MicrobesOnline Operon Predictions for Thiobacillus denitrificans

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

</
 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3415338 3415339 Tbd_0001 Tbd_0002     TRUE 0.846 179.000 0.328 1.000 Y NA
 3415339 3415340 Tbd_0002 Tbd_0003   gyrB TRUE 0.902 68.000 0.114 1.000 Y NA
 3415340 3415341 Tbd_0003 Tbd_0004 gyrB   TRUE 0.804 6.000 0.000 NA   NA
 3415341 3415342 Tbd_0004 Tbd_0005     TRUE 0.631 -21.000 0.000 NA   NA
 3415343 3415344 Tbd_0006 Tbd_0007     FALSE 0.035 245.000 0.000 1.000   NA
 3415344 3415345 Tbd_0007 Tbd_0008     FALSE 0.050 197.000 0.000 1.000 N NA
 3415345 3415346 Tbd_0008 Tbd_0009     FALSE 0.226 67.000 0.000 NA   NA
 3415346 3415347 Tbd_0009 Tbd_0010     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3415347 3415348 Tbd_0010 Tbd_0011     TRUE 0.931 7.000 0.040 NA   NA
 3415348 3415349 Tbd_0011 Tbd_0012     TRUE 0.976 5.000 0.124 NA   NA
 3415349 3415350 Tbd_0012 Tbd_0013     FALSE 0.325 99.000 0.017 1.000   NA
 3415351 3415352 Tbd_0014 Tbd_0015     TRUE 0.991 10.000 0.105 0.032 Y NA
 3415352 3415353 Tbd_0015 Tbd_0016     TRUE 0.943 102.000 0.305 1.000 Y NA
 3415353 3415354 Tbd_0016 Tbd_0017     TRUE 0.968 5.000 0.094 NA   NA
 3415354 3415355 Tbd_0017 Tbd_0018     TRUE 0.998 0.000 0.810 NA   NA
 3415355 3415356 Tbd_0018 Tbd_0019     TRUE 0.998 -3.000 0.171 1.000 Y NA
 3415356 3415357 Tbd_0019 Tbd_0020   trkA TRUE 0.764 17.000 0.008 1.000 N NA
 3415357 3415358 Tbd_0020 Tbd_0021 trkA   TRUE 0.989 0.000 0.008 0.007 Y NA
 3415358 3415359 Tbd_0021 Tbd_0022     TRUE 0.755 52.000 0.000 0.007 Y NA
 3415359 3415360 Tbd_0022 Tbd_0023     TRUE 0.876 1.000 0.000 1.000   NA
 3415360 3415361 Tbd_0023 Tbd_0024     TRUE 0.600 20.000 0.000 NA   NA
 3415362 3415363 Tbd_0025 Tbd_0026     FALSE 0.213 73.000 0.000 NA   NA
 3415363 3415364 Tbd_0026 Tbd_0027     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415364 3415365 Tbd_0027 Tbd_0028     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415365 3415366 Tbd_0028 Tbd_0029   argJ TRUE 0.491 92.000 0.056 1.000   NA
 3415366 3415367 Tbd_0029 Tbd_0030 argJ   FALSE 0.256 56.000 0.000 NA   NA
 3415367 3415368 Tbd_0030 Tbd_0031     FALSE 0.252 58.000 0.000 NA   NA
 3415368 3415369 Tbd_0031 Tbd_0032     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 3415369 3415370 Tbd_0032 Tbd_0033     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415370 3415371 Tbd_0033 Tbd_0034     TRUE 0.993 -7.000 0.117 0.053 Y NA
 3415371 3415372 Tbd_0034 Tbd_0035     FALSE 0.164 102.000 0.000 1.000 N NA
 3415373 3415374 Tbd_0036 Tbd_0037   rho TRUE 0.504 115.000 0.087 1.000   NA
 3415374 3415375 Tbd_0037 Tbd_0038 rho   TRUE 0.406 47.000 0.005 NA   NA
 3415375 3415376 Tbd_0038 Tbd_0039   rpmE TRUE 0.536 121.000 0.115 NA   NA
 3415376 3415377 Tbd_0039 Tbd_0040 rpmE   TRUE 0.595 29.000 0.004 1.000   NA
 3415377 3415378 Tbd_0040 Tbd_0041     TRUE 0.749 -10.000 0.000 NA   NA
 3415378 3415379 Tbd_0041 Tbd_0042     TRUE 0.790 7.000 0.000 NA N NA
 3415380 3415381 Tbd_0043 Tbd_0044   glcF TRUE 0.552 24.000 0.000 1.000   NA
 3415381 3415382 Tbd_0044 Tbd_0045 glcF   TRUE 0.867 2.000 0.000 1.000 N NA
 3415382 3415383 Tbd_0045 Tbd_0046   glcE TRUE 0.873 1.000 0.000 1.000 N NA
 3415383 3415384 Tbd_0046 Tbd_0047 glcE   TRUE 0.992 0.000 0.022 0.001 Y NA
 3415384 3415385 Tbd_0047 Tbd_0048     TRUE 0.920 5.000 0.022 NA   NA
 3415385 3415386 Tbd_0048 Tbd_0049     TRUE 0.927 24.000 0.146 NA   NA
 3415387 3415388 Tbd_0050 Tbd_0051     FALSE 0.053 186.000 0.000 NA   NA
 3415388 3415389 Tbd_0051 Tbd_0052     FALSE 0.029 262.000 0.000 NA   NA
 3415390 3415391 Tbd_0053 Tbd_0054     TRUE 0.541 24.000 0.000 NA   NA
 3415392 3415393 Tbd_0055 Tbd_0056     FALSE 0.161 102.000 0.000 NA   NA
 3415394 3415395 Tbd_0057 Tbd_0058     TRUE 0.718 -13.000 0.000 1.000   NA
 3415396 3415397 Tbd_0059 Tbd_0060     TRUE 0.668 14.000 0.000 NA   NA
 3415397 3415398 Tbd_0060 Tbd_0061     TRUE 0.798 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3415398 3415399 Tbd_0061 Tbd_0062     FALSE 0.254 57.000 0.000 NA   NA
 3415399 3415400 Tbd_0062 Tbd_0063     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415401 3415402 Tbd_0064 Tbd_0065     FALSE 0.176 93.000 0.000 NA   NA
 3415402 3415403 Tbd_0065 Tbd_0066     TRUE 0.794 7.000 0.000 NA   NA
 3415403 3415404 Tbd_0066 Tbd_0067     FALSE 0.062 174.000 0.000 1.000   NA
 3415406 3415407 Tbd_0069 Tbd_0070     FALSE 0.255 58.000 0.000 1.000 N NA
 3415407 3415408 Tbd_0070 Tbd_0071     TRUE 0.996 0.000 0.500 1.000   NA
 3415408 3415409 Tbd_0071 Tbd_0072     TRUE 0.987 11.000 0.348 1.000   NA
 3415409 3415410 Tbd_0072 Tbd_0073     TRUE 0.999 -3.000 0.310 NA Y NA
 3415410 3415411 Tbd_0073 Tbd_0074     TRUE 0.998 0.000 0.310 NA Y NA
 3415411 3415412 Tbd_0074 Tbd_0075     TRUE 0.995 -3.000 0.256 1.000   NA
 3415412 3415413 Tbd_0075 Tbd_0076     TRUE 0.991 -10.000 0.372 0.026   NA
 3415413 3415414 Tbd_0076 Tbd_0077     TRUE 0.755 97.000 0.160 0.026   NA
 3415414 3415415 Tbd_0077 Tbd_0078     TRUE 0.617 82.000 0.000 1.000 Y NA
 3415417 3415418 Tbd_0080 Tbd_0081     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415418 3415419 Tbd_0081 Tbd_0082     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415419 3415420 Tbd_0082 Tbd_0083     FALSE 0.170 101.000 0.000 1.000   NA
 3415421 3415422 Tbd_0084 Tbd_0085     TRUE 0.976 4.000 0.000 0.020 Y NA
 3415424 3415425 Tbd_0086 Tbd_0087     FALSE 0.135 165.000 0.013 NA   NA
 3415425 3415426 Tbd_0087 Tbd_0088     TRUE 0.986 25.000 0.916 NA   NA
 3415427 3415428 Tbd_0089 Tbd_0090     TRUE 0.997 -3.000 0.392 1.000 N NA
 3415428 3415429 Tbd_0090 Tbd_0091     FALSE 0.049 199.000 0.000 1.000 N NA
 3415429 3415430 Tbd_0091 Tbd_0092     TRUE 0.951 52.000 0.154 0.012 Y NA
 3415431 3415432 Tbd_0093 Tbd_0094     FALSE 0.061 176.000 0.000 1.000   NA
 3415432 3415433 Tbd_0094 Tbd_0095     FALSE 0.035 240.000 0.000 1.000   NA
 3415433 3415434 Tbd_0095 Tbd_0096     TRUE 0.856 3.000 0.000 1.000   NA
 3415436 3415437 Tbd_0098 Tbd_0099     TRUE 0.998 0.000 0.212 1.000 Y NA
 3415437 3415438 Tbd_0099 Tbd_0100     FALSE 0.114 127.000 0.000 1.000 N NA
 3415438 3415439 Tbd_0100 Tbd_0101     TRUE 0.566 23.000 0.000 1.000 N NA
 3415440 3415441 Tbd_0102 Tbd_0103     FALSE 0.217 76.000 0.000 1.000   NA
 3415441 3415442 Tbd_0103 Tbd_0104     FALSE 0.206 81.000 0.000 1.000 N NA
 3415442 3415443 Tbd_0104 Tbd_0105     TRUE 0.761 10.000 0.000 1.000   NA
 3415443 3415444 Tbd_0105 Tbd_0106     TRUE 0.946 -3.000 0.008 NA   NA
 3415444 3415445 Tbd_0106 Tbd_0107     TRUE 0.998 -3.000 0.613 NA   NA
 3415446 3415447 Tbd_0108 Tbd_0109     TRUE 0.951 -3.000 0.010 1.000   NA
 3415447 3415448 Tbd_0109 Tbd_R0002     FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 3415448 3415449 Tbd_R0002 Tbd_0110     FALSE 0.028 271.000 0.000 NA   NA
 3415449 3415450 Tbd_0110 Tbd_0111     TRUE 0.997 0.000 0.635 NA   NA
 3415450 3415451 Tbd_0111 Tbd_0112     TRUE 0.788 98.000 0.227 1.000 N NA
 3415451 3415452 Tbd_0112 Tbd_0113     TRUE 0.952 -3.000 0.012 1.000 N NA
 3415452 3415453 Tbd_0113 Tbd_0114     TRUE 0.986 0.000 0.008 1.000 Y NA
 3415453 3415454 Tbd_0114 Tbd_0115     TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 3415454 3415455 Tbd_0115 Tbd_0116     TRUE 0.998 3.000 0.309 0.007 Y NA
 3415455 3415456 Tbd_0116 Tbd_0117     TRUE 0.947 155.000 0.647 0.007 Y NA
 3415456 3415457 Tbd_0117 Tbd_0118     TRUE 0.996 0.000 0.297 0.006 N NA
 3415457 3415458 Tbd_0118 Tbd_0119     TRUE 0.997 0.000 0.647 1.000 N NA
 3415458 3415459 Tbd_0119 Tbd_0120   murC TRUE 0.999 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 3415459 3415460 Tbd_0120 Tbd_0121 murC murB TRUE 0.993 -10.000 0.136 0.007 Y NA
 3415460 3415461 Tbd_0121 Tbd_0122 murB ddl TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.007 Y NA
 3415461 3415462 Tbd_0122 Tbd_0123 ddl   TRUE 0.999 -3.000 0.372 NA Y NA
 3415462 3415463 Tbd_0123 Tbd_0124     TRUE 0.837 13.000 0.019 NA N NA
 3415463 3415464 Tbd_0124 Tbd_0125     TRUE 0.578 127.000 0.016 1.000 Y NA
 3415464 3415465 Tbd_0125 Tbd_0126   lpxC TRUE 0.686 93.000 0.134 1.000 N NA
 3415465 3415466 Tbd_0126 Tbd_0127 lpxC   FALSE 0.229 204.000 0.000 1.000 Y NA
 3415467 3415468 Tbd_0128 Tbd_0129     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.026 Y NA
 3415468 3415469 Tbd_0129 Tbd_0130     FALSE 0.039 222.000 0.000 NA   NA
 3415470 3415471 Tbd_0131 Tbd_0132     TRUE 0.726 11.000 0.000 NA   NA
 3415471 3415472 Tbd_0132 Tbd_0133     TRUE 0.926 57.000 0.500 NA   NA
 3415472 3415473 Tbd_0133 Tbd_0134     FALSE 0.031 253.000 0.000 NA   NA
 3415474 3415475 Tbd_0135 Tbd_0136     TRUE 0.994 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 3415475 3415476 Tbd_0136 Tbd_0137     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3415476 3415477 Tbd_0137 Tbd_0138     TRUE 0.993 11.000 0.686 NA   NA
 3415477 3415478 Tbd_0138 Tbd_0139     TRUE 0.848 -7.000 0.000 0.080   NA
 3415478 3415479 Tbd_0139 Tbd_0140     TRUE 0.652 16.000 0.000 1.000 N NA
 3415480 3415481 Tbd_0141 Tbd_0142     FALSE 0.241 62.000 0.000 NA   NA
 3415481 3415482 Tbd_0142 Tbd_0143     TRUE 0.995 4.000 0.567 1.000 N NA
 3415482 3415483 Tbd_0143 Tbd_0144     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3415484 3415485 Tbd_0145 Tbd_0146     FALSE 0.155 108.000 0.000 1.000   NA
 3415486 3415487 Tbd_R0003 Tbd_0147     FALSE 0.161 102.000 0.000 NA   NA
 3415487 3415488 Tbd_0147 Tbd_0148     FALSE 0.195 85.000 0.000 NA   NA
 3415488 3415489 Tbd_0148 Tbd_0149     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415490 3415491 Tbd_0150 Tbd_0151     FALSE 0.142 111.000 0.000 NA   NA
 3415491 3415492 Tbd_0151 Tbd_0152     FALSE 0.200 86.000 0.000 1.000   NA
 3415492 3415493 Tbd_0152 Tbd_0153     TRUE 0.901 -3.000 0.000 NA N NA
 3415493 3415494 Tbd_0153 Tbd_0154     FALSE 0.161 100.000 0.000 NA N NA
 3415494 3415495 Tbd_0154 Tbd_0155     FALSE 0.291 113.000 0.022 NA   NA
 3415496 3415497 Tbd_0156 Tbd_0157     TRUE 0.870 2.000 0.000 1.000   NA
 3415497 3415498 Tbd_0157 Tbd_0158     TRUE 0.641 -21.000 0.000 1.000   NA
 3415498 3415499 Tbd_0158 Tbd_0159   cbbT FALSE 0.189 232.000 0.000 1.000 Y NA
 3415499 3415500 Tbd_0159 Tbd_0160 cbbT cbbG TRUE 0.528 156.000 0.030 1.000 Y NA
 3415500 3415501 Tbd_0160 Tbd_0161 cbbG pgk TRUE 0.426 192.000 0.015 0.006 Y NA
 3415501 3415502 Tbd_0161 Tbd_0162 pgk pykA TRUE 0.812 86.000 0.032 0.006 Y NA
 3415502 3415503 Tbd_0162 Tbd_0163 pykA cbbA TRUE 0.982 35.000 0.232 0.006 Y NA
 3415503 3415504 Tbd_0163 Tbd_0164 cbbA   FALSE 0.040 220.000 0.000 NA   NA
 3415505 3415506 Tbd_0165 Tbd_0166     FALSE 0.014 575.000 0.000 NA   NA
 3415506 3415507 Tbd_0166 Tbd_0167     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3415509 3415510 Tbd_0169 Tbd_0170     FALSE 0.190 89.000 0.000 1.000 N NA
 3415510 3415511 Tbd_0170 Tbd_0171     FALSE 0.318 114.000 0.029 1.000 N NA
 3415511 3415512 Tbd_0171 Tbd_0172     FALSE 0.158 105.000 0.000 1.000 N NA
 3415512 3415513 Tbd_0172 Tbd_0173     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3415513 3415514 Tbd_0173 Tbd_0174     FALSE 0.158 149.000 0.010 1.000 N NA
 3415514 3415515 Tbd_0174 Tbd_0175     FALSE 0.229 66.000 0.000 NA   NA
 3415515 3415516 Tbd_0175 Tbd_0176     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3415516 3415517 Tbd_0176 Tbd_0177     TRUE 0.914 117.000 0.249 1.000 Y NA
 3415517 3415518 Tbd_0177 Tbd_0178   gcvT TRUE 0.885 174.000 0.317 0.002 Y NA
 3415518 3415519 Tbd_0178 Tbd_0179 gcvT   FALSE 0.025 293.000 0.000 NA   NA
 3415519 3415520 Tbd_0179 Tbd_0180   prmA TRUE 0.976 -3.000 0.058 NA   NA
 3415520 3415521 Tbd_0180 Tbd_0181 prmA   TRUE 0.434 169.000 0.152 1.000 N NA
 3415521 3415522 Tbd_0181 Tbd_0182     TRUE 0.966 74.000 0.275 0.002 Y NA
 3415522 3415523 Tbd_0182 Tbd_0183     TRUE 0.976 -18.000 0.254 1.000 N NA
 3415523 3415524 Tbd_0183 Tbd_0184     TRUE 0.541 60.000 0.041 1.000 N NA
 3415524 3415525 Tbd_0184 Tbd_0185     TRUE 0.846 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3415525 3415526 Tbd_0185 Tbd_0186     TRUE 0.986 34.000 0.399 NA Y NA
 3415526 3415527 Tbd_0186 Tbd_0187     TRUE 0.605 139.000 0.186 NA N NA
 3415528 3415529 Tbd_0188 Tbd_0189     FALSE 0.142 177.000 0.024 1.000   NA
 3415529 3415530 Tbd_0189 Tbd_0190     FALSE 0.213 73.000 0.000 NA   NA
 3415530 3415531 Tbd_0190 Tbd_0191     TRUE 0.985 -3.000 0.097 NA   NA
 3415532 3415533 Tbd_0192 Tbd_0193     FALSE 0.243 61.000 0.000 NA   NA
 3415533 3415534 Tbd_0193 Tbd_0194     FALSE 0.019 400.000 0.000 NA   NA
 3415534 3415535 Tbd_0194 Tbd_0195     FALSE 0.038 227.000 0.000 NA   NA
 3415535 3415536 Tbd_0195 Tbd_0196     TRUE 0.848 33.000 0.000 0.018 Y NA
 3415536 3415537 Tbd_0196 Tbd_0197     FALSE 0.319 42.000 0.000 1.000 N NA
 3415537 3415538 Tbd_0197 Tbd_0198     TRUE 0.999 -3.000 0.693 1.000 Y NA
 3415538 3415539 Tbd_0198 Tbd_0199     TRUE 0.978 17.000 0.320 NA N NA
 3415539 3415540 Tbd_0199 Tbd_0200     FALSE 0.067 165.000 0.000 NA   NA
 3415540 3415541 Tbd_0200 Tbd_0201     TRUE 0.904 12.000 0.050 NA   NA
 3415542 3415543 Tbd_0202 Tbd_0203     TRUE 0.999 -3.000 0.616 NA Y NA
 3415543 3415544 Tbd_0203 Tbd_0204     TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 3415544 3415545 Tbd_0204 Tbd_0205     TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 3415545 3415546 Tbd_0205 Tbd_0206     TRUE 0.993 30.000 0.668 NA Y NA
 3415546 3415547 Tbd_0206 Tbd_0207     TRUE 0.822 106.000 0.319 1.000 N NA
 3415547 3415548 Tbd_0207 Tbd_0208     FALSE 0.058 176.000 0.000 NA   NA
 3415548 3415549 Tbd_0208 Tbd_0209     TRUE 0.708 -13.000 0.000 NA   NA
 3415549 3415550 Tbd_0209 Tbd_0210     FALSE 0.258 57.000 0.000 1.000 N NA
 3415551 3415552 Tbd_0211 Tbd_0212     FALSE 0.045 203.000 0.000 NA   NA
 3415552 3415553 Tbd_0212 Tbd_0213   ubiB TRUE 0.895 10.000 0.025 1.000   NA
 3415556 3415557 Tbd_0216 Tbd_0217     TRUE 0.990 29.000 0.453 1.000 Y NA
 3415558 3415559 Tbd_0218 Tbd_0219     FALSE 0.388 165.000 0.118 1.000 N NA
 3415559 3415560 Tbd_0219 Tbd_0220     FALSE 0.094 142.000 0.000 NA   NA
 3415560 3415561 Tbd_0220 Tbd_0221     TRUE 0.668 14.000 0.000 NA   NA
 3415563 3415564 Tbd_0223 Tbd_0224     FALSE 0.055 180.000 0.000 NA   NA
 3415564 3415565 Tbd_0224 Tbd_0225     FALSE 0.021 360.000 0.000 NA   NA
 3415565 3415566 Tbd_0225 Tbd_0226     FALSE 0.025 301.000 0.000 1.000   NA
 3415567 3415568 Tbd_0227 Tbd_0228     TRUE 0.790 7.000 0.000 NA N NA
 3415570 3415571 Tbd_0230 Tbd_0231     TRUE 0.989 -73.000 0.775 0.032   NA
 3415571 3415572 Tbd_0231 Tbd_0232     FALSE 0.027 282.000 0.000 1.000 N NA
 3415572 3415573 Tbd_0232 Tbd_0233     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 3415576 3415577 Tbd_0236 Tbd_0237     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415577 3415578 Tbd_0237 Tbd_0238     TRUE 0.960 5.000 0.074 NA   NA
 3415579 3415580 Tbd_0239 Tbd_0240     TRUE 0.910 65.000 0.444 NA   NA
 3415580 3415581 Tbd_0240 Tbd_0241     TRUE 0.925 11.000 0.061 1.000 N NA
