MicrobesOnline Operon Predictions for Arthrobacter aurescens TC1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1806741 1806742 AAur_0001 AAur_0002 dnaA dnaN FALSE 0.076 576.000 0.328 1.000 Y NA
 1806742 1806743 AAur_0002 AAur_0003 dnaN   FALSE 0.238 105.000 0.024 1.000 N NA
 1806743 1806744 AAur_0003 AAur_0004     TRUE 0.629 24.000 0.029 1.000 N NA
 1806744 1806745 AAur_0004 AAur_0005     TRUE 0.884 -13.000 0.099 NA   NA
 1806745 1806746 AAur_0005 AAur_0006   gyrB FALSE 0.010 338.000 0.022 NA   NA
 1806746 1806747 AAur_0006 AAur_0007 gyrB gyrA TRUE 0.915 63.000 0.306 0.002 Y NA
 1806747 1806748 AAur_0007 AAur_0008 gyrA   TRUE 0.940 -3.000 0.053 NA   NA
 1806748 1806749 AAur_0008 AAur_0009     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1806749 1806750 AAur_0009 AAur_0010     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1806750 1806751 AAur_0010 AAur_0011     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1806751 1806752 AAur_0011 AAur_0012     FALSE 0.083 113.000 0.000 NA   NA
 1806753 1806754 AAur_0013 AAur_0014     FALSE 0.187 145.000 0.078 NA   NA
 1806755 1806756 AAur_0015 AAur_0017     TRUE 0.804 22.000 0.182 1.000   NA
 1806759 1806760 AAur_0019 AAur_0020     FALSE 0.535 105.000 0.004 NA Y NA
 1806760 1806761 AAur_0020 AAur_0021     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA Y NA
 1806761 1806762 AAur_0021 AAur_0022     TRUE 0.738 78.000 0.680 1.000 N NA
 1806762 1806763 AAur_0022 AAur_0023     TRUE 0.699 15.000 0.031 1.000 N NA
 1806763 1806764 AAur_0023 AAur_0024     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1806765 1806766 AAur_0025 AAur_0026     TRUE 0.960 4.000 0.333 NA   NA
 1806766 1806767 AAur_0026 AAur_0027     TRUE 0.933 -3.000 0.040 NA   NA
 1806768 1806769 AAur_0028 AAur_0029     TRUE 0.986 11.000 0.368 0.001 Y NA
 1806769 1806770 AAur_0029 AAur_0030     TRUE 0.993 -3.000 0.574 0.004 N NA
 1806770 1806771 AAur_0030 AAur_0031     TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1806771 1806772 AAur_0031 AAur_0032     TRUE 0.974 -3.000 0.180 1.000 N NA
 1806772 1806773 AAur_0032 AAur_0033     TRUE 0.610 61.000 0.267 NA   NA
 1806773 1806774 AAur_0033 AAur_0034     TRUE 0.988 -3.000 0.629 NA   NA
 1806776 1806777 AAur_0036 AAur_0037   clcB TRUE 0.942 11.000 0.500 1.000 N NA
 1806780 1806781 AAur_0040 AAur_0041     TRUE 0.980 -3.000 0.333 NA   NA
 1806783 1806784 AAur_0043 AAur_0044 puo   FALSE 0.535 91.000 0.273 1.000 N NA
 1806784 1806785 AAur_0044 AAur_0045     TRUE 0.871 24.000 0.375 1.000 N NA
 1806791 1806792 AAur_0051 AAur_0052     FALSE 0.527 48.000 0.059 1.000   NA
 1806792 1806793 AAur_0052 AAur_0053     TRUE 0.866 7.000 0.043 1.000 N NA
 1806793 1806794 AAur_0053 AAur_0054     TRUE 0.930 8.000 0.203 1.000 N NA
 1806797 1806798 AAur_0057 AAur_0058     FALSE 0.114 107.000 0.000 1.000   NA
 1806798 1806799 AAur_0058 AAur_0059     TRUE 0.613 23.000 0.029 1.000   NA
 1806800 1806801 AAur_0060 AAur_0061     TRUE 0.789 40.000 0.286 1.000 N NA
 1806804 1806805 AAur_0063 AAur_0065     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1806805 1806806 AAur_0065 AAur_0066     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1806809 1806810 AAur_0069 AAur_0070     FALSE 0.079 143.000 0.000 1.000 N NA
 1806812 1806813 AAur_0072 AAur_0073     FALSE 0.003 382.000 0.000 NA   NA
 1806814 1806815 AAur_0074 AAur_0075     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1806815 1806816 AAur_0075 AAur_0076     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806816 1806817 AAur_0076 AAur_0077     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 1806817 1806818 AAur_0077 AAur_0078     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806822 1806823 AAur_0082 AAur_0083     FALSE 0.002 818.000 0.000 1.000   NA
 1806823 1806824 AAur_0083 AAur_0084     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1806824 1806825 AAur_0084 AAur_0085   bglA TRUE 0.842 45.000 0.533 1.000 N NA
 1806825 1806826 AAur_0085 AAur_0086 bglA   TRUE 0.996 0.000 0.533 1.000 Y NA
 1806826 1806827 AAur_0086 AAur_0087     TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.085 Y NA
 1806827 1806828 AAur_0087 AAur_0088     TRUE 0.944 64.000 0.750 0.085 Y NA
 1806830 1806831 AAur_0090 AAur_0091 ncs2   FALSE 0.143 75.000 0.000 1.000   NA
 1806832 1806833 AAur_0092 AAur_0093     FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 1806834 1806835 AAur_0094 AAur_0095 pgm   FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000 N NA
 1806837 1806838 AAur_0097 AAur_0098     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1806838 1806839 AAur_0098 AAur_0099     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1806840 1806841 AAur_0100 AAur_0101   pheA FALSE 0.491 33.000 0.019 NA N NA
 1806845 1806846 AAur_0105 AAur_0106     FALSE 0.314 39.000 0.000 1.000   NA
 1806846 1806847 AAur_0106 AAur_0107     FALSE 0.105 79.000 0.000 NA   NA
 1806851 1806852 AAur_0111 AAur_0112     TRUE 0.984 -3.000 0.364 1.000 N NA
 1806852 1806853 AAur_0112 AAur_0113     TRUE 0.977 -3.000 0.244 1.000   NA
 1806853 1806854 AAur_0113 AAur_0114     TRUE 0.980 -3.000 0.111 0.020   NA
 1806854 1806855 AAur_0114 AAur_0115   gmhA FALSE 0.380 57.000 0.022 1.000 N NA
 1806855 1806856 AAur_0115 AAur_0116 gmhA rfaE TRUE 0.977 -3.000 0.065 0.030 N NA
 1806856 1806857 AAur_0116 AAur_0118 rfaE   TRUE 0.759 32.000 0.196 1.000   NA
 1806859 1806860 AAur_0119 AAur_0120     TRUE 0.911 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1806862 1806863 AAur_0122 AAur_0123     TRUE 0.973 -3.000 0.212 NA   NA
 1806863 1806864 AAur_0123 AAur_0124     TRUE 0.949 -3.000 0.071 NA   NA
 1806865 1806866 AAur_0125 AAur_0126     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1806866 1806867 AAur_0126 AAur_0127     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1806867 1806868 AAur_0127 AAur_0128     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1806868 1806869 AAur_0128 AAur_0129     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806869 1806870 AAur_0129 AAur_0130   ppa FALSE 0.017 200.000 0.000 NA   NA
 1806871 1806872 AAur_0131 AAur_0132 dacB   TRUE 0.717 61.000 0.500 NA   NA
 1806872 1806873 AAur_0132 AAur_0133     FALSE 0.260 93.000 0.050 NA   NA
 1806873 1806874 AAur_0133 AAur_0134   hpt TRUE 0.831 32.000 0.137 0.036 N NA
 1806878 1806879 AAur_0138 AAur_0139   folE TRUE 0.913 10.000 0.212 1.000 N NA
 1806879 1806880 AAur_0139 AAur_0140 folE folP TRUE 0.991 6.000 0.609 1.000 Y NA
 1806880 1806881 AAur_0140 AAur_0141 folP folB TRUE 0.975 13.000 0.471 1.000 Y NA
 1806881 1806882 AAur_0141 AAur_0142 folB folK TRUE 0.990 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 1806882 1806883 AAur_0142 AAur_0143 folK   TRUE 0.952 -3.000 0.081 NA   NA
 1806883 1806884 AAur_0143 AAur_0144     TRUE 0.896 -19.000 0.163 NA   NA
 1806884 1806885 AAur_0144 AAur_0145     TRUE 0.987 -3.000 0.577 NA   NA
 1806885 1806886 AAur_0145 AAur_0146     TRUE 0.890 -7.000 0.062 NA   NA
 1806886 1806887 AAur_0146 AAur_0147   panC TRUE 0.889 6.000 0.067 1.000   NA
 1806887 1806888 AAur_0147 AAur_0148 panC lmrB FALSE 0.161 106.000 0.002 1.000   NA
 1806890 1806891 AAur_0150 AAur_0151 rrsA rrlA FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 1806891 1806892 AAur_0151 AAur_0152 rrlA rrfA FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1806893 1806894 AAur_0153 AAur_0154     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1806895 1806896 AAur_0155 AAur_0156 rrsB rrlB FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 1806896 1806897 AAur_0156 AAur_0157 rrlB rrfB FALSE 0.050 144.000 0.000 NA   NA
 1806899 1806900 AAur_0159 AAur_0160     TRUE 0.980 -3.000 0.286 1.000   NA
 1806901 1806902 AAur_0161 AAur_0162     TRUE 0.865 64.000 0.750 0.004   NA
 1806902 1806903 AAur_0162 AAur_0163     TRUE 0.944 10.000 0.500 NA   NA
 1806904 1806905 AAur_0164 AAur_0165 lysS   TRUE 0.909 3.000 0.055 NA   NA
 1806905 1806906 AAur_0165 AAur_0166     FALSE 0.243 132.000 0.100 NA   NA
 1806906 1806907 AAur_0166 AAur_0167     FALSE 0.008 353.000 0.010 NA   NA
 1806907 1806908 AAur_0167 AAur_0168     FALSE 0.154 80.000 0.000 1.000 N NA
 1806908 1806909 AAur_0168 AAur_0169     FALSE 0.174 70.000 0.000 1.000 N NA
 1806909 1806910 AAur_0169 AAur_0170     FALSE 0.275 176.000 0.014 1.000 Y NA
 1806910 1806911 AAur_0170 AAur_0171   mcrA FALSE 0.043 171.000 0.000 1.000 N NA
 1806911 1806912 AAur_0171 AAur_0172 mcrA   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1806912 1806913 AAur_0172 AAur_0173   dhaK FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1806913 1806914 AAur_0173 AAur_0174 dhaK dhaK2 TRUE 0.994 3.000 0.242 0.002 Y NA
 1806914 1806915 AAur_0174 AAur_0175 dhaK2   TRUE 0.985 -3.000 0.442 1.000   NA
 1806915 1806916 AAur_0175 AAur_0176     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1806916 1806917 AAur_0176 AAur_0177     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1806917 1806918 AAur_0177 AAur_0178     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1806920 1806921 AAur_0180 AAur_0181     FALSE 0.031 164.000 0.000 NA   NA
 1806922 1806923 AAur_0182 AAur_0183     FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 1806925 1806926 AAur_0185 AAur_0186   atzF FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 1806926 1806927 AAur_0186 AAur_0187 atzF uca TRUE 0.966 -3.000 0.107 1.000 N NA
 1806927 1806928 AAur_0187 AAur_0188 uca   TRUE 0.991 -3.000 0.835 NA   NA
 1806928 1806929 AAur_0188 AAur_0189     TRUE 0.992 -3.000 0.931 NA   NA
 1806929 1806930 AAur_0189 AAur_0190     FALSE 0.523 54.000 0.108 NA   NA
 1806932 1806933 AAur_0191 AAur_0193   radA FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1806933 1806934 AAur_0193 AAur_0194 radA   FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1806935 1806936 AAur_0195 AAur_0196 pstS pstC TRUE 0.600 210.000 0.529 0.002 Y NA
 1806936 1806937 AAur_0196 AAur_0197 pstC pstA TRUE 0.995 1.000 0.172 0.002 Y NA
 1806937 1806938 AAur_0197 AAur_0198 pstA pstB TRUE 0.912 69.000 0.373 0.002 Y NA
 1806939 1806940 AAur_0199 AAur_0200     TRUE 0.961 2.000 0.184 NA   NA
 1806943 1806944 AAur_0203 AAur_0205   abfA FALSE 0.012 224.000 0.000 NA   NA
 1806945 1806946 AAur_0204 AAur_0206     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1806946 1806947 AAur_0206 AAur_0207     TRUE 0.949 11.000 0.667 NA   NA
 1806947 1806948 AAur_0207 AAur_0208     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 1806948 1806949 AAur_0208 AAur_0209     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1806949 1806950 AAur_0209 AAur_0210     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1806951 1806952 AAur_0211 AAur_0212     FALSE 0.304 35.000 0.000 NA N NA
 1806954 1806955 AAur_0214 AAur_0215 ureA ureB TRUE 0.990 9.000 0.356 0.001 Y NA
 1806955 1806956 AAur_0215 AAur_0216 ureB ureC TRUE 0.994 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 1806956 1806957 AAur_0216 AAur_0217 ureC ureE TRUE 0.941 9.000 0.087 0.001 N NA
 1806957 1806958 AAur_0217 AAur_0218 ureE ureF TRUE 0.601 199.000 0.460 0.002 Y NA
 1806958 1806959 AAur_0218 AAur_0219 ureF ureG TRUE 0.978 22.000 0.439 0.002 Y NA
 1806959 1806960 AAur_0219 AAur_0220 ureG ureD TRUE 0.706 162.000 0.337 0.002 Y NA
 1806960 1806961 AAur_0220 AAur_0222 ureD   TRUE 0.937 0.000 0.030 1.000 N NA
 1806965 1806966 AAur_0225 AAur_0226     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806967 1806968 AAur_0227 AAur_0228     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1806968 1806969 AAur_0228 AAur_0229     FALSE 0.359 64.000 0.041 1.000   NA
 1806969 1806970 AAur_0229 AAur_0230     FALSE 0.097 186.000 0.061 1.000 N NA
 1806970 1806971 AAur_0230 AAur_0231     TRUE 0.892 25.000 0.300 0.067   NA
 1806973 1806974 AAur_0233 AAur_0234     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1806976 1806977 AAur_0236 AAur_0237     TRUE 0.986 2.000 0.000 0.001 Y NA
 1806977 1806978 AAur_0237 AAur_0238     TRUE 0.943 51.000 0.667 1.000 Y NA
 1806978 1806979 AAur_0238 AAur_0239     TRUE 0.994 10.000 1.000 0.084 Y NA
 1806979 1806980 AAur_0239 AAur_0240     FALSE 0.269 34.000 0.000 NA   NA
 1806981 1806982 AAur_0241 AAur_0242     TRUE 0.925 6.000 0.182 NA   NA
 1806982 1806983 AAur_0242 AAur_0243     TRUE 0.974 -3.000 0.182 1.000 N NA
 1806984 1806985 AAur_0244 AAur_0245     TRUE 0.951 -3.000 0.076 NA   NA
 1806985 1806986 AAur_0245 AAur_0246     TRUE 0.888 8.000 0.118 NA   NA
 1806986 1806987 AAur_0246 AAur_0247     TRUE 0.624 25.000 0.000 0.067   NA
 1806987 1806988 AAur_0247 AAur_0248     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1806988 1806989 AAur_0248 AAur_0249     TRUE 0.726 45.000 0.240 NA N NA
 1806989 1806990 AAur_0249 AAur_0250     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1806992 1806993 AAur_0252 AAur_0253     FALSE 0.162 75.000 0.000 1.000 N NA
 1806994 1806995 AAur_0254 AAur_0255     TRUE 0.813 41.000 0.389 1.000   NA
 1806995 1806996 AAur_0255 AAur_0256     FALSE 0.201 184.000 0.261 1.000 N NA
 1806996 1806997 AAur_0256 AAur_0257     TRUE 0.991 0.000 0.130 1.000 Y NA
 1806997 1806998 AAur_0257 AAur_0259     FALSE 0.336 52.000 0.017 NA   NA
 1807000 1807001 AAur_0260 AAur_0261     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807003 1807004 AAur_0263 AAur_0264     FALSE 0.030 185.000 0.000 1.000   NA
 1807006 1807007 AAur_0266 AAur_0267     TRUE 0.990 -3.000 0.667 1.000 N NA
 1807007 1807008 AAur_0267 AAur_0268     TRUE 0.979 -3.000 0.286 NA N NA
 1807008 1807009 AAur_0268 AAur_0269     TRUE 0.987 -3.000 0.542 NA N NA
 1807011 1807012 AAur_0271 AAur_0272     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1807014 1807015 AAur_0274 AAur_0275     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807016 1807017 AAur_0276 AAur_0277     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807017 1807018 AAur_0277 AAur_0278     TRUE 0.820 8.000 0.028 1.000   NA
 1807020 1807021 AAur_0280 AAur_0281 proP   FALSE 0.010 288.000 0.000 1.000 N NA
 1807025 1807026 AAur_0285 AAur_0286     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1807026 1807027 AAur_0286 AAur_0287     TRUE 0.828 -66.000 0.091 NA   NA
 1807027 1807028 AAur_0287 AAur_0288     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 1807029 1807030 AAur_0289 AAur_0290     FALSE 0.311 45.000 0.000 1.000 N NA
 1807030 1807031 AAur_0290 AAur_0291     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 1807031 1807032 AAur_0291 AAur_0292     TRUE 0.950 7.000 0.378 NA   NA
 1807033 1807034 AAur_0293 AAur_0294     TRUE 0.803 75.000 0.055 0.003 Y NA
 1807034 1807035 AAur_0294 AAur_0295   fruK TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1807035 1807036 AAur_0295 AAur_0296 fruK   TRUE 0.995 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 1807036 1807037 AAur_0296 AAur_0297     FALSE 0.003 467.000 0.000 NA   NA
 1807037 1807038 AAur_0297 AAur_0298     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1807039 1807040 AAur_0299 AAur_0300     FALSE 0.002 703.000 0.000 NA   NA
 1807041 1807042 AAur_0301 AAur_0302     TRUE 0.844 20.000 0.261 NA N NA
 1807043 1807044 AAur_0303 AAur_0304     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 1807044 1807045 AAur_0304 AAur_0305     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1807045 1807046 AAur_0305 AAur_0306     FALSE 0.274 32.000 0.000 NA   NA
 1807047 1807048 AAur_0307 AAur_0308     FALSE 0.017 198.000 0.000 NA   NA
 1807048 1807049 AAur_0308 AAur_0309     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1807050 1807051 AAur_0310 AAur_0311     FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 1807051 1807052 AAur_0311 AAur_0312     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1807053 1807054 AAur_0313 AAur_0314     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 1807056 1807057 AAur_0315 AAur_0317     FALSE 0.007 285.000 0.000 NA   NA
 1807057 1807058 AAur_0317 AAur_0318     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807058 1807059 AAur_0318 AAur_0319   crtB TRUE 0.951 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1807059 1807060 AAur_0319 AAur_0320 crtB   TRUE 0.931 -3.000 0.018 1.000 N NA
 1807060 1807061 AAur_0320 AAur_0321   idi TRUE 0.973 -3.000 0.029 0.002 N NA
 1807064 1807065 AAur_0324 AAur_0325     FALSE 0.080 116.000 0.000 NA   NA
 1807065 1807066 AAur_0325 AAur_0327     TRUE 0.955 -91.000 0.750 NA   NA
 1807067 1807068 AAur_0326 AAur_0328     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1807068 1807069 AAur_0328 AAur_0329     FALSE 0.149 72.000 0.000 1.000   NA
 1807069 1807070 AAur_0329 AAur_0330     TRUE 0.948 0.000 0.059 1.000   NA
 1807070 1807071 AAur_0330 AAur_0331   gtdA TRUE 0.991 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 1807071 1807072 AAur_0331 AAur_0332 gtdA   FALSE 0.398 95.000 0.118 1.000 N NA
 1807073 1807074 AAur_0333 AAur_0334     TRUE 0.958 -7.000 0.273 1.000 N NA
 1807076 1807077 AAur_0336 AAur_0337     TRUE 0.705 42.000 0.167 1.000   NA
 1807078 1807079 AAur_0338 AAur_0339     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1807079 1807080 AAur_0339 AAur_0340     FALSE 0.031 190.000 0.000 1.000 N NA
 1807080 1807081 AAur_0340 AAur_0341     FALSE 0.487 -87.000 0.000 NA   NA
 1807081 1807082 AAur_0341 AAur_0342   adhT FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1807082 1807083 AAur_0342 AAur_0343 adhT   TRUE 0.562 -87.000 0.000 1.000   NA
 1807083 1807084 AAur_0343 AAur_0344     FALSE 0.102 82.000 0.000 NA   NA
 1807084 1807085 AAur_0344 AAur_0345     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807085 1807086 AAur_0345 AAur_0346     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1807086 1807087 AAur_0346 AAur_0347     TRUE 0.885 35.000 0.074 1.000 Y NA
 1807087 1807088 AAur_0347 AAur_0348   rbsB TRUE 0.964 13.000 0.074 0.003 Y NA
 1807088 1807089 AAur_0348 AAur_0349 rbsB fruK FALSE 0.548 86.000 0.000 1.000 Y NA
 1807089 1807090 AAur_0349 AAur_0350 fruK   TRUE 0.990 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 1807090 1807091 AAur_0350 AAur_0351     TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1807092 1807093 AAur_0352 AAur_0353     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1807099 1807100 AAur_0359 AAur_0360     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1807101 1807102 AAur_0361 AAur_0362     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1807103 1807104 AAur_0363 AAur_0364     TRUE 0.891 -16.000 0.130 NA   NA
 1807104 1807105 AAur_0364 AAur_0365     FALSE 0.412 22.000 0.000 1.000   NA
 1807106 1807107 AAur_0366 AAur_0367     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1807107 1807108 AAur_0367 AAur_0368     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807109 1807110 AAur_0369 AAur_0370 glpQ   FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1807110 1807111 AAur_0370 AAur_0371     TRUE 0.927 -3.000 0.032 NA   NA
 1807111 1807112 AAur_0371 AAur_0372     TRUE 0.989 -3.000 0.675 NA   NA
 1807114 1807115 AAur_0374 AAur_0375     FALSE 0.397 41.000 0.012 NA   NA
 1807115 1807116 AAur_0375 AAur_0376     TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000   NA
 1807118 1807119 AAur_0378 AAur_0379     TRUE 0.952 10.000 0.600 NA   NA
 1807122 1807123 AAur_0381 AAur_0383     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.006 Y NA
 1807124 1807125 AAur_0384 AAur_0385     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 1807125 1807126 AAur_0385 AAur_0386     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807126 1807127 AAur_0386 AAur_0387   fepD TRUE 0.995 1.000 0.500 NA Y NA
 1807127 1807128 AAur_0387 AAur_0388 fepD fepG TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.082 Y NA
 1807128 1807129 AAur_0388 AAur_0389 fepG fepC TRUE 0.920 24.000 0.096 1.000 Y NA
 1807131 1807132 AAur_0391 AAur_0392   bdh TRUE 0.927 5.000 0.119 1.000 N NA
 1807132 1807133 AAur_0392 AAur_0393 bdh   FALSE 0.095 123.000 0.000 1.000   NA
 1807135 1807136 AAur_0395 AAur_0396     FALSE 0.053 141.000 0.000 NA   NA
 1807138 1807139 AAur_0398 AAur_0399 hutU hutH TRUE 0.984 5.000 0.039 0.001 Y NA
 1807139 1807140 AAur_0399 AAur_0400 hutH   FALSE 0.498 20.000 0.006 NA   NA
 1807141 1807142 AAur_0401 AAur_0402     FALSE 0.088 103.000 0.000 NA   NA
 1807142 1807143 AAur_0402 AAur_0403     FALSE 0.066 127.000 0.000 NA   NA
 1807143 1807144 AAur_0403 AAur_0404     FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 1807144 1807145 AAur_0404 AAur_0405   hutG FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1807145 1807146 AAur_0405 AAur_0406 hutG   FALSE 0.204 100.000 0.016 1.000   NA
 1807147 1807148 AAur_0407 AAur_0408     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 1807150 1807151 AAur_0410 AAur_0411     TRUE 0.980 -58.000 0.400 1.000 Y NA
 1807152 1807153 AAur_0412 AAur_0413 czc   TRUE 0.784 11.000 0.048 1.000   NA
 1807156 1807157 AAur_0416 AAur_0417     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1807157 1807158 AAur_0417 AAur_0418     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1807161 1807162 AAur_0421 AAur_0422     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807162 1807163 AAur_0422 AAur_0423     TRUE 0.620 69.000 0.375 NA   NA
 1807163 1807164 AAur_0423 AAur_0424     FALSE 0.002 730.000 0.000 NA   NA
 1807164 1807165 AAur_0424 AAur_0425     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1807165 1807166 AAur_0425 AAur_0426     FALSE 0.490 -84.000 0.000 NA   NA
 1807166 1807167 AAur_0426 AAur_0427     FALSE 0.001 1898.000 0.000 NA   NA
 1807169 1807170 AAur_0428 AAur_0430     FALSE 0.012 223.000 0.000 NA   NA
 1807170 1807171 AAur_0430 AAur_0431     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1807171 1807172 AAur_0431 AAur_0432     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807172 1807173 AAur_0432 AAur_0433     FALSE 0.271 33.000 0.000 NA   NA
 1807173 1807174 AAur_0433 AAur_0434     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 1807174 1807175 AAur_0434 AAur_0435     TRUE 0.986 0.000 0.571 NA   NA
 1807175 1807176 AAur_0435 AAur_0436     TRUE 0.980 6.000 0.182 NA Y NA
 1807176 1807177 AAur_0436 AAur_0437     FALSE 0.004 1437.000 0.000 0.086   NA
 1807177 1807178 AAur_0437 AAur_0438     TRUE 0.957 0.000 0.111 NA   NA
 1807178 1807179 AAur_0438 AAur_0439     FALSE 0.002 566.000 0.000 NA   NA
 1807180 1807181 AAur_0440 AAur_0441     FALSE 0.117 86.000 0.000 NA N NA
 1807181 1807182 AAur_0441 AAur_0442     TRUE 0.794 75.000 1.000 NA N NA
 1807182 1807183 AAur_0442 AAur_0443     FALSE 0.021 217.000 0.000 1.000 N NA
 1807183 1807184 AAur_0443 AAur_0444     TRUE 0.988 12.000 0.688 0.081 Y NA
 1807184 1807185 AAur_0444 AAur_0445     TRUE 0.996 -6.000 0.688 0.081 Y NA
 1807186 1807187 AAur_0446 AAur_0447     TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1807188 1807189 AAur_0448 AAur_0449     TRUE 0.984 3.000 0.750 NA   NA
 1807189 1807190 AAur_0449 AAur_0450     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1807190 1807191 AAur_0450 AAur_0451     TRUE 0.734 81.000 0.800 NA   NA
 1807191 1807192 AAur_0451 AAur_0452     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807192 1807193 AAur_0452 AAur_0453     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1807193 1807194 AAur_0453 AAur_0454     FALSE 0.501 124.000 0.429 NA   NA
 1807194 1807195 AAur_0454 AAur_0455     TRUE 0.823 53.000 0.714 NA   NA
 1807195 1807196 AAur_0455 AAur_0456     TRUE 0.963 -13.000 0.583 NA   NA
 1807196 1807197 AAur_0456 AAur_0457     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1807199 1807200 AAur_0459 AAur_0460     TRUE 0.909 97.000 0.670 0.081 Y NA
 1807200 1807201 AAur_0460 AAur_0461     TRUE 0.998 -3.000 0.693 0.081 Y NA
 1807201 1807202 AAur_0461 AAur_0463   ccpA FALSE 0.239 116.000 0.032 1.000 N NA
 1807203 1807204 AAur_0462 AAur_0464   xth FALSE 0.503 33.000 0.029 NA   NA
 1807204 1807205 AAur_0464 AAur_0465 xth   FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1807205 1807206 AAur_0465 AAur_0466     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807206 1807207 AAur_0466 AAur_0467     TRUE 0.998 -3.000 0.625 0.011 Y NA
 1807208 1807209 AAur_0468 AAur_0469     TRUE 0.947 3.000 0.154 NA   NA
 1807210 1807211 AAur_0470 AAur_0471     TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 1807211 1807212 AAur_0471 AAur_0472     TRUE 0.989 20.000 0.889 0.001 Y NA
 1807216 1807217 AAur_0476 AAur_0477     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807217 1807218 AAur_0477 AAur_0478     FALSE 0.004 460.000 0.000 1.000 N NA
 1807218 1807219 AAur_0478 AAur_0479     FALSE 0.131 105.000 0.000 1.000 N NA
 1807219 1807220 AAur_0479 AAur_0480   fdhA FALSE 0.104 125.000 0.000 1.000 N NA
 1807220 1807221 AAur_0480 AAur_0481 fdhA   FALSE 0.069 148.000 0.000 1.000 N NA
 1807221 1807222 AAur_0481 AAur_0482   folD TRUE 0.594 11.000 0.000 1.000 N NA
 1807222 1807223 AAur_0482 AAur_0483 folD   TRUE 0.969 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1807223 1807224 AAur_0483 AAur_0484     TRUE 0.656 136.000 0.200 1.000 Y NA
 1807224 1807225 AAur_0484 AAur_0485   purU FALSE 0.493 59.000 0.080 1.000 N NA
 1807226 1807227 AAur_0486 AAur_0487     FALSE 0.049 162.000 0.000 1.000 N NA
 1807227 1807228 AAur_0487 AAur_0488     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1807230 1807231 AAur_0490 AAur_0491     TRUE 0.865 75.000 1.000 0.052 N NA
 1807233 1807234 AAur_0493 AAur_0494   hps TRUE 0.898 53.000 0.750 0.028 N NA
 1807236 1807237 AAur_0496 AAur_0497     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1807237 1807238 AAur_0497 AAur_0498     FALSE 0.030 166.000 0.000 NA   NA
 1807238 1807239 AAur_0498 AAur_0499   mmsA FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 1807239 1807240 AAur_0499 AAur_0500 mmsA   TRUE 0.942 0.000 0.037 1.000 N NA
 1807240 1807241 AAur_0500 AAur_0501   mmsB TRUE 0.950 12.000 0.096 1.000 Y NA
 1807241 1807242 AAur_0501 AAur_0502 mmsB   TRUE 0.904 46.000 0.222 1.000 Y NA
 1807242 1807243 AAur_0502 AAur_0503     FALSE 0.029 169.000 0.000 NA   NA
 1807243 1807244 AAur_0503 AAur_0505     FALSE 0.002 698.000 0.000 NA   NA
 1807246 1807247 AAur_0506 AAur_0507     FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000   NA
 1807248 1807249 AAur_0508 AAur_0509     TRUE 0.661 43.000 0.109 1.000 N NA
 1807251 1807252 AAur_0511 AAur_0512     TRUE 0.784 146.000 0.667 1.000 Y NA
 1807252 1807253 AAur_0512 AAur_0513   betB TRUE 0.992 1.000 1.000 1.000 N NA
 1807253 1807254 AAur_0513 AAur_0514 betB   FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807256 1807257 AAur_0516 AAur_0517 betI   TRUE 0.825 45.000 0.000 0.086 Y NA
 1807257 1807258 AAur_0517 AAur_0518     FALSE 0.540 78.000 0.000 NA Y NA
 1807258 1807259 AAur_0518 AAur_0519   nadE FALSE 0.034 169.000 0.000 NA N NA
 1807259 1807260 AAur_0519 AAur_0520 nadE   FALSE 0.271 68.000 0.010 1.000 N NA
 1807261 1807262 AAur_0521 AAur_0522     TRUE 0.826 91.000 0.200 0.081 Y NA
 1807262 1807263 AAur_0522 AAur_0523     TRUE 0.930 87.000 0.818 0.081 Y NA
 1807263 1807264 AAur_0523 AAur_0524     TRUE 0.978 3.000 0.040 NA Y NA
 1807264 1807265 AAur_0524 AAur_0525     TRUE 0.972 -3.000 0.200 NA   NA
 1807265 1807266 AAur_0525 AAur_0526     TRUE 0.958 -3.000 0.103 NA   NA
 1807266 1807267 AAur_0526 AAur_0527   uxaC TRUE 0.971 4.000 0.033 NA Y NA
 1807267 1807268 AAur_0527 AAur_0528 uxaC   TRUE 0.991 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 1807268 1807269 AAur_0528 AAur_0529   rspA TRUE 0.889 25.000 0.294 0.093 N NA
 1807269 1807270 AAur_0529 AAur_0530 rspA aroK TRUE 0.734 29.000 0.118 1.000 N NA
 1807270 1807271 AAur_0530 AAur_0531 aroK   FALSE 0.045 318.000 0.000 NA Y NA
 1807271 1807272 AAur_0531 AAur_0532     TRUE 0.658 127.000 0.176 NA Y NA
 1807272 1807273 AAur_0532 AAur_0533     TRUE 0.987 -108.000 0.800 1.000 Y NA
 1807273 1807274 AAur_0533 AAur_0534     FALSE 0.152 82.000 0.000 1.000 N NA
 1807274 1807275 AAur_0534 AAur_0535   pyrE TRUE 0.732 6.000 0.000 1.000 N NA
 1807275 1807276 AAur_0535 AAur_0536 pyrE   FALSE 0.257 48.000 0.000 1.000   NA
 1807276 1807277 AAur_0536 AAur_0537     FALSE 0.062 147.000 0.000 1.000   NA
 1807277 1807278 AAur_0537 AAur_0538     TRUE 0.978 -3.000 0.292 NA   NA
 1807278 1807279 AAur_0538 AAur_0539     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1807279 1807280 AAur_0539 AAur_0540     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1807280 1807281 AAur_0540 AAur_0541     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1807281 1807282 AAur_0541 AAur_0542     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1807282 1807283 AAur_0542 AAur_0543     FALSE 0.079 117.000 0.000 NA   NA
 1807283 1807284 AAur_0543 AAur_0544     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1807284 1807285 AAur_0544 AAur_0545     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807285 1807286 AAur_0545 AAur_0546     FALSE 0.030 165.000 0.000 NA   NA
 1807287 1807288 AAur_0547 AAur_0548     FALSE 0.002 537.000 0.000 NA   NA
 1807288 1807289 AAur_0548 AAur_0549     TRUE 0.827 49.000 0.000 0.011 Y NA
 1807289 1807290 AAur_0549 AAur_0550     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1807290 1807291 AAur_0550 AAur_0551     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1807292 1807293 AAur_0552 AAur_0553     FALSE 0.314 53.000 0.014 NA   NA
 1807295 1807296 AAur_0555 AAur_0556 fbaA   TRUE 0.933 0.000 0.047 NA   NA
 1807297 1807298 AAur_0557 AAur_0558 fepC fepG TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1807298 1807299 AAur_0558 AAur_0559 fepG fepD TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.081 Y NA
 1807304 1807305 AAur_0564 AAur_0565     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807305 1807306 AAur_0565 AAur_0566   gnl TRUE 0.911 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1807306 1807307 AAur_0566 AAur_0567 gnl   FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807312 1807313 AAur_0572 AAur_0573 aspA   FALSE 0.503 38.000 0.023 1.000   NA
 1807313 1807314 AAur_0573 AAur_0574     TRUE 0.903 -10.000 0.116 NA   NA
 1807314 1807315 AAur_0574 AAur_0575     TRUE 0.948 -3.000 0.070 NA   NA
 1807316 1807317 AAur_0576 AAur_0577     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000 N NA
 1807318 1807319 AAur_0578 AAur_0579     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1807320 1807321 AAur_0580 AAur_0581     FALSE 0.341 22.000 0.000 NA   NA
 1807321 1807322 AAur_0581 AAur_0582     FALSE 0.021 218.000 0.000 1.000 N NA
 1807323 1807324 AAur_0583 AAur_0584     FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000   NA
 1807325 1807326 AAur_0585 AAur_0586     FALSE 0.143 90.000 0.000 1.000 N NA
 1807328 1807329 AAur_0588 AAur_0589     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1807330 1807331 AAur_0590 AAur_0591     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 1807331 1807332 AAur_0591 AAur_0592     FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1807333 1807334 AAur_0593 AAur_0594     TRUE 0.948 34.000 0.231 0.079 Y NA
 1807334 1807335 AAur_0594 AAur_0595     TRUE 0.994 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 1807335 1807336 AAur_0595 AAur_0596     TRUE 0.961 0.000 0.105 1.000   NA
 1807336 1807337 AAur_0596 AAur_0597     TRUE 0.677 65.000 0.200 0.063   NA
 1807338 1807339 AAur_0598 AAur_0599     FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 1807342 1807343 AAur_0602 AAur_0603     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807343 1807344 AAur_0603 AAur_0604     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807344 1807345 AAur_0604 AAur_0605     FALSE 0.280 45.000 0.000 1.000   NA
 1807345 1807346 AAur_0605 AAur_0606     FALSE 0.009 287.000 0.000 1.000   NA
 1807346 1807347 AAur_0606 AAur_0607     TRUE 0.639 96.000 0.600 NA   NA
 1807347 1807348 AAur_0607 AAur_0608     TRUE 0.571 13.000 0.006 NA   NA
 1807348 1807349 AAur_0608 AAur_0609     FALSE 0.207 64.000 0.004 NA   NA
 1807349 1807350 AAur_0609 AAur_0610     FALSE 0.530 50.000 0.087 NA   NA
 1807350 1807351 AAur_0610 AAur_0611     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1807351 1807352 AAur_0611 AAur_0612     FALSE 0.033 178.000 0.000 1.000   NA
 1807352 1807353 AAur_0612 AAur_0613     TRUE 0.985 6.000 0.122 0.079 Y NA
 1807353 1807354 AAur_0613 AAur_0614     TRUE 0.997 0.000 0.415 0.079 Y NA
 1807354 1807355 AAur_0614 AAur_0615     FALSE 0.096 122.000 0.000 1.000   NA
 1807356 1807357 AAur_0616 AAur_0617     TRUE 0.958 2.000 0.167 NA   NA
 1807357 1807358 AAur_0617 AAur_0618     TRUE 0.968 3.000 0.333 NA   NA
 1807358 1807359 AAur_0618 AAur_0619     TRUE 0.972 0.000 0.188 1.000   NA
 1807359 1807360 AAur_0619 AAur_0620     TRUE 0.652 38.000 0.091 1.000   NA
 1807360 1807361 AAur_0620 AAur_0621     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807363 1807364 AAur_0622 AAur_0624     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1807364 1807365 AAur_0624 AAur_0625     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1807366 1807367 AAur_0626 AAur_0627     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807367 1807368 AAur_0627 AAur_0628     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807369 1807370 AAur_0629 AAur_0630 purL purQ TRUE 0.997 -3.000 0.346 0.001 Y NA
 1807370 1807371 AAur_0630 AAur_0631 purQ purS TRUE 0.998 2.000 0.656 0.001 Y NA
 1807373 1807374 AAur_0633 AAur_0634     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1807374 1807375 AAur_0634 AAur_0635     FALSE 0.102 126.000 0.000 1.000 N NA
 1807376 1807377 AAur_0636 AAur_0637     FALSE 0.006 317.000 0.000 1.000   NA
 1807378 1807379 AAur_0638 AAur_0639     TRUE 0.582 30.000 0.051 NA   NA
