CMS_1248	ppnK	recN	TRUE	0.957	-7.000	0.094	1.000	N	NA
5415323	5415324	CMS_1248	CMS_1249	recN	pyrG	FALSE	0.216	74.000	0.006	1.000	N	NA
5415324	5415325	CMS_1249	CMS_1250	pyrG		TRUE	0.948	-3.000	0.055	1.000	N	NA
5415325	5415326	CMS_1250	CMS_1251			TRUE	0.984	-3.000	0.063	1.000	Y	NA
5415326	5415327	CMS_1251	CMS_1252		parA	TRUE	0.486	73.000	0.058	1.000	N	NA
5415327	5415328	CMS_1252	CMS_1253	parA		TRUE	0.914	-16.000	0.065	NA		NA
5415328	5415329	CMS_1253	CMS_1254			TRUE	0.989	-10.000	0.570	NA		NA
5415329	5415330	CMS_1254	CMS_1255		rsuA	TRUE	0.976	-16.000	0.224	NA	N	NA
5415330	5415331	CMS_1255	CMS_1256	rsuA		TRUE	0.926	-3.000	0.030	1.000	N	NA
5415331	5415332	CMS_1256	CMS_1257		cmk	FALSE	0.276	129.000	0.032	1.000	N	NA
5415332	5415333	CMS_1257	CMS_1258	cmk		FALSE	0.116	41.000	0.002	1.000		NA
5415334	5415335	CMS_1259	CMS_1260			FALSE	0.079	171.000	0.000	1.000		NA
5415335	5415336	CMS_1260	CMS_1261			FALSE	0.119	97.000	0.000	1.000		NA
5415336	5415337	CMS_1261	CMS_1262			FALSE	0.114	127.000	0.000	1.000		NA
5415338	5415339	CMS_1263	CMS_r022			FALSE	0.148	84.000	0.000	NA		NA
5415339	5415340	CMS_r022	CMS_1264			FALSE	0.036	286.000	0.000	NA		NA
5415343	5415344	CMS_1267	CMS_1268			TRUE	0.586	44.000	0.105	NA		NA
5415344	5415345	CMS_1268	CMS_1269			FALSE	0.111	121.000	0.000	NA		NA
5415346	5415347	CMS_1270	CMS_1271			TRUE	0.972	38.000	0.792	0.050	Y	NA
5415347	5415348	CMS_1271	CMS_1272			TRUE	0.999	-3.000	0.864	0.050	Y	NA
5415348	5415349	CMS_1272	CMS_1273			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415349	5415350	CMS_1273	CMS_1275			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415350	5415351	CMS_1275	CMS_1276			TRUE	0.988	-3.000	0.375	NA		NA
5415351	5415352	CMS_1276	CMS_1277			TRUE	0.990	-3.000	0.455	NA		NA
5415352	5415353	CMS_1277	CMS_1278			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415354	5415355	CMS_1279	CMS_1280			FALSE	0.168	136.000	0.000	1.000	N	NA
5415356	5415357	CMS_1281	CMS_1282			TRUE	0.981	-3.000	0.190	NA	N	NA
5415360	5415361	CMS_1285	CMS_1287			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5415361	5415362	CMS_1287	CMS_1288			FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5415362	5415363	CMS_1288	CMS_1289			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5415363	5415364	CMS_1289	CMS_1290			FALSE	0.195	54.000	0.000	NA		NA
5415364	5415365	CMS_1290	CMS_1291			FALSE	0.157	79.000	0.000	NA		NA
5415365	5415366	CMS_1291	CMS_1293			FALSE	0.198	38.000	0.000	NA		NA
5415366	5415367	CMS_1293	CMS_1294			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5415370	5415371	CMS_1297	CMS_1298			FALSE	0.178	126.000	0.000	1.000	N	NA
5415371	5415372	CMS_1298	CMS_1299			TRUE	0.961	-3.000	0.095	1.000		NA
5415372	5415373	CMS_1299	CMS_1300			FALSE	0.197	41.000	0.000	1.000		NA
5415374	5415375	CMS_1301	CMS_1302			FALSE	0.091	156.000	0.000	NA		NA
5415375	5415376	CMS_1302	CMS_1303			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415376	5415377	CMS_1303	CMS_1304			FALSE	0.109	116.000	0.000	NA		NA
5415377	5415378	CMS_1304	CMS_1305			FALSE	0.205	90.000	0.000	NA	N	NA
5415379	5415380	CMS_1306	CMS_1307			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415382	5415383	CMS_1310	CMS_1311			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415384	5415385	CMS_1312	CMS_1313			FALSE	0.055	211.000	0.000	NA		NA
5415385	5415386	CMS_1313	CMS_1314			FALSE	0.327	14.000	0.000	NA		NA
5415386	5415387	CMS_1314	CMS_1315			FALSE	0.112	102.000	0.000	NA		NA
5415388	5415389	CMS_1316	CMS_1317			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5415390	5415391	CMS_1318	CMS_1319			TRUE	0.998	-3.000	0.750	0.026	Y	NA
5415392	5415393	CMS_1320	CMS_1321			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415393	5415394	CMS_1321	CMS_1322			FALSE	0.097	148.000	0.000	NA		NA
5415394	5415395	CMS_1322	CMS_1323			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415397	5415398	CMS_1325	CMS_1326			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415405	5415406	CMS_1333	CMS_1334			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5415406	5415407	CMS_1334	CMS_1335			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415407	5415408	CMS_1335	CMS_1336			TRUE	0.652	8.000	0.000	0.049	N	NA
5415408	5415409	CMS_1336	CMS_1337			TRUE	0.957	0.000	0.000	0.049	Y	NA
5415409	5415410	CMS_1337	CMS_1338			FALSE	0.122	120.000	0.000	0.049		NA
5415412	5415413	CMS_1341	CMS_1342			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5415413	5415414	CMS_1342	CMS_1343			TRUE	0.873	1.000	0.043	NA		NA
5415414	5415415	CMS_1343	CMS_1344			FALSE	0.125	94.000	0.000	1.000		NA
5415415	5415416	CMS_1344	CMS_1345			TRUE	0.993	-3.000	0.222	1.000	Y	NA
5415417	5415418	CMS_1346	CMS_1347			FALSE	0.208	89.000	0.000	NA	N	NA
5415418	5415419	CMS_1347	CMS_1348			TRUE	0.994	0.000	0.707	NA	N	NA
5415419	5415420	CMS_1348	CMS_1349			FALSE	0.383	253.000	0.060	0.006	Y	NA
5415422	5415423	CMS_1351	CMS_1352	pyc		TRUE	0.933	4.000	0.014	0.034	Y	NA
5415423	5415424	CMS_1352	CMS_1353			FALSE	0.306	35.000	0.000	1.000	N	NA
5415426	5415427	CMS_1355	CMS_1356			TRUE	0.676	81.000	0.182	1.000	N	NA
5415427	5415428	CMS_1356	CMS_1357		aroH	TRUE	0.622	60.000	0.082	1.000	N	NA
5415428	5415429	CMS_1357	CMS_1358	aroH		FALSE	0.141	162.000	0.000	1.000	N	NA
5415430	5415431	CMS_1359	CMS_1360			FALSE	0.225	107.000	0.021	1.000	N	NA
5415434	5415435	CMS_1363	CMS_1364		mraZ	FALSE	0.031	339.000	0.000	NA		NA
5415435	5415436	CMS_1364	CMS_1365	mraZ	mraW	TRUE	0.816	104.000	0.635	NA		NA
5415436	5415437	CMS_1365	CMS_1366	mraW		TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415437	5415438	CMS_1366	CMS_1367			FALSE	0.085	165.000	0.000	NA		NA
5415438	5415439	CMS_1367	CMS_1368		murE	TRUE	0.962	13.000	0.333	1.000	Y	NA
5415439	5415440	CMS_1368	CMS_1369	murE	murF	TRUE	0.994	-43.000	0.367	0.002	Y	NA
5415440	5415441	CMS_1369	CMS_1370	murF	mraY	TRUE	0.981	-6.000	0.071	0.005	Y	NA
5415441	5415442	CMS_1370	CMS_1371	mraY	murD	TRUE	0.996	3.000	0.647	0.005	Y	NA
5415442	5415443	CMS_1371	CMS_1372	murD	ftsW	TRUE	0.947	-43.000	0.081	0.005	N	NA
5415443	5415444	CMS_1372	CMS_1373	ftsW	murG	TRUE	0.978	-3.000	0.167	1.000	N	NA
5415444	5415445	CMS_1373	CMS_1374	murG	murC	TRUE	0.903	48.000	0.270	1.000	Y	NA
5415445	5415446	CMS_1374	CMS_1375	murC	ftsQ	FALSE	0.362	420.000	0.134	NA	Y	NA
5415446	5415447	CMS_1375	CMS_1376	ftsQ	ftsZ	FALSE	0.370	138.000	0.067	NA	N	NA
5415447	5415448	CMS_1376	CMS_1377	ftsZ		FALSE	0.105	87.000	0.006	NA		NA
5415448	5415449	CMS_1377	CMS_1378			TRUE	0.857	76.000	0.581	NA		NA
5415449	5415450	CMS_1378	CMS_1379			TRUE	0.651	68.000	0.165	NA		NA
5415450	5415451	CMS_1379	CMS_1380			TRUE	0.587	47.000	0.114	NA		NA
5415451	5415452	CMS_1380	CMS_1381		rlu	FALSE	0.219	31.000	0.000	NA		NA
5415452	5415453	CMS_1381	CMS_1382	rlu	dnaE	FALSE	0.267	77.000	0.014	1.000	N	NA
5415455	5415456	CMS_1384	CMS_1385	hisD		FALSE	0.397	18.000	0.011	NA	N	NA
5415456	5415457	CMS_1385	CMS_1386		pyrD	FALSE	0.235	58.000	0.004	NA	N	NA
5415459	5415460	CMS_1388	CMS_1389			FALSE	0.072	136.000	0.005	NA		NA
5415460	5415461	CMS_1389	CMS_1390			FALSE	0.159	86.000	0.014	NA		NA
5415461	5415462	CMS_1390	CMS_1391			TRUE	0.958	13.000	0.284	0.001	Y	NA
5415462	5415463	CMS_1391	CMS_1392			TRUE	0.970	2.000	0.250	NA		NA
5415463	5415464	CMS_1392	CMS_1393			TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5415464	5415465	CMS_1393	CMS_1394			FALSE	0.119	97.000	0.000	1.000		NA
5415466	5415467	CMS_1395	CMS_1396			FALSE	0.184	48.000	0.000	NA		NA
5415468	5415469	CMS_1397	CMS_1398			FALSE	0.232	83.000	0.000	1.000	N	NA
5415469	5415470	CMS_1398	CMS_1399			FALSE	0.191	46.000	0.000	1.000		NA
5415470	5415471	CMS_1399	CMS_1400			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415471	5415472	CMS_1400	CMS_1401			FALSE	0.048	228.000	0.000	NA		NA
5415473	5415474	CMS_1402	CMS_1403			FALSE	0.062	193.000	0.000	NA		NA
5415475	5415476	CMS_1404	CMS_1405			TRUE	0.469	101.000	0.000	NA	Y	NA
5415476	5415477	CMS_1405	CMS_1406			TRUE	0.990	6.000	0.471	0.001	Y	NA
5415477	5415478	CMS_1406	CMS_1407		mnhA	FALSE	0.196	93.000	0.000	1.000	N	NA
5415478	5415479	CMS_1407	CMS_1408	mnhA		TRUE	0.999	-3.000	0.833	0.001	Y	NA
5415479	5415480	CMS_1408	CMS_1409			TRUE	0.999	-3.000	0.870	0.001	Y	NA
5415480	5415481	CMS_1409	CMS_1410			TRUE	0.999	-3.000	0.913	1.000	Y	NA
5415481	5415482	CMS_1410	CMS_1411			TRUE	0.965	-3.000	0.109	0.047		NA
5415482	5415483	CMS_1411	CMS_1412			TRUE	0.963	-3.000	0.106	1.000		NA
5415483	5415484	CMS_1412	CMS_1413		ilvD	FALSE	0.273	70.000	0.000	1.000	N	NA
5415484	5415485	CMS_1413	CMS_1414	ilvD	ilvB	TRUE	0.667	45.000	0.020	0.002	Y	NA
5415485	5415486	CMS_1414	CMS_1415	ilvB	ilvH	TRUE	0.996	-3.000	0.380	0.001	Y	NA
5415486	5415487	CMS_1415	CMS_1416	ilvH	ilvC	TRUE	0.549	181.000	0.071	0.002	Y	NA
5415487	5415488	CMS_1416	CMS_1417	ilvC		FALSE	0.053	215.000	0.000	NA		NA
5415488	5415489	CMS_1417	CMS_1418			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415495	5415496	CMS_1424	CMS_1425	leuB	ilvE	TRUE	0.940	9.000	0.083	1.000	Y	NA
5415496	5415497	CMS_1425	CMS_1426	ilvE		FALSE	0.290	58.000	0.010	1.000	N	NA
5415497	5415498	CMS_1426	CMS_1427			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5415498	5415499	CMS_1427	CMS_1428		gltX	FALSE	0.327	14.000	0.000	NA		NA
5415499	5415500	CMS_1428	CMS_1429	gltX		FALSE	0.251	38.000	0.006	1.000	N	NA
5415500	5415501	CMS_1429	CMS_r023			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5415504	5415505	CMS_1432	CMS_1433			FALSE	0.202	55.000	0.000	1.000		NA
5415507	5415508	CMS_1435	CMS_1436			FALSE	0.048	229.000	0.000	NA		NA
5415508	5415509	CMS_1436	CMS_1437			FALSE	0.229	28.000	0.000	NA		NA
5415510	5415511	CMS_r024	CMS_1438			FALSE	0.099	143.000	0.000	NA		NA
5415511	5415512	CMS_1438	CMS_1439		ung	FALSE	0.386	11.000	0.000	1.000		NA
5415512	5415513	CMS_1439	CMS_1440	ung		FALSE	0.388	54.000	0.025	1.000	N	NA
5415516	5415517	CMS_1443	CMS_1444	hps	rmpB	TRUE	0.986	-3.000	0.250	0.021	N	NA
5415518	5415519	CMS_1445	CMS_1446			FALSE	0.134	166.000	0.000	1.000	N	NA
5415519	5415520	CMS_1446	CMS_1447			FALSE	0.334	29.000	0.000	1.000	N	NA
5415522	5415523	CMS_1449	CMS_1450			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5415524	5415525	CMS_1451	CMS_1452			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415525	5415526	CMS_1452	CMS_1453			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415526	5415527	CMS_1453	CMS_1454			FALSE	0.305	58.000	0.000	1.000	N	NA
5415527	5415528	CMS_1454	CMS_1455			FALSE	0.302	131.000	0.040	1.000	N	NA
5415528	5415529	CMS_1455	CMS_1456			FALSE	0.133	91.000	0.000	1.000		NA
5415529	5415530	CMS_1456	CMS_1457			FALSE	0.073	176.000	0.000	NA		NA
5415530	5415531	CMS_1457	CMS_1458			FALSE	0.241	199.000	0.083	NA		NA
5415531	5415532	CMS_1458	CMS_1459			FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5415532	5415533	CMS_1459	CMS_1460			FALSE	0.111	129.000	0.000	NA		NA
5415535	5415536	CMS_1461	CMS_1462			FALSE	0.208	34.000	0.000	NA		NA
5415536	5415537	CMS_1462	CMS_1463			FALSE	0.246	25.000	0.000	NA		NA
5415538	5415539	CMS_1464	CMS_1465			FALSE	0.162	78.000	0.000	1.000		NA
5415540	5415541	CMS_1466	CMS_1467			TRUE	0.970	-3.000	0.000	0.002	Y	NA
5415541	5415542	CMS_1467	CMS_1468			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415542	5415543	CMS_1468	CMS_1469			TRUE	0.645	35.000	0.000	1.000	Y	NA
5415543	5415544	CMS_1469	CMS_1470			TRUE	0.963	26.000	1.000	1.000	N	NA
5415545	5415546	CMS_1471	CMS_1472			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5415548	5415549	CMS_1474	CMS_1475	argS		FALSE	0.203	12.000	0.002	NA		NA
5415549	5415550	CMS_1475	CMS_1476		lysA	FALSE	0.089	159.000	0.000	NA		NA
5415550	5415551	CMS_1476	CMS_1477	lysA		TRUE	0.985	-3.000	0.071	1.000	Y	NA
5415551	5415552	CMS_1477	CMS_1478		thrC	TRUE	0.989	0.000	0.194	1.000	Y	NA
5415552	5415553	CMS_1478	CMS_1479	thrC	thrB	TRUE	0.993	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
5415555	5415556	CMS_1481	CMS_1482	rho	prfA	TRUE	0.732	6.000	0.017	1.000	N	NA
5415556	5415557	CMS_1482	CMS_1483	prfA		TRUE	0.833	25.000	0.069	1.000	Y	NA
5415559	5415560	CMS_1485	CMS_1486			TRUE	0.985	-3.000	0.248	NA	N	NA
5415560	5415561	CMS_1486	CMS_1487			TRUE	0.859	-3.000	0.020	NA		NA
5415561	5415562	CMS_1487	CMS_1488			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415563	5415564	CMS_1489	CMS_1490			TRUE	0.939	0.000	0.083	1.000		NA
5415564	5415565	CMS_1490	CMS_1491		pepN	FALSE	0.356	158.000	0.071	1.000	N	NA
5415566	5415567	CMS_1492	CMS_1493			TRUE	0.527	114.000	0.182	1.000		NA
5415567	5415568	CMS_1493	CMS_1494			TRUE	0.967	7.000	0.398	1.000	N	NA
5415569	5415570	CMS_1495	CMS_1496			FALSE	0.099	143.000	0.000	NA		NA
5415570	5415571	CMS_1496	CMS_r042			FALSE	0.020	639.000	0.000	NA		NA
5415572	5415573	CMS_r025	CMS_1497		tig	FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5415573	5415574	CMS_1497	CMS_1498	tig	clpP1	FALSE	0.316	185.000	0.007	1.000	Y	NA
5415574	5415575	CMS_1498	CMS_1499	clpP1	clpP2	TRUE	0.954	36.000	0.512	0.001	Y	NA
5415580	5415581	CMS_1504	CMS_1505			TRUE	0.995	0.000	1.000	NA		NA