 3415583 3415584 Tbd_0243 Tbd_0244     TRUE 0.953 17.000 0.158 NA   NA
 3415584 3415585 Tbd_0244 Tbd_0245     FALSE 0.110 129.000 0.000 NA   NA
 3415585 3415586 Tbd_0245 Tbd_0246     TRUE 0.929 3.000 0.016 NA   NA
 3415586 3415587 Tbd_0246 Tbd_0247     TRUE 0.901 -3.000 0.000 NA N NA
 3415587 3415588 Tbd_0247 Tbd_0248     TRUE 0.979 0.000 0.000 NA Y NA
 3415588 3415589 Tbd_0248 Tbd_0249     TRUE 0.949 -10.000 0.000 NA Y NA
 3415589 3415590 Tbd_0249 Tbd_0250     TRUE 0.967 -3.000 0.033 NA   NA
 3415590 3415591 Tbd_0250 Tbd_0251     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415592 3415593 Tbd_0252 Tbd_0253     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415593 3415594 Tbd_0253 Tbd_0254     TRUE 0.732 23.000 0.013 NA   NA
 3415595 3415596 Tbd_0255 Tbd_0256 pyrE   TRUE 0.747 -61.000 0.015 NA   NA
 3415597 3415598 Tbd_0257 Tbd_0258 gatB   TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.001 Y NA
 3415598 3415599 Tbd_0258 Tbd_0259     TRUE 0.992 37.000 0.643 0.001 Y NA
 3415600 3415601 Tbd_0260 Tbd_0261     TRUE 0.974 32.000 0.689 1.000 N NA
 3415601 3415602 Tbd_0261 Tbd_0262     TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.003 Y NA
 3415602 3415603 Tbd_0262 Tbd_0263     TRUE 0.860 97.000 0.108 1.000 Y NA
 3415603 3415604 Tbd_0263 Tbd_0264     TRUE 0.928 -13.000 0.073 1.000 N NA
 3415604 3415605 Tbd_0264 Tbd_0265     TRUE 0.806 18.000 0.022 NA N NA
 3415605 3415606 Tbd_0265 Tbd_0266     TRUE 0.996 -3.000 0.086 NA Y NA
 3415606 3415607 Tbd_0266 Tbd_0267     TRUE 0.997 -3.000 0.390 1.000 N NA
 3415607 3415608 Tbd_0267 Tbd_0268     TRUE 0.991 -3.000 0.155 NA   NA
 3415608 3415609 Tbd_0268 Tbd_0269     TRUE 0.994 -3.000 0.219 NA   NA
 3415609 3415610 Tbd_0269 Tbd_0270     FALSE 0.277 50.000 0.000 1.000 N NA
 3415610 3415611 Tbd_0270 Tbd_0271     TRUE 0.950 0.000 0.021 1.000 N NA
 3415612 3415613 Tbd_0272 Tbd_0273     TRUE 0.708 -13.000 0.000 NA   NA
 3415615 3415616 Tbd_0275 Tbd_0276     FALSE 0.084 150.000 0.000 NA   NA
 3415616 3415617 Tbd_0276 Tbd_0277     TRUE 0.961 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3415617 3415618 Tbd_0277 Tbd_0278     TRUE 0.820 -6.000 0.000 NA   NA
 3415618 3415619 Tbd_0278 Tbd_0279     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415619 3415620 Tbd_0279 Tbd_0280     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415621 3415622 Tbd_0281 Tbd_0282     TRUE 0.977 80.000 0.633 1.000 Y NA
 3415622 3415623 Tbd_0282 Tbd_0283     TRUE 0.774 9.000 0.000 1.000 N NA
 3415623 3415624 Tbd_0283 Tbd_0284     TRUE 0.606 -28.000 0.000 1.000   NA
 3415624 3415625 Tbd_0284 Tbd_0285     TRUE 0.895 75.000 0.400 1.000   NA
 3415625 3415626 Tbd_0285 Tbd_0286     TRUE 0.888 17.000 0.060 1.000 N NA
 3415626 3415627 Tbd_0286 Tbd_0287     TRUE 0.987 -3.000 0.107 1.000   NA
 3415627 3415628 Tbd_0287 Tbd_0288     TRUE 0.997 -3.000 0.557 1.000   NA
 3415628 3415629 Tbd_0288 Tbd_0289     TRUE 0.994 5.000 0.509 NA   NA
 3415629 3415630 Tbd_0289 Tbd_0290     TRUE 0.997 -3.000 0.413 NA   NA
 3415630 3415631 Tbd_0290 Tbd_0291     TRUE 0.996 -3.000 0.304 NA   NA
 3415631 3415632 Tbd_0291 Tbd_0292     TRUE 0.975 25.000 0.469 1.000 N NA
 3415632 3415633 Tbd_0292 Tbd_0293     TRUE 0.995 -3.000 0.281 1.000 N NA
 3415633 3415634 Tbd_0293 Tbd_0294     TRUE 0.997 -7.000 0.216 0.021 Y NA
 3415634 3415635 Tbd_0294 Tbd_0295     TRUE 0.993 -3.000 0.189 1.000 N NA
 3415635 3415636 Tbd_0295 Tbd_0296     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415636 3415637 Tbd_0296 Tbd_0297     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415639 3415640 Tbd_0299 Tbd_0300     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3415640 3415641 Tbd_0300 Tbd_0301     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415641 3415642 Tbd_0301 Tbd_0302     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3415642 3415643 Tbd_0302 Tbd_0303     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 3415643 3415644 Tbd_0303 Tbd_0304     FALSE 0.366 37.000 0.000 NA   NA
 3415644 3415645 Tbd_0304 Tbd_0305     TRUE 0.667 15.000 0.000 1.000   NA
 3415648 3415649 Tbd_0308 Tbd_0309     FALSE 0.112 127.000 0.000 NA   NA
 3415649 3415650 Tbd_0309 Tbd_0310     TRUE 0.865 2.000 0.000 NA   NA
 3415650 3415651 Tbd_0310 Tbd_0311     TRUE 0.673 -18.000 0.000 1.000   NA
 3415651 3415652 Tbd_0311 Tbd_0312     FALSE 0.100 140.000 0.000 1.000   NA
 3415652 3415653 Tbd_0312 Tbd_0313     TRUE 0.964 -3.000 0.028 NA   NA
 3415653 3415654 Tbd_0313 Tbd_0314     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3415655 3415656 Tbd_0315 Tbd_0316     TRUE 0.924 11.000 0.060 1.000 N NA
 3415658 3415659 Tbd_0318 Tbd_0319     TRUE 0.401 54.000 0.009 NA   NA
 3415659 3415660 Tbd_0319 Tbd_0320     TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.003 Y NA
 3415660 3415661 Tbd_0320 Tbd_0321     TRUE 0.960 -13.000 0.096 0.003   NA
 3415661 3415662 Tbd_0321 Tbd_0322     TRUE 0.981 -3.000 0.046 0.003   NA
 3415662 3415663 Tbd_0322 Tbd_0323     TRUE 0.992 -3.000 0.008 0.003 Y NA
 3415663 3415664 Tbd_0323 Tbd_0324     FALSE 0.127 118.000 0.000 NA   NA
 3415664 3415665 Tbd_0324 Tbd_0325     FALSE 0.252 58.000 0.000 NA   NA
 3415665 3415666 Tbd_0325 Tbd_0326     TRUE 0.997 22.000 0.741 0.005 Y NA
 3415666 3415667 Tbd_0326 Tbd_0327     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415667 3415668 Tbd_0327 Tbd_0328     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3415668 3415669 Tbd_0328 Tbd_0329     TRUE 0.974 -7.000 0.129 NA   NA
 3415669 3415670 Tbd_0329 Tbd_0330     TRUE 0.897 31.000 0.152 NA   NA
 3415672 3415673 Tbd_0332 Tbd_0333     TRUE 0.985 5.000 0.195 NA   NA
 3415673 3415674 Tbd_0333 Tbd_0334     TRUE 0.935 9.000 0.056 NA   NA
 3415674 3415675 Tbd_0334 Tbd_0335     TRUE 0.998 2.000 0.321 1.000 Y NA
 3415675 3415676 Tbd_0335 Tbd_0336     FALSE 0.191 85.000 0.000 NA N NA
 3415676 3415677 Tbd_0336 Tbd_0337     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415677 3415678 Tbd_0337 Tbd_0338     FALSE 0.152 128.000 0.000 0.078   NA
 3415678 3415679 Tbd_0338 Tbd_0339     TRUE 0.987 18.000 0.467 0.005 N NA
 3415679 3415680 Tbd_0339 Tbd_0340     TRUE 0.541 24.000 0.000 NA   NA
 3415680 3415681 Tbd_0340 Tbd_0341     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415681 3415682 Tbd_0341 Tbd_0342     TRUE 0.977 74.000 0.500 0.045 Y NA
 3415682 3415683 Tbd_0342 Tbd_0343     TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   NA
 3415683 3415684 Tbd_0343 Tbd_0344     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415685 3415686 Tbd_0345 Tbd_0346     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3415688 3415689 Tbd_0348 Tbd_0349     FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 3415689 3415690 Tbd_0349 Tbd_0350     FALSE 0.025 294.000 0.000 NA   NA
 3415691 3415692 Tbd_0351 Tbd_0352     FALSE 0.038 225.000 0.000 NA   NA
 3415692 3415693 Tbd_0352 Tbd_0353     FALSE 0.226 67.000 0.000 NA   NA
 3415693 3415694 Tbd_0353 Tbd_0354     FALSE 0.227 168.000 0.056 NA   NA
 3415694 3415695 Tbd_0354 Tbd_0355     TRUE 0.794 65.000 0.167 1.000   NA
 3415695 3415696 Tbd_0355 Tbd_0356     FALSE 0.052 195.000 0.000 1.000   NA
 3415696 3415697 Tbd_0356 Tbd_0357     FALSE 0.071 164.000 0.000 1.000   NA
 3415697 3415698 Tbd_0357 Tbd_0358     TRUE 0.994 11.000 0.655 0.044   NA
 3415698 3415699 Tbd_0358 Tbd_0359     TRUE 0.982 4.000 0.150 NA   NA
 3415699 3415700 Tbd_0359 Tbd_0360     TRUE 0.930 20.000 0.120 NA   NA
 3415700 3415701 Tbd_0360 Tbd_0361     TRUE 0.563 -112.000 0.000 NA   NA
 3415701 3415702 Tbd_0361 Tbd_0362     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3415703 3415704 Tbd_0363 Tbd_0364     FALSE 0.047 201.000 0.000 NA   NA
 3415707 3415708 Tbd_0367 Tbd_0368     TRUE 0.996 -7.000 0.846 NA   NA
 3415708 3415709 Tbd_0368 Tbd_0369     FALSE 0.119 123.000 0.000 NA   NA
 3415709 3415710 Tbd_0369 Tbd_0370     FALSE 0.073 159.000 0.000 NA   NA
 3415710 3415711 Tbd_0370 Tbd_0371     FALSE 0.082 151.000 0.000 NA   NA
 3415714 3415715 Tbd_0374 Tbd_0375     TRUE 0.992 -3.000 0.031 NA Y NA
 3415715 3415716 Tbd_0375 Tbd_0376     TRUE 0.971 7.000 0.117 1.000 N NA
 3415717 3415718 Tbd_0377 Tbd_0378     TRUE 0.994 -10.000 0.598 0.007   NA
 3415718 3415719 Tbd_0378 Tbd_0379     TRUE 0.877 -10.000 0.017 1.000   NA
 3415719 3415720 Tbd_0379 Tbd_0380     TRUE 0.922 3.000 0.012 1.000 N NA
 3415720 3415721 Tbd_0380 Tbd_0381     TRUE 0.916 18.000 0.088 1.000   NA
 3415722 3415723 Tbd_0382 Tbd_0383     FALSE 0.354 70.000 0.009 1.000   NA
 3415724 3415725 Tbd_0384 Tbd_0385     TRUE 0.974 0.000 0.067 1.000   NA
 3415725 3415726 Tbd_0385 Tbd_0386     TRUE 0.991 -3.000 0.157 1.000 N NA
 3415726 3415727 Tbd_0386 Tbd_R0004     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3415727 3415728 Tbd_R0004 Tbd_0387     FALSE 0.218 71.000 0.000 NA   NA
 3415728 3415729 Tbd_0387 Tbd_0388     TRUE 0.672 91.000 0.122 1.000 N NA
 3415729 3415730 Tbd_0388 Tbd_0389     TRUE 0.988 39.000 0.496 0.030 Y NA
 3415730 3415731 Tbd_0389 Tbd_0390     TRUE 0.998 -3.000 0.184 1.000 Y NA
 3415731 3415732 Tbd_0390 Tbd_R0005     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3415732 3415733 Tbd_R0005 Tbd_R0006     FALSE 0.205 80.000 0.000 NA   NA
 3415733 3415734 Tbd_R0006 Tbd_R0007     FALSE 0.366 37.000 0.000 NA   NA
 3415734 3415735 Tbd_R0007 Tbd_0391     FALSE 0.074 158.000 0.000 NA   NA
 3415735 3415736 Tbd_0391 Tbd_R0008     FALSE 0.229 66.000 0.000 NA   NA
 3415736 3415737 Tbd_R0008 Tbd_0392   secE TRUE 0.438 31.000 0.000 NA   NA
 3415737 3415738 Tbd_0392 Tbd_0393 secE   TRUE 0.997 3.000 0.843 1.000 N NA
 3415738 3415739 Tbd_0393 Tbd_0394   rplK TRUE 0.917 92.000 0.681 1.000 N NA
 3415739 3415740 Tbd_0394 Tbd_0395 rplK   TRUE 0.999 2.000 0.838 0.024 Y NA
 3415740 3415741 Tbd_0395 Tbd_0396   rplJ TRUE 0.700 278.000 0.302 1.000 Y NA
 3415741 3415742 Tbd_0396 Tbd_0397 rplJ rplL TRUE 0.985 66.000 0.884 1.000 Y NA
 3415742 3415743 Tbd_0397 Tbd_0398 rplL   TRUE 0.409 229.000 0.223 1.000   NA
 3415743 3415744 Tbd_0398 Tbd_0399     TRUE 0.992 22.000 0.851 0.001   NA
 3415744 3415745 Tbd_0399 Tbd_0400   rpsL TRUE 0.389 166.000 0.122 1.000 N NA
 3415745 3415746 Tbd_0400 Tbd_0401 rpsL   TRUE 0.980 89.000 0.620 0.004 Y NA
 3415746 3415747 Tbd_0401 Tbd_0402     TRUE 0.992 31.000 0.579 1.000 Y NA
 3415747 3415748 Tbd_0402 Tbd_0403     TRUE 0.915 29.000 0.005 0.001 Y NA
 3415748 3415749 Tbd_0403 Tbd_0404   rpsJ TRUE 0.947 14.000 0.006 1.000 Y NA
 3415749 3415750 Tbd_0404 Tbd_0405 rpsJ   TRUE 0.931 127.000 0.307 0.024 Y NA
 3415750 3415751 Tbd_0405 Tbd_0406   rplD TRUE 0.999 0.000 0.486 0.018 Y NA
 3415751 3415752 Tbd_0406 Tbd_0407 rplD   TRUE 0.999 0.000 0.513 1.000 Y NA
 3415752 3415753 Tbd_0407 Tbd_0408   rplB TRUE 0.998 12.000 0.849 1.000 Y NA
 3415753 3415754 Tbd_0408 Tbd_0409 rplB rpsS TRUE 0.998 16.000 0.820 0.024 Y NA
 3415754 3415755 Tbd_0409 Tbd_0410 rpsS   TRUE 0.998 11.000 0.769 0.024 Y NA
 3415755 3415756 Tbd_0410 Tbd_0411   rpsC TRUE 0.998 12.000 0.719 0.024 Y NA
 3415756 3415757 Tbd_0411 Tbd_0412 rpsC rplP TRUE 0.998 -16.000 0.828 0.024 Y NA
 3415757 3415758 Tbd_0412 Tbd_0413 rplP   TRUE 0.999 4.000 0.802 0.018 Y NA
 3415758 3415759 Tbd_0413 Tbd_0414     TRUE 1.000 -3.000 0.828 0.018 Y NA
 3415759 3415760 Tbd_0414 Tbd_0415   rplN TRUE 0.931 183.000 0.791 0.024 Y NA
 3415760 3415761 Tbd_0415 Tbd_0416 rplN   TRUE 0.999 10.000 0.810 0.024 Y NA
 3415761 3415762 Tbd_0416 Tbd_0417   rplE TRUE 0.999 3.000 0.758 0.018 Y NA
 3415762 3415763 Tbd_0417 Tbd_0418 rplE rpsN TRUE 0.997 8.000 0.309 0.018 Y NA
 3415763 3415764 Tbd_0418 Tbd_0419 rpsN   TRUE 0.996 13.000 0.295 0.018 Y NA
 3415764 3415765 Tbd_0419 Tbd_0420   rplF TRUE 0.998 13.000 0.808 0.018 Y NA
 3415765 3415766 Tbd_0420 Tbd_0421 rplF   TRUE 0.998 18.000 0.815 0.018 Y NA
 3415766 3415767 Tbd_0421 Tbd_0422   rpsE TRUE 0.998 16.000 0.814 0.024 Y NA
 3415767 3415768 Tbd_0422 Tbd_0423 rpsE rpmD TRUE 0.999 4.000 0.789 0.024 Y NA
 3415768 3415769 Tbd_0423 Tbd_0424 rpmD   TRUE 0.999 1.000 0.653 0.003 Y NA
 3415769 3415770 Tbd_0424 Tbd_0425   secY TRUE 0.988 19.000 0.730 1.000 N NA
 3415770 3415771 Tbd_0425 Tbd_0426 secY infA TRUE 0.979 0.000 0.083 1.000 N NA
 3415771 3415772 Tbd_0426 Tbd_0427 infA rpsM TRUE 0.482 249.000 0.075 0.024 Y NA
 3415772 3415773 Tbd_0427 Tbd_0428 rpsM   TRUE 0.999 10.000 0.810 0.018 Y NA
 3415773 3415774 Tbd_0428 Tbd_0429   rpsD TRUE 0.997 16.000 0.509 0.024 Y NA
 3415774 3415775 Tbd_0429 Tbd_0430 rpsD   TRUE 0.947 43.000 0.549 1.000 N NA
 3415775 3415776 Tbd_0430 Tbd_0431     TRUE 0.939 84.000 0.873 1.000 N NA
 3415776 3415777 Tbd_0431 Tbd_0432     FALSE 0.171 136.000 0.008 NA   NA
 3415778 3415779 Tbd_0433 Tbd_0434     FALSE 0.209 77.000 0.000 NA   NA
 3415779 3415780 Tbd_0434 Tbd_0435     FALSE 0.132 116.000 0.000 NA   NA
 3415780 3415781 Tbd_0435 Tbd_0436     TRUE 0.867 2.000 0.000 1.000 N NA
 3415782 3415783 Tbd_0437 Tbd_0438     FALSE 0.237 65.000 0.000 1.000 N NA
 3415783 3415784 Tbd_0438 Tbd_0439     FALSE 0.213 76.000 0.000 1.000 N NA
 3415784 3415785 Tbd_0439 Tbd_0440     FALSE 0.174 94.000 0.000 NA   NA
 3415785 3415786 Tbd_0440 Tbd_0441     TRUE 0.922 30.000 0.190 NA   NA
 3415786 3415787 Tbd_0441 Tbd_0442   aspS TRUE 0.911 12.000 0.057 NA   NA
 3415787 3415788 Tbd_0442 Tbd_0443 aspS   TRUE 0.794 7.000 0.000 NA   NA
 3415788 3415789 Tbd_0443 Tbd_0444   ntpA TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415789 3415790 Tbd_0444 Tbd_0445 ntpA   TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3415790 3415791 Tbd_0445 Tbd_0446     TRUE 0.994 -3.000 0.216 NA   NA
 3415793 3415794 Tbd_0448 Tbd_0449     FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 3415794 3415795 Tbd_0449 Tbd_0450     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415796 3415797 Tbd_0451 Tbd_0452     FALSE 0.387 59.000 0.009 NA   NA
 3415798 3415799 Tbd_0453 Tbd_0454 rplM rpsI TRUE 0.999 -3.000 0.601 0.017 Y NA
 3415799 3415800 Tbd_0454 Tbd_0455 rpsI argC FALSE 0.370 105.000 0.032 1.000 N NA
 3415800 3415801 Tbd_0455 Tbd_0456 argC   TRUE 0.401 92.000 0.031 NA   NA
 3415802 3415803 Tbd_0457 Tbd_0458 anmK   TRUE 0.992 -3.000 0.184 NA N NA
 3415804 3415805 Tbd_0459 Tbd_R0009     FALSE 0.018 412.000 0.000 NA   NA
 3415805 3415806 Tbd_R0009 Tbd_R0010     FALSE 0.199 83.000 0.000 NA   NA
 3415806 3415807 Tbd_R0010 Tbd_R0011     FALSE 0.096 140.000 0.000 NA   NA
 3415807 3415808 Tbd_R0011 Tbd_R0012     FALSE 0.016 463.000 0.000 NA   NA
 3415808 3415809 Tbd_R0012 Tbd_R0013     FALSE 0.093 143.000 0.000 NA   NA
 3415809 3415810 Tbd_R0013 Tbd_0460     FALSE 0.125 119.000 0.000 NA   NA
 3415810 3415811 Tbd_0460 Tbd_0461     TRUE 0.990 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3415811 3415812 Tbd_0461 Tbd_0462     TRUE 0.943 -3.000 0.007 NA   NA
 3415813 3415814 Tbd_0463 Tbd_0464     TRUE 0.998 -3.000 0.248 NA Y NA
 3415815 3415816 Tbd_0465 Tbd_0466     TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000   NA
 3415816 3415817 Tbd_0466 Tbd_0467     TRUE 0.998 2.000 0.308 NA Y NA
 3415817 3415818 Tbd_0467 Tbd_0468     TRUE 0.999 -3.000 0.565 NA Y NA
 3415819 3415820 Tbd_0469 Tbd_0470     TRUE 0.945 10.000 0.076 NA N NA
 3415820 3415821 Tbd_0470 Tbd_0471     TRUE 0.952 24.000 0.215 NA N NA
 3415821 3415822 Tbd_0471 Tbd_0472     TRUE 0.964 -28.000 0.058 1.000 Y NA
 3415822 3415823 Tbd_0472 Tbd_0473     TRUE 0.786 25.000 0.035 1.000 N NA
 3415823 3415824 Tbd_0473 Tbd_0474     TRUE 0.974 17.000 0.276 NA   NA
 3415825 3415826 Tbd_0475 Tbd_0476     TRUE 0.998 11.000 0.829 1.000 Y NA
 3415826 3415827 Tbd_0476 Tbd_0477     TRUE 0.491 73.000 0.040 1.000 N NA
 3415827 3415828 Tbd_0477 Tbd_0478     TRUE 0.995 -3.000 0.262 1.000 N NA
 3415828 3415829 Tbd_0478 Tbd_0479     TRUE 0.986 -7.000 0.218 1.000 N NA
 3415829 3415830 Tbd_0479 Tbd_0480     FALSE 0.058 177.000 0.000 1.000 N NA
 3415830 3415831 Tbd_0480 Tbd_0481   folE TRUE 0.885 0.000 0.000 1.000 N NA
 3415831 3415832 Tbd_0481 Tbd_0482 folE   FALSE 0.250 60.000 0.000 1.000 N NA
 3415832 3415833 Tbd_0482 Tbd_0483     TRUE 0.676 -16.000 0.000 NA   NA
 3415833 3415834 Tbd_0483 Tbd_0484     TRUE 0.608 -25.000 0.000 NA   NA
 3415834 3415835 Tbd_0484 Tbd_0485     TRUE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 3415835 3415836 Tbd_0485 Tbd_0486     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3415836 3415837 Tbd_0486 Tbd_0487     FALSE 0.093 143.000 0.000 NA   NA
 3415838 3415839 Tbd_0488 Tbd_0489     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3415839 3415840 Tbd_0489 Tbd_0490     FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 3415840 3415841 Tbd_0490 Tbd_0491     TRUE 0.997 -7.000 0.330 NA Y NA
 3415841 3415842 Tbd_0491 Tbd_0492     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA N NA
 3415842 3415843 Tbd_0492 Tbd_0493     TRUE 0.999 3.000 0.937 1.000 Y NA
 3415843 3415844 Tbd_0493 Tbd_0494     TRUE 0.999 -6.000 0.937 0.067 Y NA
 3415844 3415845 Tbd_0494 Tbd_0495     TRUE 1.000 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 3415845 3415846 Tbd_0495 Tbd_0496     TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.010 Y NA
 3415846 3415847 Tbd_0496 Tbd_0497     TRUE 1.000 0.000 0.881 0.010 Y NA
 3415847 3415848 Tbd_0497 Tbd_0498     FALSE 0.093 144.000 0.000 1.000 N NA
 3415851 3415852 Tbd_0501 Tbd_0502     TRUE 0.975 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 3415854 3415855 Tbd_0504 Tbd_0505     FALSE 0.017 429.000 0.000 NA   NA
 3415855 3415856 Tbd_0505 Tbd_0506     FALSE 0.020 385.000 0.000 NA   NA
 3415856 3415857 Tbd_0506 Tbd_0507     FALSE 0.021 355.000 0.000 NA   NA
 3415859 3415860 Tbd_0509 Tbd_0510     FALSE 0.179 92.000 0.000 NA   NA
 3415860 3415861 Tbd_0510 Tbd_0511     TRUE 0.983 14.000 0.358 NA   NA
 3415861 3415862 Tbd_0511 Tbd_0512     TRUE 0.995 -3.000 0.259 NA   NA
 3415862 3415863 Tbd_0512 Tbd_0513     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3415863 3415864 Tbd_0513 Tbd_0514     FALSE 0.038 225.000 0.000 NA   NA
 3415864 3415865 Tbd_0514 Tbd_R0014     TRUE 0.485 27.000 0.000 NA   NA
 3415865 3415866 Tbd_R0014 Tbd_0515     FALSE 0.116 125.000 0.000 NA   NA
 3415866 3415867 Tbd_0515 Tbd_0516     TRUE 0.896 73.000 0.411 NA   NA
 3415867 3415868 Tbd_0516 Tbd_0517   recR TRUE 0.987 17.000 0.604 NA   NA
 3415868 3415869 Tbd_0517 Tbd_0518 recR   FALSE 0.219 72.000 0.000 1.000 N NA
 3415869 3415870 Tbd_0518 Tbd_0519     TRUE 0.490 27.000 0.000 1.000 N NA
 3415871 3415872 Tbd_0520 Tbd_0521 greB   TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415874 3415875 Tbd_0523 Tbd_0524     FALSE 0.034 243.000 0.000 NA   NA
 3415875 3415876 Tbd_0524 Tbd_0525     TRUE 0.887 0.000 0.000 1.000   NA
 3415876 3415877 Tbd_0525 Tbd_0526     TRUE 0.895 9.000 0.020 1.000   NA
 3415877 3415878 Tbd_0526 Tbd_0527     TRUE 0.676 34.000 0.033 NA   NA
 3415878 3415879 Tbd_0527 Tbd_0528     TRUE 0.941 -19.000 0.118 NA   NA
 3415879 3415880 Tbd_0528 Tbd_0529     TRUE 0.942 0.000 0.013 NA   NA
 3415880 3415881 Tbd_0529 Tbd_0530     TRUE 0.991 0.000 0.194 NA   NA
 3415881 3415882 Tbd_0530 Tbd_0531     TRUE 0.995 7.000 0.177 1.000 Y NA
 3415882 3415883 Tbd_0531 Tbd_0532     TRUE 0.853 86.000 0.309 NA N NA
 3415883 3415884 Tbd_0532 Tbd_0533     TRUE 0.776 156.000 0.574 NA N NA
 3415884 3415885 Tbd_0533 Tbd_0534     TRUE 0.625 68.000 0.075 1.000   NA
 3415885 3415886 Tbd_0534 Tbd_0535     TRUE 0.997 -3.000 0.543 NA   NA
 3415886 3415887 Tbd_0535 Tbd_0536     TRUE 0.993 5.000 0.459 NA   NA
 3415887 3415888 Tbd_0536 Tbd_0537     TRUE 0.966 35.000 0.617 NA   NA
 3415888 3415889 Tbd_0537 Tbd_0538     TRUE 0.997 0.000 0.598 1.000   NA
 3415893 3415894 Tbd_0542 Tbd_0543     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3415894 3415895 Tbd_0543 Tbd_0544     TRUE 0.980 -7.000 0.167 NA   NA
 3415895 3415896 Tbd_0544 Tbd_0545     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 3415896 3415897 Tbd_0545 Tbd_0546     TRUE 0.996 0.000 0.379 NA   NA
 3415897 3415898 Tbd_0546 Tbd_0547     TRUE 0.999 3.000 0.448 1.000 Y NA
 3415898 3415899 Tbd_0547 Tbd_0548     TRUE 0.990 5.000 0.267 1.000   NA
 3415899 3415900 Tbd_0548 Tbd_0549     TRUE 0.949 26.000 0.222 1.000   NA
 3415900 3415901 Tbd_0549 Tbd_0550     TRUE 0.999 -3.000 0.389 1.000 Y NA
 3415901 3415902 Tbd_0550 Tbd_0551     TRUE 0.993 10.000 0.500 0.023 N NA
 3415902 3415903 Tbd_0551 Tbd_0552     FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 3415903 3415904 Tbd_0552 Tbd_0553   alaS FALSE 0.213 73.000 0.000 NA   NA
 3415904 3415905 Tbd_0553 Tbd_0554 alaS   FALSE 0.037 228.000 0.000 NA   NA
 3415905 3415906 Tbd_0554 Tbd_0555     TRUE 0.561 23.000 0.000 NA   NA
 3415906 3415907 Tbd_0555 Tbd_0556     TRUE 0.986 3.000 0.164 NA N NA
 3415907 3415908 Tbd_0556 Tbd_0557     TRUE 0.993 -6.000 0.400 NA   NA
 3415908 3415909 Tbd_0557 Tbd_0558     TRUE 0.974 4.000 0.107 NA   NA
 3415909 3415910 Tbd_0558 Tbd_0559     TRUE 0.867 19.000 0.054 NA   NA
 3415910 3415911 Tbd_0559 Tbd_0560     TRUE 0.996 3.000 0.625 NA   NA
 3415911 3415912 Tbd_0560 Tbd_0561     TRUE 0.763 43.000 0.074 0.006 N NA
 3415912 3415913 Tbd_0561 Tbd_0562     TRUE 0.976 38.000 0.794 0.006   NA
 3415913 3415914 Tbd_0562 Tbd_0563     FALSE 0.023 352.000 0.000 1.000   NA
 3415914 3415915 Tbd_0563 Tbd_0564     TRUE 0.644 61.000 0.074 1.000   NA
 3415915 3415916 Tbd_0564 Tbd_0565     TRUE 0.867 68.000 0.286 NA   NA
 3415916 3415917 Tbd_0565 Tbd_0566     TRUE 0.757 48.000 0.109 NA   NA
 3415917 3415918 Tbd_0566 Tbd_0567     TRUE 0.927 37.000 0.281 NA   NA
 3415918 3415919 Tbd_0567 Tbd_0568     FALSE 0.095 144.000 0.000 1.000   NA
 3415920 3415921 Tbd_0569 Tbd_0570     FALSE 0.019 394.000 0.000 1.000 N NA
 3415921 3415922 Tbd_0570 Tbd_0571     TRUE 0.973 45.000 0.306 1.000 Y NA
 3415922 3415923 Tbd_0571 Tbd_0572     TRUE 0.873 110.000 0.548 1.000   NA
 3415923 3415924 Tbd_0572 Tbd_0573     FALSE 0.208 78.000 0.000 NA   NA
 3415924 3415925 Tbd_0573 Tbd_0574     TRUE 0.417 136.000 0.086 NA N NA
 3415925 3415926 Tbd_0574 Tbd_0575     FALSE 0.205 80.000 0.000 NA   NA
 3415926 3415927 Tbd_0575 Tbd_0576     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 3415928 3415929 Tbd_0577 Tbd_0578 valS   FALSE 0.157 104.000 0.000 NA   NA
 3415929 3415930 Tbd_0578 Tbd_0579     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3415930 3415931 Tbd_0579 Tbd_0580     TRUE 0.997 -3.000 0.494 1.000 N NA
 3415932 3415933 Tbd_0581 Tbd_0582     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.066   NA
 3415933 3415934 Tbd_0582 Tbd_0583     TRUE 0.673 -18.000 0.000 1.000   NA
 3415935 3415936 Tbd_0584 Tbd_0585     TRUE 0.977 -3.000 0.061 NA   NA
 3415937 3415938 Tbd_0586 Tbd_0587     TRUE 0.989 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 3415938 3415939 Tbd_0587 Tbd_0588     FALSE 0.208 80.000 0.000 1.000 N NA
 3415939 3415940 Tbd_0588 Tbd_0589     TRUE 0.942 17.000 0.123 1.000 N NA
 3415940 3415941 Tbd_0589 Tbd_0590     FALSE 0.260 56.000 0.000 1.000 N NA
 3415941 3415942 Tbd_0590 Tbd_0591     TRUE 0.979 7.000 0.156 1.000   NA
 3415942 3415943 Tbd_0591 Tbd_0592     TRUE 0.976 2.000 0.086 1.000   NA
 3415943 3415944 Tbd_0592 Tbd_0593     TRUE 0.993 -3.000 0.204 1.000   NA
 3415944 3415945 Tbd_0593 Tbd_0594   ispG TRUE 0.983 10.000 0.233 1.000   NA
 3415945 3415946 Tbd_0594 Tbd_0595 ispG hisS TRUE 0.943 26.000 0.207 1.000 N NA
 3415946 3415947 Tbd_0595 Tbd_0596 hisS   TRUE 0.988 7.000 0.259 NA   NA
 3415947 3415948 Tbd_0596 Tbd_0597     TRUE 0.997 -3.000 0.492 NA   NA
 3415948 3415949 Tbd_0597 Tbd_0598   engA TRUE 0.854 52.000 0.203 1.000   NA
 3415950 3415951 Tbd_0599 Tbd_0600     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 3415952 3415953 Tbd_0601 Tbd_0602     FALSE 0.035 240.000 0.000 1.000   NA
 3415953 3415954 Tbd_0602 Tbd_0603     TRUE 0.982 7.000 0.184 1.000   NA
 3415954 3415955 Tbd_0603 Tbd_0604     TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.011 Y NA
 3415955 3415956 Tbd_0604 Tbd_0605     TRUE 0.996 -3.000 0.348 NA   NA
 3415956 3415957 Tbd_0605 Tbd_0606     TRUE 0.982 2.000 0.117 NA   NA
 3415957 3415958 Tbd_0606 Tbd_0607     TRUE 0.959 15.000 0.161 1.000 N NA
 3415960 3415961 Tbd_0608 Tbd_0609     TRUE 0.992 -3.000 0.147 0.024 N NA
 3415961 3415962 Tbd_0609 Tbd_0610     FALSE 0.087 147.000 0.000 NA   NA
 3415963 3415964 Tbd_0611 Tbd_0612     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3415968 3415969 Tbd_0616 Tbd_0617     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 3415970 3415971 Tbd_0618 Tbd_0619     FALSE 0.168 100.000 0.000 1.000 N NA
 3415971 3415972 Tbd_0619 Tbd_0620     TRUE 0.990 -3.000 0.138 1.000 N NA
 3415972 3415973 Tbd_0620 Tbd_0621   eno TRUE 0.727 71.000 0.125 1.000 N NA
 3415973 3415974 Tbd_0621 Tbd_0622 eno   TRUE 0.969 -22.000 0.241 1.000 N NA
 3415974 3415975 Tbd_0622 Tbd_0623     TRUE 0.961 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3415975 3415976 Tbd_0623 Tbd_0624     TRUE 0.929 0.000 0.005 1.000 N NA
 3415976 3415977 Tbd_0624 Tbd_0625     TRUE 0.485 41.000 0.010 1.000 N NA
 3415979 3415980 Tbd_0627 Tbd_0628     FALSE 0.229 66.000 0.000 NA   NA
 3415980 3415981 Tbd_0628 Tbd_0629     FALSE 0.209 77.000 0.000 NA   NA
 3415981 3415982 Tbd_0629 Tbd_0630     FALSE 0.217 73.000 0.000 1.000 N NA
 3415982 3415983 Tbd_0630 Tbd_0631     TRUE 0.668 14.000 0.000 NA   NA
 3415984 3415985 Tbd_0632 Tbd_0633     TRUE 0.980 14.000 0.308 NA   NA
 3415985 3415986 Tbd_0633 Tbd_0634     TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA   NA
 3415987 3415988 Tbd_0635 Tbd_0636     FALSE 0.277 50.000 0.000 1.000 N NA
 3415989 3415990 Tbd_0637 Tbd_0638     FALSE 0.388 160.000 0.111 NA   NA
 3415990 3415991 Tbd_0638 Tbd_0639     TRUE 0.931 5.000 0.030 NA   NA
 3415991 3415992 Tbd_0639 Tbd_0640     TRUE 0.967 51.000 0.231 0.043 Y NA
 3415992 3415993 Tbd_0640 Tbd_0641     TRUE 0.994 -3.000 0.182 0.005 N NA
 3415993 3415994 Tbd_0641 Tbd_0642     TRUE 0.982 9.000 0.167 0.005 N NA
 3415994 3415995 Tbd_0642 Tbd_0643     TRUE 0.992 12.000 0.525 0.005 N NA
 3415995 3415996 Tbd_0643 Tbd_0644     FALSE 0.021 491.000 0.000 0.074 N NA
 3415996 3415997 Tbd_0644 Tbd_0645     FALSE 0.014 1279.000 0.000 1.000 N NA
 3415997 3415998 Tbd_0645 Tbd_0646     TRUE 0.853 3.000 0.000 1.000 N NA
 3416000 3416001 Tbd_0648 Tbd_0649     FALSE 0.145 110.000 0.000 NA   NA
 3416001 3416002 Tbd_0649 Tbd_0650     TRUE 0.582 95.000 0.091 NA   NA
 3416002 3416003 Tbd_0650 Tbd_0651     FALSE 0.172 95.000 0.000 NA   NA
 3416003 3416004 Tbd_0651 Tbd_0652     FALSE 0.041 216.000 0.000 NA   NA
 3416004 3416005 Tbd_0652 Tbd_0653     TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 3416005 3416006 Tbd_0653 Tbd_0654     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 3416006 3416007 Tbd_0654 Tbd_0655     TRUE 0.985 48.000 0.456 0.001 Y NA
 3416013 3416014 Tbd_0661 Tbd_0662     TRUE 0.541 24.000 0.000 NA   NA
 3416014 3416015 Tbd_0662 Tbd_0663     FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 3416015 3416016 Tbd_0663 Tbd_0664     TRUE 0.561 23.000 0.000 NA   NA
 3416016 3416017 Tbd_0664 Tbd_0665     FALSE 0.173 99.000 0.000 1.000   NA
 3416019 3416020 Tbd_0667 Tbd_0668     TRUE 0.648 16.000 0.000 NA   NA
 3416020 3416021 Tbd_0668 Tbd_0669     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 3416022 3416023 Tbd_0670 Tbd_0671     TRUE 0.578 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3416024 3416025 Tbd_0672 Tbd_0673     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 3416025 3416026 Tbd_0673 Tbd_0674     FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 3416027 3416028 Tbd_0675 Tbd_0676     TRUE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 3416028 3416029 Tbd_0676 Tbd_0677     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3416029 3416030 Tbd_0677 Tbd_0678     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3416030 3416031 Tbd_0678 Tbd_0679     FALSE 0.084 152.000 0.000 1.000   NA
 3416031 3416032 Tbd_0679 Tbd_0680     FALSE 0.372 47.000 0.000 0.048   NA
 3416033 3416034 Tbd_0681 Tbd_0682     FALSE 0.264 53.000 0.000 NA   NA
 3416036 3416037 Tbd_0684 Tbd_0685     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA N NA
 3416038 3416039 Tbd_0686 Tbd_0687     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416040 3416041 Tbd_0688 Tbd_R0016     TRUE 0.726 11.000 0.000 NA   NA
 3416041 3416042 Tbd_R0016 Tbd_R0017     FALSE 0.366 37.000 0.000 NA   NA
 3416042 3416043 Tbd_R0017 Tbd_R0018     TRUE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 3416046 3416047 Tbd_0691 Tbd_0692     TRUE 0.462 29.000 0.000 NA   NA
 3416048 3416049 Tbd_0693 Tbd_0694     TRUE 0.926 125.000 0.335 1.000 Y NA
 3416049 3416050 Tbd_0694 Tbd_0695     TRUE 0.931 90.000 0.211 1.000 Y NA
 3416050 3416051 Tbd_0695 Tbd_0696     TRUE 0.999 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 3416051 3416052 Tbd_0696 Tbd_0697   infB TRUE 0.960 108.000 0.530 1.000 Y NA
 3416052 3416053 Tbd_0697 Tbd_0698 infB   TRUE 0.988 10.000 0.342 1.000 N NA
 3416053 3416054 Tbd_0698 Tbd_0699     TRUE 0.988 19.000 0.759 NA   NA
 3416054 3416055 Tbd_0699 Tbd_R0019     FALSE 0.249 59.000 0.000 NA   NA
 3416055 3416056 Tbd_R0019 Tbd_R0020     TRUE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 3416056 3416057 Tbd_R0020 Tbd_R0021     FALSE 0.220 70.000 0.000 NA   NA
 3416057 3416058 Tbd_R0021 Tbd_0700     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 3416058 3416059 Tbd_0700 Tbd_0701     TRUE 0.988 5.000 0.227 1.000 N NA
 3416059 3416060 Tbd_0701 Tbd_0702     FALSE 0.275 96.000 0.007 1.000   NA
 3416060 3416061 Tbd_0702 Tbd_0703     TRUE 0.941 3.000 0.026 NA   NA
 3416061 3416062 Tbd_0703 Tbd_0704     FALSE 0.251 56.000 0.000 NA N NA
 3416062 3416063 Tbd_0704 Tbd_0705     TRUE 0.529 157.000 0.033 NA Y NA
 3416063 3416064 Tbd_0705 Tbd_0706     FALSE 0.054 183.000 0.000 NA   NA
 3416064 3416065 Tbd_0706 Tbd_0707     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3416065 3416066 Tbd_0707 Tbd_0708     TRUE 0.988 -3.000 0.120 NA   NA
 3416066 3416067 Tbd_0708 Tbd_0709     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416067 3416068 Tbd_0709 Tbd_0710     TRUE 0.779 9.000 0.000 1.000   NA
 3416068 3416069 Tbd_0710 Tbd_0711     FALSE 0.219 74.000 0.000 1.000   NA
 3416069 3416070 Tbd_0711 Tbd_0712     TRUE 0.997 0.000 0.156 0.041 Y NA
 3416070 3416071 Tbd_0712 Tbd_0713     TRUE 0.994 3.000 0.286 0.020 N NA
 3416071 3416072 Tbd_0713 Tbd_0714     FALSE 0.226 71.000 0.000 1.000   NA
 3416072 3416073 Tbd_0714 Tbd_0715     FALSE 0.278 51.000 0.000 1.000   NA
 3416073 3416074 Tbd_0715 Tbd_0716     FALSE 0.041 216.000 0.000 1.000 N NA
 3416074 3416075 Tbd_0716 Tbd_0717     TRUE 0.983 6.000 0.185 1.000 N NA
 3416075 3416076 Tbd_0717 Tbd_0718     TRUE 0.949 -9.000 0.074 1.000 N NA
 3416076 3416077 Tbd_0718 Tbd_0719     TRUE 0.951 15.000 0.133 1.000 N NA
 3416077 3416078 Tbd_0719 Tbd_0720     TRUE 0.997 -3.000 0.463 1.000 N NA
 3416078 3416079 Tbd_0720 Tbd_0721     TRUE 0.997 -3.000 0.561 1.000 N NA
 3416079 3416080 Tbd_0721 Tbd_0722     TRUE 0.972 12.000 0.194 1.000 N NA
 3416080 3416081 Tbd_0722 Tbd_0723     TRUE 0.444 144.000 0.000 0.026 Y NA
 3416081 3416082 Tbd_0723 Tbd_0724     FALSE 0.220 70.000 0.000 NA   NA
 3416082 3416083 Tbd_0724 Tbd_0725     FALSE 0.241 62.000 0.000 NA   NA
 3416083 3416084 Tbd_0725 Tbd_0726     FALSE 0.154 263.000 0.000 NA Y NA
 3416084 3416085 Tbd_0726 Tbd_0727     TRUE 0.713 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3416085 3416086 Tbd_0727 Tbd_0728     TRUE 0.975 2.000 0.081 1.000 N NA
 3416086 3416087 Tbd_0728 Tbd_0729     TRUE 0.901 -3.000 0.000 NA N NA
 3416087 3416088 Tbd_0729 Tbd_0730     FALSE 0.017 416.000 0.000 NA N NA
 3416090 3416091 Tbd_0732 Tbd_0733     FALSE 0.019 399.000 0.000 NA   NA
 3416091 3416092 Tbd_0733 Tbd_0734     FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 3416092 3416093 Tbd_0734 Tbd_0735     FALSE 0.386 36.000 0.000 1.000   NA
 3416094 3416095 Tbd_0736 Tbd_0737     FALSE 0.357 38.000 0.000 NA   NA
 3416097 3416098 Tbd_0739 Tbd_0740     FALSE 0.045 208.000 0.000 1.000 N NA
 3416098 3416099 Tbd_0740 Tbd_0741     TRUE 0.990 -3.000 0.138 1.000 N NA
 3416099 3416100 Tbd_0741 Tbd_0742     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416100 3416101 Tbd_0742 Tbd_0743     TRUE 0.641 -21.000 0.000 1.000   NA
 3416102 3416103 Tbd_0744 Tbd_0745     FALSE 0.094 142.000 0.000 NA   NA
 3416106 3416107 Tbd_0748 Tbd_0749     TRUE 0.989 7.000 0.297 NA   NA
 3416107 3416108 Tbd_0749 Tbd_0750     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416108 3416109 Tbd_0750 Tbd_0751     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416109 3416110 Tbd_0751 Tbd_0752     FALSE 0.082 151.000 0.000 NA   NA
 3416110 3416111 Tbd_0752 Tbd_0753     TRUE 0.999 0.000 0.740 1.000 Y NA
 3416111 3416112 Tbd_0753 Tbd_0754     TRUE 0.545 119.000 0.000 0.008 Y NA
 3416112 3416113 Tbd_0754 Tbd_0755     TRUE 0.948 13.000 0.000 0.008 Y NA
 3416113 3416114 Tbd_0755 Tbd_0756     TRUE 0.960 -7.000 0.000 NA Y NA
 3416114 3416115 Tbd_0756 Tbd_0757     TRUE 0.992 -16.000 0.871 NA   NA
 3416115 3416116 Tbd_0757 Tbd_0758     TRUE 0.978 -3.000 0.065 NA   NA
 3416116 3416117 Tbd_0758 Tbd_0759     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416117 3416118 Tbd_0759 Tbd_0760     FALSE 0.249 59.000 0.000 NA   NA
 3416118 3416119 Tbd_0760 Tbd_0761     TRUE 0.997 -3.000 0.433 NA   NA
 3416119 3416120 Tbd_0761 Tbd_0762     TRUE 0.991 -10.000 0.475 NA   NA
 3416120 3416121 Tbd_0762 Tbd_0763     TRUE 0.690 -15.000 0.000 NA   NA
 3416121 3416122 Tbd_0763 Tbd_0764     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 3416122 3416123 Tbd_0764 Tbd_0765     TRUE 0.999 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 3416123 3416124 Tbd_0765 Tbd_0766     TRUE 0.611 20.000 0.000 1.000   NA
 3416125 3416126 Tbd_0767 Tbd_0768     TRUE 0.462 29.000 0.000 NA   NA
 3416126 3416127 Tbd_0768 Tbd_0769     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416127 3416128 Tbd_0769 Tbd_0770     TRUE 0.940 -3.000 0.004 NA   NA
 3416130 3416131 Tbd_0772 Tbd_0773     FALSE 0.132 116.000 0.000 NA   NA
 3416131 3416132 Tbd_0773 Tbd_0774     TRUE 0.865 2.000 0.000 NA   NA
 3416132 3416133 Tbd_0774 Tbd_0775   purT TRUE 0.856 12.000 0.020 1.000   NA
 3416133 3416134 Tbd_0775 Tbd_0776 purT   FALSE 0.194 87.000 0.000 1.000 N NA
 3416135 3416136 Tbd_0777 Tbd_0778     TRUE 0.986 11.000 0.067 0.005 Y NA
 3416136 3416137 Tbd_0778 Tbd_0779     TRUE 0.605 20.000 0.000 1.000 N NA
 3416137 3416138 Tbd_0779 Tbd_0780   def TRUE 0.916 -21.000 0.000 1.000 Y NA
 3416138 3416139 Tbd_0780 Tbd_0781 def   FALSE 0.116 125.000 0.000 NA   NA
 3416139 3416140 Tbd_0781 Tbd_0782     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416141 3416142 Tbd_0783 Tbd_0784     TRUE 0.998 -3.000 0.817 1.000 N NA
 3416143 3416144 Tbd_0785 Tbd_0786   tsf TRUE 0.965 117.000 0.748 1.000 Y NA
 3416144 3416145 Tbd_0786 Tbd_0787 tsf   TRUE 0.945 5.000 0.047 1.000 N NA
 3416145 3416146 Tbd_0787 Tbd_0788     TRUE 0.931 10.000 0.058 1.000 N NA
 3416146 3416147 Tbd_0788 Tbd_0789     TRUE 0.980 20.000 0.409 1.000 N NA
 3416147 3416148 Tbd_0789 Tbd_0790     TRUE 0.994 20.000 0.400 1.000 Y NA
 3416148 3416149 Tbd_0790 Tbd_0791     TRUE 0.999 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 3416149 3416150 Tbd_0791 Tbd_0792     TRUE 0.989 -15.000 0.568 1.000 N NA
 3416150 3416151 Tbd_0792 Tbd_0793     TRUE 0.998 -3.000 0.204 1.000 Y NA
 3416151 3416152 Tbd_0793 Tbd_0794     TRUE 0.991 25.000 0.354 1.000 Y NA
 3416152 3416153 Tbd_0794 Tbd_0795     TRUE 0.998 10.000 0.814 1.000 Y NA
 3416153 3416154 Tbd_0795 Tbd_0796     TRUE 0.997 3.000 0.796 1.000 N NA
 3416154 3416155 Tbd_0796 Tbd_0797     TRUE 0.997 2.000 0.850 1.000 N NA
 3416155 3416156 Tbd_0797 Tbd_0798     TRUE 0.995 12.000 0.289 1.000 Y NA
 3416156 3416157 Tbd_0798 Tbd_0799     TRUE 0.993 -3.000 0.186 1.000 N NA
 3416157 3416158 Tbd_0799 Tbd_0800     TRUE 0.822 11.000 0.004 1.000   NA
 3416161 3416162 Tbd_0803 Tbd_0804     FALSE 0.170 97.000 0.000 NA   NA
 3416163 3416164 Tbd_0805 Tbd_0806     TRUE 1.000 -3.000 0.806 0.001 Y NA
 3416164 3416165 Tbd_0806 Tbd_0807     TRUE 0.959 7.000 0.079 1.000   NA
 3416165 3416166 Tbd_0807 Tbd_0808     TRUE 0.995 -3.000 0.288 1.000   NA
 3416168 3416169 Tbd_0810 Tbd_0811     TRUE 0.832 48.000 0.168 NA   NA
 3416170 3416171 Tbd_0812 Tbd_0813     TRUE 0.700 -15.000 0.000 1.000   NA
 3416171 3416172 Tbd_0813 Tbd_0814     TRUE 0.802 -7.000 0.000 1.000   NA
 3416173 3416174 Tbd_0815 Tbd_0816     FALSE 0.035 230.000 0.000 NA N NA
 3416174 3416175 Tbd_0816 Tbd_0817     FALSE 0.027 276.000 0.000 NA   NA
 3416177 3416178 Tbd_0819 Tbd_0820     FALSE 0.032 250.000 0.000 NA   NA
 3416178 3416179 Tbd_0820 Tbd_0821     FALSE 0.212 74.000 0.000 NA   NA
 3416179 3416180 Tbd_0821 Tbd_0822     TRUE 0.726 11.000 0.000 NA   NA
 3416180 3416181 Tbd_0822 Tbd_0823     TRUE 0.941 10.000 0.044 0.005   NA
 3416181 3416182 Tbd_0823 Tbd_0824     TRUE 0.838 10.000 0.000 0.005   NA
 3416182 3416183 Tbd_0824 Tbd_0825     TRUE 0.893 4.000 0.000 0.005   NA
 3416184 3416185 Tbd_0826 Tbd_0827     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 3416185 3416186 Tbd_0827 Tbd_0828     TRUE 0.749 55.000 0.000 0.006 Y NA
 3416186 3416187 Tbd_0828 Tbd_0829     FALSE 0.077 158.000 0.000 1.000   NA
 3416187 3416188 Tbd_0829 Tbd_0830     TRUE 0.938 22.000 0.143 1.000   NA
 3416189 3416190 Tbd_0831 Tbd_0832     TRUE 0.728 -12.000 0.000 1.000 N NA
 3416190 3416191 Tbd_0832 Tbd_0833     FALSE 0.208 80.000 0.000 1.000 N NA
 3416191 3416192 Tbd_0833 Tbd_0834     TRUE 0.997 -3.000 0.575 NA   NA
 3416192 3416193 Tbd_0834 Tbd_0835   surE FALSE 0.021 363.000 0.000 NA   NA
 3416193 3416194 Tbd_0835 Tbd_0836 surE   TRUE 0.985 -15.000 0.353 1.000   NA
 3416194 3416195 Tbd_0836 Tbd_0837     TRUE 0.963 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3416195 3416196 Tbd_0837 Tbd_0838     TRUE 0.973 -3.000 0.047 1.000 N NA
 3416196 3416197 Tbd_0838 Tbd_0839     FALSE 0.334 41.000 0.000 1.000   NA
 3416197 3416198 Tbd_0839 Tbd_0840     FALSE 0.247 63.000 0.000 1.000   NA
 3416200 3416201 Tbd_0842 Tbd_0843     TRUE 0.966 26.000 0.102 1.000 Y NA
 3416201 3416202 Tbd_0843 Tbd_0844     TRUE 0.997 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 3416202 3416203 Tbd_0844 Tbd_0845     TRUE 0.703 -37.000 0.006 NA N NA
 3416203 3416204 Tbd_0845 Tbd_0846     TRUE 0.389 34.000 0.000 NA N NA
 3416204 3416205 Tbd_0846 Tbd_0847     TRUE 0.679 57.000 0.000 NA Y NA
 3416208 3416209 Tbd_0850 Tbd_0851     TRUE 0.799 40.000 0.000 0.045 Y NA
 3416209 3416210 Tbd_0851 Tbd_0852     TRUE 0.991 -3.000 0.158 1.000 N NA
 3416210 3416211 Tbd_0852 Tbd_0853     TRUE 0.982 -7.000 0.182 1.000 N NA
 3416214 3416215 Tbd_0856 Tbd_0857     TRUE 0.690 47.000 0.074 NA   NA
 3416215 3416216 Tbd_0857 Tbd_0858     FALSE 0.281 105.000 0.002 0.045 N NA
 3416217 3416218 Tbd_0859 Tbd_0860   metG TRUE 0.819 5.000 0.000 1.000 N NA
 3416218 3416219 Tbd_0860 Tbd_0861 metG   FALSE 0.223 72.000 0.000 1.000   NA
 3416219 3416220 Tbd_0861 Tbd_0862     TRUE 0.485 27.000 0.000 NA   NA
 3416220 3416221 Tbd_0862 Tbd_R0022     FALSE 0.093 143.000 0.000 NA   NA
 3416221 3416222 Tbd_R0022 Tbd_0863     FALSE 0.218 71.000 0.000 NA   NA
 3416223 3416224 Tbd_0864 Tbd_0865   rpmA TRUE 0.998 13.000 0.667 0.016 Y NA
 3416224 3416225 Tbd_0865 Tbd_0866 rpmA obgE TRUE 0.876 80.000 0.335 1.000   NA
 3416226 3416227 Tbd_0867 Tbd_0868     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416227 3416228 Tbd_0868 Tbd_0869     TRUE 0.997 0.000 0.600 NA   NA
 3416228 3416229 Tbd_0869 Tbd_0870     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3416229 3416230 Tbd_0870 Tbd_0871     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3416230 3416231 Tbd_0871 Tbd_0872     FALSE 0.055 180.000 0.000 NA   NA
 3416231 3416232 Tbd_0872 Tbd_0873     TRUE 0.998 19.000 0.925 0.002 Y NA
 3416232 3416233 Tbd_0873 Tbd_0874     FALSE 0.145 171.000 0.021 1.000 N NA
 3416233 3416234 Tbd_0874 Tbd_0875     FALSE 0.061 171.000 0.000 NA   NA
 3416234 3416235 Tbd_0875 Tbd_0876     FALSE 0.159 103.000 0.000 NA   NA
 3416237 3416238 Tbd_0878 Tbd_0879     TRUE 0.511 97.000 0.069 1.000   NA
 3416238 3416239 Tbd_0879 Tbd_0880     TRUE 0.998 2.000 0.246 1.000 Y NA
 3416239 3416240 Tbd_0880 Tbd_0881     TRUE 0.976 -10.000 0.177 1.000 N NA
 3416241 3416242 Tbd_0882 Tbd_0883     TRUE 0.715 59.000 0.102 1.000   NA
 3416242 3416243 Tbd_0883 Tbd_0884     TRUE 0.894 26.000 0.114 NA   NA
 3416244 3416245 Tbd_0885 Tbd_0886     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416245 3416246 Tbd_0886 Tbd_0887     TRUE 0.887 0.000 0.000 1.000   NA
 3416247 3416248 Tbd_0888 Tbd_0889     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 3416248 3416249 Tbd_0889 Tbd_0890     TRUE 0.580 22.000 0.000 NA   NA
 3416250 3416251 Tbd_0891 Tbd_0892     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 3416251 3416252 Tbd_0892 Tbd_0893     TRUE 0.395 34.000 0.000 NA   NA
 3416252 3416253 Tbd_0893 Tbd_0894     TRUE 0.771 9.000 0.000 NA   NA
 3416253 3416254 Tbd_0894 Tbd_0895     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416255 3416256 Tbd_0896 Tbd_0897     FALSE 0.041 216.000 0.000 NA   NA
 3416256 3416257 Tbd_0897 Tbd_0898     FALSE 0.025 289.000 0.000 NA   NA
 3416259 3416260 Tbd_0900 Tbd_0901     TRUE 0.749 -10.000 0.000 NA   NA
 3416260 3416261 Tbd_0901 Tbd_0902     TRUE 0.639 17.000 0.000 1.000 N NA
 3416261 3416262 Tbd_0902 Tbd_0903     FALSE 0.263 55.000 0.000 1.000 N NA
 3416262 3416263 Tbd_0903 Tbd_0904     TRUE 0.980 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3416263 3416264 Tbd_0904 Tbd_0905     FALSE 0.176 93.000 0.000 NA   NA
 3416264 3416265 Tbd_0905 Tbd_0906     FALSE 0.243 61.000 0.000 NA   NA
 3416265 3416266 Tbd_0906 Tbd_0907     FALSE 0.099 139.000 0.000 NA   NA
 3416266 3416267 Tbd_0907 Tbd_0908     TRUE 0.994 -3.000 0.232 NA   NA
 3416267 3416268 Tbd_0908 Tbd_0909     TRUE 0.573 23.000 0.000 1.000   NA
 3416268 3416269 Tbd_0909 Tbd_0910     TRUE 0.641 23.000 0.000 0.099 N NA
 3416269 3416270 Tbd_0910 Tbd_0911     TRUE 0.978 3.000 0.082 0.019 N NA
 3416270 3416271 Tbd_0911 Tbd_0912     TRUE 0.995 4.000 0.111 0.040 Y NA
 3416271 3416272 Tbd_0912 Tbd_0913     FALSE 0.015 579.000 0.000 1.000   NA
 3416272 3416273 Tbd_0913 Tbd_0914     FALSE 0.375 36.000 0.000 NA   NA
 3416273 3416274 Tbd_0914 Tbd_0915     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3416274 3416275 Tbd_0915 Tbd_0916     TRUE 0.600 20.000 0.000 NA   NA
 3416275 3416276 Tbd_0916 Tbd_0917     FALSE 0.385 35.000 0.000 NA   NA
 3416276 3416277 Tbd_0917 Tbd_0918     TRUE 0.559 30.000 0.000 0.023   NA
 3416280 3416281 Tbd_0921 Tbd_0922     FALSE 0.317 70.000 0.002 1.000   NA
 3416281 3416282 Tbd_0922 Tbd_0923     FALSE 0.035 246.000 0.000 1.000   NA
 3416282 3416283 Tbd_0923 Tbd_0924     TRUE 0.714 69.000 0.118 1.000 N NA
 3416283 3416284 Tbd_0924 Tbd_0925     FALSE 0.059 179.000 0.000 1.000   NA
 3416284 3416285 Tbd_0925 Tbd_0926     FALSE 0.224 68.000 0.000 NA   NA
 3416285 3416286 Tbd_0926 Tbd_0927     FALSE 0.100 137.000 0.000 NA   NA
 3416287 3416288 Tbd_0928 Tbd_0929     FALSE 0.024 304.000 0.000 NA   NA
 3416288 3416289 Tbd_0929 Tbd_0930     FALSE 0.024 312.000 0.000 NA   NA
 3416291 3416292 Tbd_0932 Tbd_0933     TRUE 0.541 24.000 0.000 NA   NA
 3416292 3416293 Tbd_0933 Tbd_0934     TRUE 0.985 0.000 0.119 NA   NA
 3416293 3416294 Tbd_0934 Tbd_0935     FALSE 0.247 60.000 0.000 NA   NA
 3416294 3416295 Tbd_0935 Tbd_0936     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 3416295 3416296 Tbd_0936 Tbd_0937     TRUE 0.997 0.000 0.129 0.046 Y NA
 3416296 3416297 Tbd_0937 Tbd_0938     FALSE 0.020 1020.000 0.000 0.046   NA
 3416297 3416298 Tbd_0938 Tbd_0939     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416298 3416299 Tbd_0939 Tbd_0940     FALSE 0.112 127.000 0.000 NA   NA
 3416299 3416300 Tbd_0940 Tbd_0941     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416300 3416301 Tbd_0941 Tbd_0942     TRUE 0.462 29.000 0.000 NA   NA
 3416302 3416303 Tbd_0943 Tbd_R0023     FALSE 0.061 172.000 0.000 NA   NA
 3416303 3416304 Tbd_R0023 Tbd_0944     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3416304 3416305 Tbd_0944 Tbd_0945     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416305 3416306 Tbd_0945 Tbd_0946     TRUE 0.984 -10.000 0.259 1.000   NA
 3416306 3416307 Tbd_0946 Tbd_0947     TRUE 0.986 -3.000 0.104 1.000 N NA
 3416308 3416309 Tbd_0948 Tbd_0949     TRUE 0.914 13.000 0.067 1.000 N NA
 3416309 3416310 Tbd_0949 Tbd_0950     TRUE 0.996 -7.000 0.238 1.000 Y NA
 3416310 3416311 Tbd_0950 Tbd_0951     TRUE 0.992 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 3416311 3416312 Tbd_0951 Tbd_0952     TRUE 0.996 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 3416312 3416313 Tbd_0952 Tbd_0953     TRUE 0.998 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 3416313 3416314 Tbd_0953 Tbd_0954     TRUE 0.995 0.000 0.100 1.000 Y NA
