MicrobesOnline Operon Predictions for Thermus thermophilus HB8

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 940554 940555 TTHA0001 TTHA0002     FALSE 0.276 53.000 0.008 1.000 N NA
 940555 940556 TTHA0002 TTHA0003     TRUE 0.986 -13.000 0.017 0.006 Y NA
 940557 940558 TTHA0004 TTHA0005     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940558 940559 TTHA0005 TTHA0006     TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 940559 940560 TTHA0006 TTHA0007     TRUE 0.598 9.000 0.020 NA   NA
 940560 940561 TTHA0007 TTHA0008     TRUE 0.867 44.000 0.538 NA   NA
 940562 940563 TTHA0009 TTHA0010     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 940563 940564 TTHA0010 TTHAr01   23Sa FALSE 0.080 127.000 0.000 NA   NA
 940564 940565 TTHAr01 TTHAr02 23Sa 5Sa FALSE 0.149 80.000 0.000 NA   NA
 940565 940566 TTHAr02 TTHAt01 5Sa tRNA-Gly-1 FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 940566 940567 TTHAt01 TTHA0011 tRNA-Gly-1   FALSE 0.259 52.000 0.000 NA   NA
 940569 940570 TTHA0013 TTHA0014     FALSE 0.051 187.000 0.000 NA   NA
 940570 940571 TTHA0014 TTHA0015     TRUE 0.803 2.000 0.100 NA   NA
 940571 940572 TTHA0015 TTHA0016     TRUE 0.757 -7.000 0.014 1.000 N NA
 940573 940574 TTHA0017 TTHA0018     TRUE 0.821 2.000 0.111 1.000   NA
 940574 940575 TTHA0018 TTHA0019     TRUE 0.852 2.000 0.167 NA   NA
 940575 940576 TTHA0019 TTHA0020     TRUE 0.855 27.000 0.400 NA   NA
 940576 940577 TTHA0020 TTHA0021     FALSE 0.456 9.000 0.000 1.000   NA
 940577 940578 TTHA0021 TTHA0022     TRUE 0.930 3.000 0.016 0.001   NA
 940581 940582 TTHA0025 TTHA0026     TRUE 0.557 10.000 0.013 NA   NA
 940582 940583 TTHA0026 TTHA0027     TRUE 0.693 53.000 0.222 NA   NA
 940583 940584 TTHA0027 TTHA0028     FALSE 0.091 117.000 0.000 NA   NA
 940584 940585 TTHA0028 TTHA0029     TRUE 0.610 87.000 0.333 NA   NA
 940585 940586 TTHA0029 TTHA0030     FALSE 0.039 257.000 0.000 NA   NA
 940586 940587 TTHA0030 TTHA0031     TRUE 0.638 -13.000 0.000 NA   NA
 940587 940588 TTHA0031 TTHA0032     FALSE 0.165 75.000 0.000 NA   NA
 940588 940589 TTHA0032 TTHA0033     TRUE 0.595 -18.000 0.000 NA   NA
 940589 940590 TTHA0033 TTHA0034     FALSE 0.076 131.000 0.000 NA   NA
 940590 940591 TTHA0034 TTHA0035     FALSE 0.317 34.000 0.000 NA   NA
 940591 940592 TTHA0035 TTHA0036     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 940592 940593 TTHA0036 TTHA0037     FALSE 0.426 7.000 0.000 NA   NA
 940593 940594 TTHA0037 TTHA0038     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940594 940595 TTHA0038 TTHA0039     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 940595 940596 TTHA0039 TTHA0040     FALSE 0.406 11.000 0.000 NA   NA
 940597 940598 TTHA0041 TTHA0042     FALSE 0.048 305.000 0.005 NA   NA
 940600 940601 TTHA0044 TTHA0045     TRUE 0.859 -10.000 0.062 1.000   NA
 940601 940602 TTHA0045 TTHA0046     FALSE 0.229 62.000 0.000 1.000   NA
 940603 940604 TTHA0047 TTHA0048     TRUE 0.879 8.000 0.333 NA   NA
 940606 940607 TTHA0050 TTHA0051     TRUE 0.742 -43.000 0.091 NA   NA
 940610 940611 TTHA0054 TTHA0055     TRUE 0.603 0.000 0.005 1.000 N NA
 940612 940613 TTHA0056 TTHA0057     TRUE 0.944 -3.000 0.267 1.000 N NA
 940613 940614 TTHA0057 TTHA0058     FALSE 0.396 5.000 0.003 1.000 N NA
 940614 940615 TTHA0058 TTHA0059     TRUE 0.689 -10.000 0.007 1.000 N NA
 940615 940616 TTHA0059 TTHA0060     FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 940617 940618 TTHA0061 TTHA0062     TRUE 0.854 10.000 0.273 NA   NA
 940618 940619 TTHA0062 TTHA0063     FALSE 0.317 15.000 0.002 1.000 N NA
 940620 940621 TTHA0064 TTHA0065     TRUE 0.557 10.000 0.009 1.000   NA
 940621 940622 TTHA0065 TTHA0066     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 940623 940624 TTHA0067 TTHA0068     TRUE 0.835 -3.000 0.018 NA   NA
 940625 940626 TTHA0069 TTHA0070     TRUE 0.985 3.000 0.524 NA Y NA
 940626 940627 TTHA0070 TTHA0071     TRUE 0.776 -3.000 0.014 1.000 N NA
 940627 940628 TTHA0071 TTHA0072     FALSE 0.046 123.000 0.000 NA N NA
 940629 940630 TTHA0073 TTHA0074     TRUE 0.648 0.000 0.002 NA   NA
 940631 940632 TTHA0075 TTHA0076     FALSE 0.098 97.000 0.003 1.000 N NA
 940632 940633 TTHA0076 TTHA0077     TRUE 0.680 -3.000 0.003 1.000 N NA
 940634 940635 TTHA0078 TTHA0079     FALSE 0.506 3.000 0.000 NA   NA
 940635 940636 TTHA0079 TTHAt02   tRNA-Ala-3 FALSE 0.033 337.000 0.000 NA   NA
 940636 940637 TTHAt02 TTHA0080 tRNA-Ala-3   FALSE 0.300 38.000 0.000 NA   NA
 940638 940639 TTHA0081 TTHA0082     TRUE 0.969 -3.000 0.385 1.000   NA
 940639 940640 TTHA0082 TTHA0083     TRUE 0.754 -7.000 0.003 1.000   NA
 940640 940641 TTHA0083 TTHA0084     FALSE 0.047 156.000 0.002 1.000 N NA
 940641 940642 TTHA0084 TTHA0085     TRUE 0.998 -9.000 0.498 0.004 Y NA
 940642 940643 TTHA0085 TTHA0086     TRUE 0.984 4.000 0.125 0.004 Y NA
 940643 940644 TTHA0086 TTHA0087     TRUE 0.991 -3.000 0.026 0.009 Y NA
 940644 940645 TTHA0087 TTHA0088     TRUE 0.980 11.000 0.161 0.009 Y NA
 940645 940646 TTHA0088 TTHA0089     TRUE 0.995 -3.000 0.163 0.009 Y NA
 940646 940647 TTHA0089 TTHA0090     TRUE 0.997 2.000 0.753 0.009 Y NA
 940647 940648 TTHA0090 TTHA0091     TRUE 0.995 -3.000 0.151 0.009 Y NA
 940648 940649 TTHA0091 TTHA0092     TRUE 0.996 -3.000 0.221 0.009 Y NA
 940649 940650 TTHA0092 TTHA0093     TRUE 0.996 -3.000 0.210 0.009 Y NA
 940650 940651 TTHA0093 TTHA0094     TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.004 Y NA
 940651 940652 TTHA0094 TTHA0095     TRUE 0.997 3.000 0.790 0.009 Y NA
 940652 940653 TTHA0095 TTHA0096     TRUE 0.993 -6.000 0.071 0.003 Y NA
 940653 940654 TTHA0096 TTHA0097     TRUE 0.993 -3.000 0.044 0.003 Y NA
 940654 940655 TTHA0097 TTHA0098     FALSE 0.296 13.000 0.000 1.000 N NA
 940655 940656 TTHA0098 TTHA0099     FALSE 0.417 5.000 0.004 1.000 N NA
 940656 940657 TTHA0099 TTHA0100     FALSE 0.344 5.000 0.000 1.000 N NA
 940658 940659 TTHA0101 TTHA0102     TRUE 0.786 6.000 0.167 NA   NA
 940659 940660 TTHA0102 TTHA0103     TRUE 0.577 1.000 0.000 NA   NA
 940660 940661 TTHA0103 TTHA0104     FALSE 0.194 66.000 0.000 NA   NA
 940662 940663 TTHAt03 TTHA0105 tRNA-Pro-1   FALSE 0.495 -35.000 0.000 NA   NA
 940664 940665 TTHA0106 TTHA0107     TRUE 0.669 0.000 0.003 NA   NA
 940665 940666 TTHA0107 TTHA0108     FALSE 0.363 55.000 0.013 NA   NA
 940668 940669 TTHA0109 TTHA0110     FALSE 0.368 51.000 0.026 1.000 N NA
 940669 940670 TTHA0110 TTHA0111     TRUE 0.621 7.000 0.067 1.000 N NA
 940670 940671 TTHA0111 TTHA0112     FALSE 0.400 18.000 0.010 1.000 N NA
 940673 940674 TTHA0114 TTHA0115     FALSE 0.342 49.000 0.004 1.000   NA
 940675 940676 TTHA0116 TTHA0117     TRUE 0.659 10.000 0.044 1.000   NA
 940677 940678 TTHA0118 TTHAt05   tRNA-Ile FALSE 0.153 79.000 0.000 NA   NA
 940678 940679 TTHAt05 TTHA0119 tRNA-Ile   FALSE 0.285 42.000 0.000 NA   NA
 940679 940680 TTHA0119 TTHA0120     FALSE 0.381 45.000 0.007 1.000   NA
 940683 940684 TTHA0123 TTHA0124     FALSE 0.386 17.000 0.008 1.000 N NA
 940684 940685 TTHA0124 TTHA0125     TRUE 0.757 -10.000 0.008 NA   NA
 940685 940686 TTHA0125 TTHA0126     TRUE 0.933 2.000 0.400 NA   NA
 940687 940688 TTHA0127 TTHA0128     TRUE 0.702 -3.000 0.004 1.000 N NA
 940688 940689 TTHA0128 TTHA0129     TRUE 0.996 -3.000 0.239 0.006 Y NA
 940689 940690 TTHA0129 TTHA0130     FALSE 0.372 4.000 0.000 1.000 N NA
 940693 940694 TTHA0133 TTHA0134     TRUE 0.778 -3.000 0.015 1.000 N NA
 940694 940695 TTHA0134 TTHAr03   16Sa FALSE 0.106 104.000 0.000 NA   NA
 940695 940696 TTHAr03 TTHA0135 16Sa   FALSE 0.102 106.000 0.000 NA   NA
 940697 940698 TTHA0136 TTHA0137     TRUE 0.678 46.000 0.250 NA N NA
 940698 940699 TTHA0137 TTHA0138     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 940699 940700 TTHA0138 TTHA0139     FALSE 0.451 10.000 0.000 1.000   NA
 940704 940705 TTHA0143 TTHA0144     TRUE 0.875 15.000 0.467 NA N NA
 940705 940706 TTHA0144 TTHA0145     TRUE 0.995 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 940706 940707 TTHA0145 TTHA0146     FALSE 0.162 81.000 0.000 1.000   NA
 940708 940709 TTHA0147 TTHA0148     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940710 940711 TTHA0149 TTHA0150     FALSE 0.041 238.000 0.000 NA   NA
 940711 940712 TTHA0150 TTHA0151     FALSE 0.149 80.000 0.000 NA   NA
 940712 940713 TTHA0151 TTHA0152     FALSE 0.350 58.000 0.033 1.000 N NA
 940713 940714 TTHA0152 TTHA0153     FALSE 0.417 125.000 0.000 1.000 Y NA
 940715 940716 TTHA0154 TTHA0155     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 940716 940717 TTHA0155 TTHA0156     TRUE 0.951 -24.000 0.500 NA   NA
 940719 940720 TTHA0158 TTHA0159     TRUE 0.529 19.000 0.020 NA   NA
 940720 940721 TTHA0159 TTHA0160     FALSE 0.126 92.000 0.000 NA   NA
 940722 940723 TTHA0161 TTHA0162     FALSE 0.337 172.000 0.000 1.000 Y NA
 940724 940725 TTHAt06 TTHA0163 tRNA-Leu-1   FALSE 0.472 -43.000 0.000 NA   NA
 940726 940727 TTHA0164 TTHA0165     FALSE 0.455 44.000 0.027 NA   NA
 940727 940728 TTHA0165 TTHA0166     TRUE 0.639 8.000 0.041 NA   NA
 940729 940730 TTHA0167 TTHA0168     TRUE 0.998 -3.000 0.455 0.031 Y NA
 940731 940732 TTHA0169 TTHA0170     TRUE 0.600 -22.000 0.003 NA   NA
 940732 940733 TTHA0170 TTHA0171     TRUE 0.954 -12.000 0.012 1.000 Y NA
 940736 940737 TTHA0174 TTHA0175     FALSE 0.315 116.000 0.182 1.000 N NA
 940737 940738 TTHA0175 TTHA0176     FALSE 0.488 74.000 0.150 1.000   NA
 940739 940740 TTHA0177 TTHA0178     TRUE 0.811 61.000 0.500 NA   NA
 940740 940741 TTHA0178 TTHA0179     TRUE 0.696 5.000 0.068 NA   NA
 940741 940742 TTHA0179 TTHA0180     FALSE 0.308 11.000 0.000 1.000 N NA
 940743 940744 TTHA0181 TTHA0182     TRUE 0.853 -25.000 0.167 NA   NA
 940744 940745 TTHA0182 TTHA0183     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940746 940747 TTHA0184 TTHA0185     TRUE 0.986 10.000 0.364 0.080 Y NA
 940748 940749 TTHA0186 TTHA0187     FALSE 0.322 10.000 0.000 1.000 N NA
 940749 940750 TTHA0187 TTHA0188     FALSE 0.247 37.000 0.002 1.000 N NA
 940751 940752 TTHA0189 TTHA0190     FALSE 0.140 173.000 0.057 NA   NA
 940752 940753 TTHA0190 TTHA0191     TRUE 0.931 -28.000 0.021 1.000 Y NA
 940754 940755 TTHA0192 TTHA0193     TRUE 0.901 11.000 0.500 1.000 N NA
 940755 940756 TTHA0193 TTHA0194     FALSE 0.183 103.000 0.040 1.000 N NA
 940756 940757 TTHA0194 TTHA0195     TRUE 0.986 2.000 0.465 1.000 Y NA
 940758 940759 TTHA0196 TTHA0197     TRUE 0.788 67.000 0.500 NA   NA
 940759 940760 TTHA0197 TTHA0198     FALSE 0.352 40.000 0.004 NA   NA
 940761 940762 TTHA0199 TTHA0200     TRUE 0.567 5.000 0.025 1.000 N NA
 940765 940766 TTHA0203 TTHA0204     TRUE 0.769 2.000 0.056 1.000   NA
 940766 940767 TTHA0204 TTHA0205     TRUE 0.951 -3.000 0.047 0.079   NA
 940768 940769 TTHA0206 TTHA0207     TRUE 0.995 0.000 0.829 0.002   NA
 940769 940770 TTHA0207 TTHA0208     TRUE 0.986 0.000 0.321 0.002   NA
 940770 940771 TTHA0208 TTHA0209     FALSE 0.033 189.000 0.000 1.000 N NA
 940771 940772 TTHA0209 TTHA0210     TRUE 0.988 14.000 0.884 1.000 Y NA
 940773 940774 TTHA0211 TTHA0212     TRUE 0.915 22.000 0.615 NA   NA
 940774 940775 TTHA0212 TTHA0213     FALSE 0.195 187.000 0.154 NA   NA
 940775 940776 TTHA0213 TTHA0214     FALSE 0.108 130.000 0.006 NA   NA
 940776 940777 TTHA0214 TTHA0215     TRUE 0.977 -7.000 0.567 NA   NA
 940777 940778 TTHA0215 TTHA0216     TRUE 0.624 3.000 0.010 NA   NA
 940778 940779 TTHA0216 TTHA0217     FALSE 0.465 3.000 0.003 1.000 N NA
 940780 940781 TTHA0218 TTHA0219     TRUE 0.755 -3.000 0.010 1.000 N NA
 940781 940782 TTHA0219 TTHA0220     TRUE 0.744 -3.000 0.008 1.000 N NA
 940782 940783 TTHA0220 TTHA0221     TRUE 0.791 -3.000 0.006 NA   NA
 940783 940784 TTHA0221 TTHA0222     FALSE 0.118 97.000 0.000 NA   NA
 940786 940787 TTHA0224 TTHA0225     FALSE 0.498 4.000 0.008 1.000 N NA
 940787 940788 TTHA0225 TTHA0226     FALSE 0.162 99.000 0.008 NA   NA
 940789 940790 TTHA0227 TTHA0228     TRUE 0.753 -3.000 0.003 NA   NA
 940791 940792 TTHA0229 TTHA0230     TRUE 0.996 10.000 0.647 0.001 Y NA
 940792 940793 TTHA0230 TTHA0231     FALSE 0.506 3.000 0.000 NA   NA
 940793 940794 TTHA0231 TTHA0232     FALSE 0.040 253.000 0.000 NA   NA
 940794 940795 TTHA0232 TTHA0233     TRUE 0.936 2.000 0.023 1.000 Y NA
 940796 940797 TTHA0234 TTHA0235     FALSE 0.090 79.000 0.000 NA N NA
 940797 940798 TTHA0235 TTHA0236     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940798 940799 TTHA0236 TTHA0237     FALSE 0.205 68.000 0.000 1.000   NA
 940799 940800 TTHA0237 TTHA0238     TRUE 0.634 10.000 0.039 NA   NA
 940800 940801 TTHA0238 TTHA0239     TRUE 0.782 -3.000 0.005 NA   NA
 940801 940802 TTHA0239 TTHA0240     TRUE 0.997 -10.000 0.319 0.001 Y NA
 940802 940803 TTHA0240 TTHA0241     FALSE 0.090 143.000 0.003 1.000   NA
 940803 940804 TTHA0241 TTHA0242     FALSE 0.118 104.000 0.000 1.000   NA
 940804 940805 TTHA0242 TTHA0243     TRUE 0.992 11.000 0.499 0.026 Y NA
 940805 940806 TTHA0243 TTHA0244     TRUE 0.715 -3.000 0.005 1.000 N NA
 940806 940807 TTHA0244 TTHA0245     FALSE 0.409 10.000 0.005 1.000 N NA
 940807 940808 TTHA0245 TTHAt07   tRNA-Asn FALSE 0.112 100.000 0.000 NA   NA
 940808 940809 TTHAt07 TTHA0246 tRNA-Asn   FALSE 0.123 93.000 0.000 NA   NA
 940809 940810 TTHA0246 TTHA0247     TRUE 0.999 -7.000 0.838 0.034 Y NA
 940810 940811 TTHA0247 TTHA0248     TRUE 0.956 44.000 0.681 0.026 N NA
 940811 940812 TTHA0248 TTHA0249     TRUE 0.986 -3.000 0.843 1.000 N NA
 940812 940813 TTHA0249 TTHA0250     TRUE 0.816 0.000 0.100 1.000 N NA
 940813 940814 TTHA0250 TTHA0251     TRUE 0.867 45.000 0.099 1.000 Y NA
 940814 940815 TTHA0251 TTHAt08   tRNA-Thr-3 FALSE 0.234 58.000 0.000 NA   NA
 940815 940816 TTHAt08 TTHAt09 tRNA-Thr-3 tRNA-Gly-4 FALSE 0.476 4.000 0.000 NA   NA
 940816 940817 TTHAt09 TTHAt10 tRNA-Gly-4 tRNA-Tyr FALSE 0.334 27.000 0.000 NA   NA
 940817 940818 TTHAt10 TTHAt11 tRNA-Tyr tRNA-Thr-2 FALSE 0.392 13.000 0.000 NA   NA
 940820 940821 TTHA0253 TTHA0254     TRUE 0.863 -3.000 0.041 NA   NA
 940824 940825 TTHA0257 TTHA0258     TRUE 0.789 -3.000 0.006 NA   NA
 940825 940826 TTHA0258 TTHA0259     FALSE 0.280 37.000 0.004 1.000 N NA
 940826 940827 TTHA0259 TTHA0260     TRUE 0.761 58.000 0.009 1.000 Y NA
 940827 940828 TTHA0260 TTHA0261     TRUE 0.891 332.000 0.485 0.002 Y NA
 940828 940829 TTHA0261 TTHA0262     TRUE 0.991 -6.000 0.012 0.002 Y NA
 940829 940830 TTHA0262 TTHA0263     TRUE 0.763 10.000 0.182 1.000 N NA
 940830 940831 TTHA0263 TTHA0264     FALSE 0.481 2.000 0.003 1.000 N NA
