MicrobesOnline Operon Predictions for Thiomicrospira crunogena XCL-2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1176195 1176196 Tcr_0001 Tcr_0002     TRUE 0.892 176.000 0.328 1.000 Y NA
 1176196 1176197 Tcr_0002 Tcr_0003     TRUE 0.957 99.000 0.318 1.000 Y NA
 1176197 1176198 Tcr_0003 Tcr_0004     FALSE 0.194 105.000 0.000 1.000 N NA
 1176198 1176199 Tcr_0004 Tcr_0005     TRUE 0.999 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 1176199 1176200 Tcr_0005 Tcr_0006     FALSE 0.171 116.000 0.000 1.000 N NA
 1176200 1176201 Tcr_0006 Tcr_0007     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1176201 1176202 Tcr_0007 Tcr_0008     TRUE 0.828 2.000 0.000 1.000 N NA
 1176202 1176203 Tcr_0008 Tcr_0009     TRUE 0.961 -3.000 0.054 NA   NA
 1176203 1176204 Tcr_0009 Tcr_0010     FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 1176204 1176205 Tcr_0010 Tcr_0011     TRUE 0.775 11.000 0.000 NA   NA
 1176205 1176206 Tcr_0011 Tcr_0012     FALSE 0.033 293.000 0.000 NA   NA
 1176206 1176207 Tcr_0012 Tcr_0013     FALSE 0.174 176.000 0.003 1.000 N NA
 1176210 1176211 Tcr_0016 Tcr_0017     TRUE 0.811 14.000 0.000 1.000 N NA
 1176214 1176215 Tcr_0020 Tcr_0021     FALSE 0.031 512.000 0.000 1.000   NA
 1176215 1176216 Tcr_0021 Tcr_0022     FALSE 0.409 40.000 0.000 NA   NA
 1176216 1176217 Tcr_0022 Tcr_0023     TRUE 0.775 8.000 0.000 NA   NA
 1176217 1176218 Tcr_0023 Tcr_0024     FALSE 0.177 114.000 0.000 1.000 N NA
 1176218 1176219 Tcr_0024 Tcr_0025     FALSE 0.035 282.000 0.000 NA   NA
 1176220 1176221 Tcr_0026 Tcr_0027     FALSE 0.074 166.000 0.000 NA   NA
 1176221 1176222 Tcr_0027 Tcr_0028     FALSE 0.194 290.000 0.000 NA Y NA
 1176225 1176226 Tcr_0031 Tcr_0032     FALSE 0.039 251.000 0.000 NA   NA
 1176226 1176227 Tcr_0032 Tcr_0033     TRUE 0.991 27.000 0.270 NA Y NA
 1176227 1176228 Tcr_0033 Tcr_0034     TRUE 0.999 -3.000 0.973 NA Y NA
 1176228 1176229 Tcr_0034 Tcr_0035     FALSE 0.040 336.000 0.000 1.000 N NA
 1176230 1176231 Tcr_0036 Tcr_0037     FALSE 0.034 401.000 0.000 1.000   NA
 1176231 1176232 Tcr_0037 Tcr_0038     TRUE 0.988 10.000 0.113 0.053   NA
 1176232 1176233 Tcr_0038 Tcr_0039     TRUE 0.923 59.000 0.226 1.000 N NA
 1176234 1176235 Tcr_0040 Tcr_0041     FALSE 0.115 152.000 0.000 1.000 N NA
 1176236 1176237 Tcr_0042 Tcr_0043     FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 1176238 1176239 Tcr_0044 Tcr_0045     FALSE 0.163 101.000 0.000 NA   NA
 1176239 1176240 Tcr_0045 Tcr_0046     FALSE 0.184 94.000 0.000 NA   NA
 1176242 1176243 Tcr_0048 Tcr_0049     TRUE 0.998 -3.000 0.399 NA Y NA
 1176243 1176244 Tcr_0049 Tcr_0050     TRUE 0.972 24.000 0.038 1.000 Y NA
 1176244 1176245 Tcr_0050 Tcr_0051     FALSE 0.249 166.000 0.017 1.000 N NA
 1176245 1176246 Tcr_0051 Tcr_0052     FALSE 0.357 54.000 0.000 NA   NA
 1176248 1176249 Tcr_0054 Tcr_0055     TRUE 0.687 22.000 0.000 NA N NA
 1176249 1176250 Tcr_0055 Tcr_0056     TRUE 0.959 10.000 0.000 NA Y NA
 1176250 1176251 Tcr_0056 Tcr_0057     TRUE 0.989 12.000 0.276 NA N NA
 1176252 1176253 Tcr_0058 Tcr_0059     TRUE 0.999 15.000 0.937 1.000 Y NA
 1176253 1176254 Tcr_0059 Tcr_0060     TRUE 1.000 -6.000 0.937 0.064 Y NA
 1176254 1176255 Tcr_0060 Tcr_0061     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 1176255 1176256 Tcr_0061 Tcr_0062     TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.012 Y NA
 1176256 1176257 Tcr_0062 Tcr_0063     TRUE 1.000 0.000 0.881 0.012 Y NA
 1176260 1176261 Tcr_0066 Tcr_0067     FALSE 0.186 109.000 0.000 1.000 N NA
 1176261 1176262 Tcr_0067 Tcr_0068     FALSE 0.125 140.000 0.000 1.000 N NA
 1176262 1176263 Tcr_0068 Tcr_0069     TRUE 0.910 22.000 0.000 0.036   NA
 1176263 1176264 Tcr_0069 Tcr_0070     TRUE 0.719 51.000 0.022 1.000   NA
 1176265 1176266 Tcr_0071 Tcr_0072     TRUE 0.490 32.000 0.000 NA   NA
 1176266 1176267 Tcr_0072 Tcr_0073     TRUE 0.960 0.000 0.058 NA   NA
 1176267 1176268 Tcr_0073 Tcr_0074     TRUE 0.956 -3.000 0.041 NA   NA
 1176268 1176269 Tcr_0074 Tcr_0075     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1176269 1176270 Tcr_0075 Tcr_0076     TRUE 0.957 25.000 0.179 NA   NA
 1176270 1176271 Tcr_0076 Tcr_0077     FALSE 0.087 169.000 0.000 1.000   NA
 1176271 1176272 Tcr_0077 Tcr_0078     FALSE 0.092 153.000 0.000 NA N NA
 1176272 1176273 Tcr_0078 Tcr_0079     TRUE 0.978 25.000 0.315 NA   NA
 1176273 1176274 Tcr_0079 Tcr_0080     FALSE 0.132 117.000 0.000 NA   NA
 1176274 1176275 Tcr_0080 Tcr_0081     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA N NA
 1176275 1176276 Tcr_0081 Tcr_0082     TRUE 0.574 26.000 0.000 NA   NA
 1176276 1176277 Tcr_0082 Tcr_0083     FALSE 0.029 353.000 0.000 NA   NA
 1176279 1176280 Tcr_0085 Tcr_0086     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1176280 1176281 Tcr_0086 Tcr_0087     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 1176281 1176282 Tcr_0087 Tcr_0088     TRUE 0.997 -13.000 0.500 NA   NA
 1176282 1176283 Tcr_0088 Tcr_0089     FALSE 0.100 157.000 0.000 1.000   NA
 1176285 1176286 Tcr_0091 Tcr_0092     TRUE 0.494 37.000 0.000 1.000   NA
 1176286 1176287 Tcr_0092 Tcr_0093     FALSE 0.138 129.000 0.000 1.000   NA
 1176288 1176289 Tcr_0094 Tcr_0095     FALSE 0.102 156.000 0.000 1.000   NA
 1176289 1176290 Tcr_0095 Tcr_0096     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 1176290 1176291 Tcr_0096 Tcr_0097     TRUE 0.833 -13.000 0.000 NA   NA
 1176291 1176292 Tcr_0097 Tcr_0098     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1176292 1176293 Tcr_0098 Tcr_0099     TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 1176293 1176294 Tcr_0099 Tcr_0100     TRUE 0.819 -6.000 0.000 NA   NA
 1176295 1176296 Tcr_0101 Tcr_0102     FALSE 0.353 55.000 0.000 NA   NA
 1176296 1176297 Tcr_0102 Tcr_0103     FALSE 0.246 77.000 0.000 NA   NA
 1176297 1176298 Tcr_0103 Tcr_0104     FALSE 0.032 305.000 0.000 NA   NA
 1176299 1176300 Tcr_0105 Tcr_0106     FALSE 0.196 101.000 0.000 1.000   NA
 1176302 1176303 Tcr_0108 Tcr_0109     TRUE 0.573 31.000 0.000 1.000 N NA
 1176304 1176305 Tcr_0110 Tcr_0111     FALSE 0.125 125.000 0.000 NA N NA
 1176306 1176307 Tcr_0112 Tcr_0113     TRUE 0.999 -13.000 0.205 0.003 Y NA
 1176307 1176308 Tcr_0113 Tcr_0114     TRUE 0.546 28.000 0.000 NA   NA
 1176308 1176309 Tcr_0114 Tcr_0115     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 1176311 1176312 Tcr_0117 Tcr_0118     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA N NA
 1176314 1176315 Tcr_0120 Tcr_0121     TRUE 0.984 -7.000 0.150 NA N NA
 1176315 1176316 Tcr_0121 Tcr_0122     FALSE 0.055 208.000 0.000 NA N NA
 1176317 1176318 Tcr_0123 Tcr_0124     FALSE 0.117 149.000 0.000 1.000 N NA
 1176318 1176319 Tcr_0124 Tcr_0125     FALSE 0.070 205.000 0.000 1.000 N NA
 1176319 1176320 Tcr_0125 Tcr_0126     FALSE 0.208 255.000 0.049 1.000 N NA
 1176320 1176321 Tcr_0126 Tcr_0127     TRUE 0.557 123.000 0.087 1.000   NA
 1176322 1176323 Tcr_0128 Tcr_0129     TRUE 0.831 1.000 0.000 1.000 N NA
 1176323 1176324 Tcr_0129 Tcr_0130     TRUE 0.588 30.000 0.000 1.000 N NA
 1176324 1176325 Tcr_0130 Tcr_0131     FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 1176325 1176326 Tcr_0131 Tcr_0132     TRUE 0.781 3.000 0.000 NA   NA
 1176328 1176329 Tcr_0134 Tcr_0135     TRUE 0.677 24.000 0.000 1.000   NA
 1176329 1176330 Tcr_0135 Tcr_0136     TRUE 0.484 38.000 0.000 1.000   NA
 1176330 1176331 Tcr_0136 Tcr_0137     TRUE 0.816 4.000 0.000 1.000   NA
 1176331 1176332 Tcr_0137 Tcr_0138     FALSE 0.416 39.000 0.000 NA   NA
 1176332 1176333 Tcr_0138 Tcr_0139     FALSE 0.068 174.000 0.000 NA   NA
 1176333 1176334 Tcr_0139 Tcr_0140     TRUE 0.670 130.000 0.026 0.010 N NA
 1176335 1176336 Tcr_0141 Tcr_0142     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 1176336 1176337 Tcr_0142 Tcr_0143     FALSE 0.370 67.000 0.000 1.000 N NA
 1176337 1176338 Tcr_0143 Tcr_0144     TRUE 0.995 -7.000 0.013 0.007 Y NA
 1176338 1176339 Tcr_0144 Tcr_0145     TRUE 0.992 29.000 0.118 0.007 Y NA
 1176339 1176340 Tcr_0145 Tcr_0146     TRUE 0.990 1.000 0.064 1.000 Y NA
 1176340 1176341 Tcr_0146 Tcr_0147     TRUE 0.985 24.000 0.342 1.000 N NA
 1176341 1176342 Tcr_0147 Tcr_0148     TRUE 0.771 55.000 0.044 1.000 N NA
 1176345 1176346 Tcr_0151 Tcr_0152     TRUE 0.814 7.000 0.000 1.000   NA
 1176347 1176348 Tcr_0153 Tcr_0154     TRUE 0.937 5.000 0.018 1.000 N NA
 1176349 1176350 Tcr_0155 Tcr_0156     FALSE 0.045 229.000 0.000 NA   NA
 1176350 1176351 Tcr_0156 Tcr_0157     TRUE 0.674 65.000 0.000 0.052   NA
 1176351 1176352 Tcr_0157 Tcr_0158     FALSE 0.079 179.000 0.000 1.000   NA
 1176352 1176353 Tcr_0158 Tcr_0159     TRUE 0.966 44.000 0.006 0.006 Y NA
 1176353 1176354 Tcr_0159 Tcr_0160     TRUE 1.000 4.000 0.501 0.006 Y NA
 1176354 1176355 Tcr_0160 Tcr_0161     TRUE 0.924 64.000 0.000 0.006 Y NA
 1176355 1176356 Tcr_0161 Tcr_0162     TRUE 0.992 15.000 0.004 0.006 Y NA
 1176357 1176358 Tcr_0163 Tcr_0164     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176358 1176359 Tcr_0164 Tcr_0165     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1176359 1176360 Tcr_0165 Tcr_0166     TRUE 0.838 38.000 0.000 NA Y NA
 1176360 1176361 Tcr_0166 Tcr_0167     FALSE 0.271 85.000 0.000 1.000 N NA
 1176361 1176362 Tcr_0167 Tcr_0168     TRUE 0.971 2.000 0.010 0.065   NA
 1176362 1176363 Tcr_0168 Tcr_0169     FALSE 0.235 138.000 0.002 1.000   NA
 1176363 1176364 Tcr_0169 Tcr_0170     FALSE 0.054 205.000 0.000 NA   NA
 1176364 1176365 Tcr_0170 Tcr_0171     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1176365 1176366 Tcr_0171 Tcr_0172     FALSE 0.030 336.000 0.000 NA   NA
 1176367 1176368 Tcr_0173 Tcr_0174     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 1176368 1176369 Tcr_0174 Tcr_0175     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1176370 1176371 Tcr_0176 Tcr_0177     FALSE 0.095 143.000 0.000 NA   NA
 1176371 1176372 Tcr_0177 Tcr_0178     FALSE 0.243 88.000 0.000 1.000   NA
 1176373 1176374 Tcr_0179 Tcr_0180     TRUE 0.996 11.000 0.220 1.000 Y NA
 1176374 1176375 Tcr_0180 Tcr_0181     TRUE 0.512 35.000 0.000 1.000   NA
 1176375 1176376 Tcr_0181 Tcr_0182     FALSE 0.229 82.000 0.000 NA   NA
 1176376 1176377 Tcr_0182 Tcr_0183     TRUE 0.924 7.000 0.015 NA N NA
 1176377 1176378 Tcr_0183 Tcr_0184     TRUE 0.499 38.000 0.000 1.000 N NA
 1176379 1176380 Tcr_0185 Tcr_0186     TRUE 0.828 0.000 0.000 1.000   NA
 1176380 1176381 Tcr_0186 Tcr_0187     TRUE 0.980 22.000 0.000 0.010 Y NA
 1176381 1176382 Tcr_0187 Tcr_0188     FALSE 0.071 204.000 0.000 1.000 N NA
 1176382 1176383 Tcr_0188 Tcr_0189     TRUE 0.989 24.000 0.171 1.000 Y NA
 1176383 1176384 Tcr_0189 Tcr_0190     TRUE 0.983 52.000 0.810 NA   NA
 1176384 1176385 Tcr_0190 Tcr_0191     TRUE 0.968 4.000 0.094 NA   NA
 1176385 1176386 Tcr_0191 Tcr_0192     TRUE 0.997 4.000 0.305 1.000 Y NA
 1176386 1176387 Tcr_0192 Tcr_0193     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 1176392 1176393 Tcr_0198 Tcr_0199     FALSE 0.290 70.000 0.000 NA   NA
 1176395 1176396 Tcr_0201 Tcr_0202     TRUE 0.957 15.000 0.074 NA   NA
 1176396 1176397 Tcr_0202 Tcr_0203     TRUE 0.823 1.000 0.000 1.000   NA
 1176398 1176399 Tcr_0204 Tcr_0205     TRUE 0.756 19.000 0.000 1.000   NA
 1176399 1176400 Tcr_0205 Tcr_0206     TRUE 0.740 88.000 0.115 1.000   NA
 1176400 1176401 Tcr_0206 Tcr_0207     TRUE 0.972 79.000 0.447 0.063 N NA
 1176401 1176402 Tcr_0207 Tcr_0208     TRUE 0.847 95.000 0.234 1.000 N NA
 1176402 1176403 Tcr_0208 Tcr_0209     TRUE 0.873 56.000 0.152 NA   NA
 1176403 1176404 Tcr_0209 Tcr_0210     TRUE 0.731 17.000 0.000 NA   NA
 1176404 1176405 Tcr_0210 Tcr_0211     FALSE 0.179 113.000 0.000 1.000 N NA
 1176405 1176406 Tcr_0211 Tcr_0212     TRUE 0.573 31.000 0.000 1.000 N NA
 1176407 1176408 Tcr_0213 Tcr_0214     FALSE 0.296 76.000 0.000 1.000   NA
 1176408 1176409 Tcr_0214 Tcr_0215     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 1176409 1176410 Tcr_0215 Tcr_0216     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1176411 1176412 Tcr_0217 Tcr_0218     TRUE 0.822 12.000 0.000 1.000 N NA
 1176413 1176414 Tcr_0219 Tcr_0220     TRUE 0.980 45.000 0.583 1.000   NA
 1176414 1176415 Tcr_0220 Tcr_0221     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 1176415 1176416 Tcr_0221 Tcr_0222     TRUE 0.995 10.000 0.500 1.000 N NA
 1176417 1176418 Tcr_0223 Tcr_0224     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1176419 1176420 Tcr_0225 Tcr_0226     FALSE 0.063 209.000 0.000 1.000   NA
 1176420 1176421 Tcr_0226 Tcr_0227     TRUE 0.953 12.000 0.000 0.021 N NA
 1176421 1176422 Tcr_0227 Tcr_0228     FALSE 0.246 77.000 0.000 NA   NA
 1176424 1176425 Tcr_0230 Tcr_0231     FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 1176425 1176426 Tcr_0231 Tcr_0232     TRUE 0.992 2.000 0.000 0.001 Y NA
 1176427 1176428 Tcr_0233 Tcr_0234     FALSE 0.063 209.000 0.000 1.000   NA
 1176428 1176429 Tcr_0234 Tcr_0235     FALSE 0.208 87.000 0.000 NA   NA
 1176429 1176430 Tcr_0235 Tcr_0236     TRUE 0.992 -3.000 0.300 NA   NA
 1176430 1176431 Tcr_0236 Tcr_0237     FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 1176431 1176432 Tcr_0237 Tcr_0238     FALSE 0.113 129.000 0.000 NA   NA
 1176433 1176434 Tcr_0239 Tcr_0240     TRUE 0.608 94.000 0.054 1.000 N NA
 1176434 1176435 Tcr_0240 Tcr_0241     TRUE 0.473 41.000 0.000 1.000 N NA
 1176435 1176436 Tcr_0241 Tcr_0242     FALSE 0.086 177.000 0.000 1.000 N NA
 1176436 1176437 Tcr_0242 Tcr_0243     TRUE 0.996 5.000 0.581 NA N NA
 1176437 1176438 Tcr_0243 Tcr_0244     FALSE 0.029 416.000 0.000 NA N NA
 1176438 1176439 Tcr_0244 Tcr_0245     TRUE 0.896 65.000 0.030 1.000 Y NA
 1176439 1176440 Tcr_0245 Tcr_0246     TRUE 0.800 163.000 0.015 0.007 Y NA
 1176440 1176441 Tcr_0246 Tcr_0247     TRUE 0.765 206.000 0.032 0.007 Y NA
 1176441 1176442 Tcr_0247 Tcr_0248     TRUE 0.978 101.000 0.232 0.007 Y NA
 1176442 1176443 Tcr_0248 Tcr_0249     FALSE 0.049 266.000 0.000 1.000 N NA
 1176443 1176444 Tcr_0249 Tcr_0250     TRUE 0.999 2.000 0.575 1.000 Y NA
 1176444 1176445 Tcr_0250 Tcr_0251     TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.007 Y NA
 1176445 1176446 Tcr_0251 Tcr_0252     TRUE 0.999 22.000 0.653 0.007 Y NA
 1176446 1176447 Tcr_0252 Tcr_0253     TRUE 1.000 4.000 0.599 0.007 Y NA
 1176447 1176448 Tcr_0253 Tcr_0254     TRUE 0.984 30.000 0.029 0.007 Y NA
 1176448 1176449 Tcr_0254 Tcr_0255     TRUE 0.972 -16.000 0.000 0.007   NA
 1176449 1176450 Tcr_0255 Tcr_0256     TRUE 0.989 -7.000 0.042 0.007   NA
 1176450 1176451 Tcr_0256 Tcr_0257     TRUE 0.993 0.000 0.114 1.000 Y NA
 1176451 1176452 Tcr_0257 Tcr_0258     TRUE 0.998 -7.000 0.150 0.062 Y NA
 1176452 1176453 Tcr_0258 Tcr_0259     TRUE 0.999 -13.000 0.811 1.000 Y NA
 1176453 1176454 Tcr_0259 Tcr_0260     TRUE 0.997 -3.000 0.649 1.000   NA
 1176455 1176456 Tcr_0261 Tcr_0262     TRUE 0.836 0.000 0.000 1.000 N NA