 3416314 3416315 Tbd_0954 Tbd_0955     TRUE 0.994 -3.000 0.209 1.000 N NA
 3416315 3416316 Tbd_0955 Tbd_0956   rpsA TRUE 0.843 85.000 0.281 1.000 N NA
 3416316 3416317 Tbd_0956 Tbd_0957 rpsA   TRUE 0.993 3.000 0.292 1.000 N NA
 3416317 3416318 Tbd_0957 Tbd_0958     TRUE 0.454 154.000 0.129 NA   NA
 3416318 3416319 Tbd_0958 Tbd_0959     TRUE 0.986 7.000 0.229 NA   NA
 3416319 3416320 Tbd_0959 Tbd_0960     TRUE 0.634 30.000 0.012 1.000 N NA
 3416320 3416321 Tbd_0960 Tbd_0961     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416321 3416322 Tbd_0961 Tbd_0962     TRUE 0.963 6.000 0.000 1.000 Y NA
 3416322 3416323 Tbd_0962 Tbd_0963     TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.015 Y NA
 3416323 3416324 Tbd_0963 Tbd_0964   cysM TRUE 0.952 -3.000 0.012 1.000 N NA
 3416324 3416325 Tbd_0964 Tbd_0965 cysM   TRUE 0.774 9.000 0.000 1.000 N NA
 3416325 3416326 Tbd_0965 Tbd_0966     FALSE 0.201 82.000 0.000 NA   NA
 3416327 3416328 Tbd_0967 Tbd_0968     FALSE 0.061 176.000 0.000 1.000   NA
 3416328 3416329 Tbd_0968 Tbd_R0024     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3416329 3416330 Tbd_R0024 Tbd_R0025     FALSE 0.254 57.000 0.000 NA   NA
 3416330 3416331 Tbd_R0025 Tbd_0969     FALSE 0.301 44.000 0.000 NA   NA
 3416331 3416332 Tbd_0969 Tbd_0970   rumA FALSE 0.247 61.000 0.000 1.000 N NA
 3416332 3416333 Tbd_0970 Tbd_0971 rumA   TRUE 0.961 -3.000 0.023 1.000 N NA
 3416333 3416334 Tbd_0971 Tbd_0972     TRUE 0.747 10.000 0.000 NA N NA
 3416338 3416339 Tbd_0976 Tbd_0977     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 3416339 3416340 Tbd_0977 Tbd_0978     TRUE 0.995 -3.000 0.289 NA   NA
 3416340 3416341 Tbd_0978 Tbd_0979     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416341 3416342 Tbd_0979 Tbd_0980     FALSE 0.297 45.000 0.000 NA   NA
 3416343 3416344 Tbd_0981 Tbd_0982     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3416344 3416345 Tbd_0982 Tbd_0983     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416345 3416346 Tbd_0983 Tbd_0984     TRUE 0.984 3.000 0.146 1.000   NA
 3416347 3416348 Tbd_0985 Tbd_0986     FALSE 0.139 112.000 0.000 NA   NA
 3416348 3416349 Tbd_0986 Tbd_0987     FALSE 0.349 39.000 0.000 NA   NA
 3416349 3416350 Tbd_0987 Tbd_0988     TRUE 0.661 15.000 0.000 1.000 N NA
 3416350 3416351 Tbd_0988 Tbd_0989     TRUE 0.964 6.000 0.070 0.027 N NA
 3416351 3416352 Tbd_0989 Tbd_0990     TRUE 0.982 95.000 0.844 0.027 Y NA
 3416352 3416353 Tbd_0990 Tbd_0991     FALSE 0.349 39.000 0.000 NA   NA
 3416353 3416354 Tbd_0991 Tbd_0992     TRUE 0.708 -13.000 0.000 NA   NA
 3416355 3416356 Tbd_0993 Tbd_0994     FALSE 0.189 88.000 0.000 NA   NA
 3416357 3416358 Tbd_0995 Tbd_0996     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416360 3416361 Tbd_0998 Tbd_0999     FALSE 0.123 120.000 0.000 NA   NA
 3416361 3416362 Tbd_0999 Tbd_1000     TRUE 0.600 20.000 0.000 NA   NA
 3416362 3416363 Tbd_1000 Tbd_1001     TRUE 0.963 2.000 0.053 NA   NA
 3416364 3416365 Tbd_1002 Tbd_1003     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416365 3416366 Tbd_1003 Tbd_1004     TRUE 0.998 -7.000 0.419 1.000 Y NA
 3416366 3416367 Tbd_1004 Tbd_1005     TRUE 0.889 -7.000 0.011 1.000 N NA
 3416367 3416368 Tbd_1005 Tbd_1006     FALSE 0.221 71.000 0.000 1.000 N NA
 3416368 3416369 Tbd_1006 Tbd_R0026     FALSE 0.108 131.000 0.000 NA   NA
 3416369 3416370 Tbd_R0026 Tbd_1007     FALSE 0.055 180.000 0.000 NA   NA
 3416370 3416371 Tbd_1007 Tbd_1008     TRUE 0.809 157.000 0.186 1.000 Y NA
 3416371 3416372 Tbd_1008 Tbd_1009     TRUE 0.958 122.000 0.652 1.000 Y NA
 3416372 3416373 Tbd_1009 Tbd_1010   rplT TRUE 0.998 12.000 0.928 0.016 Y NA
 3416373 3416374 Tbd_1010 Tbd_1011 rplT   TRUE 0.941 70.000 0.202 1.000 Y NA
 3416374 3416375 Tbd_1011 Tbd_1012     TRUE 0.977 95.000 0.574 0.001 Y NA
 3416375 3416376 Tbd_1012 Tbd_1013   ihfA TRUE 0.911 35.000 0.208 1.000 N NA
 3416376 3416377 Tbd_1013 Tbd_1014 ihfA   TRUE 0.985 -22.000 0.535 1.000 N NA
 3416377 3416378 Tbd_1014 Tbd_R0027     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 3416378 3416379 Tbd_R0027 Tbd_1015     FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 3416380 3416381 Tbd_1016 Tbd_1017     FALSE 0.016 440.000 0.000 NA   NA
 3416381 3416382 Tbd_1017 Tbd_1018     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416382 3416383 Tbd_1018 Tbd_1019     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416383 3416384 Tbd_1019 Tbd_1020     FALSE 0.212 74.000 0.000 NA   NA
 3416384 3416385 Tbd_1020 Tbd_1021     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3416388 3416389 Tbd_1024 Tbd_1025     TRUE 0.948 -25.000 0.004 0.004 Y NA
 3416389 3416390 Tbd_1025 Tbd_1026     TRUE 0.997 -3.000 0.095 0.004 Y NA
 3416390 3416391 Tbd_1026 Tbd_1027     TRUE 0.999 3.000 0.501 0.004 Y NA
 3416391 3416392 Tbd_1027 Tbd_1028     FALSE 0.166 101.000 0.000 1.000 N NA
 3416392 3416393 Tbd_1028 Tbd_1029     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416393 3416394 Tbd_1029 Tbd_1030     TRUE 0.990 -3.000 0.147 NA   NA
 3416394 3416395 Tbd_1030 Tbd_1031     TRUE 0.710 29.000 0.027 NA   NA
 3416395 3416396 Tbd_1031 Tbd_1032     FALSE 0.015 490.000 0.000 NA   NA
 3416396 3416397 Tbd_1032 Tbd_1033     TRUE 0.771 9.000 0.000 NA   NA
 3416399 3416400 Tbd_1035 Tbd_1036     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 3416400 3416401 Tbd_1036 Tbd_1037     TRUE 0.987 -3.000 0.110 NA   NA
 3416401 3416402 Tbd_1037 Tbd_1038     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416403 3416404 Tbd_1039 Tbd_1040     FALSE 0.189 88.000 0.000 NA   NA
 3416404 3416405 Tbd_1040 Tbd_1041     FALSE 0.153 106.000 0.000 NA   NA
 3416405 3416406 Tbd_1041 Tbd_1042     TRUE 0.514 26.000 0.000 1.000   NA
 3416407 3416408 Tbd_1043 Tbd_1044     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3416408 3416409 Tbd_1044 Tbd_1045     TRUE 0.645 17.000 0.000 1.000   NA
 3416409 3416410 Tbd_1045 Tbd_1046     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416410 3416411 Tbd_1046 Tbd_1047     FALSE 0.127 119.000 0.000 1.000 N NA
 3416411 3416412 Tbd_1047 Tbd_1048     TRUE 0.522 25.000 0.000 NA   NA
 3416413 3416414 Tbd_1049 Tbd_1050     FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 3416414 3416415 Tbd_1050 Tbd_1051     TRUE 0.596 21.000 0.000 1.000 N NA
 3416416 3416417 Tbd_1052 Tbd_1053     FALSE 0.019 387.000 0.000 NA   NA
 3416418 3416419 Tbd_1054 Tbd_1055     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 3416421 3416422 Tbd_1057 Tbd_1058     FALSE 0.028 272.000 0.000 NA   NA
 3416422 3416423 Tbd_1058 Tbd_1059     FALSE 0.215 78.000 0.000 1.000   NA
 3416423 3416424 Tbd_1059 Tbd_1060     TRUE 0.838 4.000 0.000 1.000   NA
 3416424 3416425 Tbd_1060 Tbd_1061     FALSE 0.137 113.000 0.000 NA   NA
 3416427 3416428 Tbd_1063 Tbd_1064     FALSE 0.142 111.000 0.000 NA   NA
 3416428 3416429 Tbd_1064 Tbd_1065     TRUE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 3416429 3416430 Tbd_1065 Tbd_1066     FALSE 0.025 293.000 0.000 NA   NA
 3416430 3416431 Tbd_1066 Tbd_1067     FALSE 0.032 250.000 0.000 NA   NA
 3416431 3416432 Tbd_1067 Tbd_1068     FALSE 0.036 229.000 0.000 NA   NA
 3416432 3416433 Tbd_1068 Tbd_1069     FALSE 0.176 93.000 0.000 NA   NA
 3416433 3416434 Tbd_1069 Tbd_1070     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416434 3416435 Tbd_1070 Tbd_1071     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 3416435 3416436 Tbd_1071 Tbd_1072     TRUE 0.395 34.000 0.000 NA   NA
 3416436 3416437 Tbd_1072 Tbd_1073     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 3416437 3416438 Tbd_1073 Tbd_1074     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 3416438 3416439 Tbd_1074 Tbd_1075     TRUE 0.584 -33.000 0.000 NA   NA
 3416439 3416440 Tbd_1075 Tbd_1076     FALSE 0.034 236.000 0.000 NA   NA
 3416440 3416441 Tbd_1076 Tbd_1077     FALSE 0.014 601.000 0.000 NA N NA
 3416441 3416442 Tbd_1077 Tbd_1078     FALSE 0.034 234.000 0.000 NA N NA
 3416444 3416445 Tbd_1080 Tbd_1081     TRUE 0.995 -3.000 0.255 1.000   NA
 3416445 3416446 Tbd_1081 Tbd_1082     FALSE 0.223 72.000 0.000 1.000   NA
 3416446 3416447 Tbd_1082 Tbd_1083     TRUE 0.998 -3.000 0.671 1.000 N NA
 3416447 3416448 Tbd_1083 Tbd_1084     TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3416448 3416449 Tbd_1084 Tbd_1085     FALSE 0.301 45.000 0.000 1.000 N NA
 3416450 3416451 Tbd_1086 Tbd_1087     TRUE 0.472 70.000 0.031 1.000   NA
 3416451 3416452 Tbd_1087 Tbd_1088     FALSE 0.038 228.000 0.000 1.000 N NA
 3416452 3416453 Tbd_1088 Tbd_1089     TRUE 0.920 119.000 0.220 0.011 Y NA
 3416453 3416454 Tbd_1089 Tbd_1090     TRUE 0.999 -3.000 0.320 0.007 Y NA
 3416454 3416455 Tbd_1090 Tbd_1091     TRUE 0.531 234.000 0.085 0.007 Y NA
 3416455 3416456 Tbd_1091 Tbd_1092     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.007   NA
 3416456 3416457 Tbd_1092 Tbd_1093     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3416457 3416458 Tbd_1093 Tbd_1094     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 3416458 3416459 Tbd_1094 Tbd_1095   fliP TRUE 0.993 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 3416459 3416460 Tbd_1095 Tbd_1096 fliP   TRUE 0.984 0.000 0.000 0.014 Y NA
 3416460 3416461 Tbd_1096 Tbd_1097     TRUE 0.726 56.000 0.000 0.095 Y NA
 3416461 3416462 Tbd_1097 Tbd_1098   dapA FALSE 0.153 107.000 0.000 1.000 N NA
 3416462 3416463 Tbd_1098 Tbd_1099 dapA   TRUE 0.805 60.000 0.028 NA Y NA
 3416463 3416464 Tbd_1099 Tbd_1100     TRUE 0.762 17.000 0.008 NA   NA
 3416464 3416465 Tbd_1100 Tbd_1101     TRUE 0.712 12.000 0.000 1.000   NA
 3416465 3416466 Tbd_1101 Tbd_1102     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416467 3416468 Tbd_1103 Tbd_1104     FALSE 0.232 68.000 0.000 1.000   NA
 3416468 3416469 Tbd_1104 Tbd_1105     TRUE 0.834 4.000 0.000 1.000 N NA
 3416470 3416471 Tbd_1106 Tbd_1107     TRUE 0.916 120.000 0.281 NA Y NA
 3416471 3416472 Tbd_1107 Tbd_1108     TRUE 0.933 39.000 0.328 NA   NA
 3416472 3416473 Tbd_1108 Tbd_1109     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 3416474 3416475 Tbd_1110 Tbd_1111     TRUE 0.908 65.000 0.429 NA   NA
 3416476 3416477 Tbd_1112 Tbd_1113     TRUE 0.634 17.000 0.000 NA   NA
 3416481 3416482 Tbd_1117 Tbd_1118     FALSE 0.273 50.000 0.000 NA   NA
 3416482 3416483 Tbd_1118 Tbd_1119     FALSE 0.252 58.000 0.000 NA   NA
 3416483 3416484 Tbd_1119 Tbd_1120     TRUE 0.970 -3.000 0.037 NA   NA
 3416484 3416485 Tbd_1120 Tbd_1121     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416485 3416486 Tbd_1121 Tbd_1122     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416488 3416489 Tbd_1124 Tbd_1125     TRUE 0.974 -3.000 0.049 1.000 N NA
 3416489 3416490 Tbd_1125 Tbd_1126     TRUE 0.508 26.000 0.000 1.000 N NA
 3416490 3416491 Tbd_1126 Tbd_1127     FALSE 0.108 134.000 0.000 1.000 N NA
 3416491 3416492 Tbd_1127 Tbd_1128     TRUE 0.999 3.000 0.345 0.001 Y NA
 3416492 3416493 Tbd_1128 Tbd_1129     TRUE 0.970 18.000 0.241 1.000 N NA
 3416493 3416494 Tbd_1129 Tbd_1130     TRUE 0.957 9.000 0.089 NA   NA
 3416496 3416497 Tbd_1132 Tbd_1133     FALSE 0.368 83.000 0.019 NA N NA
 3416497 3416498 Tbd_1133 Tbd_1134     TRUE 0.901 55.000 0.325 1.000 N NA
 3416498 3416499 Tbd_1134 Tbd_1135     TRUE 0.984 -10.000 0.260 1.000 N NA
 3416499 3416500 Tbd_1135 Tbd_1136     FALSE 0.208 80.000 0.000 1.000 N NA
 3416500 3416501 Tbd_1136 Tbd_1137     TRUE 0.928 102.000 0.178 0.002 Y NA
 3416501 3416502 Tbd_1137 Tbd_1138     TRUE 0.999 4.000 0.537 0.002 Y NA
 3416502 3416503 Tbd_1138 Tbd_1139     TRUE 0.996 22.000 0.526 0.002 Y NA
 3416503 3416504 Tbd_1139 Tbd_1140   cbbJ TRUE 0.406 52.000 0.008 1.000 N NA
 3416504 3416505 Tbd_1140 Tbd_1141 cbbJ secG TRUE 0.974 11.000 0.184 1.000 N NA
 3416505 3416506 Tbd_1141 Tbd_R0028 secG   TRUE 0.395 34.000 0.000 NA   NA
 3416506 3416507 Tbd_R0028 Tbd_1142   nuoA FALSE 0.079 154.000 0.000 NA   NA
 3416507 3416508 Tbd_1142 Tbd_1143 nuoA nuoB TRUE 0.992 32.000 0.507 0.004 Y NA
 3416508 3416509 Tbd_1143 Tbd_1144 nuoB nuoC TRUE 0.999 2.000 0.328 0.004 Y NA
 3416509 3416510 Tbd_1144 Tbd_1145 nuoC nuoD TRUE 0.986 43.000 0.483 0.009 Y NA
 3416510 3416511 Tbd_1145 Tbd_1146 nuoD nuoE TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.007 Y NA
 3416511 3416512 Tbd_1146 Tbd_1147 nuoE nuoF TRUE 0.999 -3.000 0.343 0.007 Y NA
 3416512 3416513 Tbd_1147 Tbd_1148 nuoF nuoG TRUE 0.996 14.000 0.395 0.009 Y NA
 3416513 3416514 Tbd_1148 Tbd_1149 nuoG nuoH TRUE 0.999 0.000 0.515 0.009 Y NA
 3416514 3416515 Tbd_1149 Tbd_1150 nuoH nuoI TRUE 0.998 8.000 0.500 0.009 Y NA
 3416515 3416516 Tbd_1150 Tbd_1151 nuoI nuoJ TRUE 0.920 160.000 0.442 0.009 Y NA
 3416516 3416517 Tbd_1151 Tbd_1152 nuoJ nuoK TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.004 Y NA
 3416517 3416518 Tbd_1152 Tbd_1153 nuoK nuoL TRUE 0.999 0.000 0.451 0.009 Y NA
 3416518 3416519 Tbd_1153 Tbd_1154 nuoL nuoM TRUE 0.994 12.000 0.175 0.003 Y NA
 3416519 3416520 Tbd_1154 Tbd_1155 nuoM nuoN TRUE 0.997 11.000 0.340 0.003 Y NA
 3416520 3416521 Tbd_1155 Tbd_1156 nuoN   TRUE 0.850 52.000 0.202 NA   NA
 3416521 3416522 Tbd_1156 Tbd_1157     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3416523 3416524 Tbd_1158 Tbd_1159     TRUE 0.667 15.000 0.000 1.000   NA
 3416524 3416525 Tbd_1159 Tbd_1160     TRUE 0.764 15.000 0.004 1.000 N NA
 3416526 3416527 Tbd_1161 Tbd_1162     TRUE 0.923 32.000 0.208 1.000 N NA
 3416527 3416528 Tbd_1162 Tbd_1163     TRUE 0.629 77.000 0.086 1.000 N NA
 3416528 3416529 Tbd_1163 Tbd_1164     TRUE 0.939 23.000 0.160 1.000 N NA
 3416529 3416530 Tbd_1164 Tbd_1165     TRUE 0.794 136.000 0.448 1.000 N NA
 3416530 3416531 Tbd_1165 Tbd_1166     TRUE 0.995 4.000 0.359 0.002   NA
 3416531 3416532 Tbd_1166 Tbd_1167   hscB TRUE 0.849 117.000 0.500 1.000   NA
 3416532 3416533 Tbd_1167 Tbd_1168 hscB hscA TRUE 0.999 3.000 0.634 1.000 Y NA
 3416533 3416534 Tbd_1168 Tbd_1169 hscA   TRUE 0.945 65.000 0.794 1.000 N NA
 3416534 3416535 Tbd_1169 Tbd_1170     TRUE 0.996 3.000 0.625 1.000   NA
 3416537 3416538 Tbd_1172 Tbd_1173     TRUE 0.898 39.000 0.022 0.002 Y NA
 3416538 3416539 Tbd_1173 Tbd_1174     TRUE 0.999 -3.000 0.263 0.002 Y NA
 3416539 3416540 Tbd_1174 Tbd_1175     FALSE 0.368 150.000 0.000 1.000 Y NA
 3416540 3416541 Tbd_1175 Tbd_1176     FALSE 0.245 62.000 0.000 1.000 N NA
 3416541 3416542 Tbd_1176 Tbd_1177     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 3416542 3416543 Tbd_1177 Tbd_1178     TRUE 0.995 -3.000 0.065 0.061 Y NA
 3416543 3416544 Tbd_1178 Tbd_1179     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3416544 3416545 Tbd_1179 Tbd_1180     TRUE 0.749 -10.000 0.000 NA   NA
 3416545 3416546 Tbd_1180 Tbd_1181     FALSE 0.215 74.000 0.000 1.000 N NA
 3416546 3416547 Tbd_1181 Tbd_1182     TRUE 0.946 18.000 0.015 1.000 Y NA
 3416547 3416548 Tbd_1182 Tbd_1183     TRUE 0.999 -3.000 0.453 0.001 Y NA
 3416548 3416549 Tbd_1183 Tbd_1184     TRUE 1.000 -3.000 0.705 0.002 Y NA
 3416549 3416550 Tbd_1184 Tbd_1185     TRUE 0.980 89.000 0.604 0.002 Y NA