 940831 940832 TTHA0264 TTHA0265     TRUE 0.513 -42.000 0.003 NA   NA
 940832 940833 TTHA0265 TTHA0266     TRUE 0.577 1.000 0.000 NA   NA
 940834 940835 TTHA0267 TTHA0268     TRUE 0.617 14.000 0.056 NA   NA
 940835 940836 TTHA0268 TTHA0269     FALSE 0.374 38.000 0.005 NA   NA
 940838 940839 TTHA0271 TTHA0272     TRUE 0.974 13.000 0.099 0.007 Y NA
 940839 940840 TTHA0272 TTHA0273     FALSE 0.131 97.000 0.000 1.000   NA
 940842 940843 TTHA0275 TTHA0276     TRUE 0.715 -10.000 0.011 1.000 N NA
 940844 940845 TTHA0277 TTHA0278     FALSE 0.509 89.000 0.004 0.003 N NA
 940845 940846 TTHA0278 TTHA0279     TRUE 0.516 0.000 0.000 1.000 N NA
 940847 940848 TTHA0280 TTHA0281     FALSE 0.050 188.000 0.000 NA   NA
 940848 940849 TTHA0281 TTHA0282     TRUE 0.649 2.000 0.009 NA   NA
 940849 940850 TTHA0282 TTHA0283     TRUE 0.924 2.000 0.008 1.000 Y NA
 940850 940851 TTHA0283 TTHA0284     TRUE 0.987 -10.000 0.278 1.000 Y NA
 940852 940853 TTHA0285 TTHA0286     TRUE 0.966 10.000 0.364 0.007   NA
 940854 940855 TTHA0287 TTHA0288     TRUE 0.975 2.000 0.253 1.000 Y NA
 940855 940856 TTHA0288 TTHA0289     TRUE 0.984 11.000 0.667 1.000 Y NA
 940857 940858 TTHA0290 TTHA0291     TRUE 0.691 -3.000 0.003 1.000 N NA
 940859 940860 TTHA0292 TTHA0293     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940860 940861 TTHA0293 TTHA0294     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940861 940862 TTHA0294 TTHA0295     TRUE 0.669 1.000 0.007 NA   NA
 940863 940864 TTHA0296 TTHA0297     FALSE 0.418 5.000 0.004 1.000 N NA
 940864 940865 TTHA0297 TTHA0298     TRUE 0.907 -15.000 0.200 NA   NA
 940865 940866 TTHA0298 TTHA0299     TRUE 0.958 -3.000 0.300 NA   NA
 940866 940867 TTHA0299 TTHA0300     TRUE 0.736 -13.000 0.009 NA   NA
 940871 940872 TTHA0304 TTHA0305     TRUE 0.786 36.000 0.000 1.000 Y NA
 940872 940873 TTHA0305 TTHA0306     TRUE 0.559 0.000 0.002 1.000 N NA
 940873 940874 TTHA0306 TTHA0307     FALSE 0.189 85.000 0.004 1.000   NA
 940874 940875 TTHA0307 TTHA0308     TRUE 0.758 22.000 0.011 0.060   NA
 940877 940878 TTHA0310 TTHA0311     TRUE 0.727 15.000 0.006 0.048 N NA
 940878 940879 TTHA0311 TTHA0312     TRUE 0.987 13.000 0.250 0.003 Y NA
 940879 940880 TTHA0312 TTHA0313     TRUE 0.660 45.000 0.167 1.000   NA
 940880 940881 TTHA0313 TTHAt12   tRNA-Lys-1 FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 940881 940882 TTHAt12 TTHAt13 tRNA-Lys-1 tRNA-Glu-1 FALSE 0.426 7.000 0.000 NA   NA
 940882 940883 TTHAt13 TTHAt14 tRNA-Glu-1 tRNA-Val-1 TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 940885 940886 TTHA0315 TTHA0316     TRUE 0.593 69.000 0.222 NA   NA
 940887 940888 TTHA0317 TTHA0318     TRUE 0.911 9.000 0.455 NA   NA
 940888 940889 TTHA0318 TTHA0319     TRUE 0.739 -19.000 0.020 NA   NA
 940889 940890 TTHA0319 TTHA0320     FALSE 0.426 9.000 0.000 NA   NA
 940890 940891 TTHA0320 TTHA0321     TRUE 0.988 -3.000 0.013 0.040 Y NA
 940891 940892 TTHA0321 TTHA0322     FALSE 0.430 6.000 0.000 NA   NA
 940892 940893 TTHA0322 TTHA0323     TRUE 0.703 -7.000 0.000 NA   NA
 940893 940894 TTHA0323 TTHA0324     TRUE 0.588 4.000 0.009 NA   NA
 940894 940895 TTHA0324 TTHA0325     TRUE 0.829 -3.000 0.016 NA   NA
 940895 940896 TTHA0325 TTHA0326     TRUE 0.626 10.000 0.033 NA   NA
 940896 940897 TTHA0326 TTHA0327     FALSE 0.371 16.000 0.000 NA   NA
 940898 940899 TTHA0328 TTHA0329     TRUE 0.732 -7.000 0.009 1.000 N NA
 940899 940900 TTHA0329 TTHA0330     TRUE 0.551 -24.000 0.000 NA   NA
 940900 940901 TTHA0330 TTHA0331     TRUE 0.826 -10.000 0.033 NA   NA
 940902 940903 TTHA0332 TTHA0333     TRUE 0.528 23.000 0.024 NA   NA
 940903 940904 TTHA0333 TTHA0334     TRUE 0.528 31.000 0.035 NA   NA
 940904 940905 TTHA0334 TTHA0335     TRUE 0.888 5.000 0.333 NA   NA
 940907 940908 TTHA0337 TTHA0338     FALSE 0.131 89.000 0.000 NA   NA
 940908 940909 TTHA0338 TTHA0339     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 940910 940911 TTHA0340 TTHA0341     FALSE 0.456 7.000 0.000 1.000   NA
 940911 940912 TTHA0341 TTHA0342     TRUE 0.725 -7.000 0.008 1.000 N NA
 940913 940914 TTHA0343 TTHA0344     TRUE 0.813 1.000 0.125 1.000 N NA
 940914 940915 TTHA0344 TTHA0345     FALSE 0.275 43.000 0.005 1.000 N NA
 940915 940916 TTHA0345 TTHA0346     FALSE 0.166 58.000 0.000 1.000 N NA
 940917 940918 TTHA0347 TTHA0348     FALSE 0.392 13.000 0.000 NA   NA
 940919 940920 TTHA0349 TTHA0350     TRUE 0.687 44.000 0.182 1.000   NA
 940920 940921 TTHA0350 TTHA0351     TRUE 0.860 -3.000 0.074 1.000 N NA
 940921 940922 TTHA0351 TTHAt15   tRNA-Arg-4 FALSE 0.109 102.000 0.000 NA   NA
 940923 940924 TTHA0352 TTHA0353     FALSE 0.175 56.000 0.000 1.000 N NA
 940925 940926 TTHA0354 TTHA0355     TRUE 0.998 -3.000 0.723 0.059 Y NA
 940926 940927 TTHA0355 TTHA0356     TRUE 0.923 52.000 0.056 0.059 Y NA
 940927 940928 TTHA0356 TTHA0357     FALSE 0.226 59.000 0.000 NA   NA
 940929 940930 TTHA0358 TTHA0359     FALSE 0.345 100.000 0.000 0.071   NA
 940930 940931 TTHA0359 TTHA0360     FALSE 0.315 59.000 0.006 1.000   NA
 940931 940932 TTHA0360 TTHA0361     TRUE 0.700 -15.000 0.006 NA   NA
 940932 940933 TTHA0361 TTHA0362     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 940933 940934 TTHA0362 TTHA0363     FALSE 0.448 35.000 0.014 NA   NA
 940934 940935 TTHA0363 TTHA0364     TRUE 0.937 -3.000 0.189 NA   NA
 940935 940936 TTHA0364 TTHA0365     TRUE 0.967 13.000 0.084 0.036 Y NA
 940936 940937 TTHA0365 TTHA0366     FALSE 0.341 11.000 0.002 1.000 N NA
 940937 940938 TTHA0366 TTHA0367     FALSE 0.386 6.000 0.003 1.000 N NA
 940938 940939 TTHA0367 TTHA0368     TRUE 0.755 -3.000 0.010 1.000 N NA
 940940 940941 TTHAt16 TTHAr04 tRNA-Gly-3 5Sb FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 940941 940942 TTHAr04 TTHAr05 5Sb 23Sb FALSE 0.149 80.000 0.000 NA   NA
 940945 940946 TTHA0371 TTHA0372     TRUE 0.791 -12.000 0.015 1.000   NA
 940946 940947 TTHA0372 TTHA0373     FALSE 0.249 15.000 0.000 NA N NA
 940947 940948 TTHA0373 TTHA0374     FALSE 0.300 38.000 0.000 NA   NA
 940950 940951 TTHA0376 TTHA0377     FALSE 0.341 25.000 0.000 NA   NA
 940951 940952 TTHA0377 TTHA0378     TRUE 0.935 47.000 0.091 0.059 Y NA
 940952 940953 TTHA0378 TTHA0379     TRUE 0.928 56.000 0.091 0.059 Y NA
 940953 940954 TTHA0379 TTHA0380     FALSE 0.146 62.000 0.000 1.000 N NA
 940956 940957 TTHA0382 TTHA0383     TRUE 0.637 4.000 0.018 NA   NA
 940957 940958 TTHA0383 TTHA0384     TRUE 0.721 0.000 0.010 NA   NA
 940958 940959 TTHA0384 TTHA0385     TRUE 0.927 2.000 0.011 1.000 Y NA
 940959 940960 TTHA0385 TTHA0386     FALSE 0.238 41.000 0.002 1.000 N NA
 940960 940961 TTHA0386 TTHA0387     TRUE 0.964 -3.000 0.012 NA Y NA
 940961 940962 TTHA0387 TTHA0388     FALSE 0.401 34.000 0.023 NA N NA
 940962 940963 TTHA0388 TTHA0389     TRUE 0.888 3.000 0.250 1.000   NA
 940963 940964 TTHA0389 TTHA0390     TRUE 0.697 25.000 0.000 0.058   NA
 940964 940965 TTHA0390 TTHA0391     TRUE 0.883 -37.000 0.024 0.045   NA
 940965 940966 TTHA0391 TTHA0392     TRUE 0.544 5.000 0.005 1.000   NA
 940966 940967 TTHA0392 TTHA0393     TRUE 0.763 0.000 0.019 NA   NA
 940968 940969 TTHA0394 TTHA0395     TRUE 0.750 5.000 0.118 NA   NA
 940969 940970 TTHA0395 TTHA0396     TRUE 0.981 -3.000 0.600 NA   NA
 940970 940971 TTHA0396 TTHA0397     TRUE 0.950 -3.000 0.250 NA   NA
 940971 940972 TTHA0397 TTHA0398     TRUE 0.996 -3.000 0.917 0.047   NA
 940972 940973 TTHA0398 TTHA0399     TRUE 0.613 56.000 0.167 NA   NA
 940973 940974 TTHA0399 TTHA0400     FALSE 0.059 168.000 0.000 NA   NA
 940974 940975 TTHA0400 TTHA0401     TRUE 0.943 -3.000 0.263 1.000 N NA
 940979 940980 TTHA0405 TTHA0406     TRUE 0.745 -3.000 0.002 NA   NA
 940981 940982 TTHA0407 TTHA0408     FALSE 0.210 48.000 0.002 1.000 N NA
 940982 940983 TTHA0408 TTHA0409     TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000 N NA
 940983 940984 TTHA0409 TTHA0410     FALSE 0.347 23.000 0.000 NA   NA
 940985 940986 TTHA0411 TTHA0412     FALSE 0.149 96.000 0.013 1.000 N NA
 940986 940987 TTHA0412 TTHA0413     TRUE 0.604 0.000 0.005 1.000 N NA
 940987 940988 TTHA0413 TTHA0414     TRUE 0.804 120.000 0.346 1.000 Y NA
 940988 940989 TTHA0414 TTHA0415     TRUE 0.952 33.000 0.021 0.007 Y NA
 940989 940990 TTHA0415 TTHA0416     TRUE 0.990 -7.000 0.022 0.007 Y NA
 940990 940991 TTHA0416 TTHA0417     TRUE 0.983 0.000 0.006 0.007 Y NA
 940991 940992 TTHA0417 TTHA0418     FALSE 0.058 165.000 0.005 1.000 N NA
 940992 940993 TTHA0418 TTHA0419     TRUE 0.841 60.000 0.599 NA   NA
 940993 940994 TTHA0419 TTHA0420     FALSE 0.131 89.000 0.000 NA   NA
 940994 940995 TTHA0420 TTHA0421     FALSE 0.372 24.000 0.000 1.000   NA
 940995 940996 TTHA0421 TTHA0422     TRUE 0.643 10.000 0.032 1.000   NA
 940996 940997 TTHA0422 TTHA0423     TRUE 0.835 -12.000 0.097 1.000 N NA
 940998 940999 TTHA0424 TTHA0425     FALSE 0.048 137.000 0.000 1.000 N NA
 941000 941001 TTHA0426 TTHA0427     FALSE 0.472 -43.000 0.000 NA   NA
 941002 941003 TTHA0428 TTHA0429     TRUE 0.991 -7.000 0.341 1.000 Y NA
 941003 941004 TTHA0429 TTHA0430     TRUE 0.836 116.000 0.046 0.005 Y NA
 941009 941010 TTHA0435 TTHA0436     FALSE 0.267 134.000 0.003 0.076   NA
 941010 941011 TTHA0436 TTHA0437     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 941011 941012 TTHA0437 TTHA0438     FALSE 0.367 17.000 0.000 NA   NA
 941013 941014 TTHA0439 TTHA0440     TRUE 0.607 3.000 0.008 NA   NA
 941015 941016 TTHA0441 TTHA0442     TRUE 0.865 13.000 0.029 0.018   NA
 941016 941017 TTHA0442 TTHA0443     TRUE 0.852 10.000 0.254 1.000   NA
 941017 941018 TTHA0443 TTHA0444     TRUE 0.975 -3.000 0.461 1.000   NA
 941018 941019 TTHA0444 TTHA0445     TRUE 0.983 5.000 0.540 0.002   NA
 941019 941020 TTHA0445 TTHA0446     TRUE 0.770 105.000 0.787 1.000   NA
 941021 941022 TTHA0447 TTHA0448     TRUE 0.881 -3.000 0.103 1.000 N NA
 941022 941023 TTHA0448 TTHA0449     TRUE 0.889 -3.000 0.121 1.000 N NA
 941023 941024 TTHA0449 TTHA0450     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 941024 941025 TTHA0450 TTHA0451     TRUE 0.891 13.000 0.038 NA Y NA
 941025 941026 TTHA0451 TTHA0452     TRUE 0.973 45.000 0.732 NA Y NA
 941026 941027 TTHA0452 TTHA0453     FALSE 0.510 67.000 0.000 0.024 N NA
 941027 941028 TTHA0453 TTHA0454     TRUE 0.983 -7.000 0.179 1.000 Y NA
 941028 941029 TTHA0454 TTHA0455     TRUE 0.755 25.000 0.263 NA N NA
 941029 941030 TTHA0455 TTHA0456     TRUE 0.741 16.000 0.211 NA N NA
 941030 941031 TTHA0456 TTHA0457     TRUE 0.794 33.000 0.000 1.000 Y NA
 941031 941032 TTHA0457 TTHA0458     TRUE 0.893 -15.000 0.209 1.000 N NA
 941032 941033 TTHA0458 TTHA0459     TRUE 0.537 4.000 0.002 1.000   NA
 941033 941034 TTHA0459 TTHA0460     TRUE 0.861 -36.000 0.200 1.000   NA
 941034 941035 TTHA0460 TTHA0461     TRUE 0.838 -3.000 0.052 1.000 N NA
 941037 941038 TTHA0462 TTHA0463     TRUE 0.825 -3.000 0.015 NA   NA
 941039 941040 TTHA0464 TTHA0465     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 941040 941041 TTHA0465 TTHA0466     FALSE 0.462 33.000 0.038 1.000 N NA
 941041 941042 TTHA0466 TTHA0467     FALSE 0.209 67.000 0.000 1.000   NA
 941042 941043 TTHA0467 TTHA0468     TRUE 0.750 14.000 0.167 NA   NA
 941044 941045 TTHA0469 TTHA0470     TRUE 0.958 42.000 0.175 0.058 Y NA
 941045 941046 TTHA0470 TTHA0471     TRUE 0.979 8.000 0.750 0.058   NA
 941046 941047 TTHA0471 TTHA0472     FALSE 0.502 74.000 0.164 1.000   NA
 941047 941048 TTHA0472 TTHA0473     TRUE 0.998 -3.000 0.436 0.001 Y NA
 941048 941049 TTHA0473 TTHA0474     FALSE 0.463 59.000 0.062 1.000   NA
 941049 941050 TTHA0474 TTHA0475     TRUE 0.955 -6.000 0.271 1.000   NA
 941050 941051 TTHA0475 TTHA0476     TRUE 0.632 5.000 0.019 1.000   NA
 941051 941052 TTHA0476 TTHA0477     TRUE 0.908 2.000 0.286 NA   NA
 941053 941054 TTHA0478 TTHA0479     TRUE 0.903 4.000 0.009 1.000 Y NA
 941054 941055 TTHA0479 TTHA0480     TRUE 0.986 -3.000 0.172 0.001   NA
 941056 941057 TTHA0481 TTHA0482     TRUE 0.524 5.000 0.015 1.000 N NA
 941057 941058 TTHA0482 TTHA0483     TRUE 0.955 -9.000 0.015 0.008   NA
 941059 941060 TTHAt18 TTHA0484 tRNA-Leu-5   TRUE 0.573 -21.000 0.000 NA   NA
 941062 941063 TTHA0486 TTHA0487     TRUE 0.716 -6.000 0.000 NA   NA
 941063 941064 TTHA0487 TTHA0488     TRUE 0.573 -21.000 0.000 NA   NA
 941065 941066 TTHA0489 TTHA0490     TRUE 0.532 5.000 0.004 1.000   NA
 941066 941067 TTHA0490 TTHA0491     FALSE 0.422 32.000 0.005 1.000   NA
 941067 941068 TTHA0491 TTHA0492     FALSE 0.512 13.000 0.011 NA   NA
 941068 941069 TTHA0492 TTHA0493     TRUE 0.923 3.000 0.400 NA   NA
 941070 941071 TTHA0494 TTHA0495     TRUE 0.959 -7.000 0.333 NA   NA
 941072 941073 TTHAt19 TTHAt20 tRNA-Cys tRNA-Val-2 FALSE 0.426 9.000 0.000 NA   NA
 941073 941074 TTHAt20 TTHA0496 tRNA-Val-2   FALSE 0.289 41.000 0.000 NA   NA
 941075 941076 TTHA0497 TTHA0498     TRUE 0.703 -7.000 0.000 NA   NA
 941076 941077 TTHA0498 TTHA0499     TRUE 0.945 -10.000 0.286 NA   NA
 941077 941078 TTHA0499 TTHA0500     FALSE 0.475 5.000 0.000 1.000   NA
 941078 941079 TTHA0500 TTHA0501     TRUE 0.888 -15.000 0.167 NA   NA
 941079 941080 TTHA0501 TTHA0502     TRUE 0.934 0.000 0.300 NA   NA
 941080 941081 TTHA0502 TTHA0503     FALSE 0.321 33.000 0.000 NA   NA
 941081 941082 TTHA0503 TTHA0504     TRUE 0.868 5.000 0.026 0.044   NA
 941082 941083 TTHA0504 TTHA0505     TRUE 0.959 -13.000 0.031 0.002   NA
 941083 941084 TTHA0505 TTHA0506     TRUE 0.681 62.000 0.000 1.000 Y NA
 941085 941086 TTHA0507 TTHA0508     TRUE 0.929 43.000 0.031 0.047 Y NA
 941086 941087 TTHA0508 TTHA0509     FALSE 0.353 60.000 0.048 1.000 N NA
 941088 941089 TTHA0510 TTHA0511     FALSE 0.314 41.000 0.000 1.000   NA
 941089 941090 TTHA0511 TTHA0512     FALSE 0.165 48.000 0.000 NA N NA
 941090 941091 TTHA0512 TTHA0513     TRUE 0.589 -3.000 0.000 NA N NA
 941091 941092 TTHA0513 TTHA0514     TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 941093 941094 TTHA0515 TTHA0516     TRUE 0.807 4.000 0.162 NA   NA
 941095 941096 TTHA0517 TTHA0518     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941097 941098 TTHA0519 TTHA0520     TRUE 0.753 19.000 0.182 NA   NA
 941098 941099 TTHA0520 TTHA0521     TRUE 0.686 5.000 0.048 1.000   NA
 941099 941100 TTHA0521 TTHA0522     TRUE 0.959 -3.000 0.310 NA   NA
 941100 941101 TTHA0522 TTHA0523     FALSE 0.449 13.000 0.004 NA   NA
 941101 941102 TTHA0523 TTHA0524     TRUE 0.989 19.000 0.317 0.002 Y NA
 941102 941103 TTHA0524 TTHA0525     TRUE 0.777 110.000 0.249 1.000 Y NA
