MicrobesOnline Operon Predictions for Polynucleobacter sp. QLW-P1DMWA-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6888925 6888926 Pnuc_0001 Pnuc_0002     TRUE 0.691 264.000 0.328 1.000 Y NA
 6888926 6888927 Pnuc_0002 Pnuc_0003     TRUE 0.944 12.000 0.114 1.000 Y NA
 6888927 6888928 Pnuc_0003 Pnuc_0004     FALSE 0.324 3.000 0.002 1.000   NA
 6888928 6888929 Pnuc_0004 Pnuc_0005     TRUE 0.762 9.000 0.081 NA   NA
 6888929 6888930 Pnuc_0005 Pnuc_0006     FALSE 0.119 102.000 0.030 NA   NA
 6888930 6888931 Pnuc_0006 Pnuc_0007     TRUE 0.997 -3.000 0.716 0.020 Y NA
 6888931 6888932 Pnuc_0007 Pnuc_0008     TRUE 0.808 29.000 0.000 NA Y NA
 6888932 6888933 Pnuc_0008 Pnuc_0009     TRUE 0.846 4.000 0.000 NA Y NA
 6888933 6888934 Pnuc_0009 Pnuc_0010     TRUE 0.983 -3.000 0.068 0.032 Y NA
 6888935 6888936 Pnuc_0011 Pnuc_0012     TRUE 0.912 8.000 0.286 NA   NA
 6888936 6888937 Pnuc_0012 Pnuc_0013     TRUE 0.993 0.000 0.571 1.000 Y NA
 6888938 6888939 Pnuc_0014 Pnuc_0015     FALSE 0.030 107.000 0.002 1.000   NA
 6888939 6888940 Pnuc_0015 Pnuc_0016     TRUE 0.758 -3.000 0.002 1.000 N NA
 6888940 6888941 Pnuc_0016 Pnuc_0017     FALSE 0.489 18.000 0.003 1.000 N NA
 6888941 6888942 Pnuc_0017 Pnuc_0018     TRUE 0.976 21.000 0.827 1.000 N NA
 6888942 6888943 Pnuc_0018 Pnuc_0019     FALSE 0.147 69.000 0.016 1.000   NA
 6888943 6888944 Pnuc_0019 Pnuc_0020     TRUE 0.878 40.000 0.330 1.000   NA
 6888944 6888945 Pnuc_0020 Pnuc_0021     TRUE 0.970 46.000 0.557 0.005 Y NA
 6888945 6888946 Pnuc_0021 Pnuc_0022     TRUE 0.943 64.000 0.666 0.005 Y NA
 6888946 6888947 Pnuc_0022 Pnuc_0023     TRUE 0.985 2.000 0.242 0.005 Y NA
 6888947 6888948 Pnuc_0023 Pnuc_0024     TRUE 0.979 46.000 0.864 0.005 Y NA
 6888948 6888949 Pnuc_0024 Pnuc_0025     TRUE 0.992 18.000 0.846 0.005 Y NA
 6888949 6888950 Pnuc_0025 Pnuc_0026     TRUE 0.958 56.000 0.724 0.005 Y NA
 6888950 6888951 Pnuc_0026 Pnuc_0027     TRUE 0.992 22.000 0.837 0.005 Y NA
 6888951 6888952 Pnuc_0027 Pnuc_0028     FALSE 0.493 16.000 0.003 1.000 N NA
 6888952 6888953 Pnuc_0028 Pnuc_0029     FALSE 0.054 270.000 0.000 1.000 N NA
 6888956 6888957 Pnuc_0032 Pnuc_R0001     FALSE 0.027 185.000 0.000 NA   NA
 6888960 6888961 Pnuc_0035 Pnuc_0036     TRUE 0.950 30.000 0.613 NA   NA
 6888961 6888962 Pnuc_0036 Pnuc_0037     TRUE 0.738 18.000 0.054 NA   NA
 6888964 6888965 Pnuc_R0002 Pnuc_R0003     FALSE 0.100 57.000 0.000 NA   NA
 6888965 6888966 Pnuc_R0003 Pnuc_R0004     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 6888966 6888967 Pnuc_R0004 Pnuc_R0005     FALSE 0.025 269.000 0.000 NA   NA
 6888967 6888968 Pnuc_R0005 Pnuc_R0006     FALSE 0.043 103.000 0.000 NA   NA
 6888968 6888969 Pnuc_R0006 Pnuc_R0007     FALSE 0.042 104.000 0.000 NA   NA
 6888969 6888970 Pnuc_R0007 Pnuc_R0008     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 6888970 6888971 Pnuc_R0008 Pnuc_R0009     FALSE 0.355 21.000 0.000 NA   NA
 6888971 6888972 Pnuc_R0009 Pnuc_0039     FALSE 0.078 65.000 0.000 NA   NA
 6888972 6888973 Pnuc_0039 Pnuc_R0010     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6888973 6888974 Pnuc_R0010 Pnuc_0040     FALSE 0.355 21.000 0.000 NA   NA
 6888974 6888975 Pnuc_0040 Pnuc_0041     TRUE 0.970 10.000 0.843 1.000 N NA
 6888975 6888976 Pnuc_0041 Pnuc_0042     TRUE 0.652 168.000 0.681 1.000 N NA
 6888976 6888977 Pnuc_0042 Pnuc_0043   rplA TRUE 0.993 3.000 0.838 0.034 Y NA
 6888977 6888978 Pnuc_0043 Pnuc_0044 rplA   TRUE 0.676 238.000 0.302 1.000 Y NA
 6888978 6888979 Pnuc_0044 Pnuc_0045   rplL TRUE 0.983 37.000 0.884 1.000 Y NA
 6888979 6888980 Pnuc_0045 Pnuc_0046 rplL rpoB FALSE 0.348 227.000 0.223 1.000   NA
 6888980 6888981 Pnuc_0046 Pnuc_0047 rpoB   TRUE 0.985 2.000 0.851 0.001   NA
 6888981 6888982 Pnuc_0047 Pnuc_0048   rpsL FALSE 0.296 178.000 0.122 1.000 N NA
 6888982 6888983 Pnuc_0048 Pnuc_0049 rpsL   TRUE 0.846 150.000 0.620 0.005 Y NA
 6888983 6888984 Pnuc_0049 Pnuc_0050     TRUE 0.802 28.000 0.002 1.000 Y NA
 6888984 6888985 Pnuc_0050 Pnuc_0051     TRUE 0.974 51.000 1.000 0.002 Y NA
 6888985 6888986 Pnuc_0051 Pnuc_0052     FALSE 0.229 134.000 0.002 1.000 Y NA
 6888986 6888987 Pnuc_0052 Pnuc_0053     TRUE 0.724 197.000 0.307 0.034 Y NA
 6888987 6888988 Pnuc_0053 Pnuc_0054     TRUE 0.984 12.000 0.486 0.025 Y NA
 6888988 6888989 Pnuc_0054 Pnuc_0055   rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 6888989 6888990 Pnuc_0055 Pnuc_0056 rplW rplB TRUE 0.992 3.000 0.849 1.000 Y NA
 6888990 6888991 Pnuc_0056 Pnuc_0057 rplB   TRUE 0.992 20.000 0.820 0.034 Y NA
 6888991 6888992 Pnuc_0057 Pnuc_0058   rplV TRUE 0.989 11.000 0.769 0.034 Y NA
 6888992 6888993 Pnuc_0058 Pnuc_0059 rplV   TRUE 0.988 9.000 0.719 0.034 Y NA
 6888993 6888994 Pnuc_0059 Pnuc_0060   rplP TRUE 0.993 3.000 0.828 0.034 Y NA
 6888994 6888995 Pnuc_0060 Pnuc_0061 rplP   TRUE 0.993 -3.000 0.802 0.025   NA
 6888995 6888996 Pnuc_0061 Pnuc_0062     TRUE 0.972 13.000 0.828 0.025   NA
 6888996 6888997 Pnuc_0062 Pnuc_0063     TRUE 0.850 184.000 0.791 0.034 Y NA
 6888997 6888998 Pnuc_0063 Pnuc_0064   rplX TRUE 0.931 10.000 0.071 0.034 Y NA
 6888998 6888999 Pnuc_0064 Pnuc_0065 rplX   TRUE 0.940 17.000 0.057 0.025 Y NA
 6888999 6889000 Pnuc_0065 Pnuc_0066   rpsN TRUE 0.976 10.000 0.309 0.025 Y NA
 6889000 6889001 Pnuc_0066 Pnuc_0067 rpsN   TRUE 0.979 25.000 0.295 0.025 Y NA
 6889001 6889002 Pnuc_0067 Pnuc_0068     TRUE 0.989 11.000 0.808 0.025 Y NA
 6889002 6889003 Pnuc_0068 Pnuc_0069     TRUE 0.991 14.000 0.815 0.025 Y NA
 6889003 6889004 Pnuc_0069 Pnuc_0070   rpsE TRUE 0.991 19.000 0.814 0.034 Y NA
 6889004 6889005 Pnuc_0070 Pnuc_0071 rpsE   TRUE 0.990 25.000 0.789 0.034 Y NA
 6889005 6889006 Pnuc_0071 Pnuc_0072     TRUE 0.988 28.000 0.653 0.005 Y NA
 6889006 6889007 Pnuc_0072 Pnuc_0073     TRUE 0.974 19.000 0.730 1.000 N NA
 6889007 6889008 Pnuc_0073 Pnuc_0074   infA TRUE 0.844 5.000 0.083 1.000 N NA
 6889008 6889009 Pnuc_0074 Pnuc_0075 infA rpsM FALSE 0.495 177.000 0.075 0.028 Y NA
 6889009 6889010 Pnuc_0075 Pnuc_0076 rpsM   TRUE 0.992 19.000 0.810 0.025 Y NA
 6889010 6889011 Pnuc_0076 Pnuc_0077     TRUE 0.844 119.000 0.509 0.034 Y NA
 6889011 6889012 Pnuc_0077 Pnuc_0078     TRUE 0.965 24.000 0.549 1.000 N NA
 6889012 6889013 Pnuc_0078 Pnuc_0079   rplQ TRUE 0.978 17.000 0.873 1.000 N NA
 6889013 6889014 Pnuc_0079 Pnuc_0080 rplQ   FALSE 0.204 76.000 0.020 1.000 N NA
 6889014 6889015 Pnuc_0080 Pnuc_0081     TRUE 0.796 -3.000 0.005 1.000 N NA
 6889015 6889016 Pnuc_0081 Pnuc_0082     FALSE 0.385 5.000 0.000 1.000   NA
 6889017 6889018 Pnuc_0083 Pnuc_0084   engB TRUE 0.914 -22.000 0.024 1.000   NA
 6889022 6889023 Pnuc_0088 Pnuc_0089     TRUE 0.966 6.000 0.208 1.000 Y NA
 6889023 6889024 Pnuc_0089 Pnuc_0090     TRUE 0.787 52.000 0.319 1.000   NA
 6889024 6889025 Pnuc_0090 Pnuc_0091     FALSE 0.100 57.000 0.000 NA   NA
 6889026 6889027 Pnuc_0092 Pnuc_0093     TRUE 0.506 13.000 0.000 1.000 N NA
 6889027 6889028 Pnuc_0093 Pnuc_0094     FALSE 0.087 196.000 0.015 1.000 N NA
 6889028 6889029 Pnuc_0094 Pnuc_0095     TRUE 0.959 39.000 0.236 0.002 Y NA
 6889029 6889030 Pnuc_0095 Pnuc_0096     TRUE 0.630 11.000 0.019 1.000 N NA
 6889030 6889031 Pnuc_0096 Pnuc_0097     TRUE 0.992 0.000 0.530 NA Y NA
 6889031 6889032 Pnuc_0097 Pnuc_0098     TRUE 0.958 22.000 0.562 NA   NA
 6889032 6889033 Pnuc_0098 Pnuc_0099     TRUE 0.552 0.000 0.007 NA   NA
 6889033 6889034 Pnuc_0099 Pnuc_0100     TRUE 0.683 62.000 0.222 NA N NA
 6889034 6889035 Pnuc_0100 Pnuc_0101     TRUE 0.683 14.000 0.047 NA   NA
 6889035 6889036 Pnuc_0101 Pnuc_0102     TRUE 0.884 5.000 0.174 NA   NA
 6889036 6889037 Pnuc_0102 Pnuc_0103     TRUE 0.992 -3.000 0.236 1.000 Y NA
 6889037 6889038 Pnuc_0103 Pnuc_0104     TRUE 0.850 21.000 0.088 NA N NA
 6889038 6889039 Pnuc_0104 Pnuc_0105     TRUE 0.769 43.000 0.129 NA N NA
 6889039 6889040 Pnuc_0105 Pnuc_0106   hisG TRUE 0.891 21.000 0.123 1.000 N NA
 6889040 6889041 Pnuc_0106 Pnuc_0107 hisG   TRUE 0.965 35.000 0.254 0.008 Y NA
 6889043 6889044 Pnuc_0109 Pnuc_0110 hisB   TRUE 0.889 48.000 0.111 0.008 Y NA
 6889044 6889045 Pnuc_0110 Pnuc_0111     TRUE 0.886 20.000 0.007 0.008 Y NA
 6889045 6889046 Pnuc_0111 Pnuc_0112     TRUE 0.926 0.000 0.002 0.008 Y NA
 6889046 6889047 Pnuc_0112 Pnuc_0113     TRUE 0.967 43.000 0.430 0.008 Y NA
 6889047 6889048 Pnuc_0113 Pnuc_0114     TRUE 0.952 33.000 0.152 0.008 Y NA
 6889048 6889049 Pnuc_0114 Pnuc_0115     TRUE 0.826 27.000 0.079 1.000 N NA
 6889049 6889050 Pnuc_0115 Pnuc_0116     TRUE 0.851 17.000 0.080 1.000 N NA
 6889050 6889051 Pnuc_0116 Pnuc_0117   tatB TRUE 0.972 38.000 0.402 0.010 Y NA
 6889051 6889052 Pnuc_0117 Pnuc_0118 tatB   TRUE 0.963 19.000 0.167 NA Y NA
 6889054 6889055 Pnuc_0120 Pnuc_0121     FALSE 0.067 138.000 0.000 1.000 N NA
 6889056 6889057 Pnuc_0122 Pnuc_0123     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6889057 6889058 Pnuc_0123 Pnuc_0124     TRUE 0.542 23.000 0.000 1.000 N NA
 6889059 6889060 Pnuc_0125 Pnuc_0126     TRUE 0.954 11.000 0.108 0.002 Y NA
 6889060 6889061 Pnuc_0126 Pnuc_0127     TRUE 0.984 34.000 0.630 0.002 Y NA
 6889061 6889062 Pnuc_0127 Pnuc_0128     TRUE 0.602 110.000 0.370 NA N NA
 6889062 6889063 Pnuc_0128 Pnuc_0129     TRUE 0.962 29.000 0.831 NA   NA
 6889063 6889064 Pnuc_0129 Pnuc_R0011     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6889064 6889065 Pnuc_R0011 Pnuc_0130     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 6889068 6889069 Pnuc_0133 Pnuc_0134     TRUE 0.501 14.000 0.015 NA   NA
 6889069 6889070 Pnuc_0134 Pnuc_0135     FALSE 0.418 98.000 0.124 1.000 N NA
 6889070 6889071 Pnuc_0135 Pnuc_0136   prfA TRUE 0.967 8.000 0.229 1.000 Y NA
 6889071 6889072 Pnuc_0136 Pnuc_0137 prfA hemA TRUE 0.952 1.000 0.171 0.056 N NA
 6889072 6889073 Pnuc_0137 Pnuc_0138 hemA   FALSE 0.054 266.000 0.000 1.000 N NA
 6889073 6889074 Pnuc_0138 Pnuc_0139     TRUE 0.694 0.000 0.013 1.000   NA
 6889074 6889075 Pnuc_0139 Pnuc_0140     TRUE 0.874 12.000 0.174 1.000   NA
 6889075 6889076 Pnuc_0140 Pnuc_0141     TRUE 0.995 -7.000 0.814 1.000 N NA
 6889080 6889081 Pnuc_0145 Pnuc_0146 trpC trpD TRUE 0.970 10.000 0.293 1.000 Y NA
 6889081 6889082 Pnuc_0146 Pnuc_0147 trpD   TRUE 0.938 9.000 0.105 1.000 Y NA
 6889082 6889083 Pnuc_0147 Pnuc_0148     TRUE 0.997 -16.000 0.230 0.001 Y NA
 6889083 6889084 Pnuc_0148 Pnuc_0149     TRUE 0.785 0.000 0.014 1.000 N NA
 6889085 6889086 Pnuc_0150 Pnuc_0151 apaG   FALSE 0.202 139.000 0.063 NA N NA
 6889087 6889088 Pnuc_0152 Pnuc_0153     FALSE 0.112 59.000 0.000 1.000   NA
 6889088 6889089 Pnuc_0153 Pnuc_0154     TRUE 0.987 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 6889089 6889090 Pnuc_0154 Pnuc_0155     TRUE 0.981 -3.000 0.054 0.017 Y NA
 6889091 6889092 Pnuc_0156 Pnuc_0157     TRUE 0.821 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6889092 6889093 Pnuc_0157 Pnuc_0158     FALSE 0.025 293.000 0.000 NA   NA
 6889093 6889094 Pnuc_0158 Pnuc_0159     TRUE 0.956 13.000 0.635 NA   NA
 6889094 6889095 Pnuc_0159 Pnuc_0160     TRUE 0.979 -3.000 0.227 1.000 N NA
 6889095 6889096 Pnuc_0160 Pnuc_0161     TRUE 0.966 -3.000 0.124 1.000 N NA
 6889096 6889097 Pnuc_0161 Pnuc_0162     TRUE 0.983 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 6889097 6889098 Pnuc_0162 Pnuc_0163     TRUE 0.994 0.000 0.569 0.005 Y NA
 6889098 6889099 Pnuc_0163 Pnuc_0164   mraY TRUE 0.997 -9.000 0.309 0.007 Y NA
 6889099 6889100 Pnuc_0164 Pnuc_0165 mraY   TRUE 0.990 15.000 0.647 0.007 Y NA
 6889100 6889101 Pnuc_0165 Pnuc_0166     TRUE 0.987 -3.000 0.297 0.005 N NA
 6889101 6889102 Pnuc_0166 Pnuc_0167   murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 6889102 6889103 Pnuc_0167 Pnuc_0168 murG murC TRUE 0.993 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 6889103 6889104 Pnuc_0168 Pnuc_0169 murC ddl TRUE 0.994 -7.000 0.153 0.007 Y NA
 6889104 6889105 Pnuc_0169 Pnuc_0170 ddl   TRUE 0.994 -3.000 0.372 NA Y NA
 6889105 6889106 Pnuc_0170 Pnuc_0171     TRUE 0.942 10.000 0.389 NA N NA
 6889106 6889107 Pnuc_0171 Pnuc_0172     TRUE 0.949 49.000 0.460 1.000 Y NA
 6889107 6889108 Pnuc_0172 Pnuc_0173     FALSE 0.126 113.000 0.018 1.000 N NA
 6889108 6889109 Pnuc_0173 Pnuc_0174   lpxC TRUE 0.531 32.000 0.012 1.000 N NA
 6889111 6889112 Pnuc_0176 Pnuc_0177     FALSE 0.061 170.000 0.000 1.000 N NA
 6889112 6889113 Pnuc_0177 Pnuc_0178     TRUE 0.983 12.000 0.455 0.078 Y NA
 6889113 6889114 Pnuc_0178 Pnuc_0179     FALSE 0.122 79.000 0.000 1.000 N NA
 6889114 6889115 Pnuc_0179 Pnuc_0180     TRUE 0.733 15.000 0.056 NA   NA
 6889115 6889116 Pnuc_0180 Pnuc_0181     TRUE 0.801 10.000 0.105 NA   NA
 6889117 6889118 Pnuc_0182 Pnuc_0183     TRUE 0.817 12.000 0.110 NA   NA
 6889118 6889119 Pnuc_0183 Pnuc_0184     FALSE 0.275 21.000 0.002 1.000   NA
 6889119 6889120 Pnuc_0184 Pnuc_0185     TRUE 0.844 0.000 0.050 1.000   NA
 6889120 6889121 Pnuc_0185 Pnuc_0186     TRUE 0.998 -9.000 0.571 1.000 Y NA
 6889121 6889122 Pnuc_0186 Pnuc_0187     TRUE 0.934 -3.000 0.056 1.000 N NA
 6889125 6889126 Pnuc_0190 Pnuc_0191     FALSE 0.086 106.000 0.000 1.000 N NA
 6889127 6889128 Pnuc_0192 Pnuc_0193     FALSE 0.445 32.000 0.000 1.000 N NA
 6889129 6889130 Pnuc_0194 Pnuc_0195   rpmA TRUE 0.990 20.000 0.667 0.025 Y NA
 6889130 6889131 Pnuc_0195 Pnuc_0196 rpmA obgE TRUE 0.597 89.000 0.335 1.000   NA
 6889131 6889132 Pnuc_0196 Pnuc_0197 obgE   TRUE 0.899 26.000 0.206 1.000   NA
 6889133 6889134 Pnuc_0198 Pnuc_0199     TRUE 0.848 2.000 0.075 NA   NA
 6889137 6889138 Pnuc_0202 Pnuc_0203     FALSE 0.044 133.000 0.007 1.000   NA
 6889138 6889139 Pnuc_0203 Pnuc_0204     FALSE 0.054 273.000 0.000 1.000 N NA
 6889139 6889140 Pnuc_0204 Pnuc_0205     TRUE 0.972 46.000 0.564 0.001 Y NA
 6889140 6889141 Pnuc_0205 Pnuc_0206     FALSE 0.030 335.000 0.000 1.000   NA
 6889142 6889143 Pnuc_0207 Pnuc_0208     FALSE 0.315 45.000 0.000 1.000 N NA
 6889143 6889144 Pnuc_0208 Pnuc_0209     TRUE 0.907 17.000 0.152 1.000 N NA
 6889144 6889145 Pnuc_0209 Pnuc_0210     TRUE 0.942 48.000 0.275 0.002 Y NA
 6889145 6889146 Pnuc_0210 Pnuc_0211     TRUE 0.888 37.000 0.254 1.000 N NA
 6889146 6889147 Pnuc_0211 Pnuc_0212     FALSE 0.128 249.000 0.041 1.000 N NA
 6889148 6889149 Pnuc_0213 Pnuc_0214     TRUE 0.565 20.000 0.007 1.000 N NA
 6889149 6889150 Pnuc_0214 Pnuc_0215     TRUE 0.748 3.000 0.027 1.000 N NA
 6889150 6889151 Pnuc_0215 Pnuc_0216     TRUE 0.973 -16.000 0.110 1.000   NA
 6889151 6889152 Pnuc_0216 Pnuc_0217     FALSE 0.273 49.000 0.016 1.000   NA
 6889152 6889153 Pnuc_0217 Pnuc_0218     TRUE 0.816 9.000 0.107 1.000   NA
 6889156 6889157 Pnuc_0221 Pnuc_0222     TRUE 0.960 -3.000 0.141 NA   NA
 6889157 6889158 Pnuc_0222 Pnuc_0223     TRUE 0.977 -3.000 0.206 1.000 N NA
 6889159 6889160 Pnuc_0224 Pnuc_0225     FALSE 0.034 129.000 0.000 NA   NA
 6889162 6889163 Pnuc_0227 Pnuc_0228     TRUE 0.964 26.000 0.198 1.000 Y NA
 6889165 6889166 Pnuc_0230 Pnuc_0231     FALSE 0.362 65.000 0.049 1.000 N NA
 6889166 6889167 Pnuc_0231 Pnuc_0232   leuS FALSE 0.369 50.000 0.009 0.055 N NA
