MicrobesOnline Operon Predictions for Photorhabdus asymbiotica

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6849795 6849796 PAU_00001 PAU_00002 dnaA dnaN TRUE 0.997 5.000 0.328 1.000 Y NA
 6849796 6849797 PAU_00002 PAU_00003 dnaN recF TRUE 0.995 22.000 0.318 1.000 Y NA
 6849797 6849798 PAU_00003 PAU_00004 recF gyrB TRUE 0.996 17.000 0.249 0.005 Y NA
 6849799 6849800 PAU_00005 PAU_00006 asd ogrK FALSE 0.136 203.000 0.000 1.000   NA
 6849800 6849801 PAU_00006 PAU_00007 ogrK   TRUE 0.918 76.000 0.500 NA   NA
 6849801 6849802 PAU_00007 PAU_00008     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6849802 6849803 PAU_00008 PAU_00009     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849803 6849804 PAU_00009 PAU_00010     FALSE 0.333 115.000 0.000 NA   NA
 6849804 6849805 PAU_00010 PAU_00011     TRUE 0.985 27.000 0.400 NA   NA
 6849805 6849806 PAU_00011 PAU_00012     TRUE 0.997 11.000 0.667 NA   NA
 6849808 6849809 PAU_00014 PAU_00015 tfaE stfE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849809 6849810 PAU_00015 PAU_00016 stfE   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849810 6849811 PAU_00016 PAU_00017     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849811 6849812 PAU_00017 PAU_00018     TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 6849812 6849813 PAU_00018 PAU_00019     TRUE 0.997 5.000 0.667 NA   NA
 6849813 6849814 PAU_00019 PAU_00020     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6849814 6849815 PAU_00020 PAU_00021     FALSE 0.055 291.000 0.000 NA   NA
 6849815 6849816 PAU_00021 PAU_00022     FALSE 0.222 154.000 0.000 NA   NA
 6849816 6849817 PAU_00022 PAU_00023   rlsC FALSE 0.060 281.000 0.000 NA   NA
 6849820 6849821 PAU_00026 PAU_00027     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6849822 6849823 PAU_00028 PAU_00029   Sc/SvP TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6849823 6849824 PAU_00029 PAU_00030 Sc/SvP rpmJ FALSE 0.033 377.000 0.000 NA   NA
 6849824 6849825 PAU_00030 PAU_00031 rpmJ rpmE2 TRUE 0.956 18.000 0.000 0.015   NA
 6849827 6849828 PAU_00033 PAU_00034 glmS glmU TRUE 0.699 110.000 0.055 1.000 Y NA
 6849828 6849829 PAU_00034 PAU_00035 glmU atpC FALSE 0.241 131.000 0.067 1.000 N NA
 6849829 6849830 PAU_00035 PAU_00036 atpC atpD TRUE 0.999 22.000 0.837 0.004 Y NA
 6849830 6849831 PAU_00036 PAU_00037 atpD atpG TRUE 0.998 35.000 0.724 0.004 Y NA
 6849831 6849832 PAU_00037 PAU_00038 atpG atpA TRUE 0.994 59.000 0.846 0.004 Y NA
 6849832 6849833 PAU_00038 PAU_00039 atpA atpH TRUE 0.999 15.000 0.864 0.004 Y NA
 6849833 6849834 PAU_00039 PAU_00040 atpH atpF TRUE 0.997 13.000 0.242 0.004 Y NA
 6849834 6849835 PAU_00040 PAU_00041 atpF atpE TRUE 0.992 57.000 0.666 0.004 Y NA
 6849835 6849836 PAU_00041 PAU_00042 atpE atpB TRUE 0.992 49.000 0.557 0.004 Y NA
 6849836 6849837 PAU_00042 PAU_00043 atpB atpI TRUE 0.990 31.000 0.291 1.000 Y NA
 6849837 6849838 PAU_00043 PAU_00044 atpI gidB FALSE 0.003 610.000 0.005 1.000 N NA
 6849838 6849839 PAU_00044 PAU_00045 gidB gidA TRUE 0.985 -7.000 0.466 1.000 N NA
 6849839 6849840 PAU_00045 PAU_00046 gidA mioC FALSE 0.016 379.000 0.000 1.000 N NA
 6849840 6849841 PAU_00046 PAU_00047 mioC asnC TRUE 0.655 71.000 0.165 1.000 N NA
 6849843 6849844 PAU_00049 PAU_00050 viaA ravA TRUE 0.995 5.000 0.443 NA   NA
 6849845 6849846 PAU_00051 PAU_00052 rbsD rbsA TRUE 0.997 8.000 0.337 1.000 Y NA
 6849846 6849847 PAU_00052 PAU_00053 rbsA rbsC TRUE 0.999 7.000 0.504 0.001 Y NA
 6849847 6849848 PAU_00053 PAU_00054 rbsC rbsB TRUE 0.998 25.000 0.847 NA Y NA
 6849848 6849849 PAU_00054 PAU_00055 rbsB rbsK TRUE 0.827 172.000 0.347 NA Y NA
 6849849 6849850 PAU_00055 PAU_00056 rbsK rbsR TRUE 0.994 3.000 0.500 1.000 N NA
 6849851 6849852 PAU_00057 PAU_00058 yieO   FALSE 0.181 171.000 0.000 NA   NA
 6849853 6849854 PAU_00407n PAU_t001 16S_rRNA   FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6849854 6849855 PAU_t001 PAU_00407g   23S_rRNA FALSE 0.008 833.000 0.000 NA   NA
 6849855 6849856 PAU_00407g PAU_r001 23S_rRNA   FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6849857 6849858 PAU_00059 PAU_00060 yhbX actP FALSE 0.252 149.000 0.000 1.000   NA
 6849858 10702227 PAU_00060 PAU_00060a actP   TRUE 0.768 -53.000 0.000 NA   NA
 10702227 6849859 PAU_00060a PAU_00061   yjcH TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6849859 6849860 PAU_00061 PAU_00062 yjcH acs TRUE 0.756 66.000 0.147 NA   NA
 6849861 6849862 PAU_00063 PAU_00064 sodA yiiM TRUE 0.567 118.000 0.129 1.000   NA
 6849863 6849864 PAU_00065 PAU_00066 orf2 trpS FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6849864 6849865 PAU_00066 PAU_00067 trpS gph TRUE 0.977 5.000 0.118 1.000   NA
 6849865 6849866 PAU_00067 PAU_00068 gph rpe TRUE 0.936 -10.000 0.120 1.000   NA
 6849866 6849867 PAU_00068 PAU_00069 rpe dam TRUE 0.473 51.000 0.040 1.000 N NA
 6849867 6849868 PAU_00069 PAU_00070 dam damX TRUE 0.790 85.000 0.234 NA   NA
 6849868 6849869 PAU_00070 PAU_00071 damX aroB FALSE 0.267 122.000 0.022 NA   NA
 6849869 6849870 PAU_00071 PAU_00072 aroB aroK TRUE 0.966 47.000 0.208 1.000 Y NA
 6849870 6849871 PAU_00072 PAU_00073 aroK hofQ FALSE 0.219 370.000 0.319 1.000   NA
 6849871 6849872 PAU_00073 PAU_00074 hofQ   TRUE 0.836 -7.000 0.009 NA   NA
 6849872 6849873 PAU_00074 PAU_00075   yrfC TRUE 0.947 -13.000 0.174 NA   NA
 6849873 6849874 PAU_00075 PAU_00076 yrfC yrfD TRUE 0.998 -3.000 0.870 NA   NA
 6849877 6849878 PAU_00079 PAU_00080 yrfF yrfF TRUE 0.979 0.000 0.080 0.020   NA
 6849878 6849879 PAU_00080 PAU_00081 yrfF hslR TRUE 0.525 57.000 0.010 1.000   NA
 6849879 6849880 PAU_00081 PAU_00082 hslR hslO TRUE 0.920 27.000 0.140 1.000 N NA
 6849880 6849881 PAU_00082 PAU_00083 hslO pckA FALSE 0.064 216.000 0.048 1.000 N NA
 6849882 6849883 PAU_00084 PAU_00085 yhhW yhhW TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6849883 6849884 PAU_00085 PAU_s001 yhhW   FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6849885 6849886 PAU_00086 PAU_00087     TRUE 0.996 0.000 0.206 1.000 Y NA
 6849886 6849887 PAU_00087 PAU_00088     TRUE 0.755 101.000 0.235 NA   NA
 6849887 6849888 PAU_00088 PAU_00089     FALSE 0.009 773.000 0.000 NA   NA
 6849888 6849889 PAU_00089 PAU_00090     TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6849889 6849890 PAU_00090 PAU_00091   pulA FALSE 0.343 111.000 0.000 NA   NA
 6849890 6849891 PAU_00091 PAU_00092 pulA cynS FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 6849892 6849893 PAU_00093 PAU_00094     TRUE 0.971 27.000 0.312 1.000 N NA
 6849894 6849895 PAU_00095 PAU_00096     TRUE 0.812 -18.000 0.000 NA   NA
 6849895 6849896 PAU_00096 PAU_00097     FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6849901 6849902 PAU_00102 PAU_00103     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849903 6849904 PAU_00104 PAU_00105   uspA FALSE 0.008 813.000 0.000 NA   NA
 6849904 6849905 PAU_00105 PAU_00106 uspA gdhA FALSE 0.035 258.000 0.000 1.000 N NA
 6849906 6849907 PAU_00107 PAU_00108 yhiQ opdA TRUE 0.972 6.000 0.098 NA   NA
 6849908 6849909 PAU_t002 PAU_00109     FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6849909 6849910 PAU_00109 PAU_00110   cipB FALSE 0.007 928.000 0.000 NA   NA
 6849910 6849911 PAU_00110 PAU_00111 cipB   FALSE 0.012 642.000 0.000 NA   NA
 6849911 6849912 PAU_00111 PAU_00112     TRUE 0.895 9.000 0.000 1.000 N NA
 6849912 6849913 PAU_00112 PAU_00113     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6849913 6849914 PAU_00113 PAU_00114     FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6849914 6849915 PAU_00114 PAU_00115     FALSE 0.114 216.000 0.000 1.000   NA
 6849915 6849916 PAU_00115 PAU_00116     TRUE 0.401 221.000 0.000 0.003 Y NA
 6849916 6849917 PAU_00116 PAU_00117     FALSE 0.266 290.000 0.000 0.003 Y NA
 6849917 6849918 PAU_00117 PAU_00118     TRUE 0.678 140.000 0.000 0.003 Y NA
 6849918 6849919 PAU_00118 PAU_00119     FALSE 0.008 519.000 0.000 1.000 N NA
 6849920 6849921 PAU_00120 PAU_00121 uxuA uxuR FALSE 0.276 90.000 0.047 1.000 N NA
 6849921 6849922 PAU_00121 PAU_00122 uxuR   TRUE 0.677 81.000 0.200 1.000 N NA
 6849923 6849924 PAU_00123 PAU_00124   ygiK TRUE 0.996 28.000 0.588 NA Y NA
 6849924 6849925 PAU_00124 PAU_00125 ygiK uxuB TRUE 0.992 39.000 0.471 1.000 Y NA
 6849925 6849926 PAU_00125 PAU_00126 uxuB uxaC TRUE 0.998 22.000 0.647 1.000 Y NA
 6849926 6849927 PAU_00126 PAU_00127 uxaC kdgK TRUE 0.993 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 6849927 6849928 PAU_00127 PAU_00128 kdgK eda TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6849928 6849929 PAU_00128 PAU_00129 eda   FALSE 0.320 121.000 0.000 NA   NA
 6849932 6849933 PAU_00132 PAU_00133   glpD FALSE 0.042 332.000 0.000 NA   NA
 6849933 6849934 PAU_00133 PAU_00134 glpD glpR FALSE 0.045 356.000 0.104 1.000 N NA
 6849934 6849935 PAU_00134 PAU_00135 glpR glpG TRUE 0.982 17.000 0.190 1.000   NA
 6849935 6849936 PAU_00135 PAU_00136 glpG glpE TRUE 0.875 95.000 0.405 1.000   NA
 6849936 6849937 PAU_00136 PAU_00137 glpE gntY FALSE 0.364 96.000 0.025 1.000   NA
 6849937 6849938 PAU_00137 PAU_00138 gntY gntX TRUE 0.670 60.000 0.066 1.000   NA
 6849938 6849939 PAU_00138 PAU_00139 gntX OSJNAa0079B05.15 TRUE 0.789 -25.000 0.000 NA   NA
 6849941 6849942 PAU_00141 PAU_00142 spnH   TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6849942 6849943 PAU_00142 PAU_00143     TRUE 0.879 11.000 0.000 NA N NA
 6849943 6849944 PAU_00143 PAU_00144     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6849944 6849945 PAU_00144 PAU_00145     FALSE 0.375 99.000 0.000 NA   NA
 6849948 6849949 PAU_00148 PAU_00149 bioH   FALSE 0.015 598.000 0.000 1.000   NA
 6849950 6849951 PAU_00150 PAU_00151 yhgG feoB TRUE 0.995 10.000 0.455 NA   NA
 6849951 6849952 PAU_00151 PAU_00152 feoB feoA TRUE 0.926 63.000 0.177 1.000 Y NA
 6849952 6849953 PAU_00152 PAU_00153 feoA yhgF FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000 N NA
 6849953 6849954 PAU_00153 PAU_00154 yhgF   FALSE 0.063 276.000 0.000 NA   NA
 6849954 6849955 PAU_00154 PAU_00155   greB TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6849955 6849956 PAU_00155 PAU_00156 greB   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6849957 6849958 PAU_00157 PAU_00158   iscS TRUE 0.647 46.000 0.019 NA   NA
 6849958 6849959 PAU_00158 PAU_00159 iscS   TRUE 0.873 23.000 0.019 NA   NA
 6849959 6849960 PAU_00159 PAU_00160   ompR FALSE 0.006 1356.000 0.000 NA   NA
 6849960 6849961 PAU_00160 PAU_00161 ompR envZ TRUE 0.998 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 6849961 6849962 PAU_00161 PAU_00162 envZ pstS TRUE 0.836 13.000 0.022 1.000 N NA
 6849962 6849963 PAU_00162 PAU_00163 pstS pstC TRUE 0.628 209.000 0.145 0.002 Y NA
 6849963 6849964 PAU_00163 PAU_00164 pstC pstA TRUE 0.999 2.000 0.537 0.002 Y NA
 6849964 6849965 PAU_00164 PAU_00165 pstA pstB TRUE 0.997 27.000 0.526 0.002 Y NA
 6849965 6849966 PAU_00165 PAU_00166 pstB phoU TRUE 0.996 -3.000 0.317 NA Y NA
 6849966 6849967 PAU_00166 PAU_00167 phoU fliY FALSE 0.018 253.000 0.014 NA N NA
 6849967 6849968 PAU_00167 PAU_00168 fliY   TRUE 0.954 69.000 0.263 0.051 Y NA
 6849968 6849969 PAU_00168 PAU_00169     TRUE 0.998 2.000 0.282 0.020 Y NA
 6849969 6849970 PAU_00169 PAU_00170   yieG FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6849970 6849971 PAU_00170 PAU_00171 yieG   TRUE 0.438 78.000 0.000 NA   NA
 6849971 6849972 PAU_00171 PAU_00172   insK TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6849974 6849975 PAU_00174 PAU_00175 yihI hemN FALSE 0.248 194.000 0.107 NA   NA
 6849976 6849977 PAU_00176 PAU_00177   glnG FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6849977 6849978 PAU_00177 PAU_00178 glnG glnL TRUE 0.999 4.000 0.587 0.071 Y NA
 6849978 6849979 PAU_00178 PAU_00179 glnL glnA FALSE 0.144 158.000 0.053 1.000 N NA
 6849981 6849982 PAU_00181 PAU_00182     FALSE 0.006 889.000 0.000 0.092 N NA
 6849983 6849984 PAU_00183 PAU_00184 yihX dtd TRUE 0.456 65.000 0.010 1.000   NA
 6849984 6849985 PAU_00184 PAU_00185 dtd yiiD TRUE 0.566 72.000 0.065 1.000   NA
 6849985 6849986 PAU_00185 PAU_00186 yiiD dinJ2 FALSE 0.076 260.000 0.000 1.000   NA
 6849986 6849987 PAU_00186 PAU_00187 dinJ2 ef0033 TRUE 0.996 4.000 0.500 NA   NA
 6849991 6849992 PAU_00191 PAU_00192 gltS   FALSE 0.056 302.000 0.000 1.000   NA
 6849992 6849993 PAU_00192 PAU_00193   relB FALSE 0.181 171.000 0.000 NA   NA
 6849993 6849994 PAU_00193 PAU_00194 relB relE TRUE 0.979 -10.000 0.444 NA N NA
 6849995 6849996 PAU_00195 PAU_00196   recG FALSE 0.007 962.000 0.000 NA   NA
 6849997 6849998 PAU_00197 PAU_00198 fimB   FALSE 0.027 430.000 0.000 1.000   NA
 6849998 6849999 PAU_00198 PAU_00199   aufB TRUE 0.821 127.000 0.400 1.000   NA
 6849999 6850000 PAU_00199 PAU_00200 aufB   TRUE 0.811 38.000 0.000 1.000   NA
 6850000 6850001 PAU_00200 PAU_00201   papA TRUE 0.709 62.000 0.000 0.006   NA
 6850001 6850002 PAU_00201 PAU_00202 papA   TRUE 0.686 136.000 0.000 0.006 Y NA
 6850002 6850003 PAU_00202 PAU_00203   afaB TRUE 0.752 77.000 0.000 1.000 Y NA
 6850003 6850004 PAU_00203 PAU_00204 afaB agg3D TRUE 0.974 29.000 0.000 0.003 Y NA
 6850004 6850005 PAU_00204 PAU_00205 agg3D lpfC TRUE 0.653 117.000 0.000 1.000 Y NA
 6850005 6850006 PAU_00205 PAU_00206 lpfC   FALSE 0.239 148.000 0.000 NA   NA
 6850006 6850007 PAU_00206 PAU_00207   yheC FALSE 0.293 130.000 0.000 NA   NA
 6850007 6850008 PAU_00207 PAU_00208 yheC   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850009 6850010 PAU_00209 PAU_00210 spoT rpoZ TRUE 0.995 18.000 0.291 1.000 Y NA
 6850010 6850011 PAU_00210 PAU_00211 rpoZ gmk TRUE 0.934 55.000 0.471 1.000 N NA
 6850013 6850014 PAU_00213 PAU_00214     FALSE 0.007 907.000 0.000 NA   NA
 6850014 6850015 PAU_00214 PAU_00215     FALSE 0.008 871.000 0.000 NA   NA
 6850015 6850016 PAU_00215 PAU_00216     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 6850016 6850017 PAU_00216 PAU_00217     FALSE 0.012 644.000 0.000 NA   NA
 6850017 6850018 PAU_00217 PAU_00218   s045 FALSE 0.144 191.000 0.000 NA   NA
 6850018 6850019 PAU_00218 PAU_00219 s045   FALSE 0.022 454.000 0.000 NA   NA
 6850019 6850020 PAU_00219 PAU_00220     TRUE 0.950 0.000 0.043 NA   NA
 6850024 6850025 PAU_00224 PAU_00225 yidQ avtA FALSE 0.010 696.000 0.000 NA   NA
 6850025 6850026 PAU_00225 PAU_00226 avtA tag FALSE 0.004 810.000 0.000 1.000 N NA
 6850027 6850028 PAU_00227 PAU_00228 glyQ glyS TRUE 0.999 10.000 0.651 0.001 Y NA
 6850028 6850029 PAU_00228 PAU_t003 glyS   FALSE 0.152 187.000 0.000 NA   NA
 6850031 6850032 PAU_00230 PAU_00231 FNV1263 dppA FALSE 0.365 102.000 0.000 NA   NA
 6850032 6850033 PAU_00231 PAU_00232 dppA dppB TRUE 0.475 217.000 0.087 0.034 Y NA
 6850033 6850034 PAU_00232 PAU_00233 dppB dppC TRUE 0.999 12.000 0.779 0.034 Y NA
 6850034 6850035 PAU_00233 PAU_00234 dppC dppD TRUE 0.999 13.000 0.560 1.000 Y NA
 6850035 6850036 PAU_00234 PAU_00235 dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 6850036 6850037 PAU_00235 PAU_00236 dppF yhjK FALSE 0.101 229.000 0.000 1.000   NA
 6850037 6850038 PAU_00236 PAU_00237 yhjK yhjJ FALSE 0.372 143.000 0.083 1.000   NA
 6850038 6850039 PAU_00237 PAU_00238 yhjJ   FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6850040 6850041 PAU_00239 PAU_00240 ybjE   TRUE 0.934 0.000 0.021 NA   NA
 6850041 6850042 PAU_00240 PAU_00241     FALSE 0.027 413.000 0.000 NA   NA
 6850042 6850043 PAU_00241 PAU_00242     TRUE 0.640 56.000 0.043 1.000   NA
 6850044 6850045 PAU_00243 PAU_00244     TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6850046 10702228 PAU_00245 PAU_00245b hylA   TRUE 0.756 -89.000 0.000 NA   NA
 10702228 6850047 PAU_00245b PAU_00246   phlB TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6850047 6850048 PAU_00246 PAU_00247 phlB   FALSE 0.010 699.000 0.000 NA   NA
 6850048 6850049 PAU_00247 PAU_00248     FALSE 0.009 755.000 0.000 NA   NA
 6850049 6850050 PAU_00248 PAU_00249     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850050 6850051 PAU_00249 PAU_00250     FALSE 0.011 668.000 0.000 NA   NA
