MicrobesOnline Operon Predictions for Agrobacterium radiobacter K84

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5481821 5481822 Arad_7000 Arad_7001 repAa1 repBf2 TRUE 0.986 -15.000 0.429 1.000 N NA
 5481822 5481823 Arad_7001 Arad_7003 repBf2 repCa1 FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5481823 5481824 Arad_7003 Arad_7004 repCa1   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5481824 5481825 Arad_7004 Arad_7005     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5481825 5481826 Arad_7005 Arad_7006   nrtB TRUE 0.994 18.000 0.795 NA Y NA
 5481826 5481827 Arad_7006 Arad_7007 nrtB   TRUE 0.990 5.000 0.318 NA Y NA
 5481831 5481832 Arad_7011 Arad_7012     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5481832 5481833 Arad_7012 Arad_7013     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 5481833 5481834 Arad_7013 Arad_7014   glf TRUE 0.757 7.000 0.008 1.000 N NA
 5481835 5481836 Arad_7015 Arad_7016     TRUE 0.991 10.000 0.812 NA   NA
 5481836 5481837 Arad_7016 Arad_7017     TRUE 0.997 -3.000 0.938 NA   NA
 5481837 5481838 Arad_7017 Arad_7019     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 5481839 5481840 Arad_7020 Arad_7021     TRUE 0.999 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5481841 5481842 Arad_7022 Arad_7023     FALSE 0.321 120.000 0.172 1.000 N NA
 5481843 5481844 Arad_7024 Arad_7026     FALSE 0.051 158.000 0.000 NA   NA
 5481845 5481846 Arad_7028 Arad_7029 tauC   TRUE 0.998 -7.000 0.607 NA Y NA
 5481846 5481847 Arad_7029 Arad_7030     TRUE 0.961 49.000 0.435 NA Y NA
 5481847 5481848 Arad_7030 Arad_7031     FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 5481848 5481849 Arad_7031 Arad_7033     FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 5481849 5481850 Arad_7033 Arad_7034     FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5481850 5481851 Arad_7034 Arad_7035     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5481854 5481855 Arad_7038 Arad_7039     FALSE 0.099 220.000 0.190 NA   NA
 5481855 5481856 Arad_7039 Arad_7040     FALSE 0.367 83.000 0.021 NA   NA
 5481858 5481859 Arad_7042 Arad_7043     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5481862 5481863 Arad_7047 Arad_7048     FALSE 0.004 229.000 0.000 1.000 N NA
 5481863 5481864 Arad_7048 Arad_7049     TRUE 0.991 -3.000 0.125 NA Y NA
 5481864 5481865 Arad_7049 Arad_7050     TRUE 0.998 4.000 0.812 NA Y NA
 5481865 5481866 Arad_7050 Arad_7051     TRUE 0.958 26.000 0.250 NA Y NA
 5481866 5481867 Arad_7051 Arad_7052   ordL TRUE 0.918 65.000 0.286 NA Y NA
 5481867 5481868 Arad_7052 Arad_7054 ordL dehII TRUE 0.991 10.000 0.800 1.000   NA
 5481868 5481869 Arad_7054 Arad_7055 dehII   TRUE 0.894 42.000 0.429 1.000   NA
 5481870 5481871 Arad_7056 Arad_7058     FALSE 0.001 414.000 0.000 1.000 N NA
 5481871 5481872 Arad_7058 Arad_7060     TRUE 0.997 -3.000 0.462 1.000 Y NA
 5481872 5481873 Arad_7060 Arad_7061     TRUE 0.995 0.000 0.286 0.018 Y NA
 5481873 5481874 Arad_7061 Arad_7062     TRUE 0.979 25.000 0.429 1.000 Y NA
 5481874 5481875 Arad_7062 Arad_7064     FALSE 0.248 68.000 0.000 1.000   NA
 5481875 5481876 Arad_7064 Arad_7065     FALSE 0.411 30.000 0.000 1.000   NA
 5481879 5481880 Arad_7069 Arad_7070     TRUE 0.879 11.000 0.077 NA   NA
 5481880 5481881 Arad_7070 Arad_7071     TRUE 0.970 6.000 0.365 NA   NA
 5481881 5481882 Arad_7071 Arad_7072     TRUE 0.915 25.000 0.442 NA N NA
 5481882 5481883 Arad_7072 Arad_7073     TRUE 0.992 -3.000 0.621 NA N NA
 5481883 5481884 Arad_7073 Arad_7074   exsA FALSE 0.000 354.000 0.000 NA N NA
 5481886 5481887 Arad_7076 Arad_7078     TRUE 0.590 35.000 0.000 0.058   NA
 5481887 5481888 Arad_7078 Arad_7079     FALSE 0.029 118.000 0.000 1.000 N NA
 5481888 5481889 Arad_7079 Arad_7080     FALSE 0.501 123.000 0.000 NA Y NA
 5481890 5481891 Arad_7081 Arad_7082     FALSE 0.001 236.000 0.000 NA N NA
 5481891 5481892 Arad_7082 Arad_7083     TRUE 0.967 99.000 0.818 NA Y NA
 5481892 5481893 Arad_7083 Arad_7084     TRUE 0.998 0.000 0.818 NA Y NA
 5481893 5481894 Arad_7084 Arad_7085     TRUE 0.992 4.000 0.727 NA   NA
 5481894 5481895 Arad_7085 Arad_7087     TRUE 0.941 40.000 0.625 NA   NA
 5481895 5481896 Arad_7087 Arad_7088     TRUE 0.979 10.000 0.571 1.000 N NA
 5481896 5481897 Arad_7088 Arad_7089     FALSE 0.152 27.000 0.000 1.000 N NA
 5481898 5481899 Arad_7091 Arad_7092 dat   TRUE 0.853 58.000 0.043 1.000 Y NA
 5481899 5481900 Arad_7092 Arad_7094     FALSE 0.418 92.000 0.072 NA   NA
 5481900 5481901 Arad_7094 Arad_7095     FALSE 0.504 40.000 0.002 NA   NA
 5481901 5481902 Arad_7095 Arad_7096     FALSE 0.524 22.000 0.002 1.000 N NA
 5481902 5481903 Arad_7096 Arad_7097     TRUE 0.946 -3.000 0.125 1.000 N NA
 5481903 5481904 Arad_7097 Arad_7098   argE TRUE 0.986 4.000 0.600 1.000 N NA
 5481904 5481905 Arad_7098 Arad_7100 argE aapP TRUE 0.997 1.000 0.600 1.000 Y NA
 5481905 5481906 Arad_7100 Arad_7101 aapP   TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5481906 5481907 Arad_7101 Arad_7102     TRUE 0.991 49.000 1.000 1.000 Y NA
 5481909 5481910 Arad_7105 Arad_7107     TRUE 0.979 -10.000 0.000 NA Y NA
 5481910 5481911 Arad_7107 Arad_7109     TRUE 0.859 115.000 0.375 NA Y NA
 5481911 5481912 Arad_7109 Arad_7110     TRUE 0.755 53.000 0.250 NA   NA
 5481912 5481913 Arad_7110 Arad_7111   fadB1 FALSE 0.218 76.000 0.000 1.000   NA
 5481913 5481914 Arad_7111 Arad_7113 fadB1   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5481914 5481915 Arad_7113 Arad_7114     TRUE 0.992 1.000 0.286 1.000 Y NA
 5481916 5481917 Arad_7115 Arad_7116     TRUE 0.581 49.000 0.125 1.000 N NA
 5481917 5481918 Arad_7116 Arad_7117   prsD FALSE 0.002 516.000 0.000 1.000   NA
 5481918 5481919 Arad_7117 Arad_7118 prsD prsE TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.005   NA
 5481919 5481920 Arad_7118 Arad_7120 prsE   FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5481920 5481921 Arad_7120 Arad_7121   exsH FALSE 0.204 71.000 0.000 NA   NA
 5481921 5481922 Arad_7121 Arad_7122 exsH   FALSE 0.050 304.000 0.000 NA Y NA
 5481923 5481924 Arad_7123 Arad_7124   dapAch1 TRUE 0.961 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5481924 5481925 Arad_7124 Arad_7125 dapAch1 ooxB TRUE 0.998 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5481925 5481926 Arad_7125 Arad_7127 ooxB ooxA TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.058   NA
 5481927 5481928 Arad_7128 Arad_7129   occQe TRUE 0.991 37.000 0.857 1.000 Y NA
 5481928 5481929 Arad_7129 Arad_7130 occQe   TRUE 0.999 0.000 1.000 0.018 Y NA
 5481929 5481930 Arad_7130 Arad_7131     TRUE 0.999 -43.000 0.750 1.000 Y NA
 5481931 5481932 Arad_7133 Arad_7134     FALSE 0.312 99.000 0.097 NA N NA
 5481932 5481933 Arad_7134 Arad_7135   appD TRUE 0.869 52.000 0.065 NA Y NA
 5481933 5481934 Arad_7135 Arad_7137 appD   TRUE 0.999 -7.000 0.677 0.006 Y NA
 5481934 5481935 Arad_7137 Arad_7138   dppCch3 TRUE 0.995 15.000 0.742 NA Y NA
 5481935 5481936 Arad_7138 Arad_7140 dppCch3   TRUE 0.998 5.000 0.871 NA Y NA
 5481936 5481937 Arad_7140 Arad_7141     TRUE 0.891 84.000 0.296 NA Y NA
 5481942 5481943 Arad_7148 Arad_7149   bglSf TRUE 0.573 105.000 0.000 NA Y NA
 5481946 5481947 Arad_7153 Arad_7154   nah FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5481947 5481948 Arad_7154 Arad_7155 nah   FALSE 0.061 76.000 0.000 1.000 N NA
 5481948 5481949 Arad_7155 Arad_7156     FALSE 0.148 92.000 0.000 NA   NA
 5481951 5481952 Arad_7158 Arad_7159     FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5481952 5481953 Arad_7159 Arad_7160     TRUE 0.953 3.000 0.200 1.000   NA
 5481953 5481954 Arad_7160 Arad_7161     TRUE 0.763 51.000 0.238 1.000   NA
 5481954 5481955 Arad_7161 Arad_7162     TRUE 0.966 11.000 0.286 0.055   NA
 5481956 5481957 Arad_7163 Arad_7164     FALSE 0.138 203.000 0.250 1.000 N NA
 5481960 5481961 Arad_7168 Arad_7169     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5481961 5481962 Arad_7169 Arad_7170     FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 5481962 5481963 Arad_7170 Arad_7171     TRUE 0.632 11.000 0.000 NA   NA
 5481965 5481966 Arad_7177 Arad_7178 cheW5   TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5481968 5481969 Arad_7180 Arad_7181     TRUE 0.913 48.000 0.400 0.014   NA
 5481969 5481970 Arad_7181 Arad_7182     TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5481972 5481973 Arad_7185 Arad_7186     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 5481973 5481974 Arad_7186 Arad_7187     FALSE 0.237 188.000 0.000 1.000 Y NA
 5481974 5481975 Arad_7187 Arad_7188     FALSE 0.001 940.000 0.000 NA   NA
 5481975 5481976 Arad_7188 Arad_7191     FALSE 0.001 593.000 0.000 NA   NA
 5481976 5481977 Arad_7191 Arad_7192     FALSE 0.001 664.000 0.000 NA   NA
 5481977 5481978 Arad_7192 Arad_7193     FALSE 0.087 128.000 0.000 NA   NA
 5481979 5481980 Arad_7194 Arad_7196     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5481981 5481982 Arad_7197 Arad_7198 iclR   TRUE 0.829 -7.000 0.000 NA   NA
 5481983 5481984 Arad_7199 Arad_7200 matB   TRUE 0.868 52.000 0.050 1.000 Y NA
 5481984 5481985 Arad_7200 Arad_7201   maiA TRUE 0.946 -3.000 0.125 1.000 N NA
 5481985 5481986 Arad_7201 Arad_7203 maiA   FALSE 0.077 61.000 0.000 1.000 N NA
 5481986 5481987 Arad_7203 Arad_7204     TRUE 0.955 -3.000 0.088 NA   NA
 5481988 5481989 Arad_7206 Arad_7207     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5481989 5481990 Arad_7207 Arad_7208     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5481990 5481991 Arad_7208 Arad_7209     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5481992 5481993 Arad_7210 Arad_7211     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5481993 5481994 Arad_7211 Arad_7212     FALSE 0.025 79.000 0.000 NA N NA
 5481994 5481995 Arad_7212 Arad_7213     TRUE 0.829 36.000 0.000 NA Y NA
 5481995 5481996 Arad_7213 Arad_7214   rbsAch2 TRUE 0.757 59.000 0.000 NA Y NA
 5481996 5481997 Arad_7214 Arad_7216 rbsAch2   FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 5481997 5481998 Arad_7216 Arad_7217     FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5481999 5482000 Arad_7218 Arad_7219     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA N NA
 5482000 5482001 Arad_7219 Arad_7221     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482001 5482002 Arad_7221 Arad_7222   tauC TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5482002 5482003 Arad_7222 Arad_7223 tauC   TRUE 0.978 -21.000 0.000 NA Y NA
 5482003 5482004 Arad_7223 Arad_7224     TRUE 0.630 93.000 0.000 NA Y NA
 5482004 5482005 Arad_7224 Arad_7225   ilvG TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482005 5482006 Arad_7225 Arad_7226 ilvG betB TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482006 5482007 Arad_7226 Arad_7227 betB   TRUE 0.802 63.000 0.400 1.000 N NA
 5482008 5482009 Arad_7228 Arad_7229   ocdch1 FALSE 0.002 287.000 0.000 1.000 N NA
 5482009 5482010 Arad_7229 Arad_7230 ocdch1   FALSE 0.176 10.000 0.000 NA N NA
 5482011 5482012 Arad_7233 Arad_7232     TRUE 0.637 69.000 0.250 NA N NA
 5482013 5482014 Arad_7234 Arad_7235   amaB FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 5482018 5482019 Arad_7241 Arad_7242     TRUE 0.991 4.000 0.700 NA   NA
 5482019 5482020 Arad_7242 Arad_7243     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5482021 5482022 Arad_7244 Arad_7246     FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 5482022 5482023 Arad_7246 Arad_7247     FALSE 0.329 45.000 0.000 1.000   NA
 5482024 5482025 Arad_7250 Arad_7251     TRUE 0.957 -10.000 0.100 NA   NA
 5482025 5482026 Arad_7251 Arad_7252     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 5482027 5482028 Arad_7253 Arad_7254     FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 5482028 5482029 Arad_7254 Arad_7255     FALSE 0.020 142.000 0.000 1.000 N NA
 5482029 5482030 Arad_7255 Arad_7256     FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482030 5482031 Arad_7256 Arad_7257     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482031 5482032 Arad_7257 Arad_7258   stcD TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5482032 5482033 Arad_7258 Arad_7260 stcD   FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482033 5482034 Arad_7260 Arad_7261     FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5482035 5482036 Arad_7262 Arad_7263   betB FALSE 0.162 86.000 0.000 NA   NA
 5482036 5482037 Arad_7263 Arad_7264 betB   TRUE 0.980 16.000 0.667 0.093 N NA
 5482037 5482038 Arad_7264 Arad_7266     TRUE 0.980 2.000 0.000 0.031 Y NA
 5482038 5482039 Arad_7266 Arad_7267     FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5482039 5482040 Arad_7267 Arad_7268     FALSE 0.150 91.000 0.000 NA   NA
 5482040 5482041 Arad_7268 Arad_7270     TRUE 0.989 -3.000 0.429 NA   NA
 5482041 5482042 Arad_7270 Arad_7271     FALSE 0.090 21.000 0.000 NA N NA
 5482043 5482044 Arad_7273 Arad_7274     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482044 5482045 Arad_7274 Arad_7275     FALSE 0.058 161.000 0.000 1.000   NA
 5482045 5482046 Arad_7275 Arad_7277     TRUE 0.964 2.000 0.250 NA   NA
 5482046 5482047 Arad_7277 Arad_7278     TRUE 0.938 -3.000 0.033 NA   NA
 5482047 5482048 Arad_7278 Arad_7279     TRUE 0.749 19.000 0.033 NA   NA
 5482050 5482051 Arad_7281 Arad_7284 phbB   FALSE 0.016 221.000 0.000 NA   NA
 5482051 5482052 Arad_7284 Arad_7285     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482055 5482056 Arad_7288 Arad_7289     TRUE 0.915 106.000 0.900 1.000   NA
 5482056 5482057 Arad_7289 Arad_7290     TRUE 0.945 36.000 0.600 1.000   NA
 5482058 5482059 Arad_7291 Arad_7293     TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482059 5482060 Arad_7293 Arad_7295     FALSE 0.014 111.000 0.000 NA N NA
 5482060 5482061 Arad_7295 Arad_7296   dadA TRUE 0.728 12.000 0.026 NA N NA
 5482062 5482063 Arad_7297 Arad_7298 braC1 braD TRUE 0.967 84.000 0.714 NA Y NA
 5482063 5482064 Arad_7298 Arad_7299 braD   TRUE 0.999 -7.000 0.714 NA Y NA
 5482064 5482065 Arad_7299 Arad_7301     TRUE 0.995 -7.000 0.312 NA Y NA
 5482065 5482066 Arad_7301 Arad_7302   braG TRUE 0.997 -3.000 0.312 0.055 Y NA
 5482066 5482067 Arad_7302 Arad_7303 braG   FALSE 0.045 45.000 0.000 NA N NA
 5482068 5482069 Arad_7304 Arad_7305     FALSE 0.012 121.000 0.000 NA N NA
 5482069 5482070 Arad_7305 Arad_7307     FALSE 0.010 131.000 0.000 NA N NA
 5482070 5482071 Arad_7307 Arad_7308     FALSE 0.100 46.000 0.000 1.000 N NA
 5482071 5482072 Arad_7308 Arad_7310     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000 Y NA
 5482072 5482073 Arad_7310 Arad_7311     TRUE 0.992 0.000 0.154 0.017 Y NA
 5482073 5482074 Arad_7311 Arad_7312     TRUE 0.891 57.000 0.154 1.000 Y NA
 5482074 5482075 Arad_7312 Arad_7314     FALSE 0.019 94.000 0.000 NA N NA
 5482075 5482076 Arad_7314 Arad_7315     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482079 5482080 Arad_7319 Arad_7320 dppBf dppCch3 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482080 5482081 Arad_7320 Arad_7321 dppCch3   TRUE 0.963 5.000 0.300 NA   NA
 5482081 5482082 Arad_7321 Arad_7322     TRUE 0.942 18.000 0.375 1.000   NA
 5482082 5482083 Arad_7322 Arad_7324     TRUE 0.996 -7.000 0.800 NA   NA
 5482083 5482084 Arad_7324 Arad_7326   dppAch2 TRUE 0.904 48.000 0.500 NA   NA
 5482084 5482085 Arad_7326 Arad_7327 dppAch2   TRUE 0.781 69.000 0.333 NA   NA
 5482085 5482086 Arad_7327 Arad_7329     TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 5482086 5482087 Arad_7329 Arad_7330     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482087 5482088 Arad_7330 Arad_7331     TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5482090 5482091 Arad_7333 Arad_7334 cheRf   FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 5482091 5482092 Arad_7334 Arad_7335     TRUE 0.933 52.000 0.667 NA   NA