 6889167 6889168 Pnuc_0232 Pnuc_0233 leuS   TRUE 0.915 19.000 0.182 NA N NA
 6889168 6889169 Pnuc_0233 Pnuc_0234     TRUE 0.919 16.000 0.199 NA N NA
 6889169 6889170 Pnuc_0234 Pnuc_0235   proA TRUE 0.543 47.000 0.047 1.000 N NA
 6889170 6889171 Pnuc_0235 Pnuc_0236 proA   FALSE 0.386 44.000 0.028 NA   NA
 6889171 6889172 Pnuc_0236 Pnuc_0237     FALSE 0.351 47.000 0.029 NA   NA
 6889172 6889173 Pnuc_0237 Pnuc_0238     FALSE 0.158 57.000 0.004 NA N NA
 6889173 6889174 Pnuc_0238 Pnuc_0239     TRUE 0.585 13.000 0.011 1.000 N NA
 6889175 6889176 Pnuc_0240 Pnuc_0241 apaH   FALSE 0.241 34.000 0.004 1.000   NA
 6889177 6889178 Pnuc_0242 Pnuc_0243     FALSE 0.348 23.000 0.000 NA   NA
 6889178 6889179 Pnuc_0243 Pnuc_0244     TRUE 0.988 -7.000 0.263 NA N NA
 6889179 6889180 Pnuc_0244 Pnuc_0245     TRUE 0.553 17.000 0.000 1.000 N NA
 6889180 6889181 Pnuc_0245 Pnuc_0246   pyrB TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6889181 6889182 Pnuc_0246 Pnuc_0247 pyrB   FALSE 0.148 34.000 0.002 NA   NA
 6889182 6889183 Pnuc_0247 Pnuc_0248     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 6889183 6889184 Pnuc_0248 Pnuc_0249     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6889185 6889186 Pnuc_0250 Pnuc_0251     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6889187 6889188 Pnuc_0252 Pnuc_0253     FALSE 0.177 44.000 0.000 NA   NA
 6889188 6889189 Pnuc_0253 Pnuc_0254     TRUE 0.934 2.000 0.018 0.007 Y NA
 6889189 6889190 Pnuc_0254 Pnuc_0255     TRUE 0.986 27.000 0.500 0.007 Y NA
 6889190 6889191 Pnuc_0255 Pnuc_0256     TRUE 0.987 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 6889191 6889192 Pnuc_0256 Pnuc_0257     TRUE 0.965 2.000 0.074 0.005 Y NA
 6889194 6889195 Pnuc_0259 Pnuc_0260     FALSE 0.361 36.000 0.013 NA   NA
 6889195 6889196 Pnuc_0260 Pnuc_0261     FALSE 0.337 25.000 0.000 NA   NA
 6889196 6889197 Pnuc_0261 Pnuc_0262     FALSE 0.487 2.000 0.000 1.000   NA
 6889198 6889199 Pnuc_0263 Pnuc_0264     FALSE 0.050 155.000 0.003 1.000 N NA
 6889199 6889200 Pnuc_0264 Pnuc_0265   ribH TRUE 0.950 5.000 0.347 1.000 N NA
 6889200 6889201 Pnuc_0265 Pnuc_0266 ribH   TRUE 0.921 30.000 0.051 0.003 Y NA
 6889202 6889203 Pnuc_0267 Pnuc_0268     TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 6889203 6889204 Pnuc_0268 Pnuc_0269     FALSE 0.462 50.000 0.059 NA   NA
 6889204 6889205 Pnuc_0269 Pnuc_0270     TRUE 0.582 17.000 0.009 NA N NA
 6889205 6889206 Pnuc_0270 Pnuc_0271     TRUE 0.980 10.000 0.456 1.000 Y NA
 6889207 6889208 Pnuc_0272 Pnuc_0273     FALSE 0.435 9.000 0.011 1.000   NA
 6889208 6889209 Pnuc_0273 Pnuc_0274     TRUE 0.929 1.000 0.167 1.000   NA
 6889209 6889210 Pnuc_0274 Pnuc_0275   tolB TRUE 0.639 146.000 0.592 1.000 N NA
 6889210 6889211 Pnuc_0275 Pnuc_0276 tolB   FALSE 0.332 4.000 0.005 NA   NA
 6889211 6889212 Pnuc_0276 Pnuc_0277     FALSE 0.337 25.000 0.000 NA   NA
 6889212 6889213 Pnuc_0277 Pnuc_0278     TRUE 0.985 10.000 0.556 0.041 Y NA
 6889214 6889215 Pnuc_0279 Pnuc_0280 glyA nrdR TRUE 0.804 26.000 0.069 NA N NA
 6889216 6889217 Pnuc_0281 Pnuc_0282 adk   FALSE 0.249 104.000 0.056 1.000 N NA
 6889217 6889218 Pnuc_0282 Pnuc_0283     TRUE 0.911 13.000 0.265 NA   NA
 6889218 6889219 Pnuc_0283 Pnuc_0284   lpxK TRUE 0.618 69.000 0.263 NA   NA
 6889219 6889220 Pnuc_0284 Pnuc_0285 lpxK   TRUE 0.867 21.000 0.096 1.000 N NA
 6889220 6889221 Pnuc_0285 Pnuc_0286     TRUE 0.990 25.000 0.746 0.041 Y NA
 6889222 6889223 Pnuc_0287 Pnuc_0288     FALSE 0.140 49.000 0.000 NA   NA
 6889225 6889226 Pnuc_0290 Pnuc_0291     FALSE 0.049 89.000 0.000 NA   NA
 6889226 6889227 Pnuc_0291 Pnuc_0292     FALSE 0.165 46.000 0.000 NA   NA
 6889227 6889228 Pnuc_0292 Pnuc_0293     FALSE 0.146 48.000 0.004 1.000   NA
 6889228 6889229 Pnuc_0293 Pnuc_0294     FALSE 0.405 3.000 0.006 NA   NA
 6889229 6889230 Pnuc_0294 Pnuc_0295     FALSE 0.196 41.000 0.000 NA   NA
 6889230 6889231 Pnuc_0295 Pnuc_0296     FALSE 0.030 397.000 0.000 1.000   NA
 6889231 6889232 Pnuc_0296 Pnuc_0297     FALSE 0.040 132.000 0.000 1.000   NA
 6889232 6889233 Pnuc_0297 Pnuc_0298     TRUE 0.845 15.000 0.000 1.000 Y NA
 6889233 6889234 Pnuc_0298 Pnuc_0299     FALSE 0.033 130.000 0.000 NA   NA
 6889236 6889237 Pnuc_0301 Pnuc_0302     TRUE 0.600 51.000 0.000 1.000 Y NA
 6889237 6889238 Pnuc_0302 Pnuc_0303     TRUE 0.917 27.000 0.042 0.010 Y NA
 6889238 6889239 Pnuc_0303 Pnuc_0304     FALSE 0.316 13.000 0.000 NA   NA
 6889239 6889240 Pnuc_0304 Pnuc_0305     FALSE 0.317 7.000 0.000 NA   NA
 6889240 6889241 Pnuc_0305 Pnuc_0306     FALSE 0.312 28.000 0.000 NA   NA
 6889241 6889242 Pnuc_0306 Pnuc_0307     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6889243 6889244 Pnuc_0308 Pnuc_0309     TRUE 0.819 11.000 0.000 1.000 Y NA
 6889244 6889245 Pnuc_0309 Pnuc_0310     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA Y NA
 6889246 6889247 Pnuc_0311 Pnuc_0312     TRUE 0.953 -3.000 0.087 1.000 N NA
 6889247 6889248 Pnuc_0312 Pnuc_0313     TRUE 0.955 14.000 0.130 1.000 Y NA
 6889248 6889249 Pnuc_0313 Pnuc_0314     FALSE 0.221 205.000 0.000 1.000 Y NA
 6889249 6889250 Pnuc_0314 Pnuc_0315     FALSE 0.025 317.000 0.000 NA   NA
 6889252 6889253 Pnuc_0317 Pnuc_0318     TRUE 0.892 21.000 0.028 NA Y NA
 6889253 6889254 Pnuc_0318 Pnuc_0319     TRUE 0.981 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 6889254 6889255 Pnuc_0319 Pnuc_0320     TRUE 0.805 10.000 0.000 NA Y NA
 6889255 6889256 Pnuc_0320 Pnuc_0321     FALSE 0.312 28.000 0.000 NA   NA
 6889256 6889257 Pnuc_0321 Pnuc_0322     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889257 6889258 Pnuc_0322 Pnuc_0323     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 6889258 6889259 Pnuc_0323 Pnuc_0324     FALSE 0.302 29.000 0.000 NA   NA
 6889259 6889260 Pnuc_0324 Pnuc_0325     TRUE 0.955 11.000 0.500 1.000 N NA
 6889260 6889261 Pnuc_0325 Pnuc_0326     TRUE 0.951 -3.000 0.107 1.000   NA
 6889262 6889263 Pnuc_0327 Pnuc_0328     TRUE 0.953 2.000 0.250 0.036   NA
 6889264 6889265 Pnuc_0329 Pnuc_0330     TRUE 0.768 -3.000 0.010 1.000   NA
 6889266 6889267 Pnuc_0331 Pnuc_0332     FALSE 0.355 21.000 0.000 NA   NA
 6889272 6889273 Pnuc_0337 Pnuc_0338     FALSE 0.156 47.000 0.000 NA   NA
 6889275 6889276 Pnuc_0340 Pnuc_0341     FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 6889276 6889277 Pnuc_0341 Pnuc_0342     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889278 6889279 Pnuc_0343 Pnuc_0344     FALSE 0.352 22.000 0.000 NA   NA
 6889279 6889280 Pnuc_0344 Pnuc_0345     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889281 6889282 Pnuc_0346 Pnuc_0347     TRUE 0.833 62.000 0.763 NA   NA
 6889283 6889284 Pnuc_0348 Pnuc_0349     FALSE 0.025 344.000 0.000 NA   NA
 6889285 6889286 Pnuc_0350 Pnuc_0351     FALSE 0.026 232.000 0.000 NA   NA
 6889288 6889289 Pnuc_0353 Pnuc_0354     TRUE 0.782 -7.000 0.000 1.000   NA
 6889289 6889290 Pnuc_0354 Pnuc_0355     FALSE 0.037 144.000 0.000 1.000   NA
 6889290 6889291 Pnuc_0355 Pnuc_0356     TRUE 0.828 147.000 0.684 1.000 Y NA
 6889291 6889292 Pnuc_0356 Pnuc_0357     TRUE 0.992 0.000 0.357 0.030 Y NA
 6889292 6889293 Pnuc_0357 Pnuc_0358     TRUE 0.973 32.000 0.308 0.019 Y NA
 6889294 6889295 Pnuc_0359 Pnuc_0360     FALSE 0.462 60.000 0.095 NA   NA
 6889295 6889296 Pnuc_0360 Pnuc_0361     FALSE 0.040 107.000 0.000 NA   NA
 6889301 6889302 Pnuc_0366 Pnuc_0367     FALSE 0.061 102.000 0.007 1.000   NA
 6889302 6889303 Pnuc_0367 Pnuc_0368     FALSE 0.158 55.000 0.008 1.000   NA
 6889303 6889304 Pnuc_0368 Pnuc_0369     FALSE 0.407 4.000 0.000 1.000   NA
 6889306 6889307 Pnuc_0371 Pnuc_0372     TRUE 0.615 14.000 0.012 1.000 N NA
 6889307 6889308 Pnuc_0372 Pnuc_0373     FALSE 0.450 30.000 0.000 0.069   NA
 6889310 6889311 Pnuc_0375 Pnuc_0376     TRUE 0.511 8.000 0.008 NA N NA
 6889311 6889312 Pnuc_0376 Pnuc_0377     FALSE 0.025 352.000 0.000 NA   NA
 6889315 6889316 Pnuc_0380 Pnuc_0381   thyA TRUE 0.875 11.000 0.134 1.000 N NA
 6889316 6889317 Pnuc_0381 Pnuc_0382 thyA   FALSE 0.345 36.000 0.003 1.000 N NA
 6889317 6889318 Pnuc_0382 Pnuc_0383     TRUE 0.837 45.000 0.188 0.075 N NA
 6889320 6889321 Pnuc_0385 Pnuc_0386     TRUE 0.863 13.000 0.156 NA   NA
 6889321 6889322 Pnuc_0386 Pnuc_0387     TRUE 0.987 -3.000 0.089 0.006 Y NA
 6889322 6889323 Pnuc_0387 Pnuc_0388   moaA TRUE 0.974 0.000 0.075 0.006 Y NA
 6889323 6889324 Pnuc_0388 Pnuc_0389 moaA   FALSE 0.250 84.000 0.042 1.000 N NA
 6889325 6889326 Pnuc_0390 Pnuc_0391     TRUE 0.984 -3.000 0.389 1.000   NA
 6889326 6889327 Pnuc_0391 Pnuc_0392     FALSE 0.183 47.000 0.000 1.000   NA
 6889328 6889329 Pnuc_0393 Pnuc_0394     TRUE 0.837 23.000 0.107 NA   NA
 6889330 6889331 Pnuc_0395 Pnuc_0396     TRUE 0.656 106.000 0.599 NA   NA
 6889331 6889332 Pnuc_0396 Pnuc_0397     TRUE 0.711 84.000 0.418 1.000 N NA
 6889332 6889333 Pnuc_0397 Pnuc_0398     TRUE 0.996 -3.000 0.380 0.008 Y NA
 6889333 6889334 Pnuc_0398 Pnuc_0399     TRUE 0.936 43.000 0.182 0.008 Y NA
 6889334 6889335 Pnuc_0399 Pnuc_0400     TRUE 0.971 40.000 0.432 0.008 Y NA
 6889335 6889336 Pnuc_0400 Pnuc_0401     TRUE 0.828 101.000 0.321 0.008 Y NA
 6889336 6889337 Pnuc_0401 Pnuc_0402     TRUE 0.980 22.000 0.346 1.000 Y NA
 6889337 6889338 Pnuc_0402 Pnuc_0403     FALSE 0.260 48.000 0.005 1.000 N NA
 6889338 6889339 Pnuc_0403 Pnuc_0404     FALSE 0.073 147.000 0.008 1.000 N NA
 6889339 6889340 Pnuc_0404 Pnuc_0405     TRUE 0.957 0.000 0.187 1.000 N NA
 6889340 6889341 Pnuc_0405 Pnuc_0406   rnc TRUE 0.879 5.000 0.117 1.000 N NA
 6889341 6889342 Pnuc_0406 Pnuc_0407 rnc   TRUE 0.830 3.000 0.058 0.035   NA
 6889342 6889343 Pnuc_0407 Pnuc_0408   recO TRUE 0.698 7.000 0.049 1.000   NA
 6889343 6889344 Pnuc_0408 Pnuc_0409 recO   TRUE 0.896 13.000 0.166 1.000 N NA
 6889344 6889345 Pnuc_0409 Pnuc_0410     TRUE 0.985 -3.000 0.326 1.000 N NA
 6889345 6889346 Pnuc_0410 Pnuc_0411     TRUE 0.766 35.000 0.081 1.000 N NA
 6889346 6889347 Pnuc_0411 Pnuc_0412     FALSE 0.489 29.000 0.000 1.000 N NA
 6889348 6889349 Pnuc_0413 Pnuc_0414     FALSE 0.267 88.000 0.074 NA   NA
 6889350 6889351 Pnuc_0415 Pnuc_0416     TRUE 0.888 35.000 0.227 1.000 N NA
 6889351 6889352 Pnuc_0416 Pnuc_R0012     FALSE 0.036 118.000 0.000 NA   NA
 6889352 6889353 Pnuc_R0012 Pnuc_R0013     FALSE 0.135 50.000 0.000 NA   NA
 6889353 6889354 Pnuc_R0013 Pnuc_0417     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 6889356 6889357 Pnuc_0419 Pnuc_0420   rpsF FALSE 0.241 136.000 0.004 1.000 Y NA
 6889357 6889358 Pnuc_0420 Pnuc_0421 rpsF   TRUE 0.588 61.000 0.122 1.000 N NA
 6889358 6889359 Pnuc_0421 Pnuc_0422   rpsR TRUE 0.885 14.000 0.128 1.000 N NA
 6889359 6889360 Pnuc_0422 Pnuc_0423 rpsR   TRUE 0.986 14.000 0.499 0.024 Y NA
 6889360 6889361 Pnuc_0423 Pnuc_0424     TRUE 0.830 25.000 0.074 1.000 N NA
 6889362 6889363 Pnuc_0425 Pnuc_0426     FALSE 0.062 75.000 0.000 NA   NA
 6889363 6889364 Pnuc_0426 Pnuc_0427     TRUE 0.825 26.000 0.000 NA Y NA
 6889364 6889365 Pnuc_0427 Pnuc_0428     TRUE 0.872 -19.000 0.000 NA N NA
 6889365 6889366 Pnuc_0428 Pnuc_0429     FALSE 0.153 233.000 0.050 1.000 N NA
 6889366 6889367 Pnuc_0429 Pnuc_0430     TRUE 0.592 33.000 0.023 1.000 N NA
 6889367 6889368 Pnuc_0430 Pnuc_0431     TRUE 0.981 13.000 0.447 1.000 Y NA
 6889368 6889369 Pnuc_0431 Pnuc_0432     TRUE 0.884 36.000 0.227 1.000 N NA
 6889369 6889370 Pnuc_0432 Pnuc_0433     TRUE 0.975 1.000 0.473 NA N NA
 6889370 6889371 Pnuc_0433 Pnuc_0434     TRUE 0.954 42.000 0.351 NA Y NA
 6889371 6889372 Pnuc_0434 Pnuc_0435     TRUE 0.907 10.000 0.061 NA Y NA
 6889372 6889373 Pnuc_0435 Pnuc_0436     TRUE 0.855 0.000 0.060 NA   NA
 6889374 6889375 Pnuc_0437 Pnuc_0438     TRUE 0.985 -3.000 0.102 1.000 Y NA
 6889375 6889376 Pnuc_0438 Pnuc_0439     TRUE 0.947 9.000 0.125 1.000 Y NA
 6889376 6889377 Pnuc_0439 Pnuc_0440     TRUE 0.517 32.000 0.011 1.000 N NA
 6889377 6889378 Pnuc_0440 Pnuc_0441     TRUE 0.958 19.000 0.095 0.006 Y NA
 6889378 6889379 Pnuc_0441 Pnuc_0442     TRUE 0.992 2.000 0.501 0.006 Y NA
 6889379 6889380 Pnuc_0442 Pnuc_0443     FALSE 0.445 32.000 0.000 1.000 N NA
 6889380 6889381 Pnuc_0443 Pnuc_0444     FALSE 0.049 233.000 0.000 NA N NA
 6889382 6889383 Pnuc_0445 Pnuc_0446     FALSE 0.075 120.000 0.000 1.000 N NA
 6889384 6889385 Pnuc_0447 Pnuc_0448     FALSE 0.165 46.000 0.000 NA   NA
 6889387 6889388 Pnuc_0450 Pnuc_0451     FALSE 0.457 9.000 0.000 NA N NA
 6889388 6889389 Pnuc_0451 Pnuc_0452     TRUE 0.985 10.000 0.713 NA Y NA
 6889389 6889390 Pnuc_0452 Pnuc_0453     FALSE 0.197 171.000 0.070 NA N NA
 6889390 6889391 Pnuc_0453 Pnuc_0454     TRUE 0.966 11.000 0.525 0.004 N NA
 6889391 6889392 Pnuc_0454 Pnuc_0455     TRUE 0.968 0.000 0.250 0.004   NA
 6889392 6889393 Pnuc_0455 Pnuc_0456     TRUE 0.969 -3.000 0.128 0.004   NA
 6889393 6889394 Pnuc_0456 Pnuc_0457     TRUE 0.974 4.000 0.231 1.000 Y NA
 6889394 6889395 Pnuc_0457 Pnuc_0458     TRUE 0.835 16.000 0.102 NA   NA
 6889395 6889396 Pnuc_0458 Pnuc_0459     TRUE 0.951 -3.000 0.114 NA   NA
 6889401 6889402 Pnuc_0464 Pnuc_0465     FALSE 0.433 33.000 0.000 1.000 N NA
 6889404 6889405 Pnuc_0467 Pnuc_0468     TRUE 0.637 90.000 0.435 NA   NA
 6889405 6889406 Pnuc_0468 Pnuc_0469     TRUE 0.836 28.000 0.118 1.000   NA
 6889406 6889407 Pnuc_0469 Pnuc_0470     TRUE 0.592 13.000 0.000 0.068 N NA
 6889411 6889412 Pnuc_0474 Pnuc_0475     FALSE 0.068 71.000 0.004 1.000   NA
 6889413 6889414 Pnuc_0476 Pnuc_0477     FALSE 0.403 12.000 0.008 1.000   NA
 6889415 6889416 Pnuc_0478 Pnuc_0479     TRUE 0.775 16.000 0.062 1.000   NA
 6889416 6889417 Pnuc_0479 Pnuc_0480     TRUE 0.998 -21.000 0.357 0.002 Y NA
 6889417 6889418 Pnuc_0480 Pnuc_0481     TRUE 0.553 18.000 0.000 1.000 N NA
 6889418 6889419 Pnuc_0481 Pnuc_0482     TRUE 0.689 23.000 0.042 1.000   NA
 6889419 6889420 Pnuc_0482 Pnuc_0483     TRUE 0.831 48.000 0.333 1.000   NA
 6889420 6889421 Pnuc_0483 Pnuc_0484     FALSE 0.081 83.000 0.008 1.000   NA
 6889422 6889423 Pnuc_0485 Pnuc_0486     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6889423 6889424 Pnuc_0486 Pnuc_0487     FALSE 0.310 8.000 0.000 NA   NA
 6889424 6889425 Pnuc_0487 Pnuc_0488     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6889425 6889426 Pnuc_0488 Pnuc_0489     FALSE 0.445 32.000 0.000 1.000 N NA
 6889427 6889428 Pnuc_R0014 Pnuc_0490     FALSE 0.076 66.000 0.000 NA   NA
 6889428 6889429 Pnuc_0490 Pnuc_0491     TRUE 0.977 -3.000 0.259 1.000   NA
 6889429 6889430 Pnuc_0491 Pnuc_0492     FALSE 0.309 95.000 0.071 1.000 N NA
 6889431 6889432 Pnuc_0493 Pnuc_0494     TRUE 0.802 27.000 0.067 1.000 N NA
 6889432 6889433 Pnuc_0494 Pnuc_0495     TRUE 0.977 0.000 0.121 1.000 Y NA
 6889433 6889434 Pnuc_0495 Pnuc_0496     TRUE 0.838 50.000 0.098 1.000 Y NA
 6889434 6889435 Pnuc_0496 Pnuc_0497     TRUE 0.969 20.000 0.198 1.000 Y NA
 6889435 6889436 Pnuc_0497 Pnuc_0498     TRUE 0.973 0.000 0.100 1.000 Y NA
 6889436 6889437 Pnuc_0498 Pnuc_0499   cmk TRUE 0.923 5.000 0.209 1.000 N NA
