MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas campestris vesicatoria 85-10

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1180854 1180855 XCV0001 XCV0002 dnaA dnaN TRUE 0.604 277.000 0.328 1.000 Y NA
 1180855 1180856 XCV0002 XCV0003 dnaN recF FALSE 0.218 1044.000 0.318 1.000 Y NA
 1180856 1180857 XCV0003 XCV0004 recF gyrB TRUE 0.958 61.000 0.249 0.005 Y NA
 1180857 1180858 XCV0004 XCV0005 gyrB   FALSE 0.376 69.000 0.005 NA   NA
 1180858 1180859 XCV0005 XCV0006     FALSE 0.407 184.000 0.079 NA   NA
 1180859 1180860 XCV0006 XCV0007     FALSE 0.084 317.000 0.063 1.000 N NA
 1180860 1180861 XCV0007 XCV0008   tonB1 FALSE 0.430 154.000 0.095 1.000 N NA
 1180861 1180862 XCV0008 XCV0009 tonB1 exbB1 TRUE 0.930 86.000 0.600 0.018 N NA
 1180862 1180863 XCV0009 XCV0010 exbB1 exbD1 TRUE 0.973 47.000 0.600 0.068 Y NA
 1180863 1180864 XCV0010 XCV0011 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.054 Y NA
 1180864 1180865 XCV0011 XCV0012 exbD2 exbD3 TRUE 0.551 247.000 0.000 0.054 Y NA
 1180866 1180867 XCV0013 XCV0014 pdxJ   TRUE 0.900 8.000 0.009 NA   NA
 1180867 1180868 XCV0014 XCV0015   cls TRUE 0.820 76.000 0.417 NA   NA
 1180869 1180870 XCV0016 XCV0017     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1180871 1180872 XCV0018 XCV0019     FALSE 0.182 208.000 0.009 NA   NA
 1180872 1180873 XCV0019 XCV0020   fadL FALSE 0.078 262.000 0.000 NA   NA
 1180874 1180875 XCV0021 XCV0022     TRUE 0.616 64.000 0.096 NA   NA
 1180875 1180876 XCV0022 XCV0023   serA TRUE 0.977 0.000 0.043 NA   NA
 1180877 1180878 XCV0024 XCV0025 ctp   TRUE 0.894 105.000 0.408 0.050 N NA
 1180879 1180880 XCV0026 XCV0027     FALSE 0.442 162.000 0.049 1.000   NA
 1180881 1180882 XCV0028 XCV0029   egl1 FALSE 0.062 295.000 0.000 1.000   NA
 1180882 1180883 XCV0029 XCV0030 egl1   FALSE 0.068 276.000 0.000 NA   NA
 1180883 1180884 XCV0030 XCV0031   egl2 FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1180884 1180885 XCV0031 XCV0032 egl2   FALSE 0.104 234.000 0.000 NA   NA
 1180885 1180886 XCV0032 XCV0033   egl3 FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1180888 1180889 XCV0035 XCV0036   gltD FALSE 0.379 37.000 0.000 NA   NA
 1180889 1180890 XCV0036 XCV0037 gltD gltB TRUE 0.932 129.000 0.032 0.001 Y NA
 1180890 1180891 XCV0037 XCV0038 gltB   FALSE 0.213 203.000 0.011 1.000   NA
 1180894 1180895 XCV0041 XCV0042     TRUE 0.843 -72.000 0.000 0.001   NA
 1180897 1180898 XCV0044 XCV0045     TRUE 0.464 204.000 0.000 1.000 Y NA
 1180898 1180899 XCV0045 XCV0046     TRUE 0.997 4.000 0.500 NA Y NA
 1180899 1180900 XCV0046 XCV0047     FALSE 0.015 681.000 0.000 NA   NA
 1180900 1180901 XCV0047 XCV0048     FALSE 0.350 88.000 0.000 NA   NA
 1180902 1180903 XCV0049 XCV0050     TRUE 0.982 11.000 0.600 1.000   NA
 1180904 1180905 XCV0051 XCV0052   avrBs2 TRUE 0.691 189.000 0.667 NA N NA
 1180905 1180906 XCV0052 XCV0053 avrBs2   FALSE 0.312 133.000 0.000 NA   NA
 1180907 1180908 XCV0054 XCV0055     TRUE 0.990 -3.000 0.010 0.019   NA
 1180909 1180910 XCV0056 XCV0057     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1180910 1180911 XCV0057 XCV0058     TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1180912 1180913 XCV0059 XCV0060     TRUE 0.945 60.000 0.250 0.063 Y NA
 1180914 1180915 XCV0061 XCV0062     FALSE 0.016 709.000 0.000 1.000   NA
 1180916 1180917 XCV0063 XCV0064     FALSE 0.365 39.000 0.000 NA   NA
 10702478 1180918 IS_1477_1 XCV0065     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1180918 1180919 XCV0065 XCV0066     TRUE 0.703 33.000 0.000 0.098   NA
 1180920 1180921 XCV0067 XCV0068     FALSE 0.030 400.000 0.000 NA   NA
 1180921 1180922 XCV0068 XCV0069     TRUE 0.632 17.000 0.000 NA   NA
 1180922 1180923 XCV0069 XCV0070     FALSE 0.019 526.000 0.000 NA   NA
 1180923 1180924 XCV0070 XCV0071     FALSE 0.111 228.000 0.000 NA   NA
 1180924 1180925 XCV0071 XCV0072     FALSE 0.100 237.000 0.000 NA   NA
 1180927 1180928 XCV0074 XCV0075     TRUE 0.988 -3.000 0.194 NA   NA
 1180928 1180929 XCV0075 XCV0076     TRUE 0.507 110.000 0.022 1.000   NA
 1180930 1180931 XCV0077 XCV0078     FALSE 0.186 41.000 0.000 1.000 N NA
 1180931 1180932 XCV0078 XCV0079     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA N NA
 1180932 1180933 XCV0079 XCV0080     TRUE 0.843 21.000 0.143 NA   NA
 1180933 1180934 XCV0080 XCV0081   proP FALSE 0.020 533.000 0.000 1.000   NA
 1180936 1180937 XCV0083 XCV0084     FALSE 0.210 197.000 0.009 NA   NA
 1180938 1180939 XCV0085 XCV0086     TRUE 0.996 -3.000 0.724 NA   NA
 1180939 1180940 XCV0086 XCV0087     TRUE 0.987 -3.000 0.172 NA   NA
 1180940 1180941 XCV0087 XCV0088     TRUE 0.691 44.000 0.161 NA   NA
 1180941 1180942 XCV0088 XCV0089     TRUE 0.919 14.000 0.193 NA   NA
 1180942 1180943 XCV0089 XCV0090     TRUE 0.703 113.000 0.168 NA   NA
 1180943 1180944 XCV0090 XCV0091     TRUE 0.996 -3.000 0.720 NA   NA
 1180944 1180945 XCV0091 XCV0092     TRUE 0.912 15.000 0.200 NA   NA
 1180945 1180946 XCV0092 XCV0093     FALSE 0.015 719.000 0.000 NA   NA
 1180946 1180947 XCV0093 XCV0094     FALSE 0.034 372.000 0.000 NA   NA
 1180947 1180948 XCV0094 XCV0095     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1180948 1180949 XCV0095 XCV0096     FALSE 0.263 148.000 0.000 NA   NA
 1180949 1180950 XCV0096 XCV0097     FALSE 0.334 81.000 0.000 NA   NA
 1180950 1180951 XCV0097 XCV0098   cbbFC FALSE 0.055 299.000 0.000 NA   NA
 1180951 1180952 XCV0098 XCV0099 cbbFC   FALSE 0.020 529.000 0.000 1.000   NA
 1180952 1180953 XCV0099 XCV0100     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 1180953 1180954 XCV0100 XCV0101     FALSE 0.335 119.000 0.000 NA   NA
 1180955 1180956 XCV0102 XCV0103     TRUE 0.947 -18.000 0.500 NA   NA
 1180956 1180957 XCV0103 XCV0104     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 1180957 1180958 XCV0104 XCV0105     FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 1180958 1180959 XCV0105 XCV0106     FALSE 0.282 177.000 0.014 NA   NA
 1180961 1180962 XCV0108 XCV0109     TRUE 0.977 0.000 0.043 NA   NA
 1180963 1180964 XCV0110 XCV0111 lctD   FALSE 0.146 140.000 0.000 1.000 N NA
 1180964 1180965 XCV0111 XCV0112     TRUE 0.759 27.000 0.091 NA   NA
 1180965 1180966 XCV0112 XCV0113     TRUE 0.495 -40.000 0.000 NA   NA
 1180967 1180968 XCV0114 XCV0115     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.035 Y NA
 1180968 1180969 XCV0115 XCV0116     FALSE 0.017 600.000 0.000 NA   NA
 1180969 1180970 XCV0116 XCV0117     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 1180971 1180972 XCV0118 XCV0119     TRUE 0.985 -3.000 0.133 NA   NA
 1180973 1180974 XCV0120 XCV0121     FALSE 0.314 167.000 0.015 NA   NA
 1180976 1180977 XCV0123 XCV0124     FALSE 0.035 365.000 0.000 NA   NA
 10702479 1180978 IS_1477_2 XCV0125     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1180978 1180979 XCV0125 XCV0126     TRUE 0.704 33.000 0.000 0.097   NA
 1180980 1180981 XCV0127 XCV0128     FALSE 0.017 563.000 0.000 NA   NA
 1180981 10702480 XCV0128 IS_1479_1     TRUE 0.543 -29.000 0.000 NA   NA
 1180983 1180984 XCV0130 XCV0131     FALSE 0.030 395.000 0.000 NA   NA
 1180984 1180985 XCV0131 XCV0132     FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1180985 1180986 XCV0132 XCV0133     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1180986 1180987 XCV0133 XCV0134     FALSE 0.016 656.000 0.000 NA   NA
 1180987 1180988 XCV0134 XCV0135     FALSE 0.038 350.000 0.000 NA   NA
 1180989 1180990 XCV0136 XCV0137     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1180990 1180991 XCV0137 XCV0138     TRUE 0.919 8.000 0.059 1.000 N NA
 1180992 1180993 XCV0139 XCV0140     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.014   NA
 1180993 1180994 XCV0140 XCV0141   glgB1 TRUE 0.998 -3.000 0.027 0.004 Y NA
 1180994 1180995 XCV0141 XCV0142 glgB1   FALSE 0.178 193.000 0.000 1.000   NA
 1180995 1180996 XCV0142 XCV0143     FALSE 0.439 69.000 0.012 1.000   NA
 1180997 1180998 XCV0144 XCV0145     TRUE 0.862 141.000 0.200 1.000 Y NA
 1180999 1181000 XCV0146 XCV0147   dctP TRUE 0.575 38.000 0.097 1.000 N NA
 1181000 1181001 XCV0147 XCV0148 dctP dctQ TRUE 0.994 11.000 0.756 NA Y NA
 1181001 1181002 XCV0148 XCV0149 dctQ dctM TRUE 0.998 0.000 0.390 NA Y NA
 1181002 1181003 XCV0149 XCV0150 dctM xylB1 TRUE 0.708 194.000 0.125 1.000 Y NA
 1181003 1181004 XCV0150 XCV0151 xylB1   TRUE 0.528 142.000 0.143 1.000 N NA
 1181004 1181005 XCV0151 XCV0152   kduI FALSE 0.011 422.000 0.000 1.000 N NA
 1181005 1181006 XCV0152 XCV0153 kduI kduD TRUE 0.679 183.000 0.571 1.000 N NA
 1181006 1181007 XCV0153 XCV0154 kduD rpiB FALSE 0.154 234.000 0.047 1.000 N NA
 1181007 1181008 XCV0154 XCV0155 rpiB   FALSE 0.054 223.000 0.000 1.000 N NA
 1181009 1181010 XCV0156 XCV0157   phhA FALSE 0.377 138.000 0.010 NA   NA
 1181011 1181012 XCV0158 XCV0159     FALSE 0.025 294.000 0.000 1.000 N NA
 1181015 1181016 XCV0162 XCV0163     FALSE 0.156 198.000 0.000 NA   NA
 1181017 1181018 XCV0164 XCV0165     TRUE 0.957 -10.000 0.333 1.000   NA
 1181018 1181019 XCV0165 XCV0166     TRUE 0.491 49.000 0.026 1.000   NA
 1181019 1181020 XCV0166 XCV0167     TRUE 0.982 -3.000 0.171 1.000 N NA
 1181022 1181023 XCV0169 XCV0170     TRUE 0.840 -126.000 0.354 NA   NA
 1181023 1181024 XCV0170 XCV0171     TRUE 0.484 49.000 0.029 NA   NA
 1181026 1181027 XCV0173 XCV0174     FALSE 0.015 835.000 0.000 1.000   NA
 1181027 1181028 XCV0174 XCV0175     FALSE 0.049 324.000 0.000 1.000   NA
 1181028 1181029 XCV0175 XCV0176     TRUE 0.792 16.000 0.079 1.000 N NA
 1181029 1181030 XCV0176 XCV0177     TRUE 0.587 61.000 0.083 NA   NA
 1181030 1181031 XCV0177 XCV0178     TRUE 0.985 -3.000 0.128 NA   NA
 1181031 1181032 XCV0178 XCV0179     FALSE 0.125 290.000 0.107 NA N NA
 1181032 1181033 XCV0179 XCV0180     TRUE 0.551 22.000 0.023 NA N NA
 1181033 1181034 XCV0180 XCV0181     TRUE 0.457 60.000 0.023 NA   NA
 1181034 1181035 XCV0181 XCV0182     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181035 1181036 XCV0182 XCV0183     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 1181036 1181037 XCV0183 XCV0184     FALSE 0.390 191.000 0.083 NA   NA
 1181037 1181038 XCV0184 XCV0185     FALSE 0.302 137.000 0.000 NA   NA
 1181039 1181040 XCV0186 XCV0187   bacA FALSE 0.036 241.000 0.000 NA N NA
 1181041 1181042 XCV0188 XCV0189 glnA glnB FALSE 0.277 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1181042 1181043 XCV0189 XCV0190 glnB amtB TRUE 0.646 23.000 0.048 1.000 N NA
 1181043 1181044 XCV0190 XCV0191 amtB ntrB FALSE 0.033 265.000 0.000 1.000 N NA
 1181044 1181045 XCV0191 XCV0192 ntrB ntrC TRUE 0.993 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 1181045 1181046 XCV0192 XCV0193 ntrC sodC1 FALSE 0.023 368.000 0.007 1.000 N NA
 1181046 1181047 XCV0193 XCV0194 sodC1 sodC2 TRUE 0.974 49.000 0.375 0.001 Y NA
 1181048 1181049 XCV0195 XCV0196     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1181049 1181050 XCV0196 XCV0197     TRUE 0.967 -3.000 0.018 NA   NA
 1181052 1181053 XCV0199 XCV0200     TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 1181053 1181054 XCV0200 XCV0201   hemD TRUE 0.951 104.000 0.600 1.000 Y NA
 1181055 1181056 XCV0202 XCV0203     FALSE 0.127 253.000 0.014 NA   NA
 1181056 1181057 XCV0203 XCV0204     TRUE 0.660 29.000 0.035 NA   NA
 1181057 1181058 XCV0204 XCV0205     TRUE 0.461 76.000 0.019 NA   NA
 1181058 1181059 XCV0205 XCV0206   secB TRUE 0.600 110.000 0.158 NA N NA
 1181059 1181060 XCV0206 XCV0207 secB   TRUE 0.632 16.000 0.015 1.000 N NA
 1181063 1181064 XCV0210 XCV0211     FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1181064 1181065 XCV0211 XCV0212     FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181065 1181066 XCV0212 XCV0213     TRUE 0.524 -33.000 0.000 NA   NA
 1181066 1181067 XCV0213 XCV0214     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1181068 1181069 XCV0215 XCV0216     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1181069 1181070 XCV0216 XCV0217     FALSE 0.139 207.000 0.000 NA   NA
 1181070 1181071 XCV0217 XCV0218     FALSE 0.032 382.000 0.000 NA   NA
 1181071 1181072 XCV0218 XCV0219     FALSE 0.310 60.000 0.000 NA   NA
 10702481 1181075 IS_1477_3 XCV0222     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1181075 1181076 XCV0222 XCV0223     TRUE 0.705 33.000 0.000 0.096   NA
 1181077 1181078 XCV0224 XCV0225     TRUE 0.979 -15.000 0.514 0.096   NA
 1181079 1181080 XCV0226 XCV0227     FALSE 0.348 106.000 0.000 NA   NA
 1181080 10702482 XCV0227 IS_Xac2_1     FALSE 0.014 869.000 0.000 NA   NA
 10702482 1181081 IS_Xac2_1 XCV0228     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181081 1181082 XCV0228 XCV0229     TRUE 0.942 -6.000 0.000 0.096   NA
 1181083 1181084 XCV0230 XCV0231 poxB   FALSE 0.160 50.000 0.000 1.000 N NA
 1181084 1181085 XCV0231 XCV0232     TRUE 0.985 -15.000 0.556 1.000 Y NA
 1181085 1181086 XCV0232 XCV0233     FALSE 0.425 191.000 0.111 NA   NA
 1181086 1181087 XCV0233 XCV0234     FALSE 0.350 103.000 0.000 NA   NA
 1181087 1181088 XCV0234 XCV0235     TRUE 0.688 93.000 0.133 NA   NA
 1181089 1181090 XCV0236 XCV0237     TRUE 0.555 27.000 0.007 NA   NA
 1181091 1181092 XCV0238 XCV0239   fabH TRUE 0.621 102.000 0.078 NA   NA
 1181092 1181093 XCV0239 XCV0240 fabH   TRUE 0.517 84.000 0.026 1.000   NA
 1181093 1181094 XCV0240 XCV0241     TRUE 0.454 149.000 0.036 1.000   NA
 1181096 1181097 XCV0243 XCV0244   cdh1 TRUE 0.463 228.000 0.418 1.000 N NA
 1181097 1181098 XCV0244 XCV0245 cdh1   TRUE 0.582 65.000 0.070 NA   NA
 1181100 1181101 XCV0247 XCV0248   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 1181101 1181102 XCV0248 XCV0249 ubiB   TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1181102 1181103 XCV0249 XCV0250   truC FALSE 0.058 293.000 0.000 NA   NA
 1181105 1181106 XCV0252 XCV0253     TRUE 0.953 3.000 0.014 1.000   NA
 1181106 1181107 XCV0253 XCV0254     FALSE 0.312 89.000 0.013 1.000 N NA
 1181107 1181108 XCV0254 XCV0255   dcp2 TRUE 0.479 199.000 0.000 1.000 Y NA
 1181109 1181110 XCV0256 XCV0257     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181112 1181113 XCV0259 XCV0260     TRUE 0.627 69.000 0.100 NA   NA
 1181113 1181114 XCV0260 XCV0261     FALSE 0.136 145.000 0.000 1.000 N NA
 1181114 1181115 XCV0261 XCV0262     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1181115 1181116 XCV0262 XCV0263     FALSE 0.345 111.000 0.000 NA   NA
 1181117 1181118 XCV0264 XCV0265   aceA TRUE 0.674 160.000 0.016 1.000 Y NA
 1181118 1181119 XCV0265 XCV0266 aceA   FALSE 0.024 300.000 0.000 1.000 N NA
 1181119 1181120 XCV0266 XCV0267     TRUE 0.997 4.000 0.154 0.010 Y NA
 1181123 1181124 XCV0270 XCV0271   accC FALSE 0.276 100.000 0.008 1.000 N NA
 1181124 1181125 XCV0271 XCV0272 accC accD TRUE 0.826 241.000 0.158 0.002 Y NA
 1181125 1181126 XCV0272 XCV0273 accD acdA TRUE 0.988 11.000 0.316 1.000 Y NA
 1181127 1181128 XCV0274 XCV0275     TRUE 0.543 87.000 0.036 NA   NA
 1181128 1181129 XCV0275 XCV0276     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181130 1181131 XCV0277 XCV0278     TRUE 0.984 -3.000 0.111 NA   NA
 1181131 1181132 XCV0278 XCV0279     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 1181132 1181133 XCV0279 XCV0280     TRUE 0.601 182.000 0.286 NA   NA