 5482092 5482093 Arad_7335 Arad_7336   cheRf FALSE 0.016 222.000 0.000 NA   NA
 5482095 5482096 Arad_7341 Arad_7342     FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5482096 5482097 Arad_7342 Arad_7343     TRUE 0.936 93.000 0.500 1.000 Y NA
 5482097 5482098 Arad_7343 Arad_7345     TRUE 0.997 4.000 0.571 0.017 Y NA
 5482098 5482099 Arad_7345 Arad_7346     TRUE 0.998 2.000 0.714 1.000 Y NA
 5482099 5482100 Arad_7346 Arad_7347     TRUE 0.977 11.000 0.150 1.000 Y NA
 5482100 5482101 Arad_7347 Arad_7348     TRUE 0.949 -3.000 0.050 1.000   NA
 5482102 5482103 Arad_7349 Arad_7350     TRUE 0.998 -3.000 0.976 NA   NA
 5482103 5482104 Arad_7350 Arad_7351     TRUE 0.997 -10.000 0.864 NA   NA
 5482104 5482105 Arad_7351 Arad_7352     TRUE 0.974 -3.000 0.208 1.000   NA
 5482105 5482106 Arad_7352 Arad_7353     TRUE 0.908 13.000 0.188 1.000   NA
 5482106 5482107 Arad_7353 Arad_7354     FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 5482107 5482108 Arad_7354 Arad_7355     FALSE 0.001 340.000 0.000 1.000 N NA
 5482108 5482109 Arad_7355 Arad_7356   ggt FALSE 0.173 172.000 0.200 1.000 N NA
 5482109 5482110 Arad_7356 Arad_7357 ggt   FALSE 0.025 79.000 0.000 NA N NA
 5482110 5482111 Arad_7357 Arad_7358   potC FALSE 0.067 28.000 0.000 NA N NA
 5482111 5482112 Arad_7358 Arad_7359 potC potH TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5482112 5482113 Arad_7359 Arad_7360 potH afuC1 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482113 5482114 Arad_7360 Arad_7362 afuC1 potD TRUE 0.992 18.000 0.667 NA Y NA
 5482114 5482115 Arad_7362 Arad_7363 potD   FALSE 0.031 361.000 0.000 NA Y NA
 5482117 5482118 Arad_7365 Arad_7366   appF TRUE 0.873 11.000 0.067 NA   NA
 5482118 5482119 Arad_7366 Arad_7367 appF appD TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 5482119 5482120 Arad_7367 Arad_7368 appD   TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 5482120 5482121 Arad_7368 Arad_7369     TRUE 0.996 11.000 0.667 NA Y NA
 5482121 5482122 Arad_7369 Arad_7371     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 5482122 5482123 Arad_7371 Arad_7372     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5482123 5482124 Arad_7372 Arad_7373     FALSE 0.182 78.000 0.000 NA   NA
 5482124 5482125 Arad_7373 Arad_7374     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5482125 5482126 Arad_7374 Arad_7375     FALSE 0.032 182.000 0.000 NA   NA
 5482126 5482127 Arad_7375 Arad_7376     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5482130 5482131 Arad_7379 Arad_7380     TRUE 0.933 -3.000 0.000 0.054   NA
 5482131 5482132 Arad_7380 Arad_7381     FALSE 0.359 31.000 0.000 NA   NA
 5482132 5482133 Arad_7381 Arad_7382   acpD FALSE 0.133 98.000 0.000 NA   NA
 5482133 5482134 Arad_7382 Arad_7383 acpD   FALSE 0.006 205.000 0.000 1.000 N NA
 5482136 5482137 Arad_7387 Arad_7388     TRUE 0.992 10.000 0.909 1.000 N NA
 5482137 5482138 Arad_7388 Arad_7389     FALSE 0.019 145.000 0.000 1.000 N NA
 5482138 5482139 Arad_7389 Arad_7390     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5482140 5482141 Arad_7391 Arad_7393 thiEb thiG TRUE 0.994 -3.000 0.118 0.005 Y NA
 5482141 5482142 Arad_7393 Arad_7394 thiG thiS TRUE 0.982 4.000 0.095 1.000 Y NA
 5482142 5482143 Arad_7394 Arad_7396 thiS thiO TRUE 0.959 -3.000 0.192 1.000 N NA
 5482143 5482144 Arad_7396 Arad_7398 thiO thiC TRUE 0.846 2.000 0.022 1.000 N NA
 5482144 5482145 Arad_7398 Arad_7399 thiC   FALSE 0.001 323.000 0.000 1.000 N NA
 5482145 5482146 Arad_7399 Arad_7400     TRUE 0.950 56.000 0.800 NA   NA
 5482147 5482148 Arad_7401 Arad_7403     TRUE 0.935 72.000 0.375 1.000 Y NA
 5482148 5482149 Arad_7403 Arad_7405     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.017 Y NA
 5482149 5482150 Arad_7405 Arad_7406     TRUE 0.999 -19.000 0.833 1.000 Y NA
 5482150 5482151 Arad_7406 Arad_7407     TRUE 0.928 27.000 0.500 1.000 N NA
 5482152 5482153 Arad_7409 Arad_7410     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5482154 5482155 Arad_7411 Arad_7412     TRUE 0.807 78.000 0.429 NA   NA
 5482155 5482156 Arad_7412 Arad_7414     TRUE 0.858 34.000 0.308 NA   NA
 5482156 5482157 Arad_7414 Arad_7415     TRUE 0.988 25.000 0.615 1.000 Y NA
 5482157 5482158 Arad_7415 Arad_7416     TRUE 0.611 148.000 0.125 1.000 Y NA
 5482162 5482163 Arad_7422 Arad_7425     FALSE 0.251 138.000 0.150 1.000 N NA
 5482166 5482167 Arad_7430 Arad_7431 pcaCd1   FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 5482167 5482168 Arad_7431 Arad_7432     TRUE 0.999 5.000 0.917 0.001 Y NA
 5482168 5482169 Arad_7432 Arad_7433     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.054 Y NA
 5482172 5482173 Arad_7437 Arad_7438     FALSE 0.001 618.000 0.000 NA   NA
 5482173 5482174 Arad_7438 Arad_7439     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 5482177 5482178 Arad_7447 Arad_7448   pepT TRUE 0.653 12.000 0.000 1.000   NA
 5482179 5482180 Arad_7449 Arad_7450     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482180 5482181 Arad_7450 Arad_7452   flgEf FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5482182 5482183 Arad_7453 Arad_7454 rpiB tpiA TRUE 0.997 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 5482183 5482184 Arad_7454 Arad_7455 tpiA glpRb TRUE 0.982 9.000 0.188 1.000 Y NA
 5482184 5482185 Arad_7455 Arad_7456 glpRb smoC TRUE 0.824 116.000 0.294 1.000 Y NA
 5482185 5482186 Arad_7456 Arad_7457 smoC   TRUE 0.797 63.000 0.333 NA   NA
 5482186 5482187 Arad_7457 Arad_7458   glpD TRUE 0.906 30.000 0.389 NA   NA
 5482187 5482188 Arad_7458 Arad_7460 glpD lyxX TRUE 0.842 67.000 0.350 0.002 N NA
 5482189 5482190 Arad_7462 Arad_7464     TRUE 0.996 -3.000 0.786 NA   NA
 5482190 5482191 Arad_7464 Arad_7465     TRUE 0.996 23.000 1.000 NA Y NA
 5482191 5482192 Arad_7465 Arad_7467     TRUE 0.945 115.000 0.727 NA Y NA
 5482192 5482193 Arad_7467 Arad_7468     TRUE 0.765 146.000 0.333 NA Y NA
 5482193 5482194 Arad_7468 Arad_7469   lyxX TRUE 0.959 44.000 0.375 1.000 Y NA
 5482194 5482195 Arad_7469 Arad_7470 lyxX   TRUE 0.976 24.000 0.833 1.000 N NA
 5482197 5482198 Arad_7473 Arad_7474     TRUE 0.995 0.000 0.275 0.002 Y NA
 5482198 5482199 Arad_7474 Arad_7476     TRUE 0.936 -3.000 0.028 NA   NA
 5482199 5482200 Arad_7476 Arad_7478     TRUE 0.975 -3.000 0.227 NA   NA
 5482200 5482201 Arad_7478 Arad_7479     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5482201 5482202 Arad_7479 Arad_7480     TRUE 0.909 38.000 0.464 NA   NA
 5482202 5482203 Arad_7480 Arad_7482   aatAc TRUE 0.839 52.000 0.348 1.000   NA
 5482205 5482206 Arad_7485 Arad_7487     TRUE 0.989 5.000 0.640 1.000   NA
 5482206 5482207 Arad_7487 Arad_7488     TRUE 0.999 -3.000 0.810 0.017 Y NA
 5482207 5482208 Arad_7488 Arad_7489     TRUE 0.999 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5482208 5482209 Arad_7489 Arad_7490     TRUE 0.986 30.000 0.632 1.000 Y NA
 5482209 5482210 Arad_7490 Arad_7492   menG TRUE 0.828 40.000 0.353 NA N NA
 5482212 5482213 Arad_7494 Arad_7496     TRUE 0.966 -7.000 0.145 1.000   NA
 5482213 5482214 Arad_7496 Arad_7497     TRUE 0.982 -3.000 0.290 1.000   NA
 5482214 5482215 Arad_7497 Arad_7499     TRUE 0.990 -3.000 0.514 1.000 N NA
 5482215 5482216 Arad_7499 Arad_7500     TRUE 0.999 -10.000 0.886 NA Y NA
 5482218 5482219 Arad_7503 Arad_7504     TRUE 0.990 55.000 1.000 NA Y NA
 5482219 5482220 Arad_7504 Arad_7506     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA Y NA
 5482220 5482221 Arad_7506 Arad_7507     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA N NA
 5482221 5482222 Arad_7507 Arad_7509     TRUE 0.996 8.000 0.500 0.002 Y NA
 5482222 5482223 Arad_7509 Arad_7511     TRUE 0.877 107.000 0.857 NA N NA
 5482223 5482224 Arad_7511 Arad_7512     TRUE 0.966 86.000 0.714 NA Y NA
 5482224 5482225 Arad_7512 Arad_7513     TRUE 0.779 32.000 0.172 1.000   NA
 5482225 5482226 Arad_7513 Arad_7515     TRUE 0.927 36.000 0.517 NA   NA
 5482226 5482227 Arad_7515 Arad_7516     TRUE 0.986 14.000 0.788 NA   NA
 5482227 5482228 Arad_7516 Arad_7517     TRUE 0.923 17.000 0.303 NA   NA
 5482228 5482229 Arad_7517 Arad_7518     TRUE 0.789 14.000 0.087 NA N NA
 5482229 5482230 Arad_7518 Arad_7520     FALSE 0.022 139.000 0.000 1.000 N NA
 5482230 5482231 Arad_7520 Arad_7521     FALSE 0.028 120.000 0.000 1.000 N NA
 5482231 5482232 Arad_7521 Arad_7522     TRUE 0.994 -3.000 0.091 0.002 Y NA
 5482232 5482233 Arad_7522 Arad_7523   potG TRUE 0.985 0.000 0.061 1.000 Y NA
 5482233 5482234 Arad_7523 Arad_7524 potG   TRUE 0.974 65.000 0.667 NA Y NA
 5482234 5482235 Arad_7524 Arad_7525     TRUE 0.957 68.000 0.500 NA Y NA
 5482235 5482236 Arad_7525 Arad_7526     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5482236 5482237 Arad_7526 Arad_7527     FALSE 0.001 321.000 0.000 NA N NA
 5482237 5482238 Arad_7527 Arad_7529     TRUE 0.900 57.000 0.200 NA Y NA
 5482238 5482239 Arad_7529 Arad_7530   mocBch2 TRUE 0.854 86.000 0.217 NA Y NA
 5482239 5482240 Arad_7530 Arad_7532 mocBch2 smoS TRUE 0.589 59.000 0.192 NA N NA
 5482240 5482241 Arad_7532 Arad_7533 smoS   TRUE 0.603 34.000 0.077 1.000 N NA
 5482241 5482242 Arad_7533 Arad_7535     TRUE 0.988 14.000 0.263 0.001 Y NA
 5482242 5482243 Arad_7535 Arad_7536     FALSE 0.428 158.000 0.263 0.001 N NA
 5482243 5482244 Arad_7536 Arad_7537     TRUE 0.974 60.000 1.000 0.001 N NA
 5482244 5482245 Arad_7537 Arad_7538     FALSE 0.208 79.000 0.000 1.000   NA
 5482246 5482247 Arad_7539 Arad_7540     TRUE 0.742 18.000 0.014 1.000   NA
 5482247 5482248 Arad_7540 Arad_7541     FALSE 0.015 237.000 0.000 1.000   NA
 5482249 5482250 Arad_7542 Arad_7543   gstch1 TRUE 0.874 30.000 0.364 1.000 N NA
 5482250 5482251 Arad_7543 Arad_7544 gstch1   TRUE 0.657 27.000 0.077 1.000 N NA
 5482251 5482252 Arad_7544 Arad_7545     TRUE 0.571 64.000 0.077 1.000   NA
 5482253 5482254 Arad_7546 Arad_7548     FALSE 0.103 168.000 0.069 NA N NA
 5482254 5482255 Arad_7548 Arad_7549     FALSE 0.000 354.000 0.000 NA N NA
 5482255 5482256 Arad_7549 Arad_7551     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5482256 5482257 Arad_7551 Arad_7552     TRUE 0.976 -28.000 0.250 NA   NA
 5482257 5482258 Arad_7552 Arad_7553     TRUE 0.753 127.000 0.500 0.003 N NA
 5482258 5482259 Arad_7553 Arad_7554     TRUE 0.986 12.000 0.800 NA N NA
 5482259 5482260 Arad_7554 Arad_7555     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 5482260 5482261 Arad_7555 Arad_7557     TRUE 0.793 97.000 0.500 NA   NA
 5482262 5482263 Arad_7556 Arad_7558     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5482263 5482264 Arad_7558 Arad_7559     FALSE 0.003 371.000 0.000 NA   NA
 5482264 5482265 Arad_7559 Arad_7560     FALSE 0.049 161.000 0.000 NA   NA
 5482266 5482267 Arad_7561 Arad_7562 rcdA rcdB TRUE 0.994 -18.000 0.714 NA N NA
 5482271 5482272 Arad_7568 Arad_7571   ackA FALSE 0.452 71.000 0.089 1.000 N NA
 5482275 5482276 Arad_7576 Arad_7578 fixKf fixL TRUE 0.755 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5482277 5482278 Arad_7579 Arad_7580     TRUE 0.865 23.000 0.230 NA   NA
 5482278 5482279 Arad_7580 Arad_7581     TRUE 0.999 6.000 0.953 0.054 Y NA
 5482279 5482280 Arad_7581 Arad_7582     TRUE 0.803 82.000 0.059 1.000 Y NA
 5482280 5482281 Arad_7582 Arad_7583   cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 5482281 5482282 Arad_7583 Arad_7584 cydD   TRUE 0.901 -3.000 0.025 1.000 N NA
 5482282 5482283 Arad_7584 Arad_7586     FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000   NA
 5482283 5482284 Arad_7586 Arad_7587     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 5482284 5482285 Arad_7587 Arad_7588     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5482285 5482286 Arad_7588 Arad_7589     FALSE 0.093 121.000 0.000 NA   NA
 5482286 5482287 Arad_7589 Arad_7590   actP FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5482287 5482288 Arad_7590 Arad_7591 actP   FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   NA
 5482291 5482292 Arad_7597 Arad_7598     TRUE 0.992 0.000 0.607 NA   NA
 5482292 5482293 Arad_7598 Arad_7600     FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 5482294 5482295 Arad_7601 Arad_7602 virB11d   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482296 5482297 Arad_7603 Arad_7604     FALSE 0.028 190.000 0.000 NA   NA
 5482298 5482299 Arad_7605 Arad_7607     FALSE 0.001 578.000 0.000 NA   NA
 5482299 5482300 Arad_7607 Arad_7608     TRUE 0.923 33.000 0.538 1.000 N NA
 5482300 5482301 Arad_7608 Arad_7609     TRUE 0.935 69.000 0.769 NA   NA
 5482301 5482302 Arad_7609 Arad_7610     TRUE 0.939 36.000 0.583 NA   NA
 5482303 5482304 Arad_7611 Arad_7612     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5482304 5482305 Arad_7612 Arad_7613     FALSE 0.000 566.000 0.000 1.000 N NA
 5482305 5482306 Arad_7613 Arad_7614   galE TRUE 0.996 0.000 0.333 0.010 Y NA
 5482306 5482307 Arad_7614 Arad_7615 galE   TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5482307 5482308 Arad_7615 Arad_7616   rkpK TRUE 0.946 34.000 0.238 1.000 Y NA
 5482308 5482309 Arad_7616 Arad_7617 rkpK   TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 5482309 5482310 Arad_7617 Arad_7618     TRUE 0.969 -3.000 0.190 NA   NA
 5482310 5482311 Arad_7618 Arad_7619     TRUE 0.871 34.000 0.333 NA   NA
 5482311 5482312 Arad_7619 Arad_7620     FALSE 0.001 966.000 0.000 NA   NA
 5482312 5482313 Arad_7620 Arad_7621     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482314 5482315 Arad_7622 Arad_7623 exoF2 exsH TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482315 5482316 Arad_7623 Arad_7624 exsH exoQ FALSE 0.000 1439.000 0.000 NA N NA
 5482316 5482317 Arad_7624 Arad_7625 exoQ   TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482317 5482318 Arad_7625 Arad_7626     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482318 5482319 Arad_7626 Arad_7627   exoY TRUE 0.732 3.000 0.000 NA   NA
 5482322 5482323 Arad_7631 Arad_7632 asnB   TRUE 0.899 15.000 0.211 NA   NA
 5482323 5482324 Arad_7632 Arad_7633   matB TRUE 0.925 22.000 0.367 NA   NA
 5482324 5482325 Arad_7633 Arad_7634 matB nadE TRUE 0.948 -3.000 0.133 1.000 N NA
 5482325 5482326 Arad_7634 Arad_7635 nadE   FALSE 0.185 22.000 0.000 1.000 N NA
 5482328 5482329 Arad_7637 Arad_7638     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5482329 5482330 Arad_7638 Arad_7639     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5482331 5482332 Arad_7640 Arad_7641     TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5482332 5482333 Arad_7641 Arad_7643     FALSE 0.249 15.000 0.000 1.000 N NA
 5482333 5482334 Arad_7643 Arad_7644   ssuD FALSE 0.198 148.000 0.125 1.000 N NA
 5482334 5482335 Arad_7644 Arad_7645 ssuD   FALSE 0.228 63.000 0.000 NA   NA
 5482336 5482337 Arad_7646 Arad_7647     TRUE 0.998 -3.000 0.520 NA Y NA
 5482337 5482338 Arad_7647 Arad_7648   tauB TRUE 0.908 114.000 0.520 NA Y NA
 5482338 5482339 Arad_7648 Arad_7649 tauB   FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482339 5482340 Arad_7649 Arad_7650   dctD TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482342 5482343 Arad_7652 Arad_7653   serA FALSE 0.113 16.000 0.000 NA N NA
 5482343 5482344 Arad_7653 Arad_7654 serA dapAch2 TRUE 0.973 5.000 0.000 0.091 Y NA
 5482347 5482348 Arad_7658 Arad_7659   ttuD FALSE 0.109 122.000 0.000 1.000   NA
 5482348 5482349 Arad_7659 Arad_7660 ttuD   TRUE 0.854 12.000 0.130 1.000 N NA
 5482349 5482350 Arad_7660 Arad_7661     TRUE 0.727 25.000 0.130 1.000 N NA
 5482351 5482352 Arad_7662 Arad_7664   rpoI FALSE 0.109 239.000 0.000 NA Y NA
 5482352 5482353 Arad_7664 Arad_7665 rpoI   TRUE 0.923 95.000 1.000 NA N NA
 5482353 5482354 Arad_7665 Arad_7666   fhuA TRUE 0.594 101.000 0.000 NA Y NA
 5482354 5482355 Arad_7666 Arad_7667 fhuA   TRUE 0.588 102.000 0.333 NA N NA