 6850051 6850052 PAU_00250 PAU_00251     TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850053 6850054 PAU_00252 PAU_00253 sdiA1   TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6850057 6850058 PAU_00256 PAU_00257     TRUE 0.904 112.000 0.600 NA   NA
 6850058 6850059 PAU_00257 PAU_00258     FALSE 0.368 101.000 0.000 NA   NA
 6850059 6850060 PAU_00258 PAU_00259     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 6850060 6850061 PAU_00259 PAU_00260     TRUE 0.996 14.000 0.600 NA   NA
 6850061 6850062 PAU_00260 PAU_00261     TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6850062 6850063 PAU_00261 PAU_00262     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850063 6850064 PAU_00262 PAU_00263     FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6850064 6850065 PAU_00263 PAU_00264     FALSE 0.053 296.000 0.000 NA   NA
 6850067 6850068 PAU_00266 PAU_00267     FALSE 0.050 308.000 0.000 NA   NA
 6850068 6850069 PAU_00267 PAU_00268     FALSE 0.035 362.000 0.000 NA   NA
 6850069 6850070 PAU_00268 PAU_00269     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 6850070 6850071 PAU_00269 PAU_00270     FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6850071 6850072 PAU_00270 PAU_00271     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA   NA
 6850072 6850073 PAU_00271 PAU_00272     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850073 6850074 PAU_00272 PAU_00273     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850074 6850075 PAU_00273 PAU_00274     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850075 6850076 PAU_00274 PAU_00275     TRUE 0.927 53.000 0.312 NA   NA
 6850076 6850077 PAU_00275 PAU_00276     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6850077 6850078 PAU_00276 PAU_00277     TRUE 0.918 123.000 0.711 NA   NA
 6850078 6850079 PAU_00277 PAU_00278     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850079 6850080 PAU_00278 PAU_00279     TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850080 6850081 PAU_00279 PAU_00280     TRUE 0.995 11.000 0.471 NA   NA
 6850081 6850082 PAU_00280 PAU_00281     TRUE 0.998 0.000 0.673 NA   NA
 6850082 6850083 PAU_00281 PAU_00282     TRUE 0.998 3.000 0.765 NA   NA
 6850083 6850084 PAU_00282 PAU_00283     TRUE 0.998 0.000 0.862 NA   NA
 6850084 6850085 PAU_00283 PAU_00284     TRUE 0.996 7.000 0.510 NA   NA
 6850085 6850086 PAU_00284 PAU_00285     TRUE 0.993 36.000 0.863 NA   NA
 6850086 6850087 PAU_00285 PAU_00286     TRUE 0.997 3.000 0.552 NA   NA
 6850087 6850088 PAU_00286 PAU_00287     TRUE 0.997 7.000 0.627 NA   NA
 6850088 6850089 PAU_00287 PAU_00288     TRUE 0.996 24.000 0.821 NA   NA
 6850090 6850091 PAU_00289 PAU_00290     FALSE 0.012 663.000 0.000 NA   NA
 6850091 6850092 PAU_00290 PAU_00291   gor TRUE 0.573 96.000 0.100 1.000   NA
 6850092 6850093 PAU_00291 PAU_00292 gor   FALSE 0.194 166.000 0.000 NA   NA
 6850093 6850094 PAU_00292 PAU_00293     FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6850094 6850095 PAU_00293 PAU_00294     FALSE 0.027 416.000 0.000 NA   NA
 6850096 6850097 PAU_00295 PAU_00296 mobB mobA TRUE 0.991 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 6850098 6850099 PAU_00297 PAU_00298 rdoA dsbA TRUE 0.974 9.000 0.111 NA   NA
 6850099 6850100 PAU_00298 PAU_00299 dsbA polA FALSE 0.036 378.000 0.000 1.000   NA
 6850106 6850107 PAU_00304 PAU_00305 pabA argD TRUE 0.725 122.000 0.088 1.000 Y NA
 6850110 6850111 PAU_00308 PAU_00309 prkB yheU TRUE 0.986 21.000 0.303 NA   NA
 6850111 6850112 PAU_00309 PAU_00310 yheU yheT TRUE 0.986 -3.000 0.222 NA   NA
 6850113 6850114 PAU_00311 PAU_00312     FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 6850114 6850115 PAU_00312 PAU_00313   tauD TRUE 0.394 94.000 0.000 NA   NA
 6850116 6850117 PAU_00314 PAU_00315   yfeU TRUE 0.910 31.000 0.087 1.000   NA
 6850117 6850118 PAU_00315 PAU_00316 yfeU   TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6850121 6850122 PAU_00319 PAU_00320     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850122 6850123 PAU_00320 PAU_00321     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6850123 6850124 PAU_00321 PAU_00322     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6850124 6850125 PAU_00322 PAU_00323     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6850125 6850126 PAU_00323 PAU_00324     TRUE 0.946 6.000 0.000 NA   NA
 6850126 6850127 PAU_00324 PAU_00325     FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6850129 6850130 PAU_00327 PAU_00328 kefG kefB TRUE 0.998 4.000 0.927 1.000   NA
 6850130 6850131 PAU_00328 PAU_00329 kefB yheV TRUE 0.994 12.000 0.400 NA   NA
 6850131 6850132 PAU_00329 PAU_00330 yheV slyD TRUE 0.910 65.000 0.370 NA   NA
 6850132 6850133 PAU_00330 PAU_00331 slyD   FALSE 0.107 215.000 0.000 NA   NA
 6850133 6850134 PAU_00331 PAU_00332     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 6850134 6850135 PAU_00332 PAU_00333   fkpA FALSE 0.007 936.000 0.000 NA   NA
 6850137 6850138 PAU_00335 PAU_00336 yheO tusD TRUE 0.989 0.000 0.220 NA   NA
 6850138 6850139 PAU_00336 PAU_00337 tusD tusC TRUE 0.999 10.000 0.790 NA Y NA
 6850139 6850140 PAU_00337 PAU_00338 tusC tusB TRUE 0.999 21.000 0.804 NA Y NA
 6850140 6850141 PAU_00338 PAU_00339 tusB rpsL TRUE 0.848 23.000 0.058 NA N NA
 6850141 6850142 PAU_00339 PAU_00340 rpsL rpsG TRUE 0.979 97.000 0.620 0.003 Y NA
 6850142 6850143 PAU_00340 PAU_00341 rpsG fusA TRUE 0.971 81.000 0.579 1.000 Y NA
 6850143 6850144 PAU_00341 PAU_00342 fusA tufA TRUE 0.821 71.000 0.003 0.001 Y NA
 6850144 6850145 PAU_00342 PAU_00343 tufA   TRUE 0.965 83.000 1.000 NA   NA
 6850145 6850146 PAU_00343 PAU_00344   secE TRUE 0.856 22.000 0.002 NA   NA
 6850146 6850147 PAU_00344 PAU_00345 secE nusG TRUE 0.998 1.000 0.843 1.000 N NA
 6850147 6850148 PAU_00345 PAU_00346 nusG rplK TRUE 0.825 155.000 0.681 1.000 N NA
 6850148 6850149 PAU_00346 PAU_00347 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.019 Y NA
 6850149 6850150 PAU_00347 PAU_00348 rplA rplJ TRUE 0.491 310.000 0.302 1.000 Y NA
 6850150 6850151 PAU_00348 PAU_00349 rplJ rplL TRUE 0.990 64.000 0.884 1.000 Y NA
 6850151 6850152 PAU_00349 PAU_00350 rplL rpoB FALSE 0.181 339.000 0.223 1.000   NA
 6850152 6850153 PAU_00350 PAU_00351 rpoB rpoC TRUE 0.988 56.000 0.851 0.001   NA
 6850153 6850154 PAU_00351 PAU_00352 rpoC   FALSE 0.012 682.000 0.000 1.000   NA
 6850154 6850155 PAU_00352 PAU_00353     TRUE 0.394 135.000 0.000 0.038   NA
 6850155 6850156 PAU_00353 PAU_00354   chpR FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 6850156 6850157 PAU_00354 PAU_00355 chpR   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850157 6850158 PAU_00355 PAU_00356     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850158 6850159 PAU_00356 PAU_00357     FALSE 0.036 359.000 0.000 NA   NA
 6850159 6850160 PAU_00357 PAU_00358   CWF19L1 TRUE 0.943 12.000 0.000 NA   NA
 6850160 6850161 PAU_00358 PAU_00359 CWF19L1 CsdB2 TRUE 0.824 -18.000 0.000 1.000   NA
 6850161 6850162 PAU_00359 PAU_00360 CsdB2   FALSE 0.065 282.000 0.000 1.000   NA
 6850162 6850163 PAU_00360 PAU_00361     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850163 6850164 PAU_00361 PAU_00362     TRUE 0.401 91.000 0.000 NA   NA
 6850164 6850165 PAU_00362 PAU_00363   rfaB TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6850166 6850167 PAU_00364 PAU_00365 malM lamB TRUE 0.393 121.000 0.057 1.000   NA
 6850167 6850168 PAU_00365 PAU_00366 lamB malK TRUE 0.958 37.000 0.044 0.049 Y NA
 6850169 6850170 PAU_00367 PAU_00368 malE malF TRUE 0.624 127.000 0.040 1.000 Y NA
 6850170 6850171 PAU_00368 PAU_00369 malF malG TRUE 0.999 13.000 0.814 0.033 Y NA
 6850174 6850175 PAU_00372 PAU_00373     FALSE 0.173 174.000 0.000 NA   NA
 6850175 6850176 PAU_00373 PAU_00374     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850176 6850177 PAU_00374 PAU_00375     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6850177 6850178 PAU_00375 PAU_00376   malQ FALSE 0.007 956.000 0.000 NA   NA
 6850178 6850179 PAU_00376 PAU_00377 malQ malP TRUE 0.990 10.000 0.039 0.015 Y NA
 6850179 6850180 PAU_00377 PAU_00378 malP   FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6850183 6850184 PAU_00381 PAU_00382 gabT   TRUE 0.996 0.000 0.227 1.000 Y NA
 6850184 6850185 PAU_00382 PAU_00383   gph TRUE 0.983 14.000 0.182 1.000   NA
 6850185 6850186 PAU_00383 PAU_00384 gph   TRUE 0.929 61.000 0.400 NA   NA
 6850186 6850187 PAU_00384 PAU_00385     TRUE 0.927 15.000 0.033 NA   NA
 6850188 6850189 PAU_00386 PAU_00387 hmu   FALSE 0.050 308.000 0.000 NA   NA
 6850189 6850190 PAU_00387 PAU_00388     FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 6850190 6850191 PAU_00388 PAU_00389   thiH FALSE 0.011 695.000 0.000 NA   NA
 6850191 6850192 PAU_00389 PAU_00390 thiH thiG TRUE 0.997 15.000 0.277 0.004 Y NA
 6850192 6850193 PAU_00390 PAU_00391 thiG thiS TRUE 0.991 2.000 0.087 1.000 Y NA
 6850193 6850194 PAU_00391 PAU_00392 thiS thiF TRUE 0.998 -3.000 0.548 1.000 Y NA
 6850194 6850195 PAU_00392 PAU_00393 thiF thiE TRUE 0.989 -10.000 0.242 1.000 Y NA
 6850195 6850196 PAU_00393 PAU_00394 thiE thiC TRUE 0.971 -16.000 0.063 0.004 Y NA
 6850196 6850197 PAU_00394 PAU_s003 thiC   FALSE 0.347 109.000 0.000 NA   NA
 6850198 6850199 PAU_00395 PAU_00396     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850199 6850200 PAU_00396 PAU_00397   PFI0330c TRUE 0.793 -24.000 0.000 NA   NA
 6850202 6850203 PAU_00399 PAU_00400 nudC hemE FALSE 0.229 98.000 0.040 1.000 N NA
 6850203 6850204 PAU_00400 PAU_00401 hemE nfi TRUE 0.870 6.000 0.028 1.000 N NA
 6850204 6850205 PAU_00401 PAU_00402 nfi yjaG TRUE 0.572 77.000 0.086 NA   NA
 6850205 6850206 PAU_00402 PAU_00403 yjaG dbhA TRUE 0.614 187.000 0.355 NA   NA
 6850206 6850207 PAU_00403 PAU_00404 dbhA yjaH TRUE 0.994 6.000 0.375 NA   NA
 6850208 6850209 PAU_00405 PAU_00406 purD purH TRUE 0.993 22.000 0.238 1.000 Y NA
 6850210 6850211 PAU_00407 PAU_00407a pdxY 16S_rRNA FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 6850211 6850212 PAU_00407a PAU_t004 16S_rRNA   FALSE 0.288 131.000 0.000 NA   NA
 6850212 6850213 PAU_t004 PAU_00407h   23S_rRNA FALSE 0.008 833.000 0.000 NA   NA
 6850213 6850214 PAU_00407h PAU_r002 23S_rRNA   FALSE 0.271 136.000 0.000 NA   NA
 6850217 6850218 PAU_00410 PAU_00411     FALSE 0.168 178.000 0.000 NA   NA
 6850218 6850219 PAU_00411 PAU_00412     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850219 6850220 PAU_00412 PAU_00413     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6850220 6850221 PAU_00413 PAU_00414     FALSE 0.033 377.000 0.000 NA   NA
 6850221 6850222 PAU_00414 PAU_00415     FALSE 0.100 220.000 0.000 NA   NA
 6850223 6850224 PAU_00416 PAU_00417 aceB aceA TRUE 0.890 64.000 0.118 1.000 Y NA
 6850224 6850225 PAU_00417 PAU_00418 aceA aceK TRUE 0.903 65.000 0.455 1.000 N NA
 6850225 6850226 PAU_00418 PAU_00419 aceK   FALSE 0.045 324.000 0.000 NA   NA
 6850228 6850229 PAU_00421 PAU_00422     FALSE 0.008 878.000 0.000 NA   NA
 6850229 6850230 PAU_00422 PAU_00423     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850230 6850231 PAU_00423 PAU_00424     TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6850231 6850232 PAU_00424 PAU_00425     TRUE 0.938 15.000 0.000 1.000   NA
 6850232 6850233 PAU_00425 PAU_00426     FALSE 0.245 90.000 0.040 1.000 N NA
 6850233 6850234 PAU_00426 PAU_00427     TRUE 0.902 -16.000 0.105 NA   NA
 6850234 6850235 PAU_00427 PAU_00428   orf24 FALSE 0.017 526.000 0.000 NA   NA
 6850235 6850236 PAU_00428 PAU_00429 orf24 orf23 TRUE 0.997 -3.000 0.740 NA   NA
 6850236 6850237 PAU_00429 PAU_00430 orf23 orf22 TRUE 0.998 9.000 0.779 NA   NA
 6850237 6850238 PAU_00430 PAU_00431 orf22   TRUE 0.975 42.000 0.477 NA   NA
 6850238 6850239 PAU_00431 PAU_00432   orf19 TRUE 0.992 0.000 0.310 NA   NA
 6850241 6850242 PAU_00434 PAU_00435   hipB FALSE 0.102 228.000 0.000 1.000   NA
 6850242 6850243 PAU_00435 PAU_00436 hipB hipA TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6850244 6850245 PAU_00437 PAU_00438     TRUE 0.982 5.000 0.154 NA   NA
 6850245 6850246 PAU_00438 PAU_00439     FALSE 0.012 659.000 0.000 NA   NA
 6850246 6850247 PAU_00439 PAU_00440     FALSE 0.050 306.000 0.000 NA   NA
 6850247 6850248 PAU_00440 PAU_00441     TRUE 0.788 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6850248 6850249 PAU_00441 PAU_00442     TRUE 0.988 6.000 0.206 1.000   NA
 6850249 6850250 PAU_00442 PAU_00443     TRUE 0.986 12.000 0.189 1.000   NA
 6850251 6850252 PAU_00444 PAU_00445     TRUE 0.912 21.000 0.000 NA   NA
 6850252 6850253 PAU_00445 PAU_00446     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850253 6850254 PAU_00446 PAU_00447   hecA1 TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6850254 6850255 PAU_00447 PAU_00448 hecA1   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850255 6850256 PAU_00448 PAU_00449     FALSE 0.249 144.000 0.000 NA   NA
 6850256 6850257 PAU_00449 PAU_00450     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850257 6850258 PAU_00450 PAU_00451   hecA2 FALSE 0.219 155.000 0.000 NA   NA
 6850258 6850259 PAU_00451 PAU_00452 hecA2   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850259 6850260 PAU_00452 PAU_00453   bacA FALSE 0.006 1372.000 0.000 NA   NA
 6850260 6850261 PAU_00453 PAU_00454 bacA   TRUE 0.872 183.000 0.500 1.000 Y NA
 6850261 6850262 PAU_00454 PAU_00455   tycC TRUE 0.736 84.000 0.000 1.000 Y NA
 6850262 6850263 PAU_00455 PAU_00456 tycC def1 FALSE 0.333 98.000 0.071 1.000 N NA
 6850263 6850264 PAU_00456 PAU_00457 def1 yjhP FALSE 0.051 220.000 0.000 1.000 N NA
 6850264 6850265 PAU_00457 PAU_00458 yjhP   FALSE 0.033 269.000 0.000 1.000 N NA
 6850267 6850268 PAU_00460 PAU_00461   pks2A FALSE 0.089 243.000 0.000 1.000   NA
 6850268 6850269 PAU_00461 PAU_00462 pks2A   FALSE 0.256 140.000 0.000 NA   NA
 6850269 6850270 PAU_00462 PAU_00463     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6850274 6850275 PAU_00467 PAU_00468   ordL FALSE 0.231 97.000 0.000 1.000 N NA
 6850275 6850276 PAU_00468 PAU_00469 ordL   TRUE 0.579 190.000 0.333 NA   NA
 6850276 6850277 PAU_00469 PAU_00470   feaB TRUE 0.952 29.000 0.167 NA   NA
 6850277 6850278 PAU_00470 PAU_00471 feaB   FALSE 0.018 507.000 0.000 NA   NA
 6850278 6850279 PAU_00471 PAU_00472   api89 TRUE 0.396 93.000 0.000 NA   NA
 6850279 6850280 PAU_00472 PAU_00473 api89   TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6850280 6850281 PAU_00473 PAU_00474     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850283 6850284 PAU_00476 PAU_00477     TRUE 0.998 17.000 0.864 NA   NA
 6850284 6850285 PAU_00477 PAU_00478     FALSE 0.015 563.000 0.000 NA   NA
 6850285 6850286 PAU_00478 PAU_00479   fes FALSE 0.027 280.000 0.000 NA N NA
 6850286 6850287 PAU_00479 PAU_00480 fes phoA TRUE 0.618 106.000 0.013 NA Y NA
 6850287 6850288 PAU_00480 PAU_00481 phoA attM/aiiB FALSE 0.064 284.000 0.000 1.000   NA
 6850288 6850289 PAU_00481 PAU_00482 attM/aiiB   FALSE 0.010 737.000 0.000 1.000   NA
 6850289 6850290 PAU_00482 PAU_00483     FALSE 0.372 97.000 0.029 1.000   NA
 6850290 6850291 PAU_00483 PAU_00484     FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6850291 6850292 PAU_00484 PAU_00485     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6850293 6850294 PAU_t005 PAU_t006     TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6850294 6850295 PAU_t006 PAU_00487   rsmC FALSE 0.046 318.000 0.000 NA   NA
 6850296 6850297 PAU_00488 PAU_00489 holD rimI TRUE 0.899 -31.000 0.121 1.000   NA
 6850297 6850298 PAU_00489 PAU_00490 rimI prfC FALSE 0.256 135.000 0.026 1.000   NA
 6850298 6850299 PAU_00490 PAU_00491 prfC osmY FALSE 0.047 316.000 0.000 NA   NA
 6850299 6850300 PAU_00491 PAU_00492 osmY yjjU FALSE 0.213 182.000 0.067 NA   NA
 6850300 6850301 PAU_00492 PAU_00493 yjjU yjjV TRUE 0.957 5.000 0.057 NA   NA
 6850301 6850302 PAU_00493 PAU_00494 yjjV yeiM FALSE 0.018 290.000 0.027 NA N NA
 6850303 6850304 PAU_00495 PAU_00496     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850304 6850305 PAU_00496 PAU_00497     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850305 6850306 PAU_00497 PAU_00498     FALSE 0.138 194.000 0.000 NA   NA