5415581	5415582	CMS_1505	CMS_1506			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415582	5415583	CMS_1506	CMS_1507		pckG	FALSE	0.156	148.000	0.000	1.000	N	NA
5415585	5415586	CMS_1509	CMS_1510			TRUE	0.967	-3.000	0.133	1.000		NA
5415586	5415587	CMS_1510	CMS_1511			TRUE	0.997	-3.000	0.533	0.048	Y	NA
5415587	5415588	CMS_1511	CMS_1512			TRUE	0.999	-3.000	0.889	0.048	Y	NA
5415589	5415590	CMS_1513	CMS_1514			TRUE	0.638	8.000	0.000	1.000	N	NA
5415590	5415591	CMS_1514	CMS_1515			FALSE	0.112	118.000	0.000	1.000		NA
5415593	5415594	CMS_1517	CMS_1518			FALSE	0.204	58.000	0.000	NA		NA
5415594	5415595	CMS_1518	CMS_1519			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5415595	5415596	CMS_1519	CMS_1520			FALSE	0.185	47.000	0.000	NA		NA
5415596	5415597	CMS_1520	CMS_1521			FALSE	0.110	118.000	0.000	NA		NA
5415597	5415598	CMS_1521	CMS_1522			FALSE	0.157	79.000	0.000	NA		NA
5415598	5415599	CMS_1522	CMS_1523			FALSE	0.036	285.000	0.000	NA		NA
5415600	5415601	CMS_1524	CMS_1525			FALSE	0.128	170.000	0.000	1.000	N	NA
5415601	5415602	CMS_1525	CMS_1526			TRUE	0.995	-3.000	0.263	0.010	Y	NA
5415602	5415603	CMS_1526	CMS_1527		treX	TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415604	5415605	CMS_1529	CMS_1530			FALSE	0.040	259.000	0.000	NA		NA
5415605	5415606	CMS_1530	CMS_1531			TRUE	0.973	3.000	0.326	NA		NA
5415606	5415607	CMS_1531	CMS_1532			TRUE	0.988	-3.000	0.372	1.000		NA
5415607	5415608	CMS_1532	CMS_1533			TRUE	0.831	-10.000	0.000	NA	N	NA
5415608	5415609	CMS_1533	CMS_1534			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5415610	5415611	CMS_1535	CMS_r043			FALSE	0.113	99.000	0.000	NA		NA
5415611	5415612	CMS_r043	CMS_1536			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5415613	5415614	CMS_1537	CMS_1538			FALSE	0.138	88.000	0.000	NA		NA
5415614	5415615	CMS_1538	CMS_r012			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5415615	5415616	CMS_r012	CMS_1539		nadE	FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5415617	5415618	CMS_1540	CMS_1541			FALSE	0.148	84.000	0.000	NA		NA
5415619	5415620	CMS_1542	CMS_1543	msrA		FALSE	0.110	107.000	0.000	NA		NA
5415620	5415621	CMS_1543	CMS_1543A			FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5415621	5415622	CMS_1543A	CMS_1544			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415622	5415623	CMS_1544	CMS_1545			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415623	5415624	CMS_1545	CMS_1546			FALSE	0.127	64.000	0.004	NA		NA
5415624	5415625	CMS_1546	CMS_1547			TRUE	0.788	4.000	0.031	NA		NA
5415627	5415628	CMS_1549	CMS_1550			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415629	5415630	CMS_1551	CMS_1552			FALSE	0.083	166.000	0.000	NA		NA
5415631	5415632	CMS_1553	CMS_1554			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415632	5415633	CMS_1554	CMS_1555			FALSE	0.125	93.000	0.000	NA		NA
5415633	5415634	CMS_1555	CMS_1556			TRUE	0.712	5.000	0.011	1.000	N	NA
5415634	5415635	CMS_1556	CMS_1557		dnaG	FALSE	0.450	65.000	0.037	1.000	N	NA
5415635	5415636	CMS_1557	CMS_1558	dnaG		FALSE	0.098	199.000	0.000	1.000	N	NA
5415636	5415637	CMS_1558	CMS_1559			FALSE	0.443	147.000	0.000	0.048	Y	NA
5415637	5415638	CMS_1559	CMS_1560			TRUE	0.994	2.000	0.435	0.048	Y	NA
5415638	5415639	CMS_1560	CMS_1561			TRUE	0.976	-3.000	0.185	1.000		NA
5415639	5415640	CMS_1561	CMS_1562			FALSE	0.121	114.000	0.000	0.021		NA
5415640	5415641	CMS_1562	CMS_1563			TRUE	0.463	111.000	0.000	1.000	Y	NA
5415641	5415642	CMS_1563	CMS_1564			FALSE	0.296	64.000	0.000	NA	N	NA
5415644	5415645	CMS_1566	CMS_1567			TRUE	0.829	101.000	0.667	NA		NA
5415645	5415646	CMS_1567	CMS_1568			TRUE	0.991	-3.000	0.500	NA		NA
5415646	5415647	CMS_1568	CMS_1569			TRUE	0.994	-3.000	0.667	NA		NA
5415647	5415648	CMS_1569	CMS_1570			TRUE	0.993	-3.000	0.600	NA		NA
5415648	5415649	CMS_1570	CMS_1571			FALSE	0.074	174.000	0.000	NA		NA
5415649	5415650	CMS_1571	CMS_1572			TRUE	0.995	-3.000	0.333	1.000	Y	NA
5415650	5415651	CMS_1572	CMS_1573			TRUE	0.996	-3.000	0.375	1.000	Y	NA
5415651	5415652	CMS_1573	CMS_1574			TRUE	0.984	-7.000	0.375	NA		NA
5415652	5415653	CMS_1574	CMS_1575			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5415653	5415654	CMS_1575	CMS_r014			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5415656	5415657	CMS_1577	CMS_1578			TRUE	0.485	169.000	0.213	NA		NA
5415657	5415658	CMS_1578	CMS_r026			FALSE	0.337	13.000	0.000	NA		NA
5415658	5415659	CMS_r026	CMS_1579			TRUE	0.506	8.000	0.000	NA		NA
5415660	5415661	CMS_1580	CMS_1581	fcl	gmd	TRUE	0.991	-3.000	0.160	0.006	Y	NA
5415662	5415663	CMS_1582	CMS_1583	wcaI	wcaF	TRUE	0.943	-3.000	0.066	1.000		NA
5415663	5415664	CMS_1583	CMS_1584	wcaF		TRUE	0.931	-3.000	0.055	1.000		NA
5415664	5415665	CMS_1584	CMS_1585		rfc	TRUE	0.982	-3.000	0.250	NA		NA
5415666	5415667	CMS_1586	CMS_1587			TRUE	0.982	-3.000	0.250	NA		NA
5415667	5415668	CMS_1587	CMS_1588			FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5415668	5415669	CMS_1588	CMS_1589		wzx	FALSE	0.206	63.000	0.000	1.000		NA
5415669	5415670	CMS_1589	CMS_1590	wzx		FALSE	0.118	96.000	0.000	NA		NA
5415670	5415671	CMS_1590	CMS_1591			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5415671	5415672	CMS_1591	CMS_1592		csp	FALSE	0.109	117.000	0.000	NA		NA
5415673	5415674	CMS_1593	CMS_1594	polA		FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5415674	5415675	CMS_1594	CMS_1595			FALSE	0.110	108.000	0.000	NA		NA
5415678	5415679	CMS_1599	CMS_1600	kasA	acpP	TRUE	0.838	80.000	0.178	1.000	Y	NA
5415679	5415680	CMS_1600	CMS_1601	acpP	fabH	TRUE	0.921	54.000	0.307	0.002	Y	NA
5415680	5415681	CMS_1601	CMS_1602	fabH	fabD	TRUE	0.908	70.000	0.294	1.000	Y	NA
5415681	5415682	CMS_1602	CMS_1603	fabD		TRUE	0.786	95.000	0.441	NA	N	NA
5415682	5415683	CMS_1603	CMS_1604		aceE	TRUE	0.547	17.000	0.028	NA	N	NA
5415688	5415689	CMS_1608	CMS_1609	bioY		TRUE	0.964	-3.000	0.117	NA		NA
5415689	5415690	CMS_1609	CMS_1610			TRUE	0.998	-3.000	0.729	1.000	Y	NA
5415690	5415691	CMS_1610	CMS_1611			FALSE	0.143	86.000	0.000	NA		NA
5415691	5415692	CMS_1611	CMS_1612			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5415692	5415693	CMS_1612	CMS_1613			TRUE	0.860	56.000	0.468	NA		NA
5415697	5415698	CMS_1617	CMS_1618	glnA2	glnE	TRUE	0.498	59.000	0.046	1.000	N	NA
5415701	5415702	CMS_1621	CMS_1622			FALSE	0.033	318.000	0.000	NA		NA
5415704	5415705	CMS_1624	CMS_1625	sucB	pdhD	TRUE	0.937	61.000	0.379	1.000	Y	NA
5415705	5415706	CMS_1625	CMS_1626	pdhD	pepA	TRUE	0.521	92.000	0.095	0.033	N	NA
5415707	5415708	CMS_1627	CMS_1628			TRUE	0.579	76.000	0.140	NA		NA
5415708	5415709	CMS_1628	CMS_1629			FALSE	0.033	628.000	0.000	NA	N	NA
5415709	5415710	CMS_1629	CMS_1630			TRUE	0.777	4.000	0.015	1.000	N	NA
5415710	5415711	CMS_1630	CMS_1631			TRUE	0.995	-3.000	0.796	1.000		NA
5415718	5415719	CMS_1638	CMS_1639			FALSE	0.080	169.000	0.000	NA		NA
5415720	5415721	CMS_1640	CMS_1641	dut		TRUE	0.953	-3.000	0.078	NA		NA
5415721	5415722	CMS_1641	CMS_1642			TRUE	0.948	3.000	0.169	NA		NA
5415722	5415723	CMS_1642	CMS_1643		acnA	FALSE	0.070	180.000	0.000	NA		NA
5415723	5415724	CMS_1643	CMS_1644	acnA	dxs	FALSE	0.154	116.000	0.008	1.000	N	NA
5415725	5415726	CMS_1645	CMS_1646	fadB	fadA	TRUE	0.998	-3.000	0.812	NA	Y	NA
5415726	5415727	CMS_1646	CMS_1647	fadA		FALSE	0.278	100.000	0.032	NA	N	NA
5415727	5415728	CMS_1647	CMS_1648			FALSE	0.414	141.000	0.115	NA		NA
5415728	5415729	CMS_1648	CMS_1649			FALSE	0.117	181.000	0.025	NA		NA
5415729	5415730	CMS_1649	CMS_1650			TRUE	0.890	-3.000	0.027	NA		NA
5415730	5415731	CMS_1650	CMS_1651		thtR	TRUE	0.987	-3.000	0.351	NA		NA
5415732	5415733	CMS_1652	CMS_1653			FALSE	0.042	252.000	0.000	NA		NA
5415733	5415734	CMS_1653	CMS_1654			FALSE	0.063	194.000	0.000	1.000		NA
5415734	5415735	CMS_1654	CMS_1655			FALSE	0.031	342.000	0.000	NA		NA
5415735	5415736	CMS_1655	CMS_1656			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5415736	5415737	CMS_1656	CMS_1658			FALSE	0.030	356.000	0.000	1.000		NA
5415737	5415738	CMS_1658	CMS_1659			FALSE	0.189	47.000	0.000	1.000		NA
5415739	5415740	CMS_1660	CMS_1661			TRUE	0.971	3.000	0.229	0.047	N	NA
5415740	5415741	CMS_1661	CMS_1662			TRUE	0.649	87.000	0.042	1.000	Y	NA
5415741	5415742	CMS_1662	CMS_1663			TRUE	0.588	128.000	0.043	1.000	Y	NA
5415744	5415745	CMS_1665	CMS_1666			FALSE	0.286	45.000	0.000	1.000	N	NA
5415745	5415746	CMS_1666	CMS_r028			FALSE	0.112	127.000	0.000	NA		NA
5415747	5415748	CMS_1667	CMS_1668			FALSE	0.160	142.000	0.000	1.000	N	NA
5415748	5415749	CMS_1668	CMS_1669		cysS	TRUE	0.574	65.000	0.071	1.000	N	NA
5415751	5415752	CMS_1671	CMS_1672			TRUE	0.830	-3.000	0.014	1.000		NA
5415752	5415753	CMS_1672	CMS_1673			FALSE	0.208	62.000	0.000	1.000		NA
5415753	5415754	CMS_1673	CMS_1674			FALSE	0.246	25.000	0.000	NA		NA
5415754	5415755	CMS_1674	CMS_1675			TRUE	0.998	-3.000	0.767	NA	Y	NA
5415755	5415756	CMS_1675	CMS_1676		tatA	FALSE	0.103	191.000	0.000	NA	N	NA
5415756	5415757	CMS_1676	CMS_1677	tatA	tatC	TRUE	0.632	55.000	0.012	NA	Y	NA
5415757	5415758	CMS_1677	CMS_1678	tatC		TRUE	0.526	95.000	0.166	NA		NA
5415758	5415759	CMS_1678	CMS_1679		lnt	TRUE	0.909	-3.000	0.035	1.000		NA
5415760	5415761	CMS_1680	CMS_1681			FALSE	0.359	76.000	0.048	NA		NA
5415761	5415762	CMS_1681	CMS_1682			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415763	5415764	CMS_1683	CMS_1684			FALSE	0.257	136.000	0.029	1.000	N	NA
5415764	5415765	CMS_1684	CMS_1685			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415765	5415766	CMS_1685	CMS_1686			FALSE	0.172	72.000	0.000	NA		NA
5415766	5415767	CMS_1686	CMS_1687		lip	FALSE	0.204	58.000	0.000	NA		NA
5415767	5415768	CMS_1687	CMS_1688	lip		FALSE	0.068	183.000	0.000	NA		NA
5415772	10691940	CMS_1692	CMS_1693			FALSE	0.145	85.000	0.000	NA		NA
10691940	5415773	CMS_1693	CMS_1693A			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415773	5415774	CMS_1693A	CMS_1694			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415774	5415775	CMS_1694	CMS_1696			FALSE	0.054	213.000	0.000	NA		NA
5415775	5415776	CMS_1696	CMS_1700			FALSE	0.018	2208.000	0.000	NA		NA
5415778	5415779	CMS_1702	CMS_1703			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415779	5415780	CMS_1703	CMS_1704			FALSE	0.196	93.000	0.000	1.000	N	NA
5415780	5415781	CMS_1704	CMS_1705			FALSE	0.114	122.000	0.000	1.000		NA
5415781	5415782	CMS_1705	CMS_1706			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415783	5415784	CMS_1707	CMS_1708			TRUE	0.994	0.000	0.333	0.045	Y	NA
5415784	5415785	CMS_1708	CMS_1709			TRUE	0.923	9.000	0.263	1.000		NA
5415786	5415787	CMS_1711	CMS_1712			FALSE	0.305	16.000	0.000	NA		NA
5415787	5415788	CMS_1712	CMS_1713			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415788	5415789	CMS_1713	CMS_1715			FALSE	0.090	157.000	0.000	NA		NA
5415789	5415790	CMS_1715	CMS_1717			FALSE	0.033	318.000	0.000	NA		NA
5415791	5415792	CMS_1718	CMS_1720			FALSE	0.030	351.000	0.000	1.000		NA
5415794	5415795	CMS_1722	CMS_1723	glyQS		FALSE	0.110	112.000	0.000	1.000		NA
5415795	5415796	CMS_1723	CMS_1724		uppS	FALSE	0.148	85.000	0.000	1.000		NA
5415796	5415797	CMS_1724	CMS_1725	uppS	recO	TRUE	0.962	-3.000	0.076	1.000	N	NA
5415799	5415800	CMS_1727	CMS_1728	leuA		FALSE	0.088	167.000	0.013	1.000		NA
5415800	5415801	CMS_1728	CMS_1729			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415801	5415802	CMS_1729	CMS_1730			FALSE	0.154	81.000	0.000	NA		NA
5415802	5415803	CMS_1730	CMS_1731			TRUE	0.978	51.000	1.000	0.015	Y	NA
5415803	5415804	CMS_1731	CMS_1732			FALSE	0.120	111.000	0.000	0.045		NA
5415804	5415805	CMS_1732	CMS_1733			TRUE	0.943	-7.000	0.089	1.000		NA
5415805	5415806	CMS_1733	CMS_1734			TRUE	0.895	10.000	0.222	NA		NA
5415806	5415807	CMS_1734	CMS_1735			TRUE	0.990	-3.000	0.457	NA		NA
5415807	5415808	CMS_1735	CMS_1736			TRUE	0.898	-13.000	0.032	1.000	N	NA
5415808	5415809	CMS_1736	CMS_1737			FALSE	0.395	29.000	0.034	NA		NA
5415809	5415810	CMS_1737	CMS_1738			TRUE	0.879	3.000	0.058	NA		NA
5415810	5415811	CMS_1738	CMS_1739		hrcA	FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
5415812	5415813	CMS_1740	CMS_1741			FALSE	0.260	23.000	0.000	NA		NA
5415817	5415818	CMS_1745	CMS_1746			FALSE	0.202	57.000	0.000	NA		NA
5415818	5415819	CMS_1746	CMS_1747			FALSE	0.180	70.000	0.000	NA		NA
5415819	5415820	CMS_1747	CMS_1748			FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
5415821	5415822	CMS_1749	CMS_1750	lepA		FALSE	0.112	100.000	0.000	NA		NA
5415822	5415823	CMS_1750	CMS_1751			FALSE	0.086	164.000	0.000	NA		NA
5415823	5415824	CMS_1751	CMS_1752			FALSE	0.191	46.000	0.000	1.000		NA
5415824	5415825	CMS_1752	CMS_1753			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415826	5415827	CMS_1754	CMS_1755		rpsT	FALSE	0.168	136.000	0.000	1.000	N	NA
5415828	5415829	CMS_1756	CMS_1757			FALSE	0.111	105.000	0.000	NA		NA
5415829	5415830	CMS_1757	CMS_1758			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5415830	5415831	CMS_1758	CMS_1759			FALSE	0.078	171.000	0.000	NA		NA
5415831	5415832	CMS_1759	CMS_1760		leuS	FALSE	0.028	360.000	0.000	NA		NA
5415832	5415833	CMS_1760	CMS_1761	leuS	trpE	FALSE	0.118	99.000	0.002	1.000	N	NA
5415835	5415836	CMS_1763	CMS_1764			TRUE	0.998	-3.000	0.631	0.005	Y	NA