 1807379 1807380 AAur_0639 AAur_0640     TRUE 0.841 -13.000 0.051 NA   NA
 1807380 1807381 AAur_0640 AAur_0641     FALSE 0.284 114.000 0.061 1.000   NA
 1807384 1807385 AAur_0644 AAur_0645     TRUE 0.987 -7.000 0.138 0.093 Y NA
 1807385 1807386 AAur_0645 AAur_0646   opuCB TRUE 0.994 -3.000 0.115 0.093 Y NA
 1807386 1807387 AAur_0646 AAur_0647 opuCB   TRUE 0.865 29.000 0.229 0.079 N NA
 1807387 1807388 AAur_0647 AAur_0648     TRUE 0.618 -27.000 0.000 1.000   NA
 1807388 1807389 AAur_0648 AAur_0649     TRUE 0.898 6.000 0.080 1.000   NA
 1807389 1807390 AAur_0649 AAur_0650     TRUE 0.906 11.000 0.120 0.091 N NA
 1807390 1807391 AAur_0650 AAur_0651   mmsB TRUE 0.778 16.000 0.087 1.000 N NA
 1807391 1807392 AAur_0651 AAur_0652 mmsB   TRUE 0.908 6.000 0.087 1.000 N NA
 1807392 1807393 AAur_0652 AAur_0653     TRUE 0.984 1.000 0.000 0.091 Y NA
 1807393 1807394 AAur_0653 AAur_0654     TRUE 0.930 0.000 0.000 0.091   NA
 1807394 1807395 AAur_0654 AAur_0655     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1807395 1807396 AAur_0655 AAur_0656     FALSE 0.028 171.000 0.000 NA   NA
 1807397 1807398 AAur_0657 AAur_0658     FALSE 0.036 156.000 0.000 NA   NA
 1807398 1807399 AAur_0658 AAur_0659     TRUE 0.994 0.000 0.286 1.000 Y NA
 1807401 1807402 AAur_0661 AAur_0662 ask   FALSE 0.033 161.000 0.000 NA   NA
 1807404 1807405 AAur_0663 AAur_0665   recR FALSE 0.356 37.000 0.000 1.000 N NA
 1807405 1807406 AAur_0665 AAur_0666 recR dnaX TRUE 0.856 34.000 0.028 1.000 Y NA
 1807406 1807407 AAur_0666 AAur_0667 dnaX   FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 1807408 1807409 AAur_0668 AAur_0670     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 1807412 1807413 AAur_0672 AAur_0673     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807414 1807415 AAur_0674 AAur_0675     FALSE 0.049 156.000 0.000 1.000   NA
 1807415 1807416 AAur_0675 AAur_0676     FALSE 0.226 78.000 0.012 1.000   NA
 1807416 1807417 AAur_0676 AAur_0678     FALSE 0.119 143.000 0.012 1.000   NA
 1807419 1807420 AAur_0679 AAur_0680     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1807420 1807421 AAur_0680 AAur_0681     FALSE 0.032 162.000 0.000 NA   NA
 1807421 1807422 AAur_0681 AAur_0682     TRUE 0.694 23.000 0.082 NA   NA
 1807424 1807425 AAur_0684 AAur_0685     FALSE 0.279 186.000 0.500 1.000 N NA
 1807425 1807426 AAur_0685 AAur_0686     TRUE 0.980 37.000 1.000 0.078 Y NA
 1807426 1807427 AAur_0686 AAur_0687     TRUE 0.994 3.000 0.333 0.078 Y NA
 1807427 1807428 AAur_0687 AAur_0688   abfA TRUE 0.935 50.000 0.333 0.078 Y NA
 1807430 1807431 AAur_0690 AAur_0691     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 N NA
 1807432 1807433 AAur_0692 AAur_0693     TRUE 0.702 6.000 0.000 1.000   NA
 1807433 1807434 AAur_0693 AAur_0694     TRUE 0.993 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 1807434 1807435 AAur_0694 AAur_0695     TRUE 0.762 48.000 0.333 1.000 N NA
 1807435 1807436 AAur_0695 AAur_0696     FALSE 0.508 70.000 0.200 NA   NA
 1807436 1807437 AAur_0696 AAur_0697     TRUE 0.848 11.000 0.133 NA   NA
 1807437 1807438 AAur_0697 AAur_0698     TRUE 0.880 93.000 0.450 0.078 Y NA
 1807438 1807439 AAur_0698 AAur_0699     TRUE 0.909 73.000 0.500 0.078 Y NA
 1807441 1807442 AAur_0701 AAur_0702     TRUE 0.797 33.000 0.278 1.000   NA
 1807442 1807443 AAur_0702 AAur_0703     TRUE 0.992 0.000 0.944 NA   NA
 1807443 1807444 AAur_0703 AAur_0704     TRUE 0.990 -3.000 0.762 NA   NA
 1807445 1807446 AAur_0705 AAur_0706     TRUE 0.980 30.000 0.826 0.098 Y NA
 1807447 1807448 AAur_0707 AAur_0708     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 1807448 1807449 AAur_0708 AAur_0709     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1807450 1807451 AAur_0710 AAur_0711     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807452 1807453 AAur_0712 AAur_0713     TRUE 0.956 4.000 0.250 1.000   NA
 1807453 1807454 AAur_0713 AAur_0714     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1807454 1807455 AAur_0714 AAur_0715     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1807455 1807456 AAur_0715 AAur_0716     TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 1807456 1807457 AAur_0716 AAur_0717     TRUE 0.938 18.000 0.500 0.062   NA
 1807457 1807458 AAur_0717 AAur_0718     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 1807459 1807460 AAur_0719 AAur_0720     FALSE 0.443 86.000 0.167 NA N NA
 1807461 1807462 AAur_0721 AAur_0722 aceB aceA TRUE 0.577 114.000 0.020 1.000 Y NA
 1807463 1807464 AAur_0723 AAur_0725     FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000   NA
 1807467 1807468 AAur_0727 AAur_0728     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807468 1807469 AAur_0728 AAur_0729     TRUE 0.965 -91.000 1.000 NA   NA
 1807469 1807470 AAur_0729 AAur_0730     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 1807470 1807471 AAur_0730 AAur_0731     FALSE 0.034 186.000 0.000 1.000 N NA
 1807473 1807474 AAur_0733 AAur_0734     TRUE 0.959 -3.000 0.086 1.000   NA
 1807476 1807477 AAur_0736 AAur_0737 tgt   FALSE 0.292 48.000 0.003 NA   NA
 1807477 1807478 AAur_0737 AAur_0738     TRUE 0.717 61.000 0.500 NA   NA
 1807478 1807479 AAur_0738 AAur_0739     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1807479 1807480 AAur_0739 AAur_0740     FALSE 0.105 78.000 0.000 NA   NA
 1807480 1807481 AAur_0740 AAur_0741     TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA N NA
 1807481 1807482 AAur_0741 AAur_0742     TRUE 0.977 -3.000 0.250 NA N NA
 1807482 1807483 AAur_0742 AAur_0743     FALSE 0.036 156.000 0.000 NA   NA
 1807484 1807485 AAur_0744 AAur_0745     TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1807485 1807486 AAur_0745 AAur_0746     FALSE 0.504 15.000 0.000 1.000 N NA
 1807486 1807487 AAur_0746 AAur_0747     TRUE 0.638 9.000 0.000 1.000   NA
 1807487 1807488 AAur_0747 AAur_0749     TRUE 0.901 9.000 0.143 1.000   NA
 1807491 1807492 AAur_0751 AAur_0752 sufC sfuB TRUE 0.811 48.000 0.275 0.078 N NA
 1807492 1807493 AAur_0752 AAur_0753 sfuB sufA TRUE 0.996 5.000 0.824 0.078 Y NA
 1807493 1807494 AAur_0753 AAur_0754 sufA   FALSE 0.115 175.000 0.062 1.000 N NA
 1807495 1807496 AAur_0755 AAur_0756     TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 1807497 1807498 AAur_0757 AAur_0758     FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 1807499 1807500 AAur_0759 AAur_0760     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807500 1807501 AAur_0760 AAur_0761     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807501 1807502 AAur_0761 AAur_0762     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1807502 1807503 AAur_0762 AAur_0763     TRUE 0.806 51.000 0.600 NA   NA
 1807503 1807504 AAur_0763 AAur_0764   ppc FALSE 0.012 229.000 0.000 NA   NA
 1807504 1807505 AAur_0764 AAur_0765 ppc   FALSE 0.379 106.000 0.150 NA   NA
 1807508 1807509 AAur_0768 AAur_0769     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA   NA
 1807510 1807511 AAur_0770 AAur_0771     TRUE 0.924 -7.000 0.130 NA   NA
 1807516 1807517 AAur_0776 AAur_0777     TRUE 0.790 3.000 0.000 1.000   NA
 1807517 1807518 AAur_0777 AAur_0778     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1807520 1807521 AAur_0780 AAur_0781     TRUE 0.963 -7.000 0.352 1.000   NA
 1807521 1807522 AAur_0781 AAur_0782     FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1807522 1807523 AAur_0782 AAur_0783     TRUE 0.651 60.000 0.333 NA   NA
 1807523 1807524 AAur_0783 AAur_0784     FALSE 0.437 126.000 0.333 NA   NA
 1807524 1807525 AAur_0784 AAur_0785     FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 1807526 1807527 AAur_0786 AAur_0787     FALSE 0.067 126.000 0.000 NA   NA
 1807529 1807530 AAur_0789 AAur_0790     TRUE 0.973 4.000 0.489 1.000 N NA
 1807530 1807531 AAur_0790 AAur_0791     FALSE 0.307 186.000 0.591 1.000 N NA
 1807531 1807532 AAur_0791 AAur_0792     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807533 1807534 AAur_0793 AAur_0794     FALSE 0.405 23.000 0.000 1.000   NA
 1807535 1807536 AAur_0795 AAur_0796 upp   FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 1807536 1807537 AAur_0796 AAur_0797     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1807537 1807538 AAur_0797 AAur_0798     FALSE 0.520 60.000 0.143 NA   NA
 1807538 1807539 AAur_0798 AAur_0799     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1807540 1807541 AAur_0800 AAur_0801     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 1807541 1807542 AAur_0801 AAur_0802     FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 1807542 1807543 AAur_0802 AAur_0803     TRUE 0.975 22.000 0.714 1.000 Y NA
 1807544 1807545 AAur_0804 AAur_0805     FALSE 0.048 246.000 0.105 NA   NA
 1807546 1807547 AAur_0806 AAur_0807     FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 1807549 1807550 AAur_0809 AAur_0810     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000   NA
 1807551 1807552 AAur_0811 AAur_0812     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807552 1807553 AAur_0812 AAur_0813     TRUE 0.997 2.000 0.800 0.077 Y NA
 1807553 1807554 AAur_0813 AAur_0814     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.077 Y NA
 1807554 1807555 AAur_0814 AAur_0815     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807555 1807556 AAur_0815 AAur_0816     FALSE 0.162 67.000 0.000 1.000   NA
 1807557 1807558 AAur_0817 AAur_0818     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 1807558 1807559 AAur_0818 AAur_0819     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807559 1807560 AAur_0819 AAur_0820     TRUE 0.976 -3.000 0.261 NA   NA
 1807560 1807561 AAur_0820 AAur_0821     TRUE 0.606 72.000 0.375 NA   NA
 1807563 1807564 AAur_0823 AAur_0824     TRUE 0.946 23.000 0.238 1.000 Y NA
 1807564 1807565 AAur_0824 AAur_0825     TRUE 0.986 -3.000 0.424 1.000 N NA
 1807565 1807566 AAur_0825 AAur_0826     TRUE 0.944 38.000 0.421 1.000 Y NA
 1807566 1807567 AAur_0826 AAur_0827     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.003 Y NA
 1807567 1807568 AAur_0827 AAur_0828     TRUE 0.992 4.000 0.299 0.077 Y NA
 1807568 1807569 AAur_0828 AAur_0829     TRUE 0.845 102.000 0.299 0.077 Y NA
 1807573 1807574 AAur_0833 AAur_0834     FALSE 0.210 187.000 0.367 NA N NA
 1807574 1807575 AAur_0834 AAur_0835     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1807575 1807576 AAur_0835 AAur_0836   manB FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1807577 1807578 AAur_0837 AAur_0838     FALSE 0.298 132.000 0.035 0.077 N NA
 1807579 1807580 AAur_0839 AAur_0840     FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 1807581 1807582 AAur_0841 AAur_0842     FALSE 0.004 325.000 0.000 NA   NA
 1807583 1807584 AAur_0843 AAur_0844     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1807584 1807585 AAur_0844 AAur_0845     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1807586 1807587 AAur_0846 AAur_0847     TRUE 0.597 31.000 0.060 NA   NA
 1807587 1807588 AAur_0847 AAur_0848     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 1807588 1807589 AAur_0848 AAur_0849     TRUE 0.922 13.000 0.532 NA   NA
 1807589 1807590 AAur_0849 AAur_0850     FALSE 0.273 92.000 0.056 NA   NA
 1807590 1807591 AAur_0850 AAur_0851     TRUE 0.864 9.000 0.093 NA   NA
 1807591 1807592 AAur_0851 AAur_0852     FALSE 0.411 137.000 0.375 NA   NA
 1807592 1807593 AAur_0852 AAur_0854     FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000   NA
 1807595 1807596 AAur_0855 AAur_0856     TRUE 0.693 65.000 0.500 NA   NA
 1807596 1807597 AAur_0856 AAur_0857     TRUE 0.817 44.000 0.500 NA   NA
 1807597 1807598 AAur_0857 AAur_0858     FALSE 0.266 35.000 0.000 NA   NA
 1807600 1807601 AAur_0860 AAur_0861     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 1807601 1807602 AAur_0861 AAur_0862   fruK TRUE 0.711 52.000 0.000 1.000 Y NA
 1807603 1807604 AAur_0863 AAur_0864     TRUE 0.730 126.000 0.087 0.008 Y NA
 1807604 1807605 AAur_0864 AAur_0865     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1807605 1807606 AAur_0865 AAur_0866     FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1807606 1807607 AAur_0866 AAur_0867     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807607 1807608 AAur_0867 AAur_0868     FALSE 0.033 274.000 0.000 0.008 N NA
 1807608 1807609 AAur_0868 AAur_0869     FALSE 0.102 126.000 0.000 1.000 N NA
 1807610 1807611 AAur_0870 AAur_0871     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807611 1807612 AAur_0871 AAur_0872     TRUE 0.842 2.000 0.000 1.000 N NA
 1807612 1807613 AAur_0872 AAur_0873     FALSE 0.006 315.000 0.000 NA N NA
 1807613 1807614 AAur_0873 AAur_0874   rbsA TRUE 0.906 62.000 0.600 NA Y NA
 1807614 1807615 AAur_0874 AAur_0875 rbsA rbsC FALSE 0.484 117.000 0.000 1.000 Y NA
 1807618 1807619 AAur_0877 AAur_0879     TRUE 0.880 -61.000 0.182 NA   NA
 1807621 1807622 AAur_0881 AAur_0882     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 1807626 1807627 AAur_0885 AAur_0887     TRUE 0.885 9.000 0.130 NA   NA
 1807627 1807628 AAur_0887 AAur_0888   tmk TRUE 0.967 -3.000 0.037 0.096 N NA
 1807629 1807630 AAur_0889 AAur_0890 metB   TRUE 0.820 11.000 0.095 NA   NA
 1807634 1807635 AAur_0894 AAur_0895     TRUE 0.908 15.000 0.020 1.000 Y NA
 1807637 1807638 AAur_0897 AAur_0898   ispD FALSE 0.364 82.000 0.068 1.000 N NA
 1807638 1807639 AAur_0898 AAur_0899 ispD ispF TRUE 0.995 0.000 0.419 1.000 Y NA
 1807639 1807640 AAur_0899 AAur_0900 ispF   TRUE 0.774 -7.000 0.003 NA   NA
 1807640 1807641 AAur_0900 AAur_0901   cysS FALSE 0.363 36.000 0.002 NA   NA
 1807641 1807642 AAur_0901 AAur_0902 cysS   TRUE 0.723 81.000 0.088 1.000 Y NA
 1807644 1807645 AAur_0904 AAur_0905 glgX   TRUE 0.645 40.000 0.082 1.000 N NA
 1807645 1807646 AAur_0905 AAur_0906     TRUE 0.847 7.000 0.052 NA   NA
 1807648 1807649 AAur_0908 AAur_0909   treS TRUE 0.992 0.000 0.544 0.010   NA
 1807649 1807650 AAur_0909 AAur_0910 treS glgB TRUE 0.992 2.000 0.075 0.010 Y NA
 1807650 1807651 AAur_0910 AAur_0911 glgB rrsC FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 1807651 1807652 AAur_0911 AAur_0912 rrsC rrlC FALSE 0.002 618.000 0.000 NA   NA
 1807652 1807653 AAur_0912 AAur_0913 rrlC rrfC FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 1807653 1807654 AAur_0913 AAur_0914 rrfC   FALSE 0.518 -48.000 0.000 NA   NA
 1807654 1807655 AAur_0914 AAur_0915     TRUE 0.675 35.000 0.125 NA   NA
 1807656 1807657 AAur_0916 AAur_0917     TRUE 0.870 21.000 0.333 1.000 N NA
 1807658 1807659 AAur_0918 AAur_0919 malE malF TRUE 0.884 98.000 0.750 1.000 Y NA
 1807659 1807660 AAur_0919 AAur_0920 malF malG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.077 Y NA
 1807660 1807661 AAur_0920 AAur_0921 malG   TRUE 0.979 3.000 0.031 1.000 Y NA
 1807661 1807662 AAur_0921 AAur_0922     FALSE 0.189 131.000 0.031 1.000 N NA
 1807662 1807663 AAur_0922 AAur_0923     FALSE 0.015 220.000 0.000 NA N NA
 1807663 1807664 AAur_0923 AAur_0924     FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 1807667 1807668 AAur_0927 AAur_0928   nahA TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807668 1807669 AAur_0928 AAur_0929 nahA   FALSE 0.480 118.000 0.000 1.000 Y NA
 1807669 1807670 AAur_0929 AAur_0930   otsB FALSE 0.148 207.000 0.000 1.000 Y NA
 1807670 1807671 AAur_0930 AAur_0931 otsB otsA TRUE 0.994 -10.000 0.471 0.001 Y NA
 1807672 1807673 AAur_0932 AAur_0933     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1807674 1807675 AAur_0934 AAur_0935     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807675 1807676 AAur_0935 AAur_0936   panE FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000   NA
 1807676 1807677 AAur_0936 AAur_0937 panE   FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1807678 1807679 AAur_0938 AAur_0939     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 1807680 1807681 AAur_0940 AAur_0941     FALSE 0.089 98.000 0.000 NA   NA
 1807681 1807682 AAur_0941 AAur_0942     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1807682 1807683 AAur_0942 AAur_0943     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1807683 1807684 AAur_0943 AAur_0944     FALSE 0.123 114.000 0.000 1.000 N NA
 1807684 1807685 AAur_0944 AAur_0945     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.076 Y NA
 1807685 1807686 AAur_0945 AAur_0946     TRUE 0.969 47.000 0.800 0.076 Y NA
 1807686 1807687 AAur_0946 AAur_0947     TRUE 0.863 50.000 0.800 1.000   NA
 1807688 1807689 AAur_0948 AAur_0949     FALSE 0.006 363.000 0.000 1.000 N NA
 1807689 1807690 AAur_0949 AAur_0950     FALSE 0.106 124.000 0.000 1.000 N NA
 1807691 1807692 AAur_0951 AAur_0952     TRUE 0.880 20.000 0.013 NA Y NA
 1807694 1807695 AAur_0953 AAur_0955     FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1807695 1807696 AAur_0955 AAur_0956     FALSE 0.557 -21.000 0.000 NA   NA
 1807696 1807697 AAur_0956 AAur_0957     FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1807698 1807699 AAur_0958 AAur_0959     FALSE 0.014 214.000 0.000 NA   NA
 1807701 1807702 AAur_0961 AAur_0962     TRUE 0.969 3.000 0.153 0.088   NA
 1807702 1807703 AAur_0962 AAur_0963     TRUE 0.931 2.000 0.051 1.000   NA
 1807703 1807704 AAur_0963 AAur_0964     TRUE 0.940 38.000 0.375 1.000 Y NA
 1807704 1807705 AAur_0964 AAur_0965     TRUE 0.572 59.000 0.143 1.000 N NA
 1807705 1807706 AAur_0965 AAur_0966   menE TRUE 0.847 13.000 0.143 1.000 N NA
 1807706 1807707 AAur_0966 AAur_0967 menE   FALSE 0.007 308.000 0.000 1.000   NA
 1807707 1807708 AAur_0967 AAur_0968     FALSE 0.084 129.000 0.000 1.000   NA
 1807710 1807711 AAur_0970 AAur_0971     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1807711 1807712 AAur_0971 AAur_0972     FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1807713 1807714 AAur_0973 AAur_0974     TRUE 0.981 13.000 0.667 1.000 Y NA
 1807719 1807720 AAur_0979 AAur_0980     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807722 1807723 AAur_0982 AAur_0983     FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 1807723 1807724 AAur_0983 AAur_0984     FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1807726 1807727 AAur_0986 AAur_0987   gcvP FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000 N NA
 1807727 1807728 AAur_0987 AAur_0988 gcvP gcvT TRUE 0.952 15.000 0.032 0.001 Y NA
 1807728 1807729 AAur_0988 AAur_0989 gcvT gcvH TRUE 0.707 126.000 0.056 0.003 Y NA
 1807729 1807730 AAur_0989 AAur_0990 gcvH sdaA FALSE 0.055 306.000 0.000 1.000 Y NA
 1807730 1807731 AAur_0990 AAur_0991 sdaA   FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1807731 1807732 AAur_0991 AAur_0992     FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1807732 1807733 AAur_0992 AAur_0993     FALSE 0.277 108.000 0.043 1.000 N NA
 1807733 1807734 AAur_0993 AAur_0994     TRUE 0.863 112.000 0.333 0.005 Y NA
 1807734 1807735 AAur_0994 AAur_0995     TRUE 0.784 28.000 0.222 NA   NA
 1807736 1807737 AAur_0996 AAur_0997   ung FALSE 0.364 70.000 0.062 NA N NA
 1807738 1807739 AAur_0998 AAur_0999     TRUE 0.645 50.000 0.196 NA   NA
 1807739 1807740 AAur_0999 AAur_1000     FALSE 0.144 173.000 0.138 NA   NA
 1807740 1807741 AAur_1000 AAur_1001   groL FALSE 0.007 324.000 0.000 1.000 N NA
 1807741 1807742 AAur_1001 AAur_1002 groL   FALSE 0.019 225.000 0.000 1.000 N NA
 1807743 1807744 AAur_1003 AAur_1004     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1807744 1807745 AAur_1004 AAur_1005     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1807745 1807746 AAur_1005 AAur_1006     FALSE 0.136 80.000 0.000 1.000   NA
 1807747 1807748 AAur_1007 AAur_1008     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1807749 1807750 AAur_1009 AAur_1010     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807750 1807751 AAur_1010 AAur_1011     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1807751 1807752 AAur_1011 AAur_1012     TRUE 0.700 44.000 0.206 NA   NA
 1807753 1807754 AAur_1013 AAur_1014     TRUE 0.795 9.000 0.037 NA   NA
 1807754 1807755 AAur_1014 AAur_1015     FALSE 0.501 44.000 0.049 NA   NA
 1807757 1807758 AAur_1017 AAur_1018     FALSE 0.004 428.000 0.000 1.000   NA
 1807758 1807759 AAur_1018 AAur_1019     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 1807759 1807760 AAur_1019 AAur_1020     FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1807760 1807761 AAur_1020 AAur_1021     FALSE 0.531 43.000 0.057 NA   NA
 1807761 1807762 AAur_1021 AAur_1022     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807762 1807763 AAur_1022 AAur_1023     FALSE 0.407 28.000 0.000 1.000 N NA
 1807763 1807764 AAur_1023 AAur_1024   fdhD TRUE 0.986 2.000 0.000 0.001 Y NA
 1807764 1807765 AAur_1024 AAur_1025 fdhD   FALSE 0.275 148.000 0.167 1.000 N NA
 1807766 1807767 AAur_1026 AAur_1027     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1807767 1807768 AAur_1027 AAur_1028     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1807768 1807769 AAur_1028 AAur_1029     TRUE 0.988 -13.000 0.481 1.000 Y NA
 1807769 1807770 AAur_1029 AAur_1030     TRUE 0.997 1.000 0.594 0.076 Y NA
 1807770 1807771 AAur_1030 AAur_1031     FALSE 0.011 231.000 0.000 NA   NA
 1807771 1807772 AAur_1031 AAur_1032     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807773 1807774 AAur_1033 AAur_1034     TRUE 0.956 3.000 0.073 0.094   NA
 1807775 1807776 AAur_1035 AAur_1036     TRUE 0.944 -3.000 0.058 NA   NA
 1807776 1807777 AAur_1036 AAur_1037     TRUE 0.772 2.000 0.000 NA   NA
 1807780 1807781 AAur_1040 AAur_1041   pcrA FALSE 0.235 80.000 0.010 1.000 N NA
 1807781 1807782 AAur_1041 AAur_1042 pcrA   TRUE 0.893 -3.000 0.007 NA   NA
 1807784 1807785 AAur_1044 AAur_1045 sucC sucD TRUE 0.983 13.000 0.382 0.001 Y NA
 1807786 1807787 AAur_1046 AAur_1047     FALSE 0.096 122.000 0.000 1.000   NA
 1807789 1807790 AAur_1049 AAur_1050     FALSE 0.282 120.000 0.000 0.001   NA
 1807790 1807791 AAur_1050 AAur_1051     FALSE 0.197 143.000 0.062 1.000   NA
 1807793 1807794 AAur_1052 AAur_1054     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 1807796 1807797 AAur_1056 AAur_1057     FALSE 0.012 256.000 0.000 1.000   NA
 1807798 1807799 AAur_1058 AAur_1059     TRUE 0.995 -3.000 0.367 1.000 Y NA
 1807799 1807800 AAur_1059 AAur_1060     FALSE 0.019 224.000 0.000 1.000 N NA
 1807800 1807801 AAur_1060 AAur_1061     TRUE 0.942 11.000 0.500 1.000 N NA
 1807801 1807802 AAur_1061 AAur_1062     FALSE 0.022 303.000 0.000 0.061 N NA
 1807802 1807803 AAur_1062 AAur_1063     FALSE 0.427 156.000 0.000 0.005 Y NA
 1807803 1807804 AAur_1063 AAur_1064     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 1807804 1807805 AAur_1064 AAur_1065     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1807805 1807806 AAur_1065 AAur_1066     FALSE 0.018 217.000 0.000 1.000   NA
 1807806 1807807 AAur_1066 AAur_1067     FALSE 0.225 53.000 0.000 1.000   NA
 1807807 1807808 AAur_1067 AAur_1068     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1807808 1807809 AAur_1068 AAur_1069     FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 1807809 1807810 AAur_1069 AAur_1070     TRUE 0.896 -13.000 0.122 NA   NA
 1807810 1807811 AAur_1070 AAur_1071     FALSE 0.269 34.000 0.000 NA   NA
 1807814 1807815 AAur_1073 AAur_1075     TRUE 0.980 7.000 0.182 1.000 Y NA
 1807815 1807816 AAur_1075 AAur_1076     TRUE 0.887 42.000 0.500 0.087 N NA
 1807816 1807817 AAur_1076 AAur_1077     TRUE 0.973 0.000 0.077 0.087 N NA
 1807817 1807818 AAur_1077 AAur_1078     TRUE 0.709 48.000 0.096 0.087 N NA
 1807818 1807819 AAur_1078 AAur_1079     TRUE 0.993 -3.000 0.667 0.087 N NA
 1807819 1807820 AAur_1079 AAur_1080     TRUE 0.993 -3.000 0.909 1.000   NA
 1807820 1807821 AAur_1080 AAur_1081   kgtP TRUE 0.944 10.000 0.455 1.000   NA
 1807821 1807822 AAur_1081 AAur_1082 kgtP   FALSE 0.235 165.000 0.222 1.000 N NA
 1807822 1807823 AAur_1082 AAur_1083     FALSE 0.031 163.000 0.000 NA   NA
 1807825 1807826 AAur_1084 AAur_1086     FALSE 0.226 58.000 0.000 1.000 N NA
 1807826 1807827 AAur_1086 AAur_1087   bioD TRUE 0.672 9.000 0.000 1.000 N NA
 1807827 1807828 AAur_1087 AAur_1088 bioD bioF TRUE 0.983 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 1807828 1807829 AAur_1088 AAur_1089 bioF bioA TRUE 0.973 9.000 0.033 0.017 Y NA
 1807836 1807837 AAur_1096 AAur_1097     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 1807837 1807838 AAur_1097 AAur_1098     FALSE 0.148 60.000 0.000 NA   NA
 1807838 1807839 AAur_1098 AAur_1099     FALSE 0.053 158.000 0.000 1.000 N NA
 1807839 1807840 AAur_1099 AAur_1100     FALSE 0.208 197.000 0.400 1.000 N NA
 1807840 1807841 AAur_1100 AAur_1101     FALSE 0.062 270.000 0.214 NA N NA
 1807841 1807842 AAur_1101 AAur_1102     TRUE 0.982 4.000 0.143 NA Y NA
 1807842 1807843 AAur_1102 AAur_1103   rpiB TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1807843 1807844 AAur_1103 AAur_1104 rpiB   TRUE 0.946 3.000 0.105 1.000 N NA
 1807844 1807845 AAur_1104 AAur_1105     TRUE 0.960 20.000 0.158 0.060 Y NA
 1807845 1807846 AAur_1105 AAur_1106     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807846 1807847 AAur_1106 AAur_1107     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807847 1807848 AAur_1107 AAur_1109     TRUE 0.975 4.000 0.042 1.000 Y NA
 1807850 1807851 AAur_1110 AAur_1111     FALSE 0.077 133.000 0.000 1.000   NA
 1807854 1807855 AAur_1114 AAur_1115     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807855 1807856 AAur_1115 AAur_1116     FALSE 0.026 174.000 0.000 NA   NA
 1807857 1807858 AAur_1117 AAur_1118 add   FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 1807858 1807859 AAur_1118 AAur_1119     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1807859 1807860 AAur_1119 AAur_1120     FALSE 0.260 52.000 0.000 1.000 N NA
 1807860 1807861 AAur_1120 AAur_1122     TRUE 0.963 -3.000 0.089 1.000 N NA
 1807862 1807863 AAur_1121 AAur_1123 rbsK   FALSE 0.360 36.000 0.000 1.000 N NA
 1807864 1807865 AAur_1124 AAur_1125     FALSE 0.477 83.000 0.167 1.000 N NA
 1807867 1807868 AAur_1127 AAur_1128     TRUE 0.899 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1807868 1807869 AAur_1128 AAur_1129     TRUE 0.936 75.000 0.800 0.075 Y NA
 1807869 1807870 AAur_1129 AAur_1130     TRUE 0.995 6.000 0.818 0.075 Y NA
 1807870 1807871 AAur_1130 AAur_1132     TRUE 0.893 6.000 0.091 NA   NA
 1807872 1807873 AAur_1131 AAur_1133     FALSE 0.007 305.000 0.000 1.000   NA
 1807873 1807874 AAur_1133 AAur_1134     FALSE 0.102 82.000 0.000 NA   NA
 1807874 1807875 AAur_1134 AAur_1135     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807875 1807876 AAur_1135 AAur_1136     FALSE 0.104 80.000 0.000 NA   NA
 1807878 1807879 AAur_1138 AAur_1139     FALSE 0.252 53.000 0.000 1.000 N NA
 1807880 1807881 AAur_1140 AAur_1141     FALSE 0.295 29.000 0.000 NA   NA
 1807881 1807882 AAur_1141 AAur_1142     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 1807882 1807883 AAur_1142 AAur_1143     FALSE 0.398 24.000 0.000 1.000   NA
 1807885 1807886 AAur_1145 AAur_1146     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1807886 1807887 AAur_1146 AAur_1147     FALSE 0.232 57.000 0.000 1.000 N NA
 1807887 1807888 AAur_1147 AAur_1148     FALSE 0.214 60.000 0.000 1.000 N NA
 1807888 1807889 AAur_1148 AAur_1149     TRUE 0.684 27.000 0.071 1.000   NA
 1807889 1807890 AAur_1149 AAur_1150     FALSE 0.361 29.000 0.000 1.000   NA
 1807891 1807892 AAur_1151 AAur_1152     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 1807892 1807893 AAur_1152 AAur_1153     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1807893 1807894 AAur_1153 AAur_1154     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807894 1807895 AAur_1154 AAur_1155     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807895 1807896 AAur_1155 AAur_1156     FALSE 0.157 69.000 0.000 1.000   NA
 1807896 1807897 AAur_1156 AAur_1157     FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000   NA
 1807897 1807898 AAur_1157 AAur_1158     FALSE 0.495 137.000 0.000 0.079 Y NA
 1807898 1807899 AAur_1158 AAur_1159     FALSE 0.551 125.000 0.000 0.079 Y NA
 1807901 1807902 AAur_1161 AAur_1162     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1807902 1807903 AAur_1162 AAur_1163     FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 1807903 1807904 AAur_1163 AAur_1164     TRUE 0.895 15.000 0.423 NA   NA
 1807904 1807905 AAur_1164 AAur_1165     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1807906 1807907 AAur_1166 AAur_1167     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1807908 1807909 AAur_1168 AAur_1169     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 1807909 1807910 AAur_1169 AAur_1170     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807910 1807911 AAur_1170 AAur_1171     FALSE 0.002 668.000 0.000 NA   NA
 1807911 1807912 AAur_1171 AAur_1172     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1807913 1807914 AAur_1173 AAur_1174     FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 1807915 1807916 AAur_1175 AAur_1176     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807916 1807917 AAur_1176 AAur_1177     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1807918 1807919 AAur_1178 AAur_1180     FALSE 0.449 22.000 0.000 1.000 N NA
 1807920 1807921 AAur_1179 AAur_1181     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 1807921 1807922 AAur_1181 AAur_1182     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1807922 1807923 AAur_1182 AAur_1183     TRUE 0.989 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 1807923 1807924 AAur_1183 AAur_1184     FALSE 0.002 667.000 0.000 1.000   NA
 1807924 1807925 AAur_1184 AAur_1185     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807925 1807926 AAur_1185 AAur_1186     FALSE 0.307 105.000 0.000 0.009 N NA
 1807927 1807928 AAur_1187 AAur_1188     FALSE 0.057 134.000 0.000 NA   NA
 1807928 1807929 AAur_1188 AAur_1189     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 1807929 1807930 AAur_1189 AAur_1190     FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1807930 1807931 AAur_1190 AAur_1191     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 1807934 1807935 AAur_1194 AAur_1195     FALSE 0.116 100.000 0.000 1.000   NA
 1807935 1807936 AAur_1195 AAur_1196     TRUE 0.809 -25.000 0.052 NA   NA
 1807937 1807938 AAur_1197 AAur_1198   purH FALSE 0.005 361.000 0.000 1.000   NA
 1807939 1807940 AAur_1199 AAur_1200     FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1807942 1807943 AAur_1202 AAur_1203 soxA phnE FALSE 0.140 92.000 0.000 1.000 N NA
 1807943 1807944 AAur_1203 AAur_1204 phnE phnC TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1807944 1807945 AAur_1204 AAur_1205 phnC phnD TRUE 0.992 0.000 0.029 0.001 Y NA
 1807945 1807946 AAur_1205 AAur_1206 phnD   FALSE 0.325 43.000 0.000 1.000 N NA
 1807947 1807948 AAur_1207 AAur_1208     TRUE 0.930 -3.000 0.024 1.000   NA
 1807948 1807949 AAur_1208 AAur_1209     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807950 1807951 AAur_1210 AAur_1211     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 1807951 1807952 AAur_1211 AAur_1212     TRUE 0.996 3.000 1.000 1.000 Y NA
 1807952 1807953 AAur_1212 AAur_1213     FALSE 0.032 173.000 0.000 NA N NA
 1807953 1807954 AAur_1213 AAur_1214     TRUE 0.959 43.000 0.800 NA Y NA
 1807954 1807955 AAur_1214 AAur_1215     TRUE 0.960 45.000 0.800 1.000 Y NA
 1807955 1807956 AAur_1215 AAur_1216     TRUE 0.783 131.000 0.500 1.000 Y NA
 1807958 1807959 AAur_1217 AAur_1219   alr TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1807960 1807961 AAur_1220 AAur_1221     TRUE 0.823 72.000 0.250 1.000 Y NA
 1807962 1807963 AAur_1222 AAur_1223     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807963 1807964 AAur_1223 AAur_1224     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1807964 1807965 AAur_1224 AAur_1225     FALSE 0.145 74.000 0.000 1.000   NA
 1807965 1807966 AAur_1225 AAur_1226   purU TRUE 0.774 22.000 0.118 1.000 N NA
 1807967 1807968 AAur_1227 AAur_1228 glyA   FALSE 0.278 150.000 0.187 1.000 N NA
 1807968 1807969 AAur_1228 AAur_1229     FALSE 0.239 119.000 0.036 1.000 N NA
 1807969 1807970 AAur_1229 AAur_1230     TRUE 0.564 50.000 0.024 0.093   NA
 1807970 1807971 AAur_1230 AAur_1231     TRUE 0.983 -3.000 0.133 0.005   NA
 1807972 1807973 AAur_1232 AAur_1233     TRUE 0.775 41.000 0.286 1.000   NA
 1807974 1807975 AAur_1234 AAur_1235     FALSE 0.135 81.000 0.000 1.000   NA
 1807975 1807976 AAur_1235 AAur_1236   xth TRUE 0.682 11.000 0.008 1.000   NA
 1807976 1807977 AAur_1236 AAur_1237 xth trpS TRUE 0.641 21.000 0.026 1.000 N NA
 1807977 1807978 AAur_1237 AAur_1238 trpS   TRUE 0.613 116.000 0.047 1.000 Y NA
 1807978 1807979 AAur_1238 AAur_1239     FALSE 0.478 86.000 0.194 1.000   NA
 1807980 1807981 AAur_1240 AAur_1241     FALSE 0.243 132.000 0.080 1.000   NA
 1807983 1807984 AAur_1243 AAur_1244   sdhB FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 1807984 1807985 AAur_1244 AAur_1245 sdhB sdhA TRUE 0.998 0.000 0.604 0.001 Y NA
 1807985 1807986 AAur_1245 AAur_1246 sdhA   TRUE 0.845 152.000 0.705 0.001 Y NA
 1807986 1807987 AAur_1246 AAur_1247   sdhC TRUE 0.991 4.000 0.157 0.001 Y NA
 1807988 1807989 AAur_1248 AAur_1249     FALSE 0.336 111.000 0.092 1.000   NA
 1807989 1807990 AAur_1249 AAur_1250     FALSE 0.272 85.000 0.033 1.000   NA
 1807990 1807991 AAur_1250 AAur_1251   ohr TRUE 0.590 53.000 0.120 1.000 N NA
 1807991 1807992 AAur_1251 AAur_1252 ohr   TRUE 0.965 -3.000 0.115 1.000   NA
 1807992 1807993 AAur_1252 AAur_1253     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000   NA
 1807993 1807994 AAur_1253 AAur_1254     TRUE 0.637 118.000 0.647 1.000   NA
 1807994 1807995 AAur_1254 AAur_1255     FALSE 0.151 158.000 0.078 1.000   NA
