MicrobesOnline Operon Predictions for Methanocella paludicola SANAE

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10154380 10154381 MCP_0002 MCP_0003     FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10154383 10154384 MCP_0005 MCP_0006     FALSE 0.098 53.000 0.000 NA   NA
 10154384 10154385 MCP_0006 MCP_0007     FALSE 0.089 114.000 0.000 1.000   NA
 10154385 10154386 MCP_0007 MCP_0008     FALSE 0.212 49.000 0.000 1.000 N NA
 10154386 10154387 MCP_0008 MCP_0009   pfdA TRUE 0.982 7.000 0.050 1.000 N NA
 10154387 10154388 MCP_0009 MCP_0010 pfdA rplX TRUE 0.994 4.000 0.348 1.000   NA
 10154388 10154389 MCP_0010 MCP_0011 rplX aif6 TRUE 0.990 7.000 0.324 1.000   NA
 10154389 10154390 MCP_0011 MCP_0012 aif6 rpl31e TRUE 0.993 13.000 0.474 1.000 Y NA
 10154390 10154391 MCP_0012 MCP_0013 rpl31e rpl39e TRUE 0.992 10.000 0.434 0.027   NA
 10154391 10154392 MCP_0013 MCP_0014 rpl39e   TRUE 0.996 -3.000 0.163 NA   NA
 10154392 10154393 MCP_0014 MCP_0015     TRUE 0.995 2.000 0.262 NA   NA
 10154393 10154394 MCP_0015 MCP_0016   rps19e TRUE 0.907 43.000 0.399 1.000   NA
 10154394 10154395 MCP_0016 MCP_0017 rps19e   FALSE 0.294 229.000 0.000 1.000 Y NA
 10154395 10154396 MCP_0017 MCP_0018     TRUE 0.951 16.000 0.098 NA   NA
 10154396 10154397 MCP_0018 MCP_0019     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 10154397 10154398 MCP_0019 MCP_0020     FALSE 0.060 281.000 0.000 NA   NA
 10154398 10154399 MCP_0020 MCP_0021     FALSE 0.057 120.000 0.000 NA   NA
 10154399 10154400 MCP_0021 MCP_0022     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10154401 10154402 MCP_0023 MCP_0024     FALSE 0.085 60.000 0.000 NA   NA
 10154402 10154403 MCP_0024 MCP_0025     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10154403 10154404 MCP_0025 MCP_0026     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154404 10154405 MCP_0026 MCP_0027     TRUE 0.592 24.000 0.000 0.077   NA
 10154405 10154406 MCP_0027 MCP_0028     FALSE 0.187 47.000 0.000 1.000   NA
 10154406 10154407 MCP_0028 MCP_0029   lysS FALSE 0.151 52.000 0.000 1.000   NA
 10154407 10154408 MCP_0029 MCP_0030 lysS   FALSE 0.173 49.000 0.000 1.000   NA
 10154408 10154409 MCP_0030 MCP_0031   coaD TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10154409 10154410 MCP_0031 MCP_0032 coaD   TRUE 0.992 -3.000 0.017 NA   NA
 10154412 10154413 MCP_t0001 MCP_0034     FALSE 0.057 246.000 0.000 NA   NA
 10154413 10154414 MCP_0034 MCP_0035     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10154414 10154415 MCP_0035 MCP_0036     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10154416 10154417 MCP_0037 MCP_0038     FALSE 0.063 98.000 0.000 NA   NA
 10154419 10154420 MCP_0040 MCP_0041 top6A-1 top6B-1 TRUE 0.914 184.000 0.328 0.003 Y NA
 10154422 10154423 MCP_0043 MCP_0044     FALSE 0.058 248.000 0.000 NA   NA
 10154423 10154424 MCP_0044 MCP_0045     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10154428 10154429 MCP_0049 MCP_0050     FALSE 0.118 49.000 0.000 NA   NA
 10154430 10154431 MCP_0051 MCP_0052     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 10154431 10154432 MCP_0052 MCP_0053     FALSE 0.278 334.000 0.000 NA Y NA
 10154433 10154434 MCP_0054 MCP_t0002     FALSE 0.055 216.000 0.000 NA   NA
 10154434 10154435 MCP_t0002 MCP_0055     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10154436 10154437 MCP_0056 MCP_0057     FALSE 0.103 134.000 0.000 1.000 N NA
 10154437 10154438 MCP_0057 MCP_0058     TRUE 0.606 16.000 0.000 1.000 N NA
 10154443 10154444 MCP_0063 MCP_0064     FALSE 0.253 33.000 0.000 NA   NA
 10154446 10154447 MCP_0066 MCP_0067     TRUE 0.992 3.000 0.161 NA   NA
 10154450 10154451 MCP_0070 MCP_t0003     FALSE 0.069 85.000 0.000 NA   NA
 10154451 10154452 MCP_t0003 MCP_0071     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10154453 10154454 MCP_0072 MCP_0073     TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10154454 10154455 MCP_0073 MCP_0074     FALSE 0.204 39.000 0.000 NA   NA
 10154455 10154456 MCP_0074 MCP_0075     FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10154458 10154459 MCP_0077 MCP_0078     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 10154460 10154461 MCP_0079 MCP_0080     TRUE 0.836 -73.000 0.000 NA   NA
 10154461 10154462 MCP_0080 MCP_0081     TRUE 0.907 -7.000 0.000 NA N NA
 10154462 10154463 MCP_0081 MCP_0082   ligT TRUE 0.441 42.000 0.000 0.037 N NA
 10154463 10154464 MCP_0082 MCP_0083 ligT cca TRUE 0.998 -10.000 0.096 1.000 Y NA
 10154467 10154468 MCP_0086 MCP_0087     TRUE 0.993 -3.000 0.012 1.000   NA
 10154472 10154473 MCP_0091 MCP_0092     FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 10154473 10154474 MCP_0092 MCP_0093     FALSE 0.323 24.000 0.000 NA   NA
 10154474 10154475 MCP_0093 MCP_0094     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154475 10154476 MCP_0094 MCP_0095     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10154478 10154479 MCP_0097 MCP_0098   dys-1 TRUE 0.858 5.000 0.000 1.000 N NA
 10154479 10154480 MCP_0098 MCP_0099 dys-1 nrpR-1 FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10154481 10154482 MCP_0100 MCP_0101     TRUE 0.503 73.000 0.009 NA   NA
 10154483 10154484 MCP_0102 MCP_0103     FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 10154484 10154485 MCP_0103 MCP_0104     FALSE 0.106 219.000 0.000 1.000 N NA
 10154485 10154486 MCP_0104 MCP_0105     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 10154486 10154487 MCP_0105 MCP_m0001     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 10154489 10154490 MCP_0107 MCP_0108     TRUE 0.979 -3.000 0.000 NA Y NA
 10154491 10154492 MCP_0109 MCP_0110 pyrC   FALSE 0.121 350.000 0.000 1.000 N NA
 10154492 10154493 MCP_0110 MCP_0111     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10154493 10154494 MCP_0111 MCP_0112     TRUE 0.708 45.000 0.017 NA   NA
 10154494 10154495 MCP_0112 MCP_0113     TRUE 0.894 426.000 0.081 0.003 Y NA
 10154499 10154500 MCP_r0001 MCP_t0004     FALSE 0.054 169.000 0.000 NA   NA
 10154500 10154501 MCP_t0004 MCP_r0002     FALSE 0.073 504.000 0.000 NA   NA
 10154501 10154502 MCP_r0002 MCP_r0003     FALSE 0.054 175.000 0.000 NA   NA
 10154502 10154503 MCP_r0003 MCP_0117     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 10154504 10154505 MCP_0118 MCP_0119 gatE gatD TRUE 0.999 -3.000 0.301 0.003 Y NA
 10154505 10154506 MCP_0119 MCP_0120 gatD argH TRUE 0.995 5.000 0.086 1.000 Y NA
 10154508 10154509 MCP_0122 MCP_0123     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10154510 10154511 MCP_0124 MCP_0125   purE TRUE 0.685 7.000 0.000 NA   NA
 10154511 10154512 MCP_0125 MCP_0126 purE   TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154514 10154515 MCP_0128 MCP_0129     FALSE 0.068 413.000 0.000 NA   NA
 10154516 10154517 MCP_0130 MCP_0131 tbp-1   FALSE 0.075 216.000 0.000 NA N NA
 10154518 10154519 MCP_0132 MCP_0133     TRUE 0.993 -3.000 0.019 1.000   NA
 10154519 10154520 MCP_0133 MCP_0134     TRUE 0.891 2.000 0.000 1.000   NA
 10154523 10154524 MCP_0137 MCP_0138     FALSE 0.054 196.000 0.000 NA   NA
 10154524 10154525 MCP_0138 MCP_0139     FALSE 0.151 52.000 0.000 1.000   NA
 10154526 10154527 MCP_0140 MCP_0141     FALSE 0.334 23.000 0.000 NA   NA
 10154528 10154529 MCP_0142 MCP_0143 tatC-1   FALSE 0.098 73.000 0.000 NA N NA
 10154529 10154530 MCP_0143 MCP_0144     TRUE 0.872 19.000 0.000 0.025 Y NA
 10154532 10154533 MCP_0146 MCP_0147     FALSE 0.094 428.000 0.000 NA N NA
 10154533 10154534 MCP_0147 MCP_0148   glyS TRUE 0.987 2.000 0.004 NA N NA
 10154534 10154535 MCP_0148 MCP_0149 glyS   FALSE 0.054 179.000 0.000 NA   NA
 10154536 10154537 MCP_0150 MCP_0151     FALSE 0.070 81.000 0.000 NA   NA
 10154537 10154538 MCP_0151 MCP_0152     FALSE 0.081 145.000 0.000 1.000   NA
 10154538 10154539 MCP_0152 MCP_0153     FALSE 0.088 117.000 0.000 1.000   NA
 10154541 10154542 MCP_t0005 MCP_0155     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 10154542 10154543 MCP_0155 MCP_0156     FALSE 0.081 64.000 0.000 NA   NA
 10154543 10154544 MCP_0156 MCP_0157     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10154545 10154546 MCP_0158 MCP_0159     TRUE 0.433 16.000 0.000 NA   NA
 10154546 10154547 MCP_0159 MCP_0160     FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 10154547 10154548 MCP_0160 MCP_0161     FALSE 0.072 73.000 0.000 NA   NA
 10154548 10154549 MCP_0161 MCP_0162     TRUE 0.999 -7.000 0.860 0.001 Y NA
 10154550 10154551 MCP_0163 MCP_0164     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 10154551 10154552 MCP_0164 MCP_0165     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10154552 10154553 MCP_0165 MCP_0166     TRUE 0.991 0.000 0.005 1.000 N NA
 10154553 10154554 MCP_0166 MCP_0167   aroE FALSE 0.144 69.000 0.000 1.000 N NA
 10154554 10154555 MCP_0167 MCP_0168 aroE   TRUE 0.996 -10.000 0.009 1.000 Y NA
 10154556 10154557 MCP_0169 MCP_0170   aroK TRUE 0.997 9.000 0.214 0.003 Y NA
 10154558 10154559 MCP_0171 MCP_0172     TRUE 0.672 51.000 0.007 1.000 N NA
 10154559 10154560 MCP_0172 MCP_0173     TRUE 0.859 -13.000 0.000 NA   NA
 10154564 10154565 MCP_0177 MCP_0178     FALSE 0.073 157.000 0.000 NA N NA
 10154565 10154566 MCP_0178 MCP_0179     TRUE 0.795 6.000 0.000 1.000   NA
 10154567 10154568 MCP_0180 MCP_0181     FALSE 0.211 38.000 0.000 NA   NA
 10154569 10154570 MCP_0182 MCP_0183   pycB FALSE 0.084 127.000 0.000 1.000   NA
 10154570 10154571 MCP_0183 MCP_0184 pycB pycA TRUE 0.995 6.000 0.240 0.001 N NA
 10154572 10154573 MCP_0185 MCP_0186     FALSE 0.055 208.000 0.000 NA   NA
 10154574 10154575 MCP_0187 MCP_0188     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 10154577 10154578 MCP_0190 MCP_0191     TRUE 0.997 -7.000 0.348 NA   NA
 10154578 10154579 MCP_0191 MCP_0192     FALSE 0.071 75.000 0.000 NA   NA
 10154579 10154580 MCP_0192 MCP_0193   nadA FALSE 0.058 116.000 0.000 NA   NA
 10154580 10154581 MCP_0193 MCP_0194 nadA hypD TRUE 0.913 2.000 0.000 1.000 N NA
 10154582 10154583 MCP_0195 MCP_t0006     FALSE 0.064 97.000 0.000 NA   NA
 10154583 10154584 MCP_t0006 MCP_0196   ef1b FALSE 0.082 705.000 0.000 NA   NA
 10154584 10154585 MCP_0196 MCP_0197 ef1b   TRUE 0.998 3.000 0.511 1.000 Y NA
 10154585 10154586 MCP_0197 MCP_0198   argG FALSE 0.262 44.000 0.000 1.000 N NA
 10154586 10154587 MCP_0198 MCP_0199 argG   FALSE 0.086 1099.000 0.000 NA   NA
 10154587 10154588 MCP_0199 MCP_0200   carB FALSE 0.061 104.000 0.000 NA   NA
 10154588 10154589 MCP_0200 MCP_0201 carB carA TRUE 0.999 0.000 0.356 0.001 Y NA
 10154590 10154591 MCP_0202 MCP_0203 fba-1 pfp TRUE 0.981 3.000 0.000 0.008 Y NA
 10154591 10154592 MCP_0203 MCP_0204 pfp   FALSE 0.093 421.000 0.000 NA N NA
 10154593 10154594 MCP_0205 MCP_0206     TRUE 0.993 -13.000 0.073 NA   NA
 10154594 10154595 MCP_0206 MCP_0207     FALSE 0.070 82.000 0.000 NA   NA
 10154595 10154596 MCP_0207 MCP_0208     FALSE 0.085 230.000 0.000 1.000   NA
 10154596 10154597 MCP_0208 MCP_0209     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.050   NA
 10154597 10154598 MCP_0209 MCP_0210     FALSE 0.063 343.000 0.000 NA   NA
 10154599 10154600 MCP_0211 MCP_0212     TRUE 0.998 -3.000 0.286 1.000 N NA
 10154601 10154602 MCP_0213 MCP_0214     TRUE 0.968 16.000 0.328 NA   NA
 10154603 10154604 MCP_0215 MCP_0216     TRUE 0.638 55.000 0.016 1.000   NA
 10154604 10154605 MCP_0216 MCP_0217     FALSE 0.275 43.000 0.000 1.000 N NA
 10154607 10154608 MCP_0219 MCP_0220   ileS FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 10154608 10154609 MCP_0220 MCP_0221 ileS   TRUE 0.993 -3.000 0.018 1.000   NA
 10154610 10154611 MCP_0222 MCP_0223   asd FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 10154611 10154612 MCP_0223 MCP_0224 asd   TRUE 0.680 13.000 0.000 1.000 N NA
 10154612 10154613 MCP_0224 MCP_0225   dapB FALSE 0.114 107.000 0.000 1.000 N NA
 10154613 10154614 MCP_0225 MCP_0226 dapB dapA-1 TRUE 0.975 18.000 0.062 1.000 Y NA
 10154614 10154615 MCP_0226 MCP_0227 dapA-1 rps17e TRUE 0.996 0.000 0.186 1.000 N NA
 10154616 10154617 MCP_0228 MCP_0229     TRUE 0.926 7.000 0.000 NA Y NA
 10154617 10154618 MCP_0229 MCP_0230     FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10154618 10154619 MCP_0230 MCP_0231     FALSE 0.054 186.000 0.000 NA   NA
 10154619 10154620 MCP_0231 MCP_0232     TRUE 0.685 17.000 0.000 0.053   NA
 10154620 10154621 MCP_0232 MCP_0233     TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.001 Y NA
 10154621 10154622 MCP_0233 MCP_0234     TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10154622 10154623 MCP_0234 MCP_0235     FALSE 0.321 33.000 0.000 NA N NA
 10154623 10154624 MCP_0235 MCP_0236     FALSE 0.248 200.000 0.000 NA Y NA
 10154625 10154626 MCP_0237 MCP_0238     FALSE 0.059 267.000 0.000 NA   NA
 10154628 10154629 MCP_0240 MCP_0241     TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10154629 10154630 MCP_0241 MCP_0242     FALSE 0.071 75.000 0.000 NA   NA
 10154630 10154631 MCP_0242 MCP_0243     FALSE 0.098 53.000 0.000 NA   NA
 10154631 10154632 MCP_0243 MCP_0244     TRUE 0.490 19.000 0.000 1.000   NA
 10154632 10154633 MCP_0244 MCP_0245     TRUE 0.371 31.000 0.000 1.000   NA
 10154633 10154634 MCP_0245 MCP_0246     TRUE 0.997 4.000 0.188 1.000 Y NA
 10154634 10154635 MCP_0246 MCP_0247     TRUE 0.949 14.000 0.057 NA   NA
 10154635 10154636 MCP_0247 MCP_0248     TRUE 0.956 12.000 0.038 NA   NA
 10154636 10154637 MCP_0248 MCP_0249     FALSE 0.139 55.000 0.000 1.000   NA
 10154637 10154638 MCP_0249 MCP_0250     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10154638 10154639 MCP_0250 MCP_0251     FALSE 0.061 104.000 0.000 NA   NA
 10154640 10154641 MCP_0252 MCP_0253   pan-1 FALSE 0.091 106.000 0.000 1.000   NA
 10154642 10154643 MCP_0254 MCP_0255     FALSE 0.125 90.000 0.000 1.000 N NA
 10154643 10154644 MCP_0255 MCP_0256     TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10154645 10154646 MCP_0257 MCP_0258     FALSE 0.056 125.000 0.000 NA   NA
 10154646 10154647 MCP_0258 MCP_t0007     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10154647 10154648 MCP_t0007 MCP_0259     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10154648 10154649 MCP_0259 MCP_0260     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 10154649 10154650 MCP_0260 MCP_0261     TRUE 0.996 -12.000 0.250 NA   NA
 10154650 10154651 MCP_0261 MCP_0262     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10154651 10154652 MCP_0262 MCP_0263     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10154652 10154653 MCP_0263 MCP_0264     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154653 10154654 MCP_0264 MCP_0265     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10154654 10154655 MCP_0265 MCP_0266     FALSE 0.055 129.000 0.000 NA   NA
 10154655 10154656 MCP_0266 MCP_0267     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154661 10154662 MCP_0272 MCP_0273     TRUE 0.983 2.000 0.000 0.024 Y NA
 10154664 10154665 MCP_0275 MCP_0276     FALSE 0.113 277.000 0.000 1.000 N NA
 10154665 10154666 MCP_0276 MCP_0277     FALSE 0.062 328.000 0.000 NA   NA
 10154666 10154667 MCP_0277 MCP_0278     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10154667 10154668 MCP_0278 MCP_0279   purA TRUE 0.976 5.000 0.010 NA   NA
 10154669 10154670 MCP_0280 MCP_0281     FALSE 0.113 523.000 0.000 1.000   NA
 10154670 10154671 MCP_0281 MCP_0282   hdrD-1 TRUE 0.995 11.000 0.692 1.000 Y NA
 10154671 10154672 MCP_0282 MCP_0283 hdrD-1   TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10154672 10154673 MCP_0283 MCP_0284     FALSE 0.053 152.000 0.000 NA   NA
 10154673 10154674 MCP_0284 MCP_0285     FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 10154674 10154675 MCP_0285 MCP_0286     TRUE 0.824 5.000 0.000 1.000   NA