 941103 941104 TTHA0525 TTHA0526     TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 941105 941106 TTHA0527 TTHA0528     TRUE 0.654 -22.000 0.018 1.000 N NA
 941107 941108 TTHA0529 TTHA0530     FALSE 0.361 27.000 0.000 1.000   NA
 941109 941110 TTHA0531 TTHA0532     FALSE 0.288 49.000 0.000 1.000   NA
 941110 941111 TTHA0532 TTHA0533     TRUE 0.564 4.000 0.017 1.000 N NA
 941112 941113 TTHA0534 TTHA0535     TRUE 0.704 0.000 0.005 1.000   NA
 941114 941115 TTHA0536 TTHA0537     TRUE 0.831 15.000 0.000 1.000 Y NA
 941115 941116 TTHA0537 TTHA0538     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 941118 941119 TTHA0540 TTHA0541     TRUE 0.873 -3.000 0.056 NA   NA
 941119 941120 TTHA0541 TTHA0542     TRUE 0.953 11.000 0.004 0.019 Y NA
 941121 941122 TTHA0543 TTHA0544     FALSE 0.069 181.000 0.004 NA   NA
 941122 941123 TTHA0544 TTHA0545     TRUE 0.761 -3.000 0.003 NA   NA
 941125 941126 TTHA0547 TTHA0548     TRUE 0.965 -7.000 0.400 NA   NA
 941127 941128 TTHA0549 TTHA0550     FALSE 0.356 14.000 0.004 1.000 N NA
 941129 941130 TTHA0551 TTHA0552     TRUE 0.923 93.000 0.652 1.000 Y NA
 941130 941131 TTHA0552 TTHA0553     TRUE 0.996 12.000 0.928 0.024 Y NA
 941131 941132 TTHA0553 TTHA0554     FALSE 0.334 43.000 0.004 NA   NA
 941132 941133 TTHA0554 TTHA0555     TRUE 0.860 -3.000 0.036 NA   NA
 941133 941134 TTHA0555 TTHA0556     TRUE 0.648 0.000 0.000 1.000   NA
 941135 941136 TTHA0557 TTHA0558     FALSE 0.146 75.000 0.003 1.000 N NA
 941138 941139 TTHA0560 TTHA0561     FALSE 0.417 34.000 0.008 NA   NA
 941140 941141 TTHA0562 TTHA0563     FALSE 0.435 30.000 0.010 NA   NA
 941141 941142 TTHA0563 TTHA0564     FALSE 0.512 9.000 0.006 NA   NA
 941146 941147 TTHA0568 TTHA0569     FALSE 0.498 13.000 0.008 NA   NA
 941147 941148 TTHA0569 TTHA0570     FALSE 0.214 40.000 0.000 1.000 N NA
 941150 941151 TTHA0572 TTHA0573     TRUE 0.864 8.000 0.002 1.000 Y NA
 941151 941152 TTHA0573 TTHA0574     TRUE 0.615 0.000 0.005 1.000 N NA
 941152 941153 TTHA0574 TTHA0575     TRUE 0.746 2.000 0.046 NA   NA
 941154 941155 TTHA0576 TTHA0577     TRUE 0.940 -15.000 0.328 NA   NA
 941155 941156 TTHA0577 TTHA0578     TRUE 0.838 -3.000 0.020 NA   NA
 941156 941157 TTHA0578 TTHA0579     FALSE 0.181 54.000 0.000 1.000 N NA
 941157 941158 TTHA0579 TTHA0580     FALSE 0.196 65.000 0.000 NA   NA
 941159 941160 TTHA0581 TTHA0582     FALSE 0.447 -111.000 0.000 NA   NA
 941163 941164 TTHA0585 TTHA0586     TRUE 0.966 2.000 0.800 1.000 N NA
 941164 941165 TTHA0586 TTHA0587     TRUE 0.812 7.000 0.235 1.000 N NA
 941165 941166 TTHA0587 TTHA0588     TRUE 0.995 -9.000 0.235 0.024 Y NA
 941166 941167 TTHA0588 TTHA0589     TRUE 0.962 0.000 0.071 1.000 Y NA
 941167 941168 TTHA0589 TTHA0590     TRUE 0.879 29.000 0.071 NA Y NA
 941168 941169 TTHA0590 TTHA0591     FALSE 0.027 198.000 0.000 NA N NA
 941173 941174 TTHA0595 TTHA0596     FALSE 0.427 8.000 0.006 1.000 N NA
 941176 941177 TTHA0598 TTHA0599     FALSE 0.501 -16.000 0.000 1.000 N NA
 941177 941178 TTHA0599 TTHA0600     TRUE 0.955 -12.000 0.014 1.000 Y NA
 941178 941179 TTHA0600 TTHA0601     TRUE 0.981 -3.000 0.131 1.000 Y NA
 941181 941182 TTHA0603 TTHA0604     FALSE 0.174 77.000 0.000 1.000   NA
 941182 941183 TTHA0604 TTHA0605     FALSE 0.026 256.000 0.000 1.000 N NA
 941183 941184 TTHA0605 TTHA0606     TRUE 0.834 27.000 0.007 1.000 Y NA
 941186 941187 TTHA0608 TTHA0609     TRUE 0.611 -15.000 0.008 NA N NA
 941187 941188 TTHA0609 TTHA0610     FALSE 0.479 21.000 0.028 1.000 N NA
 941188 941189 TTHA0610 TTHA0611     TRUE 0.969 -3.000 0.400 NA   NA
 941189 941190 TTHA0611 TTHA0612     FALSE 0.274 57.000 0.003 NA   NA
 941191 941192 TTHA0613 TTHAt21   tRNA-His FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 941192 941193 TTHAt21 TTHAt22 tRNA-His tRNA-Leu-2 FALSE 0.261 51.000 0.000 NA   NA
 941193 941194 TTHAt22 TTHA0614 tRNA-Leu-2   FALSE 0.300 38.000 0.000 NA   NA
 941194 941195 TTHA0614 TTHA0615     TRUE 0.703 66.000 0.006 1.000 Y NA
 941195 941196 TTHA0615 TTHA0616     TRUE 0.945 -13.000 0.006 1.000 Y NA
 941200 941201 TTHA0620 TTHA0621     TRUE 0.976 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 941201 941202 TTHA0621 TTHA0622     FALSE 0.209 58.000 0.004 1.000 N NA
 941204 941205 TTHA0624 TTHA0625     FALSE 0.361 19.000 0.000 NA   NA
 941205 941206 TTHA0625 TTHA0626     TRUE 0.853 -3.000 0.021 1.000   NA
 941207 941208 TTHA0627 TTHAt23   tRNA-Arg-3 FALSE 0.281 43.000 0.000 NA   NA
 941208 941209 TTHAt23 TTHAt24 tRNA-Arg-3 tRNA-Gly-2 FALSE 0.311 36.000 0.000 NA   NA
 941209 941210 TTHAt24 TTHAt25 tRNA-Gly-2 tRNA-Pro-3 TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 941212 941213 TTHA0629 TTHA0630     FALSE 0.345 20.000 0.005 1.000 N NA
 941213 941214 TTHA0630 TTHA0631     TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 941214 941215 TTHA0631 TTHA0632     FALSE 0.435 11.000 0.000 1.000   NA
 941215 941216 TTHA0632 TTHA0633     TRUE 0.969 -3.000 0.400 NA   NA
 941217 941218 TTHA0634 TTHA0635     TRUE 0.809 -10.000 0.016 1.000   NA
 941218 941219 TTHA0635 TTHA0636     TRUE 0.868 12.000 0.333 NA   NA
 941219 941220 TTHA0636 TTHA0637     TRUE 0.834 -3.000 0.018 NA   NA
 941220 941221 TTHA0637 TTHA0638     TRUE 0.791 0.000 0.035 NA   NA
 941222 941223 TTHA0639 TTHA0640     FALSE 0.483 -40.000 0.000 NA   NA
 941223 941224 TTHA0640 TTHA0641     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941224 941225 TTHA0641 TTHA0642     TRUE 0.840 13.000 0.000 1.000 Y NA
 941225 941226 TTHA0642 TTHA0643     TRUE 0.761 43.000 0.000 1.000 Y NA
 941226 941227 TTHA0643 TTHA0644     FALSE 0.509 -31.000 0.000 NA   NA
 941227 941228 TTHA0644 TTHA0645     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941230 941231 TTHA0647 TTHA0648     TRUE 0.984 -9.000 0.000 0.015 Y NA
 941231 941232 TTHA0648 TTHA0649     FALSE 0.456 7.000 0.000 1.000   NA
 941232 941233 TTHA0649 TTHA0650     FALSE 0.460 6.000 0.000 1.000   NA
 941234 941235 TTHA0651 TTHA0652     FALSE 0.383 14.000 0.000 NA   NA
 941237 941238 TTHA0654 TTHA0655     TRUE 0.614 4.000 0.032 1.000 N NA
 941238 941239 TTHA0655 TTHA0656     FALSE 0.427 4.000 0.003 1.000 N NA
 941239 941240 TTHA0656 TTHA0657     TRUE 0.705 2.000 0.021 NA   NA
 941240 941241 TTHA0657 TTHA0658     TRUE 0.850 -3.000 0.026 NA   NA
 941245 941246 TTHA0662 TTHA0663     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 941249 941250 TTHA0666 TTHA0667     TRUE 0.586 3.000 0.015 1.000 N NA
 941250 941251 TTHA0667 TTHA0668     TRUE 0.858 -7.000 0.038 1.000   NA
 941251 941252 TTHA0668 TTHA0669     TRUE 0.735 1.000 0.016 1.000   NA
 941252 941253 TTHA0669 TTHA0670     TRUE 0.950 -12.000 0.006 1.000 Y NA
 941253 941254 TTHA0670 TTHA0671     TRUE 0.970 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 941254 941255 TTHA0671 TTHA0672     TRUE 0.518 12.000 0.024 1.000 N NA
 941255 941256 TTHA0672 TTHA0673     FALSE 0.199 64.000 0.000 NA   NA
 941257 941258 TTHA0674 TTHA0675     TRUE 0.971 -13.000 0.120 1.000 Y NA
 941258 941259 TTHA0675 TTHA0676     TRUE 0.953 2.000 0.095 1.000 Y NA
 941259 941260 TTHA0676 TTHA0677     FALSE 0.448 14.000 0.014 1.000 N NA
 941260 941261 TTHA0677 TTHA0678     TRUE 0.802 -13.000 0.071 1.000 N NA
 941261 941262 TTHA0678 TTHA0679     FALSE 0.344 5.000 0.000 1.000 N NA
 941262 941263 TTHA0679 TTHA0680     TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000 N NA
 941264 941265 TTHA0681 TTHA0682     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941265 941266 TTHA0682 TTHA0683     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 941266 941267 TTHA0683 TTHA0684     TRUE 0.967 -3.000 0.132 0.064   NA
 941267 941268 TTHA0684 TTHA0685     TRUE 0.611 46.000 0.000 0.064   NA
 941268 941269 TTHA0685 TTHA0686     TRUE 0.988 0.000 0.683 0.056 N NA
 941269 941270 TTHA0686 TTHA0687     FALSE 0.456 -66.000 0.000 NA   NA
 941270 941271 TTHA0687 TTHA0688     TRUE 0.919 44.000 0.822 NA   NA
 941271 941272 TTHA0688 TTHA0689     TRUE 0.918 -58.000 0.044 NA Y NA
 941273 941274 TTHA0690 TTHA0691     TRUE 0.917 11.000 0.083 1.000 Y NA
 941274 941275 TTHA0691 TTHA0692     TRUE 0.872 -28.000 0.054 0.073 N NA
 941276 941277 TTHA0693 TTHA0694     TRUE 0.715 10.000 0.136 1.000 N NA
 941277 941278 TTHA0694 TTHA0695     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.023   NA
 941280 941281 TTHA0697 TTHA0698     FALSE 0.135 88.000 0.000 NA   NA
 941281 941282 TTHA0698 TTHA0699     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 941282 941283 TTHA0699 TTHA0700     TRUE 0.802 -31.000 0.171 NA N NA
 941283 941284 TTHA0700 TTHA0701     TRUE 0.990 -3.000 0.323 NA Y NA
 941284 941285 TTHA0701 TTHA0702     TRUE 0.939 17.000 0.759 NA   NA
 941286 941287 TTHA0703 TTHA0704     FALSE 0.094 122.000 0.010 1.000 N NA
 941287 941288 TTHA0704 TTHA0705     TRUE 0.571 -19.000 0.005 1.000 N NA
 941288 941289 TTHA0705 TTHA0706     TRUE 0.762 32.000 0.273 1.000 N NA
 941289 941290 TTHA0706 TTHA0707     FALSE 0.198 36.000 0.000 NA N NA
 941291 941292 TTHA0708 TTHA0709     FALSE 0.341 64.000 0.017 1.000   NA
 941292 941293 TTHA0709 TTHA0710     TRUE 0.941 15.000 0.727 1.000   NA
 941293 941294 TTHA0710 TTHA0711     TRUE 0.803 -3.000 0.006 1.000   NA
 941294 941295 TTHA0711 TTHA0712     TRUE 0.965 25.000 0.161 0.050 Y NA
 941296 941297 TTHA0713 TTHA0714     TRUE 0.931 47.000 1.000 NA   NA
 941298 941299 TTHA0715 TTHA0716     TRUE 0.626 -30.000 0.021 1.000 N NA
 941299 941300 TTHA0716 TTHA0717     TRUE 0.998 0.000 0.660 0.001 Y NA
 941300 941301 TTHA0717 TTHA0718     FALSE 0.073 159.000 0.010 1.000 N NA
 941301 941302 TTHA0718 TTHA0719     TRUE 0.883 -3.000 0.071 NA   NA
 941303 941304 TTHA0720 TTHA0721     TRUE 0.931 1.000 0.333 NA   NA
 941304 941305 TTHA0721 TTHA0722     TRUE 0.651 37.000 0.136 NA   NA
 941305 941306 TTHA0722 TTHA0723     TRUE 0.823 -3.000 0.035 1.000 N NA
 941306 941307 TTHA0723 TTHA0724     FALSE 0.227 36.000 0.000 1.000 N NA
 941307 941308 TTHA0724 TTHA0725     FALSE 0.198 36.000 0.000 NA N NA
 941308 941309 TTHA0725 TTHAt26   tRNA-Leu-3 FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 941310 941311 TTHA0726 TTHA0727     FALSE 0.102 106.000 0.000 NA   NA
 941311 941312 TTHA0727 TTHA0728     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 941312 941313 TTHA0728 TTHA0729     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941313 941314 TTHA0729 TTHA0730     TRUE 0.976 -3.000 0.500 NA   NA
 941314 941315 TTHA0730 TTHA0731     TRUE 0.938 4.000 0.500 1.000   NA
 941315 941316 TTHA0731 TTHA0732     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.055 Y NA
 941316 941317 TTHA0732 TTHA0733     TRUE 0.973 -7.000 0.571 1.000 N NA
 941318 941319 TTHA0734 TTHA0735     TRUE 0.787 -19.000 0.042 1.000   NA
 941320 941321 TTHA0736 TTHA0737     TRUE 0.656 -12.000 0.000 NA   NA
 941321 941322 TTHA0737 TTHA0738     TRUE 0.976 -3.000 0.500 NA   NA
 941324 941325 TTHA0740 TTHA0741     TRUE 0.553 -16.000 0.003 1.000 N NA
 941325 941326 TTHA0741 TTHA0742     FALSE 0.276 44.000 0.000 NA   NA
 941326 941327 TTHA0742 TTHA0743     FALSE 0.300 38.000 0.000 NA   NA
 941327 941328 TTHA0743 TTHA0744     TRUE 0.638 -13.000 0.000 NA   NA
 941328 941329 TTHA0744 TTHA0745     FALSE 0.294 40.000 0.000 NA   NA
 941330 941331 TTHA0746 TTHA0747     TRUE 0.972 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 941331 941332 TTHA0747 TTHA0748     TRUE 0.970 -13.000 0.112 1.000 Y NA
 941332 941333 TTHA0748 TTHA0749     TRUE 0.897 -19.000 0.208 NA   NA
 941333 941334 TTHA0749 TTHA0750     FALSE 0.294 40.000 0.000 NA   NA
 941334 941335 TTHA0750 TTHA0751     FALSE 0.100 108.000 0.000 NA   NA
 941335 941336 TTHA0751 TTHA0752     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 941337 941338 TTHA0753 TTHA0754     FALSE 0.475 5.000 0.000 1.000   NA
 941339 941340 TTHA0755 TTHA0756     FALSE 0.451 10.000 0.000 1.000   NA
 941341 941342 TTHA0757 TTHA0758     FALSE 0.259 52.000 0.000 NA   NA
 941342 941343 TTHA0758 TTHA0759     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941343 941344 TTHA0759 TTHA0760     TRUE 0.986 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 941344 941345 TTHA0760 TTHA0761     FALSE 0.033 333.000 0.000 NA   NA
 941345 941346 TTHA0761 TTHA0762     TRUE 0.586 10.000 0.018 NA   NA
 941346 941347 TTHA0762 TTHA0763     TRUE 0.860 2.000 0.000 0.042   NA
 941347 941348 TTHA0763 TTHA0764     TRUE 0.916 -3.000 0.171 1.000 N NA
 941349 941350 TTHA0765 TTHA0766     TRUE 0.562 83.000 0.000 NA Y NA
 941350 941351 TTHA0766 TTHA0767     TRUE 0.976 5.000 0.429 NA Y NA
 941351 941352 TTHA0767 TTHA0768     TRUE 0.989 -10.000 0.375 NA Y NA
 941353 941354 TTHA0769 TTHA0770     TRUE 0.868 5.000 0.000 1.000 Y NA
 941354 941355 TTHA0770 TTHA0771     FALSE 0.085 120.000 0.000 NA   NA
 941356 941357 TTHA0772 TTHA0773     FALSE 0.259 52.000 0.000 NA   NA
 941357 941358 TTHA0773 TTHA0774     FALSE 0.400 12.000 0.000 NA   NA
 941358 941359 TTHA0774 TTHA0775     TRUE 0.872 58.000 0.667 NA   NA
 941359 941360 TTHA0775 TTHA0776     TRUE 0.831 69.000 0.667 NA   NA
 941360 941361 TTHA0776 TTHA0777     TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 941364 941365 TTHA0780 TTHA0781     FALSE 0.511 5.000 0.003 1.000   NA
 941365 941366 TTHA0781 TTHA0782     TRUE 0.993 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 941366 941367 TTHA0782 TTHA0783     TRUE 0.988 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 941367 941368 TTHA0783 TTHA0784     FALSE 0.047 201.000 0.000 NA   NA
 941368 941369 TTHA0784 TTHA0785     FALSE 0.234 58.000 0.000 NA   NA
 941369 941370 TTHA0785 TTHA0786     TRUE 0.642 6.000 0.027 1.000   NA
 941370 941371 TTHA0786 TTHA0787     FALSE 0.344 24.000 0.000 NA   NA
 941371 941372 TTHA0787 TTHA0788     FALSE 0.324 32.000 0.000 NA   NA
 941372 941373 TTHA0788 TTHA0789     FALSE 0.277 35.000 0.003 1.000 N NA
 941373 941374 TTHA0789 TTHA0790     TRUE 0.696 10.000 0.071 1.000   NA
 941376 941377 TTHA0792 TTHA0793     FALSE 0.425 4.000 0.005 NA N NA
 941380 941381 TTHA0796 TTHA0797     FALSE 0.377 15.000 0.000 NA   NA
 941381 941382 TTHA0797 TTHA0798     FALSE 0.509 53.000 0.118 1.000 N NA
 941383 941384 TTHA0799 TTHA0800     TRUE 0.972 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 941384 941385 TTHA0800 TTHA0801     FALSE 0.158 141.000 0.045 NA   NA
 941385 941386 TTHA0801 TTHA0802     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 941386 941387 TTHA0802 TTHA0803     FALSE 0.278 66.000 0.010 NA   NA
 941387 941388 TTHA0803 TTHA0804     TRUE 0.941 -3.000 0.205 NA   NA