 5482355 5482356 Arad_7667 Arad_7668     FALSE 0.090 21.000 0.000 NA N NA
 5482358 5482359 Arad_7670 Arad_7672   dppAch1 FALSE 0.024 197.000 0.000 NA   NA
 5482359 5482360 Arad_7672 Arad_7673 dppAch1   TRUE 0.982 61.000 0.792 NA Y NA
 5482360 5482361 Arad_7673 Arad_7674   dppCch1 TRUE 0.999 -3.000 0.864 NA Y NA
 5482361 5482362 Arad_7674 Arad_7675 dppCch1   TRUE 0.972 45.000 0.955 NA   NA
 5482362 5482363 Arad_7675 Arad_7676     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 5482363 5482364 Arad_7676 Arad_7678     TRUE 0.897 31.000 0.375 NA   NA
 5482364 5482365 Arad_7678 Arad_7679     TRUE 0.942 23.000 0.455 NA   NA
 5482365 5482366 Arad_7679 Arad_7680     FALSE 0.023 201.000 0.000 NA   NA
 5482367 5482368 Arad_7681 Arad_7683     TRUE 0.629 80.000 0.222 NA   NA
 5482368 5482369 Arad_7683 Arad_7684     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482370 5482371 Arad_7685 Arad_7686     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5482371 5482372 Arad_7686 Arad_7687     TRUE 0.995 2.000 0.444 NA Y NA
 5482372 5482373 Arad_7687 Arad_7689   appF TRUE 1.000 -22.000 1.000 0.006 Y NA
 5482373 5482374 Arad_7689 Arad_7690 appF mocA TRUE 0.809 14.000 0.094 1.000 N NA
 5482374 5482375 Arad_7690 Arad_7691 mocA   FALSE 0.418 70.000 0.062 1.000 N NA
 5482375 5482376 Arad_7691 Arad_7694     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5482377 5482378 Arad_7696 Arad_7697     FALSE 0.001 798.000 0.000 NA   NA
 5482380 5482381 Arad_7700 Arad_7701   ntaA TRUE 0.928 14.000 0.000 NA Y NA
 5482381 5482382 Arad_7701 Arad_7702 ntaA   FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5482382 5482383 Arad_7702 Arad_7703     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5482383 5482384 Arad_7703 Arad_7704     TRUE 0.882 11.000 0.083 NA   NA
 5482384 5482385 Arad_7704 Arad_7705     FALSE 0.153 12.000 0.000 NA N NA
 5482386 5482387 Arad_7706 Arad_7708     TRUE 0.986 22.000 0.500 1.000 Y NA
 5482389 5482390 Arad_7710 Arad_7711   tauC TRUE 0.995 -21.000 0.294 NA Y NA
 5482390 5482391 Arad_7711 Arad_7712 tauC   FALSE 0.011 129.000 0.000 NA N NA
 5482391 5482392 Arad_7712 Arad_7713     FALSE 0.340 113.000 0.087 NA   NA
 5482392 5482393 Arad_7713 Arad_7715     TRUE 0.655 42.000 0.087 NA   NA
 5482393 5482394 Arad_7715 Arad_7716     TRUE 0.719 71.000 0.000 NA Y NA
 5482394 5482395 Arad_7716 Arad_7717     TRUE 0.956 57.000 0.444 NA Y NA
 5482395 5482396 Arad_7717 Arad_7718   dppCch3 TRUE 0.994 11.000 0.571 NA Y NA
 5482396 5482397 Arad_7718 Arad_7719 dppCch3   TRUE 0.993 -3.000 0.571 NA   NA
 5482397 5482398 Arad_7719 Arad_7721     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5482398 5482399 Arad_7721 Arad_7723     TRUE 0.800 46.000 0.000 NA Y NA
 5482400 5482401 Arad_7724 Arad_7725     TRUE 0.983 16.000 0.750 NA   NA
 5482401 5482402 Arad_7725 Arad_7726     TRUE 0.998 -28.000 0.600 NA Y NA
 5482402 5482403 Arad_7726 Arad_7727     TRUE 0.829 22.000 0.167 NA   NA
 5482405 5482406 Arad_7730 Arad_7732   thuG FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5482406 5482407 Arad_7732 Arad_7734 thuG thuF TRUE 0.997 6.000 0.723 NA Y NA
 5482407 5482408 Arad_7734 Arad_7735 thuF   TRUE 0.987 -3.000 0.019 NA Y NA
 5482408 5482409 Arad_7735 Arad_7736   thuE TRUE 0.901 115.000 0.500 NA Y NA
 5482411 5482412 Arad_7739 Arad_7740 lysM   FALSE 0.262 181.000 0.000 1.000 Y NA
 5482412 5482413 Arad_7740 Arad_7741     TRUE 0.561 81.000 0.154 1.000   NA
 5482413 5482414 Arad_7741 Arad_7742     TRUE 0.988 8.000 0.667 NA   NA
 5482414 5482415 Arad_7742 Arad_7743     TRUE 0.961 10.000 0.333 NA   NA
 5482415 5482416 Arad_7743 Arad_7744     TRUE 0.883 130.000 0.500 NA Y NA
 5482417 5482418 Arad_7745 Arad_7746   dapAf2 FALSE 0.040 99.000 0.000 1.000 N NA
 5482418 5482419 Arad_7746 Arad_7748 dapAf2 dppAf TRUE 0.866 79.000 0.211 NA Y NA
 5482419 5482420 Arad_7748 Arad_7749 dppAf dppBf TRUE 0.983 7.000 0.200 NA Y NA
 5482420 5482421 Arad_7749 Arad_7750 dppBf dppCf TRUE 0.984 6.000 0.200 NA Y NA
 5482421 5482422 Arad_7750 Arad_7751 dppCf dppDf TRUE 0.993 -3.000 0.231 NA Y NA
 5482422 5482423 Arad_7751 Arad_7752 dppDf dppFf TRUE 0.999 -3.000 0.733 0.054 Y NA
 5482424 5482425 Arad_7753 Arad_7754   ugpQ TRUE 0.960 0.000 0.250 1.000 N NA
 5482427 5482428 Arad_7756 Arad_7757   casA FALSE 0.041 334.000 0.000 1.000 Y NA
 5482428 5482429 Arad_7757 Arad_7759 casA   FALSE 0.001 375.000 0.000 1.000 N NA
 5482431 5482432 Arad_7761 Arad_7762     FALSE 0.317 38.000 0.000 NA   NA
 5482432 5482433 Arad_7762 Arad_7763     FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 5482433 5482434 Arad_7763 Arad_7765     TRUE 0.916 56.000 0.600 NA   NA
 5482434 5482435 Arad_7765 Arad_7766   mcpZch2 FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482435 5482436 Arad_7766 Arad_7768 mcpZch2   FALSE 0.164 85.000 0.000 NA   NA
 5482436 5482437 Arad_7768 Arad_7769     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 5482437 5482438 Arad_7769 Arad_7770     TRUE 0.999 -10.000 0.778 NA Y NA
 5482438 5482439 Arad_7770 Arad_7771   rbsBch3 TRUE 0.956 57.000 0.444 NA Y NA
 5482439 5482440 Arad_7771 Arad_7773 rbsBch3   FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5482441 5482442 Arad_7774 Arad_7775     FALSE 0.154 130.000 0.027 1.000 N NA
 5482442 5482443 Arad_7775 Arad_7777   aroEc FALSE 0.006 204.000 0.000 1.000 N NA
 5482443 5482444 Arad_7777 Arad_7778 aroEc   FALSE 0.086 140.000 0.000 1.000   NA
 5482446 5482447 Arad_7780 Arad_7781     TRUE 0.715 4.000 0.000 NA   NA
 5482447 5482448 Arad_7781 Arad_7783     FALSE 0.002 439.000 0.000 1.000   NA
 5482451 5482452 Arad_7788 Arad_7790     FALSE 0.002 442.000 0.000 NA   NA
 5482452 5482453 Arad_7790 Arad_7791   mcpGd FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 5482453 5482454 Arad_7791 Arad_7792 mcpGd   FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5482456 5482457 Arad_7796 Arad_7797   intA FALSE 0.054 165.000 0.000 1.000   NA
 5482457 5482458 Arad_7797 Arad_7798 intA   TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482458 5482459 Arad_7798 Arad_7801     FALSE 0.001 753.000 0.000 NA   NA
 5482459 5482460 Arad_7801 Arad_7802     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 5482460 5482461 Arad_7802 Arad_7803     TRUE 0.982 1.000 0.400 NA   NA
 5482461 5482462 Arad_7803 Arad_7804     FALSE 0.001 770.000 0.000 NA   NA
 5482462 5482463 Arad_7804 Arad_7805     FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 5482463 5482464 Arad_7805 Arad_7806     TRUE 0.986 5.000 0.571 NA   NA
 5482464 5482465 Arad_7806 Arad_7807     FALSE 0.100 116.000 0.000 NA   NA
 5482465 5482466 Arad_7807 Arad_7808     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5482466 5482467 Arad_7808 Arad_7809     TRUE 0.981 2.000 0.400 NA   NA
 5482467 5482468 Arad_7809 Arad_7810     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482469 5482470 Arad_7811 Arad_7812     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5482470 5482471 Arad_7812 Arad_7814     FALSE 0.527 119.000 0.286 NA   NA
 5482472 5482473 Arad_7816 Arad_7817     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5482473 5482474 Arad_7817 Arad_7818     TRUE 0.891 11.000 0.105 NA   NA
 5482474 5482475 Arad_7818 Arad_7819     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5482475 5482476 Arad_7819 Arad_7820     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482476 5482477 Arad_7820 Arad_7821     TRUE 0.936 -3.000 0.029 NA   NA
 5482477 5482478 Arad_7821 Arad_7822     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5482478 5482479 Arad_7822 Arad_7823     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482479 5482480 Arad_7823 Arad_7824     TRUE 0.994 -3.000 0.609 NA   NA
 5482480 5482481 Arad_7824 Arad_7826     TRUE 0.604 68.000 0.130 1.000   NA
 5482481 5482482 Arad_7826 Arad_7827     FALSE 0.111 191.000 0.087 NA   NA
 5482484 5482485 Arad_7831 Arad_7833 cpxP2   FALSE 0.350 9.000 0.000 1.000 N NA
 5482485 5482486 Arad_7833 Arad_7834     TRUE 0.619 53.000 0.105 NA   NA
 5482486 5482487 Arad_7834 Arad_7836     FALSE 0.001 849.000 0.000 NA   NA
 5482487 5482488 Arad_7836 Arad_7837     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 5482488 5482489 Arad_7837 Arad_7838     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5482489 5482490 Arad_7838 Arad_7839     FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 5482490 5482491 Arad_7839 Arad_7840     TRUE 0.998 6.000 0.667 0.045 Y NA
 5482491 5482492 Arad_7840 Arad_7842     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5482492 5482493 Arad_7842 Arad_7843     FALSE 0.208 70.000 0.000 NA   NA
 5482493 5482494 Arad_7843 Arad_7845     FALSE 0.089 126.000 0.000 NA   NA
 5482495 5482496 Arad_7846 Arad_7847     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 5482496 5482497 Arad_7847 Arad_7848     TRUE 0.934 6.000 0.190 NA   NA
 5482497 5482498 Arad_7848 Arad_7849     TRUE 0.979 -25.000 0.286 NA   NA
 5482500 5482501 Arad_7852 Arad_7853   dnaEf FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5482503 5482504 Arad_7854 Arad_7855 phnC   TRUE 0.964 96.000 0.589 0.002 Y NA
 5482504 5482505 Arad_7855 Arad_7856   phnE TRUE 0.978 69.000 0.568 0.001 Y NA
 5482505 5482506 Arad_7856 Arad_7857 phnE phnE TRUE 0.996 9.000 0.491 0.001 Y NA
 5482506 5482507 Arad_7857 Arad_7858 phnE   FALSE 0.007 282.000 0.000 NA   NA
 5482508 5482509 Arad_7859 Arad_7861     FALSE 0.252 54.000 0.000 NA   NA
 5482509 5482510 Arad_7861 Arad_7863     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5482510 5482511 Arad_7863 Arad_7864     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482511 5482512 Arad_7864 Arad_7865     FALSE 0.276 58.000 0.000 1.000   NA
 5482512 5482513 Arad_7865 Arad_7867   phnW TRUE 0.804 0.000 0.000 1.000   NA
 5482513 5482514 Arad_7867 Arad_7868 phnW   TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5482514 5482515 Arad_7868 Arad_7870     FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000   NA
 5482515 5482516 Arad_7870 Arad_7871     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482516 5482517 Arad_7871 Arad_7872     FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 5482518 5482519 Arad_7874 Arad_7875     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482519 5482520 Arad_7875 Arad_7877     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5482520 5482521 Arad_7877 Arad_7878     TRUE 0.749 2.000 0.000 NA   NA
 5482521 5482522 Arad_7878 Arad_7879     FALSE 0.426 24.000 0.000 NA   NA
 5482522 5482523 Arad_7879 Arad_7880     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482523 5482524 Arad_7880 Arad_7881     FALSE 0.019 214.000 0.000 NA   NA
 5482525 5482526 Arad_7882 Arad_7883     FALSE 0.118 105.000 0.000 NA   NA
 5482526 5482527 Arad_7883 Arad_7884     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 5482527 5482528 Arad_7884 Arad_7886     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 5482528 5482529 Arad_7886 Arad_7887     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482529 5482530 Arad_7887 Arad_7888     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 5482530 5482531 Arad_7888 Arad_7889     FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 5482532 5482533 Arad_7890 Arad_7891     FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 5482533 5482534 Arad_7891 Arad_7893     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482534 5482535 Arad_7893 Arad_7894     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5482535 5482536 Arad_7894 Arad_7895     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482536 5482537 Arad_7895 Arad_7896     FALSE 0.129 245.000 0.333 NA   NA
 5482537 5482538 Arad_7896 Arad_7897     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5482538 5482539 Arad_7897 Arad_7898     FALSE 0.003 420.000 0.000 1.000   NA
 5482540 5482541 Arad_7899 Arad_7900     TRUE 0.950 37.000 0.667 NA   NA
 5482541 5482542 Arad_7900 Arad_7902     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 5482542 5482543 Arad_7902 Arad_7904   rzcA FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 5482546 5482547 Arad_7907 Arad_7908     TRUE 0.774 95.000 0.080 1.000 Y NA
 5482547 5482548 Arad_7908 Arad_7909   cydB TRUE 0.993 6.000 0.324 0.052 Y NA
 5482548 5482549 Arad_7909 Arad_7910 cydB   FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5482549 5482550 Arad_7910 Arad_7913     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 5482550 5482551 Arad_7913 Arad_7914   grpE TRUE 0.759 1.000 0.000 NA   NA
 5482552 5482553 Arad_7915 Arad_7917   moeA FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5482554 5482555 Arad_7918 Arad_7920 dnaK dnaJ FALSE 0.373 182.000 0.000 0.002 Y NA
 5482555 5482556 Arad_7920 Arad_7921 dnaJ   TRUE 0.970 0.000 0.250 1.000   NA
 5482558 5482559 Arad_7923 Arad_7924     TRUE 0.996 -7.000 0.312 1.000 Y NA
 5482559 5482560 Arad_7924 Arad_7925   clpB FALSE 0.011 174.000 0.000 1.000 N NA
 5482560 5482561 Arad_7925 Arad_7926 clpB   FALSE 0.199 118.000 0.003 NA   NA
 5482561 5482562 Arad_7926 Arad_7927     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5482562 5482563 Arad_7927 Arad_7929     FALSE 0.437 65.000 0.017 NA   NA
 5482563 5482564 Arad_7929 Arad_7930     TRUE 0.980 -7.000 0.267 NA   NA
 5482564 5482565 Arad_7930 Arad_7932   leuA1 FALSE 0.001 853.000 0.000 NA   NA
 5482565 5482566 Arad_7932 Arad_7933 leuA1 ilvG FALSE 0.502 128.000 0.000 1.000 Y NA
 5482566 5482567 Arad_7933 Arad_7934 ilvG   FALSE 0.471 62.000 0.026 NA   NA
 5482567 5482568 Arad_7934 Arad_7936     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 5482570 5482571 Arad_7939 Arad_7940     TRUE 0.949 84.000 0.542 NA Y NA
 5482571 5482572 Arad_7940 Arad_7941     TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA Y NA
 5482572 5482573 Arad_7941 Arad_7942     TRUE 0.971 3.000 0.312 NA   NA
 5482573 5482574 Arad_7942 Arad_7943     TRUE 0.750 37.000 0.182 NA   NA
 5482576 5482577 Arad_7947 Arad_7948 selA   TRUE 0.692 37.000 0.083 1.000   NA
 5482578 5482579 Arad_7949 Arad_7951     TRUE 0.991 19.000 0.500 0.017 Y NA
 5482579 5482580 Arad_7951 Arad_7952     TRUE 0.907 51.000 0.182 1.000 Y NA
 5482580 5482581 Arad_7952 Arad_7953     TRUE 0.982 8.000 0.182 1.000 Y NA
 5482581 5482582 Arad_7953 Arad_7954     TRUE 0.941 -7.000 0.118 NA N NA
 5482582 5482583 Arad_7954 Arad_7955     TRUE 0.988 -3.000 0.471 NA N NA
 5482584 5482585 Arad_7957 Arad_7958     TRUE 0.993 -3.000 0.588 NA   NA
 5482586 5482587 Arad_7959 Arad_7960 speB   TRUE 0.905 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5482587 5482588 Arad_7960 Arad_7962     TRUE 0.969 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5482588 5482589 Arad_7962 Arad_7963     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 5482589 5482590 Arad_7963 Arad_7964     TRUE 0.995 21.000 0.833 1.000 Y NA
 5482593 5482594 Arad_7968 Arad_7969     TRUE 0.989 -3.000 0.071 NA Y NA
 5482594 5482595 Arad_7969 Arad_7971   matR TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5482595 5482596 Arad_7971 Arad_7972 matR serA TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5482596 5482597 Arad_7972 Arad_7973 serA   TRUE 0.991 -3.000 0.114 1.000 Y NA
 5482597 5482598 Arad_7973 Arad_7974     TRUE 0.939 -3.000 0.091 1.000 N NA
 5482598 5482599 Arad_7974 Arad_7975     TRUE 0.757 25.000 0.167 1.000 N NA
 5482601 5482602 Arad_7977 Arad_7978   occPch TRUE 0.975 0.000 0.300 NA   NA
 5482602 5482603 Arad_7978 Arad_7979 occPch   TRUE 0.995 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5482603 5482604 Arad_7979 Arad_7980     TRUE 0.936 93.000 0.500 1.000 Y NA
 5482604 5482605 Arad_7980 Arad_7982     FALSE 0.001 411.000 0.000 1.000 N NA
 5482605 5482606 Arad_7982 Arad_7984     FALSE 0.405 75.000 0.022 NA   NA