5415836	5415837	CMS_1764	CMS_1765			FALSE	0.270	22.000	0.000	1.000		NA
5415837	5415838	CMS_1765	CMS_1766		cydB	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5415838	5415839	CMS_1766	CMS_1767	cydB	cydA	TRUE	0.998	0.000	0.925	0.024	Y	NA
5415842	5415843	CMS_1770	CMS_1771			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415844	5415845	CMS_1772	CMS_1772A			TRUE	0.986	0.000	0.133	1.000	Y	NA
5415845	5415846	CMS_1772A	CMS_1773			TRUE	0.976	0.000	0.213	1.000	N	NA
5415846	5415847	CMS_1773	CMS_1774			FALSE	0.223	30.000	0.000	NA		NA
5415847	5415848	CMS_1774	CMS_1774A			FALSE	0.165	75.000	0.000	NA		NA
5415848	5415849	CMS_1774A	CMS_1774B			TRUE	0.956	15.000	0.667	0.046	N	NA
5415849	5415850	CMS_1774B	CMS_1775			TRUE	0.999	-3.000	0.918	0.046	Y	NA
5415850	5415851	CMS_1775	CMS_1776			TRUE	0.998	-3.000	0.694	1.000	Y	NA
5415852	5415853	CMS_1777	CMS_1778			FALSE	0.109	109.000	0.000	NA		NA
5415855	5415856	CMS_1780	CMS_1781			FALSE	0.069	182.000	0.000	NA		NA
5415857	5415858	CMS_1782	CMS_1783			FALSE	0.279	51.000	0.000	NA	N	NA
5415858	5415859	CMS_1783	CMS_1784		zwf	FALSE	0.179	99.000	0.000	1.000	N	NA
5415860	5415861	CMS_1785	CMS_1786			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5415861	5415862	CMS_1786	CMS_1787			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415862	5415863	CMS_1787	CMS_1788			FALSE	0.453	141.000	0.000	0.031	Y	NA
5415866	5415867	CMS_1791	CMS_1792			FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5415867	5415868	CMS_1792	CMS_1793			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5415868	5415869	CMS_1793	CMS_1794			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5415871	5415872	CMS_1796	CMS_1797			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5415873	5415874	CMS_1798	CMS_1799			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5415875	5415876	CMS_1800	CMS_1801	ptsH	fruA	TRUE	0.631	46.000	0.000	0.006	Y	NA
5415876	5415877	CMS_1801	CMS_1802	fruA		TRUE	0.918	23.000	0.200	1.000	Y	NA
5415877	5415878	CMS_1802	CMS_1803			TRUE	0.996	-3.000	0.353	1.000	Y	NA
5415878	5415879	CMS_1803	CMS_1804			FALSE	0.064	193.000	0.000	1.000		NA
5415879	5415880	CMS_1804	CMS_1805			FALSE	0.191	43.000	0.000	NA		NA
5415882	5415883	CMS_r009	CMS_1807			FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
5415883	5415884	CMS_1807	CMS_1808			FALSE	0.080	83.000	0.002	NA		NA
5415884	5415885	CMS_1808	CMS_1809			FALSE	0.107	40.000	0.002	NA		NA
5415885	5415886	CMS_1809	CMS_1810		nadD	TRUE	0.688	-3.000	0.002	NA		NA
5415886	5415887	CMS_1810	CMS_1811	nadD		FALSE	0.175	18.000	0.002	NA		NA
5415887	5415888	CMS_1811	CMS_1812		proA	FALSE	0.060	99.000	0.002	NA		NA
5415888	5415889	CMS_1812	CMS_1813	proA	proB	TRUE	0.983	6.000	0.281	0.001	Y	NA
5415889	5415890	CMS_1813	CMS_1814	proB		TRUE	0.951	4.000	0.206	1.000		NA
5415890	5415891	CMS_1814	CMS_1815		rpmA	TRUE	0.686	120.000	0.335	1.000		NA
5415891	5415892	CMS_1815	CMS_1816	rpmA	rplU	TRUE	0.974	25.000	0.667	0.015	Y	NA
5415896	5415897	CMS_1820	CMS_1821	ndk		TRUE	0.556	10.000	0.024	NA		NA
5415897	5415898	CMS_1821	CMS_1822		folC	TRUE	0.971	-3.000	0.156	NA		NA
5415898	5415899	CMS_1822	CMS_1823	folC	ileS	TRUE	0.930	-3.000	0.031	0.087	N	NA
5415899	5415900	CMS_1823	CMS_1824	ileS		FALSE	0.053	217.000	0.000	1.000		NA
5415902	5415903	CMS_1826	CMS_1827			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5415903	5415904	CMS_1827	CMS_1828			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415904	5415905	CMS_1828	CMS_1829			FALSE	0.109	111.000	0.000	NA		NA
5415909	5415910	CMS_1833	CMS_1834			TRUE	0.745	-10.000	0.000	NA		NA
5415910	5415911	CMS_1834	CMS_1835		ribF	FALSE	0.127	92.000	0.000	NA		NA
5415911	5415912	CMS_1835	CMS_1836	ribF		TRUE	0.642	3.000	0.008	NA		NA
5415912	5415913	CMS_1836	CMS_1837			TRUE	0.669	39.000	0.167	NA		NA
5415913	5415914	CMS_1837	CMS_1838		truB	TRUE	0.791	-3.000	0.010	NA		NA
5415918	5415919	CMS_1842	CMS_1843	rbfA	infB	TRUE	0.721	332.000	0.530	1.000	Y	NA
5415919	5415920	CMS_1843	CMS_1844	infB	nusA	FALSE	0.347	441.000	0.342	1.000	N	NA
5415920	5415921	CMS_1844	CMS_1845	nusA	proS	FALSE	0.222	86.000	0.000	1.000	N	NA
5415921	5415922	CMS_1845	CMS_1846	proS		FALSE	0.320	32.000	0.000	1.000	N	NA
5415922	5415923	CMS_1846	CMS_1847			TRUE	0.977	-3.000	0.154	1.000	N	NA
5415923	5415924	CMS_1847	CMS_1848		fabH	TRUE	0.850	47.000	0.154	NA	Y	NA
5415924	5415925	CMS_1848	CMS_1849	fabH	ispG	TRUE	0.464	107.000	0.000	NA	Y	NA
5415925	5415926	CMS_1849	CMS_1850	ispG		FALSE	0.432	96.000	0.072	1.000	N	NA
5415927	5415928	CMS_1851	CMS_1852			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5415929	5415930	CMS_1853	CMS_1854	dxr		FALSE	0.332	9.000	0.002	1.000		NA
5415935	5415936	CMS_1860	CMS_1861	deaD		FALSE	0.373	171.000	0.000	1.000	Y	NA
5415937	5415938	CMS_1863	CMS_1864			FALSE	0.172	72.000	0.000	NA		NA
5415939	5415940	CMS_1865	CMS_1866			TRUE	0.734	-18.000	0.000	NA		NA
5415944	5415945	CMS_1870	CMS_1871			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5415948	5415949	CMS_1875	CMS_1876			FALSE	0.112	127.000	0.000	NA		NA
5415949	5415950	CMS_1876	CMS_1877			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415950	5415951	CMS_1877	CMS_1878			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415951	5415952	CMS_1878	CMS_1879			FALSE	0.024	439.000	0.000	NA		NA
5415952	5415953	CMS_1879	CMS_1880			FALSE	0.284	19.000	0.000	NA		NA
5415953	5415954	CMS_1880	CMS_1881			FALSE	0.082	167.000	0.000	NA		NA
5415955	5415956	CMS_1882	CMS_1883	lipB	lipA	TRUE	0.995	-3.000	0.319	0.001	Y	NA
5415956	5415957	CMS_1883	CMS_1884	lipA		FALSE	0.165	75.000	0.000	NA		NA
5415957	5415958	CMS_1884	CMS_1885			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5415959	5415960	CMS_1886	CMS_r045			FALSE	0.049	223.000	0.000	NA		NA
5415960	5415961	CMS_r045	CMS_1887			FALSE	0.099	143.000	0.000	NA		NA
5415961	5415962	CMS_1887	CMS_1888			FALSE	0.279	128.000	0.053	1.000		NA
5415963	5415964	CMS_1889	CMS_1890			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
5415965	5415966	CMS_1891	CMS_1892			TRUE	0.876	11.000	0.044	1.000	Y	NA
5415968	5415969	CMS_1894	CMS_1895			TRUE	0.997	-3.000	0.493	0.003	Y	NA
5415970	5415971	CMS_1896	CMS_1897			TRUE	0.655	12.000	0.060	NA		NA
5415973	5415974	CMS_1899	CMS_1900			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5415976	5415977	CMS_1902	CMS_1903			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5415979	5415980	CMS_1905	CMS_1906			TRUE	0.899	-16.000	0.056	NA		NA
5415980	5415981	CMS_1906	CMS_1907			TRUE	0.984	-10.000	0.389	NA		NA
5415981	5415982	CMS_1907	CMS_1908			FALSE	0.110	119.000	0.000	NA		NA
5415982	5415983	CMS_1908	CMS_1909			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
5415986	5415987	CMS_1912	CMS_1913			FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5415987	5415988	CMS_1913	CMS_1914			FALSE	0.173	148.000	0.028	NA		NA
5415988	5415989	CMS_1914	CMS_1915		dapE	TRUE	0.725	-18.000	0.011	NA		NA
5415991	5415992	CMS_1917	CMS_1918			TRUE	0.909	60.000	0.667	NA		NA
5415993	5415994	CMS_1919	CMS_1920			FALSE	0.175	107.000	0.000	1.000	N	NA
5415994	5415995	CMS_1920	CMS_1921		tag	TRUE	0.748	15.000	0.008	1.000	Y	NA
5415996	5415997	CMS_1922	CMS_1923		atpC	FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
5415997	5415998	CMS_1923	CMS_1924	atpC	atpD	TRUE	0.998	2.000	0.837	0.003	Y	NA
5415998	5415999	CMS_1924	CMS_1925	atpD	atpG	TRUE	0.970	36.000	0.724	0.003	Y	NA
5415999	5416000	CMS_1925	CMS_1926	atpG	atpA	TRUE	0.975	50.000	0.846	0.003	Y	NA
5416000	5416001	CMS_1926	CMS_1927	atpA	atpH	TRUE	0.978	35.000	0.864	0.003	Y	NA
5416001	5416002	CMS_1927	CMS_1928	atpH	atpF	TRUE	0.980	0.000	0.067	0.003	Y	NA
5416002	5416003	CMS_1928	CMS_1929	atpF	atpE	TRUE	0.784	33.000	0.056	0.003	Y	NA
5416003	5416004	CMS_1929	CMS_1930	atpE	atpB	TRUE	0.768	47.000	0.062	0.003	Y	NA
5416004	5416005	CMS_1930	CMS_1931	atpB		FALSE	0.032	336.000	0.000	1.000		NA
5416006	5416007	CMS_1932	CMS_1933			FALSE	0.052	330.000	0.000	NA	N	NA
5416008	5416009	CMS_1939	CMS_1940	ppc		FALSE	0.176	105.000	0.000	1.000	N	NA
5416009	5416010	CMS_1940	CMS_1941			FALSE	0.057	206.000	0.000	NA		NA
5416013	5416014	CMS_1944	CMS_1945			FALSE	0.108	114.000	0.000	NA		NA
5416014	5416015	CMS_1945	CMS_1946			FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5416016	5416017	CMS_1947	CMS_1948			FALSE	0.125	98.000	0.000	0.068		NA
5416017	5416018	CMS_1948	CMS_1949			FALSE	0.097	200.000	0.000	1.000	N	NA
5416018	5416019	CMS_1949	CMS_1950			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5416021	5416022	CMS_1952	CMS_1953			TRUE	0.878	-3.000	0.012	1.000	N	NA
5416023	5416024	CMS_1954	CMS_1955			TRUE	0.882	-3.000	0.012	1.000	N	NA
5416025	5416026	CMS_1956	CMS_1957			TRUE	0.989	-3.000	0.400	1.000		NA
5416027	5416028	CMS_1958	CMS_1959	treS		FALSE	0.436	11.000	0.005	1.000	N	NA
5416029	5416030	CMS_1960	CMS_1961	rpmE2		FALSE	0.132	130.000	0.004	1.000	N	NA
5416030	5416031	CMS_1961	CMS_1962			TRUE	0.670	55.000	0.119	1.000	N	NA
5416032	5416033	CMS_1963	CMS_1964	glgC	serB	TRUE	0.895	-3.000	0.015	1.000	N	NA
5416034	5416035	CMS_1965	CMS_1966		fabG	FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5416036	5416037	CMS_1967	CMS_1968			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416037	5416038	CMS_1968	CMS_1969			TRUE	0.940	-3.000	0.062	NA		NA
5416039	5416040	CMS_1970	CMS_1971			FALSE	0.066	222.000	0.019	NA		NA
5416040	5416041	CMS_1971	CMS_1972			TRUE	0.867	-3.000	0.021	NA		NA
5416041	5416042	CMS_1972	CMS_1973			TRUE	0.648	14.000	0.046	NA	N	NA
5416042	5416043	CMS_1973	CMS_1974			TRUE	0.955	-3.000	0.063	NA	N	NA
5416043	5416044	CMS_1974	CMS_1975			TRUE	0.991	1.000	0.266	0.001	Y	NA
5416047	5416048	CMS_1978	CMS_1979	tkt	tal	TRUE	0.704	151.000	0.135	1.000	Y	NA
5416048	5416049	CMS_1979	CMS_1980	tal	pgi	TRUE	0.975	-3.000	0.025	1.000	Y	NA
5416049	5416050	CMS_1980	CMS_1981	pgi	zwf	TRUE	0.772	39.000	0.061	1.000	Y	NA
5416050	5416051	CMS_1981	CMS_1982	zwf		TRUE	0.997	-3.000	0.583	NA	Y	NA
5416051	5416052	CMS_1982	CMS_1983		pgl	TRUE	0.997	-3.000	0.463	NA	Y	NA
5416053	5416054	CMS_1984	CMS_1985		secG	TRUE	0.508	12.000	0.027	NA		NA
5416054	5416055	CMS_1985	CMS_1986	secG	tpiA	FALSE	0.298	142.000	0.064	1.000		NA
5416055	5416056	CMS_1986	CMS_1987	tpiA	pgk	TRUE	0.980	-9.000	0.075	1.000	Y	NA
5416056	5416057	CMS_1987	CMS_1988	pgk	gap	TRUE	0.939	7.000	0.055	0.004	Y	NA
5416057	5416058	CMS_1988	CMS_1989	gap	sodB	FALSE	0.308	128.000	0.041	1.000	N	NA
5416058	5416059	CMS_1989	CMS_1990	sodB		FALSE	0.070	169.000	0.009	NA		NA
5416059	5416060	CMS_1990	CMS_1991			TRUE	0.566	30.000	0.076	NA		NA
5416060	5416061	CMS_1991	CMS_1992		uvrC	TRUE	0.517	65.000	0.073	NA		NA
5416061	5416062	CMS_1992	CMS_1993	uvrC	uvrA	TRUE	0.974	0.000	0.043	0.001	Y	NA
5416062	5416063	CMS_1993	CMS_1994	uvrA	uvrB	TRUE	0.823	82.000	0.154	0.001	Y	NA
5416063	5416064	CMS_1994	CMS_1995	uvrB	coaE	TRUE	0.677	10.000	0.026	0.085	N	NA
5416064	5416065	CMS_1995	CMS_1996	coaE	rpsA	FALSE	0.201	156.000	0.024	1.000	N	NA
5416065	5416066	CMS_1996	CMS_1997	rpsA		FALSE	0.060	199.000	0.000	NA		NA
5416066	5416067	CMS_1997	CMS_1998		fruB	TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416067	5416068	CMS_1998	CMS_1999	fruB	polA	FALSE	0.279	50.000	0.000	1.000	N	NA
5416069	5416070	CMS_2000	CMS_2001			FALSE	0.104	137.000	0.000	NA		NA
5416071	5416072	CMS_2002	CMS_2003			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416074	5416075	CMS_2004	CMS_2005	pyk		FALSE	0.328	88.000	0.031	1.000	N	NA
5416075	5416076	CMS_2005	CMS_2006			TRUE	0.965	-7.000	0.022	0.001	Y	NA
5416076	5416077	CMS_2006	CMS_2007		lgt	TRUE	0.644	102.000	0.222	1.000	N	NA
5416077	5416078	CMS_2007	CMS_2008	lgt	trpA	FALSE	0.282	60.000	0.009	1.000	N	NA
5416078	5416079	CMS_2008	CMS_2009	trpA	trpB	TRUE	0.991	-3.000	0.153	0.001	Y	NA
5416079	5416080	CMS_2009	CMS_2010	trpB	trpC	TRUE	0.976	-3.000	0.025	0.001	Y	NA
5416080	5416081	CMS_2010	CMS_2011	trpC		TRUE	0.974	1.000	0.286	NA		NA
5416081	5416082	CMS_2011	CMS_2012			TRUE	0.596	41.000	0.109	NA		NA
5416082	5416083	CMS_2012	CMS_2013		trpE	TRUE	0.992	0.000	0.690	NA		NA
5416083	5416084	CMS_2013	CMS_2014	trpE	hisI	TRUE	0.982	-3.000	0.050	1.000	Y	NA
5416084	5416085	CMS_2014	CMS_2015	hisI	hisF	TRUE	0.996	-3.000	0.430	0.004	Y	NA
5416085	5416086	CMS_2015	CMS_2016	hisF	hisG	TRUE	0.937	3.000	0.008	0.004	Y	NA
5416086	5416087	CMS_2016	CMS_2017	hisG	hisE	TRUE	0.804	47.000	0.081	0.004	Y	NA
5416087	5416088	CMS_2017	CMS_2018	hisE		FALSE	0.109	109.000	0.000	NA		NA
5416088	5416089	CMS_2018	CMS_2020		rpe	FALSE	0.260	23.000	0.000	NA		NA
5416089	5416090	CMS_2020	CMS_2021	rpe		TRUE	0.730	11.000	0.056	1.000	N	NA
5416090	5416091	CMS_2021	CMS_2022		fmt	TRUE	0.914	68.000	0.305	1.000	Y	NA
5416091	5416092	CMS_2022	CMS_2023	fmt	priA	FALSE	0.174	116.000	0.012	NA	N	NA
5416092	5416093	CMS_2023	CMS_2024	priA	metK	FALSE	0.388	115.000	0.068	NA	N	NA
5416093	5416094	CMS_2024	CMS_2025	metK	coaBC	TRUE	0.766	40.000	0.059	1.000	Y	NA
5416094	5416095	CMS_2025	CMS_2026	coaBC	rpoZ	TRUE	0.691	79.000	0.192	1.000	N	NA
5416095	5416096	CMS_2026	CMS_2027	rpoZ	gmk	TRUE	0.871	49.000	0.471	1.000	N	NA
5416096	5416097	CMS_2027	CMS_2028	gmk	pyrF	TRUE	0.591	75.000	0.013	1.000	Y	NA