 1807995 1807996 AAur_1255 AAur_1256     FALSE 0.035 330.000 0.078 0.074   NA
 1807996 1807997 AAur_1256 AAur_1257   cdd TRUE 0.977 -3.000 0.230 1.000   NA
 1807997 1807998 AAur_1257 AAur_1258 cdd   TRUE 0.993 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 1807998 1807999 AAur_1258 AAur_1259     FALSE 0.183 90.000 0.013 NA   NA
 1807999 1808000 AAur_1259 AAur_1260     FALSE 0.192 193.000 0.400 NA   NA
 1808000 1808001 AAur_1260 AAur_1261   add FALSE 0.546 29.000 0.034 NA   NA
 1808001 1808002 AAur_1261 AAur_1262 add   TRUE 0.743 -22.000 0.008 1.000   NA
 1808002 1808003 AAur_1262 AAur_1263   eno FALSE 0.189 117.000 0.018 1.000   NA
 1808003 1808004 AAur_1263 AAur_1264 eno   FALSE 0.125 133.000 0.003 1.000 N NA
 1808004 1808005 AAur_1264 AAur_1265     TRUE 0.798 6.000 0.018 NA   NA
 1808005 1808006 AAur_1265 AAur_1266     TRUE 0.975 -3.000 0.243 NA   NA
 1808006 1808007 AAur_1266 AAur_1267     TRUE 0.920 -3.000 0.026 NA   NA
 1808007 1808008 AAur_1267 AAur_1268     TRUE 0.807 39.000 0.348 1.000   NA
 1808008 1808009 AAur_1268 AAur_1269     FALSE 0.389 104.000 0.130 1.000   NA
 1808009 1808010 AAur_1269 AAur_1270     FALSE 0.341 22.000 0.000 NA   NA
 1808010 1808011 AAur_1270 AAur_1271   braC FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 1808011 1808012 AAur_1271 AAur_1272 braC   FALSE 0.098 113.000 0.000 NA N NA
 1808013 1808014 AAur_1273 AAur_1274     TRUE 0.998 -3.000 0.582 0.025 Y NA
 1808014 1808015 AAur_1274 AAur_1275     TRUE 0.937 39.000 0.361 1.000 Y NA
 1808015 1808016 AAur_1275 AAur_1276     TRUE 0.989 10.000 0.528 0.074 Y NA
 1808018 1808019 AAur_1278 AAur_1279   galK FALSE 0.276 64.000 0.006 1.000 N NA
 1808019 1808020 AAur_1279 AAur_1280 galK galT TRUE 0.991 -3.000 0.370 0.001 N NA
 1808021 1808022 AAur_1281 AAur_1282     FALSE 0.438 84.000 0.174 NA   NA
 1808022 1808023 AAur_1282 AAur_1283   ilvA TRUE 0.872 4.000 0.041 NA   NA
 1808023 1808024 AAur_1283 AAur_1284 ilvA   TRUE 0.602 15.000 0.009 1.000   NA
 1808025 1808026 AAur_1285 AAur_1286     FALSE 0.286 153.000 0.292 NA   NA
 1808027 1808028 AAur_1287 AAur_1288     TRUE 0.581 32.000 0.056 NA   NA
 1808028 1808029 AAur_1288 AAur_1289     TRUE 0.725 -28.000 0.017 NA   NA
 1808031 1808032 AAur_1291 AAur_1292 uppS   TRUE 0.581 44.000 0.058 1.000 N NA
 1808033 1808034 AAur_1293 AAur_1294     FALSE 0.110 183.000 0.107 NA   NA
 1808035 1808036 AAur_1295 AAur_1296     FALSE 0.008 676.000 0.060 1.000   NA
 1808037 1808038 AAur_1297 AAur_1298     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808038 1808039 AAur_1298 AAur_1299   fumC FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1808039 1808040 AAur_1299 AAur_1300 fumC   FALSE 0.336 88.000 0.058 1.000 N NA
 1808040 1808041 AAur_1300 AAur_1301     FALSE 0.310 71.000 0.050 NA   NA
 1808043 1808044 AAur_1303 AAur_1304   manA TRUE 0.883 4.000 0.035 1.000   NA
 1808044 1808045 AAur_1304 AAur_1305 manA   FALSE 0.467 51.000 0.058 NA   NA
 1808045 1808046 AAur_1305 AAur_1306   purE FALSE 0.529 21.000 0.007 NA N NA
 1808046 1808047 AAur_1306 AAur_1307 purE purK TRUE 0.995 -3.000 0.141 0.001 Y NA
 1808050 1808051 AAur_1310 AAur_1311     TRUE 0.823 12.000 0.125 NA   NA
 1808051 1808052 AAur_1311 AAur_1312     TRUE 0.974 -7.000 0.606 NA   NA
 1808054 1808055 AAur_1314 AAur_1315     FALSE 0.090 146.000 0.009 NA   NA
 1808055 1808056 AAur_1315 AAur_1316   ahcY FALSE 0.338 46.000 0.007 NA   NA
 1808056 1808057 AAur_1316 AAur_1317 ahcY   FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 1808057 1808058 AAur_1317 AAur_1318     FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1808058 1808059 AAur_1318 AAur_1319     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1808061 1808062 AAur_1321 AAur_1323     TRUE 0.710 -70.000 0.023 NA   NA
 1808063 1808064 AAur_1322 AAur_1324     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 1808064 1808065 AAur_1324 AAur_1325     TRUE 0.821 2.000 0.000 1.000   NA
 1808065 1808066 AAur_1325 AAur_1326     FALSE 0.325 150.000 0.333 NA   NA
 1808066 1808067 AAur_1326 AAur_1327     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1808067 1808068 AAur_1327 AAur_1328     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 1808068 1808069 AAur_1328 AAur_1329     TRUE 0.842 11.000 0.088 1.000 N NA
 1808070 1808071 AAur_1330 AAur_1331     FALSE 0.126 161.000 0.004 0.085   NA
 1808072 1808073 AAur_1332 AAur_1333     TRUE 0.991 -3.000 0.837 NA   NA
 1808073 1808074 AAur_1333 AAur_1334     TRUE 0.948 14.000 0.867 NA   NA
 1808075 1808076 AAur_1335 AAur_1336     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 1808076 1808077 AAur_1336 AAur_1337   ksgA FALSE 0.484 27.000 0.003 1.000   NA
 1808077 1808078 AAur_1337 AAur_1338 ksgA ispE TRUE 0.641 36.000 0.068 1.000 N NA
 1808078 1808079 AAur_1338 AAur_1339 ispE   TRUE 0.697 36.000 0.045 0.092   NA
 1808080 1808081 AAur_1340 AAur_1341     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 1808082 1808083 AAur_1342 AAur_1343     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1808083 1808084 AAur_1343 AAur_1344   prs TRUE 0.919 -3.000 0.007 1.000 N NA
 1808084 1808085 AAur_1344 AAur_1345 prs   FALSE 0.007 323.000 0.000 1.000 N NA
 1808085 1808086 AAur_1345 AAur_1346   pth TRUE 0.871 120.000 0.496 0.020 Y NA
 1808086 1808087 AAur_1346 AAur_1347 pth   FALSE 0.111 142.000 0.002 1.000 N NA
 1808087 1808088 AAur_1347 AAur_1348     TRUE 0.870 36.000 0.000 0.022 Y NA
 1808088 1808089 AAur_1348 AAur_1349     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 1808089 1808090 AAur_1349 AAur_1350   sufS FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1808090 1808091 AAur_1350 AAur_1351 sufS   TRUE 0.587 69.000 0.249 1.000 N NA
 1808092 1808093 AAur_1352 AAur_1353 nhaA   FALSE 0.176 150.000 0.091 NA   NA
 1808093 1808094 AAur_1353 AAur_1354     TRUE 0.964 2.000 0.211 NA   NA
 1808094 1808095 AAur_1354 AAur_1355     FALSE 0.385 48.000 0.022 NA   NA
 1808096 1808097 AAur_1356 AAur_1357 mfd   FALSE 0.165 77.000 0.003 NA   NA
 1808098 1808099 AAur_1358 AAur_1359   deoC FALSE 0.320 54.000 0.017 NA   NA
 1808099 1808100 AAur_1359 AAur_1360 deoC   FALSE 0.153 116.000 0.013 NA   NA
 1808100 1808101 AAur_1360 AAur_1361     FALSE 0.023 183.000 0.000 NA   NA
 1808102 1808103 AAur_1362 AAur_1363     FALSE 0.047 165.000 0.000 1.000 N NA
 1808103 1808104 AAur_1363 AAur_1364     TRUE 0.983 -3.000 0.360 1.000 N NA
 1808104 1808105 AAur_1364 AAur_1365     TRUE 0.968 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1808105 1808106 AAur_1365 AAur_1367     FALSE 0.085 128.000 0.000 1.000   NA
 1808108 1808109 AAur_1368 AAur_1369     FALSE 0.001 1711.000 0.000 NA   NA
 1808109 1808110 AAur_1369 AAur_1370     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1808110 1808111 AAur_1370 AAur_1371     TRUE 0.998 -3.000 0.545 0.007 Y NA
 1808111 1808112 AAur_1371 AAur_1372     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1808112 1808113 AAur_1372 AAur_1373     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1808114 1808115 AAur_1374 AAur_1375   acsA FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 1808115 1808116 AAur_1375 AAur_1376 acsA   FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1808116 1808117 AAur_1376 AAur_1377     FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 1808117 1808118 AAur_1377 AAur_1378   maoII FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 1808118 1808119 AAur_1378 AAur_1379 maoII   FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1808119 1808120 AAur_1379 AAur_1380     FALSE 0.234 133.000 0.097 NA   NA
 1808120 1808121 AAur_1380 AAur_1381     FALSE 0.011 284.000 0.000 1.000 N NA
 1808121 1808122 AAur_1381 AAur_1382     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 1808122 1808123 AAur_1382 AAur_1383     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1808123 1808124 AAur_1383 AAur_1384     TRUE 0.601 30.000 0.000 0.054   NA
 1808124 1808125 AAur_1384 AAur_1385     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1808125 1808126 AAur_1385 AAur_1386     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1808129 1808130 AAur_1389 AAur_1390     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 1808130 1808131 AAur_1390 AAur_1391     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808132 1808133 AAur_1392 AAur_1393     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808133 1808134 AAur_1393 AAur_1394     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1808136 1808137 AAur_1396 AAur_1397   cobA TRUE 0.928 13.000 0.039 1.000 Y NA
 1808137 1808138 AAur_1397 AAur_1398 cobA nirB TRUE 0.884 10.000 0.122 1.000 N NA
 1808140 1808141 AAur_1400 AAur_1401     TRUE 0.645 102.000 0.000 0.026 Y NA
 1808141 1808142 AAur_1401 AAur_1402   sacB FALSE 0.329 35.000 0.000 1.000   NA
 1808142 1808143 AAur_1402 AAur_1403 sacB   FALSE 0.003 460.000 0.000 1.000   NA
 1808145 1808146 AAur_1405 AAur_1406     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1808146 1808147 AAur_1406 AAur_1407     TRUE 0.937 -3.000 0.046 NA   NA
 1808147 1808148 AAur_1407 AAur_1408     TRUE 0.958 1.000 0.138 NA   NA
 1808150 1808151 AAur_1410 AAur_1411 accA maf FALSE 0.192 118.000 0.026 NA N NA
 1808151 1808152 AAur_1411 AAur_1412 maf   FALSE 0.038 184.000 0.004 NA   NA
 1808152 1808153 AAur_1412 AAur_1413     TRUE 0.977 2.000 0.357 1.000   NA
 1808153 1808154 AAur_1413 AAur_1414     FALSE 0.025 176.000 0.000 NA   NA
 1808154 1808155 AAur_1414 AAur_1415     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1808155 1808156 AAur_1415 AAur_1416     FALSE 0.001 1098.000 0.000 NA   NA
 1808156 1808157 AAur_1416 AAur_1417     FALSE 0.343 67.000 0.056 NA   NA
 1808157 1808158 AAur_1417 AAur_1418     TRUE 0.978 -3.000 0.294 NA   NA
 1808159 1808160 AAur_1419 AAur_1420     FALSE 0.265 68.000 0.008 1.000 N NA
 1808160 1808161 AAur_1420 AAur_1421     TRUE 0.787 -7.000 0.005 NA   NA
 1808161 1808162 AAur_1421 AAur_1422     TRUE 0.907 -10.000 0.125 NA   NA
 1808162 1808163 AAur_1422 AAur_1423     FALSE 0.054 282.000 0.188 1.000   NA
 1808163 1808164 AAur_1423 AAur_1424     FALSE 0.467 158.000 0.750 1.000   NA
 1808164 1808165 AAur_1424 AAur_1425     FALSE 0.396 89.000 0.115 1.000   NA
 1808165 1808166 AAur_1425 AAur_1426     TRUE 0.695 110.000 0.808 NA   NA
 1808166 1808167 AAur_1426 AAur_1427     TRUE 0.992 -3.000 0.880 NA   NA
 1808167 1808168 AAur_1427 AAur_1428     TRUE 0.886 -10.000 0.083 NA   NA
 1808168 1808169 AAur_1428 AAur_1429     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1808169 1808170 AAur_1429 AAur_1430     TRUE 0.932 -13.000 0.250 NA   NA
 1808170 1808171 AAur_1430 AAur_1431     TRUE 0.988 -3.000 0.625 NA   NA
 1808171 1808172 AAur_1431 AAur_1432     TRUE 0.767 46.000 0.375 NA   NA
 1808172 1808173 AAur_1432 AAur_1433     TRUE 0.977 -3.000 0.273 NA   NA
 1808173 1808174 AAur_1433 AAur_1434   ligA FALSE 0.319 38.000 0.000 1.000   NA
 1808174 1808175 AAur_1434 AAur_1435 ligA suhB TRUE 0.918 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1808175 1808176 AAur_1435 AAur_1436 suhB   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1808177 1808178 AAur_1437 AAur_1438   ntaA TRUE 0.992 0.000 0.222 NA Y NA
 1808178 1808179 AAur_1438 AAur_1439 ntaA   TRUE 0.828 35.000 0.400 NA N NA
 1808179 1808180 AAur_1439 AAur_1440     TRUE 0.986 -24.000 0.550 1.000 Y NA
 1808180 1808181 AAur_1440 AAur_1441     TRUE 0.993 3.000 0.478 NA Y NA
 1808182 1808183 AAur_1442 AAur_1443     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1808184 1808185 AAur_1444 AAur_1445     TRUE 0.993 -7.000 0.455 0.091 Y NA
 1808188 1808189 AAur_1448 AAur_1449 gatC gatA TRUE 0.995 6.000 0.643 0.001 Y NA
 1808189 1808190 AAur_1449 AAur_1450 gatA gatB TRUE 0.997 0.000 0.492 0.001 Y NA
 1808190 1808191 AAur_1450 AAur_1452 gatB   FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1808193 1808194 AAur_1453 AAur_1454     TRUE 0.965 42.000 0.571 0.073 Y NA
 1808194 1808195 AAur_1454 AAur_1455     TRUE 0.926 67.000 0.571 0.073 Y NA
 1808195 1808196 AAur_1455 AAur_1456     TRUE 0.832 57.000 0.750 1.000 N NA
 1808196 1808197 AAur_1456 AAur_1457     TRUE 0.917 27.000 0.750 1.000   NA
 1808199 1808200 AAur_1459 AAur_1460 tdh kbl TRUE 0.749 63.000 0.547 1.000 N NA
 1808200 1808201 AAur_1460 AAur_1461 kbl   FALSE 0.002 685.000 0.000 1.000   NA
 1808201 1808202 AAur_1461 AAur_1462     TRUE 0.601 30.000 0.000 0.054   NA
 1808202 1808203 AAur_1462 AAur_1463     FALSE 0.248 54.000 0.000 1.000 N NA
 1808203 1808204 AAur_1463 AAur_1464   hutI TRUE 0.675 12.000 0.008 1.000 N NA
 1808206 1808207 AAur_1466 AAur_1467   glk TRUE 0.705 52.000 0.259 1.000 N NA
 1808207 1808208 AAur_1467 AAur_1468 glk   TRUE 0.994 -3.000 0.296 NA Y NA
 1808208 1808209 AAur_1468 AAur_1469     TRUE 0.995 -3.000 0.455 NA Y NA
 1808209 1808210 AAur_1469 AAur_1470     TRUE 0.916 24.000 0.087 1.000 Y NA
 1808214 1808215 AAur_1474 AAur_1475   metX FALSE 0.259 295.000 0.542 1.000 Y NA
 1808216 1808217 AAur_1476 AAur_1477     FALSE 0.304 81.000 0.059 NA   NA
 1808217 1808218 AAur_1477 AAur_1478     TRUE 0.604 30.000 0.059 NA   NA
 1808221 1808222 AAur_1481 AAur_1482   glyS FALSE 0.076 149.000 0.006 NA   NA
 1808222 1808223 AAur_1482 AAur_1483 glyS   TRUE 0.872 3.000 0.011 1.000   NA
 1808223 1808224 AAur_1483 AAur_1484     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1808224 1808225 AAur_1484 AAur_1485     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1808225 1808226 AAur_1485 AAur_1486     FALSE 0.149 90.000 0.003 NA   NA
 1808226 1808227 AAur_1486 AAur_1487     FALSE 0.286 65.000 0.011 1.000 N NA
 1808227 1808228 AAur_1487 AAur_1488   dnaG FALSE 0.405 59.000 0.037 1.000 N NA
 1808228 1808229 AAur_1488 AAur_1489 dnaG   FALSE 0.173 54.000 0.000 NA   NA
 1808229 1808230 AAur_1489 AAur_1490     FALSE 0.079 117.000 0.000 NA   NA
 1808231 1808232 AAur_1491 AAur_1492     FALSE 0.223 45.000 0.000 NA   NA
 1808232 1808233 AAur_1492 AAur_1493     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1808233 1808234 AAur_1493 AAur_1494     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1808234 1808235 AAur_1494 AAur_1495     TRUE 0.899 18.000 0.500 NA   NA
 1808236 1808237 AAur_1496 AAur_1497     FALSE 0.358 48.000 0.015 NA   NA
 1808237 1808238 AAur_1497 AAur_1498     TRUE 0.902 0.000 0.015 NA   NA
 1808238 1808239 AAur_1498 AAur_1499     FALSE 0.431 108.000 0.213 NA   NA
 1808239 1808240 AAur_1499 AAur_1500     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1808241 1808242 AAur_1501 AAur_1502     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 1808243 1808244 AAur_1503 AAur_1504 rpsB tsf FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 1808244 1808245 AAur_1504 AAur_1505 tsf pyrH TRUE 0.863 29.000 0.416 1.000 N NA
 1808245 1808246 AAur_1505 AAur_1506 pyrH frr TRUE 0.676 102.000 0.626 1.000 N NA
 1808246 1808247 AAur_1506 AAur_1507 frr   TRUE 0.957 0.000 0.076 1.000 N NA
 1808247 1808248 AAur_1507 AAur_1508     TRUE 0.711 22.000 0.090 NA   NA
 1808249 1808250 AAur_1509 AAur_1510     FALSE 0.017 202.000 0.000 NA   NA
 1808250 1808251 AAur_1510 AAur_1511     TRUE 0.985 -3.000 0.486 NA   NA
 1808251 1808252 AAur_1511 AAur_1512     TRUE 0.960 -3.000 0.114 NA   NA
 1808252 1808253 AAur_1512 AAur_1513     TRUE 0.949 31.000 0.167 0.010 Y NA
 1808254 1808255 AAur_1514 AAur_1515     TRUE 0.985 -3.000 0.484 NA   NA
 1808256 1808257 AAur_1516 AAur_1517     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1808257 1808258 AAur_1517 AAur_1518     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1808258 1808259 AAur_1518 AAur_1519     FALSE 0.053 142.000 0.000 NA   NA
 1808259 1808260 AAur_1519 AAur_1520     FALSE 0.226 149.000 0.150 NA   NA
 1808261 1808262 AAur_1521 AAur_1522     TRUE 0.998 0.000 0.889 0.003 Y NA
 1808262 1808263 AAur_1522 AAur_1523     TRUE 0.998 -3.000 0.818 0.083 Y NA
 1808264 1808265 AAur_1524 AAur_1525     FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000   NA
 1808265 1808266 AAur_1525 AAur_1526     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 1808266 1808267 AAur_1526 AAur_1527     FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1808268 1808269 AAur_1528 AAur_1529   accA TRUE 0.659 126.000 0.136 1.000 Y NA
 1808269 1808270 AAur_1529 AAur_1530 accA   TRUE 0.993 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 1808270 1808271 AAur_1530 AAur_1531     TRUE 0.845 38.000 0.025 1.000 Y NA
 1808271 1808272 AAur_1531 AAur_1532     TRUE 0.997 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 1808272 1808273 AAur_1532 AAur_1533     TRUE 0.991 -3.000 0.043 0.083 Y NA
 1808273 1808274 AAur_1533 AAur_1534     TRUE 0.797 41.000 0.326 1.000 N NA
 1808275 1808276 AAur_1535 AAur_1536     TRUE 0.968 -15.000 0.688 NA   NA
 1808276 1808277 AAur_1536 AAur_1537     TRUE 0.906 6.000 0.120 NA   NA
 1808277 1808278 AAur_1537 AAur_1538     TRUE 0.776 14.000 0.080 1.000   NA
 1808278 1808279 AAur_1538 AAur_1539     TRUE 0.998 0.000 0.900 0.072 Y NA
 1808279 1808280 AAur_1539 AAur_1540     TRUE 0.996 5.000 0.900 0.072 Y NA
 1808283 1808284 AAur_1543 AAur_1544 dxr   TRUE 0.680 33.000 0.088 1.000 N NA
 1808284 1808285 AAur_1544 AAur_1545     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1808285 1808286 AAur_1545 AAur_1546   ispG FALSE 0.302 49.000 0.005 NA   NA
 1808286 1808287 AAur_1546 AAur_1547 ispG   TRUE 0.731 11.000 0.022 1.000   NA
 1808287 1808288 AAur_1547 AAur_1548     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1808289 1808290 AAur_1549 AAur_1550     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1808290 1808291 AAur_1550 AAur_1551     TRUE 0.993 9.000 0.713 0.090 Y NA
 1808292 1808293 AAur_1552 AAur_1553   proS FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 1808293 1808294 AAur_1553 AAur_1554 proS   TRUE 0.914 -3.000 0.010 1.000   NA
 1808295 1808296 AAur_1555 AAur_1556 sph   FALSE 0.530 50.000 0.087 NA   NA
 1808296 1808297 AAur_1556 AAur_1557     FALSE 0.448 52.000 0.056 NA   NA
 1808298 1808299 AAur_1558 AAur_1559   nusA TRUE 0.990 0.000 0.759 NA   NA
 1808299 1808300 AAur_1559 AAur_1560 nusA   TRUE 0.801 89.000 0.323 NA Y NA
 1808300 1808301 AAur_1560 AAur_1561   infB FALSE 0.231 153.000 0.171 NA N NA
 1808301 1808302 AAur_1561 AAur_1562 infB   TRUE 0.873 78.000 0.530 1.000 Y NA
 1808302 1808303 AAur_1562 AAur_1563   guaD FALSE 0.542 89.000 0.000 1.000 Y NA
 1808305 1808306 AAur_1565 AAur_1566 truB   TRUE 0.843 3.000 0.010 NA   NA
 1808306 1808307 AAur_1566 AAur_1567     TRUE 0.950 3.000 0.167 NA   NA
 1808307 1808308 AAur_1567 AAur_1568   ribF FALSE 0.168 90.000 0.008 NA   NA
 1808308 1808309 AAur_1568 AAur_1569 ribF rpsO FALSE 0.186 160.000 0.119 1.000 N NA
 1808309 1808310 AAur_1569 AAur_1570 rpsO   FALSE 0.127 241.000 0.011 1.000 Y NA
 1808310 1808311 AAur_1570 AAur_1571     FALSE 0.474 79.000 0.171 1.000   NA
 1808311 1808312 AAur_1571 AAur_1572     FALSE 0.174 89.000 0.010 NA   NA
 1808313 1808314 AAur_1573 AAur_1574   moaA TRUE 0.964 5.000 0.410 1.000   NA
 1808315 1808316 AAur_1575 AAur_1576     TRUE 0.979 -13.000 0.191 1.000 Y NA
 1808316 1808317 AAur_1576 AAur_1577     TRUE 0.932 -3.000 0.026 1.000   NA
 1808317 1808318 AAur_1577 AAur_1578   moeA TRUE 0.575 60.000 0.176 1.000   NA
 1808318 1808319 AAur_1578 AAur_1579 moeA moaC TRUE 0.978 -12.000 0.019 0.002 Y NA
 1808319 1808320 AAur_1579 AAur_1580 moaC   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808320 1808321 AAur_1580 AAur_1581   moaE TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1808321 1808322 AAur_1581 AAur_1582 moaE dapB FALSE 0.346 52.000 0.004 1.000 N NA
 1808322 1808323 AAur_1582 AAur_1584 dapB   TRUE 0.854 5.000 0.027 1.000   NA
 1808325 1808326 AAur_1585 AAur_1586   dapA FALSE 0.509 105.000 0.333 NA   NA
 1808326 1808327 AAur_1586 AAur_1587 dapA   TRUE 0.933 7.000 0.206 1.000   NA
 1808327 1808328 AAur_1587 AAur_1588     TRUE 0.750 13.000 0.052 1.000   NA
 1808328 1808329 AAur_1588 AAur_1589   pgsA TRUE 0.691 39.000 0.025 0.058 N NA
 1808329 1808330 AAur_1589 AAur_1590 pgsA   FALSE 0.223 150.000 0.151 NA   NA
 1808330 1808331 AAur_1590 AAur_1591     FALSE 0.041 231.000 0.057 NA   NA
 1808333 1808334 AAur_1593 AAur_1594   recA FALSE 0.019 259.000 0.017 NA   NA
 1808334 1808335 AAur_1594 AAur_1595 recA   TRUE 0.949 -10.000 0.296 1.000   NA
 1808335 1808336 AAur_1595 AAur_1596   miaB TRUE 0.918 0.000 0.016 1.000   NA
 1808336 1808337 AAur_1596 AAur_1597 miaB miaA TRUE 0.900 20.000 0.028 1.000 Y NA
 1808337 1808338 AAur_1597 AAur_1599 miaA dapF TRUE 0.562 47.000 0.062 1.000 N NA
 1808340 1808341 AAur_1600 AAur_1601     TRUE 0.851 -7.000 0.019 1.000   NA
 1808343 1808344 AAur_1603 AAur_1604   hisC FALSE 0.205 79.000 0.006 1.000   NA
 1808344 1808345 AAur_1604 AAur_1605 hisC hisB TRUE 0.950 47.000 0.341 0.003 Y NA
 1808345 1808346 AAur_1605 AAur_1606 hisB hisH TRUE 0.993 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 1808346 1808347 AAur_1606 AAur_1607 hisH   TRUE 0.908 1.000 0.028 NA   NA
 1808347 1808348 AAur_1607 AAur_1608     FALSE 0.423 50.000 0.038 NA   NA
 1808348 1808349 AAur_1608 AAur_1609     TRUE 0.971 0.000 0.215 NA   NA
 1808349 1808350 AAur_1609 AAur_1610     FALSE 0.542 52.000 0.111 NA   NA
 1808352 1808353 AAur_1612 AAur_1613 infC rpmI TRUE 0.852 118.000 0.652 1.000 Y NA
 1808353 1808354 AAur_1613 AAur_1614 rpmI rplT TRUE 0.924 120.000 0.928 0.012 Y NA
 1808354 1808355 AAur_1614 AAur_1615 rplT   TRUE 0.936 27.000 0.057 0.011 Y NA
 1808355 1808356 AAur_1615 AAur_1616     FALSE 0.227 101.000 0.019 1.000 N NA
 1808361 1808362 AAur_1620 AAur_1622     TRUE 0.872 3.000 0.022 NA   NA
 1808363 1808364 AAur_1623 AAur_1624 pheS pheT TRUE 0.997 3.000 0.574 0.001 Y NA
 1808364 1808365 AAur_1624 AAur_1625 pheT   FALSE 0.018 227.000 0.000 1.000 N NA
 1808365 1808366 AAur_1625 AAur_1626     FALSE 0.093 131.000 0.000 1.000 N NA
 1808367 1808368 AAur_1627 AAur_1628     TRUE 0.942 13.000 0.667 1.000   NA
 1808368 1808369 AAur_1628 AAur_1629     FALSE 0.261 112.000 0.038 1.000 N NA
 1808369 1808370 AAur_1629 AAur_1630     FALSE 0.267 86.000 0.025 1.000 N NA
 1808371 1808372 AAur_1631 AAur_1632 argC argJ TRUE 0.997 -3.000 0.303 0.001 Y NA
 1808372 1808373 AAur_1632 AAur_1633 argJ argB TRUE 0.992 5.000 0.239 0.001 Y NA
 1808373 1808374 AAur_1633 AAur_1634 argB argD TRUE 0.991 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 1808374 1808375 AAur_1634 AAur_1635 argD argF TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1808375 1808376 AAur_1635 AAur_1636 argF argR TRUE 0.960 0.000 0.088 1.000 N NA
 1808376 1808377 AAur_1636 AAur_1637 argR argG FALSE 0.365 72.000 0.054 1.000 N NA
 1808377 1808378 AAur_1637 AAur_1638 argG argH TRUE 0.994 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 1808378 1808379 AAur_1638 AAur_1639 argH   FALSE 0.133 83.000 0.000 1.000   NA
 1808381 1808382 AAur_1641 AAur_1642     FALSE 0.241 132.000 0.005 0.053   NA
 1808382 1808383 AAur_1642 AAur_1643   tyrS TRUE 0.733 38.000 0.074 0.090   NA
 1808384 1808385 AAur_1644 AAur_1645     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1808386 1808387 AAur_1646 AAur_1647 rrsD rrlD FALSE 0.002 600.000 0.000 NA   NA
 1808387 1808388 AAur_1647 AAur_1648 rrlD rrfD FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1808388 1808389 AAur_1648 AAur_1649 rrfD   FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 1808389 1808390 AAur_1649 AAur_1650     TRUE 0.969 -7.000 0.500 NA   NA
 1808390 1808391 AAur_1650 AAur_1651     TRUE 0.727 10.000 0.021 NA   NA
 1808391 1808392 AAur_1651 AAur_1652     TRUE 0.785 4.000 0.003 NA   NA
 1808392 1808393 AAur_1652 AAur_1653   ppnK TRUE 0.820 14.000 0.120 1.000 N NA
 1808393 1808394 AAur_1653 AAur_1654 ppnK recN TRUE 0.929 4.000 0.094 1.000 N NA
 1808394 1808395 AAur_1654 AAur_1655 recN pyrG FALSE 0.147 128.000 0.006 1.000 N NA
 1808395 1808396 AAur_1655 AAur_1656 pyrG   FALSE 0.353 76.000 0.055 1.000 N NA
 1808396 1808397 AAur_1656 AAur_1657   xerD TRUE 0.983 3.000 0.063 1.000 Y NA
 1808400 1808401 AAur_1660 AAur_1661 gltA prpB TRUE 0.682 78.000 0.502 1.000 N NA
 1808401 1808402 AAur_1661 AAur_1662 prpB   TRUE 0.971 1.000 0.218 1.000   NA
 1808402 1808403 AAur_1662 AAur_1663     TRUE 0.687 11.000 0.010 1.000   NA
 1808403 1808404 AAur_1663 AAur_1664     FALSE 0.178 69.000 0.000 1.000 N NA
 1808404 1808405 AAur_1664 AAur_1665     FALSE 0.227 143.000 0.079 1.000 N NA
 1808405 1808406 AAur_1665 AAur_1666     TRUE 0.751 58.000 0.000 0.090 Y NA
 1808406 1808407 AAur_1666 AAur_1667     TRUE 0.995 -3.000 0.222 0.090 Y NA
 1808408 1808409 AAur_1668 AAur_1669     FALSE 0.028 255.000 0.021 1.000 N NA
 1808409 1808410 AAur_1669 AAur_1670   scpA TRUE 0.864 7.000 0.065 NA   NA
 1808410 1808411 AAur_1670 AAur_1671 scpA   TRUE 0.972 -7.000 0.570 NA   NA
 1808411 1808412 AAur_1671 AAur_1672     FALSE 0.274 152.000 0.224 NA N NA
 1808412 1808413 AAur_1672 AAur_1673     TRUE 0.885 4.000 0.030 1.000 N NA
 1808413 1808414 AAur_1673 AAur_1674   cmk TRUE 0.938 0.000 0.032 1.000 N NA
 1808414 1808415 AAur_1674 AAur_1675 cmk   TRUE 0.880 -7.000 0.030 1.000 N NA
 1808415 1808416 AAur_1675 AAur_1676     FALSE 0.240 86.000 0.021 1.000   NA
 1808416 1808417 AAur_1676 AAur_1677     FALSE 0.053 142.000 0.000 NA   NA
 1808419 1808420 AAur_1679 AAur_1680   gcvH FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 1808420 1808421 AAur_1680 AAur_1681 gcvH   FALSE 0.336 138.000 0.242 NA   NA
 1808421 1808422 AAur_1681 AAur_1682     TRUE 0.920 21.000 0.707 NA   NA
 1808422 1808423 AAur_1682 AAur_1683     TRUE 0.962 0.000 0.133 NA   NA
 1808423 1808424 AAur_1683 AAur_1684     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 1808429 1808430 AAur_1689 AAur_1690     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1808430 1808431 AAur_1690 AAur_1691     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1808432 1808433 AAur_1692 AAur_1693     FALSE 0.442 67.000 0.082 1.000 N NA
 1808434 1808435 AAur_1694 AAur_1695     FALSE 0.352 75.000 0.053 1.000 N NA
 1808437 1808438 AAur_1697 AAur_1698     TRUE 0.976 -3.000 0.250 NA   NA
 1808439 1808440 AAur_1699 AAur_1700     FALSE 0.087 239.000 0.257 NA   NA
 1808440 1808441 AAur_1700 AAur_1701     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 1808441 1808442 AAur_1701 AAur_1702     TRUE 0.878 32.000 0.635 NA   NA
 1808442 1808443 AAur_1702 AAur_1703     TRUE 0.881 -3.000 0.003 NA   NA
 1808443 1808444 AAur_1703 AAur_1704     FALSE 0.392 43.000 0.013 NA   NA
 1808444 1808445 AAur_1704 AAur_1705   murE TRUE 0.705 139.000 0.333 1.000 Y NA
 1808445 1808446 AAur_1705 AAur_1706 murE murF TRUE 0.992 7.000 0.367 0.001 Y NA
 1808446 1808447 AAur_1706 AAur_1707 murF mraY TRUE 0.994 -3.000 0.071 0.004 Y NA
 1808447 1808448 AAur_1707 AAur_1708 mraY murD TRUE 0.998 -3.000 0.647 0.004 Y NA
 1808448 1808449 AAur_1708 AAur_1709 murD ftsW TRUE 0.969 3.000 0.081 0.003 N NA
 1808449 1808450 AAur_1709 AAur_1710 ftsW murG TRUE 0.928 7.000 0.167 1.000 N NA
 1808450 1808451 AAur_1710 AAur_1711 murG murC TRUE 0.994 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 1808451 1808452 AAur_1711 AAur_1712 murC   TRUE 0.981 -7.000 0.134 NA Y NA
 1808452 1808453 AAur_1712 AAur_1713   ftsZ FALSE 0.057 217.000 0.067 NA N NA
 1808453 1808454 AAur_1713 AAur_1714 ftsZ   TRUE 0.677 26.000 0.082 NA   NA
 1808454 1808455 AAur_1714 AAur_1715     TRUE 0.889 -7.000 0.061 NA   NA
 1808455 1808456 AAur_1715 AAur_1716     TRUE 0.652 87.000 0.581 NA   NA
 1808456 1808457 AAur_1716 AAur_1717     FALSE 0.387 108.000 0.165 NA   NA
 1808457 1808458 AAur_1717 AAur_1718     FALSE 0.164 157.000 0.114 NA   NA
 1808458 1808459 AAur_1718 AAur_1719   lspA FALSE 0.260 132.000 0.119 NA   NA
 1808459 1808460 AAur_1719 AAur_1720 lspA   TRUE 0.915 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1808460 1808461 AAur_1720 AAur_1721   dnaE FALSE 0.370 55.000 0.014 1.000 N NA
 1808463 1808464 AAur_1723 AAur_1724   hisD TRUE 0.856 5.000 0.042 NA   NA
 1808464 1808465 AAur_1724 AAur_1725 hisD nrdR FALSE 0.056 175.000 0.011 NA N NA
 1808466 1808467 AAur_1726 AAur_1727   ppgK FALSE 0.263 92.000 0.028 1.000 N NA
 1808467 1808468 AAur_1727 AAur_1728 ppgK map TRUE 0.579 58.000 0.142 1.000 N NA
 1808471 1808472 AAur_1731 AAur_1733 glnA   TRUE 0.846 10.000 0.065 1.000 N NA
 1808474 1808475 AAur_1734 AAur_1735     TRUE 0.968 -3.000 0.167 NA   NA
 1808475 1808476 AAur_1735 AAur_1736     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1808479 1808480 AAur_1739 AAur_1740     TRUE 0.606 -33.000 0.000 1.000   NA
 1808480 1808481 AAur_1740 AAur_1741     TRUE 0.602 30.000 0.000 0.052   NA
 1808481 1808482 AAur_1741 AAur_1742     FALSE 0.007 273.000 0.000 NA   NA
 1808486 1808487 AAur_1746 AAur_1747   lipA FALSE 0.274 96.000 0.059 NA   NA
 1808487 1808488 AAur_1747 AAur_1748 lipA lipB TRUE 0.997 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 1808494 1808495 AAur_1754 AAur_1755     FALSE 0.155 147.000 0.057 NA   NA
 1808495 1808496 AAur_1755 AAur_1756   lpdA TRUE 0.805 113.000 0.379 1.000 Y NA
 1808496 1808497 AAur_1756 AAur_1757 lpdA   FALSE 0.281 158.000 0.095 0.030 N NA
 1808498 1808499 AAur_1758 AAur_1759     TRUE 0.712 36.000 0.140 1.000   NA
 1808499 1808500 AAur_1759 AAur_1760     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1808500 1808501 AAur_1760 AAur_1761   rpoD FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 1808506 1808507 AAur_1766 AAur_1767     TRUE 0.981 6.000 0.850 1.000 N NA
 1808508 1808509 AAur_1768 AAur_1769   cydB TRUE 0.988 19.000 0.925 0.046 Y NA
 1808509 1808510 AAur_1769 AAur_1770 cydB cydD TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1808510 1808511 AAur_1770 AAur_1771 cydD   FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1808515 1808516 AAur_1775 AAur_1776     TRUE 0.696 58.000 0.393 NA   NA
 1808516 1808517 AAur_1776 AAur_1777     TRUE 0.974 -3.000 0.224 NA   NA
 1808517 1808518 AAur_1777 AAur_1778   tdk TRUE 0.870 -7.000 0.030 1.000   NA
 1808522 1808523 AAur_1782 AAur_1783     FALSE 0.262 120.000 0.078 NA   NA
 1808523 1808524 AAur_1783 AAur_1785     FALSE 0.024 367.000 0.169 NA   NA
 1808525 1808526 AAur_1784 AAur_1786 trkA trkA TRUE 0.992 0.000 0.029 0.002 Y NA
 1808527 1808528 AAur_1787 AAur_1788     TRUE 0.954 1.000 0.082 1.000 N NA
 1808528 1808529 AAur_1788 AAur_1789   acnA FALSE 0.016 244.000 0.000 1.000 N NA
 1808529 1808530 AAur_1789 AAur_1790 acnA dxs FALSE 0.084 189.000 0.051 1.000 N NA
 1808530 1808531 AAur_1790 AAur_1791 dxs   TRUE 0.924 -3.000 0.029 NA   NA
 1808531 1808532 AAur_1791 AAur_1792     TRUE 0.916 -3.000 0.022 NA   NA
 1808532 1808533 AAur_1792 AAur_1793     TRUE 0.580 31.000 0.054 NA   NA
 1808533 1808534 AAur_1793 AAur_1794     FALSE 0.433 58.000 0.054 1.000   NA
 1808535 1808536 AAur_1795 AAur_1796     TRUE 0.997 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 1808536 1808537 AAur_1796 AAur_1797     FALSE 0.063 195.000 0.032 1.000 N NA
 1808537 1808538 AAur_1797 AAur_1798     FALSE 0.384 81.000 0.115 NA   NA
 1808538 1808539 AAur_1798 AAur_1799     FALSE 0.217 68.000 0.010 NA   NA
 1808539 1808540 AAur_1799 AAur_1800     TRUE 0.713 11.000 0.010 1.000 N NA
 1808540 1808541 AAur_1800 AAur_1801     TRUE 0.760 54.000 0.500 NA   NA
 1808541 1808542 AAur_1801 AAur_1802   msrB FALSE 0.087 156.000 0.024 NA   NA
 1808542 1808543 AAur_1802 AAur_1803 msrB   FALSE 0.238 111.000 0.048 NA   NA
 1808545 1808546 AAur_1805 AAur_1806   sufE FALSE 0.408 34.000 0.008 NA   NA
 1808546 1808547 AAur_1806 AAur_1807 sufE sseA TRUE 0.685 57.000 0.351 NA   NA
 1808549 1808550 AAur_1809 AAur_1810     FALSE 0.058 133.000 0.000 NA   NA
 1808550 1808551 AAur_1810 AAur_1811     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1808551 1808552 AAur_1811 AAur_1812     FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 1808552 1808553 AAur_1812 AAur_1813     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1808553 1808554 AAur_1813 AAur_1814     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1808554 1808555 AAur_1814 AAur_1815     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1808555 1808556 AAur_1815 AAur_1816     FALSE 0.252 39.000 0.000 NA   NA
 1808556 1808557 AAur_1816 AAur_1817     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808558 1808559 AAur_1818 AAur_1819     FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 1808559 1808560 AAur_1819 AAur_1820     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 1808560 1808561 AAur_1820 AAur_1821   def FALSE 0.554 51.000 0.088 1.000   NA
 1808561 1808562 AAur_1821 AAur_1822 def fmt TRUE 0.992 -3.000 0.031 0.019 Y NA
 1808562 1808563 AAur_1822 AAur_1823 fmt   TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 1808563 1808564 AAur_1823 AAur_1824   rpe FALSE 0.475 56.000 0.056 1.000 N NA
 1808564 1808565 AAur_1824 AAur_1825 rpe   FALSE 0.007 323.000 0.000 1.000 N NA
 1808565 1808566 AAur_1825 AAur_1826   ribD TRUE 0.984 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 1808566 1808567 AAur_1826 AAur_1827 ribD ribE TRUE 0.995 0.000 0.456 1.000 Y NA
 1808567 1808568 AAur_1827 AAur_1828 ribE   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808568 1808569 AAur_1828 AAur_1829   ribH FALSE 0.376 17.000 0.000 NA   NA
 1808569 1808570 AAur_1829 AAur_1830 ribH hisE TRUE 0.618 28.000 0.034 1.000 N NA
 1808570 1808571 AAur_1830 AAur_1831 hisE hisG TRUE 0.807 85.000 0.081 0.003 Y NA
 1808571 1808572 AAur_1831 AAur_1832 hisG hisF TRUE 0.806 61.000 0.008 0.003 Y NA
 1808574 1808575 AAur_1834 AAur_1835 hisI trpE TRUE 0.769 59.000 0.050 1.000 Y NA
 1808575 1808576 AAur_1835 AAur_1836 trpE   TRUE 0.989 -3.000 0.690 NA   NA
 1808576 1808577 AAur_1836 AAur_1837     FALSE 0.245 133.000 0.109 NA   NA
 1808577 1808578 AAur_1837 AAur_1838   trpC TRUE 0.965 3.000 0.300 NA   NA