 6889437 6889438 Pnuc_0499 Pnuc_0500 cmk rpsA FALSE 0.479 146.000 0.281 1.000 N NA
 6889438 6889439 Pnuc_0500 Pnuc_0501 rpsA   TRUE 0.798 53.000 0.292 1.000 N NA
 6889439 6889440 Pnuc_0501 Pnuc_0502     FALSE 0.238 61.000 0.013 1.000 N NA
 6889440 6889441 Pnuc_0502 Pnuc_0503     TRUE 0.618 35.000 0.034 1.000 N NA
 6889441 6889442 Pnuc_0503 Pnuc_0504     TRUE 0.973 -22.000 0.006 1.000 Y NA
 6889442 6889443 Pnuc_0504 Pnuc_0505     TRUE 0.990 -3.000 0.191 1.000 Y NA
 6889443 6889444 Pnuc_0505 Pnuc_0506     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6889444 6889445 Pnuc_0506 Pnuc_0507     FALSE 0.033 130.000 0.000 NA   NA
 6889445 6889446 Pnuc_0507 Pnuc_0508     FALSE 0.223 42.000 0.000 1.000   NA
 6889448 6889449 Pnuc_0510 Pnuc_0511     TRUE 0.677 44.000 0.000 NA Y NA
 6889449 6889450 Pnuc_0511 Pnuc_0512     FALSE 0.298 82.000 0.051 1.000 N NA
 6889450 6889451 Pnuc_0512 Pnuc_0513     TRUE 0.994 1.000 0.667 0.032 Y NA
 6889451 6889452 Pnuc_0513 Pnuc_0514     TRUE 0.634 61.000 0.118 0.017 N NA
 6889453 6889454 Pnuc_0515 Pnuc_0516     TRUE 0.658 13.000 0.045 NA   NA
 6889455 6889456 Pnuc_0517 Pnuc_0518 rpsP   TRUE 0.843 92.000 0.342 0.023 Y NA
 6889456 6889457 Pnuc_0518 Pnuc_0519     TRUE 0.989 18.000 0.672 1.000 Y NA
 6889457 6889458 Pnuc_0519 Pnuc_0520   rplS TRUE 0.825 127.000 0.567 1.000 Y NA
 6889458 6889459 Pnuc_0520 Pnuc_0521 rplS   FALSE 0.279 64.000 0.027 1.000 N NA
 6889459 6889460 Pnuc_0521 Pnuc_0522     TRUE 0.981 -3.000 0.254 1.000 N NA
 6889461 6889462 Pnuc_0523 Pnuc_0524     TRUE 0.751 3.000 0.046 1.000   NA
 6889465 6889466 Pnuc_0527 Pnuc_0528     FALSE 0.144 57.000 0.010 NA   NA
 6889466 6889467 Pnuc_0528 Pnuc_0529     FALSE 0.070 114.000 0.000 NA N NA
 6889467 6889468 Pnuc_0529 Pnuc_0530     FALSE 0.371 26.000 0.000 1.000   NA
 6889470 6889471 Pnuc_0532 Pnuc_0533     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6889471 6889472 Pnuc_0533 Pnuc_0534     FALSE 0.024 505.000 0.000 NA   NA
 6889472 6889473 Pnuc_0534 Pnuc_0535     TRUE 0.990 -3.000 0.684 NA   NA
 6889474 6889475 Pnuc_0536 Pnuc_0537     TRUE 0.991 -3.000 0.588 1.000 N NA
 6889475 6889476 Pnuc_0537 Pnuc_0538     FALSE 0.041 105.000 0.000 NA   NA
 6889476 6889477 Pnuc_0538 Pnuc_0539     FALSE 0.060 78.000 0.000 NA   NA
 6889477 6889478 Pnuc_0539 Pnuc_0540     FALSE 0.065 145.000 0.000 1.000 N NA
 6889479 6889480 Pnuc_0541 Pnuc_0542     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 6889480 6889481 Pnuc_0542 Pnuc_0543     FALSE 0.084 62.000 0.000 NA   NA
 6889481 6889482 Pnuc_0543 Pnuc_0544     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 6889482 6889483 Pnuc_0544 Pnuc_0545     FALSE 0.036 119.000 0.000 NA   NA
 6889483 6889484 Pnuc_0545 Pnuc_0546     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6889486 6889487 Pnuc_0548 Pnuc_0549     FALSE 0.061 77.000 0.000 NA   NA
 6889487 6889488 Pnuc_0549 Pnuc_0550     FALSE 0.041 106.000 0.000 NA   NA
 6889490 6889491 Pnuc_0552 Pnuc_0553     FALSE 0.097 95.000 0.000 1.000 N NA
 6889491 6889492 Pnuc_0553 Pnuc_0554     FALSE 0.024 451.000 0.000 NA   NA
 6889494 6889495 Pnuc_0556 Pnuc_0557     FALSE 0.127 51.000 0.000 NA   NA
 6889497 6889498 Pnuc_0559 Pnuc_0560     TRUE 0.812 4.000 0.083 NA   NA
 6889499 6889500 Pnuc_0561 Pnuc_0562     FALSE 0.024 611.000 0.000 NA   NA
 6889500 6889501 Pnuc_0562 Pnuc_0563     FALSE 0.407 4.000 0.000 1.000   NA
 6889501 6889502 Pnuc_0563 Pnuc_0564     TRUE 0.885 4.000 0.000 0.006 Y NA
 6889503 6889504 Pnuc_0565 Pnuc_0566     FALSE 0.184 43.000 0.000 NA   NA
 6889505 6889506 Pnuc_0567 Pnuc_0568     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6889506 6889507 Pnuc_0568 Pnuc_0569     FALSE 0.051 87.000 0.000 NA   NA
 6889509 6889510 Pnuc_0571 Pnuc_0572     FALSE 0.037 142.000 0.000 1.000   NA
 6889511 6889512 Pnuc_0573 Pnuc_0574     FALSE 0.219 38.000 0.000 NA   NA
 6889512 6889513 Pnuc_0574 Pnuc_0575     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 6889513 6889514 Pnuc_0575 Pnuc_0576     FALSE 0.025 353.000 0.000 NA   NA
 6889514 6889515 Pnuc_0576 Pnuc_0577     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6889516 6889517 Pnuc_0578 Pnuc_0579     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 6889519 6889520 Pnuc_0581 Pnuc_0582     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6889521 6889522 Pnuc_0583 Pnuc_0584     FALSE 0.344 9.000 0.000 1.000   NA
 6889522 6889523 Pnuc_0584 Pnuc_0585     TRUE 0.781 -22.000 0.000 NA   NA
 6889523 6889524 Pnuc_0585 Pnuc_0586     FALSE 0.024 594.000 0.000 NA   NA
 6889524 6889525 Pnuc_0586 Pnuc_0587     TRUE 0.511 86.000 0.167 1.000 N NA
 6889525 6889526 Pnuc_0587 Pnuc_0588     FALSE 0.024 568.000 0.000 NA   NA
 6889526 6889527 Pnuc_0588 Pnuc_0589     FALSE 0.304 11.000 0.000 NA   NA
 6889528 6889529 Pnuc_0590 Pnuc_0591     FALSE 0.398 3.000 0.000 NA   NA
 6889529 6889530 Pnuc_0591 Pnuc_0592     FALSE 0.030 371.000 0.000 1.000   NA
 6889530 6889531 Pnuc_0592 Pnuc_0593     FALSE 0.067 83.000 0.000 1.000   NA
 6889533 6889534 Pnuc_R0015 Pnuc_0595     FALSE 0.051 87.000 0.000 NA   NA
 6889534 6889535 Pnuc_0595 Pnuc_0596     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6889536 6889537 Pnuc_0597 Pnuc_0598     FALSE 0.305 43.000 0.000 NA N NA
 6889537 6889538 Pnuc_0598 Pnuc_0599     TRUE 0.960 0.000 0.275 NA   NA
 6889539 6889540 Pnuc_0600 Pnuc_0601     TRUE 0.917 -3.000 0.043 1.000 N NA
 6889541 6889542 Pnuc_0602 Pnuc_0603     FALSE 0.033 133.000 0.000 NA   NA
 6889542 6889543 Pnuc_0603 Pnuc_0604     TRUE 0.605 7.000 0.034 NA   NA
 6889546 6889547 Pnuc_0607 Pnuc_0608     TRUE 0.907 3.000 0.026 NA Y NA
 6889547 6889548 Pnuc_0608 Pnuc_0609     TRUE 0.975 -3.000 0.050 NA Y NA
 6889550 6889551 Pnuc_0611 Pnuc_0612     TRUE 0.987 -3.000 0.417 NA N NA
 6889551 6889552 Pnuc_0612 Pnuc_0613     TRUE 0.952 -7.000 0.074 NA   NA
 6889552 6889553 Pnuc_0613 Pnuc_0614     TRUE 0.906 31.000 0.307 NA   NA
 6889553 6889554 Pnuc_0614 Pnuc_0615     FALSE 0.410 48.000 0.044 NA   NA
 6889554 6889555 Pnuc_0615 Pnuc_0616     TRUE 0.979 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 6889555 6889556 Pnuc_0616 Pnuc_0617     TRUE 0.764 16.000 0.043 1.000 N NA
 6889556 6889557 Pnuc_0617 Pnuc_0618     TRUE 0.570 30.000 0.034 NA   NA
 6889558 6889559 Pnuc_R0016 Pnuc_0619     FALSE 0.041 106.000 0.000 NA   NA
 6889560 6889561 Pnuc_0620 Pnuc_0621     FALSE 0.074 64.000 0.004 1.000   NA
 6889561 6889562 Pnuc_0621 Pnuc_0622     TRUE 0.991 -3.000 0.631 0.064   NA
 6889563 6889564 Pnuc_0623 Pnuc_0624     TRUE 0.964 4.000 0.494 1.000 N NA
 6889564 6889565 Pnuc_0624 Pnuc_0625     FALSE 0.438 29.000 0.003 1.000 N NA
 6889565 6889566 Pnuc_0625 Pnuc_0626     FALSE 0.445 12.000 0.003 1.000 N NA
 6889566 6889567 Pnuc_0626 Pnuc_0627     FALSE 0.115 133.000 0.037 1.000   NA
 6889567 6889568 Pnuc_0627 Pnuc_0628     FALSE 0.031 140.000 0.000 NA   NA
 6889568 6889569 Pnuc_0628 Pnuc_0629     TRUE 0.970 32.000 0.359 NA Y NA
 6889569 6889570 Pnuc_0629 Pnuc_0630     TRUE 0.993 2.000 0.900 NA Y NA
 6889570 6889571 Pnuc_0630 Pnuc_0631     TRUE 0.529 25.000 0.000 1.000 N NA
 6889572 6889573 Pnuc_0632 Pnuc_0633     FALSE 0.028 181.000 0.000 NA   NA
 6889573 6889574 Pnuc_0633 Pnuc_0634     TRUE 0.784 -25.000 0.000 NA   NA
 6889574 6889575 Pnuc_0634 Pnuc_0635     FALSE 0.035 124.000 0.000 NA   NA
 6889576 6889577 Pnuc_0636 Pnuc_0637     FALSE 0.057 205.000 0.000 1.000 N NA
 6889577 6889578 Pnuc_0637 Pnuc_0638     TRUE 0.524 73.000 0.134 1.000 N NA
 6889578 6889579 Pnuc_0638 Pnuc_0639     TRUE 0.511 102.000 0.265 1.000   NA
 6889579 6889580 Pnuc_0639 Pnuc_0640     FALSE 0.341 128.000 0.161 1.000   NA
 6889580 6889581 Pnuc_0640 Pnuc_0641     TRUE 0.896 2.000 0.088 1.000 N NA
 6889584 6889585 Pnuc_0644 Pnuc_0645 panC   TRUE 0.807 -3.000 0.018 NA   NA
 6889585 6889586 Pnuc_0645 Pnuc_0646     TRUE 0.929 -7.000 0.048 NA   NA
 6889586 6889587 Pnuc_0646 Pnuc_0647     FALSE 0.128 105.000 0.036 NA   NA
 6889588 6889589 Pnuc_0648 Pnuc_0649   dcd FALSE 0.370 53.000 0.028 1.000 N NA
 6889589 6889590 Pnuc_0649 Pnuc_0650 dcd   FALSE 0.377 14.000 0.000 1.000   NA
 6889590 6889591 Pnuc_0650 Pnuc_0651     TRUE 0.697 -3.000 0.000 1.000   NA
 6889591 6889592 Pnuc_0651 Pnuc_0652     TRUE 0.553 17.000 0.000 1.000 N NA
 6889593 6889594 Pnuc_0653 Pnuc_0654     TRUE 0.993 -3.000 0.283 NA Y NA
 6889594 6889595 Pnuc_0654 Pnuc_0655     FALSE 0.474 6.000 0.005 NA N NA
 6889596 6889597 Pnuc_0656 Pnuc_0657     TRUE 0.975 24.000 0.205 0.003 Y NA
 6889598 6889599 Pnuc_0658 Pnuc_0659     TRUE 0.576 3.000 0.006 NA N NA
 6889604 6889605 Pnuc_0664 Pnuc_0665     FALSE 0.055 236.000 0.000 1.000 N NA
 6889605 6889606 Pnuc_0665 Pnuc_0666     TRUE 0.827 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6889606 6889607 Pnuc_0666 Pnuc_0667     FALSE 0.053 101.000 0.000 1.000   NA
 6889607 6889608 Pnuc_0667 Pnuc_0668   pepN FALSE 0.199 46.000 0.006 1.000   NA
 6889608 6889609 Pnuc_0668 Pnuc_0669 pepN   FALSE 0.356 82.000 0.071 1.000 N NA
 6889610 6889611 Pnuc_0670 Pnuc_0671     TRUE 0.995 1.000 0.871 0.002 Y NA
 6889612 6889613 Pnuc_0672 Pnuc_0673     TRUE 0.991 -3.000 0.848 NA   NA
 6889613 6889614 Pnuc_0673 Pnuc_R0017     FALSE 0.355 16.000 0.000 NA   NA
 6889614 6889615 Pnuc_R0017 Pnuc_0674     FALSE 0.024 749.000 0.000 NA   NA
 6889615 6889616 Pnuc_0674 Pnuc_0675     FALSE 0.028 170.000 0.000 NA   NA
 6889616 6889617 Pnuc_0675 Pnuc_0676     FALSE 0.062 75.000 0.000 NA   NA
 6889617 6889618 Pnuc_0676 Pnuc_0677     TRUE 0.563 0.000 0.000 1.000   NA
 6889618 6889619 Pnuc_0677 Pnuc_0678     TRUE 0.975 -3.000 0.232 1.000   NA
 6889619 6889620 Pnuc_0678 Pnuc_0679     FALSE 0.266 32.000 0.000 NA   NA
 6889622 6889623 Pnuc_0681 Pnuc_0682     FALSE 0.123 81.000 0.000 0.009   NA
 6889624 6889625 Pnuc_0683 Pnuc_0684     TRUE 0.635 71.000 0.288 1.000   NA
 6889625 6889626 Pnuc_0684 Pnuc_0685     FALSE 0.312 38.000 0.009 1.000   NA
 6889627 6889628 Pnuc_0686 Pnuc_0687 hppA   FALSE 0.024 388.000 0.000 NA   NA
 6889628 6889629 Pnuc_0687 Pnuc_0688     TRUE 0.982 0.000 0.727 NA   NA
 6889631 6889632 Pnuc_0690 Pnuc_0691     TRUE 0.870 10.000 0.130 1.000 N NA
 6889632 6889633 Pnuc_0691 Pnuc_0692     FALSE 0.279 47.000 0.005 1.000 N NA
 6889634 6889635 Pnuc_0693 Pnuc_0694     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6889636 6889637 Pnuc_R0018 Pnuc_0695     FALSE 0.035 122.000 0.000 NA   NA
 6889637 6889638 Pnuc_0695 Pnuc_0696     FALSE 0.058 194.000 0.000 1.000 N NA
 6889638 6889639 Pnuc_0696 Pnuc_0697     FALSE 0.056 213.000 0.000 1.000 N NA
 6889639 6889640 Pnuc_0697 Pnuc_0698     FALSE 0.066 71.000 0.000 NA   NA
 6889641 6889642 Pnuc_0699 Pnuc_R0019   ffs FALSE 0.025 289.000 0.000 NA   NA
 6889643 6889644 Pnuc_0700 Pnuc_0701     TRUE 0.735 65.000 0.411 NA   NA
 6889644 6889645 Pnuc_0701 Pnuc_0702   recR TRUE 0.980 0.000 0.604 NA   NA
 6889645 6889646 Pnuc_0702 Pnuc_0703 recR   FALSE 0.031 223.000 0.000 1.000   NA
 6889646 6889647 Pnuc_0703 Pnuc_0704     FALSE 0.038 137.000 0.000 1.000   NA
 6889647 6889648 Pnuc_0704 Pnuc_0705     TRUE 0.963 -25.000 0.053 1.000 N NA
 6889648 6889649 Pnuc_0705 Pnuc_0706     FALSE 0.030 327.000 0.000 1.000   NA
 6889649 6889650 Pnuc_0706 Pnuc_0707     FALSE 0.203 40.000 0.000 NA   NA
 6889655 6889656 Pnuc_0712 Pnuc_0713     FALSE 0.084 62.000 0.000 NA   NA
 6889658 6889659 Pnuc_0715 Pnuc_0716     FALSE 0.418 12.000 0.011 NA   NA
 6889660 6889661 Pnuc_0717 Pnuc_0718     FALSE 0.388 27.000 0.007 1.000   NA
 6889661 6889662 Pnuc_0718 Pnuc_0719     FALSE 0.100 168.000 0.018 1.000 N NA
 6889665 6889666 Pnuc_0722 Pnuc_0723     TRUE 0.923 5.000 0.286 NA   NA
 6889666 6889667 Pnuc_0723 Pnuc_0724     FALSE 0.187 59.000 0.000 1.000 N NA
 6889667 6889668 Pnuc_0724 Pnuc_0725     FALSE 0.114 53.000 0.000 NA   NA
 6889670 6889671 Pnuc_0727 Pnuc_0728     FALSE 0.041 105.000 0.000 NA   NA
 6889671 6889672 Pnuc_0728 Pnuc_0729     TRUE 0.974 15.000 0.286 NA Y NA
 6889672 6889673 Pnuc_0729 Pnuc_0730     TRUE 0.549 16.000 0.000 1.000 N NA
 6889673 6889674 Pnuc_0730 Pnuc_0731     TRUE 0.804 54.000 0.318 1.000 N NA
 6889674 6889675 Pnuc_0731 Pnuc_0732     TRUE 0.959 20.000 0.404 1.000 N NA
 6889675 6889676 Pnuc_0732 Pnuc_0733     TRUE 0.917 37.000 0.088 0.009 Y NA
 6889677 6889678 Pnuc_0734 Pnuc_0735 aceE   TRUE 0.948 15.000 0.101 1.000 Y NA
 6889678 6889679 Pnuc_0735 Pnuc_0736     TRUE 0.980 10.000 0.463 1.000 Y NA
 6889681 6889682 Pnuc_0738 Pnuc_0739     FALSE 0.377 108.000 0.160 1.000   NA
 6889683 6889684 Pnuc_0740 Pnuc_0741     FALSE 0.081 93.000 0.003 1.000 N NA
 6889684 6889685 Pnuc_0741 Pnuc_0742     TRUE 0.718 10.000 0.044 1.000 N NA
 6889685 6889686 Pnuc_0742 Pnuc_0743   aat TRUE 0.993 -3.000 0.285 1.000 Y NA
 6889686 6889687 Pnuc_0743 Pnuc_0744 aat   TRUE 0.769 9.000 0.058 1.000 N NA
 6889687 6889688 Pnuc_0744 Pnuc_0745     FALSE 0.484 10.000 0.000 1.000 N NA
 6889688 6889689 Pnuc_0745 Pnuc_0746     TRUE 0.540 23.000 0.006 1.000 N NA
 6889689 6889690 Pnuc_0746 Pnuc_0747     FALSE 0.105 88.000 0.000 1.000 N NA
 6889690 6889691 Pnuc_0747 Pnuc_0748     TRUE 0.496 12.000 0.000 1.000 N NA
 6889691 6889692 Pnuc_0748 Pnuc_0749     FALSE 0.234 5.000 0.002 NA   NA
 6889692 6889693 Pnuc_0749 Pnuc_0750     FALSE 0.038 112.000 0.000 NA   NA
 6889693 6889694 Pnuc_0750 Pnuc_0751     TRUE 0.634 2.000 0.000 1.000 N NA
 6889694 6889695 Pnuc_0751 Pnuc_0752     TRUE 0.524 14.000 0.000 1.000 N NA
 6889696 6889697 Pnuc_0753 Pnuc_0754     TRUE 0.539 0.000 0.007 NA   NA
 6889698 6889699 Pnuc_0755 Pnuc_0756     TRUE 0.507 22.000 0.014 NA   NA
 6889700 6889701 Pnuc_0757 Pnuc_0758     FALSE 0.409 133.000 0.185 1.000 N NA
 6889701 6889702 Pnuc_0758 Pnuc_0759     TRUE 0.987 25.000 0.453 0.001 Y NA
 6889702 6889703 Pnuc_0759 Pnuc_0760     TRUE 0.990 5.000 0.705 0.002 Y NA
 6889703 6889704 Pnuc_0760 Pnuc_0761     TRUE 0.990 18.000 0.604 0.002 Y NA
 6889704 6889705 Pnuc_0761 Pnuc_0762     TRUE 0.961 -3.000 0.151 NA   NA
 6889705 6889706 Pnuc_0762 Pnuc_0763   gltA FALSE 0.419 83.000 0.136 NA   NA
 6889706 6889707 Pnuc_0763 Pnuc_0764 gltA   TRUE 0.624 18.000 0.011 1.000 N NA
 6889707 6889708 Pnuc_0764 Pnuc_0765     TRUE 0.509 11.000 0.017 1.000   NA
 6889708 6889709 Pnuc_0765 Pnuc_0766   leuD TRUE 0.606 36.000 0.050 1.000   NA
 6889709 6889710 Pnuc_0766 Pnuc_0767 leuD   TRUE 0.968 24.000 0.141 0.002 Y NA
 6889710 6889711 Pnuc_0767 Pnuc_0768     TRUE 0.914 49.000 0.196 0.049 Y NA
 6889711 6889712 Pnuc_0768 Pnuc_0769     FALSE 0.453 18.000 0.010 NA   NA
 6889712 6889713 Pnuc_0769 Pnuc_0770   truA FALSE 0.312 10.000 0.006 NA   NA
 6889713 6889714 Pnuc_0770 Pnuc_0771 truA   TRUE 0.886 27.000 0.139 1.000 N NA
 6889714 6889715 Pnuc_0771 Pnuc_0772     TRUE 0.977 34.000 0.375 0.002 Y NA
 6889715 6889716 Pnuc_0772 Pnuc_0773   trpA TRUE 0.945 51.000 0.344 0.001 Y NA
 6889716 6889717 Pnuc_0773 Pnuc_0774 trpA   TRUE 0.923 7.000 0.232 1.000 N NA
 6889717 6889718 Pnuc_0774 Pnuc_0775     TRUE 0.954 5.000 0.383 1.000 N NA