 1176456 1176457 Tcr_0262 Tcr_0263     TRUE 0.900 15.000 0.004 1.000   NA
 1176458 1176459 Tcr_0264 Tcr_0265     FALSE 0.158 118.000 0.000 1.000   NA
 1176459 1176460 Tcr_0265 Tcr_0266     TRUE 0.658 166.000 0.233 1.000   NA
 1176460 1176461 Tcr_0266 Tcr_0267     TRUE 0.998 21.000 0.230 0.002 Y NA
 1176461 1176462 Tcr_0267 Tcr_0268     TRUE 0.988 20.000 0.105 1.000 Y NA
 1176462 1176463 Tcr_0268 Tcr_0269     TRUE 0.960 91.000 0.293 1.000 Y NA
 1176463 1176464 Tcr_0269 Tcr_0270     FALSE 0.148 108.000 0.000 NA   NA
 1176464 1176465 Tcr_0270 Tcr_0271     TRUE 0.993 14.000 0.429 NA   NA
 1176465 1176466 Tcr_0271 Tcr_0272     FALSE 0.038 324.000 0.000 1.000   NA
 1176466 1176467 Tcr_0272 Tcr_0273     TRUE 0.987 23.000 0.125 1.000 Y NA
 1176467 1176468 Tcr_0273 Tcr_0274     TRUE 0.818 51.000 0.000 1.000 Y NA
 1176468 1176469 Tcr_0274 Tcr_0275     TRUE 0.822 12.000 0.000 1.000 N NA
 1176470 1176471 Tcr_0276 Tcr_0277     FALSE 0.148 108.000 0.000 NA   NA
 1176474 1176475 Tcr_0280 Tcr_R0001   tRNA-Tyr1 FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   NA
 1176475 1176476 Tcr_R0001 Tcr_R0002 tRNA-Tyr1 tRNA-Gly2 TRUE 0.651 23.000 0.000 NA   NA
 1176476 1176477 Tcr_R0002 Tcr_R0003 tRNA-Gly2 tRNA-Thr2 FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 1176477 1176478 Tcr_R0003 Tcr_0281 tRNA-Thr2   FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 1176478 1176479 Tcr_0281 Tcr_R0004   tRNA-Trp1 FALSE 0.234 81.000 0.000 NA   NA
 1176479 1176480 Tcr_R0004 Tcr_0282 tRNA-Trp1   FALSE 0.383 46.000 0.000 NA   NA
 1176480 1176481 Tcr_0282 Tcr_0283     TRUE 0.998 3.000 0.843 1.000 N NA
 1176481 1176482 Tcr_0283 Tcr_0284     TRUE 0.973 73.000 0.681 1.000 N NA
 1176482 1176483 Tcr_0284 Tcr_0285     TRUE 1.000 0.000 0.838 0.035 Y NA
 1176483 1176484 Tcr_0285 Tcr_0286     TRUE 0.942 178.000 0.302 0.035 Y NA
 1176484 1176485 Tcr_0286 Tcr_0287     TRUE 0.999 40.000 0.884 0.027 Y NA
 1176485 1176486 Tcr_0287 Tcr_0288     TRUE 0.593 186.000 0.223 1.000   NA
 1176486 1176487 Tcr_0288 Tcr_0289     TRUE 0.999 0.000 0.851 0.001   NA
 1176487 1176488 Tcr_0289 Tcr_0290     TRUE 0.567 139.000 0.122 1.000 N NA
 1176488 1176489 Tcr_0290 Tcr_0291     TRUE 0.997 59.000 0.620 0.005 Y NA
 1176489 1176490 Tcr_0291 Tcr_0292     TRUE 0.872 62.000 0.007 1.000 Y NA
 1176490 1176491 Tcr_0292 Tcr_0293     TRUE 0.978 35.000 0.007 0.002 Y NA
 1176491 1176492 Tcr_0293 Tcr_0294     TRUE 0.928 134.000 0.318 1.000 Y NA
 1176492 1176493 Tcr_0294 Tcr_0295     TRUE 0.991 63.000 0.307 0.035 Y NA
 1176493 1176494 Tcr_0295 Tcr_0296     TRUE 0.999 11.000 0.486 0.027 Y NA
 1176494 1176495 Tcr_0296 Tcr_0297     TRUE 1.000 -3.000 0.513 0.027 Y NA
 1176495 1176496 Tcr_0297 Tcr_0298     TRUE 1.000 12.000 0.849 0.029 Y NA
 1176496 1176497 Tcr_0298 Tcr_0299     TRUE 1.000 12.000 0.820 0.035 Y NA
 1176497 1176498 Tcr_0299 Tcr_0300     TRUE 1.000 12.000 0.769 0.035 Y NA
 1176498 1176499 Tcr_0300 Tcr_0301     TRUE 1.000 12.000 0.719 0.035 Y NA
 1176499 1176500 Tcr_0301 Tcr_0302     TRUE 1.000 15.000 0.828 0.035 Y NA
 1176500 1176501 Tcr_0302 Tcr_0303     TRUE 1.000 2.000 0.802 0.027 Y NA
 1176501 1176502 Tcr_0303 Tcr_0304     TRUE 1.000 3.000 0.828 0.027 Y NA
 1176502 1176503 Tcr_0304 Tcr_0305     TRUE 0.988 135.000 0.791 0.035 Y NA
 1176503 1176504 Tcr_0305 Tcr_0306     TRUE 1.000 11.000 0.810 0.035 Y NA
 1176504 1176505 Tcr_0306 Tcr_0307     TRUE 1.000 13.000 0.758 0.027 Y NA
 1176505 1176506 Tcr_0307 Tcr_0308     TRUE 0.999 10.000 0.309 0.027 Y NA
 1176506 1176507 Tcr_0308 Tcr_0309     TRUE 0.999 13.000 0.295 0.027 Y NA
 1176507 1176508 Tcr_0309 Tcr_0310     TRUE 1.000 13.000 0.808 0.027 Y NA
 1176508 1176509 Tcr_0310 Tcr_0311     TRUE 1.000 16.000 0.815 0.027 Y NA
 1176509 1176510 Tcr_0311 Tcr_0312     TRUE 1.000 15.000 0.814 0.035 Y NA
 1176510 1176511 Tcr_0312 Tcr_0313     TRUE 1.000 -7.000 0.789 0.035 Y NA
 1176511 1176512 Tcr_0313 Tcr_0314     TRUE 1.000 2.000 0.653 0.004 Y NA
 1176512 1176513 Tcr_0314 Tcr_0315     TRUE 0.997 3.000 0.730 1.000 N NA
 1176513 1176514 Tcr_0315 Tcr_0316     FALSE 0.435 99.000 0.011 1.000 N NA
 1176514 1176515 Tcr_0316 Tcr_0317     TRUE 0.999 21.000 0.810 0.027 Y NA
 1176515 1176516 Tcr_0317 Tcr_0318     TRUE 0.999 17.000 0.509 0.035 Y NA
 1176516 1176517 Tcr_0318 Tcr_0319     TRUE 0.989 27.000 0.549 1.000 N NA
 1176517 1176518 Tcr_0319 Tcr_0320     TRUE 0.997 18.000 0.873 1.000 N NA
 1176518 1176519 Tcr_0320 Tcr_0321     TRUE 0.842 32.000 0.000 0.027 N NA
 1176519 1176520 Tcr_0321 Tcr_0322     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1176521 1176522 Tcr_0323 Tcr_0324     FALSE 0.218 85.000 0.000 NA   NA
 1176522 1176523 Tcr_0324 Tcr_0325     FALSE 0.142 112.000 0.000 NA   NA
 1176524 1176525 Tcr_0326 Tcr_0327     FALSE 0.375 128.000 0.022 1.000 N NA
 1176525 1176526 Tcr_0327 Tcr_0328     FALSE 0.359 175.000 0.000 1.000 Y NA
 1176526 1176527 Tcr_0328 Tcr_0329     TRUE 0.990 10.000 0.103 0.013   NA
 1176527 1176528 Tcr_0329 Tcr_0330     TRUE 0.989 -7.000 0.051 0.013   NA
 1176528 1176529 Tcr_0330 Tcr_0331     TRUE 0.996 -7.000 0.500 NA   NA
 1176529 1176530 Tcr_0331 Tcr_0332     TRUE 0.594 25.000 0.000 NA   NA
 1176530 1176531 Tcr_0332 Tcr_0333     TRUE 0.999 -3.000 0.383 0.052 Y NA
 1176531 1176532 Tcr_0333 Tcr_0334     TRUE 0.999 -3.000 0.240 0.001 Y NA
 1176532 1176533 Tcr_0334 Tcr_0335     FALSE 0.153 105.000 0.000 NA   NA
 1176533 1176534 Tcr_0335 Tcr_0336     FALSE 0.033 299.000 0.000 NA   NA
 1176535 1176536 Tcr_0337 Tcr_0338     FALSE 0.022 1189.000 0.000 NA   NA
 1176539 1176540 Tcr_0341 Tcr_0342     TRUE 0.993 100.000 0.667 0.027 Y NA
 1176540 1176541 Tcr_0342 Tcr_0343     TRUE 0.770 157.000 0.335 1.000   NA
 1176541 1176542 Tcr_0343 Tcr_0344     TRUE 0.986 10.000 0.206 1.000   NA
 1176542 1176543 Tcr_0344 Tcr_0345     FALSE 0.067 208.000 0.000 1.000 N NA
 1176543 1176544 Tcr_0345 Tcr_0346     TRUE 0.939 41.000 0.000 0.013 Y NA
 1176544 1176545 Tcr_0346 Tcr_0347     FALSE 0.337 174.000 0.000 NA Y NA
 1176545 1176546 Tcr_0347 Tcr_0348     FALSE 0.298 71.000 0.000 NA N NA
 1176546 1176547 Tcr_0348 Tcr_0349     TRUE 0.485 96.000 0.031 NA   NA
 1176547 1176548 Tcr_0349 Tcr_0350     TRUE 0.461 87.000 0.012 NA   NA
 1176549 1176550 Tcr_0351 Tcr_0352     TRUE 0.949 29.000 0.184 NA N NA
 1176550 1176551 Tcr_0352 Tcr_0353     FALSE 0.160 120.000 0.000 1.000 N NA
 1176552 1176553 Tcr_0354 Tcr_0355     TRUE 1.000 2.000 0.651 0.001 Y NA
 1176553 1176554 Tcr_0355 Tcr_0356     TRUE 0.554 147.000 0.123 1.000 N NA
 1176554 1176555 Tcr_0356 Tcr_0357     TRUE 0.993 -3.000 0.310 1.000 N NA
 1176555 1176556 Tcr_0357 Tcr_0358     TRUE 0.822 7.000 0.000 1.000 N NA
 1176556 1176557 Tcr_0358 Tcr_0359     TRUE 0.818 13.000 0.000 1.000 N NA
 1176557 1176558 Tcr_0359 Tcr_0360     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.009 N NA
 1176559 1176560 Tcr_0361 Tcr_0362     FALSE 0.284 82.000 0.000 1.000 N NA
 1176560 1176561 Tcr_0362 Tcr_0363     TRUE 0.630 27.000 0.000 1.000 N NA
 1176562 1176563 Tcr_0364 Tcr_0365     FALSE 0.057 197.000 0.000 NA   NA
 1176563 1176564 Tcr_0365 Tcr_0366     FALSE 0.053 206.000 0.000 NA   NA
 1176564 1176565 Tcr_0366 Tcr_0367     FALSE 0.244 78.000 0.000 NA   NA
 1176565 1176566 Tcr_0367 Tcr_0368     FALSE 0.191 92.000 0.000 NA   NA
 1176566 1176567 Tcr_0368 Tcr_0369     FALSE 0.027 407.000 0.000 NA   NA
 1176567 1176568 Tcr_0369 Tcr_0370     FALSE 0.122 122.000 0.000 NA   NA
 1176568 1176569 Tcr_0370 Tcr_0371     FALSE 0.403 41.000 0.000 NA   NA
 1176569 1176570 Tcr_0371 Tcr_0372     FALSE 0.081 158.000 0.000 NA   NA
 1176570 1176571 Tcr_0372 Tcr_0373     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 1176571 1176572 Tcr_0373 Tcr_0374     TRUE 0.988 13.000 0.245 NA   NA
 1176573 1176574 Tcr_0375 Tcr_0376     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 1176574 1176575 Tcr_0376 Tcr_0377     TRUE 0.828 0.000 0.000 1.000   NA
 1176575 1176576 Tcr_0377 Tcr_0378     TRUE 0.957 -10.000 0.000 0.052   NA
 1176577 1176578 Tcr_0379 Tcr_0380     TRUE 0.700 71.000 0.000 0.016   NA
 1176578 1176579 Tcr_0380 Tcr_0381     FALSE 0.036 273.000 0.000 NA   NA
 1176581 1176582 Tcr_0383 Tcr_0384     TRUE 0.499 38.000 0.000 1.000 N NA
 1176582 1176583 Tcr_0384 Tcr_0385     FALSE 0.130 136.000 0.000 1.000 N NA
 1176583 1176584 Tcr_0385 Tcr_0386     TRUE 0.964 7.000 0.000 1.000 Y NA
 1176585 1176586 Tcr_0387 Tcr_0388     TRUE 0.766 70.000 0.068 1.000 N NA
 1176586 1176587 Tcr_0388 Tcr_0389     TRUE 0.994 30.000 0.229 0.063 Y NA
 1176587 1176588 Tcr_0389 Tcr_0390     TRUE 0.971 32.000 0.171 0.063 N NA
 1176589 1176590 Tcr_0391 Tcr_R0005   tRNA-Gln1 FALSE 0.103 134.000 0.000 NA   NA
 1176590 1176591 Tcr_R0005 Tcr_0392 tRNA-Gln1   FALSE 0.321 63.000 0.000 NA   NA
 1176591 1176592 Tcr_0392 Tcr_0393     FALSE 0.328 255.000 0.122 1.000 N NA
 1176592 1176593 Tcr_0393 Tcr_0394     TRUE 0.997 34.000 0.496 0.040 Y NA
 1176593 1176594 Tcr_0394 Tcr_0395     TRUE 0.929 94.000 0.184 1.000 Y NA
 1176594 1176595 Tcr_0395 Tcr_R0006   tRNA-Met2 FALSE 0.129 118.000 0.000 NA   NA
 1176596 1176597 Tcr_0396 Tcr_0397     FALSE 0.088 168.000 0.000 1.000   NA
 1176599 1176600 Tcr_0399 Tcr_0400     TRUE 0.648 25.000 0.000 1.000   NA
 1176600 1176601 Tcr_0400 Tcr_0401     TRUE 0.994 14.000 0.432 1.000   NA
 1176601 1176602 Tcr_0401 Tcr_0402     TRUE 0.979 12.000 0.145 1.000   NA
 1176602 1176603 Tcr_0402 Tcr_0403     TRUE 0.818 47.000 0.074 NA   NA
 1176603 1176604 Tcr_0403 Tcr_0404     TRUE 0.849 36.000 0.070 NA   NA
 1176605 1176606 Tcr_0405 Tcr_0406     TRUE 0.983 0.000 0.175 NA   NA
 1176607 1176608 Tcr_0407 Tcr_0408     FALSE 0.418 52.000 0.000 1.000   NA
 1176609 1176610 Tcr_0409 Tcr_0410     TRUE 0.722 49.000 0.020 1.000 N NA
 1176610 1176611 Tcr_0410 Tcr_0411     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1176612 1176613 Tcr_0412 Tcr_0413     TRUE 0.775 8.000 0.000 NA   NA
 1176615 1176616 Tcr_0415 Tcr_0416     TRUE 0.982 -3.000 0.160 NA   NA
 1176616 1176617 Tcr_0416 Tcr_0417     TRUE 0.968 -3.000 0.058 1.000 N NA
 1176617 1176618 Tcr_0417 Tcr_0418     FALSE 0.371 153.000 0.058 NA   NA
 1176618 1176619 Tcr_0418 Tcr_0419     FALSE 0.026 442.000 0.000 NA   NA
 1176621 1176622 Tcr_0421 Tcr_0422     FALSE 0.160 102.000 0.000 NA   NA
 1176622 1176623 Tcr_0422 Tcr_0423     TRUE 0.913 86.000 0.357 NA   NA
 1176623 1176624 Tcr_0423 Tcr_0424     FALSE 0.316 245.000 0.108 1.000   NA
 1176624 1176625 Tcr_0424 Tcr_0425     FALSE 0.063 216.000 0.000 1.000 N NA
 1176625 1176626 Tcr_0425 Tcr_0426     TRUE 0.986 10.000 0.000 0.027 Y NA
 1176627 1176628 Tcr_0427 Tcr_0428     TRUE 0.997 25.000 0.569 0.003 N NA
 1176628 1176629 Tcr_0428 Tcr_0429     FALSE 0.050 246.000 0.000 1.000   NA
 1176629 1176630 Tcr_0429 Tcr_0430     FALSE 0.183 106.000 0.000 1.000   NA
 1176630 1176631 Tcr_0430 Tcr_0431     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1176632 1176633 Tcr_0432 Tcr_0433     TRUE 0.996 -7.000 0.512 NA   NA
 1176633 1176634 Tcr_0433 Tcr_0434     TRUE 0.978 30.000 0.390 NA N NA
 1176634 1176635 Tcr_0434 Tcr_0435     TRUE 0.999 0.000 0.760 NA Y NA
 1176635 1176636 Tcr_0435 Tcr_0436     TRUE 0.996 5.000 0.649 NA   NA
 1176636 1176637 Tcr_0436 Tcr_0437     FALSE 0.204 88.000 0.000 NA   NA
 1176637 1176638 Tcr_0437 Tcr_0438     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1176638 1176639 Tcr_0438 Tcr_0439     TRUE 0.981 45.000 0.238 1.000 Y NA
 1176639 1176640 Tcr_0439 Tcr_0440     TRUE 0.611 62.000 0.005 1.000 N NA
 1176640 1176641 Tcr_0440 Tcr_0441     TRUE 0.934 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1176641 1176642 Tcr_0441 Tcr_0442     TRUE 0.987 11.000 0.042 1.000 Y NA
 1176642 1176643 Tcr_0442 Tcr_0443     TRUE 0.765 94.000 0.152 1.000 N NA
 1176643 1176644 Tcr_0443 Tcr_0444     TRUE 0.999 14.000 0.275 0.002 Y NA
 1176644 1176645 Tcr_0444 Tcr_0445     TRUE 0.947 44.000 0.254 1.000 N NA
 1176645 1176646 Tcr_0445 Tcr_0446     FALSE 0.102 279.000 0.004 1.000 N NA
 1176648 1176649 Tcr_0448 Tcr_0449     FALSE 0.091 154.000 0.000 NA N NA
 1176649 1176650 Tcr_0449 Tcr_0450     FALSE 0.024 521.000 0.000 NA   NA
 1176650 1176651 Tcr_0450 Tcr_0451     FALSE 0.047 219.000 0.000 NA   NA
 1176652 1176653 Tcr_0452 Tcr_0453     FALSE 0.040 305.000 0.000 1.000   NA
 1176653 1176654 Tcr_0453 Tcr_0454     TRUE 0.986 64.000 0.422 1.000 Y NA
 1176654 1176655 Tcr_0454 Tcr_0455     TRUE 0.974 0.000 0.108 NA N NA
 1176656 1176657 Tcr_0456 Tcr_0457     TRUE 0.672 22.000 0.000 NA   NA
 1176660 1176661 Tcr_0460 Tcr_0461     FALSE 0.051 245.000 0.000 1.000   NA
 1176661 1176662 Tcr_0461 Tcr_0462     TRUE 0.999 14.000 0.601 0.026 Y NA
 1176664 1176665 Tcr_0464 Tcr_0465     FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 1176665 1176666 Tcr_0465 Tcr_0466     FALSE 0.050 211.000 0.000 NA   NA
 1176666 1176667 Tcr_0466 Tcr_0467     FALSE 0.136 115.000 0.000 NA   NA
 1176667 1176668 Tcr_0467 Tcr_0468     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176668 1176669 Tcr_0468 Tcr_0469     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1176669 1176670 Tcr_0469 Tcr_0470     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1176670 1176671 Tcr_0470 Tcr_0471     TRUE 0.986 0.000 0.029 1.000 Y NA
 1176671 1176672 Tcr_0471 Tcr_0472     FALSE 0.173 97.000 0.000 NA   NA
 1176672 1176673 Tcr_0472 Tcr_0473     FALSE 0.067 176.000 0.000 NA   NA
 1176673 1176674 Tcr_0473 Tcr_0474     TRUE 0.911 66.000 0.220 1.000 N NA
 1176674 1176675 Tcr_0474 Tcr_0475     TRUE 0.995 -3.000 0.457 NA   NA
 1176675 1176676 Tcr_0475 Tcr_0476     TRUE 0.569 142.000 0.150 NA   NA
 1176676 1176677 Tcr_0476 Tcr_0477     FALSE 0.272 75.000 0.000 NA N NA
 1176679 1176680 Tcr_0479 Tcr_0480     TRUE 0.951 28.000 0.182 NA N NA
 1176680 1176681 Tcr_0480 Tcr_0481     TRUE 0.976 21.000 0.199 NA N NA
 1176681 1176682 Tcr_0481 Tcr_0482     TRUE 0.940 19.000 0.047 1.000 N NA
 1176684 1176685 Tcr_0484 Tcr_0485     TRUE 0.981 19.000 0.221 NA   NA
 1176685 1176686 Tcr_0485 Tcr_0486     TRUE 0.935 62.000 0.307 NA   NA
 1176686 1176687 Tcr_0486 Tcr_0487     FALSE 0.094 145.000 0.000 NA   NA
 1176687 1176688 Tcr_0487 Tcr_0488     FALSE 0.107 153.000 0.000 1.000   NA
 1176688 1176689 Tcr_0488 Tcr_0489     TRUE 0.873 35.000 0.000 0.003   NA
 1176689 1176690 Tcr_0489 Tcr_0490     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1176690 1176691 Tcr_0490 Tcr_0491     TRUE 0.517 30.000 0.000 NA   NA
 1176691 1176692 Tcr_0491 Tcr_0492     FALSE 0.040 249.000 0.000 NA   NA
 1176692 1176693 Tcr_0492 Tcr_0493     FALSE 0.284 197.000 0.052 1.000   NA
 1176693 1176694 Tcr_0493 Tcr_0494     TRUE 0.724 111.000 0.169 1.000   NA
 1176694 1176695 Tcr_0494 Tcr_0495     TRUE 0.955 37.000 0.254 1.000 N NA
 1176695 1176696 Tcr_0495 Tcr_0496     TRUE 0.909 39.000 0.147 1.000 N NA
 1176696 1176697 Tcr_0496 Tcr_0497     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176699 1176700 Tcr_0499 Tcr_0500     FALSE 0.382 64.000 0.000 1.000 N NA