5416097	5416098	CMS_2028	CMS_2029	pyrF	carB	TRUE	0.986	-3.000	0.075	1.000	Y	NA
5416098	5416099	CMS_2029	CMS_2030	carB	carA	TRUE	0.994	0.000	0.345	0.001	Y	NA
5416099	5416100	CMS_2030	CMS_2031	carA		TRUE	0.927	-3.000	0.050	NA		NA
5416100	5416101	CMS_2031	CMS_2032		pyrC	TRUE	0.934	-3.000	0.057	NA		NA
5416101	5416102	CMS_2032	CMS_2033	pyrC	pyrB	TRUE	0.996	-3.000	0.452	1.000	Y	NA
5416102	5416103	CMS_2033	CMS_2034	pyrB	pyrR	TRUE	0.994	-3.000	0.247	1.000	Y	NA
5416103	5416104	CMS_2034	CMS_2035	pyrR	acsA	FALSE	0.172	112.000	0.000	1.000	N	NA
5416104	5416105	CMS_2035	CMS_2036	acsA		FALSE	0.434	74.000	0.045	1.000	N	NA
5416105	5416106	CMS_2036	CMS_2037			TRUE	0.998	-3.000	0.795	0.045	Y	NA
5416106	5416107	CMS_2037	CMS_2038			TRUE	0.811	83.000	0.146	1.000	Y	NA
5416107	5416108	CMS_2038	CMS_2039			FALSE	0.043	249.000	0.000	NA		NA
5416108	5416109	CMS_2039	CMS_2040		nusB	FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5416109	5416110	CMS_2040	CMS_2041	nusB	efp	TRUE	0.917	4.000	0.078	1.000	N	NA
5416110	5416111	CMS_2041	CMS_2042	efp	aroQ	FALSE	0.132	112.000	0.005	1.000	N	NA
5416111	5416112	CMS_2042	CMS_2043	aroQ		FALSE	0.258	24.000	0.000	1.000		NA
5416112	5416113	CMS_2043	CMS_2044		thiL	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416115	5416116	CMS_2046	CMS_2047		ddl	FALSE	0.379	169.000	0.000	NA	Y	NA
5416116	5416117	CMS_2047	CMS_2048	ddl	gpsA	TRUE	0.967	-3.000	0.088	1.000	N	NA
5416117	5416118	CMS_2048	CMS_2049	gpsA		TRUE	0.987	-7.000	0.380	1.000	N	NA
5416118	5416119	CMS_2049	CMS_2050			TRUE	0.893	12.000	0.236	1.000	N	NA
5416119	5416120	CMS_2050	CMS_2051		leuD	TRUE	0.938	1.000	0.074	1.000	N	NA
5416120	5416121	CMS_2051	CMS_2052	leuD	leuC	TRUE	0.994	3.000	0.477	0.001	Y	NA
5416121	5416122	CMS_2052	CMS_2053	leuC		FALSE	0.293	66.000	0.000	1.000	N	NA
5416122	5416123	CMS_2053	CMS_2054			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416126	5416127	CMS_2057	CMS_2058		metX	TRUE	0.951	42.000	0.542	1.000	Y	NA
5416127	5416128	CMS_2058	CMS_2059	metX		FALSE	0.174	118.000	0.000	1.000	N	NA
5416128	5416129	CMS_2059	CMS_2060			TRUE	0.646	59.000	0.000	1.000	Y	NA
5416129	5416130	CMS_2060	CMS_2061			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416130	5416131	CMS_2061	CMS_2062			FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
5416131	5416132	CMS_2062	CMS_2063			FALSE	0.204	64.000	0.000	1.000		NA
5416133	5416134	CMS_2064	CMS_2065			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5416138	5416139	CMS_2069	CMS_2070			TRUE	0.996	-7.000	1.000	0.030		NA
5416139	5416140	CMS_2070	CMS_2071			FALSE	0.111	121.000	0.000	NA		NA
5416142	5416143	CMS_2073	CMS_2074			FALSE	0.204	35.000	0.000	NA		NA
5416143	5416144	CMS_2074	CMS_2075		sigR	TRUE	0.996	-3.000	0.808	NA		NA
5416145	5416146	CMS_2076	CMS_2077	aroA		TRUE	0.942	-3.000	0.063	1.000		NA
5416146	5416147	CMS_2077	CMS_2078			FALSE	0.354	37.000	0.033	1.000		NA
5416149	5416150	CMS_2080	CMS_2081			TRUE	0.890	24.000	0.364	0.045	N	NA
5416150	5416151	CMS_2081	CMS_2082			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5416152	5416153	CMS_2083	CMS_2084	smpB	ftsX	FALSE	0.446	67.000	0.038	1.000	N	NA
5416153	5416154	CMS_2084	CMS_2085	ftsX	ftsE	TRUE	0.991	-3.000	0.431	1.000	N	NA
5416154	5416155	CMS_2085	CMS_2086	ftsE	prfB	FALSE	0.343	103.000	0.053	1.000	N	NA
5416157	5416158	CMS_2088	CMS_2089			TRUE	0.975	-3.000	0.182	NA		NA
5416158	5416159	CMS_2089	CMS_2090			TRUE	0.981	-25.000	0.364	NA		NA
5416159	5416160	CMS_2090	CMS_2091			TRUE	0.696	39.000	0.185	NA		NA
5416160	5416161	CMS_2091	CMS_2092			FALSE	0.186	51.000	0.000	NA		NA
5416161	5416162	CMS_2092	CMS_2093			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416162	5416163	CMS_2093	CMS_2094			TRUE	0.907	36.000	0.667	NA		NA
5416163	5416164	CMS_2094	CMS_2095		xylB	FALSE	0.173	117.000	0.000	1.000	N	NA
5416165	5416166	CMS_r030	CMS_2096			FALSE	0.200	64.000	0.000	NA		NA
5416166	5416167	CMS_2096	CMS_2097			FALSE	0.112	125.000	0.000	NA		NA
5416168	5416169	CMS_2098	CMS_2099			FALSE	0.405	19.000	0.000	1.000	N	NA
5416169	5416170	CMS_2099	CMS_2100		rph	TRUE	0.677	125.000	0.262	1.000	N	NA
5416170	5416171	CMS_2100	CMS_2101	rph	racE	TRUE	0.779	9.000	0.048	1.000	N	NA
5416171	5416172	CMS_2101	CMS_2102	racE		FALSE	0.209	59.000	0.000	1.000		NA
5416174	5416175	CMS_2104	CMS_2105			TRUE	0.469	62.000	0.059	NA		NA
5416175	5416176	CMS_2105	CMS_2106			TRUE	0.987	-24.000	0.508	NA		NA
5416177	5416178	CMS_2107	CMS_2108			TRUE	0.637	37.000	0.000	NA	Y	NA
5416178	5416179	CMS_2108	CMS_2109			TRUE	0.995	0.000	0.462	0.084	Y	NA
5416179	5416180	CMS_2109	CMS_2110			TRUE	0.689	85.000	0.250	NA		NA
5416183	5416184	CMS_2113	CMS_2114			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
5416184	5416185	CMS_2114	CMS_2115			TRUE	0.993	-3.000	0.600	NA		NA
5416185	5416186	CMS_2115	CMS_2116			TRUE	0.862	-3.000	0.020	NA		NA
5416186	5416187	CMS_2116	CMS_2117			FALSE	0.105	220.000	0.020	NA	N	NA
5416187	5416188	CMS_2117	CMS_2118			FALSE	0.047	230.000	0.000	NA		NA
5416188	5416189	CMS_2118	CMS_2119			TRUE	0.749	-9.000	0.000	NA		NA
5416190	5416191	CMS_2120	CMS_2121			FALSE	0.176	130.000	0.000	1.000	N	NA
5416191	5416192	CMS_2121	CMS_2122			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416192	5416193	CMS_2122	CMS_2123			FALSE	0.118	96.000	0.000	NA		NA
5416193	5416194	CMS_2123	CMS_2124			TRUE	0.652	57.000	0.000	0.014	Y	NA
5416194	5416195	CMS_2124	CMS_2125		clpS	FALSE	0.111	104.000	0.000	NA		NA
5416195	5416196	CMS_2125	CMS_2126	clpS		TRUE	0.996	-3.000	0.823	NA		NA
5416196	5416197	CMS_2126	CMS_2127			FALSE	0.108	114.000	0.000	NA		NA
5416197	5416198	CMS_2127	CMS_2128			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416198	5416199	CMS_2128	CMS_2129			FALSE	0.215	32.000	0.000	NA		NA
5416201	5416202	CMS_2131	CMS_2132			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5416202	5416203	CMS_2132	CMS_2133			TRUE	0.997	-3.000	0.545	1.000	Y	NA
5416204	5416205	CMS_2134	CMS_2135			TRUE	0.995	-3.000	0.726	NA		NA
5416211	5416212	CMS_2141	CMS_2142		purA	FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5416212	5416213	CMS_2142	CMS_2143	purA		TRUE	0.469	82.000	0.082	NA		NA
5416214	5416215	CMS_2144	CMS_2145			TRUE	0.997	0.000	0.669	NA	Y	NA
5416217	5416218	CMS_2148	CMS_2149			FALSE	0.152	82.000	0.000	NA		NA
5416218	5416219	CMS_2149	CMS_2150			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416219	5416220	CMS_2150	CMS_2151			TRUE	0.983	-3.000	0.261	NA		NA
5416221	5416222	CMS_2152	CMS_2153			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416223	5416224	CMS_2154	CMS_2155			FALSE	0.108	136.000	0.000	1.000		NA
5416224	5416225	CMS_2155	CMS_2156			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416226	5416227	CMS_2157	CMS_2158			TRUE	0.830	-3.000	0.000	0.023		NA
5416229	5416230	CMS_2160	CMS_2161		deaD	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416230	5416231	CMS_2161	CMS_2162	deaD		FALSE	0.035	300.000	0.000	NA		NA
5416232	5416233	CMS_2164	CMS_2165			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5416234	5416235	CMS_2166	CMS_2167			FALSE	0.101	141.000	0.000	NA		NA
5416235	5416236	CMS_2167	CMS_2168			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416237	5416238	CMS_2169	CMS_2170			FALSE	0.109	110.000	0.000	NA		NA
5416240	5416241	CMS_2172	CMS_2173			TRUE	0.997	-3.000	0.455	1.000	Y	NA
5416241	5416242	CMS_2173	CMS_2174			FALSE	0.185	47.000	0.000	NA		NA
5416243	5416244	CMS_2175	CMS_2176			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5416245	5416246	CMS_2177	CMS_2178		peh	FALSE	0.157	146.000	0.000	1.000	N	NA
5416247	5416248	CMS_2179	CMS_2180			FALSE	0.191	43.000	0.000	NA		NA
5416248	5416249	CMS_2180	CMS_2181			FALSE	0.195	67.000	0.000	1.000		NA
5416249	5416250	CMS_2181	CMS_2182			FALSE	0.039	269.000	0.000	1.000		NA
5416250	5416251	CMS_2182	CMS_2183			FALSE	0.190	68.000	0.000	1.000		NA
5416251	5416252	CMS_2183	CMS_2184			FALSE	0.115	125.000	0.000	1.000		NA
5416252	5416253	CMS_2184	CMS_2185			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5416253	5416254	CMS_2185	CMS_2186			FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5416254	5416255	CMS_2186	CMS_2187			FALSE	0.109	111.000	0.000	NA		NA
5416255	5416256	CMS_2187	CMS_2188			FALSE	0.233	28.000	0.000	1.000		NA
5416257	5416258	CMS_2189	CMS_2190			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5416262	5416263	CMS_2194	CMS_2195	gabT	ansA	TRUE	0.972	0.000	0.044	NA	Y	NA
5416264	5416265	CMS_2196	CMS_2197			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5416265	5416266	CMS_2197	CMS_2198			TRUE	0.996	-3.000	0.880	NA		NA
5416266	5416267	CMS_2198	CMS_2199			TRUE	0.995	-3.000	0.808	NA		NA
5416267	5416268	CMS_2199	CMS_2200			TRUE	0.914	67.000	0.731	NA		NA
5416268	5416269	CMS_2200	CMS_2201			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416269	5416270	CMS_2201	CMS_2203		gltA	FALSE	0.089	158.000	0.000	NA		NA
5416270	5416271	CMS_2203	CMS_2204	gltA		FALSE	0.320	163.000	0.064	1.000	N	NA
5416271	5416272	CMS_2204	CMS_2205			TRUE	0.691	6.000	0.012	1.000	N	NA
5416272	5416273	CMS_2205	CMS_2206			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5416274	5416275	CMS_2207	CMS_2208			TRUE	0.858	71.000	0.180	NA	Y	NA
5416275	5416276	CMS_2208	CMS_2209			TRUE	0.998	0.000	0.812	NA	Y	NA
5416277	5416278	CMS_2210	CMS_2211			FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5416278	5416279	CMS_2211	CMS_2212			FALSE	0.172	115.000	0.000	1.000	N	NA
5416279	5416280	CMS_2212	CMS_2213			FALSE	0.115	100.000	0.000	1.000		NA
5416282	5416283	CMS_2215	CMS_2216			TRUE	0.785	101.000	0.522	0.044		NA
5416283	5416284	CMS_2216	CMS_2217			FALSE	0.061	195.000	0.000	NA		NA
5416285	5416286	CMS_2219	CMS_2220			FALSE	0.110	108.000	0.000	NA		NA
5416286	5416287	CMS_2220	CMS_2221			TRUE	0.991	-3.000	0.484	NA		NA
5416288	5416289	CMS_2222	CMS_2223	gcvP	gcvH	TRUE	0.963	-3.000	0.005	1.000	Y	NA
5416289	5416290	CMS_2223	CMS_2224	gcvH	gcvT	TRUE	0.983	-3.000	0.056	0.001	Y	NA
5416290	5416291	CMS_2224	CMS_2225	gcvT		FALSE	0.027	370.000	0.000	NA		NA
5416293	5416294	CMS_2227	CMS_2228			FALSE	0.115	125.000	0.000	1.000		NA
5416294	5416295	CMS_2228	CMS_2229			FALSE	0.353	12.000	0.000	NA		NA
5416295	5416296	CMS_2229	CMS_2230			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416297	5416298	CMS_2231	CMS_2232			FALSE	0.344	15.000	0.000	0.012		NA
5416301	5416302	CMS_2235	CMS_2236	katA		TRUE	0.820	77.000	0.143	1.000	Y	NA
5416303	5416304	CMS_2237	CMS_2238			FALSE	0.098	146.000	0.000	NA		NA
5416304	5416305	CMS_2238	CMS_2239			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416305	5416306	CMS_2239	CMS_2240			TRUE	0.764	-13.000	0.000	0.035		NA
5416306	5416307	CMS_2240	CMS_2241			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416307	5416308	CMS_2241	CMS_2242			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416308	5416309	CMS_2242	CMS_2243			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416313	5416314	CMS_2247	CMS_2248			FALSE	0.121	96.000	0.000	1.000		NA
5416314	5416315	CMS_2248	CMS_2249		purQ	TRUE	0.997	0.000	0.656	0.001	Y	NA
5416315	5416316	CMS_2249	CMS_2250	purQ	purL	TRUE	0.996	-3.000	0.346	0.001	Y	NA
5416316	5416317	CMS_2250	CMS_2251	purL		TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416317	5416318	CMS_2251	CMS_2252			FALSE	0.022	506.000	0.000	NA		NA
5416318	5416319	CMS_2252	CMS_2253			FALSE	0.059	201.000	0.000	NA		NA
5416319	5416320	CMS_2253	CMS_2254			FALSE	0.113	104.000	0.000	1.000		NA
5416322	5416323	CMS_2256	CMS_2257		ptpA	TRUE	0.918	10.000	0.235	1.000	N	NA
5416323	5416324	CMS_2257	CMS_2258	ptpA		FALSE	0.089	212.000	0.000	NA	N	NA
5416324	5416325	CMS_2258	CMS_2259			TRUE	0.955	0.000	0.000	NA	Y	NA
5416325	5416326	CMS_2259	CMS_2260			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.014	Y	NA
5416326	5416327	CMS_2260	CMS_2261		wzx2	TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416327	5416328	CMS_2261	CMS_2262	wzx2		TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416328	5416329	CMS_2262	CMS_2263		wzy1	FALSE	0.223	30.000	0.000	NA		NA
5416329	10691941	CMS_2263	CMS_2265	wzy1		TRUE	0.725	-1202.000	0.000	NA		NA
10691941	5416330	CMS_2265	CMS_2266			FALSE	0.051	219.000	0.000	NA		NA
5416330	5416331	CMS_2266	CMS_2267			FALSE	0.091	156.000	0.000	NA		NA
5416331	5416332	CMS_2267	CMS_2268			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5416332	5416333	CMS_2268	CMS_2269			FALSE	0.109	116.000	0.000	NA		NA
5416334	5416335	CMS_2270	CMS_2270b			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5416335	5416336	CMS_2270b	CMS_2275			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416336	5416337	CMS_2275	CMS_2276			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416337	5416338	CMS_2276	CMS_2278			TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5416338	5416339	CMS_2278	CMS_2279			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416341	5416342	CMS_2281	CMS_2282			FALSE	0.232	83.000	0.000	1.000	N	NA
5416342	5416343	CMS_2282	CMS_2283			FALSE	0.124	172.000	0.000	1.000	N	NA
5416343	5416344	CMS_2283	CMS_2284			TRUE	0.998	-3.000	0.625	0.014	Y	NA
5416344	5416345	CMS_2284	CMS_2285			TRUE	0.833	42.000	0.333	1.000	N	NA