 6889718 6889719 Pnuc_0775 Pnuc_0776     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6889719 6889720 Pnuc_0776 Pnuc_0777     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6889720 6889721 Pnuc_0777 Pnuc_0778     FALSE 0.385 5.000 0.000 1.000   NA
 6889721 6889722 Pnuc_0778 Pnuc_0779     TRUE 0.630 61.000 0.153 1.000 N NA
 6889722 6889723 Pnuc_0779 Pnuc_0780     TRUE 0.897 -19.000 0.007 1.000 N NA
 6889724 6889725 Pnuc_0781 Pnuc_0782     TRUE 0.701 0.000 0.000 1.000 N NA
 6889726 6889727 Pnuc_0783 Pnuc_0784     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 6889727 6889728 Pnuc_0784 Pnuc_0785     FALSE 0.100 57.000 0.000 NA   NA
 6889729 6889730 Pnuc_0786 Pnuc_0787     TRUE 0.959 46.000 0.371 0.018 Y NA
 6889731 6889732 Pnuc_0788 Pnuc_0789     TRUE 0.772 2.000 0.047 NA   NA
 6889734 6889735 Pnuc_0791 Pnuc_0792     FALSE 0.345 15.000 0.000 NA   NA
 6889735 6889736 Pnuc_0792 Pnuc_0793     FALSE 0.475 13.000 0.000 NA N NA
 6889736 6889737 Pnuc_0793 Pnuc_0794     FALSE 0.345 15.000 0.000 NA   NA
 6889740 6889741 Pnuc_0797 Pnuc_0798     FALSE 0.360 13.000 0.000 1.000   NA
 6889741 6889742 Pnuc_0798 Pnuc_0799     TRUE 0.879 3.000 0.122 NA   NA
 6889743 6889744 Pnuc_0800 Pnuc_0801     FALSE 0.150 51.000 0.000 1.000   NA
 6889744 6889745 Pnuc_0801 Pnuc_0802     TRUE 0.985 -16.000 0.179 0.069   NA
 6889745 6889746 Pnuc_0802 Pnuc_0803     FALSE 0.364 84.000 0.109 NA   NA
 6889746 6889747 Pnuc_0803 Pnuc_0804     TRUE 0.750 55.000 0.312 NA   NA
 6889747 6889748 Pnuc_0804 Pnuc_0805     TRUE 0.857 46.000 0.370 NA   NA
 6889748 6889749 Pnuc_0805 Pnuc_0806     TRUE 0.978 20.000 0.926 0.018   NA
 6889749 6889750 Pnuc_0806 Pnuc_0807     TRUE 0.846 48.000 0.370 1.000   NA
 6889750 6889751 Pnuc_0807 Pnuc_0808     TRUE 0.837 25.000 0.111 NA   NA
 6889751 6889752 Pnuc_0808 Pnuc_0809     TRUE 0.917 13.000 0.294 NA   NA
 6889752 6889753 Pnuc_0809 Pnuc_0810     FALSE 0.109 60.000 0.000 1.000   NA
 6889753 6889754 Pnuc_0810 Pnuc_0811     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 6889754 6889755 Pnuc_0811 Pnuc_0812     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 6889755 6889756 Pnuc_0812 Pnuc_0813     TRUE 0.925 2.000 0.188 NA   NA
 6889756 6889757 Pnuc_0813 Pnuc_0814     FALSE 0.308 12.000 0.000 NA   NA
 6889757 6889758 Pnuc_0814 Pnuc_0815     FALSE 0.355 21.000 0.000 NA   NA
 6889758 6889759 Pnuc_0815 Pnuc_0816     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6889759 6889760 Pnuc_0816 Pnuc_0817     FALSE 0.033 131.000 0.000 NA   NA
 6889762 6889763 Pnuc_0819 Pnuc_0820     FALSE 0.032 135.000 0.000 NA   NA
 6889764 6889765 Pnuc_0821 Pnuc_0822     TRUE 0.720 -3.000 0.008 NA   NA
 6889765 6889766 Pnuc_0822 Pnuc_0823     FALSE 0.398 3.000 0.000 NA   NA
 6889766 6889767 Pnuc_0823 Pnuc_0824     TRUE 0.555 4.000 0.000 1.000 N NA
 6889768 6889769 Pnuc_0825 Pnuc_0826     TRUE 0.983 39.000 0.789 0.001 Y NA
 6889769 6889770 Pnuc_0826 Pnuc_0827     TRUE 0.618 35.000 0.034 1.000 N NA
 6889770 6889771 Pnuc_0827 Pnuc_0828     TRUE 0.652 10.000 0.026 1.000 N NA
 6889771 6889772 Pnuc_0828 Pnuc_R0020     FALSE 0.358 19.000 0.000 NA   NA
 6889772 6889773 Pnuc_R0020 Pnuc_0829     FALSE 0.045 99.000 0.000 NA   NA
 6889773 6889774 Pnuc_0829 Pnuc_0830     TRUE 0.852 58.000 0.186 1.000 Y NA
 6889774 6889775 Pnuc_0830 Pnuc_0831     TRUE 0.827 141.000 0.652 1.000 Y NA
 6889775 6889776 Pnuc_0831 Pnuc_0832     TRUE 0.991 26.000 0.928 0.022 Y NA
 6889776 6889777 Pnuc_0832 Pnuc_0833     TRUE 0.964 27.000 0.202 1.000 Y NA
 6889777 6889778 Pnuc_0833 Pnuc_0834     TRUE 0.989 24.000 0.574 0.001 Y NA
 6889778 6889779 Pnuc_0834 Pnuc_0835     TRUE 0.820 46.000 0.208 1.000 N NA
 6889779 6889780 Pnuc_0835 Pnuc_0836     TRUE 0.995 -22.000 0.535 1.000 N NA
 6889780 6889781 Pnuc_0836 Pnuc_R0021     FALSE 0.337 25.000 0.000 NA   NA
 6889781 6889782 Pnuc_R0021 Pnuc_0837     FALSE 0.135 50.000 0.000 NA   NA
 6889782 6889783 Pnuc_0837 Pnuc_0838     FALSE 0.027 203.000 0.000 NA   NA
 6889785 6889786 Pnuc_0840 Pnuc_0841 sucA   TRUE 0.957 51.000 0.667 1.000 Y NA
 6889786 6889787 Pnuc_0841 Pnuc_0842     TRUE 0.970 13.000 0.253 1.000 Y NA
 6889787 6889788 Pnuc_0842 Pnuc_0843     TRUE 0.889 1.000 0.103 NA   NA
 6889788 6889789 Pnuc_0843 Pnuc_0844     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6889789 6889790 Pnuc_0844 Pnuc_0845     FALSE 0.321 31.000 0.000 1.000   NA
 6889790 6889791 Pnuc_0845 Pnuc_0846     TRUE 0.637 52.000 0.148 NA   NA
 6889791 6889792 Pnuc_0846 Pnuc_0847     TRUE 0.858 27.000 0.147 NA   NA
 6889792 6889793 Pnuc_0847 Pnuc_0848     TRUE 0.969 -3.000 0.037 NA Y NA
 6889794 6889795 Pnuc_0849 Pnuc_0850     FALSE 0.038 112.000 0.000 NA   NA
 6889797 6889798 Pnuc_0852 Pnuc_0853     TRUE 0.923 24.000 0.208 1.000 N NA
 6889800 6889801 Pnuc_0855 Pnuc_0856     TRUE 0.961 -3.000 0.136 1.000   NA
 6889801 6889802 Pnuc_0856 Pnuc_0857     FALSE 0.385 5.000 0.000 1.000   NA
 6889803 6889804 Pnuc_0858 Pnuc_0859 cysS   TRUE 0.846 0.000 0.036 1.000 N NA
 6889804 6889805 Pnuc_0859 Pnuc_0860     TRUE 0.767 10.000 0.059 1.000 N NA
 6889805 6889806 Pnuc_0860 Pnuc_0861     TRUE 0.982 -34.000 0.123 1.000 N NA
 6889806 6889807 Pnuc_0861 Pnuc_0862     FALSE 0.384 51.000 0.023 1.000 N NA
 6889807 6889808 Pnuc_0862 Pnuc_R0022     FALSE 0.068 70.000 0.000 NA   NA
 6889808 6889809 Pnuc_R0022 Pnuc_0863     FALSE 0.025 241.000 0.000 NA   NA
 6889810 6889811 Pnuc_0864 Pnuc_0865     TRUE 0.853 0.000 0.059 NA   NA
 6889811 6889812 Pnuc_0865 Pnuc_0866     FALSE 0.029 160.000 0.000 NA   NA
 6889812 6889813 Pnuc_0866 Pnuc_0867     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6889814 6889815 Pnuc_0868 Pnuc_0869     TRUE 0.777 225.000 0.460 0.080 Y NA
 6889815 6889816 Pnuc_0869 Pnuc_0870     TRUE 0.981 3.000 0.854 1.000 N NA
 6889816 6889817 Pnuc_0870 Pnuc_0871     FALSE 0.049 89.000 0.000 NA   NA
 6889817 6889818 Pnuc_0871 Pnuc_0872     FALSE 0.046 95.000 0.000 NA   NA
 6889818 6889819 Pnuc_0872 Pnuc_0873     TRUE 0.970 14.000 0.577 0.063 N NA
 6889819 6889820 Pnuc_0873 Pnuc_0874     FALSE 0.025 262.000 0.000 NA   NA
 6889822 6889823 Pnuc_0876 Pnuc_0877     FALSE 0.291 30.000 0.000 NA   NA
 6889823 6889824 Pnuc_0877 Pnuc_0878     TRUE 0.797 31.000 0.111 NA   NA
 6889824 6889825 Pnuc_0878 Pnuc_0879     FALSE 0.490 7.000 0.016 NA   NA
 6889825 6889826 Pnuc_0879 Pnuc_0880     TRUE 0.837 -3.000 0.024 NA   NA
 6889828 6889829 Pnuc_0882 Pnuc_0883     FALSE 0.484 10.000 0.000 1.000 N NA
 6889830 6889831 Pnuc_0884 Pnuc_0885     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 6889831 6889832 Pnuc_0885 Pnuc_0886     TRUE 0.774 -16.000 0.000 NA   NA
 6889832 6889833 Pnuc_0886 Pnuc_0887     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6889836 6889837 Pnuc_0889 Pnuc_0890     FALSE 0.033 131.000 0.000 NA   NA
 6889837 6889838 Pnuc_0890 Pnuc_0891     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889839 6889840 Pnuc_0892 Pnuc_0893   thiG TRUE 0.957 12.000 0.118 0.003 Y NA
 6889840 6889841 Pnuc_0893 Pnuc_0894 thiG   TRUE 0.927 25.000 0.064 1.000 Y NA
 6889841 6889842 Pnuc_0894 Pnuc_0895     TRUE 0.991 -9.000 0.342 1.000 N NA
 6889842 6889843 Pnuc_0895 Pnuc_0896     FALSE 0.369 61.000 0.044 1.000 N NA
 6889843 6889844 Pnuc_0896 Pnuc_0897     FALSE 0.056 222.000 0.000 1.000 N NA
 6889844 6889845 Pnuc_0897 Pnuc_R0024     FALSE 0.026 225.000 0.000 NA   NA
 6889845 6889846 Pnuc_R0024 Pnuc_0898     FALSE 0.026 210.000 0.000 NA   NA
 6889846 6889847 Pnuc_0898 Pnuc_0899     TRUE 0.674 0.000 0.000 NA N NA
 6889848 6889849 Pnuc_0900 Pnuc_0901     TRUE 0.762 72.000 0.106 0.002 Y NA
 6889852 6889853 Pnuc_0904 Pnuc_0905     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 6889853 6889854 Pnuc_0905 Pnuc_0906     TRUE 0.929 31.000 0.431 NA   NA
 6889855 6889856 Pnuc_0907 Pnuc_0908     TRUE 0.989 14.000 0.688 0.017 Y NA
 6889858 6889859 Pnuc_0910 Pnuc_0911     TRUE 0.955 16.000 0.366 1.000 N NA
 6889859 6889860 Pnuc_0911 Pnuc_0912     TRUE 0.797 11.000 0.069 1.000 N NA
 6889860 6889861 Pnuc_0912 Pnuc_0913     TRUE 0.963 16.000 0.157 1.000 Y NA
 6889861 6889862 Pnuc_0913 Pnuc_0914     TRUE 0.603 16.000 0.022 1.000   NA
 6889862 6889863 Pnuc_0914 Pnuc_0915     FALSE 0.042 91.000 0.003 1.000   NA
 6889863 6889864 Pnuc_0915 Pnuc_0916     TRUE 0.952 0.000 0.209 1.000   NA
 6889864 6889865 Pnuc_0916 Pnuc_0917     TRUE 0.575 -3.000 0.004 NA   NA
 6889869 6889870 Pnuc_0921 Pnuc_0922     TRUE 0.965 -3.000 0.168 NA   NA
 6889870 6889871 Pnuc_0922 Pnuc_0923     FALSE 0.038 120.000 0.006 NA   NA
 6889871 6889872 Pnuc_0923 Pnuc_0924   fabG TRUE 0.870 42.000 0.049 0.001 Y NA
 6889872 6889873 Pnuc_0924 Pnuc_0925 fabG   FALSE 0.324 111.000 0.130 NA   NA
 6889873 6889874 Pnuc_0925 Pnuc_0926     TRUE 0.663 3.000 0.030 NA   NA
 6889874 6889875 Pnuc_0926 Pnuc_0927     FALSE 0.101 82.000 0.004 1.000 N NA
 6889876 6889877 Pnuc_0928 Pnuc_0929     TRUE 0.651 21.000 0.014 1.000 N NA
 6889878 6889879 Pnuc_0930 Pnuc_0931     TRUE 0.979 11.000 0.419 1.000 Y NA
 6889879 6889880 Pnuc_0931 Pnuc_0932     FALSE 0.290 47.000 0.000 1.000 N NA
 6889880 6889881 Pnuc_0932 Pnuc_R0025     FALSE 0.072 68.000 0.000 NA   NA
 6889881 6889882 Pnuc_R0025 Pnuc_0933   tig FALSE 0.097 58.000 0.000 NA   NA
 6889882 6889883 Pnuc_0933 Pnuc_0934 tig   TRUE 0.971 32.000 0.351 1.000 Y NA
 6889883 6889884 Pnuc_0934 Pnuc_0935   clpX TRUE 0.961 39.000 0.352 1.000 Y NA
 6889884 6889885 Pnuc_0935 Pnuc_0936 clpX   TRUE 0.652 180.000 0.201 0.097 Y NA
 6889885 6889886 Pnuc_0936 Pnuc_R0026     FALSE 0.037 117.000 0.000 NA   NA
 6889886 6889887 Pnuc_R0026 Pnuc_0937     FALSE 0.045 100.000 0.000 NA   NA
 6889889 6889890 Pnuc_0939 Pnuc_0940     TRUE 0.569 22.000 0.007 1.000 N NA
 6889890 6889891 Pnuc_0940 Pnuc_0941     TRUE 0.530 13.000 0.007 1.000 N NA
 6889892 6889893 Pnuc_0942 Pnuc_0943     FALSE 0.029 160.000 0.000 NA   NA
 6889893 6889894 Pnuc_0943 Pnuc_0944     FALSE 0.310 8.000 0.000 NA   NA
 6889895 6889896 Pnuc_0945 Pnuc_0946 pyrG   TRUE 0.878 11.000 0.138 1.000 N NA
 6889896 6889897 Pnuc_0946 Pnuc_0947   eno TRUE 0.689 51.000 0.125 1.000 N NA
 6889897 6889898 Pnuc_0947 Pnuc_0948 eno   TRUE 0.936 20.000 0.241 1.000 N NA
 6889900 6889901 Pnuc_0950 Pnuc_R0027 gltX   FALSE 0.059 79.000 0.000 NA   NA
 6889901 6889902 Pnuc_R0027 Pnuc_R0028     FALSE 0.241 35.000 0.000 NA   NA
 6889902 6889903 Pnuc_R0028 Pnuc_R0029     FALSE 0.127 51.000 0.000 NA   NA
 6889904 6889905 Pnuc_0951 Pnuc_0952     FALSE 0.127 51.000 0.000 NA   NA
 6889906 6889907 Pnuc_0953 Pnuc_0954     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6889907 6889908 Pnuc_0954 Pnuc_0955     TRUE 0.697 -3.000 0.000 1.000   NA
 6889909 6889910 Pnuc_0956 Pnuc_0957     FALSE 0.304 11.000 0.000 NA   NA
 6889911 6889912 Pnuc_0958 Pnuc_0959     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6889912 6889913 Pnuc_0959 Pnuc_0960     FALSE 0.092 88.000 0.014 NA   NA
 6889913 6889914 Pnuc_0960 Pnuc_0961     FALSE 0.308 12.000 0.000 NA   NA
 6889915 6889916 Pnuc_0962 Pnuc_0963     FALSE 0.088 61.000 0.000 NA   NA
 6889916 6889917 Pnuc_0963 Pnuc_0964     TRUE 0.890 -3.000 0.046 NA   NA
 6889917 6889918 Pnuc_0964 Pnuc_0965     TRUE 0.927 32.000 0.110 NA Y NA
 6889918 6889919 Pnuc_0965 Pnuc_0966     TRUE 0.916 13.000 0.211 1.000 N NA
 6889919 6889920 Pnuc_0966 Pnuc_0967     TRUE 0.903 15.000 0.209 NA   NA
 6889921 6889922 Pnuc_0968 Pnuc_0969     TRUE 0.634 18.000 0.032 NA   NA
 6889924 6889925 Pnuc_0971 Pnuc_0972     TRUE 0.776 30.000 0.095 NA   NA
 6889925 6889926 Pnuc_0972 Pnuc_0973     TRUE 0.849 33.000 0.136 1.000 N NA
 6889926 6889927 Pnuc_0973 Pnuc_0974     TRUE 0.966 -3.000 0.133 NA N NA
 6889927 6889928 Pnuc_0974 Pnuc_0975     FALSE 0.339 59.000 0.037 NA N NA
 6889929 6889930 Pnuc_0976 Pnuc_0977     TRUE 0.737 16.000 0.055 NA   NA
 6889930 6889931 Pnuc_0977 Pnuc_0978     FALSE 0.263 43.000 0.002 1.000 N NA
 6889931 6889932 Pnuc_0978 Pnuc_0979     FALSE 0.069 78.000 0.006 1.000   NA
 6889933 6889934 Pnuc_0980 Pnuc_0981     TRUE 0.954 10.000 0.657 NA   NA
 6889934 6889935 Pnuc_0981 Pnuc_0982     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889936 6889937 Pnuc_0983 Pnuc_0984     FALSE 0.160 50.000 0.000 1.000   NA
 6889937 6889938 Pnuc_0984 Pnuc_0985     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6889938 6889939 Pnuc_0985 Pnuc_0986     FALSE 0.302 29.000 0.000 NA   NA
 6889939 6889940 Pnuc_0986 Pnuc_0987     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6889940 6889941 Pnuc_0987 Pnuc_0988     TRUE 0.979 34.000 0.581 1.000 Y NA
 6889941 6889942 Pnuc_0988 Pnuc_0989     TRUE 0.992 22.000 0.897 0.011 Y NA
 6889942 6889943 Pnuc_0989 Pnuc_0990     TRUE 0.626 53.000 0.000 0.027 Y NA
 6889943 6889944 Pnuc_0990 Pnuc_0991     FALSE 0.053 291.000 0.000 1.000 N NA
 6889944 6889945 Pnuc_0991 Pnuc_0992     FALSE 0.047 357.000 0.000 NA N NA
 6889945 6889946 Pnuc_0992 Pnuc_0993     FALSE 0.025 343.000 0.000 NA   NA
 6889946 6889947 Pnuc_0993 Pnuc_0994     FALSE 0.060 88.000 0.000 1.000   NA
 6889947 6889948 Pnuc_0994 Pnuc_0995     TRUE 0.942 31.000 0.128 1.000 Y NA
 6889948 6889949 Pnuc_0995 Pnuc_0996     TRUE 0.999 -10.000 0.730 0.001 Y NA
 6889949 6889950 Pnuc_0996 Pnuc_0997     TRUE 0.988 16.000 0.703 NA Y NA
 6889950 6889951 Pnuc_0997 Pnuc_0998     TRUE 0.518 21.000 0.000 NA N NA
 6889952 6889953 Pnuc_0999 Pnuc_1000     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA N NA
 6889953 6889954 Pnuc_1000 Pnuc_1001     TRUE 0.995 -7.000 0.539 0.001 N NA
 6889954 6889955 Pnuc_1001 Pnuc_1002     TRUE 0.989 -7.000 0.294 1.000 N NA
 6889955 6889956 Pnuc_1002 Pnuc_1003     TRUE 0.840 8.000 0.095 1.000 N NA
 6889956 6889957 Pnuc_1003 Pnuc_1004     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6889958 6889959 Pnuc_1005 Pnuc_1006     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6889960 6889961 Pnuc_1007 Pnuc_1008     TRUE 0.774 -16.000 0.000 NA   NA
 6889962 6889963 Pnuc_R0030 Pnuc_R0031     FALSE 0.225 37.000 0.000 NA   NA
 6889964 6889965 Pnuc_1009 Pnuc_1010     TRUE 0.566 62.000 0.167 NA   NA
 6889966 6889967 Pnuc_1011 Pnuc_1012     TRUE 0.873 41.000 0.260 1.000 N NA
 6889967 6889968 Pnuc_1012 Pnuc_1013     TRUE 0.950 16.000 0.325 1.000 N NA
 6889968 6889969 Pnuc_1013 Pnuc_1014     FALSE 0.238 171.000 0.095 NA N NA
 6889971 6889972 Pnuc_1016 Pnuc_1017     TRUE 0.896 0.000 0.089 NA   NA
 6889972 6889973 Pnuc_1017 Pnuc_1018   carB TRUE 0.734 59.000 0.241 1.000 N NA
 6889973 6889974 Pnuc_1018 Pnuc_1019 carB   TRUE 0.992 0.000 0.345 0.001 Y NA
 6889974 6889975 Pnuc_1019 Pnuc_1020   prpE FALSE 0.054 265.000 0.000 1.000 N NA
 6889975 6889976 Pnuc_1020 Pnuc_1021 prpE   FALSE 0.489 35.000 0.031 NA   NA
 6889976 6889977 Pnuc_1021 Pnuc_1022     TRUE 0.955 0.000 0.233 NA   NA
 6889978 6889979 Pnuc_1023 Pnuc_1024   rnhA FALSE 0.267 10.000 0.003 1.000   NA
 6889979 6889980 Pnuc_1024 Pnuc_1025 rnhA   FALSE 0.082 111.000 0.000 1.000 N NA
 6889980 6889981 Pnuc_1025 Pnuc_1026     TRUE 0.993 -3.000 0.857 NA N NA
 6889981 6889982 Pnuc_1026 Pnuc_1027     TRUE 0.656 0.000 0.005 NA N NA
 6889983 6889984 Pnuc_1028 Pnuc_1029     FALSE 0.043 103.000 0.000 NA   NA
 6889984 6889985 Pnuc_1029 Pnuc_1030     FALSE 0.038 112.000 0.000 NA   NA
 6889985 6889986 Pnuc_1030 Pnuc_1031     FALSE 0.035 121.000 0.000 NA   NA
 6889988 6889989 Pnuc_1033 Pnuc_1034     FALSE 0.150 51.000 0.000 1.000   NA
 6889991 6889992 Pnuc_1036 Pnuc_1037     FALSE 0.258 66.000 0.046 NA   NA
 6889992 6889993 Pnuc_1037 Pnuc_1038     FALSE 0.118 122.000 0.017 1.000 N NA
 6889993 6889994 Pnuc_1038 Pnuc_1039     TRUE 0.979 11.000 0.340 0.009 Y NA
 6889994 6889995 Pnuc_1039 Pnuc_1040     TRUE 0.970 25.000 0.175 0.009 Y NA
 6889995 6889996 Pnuc_1040 Pnuc_1041     TRUE 0.989 3.000 0.451 0.009 Y NA
 6889996 6889997 Pnuc_1041 Pnuc_1042     TRUE 0.996 -3.000 0.484 0.004 Y NA
 6889997 6889998 Pnuc_1042 Pnuc_1043     TRUE 0.987 21.000 0.442 0.009 Y NA
 6889998 6889999 Pnuc_1043 Pnuc_1044     TRUE 0.985 12.000 0.500 0.009 Y NA
 6889999 6890000 Pnuc_1044 Pnuc_1045     TRUE 0.985 9.000 0.515 0.009 Y NA
 6890000 6890001 Pnuc_1045 Pnuc_1046     TRUE 0.978 32.000 0.395 0.009 Y NA
 6890001 6890002 Pnuc_1046 Pnuc_1047     TRUE 0.995 -3.000 0.343 0.009 Y NA
 6890002 6890003 Pnuc_1047 Pnuc_1048     TRUE 0.984 24.000 0.355 0.009 Y NA
 6890003 6890004 Pnuc_1048 Pnuc_1049     TRUE 0.988 4.000 0.483 0.009 Y NA
 6890004 6890005 Pnuc_1049 Pnuc_1050     TRUE 0.984 4.000 0.328 0.004 Y NA
 6890005 6890006 Pnuc_1050 Pnuc_1051     TRUE 0.987 6.000 0.507 0.004 Y NA
 6890006 6890007 Pnuc_1051 Pnuc_R0032     FALSE 0.039 109.000 0.000 NA   NA
 6890007 6890008 Pnuc_R0032 Pnuc_1052     FALSE 0.051 87.000 0.000 NA   NA
 6890008 6890009 Pnuc_1052 Pnuc_1053   tpiA TRUE 0.916 23.000 0.184 1.000 N NA
 6890009 6890010 Pnuc_1053 Pnuc_1054 tpiA   TRUE 0.870 17.000 0.099 1.000 N NA
 6890010 6890011 Pnuc_1054 Pnuc_1055     TRUE 0.662 31.000 0.034 1.000 N NA
 6890011 6890012 Pnuc_1055 Pnuc_1056     TRUE 0.695 269.000 0.335 1.000 Y NA
 6890014 6890015 Pnuc_1058 Pnuc_1059     FALSE 0.198 235.000 0.073 1.000 N NA
 6890015 6890016 Pnuc_1059 Pnuc_1060     TRUE 0.984 23.000 0.466 1.000 Y NA
 6890016 6890017 Pnuc_1060 Pnuc_1061     TRUE 0.618 40.000 0.046 1.000 N NA
 6890017 6890018 Pnuc_1061 Pnuc_1062   ilvH TRUE 0.849 52.000 0.092 0.002 Y NA
 6890018 6890019 Pnuc_1062 Pnuc_1063 ilvH   TRUE 0.993 0.000 0.371 0.001 Y NA
 6890020 6890021 Pnuc_1064 Pnuc_1065     TRUE 0.962 -3.000 0.156 NA   NA
 6890021 6890022 Pnuc_1065 Pnuc_1066     TRUE 0.925 21.000 0.277 NA   NA
 6890022 6890023 Pnuc_1066 Pnuc_1067     TRUE 0.934 19.000 0.310 NA   NA
 6890024 6890025 Pnuc_1068 Pnuc_1069     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6890025 6890026 Pnuc_1069 Pnuc_1070     FALSE 0.173 48.000 0.000 1.000   NA
 6890026 6890027 Pnuc_1070 Pnuc_1071     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 6890027 6890028 Pnuc_1071 Pnuc_1072     TRUE 0.880 -3.000 0.043 NA   NA
 6890028 6890029 Pnuc_1072 Pnuc_1073     TRUE 0.997 -3.000 0.854 NA Y NA
 6890029 6890030 Pnuc_1073 Pnuc_1074     TRUE 0.995 0.000 0.875 NA Y NA
 6890030 6890031 Pnuc_1074 Pnuc_R0033     FALSE 0.050 88.000 0.000 NA   NA
 6890033 6890034 Pnuc_1076 Pnuc_1077     TRUE 0.794 91.000 0.291 1.000 Y NA
 6890034 6890035 Pnuc_1077 Pnuc_1078     FALSE 0.265 45.000 0.003 1.000 N NA
 6890035 6890036 Pnuc_1078 Pnuc_1079     FALSE 0.358 17.000 0.000 NA   NA
 6890037 6890038 Pnuc_1080 Pnuc_1081     TRUE 0.929 13.000 0.262 1.000 N NA
 6890038 6890039 Pnuc_1081 Pnuc_1082     TRUE 0.986 -7.000 0.218 1.000 N NA
 6890039 6890040 Pnuc_1082 Pnuc_1083     FALSE 0.223 42.000 0.000 1.000   NA
 6890041 6890042 Pnuc_1084 Pnuc_1085     FALSE 0.080 112.000 0.000 1.000 N NA
 6890043 6890044 Pnuc_1086 Pnuc_1087     FALSE 0.177 44.000 0.000 NA   NA
 6890045 6890046 Pnuc_1088 Pnuc_1089     FALSE 0.027 208.000 0.000 NA   NA
 6890046 6890047 Pnuc_1089 Pnuc_R0034     FALSE 0.024 556.000 0.000 NA   NA
 6890047 6890048 Pnuc_R0034 Pnuc_1090     FALSE 0.241 35.000 0.000 NA   NA
 6890049 6890050 Pnuc_1091 Pnuc_1092     TRUE 0.568 61.000 0.017 1.000 Y NA
 6890051 6890052 Pnuc_1093 Pnuc_1094     FALSE 0.337 25.000 0.000 NA   NA
 6890052 6890053 Pnuc_1094 Pnuc_1095     FALSE 0.026 224.000 0.000 NA   NA
 6890053 6890054 Pnuc_1095 Pnuc_1096     FALSE 0.032 212.000 0.000 1.000   NA
 6890056 6890057 Pnuc_1098 Pnuc_1099     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6890057 6890058 Pnuc_1099 Pnuc_1100     TRUE 0.529 25.000 0.000 1.000 N NA
 6890059 6890060 Pnuc_1101 Pnuc_1102     FALSE 0.135 50.000 0.000 NA   NA
 6890060 6890061 Pnuc_1102 Pnuc_1103     FALSE 0.047 94.000 0.000 NA   NA
 6890061 6890062 Pnuc_1103 Pnuc_1104     TRUE 0.771 96.000 0.198 0.004 Y NA
 6890063 6890064 Pnuc_1105 Pnuc_1106     FALSE 0.076 66.000 0.000 NA   NA
 6890064 6890065 Pnuc_1106 Pnuc_1107     FALSE 0.054 271.000 0.000 1.000 N NA
 6890065 6890066 Pnuc_1107 Pnuc_1108     TRUE 0.992 0.000 0.531 NA Y NA
 6890066 6890067 Pnuc_1108 Pnuc_1109     FALSE 0.030 147.000 0.000 NA   NA
 6890067 6890068 Pnuc_1109 Pnuc_1110     TRUE 0.924 39.000 0.571 1.000   NA
 6890068 6890069 Pnuc_1110 Pnuc_1111     FALSE 0.025 385.000 0.000 NA   NA
 6890071 6890072 Pnuc_1113 Pnuc_1114     TRUE 0.967 -3.000 0.182 NA   NA
 6890072 6890073 Pnuc_1114 Pnuc_1115     FALSE 0.074 67.000 0.000 NA   NA
 6890075 6890076 Pnuc_1117 Pnuc_1118     TRUE 0.983 -7.000 0.231 NA   NA
 6890076 6890077 Pnuc_1118 Pnuc_1119     FALSE 0.024 462.000 0.000 NA   NA
 6890077 6890078 Pnuc_1119 Pnuc_1120     FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 6890078 6890079 Pnuc_1120 Pnuc_1121     TRUE 0.967 12.000 1.000 NA   NA
 6890080 6890081 Pnuc_1122 Pnuc_1123     FALSE 0.046 112.000 0.000 1.000   NA
 6890082 6890083 Pnuc_1124 Pnuc_1125     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 6890083 6890084 Pnuc_1125 Pnuc_1126     FALSE 0.024 616.000 0.000 NA   NA
 6890086 6890087 Pnuc_1128 Pnuc_1129     TRUE 0.815 4.000 0.087 NA   NA
 6890087 6890088 Pnuc_1129 Pnuc_1130     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 6890090 6890091 Pnuc_1132 Pnuc_1133     TRUE 0.877 18.000 0.000 0.036 Y NA
 6890091 6890092 Pnuc_1133 Pnuc_1134     TRUE 0.976 40.000 0.564 0.036 Y NA
 6890094 6890095 Pnuc_1136 Pnuc_1137     FALSE 0.464 1.000 0.000 NA   NA
 6890095 6890096 Pnuc_1137 Pnuc_R0035     FALSE 0.024 740.000 0.000 NA   NA
 6890096 6890097 Pnuc_R0035 Pnuc_1138     FALSE 0.094 59.000 0.000 NA   NA
 6890098 6890099 Pnuc_1139 Pnuc_1140     TRUE 0.553 19.000 0.000 1.000 N NA
 6890099 6890100 Pnuc_1140 Pnuc_1141     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6890100 6890101 Pnuc_1141 Pnuc_1142     TRUE 0.948 6.000 0.286 0.007 N NA
 6890101 6890102 Pnuc_1142 Pnuc_1143     TRUE 0.894 3.000 0.000 0.035 Y NA
 6890103 6890104 Pnuc_1144 Pnuc_1145     FALSE 0.212 39.000 0.000 NA   NA
 6890104 6890105 Pnuc_1145 Pnuc_1146     FALSE 0.308 12.000 0.000 NA   NA
 6890105 6890106 Pnuc_1146 Pnuc_1147     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA Y NA
 6890106 6890107 Pnuc_1147 Pnuc_1148     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6890107 6890108 Pnuc_1148 Pnuc_1149     FALSE 0.119 52.000 0.000 NA   NA
 6890108 6890109 Pnuc_1149 Pnuc_R0036     FALSE 0.035 123.000 0.000 NA   NA
 6890110 6890111 Pnuc_1150 Pnuc_1151     FALSE 0.076 66.000 0.000 NA   NA
 6890111 6890112 Pnuc_1151 Pnuc_1152     FALSE 0.316 13.000 0.000 NA   NA
 6890112 6890113 Pnuc_1152 Pnuc_1153   purU FALSE 0.127 51.000 0.000 NA   NA
 6890114 6890115 Pnuc_1154 Pnuc_1155     TRUE 0.991 -3.000 0.800 NA   NA
 6890115 6890116 Pnuc_1155 Pnuc_1156     TRUE 0.979 -3.000 0.300 NA   NA
 6890116 6890117 Pnuc_1156 Pnuc_1157     TRUE 0.988 -3.000 0.429 0.020   NA
 6890117 6890118 Pnuc_1157 Pnuc_1158     TRUE 0.891 28.000 0.167 0.064   NA
 6890118 6890119 Pnuc_1158 Pnuc_1159     TRUE 0.985 10.000 0.550 0.064 Y NA
 6890120 6890121 Pnuc_1160 Pnuc_1161     TRUE 0.984 -7.000 0.231 1.000   NA
 6890121 6890122 Pnuc_1161 Pnuc_1162     FALSE 0.032 215.000 0.000 1.000   NA
 6890122 6890123 Pnuc_1162 Pnuc_1163     FALSE 0.173 48.000 0.000 1.000   NA
 6890124 6890125 Pnuc_1164 Pnuc_1165     FALSE 0.261 37.000 0.000 1.000   NA
 6890125 6890126 Pnuc_1165 Pnuc_1166     TRUE 0.697 -3.000 0.000 1.000   NA
 6890127 6890128 Pnuc_1167 Pnuc_1168     FALSE 0.439 2.000 0.000 NA   NA
 6890129 6890130 Pnuc_1169 Pnuc_1170     TRUE 0.500 12.000 0.000 0.013   NA
 6890130 6890131 Pnuc_1170 Pnuc_1171     TRUE 0.664 5.000 0.000 0.002 N NA
 6890131 6890132 Pnuc_1171 Pnuc_1172     FALSE 0.317 7.000 0.000 NA   NA
 6890132 6890133 Pnuc_1172 Pnuc_1173     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890133 6890134 Pnuc_1173 Pnuc_1174     FALSE 0.477 30.000 0.000 1.000 N NA
 6890134 6890135 Pnuc_1174 Pnuc_1175     TRUE 0.821 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6890137 6890138 Pnuc_R0037 Pnuc_1177     FALSE 0.069 69.000 0.000 NA   NA
 6890138 6890139 Pnuc_1177 Pnuc_1178     FALSE 0.029 570.000 0.000 1.000   NA
 6890139 6890140 Pnuc_1178 Pnuc_1179     FALSE 0.136 53.000 0.000 1.000   NA
 6890140 6890141 Pnuc_1179 Pnuc_1180     TRUE 0.727 64.000 0.308 NA N NA
 6890141 6890142 Pnuc_1180 Pnuc_1181     TRUE 0.939 29.000 0.112 NA Y NA
 6890142 6890143 Pnuc_1181 Pnuc_1182     TRUE 0.997 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 6890143 6890144 Pnuc_1182 Pnuc_1183     FALSE 0.032 201.000 0.000 1.000   NA
 6890145 6890146 Pnuc_1184 Pnuc_1185     FALSE 0.146 68.000 0.000 1.000 N NA
 6890146 6890147 Pnuc_1185 Pnuc_1186     TRUE 0.992 3.000 0.700 0.026 Y NA
 6890147 6890148 Pnuc_1186 Pnuc_1187     TRUE 0.951 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6890148 6890149 Pnuc_1187 Pnuc_1188     FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 6890150 6890151 Pnuc_1189 Pnuc_1190     FALSE 0.025 308.000 0.000 NA   NA
 6890151 6890152 Pnuc_1190 Pnuc_1191     TRUE 0.986 12.000 0.550 0.004 Y NA
 6890152 6890153 Pnuc_1191 Pnuc_1192     TRUE 0.998 -10.000 0.560 0.004 Y NA
 6890153 6890154 Pnuc_1192 Pnuc_1193   ureC TRUE 0.949 9.000 0.315 0.002 N NA
 6890154 6890155 Pnuc_1193 Pnuc_1194 ureC   TRUE 0.994 0.000 0.486 0.002 Y NA
 6890155 6890156 Pnuc_1194 Pnuc_1195     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA N NA
 6890156 6890157 Pnuc_1195 Pnuc_1196     FALSE 0.465 12.000 0.000 NA N NA
 6890157 6890158 Pnuc_1196 Pnuc_1197     TRUE 0.978 19.000 0.664 0.004 N NA
 6890158 6890159 Pnuc_1197 Pnuc_1198     TRUE 0.922 6.000 0.221 1.000 N NA
 6890159 6890160 Pnuc_1198 Pnuc_1199     TRUE 0.978 3.000 0.731 0.016   NA
 6890160 6890161 Pnuc_1199 Pnuc_1200     TRUE 0.991 -3.000 0.823 1.000   NA
 6890161 6890162 Pnuc_1200 Pnuc_1201     TRUE 0.992 3.000 0.758 0.026 Y NA
 6890162 6890163 Pnuc_1201 Pnuc_1202     TRUE 0.947 54.000 0.654 NA Y NA
 6890163 6890164 Pnuc_1202 Pnuc_1203     FALSE 0.024 668.000 0.000 NA   NA
 6890164 6890165 Pnuc_1203 Pnuc_1204     FALSE 0.025 261.000 0.000 NA   NA
 6890165 6890166 Pnuc_1204 Pnuc_1205     FALSE 0.361 4.000 0.000 NA   NA
 6890166 6890167 Pnuc_1205 Pnuc_1206     TRUE 0.986 -3.000 0.462 NA   NA
 6890167 6890168 Pnuc_1206 Pnuc_1207     FALSE 0.135 50.000 0.000 NA   NA
 6890168 6890169 Pnuc_1207 Pnuc_1208     FALSE 0.026 229.000 0.000 NA   NA
 6890169 6890170 Pnuc_1208 Pnuc_1209     FALSE 0.327 26.000 0.000 NA   NA
 6890172 6890173 Pnuc_1211 Pnuc_1212     FALSE 0.053 392.000 0.000 1.000 N NA
 6890173 6890174 Pnuc_1212 Pnuc_1213     FALSE 0.147 48.000 0.000 NA   NA
 6890174 6890175 Pnuc_1213 Pnuc_1214     FALSE 0.355 16.000 0.000 NA   NA
 6890175 6890176 Pnuc_1214 Pnuc_1215     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890176 6890177 Pnuc_1215 Pnuc_1216     TRUE 0.760 -9.000 0.000 NA   NA
 6890177 6890178 Pnuc_1216 Pnuc_1217     TRUE 0.746 3.000 0.048 NA   NA
 6890179 6890180 Pnuc_1218 Pnuc_1219     TRUE 0.956 12.000 0.667 NA   NA
 6890180 6890181 Pnuc_1219 Pnuc_1220     TRUE 0.961 13.000 0.734 NA   NA
 6890182 6890183 Pnuc_1221 Pnuc_1222     FALSE 0.446 30.000 0.000 NA N NA
 6890185 6890186 Pnuc_1224 Pnuc_1225     FALSE 0.240 67.000 0.020 1.000 N NA
 6890186 6890187 Pnuc_1225 Pnuc_1226   rbfA TRUE 0.979 4.000 0.318 1.000 Y NA
 6890187 6890188 Pnuc_1226 Pnuc_1227 rbfA infB TRUE 0.986 21.000 0.530 1.000 Y NA
 6890188 6890189 Pnuc_1227 Pnuc_1228 infB nusA TRUE 0.947 14.000 0.342 1.000 N NA
 6890189 6890190 Pnuc_1228 Pnuc_1229 nusA   TRUE 0.990 -3.000 0.759 NA   NA
 6890190 6890191 Pnuc_1229 Pnuc_1230     FALSE 0.024 173.000 0.004 NA   NA
 6890191 6890192 Pnuc_1230 Pnuc_1231     FALSE 0.476 7.000 0.000 NA N NA
 6890194 6890195 Pnuc_1233 Pnuc_1234     FALSE 0.104 137.000 0.038 NA   NA
 6890195 6890196 Pnuc_1234 Pnuc_1235     TRUE 0.991 -3.000 0.800 1.000   NA
 6890196 6890197 Pnuc_1235 Pnuc_1236     TRUE 0.983 -3.000 0.296 0.025   NA
 6890197 6890198 Pnuc_1236 Pnuc_1237     TRUE 0.970 12.000 0.815 0.025   NA
 6890199 6890200 Pnuc_1238 Pnuc_1239     TRUE 0.807 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6890200 6890201 Pnuc_1239 Pnuc_1240     FALSE 0.087 105.000 0.000 1.000 N NA
 6890201 6890202 Pnuc_1240 Pnuc_1241     FALSE 0.355 28.000 0.000 1.000   NA
 6890202 6890203 Pnuc_1241 Pnuc_1242     FALSE 0.382 25.000 0.000 1.000   NA
 6890203 6890204 Pnuc_1242 Pnuc_1243     TRUE 0.869 26.000 0.147 1.000   NA
 6890204 6890205 Pnuc_1243 Pnuc_1244     TRUE 0.733 92.000 0.727 1.000   NA
 6890206 6890207 Pnuc_1245 Pnuc_1246     TRUE 0.979 -3.000 0.297 NA   NA
 6890207 6890208 Pnuc_1246 Pnuc_1247     TRUE 0.948 -3.000 0.081 NA N NA
 6890208 6890209 Pnuc_1247 Pnuc_1248     FALSE 0.030 322.000 0.000 1.000   NA
 6890213 6890214 Pnuc_1252 Pnuc_1253     TRUE 0.944 -7.000 0.023 0.030 N NA
 6890214 6890215 Pnuc_1253 Pnuc_1254     TRUE 0.997 -3.000 0.587 0.090 Y NA
 6890215 6890216 Pnuc_1254 Pnuc_1255     TRUE 0.792 15.000 0.053 1.000 N NA
 6890216 6890217 Pnuc_1255 Pnuc_1256     FALSE 0.036 207.000 0.007 1.000   NA
 6890217 6890218 Pnuc_1256 Pnuc_1257     TRUE 0.972 -7.000 0.123 1.000   NA
 6890218 6890219 Pnuc_1257 Pnuc_1258     TRUE 0.850 31.000 0.172 NA   NA
 6890219 6890220 Pnuc_1258 Pnuc_1259     TRUE 0.969 4.000 0.600 NA N NA
 6890220 6890221 Pnuc_1259 Pnuc_1260     TRUE 0.921 10.000 0.320 1.000   NA
 6890221 6890222 Pnuc_1260 Pnuc_1261     FALSE 0.344 60.000 0.051 1.000   NA
 6890223 6890224 Pnuc_1262 Pnuc_1263     TRUE 0.883 15.000 0.123 NA N NA
 6890227 6890228 Pnuc_1266 Pnuc_1267     FALSE 0.169 62.000 0.000 1.000 N NA
 6890228 6890229 Pnuc_1267 Pnuc_1268     TRUE 0.510 52.000 0.058 1.000 N NA
 6890229 6890230 Pnuc_1268 Pnuc_1269     FALSE 0.038 112.000 0.000 NA   NA
 6890230 6890231 Pnuc_1269 Pnuc_1270     FALSE 0.222 17.000 0.002 NA   NA
 6890231 6890232 Pnuc_1270 Pnuc_1271     TRUE 0.921 20.000 0.147 0.023 N NA
 6890233 6890234 Pnuc_R0038 Pnuc_1272     FALSE 0.036 118.000 0.000 NA   NA
 6890235 6890236 Pnuc_1273 Pnuc_1274     TRUE 0.973 0.000 0.434 NA   NA
 6890236 6890237 Pnuc_1274 Pnuc_1275     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6890237 6890238 Pnuc_1275 Pnuc_1276     FALSE 0.344 24.000 0.000 NA   NA
 6890238 6890239 Pnuc_1276 Pnuc_1277     FALSE 0.461 11.000 0.000 NA N NA
 6890241 6890242 Pnuc_1279 Pnuc_1280     FALSE 0.366 74.000 0.095 NA   NA
 6890242 6890243 Pnuc_1280 Pnuc_1281     FALSE 0.139 61.000 0.002 1.000 N NA
 6890243 6890244 Pnuc_1281 Pnuc_1282     TRUE 0.671 57.000 0.161 1.000 N NA
 6890244 6890245 Pnuc_1282 Pnuc_1283     TRUE 0.770 21.000 0.045 1.000 N NA
 6890245 6890246 Pnuc_1283 Pnuc_1284     TRUE 0.996 0.000 0.947 0.012 Y NA
 6890246 6890247 Pnuc_1284 Pnuc_1285     TRUE 0.985 -10.000 0.184 0.056   NA
 6890247 6890248 Pnuc_1285 Pnuc_1286     FALSE 0.292 71.000 0.058 1.000   NA
 6890248 6890249 Pnuc_1286 Pnuc_1287   engA FALSE 0.101 163.000 0.036 1.000   NA
 6890249 6890250 Pnuc_1287 Pnuc_1288 engA   TRUE 0.970 -3.000 0.203 NA   NA
 6890250 6890251 Pnuc_1288 Pnuc_1289     TRUE 0.975 0.000 0.492 NA   NA
 6890251 6890252 Pnuc_1289 Pnuc_1290     TRUE 0.694 60.000 0.259 1.000   NA
 6890252 6890253 Pnuc_1290 Pnuc_1291   ispG TRUE 0.921 25.000 0.207 1.000 N NA
 6890253 6890254 Pnuc_1291 Pnuc_1292 ispG   FALSE 0.341 14.000 0.004 1.000   NA
 6890254 6890255 Pnuc_1292 Pnuc_1293   ndk TRUE 0.820 35.000 0.156 1.000   NA
 6890257 6890258 Pnuc_1295 Pnuc_1296     TRUE 0.897 -7.000 0.011 1.000 N NA
 6890258 6890259 Pnuc_1296 Pnuc_1297     TRUE 0.507 7.000 0.000 1.000 N NA
 6890259 6890260 Pnuc_1297 Pnuc_1298     TRUE 0.902 -3.000 0.032 1.000 N NA
 6890260 6890261 Pnuc_1298 Pnuc_1299     TRUE 0.983 -3.000 0.353 1.000   NA
 6890261 6890262 Pnuc_1299 Pnuc_1300     FALSE 0.446 3.000 0.000 1.000   NA
 6890262 6890263 Pnuc_1300 Pnuc_1301     TRUE 0.982 1.000 0.700 1.000 N NA
 6890263 6890264 Pnuc_1301 Pnuc_1302     TRUE 0.984 10.000 0.600 1.000 Y NA
 6890264 6890265 Pnuc_1302 Pnuc_1303     FALSE 0.025 333.000 0.000 NA   NA
 6890265 6890266 Pnuc_1303 Pnuc_1304     FALSE 0.094 59.000 0.000 NA   NA
 6890266 6890267 Pnuc_1304 Pnuc_1305     FALSE 0.050 105.000 0.000 1.000   NA
 6890267 6890268 Pnuc_1305 Pnuc_1306     TRUE 0.970 3.000 0.173 NA Y NA
 6890269 6890270 Pnuc_1307 Pnuc_1308   rho FALSE 0.173 297.000 0.087 1.000   NA
 6890270 6890271 Pnuc_1308 Pnuc_1309 rho rpmE2 FALSE 0.167 155.000 0.049 1.000 N NA
 6890271 6890272 Pnuc_1309 Pnuc_1310 rpmE2   FALSE 0.275 100.000 0.067 NA N NA
 6890272 6890273 Pnuc_1310 Pnuc_1311     TRUE 0.897 5.000 0.154 NA N NA
 6890274 6890275 Pnuc_1312 Pnuc_1313     TRUE 0.744 4.000 0.056 NA   NA
 6890275 6890276 Pnuc_1313 Pnuc_1314     TRUE 0.954 24.000 0.516 NA   NA
 6890276 6890277 Pnuc_1314 Pnuc_1315     TRUE 0.934 13.000 0.372 NA   NA
 6890277 6890278 Pnuc_1315 Pnuc_1316     FALSE 0.160 50.000 0.000 1.000   NA
 6890278 6890279 Pnuc_1316 Pnuc_1317     FALSE 0.278 35.000 0.000 1.000   NA
 6890281 6890282 Pnuc_1319 Pnuc_1320     FALSE 0.127 51.000 0.000 NA   NA
 6890282 6890283 Pnuc_1320 Pnuc_1321     FALSE 0.482 10.000 0.000 0.024   NA
 6890283 6890284 Pnuc_1321 Pnuc_1322     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 6890286 6890287 Pnuc_1324 Pnuc_1325     FALSE 0.371 6.000 0.000 1.000   NA
 6890287 6890288 Pnuc_1325 Pnuc_1326     FALSE 0.039 111.000 0.000 NA   NA
 6890288 6890289 Pnuc_1326 Pnuc_1327     FALSE 0.358 19.000 0.000 NA   NA
 6890289 6890290 Pnuc_1327 Pnuc_1328     FALSE 0.073 124.000 0.000 1.000 N NA
 6890290 6890291 Pnuc_1328 Pnuc_1329     FALSE 0.055 235.000 0.000 1.000 N NA
 6890291 6890292 Pnuc_1329 Pnuc_1330     TRUE 0.997 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 6890293 6890294 Pnuc_1331 Pnuc_1332     FALSE 0.268 36.000 0.000 1.000   NA
 6890295 6890296 Pnuc_1333 Pnuc_1334     FALSE 0.063 74.000 0.000 NA   NA
 6890296 6890297 Pnuc_1334 Pnuc_1335     FALSE 0.219 38.000 0.000 NA   NA
 6890298 6890299 Pnuc_1336 Pnuc_1337     TRUE 0.790 31.000 0.000 NA Y NA
 6890301 6890302 Pnuc_1339 Pnuc_1340     TRUE 0.602 31.000 0.043 NA   NA
 6890302 6890303 Pnuc_1340 Pnuc_1341     TRUE 0.634 12.000 0.043 NA   NA
 6890303 6890304 Pnuc_1341 Pnuc_1342     FALSE 0.041 128.000 0.000 1.000   NA
 6890304 6890305 Pnuc_1342 Pnuc_1343     FALSE 0.119 52.000 0.000 NA   NA
 6890305 6890306 Pnuc_1343 Pnuc_1344     FALSE 0.302 29.000 0.000 NA   NA
 6890306 6890307 Pnuc_1344 Pnuc_1345     FALSE 0.490 28.000 0.005 1.000 N NA
 6890311 6890312 Pnuc_1349 Pnuc_1350     FALSE 0.212 39.000 0.000 NA   NA
 6890314 6890315 Pnuc_1352 Pnuc_1353     FALSE 0.312 28.000 0.000 NA   NA
 6890317 6890318 Pnuc_1355 Pnuc_1356     FALSE 0.041 125.000 0.000 1.000   NA
 6890319 6890320 Pnuc_1357 Pnuc_1358     FALSE 0.313 4.000 0.004 NA   NA
 6890320 6890321 Pnuc_1358 Pnuc_1359     FALSE 0.327 40.000 0.014 NA   NA
 6890322 6890323 Pnuc_1360 Pnuc_1361     FALSE 0.106 55.000 0.000 NA   NA
 6890325 6890326 Pnuc_1363 Pnuc_1364     TRUE 0.819 7.000 0.000 NA Y NA
 6890329 6890330 Pnuc_1367 Pnuc_1368     FALSE 0.131 54.000 0.000 1.000   NA
 6890330 6890331 Pnuc_1368 Pnuc_1369     FALSE 0.407 4.000 0.000 1.000   NA
 6890331 6890332 Pnuc_1369 Pnuc_1370     FALSE 0.075 75.000 0.000 1.000   NA
 6890333 6890334 Pnuc_1371 Pnuc_1372     FALSE 0.033 130.000 0.000 NA   NA
 6890334 6890335 Pnuc_1372 Pnuc_1373     FALSE 0.025 280.000 0.000 NA   NA
 6890336 6890337 Pnuc_1374 Pnuc_1375     FALSE 0.121 80.000 0.000 1.000 N NA
 6890338 6890339 Pnuc_1376 Pnuc_1377     TRUE 0.835 62.000 0.154 0.061 Y NA
 6890339 6890340 Pnuc_1377 Pnuc_1378     TRUE 0.648 43.000 0.083 1.000   NA
 6890341 6890342 Pnuc_1379 Pnuc_1380     FALSE 0.029 160.000 0.000 NA   NA
 6890342 6890343 Pnuc_1380 Pnuc_1381     FALSE 0.061 76.000 0.000 NA   NA
 6890345 6890346 Pnuc_1383 Pnuc_1384     FALSE 0.050 88.000 0.000 NA   NA
 6890346 6890347 Pnuc_1384 Pnuc_1385     FALSE 0.320 34.000 0.009 NA   NA
 6890347 6890348 Pnuc_1385 Pnuc_1386     FALSE 0.056 222.000 0.000 1.000 N NA
 6890348 6890349 Pnuc_1386 Pnuc_1387     FALSE 0.130 56.000 0.008 NA   NA
 6890350 6890351 Pnuc_1388 Pnuc_1389     TRUE 0.925 13.000 0.250 1.000 N NA
 6890352 6890353 Pnuc_1390 Pnuc_1391 cls   TRUE 0.828 -3.000 0.022 NA   NA
 6890354 6890355 Pnuc_1392 Pnuc_1393     TRUE 0.902 -7.000 0.000 0.072 N NA
 6890356 6890357 Pnuc_1394 Pnuc_1395     TRUE 0.898 5.000 0.205 NA   NA
 6890357 6890358 Pnuc_1395 Pnuc_1396     TRUE 0.778 48.000 0.241 NA   NA
 6890358 6890359 Pnuc_1396 Pnuc_1397     TRUE 0.966 0.000 0.333 NA   NA
 6890359 6890360 Pnuc_1397 Pnuc_1398     TRUE 0.981 28.000 0.350 0.003 Y NA
 6890360 6890361 Pnuc_1398 Pnuc_1399     FALSE 0.048 405.000 0.000 0.061   NA
 6890361 6890362 Pnuc_1399 Pnuc_1400     TRUE 0.978 -3.000 0.221 0.061   NA
 6890362 6890363 Pnuc_1400 Pnuc_1401     TRUE 0.891 12.000 0.218 NA   NA
 6890363 6890364 Pnuc_1401 Pnuc_1402     TRUE 0.985 0.000 0.901 NA   NA
 6890364 6890365 Pnuc_1402 Pnuc_1403     TRUE 0.627 7.000 0.039 NA   NA
 6890365 6890366 Pnuc_1403 Pnuc_1404     FALSE 0.074 139.000 0.007 1.000 N NA
 6890366 6890367 Pnuc_1404 Pnuc_1405     TRUE 0.977 12.000 0.396 NA Y NA
 6890367 6890368 Pnuc_1405 Pnuc_1406     FALSE 0.446 68.000 0.007 NA Y NA
 6890371 6890372 Pnuc_1409 Pnuc_1410     FALSE 0.187 65.000 0.025 NA   NA
 6890372 6890373 Pnuc_1410 Pnuc_1411     TRUE 0.642 19.000 0.034 NA   NA
 6890373 6890374 Pnuc_1411 Pnuc_1412     TRUE 0.788 6.000 0.077 1.000   NA
 6890374 6890375 Pnuc_1412 Pnuc_1413     FALSE 0.317 7.000 0.000 NA   NA
 6890376 6890377 Pnuc_1414 Pnuc_1415     FALSE 0.163 69.000 0.023 NA   NA
 6890377 6890378 Pnuc_1415 Pnuc_1416     TRUE 0.962 -3.000 0.115 NA N NA
 6890378 6890379 Pnuc_1416 Pnuc_1417     TRUE 0.824 1.000 0.038 1.000 N NA
 6890379 6890380 Pnuc_1417 Pnuc_1418     TRUE 0.839 35.000 0.139 1.000 N NA
 6890380 6890381 Pnuc_1418 Pnuc_1419     FALSE 0.239 29.000 0.004 NA   NA
 6890381 6890382 Pnuc_1419 Pnuc_1420     FALSE 0.291 30.000 0.000 NA   NA
 6890382 6890383 Pnuc_1420 Pnuc_1421     FALSE 0.341 10.000 0.000 1.000   NA
 6890383 6890384 Pnuc_1421 Pnuc_1422   guaA FALSE 0.268 23.000 0.002 1.000   NA
 6890384 6890385 Pnuc_1422 Pnuc_1423 guaA   TRUE 0.891 37.000 0.190 0.001 N NA
 6890385 6890386 Pnuc_1423 Pnuc_1424     FALSE 0.245 27.000 0.003 NA   NA
 6890386 6890387 Pnuc_1424 Pnuc_1425     TRUE 0.946 -7.000 0.063 NA   NA
 6890388 6890389 Pnuc_1426 Pnuc_1427 smpB   FALSE 0.031 141.000 0.000 NA   NA
 6890389 6890390 Pnuc_1427 Pnuc_1428     TRUE 0.966 14.000 0.805 NA   NA
 6890390 6890391 Pnuc_1428 Pnuc_1429     TRUE 0.943 19.000 0.365 NA   NA
 6890391 6890392 Pnuc_1429 Pnuc_1430     TRUE 0.809 57.000 0.383 NA N NA
 6890392 6890393 Pnuc_1430 Pnuc_1431     FALSE 0.084 99.000 0.000 NA N NA
 6890393 6890394 Pnuc_1431 Pnuc_1432     TRUE 0.845 15.000 0.000 1.000 Y NA
 6890397 6890398 Pnuc_1435 Pnuc_1436     FALSE 0.184 43.000 0.000 NA   NA
 6890398 6890399 Pnuc_1436 Pnuc_1437   rnhB TRUE 0.800 6.000 0.046 0.022 N NA
 6890399 6890400 Pnuc_1437 Pnuc_1438 rnhB   TRUE 0.975 -3.000 0.186 1.000 N NA
 6890400 6890401 Pnuc_1438 Pnuc_1439     TRUE 0.974 14.000 0.289 1.000 Y NA
 6890401 6890402 Pnuc_1439 Pnuc_1440   fabZ TRUE 0.988 0.000 0.850 1.000 N NA
 6890402 6890403 Pnuc_1440 Pnuc_1441 fabZ lpxD TRUE 0.929 47.000 0.796 1.000 N NA
 6890403 6890404 Pnuc_1441 Pnuc_1442 lpxD   TRUE 0.988 6.000 0.814 1.000 Y NA
 6890404 6890405 Pnuc_1442 Pnuc_1443     TRUE 0.981 19.000 0.354 1.000 Y NA
 6890405 6890406 Pnuc_1443 Pnuc_1444     TRUE 0.811 69.000 0.204 1.000 Y NA
 6890406 6890407 Pnuc_1444 Pnuc_1445     TRUE 0.968 22.000 0.568 1.000 N NA
 6890407 6890408 Pnuc_1445 Pnuc_1446     TRUE 0.990 0.000 0.372 1.000 Y NA
 6890408 6890409 Pnuc_1446 Pnuc_1447     TRUE 0.977 30.000 0.400 1.000 Y NA
 6890409 6890410 Pnuc_1447 Pnuc_1448   frr TRUE 0.955 25.000 0.409 1.000 N NA
 6890410 6890411 Pnuc_1448 Pnuc_1449 frr pyrH TRUE 0.773 12.000 0.058 1.000 N NA
 6890411 6890412 Pnuc_1449 Pnuc_1450 pyrH tsf FALSE 0.152 197.000 0.047 1.000 N NA
 6890412 6890413 Pnuc_1450 Pnuc_1451 tsf   TRUE 0.994 0.000 0.748 1.000 Y NA
 6890414 6890415 Pnuc_1452 Pnuc_1453     TRUE 0.976 4.000 0.817 1.000 N NA
 6890416 6890417 Pnuc_1454 Pnuc_1455     FALSE 0.177 44.000 0.000 NA   NA
 6890417 6890418 Pnuc_1455 Pnuc_1456     FALSE 0.242 10.000 0.002 1.000   NA
 6890418 6890419 Pnuc_1456 Pnuc_1457     TRUE 0.502 19.000 0.003 0.012   NA
 6890420 6890421 Pnuc_1458 Pnuc_1459 dapD   TRUE 0.953 11.000 0.109 0.003 Y NA
 6890421 6890422 Pnuc_1459 Pnuc_1460     TRUE 0.797 38.000 0.115 1.000 N NA
 6890423 6890424 Pnuc_1461 Pnuc_1462     FALSE 0.063 55.000 0.002 NA   NA
 6890424 6890425 Pnuc_1462 Pnuc_1463     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890427 6890428 Pnuc_1464 Pnuc_1465     FALSE 0.140 49.000 0.000 NA   NA
 6890428 6890429 Pnuc_1465 Pnuc_1466     FALSE 0.134 80.000 0.022 NA   NA
 6890429 6890430 Pnuc_1466 Pnuc_1467     TRUE 0.773 12.000 0.061 NA N NA
 6890430 6890431 Pnuc_1467 Pnuc_1468     TRUE 0.994 -7.000 0.620 1.000 N NA
 6890432 6890433 Pnuc_1469 Pnuc_1470     TRUE 0.627 -3.000 0.005 NA   NA
 6890433 6890434 Pnuc_1470 Pnuc_1471     FALSE 0.187 90.000 0.028 1.000 N NA
 6890434 6890435 Pnuc_1471 Pnuc_1472   lysS TRUE 0.939 39.000 0.162 0.043 Y NA
 6890436 6890437 Pnuc_1473 Pnuc_1474     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6890437 6890438 Pnuc_1474 Pnuc_1475     FALSE 0.054 85.000 0.000 NA   NA
 6890438 6890439 Pnuc_1475 Pnuc_1476     FALSE 0.027 208.000 0.000 NA   NA
 6890442 6890443 Pnuc_1479 Pnuc_1480     FALSE 0.030 301.000 0.000 1.000   NA
 6890443 6890444 Pnuc_1480 Pnuc_1481     TRUE 0.815 -3.000 0.016 1.000   NA
 6890444 6890445 Pnuc_1481 Pnuc_1482     TRUE 0.867 23.000 0.011 1.000 Y NA
 6890445 6890446 Pnuc_1482 Pnuc_1483     TRUE 0.966 0.000 0.182 0.001 N NA
 6890446 6890447 Pnuc_1483 Pnuc_1484     FALSE 0.042 104.000 0.000 NA   NA
 6890447 6890448 Pnuc_1484 Pnuc_1485     FALSE 0.165 46.000 0.000 NA   NA
 6890449 6890450 Pnuc_1486 Pnuc_1487     TRUE 0.557 11.000 0.012 0.060   NA
 6890450 6890451 Pnuc_1487 Pnuc_1488     FALSE 0.050 267.000 0.000 0.060   NA
 6890451 6890452 Pnuc_1488 Pnuc_1489     TRUE 0.965 31.000 0.794 1.000 N NA
 6890452 6890453 Pnuc_1489 Pnuc_1490     TRUE 0.984 29.000 0.634 1.000 Y NA
 6890453 6890454 Pnuc_1490 Pnuc_1491     TRUE 0.993 -22.000 0.500 1.000   NA
 6890454 6890455 Pnuc_1491 Pnuc_1492     TRUE 0.958 19.000 0.359 0.002   NA
 6890455 6890456 Pnuc_1492 Pnuc_1493     TRUE 0.939 33.000 0.448 1.000 N NA
 6890456 6890457 Pnuc_1493 Pnuc_1494     TRUE 0.882 30.000 0.160 1.000 N NA
 6890457 6890458 Pnuc_1494 Pnuc_1495     FALSE 0.054 137.000 0.003 1.000 N NA
 6890459 6890460 Pnuc_1496 Pnuc_1497     TRUE 0.695 32.000 0.046 1.000 N NA
 6890460 6890461 Pnuc_1497 Pnuc_1498     FALSE 0.467 55.000 0.055 1.000 N NA
 6890461 6890462 Pnuc_1498 Pnuc_1499     TRUE 0.925 -3.000 0.048 1.000 N NA
 6890462 6890463 Pnuc_1499 Pnuc_1500     TRUE 0.892 -13.000 0.021 NA   NA
 6890464 6890465 Pnuc_1501 Pnuc_1502     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890465 6890466 Pnuc_1502 Pnuc_1503     TRUE 0.844 24.000 0.000 1.000 Y NA
 6890466 6890467 Pnuc_1503 Pnuc_1504     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 6890467 6890468 Pnuc_1504 Pnuc_1505     FALSE 0.146 68.000 0.000 1.000 N NA
 6890468 6890469 Pnuc_1505 Pnuc_1506     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000 N NA
 6890469 6890470 Pnuc_1506 Pnuc_1507     FALSE 0.048 273.000 0.000 NA N NA
 6890470 6890471 Pnuc_1507 Pnuc_1508     FALSE 0.266 32.000 0.000 NA   NA
 6890471 6890472 Pnuc_1508 Pnuc_1509     TRUE 0.497 12.000 0.000 0.018   NA
 6890472 6890473 Pnuc_1509 Pnuc_1510     FALSE 0.160 50.000 0.000 1.000   NA
 6890473 6890474 Pnuc_1510 Pnuc_1511     TRUE 0.995 -3.000 0.429 NA Y NA
 6890474 6890475 Pnuc_1511 Pnuc_1512     TRUE 0.993 -3.000 0.286 NA Y NA
 6890475 6890476 Pnuc_1512 Pnuc_1513     TRUE 0.993 -3.000 0.222 0.004 Y NA
 6890476 6890477 Pnuc_1513 Pnuc_1514     TRUE 0.972 -3.000 0.018 0.004 Y NA
 6890477 6890478 Pnuc_1514 Pnuc_1515     TRUE 0.982 -3.000 0.344 1.000   NA
 6890478 6890479 Pnuc_1515 Pnuc_1516     TRUE 0.977 0.000 0.501 1.000   NA
 6890479 6890480 Pnuc_1516 Pnuc_1517     TRUE 0.997 -3.000 0.501 0.002 Y NA
 6890480 6890481 Pnuc_1517 Pnuc_1518     TRUE 0.973 42.000 0.503 0.004 Y NA
 6890481 6890482 Pnuc_1518 Pnuc_1519     FALSE 0.027 206.000 0.000 NA   NA
 6890482 6890483 Pnuc_1519 Pnuc_1520     FALSE 0.274 52.000 0.027 NA   NA
 6890483 6890484 Pnuc_1520 Pnuc_1521     TRUE 0.977 -13.000 0.147 NA   NA
 6890484 6890485 Pnuc_1521 Pnuc_1522     TRUE 0.693 0.000 0.000 0.029   NA
 6890485 6890486 Pnuc_1522 Pnuc_1523     FALSE 0.261 37.000 0.000 1.000   NA
 6890486 6890487 Pnuc_1523 Pnuc_1524     FALSE 0.044 117.000 0.006 1.000   NA
 6890487 6890488 Pnuc_1524 Pnuc_1525     FALSE 0.035 120.000 0.006 NA   NA
 6890488 6890489 Pnuc_1525 Pnuc_1526     FALSE 0.114 53.000 0.000 NA   NA
 6890489 6890490 Pnuc_1526 Pnuc_1527     FALSE 0.241 35.000 0.000 NA   NA
 6890491 6890492 Pnuc_1528 Pnuc_1529     TRUE 0.746 -3.000 0.011 NA   NA
 6890493 6890494 Pnuc_1530 Pnuc_1531     FALSE 0.029 169.000 0.000 NA   NA
 6890494 6890495 Pnuc_1531 Pnuc_1532     FALSE 0.165 46.000 0.000 NA   NA
 6890495 6890496 Pnuc_1532 Pnuc_1533     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 6890497 6890498 Pnuc_1534 Pnuc_1535     TRUE 0.857 101.000 0.551 1.000 Y NA
 6890499 6890500 Pnuc_1536 Pnuc_1537     FALSE 0.156 47.000 0.000 NA   NA
 6890500 6890501 Pnuc_1537 Pnuc_1538     FALSE 0.030 146.000 0.000 NA   NA
 6890501 6890502 Pnuc_1538 Pnuc_1539     TRUE 0.943 -3.000 0.091 1.000   NA
 6890502 6890503 Pnuc_1539 Pnuc_1540     FALSE 0.228 125.000 0.062 1.000 N NA
 6890503 6890504 Pnuc_1540 Pnuc_1541     FALSE 0.080 112.000 0.000 1.000 N NA
 6890504 6890505 Pnuc_1541 Pnuc_1542     TRUE 0.500 28.000 0.000 1.000 N NA
 6890505 6890506 Pnuc_1542 Pnuc_1543     TRUE 0.911 48.000 0.833 NA   NA
 6890509 6890510 Pnuc_1546 Pnuc_1547     TRUE 0.697 -3.000 0.000 1.000   NA
 6890511 6890512 Pnuc_1548 Pnuc_1549     FALSE 0.069 81.000 0.000 1.000   NA
 6890512 6890513 Pnuc_1549 Pnuc_1550     FALSE 0.248 141.000 0.000 1.000 Y NA
 6890513 6890514 Pnuc_1550 Pnuc_1551     FALSE 0.150 67.000 0.000 1.000 N NA
 6890514 6890515 Pnuc_1551 Pnuc_1552     TRUE 0.876 28.000 0.013 0.055 Y NA
 6890516 6890517 Pnuc_1553 Pnuc_1554     FALSE 0.051 104.000 0.000 1.000   NA
 6890518 6890519 Pnuc_1555 Pnuc_1556     TRUE 0.849 22.000 0.000 1.000 Y NA
 6890519 6890520 Pnuc_1556 Pnuc_1557     TRUE 0.849 22.000 0.000 1.000 Y NA
 6890520 6890521 Pnuc_1557 Pnuc_1558     TRUE 0.972 18.000 0.222 1.000 Y NA
 6890521 6890522 Pnuc_1558 Pnuc_1559     FALSE 0.484 10.000 0.000 1.000 N NA
 6890527 6890528 Pnuc_1564 Pnuc_1565     TRUE 0.983 -3.000 0.360 1.000   NA
 6890528 6890529 Pnuc_1565 Pnuc_1566     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890532 6890533 Pnuc_1569 Pnuc_1570     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890533 6890534 Pnuc_1570 Pnuc_1571     TRUE 0.964 -7.000 0.100 NA   NA
 6890534 6890535 Pnuc_1571 Pnuc_1572     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890535 6890536 Pnuc_1572 Pnuc_1573     FALSE 0.026 232.000 0.000 NA   NA
 6890536 6890537 Pnuc_1573 Pnuc_1574     FALSE 0.026 217.000 0.000 NA   NA
 6890537 6890538 Pnuc_1574 Pnuc_1575     FALSE 0.344 39.000 0.000 NA N NA
 6890538 6890539 Pnuc_1575 Pnuc_1576     FALSE 0.073 111.000 0.000 NA N NA
 6890539 6890540 Pnuc_1576 Pnuc_1577     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 6890540 6890541 Pnuc_1577 Pnuc_1578     FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 6890541 6890542 Pnuc_1578 Pnuc_1579     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA N NA
 6890542 6890543 Pnuc_1579 Pnuc_1580     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA N NA
 6890544 6890545 Pnuc_1581 Pnuc_1582     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890546 6890547 Pnuc_1583 Pnuc_1584     FALSE 0.150 51.000 0.000 1.000   NA
 6890548 6890549 Pnuc_1585 Pnuc_1586     TRUE 0.977 -3.000 0.255 1.000   NA
 6890549 6890550 Pnuc_1586 Pnuc_1587     TRUE 0.970 13.000 0.256 1.000 Y NA
 6890550 6890551 Pnuc_1587 Pnuc_1588     FALSE 0.191 42.000 0.000 NA   NA
 6890552 6890553 Pnuc_1589 Pnuc_1590     FALSE 0.039 111.000 0.000 NA   NA
 6890553 6890554 Pnuc_1590 Pnuc_1591     FALSE 0.106 55.000 0.000 NA   NA
 6890554 6890555 Pnuc_1591 Pnuc_1592     FALSE 0.404 18.000 0.000 1.000   NA
 6890555 6890556 Pnuc_1592 Pnuc_1593     FALSE 0.046 96.000 0.000 NA   NA
 6890556 6890557 Pnuc_1593 Pnuc_1594     FALSE 0.110 54.000 0.000 NA   NA
 6890559 6890560 Pnuc_1596 Pnuc_1597     TRUE 0.919 66.000 0.453 0.008 Y NA
 6890560 6890561 Pnuc_1597 Pnuc_1598     TRUE 0.868 16.000 0.104 NA N NA
 6890561 6890562 Pnuc_1598 Pnuc_1599     TRUE 0.973 13.000 0.317 NA Y NA
 6890562 6890563 Pnuc_1599 Pnuc_1600     TRUE 0.986 9.000 0.526 0.003 Y NA
 6890563 6890564 Pnuc_1600 Pnuc_1601     TRUE 0.997 -3.000 0.537 0.003 Y NA
 6890564 6890565 Pnuc_1601 Pnuc_1602     TRUE 0.820 73.000 0.178 0.003 Y NA
 6890565 6890566 Pnuc_1602 Pnuc_1603     FALSE 0.031 138.000 0.000 NA   NA
 6890566 6890567 Pnuc_1603 Pnuc_1604     TRUE 0.971 0.000 0.395 NA   NA
 6890567 6890568 Pnuc_1604 Pnuc_1605     FALSE 0.301 9.000 0.000 NA   NA
 6890570 6890571 Pnuc_1607 Pnuc_1608     TRUE 0.824 9.000 0.120 NA   NA
 6890571 6890572 Pnuc_1608 Pnuc_1609     TRUE 0.803 -3.000 0.017 NA   NA
 6890574 6890575 Pnuc_1611 Pnuc_1612     TRUE 0.858 -3.000 0.000 0.055 N NA
 6890575 6890576 Pnuc_1612 Pnuc_1613     FALSE 0.033 130.000 0.000 NA   NA
 6890576 6890577 Pnuc_1613 Pnuc_1614     FALSE 0.029 154.000 0.000 NA   NA
 6890577 6890578 Pnuc_1614 Pnuc_1615     TRUE 0.997 -10.000 0.324 0.059 Y NA
 6890578 6890579 Pnuc_1615 Pnuc_1616     FALSE 0.306 32.000 0.000 1.000   NA
 6890579 6890580 Pnuc_1616 Pnuc_1617     TRUE 0.758 34.000 0.099 1.000   NA
 6890580 6890581 Pnuc_1617 Pnuc_1618   fumC FALSE 0.188 40.000 0.003 1.000   NA
 6890581 6890582 Pnuc_1618 Pnuc_1619 fumC   FALSE 0.031 248.000 0.000 1.000   NA
 6890582 6890583 Pnuc_1619 Pnuc_1620     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890583 6890584 Pnuc_1620 Pnuc_1621     FALSE 0.031 143.000 0.000 NA   NA
 6890586 6890587 Pnuc_1623 Pnuc_1624     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 6890587 6890588 Pnuc_1624 Pnuc_1625     FALSE 0.026 210.000 0.000 NA   NA
 6890588 6890589 Pnuc_1625 Pnuc_1626     FALSE 0.038 112.000 0.000 NA   NA
 6890591 6890592 Pnuc_1628 Pnuc_1629     FALSE 0.028 176.000 0.000 NA   NA
 6890592 6890593 Pnuc_1629 Pnuc_1630     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6890593 6890594 Pnuc_1630 Pnuc_1631     FALSE 0.334 30.000 0.000 1.000   NA
 6890594 6890595 Pnuc_1631 Pnuc_1632     TRUE 0.974 15.000 0.265 1.000 Y NA
 6890595 6890596 Pnuc_1632 Pnuc_1633     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890596 6890597 Pnuc_1633 Pnuc_1634     FALSE 0.312 28.000 0.000 NA   NA
 6890597 6890598 Pnuc_1634 Pnuc_1635     FALSE 0.135 67.000 0.000 NA N NA
 6890602 6890603 Pnuc_1639 Pnuc_1640     FALSE 0.398 3.000 0.000 NA   NA
 6890603 6890604 Pnuc_1640 Pnuc_1641     FALSE 0.097 58.000 0.000 NA   NA
 6890605 6890606 Pnuc_1642 Pnuc_1643     TRUE 0.539 15.000 0.000 1.000 N NA
 6890606 6890607 Pnuc_1643 Pnuc_1644     TRUE 0.967 -3.000 0.185 NA   NA
 6890608 6890609 Pnuc_1645 Pnuc_1646     FALSE 0.041 126.000 0.000 1.000   NA
 6890609 6890610 Pnuc_1646 Pnuc_1647     FALSE 0.074 123.000 0.000 1.000 N NA
 6890610 6890611 Pnuc_1647 Pnuc_1648     TRUE 0.521 20.000 0.000 NA N NA
 6890612 6890613 Pnuc_1649 Pnuc_1650     FALSE 0.025 290.000 0.000 NA   NA
 6890613 6890614 Pnuc_1650 Pnuc_1651     FALSE 0.340 5.000 0.000 NA   NA
 6890614 6890615 Pnuc_1651 Pnuc_1652     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6890617 6890618 Pnuc_1654 Pnuc_1655     TRUE 0.747 -7.000 0.000 NA   NA
 6890618 6890619 Pnuc_1655 Pnuc_1656     FALSE 0.405 19.000 0.000 1.000   NA
 6890619 6890620 Pnuc_1656 Pnuc_R0040     FALSE 0.030 148.000 0.000 NA   NA
 6890620 6890621 Pnuc_R0040 Pnuc_1657     FALSE 0.062 75.000 0.000 NA   NA
 6890621 6890622 Pnuc_1657 Pnuc_1658     TRUE 0.994 -10.000 0.411 0.084 N NA
 6890624 6890625 Pnuc_1660 Pnuc_1661     TRUE 0.954 -10.000 0.069 NA   NA
 6890625 6890626 Pnuc_1661 Pnuc_1662     TRUE 0.765 -10.000 0.000 NA   NA
 6890629 6890630 Pnuc_1665 Pnuc_1666     FALSE 0.060 171.000 0.000 1.000 N NA
 6890630 6890631 Pnuc_1666 Pnuc_1667     TRUE 0.963 20.000 0.154 1.000 Y NA
 6890631 6890632 Pnuc_1667 Pnuc_1668     TRUE 0.877 6.000 0.100 0.069 N NA
 6890632 6890633 Pnuc_1668 Pnuc_1669     TRUE 0.990 31.000 0.877 0.001 Y NA
 6890633 6890634 Pnuc_1669 Pnuc_1670     TRUE 0.959 19.000 0.091 0.001 Y NA
 6890634 6890635 Pnuc_1670 Pnuc_1671     FALSE 0.024 934.000 0.000 NA   NA
 6890635 6890636 Pnuc_1671 Pnuc_1672     TRUE 0.939 12.000 0.444 NA   NA
 6890636 6890637 Pnuc_1672 Pnuc_1673     TRUE 0.910 23.000 0.222 NA   NA
 6890637 6890638 Pnuc_1673 Pnuc_1674     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890638 6890639 Pnuc_1674 Pnuc_1675     FALSE 0.065 72.000 0.000 NA   NA
 6890639 6890640 Pnuc_1675 Pnuc_1676     FALSE 0.029 169.000 0.000 NA   NA
 6890640 6890641 Pnuc_1676 Pnuc_1677     FALSE 0.191 42.000 0.000 NA   NA
 6890643 6890644 Pnuc_1679 Pnuc_1680     TRUE 0.993 -3.000 0.833 1.000 N NA
 6890644 6890645 Pnuc_1680 Pnuc_1681     TRUE 0.959 0.000 0.200 1.000 N NA
 6890645 6890646 Pnuc_1681 Pnuc_1682     FALSE 0.080 64.000 0.000 NA   NA
 6890646 6890647 Pnuc_1682 Pnuc_1683     FALSE 0.025 278.000 0.000 NA   NA
 6890647 6890648 Pnuc_1683 Pnuc_1684     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 6890648 6890649 Pnuc_1684 Pnuc_1685     FALSE 0.352 22.000 0.000 NA   NA
 6890649 6890650 Pnuc_1685 Pnuc_1686     FALSE 0.080 64.000 0.000 NA   NA
 6890650 6890651 Pnuc_1686 Pnuc_1687     FALSE 0.337 25.000 0.000 NA   NA
 6890653 6890654 Pnuc_1689 Pnuc_1690     FALSE 0.025 272.000 0.000 NA   NA
 6890655 6890656 Pnuc_1691 Pnuc_1692     FALSE 0.026 209.000 0.000 NA   NA
 6890656 6890657 Pnuc_1692 Pnuc_1693     FALSE 0.156 47.000 0.000 NA   NA
 6890658 6890659 Pnuc_1694 Pnuc_1695     FALSE 0.106 55.000 0.000 NA   NA
 6890659 6890660 Pnuc_1695 Pnuc_1696     FALSE 0.332 14.000 0.000 NA   NA
 6890660 6890661 Pnuc_1696 Pnuc_1697     FALSE 0.032 136.000 0.000 NA   NA
 6890661 6890662 Pnuc_1697 Pnuc_1698     FALSE 0.029 643.000 0.000 1.000   NA
 6890662 6890663 Pnuc_1698 Pnuc_1699     FALSE 0.439 734.000 0.299 1.000 N NA
 6890663 6890664 Pnuc_1699 Pnuc_1700     TRUE 0.855 28.000 0.137 1.000   NA
 6890664 6890665 Pnuc_1700 Pnuc_1701   rpsU FALSE 0.419 117.000 0.173 0.031   NA
 6890667 6890668 Pnuc_1703 Pnuc_1704     TRUE 0.768 26.000 0.069 1.000   NA
 6890668 6890669 Pnuc_1704 Pnuc_1705     TRUE 0.974 17.000 0.246 1.000 Y NA
 6890669 6890670 Pnuc_1705 Pnuc_1706     TRUE 0.945 1.000 0.177 1.000 N NA
 6890671 6890672 Pnuc_1707 Pnuc_1708     TRUE 0.765 53.000 0.066 1.000 Y NA
 6890673 6890674 Pnuc_1709 Pnuc_1710     TRUE 0.879 5.000 0.117 1.000 N NA
 6890674 6890675 Pnuc_1710 Pnuc_1711     TRUE 0.544 16.000 0.006 1.000 N NA
 6890676 6890677 Pnuc_1712 Pnuc_1713     TRUE 0.705 40.000 0.104 NA   NA
 6890677 6890678 Pnuc_1713 Pnuc_1714     TRUE 0.971 -3.000 0.209 NA   NA
 6890680 6890681 Pnuc_1716 Pnuc_1717     FALSE 0.373 32.000 0.002 1.000 N NA
 6890682 6890683 Pnuc_1718 Pnuc_1719     TRUE 0.861 -3.000 0.006 0.041 N NA
 6890684 6890685 Pnuc_1720 Pnuc_1721     TRUE 0.973 21.000 1.000 NA   NA
 6890685 6890686 Pnuc_1721 Pnuc_1722     FALSE 0.042 85.000 0.004 NA   NA
 6890688 6890689 Pnuc_1724 Pnuc_1725   argD FALSE 0.338 62.000 0.040 1.000 N NA
 6890690 6890691 Pnuc_1726 Pnuc_1727     TRUE 0.969 0.000 0.061 0.014 Y NA
 6890691 6890692 Pnuc_1727 Pnuc_1728     TRUE 0.978 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 6890692 6890693 Pnuc_1728 Pnuc_1729     TRUE 0.975 -7.000 0.000 0.023 Y NA
 6890693 6890694 Pnuc_1729 Pnuc_1730     FALSE 0.429 68.000 0.000 NA Y NA
 6890694 6890695 Pnuc_1730 Pnuc_1731     FALSE 0.446 30.000 0.000 NA N NA
 6890695 6890696 Pnuc_1731 Pnuc_1732     TRUE 0.962 10.000 0.626 1.000 N NA
 6890697 6890698 Pnuc_1733 Pnuc_1734   rpmB FALSE 0.064 148.000 0.006 1.000 N NA
 6890698 6890699 Pnuc_1734 Pnuc_1735 rpmB rpmG TRUE 0.979 12.000 0.332 0.018 Y NA
 6890700 6890701 Pnuc_1736 Pnuc_1737     TRUE 0.701 30.000 0.045 NA N NA
 6890701 6890702 Pnuc_1737 Pnuc_1738     FALSE 0.253 159.000 0.099 NA N NA
 6890703 6890704 Pnuc_1739 Pnuc_1740   ileS TRUE 0.988 -7.000 0.254 1.000 N NA
 6890704 6890705 Pnuc_1740 Pnuc_1741 ileS   TRUE 0.836 17.000 0.071 1.000 N NA
 6890705 6890706 Pnuc_1741 Pnuc_1742     TRUE 0.649 10.000 0.024 1.000 N NA
 6890706 6890707 Pnuc_1742 Pnuc_1743   dut TRUE 0.833 43.000 0.201 1.000 N NA
 6890707 6890708 Pnuc_1743 Pnuc_1744 dut   TRUE 0.873 3.000 0.000 1.000 Y NA
 6890709 6890710 Pnuc_1745 Pnuc_1746     TRUE 0.506 13.000 0.000 1.000 N NA
 6890710 6890711 Pnuc_1746 Pnuc_1747     FALSE 0.025 309.000 0.000 NA   NA
 6890711 6890712 Pnuc_1747 Pnuc_1748     FALSE 0.255 28.000 0.004 NA   NA
 6890712 6890713 Pnuc_1748 Pnuc_1749     TRUE 0.988 -3.000 0.596 NA   NA
 6890714 6890715 Pnuc_1750 Pnuc_1751     FALSE 0.060 84.000 0.007 NA   NA
 6890716 6890717 Pnuc_1752 Pnuc_1753     FALSE 0.471 31.000 0.019 NA   NA
 6890717 6890718 Pnuc_1753 Pnuc_1754     TRUE 0.893 39.000 0.088 1.000 Y NA
 6890721 6890722 Pnuc_1757 Pnuc_1758     TRUE 0.753 6.000 0.069 NA   NA
 6890726 6890727 Pnuc_1762 Pnuc_1763     TRUE 0.888 11.000 0.217 NA   NA
 6890727 6890728 Pnuc_1763 Pnuc_1764     FALSE 0.455 20.000 0.010 NA   NA
 6890728 6890729 Pnuc_1764 Pnuc_1765     TRUE 0.827 -3.000 0.008 1.000 N NA
 6890729 6890730 Pnuc_1765 Pnuc_1766     TRUE 0.770 53.000 0.234 1.000 N NA
 6890730 6890731 Pnuc_1766 Pnuc_1767     TRUE 0.955 18.000 0.117 1.000 Y NA
 6890732 6890733 Pnuc_1768 Pnuc_1769   dnaK TRUE 0.796 101.000 0.236 0.003 Y NA
 6890733 6890734 Pnuc_1769 Pnuc_1770 dnaK   FALSE 0.387 148.000 0.030 0.009 Y NA
 6890734 6890735 Pnuc_1770 Pnuc_1771   hemH FALSE 0.341 64.000 0.043 1.000 N NA
 6890735 6890736 Pnuc_1771 Pnuc_1772 hemH hrcA FALSE 0.489 51.000 0.048 1.000 N NA
 6890737 6890738 Pnuc_1773 Pnuc_1774     TRUE 0.900 27.000 0.170 1.000 N NA
 6890740 6890741 Pnuc_1776 Pnuc_1777     TRUE 0.969 0.000 0.358 NA   NA
 6890741 6890742 Pnuc_1777 Pnuc_1778     TRUE 0.912 26.000 0.259 NA   NA
 6890742 6890743 Pnuc_1778 Pnuc_1779     FALSE 0.322 20.000 0.005 NA   NA
 6890745 6890746 Pnuc_1781 Pnuc_1782     TRUE 0.940 0.000 0.009 0.013 Y NA
 6890746 6890747 Pnuc_1782 Pnuc_1783   glcF TRUE 0.873 9.000 0.013 0.027 Y NA
 6890747 6890748 Pnuc_1783 Pnuc_1784 glcF   TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890748 6890749 Pnuc_1784 Pnuc_1785     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890750 6890751 Pnuc_1786 Pnuc_1787     TRUE 0.563 10.000 0.011 1.000 N NA
 6890752 6890753 Pnuc_1788 Pnuc_1789 queA   TRUE 0.998 -27.000 0.360 0.001 Y NA
 6890753 6890754 Pnuc_1789 Pnuc_1790     TRUE 0.519 135.000 0.325 NA N NA
 6890754 6890755 Pnuc_1790 Pnuc_1791     TRUE 0.932 26.000 0.083 NA Y NA
 6890755 6890756 Pnuc_1791 Pnuc_1792   secF TRUE 0.985 4.000 0.332 0.001 Y NA
 6890757 6890758 Pnuc_1793 Pnuc_1794     FALSE 0.406 9.000 0.002 1.000 N NA
 6890761 6890762 Pnuc_1797 Pnuc_1798     TRUE 0.976 25.000 0.829 0.001   NA
 6890762 6890763 Pnuc_1798 Pnuc_1799     TRUE 0.675 34.000 0.040 0.001   NA
 6890763 6890764 Pnuc_1799 Pnuc_1800     FALSE 0.030 146.000 0.000 NA   NA
 6890766 6890767 Pnuc_1802 Pnuc_1803     FALSE 0.332 14.000 0.000 NA   NA
 6890768 6890769 Pnuc_1804 Pnuc_1805     FALSE 0.459 90.000 0.200 NA   NA
 6890769 6890770 Pnuc_1805 Pnuc_1806     TRUE 0.936 29.000 0.080 0.082 Y NA
 6890771 6890772 Pnuc_1807 Pnuc_1808     TRUE 0.514 0.000 0.000 NA   NA
 6890772 6890773 Pnuc_1808 Pnuc_1809     TRUE 0.860 8.000 0.000 0.005 Y NA
 6890773 6890774 Pnuc_1809 Pnuc_1810     FALSE 0.265 49.000 0.000 1.000 N NA
 6890775 6890776 Pnuc_1811 Pnuc_1812     TRUE 0.831 3.000 0.060 NA N NA
 6890776 6890777 Pnuc_1812 Pnuc_1813     TRUE 0.975 5.000 0.201 0.001 Y NA