 5482606 5482607 Arad_7984 Arad_7985     TRUE 0.751 48.000 0.222 NA   NA
 5482609 5482610 Arad_7990 Arad_7993     FALSE 0.001 659.000 0.000 NA   NA
 5482610 5482611 Arad_7993 Arad_7994     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5482611 5482612 Arad_7994 Arad_7995     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5482612 5482613 Arad_7995 Arad_7996     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 5482613 5482614 Arad_7996 Arad_7997     FALSE 0.140 95.000 0.000 NA   NA
 5482614 5482615 Arad_7997 Arad_7998   rosR FALSE 0.243 57.000 0.000 NA   NA
 5482615 5482616 Arad_7998 Arad_7999 rosR   FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 5482616 5482617 Arad_7999 Arad_8000     FALSE 0.188 76.000 0.000 NA   NA
 5482617 5482618 Arad_8000 Arad_8001     FALSE 0.240 58.000 0.000 NA   NA
 5482618 5482619 Arad_8001 Arad_8002     FALSE 0.286 46.000 0.000 NA   NA
 5482619 5482620 Arad_8002 Arad_8003     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 5482621 5482622 Arad_8005 Arad_8006 rinQ   FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 5482626 5482627 Arad_8012 Arad_8013     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5482627 5482628 Arad_8013 Arad_8014   dppCf TRUE 0.995 -21.000 0.667 NA   NA
 5482628 5482629 Arad_8014 Arad_8015 dppCf   TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482629 5482630 Arad_8015 Arad_8016     TRUE 0.989 35.000 0.800 NA Y NA
 5482630 5482631 Arad_8016 Arad_8018     FALSE 0.002 216.000 0.000 NA N NA
 5482631 5482632 Arad_8018 Arad_8019     FALSE 0.023 201.000 0.000 NA   NA
 5482632 5482633 Arad_8019 Arad_8020     FALSE 0.383 28.000 0.000 NA   NA
 5482633 5482634 Arad_8020 Arad_8022     TRUE 0.851 -10.000 0.000 1.000   NA
 5482634 5482635 Arad_8022 Arad_8023   rbsAch3 TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482635 5482636 Arad_8023 Arad_8024 rbsAch3   TRUE 0.667 8.000 0.000 NA   NA
 5482636 5482637 Arad_8024 Arad_8026     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 5482638 5482639 Arad_8027 Arad_8028     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 5482640 5482641 Arad_8030 Arad_8031   appD TRUE 0.998 -3.000 0.388 0.006 Y NA
 5482641 5482642 Arad_8031 Arad_8032 appD   TRUE 0.941 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5482642 5482643 Arad_8032 Arad_8033   codAch2 TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.006 Y NA
 5482643 5482644 Arad_8033 Arad_8034 codAch2 dppCch1 TRUE 0.858 10.000 0.115 NA N NA
 5482644 5482645 Arad_8034 Arad_8035 dppCch1   TRUE 0.956 17.000 0.097 NA Y NA
 5482645 5482646 Arad_8035 Arad_8036     TRUE 0.650 88.000 0.000 NA Y NA
 5482647 5482648 Arad_10055 Arad_8037     FALSE 0.529 67.000 0.054 1.000   NA
 5482649 5482650 Arad_8040 Arad_8042 rpsU   FALSE 0.009 275.000 0.000 1.000   NA
 5482650 5482651 Arad_8042 Arad_8043     FALSE 0.105 112.000 0.000 NA   NA
 5482651 5482652 Arad_8043 Arad_8044     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5482652 5482653 Arad_8044 Arad_8046   fhuA FALSE 0.103 244.000 0.000 NA Y NA
 5482653 5482654 Arad_8046 Arad_8048 fhuA   FALSE 0.219 164.000 0.214 1.000 N NA
 5482656 5482657 Arad_8050 Arad_8052     FALSE 0.001 327.000 0.000 1.000 N NA
 5482657 5482658 Arad_8052 Arad_8053     TRUE 0.978 -22.000 0.000 NA Y NA
 5482658 5482659 Arad_8053 Arad_8054     TRUE 0.790 98.000 0.160 NA Y NA
 5482659 5482660 Arad_8054 Arad_8056     TRUE 0.832 78.000 0.120 NA Y NA
 5482660 5482661 Arad_8056 Arad_8058     FALSE 0.062 894.000 0.444 NA Y NA
 5482662 5482663 Arad_8059 Arad_8060     FALSE 0.004 234.000 0.000 1.000 N NA
 5482664 5482665 Arad_8063 Arad_8064     FALSE 0.222 161.000 0.148 NA   NA
 5482666 5482667 Arad_8066 Arad_8067     TRUE 0.945 60.000 0.791 NA   NA
 5482667 5482668 Arad_8067 Arad_8069     TRUE 0.994 -28.000 0.660 1.000   NA
 5482668 5482669 Arad_8069 Arad_8071     TRUE 0.996 -3.000 0.623 0.089   NA
 5482669 5482670 Arad_8071 Arad_8072     TRUE 0.997 0.000 0.944 1.000   NA
 5482670 5482671 Arad_8072 Arad_8074     TRUE 0.965 -3.000 0.139 1.000   NA
 5482671 5482672 Arad_8074 Arad_8075     TRUE 0.939 2.000 0.128 NA   NA
 5482672 5482673 Arad_8075 Arad_8076     TRUE 0.976 12.000 0.520 NA   NA
 5482673 5482674 Arad_8076 Arad_8077     TRUE 0.976 -3.000 0.240 NA   NA
 5482674 5482675 Arad_8077 Arad_8079     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 5482675 5482676 Arad_8079 Arad_8080     TRUE 0.999 -3.000 0.706 NA Y NA
 5482676 5482677 Arad_8080 Arad_8081     TRUE 0.971 32.000 0.412 NA Y NA
 5482678 5482679 Arad_8082 Arad_8083     FALSE 0.007 193.000 0.000 1.000 N NA
 5482683 5482684 Arad_8090 Arad_8091     FALSE 0.201 72.000 0.000 NA   NA
 5482684 5482685 Arad_8091 Arad_8092     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 5482686 5482687 Arad_8093 Arad_8094     TRUE 0.987 22.000 0.556 NA Y NA
 5482687 5482688 Arad_8094 Arad_8096   braE TRUE 0.917 42.000 0.179 NA Y NA
 5482688 5482689 Arad_8096 Arad_8097 braE braF TRUE 0.992 -3.000 0.179 NA Y NA
 5482689 5482690 Arad_8097 Arad_8098 braF braG TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.052 Y NA
 5482690 5482691 Arad_8098 Arad_8100 braG aatAch TRUE 0.938 43.000 0.250 1.000 Y NA
 5482691 5482692 Arad_8100 Arad_8101 aatAch   FALSE 0.511 80.000 0.200 NA N NA
 5482692 5482693 Arad_8101 Arad_8102     FALSE 0.522 154.000 0.500 NA N NA
 5482693 5482694 Arad_8102 Arad_8103     TRUE 0.998 11.000 0.778 0.002 Y NA
 5482694 5482695 Arad_8103 Arad_8104     TRUE 0.902 10.000 0.096 1.000   NA
 5482695 5482696 Arad_8104 Arad_8106     TRUE 0.877 11.000 0.058 1.000   NA
 5482696 5482697 Arad_8106 Arad_8107     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5482697 5482698 Arad_8107 Arad_8109     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 5482698 5482699 Arad_8109 Arad_8110     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482700 5482701 Arad_8111 Arad_8112   nolRch FALSE 0.392 27.000 0.000 NA   NA
 5482702 5482703 Arad_8114 Arad_8115   ssuD TRUE 0.994 -3.000 0.667 1.000 N NA
 5482703 5482704 Arad_8115 Arad_8116 ssuD   FALSE 0.358 -7.000 0.000 NA N NA
 5482704 5482705 Arad_8116 Arad_8117     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482705 5482706 Arad_8117 Arad_8118     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482706 5482707 Arad_8118 Arad_8119     FALSE 0.250 55.000 0.000 NA   NA
 5482707 5482708 Arad_8119 Arad_8120     FALSE 0.002 418.000 0.000 NA   NA
 5482710 5482711 Arad_8124 Arad_8125     TRUE 0.902 6.000 0.158 1.000 N NA
 5482711 5482712 Arad_8125 Arad_8126     TRUE 0.920 2.000 0.048 1.000   NA
 5482712 5482713 Arad_8126 Arad_8127     FALSE 0.395 90.000 0.040 1.000   NA
 5482713 5482714 Arad_8127 Arad_8128     TRUE 0.896 109.000 0.450 NA Y NA
 5482714 5482715 Arad_8128 Arad_8130     TRUE 0.863 133.000 0.458 NA Y NA
 5482715 5482716 Arad_8130 Arad_8133     TRUE 0.996 16.000 0.917 NA Y NA
 5482716 5482717 Arad_8133 Arad_8134   mcpGc FALSE 0.000 572.000 0.000 NA N NA
 5482718 5482719 Arad_8136 Arad_8137     TRUE 0.745 63.000 0.333 NA N NA
 5482719 5482720 Arad_8137 Arad_8138     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 5482721 5482722 Arad_8140 Arad_8142   dapAf3 TRUE 0.936 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5482722 5482723 Arad_8142 Arad_8144 dapAf3 dhaL TRUE 0.996 -7.000 0.690 0.089 N NA
 5482723 5482724 Arad_8144 Arad_8145 dhaL   TRUE 0.987 -3.000 0.345 0.055 N NA
 5482724 5482725 Arad_8145 Arad_8146     TRUE 0.977 54.000 0.636 1.000 Y NA
 5482725 5482726 Arad_8146 Arad_8147     TRUE 0.963 95.000 0.727 1.000 Y NA
 5482726 5482727 Arad_8147 Arad_8148     TRUE 0.973 29.000 0.400 NA Y NA
 5482727 5482728 Arad_8148 Arad_8150     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5482728 5482729 Arad_8150 Arad_8151     TRUE 0.952 19.000 0.100 NA Y NA
 5482729 5482730 Arad_8151 Arad_8152     FALSE 0.270 103.000 0.071 NA N NA
 5482731 5482732 Arad_8153 Arad_8154     FALSE 0.231 132.000 0.100 1.000 N NA
 5482735 5482736 Arad_8157 Arad_8158   braF TRUE 0.982 0.000 0.455 NA N NA
 5482736 5482737 Arad_8158 Arad_8159 braF braD TRUE 0.998 10.000 0.917 NA Y NA
 5482737 5482738 Arad_8159 Arad_8160 braD   TRUE 0.998 4.000 0.846 NA Y NA
 5482738 5482739 Arad_8160 Arad_8161     TRUE 0.872 96.000 0.308 NA Y NA
 5482739 5482740 Arad_8161 Arad_8162   braG TRUE 0.956 16.000 0.071 NA Y NA
 5482740 5482741 Arad_8162 Arad_8164 braG   FALSE 0.487 0.000 0.000 1.000 N NA
 5482745 5482746 Arad_8169 Arad_8170     FALSE 0.522 117.000 0.000 NA Y NA
 5482746 5482747 Arad_8170 Arad_8171     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 5482747 5482748 Arad_8171 Arad_8173     TRUE 0.646 104.000 0.333 NA   NA
 5482748 5482749 Arad_8173 Arad_8174     FALSE 0.077 137.000 0.000 NA   NA
 5482749 5482750 Arad_8174 Arad_8176     TRUE 0.924 75.000 0.750 NA   NA
 5482751 5482752 Arad_8177 Arad_8178   tpiA FALSE 0.343 54.000 0.000 0.088 N NA
 5482752 5482753 Arad_8178 Arad_8179 tpiA   TRUE 0.880 -3.000 0.000 0.088 N NA
 5482753 5482754 Arad_8179 Arad_8180   rbsAch3 TRUE 0.977 6.000 0.500 1.000 N NA
 5482754 5482755 Arad_8180 Arad_8181 rbsAch3 rbsBch3 TRUE 0.988 23.000 0.600 NA Y NA
 5482755 5482756 Arad_8181 Arad_8182 rbsBch3 rbsCch4 TRUE 0.795 118.000 0.261 NA Y NA
 5482757 5482758 Arad_8183 Arad_8184 tktB tktA TRUE 0.999 0.000 0.860 0.001 Y NA
 5482758 5482759 Arad_8184 Arad_8185 tktA glpK TRUE 0.882 66.000 0.596 1.000 N NA
 5482759 5482760 Arad_8185 Arad_8186 glpK   TRUE 0.811 22.000 0.200 1.000 N NA
 5482760 5482761 Arad_8186 Arad_8187     FALSE 0.006 205.000 0.000 1.000 N NA
 5482761 5482762 Arad_8187 Arad_8188   thuBf TRUE 0.922 23.000 0.353 1.000   NA
 5482762 5482763 Arad_8188 Arad_8189 thuBf   TRUE 0.935 -3.000 0.027 NA   NA
 5482763 5482764 Arad_8189 Arad_8190   iolC TRUE 0.948 -21.000 0.068 NA   NA
 5482764 5482765 Arad_8190 Arad_8191 iolC smoS FALSE 0.492 38.000 0.044 NA N NA
 5482765 5482766 Arad_8191 Arad_8193 smoS   TRUE 0.585 58.000 0.044 0.055 N NA
 5482767 5482768 Arad_8194 Arad_8195     FALSE 0.186 203.000 0.000 NA Y NA
 5482769 5482770 Arad_8196 Arad_8197     TRUE 0.994 11.000 0.571 NA Y NA
 5482770 5482771 Arad_8197 Arad_8198     TRUE 0.999 -3.000 0.714 NA Y NA
 5482771 5482772 Arad_8198 Arad_8200     TRUE 0.988 4.000 0.667 1.000 N NA
 5482772 5482773 Arad_8200 Arad_8201   aroQ FALSE 0.054 82.000 0.000 1.000 N NA
 5482775 5482776 Arad_8203 Arad_8204 mocBf mcpB TRUE 0.982 17.000 0.833 NA N NA
 5482776 5482777 Arad_8204 Arad_8205 mcpB   FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 5482781 5482782 Arad_8211 Arad_8212 hppD hmgA FALSE 0.477 60.000 0.077 1.000 N NA
 5482782 5482783 Arad_8212 Arad_8213 hmgA   TRUE 0.902 38.000 0.060 1.000 Y NA
 5482783 5482784 Arad_8213 Arad_8214   maiA TRUE 0.978 -3.000 0.310 1.000 N NA
 5482785 5482786 Arad_8215 Arad_8216 vbsP   FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5482786 5482787 Arad_8216 Arad_8218     FALSE 0.046 164.000 0.000 NA   NA
 5482789 5482790 Arad_8221 Arad_8222 phbB fhuB FALSE 0.029 71.000 0.000 NA N NA
 5482790 5482791 Arad_8222 Arad_8223 fhuB fhuD TRUE 0.993 0.000 0.304 NA Y NA
 5482791 5482792 Arad_8223 Arad_8225 fhuD fhuC TRUE 0.989 -10.000 0.047 1.000 Y NA
 5482792 5482793 Arad_8225 Arad_8227 fhuC vbsC TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5482793 5482794 Arad_8227 Arad_8228 vbsC   TRUE 0.944 3.000 0.158 1.000   NA
 5482794 5482795 Arad_8228 Arad_8229   vbsO FALSE 0.000 445.000 0.000 NA N NA
 5482795 5482796 Arad_8229 Arad_8230 vbsO vbsS TRUE 0.935 34.000 0.200 NA Y NA
 5482797 5482798 Arad_8231 Arad_8232 vbsA vbsD TRUE 0.922 18.000 0.364 1.000 N NA
 5482798 5482799 Arad_8232 Arad_8233 vbsD vbsL TRUE 0.992 -3.000 0.583 1.000 N NA
 5482799 5482800 Arad_8233 Arad_8234 vbsL lysA TRUE 0.613 118.000 0.002 1.000 Y NA
 5482800 5482801 Arad_8234 Arad_8235 lysA   FALSE 0.092 122.000 0.000 NA   NA
 5482802 5482803 Arad_8237 Arad_8238     FALSE 0.002 279.000 0.000 1.000 N NA
 5482803 5482804 Arad_8238 Arad_8240     FALSE 0.121 35.000 0.000 1.000 N NA
 5482804 5482805 Arad_8240 Arad_8241     TRUE 0.975 -10.000 0.286 1.000 N NA
 5482805 5482806 Arad_8241 Arad_8244   potD FALSE 0.462 71.000 0.100 1.000 N NA
 5482806 5482807 Arad_8244 Arad_8245 potD potI TRUE 0.900 42.000 0.100 NA Y NA
 5482807 5482808 Arad_8245 Arad_8246 potI potH TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5482808 5482809 Arad_8246 Arad_8248 potH   FALSE 0.001 283.000 0.000 NA N NA
 5482809 5482810 Arad_8248 Arad_8249   nrdF FALSE 0.020 142.000 0.000 1.000 N NA
 5482810 5482811 Arad_8249 Arad_8250 nrdF   TRUE 0.971 17.000 0.048 0.000 Y NA
 5482811 5482812 Arad_8250 Arad_8252   nrdI TRUE 0.988 -18.000 0.054 NA Y NA
 5482812 5482813 Arad_8252 Arad_8253 nrdI nrdH TRUE 0.981 0.000 0.440 NA N NA
 5482815 5482816 Arad_8257 Arad_8258 nodW   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482816 5482817 Arad_8258 Arad_8259     FALSE 0.026 126.000 0.000 1.000 N NA
 5482817 5482818 Arad_8259 Arad_8260     TRUE 0.990 24.000 0.667 NA Y NA
 5482818 5482819 Arad_8260 Arad_8261     FALSE 0.000 651.000 0.000 NA N NA
 5482819 5482820 Arad_8261 Arad_8263     TRUE 0.985 7.000 0.083 0.023 Y NA
 5482820 5482821 Arad_8263 Arad_8264     TRUE 0.818 24.000 0.154 1.000   NA
 5482821 5482822 Arad_8264 Arad_8265   dppCch1 TRUE 0.926 2.000 0.077 NA   NA
 5482822 5482823 Arad_8265 Arad_8266 dppCch1   TRUE 0.998 -7.000 0.667 NA Y NA
 5482823 5482824 Arad_8266 Arad_8268     FALSE 0.073 271.000 0.000 NA Y NA
 5482824 5482825 Arad_8268 Arad_8269   argE TRUE 0.971 13.000 0.148 NA Y NA
 5482827 5482828 Arad_8271 Arad_8272   braF TRUE 0.999 0.000 0.750 0.052 Y NA
 5482828 5482829 Arad_8272 Arad_8273 braF   TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA Y NA
 5482829 5482830 Arad_8273 Arad_8274   braC1 TRUE 0.902 122.000 0.536 NA Y NA
 5482832 5482833 Arad_8277 Arad_8279 gcdH   FALSE 0.103 44.000 0.000 1.000 N NA
 5482833 5482834 Arad_8279 Arad_8280     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.002 Y NA
 5482834 5482835 Arad_8280 Arad_8281     FALSE 0.258 52.000 0.000 NA   NA
 5482835 5482836 Arad_8281 Arad_8282     TRUE 0.939 51.000 0.680 NA   NA
 5482836 5482837 Arad_8282 Arad_8283     TRUE 0.967 -7.000 0.171 NA   NA
 5482837 5482838 Arad_8283 Arad_8284     TRUE 0.871 20.000 0.214 NA   NA
 5482839 5482840 Arad_8286 Arad_8288   fpr FALSE 0.254 143.000 0.176 1.000 N NA
 5482841 5482842 Arad_8291 Arad_8292   xdhA TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.009 Y NA
 5482842 5482843 Arad_8292 Arad_8294 xdhA   FALSE 0.001 304.000 0.000 1.000 N NA
 5482844 5482845 Arad_8295 Arad_8296 braC1   TRUE 0.927 69.000 0.333 NA Y NA
 5482845 5482846 Arad_8296 Arad_8298     TRUE 0.982 86.000 1.000 NA Y NA
 5482846 5482847 Arad_8298 Arad_8299     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 5482847 5482848 Arad_8299 Arad_8300     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5482848 5482849 Arad_8300 Arad_8301     TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.052 Y NA
 5482849 5482850 Arad_8301 Arad_8302     TRUE 0.608 78.000 0.250 1.000 N NA
 5482850 5482851 Arad_8302 Arad_8303     TRUE 0.712 51.000 0.188 1.000   NA
 5482851 5482852 Arad_8303 Arad_8304     FALSE 0.178 90.000 0.000 1.000   NA
 5482852 5482853 Arad_8304 Arad_8305   dhaL FALSE 0.302 12.000 0.000 1.000 N NA
 5482854 5482855 Arad_8306 Arad_8307     FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 5482855 5482856 Arad_8307 Arad_8308     TRUE 0.995 -3.000 0.739 NA N NA
 5482856 5482857 Arad_8308 Arad_8309     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.008 Y NA
 5482860 5482861 Arad_8312 Arad_8314     TRUE 0.801 170.000 0.560 NA Y NA
 5482861 5482862 Arad_8314 Arad_8316     TRUE 0.999 -3.000 0.762 NA Y NA
 5482862 5482863 Arad_8316 Arad_8317     TRUE 0.993 -3.000 0.211 NA Y NA
 5482863 5482864 Arad_8317 Arad_8319     TRUE 0.987 6.000 0.250 1.000 Y NA