 941388 941389 TTHA0804 TTHA0805     TRUE 0.528 11.000 0.011 NA   NA
 941389 941390 TTHA0805 TTHA0806     TRUE 0.787 0.000 0.031 NA   NA
 941390 941391 TTHA0806 TTHA0807     TRUE 0.622 10.000 0.031 NA   NA
 941392 941393 TTHA0808 TTHA0809     TRUE 0.525 10.000 0.008 NA   NA
 941393 941394 TTHA0809 TTHA0810     TRUE 0.823 -6.000 0.012 1.000   NA
 941394 941395 TTHA0810 TTHA0811     FALSE 0.422 34.000 0.006 1.000   NA
 941395 941396 TTHA0811 TTHA0812     TRUE 0.972 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 941397 941398 TTHA0813 TTHA0814     TRUE 0.959 -3.000 0.047 0.045   NA
 941398 941399 TTHA0814 TTHA0815     TRUE 0.934 -28.000 0.486 1.000 N NA
 941399 941400 TTHA0815 TTHA0816     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941400 941401 TTHA0816 TTHA0817     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941401 941402 TTHA0817 TTHA0818     TRUE 0.930 -28.000 0.400 NA   NA
 941402 941403 TTHA0818 TTHA0819     FALSE 0.407 55.000 0.022 NA   NA
 941403 941404 TTHA0819 TTHA0820     TRUE 0.961 10.000 0.916 NA   NA
 941404 941405 TTHA0820 TTHA0821     FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 941405 941406 TTHA0821 TTHA0822     TRUE 0.542 -31.000 0.002 NA   NA
 941406 941407 TTHA0822 TTHA0823     FALSE 0.203 43.000 0.000 1.000 N NA
 941407 941408 TTHA0823 TTHA0824     FALSE 0.480 131.000 0.444 1.000 N NA
 941408 941409 TTHA0824 TTHA0825     TRUE 0.966 12.000 0.333 1.000 Y NA
 941409 941410 TTHA0825 TTHA0826     FALSE 0.450 43.000 0.061 1.000 N NA
 941410 941411 TTHA0826 TTHA0827     TRUE 0.557 41.000 0.121 1.000 N NA
 941412 941413 TTHA0828 TTHA0829     FALSE 0.423 89.000 0.167 NA   NA
 941414 941415 TTHA0830 TTHAt27   tRNA-Ser-4 FALSE 0.123 93.000 0.000 NA   NA
 941416 941417 TTHA0831 TTHA0832     TRUE 0.796 -25.000 0.094 NA   NA
 941417 941418 TTHA0832 TTHA0833     TRUE 0.820 -3.000 0.013 NA   NA
 941419 941420 TTHA0834 TTHA0835     FALSE 0.364 26.000 0.000 1.000   NA
 941420 941421 TTHA0835 TTHA0836     TRUE 0.907 2.000 0.267 1.000   NA
 941421 941422 TTHA0836 TTHA0837     TRUE 0.971 58.000 0.222 0.003 Y NA
 941423 941424 TTHA0838 TTHA0839     TRUE 0.755 2.000 0.056 NA   NA
 941424 941425 TTHA0839 TTHA0840     TRUE 0.947 0.000 0.429 1.000 N NA
 941426 941427 TTHA0841 TTHA0842     TRUE 0.969 2.000 0.761 NA   NA
 941427 941428 TTHA0842 TTHA0843     TRUE 0.966 2.000 0.683 NA   NA
 941428 941429 TTHA0843 TTHA0844     FALSE 0.135 112.000 0.006 NA   NA
 941429 941430 TTHA0844 TTHA0845     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941430 941431 TTHA0845 TTHA0846     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 941431 941432 TTHA0846 TTHA0847     TRUE 0.786 16.000 0.000 0.017   NA
 941433 941434 TTHA0848 TTHA0849     TRUE 0.563 4.000 0.006 NA   NA
 941434 941435 TTHA0849 TTHA0850     FALSE 0.429 83.000 0.154 NA   NA
 941435 941436 TTHA0850 TTHA0851     TRUE 0.947 -3.000 0.231 NA   NA
 941436 941437 TTHA0851 TTHA0852     TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000 N NA
 941437 941438 TTHA0852 TTHA0853     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 941439 941440 TTHA0854 TTHA0855     TRUE 0.915 2.000 0.312 NA   NA
 941440 941441 TTHA0855 TTHA0856     TRUE 0.943 -3.000 0.013 0.020 N NA
 941441 941442 TTHA0856 TTHA0857     TRUE 0.968 -3.000 0.372 1.000   NA
 941442 941443 TTHA0857 TTHA0858     FALSE 0.475 40.000 0.020 1.000   NA
 941443 941444 TTHA0858 TTHA0859     TRUE 0.918 13.000 0.626 1.000 N NA
 941444 941445 TTHA0859 TTHA0860     TRUE 0.806 57.000 0.416 1.000   NA
 941445 941446 TTHA0860 TTHA0861     TRUE 0.986 -3.000 0.748 1.000   NA
 941448 941449 TTHA0862 TTHA0863     FALSE 0.098 118.000 0.000 1.000   NA
 941449 941450 TTHA0863 TTHA0864     TRUE 0.775 -3.000 0.003 1.000   NA
 941451 941452 TTHA0865 TTHA0866     FALSE 0.300 38.000 0.000 NA   NA
 941453 941454 TTHA0867 TTHA0868     FALSE 0.054 182.000 0.000 NA   NA
 941456 941457 TTHA0870 TTHA0871     TRUE 0.920 -96.000 0.043 0.002   NA
 941457 941458 TTHA0871 TTHA0872     TRUE 0.810 0.000 0.041 1.000   NA
 941458 941459 TTHA0872 TTHA0873     TRUE 0.767 -19.000 0.025 1.000   NA
 941459 941460 TTHA0873 TTHA0874     TRUE 0.959 -27.000 0.273 0.071   NA
 941460 941461 TTHA0874 TTHA0875     TRUE 0.721 -9.000 0.010 1.000 N NA
 941461 941462 TTHA0875 TTHA0876     TRUE 0.915 3.000 0.010 1.000 Y NA
 941462 941463 TTHA0876 TTHA0877     TRUE 0.627 2.000 0.006 NA   NA
 941465 941466 TTHA0879 TTHA0880     TRUE 0.984 0.000 0.300 1.000 Y NA
 941468 941469 TTHA0882 TTHA0883     FALSE 0.435 11.000 0.000 1.000   NA
 941469 941470 TTHA0883 TTHA0884     TRUE 0.648 0.000 0.000 1.000   NA
 941470 941471 TTHA0884 TTHA0885     FALSE 0.341 25.000 0.000 NA   NA
 941471 941472 TTHA0885 TTHA0886     TRUE 0.847 -7.000 0.036 NA   NA
 941472 941473 TTHA0886 TTHA0887     TRUE 0.955 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 941473 941474 TTHA0887 TTHA0888     TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000 N NA
 941475 941476 TTHA0889 TTHA0890     FALSE 0.031 203.000 0.000 1.000 N NA
 941476 941477 TTHA0890 TTHA0891     TRUE 0.981 11.000 0.588 1.000 Y NA
 941477 941478 TTHA0891 TTHA0892     TRUE 0.905 12.000 0.055 1.000 Y NA
 941480 941481 TTHA0894 TTHA0895     FALSE 0.106 79.000 0.000 1.000 N NA
 941481 941482 TTHA0895 TTHA0896     FALSE 0.062 181.000 0.000 1.000   NA
 941482 941483 TTHA0896 TTHA0897     TRUE 0.667 1.000 0.007 NA   NA
 941484 941485 TTHA0898 TTHA0899     TRUE 0.713 -10.000 0.003 NA   NA
 941485 941486 TTHA0899 TTHA0900     TRUE 0.821 -3.000 0.013 NA   NA
 941486 941487 TTHA0900 TTHA0901     TRUE 0.910 -3.000 0.122 NA   NA
 941487 941488 TTHA0901 TTHA0902     TRUE 0.755 -3.000 0.010 1.000 N NA
 941488 941489 TTHA0902 TTHA0903     TRUE 0.596 2.000 0.002 1.000   NA
 941489 941490 TTHA0903 TTHA0904     FALSE 0.106 104.000 0.000 NA   NA
 941491 941492 TTHA0905 TTHA0906     TRUE 0.981 1.000 0.010 0.005 Y NA
 941492 941493 TTHA0906 TTHA0907     FALSE 0.194 46.000 0.000 1.000 N NA
 941493 941494 TTHA0907 TTHA0908     TRUE 0.698 -21.000 0.009 1.000   NA
 941494 941495 TTHA0908 TTHA0909     TRUE 0.638 10.000 0.029 1.000   NA
 941495 941496 TTHA0909 TTHA0910     TRUE 0.558 2.000 0.007 1.000 N NA
 941497 941498 TTHA0911 TTHA0912     FALSE 0.435 -148.000 0.000 NA   NA
 941498 941499 TTHA0912 TTHA0913     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941499 941500 TTHA0913 TTHA0914     FALSE 0.431 -208.000 0.000 NA   NA
 941500 941501 TTHA0914 TTHA0915     FALSE 0.091 117.000 0.000 NA   NA
 941501 941502 TTHA0915 TTHA0916     FALSE 0.261 51.000 0.000 NA   NA
 941502 941503 TTHA0916 TTHA0917     FALSE 0.452 -93.000 0.000 NA   NA
 941503 941504 TTHA0917 TTHA0918     FALSE 0.433 -153.000 0.000 NA   NA
 941504 941505 TTHA0918 TTHA0919     FALSE 0.460 -60.000 0.000 NA   NA
 941505 941506 TTHA0919 TTHA0920     FALSE 0.400 12.000 0.000 NA   NA
 941506 941507 TTHA0920 TTHA0921     FALSE 0.161 76.000 0.000 NA   NA
 941507 941508 TTHA0921 TTHA0922     FALSE 0.091 117.000 0.000 NA   NA
 941508 941509 TTHA0922 TTHA0923     FALSE 0.317 34.000 0.000 NA   NA
 941509 941510 TTHA0923 TTHA0924     FALSE 0.041 252.000 0.000 NA   NA
 941510 941511 TTHA0924 TTHA0925     FALSE 0.481 86.000 0.190 NA   NA
 941514 941515 TTHAt29 TTHA0928 tRNA-Pro-2   FALSE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 941515 941516 TTHA0928 TTHA0929     TRUE 0.684 1.000 0.031 NA N NA
 941516 941517 TTHA0929 TTHA0930     FALSE 0.436 2.000 0.000 1.000 N NA
 941518 941519 TTHA0931 TTHA0932     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941519 941520 TTHA0932 TTHA0933     TRUE 0.675 -10.000 0.000 NA   NA
 941520 941521 TTHA0933 TTHA0934     TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 941523 941524 TTHA0936 TTHA0937     FALSE 0.072 155.000 0.000 1.000   NA
 941524 941525 TTHA0937 TTHA0938     FALSE 0.421 13.000 0.000 1.000   NA
 941525 941526 TTHA0938 TTHA0939     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.002 Y NA
 941526 941527 TTHA0939 TTHA0940     TRUE 0.588 -31.000 0.015 1.000 N NA
 941527 941528 TTHA0940 TTHA0941     FALSE 0.262 21.000 0.000 1.000 N NA
 941528 941529 TTHA0941 TTHA0942     TRUE 0.840 0.000 0.091 NA   NA
 941529 941530 TTHA0942 TTHA0943     FALSE 0.430 6.000 0.000 NA   NA
 941530 941531 TTHA0943 TTHA0944     FALSE 0.041 252.000 0.000 NA   NA
 941531 941532 TTHA0944 TTHA0945     FALSE 0.126 92.000 0.000 NA   NA
 941534 941535 TTHA0947 TTHA0948     FALSE 0.326 9.000 0.000 1.000 N NA
 941535 941536 TTHA0948 TTHA0949     FALSE 0.138 74.000 0.003 1.000 N NA
 941536 941537 TTHA0949 TTHA0950     TRUE 0.535 4.000 0.004 NA   NA
 941537 941538 TTHA0950 TTHA0951     TRUE 0.958 2.000 0.600 NA   NA
 941539 941540 TTHA0952 TTHA0953     FALSE 0.049 119.000 0.000 NA N NA
 941540 941541 TTHA0953 TTHA0954     FALSE 0.066 147.000 0.000 NA   NA
 941541 941542 TTHA0954 TTHA0955     TRUE 0.980 -3.000 0.088 0.001   NA
 941544 941545 TTHA0957 TTHA0958     TRUE 0.896 -3.000 0.132 1.000 N NA
 941545 941546 TTHA0958 TTHA0959     TRUE 0.988 -3.000 0.510 0.066 N NA
 941546 941547 TTHA0959 TTHA0960     TRUE 0.642 13.000 0.102 1.000 N NA
 941547 941548 TTHA0960 TTHA0961     TRUE 0.966 -3.000 0.100 0.049   NA
 941548 941549 TTHA0961 TTHA0962     TRUE 0.848 -12.000 0.062 1.000   NA
 941549 941550 TTHA0962 TTHA0963     FALSE 0.128 98.000 0.000 1.000   NA
 941550 941551 TTHA0963 TTHA0964     TRUE 0.825 -108.000 0.000 0.021   NA
 941551 941552 TTHA0964 TTHA0965     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941552 941553 TTHA0965 TTHA0966     FALSE 0.499 -55.000 0.013 NA N NA
 941553 941554 TTHA0966 TTHA0967     TRUE 0.697 3.000 0.030 NA   NA
 941555 941556 TTHA0968 TTHA0969     TRUE 0.537 15.000 0.018 NA   NA
 941556 941557 TTHA0969 TTHA0970     TRUE 0.967 -63.000 0.919 NA   NA
 941557 941558 TTHA0970 TTHA0971     TRUE 0.988 -7.000 0.943 NA   NA
 941558 941559 TTHA0971 TTHA0972     TRUE 0.962 10.000 0.920 NA   NA
 941559 941560 TTHA0972 TTHA0973     TRUE 0.826 -13.000 0.047 1.000   NA
 941560 941561 TTHA0973 TTHA0974     FALSE 0.069 106.000 0.000 1.000 N NA
 941561 941562 TTHA0974 TTHA0975     FALSE 0.186 52.000 0.000 1.000 N NA
 941562 941563 TTHA0975 TTHA0976     TRUE 0.970 10.000 0.105 0.050 Y NA
 941563 941564 TTHA0976 TTHA0977     TRUE 0.999 -3.000 0.897 0.050 Y NA
 941564 941565 TTHA0977 TTHA0978     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 941565 941566 TTHA0978 TTHA0979     FALSE 0.421 13.000 0.000 1.000   NA
 941566 941567 TTHA0979 TTHA0980     FALSE 0.502 101.000 0.000 1.000 Y NA
 941569 941570 TTHA0982 TTHA0983     FALSE 0.092 88.000 0.000 1.000 N NA
 941570 941571 TTHA0983 TTHA0984     TRUE 0.994 0.000 0.210 0.003 Y NA
 941571 941572 TTHA0984 TTHA0985     TRUE 0.972 53.000 0.198 0.003 Y NA
 941573 941574 TTHA0986 TTHA0987     FALSE 0.056 112.000 0.000 NA N NA
 941576 941577 TTHA0989 TTHA0990     FALSE 0.135 88.000 0.000 NA   NA
 941577 941578 TTHA0990 TTHA0991     FALSE 0.439 -132.000 0.000 NA   NA
 941580 941581 TTHA0993 TTHA0994     FALSE 0.203 63.000 0.000 NA   NA
 941581 941582 TTHA0994 TTHA0995     TRUE 0.894 -3.000 0.091 NA   NA
 941585 941586 TTHA0998 TTHA0999     TRUE 0.829 -3.000 0.012 1.000   NA
 941586 941587 TTHA0999 TTHA1000     FALSE 0.266 48.000 0.000 NA   NA
 941587 941588 TTHA1000 TTHA1001     FALSE 0.141 84.000 0.000 NA   NA
 941589 941590 TTHA1002 TTHA1003     TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.064 Y NA
 941590 941591 TTHA1003 TTHA1004     FALSE 0.249 26.000 0.000 1.000 N NA
 941591 941592 TTHA1004 TTHA1005     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 941592 941593 TTHA1005 TTHA1006     TRUE 0.516 0.000 0.000 1.000 N NA
 941593 941594 TTHA1006 TTHA1007     TRUE 0.954 3.000 0.133 1.000 Y NA
 941594 941595 TTHA1007 TTHA1008     TRUE 0.986 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 941595 941596 TTHA1008 TTHA1009     FALSE 0.049 218.000 0.000 1.000   NA
 941596 941597 TTHA1009 TTHA1010     FALSE 0.467 -133.000 0.000 1.000   NA
 941597 941598 TTHA1010 TTHA1011     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941598 941599 TTHA1011 TTHA1012     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941600 941601 TTHA1013 TTHA1014     FALSE 0.253 54.000 0.000 NA   NA
 941601 941602 TTHA1014 TTHA1015     FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 941602 941603 TTHA1015 TTHA1016     FALSE 0.264 57.000 0.000 1.000   NA
 941603 941604 TTHA1016 TTHA1017     FALSE 0.176 160.000 0.000 0.059 N NA
 941604 941605 TTHA1017 TTHA1018     TRUE 0.634 24.000 0.000 0.059 N NA
 941605 941606 TTHA1018 TTHA1019     TRUE 0.703 -7.000 0.000 NA   NA
 941606 941607 TTHA1019 TTHA1020     FALSE 0.321 33.000 0.000 NA   NA
 941608 941609 TTHA1021 TTHA1022     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 941609 941610 TTHA1022 TTHA1023     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941610 941611 TTHA1023 TTHA1024     FALSE 0.027 1759.000 0.000 NA   NA
 941611 941612 TTHA1024 TTHA1025     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941612 941613 TTHA1025 TTHA1026     FALSE 0.214 61.000 0.000 NA   NA
 941613 941614 TTHA1026 TTHA1027     FALSE 0.284 121.000 0.000 0.059   NA
 941619 941620 TTHA1031 TTHA1032     TRUE 0.959 57.000 0.567 1.000 Y NA
 941620 941621 TTHA1032 TTHA1033     TRUE 0.994 0.000 0.672 1.000 Y NA
 941621 941622 TTHA1033 TTHA1034     TRUE 0.823 34.000 0.324 1.000   NA
 941622 941623 TTHA1034 TTHA1035     TRUE 0.778 59.000 0.385 1.000   NA
 941623 941624 TTHA1035 TTHA1036     TRUE 0.877 5.000 0.361 1.000 N NA
 941624 941625 TTHA1036 TTHA1037     FALSE 0.115 98.000 0.000 NA   NA
 941625 941626 TTHA1037 TTHA1038     TRUE 0.857 -3.000 0.032 NA   NA
 941626 941627 TTHA1038 TTHA1039     TRUE 0.981 11.000 0.092 0.001 Y NA
 941627 941628 TTHA1039 TTHA1040     FALSE 0.250 55.000 0.006 1.000 N NA
 941628 941629 TTHA1040 TTHA1041     TRUE 0.604 1.000 0.009 1.000 N NA
 941629 941630 TTHA1041 TTHA1042     TRUE 0.955 5.000 0.833 1.000 N NA
 941630 941631 TTHA1042 TTHA1043     TRUE 0.654 76.000 0.333 NA   NA
 941631 941632 TTHA1043 TTHA1044     TRUE 0.594 5.000 0.015 NA   NA
 941632 941633 TTHA1044 TTHA1045     TRUE 0.772 -45.000 0.123 NA   NA
 941633 941634 TTHA1045 TTHA1046     TRUE 0.947 -22.000 0.457 NA   NA
 941634 941635 TTHA1046 TTHA1047     FALSE 0.492 -36.000 0.000 NA   NA
 941635 941636 TTHA1047 TTHA1048     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941636 941637 TTHA1048 TTHA1049     TRUE 0.917 3.000 0.367 NA   NA