 1176700 1176701 Tcr_0500 Tcr_0501     FALSE 0.097 165.000 0.000 1.000 N NA
 1176702 1176703 Tcr_0502 Tcr_0503     TRUE 0.988 16.000 0.000 0.003 Y NA
 1176703 1176704 Tcr_0503 Tcr_0504     FALSE 0.383 46.000 0.000 NA   NA
 1176705 1176706 Tcr_0505 Tcr_0506     TRUE 0.987 -3.000 0.046 0.016 N NA
 1176706 1176707 Tcr_0506 Tcr_0507     TRUE 0.795 59.000 0.000 1.000 Y NA
 1176707 1176708 Tcr_0507 Tcr_0508     TRUE 0.804 88.000 0.016 1.000 Y NA
 1176708 1176709 Tcr_0508 Tcr_0509     TRUE 0.971 50.000 0.181 1.000 Y NA
 1176709 1176710 Tcr_0509 Tcr_0510     TRUE 0.987 40.000 0.130 0.016 Y NA
 1176710 1176711 Tcr_0510 Tcr_0511     TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 1176711 1176712 Tcr_0511 Tcr_0512     TRUE 0.994 16.000 0.185 1.000 Y NA
 1176712 1176713 Tcr_0512 Tcr_0513     TRUE 0.938 73.000 0.121 1.000 Y NA
 1176713 1176714 Tcr_0513 Tcr_0514     FALSE 0.058 195.000 0.000 NA   NA
 1176714 1176715 Tcr_0514 Tcr_0515     TRUE 0.753 15.000 0.000 NA   NA
 1176715 1176716 Tcr_0515 Tcr_0516     FALSE 0.274 73.000 0.000 NA   NA
 1176716 1176717 Tcr_0516 Tcr_0517     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 1176717 1176718 Tcr_0517 Tcr_0518     FALSE 0.027 399.000 0.000 NA   NA
 1176718 1176719 Tcr_0518 Tcr_0519     TRUE 0.991 11.000 0.078 0.002   NA
 1176719 1176720 Tcr_0519 Tcr_0520     TRUE 0.926 22.000 0.046 1.000   NA
 1176720 1176721 Tcr_0520 Tcr_0521     TRUE 0.958 24.000 0.149 1.000   NA
 1176721 1176722 Tcr_0521 Tcr_0522     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 1176722 1176723 Tcr_0522 Tcr_0523     FALSE 0.041 245.000 0.000 NA   NA
 1176723 1176724 Tcr_0523 Tcr_0524     TRUE 0.997 10.000 0.833 NA N NA
 1176724 1176725 Tcr_0524 Tcr_0525     TRUE 0.677 24.000 0.000 1.000   NA
 1176726 1176727 Tcr_0526 Tcr_0527     FALSE 0.340 58.000 0.000 NA   NA
 1176730 1176731 Tcr_R0008 Tcr_0529 ffs   FALSE 0.031 322.000 0.000 NA   NA
 1176731 1176732 Tcr_0529 Tcr_0530     TRUE 0.993 11.000 0.411 NA   NA
 1176732 1176733 Tcr_0530 Tcr_0531     TRUE 0.993 22.000 0.604 NA   NA
 1176734 1176735 Tcr_0532 Tcr_0533     TRUE 0.965 33.000 0.074 1.000 Y NA
 1176736 1176737 Tcr_0534 Tcr_0535     TRUE 0.930 44.000 0.223 NA   NA
 1176739 1176740 Tcr_0537 Tcr_0538     TRUE 0.995 12.000 0.489 1.000   NA
 1176740 1176741 Tcr_0538 Tcr_0539     TRUE 0.997 58.000 0.511 0.002 Y NA
 1176741 1176742 Tcr_0539 Tcr_0540     TRUE 0.986 44.000 0.330 NA Y NA
 1176742 1176743 Tcr_0540 Tcr_0541     TRUE 0.971 7.000 0.104 NA N NA
 1176743 1176744 Tcr_0541 Tcr_0542     TRUE 0.999 16.000 0.453 0.028 Y NA
 1176752 1176753 Tcr_0550 Tcr_0551     TRUE 0.999 -3.000 0.535 NA Y NA
 1176753 1176754 Tcr_0551 Tcr_R0009   tRNA-Pro2 FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 1176754 1176755 Tcr_R0009 Tcr_0552 tRNA-Pro2   FALSE 0.039 251.000 0.000 NA   NA
 1176758 1176759 Tcr_0555 Tcr_0556     FALSE 0.041 246.000 0.000 NA   NA
 1176759 1176760 Tcr_0556 Tcr_0557     FALSE 0.027 392.000 0.000 NA   NA
 1176761 1176762 Tcr_R0010 Tcr_0558 rnpB   FALSE 0.028 388.000 0.000 NA   NA
 1176762 1176763 Tcr_0558 Tcr_0559     TRUE 0.996 2.000 0.635 NA   NA
 1176763 1176764 Tcr_0559 Tcr_0560     FALSE 0.356 102.000 0.002 1.000 N NA
 1176764 1176765 Tcr_0560 Tcr_0561     TRUE 0.804 57.000 0.000 1.000 Y NA
 1176765 1176766 Tcr_0561 Tcr_0562     TRUE 0.951 11.000 0.036 1.000 N NA
 1176766 1176767 Tcr_0562 Tcr_0563     TRUE 0.985 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 1176767 1176768 Tcr_0563 Tcr_0564     TRUE 1.000 14.000 0.569 0.004 Y NA
 1176768 1176769 Tcr_0564 Tcr_0565     TRUE 0.999 6.000 0.309 0.005 Y NA
 1176769 1176770 Tcr_0565 Tcr_0566     TRUE 0.997 73.000 0.647 0.005 Y NA
 1176770 1176771 Tcr_0566 Tcr_0567     TRUE 0.997 2.000 0.297 0.005 N NA
 1176771 1176772 Tcr_0567 Tcr_0568     TRUE 0.997 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1176772 1176773 Tcr_0568 Tcr_0569     TRUE 0.643 26.000 0.000 1.000 N NA
 1176773 1176774 Tcr_0569 Tcr_0570     FALSE 0.048 272.000 0.000 1.000 N NA
 1176774 1176775 Tcr_0570 Tcr_0571     FALSE 0.075 195.000 0.000 1.000 N NA
 1176775 1176776 Tcr_0571 Tcr_0572     TRUE 0.909 44.000 0.164 1.000 N NA
 1176776 1176777 Tcr_0572 Tcr_0573     TRUE 0.982 -3.000 0.134 1.000 N NA
 1176777 1176778 Tcr_0573 Tcr_0574     FALSE 0.084 179.000 0.000 1.000 N NA
 1176779 1176780 Tcr_0575 Tcr_0576     TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 1176781 1176782 Tcr_0577 Tcr_0578     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176782 1176783 Tcr_0578 Tcr_0579     FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 1176783 1176784 Tcr_0579 Tcr_0580     TRUE 0.986 72.000 0.466 1.000 Y NA
 1176784 1176785 Tcr_0580 Tcr_0581     TRUE 0.998 9.000 0.482 1.000 Y NA
 1176785 1176786 Tcr_0581 Tcr_0582     TRUE 0.830 38.000 0.049 1.000 N NA
 1176786 1176787 Tcr_0582 Tcr_0583     FALSE 0.290 70.000 0.000 NA   NA
 1176787 1176788 Tcr_0583 Tcr_0584     FALSE 0.057 196.000 0.000 NA   NA
 1176788 1176789 Tcr_0584 Tcr_0585     TRUE 0.994 29.000 0.153 0.005 Y NA
 1176789 1176790 Tcr_0585 Tcr_0586     TRUE 0.996 22.000 0.372 NA Y NA
 1176790 1176791 Tcr_0586 Tcr_0587     TRUE 0.936 75.000 0.389 NA N NA
 1176791 1176792 Tcr_0587 Tcr_0588     TRUE 0.538 72.000 0.003 1.000 N NA
 1176792 1176793 Tcr_0588 Tcr_0589     FALSE 0.092 331.000 0.005 1.000 N NA
 1176793 1176794 Tcr_0589 Tcr_0590     TRUE 0.637 111.000 0.102 1.000 N NA
 1176797 1176798 Tcr_0593 Tcr_0594     FALSE 0.184 94.000 0.000 NA   NA
 1176799 1176800 Tcr_0595 Tcr_0596     FALSE 0.323 128.000 0.010 1.000 N NA
 1176801 1176802 Tcr_0597 Tcr_0598     TRUE 0.930 1.000 0.009 1.000 N NA
 1176803 1176804 Tcr_0599 Tcr_0600     TRUE 0.560 27.000 0.000 NA   NA
 1176805 1176806 Tcr_0601 Tcr_0602     TRUE 0.676 105.000 0.136 NA   NA
 1176806 1176807 Tcr_0602 Tcr_0603     TRUE 0.806 45.000 0.062 NA   NA
 1176807 1176808 Tcr_0603 Tcr_0604     FALSE 0.386 45.000 0.000 NA   NA
 1176808 1176809 Tcr_0604 Tcr_0605     FALSE 0.078 181.000 0.000 1.000   NA
 1176810 1176811 Tcr_0606 Tcr_0607     FALSE 0.183 111.000 0.000 1.000 N NA
 1176811 1176812 Tcr_0607 Tcr_0608     FALSE 0.421 55.000 0.000 1.000 N NA
 1176812 1176813 Tcr_0608 Tcr_0609     TRUE 0.995 -3.000 0.438 1.000 N NA
 1176813 1176814 Tcr_0609 Tcr_0610     FALSE 0.158 121.000 0.000 1.000 N NA
 1176814 1176815 Tcr_0610 Tcr_0611     TRUE 0.967 6.000 0.073 1.000 N NA
 1176815 1176816 Tcr_0611 Tcr_0612     TRUE 0.469 34.000 0.000 NA   NA
 1176816 1176817 Tcr_0612 Tcr_0613     TRUE 0.455 35.000 0.000 NA   NA
 1176819 1176820 Tcr_0615 Tcr_0616     TRUE 0.936 40.000 0.208 1.000 N NA
 1176820 1176821 Tcr_0616 Tcr_0617     TRUE 0.699 159.000 0.271 NA N NA
 1176821 1176822 Tcr_0617 Tcr_0618     FALSE 0.416 39.000 0.000 NA   NA
 1176822 1176823 Tcr_0618 Tcr_0619     FALSE 0.202 156.000 0.006 NA   NA
 1176823 1176824 Tcr_0619 Tcr_0620     TRUE 0.905 43.000 0.156 1.000   NA
 1176824 1176825 Tcr_0620 Tcr_0621     TRUE 0.952 -7.000 0.020 1.000   NA
 1176825 1176826 Tcr_0621 Tcr_0622     TRUE 0.784 35.000 0.021 1.000   NA
 1176826 1176827 Tcr_0622 Tcr_0623     TRUE 0.958 35.000 0.259 1.000   NA
 1176827 1176828 Tcr_0623 Tcr_0624     TRUE 0.995 9.000 0.492 1.000   NA
 1176828 1176829 Tcr_0624 Tcr_0625     TRUE 0.988 -3.000 0.203 1.000   NA
 1176830 1176831 Tcr_0626 Tcr_0627     FALSE 0.084 179.000 0.000 1.000 N NA
 1176831 1176832 Tcr_0627 Tcr_0628     FALSE 0.086 177.000 0.000 1.000 N NA
 1176832 1176833 Tcr_0628 Tcr_0629     TRUE 0.708 147.000 0.000 0.010 Y NA
 1176833 1176834 Tcr_0629 Tcr_0630     FALSE 0.030 549.000 0.000 1.000   NA
 1176834 1176835 Tcr_0630 Tcr_0631     TRUE 0.857 29.000 0.034 1.000   NA
 1176835 1176836 Tcr_0631 Tcr_0632     TRUE 0.740 72.000 0.059 1.000 N NA
 1176837 1176838 Tcr_0633 Tcr_0634     FALSE 0.063 217.000 0.000 1.000 N NA
 1176838 1176839 Tcr_0634 Tcr_0635     TRUE 0.999 12.000 0.371 0.002 Y NA
 1176839 1176840 Tcr_0635 Tcr_0636     TRUE 0.986 52.000 0.092 0.002 Y NA
 1176840 1176841 Tcr_0636 Tcr_0637     FALSE 0.039 338.000 0.000 1.000 N NA
 1176841 1176842 Tcr_0637 Tcr_0638     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1176842 1176843 Tcr_0638 Tcr_0639     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1176843 1176844 Tcr_0639 Tcr_0640     TRUE 0.966 1.000 0.000 1.000 Y NA
 1176844 1176845 Tcr_0640 Tcr_0641     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1176845 1176846 Tcr_0641 Tcr_0642     TRUE 0.997 23.000 0.448 1.000 Y NA
 1176846 1176847 Tcr_0642 Tcr_0643     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1176847 1176848 Tcr_0643 Tcr_0644     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176848 1176849 Tcr_0644 Tcr_0645     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1176849 1176850 Tcr_0645 Tcr_0646     FALSE 0.331 60.000 0.000 NA   NA
 1176850 1176851 Tcr_0646 Tcr_0647     FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 1176851 1176852 Tcr_0647 Tcr_0648     TRUE 0.999 21.000 0.342 0.026 Y NA
 1176852 1176853 Tcr_0648 Tcr_0649     TRUE 0.999 12.000 0.672 1.000 Y NA
 1176853 1176854 Tcr_0649 Tcr_0650     TRUE 0.979 101.000 0.567 1.000 Y NA
 1176854 1176855 Tcr_0650 Tcr_0651     FALSE 0.431 103.000 0.015 1.000 N NA
 1176855 1176856 Tcr_0651 Tcr_0652     FALSE 0.408 92.000 0.003 1.000 N NA
 1176857 1176858 Tcr_0653 Tcr_0654     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1176858 1176859 Tcr_0654 Tcr_0655     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1176859 1176860 Tcr_0655 Tcr_0656     FALSE 0.099 164.000 0.000 1.000 N NA
 1176860 1176861 Tcr_0656 Tcr_0657     FALSE 0.023 692.000 0.000 NA   NA
 1176861 1176862 Tcr_0657 Tcr_0658     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1176862 1176863 Tcr_0658 Tcr_0659     FALSE 0.027 423.000 0.000 NA   NA
 1176863 1176864 Tcr_0659 Tcr_0660     FALSE 0.026 456.000 0.000 NA   NA
 1176864 1176865 Tcr_0660 Tcr_0661     TRUE 0.731 17.000 0.000 NA   NA
 1176865 1176866 Tcr_0661 Tcr_0662     TRUE 0.594 25.000 0.000 NA   NA
 1176868 1176869 Tcr_0664 Tcr_0665     TRUE 0.990 0.000 0.250 1.000   NA
 1176869 1176870 Tcr_0665 Tcr_0666     TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 1176871 1176872 Tcr_0667 Tcr_0668     FALSE 0.046 222.000 0.000 NA   NA
 1176872 1176873 Tcr_0668 Tcr_0669     FALSE 0.173 278.000 0.000 0.022   NA
 1176873 1176874 Tcr_0669 Tcr_0670     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1176874 1176875 Tcr_0670 Tcr_0671     TRUE 0.775 11.000 0.000 NA   NA
 1176875 1176876 Tcr_0671 Tcr_0672     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1176876 1176877 Tcr_0672 Tcr_0673     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1176877 1176878 Tcr_0673 Tcr_0674     FALSE 0.024 570.000 0.000 NA   NA
 1176878 1176879 Tcr_0674 Tcr_0675     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176879 1176880 Tcr_0675 Tcr_0676     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176880 1176881 Tcr_0676 Tcr_0677     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 1176881 1176882 Tcr_0677 Tcr_0678     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1176882 1176883 Tcr_0678 Tcr_0679     TRUE 0.811 9.000 0.000 1.000   NA
 1176883 1176884 Tcr_0679 Tcr_0680     TRUE 0.812 11.000 0.000 1.000   NA
 1176884 1176885 Tcr_0680 Tcr_0681     TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 1176885 1176886 Tcr_0681 Tcr_0682     TRUE 0.974 49.000 0.545 NA   NA
 1176886 1176887 Tcr_0682 Tcr_0683     FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 1176887 1176888 Tcr_0683 Tcr_0684     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176890 1176891 Tcr_0686 Tcr_0687     TRUE 0.774 9.000 0.000 NA   NA
 1176891 1176892 Tcr_0687 Tcr_0688     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176892 1176893 Tcr_0688 Tcr_0689     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1176893 1176894 Tcr_0689 Tcr_0690     TRUE 0.992 -7.000 0.292 NA   NA
 1176894 1176895 Tcr_0690 Tcr_0691     TRUE 0.763 14.000 0.000 NA   NA
 1176895 1176896 Tcr_0691 Tcr_0692     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1176896 1176897 Tcr_0692 Tcr_0693     TRUE 0.651 23.000 0.000 NA   NA
 1176899 1176900 Tcr_0695 Tcr_0696     TRUE 0.574 26.000 0.000 NA   NA
 1176900 1176901 Tcr_0696 Tcr_0697     FALSE 0.057 197.000 0.000 NA   NA
 1176901 1834796 Tcr_0697 Tcr_2202     TRUE 0.781 3.000 0.000 NA   NA
 1834796 1176902 Tcr_2202 Tcr_0698     FALSE 0.340 58.000 0.000 NA   NA
 1176902 1176903 Tcr_0698 Tcr_0699     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 1176903 1834797 Tcr_0699 Tcr_2203     TRUE 0.975 -3.000 0.105 NA   NA
 1834797 1176904 Tcr_2203 Tcr_0700     TRUE 0.994 2.000 0.400 NA   NA
 1176908 1176909 Tcr_0704 Tcr_0705     TRUE 0.968 41.000 0.389 1.000   NA
 1176911 1176912 Tcr_0707 Tcr_0708     TRUE 0.995 18.000 0.599 NA   NA
 1176912 1176913 Tcr_0708 Tcr_0709     TRUE 0.919 93.000 0.418 1.000 N NA
 1176913 1176914 Tcr_0709 Tcr_0710     TRUE 0.993 76.000 0.380 0.007 Y NA
 1176914 1176915 Tcr_0710 Tcr_0711     TRUE 0.977 87.000 0.182 0.007 Y NA
 1176915 1176916 Tcr_0711 Tcr_0712     TRUE 0.999 10.000 0.432 0.007 Y NA
 1176916 1176917 Tcr_0712 Tcr_0713     TRUE 0.960 172.000 0.321 0.007 Y NA
 1176917 1176918 Tcr_0713 Tcr_0714     TRUE 0.864 220.000 0.346 1.000 Y NA
 1176918 1176919 Tcr_0714 Tcr_0715     TRUE 0.897 54.000 0.030 0.014 N NA
 1176919 1176920 Tcr_0715 Tcr_0716     TRUE 0.992 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 1176920 1176921 Tcr_0716 Tcr_0717     TRUE 0.987 -3.000 0.204 NA   NA
 1176921 1176922 Tcr_0717 Tcr_0718     TRUE 0.546 28.000 0.000 NA   NA
 1176922 1176923 Tcr_0718 Tcr_0719     FALSE 0.266 86.000 0.000 1.000 N NA
 1176923 1176924 Tcr_0719 Tcr_0720     TRUE 0.974 30.000 0.110 NA Y NA
 1176924 1176925 Tcr_0720 Tcr_0721     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA N NA
 1176925 1176926 Tcr_0721 Tcr_0722     FALSE 0.358 132.000 0.000 0.057 N NA
 1176927 1176928 Tcr_R0011 Tcr_R0012 tRNA-His1 tRNA-Arg2 TRUE 0.532 29.000 0.000 NA   NA
 1176928 1176929 Tcr_R0012 Tcr_R0013 tRNA-Arg2 tRNA-Pro1 FALSE 0.325 62.000 0.000 NA   NA
 1176932 1176933 Tcr_0725 Tcr_0726     TRUE 0.979 65.000 0.162 0.059 Y NA
 1176937 1176938 Tcr_0730 Tcr_0731     TRUE 0.985 11.000 0.206 NA N NA
 1176938 1176939 Tcr_0731 Tcr_0732     FALSE 0.192 207.000 0.020 1.000 N NA
 1176939 1176940 Tcr_0732 Tcr_0733     TRUE 0.984 14.000 0.187 1.000 N NA
 1176940 1176941 Tcr_0733 Tcr_0734     TRUE 0.977 2.000 0.117 1.000 N NA
 1176941 1176942 Tcr_0734 Tcr_0735     TRUE 0.993 -7.000 0.127 0.037   NA
 1176942 1176943 Tcr_0735 Tcr_0736     TRUE 0.890 38.000 0.109 1.000   NA
 1176943 1176944 Tcr_0736 Tcr_0737     TRUE 0.906 46.000 0.166 1.000 N NA
 1176944 1176945 Tcr_0737 Tcr_0738     TRUE 0.992 5.000 0.326 1.000 N NA
 1176945 1176946 Tcr_0738 Tcr_0739     FALSE 0.260 87.000 0.000 1.000 N NA