 5482864 5482865 Arad_8319 Arad_8320   lacZ1 TRUE 0.991 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5482865 5482866 Arad_8320 Arad_8321 lacZ1   FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5482866 5482867 Arad_8321 Arad_8324     FALSE 0.001 921.000 0.000 NA   NA
 5482868 5482869 Arad_8325 Arad_8326     TRUE 0.695 31.000 0.148 1.000 N NA
 5482869 5482870 Arad_8326 Arad_8327     TRUE 0.958 5.000 0.000 NA Y NA
 5482870 5482871 Arad_8327 Arad_8328     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5482871 5482872 Arad_8328 Arad_8329     TRUE 0.987 70.000 1.000 NA Y NA
 5482872 5482873 Arad_8329 Arad_8330     TRUE 0.920 59.000 0.267 NA Y NA
 5482877 5482878 Arad_8335 Arad_8336 dadA alr TRUE 0.658 29.000 0.089 1.000 N NA
 5482882 5482883 Arad_8343 Arad_8346 ropAe   FALSE 0.001 604.000 0.000 NA   NA
 5482883 5482884 Arad_8346 Arad_8347     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA   NA
 5482885 5482886 Arad_8348 Arad_8350     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 5482886 5482887 Arad_8350 Arad_8351   znuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5482887 5482888 Arad_8351 Arad_8352 znuB   TRUE 0.998 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 5482889 5482890 Arad_8353 Arad_8355 fur soxGe FALSE 0.008 148.000 0.000 NA N NA
 5482890 5482891 Arad_8355 Arad_8356 soxGe soxAe TRUE 0.992 -7.000 0.370 0.002   NA
 5482891 5482892 Arad_8356 Arad_8357 soxAe soxDe TRUE 0.998 -3.000 0.923 0.002   NA
 5482892 5482893 Arad_8357 Arad_8358 soxDe soxBe TRUE 0.998 13.000 0.846 0.002 Y NA
 5482894 5482895 Arad_8359 Arad_8360 glxA   TRUE 0.893 76.000 0.140 0.031 Y NA
 5482895 5482896 Arad_8360 Arad_8362   glxB FALSE 0.490 92.000 0.206 1.000 N NA
 5482896 5482897 Arad_8362 Arad_8364 glxB glxC TRUE 0.990 32.000 0.786 1.000 Y NA
 5482897 5482898 Arad_8364 Arad_8365 glxC glxD TRUE 0.997 16.000 0.901 1.000 Y NA
 5482898 5482899 Arad_8365 Arad_8367 glxD glnT TRUE 0.945 81.000 0.493 1.000 Y NA
 5482899 5482900 Arad_8367 Arad_8369 glnT purU FALSE 0.240 104.000 0.042 1.000 N NA
 5482900 5482901 Arad_8369 Arad_8371 purU folDch FALSE 0.411 4.000 0.000 1.000 N NA
 5482901 5482902 Arad_8371 Arad_8372 folDch   FALSE 0.031 114.000 0.000 1.000 N NA
 5482902 5482903 Arad_8372 Arad_8373     TRUE 0.965 13.000 0.438 NA   NA
 5482903 5482904 Arad_8373 Arad_8374     TRUE 0.993 -3.000 0.565 NA   NA
 5482904 5482905 Arad_8374 Arad_8376     TRUE 0.943 30.000 0.543 NA   NA
 5482905 5482906 Arad_8376 Arad_8377     TRUE 0.583 67.000 0.122 NA   NA
 5482906 5482907 Arad_8377 Arad_8378     FALSE 0.334 118.000 0.082 1.000   NA
 5482910 5482911 Arad_8382 Arad_8384     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5482911 5482912 Arad_8384 Arad_8385     FALSE 0.179 79.000 0.000 NA   NA
 5482912 5482913 Arad_8385 Arad_8387     TRUE 0.966 19.000 0.217 NA Y NA
 5482913 5482914 Arad_8387 Arad_8388     TRUE 0.987 6.000 0.261 NA Y NA
 5482914 5482915 Arad_8388 Arad_8389     FALSE 0.045 44.000 0.000 NA N NA
 5482915 5482916 Arad_8389 Arad_8390   ocdch2 TRUE 0.901 7.000 0.182 NA N NA
 5482916 5482917 Arad_8390 Arad_8392 ocdch2   FALSE 0.275 112.000 0.091 1.000 N NA
 5482917 5482918 Arad_8392 Arad_8393   hutH TRUE 0.907 76.000 0.750 1.000 N NA
 5482918 5482919 Arad_8393 Arad_8394 hutH hutC TRUE 0.914 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5482919 5482920 Arad_8394 Arad_8395 hutC   TRUE 0.914 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5482920 5482921 Arad_8395 Arad_8396     TRUE 0.988 3.000 0.087 0.055 Y NA
 5482921 5482922 Arad_8396 Arad_8397     TRUE 0.993 -10.000 0.087 0.088 Y NA
 5482923 5482924 Arad_8398 Arad_8399     TRUE 0.998 -10.000 0.694 NA Y NA
 5482924 5482925 Arad_8399 Arad_8400   proW TRUE 0.998 5.000 0.918 NA Y NA
 5482925 5482926 Arad_8400 Arad_8402 proW opuAC TRUE 0.959 24.000 0.667 NA N NA
 5482926 5482927 Arad_8402 Arad_8403 opuAC hutH FALSE 0.204 116.000 0.043 1.000 N NA
 5482927 5482928 Arad_8403 Arad_8404 hutH   FALSE 0.098 47.000 0.000 1.000 N NA
 5482928 5482929 Arad_8404 Arad_8405   hbdA FALSE 0.431 3.000 0.000 1.000 N NA
 5482929 5482930 Arad_8405 Arad_8407 hbdA fadB1 TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5482931 5482932 Arad_8408 Arad_8409 hipA   TRUE 0.961 -3.000 0.130 NA   NA
 5482932 5482933 Arad_8409 Arad_8411     FALSE 0.060 159.000 0.000 1.000   NA
 5482933 5482934 Arad_8411 Arad_8412     TRUE 0.838 5.000 0.040 1.000 N NA
 5482934 5482935 Arad_8412 Arad_8413     TRUE 0.747 95.000 0.040 1.000 Y NA
 5482935 5482936 Arad_8413 Arad_8414     TRUE 0.981 40.000 0.600 1.000 Y NA
 5482936 5482937 Arad_8414 Arad_8415     TRUE 0.998 -16.000 0.600 1.000 Y NA
 5482937 5482938 Arad_8415 Arad_8416     TRUE 0.999 12.000 1.000 0.017 Y NA
 5482938 5482939 Arad_8416 Arad_8417   uxuB TRUE 0.954 -3.000 0.167 1.000 N NA
 5482941 5482942 Arad_8419 Arad_8420     TRUE 0.906 44.000 0.143 NA Y NA
 5482942 5482943 Arad_8420 Arad_8422     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5482943 5482944 Arad_8422 Arad_8423     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5482944 5482945 Arad_8423 Arad_8425     TRUE 0.936 107.000 0.619 NA Y NA
 5482946 5482947 Arad_8426 Arad_8427     TRUE 0.998 -3.000 0.529 0.016 Y NA
 5482948 5482949 Arad_8428 Arad_8429   aceA TRUE 0.717 26.000 0.056 NA   NA
 5482950 5482951 Arad_8430 Arad_8431     FALSE 0.035 187.000 0.000 1.000   NA
 5482951 5482952 Arad_8431 Arad_8433     FALSE 0.005 385.000 0.000 0.052 N NA
 5482952 5482953 Arad_8433 Arad_8434   nuoE1 TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5482954 5482955 Arad_8435 Arad_8437     TRUE 0.929 20.000 0.357 NA   NA
 5482955 5482956 Arad_8437 Arad_8438     TRUE 0.967 -3.000 0.174 NA   NA
 5482956 5482957 Arad_8438 Arad_8440     TRUE 0.995 -3.000 0.316 NA Y NA
 5482957 5482958 Arad_8440 Arad_8441   pipb2 TRUE 0.841 52.000 0.368 NA   NA
 5482959 5482960 Arad_8442 Arad_8444   pipb1 TRUE 0.992 -3.000 0.520 1.000   NA
 5482960 5482961 Arad_8444 Arad_8446 pipb1   FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000   NA
 5482962 5482963 Arad_8448 Arad_8449 oxyR   TRUE 0.725 14.000 0.041 NA N NA
 5482963 5482964 Arad_8449 Arad_8451     TRUE 0.907 125.000 0.551 1.000 Y NA
 5482965 5482966 Arad_8453 Arad_8454     TRUE 0.759 1.000 0.000 NA   NA
 5482969 5482970 Arad_8457 Arad_8459     FALSE 0.051 358.000 0.000 0.031 Y NA
 5482970 5482971 Arad_8459 Arad_8460     FALSE 0.017 829.000 0.000 0.031 Y NA
 5482977 5482978 Arad_8472 Arad_8473     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 5482978 5482979 Arad_8473 Arad_8474     FALSE 0.310 135.000 0.135 NA   NA
 5482979 5482980 Arad_8474 Arad_8476   degPch1 FALSE 0.009 277.000 0.000 1.000   NA
 5482980 5482981 Arad_8476 Arad_8477 degPch1   FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5482981 5482982 Arad_8477 Arad_8478     FALSE 0.327 36.000 0.000 NA   NA
 5482983 5482984 Arad_8479 Arad_8481     TRUE 0.853 27.000 0.250 NA   NA
 5482985 5482986 Arad_8482 Arad_8483   manB1 FALSE 0.533 118.000 0.000 1.000 Y NA
 5482986 5482987 Arad_8483 Arad_8484 manB1   FALSE 0.134 31.000 0.000 1.000 N NA
 5482990 5482991 Arad_8490 Arad_8493     FALSE 0.002 523.000 0.000 1.000   NA
 5482992 5482993 Arad_8494 Arad_8495   kynU FALSE 0.143 29.000 0.000 1.000 N NA
 5482993 5482994 Arad_8495 Arad_8496 kynU   TRUE 0.798 14.000 0.028 NA   NA
 5482994 5482995 Arad_8496 Arad_8497     TRUE 0.948 5.000 0.222 NA   NA
 5482995 5482996 Arad_8497 Arad_8499     FALSE 0.434 77.000 0.041 NA   NA
 5482999 5483000 Arad_8503 Arad_8504     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5483000 5483001 Arad_8504 Arad_8505     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5483002 5483003 Arad_8506 Arad_8507     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483003 5483004 Arad_8507 Arad_8508     FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5483006 5483007 Arad_8511 Arad_8512     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5483008 5483009 Arad_8513 Arad_8515     FALSE 0.074 139.000 0.000 NA   NA
 5483009 5483010 Arad_8515 Arad_8517     FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 5483012 5483013 Arad_8520 Arad_8521     TRUE 0.941 53.000 0.714 NA   NA
 5483013 5483014 Arad_8521 Arad_8522     TRUE 0.997 11.000 0.833 1.000 Y NA
 5483014 5483015 Arad_8522 Arad_8523     TRUE 0.999 -13.000 0.833 NA Y NA
 5483015 5483016 Arad_8523 Arad_8526     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5483016 5483017 Arad_8526 Arad_8527     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 5483019 5483020 Arad_8530 Arad_8531     TRUE 0.852 126.000 0.400 NA Y NA
 5483020 5483021 Arad_8531 Arad_8532     TRUE 0.984 3.000 0.467 NA   NA
 5483021 5483022 Arad_8532 Arad_8533     TRUE 0.954 6.000 0.250 1.000   NA
 5483022 5483023 Arad_8533 Arad_8534   idhA TRUE 0.674 43.000 0.094 1.000   NA
 5483023 5483024 Arad_8534 Arad_8536 idhA   FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483025 5483026 Arad_8537 Arad_8538     TRUE 0.778 18.000 0.000 0.004   NA
 5483028 5483029 Arad_8540 Arad_8541   dctA TRUE 0.601 36.000 0.083 1.000 N NA
 5483032 5483033 Arad_8544 Arad_8545     TRUE 0.610 14.000 0.000 1.000   NA
 5483033 5483034 Arad_8545 Arad_8547     FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 5483034 5483035 Arad_8547 Arad_8548     FALSE 0.001 948.000 0.000 NA   NA
 5483035 5483036 Arad_8548 Arad_8549     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5483036 5483037 Arad_8549 Arad_8550     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5483037 5483038 Arad_8550 Arad_8551     FALSE 0.526 16.000 0.000 NA   NA
 5483039 5483040 Arad_8553 Arad_8554 ftsZ1 fabF2 FALSE 0.312 55.000 0.002 1.000 N NA
 5483040 5483041 Arad_8554 Arad_8555 fabF2   FALSE 0.244 124.000 0.093 1.000 N NA
 5483042 5483043 Arad_8556 Arad_8558     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA N NA
 5483044 5483045 Arad_8559 Arad_8560   gatA1 FALSE 0.043 47.000 0.000 NA N NA
 5483045 5483046 Arad_8560 Arad_8561 gatA1   FALSE 0.061 31.000 0.000 NA N NA
 5483046 5483047 Arad_8561 Arad_8562     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5483047 5483048 Arad_8562 Arad_8563   oppD TRUE 0.992 -3.000 0.026 0.005 Y NA
 5483048 5483049 Arad_8563 Arad_8564 oppD dppCch2 TRUE 0.986 -3.000 0.018 NA Y NA
 5483049 5483050 Arad_8564 Arad_8565 dppCch2 dppBf TRUE 0.990 53.000 1.000 NA Y NA
 5483050 5483051 Arad_8565 Arad_8566 dppBf dppAch2 TRUE 0.630 93.000 0.000 NA Y NA
 5483053 5483054 Arad_8568 Arad_8570     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 5483054 5483055 Arad_8570 Arad_8572     FALSE 0.322 37.000 0.000 NA   NA
 5483057 5483058 Arad_8575 Arad_8577     FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 5483058 5483059 Arad_8577 Arad_8579     FALSE 0.159 87.000 0.000 NA   NA
 5483059 5483060 Arad_8579 Arad_8580     TRUE 0.997 -3.000 0.900 NA N NA
 5483061 5483062 Arad_8582 Arad_8583     TRUE 0.999 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 5483063 5483064 Arad_8585 Arad_8586 accCch   TRUE 0.699 42.000 0.203 1.000 N NA
 5483064 5483065 Arad_8586 Arad_8587     TRUE 0.897 8.000 0.082 NA   NA
 5483065 5483066 Arad_8587 Arad_8588     TRUE 0.772 25.000 0.108 NA   NA
 5483066 5483067 Arad_8588 Arad_8589     TRUE 0.911 12.000 0.189 NA   NA
 5483069 5483070 Arad_8591 Arad_8592     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5483070 5483071 Arad_8592 Arad_8594     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 5483072 5483073 Arad_8595 Arad_8596     TRUE 0.630 42.000 0.065 NA   NA
 5483073 5483074 Arad_8596 Arad_8597     FALSE 0.180 89.000 0.000 1.000   NA
 5483074 5483075 Arad_8597 Arad_8598     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5483075 5483076 Arad_8598 Arad_8600     TRUE 0.886 75.000 0.239 NA Y NA
 5483076 5483077 Arad_8600 Arad_8601     TRUE 0.999 -10.000 0.727 NA Y NA
 5483077 5483078 Arad_8601 Arad_8603     TRUE 0.962 2.000 0.303 NA N NA
 5483078 5483079 Arad_8603 Arad_8604     TRUE 0.983 -3.000 0.364 1.000 N NA
 5483079 5483080 Arad_8604 Arad_8605     TRUE 0.988 13.000 0.385 1.000 Y NA
 5483080 5483081 Arad_8605 Arad_8606     TRUE 0.991 -27.000 0.588 1.000 N NA
 5483081 5483082 Arad_8606 Arad_8607   lyxX TRUE 0.928 34.000 0.154 1.000 Y NA
 5483082 5483083 Arad_8607 Arad_8608 lyxX   TRUE 0.936 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5483083 5483084 Arad_8608 Arad_8609     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5483084 5483085 Arad_8609 Arad_8610     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 5483085 5483086 Arad_8610 Arad_8611     TRUE 0.991 49.000 1.000 NA Y NA
 5483086 5483087 Arad_8611 Arad_8613     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 5483087 5483088 Arad_8613 Arad_8614     TRUE 0.982 18.000 0.385 NA Y NA
 5483090 5483091 Arad_8617 Arad_8618 dgoA idnO TRUE 0.905 10.000 0.076 0.087 N NA
 5483091 5483092 Arad_8618 Arad_8619 idnO idnD FALSE 0.404 65.000 0.045 1.000 N NA
 5483092 5483093 Arad_8619 Arad_8622 idnD   FALSE 0.001 316.000 0.000 1.000 N NA
 5483095 5483096 Arad_8624 Arad_8625     FALSE 0.101 129.000 0.000 1.000   NA
 5483096 5483097 Arad_8625 Arad_8627     TRUE 0.886 13.000 0.125 1.000   NA
 5483097 5483098 Arad_8627 Arad_8628     TRUE 0.927 31.000 0.476 NA   NA
 5483099 5483100 Arad_8629 Arad_8631 braC1   FALSE 0.009 276.000 0.000 1.000   NA
 5483100 5483101 Arad_8631 Arad_8633   gstA TRUE 0.634 127.000 0.415 NA   NA
 5483103 5483104 Arad_8635 Arad_8636   rhaU TRUE 0.963 -3.000 0.147 NA   NA
 5483104 5483105 Arad_8636 Arad_8637 rhaU   TRUE 0.966 -3.000 0.168 NA   NA
 5483105 5483106 Arad_8637 Arad_8638     TRUE 0.998 -3.000 0.515 NA Y NA
 5483106 5483107 Arad_8638 Arad_8639     TRUE 0.997 11.000 0.794 NA Y NA
 5483107 5483108 Arad_8639 Arad_8640   rhaS TRUE 0.943 74.000 0.446 NA Y NA
 5483108 5483109 Arad_8640 Arad_8642 rhaS   TRUE 0.946 54.000 0.357 NA Y NA
 5483110 5483111 Arad_8644 Arad_8646 rhaD rhaI TRUE 0.611 65.000 0.147 NA   NA
 5483111 5483112 Arad_8646 Arad_8648 rhaI ialA FALSE 0.101 115.000 0.000 NA   NA
 5483113 5483114 Arad_8650 Arad_8651   ggt FALSE 0.000 599.000 0.000 1.000 N NA
 5483114 5483115 Arad_8651 Arad_8652 ggt   FALSE 0.085 55.000 0.000 1.000 N NA
 5483117 5483118 Arad_8655 Arad_8656   btuE FALSE 0.041 178.000 0.000 1.000   NA
 5483118 5483119 Arad_8656 Arad_8658 btuE   FALSE 0.056 163.000 0.000 1.000   NA
 5483119 5483120 Arad_8658 Arad_8659     TRUE 0.832 49.000 0.333 NA   NA
 5483120 5483121 Arad_8659 Arad_8660   ggt TRUE 0.698 5.000 0.000 NA   NA
 5483121 5483122 Arad_8660 Arad_8661 ggt dppCf TRUE 0.942 23.000 0.095 NA Y NA
 5483122 5483123 Arad_8661 Arad_8662 dppCf   TRUE 0.999 -3.000 0.762 NA Y NA
 5483123 5483124 Arad_8662 Arad_8663     TRUE 0.884 63.000 0.176 NA Y NA
 5483124 5483125 Arad_8663 Arad_8665   ansR FALSE 0.414 90.000 0.160 NA N NA
 5483125 5483126 Arad_8665 Arad_8667 ansR   FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 5483126 5483127 Arad_8667 Arad_8668     TRUE 0.649 10.000 0.000 NA   NA
 5483128 5483129 Arad_8669 Arad_8670     TRUE 0.966 -7.000 0.167 NA   NA
 5483129 5483130 Arad_8670 Arad_8671     FALSE 0.083 131.000 0.000 NA   NA
 5483130 5483131 Arad_8671 Arad_8674     FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000   NA
 5483133 5483134 Arad_8676 Arad_8677     FALSE 0.002 453.000 0.000 1.000   NA
 5483134 5483135 Arad_8677 Arad_8679     FALSE 0.017 150.000 0.000 1.000 N NA
 5483136 5483137 Arad_8681 Arad_8682     FALSE 0.234 85.000 0.000 0.087 N NA
 5483138 5483139 Arad_8684 Arad_8686     TRUE 0.998 -12.000 0.667 NA Y NA
 5483139 5483140 Arad_8686 Arad_8688     TRUE 0.991 -19.000 0.139 NA Y NA
 5483140 5483141 Arad_8688 Arad_8689     TRUE 0.706 21.000 0.083 NA N NA
 5483141 5483142 Arad_8689 Arad_8690     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.005 Y NA