 6890777 6890778 Pnuc_1813 Pnuc_1814     TRUE 0.814 41.000 0.038 1.000 Y NA
 6890778 6890779 Pnuc_1814 Pnuc_1815     TRUE 0.768 8.000 0.055 1.000 N NA
 6890779 6890780 Pnuc_1815 Pnuc_1816     TRUE 0.949 41.000 0.218 0.006 Y NA
 6890780 6890781 Pnuc_1816 Pnuc_1817     TRUE 0.933 3.000 0.032 0.006 Y NA
 6890782 6890783 Pnuc_1818 Pnuc_1819     TRUE 0.911 25.000 0.223 1.000   NA
 6890783 6890784 Pnuc_1819 Pnuc_1820     TRUE 0.707 47.000 0.138 1.000   NA
 6890784 6890785 Pnuc_1820 Pnuc_1821     TRUE 0.809 23.000 0.088 NA   NA
 6890785 6890786 Pnuc_1821 Pnuc_1822     FALSE 0.298 10.000 0.000 NA   NA
 6890791 6890792 Pnuc_1827 Pnuc_1828     FALSE 0.121 80.000 0.000 1.000 N NA
 6890792 6890793 Pnuc_1828 Pnuc_1829     FALSE 0.272 118.000 0.077 1.000 N NA
 6890793 6890794 Pnuc_1829 Pnuc_1830     TRUE 0.560 88.000 0.220 1.000 N NA
 6890794 6890795 Pnuc_1830 Pnuc_1831   sucC TRUE 0.971 16.000 0.151 0.001 Y NA
 6890795 6890796 Pnuc_1831 Pnuc_1832 sucC   FALSE 0.028 188.000 0.004 1.000   NA
 6890796 6890797 Pnuc_1832 Pnuc_1833     TRUE 0.929 5.000 0.296 1.000   NA
 6890797 6890798 Pnuc_1833 Pnuc_1834     FALSE 0.036 119.000 0.000 NA   NA
 6890799 6890800 Pnuc_1835 Pnuc_1836     TRUE 0.654 -3.000 0.000 NA   NA
 6890800 6890801 Pnuc_1836 Pnuc_1837     FALSE 0.398 3.000 0.000 NA   NA
 6890801 6890802 Pnuc_1837 Pnuc_1838     TRUE 0.747 -7.000 0.000 NA   NA
 6890804 6890805 Pnuc_1840 Pnuc_1841     FALSE 0.308 12.000 0.000 NA   NA
 6890806 6890807 Pnuc_1842 Pnuc_1843     FALSE 0.030 147.000 0.000 NA   NA
 6890809 6890810 Pnuc_1845 Pnuc_R0041     FALSE 0.027 188.000 0.000 NA   NA
 6890810 6890811 Pnuc_R0041 Pnuc_1846     FALSE 0.072 68.000 0.000 NA   NA
 6890812 6890813 Pnuc_1847 Pnuc_1848     FALSE 0.358 19.000 0.000 NA   NA
 6890814 6890815 Pnuc_1849 Pnuc_1850     FALSE 0.025 281.000 0.000 NA   NA
 6890817 6890818 Pnuc_1852 Pnuc_1853     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 6890819 6890820 Pnuc_1854 Pnuc_1855     FALSE 0.172 45.000 0.000 NA   NA
 6890821 6890822 Pnuc_1856 Pnuc_1857     FALSE 0.451 38.000 0.012 NA N NA
 6890823 6890824 Pnuc_1858 Pnuc_1859     FALSE 0.040 68.000 0.002 NA   NA
 6890824 6890825 Pnuc_1859 Pnuc_1860     TRUE 0.795 -10.000 0.007 NA   NA
 6890825 6890826 Pnuc_1860 Pnuc_1861     TRUE 0.606 55.000 0.150 NA   NA
 6890826 6890827 Pnuc_1861 Pnuc_1862     TRUE 0.520 9.000 0.010 NA N NA
 6890827 6890828 Pnuc_1862 Pnuc_1863   glyQ FALSE 0.148 61.000 0.003 1.000 N NA
 6890828 6890829 Pnuc_1863 Pnuc_1864 glyQ glyS TRUE 0.986 32.000 0.651 0.001 Y NA
 6890829 6890830 Pnuc_1864 Pnuc_1865 glyS   TRUE 0.966 -3.000 0.123 1.000 N NA
 6890830 6890831 Pnuc_1865 Pnuc_1866     TRUE 0.929 8.000 0.279 1.000 N NA
 6890832 6890833 Pnuc_1867 Pnuc_1868     TRUE 0.923 4.000 0.197 1.000 N NA
 6890833 6890834 Pnuc_1868 Pnuc_1869     TRUE 0.994 -25.000 0.561 1.000   NA
 6890834 6890835 Pnuc_1869 Pnuc_1870     TRUE 0.942 0.000 0.168 1.000   NA
 6890836 6890837 Pnuc_1871 Pnuc_1872     TRUE 0.959 14.000 0.642 NA   NA
 6890837 6890838 Pnuc_1872 Pnuc_1873     TRUE 0.970 -13.000 0.074 1.000 N NA
 6890838 6890839 Pnuc_1873 Pnuc_1874     TRUE 0.957 16.000 0.396 1.000 N NA
 6890839 6890840 Pnuc_1874 Pnuc_1875     FALSE 0.142 153.000 0.019 0.013 N NA
 6890840 6890841 Pnuc_1875 Pnuc_1876     TRUE 0.727 51.000 0.161 1.000 N NA
 6890841 6890842 Pnuc_1876 Pnuc_1877   purH TRUE 0.721 45.000 0.101 1.000 N NA
 6890842 6890843 Pnuc_1877 Pnuc_1878 purH   TRUE 0.662 7.000 0.023 1.000 N NA
 6890843 6890844 Pnuc_1878 Pnuc_1879   ruvA TRUE 0.982 30.000 0.451 0.010 Y NA
 6890844 6890845 Pnuc_1879 Pnuc_1880 ruvA ruvB TRUE 0.989 18.000 0.549 0.002 Y NA
 6890848 6890849 Pnuc_1883 Pnuc_1884   argC FALSE 0.184 69.000 0.031 NA   NA
 6890849 6890850 Pnuc_1884 Pnuc_1885 argC   FALSE 0.159 113.000 0.032 1.000 N NA
 6890850 6890851 Pnuc_1885 Pnuc_1886   rplM TRUE 0.986 10.000 0.601 0.018 Y NA
 6890853 6890854 Pnuc_R0042 Pnuc_1888     FALSE 0.046 96.000 0.000 NA   NA
 6890854 6890855 Pnuc_1888 Pnuc_1889     TRUE 0.744 2.000 0.018 1.000 N NA
 6890855 6890856 Pnuc_1889 Pnuc_1890     FALSE 0.484 10.000 0.000 1.000 N NA
 6890856 6890857 Pnuc_1890 Pnuc_1891     TRUE 0.578 10.000 0.012 1.000 N NA
 6890857 6890858 Pnuc_1891 Pnuc_1892     TRUE 0.715 32.000 0.050 1.000 N NA
 6890858 6890859 Pnuc_1892 Pnuc_1893     TRUE 0.746 17.000 0.057 NA   NA
 6890859 6890860 Pnuc_1893 Pnuc_1894     FALSE 0.103 53.000 0.005 NA   NA
 6890860 6890861 Pnuc_1894 Pnuc_1895     TRUE 0.951 4.000 0.432 NA   NA
 6890861 6890862 Pnuc_1895 Pnuc_1896     TRUE 0.599 54.000 0.135 NA   NA
 6890862 6890863 Pnuc_1896 Pnuc_1897     FALSE 0.254 68.000 0.044 1.000   NA
 6890863 6890864 Pnuc_1897 Pnuc_1898     TRUE 0.879 0.000 0.074 NA   NA
 6890864 6890865 Pnuc_1898 Pnuc_1899     TRUE 0.711 0.000 0.019 NA   NA
 6890866 6890867 Pnuc_1900 Pnuc_1901     TRUE 0.530 12.000 0.019 1.000   NA
 6890867 6890868 Pnuc_1901 Pnuc_1902   queF TRUE 0.613 18.000 0.022 1.000   NA
 6890869 6890870 Pnuc_1903 Pnuc_1904     FALSE 0.132 82.000 0.007 1.000 N NA
 6890873 6890874 Pnuc_1907 Pnuc_1908     FALSE 0.446 30.000 0.012 1.000   NA
 6890874 6890875 Pnuc_1908 Pnuc_1909     TRUE 0.963 4.000 0.617 NA   NA
 6890875 6890876 Pnuc_1909 Pnuc_1910     TRUE 0.965 2.000 0.459 NA   NA
 6890876 6890877 Pnuc_1910 Pnuc_1911     TRUE 0.987 -3.000 0.543 NA   NA
 6890877 6890878 Pnuc_1911 Pnuc_1912     FALSE 0.028 183.000 0.006 NA   NA
 6890878 6890879 Pnuc_1912 Pnuc_1913     TRUE 0.912 34.000 0.309 NA N NA
 6890879 6890880 Pnuc_1913 Pnuc_1914     TRUE 0.990 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 6890880 6890881 Pnuc_1914 Pnuc_1915     TRUE 0.901 4.000 0.194 NA   NA
 6890882 6890883 Pnuc_1916 Pnuc_1917     TRUE 0.985 -15.000 0.021 0.002 Y NA
 6890884 6890885 Pnuc_1918 Pnuc_1919   ipk TRUE 0.782 -7.000 0.000 1.000   NA
 6890885 6890886 Pnuc_1919 Pnuc_R0043 ipk   FALSE 0.327 6.000 0.000 NA   NA
 6890886 6890887 Pnuc_R0043 Pnuc_1920     FALSE 0.106 55.000 0.000 NA   NA
 6890887 6890888 Pnuc_1920 Pnuc_1921     FALSE 0.329 136.000 0.122 1.000 N NA
 6890888 6890889 Pnuc_1921 Pnuc_1922     TRUE 0.887 86.000 0.496 0.030 Y NA
 6890890 6890891 Pnuc_1923 Pnuc_1924   coaD TRUE 0.817 18.000 0.088 NA   NA
 6890891 6890892 Pnuc_1924 Pnuc_1925 coaD   TRUE 0.915 37.000 0.367 NA N NA
 6890892 6890893 Pnuc_1925 Pnuc_1926     TRUE 0.783 20.000 0.070 NA   NA
 6890893 6890894 Pnuc_1926 Pnuc_1927     TRUE 0.984 0.000 0.598 0.005   NA
 6890895 6890896 Pnuc_1928 Pnuc_1929     FALSE 0.114 93.000 0.008 1.000 N NA
 6890897 6890898 Pnuc_1930 Pnuc_1931     TRUE 0.668 2.000 0.019 1.000   NA
 6890898 6890899 Pnuc_1931 Pnuc_1932     TRUE 0.994 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 6890899 6890900 Pnuc_1932 Pnuc_1933     TRUE 0.957 0.000 0.255 NA   NA
 6890900 6890901 Pnuc_1933 Pnuc_1934     TRUE 0.972 3.000 0.722 NA   NA
 6890903 6890904 Pnuc_1936 Pnuc_1937     TRUE 0.844 30.000 0.152 NA   NA
 6890904 6890905 Pnuc_1937 Pnuc_1938     TRUE 0.835 9.000 0.129 NA   NA
 6890905 6890906 Pnuc_1938 Pnuc_1939     TRUE 0.502 128.000 0.268 1.000 N NA
 6890906 6890907 Pnuc_1939 Pnuc_1940     TRUE 0.981 41.000 0.741 0.003 Y NA
 6890907 6890908 Pnuc_1940 Pnuc_1941     FALSE 0.033 181.000 0.006 1.000   NA
 6890909 6890910 Pnuc_1942 Pnuc_1943     TRUE 0.715 19.000 0.045 1.000   NA
 6890911 6890912 Pnuc_1944 Pnuc_1945 gpsA   TRUE 0.857 25.000 0.097 1.000 N NA
 6890912 6890913 Pnuc_1945 Pnuc_1946     TRUE 0.925 25.000 0.221 1.000 N NA
 6890913 6890914 Pnuc_1946 Pnuc_1947     TRUE 0.923 11.000 0.269 NA N NA
 6890915 6890916 Pnuc_1948 Pnuc_1949     TRUE 0.725 14.000 0.036 1.000 N NA
 6890916 6890917 Pnuc_1949 Pnuc_1950     TRUE 0.830 27.000 0.082 1.000 N NA
 6890918 6890919 Pnuc_1951 Pnuc_1952     TRUE 0.981 3.000 0.205 0.001 Y NA
 6890919 6890920 Pnuc_1952 Pnuc_1953     TRUE 0.981 17.000 0.261 0.002 Y NA
 6890920 6890921 Pnuc_1953 Pnuc_1954     TRUE 0.838 2.000 0.048 1.000 N NA
 6890921 6890922 Pnuc_1954 Pnuc_1955     TRUE 0.832 29.000 0.120 1.000   NA
 6890922 6890923 Pnuc_1955 Pnuc_1956     FALSE 0.102 106.000 0.020 1.000   NA
 6890923 6890924 Pnuc_1956 Pnuc_1957     TRUE 0.764 14.000 0.048 1.000 N NA
 6890924 6890925 Pnuc_1957 Pnuc_1958     TRUE 0.753 25.000 0.065 NA   NA
 6890927 6890928 Pnuc_1960 Pnuc_1961     TRUE 0.643 -7.000 0.003 NA   NA
 6890928 6890929 Pnuc_1961 Pnuc_1962   lipB TRUE 0.995 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 6890929 6890930 Pnuc_1962 Pnuc_1963 lipB   TRUE 0.887 10.000 0.219 NA   NA
 6890930 6890931 Pnuc_1963 Pnuc_1964     FALSE 0.391 18.000 0.007 NA   NA
 6890931 6890932 Pnuc_1964 Pnuc_1965     TRUE 0.855 31.000 0.179 NA   NA
 6890932 6890933 Pnuc_1965 Pnuc_1966     TRUE 0.936 17.000 0.320 NA   NA
 6890934 6890935 Pnuc_1967 Pnuc_1968     TRUE 0.970 -3.000 0.147 1.000 N NA
 6890937 6890938 Pnuc_1970 Pnuc_1971     TRUE 0.777 -3.000 0.011 1.000   NA
 6890938 6890939 Pnuc_1971 Pnuc_1972     TRUE 0.978 1.000 0.722 NA   NA
 6890939 6890940 Pnuc_1972 Pnuc_1973     TRUE 0.972 -3.000 0.213 NA   NA
 6890940 6890941 Pnuc_1973 Pnuc_1974     TRUE 0.869 -3.000 0.033 1.000   NA
 6890942 6890943 Pnuc_1975 Pnuc_1976     TRUE 0.956 14.000 0.573 NA   NA
 6890943 6890944 Pnuc_1976 Pnuc_1977     TRUE 0.609 39.000 0.062 NA   NA
 6890946 6890947 Pnuc_1979 Pnuc_1980     TRUE 0.979 -3.000 0.041 0.001 Y NA
 6890952 6890953 Pnuc_1985 Pnuc_1986     TRUE 0.744 11.000 0.071 NA   NA
 6890953 6890954 Pnuc_1986 Pnuc_1987     FALSE 0.345 29.000 0.000 1.000   NA
 6890955 6890956 Pnuc_1988 Pnuc_1989     TRUE 0.959 8.000 0.436 0.066 N NA
 6890956 6890957 Pnuc_1989 Pnuc_1990     FALSE 0.268 170.000 0.000 0.066 Y NA
 6890957 6890958 Pnuc_1990 Pnuc_1991     FALSE 0.225 186.000 0.000 1.000 Y NA
 6890958 6890959 Pnuc_1991 Pnuc_1992     TRUE 0.925 0.000 0.009 1.000 Y NA
 6890959 6890960 Pnuc_1992 Pnuc_1993     TRUE 0.854 -3.000 0.014 NA N NA
 6890960 6890961 Pnuc_1993 Pnuc_1994     TRUE 0.664 39.000 0.059 NA N NA
 6890961 6890962 Pnuc_1994 Pnuc_1995     TRUE 0.937 28.000 0.316 1.000 N NA
 6890964 6890965 Pnuc_1997 Pnuc_1998     TRUE 0.851 0.000 0.054 1.000   NA
 6890965 6890966 Pnuc_1998 Pnuc_1999     TRUE 0.941 29.000 0.110 1.000 Y NA
 6890968 6890969 Pnuc_2001 Pnuc_2002     TRUE 0.696 38.000 0.061 1.000 N NA
 6890969 6890970 Pnuc_2002 Pnuc_2003     TRUE 0.567 235.000 0.114 0.001 Y NA
 6890971 6890972 Pnuc_2004 Pnuc_2005     TRUE 0.889 18.000 0.000 0.001 Y NA
 6890972 6890973 Pnuc_2005 Pnuc_2006     FALSE 0.149 59.000 0.002 1.000 N NA
 6890976 6890977 Pnuc_2009 Pnuc_2010     FALSE 0.157 71.000 0.023 NA   NA
 6890977 6890978 Pnuc_2010 Pnuc_2011   metX TRUE 0.989 -3.000 0.509 NA N NA
 6890978 6890979 Pnuc_2011 Pnuc_2012 metX slmA TRUE 0.697 -3.000 0.006 1.000   NA
 6890979 6890980 Pnuc_2012 Pnuc_2013 slmA   TRUE 0.575 19.000 0.017 1.000   NA
 6890980 6890981 Pnuc_2013 Pnuc_2014     FALSE 0.462 14.000 0.003 1.000 N NA
 6890981 6890982 Pnuc_2014 Pnuc_2015     FALSE 0.139 113.000 0.045 NA   NA
 6890982 6890983 Pnuc_2015 Pnuc_2016     FALSE 0.163 70.000 0.024 NA   NA
 6890983 6890984 Pnuc_2016 Pnuc_2017     TRUE 0.994 -19.000 0.714 NA   NA
 6890984 6890985 Pnuc_2017 Pnuc_2018   gatB FALSE 0.295 28.000 0.005 NA   NA
 6890985 6890986 Pnuc_2018 Pnuc_2019 gatB   TRUE 0.994 0.000 0.492 0.001 Y NA
 6890986 6890987 Pnuc_2019 Pnuc_2020     TRUE 0.997 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 6890988 6890989 Pnuc_2021 Pnuc_2022     TRUE 0.970 25.000 0.689 1.000 N NA
 6890989 6890990 Pnuc_2022 Pnuc_2023     TRUE 0.997 -3.000 0.550 0.003 Y NA
 6890990 6890991 Pnuc_2023 Pnuc_2024     TRUE 0.940 9.000 0.108 1.000 Y NA
 6890991 6890992 Pnuc_2024 Pnuc_2025     TRUE 0.970 -18.000 0.073 1.000 N NA
 6890993 6890994 Pnuc_2026 Pnuc_2027     FALSE 0.060 78.000 0.000 NA   NA
 6890997 6890998 Pnuc_2030 Pnuc_2031     TRUE 0.507 7.000 0.000 1.000 N NA
 6890998 6890999 Pnuc_2031 Pnuc_2032     FALSE 0.371 26.000 0.000 1.000   NA
 6890999 6891000 Pnuc_2032 Pnuc_2033     TRUE 0.957 8.000 0.633 1.000   NA
 6891002 6891003 Pnuc_2035 Pnuc_2036     FALSE 0.215 164.000 0.003 1.000 Y NA
 6891005 6891006 Pnuc_2038 Pnuc_2039     TRUE 0.526 22.000 0.000 0.051   NA
 6891006 6891007 Pnuc_2039 Pnuc_2040     FALSE 0.241 35.000 0.000 NA   NA
 6891008 6891009 Pnuc_2041 Pnuc_2042     FALSE 0.045 100.000 0.000 NA   NA
 6891009 6891010 Pnuc_2042 Pnuc_2043     FALSE 0.027 186.000 0.000 NA   NA
 6891012 6891013 Pnuc_2045 Pnuc_2046     FALSE 0.438 11.000 0.012 NA   NA
 6891013 6891014 Pnuc_2046 Pnuc_2047     FALSE 0.066 71.000 0.000 NA   NA
 6891014 6891015 Pnuc_2047 Pnuc_2048     FALSE 0.039 109.000 0.000 NA   NA
 6891015 6891016 Pnuc_2048 Pnuc_2049     FALSE 0.027 186.000 0.000 NA   NA
 6891016 6891017 Pnuc_2049 Pnuc_2050     FALSE 0.080 64.000 0.000 NA   NA
 6891017 6891018 Pnuc_2050 Pnuc_2051     FALSE 0.037 114.000 0.000 NA   NA
 6891018 6891019 Pnuc_2051 Pnuc_2052     FALSE 0.024 395.000 0.000 NA   NA
 6891019 6891020 Pnuc_2052 Pnuc_2053     FALSE 0.047 92.000 0.000 NA   NA
 6891020 6891021 Pnuc_2053 Pnuc_2054     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 6891021 6891022 Pnuc_2054 Pnuc_2055     FALSE 0.031 144.000 0.000 NA   NA
 6891023 6891024 Pnuc_2056 Pnuc_2057     FALSE 0.358 18.000 0.000 NA   NA
 6891025 6891026 Pnuc_2058 Pnuc_2059     FALSE 0.345 15.000 0.000 NA   NA
 6891026 6891027 Pnuc_2059 Pnuc_2060     FALSE 0.039 134.000 0.000 1.000   NA
 6891027 6891028 Pnuc_2060 Pnuc_2061     FALSE 0.024 1776.000 0.000 NA   NA
 6891029 6891030 Pnuc_2062 Pnuc_2063     FALSE 0.028 170.000 0.000 NA   NA
 6891032 6891033 Pnuc_2065 Pnuc_2066     TRUE 0.947 19.000 0.400 NA   NA
 6891034 6891035 Pnuc_2067 Pnuc_2068     FALSE 0.043 102.000 0.000 NA   NA
 6891035 6891036 Pnuc_2068 Pnuc_2069     FALSE 0.091 60.000 0.000 NA   NA
 6891036 6891037 Pnuc_2069 Pnuc_2070     FALSE 0.029 163.000 0.000 NA   NA
 6891039 6891040 Pnuc_2072 Pnuc_R0044     FALSE 0.051 87.000 0.000 NA   NA
 6891040 6891041 Pnuc_R0044 Pnuc_2073     FALSE 0.034 128.000 0.000 NA   NA
 6891041 6891042 Pnuc_2073 Pnuc_2074     FALSE 0.119 57.000 0.000 1.000   NA
 6891042 6891043 Pnuc_2074 Pnuc_2075     TRUE 0.970 3.000 0.605 1.000   NA
 6891043 6891044 Pnuc_2075 Pnuc_2076     TRUE 0.991 -3.000 0.810 NA   NA
 6891044 6891045 Pnuc_2076 Pnuc_2077     TRUE 0.941 -3.000 0.094 NA   NA
 6891045 6891046 Pnuc_2077 Pnuc_2078     TRUE 0.975 26.000 0.305 1.000 Y NA
 6891046 6891047 Pnuc_2078 Pnuc_2079     TRUE 0.947 10.000 0.105 0.029 Y NA
 6891048 6891049 Pnuc_2080 Pnuc_2081     FALSE 0.204 247.000 0.004 1.000 Y NA
 6891050 6891051 Pnuc_2082 Pnuc_2083     FALSE 0.360 40.000 0.000 1.000 N NA
 6891051 6891052 Pnuc_2083 Pnuc_2084   trmE FALSE 0.082 91.000 0.003 0.011   NA
 6891052 6891053 Pnuc_2084 Pnuc_2085 trmE   TRUE 0.857 40.000 0.221 0.049   NA
 6891053 6891054 Pnuc_2085 Pnuc_2086     TRUE 0.952 16.000 0.461 NA   NA
 6891054 6891055 Pnuc_2086 Pnuc_2087     TRUE 0.970 2.000 0.540 NA   NA
 6891055 6891056 Pnuc_2087 Pnuc_2088   rpmH TRUE 0.961 9.000 0.787 1.000   NA