 1808578 1808579 AAur_1838 AAur_1839 trpC trpB TRUE 0.798 106.000 0.101 0.002 Y NA
 1808579 1808580 AAur_1839 AAur_1840 trpB trpA TRUE 0.995 0.000 0.153 0.001 Y NA
 1808580 1808581 AAur_1840 AAur_1841 trpA lgt FALSE 0.454 49.000 0.026 1.000 N NA
 1808581 1808582 AAur_1841 AAur_1842 lgt gltB FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 1808582 1808583 AAur_1842 AAur_1843 gltB   TRUE 0.984 -7.000 0.022 0.001 Y NA
 1808583 1808584 AAur_1843 AAur_1844   pyk FALSE 0.424 55.000 0.031 1.000 N NA
 1808588 1808589 AAur_1848 AAur_1849 xfp   FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 1808590 1808591 AAur_1850 AAur_1851     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1808593 1808594 AAur_1853 AAur_1854     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1808594 1808595 AAur_1854 AAur_1855     FALSE 0.003 578.000 0.000 1.000   NA
 1808595 1808596 AAur_1855 AAur_1856   metE TRUE 0.893 3.000 0.025 1.000   NA
 1808596 1808597 AAur_1856 AAur_1857 metE   TRUE 0.925 21.000 0.775 NA   NA
 1808598 1808599 AAur_1858 AAur_1859     FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 1808599 1808600 AAur_1859 AAur_1860     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808600 1808601 AAur_1860 AAur_1861     FALSE 0.002 562.000 0.000 NA   NA
 1808601 1808602 AAur_1861 AAur_1862     FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 1808602 1808603 AAur_1862 AAur_1863     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1808603 1808604 AAur_1863 AAur_1864     FALSE 0.050 144.000 0.000 NA   NA
 1808605 1808606 AAur_1865 AAur_1866     TRUE 0.958 12.000 0.950 NA   NA
 1808606 1808607 AAur_1866 AAur_1867   fdhA TRUE 0.794 55.000 0.000 0.020 Y NA
 1808607 1808608 AAur_1867 AAur_1868 fdhA   FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 1808610 1808611 AAur_1870 AAur_1871     FALSE 0.018 197.000 0.000 NA   NA
 1808611 1808612 AAur_1871 AAur_1872     FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 1808612 1808613 AAur_1872 AAur_1873     FALSE 0.009 276.000 0.000 NA N NA
 1808613 1808614 AAur_1873 AAur_1874     FALSE 0.398 24.000 0.000 1.000   NA
 1808615 1808616 AAur_1875 AAur_1876   dnaK FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 1808616 1808617 AAur_1876 AAur_1877 dnaK grpE TRUE 0.988 9.000 0.292 0.006 Y NA
 1808617 1808618 AAur_1877 AAur_1878 grpE   TRUE 0.992 -7.000 0.271 0.006 Y NA
 1808618 1808619 AAur_1878 AAur_1879     TRUE 0.973 -3.000 0.209 NA   NA
 1808619 1808620 AAur_1879 AAur_1880   clpB TRUE 0.900 -3.000 0.011 NA   NA
 1808620 1808621 AAur_1880 AAur_1881 clpB trx TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1808621 1808622 AAur_1881 AAur_1882 trx   FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 1808622 1808623 AAur_1882 AAur_1883     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 1808624 1808625 AAur_1884 AAur_1885     FALSE 0.063 284.000 0.000 NA Y NA
 1808626 1808627 AAur_1886 AAur_1887     TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.045   NA
 1808627 1808628 AAur_1887 AAur_1888   rbsC FALSE 0.280 45.000 0.000 1.000   NA
 1808628 1808629 AAur_1888 AAur_1889 rbsC rbsB TRUE 0.617 66.000 0.000 1.000 Y NA
 1808629 1808630 AAur_1889 AAur_1890 rbsB   FALSE 0.540 78.000 0.000 NA Y NA
 1808630 1808631 AAur_1890 AAur_1891     TRUE 0.954 -7.000 0.000 NA Y NA
 1808631 1808632 AAur_1891 AAur_1892     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA Y NA
 1808632 1808633 AAur_1892 AAur_1893     TRUE 0.819 27.000 0.000 NA Y NA
 1808633 1808634 AAur_1893 AAur_1894   ppsA FALSE 0.029 410.000 0.000 NA Y NA
 1808634 1808635 AAur_1894 AAur_1895 ppsA   TRUE 0.805 34.000 0.342 NA   NA
 1808635 1808636 AAur_1895 AAur_1896     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 1808638 1808639 AAur_1898 AAur_1899   oxdA TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1808639 1808640 AAur_1899 AAur_1900 oxdA   FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1808641 1808642 AAur_1901 AAur_1902     FALSE 0.075 146.000 0.000 1.000 N NA
 1808642 1808643 AAur_1902 AAur_1903   tdh FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000 N NA
 1808643 1808644 AAur_1903 AAur_1904 tdh   FALSE 0.389 43.000 0.013 NA   NA
 1808644 1808645 AAur_1904 AAur_1905     TRUE 0.935 -43.000 0.429 NA   NA
 1808645 1808646 AAur_1905 AAur_1906   kdgT TRUE 0.923 9.000 0.222 1.000   NA
 1808647 1808648 AAur_1907 AAur_1908     FALSE 0.002 689.000 0.000 1.000   NA
 1808648 1808649 AAur_1908 AAur_1909     FALSE 0.129 87.000 0.000 1.000   NA
 1808649 1808650 AAur_1909 AAur_1910     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1808651 1808652 AAur_1911 AAur_1912   aceE FALSE 0.005 412.000 0.000 1.000 N NA
 1808652 1808653 AAur_1912 AAur_1913 aceE   FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1808653 1808654 AAur_1913 AAur_1914     FALSE 0.481 -94.000 0.000 NA   NA
 1808654 1808655 AAur_1914 AAur_1915     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1808655 1808656 AAur_1915 AAur_1916     TRUE 0.933 -64.000 0.188 0.070 N NA
 1808656 1808657 AAur_1916 AAur_1917     TRUE 0.995 -3.000 0.156 0.070 Y NA
 1808658 1808659 AAur_1918 AAur_1919     FALSE 0.012 223.000 0.000 NA   NA
 1808659 1808660 AAur_1919 AAur_1920     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1808660 1808661 AAur_1920 AAur_1921     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 1808661 1808662 AAur_1921 AAur_1922     TRUE 0.987 7.000 0.188 0.045 Y NA
 1808662 1808663 AAur_1922 AAur_1923     TRUE 0.996 -3.000 0.222 0.045 Y NA
 1808663 1808664 AAur_1923 AAur_1924     TRUE 0.647 -13.000 0.000 NA N NA
 1808664 1808665 AAur_1924 AAur_1925     FALSE 0.052 149.000 0.000 NA N NA
 1808665 1808666 AAur_1925 AAur_1926     FALSE 0.485 43.000 0.031 NA N NA
 1808666 1808667 AAur_1926 AAur_1927     TRUE 0.656 7.000 0.000 NA N NA
 1808667 1808668 AAur_1927 AAur_1928     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1808668 1808669 AAur_1928 AAur_1929     FALSE 0.512 -55.000 0.000 NA   NA
 1808669 1808670 AAur_1929 AAur_1930     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1808670 1808671 AAur_1930 AAur_1931     TRUE 0.788 74.000 0.053 0.056 Y NA
 1808671 1808672 AAur_1931 AAur_1932     TRUE 0.649 34.000 0.068 1.000 N NA
 1808672 1808673 AAur_1932 AAur_1933     FALSE 0.496 -70.000 0.000 NA   NA
 1808673 1808674 AAur_1933 AAur_1934     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1808674 1808675 AAur_1934 AAur_1935     TRUE 0.974 4.000 0.588 NA   NA
 1808677 1808678 AAur_1937 AAur_1938     FALSE 0.247 50.000 0.000 1.000   NA
 1808681 1808682 AAur_1941 AAur_1942 mmsA   FALSE 0.160 199.000 0.000 1.000 Y NA
 1808682 1808683 AAur_1942 AAur_1943     FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1808683 1808684 AAur_1943 AAur_1944     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1808684 1808685 AAur_1944 AAur_1945     TRUE 0.990 0.000 0.810 NA   NA
 1808685 1808686 AAur_1945 AAur_1946     TRUE 0.898 25.000 0.608 NA   NA
 1808688 1808689 AAur_1948 AAur_1949     TRUE 0.944 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1808689 1808690 AAur_1949 AAur_1950     FALSE 0.003 412.000 0.000 NA   NA
 1808690 1808691 AAur_1950 AAur_1951     FALSE 0.027 173.000 0.000 NA   NA
 1808692 1808693 AAur_1952 AAur_1953 rbsR   TRUE 0.597 78.000 0.333 1.000 N NA
 1808693 1808694 AAur_1953 AAur_1954     TRUE 0.875 126.000 0.643 0.070 Y NA
 1808694 1808695 AAur_1954 AAur_1955     TRUE 0.989 11.000 0.632 0.070 Y NA
 1808695 1808696 AAur_1955 AAur_1956     TRUE 0.994 -3.000 0.316 1.000 Y NA
 1808696 1808697 AAur_1956 AAur_1957     TRUE 0.993 -3.000 0.050 0.002 Y NA
 1808697 1808698 AAur_1957 AAur_1958     TRUE 0.951 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1808698 1808699 AAur_1958 AAur_1959     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 1808699 1808700 AAur_1959 AAur_1960     TRUE 0.827 28.000 0.000 1.000 Y NA
 1808702 1808703 AAur_1962 AAur_1963 mntB   TRUE 0.960 3.000 0.238 NA   NA
 1808703 1808704 AAur_1963 AAur_1964     TRUE 0.970 -3.000 0.185 NA   NA
 1808704 1808705 AAur_1964 AAur_1965     TRUE 0.751 51.000 0.412 NA   NA
 1808706 1808707 AAur_1966 AAur_1967     TRUE 0.908 13.000 0.429 NA   NA
 1808708 1808709 AAur_1968 AAur_1969     FALSE 0.079 143.000 0.000 1.000 N NA
 1808709 1808710 AAur_1969 AAur_1970     TRUE 0.869 31.000 0.000 0.070 Y NA
 1808710 1808711 AAur_1970 AAur_1971     TRUE 0.992 -16.000 0.556 0.070 Y NA
 1808711 1808712 AAur_1971 AAur_1972     TRUE 0.621 -25.000 0.000 1.000   NA
 1808713 1808714 AAur_1973 AAur_1974     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1808714 1808715 AAur_1974 AAur_1975     TRUE 0.940 10.000 0.474 NA   NA
 1808716 1808717 AAur_1976 AAur_1977     FALSE 0.220 97.000 0.021 1.000   NA
 1808717 1808718 AAur_1977 AAur_1978     TRUE 0.972 -3.000 0.179 1.000   NA
 1808718 1808719 AAur_1978 AAur_1979     TRUE 0.943 7.000 0.098 0.040   NA
 1808719 1808720 AAur_1979 AAur_1980   mmsA TRUE 0.744 46.000 0.250 1.000 N NA
 1808720 1808721 AAur_1980 AAur_1981 mmsA   FALSE 0.543 83.000 0.250 1.000 N NA
 1808721 1808722 AAur_1981 AAur_1982     TRUE 0.724 43.000 0.200 1.000   NA
 1808722 1808723 AAur_1982 AAur_1983     TRUE 0.903 13.000 0.400 NA   NA
 1808724 1808725 AAur_1984 AAur_1985     FALSE 0.085 111.000 0.000 NA   NA
 1808725 1808726 AAur_1985 AAur_1986     TRUE 0.990 -3.000 0.727 NA   NA
 1808727 1808728 AAur_1987 AAur_1988     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA N NA
 1808728 1808729 AAur_1988 AAur_1989     TRUE 0.979 -22.000 0.333 NA Y NA
 1808729 1808730 AAur_1989 AAur_1990     TRUE 0.906 12.000 0.333 1.000   NA
 1808730 1808731 AAur_1990 AAur_1991     FALSE 0.109 113.000 0.000 1.000   NA
 1808731 1808732 AAur_1991 AAur_1992     TRUE 0.969 -3.000 0.036 0.045   NA
 1808732 1808733 AAur_1992 AAur_1993     TRUE 0.587 34.000 0.000 0.045   NA
 1808733 1808734 AAur_1993 AAur_1994     TRUE 0.920 -78.000 0.095 0.001   NA
 1808735 1808736 AAur_1995 AAur_1996     FALSE 0.479 46.000 0.026 1.000 N NA
 1808737 1808738 AAur_1997 AAur_1998     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1808738 1808739 AAur_1998 AAur_1999     TRUE 0.880 -54.000 0.154 NA N NA
 1808739 1808740 AAur_1999 AAur_2000     TRUE 0.984 -3.000 0.154 0.040 N NA
 1808740 1808741 AAur_2000 AAur_2001     FALSE 0.113 120.000 0.000 1.000 N NA
 1808743 1808744 AAur_2003 AAur_2004     TRUE 0.954 5.000 0.333 NA   NA
 1808745 1808746 AAur_2005 AAur_2006     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1808748 1808749 AAur_2008 AAur_2009     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 1808753 1808754 AAur_2012 AAur_2014     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808755 1808756 AAur_2015 AAur_2016     TRUE 0.946 45.000 0.577 1.000 Y NA
 1808756 1808757 AAur_2016 AAur_2017     TRUE 0.983 10.000 0.448 1.000 Y NA
 1808757 1808758 AAur_2017 AAur_2018     FALSE 0.088 104.000 0.000 NA   NA
 1808758 1808759 AAur_2018 AAur_2019     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1808761 1808762 AAur_2021 AAur_2022     TRUE 0.682 7.000 0.000 1.000   NA
 1808765 1808766 AAur_2024 AAur_2026     FALSE 0.481 18.000 0.000 1.000 N NA
 1808766 1808767 AAur_2026 AAur_2027     FALSE 0.115 72.000 0.000 NA   NA
 1808767 1808768 AAur_2027 AAur_2028     TRUE 0.957 -18.000 0.569 NA   NA
 1808768 1808769 AAur_2028 AAur_2029     TRUE 0.977 4.000 0.633 NA   NA
 1808769 1808770 AAur_2029 AAur_2030     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808770 1808771 AAur_2030 AAur_2031     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808771 1808772 AAur_2031 AAur_2032     FALSE 0.113 108.000 0.000 1.000   NA
 1808775 1808776 AAur_2035 AAur_2036     TRUE 0.888 37.000 0.750 NA   NA
 1808777 1808778 AAur_2037 AAur_2038     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1808778 1808779 AAur_2038 AAur_2039     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1808780 1808781 AAur_2040 AAur_2041     TRUE 0.579 -64.000 0.000 1.000   NA
 1808782 1808783 AAur_2042 AAur_2043     TRUE 0.958 -73.000 0.714 1.000   NA
 1808784 1808785 AAur_2044 AAur_2045     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1808785 1808786 AAur_2045 AAur_2046     TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000   NA
 1808788 1808789 AAur_2048 AAur_2049     FALSE 0.407 28.000 0.000 1.000 N NA
 1808790 1808791 AAur_2050 AAur_2051     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1808791 1808792 AAur_2051 AAur_2052     TRUE 0.971 -16.000 0.810 NA   NA
 1808792 1808793 AAur_2052 AAur_2053     TRUE 0.985 -3.000 0.471 NA N NA
 1808793 1808794 AAur_2053 AAur_2054     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA N NA
 1808796 1808797 AAur_2056 AAur_2057     TRUE 0.879 -58.000 0.158 NA N NA
 1808797 1808798 AAur_2057 AAur_2058   kynA TRUE 0.831 47.000 0.050 1.000 Y NA
 1808799 1808800 AAur_2059 AAur_2060     FALSE 0.023 182.000 0.000 NA   NA
 1808800 1808801 AAur_2060 AAur_2061     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1808801 1808802 AAur_2061 AAur_2062     TRUE 0.670 70.000 0.500 NA   NA
 1808802 1808803 AAur_2062 AAur_2063     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1808805 1808806 AAur_2065 AAur_2066 polA   FALSE 0.194 85.000 0.005 1.000   NA
 1808806 1808807 AAur_2066 AAur_2067     FALSE 0.240 51.000 0.000 1.000   NA
 1808807 1808808 AAur_2067 AAur_2068   rpsA FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000 N NA
 1808810 1808811 AAur_2070 AAur_2071 coaE uvrB TRUE 0.704 30.000 0.026 0.086 N NA
 1808811 1808812 AAur_2071 AAur_2072 uvrB   FALSE 0.076 169.000 0.013 1.000 N NA
 1808812 1808813 AAur_2072 AAur_2074     TRUE 0.767 30.000 0.053 0.056 N NA
 1808814 1808815 AAur_2073 AAur_2075 pip   TRUE 0.789 -31.000 0.031 1.000   NA
 1808815 1808816 AAur_2075 AAur_2076     FALSE 0.551 33.000 0.000 0.080   NA
 1808816 1808817 AAur_2076 AAur_2077     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1808818 1808819 AAur_2078 AAur_2079 tam   FALSE 0.046 158.000 0.000 1.000   NA
 1808819 1808820 AAur_2079 AAur_2080   uvrA FALSE 0.257 66.000 0.004 1.000 N NA
 1808820 1808821 AAur_2080 AAur_2081 uvrA   FALSE 0.163 114.000 0.005 1.000   NA
 1808821 1808822 AAur_2081 AAur_2082     TRUE 0.893 -13.000 0.023 0.080   NA
 1808822 1808823 AAur_2082 AAur_2083   uvrC FALSE 0.319 58.000 0.007 1.000 N NA
 1808823 1808824 AAur_2083 AAur_2084 uvrC   FALSE 0.212 132.000 0.073 NA   NA
 1808824 1808825 AAur_2084 AAur_2085     TRUE 0.975 0.000 0.259 NA   NA
 1808825 1808826 AAur_2085 AAur_2086     TRUE 0.940 10.000 0.470 NA   NA
 1808826 1808827 AAur_2086 AAur_2087   sodA FALSE 0.064 162.000 0.012 NA   NA
 1808827 1808828 AAur_2087 AAur_2088 sodA gap FALSE 0.012 272.000 0.000 1.000 N NA
 1808828 1808829 AAur_2088 AAur_2089 gap pgk TRUE 0.974 10.000 0.055 0.004 Y NA
 1808829 1808830 AAur_2089 AAur_2090 pgk tpiA TRUE 0.724 75.000 0.075 1.000 Y NA
 1808830 1808831 AAur_2090 AAur_2091 tpiA secG TRUE 0.616 37.000 0.064 1.000   NA
 1808832 1808833 AAur_2092 AAur_2093 pgl   TRUE 0.988 -10.000 0.463 NA Y NA
 1808833 1808834 AAur_2093 AAur_2094   zwf TRUE 0.996 -3.000 0.583 NA Y NA
 1808834 1808835 AAur_2094 AAur_2095 zwf pgi TRUE 0.925 16.000 0.061 1.000 Y NA
 1808835 1808836 AAur_2095 AAur_2096 pgi tal TRUE 0.962 7.000 0.025 1.000 Y NA
 1808836 1808837 AAur_2096 AAur_2097 tal tkt TRUE 0.909 33.000 0.135 1.000 Y NA
 1808839 1808840 AAur_2099 AAur_2100     FALSE 0.295 29.000 0.000 NA   NA
 1808840 1808841 AAur_2100 AAur_2101     TRUE 0.597 47.000 0.106 NA N NA
 1808841 1808842 AAur_2101 AAur_2102     TRUE 0.997 -3.000 0.743 NA Y NA
 1808843 1808844 AAur_2103 AAur_2104   sufB TRUE 0.963 0.000 0.100 1.000 N NA
 1808844 1808845 AAur_2104 AAur_2105 sufB sufD TRUE 0.995 3.000 0.266 0.001 Y NA
 1808845 1808846 AAur_2105 AAur_2106 sufD   TRUE 0.717 22.000 0.063 1.000 N NA
 1808846 1808847 AAur_2106 AAur_2107   sufC FALSE 0.552 44.000 0.046 1.000 N NA
 1808847 1808848 AAur_2107 AAur_2108 sufC   TRUE 0.622 14.000 0.021 NA   NA
 1808850 1808851 AAur_2110 AAur_2112     TRUE 0.984 -73.000 0.576 1.000 Y NA
 1808852 1808853 AAur_2111 AAur_2113     TRUE 0.978 -3.000 0.224 1.000 N NA
 1808853 1808854 AAur_2113 AAur_2114     TRUE 0.681 18.000 0.056 NA   NA
 1808856 1808857 AAur_2116 AAur_2117     TRUE 0.756 -16.000 0.017 NA   NA
 1808857 1808858 AAur_2117 AAur_2118     TRUE 0.955 1.000 0.125 NA   NA
 1808858 1808859 AAur_2118 AAur_2119     TRUE 0.987 -3.000 0.562 NA   NA
 1808860 1808861 AAur_2120 AAur_2121 fabG   FALSE 0.542 117.000 0.008 1.000 Y NA
 1808861 1808862 AAur_2121 AAur_2122   rbsA FALSE 0.006 342.000 0.000 1.000 N NA
 1808863 1808864 AAur_2123 AAur_2124   serB FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 1808865 1808866 AAur_2125 AAur_2126     TRUE 0.776 20.000 0.119 1.000   NA
 1808866 1808867 AAur_2126 AAur_2127     TRUE 0.854 8.000 0.052 1.000   NA
 1808867 1808868 AAur_2127 AAur_2128   rpmE TRUE 0.981 1.000 0.008 1.000 Y NA
 1808868 1808869 AAur_2128 AAur_2129 rpmE   FALSE 0.390 50.000 0.010 1.000 N NA
 1808870 1808871 AAur_2130 AAur_2131 pepN   TRUE 0.842 5.000 0.031 NA   NA
 1808872 1808873 AAur_2132 AAur_2133     TRUE 0.960 -67.000 0.805 NA   NA
 1808873 1808874 AAur_2133 AAur_2134     TRUE 0.955 -3.000 0.089 NA   NA
 1808875 1808876 AAur_2135 AAur_2136   glgC FALSE 0.351 65.000 0.032 1.000 N NA
 1808878 1808879 AAur_2138 AAur_2139     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808880 1808881 AAur_2140 AAur_2141     TRUE 0.977 -37.000 0.296 1.000 Y NA
 1808881 1808882 AAur_2141 AAur_2142     TRUE 0.990 -3.000 0.412 0.079   NA
 1808884 1808885 AAur_2144 AAur_2145     TRUE 0.718 29.000 0.100 1.000 N NA
 1808887 1808888 AAur_2147 AAur_2148     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1808888 1808889 AAur_2148 AAur_2149     FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1808889 1808890 AAur_2149 AAur_2150     FALSE 0.389 58.000 0.035 1.000   NA
 1808890 1808891 AAur_2150 AAur_2151     TRUE 0.961 -3.000 0.094 1.000   NA
 1808891 1808892 AAur_2151 AAur_2152     TRUE 0.996 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 1808892 1808893 AAur_2152 AAur_2153     TRUE 0.989 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 1808893 1808894 AAur_2153 AAur_2154     TRUE 0.941 -66.000 0.027 1.000 Y NA
 1808894 1808895 AAur_2154 AAur_2155     TRUE 0.972 2.000 0.273 1.000   NA
 1808895 1808896 AAur_2155 AAur_2156     FALSE 0.088 104.000 0.000 NA   NA
 1808896 1808897 AAur_2156 AAur_2157     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808897 1808898 AAur_2157 AAur_2158     TRUE 0.891 -15.000 0.125 NA   NA
 1808898 1808899 AAur_2158 AAur_2159     TRUE 0.945 -12.000 0.333 NA   NA
 1808899 1808900 AAur_2159 AAur_2160     FALSE 0.195 59.000 0.000 1.000   NA
 1808900 1808901 AAur_2160 AAur_2161     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808902 1808903 AAur_2162 AAur_2163     TRUE 0.951 -3.000 0.077 NA   NA
 1808903 1808904 AAur_2163 AAur_2164   rfbC/rfbD FALSE 0.043 162.000 0.000 1.000   NA
 1808904 1808905 AAur_2164 AAur_2165 rfbC/rfbD rfbB TRUE 0.978 4.000 0.000 0.003 Y NA
 1808908 1808909 AAur_2168 AAur_2169     TRUE 0.759 16.000 0.071 1.000 N NA
 1808911 1808912 AAur_2171 AAur_2172     TRUE 0.954 1.000 0.095 1.000   NA
 1808912 1808913 AAur_2172 AAur_2173     TRUE 0.818 22.000 0.201 1.000   NA
 1808913 1808914 AAur_2173 AAur_2174     FALSE 0.482 98.000 0.215 1.000 N NA
 1808914 1808915 AAur_2174 AAur_2175     TRUE 0.983 -3.000 0.416 NA   NA
 1808915 1808916 AAur_2175 AAur_2176     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 1808916 1808917 AAur_2176 AAur_2177     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808917 1808918 AAur_2177 AAur_2178     TRUE 0.994 -34.000 0.797 0.001 Y NA
 1808918 1808919 AAur_2178 AAur_2179     TRUE 0.969 2.000 0.271 NA   NA
 1808919 1808920 AAur_2179 AAur_2180     FALSE 0.479 46.000 0.047 NA   NA
 1808920 1808921 AAur_2180 AAur_2181     TRUE 0.563 74.000 0.063 0.001   NA
 1808921 1808922 AAur_2181 AAur_2182     FALSE 0.530 48.000 0.068 NA N NA
 1808922 1808923 AAur_2182 AAur_2183     TRUE 0.801 10.000 0.055 NA   NA
 1808923 1808924 AAur_2183 AAur_2184   tatA TRUE 0.826 37.000 0.444 NA   NA
 1808924 1808925 AAur_2184 AAur_2185 tatA tatC TRUE 0.822 7.000 0.035 NA   NA
 1808925 1808926 AAur_2185 AAur_2186 tatC   TRUE 0.772 25.000 0.166 NA N NA
 1808926 1808927 AAur_2186 AAur_2187     TRUE 0.806 17.000 0.140 1.000   NA
 1808927 1808928 AAur_2187 AAur_2188     FALSE 0.007 427.000 0.014 1.000   NA
 1808929 1808930 AAur_2189 AAur_2190     FALSE 0.021 258.000 0.021 NA   NA
 1808930 1808931 AAur_2190 AAur_2191     TRUE 0.775 93.000 0.259 NA Y NA
 1808931 1808932 AAur_2191 AAur_2192     FALSE 0.394 36.000 0.006 NA   NA
 1808936 1808937 AAur_2196 AAur_2197     TRUE 0.966 -55.000 0.133 1.000 Y NA
 1808937 1808938 AAur_2197 AAur_2198     TRUE 0.977 -3.000 0.213 1.000 N NA
 1808940 1808941 AAur_2200 AAur_2201     FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 1808941 1808942 AAur_2201 AAur_2202     FALSE 0.094 92.000 0.000 NA   NA
 1808942 1808943 AAur_2202 AAur_2203     FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 1808944 1808945 AAur_2204 AAur_2205     FALSE 0.418 50.000 0.036 NA   NA
 1808947 1808948 AAur_2207 AAur_2208     TRUE 0.780 89.000 0.070 0.044 Y NA
 1808948 1808949 AAur_2208 AAur_2209     TRUE 0.882 84.000 0.351 0.044 Y NA
 1808949 1808950 AAur_2209 AAur_2210     TRUE 0.989 -31.000 0.457 0.044 Y NA
 1808953 1808954 AAur_2213 AAur_2214   ctaD TRUE 0.976 -3.000 0.250 NA   NA
 1808954 1808955 AAur_2214 AAur_2215 ctaD   TRUE 0.984 11.000 0.284 0.001 Y NA
 1808955 1808956 AAur_2215 AAur_2216     FALSE 0.131 127.000 0.014 NA   NA
 1808956 1808957 AAur_2216 AAur_2217     FALSE 0.063 165.000 0.014 NA   NA
 1808960 1808961 AAur_2220 AAur_2221     TRUE 0.602 10.000 0.000 1.000   NA
 1808961 1808962 AAur_2221 AAur_2222     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA Y NA
 1808963 1808964 AAur_2223 AAur_2224 uppS   TRUE 0.937 3.000 0.076 1.000 N NA
 1808964 1808965 AAur_2224 AAur_2225   leuA TRUE 0.837 5.000 0.011 1.000 N NA
 1808967 1808968 AAur_2227 AAur_2228   era FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1808968 1808969 AAur_2228 AAur_2229 era   TRUE 0.832 -97.000 0.089 1.000   NA
 1808969 1808970 AAur_2229 AAur_2230     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 1808970 1808971 AAur_2230 AAur_2231     TRUE 0.984 -3.000 0.457 NA   NA
 1808973 1808974 AAur_2233 AAur_2234   dnaJ TRUE 0.912 3.000 0.058 NA   NA
 1808974 1808975 AAur_2234 AAur_2235 dnaJ hrcA FALSE 0.522 51.000 0.059 1.000 N NA
 1808976 1808977 AAur_2236 AAur_2237     TRUE 0.590 45.000 0.099 NA   NA
 1808978 1808979 AAur_2238 AAur_2239   lepA TRUE 0.954 1.000 0.083 1.000 N NA
 1808980 1808981 AAur_2240 AAur_2241   rpsT FALSE 0.045 185.000 0.013 NA   NA
 1808982 1808983 AAur_2242 AAur_2243 holA   TRUE 0.897 9.000 0.163 NA   NA
 1808983 1808984 AAur_2243 AAur_2244     TRUE 0.923 -7.000 0.130 NA   NA
 1808984 1808985 AAur_2244 AAur_2245     FALSE 0.210 74.000 0.014 NA   NA
 1808985 1808986 AAur_2245 AAur_2246   leuS TRUE 0.716 9.000 0.009 NA   NA
 1808986 1808987 AAur_2246 AAur_2247 leuS glpK FALSE 0.010 293.000 0.000 1.000 N NA
 1808987 1808988 AAur_2247 AAur_2248 glpK glpF FALSE 0.501 76.000 0.174 1.000 N NA
 1808988 1808989 AAur_2248 AAur_2249 glpF glpD FALSE 0.088 171.000 0.027 1.000 N NA
 1808990 1808991 AAur_2250 AAur_2251     TRUE 0.920 -13.000 0.167 1.000   NA
 1808991 1808992 AAur_2251 AAur_2252     TRUE 0.888 11.000 0.200 1.000   NA
 1808992 1808993 AAur_2252 AAur_2253     TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1808994 1808995 AAur_2254 AAur_2255     TRUE 0.599 -87.000 0.000 1.000 N NA
 1808995 1808996 AAur_2255 AAur_2256   vanA FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1808998 1808999 AAur_2257 AAur_2259   metK FALSE 0.099 179.000 0.068 NA N NA
 1808999 1809000 AAur_2259 AAur_2260 metK coaBC TRUE 0.702 77.000 0.059 1.000 Y NA
 1809000 1809001 AAur_2260 AAur_2261 coaBC rpoZ TRUE 0.793 28.000 0.192 1.000 N NA
 1809001 1809002 AAur_2261 AAur_2262 rpoZ   TRUE 0.843 40.000 0.471 1.000 N NA
 1809002 1809003 AAur_2262 AAur_2263     TRUE 0.681 22.000 0.054 1.000   NA
 1809003 1809004 AAur_2263 AAur_2264   pyrF FALSE 0.285 74.000 0.029 1.000   NA
 1809004 1809005 AAur_2264 AAur_2265 pyrF carB TRUE 0.978 -7.000 0.075 1.000 Y NA
 1809005 1809006 AAur_2265 AAur_2266 carB carA TRUE 0.997 0.000 0.345 0.001 Y NA
 1809006 1809007 AAur_2266 AAur_2267 carA   TRUE 0.816 -19.000 0.050 NA   NA
 1809007 1809008 AAur_2267 AAur_2268   pyrC TRUE 0.939 0.000 0.057 NA   NA
 1809008 1809009 AAur_2268 AAur_2269 pyrC pyrB TRUE 0.995 0.000 0.452 1.000 Y NA
 1809009 1809010 AAur_2269 AAur_2270 pyrB pyrR TRUE 0.994 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 1809012 1809013 AAur_2272 AAur_2273 nusB efp TRUE 0.958 0.000 0.078 1.000 N NA
 1809013 1809014 AAur_2273 AAur_2274 efp   FALSE 0.071 156.000 0.003 1.000   NA
 1809014 1809015 AAur_2274 AAur_2275   aroB TRUE 0.903 -3.000 0.003 1.000   NA
 1809015 1809016 AAur_2275 AAur_2276 aroB aroK TRUE 0.983 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 1809016 1809017 AAur_2276 AAur_2277 aroK aroF TRUE 0.982 0.000 0.002 1.000 Y NA
 1809017 1809018 AAur_2277 AAur_2278 aroF aroE TRUE 0.945 -36.000 0.021 1.000 Y NA
 1809018 1809019 AAur_2278 AAur_2279 aroE   TRUE 0.855 -9.000 0.045 NA   NA
 1809019 1809020 AAur_2279 AAur_2280     TRUE 0.932 -3.000 0.039 NA   NA
 1809020 1809021 AAur_2280 AAur_2281   alaS TRUE 0.945 3.000 0.103 1.000 N NA
 1809021 1809022 AAur_2281 AAur_2282 alaS   FALSE 0.461 38.000 0.023 NA   NA
 1809022 1809023 AAur_2282 AAur_2283     FALSE 0.402 53.000 0.042 NA   NA
 1809023 1809024 AAur_2283 AAur_2284   rpsD FALSE 0.060 159.000 0.007 NA   NA
 1809024 1809025 AAur_2284 AAur_2285 rpsD   FALSE 0.038 205.000 0.005 1.000 N NA
 1809027 1809028 AAur_2286 AAur_2288   aspS FALSE 0.164 96.000 0.002 1.000   NA
 1809028 1809029 AAur_2288 AAur_2289 aspS   TRUE 0.925 24.000 0.020 0.029 Y NA
 1809030 1809031 AAur_2290 AAur_2291     FALSE 0.422 67.000 0.103 NA   NA
 1809031 1809032 AAur_2291 AAur_2292     FALSE 0.329 104.000 0.103 NA   NA
 1809033 1809034 AAur_2293 AAur_2294   secF FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1809034 1809035 AAur_2294 AAur_2295 secF secD TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1809035 1809036 AAur_2295 AAur_2296 secD yajC TRUE 0.618 115.000 0.062 NA Y NA
 1809036 1809037 AAur_2296 AAur_2297 yajC ruvB FALSE 0.294 99.000 0.063 NA N NA
 1809037 1809038 AAur_2297 AAur_2298 ruvB ruvA TRUE 0.995 -7.000 0.549 0.001 Y NA
 1809038 1809039 AAur_2298 AAur_2299 ruvA ruvC TRUE 0.948 52.000 0.451 0.008 Y NA
 1809039 1809040 AAur_2299 AAur_2300 ruvC   TRUE 0.716 47.000 0.277 NA   NA
 1809040 1809041 AAur_2300 AAur_2301     TRUE 0.888 4.000 0.055 NA   NA
 1809042 1809043 AAur_2302 AAur_2303     TRUE 0.991 -3.000 0.796 1.000   NA
 1809046 1809047 AAur_2306 AAur_2307     FALSE 0.056 181.000 0.005 1.000 N NA
 1809047 1809048 AAur_2307 AAur_2308     TRUE 0.926 -10.000 0.140 1.000 N NA
 1809048 1809049 AAur_2308 AAur_2309   thrS TRUE 0.838 20.000 0.208 1.000 N NA
 1809049 1809050 AAur_2309 AAur_2310 thrS   FALSE 0.225 152.000 0.024 0.029 N NA
 1809050 1809051 AAur_2310 AAur_2311     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1809051 1809052 AAur_2311 AAur_2312     FALSE 0.109 75.000 0.000 NA   NA
 1809053 1809054 AAur_2313 AAur_2314     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1809056 1809057 AAur_2316 AAur_2317   adhE2 FALSE 0.171 71.000 0.000 1.000 N NA
 1809057 1809058 AAur_2317 AAur_2318 adhE2   TRUE 0.974 -3.000 0.200 1.000   NA
 1809059 1809060 AAur_2319 AAur_2320     FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1809060 1809061 AAur_2320 AAur_2321     TRUE 0.902 -3.000 0.012 NA   NA
 1809061 1809062 AAur_2321 AAur_2322     TRUE 0.613 32.000 0.071 NA   NA
 1809064 1809065 AAur_2323 AAur_2325     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 1809068 1809069 AAur_2328 AAur_2329     TRUE 0.992 -3.000 0.849 NA   NA
 1809069 1809070 AAur_2329 AAur_2330     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809070 1809071 AAur_2330 AAur_2331     TRUE 0.940 11.000 0.000 0.078 Y NA
 1809071 1809072 AAur_2331 AAur_2332     FALSE 0.481 14.000 0.000 1.000   NA
 1809072 1809073 AAur_2332 AAur_2333   fabZ TRUE 0.661 11.000 0.013 NA   NA
 1809073 1809074 AAur_2333 AAur_2334 fabZ   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809074 1809075 AAur_2334 AAur_2335     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1809075 1809076 AAur_2335 AAur_2336     TRUE 0.941 4.000 0.138 1.000 N NA
 1809076 1809077 AAur_2336 AAur_2337     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1809078 1809079 AAur_2338 AAur_2339     TRUE 0.831 123.000 0.250 0.001 Y NA
 1809079 1809080 AAur_2339 AAur_2340   nrdI TRUE 0.958 -30.000 0.075 NA Y NA
 1809080 1809081 AAur_2340 AAur_2341 nrdI   FALSE 0.461 55.000 0.060 NA N NA
 1809082 1809083 AAur_2342 AAur_2343     TRUE 0.676 51.000 0.250 NA   NA
 1809084 1809085 AAur_2344 AAur_2345     TRUE 0.950 -3.000 0.074 NA   NA
 1809085 1809086 AAur_2345 AAur_2346     TRUE 0.875 -18.000 0.110 NA   NA
 1809086 1809087 AAur_2346 AAur_2347     FALSE 0.260 37.000 0.000 NA   NA
 1809087 1809088 AAur_2347 AAur_2348     TRUE 0.930 12.000 0.552 NA   NA
 1809088 1809089 AAur_2348 AAur_2349     FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1809089 1809090 AAur_2349 AAur_2350     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1809090 1809091 AAur_2350 AAur_2351     TRUE 0.998 -3.000 0.818 0.067 Y NA
 1809091 1809092 AAur_2351 AAur_2352     TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.067 Y NA
 1809092 1809093 AAur_2352 AAur_2353     TRUE 0.726 103.000 0.143 1.000 Y NA
 1809093 1809094 AAur_2353 AAur_2354     FALSE 0.090 172.000 0.030 1.000 N NA
 1809098 1809099 AAur_2358 AAur_2359     FALSE 0.079 117.000 0.000 NA   NA
 1809099 1809100 AAur_2359 AAur_2360     FALSE 0.170 77.000 0.004 NA   NA
 1809100 1809101 AAur_2360 AAur_2361   nadD TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1809101 1809102 AAur_2361 AAur_2362 nadD   FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1809102 1809103 AAur_2362 AAur_2363   proA FALSE 0.162 84.000 0.005 NA   NA
 1809103 1809104 AAur_2363 AAur_2364 proA proB TRUE 0.997 -3.000 0.281 0.002 Y NA
 1809104 1809105 AAur_2364 AAur_2365 proB   TRUE 0.930 -13.000 0.206 1.000   NA
 1809105 1809106 AAur_2365 AAur_2366   rpmA FALSE 0.316 156.000 0.335 1.000   NA
 1809106 1809107 AAur_2366 AAur_2367 rpmA rplU TRUE 0.948 63.000 0.667 0.012 Y NA
 1809107 1809108 AAur_2367 AAur_2368 rplU thiD FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000 N NA
 1809108 1809109 AAur_2368 AAur_2369 thiD   FALSE 0.029 252.000 0.022 1.000 N NA
 1809111 1809112 AAur_2371 AAur_2372 ndk   TRUE 0.731 -45.000 0.024 NA   NA
 1809112 1809113 AAur_2372 AAur_2373   folC TRUE 0.931 -7.000 0.156 NA   NA
 1809113 1809114 AAur_2373 AAur_2374 folC ileS TRUE 0.965 -3.000 0.031 0.084 N NA
 1809117 1809118 AAur_2377 AAur_2378     FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 1809119 1809120 AAur_2379 AAur_2380   clpX FALSE 0.185 93.000 0.006 1.000   NA
 1809120 1809121 AAur_2380 AAur_2381 clpX   TRUE 0.585 120.000 0.039 1.000 Y NA
 1809121 1809122 AAur_2381 AAur_2382   clpP TRUE 0.971 40.000 0.512 0.001 Y NA
 1809122 1809123 AAur_2382 AAur_2383 clpP tig FALSE 0.205 193.000 0.007 1.000 Y NA
 1809123 1809124 AAur_2383 AAur_2384 tig   FALSE 0.118 70.000 0.000 NA   NA
 1809126 1809127 AAur_2386 AAur_2387   rpiB TRUE 0.984 0.000 0.398 1.000 N NA
 1809128 1809129 AAur_2388 AAur_2390 pepN   FALSE 0.395 60.000 0.036 1.000 N NA
 1809131 1809132 AAur_2391 AAur_2392     TRUE 0.914 -7.000 0.083 1.000   NA
 1809135 1809136 AAur_2395 AAur_2396     FALSE 0.270 56.000 0.007 NA   NA
 1809136 1809137 AAur_2396 AAur_2397     FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1809137 1809138 AAur_2397 AAur_2398     FALSE 0.002 573.000 0.000 NA   NA
 1809139 1809140 AAur_2400 AAur_2401     FALSE 0.173 64.000 0.000 1.000   NA
 1809144 1809145 AAur_2405 AAur_2406     FALSE 0.058 133.000 0.000 NA   NA
 1809145 1809146 AAur_2406 AAur_2407   def FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1809146 1809147 AAur_2407 AAur_2409 def   TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1809148 1809149 AAur_2408 AAur_2410     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1809149 1809150 AAur_2410 AAur_2411   gap TRUE 0.594 14.000 0.014 NA   NA
 1809152 1809153 AAur_2413 AAur_2414     TRUE 0.597 90.000 0.468 NA   NA
 1809154 1809155 AAur_2415 AAur_2416 msrA cysK FALSE 0.446 67.000 0.085 1.000 N NA
 1809155 1809156 AAur_2416 AAur_2418 cysK cysE TRUE 0.966 42.000 0.483 0.001 Y NA
 1809157 1809158 AAur_2417 AAur_2419   gnd FALSE 0.169 107.000 0.005 1.000   NA
 1809160 1809161 AAur_2421 AAur_2422     TRUE 0.993 0.000 0.600 0.053 N NA
 1809161 1809162 AAur_2422 AAur_2423     TRUE 0.971 22.000 0.600 1.000 Y NA
 1809164 1809165 AAur_2425 AAur_2426     FALSE 0.040 167.000 0.000 1.000   NA
 1809165 1809166 AAur_2426 AAur_2427     FALSE 0.249 143.000 0.115 1.000   NA
 1809166 1809167 AAur_2427 AAur_2428     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 1809167 1809168 AAur_2428 AAur_2429     FALSE 0.102 83.000 0.000 NA   NA
 1809168 1809169 AAur_2429 AAur_2430     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1809169 1809170 AAur_2430 AAur_2431     TRUE 0.902 3.000 0.025 1.000 N NA
 1809170 1809171 AAur_2431 AAur_2432     TRUE 0.987 -3.000 0.575 NA   NA
 1809172 1809173 AAur_2433 AAur_2434     FALSE 0.052 149.000 0.000 NA N NA
 1809173 1809174 AAur_2434 AAur_2435     TRUE 0.738 56.000 0.441 NA N NA