 10154676 10154677 MCP_0287 MCP_0288     FALSE 0.114 529.000 0.000 1.000   NA
 10154677 10154678 MCP_0288 MCP_0289     TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10154680 10154681 MCP_0291 MCP_0292     FALSE 0.058 257.000 0.000 NA   NA
 10154681 10154682 MCP_0292 MCP_0293     TRUE 0.994 -40.000 0.014 0.001   NA
 10154682 10154683 MCP_0293 MCP_0294   glyA TRUE 0.995 -19.000 0.003 1.000 Y NA
 10154683 10154684 MCP_0294 MCP_0295 glyA   FALSE 0.084 126.000 0.000 1.000   NA
 10154684 10154685 MCP_0295 MCP_0296     TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.052   NA
 10154685 10154686 MCP_0296 MCP_0297     TRUE 0.998 -3.000 0.173 0.052   NA
 10154686 10154687 MCP_0297 MCP_0298     TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.052 Y NA
 10154687 10154688 MCP_0298 MCP_0299     TRUE 0.792 12.000 0.000 0.052   NA
 10154689 10154690 MCP_0300 MCP_0301     TRUE 0.985 2.000 0.005 NA   NA
 10154690 10154691 MCP_0301 MCP_0302     TRUE 0.989 10.000 0.629 NA   NA
 10154692 10154693 MCP_0303 MCP_0304   rnp4 FALSE 0.054 136.000 0.000 NA   NA
 10154693 10154694 MCP_0304 MCP_t0008 rnp4   FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10154698 10154699 MCP_0308 MCP_0309     FALSE 0.187 47.000 0.000 1.000   NA
 10154700 10154701 MCP_0310 MCP_0311     FALSE 0.061 310.000 0.000 NA   NA
 10154701 10154702 MCP_0311 MCP_0312     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10154702 10154703 MCP_0312 MCP_0313     TRUE 0.395 18.000 0.000 NA   NA
 10154703 10154704 MCP_0313 MCP_0314     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154704 10154705 MCP_0314 MCP_0315     FALSE 0.071 75.000 0.000 NA   NA
 10154705 10154706 MCP_0315 MCP_0316     TRUE 0.685 7.000 0.000 NA   NA
 10154706 10154707 MCP_0316 MCP_0317     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10154707 10154708 MCP_0317 MCP_0318     FALSE 0.243 34.000 0.000 NA   NA
 10154708 10154709 MCP_0318 MCP_0319     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 10154709 10154710 MCP_0319 MCP_0320     TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10154710 10154711 MCP_0320 MCP_0321     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10154711 10154712 MCP_0321 MCP_0322     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154712 10154713 MCP_0322 MCP_0323     FALSE 0.204 39.000 0.000 NA   NA
 10154713 10154714 MCP_0323 MCP_0324     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10154715 10154716 MCP_0325 MCP_0326     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10154716 10154717 MCP_0326 MCP_0327     FALSE 0.082 181.000 0.000 1.000   NA
 10154717 10154718 MCP_0327 MCP_0328   rbr-1 FALSE 0.118 101.000 0.000 1.000 N NA
 10154720 10154721 MCP_0330 MCP_0331     FALSE 0.067 89.000 0.000 NA   NA
 10154721 10154722 MCP_0331 MCP_0332     FALSE 0.053 143.000 0.000 NA   NA
 10154722 10154723 MCP_0332 MCP_0333     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10154723 10154724 MCP_0333 MCP_0334     FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10154724 10154725 MCP_0334 MCP_0335   hisF TRUE 0.986 2.000 0.010 NA   NA
 10154725 10154726 MCP_0335 MCP_0336 hisF   FALSE 0.056 234.000 0.000 NA   NA
 10154726 10154727 MCP_0336 MCP_0337   atpD-1 FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 10154727 10154728 MCP_0337 MCP_0338 atpD-1 atpB-1 TRUE 0.991 11.000 0.033 0.007 Y NA
 10154728 10154729 MCP_0338 MCP_0339 atpB-1 atpA-1 TRUE 0.998 2.000 0.088 0.007 Y NA
 10154729 10154730 MCP_0339 MCP_0340 atpA-1 atpF-1 TRUE 0.987 31.000 0.437 0.007 Y NA
 10154730 10154731 MCP_0340 MCP_0341 atpF-1 atpC-1 TRUE 0.999 0.000 0.462 0.007 Y NA
 10154731 10154732 MCP_0341 MCP_0342 atpC-1 atpE-1 TRUE 0.998 5.000 0.236 0.007 Y NA
 10154732 10154733 MCP_0342 MCP_0343 atpE-1 atpK-1 TRUE 0.976 26.000 0.489 0.007   NA
 10154733 10154734 MCP_0343 MCP_0344 atpK-1 atpI-1 TRUE 0.997 5.000 0.848 0.009   NA
 10154734 10154735 MCP_0344 MCP_0345 atpI-1 atpH TRUE 0.993 -25.000 0.010 0.009   NA
 10154735 10154736 MCP_0345 MCP_0346 atpH   FALSE 0.082 189.000 0.000 1.000   NA
 10154736 10154737 MCP_0346 MCP_0347     FALSE 0.060 106.000 0.000 NA   NA
 10154737 10154738 MCP_0347 MCP_0348     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10154738 10154739 MCP_0348 MCP_0349   prs-1 TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10154740 10154741 MCP_0350 MCP_0351 eif2g   TRUE 0.982 13.000 0.511 NA   NA
 10154741 10154742 MCP_0351 MCP_0352   rpoE1 TRUE 0.729 72.000 0.221 NA   NA
 10154742 10154743 MCP_0352 MCP_0353 rpoE1   FALSE 0.106 77.000 0.000 1.000   NA
 10154743 10154744 MCP_0353 MCP_0354     FALSE 0.158 51.000 0.000 1.000   NA
 10154746 10154747 MCP_0356 MCP_0357     FALSE 0.098 365.000 0.000 1.000   NA
 10154748 10154749 MCP_0358 MCP_0359     FALSE 0.064 97.000 0.000 NA   NA
 10154749 10154750 MCP_0359 MCP_0360     FALSE 0.253 33.000 0.000 NA   NA
 10154751 10154752 MCP_0361 MCP_0362 cbiX-1   TRUE 0.824 5.000 0.000 1.000   NA
 10154752 10154753 MCP_0362 MCP_0363     TRUE 0.992 5.000 0.176 1.000 N NA
 10154753 10154754 MCP_0363 MCP_0364   nifH-1 TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.066 N NA
 10154754 10154755 MCP_0364 MCP_0365 nifH-1 cobB TRUE 0.996 -3.000 0.078 1.000 N NA
 10154755 10154756 MCP_0365 MCP_0366 cobB   FALSE 0.074 197.000 0.000 NA N NA
 10154756 10154757 MCP_0366 MCP_0367     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154757 10154758 MCP_0367 MCP_0368   rpl10e FALSE 0.069 84.000 0.000 NA   NA
 10154763 10154764 MCP_0373 MCP_0374   vhtD FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10154764 10154765 MCP_0374 MCP_0375 vhtD pyrH TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10154765 10154766 MCP_0375 MCP_0376 pyrH   FALSE 0.054 196.000 0.000 NA   NA
 10154767 10154768 MCP_0377 MCP_0378   birA FALSE 0.242 42.000 0.000 1.000   NA
 10154768 10154769 MCP_0378 MCP_0379 birA   TRUE 0.924 17.000 0.035 NA   NA
 10154769 10154770 MCP_0379 MCP_0380     TRUE 0.993 -3.000 0.032 NA   NA
 10154770 10154771 MCP_0380 MCP_0381     TRUE 0.999 -9.000 0.713 0.030 Y NA
 10154771 10154772 MCP_0381 MCP_0382     TRUE 0.976 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 10154774 10154775 MCP_0384 MCP_0385     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA Y NA
 10154776 10154777 MCP_0386 MCP_0387     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10154777 10154778 MCP_0387 MCP_0388     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10154778 10154779 MCP_0388 MCP_0389     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10154779 10154780 MCP_0389 MCP_0390     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154780 10154781 MCP_0390 MCP_0391     TRUE 0.997 -3.000 0.346 NA   NA
 10154781 10154782 MCP_0391 MCP_0392     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10154782 10154783 MCP_0392 MCP_0393     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154783 10154784 MCP_0393 MCP_0394     TRUE 0.963 16.000 0.222 NA   NA
 10154784 10154785 MCP_0394 MCP_0395   serA FALSE 0.053 151.000 0.000 NA   NA
 10154786 10154787 MCP_0396 MCP_0397 thrS   FALSE 0.106 467.000 0.000 1.000   NA
 10154787 10154788 MCP_0397 MCP_0398   ppsA-1 TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10154788 10154789 MCP_0398 MCP_0399 ppsA-1 mfnA TRUE 0.993 4.000 0.167 1.000 N NA
 10154789 10154790 MCP_0399 MCP_0400 mfnA apt FALSE 0.131 81.000 0.000 1.000 N NA
 10154790 10154791 MCP_0400 MCP_0401 apt   FALSE 0.172 55.000 0.000 1.000 N NA
 10154791 10154792 MCP_0401 MCP_0402     FALSE 0.072 73.000 0.000 NA   NA
 10154792 10154793 MCP_0402 MCP_0403     FALSE 0.060 283.000 0.000 NA   NA
 10154793 10154794 MCP_0403 MCP_0404     FALSE 0.082 132.000 0.000 1.000   NA
 10154794 10154795 MCP_0404 MCP_0405     FALSE 0.102 87.000 0.000 1.000   NA
 10154795 10154796 MCP_0405 MCP_0406     FALSE 0.064 95.000 0.000 NA   NA
 10154796 10154797 MCP_0406 MCP_0407     FALSE 0.069 85.000 0.000 NA   NA
 10154797 10154798 MCP_0407 MCP_0408   iscS-1 FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10154798 10154799 MCP_0408 MCP_0409 iscS-1   TRUE 0.955 13.000 0.018 1.000 N NA
 10154800 10154801 MCP_0410 MCP_0411     TRUE 0.998 -15.000 0.092 1.000 Y NA
 10154801 10154802 MCP_0411 MCP_0412   argD FALSE 0.103 137.000 0.000 1.000 N NA
 10154802 10154803 MCP_0412 MCP_0413 argD guaAB TRUE 0.526 102.000 0.006 1.000 N NA
 10154803 10154804 MCP_0413 MCP_0414 guaAB   FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 10154806 10154807 MCP_0416 MCP_0417     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 10154807 10154808 MCP_0417 MCP_0418     FALSE 0.096 54.000 0.000 NA   NA
 10154809 10154810 MCP_0419 MCP_0420 acsA   FALSE 0.159 115.000 0.000 0.070   NA
 10154810 10154811 MCP_0420 MCP_t0009     FALSE 0.070 79.000 0.000 NA   NA
 10154812 10154813 MCP_0421 MCP_0422     TRUE 0.996 -22.000 0.382 NA   NA
 10154814 10154815 MCP_0423 MCP_0424     FALSE 0.054 132.000 0.000 NA   NA
 10154815 10154816 MCP_0424 MCP_0425     FALSE 0.053 165.000 0.000 NA   NA
 10154816 10154817 MCP_0425 MCP_0426     FALSE 0.091 89.000 0.000 NA N NA
 10154817 10154818 MCP_0426 MCP_0427     FALSE 0.065 93.000 0.000 NA   NA
 10154818 10154819 MCP_0427 MCP_0428     FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10154820 10154821 MCP_0429 MCP_0430     FALSE 0.072 495.000 0.000 NA   NA
 10154824 10154825 MCP_0433 MCP_0434     FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10154827 10154828 MCP_0436 MCP_0437     TRUE 0.723 10.000 0.000 1.000   NA
 10154831 10154832 MCP_0440 MCP_0441     TRUE 0.867 -10.000 0.000 NA   NA
 10154833 10154834 MCP_0442 MCP_0443     FALSE 0.272 38.000 0.000 NA N NA
 10154834 10154835 MCP_0443 MCP_0444     TRUE 0.393 34.000 0.000 1.000 N NA
 10154838 10154839 MCP_0447 MCP_0448   acdB FALSE 0.065 93.000 0.000 NA   NA
 10154839 10154840 MCP_0448 MCP_0449 acdB acdA TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154840 10154841 MCP_0449 MCP_0450 acdA   FALSE 0.221 42.000 0.000 NA N NA
 10154843 10154844 MCP_0452 MCP_0453 aroD   TRUE 0.742 11.000 0.000 1.000 N NA
 10154845 10154846 MCP_0454 MCP_0455     FALSE 0.118 67.000 0.000 1.000   NA
 10154846 10154847 MCP_0455 MCP_0456     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154847 10154848 MCP_0456 MCP_0457     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10154848 10154849 MCP_0457 MCP_0458     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10154849 10154850 MCP_0458 MCP_0459     FALSE 0.073 500.000 0.000 NA   NA
 10154850 10154851 MCP_0459 MCP_0460     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10154851 10154852 MCP_0460 MCP_t0010     FALSE 0.060 108.000 0.000 NA   NA
 10154852 10154853 MCP_t0010 MCP_0461     FALSE 0.077 559.000 0.000 NA   NA
 10154856 10154857 MCP_0464 MCP_0465     TRUE 0.433 16.000 0.000 NA   NA
 10154859 10154860 MCP_0467 MCP_0468     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10154861 10154862 MCP_0469 MCP_0470     TRUE 0.998 0.000 0.950 NA   NA
 10154863 10154864 MCP_0471 MCP_0472     FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10154864 10154865 MCP_0472 MCP_0473     FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10154867 10154868 MCP_0475 MCP_0476     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 10154868 10154869 MCP_0476 MCP_0477   echF FALSE 0.057 123.000 0.000 NA   NA
 10154869 10154870 MCP_0477 MCP_0478 echF echE TRUE 0.966 6.000 0.000 0.020 Y NA
 10154870 10154871 MCP_0478 MCP_0479 echE echD TRUE 0.996 2.000 0.042 1.000 Y NA
 10154871 10154872 MCP_0479 MCP_0480 echD echC TRUE 0.998 1.000 0.075 0.005 Y NA
 10154872 10154873 MCP_0480 MCP_0481 echC echB TRUE 0.999 -3.000 0.717 1.000 Y NA
 10154873 10154874 MCP_0481 MCP_0482 echB echA TRUE 0.999 2.000 0.886 1.000 Y NA
 10154875 10154876 MCP_0483 MCP_0484     FALSE 0.204 45.000 0.000 1.000   NA
 10154877 10154878 MCP_0485 MCP_0486   asnS FALSE 0.111 263.000 0.000 1.000 N NA
 10154880 10154881 MCP_0488 MCP_0489     FALSE 0.103 136.000 0.000 1.000 N NA
 10154881 10154882 MCP_0489 MCP_0490     TRUE 0.998 -3.000 0.894 1.000 N NA
 10154882 10154883 MCP_0490 MCP_0491     FALSE 0.105 129.000 0.000 1.000 N NA
 10154883 10154884 MCP_0491 MCP_0492     FALSE 0.157 816.000 0.000 1.000 N NA
 10154885 10154886 MCP_0493 MCP_0494     FALSE 0.053 163.000 0.000 NA   NA
 10154887 10154888 MCP_0495 MCP_0496   nrpR-2 TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 10154888 10154889 MCP_0496 MCP_0497 nrpR-2 pyrG FALSE 0.072 73.000 0.000 NA   NA
 10154889 10154890 MCP_0497 MCP_0498 pyrG tmk TRUE 0.380 65.000 0.000 1.000 Y NA
 10154891 10154892 MCP_0499 MCP_0500     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10154892 10154893 MCP_0500 MCP_0501     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 10154893 10154894 MCP_0501 MCP_0502     FALSE 0.084 61.000 0.000 NA   NA
 10154894 10154895 MCP_0502 MCP_0503     TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10154895 10154896 MCP_0503 MCP_0504     TRUE 0.952 -10.000 0.000 0.064   NA
 10154896 10154897 MCP_0504 MCP_0505     FALSE 0.053 145.000 0.000 NA   NA
 10154898 10154899 MCP_0506 MCP_0507     TRUE 0.996 -3.000 0.167 NA   NA
 10154899 10154900 MCP_0507 MCP_0508     TRUE 0.427 24.000 0.000 1.000   NA
 10154900 10154901 MCP_0508 MCP_0509     TRUE 0.999 1.000 0.667 0.001 Y NA
 10154902 10154903 MCP_0510 MCP_0511     TRUE 0.986 -16.000 0.002 NA   NA
 10154903 10154904 MCP_0511 MCP_0512   mcrB FALSE 0.153 709.000 0.000 1.000 N NA
 10154904 10154905 MCP_0512 MCP_0513 mcrB mcrD-1 TRUE 0.990 28.000 0.900 0.008 Y NA
 10154905 10154906 MCP_0513 MCP_0514 mcrD-1 mcrC TRUE 0.987 21.000 0.200 0.008 Y NA
 10154906 10154907 MCP_0514 MCP_0515 mcrC mcrG TRUE 0.998 5.000 0.200 0.008 Y NA
 10154907 10154908 MCP_0515 MCP_0516 mcrG mcrA TRUE 0.993 17.000 0.409 0.002 Y NA
 10154908 10154909 MCP_0516 MCP_0517 mcrA   FALSE 0.102 144.000 0.000 1.000 N NA
 10154909 10154910 MCP_0517 MCP_0518   pdaD-1 FALSE 0.092 104.000 0.000 1.000   NA
 10154910 10154911 MCP_0518 MCP_0519 pdaD-1   FALSE 0.179 48.000 0.000 1.000   NA
 10154911 10154912 MCP_0519 MCP_0520     TRUE 0.859 -13.000 0.000 NA   NA
 10154912 10154913 MCP_0520 MCP_0521     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10154913 10154914 MCP_0521 MCP_0522   atw-1 TRUE 0.773 7.000 0.000 1.000   NA
 10154914 10154915 MCP_0522 MCP_0523 atw-1   TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10154915 10154916 MCP_0523 MCP_0524     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10154916 10154917 MCP_0524 MCP_0525     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10154917 10154918 MCP_0525 MCP_0526     FALSE 0.056 233.000 0.000 NA   NA
 10154918 10154919 MCP_0526 MCP_0527     TRUE 0.999 -15.000 0.838 0.005 Y NA
 10154919 10154920 MCP_0527 MCP_0528     TRUE 0.992 -3.000 0.017 NA   NA
 10154920 10154921 MCP_0528 MCP_0529     FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 10154921 10154922 MCP_0529 MCP_0530     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 10154922 10154923 MCP_0530 MCP_0531     TRUE 0.395 18.000 0.000 NA   NA
 10154923 10154924 MCP_0531 MCP_0532     FALSE 0.087 59.000 0.000 NA   NA
 10154924 10154925 MCP_0532 MCP_0533     FALSE 0.066 373.000 0.000 NA   NA
 10154925 10154926 MCP_0533 MCP_0534   mptH FALSE 0.081 64.000 0.000 NA   NA
 10154927 10154928 MCP_0535 MCP_0536     TRUE 0.971 5.000 0.000 0.027 Y NA
 10154928 10154929 MCP_0536 MCP_0537     FALSE 0.063 332.000 0.000 NA   NA
 10154929 10154930 MCP_0537 MCP_0538     FALSE 0.062 100.000 0.000 NA   NA
 10154931 10154932 MCP_0539 MCP_0540 mtrE mtrD TRUE 0.999 2.000 0.914 0.002 Y NA
 10154932 10154933 MCP_0540 MCP_0541 mtrD mtrC TRUE 0.999 2.000 0.842 0.005 Y NA
 10154933 10154934 MCP_0541 MCP_0542 mtrC mtrB TRUE 0.999 4.000 0.842 0.005 Y NA