5416345	5416346	CMS_2285	CMS_2286			FALSE	0.051	219.000	0.000	NA		NA
5416346	5416347	CMS_2286	CMS_2287			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416349	5416350	CMS_2289	CMS_2290			FALSE	0.146	86.000	0.000	1.000		NA
5416350	5416351	CMS_2290	CMS_2291			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416352	5416353	CMS_2292	CMS_2293	sufS		TRUE	0.986	-3.000	0.249	1.000	N	NA
5416353	5416354	CMS_2293	CMS_2294			FALSE	0.112	101.000	0.000	NA		NA
5416357	5416358	CMS_2297	CMS_2298			FALSE	0.206	60.000	0.000	NA		NA
5416359	5416360	CMS_2299	CMS_2300			FALSE	0.162	76.000	0.000	NA		NA
5416360	5416361	CMS_2300	CMS_2301			TRUE	0.990	3.000	0.667	1.000	N	NA
5416361	5416362	CMS_2301	CMS_2302			FALSE	0.056	207.000	0.000	NA		NA
5416362	5416363	CMS_2302	CMS_2303			FALSE	0.106	136.000	0.000	NA		NA
5416364	5416365	CMS_2304	CMS_2305		ispE	FALSE	0.405	19.000	0.000	1.000	N	NA
5416365	5416366	CMS_2305	CMS_2306	ispE		TRUE	0.764	11.000	0.068	1.000	N	NA
5416366	5416367	CMS_2306	CMS_2307			TRUE	0.900	-3.000	0.018	NA	N	NA
5416367	5416368	CMS_2307	CMS_2308		metG	TRUE	0.773	39.000	0.221	NA	N	NA
5416368	5416369	CMS_2308	CMS_2309	metG		FALSE	0.112	124.000	0.000	NA		NA
5416371	5416372	CMS_2311	CMS_2312			FALSE	0.033	320.000	0.000	NA		NA
5416373	5416374	CMS_2313	CMS_2314			FALSE	0.204	35.000	0.000	NA		NA
5416375	5416376	CMS_2315	CMS_2316			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416377	5416378	CMS_2317	CMS_2318			TRUE	0.993	-3.000	0.618	NA		NA
5416379	5416380	CMS_2319	CMS_2320			TRUE	0.972	0.000	0.218	1.000		NA
5416381	5416382	CMS_2321	CMS_2322			FALSE	0.204	35.000	0.000	NA		NA
5416382	5416383	CMS_2322	CMS_2323			FALSE	0.023	468.000	0.000	NA		NA
5416383	5416384	CMS_2323	CMS_2324			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416384	5416385	CMS_2324	CMS_2325			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5416387	5416388	CMS_2327	CMS_2328			FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5416389	5416390	CMS_2329	CMS_2330			FALSE	0.194	66.000	0.000	NA		NA
5416391	5416392	CMS_2332	CMS_2333			FALSE	0.072	177.000	0.000	NA		NA
5416393	5416394	CMS_2334	CMS_2335			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416395	5416396	CMS_2336	CMS_2337			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416397	5416398	CMS_2338	CMS_2339			FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5416400	5416401	CMS_2341	CMS_2342			FALSE	0.097	148.000	0.000	NA		NA
5416402	5416403	CMS_2343	CMS_2344			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
5416403	5416404	CMS_2344	CMS_2345		sdaA	FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5416404	5416405	CMS_2345	CMS_2346	sdaA		FALSE	0.198	38.000	0.000	NA		NA
5416406	5416407	CMS_2347	CMS_2348			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5416407	5416408	CMS_2348	CMS_2349			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416408	5416409	CMS_2349	CMS_2350			TRUE	0.989	-6.000	0.455	1.000	N	NA
5416410	5416411	CMS_2351	CMS_2352			TRUE	0.998	-3.000	0.611	0.043	Y	NA
5416411	5416412	CMS_2352	CMS_2353			TRUE	0.998	-3.000	0.611	0.043	Y	NA
5416412	5416413	CMS_2353	CMS_2354		gudD	TRUE	0.951	5.000	0.200	1.000	N	NA
5416413	5416414	CMS_2354	CMS_2355	gudD		TRUE	0.992	0.000	0.273	0.054	Y	NA
5416414	5416415	CMS_2355	CMS_2356			FALSE	0.114	102.000	0.000	1.000		NA
5416416	5416417	CMS_2357	CMS_2358			FALSE	0.293	40.000	0.000	1.000	N	NA
5416417	5416418	CMS_2358	CMS_2359		dkgA	FALSE	0.184	48.000	0.000	NA		NA
5416418	5416419	CMS_2359	CMS_2360	dkgA		TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416420	5416421	CMS_2361	CMS_2362			FALSE	0.083	219.000	0.000	NA	N	NA
5416421	5416422	CMS_2362	CMS_2363			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5416422	5416423	CMS_2363	CMS_2364			FALSE	0.178	100.000	0.000	1.000	N	NA
5416423	5416424	CMS_2364	CMS_2365			TRUE	0.667	62.000	0.107	1.000	N	NA
5416424	5416425	CMS_2365	CMS_2366			TRUE	0.693	6.000	0.000	1.000	N	NA
5416426	5416427	CMS_2367	CMS_2368			FALSE	0.226	29.000	0.000	NA		NA
5416427	5416428	CMS_2368	CMS_2369		nrdB	FALSE	0.070	182.000	0.000	1.000		NA
5416428	5416429	CMS_2369	CMS_2370	nrdB	nrdA	TRUE	0.583	165.000	0.064	0.001	Y	NA
5416430	5416431	CMS_2373	CMS_2374			FALSE	0.113	99.000	0.000	NA		NA
5416432	5416433	CMS_2375	CMS_2376			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5416435	5416436	CMS_2378	CMS_2380			FALSE	0.050	350.000	0.000	1.000	N	NA
5416436	5416437	CMS_2380	CMS_2381		tpiA	FALSE	0.205	91.000	0.000	1.000	N	NA
5416437	5416438	CMS_2381	CMS_2382	tpiA		TRUE	0.832	23.000	0.062	1.000	Y	NA
5416438	5416439	CMS_2382	CMS_2383			TRUE	0.912	51.000	0.300	1.000	Y	NA
5416439	5416440	CMS_2383	CMS_2385			FALSE	0.043	406.000	0.000	1.000	N	NA
5416440	5416441	CMS_2385	CMS_2386			FALSE	0.199	54.000	0.000	1.000		NA
5416441	5416442	CMS_2386	CMS_2387			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416442	5416443	CMS_2387	CMS_2388			FALSE	0.114	102.000	0.000	1.000		NA
5416443	5416444	CMS_2388	CMS_2389			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416444	5416445	CMS_2389	CMS_2390		kanE	FALSE	0.368	263.000	0.273	1.000		NA
5416446	5416447	CMS_2391	CMS_2392			FALSE	0.053	215.000	0.000	NA		NA
5416449	5416450	CMS_2394	CMS_2395		apt	FALSE	0.179	99.000	0.000	1.000	N	NA
5416450	5416451	CMS_2395	CMS_2396	apt		FALSE	0.176	72.000	0.000	1.000		NA
5416451	5416452	CMS_2396	CMS_2397			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
5416452	5416453	CMS_2397	CMS_2398			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416454	5416455	CMS_2399	CMS_2400			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416455	5416456	CMS_2400	CMS_2401			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5416456	5416457	CMS_2401	CMS_2402			FALSE	0.042	251.000	0.000	NA		NA
5416458	5416459	CMS_2403	CMS_2404			FALSE	0.282	45.000	0.000	NA	N	NA
5416459	5416460	CMS_2404	CMS_2405			TRUE	0.890	66.000	0.608	NA		NA
5416460	5416461	CMS_2405	CMS_2406			TRUE	0.996	-3.000	0.810	NA		NA
5416463	5416464	CMS_2408	CMS_2409			TRUE	0.985	-7.000	0.400	NA		NA
5416466	5416467	CMS_2411	CMS_2412		rmuC	FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5416467	5416468	CMS_2412	CMS_2413	rmuC	fba	FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5416469	5416470	CMS_2414	CMS_2415		ispH	TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416471	5416472	CMS_2416	CMS_2417	xseA	xseB	TRUE	0.975	11.000	0.412	0.001	Y	NA
5416472	5416473	CMS_2417	CMS_2418	xseB		TRUE	0.531	3.000	0.002	NA		NA
5416473	5416474	CMS_2418	CMS_2419			TRUE	0.944	-3.000	0.067	NA		NA
5416474	5416475	CMS_2419	CMS_2420		fumC	FALSE	0.436	85.000	0.058	1.000	N	NA
5416476	5416477	CMS_2422	CMS_2423		uppS	FALSE	0.219	204.000	0.058	1.000	N	NA
5416479	5416480	CMS_2425	CMS_2426			TRUE	0.893	133.000	0.455	0.043	Y	NA
5416480	5416481	CMS_2426	CMS_2427			TRUE	0.940	81.000	0.556	0.043	Y	NA
5416481	5416482	CMS_2427	CMS_2429			FALSE	0.025	418.000	0.000	NA		NA
5416482	5416483	CMS_2429	CMS_2430			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416484	5416485	CMS_2431	CMS_2432			TRUE	0.795	61.000	0.292	NA		NA
5416486	5416487	CMS_2433	CMS_2434			TRUE	0.916	-3.000	0.041	NA		NA
5416488	5416489	CMS_2435	CMS_2436			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416490	5416491	CMS_2437	CMS_2438			FALSE	0.110	108.000	0.000	NA		NA
5416492	5416493	CMS_2439	CMS_2440			FALSE	0.109	133.000	0.000	NA		NA
5416494	5416495	CMS_2441	CMS_2442			FALSE	0.068	186.000	0.000	1.000		NA
5416495	5416496	CMS_2442	CMS_2443			TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
5416496	5416497	CMS_2443	CMS_2444			TRUE	0.916	5.000	0.000	1.000	Y	NA
5416497	5416498	CMS_2444	CMS_2445			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416498	5416499	CMS_2445	CMS_2446			TRUE	0.987	-3.000	0.333	1.000		NA
5416503	5416504	CMS_2450	CMS_2451			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416504	5416505	CMS_2451	CMS_r047			FALSE	0.027	370.000	0.000	NA		NA
5416505	5416506	CMS_r047	CMS_2452			FALSE	0.108	115.000	0.000	NA		NA
5416506	5416507	CMS_2452	CMS_2453			TRUE	0.846	38.000	0.348	1.000	N	NA
5416507	5416508	CMS_2453	CMS_2454			FALSE	0.210	75.000	0.018	NA		NA
5416508	5416509	CMS_2454	CMS_2455			TRUE	0.970	-3.000	0.148	NA		NA
5416509	5416510	CMS_2455	CMS_2456		eno	FALSE	0.234	90.000	0.028	1.000		NA
5416510	5416511	CMS_2456	CMS_2457	eno	hisS	FALSE	0.173	117.000	0.000	1.000	N	NA
5416511	5416512	CMS_2457	CMS_2458	hisS		FALSE	0.343	13.000	0.000	1.000		NA
5416512	5416513	CMS_2458	CMS_2459			FALSE	0.094	155.000	0.000	1.000		NA
5416514	5416515	CMS_2460	CMS_2461			FALSE	0.083	166.000	0.000	NA		NA
5416516	5416517	CMS_2462	CMS_2463	mfd	pth	TRUE	0.589	87.000	0.137	1.000	N	NA
5416517	5416518	CMS_2463	CMS_2464	pth	rplY	TRUE	0.887	153.000	0.496	0.021	Y	NA
5416518	5416519	CMS_2464	CMS_2465	rplY		FALSE	0.079	171.000	0.000	1.000		NA
5416520	5416521	CMS_2466	CMS_2467	gnd		FALSE	0.114	71.000	0.005	NA		NA
5416521	5416522	CMS_2467	CMS_2468			FALSE	0.027	367.000	0.000	NA		NA
5416523	5416524	CMS_2469	CMS_2470	prs	glmU	FALSE	0.244	34.000	0.005	1.000	N	NA
5416524	5416525	CMS_2470	CMS_r048	glmU		FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5416525	5416526	CMS_r048	CMS_2471			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5416528	5416529	CMS_2473	CMS_2474			TRUE	0.638	8.000	0.000	1.000	N	NA
5416529	5416530	CMS_2474	CMS_2475			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416532	5416533	CMS_2477	CMS_2478			TRUE	0.967	2.000	0.047	1.000	Y	NA
5416533	5416534	CMS_2478	CMS_2479			TRUE	0.968	-3.000	0.000	NA	Y	NA
5416535	5416536	CMS_2480	CMS_2481			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5416538	5416539	CMS_2483	CMS_2483A			FALSE	0.094	153.000	0.000	NA		NA
5416540	5416541	CMS_2484	CMS_2485			TRUE	0.967	0.000	0.192	NA		NA
5416541	5416542	CMS_2485	CMS_2486			TRUE	0.726	32.000	0.192	NA		NA
5416542	5416543	CMS_2486	CMS_2487		moaE	FALSE	0.112	123.000	0.000	NA		NA
5416543	5416544	CMS_2487	CMS_2488	moaE	mog	TRUE	0.805	12.000	0.013	0.002	Y	NA
5416544	5416545	CMS_2488	CMS_2489	mog	moaC	TRUE	0.971	-3.000	0.014	0.002	Y	NA
5416545	5416546	CMS_2489	CMS_2490	moaC	moeA	TRUE	0.964	-7.000	0.019	0.002	Y	NA
5416547	5416548	CMS_2491	CMS_2492			FALSE	0.198	55.000	0.000	NA		NA
5416548	5416549	CMS_2492	CMS_2493			FALSE	0.152	82.000	0.000	NA		NA
5416550	5416551	CMS_2494	CMS_2495			TRUE	0.965	-6.000	0.022	NA	Y	NA
5416552	5416553	CMS_2496	CMS_2497			TRUE	0.847	-3.000	0.005	1.000	N	NA
5416553	5416554	CMS_2497	CMS_2498			FALSE	0.095	151.000	0.000	NA		NA
5416555	5416556	CMS_2499	CMS_2500	lvr		TRUE	0.470	9.000	0.000	NA		NA
5416556	5416557	CMS_2500	CMS_2501			FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5416557	5416558	CMS_2501	CMS_2502			FALSE	0.180	70.000	0.000	NA		NA
5416559	5416560	CMS_2503	CMS_2504			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416560	5416561	CMS_2504	CMS_2505			FALSE	0.023	466.000	0.000	NA		NA
5416561	5416562	CMS_2505	CMS_2506			FALSE	0.110	107.000	0.000	NA		NA
5416562	5416563	CMS_2506	CMS_2507			TRUE	0.506	8.000	0.000	NA		NA
5416563	5416564	CMS_2507	CMS_2508			FALSE	0.045	235.000	0.000	NA		NA
5416569	5416570	CMS_2512	CMS_2513			FALSE	0.172	72.000	0.000	NA		NA
5416570	5416571	CMS_2513	CMS_2514			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5416571	5416572	CMS_2514	CMS_2515			TRUE	0.992	-3.000	0.191	1.000	Y	NA
5416573	5416574	CMS_2516	CMS_2517			TRUE	0.963	-3.000	0.109	NA		NA
5416574	5416575	CMS_2517	CMS_2518			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416576	5416577	CMS_2519	CMS_2520			TRUE	0.986	-3.000	0.333	NA		NA
5416579	5416580	CMS_2522	CMS_2523			TRUE	0.992	-3.000	0.450	1.000	N	NA
5416580	5416581	CMS_2523	CMS_2524			TRUE	0.887	74.000	0.578	0.001	N	NA
5416581	5416582	CMS_2524	CMS_2525			TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5416583	5416584	CMS_2526	CMS_2527	moaA		TRUE	0.981	2.000	0.410	1.000		NA
5416584	5416585	CMS_2527	CMS_2528			FALSE	0.038	278.000	0.000	1.000		NA
5416585	5416586	CMS_2528	CMS_2529			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416587	5416588	CMS_2530	CMS_2531			FALSE	0.109	110.000	0.000	NA		NA
5416588	5416589	CMS_2531	CMS_2532			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416589	5416590	CMS_2532	CMS_2533			TRUE	0.623	48.000	0.000	0.038	Y	NA
5416590	5416591	CMS_2533	CMS_2534			FALSE	0.459	99.000	0.125	1.000		NA
5416598	5416599	CMS_2541	CMS_2542			FALSE	0.195	54.000	0.000	NA		NA
5416599	5416600	CMS_2542	CMS_2543			FALSE	0.117	97.000	0.000	NA		NA
5416601	5416602	CMS_2544	CMS_2545			FALSE	0.205	310.000	0.000	0.056	Y	NA
5416602	5416603	CMS_2545	CMS_2546		upp	FALSE	0.035	562.000	0.000	1.000	N	NA
5416607	5416608	CMS_2551	CMS_2552			TRUE	0.957	54.000	0.585	0.003	Y	NA
5416609	5416610	CMS_2553	CMS_2554		xis	FALSE	0.240	123.000	0.039	1.000		NA
5416610	5416611	CMS_2554	CMS_2555	xis		TRUE	0.704	75.000	0.233	NA		NA
5416613	5416614	CMS_2557	CMS_2558			FALSE	0.164	35.000	0.007	NA		NA
5416614	5416615	CMS_2558	CMS_2559			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5416615	5416616	CMS_2559	CMS_2560			TRUE	0.967	-3.000	0.136	NA		NA