 941638 941639 TTHA1050 TTHA1051     FALSE 0.094 116.000 0.000 NA   NA
 941639 941640 TTHA1051 TTHA1052     TRUE 0.979 -22.000 1.000 NA   NA
 941640 941641 TTHA1052 TTHA1053     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941641 941642 TTHA1053 TTHA1054     TRUE 0.613 2.000 0.003 1.000   NA
 941644 941645 TTHA1056 TTHA1057     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941645 941646 TTHA1057 TTHA1058     TRUE 0.639 3.000 0.013 NA   NA
 941647 941648 TTHA1059 TTHA1060     FALSE 0.017 458.000 0.000 NA N NA
 941648 941649 TTHA1060 TTHA1061     FALSE 0.076 89.000 0.000 NA N NA
 941649 941650 TTHA1061 TTHA1062     TRUE 0.845 68.000 0.182 NA Y NA
 941650 941651 TTHA1062 TTHA1063     TRUE 0.946 0.000 0.012 1.000 Y NA
 941651 941652 TTHA1063 TTHA1064     TRUE 0.988 1.000 0.456 1.000 Y NA
 941652 941653 TTHA1064 TTHA1065     FALSE 0.029 216.000 0.000 1.000 N NA
 941653 941654 TTHA1065 TTHA1066     TRUE 0.786 -3.000 0.016 1.000 N NA
 941655 941656 TTHA1067 TTHA1068     FALSE 0.084 93.000 0.000 1.000 N NA
 941656 941657 TTHA1068 TTHA1069     FALSE 0.255 24.000 0.000 1.000 N NA
 941657 941658 TTHA1069 TTHA1070     TRUE 0.906 2.000 0.000 1.000 Y NA
 941659 941660 TTHA1071 TTHA1072     TRUE 0.684 -19.000 0.005 1.000   NA
 941660 941661 TTHA1072 TTHA1073     TRUE 0.730 55.000 0.000 1.000 Y NA
 941661 941662 TTHA1073 TTHA1074     FALSE 0.139 86.000 0.000 NA   NA
 941663 941664 TTHA1075 TTHA1076     TRUE 0.982 -3.000 0.635 NA   NA
 941664 941665 TTHA1076 TTHA1077     TRUE 0.781 -3.000 0.005 NA   NA
 941665 941666 TTHA1077 TTHA1078     TRUE 0.988 -3.000 0.833 NA   NA
 941666 941667 TTHA1078 TTHA1079     TRUE 0.944 -16.000 0.013 1.000 Y NA
 941667 941668 TTHA1079 TTHA1080     TRUE 0.682 -24.000 0.013 NA   NA
 941668 941669 TTHA1080 TTHA1081     TRUE 0.747 -9.000 0.005 NA   NA
 941669 941670 TTHA1081 TTHA1082     TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.005 Y NA
 941670 941671 TTHA1082 TTHA1083     TRUE 0.890 -28.000 0.297 1.000 N NA
 941671 941672 TTHA1083 TTHA1084     FALSE 0.113 209.000 0.098 1.000 N NA
 941672 941673 TTHA1084 TTHA1085     TRUE 0.989 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 941673 941674 TTHA1085 TTHA1086     TRUE 0.993 -10.000 0.136 0.005 Y NA
 941674 941675 TTHA1086 TTHA1087     FALSE 0.392 13.000 0.000 NA   NA
 941675 941676 TTHA1087 TTHA1088     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941676 941677 TTHA1088 TTHA1089     TRUE 0.974 13.000 0.460 1.000 Y NA
 941677 941678 TTHA1089 TTHA1090     FALSE 0.344 14.000 0.003 1.000 N NA
 941681 941682 TTHA1093 TTHA1094     FALSE 0.361 19.000 0.000 NA   NA
 941682 941683 TTHA1094 TTHA1095     TRUE 0.998 -3.000 0.452 0.001 Y NA
 941686 941687 TTHA1098 TTHA1099     TRUE 0.776 59.000 0.385 1.000   NA
 941688 941689 TTHA1100 TTHA1101     TRUE 0.640 1.000 0.004 NA   NA
 941689 941690 TTHA1101 TTHA1102     TRUE 0.838 -3.000 0.020 NA   NA
 941690 941691 TTHA1102 TTHA1103     TRUE 0.597 43.000 0.120 NA   NA
 941693 941694 TTHA1105 TTHA1106     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 941695 941696 TTHA1107 TTHA1108     TRUE 0.922 -3.000 0.154 NA   NA
 941696 941697 TTHA1108 TTHA1109     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941697 941698 TTHA1109 TTHA1110     FALSE 0.427 -522.000 0.000 NA   NA
 941702 941703 TTHA1114 TTHA1115     TRUE 0.970 -3.000 0.029 NA Y NA
 941703 941704 TTHA1115 TTHA1116     TRUE 0.703 -7.000 0.000 NA   NA
 941707 941708 TTHA1119 TTHA1120     TRUE 0.797 -16.000 0.052 NA   NA
 941708 941709 TTHA1120 TTHA1121     TRUE 0.640 1.000 0.014 1.000 N NA
 941709 941710 TTHA1121 TTHA1122     TRUE 0.778 -16.000 0.032 NA   NA
 941710 941711 TTHA1122 TTHA1123     TRUE 0.709 11.000 0.106 NA   NA
 941711 941712 TTHA1123 TTHA1124     TRUE 0.993 -3.000 0.015 0.001 Y NA
 941712 941713 TTHA1124 TTHA1125     FALSE 0.296 95.000 0.120 1.000 N NA
 941713 941714 TTHA1125 TTHA1126     TRUE 0.768 -3.000 0.004 NA   NA
 941714 941715 TTHA1126 TTHA1127     TRUE 0.647 7.000 0.045 NA   NA
 941715 941716 TTHA1127 TTHA1128     TRUE 0.942 10.000 0.667 NA   NA
 941716 941717 TTHA1128 TTHA1129     FALSE 0.337 30.000 0.006 1.000 N NA
 941717 941718 TTHA1129 TTHA1130     TRUE 0.849 19.000 0.006 1.000 Y NA
 941719 941720 TTHA1131 TTHA1132     TRUE 0.939 7.000 0.643 NA   NA
 941720 941721 TTHA1132 TTHA1133     FALSE 0.060 185.000 0.000 1.000   NA
 941721 941722 TTHA1133 TTHA1134     TRUE 0.896 3.000 0.000 0.002   NA
 941722 941723 TTHA1134 TTHA1135     TRUE 0.965 4.000 0.222 0.002   NA
 941723 941724 TTHA1135 TTHA1136     TRUE 0.681 56.000 0.222 NA   NA
 941724 941725 TTHA1136 TTHA1137     TRUE 0.812 -3.000 0.011 NA   NA
 941725 941726 TTHA1137 TTHA1138     FALSE 0.153 69.000 0.003 1.000 N NA
 941726 941727 TTHA1138 TTHA1139     TRUE 0.920 62.000 0.335 1.000 Y NA
 941727 941728 TTHA1139 TTHA1140     FALSE 0.331 57.000 0.006 1.000   NA
 941729 941730 TTHA1141 TTHA1142     FALSE 0.238 32.000 0.000 1.000 N NA
 941730 941731 TTHA1142 TTHA1143     TRUE 0.968 -22.000 0.000 0.040 Y NA
 941732 941733 TTHA1144 TTHA1145     TRUE 0.948 12.000 0.417 0.048 N NA
 941733 941734 TTHA1145 TTHA1146     TRUE 0.993 4.000 0.407 0.015 Y NA
 941736 941737 TTHA1148 TTHA1149     TRUE 0.670 0.000 0.016 NA N NA
 941738 941739 TTHA1150 TTHA1151     FALSE 0.182 69.000 0.000 NA   NA
 941741 941742 TTHA1153 TTHA1154     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941742 941743 TTHA1154 TTHA1155     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941743 941744 TTHA1155 TTHA1156     FALSE 0.471 1.000 0.000 1.000 N NA
 941745 941746 TTHA1157 TTHA1158     FALSE 0.401 63.000 0.057 NA   NA
 941746 941747 TTHA1158 TTHA1159     TRUE 0.582 7.000 0.016 NA   NA
 941747 941748 TTHA1159 TTHA1160     TRUE 0.642 7.000 0.043 NA   NA
 941749 941750 TTHA1161 TTHA1162     FALSE 0.506 4.000 0.000 1.000   NA
 941750 941751 TTHA1162 TTHA1163     FALSE 0.208 62.000 0.000 NA   NA
 941752 941753 TTHA1164 TTHA1165     TRUE 0.877 5.000 0.003 1.000 Y NA
 941753 941754 TTHA1165 TTHA1166     TRUE 0.656 -12.000 0.000 NA   NA
 941754 941755 TTHA1166 TTHA1167     TRUE 0.940 -3.000 0.200 NA   NA
 941755 941756 TTHA1167 TTHA1168     TRUE 0.775 -28.000 0.083 NA   NA
 941757 941758 TTHA1169 TTHA1170     FALSE 0.178 55.000 0.000 1.000 N NA
 941758 941759 TTHA1170 TTHA1171     TRUE 0.925 66.000 0.152 0.056 Y NA
 941759 941760 TTHA1171 TTHA1172     FALSE 0.330 41.000 0.011 1.000 N NA
 941760 941761 TTHA1172 TTHA1173     FALSE 0.422 15.000 0.011 1.000 N NA
 941761 941762 TTHA1173 TTHA1174     TRUE 0.971 -31.000 0.000 0.003 Y NA
 941762 941763 TTHA1174 TTHA1175     FALSE 0.288 14.000 0.000 1.000 N NA
 941763 941764 TTHA1175 TTHA1176     FALSE 0.413 41.000 0.009 1.000   NA
 941764 941765 TTHA1176 TTHA1177     TRUE 0.613 5.000 0.019 NA   NA
 941765 941766 TTHA1177 TTHA1178     TRUE 0.527 8.000 0.008 NA   NA
 941766 941767 TTHA1178 TTHA1179     TRUE 0.786 -24.000 0.075 NA   NA
 941767 941768 TTHA1179 TTHA1180     TRUE 0.572 -37.000 0.016 1.000 N NA
 941768 941769 TTHA1180 TTHA1181     FALSE 0.265 62.000 0.003 1.000   NA
 941769 941770 TTHA1181 TTHA1182     TRUE 0.766 -13.000 0.012 1.000   NA
 941770 941771 TTHA1182 TTHA1183     FALSE 0.393 11.000 0.005 1.000 N NA
 941771 941772 TTHA1183 TTHA1184     TRUE 0.802 17.000 0.222 1.000   NA
 941772 941773 TTHA1184 TTHAt31   tRNA-Gln-2 FALSE 0.266 48.000 0.000 NA   NA
 941773 941774 TTHAt31 TTHA1185 tRNA-Gln-2   FALSE 0.029 469.000 0.000 NA   NA
 941775 941776 TTHA1186 TTHA1187     TRUE 0.748 -10.000 0.017 1.000 N NA
 941776 941777 TTHA1187 TTHA1188     TRUE 0.568 -24.000 0.011 NA N NA
 941777 941778 TTHA1188 TTHA1189     TRUE 0.716 -3.000 0.008 NA N NA
 941778 941779 TTHA1189 TTHA1190     TRUE 0.979 11.000 0.550 0.003   NA
 941779 941780 TTHA1190 TTHA1191     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 941780 941781 TTHA1191 TTHA1192     TRUE 0.577 5.000 0.009 1.000   NA
 941782 941783 TTHA1193 TTHA1194     TRUE 0.927 -3.000 0.167 NA   NA
 941783 941784 TTHA1194 TTHA1195     TRUE 0.749 20.000 0.182 NA   NA
 941784 941785 TTHA1195 TTHA1196     FALSE 0.118 97.000 0.000 NA   NA
 941785 941786 TTHA1196 TTHA1197     TRUE 0.997 -9.000 0.303 0.004 Y NA
 941786 941787 TTHA1197 TTHA1198     TRUE 0.572 3.000 0.003 1.000   NA
 941787 941788 TTHA1198 TTHA1199     TRUE 0.747 5.000 0.100 1.000   NA
 941788 941789 TTHA1199 TTHA1200     FALSE 0.438 44.000 0.021 NA   NA
 941789 941790 TTHA1200 TTHA1201     TRUE 0.703 -7.000 0.000 NA   NA
 941790 941791 TTHA1201 TTHA1202     TRUE 0.900 -10.000 0.130 1.000   NA
 941791 941792 TTHA1202 TTHA1203     FALSE 0.451 10.000 0.000 1.000   NA
 941792 941793 TTHA1203 TTHA1204     FALSE 0.325 73.000 0.036 NA   NA
 941794 941795 TTHA1205 TTHA1206     TRUE 0.869 57.000 0.648 NA   NA
 941795 941796 TTHA1206 TTHA1207     TRUE 0.606 8.000 0.023 NA   NA
 941797 941798 TTHA1208 TTHA1209     TRUE 0.740 -6.000 0.000 1.000   NA
 941798 941799 TTHA1209 TTHA1210     FALSE 0.411 26.000 0.003 1.000   NA
 941799 941800 TTHA1210 TTHA1211     TRUE 0.845 58.000 0.103 1.000 Y NA
 941800 941801 TTHA1211 TTHA1212     TRUE 0.992 -3.000 0.014 0.002 Y NA
 941801 941802 TTHA1212 TTHA1213     TRUE 0.994 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 941802 941803 TTHA1213 TTHA1214     FALSE 0.196 65.000 0.000 NA   NA
 941803 941804 TTHA1214 TTHA1215     FALSE 0.350 22.000 0.000 NA   NA
 941805 941806 TTHA1216 TTHA1217     TRUE 0.718 55.000 0.000 NA Y NA
 941806 941807 TTHA1217 TTHA1218     TRUE 0.638 -13.000 0.000 NA   NA
 941807 941808 TTHA1218 TTHA1219     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 941808 941809 TTHA1219 TTHA1220     FALSE 0.383 14.000 0.000 NA   NA
 941809 941810 TTHA1220 TTHA1221     FALSE 0.038 273.000 0.000 NA   NA
 941810 941811 TTHA1221 TTHA1222     FALSE 0.226 59.000 0.000 NA   NA
 941811 941812 TTHA1222 TTHA1223     FALSE 0.048 193.000 0.000 NA   NA
 941812 941813 TTHA1223 TTHA1224     FALSE 0.178 76.000 0.000 1.000   NA
 941814 941815 TTHA1225 TTHA1226     FALSE 0.361 19.000 0.000 NA   NA
 941815 941816 TTHA1226 TTHA1227     TRUE 0.809 -3.000 0.010 NA   NA
 941816 941817 TTHA1227 TTHAt32   tRNA-Leu-4 FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 941818 941819 TTHA1228 TTHA1229     TRUE 0.989 14.000 0.268 0.001 Y NA
 941819 941820 TTHA1229 TTHA1230     TRUE 0.993 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 941820 941821 TTHA1230 TTHA1231     TRUE 0.791 10.000 0.167 1.000   NA
 941821 941822 TTHA1231 TTHA1232     TRUE 0.993 -3.000 0.667 0.057   NA
 941822 941823 TTHA1232 TTHA1233     TRUE 0.965 -3.000 0.333 1.000   NA
 941823 941824 TTHA1233 TTHA1234     TRUE 0.912 -3.000 0.167 1.000 N NA
 941825 941826 TTHA1235 TTHA1236     TRUE 0.838 37.000 0.400 NA   NA
 941826 941827 TTHA1236 TTHA1237     TRUE 0.656 -12.000 0.000 NA   NA
 941827 941828 TTHA1237 TTHA1238     TRUE 0.987 -3.000 0.013 0.048 Y NA
 941828 941829 TTHA1238 TTHA1239     TRUE 0.988 -3.000 0.020 0.048 Y NA
 941829 941830 TTHA1239 TTHA1240     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.048 Y NA
 941830 941831 TTHA1240 TTHA1241     FALSE 0.361 12.000 0.003 1.000 N NA
 941831 941832 TTHA1241 TTHA1242     TRUE 0.886 12.000 0.022 NA Y NA
 941832 941833 TTHA1242 TTHA1243     TRUE 0.986 0.000 0.347 NA Y NA
 941833 941834 TTHA1243 TTHA1244     TRUE 0.727 -3.000 0.009 NA N NA
 941835 941836 TTHA1245 TTHA1246     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941836 941837 TTHA1246 TTHA1247     TRUE 0.587 9.000 0.017 NA   NA
 941839 941840 TTHA1249 TTHA1250     TRUE 0.993 -22.000 0.222 0.002 Y NA
 941841 941842 TTHA1251 TTHA1252     FALSE 0.107 141.000 0.006 1.000   NA
 941843 941844 TTHA1253 TTHA1254     TRUE 0.888 8.000 0.364 NA   NA
 941844 941845 TTHA1254 TTHA1255     TRUE 0.940 8.000 0.615 1.000   NA
 941847 941848 TTHA1257 TTHA1258     TRUE 0.548 6.000 0.010 NA   NA
 941848 941849 TTHA1258 TTHA1259     TRUE 0.927 -3.000 0.167 NA   NA
 941849 941850 TTHA1259 TTHA1260     FALSE 0.472 -27.000 0.002 1.000 N NA
 941851 941852 TTHA1261 TTHA1262     FALSE 0.140 89.000 0.007 1.000 N NA
 941852 941853 TTHA1262 TTHA1263     FALSE 0.474 21.000 0.007 1.000   NA
 941853 941854 TTHA1263 TTHA1264     TRUE 0.771 -10.000 0.007 1.000   NA
 941854 941855 TTHA1264 TTHA1265     TRUE 0.968 -7.000 0.057 0.006   NA
 941856 941857 TTHA1266 TTHA1267     TRUE 0.726 0.000 0.007 1.000   NA
 941860 941861 TTHA1270 TTHA1271     FALSE 0.123 93.000 0.000 NA   NA
 941861 941862 TTHA1271 TTHA1272     TRUE 0.972 11.000 0.052 0.004 Y NA
 941862 941863 TTHA1272 TTHA1273     TRUE 0.980 11.000 0.129 0.004 Y NA
 941863 941864 TTHA1273 TTHA1274     TRUE 0.977 13.000 0.118 0.004 Y NA
 941864 941865 TTHA1274 TTHA1275     TRUE 0.989 3.000 0.172 0.004 Y NA
 941865 941866 TTHA1275 TTHA1276     TRUE 0.991 4.000 0.258 0.004 Y NA
 941866 941867 TTHA1276 TTHA1277     TRUE 0.941 60.000 0.489 0.004   NA
 941867 941868 TTHA1277 TTHA1278     TRUE 0.986 15.000 0.848 0.004   NA
 941868 941869 TTHA1278 TTHA1279     TRUE 0.848 -3.000 0.025 NA   NA
 941870 941871 TTHA1280 TTHA1281     TRUE 0.573 10.000 0.015 NA   NA
 941871 941872 TTHA1281 TTHA1282     TRUE 0.988 -3.000 0.833 NA   NA
 941872 941873 TTHA1282 TTHA1283     FALSE 0.476 28.000 0.015 NA   NA
 941873 941874 TTHA1283 TTHA1284     TRUE 0.538 20.000 0.018 1.000   NA
 941874 941875 TTHA1284 TTHA1285     FALSE 0.486 59.000 0.076 1.000   NA
 941876 941877 TTHA1286 TTHA1287     TRUE 0.728 -7.000 0.000 1.000   NA
 941877 941878 TTHA1287 TTHA1288     FALSE 0.400 16.000 0.000 1.000   NA
 941878 941879 TTHA1288 TTHA1289     TRUE 0.998 -19.000 0.669 0.002 Y NA
 941879 941880 TTHA1289 TTHA1290     FALSE 0.485 -645.000 0.004 NA   NA
 941880 941881 TTHA1290 TTHA1291     TRUE 0.598 -934.000 0.021 NA   NA
 941883 941884 TTHA1293 TTHA1294     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 941884 941885 TTHA1294 TTHA1295     TRUE 0.713 -3.000 0.007 NA N NA
 941887 941888 TTHA1297 TTHA1298     FALSE 0.096 115.000 0.000 NA   NA
 941888 941889 TTHA1298 TTHA1299     FALSE 0.108 91.000 0.003 1.000 N NA
 941889 941890 TTHA1299 TTHA1300     TRUE 0.670 0.000 0.012 1.000 N NA
 941890 941891 TTHA1300 TTHA1301     FALSE 0.320 40.000 0.000 1.000   NA
 941891 941892 TTHA1301 TTHA1302     TRUE 0.747 3.000 0.059 1.000   NA
 941892 941893 TTHA1302 TTHA1303     TRUE 0.963 0.000 0.182 0.047   NA
 941893 941894 TTHA1303 TTHA1304     TRUE 0.980 -3.000 0.545 1.000   NA
