MicrobesOnline Operon Predictions for Shigella dysenteriae Sd197

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1153829 1153830 SDY_0001 SDY_0002 thrL thrA FALSE 0.445 81.000 0.043 1.000   NA
 1153830 1153831 SDY_0002 SDY_0003 thrA thrB TRUE 0.985 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1153831 1153832 SDY_0003 SDY_0004 thrB thrC TRUE 0.991 1.000 0.233 1.000 Y NA
 1153832 1153833 SDY_0004 SDY_0005 thrC   FALSE 0.027 214.000 0.003 NA   NA
 1153834 1153835 SDY_0006 SDY_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.017 291.000 0.028 NA   NA
 1153836 1153837 SDY_0008 SDY_0009 talB mog FALSE 0.362 115.000 0.042 1.000 N NA
 1153838 1153839 SDY_0010 SDY_0011 yaaH   FALSE 0.225 149.000 0.043 NA   NA
 1153839 1153840 SDY_0011 SDY_0012   yaaI TRUE 0.971 26.000 0.500 NA   NA
 1153841 1153842 SDY_0013 SDY_0014 dnaK dnaJ TRUE 0.950 89.000 0.236 0.004 Y NA
 1153843 1153844 SDY_0015 SDY_0016 gef   FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 1153844 1153845 SDY_0016 SDY_0017     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1153846 1153847 SDY_0018 SDY_0019 nhaA nhaR TRUE 0.883 60.000 0.292 1.000 N NA
 1153848 1153849 SDY_0020 SDY_0021     FALSE 0.496 -9.000 0.000 NA   NA
 1153851 1153852 SDY_0023 SDY_0024 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153853 1153854 SDY_0025 SDY_0026 acnB yacL FALSE 0.206 175.000 0.068 NA   NA
 1153855 1153856 SDY_0027 SDY_0028 speD speE TRUE 0.976 16.000 0.162 1.000 Y NA
 1153856 1153857 SDY_0028 SDY_0029 speE yacC TRUE 0.775 106.000 0.354 NA   NA
 1153860 1153861 SDY_0031 SDY_0032 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153861 1153862 SDY_0032 SDY_0034 insB hpt FALSE 0.001 1728.000 0.000 NA N NA
 1153864 1153865 SDY_0036 SDY_0037 yadG yadH TRUE 0.996 -3.000 0.688 0.082 Y NA
 1153865 1153866 SDY_0037 SDY_0038 yadH yadI FALSE 0.310 105.000 0.037 1.000 N NA
 1153866 1153867 SDY_0038 SDY_0039 yadI   TRUE 0.812 64.000 0.222 NA   NA
 1153867 1153868 SDY_0039 SDY_0040   yadE FALSE 0.544 -22.000 0.056 NA   NA
 1153870 1153871 SDY_0042 SDY_0043 yadD insA TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1153871 1153872 SDY_0043 SDY_0044 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153874 1153875 SDY_0046 SDY_0047   ribF TRUE 0.655 8.000 0.019 NA   NA
 1153875 1153876 SDY_0047 SDY_0048 ribF ileS TRUE 0.941 43.000 0.254 1.000 N NA
 1153876 1153877 SDY_0048 SDY_0049 ileS lspA TRUE 0.832 0.000 0.045 1.000 N NA
 1153877 1153878 SDY_0049 SDY_0050 lspA slpA FALSE 0.620 88.000 0.154 1.000 N NA
 1153878 1153879 SDY_0050 SDY_0051 slpA lytB TRUE 0.986 2.000 0.626 1.000 N NA
 1153879 1153880 SDY_0051 SDY_0052 lytB yaaF FALSE 0.444 66.000 0.028 1.000 N NA
 1153880 1153881 SDY_0052 SDY_0053 yaaF dapB FALSE 0.118 167.000 0.003 1.000 N NA
 1153881 1153882 SDY_0053 SDY_0054 dapB carA FALSE 0.048 458.000 0.034 1.000 Y NA
 1153882 1153883 SDY_0054 SDY_0055 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 1153883 1153884 SDY_0055 SDY_0056 carB caiF FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1153885 1153886 SDY_0057 SDY_0058 caiE caiD FALSE 0.569 -15.000 0.000 1.000   NA
 1153886 1153887 SDY_0058 SDY_0059 caiD caiC TRUE 0.981 1.000 0.000 0.018 Y NA
 1153887 1153888 SDY_0059 SDY_0060 caiC caiB TRUE 0.857 59.000 0.154 0.018 N NA
 1153888 1153889 SDY_0060 SDY_0061 caiB caiA TRUE 0.870 129.000 0.529 1.000 N NA
 1153889 1153890 SDY_0061 SDY_0062 caiA caiT TRUE 0.879 31.000 0.118 1.000 N NA
 1153891 1153892 SDY_0063 SDY_0064 fixA fixB TRUE 0.988 15.000 0.231 0.014 Y NA
 1153892 1153893 SDY_0064 SDY_0065 fixB fixC FALSE 0.165 287.000 0.000 1.000 Y NA
 1153893 1153894 SDY_0065 SDY_0066 fixC fixX TRUE 0.981 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 1153894 1153895 SDY_0066 SDY_0067 fixX yaaU FALSE 0.558 58.000 0.000 1.000   NA
 1153895 1153896 SDY_0067 SDY_0068 yaaU   TRUE 0.863 10.000 0.000 0.049   NA
 1153896 1153897 SDY_0068 SDY_0069   yabF FALSE 0.027 279.000 0.000 1.000   NA
 1153897 1153898 SDY_0069 SDY_0070 yabF kefC TRUE 0.964 -7.000 0.560 1.000   NA
 1153898 1153899 SDY_0070 SDY_0071 kefC folA FALSE 0.072 192.000 0.012 1.000 N NA
 1153899 1153900 SDY_0071 SDY_0072 folA   FALSE 0.357 86.000 0.000 1.000   NA
 1153900 1153901 SDY_0072 SDY_0073     TRUE 0.814 3.000 0.000 1.000   NA
 1153902 1153903 SDY_0074 SDY_0075 apaH apaG TRUE 0.946 7.000 0.267 NA N NA
 1153903 1153904 SDY_0075 SDY_0076 apaG ksgA TRUE 0.840 3.000 0.078 NA N NA
 1153904 1153905 SDY_0076 SDY_0077 ksgA pdxA TRUE 0.930 -3.000 0.197 1.000 N NA
 1153905 1153906 SDY_0077 SDY_0078 pdxA surA TRUE 0.983 0.000 0.561 1.000 N NA
 1153906 1153907 SDY_0078 SDY_0079 surA imp TRUE 0.854 53.000 0.182 1.000 N NA
 1153908 1153909 SDY_0080 SDY_0081 yabH yabP FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 1153910 1153911 SDY_0082 SDY_0083 yabO hepA TRUE 0.946 12.000 0.294 1.000 N NA
 1153911 1153912 SDY_0083 SDY_0087 hepA polB FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 1153912 1153913 SDY_0087 SDY_0084 polB   FALSE 0.206 -1872.000 0.000 NA   NA
 1153914 1153915 SDY_0085 SDY_0086 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153916 1153917 SDY_0088 SDY_0089 araD araA FALSE 0.630 168.000 0.017 1.000 Y NA
 1153917 1153918 SDY_0089 SDY_0090 araA araB TRUE 0.888 11.000 0.138 1.000 N NA
 1153919 1153920 SDY_0091 SDY_0092 araC yabI FALSE 0.252 86.000 0.000 NA   NA
 1153921 1153922 SDY_0093 SDY_0094 yabJ yabK TRUE 0.959 -16.000 0.522 0.015 N NA
 1153922 1153923 SDY_0094 SDY_0095 yabK tbpA TRUE 0.962 -24.000 0.697 0.063 N NA
 1153923 1153924 SDY_0095 SDY_0096 tbpA insA FALSE 0.003 700.000 0.000 1.000 N NA
 1153924 1153925 SDY_0096 SDY_0097 insA yabN FALSE 0.005 523.000 0.000 1.000   NA
 1153925 1153926 SDY_0097 SDY_0098 yabN leuD FALSE 0.018 328.000 0.000 1.000   NA
 1153926 1153927 SDY_0098 SDY_0099 leuD leuC TRUE 0.993 11.000 0.309 0.001 Y NA
 1153927 1153928 SDY_0099 SDY_0100 leuC leuB TRUE 0.995 3.000 0.275 0.001 Y NA
 1153928 1153929 SDY_0100 SDY_0101 leuB leuA TRUE 0.990 0.000 0.126 0.001 Y NA
 1153929 1153930 SDY_0101 SDY_0102 leuA leuL FALSE 0.542 93.000 0.010 0.001   NA
 1153931 1153932 SDY_0103 SDY_0104   leuO TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1153933 1153934 SDY_0105 SDY_0106 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153935 1153936 SDY_0107 SDY_0108 ilvI ilvH TRUE 0.996 3.000 0.371 0.002 Y NA
 1153936 1153937 SDY_0108 SDY_0109 ilvH fruL FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1153937 1153938 SDY_0109 SDY_0110 fruL fruR FALSE 0.263 82.000 0.000 NA   NA
 1153938 1153939 SDY_0110 SDY_0111 fruR yabB FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 1153939 1153940 SDY_0111 SDY_0112 yabB yabC TRUE 0.985 2.000 0.635 NA   NA
 1153940 1153941 SDY_0112 SDY_0113 yabC ftsL TRUE 0.941 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1153941 1153942 SDY_0113 SDY_0114 ftsL ftsI TRUE 0.865 16.000 0.124 1.000 N NA
 1153942 1153943 SDY_0114 SDY_0115 ftsI murE TRUE 0.931 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 1153943 1153944 SDY_0115 SDY_0116 murE murF TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1153944 1153945 SDY_0116 SDY_0117 murF mraY TRUE 0.989 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 1153945 1153946 SDY_0117 SDY_0118 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 1153946 1153947 SDY_0118 SDY_0119 murD ftsW TRUE 0.979 0.000 0.297 0.003 N NA
 1153947 1153948 SDY_0119 SDY_0120 ftsW murG TRUE 0.981 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1153948 1153949 SDY_0120 SDY_0121 murG murC TRUE 0.976 54.000 0.283 1.000 Y NA
 1153949 1153950 SDY_0121 SDY_0122 murC ddlB TRUE 0.977 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 1153950 1153951 SDY_0122 SDY_0123 ddlB ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 1153951 1153952 SDY_0123 SDY_0124 ftsQ ftsA TRUE 0.959 -3.000 0.389 NA N NA
 1153952 1153953 SDY_0124 SDY_0125 ftsA ftsZ TRUE 0.979 61.000 0.460 1.000 Y NA
 1153953 1153954 SDY_0125 SDY_0126 ftsZ lpxC FALSE 0.539 101.000 0.134 1.000 N NA
 1153954 1153955 SDY_0126 SDY_0127 lpxC yacA FALSE 0.052 230.000 0.000 1.000   NA
 1153955 1153956 SDY_0127 SDY_0128 yacA secA TRUE 0.644 62.000 0.065 1.000   NA
 1153956 1153957 SDY_0128 SDY_0129 secA mutT TRUE 0.794 60.000 0.168 1.000 N NA
 1153958 1153959 SDY_0130 SDY_0131   yacG FALSE 0.272 -49.000 0.000 NA   NA
 1153959 1153960 SDY_0131 SDY_0132 yacG yacF TRUE 0.960 10.000 0.356 NA   NA
 1153960 1153961 SDY_0132 SDY_0133 yacF yacE TRUE 0.894 0.000 0.110 NA   NA
 1153963 1153964 SDY_0135 SDY_0136   hofC TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1153964 1153965 SDY_0136 SDY_0137 hofC hofB FALSE 0.634 40.000 0.000 NA   NA
 1153965 1153966 SDY_0137 SDY_0138 hofB ppdD TRUE 0.993 10.000 0.556 NA Y NA
 1153966 1153967 SDY_0138 SDY_0139 ppdD nadC FALSE 0.031 203.000 0.015 NA N NA
 1153968 1153969 SDY_0140 SDY_0141 ampD ampE TRUE 0.987 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 1153971 1153972 SDY_0143 SDY_0144 pdhR aceE FALSE 0.621 161.000 0.276 1.000 N NA
 1153972 1153973 SDY_0144 SDY_0145 aceE aceF TRUE 0.982 15.000 0.220 1.000 Y NA
 1153973 1153974 SDY_0145 SDY_0146 aceF lpdA TRUE 0.775 208.000 0.463 1.000 Y NA
 1153975 1153976 SDY_0147 SDY_0148     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1153976 1153977 SDY_0148 SDY_0149   insB FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1153977 1153978 SDY_0149 SDY_0150 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1153978 1153979 SDY_0150 SDY_0151 insA   FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1153979 1153980 SDY_0151 SDY_0152     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1153981 1153982 SDY_0153 SDY_0154   panB FALSE 0.004 463.000 0.000 NA   NA
 1153982 1153983 SDY_0154 SDY_0155 panB panC TRUE 0.994 12.000 0.395 0.001 Y NA
 1153983 1153984 SDY_0155 SDY_0156 panC insB FALSE 0.002 613.000 0.000 NA N NA
 1153984 1153985 SDY_0156 SDY_0157 insB   FALSE 0.028 548.000 0.000 NA Y NA
 1153986 1153987 SDY_0158 SDY_0159 folK pcnB TRUE 0.943 -3.000 0.234 1.000 N NA
 1153987 1153988 SDY_0159 SDY_0160 pcnB yadB TRUE 0.976 39.000 0.131 1.000 Y NA
 1153988 1153989 SDY_0160 SDY_0161 yadB dksA TRUE 0.819 67.000 0.231 1.000 N NA
 1153989 1153990 SDY_0161 SDY_0162 dksA sfsA FALSE 0.329 178.000 0.151 NA   NA
 1153990 1153991 SDY_0162 SDY_0163 sfsA yadP TRUE 0.693 15.000 0.045 NA   NA
 1153992 1153993 SDY_0164 SDY_0165 hrpB mrcB FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 1153993 1153994 SDY_0165 SDY_0166 mrcB fhuA FALSE 0.049 220.000 0.000 1.000 N NA
 1153994 1153995 SDY_0166 SDY_0167 fhuA fhuC TRUE 0.965 51.000 0.156 1.000 Y NA
 1153995 1153996 SDY_0167 SDY_0168 fhuC fhuD TRUE 0.972 0.000 0.031 1.000 Y NA
 1153996 1153997 SDY_0168 SDY_0169 fhuD fhuB TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1153999 1154000 SDY_0171 SDY_0172 yadQ yadR FALSE 0.300 82.000 0.031 NA   NA
 1154001 1154002 SDY_0173 SDY_0174 yadS yadT TRUE 0.925 38.000 0.213 NA   NA
 1154002 1154003 SDY_0174 SDY_0175 yadT pfs TRUE 0.745 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1154004 1154005 SDY_0176 SDY_0177 dgt   FALSE 0.220 -937.000 0.000 NA   NA
 1154005 1154006 SDY_0177 SDY_0178   htrA FALSE 0.001 672.000 0.000 NA N NA
 1154006 1154007 SDY_0178 SDY_0179 htrA yaeG FALSE 0.185 178.000 0.080 NA N NA
 1154007 1154008 SDY_0179 SDY_0180 yaeG   TRUE 0.741 4.000 0.030 NA   NA
 1154009 1154010 SDY_0181 SDY_0182 yaeH dapD FALSE 0.016 314.000 0.035 NA   NA
 1154010 1154011 SDY_0182 SDY_0183 dapD glnD TRUE 0.861 31.000 0.097 1.000 N NA
 1154011 1154012 SDY_0183 SDY_0184 glnD map TRUE 0.852 62.000 0.243 1.000 N NA
 1154013 1154014 SDY_0185 SDY_0186 rpsB tsf TRUE 0.723 258.000 0.748 1.000 Y NA
 1154014 1154015 SDY_0186 SDY_0187 tsf pyrH TRUE 0.767 147.000 0.416 1.000 N NA
 1154015 1154016 SDY_0187 SDY_0188 pyrH frr FALSE 0.278 292.000 0.626 1.000 N NA
 1154016 1154017 SDY_0188 SDY_0189 frr yaeM FALSE 0.312 92.000 0.032 1.000 N NA
 1154017 1154018 SDY_0189 SDY_0190 yaeM yaeS FALSE 0.524 186.000 0.025 1.000 Y NA
 1154018 1154019 SDY_0190 SDY_0191 yaeS cdsA TRUE 0.989 13.000 0.400 1.000 Y NA
 1154019 1154020 SDY_0191 SDY_0192 cdsA yaeL TRUE 0.818 12.000 0.080 1.000 N NA
 1154020 1154021 SDY_0192 SDY_0193 yaeL yaeT TRUE 0.984 30.000 0.204 1.000 Y NA
 1154021 1154022 SDY_0193 SDY_0194 yaeT hlpA TRUE 0.949 122.000 0.354 1.000 Y NA
 1154022 1154023 SDY_0194 SDY_0195 hlpA lpxD TRUE 0.997 4.000 0.814 1.000 Y NA
 1154023 1154024 SDY_0195 SDY_0196 lpxD fabZ TRUE 0.899 105.000 0.796 1.000 N NA
 1154024 1154025 SDY_0196 SDY_0197 fabZ lpxA TRUE 0.989 4.000 0.850 1.000 N NA
 1154025 1154026 SDY_0197 SDY_0198 lpxA lpxB TRUE 0.992 0.000 0.289 1.000 Y NA
 1154026 1154027 SDY_0198 SDY_0199 lpxB rnhB TRUE 0.928 -3.000 0.186 1.000 N NA
 1154027 1154028 SDY_0199 SDY_0200 rnhB dnaE TRUE 0.973 37.000 0.104 1.000 Y NA
 1154028 1154029 SDY_0200 SDY_0201 dnaE accA TRUE 0.860 13.000 0.122 1.000 N NA
 1154029 1154030 SDY_0201 SDY_0202 accA insA FALSE 0.016 312.000 0.000 1.000 N NA
 1154030 1154031 SDY_0202 SDY_0203 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154031 1154032 SDY_0203 SDY_0204 insB ldcC TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1154032 1154033 SDY_0204 SDY_0205 ldcC yaeR FALSE 0.208 100.000 0.000 NA   NA
 1154033 1154034 SDY_0205 SDY_0206 yaeR mesJ FALSE 0.364 68.000 0.015 1.000 N NA
 1154035 1154036 SDY_0207 SDY_0208 yaeO yaeP TRUE 0.816 -13.000 0.179 NA   NA
 1154037 1154038 SDY_0209 SDY_0210 yaeQ yaeJ TRUE 0.701 -3.000 0.034 NA   NA
 1154038 1154039 SDY_0210 SDY_0211 yaeJ cutF FALSE 0.621 14.000 0.027 NA   NA
 1154040 1154041 SDY_0212 SDY_0213 yaeF proS FALSE 0.379 53.000 0.002 NA   NA
 1154041 1154042 SDY_0213 SDY_0214 proS yaeB FALSE 0.326 111.000 0.048 NA   NA
 1154042 1154043 SDY_0214 SDY_0215 yaeB rcsF TRUE 0.940 -3.000 0.247 NA   NA
 1154043 1154044 SDY_0215 SDY_0216 rcsF yaeC TRUE 0.853 118.000 0.500 NA   NA
 1154044 1154045 SDY_0216 SDY_0217 yaeC yaeE TRUE 0.989 40.000 0.411 NA Y NA
 1154045 1154046 SDY_0217 SDY_0218 yaeE abc TRUE 0.990 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 1154047 1154048 SDY_0219 SDY_0220 yaeD rrsH FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154048 1154049 SDY_0220 SDY_0221 rrsH   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154049 1154050 SDY_0221 SDY_0222     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1154050 1154051 SDY_0222 SDY_0223   rrlH FALSE 0.107 175.000 0.000 NA   NA
 1154051 1154052 SDY_0223 SDY_0224 rrlH rrfH FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1154052 1154053 SDY_0224 SDY_0225 rrfH   FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1154053 1154054 SDY_0225 SDY_0226   yafB FALSE 0.137 163.000 0.000 NA   NA
 1154056 1154057 SDY_0228 SDY_0229 yafD yafE FALSE 0.038 269.000 0.066 NA   NA
 1154058 1154059 SDY_0230 SDY_0231 dniR gloB TRUE 0.810 72.000 0.233 1.000   NA
 1154062 1154063 SDY_0234 SDY_0235 dnaQ   FALSE 0.232 133.000 0.000 NA   NA
 1154064 1154065 SDY_0236 SDY_0237 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154065 1154066 SDY_0237 SDY_0238 insA   FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1154066 1154067 SDY_0238 SDY_0239     FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1154067 1154068 SDY_0239 SDY_0240     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154068 1154069 SDY_0240 SDY_0241     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1154070 1154071 SDY_0242 SDY_0243     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1154071 1154072 SDY_0243 SDY_0244     FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 1154076 1154077 SDY_0248 SDY_0249 gmhA yafJ FALSE 0.327 206.000 0.229 1.000   NA
 1154078 1154079 SDY_0250 SDY_0251 yafK yafQ FALSE 0.146 156.000 0.000 NA   NA
 1154079 1154080 SDY_0251 SDY_0252 yafQ dinJ TRUE 0.928 3.000 0.167 NA   NA
 1154081 1154082 SDY_0253 SDY_0254 yafL yafM FALSE 0.077 176.000 0.000 NA N NA
 1154082 1154083 SDY_0254 SDY_0255 yafM   FALSE 0.094 335.000 0.000 NA Y NA
 1154083 1154084 SDY_0255 SDY_0256   sfmC FALSE 0.031 231.000 0.000 NA   NA
 1154084 1154085 SDY_0256 SDY_0257 sfmC insA TRUE 0.750 34.000 0.000 1.000   NA
 1154085 1154086 SDY_0257 SDY_0258 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154086 1154087 SDY_0258 SDY_0259 insB   FALSE 0.125 167.000 0.000 NA   NA
 1154088 1154089 SDY_0260 SDY_0262   envY FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1154091 1154092 SDY_0263 SDY_0264   ybcH FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1154092 1154093 SDY_0264 SDY_0265 ybcH nfrA TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1154093 1154094 SDY_0265 SDY_0266 nfrA nfrB FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1154095 1154096 SDY_0267 SDY_0268 insB fdrA FALSE 0.007 336.000 0.000 NA N NA
 1154096 1154097 SDY_0268 SDY_0269 fdrA ylbE FALSE 0.217 268.000 0.412 NA   NA
 1154097 1154098 SDY_0269 SDY_0270 ylbE ylbF TRUE 0.939 11.000 0.265 NA   NA
 1154098 1154099 SDY_0270 SDY_0271 ylbF arcC TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154100 1154101 SDY_0272 SDY_0273 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154101 1154102 SDY_0273 SDY_0274 insA purK FALSE 0.002 840.000 0.000 1.000 N NA
 1154102 1154103 SDY_0274 SDY_0275 purK purE TRUE 0.987 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 1154103 1154104 SDY_0275 SDY_0276 purE ybbF FALSE 0.328 118.000 0.016 1.000   NA
 1154104 1154105 SDY_0276 SDY_0277 ybbF ppiB TRUE 0.963 3.000 0.237 1.000   NA
 1154107 1154108 SDY_0279 SDY_0280 ybcI ybcJ FALSE 0.223 -48.000 0.011 NA   NA
 1154108 1154109 SDY_0280 SDY_0281 ybcJ folD TRUE 0.647 -19.000 0.055 1.000   NA
 1154109 1154110 SDY_0281 SDY_0282 folD insA FALSE 0.003 609.000 0.000 1.000 N NA
 1154110 1154111 SDY_0282 SDY_0283 insA   TRUE 0.791 111.000 0.000 1.000 Y NA
 1154111 1154112 SDY_0283 SDY_0284     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154113 1154114 SDY_0285 SDY_0286 ybaE ybaX FALSE 0.014 341.000 0.019 1.000   NA
 1154115 1154116 SDY_0287 SDY_0288 ybaW   FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1154118 1154119 SDY_0290 SDY_0291 ybaV ybaU FALSE 0.226 151.000 0.033 1.000 N NA
 1154119 1154120 SDY_0291 SDY_0292 ybaU hupB FALSE 0.048 192.000 0.000 NA N NA
 1154120 1154121 SDY_0292 SDY_0293 hupB lon FALSE 0.175 134.000 0.000 NA N NA
 1154121 1154122 SDY_0293 SDY_0294 lon clpX TRUE 0.784 188.000 0.201 0.081 Y NA
 1154122 1154123 SDY_0294 SDY_0295 clpX clpP TRUE 0.949 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1154123 1154124 SDY_0295 SDY_0296 clpP tig FALSE 0.604 245.000 0.351 1.000 Y NA
 1154124 1154125 SDY_0296 SDY_0297 tig   FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1154125 1154126 SDY_0297 SDY_0298   bolA FALSE 0.260 -66.000 0.000 NA   NA
 1154127 1154128 SDY_0299 SDY_0300 yajG ampG TRUE 0.934 44.000 0.256 NA   NA
 1154130 1154131 SDY_0302 SDY_0303   yajR FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 1154133 1154134 SDY_0305 SDY_0306 apbA thiJ FALSE 0.637 -43.000 0.155 NA   NA
 1154136 1154137 SDY_0308 SDY_0309 xseB ispA TRUE 0.808 0.000 0.035 1.000 N NA
 1154137 1154138 SDY_0309 SDY_0310 ispA dxs TRUE 0.969 25.000 0.060 1.000 Y NA
 1154138 1154139 SDY_0310 SDY_0311 dxs yajO FALSE 0.475 55.000 0.009 1.000 N NA
 1154139 1154140 SDY_0311 SDY_0312 yajO   FALSE 0.005 377.000 0.000 NA N NA
 1154140 1154141 SDY_0312 SDY_0313     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1154144 1154145 SDY_0316 SDY_0317 pgpA thiL TRUE 0.830 -22.000 0.206 1.000 N NA
 1154145 1154146 SDY_0317 SDY_0318 thiL nusB TRUE 0.766 78.000 0.225 1.000 N NA
 1154146 1154147 SDY_0318 SDY_0319 nusB ribH TRUE 0.959 20.000 0.347 1.000 N NA
 1154147 1154148 SDY_0319 SDY_0320 ribH ribD TRUE 0.883 89.000 0.034 0.001 Y NA
 1154148 1154149 SDY_0320 SDY_0321 ribD ybaD TRUE 0.954 4.000 0.277 NA N NA
 1154150 1154151 SDY_0322 SDY_0323 yajI tsx FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 1154152 1154153 SDY_0324 SDY_0325 yajD secF FALSE 0.320 129.000 0.015 1.000   NA
 1154153 1154154 SDY_0325 SDY_0326 secF secD TRUE 0.990 11.000 0.206 0.001 Y NA
 1154154 1154155 SDY_0326 SDY_0327 secD yajC TRUE 0.958 28.000 0.045 NA Y NA
 1154155 1154156 SDY_0327 SDY_0328 yajC tgt TRUE 0.950 23.000 0.325 NA N NA
 1154156 1154157 SDY_0328 SDY_0329 tgt queA TRUE 0.988 55.000 0.360 0.001 Y NA
 1154160 1154161 SDY_0332 SDY_0333     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154162 1154163 SDY_0334 SDY_0335 malZ proY FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 1154163 1154164 SDY_0335 SDY_0336 proY brnQ TRUE 0.968 76.000 0.348 0.074 Y NA
 1154164 1154165 SDY_0336 SDY_0337 brnQ phoR FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 1154165 1154166 SDY_0337 SDY_0338 phoR phoB FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1154169 1154170 SDY_0341 SDY_0342 sbcC araJ FALSE 0.629 42.000 0.000 NA   NA
 1154170 1154171 SDY_0342 SDY_0343 araJ   FALSE 0.219 -961.000 0.000 NA   NA
 1154174 1154175 SDY_0346 SDY_0347     FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1154175 1154176 SDY_0347 SDY_0348     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1154177 1154178 SDY_0349 SDY_0350     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154178 1154179 SDY_0350 SDY_0351     FALSE 0.002 732.000 0.000 NA   NA
 1154180 1154181 SDY_0352 SDY_0353 yaiE aroM FALSE 0.416 72.000 0.049 NA   NA
 1154181 1154182 SDY_0353 SDY_0354 aroM yaiA FALSE 0.022 258.000 0.000 NA   NA
 1154182 1154183 SDY_0354 SDY_0355 yaiA aroL FALSE 0.621 50.000 0.044 NA   NA
 1154183 1154184 SDY_0355 SDY_0357 aroL yaiI FALSE 0.065 183.000 0.007 NA   NA
 1154186 1154187 SDY_0358 SDY_0359 yaiC   FALSE 0.118 182.000 0.000 1.000 N NA
 1154187 1154188 SDY_0359 SDY_0360   psiF FALSE 0.003 537.000 0.000 NA   NA
 1154188 1154189 SDY_0360 SDY_0361 psiF phoA FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1154191 1154192 SDY_0363 SDY_0364 yaiB   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1154196 1154197 SDY_0368 SDY_0369 yaiW sbmA TRUE 0.713 13.000 0.000 1.000   NA
 1154201 1154202 SDY_0373 SDY_0374 yaiV insB FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1154202 1154203 SDY_0374 SDY_0375 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154203 1154204 SDY_0375 SDY_0376 insA lacY TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154206 1154207 SDY_0378 SDY_0379 lacZ lacI FALSE 0.083 289.000 0.174 1.000 N NA
 1154207 1154208 SDY_0379 SDY_0380 lacI   TRUE 0.871 37.000 0.032 0.037   NA
 1154209 1154210 SDY_0381 SDY_0382     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154210 1154211 SDY_0382 SDY_0383   cof TRUE 0.754 28.000 0.000 1.000   NA
 1154211 1154212 SDY_0383 SDY_0384 cof ybaO FALSE 0.461 66.000 0.020 1.000   NA
 1154212 1154213 SDY_0384 SDY_0385 ybaO mdlA TRUE 0.917 30.000 0.179 1.000 N NA
 1154213 1154214 SDY_0385 SDY_0386 mdlA mdlB TRUE 0.996 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 1154214 1154215 SDY_0386 SDY_0387 mdlB glnK FALSE 0.132 181.000 0.028 1.000 N NA
 1154215 1154216 SDY_0387 SDY_0388 glnK amtB TRUE 0.905 30.000 0.156 1.000 N NA
 1154223 1154224 SDY_0395 SDY_0396 gcl ybbU FALSE 0.438 90.000 0.054 1.000   NA
 1154224 1154225 SDY_0396 SDY_0397 ybbU ybbT TRUE 0.910 78.000 0.625 1.000 N NA
 1154226 1154227 SDY_0398 SDY_0399 ybbS ybbB FALSE 0.275 69.000 0.012 NA   NA
 1154227 1154228 SDY_0399 SDY_0400 ybbB   FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1154228 1154229 SDY_0400 SDY_0401   insA FALSE 0.002 705.000 0.000 NA   NA
 1154229 1154230 SDY_0401 SDY_0402 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154231 1154232 SDY_0403 SDY_0405 ybbP ybbA TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154233 1154234 SDY_0404 SDY_0406 tesA ybbO TRUE 0.738 -10.000 0.072 1.000   NA
 1154234 1154235 SDY_0406 SDY_0407 ybbO ybbN TRUE 0.895 25.000 0.118 1.000   NA
 1154236 1154237 SDY_0408 SDY_0409 ybbM ybbL TRUE 0.641 -40.000 0.127 NA   NA
 1154238 1154239 SDY_0410 SDY_0411 ybbK ybbJ TRUE 0.987 -3.000 0.313 NA Y NA
 1154240 1154241 SDY_0412 SDY_0413     FALSE 0.006 390.000 0.000 NA   NA
 1154243 1154244 SDY_0415 SDY_0416 ybbI   TRUE 0.712 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1154244 1154245 SDY_0416 SDY_0417     TRUE 0.838 -3.000 0.000 0.073 N NA
 1154245 1154246 SDY_0417 SDY_0418     TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1154246 1154247 SDY_0418 SDY_0419     FALSE 0.626 43.000 0.000 NA   NA
 1154247 1154248 SDY_0419 SDY_0420     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1154248 1154249 SDY_0420 SDY_0421     FALSE 0.367 64.000 0.000 NA   NA
 1154249 1154250 SDY_0421 SDY_0422     FALSE 0.211 104.000 0.000 NA   NA
 1154250 1154251 SDY_0422 SDY_0423     TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1154251 1154252 SDY_0423 SDY_0424     FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1154252 1154253 SDY_0424 SDY_0425     FALSE 0.248 -90.000 0.000 NA   NA
 1154253 1154254 SDY_0425 SDY_0426     FALSE 0.311 71.000 0.000 NA   NA
 1154256 1154257 SDY_0428 SDY_0429     TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1154258 1154259 SDY_0430 SDY_0431 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154260 1154261 SDY_0432 SDY_0433 ybaT ybaS TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1154264 1154265 SDY_0436 SDY_0437 ybaP ybaK FALSE 0.050 204.000 0.022 NA   NA
 1154272 1154273 SDY_0444 SDY_0445 hemH adk FALSE 0.254 132.000 0.013 1.000 N NA
 1154273 1154274 SDY_0445 SDY_0446 adk htpG FALSE 0.247 181.000 0.035 0.080 N NA
 1154274 1154275 SDY_0446 SDY_0447 htpG recR FALSE 0.301 110.000 0.028 1.000 N NA
 1154275 1154276 SDY_0447 SDY_0448 recR ybaB TRUE 0.983 0.000 0.604 NA   NA
 1154276 1154277 SDY_0448 SDY_0449 ybaB dnaX TRUE 0.933 53.000 0.411 NA   NA
 1154277 1154278 SDY_0449 SDY_0450 dnaX apt FALSE 0.497 129.000 0.088 1.000 N NA
 1154278 1154279 SDY_0450 SDY_0451 apt ybaN FALSE 0.210 153.000 0.043 NA   NA
 1154280 1154281 SDY_0452 SDY_0453 priC ybaM TRUE 0.961 14.000 0.474 NA   NA
 1154282 1154283 SDY_0454 SDY_0455 aefA acrR FALSE 0.300 128.000 0.000 1.000 N NA
 1154284 1154285 SDY_0456 SDY_0457 acrA acrB TRUE 0.971 23.000 0.458 1.000 N NA
 1154285 1154286 SDY_0457 SDY_0458 acrB ybaJ FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1154286 1154287 SDY_0458 SDY_0459 ybaJ hha TRUE 0.819 26.000 0.080 NA   NA
 1154287 1154288 SDY_0459 SDY_0460 hha ylaD FALSE 0.232 172.000 0.076 NA   NA
 1154288 1154289 SDY_0460 SDY_0461 ylaD ylaC FALSE 0.613 77.000 0.101 1.000   NA
 1154289 1154290 SDY_0461 SDY_0462 ylaC   FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 1154290 1154291 SDY_0462 SDY_0463     FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1154291 1154292 SDY_0463 SDY_0464     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154293 1154294 SDY_0465 SDY_0466 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154295 1154296 SDY_0467 SDY_0468     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154296 1154297 SDY_0468 SDY_0469     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154297 1154298 SDY_0469 SDY_0470     FALSE 0.035 478.000 0.000 NA Y NA
 1154299 1154300 SDY_0471 SDY_0472     FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 1154300 1154301 SDY_0472 SDY_0473   proA FALSE 0.240 115.000 0.000 NA   NA
 1154301 1154302 SDY_0473 SDY_0474 proA proB TRUE 0.973 12.000 0.026 0.001 Y NA
 1154303 1154304 SDY_0475 SDY_0476 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154305 1154306 SDY_0477 SDY_0478 crl yafA FALSE 0.549 58.000 0.048 NA   NA
 1154306 1154307 SDY_0478 SDY_0479 yafA gpt FALSE 0.291 92.000 0.040 NA   NA
 1154309 1154310 SDY_0481 SDY_0482 prfH   TRUE 0.844 -31.000 0.303 NA   NA
 1154310 1154311 SDY_0482 SDY_0483   dinP FALSE 0.002 756.000 0.000 NA   NA
 1154311 1154312 SDY_0483 SDY_0484 dinP mbhA FALSE 0.373 71.000 0.000 1.000 N NA
 1154312 1154313 SDY_0484 SDY_0485 mbhA   TRUE 0.965 147.000 0.846 1.000 Y NA
 1154314 1154315 SDY_0486 SDY_0487   insA FALSE 0.018 270.000 0.000 NA   NA
 1154315 1154316 SDY_0487 SDY_0488 insA   FALSE 0.003 496.000 0.000 NA   NA
 1154316 1154317 SDY_0488 SDY_0489   pheP FALSE 0.208 102.000 0.000 NA   NA
 1154318 1154319 SDY_0490 SDY_0491 ybdG nfnB FALSE 0.236 108.000 0.012 1.000 N NA
 1154319 1154320 SDY_0491 SDY_0492 nfnB ybdF TRUE 0.833 94.000 0.500 NA   NA
 1154320 1154321 SDY_0492 SDY_0493 ybdF ybdJ FALSE 0.360 65.000 0.000 NA   NA
 1154321 1154322 SDY_0493 SDY_0494 ybdJ ybdK FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1154322 1154323 SDY_0494 SDY_0495 ybdK   FALSE 0.003 924.000 0.000 1.000   NA
 1154323 1154324 SDY_0495 SDY_0496     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154325 1154326 SDY_0497 SDY_0498     FALSE 0.216 139.000 0.000 NA   NA
 1154326 1154327 SDY_0498 SDY_0499   insA FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1154327 1154328 SDY_0499 SDY_0500 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154328 1154329 SDY_0500 SDY_0501 insB hemB FALSE 0.012 282.000 0.000 NA N NA
 1154330 1154331 SDY_0502 SDY_0503 tauD tauC TRUE 0.936 -3.000 0.214 1.000 N NA
 1154331 1154332 SDY_0503 SDY_0504 tauC tauB TRUE 0.995 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 1154332 1154333 SDY_0504 SDY_0505 tauB tauA TRUE 0.957 13.000 0.047 1.000 Y NA
 1154334 1154335 SDY_0506 SDY_0507     TRUE 0.998 0.000 0.900 0.011 Y NA
 1154336 1154337 SDY_0508 SDY_0509     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154337 1154338 SDY_0509 SDY_0510     FALSE 0.300 -42.000 0.000 NA   NA
 1154338 1154339 SDY_0510 SDY_0511   entD FALSE 0.004 400.000 0.000 NA N NA
 1154339 1154340 SDY_0511 SDY_0512 entD fepA TRUE 0.813 166.000 0.700 1.000 N NA
 1154341 1154342 SDY_0513 SDY_0514 fes ybdZ TRUE 0.967 3.000 0.320 NA   NA
 1154342 1154343 SDY_0514 SDY_0515 ybdZ entF TRUE 0.819 -3.000 0.080 NA   NA
 1154344 1154345 SDY_0516 SDY_0517 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154347 1154348 SDY_0519 SDY_0520 fepC fepG TRUE 0.963 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1154348 1154349 SDY_0520 SDY_0521 fepG fepD TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 1154352 1154353 SDY_0524 SDY_0525 entC entE TRUE 0.995 10.000 0.667 1.000 Y NA
 1154353 1154354 SDY_0525 SDY_0526 entE entB TRUE 0.994 14.000 0.667 1.000 Y NA
 1154354 1154355 SDY_0526 SDY_0527 entB entA TRUE 0.971 0.000 0.024 1.000 Y NA
 1154355 1154356 SDY_0527 SDY_0528 entA ybdB TRUE 0.974 3.000 0.065 NA Y NA
 1154356 1154357 SDY_0528 SDY_0529 ybdB cstA FALSE 0.095 181.000 0.000 NA   NA
 1154357 1154358 SDY_0529 SDY_0530 cstA ybdD FALSE 0.092 182.000 0.000 NA   NA
 1154361 1154362 SDY_0533 SDY_0534 ybdM   FALSE 0.369 -27.000 0.000 NA   NA
 1154363 1154364 SDY_0535 SDY_0536     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154368 1154369 SDY_0540 SDY_0541 ahpC ahpF TRUE 0.958 99.000 0.551 1.000 Y NA
 1154371 1154372 SDY_0543 SDY_0544 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154372 1154373 SDY_0544 SDY_0545 insB   FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1154373 1154374 SDY_0545 SDY_0546   cspE FALSE 0.623 175.000 0.333 1.000   NA
 1154376 1154377 SDY_0548 SDY_0549 ybeM ybeC FALSE 0.112 285.000 0.196 1.000   NA
 1154378 1154379 SDY_0550 SDY_0551 lipA ybeF FALSE 0.044 209.000 0.005 1.000 N NA
 1154379 1154380 SDY_0551 SDY_0552 ybeF lipB FALSE 0.006 413.000 0.000 1.000 N NA
 1154380 1154381 SDY_0552 SDY_0553 lipB ybeD TRUE 0.656 100.000 0.219 NA   NA
 1154381 1154382 SDY_0553 SDY_0554 ybeD dacA FALSE 0.419 110.000 0.081 NA   NA
 1154382 1154383 SDY_0554 SDY_0555 dacA rlpA TRUE 0.944 140.000 0.475 NA Y NA
 1154383 1154384 SDY_0555 SDY_0556 rlpA mrdB FALSE 0.629 11.000 0.035 NA N NA
 1154384 1154385 SDY_0556 SDY_0557 mrdB mrdA TRUE 0.836 3.000 0.046 1.000 N NA
 1154385 1154386 SDY_0557 SDY_0558 mrdA ybeA TRUE 0.685 31.000 0.031 NA   NA
 1154386 1154387 SDY_0558 SDY_0559 ybeA ybeB TRUE 0.962 4.000 0.307 NA   NA
 1154387 1154388 SDY_0559 SDY_0560 ybeB phpB FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154388 1154389 SDY_0560 SDY_0561 phpB ybeN TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154389 1154390 SDY_0561 SDY_0562 ybeN holA TRUE 0.839 2.000 0.045 1.000 N NA
 1154390 1154391 SDY_0562 SDY_0563 holA rlpB TRUE 0.938 0.000 0.199 NA N NA
 1154391 1154392 SDY_0563 SDY_0564 rlpB leuS TRUE 0.889 15.000 0.182 NA N NA
 1154393 1154394 SDY_0565 SDY_0566     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1154394 1154395 SDY_0566 SDY_0567   ybeL FALSE 0.352 121.000 0.000 1.000   NA
 1154396 1154397 SDY_0568 SDY_0569 ybeQ insB FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 1154397 1154398 SDY_0569 SDY_0570 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154398 1154399 SDY_0570 SDY_0571 insA   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1154399 1154400 SDY_0571 SDY_0572     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154400 1154401 SDY_0572 SDY_0573     FALSE 0.003 551.000 0.000 NA   NA
 1154401 1154402 SDY_0573 SDY_0574     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1154402 1154403 SDY_0574 SDY_0575     TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1154403 1154404 SDY_0575 SDY_0576     TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1154404 1154405 SDY_0576 SDY_0577     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 1154405 1154406 SDY_0577 SDY_0578     FALSE 0.018 273.000 0.000 NA   NA
 1154406 1154407 SDY_0578 SDY_0579     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA   NA
 1154407 1154408 SDY_0579 SDY_0580     FALSE 0.565 207.000 0.667 NA   NA
 1154408 1154409 SDY_0580 SDY_0581     FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1154409 1154410 SDY_0581 SDY_0582     FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1154410 1154411 SDY_0582 SDY_0583     FALSE 0.247 -94.000 0.000 NA   NA
 1154411 1154412 SDY_0583 SDY_0584     FALSE 0.552 81.000 0.000 0.041   NA
 1154412 1154413 SDY_0584 SDY_0585     TRUE 0.911 36.000 0.182 NA   NA
 1154414 1154415 SDY_0586 SDY_0587     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1154416 1154417 SDY_0588 SDY_0589 gltK gltJ TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154418 1154419 SDY_0590 SDY_0591     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154420 1154421 SDY_0592 SDY_0593 ybeJ lnt FALSE 0.007 397.000 0.000 1.000 N NA
 1154421 1154422 SDY_0593 SDY_0594 lnt ybeX TRUE 0.977 25.000 0.557 1.000 N NA
 1154422 1154423 SDY_0594 SDY_0595 ybeX ybeY FALSE 0.571 90.000 0.150 NA   NA
 1154423 1154424 SDY_0595 SDY_0596 ybeY ybeZ TRUE 0.968 -3.000 0.457 NA   NA
 1154424 1154425 SDY_0596 SDY_0597 ybeZ yleA TRUE 0.717 114.000 0.220 1.000 N NA
 1154428 1154429 SDY_0600 SDY_0602     FALSE 0.527 49.000 0.000 NA   NA
 1154429 1154431 SDY_0602 SDY_0603     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1154431 1154433 SDY_0603 SDY_0605     TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1154433 1154434 SDY_0605 SDY_0606     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154434 1154435 SDY_0606 SDY_0607     TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1154435 1154436 SDY_0607 SDY_0608   asnB FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 1154436 1154437 SDY_0608 SDY_0609 asnB nagD FALSE 0.029 257.000 0.000 1.000 N NA
 1154437 1154438 SDY_0609 SDY_0610 nagD nagC TRUE 0.951 48.000 0.070 1.000 Y NA
 1154438 1154439 SDY_0610 SDY_0611 nagC nagA TRUE 0.995 9.000 0.571 1.000 Y NA
 1154439 1154440 SDY_0611 SDY_0612 nagA nagB TRUE 0.990 60.000 0.557 0.001 Y NA
 1154441 1154442 SDY_0613 SDY_0614 nagE glnS FALSE 0.052 203.000 0.006 1.000 N NA
 1154443 1154444 SDY_0615 SDY_0616 insB insA FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1154445 1154446 SDY_0617 SDY_0618     FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1154446 1154447 SDY_0618 SDY_0619   insA FALSE 0.633 51.000 0.000 1.000   NA
 1154447 1154448 SDY_0619 SDY_0620 insA   FALSE 0.004 588.000 0.000 1.000   NA
 1154449 1154450 SDY_0621 SDY_0622     FALSE 0.623 44.000 0.000 NA   NA
 1154450 1154451 SDY_0622 SDY_0623   fur TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154451 1154452 SDY_0623 SDY_0624 fur fldA FALSE 0.074 289.000 0.156 1.000 N NA
 1154452 1154453 SDY_0624 SDY_0625 fldA ybfE TRUE 0.842 140.000 0.473 1.000   NA
 1154453 1154454 SDY_0625 SDY_0626 ybfE ybfF TRUE 0.806 71.000 0.276 NA   NA
 1154455 1154456 SDY_0627 SDY_0628 seqA pgm TRUE 0.903 26.000 0.151 1.000 N NA
 1154457 1154458 SDY_0629 SDY_0630 kdpE kdpD FALSE 0.175 146.000 0.000 NA   NA
 1154458 1154459 SDY_0630 SDY_0631 kdpD kdpC FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1154459 1154460 SDY_0631 SDY_0632 kdpC kdpB TRUE 0.671 9.000 0.000 NA   NA
 1154460 1154461 SDY_0632 SDY_0633 kdpB kdpA TRUE 0.655 23.000 0.000 NA   NA
 1154461 1154462 SDY_0633 SDY_0634 kdpA kdpF TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154463 1154464 SDY_0635 SDY_0636 ybfA rhsC FALSE 0.027 243.000 0.000 NA   NA
 1154466 1154467 SDY_0638 SDY_0639     FALSE 0.299 74.000 0.000 NA   NA
 1154469 1154470 SDY_0641 SDY_0642   ybgA FALSE 0.004 425.000 0.000 NA   NA
 1154470 1154471 SDY_0642 SDY_0643 ybgA phrB FALSE 0.634 -3.000 0.019 NA   NA
 1154473 1154474 SDY_0645 SDY_0646 ybgI ybgJ TRUE 0.759 23.000 0.050 NA   NA
 1154474 1154475 SDY_0646 SDY_0647 ybgJ ybgK TRUE 0.985 -6.000 0.379 NA Y NA
 1154475 1154476 SDY_0647 SDY_0648 ybgK ybgL TRUE 0.864 -10.000 0.211 NA   NA
 1154476 1154477 SDY_0648 SDY_0649 ybgL nei TRUE 0.783 36.000 0.037 1.000   NA
 1154478 1154479 SDY_0650 SDY_0651 abrB ybgO FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1154479 1154480 SDY_0651 SDY_0652 ybgO ybgP TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1154482 1154483 SDY_0654 SDY_0655 ybgQ ybgD FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1154483 1154484 SDY_0655 SDY_0656 ybgD insB FALSE 0.574 26.000 0.000 NA N NA
 1154484 1154485 SDY_0656 SDY_0657 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154485 1154486 SDY_0657 SDY_0658 insA gltA FALSE 0.005 441.000 0.000 1.000 N NA
 1154487 1154488 SDY_0659 SDY_0660 sdhC sdhD TRUE 0.993 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 1154488 1154489 SDY_0660 SDY_0661 sdhD sdhA TRUE 0.998 0.000 0.705 0.003 Y NA
 1154489 1154490 SDY_0661 SDY_0662 sdhA sdhB TRUE 0.996 16.000 0.604 0.003 Y NA
 1154490 1154491 SDY_0662 SDY_0663 sdhB   FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1154491 1154492 SDY_0663 SDY_0664   sucA FALSE 0.427 -18.000 0.000 NA   NA
 1154492 1154493 SDY_0664 SDY_0665 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 1154493 1154494 SDY_0665 SDY_0666 sucB sucC TRUE 0.870 94.000 0.136 1.000 Y NA
 1154494 1154495 SDY_0666 SDY_0667 sucC sucD TRUE 0.998 0.000 0.806 0.001 Y NA
 1154495 1154496 SDY_0667 SDY_0668 sucD insA FALSE 0.003 706.000 0.000 1.000 N NA
 1154496 1154497 SDY_0668 SDY_0669 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154497 1154498 SDY_0669 SDY_0670 insB insA TRUE 0.804 78.000 0.000 NA Y NA
 1154498 1154499 SDY_0670 SDY_0671 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154500 1154501 SDY_0672 SDY_0673     TRUE 0.966 4.000 0.333 NA   NA
 1154501 1154502 SDY_0673 SDY_0674     TRUE 0.996 0.000 0.651 1.000 Y NA
 1154502 1154503 SDY_0674 SDY_0675     TRUE 0.963 19.000 0.429 NA   NA
 1154503 1154504 SDY_0675 SDY_0676     TRUE 0.971 0.000 0.367 NA   NA
 1154505 1154506 SDY_0677 SDY_0678     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154508 1154509 SDY_0680 SDY_0681 cydA cydB TRUE 0.966 16.000 0.000 0.042 Y NA
 1154509 1154510 SDY_0681 SDY_0682 cydB ybgT TRUE 0.866 15.000 0.149 NA   NA
 1154510 1154511 SDY_0682 SDY_0683 ybgT ybgE TRUE 0.965 0.000 0.310 NA   NA
 1154511 1154512 SDY_0683 SDY_0684 ybgE ybgC FALSE 0.353 150.000 0.095 NA   NA
 1154512 1154513 SDY_0684 SDY_0685 ybgC tolQ TRUE 0.980 -3.000 0.593 1.000   NA
 1154513 1154514 SDY_0685 SDY_0686 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.060 Y NA
 1154514 1154515 SDY_0686 SDY_0687 tolR tolA FALSE 0.618 65.000 0.114 NA N NA
 1154515 1154516 SDY_0687 SDY_0688 tolA tolB FALSE 0.288 133.000 0.051 NA N NA
 1154516 1154517 SDY_0688 SDY_0689 tolB pal TRUE 0.978 35.000 0.592 1.000 N NA
 1154517 1154518 SDY_0689 SDY_0690 pal ybgF TRUE 0.872 10.000 0.088 1.000   NA
 1154518 1154519 SDY_0690 SDY_0691 ybgF   FALSE 0.131 165.000 0.000 NA   NA
 1154519 1154520 SDY_0691 SDY_0692     FALSE 0.171 147.000 0.000 NA   NA
 1154520 1154521 SDY_0692 SDY_0693     TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1154521 1154522 SDY_0693 SDY_0694   nadA FALSE 0.017 278.000 0.000 NA   NA
 1154522 1154523 SDY_0694 SDY_0695 nadA pnuC TRUE 0.957 38.000 0.023 1.000 Y NA
 1154524 1154525 SDY_0696 SDY_0697 ybgR   FALSE 0.457 114.000 0.057 1.000   NA
 1154525 1154526 SDY_0697 SDY_0698     FALSE 0.252 86.000 0.000 NA   NA
 1154527 1154528 SDY_0699 SDY_0700     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154528 1154529 SDY_0700 SDY_0701   aroG FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1154530 1154531 SDY_0702 SDY_0703 gpmA galM FALSE 0.380 205.000 0.009 1.000 Y NA
 1154531 1154532 SDY_0703 SDY_0704 galM galK TRUE 0.975 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 1154532 1154533 SDY_0704 SDY_0705 galK galT TRUE 0.984 4.000 0.370 0.001 N NA
 1154533 1154534 SDY_0705 SDY_0706 galT galE TRUE 0.910 10.000 0.053 0.001 N NA
 1154534 1154535 SDY_0706 SDY_0707 galE modF FALSE 0.033 262.000 0.023 1.000   NA
 1154535 1154536 SDY_0707 SDY_0708 modF modE FALSE 0.580 68.000 0.009 0.078   NA
 1154537 1154538 SDY_0709 SDY_0710   modA FALSE 0.243 167.000 0.072 NA   NA
 1154538 1154539 SDY_0710 SDY_0711 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 1154539 1154540 SDY_0711 SDY_0712 modB modC TRUE 0.997 3.000 0.537 0.001 Y NA
 1154541 1154542 SDY_0713 SDY_0714 ybhA   FALSE 0.002 736.000 0.000 NA   NA
 1154542 1154543 SDY_0714 SDY_0715     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154543 1154544 SDY_0715 SDY_0716     TRUE 0.825 71.000 0.000 NA Y NA
 1154546 1154547 SDY_0718 SDY_0719     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154547 1154548 SDY_0719 SDY_0720     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154548 1154549 SDY_0720 SDY_0721     TRUE 0.935 57.000 0.500 NA   NA
 1154549 1154550 SDY_0721 SDY_0722     TRUE 0.962 45.000 0.500 NA   NA
 1154551 1154552 SDY_0723 SDY_0724     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154552 1154553 SDY_0724 SDY_0725     FALSE 0.001 1431.000 0.000 NA   NA
 1154553 1154554 SDY_0725 SDY_0726     TRUE 0.926 -76.000 1.000 NA   NA
 1154555 1154556 SDY_0727 SDY_0728     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154556 1154557 SDY_0728 SDY_0729     TRUE 0.735 97.000 0.000 NA Y NA
 1154557 1154558 SDY_0729 SDY_0730     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154559 1154560 SDY_0731 SDY_0732     FALSE 0.256 -72.000 0.000 NA   NA
 1154560 1154561 SDY_0732 SDY_0733     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154561 1154562 SDY_0733 SDY_0734   insA FALSE 0.511 51.000 0.000 NA   NA
 1154562 1154563 SDY_0734 SDY_0735 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154564 1154565 SDY_0736 SDY_0737 ybjF ybjO TRUE 0.929 41.000 0.226 NA   NA
 1154565 1154566 SDY_0737 SDY_0738 ybjO potI TRUE 0.855 61.000 0.264 NA   NA
 1154566 1154567 SDY_0738 SDY_0739 potI potH TRUE 0.995 -3.000 0.528 0.047 Y NA
 1154567 1154568 SDY_0739 SDY_0740 potH potG TRUE 0.996 10.000 0.857 1.000 Y NA
 1154568 1154569 SDY_0740 SDY_0741 potG potF TRUE 0.968 95.000 0.679 1.000 Y NA
 1154569 1154570 SDY_0741 SDY_0742 potF ybjN FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 1154570 1154571 SDY_0742 SDY_0743 ybjN rimK FALSE 0.397 88.000 0.065 NA   NA
 1154571 1154572 SDY_0743 SDY_0744 rimK mdaA FALSE 0.465 61.000 0.000 1.000 N NA
 1154572 1154573 SDY_0744 SDY_0745 mdaA ybjC TRUE 0.783 -16.000 0.159 NA   NA
 1154576 1154577 SDY_0748 SDY_0749     FALSE 0.017 333.000 0.000 1.000   NA
 1154579 1154580 SDY_0751 SDY_0752     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154581 1154582 SDY_0753 SDY_0754 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154582 1154583 SDY_0754 SDY_0755 insA   FALSE 0.276 93.000 0.000 1.000 N NA
 1154583 1154584 SDY_0755 SDY_0756     TRUE 0.998 3.000 0.689 0.047 Y NA
 1154584 1154585 SDY_0756 SDY_0757     TRUE 0.996 18.000 0.803 0.047 Y NA
 1154585 1154586 SDY_0757 SDY_0758     TRUE 0.857 20.000 0.083 1.000   NA
 1154586 1154587 SDY_0758 SDY_0759   ybiK TRUE 0.877 20.000 0.104 1.000   NA
 1154588 1154589 SDY_0760 SDY_0761 moeA moeB TRUE 0.995 0.000 0.323 0.003 Y NA
 1154591 1154592 SDY_0763 SDY_0764 ybiY ybiW TRUE 0.977 6.000 0.316 0.003 N NA
 1154592 1154593 SDY_0764 SDY_0765 ybiW   FALSE 0.258 146.000 0.000 1.000   NA
 1154594 1154595 SDY_0766 SDY_0767     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 1154597 1154598 SDY_0769 SDY_0770     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154599 1154600 SDY_0771 SDY_0772     FALSE 0.455 -13.000 0.000 NA   NA
 1154600 1154601 SDY_0772 SDY_0773     FALSE 0.013 301.000 0.000 NA   NA
 1154601 1154602 SDY_0773 SDY_0774     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1154602 1154603 SDY_0774 SDY_0775   ybiU FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 1154606 1154607 SDY_0778 SDY_0779 ybiR   FALSE 0.176 151.000 0.014 1.000 N NA
 1154610 1154611 SDY_0782 SDY_0783 ybiF dps FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 1154613 1154614 SDY_0785 SDY_0786 glnH glnP TRUE 0.855 139.000 0.051 0.059 Y NA
 1154614 1154615 SDY_0786 SDY_0787 glnP glnQ TRUE 0.963 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1154615 1154616 SDY_0787 SDY_0788 glnQ ybiO FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1154617 1154618 SDY_0789 SDY_0790   ybiN FALSE 0.002 1232.000 0.000 NA   NA
 1154619 1154620 SDY_0791 SDY_0792 ybiM   FALSE 0.020 265.000 0.000 NA   NA
 1154620 1154621 SDY_0792 SDY_0793     FALSE 0.636 39.000 0.000 NA   NA
 1154621 1154622 SDY_0793 SDY_0794     FALSE 0.082 174.000 0.000 NA N NA
 1154622 1154623 SDY_0794 SDY_0795   ybiX TRUE 0.915 42.000 0.171 1.000   NA
 1154623 1154624 SDY_0795 SDY_0796 ybiX ybiI FALSE 0.412 74.000 0.000 1.000   NA
 1154624 1154625 SDY_0796 SDY_0797 ybiI ybiJ FALSE 0.021 266.000 0.027 NA   NA
 1154626 1154627 SDY_0798 SDY_0799 ybiC ybiB FALSE 0.423 141.000 0.000 0.039 N NA
 1154627 1154628 SDY_0799 SDY_0800 ybiB dinG TRUE 0.766 28.000 0.041 1.000 N NA
 1154628 1154629 SDY_0800 SDY_0801 dinG   FALSE 0.050 397.000 0.000 NA Y NA
 1154630 1154631 SDY_0802 SDY_0803     FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1154635 1154636 SDY_0807 SDY_0808 ybiH   TRUE 0.959 0.000 0.236 1.000 N NA
 1154636 1154637 SDY_0808 SDY_0809   ybhF TRUE 0.939 -22.000 0.545 1.000   NA
 1154637 1154638 SDY_0809 SDY_0810 ybhF ybhS TRUE 0.972 -7.000 0.547 0.078   NA
 1154638 1154639 SDY_0810 SDY_0811 ybhS ybhR TRUE 0.996 11.000 0.609 0.005 Y NA
 1154641 1154642 SDY_0813 SDY_0814 ybhP ybhO TRUE 0.956 -3.000 0.333 NA   NA
 1154642 1154643 SDY_0814 SDY_0815 ybhO ybhN TRUE 0.853 0.000 0.071 NA   NA
 1154644 1154645 SDY_0816 SDY_0817   ybhL FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1154645 1154646 SDY_0817 SDY_0818 ybhL   FALSE 0.235 112.000 0.000 NA   NA
 1154647 1154648 SDY_0819 SDY_0820     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154649 1154650 SDY_0821 SDY_0822 moaE moaD TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 1154650 1154651 SDY_0822 SDY_0823 moaD moaC TRUE 0.980 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 1154651 1154652 SDY_0823 SDY_0824 moaC moaB TRUE 0.989 3.000 0.109 0.003 Y NA
 1154652 1154653 SDY_0824 SDY_0825 moaB moaA TRUE 0.984 22.000 0.108 0.003 Y NA
 1154655 1154656 SDY_0827 SDY_0828 uvrB bioD FALSE 0.007 579.000 0.000 0.077 N NA
 1154656 1154657 SDY_0828 SDY_0829 bioD bioC TRUE 0.966 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 1154657 1154658 SDY_0829 SDY_0830 bioC bioF TRUE 0.969 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 1154658 1154659 SDY_0830 SDY_0831 bioF bioB TRUE 0.988 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 1154660 1154661 SDY_0832 SDY_0833 bioA ybhB FALSE 0.317 59.000 0.003 NA   NA
 1154661 1154662 SDY_0833 SDY_0834 ybhB ipaH_1 FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 1154662 1154663 SDY_0834 SDY_0835 ipaH_1   FALSE 0.011 325.000 0.000 NA   NA
 1154663 1154664 SDY_0835 SDY_0836     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154664 1154665 SDY_0836 SDY_0837     TRUE 0.725 12.000 0.000 1.000   NA
 1154666 1154667 SDY_0838 SDY_0839 yliJ   FALSE 0.023 230.000 0.000 NA N NA
 1154668 1154669 SDY_0840 SDY_0841   dacC FALSE 0.244 -97.000 0.000 NA   NA
 1154670 1154671 SDY_0842 SDY_0843 deoR ybjG TRUE 0.882 58.000 0.235 1.000   NA
 1154672 1154673 SDY_0844 SDY_0845 cmr   FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 1154673 1154674 SDY_0845 SDY_0846     TRUE 0.989 45.000 0.500 NA Y NA
 1154674 1154675 SDY_0846 SDY_0847     FALSE 0.094 387.000 0.000 0.040 Y NA
 1154675 1154676 SDY_0847 SDY_0848     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154678 1154679 SDY_0849 SDY_0850     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1154679 1154680 SDY_0850 SDY_0852   yfaSR FALSE 0.002 1343.000 0.000 1.000   NA
 1154680 1154681 SDY_0852 SDY_0853 yfaSR   TRUE 0.941 1.000 0.182 NA   NA
 1154681 1154682 SDY_0853 SDY_0854     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154682 1154683 SDY_0854 SDY_0855     FALSE 0.552 -6.000 0.000 NA   NA
 1154683 1154684 SDY_0855 SDY_0856   rcsC FALSE 0.017 275.000 0.000 NA   NA
 1154685 1154686 SDY_0857 SDY_0858 rcsB yojN TRUE 0.993 17.000 0.558 1.000 Y NA
 1154686 1154687 SDY_0858 SDY_0859 yojN   FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1154688 1154689 SDY_0860 SDY_0861   ompC FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 1154689 1154690 SDY_0861 SDY_0862 ompC yojL FALSE 0.432 112.000 0.066 1.000 N NA
 1154690 1154691 SDY_0862 SDY_0863 yojL ada FALSE 0.342 74.000 0.019 1.000 N NA
 1154691 1154692 SDY_0863 SDY_0864 ada alkB TRUE 0.885 0.000 0.015 0.012 N NA
 1154692 1154693 SDY_0864 SDY_0865 alkB yojI FALSE 0.528 76.000 0.076 1.000 N NA
 1154693 1154694 SDY_0865 SDY_0866 yojI yojH FALSE 0.063 218.000 0.000 1.000   NA
 1154695 1154696 SDY_0869 SDY_0867 eco   FALSE 0.212 -1096.000 0.000 NA   NA
 1154696 1154697 SDY_0867 SDY_0868     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154698 1154699 SDY_0870 SDY_0871 napF napD TRUE 0.885 -10.000 0.209 1.000   NA
 1154699 1154700 SDY_0871 SDY_0872 napD napA TRUE 0.991 -3.000 0.875 0.004 N NA
 1154700 1154701 SDY_0872 SDY_0873 napA napG TRUE 0.972 7.000 0.243 0.004   NA
 1154701 1154702 SDY_0873 SDY_0874 napG napH TRUE 0.978 -13.000 0.795 0.004   NA
 1154702 1154703 SDY_0874 SDY_0875 napH napB TRUE 0.993 -3.000 0.316 0.004 Y NA
 1154703 1154704 SDY_0875 SDY_0876 napB napC TRUE 0.995 10.000 0.490 0.002 Y NA
 1154704 1154705 SDY_0876 SDY_0877 napC ccmA TRUE 0.754 19.000 0.043 1.000 N NA
 1154705 1154706 SDY_0877 SDY_0878 ccmA ccmB TRUE 0.996 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 1154706 1154707 SDY_0878 SDY_0879 ccmB ccmC TRUE 0.995 42.000 0.501 0.001 Y NA
 1154707 1154708 SDY_0879 SDY_0880 ccmC ccmD TRUE 0.974 -3.000 0.501 1.000 N NA
 1154708 1154709 SDY_0880 SDY_0881 ccmD ccmE TRUE 0.961 -3.000 0.344 1.000 N NA
 1154709 1154710 SDY_0881 SDY_0882 ccmE ccmF TRUE 0.991 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 1154710 1154711 SDY_0882 SDY_0883 ccmF dsbE TRUE 0.997 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 1154711 1154712 SDY_0883 SDY_0884 dsbE ccmH TRUE 0.994 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 1154713 1154714 SDY_0885 SDY_0886 narP   FALSE 0.002 629.000 0.000 NA N NA
 1154714 1154715 SDY_0886 SDY_0887   insB FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 1154715 1154716 SDY_0887 SDY_0888 insB insA FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1154718 1154719 SDY_0890 SDY_0891   yejM FALSE 0.295 75.000 0.000 NA   NA
 1154719 1154720 SDY_0891 SDY_0892 yejM yejL TRUE 0.709 20.000 0.040 NA   NA
 1154722 1154723 SDY_0894 SDY_0895 rplY yejH FALSE 0.515 125.000 0.024 0.012 N NA
 1154724 1154725 SDY_0896 SDY_0897 rsuA bcr TRUE 0.754 28.000 0.036 1.000 N NA
 1154725 1154726 SDY_0897 SDY_0898 bcr yejG FALSE 0.010 333.000 0.000 NA   NA
 1154727 1154728 SDY_0899 SDY_0900 yejF yejE TRUE 0.989 2.000 0.758 1.000   NA
 1154728 1154729 SDY_0900 SDY_0901 yejE yejB TRUE 0.993 0.000 0.833 0.046   NA
 1154729 1154730 SDY_0901 SDY_0902 yejB yejA TRUE 0.993 1.000 0.848 0.046   NA
 1154730 1154731 SDY_0902 SDY_0903 yejA rtn TRUE 0.819 82.000 0.394 NA N NA
 1154731 1154732 SDY_0903 SDY_0904 rtn spr FALSE 0.408 181.000 0.219 NA N NA
 1154732 1154733 SDY_0904 SDY_0905 spr   FALSE 0.003 412.000 0.000 NA N NA
 1154733 1154734 SDY_0905 SDY_0906   yeiR TRUE 0.960 3.000 0.275 NA   NA
 1154734 1154735 SDY_0906 SDY_0907 yeiR yeiQ FALSE 0.368 175.000 0.167 NA   NA
 1154735 1154736 SDY_0907 SDY_0908 yeiQ yeiP FALSE 0.047 223.000 0.000 1.000 N NA
 1154736 1154737 SDY_0908 SDY_0909 yeiP yeiO FALSE 0.006 406.000 0.000 1.000 N NA
 1154737 1154738 SDY_0909 SDY_0910 yeiO   FALSE 0.213 140.000 0.000 NA   NA
 1154739 1154740 SDY_0911 SDY_0912     TRUE 0.647 49.000 0.000 1.000   NA
 1154740 1154741 SDY_0912 SDY_0913     FALSE 0.003 574.000 0.000 NA   NA
 1154741 1154742 SDY_0913 SDY_0914     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1154742 1154743 SDY_0914 SDY_0915     TRUE 0.971 44.000 0.000 0.003 Y NA
 1154743 1154744 SDY_0915 SDY_0916     TRUE 0.987 -40.000 0.667 0.003 Y NA
 1154744 1154745 SDY_0916 SDY_0917   ycbF TRUE 0.975 -34.000 0.500 1.000 Y NA
 1154745 1154746 SDY_0917 SDY_0918 ycbF pyrD FALSE 0.283 111.000 0.000 1.000 N NA
 1154746 1154747 SDY_0918 SDY_0919 pyrD ycbW FALSE 0.409 138.000 0.081 NA   NA
 1154749 1154750 SDY_0921 SDY_0922 ycbY uup TRUE 0.816 12.000 0.061 1.000   NA
 1154750 1154751 SDY_0922 SDY_0923 uup pqiA FALSE 0.360 130.000 0.054 NA   NA
 1154751 1154752 SDY_0923 SDY_0924 pqiA pqiB TRUE 0.986 5.000 0.819 NA   NA
 1154752 1154753 SDY_0924 SDY_0925 pqiB ymbA TRUE 0.969 12.000 0.531 NA   NA
 1154753 1154754 SDY_0925 SDY_0926 ymbA rmf FALSE 0.023 256.000 0.000 NA   NA
 1154755 1154756 SDY_0927 SDY_0928 fabA   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154758 1154759 SDY_0930 SDY_0933 ompA sulA FALSE 0.007 358.000 0.000 NA   NA
 1154760 1154761 SDY_0931 SDY_0932     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154761 1154762 SDY_0932 SDY_0934     FALSE 0.003 471.000 0.000 NA N NA
 1154763 1154764 SDY_0935 SDY_0936   yccF TRUE 0.839 10.000 0.090 NA   NA
 1154766 1154767 SDY_0938 SDY_0939 mgsA   FALSE 0.327 96.000 0.055 NA   NA
 1154769 1154770 SDY_0941 SDY_0942 yccV yccW TRUE 0.859 7.000 0.094 NA   NA
 1154772 1154773 SDY_0944 SDY_0945 yccK yccA FALSE 0.611 91.000 0.140 1.000   NA
 1154773 1154774 SDY_0945 SDY_0946 yccA   FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1154775 1154776 SDY_0947 SDY_0948 hyaA hyaB TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1154776 1154777 SDY_0948 SDY_0949 hyaB hyaC TRUE 0.959 92.000 0.355 0.042 Y NA
 1154777 1154778 SDY_0949 SDY_0950 hyaC hyaD TRUE 0.982 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 1154778 1154779 SDY_0950 SDY_0951 hyaD hyaE TRUE 0.844 -3.000 0.096 NA   NA
 1154779 1154780 SDY_0951 SDY_0952 hyaE hyaF TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154780 1154781 SDY_0952 SDY_0953 hyaF appC FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 1154781 1154782 SDY_0953 SDY_0954 appC appB TRUE 0.983 12.000 0.158 0.042 Y NA
 1154782 1154783 SDY_0954 SDY_0955 appB yccB TRUE 0.823 13.000 0.105 NA   NA
 1154783 1154784 SDY_0955 SDY_0956 yccB appA FALSE 0.272 80.000 0.000 NA   NA
 1154785 1154786 SDY_0957 SDY_0958 yccC etp TRUE 0.986 20.000 1.000 1.000 N NA
 1154786 1154787 SDY_0958 SDY_0959 etp yccZ TRUE 0.964 -12.000 0.750 1.000 N NA
 1154787 1154788 SDY_0959 SDY_0960 yccZ ymcA FALSE 0.543 46.000 0.000 NA   NA
 1154788 1154789 SDY_0960 SDY_0961 ymcA ymcB TRUE 0.836 0.000 0.060 NA   NA
 1154789 1154790 SDY_0961 SDY_0962 ymcB ymcC TRUE 0.977 -3.000 0.600 NA   NA
 1154790 1154791 SDY_0962 SDY_0963 ymcC ymcD FALSE 0.219 107.000 0.000 NA   NA
 1154791 1154792 SDY_0963 SDY_0964 ymcD cspH FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 1154792 1154793 SDY_0964 SDY_0965 cspH   FALSE 0.012 277.000 0.000 NA N NA
 1154793 1154794 SDY_0965 SDY_0966   yccM FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1154794 1154795 SDY_0966 SDY_0967 yccM torS FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 1154798 1154799 SDY_0970 SDY_0971 torC torA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154799 1154800 SDY_0971 SDY_0972 torA torD FALSE 0.334 68.000 0.000 NA   NA
 1154801 1154802 SDY_0973 SDY_0974 yccD cbpA TRUE 0.980 0.000 0.512 NA   NA
 1154805 1154806 SDY_0977 SDY_0978   agp FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 1154807 1154808 SDY_0979 SDY_0980 yccJ wrbA TRUE 0.947 21.000 0.290 NA   NA
 1154808 1154809 SDY_0980 SDY_0981 wrbA ycdG FALSE 0.004 629.000 0.000 1.000   NA
 1154809 1154810 SDY_0981 SDY_0982 ycdG   TRUE 0.898 -45.000 0.533 1.000   NA
 1154810 1154811 SDY_0982 SDY_0983     TRUE 0.979 47.000 0.625 0.023   NA
 1154811 1154812 SDY_0983 SDY_0984     TRUE 0.952 10.000 0.256 1.000   NA
 1154812 1154813 SDY_0984 SDY_0985     TRUE 0.964 8.000 0.365 NA   NA
 1154813 1154814 SDY_0985 SDY_0986     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1154814 1154815 SDY_0986 SDY_0987     FALSE 0.300 -42.000 0.000 NA   NA
 1154819 1154820 SDY_0991 SDY_0992     FALSE 0.002 736.000 0.000 NA   NA
 1154821 1154822 SDY_0993 SDY_0994 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154824 1154825 SDY_0996 SDY_0997 csgD csgE TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1154825 1154826 SDY_0997 SDY_0998 csgE csgF TRUE 0.982 25.000 0.723 NA   NA
 1154826 1154827 SDY_0998 SDY_0999 csgF csgG TRUE 0.732 27.000 0.043 NA   NA
 1154827 1154828 SDY_0999 SDY_1000 csgG   FALSE 0.004 391.000 0.000 NA N NA
 1154829 1154830 SDY_1001 SDY_1002 ycdZ ycdY TRUE 0.796 54.000 0.145 NA   NA
 1154830 1154831 SDY_1002 SDY_1003 ycdY ycdX TRUE 0.971 24.000 0.417 1.000   NA
 1154831 1154832 SDY_1003 SDY_1004 ycdX ycdW TRUE 0.961 55.000 0.169 1.000 Y NA
 1154834 1154835 SDY_1006 SDY_1007     FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 1154835 1154836 SDY_1007 SDY_1008     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1154836 1154837 SDY_1008 SDY_1009   yeeV TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154837 1154838 SDY_1009 SDY_1010 yeeV yeeU FALSE 0.538 47.000 0.000 NA   NA
 1154838 1154839 SDY_1010 SDY_1011 yeeU   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1154839 1154840 SDY_1011 SDY_1012   yeeT TRUE 0.978 19.000 0.667 NA   NA
 1154840 1154841 SDY_1012 SDY_1013 yeeT   FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1154841 1154842 SDY_1013 SDY_1014     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1154842 1154843 SDY_1014 SDY_1015     FALSE 0.047 208.000 0.000 NA   NA
 1154843 1154844 SDY_1015 SDY_1016     FALSE 0.005 394.000 0.000 NA   NA
 1154844 1154845 SDY_1016 SDY_1017     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 1154847 1154848 SDY_1019 SDY_1020     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154848 1154849 SDY_1020 SDY_1021     FALSE 0.020 712.000 0.000 NA Y NA
 1154851 1154852 SDY_1023 SDY_1024 iroE iroD FALSE 0.411 85.000 0.065 NA   NA
 1154852 1154853 SDY_1024 SDY_1025 iroD iroC TRUE 0.865 104.000 0.667 NA N NA
 1154853 1154854 SDY_1025 SDY_1026 iroC iroB FALSE 0.263 140.000 0.000 1.000 N NA
 1154856 1154857 SDY_1028 SDY_1029     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154857 1154858 SDY_1029 SDY_1030     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1154858 1154859 SDY_1030 SDY_1031     FALSE 0.023 633.000 0.000 NA Y NA
 1154861 1154862 SDY_1033 SDY_1034     FALSE 0.036 257.000 0.000 1.000   NA
 1154862 1154863 SDY_1034 SDY_1035     TRUE 0.993 1.000 0.790 0.041   NA
 1154863 1154864 SDY_1035 SDY_1036     FALSE 0.035 226.000 0.000 NA   NA
 1154869 1154870 SDY_1041 SDY_1042     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1154870 1154871 SDY_1042 SDY_1043     TRUE 0.775 40.000 0.062 NA   NA
 1154871 1154872 SDY_1043 SDY_1044   yedJ TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1154872 1154873 SDY_1044 SDY_1045 yedJ dcm FALSE 0.342 67.000 0.000 NA   NA
 1154873 1154874 SDY_1045 SDY_1046 dcm vsr TRUE 0.899 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 1154876 1154877 SDY_1048 SDY_1049 yedI   FALSE 0.289 79.000 0.025 NA   NA
 1154877 1154878 SDY_1049 SDY_1050     FALSE 0.349 189.000 0.208 NA   NA
 1154879 1154880 SDY_1051 SDY_1052     FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 1154881 1154882 SDY_1053 SDY_1054 dsrB   FALSE 0.002 639.000 0.000 NA   NA
 1154883 1154884 SDY_1055 SDY_1056 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154884 1154885 SDY_1056 SDY_1057 insA   FALSE 0.097 334.000 0.000 NA Y NA
 1154886 1154887 SDY_1058 SDY_1059     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1154887 1154888 SDY_1059 SDY_1060     FALSE 0.002 1057.000 0.000 NA   NA
 1154888 1154889 SDY_1060 SDY_1061     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 1154889 1154890 SDY_1061 SDY_1062   ipaH_3 FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 1154891 1154892 SDY_1063 SDY_1064     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154892 1154893 SDY_1064 SDY_1065     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 1154893 1154894 SDY_1065 SDY_1066     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154894 1154895 SDY_1066 SDY_1067     FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1154896 1154897 SDY_1068 SDY_1069     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154898 1154899 SDY_1070 SDY_1071     FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 1154900 1154901 SDY_1072 SDY_1073     FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1154901 1154902 SDY_1073 SDY_1074     FALSE 0.016 286.000 0.000 NA   NA
 1154902 1154903 SDY_1074 SDY_1075     FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1154903 1154904 SDY_1075 SDY_1076     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154904 1154905 SDY_1076 SDY_1077     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 1154906 1154907 SDY_1078 SDY_1079     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154907 1154908 SDY_1079 SDY_1080     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 1154908 1154909 SDY_1080 SDY_1081     TRUE 0.656 24.000 0.000 NA   NA
 1154911 1154912 SDY_1083 SDY_1084   yedK FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 1154912 1154913 SDY_1084 SDY_1085 yedK yedF FALSE 0.225 109.000 0.000 NA   NA
 1154913 1154914 SDY_1085 SDY_1086 yedF yedE TRUE 0.984 -3.000 0.844 NA   NA
 1154916 1154917 SDY_1088 SDY_1089 amyA fliT FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1154917 1154918 SDY_1089 SDY_1090 fliT fliS TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1154918 1154919 SDY_1090 SDY_1091 fliS fliD TRUE 0.993 25.000 0.284 0.001 Y NA
 1154921 1154922 SDY_1093 SDY_1094 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1154923 1154924 SDY_1095 SDY_1096 fliA fliZ TRUE 0.888 10.000 0.108 1.000   NA
 1154924 1154925 SDY_1096 SDY_1097 fliZ fliY TRUE 0.785 88.000 0.280 1.000   NA
 1154925 1154926 SDY_1097 SDY_1098 fliY yedO TRUE 0.951 105.000 0.469 1.000 Y NA
 1154926 1154927 SDY_1098 SDY_1099 yedO yecS TRUE 0.957 15.000 0.050 1.000 Y NA
 1154927 1154928 SDY_1099 SDY_1100 yecS yecC TRUE 0.979 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 1154928 1154929 SDY_1100 SDY_1101 yecC sdiA FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1154929 1154930 SDY_1101 SDY_1102 sdiA   FALSE 0.233 -584.000 0.000 NA   NA
 1154932 1154933 SDY_1104 SDY_1105 uvrY uvrC TRUE 0.851 -3.000 0.086 1.000 N NA
 1154933 1154934 SDY_1105 SDY_1106 uvrC pgsA FALSE 0.568 164.000 0.227 1.000 N NA
 1154934 1154935 SDY_1106 SDY_1107 pgsA   FALSE 0.155 152.000 0.000 NA   NA
 1154935 1154936 SDY_1107 SDY_1108     FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1154936 1154937 SDY_1108 SDY_1109     FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1154937 1154938 SDY_1109 SDY_1110   yecA FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 1154941 1154942 SDY_1113 SDY_1114 ftn   FALSE 0.117 171.000 0.000 NA   NA
 1154942 1154943 SDY_1114 SDY_1115     FALSE 0.044 211.000 0.000 NA   NA
 1154945 1154946 SDY_1117 SDY_1119     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 1154947 1154948 SDY_1118 SDY_1120   araF FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1154948 1154949 SDY_1120 SDY_1121 araF araG TRUE 0.990 70.000 0.917 0.002 Y NA
 1154949 1154950 SDY_1121 SDY_1122 araG araH TRUE 0.994 12.000 0.451 0.002 Y NA
 1154950 1154951 SDY_1122 SDY_1123 araH   FALSE 0.002 544.000 0.000 NA N NA
 1154951 1154952 SDY_1123 SDY_1124     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1154953 1154954 SDY_1125 SDY_1126     TRUE 0.976 13.000 0.704 NA   NA
 1154954 1154955 SDY_1126 SDY_1127     FALSE 0.568 209.000 0.613 1.000   NA
 1154956 1154957 SDY_1128 SDY_1129 holE   TRUE 0.706 102.000 0.222 1.000   NA
 1154957 1154958 SDY_1129 SDY_1130     TRUE 0.976 24.000 0.500 1.000   NA
 1154959 1154960 SDY_1131 SDY_1132 ptrB yebE FALSE 0.117 209.000 0.092 NA   NA
 1154960 1154961 SDY_1132 SDY_1133 yebE yebF FALSE 0.013 324.000 0.028 NA   NA
 1154961 1154962 SDY_1133 SDY_1134 yebF yebG FALSE 0.488 55.000 0.027 NA   NA
 1154964 1154965 SDY_1136 SDY_1137 eda edd TRUE 0.993 37.000 0.523 1.000 Y NA
 1154965 1154966 SDY_1137 SDY_1138 edd zwf FALSE 0.305 235.000 0.041 1.000 Y NA
 1154967 1154968 SDY_1139 SDY_1140     TRUE 0.755 30.000 0.024 1.000   NA
 1154968 1154969 SDY_1140 SDY_1141   pykA FALSE 0.498 128.000 0.071 1.000   NA
 1154970 1154971 SDY_1142 SDY_1143 msbB yebA TRUE 0.939 120.000 0.299 1.000 Y NA
 1154971 1154972 SDY_1143 SDY_1144 yebA znuA TRUE 0.870 16.000 0.131 1.000 N NA
 1154973 1154974 SDY_1145 SDY_1146 yebM yebI TRUE 0.997 -3.000 0.755 0.075 Y NA
 1154975 1154976 SDY_1147 SDY_1148 ruvB ruvA TRUE 0.996 9.000 0.549 0.001 Y NA
 1154978 1154979 SDY_1150 SDY_1151 ruvC yebC TRUE 0.944 35.000 0.277 NA   NA
 1154979 1154980 SDY_1151 SDY_1152 yebC ntpA TRUE 0.702 29.000 0.035 NA   NA
 1154980 1154981 SDY_1152 SDY_1153 ntpA aspS FALSE 0.398 118.000 0.050 1.000 N NA
 1154982 1154983 SDY_1154 SDY_1155     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1154983 1154984 SDY_1155 SDY_1156   insA FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 1154984 1154985 SDY_1156 SDY_1157 insA insB TRUE 0.951 22.000 0.000 NA Y NA
 1154985 1154986 SDY_1157 SDY_1158 insB   FALSE 0.016 1102.000 0.000 NA Y NA
 1154986 1154987 SDY_1158 SDY_1159     TRUE 0.971 27.000 0.500 NA   NA
 1154987 1154988 SDY_1159 SDY_1160     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1154989 1154990 SDY_1161 SDY_1162 insB   TRUE 0.893 -15.000 0.000 NA Y NA
 1154990 1154991 SDY_1162 SDY_1163     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1154991 1154992 SDY_1163 SDY_1164   insA TRUE 0.751 93.000 0.000 NA Y NA
 1154992 1154993 SDY_1164 SDY_1165 insA   FALSE 0.071 361.000 0.000 NA Y NA
 1154993 1154994 SDY_1165 SDY_1166     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1154995 1154996 SDY_1167 SDY_1168   yecN TRUE 0.781 53.000 0.126 NA   NA
 1154996 1154997 SDY_1168 SDY_1169 yecN yecO TRUE 0.822 41.000 0.089 NA   NA
 1154997 1154998 SDY_1169 SDY_1170 yecO yecP TRUE 0.952 -3.000 0.315 NA   NA
 1154999 1155000 SDY_1171 SDY_1175 bisZ yecK TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1155000 1155001 SDY_1175 SDY_1172 yecK   FALSE 0.225 -721.000 0.000 NA   NA
 1155001 1155002 SDY_1172 SDY_1173     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155002 1155003 SDY_1173 SDY_1174     FALSE 0.002 754.000 0.000 NA   NA
 1155003 1155004 SDY_1174 SDY_1176     FALSE 0.017 906.000 0.000 NA Y NA
 1155006 1155007 SDY_1178 SDY_1179 cutC yecM TRUE 0.735 14.000 0.057 NA   NA
 1155008 1155009 SDY_1180 SDY_1181 argS insA FALSE 0.039 235.000 0.000 1.000 N NA
 1155009 1155010 SDY_1181 SDY_1182 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155011 1155012 SDY_1183 SDY_1184 flhE flhA TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155012 1155013 SDY_1184 SDY_1185 flhA   FALSE 0.420 59.000 0.000 NA   NA
 1155014 1155015 SDY_1186 SDY_1187     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155016 1155017 SDY_1188 SDY_1189 motB motA TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155017 1155018 SDY_1189 SDY_1190 motA flhC TRUE 0.849 126.000 0.408 1.000   NA
 1155018 1155019 SDY_1190 SDY_1191 flhC flhD TRUE 0.924 3.000 0.000 0.001   NA
 1155021 1155022 SDY_1193 SDY_1194 otsA otsB FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1155022 1155023 SDY_1194 SDY_1195 otsB   FALSE 0.552 -6.000 0.000 NA   NA
 1155023 1155024 SDY_1195 SDY_1196     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1155024 1155025 SDY_1196 SDY_1197     TRUE 0.859 -27.000 0.000 NA Y NA
 1155025 1155026 SDY_1197 SDY_1198     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155027 1155028 SDY_1199 SDY_1200 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155028 1155029 SDY_1200 SDY_1201 insB   FALSE 0.017 847.000 0.000 NA Y NA
 1155029 1155030 SDY_1201 SDY_1202     FALSE 0.005 393.000 0.000 NA   NA
 1155033 1155034 SDY_1205 SDY_1206 minE minD TRUE 0.995 4.000 0.618 NA Y NA
 1155034 1155035 SDY_1206 SDY_1207 minD minC TRUE 0.993 24.000 0.466 1.000 Y NA
 1155035 1155036 SDY_1207 SDY_1208 minC   FALSE 0.002 640.000 0.000 NA N NA
 1155039 1155040 SDY_1211 SDY_1212 ycgL   FALSE 0.451 72.000 0.056 NA   NA
 1155040 1155041 SDY_1212 SDY_1213   ycgN FALSE 0.440 92.000 0.088 NA   NA
 1155041 1155042 SDY_1213 SDY_1214 ycgN insA FALSE 0.260 83.000 0.000 NA   NA
 1155042 1155043 SDY_1214 SDY_1215 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155043 1155044 SDY_1215 SDY_1216 insB   FALSE 0.030 530.000 0.000 NA Y NA
 1155048 1155049 SDY_1220 SDY_1221 umuD umuC TRUE 0.775 0.000 0.000 1.000 N NA
 1155050 1155051 SDY_1222 SDY_1223 dsbB nhaB TRUE 0.865 146.000 0.723 1.000 N NA
 1155054 1155055 SDY_1226 SDY_1227 dadA dadX TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1155058 1155059 SDY_1230 SDY_1232     FALSE 0.417 95.000 0.103 NA N NA
 1155063 1155064 SDY_1235 SDY_1236 prrA modD TRUE 0.750 26.000 0.034 1.000 N NA
 1155064 1155065 SDY_1236 SDY_1237 modD   TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155067 1155068 SDY_1239 SDY_1240     TRUE 0.899 10.000 0.123 1.000   NA
 1155068 1155069 SDY_1240 SDY_1241     TRUE 0.996 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 1155069 1155070 SDY_1241 SDY_1242     TRUE 0.979 0.000 0.422 1.000   NA
 1155070 1155071 SDY_1242 SDY_1243     TRUE 0.826 49.000 0.000 0.002   NA
 1155071 1155072 SDY_1243 SDY_1244     FALSE 0.025 250.000 0.000 NA   NA
 1155072 1155073 SDY_1244 SDY_1246   treA FALSE 0.002 642.000 0.000 NA   NA
 1155075 1155076 SDY_1247 SDY_1248 ycgC   TRUE 0.677 8.000 0.000 NA   NA
 1155078 1155079 SDY_1250 SDY_1251     FALSE 0.002 650.000 0.000 NA   NA
 1155079 1155080 SDY_1251 SDY_1252   ychF FALSE 0.002 573.000 0.000 NA N NA
 1155080 1155081 SDY_1252 SDY_1253 ychF pth TRUE 0.911 117.000 0.184 1.000 Y NA
 1155083 1155084 SDY_1255 SDY_1256 ychM prsA FALSE 0.207 152.000 0.027 1.000 N NA
 1155084 1155085 SDY_1256 SDY_1257 prsA ychB FALSE 0.282 151.000 0.053 1.000 N NA
 1155085 1155086 SDY_1257 SDY_1258 ychB hemM TRUE 0.931 0.000 0.157 1.000 N NA
 1155087 1155088 SDY_1259 SDY_1260 hemA prfA TRUE 0.939 42.000 0.171 0.039 N NA
 1155088 1155089 SDY_1260 SDY_1261 prfA hemK TRUE 0.993 0.000 0.229 0.039 Y NA
 1155089 1155090 SDY_1261 SDY_1262 hemK   TRUE 0.858 -3.000 0.109 NA   NA
 1155090 1155091 SDY_1262 SDY_1263   ychA TRUE 0.940 4.000 0.195 NA   NA
 1155091 1155092 SDY_1263 SDY_1264 ychA kdsA TRUE 0.866 36.000 0.089 1.000   NA
 1155093 1155094 SDY_1265 SDY_1266   chaA FALSE 0.006 378.000 0.000 NA   NA
 1155095 1155096 SDY_1267 SDY_1268 insA insB FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1155096 1155097 SDY_1268 SDY_1269 insB chaB FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 1155097 1155098 SDY_1269 SDY_1270 chaB chaC FALSE 0.535 137.000 0.140 NA   NA
 1155099 1155100 SDY_1271 SDY_1272 ychN   FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 1155101 1155102 SDY_1273 SDY_1274   ychP FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155103 1155104 SDY_1275 SDY_1276 narL narX TRUE 0.992 -7.000 0.521 0.010 Y NA
 1155105 1155106 SDY_1277 SDY_1278   narK FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 1155106 1155107 SDY_1278 SDY_1279 narK narG FALSE 0.007 393.000 0.000 1.000 N NA
 1155107 1155108 SDY_1279 SDY_1280 narG narH TRUE 0.995 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 1155108 1155109 SDY_1280 SDY_1281 narH narJ TRUE 0.996 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 1155109 1155110 SDY_1281 SDY_1282 narJ narI TRUE 0.997 0.000 0.500 0.004 Y NA
 1155111 1155112 SDY_1283 SDY_1284   purU FALSE 0.143 159.000 0.000 NA   NA
 1155112 1155113 SDY_1284 SDY_1285 purU ychJ TRUE 0.876 50.000 0.200 NA   NA
 1155114 1155115 SDY_1286 SDY_1287 ychK hnr FALSE 0.049 258.000 0.048 1.000   NA
 1155115 1155116 SDY_1287 SDY_1288 hnr galU FALSE 0.338 202.000 0.235 1.000 N NA
 1155120 1155121 SDY_1292 SDY_1293   insA TRUE 0.916 51.000 0.000 NA Y NA
 1155121 1155122 SDY_1293 SDY_1294 insA insB FALSE 0.587 45.000 0.000 NA   NA
 1155124 1155125 SDY_1296 SDY_1297   insA TRUE 0.770 129.000 0.000 NA Y NA
 1155125 1155126 SDY_1297 SDY_1298 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155128 1155129 SDY_1300 SDY_1301   oppA FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 1155129 1155130 SDY_1301 SDY_1302 oppA oppB TRUE 0.923 86.000 0.151 0.045 Y NA
 1155130 1155131 SDY_1302 SDY_1303 oppB oppC TRUE 0.996 15.000 0.870 0.045 Y NA
 1155131 1155132 SDY_1303 SDY_1304 oppC oppD TRUE 0.993 12.000 0.554 1.000 Y NA
 1155132 1155133 SDY_1304 SDY_1305 oppD oppF TRUE 0.995 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1155134 1155135 SDY_1306 SDY_1307   cls TRUE 0.934 35.000 0.231 NA   NA
 1155135 1155136 SDY_1307 SDY_1308 cls kch FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000 N NA
 1155136 1155137 SDY_1308 SDY_1309 kch yciI FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 1155138 1155139 SDY_1310 SDY_1311     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155139 1155140 SDY_1311 SDY_1312     FALSE 0.401 205.000 0.000 1.000 Y NA
 1155140 1155141 SDY_1312 SDY_1313     TRUE 0.792 81.000 0.000 NA Y NA
 1155141 1155142 SDY_1313 SDY_1314     TRUE 0.971 27.000 0.500 NA   NA
 1155142 1155143 SDY_1314 SDY_1315     FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1155143 1155144 SDY_1315 SDY_1316   tonB FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 1155145 1155146 SDY_1317 SDY_1318 yciA yciB FALSE 0.538 105.000 0.167 NA N NA
 1155146 1155147 SDY_1318 SDY_1319 yciB yciC TRUE 0.784 30.000 0.061 NA   NA
 1155149 1155150 SDY_1321 SDY_1322 yciE   TRUE 0.754 28.000 0.000 1.000   NA
 1155151 1155152 SDY_1323 SDY_1324 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155152 1155153 SDY_1324 SDY_1325 insB   FALSE 0.034 484.000 0.000 NA Y NA
 1155153 1155154 SDY_1325 SDY_1326     TRUE 0.868 62.000 0.000 NA Y NA
 1155154 1155155 SDY_1326 SDY_1327     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155156 1155157 SDY_1328 SDY_1329 trpA trpB TRUE 0.998 0.000 0.947 0.001 Y NA
 1155157 1155158 SDY_1329 SDY_1330 trpB trpC TRUE 0.990 12.000 0.221 0.001 Y NA
 1155158 1155159 SDY_1330 SDY_1331 trpC trpD TRUE 0.992 1.000 0.293 1.000 Y NA
 1155159 1155160 SDY_1331 SDY_1332 trpD trpE TRUE 0.982 0.000 0.010 0.001 Y NA
 1155160 1155161 SDY_1332 SDY_1333 trpE trpL FALSE 0.232 92.000 0.023 NA   NA
 1155162 1155163 SDY_1334 SDY_1335 yciV yciO TRUE 0.820 -39.000 0.281 NA   NA
 1155163 1155164 SDY_1335 SDY_1336 yciO insA FALSE 0.287 65.000 0.000 NA N NA
 1155164 1155165 SDY_1336 SDY_1337 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155165 1155166 SDY_1337 SDY_1338 insB   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155166 1155167 SDY_1338 SDY_1339   yciL FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1155168 1155169 SDY_1340 SDY_1341 btuR yciK TRUE 0.791 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1155172 1155173 SDY_1344 SDY_1345 topA cysB FALSE 0.045 210.000 0.008 1.000 N NA
 1155174 1155175 SDY_1346 SDY_1347 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155176 1155177 SDY_1348 SDY_1349   yciX TRUE 0.938 -18.000 0.556 NA   NA
 1155177 1155178 SDY_1349 SDY_1350 yciX acnA FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 1155179 1155180 SDY_1351 SDY_1352     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155180 1155181 SDY_1352 SDY_1353   ribA FALSE 0.001 760.000 0.000 NA N NA
 1155182 1155183 SDY_1354 SDY_1355 pgpB yciS FALSE 0.450 149.000 0.143 NA   NA
 1155183 1155184 SDY_1355 SDY_1356 yciS yciM TRUE 0.979 7.000 0.576 NA   NA
 1155184 1155185 SDY_1356 SDY_1357 yciM pyrF FALSE 0.222 193.000 0.125 1.000 N NA
 1155185 1155186 SDY_1357 SDY_1358 pyrF yciH TRUE 0.781 -3.000 0.045 1.000 N NA
 1155187 1155188 SDY_1359 SDY_1360 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155188 1155189 SDY_1360 SDY_1361 insA   FALSE 0.162 166.000 0.000 1.000 N NA
 1155189 1155190 SDY_1361 SDY_1362     FALSE 0.566 90.000 0.146 NA   NA
 1155190 1155191 SDY_1362 SDY_1363   yciR FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 1155192 1155193 SDY_1364 SDY_1365 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155194 1155195 SDY_1366 SDY_1367 rnb yciW FALSE 0.609 68.000 0.105 NA   NA
 1155195 1155196 SDY_1367 SDY_1368 yciW fabI FALSE 0.045 251.000 0.057 NA   NA
 1155196 1155197 SDY_1368 SDY_1369 fabI   FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1155200 1155201 SDY_1372 SDY_1373     TRUE 0.977 10.000 0.367 0.044   NA
 1155201 1155202 SDY_1373 SDY_1374     TRUE 0.789 49.000 0.000 0.044   NA
 1155202 1155203 SDY_1374 SDY_1375     TRUE 0.944 9.000 0.143 0.044   NA
 1155204 1155205 SDY_1376 SDY_1377   sapF FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 1155205 1155206 SDY_1377 SDY_1378 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.013 Y NA
 1155206 1155207 SDY_1378 SDY_1379 sapD sapC TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1155208 1155209 SDY_1380 SDY_1381 int insA FALSE 0.349 214.000 0.000 1.000 Y NA
 1155210 1155211 SDY_1382 SDY_1383   bet TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1155211 1155212 SDY_1383 SDY_1384 bet gam TRUE 0.753 6.000 0.040 NA   NA
 1155212 1155213 SDY_1384 SDY_1385 gam   TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155214 1155215 SDY_1386 SDY_1387     TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1155215 1155216 SDY_1387 SDY_1388     TRUE 0.865 29.000 0.000 0.038   NA
 1155216 1155217 SDY_1388 SDY_1389   stxA FALSE 0.174 173.000 0.000 1.000   NA
 1155217 1155218 SDY_1389 SDY_1390 stxA stxB TRUE 0.758 10.000 0.000 1.000   NA
 1155218 1155219 SDY_1390 SDY_1391 stxB yjhS FALSE 0.003 510.000 0.000 NA   NA
 1155219 1155220 SDY_1391 SDY_1392 yjhS   FALSE 0.077 187.000 0.000 NA   NA
 1155220 1155221 SDY_1392 SDY_1393     FALSE 0.286 77.000 0.000 NA   NA
 1155221 1155222 SDY_1393 SDY_1394     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155224 1155225 SDY_1396 SDY_1397 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155227 1155228 SDY_1399 SDY_1400 ycjX ycjF TRUE 0.983 -3.000 0.791 NA   NA
 1155228 1155229 SDY_1400 SDY_1401 ycjF tyrR FALSE 0.324 175.000 0.137 NA   NA
 1155232 1155233 SDY_1404 SDY_1405 ycjI   FALSE 0.004 388.000 0.000 NA N NA
 1155234 1155235 SDY_1406 SDY_1407     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1155235 1155236 SDY_1407 SDY_1408   ycjZ FALSE 0.184 130.000 0.000 NA N NA
 1155236 1155237 SDY_1408 SDY_1409 ycjZ   FALSE 0.016 316.000 0.000 1.000 N NA
 1155238 1155239 SDY_1410 SDY_1411   insB FALSE 0.004 381.000 0.000 NA N NA
 1155239 1155240 SDY_1411 SDY_1412 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155240 1155241 SDY_1412 SDY_1413 insA ydaA FALSE 0.032 250.000 0.000 1.000 N NA
 1155241 1155242 SDY_1413 SDY_1414 ydaA   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA N NA
 1155242 1155243 SDY_1414 SDY_1415   fnr FALSE 0.003 437.000 0.000 NA N NA
 1155243 1155244 SDY_1415 SDY_1416 fnr ogt FALSE 0.079 195.000 0.000 1.000 N NA
 1155244 1155245 SDY_1416 SDY_1417 ogt   FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 1155246 1155247 SDY_1418 SDY_1419   ydaL FALSE 0.002 692.000 0.000 NA   NA