 3416550 3416551 Tbd_1185 Tbd_1186     TRUE 0.977 -7.000 0.151 NA   NA
 3416551 3416552 Tbd_1186 Tbd_1187     TRUE 0.990 -3.000 0.136 NA   NA
 3416552 3416553 Tbd_1187 Tbd_1188   kgd TRUE 0.936 -298.000 0.020 1.000 Y NA
 3416553 3416554 Tbd_1188 Tbd_1189 kgd   TRUE 0.998 -10.000 0.667 1.000 Y NA
 3416554 3416555 Tbd_1189 Tbd_1190     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3416556 3416557 Tbd_1191 Tbd_1192     TRUE 0.973 31.000 0.130 0.020 Y NA
 3416557 3416558 Tbd_1192 Tbd_1193     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 3416558 3416559 Tbd_1193 Tbd_1194     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 3416559 3416560 Tbd_1194 Tbd_1195     FALSE 0.229 66.000 0.000 NA   NA
 3416560 3416561 Tbd_1195 Tbd_1196     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3416561 3416562 Tbd_1196 Tbd_1197     TRUE 0.541 24.000 0.000 NA   NA
 3416562 3416563 Tbd_1197 Tbd_1198     FALSE 0.301 44.000 0.000 NA   NA
 3416564 3416565 Tbd_1199 Tbd_1200     FALSE 0.145 110.000 0.000 NA   NA
 3416565 3416566 Tbd_1200 Tbd_1201     TRUE 0.982 0.000 0.100 NA   NA
 3416567 3416568 Tbd_1202 Tbd_1203     FALSE 0.105 135.000 0.000 NA   NA
 3416568 3416569 Tbd_1203 Tbd_1204     TRUE 0.634 17.000 0.000 NA   NA
 3416569 3416570 Tbd_1204 Tbd_1205     FALSE 0.123 120.000 0.000 NA   NA
 3416570 3416571 Tbd_1205 Tbd_1206     TRUE 0.761 10.000 0.000 1.000   NA
 3416571 3416572 Tbd_1206 Tbd_1207     TRUE 0.648 -19.000 0.000 NA   NA
 3416572 3416573 Tbd_1207 Tbd_1208     FALSE 0.033 248.000 0.000 NA   NA
 3416575 3416576 Tbd_1210 Tbd_1211     FALSE 0.020 371.000 0.000 NA   NA
 3416576 3416577 Tbd_1211 Tbd_1212     FALSE 0.019 399.000 0.000 NA   NA
 3416578 3416579 Tbd_1213 Tbd_1214     FALSE 0.016 440.000 0.000 NA   NA
 3416579 3416580 Tbd_1214 Tbd_1215     FALSE 0.134 115.000 0.000 NA   NA
 3416580 3416581 Tbd_1215 Tbd_1216     TRUE 0.625 18.000 0.000 1.000 N NA
 3416581 3416582 Tbd_1216 Tbd_1217     TRUE 0.972 -3.000 0.045 NA   NA
 3416583 3416584 Tbd_1218 Tbd_1219     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416584 3416585 Tbd_1219 Tbd_1220   dapD FALSE 0.324 89.000 0.012 1.000 N NA
 3416585 3416586 Tbd_1220 Tbd_1221 dapD   TRUE 0.956 39.000 0.149 1.000 Y NA
 3416587 3416588 Tbd_1222 Tbd_1223     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 3416589 3416590 Tbd_1224 Tbd_1225     FALSE 0.161 102.000 0.000 NA   NA
 3416590 3416591 Tbd_1225 Tbd_1226     FALSE 0.026 284.000 0.000 NA   NA
 3416591 3416592 Tbd_1226 Tbd_1227     TRUE 0.911 5.000 0.015 1.000   NA
 3416593 3416594 Tbd_1228 Tbd_1229     FALSE 0.215 74.000 0.000 1.000 N NA
 3416598 3416599 Tbd_1232 Tbd_1233     TRUE 0.990 14.000 0.683 NA   NA
 3416599 3416600 Tbd_1233 Tbd_1234     TRUE 0.997 2.000 0.761 NA   NA
 3416602 3416603 Tbd_1236 Tbd_1237     TRUE 0.997 1.000 0.596 NA   NA
 3416603 3416604 Tbd_1237 Tbd_1238     FALSE 0.084 150.000 0.000 NA   NA
 3416604 3416605 Tbd_1238 Tbd_1239     FALSE 0.016 467.000 0.000 NA   NA
 3416605 3416606 Tbd_1239 Tbd_1240     FALSE 0.033 250.000 0.000 1.000   NA
 3416606 3416607 Tbd_1240 Tbd_1241     TRUE 0.978 25.000 0.375 0.002   NA
 3416607 3416608 Tbd_1241 Tbd_1242     TRUE 0.942 21.000 0.150 1.000   NA
 3416608 3416609 Tbd_1242 Tbd_1243     FALSE 0.087 150.000 0.000 1.000   NA
 3416609 3416610 Tbd_1243 Tbd_1244   motB TRUE 0.961 28.000 0.097 1.000 Y NA
 3416610 3416611 Tbd_1244 Tbd_1245 motB   TRUE 0.471 120.000 0.000 1.000 Y NA
 3416611 3416612 Tbd_1245 Tbd_1246     TRUE 0.999 -3.000 0.287 0.014 Y NA
 3416612 3416613 Tbd_1246 Tbd_1247   flhF TRUE 0.995 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 3416613 3416614 Tbd_1247 Tbd_1248 flhF   TRUE 0.632 71.000 0.083 1.000 N NA
 3416614 3416615 Tbd_1248 Tbd_1249     TRUE 0.988 3.000 0.193 1.000 N NA
 3416615 3416616 Tbd_1249 Tbd_1250   motC TRUE 0.930 -18.000 0.089 1.000 N NA
 3416616 3416617 Tbd_1250 Tbd_1251 motC   TRUE 0.763 211.000 0.248 1.000 Y NA
 3416617 3416618 Tbd_1251 Tbd_1252     FALSE 0.250 60.000 0.000 1.000 N NA
 3416619 3416620 Tbd_1253 Tbd_1254     TRUE 0.966 11.000 0.143 NA   NA
 3416620 3416621 Tbd_1254 Tbd_1255     FALSE 0.293 174.000 0.087 1.000 N NA
 3416622 3416623 Tbd_1256 Tbd_1257     TRUE 0.776 -19.000 0.009 NA   NA
 3416623 3416624 Tbd_1257 Tbd_1258     TRUE 0.924 5.000 0.026 NA N NA
 3416626 3416627 Tbd_1260 Tbd_1261     TRUE 0.996 -3.000 0.273 0.036   NA
 3416627 3416628 Tbd_1261 Tbd_1262     TRUE 0.999 0.000 0.470 1.000 Y NA
 3416628 3416629 Tbd_1262 Tbd_1263     TRUE 0.998 -7.000 0.635 1.000 Y NA
 3416631 3416632 Tbd_1265 Tbd_1266     FALSE 0.044 259.000 0.000 0.026 N NA
 3416632 3416633 Tbd_1266 Tbd_1267     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3416633 3416634 Tbd_1267 Tbd_1268     TRUE 0.995 -3.000 0.286 NA   NA
 3416634 3416635 Tbd_1268 Tbd_1269     TRUE 0.999 0.000 0.250 0.020 Y NA
 3416636 3416637 Tbd_1270 Tbd_1271     TRUE 0.954 -13.000 0.115 1.000 N NA
 3416637 3416638 Tbd_1271 Tbd_1272     TRUE 0.989 7.000 0.292 1.000 N NA
 3416639 3416640 Tbd_1273 Tbd_1274     TRUE 0.918 0.000 0.000 0.038   NA
 3416640 3416641 Tbd_1274 Tbd_1275     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416641 3416642 Tbd_1275 Tbd_1276     FALSE 0.066 169.000 0.000 1.000   NA
 3416643 3416644 Tbd_1277 Tbd_1278     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 3416644 3416645 Tbd_1278 Tbd_1279     FALSE 0.205 80.000 0.000 NA   NA
 3416647 3416648 Tbd_1281 Tbd_1282     FALSE 0.069 164.000 0.000 NA   NA
 3416649 3416650 Tbd_1283 Tbd_1284     TRUE 0.999 10.000 0.660 0.001 Y NA
 3416650 3416651 Tbd_1284 Tbd_1285     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 3416651 3416652 Tbd_1285 Tbd_1286     FALSE 0.042 215.000 0.000 1.000 N NA
 3416652 3416653 Tbd_1286 Tbd_1287     FALSE 0.062 173.000 0.000 1.000 N NA
 3416653 3416654 Tbd_1287 Tbd_1288     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3416654 3416655 Tbd_1288 Tbd_1289     TRUE 0.900 25.000 0.000 0.012 Y NA
 3416655 3416656 Tbd_1289 Tbd_1290     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 3416656 3416657 Tbd_1290 Tbd_1291     FALSE 0.020 366.000 0.000 NA   NA
 3416657 3416658 Tbd_1291 Tbd_1292     FALSE 0.252 58.000 0.000 NA   NA
 3416658 3416659 Tbd_1292 Tbd_1293     TRUE 0.546 24.000 0.000 1.000 N NA
 3416659 3416660 Tbd_1293 Tbd_1294     TRUE 0.874 30.000 0.000 0.007 Y NA
 3416660 3416661 Tbd_1294 Tbd_1295     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3416661 3416662 Tbd_1295 Tbd_1296     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 3416662 3416663 Tbd_1296 Tbd_1297     TRUE 0.986 -7.000 0.222 NA   NA
 3416663 3416664 Tbd_1297 Tbd_1298     TRUE 0.994 -3.000 0.222 NA   NA
 3416664 3416665 Tbd_1298 Tbd_1299     TRUE 0.995 -3.000 0.286 NA   NA
 3416665 3416666 Tbd_1299 Tbd_1300     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416666 3416667 Tbd_1300 Tbd_1301     TRUE 0.997 2.000 0.200 1.000 Y NA
 3416667 3416668 Tbd_1301 Tbd_1302     TRUE 0.997 -6.000 0.200 0.007 Y NA
 3416668 3416669 Tbd_1302 Tbd_1303     TRUE 0.997 -6.000 0.231 NA Y NA
 3416670 3416671 Tbd_1304 Tbd_1305     FALSE 0.021 358.000 0.000 1.000 N NA
 3416672 3416673 Tbd_1306 Tbd_1307     FALSE 0.375 36.000 0.000 NA   NA
 3416673 3416674 Tbd_1307 Tbd_1308     FALSE 0.089 145.000 0.000 NA   NA
 3416674 3416675 Tbd_1308 Tbd_1309     FALSE 0.145 110.000 0.000 NA   NA
 3416677 3416678 Tbd_1311 Tbd_1312 mdoG   TRUE 0.997 -3.000 0.469 NA N NA
 3416678 3416679 Tbd_1312 Tbd_1313     FALSE 0.039 222.000 0.000 NA   NA
 3416679 3416680 Tbd_1313 Tbd_1314     FALSE 0.015 482.000 0.000 NA   NA
 3416680 3416681 Tbd_1314 Tbd_1315     TRUE 0.992 -7.000 0.429 NA   NA
 3416681 3416682 Tbd_1315 Tbd_1316     TRUE 0.989 16.000 0.667 NA   NA
 3416682 3416683 Tbd_1316 Tbd_1317     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3416684 3416685 Tbd_1318 Tbd_1319     FALSE 0.207 79.000 0.000 NA   NA
 3416686 3416687 Tbd_1320 Tbd_1321     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3416687 3416688 Tbd_1321 Tbd_1322     TRUE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 3416688 3416689 Tbd_1322 Tbd_1323     FALSE 0.199 83.000 0.000 NA   NA
 3416689 3416690 Tbd_1323 Tbd_1324     FALSE 0.019 399.000 0.000 NA   NA
 3416690 3416691 Tbd_1324 Tbd_1325     TRUE 0.989 26.000 1.000 0.004 N NA
 3416691 3416692 Tbd_1325 Tbd_1326     FALSE 0.366 37.000 0.000 NA   NA
 3416693 3416694 Tbd_1327 Tbd_1328     TRUE 0.562 184.000 0.286 1.000 N NA
 3416694 3416695 Tbd_1328 Tbd_1329     TRUE 0.998 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3416695 3416696 Tbd_1329 Tbd_1330     FALSE 0.172 95.000 0.000 NA   NA
 3416696 3416697 Tbd_1330 Tbd_1331     FALSE 0.273 50.000 0.000 NA   NA
 3416697 3416698 Tbd_1331 Tbd_1332     FALSE 0.018 403.000 0.000 NA   NA
 3416698 3416699 Tbd_1332 Tbd_1333     FALSE 0.218 71.000 0.000 NA   NA
 3416699 3416700 Tbd_1333 Tbd_1334     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3416700 3416701 Tbd_1334 Tbd_1335     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3416701 3416702 Tbd_1335 Tbd_1336     FALSE 0.136 114.000 0.000 NA   NA
 3416702 3416703 Tbd_1336 Tbd_1337     TRUE 0.663 -18.000 0.000 NA   NA
 3416703 3416704 Tbd_1337 Tbd_1338     TRUE 0.827 19.000 0.029 1.000   NA
 3416705 3416706 Tbd_1339 Tbd_1340     TRUE 0.798 13.000 0.000 0.002   NA
 3416706 3416707 Tbd_1340 Tbd_1341     TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.001 N NA
 3416708 3416709 Tbd_1342 Tbd_1343     FALSE 0.015 569.000 0.000 NA   NA
 3416709 3416710 Tbd_1343 Tbd_1344     TRUE 0.618 -22.000 0.000 NA   NA
 3416710 3416711 Tbd_1344 Tbd_1345     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 3416711 3416712 Tbd_1345 Tbd_1346     FALSE 0.022 338.000 0.000 NA   NA
 3416712 3416713 Tbd_1346 Tbd_1347     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416713 3416714 Tbd_1347 Tbd_1348     TRUE 0.795 -7.000 0.000 NA   NA
 3416714 3416715 Tbd_1348 Tbd_1349     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416715 3416716 Tbd_1349 Tbd_1350     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416716 3416717 Tbd_1350 Tbd_1351     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416717 3416718 Tbd_1351 Tbd_1352     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416718 3416719 Tbd_1352 Tbd_1353     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416719 3416720 Tbd_1353 Tbd_1354     FALSE 0.017 423.000 0.000 NA   NA
 3416720 3416721 Tbd_1354 Tbd_1355     FALSE 0.053 184.000 0.000 NA   NA
 3416721 3416722 Tbd_1355 Tbd_1356     FALSE 0.026 284.000 0.000 NA   NA
 3416722 3416723 Tbd_1356 Tbd_1357     TRUE 0.959 -13.000 0.125 1.000   NA
 3416723 3416724 Tbd_1357 Tbd_1358     FALSE 0.199 83.000 0.000 NA   NA
 3416724 3416725 Tbd_1358 Tbd_1359     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416725 3416726 Tbd_1359 Tbd_1360     TRUE 0.997 2.000 0.827 1.000 N NA
 3416726 3416727 Tbd_1360 Tbd_1361     TRUE 1.000 -3.000 0.842 0.092 Y NA
 3416727 3416728 Tbd_1361 Tbd_1362     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416731 3416732 Tbd_1365 Tbd_1366     FALSE 0.015 471.000 0.000 NA N NA
 3416732 3416733 Tbd_1366 Tbd_1367     FALSE 0.212 74.000 0.000 NA   NA
 3416735 3416736 Tbd_1369 Tbd_1370     FALSE 0.173 93.000 0.000 NA N NA
 3416736 3416737 Tbd_1370 Tbd_1371     FALSE 0.099 139.000 0.000 NA   NA
 3416737 3416738 Tbd_1371 Tbd_1372     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 3416738 3416739 Tbd_1372 Tbd_1373     TRUE 0.995 4.000 0.545 NA   NA
 3416740 3416741 Tbd_1374 Tbd_1375     TRUE 0.573 22.000 0.000 NA N NA
 3416741 3416742 Tbd_1375 Tbd_1376     TRUE 0.999 5.000 0.667 0.066 Y NA
 3416742 3416743 Tbd_1376 Tbd_1377     TRUE 0.929 71.000 0.636 NA   NA
 3416743 3416744 Tbd_1377 Tbd_1378     TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA   NA
 3416744 3416745 Tbd_1378 Tbd_1379     TRUE 0.938 40.000 0.385 NA   NA
 3416745 3416746 Tbd_1379 Tbd_1380     TRUE 0.982 -10.000 0.231 NA   NA
 3416747 3416748 Tbd_1381 Tbd_1382     TRUE 0.815 -55.000 0.035 NA   NA
 3416748 3416749 Tbd_1382 Tbd_1383     TRUE 0.970 13.000 0.142 0.002   NA
 3416749 3416750 Tbd_1383 Tbd_1384     TRUE 0.994 0.000 0.074 1.000 Y NA
 3416750 3416751 Tbd_1384 Tbd_1385     TRUE 0.976 -7.000 0.015 1.000 Y NA
 3416751 3416752 Tbd_1385 Tbd_1386     TRUE 0.995 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 3416753 3416754 Tbd_1387 Tbd_1388     FALSE 0.023 320.000 0.000 NA   NA
 3416755 3416756 Tbd_1389 Tbd_1390     FALSE 0.364 142.000 0.058 0.091 N NA
 3416756 3416757 Tbd_1390 Tbd_1391     TRUE 0.983 -12.000 0.269 1.000 N NA
 3416757 3416758 Tbd_1391 Tbd_1392     TRUE 0.990 -28.000 0.941 1.000 N NA
 3416758 3416759 Tbd_1392 Tbd_1393     TRUE 0.994 12.000 1.000 NA   NA
 3416759 3416760 Tbd_1393 Tbd_1394     TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA   NA
 3416760 3416761 Tbd_1394 Tbd_1395     TRUE 0.987 7.000 0.250 NA   NA
 3416761 3416762 Tbd_1395 Tbd_1396     TRUE 0.998 0.000 0.889 NA   NA
 3416762 3416763 Tbd_1396 Tbd_1397     TRUE 0.986 0.000 0.125 NA   NA
 3416764 3416765 Tbd_1398 Tbd_1399     FALSE 0.021 375.000 0.000 1.000 N NA
 3416765 3416766 Tbd_1399 Tbd_1400     TRUE 0.999 6.000 0.521 0.026 Y NA
 3416767 3416768 Tbd_1401 Tbd_1402     TRUE 0.912 35.000 0.212 NA   NA
 3416768 3416769 Tbd_1402 Tbd_1403     TRUE 0.896 32.000 0.158 NA   NA
 3416769 3416770 Tbd_1403 Tbd_1404     TRUE 0.999 11.000 1.000 0.001 Y NA
 3416770 3416771 Tbd_1404 Tbd_1405     TRUE 0.999 11.000 1.000 0.003 Y NA
 3416771 3416772 Tbd_1405 Tbd_1406     TRUE 0.996 26.000 0.800 0.003 Y NA
 3416772 3416773 Tbd_1406 Tbd_1407     TRUE 0.979 0.000 0.000 NA Y NA
 3416773 3416774 Tbd_1407 Tbd_1408     FALSE 0.144 109.000 0.000 NA N NA
 3416774 3416775 Tbd_1408 Tbd_1409     TRUE 0.872 25.000 0.000 NA Y NA
 3416775 3416776 Tbd_1409 Tbd_1410     FALSE 0.229 65.000 0.000 NA N NA
 3416777 3416778 Tbd_1411 Tbd_1412     FALSE 0.020 387.000 0.000 1.000 N NA
 3416778 3416779 Tbd_1412 Tbd_1413     TRUE 0.999 0.000 0.459 1.000 Y NA
 3416779 3416780 Tbd_1413 Tbd_1414     TRUE 0.998 -3.000 0.929 1.000 N NA
 3416780 3416781 Tbd_1414 Tbd_1415     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.091 Y NA
 3416781 3416782 Tbd_1415 Tbd_1416     TRUE 0.981 3.000 0.000 0.001 Y NA
 3416782 3416783 Tbd_1416 Tbd_1417     TRUE 0.986 0.000 0.105 0.025 N NA
 3416783 3416784 Tbd_1417 Tbd_1418     TRUE 0.995 7.000 0.667 1.000 N NA
 3416787 3416788 Tbd_1421 Tbd_1422     FALSE 0.161 102.000 0.000 NA   NA
 3416790 3416791 Tbd_1424 Tbd_1425     FALSE 0.232 66.000 0.000 1.000 N NA
 3416791 3416792 Tbd_1425 Tbd_1426     TRUE 0.797 7.000 0.000 1.000 N NA
 3416792 3416793 Tbd_1426 Tbd_1427     TRUE 0.657 15.000 0.000 NA   NA
 3416793 3416794 Tbd_1427 Tbd_1428   arsM FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 3416794 3416795 Tbd_1428 Tbd_1429 arsM   TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 3416796 3416797 Tbd_1430 Tbd_1431     TRUE 0.994 3.000 0.388 NA   NA