 941894 941895 TTHA1304 TTHA1305     FALSE 0.337 26.000 0.000 NA   NA
 941895 941896 TTHA1305 TTHA1306     FALSE 0.486 10.000 0.004 NA   NA
 941896 941897 TTHA1306 TTHA1307     TRUE 0.571 4.000 0.007 NA   NA
 941897 941898 TTHA1307 TTHA1308     FALSE 0.452 11.000 0.003 NA   NA
 941901 941902 TTHA1311 TTHA1312     FALSE 0.423 11.000 0.011 NA N NA
 941902 941903 TTHA1312 TTHA1313     TRUE 0.719 -13.000 0.018 1.000 N NA
 941903 941904 TTHA1313 TTHA1314     TRUE 0.960 -15.000 0.059 1.000 Y NA
 941906 941907 TTHA1316 TTHA1317     FALSE 0.057 174.000 0.000 NA   NA
 941907 941908 TTHA1317 TTHA1318     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 941909 941910 TTHA1319 TTHA1320     TRUE 0.882 1.000 0.000 0.027   NA
 941910 941911 TTHA1320 TTHA1321     FALSE 0.314 47.000 0.012 1.000 N NA
 941913 941914 TTHA1323 TTHA1324     TRUE 0.988 -3.000 0.220 0.001   NA
 941915 941916 TTHA1325 TTHA1326     FALSE 0.435 87.000 0.000 0.047   NA
 941916 941917 TTHA1326 TTHA1327     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 941919 941920 TTHA1329 TTHA1330     FALSE 0.509 138.000 0.038 1.000 Y NA
 941920 941921 TTHA1330 TTHA1331     TRUE 0.618 75.000 0.000 1.000 Y NA
 941921 941922 TTHA1331 TTHA1332     TRUE 0.998 -3.000 0.508 0.047 Y NA
 941922 941923 TTHA1332 TTHA1333     TRUE 0.879 -3.000 0.065 NA   NA
 941923 941924 TTHA1333 TTHA1334     FALSE 0.429 -349.000 0.000 NA   NA
 941924 941925 TTHA1334 TTHA1335     TRUE 0.999 -3.000 0.773 0.020 Y NA
 941925 941926 TTHA1335 TTHA1336     TRUE 0.805 67.000 0.100 1.000 Y NA
 941926 941927 TTHA1336 TTHA1337     TRUE 0.953 61.000 0.222 0.047 Y NA
 941927 941928 TTHA1337 TTHA1338     TRUE 0.985 -7.000 0.333 0.047   NA
 941928 941929 TTHA1338 TTHA1339     FALSE 0.495 47.000 0.061 NA   NA
 941930 941931 TTHA1340 TTHA1341     TRUE 0.860 1.000 0.015 0.092 N NA
 941931 941932 TTHA1341 TTHA1342     TRUE 0.995 -3.000 0.118 0.002 Y NA
 941932 941933 TTHA1342 TTHA1343     FALSE 0.151 61.000 0.000 1.000 N NA
 941933 941934 TTHA1343 TTHA1344     FALSE 0.271 73.000 0.036 1.000 N NA
 941934 941935 TTHA1344 TTHA1345     FALSE 0.041 160.000 0.000 1.000 N NA
 941936 941937 TTHA1346 TTHA1347     TRUE 0.601 4.000 0.011 NA   NA
 941937 941938 TTHA1347 TTHA1348     FALSE 0.506 6.000 0.015 1.000 N NA
 941938 941939 TTHA1348 TTHA1349     FALSE 0.283 117.000 0.167 1.000 N NA
 941940 941941 TTHA1350 TTHA1351     TRUE 0.698 7.000 0.086 NA   NA
 941941 941942 TTHA1351 TTHA1352     TRUE 0.902 -3.000 0.143 1.000 N NA
 941943 941944 TTHA1353 TTHA1354     FALSE 0.194 37.000 0.000 NA N NA
 941944 941945 TTHA1354 TTHA1355     FALSE 0.124 76.000 0.002 1.000 N NA
 941945 941946 TTHA1355 TTHA1356     TRUE 0.572 0.000 0.003 1.000 N NA
 941946 941947 TTHA1356 TTHA1357     TRUE 0.779 -3.000 0.005 NA   NA
 941947 941948 TTHA1357 TTHA1358     TRUE 0.912 -3.000 0.125 NA   NA
 941948 941949 TTHA1358 TTHA1359     FALSE 0.502 77.000 0.182 NA   NA
 941949 941950 TTHA1359 TTHA1360     FALSE 0.450 22.000 0.008 NA   NA
 941950 941951 TTHA1360 TTHA1361     TRUE 0.526 10.000 0.008 NA   NA
 941951 941952 TTHA1361 TTHA1362     TRUE 0.970 -3.000 0.417 NA   NA
 941952 941953 TTHA1362 TTHA1363     TRUE 0.986 1.000 0.417 1.000 Y NA
 941955 941956 TTHA1365 TTHA1366     TRUE 0.985 -10.000 0.263 NA Y NA
 941956 941957 TTHA1366 TTHA1367     TRUE 0.984 -10.000 0.217 0.002   NA
 941958 941959 TTHA1368 TTHA1369     TRUE 0.988 -3.000 0.833 1.000   NA
 941960 941961 TTHA1370 TTHA1371     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 941963 941964 TTHA1373 TTHA1374     TRUE 0.567 0.000 0.003 1.000 N NA
 941966 941967 TTHAt33 TTHAt34 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 941967 941968 TTHAt34 TTHA1376 tRNA-Phe   FALSE 0.029 551.000 0.000 NA   NA
 941968 941969 TTHA1376 TTHA1377     TRUE 0.709 51.000 0.231 NA   NA
 941969 941970 TTHA1377 TTHA1378     FALSE 0.424 55.000 0.029 NA   NA
 941970 941971 TTHA1378 TTHA1379     FALSE 0.093 136.000 0.014 1.000 N NA
 941971 941972 TTHA1379 TTHA1380     TRUE 0.857 -7.000 0.050 NA   NA
 941972 941973 TTHA1380 TTHA1381     TRUE 0.963 -10.000 0.417 NA   NA
 941973 941974 TTHA1381 TTHA1382     TRUE 0.927 -3.000 0.167 NA   NA
 941974 941975 TTHA1382 TTHA1383     TRUE 0.969 -3.000 0.400 NA   NA
 941975 941976 TTHA1383 TTHA1384     FALSE 0.203 59.000 0.004 1.000 N NA
 941976 941977 TTHA1384 TTHA1385     TRUE 0.845 25.000 0.010 1.000 Y NA
 941977 941978 TTHA1385 TTHA1386     TRUE 0.933 -22.000 0.013 1.000 Y NA
 941981 941982 TTHA1389 TTHA1390     TRUE 0.819 -3.000 0.013 NA   NA
 941985 941986 TTHA1393 TTHA1394     FALSE 0.236 35.000 0.003 NA N NA
 941986 941987 TTHA1394 TTHA1395     TRUE 0.713 -15.000 0.008 NA   NA
 941988 941989 TTHA1396 TTHA1397     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 941989 941990 TTHA1397 TTHA1398     FALSE 0.249 61.000 0.003 NA   NA
 941992 941993 TTHA1400 TTHA1401     TRUE 0.943 3.000 0.231 0.046 N NA
 941993 941994 TTHA1401 TTHA1402     TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA Y NA
 941994 941995 TTHA1402 TTHA1403     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA Y NA
 941995 941996 TTHA1403 TTHA1404     TRUE 0.978 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 941996 941997 TTHA1404 TTHA1405     TRUE 0.994 -3.000 0.086 0.003 Y NA
 941997 941998 TTHA1405 TTHA1406     TRUE 0.893 92.000 0.067 0.003 Y NA
 941998 941999 TTHA1406 TTHA1407     TRUE 0.987 62.000 0.501 0.001 Y NA
 941999 942000 TTHA1407 TTHA1408     TRUE 0.982 -3.000 0.196 0.003 N NA
 942000 942001 TTHA1408 TTHA1409     TRUE 0.832 41.000 0.075 0.003 N NA
 942001 942002 TTHA1409 TTHA1410     TRUE 0.721 10.000 0.095 1.000   NA
 942002 942003 TTHA1410 TTHA1411     TRUE 0.974 -7.000 0.176 0.046   NA
 942003 942004 TTHA1411 TTHA1412     TRUE 0.803 71.000 0.600 NA   NA
 942004 942005 TTHA1412 TTHA1413     TRUE 0.627 16.000 0.068 NA   NA
 942005 942006 TTHA1413 TTHA1414     TRUE 0.882 -3.000 0.068 NA   NA
 942006 942007 TTHA1414 TTHA1415     TRUE 0.942 3.000 0.500 NA   NA
 942007 942008 TTHA1415 TTHA1416     TRUE 0.980 4.000 0.500 0.009   NA
 942008 942009 TTHA1416 TTHA1417     TRUE 0.917 -3.000 0.125 1.000   NA
 942009 942010 TTHA1417 TTHA1418     TRUE 0.917 -3.000 0.125 1.000   NA
 942010 942011 TTHA1418 TTHA1419     TRUE 0.982 10.000 0.667 0.009   NA
 942011 942012 TTHA1419 TTHA1420     TRUE 0.587 70.000 0.222 NA   NA
 942012 942013 TTHA1420 TTHA1421     TRUE 0.946 13.000 0.778 NA   NA
 942013 942014 TTHA1421 TTHA1422     TRUE 0.951 -13.000 0.375 NA   NA
 942015 942016 TTHA1423 TTHA1424     TRUE 0.638 10.000 0.029 1.000   NA
 942016 942017 TTHA1424 TTHA1425     TRUE 0.924 -3.000 0.016 0.090 N NA
 942018 942019 TTHA1426 TTHA1427     TRUE 0.779 -3.000 0.005 NA   NA
 942020 942021 TTHA1428 TTHA1429     TRUE 0.924 -3.000 0.143 1.000   NA
 942021 942022 TTHA1429 TTHA1430     FALSE 0.183 75.000 0.000 1.000   NA
 942022 942023 TTHA1430 TTHA1431     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 942023 942024 TTHA1431 TTHA1432     FALSE 0.178 70.000 0.000 NA   NA
 942025 942026 TTHA1433 TTHA1434     TRUE 0.571 44.000 0.102 NA   NA
 942026 942027 TTHA1434 TTHA1435     TRUE 0.893 4.000 0.368 1.000 N NA
 942027 942028 TTHA1435 TTHA1436     TRUE 0.796 13.000 0.250 1.000 N NA
 942029 942030 TTHA1437 TTHA1438     TRUE 0.674 10.000 0.105 1.000 N NA
 942033 942034 TTHA1441 TTHA1442     TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 942035 942036 TTHA1443 TTHA1444     TRUE 0.767 -3.000 0.002 1.000   NA
 942036 942037 TTHA1444 TTHA1445     TRUE 0.993 5.000 0.430 0.004 Y NA
 942037 942038 TTHA1445 TTHA1446     TRUE 0.659 -10.000 0.005 1.000 N NA
 942038 942039 TTHA1446 TTHA1447     FALSE 0.050 134.000 0.000 1.000 N NA
 942039 942040 TTHA1447 TTHA1448     TRUE 0.812 -3.000 0.026 1.000 N NA
 942040 942041 TTHA1448 TTHA1449     FALSE 0.057 110.000 0.000 NA N NA
 942041 942042 TTHA1449 TTHA1450     TRUE 0.712 -18.000 0.040 NA N NA
 942042 942043 TTHA1450 TTHA1451     TRUE 0.920 -13.000 0.222 NA   NA
 942043 942044 TTHA1451 TTHA1452     FALSE 0.185 116.000 0.027 NA   NA
 942045 942046 TTHA1453 TTHA1454     TRUE 0.996 10.000 0.604 0.002 Y NA
 942046 942047 TTHA1454 TTHA1455     TRUE 0.998 2.000 0.705 0.002 Y NA
 942047 942048 TTHA1455 TTHA1456     TRUE 0.990 -10.000 0.010 0.001 Y NA
 942049 942050 TTHA1457 TTHA1458     FALSE 0.212 88.000 0.013 NA   NA
 942050 942051 TTHA1458 TTHA1459     TRUE 0.965 2.000 0.673 NA   NA
 942051 942052 TTHA1459 TTHA1460     TRUE 0.986 -10.000 0.925 NA   NA
 942053 942054 TTHA1461 TTHA1462     TRUE 0.827 -12.000 0.034 1.000   NA
 942056 942057 TTHA1464 TTHA1465     TRUE 0.996 3.000 0.601 0.020 Y NA
 942059 942060 TTHA1467 TTHAt35   tRNA-Lys-2 FALSE 0.270 46.000 0.000 NA   NA
 942061 942062 TTHA1468 TTHA1469     FALSE 0.169 178.000 0.088 1.000   NA
 942065 942066 TTHA1472 TTHA1473     TRUE 0.965 0.000 0.500 1.000   NA
 942066 942067 TTHA1473 TTHA1474     TRUE 0.919 11.000 0.500 1.000   NA
 942067 942068 TTHA1474 TTHA1475     TRUE 0.827 -3.000 0.015 NA   NA
 942068 942069 TTHA1475 TTHA1476     FALSE 0.407 19.000 0.015 NA N NA
 942069 942070 TTHA1476 TTHA1477     TRUE 0.977 0.000 0.188 1.000 Y NA
 942070 942071 TTHA1477 TTHA1478     TRUE 0.888 -3.000 0.067 1.000   NA
 942071 942072 TTHA1478 TTHA1479     TRUE 0.742 -37.000 0.067 1.000   NA
 942072 942073 TTHA1479 TTHA1480     FALSE 0.474 68.000 0.125 NA   NA
 942073 942074 TTHA1480 TTHA1481     TRUE 0.883 4.000 0.286 NA   NA
 942074 942075 TTHA1481 TTHA1482     FALSE 0.223 63.000 0.000 1.000   NA
 942075 942076 TTHA1482 TTHA1483     FALSE 0.139 86.000 0.000 NA   NA
 942076 942077 TTHA1483 TTHA1484     TRUE 0.727 13.000 0.133 NA   NA
 942077 942078 TTHA1484 TTHA1485     TRUE 0.780 16.000 0.200 NA   NA
 942078 942079 TTHA1485 TTHA1486     TRUE 0.927 -3.000 0.167 NA   NA
 942079 942080 TTHA1486 TTHA1487     FALSE 0.484 10.000 0.003 1.000   NA
 942080 942081 TTHA1487 TTHA1488     FALSE 0.248 59.000 0.000 1.000   NA
 942081 942082 TTHA1488 TTHA1489     TRUE 0.666 -13.000 0.000 1.000   NA
 942082 942083 TTHA1489 TTHA1490     TRUE 0.981 4.000 0.083 0.006 Y NA
 942083 942084 TTHA1490 TTHA1491     TRUE 0.971 56.000 0.229 0.006 Y NA
 942087 942088 TTHA1494 TTHA1495     TRUE 0.887 -6.000 0.087 NA   NA
 942089 942090 TTHA1496 TTHA1497     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 942091 942092 TTHA1498 TTHA1499     TRUE 0.703 1.000 0.009 1.000   NA
 942092 942093 TTHA1499 TTHA1500     TRUE 0.976 -3.000 0.200 0.090   NA
 942093 942094 TTHA1500 TTHA1501     FALSE 0.456 9.000 0.000 1.000   NA
 942094 942095 TTHA1501 TTHA1502     FALSE 0.368 25.000 0.000 1.000   NA
 942095 942096 TTHA1502 TTHA1503     TRUE 0.985 22.000 0.423 0.060 Y NA
 942097 942098 TTHA1504 TTHA1505     FALSE 0.186 68.000 0.000 NA   NA
 942098 942099 TTHA1505 TTHA1506     TRUE 0.911 -3.000 0.112 1.000   NA
 942099 942100 TTHA1506 TTHA1507     TRUE 0.938 43.000 0.006 0.003 Y NA
 942100 942101 TTHA1507 TTHA1508     TRUE 0.654 -28.000 0.008 1.000   NA
 942101 942102 TTHA1508 TTHA1509     TRUE 0.974 -3.000 0.455 1.000   NA
 942103 942104 TTHA1510 TTHA1511     TRUE 0.888 0.000 0.167 NA   NA
 942108 942109 TTHA1515 TTHA1516     TRUE 0.975 12.000 0.460 1.000 Y NA
 942109 942110 TTHA1516 TTHA1517     TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 942110 942111 TTHA1517 TTHA1518     TRUE 0.810 -3.000 0.007 1.000   NA
 942111 942112 TTHA1518 TTHA1519     TRUE 0.716 0.000 0.006 1.000   NA
 942112 942113 TTHA1519 TTHA1520     TRUE 0.986 -7.000 0.223 1.000 Y NA
 942114 942115 TTHA1521 TTHA1522     FALSE 0.174 77.000 0.000 1.000   NA
 942115 942116 TTHA1522 TTHA1523     TRUE 0.586 -19.000 0.000 NA   NA
 942117 942118 TTHA1524 TTHA1525     FALSE 0.252 25.000 0.000 1.000 N NA
 942118 942119 TTHA1525 TTHA1526     FALSE 0.303 12.000 0.000 1.000 N NA
 942120 942121 TTHA1527 TTHA1528     FALSE 0.208 62.000 0.000 NA   NA
 942121 942122 TTHA1528 TTHA1529     TRUE 0.625 17.000 0.069 NA   NA
 942124 942125 TTHA1531 TTHA1532     FALSE 0.483 15.000 0.006 1.000   NA
 942126 942127 TTHA1533 TTHA1534     FALSE 0.378 60.000 0.026 NA   NA
 942131 942132 TTHA1538 TTHAt36   tRNA-Met-1 FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 942132 942133 TTHAt36 TTHA1539 tRNA-Met-1   FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 942135 942136 TTHA1541 TTHA1542     FALSE 0.027 1596.000 0.000 NA   NA
 942136 942137 TTHA1542 TTHAt37   tRNA-Ser-1 TRUE 0.573 -21.000 0.000 NA   NA
 942138 942139 TTHA1543 TTHA1544     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942139 942140 TTHA1544 TTHA1545     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942144 942145 TTHA1549 TTHA1550     TRUE 0.968 13.000 0.385 1.000 Y NA
 942145 942146 TTHA1550 TTHA1551     TRUE 0.768 -3.000 0.013 1.000 N NA
 942147 942148 TTHA1552 TTHA1553     TRUE 0.762 -3.000 0.002 1.000   NA
 942148 942149 TTHA1553 TTHA1554     TRUE 0.550 25.000 0.039 NA   NA
 942149 942150 TTHA1554 TTHA1555     TRUE 0.761 0.000 0.018 NA   NA
 942150 942151 TTHA1555 TTHA1556     TRUE 0.589 -3.000 0.000 NA N NA
 942151 942152 TTHA1556 TTHA1557     FALSE 0.382 19.000 0.008 1.000 N NA
 942153 942154 TTHA1558 TTHA1559     TRUE 0.634 2.000 0.024 NA N NA
 942154 942155 TTHA1559 TTHA1560     FALSE 0.450 10.000 0.009 1.000 N NA
 942155 942156 TTHA1560 TTHA1561     TRUE 0.820 7.000 0.192 1.000   NA
 942156 942157 TTHA1561 TTHA1562     TRUE 0.956 -19.000 0.471 1.000   NA
 942159 942160 TTHA1564 TTHA1565     TRUE 0.668 5.000 0.087 1.000 N NA
 942160 942161 TTHA1565 TTHA1566     FALSE 0.158 129.000 0.028 NA   NA
 942161 942162 TTHA1566 TTHA1567     TRUE 0.674 11.000 0.077 NA   NA
 942162 942163 TTHA1567 TTHA1568     TRUE 0.597 10.000 0.021 NA   NA
 942163 942164 TTHA1568 TTHA1569     FALSE 0.426 7.000 0.000 NA   NA
 942164 942165 TTHA1569 TTHA1570     FALSE 0.273 55.000 0.000 1.000   NA
 942165 942166 TTHA1570 TTHA1571     FALSE 0.396 48.000 0.015 NA   NA
 942166 942167 TTHA1571 TTHA1572     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 942167 942168 TTHA1572 TTHA1573     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942168 942169 TTHA1573 TTHA1574     FALSE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 942169 942170 TTHA1574 TTHA1575     TRUE 0.851 -25.000 0.196 1.000 N NA
 942170 942171 TTHA1575 TTHA1576     TRUE 0.628 10.000 0.074 1.000 N NA
 942171 942172 TTHA1576 TTHA1577     TRUE 0.985 10.000 0.147 0.001 Y NA
 942172 942173 TTHA1577 TTHA1578     FALSE 0.249 26.000 0.000 1.000 N NA