 6850306 6850307 PAU_00498 PAU_00499     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850307 6850308 PAU_00499 PAU_00500     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850308 6850309 PAU_00500 PAU_00501     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850309 6850310 PAU_00501 PAU_00502     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850310 6850311 PAU_00502 PAU_00503     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850311 6850312 PAU_00503 PAU_00504     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850312 6850313 PAU_00504 PAU_00505     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6850313 6850314 PAU_00505 PAU_00506     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850314 6850315 PAU_00506 PAU_00507     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850315 6850316 PAU_00507 PAU_00508     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850316 6850317 PAU_00508 PAU_00509     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6850317 6850318 PAU_00509 PAU_00510     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850318 6850319 PAU_00510 PAU_00511     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850319 6850320 PAU_00511 PAU_00512     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850321 6850322 PAU_00513 PAU_00514 deoC deoA TRUE 0.936 74.000 0.286 1.000 Y NA
 6850322 6850323 PAU_00514 PAU_00515 deoA deoB TRUE 0.874 68.000 0.398 1.000 N NA
 6850323 6850324 PAU_00515 PAU_00516 deoB deoD TRUE 0.855 77.000 0.414 1.000 N NA
 6850325 6850326 PAU_00517 PAU_00518   mtcB TRUE 0.991 22.000 0.133 0.022 Y NA
 6850326 6850327 PAU_00518 PAU_00519 mtcB smp FALSE 0.006 1585.000 0.000 NA   NA
 6850328 6850329 PAU_00520 PAU_00521 serB radA TRUE 0.728 25.000 0.024 1.000 N NA
 6850329 6850330 PAU_00521 PAU_00522 radA nadR TRUE 0.833 13.000 0.021 1.000 N NA
 6850330 6850331 PAU_00522 PAU_00523 nadR   FALSE 0.005 669.000 0.000 1.000 N NA
 6850333 6850334 PAU_00525 PAU_00526   slt TRUE 0.486 70.000 0.000 NA   NA
 6850334 6850335 PAU_00526 PAU_00527 slt trpR TRUE 0.757 58.000 0.167 1.000 N NA
 6850341 6850342 PAU_s004 PAU_00533   thrA TRUE 0.824 -15.000 0.000 NA   NA
 6850342 6850343 PAU_00533 PAU_00534 thrA thrB TRUE 0.993 3.000 0.133 1.000 Y NA
 6850343 6850344 PAU_00534 PAU_00535 thrB thrC TRUE 0.996 4.000 0.233 1.000 Y NA
 6850346 6850347 PAU_00537 PAU_00538   tal FALSE 0.127 201.000 0.000 NA   NA
 6850347 6850348 PAU_00538 PAU_00539 tal mog FALSE 0.260 88.000 0.042 1.000 N NA
 6850348 6850349 PAU_00539 PAU_00540 mog galT FALSE 0.142 140.000 0.000 1.000 N NA
 6850349 6850350 PAU_00540 PAU_00541 galT galK TRUE 0.927 63.000 0.370 0.001 N NA
 6850352 6850353 PAU_00543 PAU_00544 dnaK dnaJ TRUE 0.922 109.000 0.236 0.003 Y NA
 6850354 6850355 PAU_00545 PAU_00546   bglB TRUE 0.876 14.000 0.000 1.000 N NA
 6850355 6850356 PAU_00546 PAU_00547 bglB bglF TRUE 0.822 63.000 0.000 1.000 Y NA
 6850357 6850358 PAU_00548 PAU_00549 bglG bglP TRUE 0.747 115.000 0.250 1.000   NA
 6850358 6850359 PAU_00549 PAU_00550 bglP   TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6850359 6850360 PAU_00550 PAU_00551   nhaA FALSE 0.054 294.000 0.000 NA   NA
 6850360 6850361 PAU_00551 PAU_00552 nhaA nhaR TRUE 0.488 175.000 0.292 1.000 N NA
 6850363 6850364 PAU_00554 PAU_00555 ribF ileS TRUE 0.968 25.000 0.254 1.000 N NA
 6850364 6850365 PAU_00555 PAU_00556 ileS lspA TRUE 0.908 0.000 0.045 1.000 N NA
 6850365 6850366 PAU_00556 PAU_00557 lspA   TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850366 6850367 PAU_00557 PAU_00558   fkpB TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850367 6850368 PAU_00558 PAU_00559 fkpB ispH TRUE 0.983 -19.000 0.626 1.000 N NA
 6850368 6850369 PAU_00559 PAU_00560 ispH dapB FALSE 0.105 115.000 0.009 1.000 N NA
 6850369 6850370 PAU_00560 PAU_00561 dapB carA FALSE 0.084 436.000 0.034 1.000 Y NA
 6850370 6850371 PAU_00561 PAU_00562 carA carB TRUE 0.998 16.000 0.345 0.001 Y NA
 6850374 6850375 PAU_00565 PAU_00566 apaH apaG TRUE 0.986 3.000 0.267 NA N NA
 6850375 6850376 PAU_00566 PAU_00567 apaG ksgA TRUE 0.926 13.000 0.078 NA N NA
 6850376 6850377 PAU_00567 PAU_00568 ksgA pdxA TRUE 0.955 -7.000 0.197 1.000 N NA
 6850377 6850378 PAU_00568 PAU_00569 pdxA surA TRUE 0.979 -22.000 0.561 1.000 N NA
 6850378 6850379 PAU_00569 PAU_00570 surA imp TRUE 0.698 70.000 0.182 1.000 N NA
 6850381 6850382 PAU_00572 PAU_00573 rluA rapA TRUE 0.542 162.000 0.294 1.000 N NA
 6850382 6850383 PAU_00573 PAU_00574 rapA dinA FALSE 0.243 196.000 0.098 1.000   NA
 6850383 6850384 PAU_00574 PAU_00575 dinA rsib_orf.195 FALSE 0.011 708.000 0.000 1.000   NA
 6850384 6850385 PAU_00575 PAU_00576 rsib_orf.195 thiQ FALSE 0.007 1208.000 0.000 1.000   NA
 6850385 6850386 PAU_00576 PAU_00577c thiQ yabK TRUE 0.991 -7.000 0.522 0.019 N NA
 6850386 10702229 PAU_00577c PAU_00577 yabK   TRUE 0.750 -95.000 0.000 NA   NA
 10702229 6850387 PAU_00577 PAU_00578   tbpA TRUE 0.793 -24.000 0.000 NA   NA
 6850387 6850388 PAU_00578 PAU_s005 tbpA   TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6850389 6850390 PAU_00579 PAU_00580 rppH ptsP TRUE 0.823 10.000 0.012 1.000 N NA
 6850390 6850391 PAU_00580 PAU_00581 ptsP lgt FALSE 0.160 75.000 0.008 1.000 N NA
 6850391 6850392 PAU_00581 PAU_00582 lgt thyA TRUE 0.967 -3.000 0.164 1.000 N NA
 6850393 6850394 PAU_00583 PAU_00584 ygjM   TRUE 0.990 -3.000 0.308 NA   NA
 6850395 6850396 PAU_00585 PAU_00586 ppdA ppdB TRUE 0.842 168.000 0.368 NA Y NA
 6850396 6850397 PAU_00586 PAU_00587 ppdB   TRUE 0.994 6.000 0.373 NA   NA
 6850397 6850398 PAU_00587 PAU_00588   ppdC TRUE 0.995 -3.000 0.538 NA   NA
 6850398 6850399 PAU_00588 PAU_00589 ppdC recC TRUE 0.754 -22.000 0.076 NA N NA
 6850399 6850400 PAU_00589 PAU_00590 recC ptrA TRUE 0.934 16.000 0.092 1.000 N NA
 6850400 6850401 PAU_00590 PAU_00591 ptrA recB TRUE 0.938 -3.000 0.092 1.000 N NA
 6850401 6850402 PAU_00591 PAU_00592 recB recD TRUE 0.999 0.000 0.688 0.001 Y NA
 6850403 6850404 PAU_00593 PAU_00594 argA GE16597 TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6850408 6850409 PAU_t008 PAU_t009     TRUE 0.424 83.000 0.000 NA   NA
 6850410 6850411 PAU_00597 PAU_00598   mltA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850411 6850412 PAU_00598 PAU_00599 mltA   TRUE 0.432 46.000 0.021 1.000 N NA
 6850413 6850414 PAU_00600 PAU_00601 ygdK csdA TRUE 0.987 4.000 0.122 0.002   NA
 6850414 6850415 PAU_00601 PAU_s006 csdA   FALSE 0.097 223.000 0.000 NA   NA
 6850416 6850417 PAU_00602 PAU_00603 gcvA   FALSE 0.074 315.000 0.081 NA   NA
 6850417 6850418 PAU_00603 PAU_00604   ygdE TRUE 0.956 -7.000 0.144 NA   NA
 6850418 6850419 PAU_00604 PAU_00605 ygdE   FALSE 0.006 1292.000 0.000 NA   NA
 6850419 6850420 PAU_00605 PAU_00606     TRUE 0.770 54.000 0.095 1.000   NA
 6850420 6850421 PAU_00606 PAU_00607   hasD TRUE 0.559 76.000 0.071 1.000   NA
 6850421 6850422 PAU_00607 PAU_00608 hasD   TRUE 0.970 61.000 0.562 0.010   NA
 6850422 6850423 PAU_00608 PAU_00609     TRUE 0.996 3.000 0.375 0.010   NA
 6850424 6850425 PAU_00610 PAU_00611 xni   TRUE 0.954 30.000 0.178 NA   NA
 6850425 6850426 PAU_00611 PAU_00612   queF FALSE 0.304 155.000 0.079 NA   NA
 6850426 6850427 PAU_00612 PAU_00613 queF   FALSE 0.036 380.000 0.000 1.000   NA
 6850427 6850428 PAU_00613 PAU_00614     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850429 6850430 PAU_00615 PAU_00616 nikM hisC FALSE 0.053 217.000 0.000 1.000 N NA
 6850430 6850431 PAU_00616 PAU_00617 hisC   TRUE 0.654 -22.000 0.000 1.000 N NA
 6850432 6850433 PAU_00618 PAU_00619     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850433 6850434 PAU_00619 PAU_00620     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6850434 6850435 PAU_00620 PAU_00621   sanC TRUE 0.836 33.000 0.000 NA   NA
 6850435 6850436 PAU_00621 PAU_00622 sanC   TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850436 6850437 PAU_00622 PAU_00623   yqkA TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6850437 6850438 PAU_00623 PAU_00624 yqkA   TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850440 6850441 PAU_00626 PAU_00627   bmyC FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6850441 6850442 PAU_00627 PAU_00628 bmyC   TRUE 0.808 37.000 0.000 NA   NA
 6850442 6850443 PAU_00628 PAU_00629     TRUE 0.508 70.000 0.000 1.000   NA
 6850443 6850444 PAU_00629 PAU_00630   speC TRUE 0.747 44.000 0.000 1.000   NA
 6850444 6850445 PAU_00630 PAU_00631 speC   TRUE 0.965 3.000 0.067 1.000   NA
 6850445 6850446 PAU_00631 PAU_00632     FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6850446 6850447 PAU_00632 PAU_00633   murA TRUE 0.455 74.000 0.000 NA   NA
 6850447 6850448 PAU_00633 PAU_00634 murA   FALSE 0.166 130.000 0.000 1.000 N NA
 6850449 6850450 PAU_00635 PAU_00636     FALSE 0.017 538.000 0.000 NA   NA
 6850450 6850451 PAU_00636 PAU_00637   truC TRUE 0.996 2.000 0.518 NA   NA
 6850454 6850455 PAU_00640 PAU_00641 yaeH dapD FALSE 0.105 213.000 0.035 NA   NA
 6850455 6850456 PAU_00641 PAU_00642 dapD glnD TRUE 0.868 30.000 0.097 1.000 N NA
 6850456 6850457 PAU_00642 PAU_00643 glnD map TRUE 0.566 138.000 0.243 1.000 N NA
 6850458 6850459 PAU_s007 PAU_00644   rpsB TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6850459 6850460 PAU_00644 PAU_00645 rpsB tsf TRUE 0.950 153.000 0.748 1.000 Y NA
 6850460 6850461 PAU_00645 PAU_00646 tsf pyrH TRUE 0.704 147.000 0.416 1.000 N NA
 6850461 6850462 PAU_00646 PAU_00647 pyrH frr TRUE 0.869 121.000 0.626 1.000 N NA
 6850462 6850463 PAU_00647 PAU_00648 frr dxr FALSE 0.114 148.000 0.032 1.000 N NA
 6850463 6850464 PAU_00648 PAU_00649 dxr uppS FALSE 0.121 344.000 0.025 1.000 Y NA
 6850464 6850465 PAU_00649 PAU_00650 uppS cdsA TRUE 0.998 10.000 0.400 1.000 Y NA
 6850465 6850466 PAU_00650 PAU_00651 cdsA rseP TRUE 0.829 31.000 0.080 1.000 N NA
 6850466 6850467 PAU_00651 PAU_00652 rseP yaeT TRUE 0.983 35.000 0.204 1.000 Y NA
 6850467 6850468 PAU_00652 PAU_00653d yaeT hlpA TRUE 0.997 -3.000 0.354 1.000 Y NA
 6850468 10702230 PAU_00653d PAU_00653 hlpA   TRUE 0.737 -179.000 0.000 NA   NA
 10702230 6850469 PAU_00653 PAU_00654   lpxD FALSE 0.024 436.000 0.000 NA   NA
 6850469 6850470 PAU_00654 PAU_00655 lpxD fabZ TRUE 0.906 121.000 0.796 1.000 N NA
 6850470 6850471 PAU_00655 PAU_00656 fabZ lpxA TRUE 0.998 4.000 0.850 1.000 N NA
 6850471 6850472 PAU_00656 PAU_00657 lpxA lpxB TRUE 0.997 5.000 0.289 1.000 Y NA
 6850472 6850473 PAU_00657 PAU_00658 lpxB rnhB TRUE 0.973 -3.000 0.186 1.000 N NA
 6850473 6850474 PAU_00658 PAU_00659 rnhB dnaE TRUE 0.451 209.000 0.104 1.000 Y NA
 6850474 6850475 PAU_00659 PAU_00660 dnaE accA TRUE 0.958 13.000 0.122 1.000 N NA
 6850475 6850476 PAU_00660 PAU_00661 accA tilS FALSE 0.153 213.000 0.123 1.000 N NA
 6850479 6850480 PAU_00664 PAU_00665 proS   FALSE 0.332 127.000 0.048 NA   NA
 6850480 6850481 PAU_00665 PAU_00666   rcsF TRUE 0.987 -3.000 0.247 NA   NA
 6850481 6850482 PAU_00666 PAU_00667 rcsF metQ TRUE 0.818 145.000 0.500 NA   NA
 6850482 6850483 PAU_00667 PAU_00668 metQ metI TRUE 0.966 66.000 0.411 NA Y NA
 6850483 6850484 PAU_00668 PAU_00669 metI metN TRUE 0.997 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 6850485 6850486 PAU_00670 PAU_00407b gmhB 16S_rRNA FALSE 0.032 384.000 0.000 NA   NA
 6850486 6850487 PAU_00407b PAU_t010 16S_rRNA   FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6850487 6850488 PAU_t010 PAU_t011     FALSE 0.281 133.000 0.000 NA   NA
 6850488 6850489 PAU_t011 PAU_00407j   23S_rRNA FALSE 0.009 805.000 0.000 NA   NA
 6850489 6850490 PAU_00407j PAU_r003 23S_rRNA   FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6850490 6850491 PAU_r003 PAU_t012     TRUE 0.625 54.000 0.000 NA   NA
 6850491 6850492 PAU_t012 PAU_00671   ISPlu6L FALSE 0.166 179.000 0.000 NA   NA
 6850492 6850493 PAU_00671 PAU_00672 ISPlu6L ISPlu6L TRUE 0.580 59.000 0.000 NA   NA
 6850493 6850494 PAU_00672 PAU_00673 ISPlu6L yafD TRUE 0.406 89.000 0.000 NA   NA
 6850498 6850499 PAU_00677 PAU_00678 cysJ cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y NA
 6850499 6850500 PAU_00678 PAU_00679 cysI cysH TRUE 0.950 -3.000 0.116 1.000 N NA
 6850502 6850503 PAU_00681 PAU_00682 cysG cysD TRUE 0.998 11.000 0.417 1.000 Y NA
 6850503 6850504 PAU_00682 PAU_00683 cysD cysN FALSE 0.371 396.000 0.574 0.001 N NA
 6850504 6850505 PAU_00683 PAU_00684 cysN cysC TRUE 0.998 2.000 0.340 0.001 Y NA
 6850505 6850506 PAU_00684 PAU_00685 cysC ftsB FALSE 0.081 145.000 0.013 1.000 N NA
 6850506 6850507 PAU_00685 PAU_00686 ftsB ispD TRUE 0.978 6.000 0.185 1.000 N NA
 6850507 6850508 PAU_00686 PAU_00687 ispD ispF TRUE 0.998 13.000 0.419 1.000 Y NA
 6850508 6850509 PAU_00687 PAU_00688 ispF truD TRUE 0.986 1.000 0.173 1.000   NA
 6850509 6850510 PAU_00688 PAU_00689 truD surE TRUE 0.956 -22.000 0.235 1.000   NA
 6850510 6850511 PAU_00689 PAU_00690 surE pcm TRUE 0.988 -6.000 0.353 1.000   NA
 6850511 6850512 PAU_00690 PAU_00691 pcm nlpD FALSE 0.173 109.000 0.030 1.000 N NA
 6850512 6850513 PAU_00691 PAU_00692 nlpD rpoS TRUE 0.759 52.000 0.142 1.000 N NA
 6850513 6850514 PAU_00692 PAU_00693 rpoS   FALSE 0.007 1016.000 0.000 NA   NA
 6850514 6850515 PAU_00693 PAU_00694     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850516 6850517 PAU_00695 PAU_00696 miaE mutS TRUE 0.787 5.000 0.004 1.000 N NA
 6850517 6850518 PAU_00696 PAU_00697 mutS   FALSE 0.021 471.000 0.000 NA   NA
 6850518 6850519 PAU_00697 PAU_00698     FALSE 0.018 506.000 0.000 NA   NA
 6850519 6850520 PAU_00698 PAU_00699     FALSE 0.013 635.000 0.000 NA   NA
 6850520 6850521 PAU_00699 PAU_00700   fucR FALSE 0.008 822.000 0.000 NA   NA
 6850521 6850522 PAU_00700 PAU_00701 fucR fucK TRUE 0.984 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6850522 6850523 PAU_00701 PAU_00702 fucK fucI TRUE 0.997 1.000 0.269 1.000 Y NA
 6850523 6850524 PAU_00702 PAU_00703 fucI fucP TRUE 0.990 14.000 0.104 1.000 Y NA
 6850525 6850526 PAU_00704 PAU_00705 fucA   FALSE 0.355 114.000 0.000 1.000   NA
 6850526 6850527 PAU_00705 PAU_00706   ygcB FALSE 0.014 623.000 0.000 1.000   NA
 6850527 6850528 PAU_00706 PAU_00707 ygcB   TRUE 0.988 15.000 0.263 NA   NA
 6850528 6850529 PAU_00707 PAU_00708     TRUE 0.993 9.000 0.336 NA   NA
 6850529 6850530 PAU_00708 PAU_00709     TRUE 0.985 21.000 0.276 NA   NA
 6850530 6850531 PAU_00709 PAU_00710     TRUE 0.998 0.000 0.780 NA   NA
 6850531 6850532 PAU_00710 PAU_00711     TRUE 0.970 -13.000 0.282 NA   NA
 6850532 6850533 PAU_00711 PAU_00712   torD3 FALSE 0.016 549.000 0.000 NA   NA
 6850534 6850535 PAU_00713 PAU_00714     FALSE 0.149 188.000 0.000 NA   NA
 6850535 6850536 PAU_00714 PAU_00715     FALSE 0.141 192.000 0.000 NA   NA
 6850536 6850537 PAU_00715 PAU_00716     TRUE 0.784 -31.000 0.000 NA   NA
 6850537 6850538 PAU_00716 PAU_00717     FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6850538 6850539 PAU_00717 PAU_00718     TRUE 0.429 81.000 0.000 NA   NA
 6850539 6850540 PAU_00718 PAU_00719     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850540 6850541 PAU_00719 PAU_00720     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6850541 6850542 PAU_00720 PAU_00721     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850542 6850543 PAU_00721 PAU_00722     FALSE 0.009 754.000 0.000 NA   NA
 6850543 6850544 PAU_00722 PAU_00723     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6850544 6850545 PAU_00723 PAU_00724     FALSE 0.006 1139.000 0.000 NA   NA
 6850546 10702232 PAU_00725e PAU_00726 smfA   TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 10702231 6850546 PAU_00725 PAU_00725e   smfA TRUE 0.738 -164.000 0.000 NA   NA
 6850547 6850548 PAU_00726f PAU_00727 mrfB mrfC TRUE 0.976 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10702232 6850547 PAU_00726 PAU_00726f   mrfB TRUE 0.752 -92.000 0.000 NA   NA
 6850548 10702233 PAU_00727 PAU_00728 mrfC   TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6850549 6850550 PAU_00728g PAU_00729 mrfD mrfX TRUE 0.955 31.000 0.000 1.000 Y NA
 10702233 6850549 PAU_00728 PAU_00728g   mrfD TRUE 0.762 -74.000 0.000 NA   NA
 6850550 6850551 PAU_00729 PAU_00730h mrfX mrfF TRUE 0.978 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 6850551 10702234 PAU_00730h PAU_00730 mrfF   TRUE 0.750 -95.000 0.000 NA   NA
 10702234 10702235 PAU_00730 PAU_00731     FALSE 0.019 485.000 0.000 NA   NA
 6850552 10702235 PAU_00731j PAU_00731 mrfG   TRUE 0.763 -71.000 0.000 NA   NA
 10702235 6850553 PAU_00731 PAU_00732   mrfG FALSE 0.025 432.000 0.000 NA   NA
 6850553 6850554 PAU_00732 PAU_00733 mrfG   TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6850554 6850555 PAU_00733 PAU_00734   mrfJ TRUE 0.858 29.000 0.000 NA   NA
 6850556 6850557 PAU_00735 PAU_00736   purA1 TRUE 0.948 12.000 0.000 1.000   NA
 6850557 6850558 PAU_00736 PAU_00737 purA1   FALSE 0.212 207.000 0.100 NA   NA
 6850558 6850559 PAU_00737 PAU_00738     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6850559 6850560 PAU_00738 PAU_00739   hisA2 TRUE 0.952 3.000 0.000 1.000   NA
 6850560 6850561 PAU_00739 PAU_00740 hisA2 gene0004 FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6850561 6850562 PAU_00740 PAU_00741 gene0004 yhaO FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6850562 6850563 PAU_00741 PAU_00742 yhaO gene0005 FALSE 0.005 650.000 0.000 NA N NA
 6850563 6850564 PAU_00742 PAU_00743 gene0005 fdoH2 TRUE 1.000 0.000 0.944 0.002 Y NA
 6850564 6850565 PAU_00743 PAU_00744 fdoH2 fdnG TRUE 0.986 19.000 0.000 0.002 Y NA
 6850566 6850567 PAU_00745 PAU_00746     FALSE 0.016 572.000 0.000 1.000   NA
 6850567 6850568 PAU_00746 PAU_00747     TRUE 0.901 22.000 0.028 1.000   NA
 6850568 6850569 PAU_00747 PAU_00748     TRUE 0.923 -3.000 0.027 NA   NA
 6850571 6850572 PAU_00750 PAU_00751 paaA paaB TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850572 6850573 PAU_00751 PAU_00752 paaB paaC TRUE 0.980 -7.000 0.286 NA   NA
 6850573 6850574 PAU_00752 PAU_00753 paaC   TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850575 6850576 PAU_00754 PAU_00755     FALSE 0.032 381.000 0.000 NA   NA
 6850576 6850577 PAU_00755 PAU_00756     FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6850578 6850579 PAU_00757 PAU_00758     TRUE 0.388 101.000 0.000 1.000   NA
 6850579 6850580 PAU_00758 PAU_00759     FALSE 0.009 849.000 0.000 1.000   NA
 6850580 6850581 PAU_00759 PAU_00760     FALSE 0.195 114.000 0.000 1.000 N NA
 6850581 6850582 PAU_00760 PAU_00761     TRUE 0.881 6.000 0.000 NA N NA
 6850583 6850584 PAU_00762 PAU_00763 fbpC afuB TRUE 0.992 16.000 0.381 0.031 N NA
 6850584 6850585 PAU_00763 PAU_00764 afuB afuA TRUE 0.971 125.000 0.667 0.031 Y NA
 6850585 6850586 PAU_00764 PAU_00765 afuA uhpC TRUE 0.923 53.000 0.407 NA N NA
 6850586 6850587 PAU_00765 PAU_00766 uhpC uhpB TRUE 0.597 218.000 0.611 NA N NA
 6850587 6850588 PAU_00766 PAU_00767 uhpB uhpA TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.012 Y NA
 6850588 6850589 PAU_00767 PAU_00768 uhpA   FALSE 0.066 270.000 0.000 NA   NA
 6850589 6850590 PAU_00768 PAU_00769     FALSE 0.021 464.000 0.000 NA   NA
 6850593 6850594 PAU_00772 PAU_00773 agaR agaZ TRUE 0.989 24.000 0.182 1.000 Y NA
 6850594 6850595 PAU_00773 PAU_00774 agaZ agaS TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 N NA
 6850595 6850596 PAU_00774 PAU_00775 agaS agaV TRUE 0.941 -34.000 0.286 1.000 N NA
 6850596 6850597 PAU_00775 PAU_00776 agaV agaC TRUE 1.000 11.000 0.905 0.009 Y NA
 6850597 6850598 PAU_00776 PAU_00777 agaC agaD TRUE 0.975 41.000 0.143 0.009 Y NA
 6850598 6850599 PAU_00777 PAU_00778 agaD yadI TRUE 0.981 23.000 0.000 0.009 Y NA
 6850599 6850600 PAU_00778 PAU_00779 yadI gatY TRUE 0.985 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6850600 6850601 PAU_00779 PAU_00780 gatY ast TRUE 0.875 45.000 0.130 1.000   NA
 6850601 6850602 PAU_00780 PAU_00781 ast   FALSE 0.356 106.000 0.000 NA   NA
 6850602 6850603 PAU_00781 PAU_00782     FALSE 0.253 142.000 0.000 NA   NA
 6850603 6850604 PAU_00782 PAU_00783     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850604 6850605 PAU_00783 PAU_00784     FALSE 0.060 281.000 0.000 NA   NA
 6850605 6850606 PAU_00784 PAU_00785     TRUE 0.840 32.000 0.000 NA   NA
 6850606 6850607 PAU_00785 PAU_00786     FALSE 0.051 302.000 0.000 NA   NA
 6850607 6850608 PAU_00786 PAU_00787     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850610 6850611 PAU_00789 PAU_00790     FALSE 0.012 645.000 0.000 NA   NA
 6850611 6850612 PAU_00790 PAU_00791     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850615 6850616 PAU_00794 PAU_00795 speD speE TRUE 0.980 32.000 0.162 1.000 Y NA
 6850616 6850617 PAU_00795 PAU_00796 speE   TRUE 0.822 111.000 0.354 NA   NA
 6850618 6850619 PAU_00797 PAU_00798 cueO hpt FALSE 0.010 349.000 0.010 1.000 N NA
 6850620 6850621 PAU_00799 PAU_00800 chpB   TRUE 0.989 0.000 0.083 NA Y NA
 6850621 6850622 PAU_00800 PAU_00801   yadF FALSE 0.007 534.000 0.000 NA N NA
 6850623 6850624 PAU_00802 PAU_00803 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.097 Y NA
 6850625 6850626 PAU_00804 PAU_00805 panD panC TRUE 0.944 81.000 0.342 1.000 Y NA
 6850626 6850627 PAU_00805 PAU_00806 panC panB TRUE 0.986 54.000 0.395 0.001 Y NA
 6850627 6850628 PAU_00806 PAU_00807 panB folK TRUE 0.877 67.000 0.117 1.000 Y NA
 6850628 6850629 PAU_00807 PAU_00808 folK pcnB TRUE 0.985 3.000 0.234 1.000 N NA
 6850629 6850630 PAU_00808 PAU_00809 pcnB yadB TRUE 0.856 80.000 0.131 1.000 Y NA
 6850630 6850631 PAU_00809 PAU_00810 yadB dksA TRUE 0.825 60.000 0.231 1.000 N NA
 6850631 6850632 PAU_00810 PAU_00811 dksA dksA TRUE 0.780 -36.000 0.000 NA   NA
 6850632 6850633 PAU_00811 PAU_00812 dksA sfsA FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 6850634 6850635 PAU_00813 PAU_00814 hrpB mrcB TRUE 0.846 44.000 0.158 1.000 N NA
 6850635 6850636 PAU_00814 PAU_00815 mrcB   FALSE 0.018 545.000 0.000 1.000   NA
 6850636 6850637 PAU_00815 PAU_00816     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6850637 6850638 PAU_00816 PAU_00817     TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6850638 6850639 PAU_00817 PAU_00818     FALSE 0.103 218.000 0.000 NA   NA
 6850640 6850641 PAU_00819 PAU_00820     FALSE 0.062 278.000 0.000 NA   NA
 6850643 6850644 PAU_00822 PAU_00823 hemL   TRUE 0.660 50.000 0.000 NA   NA
 6850645 6850646 PAU_00824 PAU_00825   yadR FALSE 0.305 126.000 0.000 NA   NA
 6850647 6850648 PAU_00826 PAU_00827 btuF mtnA FALSE 0.202 150.000 0.073 1.000 N NA
 6850651 6850652 PAU_00830 PAU_00831 rumA relA FALSE 0.078 242.000 0.082 1.000 N NA
 6850652 6850653 PAU_00831 PAU_00832 relA mazG TRUE 0.387 102.000 0.040 1.000   NA
 6850653 6850654 PAU_00832 PAU_00833 mazG nad2 FALSE 0.015 568.000 0.000 NA   NA
 6850654 6850655 PAU_00833 PAU_00834 nad2   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6850655 6850656 PAU_00834 PAU_00835   vgaB TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850657 6850658 PAU_00836 PAU_00837     FALSE 0.323 120.000 0.000 NA   NA
 6850658 6850659 PAU_00837 PAU_00838     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6850659 6850660 PAU_00838 PAU_00839     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850661 6850662 PAU_00840 PAU_00841 pyrG eno TRUE 0.405 73.000 0.068 1.000 N NA
 6850662 6850663 PAU_00841 PAU_00842 eno pln FALSE 0.017 372.000 0.000 1.000 N NA
 6850664 6850665 PAU_00843 PAU_00844 orf80 orf78 FALSE 0.055 684.000 0.000 0.035 Y NA
 6850666 6850667 PAU_00845 PAU_00846     FALSE 0.012 647.000 0.000 NA   NA
 6850667 6850668 PAU_00846 PAU_00847     TRUE 0.998 10.000 1.000 NA   NA
 6850668 6850669 PAU_00847 PAU_00848     TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6850669 6850670 PAU_00848 PAU_00849     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850670 6850671 PAU_00849 PAU_00850     TRUE 0.951 5.000 0.000 1.000   NA
 6850671 6850672 PAU_00850 PAU_00851   tmk TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6850672 6850673 PAU_00851 PAU_00852 tmk   TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6850674 6850675 PAU_00853 PAU_00854   orf74 FALSE 0.007 1023.000 0.000 NA   NA
 6850676 6850677 PAU_00855 PAU_00856     FALSE 0.022 454.000 0.000 NA   NA
 6850678 10702236 PAU_00857l PAU_00857 mltD   TRUE 0.764 -68.000 0.000 NA   NA
 10702236 6850679 PAU_00857 PAU_00858   gloB TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6850682 6850683 PAU_00861 PAU_t013 dnaQ   FALSE 0.293 130.000 0.000 NA   NA
 6850684 6850685 PAU_00862 PAU_00863     FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6850687 6850688 PAU_00865 PAU_00866 orf67 orf66 TRUE 0.954 18.000 0.000 0.035   NA
 6850688 6850689 PAU_00866 PAU_00867 orf66 orf66 TRUE 0.557 84.000 0.000 0.035   NA
 6850690 6850691 PAU_00868 PAU_00869 tktA   FALSE 0.009 836.000 0.000 1.000   NA
 6850691 6850692 PAU_00869 PAU_00870     TRUE 0.998 4.000 0.778 NA   NA
 6850692 6850693 PAU_00870 PAU_00871     TRUE 0.934 -12.000 0.130 NA   NA
 6850693 6850694 PAU_00871 PAU_00872     TRUE 0.998 11.000 0.914 NA   NA
 6850694 6850695 PAU_00872 PAU_00873     TRUE 0.991 5.000 0.271 NA   NA
 6850695 6850696 PAU_00873 PAU_00874   cydA1 FALSE 0.379 98.000 0.000 NA   NA
 6850696 6850697 PAU_00874 PAU_00875 cydA1 cydB1 TRUE 0.968 30.000 0.000 0.039 Y NA
 6850697 6850698 PAU_00875 PAU_00876 cydB1   FALSE 0.035 382.000 0.000 1.000   NA
 6850698 6850699 PAU_00876 PAU_00877   epd FALSE 0.016 570.000 0.000 1.000   NA
 6850699 6850700 PAU_00877 PAU_00878 epd pgk TRUE 0.848 83.000 0.070 0.005 Y NA
 6850700 6850701 PAU_00878 PAU_00879 pgk fba TRUE 0.920 54.000 0.056 0.005 Y NA
 6850703 6850704 PAU_00881 PAU_00882 basA/D phbF TRUE 0.577 84.000 0.095 NA   NA
 6850706 6850707 PAU_00884 PAU_00885     FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6850707 10702237 PAU_00885 PAU_00886     FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6850708 10702238 PAU_00886m PAU_00887 phuB   TRUE 0.894 24.000 0.000 NA   NA
 10702237 6850708 PAU_00886 PAU_00886m   phuB TRUE 0.744 -125.000 0.000 NA   NA
 6850709 10702239 PAU_00887m PAU_00888 phuG   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 10702238 6850709 PAU_00887 PAU_00887m   phuG TRUE 0.743 -131.000 0.000 NA   NA
 6850710 6850711 PAU_00888p PAU_00889 phuD phuA FALSE 0.059 667.000 0.000 0.031 Y NA
 10702239 6850710 PAU_00888 PAU_00888p   phuD TRUE 0.741 -146.000 0.000 NA   NA
 6850711 6850712 PAU_00889 PAU_00890 phuA phbH TRUE 0.412 137.000 0.091 1.000   NA
 6850712 6850713 PAU_00890 PAU_00891 phbH phuC FALSE 0.229 156.000 0.038 1.000   NA
 6850713 6850714 PAU_00891 PAU_00892 phuC phbC FALSE 0.202 278.000 0.000 1.000 Y NA
 6850714 6850715 PAU_00892 PAU_00893 phbC phbE TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6850715 6850716 PAU_00893 PAU_00894 phbE phbB TRUE 0.997 -13.000 0.667 1.000 Y NA
 6850716 6850717 PAU_00894 PAU_00895 phbB phbA TRUE 0.986 2.000 0.040 1.000 Y NA
 6850718 6850719 PAU_00896 PAU_00897 tccC3 tchA FALSE 0.305 126.000 0.000 NA   NA
 6850719 6850720 PAU_00897 PAU_00898 tchA tcaC TRUE 0.635 53.000 0.000 NA   NA
 6850720 6850721 PAU_00898 PAU_00899 tcaC tcdA2 TRUE 0.586 58.000 0.000 NA   NA
 6850721 6850722 PAU_00899 PAU_00900 tcdA2   FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 6850722 6850723 PAU_00900 PAU_00901   tcdA FALSE 0.316 122.000 0.000 NA   NA
 6850727 6850728 PAU_00905 PAU_00906     TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6850730 6850731 PAU_00908 PAU_00909 yhiP hpaC FALSE 0.044 338.000 0.000 1.000   NA
 6850731 6850732 PAU_00909 PAU_00910 hpaC hpaB TRUE 0.958 21.000 0.000 0.001   NA
 6850732 6850733 PAU_00910 PAU_00911 hpaB   FALSE 0.014 600.000 0.000 NA   NA
 6850734 6850735 PAU_00912 PAU_00913   yfaA FALSE 0.049 309.000 0.000 NA   NA
 6850735 6850736 PAU_00913 PAU_00914 yfaA   TRUE 0.788 90.000 0.000 0.024 Y NA
 6850736 6850737 PAU_00914 PAU_00915   pfaC TRUE 0.883 59.000 0.000 0.024 Y NA
 6850737 6850738 PAU_00915 PAU_00916 pfaC   TRUE 0.910 5.000 0.048 1.000 N NA
 6850739 6850740 PAU_00917 PAU_00918 orf28 orf25 FALSE 0.029 401.000 0.000 NA   NA
 6850740 6850741 PAU_00918 PAU_00919 orf25 orf24 TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6850741 6850742 PAU_00919 PAU_00920 orf24   TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6850742 6850743 PAU_00920 PAU_00921     FALSE 0.011 680.000 0.000 NA   NA
 6850745 6850746 PAU_00923 PAU_00924 hpaA hpaX TRUE 0.962 26.000 0.233 1.000 N NA
 6850746 6850747 PAU_00924 PAU_00925 hpaX hpaI TRUE 0.863 98.000 0.175 1.000 Y NA
 6850747 6850748 PAU_00925 PAU_00926 hpaI hpaH TRUE 0.993 12.000 0.439 1.000 N NA
 6850748 6850749 PAU_00926 PAU_00927 hpaH gabD TRUE 0.960 5.000 0.075 0.059 N NA
 6850749 6850750 PAU_00927 PAU_00928 gabD bcr TRUE 0.959 -3.000 0.136 1.000 N NA
 6850750 6850751 PAU_00928 PAU_00929 bcr hpaF TRUE 0.896 3.000 0.039 1.000 N NA
 6850751 6850752 PAU_00929 PAU_00930 hpaF hpaD TRUE 0.992 14.000 0.330 1.000   NA
 6850752 6850753 PAU_00930 PAU_00931 hpaD hpaE TRUE 0.917 65.000 0.378 1.000   NA
 6850753 6850754 PAU_00931 PAU_00932 hpaE hpaG2 TRUE 0.995 -3.000 0.510 0.059 N NA
 6850754 6850755 PAU_00932 PAU_00933 hpaG2 hpaG1 TRUE 0.999 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 6850759 6850760 PAU_00937 PAU_00938     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850760 6850761 PAU_00938 PAU_00939   gene0006 FALSE 0.009 787.000 0.000 NA   NA
 6850761 6850762 PAU_00939 PAU_00940 gene0006 gene0007 TRUE 0.768 45.000 0.059 NA   NA
 6850762 6850763 PAU_00940 PAU_00941 gene0007 gene0008 TRUE 0.557 219.000 0.147 0.067 Y NA
 6850764 6850765 PAU_00942 PAU_00943 gene0009 gene0010 TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6850765 6850766 PAU_00943 PAU_00944 gene0010 gene0011 TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6850767 6850768 PAU_00945 PAU_00946     TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6850770 6850771 PAU_00948 PAU_00949 gene0012 gene0013 FALSE 0.198 461.000 0.147 0.067 Y NA
 6850772 6850773 PAU_00950 PAU_00951 gene0014 gene0015 TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850774 6850775 PAU_00952 PAU_00953 gene0016   TRUE 0.992 14.000 0.333 NA   NA
 6850775 6850776 PAU_00953 PAU_00954   gene0017 FALSE 0.006 1136.000 0.000 NA   NA
 6850776 6850777 PAU_00954 PAU_00955 gene0017 gene0018 FALSE 0.198 461.000 0.147 0.067 Y NA
 6850778 6850779 PAU_00956 PAU_00957 gene0019 gene0020 TRUE 0.461 73.000 0.000 NA   NA
 6850780 6850781 PAU_00958 PAU_00959 gene0021 gene0022 TRUE 0.992 14.000 0.333 NA   NA
 6850781 6850782 PAU_00959 PAU_00960 gene0022 gene0023 FALSE 0.052 300.000 0.000 NA   NA
 6850782 6850783 PAU_00960 PAU_00961 gene0023 gene0024 TRUE 0.903 -6.000 0.000 NA   NA
 6850783 6850784 PAU_00961 PAU_00962 gene0024 gene0025 TRUE 0.768 45.000 0.059 NA   NA
 6850784 6850785 PAU_00962 PAU_00963 gene0025 gene0026 TRUE 0.557 219.000 0.147 0.067 Y NA
 6850786 6850787 PAU_00964 PAU_00965 gene0027 gene0028 TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6850788 6850789 PAU_00966 PAU_00967 gene0029 rhs-core TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6850789 6850790 PAU_00967 PAU_00968 rhs-core   TRUE 0.994 18.000 0.500 NA   NA
 6850790 6850791 PAU_00968 PAU_00969   vgrG TRUE 0.901 55.000 0.250 NA   NA
 6850791 6850792 PAU_00969 PAU_00970 vgrG ngrA FALSE 0.009 745.000 0.000 NA   NA
 6850792 6850793 PAU_00970 PAU_00971 ngrA phfB TRUE 0.522 47.000 0.000 1.000 N NA
 6850793 6850794 PAU_00971 PAU_00972 phfB yraJ TRUE 0.959 29.000 0.000 1.000 Y NA
 6850794 6850795 PAU_00972 PAU_00973q yraJ yraI TRUE 0.970 24.000 0.000 1.000 Y NA
 6850795 10702240 PAU_00973q PAU_00973 yraI   TRUE 0.765 -56.000 0.000 NA   NA
 10702240 6850796 PAU_00973 PAU_00974   phfS TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6850797 6850798 PAU_00975 PAU_00976 pltP   TRUE 0.846 31.000 0.000 NA   NA
 6850799 6850800 PAU_00977 PAU_00978 ybaL fsr FALSE 0.037 242.000 0.000 NA N NA
 6850802 6850803 PAU_00980 PAU_00981 ybbP ybbA TRUE 0.998 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 6850804 6850805 PAU_00982 PAU_00983 tesA ybbO TRUE 0.749 51.000 0.072 1.000   NA
 6850805 6850806 PAU_00983 PAU_00984 ybbO ybbN TRUE 0.714 67.000 0.118 1.000   NA