 3416798 3416799 Tbd_1432 Tbd_1433     TRUE 0.983 1.000 0.000 0.007 Y NA
 3416799 3416800 Tbd_1433 Tbd_1434     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 3416800 3416801 Tbd_1434 Tbd_1435     TRUE 0.648 -19.000 0.000 NA   NA
 3416801 3416802 Tbd_1435 Tbd_1436     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3416802 3416803 Tbd_1436 Tbd_1437     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416803 3416804 Tbd_1437 Tbd_1438     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416804 3416805 Tbd_1438 Tbd_1439     TRUE 0.865 2.000 0.000 NA   NA
 3416805 3416806 Tbd_1439 Tbd_1440     TRUE 0.973 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3416806 3416807 Tbd_1440 Tbd_1441     TRUE 0.962 -10.000 0.000 0.007 Y NA
 3416807 3416808 Tbd_1441 Tbd_1442     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA Y NA
 3416808 3416809 Tbd_1442 Tbd_1443     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416809 3416810 Tbd_1443 Tbd_1444     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3416813 3416814 Tbd_1447 Tbd_1448     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 3416815 3416816 Tbd_1449 Tbd_1450     TRUE 0.580 22.000 0.000 NA   NA
 3416816 3416817 Tbd_1450 Tbd_1451     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 3416817 3416818 Tbd_1451 Tbd_1452     FALSE 0.110 130.000 0.000 NA   NA
 3416818 3416819 Tbd_1452 Tbd_1453     TRUE 0.978 3.000 0.108 NA   NA
 3416819 3416820 Tbd_1453 Tbd_1454     TRUE 0.991 -3.000 0.157 1.000   NA
 3416820 3416821 Tbd_1454 Tbd_1455     TRUE 0.998 -3.000 0.714 1.000   NA
 3416821 3416822 Tbd_1455 Tbd_1456     FALSE 0.225 69.000 0.000 1.000 N NA
 3416822 3416823 Tbd_1456 Tbd_1457     FALSE 0.157 104.000 0.000 NA   NA
 3416823 3416824 Tbd_1457 Tbd_1458     TRUE 0.561 23.000 0.000 NA   NA
 3416824 3416825 Tbd_1458 Tbd_1459     FALSE 0.114 126.000 0.000 NA   NA
 3416825 3416826 Tbd_1459 Tbd_1460     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3416826 3416827 Tbd_1460 Tbd_1461     TRUE 0.668 14.000 0.000 NA   NA
 3416827 3416828 Tbd_1461 Tbd_1462     FALSE 0.022 332.000 0.000 NA   NA
 3416828 3416829 Tbd_1462 Tbd_1463     FALSE 0.049 200.000 0.000 1.000 N NA
 3416833 3416834 Tbd_1467 Tbd_1468     FALSE 0.226 67.000 0.000 NA   NA
 3416836 3416837 Tbd_1470 Tbd_1471     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 3416837 3416838 Tbd_1471 Tbd_1472     FALSE 0.277 50.000 0.000 1.000 N NA
 3416839 3416840 Tbd_1473 Tbd_1474     TRUE 0.955 -10.000 0.099 NA   NA
 3416840 3416841 Tbd_1474 Tbd_1475     FALSE 0.173 99.000 0.000 1.000   NA
 3416841 3416842 Tbd_1475 Tbd_1476     TRUE 0.842 14.000 0.024 NA   NA
 3416842 3416843 Tbd_1476 Tbd_1477     TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 3416843 3416844 Tbd_1477 Tbd_1478     FALSE 0.293 46.000 0.000 NA   NA
 3416847 3416848 Tbd_1481 Tbd_1482     FALSE 0.290 48.000 0.000 1.000   NA
 3416849 3416850 Tbd_1483 Tbd_1484     FALSE 0.045 211.000 0.000 1.000   NA
 3416853 3416854 Tbd_1487 Tbd_1488     FALSE 0.023 330.000 0.000 NA   NA
 3416855 3416856 Tbd_1489 Tbd_1490     TRUE 0.907 48.000 0.317 NA   NA
 3416856 3416857 Tbd_1490 Tbd_1491     TRUE 0.804 6.000 0.000 NA   NA
 3416857 3416858 Tbd_1491 Tbd_1492     TRUE 0.978 3.000 0.083 0.042   NA
 3416858 3416859 Tbd_1492 Tbd_1493     FALSE 0.015 517.000 0.000 NA   NA
 3416859 3416860 Tbd_1493 Tbd_1494     TRUE 0.997 -3.000 0.562 NA   NA
 3416860 3416861 Tbd_1494 Tbd_1495     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 3416861 3416862 Tbd_1495 Tbd_1496     FALSE 0.237 65.000 0.000 1.000 N NA
 3416862 3416863 Tbd_1496 Tbd_1497     TRUE 0.769 77.000 0.167 1.000 N NA
 3416863 3416864 Tbd_1497 Tbd_1498     FALSE 0.213 73.000 0.000 NA   NA
 3416864 3416865 Tbd_1498 Tbd_1499     FALSE 0.020 383.000 0.000 NA   NA
 3416865 3416866 Tbd_1499 Tbd_1500   hppA FALSE 0.195 85.000 0.000 NA   NA
 3416866 3416867 Tbd_1500 Tbd_1501 hppA   FALSE 0.264 53.000 0.000 NA   NA
 3416867 3416868 Tbd_1501 Tbd_1502     TRUE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 3416868 3416869 Tbd_1502 Tbd_1503     TRUE 0.472 79.000 0.037 NA   NA
 3416869 3416870 Tbd_1503 Tbd_1504     FALSE 0.385 35.000 0.000 NA   NA
 3416870 3416871 Tbd_1504 Tbd_1505     TRUE 0.437 107.000 0.056 1.000 N NA
 3416871 3416872 Tbd_1505 Tbd_1506     TRUE 0.987 8.000 0.265 1.000   NA
 3416872 3416873 Tbd_1506 Tbd_1507     TRUE 0.658 -19.000 0.000 1.000   NA
 3416873 3416874 Tbd_1507 Tbd_1508     TRUE 0.427 32.000 0.000 1.000 N NA
 3416874 3416875 Tbd_1508 Tbd_1509     TRUE 0.569 103.000 0.096 1.000 N NA
 3416875 3416876 Tbd_1509 Tbd_1510     TRUE 0.999 8.000 0.746 0.037 Y NA
 3416879 3416880 Tbd_1513 Tbd_1514     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416881 3416882 Tbd_1515 Tbd_1516     FALSE 0.116 125.000 0.000 NA   NA
 3416882 3416883 Tbd_1516 Tbd_1517     FALSE 0.241 62.000 0.000 NA   NA
 3416883 3416884 Tbd_1517 Tbd_1518     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416884 3416885 Tbd_1518 Tbd_1519     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416888 3416889 Tbd_1522 Tbd_1523     TRUE 0.658 16.000 0.000 1.000   NA
 3416890 3416891 Tbd_1524 Tbd_1525     TRUE 0.585 22.000 0.000 1.000 N NA
 3416891 3416892 Tbd_1525 Tbd_1526     TRUE 0.904 31.000 0.158 1.000   NA
 3416892 3416893 Tbd_1526 Tbd_1527     TRUE 0.892 5.000 0.009 NA   NA
 3416893 3416894 Tbd_1527 Tbd_1528     TRUE 0.859 8.000 0.005 NA   NA
 3416895 3416896 Tbd_1529 Tbd_1530     TRUE 0.993 0.000 0.224 NA   NA
 3416896 3416897 Tbd_1530 Tbd_1531     TRUE 0.986 -3.000 0.103 NA   NA
 3416897 3416898 Tbd_1531 Tbd_1532     TRUE 0.963 13.000 0.162 NA N NA
 3416898 3416899 Tbd_1532 Tbd_1533     FALSE 0.255 60.000 0.000 1.000   NA
 3416900 3416901 Tbd_1534 Tbd_1535     TRUE 0.749 -10.000 0.000 NA   NA
 3416901 3416902 Tbd_1535 Tbd_1536     TRUE 0.984 16.000 0.444 NA   NA
 3416902 3416903 Tbd_1536 Tbd_R0030     TRUE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 3416904 3416905 Tbd_1537 Tbd_1538     TRUE 0.820 75.000 0.030 0.010 Y NA
 3416905 3416906 Tbd_1538 Tbd_1539     TRUE 0.935 113.000 0.236 0.004 Y NA
 3416907 3416908 Tbd_1540 Tbd_1541     TRUE 0.934 13.000 0.089 NA N NA
 3416908 3416909 Tbd_1541 Tbd_1542     TRUE 0.986 12.000 0.382 NA N NA
 3416909 3416910 Tbd_1542 Tbd_1543     TRUE 0.994 -3.000 0.211 1.000 N NA
 3416910 3416911 Tbd_1543 Tbd_1544     TRUE 0.993 -3.000 0.209 NA   NA
 3416911 3416912 Tbd_1544 Tbd_1545     TRUE 0.959 -28.000 0.204 NA   NA
 3416912 3416913 Tbd_1545 Tbd_1546     TRUE 0.995 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 3416913 3416914 Tbd_1546 Tbd_1547     TRUE 0.470 92.000 0.030 0.017 N NA
 3416914 3416915 Tbd_1547 Tbd_1548     TRUE 0.828 201.000 0.346 1.000 Y NA
 3416915 3416916 Tbd_1548 Tbd_1549     TRUE 0.966 87.000 0.321 0.004 Y NA
 3416916 3416917 Tbd_1549 Tbd_1550     TRUE 0.998 11.000 0.432 0.004 Y NA
 3416917 3416918 Tbd_1550 Tbd_1551     TRUE 0.818 169.000 0.182 0.004 Y NA
 3416918 3416919 Tbd_1551 Tbd_1552     TRUE 0.999 -3.000 0.380 0.004 Y NA
 3416919 3416920 Tbd_1552 Tbd_1553   rpmF TRUE 0.915 59.000 0.418 1.000 N NA
 3416920 3416921 Tbd_1553 Tbd_1554 rpmF   TRUE 0.974 29.000 0.599 NA   NA
 3416922 3416923 Tbd_1555 Tbd_1556     TRUE 0.986 16.000 0.354 0.002 N NA
 3416923 3416924 Tbd_1556 Tbd_1557     TRUE 0.955 -3.000 0.017 NA N NA
 3416924 3416925 Tbd_1557 Tbd_1558     TRUE 0.969 6.000 0.107 NA   NA
 3416926 3416927 Tbd_1559 Tbd_1560     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3416927 3416928 Tbd_1560 Tbd_1561     TRUE 0.994 -3.000 0.218 1.000 N NA
 3416928 3416929 Tbd_1561 Tbd_1562     TRUE 0.964 -21.000 0.199 1.000   NA
 3416929 3416930 Tbd_1562 Tbd_1563     TRUE 0.985 -16.000 0.389 1.000   NA
 3416932 3416933 Tbd_1565 Tbd_1566     FALSE 0.256 56.000 0.000 NA   NA
 3416936 3416937 Tbd_1569 Tbd_1570     FALSE 0.346 40.000 0.000 1.000   NA
 3416937 3416938 Tbd_1570 Tbd_R0031     FALSE 0.078 155.000 0.000 NA   NA
 3416938 3416939 Tbd_R0031 Tbd_1571     FALSE 0.084 150.000 0.000 NA   NA
 3416939 3416940 Tbd_1571 Tbd_1572     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3416941 3416942 Tbd_1573 Tbd_1574     FALSE 0.014 722.000 0.000 NA   NA
 3416942 3416943 Tbd_1574 Tbd_1575     FALSE 0.039 223.000 0.000 NA   NA
 3416943 3416944 Tbd_1575 Tbd_1576     FALSE 0.050 194.000 0.000 NA   NA
 3416945 3416946 Tbd_1577 Tbd_1578     FALSE 0.091 145.000 0.000 1.000 N NA
 3416946 3416947 Tbd_1578 Tbd_1579     TRUE 0.816 5.000 0.000 NA   NA
 3416947 3416948 Tbd_1579 Tbd_1580     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 3416949 3416950 Tbd_1581 Tbd_1582     TRUE 0.995 11.000 0.819 0.089 N NA
 3416950 3416951 Tbd_1582 Tbd_1583     TRUE 0.998 12.000 0.849 1.000 Y NA
 3416951 3416952 Tbd_1583 Tbd_1584     FALSE 0.260 56.000 0.000 1.000 N NA
 3416952 3416953 Tbd_1584 Tbd_1585     TRUE 0.966 -3.000 0.030 1.000 N NA
 3416953 3416954 Tbd_1585 Tbd_1586     TRUE 0.941 -13.000 0.089 NA   NA
 3416955 3416956 Tbd_1587 Tbd_1588     TRUE 0.964 38.000 0.143 0.026 Y NA
 3416956 3416957 Tbd_1588 Tbd_1589     TRUE 0.786 121.000 0.095 1.000 Y NA
 3416957 3416958 Tbd_1589 Tbd_1590     FALSE 0.068 165.000 0.000 1.000 N NA
 3416958 3416959 Tbd_1590 Tbd_1591     TRUE 0.786 57.000 0.018 NA Y NA
 3416959 3416960 Tbd_1591 Tbd_1592     TRUE 0.971 12.000 0.035 NA Y NA
 3416960 3416961 Tbd_1592 Tbd_1593     TRUE 0.994 15.000 0.216 0.004 Y NA
 3416961 3416962 Tbd_1593 Tbd_1594     TRUE 0.981 15.000 0.338 1.000   NA
 3416962 3416963 Tbd_1594 Tbd_1595     TRUE 0.695 13.000 0.000 1.000   NA
 3416963 3416964 Tbd_1595 Tbd_1596     TRUE 0.899 -13.000 0.041 1.000   NA
 3416964 3416965 Tbd_1596 Tbd_1597     TRUE 0.947 6.000 0.057 NA   NA
 3416965 3416966 Tbd_1597 Tbd_1598     FALSE 0.351 38.000 0.000 NA N NA
 3416968 3416969 Tbd_1600 Tbd_1601 fliF   TRUE 0.997 -7.000 0.220 0.010 Y NA
 3416969 3416970 Tbd_1601 Tbd_1602     TRUE 0.998 -7.000 0.320 0.007 Y NA
 3416970 3416971 Tbd_1602 Tbd_1603     TRUE 0.988 11.000 0.085 0.007 Y NA
 3416971 3416972 Tbd_1603 Tbd_1604     TRUE 0.977 19.000 0.073 0.012 Y NA
 3416972 3416973 Tbd_1604 Tbd_1605     TRUE 0.994 20.000 0.317 0.010 Y NA
 3416973 3416974 Tbd_1605 Tbd_1606   fliL TRUE 0.664 119.000 0.031 1.000 Y NA
 3416974 3416975 Tbd_1606 Tbd_1607 fliL fliM TRUE 0.991 8.000 0.076 0.001 Y NA
 3416975 3416976 Tbd_1607 Tbd_1608 fliM   TRUE 0.999 -7.000 0.741 0.001 Y NA
 3416976 3416977 Tbd_1608 Tbd_1609     TRUE 0.999 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 3416977 3416978 Tbd_1609 Tbd_1610   fliP TRUE 0.994 -10.000 0.203 1.000 Y NA
 3416978 3416979 Tbd_1610 Tbd_1611 fliP   TRUE 0.999 10.000 0.827 0.013 Y NA
 3416979 3416980 Tbd_1611 Tbd_1612     TRUE 0.783 167.000 0.139 0.004 Y NA
 3416981 3416982 Tbd_1613 Tbd_1614     TRUE 0.999 2.000 0.857 1.000 Y NA
 3416982 3416983 Tbd_1614 Tbd_1615     TRUE 0.924 100.000 0.179 0.019 Y NA
 3416983 3416984 Tbd_1615 Tbd_1616     TRUE 0.985 28.000 0.256 1.000 Y NA
 3416984 3416985 Tbd_1616 Tbd_1617     TRUE 0.999 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 3416985 3416986 Tbd_1617 Tbd_1618     TRUE 0.496 115.000 0.000 1.000 Y NA
 3416986 3416987 Tbd_1618 Tbd_1619     FALSE 0.165 326.000 0.000 0.007 Y NA
 3416987 3416988 Tbd_1619 Tbd_1620     FALSE 0.174 295.000 0.000 0.007 Y NA
 3416988 3416989 Tbd_1620 Tbd_1621     FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000 N NA
 3416989 3416990 Tbd_1621 Tbd_1622     FALSE 0.127 119.000 0.000 1.000 N NA
 3416990 3416991 Tbd_1622 Tbd_1623     TRUE 0.685 80.000 0.000 0.007 Y NA
 3416991 3416992 Tbd_1623 Tbd_1624     TRUE 0.995 22.000 0.429 0.007 Y NA
 3416992 3416993 Tbd_1624 Tbd_1625     TRUE 0.948 47.000 0.167 1.000 Y NA
 3416993 3416994 Tbd_1625 Tbd_1626     FALSE 0.264 53.000 0.000 NA   NA
 3416994 3416995 Tbd_1626 Tbd_1627   flgL TRUE 0.771 9.000 0.000 NA   NA
 3416995 3416996 Tbd_1627 Tbd_1628 flgL flgK TRUE 0.986 13.000 0.080 0.002 Y NA
 3416996 3416997 Tbd_1628 Tbd_1629 flgK   TRUE 0.984 81.000 0.705 0.004 Y NA
 3416997 3416998 Tbd_1629 Tbd_1630   flgI TRUE 0.993 1.000 0.054 0.012 Y NA
 3416998 3416999 Tbd_1630 Tbd_1631 flgI   TRUE 0.992 10.000 0.110 0.012 Y NA
 3416999 3417000 Tbd_1631 Tbd_1632     TRUE 0.998 9.000 0.463 0.010 Y NA
 3417000 3417001 Tbd_1632 Tbd_1633   flgF TRUE 0.986 41.000 0.381 0.002 Y NA
 3417001 3417002 Tbd_1633 Tbd_1634 flgF flgE TRUE 0.994 26.000 0.520 0.005 Y NA
 3417002 3417003 Tbd_1634 Tbd_1635 flgE flgD TRUE 0.963 50.000 0.244 NA Y NA
 3417003 3417004 Tbd_1635 Tbd_1636 flgD   TRUE 0.983 30.000 0.256 NA Y NA
 3417004 3417005 Tbd_1636 Tbd_1637     TRUE 0.963 10.000 0.000 0.005 Y NA
 3417006 3417007 Tbd_1638 Tbd_1639 flgA   TRUE 0.841 98.000 0.330 NA   NA
 3417007 3417008 Tbd_1639 Tbd_1640     TRUE 0.982 -13.000 0.211 0.004   NA
 3417011 3417012 Tbd_1643 Tbd_1644     FALSE 0.031 252.000 0.000 NA   NA
 3417012 3417013 Tbd_1644 Tbd_1645     FALSE 0.100 137.000 0.000 NA   NA
 3417013 3417014 Tbd_1645 Tbd_1646     TRUE 0.998 15.000 0.812 0.002 Y NA
 3417014 3417015 Tbd_1646 Tbd_1647     TRUE 0.954 46.000 0.133 0.002 Y NA
 3417015 3417016 Tbd_1647 Tbd_1648     TRUE 0.996 4.000 0.150 0.002 Y NA
 3417017 3417018 Tbd_1649 Tbd_1650     FALSE 0.375 36.000 0.000 NA   NA
 3417019 3417020 Tbd_1651 Tbd_1652     FALSE 0.085 151.000 0.000 1.000   NA
 3417020 3417021 Tbd_1652 Tbd_1653     FALSE 0.197 82.000 0.000 NA N NA
 3417021 3417022 Tbd_1653 Tbd_1654     TRUE 0.999 -3.000 0.619 NA Y NA
 3417022 3417023 Tbd_1654 Tbd_1655     TRUE 0.996 1.000 0.571 NA   NA
 3417024 3417025 Tbd_1656 Tbd_1657     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417025 3417026 Tbd_1657 Tbd_1658     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 3417026 3417027 Tbd_1658 Tbd_1659     FALSE 0.214 79.000 0.000 1.000   NA
 3417028 3417029 Tbd_1660 Tbd_1661     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3417029 3417030 Tbd_1661 Tbd_1662     TRUE 0.604 -27.000 0.000 NA   NA
 3417030 3417031 Tbd_1662 Tbd_1663     TRUE 0.995 10.000 0.248 1.000 Y NA
 3417031 3417032 Tbd_1663 Tbd_1664     TRUE 0.961 -10.000 0.111 1.000   NA
 3417033 3417034 Tbd_1665 Tbd_1666     TRUE 0.872 54.000 0.233 1.000   NA
 3417035 3417036 Tbd_1667 Tbd_1668     TRUE 0.580 22.000 0.000 NA   NA
 3417036 3417037 Tbd_1668 Tbd_1669     TRUE 0.998 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 3417037 3417038 Tbd_1669 Tbd_1670     TRUE 1.000 -3.000 0.738 0.025 Y NA
 3417038 3417039 Tbd_1670 Tbd_1671     TRUE 0.999 0.000 0.619 0.025 Y NA
 3417041 3417042 Tbd_1673 Tbd_R0032     FALSE 0.201 82.000 0.000 NA   NA
 3417042 3417043 Tbd_R0032 Tbd_R0033     FALSE 0.293 46.000 0.000 NA   NA
 3417043 3417044 Tbd_R0033 Tbd_1674     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 3417044 3417045 Tbd_1674 Tbd_1675     FALSE 0.234 149.000 0.033 1.000 N NA
 3417045 3417046 Tbd_1675 Tbd_1676   clpX TRUE 0.891 118.000 0.201 1.000 Y NA
 3417046 3417047 Tbd_1676 Tbd_1677 clpX   TRUE 0.995 13.000 0.352 1.000 Y NA
 3417047 3417048 Tbd_1677 Tbd_1678     TRUE 0.999 0.000 0.351 1.000 Y NA