 1155249 1155250 SDY_1421 SDY_1422     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155252 1155253 SDY_1424 SDY_1425   dbpA FALSE 0.003 478.000 0.000 NA   NA
 1155254 1155255 SDY_1426 SDY_1427 ydaO   FALSE 0.445 52.000 0.012 NA   NA
 1155255 1155256 SDY_1427 SDY_1428     TRUE 0.865 28.000 0.000 0.038   NA
 1155256 1155257 SDY_1428 SDY_1429   insB TRUE 0.804 78.000 0.000 NA Y NA
 1155257 1155258 SDY_1429 SDY_1430 insB insA TRUE 0.951 22.000 0.000 NA Y NA
 1155259 1155260 SDY_1431 SDY_1432   relF FALSE 0.003 521.000 0.000 NA   NA
 1155260 1155261 SDY_1432 SDY_1433 relF rem FALSE 0.040 217.000 0.000 NA   NA
 1155261 1155262 SDY_1433 SDY_1434 rem   FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 1155262 1155263 SDY_1434 SDY_1435     FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1155263 1155264 SDY_1435 SDY_1436     TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1155264 1155265 SDY_1436 SDY_1437     FALSE 0.179 144.000 0.000 NA   NA
 1155265 1155266 SDY_1437 SDY_1438     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 1155266 1155267 SDY_1438 SDY_1439   insA FALSE 0.229 92.000 0.000 NA   NA
 1155267 1155268 SDY_1439 SDY_1440 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155270 1155271 SDY_1442 SDY_1443     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155271 1155272 SDY_1443 SDY_1444     FALSE 0.120 170.000 0.000 NA   NA
 1155272 1155273 SDY_1444 SDY_1445     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155275 1155276 SDY_1447 SDY_1448     FALSE 0.377 -25.000 0.000 NA   NA
 1155276 1155277 SDY_1448 SDY_1449     FALSE 0.007 358.000 0.000 NA   NA
 1155277 1155278 SDY_1449 SDY_1450     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155279 1155280 SDY_1451 SDY_1452     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155282 1155283 SDY_1454 SDY_1455 sitD sitC TRUE 0.996 -3.000 0.525 0.005 Y NA
 1155283 1155284 SDY_1455 SDY_1456 sitC sitB TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.074 Y NA
 1155284 1155285 SDY_1456 SDY_1457 sitB sitA TRUE 0.997 0.000 0.894 1.000 Y NA
 1155285 1155286 SDY_1457 SDY_1458 sitA ynaF FALSE 0.003 587.000 0.000 1.000 N NA
 1155286 1155287 SDY_1458 SDY_1459 ynaF ompN FALSE 0.324 69.000 0.000 NA   NA
 1155287 1155288 SDY_1459 SDY_1460 ompN   FALSE 0.028 241.000 0.000 NA   NA
 1155288 1155289 SDY_1460 SDY_1461   ydbK FALSE 0.003 668.000 0.000 1.000 N NA
 1155291 1155292 SDY_1463 SDY_1464 hslJ ldhA FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 1155293 1155294 SDY_1465 SDY_1466 ydbH ynbE TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155294 1155295 SDY_1466 SDY_1467 ynbE ydbL TRUE 0.905 -73.000 0.726 NA   NA
 1155295 1155296 SDY_1467 SDY_1468 ydbL   FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1155296 1155297 SDY_1468 SDY_1469   insA FALSE 0.272 228.000 0.000 NA Y NA
 1155297 1155298 SDY_1469 SDY_1470 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155298 1155299 SDY_1470 SDY_1471 insB   FALSE 0.198 141.000 0.000 NA   NA
 1155299 1155300 SDY_1471 SDY_1472     FALSE 0.120 170.000 0.000 NA   NA
 1155301 1155302 SDY_1473 SDY_1474   aroD FALSE 0.001 667.000 0.000 NA N NA
 1155302 1155303 SDY_1474 SDY_1475 aroD ydiB TRUE 0.975 31.000 0.113 1.000 Y NA
 1155303 1155304 SDY_1475 SDY_1476 ydiB   FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155304 1155305 SDY_1476 SDY_1477     FALSE 0.003 565.000 0.000 NA   NA
 1155305 1155306 SDY_1477 SDY_1478   insB FALSE 0.210 97.000 0.000 NA   NA
 1155306 1155307 SDY_1478 SDY_1479 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155307 1155308 SDY_1479 SDY_1480 insA   TRUE 0.850 71.000 0.000 1.000 Y NA
 1155308 1155309 SDY_1480 SDY_1481     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1155311 1155312 SDY_1483 SDY_1484     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155313 1155314 SDY_1485 SDY_1486 yeaF   FALSE 0.395 90.000 0.067 NA   NA
 1155315 1155316 SDY_1487 SDY_1488 yeaD gapA TRUE 0.940 63.000 0.154 1.000 Y NA
 1155317 1155318 SDY_1489 SDY_1490 yeaA   TRUE 0.930 -3.000 0.216 NA   NA
 1155318 1155319 SDY_1490 SDY_1491     FALSE 0.007 369.000 0.000 NA   NA
 1155319 1155320 SDY_1491 SDY_1492     TRUE 0.946 27.000 0.250 1.000 N NA
 1155320 1155321 SDY_1492 SDY_1493   ydjJ TRUE 0.819 56.000 0.167 1.000 N NA
 1155323 1155324 SDY_1495 SDY_1496     TRUE 0.945 10.000 0.269 NA   NA
 1155324 1155325 SDY_1496 SDY_1497     FALSE 0.523 131.000 0.000 0.022   NA
 1155325 1155326 SDY_1497 SDY_1498     TRUE 0.740 137.000 0.269 1.000 N NA
 1155326 1155327 SDY_1498 SDY_1499   ydjE FALSE 0.244 117.000 0.000 NA   NA
 1155327 1155328 SDY_1499 SDY_1500 ydjE   FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 1155328 1155329 SDY_1500 SDY_1501   insA TRUE 0.950 34.000 0.000 NA Y NA
 1155329 1155330 SDY_1501 SDY_1502 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155333 1155334 SDY_1505 SDY_1506 ydjB ansA TRUE 0.749 11.000 0.040 1.000 N NA
 1155334 1155335 SDY_1506 SDY_1507 ansA sppA FALSE 0.402 154.000 0.113 1.000 N NA
 1155336 1155337 SDY_1508 SDY_1509 ydjA selD FALSE 0.336 117.000 0.033 1.000 N NA
 1155337 1155338 SDY_1509 SDY_1510 selD topB TRUE 0.801 5.000 0.041 1.000 N NA
 1155339 1155340 SDY_1511 SDY_1512     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA   NA
 1155346 1155347 SDY_1518 SDY_1519     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1155347 1155348 SDY_1519 SDY_1520     TRUE 0.856 142.000 0.602 1.000   NA
 1155348 1155349 SDY_1520 SDY_1521     TRUE 0.898 -51.000 0.627 NA   NA
 1155349 1155350 SDY_1521 SDY_1522     FALSE 0.176 154.000 0.032 NA   NA
 1155350 1155351 SDY_1522 SDY_1523   ynjA TRUE 0.721 7.000 0.032 NA   NA
 1155351 1155352 SDY_1523 SDY_1524 ynjA ydjZ TRUE 0.872 0.000 0.087 NA   NA
 1155352 1155353 SDY_1524 SDY_1525 ydjZ ydjY TRUE 0.885 15.000 0.174 NA   NA
 1155353 1155354 SDY_1525 SDY_1526 ydjY ydjX TRUE 0.852 5.000 0.083 NA   NA
 1155354 1155355 SDY_1526 SDY_1527 ydjX xthA FALSE 0.111 167.000 0.016 NA   NA
 1155358 1155359 SDY_1530 SDY_1531     TRUE 0.918 -3.000 0.179 1.000 N NA
 1155359 1155360 SDY_1531 SDY_1532     FALSE 0.039 469.000 0.306 1.000 N NA
 1155360 1155361 SDY_1532 SDY_1533   ydjS TRUE 0.883 120.000 0.126 1.000 Y NA
 1155361 1155362 SDY_1533 SDY_1534 ydjS spy FALSE 0.008 330.000 0.000 NA N NA
 1155362 1155363 SDY_1534 SDY_1535 spy   FALSE 0.059 203.000 0.028 NA   NA
 1155364 1155365 SDY_1536 SDY_1537     FALSE 0.629 19.000 0.000 NA   NA
 1155367 1155368 SDY_1539 SDY_1540   nadE FALSE 0.034 230.000 0.010 1.000 N NA
 1155369 1155370 SDY_1541 SDY_1542 osmE   FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 1155372 1155373 SDY_1544 SDY_1545 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155373 1155374 SDY_1545 SDY_1546 insB ydgC FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1155375 1155376 SDY_1547 SDY_1548 ydgB   TRUE 0.891 37.000 0.140 1.000 N NA
 1155376 1155377 SDY_1548 SDY_1549     FALSE 0.262 186.000 0.143 NA   NA
 1155378 1155379 SDY_1550 SDY_1551 pntA pntB TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 1155381 1155382 SDY_1553 SDY_1554     TRUE 0.994 -13.000 0.869 0.067 Y NA
 1155383 1155384 SDY_1555 SDY_1556   asr FALSE 0.017 276.000 0.000 NA   NA
 1155384 1155385 SDY_1556 SDY_1557 asr   FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 1155388 1155389 SDY_1560 SDY_1561 insB ynfL FALSE 0.237 73.000 0.000 NA N NA
 1155389 1155390 SDY_1561 SDY_1562 ynfL mlc TRUE 0.948 135.000 0.408 1.000 Y NA
 1155390 1155391 SDY_1562 SDY_1563 mlc   TRUE 0.851 125.000 0.455 1.000 N NA
 1155392 1155393 SDY_1564 SDY_1565     FALSE 0.239 114.000 0.000 NA   NA
 1155393 1155394 SDY_1565 SDY_1566     TRUE 0.645 34.000 0.000 NA   NA
 1155394 1155395 SDY_1566 SDY_1567     TRUE 0.974 2.000 0.333 1.000   NA
 1155395 1155396 SDY_1567 SDY_1568     FALSE 0.634 11.000 0.000 NA   NA
 1155396 1155397 SDY_1568 SDY_1569     FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1155397 1155398 SDY_1569 SDY_1570     FALSE 0.058 198.000 0.000 NA   NA
 1155399 1155400 SDY_1571 SDY_1572 ynfC   TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155403 1155404 SDY_1575 SDY_1576 speG   TRUE 0.644 35.000 0.000 NA   NA
 1155405 1155406 SDY_1577 SDY_1578   rspA FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 1155406 1155407 SDY_1578 SDY_1579 rspA rspB FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1155409 1155410 SDY_1581 SDY_1582     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1155410 1155411 SDY_1582 SDY_1583   ydfI FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1155412 1155413 SDY_1584 SDY_1585   ydfH FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 1155413 1155414 SDY_1585 SDY_1586 ydfH ydfG FALSE 0.342 89.000 0.000 1.000   NA
 1155417 1155418 SDY_1589 SDY_1590 ydeI ydeH FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 1155418 1155419 SDY_1590 SDY_1591 ydeH insA FALSE 0.006 408.000 0.000 1.000 N NA
 1155419 1155420 SDY_1591 SDY_1592 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155423 1155424 SDY_1595 SDY_1596 marB marA TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1155424 1155425 SDY_1596 SDY_1597 marA marR TRUE 0.996 20.000 0.667 0.033 Y NA
 1155427 1155428 SDY_1599 SDY_1600 ydeA   FALSE 0.538 47.000 0.000 NA   NA
 1155430 1155431 SDY_1602 SDY_1603   yddG FALSE 0.027 342.000 0.000 0.071   NA
 1155432 1155433 SDY_1604 SDY_1605 fdnG fdnH FALSE 0.601 13.000 0.000 NA   NA
 1155433 1155434 SDY_1605 SDY_1606 fdnH fdnI TRUE 0.990 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 1155435 1155436 SDY_1607 SDY_1608 yddM adhP FALSE 0.551 -18.000 0.000 1.000   NA
 1155436 1155437 SDY_1608 SDY_1609 adhP sfcA FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1155439 1155440 SDY_1611 SDY_1612     FALSE 0.398 61.000 0.000 NA   NA
 1155440 1155441 SDY_1612 SDY_1613     FALSE 0.004 465.000 0.000 NA   NA
 1155441 1155442 SDY_1613 SDY_1614   xasA FALSE 0.337 131.000 0.000 1.000   NA
 1155442 1155443 SDY_1614 SDY_1615 xasA gadB TRUE 0.776 156.000 0.103 1.000 Y NA
 1155444 1155445 SDY_1616 SDY_1617 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155445 1155446 SDY_1617 SDY_1618 insB   TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1155446 1155447 SDY_1618 SDY_1619     FALSE 0.003 515.000 0.000 NA   NA
 1155447 1155448 SDY_1619 SDY_1620   insA FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 1155448 1155449 SDY_1620 SDY_1621 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155449 1155450 SDY_1621 SDY_1622 insB   FALSE 0.051 396.000 0.000 NA Y NA
 1155450 1155451 SDY_1622 SDY_1623   yneB FALSE 0.318 -22.000 0.000 NA N NA
 1155451 1155452 SDY_1623 SDY_1624 yneB   TRUE 0.759 24.000 0.000 1.000   NA
 1155452 1155453 SDY_1624 SDY_1625     FALSE 0.570 57.000 0.000 1.000   NA
 1155454 1155455 SDY_1626 SDY_1627     TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155455 1155456 SDY_1627 SDY_1628   uxaB FALSE 0.175 146.000 0.000 NA   NA
 1155456 1155457 SDY_1628 SDY_1629 uxaB   FALSE 0.177 145.000 0.000 NA   NA
 1155457 1155458 SDY_1629 SDY_1630     FALSE 0.447 139.000 0.098 NA   NA
 1155458 1155459 SDY_1630 SDY_1631   yneH TRUE 0.776 0.000 0.037 NA   NA
 1155459 1155460 SDY_1631 SDY_1632 yneH   FALSE 0.433 64.000 0.000 1.000 N NA
 1155461 1155462 SDY_1633 SDY_1634 yneJ   FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1155464 1155465 SDY_1636 SDY_1637   ymjA FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1155465 1155466 SDY_1637 SDY_1638 ymjA sapA FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 1155466 1155467 SDY_1638 SDY_1639 sapA sapB TRUE 0.965 -3.000 0.264 0.043 N NA
 1155468 1155469 SDY_1640 SDY_1641     FALSE 0.055 201.000 0.000 NA   NA
 1155469 1155470 SDY_1641 SDY_1642     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155470 1155471 SDY_1642 SDY_1643     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 1155473 1155474 SDY_1645 SDY_1646     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155475 1155476 SDY_1647 SDY_1648 narU narZ FALSE 0.057 199.000 0.000 NA   NA
 1155478 1155479 SDY_1650 SDY_1651   narY FALSE 0.001 1636.000 0.000 NA   NA
 1155479 1155480 SDY_1651 SDY_1652 narY narW TRUE 0.998 0.000 0.714 0.004 Y NA
 1155480 1155481 SDY_1652 SDY_1653 narW narV TRUE 0.995 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 1155481 1155482 SDY_1653 SDY_1654 narV yddE FALSE 0.381 80.000 0.000 1.000   NA
 1155484 1155485 SDY_1656 SDY_1657     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155485 1155486 SDY_1657 SDY_1658     FALSE 0.017 334.000 0.000 1.000   NA
 1155486 1155487 SDY_1658 SDY_1659     FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 1155487 1155488 SDY_1659 SDY_1660     FALSE 0.295 75.000 0.000 NA   NA
 1155488 1155489 SDY_1660 SDY_1661     FALSE 0.009 387.000 0.000 1.000   NA
 1155491 1155492 SDY_1663 SDY_1664     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 1155492 1155493 SDY_1664 SDY_1665   insB FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 1155495 1155496 SDY_1667 SDY_1668     FALSE 0.219 107.000 0.000 NA   NA
 1155497 1155498 SDY_1669 SDY_1670     FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155498 1155499 SDY_1670 SDY_1671     FALSE 0.248 120.000 0.000 NA   NA
 1155499 1155500 SDY_1671 SDY_1672     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155500 1155501 SDY_1672 SDY_1673     FALSE 0.003 502.000 0.000 NA   NA
 1155501 1155502 SDY_1673 SDY_1674     TRUE 0.673 19.000 0.032 NA   NA
 1155502 1155503 SDY_1674 SDY_1675   ydiJ TRUE 0.862 -3.000 0.129 NA N NA
 1155505 1155506 SDY_1677 SDY_1678     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155509 1155510 SDY_1681 SDY_1682     TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155510 1155511 SDY_1682 SDY_1683     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 1155511 1155512 SDY_1683 SDY_1684     FALSE 0.219 78.000 0.000 NA N NA
 1155512 1155513 SDY_1684 SDY_1685   yeaK TRUE 0.808 43.000 0.083 NA   NA
 1155517 1155518 SDY_1689 SDY_1690 yeaN yeaO FALSE 0.560 34.000 0.007 NA   NA
 1155523 1155524 SDY_1695 SDY_1696 yeaQ yoaG FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 1155524 1155525 SDY_1696 SDY_1697 yoaG yeaR TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155525 1155526 SDY_1697 SDY_1698 yeaR yeaS FALSE 0.084 173.000 0.000 NA N NA
 1155526 1155527 SDY_1698 SDY_1699 yeaS   FALSE 0.158 100.000 0.000 NA N NA
 1155527 1155528 SDY_1699 SDY_1700   yeaT FALSE 0.005 369.000 0.000 NA N NA
 1155529 1155530 SDY_1701 SDY_1702 yeaU   FALSE 0.222 251.000 0.333 NA   NA
 1155532 1155533 SDY_1704 SDY_1705   yeaV FALSE 0.209 98.000 0.000 NA   NA
 1155533 1155534 SDY_1705 SDY_1706 yeaV yeaW TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 1155534 1155535 SDY_1706 SDY_1707 yeaW yeaX TRUE 0.753 56.000 0.043 0.039 N NA
 1155536 1155537 SDY_1708 SDY_1709 rnd fadD TRUE 0.640 70.000 0.115 1.000 N NA
 1155537 1155538 SDY_1709 SDY_1710 fadD   FALSE 0.230 205.000 0.169 1.000 N NA
 1155538 1155539 SDY_1710 SDY_1711   yeaZ TRUE 0.699 40.000 0.024 1.000 N NA
 1155539 1155540 SDY_1711 SDY_1712 yeaZ   TRUE 0.691 58.000 0.082 1.000 N NA
 1155541 1155542 SDY_1713 SDY_1714   insA FALSE 0.039 202.000 0.000 NA N NA
 1155542 1155543 SDY_1714 SDY_1715 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155543 1155544 SDY_1715 SDY_1716 insB   FALSE 0.028 240.000 0.000 NA   NA
 1155546 1155547 SDY_1718 SDY_1719 pabB yeaB TRUE 0.915 4.000 0.116 1.000   NA
 1155547 1155548 SDY_1719 SDY_1720 yeaB sdaA FALSE 0.618 184.000 0.409 1.000   NA
 1155548 1155549 SDY_1720 SDY_1721 sdaA insA FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000 N NA
 1155549 1155550 SDY_1721 SDY_1722 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155551 1155552 SDY_1723 SDY_1724   yncB FALSE 0.092 198.000 0.000 1.000   NA
 1155553 1155554 SDY_1725 SDY_1726     TRUE 0.806 -3.000 0.070 NA   NA
 1155557 1155558 SDY_1729 SDY_1730     FALSE 0.013 312.000 0.000 NA   NA
 1155558 1155559 SDY_1730 SDY_1731     TRUE 0.651 22.000 0.000 NA   NA
 1155559 1155560 SDY_1731 SDY_1732     FALSE 0.478 -10.000 0.000 NA   NA
 1155560 1155561 SDY_1732 SDY_1733     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155561 1155562 SDY_1733 SDY_1734     TRUE 0.995 18.000 0.609 0.043 Y NA
 1155562 1155563 SDY_1734 SDY_1735     FALSE 0.256 245.000 0.000 1.000 Y NA
 1155563 1155564 SDY_1735 SDY_1736     FALSE 0.386 79.000 0.000 1.000   NA
 1155568 1155569 SDY_1740 SDY_1742 ydcP ydcN TRUE 0.752 31.000 0.000 1.000   NA
 1155570 1155571 SDY_1741 SDY_1743     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1155572 1155573 SDY_1744 SDY_1745 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155573 1155574 SDY_1745 SDY_1746 insA   TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1155574 1155575 SDY_1746 SDY_1747   tehB FALSE 0.034 303.000 0.088 NA   NA
 1155575 1155576 SDY_1747 SDY_1748 tehB tehA TRUE 0.924 -3.000 0.175 1.000   NA
 1155577 1155578 SDY_1749 SDY_1750     FALSE 0.116 231.000 0.000 0.003   NA
 1155579 1155580 SDY_1751 SDY_1752 rimL ydcH FALSE 0.393 63.000 0.026 NA   NA
 1155581 1155582 SDY_1753 SDY_1754 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155582 1155583 SDY_1754 SDY_1755 insB   FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1155584 1155585 SDY_1756 SDY_1757 ydcG   FALSE 0.035 225.000 0.000 NA   NA
 1155586 1155587 SDY_1758 SDY_1759     FALSE 0.007 335.000 0.000 NA N NA
 1155588 1155589 SDY_1760 SDY_1761 trg   FALSE 0.428 51.000 0.000 NA N NA
 1155591 1155592 SDY_1763 SDY_1764 ydcA cybB FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 1155594 1155595 SDY_1766 SDY_1767 aldA   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1155595 1155596 SDY_1767 SDY_1768     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155596 1155597 SDY_1768 SDY_1769     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 1155597 1155598 SDY_1769 SDY_1770     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 1155599 1155600 SDY_1771 SDY_1772 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155601 1155602 SDY_1773 SDY_1774   hrpA FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1155604 1155605 SDY_1776 SDY_1777 ynbD   TRUE 0.723 0.000 0.000 NA   NA
 1155607 1155608 SDY_1779 SDY_1780     TRUE 0.687 6.000 0.000 NA   NA
 1155608 1155609 SDY_1780 SDY_1781     FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155610 1155611 SDY_1782 SDY_1783     FALSE 0.052 204.000 0.000 NA   NA
 1155612 1155613 SDY_1784 SDY_1785     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155613 1155614 SDY_1785 SDY_1786     FALSE 0.387 62.000 0.000 NA   NA
 1155616 1155617 SDY_1788 SDY_1789     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155618 1155619 SDY_1790 SDY_1791 ydiR ydiS FALSE 0.467 55.000 0.000 NA   NA
 1155619 1155620 SDY_1791 SDY_1792 ydiS ydiT TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.039 Y NA
 1155620 1155621 SDY_1792 SDY_1793 ydiT ydiD FALSE 0.446 57.000 0.000 NA   NA
 1155623 1155624 SDY_1795 SDY_1796     TRUE 0.645 155.000 0.000 NA Y NA
 1155624 1155625 SDY_1796 SDY_1797   ydiA FALSE 0.069 212.000 0.000 1.000   NA
 1155625 1155626 SDY_1797 SDY_1798 ydiA aroH FALSE 0.502 157.000 0.165 1.000   NA
 1155626 1155627 SDY_1798 SDY_1799 aroH ydiE FALSE 0.305 132.000 0.054 NA N NA
 1155628 1155629 SDY_1800 SDY_1801     FALSE 0.458 -7.000 0.011 NA   NA
 1155629 1155630 SDY_1801 SDY_1802     FALSE 0.416 63.000 0.031 NA   NA
 1155630 1155631 SDY_1802 SDY_1803   nlpC FALSE 0.019 247.000 0.000 NA N NA
 1155631 1155632 SDY_1803 SDY_1804 nlpC btuD FALSE 0.219 78.000 0.000 NA N NA
 1155632 1155633 SDY_1804 SDY_1805 btuD btuE TRUE 0.775 0.000 0.000 1.000 N NA
 1155633 1155634 SDY_1805 SDY_1806 btuE btuC TRUE 0.644 63.000 0.084 1.000 N NA
 1155634 1155635 SDY_1806 SDY_1807 btuC himA FALSE 0.259 101.000 0.023 1.000 N NA
 1155635 1155636 SDY_1807 SDY_1808 himA pheT TRUE 0.945 5.000 0.208 1.000 N NA
 1155636 1155637 SDY_1808 SDY_1809 pheT pheS TRUE 0.995 15.000 0.574 0.001 Y NA
 1155637 1155638 SDY_1809 SDY_1810 pheS   FALSE 0.016 283.000 0.000 NA   NA
 1155638 1155639 SDY_1810 SDY_1811   rplT FALSE 0.248 123.000 0.000 NA   NA
 1155639 1155640 SDY_1811 SDY_1812 rplT rpmI TRUE 0.995 53.000 0.928 0.011 Y NA
 1155640 1155641 SDY_1812 SDY_1813 rpmI infC TRUE 0.967 94.000 0.652 1.000 Y NA
 1155641 1155642 SDY_1813 SDY_1814 infC thrS TRUE 0.908 112.000 0.186 1.000 Y NA
 1155643 1155644 SDY_1815 SDY_1816   pfkB FALSE 0.093 167.000 0.000 NA N NA
 1155644 1155645 SDY_1816 SDY_1817 pfkB   FALSE 0.208 101.000 0.000 NA   NA
 1155645 1155646 SDY_1817 SDY_1818     FALSE 0.216 106.000 0.000 NA   NA
 1155648 1155649 SDY_1820 SDY_1821 yniC   FALSE 0.250 164.000 0.068 NA   NA
 1155650 1155651 SDY_1822 SDY_1823 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155652 1155653 SDY_1824 SDY_1825 rstA rstB TRUE 0.986 4.000 0.181 1.000 Y NA
 1155653 1155654 SDY_1825 SDY_1826 rstB tus TRUE 0.767 76.000 0.200 1.000   NA
 1155655 1155656 SDY_1827 SDY_1828 fumC fumA TRUE 0.831 142.000 0.000 0.001 Y NA
 1155657 1155658 SDY_1829 SDY_1830 manA ydgA TRUE 0.885 101.000 0.778 NA   NA
 1155663 1155664 SDY_1835 SDY_1836 uidB uidA FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 1155664 1155665 SDY_1836 SDY_1837 uidA uidR FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 1155665 1155666 SDY_1837 SDY_1838 uidR hdhA FALSE 0.044 229.000 0.000 1.000 N NA
 1155666 1155667 SDY_1838 SDY_1839 hdhA   FALSE 0.046 193.000 0.000 NA N NA
 1155667 1155668 SDY_1839 SDY_1840     FALSE 0.264 -58.000 0.000 NA   NA
 1155668 1155669 SDY_1840 SDY_1841   malI FALSE 0.182 142.000 0.000 NA   NA
 1155672 1155673 SDY_1844 SDY_1845   malY FALSE 0.062 194.000 0.000 NA   NA
 1155673 1155674 SDY_1845 SDY_1846 malY add FALSE 0.540 104.000 0.132 1.000 N NA
 1155676 1155677 SDY_1848 SDY_1849     FALSE 0.327 168.000 0.120 NA   NA
 1155677 1155678 SDY_1849 SDY_1850     FALSE 0.633 77.000 0.148 NA   NA
 1155678 1155679 SDY_1850 SDY_1851     TRUE 0.997 0.000 0.564 0.039 Y NA
 1155679 1155680 SDY_1851 SDY_1852     TRUE 0.992 -7.000 0.537 0.012 Y NA
 1155680 1155681 SDY_1852 SDY_1853   ydgO TRUE 0.998 1.000 0.814 0.039 Y NA
 1155681 1155682 SDY_1853 SDY_1854 ydgO   TRUE 0.998 4.000 0.924 0.039 Y NA
 1155682 1155683 SDY_1854 SDY_1855   ydgQ TRUE 0.998 4.000 0.908 0.039 Y NA
 1155683 1155684 SDY_1855 SDY_1856 ydgQ nth TRUE 0.906 0.000 0.109 1.000 N NA
 1155684 1155685 SDY_1856 SDY_1857 nth ydgR FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 1155685 1155686 SDY_1857 SDY_1858 ydgR gst TRUE 0.784 106.000 0.344 1.000 N NA
 1155687 1155688 SDY_1859 SDY_1860 pdxY tyrS FALSE 0.562 59.000 0.041 1.000 N NA
 1155688 1155689 SDY_1860 SDY_1861 tyrS pdxH FALSE 0.408 129.000 0.054 1.000 N NA
 1155689 1155690 SDY_1861 SDY_1862 pdxH ydhA FALSE 0.582 59.000 0.034 1.000   NA
 1155690 1155691 SDY_1862 SDY_1863 ydhA   FALSE 0.121 179.000 0.034 NA   NA
 1155694 1155695 SDY_1866 SDY_1867     TRUE 0.876 -39.000 0.412 NA   NA
 1155695 1155696 SDY_1867 SDY_1868     FALSE 0.597 14.000 0.000 NA   NA
 1155696 1155697 SDY_1868 SDY_1869     FALSE 0.277 79.000 0.000 NA   NA
 1155698 1155699 SDY_1870 SDY_1871 sodC   FALSE 0.410 81.000 0.033 1.000   NA
 1155699 1155700 SDY_1871 SDY_1873     FALSE 0.631 49.000 0.045 NA   NA
 1155703 1155704 SDY_1875 SDY_1876   nemA FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1155704 1155705 SDY_1876 SDY_1877 nemA gloA FALSE 0.451 81.000 0.057 1.000 N NA
 1155705 1155706 SDY_1877 SDY_1878 gloA rnt FALSE 0.544 103.000 0.136 1.000 N NA
 1155706 1155707 SDY_1878 SDY_1879 rnt lhr FALSE 0.224 93.000 0.000 NA   NA
 1155709 1155710 SDY_1881 SDY_1882 ydhO sodB FALSE 0.159 128.000 0.015 NA N NA
 1155714 1155715 SDY_1886 SDY_1887 ydhC cfa FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000 N NA
 1155717 1155718 SDY_1889 SDY_1890   ydhE FALSE 0.135 144.000 0.000 NA N NA
 1155720 1155721 SDY_1892 SDY_1893     TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155722 1155723 SDY_1894 SDY_1895     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155725 1155726 SDY_1897 SDY_1898   ydhU TRUE 0.948 4.000 0.222 NA   NA
 1155726 1155727 SDY_1898 SDY_1899 ydhU   TRUE 0.994 -3.000 0.444 0.038 Y NA
 1155727 1155728 SDY_1899 SDY_1900     TRUE 0.924 13.000 0.235 NA   NA
 1155729 1155730 SDY_1901 SDY_1902     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 1155730 1155731 SDY_1902 SDY_1903     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155733 1155734 SDY_1905 SDY_1906 pykF insA FALSE 0.096 188.000 0.000 1.000 N NA
 1155734 1155735 SDY_1906 SDY_1907 insA insB FALSE 0.043 212.000 0.000 NA   NA
 1155735 1155736 SDY_1907 SDY_1908 insB lpp FALSE 0.053 203.000 0.000 NA   NA
 1155737 1155738 SDY_1909 SDY_1910 ynhG ynhA FALSE 0.299 149.000 0.069 NA   NA
 1155738 1155739 SDY_1910 SDY_1911 ynhA   TRUE 0.901 13.000 0.183 NA   NA
 1155739 1155740 SDY_1911 SDY_1912   ynhC FALSE 0.202 228.000 0.193 1.000 N NA
 1155740 1155741 SDY_1912 SDY_1913 ynhC ynhD TRUE 0.978 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 1155741 1155742 SDY_1913 SDY_1914 ynhD ynhE TRUE 0.974 10.000 0.466 1.000   NA
 1155742 1155743 SDY_1914 SDY_1915 ynhE   FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 1155743 1155744 SDY_1915 SDY_1916     FALSE 0.066 192.000 0.000 NA   NA
 1155746 1155747 SDY_1918 SDY_1919     FALSE 0.014 1989.000 0.000 NA Y NA
 1155748 1155749 SDY_1920 SDY_1921     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155750 1155751 SDY_1922 SDY_1923     TRUE 0.809 -6.000 0.118 NA   NA
 1155751 1155752 SDY_1923 SDY_1924     FALSE 0.003 547.000 0.000 NA   NA
 1155753 1155754 SDY_1925 SDY_1926     FALSE 0.316 94.000 0.000 1.000   NA
 1155754 1155755 SDY_1926 SDY_1927     TRUE 0.975 -3.000 0.500 1.000   NA
 1155755 1155756 SDY_1927 SDY_1928     FALSE 0.002 894.000 0.000 NA   NA
 1155756 1155757 SDY_1928 SDY_1929     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1155758 1155759 SDY_1930 SDY_1931     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1155759 1155760 SDY_1931 SDY_1932     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1155761 1155762 SDY_1933 SDY_1934   insA FALSE 0.453 56.000 0.000 NA   NA
 1155763 1155764 SDY_1935 SDY_1936 ycjM pspE FALSE 0.086 184.000 0.000 NA   NA
 1155764 1155765 SDY_1936 SDY_1937 pspE pspD FALSE 0.619 75.000 0.133 NA   NA
 1155765 1155766 SDY_1937 SDY_1938 pspD pspC TRUE 0.908 9.000 0.167 NA   NA
 1155766 1155767 SDY_1938 SDY_1939 pspC pspB TRUE 0.989 0.000 0.913 NA   NA
 1155767 1155768 SDY_1939 SDY_1940 pspB pspA TRUE 0.963 54.000 0.739 NA   NA
 1155770 1155771 SDY_1942 SDY_1943 goaG ordL FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1155771 1155772 SDY_1943 SDY_1944 ordL aldH TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1155772 1155773 SDY_1944 SDY_1945 aldH ycjC FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 1155773 1155774 SDY_1945 SDY_1946 ycjC ycjL TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1155775 1155776 SDY_1947 SDY_1948   ycjJ FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 1155777 1155778 SDY_1949 SDY_1950     FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 1155778 1155779 SDY_1950 SDY_1951     FALSE 0.291 76.000 0.000 NA   NA
 1155786 1155787 SDY_1958 SDY_1959 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155787 1155788 SDY_1959 SDY_1960 insB   FALSE 0.520 50.000 0.000 NA   NA
 1155788 1155789 SDY_1960 SDY_1961     FALSE 0.606 16.000 0.000 NA   NA
 1155791 1155792 SDY_1963 SDY_1964 manX manY FALSE 0.377 63.000 0.000 NA   NA
 1155792 1155793 SDY_1964 SDY_1965 manY manZ TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155793 1155794 SDY_1965 SDY_1966 manZ   TRUE 0.962 55.000 0.755 NA   NA
 1155794 1155795 SDY_1966 SDY_1967     FALSE 0.006 375.000 0.000 NA   NA
 1155796 1155797 SDY_1968 SDY_1969 yebH cspC FALSE 0.229 166.000 0.038 1.000   NA
 1155797 1155798 SDY_1969 SDY_1970 cspC   TRUE 0.915 13.000 0.214 NA   NA
 1155800 1155801 SDY_1972 SDY_1973     TRUE 0.881 75.000 0.500 NA   NA
 1155805 1155806 SDY_1977 SDY_1978 htpX prc FALSE 0.210 192.000 0.042 0.018 N NA
 1155806 1155807 SDY_1978 SDY_1979 prc proQ TRUE 0.942 20.000 0.304 NA N NA
 1155807 1155808 SDY_1979 SDY_1980 proQ   TRUE 0.801 97.000 0.081 NA Y NA
 1155809 1155810 SDY_1981 SDY_1982     TRUE 0.704 37.000 0.038 NA   NA
 1155810 1155811 SDY_1982 SDY_1983     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1155811 1155812 SDY_1983 SDY_1984     TRUE 0.648 30.000 0.000 NA   NA
 1155812 1155813 SDY_1984 SDY_1985     TRUE 0.942 -37.000 0.840 NA   NA
 1155813 1155814 SDY_1985 SDY_1986   yebU TRUE 0.862 74.000 0.420 NA   NA
 1155814 1155815 SDY_1986 SDY_1987 yebU   FALSE 0.482 103.000 0.121 NA   NA
 1155815 1155816 SDY_1987 SDY_1988     TRUE 0.958 21.000 0.353 NA   NA
 1155817 1155818 SDY_1989 SDY_1990 pphA   FALSE 0.331 -37.000 0.000 NA   NA
 1155819 1155820 SDY_1991 SDY_1992     TRUE 0.992 27.000 0.500 NA Y NA
 1155822 1155823 SDY_1994 SDY_1995     TRUE 0.735 2.000 0.000 NA   NA
 1155823 1155824 SDY_1995 SDY_1996     TRUE 0.727 3.000 0.000 NA   NA
 1155824 1155825 SDY_1996 SDY_1997     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155825 1155826 SDY_1997 SDY_1998   ybcR FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 1155826 1155827 SDY_1998 SDY_1999 ybcR   FALSE 0.083 185.000 0.000 NA   NA
 1155827 1155828 SDY_1999 SDY_2000     FALSE 0.584 141.000 0.182 NA   NA
 1155830 1155831 SDY_2002 SDY_2003   ipaH_5 FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 1155832 1155833 SDY_2004 SDY_2005     FALSE 0.288 192.000 0.182 NA   NA
 1155833 1155834 SDY_2005 SDY_2006     FALSE 0.387 62.000 0.000 NA   NA
 1155834 1155835 SDY_2006 SDY_2007     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155836 1155837 SDY_2008 SDY_2009     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1155837 1155838 SDY_2009 SDY_2010     FALSE 0.240 89.000 0.000 NA   NA
 1155838 1155839 SDY_2010 SDY_2011   ybhE FALSE 0.222 108.000 0.000 NA   NA
 1155840 1155841 SDY_2012 SDY_2013     FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1155842 1155843 SDY_2014 SDY_2015   ycgW FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1155845 1155846 SDY_2017 SDY_2018 ymfC   TRUE 0.927 10.000 0.182 1.000 N NA
 1155846 1155847 SDY_2018 SDY_2019   trmU TRUE 0.829 54.000 0.158 1.000 N NA
 1155847 1155848 SDY_2019 SDY_2020 trmU ycfC TRUE 0.906 36.000 0.180 NA   NA
 1155848 1155849 SDY_2020 SDY_2021 ycfC purB TRUE 0.873 4.000 0.093 NA   NA
 1155849 1155850 SDY_2021 SDY_2022 purB phoP FALSE 0.129 169.000 0.011 1.000 N NA
 1155850 1155851 SDY_2022 SDY_2023 phoP phoQ TRUE 0.997 0.000 0.940 1.000 Y NA
 1155851 1155852 SDY_2023 SDY_2024 phoQ ycfD TRUE 0.882 67.000 0.408 NA   NA
 1155854 1155855 SDY_2026 SDY_2027 potA potB TRUE 0.994 14.000 0.789 1.000 Y NA
 1155855 1155856 SDY_2027 SDY_2028 potB potC TRUE 0.992 -3.000 0.286 0.042 Y NA
 1155856 1155857 SDY_2028 SDY_2029 potC potD TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.042 Y NA
 1155858 1155859 SDY_2030 SDY_2031 cobB ycfX TRUE 0.971 16.000 0.119 1.000 Y NA
 1155859 1155860 SDY_2031 SDY_2032 ycfX ycfW TRUE 0.939 29.000 0.225 1.000 N NA
 1155860 1155861 SDY_2032 SDY_2033 ycfW lolD TRUE 0.946 0.000 0.125 0.053 N NA
 1155861 1155862 SDY_2033 SDY_2034 lolD ycfU TRUE 0.907 -7.000 0.175 0.053 N NA
 1155863 1155864 SDY_2035 SDY_2036 ycfT mfd FALSE 0.287 128.000 0.003 1.000   NA
 1155864 1155865 SDY_2036 SDY_2037 mfd ycfS FALSE 0.222 142.000 0.006 1.000   NA
 1155868 1155869 SDY_2040 SDY_2041 ycfJ ndh FALSE 0.100 227.000 0.071 1.000   NA
 1155869 1155870 SDY_2041 SDY_2042 ndh ycfP FALSE 0.009 406.000 0.057 NA   NA
 1155870 1155871 SDY_2042 SDY_2043 ycfP ycfO TRUE 0.838 23.000 0.091 NA   NA
 1155871 1155872 SDY_2043 SDY_2044 ycfO ycfN TRUE 0.817 11.000 0.069 1.000 N NA
 1155872 1155873 SDY_2044 SDY_2045 ycfN ycfM TRUE 0.882 -19.000 0.310 NA   NA
 1155873 1155874 SDY_2045 SDY_2046 ycfM ycfL TRUE 0.965 14.000 0.516 NA   NA
 1155874 1155875 SDY_2046 SDY_2047 ycfL ycfF TRUE 0.819 3.000 0.051 NA   NA
 1155877 1155878 SDY_2049 SDY_2050 ptsG ycfH FALSE 0.006 295.000 0.004 NA N NA
 1155878 1155879 SDY_2050 SDY_2051 ycfH holB TRUE 0.969 11.000 0.110 NA Y NA
 1155879 1155880 SDY_2051 SDY_2052 holB tmk TRUE 0.935 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1155880 1155881 SDY_2052 SDY_2053 tmk yceG TRUE 0.934 -10.000 0.209 0.001   NA
 1155881 1155882 SDY_2053 SDY_2054 yceG pabC TRUE 0.956 3.000 0.204 1.000   NA
 1155882 1155883 SDY_2054 SDY_2055 pabC fabF TRUE 0.694 120.000 0.187 1.000 N NA
 1155883 1155884 SDY_2055 SDY_2056 fabF acpP TRUE 0.949 86.000 0.346 1.000 Y NA
 1155884 1155885 SDY_2056 SDY_2057 acpP fabG TRUE 0.781 211.000 0.321 0.003 Y NA
 1155885 1155886 SDY_2057 SDY_2058 fabG fabD TRUE 0.994 13.000 0.432 0.003 Y NA
 1155886 1155887 SDY_2058 SDY_2059 fabD fabH TRUE 0.987 16.000 0.182 0.003 Y NA
 1155887 1155888 SDY_2059 SDY_2060 fabH plsX TRUE 0.979 68.000 0.380 0.003 Y NA
 1155888 1155889 SDY_2060 SDY_2061 plsX rpmF TRUE 0.853 81.000 0.418 1.000 N NA
 1155889 1155890 SDY_2061 SDY_2062 rpmF yceD TRUE 0.958 52.000 0.599 NA   NA
 1155890 1155891 SDY_2062 SDY_2063 yceD   FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 1155893 1155894 SDY_2065 SDY_2066 yceC   FALSE 0.180 118.000 0.005 NA   NA
 1155896 1155897 SDY_2068 SDY_2069 flgL flgK FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1155897 1155898 SDY_2069 SDY_2070 flgK flgJ FALSE 0.352 66.000 0.000 NA   NA
 1155898 1155899 SDY_2070 SDY_2071 flgJ flgI TRUE 0.984 0.000 0.036 0.002 Y NA
 1155899 1155900 SDY_2071 SDY_2072 flgI flgH TRUE 0.979 12.000 0.073 0.002 Y NA
 1155900 1155901 SDY_2072 SDY_2073 flgH flgG FALSE 0.491 53.000 0.000 NA   NA
 1155901 1155902 SDY_2073 SDY_2074 flgG flgF FALSE 0.219 138.000 0.000 NA   NA
 1155902 1155903 SDY_2074 SDY_2075 flgF flgE FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1155903 1155904 SDY_2075 SDY_2076 flgE flgD TRUE 0.972 25.000 0.116 NA Y NA
 1155904 1155905 SDY_2076 SDY_2077 flgD flgC TRUE 0.978 12.000 0.186 NA Y NA
 1155905 1155906 SDY_2077 SDY_2078 flgC flgB TRUE 0.998 4.000 0.824 0.001 Y NA
 1155907 1155908 SDY_2079 SDY_2080   flgA FALSE 0.118 151.000 0.000 NA N NA
 1155908 1155909 SDY_2080 SDY_2081 flgA flgM TRUE 0.947 76.000 0.330 NA Y NA
 1155909 1155910 SDY_2081 SDY_2082 flgM flgN TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155911 1155912 SDY_2083 SDY_2084 mviN mviM FALSE 0.324 110.000 0.022 1.000   NA
 1155912 1155913 SDY_2084 SDY_2085 mviM yceH TRUE 0.893 2.000 0.103 NA   NA
 1155913 1155914 SDY_2085 SDY_2086 yceH rimJ TRUE 0.854 11.000 0.116 NA   NA
 1155914 1155915 SDY_2086 SDY_2087 rimJ   FALSE 0.089 170.000 0.000 NA N NA
 1155916 1155917 SDY_2088 SDY_2089 yceL grxB FALSE 0.636 64.000 0.103 NA   NA
 1155917 1155918 SDY_2089 SDY_2090 grxB yceB FALSE 0.412 134.000 0.078 NA   NA
 1155918 1155919 SDY_2090 SDY_2091 yceB pyrC FALSE 0.212 106.000 0.022 NA   NA
 1155919 1155920 SDY_2091 SDY_2092 pyrC dinI FALSE 0.334 74.000 0.031 NA   NA
 1155922 1155923 SDY_2094 SDY_2095   yceP FALSE 0.117 171.000 0.000 NA   NA
 1155923 1155924 SDY_2095 SDY_2096 yceP solA TRUE 0.824 115.000 0.423 NA   NA
 1155924 1155925 SDY_2096 SDY_2097 solA yceO TRUE 0.943 21.000 0.269 NA   NA
 1155926 1155927 SDY_2098 SDY_2099   yeiL FALSE 0.003 425.000 0.000 NA N NA
 1155927 1155928 SDY_2099 SDY_2100 yeiL   FALSE 0.577 24.000 0.000 NA N NA
 1155930 1155931 SDY_2102 SDY_2103 insB insA FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 1155932 1155933 SDY_2104 SDY_2105 yeiK yeiJ TRUE 0.805 100.000 0.056 1.000 Y NA
 1155934 1155935 SDY_2106 SDY_2107 yeiI nfo FALSE 0.516 3.000 0.004 NA N NA
 1155935 1155936 SDY_2107 SDY_2108 nfo yeiH FALSE 0.374 74.000 0.040 NA   NA
 1155937 1155938 SDY_2109 SDY_2110 yeiE lysP FALSE 0.065 205.000 0.000 1.000 N NA
 1155938 1155939 SDY_2110 SDY_2111 lysP cirA FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 1155940 1155941 SDY_2112 SDY_2113 yeiG   FALSE 0.256 -72.000 0.000 NA   NA
 1155943 1155944 SDY_2115 SDY_2116     FALSE 0.034 229.000 0.000 NA   NA
 1155944 1155945 SDY_2116 SDY_2117     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 1155945 1155946 SDY_2117 SDY_2118     TRUE 0.735 1.000 0.000 NA   NA
 1155946 1155947 SDY_2118 SDY_2119     TRUE 0.710 4.000 0.000 NA   NA
 1155947 1155948 SDY_2119 SDY_2120     FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1155948 1155949 SDY_2120 SDY_2121     FALSE 0.002 638.000 0.000 NA   NA
 1155949 1155950 SDY_2121 SDY_2122   insB FALSE 0.224 93.000 0.000 NA   NA
 1155951 1155952 SDY_2123 SDY_2124     FALSE 0.001 830.000 0.000 NA N NA
 1155954 1155955 SDY_2126 SDY_2127   folE FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 1155955 1155956 SDY_2127 SDY_2128 folE yeiB TRUE 0.978 17.000 0.719 NA   NA
 1155956 1155957 SDY_2128 SDY_2129 yeiB galS FALSE 0.105 372.000 0.500 NA   NA
 1155957 1155958 SDY_2129 SDY_2130 galS mglB FALSE 0.012 280.000 0.000 NA N NA
 1155960 1155961 SDY_2132 SDY_2133   mglA FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1155961 1155962 SDY_2133 SDY_2134 mglA insB FALSE 0.229 -655.000 0.000 NA   NA
 1155963 1155964 SDY_2135 SDY_2136 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1155966 1155967 SDY_2139 SDY_2138 yeiA   FALSE 0.230 -592.000 0.000 NA   NA
 1155967 1155968 SDY_2138 SDY_2140     FALSE 0.001 1552.000 0.000 NA N NA
 1155970 1155971 SDY_2142 SDY_2143   sanA TRUE 0.709 3.000 0.019 NA   NA
 1155971 1155972 SDY_2143 SDY_2144 sanA cdd FALSE 0.226 150.000 0.045 NA   NA
 1155972 1155973 SDY_2144 SDY_2145 cdd yohK TRUE 0.693 130.000 0.198 1.000 N NA
 1155973 1155974 SDY_2145 SDY_2146 yohK yohJ TRUE 0.964 -3.000 0.340 1.000   NA
 1155977 1155978 SDY_2149 SDY_2150 yohH yohG TRUE 0.729 94.000 0.286 NA   NA
 1155978 1155979 SDY_2150 SDY_2151 yohG yohF FALSE 0.137 220.000 0.105 1.000   NA
 1155981 1155982 SDY_2153 SDY_2154 yohC pbpG FALSE 0.387 165.000 0.145 NA   NA
 1155984 1155985 SDY_2156 SDY_2157 bglX yehZ FALSE 0.077 252.000 0.099 1.000 N NA
 1155985 1155986 SDY_2157 SDY_2158 yehZ yehY TRUE 0.682 7.000 0.000 NA   NA
 1155986 1155987 SDY_2158 SDY_2159 yehY yehX FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1155987 1155988 SDY_2159 SDY_2160 yehX yehW TRUE 0.695 5.000 0.000 NA   NA
 1155989 1155990 SDY_2161 SDY_2162   yehV FALSE 0.409 60.000 0.000 NA   NA
 1155991 1155992 SDY_2163 SDY_2164 yehU yehT TRUE 0.993 -18.000 0.877 0.009 Y NA
 1155992 1155993 SDY_2164 SDY_2165 yehT yehS TRUE 0.661 47.000 0.051 NA   NA
 1155994 1155995 SDY_2166 SDY_2167 yehR   FALSE 0.237 113.000 0.000 NA   NA
 1155995 1155996 SDY_2167 SDY_2168     TRUE 0.650 28.000 0.000 NA   NA
 1155996 1155997 SDY_2168 SDY_2169     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1155997 1155998 SDY_2169 SDY_2170     FALSE 0.629 42.000 0.000 NA   NA
 1155998 1155999 SDY_2170 SDY_2171     TRUE 0.732 -27.000 0.160 NA   NA
 1155999 1156000 SDY_2171 SDY_2172   yehP FALSE 0.445 -15.000 0.000 NA   NA
 1156000 1156001 SDY_2172 SDY_2173 yehP   FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1156001 1156002 SDY_2173 SDY_2174     FALSE 0.615 12.000 0.000 NA   NA
 1156004 1156005 SDY_2176 SDY_2177   molR_D TRUE 0.656 10.000 0.000 NA   NA
 1156005 1156006 SDY_2177 SDY_2178 molR_D   FALSE 0.281 78.000 0.000 NA   NA
 1156006 1156007 SDY_2178 SDY_2179     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1156007 1156008 SDY_2179 SDY_2180     FALSE 0.323 -40.000 0.000 NA   NA
 1156008 1156009 SDY_2180 SDY_2181   metG FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 1156010 1156011 SDY_2182 SDY_2183 mrp yehE FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 1156011 1156012 SDY_2183 SDY_2184 yehE   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1156012 1156013 SDY_2184 SDY_2185     TRUE 0.864 141.000 0.182 NA Y NA
 1156014 1156015 SDY_2186 SDY_2187 baeR baeS TRUE 0.994 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 1156015 1156016 SDY_2187 SDY_2188 baeS yegB FALSE 0.564 -106.000 0.139 NA   NA
 1156016 1156017 SDY_2188 SDY_2189 yegB   FALSE 0.342 67.000 0.000 NA   NA
 1156018 1156019 SDY_2190 SDY_2191     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156019 1156020 SDY_2191 SDY_2192     TRUE 0.973 -3.000 0.455 1.000   NA
 1156024 1156025 SDY_2196 SDY_2197 udk dcd TRUE 0.855 92.000 0.098 1.000 Y NA
 1156025 1156026 SDY_2197 SDY_2198 dcd asmA TRUE 0.744 22.000 0.057 NA N NA
 1156027 1156028 SDY_2199 SDY_2200     TRUE 0.897 -10.000 0.286 NA   NA
 1156028 1156029 SDY_2200 SDY_2201   yegH FALSE 0.009 338.000 0.000 NA   NA
 1156030 1156031 SDY_2202 SDY_2203   galF FALSE 0.028 219.000 0.000 NA N NA
 1156031 1156032 SDY_2203 SDY_2204 galF rfbB FALSE 0.077 372.000 0.000 1.000 Y NA
 1156032 1156033 SDY_2204 SDY_2205 rfbB rfbD TRUE 0.988 0.000 0.084 0.001 Y NA
 1156033 1156034 SDY_2205 SDY_2206 rfbD rfbA TRUE 0.953 58.000 0.053 0.001 Y NA
 1156034 1156035 SDY_2206 SDY_2207 rfbA rfbC TRUE 0.989 3.000 0.211 1.000 Y NA
 1156035 1156036 SDY_2207 SDY_2208 rfbC rfbX TRUE 0.756 -3.000 0.000 1.000   NA
 1156036 1156037 SDY_2208 SDY_2209 rfbX rfc TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156037 1156038 SDY_2209 SDY_2210 rfc rfbR FALSE 0.523 -7.000 0.000 NA   NA
 1156038 1156039 SDY_2210 SDY_2211 rfbR rfbQ TRUE 0.656 25.000 0.000 NA   NA
 1156039 1156040 SDY_2211 SDY_2212 rfbQ gnd FALSE 0.002 1186.000 0.000 NA   NA
 1156040 1156041 SDY_2212 SDY_2213 gnd ugd FALSE 0.032 250.000 0.000 1.000 N NA
 1156041 1156042 SDY_2213 SDY_2214 ugd wzzB TRUE 0.795 90.000 0.000 1.000 Y NA
 1156043 1156044 SDY_2215 SDY_2216 hisI hisF TRUE 0.992 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 1156044 1156045 SDY_2216 SDY_2217 hisF hisA TRUE 0.934 -18.000 0.003 0.002 Y NA
 1156045 1156046 SDY_2217 SDY_2218 hisA hisH TRUE 0.981 0.000 0.010 0.002 Y NA
 1156046 1156047 SDY_2218 SDY_2219 hisH hisB TRUE 0.990 0.000 0.128 0.002 Y NA
 1156047 1156048 SDY_2219 SDY_2220 hisB hisC TRUE 0.996 0.000 0.341 0.002 Y NA
 1156048 1156049 SDY_2220 SDY_2221 hisC hisD TRUE 0.993 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 1156049 1156050 SDY_2221 SDY_2222 hisD hisG TRUE 0.990 6.000 0.171 0.002 Y NA
 1156051 1156052 SDY_2223 SDY_2224   yeeY FALSE 0.637 46.000 0.015 1.000   NA
 1156052 1156053 SDY_2224 SDY_2225 yeeY   FALSE 0.502 52.000 0.000 NA   NA
 1156053 1156054 SDY_2225 SDY_2226   yeeF FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 1156054 1156055 SDY_2226 SDY_2227 yeeF yeeE FALSE 0.099 179.000 0.000 NA   NA
 1156056 1156057 SDY_2228 SDY_2229     TRUE 0.817 -42.000 0.000 NA Y NA
 1156059 1156060 SDY_2231 SDY_2232 sbcB   FALSE 0.206 251.000 0.000 NA Y NA
 1156061 1156062 SDY_2233 SDY_2234 dacD sbmC FALSE 0.247 119.000 0.000 NA   NA
 1156062 1156063 SDY_2234 SDY_2235 sbmC   FALSE 0.234 -550.000 0.000 NA   NA
 1156063 1156064 SDY_2235 SDY_2236   yeeA FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 1156064 1156065 SDY_2236 SDY_2237 yeeA yeeX FALSE 0.598 106.000 0.180 NA   NA
 1156067 1156068 SDY_2239 SDY_2240   cobU FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 1156068 1156069 SDY_2240 SDY_2241 cobU cobS TRUE 0.959 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1156069 1156070 SDY_2241 SDY_2242 cobS cobT TRUE 0.976 12.000 0.056 0.003 Y NA
 1156070 1156071 SDY_2242 SDY_2243 cobT erfK FALSE 0.324 65.000 0.015 NA   NA
 1156073 1156074 SDY_2245 SDY_2246 nac cbl TRUE 0.932 102.000 0.222 0.037 Y NA
 1156076 1156077 SDY_2248 SDY_2249     TRUE 0.900 -9.000 0.120 0.001   NA
 1156077 1156078 SDY_2249 SDY_2250     FALSE 0.434 58.000 0.000 NA   NA
 1156078 1156079 SDY_2250 SDY_2251   insA FALSE 0.246 128.000 0.000 NA   NA
 1156079 1156080 SDY_2251 SDY_2252 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156081 1156082 SDY_2253 SDY_2254 amn shiA FALSE 0.250 102.000 0.021 1.000 N NA
 1156082 1156083 SDY_2254 SDY_2255 shiA   FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 1156083 1156084 SDY_2255 SDY_2256     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156085 1156086 SDY_2257 SDY_2258     FALSE 0.638 20.000 0.000 NA   NA
 1156086 1156087 SDY_2258 SDY_2259   yegQ FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 1156090 1156091 SDY_2262 SDY_2263 gatR gatD FALSE 0.257 100.000 0.000 1.000 N NA
 1156091 1156092 SDY_2263 SDY_2264 gatD gatC FALSE 0.079 186.000 0.000 NA   NA
 1156092 1156093 SDY_2264 SDY_2265 gatC gatB TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1156093 1156094 SDY_2265 SDY_2266 gatB gatA TRUE 0.648 31.000 0.000 NA   NA
 1156094 1156095 SDY_2266 SDY_2267 gatA   FALSE 0.229 134.000 0.000 NA   NA
 1156095 1156096 SDY_2267 SDY_2268   gatZ FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 1156096 1156097 SDY_2268 SDY_2269 gatZ gatY TRUE 0.649 29.000 0.000 NA   NA
 1156097 1156098 SDY_2269 SDY_2270 gatY   FALSE 0.426 230.000 0.000 0.001 Y NA
 1156099 1156100 SDY_2271 SDY_2272 yegT   TRUE 0.960 -3.000 0.364 NA   NA
 1156100 1156101 SDY_2272 SDY_2273     TRUE 0.975 -3.000 0.600 NA N NA
 1156102 1156103 SDY_2274 SDY_2275 yegW yegX FALSE 0.570 52.000 0.000 1.000 N NA
 1156103 1156104 SDY_2275 SDY_2276 yegX   TRUE 0.895 13.000 0.048 0.001   NA
 1156104 1156105 SDY_2276 SDY_2277   thiD FALSE 0.481 65.000 0.000 1.000   NA
 1156105 1156106 SDY_2277 SDY_2278 thiD thiM TRUE 0.977 -3.000 0.037 0.003 Y NA
 1156106 1156107 SDY_2278 SDY_2279 thiM yohL FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1156108 1156109 SDY_2280 SDY_2281 yohM   FALSE 0.638 38.000 0.000 NA   NA
 1156111 1156112 SDY_2283 SDY_2284     TRUE 0.653 -3.000 0.000 NA   NA
 1156115 1156116 SDY_2287 SDY_2288 yehB insB FALSE 0.191 121.000 0.000 NA N NA
 1156116 1156117 SDY_2288 SDY_2289 insB insA TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156117 1156118 SDY_2289 SDY_2290 insA   TRUE 0.959 29.000 0.000 1.000 Y NA
 1156118 1156119 SDY_2290 SDY_2291     TRUE 0.720 141.000 0.000 NA Y NA
 1156119 1156120 SDY_2291 SDY_2292   yceA FALSE 0.177 145.000 0.000 NA   NA
 1156122 1156123 SDY_2294 SDY_2295     FALSE 0.347 -31.000 0.000 NA   NA
 1156123 1156124 SDY_2295 SDY_2296     TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1156125 1156126 SDY_2297 SDY_2298 yceE   FALSE 0.277 -45.000 0.000 NA   NA
 1156126 1156127 SDY_2298 SDY_2299   msyB TRUE 0.652 27.000 0.000 NA   NA
 1156128 1156129 SDY_2300 SDY_2301 yceK mdoH FALSE 0.336 173.000 0.135 NA   NA
 1156129 1156130 SDY_2301 SDY_2302 mdoH mdoG TRUE 0.952 -7.000 0.469 1.000 N NA
 1156132 1156133 SDY_2304 SDY_2305 ymdC   FALSE 0.358 -58.000 0.046 NA   NA
 1156133 1156134 SDY_2305 SDY_2306     FALSE 0.234 95.000 0.028 NA   NA
 1156135 1156136 SDY_2307 SDY_2308 insA insB TRUE 0.937 45.000 0.000 NA Y NA
 1156136 1156137 SDY_2308 SDY_2309 insB   TRUE 0.642 36.000 0.000 NA   NA
 1156137 1156138 SDY_2309 SDY_2310     FALSE 0.239 130.000 0.000 NA   NA
 1156139 1156140 SDY_2311 SDY_2312 yceI   TRUE 0.985 4.000 0.676 NA   NA
 1156140 1156141 SDY_2312 SDY_2313     FALSE 0.395 -22.000 0.000 NA   NA
 1156143 1156144 SDY_2315 SDY_2316 fruA fruK TRUE 0.993 17.000 0.562 1.000 Y NA
 1156144 1156145 SDY_2316 SDY_2317 fruK fruB TRUE 0.982 0.000 0.112 1.000 Y NA
 1156145 1156146 SDY_2317 SDY_2318 fruB   FALSE 0.013 272.000 0.000 NA N NA
 1156147 1156148 SDY_2319 SDY_2320 ycbP ycbO TRUE 0.873 -7.000 0.169 1.000   NA
 1156148 1156149 SDY_2320 SDY_2321 ycbO   TRUE 0.871 -40.000 0.341 1.000   NA
 1156149 1156150 SDY_2321 SDY_2322     TRUE 0.918 -3.000 0.049 0.000   NA
 1156150 1156151 SDY_2322 SDY_2323   ycbM TRUE 0.937 12.000 0.226 1.000   NA
 1156151 1156152 SDY_2323 SDY_2324 ycbM ycbE TRUE 0.706 230.000 0.472 1.000 Y NA
 1156154 1156155 SDY_2326 SDY_2327 pncB asnS FALSE 0.178 170.000 0.034 1.000 N NA
 1156155 1156156 SDY_2327 SDY_2328 asnS ompF FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 1156156 1156157 SDY_2328 SDY_2329 ompF aspC FALSE 0.128 185.000 0.036 1.000 N NA
 1156158 1156159 SDY_2330 SDY_2331 ycbL ycbK TRUE 0.835 27.000 0.089 NA   NA
 1156159 1156160 SDY_2331 SDY_2332 ycbK ycbB FALSE 0.581 181.000 0.372 NA   NA
 1156160 1156161 SDY_2332 SDY_2333 ycbB   FALSE 0.079 186.000 0.000 NA   NA
 1156161 1156162 SDY_2333 SDY_2334   mukB FALSE 0.004 402.000 0.000 NA N NA
 1156162 1156163 SDY_2334 SDY_2335 mukB mukE TRUE 0.984 0.000 0.000 0.000 Y NA
 1156163 1156164 SDY_2335 SDY_2336 mukE mukF TRUE 0.960 8.000 0.036 NA Y NA
 1156164 1156165 SDY_2336 SDY_2337 mukF smtA TRUE 0.950 -3.000 0.325 NA N NA
 1156167 1156168 SDY_2339 SDY_2340   kdsB FALSE 0.150 154.000 0.023 NA   NA
 1156168 1156169 SDY_2340 SDY_2341 kdsB ycaR TRUE