 5483142 5483143 Arad_8690 Arad_8691     TRUE 0.957 13.000 0.452 NA N NA
 5483144 5483145 Arad_8692 Arad_8693     FALSE 0.051 86.000 0.000 1.000 N NA
 5483146 5483147 Arad_8694 Arad_8696   ftsZ1 FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5483147 5483148 Arad_8696 Arad_8697 ftsZ1   FALSE 0.001 309.000 0.000 1.000 N NA
 5483148 5483149 Arad_8697 Arad_8698     FALSE 0.014 244.000 0.000 1.000   NA
 5483150 5483151 Arad_8700 Arad_8701     FALSE 0.143 94.000 0.000 NA   NA
 5483151 5483152 Arad_8701 Arad_8702   narB FALSE 0.083 131.000 0.000 NA   NA
 5483152 5483153 Arad_8702 Arad_8703 narB nirD TRUE 0.931 12.000 0.294 1.000 N NA
 5483153 5483154 Arad_8703 Arad_8704 nirD nirB TRUE 0.989 5.000 0.539 0.000 N NA
 5483154 5483155 Arad_8704 Arad_8705 nirB nrtCf TRUE 0.871 5.000 0.074 1.000 N NA
 5483155 5483156 Arad_8705 Arad_8706 nrtCf nrtB TRUE 0.993 11.000 0.323 0.000 Y NA
 5483156 5483157 Arad_8706 Arad_8707 nrtB nrtA TRUE 0.986 66.000 0.915 NA Y NA
 5483157 5483158 Arad_8707 Arad_8708 nrtA nrtCch FALSE 0.030 366.000 0.000 NA Y NA
 5483158 5483159 Arad_8708 Arad_8709 nrtCch nasT TRUE 0.860 50.000 0.466 NA N NA
 5483161 5483162 Arad_8713 Arad_8714     FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 5483163 5483164 Arad_8715 Arad_8716   pqqB FALSE 0.002 650.000 0.000 1.000   NA
 5483164 5483165 Arad_8716 Arad_8717 pqqB pqqC TRUE 0.998 -19.000 0.825 0.001   NA
 5483165 5483166 Arad_8717 Arad_8718 pqqC   TRUE 0.993 -3.000 0.404 0.001   NA
 5483166 5483167 Arad_8718 Arad_8719   pqqE TRUE 0.887 63.000 0.361 0.001   NA
 5483167 5483168 Arad_8719 Arad_8720 pqqE   FALSE 0.048 162.000 0.000 NA   NA
 5483169 5483170 Arad_8721 Arad_8722 rpsU   TRUE 0.734 42.000 0.188 NA   NA
 5483170 5483171 Arad_8722 Arad_8723   modA FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 5483171 5483172 Arad_8723 Arad_8724 modA   TRUE 0.990 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5483172 5483173 Arad_8724 Arad_8725   hmuU TRUE 0.997 8.000 0.792 NA Y NA
 5483173 5483174 Arad_8725 Arad_8726 hmuU   TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA Y NA
 5483175 5483176 Arad_8727 Arad_8728 panB purU FALSE 0.079 59.000 0.000 1.000 N NA
 5483176 5483177 Arad_8728 Arad_8730 purU folDch FALSE 0.411 4.000 0.000 1.000 N NA
 5483177 5483178 Arad_8730 Arad_8731 folDch ropAe FALSE 0.002 604.000 0.000 1.000   NA
 5483179 5483180 Arad_8732 Arad_8733     FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 5483184 5483185 Arad_8741 Arad_8742     TRUE 0.891 73.000 0.600 NA   NA
 5483185 5483186 Arad_8742 Arad_8744   groL TRUE 0.933 74.000 0.800 NA   NA
 5483186 5483187 Arad_8744 Arad_8745 groL groESch3 TRUE 0.983 49.000 0.714 1.000 Y NA
 5483188 5483189 Arad_8748 Arad_8750     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5483189 5483190 Arad_8750 Arad_8751     FALSE 0.169 83.000 0.000 NA   NA
 5483190 5483191 Arad_8751 Arad_8752   glpRb FALSE 0.002 232.000 0.000 NA N NA
 5483191 5483192 Arad_8752 Arad_8754 glpRb   FALSE 0.184 228.000 0.000 0.065 Y NA
 5483194 5483195 Arad_8758 Arad_8760   hrcJ TRUE 0.994 -3.000 0.600 NA   NA
 5483195 5483196 Arad_8760 Arad_8761 hrcJ   TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 5483196 5483197 Arad_8761 Arad_8762   hrpE TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483197 5483198 Arad_8762 Arad_8764 hrpE hrcN TRUE 0.854 -7.000 0.000 1.000   NA
 5483198 5483199 Arad_8764 Arad_8765 hrcN hrcQ TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483199 5483200 Arad_8765 Arad_8766 hrcQ hrcR TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483200 5483201 Arad_8766 Arad_8768 hrcR hrcS TRUE 0.995 4.000 0.333 0.009 Y NA
 5483201 5483202 Arad_8768 Arad_8770 hrcS hrcT TRUE 0.991 6.000 0.333 1.000 Y NA
 5483202 5483203 Arad_8770 Arad_8772 hrcT hrcU TRUE 0.999 -13.000 1.000 1.000 Y NA
 5483204 5483205 Arad_8773 Arad_8774   hrcV FALSE 0.222 65.000 0.000 NA   NA
 5483205 5483206 Arad_8774 Arad_8775 hrcV   TRUE 0.984 4.000 0.500 NA   NA
 5483206 5483207 Arad_8775 Arad_8777     TRUE 0.643 143.000 0.500 NA   NA
 5483209 5483210 Arad_8780 Arad_8781     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483210 5483211 Arad_8781 Arad_8782   hflK TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA N NA
 5483211 5483212 Arad_8782 Arad_8783 hflK hflC TRUE 0.977 3.000 0.022 NA Y NA
 5483212 5483213 Arad_8783 Arad_8784 hflC   TRUE 0.987 -3.000 0.019 NA Y NA
 5483213 5483214 Arad_8784 Arad_8785     FALSE 0.003 187.000 0.000 NA N NA
 5483214 5483215 Arad_8785 Arad_8786     TRUE 0.887 19.000 0.235 NA   NA
 5483215 5483216 Arad_8786 Arad_8787     TRUE 0.959 -3.000 0.118 NA   NA
 5483216 5483217 Arad_8787 Arad_8788     TRUE 0.997 -3.000 0.273 0.005 Y NA
 5483217 5483218 Arad_8788 Arad_8789     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 5483218 5483219 Arad_8789 Arad_8790     TRUE 0.996 -3.000 0.400 NA Y NA
 5483219 5483220 Arad_8790 Arad_8791     TRUE 0.949 47.000 0.333 NA Y NA
 5483221 5483222 Arad_8792 Arad_8793 dapAb   TRUE 0.831 12.000 0.108 NA N NA
 5483222 5483223 Arad_8793 Arad_8794     FALSE 0.196 114.000 0.046 NA N NA
 5483223 5483224 Arad_8794 Arad_8795   pdxA TRUE 0.805 19.000 0.167 1.000 N NA
 5483226 5483227 Arad_8797 Arad_8799     TRUE 0.880 11.000 0.080 NA   NA
 5483227 5483228 Arad_8799 Arad_8800     FALSE 0.012 119.000 0.000 NA N NA
 5483228 5483229 Arad_8800 Arad_8801   braC2 FALSE 0.278 133.000 0.182 NA N NA
 5483229 5483230 Arad_8801 Arad_8803 braC2   TRUE 0.883 61.000 0.167 NA Y NA
 5483230 5483231 Arad_8803 Arad_8804     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA Y NA
 5483231 5483232 Arad_8804 Arad_8805     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 5483232 5483233 Arad_8805 Arad_8807   braG TRUE 0.998 4.000 0.667 0.051 Y NA
 5483233 5483234 Arad_8807 Arad_8808 braG aroEc TRUE 0.987 1.000 0.133 1.000 Y NA
 5483234 5483235 Arad_8808 Arad_8810 aroEc hppD TRUE 0.983 6.000 0.167 1.000 Y NA
 5483235 5483236 Arad_8810 Arad_8811 hppD   FALSE 0.000 747.000 0.000 1.000 N NA
 5483236 5483237 Arad_8811 Arad_8812     TRUE 0.999 -3.000 0.958 NA Y NA
 5483237 5483238 Arad_8812 Arad_8813     TRUE 0.996 -3.000 0.348 NA Y NA
 5483238 5483239 Arad_8813 Arad_8815     TRUE 0.990 3.000 0.250 1.000 Y NA
 5483241 5483242 Arad_8817 Arad_8818     TRUE 0.883 36.000 0.375 NA   NA
 5483242 5483243 Arad_8818 Arad_8820     TRUE 0.997 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 5483243 5483244 Arad_8820 Arad_8821     TRUE 0.996 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 5483244 5483245 Arad_8821 Arad_8823     TRUE 0.620 124.000 0.375 1.000   NA
 5483246 5483247 Arad_8824 Arad_8825   matR FALSE 0.152 27.000 0.000 1.000 N NA
 5483248 5483249 Arad_8826 Arad_8827 matA matB TRUE 0.805 24.000 0.130 1.000   NA
 5483249 5483250 Arad_8827 Arad_8828 matB matC FALSE 0.333 111.000 0.058 1.000   NA
 5483254 5483255 Arad_8836 Arad_8838     TRUE 0.951 104.000 0.697 NA Y NA
 5483255 5483256 Arad_8838 Arad_8839   dppCch1 TRUE 0.998 2.000 0.694 NA Y NA
 5483256 5483257 Arad_8839 Arad_8840 dppCch1   FALSE 0.128 174.000 0.056 NA   NA
 5483257 5483258 Arad_8840 Arad_8841   argE FALSE 0.186 87.000 0.000 1.000   NA
 5483258 5483259 Arad_8841 Arad_8842 argE   FALSE 0.098 47.000 0.000 1.000 N NA
 5483263 5483264 Arad_8846 Arad_8848     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 5483266 5483267 Arad_8850 Arad_8852 ansP   TRUE 0.987 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5483268 5483269 Arad_8854 Arad_8855     FALSE 0.016 103.000 0.000 NA N NA
 5483270 5483271 Arad_8856 Arad_8857 minC minD TRUE 0.976 33.000 0.466 1.000 Y NA
 5483271 5483272 Arad_8857 Arad_8858 minD minE TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 5483274 5483275 Arad_8861 Arad_8862 prsD prsE TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.004   NA
 5483277 5483278 Arad_8864 Arad_8865     FALSE 0.263 51.000 0.000 NA   NA
 5483278 5483279 Arad_8865 Arad_8867     FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 5483279 5483280 Arad_8867 Arad_8870     FALSE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 5483283 5483284 Arad_8874 Arad_8875   occT FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000   NA
 5483284 5483285 Arad_8875 Arad_8876 occT occPch TRUE 0.929 37.000 0.182 1.000 Y NA
 5483285 5483286 Arad_8876 Arad_8877 occPch occMch TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5483286 5483287 Arad_8877 Arad_8878 occMch occQch TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.016 Y NA
 5483287 5483288 Arad_8878 Arad_8880 occQch hipO FALSE 0.482 85.000 0.083 1.000   NA
 5483290 5483291 Arad_8882 Arad_8883     FALSE 0.004 225.000 0.000 1.000 N NA
 5483292 5483293 Arad_8885 Arad_8887 uxuA uxuB TRUE 0.995 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 5483293 5483294 Arad_8887 Arad_8888 uxuB   FALSE 0.023 136.000 0.000 1.000 N NA
 5483294 5483295 Arad_8888 Arad_8889     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483295 5483296 Arad_8889 Arad_8890     TRUE 0.760 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5483296 5483297 Arad_8890 Arad_8892     TRUE 0.970 9.000 0.000 0.016 Y NA
 5483297 5483298 Arad_8892 Arad_8893   aapP TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483298 5483299 Arad_8893 Arad_8894 aapP   FALSE 0.390 5.000 0.000 1.000 N NA
 5483299 5483300 Arad_8894 Arad_8896   recX FALSE 0.116 117.000 0.000 1.000   NA
 5483300 5483301 Arad_8896 Arad_8897 recX   FALSE 0.219 66.000 0.000 NA   NA
 5483303 5483304 Arad_8900 Arad_8901   dppAch1 FALSE 0.005 173.000 0.000 NA N NA
 5483304 5483305 Arad_8901 Arad_8902 dppAch1 appD TRUE 0.945 11.000 0.000 NA Y NA
 5483305 5483306 Arad_8902 Arad_8904 appD   TRUE 0.988 -7.000 0.000 0.011 Y NA
 5483306 5483307 Arad_8904 Arad_8905     TRUE 0.940 12.000 0.000 NA Y NA
 5483307 5483308 Arad_8905 Arad_8907   dppCch3 TRUE 0.986 25.000 0.571 NA Y NA
 5483308 5483309 Arad_8907 Arad_8908 dppCch3 ugpQ FALSE 0.048 41.000 0.000 NA N NA
 5483309 5483310 Arad_8908 Arad_8909 ugpQ   FALSE 0.010 177.000 0.000 1.000 N NA
 5483310 5483311 Arad_8909 Arad_8910     FALSE 0.044 46.000 0.000 NA N NA
 5483311 5483312 Arad_8910 Arad_8911   dppCch1 TRUE 0.994 -3.000 0.250 NA Y NA
 5483312 5483313 Arad_8911 Arad_8912 dppCch1   FALSE 0.200 6.000 0.000 NA N NA
 5483313 5483314 Arad_8912 Arad_8913     FALSE 0.216 18.000 0.000 1.000 N NA
 5483314 5483315 Arad_8913 Arad_8914   ggt TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5483315 5483316 Arad_8914 Arad_8915 ggt   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483316 5483317 Arad_8915 Arad_8916     TRUE 0.995 -3.000 0.180 0.005 Y NA
 5483317 5483318 Arad_8916 Arad_8917     TRUE 0.969 1.000 0.000 NA Y NA
 5483319 5483320 Arad_8918 Arad_8919   ilvD TRUE 0.766 19.000 0.133 NA N NA
 5483320 5483321 Arad_8919 Arad_8920 ilvD   FALSE 0.036 56.000 0.000 NA N NA
 5483321 5483322 Arad_8920 Arad_8921   tauB TRUE 0.995 4.000 0.500 NA Y NA
 5483322 5483323 Arad_8921 Arad_8923 tauB   TRUE 0.994 19.000 0.800 1.000 Y NA
 5483326 5483327 Arad_8927 Arad_8928   nadA FALSE 0.484 70.000 0.037 1.000   NA
 5483327 5483328 Arad_8928 Arad_8930 nadA nadB TRUE 0.996 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5483328 5483329 Arad_8930 Arad_8931 nadB nadC TRUE 0.994 2.000 0.223 0.002 Y NA
 5483330 5483331 Arad_8932 Arad_8933 idnO   FALSE 0.032 111.000 0.000 1.000 N NA
 5483332 5483333 Arad_8934 Arad_8935 murA   TRUE 0.856 -3.000 0.007 NA N NA
 5483333 5483334 Arad_8935 Arad_8937     FALSE 0.024 274.000 0.035 NA   NA
 5483334 5483335 Arad_8937 Arad_8938     FALSE 0.168 170.000 0.111 NA   NA
 5483335 5483336 Arad_8938 Arad_8939     TRUE 0.934 28.000 0.134 NA Y NA
 5483336 5483337 Arad_8939 Arad_8940     TRUE 0.990 -3.000 0.104 NA Y NA
 5483337 5483338 Arad_8940 Arad_8941     TRUE 0.973 -3.000 0.211 NA   NA
 5483338 5483339 Arad_8941 Arad_8942     TRUE 0.928 6.000 0.150 1.000   NA
 5483339 5483340 Arad_8942 Arad_8943     TRUE 0.695 11.000 0.011 NA N NA
 5483340 5483341 Arad_8943 Arad_8945     FALSE 0.114 107.000 0.000 NA   NA
 5483341 5483342 Arad_8945 Arad_8947     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5483343 5483344 Arad_8948 Arad_8949 guaD   FALSE 0.150 91.000 0.000 NA   NA
 5483344 5483345 Arad_8949 Arad_8950     FALSE 0.255 53.000 0.000 NA   NA
 5483345 5483346 Arad_8950 Arad_8951     TRUE 0.951 10.000 0.286 NA   NA
 5483346 5483347 Arad_8951 Arad_8952     TRUE 0.984 15.000 0.750 NA   NA
 5483347 5483348 Arad_8952 Arad_8954     TRUE 0.986 2.000 0.500 NA   NA
 5483348 5483349 Arad_8954 Arad_8955     TRUE 0.769 79.000 0.353 1.000   NA
 5483350 5483351 Arad_8956 Arad_8959     FALSE 0.056 153.000 0.000 NA   NA
 5483351 5483352 Arad_8959 Arad_8960   gstc TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 5483352 5483353 Arad_8960 Arad_8961 gstc ade TRUE 0.646 19.000 0.038 NA N NA
 5483354 5483355 Arad_8962 Arad_8963     FALSE 0.040 100.000 0.000 1.000 N NA
 5483355 5483356 Arad_8963 Arad_8964     TRUE 0.984 2.000 0.444 1.000   NA
 5483356 5483357 Arad_8964 Arad_8965     TRUE 0.928 27.000 0.444 NA   NA
 5483357 5483358 Arad_8965 Arad_8966     TRUE 0.999 -3.000 0.900 NA Y NA
 5483358 5483359 Arad_8966 Arad_8967     TRUE 0.979 72.000 0.800 NA Y NA
 5483359 5483360 Arad_8967 Arad_8968     TRUE 0.930 68.000 0.818 NA N NA
 5483360 5483361 Arad_8968 Arad_8971     FALSE 0.010 179.000 0.000 1.000 N NA
 5483361 5483362 Arad_8971 Arad_8972   vbsS TRUE 0.763 15.000 0.061 1.000 N NA
 5483362 5483363 Arad_8972 Arad_8973 vbsS   FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 5483364 5483365 Arad_8974 Arad_8975 dctB dctD TRUE 0.995 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 5483366 5483367 Arad_8977 Arad_8978     TRUE 0.988 6.000 0.286 NA Y NA
 5483367 5483368 Arad_8978 Arad_8979     TRUE 0.936 90.000 0.500 NA Y NA
 5483368 5483369 Arad_8979 Arad_8981     FALSE 0.019 455.000 0.000 NA Y NA
 5483369 5483370 Arad_8981 Arad_8982     TRUE 0.746 135.000 0.250 NA Y NA
 5483370 5483371 Arad_8982 Arad_8983     TRUE 0.993 4.000 0.400 NA Y NA
 5483372 5483373 Arad_8985 Arad_8986     TRUE 0.588 13.000 0.000 NA   NA
 5483373 5483374 Arad_8986 Arad_8987     FALSE 0.002 436.000 0.000 NA   NA
 5483374 5483375 Arad_8987 Arad_8988     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 5483375 5483376 Arad_8988 Arad_8991   rzcA FALSE 0.000 733.000 0.000 1.000 N NA
 5483376 5483377 Arad_8991 Arad_8992 rzcA   TRUE 0.990 8.000 0.750 NA   NA
 5483377 5483378 Arad_8992 Arad_8993     TRUE 0.967 15.000 0.500 NA   NA
 5483378 5483379 Arad_8993 Arad_8994     TRUE 0.959 30.000 0.667 NA   NA
 5483379 5483380 Arad_8994 Arad_8995   invp FALSE 0.351 146.000 0.222 NA   NA
 5483381 5483382 Arad_8996 Arad_8997     FALSE 0.001 374.000 0.000 1.000 N NA
 5483382 5483383 Arad_8997 Arad_8998     TRUE 0.997 -7.000 0.500 NA Y NA
 5483383 5483384 Arad_8998 Arad_8999     TRUE 0.934 100.000 0.556 NA Y NA
 5483384 5483385 Arad_8999 Arad_9000   proC TRUE 0.892 69.000 0.207 1.000 Y NA
 5483385 5483386 Arad_9000 Arad_9001 proC   TRUE 0.867 14.000 0.194 1.000 N NA
 5483387 5483388 Arad_9002 Arad_9004     TRUE 0.694 49.000 0.171 NA   NA
 5483390 5483391 Arad_9006 Arad_9007     FALSE 0.002 269.000 0.000 1.000 N NA
 5483391 5483392 Arad_9007 Arad_9008     FALSE 0.135 97.000 0.000 NA   NA
 5483392 5483393 Arad_9008 Arad_9010     FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5483393 5483394 Arad_9010 Arad_9011     TRUE 0.673 52.000 0.167 NA   NA
 5483394 5483395 Arad_9011 Arad_9013     TRUE 0.947 17.000 0.400 NA   NA
 5483395 5483396 Arad_9013 Arad_9015     FALSE 0.013 233.000 0.000 NA   NA
 5483398 5483399 Arad_9017 Arad_9019   nerA TRUE 0.677 134.000 0.378 0.054   NA
 5483399 5483400 Arad_9019 Arad_9021 nerA   FALSE 0.013 232.000 0.000 NA   NA
 5483400 5483401 Arad_9021 Arad_9023     FALSE 0.002 484.000 0.000 NA   NA
 5483401 5483402 Arad_9023 Arad_9024     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 5483402 5483403 Arad_9024 Arad_9026     FALSE 0.002 399.000 0.000 NA   NA
 5483403 5483404 Arad_9026 Arad_9027     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5483404 5483405 Arad_9027 Arad_9029     FALSE 0.001 881.000 0.000 NA   NA
 5483406 5483407 Arad_9031 Arad_9032     TRUE 0.963 -6.000 0.200 1.000 N NA
 5483408 5483409 Arad_9033 Arad_9035     FALSE 0.001 766.000 0.000 NA   NA
 5483409 5483410 Arad_9035 Arad_9036     TRUE 0.968 9.000 0.250 0.010   NA
 5483411 5483412 Arad_9039 Arad_9040     FALSE 0.344 33.000 0.000 NA   NA
 5483412 5483413 Arad_9040 Arad_9041     FALSE 0.105 112.000 0.000 NA   NA
 5483415 5483416 Arad_9044 Arad_9045 lacZ1   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483416 5483417 Arad_9045 Arad_9047     TRUE 0.733 68.000 0.000 NA Y NA
 5483417 5483418 Arad_9047 Arad_9048     TRUE 0.995 0.000 0.375 NA Y NA
 5483418 5483419 Arad_9048 Arad_9049     TRUE 0.939 65.000 0.375 NA Y NA
 5483420 5483421 Arad_9050 Arad_9051     FALSE 0.039 51.000 0.000 NA N NA
 5483421 5483422 Arad_9051 Arad_9052     TRUE 0.989 -3.000 0.421 NA   NA
 5483422 5483423 Arad_9052 Arad_9054   gcd FALSE 0.001 594.000 0.000 NA   NA
 5483423 5483424 Arad_9054 Arad_9055 gcd   FALSE 0.033 210.000 0.000 0.050 N NA
 5483425 5483426 Arad_9057 Arad_9058     FALSE 0.329 85.000 0.065 NA N NA
 5483427 5483428 Arad_9059 Arad_9061     TRUE 0.999 -3.000 0.952 NA Y NA
 5483428 5483429 Arad_9061 Arad_9062     FALSE 0.539 38.000 0.066 NA N NA
 5483430 5483431 Arad_9063 Arad_9064     FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 5483431 5483432 Arad_9064 Arad_9065     TRUE 0.799 31.000 0.263 NA N NA
 5483432 5483433 Arad_9065 Arad_9067     TRUE 0.914 66.000 0.158 0.018 Y NA
 5483433 5483434 Arad_9067 Arad_9068     FALSE 0.059 77.000 0.000 1.000 N NA
 5483434 5483435 Arad_9068 Arad_9069     FALSE 0.349 40.000 0.000 1.000   NA
 5483435 5483436 Arad_9069 Arad_9070     TRUE 0.803 26.000 0.154 1.000   NA
 5483436 5483437 Arad_9070 Arad_9072     TRUE 0.945 19.000 0.421 NA   NA
 5483437 5483438 Arad_9072 Arad_9073     TRUE 0.983 27.000 0.526 NA Y NA
 5483439 5483440 Arad_9075 Arad_9077     FALSE 0.498 18.000 0.000 NA   NA
 5483441 5483442 Arad_9078 Arad_9079     TRUE 0.996 5.000 0.613 NA Y NA
 5483442 5483443 Arad_9079 Arad_9080     TRUE 0.997 2.000 0.571 NA Y NA
 5483443 5483444 Arad_9080 Arad_9081     TRUE 0.825 77.000 0.094 NA Y NA
 5483444 5483445 Arad_9081 Arad_9083     TRUE 0.989 31.000 0.737 NA Y NA
 5483446 5483447 Arad_9084 Arad_9085   codAb FALSE 0.082 57.000 0.000 1.000 N NA
 5483447 5483448 Arad_9085 Arad_9086 codAb codAb TRUE 0.907 56.000 0.050 0.006 Y NA
 5483450 5483451 Arad_9090 Arad_9091     FALSE 0.338 34.000 0.000 NA   NA
 5483451 5483452 Arad_9091 Arad_9092   mdeAe TRUE 0.989 -3.000 0.478 1.000 N NA
 5483452 5483453 Arad_9092 Arad_9093 mdeAe   TRUE 0.745 45.000 0.265 NA N NA
 5483453 5483454 Arad_9093 Arad_9095     TRUE 0.943 88.000 0.529 NA Y NA
 5483454 5483455 Arad_9095 Arad_9096     TRUE 0.997 4.000 0.647 NA Y NA
 5483455 5483456 Arad_9096 Arad_9098     TRUE 0.890 50.000 0.118 NA Y NA
 5483457 5483458 Arad_9099 Arad_9100 map1   FALSE 0.078 60.000 0.000 1.000 N NA
 5483461 5483462 Arad_9104 Arad_9105     TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.016 Y NA
 5483462 5483463 Arad_9105 Arad_9106     FALSE 0.544 15.000 0.000 NA   NA
 5483466 5483467 Arad_9111 Arad_9112     TRUE 0.995 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 5483467 5483468 Arad_9112 Arad_9114     TRUE 0.999 -3.000 0.812 0.016 Y NA
 5483468 5483469 Arad_9114 Arad_9116     TRUE 0.979 81.000 0.846 1.000 Y NA
 5483470 5483471 Arad_9117 Arad_9118 hutC   TRUE 0.995 -3.000 0.214 0.099 Y NA
 5483471 5483472 Arad_9118 Arad_9119     FALSE 0.413 106.000 0.214 NA N NA
 5483473 5483474 Arad_9120 Arad_9121 aspB2 speB FALSE 0.509 149.000 0.016 1.000 Y NA
 5483475 5483476 Arad_9122 Arad_9124     FALSE 0.009 262.000 0.000 NA   NA
 5483476 5483477 Arad_9124 Arad_9126     TRUE 0.651 112.000 0.439 1.000 N NA
 5483478 5483479 Arad_9127 Arad_9128     TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483479 5483480 Arad_9128 Arad_9129     FALSE 0.046 165.000 0.000 NA   NA
 5483480 5483481 Arad_9129 Arad_9130     FALSE 0.485 19.000 0.000 NA   NA
 5483481 5483482 Arad_9130 Arad_9131     FALSE 0.461 21.000 0.000 NA   NA
 5483482 5483483 Arad_9131 Arad_9133   pssN FALSE 0.281 47.000 0.000 NA   NA
 5483483 5483484 Arad_9133 Arad_9134 pssN glxA FALSE 0.083 56.000 0.000 1.000 N NA
 5483484 5483485 Arad_9134 Arad_9136 glxA   FALSE 0.000 662.000 0.000 1.000 N NA
 5483485 5483486 Arad_9136 Arad_9137     TRUE 0.761 90.000 0.036 1.000 Y NA
 5483487 5483488 Arad_9138 Arad_9140     TRUE 0.984 22.000 0.315 0.001 Y NA
 5483488 5483489 Arad_9140 Arad_9141     TRUE 0.991 -3.000 0.135 1.000 Y NA
 5483489 5483490 Arad_9141 Arad_9142   nlpE1 TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483490 5483491 Arad_9142 Arad_9143 nlpE1   FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 5483494 5483495 Arad_9148 Arad_9149     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483495 5483496 Arad_9149 Arad_9152     TRUE 0.819 -22.000 0.000 NA   NA
 5483496 5483497 Arad_9152 Arad_9153     FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 5483497 5483498 Arad_9153 Arad_9154   ropB2 FALSE 0.312 39.000 0.000 NA   NA
 5483501 5483502 Arad_9158 Arad_9160     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 5483503 5483504 Arad_9161 Arad_9162 exsI   FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 5483504 5483505 Arad_9162 Arad_9163     FALSE 0.121 104.000 0.000 NA   NA
 5483506 5483507 Arad_9164 Arad_9165   argE TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5483507 5483508 Arad_9165 Arad_9166 argE   TRUE 0.915 101.000 0.455 1.000 Y NA
 5483508 5483509 Arad_9166 Arad_9167     TRUE 0.946 23.000 0.476 NA   NA
 5483509 5483510 Arad_9167 Arad_9168     FALSE 0.312 158.000 0.235 NA   NA
 5483510 5483511 Arad_9168 Arad_9169     TRUE 0.994 10.000 0.412 0.085 Y NA
 5483511 5483512 Arad_9169 Arad_9170   gabDf1 TRUE 0.989 21.000 0.481 0.085 Y NA
 5483515 5483516 Arad_9174 Arad_9176   dehII TRUE 0.926 14.000 0.250 1.000   NA
 5483517 5483518 Arad_9178 Arad_9179   bioA TRUE 0.921 12.000 0.200 1.000   NA
 5483518 5483519 Arad_9179 Arad_9180 bioA   FALSE 0.164 221.000 0.300 1.000   NA
 5483519 5483520 Arad_9180 Arad_9181     TRUE 0.787 75.000 0.375 NA   NA
 5483520 5483521 Arad_9181 Arad_9182     TRUE 0.915 97.000 0.450 NA Y NA
 5483521 5483522 Arad_9182 Arad_9183     TRUE 0.999 3.000 0.900 NA Y NA
 5483522 5483523 Arad_9183 Arad_9184     TRUE 0.997 -3.000 0.900 NA   NA
 5483525 5483526 Arad_9188 Arad_9189     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA N NA
 5483526 5483527 Arad_9189 Arad_9190     TRUE 0.999 -6.000 0.833 NA Y NA
 5483528 5483529 Arad_9192 Arad_9193     FALSE 0.246 56.000 0.000 NA   NA
 5483529 5483530 Arad_9193 Arad_9194   fhuA TRUE 0.864 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5483531 5483532 Arad_9196 Arad_9197     FALSE 0.151 100.000 0.000 1.000   NA
 5483533 5483534 Arad_9198 Arad_9199     FALSE 0.473 132.000 0.000 NA Y NA
 5483534 5483535 Arad_9199 Arad_9201     FALSE 0.234 60.000 0.000 NA   NA
 5483538 5483539 Arad_9204 Arad_9205     TRUE 0.993 2.000 0.810 1.000 N NA
 5483539 5483540 Arad_9205 Arad_9206     TRUE 0.991 6.000 0.839 NA N NA
 5483540 5483541 Arad_9206 Arad_9207     TRUE 0.998 5.000 0.820 NA Y NA
 5483542 5483543 Arad_9208 Arad_9210   dctA FALSE 0.020 220.000 0.000 1.000   NA
 5483544 5483545 Arad_9211 Arad_9212 dctB dctD FALSE 0.207 423.000 0.615 1.000 Y NA
 5483545 5483546 Arad_9212 Arad_9214 dctD   FALSE 0.023 135.000 0.000 1.000 N NA
 5483547 5483548 Arad_9215 Arad_9216     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 5483548 5483549 Arad_9216 Arad_9217     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 5483549 5483550 Arad_9217 Arad_9218     TRUE 0.819 -22.000 0.000 NA   NA
 5483551 5483552 Arad_9219 Arad_9220 thiM thiEe TRUE 0.995 -3.000 0.146 0.005 Y NA
 5483552 5483553 Arad_9220 Arad_9221 thiEe thiD TRUE 0.994 -3.000 0.109 0.005 Y NA
 5483553 5483554 Arad_9221 Arad_9222 thiD   TRUE 0.906 -3.000 0.030 1.000 N NA
 5483555 5483556 Arad_9223 Arad_9224 phnA   FALSE 0.055 81.000 0.000 1.000 N NA
 5483556 5483557 Arad_9224 Arad_9226     FALSE 0.131 99.000 0.000 NA   NA
 5483557 5483558 Arad_9226 Arad_9228     FALSE 0.053 156.000 0.000 NA   NA
 5483559 5483560 Arad_9230 Arad_9231 rbcL   TRUE 0.984 6.000 0.541 NA   NA
 5483560 5483561 Arad_9231 Arad_9232     FALSE 0.475 97.000 0.162 NA   NA
 5483561 5483562 Arad_9232 Arad_9233     TRUE 0.737 78.000 0.320 NA   NA
 5483562 5483563 Arad_9233 Arad_9235     TRUE 0.873 70.000 0.520 NA   NA
 5483563 5483564 Arad_9235 Arad_9236     TRUE 0.993 -3.000 0.542 NA   NA
 5483564 5483565 Arad_9236 Arad_9237     TRUE 0.996 -3.000 0.793 NA   NA
 5483565 5483566 Arad_9237 Arad_9238     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 5483566 5483567 Arad_9238 Arad_9239     TRUE 0.985 0.000 0.433 NA   NA
 5483567 5483568 Arad_9239 Arad_9240     TRUE 0.797 41.000 0.250 NA   NA
 5483568 5483569 Arad_9240 Arad_9241     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5483569 5483570 Arad_9241 Arad_9242     TRUE 0.917 83.000 0.375 NA Y NA
 5483570 5483571 Arad_9242 Arad_9244     TRUE 0.969 105.000 0.875 NA Y NA
 5483571 5483572 Arad_9244 Arad_9246     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5483572 5483573 Arad_9246 Arad_9247     TRUE 0.886 35.000 0.375 NA   NA
 5483573 5483574 Arad_9247 Arad_9248     TRUE 0.977 25.000 0.800 1.000   NA
 5483575 5483576 Arad_9249 Arad_9250     TRUE 0.774 0.000 0.000 NA   NA
 5483576 5483577 Arad_9250 Arad_9252     FALSE 0.001 695.000 0.000 NA   NA
 5483577 5483578 Arad_9252 Arad_9253     TRUE 0.903 62.000 0.211 1.000 Y NA
 5483578 5483579 Arad_9253 Arad_9254   glnH TRUE 0.942 93.000 0.538 1.000 Y NA
 5483584 5483585 Arad_9259 Arad_9260     TRUE 0.986 8.000 0.608 1.000   NA
 5483585 5483586 Arad_9260 Arad_9261     TRUE 0.968 13.000 0.081 1.000 Y NA
 5483586 5483587 Arad_9261 Arad_9262     FALSE 0.143 29.000 0.000 1.000 N NA
 5483587 5483588 Arad_9262 Arad_9264     TRUE 0.919 7.000 0.069 0.028 N NA
 5483588 5483589 Arad_9264 Arad_9265     FALSE 0.248 130.000 0.138 NA N NA
 5483589 5483590 Arad_9265 Arad_9267     TRUE 0.829 98.000 0.227 NA Y NA
 5483590 5483591 Arad_9267 Arad_9268     TRUE 0.995 -3.000 0.318 NA Y NA
 5483591 5483592 Arad_9268 Arad_9270     TRUE 0.823 -13.000 0.000 NA   NA
 5483594 5483595 Arad_9272 Arad_9273     TRUE 0.936 16.000 0.333 NA   NA
 5483596 5483597 Arad_9274 Arad_9276     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 5483597 5483598 Arad_9276 Arad_9277     TRUE 0.983 4.000 0.477 NA   NA
 5483600 5483601 Arad_9280 Arad_9281 nodTch   TRUE 0.754 57.000 0.312 1.000 N NA
 5483601 5483602 Arad_9281 Arad_9282     TRUE 0.993 10.000 1.000 1.000 N NA
 5483603 5483604 Arad_9283 Arad_9284     TRUE 0.982 6.000 0.143 1.000 Y NA
 5483608 5483609 Arad_9289 Arad_9290   hmuU TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 5483609 5483610 Arad_9290 Arad_9291 hmuU   TRUE 0.992 -3.000 0.182 NA Y NA
 5483610 5483611 Arad_9291 Arad_9292     TRUE 0.979 9.000 0.156 NA Y NA
 5483611 5483612 Arad_9292 Arad_9293     FALSE 0.531 93.000 0.242 1.000 N NA
 5483612 5483613 Arad_9293 Arad_9294     FALSE 0.246 56.000 0.000 NA   NA
 5483613 5483614 Arad_9294 Arad_9295     FALSE 0.055 154.000 0.000 NA   NA
 5483614 5483615 Arad_9295 Arad_9296     TRUE 0.953 31.000 0.250 1.000 Y NA
 5483615 5483616 Arad_9296 Arad_9297     TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.016 Y NA
 5483616 5483617 Arad_9297 Arad_9298     TRUE 0.997 11.000 0.789 1.000 Y NA
 5483617 5483618 Arad_9298 Arad_9299     TRUE 0.943 12.000 0.273 1.000   NA
 5483618 5483619 Arad_9299 Arad_9300     TRUE 0.776 67.000 0.318 NA   NA
 5483621 5483622 Arad_9304 Arad_9305     TRUE 0.947 0.000 0.133 NA   NA
 5483622 5483623 Arad_9305 Arad_9306     TRUE 0.962 2.000 0.238 NA   NA
 5483623 5483624 Arad_9306 Arad_9308     TRUE 0.933 9.000 0.267 NA N NA
 5483627 5483628 Arad_9311 Arad_9313   dppCf TRUE 0.991 -3.000 0.467 NA   NA
 5483628 5483629 Arad_9313 Arad_9314 dppCf   TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA Y NA
 5483629 5483630 Arad_9314 Arad_9315     TRUE 0.997 2.000 0.556 NA Y NA
 5483630 5483631 Arad_9315 Arad_9316     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 5483631 5483632 Arad_9316 Arad_9318     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5483632 5483633 Arad_9318 Arad_9319     FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483633 5483634 Arad_9319 Arad_9321     FALSE 0.032 112.000 0.000 1.000 N NA
 5483635 5483636 Arad_9323 Arad_9324   ugpBc FALSE 0.070 275.000 0.000 NA Y NA
 5483636 5483637 Arad_9324 Arad_9326 ugpBc ugpAc TRUE 0.980 68.000 0.793 NA Y NA
 5483637 5483638 Arad_9326 Arad_9327 ugpAc ugpEc TRUE 0.994 10.000 0.559 NA Y NA
 5483638 5483639 Arad_9327 Arad_9328 ugpEc ugpCc TRUE 0.996 0.000 0.464 NA Y NA
 5483639 5483640 Arad_9328 Arad_9331 ugpCc   FALSE 0.009 142.000 0.000 NA N NA
 5483640 5483641 Arad_9331 Arad_9333   pit TRUE 0.996 -3.000 0.396 NA Y NA
 5483641 5483642 Arad_9333 Arad_9335 pit   FALSE 0.000 482.000 0.000 NA N NA
 5483642 5483643 Arad_9335 Arad_9336     TRUE 0.980 69.000 0.800 NA Y NA
 5483643 5483644 Arad_9336 Arad_9337   dppCch1 TRUE 0.999 -3.000 0.850 NA Y NA
 5483644 5483645 Arad_9337 Arad_9338 dppCch1   TRUE 0.979 7.000 0.471 NA   NA
 5483645 5483646 Arad_9338 Arad_9339   bioA TRUE 0.615 41.000 0.040 1.000   NA
 5483646 5483647 Arad_9339 Arad_9340 bioA gatA1 TRUE 0.701 17.000 0.040 1.000 N NA
 5483647 5483648 Arad_9340 Arad_9341 gatA1   FALSE 0.297 115.000 0.056 NA   NA
 5483648 5483649 Arad_9341 Arad_9343     TRUE 0.980 33.000 1.000 NA   NA
 5483649 5483650 Arad_9343 Arad_9344     FALSE 0.004 230.000 0.000 1.000 N NA
 5483651 5483652 Arad_9345 Arad_9346 dppCch1   TRUE 0.982 50.000 0.725 NA Y NA
 5483652 5483653 Arad_9346 Arad_9347     TRUE 0.804 75.000 0.042 NA Y NA
 5483655 5483656 Arad_9350 Arad_9351     TRUE 0.565 14.000 0.000 NA   NA
 5483656 5483657 Arad_9351 Arad_9353     TRUE 0.621 31.000 0.000 0.053   NA
 5483657 5483658 Arad_9353 Arad_9355   braG TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5483658 5483659 Arad_9355 Arad_9356 braG braF TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 5483659 5483660 Arad_9356 Arad_9357 braF braE TRUE 0.980 -7.000 0.000 NA Y NA
 5483660 5483661 Arad_9357 Arad_9358 braE braD TRUE 0.977 4.000 0.033 NA Y NA
 5483661 5483662 Arad_9358 Arad_9359 braD   TRUE 0.987 -3.000 0.033 NA Y NA
 5483662 5483663 Arad_9359 Arad_9360     FALSE 0.012 118.000 0.000 NA N NA
 5483663 5483664 Arad_9360 Arad_9362     FALSE 0.057 33.000 0.000 NA N NA
 5483665 5483666 Arad_9363 Arad_9364   ampR FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483667 5483668 Arad_9365 Arad_9366     TRUE 0.995 -3.000 0.296 NA Y NA
 5483668 5483669 Arad_9366 Arad_9368     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 5483669 5483670 Arad_9368 Arad_9369   oxyR FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 5483674 5483675 Arad_9373 Arad_9375 exsH   FALSE 0.311 49.000 0.000 1.000   NA
 5483675 5483676 Arad_9375 Arad_9376     FALSE 0.164 176.000 0.200 1.000 N NA
 5483677 5483678 Arad_9378 Arad_9379     FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 5483679 5483680 Arad_9380 Arad_9381 pssF pssP FALSE 0.354 -3.000 0.000 NA N NA
 5483680 5483681 Arad_9381 Arad_9382 pssP   TRUE 0.569 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5483681 5483682 Arad_9382 Arad_9384     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483682 5483683 Arad_9384 Arad_9385     FALSE 0.099 117.000 0.000 NA   NA
 5483683 5483684 Arad_9385 Arad_9388   exoY FALSE 0.005 168.000 0.000 NA N NA
 5483685 5483686 Arad_9389 Arad_9390     FALSE 0.054 165.000 0.000 1.000   NA
 5483686 5483687 Arad_9390 Arad_9391   exoF1 TRUE 0.835 37.000 0.000 1.000 Y NA
 5483688 5483689 Arad_9393 Arad_9394     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 5483689 5483690 Arad_9394 Arad_9395     FALSE 0.116 106.000 0.000 NA   NA
 5483692 5483693 Arad_9398 Arad_9399 feuQ feuP TRUE 0.999 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 5483693 5483694 Arad_9399 Arad_9400 feuP   TRUE 0.610 12.000 0.000 NA   NA
 5483698 5483699 Arad_9405 Arad_9406     TRUE 0.993 5.000 0.414 1.000 Y NA
 5483699 5483700 Arad_9406 Arad_9407     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5483701 5483702 Arad_9408 Arad_9410     TRUE 0.785 131.000 0.667 NA   NA
 5483702 5483703 Arad_9410 Arad_9411     TRUE 0.826 -3.000 0.000 NA   NA
 5483703 5483704 Arad_9411 Arad_9414     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5483706 5483707 Arad_9417 Arad_9418     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 5483707 5483708 Arad_9418 Arad_9420     FALSE 0.002 424.000 0.000 NA   NA
 5483710 5483711 Arad_9422 Arad_9423     FALSE 0.075 25.000 0.000 NA N NA
 5483711 5483712 Arad_9423 Arad_9424     TRUE 0.974 101.000 0.941 NA Y NA
 5483712 5483713 Arad_9424 Arad_9425   rbsCch4 TRUE 0.999 -7.000 0.941 NA Y NA
 5483713 5483714 Arad_9425 Arad_9426 rbsCch4   TRUE 0.999 -7.000 0.938 NA Y NA
 5483714 5483715 Arad_9426 Arad_9427     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 5483715 5483716 Arad_9427 Arad_9428     TRUE 0.968 23.000 0.273 1.000 Y NA
 5483717 5483718 Arad_9431 Arad_9432     FALSE 0.220 154.000 0.200 NA N NA
 5483718 5483719 Arad_9432 Arad_9433     TRUE 0.745 63.000 0.333 NA N NA
 5483719 5483720 Arad_9433 Arad_9434     TRUE 0.968 14.000 0.125 1.000 Y NA
 5483720 5483721 Arad_9434 Arad_9435     TRUE 0.989 5.000 0.148 0.016 Y NA
 5483721 5483722 Arad_9435 Arad_9436     TRUE 0.978 63.000 0.706 1.000 Y NA
 5483722 5483723 Arad_9436 Arad_9437     FALSE 0.001 320.000 0.000 1.000 N NA
 5483724 5483725 Arad_9438 Arad_9439     TRUE 0.856 24.000 0.276 1.000 N NA
 5483725 5483726 Arad_9439 Arad_9440     TRUE 0.695 39.000 0.194 1.000 N NA
 5483726 5483727 Arad_9440 Arad_9441     TRUE 0.969 -3.000 0.194 NA   NA
 5483727 5483728 Arad_9441 Arad_9442     TRUE 0.793 21.000 0.088 NA   NA
 5483728 5483729 Arad_9442 Arad_9443     FALSE 0.295 43.000 0.000 NA   NA
 5483730 5483731 Arad_9445 Arad_9446     TRUE 0.994 -3.000 0.083 0.013 Y NA
 5483731 5483732 Arad_9446 Arad_9447     TRUE 0.984 12.000 0.167 0.013 Y NA
 5483732 5483733 Arad_9447 Arad_9449   mctS TRUE 0.996 -3.000 0.261 0.015 Y NA
 5483735 5483736 Arad_9452 Arad_9453     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 5483736 5483737 Arad_9453 Arad_9454     TRUE 0.997 4.000 0.714 NA Y NA
 5483737 5483738 Arad_9454 Arad_9455     TRUE 0.998 4.000 0.833 NA Y NA
 5483738 5483739 Arad_9455 Arad_9456     TRUE 0.897 118.000 0.500 NA Y NA
 5483739 5483740 Arad_9456 Arad_9457     FALSE 0.114 211.000 0.250 NA N NA
 5483740 5483741 Arad_9457 Arad_9458   celI FALSE 0.061 227.000 0.167 1.000 N NA
 5483741 5483742 Arad_9458 Arad_9459 celI   FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5483743 5483744 Arad_9462 Arad_9463 kdpA kdpB FALSE 0.446 221.000 0.201 0.001 Y NA
 5483744 5483745 Arad_9463 Arad_9464 kdpB kdpC TRUE 0.998 13.000 0.877 0.001 Y NA
 5483745 5483746 Arad_9464 Arad_9466 kdpC kdpD FALSE 0.506 62.000 0.106 1.000 N NA
 5483746 5483747 Arad_9466 Arad_9467 kdpD kdpE TRUE 0.999 -3.000 0.695 1.000 Y NA
 5483747 5483748 Arad_9467 Arad_9468 kdpE ptsNe TRUE 0.984 5.000 0.169 1.000 Y NA
 5483748 5483749 Arad_9468 Arad_9469 ptsNe   FALSE 0.013 163.000 0.000 1.000 N NA
 5483749 5483750 Arad_9469 Arad_9470   cysT TRUE 0.912 7.000 0.026 0.001 N NA
 5483750 5483751 Arad_9470 Arad_9472 cysT cysW TRUE 0.998 -10.000 0.935 0.000 N NA
 5483751 5483752 Arad_9472 Arad_9473 cysW   TRUE 0.963 12.000 0.025 1.000 Y NA
 5483753 5483754 Arad_9474 Arad_9475     FALSE 0.062 157.000 0.000 1.000   NA
 5483754 5483755 Arad_9475 Arad_9477     FALSE 0.107 111.000 0.000 NA   NA
 5483755 5483756 Arad_9477 Arad_9478   cls FALSE 0.335 123.000 0.121 NA   NA
 5483757 5483758 Arad_9480 Arad_9483     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 5483758 5483759 Arad_9483 Arad_9486   gste FALSE 0.061 149.000 0.000 NA   NA
 5483759 5483760 Arad_9486 Arad_9487 gste   TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 5483761 5483762 Arad_9488 Arad_9489     FALSE 0.055 81.000 0.000 1.000 N NA
 5483762 5483763 Arad_9489 Arad_9490   pcaF FALSE 0.380 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5483763 5483764 Arad_9490 Arad_9491 pcaF pcaJ TRUE 0.994 11.000 0.517 1.000 Y NA
 5483764 5483765 Arad_9491 Arad_9494 pcaJ pcaI TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 5483770 5483771 Arad_9500 Arad_9502 pcaD pcaC TRUE 0.995 -7.000 0.636 1.000   NA
 5483771 5483772 Arad_9502 Arad_9503 pcaC pcaH TRUE 0.869 13.000 0.080 1.000   NA
 5483772 5483773 Arad_9503 Arad_9504 pcaH pcaG TRUE 0.999 -3.000 0.782 0.000 Y NA
 5483773 5483774 Arad_9504 Arad_9505 pcaG pcaB TRUE 0.960 4.000 0.314 1.000 N NA
 5483774 5483775 Arad_9505 Arad_9506 pcaB   FALSE 0.106 153.000 0.028 1.000 N NA
 5483775 5483776 Arad_9506 Arad_9507     TRUE 0.964 112.000 0.867 NA Y NA
 5483776 5483777 Arad_9507 Arad_9508     TRUE 0.999 2.000 1.000 NA Y NA
 5483777 5483778 Arad_9508 Arad_9509     TRUE 0.999 -3.000 0.824 NA Y NA
 5483778 5483779 Arad_9509 Arad_9510     TRUE 0.999 -19.000 0.824 0.050 Y NA
 5483781 5483782 Arad_9512 Arad_9513     FALSE 0.042 232.000 0.000 0.013   NA
 5483783 5483784 Arad_9514 Arad_9516     TRUE 0.961 -10.000 0.111 1.000   NA
 5483785 5483786 Arad_9517 Arad_9518 cyaCe   FALSE 0.367 30.000 0.000 NA   NA
 5483788 5483789 Arad_9522 Arad_9523   cyaA FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5483789 5483790 Arad_9523 Arad_9524 cyaA   FALSE 0.367 162.000 0.292 1.000   NA
 5483790 5483791 Arad_9524 Arad_9525     TRUE 0.996 -6.000 0.741 NA   NA
 5483791 5483792 Arad_9525 Arad_9526     TRUE 0.999 -7.000 0.821 NA Y NA
 5483792 5483793 Arad_9526 Arad_9527     TRUE 0.946 81.000 0.929 NA   NA
 5483793 5483794 Arad_9527 Arad_9528   redA TRUE 0.576 75.000 0.158 NA   NA
 5483794 5483795 Arad_9528 Arad_9529 redA redB TRUE 0.973 18.000 0.614 1.000   NA
 5483795 5483796 Arad_9529 Arad_9530 redB   TRUE 0.984 -18.000 0.318 1.000   NA
 5483796 5483797 Arad_9530 Arad_9531     FALSE 0.052 238.000 0.068 1.000   NA
 5483797 5483798 Arad_9531 Arad_9532     TRUE 0.627 52.000 0.186 1.000 N NA
 5483798 5483799 Arad_9532 Arad_9534     FALSE 0.050 87.000 0.000 1.000 N NA
 5483799 5483800 Arad_9534 Arad_9535     FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 5483801 5483802 Arad_9536 Arad_9538   agaL2 FALSE 0.037 184.000 0.000 1.000   NA
 5483802 5483803 Arad_9538 Arad_9539 agaL2   TRUE 0.958 18.000 0.464 1.000   NA
 5483803 5483804 Arad_9539 Arad_9540     TRUE 0.989 14.000 0.857 NA   NA
 5483804 5483805 Arad_9540 Arad_9543     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5483805 5483806 Arad_9543 Arad_9544   agpA TRUE 0.933 152.000 0.867 NA Y NA
 5483806 5483807 Arad_9544 Arad_9545 agpA agaL1 FALSE 0.449 141.000 0.348 NA N NA
 5483808 5483809 Arad_9546 Arad_9548   lacZ2 FALSE 0.002 287.000 0.000 1.000 N NA
 5483809 5483810 Arad_9548 Arad_9549 lacZ2   FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5483812 5483813 Arad_9551 Arad_9552     TRUE 0.588 89.000 0.273 1.000 N NA
 5483813 5483814 Arad_9552 Arad_9553     FALSE 0.004 181.000 0.000 NA N NA
 5483814 5483815 Arad_9553 Arad_9554     TRUE 0.812 93.000 0.171 NA Y NA
 5483815 5483816 Arad_9554 Arad_9556     TRUE 0.784 32.000 0.195 NA   NA
 5483817 5483818 Arad_9558 Arad_9559   exoZ FALSE 0.003 367.000 0.000 NA   NA
 5483818 5483819 Arad_9559 Arad_9561 exoZ   TRUE 0.947 -3.000 0.150 NA N NA
 5483819 5483820 Arad_9561 Arad_9562   exoF2 TRUE 0.991 10.000 0.400 NA Y NA
 5483820 5483821 Arad_9562 Arad_9563 exoF2 exoY TRUE 0.957 84.000 0.611 NA Y NA
 5483822 5483823 Arad_9564 Arad_9565 exoX exoU FALSE 0.152 90.000 0.000 NA   NA
 5483824 5483825 Arad_9566 Arad_9567 exoV exoW FALSE 0.475 86.000 0.100 NA   NA
 5483826 5483827 Arad_9569 Arad_9570 exoT exoH FALSE 0.003 400.000 0.000 1.000   NA
 5483827 5483828 Arad_9570 Arad_9571 exoH exoK TRUE 0.960 4.000 0.250 1.000   NA
 5483828 5483829 Arad_9571 Arad_9573 exoK exoL TRUE 0.594 65.000 0.129 NA   NA
 5483829 5483830 Arad_9573 Arad_9574 exoL exoA TRUE 0.963 -3.000 0.143 NA   NA
 5483830 5483831 Arad_9574 Arad_9575 exoA exoM TRUE 0.963 -3.000 0.143 NA   NA
 5483831 5483832 Arad_9575 Arad_9576 exoM exoO TRUE 0.980 -3.000 0.280 NA   NA
 5483832 5483833 Arad_9576 Arad_9577 exoO exoN TRUE 0.992 5.000 0.357 NA Y NA
 5483833 5483834 Arad_9577 Arad_9578 exoN exoP TRUE 0.915 84.000 0.357 1.000 Y NA
 5483835 5483836 Arad_9579 Arad_9580     FALSE 0.086 129.000 0.000 NA   NA
 5483836 5483837 Arad_9580 Arad_9582   mocFe FALSE 0.172 82.000 0.000 NA   NA
 5483837 5483838 Arad_9582 Arad_9583 mocFe mocEe TRUE 0.988 11.000 0.727 NA   NA
 5483838 5483839 Arad_9583 Arad_9584 mocEe mocD TRUE 0.975 32.000 1.000 NA N NA
 5483840 5483841 Arad_9585 Arad_9586     FALSE 0.538 160.000 0.119 NA Y NA
 5483842 5483843 Arad_9587 Arad_9589 nikR cobM FALSE 0.065 72.000 0.000 1.000 N NA
 5483843 5483844 Arad_9589 Arad_9591 cobM cobL TRUE 0.964 17.000 0.016 0.006 Y NA
 5483846 5483847 Arad_9593 Arad_9594 cobJ cobI TRUE 0.994 -18.000 0.138 0.006 Y NA
 5483847 5483848 Arad_9594 Arad_9595 cobI cobH TRUE 0.995 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 5483848 5483849 Arad_9595 Arad_9596 cobH cobG TRUE 0.952 3.000 0.255 1.000 N NA
 5483849 5483850 Arad_9596 Arad_9597 cobG cobF FALSE 0.116 169.000 0.082 1.000 N NA
 5483850 5483851 Arad_9597 Arad_9599 cobF   FALSE 0.192 75.000 0.000 NA   NA
 5483851 5483852 Arad_9599 Arad_9600     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5483852 5483853 Arad_9600 Arad_9601   putR FALSE 0.095 134.000 0.000 1.000   NA
 5483855 5483856 Arad_9604 Arad_9605   hydA TRUE 0.946 -3.000 0.053 NA   NA
 5483856 5483857 Arad_9605 Arad_9606 hydA   TRUE 0.945 -3.000 0.118 1.000 N NA
 5483857 5483858 Arad_9606 Arad_9607   ooxA TRUE 0.989 -3.000 0.429 1.000   NA
 5483858 5483859 Arad_9607 Arad_9608 ooxA dapA TRUE 0.932 11.000 0.211 1.000   NA
 5483859 5483860 Arad_9608 Arad_9609 dapA   TRUE 0.959 17.000 0.105 1.000 Y NA
 5483860 5483861 Arad_9609 Arad_9611     TRUE 0.954 73.000 0.500 1.000 Y NA
 5483861 5483862 Arad_9611 Arad_9612     FALSE 0.494 112.000 0.286 1.000 N NA
 5483864 5483865 Arad_9614 Arad_9616 xylG   TRUE 0.979 -7.000 0.263 NA   NA
 5483865 5483866 Arad_9616 Arad_9618     FALSE 0.420 108.000 0.158 NA   NA
 5483866 5483867 Arad_9618 Arad_9619     FALSE 0.119 232.000 0.000 NA Y NA
 5483867 5483868 Arad_9619 Arad_9621     TRUE 0.998 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 5483869 5483870 Arad_9622 Arad_9623     TRUE 0.572 16.000 0.000 1.000   NA
 5483871 5483872 Arad_9624 Arad_9625     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA Y NA
 5483874 5483875 Arad_9627 Arad_9628     TRUE 0.857 21.000 0.190 1.000   NA
 5483876 5483877 Arad_9629 Arad_9630 thuE thuF TRUE 0.993 2.000 0.333 NA Y NA
 5483877 5483878 Arad_9630 Arad_9631 thuF thuG TRUE 0.987 -3.000 0.021 NA Y NA
 5483878 5483879 Arad_9631 Arad_9632 thuG   TRUE 0.958 5.000 0.000 NA Y NA
 5483879 5483880 Arad_9632 Arad_9633     TRUE 0.898 12.000 0.154 NA   NA
 5483880 5483881 Arad_9633 Arad_9634     TRUE 0.997 -3.000 0.889 NA   NA
 5483881 5483882 Arad_9634 Arad_9635     TRUE 0.993 -3.000 0.556 NA   NA
 5483882 5483883 Arad_9635 Arad_9636   rpe TRUE 0.982 -3.000 0.308 NA   NA
 5483883 5483884 Arad_9636 Arad_9637 rpe   TRUE 0.981 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5483884 5483885 Arad_9637 Arad_9638     TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5483885 5483886 Arad_9638 Arad_9639     FALSE 0.234 121.000 0.000 0.049   NA
 5483886 5483887 Arad_9639 Arad_9640     FALSE 0.009 271.000 0.000 1.000   NA
 5483887 5483888 Arad_9640 Arad_9641     TRUE 0.774 25.000 0.088 1.000   NA
 5483888 5483889 Arad_9641 Arad_9642     TRUE 0.956 3.000 0.088 0.052   NA
 5483889 5483890 Arad_9642 Arad_9643     TRUE 0.881 80.000 0.250 NA Y NA
 5483890 5483891 Arad_9643 Arad_9644   appB TRUE 0.971 82.000 0.750 NA Y NA
 5483891 5483892 Arad_9644 Arad_9645 appB appC TRUE 0.997 11.000 0.800 NA Y NA
 5483892 5483893 Arad_9645 Arad_9647 appC   TRUE 0.977 9.000 0.125 NA Y NA
 5483894 5483895 Arad_9648 Arad_9649 rtlK   TRUE 0.971 3.000 0.306 1.000   NA
 5483895 5483896 Arad_9649 Arad_9651     TRUE 0.881 37.000 0.375 NA   NA
 5483896 5483897 Arad_9651 Arad_9652     TRUE 0.993 -3.000 0.565 NA   NA
 5483897 5483898 Arad_9652 Arad_9653     TRUE 0.843 90.000 0.565 NA   NA
 5483898 5483899 Arad_9653 Arad_9654     FALSE 0.002 213.000 0.000 NA N NA
 5483899 5483900 Arad_9654 Arad_9656   mcpCf FALSE 0.004 231.000 0.000 1.000 N NA
 5483900 5483901 Arad_9656 Arad_9657 mcpCf   FALSE 0.081 133.000 0.000 NA   NA
 5483901 5483902 Arad_9657 Arad_9658     FALSE 0.079 135.000 0.000 NA   NA
 5483903 5483904 Arad_9660 Arad_9661     TRUE 0.996 16.000 0.852 NA Y NA
 5483904 5483905 Arad_9661 Arad_9664     TRUE 0.985 44.000 0.741 NA Y NA
 5483906 5483907 Arad_9666 Arad_9668     FALSE 0.115 196.000 0.125 NA   NA
 5483907 5483908 Arad_9668 Arad_9669     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 5483908 5483909 Arad_9669 Arad_9671   idnO TRUE 0.674 140.000 0.167 1.000 Y NA
 5483910 5483911 Arad_9672 Arad_9673   idnD TRUE 0.938 11.000 0.300 1.000 N NA
 5483914 5483915 Arad_9677 Arad_9679     FALSE 0.331 44.000 0.000 1.000   NA
 5483915 5483916 Arad_9679 Arad_9680     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 5483916 5483917 Arad_9680 Arad_9681     TRUE 0.991 -3.000 0.136 NA Y NA
 5483917 5483918 Arad_9681 Arad_9683     FALSE 0.403 188.000 0.136 NA Y NA
 5483918 5483919 Arad_9683 Arad_9685   hipO FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5483920 5483921 Arad_9686 Arad_9687     TRUE 0.661 164.000 0.750 NA N NA
 5483921 5483922 Arad_9687 Arad_9688   fhuA FALSE 0.510 120.000 0.000 NA Y NA
 5483922 5483923 Arad_9688 Arad_9689 fhuA   TRUE 0.973 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5483923 5483924 Arad_9689 Arad_9690     TRUE 0.711 73.000 0.000 NA Y NA
 5483925 5483926 Arad_9691 Arad_9692     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 5483926 5483927 Arad_9692 Arad_9693     TRUE 0.772 177.000 1.000 NA   NA
 5483927 5483928 Arad_9693 Arad_9694     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5483930 5483931 Arad_9696 Arad_9697 dppFch2 dppDch2 TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.049 Y NA
 5483931 5483932 Arad_9697 Arad_9699 dppDch2 dppCch2 TRUE 0.997 -13.000 0.500 NA Y NA
 5483932 5483933 Arad_9699 Arad_9700 dppCch2 dppBch2 TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5483933 5483934 Arad_9700 Arad_9701 dppBch2 dppAch2 TRUE 0.993 21.000 0.750 NA Y NA
 5483935 5483936 Arad_9702 Arad_9703   uxuAch TRUE 0.883 35.000 0.429 1.000 N NA
 5483936 5483937 Arad_9703 Arad_9704 uxuAch   TRUE 0.576 39.000 0.078 1.000 N NA
 5483937 5483938 Arad_9704 Arad_9705     FALSE 0.029 71.000 0.000 NA N NA
 5483939 5483940 Arad_9706 Arad_9707   braG TRUE 0.693 30.000 0.138 1.000 N NA
 5483940 5483941 Arad_9707 Arad_9708 braG   TRUE 0.924 90.000 0.444 NA Y NA
 5483941 5483942 Arad_9708 Arad_9709   braE TRUE 0.931 103.000 0.556 NA Y NA
 5483942 5483943 Arad_9709 Arad_9710 braE braD TRUE 0.999 -3.000 0.818 NA Y NA
 5483945 5483946 Arad_9713