 1176946 1176947 Tcr_0739 Tcr_0740     TRUE 0.984 6.000 0.023 1.000 Y NA
 1176947 1176948 Tcr_0740 Tcr_0741     TRUE 1.000 0.000 0.625 0.016 Y NA
 1176948 1176949 Tcr_0741 Tcr_0742     TRUE 0.899 79.000 0.000 0.004 Y NA
 1176949 1176950 Tcr_0742 Tcr_0743     TRUE 0.912 45.000 0.018 1.000 Y NA
 1176950 1176951 Tcr_0743 Tcr_0744     TRUE 0.998 14.000 0.205 0.016 Y NA
 1176951 1176952 Tcr_0744 Tcr_0745     TRUE 0.995 1.000 0.178 1.000 Y NA
 1176952 1176953 Tcr_0745 Tcr_0746     TRUE 0.992 -10.000 0.241 1.000 N NA
 1176953 1176954 Tcr_0746 Tcr_0747     TRUE 0.993 19.000 0.482 1.000 N NA
 1176954 1176955 Tcr_0747 Tcr_0748     TRUE 0.993 21.000 0.283 0.056 N NA
 1176955 1176956 Tcr_0748 Tcr_0749     TRUE 0.983 86.000 0.516 1.000 Y NA
 1176956 1176957 Tcr_0749 Tcr_0750     TRUE 0.942 127.000 0.341 1.000 Y NA
 1176957 1176958 Tcr_0750 Tcr_0751     TRUE 0.986 15.000 0.000 0.013 Y NA
 1176959 1176960 Tcr_0752 Tcr_0753     FALSE 0.371 50.000 0.000 NA   NA
 1176960 1176961 Tcr_0753 Tcr_0754     TRUE 0.984 31.000 0.514 NA   NA
 1176961 1176962 Tcr_0754 Tcr_0755     TRUE 0.804 57.000 0.000 1.000 Y NA
 1176962 1176963 Tcr_0755 Tcr_0756     FALSE 0.070 171.000 0.000 NA   NA
 1176964 1176965 Tcr_0757 Tcr_0758     TRUE 0.989 51.000 0.439 1.000 Y NA
 1176965 1176966 Tcr_0758 Tcr_0759     TRUE 0.757 213.000 0.227 0.019   NA
 1176969 1176970 Tcr_0762 Tcr_0763     TRUE 0.624 96.000 0.000 1.000 Y NA
 1176971 1176972 Tcr_0764 Tcr_0765     TRUE 0.951 50.000 0.305 1.000 N NA
 1176972 1176973 Tcr_0765 Tcr_0766     TRUE 0.982 10.000 0.167 1.000 N NA
 1176973 1176974 Tcr_0766 Tcr_0767     TRUE 0.947 0.000 0.033 NA N NA
 1176974 1176975 Tcr_0767 Tcr_0768     TRUE 0.622 75.000 0.033 NA N NA
 1176975 1176976 Tcr_0768 Tcr_R0014   tRNA-Ser3 FALSE 0.045 225.000 0.000 NA   NA
 1176976 1176977 Tcr_R0014 Tcr_R0015 tRNA-Ser3 tRNA-Arg3 FALSE 0.107 132.000 0.000 NA   NA
 1176977 1176978 Tcr_R0015 Tcr_0769 tRNA-Arg3   FALSE 0.036 277.000 0.000 NA   NA
 1176978 1176979 Tcr_0769 Tcr_0770     TRUE 0.750 68.000 0.000 NA Y NA
 1176979 1176980 Tcr_0770 Tcr_0771     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 1176980 1176981 Tcr_0771 Tcr_0772     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1176981 1176982 Tcr_0772 Tcr_0773     TRUE 0.991 0.000 0.302 NA   NA
 1176982 1176983 Tcr_0773 Tcr_0774     TRUE 0.969 31.000 0.318 NA   NA
 1176983 1176984 Tcr_0774 Tcr_0775     TRUE 0.738 74.000 0.000 1.000 Y NA
 1176984 1176985 Tcr_0775 Tcr_0776     FALSE 0.058 231.000 0.000 1.000 N NA
 1176988 1176989 Tcr_0779 Tcr_0780     FALSE 0.045 230.000 0.000 NA   NA
 1176989 1176990 Tcr_0780 Tcr_0781     TRUE 0.981 48.000 0.676 NA   NA
 1176990 1176991 Tcr_0781 Tcr_0782     FALSE 0.075 184.000 0.000 1.000   NA
 1176991 1176992 Tcr_0782 Tcr_0783     TRUE 0.559 31.000 0.000 1.000   NA
 1176992 1176993 Tcr_0783 Tcr_0784     TRUE 0.579 106.000 0.000 1.000 Y NA
 1176996 1176997 Tcr_0787 Tcr_0788     FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 1176997 1176998 Tcr_0788 Tcr_0789     FALSE 0.136 115.000 0.000 NA   NA
 1176998 1176999 Tcr_0789 Tcr_0790     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1177000 1177001 Tcr_0791 Tcr_0792     TRUE 0.753 15.000 0.000 NA   NA
 1177004 1177005 Tcr_0795 Tcr_0796     TRUE 1.000 3.000 0.463 0.001 Y NA
 1177005 1177006 Tcr_0796 Tcr_0797     TRUE 0.995 29.000 0.159 0.003 Y NA
 1177006 1177007 Tcr_0797 Tcr_0798     FALSE 0.263 84.000 0.000 1.000   NA
 1177007 1177008 Tcr_0798 Tcr_0799     TRUE 0.987 -78.000 0.178 NA   NA
 1177008 1177009 Tcr_0799 Tcr_0800     TRUE 0.787 11.000 0.000 NA N NA
 1177009 1177010 Tcr_0800 Tcr_0801     TRUE 0.954 6.000 0.040 1.000 N NA
 1177010 1177011 Tcr_0801 Tcr_0802     TRUE 0.976 15.000 0.139 1.000 N NA
 1177011 1177012 Tcr_0802 Tcr_0803     TRUE 0.997 42.000 0.375 0.003 Y NA
 1177012 1177013 Tcr_0803 Tcr_0804     TRUE 0.999 2.000 0.344 0.002 Y NA
 1177013 1177014 Tcr_0804 Tcr_0805     TRUE 0.918 65.000 0.232 1.000 N NA
 1177014 1177015 Tcr_0805 Tcr_0806     TRUE 0.984 26.000 0.383 1.000 N NA
 1177015 1177016 Tcr_0806 Tcr_0807     TRUE 0.924 -7.000 0.004 NA   NA
 1177016 1177017 Tcr_0807 Tcr_0808     TRUE 0.490 32.000 0.000 NA   NA
 1177017 1177018 Tcr_0808 Tcr_0809     TRUE 0.986 -10.000 0.153 1.000 N NA
 1177020 1177021 Tcr_0811 Tcr_0812     FALSE 0.400 153.000 0.066 NA N NA
 1177021 1177022 Tcr_0812 Tcr_0813     TRUE 0.947 61.000 0.325 1.000 N NA
 1177022 1177023 Tcr_0813 Tcr_0814     TRUE 0.979 24.000 0.260 1.000 N NA
 1177023 1177024 Tcr_0814 Tcr_0815     TRUE 0.924 72.000 0.082 1.000 Y NA
 1177024 1177025 Tcr_0815 Tcr_0816     TRUE 0.985 2.000 0.184 1.000 N NA
 1177025 1177026 Tcr_0816 Tcr_R0016   tRNA-Leu2 TRUE 0.722 18.000 0.000 NA   NA
 1177026 1177027 Tcr_R0016 Tcr_0817 tRNA-Leu2   FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 1177027 1177028 Tcr_0817 Tcr_0818     TRUE 1.000 -9.000 0.507 0.005 Y NA
 1177028 1177029 Tcr_0818 Tcr_0819     TRUE 0.998 25.000 0.328 0.005 Y NA
 1177029 1177030 Tcr_0819 Tcr_0820     TRUE 0.999 14.000 0.483 0.010 Y NA
 1177030 1177031 Tcr_0820 Tcr_0821     TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.010 Y NA
 1177031 1177032 Tcr_0821 Tcr_0822     TRUE 0.999 5.000 0.343 0.010 Y NA
 1177032 1177033 Tcr_0822 Tcr_0823     TRUE 0.995 54.000 0.395 0.010 Y NA
 1177033 1177034 Tcr_0823 Tcr_0824     TRUE 0.999 19.000 0.515 0.010 Y NA
 1177034 1177035 Tcr_0824 Tcr_0825     TRUE 0.999 11.000 0.500 0.047 Y NA
 1177035 1177036 Tcr_0825 Tcr_0826     TRUE 0.993 34.000 0.442 1.000 Y NA
 1177036 1177037 Tcr_0826 Tcr_0827     TRUE 1.000 0.000 0.484 0.005 Y NA
 1177037 1177038 Tcr_0827 Tcr_0828     TRUE 0.999 9.000 0.451 0.010 Y NA
 1177038 1177039 Tcr_0828 Tcr_0829     TRUE 0.994 34.000 0.175 0.004 Y NA
 1177039 1177040 Tcr_0829 Tcr_0830     TRUE 0.998 24.000 0.340 0.004 Y NA
 1177040 1177041 Tcr_0830 Tcr_0831     TRUE 0.883 69.000 0.202 NA   NA
 1177041 1177042 Tcr_0831 Tcr_R0017   tRNA-Met3 FALSE 0.224 83.000 0.000 NA   NA
 1177043 1177044 Tcr_0832 Tcr_0833     FALSE 0.131 559.000 0.000 0.012   NA
 1177045 1177046 Tcr_0834 Tcr_0835     FALSE 0.090 150.000 0.000 NA   NA
 1177046 1177047 Tcr_0835 Tcr_0836     FALSE 0.022 861.000 0.000 NA   NA
 1177049 1177050 Tcr_0838 Tcr_0839     TRUE 0.840 46.000 0.000 0.003 N NA
 1177050 1177051 Tcr_0839 Tcr_0840     FALSE 0.334 59.000 0.000 NA   NA
 1177051 1177052 Tcr_0840 Tcr_0841     TRUE 0.993 28.000 0.925 NA   NA
 1177052 1177053 Tcr_0841 Tcr_0842     TRUE 0.998 15.000 0.925 1.000   NA
 1177053 1177054 Tcr_0842 Tcr_0843     TRUE 0.999 -19.000 0.868 NA Y NA
 1177054 1177055 Tcr_0843 Tcr_0844     TRUE 0.821 39.000 0.059 NA   NA
 1177055 1177056 Tcr_0844 Tcr_0845     TRUE 0.560 27.000 0.000 NA   NA
 1177056 1177057 Tcr_0845 Tcr_0846     TRUE 0.560 27.000 0.000 NA   NA
 1177057 1177058 Tcr_0846 Tcr_0847     TRUE 0.696 59.000 0.031 NA N NA
 1177058 1177059 Tcr_0847 Tcr_0848     TRUE 0.946 -3.000 0.025 NA N NA
 1177059 1177060 Tcr_0848 Tcr_0849     FALSE 0.022 715.000 0.000 NA   NA
 1177060 1177061 Tcr_0849 Tcr_0850     TRUE 0.774 9.000 0.000 NA   NA
 1177061 1177062 Tcr_0850 Tcr_0851     TRUE 0.938 -3.000 0.018 NA   NA
 1177062 1177063 Tcr_0851 Tcr_0852     FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 1177063 1177064 Tcr_0852 Tcr_0853     FALSE 0.036 404.000 0.000 1.000 N NA
 1177064 1177065 Tcr_0853 Tcr_0854     TRUE 0.997 -3.000 0.783 NA   NA
 1177067 1177068 Tcr_0856 Tcr_0857     TRUE 0.574 26.000 0.000 NA   NA
 1177070 1177071 Tcr_0859 Tcr_0860     FALSE 0.112 133.000 0.000 NA N NA
 1177071 1177072 Tcr_0860 Tcr_0861     TRUE 0.964 0.000 0.000 NA Y NA
 1177074 1177075 Tcr_0863 Tcr_0864     FALSE 0.062 182.000 0.000 NA   NA
 1177075 1177076 Tcr_0864 Tcr_0865     TRUE 0.902 121.000 0.556 NA   NA
 1177077 1177078 Tcr_0866 Tcr_0867     TRUE 0.913 43.000 0.170 1.000 N NA
 1177079 1177080 Tcr_0868 Tcr_0869     FALSE 0.335 141.000 0.025 1.000 N NA
 1177080 1177081 Tcr_0869 Tcr_0870     TRUE 0.875 141.000 0.049 0.011 Y NA
 1177081 1177082 Tcr_0870 Tcr_0871     TRUE 0.919 233.000 0.236 0.005 Y NA
 1177082 1177083 Tcr_0871 Tcr_0872     TRUE 0.950 14.000 0.041 1.000 N NA
 1177083 1177084 Tcr_0872 Tcr_0873     FALSE 0.099 138.000 0.000 NA   NA
 1177084 1177085 Tcr_0873 Tcr_0874     FALSE 0.136 115.000 0.000 NA   NA
 1177085 1177086 Tcr_0874 Tcr_0875     TRUE 0.480 33.000 0.000 NA   NA
 1177086 1177087 Tcr_0875 Tcr_0876     FALSE 0.315 74.000 0.000 1.000   NA
 1177089 1177090 Tcr_0878 Tcr_0879     TRUE 0.999 18.000 0.345 0.001 Y NA
 1177090 1177091 Tcr_0879 Tcr_0880     TRUE 0.882 84.000 0.241 1.000 N NA
 1177091 1177092 Tcr_0880 Tcr_0881     TRUE 0.890 32.000 0.089 NA   NA
 1177092 1177093 Tcr_0881 Tcr_0882     FALSE 0.098 139.000 0.000 NA   NA
 1177093 1177094 Tcr_0882 Tcr_0883     FALSE 0.102 135.000 0.000 NA   NA
 1177094 1177095 Tcr_0883 Tcr_0884     TRUE 0.594 25.000 0.000 NA   NA
 1177095 1177096 Tcr_0884 Tcr_0885     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1177096 1177097 Tcr_0885 Tcr_0886     FALSE 0.393 58.000 0.000 1.000   NA
 1177098 1177099 Tcr_0887 Tcr_0888     TRUE 0.815 5.000 0.000 1.000   NA
 1177100 1177101 Tcr_0889 Tcr_0890     TRUE 0.609 88.000 0.057 NA   NA
 1177101 1177102 Tcr_0890 Tcr_0891     TRUE 0.780 30.000 0.006 1.000 N NA
 1177102 1177103 Tcr_0891 Tcr_0892     FALSE 0.140 131.000 0.000 1.000 N NA
 1177103 1177104 Tcr_0892 Tcr_0893     TRUE 0.999 10.000 0.451 0.017 Y NA
 1177104 1177105 Tcr_0893 Tcr_0894     TRUE 0.974 218.000 0.549 0.003 Y NA
 1177105 1177106 Tcr_0894 Tcr_0895     TRUE 0.942 -7.000 0.007 1.000 N NA
 1177106 1177107 Tcr_0895 Tcr_0896     TRUE 0.999 10.000 0.556 0.046 Y NA
 1177107 1177108 Tcr_0896 Tcr_0897     TRUE 0.995 2.000 0.460 NA   NA
 1177108 1177109 Tcr_0897 Tcr_0898     TRUE 0.946 34.000 0.215 NA   NA
 1177109 1177110 Tcr_0898 Tcr_0899     TRUE 0.976 58.000 0.592 1.000   NA
 1177110 1177111 Tcr_0899 Tcr_0900     TRUE 0.987 18.000 0.278 1.000   NA
 1177111 1177112 Tcr_0900 Tcr_0901     TRUE 0.923 0.000 0.005 1.000   NA
 1177112 1177113 Tcr_0901 Tcr_R0018   tRNA-Lys1 FALSE 0.274 73.000 0.000 NA   NA
 1177113 1177114 Tcr_R0018 Tcr_R0019 tRNA-Lys1 tRNA-Lys2 FALSE 0.376 48.000 0.000 NA   NA
 1177116 1177117 Tcr_0903 Tcr_0904     TRUE 0.775 11.000 0.000 NA   NA
 1177117 1177118 Tcr_0904 Tcr_0905     TRUE 0.630 27.000 0.000 1.000 N NA
 1177118 1177119 Tcr_0905 Tcr_0906     TRUE 0.995 37.000 0.587 1.000 Y NA
 1177119 1177120 Tcr_0906 Tcr_0907     FALSE 0.151 106.000 0.000 NA   NA
 1177121 1177122 Tcr_0908 Tcr_0909     TRUE 0.774 9.000 0.000 NA   NA
 1177122 1177123 Tcr_0909 Tcr_0910     TRUE 0.995 -10.000 0.417 NA   NA
 1177123 1177124 Tcr_0910 Tcr_0911     TRUE 0.444 36.000 0.000 NA   NA
 1177124 1177125 Tcr_0911 Tcr_0912     FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 1177125 1177126 Tcr_0912 Tcr_0913     FALSE 0.191 107.000 0.000 1.000 N NA
 1177127 1177128 Tcr_0914 Tcr_0915     FALSE 0.298 79.000 0.000 1.000 N NA
 1177128 1177129 Tcr_0915 Tcr_0916     FALSE 0.369 55.000 0.000 NA N NA
 1177129 1177130 Tcr_0916 Tcr_0917     FALSE 0.123 127.000 0.000 NA N NA
 1177130 1177131 Tcr_0917 Tcr_0918     TRUE 0.594 25.000 0.000 NA   NA
 1177132 1177133 Tcr_0919 Tcr_0920     TRUE 0.603 72.000 0.015 1.000   NA
 1177133 1177134 Tcr_0920 Tcr_0921     TRUE 0.947 81.000 0.028 0.006 Y NA
 1177135 1177136 Tcr_0922 Tcr_0923     TRUE 0.994 0.000 0.032 0.057 Y NA
 1177137 1177138 Tcr_0924 Tcr_0925     TRUE 0.815 5.000 0.000 1.000   NA
 1177138 1177139 Tcr_0925 Tcr_0926     TRUE 0.991 -7.000 0.233 1.000   NA
 1177140 1177141 Tcr_0927 Tcr_0928     TRUE 0.815 5.000 0.000 1.000   NA
 1177142 1177143 Tcr_0929 Tcr_0930     FALSE 0.415 53.000 0.000 1.000   NA
 1177145 1177146 Tcr_0932 Tcr_0933     FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 1177146 1177147 Tcr_0933 Tcr_0934     TRUE 0.944 18.000 0.059 NA   NA
 1177147 1177148 Tcr_0934 Tcr_0935     FALSE 0.231 94.000 0.000 1.000 N NA
 1177148 1177149 Tcr_0935 Tcr_0936     FALSE 0.060 187.000 0.000 NA   NA
 1177149 1177150 Tcr_0936 Tcr_0937     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 1177151 1177152 Tcr_0938 Tcr_0939     FALSE 0.023 666.000 0.000 NA   NA
 1177152 1177153 Tcr_0939 Tcr_0940     FALSE 0.029 347.000 0.000 NA   NA
 1177154 1177155 Tcr_0941 Tcr_0942     TRUE 0.517 30.000 0.000 NA   NA
 1177155 1177156 Tcr_0942 Tcr_0943     FALSE 0.200 89.000 0.000 NA   NA
 1177159 1177160 Tcr_0946 Tcr_0947     TRUE 0.998 -3.000 0.330 NA Y NA
 1177161 1177162 Tcr_0948 Tcr_0949     FALSE 0.083 156.000 0.000 NA   NA
 1177163 1177164 Tcr_0950 Tcr_0951     FALSE 0.061 183.000 0.000 NA   NA
 1177164 1177165 Tcr_0951 Tcr_0952     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 1177167 1177168 Tcr_0954 Tcr_0955     FALSE 0.271 85.000 0.000 1.000 N NA
 1177170 1177171 Tcr_0957 Tcr_0958     TRUE 0.512 35.000 0.000 1.000   NA
 1177171 1177172 Tcr_0958 Tcr_0959     TRUE 0.943 42.000 0.263 NA   NA
 1177172 1177173 Tcr_0959 Tcr_0960     TRUE 0.974 25.000 0.265 NA   NA
 1177173 1177174 Tcr_0960 Tcr_0961     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1177175 1177176 Tcr_0962 Tcr_0963     TRUE 0.825 4.000 0.000 1.000 N NA
 1177176 1177177 Tcr_0963 Tcr_0964     FALSE 0.026 452.000 0.000 NA   NA
 1177177 1177178 Tcr_0964 Tcr_0965     FALSE 0.036 273.000 0.000 NA   NA
 1177178 1177179 Tcr_0965 Tcr_0966     TRUE 0.702 20.000 0.000 NA   NA
 1177180 1177181 Tcr_0967 Tcr_0968     FALSE 0.218 97.000 0.000 1.000 N NA
 1177181 1177182 Tcr_0968 Tcr_0969     TRUE 0.999 12.000 0.591 1.000 Y NA
 1177182 1177183 Tcr_0969 Tcr_0970     FALSE 0.030 665.000 0.000 1.000 N NA
 1177184 1177185 Tcr_0971 Tcr_0972     FALSE 0.076 168.000 0.000 NA N NA
 1177185 1177186 Tcr_0972 Tcr_0973     FALSE 0.083 156.000 0.000 NA   NA
 1177186 1177187 Tcr_0973 Tcr_0974     TRUE 0.996 1.000 0.543 NA   NA
 1177187 1177188 Tcr_0974 Tcr_0975     TRUE 0.970 44.000 0.459 NA   NA
 1177188 1177189 Tcr_0975 Tcr_0976     TRUE 0.463 92.000 0.020 NA   NA
 1177189 1177190 Tcr_0976 Tcr_0977     TRUE 0.809 13.000 0.000 1.000   NA
 1177191 1177192 Tcr_0978 Tcr_0979     FALSE 0.398 97.000 0.011 NA   NA
 1177192 1177193 Tcr_0979 Tcr_0980     TRUE 0.999 -3.000 0.530 NA Y NA
 1177193 1177194 Tcr_0980 Tcr_0981     TRUE 0.976 47.000 0.562 NA   NA
 1177194 1177195 Tcr_0981 Tcr_0982     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177195 1177196 Tcr_0982 Tcr_0983     TRUE 0.776 7.000 0.000 NA   NA
 1177196 1177197 Tcr_0983 Tcr_0984     TRUE 0.818 81.000 0.174 NA   NA
 1177197 1177198 Tcr_0984 Tcr_0985     TRUE 0.989 2.000 0.236 1.000 N NA
 1177198 1177199 Tcr_0985 Tcr_0986     TRUE 0.840 47.000 0.088 NA N NA
 1177199 1177200 Tcr_0986 Tcr_0987     TRUE 0.976 4.000 0.129 NA N NA
 1177200 1177201 Tcr_0987 Tcr_0988     TRUE 0.810 75.000 0.123 1.000 N NA
 1177201 1177202 Tcr_0988 Tcr_0989     TRUE 0.982 96.000 0.254 0.006 Y NA
 1177202 1177203 Tcr_0989 Tcr_0990     FALSE 0.125 120.000 0.000 NA   NA
 1177203 1177204 Tcr_0990 Tcr_0991     FALSE 0.034 290.000 0.000 NA   NA
 1177204 1177205 Tcr_0991 Tcr_0992     TRUE 0.999 0.000 0.233 0.002 Y NA
 1177205 1177206 Tcr_0992 Tcr_0993     TRUE 1.000 1.000 0.630 0.002 Y NA
 1177206 1177207 Tcr_0993 Tcr_0994     FALSE 0.432 52.000 0.000 1.000 N NA
 1177208 1177209 Tcr_0995 Tcr_0996     TRUE 0.818 13.000 0.000 1.000 N NA
 1177209 1177210 Tcr_0996 Tcr_0997     TRUE 0.891 99.000 0.349 1.000   NA
 1177213 1177214 Tcr_1000 Tcr_1001     FALSE 0.035 430.000 0.000 1.000 N NA
 1177214 1177215 Tcr_1001 Tcr_1002     TRUE 0.835 117.000 0.009 0.041 Y NA
 1177215 1177216 Tcr_1002 Tcr_1003     TRUE 0.998 13.000 0.463 1.000 Y NA
 1177217 1177218 Tcr_1004 Tcr_1005     TRUE 0.983 4.000 0.188 NA   NA
 1177219 1177220 Tcr_1006 Tcr_1007     FALSE 0.070 170.000 0.000 NA   NA
 1177220 1177221 Tcr_1007 Tcr_1008     FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 1177221 1177222 Tcr_1008 Tcr_1009     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA N NA
 1177222 1177223 Tcr_1009 Tcr_1010     FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 1177224 1177225 Tcr_1011 Tcr_1012     FALSE 0.113 129.000 0.000 NA   NA
 1177226 1177227 Tcr_1013 Tcr_1014     FALSE 0.037 345.000 0.000 1.000   NA
 1177229 1177230 Tcr_1016 Tcr_1017     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA   NA
 1177230 1177231 Tcr_1017 Tcr_1018     FALSE 0.034 289.000 0.000 NA   NA
 1177231 1177232 Tcr_1018 Tcr_1019     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177232 1177233 Tcr_1019 Tcr_1020     FALSE 0.053 206.000 0.000 NA   NA
 1177233 1177234 Tcr_1020 Tcr_1021     FALSE 0.052 253.000 0.000 1.000 N NA
 1177234 1177235 Tcr_1021 Tcr_1022     FALSE 0.043 301.000 0.000 1.000 N NA
 1177235 1177236 Tcr_1022 Tcr_1023     TRUE 0.987 0.000 0.214 NA   NA
 1177236 1177237 Tcr_1023 Tcr_1024     FALSE 0.088 152.000 0.000 NA   NA
 1177242 1177243 Tcr_1029 Tcr_1030     FALSE 0.125 120.000 0.000 NA   NA
 1177243 1177244 Tcr_1030 Tcr_1031     TRUE 0.974 13.000 0.109 1.000 N NA
 1177244 1177245 Tcr_1031 Tcr_1032     TRUE 1.000 -7.000 0.908 0.045 Y NA
 1177245 1177246 Tcr_1032 Tcr_1033     TRUE 1.000 4.000 0.924 0.045 Y NA
 1177246 1177247 Tcr_1033 Tcr_1034     TRUE 0.997 73.000 0.814 0.045 Y NA
 1177247 1177248 Tcr_1034 Tcr_1035     TRUE 0.999 12.000 0.537 0.020 Y NA
 1177248 1177249 Tcr_1035 Tcr_1036     TRUE 1.000 -3.000 0.564 0.045 Y NA
 1177249 1177250 Tcr_1036 Tcr_1037     TRUE 0.832 32.000 0.031 1.000 N NA
 1177251 1177252 Tcr_1038 Tcr_1039     TRUE 0.722 18.000 0.000 NA   NA
 1177252 1177253 Tcr_1039 Tcr_1040     TRUE 0.991 -10.000 0.000 0.018 Y NA
 1177253 1177254 Tcr_1040 Tcr_1041     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 1177255 1177256 Tcr_1042 Tcr_1043     FALSE 0.435 114.000 0.025 1.000 N NA
 1177256 1177257 Tcr_1043 Tcr_1044     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177257 1177258 Tcr_1044 Tcr_1045     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177258 1177259 Tcr_1045 Tcr_1046     TRUE 0.981 98.000 0.230 0.004 Y NA
 1177260 1177261 Tcr_1047 Tcr_1048     TRUE 0.892 53.000 0.174 NA   NA
 1177261 1177262 Tcr_1048 Tcr_1049     FALSE 0.296 76.000 0.000 1.000   NA
 1177262 1177263 Tcr_1049 Tcr_1050     FALSE 0.229 82.000 0.000 NA   NA
 1177263 1177264 Tcr_1050 Tcr_1051     TRUE 0.774 9.000 0.000 NA   NA
 1177264 1177265 Tcr_1051 Tcr_1052     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177266 1177267 Tcr_1053 Tcr_1054     TRUE 0.537 33.000 0.000 1.000   NA
 1177267 1177268 Tcr_1054 Tcr_1055     FALSE 0.238 80.000 0.000 NA   NA
 1177270 1177271 Tcr_1057 Tcr_1058     FALSE 0.037 266.000 0.000 NA   NA
 1177274 1177275 Tcr_1061 Tcr_1062     FALSE 0.085 154.000 0.000 NA   NA
 1177275 1177276 Tcr_1062 Tcr_1063     FALSE 0.115 128.000 0.000 NA   NA
 1177276 1177277 Tcr_1063 Tcr_1064     TRUE 0.763 14.000 0.000 NA   NA
 1177277 1177278 Tcr_1064 Tcr_1065     TRUE 0.781 3.000 0.000 NA   NA
 1177282 1177283 Tcr_1069 Tcr_1070     FALSE 0.214 86.000 0.000 NA   NA
 1177284 1177285 Tcr_1071 Tcr_1072     FALSE 0.040 248.000 0.000 NA   NA
 1177285 1177286 Tcr_1072 Tcr_1073     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1177286 1177287 Tcr_1073 Tcr_1074     FALSE 0.090 150.000 0.000 NA   NA
 1177287 1177288 Tcr_1074 Tcr_1075     FALSE 0.025 507.000 0.000 NA   NA
 1177288 1177289 Tcr_1075 Tcr_1076     FALSE 0.199 100.000 0.000 1.000   NA
 1177289 1177290 Tcr_1076 Tcr_1077     FALSE 0.069 173.000 0.000 NA   NA
 1177290 1177291 Tcr_1077 Tcr_1078     FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 1177293 1177294 Tcr_1080 Tcr_1081     FALSE 0.188 108.000 0.000 1.000 N NA
 1177295 1177296 Tcr_1082 Tcr_1083     TRUE 0.675 36.000 0.004 NA   NA
 1177296 1177297 Tcr_1083 Tcr_1084     FALSE 0.152 198.000 0.004 1.000 N NA
 1177297 1177298 Tcr_1084 Tcr_1085     TRUE 0.986 1.000 0.188 1.000 N NA
 1177298 1177299 Tcr_1085 Tcr_1086     TRUE 0.844 166.000 0.531 1.000   NA
 1177299 1177300 Tcr_1086 Tcr_1087     FALSE 0.418 207.000 0.141 1.000   NA
 1177300 1177301 Tcr_1087 Tcr_1088     FALSE 0.353 68.000 0.000 1.000   NA
 1177301 1177302 Tcr_1088 Tcr_1089     TRUE 0.449 47.000 0.000 1.000 N NA
 1177302 1177303 Tcr_1089 Tcr_1090     FALSE 0.140 131.000 0.000 1.000 N NA
 1177303 1177304 Tcr_1090 Tcr_1091     TRUE 1.000 2.000 0.947 0.013 Y NA
 1177304 1177305 Tcr_1091 Tcr_1092     TRUE 0.851 116.000 0.348 NA   NA
 1177305 1177306 Tcr_1092 Tcr_1093     TRUE 0.972 11.000 0.117 NA   NA
 1177306 1177307 Tcr_1093 Tcr_1094     TRUE 0.962 24.000 0.161 1.000 N NA
 1177310 1177311 Tcr_1097 Tcr_1098     TRUE 0.517 30.000 0.000 NA   NA
 1177311 1177312 Tcr_1098 Tcr_1099     TRUE 0.981 10.000 0.180 NA   NA
 1177312 1177313 Tcr_1099 Tcr_1100     TRUE 0.981 13.000 0.011 1.000 Y NA
 1177314 1177315 Tcr_1101 Tcr_1102     FALSE 0.027 428.000 0.000 NA   NA
 1177315 1177316 Tcr_1102 Tcr_1103     FALSE 0.061 183.000 0.000 NA   NA
 1177318 1177319 Tcr_1105 Tcr_1106     TRUE 0.970 0.000 0.090 NA   NA
 1177319 1177320 Tcr_1106 Tcr_1107     TRUE 0.998 0.000 0.923 NA   NA
 1177320 1177321 Tcr_1107 Tcr_1108     FALSE 0.115 145.000 0.000 1.000   NA
 1177323 1177324 Tcr_1110 Tcr_1111     TRUE 0.444 36.000 0.000 NA   NA
 1177324 1177325 Tcr_1111 Tcr_1112     TRUE 0.996 0.000 0.596 NA   NA
 1177326 1177327 Tcr_1113 Tcr_1114     TRUE 0.446 104.000 0.020 1.000 N NA
 1177328 1177329 Tcr_1115 Tcr_1116     FALSE 0.077 192.000 0.000 1.000 N NA
 1177329 1177330 Tcr_1116 Tcr_1117     FALSE 0.062 182.000 0.000 NA   NA
 1177330 1177331 Tcr_1117 Tcr_1118     TRUE 0.998 0.000 0.826 NA   NA
 1177331 1177332 Tcr_1118 Tcr_1119     TRUE 0.778 86.000 0.138 1.000   NA
 1177332 1177333 Tcr_1119 Tcr_1120     TRUE 0.996 15.000 0.588 1.000 N NA
 1177333 1177334 Tcr_1120 Tcr_1121     FALSE 0.091 149.000 0.000 NA   NA
 1177334 1177335 Tcr_1121 Tcr_1122     TRUE 0.975 69.000 0.759 NA   NA
 1177335 1177336 Tcr_1122 Tcr_1123     TRUE 0.989 20.000 0.342 1.000 N NA
 1177336 1177337 Tcr_1123 Tcr_1124     TRUE 0.968 121.000 0.530 1.000 Y NA
 1177337 1177338 Tcr_1124 Tcr_1125     TRUE 0.991 32.000 0.318 1.000 Y NA
 1177338 1177339 Tcr_1125 Tcr_1126     TRUE 0.811 9.000 0.000 1.000   NA
 1177339 1177340 Tcr_1126 Tcr_1127     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1177340 1177341 Tcr_1127 Tcr_1128     FALSE 0.128 123.000 0.000 NA N NA
 1177341 1177342 Tcr_1128 Tcr_1129     TRUE 0.818 280.000 0.335 1.000 Y NA
 1177342 1177343 Tcr_1129 Tcr_1130     FALSE 0.191 103.000 0.000 1.000   NA
 1177343 1177344 Tcr_1130 Tcr_1131     TRUE 0.776 12.000 0.000 NA   NA
 1177346 1177347 Tcr_1133 Tcr_1134     TRUE 0.965 2.000 0.000 1.000 Y NA
 1177347 1177348 Tcr_1134 Tcr_1135     TRUE 0.822 12.000 0.000 1.000 N NA
 1177348 1177349 Tcr_1135 Tcr_1136     TRUE 1.000 -3.000 0.500 0.005 Y NA
 1177352 1177353 Tcr_1139 Tcr_1140     FALSE 0.234 81.000 0.000 NA   NA
 1177354 1177355 Tcr_1141 Tcr_1142     FALSE 0.069 206.000 0.000 1.000 N NA
 1177356 1177357 Tcr_1143 Tcr_1144     FALSE 0.226 95.000 0.000 1.000 N NA
 1177358 1177359 Tcr_1145 Tcr_1146     TRUE 0.855 90.000 0.227 1.000 N NA
 1177359 1177360 Tcr_1146 Tcr_R0020   tRNA-Gly3 FALSE 0.142 112.000 0.000 NA   NA
 1177360 1177361 Tcr_R0020 Tcr_R0021 tRNA-Gly3 tRNA-Cys1 TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177361 1177362 Tcr_R0021 Tcr_R0022 tRNA-Cys1 tRNA-Leu3 FALSE 0.357 54.000 0.000 NA   NA
 1177362 1177363 Tcr_R0022 Tcr_1147 tRNA-Leu3   FALSE 0.031 316.000 0.000 NA   NA
 1177363 1834798 Tcr_1147 Tcr_2204     FALSE 0.039 254.000 0.000 NA   NA
 1834798 1177364 Tcr_2204 Tcr_1148     FALSE 0.373 49.000 0.000 NA   NA
 1177364 1177365 Tcr_1148 Tcr_1149     FALSE 0.144 111.000 0.000 NA   NA
 1177365 1177366 Tcr_1149 Tcr_1150     FALSE 0.302 68.000 0.000 NA   NA
 1177366 1177367 Tcr_1150 Tcr_1151     TRUE 0.899 69.000 0.000 0.025 Y NA
 1177367 1177368 Tcr_1151 Tcr_1152     TRUE 0.995 8.000 0.466 NA N NA
 1177368 1177369 Tcr_1152 Tcr_1153     FALSE 0.199 283.000 0.000 NA Y NA
 1177369 1177370 Tcr_1153 Tcr_1154     TRUE 0.994 56.000 0.767 NA Y NA
 1177370 1177371 Tcr_1154 Tcr_1155     TRUE 0.997 20.000 0.219 0.096 Y NA
 1177371 1177372 Tcr_1155 Tcr_1156     TRUE 0.959 16.000 0.074 1.000   NA
 1177372 1177373 Tcr_1156 Tcr_1157     TRUE 0.872 37.000 0.000 0.002   NA
 1177373 1177374 Tcr_1157 Tcr_1158     TRUE 0.787 70.000 0.000 0.002 N NA
 1177374 1177375 Tcr_1158 Tcr_1159     TRUE 0.944 1.000 0.022 1.000 N NA
 1177375 1177376 Tcr_1159 Tcr_1160     TRUE 0.819 10.000 0.000 1.000 N NA
 1177376 1177377 Tcr_1160 Tcr_1161     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1177377 1177378 Tcr_1161 Tcr_1162     TRUE 0.858 -6.000 0.000 1.000 N NA
 1177378 1177379 Tcr_1162 Tcr_1163     TRUE 0.964 0.000 0.000 NA Y NA
 1177379 1177380 Tcr_1163 Tcr_1164     FALSE 0.088 156.000 0.000 NA N NA
 1177380 1177381 Tcr_1164 Tcr_1165     TRUE 0.967 114.000 0.466 1.000 Y NA
 1177381 1177382 Tcr_1165 Tcr_1166     TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y NA
 1177383 1177384 Tcr_1167 Tcr_1168     TRUE 0.961 7.000 0.071 NA   NA
 1177385 1177386 Tcr_1169 Tcr_1170     FALSE 0.055 201.000 0.000 NA   NA
 1177386 1177387 Tcr_1170 Tcr_1171     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1177387 1177388 Tcr_1171 Tcr_1172     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1177388 1177389 Tcr_1172 Tcr_1173     TRUE 0.999 -7.000 0.620 0.044 N NA
 1177389 1177390 Tcr_1173 Tcr_1174     TRUE 0.954 4.000 0.000 0.016   NA
 1177392 1177393 Tcr_1176 Tcr_1177     TRUE 0.886 199.000 0.351 1.000 Y NA
 1177393 1177394 Tcr_1177 Tcr_1178     TRUE 0.996 23.000 0.352 1.000 Y NA
 1177394 1177395 Tcr_1178 Tcr_1179     TRUE 0.869 145.000 0.201 1.000 Y NA
 1177395 1177396 Tcr_1179 Tcr_1180     FALSE 0.353 116.000 0.008 1.000 N NA
 1177396 1177397 Tcr_1180 Tcr_R0023   tRNA-Val2 FALSE 0.050 210.000 0.000 NA   NA
 1177397 1177398 Tcr_R0023 Tcr_R0024 tRNA-Val2 tRNA-Asp1 TRUE 0.722 18.000 0.000 NA   NA
 1177398 1177399 Tcr_R0024 Tcr_R0025 tRNA-Asp1 tRNA-Val3 FALSE 0.427 38.000 0.000 NA   NA
 1177399 1177400 Tcr_R0025 Tcr_R0026 tRNA-Val3 tRNA-Asp2 FALSE 0.416 39.000 0.000 NA   NA
 1177402 1177403 Tcr_1182 Tcr_1183     TRUE 1.000 0.000 0.619 0.029 Y NA
 1177403 1177404 Tcr_1183 Tcr_1184     TRUE 1.000 0.000 0.738 0.029 Y NA
 1177404 1177405 Tcr_1184 Tcr_1185     TRUE 0.987 11.000 0.216 1.000   NA
 1177408 1177409 Tcr_1188 Tcr_1189     TRUE 0.990 -3.000 0.098 0.040   NA
 1177409 1177410 Tcr_1189 Tcr_1190     TRUE 0.970 28.000 0.259 1.000   NA
 1177411 1177412 Tcr_1191 Tcr_1192     TRUE 0.490 131.000 0.067 1.000 N NA
 1177412 1177413 Tcr_1192 Tcr_1193     TRUE 0.962 45.000 0.121 1.000 Y NA
 1177413 1177414 Tcr_1193 Tcr_1194     TRUE 0.972 31.000 0.098 1.000 Y NA
 1177414 1177415 Tcr_1194 Tcr_1195     TRUE 0.987 28.000 0.198 1.000 Y NA
 1177415 1177416 Tcr_1195 Tcr_1196     TRUE 0.959 42.000 0.100 1.000 Y NA
 1177416 1177417 Tcr_1196 Tcr_1197     TRUE 0.987 11.000 0.209 1.000 N NA
 1177417 1177418 Tcr_1197 Tcr_1198     TRUE 0.624 207.000 0.281 1.000 N NA
 1177418 1177419 Tcr_1198 Tcr_1199     TRUE 0.825 117.000 0.292 1.000 N NA
 1177419 1177420 Tcr_1199 Tcr_1200     TRUE 0.946 33.000 0.208 NA   NA
 1177420 1177421 Tcr_1200 Tcr_1201     TRUE 0.523 74.000 0.009 NA   NA
 1177422 1177423 Tcr_1202 Tcr_1203     TRUE 0.832 44.000 0.000 1.000 Y NA
 1177423 1177424 Tcr_1203 Tcr_1204     TRUE 0.445 48.000 0.000 1.000 N NA
 1177424 1177425 Tcr_1204 Tcr_1205     TRUE 0.661 25.000 0.000 1.000 N NA
 1177427 1177428 Tcr_1207 Tcr_1208     TRUE 0.766 18.000 0.000 1.000   NA
 1177428 1177429 Tcr_1208 Tcr_1209     TRUE 0.987 18.000 0.052 0.001   NA
 1177429 1177430 Tcr_1209 Tcr_1210     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1177431 1177432 Tcr_1211 Tcr_1212     FALSE 0.244 91.000 0.000 1.000 N NA
 1177433 1177434 Tcr_1213 Tcr_1214     TRUE 0.992 0.000 0.085 1.000 Y NA
 1177434 1177435 Tcr_1214 Tcr_1215     TRUE 0.981 3.000 0.009 1.000 Y NA
 1177435 1177436 Tcr_1215 Tcr_R0027   tRNA-Glu2 FALSE 0.041 246.000 0.000 NA   NA
 1177436 1177437 Tcr_R0027 Tcr_R0028 tRNA-Glu2 tRNA-Gly1 FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 1177437 1177438 Tcr_R0028 Tcr_R0029 tRNA-Gly1 tRNA-Glu1 TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177438 1177439 Tcr_R0029 Tcr_R0030 tRNA-Glu1 tRNA-Ala4 FALSE 0.140 113.000 0.000 NA   NA
 1177439 1177440 Tcr_R0030 Tcr_1216 tRNA-Ala4   FALSE 0.076 164.000 0.000 NA   NA
 1177441 1177442 Tcr_1217 Tcr_1218     TRUE 0.835 -15.000 0.000 NA   NA
 1177443 1177444 Tcr_1219 Tcr_1220     FALSE 0.139 114.000 0.000 NA   NA
 1177445 1177446 Tcr_1221 Tcr_1222     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1177446 1177447 Tcr_1222 Tcr_1223     FALSE 0.148 128.000 0.000 1.000 N NA
 1177447 1177448 Tcr_1223 Tcr_1224     FALSE 0.095 167.000 0.000 1.000 N NA
 1177449 1177450 Tcr_1225 Tcr_1226     FALSE 0.183 97.000 0.000 NA N NA
 1177450 1177451 Tcr_1226 Tcr_1227     FALSE 0.123 121.000 0.000 NA   NA
 1177451 1177452 Tcr_1227 Tcr_1228     FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 1177452 1177453 Tcr_1228 Tcr_1229     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 1177453 1177454 Tcr_1229 Tcr_1230     TRUE 0.807 65.000 0.104 NA   NA
 1177454 1177455 Tcr_1230 Tcr_1231     TRUE 0.780 126.000 0.281 NA   NA
 1177456 1177457 Tcr_1232 Tcr_1233     TRUE 0.960 29.000 0.224 NA   NA
 1177457 1177458 Tcr_1233 Tcr_1234     FALSE 0.347 57.000 0.000 NA   NA
 1177458 1177459 Tcr_1234 Tcr_1235     TRUE 0.442 45.000 0.000 1.000   NA
 1177459 1177460 Tcr_1235 Tcr_1236     FALSE 0.272 82.000 0.000 1.000   NA
 1177460 1177461 Tcr_1236 Tcr_1237     TRUE 0.502 31.000 0.000 NA   NA
 1177462 1177463 Tcr_1238 Tcr_1239     FALSE 0.259 75.000 0.000 NA   NA
 1177463 1177464 Tcr_1239 Tcr_1240     TRUE 0.974 8.000 0.106 1.000 N NA
 1177467 1177468 Tcr_1243 Tcr_1244     FALSE 0.199 100.000 0.000 1.000   NA
 1177468 1177469 Tcr_1244 Tcr_1245     TRUE 0.517 30.000 0.000 NA   NA
 1177469 1177470 Tcr_1245 Tcr_1246     FALSE 0.379 47.000 0.000 NA   NA
 1177473 1177474 Tcr_1249 Tcr_1250     FALSE 0.200 89.000 0.000 NA   NA
 1177474 1177475 Tcr_1250 Tcr_1251     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 1177475 1177476 Tcr_1251 Tcr_1252     TRUE 0.995 15.000 0.202 1.000 Y NA
 1177478 1177479 Tcr_1254 Tcr_1255     TRUE 0.889 20.000 0.015 NA   NA
 1177479 1177480 Tcr_1255 Tcr_1256     TRUE 0.873 29.000 0.055 NA   NA
 1177480 1177481 Tcr_1256 Tcr_1257     TRUE 0.994 -3.000 0.353 1.000   NA
 1177483 1177484 Tcr_1259 Tcr_1260     TRUE 0.988 15.000 0.241 1.000 N NA
 1177484 1177485 Tcr_1260 Tcr_1261     TRUE 0.524 157.000 0.125 1.000 N NA
 1177485 1177486 Tcr_1261 Tcr_1262     TRUE 0.974 16.000 0.138 1.000 N NA
 1177486 1177487 Tcr_1262 Tcr_1263     FALSE 0.309 139.000 0.016 1.000 N NA
 1177487 1177488 Tcr_1263 Tcr_1264     TRUE 0.965 21.000 0.123 1.000 N NA
 1177488 1177489 Tcr_1264 Tcr_1265     FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 1177491 1177492 Tcr_1267 Tcr_1268     FALSE 0.043 237.000 0.000 NA   NA
 1177492 1177493 Tcr_1268 Tcr_1269     TRUE 0.974 -3.000 0.082 1.000 N NA
 1177495 1177496 Tcr_1271 Tcr_1272     FALSE 0.119 147.000 0.000 1.000 N NA
 1177496 1177497 Tcr_1272 Tcr_1273     TRUE 0.989 -7.000 0.186 1.000 N NA
 1177497 1177498 Tcr_1273 Tcr_1274     TRUE 0.988 35.000 0.289 1.000 Y NA
 1177498 1177499 Tcr_1274 Tcr_1275     TRUE 0.992 31.000 0.850 1.000 N NA
 1177499 1177500 Tcr_1275 Tcr_1276     TRUE 0.998 -7.000 0.796 1.000 N NA
 1177500 1177501 Tcr_1276 Tcr_1277     TRUE 0.999 18.000 0.814 1.000 Y NA
 1177501 1177502 Tcr_1277 Tcr_1278     TRUE 0.953 117.000 0.354 1.000 Y NA
 1177502 1177503 Tcr_1278 Tcr_1279     TRUE 0.997 -7.000 0.204 1.000 Y NA
 1177503 1177504 Tcr_1279 Tcr_1280     TRUE 0.918 0.000 0.004 1.000   NA
 1177504 1177505 Tcr_1280 Tcr_1281     TRUE 0.938 -6.000 0.007 1.000   NA
 1177505 1177506 Tcr_1281 Tcr_1282     TRUE 0.877 118.000 0.409 1.000 N NA
 1177506 1177507 Tcr_1282 Tcr_1283     TRUE 0.831 40.000 0.058 1.000 N NA
 1177507 1177508 Tcr_1283 Tcr_1284     FALSE 0.244 217.000 0.047 1.000 N NA
 1177508 1177509 Tcr_1284 Tcr_1285     TRUE 0.987 91.000 0.748 1.000 Y NA
 1177510 1177511 Tcr_1286 Tcr_1287     TRUE 0.616 28.000 0.000 1.000 N NA
 1177513 1177514 Tcr_1289 Tcr_1290     TRUE 0.711 77.000 0.061 1.000 N NA
 1177514 1177515 Tcr_1290 Tcr_1291     TRUE 0.962 36.000 0.292 1.000 N NA
 1177515 1177516 Tcr_1291 Tcr_1292     FALSE 0.042 244.000 0.000 NA   NA
 1177519 1177520 Tcr_1295 Tcr_1296     FALSE 0.422 117.000 0.025 1.000 N NA
 1177522 1177523 Tcr_1298 Tcr_1299     TRUE 1.000 11.000 0.615 0.029 Y NA
 1177523 1177524 Tcr_1299 Tcr_1300     TRUE 0.977 -3.000 0.117 NA   NA
 1177524 1177525 Tcr_1300 Tcr_1301     FALSE 0.073 167.000 0.000 NA   NA
 1177525 1177526 Tcr_1301 Tcr_1302     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 1177526 1177527 Tcr_1302 Tcr_1303     TRUE 0.722 18.000 0.000 NA   NA
 1177527 1177528 Tcr_1303 Tcr_1304     TRUE 0.734 58.000 0.000 0.029 N NA
 1177528 1177529 Tcr_1304 Tcr_1305     TRUE 0.512 35.000 0.000 1.000   NA
 1177529 1177530 Tcr_1305 Tcr_1306     FALSE 0.435 47.000 0.000 1.000   NA
 1177530 1177531 Tcr_1306 Tcr_1307     TRUE 0.690 24.000 0.000 1.000 N NA
 1177531 1177532 Tcr_1307 Tcr_1308     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177532 1177533 Tcr_1308 Tcr_1309     TRUE 0.546 28.000 0.000 NA   NA
 1177533 1177534 Tcr_1309 Tcr_1310     FALSE 0.055 201.000 0.000 NA   NA
 1177534 1177535 Tcr_1310 Tcr_1311     FALSE 0.098 139.000 0.000 NA   NA
 1177535 1177536 Tcr_1311 Tcr_1312     TRUE 0.971 6.000 0.093 1.000   NA
 1177536 1177537 Tcr_1312 Tcr_1313     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA N NA
 1177537 1177538 Tcr_1313 Tcr_1314     TRUE 0.531 71.000 0.006 NA N NA
 1177539 1177540 Tcr_1315 Tcr_1316     TRUE 0.997 0.000 0.381 0.094   NA
 1177540 1177541 Tcr_1316 Tcr_1317     TRUE 0.994 15.000 0.500 NA   NA
 1177542 1177543 Tcr_1318 Tcr_1319     FALSE 0.023 695.000 0.000 NA   NA
 1177543 1177544 Tcr_1319 Tcr_1320     FALSE 0.376 48.000 0.000 NA   NA
 1177544 1177545 Tcr_1320 Tcr_1321     FALSE 0.032 303.000 0.000 NA   NA
 1177545 1177546 Tcr_1321 Tcr_1322     FALSE 0.031 318.000 0.000 NA   NA
 1177546 1177547 Tcr_1322 Tcr_1323     FALSE 0.118 125.000 0.000 NA   NA
 1177547 1177548 Tcr_1323 Tcr_1324     FALSE 0.083 156.000 0.000 NA   NA
 1177548 1177549 Tcr_1324 Tcr_1325     TRUE 0.651 23.000 0.000 NA   NA
 1177551 1177552 Tcr_1327 Tcr_1328     TRUE 0.722 18.000 0.000 NA   NA
 1177554 1177555 Tcr_1330 Tcr_1331     TRUE 0.999 17.000 0.332 0.001 Y NA
 1177555 1177556 Tcr_1331 Tcr_1332     TRUE 0.776 132.000 0.083 NA Y NA
 1177556 1177557 Tcr_1332 Tcr_1333     TRUE 0.874 97.000 0.325 NA N NA
 1177557 1177558 Tcr_1333 Tcr_1334     TRUE 0.999 13.000 0.360 0.001 Y NA
 1177561 1177562 Tcr_1337 Tcr_1338     FALSE 0.056 239.000 0.000 1.000 N NA
 1177562 1177563 Tcr_1338 Tcr_1339     FALSE 0.063 216.000 0.000 1.000 N NA
 1177563 1177564 Tcr_1339 Tcr_1340     TRUE 0.904 21.000 0.017 1.000 N NA
 1177564 1177565 Tcr_1340 Tcr_1341     FALSE 0.272 82.000 0.000 1.000   NA
 1177566 1177567 Tcr_1342 Tcr_1343     FALSE 0.068 207.000 0.000 1.000 N NA
 1177567 1177568 Tcr_1343 Tcr_1344     TRUE 0.932 5.000 0.013 1.000 N NA
 1177568 1177569 Tcr_1344 Tcr_1345     TRUE 0.997 35.000 0.901 1.000 Y NA
 1177569 1177570 Tcr_1345 Tcr_1346     TRUE 0.998 24.000 0.786 1.000 Y NA
 1177570 1177571 Tcr_1346 Tcr_1347     TRUE 0.993 12.000 0.132 1.000 Y NA
 1177571 1177572 Tcr_1347 Tcr_1348     TRUE 0.980 -19.000 0.095 1.000   NA
 1177572 1177573 Tcr_1348 Tcr_1349     TRUE 0.982 -3.000 0.143 1.000   NA
 1177573 1177574 Tcr_1349 Tcr_1350     TRUE 0.998 -10.000 0.875 1.000   NA
 1177574 1177575 Tcr_1350 Tcr_1351     TRUE 1.000 10.000 0.750 0.001 Y NA
 1177575 1177576 Tcr_1351 Tcr_1352     TRUE 0.967 10.000 0.078 1.000 N NA
 1177578 1177579 Tcr_R0031 Tcr_R0032 tRNA-Val1 tRNA-Leu1 TRUE 0.731 17.000 0.000 NA   NA
 1177579 1177580 Tcr_R0032 Tcr_1354 tRNA-Leu1   FALSE 0.150 107.000 0.000 NA   NA
 1177580 1177581 Tcr_1354 Tcr_1355     FALSE 0.028 358.000 0.000 NA   NA
 1177581 1177582 Tcr_1355 Tcr_1356     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1177582 1177583 Tcr_1356 Tcr_1357     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1177583 1177584 Tcr_1357 Tcr_1358     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177584 1177585 Tcr_1358 Tcr_1359     TRUE 0.816 4.000 0.000 1.000   NA
 1177585 1177586 Tcr_1359 Tcr_1360     TRUE 0.553 76.000 0.010 1.000 N NA
 1177586 1177587 Tcr_1360 Tcr_1361     FALSE 0.227 292.000 0.074 1.000 N NA
 1177587 1177588 Tcr_1361 Tcr_1362     TRUE 0.766 39.000 0.034 NA   NA
 1177588 1177589 Tcr_1362 Tcr_1363     TRUE 0.790 36.000 0.034 NA   NA
 1177589 1177590 Tcr_1363 Tcr_1364     TRUE 0.999 0.000 0.319 0.022 Y NA
 1177590 1177591 Tcr_1364 Tcr_1365     FALSE 0.050 258.000 0.000 1.000 N NA
 1177591 1177592 Tcr_1365 Tcr_1366     FALSE 0.033 491.000 0.000 1.000 N NA
 1177593 1177594 Tcr_1367 Tcr_1368     TRUE 0.824 5.000 0.000 1.000 N NA
 1177595 1177596 Tcr_1369 Tcr_1370     TRUE 0.742 98.000 0.168 NA   NA
 1177598 1177599 Tcr_1372 Tcr_1373     TRUE 0.845 47.000 0.079 1.000 N NA
 1177599 1177600 Tcr_1373 Tcr_1374     TRUE 1.000 -3.000 0.806 0.001 Y NA
 1177602 1177603 Tcr_1376 Tcr_1377     FALSE 0.437 51.000 0.000 1.000 N NA
 1177603 1177604 Tcr_1377 Tcr_1378     FALSE 0.427 38.000 0.000 NA   NA
 1177604 1177605 Tcr_1378 Tcr_1379     FALSE 0.376 48.000 0.000 NA   NA
 1177605 1177606 Tcr_1379 Tcr_1380     FALSE 0.115 128.000 0.000 NA   NA
 1177608 1177609 Tcr_1382 Tcr_1383     TRUE 0.888 74.000 0.000 0.017 Y NA
 1177610 1177611 Tcr_1384 Tcr_1385     TRUE 0.832 44.000 0.000 1.000 Y NA
 1177613 1177614 Tcr_1387 Tcr_1388     FALSE 0.264 134.000 0.004 1.000 N NA
 1177614 1177615 Tcr_1388 Tcr_1389     TRUE 0.635 94.000 0.000 1.000 Y NA
 1177615 1177616 Tcr_1389 Tcr_1390     FALSE 0.201 92.000 0.000 NA N NA
 1177616 1177617 Tcr_1390 Tcr_1391     TRUE 0.784 10.000 0.000 NA N NA
 1177619 1177620 Tcr_1393 Tcr_1394     FALSE 0.151 126.000 0.000 1.000 N NA
 1177621 1177622 Tcr_1395 Tcr_1396     TRUE 0.866 86.000 0.225 1.000 N NA
 1177622 1177623 Tcr_1396 Tcr_1397     TRUE 0.992 16.000 0.347 1.000 N NA
 1177623 1177624 Tcr_1397 Tcr_1398     TRUE 0.977 59.000 0.049 0.002 Y NA
 1177624 1177625 Tcr_1398 Tcr_1399     TRUE 0.985 19.000 0.065 1.000 Y NA
 1177625 1177626 Tcr_1399 Tcr_1400     TRUE 0.998 0.000 0.456 1.000 Y NA
 1177626 1177627 Tcr_1400 Tcr_1401     TRUE 0.990 0.000 0.277 NA N NA
 1177627 1177628 Tcr_1401 Tcr_1402     TRUE 0.907 20.000 0.024 NA N NA
 1177629 1177630 Tcr_1403 Tcr_1404     TRUE 0.484 38.000 0.000 1.000   NA
 1177633 1177634 Tcr_1407 Tcr_1408     TRUE 0.914 0.000 0.006 NA   NA
 1177635 1177636 Tcr_1409 Tcr_R0033   ssrA FALSE 0.103 134.000 0.000 NA   NA
 1177636 1177637 Tcr_R0033 Tcr_1410 ssrA   FALSE 0.070 171.000 0.000 NA   NA
 1177638 1177639 Tcr_1411 Tcr_1412     FALSE 0.022 1159.000 0.000 NA   NA
 1177639 1177640 Tcr_1412 Tcr_1413     TRUE 0.793 15.000 0.000 1.000   NA
 1177640 1177641 Tcr_1413 Tcr_1414     TRUE 0.960 3.000 0.052 1.000 N NA
 1177641 1177642 Tcr_1414 Tcr_1415     TRUE 0.991 4.000 0.096 NA Y NA
 1177642 1177643 Tcr_1415 Tcr_1416     TRUE 0.991 8.000 0.096 NA Y NA
 1177643 1177644 Tcr_1416 Tcr_1417     TRUE 0.455 35.000 0.000 NA   NA
 1177645 1177646 Tcr_1418 Tcr_1419     FALSE 0.023 612.000 0.000 NA   NA
 1177646 1177647 Tcr_1419 Tcr_1420     FALSE 0.321 63.000 0.000 NA   NA
 1177647 1177648 Tcr_1420 Tcr_1421     FALSE 0.038 256.000 0.000 NA   NA
 1177648 1177649 Tcr_1421 Tcr_1422     FALSE 0.024 547.000 0.000 NA   NA
 1177649 1177650 Tcr_1422 Tcr_1423     FALSE 0.034 289.000 0.000 NA   NA
 1177650 1177651 Tcr_1423 Tcr_1424     FALSE 0.075 165.000 0.000 NA   NA
 1177653 1177654 Tcr_1426 Tcr_1427     TRUE 0.995 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 1177654 1177655 Tcr_1427 Tcr_1428     TRUE 0.984 16.000 0.208 1.000 N NA
 1177655 1177656 Tcr_1428 Tcr_1429     TRUE 0.699 153.000 0.000 0.008 Y NA
 1177658 1177659 Tcr_1431 Tcr_1432     TRUE 1.000 -7.000 0.741 0.001 Y NA
 1177659 1177660 Tcr_1432 Tcr_1433     TRUE 0.986 22.000 0.000 0.001 Y NA
 1177660 1177661 Tcr_1433 Tcr_1434     TRUE 0.846 39.000 0.000 1.000 Y NA
 1177661 1177662 Tcr_1434 Tcr_1435     TRUE 0.872 34.000 0.000 1.000 Y NA
 1177662 1177663 Tcr_1435 Tcr_1436     TRUE 0.872 80.000 0.000 0.017 Y NA
 1177663 1177664 Tcr_1436 Tcr_1437     TRUE 0.748 20.000 0.000 1.000   NA
 1177664 1177665 Tcr_1437 Tcr_1438     TRUE 0.967 80.000 0.317 0.011   NA
 1177665 1177666 Tcr_1438 Tcr_1439     TRUE 0.986 28.000 0.044 0.014 Y NA
 1177666 1177667 Tcr_1439 Tcr_1440     TRUE 0.997 14.000 0.085 0.007 Y NA
 1177667 1177668 Tcr_1440 Tcr_1441     TRUE 0.999 1.000 0.320 0.007 Y NA
 1177668 1177669 Tcr_1441 Tcr_1442     TRUE 0.998 2.000 0.189 0.011 Y NA
 1177669 1177670 Tcr_1442 Tcr_1443     TRUE 0.999 31.000 0.910 0.011 Y NA
 1177670 1177671 Tcr_1443 Tcr_1444     TRUE 0.752 204.000 0.446 1.000 N NA
 1177671 1177672 Tcr_1444 Tcr_1445     TRUE 1.000 -3.000 0.679 0.050 Y NA
 1177672 1177673 Tcr_1445 Tcr_1446     TRUE 0.999 16.000 0.377 0.050 Y NA
 1177673 1177674 Tcr_1446 Tcr_1447     FALSE 0.208 87.000 0.000 NA   NA
 1177674 1177675 Tcr_1447 Tcr_1448     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1177675 1177676 Tcr_1448 Tcr_1449     TRUE 0.974 26.000 0.000 0.004 Y NA
 1177676 1177677 Tcr_1449 Tcr_1450     FALSE 0.297 176.000 0.053 NA   NA
 1177677 1177678 Tcr_1450 Tcr_1451     TRUE 0.546 28.000 0.000 NA   NA
 1177678 1177679 Tcr_1451 Tcr_1452     TRUE 0.846 36.000 0.000 NA Y NA
 1177679 1177680 Tcr_1452 Tcr_1453     TRUE 0.716 165.000 0.000 0.002 Y NA
 1177680 1177681 Tcr_1453 Tcr_1454     FALSE 0.043 286.000 0.000 1.000   NA
 1177681 1177682 Tcr_1454 Tcr_1455     TRUE 0.886 22.000 0.013 1.000   NA
 1177682 1177683 Tcr_1455 Tcr_1456     TRUE 0.990 27.000 0.235 1.000 Y NA
 1177683 1177684 Tcr_1456 Tcr_1457     TRUE 0.994 -3.000 0.131 1.000 Y NA
 1177684 1177685 Tcr_1457 Tcr_1458     TRUE 0.999 -7.000 0.549 1.000 Y NA
 1177685 1177686 Tcr_1458 Tcr_1459     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177686 1177687 Tcr_1459 Tcr_1460     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 1177687 1177688 Tcr_1460 Tcr_1461     TRUE 0.996 -3.000 0.185 1.000 Y NA
 1177688 1177689 Tcr_1461 Tcr_1462     TRUE 0.999 -7.000 0.418 1.000 Y NA
 1177689 1177690 Tcr_1462 Tcr_1463     TRUE 0.455 35.000 0.000 NA   NA
 1177690 1177691 Tcr_1463 Tcr_1464     FALSE 0.102 135.000 0.000 NA   NA
 1177691 1177692 Tcr_1464 Tcr_1465     TRUE 0.992 22.000 0.011 0.002 Y NA
 1177692 1177693 Tcr_1465 Tcr_1466     TRUE 0.806 42.000 0.000 0.011   NA
 1177693 1177694 Tcr_1466 Tcr_1467     TRUE 0.954 11.000 0.000 0.014   NA
 1177694 1177695 Tcr_1467 Tcr_1468     TRUE 0.772 289.000 0.106 0.014 Y NA
 1177695 1177696 Tcr_1468 Tcr_1469     TRUE 0.996 46.000 0.455 0.011 Y NA
 1177696 1177697 Tcr_1469 Tcr_1470     TRUE 0.997 13.000 0.076 0.001 Y NA
 1177697 1177698 Tcr_1470 Tcr_1471     FALSE 0.201 314.000 0.000 1.000 Y NA
 1177698 1177699 Tcr_1471 Tcr_1472     TRUE 0.959 69.000 0.188 NA Y NA
 1177699 1177700 Tcr_1472 Tcr_1473     TRUE 0.960 12.000 0.000 NA Y NA
 1177700 1177701 Tcr_1473 Tcr_1474     TRUE 0.989 3.000 0.000 0.006 Y NA
 1177701 1177702 Tcr_1474 Tcr_1475     FALSE 0.026 431.000 0.000 NA   NA
 1177702 1177703 Tcr_1475 Tcr_1476     TRUE 0.560 27.000 0.000 NA   NA
 1177704 1177705 Tcr_1477 Tcr_1478     TRUE 0.720 112.000 0.021 NA Y NA
 1177705 1177706 Tcr_1478 Tcr_1479     TRUE 0.975 25.000 0.062 0.004   NA
 1177706 1177707 Tcr_1479 Tcr_1480     FALSE 0.111 130.000 0.000 NA   NA
 1177708 1177709 Tcr_1481 Tcr_1482     FALSE 0.391 44.000 0.000 NA   NA
 1177709 1177710 Tcr_1482 Tcr_1483     FALSE 0.033 294.000 0.000 NA   NA
 1177710 1177711 Tcr_1483 Tcr_1484     FALSE 0.127 119.000 0.000 NA   NA
 1177711 1177712 Tcr_1484 Tcr_1485     TRUE 0.781 3.000 0.000 NA   NA
 1177712 1177713 Tcr_1485 Tcr_1486     FALSE 0.078 190.000 0.000 1.000 N NA
 1177713 1177714 Tcr_1486 Tcr_1487     FALSE 0.079 185.000 0.000 1.000 N NA
 1177716 1177717 Tcr_1489 Tcr_1490     TRUE 0.993 -3.000 0.147 0.023 N NA
 1177717 1177718 Tcr_1490 Tcr_1491     FALSE 0.051 256.000 0.000 1.000 N NA
 1177720 1177721 Tcr_1493 Tcr_1494     FALSE 0.194 94.000 0.000 NA N NA
 1177722 1177723 Tcr_1495 Tcr_1496     TRUE 0.442 89.000 0.004 1.000 N NA
 1177724 1177725 Tcr_1497 Tcr_1498     FALSE 0.340 58.000 0.000 NA   NA
 1177726 1177727 Tcr_1499 Tcr_1500     TRUE 0.709 51.000 0.017 1.000 N NA
 1177729 1177730 Tcr_1502 Tcr_1503     FALSE 0.042 312.000 0.000 1.000 N NA