 1181134 1181135 XCV0281 XCV0282     FALSE 0.237 277.000 0.158 NA   NA
 1181138 1181139 XCV0285 XCV0286     TRUE 0.537 97.000 0.032 NA   NA
 1181140 1181141 XCV0287 XCV0288     TRUE 0.496 82.000 0.026 NA   NA
 1181141 1181142 XCV0288 XCV0289   ohrR FALSE 0.030 400.000 0.000 NA   NA
 1181142 1181143 XCV0289 XCV0290 ohrR ohr TRUE 0.534 100.000 0.086 1.000 N NA
 1181143 1181144 XCV0290 XCV0291 ohr   TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181147 1181148 XCV0294 XCV0295     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1181148 1181149 XCV0295 XCV0296     TRUE 0.746 135.000 0.028 0.037   NA
 1181150 1181151 XCV0297 XCV0298   rluE FALSE 0.429 93.000 0.008 NA   NA
 1181152 1181153 XCV0299 XCV0300   hrpB FALSE 0.036 467.000 0.012 1.000   NA
 1181155 1181156 XCV0302 XCV0303     FALSE 0.307 168.000 0.014 NA   NA
 1181156 1181157 XCV0303 XCV0304     TRUE 0.846 -30.000 0.167 1.000   NA
 1181157 1181158 XCV0304 XCV0305     TRUE 0.983 -3.000 0.103 NA   NA
 1181158 1181159 XCV0305 XCV0306     TRUE 0.979 -3.000 0.061 NA   NA
 1181159 1181160 XCV0306 XCV0307     TRUE 0.665 -24.000 0.013 NA   NA
 1181160 1181161 XCV0307 XCV0308     TRUE 0.959 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1181161 1181162 XCV0308 XCV0309     TRUE 0.807 53.000 0.060 1.000 Y NA
 1181162 1181163 XCV0309 XCV0310     FALSE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 1181163 1181164 XCV0310 XCV0311     FALSE 0.198 178.000 0.000 NA   NA
 1181166 1181167 XCV0313 XCV0314   ggt1 FALSE 0.118 224.000 0.000 NA   NA
 1181167 1181168 XCV0314 XCV0315 ggt1 gatA TRUE 0.970 0.000 0.068 1.000 N NA
 1181168 1181169 XCV0315 XCV0316 gatA   FALSE 0.008 467.000 0.000 NA N NA
 1181169 1181170 XCV0316 XCV0317   add TRUE 0.579 98.000 0.048 NA   NA
 1181170 1181171 XCV0317 XCV0318 add   FALSE 0.035 509.000 0.017 1.000   NA
 1181171 1181172 XCV0318 XCV0319     FALSE 0.193 186.000 0.000 1.000   NA
 1181172 1181173 XCV0319 XCV0320     TRUE 0.944 18.000 0.091 0.001 N NA
 1181174 1181175 XCV0321 XCV0322     FALSE 0.100 157.000 0.000 NA N NA
 1181181 1181182 XCV0328 XCV0329     FALSE 0.071 279.000 0.000 1.000   NA
 1181182 1181183 XCV0329 XCV0330     FALSE 0.361 60.000 0.031 1.000 N NA
 1181183 1181184 XCV0330 XCV0331     TRUE 0.484 35.000 0.040 1.000 N NA
 1181184 1181185 XCV0331 XCV0332     FALSE 0.129 214.000 0.000 NA   NA
 1181185 1181186 XCV0332 XCV0333   purU FALSE 0.098 240.000 0.000 NA   NA
 1181187 1181188 XCV0334 XCV0335     TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 1181189 1181190 XCV0336 XCV0337     TRUE 0.960 10.000 0.300 1.000 N NA
 1181190 1181191 XCV0337 XCV0338   oprN1 TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.052 N NA
 1181192 1181193 XCV0339 XCV0340     FALSE 0.027 417.000 0.000 NA   NA
 1181193 1181194 XCV0340 XCV0341     TRUE 0.571 30.000 0.014 NA   NA
 1181194 1181195 XCV0341 XCV0342   metR TRUE 0.965 0.000 0.014 NA   NA
 1181196 1181197 XCV0343 XCV0344     TRUE 0.620 82.000 0.088 NA   NA
 1181197 1181198 XCV0344 XCV0345   metE TRUE 0.937 29.000 0.775 NA   NA
 1181199 1181200 XCV0346 XCV0347 kdgT   FALSE 0.253 153.000 0.000 NA   NA
 1181200 1181201 XCV0347 XCV0348     FALSE 0.016 611.000 0.000 NA   NA
 1181201 1181202 XCV0348 XCV0349     FALSE 0.325 66.000 0.000 NA   NA
 1181204 1181205 XCV0351 XCV0352     FALSE 0.022 471.000 0.000 NA   NA
 1181205 1181206 XCV0352 XCV0353     FALSE 0.330 124.000 0.000 NA   NA
 1181206 10702483 XCV0353 IS_Xac3_1     FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   NA
 10702483 1181207 IS_Xac3_1 XCV0354     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181207 1181208 XCV0354 XCV0355     TRUE 0.996 9.000 0.409 0.094 Y NA
 1181211 1181212 XCV0358 XCV0359     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181213 1181214 XCV0360 XCV0361     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1181215 1181216 XCV0362 XCV0363     FALSE 0.376 150.000 0.056 1.000 N NA
 1181216 1181217 XCV0363 XCV0364     FALSE 0.014 383.000 0.000 1.000 N NA
 1181217 1181218 XCV0364 XCV0365     TRUE 0.704 175.000 0.600 NA N NA
 1181218 1181219 XCV0365 XCV0366     TRUE 0.581 34.000 0.091 NA N NA
 1181219 1181220 XCV0366 XCV0367     TRUE 0.905 32.000 0.286 0.037 N NA
 1181225 1181226 XCV0372 XCV0373 glpK glpF FALSE 0.217 140.000 0.008 1.000 N NA
 1181226 1181227 XCV0373 XCV0374 glpF glpD FALSE 0.063 442.000 0.129 1.000 N NA
 1181227 1181228 XCV0374 XCV0375 glpD glpR FALSE 0.162 224.000 0.040 1.000 N NA
 1181228 1181229 XCV0375 XCV0376 glpR   FALSE 0.063 208.000 0.000 1.000 N NA
 1181229 1181230 XCV0376 XCV0377     TRUE 0.819 101.000 0.170 0.055 N NA
 1181231 1181232 XCV0378 XCV0379 gctA gctB TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.001 Y NA
 1181232 1181233 XCV0379 XCV0380 gctB pcaF TRUE 0.997 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 1181233 1181234 XCV0380 XCV0381 pcaF pcaH TRUE 0.823 79.000 0.066 0.001 N NA
 1181234 1181235 XCV0381 XCV0382 pcaH pcaG TRUE 0.999 5.000 0.782 0.001 Y NA
 1181235 1181236 XCV0382 XCV0383 pcaG pcaB FALSE 0.193 328.000 0.314 1.000 N NA
 1181236 1181237 XCV0383 XCV0384 pcaB   TRUE 0.871 11.000 0.014 1.000   NA
 1181237 1181238 XCV0384 XCV0385   pcaC TRUE 0.929 27.000 0.600 1.000   NA
 1181238 1181239 XCV0385 XCV0386 pcaC   FALSE 0.190 181.000 0.000 NA   NA
 1181241 1181242 XCV0388 XCV0389     FALSE 0.037 255.000 0.000 1.000 N NA
 1181243 1181244 XCV0390 XCV0391   gidA FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 1181244 1181245 XCV0391 XCV0392 gidA   FALSE 0.078 262.000 0.000 NA   NA
 1181245 1181246 XCV0392 XCV0393     TRUE 0.869 133.000 0.667 NA   NA
 1181247 1181248 XCV0394 XCV0395     TRUE 0.514 51.000 0.042 NA   NA
 1181248 1181249 XCV0395 XCV0396     TRUE 0.469 44.000 0.019 NA   NA
 1181250 1181251 XCV0397 XCV0398 aspH bioC FALSE 0.038 250.000 0.000 1.000 N NA
 1181251 1181252 XCV0398 XCV0399 bioC   TRUE 0.733 64.000 0.006 1.000 Y NA
 1181252 1181253 XCV0399 XCV0400   bioH TRUE 0.527 46.000 0.033 1.000   NA
 1181253 1181254 XCV0400 XCV0401 bioH   TRUE 0.687 -67.000 0.065 NA   NA
 1181254 1181255 XCV0401 XCV0402   bioF FALSE 0.216 192.000 0.008 NA   NA
 1181255 1181256 XCV0402 XCV0403 bioF bioB TRUE 0.962 92.000 0.168 0.002 Y NA
 1181258 1181259 XCV0405 XCV0406 ubiA   FALSE 0.348 107.000 0.000 NA   NA
 1181261 1181262 XCV0407 XCV0408   hpaG FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1181262 1181263 XCV0408 XCV0409 hpaG hpaF FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1181263 1181264 XCV0409 XCV0410 hpaF   FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181264 1181265 XCV0410 XCV0411   hrpF FALSE 0.339 116.000 0.000 NA   NA
 1181266 1181267 XCV0412 XCV0413     TRUE 0.827 10.000 0.000 NA   NA
 1181267 1181268 XCV0413 XCV0414   xopF1 TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181269 1181270 XCV0415 XCV0416 hpaE hpaB TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1181270 1181271 XCV0416 XCV0417 hpaB hrpE FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181271 1181272 XCV0417 XCV0418 hrpE hrpD6 TRUE 0.912 82.000 1.000 NA   NA
 1181272 1181273 XCV0418 XCV0419 hrpD6 hrcD TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181273 1181274 XCV0419 XCV0420 hrcD hpaA TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181274 1181275 XCV0420 XCV0421 hpaA hrcS TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1181275 1181276 XCV0421 XCV0422 hrcS hrcR TRUE 0.998 5.000 0.400 0.013 Y NA
 1181276 1181277 XCV0422 XCV0423 hrcR hrcQ TRUE 0.971 -13.000 0.182 1.000 Y NA
 1181277 1181278 XCV0423 XCV0424 hrcQ hpaC TRUE 0.740 132.000 0.273 NA   NA
 1181278 1181279 XCV0424 XCV0425 hpaC hrcV TRUE 0.994 0.000 0.400 NA   NA
 1181279 1181280 XCV0425 XCV0426 hrcV hrcU TRUE 0.998 9.000 0.500 0.013 Y NA
 1181281 1181282 XCV0427 XCV0428 hrpB1 hrpB2 TRUE 0.898 34.000 0.600 NA   NA
 1181282 1181283 XCV0428 XCV0429 hrpB2 hrcJ TRUE 0.996 2.000 0.833 1.000   NA
 1181283 1181284 XCV0429 XCV0430 hrcJ hrpB4 TRUE 0.992 8.000 0.833 NA   NA
 1181284 1181285 XCV0430 XCV0431 hrpB4 hrcL TRUE 0.933 -15.000 0.312 NA   NA
 1181285 1181286 XCV0431 XCV0432 hrcL hrcN TRUE 0.983 -10.000 0.312 NA Y NA
 1181286 1181287 XCV0432 XCV0433 hrcN hrpB7 TRUE 0.986 -7.000 0.800 NA   NA
 1181287 1181288 XCV0433 XCV0434 hrpB7 hrcT TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181288 1181289 XCV0434 XCV0435 hrcT hrcC TRUE 0.966 82.000 1.000 1.000 Y NA
 10702484 1181290 IS_1595_2 XCV0436     FALSE 0.279 -863.000 0.000 NA   NA
 1181291 1181292 XCV0437 XCV0438 xopD   FALSE 0.308 140.000 0.000 1.000   NA
 1181292 1181293 XCV0438 XCV0439     TRUE 0.861 51.000 0.286 0.093   NA
 1181296 1181297 XCV0442 XCV0443     FALSE 0.064 281.000 0.000 NA   NA
 1181297 1181298 XCV0443 XCV0444     FALSE 0.015 692.000 0.000 NA   NA
 1181305 1181306 XCV0451 XCV0452 glgA glgB2 TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 1181306 1181307 XCV0452 XCV0453 glgB2   TRUE 0.999 3.000 0.600 0.004 Y NA
 1181307 1181308 XCV0453 XCV0454   malQ TRUE 0.998 -3.000 0.093 0.013 Y NA
 1181308 1181309 XCV0454 XCV0455 malQ glgY TRUE 0.998 -3.000 0.141 0.013 Y NA
 1181309 1181310 XCV0455 XCV0456 glgY   TRUE 0.717 22.000 0.031 NA   NA
 1181310 1181311 XCV0456 XCV0457   glgX1 TRUE 0.793 118.000 0.333 NA   NA
 1181311 1181312 XCV0457 XCV0458 glgX1   TRUE 0.918 17.000 0.016 NA Y NA
 1181313 1181314 XCV0459 XCV0460     TRUE 0.513 -36.000 0.000 NA   NA
 1181315 1181316 XCV0461 XCV0462   virK FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181318 1181319 XCV0464 XCV0465     TRUE 0.799 78.000 0.500 1.000 N NA
 1181319 1181320 XCV0465 XCV0466     TRUE 0.996 -3.000 0.857 NA N NA
 1181320 1181321 XCV0466 XCV0467     TRUE 0.711 133.000 0.218 NA   NA
 1181321 1181322 XCV0467 XCV0468     TRUE 0.977 2.000 0.074 NA   NA
 1181322 1181323 XCV0468 XCV0469     TRUE 0.981 -3.000 0.074 NA   NA
 1181326 1181327 XCV0472 XCV0473     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1181327 1181328 XCV0473 XCV0474     TRUE 0.979 -3.000 0.064 NA   NA
 1181328 1181329 XCV0474 XCV0475     TRUE 0.971 2.000 0.042 NA   NA
 1181329 1181330 XCV0475 XCV0476     TRUE 0.997 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 1181330 1181331 XCV0476 XCV0477     FALSE 0.289 178.000 0.013 1.000   NA
 1181332 1181333 XCV0478 XCV0479     FALSE 0.325 250.000 0.000 1.000 Y NA
 1181333 1181334 XCV0479 XCV0480     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181336 1181337 XCV0482 XCV0483     FALSE 0.223 172.000 0.000 1.000   NA
 1181337 1181338 XCV0483 XCV0484   hmgA TRUE 0.452 61.000 0.017 1.000   NA
 1181341 1181342 XCV0487 XCV0488 phag phaF TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 1181342 1181343 XCV0488 XCV0489 phaF phaE TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.064 Y NA
 1181343 1181344 XCV0489 XCV0490 phaE phaD TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 1181344 1181345 XCV0490 XCV0491 phaD phaC TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 1181345 1181346 XCV0491 XCV0492 phaC phaA TRUE 1.000 0.000 0.881 0.006 Y NA
 1181348 1181349 XCV0494 XCV0495     FALSE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 1181349 1181350 XCV0495 XCV0496     FALSE 0.028 426.000 0.000 1.000   NA
 1181350 1181351 XCV0496 XCV0497     FALSE 0.326 73.000 0.000 NA   NA
 1181351 1181352 XCV0497 XCV0498     FALSE 0.100 237.000 0.000 NA   NA
 1181352 1181353 XCV0498 XCV0499     FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181353 1181354 XCV0499 XCV0500   purC FALSE 0.356 132.000 0.004 NA   NA
 1181355 1181356 XCV0501 XCV0502   rpe FALSE 0.364 154.000 0.015 1.000   NA
 1181356 1181357 XCV0502 XCV0503 rpe   TRUE 0.979 -3.000 0.050 1.000   NA
 1181357 1181358 XCV0503 XCV0504     FALSE 0.110 236.000 0.000 1.000   NA
 1181358 1181359 XCV0504 XCV0505   trpE FALSE 0.036 258.000 0.000 1.000 N NA
 1181359 1181360 XCV0505 XCV0506 trpE   TRUE 0.990 0.000 0.007 1.000 Y NA
 1181360 1181361 XCV0506 XCV0507     TRUE 0.658 19.000 0.007 NA   NA
 1181361 1181362 XCV0507 XCV0508     FALSE 0.273 145.000 0.000 NA   NA
 1181362 1181363 XCV0508 XCV0509   hsdR1 TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181363 1181364 XCV0509 XCV0510 hsdR1 hsdS1 TRUE 0.999 3.000 0.500 0.001 Y NA
 1181364 1181365 XCV0510 XCV0511 hsdS1   TRUE 0.995 2.000 0.286 0.093   NA
 1181365 1181366 XCV0511 XCV0512     TRUE 0.983 -3.000 0.102 NA   NA
 1181366 1181367 XCV0512 XCV0513   hsdM1 TRUE 0.983 -3.000 0.093 NA   NA
 1181367 1181368 XCV0513 XCV0514 hsdM1 trpG FALSE 0.208 146.000 0.008 1.000 N NA
 1181368 1181369 XCV0514 XCV0515 trpG   TRUE 0.468 101.000 0.013 1.000   NA
 1181369 1181370 XCV0515 XCV0516   trpD FALSE 0.396 116.000 0.003 1.000   NA
 1181370 1181371 XCV0516 XCV0517 trpD trpC TRUE 0.888 141.000 0.293 1.000 Y NA
 1181371 1181372 XCV0517 XCV0518 trpC   TRUE 0.962 -7.000 0.010 1.000 Y NA
 1181374 1181375 XCV0520 XCV0521 speD sugE FALSE 0.227 165.000 0.019 1.000 N NA
 1181377 1181378 XCV0523 XCV0524 rplM rpsI TRUE 0.999 3.000 0.601 0.012 Y NA
 1181379 1181380 XCV_tRNA02 XCV_tRNA03 tRNA-Gln tRNA-Met FALSE 0.303 53.000 0.000 NA   NA
 1181381 1181382 XCV0525 XCV0526 nudH   FALSE 0.287 81.000 0.015 NA N NA
 1181382 1181383 XCV0526 XCV0527   bfr FALSE 0.332 315.000 0.070 NA Y NA
 1181384 1181385 XCV0528 XCV0529     TRUE 0.999 1.000 0.556 0.027 Y NA
 1181388 1181389 XCV0532 XCV0533     TRUE 0.969 4.000 0.086 NA   NA
 1181389 1181390 XCV0533 XCV0534     TRUE 0.612 84.000 0.079 NA   NA
 1181392 1181393 XCV0536 XCV0537     FALSE 0.078 272.000 0.000 1.000   NA
 1181393 1181394 XCV0537 XCV0538     FALSE 0.332 74.000 0.020 1.000 N NA
 1181395 1181396 XCV0539 XCV0540     TRUE 0.667 48.000 0.148 NA   NA
 1181396 1181397 XCV0540 XCV0541     FALSE 0.026 463.000 0.000 1.000   NA
 1181397 1181398 XCV0541 XCV0542     FALSE 0.277 69.000 0.011 1.000 N NA
 1181400 1181401 XCV0544 XCV0545   purD FALSE 0.135 209.000 0.000 NA   NA
 1181401 1181402 XCV0545 XCV0546 purD   TRUE 0.451 33.000 0.002 NA   NA
 1181402 1181403 XCV0546 XCV0547   purH TRUE 0.558 25.000 0.003 NA   NA
 1181404 1181405 XCV0548 XCV0549 pgsA   TRUE 0.898 92.000 0.215 NA Y NA
 1181405 1181406 XCV0549 XCV0550     TRUE 0.991 -3.000 0.285 NA   NA
 1181406 1181407 XCV0550 XCV0551     TRUE 0.982 -3.000 0.090 NA   NA
 1181407 1181408 XCV0551 XCV0552     TRUE 0.989 -3.000 0.200 NA   NA
 1181408 1181409 XCV0552 XCV0553     TRUE 0.981 0.000 0.069 NA   NA
 1181409 1181410 XCV0553 XCV0554     TRUE 0.997 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 1181410 1181411 XCV0554 XCV0555     TRUE 0.996 -3.000 0.595 1.000   NA
 1181412 1181413 XCV0556 XCV0557     FALSE 0.348 106.000 0.000 NA   NA
 1181413 1181414 XCV0557 XCV0558     FALSE 0.013 955.000 0.000 NA   NA
 1181417 1181418 XCV0561 XCV0562     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1181419 1181420 XCV0563 XCV0564 accC   TRUE 0.818 -10.000 0.014 NA   NA
 1181420 1181421 XCV0564 XCV0565   accB TRUE 0.614 21.000 0.004 NA   NA
 1181421 1181422 XCV0565 XCV0566 accB aroQ TRUE 0.703 97.000 0.254 1.000 N NA
 1181422 1181423 XCV0566 XCV0567 aroQ   FALSE 0.006 845.000 0.000 1.000 N NA