 942173 942174 TTHA1578 TTHA1579     TRUE 0.683 16.000 0.154 1.000 N NA
 942174 942175 TTHA1579 TTHA1580     TRUE 0.978 -3.000 0.625 1.000 N NA
 942175 942176 TTHA1580 TTHA1581     FALSE 0.290 48.000 0.000 1.000   NA
 942177 942178 TTHA1582 TTHA1583     TRUE 0.730 2.000 0.023 1.000   NA
 942178 942179 TTHA1583 TTHA1584     TRUE 0.697 -40.000 0.045 NA   NA
 942182 942183 TTHA1587 TTHA1588     FALSE 0.371 10.000 0.003 1.000 N NA
 942183 942184 TTHA1588 TTHA1589     TRUE 0.990 16.000 0.496 0.030 Y NA
 942184 942185 TTHA1589 TTHA1590     FALSE 0.085 120.000 0.000 NA   NA
 942185 942186 TTHA1590 TTHA1591     TRUE 0.921 8.000 0.500 NA   NA
 942186 942187 TTHA1591 TTHA1592     TRUE 0.857 26.000 0.400 NA   NA
 942187 942188 TTHA1592 TTHA1593     TRUE 0.987 -31.000 0.571 1.000 Y NA
 942188 942189 TTHA1593 TTHA1594     TRUE 0.982 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 942189 942190 TTHA1594 TTHA1595     TRUE 0.973 0.000 0.161 1.000 Y NA
 942191 942192 TTHA1596 TTHA1597     FALSE 0.281 43.000 0.000 NA   NA
 942194 942195 TTHA1599 TTHA1600     TRUE 0.964 1.000 0.604 NA   NA
 942195 942196 TTHA1600 TTHA1601     TRUE 0.597 3.000 0.006 NA   NA
 942196 942197 TTHA1601 TTHA1602     TRUE 0.945 -12.000 0.310 NA   NA
 942197 942198 TTHA1602 TTHA1603     TRUE 0.946 -15.000 0.364 NA   NA
 942198 942199 TTHA1603 TTHA1604     TRUE 0.860 -3.000 0.036 NA   NA
 942201 942202 TTHA1606 TTHA1607     TRUE 0.698 1.000 0.012 NA   NA
 942202 942203 TTHA1607 TTHA1608     FALSE 0.478 8.000 0.003 NA   NA
 942203 942204 TTHA1608 TTHA1609     TRUE 0.635 2.000 0.007 NA   NA
 942206 942207 TTHA1611 TTHA1612     FALSE 0.503 6.000 0.003 1.000   NA
 942208 942209 TTHA1613 TTHA1614     TRUE 0.995 10.000 0.538 0.001 Y NA
 942210 942211 TTHA1615 TTHA1616     FALSE 0.399 32.000 0.005 NA   NA
 942212 942213 TTHA1617 TTHA1618     TRUE 0.899 2.000 0.051 0.033 N NA
 942214 942215 TTHA1619 TTHA1620     FALSE 0.441 20.000 0.004 1.000   NA
 942217 942218 TTHA1622 TTHA1623     TRUE 0.878 -3.000 0.052 1.000   NA
 942218 942219 TTHA1623 TTHA1624     TRUE 0.798 -12.000 0.022 NA   NA
 942220 942221 TTHA1625 TTHA1626     FALSE 0.161 76.000 0.000 NA   NA
 942222 942223 TTHA1627 TTHA1628     FALSE 0.250 68.000 0.004 1.000   NA
 942223 942224 TTHA1628 TTHA1629     TRUE 0.986 45.000 0.583 0.045 Y NA
 942224 942225 TTHA1629 TTHA1630     TRUE 0.917 -21.000 0.083 0.045 N NA
 942225 942226 TTHA1630 TTHA1631     FALSE 0.455 5.000 0.006 1.000 N NA
 942227 942228 TTHA1632 TTHA1633     TRUE 0.972 10.000 0.538 0.045   NA
 942228 942229 TTHA1633 TTHA1634     TRUE 0.981 75.000 0.750 0.045 Y NA
 942229 942230 TTHA1634 TTHA1635     FALSE 0.074 181.000 0.005 NA   NA
 942231 942232 TTHA1636 TTHA1637     TRUE 0.883 27.000 0.065 1.000 Y NA
 942232 942233 TTHA1637 TTHA1638     TRUE 0.866 -3.000 0.045 NA   NA
 942233 942234 TTHA1638 TTHA1639     TRUE 0.586 11.000 0.022 NA   NA
 942234 942235 TTHA1639 TTHA1640     TRUE 0.595 3.000 0.006 NA   NA
 942235 942236 TTHA1640 TTHA1641     FALSE 0.172 57.000 0.000 1.000 N NA
 942238 942239 TTHA1643 TTHA1644     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 942240 942241 TTHA1645 TTHA1646     FALSE 0.446 23.000 0.005 1.000   NA
 942241 942242 TTHA1646 TTHA1647     TRUE 0.865 -3.000 0.031 1.000   NA
 942242 942243 TTHA1647 TTHA1648     FALSE 0.253 54.000 0.000 NA   NA
 942243 942244 TTHA1648 TTHA1649     TRUE 0.765 40.000 0.267 NA   NA
 942244 942245 TTHA1649 TTHA1650     FALSE 0.475 5.000 0.000 1.000   NA
 942245 942246 TTHA1650 TTHA1651     TRUE 0.986 1.000 0.136 0.045 Y NA
 942246 942247 TTHA1651 TTHA1652     TRUE 0.918 60.000 0.318 1.000 Y NA
 942247 942248 TTHA1652 TTHA1653     FALSE 0.255 100.000 0.062 NA   NA
 942248 942249 TTHA1653 TTHA1654     TRUE 0.767 -3.000 0.004 NA   NA
 942249 942250 TTHA1654 TTHA1655     FALSE 0.372 4.000 0.000 1.000 N NA
 942250 942251 TTHA1655 TTHA1656     FALSE 0.367 17.000 0.000 NA   NA
 942251 942252 TTHA1656 TTHA1657     FALSE 0.392 13.000 0.000 NA   NA
 942252 942253 TTHA1657 TTHA1658     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942253 942254 TTHA1658 TTHA1659     TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 942258 942259 TTHA1663 TTHA1664     TRUE 0.958 5.000 0.873 1.000 N NA
 942259 942260 TTHA1664 TTHA1665     TRUE 0.893 19.000 0.549 1.000 N NA
 942260 942261 TTHA1665 TTHA1666     TRUE 0.992 13.000 0.509 0.026 Y NA
 942261 942262 TTHA1666 TTHA1667     TRUE 0.993 37.000 0.810 0.019 Y NA
 942262 942263 TTHA1667 TTHA1668     TRUE 0.932 12.000 0.194 0.019   NA
 942263 942264 TTHA1668 TTHA1669     TRUE 0.853 10.000 0.257 1.000   NA
 942264 942265 TTHA1669 TTHA1670     TRUE 0.879 9.000 0.006 1.000 Y NA
 942265 942266 TTHA1670 TTHA1671     TRUE 0.961 0.000 0.556 1.000 N NA
 942266 942267 TTHA1671 TTHA1672     FALSE 0.491 4.000 0.007 1.000 N NA
 942267 942268 TTHA1672 TTHA1673     TRUE 0.962 2.000 0.730 1.000 N NA
 942268 942269 TTHA1673 TTHA1674     TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.003 Y NA
 942269 942270 TTHA1674 TTHA1675     TRUE 0.998 -19.000 0.789 0.026 Y NA
 942270 942271 TTHA1675 TTHA1676     TRUE 0.995 13.000 0.814 0.026 Y NA
 942271 942272 TTHA1676 TTHA1677     TRUE 0.996 12.000 0.815 0.019 Y NA
 942272 942273 TTHA1677 TTHA1678     TRUE 0.998 0.000 0.808 0.019 Y NA
 942273 942274 TTHA1678 TTHA1679     TRUE 0.975 70.000 0.473 0.019 Y NA
 942274 942275 TTHA1679 TTHA1680     TRUE 0.993 8.000 0.496 0.019 Y NA
 942275 942276 TTHA1680 TTHA1681     TRUE 0.996 4.000 0.758 0.019 Y NA
 942276 942277 TTHA1681 TTHA1682     TRUE 0.998 0.000 0.810 0.026 Y NA
 942277 942278 TTHA1682 TTHA1683     TRUE 0.999 -3.000 0.791 0.026 Y NA
 942278 942279 TTHA1683 TTHA1684     TRUE 0.996 -7.000 0.828 0.019   NA
 942279 942280 TTHA1684 TTHA1685     TRUE 0.994 -13.000 0.802 0.019   NA
 942280 942281 TTHA1685 TTHA1686     TRUE 0.997 4.000 0.828 0.026 Y NA
 942281 942282 TTHA1686 TTHA1687     TRUE 0.998 -10.000 0.719 0.026 Y NA
 942282 942283 TTHA1687 TTHA1688     TRUE 0.997 3.000 0.769 0.026 Y NA
 942283 942284 TTHA1688 TTHA1689     TRUE 0.996 9.000 0.820 0.026 Y NA
 942284 942285 TTHA1689 TTHA1690     TRUE 0.992 52.000 0.849 0.020 Y NA
 942285 942286 TTHA1690 TTHA1691   rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.019 Y NA
 942286 942287 TTHA1691 TTHA1692 rplD   TRUE 0.989 12.000 0.361 0.019 Y NA
 942287 942288 TTHA1692 TTHA1693     TRUE 0.998 -3.000 0.467 0.026 Y NA
 942288 942289 TTHA1693 TTHA1694     TRUE 0.968 9.000 0.318 1.000 Y NA
 942289 942290 TTHA1694 TTHA1695     TRUE 0.984 58.000 0.400 0.002 Y NA
 942290 942291 TTHA1695 TTHA1696     TRUE 0.987 3.000 0.579 1.000 Y NA
 942291 942292 TTHA1696 TTHA1697     TRUE 0.995 8.000 0.620 0.004 Y NA
 942293 942294 TTHA1698 TTHA1699     TRUE 0.817 -3.000 0.013 NA   NA
 942294 942295 TTHA1699 TTHA1700     TRUE 0.612 3.000 0.008 NA   NA
 942295 942296 TTHA1700 TTHA1701     TRUE 0.782 12.000 0.182 NA   NA
 942296 942297 TTHA1701 TTHA1702     TRUE 0.942 3.000 0.500 NA   NA
 942298 942299 TTHA1703 TTHA1704     TRUE 0.910 4.000 0.385 NA   NA
 942300 942301 TTHA1705 TTHA1706     TRUE 0.667 13.000 0.069 1.000   NA
 942302 942303 TTHA1707 TTHAt38   tRNA-Ser-3 FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 942303 942304 TTHAt38 TTHAt39 tRNA-Ser-3 tRNA-Ser-2 FALSE 0.425 8.000 0.000 NA   NA
 942304 942305 TTHAt39 TTHA1708 tRNA-Ser-2   FALSE 0.350 22.000 0.000 NA   NA
 942305 942306 TTHA1708 TTHA1709     TRUE 0.606 -16.000 0.000 NA   NA
 942307 942308 TTHA1710 TTHA1711     TRUE 0.707 -12.000 0.002 1.000   NA
 942312 942313 TTHA1715 TTHA1716     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942313 942314 TTHA1716 TTHA1717     FALSE 0.356 20.000 0.000 NA   NA
 942314 942315 TTHA1717 TTHA1718     FALSE 0.023 306.000 0.000 1.000 N NA
 942315 942316 TTHA1718 TTHA1719     TRUE 0.685 3.000 0.024 NA   NA
 942316 942317 TTHA1719 TTHA1720     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 942317 942318 TTHA1720 TTHA1721     FALSE 0.361 19.000 0.000 NA   NA
 942318 942319 TTHA1721 TTHA1722     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942319 942320 TTHA1722 TTHA1723     TRUE 0.992 -16.000 0.600 1.000 Y NA
 942320 942321 TTHA1723 TTHA1724     TRUE 0.690 11.000 0.094 NA   NA
 942321 942322 TTHA1724 TTHA1725     TRUE 0.675 -10.000 0.000 NA   NA
 942322 942323 TTHA1725 TTHA1726     FALSE 0.476 4.000 0.000 NA   NA
 942323 942324 TTHA1726 TTHA1727     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 942324 942325 TTHA1727 TTHA1728     FALSE 0.456 9.000 0.000 1.000   NA
 942327 942328 TTHA1730 TTHA1731     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942328 942329 TTHA1731 TTHA1732     FALSE 0.347 23.000 0.000 NA   NA
 942329 942330 TTHA1732 TTHA1733     TRUE 0.561 80.000 0.250 NA   NA
 942330 942331 TTHA1733 TTHA1734     FALSE 0.311 36.000 0.000 NA   NA
 942331 942332 TTHA1734 TTHA1735     FALSE 0.259 52.000 0.000 NA   NA
 942332 942333 TTHA1735 TTHA1736     TRUE 0.814 8.000 0.249 1.000 N NA
 942333 942334 TTHA1736 TTHA1737     TRUE 0.791 -3.000 0.006 NA   NA
 942334 942335 TTHA1737 TTHA1738     TRUE 0.837 -3.000 0.019 NA   NA
 942336 942337 TTHA1739 TTHA1740     FALSE 0.254 114.000 0.074 1.000   NA
 942337 942338 TTHA1740 TTHA1741     TRUE 0.936 -3.000 0.185 NA   NA
 942338 942339 TTHA1741 TTHA1742     TRUE 0.706 2.000 0.021 NA   NA
 942339 942340 TTHA1742 TTHA1743     TRUE 0.886 6.000 0.009 1.000 Y NA
 942340 942341 TTHA1743 TTHAr06   16Sb FALSE 0.037 278.000 0.000 NA   NA
 942342 942343 TTHA1744 TTHA1745     TRUE 0.823 -9.000 0.024 NA   NA
 942344 942345 TTHA1746 TTHA1747     TRUE 0.609 3.000 0.005 1.000   NA
 942345 942346 TTHA1747 TTHA1748     FALSE 0.324 64.000 0.014 1.000   NA
 942346 942347 TTHA1748 TTHA1749     FALSE 0.242 41.000 0.003 1.000 N NA
 942347 942348 TTHA1749 TTHA1750     TRUE 0.673 -3.000 0.003 1.000 N NA
 942348 942349 TTHA1750 TTHA1751     TRUE 0.991 -3.000 0.028 0.012 Y NA
 942349 942350 TTHA1751 TTHA1752     FALSE 0.426 9.000 0.000 NA   NA
 942350 942351 TTHA1752 TTHA1753     TRUE 0.562 -22.000 0.000 NA   NA
 942351 942352 TTHA1753 TTHA1754     FALSE 0.091 117.000 0.000 NA   NA
 942353 942354 TTHA1755 TTHA1756     FALSE 0.446 5.000 0.000 NA   NA
 942354 942355 TTHA1756 TTHA1757     FALSE 0.046 204.000 0.000 NA   NA
 942355 942356 TTHA1757 TTHA1758     FALSE 0.509 15.000 0.030 1.000 N NA
 942357 942358 TTHA1759 TTHA1760     FALSE 0.049 190.000 0.000 NA   NA
 942358 942359 TTHA1760 TTHA1761     TRUE 0.606 -16.000 0.000 NA   NA
 942359 942360 TTHA1761 TTHA1762     TRUE 0.709 41.000 0.200 NA   NA
 942360 942361 TTHA1762 TTHA1763     TRUE 0.757 10.000 0.140 NA   NA
 942361 942362 TTHA1763 TTHA1764     TRUE 0.951 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 942362 942363 TTHA1764 TTHA1765     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 942363 942364 TTHA1765 TTHA1766     FALSE 0.063 157.000 0.000 NA   NA
 942364 942365 TTHA1766 TTHA1767     FALSE 0.241 69.000 0.004 1.000   NA
 942365 942366 TTHA1767 TTHA1768     TRUE 0.995 -16.000 0.234 0.002 Y NA
 942366 942367 TTHA1768 TTHA1769     TRUE 0.593 0.000 0.006 NA N NA
 942367 942368 TTHA1769 TTHA1770     TRUE 0.896 2.000 0.250 NA   NA
 942368 942369 TTHA1770 TTHA1771     FALSE 0.087 129.000 0.000 1.000   NA
 942371 942372 TTHA1773 TTHA1774     FALSE 0.154 119.000 0.045 1.000 N NA
 942372 942373 TTHA1774 TTHA1775     TRUE 0.762 -3.000 0.011 1.000 N NA
 942373 942374 TTHA1775 TTHA1776     FALSE 0.264 49.000 0.000 NA   NA
 942374 942375 TTHA1776 TTHA1777     TRUE 0.577 1.000 0.000 NA   NA
 942375 942376 TTHA1777 TTHA1778     TRUE 0.543 7.000 0.010 NA   NA
 942376 942377 TTHA1778 TTHA1779     TRUE 0.739 0.000 0.045 NA N NA
 942377 942378 TTHA1779 TTHA1780     TRUE 0.916 41.000 0.199 1.000 Y NA
 942378 942379 TTHA1780 TTHA1781     TRUE 0.627 1.000 0.002 1.000   NA
 942379 942380 TTHA1781 TTHA1782     FALSE 0.491 10.000 0.003 1.000   NA
 942380 942381 TTHA1782 TTHA1783     TRUE 0.996 4.000 0.667 0.019 Y NA
 942381 942382 TTHA1783 TTHAt40   tRNA-Ala-2 FALSE 0.115 98.000 0.000 NA   NA
 942382 942383 TTHAt40 TTHA1784 tRNA-Ala-2   FALSE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 942384 942385 TTHAt41 TTHA1785 tRNA-Thr-1   FALSE 0.074 134.000 0.000 NA   NA
 942385 942386 TTHA1785 TTHA1786     FALSE 0.073 135.000 0.000 NA   NA
 942386 942387 TTHA1786 TTHA1787     FALSE 0.367 17.000 0.000 NA   NA
 942388 942389 TTHA1788 TTHA1789     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 942389 942390 TTHA1789 TTHA1790     FALSE 0.045 146.000 0.000 1.000 N NA
 942391 942392 TTHA1791 TTHA1792     FALSE 0.379 50.000 0.013 NA   NA
 942394 942395 TTHA1794 TTHA1795     FALSE 0.240 60.000 0.000 1.000   NA
 942395 942396 TTHA1795 TTHA1796     FALSE 0.500 11.000 0.005 1.000   NA
 942396 942397 TTHA1796 TTHA1797     TRUE 0.620 -13.000 0.005 1.000 N NA
 942398 942399 TTHA1798 TTHA1799     TRUE 0.697 -22.000 0.036 1.000 N NA
 942402 942403 TTHA1802 TTHAt42   tRNA-Met-2 FALSE 0.406 11.000 0.000 NA   NA
 942403 942404 TTHAt42 TTHA1803 tRNA-Met-2   FALSE 0.253 54.000 0.000 NA   NA
 942404 942405 TTHA1803 TTHA1804     FALSE 0.387 13.000 0.008 NA N NA
 942405 942406 TTHA1804 TTHA1805     TRUE 0.606 -16.000 0.000 NA   NA
 942406 942407 TTHA1805 TTHA1806     FALSE 0.497 -34.000 0.000 NA   NA
 942408 942409 TTHA1807 TTHA1808     TRUE 0.976 7.000 0.697 0.044 N NA
 942409 942410 TTHA1808 TTHA1809     FALSE 0.104 117.000 0.010 1.000 N NA
 942410 942411 TTHA1809 TTHA1810     TRUE 0.825 -30.000 0.147 NA   NA
 942411 942412 TTHA1810 TTHA1811     TRUE 0.847 -3.000 0.024 NA   NA
 942412 942413 TTHA1811 TTHA1812     FALSE 0.171 64.000 0.003 1.000 N NA
 942413 942414 TTHA1812 TTHA1813     TRUE 0.996 30.000 0.851 0.002 Y NA
 942414 942415 TTHA1813 TTHA1814     FALSE 0.060 190.000 0.002 1.000   NA
 942415 942416 TTHA1814 TTHA1815     TRUE 0.701 0.000 0.004 1.000   NA
 942416 942417 TTHA1815 TTHA1816     TRUE 0.574 7.000 0.037 1.000 N NA
 942417 942418 TTHA1816 TTHA1817     TRUE 0.513 12.000 0.006 1.000   NA
 942418 942419 TTHA1817 TTHA1818     TRUE 0.696 1.000 0.008 1.000   NA
 942419 942420 TTHA1818 TTHA1819     TRUE 0.518 -49.000 0.012 1.000 N NA
 942420 942421 TTHA1819 TTHA1820     TRUE 0.878 -3.000 0.051 1.000   NA
 942421 942422 TTHA1820 TTHA1821     TRUE 0.641 -27.000 0.005 1.000   NA
 942423 942424 TTHA1822 TTHA1823     TRUE 0.959 -7.000 0.333 NA   NA
 942425 942426 TTHA1824 TTHA1825     FALSE 0.426 9.000 0.000 NA   NA
 942427 942428 TTHA1826 TTHA1827     TRUE 0.923 4.000 0.444 NA   NA
 942429 942430 TTHA1828 TTHA1829     FALSE 0.467 20.000 0.009 NA   NA
 942430 942431 TTHA1829 TTHA1830     TRUE 0.586 -19.000 0.000 NA   NA
 942431 942432 TTHA1830 TTHA1831     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 942433 942434 TTHA1832 TTHA1833     FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 942434 942435 TTHA1833 TTHA1834     TRUE 0.987 1.000 0.455 1.000 Y NA
 942435 942436 TTHA1834 TTHA1835     FALSE 0.290 48.000 0.000 1.000   NA
 942436 942437 TTHA1835 TTHA1836     FALSE 0.074 147.000 0.000 1.000   NA
 942437 942438 TTHA1836 TTHA1837     FALSE 0.258 73.000 0.008 1.000   NA
 942438 942439 TTHA1837 TTHA1838     FALSE 0.179 83.000 0.003 1.000   NA
 942439 942440 TTHA1838 TTHA1839     TRUE 0.994 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 942440 942441 TTHA1839 TTHA1840     TRUE 0.980 53.000 0.266 0.001 Y NA
 942441 942442 TTHA1840 TTHA1841     TRUE 0.537 3.000 0.009 1.000 N NA
 942443 942444 TTHA1842 TTHA1843     TRUE 0.972 -12.000 0.105 1.000 Y NA
 942444 942445 TTHA1843 TTHA1844     TRUE 0.955 46.000 0.029 0.001 Y NA
 942445 942446 TTHA1844 TTHA1845     FALSE 0.208 62.000 0.000 NA   NA
 942446 942447 TTHA1845 TTHA1846     FALSE 0.294 40.000 0.000 NA   NA
 942448 942449 TTHA1847 TTHA1848     FALSE 0.178 70.000 0.000 NA   NA
 942449 942450 TTHA1848 TTHA1849     FALSE 0.145 82.000 0.000 NA   NA
 942450 942451 TTHA1849 TTHA1850     FALSE 0.062 159.000 0.000 NA   NA
 942451 942452 TTHA1850 TTHA1851     FALSE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 942452 942453 TTHA1851 TTHA1852     FALSE 0.337 26.000 0.000 NA   NA
 942453 942454 TTHA1852 TTHA1853     FALSE 0.370 25.000 0.009 1.000 N NA
 942456 942457 TTHA1855 TTHA1856     TRUE 0.994 -3.000 0.720 0.044   NA
 942458 942459 TTHA1857 TTHA1858     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 942459 942460 TTHA1858 TTHA1859     TRUE 0.795 -3.000 0.007 NA   NA
 942460 942461 TTHA1859 TTHA1860     TRUE 0.830 -3.000 0.016 NA   NA
 942461 942462 TTHA1860 TTHA1861     TRUE 0.766 -33.000 0.078 1.000   NA
 942463 942464 TTHA1862 TTHA1863     TRUE 0.955 11.000 0.833 NA   NA
 942464 942465 TTHA1863 TTHA1864     FALSE 0.226 59.000 0.000 NA   NA
 942466 942467 TTHA1865 TTHA1866     TRUE 0.949 -3.000 0.000 0.005   NA
 942469 942470 TTHA1868 TTHA1869     FALSE 0.054 197.000 0.000 1.000   NA
 942470 942471 TTHA1869 TTHA1870     FALSE 0.043 226.000 0.000 NA   NA
 942471 942472 TTHA1870 TTHA1871     FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 942472 942473 TTHA1871 TTHA1872     TRUE 0.716 -6.000 0.000 NA   NA
 942473 942474 TTHA1872 TTHA1873     FALSE 0.061 160.000 0.000 NA   NA
 942474 942475 TTHA1873 TTHA1874     FALSE 0.171 73.000 0.000 NA   NA
 942476 942477 TTHA1875 TTHA1876     TRUE 0.815 4.000 0.211 NA N NA
 942477 942478 TTHA1876 TTHA1877     FALSE 0.272 11.000 0.000 NA N NA
 942479 942480 TTHA1878 TTHA1879     TRUE 0.852 -3.000 0.021 1.000   NA
 942480 942481 TTHA1879 TTHA1880     TRUE 0.806 -19.000 0.062 1.000   NA
 942481 942482 TTHA1880 TTHA1881     TRUE 0.866 -9.000 0.062 1.000   NA
 942486 942487 TTHA1885 TTHA1886     FALSE 0.334 27.000 0.000 NA   NA
 942488 942489 TTHA1887 TTHA1888     FALSE 0.106 79.000 0.000 1.000 N NA
 942489 942490 TTHA1888 TTHA1889     TRUE 0.887 -7.000 0.096 NA   NA
 942493 942494 TTHA1892 TTHA1893     FALSE 0.129 97.000 0.002 NA   NA
 942494 942495 TTHA1893 TTHA1894     FALSE 0.066 147.000 0.000 NA   NA
 942496 942497 TTHA1895 TTHA1896     FALSE 0.036 348.000 0.000 1.000   NA
 942497 942498 TTHA1896 TTHAt43   tRNA-Trp FALSE 0.270 46.000 0.000 NA   NA
 942498 942499 TTHAt43 TTHA1897 tRNA-Trp   FALSE 0.268 47.000 0.000 NA   NA
 942500 942501 TTHA1898 TTHA1899     TRUE 0.592 3.000 0.006 NA   NA
 942501 942502 TTHA1899 TTHA1900     TRUE 0.768 -3.000 0.004 NA   NA
 942502 942503 TTHA1900 TTHA1901     TRUE 0.927 -13.000 0.230 1.000   NA
 942503 942504 TTHA1901 TTHA1902     TRUE 0.753 0.000 0.013 1.000   NA
 942504 942505 TTHA1902 TTHA1903     FALSE 0.510 5.000 0.003 1.000   NA
 942505 942506 TTHA1903 TTHA1904     TRUE 0.962 31.000 0.058 0.004 Y NA
 942506 942507 TTHA1904 TTHA1905     TRUE 0.675 -10.000 0.000 NA   NA
 942507 942508 TTHA1905 TTHA1906     TRUE 0.529 -28.000 0.000 NA   NA
 942508 942509 TTHA1906 TTHA1907     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 942509 942510 TTHA1907 TTHA1908     FALSE 0.318 105.000 0.118 1.000   NA
 942510 942511 TTHA1908 TTHA1909     TRUE 0.940 -6.000 0.000 0.016   NA
 942511 942512 TTHA1909 TTHA1910     TRUE 0.640 10.000 0.030 1.000   NA
 942512 942513 TTHA1910 TTHA1911     TRUE 0.998 -7.000 0.417 0.002 Y NA
 942514 942515 TTHA1912 TTHA1913     TRUE 0.910 -10.000 0.167 NA   NA
 942516 942517 TTHA1914 TTHA1915     FALSE 0.104 144.000 0.023 1.000 N NA
 942517 942518 TTHA1915 TTHA1916     TRUE 0.848 36.000 0.023 1.000 Y NA
 942518 942519 TTHA1916 TTHA1917     FALSE 0.396 38.000 0.021 1.000 N NA
 942519 942520 TTHA1917 TTHA1918     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 942520 942521 TTHA1918 TTHA1919     FALSE 0.080 127.000 0.000 NA   NA
 942521 942522 TTHA1919 TTHA1920     TRUE 0.617 8.000 0.027 NA   NA
 942522 942523 TTHA1920 TTHAt44   tRNA-Glu-3 FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 942523 942524 TTHAt44 TTHAt45 tRNA-Glu-3 tRNA-Glu-2 FALSE 0.353 21.000 0.000 NA   NA
 942524 942525 TTHAt45 TTHAt46 tRNA-Glu-2 tRNA-Gln-1 FALSE 0.426 7.000 0.000 NA   NA
 942526 942527 TTHA1921 TTHA1922     TRUE 0.751 125.000 0.917 NA   NA
 942528 942529 TTHA1923 TTHA1924     TRUE 0.968 0.000 0.115 1.000 Y NA
 942531 942532 TTHA1926 TTHAt47   tRNA-Arg-2 FALSE 0.219 60.000 0.000 NA   NA
 942533 942534 TTHA1927 TTHA1928     TRUE 0.997 -3.000 0.281 0.002 Y NA
 942534 942535 TTHA1928 TTHA1929     FALSE 0.290 60.000 0.005 1.000   NA
 942536 942537 TTHA1930 TTHA1931     TRUE 0.988 10.000 0.182 0.001 Y NA
 942537 942538 TTHA1931 TTHA1932     TRUE 0.830 9.000 0.222 NA   NA
 942538 942539 TTHA1932 TTHA1933     TRUE 0.924 11.000 0.556 NA   NA
 942539 942540 TTHA1933 TTHA1934     TRUE 0.714 80.000 0.556 NA N NA
 942540 942541 TTHA1934 TTHA1935     TRUE 0.543 2.000 0.000 NA   NA
 942541 942542 TTHA1935 TTHA1936     TRUE 0.648 0.000 0.000 1.000   NA
 942544 942545 TTHA1938 TTHA1939     FALSE 0.069 106.000 0.000 1.000 N NA
 942545 942546 TTHA1939 TTHA1940     TRUE 0.660 0.000 0.010 1.000 N NA
 942548 942549 TTHA1942 TTHA1943     TRUE 0.852 -3.000 0.028 NA   NA
 942550 942551 TTHA1944 TTHA1945     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 942551 942552 TTHA1945 TTHA1946     TRUE 0.606 -25.000 0.004 NA   NA
 942552 942553 TTHA1946 TTHA1947     FALSE 0.475 30.000 0.013 1.000   NA
 942553 942554 TTHA1947 TTHA1948     FALSE 0.032 778.000 0.000 1.000   NA
 942554 942555 TTHA1948 TTHA1949     FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 942556 942557 TTHA1950 TTHA1951     TRUE 0.807 -7.000 0.014 NA   NA
 942558 942559 TTHA1952 TTHA1953     FALSE 0.472 8.000 0.003 NA   NA
 942559 942560 TTHA1953 TTHA1954     TRUE 0.791 1.000 0.065 NA   NA
 942560 942561 TTHA1954 TTHA1955     TRUE 0.656 51.000 0.182 NA   NA
 942561 942562 TTHA1955 TTHA1956     TRUE 0.998 2.000 0.800 0.001 Y NA
 942564 942565 TTHA1958 TTHA1959     TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 942565 942566 TTHA1959 TTHA1960     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA   NA
 942566 942567 TTHA1960 TTHA1961     FALSE 0.285 42.000 0.000 NA   NA
 942568 942569 TTHA1962 TTHA1963     TRUE 0.827 -3.000 0.011 1.000   NA
 942569 942570 TTHA1963 TTHA1964     TRUE 0.570 2.000 0.002 NA   NA
 942570 942571 TTHA1964 TTHA1965     TRUE 0.745 64.000 0.400 NA   NA
 942572 942573 TTHA1966 TTHA1967     FALSE 0.253 54.000 0.000 NA   NA
 942573 942574 TTHA1967 TTHA1968     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000   NA
 942575 942576 TTHA1969 TTHA1970     TRUE 0.975 -16.000 0.827 1.000 N NA
 942576 942577 TTHA1970 TTHA1971     TRUE 0.956 -6.000 0.339 1.000 N NA
 942577 942578 TTHA1971 TTHA1972     TRUE 0.952 0.000 0.466 1.000 N NA
 942579 940554 TTHA1973 TTHA0001     TRUE 0.605 302.000 0.328 1.000 Y NA
 942580 942581 TTHB001 TTHB002     TRUE 0.718 150.000 1.000 NA   NA
 942583 942584 TTHB004 TTHB005     FALSE 0.276 54.000 0.000 1.000   NA
 942584 942585 TTHB005 TTHB006     TRUE 0.801 25.000 0.000 0.003   NA
 942585 942586 TTHB006 TTHB007     TRUE 0.577 1.000 0.000 NA   NA
 942587 942588 TTHB008 TTHB009     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942589 942590 TTHB010 TTHB011     FALSE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 942590 942591 TTHB011 TTHB012     FALSE 0.031 419.000 0.000 NA   NA
 942591 942592 TTHB012 TTHB013     TRUE 0.886 -3.000 0.074 NA   NA
 942592 942593 TTHB013 TTHB014     TRUE 0.963 -7.000 0.367 NA   NA
 942593 942594 TTHB014 TTHB015     TRUE 0.872 -3.000 0.041 1.000   NA
 942594 942595 TTHB015 TTHB016     TRUE 0.840 13.000 0.000 1.000 Y NA
 942595 942596 TTHB016 TTHB017     TRUE 0.941 0.000 0.087 0.056   NA
 942596 942597 TTHB017 TTHB018     FALSE 0.510 36.000 0.034 NA   NA
 942597 942598 TTHB018 TTHB019     TRUE 0.589 -3.000 0.000 NA N NA
 942598 942599 TTHB019 TTHB020     TRUE 0.970 -16.000 0.000 0.056 Y NA
 942599 942600 TTHB020 TTHB021     TRUE 0.878 0.000 0.133 1.000   NA
 942600 942601 TTHB021 TTHB022     FALSE 0.421 13.000 0.000 1.000   NA
 942601 942602 TTHB022 TTHB023     TRUE 0.925 -13.000 0.286 1.000 N NA
 942602 942603 TTHB023 TTHB025     FALSE 0.034 448.000 0.000 1.000   NA
 942604 942605 TTHB024 TTHB026     FALSE 0.426 9.000 0.000 NA   NA
 942606 942607 TTHB027 TTHB028     FALSE 0.031 412.000 0.000 NA   NA
 942608 942609 TTHB029 TTHB030     FALSE 0.383 14.000 0.000 NA   NA
 942609 942610 TTHB030 TTHB031     FALSE 0.445 -114.000 0.000 NA   NA
 942610 942611 TTHB031 TTHB032     FALSE 0.506 3.000 0.000 NA   NA
 942611 942612 TTHB032 TTHB033     TRUE 0.619 63.000 0.000 0.011   NA
 942612 942613 TTHB033 TTHB034     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.011   NA
 942613 942614 TTHB034 TTHB035     FALSE 0.109 102.000 0.000 NA   NA
 942614 942615 TTHB035 TTHB036     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 942617 942618 TTHB038 TTHB039     FALSE 0.035 308.000 0.000 NA   NA
 942618 942619 TTHB039 TTHB040     TRUE 0.620 0.000 0.000 NA   NA
 942619 942620 TTHB040 TTHB041     TRUE 0.705 9.000 0.091 NA   NA
 942620 942621 TTHB041 TTHB042     TRUE 0.980 -21.000 1.000 NA   NA
 942622 942623 TTHB043 TTHB044     TRUE 0.990 0.000 0.114 0.009 Y NA
 942623 942624 TTHB044 TTHB045     FALSE 0.350 32.000 0.000 1.000   NA
 942624 942625 TTHB045 TTHB046     FALSE 0.475 5.000 0.000 1.000   NA
 942625 942626 TTHB046 TTHB047     TRUE 0.606 1.000 0.000 1.000   NA
 942626 942627 TTHB047 TTHB048     FALSE 0.374 23.000 0.000 1.000   NA
 942628 942629 TTHB049 TTHB050     FALSE 0.026 265.000 0.000 1.000 N NA
 942629 942630 TTHB050 TTHB051     TRUE 0.720 -3.000 0.005 1.000 N NA
 942630 942631 TTHB051 TTHB052     TRUE 0.964 35.000 0.102 0.009 Y NA
 942631 942632 TTHB052 TTHB053     TRUE 0.985 1.000 0.054 0.009 Y NA
 942632 942633 TTHB053 TTHB054     TRUE 0.994 -3.000 0.128 0.009 Y NA
 942633 942634 TTHB054 TTHB055     TRUE 0.990 -3.000 0.291 1.000 Y NA
 942634 942635 TTHB055 TTHB056     TRUE 0.916 5.000 0.040 1.000 Y NA
 942635 942636 TTHB056 TTHB057     TRUE 0.997 -7.000 0.352 0.009 Y NA
 942636 942637 TTHB057 TTHB058     TRUE 0.955 -3.000 0.006 0.009   NA
 942637 942638 TTHB058 TTHB059     TRUE 0.971 1.000 0.700 NA   NA
 942638 942639 TTHB059 TTHB060     TRUE 0.916 -3.000 0.133 NA   NA
 942639 942640 TTHB060 TTHB061     FALSE 0.392 -34.000 0.000 1.000 N NA
 942640 942641 TTHB061 TTHB062     TRUE 0.824 -3.000 0.036 1.000 N NA
 942641 942642 TTHB062 TTHB063     TRUE 0.580 10.000 0.017 NA   NA
 942642 942643 TTHB063 TTHB064     TRUE 0.917 -73.000 0.444 NA   NA
 942643 942644 TTHB064 TTHB065     FALSE 0.331 37.000 0.000 1.000   NA
 942644 942645 TTHB065 TTHB066     FALSE 0.071 214.000 0.026 1.000 N NA
 942646 942647 TTHB067 TTHB068     FALSE 0.064 175.000 0.000 1.000   NA
 942649 942650 TTHB070 TTHB071     FALSE 0.451 10.000 0.000 1.000   NA
 942653 942654 TTHB074 TTHB075     TRUE 0.980 42.000 0.846 NA Y NA
 942654 942655 TTHB075 TTHB076     TRUE 0.992 3.000 0.846 NA Y NA
 942655 942656 TTHB076 TTHB077     TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000 N NA
 942656 942657 TTHB077 TTHB078     TRUE 0.915 -3.000 0.000 0.032 N NA
 942657 942658 TTHB078 TTHB079     TRUE 0.607 -7.000 0.000 1.000 N NA
 942658 942659 TTHB079 TTHB080     FALSE 0.322 10.000 0.000 1.000 N NA
 942659 942660 TTHB080 TTHB081     FALSE 0.029 218.000 0.000 1.000 N NA
 942660 942661 TTHB081 TTHB082     FALSE 0.111 76.000 0.000 1.000 N NA
 942661 942662 TTHB082 TTHB083     TRUE 0.810 39.000 0.067 0.042   NA
 942664 942665 TTHB085 TTHB086     TRUE 0.987 4.000 0.818 0.042   NA
 942665 942666 TTHB086 TTHB087     TRUE 0.814 22.000 0.000 1.000 Y NA
 942668 942669 TTHB089 TTHB090     TRUE 0.864 -13.000 0.111 NA   NA
 942669 942670 TTHB090 TTHB091     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942672 942673 TTHB093 TTHB094     FALSE 0.229 62.000 0.000 1.000   NA
 942673 942674 TTHB094 TTHB095     TRUE 0.910 2.000 0.025 0.032   NA
 942674 942675 TTHB095 TTHB096     TRUE 0.848 -3.000 0.025 NA   NA
 942676 942677 TTHB097 TTHB098     FALSE 0.058 173.000 0.000 NA   NA
 942677 942678 TTHB098 TTHB099     TRUE 0.631 1.000 0.013 1.000 N NA
 942678 942679 TTHB099 TTHB100     TRUE 0.991 -3.000 0.444 0.021   NA
 942680 942681 TTHB101 TTHB102     TRUE 0.590 0.000 0.004 1.000 N NA
 942681 942682 TTHB102 TTHB103     FALSE 0.035 186.000 0.000 1.000 N NA
 942682 942683 TTHB103 TTHB104     TRUE 0.940 -3.000 0.200 NA   NA
 942683 942684 TTHB104 TTHB105     TRUE 0.676 5.000 0.056 NA   NA
 942684 942685 TTHB105 TTHB106     TRUE 0.906 -3.000 0.167 NA N NA
 942685 942686 TTHB106 TTHB107     FALSE 0.253 54.000 0.000 NA   NA
 942686 942687 TTHB107 TTHB108     FALSE 0.353 21.000 0.000 NA   NA
 942687 942688 TTHB108 TTHB109     FALSE 0.115 98.000 0.000 NA   NA
 942688 942689 TTHB109 TTHB110     TRUE 0.929 -3.000 0.005 0.032 N NA
 942689 942690 TTHB110 TTHB111     FALSE 0.451 10.000 0.000 1.000   NA
 942691 942692 TTHB112 TTHB113     TRUE 0.724 -3.000 0.000 NA   NA
 942692 942693 TTHB113 TTHB114     FALSE 0.149 80.000 0.000 NA   NA
 942693 942694 TTHB114 TTHB115     TRUE 0.784 -16.000 0.026 1.000   NA
 942694 942695 TTHB115 TTHB116