 10154934 10154935 MCP_0542 MCP_0543 mtrB mtrA-1 TRUE 0.999 2.000 0.273 0.005 Y NA
 10154935 10154936 MCP_0543 MCP_0544 mtrA-1 mtrF TRUE 0.990 12.000 0.360 0.005   NA
 10154936 10154937 MCP_0544 MCP_0545 mtrF mtrG TRUE 0.998 2.000 0.607 0.005   NA
 10154937 10154938 MCP_0545 MCP_0546 mtrG mtrH TRUE 0.993 16.000 0.357 0.005 Y NA
 10154938 10154939 MCP_0546 MCP_0547 mtrH   FALSE 0.108 123.000 0.000 1.000 N NA
 10154940 10154941 MCP_0548 MCP_0549   trkA-1 TRUE 0.987 1.000 0.000 0.005 Y NA
 10154942 10154943 MCP_0550 MCP_0551     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10154943 10154944 MCP_0551 MCP_0552     FALSE 0.056 229.000 0.000 NA   NA
 10154946 10154947 MCP_0554 MCP_0555     TRUE 0.997 -3.000 0.405 NA   NA
 10154947 10154948 MCP_0555 MCP_0556     FALSE 0.057 246.000 0.000 NA   NA
 10154951 10154952 MCP_0559 MCP_0560 mcrD-2   FALSE 0.195 40.000 0.000 NA   NA
 10154952 10154953 MCP_0560 MCP_0561     FALSE 0.059 110.000 0.000 NA   NA
 10154953 10154954 MCP_0561 MCP_0562     FALSE 0.129 86.000 0.000 1.000 N NA
 10154954 10154955 MCP_0562 MCP_0563     FALSE 0.307 26.000 0.000 NA   NA
 10154955 10154956 MCP_0563 MCP_0564     FALSE 0.062 101.000 0.000 NA   NA
 10154956 10154957 MCP_0564 MCP_0565     TRUE 0.823 12.000 0.000 0.009   NA
 10154957 10154958 MCP_0565 MCP_0566     TRUE 0.997 2.000 0.750 1.000 N NA
 10154958 10154959 MCP_0566 MCP_0567     TRUE 0.922 4.000 0.000 0.029   NA
 10154961 10154962 MCP_0569 MCP_0570   htpX-1 TRUE 0.982 6.000 0.070 NA   NA
 10154962 10154963 MCP_0570 MCP_0571 htpX-1   FALSE 0.262 44.000 0.000 1.000 N NA
 10154964 10154965 MCP_0572 MCP_0573   hisI FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10154965 10154966 MCP_0573 MCP_0574 hisI   TRUE 0.811 41.000 0.026 1.000   NA
 10154966 10154967 MCP_0574 MCP_0575     FALSE 0.059 276.000 0.000 NA   NA
 10154971 10154972 MCP_0578 MCP_0579     FALSE 0.187 52.000 0.000 1.000 N NA
 10154978 10154979 MCP_0585 MCP_0586     TRUE 0.939 25.000 0.100 1.000 N NA
 10154979 10154980 MCP_0586 MCP_0587     TRUE 0.662 208.000 0.100 1.000 N NA
 10154980 10154981 MCP_0587 MCP_0588     TRUE 0.980 11.000 0.100 1.000 N NA
 10154981 10154982 MCP_0588 MCP_0589     FALSE 0.061 104.000 0.000 NA   NA
 10154982 10154983 MCP_0589 MCP_0590     FALSE 0.061 105.000 0.000 NA   NA
 10154983 10154984 MCP_0590 MCP_0591     FALSE 0.064 96.000 0.000 NA   NA
 10154985 10154986 MCP_0592 MCP_0593     FALSE 0.170 47.000 0.000 NA N NA
 10154986 10154987 MCP_0593 MCP_0594     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10154987 10154988 MCP_0594 MCP_0595     FALSE 0.142 54.000 0.000 1.000   NA
 10154988 10154989 MCP_0595 MCP_0596     FALSE 0.095 99.000 0.000 1.000   NA
 10154989 10154990 MCP_0596 MCP_0597     TRUE 0.746 9.000 0.000 1.000   NA
 10154991 10154992 MCP_0598 MCP_0599     FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10154997 10154998 MCP_0604 MCP_0605   aif1a-1 TRUE 0.413 17.000 0.000 NA   NA
 10155001 10155002 MCP_0608 MCP_0609     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155002 10155003 MCP_0609 MCP_0610     FALSE 0.074 505.000 0.000 NA   NA
 10155004 10155005 MCP_0611 MCP_t0012     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10155007 10155008 MCP_0613 MCP_0614 lig msrB FALSE 0.127 88.000 0.000 1.000 N NA
 10155011 10155012 MCP_0617 MCP_0618     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.033 Y NA
 10155012 10155013 MCP_0618 MCP_0619     FALSE 0.195 51.000 0.000 1.000 N NA
 10155013 10155014 MCP_0619 MCP_0620   trxB-1 TRUE 0.763 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10155015 10155016 MCP_0621 MCP_0622     FALSE 0.060 109.000 0.000 NA   NA
 10155016 10155017 MCP_0622 MCP_0623     TRUE 0.544 16.000 0.000 1.000   NA
 10155019 10155020 MCP_0625 MCP_0626     FALSE 0.092 406.000 0.000 NA N NA
 10155020 10155021 MCP_0626 MCP_0627     TRUE 0.997 -7.000 0.570 NA   NA
 10155021 10155022 MCP_0627 MCP_0628     TRUE 0.992 -10.000 0.056 NA   NA
 10155022 10155023 MCP_0628 MCP_0629     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10155023 10155024 MCP_0629 MCP_0630     FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 10155025 10155026 MCP_0631 MCP_0632     TRUE 0.911 -10.000 0.000 1.000   NA
 10155026 10155027 MCP_0632 MCP_0633     FALSE 0.114 70.000 0.000 1.000   NA
 10155028 10155029 MCP_0634 MCP_0635     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 10155029 10155030 MCP_0635 MCP_0636     FALSE 0.102 158.000 0.000 1.000 N NA
 10155030 10155031 MCP_0636 MCP_0637     FALSE 0.053 150.000 0.000 NA   NA
 10155032 10155033 MCP_0638 MCP_0639   hisH TRUE 0.998 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 10155033 10155034 MCP_0639 MCP_0640 hisH   TRUE 0.795 6.000 0.000 1.000   NA
 10155036 10155037 MCP_0642 MCP_0643     FALSE 0.076 229.000 0.000 NA N NA
 10155038 10155039 MCP_0644 MCP_0645 dut   TRUE 0.840 -37.000 0.000 NA   NA
 10155039 10155040 MCP_0645 MCP_0646     FALSE 0.096 54.000 0.000 NA   NA
 10155040 10155041 MCP_0646 MCP_0647     TRUE 0.395 18.000 0.000 NA   NA
 10155042 10155043 MCP_0648 MCP_0649   cdc6-2 FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10155044 10155045 MCP_0650 MCP_0651     FALSE 0.118 49.000 0.000 NA   NA
 10155045 10155046 MCP_0651 MCP_0652     TRUE 0.991 -3.000 0.007 NA   NA
 10155048 10155049 MCP_0654 MCP_0655     TRUE 0.981 12.000 0.206 1.000 N NA
 10155049 10155050 MCP_0655 MCP_0656     TRUE 0.423 103.000 0.000 0.022 Y NA
 10155050 10155051 MCP_0656 MCP_0657     FALSE 0.091 106.000 0.000 1.000   NA
 10155051 10155052 MCP_0657 MCP_0658     TRUE 0.868 3.000 0.000 1.000   NA
 10155052 10155053 MCP_0658 MCP_0659   dapA-2 TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10155053 10155054 MCP_0659 MCP_0660 dapA-2   FALSE 0.127 923.000 0.000 1.000   NA
 10155054 10155055 MCP_0660 MCP_0661     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 10155055 10155056 MCP_0661 MCP_t0013     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 10155056 10155057 MCP_t0013 MCP_0662     FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 10155057 10155058 MCP_0662 MCP_0663     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10155058 10155059 MCP_0663 MCP_0664     FALSE 0.125 797.000 0.000 1.000   NA
 10155060 10155061 MCP_0665 MCP_0666     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155061 10155062 MCP_0666 MCP_0667     FALSE 0.098 53.000 0.000 NA   NA
 10155062 10155063 MCP_0667 MCP_0668   recJ FALSE 0.085 857.000 0.000 NA   NA
 10155063 10155064 MCP_0668 MCP_0669 recJ   FALSE 0.084 61.000 0.000 NA   NA
 10155065 10155066 MCP_0670 MCP_0671     TRUE 0.919 -6.000 0.000 1.000   NA
 10155066 10155067 MCP_0671 MCP_0672     FALSE 0.086 1079.000 0.000 NA   NA
 10155067 10155068 MCP_0672 MCP_0673     TRUE 0.996 3.000 0.667 NA   NA
 10155068 10155069 MCP_0673 MCP_0674     FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 10155069 10155070 MCP_0674 MCP_0675     FALSE 0.093 55.000 0.000 NA   NA
 10155070 10155071 MCP_0675 MCP_0676     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155071 10155072 MCP_0676 MCP_0677     FALSE 0.220 37.000 0.000 NA   NA
 10155073 10155074 MCP_0678 MCP_0679 mtrA-2   TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10155074 10155075 MCP_0679 MCP_0680   trxB-2 FALSE 0.264 32.000 0.000 NA   NA
 10155075 10155076 MCP_0680 MCP_0681 trxB-2   FALSE 0.307 26.000 0.000 NA   NA
 10155076 10155077 MCP_0681 MCP_0682     FALSE 0.070 79.000 0.000 NA   NA
 10155077 10155078 MCP_0682 MCP_0683     FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 10155079 10155080 MCP_0684 MCP_0685     TRUE 0.995 3.000 0.333 1.000   NA
 10155080 10155081 MCP_0685 MCP_0686     TRUE 0.482 14.000 0.000 NA   NA
 10155081 10155082 MCP_0686 MCP_0687     FALSE 0.069 85.000 0.000 NA   NA
 10155082 10155083 MCP_0687 MCP_0688     FALSE 0.122 48.000 0.000 NA   NA
 10155083 10155084 MCP_0688 MCP_0689     TRUE 0.413 17.000 0.000 NA   NA
 10155084 10155085 MCP_0689 MCP_0690     FALSE 0.083 736.000 0.000 NA   NA
 10155085 10155086 MCP_0690 MCP_0691     TRUE 0.998 -3.000 0.509 NA   NA
 10155086 10155087 MCP_0691 MCP_0692     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 10155087 10155088 MCP_0692 MCP_0693     FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 10155088 10155089 MCP_0693 MCP_0694     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155089 10155090 MCP_0694 MCP_0695   phoU-1 TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10155090 10155091 MCP_0695 MCP_0696 phoU-1   FALSE 0.065 93.000 0.000 NA   NA
 10155091 10155092 MCP_0696 MCP_0697     FALSE 0.098 367.000 0.000 1.000   NA
 10155092 10155093 MCP_0697 MCP_0698     TRUE 0.995 -3.000 0.046 1.000 N NA
 10155093 10155094 MCP_0698 MCP_0699     TRUE 0.996 -3.000 0.207 NA   NA
 10155094 10155095 MCP_0699 MCP_0700   queC TRUE 0.992 -3.000 0.023 NA   NA
 10155095 10155096 MCP_0700 MCP_0701 queC   TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155099 10155100 MCP_0704 MCP_0705 hisD aspS TRUE 0.994 0.000 0.054 1.000 N NA
 10155101 10155102 MCP_0706 MCP_0707     FALSE 0.064 97.000 0.000 NA   NA
 10155102 10155103 MCP_0707 MCP_0708     FALSE 0.071 75.000 0.000 NA   NA
 10155103 10155104 MCP_0708 MCP_0709     TRUE 0.998 2.000 0.381 1.000 Y NA
 10155104 10155105 MCP_0709 MCP_0710     TRUE 0.999 -3.000 0.588 1.000 Y NA
 10155105 10155106 MCP_0710 MCP_0711   gyrA FALSE 0.106 225.000 0.000 1.000 N NA
 10155106 10155107 MCP_0711 MCP_0712 gyrA gyrB TRUE 0.998 4.000 0.306 0.003 Y NA
 10155109 10155110 MCP_0714 MCP_0715     FALSE 0.091 56.000 0.000 NA   NA
 10155112 10155113 MCP_0717 MCP_0718     TRUE 0.997 1.000 0.571 NA   NA
 10155113 10155114 MCP_0718 MCP_0719     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155114 10155115 MCP_0719 MCP_0720     FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 10155115 10155116 MCP_0720 MCP_0721     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155117 10155118 MCP_0722 MCP_0723   rpl21e TRUE 0.998 -57.000 0.255 1.000 Y NA
 10155118 10155119 MCP_0723 MCP_0724 rpl21e   TRUE 0.982 14.000 0.479 1.000   NA
 10155119 10155120 MCP_0724 MCP_0725     TRUE 0.849 56.000 0.730 NA   NA
 10155120 10155121 MCP_0725 MCP_0726   ksgA TRUE 0.997 1.000 0.049 NA Y NA
 10155121 10155122 MCP_0726 MCP_0727 ksgA   TRUE 0.996 -25.000 0.028 1.000 Y NA
 10155122 10155123 MCP_0727 MCP_0728     FALSE 0.186 45.000 0.000 NA N NA
 10155123 10155124 MCP_0728 MCP_0729   moaC FALSE 0.221 42.000 0.000 NA N NA
 10155124 10155125 MCP_0729 MCP_0730 moaC   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10155125 10155126 MCP_0730 MCP_0731     TRUE 0.427 24.000 0.000 1.000   NA
 10155126 10155127 MCP_0731 MCP_0732     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155130 10155131 MCP_0735 MCP_0736   metG FALSE 0.078 621.000 0.000 NA   NA
 10155131 10155132 MCP_0736 MCP_0737 metG   FALSE 0.114 109.000 0.000 1.000 N NA
 10155132 10155133 MCP_0737 MCP_0738     FALSE 0.131 83.000 0.000 1.000 N NA
 10155134 10155135 MCP_0739 MCP_0740     FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10155135 10155136 MCP_0740 MCP_0741     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 10155137 10155138 MCP_0742 MCP_0743     FALSE 0.070 81.000 0.000 NA   NA
 10155138 10155139 MCP_0743 MCP_0744     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 10155139 10155140 MCP_0744 MCP_0745     FALSE 0.314 25.000 0.000 NA   NA
 10155140 10155141 MCP_0745 MCP_0746     TRUE 0.413 17.000 0.000 NA   NA
 10155141 10155142 MCP_0746 MCP_0747     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155143 10155144 MCP_0748 MCP_0749     FALSE 0.081 64.000 0.000 NA   NA
 10155144 10155145 MCP_0749 MCP_t0014     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10155145 10155146 MCP_t0014 MCP_0750     FALSE 0.063 332.000 0.000 NA   NA
 10155146 10155147 MCP_0750 MCP_0751     FALSE 0.243 670.000 0.000 0.057 N NA
 10155147 10155148 MCP_0751 MCP_0752     FALSE 0.074 188.000 0.000 NA N NA
 10155149 10155150 MCP_0753 MCP_0754     FALSE 0.065 367.000 0.000 NA   NA
 10155150 10155151 MCP_0754 MCP_0755     FALSE 0.053 150.000 0.000 NA   NA
 10155152 10155153 MCP_0756 MCP_0757     TRUE 0.593 14.000 0.000 1.000   NA
 10155153 10155154 MCP_0757 MCP_0758     FALSE 0.058 248.000 0.000 NA   NA
 10155154 10155155 MCP_0758 MCP_0759     FALSE 0.061 296.000 0.000 NA   NA
 10155155 10155156 MCP_0759 MCP_0760     TRUE 0.395 18.000 0.000 NA   NA
 10155156 10155157 MCP_0760 MCP_0761     FALSE 0.070 81.000 0.000 NA   NA
 10155157 10155158 MCP_0761 MCP_0762     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155158 10155159 MCP_0762 MCP_0763     FALSE 0.097 354.000 0.000 1.000   NA
 10155159 10155160 MCP_0763 MCP_0764     TRUE 0.997 2.000 0.070 1.000 Y NA
 10155160 10155161 MCP_0764 MCP_0765     TRUE 0.942 23.000 0.131 1.000   NA
 10155161 10155162 MCP_0765 MCP_0766     FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 10155162 10155163 MCP_0766 MCP_0767     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10155163 10155164 MCP_0767 MCP_0768     FALSE 0.134 46.000 0.000 NA   NA
 10155164 10155165 MCP_0768 MCP_0769     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10155165 10155166 MCP_0769 MCP_0770     TRUE 0.995 -10.000 0.105 1.000   NA
 10155166 10155167 MCP_0770 MCP_0771     TRUE 0.691 11.000 0.000 1.000   NA
 10155169 10155170 MCP_0773 MCP_0774     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10155172 10155173 MCP_0776 MCP_0777     TRUE 0.780 72.000 0.222 1.000 N NA
 10155173 10155174 MCP_0777 MCP_0778     TRUE 0.997 -10.000 0.667 NA   NA
 10155174 10155175 MCP_0778 MCP_0779     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10155175 10155176 MCP_0779 MCP_0780     TRUE 0.995 2.000 0.333 NA   NA
 10155176 10155177 MCP_0780 MCP_0781     FALSE 0.059 275.000 0.000 NA   NA
 10155177 10155178 MCP_0781 MCP_0782     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10155178 10155179 MCP_0782 MCP_0783     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10155179 10155180 MCP_0783 MCP_0784     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 10155180 10155181 MCP_0784 MCP_0785     FALSE 0.056 225.000 0.000 NA   NA
 10155181 10155182 MCP_0785 MCP_0786     TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10155183 10155184 MCP_0787 MCP_0788     TRUE 0.665 22.000 0.000 0.010   NA
 10155185 10155186 MCP_0789 MCP_0790     FALSE 0.062 326.000 0.000 NA   NA
 10155186 10155187 MCP_0790 MCP_0791     FALSE 0.076 551.000 0.000 NA   NA
 10155187 10155188 MCP_0791 MCP_0792     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155191 10155192 MCP_0795 MCP_0796     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10155192 10155193 MCP_0796 MCP_0797     TRUE 0.643 39.000 0.000 1.000 Y NA
 10155193 10155194 MCP_0797 MCP_0798     TRUE 0.855 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10155194 10155195 MCP_0798 MCP_0799     TRUE 0.979 10.000 0.062 1.000 N NA
 10155196 10155197 MCP_0800 MCP_0801     FALSE 0.063 98.000 0.000 NA   NA
 10155198 10155199 MCP_0802 MCP_0803     TRUE 0.997 -12.000 0.333 1.000 N NA
 10155199 10155200 MCP_0803 MCP_0804   glmS-1 TRUE 0.990 2.000 0.012 1.000 N NA
 10155200 10155201 MCP_0804 MCP_0805 glmS-1   TRUE 0.989 9.000 0.033 1.000 Y NA
 10155202 10155203 MCP_0806 MCP_0807 rpl40e   FALSE 0.117 319.000 0.000 1.000 N NA
 10155203 10155204 MCP_0807 MCP_0808     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10155204 10155205 MCP_0808 MCP_0809   hisB FALSE 0.134 46.000 0.000 NA   NA
 10155205 10155206 MCP_0809 MCP_0810 hisB   TRUE 0.977 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10155206 10155207 MCP_0810 MCP_0811     FALSE 0.318 36.000 0.000 1.000   NA