 1809174 1809175 AAur_2435 AAur_2436   fabH TRUE 0.994 -3.000 0.294 1.000 Y NA
 1809175 1809176 AAur_2436 AAur_2437 fabH   TRUE 0.855 116.000 0.307 0.002 Y NA
 1809176 1809177 AAur_2437 AAur_2438     TRUE 0.745 98.000 0.178 1.000 Y NA
 1809178 1809179 AAur_2439 AAur_2440     FALSE 0.021 226.000 0.005 NA   NA
 1809179 1809180 AAur_2440 AAur_2441   dprA TRUE 0.788 53.000 0.037 1.000 Y NA
 1809180 1809181 AAur_2441 AAur_2442 dprA   TRUE 0.952 -3.000 0.053 1.000 N NA
 1809181 1809182 AAur_2442 AAur_2443     TRUE 0.911 -6.000 0.050 1.000 N NA
 1809182 1809183 AAur_2443 AAur_2444     FALSE 0.207 115.000 0.036 NA   NA
 1809183 1809184 AAur_2444 AAur_2445     TRUE 0.617 30.000 0.067 NA   NA
 1809184 1809185 AAur_2445 AAur_2446   lepB FALSE 0.364 19.000 0.000 NA   NA
 1809185 1809186 AAur_2446 AAur_2447 lepB lepB TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1809186 1809187 AAur_2447 AAur_2448 lepB rplS FALSE 0.271 33.000 0.000 NA   NA
 1809187 1809188 AAur_2448 AAur_2449 rplS trmD FALSE 0.398 234.000 0.567 1.000 Y NA
 1809188 1809189 AAur_2449 AAur_2450 trmD rimM TRUE 0.996 1.000 0.672 1.000 Y NA
 1809189 1809190 AAur_2450 AAur_2451 rimM   TRUE 0.767 45.000 0.324 1.000   NA
 1809190 1809191 AAur_2451 AAur_2452   rpsP TRUE 0.978 2.000 0.385 1.000   NA
 1809191 1809192 AAur_2452 AAur_2453 rpsP   FALSE 0.158 81.000 0.003 NA   NA
 1809192 1809193 AAur_2453 AAur_2454     FALSE 0.173 112.000 0.018 NA   NA
 1809193 1809194 AAur_2454 AAur_2455     FALSE 0.265 80.000 0.028 1.000   NA
 1809196 1809197 AAur_2456 AAur_2458   ffh FALSE 0.138 105.000 0.004 NA   NA
 1809199 1809200 AAur_2460 AAur_2461 glnK amt TRUE 0.991 -3.000 0.750 1.000 N NA
 1809202 1809203 AAur_2463 AAur_2464 ftsY smc TRUE 0.886 21.000 0.165 0.011 N NA
 1809205 1809206 AAur_2466 AAur_2467     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809206 1809207 AAur_2467 AAur_2468     TRUE 0.724 9.000 0.011 NA   NA
 1809207 1809208 AAur_2468 AAur_2469   mutM FALSE 0.038 181.000 0.003 NA   NA
 1809208 1809209 AAur_2469 AAur_2470 mutM   TRUE 0.888 7.000 0.068 1.000 N NA
 1809209 1809210 AAur_2470 AAur_2471   rpmF TRUE 0.648 24.000 0.044 1.000   NA
 1809210 1809211 AAur_2471 AAur_2472 rpmF   TRUE 0.865 34.000 0.599 NA   NA
 1809211 1809212 AAur_2472 AAur_2473   coaD FALSE 0.049 166.000 0.004 NA   NA
 1809213 1809214 AAur_2474 AAur_2475     FALSE 0.152 132.000 0.020 1.000   NA
 1809215 1809216 AAur_2476 AAur_2477     TRUE 0.979 7.000 0.044 0.013 Y NA
 1809216 1809217 AAur_2477 AAur_2478     TRUE 0.923 -10.000 0.144 1.000   NA
 1809217 1809218 AAur_2478 AAur_2479   thiL FALSE 0.541 23.000 0.009 1.000   NA
 1809220 1809221 AAur_2481 AAur_2482 ddlA   TRUE 0.960 0.000 0.088 1.000 N NA
 1809221 1809222 AAur_2482 AAur_2483     TRUE 0.984 -3.000 0.380 1.000 N NA
 1809222 1809223 AAur_2483 AAur_2484   murA TRUE 0.892 12.000 0.236 1.000 N NA
 1809223 1809224 AAur_2484 AAur_2485 murA leuD FALSE 0.074 210.000 0.074 1.000 N NA
 1809224 1809225 AAur_2485 AAur_2486 leuD leuC TRUE 0.990 10.000 0.477 0.001 Y NA
 1809226 1809227 AAur_2487 AAur_2489     TRUE 0.910 2.000 0.037 NA   NA
 1809228 1809229 AAur_2488 AAur_2490     TRUE 0.990 -3.000 0.706 NA   NA
 1809229 1809230 AAur_2490 AAur_2491     FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1809230 1809231 AAur_2491 AAur_2492     FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1809231 1809232 AAur_2492 AAur_2493     FALSE 0.054 139.000 0.000 NA   NA
 1809232 1809233 AAur_2493 AAur_2494   gltX TRUE 0.689 15.000 0.035 1.000   NA
 1809233 1809234 AAur_2494 AAur_2495 gltX   FALSE 0.272 125.000 0.070 1.000 N NA
 1809234 1809235 AAur_2495 AAur_2496     FALSE 0.546 24.000 0.012 1.000   NA
 1809235 1809236 AAur_2496 AAur_2497   ilvE FALSE 0.004 385.000 0.000 1.000   NA
 1809236 1809237 AAur_2497 AAur_2498 ilvE leuB TRUE 0.642 120.000 0.083 1.000 Y NA
 1809238 1809239 AAur_2499 AAur_2500     TRUE 0.995 4.000 0.516 0.009 Y NA
 1809239 1809240 AAur_2500 AAur_2501     FALSE 0.332 125.000 0.121 1.000 N NA
 1809240 1809241 AAur_2501 AAur_2502     TRUE 0.979 4.000 0.606 1.000 N NA
 1809242 1809243 AAur_2503 AAur_2504 metG   TRUE 0.629 35.000 0.005 0.083 N NA
 1809243 1809244 AAur_2504 AAur_2505     TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 1809244 1809245 AAur_2505 AAur_2506   serA FALSE 0.039 168.000 0.000 1.000   NA
 1809245 1809246 AAur_2506 AAur_2507 serA ilvC FALSE 0.087 282.000 0.006 1.000 Y NA
 1809246 1809247 AAur_2507 AAur_2508 ilvC ilvN TRUE 0.994 -3.000 0.071 0.001 Y NA
 1809247 1809248 AAur_2508 AAur_2509 ilvN ilvB TRUE 0.996 3.000 0.380 0.001 Y NA
 1809248 1809249 AAur_2509 AAur_2510 ilvB ilvD FALSE 0.145 295.000 0.020 0.001 Y NA
 1809249 1809250 AAur_2510 AAur_2511 ilvD   FALSE 0.241 124.000 0.048 1.000 N NA
 1809251 1809252 AAur_2512 AAur_2513     TRUE 0.680 19.000 0.057 NA   NA
 1809252 1809253 AAur_2513 AAur_2514     FALSE 0.077 118.000 0.000 NA   NA
 1809253 1809254 AAur_2514 AAur_2515     FALSE 0.018 196.000 0.000 NA   NA
 1809256 1809257 AAur_2517 AAur_2518 bcp   FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1809257 1809258 AAur_2518 AAur_2519     FALSE 0.524 -38.000 0.000 NA   NA
 1809258 1809259 AAur_2519 AAur_2520   mqo FALSE 0.355 74.000 0.059 1.000   NA
 1809259 1809260 AAur_2520 AAur_2521 mqo   FALSE 0.355 68.000 0.050 1.000   NA
 1809260 1809261 AAur_2521 AAur_2522     FALSE 0.287 96.000 0.058 NA N NA
 1809261 1809262 AAur_2522 AAur_2523     TRUE 0.945 0.000 0.058 NA N NA
 1809264 1809265 AAur_2525 AAur_2527     FALSE 0.020 189.000 0.000 NA   NA
 1809267 1809268 AAur_2528 AAur_2529     FALSE 0.088 102.000 0.000 NA   NA
 1809268 1809269 AAur_2529 AAur_2530     FALSE 0.436 19.000 0.000 1.000   NA
 1809270 1809271 AAur_2531 AAur_2532   nadC TRUE 0.683 14.000 0.021 1.000 N NA
 1809271 1809272 AAur_2532 AAur_2533 nadC nadB TRUE 0.992 -7.000 0.223 0.002 Y NA
 1809272 1809273 AAur_2533 AAur_2534 nadB nadA TRUE 0.943 44.000 0.210 0.002 Y NA
 1809273 1809274 AAur_2534 AAur_2535 nadA   TRUE 0.932 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1809274 1809275 AAur_2535 AAur_2536     FALSE 0.327 102.000 0.069 1.000 N NA
 1809276 1809277 AAur_2537 AAur_2538     TRUE 0.580 121.000 0.500 1.000 N NA
 1809277 1809278 AAur_2538 AAur_2539     TRUE 0.996 -7.000 0.750 0.003 Y NA
 1809278 1809279 AAur_2539 AAur_2540     FALSE 0.195 50.000 0.000 NA   NA
 1809279 1809280 AAur_2540 AAur_2541     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1809284 1809285 AAur_2545 AAur_2546     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1809288 1809289 AAur_2549 AAur_2550     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1809289 1809290 AAur_2550 AAur_2551     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1809290 1809291 AAur_2551 AAur_2552     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.066 Y NA
 1809291 1809292 AAur_2552 AAur_2553     TRUE 0.887 27.000 0.000 0.066 Y NA
 1809292 1809293 AAur_2553 AAur_2554     FALSE 0.190 60.000 0.000 1.000   NA
 1809295 1809296 AAur_2555 AAur_2557     FALSE 0.198 87.000 0.007 1.000   NA
 1809296 1809297 AAur_2557 AAur_2558     TRUE 0.998 -3.000 0.669 0.001 Y NA
 1809297 1809298 AAur_2558 AAur_2559   aqpZ FALSE 0.250 70.000 0.006 1.000 N NA
 1809298 1809299 AAur_2559 AAur_2560 aqpZ   FALSE 0.033 161.000 0.000 NA   NA
 1809299 1809300 AAur_2560 AAur_2561     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1809302 1809303 AAur_2563 AAur_2564     FALSE 0.144 138.000 0.034 NA   NA
 1809303 1809304 AAur_2564 AAur_2565     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1809304 1809305 AAur_2565 AAur_2566     TRUE 0.992 -3.000 0.857 NA   NA
 1809305 1809306 AAur_2566 AAur_2567     TRUE 0.989 -3.000 0.571 1.000 N NA
 1809308 1809309 AAur_2569 AAur_2570 rdgB rph TRUE 0.980 -3.000 0.262 1.000 N NA
 1809309 1809310 AAur_2570 AAur_2571 rph   FALSE 0.448 56.000 0.053 1.000   NA
 1809310 1809311 AAur_2571 AAur_2572   murI TRUE 0.949 -3.000 0.054 1.000   NA
 1809311 1809312 AAur_2572 AAur_2573 murI   TRUE 0.590 14.000 0.013 NA   NA
 1809312 1809313 AAur_2573 AAur_2574   clpS TRUE 0.981 -7.000 0.823 NA   NA
 1809314 1809315 AAur_2575 AAur_2576     TRUE 0.949 0.000 0.053 1.000 N NA
 1809316 1809317 AAur_2577 AAur_2578     FALSE 0.405 113.000 0.198 NA   NA
 1809317 1809318 AAur_2578 AAur_2579   nagB TRUE 0.856 -15.000 0.071 NA   NA
 1809318 1809319 AAur_2579 AAur_2580 nagB   FALSE 0.382 82.000 0.115 NA   NA
 1809319 1809320 AAur_2580 AAur_2581     TRUE 0.822 -18.000 0.051 NA   NA
 1809320 1809321 AAur_2581 AAur_2582     TRUE 0.608 36.000 0.051 1.000 N NA
 1809321 1809322 AAur_2582 AAur_2583     TRUE 0.940 0.000 0.035 1.000 N NA
 1809322 1809323 AAur_2583 AAur_2584     TRUE 0.608 30.000 0.061 NA   NA
 1809325 1809326 AAur_2586 AAur_2587     TRUE 0.729 20.000 0.092 NA   NA
 1809327 1809328 AAur_2588 AAur_2589   nagA TRUE 0.653 21.000 0.030 1.000 N NA
 1809328 1809329 AAur_2589 AAur_2590 nagA   FALSE 0.026 202.000 0.000 1.000 N NA
 1809330 1809331 AAur_2591 AAur_2592     TRUE 0.571 -18.000 0.000 NA   NA
 1809331 1809332 AAur_2592 AAur_2593     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1809332 1809333 AAur_2593 AAur_2594   atpD FALSE 0.011 234.000 0.000 NA   NA
 1809333 1809334 AAur_2594 AAur_2595 atpD atpG TRUE 0.940 76.000 0.724 0.002 Y NA
 1809334 1809335 AAur_2595 AAur_2596 atpG atpA TRUE 0.947 77.000 0.846 0.002 Y NA
 1809335 1809336 AAur_2596 AAur_2597 atpA   FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1809336 1809337 AAur_2597 AAur_2598   atpF TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1809337 1809338 AAur_2598 AAur_2599 atpF atpE TRUE 0.748 51.000 0.121 0.002   NA
 1809338 1809339 AAur_2599 AAur_2600 atpE atpB TRUE 0.808 80.000 0.628 0.002   NA
 1809339 1809340 AAur_2600 AAur_2601 atpB atpI FALSE 0.014 404.000 0.000 0.002   NA
 1809340 1809341 AAur_2601 AAur_2602 atpI   FALSE 0.213 120.000 0.033 1.000   NA
 1809341 1809342 AAur_2602 AAur_2603     FALSE 0.553 -22.000 0.000 NA   NA
 1809342 1809343 AAur_2603 AAur_2604     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1809343 1809344 AAur_2604 AAur_2605     TRUE 0.937 -3.000 0.038 NA N NA
 1809344 1809345 AAur_2605 AAur_2606     TRUE 0.977 13.000 0.583 NA Y NA
 1809345 1809346 AAur_2606 AAur_2607   prfA TRUE 0.879 37.000 0.069 1.000 Y NA
 1809346 1809347 AAur_2607 AAur_2608 prfA   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809347 1809348 AAur_2608 AAur_2609   rho FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1809348 1809349 AAur_2609 AAur_2610 rho thrB FALSE 0.019 305.000 0.000 0.082 N NA
 1809349 1809350 AAur_2610 AAur_2611 thrB thrC TRUE 0.989 3.000 0.221 1.000 Y NA
 1809350 1809351 AAur_2611 AAur_2612 thrC thrA TRUE 0.991 1.000 0.194 1.000 Y NA
 1809351 1809352 AAur_2612 AAur_2613 thrA lysA TRUE 0.977 -7.000 0.071 1.000 Y NA
 1809352 1809353 AAur_2613 AAur_2614 lysA argS TRUE 0.907 5.000 0.071 1.000 N NA
 1809354 1809355 AAur_2615 AAur_2616     TRUE 0.959 6.000 0.389 1.000   NA
 1809355 1809356 AAur_2616 AAur_2617     TRUE 0.968 -3.000 0.125 1.000 N NA
 1809356 1809357 AAur_2617 AAur_2618     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1809357 1809358 AAur_2618 AAur_2619     FALSE 0.094 92.000 0.000 NA   NA
 1809358 1809359 AAur_2619 AAur_2620     TRUE 0.792 -27.000 0.043 NA   NA
 1809361 1809362 AAur_2622 AAur_2623   hrpA FALSE 0.406 14.000 0.000 NA   NA
 1809363 1809364 AAur_2624 AAur_2625     TRUE 0.933 -3.000 0.028 1.000   NA
 1809364 1809365 AAur_2625 AAur_2626     TRUE 0.923 -3.000 0.017 1.000   NA
 1809369 1809370 AAur_2629 AAur_2631     TRUE 0.995 1.000 0.291 0.082 Y NA
 1809370 1809371 AAur_2631 AAur_2632     TRUE 0.577 152.000 0.204 1.000 Y NA
 1809371 1809372 AAur_2632 AAur_2633     FALSE 0.422 102.000 0.167 1.000   NA
 1809372 1809373 AAur_2633 AAur_2634     TRUE 0.995 -3.000 0.857 0.038   NA
 1809374 1809375 AAur_2635 AAur_2636 sucA   FALSE 0.224 91.000 0.019 1.000   NA
 1809375 1809376 AAur_2636 AAur_2637     TRUE 0.935 3.000 0.083 1.000   NA
 1809376 1809377 AAur_2637 AAur_2638     FALSE 0.321 104.000 0.095 NA   NA
 1809377 1809378 AAur_2638 AAur_2639     TRUE 0.955 0.000 0.101 NA   NA
 1809379 1809380 AAur_2640 AAur_2641     TRUE 0.991 -3.000 0.808 NA   NA
 1809381 1809382 AAur_2642 AAur_2643   aroA TRUE 0.782 7.000 0.017 NA   NA
 1809382 1809383 AAur_2643 AAur_2644 aroA   TRUE 0.926 3.000 0.063 1.000   NA
 1809383 1809384 AAur_2644 AAur_2645     FALSE 0.398 56.000 0.033 1.000   NA
 1809384 1809385 AAur_2645 AAur_2646     FALSE 0.007 326.000 0.000 1.000 N NA
 1809385 1809386 AAur_2646 AAur_2647     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1809386 1809387 AAur_2647 AAur_2648     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1809390 1809391 AAur_2651 AAur_2652   ssrA FALSE 0.026 175.000 0.000 NA   NA
 1809391 1809392 AAur_2652 AAur_2653 ssrA smpB FALSE 0.089 98.000 0.000 NA   NA
 1809392 1809393 AAur_2653 AAur_2654 smpB   FALSE 0.212 77.000 0.002 1.000 N NA
 1809393 1809394 AAur_2654 AAur_2655     TRUE 0.974 3.000 0.005 1.000 Y NA
 1809394 1809395 AAur_2655 AAur_2656     TRUE 0.996 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 1809395 1809396 AAur_2656 AAur_2657   prfB FALSE 0.334 83.000 0.053 1.000 N NA
 1809396 1809397 AAur_2657 AAur_2658 prfB   FALSE 0.377 32.000 0.002 NA   NA
 1809397 1809398 AAur_2658 AAur_2659     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809398 1809399 AAur_2659 AAur_2660     TRUE 0.881 -19.000 0.125 NA   NA
 1809399 1809400 AAur_2660 AAur_2661     TRUE 0.904 9.000 0.185 NA   NA
 1809400 1809401 AAur_2661 AAur_2662     TRUE 0.720 84.000 0.758 NA   NA
 1809401 1809402 AAur_2662 AAur_2663     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.002 Y NA
 1809402 1809403 AAur_2663 AAur_2664     TRUE 0.997 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1809404 1809405 AAur_2665 AAur_2666     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 1809405 1809406 AAur_2666 AAur_2667     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1809406 1809407 AAur_2667 AAur_2668     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1809407 1809408 AAur_2668 AAur_2669     FALSE 0.557 -21.000 0.000 NA   NA
 1809408 1809409 AAur_2669 AAur_2670     FALSE 0.058 133.000 0.000 NA   NA
 1809409 1809410 AAur_2670 AAur_2671     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809410 1809411 AAur_2671 AAur_2672     FALSE 0.383 68.000 0.080 NA   NA
 1809412 1809413 AAur_2673 AAur_2674     TRUE 0.997 1.000 0.548 0.082 Y NA
 1809413 1809414 AAur_2674 AAur_2675     TRUE 0.905 -39.000 0.239 NA   NA
 1809414 1809415 AAur_2675 AAur_2676   glf TRUE 0.958 -3.000 0.105 NA   NA
 1809415 1809416 AAur_2676 AAur_2677 glf   FALSE 0.162 146.000 0.000 0.052   NA
 1809416 1809417 AAur_2677 AAur_2678     TRUE 0.966 0.000 0.131 1.000   NA
 1809417 1809418 AAur_2678 AAur_2679     TRUE 0.955 -3.000 0.070 1.000   NA
 1809422 1809423 AAur_2683 AAur_2684     FALSE 0.274 32.000 0.000 NA   NA
 1809423 1809424 AAur_2684 AAur_2685     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1809424 1809425 AAur_2685 AAur_2686     TRUE 0.939 -27.000 0.410 NA   NA
 1809429 1809430 AAur_2690 AAur_2691   secA TRUE 0.633 29.000 0.000 0.013   NA
 1809430 1809431 AAur_2691 AAur_2692 secA   FALSE 0.471 43.000 0.034 NA   NA
 1809431 1809432 AAur_2692 AAur_2693     FALSE 0.496 30.000 0.022 NA   NA
 1809432 1809433 AAur_2693 AAur_2694     FALSE 0.280 111.000 0.072 NA   NA
 1809433 1809434 AAur_2694 AAur_2695     FALSE 0.102 83.000 0.000 NA   NA
 1809434 1809435 AAur_2695 AAur_2696     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1809435 1809436 AAur_2696 AAur_2697   mtrA TRUE 0.990 -28.000 0.772 1.000 Y NA
 1809437 1809438 AAur_2698 AAur_2699     TRUE 0.988 -3.000 0.628 NA   NA
 1809438 1809439 AAur_2699 AAur_2700     TRUE 0.991 -3.000 0.841 NA   NA
 1809439 1809440 AAur_2700 AAur_2701     TRUE 0.978 -3.000 0.302 NA   NA
 1809440 1809441 AAur_2701 AAur_2702     TRUE 0.878 33.000 0.648 NA   NA
 1809441 1809442 AAur_2702 AAur_2703     FALSE 0.381 47.000 0.019 NA   NA
 1809443 1809444 AAur_2704 AAur_2705     TRUE 0.898 4.000 0.065 NA   NA
 1809444 1809445 AAur_2705 AAur_2706     TRUE 0.770 -49.000 0.028 1.000   NA
 1809445 1809446 AAur_2706 AAur_2707   dppC TRUE 0.973 -3.000 0.185 1.000   NA
 1809446 1809447 AAur_2707 AAur_2708 dppC   TRUE 0.995 3.000 0.435 0.066 Y NA
 1809447 1809448 AAur_2708 AAur_2709     FALSE 0.536 130.000 0.000 0.066 Y NA
 1809448 1809449 AAur_2709 AAur_2710   trmU FALSE 0.134 97.000 0.000 1.000 N NA
 1809451 1809452 AAur_2712 AAur_2713     FALSE 0.352 27.000 0.000 NA N NA
 1809452 1809453 AAur_2713 AAur_2714     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1809453 1809454 AAur_2714 AAur_2715     TRUE 0.869 -7.000 0.043 NA   NA
 1809455 1809456 AAur_2716 AAur_2717     FALSE 0.264 63.000 0.007 1.000   NA
 1809456 1809457 AAur_2717 AAur_2718     FALSE 0.156 78.000 0.000 1.000 N NA
 1809457 1809458 AAur_2718 AAur_2719     TRUE 0.950 2.000 0.121 NA   NA
 1809459 1809460 AAur_2720 AAur_2721 gntP aroK TRUE 0.993 -3.000 0.185 1.000 Y NA
 1809460 1809461 AAur_2721 AAur_2722 aroK   FALSE 0.115 72.000 0.000 NA   NA
 1809461 1809462 AAur_2722 AAur_2723   etfA TRUE 0.844 6.000 0.041 NA   NA
 1809462 1809463 AAur_2723 AAur_2724 etfA etfB TRUE 0.990 15.000 0.877 0.005 Y NA
 1809463 1809464 AAur_2724 AAur_2725 etfB   FALSE 0.015 246.000 0.000 1.000 N NA
 1809465 1809466 AAur_2726 AAur_2727     FALSE 0.437 66.000 0.111 NA   NA
 1809467 1809468 AAur_2728 AAur_2729     FALSE 0.115 103.000 0.000 1.000   NA
 1809468 1809469 AAur_2729 AAur_2730     FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1809469 1809470 AAur_2730 AAur_2731     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 1809470 1809471 AAur_2731 AAur_2732     FALSE 0.057 134.000 0.000 NA   NA
 1809471 1809472 AAur_2732 AAur_2733     TRUE 0.562 42.000 0.053 1.000   NA
 1809474 1809475 AAur_2735 AAur_2736     TRUE 0.916 0.000 0.014 1.000   NA
 1809475 1809476 AAur_2736 AAur_2737     TRUE 0.953 -36.000 0.044 1.000 Y NA
 1809478 1809479 AAur_2739 AAur_2740     TRUE 0.998 -3.000 0.493 0.002 Y NA
 1809479 1809480 AAur_2740 AAur_2741     TRUE 0.981 -3.000 0.102 0.007   NA
 1809481 1809482 AAur_2742 AAur_2743     FALSE 0.018 231.000 0.000 1.000 N NA
 1809482 1809483 AAur_2743 AAur_2744     TRUE 0.974 13.000 0.231 0.065 Y NA
 1809483 1809484 AAur_2744 AAur_2745     TRUE 0.994 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 1809485 1809486 AAur_2746 AAur_2747   hemL FALSE 0.160 76.000 0.000 1.000 N NA
 1809486 1809487 AAur_2747 AAur_2748 hemL   FALSE 0.429 44.000 0.018 NA N NA
 1809487 1809488 AAur_2748 AAur_2749   hemB TRUE 0.941 0.000 0.052 NA N NA
 1809488 1809489 AAur_2749 AAur_2750 hemB hemD TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809489 1809490 AAur_2750 AAur_2751 hemD hemC TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1809490 1809491 AAur_2751 AAur_2752 hemC   TRUE 0.985 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 1809491 1809492 AAur_2752 AAur_2753     TRUE 0.928 -3.000 0.034 NA   NA
 1809492 1809493 AAur_2753 AAur_2754   hemG FALSE 0.457 73.000 0.158 NA   NA
 1809493 1809494 AAur_2754 AAur_2755 hemG hemE TRUE 0.983 6.000 0.049 0.001 Y NA
 1809497 1809498 AAur_2758 AAur_2759     TRUE 0.788 51.000 0.518 NA   NA
 1809498 1809499 AAur_2759 AAur_2760     TRUE 0.572 38.000 0.060 NA   NA
 1809500 1809501 AAur_2761 AAur_2762     TRUE 0.834 31.000 0.003 1.000 Y NA
 1809501 1809502 AAur_2762 AAur_2763   thiS TRUE 0.981 4.000 0.104 1.000 Y NA
 1809502 1809503 AAur_2763 AAur_2764 thiS thiO TRUE 0.990 -3.000 0.625 1.000 N NA
 1809506 1809507 AAur_2767 AAur_2768     FALSE 0.173 64.000 0.000 1.000   NA
 1809507 1809508 AAur_2768 AAur_2769     FALSE 0.074 278.000 0.000 1.000 Y NA
 1809508 1809509 AAur_2769 AAur_2771     TRUE 0.954 9.000 0.027 1.000 Y NA
 1809510 1809511 AAur_2770 AAur_2772     TRUE 0.685 14.000 0.043 NA   NA
 1809514 1809515 AAur_2775 AAur_2776     TRUE 0.969 -19.000 0.806 NA   NA
 1809515 1809516 AAur_2776 AAur_2777     TRUE 0.959 5.000 0.389 NA   NA
 1809517 1809518 AAur_2778 AAur_2779     TRUE 0.806 11.000 0.081 NA   NA
 1809518 1809519 AAur_2779 AAur_2780     TRUE 0.911 2.000 0.037 NA   NA
 1809521 1809522 AAur_2782 AAur_2783     TRUE 0.977 -3.000 0.286 NA   NA
 1809522 1809523 AAur_2783 AAur_2784     FALSE 0.518 19.000 0.008 NA   NA
 1809524 1809525 AAur_2785 AAur_2786 gluA gluB TRUE 0.838 55.000 0.121 1.000 Y NA
 1809525 1809526 AAur_2786 AAur_2787 gluB gluC TRUE 0.881 97.000 0.462 0.065 Y NA
 1809526 1809527 AAur_2787 AAur_2788 gluC gluD TRUE 0.992 -3.000 0.429 0.004 N NA
 1809529 1809530 AAur_2790 AAur_2791     TRUE 0.895 -22.000 0.169 NA   NA
 1809531 1809532 AAur_2792 AAur_2793     FALSE 0.102 83.000 0.000 NA   NA
 1809534 1809535 AAur_2795 AAur_2796 gltA   FALSE 0.321 104.000 0.064 1.000 N NA
 1809535 1809536 AAur_2796 AAur_2797     TRUE 0.720 13.000 0.029 1.000 N NA
 1809536 1809537 AAur_2797 AAur_2798     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 1809537 1809538 AAur_2798 AAur_2799     FALSE 0.368 35.000 0.002 NA   NA
 1809540 1809541 AAur_2801 AAur_2802     TRUE 0.991 -3.000 0.725 1.000   NA
 1809541 1809542 AAur_2802 AAur_2803     TRUE 0.993 -52.000 0.811 0.065 Y NA
 1809542 1809543 AAur_2803 AAur_2804     FALSE 0.307 212.000 0.059 0.065 Y NA
 1809543 1809544 AAur_2804 AAur_2805     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 1809544 1809545 AAur_2805 AAur_2806     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1809547 1809548 AAur_2808 AAur_2809 ispH   FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1809549 1809550 AAur_2810 AAur_2812 xseA xseB TRUE 0.945 56.000 0.412 0.000 Y NA
 1809551 1809552 AAur_2811 AAur_2813     FALSE 0.335 48.000 0.010 NA   NA
 1809552 1809553 AAur_2813 AAur_2814   proX FALSE 0.168 121.000 0.008 1.000 N NA
 1809553 1809554 AAur_2814 AAur_2815 proX proZ TRUE 0.994 -3.000 0.667 0.065 N NA
 1809554 1809555 AAur_2815 AAur_2816 proZ proW TRUE 0.998 -3.000 0.918 0.065 Y NA
 1809555 1809556 AAur_2816 AAur_2817 proW proV TRUE 0.997 0.000 0.694 1.000 Y NA
 1809556 1809557 AAur_2817 AAur_2818 proV rsgA FALSE 0.040 167.000 0.000 1.000   NA
 1809557 1809558 AAur_2818 AAur_2819 rsgA   FALSE 0.295 29.000 0.000 NA   NA
 1809558 1809559 AAur_2819 AAur_2820     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1809559 1809560 AAur_2820 AAur_2821   bgaC FALSE 0.378 31.000 0.000 1.000 N NA
 1809565 1809566 AAur_2826 AAur_2827     FALSE 0.274 32.000 0.000 NA   NA
 1809566 1809567 AAur_2827 AAur_2828     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1809569 1809570 AAur_2830 AAur_2831     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1809570 1809571 AAur_2831 AAur_2832   corA FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1809571 1809572 AAur_2832 AAur_2833 corA   TRUE 0.852 -9.000 0.029 1.000   NA
 1809573 1809574 AAur_2834 AAur_2835     FALSE 0.243 55.000 0.000 1.000 N NA
 1809574 1809575 AAur_2835 AAur_2836     TRUE 0.997 -3.000 0.452 0.077 Y NA
 1809575 1809576 AAur_2836 AAur_2837     TRUE 0.673 -13.000 0.000 1.000   NA
 1809576 1809577 AAur_2837 AAur_2838     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 1809577 1809578 AAur_2838 AAur_2839     TRUE 0.920 6.000 0.160 NA   NA
 1809579 1809580 AAur_2840 AAur_2841     TRUE 0.980 -3.000 0.333 NA   NA
 1809581 1809582 AAur_2842 AAur_2843     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1809582 1809583 AAur_2843 AAur_2844     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1809584 1809585 AAur_2845 AAur_2846     FALSE 0.557 127.000 0.600 NA   NA
 1809585 1809586 AAur_2846 AAur_2847     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1809587 1809588 AAur_2848 AAur_2849     FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1809588 1809589 AAur_2849 AAur_2850     TRUE 0.952 7.000 0.400 NA   NA
 1809589 1809590 AAur_2850 AAur_2851     FALSE 0.194 107.000 0.024 NA   NA
 1809590 1809591 AAur_2851 AAur_2852   galU TRUE 0.858 7.000 0.037 1.000 N NA
 1809592 1809593 AAur_2853 AAur_2854     FALSE 0.110 154.000 0.041 NA   NA
 1809593 1809594 AAur_2854 AAur_2855     FALSE 0.227 66.000 0.011 NA   NA
 1809595 1809596 AAur_2856 AAur_2857   guaA FALSE 0.068 162.000 0.005 1.000   NA
 1809596 1809597 AAur_2857 AAur_2858 guaA   FALSE 0.165 106.000 0.013 NA   NA
 1809597 1809598 AAur_2858 AAur_2859     TRUE 0.971 -3.000 0.198 NA   NA
 1809598 1809599 AAur_2859 AAur_2860     FALSE 0.019 311.000 0.061 NA   NA
 1809599 1809600 AAur_2860 AAur_2861     TRUE 0.673 48.000 0.167 1.000 N NA
 1809600 1809601 AAur_2861 AAur_2862     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1809601 1809602 AAur_2862 AAur_2863     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 1809602 1809603 AAur_2863 AAur_2864     TRUE 0.785 50.000 0.500 NA   NA
 1809603 1809604 AAur_2864 AAur_2865     FALSE 0.081 152.000 0.013 NA   NA
 1809604 1809605 AAur_2865 AAur_2866     FALSE 0.132 104.000 0.000 1.000 N NA
 1809605 1809606 AAur_2866 AAur_2867   guaB FALSE 0.180 98.000 0.002 1.000 N NA
 1809606 1809607 AAur_2867 AAur_2868 guaB   FALSE 0.016 244.000 0.000 1.000 N NA
 1809607 1809608 AAur_2868 AAur_2869     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.002 Y NA
 1809608 1809609 AAur_2869 AAur_2870     FALSE 0.198 178.000 0.222 1.000 N NA
 1809609 1809610 AAur_2870 AAur_2871     TRUE 0.980 -3.000 0.333 NA   NA
 1809612 1809613 AAur_2873 AAur_2874   groL FALSE 0.049 162.000 0.000 1.000 N NA
 1809613 1809614 AAur_2874 AAur_2875 groL groES TRUE 0.918 86.000 0.592 0.005 Y NA
 1809614 1809615 AAur_2875 AAur_2876 groES   FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1809617 1809618 AAur_2878 AAur_2879 aroE   FALSE 0.190 60.000 0.000 1.000   NA
 1809618 1809619 AAur_2879 AAur_2880     FALSE 0.286 30.000 0.000 NA   NA
 1809621 1809622 AAur_2881 AAur_2883     FALSE 0.092 94.000 0.000 NA   NA
 1809622 1809623 AAur_2883 AAur_2884   rimI TRUE 0.602 36.000 0.056 1.000   NA
 1809623 1809624 AAur_2884 AAur_2885 rimI   TRUE 0.754 14.000 0.062 1.000   NA
 1809624 1809625 AAur_2885 AAur_2886     TRUE 0.972 0.000 0.217 NA   NA
 1809625 1809626 AAur_2886 AAur_2887   alr TRUE 0.922 -3.000 0.028 NA   NA
 1809626 1809627 AAur_2887 AAur_2888 alr   FALSE 0.358 57.000 0.027 NA N NA
 1809630 1809631 AAur_2891 AAur_2892   fhs FALSE 0.288 100.000 0.047 1.000 N NA
 1809632 1809633 AAur_2893 AAur_2894     FALSE 0.102 169.000 0.038 1.000 N NA
 1809633 1809634 AAur_2894 AAur_2895   treZ FALSE 0.264 80.000 0.020 1.000 N NA
 1809634 1809635 AAur_2895 AAur_2896 treZ treY TRUE 0.807 128.000 0.263 0.008 Y NA
 1809635 1809636 AAur_2896 AAur_2897 treY glgX TRUE 0.992 -3.000 0.031 0.008 Y NA
 1809636 1809637 AAur_2897 AAur_2898 glgX   TRUE 0.621 70.000 0.005 NA Y NA
 1809637 1809638 AAur_2898 AAur_2899     FALSE 0.305 94.000 0.066 NA N NA
 1809638 1809639 AAur_2899 AAur_2900   glmS TRUE 0.890 5.000 0.048 1.000 N NA
 1809640 1809641 AAur_2901 AAur_2902 coaA   FALSE 0.280 71.000 0.017 1.000 N NA
 1809642 1809643 AAur_2903 AAur_2904 glmM rpsI FALSE 0.147 160.000 0.068 1.000 N NA
 1809643 1809644 AAur_2904 AAur_2905 rpsI rplM TRUE 0.972 39.000 0.601 0.011 Y NA
 1809645 1809646 AAur_2906 AAur_2907     FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 1809646 1809647 AAur_2907 AAur_2908     FALSE 0.555 96.000 0.400 NA   NA
 1809647 1809648 AAur_2908 AAur_2909     TRUE 0.616 -12.000 0.000 NA   NA
 1809648 1809649 AAur_2909 AAur_2910     TRUE 0.964 45.000 1.000 NA Y NA
 1809649 1809650 AAur_2910 AAur_2911     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA Y NA
 1809650 1809651 AAur_2911 AAur_2912     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 1809651 1809652 AAur_2912 AAur_2913     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1809652 1809653 AAur_2913 AAur_2914     TRUE 0.958 10.000 0.000 0.002 Y NA
 1809653 1809654 AAur_2914 AAur_2915     FALSE 0.009 288.000 0.000 1.000   NA
 1809655 1809656 AAur_2916 AAur_2917 truA rplQ TRUE 0.899 33.000 0.102 1.000 Y NA
 1809656 1809657 AAur_2917 AAur_2918 rplQ rpoA TRUE 0.814 67.000 0.873 1.000 N NA
 1809657 1809658 AAur_2918 AAur_2919 rpoA rpsK FALSE 0.349 150.000 0.308 1.000 N NA
 1809658 1809659 AAur_2919 AAur_2920 rpsK rpsM TRUE 0.832 157.000 0.810 0.011 Y NA
 1809659 1809660 AAur_2920 AAur_2921 rpsM rpmJ FALSE 0.213 197.000 0.194 0.011   NA
 1809660 1809661 AAur_2921 AAur_2922 rpmJ infA FALSE 0.245 73.000 0.013 1.000   NA
 1809661 1809662 AAur_2922 AAur_2923 infA   FALSE 0.037 196.000 0.007 NA N NA
 1809663 1809664 AAur_2924 AAur_2925 ugpA ugpE TRUE 0.948 54.000 0.556 0.064 Y NA
 1809664 1809665 AAur_2925 AAur_2926 ugpE ugpB TRUE 0.930 53.000 0.333 0.064 Y NA
 1809666 1809667 AAur_2927 AAur_2928 map adk TRUE 0.891 31.000 0.606 1.000 N NA
 1809667 1809668 AAur_2928 AAur_2929 adk secY TRUE 0.954 -3.000 0.057 1.000 N NA
 1809668 1809669 AAur_2929 AAur_2930 secY rplO FALSE 0.365 185.000 0.730 1.000 N NA
 1809669 1809670 AAur_2930 AAur_2931 rplO rpmD TRUE 0.998 0.000 0.653 0.002 Y NA
 1809670 1809671 AAur_2931 AAur_2932 rpmD rpsE TRUE 0.997 3.000 0.789 0.014 Y NA
 1809671 1809672 AAur_2932 AAur_2933 rpsE rplR TRUE 0.982 30.000 0.814 0.014 Y NA
 1809672 1809673 AAur_2933 AAur_2934 rplR rplF TRUE 0.997 4.000 0.815 0.011 Y NA
 1809673 1809674 AAur_2934 AAur_2935 rplF rpsH TRUE 0.987 19.000 0.808 0.011 Y NA
 1809674 1809675 AAur_2935 AAur_2936 rpsH   TRUE 0.794 79.000 0.059 0.011 Y NA
 1809675 1809676 AAur_2936 AAur_2937   rplX TRUE 0.998 0.000 0.758 0.011 Y NA
 1809676 1809677 AAur_2937 AAur_2938 rplX rplN TRUE 0.997 4.000 0.810 0.014 Y NA
 1809677 1809678 AAur_2938 AAur_2939 rplN rpsQ FALSE 0.332 354.000 0.791 0.014 Y NA
 1809678 1809679 AAur_2939 AAur_2940 rpsQ rpmC TRUE 0.998 -3.000 0.828 0.011 Y NA
 1809679 1809680 AAur_2940 AAur_2941 rpmC rplP TRUE 0.997 3.000 0.802 0.011 Y NA
 1809680 1809681 AAur_2941 AAur_2942 rplP rpsC TRUE 0.998 1.000 0.828 0.014 Y NA
 1809681 1809682 AAur_2942 AAur_2943 rpsC rplV TRUE 0.998 1.000 0.719 0.014 Y NA
 1809682 1809683 AAur_2943 AAur_2944 rplV rpsS TRUE 0.977 39.000 0.769 0.014 Y NA
 1809683 1809684 AAur_2944 AAur_2945 rpsS rplB TRUE 0.990 13.000 0.820 0.014 Y NA
 1809684 1809685 AAur_2945 AAur_2946 rplB rplW TRUE 0.973 30.000 0.849 1.000 Y NA
 1809685 1809686 AAur_2946 AAur_2947 rplW rplD TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 1809686 1809687 AAur_2947 AAur_2948 rplD rplC TRUE 0.993 5.000 0.361 0.011 Y NA
 1809687 1809688 AAur_2948 AAur_2949 rplC rpsJ TRUE 0.980 18.000 0.467 0.014 Y NA
 1809690 1809691 AAur_2951 AAur_2952   tuf FALSE 0.060 155.000 0.003 NA   NA
 1809691 1809692 AAur_2952 AAur_2953 tuf fusA FALSE 0.485 232.000 0.400 0.001 Y NA
 1809692 1809693 AAur_2953 AAur_2954 fusA rpsG TRUE 0.892 70.000 0.579 1.000 Y NA
 1809693 1809694 AAur_2954 AAur_2955 rpsG rpsL TRUE 0.997 2.000 0.620 0.002 Y NA
 1809694 1809695 AAur_2955 AAur_2956 rpsL rpoC FALSE 0.019 414.000 0.122 1.000 N NA
 1809695 1809696 AAur_2956 AAur_2957 rpoC rpoB TRUE 0.937 104.000 0.851 0.001 Y NA
 1809697 1809698 AAur_2958 AAur_2959     TRUE 0.935 0.000 0.036 1.000   NA
 1809699 1809700 AAur_2960 AAur_2961 rplL rplJ TRUE 0.946 77.000 0.884 0.011 Y NA
 1809700 1809701 AAur_2961 AAur_2962 rplJ   FALSE 0.008 300.000 0.000 1.000   NA
 1809701 1809702 AAur_2962 AAur_2963     TRUE 0.993 -3.000 0.600 0.010   NA
 1809702 1809703 AAur_2963 AAur_2964   rplA FALSE 0.156 112.000 0.003 1.000   NA
 1809703 1809704 AAur_2964 AAur_2965 rplA rplK TRUE 0.868 148.000 0.838 0.014 Y NA
 1809704 1809705 AAur_2965 AAur_2966 rplK nusG TRUE 0.692 131.000 0.681 0.081 N NA
 1809705 1809706 AAur_2966 AAur_2967 nusG secE TRUE 0.767 85.000 0.843 1.000 N NA
 1809706 1809707 AAur_2967 AAur_2968 secE   FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1809709 1809710 AAur_2970 AAur_2971     TRUE 0.997 0.000 0.797 1.000 Y NA
 1809710 1809711 AAur_2971 AAur_2972     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 1809712 1809713 AAur_2973 AAur_2974     TRUE 0.976 2.000 0.385 NA   NA
 1809713 1809714 AAur_2974 AAur_2975     FALSE 0.195 50.000 0.000 NA   NA
 1809714 1809715 AAur_2975 AAur_2976   pfkA FALSE 0.088 192.000 0.086 NA N NA
 1809715 1809716 AAur_2976 AAur_2977 pfkA   TRUE 0.716 18.000 0.057 1.000   NA
 1809717 1809718 AAur_2978 AAur_2979     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1809718 1809719 AAur_2979 AAur_2980     FALSE 0.085 111.000 0.000 NA   NA
 1809719 1809720 AAur_2980 AAur_2981     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809720 1809721 AAur_2981 AAur_2982     FALSE 0.232 61.000 0.006 NA   NA
 1809721 1809722 AAur_2982 AAur_2983     FALSE 0.387 50.000 0.027 NA   NA
 1809722 1809723 AAur_2983 AAur_2984     TRUE 0.733 36.000 0.200 NA   NA
 1809723 1809724 AAur_2984 AAur_2985     TRUE 0.784 17.000 0.133 NA   NA
 1809725 1809726 AAur_2986 AAur_2987     FALSE 0.053 232.000 0.076 1.000   NA
 1809726 1809727 AAur_2987 AAur_2988   ppk FALSE 0.227 104.000 0.026 1.000   NA
 1809727 1809728 AAur_2988 AAur_2989 ppk   TRUE 0.672 9.000 0.000 1.000 N NA
 1809729 1809730 AAur_2990 AAur_2991     FALSE 0.102 83.000 0.000 NA   NA
 1809731 1809732 AAur_2992 AAur_2993 thyA folA TRUE 0.614 69.000 0.295 1.000 N NA
 1809732 1809733 AAur_2993 AAur_2994 folA   TRUE 0.645 11.000 0.010 NA   NA
 1809733 1809734 AAur_2994 AAur_2995   asd FALSE 0.182 107.000 0.019 NA   NA
 1809735 1809736 AAur_2996 AAur_2997     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1809738 1809739 AAur_2999 AAur_3000 murB   TRUE 0.705 10.000 0.008 NA N NA
 1809739 1809740 AAur_3000 AAur_3001     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA N NA
 1809740 1809741 AAur_3001 AAur_3002     TRUE 0.996 3.000 0.600 0.051 Y NA
 1809741 1809742 AAur_3002 AAur_3003     TRUE 0.634 59.000 0.286 NA   NA
 1809742 1809743 AAur_3003 AAur_3004     FALSE 0.210 104.000 0.031 NA   NA