 3417052 3417053 Tbd_1682 Tbd_1683     TRUE 0.561 23.000 0.000 NA   NA
 3417053 3417054 Tbd_1683 Tbd_1684     FALSE 0.072 160.000 0.000 NA   NA
 3417054 3417055 Tbd_1684 Tbd_1685     TRUE 0.648 16.000 0.000 NA   NA
 3417055 3417056 Tbd_1685 Tbd_1686     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417056 3417057 Tbd_1686 Tbd_1687     TRUE 0.885 0.000 0.000 1.000 N NA
 3417057 3417058 Tbd_1687 Tbd_1688     FALSE 0.069 164.000 0.000 NA   NA
 3417058 3417059 Tbd_1688 Tbd_1689     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417059 3417060 Tbd_1689 Tbd_1690     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417061 3417062 Tbd_1691 Tbd_1692     FALSE 0.142 111.000 0.000 NA   NA
 3417062 3417063 Tbd_1692 Tbd_1693     TRUE 0.984 21.000 0.565 1.000   NA
 3417064 3417065 Tbd_1694 Tbd_1695     TRUE 0.724 -12.000 0.000 NA   NA
 3417065 3417066 Tbd_1695 Tbd_R0034     FALSE 0.015 482.000 0.000 NA   NA
 3417067 3417068 Tbd_1696 Tbd_1697     TRUE 0.989 3.000 0.020 0.001 Y NA
 3417068 3417069 Tbd_1697 Tbd_1698     TRUE 0.958 -3.000 0.019 1.000   NA
 3417069 3417070 Tbd_1698 Tbd_1699     TRUE 0.968 -3.000 0.019 0.034   NA
 3417070 3417071 Tbd_1699 Tbd_1700     TRUE 0.672 14.000 0.000 1.000 N NA
 3417072 3417073 Tbd_1701 Tbd_1702     FALSE 0.086 146.000 0.000 NA N NA
 3417073 3417074 Tbd_1702 Tbd_1703     TRUE 0.994 -3.000 0.051 NA Y NA
 3417074 3417075 Tbd_1703 Tbd_1704   tatA TRUE 0.670 93.000 0.098 0.009   NA
 3417075 3417076 Tbd_1704 Tbd_1705 tatA   TRUE 0.913 17.000 0.080 1.000   NA
 3417076 3417077 Tbd_1705 Tbd_1706     TRUE 0.982 -3.000 0.079 1.000 N NA
 3417077 3417078 Tbd_1706 Tbd_1707     TRUE 0.998 -3.000 0.152 0.005 Y NA
 3417078 3417079 Tbd_1707 Tbd_1708     TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 3417079 3417080 Tbd_1708 Tbd_1709     TRUE 0.975 5.000 0.000 0.005 Y NA
 3417080 3417081 Tbd_1709 Tbd_1710     TRUE 0.838 36.000 0.000 0.005 Y NA
 3417081 3417082 Tbd_1710 Tbd_1711   hisB TRUE 0.932 59.000 0.111 0.005 Y NA
 3417082 3417083 Tbd_1711 Tbd_1712 hisB   TRUE 0.859 51.000 0.025 0.005 Y NA
 3417083 3417084 Tbd_1712 Tbd_1713     TRUE 0.997 -3.000 0.087 0.005 Y NA
 3417085 3417086 Tbd_1714 Tbd_1715     FALSE 0.208 78.000 0.000 NA   NA
 3417087 3417088 Tbd_1716 Tbd_1717     TRUE 0.984 0.000 0.111 NA   NA
 3417090 3417091 Tbd_1719 Tbd_1720     TRUE 0.961 -6.000 0.074 NA   NA
 3417091 3417092 Tbd_1720 Tbd_1721     TRUE 0.741 32.000 0.049 NA   NA
 3417092 3417093 Tbd_1721 Tbd_1722     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3417093 3417094 Tbd_1722 Tbd_1723     FALSE 0.186 92.000 0.000 1.000   NA
 3417094 3417095 Tbd_1723 Tbd_1724     TRUE 0.970 -6.000 0.096 1.000   NA
 3417095 3417096 Tbd_1724 Tbd_1725     TRUE 0.995 -3.000 0.209 0.025   NA
 3417096 3417097 Tbd_1725 Tbd_1726     TRUE 0.730 11.000 0.000 1.000 N NA
 3417097 3417098 Tbd_1726 Tbd_1727     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3417099 3417100 Tbd_1728 Tbd_1729     TRUE 0.561 23.000 0.000 NA   NA
 3417100 3417101 Tbd_1729 Tbd_1730     TRUE 0.522 25.000 0.000 NA   NA
 3417102 3417103 Tbd_1731 Tbd_1732     TRUE 0.449 31.000 0.000 1.000   NA
 3417103 3417104 Tbd_1732 Tbd_1733     TRUE 0.449 31.000 0.000 1.000   NA
 3417104 3417105 Tbd_1733 Tbd_R0035     FALSE 0.028 263.000 0.000 NA   NA
 3417106 3417107 Tbd_1734 Tbd_R0036 gltX   FALSE 0.287 47.000 0.000 NA   NA
 3417108 3417109 Tbd_1735 Tbd_1736     FALSE 0.225 69.000 0.000 1.000 N NA
 3417109 3417110 Tbd_1736 Tbd_1737     FALSE 0.043 216.000 0.000 1.000   NA
 3417110 3417111 Tbd_1737 Tbd_1738     TRUE 0.810 -16.000 0.010 1.000   NA
 3417112 3417113 Tbd_1739 Tbd_1740     TRUE 0.991 3.000 0.233 NA   NA
 3417113 3417114 Tbd_1740 Tbd_1741     TRUE 0.981 -13.000 0.273 NA   NA
 3417114 3417115 Tbd_1741 Tbd_1742     FALSE 0.346 40.000 0.000 1.000   NA
 3417116 3417117 Tbd_1743 Tbd_1744     TRUE 0.976 -16.000 0.240 1.000 N NA
 3417117 3417118 Tbd_1744 Tbd_1745     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 3417118 3417119 Tbd_1745 Tbd_1746     TRUE 0.987 24.000 1.000 NA   NA
 3417119 3417120 Tbd_1746 Tbd_1747     TRUE 0.971 9.000 0.133 NA N NA
 3417120 3417121 Tbd_1747 Tbd_1748     TRUE 0.983 -3.000 0.000 NA Y NA
 3417122 3417123 Tbd_1749 Tbd_1750     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 3417124 3417125 Tbd_1751 Tbd_1752 guaA   TRUE 0.909 122.000 0.190 0.001 Y NA
 3417127 3417128 Tbd_1754 Tbd_1755     TRUE 0.959 -3.000 0.020 NA   NA
 3417129 3417130 Tbd_1756 Tbd_1757 smpB   FALSE 0.018 421.000 0.000 1.000   NA
 3417131 3417132 Tbd_1758 Tbd_1759     TRUE 0.939 -3.000 0.002 1.000   NA
 3417132 3417133 Tbd_1759 Tbd_1760     TRUE 0.842 11.000 0.010 1.000   NA
 3417133 3417134 Tbd_1760 Tbd_1761     TRUE 0.995 -7.000 0.620 0.036 N NA
 3417134 3417135 Tbd_1761 Tbd_1762     FALSE 0.315 42.000 0.000 NA   NA
 3417137 3417138 Tbd_1764 Tbd_1765     FALSE 0.099 184.000 0.009 1.000 N NA
 3417138 3417139 Tbd_1765 Tbd_1766     FALSE 0.081 155.000 0.000 1.000   NA
 3417139 3417140 Tbd_1766 Tbd_R0037     FALSE 0.027 273.000 0.000 NA   NA
 3417140 3417141 Tbd_R0037 Tbd_R0038     FALSE 0.052 187.000 0.000 NA   NA
 3417141 3417142 Tbd_R0038 Tbd_R0039     FALSE 0.017 436.000 0.000 NA   NA
 3417142 3417143 Tbd_R0039 Tbd_R0040     FALSE 0.096 140.000 0.000 NA   NA
 3417143 3417144 Tbd_R0040 Tbd_R0041     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 3417144 3417145 Tbd_R0041 Tbd_R0042     FALSE 0.025 287.000 0.000 NA   NA
 3417146 3417147 Tbd_1767 Tbd_1768     FALSE 0.062 170.000 0.000 NA   NA
 3417148 3417149 Tbd_1769 Tbd_1770     FALSE 0.281 48.000 0.000 NA   NA
 3417150 3417151 Tbd_1771 Tbd_1772     TRUE 0.658 16.000 0.000 1.000   NA
 3417152 3417153 Tbd_1773 Tbd_1774     FALSE 0.165 103.000 0.000 1.000   NA
 3417153 3417154 Tbd_1774 Tbd_1775     TRUE 0.597 110.000 0.000 0.004 Y NA
 3417154 3417155 Tbd_1775 Tbd_1776     TRUE 0.996 4.000 0.154 0.004 Y NA
 3417155 3417156 Tbd_1776 Tbd_1777     TRUE 0.667 89.000 0.000 0.004 Y NA
 3417156 3417157 Tbd_1777 Tbd_1778     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3417157 3417158 Tbd_1778 Tbd_1779     TRUE 0.926 43.000 0.100 1.000 Y NA
 3417158 3417159 Tbd_1779 Tbd_1780     TRUE 0.993 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 3417159 3417160 Tbd_1780 Tbd_1781     TRUE 0.753 41.000 0.000 1.000 Y NA
 3417160 3417161 Tbd_1781 Tbd_1782     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3417161 3417162 Tbd_1782 Tbd_1783     FALSE 0.191 87.000 0.000 NA   NA
 3417162 3417163 Tbd_1783 Tbd_1784     TRUE 0.983 -3.000 0.000 NA Y NA
 3417163 3417164 Tbd_1784 Tbd_1785     FALSE 0.268 55.000 0.000 1.000   NA
 3417164 3417165 Tbd_1785 Tbd_1786     TRUE 0.668 14.000 0.000 NA   NA
 3417165 3417166 Tbd_1786 Tbd_1787     FALSE 0.039 223.000 0.000 NA   NA
 3417166 3417167 Tbd_1787 Tbd_1788     TRUE 0.654 26.000 0.000 0.001   NA
 3417167 3417168 Tbd_1788 Tbd_1789     FALSE 0.174 94.000 0.000 NA   NA
 3417168 3417169 Tbd_1789 Tbd_1790     TRUE 0.831 4.000 0.000 NA   NA
 3417169 3417170 Tbd_1790 Tbd_1791     FALSE 0.112 127.000 0.000 NA   NA
 3417170 3417171 Tbd_1791 Tbd_1792     TRUE 0.869 24.000 0.075 NA   NA
 3417171 3417172 Tbd_1792 Tbd_1793     TRUE 0.967 19.000 0.231 NA   NA
 3417172 3417173 Tbd_1793 Tbd_1794     TRUE 0.489 156.000 0.154 1.000 N NA
 3417173 3417174 Tbd_1794 Tbd_1795     TRUE 0.931 65.000 0.133 0.087 Y NA
 3417174 3417175 Tbd_1795 Tbd_1796     TRUE 0.429 161.000 0.133 NA   NA
 3417175 3417176 Tbd_1796 Tbd_1797     TRUE 0.790 30.000 0.061 NA   NA
 3417176 3417177 Tbd_1797 Tbd_1798     TRUE 0.395 34.000 0.000 NA   NA
 3417177 3417178 Tbd_1798 Tbd_1799     FALSE 0.027 279.000 0.000 1.000   NA
 3417178 3417179 Tbd_1799 Tbd_1800     FALSE 0.099 139.000 0.000 NA   NA
 3417179 3417180 Tbd_1800 Tbd_1801     FALSE 0.017 423.000 0.000 NA   NA
 3417182 3417183 Tbd_1803 Tbd_1804     FALSE 0.014 834.000 0.000 NA   NA
 3417183 3417184 Tbd_1804 Tbd_1805     FALSE 0.273 50.000 0.000 NA   NA
 3417185 3417186 Tbd_1806 Tbd_1807     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.099 Y NA
 3417186 3417187 Tbd_1807 Tbd_1808     FALSE 0.047 202.000 0.000 1.000 N NA
 3417187 3417188 Tbd_1808 Tbd_1809     FALSE 0.137 116.000 0.000 1.000   NA
 3417188 3417189 Tbd_1809 Tbd_1810     TRUE 0.802 -7.000 0.000 1.000   NA
 3417189 3417190 Tbd_1810 Tbd_1811     TRUE 0.988 0.000 0.154 NA   NA
 3417190 3417191 Tbd_1811 Tbd_1812     TRUE 0.983 -3.000 0.086 NA   NA
 3417192 3417193 Tbd_1813 Tbd_1814     TRUE 0.595 -28.000 0.000 NA   NA
 3417193 3417194 Tbd_1814 Tbd_1815     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 3417196 3417197 Tbd_1817 Tbd_1818     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3417197 3417198 Tbd_1818 Tbd_1819     TRUE 0.726 11.000 0.000 NA   NA
 3417198 3417199 Tbd_1819 Tbd_1820     FALSE 0.018 403.000 0.000 NA   NA
 3417199 3417200 Tbd_1820 Tbd_1821     TRUE 0.847 3.000 0.000 NA N NA
 3417201 3417202 Tbd_1822 Tbd_1823     FALSE 0.030 259.000 0.000 NA   NA
 3417203 3417204 Tbd_1824 Tbd_1825     TRUE 0.676 -16.000 0.000 NA   NA
 3417204 3417205 Tbd_1825 Tbd_1826     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417205 3417206 Tbd_1826 Tbd_1827     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417206 3417207 Tbd_1827 Tbd_1828     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417207 3417208 Tbd_1828 Tbd_R0043     FALSE 0.024 317.000 0.000 NA   NA
 3417208 3417209 Tbd_R0043 Tbd_1829     FALSE 0.308 43.000 0.000 NA   NA
 3417209 3417210 Tbd_1829 Tbd_1830     TRUE 0.989 20.000 0.831 NA   NA
 3417210 3417211 Tbd_1830 Tbd_1831     TRUE 0.843 103.000 0.370 NA N NA
 3417211 3417212 Tbd_1831 Tbd_1832     TRUE 0.999 1.000 0.630 0.002 Y NA
 3417212 3417213 Tbd_1832 Tbd_1833     TRUE 0.988 5.000 0.029 0.002 Y NA
 3417215 3417216 Tbd_1835 Tbd_1836     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 3417217 3417218 Tbd_1837 Tbd_1838     FALSE 0.105 135.000 0.000 NA   NA
 3417220 3417221 Tbd_1840 Tbd_1841     TRUE 0.869 10.000 0.012 1.000   NA
 3417221 3417222 Tbd_1841 Tbd_1842     FALSE 0.216 157.000 0.034 1.000   NA
 3417222 3417223 Tbd_1842 Tbd_1843     FALSE 0.366 37.000 0.000 NA   NA
 3417224 3417225 Tbd_1844 Tbd_1845     FALSE 0.243 61.000 0.000 NA   NA
 3417225 3417226 Tbd_1845 Tbd_1846     TRUE 0.620 18.000 0.000 NA   NA
 3417226 3417227 Tbd_1846 Tbd_1847     TRUE 0.794 7.000 0.000 NA   NA
 3417227 3417228 Tbd_1847 Tbd_1848     TRUE 0.726 11.000 0.000 NA   NA
 3417228 3417229 Tbd_1848 Tbd_1849     TRUE 0.931 3.000 0.019 NA   NA
 3417229 3417230 Tbd_1849 Tbd_1850     TRUE 0.448 255.000 0.088 1.000 Y NA
 3417230 3417231 Tbd_1850 Tbd_1851     TRUE 0.994 0.000 0.074 1.000 Y NA
 3417231 3417232 Tbd_1851 Tbd_1852     FALSE 0.373 107.000 0.035 NA   NA
 3417235 3417236 Tbd_1855 Tbd_1856     TRUE 0.817 57.000 0.169 1.000   NA
 3417236 3417237 Tbd_1856 Tbd_1857     TRUE 0.978 13.000 0.254 1.000 N NA
 3417237 3417238 Tbd_1857 Tbd_1858     TRUE 0.639 17.000 0.000 1.000 N NA
 3417238 3417239 Tbd_1858 Tbd_1859     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3417239 3417240 Tbd_1859 Tbd_1860     TRUE 0.989 14.000 0.626 1.000 N NA
 3417241 3417242 Tbd_1861 Tbd_1862     TRUE 0.993 12.000 0.833 NA   NA
 3417242 3417243 Tbd_1862 Tbd_1863     TRUE 0.850 3.000 0.000 NA   NA
 3417243 3417244 Tbd_1863 Tbd_1864     TRUE 0.820 -6.000 0.000 NA   NA
 3417244 3417245 Tbd_1864 Tbd_1865     TRUE 0.987 10.000 0.088 NA Y NA
 3417246 3417247 Tbd_1866 Tbd_1867     FALSE 0.264 117.000 0.020 NA N NA
 3417247 3417248 Tbd_1867 Tbd_1868     TRUE 0.992 7.000 0.116 NA Y NA
 3417249 3417250 Tbd_1869 Tbd_1870     TRUE 0.887 0.000 0.000 1.000   NA
 3417250 3417251 Tbd_1870 Tbd_1871     TRUE 0.840 30.000 0.000 1.000 Y NA
 3417251 3417252 Tbd_1871 Tbd_1872     TRUE 0.991 -10.000 0.129 1.000 Y NA
 3417252 3417253 Tbd_1872 Tbd_1873     TRUE 0.999 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3417253 3417254 Tbd_1873 Tbd_1874     TRUE 0.990 -3.000 0.019 NA Y NA
 3417254 3417255 Tbd_1874 Tbd_1875     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417255 3417256 Tbd_1875 Tbd_1876     FALSE 0.016 447.000 0.000 NA   NA
 3417256 3417257 Tbd_1876 Tbd_1877     FALSE 0.319 42.000 0.000 1.000 N NA
 3417257 3417258 Tbd_1877 Tbd_1878     TRUE 0.991 3.000 0.061 NA Y NA
 3417258 3417259 Tbd_1878 Tbd_1879     TRUE 0.810 33.000 0.000 NA Y NA
 3417259 3417260 Tbd_1879 Tbd_1880     TRUE 0.987 25.000 0.247 1.000 Y NA
 3417260 3417261 Tbd_1880 Tbd_1881     TRUE 0.997 -15.000 0.624 1.000 Y NA
 3417261 3417262 Tbd_1881 Tbd_1882     TRUE 0.533 105.000 0.000 NA Y NA
 3417262 3417263 Tbd_1882 Tbd_1883     FALSE 0.086 149.000 0.000 NA   NA
 3417263 3417264 Tbd_1883 Tbd_1884     TRUE 0.883 0.000 0.000 NA   NA
 3417264 3417265 Tbd_1884 Tbd_1885     TRUE 0.868 16.000 0.041 1.000 N NA
 3417265 3417266 Tbd_1885 Tbd_1886     TRUE 0.849 -16.000 0.024 1.000 N NA
 3417266 3417267 Tbd_1886 Tbd_1887     TRUE 0.907 -3.000 0.000 1.000   NA
 3417267 3417268 Tbd_1887 Tbd_1888     FALSE 0.216 72.000 0.000 NA   NA
 3417270 3417271 Tbd_1890 Tbd_1891 hisG   TRUE 0.949 14.000 0.123 1.000 N NA
 3417271 3417272 Tbd_1891 Tbd_1892     TRUE 0.984 2.000 0.129 NA N NA
 3417272 3417273 Tbd_1892 Tbd_1893     TRUE 0.843 27.000 0.077 NA N NA
 3417273 3417274 Tbd_1893 Tbd_1894     TRUE 0.998 -3.000 0.170 0.097 Y NA
 3417274 3417275 Tbd_1894 Tbd_1895     TRUE 0.992 -3.000 0.174 NA   NA
 3417275 3417276 Tbd_1895 Tbd_1896     TRUE 0.974 -3.000 0.052 NA   NA
 3417276 3417277 Tbd_1896 Tbd_1897     FALSE 0.222 67.000 0.000 NA N NA
 3417277 3417278 Tbd_1897 Tbd_1898     TRUE 0.962 -3.000 0.024 NA   NA
 3417278 3417279 Tbd_1898 Tbd_1899     TRUE 0.996 3.000 0.562 NA   NA
 3417279 3417280 Tbd_1899 Tbd_1900     TRUE 0.998 -7.000 0.530 NA Y NA
 3417280 3417281 Tbd_1900 Tbd_1901     FALSE 0.187 89.000 0.000 NA   NA
 3417281 3417282 Tbd_1901 Tbd_1902     TRUE 0.703 12.000 0.000 NA   NA
 3417283 3417284 Tbd_1903 Tbd_1904     FALSE 0.049 201.000 0.000 1.000   NA
 3417284 3417285 Tbd_1904 Tbd_1905     TRUE 0.972 9.000 0.136 1.000   NA
 3417286 3417287 Tbd_1906 Tbd_1907     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   NA
 3417287 3417288 Tbd_1907 Tbd_1908     TRUE 0.528 145.000 0.153 1.000 N NA
 3417288 3417289 Tbd_1908 Tbd_1909     TRUE 0.967 22.000 0.262 1.000   NA
 3417289 3417290 Tbd_1909 Tbd_1910     TRUE 0.978 -3.000 0.066 NA   NA
 3417290 3417291 Tbd_1910 Tbd_1911     TRUE 0.931 -19.000 0.100 NA   NA
 3417291 3417292 Tbd_1911 Tbd_1912     TRUE 0.989 -10.000 0.383 1.000 N NA
 3417292 3417293 Tbd_1912 Tbd_1913     TRUE 0.993 0.000 0.232 1.000 N NA
 3417293 3417294 Tbd_1913 Tbd_1914     TRUE 0.983 44.000 0.344 0.001 Y NA
 3417294 3417295 Tbd_1914 Tbd_1915     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 3417295 3417296 Tbd_1915 Tbd_1916   truA TRUE 0.960 -15.000 0.139 1.000 N NA
 3417296 3417297 Tbd_1916 Tbd_1917 truA   TRUE 0.812 11.000 0.003 NA   NA
 3417297 3417298 Tbd_1917 Tbd_1918     FALSE 0.264 53.000 0.000 NA   NA