 10155207 10155208 MCP_0811 MCP_0812     TRUE 0.474 20.000 0.000 1.000   NA
 10155211 10155212 MCP_0815 MCP_0816     TRUE 0.997 -13.000 0.185 0.013   NA
 10155212 10155213 MCP_0816 MCP_0817     FALSE 0.104 194.000 0.000 1.000 N NA
 10155217 10155218 MCP_0820 MCP_0821     FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10155220 10155221 MCP_0823 MCP_0824     FALSE 0.172 55.000 0.000 1.000 N NA
 10155223 10155224 MCP_0826 MCP_0827     FALSE 0.230 36.000 0.000 NA   NA
 10155224 10155225 MCP_0827 MCP_0828     FALSE 0.081 692.000 0.000 NA   NA
 10155225 10155226 MCP_0828 MCP_0829     TRUE 0.989 -13.000 0.015 NA   NA
 10155229 10155230 MCP_0832 MCP_0833   rps3Ae FALSE 0.108 234.000 0.000 1.000 N NA
 10155231 10155232 MCP_0834 MCP_0835     FALSE 0.053 143.000 0.000 NA   NA
 10155232 10155233 MCP_0835 MCP_0836     FALSE 0.076 542.000 0.000 NA   NA
 10155233 10155234 MCP_0836 MCP_0837     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10155234 10155235 MCP_0837 MCP_0838     TRUE 0.800 86.000 0.667 NA   NA
 10155235 10155236 MCP_0838 MCP_0839     FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 10155237 10155238 MCP_0840 MCP_0841     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 10155238 10155239 MCP_0841 MCP_0842     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155239 10155240 MCP_0842 MCP_0843     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155240 10155241 MCP_0843 MCP_0844     FALSE 0.070 80.000 0.000 NA   NA
 10155241 10155242 MCP_0844 MCP_0845     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10155243 10155244 MCP_0846 MCP_0847     FALSE 0.053 146.000 0.000 NA   NA
 10155244 10155245 MCP_0847 MCP_0848     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155245 10155246 MCP_0848 MCP_0849     TRUE 0.993 -3.000 0.029 NA   NA
 10155246 10155247 MCP_0849 MCP_0850     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10155247 10155248 MCP_0850 MCP_0851     TRUE 0.685 7.000 0.000 NA   NA
 10155248 10155249 MCP_0851 MCP_0852     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155249 10155250 MCP_0852 MCP_0853     TRUE 0.996 -3.000 0.131 1.000   NA
 10155250 10155251 MCP_0853 MCP_0854     TRUE 0.995 5.000 0.070 1.000 Y NA
 10155251 10155252 MCP_0854 MCP_0855     TRUE 0.567 15.000 0.000 1.000   NA
 10155252 10155253 MCP_0855 MCP_0856   iscS-2 FALSE 0.093 319.000 0.000 1.000   NA
 10155255 10155256 MCP_0858 MCP_0859 dapF lysA TRUE 0.999 -3.000 0.104 0.002 Y NA
 10155256 10155257 MCP_0859 MCP_0860 lysA   TRUE 0.997 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 10155258 10155259 MCP_0861 MCP_0862     FALSE 0.127 400.000 0.000 1.000 N NA
 10155260 10155261 MCP_0863 MCP_0864     FALSE 0.151 52.000 0.000 1.000   NA
 10155262 10155263 MCP_0865 MCP_0866     FALSE 0.063 336.000 0.000 NA   NA
 10155265 10155266 MCP_0868 MCP_0869     TRUE 0.956 -24.000 0.000 0.009   NA
 10155267 10155268 MCP_0870 MCP_0871     TRUE 0.685 7.000 0.000 NA   NA
 10155268 10155269 MCP_0871 MCP_0872     FALSE 0.237 35.000 0.000 NA   NA
 10155269 10155270 MCP_0872 MCP_0873     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10155270 10155271 MCP_0873 MCP_0874     TRUE 0.433 16.000 0.000 NA   NA
 10155271 10155272 MCP_0874 MCP_0875     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155272 10155273 MCP_0875 MCP_0876     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10155274 10155275 MCP_0877 MCP_0878     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155275 10155276 MCP_0878 MCP_0879     FALSE 0.054 134.000 0.000 NA   NA
 10155276 10155277 MCP_0879 MCP_0880     FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 10155278 10155279 MCP_0881 MCP_0882     FALSE 0.086 121.000 0.000 1.000   NA
 10155279 10155280 MCP_0882 MCP_0883     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10155280 10155281 MCP_0883 MCP_0884     FALSE 0.062 320.000 0.000 NA   NA
 10155281 10155282 MCP_0884 MCP_0885     TRUE 0.998 0.000 0.375 0.046   NA
 10155282 10155283 MCP_0885 MCP_0886     TRUE 0.968 17.000 0.250 1.000   NA
 10155283 10155284 MCP_0886 MCP_0887     FALSE 0.085 227.000 0.000 1.000   NA
 10155284 10155285 MCP_0887 MCP_0888     FALSE 0.061 105.000 0.000 NA   NA
 10155286 10155287 MCP_0889 MCP_0890     FALSE 0.127 60.000 0.000 1.000   NA
 10155288 10155289 MCP_0891 MCP_0892     TRUE 0.685 7.000 0.000 NA   NA
 10155289 10155290 MCP_0892 MCP_0893     TRUE 0.999 0.000 0.200 0.021 Y NA
 10155290 10155291 MCP_0893 MCP_0894     TRUE 0.673 32.000 0.000 NA Y NA
 10155291 10155292 MCP_0894 MCP_0895     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155292 10155293 MCP_0895 MCP_0896     TRUE 0.995 1.000 0.131 1.000   NA
 10155293 10155294 MCP_0896 MCP_0897     TRUE 0.993 7.000 0.070 1.000 Y NA
 10155294 10155295 MCP_0897 MCP_0898     FALSE 0.126 386.000 0.000 1.000 N NA
 10155295 10155296 MCP_0898 MCP_0899     FALSE 0.053 140.000 0.000 NA   NA
 10155297 10155298 MCP_0900 MCP_0901     FALSE 0.061 308.000 0.000 NA   NA
 10155300 10155301 MCP_0903 MCP_0904     TRUE 0.999 -13.000 0.667 0.033 Y NA
 10155301 10155302 MCP_0904 MCP_0905   nifH-2 TRUE 0.991 8.000 0.182 0.059 N NA
 10155303 10155304 MCP_0906 MCP_0907   hisA FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10155305 10155306 MCP_0908 MCP_0909     FALSE 0.084 807.000 0.000 NA   NA
 10155306 10155307 MCP_0909 MCP_0910     FALSE 0.056 225.000 0.000 NA   NA
 10155307 10155308 MCP_0910 MCP_t0016     FALSE 0.060 109.000 0.000 NA   NA
 10155308 10155309 MCP_t0016 MCP_0911     FALSE 0.064 96.000 0.000 NA   NA
 10155309 10155310 MCP_0911 MCP_0912     FALSE 0.113 50.000 0.000 NA   NA
 10155310 10155311 MCP_0912 MCP_0913     FALSE 0.097 354.000 0.000 1.000   NA
 10155311 10155312 MCP_0913 MCP_0914   hemG FALSE 0.142 526.000 0.000 1.000 N NA
 10155312 10155313 MCP_0914 MCP_0915 hemG   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10155313 10155314 MCP_0915 MCP_0916     FALSE 0.109 494.000 0.000 1.000   NA
 10155314 10155315 MCP_0916 MCP_0917     TRUE 0.765 13.000 0.000 0.056   NA
 10155316 10155317 MCP_0918 MCP_0919     FALSE 0.067 386.000 0.000 NA   NA
 10155317 10155318 MCP_0919 MCP_0920     FALSE 0.063 98.000 0.000 NA   NA
 10155318 10155319 MCP_0920 MCP_0921     TRUE 0.707 102.000 0.250 NA   NA
 10155319 10155320 MCP_0921 MCP_0922     TRUE 0.995 -3.000 0.094 NA   NA
 10155323 10155324 MCP_0925 MCP_0926     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 10155325 10702413 MCP_0927 MCP_t0049     FALSE 0.073 500.000 0.000 NA   NA
 10155326 10155327 MCP_t0017 MCP_0928     FALSE 0.060 279.000 0.000 NA   NA
 10155327 10155328 MCP_0928 MCP_0929     FALSE 0.074 505.000 0.000 NA   NA
 10155328 10155329 MCP_0929 MCP_0930     FALSE 0.065 367.000 0.000 NA   NA
 10155329 10155330 MCP_0930 MCP_0931     TRUE 0.482 14.000 0.000 NA   NA
 10155330 10155331 MCP_0931 MCP_0932     FALSE 0.060 277.000 0.000 NA   NA
 10155334 10155335 MCP_0935 MCP_0936     TRUE 0.989 11.000 0.731 1.000   NA
 10155335 10155336 MCP_0936 MCP_0937     FALSE 0.088 250.000 0.000 1.000   NA
 10155339 10155340 MCP_0940 MCP_0941     FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10155341 10155342 MCP_0942 MCP_0943     FALSE 0.061 105.000 0.000 NA   NA
 10155342 10155343 MCP_0943 MCP_0944     FALSE 0.053 153.000 0.000 NA   NA
 11497796 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11640159 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11782551 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1750.000 0.000 NA   NA
 11497797 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1769.000 0.000 NA   NA
 11640160 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1769.000 0.000 NA   NA
 11782552 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1769.000 0.000 NA   NA
 11497798 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1789.000 0.000 NA   NA
 11640161 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1789.000 0.000 NA   NA
 11782553 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1789.000 0.000 NA   NA
 11497799 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1808.000 0.000 NA   NA
 11640162 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1808.000 0.000 NA   NA
 11782554 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1808.000 0.000 NA   NA
 11497800 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1828.000 0.000 NA   NA
 11640163 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1828.000 0.000 NA   NA
 11782555 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1828.000 0.000 NA   NA
 11497801 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11640164 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11782556 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11497802 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 11640165 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 11782557 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 11497803 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1910.000 0.000 NA   NA
 11640166 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1910.000 0.000 NA   NA
 11782558 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1910.000 0.000 NA   NA
 11497804 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1930.000 0.000 NA   NA
 11640167 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1930.000 0.000 NA   NA
 11782559 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1930.000 0.000 NA   NA
 11497805 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1949.000 0.000 NA   NA
 11640168 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1949.000 0.000 NA   NA
 11782560 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1949.000 0.000 NA   NA
 11497806 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 11640169 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 11782561 10155339   MCP_0940     FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 10155345 10155346 MCP_0946 MCP_0947 engC   FALSE 0.073 500.000 0.000 NA   NA
 10155346 10155347 MCP_0947 MCP_0948     TRUE 0.482 14.000 0.000 NA   NA
 10155348 10155349 MCP_0949 MCP_0950     TRUE 0.993 0.000 0.034 1.000   NA
 10155349 10155350 MCP_0950 MCP_0951     TRUE 0.990 2.000 0.050 NA   NA
 10155350 10155351 MCP_0951 MCP_0952     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10155351 10155352 MCP_0952 MCP_0953     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155355 10155356 MCP_0956 MCP_0957     TRUE 0.997 -13.000 0.833 NA   NA
 10155356 10155357 MCP_0957 MCP_0958     FALSE 0.055 213.000 0.000 NA   NA
 10155358 10155359 MCP_0959 MCP_0960     FALSE 0.059 115.000 0.000 NA   NA
 10155362 10155363 MCP_0963 MCP_0964     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155363 10155364 MCP_0964 MCP_0965     TRUE 0.854 -16.000 0.000 NA   NA
 10155364 10155365 MCP_0965 MCP_0966     TRUE 0.939 4.000 0.000 0.003   NA
 10155365 10155366 MCP_0966 MCP_0967     FALSE 0.053 157.000 0.000 NA   NA
 10155366 10155367 MCP_0967 MCP_0968     TRUE 0.995 4.000 0.759 NA   NA
 10155367 10155368 MCP_0968 MCP_0969     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 10155371 10155372 MCP_0972 MCP_0973 glmS-2   FALSE 0.147 631.000 0.000 1.000 N NA
 10155374 10155375 MCP_0975 MCP_0976     TRUE 0.906 0.000 0.000 NA N NA
 10155375 10155376 MCP_0976 MCP_0977     TRUE 0.996 -3.000 0.068 1.000 N NA
 10155376 10155377 MCP_0977 MCP_0978     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA N NA
 10155381 10155382 MCP_0982 MCP_0983     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155383 10155384 MCP_0984 MCP_0985     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10155384 10155385 MCP_0985 MCP_0986     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155386 10155387 MCP_0987 MCP_0988     FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 10155388 10155389 MCP_0989 MCP_0990     TRUE 0.953 -27.000 0.000 0.057 N NA
 10155390 10155391 MCP_0991 MCP_0992     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 10155391 10155392 MCP_0992 MCP_0993     TRUE 0.994 -3.000 0.055 NA   NA
 10155392 10155393 MCP_0993 MCP_0994     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 10155396 10155397 MCP_0997 MCP_0998   map-1 TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155403 10155404 MCP_1004 MCP_1005     TRUE 0.993 -3.000 0.018 NA N NA
 10155404 10155405 MCP_1005 MCP_1006   hisC TRUE 0.992 -3.000 0.009 NA N NA
 10155406 10155407 MCP_1007 MCP_1008     FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 10155407 10155408 MCP_1008 MCP_1009   albA FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 10155409 10155410 MCP_1010 MCP_1011     FALSE 0.067 385.000 0.000 NA   NA
 10155410 10155411 MCP_1011 MCP_1012     FALSE 0.124 772.000 0.000 1.000   NA
 10155411 10155412 MCP_1012 MCP_1013     TRUE 0.998 2.000 0.286 1.000 Y NA
 10155414 10155415 MCP_1015 MCP_1016     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155417 10155418 MCP_1018 MCP_1019     TRUE 0.995 -3.000 0.111 NA   NA
 10155418 10155419 MCP_1019 MCP_1020     FALSE 0.053 153.000 0.000 NA   NA
 10155420 10155421 MCP_1021 MCP_1022     FALSE 0.085 60.000 0.000 NA   NA
 10155422 10155423 MCP_1023 MCP_1024     FALSE 0.070 80.000 0.000 NA   NA
 10155423 10155424 MCP_1024 MCP_1025     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155424 10155425 MCP_1025 MCP_1026     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10155425 10155426 MCP_1026 MCP_1027     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155426 10155427 MCP_1027 MCP_1028     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10155427 10155428 MCP_1028 MCP_1029   trm1 FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 10155428 10155429 MCP_1029 MCP_1030 trm1   FALSE 0.286 39.000 0.000 1.000   NA
 10155429 10155430 MCP_1030 MCP_1031     FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 10155431 10155432 MCP_1032 MCP_1033   ftr FALSE 0.105 78.000 0.000 1.000   NA
 10155434 10155435 MCP_1035 MCP_1036     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155436 10155437 MCP_1037 MCP_1038 infB ndk TRUE 0.931 20.000 0.037 1.000 N NA
 10155437 10155438 MCP_1038 MCP_1039 ndk rpl24e TRUE 0.983 7.000 0.054 1.000 N NA
 10155438 10155439 MCP_1039 MCP_1040 rpl24e rps28e TRUE 0.998 6.000 0.761 0.021 Y NA
 10155439 10155440 MCP_1040 MCP_1041 rps28e rpl7ae TRUE 0.992 20.000 0.602 0.021 Y NA
 10155440 10155441 MCP_1041 MCP_1042 rpl7ae   FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 10155441 10155442 MCP_1042 MCP_1043     FALSE 0.071 75.000 0.000 NA   NA
 10155442 10155443 MCP_1043 MCP_1044     FALSE 0.063 98.000 0.000 NA   NA
 10155443 10155444 MCP_1044 MCP_1045     FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 10155444 10155445 MCP_1045 MCP_1046     FALSE 0.065 94.000 0.000 NA   NA
 10155445 10155446 MCP_1046 MCP_1047     FALSE 0.064 96.000 0.000 NA   NA
 10155447 10155448 MCP_1048 MCP_1049     TRUE 0.882 -30.000 0.000 NA N NA
 10155448 10155449 MCP_1049 MCP_1050     TRUE 0.993 -7.000 0.060 NA   NA
 10155451 10155452 MCP_1052 MCP_1053     FALSE 0.059 111.000 0.000 NA   NA
 10155452 10155453 MCP_1053 MCP_1054     FALSE 0.069 84.000 0.000 NA   NA
 10155455 10155456 MCP_1056 MCP_1057     TRUE 0.998 7.000 0.500 0.003 Y NA
 10155456 10155457 MCP_1057 MCP_1058     FALSE 0.185 85.000 0.000 0.059   NA
 10155457 10155458 MCP_1058 MCP_1059   atw-2 TRUE 0.853 45.000 0.171 1.000   NA
 10155458 10155459 MCP_1059 MCP_1060 atw-2   TRUE 0.750 103.000 0.429 NA   NA
 10155459 10155460 MCP_1060 MCP_1061     TRUE 0.996 2.000 0.559 NA   NA
 10155460 10155461 MCP_1061 MCP_1062     TRUE 0.997 -3.000 0.472 NA   NA
 10155461 10155462 MCP_1062 MCP_1063     TRUE 0.997 -3.000 0.420 NA   NA
 10155462 10155463 MCP_1063 MCP_1064     TRUE 0.982 12.000 0.420 NA   NA