 1177730 1177731 Tcr_1503 Tcr_1504     TRUE 0.858 20.000 0.003 NA N NA
 1177732 1177733 Tcr_R0034 Tcr_R0035     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1177733 1177734 Tcr_R0035 Tcr_R0036   tRNA-Ala3 FALSE 0.025 477.000 0.000 NA   NA
 1177734 1177735 Tcr_R0036 Tcr_R0037 tRNA-Ala3 tRNA-Ile3 FALSE 0.267 74.000 0.000 NA   NA
 1177735 1177736 Tcr_R0037 Tcr_R0038 tRNA-Ile3   FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 1177736 1177737 Tcr_R0038 Tcr_1505     FALSE 0.025 463.000 0.000 NA   NA
 1177737 1177738 Tcr_1505 Tcr_1506     TRUE 0.991 1.000 0.296 NA   NA
 1177738 1177739 Tcr_1506 Tcr_1507     TRUE 0.994 5.000 0.417 NA N NA
 1177741 1177742 Tcr_1509 Tcr_1510     TRUE 0.967 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1177742 1177743 Tcr_1510 Tcr_1511     TRUE 0.827 40.000 0.000 NA Y NA
 1177743 1177744 Tcr_1511 Tcr_1512     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177744 1177745 Tcr_1512 Tcr_1513     TRUE 0.986 -3.000 0.200 NA   NA
 1177745 1177746 Tcr_1513 Tcr_1514     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1177746 1177747 Tcr_1514 Tcr_1515     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 1177747 1177748 Tcr_1515 Tcr_1516     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177748 1177749 Tcr_1516 Tcr_1517     TRUE 0.982 0.000 0.009 1.000 Y NA
 1177750 1177751 Tcr_1518 Tcr_1519     TRUE 0.925 2.000 0.009 1.000   NA
 1177751 1177752 Tcr_1519 Tcr_1520     TRUE 0.960 -13.000 0.000 0.050 N NA
 1177752 1177753 Tcr_1520 Tcr_1521     FALSE 0.153 124.000 0.000 1.000 N NA
 1177753 1177754 Tcr_1521 Tcr_1522     FALSE 0.136 133.000 0.000 1.000 N NA
 1177755 1177756 Tcr_1523 Tcr_1524     TRUE 0.989 0.000 0.051 1.000 Y NA
 1177756 1177757 Tcr_1524 Tcr_1525     FALSE 0.203 102.000 0.000 1.000 N NA
 1177757 1177758 Tcr_1525 Tcr_1526     TRUE 0.999 5.000 0.395 0.001 Y NA
 1177758 1177759 Tcr_1526 Tcr_1527     TRUE 0.993 0.000 0.117 1.000 Y NA
 1177759 1177760 Tcr_1527 Tcr_1528     TRUE 0.988 10.000 0.234 1.000 N NA
 1177761 1177762 Tcr_1529 Tcr_1530     FALSE 0.062 192.000 0.000 NA N NA
 1177762 1177763 Tcr_1530 Tcr_1531     FALSE 0.043 296.000 0.000 1.000 N NA
 1177763 1177764 Tcr_1531 Tcr_1532     TRUE 0.826 3.000 0.000 1.000 N NA
 1177765 1177766 Tcr_1533 Tcr_1534     FALSE 0.030 340.000 0.000 NA   NA
 1177766 1177767 Tcr_1534 Tcr_1535     FALSE 0.251 76.000 0.000 NA   NA
 1177767 1177768 Tcr_1535 Tcr_1536     TRUE 0.594 25.000 0.000 NA   NA
 1177768 1177769 Tcr_1536 Tcr_1537     FALSE 0.046 266.000 0.000 1.000   NA
 1177769 1177770 Tcr_1537 Tcr_1538     TRUE 0.585 97.000 0.055 1.000   NA
 1177772 1177773 Tcr_1540 Tcr_1541     FALSE 0.142 112.000 0.000 NA   NA
 1177773 1177774 Tcr_1541 Tcr_1542     FALSE 0.382 64.000 0.000 1.000 N NA
 1177774 1177775 Tcr_1542 Tcr_1543     TRUE 0.972 1.000 0.088 1.000   NA
 1177775 1177776 Tcr_1543 Tcr_1544     TRUE 0.465 40.000 0.000 1.000   NA
 1177776 1177777 Tcr_1544 Tcr_1545     FALSE 0.107 153.000 0.000 1.000   NA
 1177777 1177778 Tcr_1545 Tcr_1546     FALSE 0.174 115.000 0.000 1.000 N NA
 1177778 1177779 Tcr_1546 Tcr_1547     TRUE 0.499 38.000 0.000 1.000 N NA
 1177781 1177782 Tcr_1549 Tcr_1550     FALSE 0.267 229.000 0.000 1.000 Y NA
 1177782 1177783 Tcr_1550 Tcr_1551     FALSE 0.274 73.000 0.000 NA   NA
 1177783 1177784 Tcr_1551 Tcr_1552     TRUE 0.778 5.000 0.000 NA   NA
 1177785 1177786 Tcr_1553 Tcr_1554     TRUE 0.815 42.000 0.050 1.000 N NA
 1177787 1177788 Tcr_1555 Tcr_1556     FALSE 0.095 142.000 0.000 NA   NA
 1177788 1177789 Tcr_1556 Tcr_1557     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177789 1177790 Tcr_1557 Tcr_1558     TRUE 1.000 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 1177790 1177791 Tcr_1558 Tcr_1559     TRUE 0.994 12.000 0.396 1.000 N NA
 1177791 1177792 Tcr_1559 Tcr_1560     TRUE 0.992 0.000 0.329 NA   NA
 1177793 1177794 Tcr_1561 Tcr_1562     FALSE 0.119 377.000 0.034 NA   NA
 1177796 1177797 Tcr_1564 Tcr_1565     FALSE 0.305 75.000 0.000 1.000   NA
 1177797 1177798 Tcr_1565 Tcr_1566     TRUE 0.731 17.000 0.000 NA   NA
 1177798 1177799 Tcr_1566 Tcr_1567     FALSE 0.103 134.000 0.000 NA   NA
 1177799 1177800 Tcr_1567 Tcr_1568     FALSE 0.065 177.000 0.000 NA   NA
 1177800 1177801 Tcr_1568 Tcr_1569     FALSE 0.318 75.000 0.000 1.000 N NA
 1177801 1177802 Tcr_1569 Tcr_1570     FALSE 0.318 75.000 0.000 1.000 N NA
 1177802 1177803 Tcr_1570 Tcr_1571     FALSE 0.367 51.000 0.000 NA   NA
 1177803 1177804 Tcr_1571 Tcr_1572     FALSE 0.127 119.000 0.000 NA   NA
 1177804 1177805 Tcr_1572 Tcr_1573     FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 1177805 1177806 Tcr_1573 Tcr_1574     TRUE 0.996 39.000 0.800 0.003 N NA
 1177806 1177807 Tcr_1574 Tcr_1575     FALSE 0.381 61.000 0.000 1.000   NA
 1177807 1177808 Tcr_1575 Tcr_1576     TRUE 0.494 37.000 0.000 1.000   NA
 1177808 1177809 Tcr_1576 Tcr_1577     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1177809 1177810 Tcr_1577 Tcr_1578     FALSE 0.023 626.000 0.000 NA   NA
 1177810 1177811 Tcr_1578 Tcr_1579     FALSE 0.023 596.000 0.000 NA   NA
 1177812 1177813 Tcr_1580 Tcr_1581     FALSE 0.373 66.000 0.000 1.000 N NA
 1177814 1177815 Tcr_1582 Tcr_1583     FALSE 0.208 100.000 0.000 1.000 N NA
 1177815 1177816 Tcr_1583 Tcr_1584     FALSE 0.087 176.000 0.000 1.000 N NA
 1177816 1177817 Tcr_1584 Tcr_1585     TRUE 0.920 24.000 0.000 NA Y NA
 1177817 1177818 Tcr_1585 Tcr_1586     FALSE 0.031 350.000 0.000 NA N NA
 1177818 1177819 Tcr_1586 Tcr_1587     TRUE 0.999 15.000 0.913 1.000 Y NA
 1177820 1177821 Tcr_R0039 Tcr_1588 tRNA-Ser2   FALSE 0.134 116.000 0.000 NA   NA
 1177821 1177822 Tcr_1588 Tcr_1589     FALSE 0.377 179.000 0.079 1.000 N NA
 1177822 1177823 Tcr_1589 Tcr_1590     FALSE 0.254 241.000 0.065 1.000 N NA
 1177823 1177824 Tcr_1590 Tcr_1591     TRUE 0.556 123.000 0.085 1.000   NA
 1177824 1177825 Tcr_1591 Tcr_1592     TRUE 0.959 38.000 0.296 1.000   NA
 1177825 1177826 Tcr_1592 Tcr_1593     FALSE 0.266 232.000 0.082 NA   NA
 1177827 1177828 Tcr_1594 Tcr_1595     TRUE 0.616 28.000 0.000 1.000 N NA
 1177828 1177829 Tcr_1595 Tcr_1596     TRUE 0.775 8.000 0.000 NA   NA
 1177829 1177830 Tcr_1596 Tcr_1597     FALSE 0.036 273.000 0.000 NA   NA
 1177830 1177831 Tcr_1597 Tcr_1598     TRUE 0.465 40.000 0.000 1.000   NA
 1177832 1177833 Tcr_1599 Tcr_1600     TRUE 0.548 32.000 0.000 1.000   NA
 1177834 1177835 Tcr_1601 Tcr_1602     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 1177835 1177836 Tcr_1602 Tcr_1603     FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 1177836 1177837 Tcr_1603 Tcr_1604     TRUE 0.828 0.000 0.000 1.000   NA
 1177837 1177838 Tcr_1604 Tcr_1605     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 1177840 1177841 Tcr_1607 Tcr_1608     FALSE 0.315 74.000 0.000 1.000   NA
 1177842 1177843 Tcr_1609 Tcr_1610     FALSE 0.062 212.000 0.000 1.000   NA
 1177843 1177844 Tcr_1610 Tcr_1611     FALSE 0.061 183.000 0.000 NA   NA
 1177844 1177845 Tcr_1611 Tcr_1612     TRUE 0.469 34.000 0.000 NA   NA
 1177845 1177846 Tcr_1612 Tcr_1613     TRUE 0.963 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1177846 1177847 Tcr_1613 Tcr_1614     FALSE 0.163 119.000 0.000 1.000 N NA
 1177847 1177848 Tcr_1614 Tcr_1615     TRUE 0.872 70.000 0.019 1.000 Y NA
 1177848 1177849 Tcr_1615 Tcr_1616     TRUE 0.991 66.000 0.190 0.001 Y NA
 1177852 1177853 Tcr_1619 Tcr_1620     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177855 1177856 Tcr_1622 Tcr_1623     TRUE 0.999 29.000 1.000 0.041 Y NA
 1177856 1177857 Tcr_1623 Tcr_1624     TRUE 0.954 -7.000 0.000 0.090 N NA
 1177857 1177858 Tcr_1624 Tcr_1625     FALSE 0.180 108.000 0.000 1.000   NA
 1177859 1177860 Tcr_1626 Tcr_1627     FALSE 0.076 194.000 0.000 1.000 N NA
 1177860 1177861 Tcr_1627 Tcr_1628     TRUE 0.999 16.000 0.492 0.002 Y NA
 1177861 1177862 Tcr_1628 Tcr_1629     TRUE 1.000 20.000 0.643 0.002 Y NA
 1177863 1177864 Tcr_1630 Tcr_1631     TRUE 0.981 58.000 0.689 1.000 N NA
 1177864 1177865 Tcr_1631 Tcr_1632     TRUE 1.000 -10.000 0.550 0.003 Y NA
 1177865 1177866 Tcr_1632 Tcr_1633     TRUE 0.982 0.000 0.006 1.000 Y NA
 1177866 1177867 Tcr_1633 Tcr_1634     TRUE 0.867 -10.000 0.000 1.000 N NA
 1177867 1177868 Tcr_1634 Tcr_1635     FALSE 0.240 142.000 0.003 1.000 N NA
 1177868 1177869 Tcr_1635 Tcr_1636     TRUE 0.977 15.000 0.143 1.000 N NA
 1177869 1177870 Tcr_1636 Tcr_1637     TRUE 0.964 22.000 0.155 NA   NA
 1177870 1177871 Tcr_1637 Tcr_1638     TRUE 0.978 21.000 0.219 NA   NA
 1177871 1177872 Tcr_1638 Tcr_1639     TRUE 0.989 97.000 0.319 0.001 Y NA
 1177872 1177873 Tcr_1639 Tcr_1640     FALSE 0.272 116.000 0.003 NA   NA
 1177873 1177874 Tcr_1640 Tcr_1641     FALSE 0.043 235.000 0.000 NA   NA
 1177874 1177875 Tcr_1641 Tcr_1642     TRUE 0.912 54.000 0.000 0.042 Y NA
 1177878 1177879 Tcr_1645 Tcr_1646     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1177879 1177880 Tcr_1646 Tcr_1647     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 1177880 1177881 Tcr_1647 Tcr_1648     TRUE 0.560 27.000 0.000 NA   NA
 1177883 1177884 Tcr_1650 Tcr_1651     FALSE 0.122 122.000 0.000 NA   NA
 1177884 1177885 Tcr_1651 Tcr_1652     FALSE 0.111 130.000 0.000 NA   NA
 1177885 1177886 Tcr_1652 Tcr_1653     TRUE 0.997 2.000 0.642 NA   NA
 1177887 1177888 Tcr_1654 Tcr_1655     FALSE 0.399 97.000 0.006 1.000   NA
 1177888 1177889 Tcr_1655 Tcr_1656     TRUE 0.979 43.000 0.561 1.000   NA
 1177889 1177890 Tcr_1656 Tcr_1657     TRUE 0.985 6.000 0.197 1.000 N NA
 1177890 1177891 Tcr_1657 Tcr_1658     TRUE 0.943 5.000 0.025 1.000   NA
 1177891 1177892 Tcr_1658 Tcr_1659     TRUE 0.775 8.000 0.000 NA   NA
 1177893 1177894 Tcr_1660 Tcr_1661     TRUE 0.997 -13.000 0.535 1.000 N NA
 1177894 1177895 Tcr_1661 Tcr_1662     TRUE 0.893 72.000 0.208 1.000 N NA
 1177895 1177896 Tcr_1662 Tcr_1663     TRUE 0.999 25.000 0.574 0.001 Y NA
 1177896 1177897 Tcr_1663 Tcr_1664     TRUE 0.702 281.000 0.202 1.000 Y NA
 1177897 1177898 Tcr_1664 Tcr_1665     TRUE 1.000 13.000 0.928 0.022 Y NA
 1177898 1177899 Tcr_1665 Tcr_1666     TRUE 0.931 223.000 0.652 1.000 Y NA
 1177899 1177900 Tcr_1666 Tcr_1667     TRUE 0.723 243.000 0.186 1.000 Y NA
 1177900 1177901 Tcr_1667 Tcr_1668     FALSE 0.043 246.000 0.000 NA N NA
 1177901 1177902 Tcr_1668 Tcr_1669     FALSE 0.104 139.000 0.000 NA N NA
 1177902 1177903 Tcr_1669 Tcr_1670     TRUE 0.961 3.000 0.000 NA Y NA
 1177905 1177906 Tcr_1672 Tcr_1673     FALSE 0.347 69.000 0.000 1.000   NA
 1177906 1177907 Tcr_1673 Tcr_1674     FALSE 0.054 234.000 0.000 1.000   NA
 1177909 1177910 Tcr_1676 Tcr_1677     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1177910 1177911 Tcr_1677 Tcr_1678     TRUE 0.960 -10.000 0.027 1.000 N NA
 1177911 1177912 Tcr_1678 Tcr_1679     TRUE 0.973 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 1177912 1177913 Tcr_1679 Tcr_1680     TRUE 1.000 -22.000 0.444 0.003 Y NA
 1177913 1177914 Tcr_1680 Tcr_1681     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1177914 1177915 Tcr_1681 Tcr_1682     TRUE 0.971 -10.000 0.000 NA Y NA
 1177915 1177916 Tcr_1682 Tcr_1683     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177916 1177917 Tcr_1683 Tcr_1684     TRUE 0.784 2.000 0.000 NA   NA
 1177917 1177918 Tcr_1684 Tcr_1685     TRUE 0.835 -16.000 0.000 NA   NA
 1177918 1177919 Tcr_1685 Tcr_1686     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1177919 1177920 Tcr_1686 Tcr_1687     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1177920 1177921 Tcr_1687 Tcr_1688     TRUE 0.967 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1177921 1177922 Tcr_1688 Tcr_1689     TRUE 0.998 -13.000 0.247 1.000 Y NA
 1177922 1177923 Tcr_1689 Tcr_1690     TRUE 0.999 4.000 0.624 1.000 Y NA
 1177923 1177924 Tcr_1690 Tcr_1691     TRUE 0.866 29.000 0.038 1.000 N NA
 1177924 1177925 Tcr_1691 Tcr_1692     TRUE 0.828 2.000 0.000 1.000 N NA
 1177925 1177926 Tcr_1692 Tcr_1693     FALSE 0.057 222.000 0.000 1.000   NA
 1177927 1177928 Tcr_1694 Tcr_1695     TRUE 0.981 3.000 0.172 NA   NA
 1177929 1177930 Tcr_1696 Tcr_1697     TRUE 0.541 34.000 0.000 1.000 N NA
 1177930 1177931 Tcr_1697 Tcr_1698     TRUE 0.974 -3.000 0.098 NA   NA
 1177931 1177932 Tcr_1698 Tcr_1699     FALSE 0.107 132.000 0.000 NA   NA
 1177932 1177933 Tcr_1699 Tcr_1700     FALSE 0.155 119.000 0.000 1.000   NA
 1177933 1177934 Tcr_1700 Tcr_1701     TRUE 0.776 12.000 0.000 NA   NA
 1177934 1177935 Tcr_1701 Tcr_1702     TRUE 0.753 15.000 0.000 NA   NA
 1177935 1177936 Tcr_1702 Tcr_1703     FALSE 0.097 148.000 0.000 NA N NA
 1177936 1177937 Tcr_1703 Tcr_1704     TRUE 0.998 -3.000 0.857 NA N NA
 1177939 1177940 Tcr_1706 Tcr_1707     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1177941 1177942 Tcr_1708 Tcr_1709     FALSE 0.045 288.000 0.000 1.000 N NA
 1177942 1177943 Tcr_1709 Tcr_1710     TRUE 0.998 -3.000 0.099 0.001 Y NA
 1177943 1177944 Tcr_1710 Tcr_1711     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 1177944 1177945 Tcr_1711 Tcr_1712     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1177945 1177946 Tcr_1712 Tcr_1713     FALSE 0.290 70.000 0.000 NA   NA
 1177946 1177947 Tcr_1713 Tcr_1714     FALSE 0.145 129.000 0.000 1.000 N NA
 1177948 1177949 Tcr_1715 Tcr_1716     FALSE 0.057 222.000 0.000 1.000   NA
 1177950 1177951 Tcr_1717 Tcr_1718     TRUE 0.932 7.000 0.013 1.000 N NA
 1177951 1177952 Tcr_1718 Tcr_1719     TRUE 0.979 21.000 0.034 0.004 N NA
 1177953 1177954 Tcr_R0040 Tcr_1720 tRNA-Ser1   FALSE 0.305 67.000 0.000 NA   NA
 1177954 1177955 Tcr_1720 Tcr_1721     FALSE 0.353 68.000 0.000 1.000   NA
 1177955 1177956 Tcr_1721 Tcr_1722     TRUE 0.812 11.000 0.000 1.000   NA
 1177956 1177957 Tcr_1722 Tcr_1723     TRUE 0.967 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1177957 1177958 Tcr_1723 Tcr_1724     TRUE 0.989 0.000 0.000 0.013 Y NA
 1177958 1177959 Tcr_1724 Tcr_1725     TRUE 0.966 1.000 0.000 1.000 Y NA
 1177959 1177960 Tcr_1725 Tcr_1726     TRUE 0.955 17.000 0.000 1.000 Y NA
 1177960 1177961 Tcr_1726 Tcr_1727     TRUE 0.970 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1177961 1177962 Tcr_1727 Tcr_1728     TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 1177962 1177963 Tcr_1728 Tcr_1729     TRUE 0.469 34.000 0.000 NA   NA
 1177963 1177964 Tcr_1729 Tcr_1730     TRUE 0.793 0.000 0.000 NA   NA
 1177964 1177965 Tcr_1730 Tcr_1731     FALSE 0.029 356.000 0.000 NA   NA
 1177966 1177967 Tcr_1732 Tcr_1733     TRUE 0.994 23.000 0.040 0.001 Y NA
 1177967 1177968 Tcr_1733 Tcr_1734     TRUE 0.999 19.000 0.312 0.002 Y NA
 1177969 1177970 Tcr_1735 Tcr_1736     FALSE 0.398 42.000 0.000 NA   NA
 1177970 1177971 Tcr_1736 Tcr_1737     TRUE 0.824 -7.000 0.000 NA   NA
 1177971 1177972 Tcr_1737 Tcr_1738     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1177972 1177973 Tcr_1738 Tcr_1739     TRUE 0.984 52.000 0.831 NA   NA
 1177973 1177974 Tcr_1739 Tcr_1740     FALSE 0.063 191.000 0.000 NA N NA