5416617	5416618	CMS_2561	CMS_2562			FALSE	0.160	77.000	0.000	NA		NA
5416618	5416619	CMS_2562	CMS_2563			TRUE	0.756	-7.000	0.000	NA		NA
5416619	5416620	CMS_2563	CMS_2564		aspS	FALSE	0.108	185.000	0.000	NA	N	NA
5416621	5416622	CMS_2565	CMS_2566			TRUE	0.906	-3.000	0.033	1.000		NA
5416622	5416623	CMS_2566	CMS_2567			TRUE	0.956	60.000	0.551	1.000	Y	NA
5416624	5416625	CMS_2568	CMS_2569		uvrA	FALSE	0.110	119.000	0.000	NA		NA
5416625	5416626	CMS_2569	CMS_2570	uvrA		FALSE	0.109	111.000	0.000	NA		NA
5416626	5416627	CMS_2570	CMS_2571			FALSE	0.071	179.000	0.000	NA		NA
5416628	5416629	CMS_2572	CMS_2574			FALSE	0.055	210.000	0.000	NA		NA
5416629	5416630	CMS_2574	CMS_2575			TRUE	0.997	4.000	0.900	0.042	Y	NA
5416630	5416631	CMS_2575	CMS_2576			TRUE	0.941	26.000	0.692	1.000	N	NA
5416633	5416634	CMS_2578	CMS_2579			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA	N	NA
5416634	5416635	CMS_2579	CMS_2580			TRUE	0.948	1.000	0.000	1.000	Y	NA
5416635	5416636	CMS_2580	CMS_2581			TRUE	0.966	-16.000	0.033	NA	Y	NA
5416636	5416637	CMS_2581	CMS_2582			TRUE	0.993	-3.000	0.213	NA	Y	NA
5416639	5416640	CMS_2584	CMS_2585	menB	menE	TRUE	0.758	62.000	0.193	1.000	N	NA
5416642	5416643	CMS_2587	CMS_2588			FALSE	0.112	123.000	0.000	NA		NA
5416644	5416645	CMS_2589	CMS_2590			TRUE	0.970	-3.000	0.000	0.004	Y	NA
5416645	5416646	CMS_2590	CMS_2591			FALSE	0.033	680.000	0.000	1.000	N	NA
5416646	5416647	CMS_2591	CMS_r004			FALSE	0.026	407.000	0.000	NA		NA
5416647	5416648	CMS_r004	CMS_r005			FALSE	0.079	170.000	0.000	NA		NA
5416648	5416649	CMS_r005	CMS_r006			FALSE	0.023	447.000	0.000	NA		NA
5416649	5416650	CMS_r006	CMS_2592		purH	FALSE	0.021	558.000	0.000	NA		NA
5416650	5416651	CMS_2592	CMS_2593	purH	purN	TRUE	0.968	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
5416651	5416652	CMS_2593	CMS_2594	purN		TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
5416652	5416653	CMS_2594	CMS_2595		sucD	FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5416653	5416654	CMS_2595	CMS_2596	sucD	sucC	TRUE	0.949	27.000	0.382	0.001	Y	NA
5416655	5416656	CMS_2597	CMS_2598			FALSE	0.064	191.000	0.000	NA		NA
5416661	5416662	CMS_2604	CMS_2605			TRUE	0.972	-7.000	0.217	NA		NA
5416662	5416663	CMS_2605	CMS_2606			TRUE	0.986	-3.000	0.333	NA		NA
5416663	5416664	CMS_2606	CMS_2607			TRUE	0.975	0.000	0.242	NA		NA
5416664	5416665	CMS_2607	CMS_2608			TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416666	5416667	CMS_2609	CMS_2610	idi		FALSE	0.128	170.000	0.000	1.000	N	NA
5416669	5416670	CMS_2612	CMS_r033			FALSE	0.108	115.000	0.000	NA		NA
5416670	5416671	CMS_r033	CMS_r034			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5416671	5416672	CMS_r034	CMS_2613			FALSE	0.057	206.000	0.000	NA		NA
5416672	5416673	CMS_2613	CMS_2614			FALSE	0.026	381.000	0.000	NA		NA
5416673	5416674	CMS_2614	CMS_2615			FALSE	0.102	139.000	0.000	NA		NA
5416674	5416675	CMS_2615	CMS_2616			TRUE	0.732	48.000	0.222	0.034		NA
5416675	5416676	CMS_2616	CMS_2617		murB	TRUE	0.567	7.000	0.014	1.000		NA
5416678	5416679	CMS_r2621	CMS_2622		secE	FALSE	0.138	88.000	0.000	NA		NA
5416679	5416680	CMS_2622	CMS_2623	secE	nusG	TRUE	0.835	186.000	0.843	1.000	N	NA
5416680	5416681	CMS_2623	CMS_2624	nusG	rplK	TRUE	0.924	54.000	0.681	1.000	N	NA
5416681	5416682	CMS_2624	CMS_2625	rplK	rplA	TRUE	0.955	100.000	0.838	0.018	Y	NA
5416682	5416683	CMS_2625	CMS_2626	rplA		FALSE	0.045	153.000	0.002	1.000		NA
5416684	5416685	CMS_2627	CMS_2628			FALSE	0.040	263.000	0.000	NA		NA
5416685	5416686	CMS_2628	CMS_2629			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5416686	5416687	CMS_2629	CMS_2630			FALSE	0.050	221.000	0.000	NA		NA
5416687	5416688	CMS_2630	CMS_2631			FALSE	0.107	135.000	0.000	NA		NA
5416696	5416697	CMS_2640	CMS_2641			TRUE	0.537	7.000	0.000	NA		NA
5416699	5416700	CMS_2643	CMS_2644			FALSE	0.172	72.000	0.000	NA		NA
5416700	5416701	CMS_2644	CMS_2645			TRUE	0.749	-9.000	0.000	NA		NA
5416701	5416702	CMS_2645	CMS_2646			FALSE	0.112	127.000	0.000	NA		NA
5416702	5416703	CMS_2646	CMS_2647			FALSE	0.204	62.000	0.000	NA		NA
5416703	5416704	CMS_2647	CMS_2648			FALSE	0.028	364.000	0.000	NA		NA
5416704	5416705	CMS_2648	CMS_2649			FALSE	0.195	40.000	0.000	NA		NA
5416705	5416706	CMS_2649	CMS_2650			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416709	5416710	CMS_2654	CMS_2655			TRUE	0.764	-6.000	0.000	NA		NA
5416711	5416712	CMS_2656	CMS_2657			TRUE	0.929	0.000	0.071	NA		NA
5416713	5416714	CMS_2658	CMS_2659			TRUE	0.982	-3.000	0.244	1.000		NA
5416714	5416715	CMS_2659	CMS_2660			TRUE	0.966	-3.000	0.111	0.013		NA
5416715	5416716	CMS_2660	CMS_2661			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.013	Y	NA
5416716	5416717	CMS_2661	CMS_2662			TRUE	0.504	155.000	0.196	1.000		NA
5416717	5416718	CMS_2662	CMS_2663			FALSE	0.054	216.000	0.000	1.000		NA
5416720	5416721	CMS_2665	CMS_2666			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
5416721	5416722	CMS_2666	CMS_2667			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5416722	5416723	CMS_2667	CMS_2669			FALSE	0.110	130.000	0.000	NA		NA
5416724	5416725	CMS_2670	CMS_2671			FALSE	0.247	77.000	0.000	1.000	N	NA
5416726	5416727	CMS_2672	CMS_2673			TRUE	0.941	3.000	0.000	0.041	Y	NA
5416727	5416728	CMS_2673	CMS_2674			TRUE	0.636	53.000	0.000	0.041	Y	NA
5416728	5416729	CMS_2674	CMS_2675		bga	TRUE	0.907	33.000	0.231	1.000	Y	NA
5416731	5416732	CMS_2677	CMS_2678			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416732	5416733	CMS_2678	CMS_2680			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5416734	5416735	CMS_2681	CMS_2682			FALSE	0.100	142.000	0.000	NA		NA
5416735	5416736	CMS_2682	CMS_2683			FALSE	0.099	143.000	0.000	NA		NA
5416738	5416739	CMS_2685	CMS_2686			FALSE	0.041	256.000	0.000	NA		NA
5416739	5416740	CMS_2686	CMS_2687			FALSE	0.277	20.000	0.000	NA		NA
5416740	5416741	CMS_2687	CMS_2688			FALSE	0.102	140.000	0.000	NA		NA
5416741	5416742	CMS_2688	CMS_2689			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5416742	5416743	CMS_2689	CMS_2690			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5416743	5416744	CMS_2690	CMS_2691			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416744	5416745	CMS_2691	CMS_2692			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416746	5416747	CMS_2693	CMS_2694			FALSE	0.233	27.000	0.000	NA		NA
5416747	5416748	CMS_2694	CMS_2695			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5416748	5416749	CMS_2695	CMS_2696			FALSE	0.170	73.000	0.000	NA		NA
5416749	5416750	CMS_2696	CMS_2697			TRUE	0.692	97.000	0.333	NA		NA
5416750	5416751	CMS_2697	CMS_2698			FALSE	0.094	153.000	0.000	NA		NA
5416751	5416752	CMS_2698	CMS_2699			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416752	5416753	CMS_2699	CMS_2700			TRUE	0.764	-6.000	0.000	NA		NA
5416753	5416754	CMS_2700	CMS_2701			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416755	5416756	CMS_2702	CMS_2703			FALSE	0.429	156.000	0.000	0.001	Y	NA
5416756	5416757	CMS_2703	CMS_2704			TRUE	0.956	0.000	0.000	1.000	Y	NA
5416757	5416758	CMS_2704	CMS_2705			TRUE	0.956	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
5416761	5416762	CMS_2708	CMS_2709	B1047H05.25		TRUE	0.699	-21.000	0.009	NA		NA
5416762	5416763	CMS_2709	CMS_2710			FALSE	0.141	87.000	0.000	NA		NA
5416763	5416764	CMS_2710	CMS_2711			FALSE	0.265	22.000	0.000	NA		NA
5416766	5416767	CMS_2714	CMS_2715			FALSE	0.093	154.000	0.000	NA		NA
5416767	5416768	CMS_2715	CMS_2716			TRUE	0.997	0.000	0.667	0.041	Y	NA
5416769	5416770	CMS_2717	CMS_2718			TRUE	0.506	8.000	0.000	NA		NA
5416770	5416771	CMS_2718	CMS_2719			FALSE	0.190	68.000	0.000	1.000		NA
5416771	5416772	CMS_2719	CMS_2720			FALSE	0.178	126.000	0.000	1.000	N	NA
5416772	5416773	CMS_2720	CMS_2721			FALSE	0.178	125.000	0.000	1.000	N	NA
5416773	5416774	CMS_2721	CMS_2722		glpX	TRUE	0.483	12.000	0.000	1.000	N	NA
5416774	5416775	CMS_2722	CMS_2723	glpX		FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5416775	5416776	CMS_2723	CMS_2724			FALSE	0.020	602.000	0.000	NA		NA
5416776	5416777	CMS_2724	CMS_2725			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416777	5416778	CMS_2725	CMS_2726			TRUE	0.781	105.000	0.172	0.002	Y	NA
5416778	5416779	CMS_2726	CMS_2727			TRUE	0.911	107.000	0.529	0.002	Y	NA
5416779	5416780	CMS_2727	CMS_2728			FALSE	0.096	203.000	0.000	1.000	N	NA
5416780	5416781	CMS_2728	CMS_2729		ppk	FALSE	0.284	32.000	0.007	1.000	N	NA
5416781	5416782	CMS_2729	CMS_2730	ppk		FALSE	0.205	94.000	0.026	1.000		NA
5416782	5416783	CMS_2730	CMS_2731			TRUE	0.925	-31.000	0.076	1.000		NA
5416784	5416785	CMS_2732	CMS_2733			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5416785	5416786	CMS_2733	CMS_2734			TRUE	0.848	12.000	0.200	NA		NA
5416786	5416787	CMS_2734	CMS_2735			TRUE	0.762	-10.000	0.013	NA		NA
5416787	5416788	CMS_2735	CMS_2736			TRUE	0.728	-16.000	0.011	NA		NA
5416788	5416789	CMS_2736	CMS_2737			FALSE	0.019	746.000	0.000	NA		NA
5416793	5416794	CMS_2741	CMS_2742			TRUE	0.996	-3.000	0.437	1.000	Y	NA
5416796	5416797	CMS_2744	CMS_2745		ispDF	TRUE	0.582	60.000	0.068	1.000	N	NA
5416797	5416798	CMS_2745	CMS_2746	ispDF	cysS	FALSE	0.195	84.000	0.007	1.000	N	NA
5416798	5416799	CMS_2746	CMS_2747	cysS		TRUE	0.982	-10.000	0.088	1.000	Y	NA
5416800	5416801	CMS_2748	CMS_2749			TRUE	0.611	102.000	0.233	0.077		NA
5416802	5416803	CMS_2750	CMS_r035			FALSE	0.192	42.000	0.000	NA		NA
5416804	5416805	CMS_2751	CMS_2752			TRUE	0.850	-3.000	0.006	1.000	N	NA
5416806	5416807	CMS_2753	CMS_2754			TRUE	0.723	34.000	0.196	NA		NA
5416807	5416808	CMS_2754	CMS_2755			FALSE	0.247	237.000	0.138	NA		NA
5416808	5416809	CMS_2755	CMS_2756		groL2	FALSE	0.106	189.000	0.000	1.000	N	NA
5416810	5416811	CMS_2757	CMS_2758			FALSE	0.393	47.000	0.048	NA		NA
5416811	5416812	CMS_2758	CMS_2759			TRUE	0.875	124.000	0.824	1.000		NA
5416812	5416813	CMS_2759	CMS_2760			TRUE	0.614	78.000	0.020	0.061	Y	NA
5416813	5416814	CMS_2760	CMS_2761			TRUE	0.796	21.000	0.206	NA		NA
5416814	5416815	CMS_2761	CMS_2762			FALSE	0.433	26.000	0.038	NA		NA
5416816	5416817	CMS_2763	CMS_2764			TRUE	0.980	-7.000	0.317	NA		NA
5416819	5416820	CMS_2766	CMS_2767			FALSE	0.053	324.000	0.000	NA	N	NA
5416820	5416821	CMS_2767	CMS_2768			FALSE	0.118	175.000	0.000	NA	N	NA
5416821	5416822	CMS_2768	CMS_2769			FALSE	0.310	34.000	0.000	1.000	N	NA
5416823	5416824	CMS_2770	CMS_2771			FALSE	0.043	249.000	0.000	NA		NA
5416824	5416825	CMS_2771	CMS_2772			FALSE	0.050	221.000	0.000	NA		NA
5416825	5416826	CMS_2772	CMS_2773			FALSE	0.027	366.000	0.000	NA		NA
5416828	5416829	CMS_2775	CMS_2776			TRUE	0.989	-3.000	0.417	1.000		NA
5416830	5416831	CMS_2777	CMS_2778			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416831	5416832	CMS_2778	CMS_2779			FALSE	0.022	491.000	0.000	NA		NA
5416832	5416833	CMS_2779	CMS_2780			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5416834	5416835	CMS_2781	CMS_2782			FALSE	0.068	183.000	0.000	NA		NA
5416835	5416836	CMS_2782	CMS_2783			TRUE	0.869	-13.000	0.036	NA		NA
5416838	5416839	CMS_2785	CMS_2786			FALSE	0.191	44.000	0.000	NA		NA
5416839	5416840	CMS_2786	CMS_2787			FALSE	0.198	38.000	0.000	NA		NA
5416840	5416841	CMS_2787	CMS_2788			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416841	5416842	CMS_2788	CMS_2789			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5416842	5416843	CMS_2789	CMS_2790			FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5416843	5416844	CMS_2790	CMS_2791			TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5416844	5416845	CMS_2791	CMS_2792			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5416845	5416846	CMS_2792	CMS_2793			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5416846	5416847	CMS_2793	CMS_r013			FALSE	0.195	40.000	0.000	NA		NA
5416850	5416851	CMS_2797	CMS_2798			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416852	5416853	CMS_2799	CMS_2800			FALSE	0.029	352.000	0.000	NA		NA
5416853	5416854	CMS_2800	CMS_2801			FALSE	0.063	192.000	0.000	NA		NA
5416854	5416855	CMS_2801	CMS_2802			TRUE	0.990	0.000	0.600	NA		NA
5416855	5416856	CMS_2802	CMS_2803			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416856	5416857	CMS_2803	CMS_2804			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
5416857	5416858	CMS_2804	CMS_2805			FALSE	0.096	150.000	0.000	NA		NA
5416859	5416860	CMS_2806	CMS_2807	dnaK	grpE	TRUE	0.986	-3.000	0.074	0.004	Y	NA
5416860	5416861	CMS_2807	CMS_2808	grpE	dnaJ	TRUE	0.833	121.000	0.248	0.004	Y	NA
5416861	5416862	CMS_2808	CMS_2809	dnaJ	hspR	TRUE	0.978	2.000	0.286	1.000	N	NA
5416862	5416863	CMS_2809	CMS_2810	hspR		TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416863	5416864	CMS_2810	CMS_2811			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416864	5416865	CMS_2811	CMS_2812			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5416865	5416866	CMS_2812	CMS_2813			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416866	5416867	CMS_2813	CMS_2814			FALSE	0.202	38.000	0.000	1.000		NA
5416868	5416869	CMS_2815	CMS_2816			FALSE	0.270	21.000	0.000	NA		NA