 10155463 10155464 MCP_1064 MCP_1065     TRUE 0.995 3.000 0.429 NA   NA
 10155465 10155466 MCP_1066 MCP_1067     FALSE 0.087 59.000 0.000 NA   NA
 10155466 10155467 MCP_1067 MCP_1068     FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10155473 10155474 MCP_1074 MCP_1075     FALSE 0.140 518.000 0.000 1.000 N NA
 10155474 10155475 MCP_1075 MCP_1076     TRUE 0.998 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 10155475 10155476 MCP_1076 MCP_1077     TRUE 0.992 13.000 0.400 1.000 Y NA
 10155476 10155477 MCP_1077 MCP_1078     TRUE 0.399 1249.000 0.000 1.000 Y NA
 10155477 10155478 MCP_1078 MCP_1079     FALSE 0.290 208.000 0.000 1.000 Y NA
 10155478 10155479 MCP_1079 MCP_1080     TRUE 0.977 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10155479 10155480 MCP_1080 MCP_1081     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155482 10155483 MCP_1083 MCP_1084     TRUE 0.996 9.000 0.682 1.000 Y NA
 10155484 10155485 MCP_1085 MCP_1086     TRUE 0.964 10.000 0.026 NA   NA
 10155487 10155488 MCP_1088 MCP_1089     FALSE 0.069 430.000 0.000 NA   NA
 10155489 10155490 MCP_1090 MCP_1091     FALSE 0.180 53.000 0.000 1.000 N NA
 10155491 10155492 MCP_1092 MCP_1093     FALSE 0.334 23.000 0.000 NA   NA
 10155493 10155494 MCP_1094 MCP_1095     TRUE 0.998 3.000 0.255 1.000 Y NA
 10155495 10155496 MCP_1096 MCP_1097     FALSE 0.056 126.000 0.000 NA   NA
 10155497 10155498 MCP_1098 MCP_1099     FALSE 0.053 165.000 0.000 NA   NA
 10155498 10155499 MCP_1099 MCP_1100     FALSE 0.053 150.000 0.000 NA   NA
 10155500 10155501 MCP_t0018 MCP_1101     FALSE 0.054 134.000 0.000 NA   NA
 10155505 10155506 MCP_1105 MCP_1106     TRUE 0.995 -10.000 0.200 NA   NA
 10155507 10155508 MCP_1107 MCP_1108 hdrD-2   TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 10155509 10155510 MCP_1109 MCP_1110   uvsE FALSE 0.057 238.000 0.000 NA   NA
 10155510 10155511 MCP_1110 MCP_1111 uvsE   FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10155511 10155512 MCP_1111 MCP_1112     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155515 10155516 MCP_1115 MCP_1116   rbcL FALSE 0.102 142.000 0.000 1.000 N NA
 10155517 10155518 MCP_1117 MCP_1118     FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10155518 10155519 MCP_1118 MCP_1119     TRUE 0.663 46.000 0.000 0.005 Y NA
 10155521 10155522 MCP_1121 MCP_1122 nadX   FALSE 0.253 33.000 0.000 NA   NA
 10155522 10155523 MCP_1122 MCP_1123     FALSE 0.169 42.000 0.000 NA   NA
 10155525 10155526 MCP_1125 MCP_1126 ogt   FALSE 0.064 95.000 0.000 NA   NA
 10155528 10155529 MCP_1128 MCP_1129     TRUE 0.891 2.000 0.000 1.000   NA
 10155529 10155530 MCP_1129 MCP_1130     FALSE 0.053 150.000 0.000 NA   NA
 10155530 10155531 MCP_1130 MCP_1131     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10155531 10155532 MCP_1131 MCP_1132   mch-1 FALSE 0.085 60.000 0.000 NA   NA
 10155532 10155533 MCP_1132 MCP_1133 mch-1 mptA-1 FALSE 0.087 120.000 0.000 1.000   NA
 10155533 10155534 MCP_1133 MCP_1134 mptA-1   FALSE 0.054 137.000 0.000 NA   NA
 10155534 10155535 MCP_1134 MCP_1135   thiM FALSE 0.070 80.000 0.000 NA   NA
 10155535 10155536 MCP_1135 MCP_1136 thiM thiE TRUE 0.999 -3.000 0.146 0.005 Y NA
 10155536 10155537 MCP_1136 MCP_1137 thiE   TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155538 10155539 MCP_1138 MCP_1139     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155539 10155540 MCP_1139 MCP_1140     FALSE 0.104 84.000 0.000 1.000   NA
 10155540 10155541 MCP_1140 MCP_1141     FALSE 0.055 204.000 0.000 NA   NA
 10155541 10155542 MCP_1141 MCP_1142     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10155543 10155544 MCP_m0002 MCP_1143     FALSE 0.053 151.000 0.000 NA   NA
 10155546 10155547 MCP_1145 MCP_1146     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10155547 10155548 MCP_1146 MCP_1147     FALSE 0.061 311.000 0.000 NA   NA
 10155548 10155549 MCP_1147 MCP_1148     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10155549 10155550 MCP_1148 MCP_1149     FALSE 0.063 342.000 0.000 NA   NA
 10155551 10155552 MCP_1150 MCP_1151     FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 10155554 10155555 MCP_1153 MCP_1154     FALSE 0.066 376.000 0.000 NA   NA
 10155555 10155556 MCP_1154 MCP_1155     TRUE 0.433 16.000 0.000 NA   NA
 10155556 10155557 MCP_1155 MCP_1156     FALSE 0.055 210.000 0.000 NA   NA
 10155557 10155558 MCP_1156 MCP_1157     FALSE 0.230 36.000 0.000 NA   NA
 10155560 10155561 MCP_1159 MCP_1160 top6A-2 top6B-2 TRUE 0.999 -16.000 0.328 0.003 Y NA
 10155562 10155563 MCP_1161 MCP_1162     FALSE 0.292 42.000 0.000 1.000 N NA
 10155563 10155564 MCP_1162 MCP_1163     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10155565 10155566 MCP_1164 MCP_1165     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 10155566 10155567 MCP_1165 MCP_1166     FALSE 0.070 81.000 0.000 NA   NA
 10155567 10155568 MCP_1166 MCP_1167     FALSE 0.253 33.000 0.000 NA   NA
 10155568 10155569 MCP_1167 MCP_1168     FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 10155570 10155571 MCP_1169 MCP_1170 pth   TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155571 10155572 MCP_1170 MCP_1171   truD TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155572 10155573 MCP_1171 MCP_1172 truD   FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 10155575 10155576 MCP_1174 MCP_1175     FALSE 0.075 513.000 0.000 NA   NA
 10155580 10155581 MCP_1179 MCP_1180   tgtA FALSE 0.219 48.000 0.000 1.000 N NA
 10155581 10155582 MCP_1180 MCP_1181 tgtA   TRUE 0.345 80.000 0.000 1.000 Y NA
 10155582 10155583 MCP_1181 MCP_1182     TRUE 0.986 9.000 0.163 1.000 N NA
 10155583 10155584 MCP_1182 MCP_1183     TRUE 0.994 4.000 0.288 1.000   NA
 10155585 10155586 MCP_1184 MCP_1185     FALSE 0.070 441.000 0.000 NA   NA
 10155586 10155587 MCP_1185 MCP_1186     FALSE 0.195 40.000 0.000 NA   NA
 10155588 10155589 MCP_1187 MCP_1188 iorA iorB TRUE 0.998 3.000 0.188 0.001 Y NA
 10155589 10155590 MCP_1188 MCP_1189 iorB   FALSE 0.102 165.000 0.000 1.000 N NA
 10155590 10155591 MCP_1189 MCP_1190     FALSE 0.105 82.000 0.000 1.000   NA
 10155592 10155593 MCP_1191 MCP_1192     TRUE 0.966 26.000 0.700 1.000   NA
 10155593 10155594 MCP_1192 MCP_1193     TRUE 0.918 141.000 0.350 0.002 Y NA
 10155594 10155595 MCP_1193 MCP_1194     FALSE 0.084 800.000 0.000 NA   NA
 10155595 10155596 MCP_1194 MCP_1195     FALSE 0.068 87.000 0.000 NA   NA
 10155596 10155597 MCP_1195 MCP_1196     TRUE 0.858 5.000 0.000 1.000 N NA
 10155597 10155598 MCP_1196 MCP_1197     TRUE 0.771 10.000 0.000 1.000 N NA
 10155600 10155601 MCP_1199 MCP_1200     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155602 10155603 MCP_1201 MCP_1202     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155603 10155604 MCP_1202 MCP_1203     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155604 10155605 MCP_1203 MCP_1204     FALSE 0.053 157.000 0.000 NA   NA
 10155607 10155608 MCP_1206 MCP_1207     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155608 10155609 MCP_1207 MCP_1208     FALSE 0.067 89.000 0.000 NA   NA
 10155613 10155614 MCP_1212 MCP_1213     FALSE 0.055 130.000 0.000 NA   NA
 10155616 10155617 MCP_t0019 MCP_1215   rpoH FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10155617 10155618 MCP_1215 MCP_1216 rpoH rpoB2 TRUE 0.980 18.000 0.292 0.005   NA
 10155618 10155619 MCP_1216 MCP_1217 rpoB2 rpoB1 TRUE 0.998 2.000 0.909 0.005   NA
 10155619 10155620 MCP_1217 MCP_1218 rpoB1 rpoA1 TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.005   NA
 10155620 10155621 MCP_1218 MCP_1219 rpoA1 rpoA2 TRUE 0.998 -3.000 0.366 0.005   NA
 10155621 10155622 MCP_1219 MCP_1220 rpoA2 rpl30e TRUE 0.905 32.000 0.074 1.000   NA
 10155622 10155623 MCP_1220 MCP_1221 rpl30e   TRUE 0.995 -7.000 0.068 1.000 N NA
 10155623 10155624 MCP_1221 MCP_1222   rps12p TRUE 0.965 13.000 0.057 1.000 N NA
 10155624 10155625 MCP_1222 MCP_1223 rps12p rps7p TRUE 0.997 10.000 0.410 0.003 Y NA
 10155625 10155626 MCP_1223 MCP_1224 rps7p fusA TRUE 0.981 20.000 0.211 1.000 Y NA
 10155626 10155627 MCP_1224 MCP_1225 fusA tuf TRUE 0.881 127.000 0.095 0.001 Y NA
 10155627 10155628 MCP_1225 MCP_1226 tuf rps10p TRUE 0.902 61.000 0.249 1.000 Y NA
 10155633 10155634 MCP_1231 MCP_1232     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 10155635 10155636 MCP_1233 MCP_1234     FALSE 0.059 114.000 0.000 NA   NA
 10155637 10155638 MCP_1235 MCP_1236     FALSE 0.301 27.000 0.000 NA   NA
 10155638 10155639 MCP_1236 MCP_1237     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155639 10155640 MCP_1237 MCP_1238     FALSE 0.087 119.000 0.000 1.000   NA
 10155640 10155641 MCP_1238 MCP_1239     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10155642 10155643 MCP_1240 MCP_1241     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10155643 10155644 MCP_1241 MCP_1242     FALSE 0.053 165.000 0.000 NA   NA
 10155644 10155645 MCP_1242 MCP_1243     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 10155645 10155646 MCP_1243 MCP_1244     TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155648 10155649 MCP_1246 MCP_1247     FALSE 0.092 87.000 0.000 NA N NA
 10155649 10155650 MCP_1247 MCP_1248     FALSE 0.259 41.000 0.000 1.000   NA
 10155652 10155653 MCP_1250 MCP_1251 mcm   TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10155653 10155654 MCP_1251 MCP_1252     FALSE 0.059 270.000 0.000 NA   NA
 10155655 10155656 MCP_1253 MCP_1254     FALSE 0.095 99.000 0.000 1.000   NA
 10155656 10155657 MCP_1254 MCP_1255     FALSE 0.105 82.000 0.000 1.000   NA
 10155657 10155658 MCP_1255 MCP_1256     TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.003 Y NA
 10155658 10155659 MCP_1256 MCP_1257     TRUE 0.999 0.000 0.074 0.003 Y NA
 10155659 10155660 MCP_1257 MCP_1258     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 10155661 10155662 MCP_1259 MCP_1260     FALSE 0.082 132.000 0.000 1.000   NA
 10155663 10155664 MCP_1261 MCP_1262     FALSE 0.067 89.000 0.000 NA   NA
 10155664 10155665 MCP_1262 MCP_1263   apgM-1 TRUE 0.763 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10155665 10155666 MCP_1263 MCP_1264 apgM-1   FALSE 0.103 137.000 0.000 1.000 N NA
 10155666 10155667 MCP_1264 MCP_1265     FALSE 0.328 40.000 0.000 1.000 N NA
 10155668 10155669 MCP_1266 MCP_1267 ppsA-2   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10155669 10155670 MCP_1267 MCP_1268   pgk-2 TRUE 0.606 16.000 0.000 1.000 N NA
 10155670 10155671 MCP_1268 MCP_1269 pgk-2 pfkA-1 TRUE 0.416 135.000 0.000 0.006 Y NA
 10155672 10155673 MCP_1270 MCP_1271 gap-1   FALSE 0.053 142.000 0.000 NA   NA
 10155673 10155674 MCP_1271 MCP_1272     FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 10155676 10155677 MCP_1274 MCP_1275     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 10155677 10155678 MCP_1275 MCP_1276     FALSE 0.070 80.000 0.000 NA   NA
 10155679 10155680 MCP_1277 MCP_1278     FALSE 0.060 109.000 0.000 NA   NA
 10155683 10155684 MCP_1281 MCP_1282     TRUE 0.996 -3.000 0.163 NA   NA
 10155685 10155686 MCP_1283 MCP_1284     FALSE 0.107 232.000 0.000 1.000 N NA
 10155688 10155689 MCP_1286 MCP_1287     TRUE 0.395 214.000 0.000 0.022 Y NA
 10155690 10155691 MCP_1288 MCP_1289     FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 10155691 10155692 MCP_1289 MCP_1290     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155693 10155694 MCP_1291 MCP_1292   cysS FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 10155696 10155697 MCP_1294 MCP_1295     FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10155697 10155698 MCP_1295 MCP_1296     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10155698 10155699 MCP_1296 MCP_1297   cofE-1 FALSE 0.060 106.000 0.000 NA   NA
 10155700 10155701 MCP_1298 MCP_1299     TRUE 0.992 -3.000 0.016 NA   NA
 10155702 10155703 MCP_1300 MCP_1301     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155704 10155705 MCP_1302 MCP_1303   pol FALSE 0.071 472.000 0.000 NA   NA
 10155706 10155707 MCP_1304 MCP_1305     TRUE 0.669 143.000 0.240 NA   NA
 10155707 10155708 MCP_1305 MCP_1306     TRUE 0.997 -3.000 0.233 1.000   NA
 10155708 10155709 MCP_1306 MCP_1307     FALSE 0.133 76.000 0.000 1.000 N NA
 10155713 10155714 MCP_1311 MCP_1312   pfkA-2 TRUE 0.348 76.000 0.000 1.000 Y NA
 10155714 10155715 MCP_1312 MCP_1313 pfkA-2 mtd FALSE 0.103 187.000 0.000 1.000 N NA
 10155715 10155716 MCP_1313 MCP_1314 mtd   FALSE 0.081 145.000 0.000 1.000   NA
 10155716 10155717 MCP_1314 MCP_1315     FALSE 0.136 56.000 0.000 1.000   NA
 10155717 10155718 MCP_1315 MCP_1316     FALSE 0.133 57.000 0.000 1.000   NA
 10155718 10155719 MCP_1316 MCP_1317     TRUE 0.572 37.000 0.000 0.001   NA
 10155719 10155720 MCP_1317 MCP_1318   truA TRUE 0.893 -31.000 0.000 1.000   NA
 10155720 10155721 MCP_1318 MCP_1319 truA   FALSE 0.070 79.000 0.000 NA   NA
 10155722 10155723 MCP_1320 MCP_1321   surE FALSE 0.118 633.000 0.000 1.000   NA
 10155723 10155724 MCP_1321 MCP_1322 surE   FALSE 0.112 517.000 0.000 1.000   NA
 10155725 10155726 MCP_1323 MCP_1324     FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 10155726 10155727 MCP_1324 MCP_1325     TRUE 0.998 -3.000 0.485 1.000   NA
 10155727 10155728 MCP_1325 MCP_1326     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155728 10155729 MCP_1326 MCP_1327     FALSE 0.054 187.000 0.000 NA   NA
 10155729 10155730 MCP_1327 MCP_1328     TRUE 0.992 11.000 0.222 NA Y NA
 10155730 10155731 MCP_1328 MCP_1329     FALSE 0.283 37.000 0.000 NA N NA
 10155732 10155733 MCP_1330 MCP_1331     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155734 10155735 MCP_1332 MCP_1333     TRUE 0.960 21.000 0.381 NA   NA
 10155735 10155736 MCP_1333 MCP_1334     TRUE 0.620 147.000 0.154 NA   NA
 10155736 10155737 MCP_1334 MCP_1335     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10155737 10155738 MCP_1335 MCP_1336     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10155738 10155739 MCP_1336 MCP_1337     FALSE 0.084 61.000 0.000 NA   NA
 10155739 10155740 MCP_1337 MCP_1338     FALSE 0.085 227.000 0.000 1.000   NA
 10155740 10155741 MCP_1338 MCP_1339     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.039   NA
 10155742 10155743 MCP_1340 MCP_1341     TRUE 0.482 14.000 0.000 NA   NA
 10155743 10155744 MCP_1341 MCP_1342     FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 10155744 10155745 MCP_1342 MCP_1343     FALSE 0.222 78.000 0.000 0.049 N NA
 10155746 10155747 MCP_1344 MCP_1345 ahcY   TRUE 0.936 13.000 0.003 NA N NA
 10155747 10155748 MCP_1345 MCP_1346     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155748 10155749 MCP_1346 MCP_1347   cysC TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10155749 10155750 MCP_1347 MCP_1348 cysC fbp/suhB TRUE 0.934 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10155751 10155752 MCP_1349 MCP_1350     FALSE 0.064 345.000 0.000 NA   NA
 10155752 10155753 MCP_1350 MCP_1351     TRUE 0.391 195.000 0.000 0.022 Y NA
 10155754 10155755 MCP_1352 MCP_1353     FALSE 0.086 238.000 0.000 1.000   NA
 10155756 10155757 MCP_1354 MCP_1355     FALSE 0.081 685.000 0.000 NA   NA
 10155757 10155758 MCP_1355 MCP_1356   pdaD-2 TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155762 10155763 MCP_1360 MCP_1361     TRUE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10155764 10155765 MCP_1362 MCP_1363     FALSE 0.200 100.000 0.000 0.011   NA
 10155766 10155767 MCP_1364 MCP_1365     FALSE 0.059 111.000 0.000 NA   NA
 10155767 10155768 MCP_1365 MCP_1366     TRUE 0.980 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 10155768 10155769 MCP_1366 MCP_1367     TRUE 0.933 0.000 0.000 1.000 N NA
 10155769 10155770 MCP_1367 MCP_1368     FALSE 0.091 107.000 0.000 1.000   NA