 1809743 1809744 AAur_3004 AAur_3005     TRUE 0.885 3.000 0.031 NA   NA
 1809745 1809746 AAur_3006 AAur_3007     TRUE 0.994 3.000 0.533 1.000 Y NA
 1809746 1809747 AAur_3007 AAur_3008     TRUE 0.996 0.000 0.618 1.000 Y NA
 1809747 1809748 AAur_3008 AAur_3009   tauD FALSE 0.561 52.000 0.088 1.000 N NA
 1809749 1809750 AAur_3010 AAur_3011     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 1809750 1809751 AAur_3011 AAur_3012     TRUE 0.718 77.000 0.075 1.000 Y NA
 1809751 1809752 AAur_3012 AAur_3013     TRUE 0.998 0.000 0.925 0.064 Y NA
 1809752 1809753 AAur_3013 AAur_3014     TRUE 0.979 25.000 0.650 0.064 Y NA
 1809755 1809756 AAur_3016 AAur_3017     FALSE 0.315 127.000 0.115 1.000 N NA
 1809756 1809757 AAur_3017 AAur_3018     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1809757 1809758 AAur_3018 AAur_3019     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1809758 1809759 AAur_3019 AAur_3020     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 1809759 1809760 AAur_3020 AAur_3021     FALSE 0.015 231.000 0.000 1.000   NA
 1809760 1809761 AAur_3021 AAur_3022     FALSE 0.004 387.000 0.000 1.000   NA
 1809761 1809762 AAur_3022 AAur_3023   kdpE FALSE 0.259 99.000 0.040 1.000   NA
 1809762 1809763 AAur_3023 AAur_3024 kdpE   TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 1809764 1809765 AAur_3025 AAur_3026     TRUE 0.950 3.000 0.167 NA   NA
 1809765 1809766 AAur_3026 AAur_3027     TRUE 0.991 -3.000 0.133 NA Y NA
 1809766 1809767 AAur_3027 AAur_3029     TRUE 0.774 52.000 0.429 1.000 N NA
 1809769 1809770 AAur_3030 AAur_3031     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.064 Y NA
 1809770 1809771 AAur_3031 AAur_3032     TRUE 0.998 -3.000 0.667 0.064 Y NA
 1809771 1809772 AAur_3032 AAur_3033     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1809773 1809774 AAur_3034 AAur_3035     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA N NA
 1809776 1809777 AAur_3037 AAur_3038 metB   TRUE 0.857 62.000 0.087 0.015 Y NA
 1809777 1809778 AAur_3038 AAur_3039     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1809779 1809780 AAur_3040 AAur_3041     FALSE 0.131 105.000 0.000 1.000 N NA
 1809780 1809781 AAur_3041 AAur_3042     TRUE 0.998 0.000 0.833 0.080 Y NA
 1809785 1809786 AAur_3046 AAur_3047     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809786 1809787 AAur_3047 AAur_3049     TRUE 0.959 -7.000 0.357 NA   NA
 1809789 1809790 AAur_3050 AAur_3051     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1809791 1809792 AAur_3052 AAur_3053     FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 1809794 1809795 AAur_3055 AAur_3056     FALSE 0.157 109.000 0.010 NA   NA
 1809796 1809797 AAur_3057 AAur_3058   fur FALSE 0.343 31.000 0.000 1.000   NA
 1809797 1809798 AAur_3058 AAur_3059 fur   TRUE 0.924 16.000 0.057 1.000 Y NA
 1809798 1809799 AAur_3059 AAur_3060     FALSE 0.172 131.000 0.043 NA   NA
 1809800 1809801 AAur_3061 AAur_3062     FALSE 0.068 167.000 0.021 NA   NA
 1809801 1809802 AAur_3062 AAur_3063   adhA TRUE 0.938 0.000 0.055 NA   NA
 1809802 1809803 AAur_3063 AAur_3064 adhA   FALSE 0.329 35.000 0.000 1.000   NA
 1809803 1809804 AAur_3064 AAur_3065     FALSE 0.117 97.000 0.000 1.000   NA
 1809804 1809805 AAur_3065 AAur_3066     FALSE 0.456 64.000 0.091 1.000   NA
 1809806 1809807 AAur_3067 AAur_3068     FALSE 0.006 326.000 0.000 1.000   NA
 1809808 1809809 AAur_3069 AAur_3070 gabT   TRUE 0.658 60.000 0.278 1.000 N NA
 1809810 1809811 AAur_3071 AAur_3072     FALSE 0.126 77.000 0.000 NA N NA
 1809811 1809812 AAur_3072 AAur_3073     TRUE 0.963 -3.000 0.115 NA N NA
 1809813 1809814 AAur_3074 AAur_3075     FALSE 0.131 85.000 0.000 1.000   NA
 1809814 1809815 AAur_3075 AAur_3076   cobA TRUE 0.917 21.000 0.600 1.000 N NA
 1809815 1809816 AAur_3076 AAur_3077 cobA   FALSE 0.471 13.000 0.000 NA N NA
 1809818 1809819 AAur_3079 AAur_3080     FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 1809819 1809820 AAur_3080 AAur_3081     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA   NA
 1809820 1809821 AAur_3081 AAur_3082     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1809822 1809823 AAur_3083 AAur_3084     TRUE 0.599 96.000 0.500 NA   NA
 1809824 1809825 AAur_3085 AAur_3086     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1809825 1809826 AAur_3086 AAur_3087     TRUE 0.988 -10.000 0.393 1.000 Y NA
 1809826 1809827 AAur_3087 AAur_3088     TRUE 0.911 55.000 0.438 1.000 Y NA
 1809827 1809828 AAur_3088 AAur_3089   mmuM FALSE 0.058 155.000 0.000 1.000 N NA
 1809828 1809829 AAur_3089 AAur_3090 mmuM cysN FALSE 0.132 100.000 0.000 1.000 N NA
 1809829 1809830 AAur_3090 AAur_3091 cysN cysD TRUE 0.995 1.000 0.925 0.000 N NA
 1809830 1809831 AAur_3091 AAur_3092 cysD cysH TRUE 0.988 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 1809831 1809832 AAur_3092 AAur_3093 cysH   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809833 1809834 AAur_3094 AAur_3095     FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1809836 1809837 AAur_3097 AAur_3098     TRUE 0.678 14.000 0.040 NA   NA
 1809838 1809839 AAur_3099 AAur_3100     FALSE 0.003 556.000 0.000 1.000   NA
 1809839 1809840 AAur_3100 AAur_3101     TRUE 0.931 10.000 0.312 1.000 N NA
 1809840 1809841 AAur_3101 AAur_3102     TRUE 0.572 30.000 0.026 1.000 N NA
 1809842 1809843 AAur_3103 AAur_3104     FALSE 0.147 159.000 0.065 1.000 N NA
 1809843 1809844 AAur_3104 AAur_3105     TRUE 0.850 105.000 0.304 0.064 Y NA
 1809844 1809845 AAur_3105 AAur_3106   glnQ TRUE 0.975 12.000 0.406 1.000 Y NA
 1809845 1809846 AAur_3106 AAur_3108 glnQ   FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 1809847 1809848 AAur_3107 AAur_3109 menD   FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 1809848 1809849 AAur_3109 AAur_3110     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1809849 1809850 AAur_3110 AAur_3111     TRUE 0.605 30.000 0.000 0.047   NA
 1809851 1809852 AAur_3112 AAur_3113     TRUE 0.605 30.000 0.000 0.047   NA
 1809853 1809854 AAur_3114 AAur_3115   menC FALSE 0.208 79.000 0.017 NA   NA
 1809854 1809855 AAur_3115 AAur_3116 menC   FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1809856 1809857 AAur_3117 AAur_3118     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 1809858 1809859 AAur_3119 AAur_3120     TRUE 0.975 28.000 0.571 0.064 Y NA
 1809859 1809860 AAur_3120 AAur_3121     TRUE 0.994 9.000 0.857 0.064 Y NA
 1809860 1809861 AAur_3121 AAur_3122     TRUE 0.998 -3.000 0.714 0.064 Y NA
 1809865 1809866 AAur_3126 AAur_3127     FALSE 0.069 148.000 0.000 1.000 N NA
 1809866 1809867 AAur_3127 AAur_3128     FALSE 0.002 801.000 0.000 1.000   NA
 1809867 1809868 AAur_3128 AAur_3129     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1809868 1809869 AAur_3129 AAur_3130     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1809869 1809870 AAur_3130 AAur_3131     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 1809870 1809871 AAur_3131 AAur_3132     FALSE 0.504 -64.000 0.000 NA   NA
 1809873 1809874 AAur_3134 AAur_3135     FALSE 0.037 172.000 0.000 1.000   NA
 1809876 1809877 AAur_3137 AAur_3138     TRUE 0.983 -3.000 0.364 1.000   NA
 1809878 1809879 AAur_3139 AAur_3140     TRUE 0.991 -7.000 1.000 0.036   NA
 1809884 1809885 AAur_3145 AAur_3146     FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 1809885 1809886 AAur_3146 AAur_3147     FALSE 0.199 49.000 0.000 NA   NA
 1809887 1809888 AAur_3148 AAur_3149     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 1809889 1809890 AAur_3150 AAur_3151     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809890 1809891 AAur_3151 AAur_3152     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 1809891 1809892 AAur_3152 AAur_3153     TRUE 0.605 30.000 0.000 0.047   NA
 1809892 1809893 AAur_3153 AAur_3154     FALSE 0.024 197.000 0.000 1.000   NA
 1809893 1809894 AAur_3154 AAur_3155     TRUE 0.992 3.000 0.393 1.000 Y NA
 1809894 1809895 AAur_3155 AAur_3156     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809896 1809897 AAur_3157 AAur_3158     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809899 1809900 AAur_3160 AAur_3161 rfbB rfbC/rfbD TRUE 0.998 2.000 1.000 0.003 Y NA
 1809901 1809902 AAur_3162 AAur_3163     FALSE 0.002 1281.000 0.000 1.000   NA
 1809902 1809903 AAur_3163 AAur_3164     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809903 1809904 AAur_3164 AAur_3165     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1809904 1809905 AAur_3165 AAur_3166     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1809905 1809906 AAur_3166 AAur_3167     FALSE 0.001 895.000 0.000 NA   NA
 1809906 1809907 AAur_3167 AAur_3168     TRUE 0.932 -16.000 0.000 NA Y NA
 1809908 1809909 AAur_3169 AAur_3170     TRUE 0.879 53.000 0.222 1.000 Y NA
 1809909 1809910 AAur_3170 AAur_3171     TRUE 0.948 4.000 0.222 NA   NA
 1809910 1809911 AAur_3171 AAur_3172     FALSE 0.318 176.000 0.600 NA   NA
 1809911 1809912 AAur_3172 AAur_3174     FALSE 0.001 2348.000 0.000 NA   NA
 1809913 1809914 AAur_3173 AAur_3175     TRUE 0.605 30.000 0.000 0.047   NA
 1809915 1809916 AAur_3176 AAur_3177     FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 1809917 1809918 AAur_3178 AAur_3179     FALSE 0.009 283.000 0.000 1.000   NA
 1809918 1809919 AAur_3179 AAur_3180     FALSE 0.042 163.000 0.000 1.000   NA
 1809919 1809920 AAur_3180 AAur_3181     TRUE 0.959 14.000 1.000 1.000 N NA
 1809921 1809922 AAur_3182 AAur_3183     FALSE 0.266 35.000 0.000 NA   NA
 1809922 1809923 AAur_3183 AAur_3184     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809923 1809924 AAur_3184 AAur_3185     FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1809924 1809925 AAur_3185 AAur_3186     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809925 1809926 AAur_3186 AAur_3187     TRUE 0.612 -30.000 0.000 1.000   NA
 1809926 1809927 AAur_3187 AAur_3188     FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 1809927 1809928 AAur_3188 AAur_3189     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1809930 1809931 AAur_3191 AAur_3192     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1809932 1809933 AAur_3193 AAur_3194     FALSE 0.286 30.000 0.000 NA   NA
 1809933 1809934 AAur_3194 AAur_3195     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1809938 1809939 AAur_3199 AAur_3200     FALSE 0.027 172.000 0.000 NA   NA
 1809940 1809941 AAur_3201 AAur_3202     FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1809941 1809942 AAur_3202 AAur_3203     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1809942 1809943 AAur_3203 AAur_3204     FALSE 0.035 157.000 0.000 NA   NA
 1809944 1809945 AAur_3205 AAur_3206     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 1809946 1809947 AAur_3207 AAur_3208     FALSE 0.001 1100.000 0.000 NA   NA
 1809952 1809953 AAur_3213 AAur_3214     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 1809954 1809955 AAur_3215 AAur_3216     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 1809960 1809961 AAur_3221 AAur_3222   paaK TRUE 0.847 10.000 0.065 1.000 N NA
 1809961 1809962 AAur_3222 AAur_3223 paaK paaJ TRUE 0.956 9.000 0.571 NA   NA
 1809962 1809963 AAur_3223 AAur_3224 paaJ paaI TRUE 0.992 -3.000 0.919 NA   NA
 1809963 1809964 AAur_3224 AAur_3225 paaI paaH TRUE 0.992 -3.000 0.943 NA   NA
 1809964 1809965 AAur_3225 AAur_3226 paaH paaG TRUE 0.992 -3.000 0.920 NA   NA
 1809969 1809970 AAur_3230 AAur_3231 lepB   FALSE 0.406 14.000 0.000 NA   NA
 1809970 1809971 AAur_3231 AAur_3232     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1809972 1809973 AAur_3233 AAur_3234     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 1809973 1809974 AAur_3234 AAur_3235     FALSE 0.137 94.000 0.000 1.000 N NA
 1809975 1809976 AAur_3236 AAur_3237     TRUE 0.810 20.000 0.200 NA   NA
 1809977 1809978 AAur_3238 AAur_3239     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 1809978 1809979 AAur_3239 AAur_3240     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1809979 1809980 AAur_3240 AAur_3242     TRUE 0.790 3.000 0.000 1.000   NA
 1809982 1809983 AAur_3243 AAur_3244 paaD paaF TRUE 0.817 8.000 0.031 NA N NA
 1809983 1809984 AAur_3244 AAur_3245 paaF   FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1809985 1809986 AAur_3246 AAur_3247 maoC   FALSE 0.029 186.000 0.000 1.000   NA
 1809986 1809987 AAur_3247 AAur_3248     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1809987 1809988 AAur_3248 AAur_3249     FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1809989 1809990 AAur_3250 AAur_3251     TRUE 0.586 100.000 0.400 1.000 N NA
 1809990 1809991 AAur_3251 AAur_3252     TRUE 0.993 10.000 0.833 0.063 Y NA
 1809991 1809992 AAur_3252 AAur_3253     TRUE 0.995 8.000 0.833 0.063 Y NA
 1809992 1809993 AAur_3253 AAur_3254     TRUE 0.951 32.000 0.500 NA Y NA
 1809993 1809994 AAur_3254 AAur_3255     FALSE 0.544 69.000 0.240 NA   NA
 1809995 1809996 AAur_3256 AAur_3257     FALSE 0.032 215.000 0.019 NA   NA
 1809996 1809997 AAur_3257 AAur_3258     FALSE 0.344 28.000 0.000 NA N NA
 1809997 1809998 AAur_3258 AAur_3259   crt TRUE 0.918 51.000 0.404 1.000 Y NA
 1809998 1809999 AAur_3259 AAur_3260 crt pcaF TRUE 0.991 0.000 0.130 1.000 Y NA
 1809999 1810000 AAur_3260 AAur_3261 pcaF   FALSE 0.109 142.000 0.016 NA   NA
 1810000 1810001 AAur_3261 AAur_3262     TRUE 0.902 0.000 0.016 NA   NA
 1810001 1810002 AAur_3262 AAur_3263     FALSE 0.004 332.000 0.000 NA   NA
 1810002 1810003 AAur_3263 AAur_3264     FALSE 0.021 217.000 0.000 1.000 N NA
 1810003 1810004 AAur_3264 AAur_3265     TRUE 0.982 -3.000 0.085 0.001 N NA
 1810004 1810005 AAur_3265 AAur_3266     TRUE 0.986 0.000 0.571 NA   NA
 1810005 1810006 AAur_3266 AAur_3267     FALSE 0.500 64.000 0.154 NA   NA
 1810007 1810008 AAur_3268 AAur_3269     TRUE 0.925 -12.000 0.200 NA   NA
 1810009 1810010 AAur_3270 AAur_3271     TRUE 0.977 40.000 0.857 0.078 Y NA
 1810010 1810011 AAur_3271 AAur_3272     TRUE 0.998 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 1810012 1810013 AAur_3273 AAur_3274     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1810013 1810014 AAur_3274 AAur_3275   menB FALSE 0.494 22.000 0.008 NA   NA
 1810014 1810015 AAur_3275 AAur_3276 menB menE TRUE 0.927 8.000 0.193 1.000 N NA
 1810015 1810016 AAur_3276 AAur_3277 menE menA FALSE 0.477 60.000 0.075 1.000 N NA
 1810018 1810019 AAur_3279 AAur_3281     TRUE 0.842 7.000 0.048 NA   NA
 1810020 1810021 AAur_3280 AAur_3282     TRUE 0.952 -3.000 0.000 0.004   NA
 1810023 1810024 AAur_3284 AAur_3285     TRUE 0.925 4.000 0.083 1.000 N NA
 1810024 1810025 AAur_3285 AAur_3286     FALSE 0.220 177.000 0.000 1.000 Y NA
 1810025 1810026 AAur_3286 AAur_3287     TRUE 0.992 0.000 0.211 NA Y NA
 1810026 1810027 AAur_3287 AAur_3288   ccdA TRUE 0.996 0.000 0.571 NA Y NA
 1810027 1810028 AAur_3288 AAur_3289 ccdA   TRUE 0.992 6.000 0.714 1.000 Y NA
 1810028 1810029 AAur_3289 AAur_3290     TRUE 0.887 4.000 0.044 NA N NA
 1810030 1810031 AAur_3291 AAur_3292     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 1810031 1810032 AAur_3292 AAur_3293     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1810033 1810034 AAur_3294 AAur_3295     FALSE 0.299 77.000 0.054 NA   NA
 1810035 1810036 AAur_3296 AAur_3297     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1810036 1810037 AAur_3297 AAur_3298     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1810037 1810038 AAur_3298 AAur_3299     TRUE 0.607 30.000 0.000 0.046   NA
 1810039 1810040 AAur_3300 AAur_3301     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1810040 1810041 AAur_3301 AAur_3302     TRUE 0.636 -19.000 0.000 1.000   NA
 1810041 1810042 AAur_3302 AAur_3303     FALSE 0.020 221.000 0.000 1.000 N NA
 1810044 1810045 AAur_3305 AAur_3306     TRUE 0.882 40.000 0.750 NA   NA
 1810045 1810046 AAur_3306 AAur_3307     TRUE 0.843 21.000 0.300 NA   NA
 1810046 1810047 AAur_3307 AAur_3308     TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.062 Y NA
 1810047 1810048 AAur_3308 AAur_3309     TRUE 0.958 31.000 0.300 0.062 Y NA
 1810050 1810051 AAur_3311 AAur_3312     FALSE 0.144 249.000 0.000 0.062 Y NA
 1810051 1810052 AAur_3312 AAur_3313     TRUE 0.996 -7.000 0.750 0.062 Y NA
 1810053 1810054 AAur_3314 AAur_3315     TRUE 0.978 -3.000 0.250 1.000   NA
 1810054 1810055 AAur_3315 AAur_3316     TRUE 0.976 -3.000 0.214 1.000   NA
 1810056 1810057 AAur_3317 AAur_3318 aldH   TRUE 0.978 -19.000 0.667 0.072 N NA
 1810057 1810058 AAur_3318 AAur_3319     TRUE 0.996 0.000 0.273 0.072 Y NA
 1810058 1810059 AAur_3319 AAur_3320     TRUE 0.994 -3.000 0.227 1.000 Y NA
 1810059 1810060 AAur_3320 AAur_3321     TRUE 0.801 31.000 0.273 1.000   NA
 1810064 1810065 AAur_3325 AAur_3326 gdhA   FALSE 0.024 208.000 0.000 1.000 N NA
 1810065 1810066 AAur_3326 AAur_3327   acuC FALSE 0.292 89.000 0.037 1.000 N NA
 1810067 1810068 AAur_3328 AAur_3329 trkB trkA TRUE 0.971 41.000 0.585 0.003 Y NA
 1810069 1810070 AAur_3330 AAur_3331 proC   FALSE 0.006 321.000 0.000 NA N NA
 1810070 1810071 AAur_3331 AAur_3332     TRUE 0.803 2.000 0.000 NA N NA
 1810071 1810072 AAur_3332 AAur_3333     FALSE 0.292 75.000 0.048 NA   NA
 1810072 1810073 AAur_3333 AAur_3334   topA FALSE 0.187 67.000 0.002 NA   NA
 1810073 1810074 AAur_3334 AAur_3335 topA   FALSE 0.129 125.000 0.002 1.000   NA
 1810074 1810075 AAur_3335 AAur_3336     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810076 1810077 AAur_3337 AAur_3338     TRUE 0.674 92.000 0.667 NA   NA
 1810079 1810080 AAur_3340 AAur_3341     FALSE 0.295 84.000 0.043 1.000   NA
 1810081 1810082 AAur_3342 AAur_3343     FALSE 0.109 75.000 0.000 NA   NA
 1810082 1810083 AAur_3343 AAur_3344     TRUE 0.937 -3.000 0.048 NA   NA
 1810083 1810084 AAur_3344 AAur_3345     FALSE 0.070 243.000 0.190 NA   NA
 1810084 1810085 AAur_3345 AAur_3346     FALSE 0.003 509.000 0.000 1.000   NA
 1810085 1810086 AAur_3346 AAur_3347     TRUE 0.990 -3.000 0.776 NA   NA
 1810087 1810088 AAur_3348 AAur_3349     FALSE 0.290 98.000 0.071 NA   NA
 1810089 1810090 AAur_3350 AAur_3351   nth FALSE 0.196 120.000 0.025 1.000   NA
 1810090 1810091 AAur_3351 AAur_3352 nth   TRUE 0.575 12.000 0.003 NA   NA
 1810092 1810093 AAur_3353 AAur_3354 acsA   FALSE 0.045 168.000 0.000 1.000 N NA
 1810093 1810094 AAur_3354 AAur_3355     FALSE 0.121 115.000 0.000 1.000 N NA
 1810094 1810095 AAur_3355 AAur_3356     TRUE 0.975 8.000 0.811 1.000   NA
 1810096 1810097 AAur_3357 AAur_3358     TRUE 0.815 15.000 0.136 1.000   NA
 1810098 1810099 AAur_3359 AAur_3360     TRUE 0.981 26.000 0.700 0.062 Y NA
 1810099 1810100 AAur_3360 AAur_3361     TRUE 0.940 42.000 0.211 0.062 Y NA
 1810100 1810101 AAur_3361 AAur_3362   rafA TRUE 0.645 118.000 0.079 1.000 Y NA
 1810102 1810103 AAur_3363 AAur_3364 aroQ   FALSE 0.214 115.000 0.028 1.000   NA
 1810105 1810106 AAur_3366 AAur_3367     TRUE 0.790 18.000 0.150 NA   NA
 1810106 1810107 AAur_3367 AAur_3368     TRUE 0.969 3.000 0.340 NA   NA
 1810108 1810109 AAur_3369 AAur_3370     TRUE 0.901 3.000 0.031 1.000   NA
 1810110 1810111 AAur_3371 AAur_3372     FALSE 0.111 111.000 0.000 1.000   NA
 1810111 1810112 AAur_3372 AAur_3373     FALSE 0.467 15.000 0.000 1.000   NA
 1810112 1810113 AAur_3373 AAur_3374     TRUE 0.749 5.000 0.000 1.000 N NA
 1810113 1810114 AAur_3374 AAur_3375     TRUE 0.787 33.000 0.250 1.000   NA
 1810114 1810115 AAur_3375 AAur_3376     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810115 1810116 AAur_3376 AAur_3377     FALSE 0.056 136.000 0.000 NA   NA
 1810117 1810118 AAur_3378 AAur_3379     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1810118 1810119 AAur_3379 AAur_3380     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1810122 1810123 AAur_3383 AAur_3384 purC purD TRUE 0.985 3.000 0.021 0.077 Y NA
 1810124 1810125 AAur_3385 AAur_3386     TRUE 0.739 21.000 0.111 NA   NA
 1810126 1810127 AAur_3387 AAur_3388 dctA   FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000 N NA
 1810127 1810128 AAur_3388 AAur_3389   hyuE TRUE 0.698 32.000 0.024 0.072 N NA
 1810128 1810129 AAur_3389 AAur_3390 hyuE   TRUE 0.745 78.000 0.714 1.000 N NA
 1810130 1810131 AAur_3391 AAur_3392     FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 1810131 1810132 AAur_3392 AAur_3393     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1810133 1810134 AAur_3394 AAur_3395     TRUE 0.995 -10.000 0.750 0.040 Y NA
 1810134 1810135 AAur_3395 AAur_3396     TRUE 0.910 -9.000 0.107 NA N NA
 1810135 1810136 AAur_3396 AAur_3397     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 1810136 1810137 AAur_3397 AAur_3398     TRUE 0.902 7.000 0.103 1.000   NA
 1810140 1810141 AAur_3401 AAur_3402     FALSE 0.002 791.000 0.000 1.000   NA
 1810141 1810142 AAur_3402 AAur_3403   ncs2 FALSE 0.054 192.000 0.016 1.000 N NA
 1810142 1810143 AAur_3403 AAur_3404 ncs2   FALSE 0.060 132.000 0.000 NA   NA
 1810145 1810146 AAur_3406 AAur_3407   aceB TRUE 0.933 19.000 0.111 1.000 Y NA
 1810146 1810147 AAur_3407 AAur_3408 aceB   TRUE 0.955 2.000 0.120 1.000   NA
 1810147 1810148 AAur_3408 AAur_3409     TRUE 0.648 15.000 0.033 NA   NA
 1810149 1810150 AAur_3410 AAur_3411     FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1810151 1810152 AAur_3412 AAur_3413     FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 1810152 1810153 AAur_3413 AAur_3414     TRUE 0.951 -10.000 0.333 NA N NA
 1810153 1810154 AAur_3414 AAur_3415     FALSE 0.012 226.000 0.000 NA   NA
 1810154 1810155 AAur_3415 AAur_3416     FALSE 0.113 108.000 0.000 1.000   NA
 1810157 1810158 AAur_3418 AAur_3419   amt FALSE 0.249 115.000 0.000 0.069 N NA
 1810159 1810160 AAur_3420 AAur_3421     FALSE 0.010 238.000 0.000 NA   NA
 1810161 1810162 AAur_3422 AAur_3423     FALSE 0.088 104.000 0.000 NA   NA
 1810162 1810163 AAur_3423 AAur_3424     TRUE 0.936 -6.000 0.119 1.000   NA
 1810163 1810164 AAur_3424 AAur_3425     TRUE 0.953 3.000 0.189 NA   NA
 1810165 1810166 AAur_3426 AAur_3427 adk   FALSE 0.252 39.000 0.000 NA   NA
 1810166 1810167 AAur_3427 AAur_3428     TRUE 0.988 -3.000 0.607 NA   NA
 1810167 1810168 AAur_3428 AAur_3429     FALSE 0.322 70.000 0.000 0.066   NA
 1810169 1810170 AAur_3430 AAur_3431     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810170 1810171 AAur_3431 AAur_3432     TRUE 0.772 2.000 0.000 NA   NA
 1810171 1810172 AAur_3432 AAur_3433     FALSE 0.016 207.000 0.000 NA   NA
 1810173 1810174 AAur_3434 AAur_3435     FALSE 0.027 172.000 0.000 NA   NA
 1810174 1810175 AAur_3435 AAur_3436     TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 1810175 1810176 AAur_3436 AAur_3437     TRUE 0.983 11.000 0.333 0.062 Y NA
 1810176 1810177 AAur_3437 AAur_3438     TRUE 0.991 8.000 0.417 0.062 Y NA
 1810177 1810178 AAur_3438 AAur_3439     TRUE 0.983 -3.000 0.400 NA N NA
 1810178 1810179 AAur_3439 AAur_3440     TRUE 0.878 50.000 1.000 NA   NA
 1810180 1810181 AAur_3441 AAur_3443     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1810184 1810185 AAur_3445 AAur_3446     FALSE 0.435 24.000 0.000 1.000 N NA
 1810185 1810186 AAur_3446 AAur_3447     TRUE 0.995 3.000 0.674 1.000 Y NA
 1810187 1810188 AAur_3448 AAur_3449     FALSE 0.172 60.000 0.000 NA N NA
 1810188 1810189 AAur_3449 AAur_3450     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810189 1810190 AAur_3450 AAur_3451     FALSE 0.016 206.000 0.000 NA   NA
 1810190 1810191 AAur_3451 AAur_3452     FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 1810193 1810194 AAur_3454 AAur_3455     FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 1810194 1810195 AAur_3455 AAur_3456     FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 1810196 1810197 AAur_3457 AAur_3458     FALSE 0.081 115.000 0.000 NA   NA
 1810197 1810198 AAur_3458 AAur_3459     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 1810202 1810203 AAur_3463 AAur_3464     TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.004 Y NA
 1810203 1810204 AAur_3464 AAur_3465     FALSE 0.151 83.000 0.000 1.000 N NA
 1810205 1810206 AAur_3466 AAur_3467     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1810207 1810208 AAur_3468 AAur_3469     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 1810208 1810209 AAur_3469 AAur_3470     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1810209 1810210 AAur_3470 AAur_3471     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA   NA
 1810210 1810211 AAur_3471 AAur_3472     FALSE 0.006 300.000 0.000 NA   NA
 1810211 1810212 AAur_3472 AAur_3473     FALSE 0.013 220.000 0.000 NA   NA
 1810213 1810214 AAur_3474 AAur_3475     TRUE 0.951 -3.000 0.000 0.035 N NA
 1810214 1810215 AAur_3475 AAur_3476     FALSE 0.132 102.000 0.000 1.000 N NA
 1810215 1810216 AAur_3476 AAur_3477     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1810218 1810219 AAur_3479 AAur_3480     TRUE 0.907 10.000 0.220 NA N NA
 1810219 1810220 AAur_3480 AAur_3481     FALSE 0.018 194.000 0.000 NA   NA
 1810220 1810221 AAur_3481 AAur_3482   ggt FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1810221 1810222 AAur_3482 AAur_3483 ggt   FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1810223 1810224 AAur_3484 AAur_3485     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1810224 1810225 AAur_3485 AAur_3486     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810225 1810226 AAur_3486 AAur_3487     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810226 1810227 AAur_3487 AAur_3488     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810227 1810228 AAur_3488 AAur_3489     TRUE 0.616 -12.000 0.000 NA   NA
 1810228 1810229 AAur_3489 AAur_3490     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1810229 1810230 AAur_3490 AAur_3491     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1810230 1810231 AAur_3491 AAur_3492     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1810231 1810232 AAur_3492 AAur_3493     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810232 1810233 AAur_3493 AAur_3494     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1810235 1810236 AAur_3496 AAur_3497     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1810236 1810237 AAur_3497 AAur_3498     TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 1810237 1810238 AAur_3498 AAur_3499     FALSE 0.473 38.000 0.014 1.000   NA
 1810238 1810239 AAur_3499 AAur_3500     TRUE 0.998 -3.000 0.723 0.061 Y NA
 1810239 1810240 AAur_3500 AAur_3501     TRUE 0.985 3.000 0.019 0.061 Y NA
 1810240 1810241 AAur_3501 AAur_3502     FALSE 0.027 199.000 0.000 1.000 N NA
 1810241 1810242 AAur_3502 AAur_3503     FALSE 0.143 90.000 0.000 1.000 N NA
 1810245 1810246 AAur_3506 AAur_3507     TRUE 0.648 90.000 0.500 1.000 N NA
 1810246 1810247 AAur_3507 AAur_3508   gcl FALSE 0.287 126.000 0.097 1.000   NA
 1810247 1810248 AAur_3508 AAur_3509 gcl glxK TRUE 0.631 26.000 0.043 1.000   NA
 1810248 1810249 AAur_3509 AAur_3510 glxK allB TRUE 0.911 -7.000 0.066 1.000 N NA
 1810249 1810250 AAur_3510 AAur_3511 allB   TRUE 0.785 11.000 0.049 1.000   NA
 1810250 1810251 AAur_3511 AAur_3512   bcp FALSE 0.169 98.000 0.004 1.000   NA
 1810251 1810252 AAur_3512 AAur_3513 bcp   FALSE 0.072 147.000 0.000 1.000 N NA
 1810252 1810253 AAur_3513 AAur_3514     TRUE 0.921 21.000 0.667 1.000   NA
 1810253 1810254 AAur_3514 AAur_3515     TRUE 0.978 -16.000 1.000 1.000   NA
 1810254 1810255 AAur_3515 AAur_3516     TRUE 0.979 -7.000 0.091 1.000 Y NA
 1810255 1810256 AAur_3516 AAur_3517     FALSE 0.016 203.000 0.000 NA   NA
 1810257 1810258 AAur_3518 AAur_3519     FALSE 0.243 55.000 0.000 1.000 N NA
 1810259 1810260 AAur_3520 AAur_3521     FALSE 0.119 84.000 0.000 NA N NA
 1810260 1810261 AAur_3521 AAur_3522     FALSE 0.075 120.000 0.000 NA   NA
 1810261 1810262 AAur_3522 AAur_3523     TRUE 0.952 -3.000 0.080 NA   NA
 1810262 1810263 AAur_3523 AAur_3524     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1810263 1810264 AAur_3524 AAur_3525   purF FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1810264 1810265 AAur_3525 AAur_3526 purF purM TRUE 0.784 93.000 0.248 1.000 Y NA
 1810266 1810267 AAur_3527 AAur_3528     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810267 1810268 AAur_3528 AAur_3529     FALSE 0.022 186.000 0.000 NA   NA
 1810272 1810273 AAur_3533 AAur_3534   modB TRUE 0.986 -3.000 0.450 1.000 N NA
 1810273 1810274 AAur_3534 AAur_3535 modB modA TRUE 0.806 83.000 0.578 0.000 N NA
 1810274 1810275 AAur_3535 AAur_3536 modA   TRUE 0.983 -3.000 0.365 1.000   NA
 1810276 1810277 AAur_3537 AAur_3538     FALSE 0.067 126.000 0.000 NA   NA
 1810277 1810278 AAur_3538 AAur_3540     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1810279 1810280 AAur_3539 AAur_3541     FALSE 0.088 102.000 0.000 NA   NA
 1810280 1810281 AAur_3541 AAur_3542   trpF FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 1810282 1810283 AAur_3543 AAur_3544     FALSE 0.058 133.000 0.000 NA   NA
 1810283 1810284 AAur_3544 AAur_3545     TRUE 0.998 3.000 1.000 0.049 Y NA
 1810284 1810285 AAur_3545 AAur_3546     FALSE 0.025 205.000 0.000 1.000 N NA
 1810285 1810286 AAur_3546 AAur_3547     TRUE 0.858 5.000 0.029 1.000   NA
 1810287 1810288 AAur_3548 AAur_3549     FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000 N NA
 1810289 1810290 AAur_3550 AAur_3552 soxR   TRUE 0.637 10.000 0.000 1.000 N NA
 1810292 1810293 AAur_3553 AAur_3554     TRUE 0.892 36.000 0.700 1.000   NA
 1810295 1810296 AAur_3556 AAur_3557   trmB FALSE 0.105 78.000 0.000 NA   NA
 1810296 1810297 AAur_3557 AAur_3558 trmB   FALSE 0.341 22.000 0.000 NA   NA
 1810297 1810298 AAur_3558 AAur_3559     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1810299 1810300 AAur_3560 AAur_3561     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1810304 1810305 AAur_3565 AAur_3566     TRUE 0.982 2.000 0.545 NA   NA
 1810305 1810306 AAur_3566 AAur_3567     TRUE 0.983 -7.000 0.886 NA   NA
 1810307 1810308 AAur_3568 AAur_3569     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1810309 1810310 AAur_3570 AAur_3571     TRUE 0.958 -3.000 0.070 1.000 N NA
 1810312 1810313 AAur_3573 AAur_3574     TRUE 0.959 0.000 0.105 NA N NA
 1810314 1810315 AAur_3575 AAur_3576     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1810315 1810316 AAur_3576 AAur_3577     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1810319 1810320 AAur_3579 AAur_3581     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.045 Y NA
 1810321 1810322 AAur_3582 AAur_3583     FALSE 0.383 82.000 0.080 1.000 N NA
 1810322 1810323 AAur_3583 AAur_3584     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 1810323 1810324 AAur_3584 AAur_3585     FALSE 0.545 18.000 0.012 NA   NA
 1810324 1810325 AAur_3585 AAur_3586     FALSE 0.459 29.000 0.012 NA   NA
 1810326 1810327 AAur_3587 AAur_3588   kgtP FALSE 0.325 149.000 0.250 1.000 N NA
 1810329 1810330 AAur_3590 AAur_3591 hspR   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1810330 1810331 AAur_3591 AAur_3592   grpE FALSE 0.025 178.000 0.000 NA   NA
 1810331 1810332 AAur_3592 AAur_3593 grpE dnaK TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1810334 1810335 AAur_3594 AAur_3596     FALSE 0.161 128.000 0.031 NA   NA
 1810335 1810336 AAur_3596 AAur_3597     FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 1810337 1810338 AAur_3598 AAur_3599     FALSE 0.457 21.000 0.000 1.000 N NA
 1810345 1810346 AAur_3606 AAur_3607 betA   FALSE 0.023 183.000 0.000 NA   NA
 1810347 1810348 AAur_3608 AAur_3609     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1810348 1810349 AAur_3609 AAur_3610     TRUE 0.772 2.000 0.000 NA   NA
 1810349 1810350 AAur_3610 AAur_3611     FALSE 0.010 240.000 0.000 NA   NA
 1810350 1810351 AAur_3611 AAur_3612     TRUE 0.977 -3.000 0.273 NA   NA
 1810351 1810352 AAur_3612 AAur_3613     TRUE 0.796 39.000 0.364 NA   NA
 1810352 1810353 AAur_3613 AAur_3614     TRUE 0.943 14.000 0.800 NA   NA
 1810353 1810354 AAur_3614 AAur_3615     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810354 1810355 AAur_3615 AAur_3616     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810355 1810356 AAur_3616 AAur_3617     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 1810356 1810357 AAur_3617 AAur_3618     FALSE 0.319 38.000 0.000 1.000   NA
 1810357 1810358 AAur_3618 AAur_3619     FALSE 0.132 84.000 0.000 1.000   NA
 1810358 1810359 AAur_3619 AAur_3620     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810360 1810361 AAur_3621 AAur_3622     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1810361 1810362 AAur_3622 AAur_3623     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1810365 1810366 AAur_3626 AAur_3627 maoB   FALSE 0.027 199.000 0.000 1.000 N NA
 1810367 1810368 AAur_3628 AAur_3629   trxB TRUE 0.666 30.000 0.003 0.039   NA
 1810368 1810369 AAur_3629 AAur_3630 trxB arsC FALSE 0.427 25.000 0.000 1.000 N NA
 1810369 1810370 AAur_3630 AAur_3631 arsC   FALSE 0.546 137.000 0.000 0.002 Y NA
 1810371 1810372 AAur_3632 AAur_3633     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1810372 1810373 AAur_3633 AAur_3634     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1810373 1810374 AAur_3634 AAur_3635     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1810376 1810377 AAur_3637 AAur_3638     TRUE 0.594 30.000 0.042 1.000   NA
 1810377 1810378 AAur_3638 AAur_3639     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1810378 1810379 AAur_3639 AAur_3640     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1810379 1810380 AAur_3640 AAur_3641     FALSE 0.474 19.000 0.000 1.000 N NA
 1810382 1810383 AAur_3643 AAur_3645     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1810385 1810386 AAur_3646 AAur_3647     TRUE 0.979 0.000 0.306 1.000   NA
 1810386 1810387 AAur_3647 AAur_3648   rbsK TRUE 0.978 -3.000 0.250 1.000   NA