 6850806 6850807 PAU_00984 PAU_00985 ybbN ybbK TRUE 0.979 23.000 0.075 1.000 Y NA
 6850807 6850808 PAU_00985 PAU_00986 ybbK ybbJ TRUE 0.997 3.000 0.313 NA Y NA
 6850813 6850814 PAU_00991 PAU_00992     TRUE 0.727 83.000 0.250 NA N NA
 6850814 6850815 PAU_00992 PAU_00993     TRUE 0.861 57.000 0.286 NA N NA
 6850817 6850818 PAU_00995 PAU_00996   purK FALSE 0.064 272.000 0.000 NA   NA
 6850818 6850819 PAU_00996 PAU_00997 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 6850819 6850820 PAU_00997 PAU_00998 purE lpxH FALSE 0.235 135.000 0.016 1.000   NA
 6850820 6850821 PAU_00998 PAU_00999 lpxH ppiB TRUE 0.990 11.000 0.237 1.000   NA
 6850823 6850824 PAU_01001 PAU_01002   folD TRUE 0.960 0.000 0.055 1.000   NA
 6850825 6850826 PAU_t014 PAU_01003     FALSE 0.185 169.000 0.000 NA   NA
 6850827 6850828 PAU_01004 PAU_01005   yabA FALSE 0.021 462.000 0.000 NA   NA
 6850828 6850829 PAU_01005 PAU_01006 yabA   TRUE 0.902 92.000 0.500 NA   NA
 6850829 6850830 PAU_01006 PAU_01007   alpA1 TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6850830 6850831 PAU_01007 PAU_01008 alpA1   TRUE 0.997 4.000 0.667 NA   NA
 6850834 6850835 PAU_01011 PAU_01012     TRUE 0.992 -3.000 0.370 NA   NA
 6850835 6850836 PAU_01012 PAU_01013     TRUE 0.998 2.000 0.630 0.011   NA
 6850836 6850837 PAU_01013 PAU_01014     TRUE 0.995 -3.000 0.485 1.000   NA
 6850837 6850838 PAU_01014 PAU_01015     TRUE 0.976 23.000 0.211 NA   NA
 6850838 6850839 PAU_01015 PAU_01016   Sc/SvQ FALSE 0.007 944.000 0.000 NA   NA
 6850839 6850840 PAU_01016 PAU_01017 Sc/SvQ Sc/SvP FALSE 0.030 392.000 0.000 NA   NA
 6850841 6850842 PAU_01018 PAU_01019   atoA FALSE 0.006 1292.000 0.000 NA   NA
 6850842 6850843 PAU_01019 PAU_01020 atoA atoD TRUE 0.991 7.000 0.000 0.001 Y NA
 6850843 6850844 PAU_01020 PAU_01021 atoD atoC FALSE 0.026 301.000 0.000 1.000 N NA
 6850844 6850845 PAU_01021 PAU_01022 atoC   FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 6850847 6850848 PAU_01024 PAU_01025     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6850849 6850850 PAU_01026 PAU_01027 msc_3   FALSE 0.021 468.000 0.000 NA   NA
 6850850 6850851 PAU_01027 PAU_01028   cspI FALSE 0.025 431.000 0.000 NA   NA
 6850852 6850853 PAU_01029 PAU_01030 sctL sctK TRUE 0.991 -21.000 0.727 1.000   NA
 6850853 6850854 PAU_01030 PAU_01031 sctK sctJ TRUE 0.998 0.000 0.800 1.000   NA
 6850854 6850855 PAU_01031 PAU_01032 sctJ sctI TRUE 0.995 7.000 0.333 0.012   NA
 6850855 6850856 PAU_01032 PAU_01033 sctI sctH TRUE 0.996 0.000 0.333 0.009   NA
 6850856 6850857 PAU_01033 PAU_01034 sctH sctG TRUE 0.997 -7.000 0.900 0.009   NA
 6850857 6850858 PAU_01034 PAU_01035 sctG sctF TRUE 0.998 3.000 0.556 0.009   NA
 6850858 6850859 PAU_01035 PAU_01036 sctF sctD FALSE 0.255 151.000 0.049 NA   NA
 6850859 6850860 PAU_01036 PAU_01037r sctD sctC TRUE 0.985 -3.000 0.220 NA   NA
 6850860 10702241 PAU_01037r PAU_01037 sctC   TRUE 0.756 -89.000 0.000 NA   NA
 10702241 6850861 PAU_01037 PAU_01038   sctB TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6850861 6850862 PAU_01038 PAU_01039 sctB   TRUE 0.996 16.000 0.583 NA   NA
 6850862 6850863 PAU_01039 PAU_01040   rhaS TRUE 0.906 115.000 0.615 NA   NA
 6850863 6850864 PAU_01040 PAU_01041 rhaS   FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6850864 6850865 PAU_01041 PAU_01042   spcU TRUE 0.743 43.000 0.000 NA   NA
 6850865 6850866 PAU_01042 PAU_01043 spcU exoU TRUE 0.996 10.000 0.500 NA   NA
 6850866 6850867 PAU_01043 PAU_01044 exoU   TRUE 0.389 96.000 0.000 NA   NA
 6850867 6850868 PAU_01044 PAU_01045   sctU FALSE 0.251 143.000 0.000 NA   NA
 6850868 6850869 PAU_01045 PAU_01046 sctU sctT TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.064 Y NA
 6850869 6850870 PAU_01046 PAU_01047 sctT sctS TRUE 0.991 -3.000 0.097 0.064 Y NA
 6850870 6850871 PAU_01047 PAU_01048 sctS sctR TRUE 0.998 3.000 0.300 0.012 Y NA
 6850871 6850872 PAU_01048 PAU_01049 sctR sctQ TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 6850872 6850873 PAU_01049 PAU_01050 sctQ sctP TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.006   NA
 6850873 6850874 PAU_01050 PAU_01051 sctP sctO TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850874 6850875 PAU_01051 PAU_01052 sctO sctN TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850876 6850877 PAU_01053 PAU_01054 sctW lssN TRUE 0.985 -3.000 0.208 1.000   NA
 6850877 6850878 PAU_01054 PAU_01055 lssN sctX TRUE 0.985 -3.000 0.214 NA   NA
 6850878 6850879 PAU_01055 PAU_01056 sctX sctY TRUE 0.969 3.000 0.087 NA   NA
 6850879 6850880 PAU_01056 PAU_01057 sctY lssD TRUE 0.953 -3.000 0.062 1.000   NA
 6850880 6850881 PAU_01057 PAU_01058 lssD pcrR TRUE 0.989 -3.000 0.281 NA   NA
 6850881 6850882 PAU_01058 PAU_01059 pcrR lssG TRUE 0.988 47.000 1.000 NA   NA
 6850882 6850883 PAU_01059 PAU_01060 lssG lssV TRUE 0.996 11.000 0.556 NA   NA
 6850883 6850884 PAU_01060 PAU_01061 lssV sycD TRUE 0.950 10.000 0.000 1.000   NA
 6850884 6850885 PAU_01061 PAU_01062 sycD   TRUE 0.818 -19.000 0.000 1.000   NA
 6850885 6850886 PAU_01062 PAU_01063     TRUE 0.996 13.000 0.526 NA   NA
 6850888 6850889 PAU_01065 PAU_01066 exsC exsE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850889 6850890 PAU_01066 PAU_01067 exsE lscW TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6850890 6850891 PAU_01067 PAU_01068 lscW hod FALSE 0.007 918.000 0.000 NA   NA
 6850891 6850892 PAU_01068 PAU_01069 hod orf35 FALSE 0.018 514.000 0.000 NA   NA
 6850892 6850893 PAU_01069 PAU_01070 orf35 orf36 TRUE 0.987 10.000 0.200 NA   NA
 6850893 6850894 PAU_01070 PAU_01071 orf36 Rz TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6850896 6850897 PAU_01073 PAU_01074 wza wzb TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000 N NA
 6850897 6850898 PAU_01074 PAU_01075 wzb wzc TRUE 0.965 67.000 1.000 1.000 N NA
 6850898 6850899 PAU_01075 PAU_01076 wzc tehB FALSE 0.044 237.000 0.000 1.000 N NA
 6850901 6850902 PAU_01078 PAU_01079     TRUE 0.537 66.000 0.000 1.000   NA
 6850902 6850903 PAU_01079 PAU_01080     TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6850904 6850905 PAU_01081 PAU_01082 aldB   FALSE 0.023 318.000 0.000 1.000 N NA
 6850906 6850907 PAU_01083 PAU_01084 hcr   FALSE 0.081 244.000 0.000 NA   NA
 6850907 6850908 PAU_01084 PAU_s008     FALSE 0.219 155.000 0.000 NA   NA
 6850908 6850909 PAU_s008 PAU_01085     TRUE 0.450 75.000 0.000 NA   NA
 6850910 6850911 PAU_01086 PAU_01087 sprT metK FALSE 0.200 155.000 0.030 NA   NA
 6850912 6850913 PAU_01088 PAU_01089 speA speB TRUE 0.488 172.000 0.055 1.000 Y NA
 6850914 6850915 PAU_01090 PAU_01091 api10   FALSE 0.092 231.000 0.000 NA   NA
 6850915 6850916 PAU_01091 PAU_01092   mutH FALSE 0.238 94.000 0.000 1.000 N NA
 6850916 6850917 PAU_01092 PAU_01093 mutH sgrR FALSE 0.016 584.000 0.000 1.000   NA
 6850917 6850918 PAU_01093 PAU_01094 sgrR leuD FALSE 0.018 539.000 0.000 1.000   NA
 6850918 6850919 PAU_01094 PAU_01095 leuD leuC TRUE 0.998 13.000 0.309 0.001 Y NA
 6850919 6850920 PAU_01095 PAU_01096 leuC leuB TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 6850920 6850921 PAU_01096 PAU_01097 leuB leuA TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 6850922 6850923 PAU_01098 PAU_01099 leuO fadD FALSE 0.055 235.000 0.050 1.000 N NA
 6850923 6850924 PAU_01099 PAU_01100 fadD   FALSE 0.013 627.000 0.000 NA   NA
 6850924 6850925 PAU_01100 PAU_01101   ilvI FALSE 0.037 355.000 0.000 NA   NA
 6850925 6850926 PAU_01101 PAU_01102 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.001 Y NA
 6850926 6850927 PAU_01102 PAU_01103 ilvH fruR FALSE 0.342 87.000 0.063 1.000 N NA
 6850927 6850928 PAU_01103 PAU_01104 fruR mraZ FALSE 0.014 585.000 0.000 NA   NA
 6850928 6850929 PAU_01104 PAU_01105 mraZ mraW TRUE 0.997 3.000 0.635 NA   NA
 6850929 6850930 PAU_01105 PAU_01106 mraW ftsL TRUE 0.984 0.000 0.227 1.000 N NA
 6850930 6850931 PAU_01106 PAU_01107 ftsL ftsI TRUE 0.896 30.000 0.124 1.000 N NA
 6850931 6850932 PAU_01107 PAU_01108 ftsI murE TRUE 0.959 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 6850932 6850933 PAU_01108 PAU_01109 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 6850933 6850934 PAU_01109 PAU_01110 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 6850934 6850935 PAU_01110 PAU_01111 mraY murD TRUE 0.996 42.000 0.647 0.004 Y NA
 6850935 6850936 PAU_01111 PAU_01112 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 6850936 6850937 PAU_01112 PAU_01113 ftsW murG TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 6850937 6850938 PAU_01113 PAU_01114 murG murC TRUE 0.968 53.000 0.283 1.000 Y NA
 6850938 6850939 PAU_01114 PAU_01115 murC ddlB TRUE 0.990 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 6850939 6850940 PAU_01115 PAU_01116 ddlB ftsQ TRUE 0.998 2.000 0.372 NA Y NA
 6850940 6850941 PAU_01116 PAU_01117 ftsQ ftsA TRUE 0.949 43.000 0.389 NA N NA
 6850941 6850942 PAU_01117 PAU_01118 ftsA ftsZ TRUE 0.974 64.000 0.460 1.000 Y NA
 6850942 6850943 PAU_01118 PAU_01119 ftsZ lpxC TRUE 0.499 99.000 0.134 1.000 N NA
 6850945 6850946 PAU_01121 PAU_01122 secM secA TRUE 0.530 81.000 0.065 1.000   NA
 6850946 6850947 PAU_01122 PAU_01123 secA mutT TRUE 0.520 117.000 0.168 1.000 N NA
 6850948 6850949 PAU_01124 PAU_01125 yacG yacF TRUE 0.980 31.000 0.356 NA   NA
 6850949 6850950 PAU_01125 PAU_01126 yacF coaE TRUE 0.969 14.000 0.110 NA   NA
 6850950 6850951 PAU_01126 PAU_01127 coaE hofC FALSE 0.120 92.000 0.004 1.000 N NA
 6850951 6850952 PAU_01127 PAU_01128 hofC hofB TRUE 0.998 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 6850952 6850953 PAU_01128 PAU_01129 hofB ppdD TRUE 0.904 167.000 0.556 NA Y NA
 6850953 6850954 PAU_01129 PAU_01130 ppdD nadC FALSE 0.033 199.000 0.015 NA N NA
 6850955 6850956 PAU_01131 PAU_01132 ampE   FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6850956 6850957 PAU_01132 PAU_01133     TRUE 0.963 9.000 0.073 NA   NA
 6850959 6850960 PAU_01135 PAU_01136     TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6850960 6850961 PAU_01136 PAU_01137   pdhR FALSE 0.010 709.000 0.000 NA   NA
 6850961 6850962 PAU_01137 PAU_01138 pdhR aceE TRUE 0.423 189.000 0.276 1.000 N NA
 6850962 6850963 PAU_01138 PAU_01139 aceE aceF TRUE 0.995 15.000 0.220 1.000 Y NA
 6850963 6850964 PAU_01139 PAU_01140 aceF lpdA TRUE 0.840 192.000 0.463 1.000 Y NA
 6850964 6850965 PAU_01140 PAU_01141 lpdA acnB FALSE 0.076 468.000 0.000 1.000 Y NA
 6850967 6850968 PAU_01143 PAU_01144 yacL yggB FALSE 0.332 138.000 0.066 NA   NA
 6850969 6850970 PAU_01145 PAU_01146     TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6850970 6850971 PAU_01146 PAU_01147     FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 6850972 6850973 PAU_01148 PAU_01149 argO yggE TRUE 0.437 113.000 0.075 NA   NA
 6850975 6850976 PAU_01151 PAU_01152 rpiA serA FALSE 0.026 273.000 0.029 1.000 N NA
 6850977 6850978 PAU_01153 PAU_s009 ygfA   TRUE 0.763 41.000 0.000 NA   NA
 6850978 6850979 PAU_s009 PAU_01154   ygfE FALSE 0.338 113.000 0.000 NA   NA
 6850980 6850981 PAU_01155 PAU_01156 ygfB pepP TRUE 0.751 49.000 0.073 NA   NA
 6850981 6850982 PAU_01156 PAU_01157 pepP ubiH TRUE 0.909 8.000 0.047 1.000 N NA
 6850982 6850983 PAU_01157 PAU_01158 ubiH visC TRUE 0.995 39.000 0.474 0.001 Y NA
 6850983 6850984 PAU_01158 PAU_01159 visC gcvT FALSE 0.008 359.000 0.004 1.000 N NA
 6850984 6850985 PAU_01159 PAU_01160 gcvT gcvH TRUE 0.759 234.000 0.317 0.001 Y NA
 6850985 6850986 PAU_01160 PAU_01161 gcvH gcvP TRUE 0.913 88.000 0.249 1.000 Y NA
 6850986 6850987 PAU_01161 PAU_01162 gcvP cdiB FALSE 0.010 435.000 0.000 NA N NA
 6850987 6850988 PAU_01162 PAU_01163 cdiB   TRUE 0.556 62.000 0.000 NA   NA
 6850988 6850989 PAU_01163 PAU_01164     TRUE 0.915 20.000 0.000 NA   NA
 6850989 6850990 PAU_01164 PAU_01165     FALSE 0.188 168.000 0.000 NA   NA
 6850990 6850991 PAU_01165 PAU_01166   fhaB FALSE 0.042 331.000 0.000 NA   NA
 6850991 6850992 PAU_01166 PAU_01167 fhaB   TRUE 0.870 27.000 0.000 NA   NA
 6850992 6850993 PAU_01167 PAU_01168     FALSE 0.302 127.000 0.000 NA   NA
 6850993 6850994 PAU_01168 PAU_01169     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6850994 6850995 PAU_01169 PAU_01170     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6850995 6850996 PAU_01170 PAU_01171     TRUE 0.904 89.000 0.500 NA   NA
 6850996 6850997 PAU_01171 PAU_01172     TRUE 0.846 -12.000 0.000 NA   NA
 6850997 6850998 PAU_01172 PAU_01173   ydcW FALSE 0.006 1543.000 0.000 NA   NA
 6850998 6850999 PAU_01173 PAU_01174 ydcW   TRUE 0.985 16.000 0.222 NA   NA
 6850999 6851000 PAU_01174 PAU_01175     TRUE 0.821 56.000 0.150 NA   NA
 6851000 6851001 PAU_01175 PAU_01176     TRUE 0.962 36.000 0.250 NA   NA
 6851001 6851002 PAU_01176 PAU_01177   goaG TRUE 0.971 37.000 0.333 NA   NA
 6851002 6851003 PAU_01177 PAU_01178 goaG yhaH TRUE 0.797 122.000 0.333 1.000   NA
 6851003 6851004 PAU_01178 PAU_01179 yhaH   TRUE 0.947 40.000 0.222 1.000   NA
 6851004 6851005 PAU_01179 PAU_01180   forZ FALSE 0.030 851.000 0.000 1.000 Y NA
 6851005 6851006 PAU_01180 PAU_01181 forZ   TRUE 0.817 -3.000 0.021 1.000 N NA
 6851006 6851007 PAU_01181 PAU_01182     TRUE 0.712 25.000 0.021 1.000 N NA
 6851007 6851008 PAU_01182 PAU_01183   papB TRUE 0.640 44.000 0.056 1.000 N NA
 6851008 6851009 PAU_01183 PAU_01184 papB   TRUE 0.948 -19.000 0.056 1.000 Y NA
 6851009 6851010 PAU_01184 PAU_01185   papC TRUE 0.959 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 6851010 6851011 PAU_01185 PAU_01186 papC   TRUE 0.676 20.000 0.009 NA N NA
 6851011 6851012 PAU_01186 PAU_01187   alkB TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6851014 6851015 PAU_01189 PAU_01190   PE_PGRS51 FALSE 0.164 795.000 0.667 NA   NA
 6851015 6851016 PAU_01190 PAU_01191 PE_PGRS51   TRUE 0.931 98.000 0.667 NA   NA
 6851016 6851017 PAU_01191 PAU_01192     TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6851017 6851018 PAU_01192 PAU_01193     FALSE 0.018 517.000 0.000 NA   NA
 6851018 6851019 PAU_01193 PAU_01194   PE_PGRS23 FALSE 0.166 788.000 0.667 NA   NA
 6851019 6851020 PAU_01194 PAU_01195 PE_PGRS23 wdpA FALSE 0.007 1024.000 0.000 NA   NA
 6851020 6851021 PAU_01195 PAU_01196 wdpA   TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6851021 6851022 PAU_01196 PAU_01197   LOC496414 TRUE 0.929 16.000 0.000 NA   NA
 6851022 6851023 PAU_01197 PAU_01198 LOC496414   TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6851023 6851024 PAU_01198 PAU_01199     TRUE 0.960 53.000 0.500 NA   NA
 6851024 6851025 PAU_01199 PAU_01200     TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6851025 6851026 PAU_01200 PAU_01201   ISPlu10B TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851026 6851027 PAU_01201 PAU_01202 ISPlu10B FNV1726 FALSE 0.007 923.000 0.000 NA   NA
 6851027 6851028 PAU_01202 PAU_01203 FNV1726   TRUE 0.857 -10.000 0.000 NA   NA
 6851028 6851029 PAU_01203 PAU_01204   cysX TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6851029 6851030 PAU_01204 PAU_01205 cysX   TRUE 0.902 24.000 0.000 1.000   NA
 6851031 6851032 PAU_01206 PAU_01207   ygfZ TRUE 0.921 11.000 0.009 NA   NA
 6851033 6851034 PAU_01208 PAU_01209 ygfY ygfX TRUE 0.846 -19.000 0.061 NA   NA
 6851036 6851037 PAU_01211 PAU_01212 xerD dsbC TRUE 0.873 25.000 0.079 1.000 N NA
 6851037 6851038 PAU_01212 PAU_01213 dsbC recJ TRUE 0.942 6.000 0.082 1.000 N NA
 6851038 6851039 PAU_01213 PAU_01214 recJ usp FALSE 0.017 546.000 0.000 1.000   NA
 6851039 6851040 PAU_01214 PAU_01215 usp   TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851040 6851041 PAU_01215 PAU_01216     FALSE 0.006 1550.000 0.000 NA   NA
 6851041 6851042 PAU_01216 PAU_01217   col TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851042 6851043 PAU_01217 PAU_01218 col imm TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6851043 6851044 PAU_01218 PAU_01219 imm col FALSE 0.185 175.000 0.000 1.000   NA
 6851044 6851045 PAU_01219 PAU_01220 col   TRUE 0.831 -16.000 0.000 1.000   NA
 6851045 6851046 PAU_01220 PAU_01221     FALSE 0.080 245.000 0.000 NA   NA
 6851046 6851047 PAU_01221 PAU_01222     FALSE 0.076 250.000 0.000 NA   NA
 6851049 6851050 PAU_01224 PAU_01225   prfB FALSE 0.071 258.000 0.000 NA   NA
 6851050 6851051 PAU_01225 PAU_01226 prfB lysS TRUE 0.995 10.000 0.162 0.045 Y NA
 6851051 6851052 PAU_01226 PAU_t015 lysS   FALSE 0.239 148.000 0.000 NA   NA
 6851052 6851053 PAU_t015 PAU_01227     FALSE 0.027 416.000 0.000 NA   NA
 6851053 6851054 PAU_01227 PAU_01228   pqqE-4 FALSE 0.014 641.000 0.000 1.000   NA
 6851054 6851055 PAU_01228 PAU_01229 pqqE-4 DAK TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000   NA
 6851055 6851056 PAU_01229 PAU_01230 DAK yfaO FALSE 0.265 81.000 0.000 1.000 N NA
 6851060 6851061 PAU_01234 PAU_01235 prpB prpC TRUE 0.928 62.000 0.502 1.000 N NA
 6851061 6851062 PAU_01235 PAU_01236 prpC prpD TRUE 0.873 59.000 0.216 1.000   NA
 6851062 6851063 PAU_01236 PAU_01237 prpD prpE TRUE 0.666 71.000 0.038 0.001   NA
 6851064 6851065 PAU_01238 PAU_01239     FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6851066 6851067 PAU_01240 PAU_01241   oprC FALSE 0.105 216.000 0.000 NA   NA
 6851069 10702242 PAU_01243s PAU_01243 norM   TRUE 0.743 -131.000 0.000 NA   NA
 10702242 6851070 PAU_01243 PAU_01244     FALSE 0.006 2082.000 0.000 NA   NA
 6851070 6851071 PAU_01244 PAU_01245     TRUE 0.912 95.000 0.556 NA   NA
 6851071 6851072 PAU_01245 PAU_01246     TRUE 0.901 53.000 0.222 1.000   NA
 6851072 6851073 PAU_01246 PAU_01247   tonB FALSE 0.380 84.000 0.000 0.078 N NA
 6851075 6851076 PAU_01249 PAU_01250 lip-1   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851078 6851079 PAU_01252 PAU_01253   prpA FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851079 6851080 PAU_01253 PAU_01254 prpA ybcA FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 6851080 6851081 PAU_01254 PAU_01255 ybcA   FALSE 0.005 484.000 0.014 NA N NA
 6851081 6851082 PAU_01255 PAU_01256     TRUE 0.426 82.000 0.000 NA   NA
 6851082 6851083 PAU_01256 PAU_01257   fic TRUE 0.948 55.000 0.429 NA   NA
 6851083 6851084 PAU_01257 PAU_01258 fic scrK FALSE 0.003 1151.000 0.000 1.000 N NA
 6851084 6851085 PAU_01258 PAU_01259 scrK   FALSE 0.144 191.000 0.000 NA   NA
 6851085 6851086 PAU_01259 PAU_01260   scrA TRUE 0.524 70.000 0.050 NA   NA
 6851086 6851087 PAU_01260 PAU_01261 scrA scrB TRUE 0.998 0.000 0.475 1.000 Y NA
 6851087 6851088 PAU_01261 PAU_01262 scrB   FALSE 0.296 129.000 0.000 NA   NA
 6851088 6851089 PAU_01262 PAU_01263   ISPlu16B FALSE 0.330 117.000 0.000 NA   NA
 6851089 6851090 PAU_01263 PAU_01264 ISPlu16B psu TRUE 0.417 85.000 0.000 NA   NA
 6851090 6851091 PAU_01264 PAU_01265 psu psu TRUE 0.758 -85.000 0.000 NA   NA
 6851092 6851093 PAU_01266 PAU_01267     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851093 6851094 PAU_01267 PAU_s010     FALSE 0.037 357.000 0.000 NA   NA
 6851094 6851095 PAU_s010 PAU_01268     TRUE 0.746 -122.000 0.000 NA   NA
 6851095 6851096 PAU_01268 PAU_01269   smpB TRUE 0.571 48.000 0.003 NA   NA
 6851097 6851098 PAU_01270 PAU_01271 yfjG yfjF TRUE 0.949 -7.000 0.124 NA   NA
 6851099 6851100 PAU_01272 PAU_01273 smpA recN FALSE 0.232 113.000 0.049 1.000 N NA
 6851100 6851101 PAU_01273 PAU_01274 recN ppnK TRUE 0.608 88.000 0.170 1.000 N NA
 6851101 6851102 PAU_01274 PAU_01275 ppnK   TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   NA
 6851102 6851103 PAU_01275 PAU_01276   ung FALSE 0.123 205.000 0.000 NA   NA
 6851104 6851105 PAU_01277 PAU_01278 yplA   TRUE 0.992 16.000 0.375 NA   NA
 6851107 6851108 PAU_01280 PAU_01281     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851108 6851109 PAU_01281 PAU_01282   pcrB TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6851109 6851110 PAU_01282 PAU_01283 pcrB idi TRUE 0.935 16.000 0.000 1.000   NA
 6851110 6851111 PAU_01283 PAU_01284 idi   FALSE 0.238 94.000 0.000 1.000 N NA
 6851111 6851112 PAU_01284 PAU_01285     FALSE 0.015 572.000 0.000 NA   NA
 6851112 6851113 PAU_01285 PAU_01286     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851113 6851114 PAU_01286 PAU_01287     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851114 6851115 PAU_01287 PAU_01288     FALSE 0.072 269.000 0.000 1.000   NA
 6851115 6851116 PAU_01288 PAU_01289     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6851116 6851117 PAU_01289 PAU_01290     TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6851117 6851118 PAU_01290 PAU_01291     TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6851118 6851119 PAU_01291 PAU_01292     TRUE 0.413 86.000 0.000 NA   NA
 6851119 6851120 PAU_01292 PAU_01293     FALSE 0.314 129.000 0.000 1.000   NA
 6851120 6851121 PAU_01293 PAU_01294   hlyD TRUE 0.894 -7.000 0.000 1.000   NA
 6851121 6851122 PAU_01294 PAU_01295 hlyD   FALSE 0.009 811.000 0.000 NA   NA
 6851126 6851127 PAU_01299 PAU_01300 rpoE rseA TRUE 0.983 40.000 0.705 NA N NA
 6851127 6851128 PAU_01300 PAU_01301 rseA rseB TRUE 0.999 3.000 0.856 NA Y NA
 6851128 6851129 PAU_01301 PAU_01302 rseB rseC TRUE 0.999 0.000 0.609 NA Y NA
 6851129 6851130 PAU_01302 PAU_01303 rseC lepA FALSE 0.069 196.000 0.045 NA N NA
 6851130 6851131 PAU_01303 PAU_01304 lepA lepB TRUE 0.977 21.000 0.187 1.000   NA
 6851131 6851132 PAU_01304 PAU_01305 lepB rnc FALSE 0.350 170.000 0.117 1.000   NA
 6851132 6851133 PAU_01305 PAU_01306 rnc era TRUE 0.981 -3.000 0.127 0.039   NA
 6851133 6851134 PAU_01306 PAU_01307 era recO TRUE 0.975 11.000 0.109 1.000   NA
 6851134 6851135 PAU_01307 PAU_01308 recO pdxJ TRUE 0.388 150.000 0.166 1.000 N NA
 6851135 6851136 PAU_01308 PAU_01309 pdxJ acpS TRUE 0.990 0.000 0.326 1.000 N NA
 6851137 6851138 PAU_01310 PAU_01311 yfhL   FALSE 0.024 443.000 0.000 NA   NA
 6851138 6851139 PAU_01311 PAU_01312     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851139 6851140 PAU_01312 PAU_01313     FALSE 0.065 271.000 0.000 NA   NA
 6851140 6851141 PAU_01313 PAU_01314     TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6851141 6851142 PAU_01314 PAU_01315     FALSE 0.029 403.000 0.000 NA   NA
 6851142 6851143 PAU_01315 PAU_01316     TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6851143 6851144 PAU_01316 PAU_01317     FALSE 0.015 575.000 0.000 NA   NA
 6851144 6851145 PAU_01317 PAU_01318     FALSE 0.022 456.000 0.000 NA   NA
 6851146 6851147 PAU_01319 PAU_01320     FALSE 0.089 235.000 0.000 NA   NA
 6851148 6851149 PAU_01321 PAU_01322 adiA yfhD FALSE 0.172 127.000 0.000 1.000 N NA
 6851150 6851151 PAU_01323 PAU_01324   purL FALSE 0.327 118.000 0.000 NA   NA
 6851152 6851153 PAU_01325 PAU_s011     FALSE 0.025 430.000 0.000 NA   NA
 6851154 6851155 PAU_01326 PAU_01327 yfhK   TRUE 0.979 0.000 0.132 NA   NA
 6851155 6851156 PAU_01327 PAU_01328   yfhA TRUE 0.973 -3.000 0.130 NA   NA
 6851156 6851157 PAU_01328 PAU_01329 yfhA nadE TRUE 0.544 68.000 0.065 0.090 N NA
 6851157 6851158 PAU_01329 PAU_01330 nadE glnB TRUE 0.962 16.000 0.151 1.000 N NA
 6851158 6851159 PAU_01330 PAU_01331 glnB ehpF FALSE 0.014 641.000 0.000 1.000   NA
 6851159 6851160 PAU_01331 PAU_01332 ehpF ehpG TRUE 0.917 137.000 0.667 0.056   NA
 6851160 6851161 PAU_01332 PAU_01333 ehpG ehpG TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851161 6851162 PAU_01333 PAU_01334 ehpG   FALSE 0.073 254.000 0.000 NA   NA
 6851162 6851163 PAU_01334 PAU_01335     FALSE 0.212 158.000 0.000 NA   NA
 6851163 6851164 PAU_01335 PAU_01336     TRUE 0.834 -13.000 0.000 NA   NA
 6851165 6851166 PAU_01337 PAU_01338   mxcG TRUE 0.872 64.000 0.000 0.006 Y NA
 6851166 6851167 PAU_01338 PAU_01339 mxcG mchD TRUE 0.669 37.000 0.000 1.000 N NA
 6851167 6851168 PAU_01339 PAU_01340 mchD mchC TRUE 0.992 19.000 0.429 NA   NA
 6851168 6851169 PAU_01340 PAU_01341 mchC   TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6851169 6851170 PAU_01341 PAU_01342   mchB FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 6851171 6851172 PAU_01343 PAU_01344 mclA mchF TRUE 0.430 88.000 0.000 1.000   NA
 6851172 6851173 PAU_01344 PAU_01345 mchF mchF TRUE 0.851 40.000 0.000 0.061   NA
 6851173 6851174 PAU_01345 PAU_01346 mchF   FALSE 0.010 729.000 0.000 NA   NA
 6851174 6851175 PAU_01346 PAU_01347     TRUE 0.798 38.000 0.000 NA   NA
 6851175 6851176 PAU_01347 PAU_01348     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851176 6851177 PAU_01348 PAU_01349     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851177 6851178 PAU_01349 PAU_01350     TRUE 0.940 13.000 0.000 NA   NA
 6851178 6851179 PAU_01350 PAU_01351     TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851181 6851182 PAU_01353 PAU_01354 N glyA FALSE 0.175 173.000 0.000 NA   NA
 6851182 6851183 PAU_01354 PAU_01355 glyA hcaT FALSE 0.179 184.000 0.044 1.000   NA
 6851183 6851184 PAU_01355 PAU_01356 hcaT treR TRUE 0.471 75.000 0.000 1.000   NA
 6851184 6851185 PAU_01356 PAU_01357 treR treB TRUE 0.419 145.000 0.168 1.000 N NA
 6851185 6851186 PAU_01357 PAU_01358 treB treC TRUE 0.977 76.000 0.650 1.000 Y NA
 6851188 6851189 PAU_01360 PAU_01361 trmJ iscR TRUE 0.515 88.000 0.126 1.000 N NA
 6851189 6851190 PAU_01361 PAU_01362 iscR iscS TRUE 0.935 51.000 0.424 1.000 N NA
 6851190 6851191 PAU_01362 PAU_01363 iscS nifU TRUE 0.983 26.000 0.448 1.000 N NA
 6851191 6851192 PAU_01363 PAU_01364 nifU iscA TRUE 0.891 104.000 0.359 0.003   NA
 6851192 6851193 PAU_01364 PAU_01365 iscA hscB TRUE 0.980 40.000 0.500 1.000   NA
 6851193 6851194 PAU_01365 PAU_01366 hscB hscA TRUE 0.999 12.000 0.634 1.000 Y NA
 6851194 6851195 PAU_01366 PAU_01367 hscA fdx TRUE 0.997 3.000 0.794 1.000 N NA
 6851195 6851196 PAU_01367 PAU_01368 fdx   TRUE 0.996 19.000 0.625 1.000   NA
 6851196 6851197 PAU_01368 PAU_01369   pepB TRUE 0.405 184.000 0.171 1.000   NA
 6851197 6851198 PAU_01369 PAU_01370 pepB   TRUE 0.964 35.000 0.253 NA   NA
 6851198 6851199 PAU_01370 PAU_01371     TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851199 6851200 PAU_01371 PAU_01372   cysK FALSE 0.014 587.000 0.000 NA   NA
 6851200 6851201 PAU_01372 PAU_01373 cysK   TRUE 0.907 18.000 0.025 NA   NA
 6851201 6851202 PAU_01373 PAU_01374     FALSE 0.091 232.000 0.000 NA   NA
 6851202 6851203 PAU_01374 PAU_01375     TRUE 0.949 2.000 0.000 NA   NA
 6851203 6851204 PAU_01375 PAU_01376     FALSE 0.030 392.000 0.000 NA   NA
 6851204 6851205 PAU_01376 PAU_01377     TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6851205 6851206 PAU_01377 PAU_01378     FALSE 0.215 157.000 0.000 NA   NA
 6851208 6851209 PAU_01380 PAU_01381   pbpC TRUE 0.977 55.000 0.711 1.000   NA
 6851209 6851210 PAU_01381 PAU_01382 pbpC ndk FALSE 0.072 144.000 0.008 1.000 N NA
 6851210 6851211 PAU_01382 PAU_01383 ndk yfgB FALSE 0.378 184.000 0.156 1.000   NA
 6851211 6851212 PAU_01383 PAU_01384 yfgB pilF TRUE 0.525 84.000 0.067 1.000   NA
 6851212 6851213 PAU_01384 PAU_01385 pilF yfgA TRUE 0.596 122.000 0.153 1.000   NA
 6851213 6851214 PAU_01385 PAU_01386 yfgA ispG TRUE 0.834 71.000 0.233 1.000   NA
 6851214 6851215 PAU_01386 PAU_01387 ispG hisS TRUE 0.583 121.000 0.207 1.000 N NA
 6851215 6851216 PAU_01387 PAU_01388 hisS   TRUE 0.990 12.000 0.259 1.000   NA
 6851216 6851217 PAU_01388 PAU_01389     TRUE 0.995 14.000 0.492 1.000   NA
 6851217 6851218 PAU_01389 PAU_01390   engA FALSE 0.243 269.000 0.203 1.000   NA
 6851219 6851220 PAU_01391 PAU_01392     FALSE 0.207 160.000 0.000 NA   NA
 6851220 6851221 PAU_01392 PAU_01393   hemF FALSE 0.098 232.000 0.000 1.000   NA
 6851224 6851225 PAU_01396 PAU_01397   cysP FALSE 0.053 296.000 0.000 NA   NA
 6851225 6851226 PAU_01397 PAU_01398 cysP cysU TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 6851226 6851227 PAU_01398 PAU_01399 cysU cysW TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 6851227 6851228 PAU_01399 PAU_01400 cysW cysA TRUE 0.988 -7.000 0.180 1.000 Y NA
 6851228 6851229 PAU_01400 PAU_01401 cysA cysM FALSE 0.169 140.000 0.049 1.000 N NA
 6851230 6851231 PAU_01402 PAU_01403 crr ptsI TRUE 0.952 50.000 0.114 0.006 Y NA
 6851231 6851232 PAU_01403 PAU_01404 ptsI ptsH TRUE 0.611 185.000 0.088 0.006 Y NA
 6851232 6851233 PAU_01404 PAU_01405 ptsH cysK FALSE 0.014 329.000 0.019 1.000 N NA
 6851233 6851234 PAU_01405 PAU_01406 cysK cysZ TRUE 0.769 122.000 0.122 1.000 Y NA
 6851235 6851236 PAU_01407 PAU_01408 zipA ligA FALSE 0.253 62.000 0.013 1.000 N NA
 6851236 6851237 PAU_01408 PAU_01409 ligA nupC FALSE 0.097 170.000 0.000 1.000 N NA
 6851237 6851238 PAU_01409 PAU_01410 nupC   FALSE 0.361 85.000 0.022 NA   NA
 6851239 6851240 PAU_t016 PAU_t017     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851240 6851241 PAU_t017 PAU_01411   gltX FALSE 0.069 263.000 0.000 NA   NA
 6851242 6851243 PAU_t018 PAU_t019     TRUE 0.832 34.000 0.000 NA   NA
 6851243 6851244 PAU_t019 PAU_t020     TRUE 0.694 47.000 0.000 NA   NA
 6851244 6851245 PAU_t020 PAU_t021     TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6851245 6851246 PAU_t021 PAU_t022     TRUE 0.755 42.000 0.000 NA   NA
 6851246 6851247 PAU_t022 PAU_t023     TRUE 0.731 44.000 0.000 NA   NA
 6851247 6851248 PAU_t023 PAU_t024     FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6851248 6851249 PAU_t024 PAU_t025     FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851249 6851250 PAU_t025 PAU_t026     FALSE 0.341 112.000 0.000 NA   NA
 6851250 6851251 PAU_t026 PAU_t027     FALSE 0.350 108.000 0.000 NA   NA
 6851251 6851252 PAU_t027 PAU_01412   glk FALSE 0.050 307.000 0.000 NA   NA
 6851256 6851257 PAU_01415 PAU_01416   fadI FALSE 0.072 292.000 0.061 NA   NA
 6851257 6851258 PAU_01416 PAU_01417 fadI fadJ TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 6851258 6851259 PAU_01417 PAU_01418 fadJ sixA FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 6851261 6851262 PAU_01420 PAU_01421 hutI hutG TRUE 0.964 18.000 0.171 1.000 N NA
 6851262 6851263 PAU_01421 PAU_01422 hutG hutC FALSE 0.282 108.000 0.062 1.000 N NA
 6851263 6851264 PAU_01422 PAU_01423 hutC hutU FALSE 0.011 444.000 0.037 1.000 N NA
 6851264 6851265 PAU_01423 PAU_01424 hutU hutH TRUE 0.998 9.000 0.315 0.001 Y NA
 6851265 6851266 PAU_01424 PAU_01425 hutH   TRUE 0.677 86.000 0.008 1.000 Y NA
 6851266 6851267 PAU_01425 PAU_01426     FALSE 0.044 236.000 0.000 1.000 N NA
 6851267 6851268 PAU_01426 PAU_01427   aroC TRUE 0.407 81.000 0.081 1.000 N NA
 6851268 6851269 PAU_01427 PAU_01428 aroC   FALSE 0.326 88.000 0.005 1.000   NA
 6851269 6851270 PAU_01428 PAU_01429     TRUE 0.962 24.000 0.153 NA   NA
 6851270 6851271 PAU_01429 PAU_01430     TRUE 0.991 22.000 0.425 NA   NA
 6851272 6851273 PAU_01431 PAU_01432   dinJ TRUE 0.905 -4.000 0.000 NA   NA
 6851273 6851274 PAU_01432 PAU_01433 dinJ yfcK FALSE 0.361 104.000 0.000 NA   NA
 6851274 6851275 PAU_01433 PAU_01434 yfcK   TRUE 0.462 170.000 0.000 1.000 Y NA
 6851277 6851278 PAU_01436 PAU_01437   env FALSE 0.016 543.000 0.000 NA   NA
 6851279 6851280 PAU_01438 PAU_01439 fabB   FALSE 0.077 248.000 0.000 NA   NA
 6851281 6851282 PAU_01440 PAU_01441 tctA tctB TRUE 0.986 11.000 0.192 NA   NA
 6851282 6851283 PAU_01441 PAU_01442 tctB tctC TRUE 0.993 15.000 0.426 NA   NA
 6851284 6851285 PAU_01443 PAU_01444     FALSE 0.026 424.000 0.000 NA   NA
 6851285 6851286 PAU_01444 PAU_01445   tctD FALSE 0.013 620.000 0.000 NA   NA
 6851286 6851287 PAU_01445 PAU_01446 tctD tctE TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 6851289 6851290 PAU_01448 PAU_01449   pdxB TRUE 0.424 90.000 0.000 1.000   NA
 6851290 6851291 PAU_01449 PAU_01450 pdxB usg TRUE 0.929 57.000 0.097 0.009 Y NA
 6851291 6851292 PAU_01450 PAU_01451 usg truA TRUE 0.598 42.000 0.040 1.000 N NA
 6851292 6851293 PAU_01451 PAU_01452 truA dedA TRUE 0.689 47.000 0.038 NA   NA
 6851293 6851294 PAU_01452 PAU_01453 dedA accD FALSE 0.307 102.000 0.020 NA   NA
 6851294 6851295 PAU_01453 PAU_01454 accD folC TRUE 0.981 -7.000 0.383 1.000 N NA
 6851295 6851296 PAU_01454 PAU_01455 folC dedD TRUE 0.966 -10.000 0.216 NA   NA
 6851296 6851297 PAU_01455 PAU_01456 dedD cvpA FALSE 0.246 200.000 0.116 NA   NA
 6851297 6851298 PAU_01456 PAU_01457 cvpA purF TRUE 0.989 15.000 0.262 1.000   NA
 6851298 6851299 PAU_01457 PAU_01458 purF ubiX TRUE 0.643 44.000 0.056 1.000 N NA
 6851300 6851301 PAU_01459 PAU_01460   yfcG FALSE 0.289 128.000 0.035 NA   NA
 6851302 6851303 PAU_01461 PAU_01462 pdl yfcD FALSE 0.026 442.000 0.000 1.000   NA
 6851303 6851304 PAU_01462 PAU_01463 yfcD   FALSE 0.021 472.000 0.000 NA   NA
 6851304 6851305 PAU_01463 PAU_01464     FALSE 0.059 284.000 0.000 NA   NA
 6851305 6851306 PAU_01464 PAU_01465     TRUE 0.805 -19.000 0.000 NA   NA
 6851307 6851308 PAU_01466 PAU_01467     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851308 6851309 PAU_01467 PAU_01468   lsrG FALSE 0.023 448.000 0.000 NA   NA
 6851309 6851310 PAU_01468 PAU_01469 lsrG yneB TRUE 0.940 12.000 0.028 1.000   NA
 6851311 6851312 PAU_01470 PAU_01471 lsrR   TRUE 0.661 87.000 0.200 1.000 N NA
 6851312 6851313 PAU_01471 PAU_01472   sypC FALSE 0.003 1648.000 0.000 1.000 N NA
 6851314 6851315 PAU_01473 PAU_01474 cdiA   FALSE 0.090 233.000 0.000 NA   NA
 6851315 6851316 PAU_01474 PAU_01475     TRUE 0.936 14.000 0.000 NA   NA
 6851316 6851317 PAU_01475 PAU_01476     FALSE 0.046 320.000 0.000 NA   NA
 6851317 6851318 PAU_01476 PAU_01477     TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6851318 6851319 PAU_01477 PAU_01478   cdiA TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851319 6851320 PAU_01478 PAU_01479 cdiA   TRUE 0.653 51.000 0.000 NA   NA
 6851320 6851321 PAU_01479 PAU_01480     TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6851321 6851322 PAU_01480 PAU_01481     FALSE 0.057 287.000 0.000 NA   NA
 6851322 6851323 PAU_01481 PAU_01482     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851323 6851324 PAU_01482 PAU_01483   fhaB2 FALSE 0.047 316.000 0.000 NA   NA
 6851324 6851325 PAU_01483 PAU_01484 fhaB2   FALSE 0.149 188.000 0.000 NA   NA
 6851325 6851326 PAU_01484 PAU_01485     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851326 6851327 PAU_01485 PAU_01486     TRUE 0.842 57.000 0.000 NA Y NA
 6851328 6851329 PAU_01487 PAU_01488   yadA TRUE 0.774 69.000 0.167 1.000   NA
 6851330 6851331 PAU_01489 PAU_01490     FALSE 0.023 445.000 0.000 NA   NA
 6851332 6851333 PAU_01491 PAU_01492 sypB   FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6851334 6851335 PAU_01493 PAU_01494     TRUE 0.919 19.000 0.000 NA   NA
 6851335 6851336 PAU_01494 PAU_01495   tnp FALSE 0.076 249.000 0.000 NA   NA
 6851336 6851337 PAU_01495 PAU_01496 tnp   FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6851338 6851339 PAU_01497 PAU_01498 argM astA TRUE 0.998 22.000 0.750 1.000 Y NA
 6851339 6851340 PAU_01498 PAU_01499 astA astD TRUE 0.940 4.000 0.077 1.000 N NA
 6851340 6851341 PAU_01499 PAU_01500 astD astB TRUE 0.969 28.000 0.306 1.000 N NA
 6851341 6851342 PAU_01500 PAU_01501 astB astE TRUE 0.992 13.000 0.126 1.000 Y NA
 6851342 6851343 PAU_01501 PAU_01502 astE cycA TRUE 0.827 102.000 0.143 1.000 Y NA
 6851343 6851344 PAU_01502 PAU_01503 cycA   FALSE 0.013 626.000 0.000 NA   NA
 6851344 6851345 PAU_01503 PAU_01504     FALSE 0.015 572.000 0.000 NA   NA
 6851345 6851346 PAU_01504 PAU_01505     FALSE 0.026 418.000 0.000 NA   NA
 6851347 6851348 PAU_01506 PAU_01507     TRUE 0.950 35.000 0.190 NA   NA
 6851351 6851352 PAU_01510 PAU_01511   yfcA FALSE 0.067 267.000 0.000 NA   NA
 6851353 6851354 PAU_01512 PAU_01513 pta ackA TRUE 0.939 85.000 0.634 1.000   NA
 6851355 6851356 PAU_01514 PAU_01515 yfbV yfbS FALSE 0.128 200.000 0.000 NA   NA
 6851357 6851358 PAU_01516 PAU_01517 yfbR yfbQ FALSE 0.023 692.000 0.104 1.000   NA
 6851361 6851362 PAU_01520 PAU_01521 nuoA nuoB TRUE 0.998 17.000 0.377 0.002 Y NA
 6851362 6851363 PAU_01521 PAU_01522 nuoB nuoC TRUE 0.978 122.000 0.691 0.002 Y NA
 6851363 6851364 PAU_01522 PAU_01523 nuoC nuoE TRUE 0.999 3.000 0.407 0.004 Y NA
 6851364 6851365 PAU_01523 PAU_01524 nuoE nuoF TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 6851365 6851366 PAU_01524 PAU_01525 nuoF nuoG TRUE 0.942 67.000 0.180 0.004 Y NA
 6851366 6851367 PAU_01525 PAU_01526 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 6851367 6851368 PAU_01526 PAU_01527 nuoH nuoI TRUE 0.998 14.000 0.423 0.004 Y NA
 6851368 6851369 PAU_01527 PAU_01528 nuoI nuoJ TRUE 0.999 13.000 0.428 0.004 Y NA
 6851369 6851370 PAU_01528 PAU_01529 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 6851370 6851371 PAU_01529 PAU_01530 nuoK nuoL TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 6851371 6851372 PAU_01530 PAU_01531 nuoL nuoM TRUE 0.999 21.000 0.713 0.001 Y NA
 6851372 6851373 PAU_01531 PAU_01532 nuoM nuoN TRUE 0.999 7.000 0.437 0.001 Y NA
 6851374 6851375 PAU_01533 PAU_01534   xaxA TRUE 0.719 45.000 0.000 NA   NA
 6851376 6851377 PAU_01535 PAU_01536   menF TRUE 0.684 48.000 0.000 NA   NA
 6851377 6851378 PAU_01536 PAU_01537 menF menF TRUE 0.788 39.000 0.000 NA   NA
 6851378 6851379 PAU_01537 PAU_01538 menF menD TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851379 6851380 PAU_01538 PAU_01539 menD   TRUE 0.992 -3.000 0.355 NA   NA
 6851380 6851381 PAU_01539 PAU_01540   menB TRUE 0.991 3.000 0.280 NA   NA
 6851381 6851382 PAU_01540 PAU_01541 menB menC TRUE 0.996 0.000 0.171 0.002 Y NA
 6851382 6851383 PAU_01541 PAU_01542 menC menE TRUE 0.975 -12.000 0.283 0.002 N NA
 6851383 6851384 PAU_01542 PAU_01543 menE   TRUE 0.785 -30.000 0.000 NA   NA
 6851384 6851385 PAU_01543 PAU_01544     TRUE 0.987 11.000 0.211 NA   NA
 6851389 6851390 PAU_01548 PAU_01549     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851390 6851391 PAU_01549 PAU_01550     FALSE 0.209 159.000 0.000 NA   NA
 6851392 6851393 PAU_01551 PAU_01552     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6851393 6851394 PAU_01552 PAU_01553     TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6851394 6851395 PAU_01553 PAU_01554   yfaE TRUE 0.442 77.000 0.000 NA   NA
 6851395 6851396 PAU_01554 PAU_01555 yfaE nrdB TRUE 0.889 0.000 0.034 1.000 N NA
 6851396 6851397 PAU_01555 PAU_01556 nrdB nrdA TRUE 0.998 13.000 0.333 0.001 Y NA
 6851397 6851398 PAU_01556 PAU_01557 nrdA ubiG FALSE 0.017 366.000 0.000 1.000 N NA
 6851399 6851400 PAU_01558 PAU_01559 gyrA rcsC FALSE 0.037 277.000 0.013 0.087 N NA
 6851401 6851402 PAU_01560 PAU_01561 rcsB yojN TRUE 0.999 4.000 0.558 1.000 Y NA
 6851403 6851404 PAU_01562 PAU_t029     TRUE 0.409 88.000 0.000 NA   NA
 6851406 6851407 PAU_t030 PAU_01564     FALSE 0.011 670.000 0.000 NA   NA
 6851407 6851408 PAU_01564 PAU_01565   Q FALSE 0.064 272.000 0.000 NA   NA
 6851408 6851409 PAU_01565 PAU_01566 Q   FALSE 0.031 387.000 0.000 NA   NA
 6851409 6851410 PAU_01566 PAU_01567     TRUE 0.973 4.000 0.100 NA   NA
 6851410 6851411 PAU_01567 PAU_01568     TRUE 0.972 10.000 0.100 NA   NA
 6851411 6851412 PAU_01568 PAU_01569     FALSE 0.338 113.000 0.000 NA   NA
 6851412 6851413 PAU_01569 PAU_01570     FALSE 0.139 193.000 0.000 NA   NA
 6851413 6851414 PAU_01570 PAU_01571     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851414 6851415 PAU_01571 PAU_01572     TRUE 0.824 -15.000 0.000 NA   NA
 6851415 6851416 PAU_01572 PAU_01573     TRUE 0.546 63.000 0.000 NA   NA
 6851416 6851417 PAU_01573 PAU_01574     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851417 6851418 PAU_01574 PAU_01575     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851418 6851419 PAU_01575 PAU_01576     TRUE 0.885 -7.000 0.000 NA   NA
 6851419 6851420 PAU_01576 PAU_01577     TRUE 0.998 9.000 0.792 NA   NA
 6851420 6851421 PAU_01577 PAU_01578     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851422 6851423 PAU_01579 PAU_01580 wabK waaX TRUE 0.948 35.000 0.000 1.000 Y NA
 6851425 6851426 PAU_01582 PAU_01583     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851426 6851427 PAU_01583 PAU_01584     TRUE 0.508 67.000 0.000 NA   NA
 6851427 6851428 PAU_01584 PAU_01585     FALSE 0.284 132.000 0.000 NA   NA
 6851429 6851430 PAU_01586 PAU_01587     FALSE 0.007 920.000 0.000 NA   NA
 6851430 6851431 PAU_01587 PAU_01588     FALSE 0.034 376.000 0.000 NA   NA
 6851431 6851432 PAU_01588 PAU_01589     TRUE 0.945 11.000 0.000 NA   NA
 6851433 6851434 PAU_01590 PAU_01591     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851435 6851436 PAU_01592 PAU_01593   ycfB TRUE 0.688 49.000 0.000 1.000   NA
 6851436 6851437 PAU_01593 PAU_01594 ycfB   FALSE 0.010 741.000 0.000 NA   NA
 6851437 6851438 PAU_01594 PAU_01595     TRUE 0.949 1.000 0.000 NA   NA
 6851438 6851439 PAU_01595 PAU_01596   DKFZp469A1918 TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851440 6851441 PAU_01597 PAU_01598     FALSE 0.029 399.000 0.000 NA   NA
 6851441 6851442 PAU_01598 PAU_01599   dmsD FALSE 0.017 561.000 0.000 1.000   NA
 6851442 6851443 PAU_01599 PAU_01600 dmsD   FALSE 0.024 437.000 0.000 NA   NA
 6851444 6851445 PAU_01601 PAU_01602 cbiA cobD TRUE 0.993 -3.000 0.124 0.008 Y NA
 6851445 6851446 PAU_01602 PAU_01603 cobD cbiC TRUE 0.993 15.000 0.107 0.008 Y NA
 6851446 6851447 PAU_01603 PAU_01604 cbiC cbiD TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.008 Y NA
 6851447 6851448 PAU_01604 PAU_01605 cbiD cbiE TRUE 0.994 -3.000 0.126 0.008 Y NA
 6851448 6851449 PAU_01605 PAU_01606 cbiE cbiT TRUE 0.994 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 6851449 6851450 PAU_01606 PAU_01607 cbiT cbiF TRUE 0.976 -10.000 0.056 0.008 Y NA
 6851450 6851451 PAU_01607 PAU_01608 cbiF cbiG TRUE 0.994 -19.000 0.397 0.008 Y NA
 6851451 6851452 PAU_01608 PAU_01609 cbiG cbiH TRUE 0.997 -6.000 0.352 0.008 Y NA
 6851452 6851453 PAU_01609 PAU_01610 cbiH cbiJ TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.008 Y NA
 6851453 6851454 PAU_01610 PAU_01611 cbiJ cbiK TRUE 0.985 2.000 0.029 1.000 Y NA
 6851454 6851455 PAU_01611 PAU_01612 cbiK cbiL TRUE 0.987 0.000 0.048 1.000 Y NA
 6851455 6851456 PAU_01612 PAU_01613 cbiL cobQ TRUE 0.980 19.000 0.003 0.008 Y NA
 6851456 6851457 PAU_01613 PAU_01614 cobQ cobU TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 6851457 6851458 PAU_01614 PAU_01615 cobU cobS TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 6851460 6851461 PAU_01617 PAU_01618 cobC cobT TRUE 0.856 5.000 0.023 1.000 N NA
 6851463 6851464 PAU_01620 PAU_01621     FALSE 0.028 411.000 0.000 NA   NA
 6851464 6851465 PAU_01621 PAU_01622     TRUE 0.946 8.000 0.000 NA   NA
 6851466 6851467 PAU_01623 PAU_01624     TRUE 0.574 60.000 0.000 NA   NA
 6851467 6851468 PAU_01624 PAU_01625     TRUE 0.526 65.000 0.000 NA   NA
 6851468 6851469 PAU_01625 PAU_01626   mcoln1 TRUE 0.926 17.000 0.000 NA   NA
 6851469 6851470 PAU_01626 PAU_01627 mcoln1   TRUE 0.608 56.000 0.000 NA   NA
 6851471 6851472 PAU_01628 PAU_01629 LytE   FALSE 0.045 321.000 0.000 NA   NA
 6851473 6851474 PAU_01630 PAU_01631   eutC FALSE 0.078 256.000 0.000 1.000   NA
 6851474 6851475 PAU_01631 PAU_01632 eutC eutB TRUE 0.983 23.000 0.000 0.001 Y NA
 6851475 6851476 PAU_01632 PAU_01633 eutB eutA TRUE 0.993 12.000 0.167 NA Y NA
 6851477 6851478 PAU_01634 PAU_01635 cysG cobD TRUE 0.737 34.000 0.047 1.000 N NA
 6851478 6851479 PAU_01635 PAU_01636 cobD pduX TRUE 0.941 -52.000 0.300 1.000 N NA
 6851479 6851480 PAU_01636 PAU_01637 pduX cysG TRUE 0.851 18.000 0.000 1.000 N NA
 6851480 6851481 PAU_01637 PAU_01638 cysG btuR TRUE 0.986 1.000 0.000 1.000 Y NA
 6851482 6851483 PAU_01639 PAU_01640     TRUE 0.435 79.000 0.000 NA   NA
 6851484 6851485 PAU_01641 PAU_01642     FALSE 0.196 165.000 0.000 NA   NA
 6851485 6851486 PAU_01642 PAU_01643     FALSE 0.262 138.000 0.000 NA   NA
 6851486 6851487 PAU_01643 PAU_01644     TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6851487 6851488 PAU_01644 PAU_01645     FALSE 0.028 405.000 0.000 NA   NA
 6851488 6851489 PAU_01645 PAU_01646   tfa TRUE 0.947 5.000 0.000 NA   NA
 6851489 6851490 PAU_01646 PAU_01647 tfa   FALSE 0.038 353.000 0.000 NA   NA
 6851490 6851491 PAU_01647 PAU_01648     FALSE 0.044 326.000 0.000 NA   NA
 6851491 6851492 PAU_01648 PAU_01649     FALSE 0.039 349.000 0.000 NA   NA
 6851492 6851493 PAU_01649 PAU_01650     FALSE 0.034 369.000 0.000 NA   NA
 6851493 6851494 PAU_01650 PAU_01651     FALSE 0.017 523.000 0.000 NA   NA
 6851494 6851495 PAU_01651 PAU_01652     FALSE 0.075 251.000 0.000 NA   NA
 6851495 6851496 PAU_01652 PAU_01653   stfE FALSE 0.013 610.000 0.000 NA   NA
 6851496 6851497 PAU_01653 PAU_01654 stfE   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 6851497 6851498 PAU_01654 PAU_01655     FALSE 0.040 339.000 0.000 NA   NA
 6851498 6851499 PAU_01655 PAU_01656     FALSE 0.066 269.000 0.000 NA   NA
 6851499 6851500 PAU_01656 PAU_01657     FALSE 0.021 468.000 0.000 NA   NA
 6851500 6851501 PAU_01657 PAU_01658     FALSE 0.009 767.000 0.000 NA   NA
 6851502 6851503 PAU_01659 PAU_01660 insI ISPlu1B TRUE 0.516 66.000 0.000 NA   NA
 6851503 6851504 PAU_01660 PAU_01661 ISPlu1B waaX FALSE 0.205 161.000 0.000 NA   NA
 6851504 6851505 PAU_01661 PAU_t031 waaX   FALSE 0.017 539.000 0.000 NA   NA
 6851505 6851506 PAU_t031 PAU_01662   yejM TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6851506 6851507 PAU_01662 PAU_01663 yejM yejL TRUE 0.811 33.000 0.027 NA   NA
 6851509 6851510 PAU_01665 PAU_01666 rplY yejH FALSE 0.177 157.000 0.024 0.019 N NA
 6851511 6851512 PAU_01667 PAU_01668   rsuA TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851512 6851513 PAU_01668 PAU_01669 rsuA bcr TRUE 0.830 44.000 0.145 1.000 N NA
 6851513 6851514 PAU_01669 PAU_01670 bcr   FALSE 0.375 99.000 0.000 NA   NA
 6851514 6851515 PAU_01670 PAU_01671   yejG FALSE 0.011 690.000 0.000 NA   NA
 6851516 6851517 PAU_01672 PAU_01673 spr   FALSE 0.036 360.000 0.000 NA   NA
 6851519 6851520 PAU_01675 PAU_01676 yeiP mtr TRUE 0.402 139.000 0.153 1.000 N NA
 6851520 6851521 PAU_01676 PAU_01677 mtr   FALSE 0.256 118.000 0.060 1.000 N NA
 6851523 6851524 PAU_01679 PAU_01680 nfo yeiH FALSE 0.346 111.000 0.040 NA   NA
 6851525 6851526 PAU_01681 PAU_01682 yeiE lysP TRUE 0.398 160.000 0.185 1.000 N NA
 6851526 6851527 PAU_01682 PAU_01683 lysP   FALSE 0.020 335.000 0.000 1.000 N NA
 6851527 6851528 PAU_01683 PAU_01684     TRUE 0.824 123.000 0.175 1.000 Y NA
 6851528 6851529 PAU_01684 PAU_01685   fepC TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 6851531 6851532 PAU_01687 PAU_01688   yeeF FALSE 0.009 681.000 0.000 0.073 N NA
 6851532 6851533 PAU_01688 PAU_01689 yeeF   TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6851533 6851534 PAU_01689 PAU_01690   dld TRUE 0.446 76.000 0.000 NA   NA
 6851536 6851537 PAU_01692 PAU_01693     TRUE 0.946 7.000 0.000 NA   NA
 6851537 6851538 PAU_01693 PAU_01694   yeeX FALSE 0.026 419.000 0.000 NA   NA
 6851539 6851540 PAU_01695 PAU_01696   rne FALSE 0.052 163.000 0.005 1.000 N NA
 6851540 6851541 PAU_01696 PAU_s012 rne   TRUE 0.886 25.000 0.000 NA   NA
 6851544 6851545 PAU_01699 PAU_01700 yceD rpmF TRUE 0.996 13.000 0.599 NA   NA
 6851545 6851546 PAU_01700 PAU_01701 rpmF plsX TRUE 0.976 31.000 0.418 1.000 N NA
 6851546 6851547 PAU_01701 PAU_01702 plsX fabH TRUE 0.998 7.000 0.380 0.004 Y NA
 6851547 6851548 PAU_01702 PAU_01703 fabH fabD TRUE 0.995 19.000 0.182 0.004 Y NA
 6851548 6851549 PAU_01703 PAU_01704 fabD fabG TRUE 0.999 9.000 0.432 0.004 Y NA
 6851549 6851550 PAU_01704 PAU_01705 fabG acpP TRUE 0.894 155.000 0.321 0.004 Y NA
 6851550 6851551 PAU_01705 PAU_01706 acpP fabF TRUE 0.950 75.000 0.346 1.000 Y NA
 6851551 6851552 PAU_01706 PAU_01707 fabF pabC FALSE 0.176 249.000 0.187 1.000 N NA
 6851552 6851553 PAU_01707 PAU_01708 pabC yceG TRUE 0.957 33.000 0.204 NA   NA
 6851553 6851554 PAU_01708 PAU_01709 yceG tmk TRUE 0.984 -3.000 0.209 NA   NA
 6851554 6851555 PAU_01709 PAU_01710 tmk holB TRUE 0.982 0.000 0.211 1.000 N NA
 6851555 6851556 PAU_01710 PAU_01711 holB ycfH TRUE 0.952 31.000 0.000 NA Y NA
 6851556 6851557 PAU_01711 PAU_01712 ycfH hinT FALSE 0.060 197.000 0.000 NA N NA
 6851557 6851558 PAU_01712 PAU_01713 hinT ycfM FALSE 0.036 299.000 0.010 NA   NA
 6851558 6851559 PAU_01713 PAU_01714 ycfM thiK TRUE 0.973 -13.000 0.310 NA   NA
 6851561 6851562 PAU_01716 PAU_01717 nagZ ndh FALSE 0.009 487.000 0.000 1.000 N NA
 6851563 6851564 PAU_01718 PAU_01719   yiaC FALSE 0.065 282.000 0.000 1.000   NA
 6851564 6851565 PAU_01719 PAU_01720 yiaC pvcB FALSE 0.146 195.000 0.000 1.000   NA
 6851565 6851566 PAU_01720 PAU_01721 pvcB pvcA TRUE 0.999 13.000 0.630 NA Y NA