 10155770 10155771 MCP_1368 MCP_1369     FALSE 0.068 87.000 0.000 NA   NA
 10155771 10155772 MCP_1369 MCP_1370   cadA FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10155772 10155773 MCP_1370 MCP_1371 cadA   TRUE 0.792 9.000 0.000 1.000 N NA
 10155773 10155774 MCP_1371 MCP_1372     FALSE 0.192 90.000 0.000 0.023   NA
 10155775 10155776 MCP_1373 MCP_1374     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10155776 10155777 MCP_1374 MCP_t0020     FALSE 0.058 255.000 0.000 NA   NA
 10155777 10155778 MCP_t0020 MCP_1375     FALSE 0.083 776.000 0.000 NA   NA
 10155778 10155779 MCP_1375 MCP_1376     FALSE 0.063 339.000 0.000 NA   NA
 10155779 10155780 MCP_1376 MCP_1377     FALSE 0.089 92.000 0.000 NA N NA
 10155781 10155782 MCP_1378 MCP_1379     TRUE 0.350 45.000 0.000 0.029   NA
 10155782 10155783 MCP_1379 MCP_1380     TRUE 0.990 7.000 0.100 0.029   NA
 10155784 10155785 MCP_1381 MCP_1382     FALSE 0.230 36.000 0.000 NA   NA
 10155785 10155786 MCP_1382 MCP_1383     FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 10155789 10155790 MCP_1386 MCP_1387     TRUE 0.359 32.000 0.000 1.000   NA
 10155791 10155792 MCP_1388 MCP_1389     FALSE 0.089 367.000 0.000 NA N NA
 10155793 10155794 MCP_1390 MCP_1391     FALSE 0.053 149.000 0.000 NA   NA
 10155797 10155798 MCP_1394 MCP_1395     FALSE 0.082 135.000 0.000 1.000   NA
 10155798 10155799 MCP_1395 MCP_1396   ftsZ-1 FALSE 0.101 389.000 0.000 1.000   NA
 10155801 10155802 MCP_1398 MCP_1399     FALSE 0.062 316.000 0.000 NA   NA
 10155802 10155803 MCP_1399 MCP_1400     FALSE 0.053 146.000 0.000 NA   NA
 10155803 10155804 MCP_1400 MCP_1401     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 10155806 10155807 MCP_1402 MCP_1403     FALSE 0.055 129.000 0.000 NA   NA
 10155807 10155808 MCP_1403 MCP_1404     FALSE 0.333 32.000 0.000 NA N NA
 10155808 10155809 MCP_1404 MCP_1405     FALSE 0.061 104.000 0.000 NA   NA
 10155809 10155810 MCP_1405 MCP_1406     FALSE 0.066 91.000 0.000 NA   NA
 10155810 10155811 MCP_1406 MCP_1407     FALSE 0.055 130.000 0.000 NA   NA
 10155811 10155812 MCP_1407 MCP_1408   endA FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 10155812 10155813 MCP_1408 MCP_1409 endA trpS TRUE 0.895 12.000 0.000 1.000 Y NA
 10155813 10155814 MCP_1409 MCP_1410 trpS pheS TRUE 0.995 2.000 0.002 1.000 Y NA
 10155814 10155815 MCP_1410 MCP_1411 pheS pheT TRUE 0.998 -12.000 0.046 0.001 Y NA
 10155815 10155816 MCP_1411 MCP_1412 pheT   FALSE 0.242 42.000 0.000 1.000   NA
 10155818 10155819 MCP_1414 MCP_1415     FALSE 0.106 77.000 0.000 1.000   NA
 10155819 10155820 MCP_1415 MCP_1416     TRUE 0.669 8.000 0.000 NA   NA
 10155821 10155822 MCP_1417 MCP_1418     TRUE 0.997 -3.000 0.417 NA   NA
 10155823 10155824 MCP_1419 MCP_1420     TRUE 0.867 -10.000 0.000 NA   NA
 10155825 10155826 MCP_1421 MCP_1422     TRUE 0.996 -28.000 0.400 NA   NA
 10155826 10155827 MCP_1422 MCP_1423     TRUE 0.998 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 10155827 10155828 MCP_1423 MCP_1424     FALSE 0.064 95.000 0.000 NA   NA
 10155828 10155829 MCP_1424 MCP_1425     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155830 10155831 MCP_1426 MCP_1427     FALSE 0.169 42.000 0.000 NA   NA
 10155831 10155832 MCP_1427 MCP_1428     FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 10155832 10155833 MCP_1428 MCP_1429     TRUE 0.846 -27.000 0.000 NA   NA
 10155833 10155834 MCP_1429 MCP_1430   thiL FALSE 0.084 126.000 0.000 1.000   NA
 10155835 10155836 MCP_1431 MCP_1432     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 10155836 10155837 MCP_1432 MCP_1433     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10155839 10155840 MCP_1435 MCP_1436     FALSE 0.082 185.000 0.000 1.000   NA
 10155841 10155842 MCP_1437 MCP_1438     FALSE 0.117 594.000 0.000 1.000   NA
 10155843 10155844 MCP_1439 MCP_1440     FALSE 0.310 41.000 0.000 1.000 N NA
 10155845 10155846 MCP_1441 MCP_1442 dys-2   TRUE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 10155847 10155848 MCP_1443 MCP_1444     TRUE 0.421 107.000 0.000 0.021 Y NA
 10155850 10155851 MCP_1446 MCP_1447     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10155851 10155852 MCP_1447 MCP_1448   pdxS FALSE 0.101 89.000 0.000 1.000   NA
 10155852 10155853 MCP_1448 MCP_1449 pdxS   FALSE 0.059 268.000 0.000 NA   NA
 10155853 10155854 MCP_1449 MCP_1450     FALSE 0.243 34.000 0.000 NA   NA
 10155854 10155855 MCP_1450 MCP_1451     FALSE 0.117 59.000 0.000 NA N NA
 10155855 10155856 MCP_1451 MCP_1452   aspC-1 FALSE 0.141 71.000 0.000 1.000 N NA
 10155856 10155857 MCP_1452 MCP_1453 aspC-1 ribH TRUE 0.935 18.000 0.029 1.000 N NA
 10155857 10155858 MCP_1453 MCP_1454 ribH ribC TRUE 0.986 15.000 0.027 0.001 Y NA
 10155858 10155859 MCP_1454 MCP_1455 ribC aspC-2 TRUE 0.968 19.000 0.270 1.000 N NA
 10155859 10155860 MCP_1455 MCP_1456 aspC-2   FALSE 0.065 94.000 0.000 NA   NA
 10155861 10155862 MCP_1457 MCP_1458   nfi TRUE 0.990 2.000 0.015 1.000 N NA
 10155862 10155863 MCP_1458 MCP_1459 nfi   FALSE 0.107 75.000 0.000 1.000   NA
 10155864 10155865 MCP_1460 MCP_1461     TRUE 0.999 1.000 0.579 0.002 Y NA
 10155866 10155867 MCP_1462 MCP_1463   metK FALSE 0.063 98.000 0.000 NA   NA
 10155867 10155868 MCP_1463 MCP_1464 metK   FALSE 0.061 289.000 0.000 NA   NA
 10155869 10155870 MCP_1465 MCP_1466     FALSE 0.085 60.000 0.000 NA   NA
 10155871 10155872 MCP_1467 MCP_1468     TRUE 0.994 5.000 0.925 NA   NA
 10155872 10155873 MCP_1468 MCP_1469     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10155873 10155874 MCP_1469 MCP_1470   fgd FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 10155874 10155875 MCP_1470 MCP_t0022 fgd   FALSE 0.058 252.000 0.000 NA   NA
 10155875 10155876 MCP_t0022 MCP_t0023     FALSE 0.067 89.000 0.000 NA   NA
 10155876 10155877 MCP_t0023 MCP_1471     FALSE 0.064 356.000 0.000 NA   NA
 10155879 10155880 MCP_1473 MCP_1474     FALSE 0.220 37.000 0.000 NA   NA
 10155881 10155882 MCP_1475 MCP_1476     FALSE 0.054 168.000 0.000 NA   NA
 10155886 10155887 MCP_1480 MCP_1481     TRUE 0.626 10.000 0.000 NA   NA
 10155887 10155888 MCP_1481 MCP_1482     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10155890 10155891 MCP_1484 MCP_1485     FALSE 0.056 125.000 0.000 NA   NA
 10155892 10155893 MCP_1486 MCP_1487     FALSE 0.062 101.000 0.000 NA   NA
 10155893 10155894 MCP_1487 MCP_1488     FALSE 0.066 381.000 0.000 NA   NA
 10155896 10155897 MCP_1490 MCP_1491     TRUE 0.919 5.000 0.000 0.049 N NA
 10155897 10155898 MCP_1491 MCP_1492     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 10155899 10155900 MCP_1493 MCP_1494 pyrF   FALSE 0.243 34.000 0.000 NA   NA
 10155900 10155901 MCP_1494 MCP_1495     FALSE 0.301 27.000 0.000 NA   NA
 10155902 10155903 MCP_t0024 MCP_1496     FALSE 0.060 285.000 0.000 NA   NA
 10155904 10155905 MCP_1497 MCP_1498     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10155907 10155908 MCP_1500 MCP_1501     FALSE 0.062 102.000 0.000 NA   NA
 10155908 10155909 MCP_1501 MCP_1502     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10155909 10155910 MCP_1502 MCP_1503     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10155911 10155912 MCP_1504 MCP_1505     TRUE 0.984 15.000 0.101 1.000 Y NA
 10155912 10155913 MCP_1505 MCP_1506   rpoL TRUE 0.963 11.000 0.010 1.000 N NA
 10155913 10155914 MCP_1506 MCP_1507 rpoL   FALSE 0.220 37.000 0.000 NA   NA
 10155914 10155915 MCP_1507 MCP_1508     TRUE 0.984 6.000 0.091 NA   NA
 10155915 10155916 MCP_1508 MCP_1509   tfe TRUE 0.722 75.000 0.157 1.000   NA
 10155916 10155917 MCP_1509 MCP_1510 tfe   TRUE 0.985 7.000 0.105 1.000   NA
 10155918 10155919 MCP_1511 MCP_1512     FALSE 0.070 81.000 0.000 NA   NA
 10155919 10155920 MCP_1512 MCP_1513     FALSE 0.053 166.000 0.000 NA   NA
 10155920 10155921 MCP_1513 MCP_1514     FALSE 0.098 53.000 0.000 NA   NA
 10155921 10155922 MCP_1514 MCP_1515     TRUE 0.593 14.000 0.000 1.000   NA
 10155922 10155923 MCP_1515 MCP_1516     TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10155924 10155925 MCP_1517 MCP_1518     FALSE 0.053 149.000 0.000 NA   NA
 10155927 10155928 MCP_1519 MCP_1520     FALSE 0.078 67.000 0.000 NA   NA
 10155930 10155931 MCP_1521 MCP_1522     FALSE 0.291 28.000 0.000 NA   NA
 10155931 10155932 MCP_1522 MCP_1523     FALSE 0.070 80.000 0.000 NA   NA
 10155933 10155934 MCP_r0006 MCP_r0007     FALSE 0.054 175.000 0.000 NA   NA
 10155934 10155935 MCP_r0007 MCP_t0025     FALSE 0.073 504.000 0.000 NA   NA
 10155935 10155936 MCP_t0025 MCP_r0008     FALSE 0.054 169.000 0.000 NA   NA
 10155936 10155937 MCP_r0008 MCP_1524   pyk FALSE 0.071 482.000 0.000 NA   NA
 10155937 10155938 MCP_1524 MCP_1525 pyk   FALSE 0.237 35.000 0.000 NA   NA
 10155938 10155939 MCP_1525 MCP_1526     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10155939 10155940 MCP_1526 MCP_1527     TRUE 0.932 39.000 0.611 NA   NA
 10155940 10155941 MCP_1527 MCP_1528     TRUE 0.985 6.000 0.111 NA   NA
 10155941 10155942 MCP_1528 MCP_1529     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 10155943 10155944 MCP_1530 MCP_1531     TRUE 0.895 3.000 0.000 1.000 N NA
 10155944 10155945 MCP_1531 MCP_1532     TRUE 0.992 6.000 0.387 1.000   NA
 10155946 10155947 MCP_1533 MCP_1534     TRUE 0.985 10.000 0.305 NA   NA
 10155947 10155948 MCP_1534 MCP_1535   eif2a TRUE 0.987 19.000 0.519 NA Y NA
 10155948 10155949 MCP_1535 MCP_1536 eif2a rps27e TRUE 0.990 20.000 0.386 0.026 Y NA
 10155949 10155950 MCP_1536 MCP_1537 rps27e rpl44e TRUE 0.995 13.000 0.436 0.019 Y NA
 10155950 10155951 MCP_1537 MCP_1538 rpl44e   TRUE 0.869 37.000 0.077 NA   NA
 10155951 10155952 MCP_1538 MCP_1539   priA TRUE 0.995 -10.000 0.173 NA   NA
 10155953 10155954 MCP_1540 MCP_1541     FALSE 0.071 458.000 0.000 NA   NA
 10155955 10155956 MCP_1542 MCP_1543 valS   FALSE 0.110 248.000 0.000 1.000 N NA
 10155956 10155957 MCP_1543 MCP_1544     TRUE 0.451 399.000 0.000 0.021 Y NA
 10155957 10155958 MCP_1544 MCP_1545     TRUE 0.414 108.000 0.000 0.024 Y NA
 10155958 10155959 MCP_1545 MCP_1546     TRUE 0.886 17.000 0.000 0.024 Y NA
 10155959 10155960 MCP_1546 MCP_1547     TRUE 0.409 120.000 0.000 0.021 Y NA
 10155961 10155962 MCP_1548 MCP_1549     FALSE 0.054 169.000 0.000 NA   NA
 10155963 10155964 MCP_1550 MCP_1551     FALSE 0.157 811.000 0.000 1.000 N NA
 10155964 10155965 MCP_1551 MCP_1552   pyrK TRUE 0.994 -3.000 0.020 1.000 N NA
 10155965 10155966 MCP_1552 MCP_1553 pyrK pyrD TRUE 0.995 -19.000 0.124 1.000 N NA
 10155966 10155967 MCP_1553 MCP_1554 pyrD   TRUE 0.927 -3.000 0.000 1.000   NA
 10155968 10155969 MCP_1555 MCP_1556 mptG-1   TRUE 0.863 -12.000 0.000 NA   NA
 10155969 10155970 MCP_1556 MCP_1557   flpA TRUE 0.999 -3.000 0.720 NA Y NA
 10155971 10155972 MCP_1558 MCP_1559     TRUE 0.402 27.000 0.000 1.000   NA
 10155972 10155973 MCP_1559 MCP_1560     FALSE 0.116 104.000 0.000 1.000 N NA
 10155973 10155974 MCP_1560 MCP_1561     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 10155974 10155975 MCP_1561 MCP_1562     TRUE 0.974 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10155975 10155976 MCP_1562 MCP_1563     TRUE 0.973 5.000 0.000 0.009 Y NA
 10155976 10155977 MCP_1563 MCP_1564     TRUE 0.476 83.000 0.000 0.009 Y NA
 10155979 10155980 MCP_1566 MCP_1567     TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10155980 10155981 MCP_1567 MCP_1568     FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10155981 10155982 MCP_1568 MCP_1569   fdhB-1 FALSE 0.053 144.000 0.000 NA   NA
 10155982 10155983 MCP_1569 MCP_1570 fdhB-1 fdhA-1 TRUE 0.995 6.000 0.286 0.002   NA
 10155983 10155984 MCP_1570 MCP_1571 fdhA-1 fwdC-1 TRUE 0.346 33.000 0.000 1.000   NA
 10155984 10155985 MCP_1571 MCP_1572 fwdC-1 fwdA-1 TRUE 0.989 0.000 0.000 0.004 Y NA
 10155985 10155986 MCP_1572 MCP_1573 fwdA-1 fwdB-1 TRUE 0.961 9.000 0.000 0.004 Y NA
 10155986 10155987 MCP_1573 MCP_1574 fwdB-1 fwdD-1 TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 10155987 10155988 MCP_1574 MCP_1575 fwdD-1 mvhD-1 TRUE 0.983 28.000 0.571 1.000 Y NA
 10155988 10155989 MCP_1575 MCP_1576 mvhD-1 hdrA-1 TRUE 0.999 0.000 0.875 1.000 Y NA
 10155989 10155990 MCP_1576 MCP_1577 hdrA-1 hdrB-1 TRUE 0.997 11.000 0.467 0.004 Y NA
 10155990 10155991 MCP_1577 MCP_1578 hdrB-1 hdrC-1 TRUE 0.999 0.000 0.467 0.004 Y NA
 10155991 10155992 MCP_1578 MCP_1579 hdrC-1 fwdF-1 TRUE 0.975 4.000 0.000 0.027 Y NA
 10155992 10155993 MCP_1579 MCP_1580 fwdF-1 fwdG-1 TRUE 0.817 12.000 0.000 0.016   NA
 10155995 10155996 MCP_1582 MCP_1583     FALSE 0.076 549.000 0.000 NA   NA
 10155996 10155997 MCP_1583 MCP_1584     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 10155997 10155998 MCP_1584 MCP_1585     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10155999 10156000 MCP_1586 MCP_1587     FALSE 0.057 120.000 0.000 NA   NA
 10156000 10156001 MCP_1587 MCP_1588     FALSE 0.056 126.000 0.000 NA   NA
 10156002 10156003 MCP_1589 MCP_1590     FALSE 0.055 130.000 0.000 NA   NA
 10156005 10156006 MCP_1592 MCP_1593     FALSE 0.128 47.000 0.000 NA   NA
 10156006 10156007 MCP_1593 MCP_1594     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156007 10156008 MCP_1594 MCP_1595     FALSE 0.069 85.000 0.000 NA   NA
 10156008 10156009 MCP_1595 MCP_1596     FALSE 0.060 109.000 0.000 NA   NA
 10156009 10156010 MCP_1596 MCP_1597     TRUE 0.965 17.000 0.297 NA   NA
 10156011 10156012 MCP_1598 MCP_1599     TRUE 0.353 46.000 0.000 0.019   NA
 10156012 10156013 MCP_1599 MCP_1600     FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 10156013 10156014 MCP_1600 MCP_1601     FALSE 0.072 484.000 0.000 NA   NA
 10156014 10156015 MCP_1601 MCP_1602     TRUE 0.746 9.000 0.000 1.000   NA
 10156015 10156016 MCP_1602 MCP_1603     TRUE 0.713 6.000 0.000 NA   NA
 10156018 10156019 MCP_1605 MCP_1606     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10156019 10156020 MCP_1606 MCP_1607     TRUE 0.696 214.000 0.051 0.003   NA
 10156021 10156022 MCP_1608 MCP_1609     FALSE 0.062 327.000 0.000 NA   NA
 10156022 10156023 MCP_1609 MCP_1610     TRUE 0.888 -73.000 0.000 1.000   NA
 10156024 10156025 MCP_1611 MCP_1612     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 10156025 10156026 MCP_1612 MCP_1613     FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 10156027 10156028 MCP_1614 MCP_1615     TRUE 0.399 127.000 0.000 0.021 Y NA
 10156028 10156029 MCP_1615 MCP_1616     FALSE 0.079 639.000 0.000 NA   NA
 10156031 10156032 MCP_1618 MCP_1619     TRUE 0.859 -13.000 0.000 NA   NA
 10156033 10156034 MCP_1620 MCP_1621     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156034 10156035 MCP_1621 MCP_1622     FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 10156036 10156037 MCP_1623 MCP_1624     FALSE 0.149 651.000 0.000 1.000 N NA
 10156037 10156038 MCP_1624 MCP_1625     FALSE 0.081 109.000 0.000 NA N NA
 10156039 10156040 MCP_1626 MCP_1627     FALSE 0.307 26.000 0.000 NA   NA
 10156040 10156041 MCP_1627 MCP_1628     FALSE 0.122 48.000 0.000 NA   NA
 10156042 10156043 MCP_1629 MCP_1630 gltX   FALSE 0.147 67.000 0.000 1.000 N NA
 10156044 10156045 MCP_1631 MCP_1632     TRUE 0.996 -3.000 0.143 NA N NA
 10156045 10156046 MCP_1632 MCP_1633     FALSE 0.080 113.000 0.000 NA N NA
 10156046 10156047 MCP_1633 MCP_1634     TRUE 0.996 -3.000 0.222 NA   NA
 10156047 10156048 MCP_1634 MCP_1635     TRUE 0.996 1.000 0.333 NA   NA
 10156049 10156050 MCP_1636 MCP_1637   fni TRUE 0.920 28.000 0.079 1.000   NA
 10156050 10156051 MCP_1637 MCP_1638 fni   TRUE 0.991 4.000 0.105 1.000   NA
 10156051 10156052 MCP_1638 MCP_1639   mvk TRUE 0.997 -3.000 0.185 1.000   NA
 10156052 10156053 MCP_1639 MCP_1640 mvk   TRUE 0.987 5.000 0.072 1.000   NA
 10156053 10156054 MCP_1640 MCP_1641   rps2p TRUE 0.894 28.000 0.036 1.000   NA
 10156054 10156055 MCP_1641 MCP_1642 rps2p eno-1 TRUE 0.663 56.000 0.017 1.000 N NA
 10156055 10156056 MCP_1642 MCP_1643 eno-1 rpoK TRUE 0.849 45.000 0.100 1.000 N NA
 10156056 10156057 MCP_1643 MCP_t0026 rpoK   FALSE 0.053 148.000 0.000 NA   NA
 10156057 10156058 MCP_t0026 MCP_1644   rpoN TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10156058 10156059 MCP_1644 MCP_1645 rpoN rps9p TRUE 0.842 72.000 0.536 1.000 N NA
 10156059 10156060 MCP_1645 MCP_1646 rps9p rpl13p TRUE 0.997 10.000 0.515 0.024 Y NA
 10156060 10156061 MCP_1646 MCP_1647 rpl13p rpl18e TRUE 0.992 13.000 0.075 0.002 Y NA
 10156061 10156062 MCP_1647 MCP_1648 rpl18e   FALSE 0.086 961.000 0.000 NA   NA
 10156062 10156063 MCP_1648 MCP_1649     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 10156067 10156068 MCP_1653 MCP_1654     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 10156068 10156069 MCP_1654 MCP_1655     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10156069 10156070 MCP_1655 MCP_1656     FALSE 0.116 69.000 0.000 1.000   NA
 10156070 10156071 MCP_1656 MCP_1657     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10156072 10156073 MCP_1658 MCP_1659     FALSE 0.055 215.000 0.000 NA   NA
 10156080 10156081 MCP_1666 MCP_1667     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10156081 10156082 MCP_1667 MCP_1668     FALSE 0.134 46.000 0.000 NA   NA
 10156082 10156083 MCP_1668 MCP_1669     TRUE 0.997 -3.000 0.088 0.053 N NA
 10156084 10156085 MCP_1670 MCP_1671     FALSE 0.058 116.000 0.000 NA   NA
 10156085 10156086 MCP_1671 MCP_1672     FALSE 0.170 47.000 0.000 NA N NA
 10156086 10156087 MCP_1672 MCP_1673     FALSE 0.117 102.000 0.000 1.000 N NA
 10156087 10156088 MCP_1673 MCP_1674   pheA FALSE 0.205 50.000 0.000 1.000 N NA
 10156088 10156089 MCP_1674 MCP_1675 pheA   TRUE 0.943 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10156089 10156090 MCP_1675 MCP_1676     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10156091 10156092 MCP_1677 MCP_1678     FALSE 0.081 166.000 0.000 1.000   NA
 10156095 10156096 MCP_1681 MCP_1682   rps6e FALSE 0.092 291.000 0.000 1.000   NA
 10156098 10156099 MCP_1684 MCP_1685     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10156099 10156100 MCP_1685 MCP_1686     FALSE 0.055 208.000 0.000 NA   NA
 10156100 10156101 MCP_1686 MCP_1687     FALSE 0.056 226.000 0.000 NA   NA
 10156101 10156102 MCP_1687 MCP_1688     FALSE 0.057 241.000 0.000 NA   NA
 10156102 10156103 MCP_1688 MCP_1689     FALSE 0.053 151.000 0.000 NA   NA
 10156103 10156104 MCP_1689 MCP_1690     FALSE 0.053 141.000 0.000 NA   NA
 10156104 10156105 MCP_1690 MCP_1691     FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 10156105 10156106 MCP_1691 MCP_1692     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10156106 10156107 MCP_1692 MCP_1693     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 10156107 10156108 MCP_1693 MCP_1694     FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 10156108 10156109 MCP_1694 MCP_1695     FALSE 0.059 267.000 0.000 NA   NA
 10156109 10156110 MCP_1695 MCP_1696     FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10156110 10156111 MCP_1696 MCP_1697     FALSE 0.060 284.000 0.000 NA   NA
 10156111 10156112 MCP_1697 MCP_1698     FALSE 0.055 131.000 0.000 NA   NA
 10156113 10156114 MCP_1699 MCP_1700     TRUE 0.782 100.000 0.643 NA   NA
 10156115 10156116 MCP_1701 MCP_1702     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10156119 10156120 MCP_1705 MCP_1706     FALSE 0.169 42.000 0.000 NA   NA
 10156122 10156123 MCP_1708 MCP_1709     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10156126 10156127 MCP_1712 MCP_1713     TRUE 0.999 0.000 0.615 NA Y NA
 10156127 10156128 MCP_1713 MCP_1714     FALSE 0.098 53.000 0.000 NA   NA
 10156128 10156129 MCP_1714 MCP_1715     FALSE 0.314 25.000 0.000 NA   NA
 10156131 10156132 MCP_1716 MCP_1717 lipA pdhA TRUE 0.895 3.000 0.000 1.000 N NA
 10156132 10156133 MCP_1717 MCP_1718 pdhA pdhB TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 10156133 10156134 MCP_1718 MCP_1719 pdhB pdhC TRUE 0.938 11.000 0.000 0.052 Y NA
 10156134 10156135 MCP_1719 MCP_1720 pdhC pdhD TRUE 0.930 9.000 0.000 1.000 Y NA
 10156136 10156137 MCP_1721 MCP_1722     TRUE 0.851 -22.000 0.000 NA   NA
 10156137 10156138 MCP_1722 MCP_1723     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156138 10156139 MCP_1723 MCP_1724     FALSE 0.073 146.000 0.000 NA N NA
 10156140 10156141 MCP_1725 MCP_1726     FALSE 0.099 373.000 0.000 1.000   NA
 10156145 10156146 MCP_1730 MCP_1731     FALSE 0.292 42.000 0.000 1.000 N NA
 10156146 10156147 MCP_1731 MCP_1732     FALSE 0.101 390.000 0.000 1.000   NA
 10156149 10156150 MCP_1734 MCP_1735     FALSE 0.301 27.000 0.000 NA   NA
 10156152 10156153 MCP_1737 MCP_1738   aif5A FALSE 0.081 694.000 0.000 NA   NA
 10156153 10156154 MCP_1738 MCP_1739 aif5A speB TRUE 0.642 67.000 0.022 1.000 N NA
 10156156 10156157 MCP_1741 MCP_1742   rps15p FALSE 0.082 135.000 0.000 1.000   NA
 10156157 10156158 MCP_1742 MCP_1743 rps15p   TRUE 0.940 30.000 0.177 1.000 N NA
 10156158 10156159 MCP_1743 MCP_1744     TRUE 0.994 -13.000 0.100 NA   NA
 10156159 10156160 MCP_1744 MCP_1745     FALSE 0.057 122.000 0.000 NA   NA
 10156163 10156164 MCP_1748 MCP_1749     FALSE 0.230 68.000 0.000 0.019   NA
 10156164 10156165 MCP_1749 MCP_1750     TRUE 0.363 37.000 0.000 1.000 N NA
 10156166 10156167 MCP_1751 MCP_1752     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156167 10156168 MCP_1752 MCP_1753   argC FALSE 0.328 40.000 0.000 1.000 N NA
 10156168 10156169 MCP_1753 MCP_1754 argC   TRUE 0.989 9.000 0.359 1.000   NA
 10156169 10156170 MCP_1754 MCP_1755   argJ TRUE 0.993 -3.000 0.019 1.000   NA
 10156170 10156171 MCP_1755 MCP_1756 argJ hisS TRUE 0.983 4.000 0.003 1.000 N NA
 10156172 10156173 MCP_1757 MCP_1758     TRUE 0.711 12.000 0.000 1.000 N NA
 10156173 10156174 MCP_1758 MCP_1759     FALSE 0.053 160.000 0.000 NA   NA
 10156174 10156175 MCP_1759 MCP_1760     TRUE 0.998 0.000 0.842 NA   NA
 10156176 10156177 MCP_1761 MCP_1762     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10156177 10156178 MCP_1762 MCP_1763   ftsZ-2 FALSE 0.069 424.000 0.000 NA   NA
 10156178 10156179 MCP_1763 MCP_1764 ftsZ-2   FALSE 0.055 130.000 0.000 NA   NA
 10156179 10156180 MCP_1764 MCP_1765     FALSE 0.102 52.000 0.000 NA   NA
 10156180 10156181 MCP_1765 MCP_1766     TRUE 0.957 0.000 0.000 0.047   NA
 10156181 10156182 MCP_1766 MCP_1767     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156182 10156183 MCP_1767 MCP_1768     FALSE 0.057 237.000 0.000 NA   NA
 10156183 10156184 MCP_1768 MCP_1769     FALSE 0.108 74.000 0.000 1.000   NA
 10156184 10156185 MCP_1769 MCP_1770     FALSE 0.058 119.000 0.000 NA   NA
 10156185 10156186 MCP_1770 MCP_1771   leuS FALSE 0.062 330.000 0.000 NA   NA
 10156186 10156187 MCP_1771 MCP_t0028 leuS   FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 10156187 10156188 MCP_t0028 MCP_1772     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 10156188 10156189 MCP_1772 MCP_1773     FALSE 0.054 167.000 0.000 NA   NA
 10156189 10156190 MCP_1773 MCP_1774     FALSE 0.087 1285.000 0.000 NA   NA
 10156191 10156192 MCP_1775 MCP_1776     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156194 10156195 MCP_1778 MCP_1779     TRUE 0.345 22.000 0.000 NA   NA
 10156195 10156196 MCP_1779 MCP_1780     FALSE 0.169 42.000 0.000 NA   NA
 10156196 10156197 MCP_1780 MCP_1781     FALSE 0.056 228.000 0.000 NA   NA
 10156197 10156198 MCP_1781 MCP_1782     FALSE 0.059 268.000 0.000 NA   NA
 10156198 10156199 MCP_1782 MCP_1783     FALSE 0.094 83.000 0.000 NA N NA
 10156199 10156200 MCP_1783 MCP_1784     FALSE 0.080 680.000 0.000 NA   NA
 10156201 10156202 MCP_1785 MCP_1786     TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10156203 10156204 MCP_1787 MCP_1788     FALSE 0.230 36.000 0.000 NA   NA
 10156204 10156205 MCP_1788 MCP_1789     FALSE 0.077 580.000 0.000 NA   NA
 10156205 10156206 MCP_1789 MCP_1790     TRUE 0.996 9.000 0.625 1.000 Y NA
 10156206 10156207 MCP_1790 MCP_1791     TRUE 0.881 115.000 0.375 1.000 Y NA
 10156207 10156208 MCP_1791 MCP_1792     FALSE 0.056 234.000 0.000 NA   NA
 10156209 10156210 MCP_1793 MCP_1794     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156210 10156211 MCP_1794 MCP_1795     FALSE 0.102 52.000 0.000 NA   NA
 10156213 10156214 MCP_1797 MCP_1798 purL purQ TRUE 0.999 3.000 0.346 0.001 Y NA
 10156214 10156215 MCP_1798 MCP_1799 purQ   FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 10156218 10156219 MCP_1802 MCP_1803     TRUE 0.930 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10156219 10156220 MCP_1803 MCP_1804     TRUE 0.478 67.000 0.000 0.046 Y NA
 10156220 10156221 MCP_1804 MCP_1805     TRUE 0.988 7.000 0.204 1.000   NA
 10156221 10156222 MCP_1805 MCP_1806     FALSE 0.151 52.000 0.000 1.000   NA
 10156222 10156223 MCP_1806 MCP_1807     FALSE 0.093 55.000 0.000 NA   NA
 10156223 10156224 MCP_1807 MCP_1808     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10156227 10156228 MCP_1811 MCP_1812     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 10156231 10156232 MCP_1815 MCP_1816     TRUE 0.995 2.000 0.272 NA   NA
 10156232 10156233 MCP_1816 MCP_1817   uppS FALSE 0.078 588.000 0.000 NA   NA
 10156233 10156234 MCP_1817 MCP_1818 uppS   TRUE 0.930 22.000 0.095 NA   NA
 10156234 10156235 MCP_1818 MCP_1819     TRUE 0.957 14.000 0.083 NA   NA
 10156235 10156236 MCP_1819 MCP_1820     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10156236 10156237 MCP_1820 MCP_1821     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10156237 10156238 MCP_1821 MCP_1822     TRUE 0.984 10.000 0.044 0.004   NA
 10156239 10156240 MCP_1823 MCP_1824     TRUE 0.891 2.000 0.000 1.000   NA
 10156240 10156241 MCP_1824 MCP_1825     TRUE 0.354 47.000 0.000 0.012   NA
 10156241 10156242 MCP_1825 MCP_1826     FALSE 0.063 99.000 0.000 NA   NA
 10156242 10156243 MCP_1826 MCP_1827     TRUE 0.987 4.000 0.065 NA   NA
 10156243 10156244 MCP_1827 MCP_1828     FALSE 0.065 365.000 0.000 NA   NA
 10156247 10156248 MCP_1831 MCP_1832     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156248 10156249 MCP_1832 MCP_1833     TRUE 0.381 19.000 0.000 NA   NA
 10156251 10156252 MCP_1835 MCP_1836     TRUE 0.852 115.000 0.214 1.000 Y NA
 10156252 10156253 MCP_1836 MCP_1837     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10156253 10156254 MCP_1837 MCP_1838     FALSE 0.088 58.000 0.000 NA   NA
 10156255 10156256 MCP_1839 MCP_1840     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10156258 10156259 MCP_1842 MCP_1843     TRUE 0.490 19.000 0.000 1.000   NA
 10156262 10156263 MCP_1846 MCP_1847     TRUE 0.996 -3.000 0.200 NA   NA
 10156266 10156267 MCP_1850 MCP_1851     TRUE 0.694 45.000 0.000 0.002 Y NA
 10156267 10156268 MCP_1851 MCP_1852     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10156269 10156270 MCP_1853 MCP_1854 proS   FALSE 0.158 60.000 0.000 1.000 N NA
 10156270 10156271 MCP_1854 MCP_1855     TRUE 0.968 2.000 0.000 NA Y NA
 10156271 10156272 MCP_1855 MCP_1856     FALSE 0.075 212.000 0.000 NA N NA
 10156273 10156274 MCP_1857 MCP_1858     FALSE 0.057 243.000 0.000 NA   NA
 10156274 10156275 MCP_1858 MCP_1859     FALSE 0.053 140.000 0.000 NA   NA
 10156275 10156276 MCP_1859 MCP_1860     TRUE 0.994 0.000 0.074 NA   NA
 10156277 10156278 MCP_1861 MCP_1862     TRUE 0.995 -3.000 0.056 1.000 N NA
 10156278 10156279 MCP_1862 MCP_1863     TRUE 0.994 -7.000 0.042 1.000 N NA
 10156279 10156280 MCP_1863 MCP_1864     FALSE 0.073 179.000 0.000 NA N NA
 10156281 10156282 MCP_1865 MCP_1866     FALSE 0.220 37.000 0.000 NA   NA
 10156282 10156283 MCP_1866 MCP_1867     TRUE 0.837 -51.000 0.000 NA   NA
 10156283 10156284 MCP_1867 MCP_1868     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10156284 10156285 MCP_1868 MCP_1869     FALSE 0.054 182.000 0.000 NA   NA
 10156285 10156286 MCP_1869 MCP_1870     FALSE 0.078 608.000 0.000 NA   NA
 10156288 10156289 MCP_1872 MCP_1873     TRUE 0.997 1.000 0.643 NA   NA
 10156289 10156290 MCP_1873 MCP_1874     FALSE 0.053 160.000 0.000 NA   NA
 10156290 10156291 MCP_1874 MCP_1875     FALSE 0.071 482.000 0.000 NA   NA
 10156291 10156292 MCP_1875 MCP_1876     FALSE 0.059 264.000 0.000 NA   NA
 10156293 10156294 MCP_1877 MCP_1878     FALSE 0.192 98.000 0.000 0.019   NA
 10156294 10156295 MCP_1878 MCP_1879   phoU-2 TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10156295 10156296 MCP_1879 MCP_1880 phoU-2 pstB TRUE 0.991 6.000 0.046 NA Y NA
 10156296 10156297 MCP_1880 MCP_1881 pstB pstA TRUE 0.990 0.000 0.000 0.002 Y NA
 10156297 10156298 MCP_1881 MCP_1882 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.219 0.002 Y NA
 10156298 10156299 MCP_1882 MCP_1883 pstC pstS TRUE 0.494 48.000 0.000 1.000 Y NA
 10156299 10156300 MCP_1883 MCP_1884 pstS   FALSE 0.294 403.000 0.000 NA Y NA
 10156301 10156302 MCP_1885 MCP_1886 rrmJ   FALSE 0.054 176.000 0.000 NA   NA
 10156305 10156306 MCP_1889 MCP_1890     FALSE 0.284 29.000 0.000 NA   NA
 10156306 10156307 MCP_1890 MCP_1891     FALSE 0.056 228.000 0.000 NA   NA
 10156307 10156308 MCP_1891 MCP_1892     FALSE 0.122 48.000 0.000 NA   NA
 10156308 10156309 MCP_1892 MCP_1893     FALSE 0.082 717.000 0.000 NA   NA
 10156312 10156313 MCP_1895 MCP_1896     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 10156314 10156315 MCP_1897 MCP_1898     FALSE 0.063 333.000 0.000 NA   NA
 10156317 10156318 MCP_1900 MCP_1901     FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10156318 10156319 MCP_1901 MCP_1902     FALSE 0.113 277.000 0.000 1.000 N NA
 10156319 10156320 MCP_1902 MCP_1903   argB TRUE 0.815 7.000 0.000 1.000 N NA
 10156322 10156323 MCP_1905 MCP_1906   lldP FALSE 0.106 226.000 0.000 1.000 N NA
 10156323 10156324 MCP_1906 MCP_1907 lldP   FALSE 0.333 32.000 0.000 NA N NA
 10156324 10156325 MCP_1907 MCP_1908     FALSE 0.082 105.000 0.000 NA N NA
 10156325 10156326 MCP_1908 MCP_t0030     FALSE 0.054 198.000 0.000 NA   NA
 10156327 10156328 MCP_1909 MCP_1910     FALSE 0.058 250.000 0.000 NA   NA
 10156329 10156330 MCP_1911 MCP_1912     FALSE 0.061 103.000 0.000 NA   NA
 10156330 10156331 MCP_1912 MCP_1913     TRUE 0.996 -15.000 0.300 NA   NA
 10156331 10156332 MCP_1913 MCP_1914     TRUE 0.996 0.000 0.300 NA   NA
 10156336 10156337 MCP_1918 MCP_1919     TRUE 0.997 -10.000 0.245 0.051   NA
 10156337 10156338 MCP_1919 MCP_1920     FALSE 0.069 432.000 0.000 NA   NA
 10156340 10156341 MCP_1922 MCP_1923     FALSE 0.077 582.000 0.000 NA   NA
 10156341 10156342 MCP_1923 MCP_1924     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.035   NA
 10156342 10156343 MCP_1924 MCP_1925     FALSE 0.089 266.000 0.000 1.000   NA
 10156343 10156344 MCP_1925 MCP_1926     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 10156348 10156349 MCP_1930 MCP_1931     TRUE 0.345 22.000 0.000 NA   NA
 10156349 10156350 MCP_1931 MCP_1932     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10156350 10156351 MCP_1932 MCP_1933     TRUE 0.653 9.000 0.000 NA   NA
 10156351 10156352 MCP_1933 MCP_1934     FALSE 0.323 24.000 0.000 NA   NA
 10156352 10156353 MCP_1934 MCP_1935     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10156353 10156354 MCP_1935 MCP_1936     TRUE 0.997 3.000 0.160 1.000 Y NA
 10156354 10156355 MCP_1936 MCP_1937     FALSE 0.057 123.000 0.000 NA   NA
 10156357 10156358 MCP_1939 MCP_1940   hppA FALSE 0.116 581.000 0.000 1.000   NA
 10156360 10156361 MCP_1942 MCP_1943 mptG-2   FALSE 0.096 351.000 0.000 1.000   NA
 10156363 10156364 MCP_1945 MCP_1946 apgM-2   FALSE 0.080 651.000 0.000 NA   NA
 10156364 10156365 MCP_1946 MCP_1947     TRUE 0.838 -46.000 0.000 NA   NA
 10156366 10156367 MCP_1948 MCP_1949     FALSE 0.133 470.000 0.000 1.000 N NA
 10156369 10156370 MCP_1951 MCP_1952     FALSE 0.066 383.000 0.000 NA   NA
 10156370 10156371 MCP_1952 MCP_1953   cobD TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.008 N NA
 10156371 10156372 MCP_1953 MCP_1954 cobD cobS TRUE 0.993 10.000 0.046 0.008 Y NA
 10156372 10156373 MCP_1954 MCP_1955 cobS cobY TRUE 0.996 -15.000 0.025 1.000 Y NA
 10156373 10156374 MCP_1955 MCP_1956 cobY   TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10156374 10156375 MCP_1956 MCP_1957     TRUE 0.874 0.000 0.000 NA   NA
 10156379 10156380 MCP_1961 MCP_1962     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10156380 10156381 MCP_1962 MCP_1963   aksF TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 10156381 10156382 MCP_1963 MCP_1964 aksF   TRUE 0.994 -3.000 0.058 NA   NA
 10156382 10156383 MCP_1964 MCP_1965     FALSE 0.282 30.000 0.000 NA   NA
 10156383 10156384 MCP_1965 MCP_1966     FALSE 0.222 128.000 0.000 0.004 N NA
 10156384 10156385 MCP_1966 MCP_1967   kdpA FALSE 0.110 118.000 0.000 1.000 N NA
 10156385 10156386 MCP_1967 MCP_1968 kdpA kdpB TRUE 0.999 1.000 0.201 0.001 Y NA
 10156386 10156387 MCP_1968 MCP_1969 kdpB kdpC TRUE 1.000 -3.000 0.877 0.001 Y NA
 10156387 10156388 MCP_1969 MCP_1970 kdpC   TRUE 0.913 2.000 0.000 1.000 N NA
 10156389 10156390 MCP_1971 MCP_1972     FALSE 0.083 788.000 0.000 NA   NA
 10156391 10156392 MCP_1973 MCP_1974     FALSE 0.062 100.000 0.000 NA   NA
 10156392 10156393 MCP_1974 MCP_1975     FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 10156395 10156396 MCP_1977 MCP_1978     FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10156397 10156398 MCP_1979 MCP_1980     FALSE 0.137 52.000 0.000 NA N NA
 10156399 10156400 MCP_1981 MCP_1982   hisE TRUE 0.989 3.000 0.019 1.000 N NA
 10156400 10156401 MCP_1982 MCP_1983 hisE   FALSE 0.082 724.000 0.000 NA   NA
 10156401 10156402 MCP_1983 MCP_1984     TRUE 0.345 22.000 0.000 NA   NA
 10156407 10156408 MCP_1989 MCP_1990 hdrA/mvhD hdrB-2 TRUE 0.999 -3.000 0.069 0.003 Y NA
 10156408 10156409 MCP_1990 MCP_1991 hdrB-2 hdrC-2 TRUE 0.999 -7.000 0.526 0.003 Y NA
 10156410 10156411 MCP_1992 MCP_1993   comD/comE TRUE 0.996 -27.000 0.231 1.000   NA
 10156411 10156412 MCP_1993 MCP_t0031 comD/comE   FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 10156412 10156413 MCP_t0031 MCP_t0032     FALSE 0.070 82.000 0.000 NA   NA
 10156413 10156414 MCP_t0032 MCP_1994     FALSE 0.323 24.000 0.000 NA   NA
 10156414 10156415 MCP_1994 MCP_1995     FALSE 0.055 202.000 0.000 NA   NA
 10156415 10156416 MCP_1995 MCP_1996     FALSE 0.074 510.000 0.000 NA   NA
 10156416 10156417 MCP_1996 MCP_1997     TRUE 0.456 15.000 0.000 NA   NA
 10156417 10156418 MCP_1997 MCP_1998     FALSE 0.054 136.000 0.000 NA   NA
 10156419 10156420 MCP_1999 MCP_2000     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10156421 10156422 MCP_2001 MCP_2002     FALSE 0.078 615.000 0.000 NA   NA
 10156424 10156425 MCP_2004 MCP_2005     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10156425 10156426 MCP_2005 MCP_2006     FALSE 0.064 351.000 0.000 NA   NA
 10156426 10156427 MCP_2006 MCP_2007     TRUE 0.353 21.000 0.000 NA   NA
 10156427 10156428 MCP_2007 MCP_2008     FALSE 0.057 245.000 0.000 NA   NA
 10156428 10156429 MCP_2008 MCP_2009     FALSE 0.084 126.000 0.000 1.000   NA
 10156429 10156430 MCP_2009 MCP_2010     TRUE 0.906 1.000 0.000 1.000   NA
 10156434 10156435 MCP_2014 MCP_2015     FALSE 0.081 172.000 0.000 1.000   NA
 10156435 10156436 MCP_2015 MCP_2016     FALSE 0.169 42.000 0.000 NA   NA
 10156436 10156437 MCP_2016 MCP_2017     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10156438 10156439 MCP_2018 MCP_2019     TRUE 0.965 43.000 0.196 0.004 Y NA
 10156439 10156440 MCP_2019 MCP_2020     TRUE 0.999 0.000 0.224 0.006 Y NA
 10156443 10156444 MCP_2023 MCP_2024     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10156445 10156446 MCP_2025 MCP_2026     FALSE 0.065 361.000 0.000 NA   NA
 10156447 10156448 MCP_2027 MCP_2028     FALSE 0.091 56.000 0.000 NA   NA
 10156448 10156449 MCP_2028 MCP_2029     TRUE 0.970 15.000 0.279 NA   NA
 10156449 10156450 MCP_2029 MCP_2030     TRUE 0.915 19.000 0.035 NA   NA
 10156451 10156452 MCP_2031 MCP_2032     FALSE 0.085 60.000 0.000 NA   NA
 10156452 10156453 MCP_2032 MCP_2033     FALSE 0.054 134.000 0.000 NA   NA
 10156453 10156454 MCP_2033 MCP_2034     FALSE 0.089 57.000 0.000 NA   NA
 10156454 10156455 MCP_2034 MCP_2035     FALSE 0.334 23.000 0.000 NA   NA
 10156455 10156456 MCP_2035 MCP_2036     FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 10156456 10156457 MCP_2036 MCP_2037     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10156458 10156459 MCP_2038 MCP_t0033     TRUE 0.846 -27.000 0.000 NA   NA
 10156460 10156461 MCP_2039 MCP_2040     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10156461 10156462 MCP_2040 MCP_2041     FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 10156462 10156463 MCP_2041 MCP_2042     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 10156464 10156465 MCP_2043 MCP_2044     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10156465 10156466 MCP_2044 MCP_2045     FALSE 0.053 141.000 0.000 NA   NA
 10156468 10156469 MCP_2047 MCP_2048     TRUE 0.876 -7.000 0.000 NA   NA
 10156469 10156470 MCP_2048 MCP_2049   argF TRUE 0.905 -13.000 0.000 1.000   NA
 10156471 10156472 MCP_t0034 MCP_t0035     TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10156472 10156473 MCP_t0035 MCP_t0036     FALSE 0.081 64.000 0.000 NA   NA
 10156473 10156474 MCP_t0036 MCP_2050     FALSE 0.063 99.000 0.000 NA   NA
 10156478 10156479 MCP_2054 MCP_2055     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156481 10156482 MCP_2057 MCP_2058     FALSE 0.141 45.000 0.000 NA   NA
 10156482 10156483 MCP_2058 MCP_2059     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 10156484 10156485 MCP_2060 MCP_2061     TRUE 0.365 20.000 0.000 NA   NA
 10156485 10156486 MCP_2061 MCP_2062     FALSE 0.055 209.000 0.000 NA   NA
 10156486 10156487 MCP_2062 MCP_2063     TRUE 0.513 13.000 0.000 NA   NA
 10156487 10156488 MCP_2063 MCP_2064   pcm FALSE 0.112 511.000 0.000 1.000   NA
 10156488 10156489 MCP_2064 MCP_2065 pcm   TRUE 0.711 48.000 0.037 NA   NA
 10156490 10156491 MCP_2066 MCP_2067     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 10156493 10156494 MCP_2069 MCP_2070     FALSE 0.061 105.000 0.000 NA   NA
 10156495 10156496 MCP_2071 MCP_2072     FALSE 0.098 73.000 0.000 NA N NA
 10156496 10156497 MCP_2072 MCP_2073     FALSE 0.195 40.000 0.000 NA   NA
 10156497 10156498 MCP_2073 MCP_2074     FALSE 0.264 32.000 0.000 NA   NA
 10156498 10156499 MCP_2074 MCP_2075   rpl12p FALSE 0.098 94.000 0.000 1.000   NA
 10156499 10156500 MCP_2075 MCP_2076 rpl12p rplP0 TRUE 0.994 17.000 0.758 0.017 Y NA
 10156500 10156501 MCP_2076 MCP_2077 rplP0 rpl1p TRUE 0.998 3.000 0.076 0.017 Y NA
 10156501 10156502 MCP_2077 MCP_2078 rpl1p rpl11p TRUE 0.954 63.000 0.838 0.017 Y NA
 10156502 10156503 MCP_2078 MCP_2079 rpl11p   FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 10156508 10156509 MCP_2084 MCP_2085     FALSE 0.055 213.000 0.000 NA   NA
 10156509 10156510 MCP_2085 MCP_2086     FALSE 0.053 139.000 0.000 NA   NA
 10156510 10156511 MCP_2086 MCP_2087     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156512 10156513 MCP_2088 MCP_2089     FALSE 0.057 244.000 0.000 NA   NA
 10156513 10156514 MCP_2089 MCP_2090     TRUE 0.990 8.000 0.440 NA   NA
 10156514 10156515 MCP_2090 MCP_2091     FALSE 0.274 31.000 0.000 NA   NA
 10156515 10156516 MCP_2091 MCP_2092     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 10156516 10156517 MCP_2092 MCP_2093     FALSE 0.053 166.000 0.000 NA   NA
 10156519 10156520 MCP_2095 MCP_2096     FALSE 0.070 452.000 0.000 NA   NA
 10156520 10156521 MCP_2096 MCP_2097   aif1a-2 FALSE 0.264 32.000 0.000 NA   NA
 10156521 10156522 MCP_2097 MCP_2098 aif1a-2   FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 10156524 10156525 MCP_2100 MCP_2101     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 10156525 10156526 MCP_2101 MCP_2102     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 10156526 10156527 MCP_2102 MCP_2103     FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 10156527 10156528 MCP_2103 MCP_2104     FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 10156528 10156529 MCP_2104 MCP_2105     FALSE 0.064 97.000 0.000 NA   NA
 10156529 10156530 MCP_2105 MCP_2106     FALSE 0.055 131.000 0.000 NA   NA
 10156532 10156533 MCP_2108 MCP_2109   bfr FALSE 0.053 147.000 0.000 NA   NA
 10156533 10156534 MCP_2109 MCP_2110 bfr aqpM FALSE 0.103 134.000 0.000 1.000 N NA
 10156534 10156535 MCP_2110 MCP_2111 aqpM   FALSE 0.113 112.000 0.000 1.000 N NA
 10156538 10156539 MCP_2114 MCP_2115     FALSE 0.059 115.000 0.000 NA   NA
 10156541 10156542 MCP_2117 MCP_2118     FALSE 0.093 55.000 0.000 NA   NA
 10156542 10156543 MCP_2118 MCP_2119     FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 10156544 10156545 MCP_2120 MCP_2121     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156545 10156546 MCP_2121 MCP_2122     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA   NA
 10156548 10156549 MCP_2124 MCP_2125     FALSE 0.104 426.000 0.000 1.000   NA
 10156549 10156550 MCP_2125 MCP_2126     TRUE 0.999 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 10156550 10156551 MCP_2126 MCP_2127     TRUE 0.961 2.000 0.000 0.001   NA
 10156551 10156552 MCP_2127 MCP_2128     FALSE 0.150 44.000 0.000 NA   NA
 10156552 10156553 MCP_2128 MCP_2129     TRUE 0.995 -3.000 0.074 NA   NA
 10156554 10156555 MCP_2130 MCP_2131     TRUE 0.991 10.000 0.676 1.000   NA
 10156555 10156556 MCP_2131 MCP_2132     FALSE 0.274 40.000 0.000 1.000   NA
 10156557 10156558 MCP_2133 MCP_2134     FALSE 0.105 79.000 0.000 1.000   NA
 10156558 10156559 MCP_2134 MCP_2135   secE TRUE 0.984 14.000 0.506 1.000 N NA
 10156559 10156560 MCP_2135 MCP_2136 secE   TRUE 0.812 64.000 0.272 1.000 N NA
 10156561 10156562 MCP_2137 MCP_2138     FALSE 0.243 34.000 0.000 NA   NA
 10156562 10156563 MCP_2138 MCP_2139     FALSE 0.070 456.000 0.000 NA   NA
 10156565 10156566 MCP_2141 MCP_2142     FALSE 0.067 88.000 0.000 NA   NA
 10156566 10156567 MCP_2142 MCP_2143     TRUE 0.859 -13.000 0.000 NA   NA
 10156568 10156569 MCP_2144 MCP_2145     FALSE 0.059 275.000 0.000 NA   NA
 10156570 10156571 MCP_2146 MCP_2147     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 10156571 10156572 MCP_2147 MCP_2148     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 10156572 10156573 MCP_2148 MCP_2149     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 10156573 10156574 MCP_2149 MCP_2150   gcp FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 10156574 10156575 MCP_2150 MCP_2151 gcp   TRUE 0.932 -9.000 0.000 1.000 N NA
 10156575 10156576 MCP_2151 MCP_2152     TRUE 0.629 15.000 0.000 1.000 N NA
 10156577 10156578 MCP_2153 MCP_2154     TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA   NA
 10156578 10156579 MCP_2154 MCP_2155     FALSE 0.123 94.000 0.000 1.000 N NA
 10156579 10156580 MCP_2155 MCP_2156     FALSE 0.107 125.000 0.000 1.000 N NA
 10156580 10156581 MCP_2156 MCP_2157     FALSE 0.122 48.000 0.000 NA   NA
 10156581 10156582 MCP_2157 MCP_2158     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10156582 10156583 MCP_2158 MCP_2159     TRUE 0.848 -25.000 0.000 NA   NA
 10156584 10156585 MCP_2160 MCP_2161     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 10156585 10156586 MCP_2161 MCP_2162     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 10156586 10156587 MCP_2162 MCP_2163     FALSE 0.085 864.000 0.000 NA   NA
 10156587 10156588 MCP_2163 MCP_2164     TRUE 0.844 -28.000 0.000 NA   NA
 10156588 10156589 MCP_2164 MCP_2165     FALSE 0.070 433.000 0.000 NA   NA
 10156589 10156590 MCP_2165 MCP_2166     FALSE 0.087 1314.000 0.000 NA   NA
 10156591 10156592 MCP_2167 MCP_2168     TRUE 0.482 14.000 0.000 NA   NA
 10156592 10156593 MCP_2168 MCP_2169     FALSE 0.075 523.000 0.000 NA   NA
 10156593 10156594 MCP_2169 MCP_2170     TRUE 0.750 5.000 0.000 NA   NA
 10156594 10156595 MCP_2170 MCP_2171     FALSE 0.054 136.000 0.000 NA   NA
 10156595 10156596 MCP_2171 MCP_2172   aif1a-3 FALSE 0.064 352.000 0.000 NA   NA
 10156597 10156598 MCP_2173 MCP_2174   frhB-1 FALSE 0.058 119.000 0.000 NA   NA
 10156602 10156603 MCP_2178 MCP_2179     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 10156603 10156604 MCP_2179 MCP_2180     FALSE 0.146 53.000 0.000 1.000   NA
 10156606 10156607 MCP_2182 MCP_2183     FALSE 0.054 185.000 0.000 NA   NA
 10156610 10156611 MCP_2186 MCP_2187     FALSE 0.056 126.000 0.000 NA   NA
 10156612 10156613 MCP_2188 MCP_2189     FALSE 0.159 43.000 0.000 NA   NA
 10156613 10156614 MCP_2189 MCP_2190     FALSE 0.058 255.000 0.000 NA   NA
 10156615 10156616 MCP_2191 MCP_2192     FALSE 0.075 519.000 0.000 NA   NA
 10156616 10156617 MCP_2192 MCP_2193     TRUE 0.412 241.000 0.000 0.018 Y NA
 10156617 10156618 MCP_2193 MCP_2194     FALSE 0.056 231.000 0.000 NA   NA
 10156621 10156622 MCP_2197 MCP_2198     TRUE 0.419 260.000 0.000 0.018 Y NA
 10156622 10156623 MCP_2198 MCP_2199     TRUE 0.449 92.000 0.000 0.018 Y NA
 10156623 10156624 MCP_2199 MCP_2200     FALSE 0.081 681.000 0.000 NA   NA
 10156625 10156626 MCP_2201 MCP_2202     FALSE 0.091 288.000 0.000 1.000   NA
 10156626 10156627 MCP_2202 MCP_2203     FALSE 0.057 243.000 0.000 NA   NA
 10156628 10156629 MCP_2204 MCP_2205     TRUE 0.549 12.000 0.000 NA   NA
 10156631 10156632 MCP_2207 MCP_2208     FALSE 0.182 41.000 0.000 NA   NA
 10156633 10156634 MCP_2209 MCP_2210     TRUE 0.813 72.000 0.667 NA   NA
 10156636 10156637 MCP_2212 MCP_2213     TRUE 0.990 2.000 0.042 NA   NA
 10156638 10156639 MCP_2214 MCP_2215     FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 10156640 10156641 MCP_2216 MCP_2217     TRUE 0.990 4.000 0.125 NA   NA
 10156641 10156642 MCP_2217 MCP_2218     FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 10156643 10156644 MCP_2219 MCP_2220   rpl3p TRUE 0.738 102.000 0.359 NA   NA
 10156644 10156645 MCP_2220 MCP_2221 rpl3p rpl4p TRUE 0.999 3.000 0.885 0.017 Y NA
 10156645 10156646 MCP_2221 MCP_2222 rpl4p rpl23p TRUE 0.998 0.000 0.075 1.000 Y NA
 10156646 10156647 MCP_2222 MCP_2223 rpl23p rpl2p TRUE 0.993 14.000 0.849 1.000 Y NA
 10156647 10156648 MCP_2223 MCP_2224 rpl2p rps19p TRUE 0.987 14.000 0.051 0.021 Y NA
 10156648 10156649 MCP_2224 MCP_2225 rps19p rpl22p TRUE 0.995 12.000 0.355 0.021 Y NA
 10156649 10156650 MCP_2225 MCP_2226 rpl22p rps3p TRUE 0.998 2.000 0.074 0.021 Y NA
 10156650 10156651 MCP_2226 MCP_2227 rps3p rpl29p TRUE 0.998 0.000 0.074 0.021 Y NA
 10156651 10156652 MCP_2227 MCP_2228 rpl29p   TRUE 0.996 2.000 0.023 1.000 Y NA
 10156652 10156653 MCP_2228 MCP_2229   rnp1 TRUE 0.969 23.000 0.070 1.000 Y NA
 10156653 10156654 MCP_2229 MCP_2230 rnp1 rps17p TRUE 0.976 35.000 0.468 1.000 Y NA
 10156654 10156655 MCP_2230 MCP_2231 rps17p rpl14p TRUE 0.999 -3.000 0.506 0.017 Y NA
 10156655 10156656 MCP_2231 MCP_2232 rpl14p rpl24p TRUE 0.999 -3.000 0.472 0.021 Y NA
 10156656 10156657 MCP_2232 MCP_2233 rpl24p rps4e TRUE 0.999 0.000 0.478 0.021 Y NA
 10156657 10156658 MCP_2233 MCP_2234 rps4e rpl5p TRUE 0.999 -3.000 0.073 0.017 Y NA
 10156658 10156659 MCP_2234 MCP_2235 rpl5p rps14p TRUE 0.999 0.000 0.496 0.017 Y NA
 10156659 10156660 MCP_2235 MCP_2236 rps14p rps8p TRUE 0.996 11.000 0.473 0.017 Y NA
 10156660 10156661 MCP_2236 MCP_2237 rps8p rpl6p TRUE 0.994 10.000 0.068 0.017 Y NA
 10156661 10156662 MCP_2237 MCP_2238 rpl6p rpl32e TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.017 Y NA
 10156662 10156663 MCP_2238 MCP_2239 rpl32e rpl19e TRUE 0.999 4.000 0.529 0.017 Y NA
 10156663 10156664 MCP_2239 MCP_2240 rpl19e rpl18p TRUE 0.996 6.000 0.079 0.017 Y NA
 10156664