 1810389 1810390 AAur_3650 AAur_3651     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1810390 1810391 AAur_3651 AAur_3652   pabB TRUE 0.918 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1810393 1810394 AAur_3654 AAur_3655     FALSE 0.090 256.000 0.000 1.000 Y NA
 1810395 1810396 AAur_3656 AAur_3657     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1810396 1810397 AAur_3657 AAur_3658     FALSE 0.035 157.000 0.000 NA   NA
 1810397 1810398 AAur_3658 AAur_3659   hutH TRUE 0.988 -6.000 0.250 1.000 Y NA
 1810398 1810399 AAur_3659 AAur_3660 hutH   TRUE 0.982 0.000 0.400 NA N NA
 1810400 1810401 AAur_3661 AAur_3662     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1810401 1810402 AAur_3662 AAur_3663     TRUE 0.944 -3.000 0.058 NA   NA
 1810402 1810403 AAur_3663 AAur_3664   metB TRUE 0.951 1.000 0.092 NA N NA
 1810403 1810404 AAur_3664 AAur_3666 metB   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1810405 1810406 AAur_3665 AAur_3667     FALSE 0.200 105.000 0.014 1.000   NA
 1810406 1810407 AAur_3667 AAur_3668     FALSE 0.005 325.000 0.000 NA N NA
 1810408 1810409 AAur_3669 AAur_3671     FALSE 0.541 63.000 0.160 1.000   NA
 1810410 1810411 AAur_3670 AAur_3672     TRUE 0.983 -3.000 0.372 1.000   NA
 1810411 1810412 AAur_3672 AAur_3673     TRUE 0.978 0.000 0.326 NA   NA
 1810413 1810414 AAur_3674 AAur_3675     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1810415 1810416 AAur_3676 AAur_3677     TRUE 0.908 -10.000 0.128 NA   NA
 1810416 1810417 AAur_3677 AAur_3678     TRUE 0.963 -3.000 0.130 NA   NA
 1810417 1810418 AAur_3678 AAur_3679     TRUE 0.998 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 1810418 1810419 AAur_3679 AAur_3680     TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.001 Y NA
 1810419 1810420 AAur_3680 AAur_3681     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 1810421 1810422 AAur_3682 AAur_3683     FALSE 0.259 65.000 0.009 1.000   NA
 1810422 1810423 AAur_3683 AAur_3684     TRUE 0.986 6.000 0.300 1.000 Y NA
 1810424 1810425 AAur_3685 AAur_3686   dcd FALSE 0.009 283.000 0.000 1.000   NA
 1810428 1810429 AAur_3689 AAur_3690     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1810429 1810430 AAur_3690 AAur_3691     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1810430 1810431 AAur_3691 AAur_3692     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1810431 1810432 AAur_3692 AAur_3693     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810434 1810435 AAur_3695 AAur_3696     FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000   NA
 1810435 1810436 AAur_3696 AAur_3698     FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 1810437 1810438 AAur_3697 AAur_3699     TRUE 0.971 -3.000 0.150 1.000 N NA
 1810439 1810440 AAur_3700 AAur_3701     TRUE 0.963 -3.000 0.127 NA   NA
 1810440 1810441 AAur_3701 AAur_3702     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 1810442 1810443 AAur_3703 AAur_3704     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1810443 1810444 AAur_3704 AAur_3705     FALSE 0.032 181.000 0.000 1.000   NA
 1810445 1810446 AAur_3706 AAur_3707 xylA xylB TRUE 0.721 99.000 0.027 0.021 Y NA
 1810446 1810447 AAur_3707 AAur_3708 xylB   FALSE 0.378 31.000 0.000 1.000 N NA
 1810447 1810448 AAur_3708 AAur_3709   araB FALSE 0.054 157.000 0.000 1.000 N NA
 1810448 1810449 AAur_3709 AAur_3710 araB araD TRUE 0.977 -3.000 0.217 1.000 N NA
 1810449 1810450 AAur_3710 AAur_3711 araD araA TRUE 0.768 75.000 0.138 1.000 Y NA
 1810450 1810451 AAur_3711 AAur_3712 araA   TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1810453 1810454 AAur_3714 AAur_3715   rhaI TRUE 0.964 -3.000 0.132 NA   NA
 1810454 1810455 AAur_3715 AAur_3716 rhaI rhaD TRUE 0.964 5.000 0.402 1.000   NA
 1810455 1810456 AAur_3716 AAur_3717 rhaD rhaB TRUE 0.644 57.000 0.225 1.000   NA
 1810456 1810457 AAur_3717 AAur_3718 rhaB   FALSE 0.146 88.000 0.000 1.000 N NA
 1810457 1810458 AAur_3718 AAur_3719     FALSE 0.128 66.000 0.000 NA   NA
 1810458 1810459 AAur_3719 AAur_3720   panD FALSE 0.104 80.000 0.000 NA   NA
 1810459 1810460 AAur_3720 AAur_3721 panD   FALSE 0.073 163.000 0.011 1.000   NA
 1810461 1810462 AAur_3722 AAur_3723 otsB   FALSE 0.200 97.000 0.007 1.000 N NA
 1810465 1810466 AAur_3726 AAur_3727     FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 1810467 1810468 AAur_3728 AAur_3729     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810468 1810469 AAur_3729 AAur_3730     TRUE 0.991 10.000 1.000 NA Y NA
 1810469 1810470 AAur_3730 AAur_3731     TRUE 0.969 -3.000 0.176 NA   NA
 1810470 1810471 AAur_3731 AAur_3732     TRUE 0.923 -10.000 0.176 NA   NA
 1810471 1810472 AAur_3732 AAur_3733     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA N NA
 1810472 1810473 AAur_3733 AAur_3734     TRUE 0.961 10.000 0.083 1.000 Y NA
 1810473 1810474 AAur_3734 AAur_3735     TRUE 0.643 153.000 0.366 1.000 Y NA
 1810475 1810476 AAur_3736 AAur_3737     TRUE 0.718 31.000 0.158 NA   NA
 1810476 1810477 AAur_3737 AAur_3738     TRUE 0.841 4.000 0.011 1.000   NA
 1810477 1810478 AAur_3738 AAur_3739     FALSE 0.017 251.000 0.007 NA   NA
 1810479 1810480 AAur_3740 AAur_3741     FALSE 0.041 165.000 0.000 1.000   NA
 1810480 1810481 AAur_3741 AAur_3742     TRUE 0.946 0.000 0.055 1.000   NA
 1810481 1810482 AAur_3742 AAur_3743   hup FALSE 0.257 131.000 0.087 1.000   NA
 1810482 1810483 AAur_3743 AAur_3744 hup   FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 1810485 1810486 AAur_3746 AAur_3747 rrfE rrlE FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1810486 1810487 AAur_3747 AAur_3748 rrlE rrsE FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 1810487 1810488 AAur_3748 AAur_3749 rrsE   FALSE 0.003 450.000 0.000 NA   NA
 1810490 1810491 AAur_3751 AAur_3752 rrfF rrlF FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1810491 1810492 AAur_3752 AAur_3753 rrlF rrsF FALSE 0.002 581.000 0.000 NA   NA
 1810492 1810493 AAur_3753 AAur_3754 rrsF rpsN FALSE 0.001 1051.000 0.000 NA   NA
 1810493 1810494 AAur_3754 AAur_3755 rpsN rpmG TRUE 0.984 5.000 0.052 0.010 Y NA
 1810494 1810495 AAur_3755 AAur_3756 rpmG rpmB TRUE 0.996 0.000 0.332 0.010 Y NA
 1810495 1810496 AAur_3756 AAur_3757 rpmB   FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000 N NA
 1810496 1810497 AAur_3757 AAur_3758     TRUE 0.827 54.000 0.667 1.000 N NA
 1810499 1810500 AAur_3759 AAur_3761     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 1810500 1810501 AAur_3761 AAur_3762     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA N NA
 1810501 1810502 AAur_3762 AAur_3763     TRUE 0.993 -3.000 0.214 NA Y NA
 1810502 1810503 AAur_3763 AAur_3764     TRUE 0.991 2.000 0.200 1.000 Y NA
 1810503 1810504 AAur_3764 AAur_3765     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.060 Y NA
 1810504 1810505 AAur_3765 AAur_3766     TRUE 0.940 57.000 0.778 1.000 Y NA
 1810507 1810508 AAur_3768 AAur_3769     TRUE 0.614 105.000 0.561 NA   NA
 1810508 1810509 AAur_3769 AAur_3770     TRUE 0.955 -7.000 0.311 NA   NA
 1810510 1810511 AAur_3771 AAur_3772     FALSE 0.427 62.000 0.083 NA   NA
 1810515 1810516 AAur_3776 AAur_3777     FALSE 0.108 164.000 0.000 0.048   NA
 1810516 1810517 AAur_3777 AAur_3779     FALSE 0.405 59.000 0.000 0.048   NA
 1810518 1810519 AAur_3778 AAur_3780     FALSE 0.429 20.000 0.000 1.000   NA
 1810519 1810520 AAur_3780 AAur_3781     TRUE 0.737 -7.000 0.000 1.000   NA
 1810520 1810521 AAur_3781 AAur_3782     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810521 1810522 AAur_3782 AAur_3783     TRUE 0.834 1.000 0.000 1.000   NA
 1810522 1810523 AAur_3783 AAur_3784     TRUE 0.720 5.000 0.000 1.000   NA
 1810523 1810524 AAur_3784 AAur_3785     FALSE 0.456 16.000 0.000 1.000   NA
 1810524 1810525 AAur_3785 AAur_3786     FALSE 0.195 50.000 0.000 NA   NA
 1810526 1810527 AAur_3787 AAur_3788     FALSE 0.002 785.000 0.000 NA   NA
 1810528 1810529 AAur_3789 AAur_3790     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 1810529 1810530 AAur_3790 AAur_3791     FALSE 0.530 -34.000 0.000 NA   NA
 1810531 1810532 AAur_3792 AAur_3793     TRUE 0.871 24.000 0.375 1.000 N NA
 1810532 1810533 AAur_3793 AAur_3794   aspA TRUE 0.919 14.000 0.030 1.000 Y NA
 1810533 1810534 AAur_3794 AAur_3795 aspA   FALSE 0.457 139.000 0.015 1.000 Y NA
 1810534 1810535 AAur_3795 AAur_3797     FALSE 0.059 154.000 0.000 1.000 N NA
 1810536 1810537 AAur_3796 AAur_3798     TRUE 0.942 -7.000 0.176 1.000   NA
 1810537 1810538 AAur_3798 AAur_3799     TRUE 0.915 -3.000 0.021 NA   NA
 1810538 1810539 AAur_3799 AAur_3800     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810539 1810540 AAur_3800 AAur_3801     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1810541 1810542 AAur_3802 AAur_3803     TRUE 0.598 116.000 0.000 0.069 Y NA
 1810544 1810545 AAur_3805 AAur_3806     FALSE 0.032 162.000 0.000 NA   NA
 1810545 1810546 AAur_3806 AAur_3807     FALSE 0.262 124.000 0.088 NA   NA
 1810547 1810548 AAur_3808 AAur_3809     FALSE 0.013 220.000 0.000 NA   NA
 1810550 1810551 AAur_3811 AAur_3812 estA   FALSE 0.385 26.000 0.000 1.000   NA
 1810551 1810552 AAur_3812 AAur_3813     FALSE 0.077 118.000 0.000 NA   NA
 1810556 1810557 AAur_3816 AAur_3818     TRUE 0.984 -3.000 0.455 NA   NA
 1810557 1810558 AAur_3818 AAur_3819     FALSE 0.115 106.000 0.000 1.000   NA
 1810560 1810561 AAur_3821 AAur_3822     TRUE 0.977 0.000 0.227 1.000 N NA
 1810561 1810562 AAur_3822 AAur_3823     TRUE 0.862 29.000 0.409 1.000 N NA
 1810562 1810563 AAur_3823 AAur_3824     FALSE 0.002 753.000 0.000 1.000 N NA
 1810564 1810565 AAur_3825 AAur_3826 glyA soxB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 1810565 1810566 AAur_3826 AAur_3827 soxB   TRUE 0.984 18.000 0.571 0.001 Y NA
 1810566 1810567 AAur_3827 AAur_3828     TRUE 0.989 3.000 0.571 0.001   NA
 1810567 1810568 AAur_3828 AAur_3829   soxG TRUE 0.991 -7.000 0.857 0.001   NA
 1810568 1810569 AAur_3829 AAur_3830 soxG sdaA TRUE 0.991 0.000 0.130 1.000 Y NA
 1810569 1810570 AAur_3830 AAur_3831 sdaA purU TRUE 0.951 3.000 0.130 1.000 N NA
 1810572 1810573 AAur_3833 AAur_3834     TRUE 0.984 -3.000 0.400 1.000   NA
 1810574 1810575 AAur_3835 AAur_3836     FALSE 0.168 102.000 0.013 NA   NA
 1810575 1810576 AAur_3836 AAur_3837     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 1810577 1810578 AAur_3838 AAur_3839     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1810578 1810579 AAur_3839 AAur_3840     FALSE 0.252 39.000 0.000 NA   NA
 1810581 1810582 AAur_3842 AAur_3843     FALSE 0.175 133.000 0.042 NA N NA
 1810582 1810583 AAur_3843 AAur_3844     FALSE 0.017 324.000 0.000 0.048   NA
 1810584 1810585 AAur_3845 AAur_3846     TRUE 0.684 31.000 0.084 1.000 N NA
 1810585 1810586 AAur_3846 AAur_3847     FALSE 0.370 61.000 0.037 1.000   NA
 1810587 1810588 AAur_3848 AAur_3849     TRUE 0.964 2.000 0.211 NA   NA
 1810588 1810589 AAur_3849 AAur_3850     TRUE 0.961 -3.000 0.116 NA   NA
 1810589 1810590 AAur_3850 AAur_3851     TRUE 0.995 -3.000 0.860 0.074 N NA
 1810590 1810591 AAur_3851 AAur_3852     FALSE 0.193 132.000 0.000 0.070 N NA
 1810592 1810593 AAur_3853 AAur_3854     FALSE 0.024 197.000 0.000 1.000   NA
 1810593 1810594 AAur_3854 AAur_3855     TRUE 0.977 26.000 0.870 1.000 Y NA
 1810594 1810595 AAur_3855 AAur_3856     TRUE 0.932 95.000 0.870 0.060 Y NA
 1810595 1810596 AAur_3856 AAur_3857     TRUE 0.952 27.000 0.356 1.000 Y NA
 1810596 1810597 AAur_3857 AAur_3858   mtlD FALSE 0.042 172.000 0.000 1.000 N NA
 1810597 1810598 AAur_3858 AAur_3859 mtlD mtlA TRUE 0.994 0.000 0.292 1.000 Y NA
 1810598 1810599 AAur_3859 AAur_3860 mtlA   FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1810600 1810601 AAur_3861 AAur_3862 ptsI   TRUE 0.965 31.000 0.333 0.002 Y NA
 1810601 1810602 AAur_3862 AAur_3863     TRUE 0.633 121.000 0.667 1.000   NA
 1810602 1810603 AAur_3863 AAur_3864     FALSE 0.364 19.000 0.000 NA   NA
 1810603 1810604 AAur_3864 AAur_3865     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1810604 1810605 AAur_3865 AAur_3866     FALSE 0.094 92.000 0.000 NA   NA
 1810610 1810611 AAur_3871 AAur_3872     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1810611 1810612 AAur_3872 AAur_3873     FALSE 0.002 951.000 0.000 1.000   NA
 1810614 1810615 AAur_3875 AAur_3876     TRUE 0.732 77.000 0.091 1.000 Y NA
 1810615 1810616 AAur_3876 AAur_3877     TRUE 0.995 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 1810616 1810617 AAur_3877 AAur_3878     TRUE 0.998 0.000 0.812 0.060 Y NA
 1810617 1810618 AAur_3878 AAur_3879     FALSE 0.006 331.000 0.000 1.000   NA
 1810619 1810620 AAur_3880 AAur_3881     FALSE 0.095 183.000 0.080 NA   NA
 1810621 1810622 AAur_3882 AAur_3883     TRUE 0.762 29.000 0.200 NA   NA
 1810622 1810623 AAur_3883 AAur_3884     FALSE 0.088 105.000 0.000 NA   NA
 1810624 1810625 AAur_3885 AAur_3886     TRUE 0.944 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1810625 1810626 AAur_3886 AAur_3888     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1810629 1810630 AAur_3890 AAur_3891     TRUE 0.882 -7.000 0.040 1.000   NA
 1810630 1810631 AAur_3891 AAur_3892     TRUE 0.927 101.000 0.860 0.069 Y NA
 1810631 1810632 AAur_3892 AAur_3893     TRUE 0.998 0.000 0.917 0.002 Y NA
 1810632 1810633 AAur_3893 AAur_3894     FALSE 0.227 152.000 0.129 1.000 N NA
 1810636 1810637 AAur_3897 AAur_3898 purB   FALSE 0.013 298.000 0.002 1.000 N NA
 1810637 1810638 AAur_3898 AAur_3899     TRUE 0.936 0.000 0.000 0.069   NA
 1810638 1810639 AAur_3899 AAur_3900     FALSE 0.273 71.000 0.033 NA   NA
 1810640 1810641 AAur_3901 AAur_3902     FALSE 0.092 94.000 0.000 NA   NA
 1810641 1810642 AAur_3902 AAur_3903     TRUE 0.798 56.000 0.667 NA   NA
 1810642 1810643 AAur_3903 AAur_3904     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA Y NA
 1810643 1810644 AAur_3904 AAur_3905     TRUE 0.991 2.000 1.000 1.000   NA
 1810646 1810647 AAur_3907 AAur_3908     FALSE 0.010 246.000 0.000 NA   NA
 1810647 1810648 AAur_3908 AAur_3909     TRUE 0.773 29.000 0.200 NA N NA
 1810649 1810650 AAur_3910 AAur_3911     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 1810651 1810652 AAur_3912 AAur_3913   hpaH TRUE 0.949 -15.000 0.123 0.008 N NA
 1810652 1810653 AAur_3913 AAur_3914 hpaH hpaD TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1810653 1810654 AAur_3914 AAur_3915 hpaD hpaE FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1810654 1810655 AAur_3915 AAur_3916 hpaE   TRUE 0.806 15.000 0.112 1.000 N NA
 1810655 1810656 AAur_3916 AAur_3917     TRUE 0.961 -7.000 0.304 1.000 N NA
 1810657 1810658 AAur_3918 AAur_3919     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1810660 1810661 AAur_3921 AAur_3922     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 1810661 1810662 AAur_3922 AAur_3923     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810662 1810663 AAur_3923 AAur_3925     FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 1810664 1810665 AAur_3924 AAur_3926     TRUE 0.793 52.000 0.000 0.069 Y NA
 1810665 1810666 AAur_3926 AAur_3927     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1810666 1810667 AAur_3927 AAur_3928     FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1810667 1810668 AAur_3928 AAur_3929     FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1810668 1810669 AAur_3929 AAur_3930     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1810670 1810671 AAur_3931 AAur_3932     TRUE 0.918 -3.000 0.024 NA   NA
 1810671 1810672 AAur_3932 AAur_3933     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810672 1810673 AAur_3933 AAur_3934     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 1810673 1810674 AAur_3934 AAur_3935     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1810676 1810677 AAur_3937 AAur_3938     TRUE 0.949 -3.000 0.071 NA   NA
 1810677 1810678 AAur_3938 AAur_3939     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1810678 1810679 AAur_3939 AAur_3940     FALSE 0.109 75.000 0.000 NA   NA
 1810679 1810680 AAur_3940 AAur_3941     FALSE 0.086 136.000 0.000 1.000 N NA
 1810680 1810681 AAur_3941 AAur_3942     TRUE 0.918 59.000 0.333 0.059 Y NA
 1810681 1810682 AAur_3942 AAur_3943     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.059 Y NA
 1810682 1810683 AAur_3943 AAur_3944     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1810684 1810685 AAur_3945 AAur_3946     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1810689 1810690 AAur_3950 AAur_3951     FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 1810691 1810692 AAur_3952 AAur_3953   nylB TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1810692 1810693 AAur_3953 AAur_3954 nylB   TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810693 1810694 AAur_3954 AAur_3955     FALSE 0.132 84.000 0.000 1.000   NA
 1810694 1810695 AAur_3955 AAur_3956     FALSE 0.123 92.000 0.000 1.000   NA
 1810696 1810697 AAur_3957 AAur_3958     FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 1810698 1810699 AAur_3959 AAur_3960     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1810699 1810700 AAur_3960 AAur_3961     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 1810701 1810702 AAur_3962 AAur_3963     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1810703 1810704 AAur_3964 AAur_3965     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810704 1810705 AAur_3965 AAur_3966     TRUE 0.790 3.000 0.000 1.000   NA
 1810707 1810708 AAur_3968 AAur_3969     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1810710 1810711 AAur_3971 AAur_3972     FALSE 0.412 22.000 0.000 1.000   NA
 1810713 1810714 AAur_3974 AAur_3975     FALSE 0.092 94.000 0.000 NA   NA
 1810716 1810717 AAur_3977 AAur_3978     FALSE 0.199 49.000 0.000 NA   NA
 1810718 1810719 AAur_3979 AAur_3980 pobA   FALSE 0.400 119.000 0.167 1.000 N NA
 1810721 1810722 AAur_3982 AAur_3983     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810722 1810723 AAur_3983 AAur_3984     TRUE 0.630 107.000 0.600 NA   NA
 1810726 1810727 AAur_3987 AAur_3988     FALSE 0.223 45.000 0.000 NA   NA
 1810727 1810728 AAur_3988 AAur_3989     TRUE 0.613 7.000 0.000 NA   NA
 1810731 1810732 AAur_3992 AAur_3993     FALSE 0.145 74.000 0.000 1.000   NA
 1810732 1810733 AAur_3993 AAur_3994     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1810733 1810734 AAur_3994 AAur_3995     FALSE 0.104 80.000 0.000 NA   NA
 1810734 1810735 AAur_3995 AAur_3996     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1810735 1810736 AAur_3996 AAur_3997     FALSE 0.016 204.000 0.000 NA   NA
 1810736 1810737 AAur_3997 AAur_3998     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810737 1810738 AAur_3998 AAur_3999     TRUE 0.772 2.000 0.000 NA   NA
 1810738 1810739 AAur_3999 AAur_4000     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1810739 1810740 AAur_4000 AAur_4001     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 1810740 1810741 AAur_4001 AAur_4002   lipA FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1810741 1810742 AAur_4002 AAur_4003 lipA sdaA FALSE 0.384 47.000 0.004 1.000 N NA
 1810742 1810743 AAur_4003 AAur_4004 sdaA glyA FALSE 0.111 303.000 0.088 1.000 Y NA
 1810743 1810744 AAur_4004 AAur_4005 glyA gcvH TRUE 0.991 -3.000 0.108 1.000 Y NA
 1810744 1810745 AAur_4005 AAur_4006 gcvH gcvT TRUE 0.945 23.000 0.056 0.002 Y NA
 1810745 1810746 AAur_4006 AAur_4007 gcvT gcvP TRUE 0.962 12.000 0.032 0.001 Y NA
 1810746 1810747 AAur_4007 AAur_4008 gcvP   FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000 N NA
 1810748 1810749 AAur_4009 AAur_4010     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1810749 1810750 AAur_4010 AAur_4011     FALSE 0.096 129.000 0.000 1.000 N NA
 1810750 1810751 AAur_4011 AAur_4012     TRUE 0.815 30.000 0.000 1.000 Y NA
 1810751 1810752 AAur_4012 AAur_4013   mscL FALSE 0.056 208.000 0.000 0.069 N NA
 1810752 1810753 AAur_4013 AAur_4014 mscL   FALSE 0.057 150.000 0.000 1.000   NA
 1810754 1810755 AAur_4015 AAur_4016     TRUE 0.613 7.000 0.000 NA   NA
 1810755 1810756 AAur_4016 AAur_4017     FALSE 0.118 70.000 0.000 NA   NA
 1810756 1810757 AAur_4017 AAur_4018     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1810757 1810758 AAur_4018 AAur_4019     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810761 1810762 AAur_4022 AAur_4023     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1810763 1810764 AAur_4024 AAur_4025     FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 1810766 1810767 AAur_4027 AAur_4028     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1810767 1810768 AAur_4028 AAur_4029     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1810768 1810769 AAur_4029 AAur_4030     FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1810769 1810770 AAur_4030 AAur_4031   tesB TRUE 0.780 57.000 0.049 1.000 Y NA
 1810770 1810771 AAur_4031 AAur_4032 tesB   TRUE 0.909 4.000 0.056 1.000 N NA
 1810771 1810772 AAur_4032 AAur_4033     TRUE 0.563 41.000 0.042 1.000 N NA
 1810773 1810774 AAur_4034 AAur_4035     FALSE 0.311 27.000 0.000 NA   NA
 1810775 1810776 AAur_4036 AAur_4037     FALSE 0.131 106.000 0.000 1.000 N NA
 1810776 1810777 AAur_4037 AAur_4038     TRUE 0.996 3.000 0.500 0.001 Y NA
 1810777 1810778 AAur_4038 AAur_4039   pcaF TRUE 0.947 15.000 0.150 1.000 Y NA
 1810778 1810779 AAur_4039 AAur_4040 pcaF pcaC TRUE 0.716 37.000 0.150 1.000   NA
 1810779 1810780 AAur_4040 AAur_4041 pcaC   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810780 1810781 AAur_4041 AAur_4042     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810781 1810782 AAur_4042 AAur_4043   pcaG TRUE 0.982 -3.000 0.314 1.000 N NA
 1810782 1810783 AAur_4043 AAur_4044 pcaG pcaH TRUE 0.996 5.000 0.782 0.000 Y NA
 1810783 1810784 AAur_4044 AAur_4045 pcaH   FALSE 0.181 132.000 0.029 1.000 N NA
 1810784 1810785 AAur_4045 AAur_4046   aroE TRUE 0.987 0.000 0.045 1.000 Y NA
 1810785 1810786 AAur_4046 AAur_4047 aroE   FALSE 0.170 205.000 0.333 1.000 N NA
 1810790 1810791 AAur_4051 AAur_4052     TRUE 0.914 8.000 0.190 NA   NA
 1810792 1810793 AAur_4053 AAur_4054     FALSE 0.085 137.000 0.000 1.000 N NA
 1810798 1810799 AAur_4059 AAur_4060     TRUE 0.847 23.000 0.000 1.000 Y NA
 1810799 1810800 AAur_4060 AAur_4061     TRUE 0.980 -3.000 0.259 1.000 N NA
 1810800 1810801 AAur_4061 AAur_4062     TRUE 0.869 11.000 0.163 NA N NA
 1810802 1810803 AAur_4063 AAur_4064 kdgK   TRUE 0.931 5.000 0.130 1.000 N NA
 1810803 1810804 AAur_4064 AAur_4065     TRUE 0.982 -3.000 0.348 NA N NA
 1810805 1810806 AAur_4066 AAur_4067     FALSE 0.060 132.000 0.000 NA   NA
 1810806 1810807 AAur_4067 AAur_4068     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1810809 1810810 AAur_4070 AAur_4071     FALSE 0.002 974.000 0.000 1.000   NA
 1810810 1810811 AAur_4071 AAur_4072     FALSE 0.129 87.000 0.000 1.000   NA
 1810811 1810812 AAur_4072 AAur_4073     FALSE 0.211 56.000 0.000 1.000   NA
 1810813 1810814 AAur_4074 AAur_4075     FALSE 0.400 57.000 0.051 NA   NA
 1810815 1810816 AAur_4076 AAur_4077     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1810816 1810817 AAur_4077 AAur_4078     FALSE 0.101 84.000 0.000 NA   NA
 1810817 1810818 AAur_4078 AAur_4079     TRUE 0.928 21.000 0.692 1.000 N NA
 1810818 1810819 AAur_4079 AAur_4080     TRUE 0.997 3.000 0.900 0.059 Y NA
 1810819 1810820 AAur_4080 AAur_4081     TRUE 0.767 175.000 0.800 0.059 Y NA
 1810821 1810822 AAur_4082 AAur_4083     FALSE 0.028 170.000 0.000 NA   NA
 1810823 1810824 AAur_4084 AAur_4085     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1810824 1810825 AAur_4085 AAur_4086     FALSE 0.001 1465.000 0.000 NA   NA
 1810825 1810826 AAur_4086 AAur_4087     FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1810826 1810827 AAur_4087 AAur_4088     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1810827 1810828 AAur_4088 AAur_4089   nahA TRUE 0.854 1.000 0.000 1.000 N NA
 1810828 1810829 AAur_4089 AAur_4090 nahA   TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1810829 1810830 AAur_4090 AAur_4091     TRUE 0.998 -3.000 0.900 0.059 Y NA
 1810830 1810831 AAur_4091 AAur_4092     TRUE 0.970 44.000 0.692 0.059 Y NA
 1810832 1810833 AAur_4093 AAur_4094     FALSE 0.195 50.000 0.000 NA   NA
 1810833 1810834 AAur_4094 AAur_4095     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1810839 1810840 AAur_4100 AAur_4101     TRUE 0.738 108.000 1.000 NA   NA
 1810840 1810841 AAur_4101 AAur_4102     TRUE 0.709 10.000 0.015 NA   NA
 1810842 1810843 AAur_4103 AAur_4104     FALSE 0.271 33.000 0.000 NA   NA
 1810843 1810844 AAur_4104 AAur_4105     FALSE 0.093 124.000 0.000 1.000   NA
 1810844 1810845 AAur_4105 AAur_4106     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1810845 1810846 AAur_4106 AAur_4107     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1810846 1810847 AAur_4107 AAur_4108     FALSE 0.003 419.000 0.000 NA N NA
 1810847 1810848 AAur_4108 AAur_4109     FALSE 0.511 91.000 0.000 NA Y NA
 1810849 1810850 AAur_4110 AAur_4111     FALSE 0.118 70.000 0.000 NA   NA
 1810850 1810851 AAur_4111 AAur_4112     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1810851 1810852 AAur_4112 AAur_4113   gmd TRUE 0.995 -3.000 0.160 0.010 Y NA
 1810852 1810853 AAur_4113 AAur_4114 gmd   TRUE 0.827 46.000 0.037 1.000 Y NA
 1810853 1810854 AAur_4114 AAur_4115     FALSE 0.102 83.000 0.000 NA   NA
 1810855 1810856 AAur_4116 AAur_4117     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1810856 1810857 AAur_4117 AAur_4118     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1810857 1810858 AAur_4118 AAur_4119     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1810858 1810859 AAur_4119 AAur_4120     FALSE 0.271 33.000 0.000 NA   NA
 1810859 1810860 AAur_4120 AAur_4121     TRUE 0.873 35.000 0.000 0.014 Y NA
 1810860 1810861 AAur_4121 AAur_4122     TRUE 0.965 8.000 0.000 0.014 Y NA
 1810861 1810862 AAur_4122 AAur_4123     FALSE 0.023 200.000 0.000 1.000   NA
 1810862 1810863 AAur_4123 AAur_4124     FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000   NA
 1810866 1810867 AAur_4127 AAur_4128     FALSE 0.011 235.000 0.000 NA   NA
 1810867 1810868 AAur_4128 AAur_4129     FALSE 0.005 359.000 0.000 1.000   NA
 1810868 1810869 AAur_4129 AAur_4130     FALSE 0.304 121.000 0.082 1.000 N NA
 1810869 1810870 AAur_4130 AAur_4131     TRUE 0.998 -3.000 0.812 0.002 Y NA
 1810870 1810871 AAur_4131 AAur_4132     TRUE 0.683 93.000 0.072 1.000 Y NA
 1810872 1810873 AAur_4133 AAur_4134     TRUE 0.864 30.000 0.500 NA N NA
 1810873 1810874 AAur_4134 AAur_4135     TRUE 0.841 35.000 0.400 1.000 N NA
 1810874 1810875 AAur_4135 AAur_4136   rpiB TRUE 0.967 11.000 0.200 1.000 Y NA
 1810875 1810876 AAur_4136 AAur_4137 rpiB   FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1810877 1810878 AAur_4138 AAur_4139   dnaB FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1810879 1810880 AAur_4140 AAur_4141     TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1810881 1810882 AAur_4142 AAur_4143     FALSE 0.002 715.000 0.000 NA   NA
 1810882 1810883 AAur_4143 AAur_4144     TRUE 0.576 38.000 0.062 NA   NA
 1810883 1810884 AAur_4144 AAur_4145     FALSE 0.004 412.000 0.000 1.000   NA
 1810885 1810886 AAur_4146 AAur_4147     TRUE 0.880 44.000 0.714 1.000 N NA
 1810886 1810887 AAur_4147 AAur_4148     TRUE 0.994 -3.000 0.714 0.067 N NA
 1810887 1810888 AAur_4148 AAur_4149     TRUE 0.987 3.000 0.500 0.067 N NA
 1810888 1810889 AAur_4149 AAur_4150     TRUE 0.622 51.000 0.130 1.000 N NA
 1810890 1810891 AAur_4151 AAur_4152     FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1810893 1810894 AAur_4154 AAur_4155     FALSE 0.335 33.000 0.000 1.000   NA
 1810894 1810895 AAur_4155 AAur_4156     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1810895 1810896 AAur_4156 AAur_4157     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 1810897 1810898 AAur_4158 AAur_4159     TRUE 0.972 2.000 0.318 NA   NA
 1810901 1810902 AAur_4162 AAur_4163 rplI rpsR TRUE 0.980 19.000 0.499 0.010 Y NA
 1810902 1810903 AAur_4163 AAur_4164 rpsR ssb FALSE 0.137 129.000 0.004 1.000 N NA
 1810903 1810904 AAur_4164 AAur_4165 ssb rpsF FALSE 0.354 51.000 0.004 1.000 N NA
 1810908 1810909 AAur_4169 AAur_4170     FALSE 0.122 223.000 0.000 1.000 Y NA
 1810909 1810910 AAur_4170 AAur_4171     FALSE 0.505 38.000 0.016 1.000 N NA
 1810910 1810911 AAur_4171 AAur_4172     FALSE 0.401 63.000 0.048 1.000 N NA
 1810911 1810912 AAur_4172 AAur_4173     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 1810912 1810913 AAur_4173 AAur_4174     FALSE 0.469 147.000 0.600 NA   NA
 1810913 1810914 AAur_4174 AAur_4175     TRUE 0.980 3.000 0.600 NA   NA
 1810914 1810915 AAur_4175 AAur_4176     FALSE 0.414 166.000 0.667 1.000 N NA
 1810917 1810918 AAur_4177 AAur_4179     TRUE 0.991 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 1810918 1810919 AAur_4179 AAur_4180     FALSE 0.049 156.000 0.000 1.000   NA
 1810921 1810922 AAur_4181 AAur_4183     FALSE 0.299 42.000 0.000 1.000   NA
 1810922 1810923 AAur_4183 AAur_4184     FALSE 0.091 125.000 0.000 1.000   NA
 1810923 1810924 AAur_4184 AAur_4185     TRUE 0.998 -3.000 0.611 0.008 Y NA
 1810925 1810926 AAur_4186 AAur_4188     TRUE 0.770 25.000 0.130 1.000 N NA
 1810929 1810930 AAur_4190 AAur_4191     TRUE 0.915 -7.000 0.107 NA   NA
 1810930 1810931 AAur_4191 AAur_4192     FALSE 0.342 176.000 0.667 NA   NA
 1810931 1810932 AAur_4192 AAur_4193     FALSE 0.002 600.000 0.000 NA   NA
 1810932 1810933 AAur_4193 AAur_4194     TRUE 0.948 -3.000 0.044 1.000 N NA
 1810934 1810935 AAur_4195 AAur_4196   mviN FALSE 0.336 87.000 0.068 1.000   NA
 1810935 1810936 AAur_4196 AAur_4197 mviN   FALSE 0.417 140.000 0.357 1.000   NA
 1810936 1810937 AAur_4197 AAur_4198   trxB FALSE 0.017 260.000 0.003 1.000   NA
 1810937 1810938 AAur_4198 AAur_4199 trxB trx FALSE 0.266 35.000 0.000 NA   NA
 1810939 1810940 AAur_4200 AAur_4201     FALSE 0.085 111.000 0.000 NA   NA
 1810940 1810941 AAur_4201 AAur_4202     FALSE 0.001 1842.000 0.000 NA   NA
 1810941 1810942 AAur_4202 AAur_4203     FALSE 0.001 3298.000 0.000 NA   NA
 1810942 1810943 AAur_4203 AAur_4204     TRUE 0.802 68.000 0.827 1.000 N NA
 1810943 1810944 AAur_4204 AAur_4205   gidB TRUE 0.584 88.000 0.339 1.000 N NA
 1810944 1810945 AAur_4205 AAur_4206 gidB   TRUE 0.882 7.000 0.070 1.000   NA
 1810945 1810946 AAur_4206 AAur_4207     TRUE 0.906 0.000 0.008 1.000   NA
 1810946 1810947 AAur_4207 AAur_4208     FALSE 0.503 17.000 0.004 NA   NA
 1810947 1810948 AAur_4208 AAur_4209   rpmH FALSE 0.006 382.000 0.005 NA   NA
 1806169 1806170 AAur_pTC10001 AAur_pTC10002     TRUE 0.862 15.000 0.286 NA   NA
 1806170 1806171 AAur_pTC10002 AAur_pTC10003     TRUE 0.929 28.000 1.000 NA   NA
 1806171 1806172 AAur_pTC10003 AAur_pTC10004     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806175 1806176 AAur_pTC10007 AAur_pTC10008     TRUE 0.837 16.000 0.222 NA   NA
 1806176 1806177 AAur_pTC10008 AAur_pTC10009     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1806178 1806179 AAur_pTC10010 AAur_pTC10011     TRUE 0.951 15.000 1.000 NA   NA
 1806179 1806180 AAur_pTC10011 AAur_pTC10012     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806180 1806181 AAur_pTC10012 AAur_pTC10013     TRUE 0.945 7.000 0.333 NA   NA
 1806181 1806182 AAur_pTC10013 AAur_pTC10014     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 1806182 1806183 AAur_pTC10014 AAur_pTC10015     FALSE 0.452 89.000 0.200 NA   NA
 1806183 1806184 AAur_pTC10015 AAur_pTC10016     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806184 1806185 AAur_pTC10016 AAur_pTC10017     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1806185 1806186 AAur_pTC10017 AAur_pTC10018     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA   NA
 1806186 1806187 AAur_pTC10018 AAur_pTC10019     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806187 1806188 AAur_pTC10019 AAur_pTC10020     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806188 1806189 AAur_pTC10020 AAur_pTC10021     TRUE 0.943 20.000 1.000 NA   NA
 1806189 1806190 AAur_pTC10021 AAur_pTC10022     FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 1806190 1806191 AAur_pTC10022 AAur_pTC10023     TRUE 0.781 77.000 1.000 NA   NA
 1806191 1806192 AAur_pTC10023 AAur_pTC10024     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806192 1806193 AAur_pTC10024 AAur_pTC10025     TRUE 0.946 18.000 1.000 NA   NA
 1806193 1806194 AAur_pTC10025 AAur_pTC10026     TRUE 0.990 2.000 1.000 NA   NA
 1806194 1806195 AAur_pTC10026 AAur_pTC10027     TRUE 0.741 105.000 1.000 NA   NA
 1806195 1806196 AAur_pTC10027 AAur_pTC10028     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806196 1806197 AAur_pTC10028 AAur_pTC10029     FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 1806200 1806201 AAur_pTC10032 AAur_pTC10033     TRUE 0.871 39.000 0.667 NA   NA
 1806201 1806202 AAur_pTC10033 AAur_pTC10034     TRUE 0.758 41.000 0.286 NA   NA
 1806203 1806204 AAur_pTC10035 AAur_pTC10036     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1806204 1806205 AAur_pTC10036 AAur_pTC10037     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806205 1806206 AAur_pTC10037 AAur_pTC10038     TRUE 0.888 47.000 1.000 NA   NA
 1806206 1806207 AAur_pTC10038 AAur_pTC10039     TRUE 0.957 13.000 1.000 NA   NA
 1806207 1806208 AAur_pTC10039 AAur_pTC10040     TRUE 0.981 6.000 1.000 NA   NA
 1806208 1806209 AAur_pTC10040 AAur_pTC10041     TRUE 0.949 16.000 1.000 NA   NA
 1806209 1806210 AAur_pTC10041 AAur_pTC10042     FALSE 0.105 79.000 0.000 NA   NA
 1806210 1806211 AAur_pTC10042 AAur_pTC10043     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1806212 1806213 AAur_pTC10044 AAur_pTC10045     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1806213 1806214 AAur_pTC10045 AAur_pTC10046     FALSE 0.080 191.000 0.000 0.005   NA