 1181423 1181424 XCV0567 XCV0568   cutA TRUE 0.871 6.000 0.014 1.000 N NA
 1181424 1181425 XCV0568 XCV0569 cutA   FALSE 0.010 467.000 0.000 1.000 N NA
 1181426 1181427 XCV0570 XCV0571 groES groEL TRUE 0.952 143.000 0.269 0.007 Y NA
 1181429 1181430 XCV0573 XCV0574   aroG FALSE 0.020 533.000 0.000 1.000   NA
 1181430 1181431 XCV0574 XCV0575 aroG   FALSE 0.014 785.000 0.000 NA   NA
 1181431 1181432 XCV0575 XCV0576     FALSE 0.357 94.000 0.000 NA   NA
 1181433 1181434 XCV0577 XCV0578 gnl   TRUE 0.971 0.000 0.025 NA   NA
 1181440 1181441 XCV0584 XCV0585     TRUE 0.982 -3.000 0.088 NA   NA
 1181441 1181442 XCV0585 XCV0586     TRUE 0.626 43.000 0.088 NA   NA
 1181443 1181444 XCV0587 XCV0588     FALSE 0.320 232.000 0.132 NA   NA
 1181444 1181445 XCV0588 XCV0589     FALSE 0.035 367.000 0.000 NA   NA
 1181445 1181446 XCV0589 XCV0590   appA TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1181447 1181448 XCV0591 XCV0592   mxcB TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1181448 1181449 XCV0592 XCV0593 mxcB   FALSE 0.166 311.000 0.223 NA N NA
 1181450 1181451 XCV0594 XCV0595 mdcA mdcC TRUE 0.974 10.000 0.342 NA   NA
 1181451 1181452 XCV0595 XCV0596 mdcC mdcD TRUE 0.837 107.000 0.438 NA   NA
 1181452 1181453 XCV0596 XCV0597 mdcD mdcE TRUE 0.981 -9.000 0.700 NA   NA
 1181453 1181454 XCV0597 XCV0598 mdcE mdcG TRUE 0.977 3.000 0.102 NA   NA
 1181454 1181455 XCV0598 XCV0599 mdcG mdcB TRUE 0.983 -3.000 0.085 1.000   NA
 1181455 1181456 XCV0599 XCV0600 mdcB mdcH FALSE 0.319 227.000 0.203 1.000 N NA
 1181456 1181457 XCV0600 XCV0601 mdcH matC TRUE 0.623 88.000 0.070 1.000   NA
 1181457 1181458 XCV0601 XCV0602 matC mdcY TRUE 0.778 46.000 0.300 1.000   NA
 1181459 1181460 XCV0603 XCV0604     FALSE 0.193 222.000 0.015 1.000   NA
 1181460 1181461 XCV0604 XCV0605     TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1181461 1181462 XCV0605 XCV0606     TRUE 0.995 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1181463 1181464 XCV0607 XCV0608     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181464 1181465 XCV0608 XCV0609     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 1181465 1181466 XCV0609 XCV0610   ganA TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181466 1181467 XCV0610 XCV0611 ganA aceE TRUE 0.880 0.000 0.000 1.000 N NA
 1181467 1181468 XCV0611 XCV0612 aceE   FALSE 0.028 426.000 0.000 1.000   NA
 1181468 1181469 XCV0612 XCV0613     TRUE 0.981 11.000 0.565 1.000   NA
 1181469 1181470 XCV0613 XCV0614     TRUE 0.869 -99.000 0.037 0.005   NA
 1181472 1181473 XCV0616 XCV0617     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181473 10702485 XCV0617 IS_Xcv1_1     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1181474 1181475 XCV0618 XCV0619     TRUE 0.812 153.000 0.250 0.091   NA
 10702486 1181476 IS_Xac2_2 XCV0620     FALSE 0.345 -335.000 0.000 NA   NA
 1181476 1181477 XCV0620 XCV0621     TRUE 0.943 -6.000 0.000 0.091   NA
 1181477 10702487 XCV0621 IS_1479_2     FALSE 0.013 1767.000 0.000 NA   NA
 1181481 1181482 XCV0625 XCV0626     TRUE 0.709 33.000 0.000 0.091   NA
 1181482 1181483 XCV0626 XCV0627     FALSE 0.342 48.000 0.000 1.000   NA
 1181484 1181485 XCV0628 XCV0629     FALSE 0.066 277.000 0.000 NA   NA
 1181485 1181486 XCV0629 XCV0630     FALSE 0.225 164.000 0.000 NA   NA
 1181486 1181487 XCV0630 XCV0631     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 1181489 1181490 XCV0633 XCV0634     FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   NA
 1181492 1181493 XCV0636 XCV0637     FALSE 0.227 163.000 0.000 NA   NA
 1181493 1181494 XCV0637 XCV0638     FALSE 0.395 73.000 0.041 NA N NA
 1181495 1181496 XCV0639 XCV0640     FALSE 0.083 256.000 0.000 NA   NA
 1181496 1181497 XCV0640 XCV0641     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181497 1181498 XCV0641 XCV0642     FALSE 0.014 773.000 0.000 NA   NA
 1181501 1181502 XCV0645 XCV0646     FALSE 0.352 109.000 0.024 NA N NA
 1181502 1181503 XCV0646 XCV0647     TRUE 0.641 103.000 0.195 NA N NA
 1181503 1181504 XCV0647 XCV0648     FALSE 0.201 176.000 0.000 NA   NA
 1181505 1181506 XCV0649 XCV0650     TRUE 0.516 25.000 0.000 NA   NA
 1181506 1181507 XCV0650 XCV0651     FALSE 0.353 99.000 0.000 NA   NA
 1181515 1181516 XCV0659 XCV0660   treA FALSE 0.026 426.000 0.000 NA   NA
 1181516 1181517 XCV0660 XCV0661 treA   FALSE 0.071 273.000 0.000 NA   NA
 1181521 1181522 XCV0665 XCV0666     FALSE 0.035 366.000 0.000 NA   NA
 1181524 1181525 XCV0668 XCV0669     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181525 1181526 XCV0669 XCV0670   engXCA FALSE 0.039 249.000 0.000 1.000 N NA
 1181527 1181528 XCV0671 XCV0672     FALSE 0.044 238.000 0.000 1.000 N NA
 1181528 1181529 XCV0672 XCV0673     FALSE 0.232 168.000 0.000 1.000   NA
 1181531 1181532 XCV0675 XCV0676 opgH   TRUE 0.461 151.000 0.046 NA   NA
 1181532 1181533 XCV0676 XCV0677     TRUE 0.953 5.000 0.037 1.000   NA
 1181533 1181534 XCV0677 XCV0678   algR TRUE 0.988 31.000 0.775 0.033 Y NA
 1181534 1181535 XCV0678 XCV0679 algR hemC TRUE 0.511 31.000 0.032 1.000 N NA
 1181538 1181539 XCV0682 XCV0683   blc1 FALSE 0.023 462.000 0.000 NA   NA
 1181540 1181541 XCV0684 XCV0685     TRUE 0.512 68.000 0.034 NA   NA
 1181543 1181544 XCV0687 XCV0688 ptrB   FALSE 0.113 368.000 0.105 NA   NA
 1181544 1181545 XCV0688 XCV0689   dapF FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1181545 1181546 XCV0689 XCV0690 dapF   TRUE 0.987 -3.000 0.175 NA   NA
 1181546 1181547 XCV0690 XCV0691   xerC TRUE 0.787 181.000 0.714 NA   NA
 1181547 1181548 XCV0691 XCV0692 xerC hslV FALSE 0.162 197.000 0.020 1.000 N NA
 1181548 1181549 XCV0692 XCV0693 hslV hslU TRUE 0.960 111.000 0.752 1.000 Y NA
 1181550 1181551 XCV0694 XCV0695     TRUE 0.967 -3.000 0.014 1.000   NA
 1181551 1181552 XCV0695 XCV0696     TRUE 0.561 123.000 0.044 1.000   NA
 1181552 1181553 XCV0696 XCV0697     TRUE 0.996 -3.000 0.578 1.000   NA
 1181554 1181555 XCV0698 XCV0699 ubiE   FALSE 0.425 20.000 0.002 1.000 N NA
 1181555 1181556 XCV0699 XCV0700   pepN FALSE 0.439 121.000 0.047 1.000 N NA
 1181556 1181557 XCV0700 XCV0701 pepN   TRUE 0.610 88.000 0.070 NA   NA
 1181557 1181558 XCV0701 XCV0702     FALSE 0.063 385.000 0.031 NA   NA
 1181558 1181559 XCV0702 XCV0703     FALSE 0.021 497.000 0.000 NA   NA
 1181559 1181560 XCV0703 XCV0704     TRUE 0.449 31.000 0.000 NA   NA
 10702489 1181561 IS_Xac3_3 XCV0705     FALSE 0.267 -865.000 0.000 NA   NA
 1181561 1181562 XCV0705 XCV0706     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.090 Y NA
 1181563 1181564 XCV0707 XCV0708   mxaF FALSE 0.023 463.000 0.000 NA   NA
 1181564 1181565 XCV0708 XCV0709 mxaF mxaF TRUE 0.898 -25.000 0.000 0.001   NA
 1181565 1181566 XCV0709 XCV0710 mxaF   TRUE 0.855 84.000 0.500 1.000   NA
 1181566 1181567 XCV0710 XCV0711     TRUE 0.841 63.000 0.500 1.000   NA
 1181567 1181568 XCV0711 XCV0712     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 1181568 1181569 XCV0712 XCV0713     TRUE 0.847 36.000 0.400 NA   NA
 1181569 1181570 XCV0713 XCV0714     TRUE 0.972 12.000 0.667 1.000 N NA
 1181571 1181572 XCV0715 XCV0716     FALSE 0.037 256.000 0.000 1.000 N NA
 1181573 1181574 XCV0717 XCV0718 mreB mreC TRUE 0.769 166.000 0.689 1.000 N NA
 1181574 1181575 XCV0718 XCV0719 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 1181575 1181576 XCV0719 XCV0720 mreD mrdA TRUE 0.985 4.000 0.013 1.000 Y NA
 1181576 1181577 XCV0720 XCV0721 mrdA mrdB TRUE 0.933 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1181577 1181578 XCV0721 XCV0722 mrdB pgl FALSE 0.016 357.000 0.000 1.000 N NA
 1181578 1181579 XCV0722 XCV0723 pgl mltB FALSE 0.071 678.000 0.000 NA Y NA
 1181579 1181580 XCV0723 XCV0724 mltB rlpA TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 1181580 1181581 XCV0724 XCV0725 rlpA dacC FALSE 0.209 442.000 0.080 1.000 Y NA
 1181583 1181584 XCV0727 XCV0728   lipB TRUE 0.931 -12.000 0.219 NA   NA
 1181584 1181585 XCV0728 XCV0729 lipB lipA TRUE 0.993 16.000 0.319 0.001 Y NA
 1181585 1181586 XCV0729 XCV0730 lipA prc FALSE 0.013 395.000 0.000 1.000 N NA
 1181590 1181591 XCV0734 XCV0735     TRUE 0.837 123.000 0.078 1.000 Y NA
 1181591 1181592 XCV0735 XCV0736     TRUE 0.683 23.000 0.022 NA   NA
 1181592 1181593 XCV0736 XCV0737     TRUE 0.825 -7.000 0.003 NA   NA
 1181593 1181594 XCV0737 XCV0738     FALSE 0.403 39.000 0.003 NA   NA
 1181594 1181595 XCV0738 XCV0739     TRUE 0.561 125.000 0.053 NA   NA
 1181595 1181596 XCV0739 XCV0740     TRUE 0.544 101.000 0.035 NA   NA
 1181596 1181597 XCV0740 XCV0741   gndA TRUE 0.754 21.000 0.042 NA   NA
 1181599 1181600 XCV0743 XCV0744     FALSE 0.063 282.000 0.000 NA   NA
 1181600 1181601 XCV0744 XCV0745     TRUE 0.995 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 1181601 1181602 XCV0745 XCV0746     TRUE 0.997 4.000 0.116 0.026 Y NA
 1181602 1181603 XCV0746 XCV0747   folK FALSE 0.344 93.000 0.017 1.000 N NA
 1181605 1181606 XCV0749 XCV0750     TRUE 0.785 -12.000 0.012 NA   NA
 1181607 1181608 XCV0751 XCV0752     FALSE 0.047 333.000 0.000 1.000   NA
 1181609 1181610 XCV0753 XCV0754     TRUE 0.803 77.000 0.373 NA   NA
 1181610 1181611 XCV0754 XCV0755   xcsC FALSE 0.439 159.000 0.043 1.000   NA
 1181611 1181612 XCV0755 XCV0756 xcsC xcsD TRUE 0.996 -3.000 0.575 1.000   NA
 1181612 1181613 XCV0756 XCV0757 xcsD xcsE TRUE 0.999 5.000 0.776 0.005 Y NA
 1181613 1181614 XCV0757 XCV0758 xcsE xcsF TRUE 0.996 -13.000 0.653 0.005 Y NA
 1181614 1181615 XCV0758 XCV0759 xcsF xcsG TRUE 0.989 29.000 0.599 0.005 Y NA
 1181615 1181616 XCV0759 XCV0760 xcsG xcsH TRUE 0.928 52.000 0.425 0.005   NA
 1181616 1181617 XCV0760 XCV0761 xcsH xcsI TRUE 0.986 -16.000 0.605 0.005   NA
 1181617 1181618 XCV0761 XCV0762 xcsI xcsJ TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.005   NA
 1181618 1181619 XCV0762 XCV0763 xcsJ xcsK TRUE 0.998 0.000 0.461 1.000 Y NA
 1181619 1181620 XCV0763 XCV0764 xcsK xcsL TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.062 Y NA
 1181620 1181621 XCV0764 XCV0765 xcsL xcsM TRUE 0.999 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 1181621 1181622 XCV0765 XCV0766 xcsM xcsN TRUE 0.991 6.000 0.649 1.000   NA
 1181622 1181623 XCV0766 XCV0767 xcsN   FALSE 0.041 353.000 0.000 1.000   NA
 1181623 1181624 XCV0767 XCV0768   gluP TRUE 0.531 44.000 0.093 1.000 N NA
 1181624 1181625 XCV0768 XCV0769 gluP   TRUE 0.604 41.000 0.140 1.000 N NA
 1181625 1181626 XCV0769 XCV0770   glmS TRUE 0.896 7.000 0.030 1.000 N NA
 1181626 1181627 XCV0770 XCV0771 glmS nagA TRUE 0.937 3.000 0.030 1.000 N NA
 1181627 1181628 XCV0771 XCV0772 nagA   FALSE 0.006 804.000 0.000 1.000 N NA
 1181629 1181630 XCV0773 XCV0774 cca beta FALSE 0.116 158.000 0.000 1.000 N NA
 1181630 1181631 XCV0774 XCV0775 beta betB TRUE 0.832 127.000 0.634 1.000 N NA
 1181631 1181632 XCV0775 XCV0776 betB betT FALSE 0.301 41.000 0.012 1.000 N NA
 1181632 1181633 XCV0776 XCV0777 betT   FALSE 0.122 282.000 0.029 NA   NA
 1181633 1181634 XCV0777 XCV0778     TRUE 0.802 20.000 0.074 NA   NA
 1181634 1181635 XCV0778 XCV0779     TRUE 0.985 92.000 0.714 0.006 Y NA
 1181635 1181636 XCV0779 XCV0780     TRUE 0.723 94.000 0.286 1.000 N NA
 1181637 1181638 XCV0781 XCV0782   gsh1 FALSE 0.211 179.000 0.000 1.000   NA
 1181639 1181640 XCV0783 XCV0784     TRUE 0.996 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 1181641 1181642 XCV0785 XCV0786     FALSE 0.379 95.000 0.000 1.000   NA
 1181642 1181643 XCV0786 XCV0787     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 1181643 1181644 XCV0787 XCV0788     TRUE 0.851 67.000 0.531 NA   NA
 1181644 1181645 XCV0788 XCV0789     TRUE 0.586 69.000 0.061 1.000   NA
 1181645 1181646 XCV0789 XCV0790     TRUE 0.560 59.000 0.057 1.000   NA
 1181647 1181648 XCV0791 XCV0792     FALSE 0.196 179.000 0.000 NA   NA
 1181649 1181650 XCV0793 XCV0794   glyA FALSE 0.156 198.000 0.000 NA   NA
 1181650 1181651 XCV0794 XCV0795 glyA   TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181651 1181652 XCV0795 XCV0796     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1181652 1181653 XCV0796 XCV0797     TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1181653 1181654 XCV0797 XCV0798   ribD TRUE 0.843 -7.000 0.005 1.000   NA
 1181656 1181657 XCV0800 XCV0801 ribE ribB TRUE 0.991 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 1181657 1181658 XCV0801 XCV0802 ribB ribH TRUE 0.850 290.000 0.417 0.001 Y NA
 1181658 1181659 XCV0802 XCV0803 ribH nusB TRUE 0.930 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1181659 1181660 XCV0803 XCV0804 nusB thiL TRUE 0.676 111.000 0.225 1.000 N NA
 1181660 1181661 XCV0804 XCV0805 thiL   FALSE 0.036 382.000 0.000 1.000   NA
 1181661 1181662 XCV0805 XCV0806     FALSE 0.116 225.000 0.000 NA   NA
 1181662 1181663 XCV0806 XCV0807   kdpF FALSE 0.024 448.000 0.000 NA   NA
 1181663 1181664 XCV0807 XCV0808 kdpF kdpA TRUE 0.847 16.000 0.071 NA   NA
 1181664 1181665 XCV0808 XCV0809 kdpA kdpB TRUE 0.992 13.000 0.145 0.001 Y NA
 1181665 1181666 XCV0809 XCV0810 kdpB kdpC TRUE 0.999 11.000 0.877 0.001 Y NA
 1181666 1181667 XCV0810 XCV0811 kdpC kdpD FALSE 0.234 171.000 0.026 1.000 N NA
 1181667 1181668 XCV0811 XCV0812 kdpD kdpE TRUE 0.986 -10.000 0.379 1.000 Y NA
 1181669 1181670 XCV0813 XCV0814     TRUE 0.965 5.000 0.091 NA   NA
 1181670 1181671 XCV0814 XCV0815     TRUE 0.798 -39.000 0.130 NA   NA
 1181671 1181672 XCV0815 XCV0816     TRUE 0.504 30.000 0.004 NA   NA
 1181672 1181673 XCV0816 XCV0817     TRUE 0.979 4.000 0.172 NA   NA
 1181675 1181676 XCV0819 XCV0820     TRUE 0.987 -3.000 0.170 NA   NA
 1181676 1181677 XCV0820 XCV0821     FALSE 0.396 48.000 0.009 NA   NA
 1181678 1181679 XCV0822 XCV0823 mraZ mraW TRUE 0.873 45.000 0.635 NA   NA
 1181679 1181680 XCV0823 XCV0824 mraW ftsL TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1181680 1181681 XCV0824 XCV0825 ftsL ftsI FALSE 0.069 284.000 0.024 1.000 N NA
 1181681 1181682 XCV0825 XCV0826 ftsI murE TRUE 0.973 9.000 0.012 1.000 Y NA
 1181682 1181683 XCV0826 XCV0827 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1181683 1181684 XCV0827 XCV0828 murF mraY TRUE 0.994 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 1181684 1181685 XCV0828 XCV0829 mraY ftsW TRUE 0.990 0.000 0.018 0.004 N NA
 1181685 1181686 XCV0829 XCV0830 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1181686 1181687 XCV0830 XCV0831 murG murC TRUE 0.997 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 1181687 1181688 XCV0831 XCV0832 murC ddlB TRUE 0.999 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 1181688 1181689 XCV0832 XCV0833 ddlB ftsQ TRUE 0.918 125.000 0.372 NA Y NA
 1181689 1181690 XCV0833 XCV0834 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 1181690 1181691 XCV0834 XCV0835 ftsA ftsZ TRUE 0.596 314.000 0.460 1.000 Y NA
 1181691 1181692 XCV0835 XCV0836 ftsZ lpxC FALSE 0.239 235.000 0.134 1.000 N NA
 1181694 1181695 XCV0838 XCV0839   secA FALSE 0.373 157.000 0.068 1.000 N NA
 1181695 1181696 XCV0839 XCV0840 secA   FALSE 0.029 323.000 0.006 1.000 N NA
 1181697 1181698 XCV0841 XCV0842   metF FALSE 0.432 46.000 0.014 NA   NA
 1181698 1181699 XCV0842 XCV0843 metF   FALSE 0.442 40.000 0.007 1.000   NA
 1181700 1181701 XCV0844 XCV0845     FALSE 0.106 240.000 0.000 1.000   NA
 1181703 1181704 XCV0847 XCV0848     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1181705 1181706 XCV0849 XCV0850     TRUE 0.826 -120.000 0.000 0.001   NA
 1181707 1181708 XCV0851 XCV0852     FALSE 0.301 220.000 0.080 NA   NA
 1181708 1181709 XCV0852 XCV0853     FALSE 0.257 151.000 0.000 NA   NA
 1181709 1181710 XCV0853 XCV0854     FALSE 0.021 493.000 0.000 NA   NA
 1181710 1181711 XCV0854 XCV0855     TRUE 0.805 32.000 0.200 1.000   NA
 1181713 1181714 XCV0857 XCV0858     FALSE 0.078 352.000 0.089 1.000 N NA
 1181714 1181715 XCV0858 XCV0859     TRUE 0.639 65.000 0.105 1.000   NA
 1181715 1181716 XCV0859 XCV0860     TRUE 0.975 -3.000 0.039 NA   NA
 1181716 1181717 XCV0860 XCV0861     TRUE 0.946 9.000 0.078 NA   NA
 1181717 1181718 XCV0861 XCV0862     TRUE 0.719 142.000 0.286 NA   NA
 1181718 1181719 XCV0862 XCV0863     FALSE 0.009 505.000 0.000 1.000 N NA
 1181719 1181720 XCV0863 XCV0864   appA TRUE 0.791 56.000 0.375 1.000   NA
 1181723 1181724 XCV0867 XCV0868     TRUE 0.524 29.000 0.002 1.000   NA
 1181724 1181725 XCV0868 XCV0869     FALSE 0.399 108.000 0.002 1.000   NA
 1181725 1181726 XCV0869 XCV0870   rbsK FALSE 0.020 527.000 0.000 1.000   NA
 1181726 1181727 XCV0870 XCV0871 rbsK   FALSE 0.392 91.000 0.027 1.000 N NA
 1181727 1181728 XCV0871 XCV0872     FALSE 0.016 631.000 0.000 NA   NA
 1181729 1181730 XCV0873 XCV0874     FALSE 0.374 157.000 0.023 NA   NA
 1181730 1181731 XCV0874 XCV0875     FALSE 0.197 247.000 0.046 NA   NA
 1181731 1181732 XCV0875 XCV0876     TRUE 0.971 6.000 0.160 NA   NA
 1181732 1181733 XCV0876 XCV0877     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1181733 1181734 XCV0877 XCV0878     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1181735 1181736 XCV0879 XCV0880     FALSE 0.419 80.000 0.011 NA   NA
 1181736 1181737 XCV0880 XCV0881     TRUE 0.999 -3.000 0.795 1.000 Y NA
 1181737 1181738 XCV0881 XCV0882     TRUE 0.997 4.000 0.553 NA Y NA
 1181738 1181739 XCV0882 XCV0883   tauD TRUE 0.844 41.000 0.647 NA N NA
 1181739 1181740 XCV0883 XCV0884 tauD   FALSE 0.368 249.000 0.011 NA Y NA
 1181740 1181741 XCV0884 XCV0885     TRUE 0.993 -3.000 0.535 NA N NA
 1181742 1181743 XCV0886 XCV0887     FALSE 0.336 92.000 0.016 1.000 N NA
 1181743 1181744 XCV0887 XCV0888     TRUE 0.933 50.000 0.500 1.000 Y NA
 1181746 1181747 XCV0890 XCV0891 dgkA   FALSE 0.379 64.000 0.007 NA   NA
 1181747 1181748 XCV0891 XCV0892     FALSE 0.039 345.000 0.000 NA   NA
 1181748 1181749 XCV0892 XCV0893     TRUE 0.966 0.000 0.015 NA   NA
 1181749 1181750 XCV0893 XCV0894   lgt FALSE 0.348 55.000 0.005 NA   NA
 1181750 1181751 XCV0894 XCV0895 lgt thyA TRUE 0.981 -3.000 0.164 1.000 N NA
 1181751 1181752 XCV0895 XCV0896 thyA   FALSE 0.303 54.000 0.000 NA   NA
 1181752 1181753 XCV0896 XCV0897   folA TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1181754 1181755 XCV0898 XCV0899 apaH   TRUE 0.787 29.000 0.267 NA N NA
 1181755 1181756 XCV0899 XCV0900   ksgA TRUE 0.533 37.000 0.078 NA N NA
 1181756 1181757 XCV0900 XCV0901 ksgA pdxA TRUE 0.641 118.000 0.197 1.000 N NA
 1181757 1181758 XCV0901 XCV0902 pdxA surA TRUE 0.926 20.000 0.561 1.000 N NA
 1181758 1181759 XCV0902 XCV0903 surA ostA TRUE 0.945 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1181759 1181760 XCV0903 XCV0904 ostA   TRUE 0.726 129.000 0.357 NA N NA
 1181760 1181761 XCV0904 XCV0905     TRUE 0.465 39.000 0.013 NA   NA
 1181761 1181762 XCV0905 XCV0906     TRUE 0.937 4.000 0.013 NA   NA
 1181763 1181764 XCV0907 XCV0908 ubiH ubif TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 1181764 1181765 XCV0908 XCV0909 ubif   TRUE 0.803 98.000 0.017 0.007   NA
 1181765 1181766 XCV0909 XCV0910     TRUE 0.778 103.000 0.273 1.000   NA
 1181766 1181767 XCV0910 XCV0911     TRUE 0.532 151.000 0.091 NA   NA
 1181769 1181770 XCV0913 XCV0914 ligB ligA TRUE 0.988 11.000 0.190 0.001   NA
 1181770 1181771 XCV0914 XCV0915 ligA   TRUE 0.634 67.000 0.095 1.000   NA
 1181772 1181773 XCV0916 XCV0917     FALSE 0.303 204.000 0.000 0.057 N NA
 1181773 1181774 XCV0917 XCV0918   paaF TRUE 0.871 84.000 0.333 0.057 N NA
 1181774 1181775 XCV0918 XCV0919 paaF   TRUE 0.798 46.000 0.500 1.000 N NA
 1181775 1181776 XCV0919 XCV0920     FALSE 0.319 138.000 0.000 1.000   NA
 1181776 1181777 XCV0920 XCV0921     TRUE 0.501 26.000 0.000 NA   NA
 1181777 1181778 XCV0921 XCV0922     TRUE 0.629 82.000 0.094 NA   NA
 1181780 1181781 XCV0924 XCV0925     TRUE 0.542 40.000 0.032 NA   NA
 1181781 1181782 XCV0925 XCV0926     TRUE 0.980 0.000 0.065 NA   NA
 1181782 1181783 XCV0926 XCV0927     FALSE 0.047 318.000 0.000 NA   NA
 1181783 1181784 XCV0927 XCV0928     FALSE 0.436 32.000 0.000 NA   NA
 1181784 1181785 XCV0928 XCV0929     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181785 1181786 XCV0929 XCV0930   glnS FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1181787 1181788 XCV0931 XCV0932 gst1   TRUE 0.771 -16.000 0.024 NA   NA
 1181789 1181790 XCV0933 XCV0934     TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.026 Y NA
 1181790 1181791 XCV0934 XCV0935     TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.082 N NA
 1181792 1181793 XCV0936 XCV0937   pms TRUE 0.457 96.000 0.013 NA   NA
 1181794 1181795 XCV0938 XCV0939   talB FALSE 0.037 356.000 0.000 NA   NA
 1181795 1181796 XCV0939 XCV0940 talB rnk FALSE 0.340 52.000 0.027 1.000 N NA
 1181796 1181797 XCV0940 XCV0941 rnk oxyR FALSE 0.211 498.000 0.008 0.082 Y NA
 1181797 1181798 XCV0941 XCV0942 oxyR ahpF TRUE 0.448 92.000 0.041 1.000 N NA
 1181798 1181799 XCV0942 XCV0943 ahpF ahpC TRUE 0.880 187.000 0.551 1.000 Y NA
 1181800 1181801 XCV0944 XCV0945 hemK pip FALSE 0.155 235.000 0.012 1.000   NA
 1181802 1181803 XCV0946 XCV0947     TRUE 0.944 -7.000 0.135 1.000   NA
 1181803 1181804 XCV0947 XCV0948   exo TRUE 0.981 -3.000 0.068 1.000   NA
 1181804 1181805 XCV0948 XCV0949 exo   TRUE 0.936 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1181806 1181807 XCV0950 XCV0951     FALSE 0.361 147.000 0.014 NA   NA
 1181808 1181809 XCV0952 XCV0953     TRUE 0.989 6.000 0.556 NA   NA
 1181809 1181810 XCV0953 XCV0954   rpoE1 TRUE 0.979 -3.000 0.065 NA   NA
 1181813 1181814 XCV0957 XCV0958   ilvE TRUE 0.465 65.000 0.017 1.000   NA
 1181814 1181815 XCV0958 XCV0959 ilvE   FALSE 0.022 308.000 0.000 1.000 N NA
 1181815 1181816 XCV0959 XCV0960     TRUE 0.907 259.000 0.667 0.005 Y NA
 1181816 1181817 XCV0960 XCV0961     FALSE 0.407 343.000 0.000 0.005 Y NA
 1181818 1181819 XCV0962 XCV0963     TRUE 0.920 5.000 0.006 1.000   NA
 1181820 1181821 XCV0964 XCV0965     FALSE 0.326 71.000 0.000 NA   NA
 1181822 1181823 XCV0966 XCV0967   wrbA TRUE 0.978 12.000 0.657 NA   NA
 1181824 1181825 XCV0968 XCV0969     TRUE 0.970 -3.000 0.020 1.000   NA
 1181825 1181826 XCV0969 XCV0970     TRUE 0.930 0.000 0.011 1.000 N NA
 1181826 1181827 XCV0970 XCV0971     FALSE 0.346 86.000 0.000 NA   NA
 1181828 1181829 XCV0972 XCV0973   moaB TRUE 0.497 33.000 0.006 1.000   NA
 1181829 1181830 XCV0973 XCV0974 moaB   FALSE 0.012 403.000 0.000 1.000 N NA
 1181830 1181831 XCV0974 XCV0975   prfA TRUE 0.907 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1181831 1181832 XCV0975 XCV0976 prfA hemA TRUE 0.924 -22.000 0.171 0.035 N NA
 1181833 1181834 XCV0977 XCV0978   lolB TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000   NA
 1181834 1181835 XCV0978 XCV0979 lolB ispE TRUE 0.830 -18.000 0.157 1.000 N NA
 1181835 1181836 XCV0979 XCV_tRNA04 ispE tRNA-Gln TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1181836 1181837 XCV_tRNA04 XCV0980 tRNA-Gln prsA FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1181837 1181838 XCV0980 XCV0981 prsA rplY TRUE 0.578 109.000 0.122 1.000 N NA
 1181838 1181839 XCV0981 XCV0982 rplY pth TRUE 0.969 52.000 0.496 0.018 Y NA
 1181839 1181840 XCV0982 XCV0983 pth   TRUE 0.881 78.000 0.184 1.000 Y NA
 1181840 1181841 XCV0983 XCV_tRNA05   tRNA-Tyr FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1181841 1181842 XCV_tRNA05 XCV_tRNA06 tRNA-Tyr tRNA-Gly TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1181842 1181843 XCV_tRNA06 XCV_tRNA07 tRNA-Gly tRNA-Thr FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 1181843 1181844 XCV_tRNA07 XCV0984 tRNA-Thr tufA FALSE 0.325 47.000 0.000 NA   NA
 1181844 1181845 XCV0984 XCV_tRNA08 tufA tRNA-Trp FALSE 0.348 107.000 0.000 NA   NA
 1181845 1181846 XCV_tRNA08 XCV0985 tRNA-Trp secE FALSE 0.312 50.000 0.000 NA   NA
 1181846 1181847 XCV0985 XCV0986 secE nusG TRUE 0.970 14.000 0.843 1.000 N NA
 1181847 1181848 XCV0986 XCV0987 nusG rplK TRUE 0.675 199.000 0.681 1.000 N NA
 1181848 1181849 XCV0987 XCV0988 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.016 Y NA
 1181849 1181850 XCV0988 XCV0989 rplA rplJ FALSE 0.271 543.000 0.302 1.000 Y NA
 1181850 1181851 XCV0989 XCV0990 rplJ rplL TRUE 0.957 55.000 0.884 1.000 Y NA
 1181851 1181852 XCV0990 XCV0991 rplL rpoB FALSE 0.266 292.000 0.223 1.000   NA
 1181852 1181853 XCV0991 XCV0992 rpoB rpoC TRUE 0.973 101.000 0.851 0.001   NA
 1181853 1181854 XCV0992 XCV0993 rpoC rpsL FALSE 0.267 219.000 0.122 1.000 N NA
 1181854 1181855 XCV0993 XCV0994 rpsL rpsG TRUE 0.997 13.000 0.620 0.002 Y NA
 1181855 1181856 XCV0994 XCV0995 rpsG fusA TRUE 0.938 138.000 0.579 1.000 Y NA
 1181856 1181857 XCV0995 XCV0996 fusA tufB TRUE 0.976 49.000 0.400 0.001 Y NA
 1181859 1181860 XCV0998 XCV0999 rpsJ rplC TRUE 0.994 12.000 0.307 0.016 Y NA
 1181860 1181861 XCV0999 XCV1000 rplC rplD TRUE 0.995 13.000 0.486 0.012 Y NA
 1181861 1181862 XCV1000 XCV1001 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 1181862 1181863 XCV1001 XCV1002 rplW rplB TRUE 0.995 11.000 0.849 1.000 Y NA
 1181863 1181864 XCV1002 XCV1003 rplB rpsS TRUE 0.999 7.000 0.820 0.016 Y NA
 1181864 1181865 XCV1003 XCV1004 rpsS rplV TRUE 0.997 13.000 0.769 0.016 Y NA
 1181865 1181866 XCV1004 XCV1005 rplV rpsC TRUE 0.994 18.000 0.719 0.016 Y NA
 1181866 1181867 XCV1005 XCV1006 rpsC rplP TRUE 0.999 6.000 0.828 0.016 Y NA
 1181867 1181868 XCV1006 XCV1007 rplP rpmC TRUE 1.000 0.000 0.802 0.012 Y NA
 1181868 1181869 XCV1007 XCV1008 rpmC rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.012 Y NA
 1181869 1181870 XCV1008 XCV1009 rpsQ rplN TRUE 0.996 15.000 0.791 0.016 Y NA
 1181870 1181871 XCV1009 XCV1010 rplN rplX TRUE 0.995 16.000 0.810 0.016 Y NA
 1181871 1181872 XCV1010 XCV1011 rplX rplE TRUE 0.997 12.000 0.758 0.012 Y NA
 1181872 1181873 XCV1011 XCV1012 rplE rpsN TRUE 0.988 19.000 0.309 0.012 Y NA
 1181873 1181874 XCV1012 XCV1013 rpsN rpsH TRUE 0.896 206.000 0.295 0.012 Y NA
 1181874 1181875 XCV1013 XCV1014 rpsH rplF TRUE 0.996 16.000 0.808 0.012 Y NA
 1181875 1181876 XCV1014 XCV1015 rplF rplR TRUE 0.986 92.000 0.815 0.012 Y NA
 1181876 1181877 XCV1015 XCV1016 rplR rpsE TRUE 0.973 160.000 0.814 0.016 Y NA
 1181877 1181878 XCV1016 XCV1017 rpsE rpmD TRUE 0.998 -7.000 0.789 0.016 Y NA
 1181878 1181879 XCV1017 XCV1018 rpmD rplO TRUE 0.999 5.000 0.653 0.002 Y NA
 1181879 1181880 XCV1018 XCV1019 rplO secY TRUE 0.987 8.000 0.730 1.000 N NA
 1181880 1181881 XCV1019 XCV1020 secY rpsM FALSE 0.034 333.000 0.011 1.000 N NA
 1181881 1181882 XCV1020 XCV1021 rpsM rpsK TRUE 0.998 11.000 0.810 0.012 Y NA
 1181882 1181883 XCV1021 XCV1022 rpsK rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.016 Y NA
 1181883 1181884 XCV1022 XCV1023 rpsD rpoA TRUE 0.796 54.000 0.549 1.000 N NA
 1181884 1181885 XCV1023 XCV1024 rpoA rplQ TRUE 0.769 181.000 0.873 1.000 N NA
 1181885 1181886 XCV1024 XCV1025 rplQ   FALSE 0.330 124.000 0.000 NA   NA
 1181886 1181887 XCV1025 XCV1026   dsbB TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1181889 1181890 XCV1028 XCV1029     FALSE 0.298 86.000 0.015 NA N NA
 1181891 1181892 XCV1030 XCV1031     TRUE 0.571 90.000 0.045 NA   NA
 1181892 1181893 XCV1031 XCV1032   typA TRUE 0.684 17.000 0.006 NA   NA
 1181894 1181895 XCV1033 XCV1034   mdh FALSE 0.333 118.000 0.018 1.000 N NA
 1181896 1181897 XCV1035 XCV1036 gst2   FALSE 0.099 409.000 0.111 1.000   NA
 1181897 1181898 XCV1036 XCV1037     FALSE 0.027 414.000 0.000 NA   NA
 1181898 1181899 XCV1037 XCV1038     FALSE 0.253 153.000 0.000 NA   NA
 1181899 1181900 XCV1038 XCV1039   fadH FALSE 0.227 163.000 0.000 NA   NA
 1181900 1181901 XCV1039 XCV1040 fadH   FALSE 0.157 204.000 0.000 1.000   NA
 1181901 1181902 XCV1040 XCV1041     TRUE 0.871 19.000 0.000 0.023   NA
 1181903 1181904 XCV1042 XCV1043     TRUE 0.598 193.000 0.333 NA   NA
 1181904 1181905 XCV1043 XCV1044   rluB1 TRUE 0.885 20.000 0.227 NA   NA
 1181906 1181907 XCV1045 XCV1046   kbl TRUE 0.945 3.000 0.007 1.000   NA
 1181908 1181909 XCV1047 XCV1048 cysP cysU TRUE 0.985 4.000 0.020 0.001 N NA
 1181909 1181910 XCV1048 XCV1049 cysU cysW TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 1181910 1181911 XCV1049 XCV1050 cysW cysA TRUE 0.983 8.000 0.050 1.000 Y NA
 1181911 1181912 XCV1050 XCV1051 cysA   FALSE 0.066 278.000 0.000 NA   NA
 1181913 1181914 XCV1052 XCV1053 tdh   FALSE 0.026 290.000 0.000 1.000 N NA
 1181915 1181916 XCV1054 XCV1055 phlN1 xopO FALSE 0.108 231.000 0.000 NA   NA
 1181916 1181917 XCV1055 XCV1056 xopO   FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1181917 1181918 XCV1056 XCV1057     TRUE 0.745 34.000 0.143 1.000   NA
 1181918 1181919 XCV1057 XCV1058   folC FALSE 0.029 330.000 0.006 1.000 N NA
 1181919 1181920 XCV1058 XCV1059 folC   FALSE 0.425 68.000 0.013 NA   NA
 1181920 1181921 XCV1059 XCV1060   cvpA FALSE 0.165 214.000 0.007 NA   NA
 1181921 1181922 XCV1060 XCV1061 cvpA purF TRUE 0.838 31.000 0.262 1.000   NA
 1181922 1181923 XCV1061 XCV1062 purF   FALSE 0.349 154.000 0.012 1.000   NA
 1181923 1181924 XCV1062 XCV1063     FALSE 0.318 63.000 0.000 NA   NA
 1181924 1181925 XCV1063 XCV1064     FALSE 0.327 68.000 0.000 NA   NA
 1181925 1181926 XCV1064 XCV1065     TRUE 0.647 135.000 0.143 NA   NA
 1181927 1181928 XCV1066 XCV1067     FALSE 0.060 336.000 0.008 1.000   NA
 1181928 1181929 XCV1067 XCV1068   gtrB TRUE 0.857 -19.000 0.125 1.000   NA
 1181929 1181930 XCV1068 XCV1069 gtrB ppx FALSE 0.115 224.000 0.018 1.000 N NA
 1181930 1181931 XCV1069 XCV1070 ppx ppk TRUE 0.727 173.000 0.076 1.000 Y NA
 1181931 1181932 XCV1070 XCV1071 ppk phoR TRUE 0.444 113.000 0.045 1.000 N NA
 1181932 1181933 XCV1071 XCV1072 phoR phoB TRUE 0.931 74.000 0.453 1.000 Y NA
 1181933 1181934 XCV1072 XCV1073 phoB   FALSE 0.285 183.000 0.016 1.000   NA
 1181935 1181936 XCV1074 XCV1075     TRUE 0.976 -3.000 0.045 NA   NA
 1181936 1181937 XCV1075 XCV1076     FALSE 0.196 227.000 0.025 NA   NA
 1181939 1181940 XCV_tRNA09 XCV_tRNA10 tRNA-Pro tRNA-Arg FALSE 0.341 43.000 0.000 NA   NA
 1181940 1181941 XCV_tRNA10 XCV_tRNA11 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1181941 1181942 XCV_tRNA11 XCV_tRNA12 tRNA-His tRNA-Lys FALSE 0.357 94.000 0.000 NA   NA
 1181943 1181944 XCV1078 XCV1079     FALSE 0.418 33.000 0.000 NA   NA
 1181945 1181946 XCV_tRNA13 XCV1080 tRNA-Leu tig FALSE 0.149 202.000 0.000 NA   NA
 1181946 1181947 XCV1080 XCV1081 tig clpP TRUE 0.928 93.000 0.351 1.000 Y NA
 1181947 1181948 XCV1081 XCV1082 clpP clpX TRUE 0.918 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1181948 1181949 XCV1082 XCV1083 clpX lon TRUE 0.920 145.000 0.201 0.094 Y NA