 6851566 6851567 PAU_01721 PAU_01722 pvcA   FALSE 0.363 103.000 0.000 NA   NA
 6851567 6851568 PAU_01722 PAU_01723   mfd FALSE 0.015 563.000 0.000 NA   NA
 6851568 6851569 PAU_01723 PAU_01724 mfd   FALSE 0.030 389.000 0.000 NA   NA
 6851570 6851571 PAU_01725 PAU_01726   lolC FALSE 0.086 238.000 0.000 NA   NA
 6851571 6851572 PAU_01726 PAU_01727 lolC lolD TRUE 0.963 -7.000 0.175 0.041 N NA
 6851572 6851573 PAU_01727 PAU_01728 lolD lolE TRUE 0.976 0.000 0.125 0.041 N NA
 6851573 6851574 PAU_01728 PAU_01729 lolE cobB FALSE 0.236 78.000 0.030 1.000 N NA
 6851574 6851575 PAU_01729 PAU_01730 cobB pepT FALSE 0.323 56.000 0.019 1.000 N NA
 6851576 6851577 PAU_01731 PAU_01732   ycfD FALSE 0.054 293.000 0.000 NA   NA
 6851577 6851578 PAU_01732 PAU_01733 ycfD phoQ TRUE 0.884 84.000 0.408 NA   NA
 6851578 6851579 PAU_01733 PAU_01734 phoQ phoP TRUE 0.999 20.000 0.940 1.000 Y NA
 6851579 6851580 PAU_01734 PAU_01735 phoP purB FALSE 0.022 244.000 0.011 1.000 N NA
 6851580 6851581 PAU_01735 PAU_01736 purB   TRUE 0.939 24.000 0.093 NA   NA
 6851581 6851582 PAU_01736 PAU_01737   trmU TRUE 0.985 3.000 0.180 NA   NA
 6851582 6851583 PAU_01737 PAU_01738 trmU ymfB TRUE 0.592 85.000 0.158 1.000 N NA
 6851583 6851584 PAU_01738 PAU_01739 ymfB rluE TRUE 0.937 -10.000 0.182 1.000 N NA
 6851585 6851586 PAU_01740 PAU_01741 icdA   FALSE 0.311 130.000 0.000 1.000   NA
 6851586 6851587 PAU_01741 PAU_01742     FALSE 0.006 1656.000 0.000 NA   NA
 6851587 6851588 PAU_01742 PAU_01743     TRUE 0.864 28.000 0.000 NA   NA
 6851588 6851589 PAU_01743 PAU_01744   yaaJ FALSE 0.025 447.000 0.000 1.000   NA
 6851589 6851590 PAU_01744 PAU_01745 yaaJ ybjR FALSE 0.080 254.000 0.095 1.000 N NA
 6851592 6851593 PAU_01747 PAU_01748   yddG TRUE 0.877 26.000 0.000 NA   NA
 6851594 6851595 PAU_01749 PAU_01750 yidA   TRUE 0.787 86.000 0.222 1.000   NA
 6851596 6851597 PAU_01751 PAU_01752 yobG   FALSE 0.166 179.000 0.000 NA   NA
 6851597 6851598 PAU_01752 PAU_01753   aroP TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851599 6851600 PAU_01754 PAU_01755 crcA ERF2 TRUE 0.947 4.000 0.000 NA   NA
 6851601 6851602 PAU_01756 PAU_s013 cspC   FALSE 0.331 116.000 0.000 NA   NA
 6851602 6851603 PAU_s013 PAU_01757   thiD TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851606 6851607 PAU_01760 PAU_01761   cII TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851607 6851608 PAU_01761 PAU_01762 cII yegQ FALSE 0.006 1553.000 0.000 NA   NA
 6851608 6851609 PAU_01762 PAU_01763 yegQ   FALSE 0.090 197.000 0.008 NA   NA
 6851609 6851610 PAU_01763 PAU_01764   baeR TRUE 0.485 87.000 0.062 NA   NA
 6851610 6851611 PAU_01764 PAU_01765 baeR baeS TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 6851611 6851612 PAU_01765 PAU_01766 baeS mdtC TRUE 0.910 -3.000 0.070 NA N NA
 6851612 6851613 PAU_01766 PAU_01767 mdtC mdtB TRUE 0.992 -3.000 0.156 NA Y NA
 6851613 6851614 PAU_01767 PAU_01768 mdtB mdtA TRUE 0.994 0.000 0.500 NA N NA
 6851615 6851616 PAU_01769 PAU_01770   rihB FALSE 0.024 313.000 0.000 1.000 N NA
 6851616 6851617 PAU_01770 PAU_01771 rihB   TRUE 0.486 150.000 0.013 1.000 Y NA
 6851617 6851618 PAU_01771 PAU_01772     TRUE 0.969 9.000 0.013 0.001   NA
 6851618 6851619 PAU_01772 PAU_01773     TRUE 0.946 9.000 0.000 NA   NA
 6851619 6851620 PAU_01773 PAU_01774     FALSE 0.154 186.000 0.000 NA   NA
 6851621 6851622 PAU_01775 PAU_01776 yfgG ppx TRUE 0.946 13.000 0.047 NA   NA
 6851622 6851623 PAU_01776 PAU_01777 ppx ppk TRUE 0.998 4.000 0.486 1.000 Y NA
 6851623 6851624 PAU_01777 PAU_01778 ppk speG FALSE 0.276 79.000 0.041 1.000 N NA
 6851624 6851625 PAU_01778 PAU_01779 speG purN FALSE 0.116 125.000 0.017 1.000 N NA
 6851625 6851626 PAU_01779 PAU_01780 purN purM TRUE 0.997 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 6851627 6851628 PAU_01781 PAU_01782 upp uraA TRUE 0.861 69.000 0.101 1.000 Y NA
 6851628 6851629 PAU_01782 PAU_01783 uraA   FALSE 0.325 119.000 0.000 NA   NA
 6851630 6851631 PAU_01784 PAU_01785   celF FALSE 0.068 266.000 0.000 NA   NA
 6851631 6851632 PAU_01785 PAU_01786 celF celC TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 6851632 6851633 PAU_01786 PAU_01787 celC celB TRUE 0.991 16.000 0.091 0.005 Y NA
 6851633 6851634 PAU_01787 PAU_01788 celB celA TRUE 0.980 31.000 0.091 0.005 Y NA
 6851636 6851637 PAU_01790 PAU_01791   yfgC TRUE 0.991 10.000 0.259 1.000   NA
 6851639 6851640 PAU_01793 PAU_01794 bcp gcvR TRUE 0.910 24.000 0.102 1.000 N NA
 6851640 6851641 PAU_01794 PAU_01795 gcvR   FALSE 0.335 114.000 0.000 NA   NA
 6851642 6851643 PAU_01796 PAU_01797 dapA nlpB TRUE 0.977 17.000 0.032 NA Y NA
 6851643 6851644 PAU_01797 PAU_01798 nlpB purC FALSE 0.104 93.000 0.008 NA N NA
 6851644 6851645 PAU_01798 PAU_01799 purC   FALSE 0.008 761.000 0.000 0.084 N NA
 6851645 6851646 PAU_01799 PAU_01800     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 6851646 6851647 PAU_01800 PAU_01801     FALSE 0.064 274.000 0.000 NA   NA
 6851647 6851648 PAU_01801 PAU_01802     FALSE 0.033 380.000 0.000 NA   NA
 6851649 6851650 PAU_01803 PAU_01804 entB   TRUE 0.711 33.000 0.000 1.000 N NA
 6851650 6851651 PAU_01804 PAU_01805     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6851651 6851652 PAU_01805 PAU_01806     TRUE 0.685 -16.000 0.000 1.000 N NA
 6851652 6851653 PAU_01806 PAU_01807   pvdD/pvdJ TRUE 0.494 49.000 0.000 1.000 N NA
 6851653 6851654 PAU_01807 PAU_01808 pvdD/pvdJ   TRUE 0.923 18.000 0.000 NA   NA
 6851654 6851655 PAU_01808 PAU_01809     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA   NA
 6851655 6851656 PAU_01809 PAU_01810     FALSE 0.012 654.000 0.000 NA   NA
 6851656 6851657 PAU_01810 PAU_01811     TRUE 0.986 11.000 0.200 NA   NA
 6851658 6851659 PAU_01812 PAU_01813   yeaL TRUE 0.660 50.000 0.000 NA   NA
 6851659 6851660 PAU_01813 PAU_01814 yeaL ypfI TRUE 0.972 6.000 0.100 NA   NA
 6851661 6851662 PAU_01815 PAU_01816 ypfN vanY TRUE 0.934 -12.000 0.130 NA   NA
 6851662 6851663 PAU_01816 PAU_01817 vanY dapE TRUE 0.978 -3.000 0.163 0.017 N NA
 6851663 6851664 PAU_01817 PAU_01818 dapE   TRUE 0.988 2.000 0.292 1.000 N NA
 6851664 6851665 PAU_01818 PAU_01819   narP FALSE 0.060 208.000 0.000 1.000 N NA
 6851666 6851667 PAU_01820 PAU_01821 maeB cjrA FALSE 0.382 89.000 0.032 NA   NA
 6851667 6851668 PAU_01821 PAU_01822 cjrA   FALSE 0.247 153.000 0.048 NA   NA
 6851668 6851669 PAU_01822 PAU_01823   ptrB TRUE 0.530 131.000 0.200 1.000 N NA
 6851669 6851670 PAU_01823 PAU_01824 ptrB cjrC TRUE 0.459 132.000 0.167 1.000 N NA
 6851672 6851673 PAU_01826 PAU_01827 guaB guaA TRUE 0.935 78.000 0.190 0.001 Y NA
 6851673 6851674 PAU_01827 PAU_01828 guaA   FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 6851674 6851675 PAU_01828 PAU_01829     FALSE 0.055 292.000 0.000 NA   NA
 6851676 6851677 PAU_01830 PAU_01831     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6851679 6851680 PAU_01833 PAU_s014 yebN   TRUE 0.566 61.000 0.000 NA   NA
 6851680 6851681 PAU_s014 PAU_01834   yobD FALSE 0.207 160.000 0.000 NA   NA
 6851681 6851682 PAU_01834 PAU_01835 yobD manZ TRUE 0.794 204.000 0.755 NA   NA
 6851682 6851683 PAU_01835 PAU_01836 manZ manY TRUE 1.000 13.000 0.939 0.007 Y NA
 6851683 6851684 PAU_01836 PAU_01837 manY manX TRUE 0.949 75.000 0.255 0.007 Y NA
 6851684 6851685 PAU_01837 PAU_01838 manX   FALSE 0.043 328.000 0.000 NA   NA
 6851685 6851686 PAU_01838 PAU_01839   sdaA TRUE 0.775 40.000 0.000 NA   NA
 6851686 6851687 PAU_01839 PAU_01840 sdaA nudL TRUE 0.386 171.000 0.136 1.000   NA
 6851687 6851688 PAU_01840 PAU_01841 nudL pabB TRUE 0.971 -3.000 0.116 1.000   NA
 6851689 6851690 PAU_01842 PAU_01843 yoaH yebF TRUE 0.506 114.000 0.104 NA   NA
 6851690 6851691 PAU_01843 PAU_01844 yebF pip TRUE 0.446 73.000 0.034 NA   NA
 6851692 6851693 PAU_01845 PAU_01846 holE   TRUE 0.706 46.000 0.000 NA   NA
 6851694 6851695 PAU_01847 PAU_01848 ftnA   FALSE 0.131 195.000 0.029 1.000   NA
 6851695 6851696 PAU_01848 PAU_01849     TRUE 0.997 3.000 0.613 1.000   NA
 6851696 6851697 PAU_01849 PAU_01850     TRUE 0.978 52.000 0.704 NA   NA
 6851699 6851700 PAU_01852 PAU_01853   proQ TRUE 0.762 96.000 0.081 NA Y NA
 6851700 6851701 PAU_01853 PAU_01854 proQ prc TRUE 0.980 20.000 0.304 NA N NA
 6851701 6851702 PAU_01854 PAU_01855 prc htpX FALSE 0.040 335.000 0.000 0.017 N NA
 6851703 6851704 PAU_01856 PAU_01857 ydjN   FALSE 0.264 187.000 0.102 NA   NA
 6851705 6851706 PAU_01858 PAU_01859   yniB FALSE 0.038 351.000 0.000 NA   NA
 6851707 6851708 PAU_01860 PAU_01861 yniA yfeD FALSE 0.139 124.000 0.033 NA N NA
 6851708 6851709 PAU_01861 PAU_01862 yfeD yfeC TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.007 Y NA
 6851709 6851710 PAU_01862 PAU_01863 yfeC   TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.083 Y NA
 6851710 6851711 PAU_01863 PAU_01864     TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 6851712 6851713 PAU_01865 PAU_01866 emtA thrS FALSE 0.027 415.000 0.000 NA   NA
 6851713 6851714 PAU_01866 PAU_01867 thrS infC TRUE 0.776 148.000 0.186 1.000 Y NA
 6851714 6851715 PAU_01867 PAU_01868 infC rpmI TRUE 0.970 99.000 0.652 1.000 Y NA
 6851715 6851716 PAU_01868 PAU_01869 rpmI rplT TRUE 0.997 43.000 0.928 0.011 Y NA
 6851716 6851717 PAU_01869 PAU_01870 rplT pheS FALSE 0.349 330.000 0.202 1.000 Y NA
 6851717 6851718 PAU_01870 PAU_01871 pheS pheT TRUE 0.999 15.000 0.574 0.001 Y NA
 6851718 6851719 PAU_01871 PAU_01872 pheT ihfA TRUE 0.982 5.000 0.208 1.000 N NA
 6851719 6851720 PAU_01872 PAU_01873 ihfA btuC FALSE 0.243 70.000 0.023 1.000 N NA
 6851720 6851721 PAU_01873 PAU_01874 btuC btuD TRUE 0.988 20.000 0.133 1.000 Y NA
 6851721 6851722 PAU_01874 PAU_01875 btuD arnB FALSE 0.362 138.000 0.129 1.000 N NA
 6851722 6851723 PAU_01875 PAU_01876 arnB arnC TRUE 0.993 -10.000 0.378 NA Y NA
 6851723 6851724 PAU_01876 PAU_01877 arnC arnA TRUE 0.996 0.000 0.220 NA Y NA
 6851724 6851725 PAU_01877 PAU_01878 arnA   TRUE 0.998 0.000 0.447 1.000 Y NA
 6851725 6851726 PAU_01878 PAU_01879   arnT TRUE 0.915 8.000 0.051 1.000 N NA
 6851726 6851727 PAU_01879 PAU_01880 arnT   TRUE 0.987 15.000 0.182 0.071   NA
 6851727 6851728 PAU_01880 PAU_01881   yfbJ TRUE 0.998 0.000 0.613 0.071   NA
 6851728 6851729 PAU_01881 PAU_01882 yfbJ   TRUE 0.617 55.000 0.000 NA   NA
 6851729 6851730 PAU_01882 PAU_01883   nlpC TRUE 0.763 41.000 0.000 NA   NA
 6851734 6851735 PAU_01887 PAU_01888     TRUE 0.985 9.000 0.000 1.000 Y NA
 6851735 6851736 PAU_01888 PAU_01889     TRUE 0.963 -7.000 0.222 1.000 N NA
 6851736 6851737 PAU_01889 PAU_01890     TRUE 0.991 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 6851737 6851738 PAU_01890 PAU_01891     FALSE 0.013 614.000 0.000 NA   NA
 6851738 6851739 PAU_01891 PAU_01892     FALSE 0.020 477.000 0.000 NA   NA
 6851742 6851743 PAU_01895 PAU_01896 hmuV   TRUE 0.996 0.000 0.220 1.000 Y NA
 6851743 6851744 PAU_01896 PAU_01897   chuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 6851744 6851745 PAU_01897 PAU_01898 chuT chuS TRUE 0.997 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 6851745 6851746 PAU_01898 PAU_01899 chuS   TRUE 0.951 33.000 0.000 1.000 Y NA
 6851746 6851747 PAU_01899 PAU_01900   aroH FALSE 0.022 326.000 0.000 1.000 N NA
 6851747 6851748 PAU_01900 PAU_01901 aroH ydiA FALSE 0.196 267.000 0.165 1.000   NA
 6851751 6851752 PAU_01904 PAU_01905     TRUE 0.954 -3.000 0.129 NA N NA
 6851754 6851755 PAU_01907 PAU_01908 ydiC sufB TRUE 0.942 13.000 0.041 NA   NA
 6851755 6851756 PAU_01908 PAU_01909 sufB ynhD TRUE 0.979 57.000 0.466 1.000 Y NA
 6851756 6851757 PAU_01909 PAU_01910 ynhD ynhC TRUE 0.992 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 6851757 6851758 PAU_01910 PAU_01911 ynhC sufS TRUE 0.974 -3.000 0.193 1.000 N NA
 6851758 6851759 PAU_01911 PAU_01912 sufS sufE TRUE 0.937 38.000 0.183 NA   NA
 6851759 6851760 PAU_01912 PAU_01913 sufE ycfS TRUE 0.481 122.000 0.103 NA   NA
 6851763 6851764 PAU_01916 PAU_01917     TRUE 0.907 22.000 0.000 NA   NA
 6851764 6851765 PAU_01917 PAU_01918     FALSE 0.347 109.000 0.000 NA   NA
 6851765 6851766 PAU_01918 PAU_01919     FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 6851766 6851767 PAU_01919 PAU_01920   pykF FALSE 0.060 291.000 0.000 1.000   NA
 6851767 6851768 PAU_01920 PAU_t032 pykF   FALSE 0.022 461.000 0.000 NA   NA
 6851768 6851769 PAU_t032 PAU_t033     TRUE 0.817 36.000 0.000 NA   NA
 6851769 6851770 PAU_t033 PAU_01921   mdtK FALSE 0.178 172.000 0.000 NA   NA
 6851771 6851772 PAU_01922 PAU_01923 ribE   FALSE 0.020 476.000 0.000 NA   NA
 6851773 6851774 PAU_01924 PAU_01925 cfa ydhC FALSE 0.028 288.000 0.000 1.000 N NA
 6851776 6851777 PAU_01927 PAU_01928 purR sodB FALSE 0.009 484.000 0.000 1.000 N NA
 6851778 6851779 PAU_01929 PAU_01930   grxD FALSE 0.204 162.000 0.000 NA   NA
 6851780 6851781 PAU_01931 PAU_01932 rnt gloA TRUE 0.968 0.000 0.136 1.000 N NA
 6851782 6851783 PAU_01933 PAU_01934   slyA FALSE 0.016 559.000 0.000 NA   NA
 6851785 6851786 PAU_01936 PAU_01937 anmK pdxH FALSE 0.318 48.000 0.013 NA N NA
 6851786 6851787 PAU_01937 PAU_01938 pdxH tyrS FALSE 0.056 239.000 0.054 1.000 N NA
 6851787 6851788 PAU_01938 PAU_01939 tyrS pdxY FALSE 0.244 95.000 0.041 1.000 N NA
 6851789 6851790 PAU_01940 PAU_01941 gst   FALSE 0.039 342.000 0.000 NA   NA
 6851790 6851791 PAU_01941 PAU_01942   fabI FALSE 0.027 414.000 0.000 NA   NA
 6851791 6851792 PAU_01942 PAU_01943 fabI sapF FALSE 0.136 187.000 0.078 1.000 N NA
 6851792 6851793 PAU_01943 PAU_01944 sapF sapD TRUE 0.999 3.000 0.684 0.013 Y NA
 6851793 6851794 PAU_01944 PAU_01945 sapD sapC TRUE 0.999 1.000 0.667 1.000 Y NA
 6851794 6851795 PAU_01945 PAU_01946 sapC sapB TRUE 0.992 -13.000 0.284 0.027 Y NA
 6851795 6851796 PAU_01946 PAU_01947 sapB sapA TRUE 0.988 -3.000 0.264 0.027 N NA
 6851796 6851797 PAU_01947 PAU_01948 sapA pspF FALSE 0.356 258.000 0.402 1.000 N NA
 6851798 6851799 PAU_01949 PAU_01950 pspA pspB TRUE 0.991 36.000 0.739 NA   NA
 6851799 6851800 PAU_01950 PAU_01951 pspB pspC TRUE 0.994 -13.000 0.913 NA   NA
 6851800 6851801 PAU_01951 PAU_01952 pspC   TRUE 0.946 10.000 0.000 NA   NA
 6851801 6851802 PAU_01952 PAU_01953   ycjX FALSE 0.368 101.000 0.000 NA   NA
 6851802 6851803 PAU_01953 PAU_01954 ycjX ycjF TRUE 0.997 -3.000 0.791 NA   NA
 6851807 6851808 PAU_01958 PAU_01959 mppA   FALSE 0.090 234.000 0.000 NA   NA
 6851808 6851809 PAU_01959 PAU_01960     FALSE 0.015 575.000 0.000 NA   NA
 6851809 6851810 PAU_01960 PAU_01961     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 6851810 6851811 PAU_01961 PAU_01962     FALSE 0.161 182.000 0.000 NA   NA
 6851811 6851812 PAU_01962 PAU_01963   zntB TRUE 0.469 72.000 0.000 NA   NA
 6851812 6851813 PAU_01963 PAU_01964 zntB ydaO FALSE 0.007 558.000 0.000 NA N NA
 6851813 6851814 PAU_01964 PAU_01965 ydaO   FALSE 0.003 861.000 0.000 NA N NA
 6851814 6851815 PAU_01965 PAU_01966   ydbJ TRUE 0.670 49.000 0.000 NA   NA
 6851816 6851817 PAU_01967 PAU_01968 dsbB nhaB TRUE 0.824 160.000 0.723 1.000 N NA
 6851818 6851819 PAU_01969 PAU_01970 fadR dadA FALSE 0.008 522.000 0.000 1.000 N NA
 6851819 6851820 PAU_01970 PAU_01971 dadA dadX TRUE 0.969 15.000 0.168 1.000 N NA
 6851820 6851821 PAU_01971 PAU_01972 dadX yeaF FALSE 0.145 392.000 0.091 NA Y NA
 6851822 6851823 PAU_01973 PAU_01974 yeaD gapA TRUE 0.802 124.000 0.154 1.000 Y NA
 6851824 6851825 PAU_01975 PAU_01976 msrB yeaC TRUE 0.768 86.000 0.216 NA   NA
 6851826 6851827 PAU_01977 PAU_01978 ydjB ansA TRUE 0.882 13.000 0.040 1.000 N NA
 6851827 6851828 PAU_01978 PAU_01979 ansA sppA FALSE 0.277 153.000 0.113 1.000 N NA
 6851829 6851830 PAU_01980 PAU_01981 ydjA selD TRUE 0.870 13.000 0.033 1.000 N NA
 6851830 6851831 PAU_01981 PAU_01982 selD topB TRUE 0.897 6.000 0.041 1.000 N NA
 6851835 6851836 PAU_01986 PAU_01987     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   NA
 6851836 6851837 PAU_01987 PAU_01988   orf47 FALSE 0.010 719.000 0.000 NA   NA
 6851837 6851838 PAU_01988 PAU_01989 orf47   TRUE 0.900 23.000 0.000 NA   NA
 6851838 6851839 PAU_01989 PAU_01990     TRUE 0.644 52.000 0.000 NA   NA
 6851839 6851840 PAU_01990 PAU_01991     FALSE 0.200 164.000 0.000 NA   NA
 6851842 6851843 PAU_01993 PAU_01994     TRUE