 1177974 1177975 Tcr_1740 Tcr_1741     TRUE 0.994 18.000 0.082 0.050 Y NA
 1177976 1177977 Tcr_1742 Tcr_1743     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1177977 1177978 Tcr_1743 Tcr_1744     TRUE 0.552 82.000 0.025 NA   NA
 1177978 1177979 Tcr_1744 Tcr_1745     TRUE 0.803 34.000 0.034 NA   NA
 1177980 1177981 Tcr_1746 Tcr_1747     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.049   NA
 1177982 1177983 Tcr_1748 Tcr_1749     TRUE 0.996 0.000 0.494 1.000 N NA
 1177983 1177984 Tcr_1749 Tcr_1750     FALSE 0.415 57.000 0.000 1.000 N NA
 1177984 1177985 Tcr_1750 Tcr_1751     FALSE 0.168 114.000 0.000 1.000   NA
 1177986 1177987 Tcr_1752 Tcr_1753     TRUE 0.947 -7.000 0.021 NA   NA
 1177987 1177988 Tcr_1753 Tcr_1754     FALSE 0.110 151.000 0.000 1.000   NA
 1177993 1177994 Tcr_1759 Tcr_1760     TRUE 0.809 13.000 0.000 1.000   NA
 1177994 1177995 Tcr_1760 Tcr_1761     FALSE 0.047 262.000 0.000 1.000   NA
 1177997 1177998 Tcr_1763 Tcr_1764     FALSE 0.155 109.000 0.000 NA N NA
 1177998 1177999 Tcr_1764 Tcr_1765     TRUE 0.996 11.000 0.625 NA   NA
 1177999 1178000 Tcr_1765 Tcr_1766     TRUE 0.996 21.000 0.833 NA   NA
 1178000 1178001 Tcr_1766 Tcr_1767     TRUE 0.672 22.000 0.000 NA   NA
 1178001 1178002 Tcr_1767 Tcr_1768     TRUE 0.987 -7.000 0.185 NA   NA
 1178002 1178003 Tcr_1768 Tcr_1769     TRUE 0.868 25.000 0.032 NA   NA
 1178004 1178005 Tcr_1770 Tcr_1771     TRUE 0.998 -3.000 0.946 NA   NA
 1178005 1178006 Tcr_1771 Tcr_1772     FALSE 0.286 79.000 0.000 1.000   NA
 1178008 1178009 Tcr_1774 Tcr_1775     TRUE 0.877 29.000 0.058 NA   NA
 1178009 1178010 Tcr_1775 Tcr_1776     TRUE 0.873 114.000 0.406 NA   NA
 1178010 1178011 Tcr_1776 Tcr_1777     FALSE 0.148 108.000 0.000 NA   NA
 1178011 1178012 Tcr_1777 Tcr_1778     TRUE 0.828 2.000 0.000 1.000 N NA
 1178012 1178013 Tcr_1778 Tcr_1779     TRUE 0.985 9.000 0.190 1.000 N NA
 1178013 1178014 Tcr_1779 Tcr_1780     FALSE 0.022 817.000 0.000 NA   NA
 1178014 1178015 Tcr_1780 Tcr_1781     TRUE 0.943 -3.000 0.024 NA   NA
 1178019 1178020 Tcr_R0041 Tcr_R0042     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1178020 1178021 Tcr_R0042 Tcr_R0043   tRNA-Ala2 FALSE 0.025 476.000 0.000 NA   NA
 1178021 1178022 Tcr_R0043 Tcr_R0044 tRNA-Ala2 tRNA-Ile2 FALSE 0.267 74.000 0.000 NA   NA
 1178022 1178023 Tcr_R0044 Tcr_R0045 tRNA-Ile2   FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 1178024 1178025 Tcr_1785 Tcr_1786     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1178025 1178026 Tcr_1786 Tcr_1787     FALSE 0.071 195.000 0.000 1.000   NA
 1178026 1178027 Tcr_1787 Tcr_1788     TRUE 0.998 13.000 0.486 1.000 Y NA
 1178027 1178028 Tcr_1788 Tcr_1789     TRUE 0.934 0.000 0.010 1.000 N NA
 1178028 1178029 Tcr_1789 Tcr_1790     TRUE 0.962 -7.000 0.046 NA   NA
 1178029 1178030 Tcr_1790 Tcr_1791     TRUE 0.998 -13.000 0.931 NA   NA
 1178030 1178031 Tcr_1791 Tcr_1792     TRUE 0.985 50.000 0.835 NA   NA
 1178031 1178032 Tcr_1792 Tcr_1793     TRUE 0.999 0.000 0.437 0.001 N NA
 1178032 1178033 Tcr_1793 Tcr_1794     FALSE 0.058 231.000 0.000 1.000 N NA
 1178033 1178034 Tcr_1794 Tcr_1795     TRUE 0.982 0.000 0.156 1.000   NA
 1178034 1178035 Tcr_1795 Tcr_1796     TRUE 0.957 19.000 0.083 1.000   NA
 1178035 1178036 Tcr_1796 Tcr_1797     TRUE 0.934 58.000 0.065 1.000 Y NA
 1178037 1178038 Tcr_1798 Tcr_1799     TRUE 0.996 16.000 0.688 1.000   NA
 1178038 1178039 Tcr_1799 Tcr_1800     FALSE 0.355 153.000 0.041 1.000   NA
 1178039 1178040 Tcr_1800 Tcr_1801     FALSE 0.077 182.000 0.000 1.000   NA
 1178040 1178041 Tcr_1801 Tcr_1802     TRUE 0.574 30.000 0.000 1.000   NA
 1178041 1178042 Tcr_1802 Tcr_1803     TRUE 0.814 6.000 0.000 1.000   NA
 1178042 1178043 Tcr_1803 Tcr_1804     TRUE 0.782 16.000 0.000 1.000   NA
 1178043 1178044 Tcr_1804 Tcr_1805     FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 1178044 1178045 Tcr_1805 Tcr_R0046   tRNA-Met1 FALSE 0.075 165.000 0.000 NA   NA
 1178045 1178046 Tcr_R0046 Tcr_1806 tRNA-Met1   FALSE 0.148 108.000 0.000 NA   NA
 1178046 1178047 Tcr_1806 Tcr_1807     TRUE 0.781 138.000 0.299 1.000 N NA
 1178047 1178048 Tcr_1807 Tcr_1808     TRUE 0.497 168.000 0.137 1.000   NA
 1178048 1178049 Tcr_1808 Tcr_1809     TRUE 0.980 27.000 0.173 0.031   NA
 1178053 1178054 Tcr_1813 Tcr_1814     TRUE 0.863 33.000 0.000 0.007   NA
 1178055 1178056 Tcr_1815 Tcr_1816     TRUE 0.896 14.000 0.005 NA   NA
 1178056 1178057 Tcr_1816 Tcr_1817     TRUE 0.534 30.000 0.000 NA N NA
 1178058 1178059 Tcr_1818 Tcr_1819     TRUE 0.966 110.000 0.136 0.001 Y NA
 1178059 1178060 Tcr_1819 Tcr_1820     FALSE 0.113 153.000 0.000 1.000 N NA
 1178061 1178062 Tcr_1821 Tcr_1822     FALSE 0.278 83.000 0.000 1.000 N NA
 1178062 1178063 Tcr_1822 Tcr_1823     TRUE 0.911 20.000 0.031 NA   NA
 1178063 1178064 Tcr_1823 Tcr_1824     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 1178064 1178065 Tcr_1824 Tcr_1825     TRUE 0.980 -3.000 0.120 1.000   NA
 1178065 1178066 Tcr_1825 Tcr_1826     TRUE 0.818 96.000 0.038 1.000 Y NA
 1178066 1178067 Tcr_1826 Tcr_1827     FALSE 0.332 64.000 0.000 NA N NA
 1178067 1178068 Tcr_1827 Tcr_1828     TRUE 0.992 -7.000 0.263 NA N NA
 1178068 1178069 Tcr_1828 Tcr_1829     TRUE 0.919 19.000 0.022 1.000 N NA
 1178069 1178070 Tcr_1829 Tcr_1830     TRUE 0.999 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 1178070 1178071 Tcr_1830 Tcr_1831     TRUE 0.741 16.000 0.000 NA   NA
 1178072 1178073 Tcr_1832 Tcr_1833     TRUE 0.691 21.000 0.000 NA   NA
 1178076 1178077 Tcr_1836 Tcr_1837     TRUE 0.485 131.000 0.000 1.000 Y NA
 1178077 1178078 Tcr_1837 Tcr_1838     TRUE 0.982 0.000 0.152 1.000   NA
 1178078 1178079 Tcr_1838 Tcr_1839     TRUE 0.440 102.000 0.018 1.000   NA
 1178079 1178080 Tcr_1839 Tcr_1840     TRUE 0.995 4.000 0.509 NA   NA
 1178080 1178081 Tcr_1840 Tcr_1841     FALSE 0.030 328.000 0.000 NA   NA
 1178081 1178082 Tcr_1841 Tcr_1842     TRUE 0.976 25.000 0.288 NA   NA
 1178082 1178083 Tcr_1842 Tcr_1843     FALSE 0.148 108.000 0.000 NA   NA
 1178083 1178084 Tcr_1843 Tcr_1844     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1178085 1178086 Tcr_1845 Tcr_1846     FALSE 0.308 66.000 0.000 NA   NA
 1178088 1178089 Tcr_1848 Tcr_1849     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1178089 1178090 Tcr_1849 Tcr_1850     FALSE 0.273 148.000 0.013 1.000   NA
 1178090 1178091 Tcr_1850 Tcr_1851     FALSE 0.072 200.000 0.000 1.000 N NA
 1178091 1178092 Tcr_1851 Tcr_1852     FALSE 0.437 51.000 0.000 1.000 N NA
 1178092 1178093 Tcr_1852 Tcr_1853     TRUE 0.681 135.000 0.000 0.040 Y NA
 1178093 1178094 Tcr_1853 Tcr_1854     FALSE 0.045 230.000 0.000 NA   NA
 1178094 1178095 Tcr_1854 Tcr_1855     FALSE 0.350 56.000 0.000 NA   NA
 1178095 1178096 Tcr_1855 Tcr_1856     TRUE 0.921 64.000 0.000 0.007 Y NA
 1178096 1178097 Tcr_1856 Tcr_1857     TRUE 0.712 19.000 0.000 NA   NA
 1178098 1178099 Tcr_1858 Tcr_1859     TRUE 0.913 54.000 0.000 0.040 Y NA
 1178100 1178101 Tcr_1861 Tcr_R0047   tRNA-Arg1 FALSE 0.022 755.000 0.000 NA   NA
 1178101 1178102 Tcr_R0047 Tcr_1862 tRNA-Arg1   FALSE 0.025 501.000 0.000 NA   NA
 1178102 1178103 Tcr_1862 Tcr_1863     FALSE 0.055 203.000 0.000 NA   NA
 1178105 1178106 Tcr_1865 Tcr_1866     FALSE 0.267 74.000 0.000 NA   NA
 1178106 1178107 Tcr_1866 Tcr_1867     TRUE 0.997 8.000 0.689 NA   NA
 1178107 1178108 Tcr_1867 Tcr_1868     TRUE 0.978 -7.000 0.000 0.001   NA
 1178108 1178109 Tcr_1868 Tcr_1869     FALSE 0.218 85.000 0.000 NA   NA
 1178109 1178110 Tcr_1869 Tcr_1870     TRUE 0.635 70.000 0.028 NA   NA
 1178110 1178111 Tcr_1870 Tcr_1871     TRUE 0.625 24.000 0.000 NA   NA
 1178112 1178113 Tcr_1872 Tcr_1873     FALSE 0.175 111.000 0.000 1.000   NA
 1178113 1178114 Tcr_1873 Tcr_1874     TRUE 0.731 17.000 0.000 NA   NA
 1178114 1178115 Tcr_1874 Tcr_1875     FALSE 0.065 177.000 0.000 NA   NA
 1178116 1178117 Tcr_1876 Tcr_1877     TRUE 0.771 13.000 0.000 NA   NA
 1178118 1178119 Tcr_1878 Tcr_1879     FALSE 0.143 130.000 0.000 1.000 N NA
 1178120 1178121 Tcr_1880 Tcr_1881     FALSE 0.089 151.000 0.000 NA   NA
 1178122 1178123 Tcr_1882 Tcr_1883     FALSE 0.208 87.000 0.000 NA   NA
 1178123 1178124 Tcr_1883 Tcr_1884     TRUE 0.524 120.000 0.000 1.000 Y NA
 1178124 1178125 Tcr_1884 Tcr_1885     TRUE 0.820 2.000 0.000 1.000   NA
 1178126 1178127 Tcr_1886 Tcr_1887     TRUE 0.828 0.000 0.000 1.000   NA
 1178127 1178128 Tcr_1887 Tcr_1888     FALSE 0.419 41.000 0.000 NA N NA
 1178128 1178129 Tcr_1888 Tcr_1889     FALSE 0.054 209.000 0.000 NA N NA
 1178130 1178131 Tcr_1890 Tcr_1891     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 1178131 1178132 Tcr_1891 Tcr_1892     TRUE 0.712 102.000 0.004 1.000 Y NA
 1178133 1178134 Tcr_1893 Tcr_1894     FALSE 0.097 140.000 0.000 NA   NA
 1178135 1178136 Tcr_1895 Tcr_1896     FALSE 0.312 69.000 0.000 NA N NA
 1178136 1178137 Tcr_1896 Tcr_1897     TRUE 0.581 99.000 0.000 NA Y NA
 1178138 1178139 Tcr_1898 Tcr_1899     TRUE 0.721 22.000 0.000 1.000   NA
 1178141 1178142 Tcr_1901 Tcr_1902     FALSE 0.043 238.000 0.000 NA   NA
 1178144 1178145 Tcr_1904 Tcr_1905     FALSE 0.142 116.000 0.000 NA N NA
 1178145 1178146 Tcr_1905 Tcr_1906     TRUE 0.677 74.000 0.039 1.000 N NA
 1178147 1178148 Tcr_1907 Tcr_1908     FALSE 0.400 118.000 0.000 0.086 N NA
 1178149 1178150 Tcr_1909 Tcr_1910     FALSE 0.308 66.000 0.000 NA   NA
 1178150 1178151 Tcr_1910 Tcr_1911     FALSE 0.144 111.000 0.000 NA   NA
 1178151 1178152 Tcr_1911 Tcr_1912     TRUE 0.968 -19.000 0.000 0.016   NA
 1178152 1178153 Tcr_1912 Tcr_1913     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.023   NA
 1178153 1178154 Tcr_1913 Tcr_1914     FALSE 0.051 208.000 0.000 NA   NA
 1178154 1178155 Tcr_1914 Tcr_1915     TRUE 0.753 15.000 0.000 NA   NA
 1178155 1178156 Tcr_1915 Tcr_1916     TRUE 0.840 -3.000 0.000 1.000   NA
 1178157 1178158 Tcr_1917 Tcr_1918     FALSE 0.057 234.000 0.000 1.000 N NA
 1178158 1178159 Tcr_1918 Tcr_1919     TRUE 0.999 12.000 0.332 0.021 Y NA
 1178161 1178162 Tcr_1921 Tcr_1922     FALSE 0.177 96.000 0.000 NA   NA
 1178162 1178163 Tcr_1922 Tcr_1923     FALSE 0.229 82.000 0.000 NA   NA
 1178163 1178164 Tcr_1923 Tcr_1924     FALSE 0.334 136.000 0.000 0.086 N NA
 1178165 1178166 Tcr_1925 Tcr_1926     TRUE 0.999 5.000 0.308 0.001 Y NA
 1178166 1178167 Tcr_1926 Tcr_1927     TRUE 0.996 91.000 0.660 0.001 Y NA
 1178167 1178168 Tcr_1927 Tcr_1928     TRUE 0.906 64.000 0.021 0.001   NA
 1178170 1178171 Tcr_1930 Tcr_1931     FALSE 0.278 83.000 0.000 1.000 N NA
 1178171 1178172 Tcr_1931 Tcr_1932     FALSE 0.239 92.000 0.000 1.000 N NA
 1178173 1178174 Tcr_1933 Tcr_1934     TRUE 0.848 64.000 0.143 NA   NA
 1178174 1178175 Tcr_1934 Tcr_1935     FALSE 0.363 52.000 0.000 NA   NA
 1178175 1178176 Tcr_1935 Tcr_1936     FALSE 0.386 45.000 0.000 NA   NA
 1178177 1178178 Tcr_1937 Tcr_1938     FALSE 0.154 123.000 0.000 1.000 N NA
 1178178 1178179 Tcr_1938 Tcr_1939     TRUE 0.983 -7.000 0.128 1.000   NA
 1178179 1178180 Tcr_1939 Tcr_1940     FALSE 0.084 175.000 0.000 1.000   NA
 1178180 1178181 Tcr_1940 Tcr_1941     TRUE 0.999 0.000 0.598 0.006   NA
 1178182 1178183 Tcr_1942 Tcr_1943     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1178183 1178184 Tcr_1943 Tcr_1944     TRUE 0.772 10.000 0.000 NA   NA
 1178185 1178186 Tcr_1945 Tcr_1946     TRUE 0.998 2.000 0.451 1.000 Y NA
 1178186 1178187 Tcr_1946 Tcr_R0048   tRNA-Thr1 FALSE 0.127 119.000 0.000 NA   NA
 1178187 1178188 Tcr_R0048 Tcr_1947 tRNA-Thr1   FALSE 0.376 48.000 0.000 NA   NA
 1178188 1178189 Tcr_1947 Tcr_1948     TRUE 0.930 2.000 0.010 1.000 N NA
 1178189 1178190 Tcr_1948 Tcr_R0049     FALSE 0.158 103.000 0.000 NA   NA
 1178190 1178191 Tcr_R0049 Tcr_R0050     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1178191 1178192 Tcr_R0050 Tcr_R0051   tRNA-Ala1 FALSE 0.025 476.000 0.000 NA   NA
 1178192 1178193 Tcr_R0051 Tcr_R0052 tRNA-Ala1 tRNA-Ile1 FALSE 0.267 74.000 0.000 NA   NA
 1178193 1178194 Tcr_R0052 Tcr_R0053 tRNA-Ile1   FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 1178194 1178195 Tcr_R0053 Tcr_1949     FALSE 0.023 643.000 0.000 NA   NA
 1178195 1178196 Tcr_1949 Tcr_1950     TRUE 0.932 16.000 0.000 0.048 N NA
 1178198 1178199 Tcr_1952 Tcr_1953     TRUE 0.792 16.000 0.000 1.000 N NA
 1178199 1178200 Tcr_1953 Tcr_1954     TRUE 0.977 23.000 0.221 1.000 N NA
 1178200 1178201 Tcr_1954 Tcr_1955     TRUE 0.882 57.000 0.166 NA N NA
 1178202 1178203 Tcr_1956 Tcr_1957     FALSE 0.050 257.000 0.000 1.000 N NA
 1178203 1178204 Tcr_1957 Tcr_1958     TRUE 0.999 13.000 0.214 0.001 Y NA
 1178205 1178206 Tcr_1959 Tcr_1960     TRUE 0.997 30.000 0.713 NA Y NA
 1178206 1178207 Tcr_1960 Tcr_1961     TRUE 0.995 14.000 0.206 NA Y NA
 1178207 1178208 Tcr_1961 Tcr_1962     TRUE 0.709 76.000 0.069 NA N NA
 1178208 1178209 Tcr_1962 Tcr_1963     FALSE 0.388 361.000 0.000 0.017 Y NA
 1178209 1178210 Tcr_1963 Tcr_1964     TRUE 0.956 197.000 0.286 0.001 Y NA
 1178210 1178211 Tcr_1964 Tcr_1965     TRUE 0.983 80.000 0.400 0.001 N NA
 1178212 1178213 Tcr_1966 Tcr_1967     TRUE 0.998 4.000 0.111 0.005 Y NA
 1178213 1178214 Tcr_1967 Tcr_1968     TRUE 0.997 17.000 0.120 0.005 Y NA
 1178214 1178215 Tcr_1968 Tcr_1969     TRUE 0.999 10.000 0.433 0.005 Y NA
 1178215 1178216 Tcr_1969 Tcr_1970     TRUE 0.998 -3.000 0.105 0.005 Y NA
 1178216 1178217 Tcr_1970 Tcr_1971     TRUE 0.952 21.000 0.079 1.000 N NA
 1178217 1178218 Tcr_1971 Tcr_1972     FALSE 0.145 129.000 0.000 1.000 N NA
 1178218 1178219 Tcr_1972 Tcr_1973     TRUE 0.940 46.000 0.000 0.007 Y NA
 1178219 1178220 Tcr_1973 Tcr_1974     TRUE 0.998 -3.000 0.314 NA Y NA
 1178220 1178221 Tcr_1974 Tcr_1975     TRUE 0.666 23.000 0.000 NA N NA
 1178221 1178222 Tcr_1975 Tcr_1976     TRUE 0.816 4.000 0.000 1.000   NA
 1178224 1178225 Tcr_1978 Tcr_1979     TRUE 0.997 23.000 0.168 0.003 Y NA
 1178225 1178226 Tcr_1979 Tcr_1980     TRUE 0.992 10.000 0.092 0.003   NA
 1178226 1178227 Tcr_1980 Tcr_1981     TRUE 0.995 4.000 0.163 0.003   NA
 1178228 1178229 Tcr_1982 Tcr_1983     TRUE 0.776 12.000 0.000 NA   NA
 1178229 1178230 Tcr_1983 Tcr_1984     TRUE 0.782 16.000 0.000 1.000   NA
 1178230 1178231 Tcr_1984 Tcr_1985     FALSE 0.170 98.000 0.000 NA   NA
 1178231 1178232 Tcr_1985 Tcr_1986     TRUE 0.997 -3.000 0.724 NA   NA
 1178232 1178233 Tcr_1986 Tcr_1987     TRUE 0.490 32.000 0.000 NA   NA
 1178234 1178235 Tcr_1988 Tcr_1989     FALSE 0.153 105.000 0.000 NA   NA
 1178235 1178236 Tcr_1989 Tcr_1990     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 1178236 1178237 Tcr_1990 Tcr_1991     FALSE 0.290 70.000 0.000 NA   NA
 1178238 1178239 Tcr_1992 Tcr_1993     FALSE 0.043 302.000 0.000 1.000 N NA
 1178239 1178240 Tcr_1993 Tcr_1994     TRUE 0.948 11.000 0.033 1.000 N NA
 1178240 1178241 Tcr_1994 Tcr_1995     FALSE 0.063 180.000 0.000 NA   NA
 1178241 1178242 Tcr_1995 Tcr_1996     TRUE 0.532 69.000 0.005 NA   NA
 1178246 1178247 Tcr_2000 Tcr_2001