 1181949 1181950 XCV1083 XCV1084 lon hupB FALSE 0.092 214.000 0.008 1.000 N NA
 1181950 1181951 XCV1084 XCV_tRNA14 hupB tRNA-Val TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1181951 1181952 XCV_tRNA14 XCV_tRNA15 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1181952 1181953 XCV_tRNA15 XCV_tRNA16 tRNA-Asp tRNA-Asp FALSE 0.357 95.000 0.000 NA   NA
 1181953 1181954 XCV_tRNA16 XCV1085 tRNA-Asp ppiD FALSE 0.066 278.000 0.000 NA   NA
 1181955 1181956 XCV1086 XCV1087 mltD gloB TRUE 0.962 -3.000 0.008 1.000   NA
 1181957 1181958 XCV1088 XCV1089   rnhA TRUE 0.519 28.000 0.003 NA   NA
 1181958 1181959 XCV1089 XCV1090 rnhA dnaQ TRUE 0.990 9.000 0.248 1.000 Y NA
 1181961 1181962 XCV_tRNA17 XCV1092 tRNA-Ser   FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1181965 1181966 XCV1095 XCV1096     TRUE 0.629 56.000 0.129 NA   NA
 10702490 1181967 IS_1477_5 XCV1097     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1181967 1181968 XCV1097 XCV1098     TRUE 0.711 33.000 0.000 0.088   NA
 1181970 1181971 XCV1100 XCV1101     FALSE 0.031 385.000 0.000 NA   NA
 1181973 1181974 XCV1103 XCV1104 kdkA   TRUE 0.975 0.000 0.032 1.000   NA
 1181974 1181975 XCV1104 XCV1105   moaA TRUE 0.985 0.000 0.108 1.000   NA
 1181975 1181976 XCV1105 XCV1106 moaA   TRUE 0.974 -3.000 0.037 NA   NA
 1181976 1181977 XCV1106 XCV1107   moaC TRUE 0.565 25.000 0.004 NA   NA
 1181977 1181978 XCV1107 XCV1108 moaC moaD TRUE 0.999 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 1181978 1181979 XCV1108 XCV1109 moaD moaE TRUE 0.999 3.000 0.501 0.002 Y NA
 1181980 1181981 XCV1110 XCV1111     FALSE 0.131 213.000 0.000 NA   NA
 1181981 1181982 XCV1111 XCV1112     TRUE 0.909 69.000 1.000 NA   NA
 10702491 1181983 IS_Xcc1_1 XCV1113     FALSE 0.335 -340.000 0.000 NA   NA
 1181983 1181984 XCV1113 XCV1114     TRUE 0.925 99.000 0.500 0.087   NA
 1181984 1181985 XCV1114 XCV1115     FALSE 0.154 371.000 0.000 1.000 Y NA
 1181985 1181986 XCV1115 XCV1116     FALSE 0.153 199.000 0.000 NA   NA
 1181986 1181987 XCV1116 XCV1117     TRUE 0.801 -7.000 0.000 NA   NA
 1181987 10702492 XCV1117 IS_Xac3_4     TRUE 0.471 -52.000 0.000 NA   NA
 10702492 1181988 IS_Xac3_4 XCV1118     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1181988 1181989 XCV1118 XCV1119     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.087 Y NA
 1181989 1181990 XCV1119 XCV1120     FALSE 0.316 62.000 0.000 NA   NA
 1181990 1181991 XCV1120 XCV1121     FALSE 0.034 374.000 0.000 NA   NA
 1181994 1181995 XCV1124 XCV1125     TRUE 0.868 157.000 1.000 NA   NA
 1181995 1181996 XCV1125 XCV1126     FALSE 0.269 146.000 0.000 NA   NA
 1181996 1181997 XCV1126 XCV_tRNA18   tRNA-Ser FALSE 0.348 87.000 0.000 NA   NA
 1181998 1181999 XCV1127 XCV1128 dnaX   TRUE 0.985 7.000 0.411 NA   NA
 1181999 1182000 XCV1128 XCV1129   recR TRUE 0.880 98.000 0.604 NA   NA
 1182000 1182001 XCV1129 XCV1130 recR   FALSE 0.306 101.000 0.013 1.000 N NA
 1182002 1182003 XCV1131 XCV1132 slp   TRUE 0.962 -3.000 0.012 NA   NA
 1182003 1182004 XCV1132 XCV1133     TRUE 0.985 -7.000 0.727 NA   NA
 1182004 1182005 XCV1133 XCV1134     TRUE 0.993 5.000 0.739 NA   NA
 1182006 1182007 XCV1135 XCV1136     FALSE 0.343 113.000 0.000 NA   NA
 10702493 1182009 IS_Xcc1_2 XCV1138     FALSE 0.335 -340.000 0.000 NA   NA
 1182009 1182010 XCV1138 XCV1139     TRUE 0.925 99.000 0.500 0.087   NA
 1182012 1182013 XCV1141 XCV1142   rpmF TRUE 0.876 98.000 0.599 NA   NA
 1182013 1182014 XCV1142 XCV1143 rpmF fabH FALSE 0.327 91.000 0.014 1.000 N NA
 1182014 1182015 XCV1143 XCV1144 fabH   FALSE 0.096 248.000 0.000 1.000   NA
 1182015 1182016 XCV1144 XCV1145   fabD FALSE 0.066 289.000 0.000 1.000   NA
 1182016 1182017 XCV1145 XCV1146 fabD fabG TRUE 0.977 83.000 0.432 0.003 Y NA
 1182017 1182018 XCV1146 XCV1147 fabG acpP TRUE 0.914 205.000 0.321 0.003 Y NA
 1182018 1182019 XCV1147 XCV1148 acpP fabF TRUE 0.900 142.000 0.346 1.000 Y NA
 1182019 1182020 XCV1148 XCV1149 fabF trpE TRUE 0.608 168.000 0.030 0.011 N NA
 1182020 1182021 XCV1149 XCV1150 trpE   FALSE 0.409 73.000 0.010 NA   NA
 1182021 1182022 XCV1150 XCV1151   holB TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1182022 1182023 XCV1151 XCV1152 holB   TRUE 0.990 -3.000 0.382 NA N NA
 1182023 1182024 XCV1152 XCV_tRNA19   tRNA-Val FALSE 0.224 165.000 0.000 NA   NA
 1182024 1182025 XCV_tRNA19 XCV1153 tRNA-Val   FALSE 0.036 361.000 0.000 NA   NA
 1182025 1182026 XCV1153 XCV1154     FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 1182028 1182029 XCV1156 XCV1157 prpB   TRUE 0.806 75.000 0.502 1.000 N NA
 1182029 1182030 XCV1157 XCV1158   acnA TRUE 0.870 153.000 0.289 1.000 Y NA
 1182030 1182031 XCV1158 XCV1159 acnA   TRUE 0.899 10.000 0.018 1.000   NA
 1182031 1182032 XCV1159 XCV1160     TRUE 0.464 114.000 0.017 NA   NA
 1182032 1182033 XCV1160 XCV1161     FALSE 0.019 516.000 0.000 NA   NA
 1182033 1182034 XCV1161 XCV1162     TRUE 0.654 111.000 0.214 NA N NA
 1182034 1182035 XCV1162 XCV1163     FALSE 0.216 168.000 0.000 NA   NA
 1182035 1182036 XCV1163 XCV1164     TRUE 0.488 27.000 0.000 NA   NA
 1182036 1182037 XCV1164 XCV1165     FALSE 0.049 326.000 0.000 1.000   NA
 1182037 1182038 XCV1165 XCV1166     FALSE 0.414 272.000 0.400 1.000   NA
 1182038 1182039 XCV1166 XCV1167     FALSE 0.305 136.000 0.000 NA   NA
 1182039 1182040 XCV1167 XCV1168   pbpC TRUE 0.479 28.000 0.000 NA   NA
 1182041 1182042 XCV1169 XCV1170     TRUE 0.692 40.000 0.016 0.034 N NA
 1182042 1182043 XCV1170 XCV1171     TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 1182044 1182045 XCV1172 XCV1173   cbpA FALSE 0.257 414.000 0.133 NA Y NA
 1182045 1182046 XCV1173 XCV1174 cbpA   FALSE 0.048 498.000 0.111 1.000 N NA
 1182046 1182047 XCV1174 XCV1175   hflK FALSE 0.006 680.000 0.000 1.000 N NA
 1182047 1182048 XCV1175 XCV1176 hflK hflC TRUE 1.000 0.000 0.947 0.010 Y NA
 1182048 1182049 XCV1176 XCV1177 hflC   FALSE 0.039 249.000 0.000 1.000 N NA
 1182049 1182050 XCV1177 XCV1178   purA FALSE 0.008 535.000 0.000 1.000 N NA
 1182050 1182051 XCV1178 XCV1179 purA pepN2 FALSE 0.014 376.000 0.000 1.000 N NA
 1182052 1182053 XCV1180 XCV1181     FALSE 0.121 221.000 0.000 NA   NA
 1182054 1182055 XCV1182 XCV1183     FALSE 0.021 490.000 0.000 NA   NA
 1182055 1182056 XCV1183 XCV1184     FALSE 0.222 166.000 0.000 NA   NA
 1182056 1182057 XCV1184 XCV1185     TRUE 0.950 21.000 0.667 NA   NA
 1182057 1182058 XCV1185 XCV1186     TRUE 0.579 127.000 0.069 NA   NA
 1182058 1182059 XCV1186 XCV1187     TRUE 0.971 -10.000 0.517 NA   NA
 1182059 1182060 XCV1187 XCV1188     FALSE 0.437 190.000 0.118 NA   NA
 1182060 1182061 XCV1188 XCV1189     TRUE 0.993 7.000 1.000 NA   NA
 1182061 1182062 XCV1189 XCV1190     TRUE 0.610 41.000 0.069 NA   NA
 1182062 1182063 XCV1190 XCV1191   hsdM2 TRUE 0.901 73.000 0.051 0.087 Y NA
 1182063 1182064 XCV1191 XCV1192 hsdM2   TRUE 0.975 -3.000 0.038 NA   NA
 1182064 1182065 XCV1192 XCV1193   hsdS2 TRUE 0.977 -3.000 0.048 NA   NA
 1182065 1182066 XCV1193 XCV1194 hsdS2 hsdR2 TRUE 0.993 10.000 0.034 0.001 Y NA
 1182066 1182067 XCV1194 XCV1195 hsdR2   FALSE 0.054 300.000 0.000 NA   NA
 1182069 1182070 XCV1197 XCV1198     TRUE 0.614 18.000 0.000 NA   NA
 1182072 1182073 XCV1200 XCV1201     TRUE 0.991 0.000 0.013 NA Y NA
 1182073 1182074 XCV1201 XCV1202     FALSE 0.015 333.000 0.000 NA N NA
 1182075 1182076 XCV1203 XCV1204     TRUE 0.986 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1182076 1182077 XCV1204 XCV1205     FALSE 0.009 479.000 0.000 1.000 N NA
 1182077 1182078 XCV1205 XCV1206     FALSE 0.038 370.000 0.000 1.000   NA
 1182079 1182080 XCV1207 XCV1208     FALSE 0.014 350.000 0.000 NA N NA
 1182080 1182081 XCV1208 XCV1209     TRUE 0.986 -3.000 0.125 1.000   NA
 1182083 1182084 XCV1211 XCV1212     FALSE 0.305 52.000 0.000 NA   NA
 1182084 1182085 XCV1212 XCV1213     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1182086 1182087 XCV1214 XCV1215     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 1182087 1182088 XCV1215 XCV1216     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.051 Y NA
 1182089 1182090 XCV1217 XCV1218     TRUE 0.968 -3.000 0.021 NA   NA
 1182090 1182091 XCV1218 XCV1219     TRUE 0.514 63.000 0.038 NA   NA
 1182091 1182092 XCV1219 XCV1220     FALSE 0.400 163.000 0.038 NA   NA
 1182093 1182094 XCV1221 XCV1222     TRUE 0.944 9.000 0.074 NA   NA
 1182095 1182096 XCV1223 XCV1224 lexA1   TRUE 0.992 2.000 0.381 NA   NA
 1182096 1182097 XCV1224 XCV1225     TRUE 0.986 10.000 0.667 NA   NA
 1182097 1182098 XCV1225 XCV1226   dnaE1 TRUE 0.742 175.000 0.500 1.000   NA
 1182098 1182099 XCV1226 XCV1227 dnaE1   FALSE 0.169 67.000 0.000 1.000 N NA
 1182099 1182100 XCV1227 XCV1228     FALSE 0.172 78.000 0.000 1.000 N NA
 1182100 1182101 XCV1228 XCV1229     TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1182101 1182102 XCV1229 XCV1230     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182102 1182103 XCV1230 XCV1231     FALSE 0.015 707.000 0.000 NA   NA
 1182103 1182104 XCV1231 XCV1232     FALSE 0.060 290.000 0.000 NA   NA
 1182106 1182107 XCV1234 XCV1235     TRUE 0.833 132.000 0.500 NA   NA
 1182107 1182108 XCV1235 XCV1236   xopP FALSE 0.015 676.000 0.000 NA   NA
 1182109 1182110 XCV1237 XCV1238     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182110 1182111 XCV1238 XCV1239     FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1182111 1182112 XCV1239 XCV1240   katE FALSE 0.042 338.000 0.000 NA   NA
 1182112 1182113 XCV1240 XCV1241 katE   FALSE 0.148 208.000 0.000 1.000   NA
 1182113 1182114 XCV1241 XCV1242     FALSE 0.325 58.000 0.000 1.000   NA
 1182114 1182115 XCV1242 XCV1243   gcvP FALSE 0.093 179.000 0.000 1.000 N NA
 1182116 1182117 XCV1244 XCV1245 raxST raxA FALSE 0.373 89.000 0.000 1.000   NA
 1182117 1182118 XCV1245 XCV1246 raxA raxB TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1182118 1182119 XCV1246 XCV1247 raxB   FALSE 0.151 279.000 0.000 0.059 N NA
 1182119 1182120 XCV1247 XCV1248     TRUE 0.820 17.000 0.054 NA   NA
 1182121 1182122 XCV1249 XCV1250     TRUE 0.579 115.000 0.049 1.000   NA
 1182122 1182123 XCV1250 XCV1251     TRUE 0.987 -3.000 0.152 1.000   NA
 1182123 1182124 XCV1251 XCV1252     TRUE 0.612 100.000 0.061 1.000   NA
 1182125 1182126 XCV1253 XCV1254     TRUE 0.995 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 1182127 1182128 XCV1255 XCV1256   minE FALSE 0.441 69.000 0.015 NA   NA
 1182128 1182129 XCV1256 XCV1257 minE minD TRUE 0.998 3.000 0.618 NA Y NA
 1182129 1182130 XCV1257 XCV1258 minD minC TRUE 0.948 36.000 0.466 1.000 Y NA
 1182130 1182131 XCV1258 XCV1259 minC   TRUE 0.942 4.000 0.013 1.000   NA
 1182132 1182133 XCV1260 XCV1261     TRUE 1.000 0.000 0.900 0.031 Y NA
 1182133 1182134 XCV1261 XCV1262     FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 1182134 1182135 XCV1262 XCV1263     FALSE 0.437 82.000 0.013 NA   NA
 1182135 1182136 XCV1263 XCV1264   alkA TRUE 0.943 3.000 0.008 NA   NA
 1182137 1182138 XCV1265 XCV1266     FALSE 0.060 298.000 0.000 1.000   NA
 1182138 1182139 XCV1266 XCV1267     TRUE 0.968 -3.000 0.020 NA   NA
 1182139 1182140 XCV1267 XCV1268     FALSE 0.355 157.000 0.018 NA   NA
 1182142 1182143 XCV1270 XCV1271     TRUE 0.928 29.000 0.667 NA   NA
 1182143 1182144 XCV1271 XCV1272     FALSE 0.083 256.000 0.000 NA   NA
 1182144 1182145 XCV1272 XCV1273   ate TRUE 0.593 -46.000 0.014 NA   NA
 1182147 1182148 XCV1275 XCV1276   rfaY FALSE 0.079 260.000 0.000 NA   NA
 1182148 1182149 XCV1276 XCV1277 rfaY   FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 1182149 1182150 XCV1277 XCV1278   tesB FALSE 0.184 234.000 0.026 NA   NA
 1182150 1182151 XCV1278 XCV1279 tesB tesB TRUE 0.976 10.000 0.010 0.001   NA
 1182151 1182152 XCV1279 XCV1280 tesB   TRUE 0.778 70.000 0.021 1.000 Y NA
 1182154 1182155 XCV1282 XCV1283     TRUE 0.959 0.000 0.005 1.000   NA
 1182156 1182157 XCV1284 XCV1285 rplU rpmA TRUE 0.997 13.000 0.667 0.011 Y NA
 1182157 1182158 XCV1285 XCV1286 rpmA   TRUE 0.446 247.000 0.335 1.000   NA
 1182160 1182161 XCV1288 XCV1289   ribF TRUE 0.509 187.000 0.169 1.000   NA
 1182161 1182162 XCV1289 XCV1290 ribF ileS TRUE 0.968 7.000 0.254 1.000 N NA
 1182162 1182163 XCV1290 XCV1291 ileS lspA TRUE 0.590 79.000 0.147 1.000 N NA
 1182163 1182164 XCV1291 XCV1292 lspA ispH TRUE 0.845 67.000 0.095 1.000 Y NA
 1182164 1182165 XCV1292 XCV_tRNA20 ispH tRNA-Thr FALSE 0.355 91.000 0.000 NA   NA
 1182165 1182166 XCV_tRNA20 XCV1293 tRNA-Thr   FALSE 0.015 718.000 0.000 NA   NA
 1182166 10702494 XCV1293 IS_1479_3     TRUE 0.543 -29.000 0.000 NA   NA
 1182168 10702495 XCV1295 IS_Xac2_3     FALSE 0.045 323.000 0.000 NA   NA
 1182169 1182170 XCV1296 XCV1297     TRUE 0.944 -6.000 0.000 0.086   NA
 1182171 1182172 XCV1298 XCV1299     FALSE 0.021 488.000 0.000 NA   NA
 10702496 1182173 IS_1477_18 XCV1300     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1182173 1182174 XCV1300 XCV1301     TRUE 0.714 33.000 0.000 0.086   NA
 1182174 1182175 XCV1301 XCV1302     FALSE 0.153 199.000 0.000 NA   NA
 1182175 1182176 XCV1302 XCV1303     TRUE 0.940 25.000 0.667 NA   NA
 1182176 1182177 XCV1303 XCV1304     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182177 1182178 XCV1304 XCV1305     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 1182178 1182179 XCV1305 XCV1306     TRUE 0.798 11.000 0.000 NA   NA
 1182180 1182181 XCV1307 XCV1308 cyoA cyoB TRUE 0.999 0.000 0.385 0.010 Y NA
 1182181 1182182 XCV1308 XCV1309 cyoB cyoC TRUE 0.998 3.000 0.385 0.050 Y NA
 1182182 1182183 XCV1309 XCV1310 cyoC cyoD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.050 Y NA
 1182183 1182184 XCV1310 XCV1311 cyoD   TRUE 0.562 169.000 0.167 1.000   NA
 1182184 1182185 XCV1311 XCV1312   radA FALSE 0.283 250.000 0.000 0.043   NA
 1182185 1182186 XCV1312 XCV1313 radA   FALSE 0.030 411.000 0.000 1.000   NA
 1182188 1182189 XCV1315 XCV1316 hrpXv   FALSE 0.182 110.000 0.000 1.000 N NA
 1182189 1182190 XCV1316 XCV1317     TRUE 0.944 26.000 0.727 1.000   NA
 1182190 1182191 XCV1317 XCV1318     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 1182191 1182192 XCV1318 XCV1319   rsbR FALSE 0.080 259.000 0.000 NA   NA
 1182192 1182193 XCV1319 XCV1320 rsbR rsbS TRUE 0.997 2.000 0.361 NA Y NA
 1182193 1182194 XCV1320 XCV1321 rsbS rsbT TRUE 0.998 -3.000 0.454 NA Y NA
 1182194 1182195 XCV1321 XCV1322 rsbT   TRUE 0.987 -9.000 0.522 0.091   NA
 1182195 1182196 XCV1322 XCV1323     TRUE 0.996 -3.000 0.261 0.091   NA
 1182196 1182197 XCV1323 XCV1324     TRUE 0.989 -10.000 0.125 0.015 Y NA
 1182200 1182201 XCV1327 XCV1328     FALSE 0.410 174.000 0.059 NA   NA
 1182201 1182202 XCV1328 XCV1329     FALSE 0.107 232.000 0.000 NA   NA
 1182202 1182203 XCV1329 XCV1330   cheB TRUE 0.980 -3.000 0.059 1.000   NA
 1182203 1182204 XCV1330 XCV1331 cheB cheR1 TRUE 0.994 -3.000 0.416 1.000   NA
 1182204 1182205 XCV1331 XCV1332 cheR1   TRUE 0.996 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 1182206 1182207 XCV1333 XCV1334     TRUE 0.993 -7.000 0.200 0.031 Y NA
 1182211 1182212 XCV1338 XCV1339 ffh   FALSE 0.214 188.000 0.003 1.000   NA
 1182212 1182213 XCV1339 XCV1340     TRUE 0.933 -15.000 0.000 0.001   NA
 1182213 1182214 XCV1340 XCV1341     TRUE 0.536 -36.000 0.000 1.000   NA
 1182214 1182215 XCV1341 XCV1342   rpsP FALSE 0.241 98.000 0.004 1.000 N NA
 1182215 1182216 XCV1342 XCV1343 rpsP rimM TRUE 0.993 14.000 0.342 0.011 Y NA
 1182216 1182217 XCV1343 XCV1344 rimM trmD TRUE 0.953 66.000 0.672 1.000 Y NA
 1182217 1182218 XCV1344 XCV1345 trmD rplS TRUE 0.927 146.000 0.567 1.000 Y NA
 1182220 1182221 XCV1347 XCV1348   gst3 TRUE 0.513 59.000 0.116 NA N NA
 1182221 1182222 XCV1348 XCV1349 gst3 hslR FALSE 0.053 224.000 0.000 1.000 N NA
 1182223 1182224 XCV1350 XCV1351 katG   FALSE 0.027 431.000 0.000 1.000   NA
 1182224 1182225 XCV1351 XCV1352   mutS FALSE 0.066 288.000 0.000 1.000   NA
 1182226 1182227 XCV1353 XCV1354     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 10702497 1182228 IS_Xcc1_3 XCV1355     FALSE 0.307 -760.000 0.000 NA   NA
 1182228 1182229 XCV1355 XCV1356     TRUE 0.926 99.000 0.500 0.085   NA
 1182230 1182231 XCV1357 XCV1358     TRUE 0.988 -3.000 0.182 NA   NA
 1182232 1182233 XCV1359 XCV1360     TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.012   NA
 1182233 1182234 XCV1360 XCV1361     TRUE 0.560 185.000 0.222 1.000   NA
 1182234 1182235 XCV1361 XCV1362     FALSE 0.021 516.000 0.000 1.000   NA
 1182236 1182237 XCV1363 XCV1364     TRUE 0.534 -31.000 0.019 1.000 N NA
 1182237 1182238 XCV1364 XCV1365     TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 1182238 1182239 XCV1365 XCV1366     TRUE 1.000 0.000 0.627 0.002 Y NA
 1182239 1182240 XCV1366 XCV1367     TRUE 0.924 166.000 0.687 1.000 Y NA
 1182240 1182241 XCV1367 XCV1368   czcD FALSE 0.059 214.000 0.000 1.000 N NA
 1182243 1182244 XCV1370 XCV1371 rpoE2   TRUE 0.995 -3.000 0.705 NA N NA
 1182244 1182245 XCV1371 XCV1372   mucD FALSE 0.396 110.000 0.035 NA N NA
 1182245 1182246 XCV1372 XCV1373 mucD lepA FALSE 0.118 191.000 0.007 1.000 N NA
 1182246 1182247 XCV1373 XCV1374 lepA lepB TRUE 0.646 106.000 0.187 1.000 N NA
 1182247 1182248 XCV1374 XCV1375 lepB   TRUE 0.682 31.000 0.053 NA   NA
 1182248 1182249 XCV1375 XCV1376   rnc TRUE 0.812 -10.000 0.013 NA   NA
 1182249 1182250 XCV1376 XCV1377 rnc era TRUE 0.990 -3.000 0.017 0.043   NA
 1182250 1182251 XCV1377 XCV1378 era   FALSE 0.049 315.000 0.000 NA   NA
 1182251 1182252 XCV1378 XCV1379     FALSE 0.300 138.000 0.000 NA   NA
 1182254 1182255 XCV1381 XCV1382 rumA   FALSE 0.416 80.000 0.007 1.000   NA
 1182255 1182256 XCV1382 XCV1383     FALSE 0.314 181.000 0.021 1.000   NA
 1182256 1182257 XCV1383 XCV1384     TRUE 0.757 17.000 0.017 1.000   NA
 1182257 1182258 XCV1384 XCV1385     TRUE 0.454 118.000 0.013 1.000   NA
 1182258 1182259 XCV1385 XCV1386     FALSE 0.416 35.000 0.000 1.000   NA
 1182259 1182260 XCV1386 XCV1387   hpt TRUE 0.959 0.000 0.034 1.000 N NA
 1182260 1182261 XCV1387 XCV1388 hpt deoD TRUE 0.944 88.000 0.067 0.003 Y NA
 1182261 1182262 XCV1388 XCV1389 deoD scoF FALSE 0.309 88.000 0.013 1.000 N NA
 1182262 1182263 XCV1389 XCV1390 scoF   TRUE 0.571 95.000 0.107 1.000 N NA
 1182263 1182264 XCV1390 XCV1391     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182265 1182266 XCV1392 XCV1393     TRUE 0.967 -10.000 0.460 1.000   NA
 1182266 1182267 XCV1393 XCV1394     TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.091   NA
 1182267 1182268 XCV1394 XCV1395     TRUE 0.605 227.000 0.751 NA N NA
 1182268 1182269 XCV1395 XCV1396     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 1182269 1182270 XCV1396 XCV1397     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 1182270 1182271 XCV1397 XCV1398     TRUE 0.473 234.000 0.500 NA N NA
 1182271 1182272 XCV1398 XCV1399     TRUE 0.886 108.000 0.667 NA   NA
 1182272 1182273 XCV1399 XCV1400     FALSE 0.109 229.000 0.000 NA   NA
 1182273 1182274 XCV1400 XCV1401   thlA TRUE 0.732 123.000 0.222 NA   NA
 1182276 1182277 XCV1403 XCV1404 ldh   FALSE 0.259 157.000 0.000 1.000   NA
 1182277 1182278 XCV1404 XCV1405     FALSE 0.159 197.000 0.000 NA   NA
 1182282 1182283 XCV1409 XCV1410     FALSE 0.024 453.000 0.000 NA   NA
 1182283 1182284 XCV1410 XCV1411     FALSE 0.226 190.000 0.009 NA   NA
 1182284 1182285 XCV1411 XCV1412     FALSE 0.271 153.000 0.000 1.000   NA
 1182285 1182286 XCV1412 XCV1413     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.003   NA
 1182286 1182287 XCV1413 XCV1414     FALSE 0.043 343.000 0.000 1.000   NA
 1182288 1182289 XCV1415 XCV1416     FALSE 0.068 276.000 0.000 NA   NA
 1182291 1182292 XCV1418 XCV1419     TRUE 0.654 16.000 0.000 NA   NA
 1182292 1182293 XCV1419 XCV1420     FALSE 0.123 220.000 0.000 NA   NA
 1182293 1182294 XCV1420 XCV1421     FALSE 0.078 272.000 0.000 1.000   NA
 1182294 1182295 XCV1421 XCV1422     FALSE 0.437 36.000 0.005 NA   NA
 1182295 1182296 XCV1422 XCV1423     TRUE 0.549 61.000 0.056 NA   NA
 1182296 1182297 XCV1423 XCV1424     TRUE 0.565 70.000 0.056 NA   NA
 1182299 1182300 XCV1426 XCV1427     TRUE 0.871 11.000 0.018 NA   NA
 1182301 1182302 XCV1428 XCV1429 cfa   TRUE 0.924 18.000 0.324 1.000   NA
 1182302 1182303 XCV1429 XCV1430     TRUE 0.984 -3.000 0.113 NA   NA
 1182303 1182304 XCV1430 XCV1431   cfa TRUE 0.982 -3.000 0.087 NA   NA
 1182304 1182305 XCV1431 XCV1432 cfa   TRUE 0.978 -3.000 0.053 NA   NA
 1182305 1182306 XCV1432 XCV1433     TRUE 0.996 -3.000 0.722 NA   NA
 1182306 1182307 XCV1433 XCV1434     TRUE 0.641 -120.000 0.047 1.000   NA
 1182307 1182308 XCV1434 XCV1435     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182308 1182309 XCV1435 XCV1436   rpoE3 TRUE 0.940 -15.000 0.349 NA   NA
 1182309 1182310 XCV1436 XCV1437 rpoE3   TRUE 0.526 59.000 0.048 NA   NA
 1182310 1182311 XCV1437 XCV1438     TRUE 0.775 86.000 0.286 NA   NA
 1182311 1182312 XCV1438 XCV1439     FALSE 0.016 614.000 0.000 NA   NA
 1182312 1182313 XCV1439 XCV1440     FALSE 0.293 -40.000 0.000 1.000 N NA
 1182313 1182314 XCV1440 XCV1441   metS FALSE 0.406 228.000 0.333 1.000 N NA
 1182314 1182315 XCV1441 XCV1442 metS   FALSE 0.148 247.000 0.019 NA   NA
 1182315 1182316 XCV1442 XCV1443     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182316 1182317 XCV1443 XCV1444     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1182317 1182318 XCV1444 XCV1445     FALSE 0.142 205.000 0.000 NA   NA
 1182319 1182320 XCV1446 XCV1447     TRUE 0.900 57.000 1.000 NA   NA
 1182320 1182321 XCV1447 XCV1448     FALSE 0.273 145.000 0.000 NA   NA
 1182321 1182322 XCV1448 XCV1449   mmuM TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 1182323 1182324 XCV1450 XCV1451     FALSE 0.132 276.000 0.032 NA   NA
 1182324 1182325 XCV1451 XCV1452     TRUE 0.937 5.000 0.020 NA   NA
 1182328 1182329 XCV1455 XCV1456     TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 1182330 1182331 XCV1457 XCV1458 phaZ   FALSE 0.140 274.000 0.034 NA   NA
 1182333 1182334 XCV1460 XCV1461     FALSE 0.353 90.000 0.000 NA   NA
 1182334 1182335 XCV1461 XCV1462   accA FALSE 0.359 58.000 0.003 1.000   NA
 1182335 1182336 XCV1462 XCV1463 accA dnaE2 FALSE 0.366 184.000 0.122 1.000 N NA
 1182336 1182337 XCV1463 XCV1464 dnaE2 rnhB FALSE 0.345 218.000 0.104 1.000   NA
 1182337 1182338 XCV1464 XCV1465 rnhB lpxB FALSE 0.166 352.000 0.186 1.000   NA
 1182338 1182339 XCV1465 XCV1466 lpxB lpxA TRUE 0.997 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 1182339 1182340 XCV1466 XCV1467 lpxA fabZ TRUE 0.517 26.000 0.022 1.000 N NA
 1182340 1182341 XCV1467 XCV1468 fabZ lpxD TRUE 0.945 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1182343 1182344 XCV1470 XCV1471 oma   TRUE 0.756 84.000 0.007 1.000 Y NA
 1182344 1182345 XCV1471 XCV1472   dxr TRUE 0.898 27.000 0.568 1.000 N NA
 1182345 1182346 XCV1472 XCV1473 dxr cdsA TRUE 0.997 3.000 0.372 1.000 Y NA
 1182346 1182347 XCV1473 XCV1474 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 1182347 1182348 XCV1474 XCV1475 uppS frr TRUE 0.916 18.000 0.409 1.000 N NA
 1182348 1182349 XCV1475 XCV1476 frr pyrH TRUE 0.688 188.000 0.626 1.000 N NA
 1182349 1182350 XCV1476 XCV1477 pyrH   FALSE 0.240 107.000 0.004 1.000 N NA
 1182350 1182351 XCV1477 XCV1478   tsf FALSE 0.037 277.000 0.002 1.000 N NA
 1182351 1182352 XCV1478 XCV1479 tsf rpsB TRUE 0.923 170.000 0.748 1.000 Y NA
 1182352 1182353 XCV1479 XCV1480 rpsB papD1 FALSE 0.011 392.000 0.000 NA N NA
 1182353 1182354 XCV1480 XCV1481 papD1   FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 1182354 1182355 XCV1481 XCV1482   papC TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 1182355 1182356 XCV1482 XCV1483 papC papD2 TRUE 0.973 -46.000 0.667 NA Y NA
 1182356 1182357 XCV1483 XCV1484 papD2   TRUE 0.956 9.000 0.125 NA   NA
 1182358 1182359 XCV1485 XCV1486 map glnD TRUE 0.978 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1182359 1182360 XCV1486 XCV1487 glnD dapD FALSE 0.029 361.000 0.012 1.000 N NA
 1182360 1182361 XCV1487 XCV1488 dapD   FALSE 0.260 193.000 0.061 1.000 N NA
 1182361 1182362 XCV1488 XCV1489   dapE FALSE 0.329 246.000 0.292 1.000 N NA
 1182362 1182363 XCV1489 XCV1490 dapE asnB FALSE 0.236 294.000 0.000 1.000 Y NA
 1182364 1182365 XCV1491 XCV1492     FALSE 0.031 388.000 0.000 NA   NA
 1182365 1182366 XCV1492 XCV1493     TRUE 0.979 4.000 0.000 0.020   NA
 1182366 1182367 XCV1493 XCV1494     FALSE 0.029 417.000 0.000 1.000   NA
 1182369 1182370 XCV1496 XCV1497 tpmT parC FALSE 0.016 778.000 0.000 1.000   NA
 1182370 1182371 XCV1497 XCV1498 parC   FALSE 0.220 62.000 0.005 1.000 N NA
 1182372 1182373 XCV1499 XCV1500   oprN3 TRUE 0.731 79.000 0.333 1.000 N NA
 1182373 1182374 XCV1500 XCV1501 oprN3   TRUE 0.947 11.000 0.278 1.000 N NA
 1182374 1182375 XCV1501 XCV1502     TRUE 0.993 7.000 0.900 1.000   NA
 1182375 1182376 XCV1502 XCV1503     FALSE 0.019 511.000 0.000 NA   NA
 1182376 1182377 XCV1503 XCV1504     FALSE 0.341 114.000 0.000 NA   NA
 1182378 1182379 XCV_tRNA21 XCV1505 tRNA-Leu bglS FALSE 0.285 141.000 0.000 NA   NA
 1182379 1182380 XCV1505 XCV1506 bglS   TRUE 0.530 107.000 0.027 1.000   NA
 1182381 1182382 XCV1507 XCV1508     TRUE 0.957 8.000 0.091 1.000   NA
 1182384 1182385 XCV1510 XCV1511     TRUE 0.827 52.000 0.500 NA   NA
 1182385 1182386 XCV1511 XCV1512     TRUE 0.821 67.000 0.429 NA   NA
 1182389 1182390 XCV1515 XCV1516     FALSE 0.177 199.000 0.028 1.000 N NA
 1182391 1182392 XCV1517 XCV1518   gst4 FALSE 0.062 242.000 0.006 1.000 N NA
 1182392 1182393 XCV1518 XCV1519 gst4 cynT1 TRUE 0.509 113.000 0.077 1.000 N NA
 1182394 1182395 XCV1520 XCV1521 pldA   FALSE 0.275 190.000 0.021 NA   NA
 1182397 1182398 XCV1523 XCV1524 pcp   TRUE 0.852 133.000 0.556 1.000   NA
 1182400 1182401 XCV1526 XCV1527     TRUE 0.964 0.000 0.013 NA   NA
 1182402 1182403 XCV1528 XCV1529     TRUE 0.791 144.000 0.429 1.000   NA
 1182403 1182404 XCV1529 XCV1530     TRUE 0.854 32.000 0.333 NA   NA
 1182404 1182405 XCV1530 XCV1531     TRUE 0.924 3.000 0.000 NA   NA
 1182405 1182406 XCV1531 XCV1532   gst5 FALSE 0.323 127.000 0.000 NA   NA
 1182406 1182407 XCV1532 XCV1533 gst5 asnB2 FALSE 0.209 185.000 0.028 1.000 N NA
 1182407 1182408 XCV1533 XCV1534 asnB2   FALSE 0.399 171.000 0.048 NA   NA
 1182408 1182409 XCV1534 XCV1535   dnaB FALSE 0.206 222.000 0.024 NA   NA
 1182409 1182410 XCV1535 XCV1536 dnaB   TRUE 0.877 22.000 0.006 1.000 Y NA
 1182410 1182411 XCV1536 XCV1537     FALSE 0.042 273.000 0.004 1.000 N NA
 1182413 1182414 XCV1539 XCV1540   mexE TRUE 0.963 -3.000 0.009 1.000   NA
 1182414 1182415 XCV1540 XCV1541 mexE mexF TRUE 0.750 179.000 0.750 1.000 N NA
 1182415 1182416 XCV1541 XCV1542 mexF   TRUE 0.607 44.000 0.160 1.000 N NA
 1182416 1182417 XCV1542 XCV1543   oprN4 TRUE 0.937 -6.000 0.160 1.000 N NA
 1182421 1182422 XCV1547 XCV1548     FALSE 0.331 79.000 0.000 NA   NA
 10702498 1182424 IS_1477_6 XCV1550     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182424 1182425 XCV1550 XCV1551     TRUE 0.715 33.000 0.000 0.084   NA
 1182426 1182427 XCV1552 XCV1553     TRUE 0.819 18.000 0.067 NA   NA
 1182428 1182429 XCV1554 XCV1555     TRUE 0.527 24.000 0.000 NA   NA
 1182431 1182432 XCV1557 XCV1558     TRUE 0.864 14.000 0.063 NA   NA
 1182436 1182437 XCV1562 XCV1563 hrcA grpE FALSE 0.382 99.000 0.025 1.000 N NA
 1182437 1182438 XCV1563 XCV1564 grpE dnaK TRUE 0.913 142.000 0.049 0.006 Y NA
 1182438 1182439 XCV1564 XCV1565 dnaK dnaJ TRUE 0.940 161.000 0.236 0.003 Y NA
 1182439 1182440 XCV1565 XCV1566 dnaJ pdxY FALSE 0.008 525.000 0.000 1.000 N NA
 1182440 1182441 XCV1566 XCV1567 pdxY   TRUE 0.917 -3.000 0.007 1.000 N NA
 1182442 1182443 XCV1568 XCV1569   oprN5 FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 1182443 1182444 XCV1569 XCV1570 oprN5   TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 N NA
 1182444 1182445 XCV1570 XCV1571     TRUE 0.976 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 1182445 1182446 XCV1571 XCV1572     FALSE 0.363 90.000 0.021 1.000 N NA
 1182446 1182447 XCV1572 XCV1573     FALSE 0.042 242.000 0.000 1.000 N NA
 1182447 1182448 XCV1573 XCV1574     TRUE 0.965 -3.000 0.012 1.000   NA
 1182448 1182449 XCV1574 XCV1575     FALSE 0.074 268.000 0.000 NA   NA
 1182449 1182450 XCV1575 XCV1576   lpd FALSE 0.308 154.000 0.008 NA   NA
 1182450 1182451 XCV1576 XCV1577 lpd sucB TRUE 0.904 112.000 0.253 1.000 Y NA
 1182451 1182452 XCV1577 XCV1578 sucB sucA TRUE 0.955 43.000 0.667 1.000 Y NA
 1182452 1182453 XCV1578 XCV1579 sucA   FALSE 0.401 37.000 0.000 1.000   NA
 1182453 1182454 XCV1579 XCV1580     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182454 1182455 XCV1580 XCV1581     FALSE 0.092 246.000 0.000 NA   NA
 1182455 1182456 XCV1581 XCV1582   purB FALSE 0.093 244.000 0.000 NA   NA
 1182460 1182461 XCV1586 XCV1587     FALSE 0.271 340.000 0.400 NA   NA
 1182461 1182462 XCV1587 XCV1588     TRUE 0.729 35.000 0.143 NA   NA
 1182462 1182463 XCV1588 XCV1589     TRUE 0.942 11.000 0.143 NA   NA
 1182463 1182464 XCV1589 XCV1590     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 1182464 1182465 XCV1590 XCV1591     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1182466 1182467 XCV1592 XCV1593   fkpA TRUE 0.821 86.000 0.042 1.000 Y NA
 1182467 1182468 XCV1593 XCV1594 fkpA ugd1 TRUE 0.856 26.000 0.357 1.000 N NA
 1182468 1182469 XCV1594 XCV1595 ugd1   TRUE 0.878 -7.000 0.020 NA   NA
 1182469 1182470 XCV1595 XCV1596     TRUE 0.737 19.000 0.024 NA   NA
 1182470 1182471 XCV1596 XCV1597     FALSE 0.040 343.000 0.000 NA   NA
 1182471 1182472 XCV1597 XCV1598     TRUE 0.558 139.000 0.077 NA   NA
 1182472 1182473 XCV1598 XCV1599     TRUE 0.851 14.000 0.115 1.000 N NA
 1182473 1182474 XCV1599 XCV1600     TRUE 0.997 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 1182474 1182475 XCV1600 XCV1601     TRUE 0.993 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 1182476 1182477 XCV1602 XCV1603 meth meth TRUE 0.867 167.000 0.009 0.001 Y NA
 1182477 1182478 XCV1603 XCV1604 meth   TRUE 0.941 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1182479 1182480 XCV1605 XCV1606 acdA   FALSE 0.033 265.000 0.000 1.000 N NA
 1182482 1182483 XCV1607 XCV1608 vacB   FALSE 0.089 274.000 0.004 1.000   NA
 1182483 1182484 XCV1608 XCV1609     FALSE 0.062 309.000 0.002 1.000   NA
 1182484 1182485 XCV1609 XCV1610     FALSE 0.223 103.000 0.002 1.000 N NA
 1182486 1182487 XCV1611 XCV1612 rnt   FALSE 0.076 264.000 0.000 NA   NA
 1182487 1182488 XCV1612 XCV1613   phoU TRUE 0.627 111.000 0.087 NA   NA
 1182488 1182489 XCV1613 XCV1614 phoU pstB TRUE 0.787 129.000 0.034 NA Y NA
 1182489 1182490 XCV1614 XCV1615 pstB pstA TRUE 0.992 23.000 0.526 0.002 Y NA
 1182490 1182491 XCV1615 XCV1616 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 1182491 1182492 XCV1616 XCV1617 pstC pstS TRUE 0.934 113.000 0.033 0.002 Y NA
 1182492 1182493 XCV1617 XCV1618 pstS phoX TRUE 0.735 349.000 0.333 0.002 Y NA
 1182493 1182494 XCV1618 XCV1619 phoX oprP1 TRUE 0.899 191.000 0.750 NA Y NA
 1182495 1182496 XCV1620 XCV1621   cynT2 TRUE 0.914 115.000 1.000 NA   NA
 1182496 1182497 XCV1621 XCV1622 cynT2   TRUE 0.969 12.000 0.069 1.000 Y NA
 1182498 1182499 XCV1623 XCV1624     TRUE 0.955 -3.000 0.005 NA   NA
 1182499 1182500 XCV1624 XCV1625     TRUE 0.966 8.000 0.160 NA   NA
 1182501 1182502 XCV1626 XCV1627     TRUE 0.527 113.000 0.028 1.000   NA
 1182502 1182503 XCV1627 XCV1628   sseA TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1182503 1182504 XCV1628 XCV1629 sseA   FALSE 0.352 89.000 0.000 NA   NA
 1182506 1182507 XCV1631 XCV1632     TRUE 0.963 -3.000 0.014 NA   NA
 1182507 1182508 XCV1632 XCV1633     FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182508 1182509 XCV1633 XCV1634     FALSE 0.057 302.000 0.000 1.000   NA
 1182509 1182510 XCV1634 XCV1635     FALSE 0.269 167.000 0.004 1.000   NA
 1182510 1182511 XCV1635 XCV1636   ppnk FALSE 0.055 221.000 0.000 1.000 N NA
 1182511 1182512 XCV1636 XCV1637 ppnk   FALSE 0.396 168.000 0.036 1.000   NA
 1182513 1182514 XCV1638 XCV1639     TRUE 0.675 116.000 0.139 NA   NA
 1182514 1182515 XCV1639 XCV1640   sbcB TRUE 0.974 -3.000 0.034 NA   NA
 1182515 1182516 XCV1640 XCV1641 sbcB   FALSE 0.077 259.000 0.017 1.000 N NA
 1182516 1182517 XCV1641 XCV1642     FALSE 0.378 172.000 0.100 1.000 N NA
 1182517 1182518 XCV1642 XCV1643     TRUE 0.647 34.000 0.060 NA   NA
 1182518 1182519 XCV1643 XCV1644     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182519 1182520 XCV1644 XCV1645     TRUE 0.728 13.000 0.000 NA   NA
 1182520 1182521 XCV1645 XCV1646     TRUE 0.530 87.000 0.027 1.000   NA
 1182522 1182523 XCV1647 XCV1648     TRUE 0.796 43.000 0.333 NA   NA
 1182523 1182524 XCV1648 XCV1649     TRUE 0.827 52.000 0.500 NA   NA
 1182524 1182525 XCV1649 XCV1650     TRUE 0.887 47.000 0.750 NA   NA
 1182525 1182526 XCV1650 XCV1651     TRUE 0.990 1.000 0.286 NA   NA
 1182526 1182527 XCV1651 XCV1652     FALSE 0.123 220.000 0.000 NA   NA
 1182527 1182528 XCV1652 XCV1653     TRUE 0.740 40.000 0.200 NA   NA
 1182528 1182529 XCV1653 XCV1654     FALSE 0.033 376.000 0.000 NA   NA
 1182529 1182530 XCV1654 XCV1655     TRUE 0.739 -10.000 0.000 NA   NA
 1182531 1182532 XCV1656 XCV1657     TRUE 0.981 2.000 0.116 NA   NA
 1182532 1182533 XCV1657 XCV1658     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1182533 1182534 XCV1658 XCV1659   asnS FALSE 0.379 136.000 0.009 NA   NA
 1182535 1182536 XCV1660 XCV1661   rpsF FALSE 0.028 407.000 0.000 NA   NA
 1182536 1182537 XCV1661 XCV1662 rpsF rpsR TRUE 0.994 12.000 0.319 0.011 Y NA
 1182537 1182538 XCV1662 XCV1663 rpsR rplI TRUE 0.943 188.000 0.499 0.011 Y NA
 1182538 1182539 XCV1663 XCV1664 rplI smc FALSE 0.061 210.000 0.000 1.000 N NA
 1182539 1182540 XCV1664 XCV1665 smc zipA TRUE 0.937 57.000 0.115 0.009 Y NA
 1182540 1182541 XCV1665 XCV1666 zipA   TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182543 1182544 XCV1668 XCV1669 ligA lysS TRUE 0.909 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1182544 1182545 XCV1669 XCV1670 lysS   TRUE 0.505 109.000 0.026 NA   NA
 1182545 1182546 XCV1670 XCV1671   gcn3 FALSE 0.202 199.000 0.009 NA   NA
 1182546 1182547 XCV1671 XCV1672 gcn3 gyrA FALSE 0.092 210.000 0.007 1.000 N NA
 1182547 1182548 XCV1672 XCV1673 gyrA gcd1 FALSE 0.065 225.000 0.002 1.000 N NA
 1182548 1182549 XCV1673 XCV1674 gcd1   FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 1182550 1182551 XCV1675 XCV1676   hutU FALSE 0.098 269.000 0.008 NA   NA
 1182551 1182552 XCV1676 XCV1677 hutU hutG TRUE 0.943 17.000 0.061 1.000 Y NA
 1182552 1182553 XCV1677 XCV1678 hutG hutH TRUE 0.662 182.000 0.039 1.000 Y NA
 1182553 1182554 XCV1678 XCV1679 hutH hutI TRUE 0.957 14.000 0.192 0.033 N NA
 1182555 1182556 XCV1680 XCV1681     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 1182556 1182557 XCV1681 XCV1682   hutC TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1182558 1182559 XCV1683 XCV1684     FALSE 0.055 540.000 0.087 NA   NA
 1182559 1182560 XCV1684 XCV1685     TRUE 0.499 163.000 0.095 NA   NA
 1182562 1182563 XCV1687 XCV1688     TRUE 0.950 126.000 0.790 0.049   NA
 1182564 1182565 XCV1689 XCV1690 serC pheA TRUE 0.866 85.000 0.121 1.000 Y NA
 1182565 1182566 XCV1690 XCV1691 pheA aroA TRUE 0.801 124.000 0.035 1.000 Y NA
 1182567 1182568 XCV1692 XCV1693 tonB2 tonB3 TRUE 0.722 248.000 0.333 0.002   NA
 1182571 1182572 XCV1696 XCV_tRNA23   tRNA-Ser FALSE 0.035 369.000 0.000 NA   NA
 1182572 1182573 XCV_tRNA23 XCV1697 tRNA-Ser   FALSE 0.350 88.000 0.000 NA   NA
 1182573 10702499 XCV1697 IS_Xac3_5     TRUE 0.471 -52.000 0.000 NA   NA
 10702499 1182574 IS_Xac3_5 XCV1698     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1182574 1182575 XCV1698 XCV1699     TRUE 0.991 9.000 0.409 0.083   NA
 1182578 1182579 XCV1702 XCV1703     FALSE 0.032 270.000 0.000 1.000 N NA
 1182579 1182580 XCV1703 XCV1704     FALSE 0.210 36.000 0.000 1.000 N NA
 1182583 1182584 XCV1707 XCV1708   cvgSY TRUE 0.994 -13.000 0.667 0.088 Y NA
 1182585 1182586 XCV1709 XCV1710   ccmH1 TRUE 0.993 -6.000 0.500 NA Y NA
 1182586 1182587 XCV1710 XCV1711 ccmH1 ccmG1 TRUE 0.962 63.000 1.000 NA Y NA
 1182587 1182588 XCV1711 XCV1712 ccmG1 ccmF1 TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.003 Y NA
 1182588 1182589 XCV1712 XCV1713 ccmF1 ccmE1 TRUE 0.905 64.000 0.008 0.003 Y NA
 1182589 1182590 XCV1713 XCV1714 ccmE1 ccmD1 TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 1182590 1182591 XCV1714 XCV1715 ccmD1 ccmC1 TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 1182591 1182592 XCV1715 XCV1716 ccmC1   TRUE 0.852 11.000 0.008 1.000   NA
 1182592 1182593 XCV1716 XCV1717     FALSE 0.270 504.000 0.833 NA   NA
 1182593 1182594 XCV1717 XCV1718   rpoE4 TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1182594 1182595 XCV1718 XCV1719 rpoE4   TRUE 0.865 52.000 0.667 NA   NA
 1182595 1182596 XCV1719 XCV1720     FALSE 0.145 429.000 0.286 NA   NA
 1182596 1182597 XCV1720 XCV1721     TRUE 0.923 27.000 0.571 NA   NA
 1182597 1182598 XCV1721 XCV1722     TRUE 0.849 84.000 0.500 NA   NA
 1182599 1182600 XCV1723 XCV1724     TRUE 0.757 -25.000 0.047 NA   NA
 1182600 1182601 XCV1724 XCV1725   wzxE TRUE 0.964 -3.000 0.012 1.000   NA
 1182601 1182602 XCV1725 XCV1726 wzxE   TRUE 0.973 -3.000 0.034 NA   NA
 1182602 1182603 XCV1726 XCV1727     TRUE 0.810 -15.000 0.034 NA   NA
 1182603 1182604 XCV1727 XCV1728     TRUE 0.912 44.000 1.000 NA   NA
 1182604 1182605 XCV1728 XCV1729     FALSE 0.068 284.000 0.000 1.000   NA
 1182605 1182606 XCV1729 XCV1730     TRUE 0.800 13.000 0.043 1.000 N NA
 1182606 1182607 XCV1730 XCV1731     TRUE 0.972 -3.000 0.083 1.000 N NA
 1182607 1182608 XCV1731 XCV1732     FALSE 0.418 125.000 0.042 1.000 N NA
 1182608 1182609 XCV1732 XCV1733     TRUE 0.997 -3.000 0.011 0.010 Y NA
 1182610 1182611 XCV1734 XCV1735     TRUE 0.706 56.000 0.222 NA   NA
 1182612 1182613 XCV1736 XCV1737     FALSE 0.408 67.000 0.007 1.000   NA
 1182614 1182615 XCV1738 XCV1739     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182616 1182617 XCV1740 XCV1741     FALSE 0.419 61.000 0.011 1.000   NA
 1182618 1182619 XCV1742 XCV1743 exoD   TRUE 0.905 -16.000 0.200 1.000   NA
 1182620 1182621 XCV1744 XCV1745 pitX pitA TRUE 0.973 10.000 0.030 NA Y NA
 1182621 1182622 XCV1745 XCV1746 pitA   FALSE 0.345 110.000 0.000 NA   NA
 1182623 1182624 XCV1747 XCV1748   parE FALSE 0.015 364.000 0.000 1.000 N NA
 1182625 1182626 XCV1749 XCV1750 pyrG   FALSE 0.277 221.000 0.138 1.000 N NA
 1182626 1182627 XCV1750 XCV1751     FALSE 0.387 108.000 0.004 NA   NA
 1182627 1182628 XCV1751 XCV1752   eno FALSE 0.366 125.000 0.003 NA   NA
 1182628 1182629 XCV1752 XCV1753 eno ftsB TRUE 0.976 4.000 0.241 1.000 N NA
 1182629 1182630 XCV1753 XCV1754 ftsB ispD TRUE 0.983 -3.000 0.185 1.000 N NA
 1182630 1182631 XCV1754 XCV1755 ispD ispF TRUE 0.996 4.000 0.419 1.000 Y NA
 1182631 1182632 XCV1755 XCV1756 ispF truD TRUE 0.715 114.000 0.173 1.000   NA
 1182634 1182635 XCV1758 XCV1759 surE   TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 1182635 1182636 XCV1759 XCV1760     TRUE 0.797 19.000 0.055 NA   NA
 1182636 1182637 XCV1760 XCV1761   nlpD TRUE 0.981 -3.000 0.074 NA   NA
 1182638 1182639 XCV1762 XCV1763     TRUE 0.752 16.000 0.014 NA   NA
 1182640 1182641 XCV1764 XCV1765 ftsJ ftsH FALSE 0.427 55.000 0.066 NA N NA
 1182641 1182642 XCV1765 XCV1766 ftsH folP TRUE 0.717 127.000 0.325 1.000 N NA
 1182642 1182643 XCV1766 XCV1767 folP miaA TRUE 0.928 0.000 0.009 1.000 N NA
 1182643 1182644 XCV1767 XCV1768 miaA hfq TRUE 0.859 78.000 0.531 1.000   NA
 1182644 1182645 XCV1768 XCV1769 hfq hflX TRUE 0.931 12.000 0.141 1.000   NA
 1182645 1182646 XCV1769 XCV1770 hflX   FALSE 0.031 422.000 0.002 NA   NA
 1182646 1182647 XCV1770 XCV1771     FALSE 0.033 466.000 0.011 NA   NA
 1182647 1182648 XCV1771 XCV1772   lexA2 TRUE 0.857 86.000 0.500 1.000   NA
 1182648 1182649 XCV1772 XCV1773 lexA2 recA FALSE 0.401 173.000 0.005 0.082 N NA
 1182649 1182650 XCV1773 XCV1774 recA recX FALSE 0.295 297.000 0.296 1.000   NA
 1182650 1182651 XCV1774 XCV1775 recX alaS TRUE 0.643 102.000 0.085 1.000   NA
 1182651 1182652 XCV1775 XCV1776 alaS csrA1 FALSE 0.292 140.000 0.020 1.000 N NA
 1182652 1182653 XCV1776 XCV_tRNA24 csrA1 tRNA-Ser FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1182653 1182654 XCV_tRNA24 XCV1777 tRNA-Ser   FALSE 0.015 680.000 0.000 NA   NA
 1182654 1182655 XCV1777 XCV1778     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 1182655 1182656 XCV1778 XCV1779     FALSE 0.341 84.000 0.000 NA   NA
 1182658 1182659 XCV1781 XCV1782     TRUE 0.732 45.000 0.222 NA   NA
 1182660 1182661 XCV_tRNA25 XCV_tRNA26 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.351 102.000 0.000 NA   NA
 1182661 1182662 XCV_tRNA26 XCV1783 tRNA-Arg   FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182662 1182663 XCV1783 XCV1784   thiD TRUE 0.986 -3.000 0.148 NA   NA
 1182663 1182664 XCV1784 XCV1785 thiD   TRUE 0.735 -40.000 0.065 NA   NA
 1182664 1182665 XCV1785 XCV1786     TRUE 0.952 7.000 0.065 NA   NA
 1182665 1182666 XCV1786 XCV1787     TRUE 0.972 0.000 0.027 NA   NA
 1182666 1182667 XCV1787 XCV1788     TRUE 0.451 83.000 0.050 1.000 N NA
 1182667 1182668 XCV1788 XCV1789     FALSE 0.414 37.000 0.002 NA   NA
 1182668 1182669 XCV1789 XCV1790   gcvR TRUE 0.848 12.000 0.020 NA   NA
 1182670 1182671 XCV1791 XCV1792 dapA   TRUE 0.773 17.000 0.028 NA   NA
 1182672 1182673 XCV1793 XCV1794     TRUE 0.919 84.000 0.500 0.013 N NA
 1182673 1182674 XCV1794 XCV1795     TRUE 0.993 -3.000 0.053 NA Y NA
 1182674 1182675 XCV1795 XCV1796   dgoD TRUE 0.884 -6.000 0.053 NA N NA
 1182675 1182676 XCV1796 XCV1797 dgoD dgoA TRUE 0.994 -3.000 0.192 0.034 N NA
 1182677 1182678 XCV1798 XCV1799     TRUE 0.676 159.000 0.286 1.000   NA
 1182678 1182679 XCV1799 XCV1800     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.020   NA
 1182679 1182680 XCV1800 XCV1801     FALSE 0.375 339.000 0.000 0.020 Y NA
 1182680 1182681 XCV1801 XCV1802     TRUE 0.838 112.000 0.429 1.000   NA
 1182681 1182682 XCV1802 XCV1803     TRUE 0.843 89.000 0.429 1.000   NA
 1182682 1182683 XCV1803 XCV1804     TRUE 0.958 12.000 0.300 1.000   NA
 1182683 1182684 XCV1804 XCV1805     TRUE 0.959 102.000 0.250 0.023 Y NA
 1182684 1182685 XCV1805 XCV1806     TRUE 0.717 -106.000 0.094 1.000   NA
 1182685 1182686 XCV1806 XCV1807     TRUE 0.974 -3.000 0.029 1.000   NA
 1182686 1182687 XCV1807 XCV1808     TRUE 0.842 47.000 0.091 1.000 Y NA
 1182687 1182688 XCV1808 XCV1809     TRUE 0.468 86.000 0.013 1.000   NA
 1182688 1182689 XCV1809 XCV1810     FALSE 0.082 257.000 0.000 NA   NA
 1182691 1182692 XCV1812 XCV1813 amiC   TRUE 0.559 37.000 0.026 1.000   NA
 1182694 1182695 XCV1814 XCV1815 pcnB folK TRUE 0.976 4.000 0.234 1.000 N NA
 1182695 1182696 XCV1815 XCV1816 folK panB TRUE 0.885 36.000 0.117 1.000 Y NA
 1182696 1182697 XCV1816 XCV1817 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 1182697 1182698 XCV1817 XCV1818 panC panD TRUE 0.850 177.000 0.342 1.000 Y NA
 1182698 1182699 XCV1818 XCV1819 panD pgi TRUE 0.929 -3.000 0.011 1.000 N NA
 1182699 1182700 XCV1819 XCV1820 pgi   FALSE 0.246 155.000 0.000 NA   NA
 1182700 1182701 XCV1820 XCV1821     TRUE 0.984 4.000 0.278 NA   NA
 1182703 1182704 XCV1823 XCV1824 celD   FALSE 0.216 257.000 0.071 1.000   NA
 1182707 1182708 XCV1827 XCV1828 regR regS TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 1182709 1182710 XCV1829 XCV1830 ispG   TRUE 0.896 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 1182711 1182712 XCV1831 XCV1832     FALSE 0.130 194.000 0.011 1.000 N NA
 1182712 1182713 XCV1832 XCV1833     FALSE 0.218 140.000 0.011 NA N NA
 1182713 1182714 XCV1833 XCV1834   murB TRUE 0.914 -3.000 0.008 NA N NA
 1182714 1182715 XCV1834 XCV1835 murB pyrD TRUE 0.925 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1182715 1182716 XCV1835 XCV1836 pyrD   TRUE 0.913 6.000 0.006 1.000   NA
 1182716 1182717 XCV1836 XCV1837     TRUE 0.986 -3.000 0.138 NA   NA
 1182717 1182718 XCV1837 XCV1838     FALSE 0.043 495.000 0.032 NA   NA
 10702500 1182720 IS_1477_7 XCV1840     FALSE 0.288 -862.000 0.000 NA   NA
 1182720 1182721 XCV1840 XCV1841     TRUE 0.717 33.000 0.000 0.082   NA
 1182721 1182722 XCV1841 XCV1842     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 10702501 1182723 IS_xac3_2 XCV1843     FALSE 0.324 -349.000 0.000 NA   NA
 1182723 1182724 XCV1843 XCV1844     TRUE 0.997 9.000 0.409 0.082 Y NA
 1182724 1182725 XCV1844 XCV1845     FALSE 0.323 65.000 0.000 NA   NA
 10702502 1182726 IS_Xcc1_5 XCV1846     FALSE 0.307 -760.000 0.000 NA   NA
 1182726 1182727 XCV1846 XCV1847     TRUE 0.927 99.000 0.500 0.082   NA
 1182727 1182728 XCV1847 XCV1848     FALSE 0.223 266.000 0.000 0.082   NA
 1182730 10702503 XCV1849 IS_Xcv2_1     FALSE 0.252 -895.000 0.000 NA   NA
 10702503 1182731 IS_Xcv2_1 XCV1850     FALSE 0.326 67.000 0.000 NA   NA
 1182731 1182732 XCV1850 XCV1851     TRUE 0.927 99.000 0.500 0.081   NA
 1182733 1182734 XCV1852 XCV1853     FALSE 0.116 225.000 0.000 NA   NA
 1182734 1182735 XCV1853 XCV1854     FALSE 0.128 215.000 0.000 NA   NA
 1182736 1182737 XCV1855 XCV1856     FALSE 0.085 251.000 0.000 NA   NA
 1182737 1182738 XCV1856 XCV1857     FALSE 0.028 408.000 0.000 NA   NA
 1182739 1182740 XCV1858 XCV1859   fhaC FALSE 0.005 782.000 0.000 NA N NA
 1182740 1182741 XCV1859 XCV1860 fhaC fhaB1 FALSE 0.352 41.000 0.000 NA   NA
 1182741 1182742 XCV1860 XCV1861 fhaB1 fhaB2 TRUE 0.682 52.000 0.000 0.014   NA
 1182742 10702504 XCV1861 IS_1477_8 fhaB2   TRUE 0.640 -16.000 0.000 NA   NA
 10702504 1182743 IS_1477_8 XCV1862     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182743 1182744 XCV1862 XCV1863     TRUE 0.719 33.000 0.000 0.081   NA
 1182744 1182745 XCV1863 XCV1864     FALSE 0.307 135.000 0.000 NA   NA
 1182745 1182746 XCV1864 XCV1865     TRUE 0.469 29.000 0.000 NA   NA
 1182746 1182747 XCV1865 XCV1866   thrA FALSE 0.007 590.000 0.000 1.000 N NA
 1182747 1182748 XCV1866 XCV1867 thrA thrB TRUE 0.991 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 1182750 1182751 XCV1869 XCV1870 thrC   FALSE 0.388 102.000 0.003 NA   NA
 1182753 1182754 XCV1872 XCV1873 hisS   FALSE 0.140 214.000 0.000 1.000   NA
 1182754 1182755 XCV1873 XCV1874   hisG TRUE 0.889 10.000 0.013 1.000   NA
 1182755 1182756 XCV1874 XCV1875 hisG hisD TRUE 0.999 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 1182756 1182757 XCV1875 XCV1876 hisD hisC2 TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 1182757 1182758 XCV1876 XCV1877 hisC2 hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 1182758 1182759 XCV1877 XCV1878 hisB hisH TRUE 0.999 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 1182759 1182760 XCV1878 XCV1879 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 1182760 1182761 XCV1879 XCV1880 hisA hisF TRUE 0.998 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 1182761 1182762 XCV1880 XCV1881 hisF hisIE TRUE 0.996 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 1182762 1182763 XCV1881 XCV1882 hisIE   FALSE 0.221 180.000 0.003 NA   NA
 1182764 1182765 XCV1883 XCV1884     TRUE 0.467 98.000 0.012 1.000   NA
 1182765 1182766 XCV1884 XCV1885     TRUE 0.986 3.000 0.231 1.000   NA
 1182766 1182767 XCV1885 XCV1886     TRUE 0.738 36.000 0.148 1.000   NA
 1182767 1182768 XCV1886 XCV1887     FALSE 0.442 90.000 0.041 1.000 N NA
 1182768 1182769 XCV1887 XCV1888     TRUE 0.986 77.000 0.833 0.003 Y NA
 1182772 1182773 XCV1891 XCV1892     TRUE 0.701 35.000 0.111 NA   NA
 1182773 1182774 XCV1892 XCV1893     TRUE 0.991 -3.000 0.294 NA   NA
 1182775 1182776 XCV1894 XCV1895   efP1 TRUE 0.978 0.000 0.051 NA   NA
 1182776 1182777 XCV1895 XCV1896 efP1   TRUE 0.531 101.000 0.085 1.000 N NA
 1182777 1182778 XCV1896 XCV1897   mvaB TRUE 0.755 138.000 0.125 0.052 N NA
 1182778 1182779 XCV1897 XCV1898 mvaB   TRUE 0.815 107.000 0.042 NA Y NA
 1182779 1182780 XCV1898 XCV1899     TRUE 0.948 -3.000 0.027 NA N NA
 1182781 1182782 XCV1900 XCV1901 feoA feoB TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 1182782 1182783 XCV1901 XCV1902 feoB   TRUE 0.966 2.000 0.028 NA   NA
 1182783 1182784 XCV1902 XCV1903     TRUE 0.800 61.000 0.400 NA   NA
 1182784 1182785 XCV1903 XCV1904     FALSE 0.442 52.000 0.021 NA   NA
 1182785 1182786 XCV1904 XCV1905     TRUE 0.990 3.000 0.031 0.012   NA
 1182786 1182787 XCV1905 XCV1906   dapB FALSE 0.017 672.000 0.000 1.000   NA
 1182787 1182788 XCV1906 XCV1907 dapB carA TRUE 0.465 241.000 0.034 1.000 Y NA
 1182788 1182789 XCV1907 XCV1908 carA   TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182789 1182790 XCV1908 XCV1909   carB TRUE 0.851 9.000 0.000 NA   NA
 1182790 1182791 XCV1909 XCV1910 carB greA TRUE 0.986 -3.000 0.241 1.000 N NA
 1182791 1182792 XCV1910 XCV1911 greA rpfE TRUE 0.557 -55.000 0.011 NA   NA
 1182792 1182793 XCV1911 XCV1912 rpfE   TRUE 0.960 -3.000 0.010 NA   NA
 1182795 1182796 XCV1914 XCV1915 rpfD prfB FALSE 0.087 249.000 0.000 NA   NA
 1182796 1182797 XCV1915 XCV1916 prfB lysU TRUE 0.850 204.000 0.162 0.032 Y NA
 1182797 1182798 XCV1916 XCV1917 lysU rpfG FALSE 0.198 141.000 0.005 1.000 N NA
 1182798 1182799 XCV1917 XCV1918 rpfG rpfH TRUE 0.983 2.000 0.133 NA   NA
 1182799 1182800 XCV1918 XCV1919 rpfH rpfC TRUE 0.957 8.000 0.100 NA   NA
 1182801 1182802 XCV1920 XCV1921 rpfF rpfB TRUE 0.868 177.000 0.108 0.052 Y NA
 1182803 1182804 XCV1922 XCV1923     TRUE 0.579 -21.000 0.000 NA   NA
 1182806 1182807 XCV1925 XCV1926     TRUE 0.988 -3.000 0.177 NA   NA
 1182807 1182808 XCV1926 XCV1927   acnB TRUE 0.456 51.000 0.023 NA   NA
 1182808 1182809 XCV1927 XCV1928 acnB   FALSE 0.229 189.000 0.007 1.000   NA
 1182810 1182811 XCV1929 XCV1930   cheB1 TRUE 0.915 67.000 0.045 0.029 Y NA
 1182811 1182812 XCV1930 XCV1931 cheB1 CheD TRUE 0.997 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 1182812 1182813 XCV1931 XCV1932 CheD cheR2 TRUE 0.991 3.000 0.056 1.000 Y NA
 1182813 1182814 XCV1932 XCV1933 cheR2   FALSE 0.346 243.000 0.000 1.000 Y NA
 1182814 1182815 XCV1933 XCV1934     TRUE 0.741 84.000 0.222 NA   NA
 1182815 1182816 XCV1934 XCV1935   cheW1 FALSE 0.156 453.000 0.333 NA   NA
 1182816 1182817 XCV1935 XCV1936 cheW1   TRUE 0.598 136.000 0.200 NA N NA
 1182817 1182818 XCV1936 XCV1937     FALSE 0.054 300.000 0.000 NA   NA
 1182818 1182819 XCV1937 XCV1938     TRUE 0.595 19.000 0.000 NA   NA
 1182819 1182820 XCV1938 XCV1939     FALSE 0.197 649.000 0.000 0.012 Y NA
 1182820 1182821 XCV1939 XCV1940     FALSE 0.414 327.000 0.000 0.012 Y NA
 1182821 1182822 XCV1940 XCV1941     FALSE 0.208 587.000 0.000 0.012 Y NA
 1182822 1182823 XCV1941 XCV1942     TRUE 0.889 108.000 0.000 0.012 Y NA
 1182823 1182824 XCV1942 XCV1943     FALSE 0.163 194.000 0.000 NA   NA
 1182824 1182825 XCV1943 XCV1944     TRUE 0.578 20.000 0.000 NA   NA
 1182825 1182826 XCV1944 XCV1945     TRUE 0.501 284.000 0.000 0.012 Y NA
 1182826 1182827 XCV1945 XCV1946     FALSE 0.082 257.000 0.000 NA   NA
 1182827 1182828 XCV1946 XCV1947     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 1182828 1182829 XCV1947 XCV1948     TRUE 0.674 222.000 0.000 0.012 Y NA
 1182829 1182830 XCV1948 XCV1949     TRUE 0.946 0.000 0.000 NA   NA
 1182830 1182831 XCV1949 XCV1950     TRUE 0.696 14.000 0.000 NA   NA
 1182831 1182832 XCV1950 XCV1951     FALSE 0.053 301.000 0.000 NA   NA
 1182832 1182833 XCV1951 XCV1952     TRUE 0.991 7.000 0.000 0.012 Y NA
 1182833 1182834 XCV1952 XCV1953     FALSE 0.018 540.000 0.000 NA   NA
 1182834 1182835 XCV1953 XCV1954     FALSE 0.124 219.000 0.000 NA   NA
 1182835 1182836 XCV1954 XCV1955     TRUE 0.450 307.000 0.000 0.012 Y NA
 1182836 1182837 XCV1955 XCV1956   cheA1 TRUE 0.869 52.000 0.000 0.012 Y NA
 1182837 1182838 XCV1956 XCV1957 cheA1 cheY TRUE 0.897 34.000 0.135 1.000 Y NA
 1182838 1182839 XCV1957 XCV1958 cheY   TRUE 0.995 -3.000 0.514 NA   NA
 1182839 1182840 XCV1958 XCV1959   cheW2 TRUE 0.725 103.000 0.190 NA   NA
 1182840 1182841 XCV1959 XCV1960 cheW2   TRUE 0.953 -3.000 0.028 1.000 N NA
 1182841 1182842 XCV1960 XCV1961   motB1 TRUE 0.980 2.000 0.199 1.000 N NA
 1182842 1182843 XCV1961 XCV1962 motB1 motA1 TRUE 0.992 7.000 0.248 1.000 Y NA
 1182844 1182845 XCV1963 XCV1964     TRUE 0.578 20.000 0.000 NA   NA
 1182845 1182846 XCV1964 XCV1965     TRUE 0.875 7.000 0.000 NA   NA
 1182846 1182847 XCV1965 XCV1966     FALSE 0.049 314.000 0.000 NA   NA
 1182847 1182848 XCV1966 XCV1967     FALSE 0.346 42.000 0.000 NA   NA
 1182848 10702505 XCV1967 IS_1477_9     FALSE 0.020 505.000 0.000 NA   NA
 10702505 1182849 IS_1477_9 XCV1968     FALSE 0.364 -330.000 0.000 NA   NA
 1182849 1182850 XCV1968 XCV1969     TRUE 0.719 33.000 0.000 0.081   NA
 1182850 1182851 XCV1969 XCV1970     FALSE 0.037 372.000 0.000 1.000   NA
 1182851 1182852 XCV1970 XCV1971     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 1182852 1182853 XCV1971 XCV1972     TRUE 0.917 87.000 1.000 NA   NA
 1182853 1182854 XCV1972 XCV1973     TRUE 0.654 16.000 0.000 NA   NA
 1182855 1182856 XCV1974 XCV1975 cheA2 cheZ TRUE 0.996 3.000 0.341 1.000 Y NA
 1182856 1182857 XCV1975 XCV1976 cheZ cheY TRUE 0.998 0.000 0.516 1.000 Y NA
 1182857 1182858 XCV1976 XCV1977 cheY fliA TRUE 0.869 36.000 0.283 0.075 N NA
 1182858 1182859 XCV1977 XCV1978 fliA fleN TRUE 0.992 -3.000 0.482 1.000 N NA
 1182859 1182860 XCV1978 XCV1979 fleN flhF TRUE 0.963 -13.000 0.241 0.016 N NA
 1182860 1182861 XCV1979 XCV1980 flhF flhA FALSE 0.086 674.000 0.008 1.000 Y NA
 1182861 1182862 XCV1980 XCV1981 flhA flhB TRUE 0.997 -3.000 0.029 0.011 Y NA
 1182862 1182863 XCV1981 XCV1982 flhB   FALSE 0.244 140.000 0.012 1.000 N NA
 1182863 1182864 XCV1982 XCV1983     TRUE 0.557 271.000 0.000 0.008 Y NA
 1182864 1182865 XCV1983 XCV1984     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 1182865 1182866 XCV1984 XCV1985     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182866 1182867 XCV1985 XCV1986   fliR FALSE 0.299 202.000 0.111 1.000 N NA
 1182867 1182868 XCV1986 XCV1987 fliR fliQ TRUE 0.974 14.000 0.215 1.000 Y NA
 1182868 1182869 XCV1987 XCV1988 fliQ fliP FALSE 0.353 893.000 0.177 0.011 Y NA
 1182869 1182870 XCV1988 XCV1989 fliP fliO TRUE 0.991 2.000 0.029 1.000 Y NA
 1182870 1182871 XCV1989 XCV1990 fliO fliN TRUE 0.983 -3.000 0.090 1.000   NA
 1182871 1182872 XCV1990 XCV1991 fliN fliM TRUE 0.994 -3.000 0.026 0.001   NA
 1182872 1182873 XCV1991 XCV1992 fliM fliL TRUE 0.991 11.000 0.029 0.001 Y NA
 1182873 1182874 XCV1992 XCV1993 fliL fliK TRUE 0.682 166.000 0.025 1.000 Y NA
 1182874 1182875 XCV1993 XCV1994 fliK fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005   NA
 1182875 1182876 XCV1994 XCV1995 fliJ fliI TRUE 0.962 4.000 0.044 1.000   NA
 1182876 1182877 XCV1995 XCV1996 fliI fliH TRUE 0.995 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 1182877 1182878 XCV1996 XCV1997 fliH fliG TRUE 0.999 -3.000 0.320 0.003 Y NA
 1182878 1182879 XCV1997 XCV1998 fliG fliF TRUE 0.992 -10.000 0.189 0.005 Y NA
 1182879 1182880 XCV1998 XCV1999 fliF fliE TRUE 0.997 14.000 0.910 0.005 Y NA
 1182880 1182881 XCV1999 XCV2000 fliE   FALSE 0.121 221.000 0.000 NA   NA
 1182881 1182882 XCV2000 XCV2001     FALSE 0.313 61.000 0.000 NA   NA
 1182882 1182883 XCV2001 XCV2002     FALSE 0.014 797.000 0.000 NA   NA
 1182883 1182884 XCV2002 XCV2003   kdsB1 TRUE 0.759 12.000 0.000 NA   NA
 1182884 1182885 XCV2003 XCV2004 kdsB1   TRUE 0.448 42.000 0.013 NA   NA
 1182885 1182886 XCV2004 XCV2005     FALSE 0.181 185.000 0.000 NA   NA
 1182886 1182887 XCV2005 XCV2006     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA   NA
 1182887 1182888 XCV2006 XCV2007     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 1182888 1182889 XCV2007 XCV2008     TRUE 0.631 31.000 0.027 1.000   NA
 1182889 1182890 XCV2008 XCV2009     TRUE 0.979 -3.000 0.054 1.000   NA
 1182890 1182891 XCV2009 XCV2010     TRUE 0.992 15.000 0.400 0.032 Y NA
 1182891 1182892 XCV2010 XCV2011   fabH TRUE 0.900 57.000 0.308 1.000 Y NA
 1182892 1182893 XCV2011 XCV2012 fabH   TRUE 0.976 6.000 0.219 NA   NA
 1182893 1182894 XCV2012 XCV2013     TRUE 0.528 65.000 0.041 NA   NA
 1182894 1182895 XCV2013 XCV2014   fleQ FALSE 0.303 118.000 0.014 1.000 N NA
 1182895 1182896 XCV2014 XCV2015 fleQ   TRUE 0.987 -7.000 0.050 0.075 Y NA
 1182896 1182897 XCV2015 XCV2016   rpoN1 TRUE 0.964 9.000 0.050 0.075 N NA
 1182897 1182898 XCV2016 XCV2017 rpoN1   TRUE 0.700 217.000 0.000 0.006 Y NA
 1182898 1182899 XCV2017 XCV2018     TRUE 0.783 36.000 0.238 NA   NA
 1182899 1182900 XCV2018 XCV2019     TRUE 0.990 0.000 0.250 NA   NA
 1182900 1182901 XCV2019 XCV2020   fliS TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 1182901 1182902 XCV2020 XCV2021 fliS fliD TRUE 0.970 151.000 0.500 0.002 Y NA
 1182902 1182903 XCV2021 XCV2022 fliD fliC FALSE 0.283 272.000 0.000 1.000 Y NA
 1182903 1182904 XCV2022 XCV2023 fliC flgL TRUE 0.497 318.000 0.000 0.001 Y NA
 1182904 1182905 XCV2023 XCV2024 flgL flgK TRUE 0.999 0.000 0.108 0.001 Y NA
 1182905 1182906 XCV2024 XCV2025 flgK flgJ TRUE 0.989 12.000 0.034 0.002 Y NA
 1182906 1182907 XCV2025 XCV2026 flgJ flgI TRUE 0.998 2.000 0.064 0.006 Y NA
 1182907 1182908 XCV2026 XCV2027 flgI flgH TRUE 0.993 11.000 0.106 0.006 Y NA
 1182908 1182909 XCV2027 XCV2028 flgH flgG TRUE 0.954 39.000 0.120 0.005 Y NA
 1182909 1182910 XCV2028 XCV2029 flgG flgF FALSE 0.426 760.000 0.174 0.001 Y NA
 1182910 1182911 XCV2029 XCV2030 flgF flgE TRUE 0.975 145.000 0.594 0.003 Y NA
 1182911 1182912 XCV2030 XCV2031 flgE flgD TRUE 0.975 32.000 0.875 NA Y NA
 1182912 1182913 XCV2031 XCV2032 flgD flgC TRUE 0.892 38.000 0.174 NA Y NA
 1182913 1182914 XCV2032 XCV2033 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.611 0.003 Y NA
 1182914 1182915 XCV2033 XCV2034 flgB   TRUE 0.450 334.000 0.267 1.000 Y NA
 1182916 1182917 XCV2035 XCV2036 flgA   TRUE 0.800 67.000 0.371 NA   NA
 1182917 1182918 XCV2036 XCV2037     TRUE 0.956 16.000 0.052 0.002   NA
 1182918 1182919 XCV2037 XCV2038     TRUE 0.706 167.000 0.364 1.000   NA
 1182920 1182921 XCV2039 XCV2040     TRUE 0.997 4.000 0.200 0.029 Y NA
 1182923 1182924 XCV2042 XCV2043     FALSE 0.029 405.000 0.000 NA   NA
 1182924 1182925 XCV2043 XCV2044     TRUE 0.555 87.000 0.041 NA   NA
 1182925 1182926 XCV2044 XCV2045     FALSE 0.440 149.000 0.036 NA   NA
 1182926 1182927 XCV2045 XCV2046   trmU TRUE 0.988 0.000 0.180 NA   NA
 1182927 1182928 XCV2046 XCV2047 trmU   TRUE 0.981 -3.000 0.158 1.000 N NA
 1182929 1182930 XCV2048 XCV2049 clpS clpA TRUE 0.832 143.000 0.596 NA   NA
 1182930 1182931 XCV2049 XCV2050 clpA   TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   NA
 1182932 1182933 XCV2051 XCV2052 infA aat FALSE 0.340 81.000 0.020 1.000 N NA
 1182933 1182934 XCV2052 XCV2053 aat   FALSE 0.163 131.000 0.000 1.000 N NA
 1182934 1182935 XCV2053 XCV2054     FALSE 0.074 269.000 0.000 NA   NA
 1182935 1182936 XCV2054 XCV2055   trxB1 FALSE 0.383 58.000 0.010 NA   NA
 1182937 1182938 XCV2056 XCV2057 ftsK   FALSE 0.426 151.000 0.033 NA   NA
 1182938 1182939 XCV2057 XCV2058   lolA FALSE 0.437 107.000 0.011 NA   NA
 1182941 1182942 XCV2060 XCV2061   crcB FALSE 0.100 180.000 0.002 NA N NA
 1182942 1182943 XCV2061 XCV2062 crcB   TRUE 0.501 26.000 0.000 NA   NA
 1182944 1182945 XCV2063 XCV2064 fadA fadB TRUE 0.921 155.000 0.588 1.000 Y NA
 1182945 1182946 XCV2064 XCV2065 fadB   TRUE 0.517 25.000 0.019 1.000 N NA
 1182947 1182948 XCV2066 XCV2067 ndk   TRUE 0.969 7.000 0.156 1.000   NA
 1182948 1182949 XCV2067 XCV2068     TRUE 0.930 11.000 0.086 1.000   NA
 1182949 1182950 XCV2068 XCV2069     TRUE 0.989 -3.000 0.204 1.000   NA
 1182950 1182951 XCV2069 XCV2070     TRUE 0.457 71.000 0.015 1.000   NA
 1182951 1182952 XCV2070 XCV2071     TRUE 0.995 0.000 0.492 1.000   NA
 1182952 1182953 XCV2071 XCV2072   engA TRUE 0.956 11.000 0.203 1.000   NA
 1182953 1182954 XCV2072 XCV2073 engA moeA1 FALSE 0.057 303.000 0.000 1.000   NA
 1182956 1182957 XCV2075 XCV2076     TRUE 0.857 98.000 0.500 NA   NA
 1182957 1182958 XCV2076 XCV2077     FALSE 0.021 496.000 0.000 NA   NA
 1182958 1182959 XCV2077 XCV2078     TRUE 0.993 4.000 0.667 NA   NA
 1182959 1182960 XCV2078 XCV2079     TRUE 0.883 14.000 0.091 NA   NA
 1182964 1182965 XCV2083 XCV2084 moeA2   TRUE 0.922 38.000 0.005 0.002 Y NA
 1182965 1182966 XCV2084 XCV2085     TRUE 0.686 -16.000 0.005 NA   NA
 1182966 1182967 XCV2085 XCV2086     FALSE 0.113 227.000 0.000 NA   NA
 1182968 1182969 XCV2087 XCV2088   pedG TRUE 0.929 -7.000 0.081 1.000   NA
 1182969 1182970 XCV2088 XCV2089 pedG   FALSE 0.134 146.000 0.000 1.000 N NA
 1182971 1182972 XCV2090 XCV2091 nasT nasS TRUE 0.968 5.000 0.218 NA N NA
 1182972 1182973 XCV2091 XCV2092 nasS nasA FALSE 0.062 888.000 0.000 NA Y NA
 1182973 1182974 XCV2092 XCV2093 nasA nasB TRUE 0.694 23.000 0.074 1.000 N NA
 1182974 1182975 XCV2093 XCV2094 nasB nasE TRUE 0.998 -3.000 0.539 0.001 N NA
 1182975 1182976 XCV2094 XCV2095 nasE   TRUE