5416869	5416870	CMS_2816	CMS_2817			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416870	5416871	CMS_2817	CMS_2818			TRUE	0.727	1.000	0.000	1.000		NA
5416873	5416874	CMS_2820	CMS_2821			TRUE	0.978	-3.000	0.200	NA		NA
5416874	5416875	CMS_2821	CMS_2822			FALSE	0.451	174.000	0.200	NA		NA
5416875	5416876	CMS_2822	CMS_2823			FALSE	0.110	118.000	0.000	NA		NA
5416878	5416879	CMS_2825	CMS_2826			FALSE	0.285	67.000	0.000	NA	N	NA
5416879	5416880	CMS_2826	CMS_2827			FALSE	0.145	156.000	0.000	NA	N	NA
5416885	5416886	CMS_2832	CMS_2833	pfkA		FALSE	0.293	66.000	0.000	1.000	N	NA
5416886	5416887	CMS_2833	CMS_2834			FALSE	0.121	94.000	0.012	NA		NA
5416887	5416888	CMS_2834	CMS_2835			FALSE	0.090	157.000	0.000	NA		NA
5416888	5416889	CMS_2835	CMS_2836			FALSE	0.112	182.000	0.000	1.000	N	NA
5416889	5416890	CMS_2836	CMS_2837			FALSE	0.112	119.000	0.000	1.000		NA
5416891	5416892	CMS_2838	CMS_2839	hemL	hemB	TRUE	0.738	81.000	0.067	0.002	Y	NA
5416892	5416893	CMS_2839	CMS_2840	hemB		TRUE	0.986	-3.000	0.071	0.002	Y	NA
5416893	5416894	CMS_2840	CMS_2841		hemC	TRUE	0.993	-3.000	0.205	0.002	Y	NA
5416894	5416895	CMS_2841	CMS_2842	hemC	hemH	TRUE	0.970	-3.000	0.015	1.000	Y	NA
5416895	5416896	CMS_2842	CMS_2843	hemH		FALSE	0.233	96.000	0.034	NA		NA
5416896	5416897	CMS_2843	CMS_2844			FALSE	0.215	32.000	0.000	NA		NA
5416897	5416898	CMS_2844	CMS_2845			FALSE	0.265	22.000	0.000	NA		NA
5416898	5416899	CMS_2845	CMS_2846			TRUE	0.745	-10.000	0.000	NA		NA
5416899	5416900	CMS_2846	CMS_2847			FALSE	0.211	33.000	0.000	NA		NA
5416900	5416901	CMS_2847	CMS_2848		hemY	FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
5416901	5416902	CMS_2848	CMS_2849	hemY	hemE	TRUE	0.745	47.000	0.049	0.001	Y	NA
5416903	5416904	CMS_2850	CMS_2851	hemA		TRUE	0.880	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5416904	5416905	CMS_2851	CMS_2852			TRUE	0.853	15.000	0.049	0.011	Y	NA
5416905	5416906	CMS_2852	CMS_2853			TRUE	0.558	10.000	0.000	1.000	N	NA
5416907	5416908	CMS_2854	CMS_2855		add	FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416910	5416911	CMS_2857	CMS_2858	deoA		TRUE	0.993	-3.000	0.221	1.000	Y	NA
5416911	5416912	CMS_2858	CMS_2859			TRUE	0.981	-3.000	0.230	1.000		NA
5416912	5416913	CMS_2859	CMS_2860			TRUE	0.955	-3.000	0.078	0.058		NA
5416913	5416914	CMS_2860	CMS_2861			TRUE	0.953	-3.000	0.078	1.000		NA
5416914	5416915	CMS_2861	CMS_2862			TRUE	0.868	82.000	0.647	1.000		NA
5416915	5416916	CMS_2862	CMS_2863			FALSE	0.110	151.000	0.000	0.001		NA
5416916	5416917	CMS_2863	CMS_2864		manC	FALSE	0.168	75.000	0.000	1.000		NA
5416918	5416919	CMS_2865	CMS_2866		sdhC	FALSE	0.078	231.000	0.000	1.000	N	NA
5416919	5416920	CMS_2866	CMS_2867	sdhC	sdhD	TRUE	0.988	-9.000	0.157	0.001	Y	NA
5416920	5416921	CMS_2867	CMS_2868	sdhD	sdhA	TRUE	0.970	34.000	0.705	0.001	Y	NA
5416921	5416922	CMS_2868	CMS_2869	sdhA	sdhB	TRUE	0.923	121.000	0.604	0.001	Y	NA
5416924	5416925	CMS_2871	CMS_2872			FALSE	0.386	11.000	0.000	1.000		NA
5416925	5416926	CMS_2872	CMS_2873		trpS	FALSE	0.295	89.000	0.026	1.000	N	NA
5416926	5416927	CMS_2873	CMS_2874	trpS		TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416929	5416930	CMS_2876	CMS_2877	ribD	ribE	TRUE	0.997	-3.000	0.456	1.000	Y	NA
5416930	5416931	CMS_2877	CMS_2878	ribE	ribA	TRUE	0.971	-3.000	0.016	1.000	Y	NA
5416931	5416932	CMS_2878	CMS_2879	ribA	ribH	TRUE	0.969	-3.000	0.011	0.002	Y	NA
5416932	5416933	CMS_2879	CMS_2880	ribH		FALSE	0.177	102.000	0.000	1.000	N	NA
5416933	5416934	CMS_2880	CMS_2881			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.017	Y	NA
5416934	5416935	CMS_2881	CMS_2882			TRUE	0.824	54.000	0.095	NA	Y	NA
5416935	5416936	CMS_2882	CMS_2883			TRUE	0.962	-10.000	0.137	NA	N	NA
5416936	5416937	CMS_2883	CMS_2884			TRUE	0.994	0.000	0.353	0.040	Y	NA
5416937	5416938	CMS_2884	CMS_2885			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416940	5416941	CMS_2887	CMS_2888			FALSE	0.086	165.000	0.000	1.000		NA
5416942	5416943	CMS_2889	CMS_2890			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416943	5416944	CMS_2890	CMS_2891			FALSE	0.061	195.000	0.000	NA		NA
5416944	5416945	CMS_2891	CMS_2892			FALSE	0.093	154.000	0.000	NA		NA
5416945	5416946	CMS_2892	CMS_2893			TRUE	0.993	-3.000	0.588	1.000		NA
5416946	5416947	CMS_2893	CMS_2894			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5416947	5416948	CMS_2894	CMS_2895			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5416948	5416949	CMS_2895	CMS_2896		pit	TRUE	0.760	12.000	0.100	NA		NA
5416950	5416951	CMS_2897	CMS_2898			FALSE	0.103	138.000	0.000	NA		NA
5416951	5416952	CMS_2898	CMS_2899			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5416952	5416953	CMS_2899	CMS_2900			FALSE	0.135	89.000	0.000	NA		NA
5416953	5416954	CMS_2900	CMS_2901			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5416954	5416955	CMS_2901	CMS_2902			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5416956	5416957	CMS_2903	CMS_2904			FALSE	0.215	32.000	0.000	NA		NA
5416958	5416959	CMS_2905	CMS_2906			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5416960	5416961	CMS_2907	CMS_2908			FALSE	0.165	75.000	0.000	NA		NA
5416964	5416965	CMS_2911	CMS_2912			FALSE	0.083	167.000	0.000	1.000		NA
5416965	5416966	CMS_2912	CMS_2913			FALSE	0.122	94.000	0.000	NA		NA
5416966	5416967	CMS_2913	CMS_2914			FALSE	0.110	108.000	0.000	NA		NA
5416968	5416969	CMS_2914A	CMS_2915			FALSE	0.353	12.000	0.000	NA		NA
5416970	5416971	CMS_2917	CMS_2918			FALSE	0.112	100.000	0.000	NA		NA
5416972	5416973	CMS_2919	CMS_2920			FALSE	0.112	132.000	0.000	1.000		NA
5416974	5416975	CMS_2921	CMS_2922			FALSE	0.047	232.000	0.000	NA		NA
5416975	5416976	CMS_2922	CMS_2923			FALSE	0.029	357.000	0.000	NA		NA
5416977	5416978	CMS_2924	CMS_2925		ald	FALSE	0.168	74.000	0.000	NA		NA
5416979	5416980	CMS_2926	CMS_2927			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5416981	5416982	CMS_2928	CMS_2929			FALSE	0.112	123.000	0.000	NA		NA
5416982	5416983	CMS_2929	CMS_2930			FALSE	0.424	10.000	0.000	NA		NA
5416986	5416987	CMS_2933	CMS_2934			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5416987	5416988	CMS_2934	CMS_2935			FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5416989	5416990	CMS_2936	CMS_2937			FALSE	0.174	105.000	0.000	NA	N	NA
5416991	5416992	CMS_2938	CMS_2939			TRUE	0.882	20.000	0.375	NA		NA
5416992	5416993	CMS_2939	CMS_2940			TRUE	0.974	-10.000	0.250	NA		NA
5416993	5416994	CMS_2940	CMS_2941			TRUE	0.995	-3.000	0.750	NA		NA
5416994	5416995	CMS_2941	CMS_2942			FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5416996	5416997	CMS_2943	CMS_2944			FALSE	0.277	20.000	0.000	NA		NA
5416997	5416998	CMS_2944	CMS_2945			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5416998	5416999	CMS_2945	CMS_2946			FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5417001	5417002	CMS_2948	CMS_2949			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5417002	5417003	CMS_2949	CMS_2950			TRUE	0.993	-24.000	0.797	1.000		NA
5417003	5417004	CMS_2950	CMS_2951			TRUE	0.997	-15.000	0.676	NA	Y	NA
5417005	5417006	CMS_2952	CMS_2953			TRUE	0.842	-7.000	0.000	1.000	N	NA
5417006	5417007	CMS_2953	CMS_2954			FALSE	0.025	408.000	0.000	NA		NA
5417007	5417008	CMS_2954	CMS_2955			FALSE	0.305	16.000	0.000	NA		NA
5417008	5417009	CMS_2955	CMS_2956			FALSE	0.277	20.000	0.000	NA		NA
5417009	5417010	CMS_2956	CMS_2957			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5417011	5417012	CMS_2958	CMS_2959			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417013	5417014	CMS_2960	CMS_2961			FALSE	0.108	134.000	0.000	NA		NA
5417015	5417016	CMS_2962	CMS_2963			TRUE	0.764	-6.000	0.000	NA		NA
5417016	5417017	CMS_2963	CMS_2964			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417017	5417018	CMS_2964	CMS_2965			FALSE	0.380	11.000	0.000	NA		NA
5417018	5417019	CMS_2965	CMS_2966			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5417019	5417020	CMS_2966	CMS_2967			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417020	5417021	CMS_2967	CMS_2968			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417021	5417022	CMS_2968	CMS_2969			TRUE	0.988	-3.000	0.357	NA		NA
5417022	5417023	CMS_2969	CMS_2970			FALSE	0.032	792.000	0.000	1.000	N	NA
5417023	5417024	CMS_2970	CMS_2971			FALSE	0.174	121.000	0.000	NA	N	NA
5417024	5417025	CMS_2971	CMS_2972			FALSE	0.193	93.000	0.000	NA	N	NA
5417028	5417029	CMS_2975	CMS_2976			FALSE	0.200	39.000	0.000	1.000		NA
5417029	5417030	CMS_2976	CMS_2977			FALSE	0.049	222.000	0.000	NA		NA
5417030	5417031	CMS_2977	CMS_2978			FALSE	0.277	20.000	0.000	NA		NA
5417031	5417032	CMS_2978	CMS_2979			FALSE	0.200	37.000	0.000	NA		NA
5417032	5417033	CMS_2979	CMS_2980			FALSE	0.057	206.000	0.000	NA		NA
5417033	5417034	CMS_2980	CMS_2981			FALSE	0.194	66.000	0.000	NA		NA
5417036	5417037	CMS_2983	CMS_2984			FALSE	0.073	176.000	0.000	NA		NA
5417040	5417041	CMS_2987	CMS_2988			FALSE	0.037	276.000	0.000	NA		NA
5417043	5417044	CMS_2990	CMS_2991			FALSE	0.058	204.000	0.000	NA		NA
5417044	5417045	CMS_2991	CMS_2993			FALSE	0.029	357.000	0.000	NA		NA
5417045	5417046	CMS_2993	CMS_2994			FALSE	0.087	162.000	0.000	NA		NA
5417047	5417048	CMS_2995	CMS_2996			TRUE	0.964	-3.000	0.079	1.000	N	NA
5417049	5417050	CMS_2997	CMS_2998			FALSE	0.085	165.000	0.000	NA		NA
5417052	5417053	CMS_3000	CMS_3001			FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5417055	5417056	CMS_3003	CMS_3004	suhB		FALSE	0.189	45.000	0.000	NA		NA
5417056	5417057	CMS_3004	CMS_3005			FALSE	0.195	54.000	0.000	NA		NA
5417057	5417058	CMS_3005	CMS_r049			FALSE	0.109	116.000	0.000	NA		NA
5417059	5417060	CMS_3006	CMS_3007		cls	FALSE	0.110	106.000	0.000	NA		NA
5417061	5417062	CMS_3008	CMS_3009			FALSE	0.223	31.000	0.000	1.000		NA
5417062	5417063	CMS_3009	CMS_3010		fprA	FALSE	0.111	133.000	0.000	1.000		NA
5417063	5417064	CMS_3010	CMS_3011	fprA		FALSE	0.335	92.000	0.039	1.000	N	NA
5417064	5417065	CMS_3011	CMS_3012		ubiE	FALSE	0.432	132.000	0.006	1.000	Y	NA
5417067	5417068	CMS_3014	CMS_3015			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417070	5417071	CMS_3017	CMS_3018	menD		TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5417073	5417074	CMS_3020	CMS_3021		menA	TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5417074	5417075	CMS_3021	CMS_3022	menA		FALSE	0.091	207.000	0.000	NA	N	NA
5417075	5417076	CMS_3022	CMS_3023			FALSE	0.176	100.000	0.000	NA	N	NA
5417076	5417077	CMS_3023	CMS_3024			TRUE	0.479	12.000	0.000	NA	N	NA
5417077	5417078	CMS_3024	CMS_3025			FALSE	0.250	25.000	0.000	1.000		NA
5417078	5417079	CMS_3025	CMS_3026			FALSE	0.109	117.000	0.000	NA		NA
5417081	5417082	CMS_3028	CMS_3029			TRUE	0.470	9.000	0.000	NA		NA
5417082	5417083	CMS_3029	CMS_3030		dcd	FALSE	0.062	194.000	0.000	NA		NA
5417084	5417085	CMS_r036	CMS_3031			FALSE	0.089	158.000	0.000	NA		NA
5417089	5417090	CMS_3035	CMS_3036	gntP		FALSE	0.117	98.000	0.000	1.000		NA
5417091	5417092	CMS_3037	CMS_3038			FALSE	0.303	57.000	0.000	1.000	N	NA
5417092	5417093	CMS_3038	CMS_3039			TRUE	0.998	-3.000	0.786	0.039	Y	NA
5417093	5417094	CMS_3039	CMS_3040			TRUE	0.955	88.000	0.750	0.039	Y	NA
5417095	5417096	CMS_3041	CMS_3042			FALSE	0.104	137.000	0.000	NA		NA
5417097	5417098	CMS_3044	CMS_3046	fdh		FALSE	0.026	392.000	0.000	NA		NA
5417098	5417099	CMS_3046	CMS_3047			FALSE	0.102	139.000	0.000	NA		NA
5417100	5417101	CMS_3048	CMS_3049			FALSE	0.113	106.000	0.000	1.000		NA
5417101	5417102	CMS_3049	CMS_3050			TRUE	0.815	-3.000	0.000	1.000		NA
5417102	5417103	CMS_3050	CMS_3051			TRUE	0.953	-16.000	0.013	1.000	Y	NA
5417103	5417104	CMS_3051	CMS_3052			FALSE	0.125	93.000	0.000	NA		NA
5417106	5417107	CMS_3054	CMS_3055	deoC		TRUE	0.840	0.000	0.000	1.000	N	NA
5417109	5417110	CMS_3057	CMS_3058			FALSE	0.114	98.000	0.000	NA		NA
5417110	5417111	CMS_3058	CMS_3059			FALSE	0.112	124.000	0.000	NA		NA
5417113	5417114	CMS_3061	CMS_3062			FALSE	0.109	116.000	0.000	NA		NA
5417115	5417116	CMS_3063	CMS_3064			TRUE	0.730	20.000	0.000	1.000	Y	NA
5417116	5417117	CMS_3064	CMS_3065			TRUE	0.969	-3.000	0.000	0.039	Y	NA
5417118	5417119	CMS_3066	CMS_3067			FALSE	0.074	174.000	0.000	NA		NA
5417120	5417121	CMS_3068	CMS_3069		hup	FALSE	0.104	256.000	0.043	1.000		NA
5417121	5417122	CMS_3069	CMS_3070	hup	rpsN	FALSE	0.146	132.000	0.007	1.000	N	NA
5417122	5417123	CMS_3070	CMS_3071	rpsN	rpmG	TRUE	0.966	3.000	0.052	0.012	Y	NA
5417123	5417124	CMS_3071	CMS_3072	rpmG	rpmB	TRUE	0.994	0.000	0.332	0.012	Y	NA
5417124	5417125	CMS_3072	CMS_3073	rpmB	fur	FALSE	0.066	195.000	0.002	1.000	N	NA
5417125	5417126	CMS_3073	CMS_3074	fur		TRUE	0.986	-3.000	0.073	1.000	Y	NA
5417126	5417127	CMS_3074	CMS_3075		fhuC	TRUE	0.995	-3.000	0.291	0.074	Y	NA
5417127	5417128	CMS_3075	CMS_3076	fhuC		TRUE	0.993	-3.000	0.204	1.000	Y	NA
5417128	5417129	CMS_3076	CMS_3077		sucB	FALSE	0.434	70.000	0.040	1.000	N	NA
5417129	5417130	CMS_3077	CMS_3078	sucB	pdhB	TRUE	0.986	19.000	0.860	0.049	Y	NA
5417130	5417131	CMS_3078	CMS_3079	pdhB	pdhA	TRUE	0.969	87.000	0.917	0.001	Y	NA
5417131	5417132	CMS_3079	CMS_3080	pdhA	pat	TRUE	0.728	10.000	0.043	1.000	N	NA
5417134	5417135	CMS_3082	CMS_3083			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417136	5417137	CMS_3084	CMS_3085	ptpA	purB	FALSE	0.376	23.000	0.000	1.000	N	NA
5417138	5417139	CMS_3086	CMS_3087			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5417140	5417141	CMS_3088	CMS_3089			FALSE	0.110	120.000	0.000	NA		NA
5417141	5417142	CMS_3089	CMS_3090			FALSE	0.279	217.000	0.000	1.000	Y	NA
5417144	5417145	CMS_3092	CMS_3093		prfC	FALSE	0.179	99.000	0.000	1.000	N	NA
5417145	5417146	CMS_3093	CMS_3094	prfC		FALSE	0.114	124.000	0.000	1.000		NA
5417147	5417148	CMS_3095	CMS_3096	dnaB	rplI	FALSE	0.039	457.000	0.012	1.000	N	NA
5417148	5417149	CMS_3096	CMS_3097	rplI	rpsR	TRUE	0.977	12.000	0.499	0.012	Y	NA
5417149	5417150	CMS_3097	CMS_3098	rpsR	ssb	FALSE	0.228	37.000	0.003	1.000	N	NA
5417150	5417151	CMS_3098	CMS_3099	ssb	rpsF	TRUE	0.678	4.000	0.003	1.000	N	NA
5417151	5417152	CMS_3099	CMS_3100	rpsF		FALSE	0.344	164.000	0.002	1.000	Y	NA
5417153	5417154	CMS_3101	CMS_3102			FALSE	0.195	40.000	0.000	NA		NA
5417154	5417155	CMS_3102	CMS_3103		trxB	FALSE	0.092	157.000	0.000	1.000		NA
5417155	5417156	CMS_3103	CMS_3104	trxB	trxA	FALSE	0.253	69.000	0.021	1.000		NA
5417156	5417157	CMS_3104	CMS_3105	trxA		FALSE	0.172	167.000	0.036	1.000		NA
5417157	5417158	CMS_3105	CMS_3106		ddlB	TRUE	0.493	44.000	0.053	1.000	N	NA
5417159	5417160	CMS_3107	CMS_3108	parB	parA	TRUE	0.995	0.000	0.827	1.000	N	NA
5417160	5417161	CMS_3108	CMS_3109	parA	gidB	TRUE	0.698	150.000	0.339	1.000	N	NA
5417161	5417162	CMS_3109	CMS_3110	gidB		FALSE	0.111	103.000	0.000	NA		NA
5417162	5417163	CMS_3110	CMS_3111			FALSE	0.039	265.000	0.000	NA		NA
5417163	5417164	CMS_3111	CMS_3112		oxaA	TRUE	0.745	-3.000	0.005	1.000		NA
5417164	5417165	CMS_3112	CMS_3113	oxaA		FALSE	0.246	11.000	0.002	NA		NA
5417165	5417166	CMS_3113	CMS_3114		rnpA	TRUE	0.992	-3.000	0.540	NA		NA
5417166	5417167	CMS_3114	CMS_3115	rnpA	rpmH	TRUE	0.941	25.000	0.787	1.000		NA
5417168	5417169	CMS_pCS0001	CMS_pCS0002			FALSE	0.021	529.000	0.000	NA		NA
5417169	5417170	CMS_pCS0002	CMS_pCS0003			FALSE	0.022	478.000	0.000	NA		NA
5417170	5417171	CMS_pCS0003	CMS_pCS0004			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417171	5417172	CMS_pCS0004	CMS_pCS0005		parA	FALSE	0.051	219.000	0.000	NA		NA
5417172	5417173	CMS_pCS0005	CMS_pCS0006	parA		TRUE	0.758	0.000	0.000	1.000		NA
5417173	5417174	CMS_pCS0006	CMS_pCS0007			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5417176	5417177	CMS_pCS0009	CMS_pCS0010			FALSE	0.184	48.000	0.000	NA		NA
5417177	5417178	CMS_pCS0010	CMS_pCS0011			TRUE	0.470	9.000	0.000	NA		NA
5417178	5417179	CMS_pCS0011	CMS_pCS0012			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5417179	5417180	CMS_pCS0012	CMS_pCS0013			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
5417180	5417181	CMS_pCS0013	CMS_pCS0014			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417181	5417182	CMS_pCS0014	CMS_pCS0015			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5417182	5417183	CMS_pCS0015	CMS_pCS0016			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417183	5417184	CMS_pCS0016	CMS_pCS0017			TRUE	0.764	-6.000	0.000	NA		NA
5417184	5417185	CMS_pCS0017	CMS_pCS0018			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417185	5417186	CMS_pCS0018	CMS_pCS0019			FALSE	0.265	22.000	0.000	NA		NA
5417189	5417190	CMS_pCS0022	CMS_pCS0023	pat1		FALSE	0.246	25.000	0.000	NA		NA
5417192	5417193	CMS_pCS0025	CMS_pCS0026			TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5417194	5417195	CMS_pCS0027	CMS_pCS0028			FALSE	0.034	310.000	0.000	NA		NA
5417197	5417198	CMS_pCS0030	CMS_pCS0031			FALSE	0.246	25.000	0.000	NA		NA
5417199	5417200	CMS_pCS0032	CMS_pCS0033			TRUE	0.731	-22.000	0.000	NA		NA
5417202	5417203	CMS_pCS0035	CMS_pCS0036			FALSE	0.047	232.000	0.000	NA		NA
5417204	5417205	CMS_pCS0037	CMS_pCS0038	pat1		FALSE	0.191	43.000	0.000	NA		NA
5417206	5417207	CMS_pCS0039	CMS_pCS0040			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5417208	5417209	CMS_pCS0041	CMS_pCS0042			FALSE	0.229	28.000	0.000	NA		NA
5417209	5417210	CMS_pCS0042	CMS_pCS0043			FALSE	0.184	50.000	0.000	NA		NA
5417210	5417211	CMS_pCS0043	CMS_pCS0044			FALSE	0.113	99.000	0.000	NA		NA
5417211	5417212	CMS_pCS0044	CMS_pCS0045			TRUE	0.512	8.000	0.000	1.000		NA
5417212	5417213	CMS_pCS0045	CMS_pCS0046			FALSE	0.111	122.000	0.000	NA		NA
5417213	5417214	CMS_pCS0046	CMS_pCS0047		fic	FALSE	0.239	26.000	0.000	NA		NA
5417214	5417215	CMS_pCS0047	CMS_pCS0048	fic		TRUE	0.732	-21.000	0.000	NA		NA
5417215	5417216	CMS_pCS0048	CMS_pCS0049			TRUE	0.711	2.000	0.000	NA		NA
5417216	5417217	CMS_pCS0049	CMS_pCS0050		parB	FALSE	0.028	358.000	0.000	NA		NA
5417218	5417219	CMS_pCS0051	CMS_pCS0052			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417220	5417221	CMS_pCS0053	CMS_pCS0054			FALSE	0.021	518.000	0.000	NA		NA
5417221	5417222	CMS_pCS0054	CMS_pCS0055		ssb	FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5417222	5417223	CMS_pCS0055	CMS_pCS0056	ssb		TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5417223	5417224	CMS_pCS0056	CMS_pCS0057			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417224	5417225	CMS_pCS0057	CMS_pCS0058			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417225	5417226	CMS_pCS0058	CMS_pCS0059			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5417229	5417230	CMS_pCS0062	CMS_pCS0063			FALSE	0.023	453.000	0.000	NA		NA
5417230	5417231	CMS_pCS0063	CMS_pCS0064			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417231	5417232	CMS_pCS0064	CMS_pCS0065			FALSE	0.063	192.000	0.000	NA		NA
5417232	5417233	CMS_pCS0065	CMS_pCS0066			FALSE	0.019	700.000	0.000	NA		NA
5417234	5417168	CMS_pCS0067	CMS_pCS0001			FALSE	0.027	377.000	0.000	NA		NA
5417235	5417236	CMS_pCSL0004	CMS_pCSL0005			FALSE	0.072	178.000	0.000	NA		NA
5417236	5417237	CMS_pCSL0005	CMS_pCSL0006			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5417237	5417238	CMS_pCSL0006	CMS_pCSL0007			FALSE	0.039	264.000	0.000	NA		NA
5417238	5417239	CMS_pCSL0007	CMS_pCSL0008			FALSE	0.120	95.000	0.000	NA		NA
5417239	5417240	CMS_pCSL0008	CMS_pCSL0009		smf	FALSE	0.038	270.000	0.000	NA		NA
5417243	5417244	CMS_pCSL0012	CMS_pCSL0014			FALSE	0.112	127.000	0.000	NA		NA
5417244	5417245	CMS_pCSL0014	CMS_pCSL0015			FALSE	0.301	17.000	0.000	NA		NA
5417245	5417246	CMS_pCSL0015	CMS_pCSL0016			FALSE	0.200	56.000	0.000	NA		NA
5417246	5417247	CMS_pCSL0016	CMS_pCSL0018			FALSE	0.193	41.000	0.000	NA		NA
5417247	5417248	CMS_pCSL0018	CMS_pCSL0019			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5417248	5417249	CMS_pCSL0019	CMS_pCSL0020			FALSE	0.034	309.000	0.000	NA		NA
5417249	5417250	CMS_pCSL0020	CMS_pCSL0021			FALSE	0.202	63.000	0.000	NA		NA
5417254	5417255	CMS_pCSL0025	CMS_pCSL0026			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5417255	5417256	CMS_pCSL0026	CMS_pCSL0027			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5417256	5417257	CMS_pCSL0027	CMS_pCSL0028			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417257	5417258	CMS_pCSL0028	CMS_pCSL0029			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
5417259	5417260	CMS_pCSL0030	CMS_pCSL0032			FALSE	0.046	234.000	0.000	NA		NA
5417260	5417261	CMS_pCSL0032	CMS_pCSL0033			FALSE	0.108	113.000	0.000	NA		NA
5417261	5417262	CMS_pCSL0033	CMS_pCSL0034			FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5417262	5417263	CMS_pCSL0034	CMS_pCSL0035			FALSE	0.204	35.000	0.000	NA		NA
5417263	5417264	CMS_pCSL0035	CMS_pCSL0036			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417264	5417265	CMS_pCSL0036	CMS_pCSL0037			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417265	5417266	CMS_pCSL0037	CMS_pCSL0039			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417266	5417267	CMS_pCSL0039	CMS_pCSL0040			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417267	5417268	CMS_pCSL0040	CMS_pCSL0041			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417268	5417269	CMS_pCSL0041	CMS_pCSL0042			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417269	5417270	CMS_pCSL0042	CMS_pCSL0043			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417270	5417271	CMS_pCSL0043	CMS_pCSL0044			FALSE	0.066	186.000	0.000	NA		NA
5417272	5417273	CMS_pCSL0045	CMS_pCSL0046			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417273	5417274	CMS_pCSL0046	CMS_pCSL0047			FALSE	0.226	29.000	0.000	NA		NA
5417274	5417275	CMS_pCSL0047	CMS_pCSL0048			FALSE	0.195	40.000	0.000	NA		NA
5417275	5417276	CMS_pCSL0048	CMS_pCSL0049			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417276	5417277	CMS_pCSL0049	CMS_pCSL0050			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417277	5417278	CMS_pCSL0050	CMS_pCSL0051			FALSE	0.253	24.000	0.000	NA		NA
5417278	5417279	CMS_pCSL0051	CMS_pCSL0052		SLP2.27	TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5417279	5417280	CMS_pCSL0052	CMS_pCSL0053	SLP2.27		FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5417280	5417281	CMS_pCSL0053	CMS_pCSL0054			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417281	5417282	CMS_pCSL0054	CMS_pCSL0055			FALSE	0.196	39.000	0.000	NA		NA
5417282	5417283	CMS_pCSL0055	CMS_pCSL0056			TRUE	0.470	9.000	0.000	NA		NA
5417283	5417284	CMS_pCSL0056	CMS_pCSL0057			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417284	5417285	CMS_pCSL0057	CMS_pCSL0058			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417285	5417286	CMS_pCSL0058	CMS_pCSL0059			FALSE	0.197	65.000	0.000	NA		NA
5417286	5417287	CMS_pCSL0059	CMS_pCSL0060			FALSE	0.189	52.000	0.000	NA		NA
5417287	5417288	CMS_pCSL0060	CMS_pCSL0061			FALSE	0.314	15.000	0.000	NA		NA
5417288	5417289	CMS_pCSL0061	CMS_pCSL0062			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417289	5417290	CMS_pCSL0062	CMS_pCSL0063			FALSE	0.182	69.000	0.000	NA		NA
5417294	5417295	CMS_pCSL0067	CMS_pCSL0068			FALSE	0.197	65.000	0.000	NA		NA
5417295	5417296	CMS_pCSL0068	CMS_pCSL0069			FALSE	0.327	14.000	0.000	NA		NA
5417296	5417297	CMS_pCSL0069	CMS_pCSL0070			FALSE	0.327	14.000	0.000	NA		NA
5417297	5417298	CMS_pCSL0070	CMS_pCSL0071			FALSE	0.025	409.000	0.000	NA		NA
5417298	5417299	CMS_pCSL0071	CMS_pCSL0072			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5417299	5417300	CMS_pCSL0072	CMS_pCSL0073			TRUE	0.605	5.000	0.000	NA		NA
5417300	5417301	CMS_pCSL0073	CMS_pCSL0074			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417301	5417302	CMS_pCSL0074	CMS_pCSL0075			FALSE	0.380	11.000	0.000	NA		NA
5417302	5417303	CMS_pCSL0075	CMS_pCSL0076			FALSE	0.284	19.000	0.000	NA		NA
5417303	5417304	CMS_pCSL0076	CMS_pCSL0077			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417304	5417305	CMS_pCSL0077	CMS_pCSL0078			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5417305	5417306	CMS_pCSL0078	CMS_pCSL0079			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5417306	5417307	CMS_pCSL0079	CMS_pCSL0080			TRUE	0.962	3.000	0.222	NA		NA
5417307	5417308	CMS_pCSL0080	CMS_pCSL0081			FALSE	0.069	181.000	0.000	NA		NA
5417311	5417312	CMS_pCSL0084	CMS_pCSL0085			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
5417312	5417313	CMS_pCSL0085	CMS_pCSL0086			TRUE	0.685	3.000	0.000	NA		NA
5417313	5417314	CMS_pCSL0086	CMS_pCSL0087			TRUE	0.537	7.000	0.000	NA		NA
5417314	5417315	CMS_pCSL0087	CMS_pCSL0088			TRUE	0.993	0.000	0.750	NA		NA
5417315	5417316	CMS_pCSL0088	CMS_pCSL0089			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417316	5417317	CMS_pCSL0089	CMS_pCSL0090			TRUE	0.965	-3.000	0.118	NA		NA
5417317	5417318	CMS_pCSL0090	CMS_pCSL0091			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417318	5417319	CMS_pCSL0091	CMS_pCSL0092			FALSE	0.098	147.000	0.000	NA		NA
5417319	5417320	CMS_pCSL0092	CMS_pCSL0093			FALSE	0.191	43.000	0.000	NA		NA
5417320	5417321	CMS_pCSL0093	CMS_pCSL0094			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417321	5417322	CMS_pCSL0094	CMS_pCSL0095			FALSE	0.170	73.000	0.000	NA		NA
5417322	5417323	CMS_pCSL0095	CMS_pCSL0096			FALSE	0.032	323.000	0.000	NA		NA
5417324	5417325	CMS_pCSL0097	CMS_pCSL0098			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417325	5417326	CMS_pCSL0098	CMS_pCSL0099			FALSE	0.176	71.000	0.000	NA		NA
5417326	5417327	CMS_pCSL0099	CMS_pCSL0100			TRUE	0.754	0.000	0.000	NA		NA
5417327	5417328	CMS_pCSL0100	CMS_pCSL0101			FALSE	0.108	112.000	0.000	NA		NA
5417329	5417330	CMS_pCSL0102	CMS_pCSL0103			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
5417330	5417331	CMS_pCSL0103	CMS_pCSL0104			TRUE	0.811	-3.000	0.000	NA		NA
5417333	5417334	CMS_pCSL0106	CMS_pCSL0107			TRUE	0.568	6.000	0.000	NA		NA
5417334	5417335	CMS_pCSL0107	CMS_pCSL0108			FALSE	0.120	95.000	0.000	NA		NA
5417337	5417338	CMS_pCSL0110	CMS_pCSL0111			FALSE	0.187	68.000	0.000	NA		NA
5417338	5417339	CMS_pCSL0111	CMS_pCSL0112			FALSE	0.205	59.000	0.000	NA		NA
5417339	5417340	CMS_pCSL0112	CMS_pCSL0114			FALSE	0.192	53.000	0.000	NA		NA
5417340	5417341	CMS_pCSL0114	CMS_pCSL0115			FALSE	0.305	16.000	0.000	NA		NA
5417342	5417343	CMS_pCSL0116	CMS_pCSL0117			TRUE	0.643	4.000	0.000	NA		NA
5417345	5417346	CMS_pCSL0119	CMS_pCSL0120			FALSE	0.293	18.000	0.000	NA		NA
5417346	5417347	CMS_pCSL0120	CMS_pCSL0121			FALSE	0.072	178.000	0.000	NA		NA