 1806215 1806216 AAur_pTC10047 AAur_pTC10048     TRUE 0.854 18.000 0.250 1.000   NA
 1806216 1806217 AAur_pTC10048 AAur_pTC10049     FALSE 0.057 134.000 0.000 NA   NA
 1806217 1806218 AAur_pTC10049 AAur_pTC10050     FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 1806219 1806220 AAur_pTC10051 AAur_pTC10052     TRUE 0.992 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 1806220 1806221 AAur_pTC10052 AAur_pTC10053     FALSE 0.003 386.000 0.000 NA   NA
 1806221 1806222 AAur_pTC10053 AAur_pTC10054     FALSE 0.118 70.000 0.000 NA   NA
 1806222 1806223 AAur_pTC10054 AAur_pTC10055     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1806223 1806224 AAur_pTC10055 AAur_pTC10056     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 1806224 1806225 AAur_pTC10056 AAur_pTC10057     FALSE 0.454 124.000 0.000 1.000 Y NA
 1806226 1806227 AAur_pTC10058 AAur_pTC10059     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1806227 1806228 AAur_pTC10059 AAur_pTC10060     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806228 1806229 AAur_pTC10060 AAur_pTC10061   maoB TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.067 N NA
 1806229 1806230 AAur_pTC10061 AAur_pTC10062 maoB   FALSE 0.032 189.000 0.000 1.000 N NA
 1806232 1806233 AAur_pTC10064 AAur_pTC10065     TRUE 0.821 2.000 0.000 1.000   NA
 1806233 1806234 AAur_pTC10065 AAur_pTC10066     FALSE 0.500 13.000 0.000 1.000   NA
 1806234 1806235 AAur_pTC10066 AAur_pTC10067     TRUE 0.975 7.000 0.778 NA N NA
 1806235 1806236 AAur_pTC10067 AAur_pTC10068     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1806236 1806237 AAur_pTC10068 AAur_pTC10069   ipuC FALSE 0.084 129.000 0.000 1.000   NA
 1806237 1806238 AAur_pTC10069 AAur_pTC10071 ipuC   TRUE 0.832 49.000 0.667 NA   NA
 1806240 1806241 AAur_pTC10072 AAur_pTC10073 ald pyc FALSE 0.435 24.000 0.000 1.000 N NA
 1806241 1806242 AAur_pTC10073 AAur_pTC10074 pyc   TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1806242 1806243 AAur_pTC10074 AAur_pTC10075     FALSE 0.002 769.000 0.000 NA   NA
 1806243 1806244 AAur_pTC10075 AAur_pTC10076     FALSE 0.050 144.000 0.000 NA   NA
 1806244 1806245 AAur_pTC10076 AAur_pTC10077     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1806246 1806247 AAur_pTC10078 AAur_pTC10079 dnaG   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806247 1806248 AAur_pTC10079 AAur_pTC10080     TRUE 0.635 6.000 0.000 NA   NA
 1806249 1806250 AAur_pTC10081 AAur_pTC10082     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1806250 1806251 AAur_pTC10082 AAur_pTC10083     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1806253 1806254 AAur_pTC10085 AAur_pTC10086     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806254 1806255 AAur_pTC10086 AAur_pTC10087   trzN FALSE 0.064 151.000 0.000 1.000 N NA
 1806255 1806256 AAur_pTC10087 AAur_pTC10088 trzN   FALSE 0.001 898.000 0.000 NA   NA
 1806256 1806257 AAur_pTC10088 AAur_pTC10089     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1806257 1806258 AAur_pTC10089 AAur_pTC10090     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 1806259 1806260 AAur_pTC10091 AAur_pTC10092     FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 1806261 1806262 AAur_pTC10093 AAur_pTC10094     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806263 1806264 AAur_pTC10095 AAur_pTC10096     FALSE 0.466 151.000 0.667 NA   NA
 1806264 1806265 AAur_pTC10096 AAur_pTC10097     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1806266 1806267 AAur_pTC10098 AAur_pTC10099     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1806267 1806268 AAur_pTC10099 AAur_pTC10101     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1806269 1806270 AAur_pTC10100 AAur_pTC10102     TRUE 0.610 30.000 0.000 0.042   NA
 1806273 1806274 AAur_pTC10105 AAur_pTC10106     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806274 1806275 AAur_pTC10106 AAur_pTC10107     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1806275 1806276 AAur_pTC10107 AAur_pTC10108     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1806276 1806277 AAur_pTC10108 AAur_pTC10109     FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1806277 1806278 AAur_pTC10109 AAur_pTC10110     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1806278 1806279 AAur_pTC10110 AAur_pTC10111     TRUE 0.563 -19.000 0.000 NA   NA
 1806279 1806280 AAur_pTC10111 AAur_pTC10112     TRUE 0.918 33.000 1.000 NA   NA
 1806280 1806281 AAur_pTC10112 AAur_pTC10113     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806281 1806282 AAur_pTC10113 AAur_pTC10114     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806282 1806283 AAur_pTC10114 AAur_pTC10115     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1806283 1806284 AAur_pTC10115 AAur_pTC10116     FALSE 0.098 87.000 0.000 NA   NA
 1806285 1806286 AAur_pTC10117 AAur_pTC10118     TRUE 0.563 -19.000 0.000 NA   NA
 1806288 1806289 AAur_pTC10120 AAur_pTC10121     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 1806290 1806291 AAur_pTC10122 AAur_pTC10123     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 1806293 1806294 AAur_pTC10125 AAur_pTC10126     FALSE 0.118 70.000 0.000 NA   NA
 1806294 1806295 AAur_pTC10126 AAur_pTC10127     FALSE 0.002 612.000 0.000 NA   NA
 1806296 1806297 AAur_pTC10128 AAur_pTC10129     FALSE 0.118 96.000 0.000 1.000   NA
 1806297 1806298 AAur_pTC10129 AAur_pTC10130     TRUE 0.971 -3.000 0.143 1.000 N NA
 1806299 1806300 AAur_pTC10131 AAur_pTC10132     TRUE 0.897 28.000 0.000 0.003 Y NA
 1806300 1806301 AAur_pTC10132 AAur_pTC10133     FALSE 0.371 28.000 0.000 1.000   NA
 1806301 1806302 AAur_pTC10133 AAur_pTC10134     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1806302 1806303 AAur_pTC10134 AAur_pTC10135     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 1806305 1806306 AAur_pTC10137 AAur_pTC10138     FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1806306 1806307 AAur_pTC10138 AAur_pTC10139     TRUE 0.893 29.000 0.000 0.003 Y NA
 1806307 1806308 AAur_pTC10139 AAur_pTC10140     FALSE 0.066 127.000 0.000 NA   NA
 1806308 1806309 AAur_pTC10140 AAur_pTC10141     FALSE 0.080 116.000 0.000 NA   NA
 1806309 1806310 AAur_pTC10141 AAur_pTC10142     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 1806310 1806311 AAur_pTC10142 AAur_pTC10143     FALSE 0.104 80.000 0.000 NA   NA
 1806311 1806312 AAur_pTC10143 AAur_pTC10144   ccdA FALSE 0.195 59.000 0.000 1.000   NA
 1806312 1806313 AAur_pTC10144 AAur_pTC10145 ccdA   FALSE 0.393 137.000 0.000 1.000 Y NA
 1806314 1806315 AAur_pTC10146 AAur_pTC10147     FALSE 0.018 197.000 0.000 NA   NA
 1806315 1806316 AAur_pTC10147 AAur_pTC10148     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1806316 1806317 AAur_pTC10148 AAur_pTC10149     FALSE 0.092 94.000 0.000 NA   NA
 1806318 1806319 AAur_pTC10150 AAur_pTC10151     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 1806320 1806321 AAur_pTC10152 AAur_pTC10153     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1806321 1806322 AAur_pTC10153 AAur_pTC10154     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1806322 1806323 AAur_pTC10154 AAur_pTC10155     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1806324 1806325 AAur_pTC10156 AAur_pTC10157     FALSE 0.027 173.000 0.000 NA   NA
 1806325 1806326 AAur_pTC10157 AAur_pTC10158     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806326 1806327 AAur_pTC10158 AAur_pTC10159     FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1806327 1806328 AAur_pTC10159 AAur_pTC10160     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1806328 1806329 AAur_pTC10160 AAur_pTC10161     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 1806329 1806330 AAur_pTC10161 AAur_pTC10162     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1806331 1806332 AAur_pTC10163 AAur_pTC10164     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 1806332 1806333 AAur_pTC10164 AAur_pTC10165     FALSE 0.260 37.000 0.000 NA   NA
 1806333 1806334 AAur_pTC10165 AAur_pTC10166     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1806334 1806335 AAur_pTC10166 AAur_pTC10167     TRUE 0.936 3.000 0.111 NA   NA
 1806338 1806339 AAur_pTC10170 AAur_pTC10171     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1806340 1806341 AAur_pTC10172 AAur_pTC10173     FALSE 0.075 120.000 0.000 NA   NA
 1806341 1806342 AAur_pTC10173 AAur_pTC10174     TRUE 0.993 -3.000 0.213 NA Y NA
 1806342 1806343 AAur_pTC10174 AAur_pTC10175     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806343 1806344 AAur_pTC10175 AAur_pTC10176     FALSE 0.019 193.000 0.000 NA   NA
 1806344 1806345 AAur_pTC10176 AAur_pTC10177     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1806346 1806347 AAur_pTC10178 AAur_pTC10179   ctaE FALSE 0.077 144.000 0.000 1.000 N NA
 1806348 1806349 AAur_pTC10180 AAur_pTC10181     FALSE 0.013 221.000 0.000 NA   NA
 1806351 1806352 AAur_pTC10183 AAur_pTC10184     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806352 1806353 AAur_pTC10184 AAur_pTC10185     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806353 1806354 AAur_pTC10185 AAur_pTC10186     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 1806354 1806355 AAur_pTC10186 AAur_pTC10187   lspA FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1806355 1806356 AAur_pTC10187 AAur_pTC10188 lspA cadA TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1806356 1806357 AAur_pTC10188 AAur_pTC10189 cadA   TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1806358 1806359 AAur_pTC10190 AAur_pTC10191   czc FALSE 0.265 108.000 0.000 0.067 N NA
 1806359 1806360 AAur_pTC10191 AAur_pTC10192 czc   FALSE 0.286 48.000 0.000 1.000 N NA
 1806360 1806361 AAur_pTC10192 AAur_pTC10193     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1806361 1806362 AAur_pTC10193 AAur_pTC10194     FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 1806362 1806363 AAur_pTC10194 AAur_pTC10195     TRUE 0.613 7.000 0.000 NA   NA
 1806363 1806364 AAur_pTC10195 AAur_pTC10196     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1806364 1806365 AAur_pTC10196 AAur_pTC10197   ccdA FALSE 0.131 85.000 0.000 1.000   NA
 1806365 1806366 AAur_pTC10197 AAur_pTC10198 ccdA   TRUE 0.977 17.000 0.667 1.000 Y NA
 1806366 1806367 AAur_pTC10198 AAur_pTC10199     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 1806369 1806370 AAur_pTC10201 AAur_pTC10202     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 1806371 1806372 AAur_pTC10203 AAur_pTC10204     FALSE 0.381 55.000 0.025 1.000   NA
 1806372 1806373 AAur_pTC10204 AAur_pTC10205     FALSE 0.436 19.000 0.000 1.000   NA
 1806375 1806376 AAur_pTC10207 AAur_pTC10208     TRUE 0.666 34.000 0.115 NA   NA
 1806376 1806377 AAur_pTC10208 AAur_pTC10209     FALSE 0.024 181.000 0.000 NA   NA
 1806377 1806378 AAur_pTC10209 AAur_pTC10210     FALSE 0.201 58.000 0.000 1.000   NA
 1806380 1806381 AAur_pTC10212 AAur_pTC10213 atzC   FALSE 0.106 124.000 0.000 1.000 N NA
 1806381 1806382 AAur_pTC10213 AAur_pTC10214     FALSE 0.274 32.000 0.000 NA   NA
 1806382 1806383 AAur_pTC10214 AAur_pTC10215     FALSE 0.025 176.000 0.000 NA   NA
 1806384 1806385 AAur_pTC10216 AAur_pTC10218   atzB FALSE 0.137 63.000 0.000 NA   NA
 1806386 1806387 AAur_pTC10217 AAur_pTC10219     FALSE 0.370 18.000 0.000 NA   NA
 1806387 1806388 AAur_pTC10219 AAur_pTC10220     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 1806388 1806389 AAur_pTC10220 AAur_pTC10221     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 1806389 1806390 AAur_pTC10221 AAur_pTC10222     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1806390 1806391 AAur_pTC10222 AAur_pTC10223     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1806392 1806393 AAur_pTC10224 AAur_pTC10225     FALSE 0.056 388.000 0.000 0.042 Y NA
 1806394 1806395 AAur_pTC10226 AAur_pTC10227 lgt   FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 1806395 1806396 AAur_pTC10227 AAur_pTC10228     FALSE 0.025 177.000 0.000 NA   NA
 1806396 1806397 AAur_pTC10228 AAur_pTC10229     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806397 1806398 AAur_pTC10229 AAur_pTC10230     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1806400 1806401 AAur_pTC10232 AAur_pTC10233 trx   TRUE 0.815 54.000 0.667 NA N NA
 1806401 1806402 AAur_pTC10233 AAur_pTC10234     TRUE 0.799 49.000 0.039 NA Y NA
 1806402 1806403 AAur_pTC10234 AAur_pTC10235     FALSE 0.551 30.000 0.039 NA   NA
 1806403 1806404 AAur_pTC10235 AAur_pTC10236     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 1806405 1806406 AAur_pTC10237 AAur_pTC10238     TRUE 0.845 35.000 0.500 NA   NA
 1806406 1806407 AAur_pTC10238 AAur_pTC10239     FALSE 0.092 94.000 0.000 NA   NA
 1806411 1806412 AAur_pTC10243 AAur_pTC10244     FALSE 0.132 84.000 0.000 1.000   NA
 1806412 1806413 AAur_pTC10244 AAur_pTC10245     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1806414 1806415 AAur_pTC10246 AAur_pTC10247     FALSE 0.002 570.000 0.000 NA   NA
 1806415 1806416 AAur_pTC10247 AAur_pTC10248     TRUE 0.914 59.000 0.556 1.000 Y NA
 1806416 1806417 AAur_pTC10248 AAur_pTC10249     TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.056 Y NA
 1806417 1806418 AAur_pTC10249 AAur_pTC10250     FALSE 0.003 607.000 0.000 1.000 N NA
 1806418 1806419 AAur_pTC10250 AAur_pTC10251     TRUE 0.662 20.000 0.030 1.000 N NA
 1806419 1806420 AAur_pTC10251 AAur_pTC10252     TRUE 0.989 -3.000 0.600 1.000 N NA
 1806420 1806421 AAur_pTC10252 AAur_pTC10253     TRUE 0.995 2.000 1.000 0.000 N NA
 1806423 1806424 AAur_pTC10255 AAur_pTC10256     FALSE 0.018 231.000 0.000 1.000 N NA
 1806425 1806426 AAur_pTC10257 AAur_pTC10258     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1806426 1806427 AAur_pTC10258 AAur_pTC10259     FALSE 0.002 705.000 0.000 NA   NA
 1806429 1806430 AAur_pTC10261 AAur_pTC10262     TRUE 0.610 30.000 0.000 0.042   NA
 1806435 1806436 AAur_pTC10267 AAur_pTC10268     TRUE 0.990 1.000 0.900 NA   NA
 1806440 1806441 AAur_pTC10272 AAur_pTC10273     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1806441 1806442 AAur_pTC10273 AAur_pTC10274     TRUE 0.981 0.000 0.400 NA   NA
 1806442 1806443 AAur_pTC10274 AAur_pTC10275     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 1806444 1806445 AAur_pTC10276 AAur_pTC10277     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1806445 1806446 AAur_pTC10277 AAur_pTC10278     TRUE 0.744 57.000 0.500 NA   NA
 1806446 1806447 AAur_pTC10278 AAur_pTC10279     FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 1806447 1806448 AAur_pTC10279 AAur_pTC10280     FALSE 0.099 86.000 0.000 NA   NA
 1806448 1806449 AAur_pTC10280 AAur_pTC10281     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806449 1806450 AAur_pTC10281 AAur_pTC10282     FALSE 0.013 222.000 0.000 NA   NA
 1806450 1806451 AAur_pTC10282 AAur_pTC10283     FALSE 0.535 -31.000 0.000 NA   NA
 1806451 1806452 AAur_pTC10283 AAur_pTC10284     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1806453 1806454 AAur_pTC10285 AAur_pTC10286     TRUE 0.973 -3.000 0.188 1.000   NA
 1806454 1806455 AAur_pTC10286 AAur_pTC10287     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 1806455 1806456 AAur_pTC10287 AAur_pTC10288     FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 1806457 1806458 AAur_pTC10289 AAur_pTC10290     FALSE 0.437 155.000 0.667 NA   NA
 1806458 1806459 AAur_pTC10290 AAur_pTC10291     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806459 1806460 AAur_pTC10291 AAur_pTC10292     TRUE 0.735 110.000 1.000 NA   NA
 1806460 1806461 AAur_pTC10292 AAur_pTC10293     FALSE 0.102 82.000 0.000 NA   NA
 1806461 1806462 AAur_pTC10293 AAur_pTC10294     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1806462 1806463 AAur_pTC10294 AAur_pTC10295     FALSE 0.376 17.000 0.000 NA   NA
 1806463 1806464 AAur_pTC10295 AAur_pTC10296     FALSE 0.314 39.000 0.000 1.000   NA
 1806464 1806465 AAur_pTC10296 AAur_pTC10297     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1806465 1806169 AAur_pTC10297 AAur_pTC10001     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 1806466 1806467 AAur_pTC20001 AAur_pTC20002     FALSE 0.004 496.000 0.000 1.000 N NA
 1806470 1806471 AAur_pTC20005 AAur_pTC20006     FALSE 0.012 225.000 0.000 NA   NA
 1806472 1806473 AAur_pTC20007 AAur_pTC20008     FALSE 0.032 262.000 0.000 0.041   NA
 1806473 1806474 AAur_pTC20008 AAur_pTC20009     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1806476 1806477 AAur_pTC20011 AAur_pTC20012     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 1806478 1806479 AAur_pTC20013 AAur_pTC20014     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806480 1806481 AAur_pTC20015 AAur_pTC20016     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 1806483 1806484 AAur_pTC20018 AAur_pTC20019     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1806485 1806486 AAur_pTC20020 AAur_pTC20021     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 1806486 1806487 AAur_pTC20021 AAur_pTC20022     TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1806489 1806490 AAur_pTC20024 AAur_pTC20025     FALSE 0.533 124.000 0.500 NA   NA
 1806490 1806491 AAur_pTC20025 AAur_pTC20026     FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 1806491 1806492 AAur_pTC20026 AAur_pTC20027     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1806492 1806493 AAur_pTC20027 AAur_pTC20028     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1806494 1806495 AAur_pTC20029 AAur_pTC20030     FALSE 0.010 239.000 0.000 NA   NA
 1806495 1806496 AAur_pTC20030 AAur_pTC20031   cadA TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1806496 1806497 AAur_pTC20031 AAur_pTC20032 cadA lspA TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1806497 1806498 AAur_pTC20032 AAur_pTC20033 lspA ccdA FALSE 0.295 87.000 0.000 0.066 N NA
 1806498 1806499 AAur_pTC20033 AAur_pTC20034 ccdA   TRUE 0.766 44.000 0.000 1.000 Y NA
 1806499 1806500 AAur_pTC20034 AAur_pTC20035     FALSE 0.252 39.000 0.000 NA   NA
 1806501 1806502 AAur_pTC20036 AAur_pTC20037     FALSE 0.011 232.000 0.000 NA   NA
 1806502 1806503 AAur_pTC20037 AAur_pTC20038     FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 1806503 1806504 AAur_pTC20038 AAur_pTC20039     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1806504 1806505 AAur_pTC20039 AAur_pTC20040     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806505 1806506 AAur_pTC20040 AAur_pTC20041     TRUE 0.741 47.000 0.333 NA   NA
 1806507 1806508 AAur_pTC20042 AAur_pTC20043     FALSE 0.151 71.000 0.000 1.000   NA
 1806508 1806509 AAur_pTC20043 AAur_pTC20044   czc TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.066 N NA
 1806509 1806510 AAur_pTC20044 AAur_pTC20045 czc   TRUE 0.978 0.000 0.250 1.000 N NA
 1806510 1806511 AAur_pTC20045 AAur_pTC20046     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1806511 1806512 AAur_pTC20046 AAur_pTC20047     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1806515 1806516 AAur_pTC20050 AAur_pTC20051 mntH   FALSE 0.148 244.000 0.000 0.066 Y NA
 1806517 1806518 AAur_pTC20052 AAur_pTC20053     TRUE 0.698 -10.000 0.000 1.000   NA
 1806519 1806520 AAur_pTC20054 AAur_pTC20055     FALSE 0.435 24.000 0.000 1.000 N NA
 1806520 1806521 AAur_pTC20055 AAur_pTC20056     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1806522 1806523 AAur_pTC20057 AAur_pTC20058   arsC FALSE 0.437 157.000 0.000 0.001 Y NA
 1806523 1806524 AAur_pTC20058 AAur_pTC20059 arsC trxB FALSE 0.352 38.000 0.000 1.000 N NA
 1806524 1806525 AAur_pTC20059 AAur_pTC20060 trxB   FALSE 0.396 41.000 0.003 1.000   NA
 1806525 1806526 AAur_pTC20060 AAur_pTC20061   arsC FALSE 0.332 34.000 0.000 1.000   NA
 1806526 1806527 AAur_pTC20061 AAur_pTC20062 arsC arsC TRUE 0.989 0.000 0.000 0.001 Y NA
 1806527 1806528 AAur_pTC20062 AAur_pTC20063 arsC   FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1806528 1806529 AAur_pTC20063 AAur_pTC20065     FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1806530 1806531 AAur_pTC20064 AAur_pTC20066     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 1806531 1806532 AAur_pTC20066 AAur_pTC20067     FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 1806532 1806533 AAur_pTC20067 AAur_pTC20068     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1806534 1806535 AAur_pTC20069 AAur_pTC20070     TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1806535 1806536 AAur_pTC20070 AAur_pTC20071   nrdH FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 1806536 1806537 AAur_pTC20071 AAur_pTC20072 nrdH   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806537 1806538 AAur_pTC20072 AAur_pTC20073   ssb FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 1806538 1806539 AAur_pTC20073 AAur_pTC20074 ssb   TRUE 0.635 6.000 0.000 NA   NA
 1806539 1806540 AAur_pTC20074 AAur_pTC20075     FALSE 0.029 168.000 0.000 NA   NA
 1806542 1806543 AAur_pTC20077 AAur_pTC20078     TRUE 0.985 4.000 1.000 NA   NA
 1806543 1806544 AAur_pTC20078 AAur_pTC20079     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1806545 1806546 AAur_pTC20080 AAur_pTC20081     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1806546 1806547 AAur_pTC20081 AAur_pTC20082     FALSE 0.002 780.000 0.000 NA   NA
 1806549 1806550 AAur_pTC20084 AAur_pTC20085     TRUE 0.675 44.000 0.143 1.000   NA
 1806550 1806551 AAur_pTC20085 AAur_pTC20086     FALSE 0.002 727.000 0.000 NA   NA
 1806551 1806552 AAur_pTC20086 AAur_pTC20087     FALSE 0.024 181.000 0.000 NA   NA
 1806552 1806553 AAur_pTC20087 AAur_pTC20088     FALSE 0.075 146.000 0.000 1.000 N NA
 1806554 1806555 AAur_pTC20089 AAur_pTC20090     TRUE 0.961 -7.000 0.304 1.000 N NA
 1806555 1806556 AAur_pTC20090 AAur_pTC20091   hpaE TRUE 0.744 27.000 0.112 1.000 N NA
 1806556 1806557 AAur_pTC20091 AAur_pTC20092 hpaE hpaD FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1806557 1806558 AAur_pTC20092 AAur_pTC20093 hpaD   FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 1806558 1806559 AAur_pTC20093 AAur_pTC20094     TRUE 0.869 -15.000 0.000 0.008 N NA
 1806559 1806560 AAur_pTC20094 AAur_pTC20095     FALSE 0.421 26.000 0.000 1.000 N NA
 1806560 1806561 AAur_pTC20095 AAur_pTC20096   maoB/feaB FALSE 0.463 147.000 0.000 0.064 Y NA
 1806562 1806563 AAur_pTC20097 AAur_pTC20098     FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 1806563 1806564 AAur_pTC20098 AAur_pTC20099     FALSE 0.079 132.000 0.000 1.000   NA
 1806565 1806566 AAur_pTC20100 AAur_pTC20101     FALSE 0.160 76.000 0.000 1.000 N NA
 1806566 1806567 AAur_pTC20101 AAur_pTC20102     FALSE 0.041 174.000 0.000 1.000 N NA
 1806569 1806570 AAur_pTC20104 AAur_pTC20105     FALSE 0.260 37.000 0.000 NA   NA
 1806570 1806571 AAur_pTC20105 AAur_pTC20106     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1806572 1806573 AAur_pTC20107 AAur_pTC20108     FALSE 0.008 292.000 0.000 1.000   NA
 1806574 1806575 AAur_pTC20109 AAur_pTC20110 proP   TRUE 0.928 11.000 0.375 1.000 N NA
 1806575 1806576 AAur_pTC20110 AAur_pTC20111     TRUE 0.950 28.000 0.400 NA Y NA
 1806577 1806578 AAur_pTC20112 AAur_pTC20113     TRUE 0.840 64.000 1.000 1.000 N NA
 1806582 1806583 AAur_pTC20117 AAur_pTC20118     FALSE 0.003 404.000 0.000 NA   NA
 1806584 1806585 AAur_pTC20119 AAur_pTC20120     FALSE 0.109 75.000 0.000 NA   NA
 1806585 1806586 AAur_pTC20120 AAur_pTC20121     FALSE 0.085 137.000 0.000 1.000 N NA
 1806586 1806587 AAur_pTC20121 AAur_pTC20122     TRUE 0.974 2.000 0.000 1.000 Y NA
 1806587 1806588 AAur_pTC20122 AAur_pTC20123     FALSE 0.376 17.000 0.000 NA   NA
 1806588 1806589 AAur_pTC20123 AAur_pTC20124     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1806589 1806590 AAur_pTC20124 AAur_pTC20125   panD FALSE 0.020 212.000 0.000 1.000   NA
 1806590 1806591 AAur_pTC20125 AAur_pTC20126 panD   FALSE 0.002 740.000 0.000 NA   NA
 1806592 1806593 AAur_pTC20127 AAur_pTC20128     FALSE 0.003 382.000 0.000 NA   NA
 1806593 1806594 AAur_pTC20128 AAur_pTC20129     FALSE 0.099 120.000 0.000 1.000   NA
 1806594 1806595 AAur_pTC20129 AAur_pTC20130     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1806595 1806596 AAur_pTC20130 AAur_pTC20131     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1806596 1806597 AAur_pTC20131 AAur_pTC20132     FALSE 0.132 84.000 0.000 1.000   NA
 1806597 1806598 AAur_pTC20132 AAur_pTC20133     TRUE 0.602 118.000 0.000 0.055 Y NA
 1806598 1806599 AAur_pTC20133 AAur_pTC20134     TRUE 0.997 -7.000 1.000 0.055 Y NA
 1806599 1806600 AAur_pTC20134 AAur_pTC20135     FALSE 0.006 333.000 0.000 1.000 N NA
 1806601 1806602 AAur_pTC20136 AAur_pTC20137     FALSE 0.010 241.000 0.000 NA   NA
 1806603 1806604 AAur_pTC20138 AAur_pTC20139     TRUE 0.687 105.000 0.667 1.000 N NA
 1806606 1806607 AAur_pTC20141 AAur_pTC20142     FALSE 0.002 539.000 0.000 NA   NA
 1806607 1806608 AAur_pTC20142 AAur_pTC20143     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806608 1806609 AAur_pTC20143 AAur_pTC20144     FALSE 0.088 102.000 0.000 NA   NA
 1806609 1806610 AAur_pTC20144 AAur_pTC20145   nthB FALSE 0.028 171.000 0.000 NA   NA
 1806610 1806611 AAur_pTC20145 AAur_pTC20146 nthB nthA TRUE 0.976 -3.000 0.047 0.001   NA
 1806611 1806612 AAur_pTC20146 AAur_pTC20147 nthA nthB TRUE 0.979 -3.000 0.065 0.001   NA
 1806612 1806613 AAur_pTC20147 AAur_pTC20148 nthB amdA TRUE 0.943 -3.000 0.043 1.000   NA
 1806613 1806614 AAur_pTC20148 AAur_pTC20149 amdA adk FALSE 0.004 497.000 0.000 1.000 N NA
 1806614 1806615 AAur_pTC20149 AAur_pTC20150 adk gltA FALSE 0.003 691.000 0.000 1.000 N NA
 1806615 1806616 AAur_pTC20150 AAur_pTC20151 gltA prpB TRUE 0.865 37.000 0.502 1.000 N NA
 1806616 1806617 AAur_pTC20151 AAur_pTC20152 prpB   TRUE 0.798 28.000 0.218 1.000   NA
 1806617 1806618 AAur_pTC20152 AAur_pTC20153     TRUE 0.831 -7.000 0.010 1.000   NA
 1806619 1806620 AAur_pTC20154 AAur_pTC20155 prpE   FALSE 0.037 155.000 0.000 NA   NA
 1806620 1806621 AAur_pTC20155 AAur_pTC20156     FALSE 0.013 220.000 0.000 NA   NA
 1806621 1806622 AAur_pTC20156 AAur_pTC20157     TRUE 0.954 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1806622 1806623 AAur_pTC20157 AAur_pTC20158     TRUE 0.776 4.000 0.000 1.000 N NA
 1806623 1806624 AAur_pTC20158 AAur_pTC20159     FALSE 0.120 94.000 0.000 1.000   NA
 1806624 1806625 AAur_pTC20159 AAur_pTC20160     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 1806625 1806626 AAur_pTC20160 AAur_pTC20161     FALSE 0.075 120.000 0.000 NA   NA
 1806626 1806627 AAur_pTC20161 AAur_pTC20162     TRUE 0.907 4.000 0.080 NA   NA
 1806630 1806631 AAur_pTC20165 AAur_pTC20166     FALSE 0.115 72.000 0.000 NA   NA
 1806631 1806632 AAur_pTC20166 AAur_pTC20167     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806634 1806635 AAur_pTC20169 AAur_pTC20170     FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1806635 1806636 AAur_pTC20170 AAur_pTC20171     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806636 1806637 AAur_pTC20171 AAur_pTC20172     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1806638 1806639 AAur_pTC20173 AAur_pTC20174     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806639 1806640 AAur_pTC20174 AAur_pTC20175     FALSE 0.008 262.000 0.000 NA   NA
 1806640 1806641 AAur_pTC20175 AAur_pTC20176     FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 1806643 1806644 AAur_pTC20178 AAur_pTC20179     TRUE 0.890 6.000 0.069 1.000   NA
 1806644 1806645 AAur_pTC20179 AAur_pTC20180     FALSE 0.004 383.000 0.000 1.000   NA
 1806645 1806646 AAur_pTC20180 AAur_pTC20181     FALSE 0.011 261.000 0.000 1.000   NA
 1806646 1806647 AAur_pTC20181 AAur_pTC20182     FALSE 0.458 42.000 0.021 NA N NA
 1806647 1806648 AAur_pTC20182 AAur_pTC20183     FALSE 0.170 55.000 0.000 NA   NA
 1806648 1806649 AAur_pTC20183 AAur_pTC20184     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1806649 1806650 AAur_pTC20184 AAur_pTC20185     FALSE 0.087 127.000 0.000 1.000   NA
 1806651 1806652 AAur_pTC20186 AAur_pTC20187     FALSE 0.028 170.000 0.000 NA   NA
 1806654 1806655 AAur_pTC20189 AAur_pTC20190 acsA   FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1806655 1806656 AAur_pTC20190 AAur_pTC20191     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1806656 1806657 AAur_pTC20191 AAur_pTC20192     FALSE 0.009 297.000 0.000 1.000 N NA
 1806657 1806658 AAur_pTC20192 AAur_pTC20193     FALSE 0.154 80.000 0.000 1.000 N NA
 1806658 1806659 AAur_pTC20193 AAur_pTC20194     TRUE 0.611 30.000 0.000 0.041   NA
 1806659 1806660 AAur_pTC20194 AAur_pTC20195     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1806660 1806661 AAur_pTC20195 AAur_pTC20196     FALSE 0.437 35.000 0.014 NA   NA
 1806662 1806663 AAur_pTC20197 AAur_pTC20198     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 N NA
 1806664 1806665 AAur_pTC20199 AAur_pTC20200     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 1806666 1806667 AAur_pTC20201 AAur_pTC20202     FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 1806669 1806670 AAur_pTC20204 AAur_pTC20205 ald   FALSE 0.001 859.000 0.000 NA   NA
 1806671 1806672 AAur_pTC20206 AAur_pTC20207     FALSE 0.008 281.000 0.000 NA N NA
 1806672 1806673 AAur_pTC20207 AAur_pTC20208     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1806673 1806674 AAur_pTC20208 AAur_pTC20209     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1806674 1806675 AAur_pTC20209 AAur_pTC20210     TRUE 0.677 6.000 0.000 NA N NA
 1806675 1806676 AAur_pTC20210 AAur_pTC20211     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1806676 1806677 AAur_pTC20211 AAur_pTC20212     TRUE 0.821 2.000 0.000 1.000   NA
 1806677 1806678 AAur_pTC20212 AAur_pTC20213   ipuC FALSE 0.204 62.000 0.000 1.000 N NA
 1806678 1806679 AAur_pTC20213 AAur_pTC20214 ipuC   FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000 N NA
 1806679 1806680 AAur_pTC20214 AAur_pTC20215     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1806681 1806682 AAur_pTC20216 AAur_pTC20217     FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000 N NA
 1806682 1806683 AAur_pTC20217 AAur_pTC20218     FALSE 0.012 266.000 0.000 1.000 N NA
 1806683 1806684 AAur_pTC20218 AAur_pTC20219     FALSE 0.147 208.000 0.000 1.000 Y NA
 1806684 1806685 AAur_pTC20219 AAur_pTC20220     FALSE 0.049 156.000 0.000 1.000   NA
 1806685 1806686 AAur_pTC20220 AAur_pTC20221     FALSE 0.018 197.000 0.000 NA   NA
 1806688 1806689 AAur_pTC20223 AAur_pTC20224     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1806689 1806690 AAur_pTC20224 AAur_pTC20225     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 1806691 1806692 AAur_pTC20226 AAur_pTC20227   galU FALSE 0.409 154.000 0.500 1.000 N NA
 1806693 1806694 AAur_pTC20228 AAur_pTC20229     FALSE 0.443 175.000 1.000 NA   NA
 1806694 1806695 AAur_pTC20229 AAur_pTC20230     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 1806695 1806696 AAur_pTC20230 AAur_pTC20231   galE TRUE 0.973 -4.000 0.500 NA   NA
 1806698 1806699 AAur_pTC20233 AAur_pTC20234     FALSE 0.004 369.000 0.000 NA   NA
 1806700 1806701 AAur_pTC20235 AAur_pTC20236     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1806702 1806703 AAur_pTC20237 AAur_pTC20238     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1806704 1806705 AAur_pTC20239 AAur_pTC20240     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 1806705 1806706 AAur_pTC20240 AAur_pTC20241     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1806707 1806708 AAur_pTC20242 AAur_pTC20243     FALSE 0.037 155.000 0.000 NA   NA
 1806711 1806712 AAur_pTC20246 AAur_pTC20247     FALSE 0.147 73.000 0.000 1.000   NA
 1806712 1806713 AAur_pTC20247 AAur_pTC20248     FALSE 0.033 160.000 0.000 NA   NA
 1806713 1806714 AAur_pTC20248 AAur_pTC20249     TRUE 0.992 -3.000 0.857 NA   NA
 1806714 1806715 AAur_pTC20249 AAur_pTC20250     TRUE 0.991 0.000 0.875 NA   NA
 1806715 1806716 AAur_pTC20250 AAur_pTC20251     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 1806716 1806717 AAur_pTC20251 AAur_pTC20252     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 1806717 1806718 AAur_pTC20252 AAur_pTC20253     FALSE 0.005 311.000 0.000 NA   NA
 1806718 1806719 AAur_pTC20253 AAur_pTC20254     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 1806722 1806723 AAur_pTC20257 AAur_pTC20258     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806724 1806725 AAur_pTC20259 AAur_pTC20260     FALSE 0.101 84.000 0.000 NA   NA
 1806725 1806726 AAur_pTC20260 AAur_pTC20261     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 1806726 1806727 AAur_pTC20261 AAur_pTC20262     TRUE 0.815 16.000 0.182 NA   NA
 1806727 1806728 AAur_pTC20262 AAur_pTC20263     FALSE 0.420 21.000 0.000 1.000   NA
 1806728 1806729 AAur_pTC20263 AAur_pTC20264     FALSE 0.394 135.000 0.333 NA   NA
 1806729 1806730 AAur_pTC20264 AAur_pTC20265     TRUE 0.943 -13.000 0.333 NA   NA
 1806730 1806731 AAur_pTC20265 AAur_pTC20266     FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1806731 1806732 AAur_pTC20266 AAur_pTC20267     TRUE 0.926 29.000 1.000 NA   NA
 1806732 1806733 AAur_pTC20267 AAur_pTC20268     TRUE 0.953 14.000 1.000 NA   NA
 1806733 1806734 AAur_pTC20268 AAur_pTC20269     TRUE 0.880 34.000 0.667 NA   NA
 1806734 1806735 AAur_pTC20269 AAur_pTC20270     TRUE 0.841 47.000 0.667 NA   NA
 1806735 1806736 AAur_pTC20270 AAur_pTC20271     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806737 1806738 AAur_pTC20272 AAur_pTC20273     FALSE 0.004 403.000 0.000 1.000   NA
 1806740 1806466 AAur_pTC20275 AAur_pTC20001     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA