MicrobesOnline Operon Predictions for Arthrobacter aurescens TC1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1806741 1806742 AAur_0001 AAur_0002 dnaA dnaN FALSE 0.076 576.000 0.328 1.000 Y NA
 1806742 1806743 AAur_0002 AAur_0003 dnaN   FALSE 0.238 105.000 0.024 1.000 N NA
 1806743 1806744 AAur_0003 AAur_0004     TRUE 0.629 24.000 0.029 1.000 N NA
 1806744 1806745 AAur_0004 AAur_0005     TRUE 0.884 -13.000 0.099 NA   NA
 1806745 1806746 AAur_0005 AAur_0006   gyrB FALSE 0.010 338.000 0.022 NA   NA
 1806746 1806747 AAur_0006 AAur_0007 gyrB gyrA TRUE 0.915 63.000 0.306 0.002 Y NA
 1806747 1806748 AAur_0007 AAur_0008 gyrA   TRUE 0.940 -3.000 0.053 NA   NA
 1806748 1806749 AAur_0008 AAur_0009     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1806749 1806750 AAur_0009 AAur_0010     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1806750 1806751 AAur_0010 AAur_0011     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1806751 1806752 AAur_0011 AAur_0012     FALSE 0.083 113.000 0.000 NA   NA
 1806753 1806754 AAur_0013 AAur_0014     FALSE 0.187 145.000 0.078 NA   NA
 1806755 1806756 AAur_0015 AAur_0017     TRUE 0.804 22.000 0.182 1.000   NA
 1806759 1806760 AAur_0019 AAur_0020     FALSE 0.535 105.000 0.004 NA Y NA
 1806760 1806761 AAur_0020 AAur_0021     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA Y NA
 1806761 1806762 AAur_0021 AAur_0022     TRUE 0.738 78.000 0.680 1.000 N NA
 1806762 1806763 AAur_0022 AAur_0023     TRUE 0.699 15.000 0.031 1.000 N NA
 1806763 1806764 AAur_0023 AAur_0024     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1806765 1806766 AAur_0025 AAur_0026     TRUE 0.960 4.000 0.333 NA   NA
 1806766 1806767 AAur_0026 AAur_0027     TRUE 0.933 -3.000 0.040 NA   NA
 1806768 1806769 AAur_0028 AAur_0029     TRUE 0.986 11.000 0.368 0.001 Y NA
 1806769 1806770 AAur_0029 AAur_0030     TRUE 0.993 -3.000 0.574 0.004 N NA
 1806770 1806771 AAur_0030 AAur_0031     TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1806771 1806772 AAur_0031 AAur_0032     TRUE 0.974 -3.000 0.180 1.000 N NA
 1806772 1806773 AAur_0032 AAur_0033     TRUE 0.610 61.000 0.267 NA   NA
 1806773 1806774 AAur_0033 AAur_0034     TRUE 0.988 -3.000 0.629 NA   NA
 1806776 1806777 AAur_0036 AAur_0037   clcB TRUE 0.942 11.000 0.500 1.000 N NA
 1806780 1806781 AAur_0040 AAur_0041     TRUE 0.980 -3.000 0.333 NA   NA
 1806783 1806784 AAur_0043 AAur_0044 puo   FALSE 0.535 91.000 0.273 1.000 N NA
 1806784 1806785 AAur_0044 AAur_0045     TRUE 0.871 24.000 0.375 1.000 N NA
 1806791 1806792 AAur_0051 AAur_0052     FALSE 0.527 48.000 0.059 1.000   NA
 1806792 1806793 AAur_0052 AAur_0053     TRUE 0.866 7.000 0.043 1.000 N NA
 1806793 1806794 AAur_0053 AAur_0054     TRUE 0.930 8.000 0.203 1.000 N NA
 1806797 1806798 AAur_0057 AAur_0058     FALSE 0.114 107.000 0.000 1.000   NA
 1806798 1806799 AAur_0058 AAur_0059     TRUE 0.613 23.000 0.029 1.000   NA
 1806800 1806801 AAur_0060 AAur_0061     TRUE 0.789 40.000 0.286 1.000 N NA
 1806804 1806805 AAur_0063 AAur_0065     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1806805 1806806 AAur_0065 AAur_0066     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1806809 1806810 AAur_0069 AAur_0070     FALSE 0.079 143.000 0.000 1.000 N NA
 1806812 1806813 AAur_0072 AAur_0073     FALSE 0.003 382.000 0.000 NA   NA
 1806814 1806815 AAur_0074 AAur_0075     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1806815 1806816 AAur_0075 AAur_0076     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806816 1806817 AAur_0076 AAur_0077     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 1806817 1806818 AAur_0077 AAur_0078     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1806822 1806823 AAur_0082 AAur_0083     FALSE 0.002 818.000 0.000 1.000   NA
 1806823 1806824 AAur_0083 AAur_0084     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1806824 1806825 AAur_0084 AAur_0085   bglA TRUE 0.842 45.000 0.533 1.000 N NA
 1806825 1806826 AAur_0085 AAur_0086 bglA   TRUE 0.996 0.000 0.533 1.000 Y NA
 1806826 1806827 AAur_0086 AAur_0087     TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.085 Y NA
 1806827 1806828 AAur_0087 AAur_0088     TRUE 0.944 64.000 0.750 0.085 Y NA
 1806830 1806831 AAur_0090 AAur_0091 ncs2   FALSE 0.143 75.000 0.000 1.000   NA
 1806832 1806833 AAur_0092 AAur_0093     FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 1806834 1806835 AAur_0094 AAur_0095 pgm   FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000 N NA
 1806837 1806838 AAur_0097 AAur_0098     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1806838 1806839 AAur_0098 AAur_0099     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1806840 1806841 AAur_0100 AAur_0101   pheA FALSE 0.491 33.000 0.019 NA N NA
 1806845 1806846 AAur_0105 AAur_0106     FALSE 0.314 39.000 0.000 1.000   NA
 1806846 1806847 AAur_0106 AAur_0107     FALSE 0.105 79.000 0.000 NA   NA
 1806851 1806852 AAur_0111 AAur_0112     TRUE 0.984 -3.000 0.364 1.000 N NA
 1806852 1806853 AAur_0112 AAur_0113     TRUE 0.977 -3.000 0.244 1.000   NA
 1806853 1806854 AAur_0113 AAur_0114     TRUE 0.980 -3.000 0.111 0.020   NA
 1806854 1806855 AAur_0114 AAur_0115   gmhA FALSE 0.380 57.000 0.022 1.000 N NA
 1806855 1806856 AAur_0115 AAur_0116 gmhA rfaE TRUE 0.977 -3.000 0.065 0.030 N NA
 1806856 1806857 AAur_0116 AAur_0118 rfaE   TRUE 0.759 32.000 0.196 1.000   NA
 1806859 1806860 AAur_0119 AAur_0120     TRUE 0.911 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1806862 1806863 AAur_0122 AAur_0123     TRUE 0.973 -3.000 0.212 NA   NA
 1806863 1806864 AAur_0123 AAur_0124     TRUE 0.949 -3.000 0.071 NA   NA
 1806865 1806866 AAur_0125 AAur_0126     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1806866 1806867 AAur_0126 AAur_0127     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1806867 1806868 AAur_0127 AAur_0128     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1806868 1806869 AAur_0128 AAur_0129     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806869 1806870 AAur_0129 AAur_0130   ppa FALSE 0.017 200.000 0.000 NA   NA
 1806871 1806872 AAur_0131 AAur_0132 dacB   TRUE 0.717 61.000 0.500 NA   NA
 1806872 1806873 AAur_0132 AAur_0133     FALSE 0.260 93.000 0.050 NA   NA
 1806873 1806874 AAur_0133 AAur_0134   hpt TRUE 0.831 32.000 0.137 0.036 N NA
 1806878 1806879 AAur_0138 AAur_0139   folE TRUE 0.913 10.000 0.212 1.000 N NA
 1806879 1806880 AAur_0139 AAur_0140 folE folP TRUE 0.991 6.000 0.609 1.000 Y NA
 1806880 1806881 AAur_0140 AAur_0141 folP folB TRUE 0.975 13.000 0.471 1.000 Y NA
 1806881 1806882 AAur_0141 AAur_0142 folB folK TRUE 0.990 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 1806882 1806883 AAur_0142 AAur_0143 folK   TRUE 0.952 -3.000 0.081 NA   NA
 1806883 1806884 AAur_0143 AAur_0144     TRUE 0.896 -19.000 0.163 NA   NA
 1806884 1806885 AAur_0144 AAur_0145     TRUE 0.987 -3.000 0.577 NA   NA
 1806885 1806886 AAur_0145 AAur_0146     TRUE 0.890 -7.000 0.062 NA   NA
 1806886 1806887 AAur_0146 AAur_0147   panC TRUE 0.889 6.000 0.067 1.000   NA
 1806887 1806888 AAur_0147 AAur_0148 panC lmrB FALSE 0.161 106.000 0.002 1.000   NA
 1806890 1806891 AAur_0150 AAur_0151 rrsA rrlA FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 1806891 1806892 AAur_0151 AAur_0152 rrlA rrfA FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1806893 1806894 AAur_0153 AAur_0154     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1806895 1806896 AAur_0155 AAur_0156 rrsB rrlB FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 1806896 1806897 AAur_0156 AAur_0157 rrlB rrfB FALSE 0.050 144.000 0.000 NA   NA
 1806899 1806900 AAur_0159 AAur_0160     TRUE 0.980 -3.000 0.286 1.000   NA
 1806901 1806902 AAur_0161 AAur_0162     TRUE 0.865 64.000 0.750 0.004   NA
 1806902 1806903 AAur_0162 AAur_0163     TRUE 0.944 10.000 0.500 NA   NA
 1806904 1806905 AAur_0164 AAur_0165 lysS   TRUE 0.909 3.000 0.055 NA   NA
 1806905 1806906 AAur_0165 AAur_0166     FALSE 0.243 132.000 0.100 NA   NA
 1806906 1806907 AAur_0166 AAur_0167     FALSE 0.008 353.000 0.010 NA   NA
 1806907 1806908 AAur_0167 AAur_0168     FALSE 0.154 80.000 0.000 1.000 N NA
 1806908 1806909 AAur_0168 AAur_0169     FALSE 0.174 70.000 0.000 1.000 N NA
 1806909 1806910 AAur_0169 AAur_0170     FALSE 0.275 176.000 0.014 1.000 Y NA
 1806910 1806911 AAur_0170 AAur_0171   mcrA FALSE 0.043 171.000 0.000 1.000 N NA
 1806911 1806912 AAur_0171 AAur_0172 mcrA   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1806912 1806913 AAur_0172 AAur_0173   dhaK FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1806913 1806914 AAur_0173 AAur_0174 dhaK dhaK2 TRUE 0.994 3.000 0.242 0.002 Y NA
 1806914 1806915 AAur_0174 AAur_0175 dhaK2   TRUE 0.985 -3.000 0.442 1.000   NA
 1806915 1806916 AAur_0175 AAur_0176     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1806916 1806917 AAur_0176 AAur_0177     FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1806917 1806918 AAur_0177 AAur_0178     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1806920 1806921 AAur_0180 AAur_0181     FALSE 0.031 164.000 0.000 NA   NA
 1806922 1806923 AAur_0182 AAur_0183     FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 1806925 1806926 AAur_0185 AAur_0186   atzF FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 1806926 1806927 AAur_0186 AAur_0187 atzF uca TRUE 0.966 -3.000 0.107 1.000 N NA
 1806927 1806928 AAur_0187 AAur_0188 uca   TRUE 0.991 -3.000 0.835 NA   NA
 1806928 1806929 AAur_0188 AAur_0189     TRUE 0.992 -3.000 0.931 NA   NA
 1806929 1806930 AAur_0189 AAur_0190     FALSE 0.523 54.000 0.108 NA   NA
 1806932 1806933 AAur_0191 AAur_0193   radA FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1806933 1806934 AAur_0193 AAur_0194 radA   FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1806935 1806936 AAur_0195 AAur_0196 pstS pstC TRUE 0.600 210.000 0.529 0.002 Y NA
 1806936 1806937 AAur_0196 AAur_0197 pstC pstA TRUE 0.995 1.000 0.172 0.002 Y NA
 1806937 1806938 AAur_0197 AAur_0198 pstA pstB TRUE 0.912 69.000 0.373 0.002 Y NA
 1806939 1806940 AAur_0199 AAur_0200     TRUE 0.961 2.000 0.184 NA   NA
 1806943 1806944 AAur_0203 AAur_0205   abfA FALSE 0.012 224.000 0.000 NA   NA
 1806945 1806946 AAur_0204 AAur_0206     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1806946 1806947 AAur_0206 AAur_0207     TRUE 0.949 11.000 0.667 NA   NA
 1806947 1806948 AAur_0207 AAur_0208     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 1806948 1806949 AAur_0208 AAur_0209     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1806949 1806950 AAur_0209 AAur_0210     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1806951 1806952 AAur_0211 AAur_0212     FALSE 0.304 35.000 0.000 NA N NA
 1806954 1806955 AAur_0214 AAur_0215 ureA ureB TRUE 0.990 9.000 0.356 0.001 Y NA
 1806955 1806956 AAur_0215 AAur_0216 ureB ureC TRUE 0.994 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 1806956 1806957 AAur_0216 AAur_0217 ureC ureE TRUE 0.941 9.000 0.087 0.001 N NA
 1806957 1806958 AAur_0217 AAur_0218 ureE ureF TRUE 0.601 199.000 0.460 0.002 Y NA
 1806958 1806959 AAur_0218 AAur_0219 ureF ureG TRUE 0.978 22.000 0.439 0.002 Y NA
 1806959 1806960 AAur_0219 AAur_0220 ureG ureD TRUE 0.706 162.000 0.337 0.002 Y NA
 1806960 1806961 AAur_0220 AAur_0222 ureD   TRUE 0.937 0.000 0.030 1.000 N NA
 1806965 1806966 AAur_0225 AAur_0226     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1806967 1806968 AAur_0227 AAur_0228     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1806968 1806969 AAur_0228 AAur_0229     FALSE 0.359 64.000 0.041 1.000   NA
 1806969 1806970 AAur_0229 AAur_0230     FALSE 0.097 186.000 0.061 1.000 N NA
 1806970 1806971 AAur_0230 AAur_0231     TRUE 0.892 25.000 0.300 0.067   NA
 1806973 1806974 AAur_0233 AAur_0234     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1806976 1806977 AAur_0236 AAur_0237     TRUE 0.986 2.000 0.000 0.001 Y NA
 1806977 1806978 AAur_0237 AAur_0238     TRUE 0.943 51.000 0.667 1.000 Y NA
 1806978 1806979 AAur_0238 AAur_0239     TRUE 0.994 10.000 1.000 0.084 Y NA
 1806979 1806980 AAur_0239 AAur_0240     FALSE 0.269 34.000 0.000 NA   NA
 1806981 1806982 AAur_0241 AAur_0242     TRUE 0.925 6.000 0.182 NA   NA
 1806982 1806983 AAur_0242 AAur_0243     TRUE 0.974 -3.000 0.182 1.000 N NA
 1806984 1806985 AAur_0244 AAur_0245     TRUE 0.951 -3.000 0.076 NA   NA
 1806985 1806986 AAur_0245 AAur_0246     TRUE 0.888 8.000 0.118 NA   NA
 1806986 1806987 AAur_0246 AAur_0247     TRUE 0.624 25.000 0.000 0.067   NA
 1806987 1806988 AAur_0247 AAur_0248     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1806988 1806989 AAur_0248 AAur_0249     TRUE 0.726 45.000 0.240 NA N NA
 1806989 1806990 AAur_0249 AAur_0250     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1806992 1806993 AAur_0252 AAur_0253     FALSE 0.162 75.000 0.000 1.000 N NA
 1806994 1806995 AAur_0254 AAur_0255     TRUE 0.813 41.000 0.389 1.000   NA
 1806995 1806996 AAur_0255 AAur_0256     FALSE 0.201 184.000 0.261 1.000 N NA
 1806996 1806997 AAur_0256 AAur_0257     TRUE 0.991 0.000 0.130 1.000 Y NA
 1806997 1806998 AAur_0257 AAur_0259     FALSE 0.336 52.000 0.017 NA   NA
 1807000 1807001 AAur_0260 AAur_0261     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807003 1807004 AAur_0263 AAur_0264     FALSE 0.030 185.000 0.000 1.000   NA
 1807006 1807007 AAur_0266 AAur_0267     TRUE 0.990 -3.000 0.667 1.000 N NA
 1807007 1807008 AAur_0267 AAur_0268     TRUE 0.979 -3.000 0.286 NA N NA
 1807008 1807009 AAur_0268 AAur_0269     TRUE 0.987 -3.000 0.542 NA N NA
 1807011 1807012 AAur_0271 AAur_0272     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1807014 1807015 AAur_0274 AAur_0275     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807016 1807017 AAur_0276 AAur_0277     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807017 1807018 AAur_0277 AAur_0278     TRUE 0.820 8.000 0.028 1.000   NA
 1807020 1807021 AAur_0280 AAur_0281 proP   FALSE 0.010 288.000 0.000 1.000 N NA
 1807025 1807026 AAur_0285 AAur_0286     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1807026 1807027 AAur_0286 AAur_0287     TRUE 0.828 -66.000 0.091 NA   NA
 1807027 1807028 AAur_0287 AAur_0288     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 1807029 1807030 AAur_0289 AAur_0290     FALSE 0.311 45.000 0.000 1.000 N NA
 1807030 1807031 AAur_0290 AAur_0291     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 1807031 1807032 AAur_0291 AAur_0292     TRUE 0.950 7.000 0.378 NA   NA
 1807033 1807034 AAur_0293 AAur_0294     TRUE 0.803 75.000 0.055 0.003 Y NA
 1807034 1807035 AAur_0294 AAur_0295   fruK TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1807035 1807036 AAur_0295 AAur_0296 fruK   TRUE 0.995 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 1807036 1807037 AAur_0296 AAur_0297     FALSE 0.003 467.000 0.000 NA   NA
 1807037 1807038 AAur_0297 AAur_0298     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1807039 1807040 AAur_0299 AAur_0300     FALSE 0.002 703.000 0.000 NA   NA
 1807041 1807042 AAur_0301 AAur_0302     TRUE 0.844 20.000 0.261 NA N NA
 1807043 1807044 AAur_0303 AAur_0304     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 1807044 1807045 AAur_0304 AAur_0305     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1807045 1807046 AAur_0305 AAur_0306     FALSE 0.274 32.000 0.000 NA   NA
 1807047 1807048 AAur_0307 AAur_0308     FALSE 0.017 198.000 0.000 NA   NA
 1807048 1807049 AAur_0308 AAur_0309     FALSE 0.097 89.000 0.000 NA   NA
 1807050 1807051 AAur_0310 AAur_0311     FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 1807051 1807052 AAur_0311 AAur_0312     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1807053 1807054 AAur_0313 AAur_0314     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 1807056 1807057 AAur_0315 AAur_0317     FALSE 0.007 285.000 0.000 NA   NA
 1807057 1807058 AAur_0317 AAur_0318     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807058 1807059 AAur_0318 AAur_0319   crtB TRUE 0.951 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1807059 1807060 AAur_0319 AAur_0320 crtB   TRUE 0.931 -3.000 0.018 1.000 N NA
 1807060 1807061 AAur_0320 AAur_0321   idi TRUE 0.973 -3.000 0.029 0.002 N NA
 1807064 1807065 AAur_0324 AAur_0325     FALSE 0.080 116.000 0.000 NA   NA
 1807065 1807066 AAur_0325 AAur_0327     TRUE 0.955 -91.000 0.750 NA   NA
 1807067 1807068 AAur_0326 AAur_0328     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1807068 1807069 AAur_0328 AAur_0329     FALSE 0.149 72.000 0.000 1.000   NA
 1807069 1807070 AAur_0329 AAur_0330     TRUE 0.948 0.000 0.059 1.000   NA
 1807070 1807071 AAur_0330 AAur_0331   gtdA TRUE 0.991 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 1807071 1807072 AAur_0331 AAur_0332 gtdA   FALSE 0.398 95.000 0.118 1.000 N NA
 1807073 1807074 AAur_0333 AAur_0334     TRUE 0.958 -7.000 0.273 1.000 N NA
 1807076 1807077 AAur_0336 AAur_0337     TRUE 0.705 42.000 0.167 1.000   NA
 1807078 1807079 AAur_0338 AAur_0339     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 1807079 1807080 AAur_0339 AAur_0340     FALSE 0.031 190.000 0.000 1.000 N NA
 1807080 1807081 AAur_0340 AAur_0341     FALSE 0.487 -87.000 0.000 NA   NA
 1807081 1807082 AAur_0341 AAur_0342   adhT FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1807082 1807083 AAur_0342 AAur_0343 adhT   TRUE 0.562 -87.000 0.000 1.000   NA
 1807083 1807084 AAur_0343 AAur_0344     FALSE 0.102 82.000 0.000 NA   NA
 1807084 1807085 AAur_0344 AAur_0345     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807085 1807086 AAur_0345 AAur_0346     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1807086 1807087 AAur_0346 AAur_0347     TRUE 0.885 35.000 0.074 1.000 Y NA
 1807087 1807088 AAur_0347 AAur_0348   rbsB TRUE 0.964 13.000 0.074 0.003 Y NA
 1807088 1807089 AAur_0348 AAur_0349 rbsB fruK FALSE 0.548 86.000 0.000 1.000 Y NA
 1807089 1807090 AAur_0349 AAur_0350 fruK   TRUE 0.990 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 1807090 1807091 AAur_0350 AAur_0351     TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1807092 1807093 AAur_0352 AAur_0353     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1807099 1807100 AAur_0359 AAur_0360     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1807101 1807102 AAur_0361 AAur_0362     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1807103 1807104 AAur_0363 AAur_0364     TRUE 0.891 -16.000 0.130 NA   NA
 1807104 1807105 AAur_0364 AAur_0365     FALSE 0.412 22.000 0.000 1.000   NA
 1807106 1807107 AAur_0366 AAur_0367     FALSE 0.393 15.000 0.000 NA   NA
 1807107 1807108 AAur_0367 AAur_0368     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807109 1807110 AAur_0369 AAur_0370 glpQ   FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1807110 1807111 AAur_0370 AAur_0371     TRUE 0.927 -3.000 0.032 NA   NA
 1807111 1807112 AAur_0371 AAur_0372     TRUE 0.989 -3.000 0.675 NA   NA
 1807114 1807115 AAur_0374 AAur_0375     FALSE 0.397 41.000 0.012 NA   NA
 1807115 1807116 AAur_0375 AAur_0376     TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000   NA
 1807118 1807119 AAur_0378 AAur_0379     TRUE 0.952 10.000 0.600 NA   NA
 1807122 1807123 AAur_0381 AAur_0383     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.006 Y NA
 1807124 1807125 AAur_0384 AAur_0385     FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 1807125 1807126 AAur_0385 AAur_0386     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807126 1807127 AAur_0386 AAur_0387   fepD TRUE 0.995 1.000 0.500 NA Y NA
 1807127 1807128 AAur_0387 AAur_0388 fepD fepG TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.082 Y NA
 1807128 1807129 AAur_0388 AAur_0389 fepG fepC TRUE 0.920 24.000 0.096 1.000 Y NA
 1807131 1807132 AAur_0391 AAur_0392   bdh TRUE 0.927 5.000 0.119 1.000 N NA
 1807132 1807133 AAur_0392 AAur_0393 bdh   FALSE 0.095 123.000 0.000 1.000   NA
 1807135 1807136 AAur_0395 AAur_0396     FALSE 0.053 141.000 0.000 NA   NA
 1807138 1807139 AAur_0398 AAur_0399 hutU hutH TRUE 0.984 5.000 0.039 0.001 Y NA
 1807139 1807140 AAur_0399 AAur_0400 hutH   FALSE 0.498 20.000 0.006 NA   NA
 1807141 1807142 AAur_0401 AAur_0402     FALSE 0.088 103.000 0.000 NA   NA
 1807142 1807143 AAur_0402 AAur_0403     FALSE 0.066 127.000 0.000 NA   NA
 1807143 1807144 AAur_0403 AAur_0404     FALSE 0.020 190.000 0.000 NA   NA
 1807144 1807145 AAur_0404 AAur_0405   hutG FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1807145 1807146 AAur_0405 AAur_0406 hutG   FALSE 0.204 100.000 0.016 1.000   NA
 1807147 1807148 AAur_0407 AAur_0408     FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 1807150 1807151 AAur_0410 AAur_0411     TRUE 0.980 -58.000 0.400 1.000 Y NA
 1807152 1807153 AAur_0412 AAur_0413 czc   TRUE 0.784 11.000 0.048 1.000   NA
 1807156 1807157 AAur_0416 AAur_0417     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1807157 1807158 AAur_0417 AAur_0418     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1807161 1807162 AAur_0421 AAur_0422     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807162 1807163 AAur_0422 AAur_0423     TRUE 0.620 69.000 0.375 NA   NA
 1807163 1807164 AAur_0423 AAur_0424     FALSE 0.002 730.000 0.000 NA   NA
 1807164 1807165 AAur_0424 AAur_0425     FALSE 0.203 48.000 0.000 NA   NA
 1807165 1807166 AAur_0425 AAur_0426     FALSE 0.490 -84.000 0.000 NA   NA
 1807166 1807167 AAur_0426 AAur_0427     FALSE 0.001 1898.000 0.000 NA   NA
 1807169 1807170 AAur_0428 AAur_0430     FALSE 0.012 223.000 0.000 NA   NA
 1807170 1807171 AAur_0430 AAur_0431     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1807171 1807172 AAur_0431 AAur_0432     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807172 1807173 AAur_0432 AAur_0433     FALSE 0.271 33.000 0.000 NA   NA
 1807173 1807174 AAur_0433 AAur_0434     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 1807174 1807175 AAur_0434 AAur_0435     TRUE 0.986 0.000 0.571 NA   NA
 1807175 1807176 AAur_0435 AAur_0436     TRUE 0.980 6.000 0.182 NA Y NA
 1807176 1807177 AAur_0436 AAur_0437     FALSE 0.004 1437.000 0.000 0.086   NA
 1807177 1807178 AAur_0437 AAur_0438     TRUE 0.957 0.000 0.111 NA   NA
 1807178 1807179 AAur_0438 AAur_0439     FALSE 0.002 566.000 0.000 NA   NA
 1807180 1807181 AAur_0440 AAur_0441     FALSE 0.117 86.000 0.000 NA N NA
 1807181 1807182 AAur_0441 AAur_0442     TRUE 0.794 75.000 1.000 NA N NA
 1807182 1807183 AAur_0442 AAur_0443     FALSE 0.021 217.000 0.000 1.000 N NA
 1807183 1807184 AAur_0443 AAur_0444     TRUE 0.988 12.000 0.688 0.081 Y NA
 1807184 1807185 AAur_0444 AAur_0445     TRUE 0.996 -6.000 0.688 0.081 Y NA
 1807186 1807187 AAur_0446 AAur_0447     TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1807188 1807189 AAur_0448 AAur_0449     TRUE 0.984 3.000 0.750 NA   NA
 1807189 1807190 AAur_0449 AAur_0450     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1807190 1807191 AAur_0450 AAur_0451     TRUE 0.734 81.000 0.800 NA   NA
 1807191 1807192 AAur_0451 AAur_0452     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807192 1807193 AAur_0452 AAur_0453     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1807193 1807194 AAur_0453 AAur_0454     FALSE 0.501 124.000 0.429 NA   NA
 1807194 1807195 AAur_0454 AAur_0455     TRUE 0.823 53.000 0.714 NA   NA
 1807195 1807196 AAur_0455 AAur_0456     TRUE 0.963 -13.000 0.583 NA   NA
 1807196 1807197 AAur_0456 AAur_0457     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1807199 1807200 AAur_0459 AAur_0460     TRUE 0.909 97.000 0.670 0.081 Y NA
 1807200 1807201 AAur_0460 AAur_0461     TRUE 0.998 -3.000 0.693 0.081 Y NA
 1807201 1807202 AAur_0461 AAur_0463   ccpA FALSE 0.239 116.000 0.032 1.000 N NA
 1807203 1807204 AAur_0462 AAur_0464   xth FALSE 0.503 33.000 0.029 NA   NA
 1807204 1807205 AAur_0464 AAur_0465 xth   FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 1807205 1807206 AAur_0465 AAur_0466     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807206 1807207 AAur_0466 AAur_0467     TRUE 0.998 -3.000 0.625 0.011 Y NA
 1807208 1807209 AAur_0468 AAur_0469     TRUE 0.947 3.000 0.154 NA   NA
 1807210 1807211 AAur_0470 AAur_0471     TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 1807211 1807212 AAur_0471 AAur_0472     TRUE 0.989 20.000 0.889 0.001 Y NA
 1807216 1807217 AAur_0476 AAur_0477     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807217 1807218 AAur_0477 AAur_0478     FALSE 0.004 460.000 0.000 1.000 N NA
 1807218 1807219 AAur_0478 AAur_0479     FALSE 0.131 105.000 0.000 1.000 N NA
 1807219 1807220 AAur_0479 AAur_0480   fdhA FALSE 0.104 125.000 0.000 1.000 N NA
 1807220 1807221 AAur_0480 AAur_0481 fdhA   FALSE 0.069 148.000 0.000 1.000 N NA
 1807221 1807222 AAur_0481 AAur_0482   folD TRUE 0.594 11.000 0.000 1.000 N NA
 1807222 1807223 AAur_0482 AAur_0483 folD   TRUE 0.969 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1807223 1807224 AAur_0483 AAur_0484     TRUE 0.656 136.000 0.200 1.000 Y NA
 1807224 1807225 AAur_0484 AAur_0485   purU FALSE 0.493 59.000 0.080 1.000 N NA
 1807226 1807227 AAur_0486 AAur_0487     FALSE 0.049 162.000 0.000 1.000 N NA
 1807227 1807228 AAur_0487 AAur_0488     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1807230 1807231 AAur_0490 AAur_0491     TRUE 0.865 75.000 1.000 0.052 N NA
 1807233 1807234 AAur_0493 AAur_0494   hps TRUE 0.898 53.000 0.750 0.028 N NA
 1807236 1807237 AAur_0496 AAur_0497     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1807237 1807238 AAur_0497 AAur_0498     FALSE 0.030 166.000 0.000 NA   NA
 1807238 1807239 AAur_0498 AAur_0499   mmsA FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 1807239 1807240 AAur_0499 AAur_0500 mmsA   TRUE 0.942 0.000 0.037 1.000 N NA
 1807240 1807241 AAur_0500 AAur_0501   mmsB TRUE 0.950 12.000 0.096 1.000 Y NA
 1807241 1807242 AAur_0501 AAur_0502 mmsB   TRUE 0.904 46.000 0.222 1.000 Y NA
 1807242 1807243 AAur_0502 AAur_0503     FALSE 0.029 169.000 0.000 NA   NA
 1807243 1807244 AAur_0503 AAur_0505     FALSE 0.002 698.000 0.000 NA   NA
 1807246 1807247 AAur_0506 AAur_0507     FALSE 0.018 218.000 0.000 1.000   NA
 1807248 1807249 AAur_0508 AAur_0509     TRUE 0.661 43.000 0.109 1.000 N NA
 1807251 1807252 AAur_0511 AAur_0512     TRUE 0.784 146.000 0.667 1.000 Y NA
 1807252 1807253 AAur_0512 AAur_0513   betB TRUE 0.992 1.000 1.000 1.000 N NA
 1807253 1807254 AAur_0513 AAur_0514 betB   FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807256 1807257 AAur_0516 AAur_0517 betI   TRUE 0.825 45.000 0.000 0.086 Y NA
 1807257 1807258 AAur_0517 AAur_0518     FALSE 0.540 78.000 0.000 NA Y NA
 1807258 1807259 AAur_0518 AAur_0519   nadE FALSE 0.034 169.000 0.000 NA N NA
 1807259 1807260 AAur_0519 AAur_0520 nadE   FALSE 0.271 68.000 0.010 1.000 N NA
 1807261 1807262 AAur_0521 AAur_0522     TRUE 0.826 91.000 0.200 0.081 Y NA
 1807262 1807263 AAur_0522 AAur_0523     TRUE 0.930 87.000 0.818 0.081 Y NA
 1807263 1807264 AAur_0523 AAur_0524     TRUE 0.978 3.000 0.040 NA Y NA
 1807264 1807265 AAur_0524 AAur_0525     TRUE 0.972 -3.000 0.200 NA   NA
 1807265 1807266 AAur_0525 AAur_0526     TRUE 0.958 -3.000 0.103 NA   NA
 1807266 1807267 AAur_0526 AAur_0527   uxaC TRUE 0.971 4.000 0.033 NA Y NA
 1807267 1807268 AAur_0527 AAur_0528 uxaC   TRUE 0.991 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 1807268 1807269 AAur_0528 AAur_0529   rspA TRUE 0.889 25.000 0.294 0.093 N NA
 1807269 1807270 AAur_0529 AAur_0530 rspA aroK TRUE 0.734 29.000 0.118 1.000 N NA
 1807270 1807271 AAur_0530 AAur_0531 aroK   FALSE 0.045 318.000 0.000 NA Y NA
 1807271 1807272 AAur_0531 AAur_0532     TRUE 0.658 127.000 0.176 NA Y NA
 1807272 1807273 AAur_0532 AAur_0533     TRUE 0.987 -108.000 0.800 1.000 Y NA
 1807273 1807274 AAur_0533 AAur_0534     FALSE 0.152 82.000 0.000 1.000 N NA
 1807274 1807275 AAur_0534 AAur_0535   pyrE TRUE 0.732 6.000 0.000 1.000 N NA
 1807275 1807276 AAur_0535 AAur_0536 pyrE   FALSE 0.257 48.000 0.000 1.000   NA
 1807276 1807277 AAur_0536 AAur_0537     FALSE 0.062 147.000 0.000 1.000   NA
 1807277 1807278 AAur_0537 AAur_0538     TRUE 0.978 -3.000 0.292 NA   NA
 1807278 1807279 AAur_0538 AAur_0539     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1807279 1807280 AAur_0539 AAur_0540     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1807280 1807281 AAur_0540 AAur_0541     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1807281 1807282 AAur_0541 AAur_0542     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1807282 1807283 AAur_0542 AAur_0543     FALSE 0.079 117.000 0.000 NA   NA
 1807283 1807284 AAur_0543 AAur_0544     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1807284 1807285 AAur_0544 AAur_0545     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807285 1807286 AAur_0545 AAur_0546     FALSE 0.030 165.000 0.000 NA   NA
 1807287 1807288 AAur_0547 AAur_0548     FALSE 0.002 537.000 0.000 NA   NA
 1807288 1807289 AAur_0548 AAur_0549     TRUE 0.827 49.000 0.000 0.011 Y NA
 1807289 1807290 AAur_0549 AAur_0550     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1807290 1807291 AAur_0550 AAur_0551     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1807292 1807293 AAur_0552 AAur_0553     FALSE 0.314 53.000 0.014 NA   NA
 1807295 1807296 AAur_0555 AAur_0556 fbaA   TRUE 0.933 0.000 0.047 NA   NA
 1807297 1807298 AAur_0557 AAur_0558 fepC fepG TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1807298 1807299 AAur_0558 AAur_0559 fepG fepD TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.081 Y NA
 1807304 1807305 AAur_0564 AAur_0565     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807305 1807306 AAur_0565 AAur_0566   gnl TRUE 0.911 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1807306 1807307 AAur_0566 AAur_0567 gnl   FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807312 1807313 AAur_0572 AAur_0573 aspA   FALSE 0.503 38.000 0.023 1.000   NA
 1807313 1807314 AAur_0573 AAur_0574     TRUE 0.903 -10.000 0.116 NA   NA
 1807314 1807315 AAur_0574 AAur_0575     TRUE 0.948 -3.000 0.070 NA   NA
 1807316 1807317 AAur_0576 AAur_0577     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000 N NA
 1807318 1807319 AAur_0578 AAur_0579     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1807320 1807321 AAur_0580 AAur_0581     FALSE 0.341 22.000 0.000 NA   NA
 1807321 1807322 AAur_0581 AAur_0582     FALSE 0.021 218.000 0.000 1.000 N NA
 1807323 1807324 AAur_0583 AAur_0584     FALSE 0.020 211.000 0.000 1.000   NA
 1807325 1807326 AAur_0585 AAur_0586     FALSE 0.143 90.000 0.000 1.000 N NA
 1807328 1807329 AAur_0588 AAur_0589     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1807330 1807331 AAur_0590 AAur_0591     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 1807331 1807332 AAur_0591 AAur_0592     FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1807333 1807334 AAur_0593 AAur_0594     TRUE 0.948 34.000 0.231 0.079 Y NA
 1807334 1807335 AAur_0594 AAur_0595     TRUE 0.994 -3.000 0.263 1.000 Y NA
 1807335 1807336 AAur_0595 AAur_0596     TRUE 0.961 0.000 0.105 1.000   NA
 1807336 1807337 AAur_0596 AAur_0597     TRUE 0.677 65.000 0.200 0.063   NA
 1807338 1807339 AAur_0598 AAur_0599     FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 1807342 1807343 AAur_0602 AAur_0603     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807343 1807344 AAur_0603 AAur_0604     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807344 1807345 AAur_0604 AAur_0605     FALSE 0.280 45.000 0.000 1.000   NA
 1807345 1807346 AAur_0605 AAur_0606     FALSE 0.009 287.000 0.000 1.000   NA
 1807346 1807347 AAur_0606 AAur_0607     TRUE 0.639 96.000 0.600 NA   NA
 1807347 1807348 AAur_0607 AAur_0608     TRUE 0.571 13.000 0.006 NA   NA
 1807348 1807349 AAur_0608 AAur_0609     FALSE 0.207 64.000 0.004 NA   NA
 1807349 1807350 AAur_0609 AAur_0610     FALSE 0.530 50.000 0.087 NA   NA
 1807350 1807351 AAur_0610 AAur_0611     FALSE 0.089 97.000 0.000 NA   NA
 1807351 1807352 AAur_0611 AAur_0612     FALSE 0.033 178.000 0.000 1.000   NA
 1807352 1807353 AAur_0612 AAur_0613     TRUE 0.985 6.000 0.122 0.079 Y NA
 1807353 1807354 AAur_0613 AAur_0614     TRUE 0.997 0.000 0.415 0.079 Y NA
 1807354 1807355 AAur_0614 AAur_0615     FALSE 0.096 122.000 0.000 1.000   NA
 1807356 1807357 AAur_0616 AAur_0617     TRUE 0.958 2.000 0.167 NA   NA
 1807357 1807358 AAur_0617 AAur_0618     TRUE 0.968 3.000 0.333 NA   NA
 1807358 1807359 AAur_0618 AAur_0619     TRUE 0.972 0.000 0.188 1.000   NA
 1807359 1807360 AAur_0619 AAur_0620     TRUE 0.652 38.000 0.091 1.000   NA
 1807360 1807361 AAur_0620 AAur_0621     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807363 1807364 AAur_0622 AAur_0624     FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1807364 1807365 AAur_0624 AAur_0625     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1807366 1807367 AAur_0626 AAur_0627     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807367 1807368 AAur_0627 AAur_0628     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807369 1807370 AAur_0629 AAur_0630 purL purQ TRUE 0.997 -3.000 0.346 0.001 Y NA
 1807370 1807371 AAur_0630 AAur_0631 purQ purS TRUE 0.998 2.000 0.656 0.001 Y NA
 1807373 1807374 AAur_0633 AAur_0634     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1807374 1807375 AAur_0634 AAur_0635     FALSE 0.102 126.000 0.000 1.000 N NA
 1807376 1807377 AAur_0636 AAur_0637     FALSE 0.006 317.000 0.000 1.000   NA
 1807378 1807379 AAur_0638 AAur_0639     TRUE 0.582 30.000 0.051 NA   NA
 1807379 1807380 AAur_0639 AAur_0640     TRUE 0.841 -13.000 0.051 NA   NA
 1807380 1807381 AAur_0640 AAur_0641     FALSE 0.284 114.000 0.061 1.000   NA
 1807384 1807385 AAur_0644 AAur_0645     TRUE 0.987 -7.000 0.138 0.093 Y NA
 1807385 1807386 AAur_0645 AAur_0646   opuCB TRUE 0.994 -3.000 0.115 0.093 Y NA
 1807386 1807387 AAur_0646 AAur_0647 opuCB   TRUE 0.865 29.000 0.229 0.079 N NA
 1807387 1807388 AAur_0647 AAur_0648     TRUE 0.618 -27.000 0.000 1.000   NA
 1807388 1807389 AAur_0648 AAur_0649     TRUE 0.898 6.000 0.080 1.000   NA
 1807389 1807390 AAur_0649 AAur_0650     TRUE 0.906 11.000 0.120 0.091 N NA
 1807390 1807391 AAur_0650 AAur_0651   mmsB TRUE 0.778 16.000 0.087 1.000 N NA
 1807391 1807392 AAur_0651 AAur_0652 mmsB   TRUE 0.908 6.000 0.087 1.000 N NA
 1807392 1807393 AAur_0652 AAur_0653     TRUE 0.984 1.000 0.000 0.091 Y NA
 1807393 1807394 AAur_0653 AAur_0654     TRUE 0.930 0.000 0.000 0.091   NA
 1807394 1807395 AAur_0654 AAur_0655     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 1807395 1807396 AAur_0655 AAur_0656     FALSE 0.028 171.000 0.000 NA   NA
 1807397 1807398 AAur_0657 AAur_0658     FALSE 0.036 156.000 0.000 NA   NA
 1807398 1807399 AAur_0658 AAur_0659     TRUE 0.994 0.000 0.286 1.000 Y NA
 1807401 1807402 AAur_0661 AAur_0662 ask   FALSE 0.033 161.000 0.000 NA   NA
 1807404 1807405 AAur_0663 AAur_0665   recR FALSE 0.356 37.000 0.000 1.000 N NA
 1807405 1807406 AAur_0665 AAur_0666 recR dnaX TRUE 0.856 34.000 0.028 1.000 Y NA
 1807406 1807407 AAur_0666 AAur_0667 dnaX   FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 1807408 1807409 AAur_0668 AAur_0670     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 1807412 1807413 AAur_0672 AAur_0673     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807414 1807415 AAur_0674 AAur_0675     FALSE 0.049 156.000 0.000 1.000   NA
 1807415 1807416 AAur_0675 AAur_0676     FALSE 0.226 78.000 0.012 1.000   NA
 1807416 1807417 AAur_0676 AAur_0678     FALSE 0.119 143.000 0.012 1.000   NA
 1807419 1807420 AAur_0679 AAur_0680     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 1807420 1807421 AAur_0680 AAur_0681     FALSE 0.032 162.000 0.000 NA   NA
 1807421 1807422 AAur_0681 AAur_0682     TRUE 0.694 23.000 0.082 NA   NA
 1807424 1807425 AAur_0684 AAur_0685     FALSE 0.279 186.000 0.500 1.000 N NA
 1807425 1807426 AAur_0685 AAur_0686     TRUE 0.980 37.000 1.000 0.078 Y NA
 1807426 1807427 AAur_0686 AAur_0687     TRUE 0.994 3.000 0.333 0.078 Y NA
 1807427 1807428 AAur_0687 AAur_0688   abfA TRUE 0.935 50.000 0.333 0.078 Y NA
 1807430 1807431 AAur_0690 AAur_0691     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 N NA
 1807432 1807433 AAur_0692 AAur_0693     TRUE 0.702 6.000 0.000 1.000   NA
 1807433 1807434 AAur_0693 AAur_0694     TRUE 0.993 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 1807434 1807435 AAur_0694 AAur_0695     TRUE 0.762 48.000 0.333 1.000 N NA
 1807435 1807436 AAur_0695 AAur_0696     FALSE 0.508 70.000 0.200 NA   NA
 1807436 1807437 AAur_0696 AAur_0697     TRUE 0.848 11.000 0.133 NA   NA
 1807437 1807438 AAur_0697 AAur_0698     TRUE 0.880 93.000 0.450 0.078 Y NA
 1807438 1807439 AAur_0698 AAur_0699     TRUE 0.909 73.000 0.500 0.078 Y NA
 1807441 1807442 AAur_0701 AAur_0702     TRUE 0.797 33.000 0.278 1.000   NA
 1807442 1807443 AAur_0702 AAur_0703     TRUE 0.992 0.000 0.944 NA   NA
 1807443 1807444 AAur_0703 AAur_0704     TRUE 0.990 -3.000 0.762 NA   NA
 1807445 1807446 AAur_0705 AAur_0706     TRUE 0.980 30.000 0.826 0.098 Y NA
 1807447 1807448 AAur_0707 AAur_0708     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 1807448 1807449 AAur_0708 AAur_0709     FALSE 0.182 52.000 0.000 NA   NA
 1807450 1807451 AAur_0710 AAur_0711     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807452 1807453 AAur_0712 AAur_0713     TRUE 0.956 4.000 0.250 1.000   NA
 1807453 1807454 AAur_0713 AAur_0714     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1807454 1807455 AAur_0714 AAur_0715     FALSE 0.448 12.000 0.000 NA   NA
 1807455 1807456 AAur_0715 AAur_0716     TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 1807456 1807457 AAur_0716 AAur_0717     TRUE 0.938 18.000 0.500 0.062   NA
 1807457 1807458 AAur_0717 AAur_0718     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 1807459 1807460 AAur_0719 AAur_0720     FALSE 0.443 86.000 0.167 NA N NA
 1807461 1807462 AAur_0721 AAur_0722 aceB aceA TRUE 0.577 114.000 0.020 1.000 Y NA
 1807463 1807464 AAur_0723 AAur_0725     FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000   NA
 1807467 1807468 AAur_0727 AAur_0728     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807468 1807469 AAur_0728 AAur_0729     TRUE 0.965 -91.000 1.000 NA   NA
 1807469 1807470 AAur_0729 AAur_0730     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 1807470 1807471 AAur_0730 AAur_0731     FALSE 0.034 186.000 0.000 1.000 N NA
 1807473 1807474 AAur_0733 AAur_0734     TRUE 0.959 -3.000 0.086 1.000   NA
 1807476 1807477 AAur_0736 AAur_0737 tgt   FALSE 0.292 48.000 0.003 NA   NA
 1807477 1807478 AAur_0737 AAur_0738     TRUE 0.717 61.000 0.500 NA   NA
 1807478 1807479 AAur_0738 AAur_0739     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1807479 1807480 AAur_0739 AAur_0740     FALSE 0.105 78.000 0.000 NA   NA
 1807480 1807481 AAur_0740 AAur_0741     TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA N NA
 1807481 1807482 AAur_0741 AAur_0742     TRUE 0.977 -3.000 0.250 NA N NA
 1807482 1807483 AAur_0742 AAur_0743     FALSE 0.036 156.000 0.000 NA   NA
 1807484 1807485 AAur_0744 AAur_0745     TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1807485 1807486 AAur_0745 AAur_0746     FALSE 0.504 15.000 0.000 1.000 N NA
 1807486 1807487 AAur_0746 AAur_0747     TRUE 0.638 9.000 0.000 1.000   NA
 1807487 1807488 AAur_0747 AAur_0749     TRUE 0.901 9.000 0.143 1.000   NA
 1807491 1807492 AAur_0751 AAur_0752 sufC sfuB TRUE 0.811 48.000 0.275 0.078 N NA
 1807492 1807493 AAur_0752 AAur_0753 sfuB sufA TRUE 0.996 5.000 0.824 0.078 Y NA
 1807493 1807494 AAur_0753 AAur_0754 sufA   FALSE 0.115 175.000 0.062 1.000 N NA
 1807495 1807496 AAur_0755 AAur_0756     TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 1807497 1807498 AAur_0757 AAur_0758     FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 1807499 1807500 AAur_0759 AAur_0760     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807500 1807501 AAur_0760 AAur_0761     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1807501 1807502 AAur_0761 AAur_0762     TRUE 0.843 -3.000 0.000 NA N NA
 1807502 1807503 AAur_0762 AAur_0763     TRUE 0.806 51.000 0.600 NA   NA
 1807503 1807504 AAur_0763 AAur_0764   ppc FALSE 0.012 229.000 0.000 NA   NA
 1807504 1807505 AAur_0764 AAur_0765 ppc   FALSE 0.379 106.000 0.150 NA   NA
 1807508 1807509 AAur_0768 AAur_0769     FALSE 0.107 77.000 0.000 NA   NA
 1807510 1807511 AAur_0770 AAur_0771     TRUE 0.924 -7.000 0.130 NA   NA
 1807516 1807517 AAur_0776 AAur_0777     TRUE 0.790 3.000 0.000 1.000   NA
 1807517 1807518 AAur_0777 AAur_0778     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1807520 1807521 AAur_0780 AAur_0781     TRUE 0.963 -7.000 0.352 1.000   NA
 1807521 1807522 AAur_0781 AAur_0782     FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1807522 1807523 AAur_0782 AAur_0783     TRUE 0.651 60.000 0.333 NA   NA
 1807523 1807524 AAur_0783 AAur_0784     FALSE 0.437 126.000 0.333 NA   NA
 1807524 1807525 AAur_0784 AAur_0785     FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 1807526 1807527 AAur_0786 AAur_0787     FALSE 0.067 126.000 0.000 NA   NA
 1807529 1807530 AAur_0789 AAur_0790     TRUE 0.973 4.000 0.489 1.000 N NA
 1807530 1807531 AAur_0790 AAur_0791     FALSE 0.307 186.000 0.591 1.000 N NA
 1807531 1807532 AAur_0791 AAur_0792     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807533 1807534 AAur_0793 AAur_0794     FALSE 0.405 23.000 0.000 1.000   NA
 1807535 1807536 AAur_0795 AAur_0796 upp   FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 1807536 1807537 AAur_0796 AAur_0797     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1807537 1807538 AAur_0797 AAur_0798     FALSE 0.520 60.000 0.143 NA   NA
 1807538 1807539 AAur_0798 AAur_0799     FALSE 0.232 52.000 0.000 1.000   NA
 1807540 1807541 AAur_0800 AAur_0801     FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 1807541 1807542 AAur_0801 AAur_0802     FALSE 0.014 215.000 0.000 NA   NA
 1807542 1807543 AAur_0802 AAur_0803     TRUE 0.975 22.000 0.714 1.000 Y NA
 1807544 1807545 AAur_0804 AAur_0805     FALSE 0.048 246.000 0.105 NA   NA
 1807546 1807547 AAur_0806 AAur_0807     FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 1807549 1807550 AAur_0809 AAur_0810     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000   NA
 1807551 1807552 AAur_0811 AAur_0812     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807552 1807553 AAur_0812 AAur_0813     TRUE 0.997 2.000 0.800 0.077 Y NA
 1807553 1807554 AAur_0813 AAur_0814     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.077 Y NA
 1807554 1807555 AAur_0814 AAur_0815     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807555 1807556 AAur_0815 AAur_0816     FALSE 0.162 67.000 0.000 1.000   NA
 1807557 1807558 AAur_0817 AAur_0818     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 1807558 1807559 AAur_0818 AAur_0819     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807559 1807560 AAur_0819 AAur_0820     TRUE 0.976 -3.000 0.261 NA   NA
 1807560 1807561 AAur_0820 AAur_0821     TRUE 0.606 72.000 0.375 NA   NA
 1807563 1807564 AAur_0823 AAur_0824     TRUE 0.946 23.000 0.238 1.000 Y NA
 1807564 1807565 AAur_0824 AAur_0825     TRUE 0.986 -3.000 0.424 1.000 N NA
 1807565 1807566 AAur_0825 AAur_0826     TRUE 0.944 38.000 0.421 1.000 Y NA
 1807566 1807567 AAur_0826 AAur_0827     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.003 Y NA
 1807567 1807568 AAur_0827 AAur_0828     TRUE 0.992 4.000 0.299 0.077 Y NA
 1807568 1807569 AAur_0828 AAur_0829     TRUE 0.845 102.000 0.299 0.077 Y NA
 1807573 1807574 AAur_0833 AAur_0834     FALSE 0.210 187.000 0.367 NA N NA
 1807574 1807575 AAur_0834 AAur_0835     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1807575 1807576 AAur_0835 AAur_0836   manB FALSE 0.425 13.000 0.000 NA   NA
 1807577 1807578 AAur_0837 AAur_0838     FALSE 0.298 132.000 0.035 0.077 N NA
 1807579 1807580 AAur_0839 AAur_0840     FALSE 0.038 154.000 0.000 NA   NA
 1807581 1807582 AAur_0841 AAur_0842     FALSE 0.004 325.000 0.000 NA   NA
 1807583 1807584 AAur_0843 AAur_0844     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1807584 1807585 AAur_0844 AAur_0845     FALSE 0.020 191.000 0.000 NA   NA
 1807586 1807587 AAur_0846 AAur_0847     TRUE 0.597 31.000 0.060 NA   NA
 1807587 1807588 AAur_0847 AAur_0848     FALSE 0.002 551.000 0.000 NA   NA
 1807588 1807589 AAur_0848 AAur_0849     TRUE 0.922 13.000 0.532 NA   NA
 1807589 1807590 AAur_0849 AAur_0850     FALSE 0.273 92.000 0.056 NA   NA
 1807590 1807591 AAur_0850 AAur_0851     TRUE 0.864 9.000 0.093 NA   NA
 1807591 1807592 AAur_0851 AAur_0852     FALSE 0.411 137.000 0.375 NA   NA
 1807592 1807593 AAur_0852 AAur_0854     FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000   NA
 1807595 1807596 AAur_0855 AAur_0856     TRUE 0.693 65.000 0.500 NA   NA
 1807596 1807597 AAur_0856 AAur_0857     TRUE 0.817 44.000 0.500 NA   NA
 1807597 1807598 AAur_0857 AAur_0858     FALSE 0.266 35.000 0.000 NA   NA
 1807600 1807601 AAur_0860 AAur_0861     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 1807601 1807602 AAur_0861 AAur_0862   fruK TRUE 0.711 52.000 0.000 1.000 Y NA
 1807603 1807604 AAur_0863 AAur_0864     TRUE 0.730 126.000 0.087 0.008 Y NA
 1807604 1807605 AAur_0864 AAur_0865     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1807605 1807606 AAur_0865 AAur_0866     FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1807606 1807607 AAur_0866 AAur_0867     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807607 1807608 AAur_0867 AAur_0868     FALSE 0.033 274.000 0.000 0.008 N NA
 1807608 1807609 AAur_0868 AAur_0869     FALSE 0.102 126.000 0.000 1.000 N NA
 1807610 1807611 AAur_0870 AAur_0871     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807611 1807612 AAur_0871 AAur_0872     TRUE 0.842 2.000 0.000 1.000 N NA
 1807612 1807613 AAur_0872 AAur_0873     FALSE 0.006 315.000 0.000 NA N NA
 1807613 1807614 AAur_0873 AAur_0874   rbsA TRUE 0.906 62.000 0.600 NA Y NA
 1807614 1807615 AAur_0874 AAur_0875 rbsA rbsC FALSE 0.484 117.000 0.000 1.000 Y NA
 1807618 1807619 AAur_0877 AAur_0879     TRUE 0.880 -61.000 0.182 NA   NA
 1807621 1807622 AAur_0881 AAur_0882     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 1807626 1807627 AAur_0885 AAur_0887     TRUE 0.885 9.000 0.130 NA   NA
 1807627 1807628 AAur_0887 AAur_0888   tmk TRUE 0.967 -3.000 0.037 0.096 N NA
 1807629 1807630 AAur_0889 AAur_0890 metB   TRUE 0.820 11.000 0.095 NA   NA
 1807634 1807635 AAur_0894 AAur_0895     TRUE 0.908 15.000 0.020 1.000 Y NA
 1807637 1807638 AAur_0897 AAur_0898   ispD FALSE 0.364 82.000 0.068 1.000 N NA
 1807638 1807639 AAur_0898 AAur_0899 ispD ispF TRUE 0.995 0.000 0.419 1.000 Y NA
 1807639 1807640 AAur_0899 AAur_0900 ispF   TRUE 0.774 -7.000 0.003 NA   NA
 1807640 1807641 AAur_0900 AAur_0901   cysS FALSE 0.363 36.000 0.002 NA   NA
 1807641 1807642 AAur_0901 AAur_0902 cysS   TRUE 0.723 81.000 0.088 1.000 Y NA
 1807644 1807645 AAur_0904 AAur_0905 glgX   TRUE 0.645 40.000 0.082 1.000 N NA
 1807645 1807646 AAur_0905 AAur_0906     TRUE 0.847 7.000 0.052 NA   NA
 1807648 1807649 AAur_0908 AAur_0909   treS TRUE 0.992 0.000 0.544 0.010   NA
 1807649 1807650 AAur_0909 AAur_0910 treS glgB TRUE 0.992 2.000 0.075 0.010 Y NA
 1807650 1807651 AAur_0910 AAur_0911 glgB rrsC FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 1807651 1807652 AAur_0911 AAur_0912 rrsC rrlC FALSE 0.002 618.000 0.000 NA   NA
 1807652 1807653 AAur_0912 AAur_0913 rrlC rrfC FALSE 0.050 145.000 0.000 NA   NA
 1807653 1807654 AAur_0913 AAur_0914 rrfC   FALSE 0.518 -48.000 0.000 NA   NA
 1807654 1807655 AAur_0914 AAur_0915     TRUE 0.675 35.000 0.125 NA   NA
 1807656 1807657 AAur_0916 AAur_0917     TRUE 0.870 21.000 0.333 1.000 N NA
 1807658 1807659 AAur_0918 AAur_0919 malE malF TRUE 0.884 98.000 0.750 1.000 Y NA
 1807659 1807660 AAur_0919 AAur_0920 malF malG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.077 Y NA
 1807660 1807661 AAur_0920 AAur_0921 malG   TRUE 0.979 3.000 0.031 1.000 Y NA
 1807661 1807662 AAur_0921 AAur_0922     FALSE 0.189 131.000 0.031 1.000 N NA
 1807662 1807663 AAur_0922 AAur_0923     FALSE 0.015 220.000 0.000 NA N NA
 1807663 1807664 AAur_0923 AAur_0924     FALSE 0.263 36.000 0.000 NA   NA
 1807667 1807668 AAur_0927 AAur_0928   nahA TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807668 1807669 AAur_0928 AAur_0929 nahA   FALSE 0.480 118.000 0.000 1.000 Y NA
 1807669 1807670 AAur_0929 AAur_0930   otsB FALSE 0.148 207.000 0.000 1.000 Y NA
 1807670 1807671 AAur_0930 AAur_0931 otsB otsA TRUE 0.994 -10.000 0.471 0.001 Y NA
 1807672 1807673 AAur_0932 AAur_0933     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 1807674 1807675 AAur_0934 AAur_0935     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807675 1807676 AAur_0935 AAur_0936   panE FALSE 0.009 290.000 0.000 1.000   NA
 1807676 1807677 AAur_0936 AAur_0937 panE   FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1807678 1807679 AAur_0938 AAur_0939     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 1807680 1807681 AAur_0940 AAur_0941     FALSE 0.089 98.000 0.000 NA   NA
 1807681 1807682 AAur_0941 AAur_0942     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1807682 1807683 AAur_0942 AAur_0943     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1807683 1807684 AAur_0943 AAur_0944     FALSE 0.123 114.000 0.000 1.000 N NA
 1807684 1807685 AAur_0944 AAur_0945     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.076 Y NA
 1807685 1807686 AAur_0945 AAur_0946     TRUE 0.969 47.000 0.800 0.076 Y NA
 1807686 1807687 AAur_0946 AAur_0947     TRUE 0.863 50.000 0.800 1.000   NA
 1807688 1807689 AAur_0948 AAur_0949     FALSE 0.006 363.000 0.000 1.000 N NA
 1807689 1807690 AAur_0949 AAur_0950     FALSE 0.106 124.000 0.000 1.000 N NA
 1807691 1807692 AAur_0951 AAur_0952     TRUE 0.880 20.000 0.013 NA Y NA
 1807694 1807695 AAur_0953 AAur_0955     FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1807695 1807696 AAur_0955 AAur_0956     FALSE 0.557 -21.000 0.000 NA   NA
 1807696 1807697 AAur_0956 AAur_0957     FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1807698 1807699 AAur_0958 AAur_0959     FALSE 0.014 214.000 0.000 NA   NA
 1807701 1807702 AAur_0961 AAur_0962     TRUE 0.969 3.000 0.153 0.088   NA
 1807702 1807703 AAur_0962 AAur_0963     TRUE 0.931 2.000 0.051 1.000   NA
 1807703 1807704 AAur_0963 AAur_0964     TRUE 0.940 38.000 0.375 1.000 Y NA
 1807704 1807705 AAur_0964 AAur_0965     TRUE 0.572 59.000 0.143 1.000 N NA
 1807705 1807706 AAur_0965 AAur_0966   menE TRUE 0.847 13.000 0.143 1.000 N NA
 1807706 1807707 AAur_0966 AAur_0967 menE   FALSE 0.007 308.000 0.000 1.000   NA
 1807707 1807708 AAur_0967 AAur_0968     FALSE 0.084 129.000 0.000 1.000   NA
 1807710 1807711 AAur_0970 AAur_0971     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1807711 1807712 AAur_0971 AAur_0972     FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1807713 1807714 AAur_0973 AAur_0974     TRUE 0.981 13.000 0.667 1.000 Y NA
 1807719 1807720 AAur_0979 AAur_0980     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1807722 1807723 AAur_0982 AAur_0983     FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 1807723 1807724 AAur_0983 AAur_0984     FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1807726 1807727 AAur_0986 AAur_0987   gcvP FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000 N NA
 1807727 1807728 AAur_0987 AAur_0988 gcvP gcvT TRUE 0.952 15.000 0.032 0.001 Y NA
 1807728 1807729 AAur_0988 AAur_0989 gcvT gcvH TRUE 0.707 126.000 0.056 0.003 Y NA
 1807729 1807730 AAur_0989 AAur_0990 gcvH sdaA FALSE 0.055 306.000 0.000 1.000 Y NA
 1807730 1807731 AAur_0990 AAur_0991 sdaA   FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1807731 1807732 AAur_0991 AAur_0992     FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1807732 1807733 AAur_0992 AAur_0993     FALSE 0.277 108.000 0.043 1.000 N NA
 1807733 1807734 AAur_0993 AAur_0994     TRUE 0.863 112.000 0.333 0.005 Y NA
 1807734 1807735 AAur_0994 AAur_0995     TRUE 0.784 28.000 0.222 NA   NA
 1807736 1807737 AAur_0996 AAur_0997   ung FALSE 0.364 70.000 0.062 NA N NA
 1807738 1807739 AAur_0998 AAur_0999     TRUE 0.645 50.000 0.196 NA   NA
 1807739 1807740 AAur_0999 AAur_1000     FALSE 0.144 173.000 0.138 NA   NA
 1807740 1807741 AAur_1000 AAur_1001   groL FALSE 0.007 324.000 0.000 1.000 N NA
 1807741 1807742 AAur_1001 AAur_1002 groL   FALSE 0.019 225.000 0.000 1.000 N NA
 1807743 1807744 AAur_1003 AAur_1004     FALSE 0.072 123.000 0.000 NA   NA
 1807744 1807745 AAur_1004 AAur_1005     TRUE 0.687 4.000 0.000 NA   NA
 1807745 1807746 AAur_1005 AAur_1006     FALSE 0.136 80.000 0.000 1.000   NA
 1807747 1807748 AAur_1007 AAur_1008     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1807749 1807750 AAur_1009 AAur_1010     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807750 1807751 AAur_1010 AAur_1011     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1807751 1807752 AAur_1011 AAur_1012     TRUE 0.700 44.000 0.206 NA   NA
 1807753 1807754 AAur_1013 AAur_1014     TRUE 0.795 9.000 0.037 NA   NA
 1807754 1807755 AAur_1014 AAur_1015     FALSE 0.501 44.000 0.049 NA   NA
 1807757 1807758 AAur_1017 AAur_1018     FALSE 0.004 428.000 0.000 1.000   NA
 1807758 1807759 AAur_1018 AAur_1019     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 1807759 1807760 AAur_1019 AAur_1020     FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 1807760 1807761 AAur_1020 AAur_1021     FALSE 0.531 43.000 0.057 NA   NA
 1807761 1807762 AAur_1021 AAur_1022     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807762 1807763 AAur_1022 AAur_1023     FALSE 0.407 28.000 0.000 1.000 N NA
 1807763 1807764 AAur_1023 AAur_1024   fdhD TRUE 0.986 2.000 0.000 0.001 Y NA
 1807764 1807765 AAur_1024 AAur_1025 fdhD   FALSE 0.275 148.000 0.167 1.000 N NA
 1807766 1807767 AAur_1026 AAur_1027     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1807767 1807768 AAur_1027 AAur_1028     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1807768 1807769 AAur_1028 AAur_1029     TRUE 0.988 -13.000 0.481 1.000 Y NA
 1807769 1807770 AAur_1029 AAur_1030     TRUE 0.997 1.000 0.594 0.076 Y NA
 1807770 1807771 AAur_1030 AAur_1031     FALSE 0.011 231.000 0.000 NA   NA
 1807771 1807772 AAur_1031 AAur_1032     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 1807773 1807774 AAur_1033 AAur_1034     TRUE 0.956 3.000 0.073 0.094   NA
 1807775 1807776 AAur_1035 AAur_1036     TRUE 0.944 -3.000 0.058 NA   NA
 1807776 1807777 AAur_1036 AAur_1037     TRUE 0.772 2.000 0.000 NA   NA
 1807780 1807781 AAur_1040 AAur_1041   pcrA FALSE 0.235 80.000 0.010 1.000 N NA
 1807781 1807782 AAur_1041 AAur_1042 pcrA   TRUE 0.893 -3.000 0.007 NA   NA
 1807784 1807785 AAur_1044 AAur_1045 sucC sucD TRUE 0.983 13.000 0.382 0.001 Y NA
 1807786 1807787 AAur_1046 AAur_1047     FALSE 0.096 122.000 0.000 1.000   NA
 1807789 1807790 AAur_1049 AAur_1050     FALSE 0.282 120.000 0.000 0.001   NA
 1807790 1807791 AAur_1050 AAur_1051     FALSE 0.197 143.000 0.062 1.000   NA
 1807793 1807794 AAur_1052 AAur_1054     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 1807796 1807797 AAur_1056 AAur_1057     FALSE 0.012 256.000 0.000 1.000   NA
 1807798 1807799 AAur_1058 AAur_1059     TRUE 0.995 -3.000 0.367 1.000 Y NA
 1807799 1807800 AAur_1059 AAur_1060     FALSE 0.019 224.000 0.000 1.000 N NA
 1807800 1807801 AAur_1060 AAur_1061     TRUE 0.942 11.000 0.500 1.000 N NA
 1807801 1807802 AAur_1061 AAur_1062     FALSE 0.022 303.000 0.000 0.061 N NA
 1807802 1807803 AAur_1062 AAur_1063     FALSE 0.427 156.000 0.000 0.005 Y NA
 1807803 1807804 AAur_1063 AAur_1064     FALSE 0.161 57.000 0.000 NA   NA
 1807804 1807805 AAur_1064 AAur_1065     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1807805 1807806 AAur_1065 AAur_1066     FALSE 0.018 217.000 0.000 1.000   NA
 1807806 1807807 AAur_1066 AAur_1067     FALSE 0.225 53.000 0.000 1.000   NA
 1807807 1807808 AAur_1067 AAur_1068     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1807808 1807809 AAur_1068 AAur_1069     FALSE 0.039 153.000 0.000 NA   NA
 1807809 1807810 AAur_1069 AAur_1070     TRUE 0.896 -13.000 0.122 NA   NA
 1807810 1807811 AAur_1070 AAur_1071     FALSE 0.269 34.000 0.000 NA   NA
 1807814 1807815 AAur_1073 AAur_1075     TRUE 0.980 7.000 0.182 1.000 Y NA
 1807815 1807816 AAur_1075 AAur_1076     TRUE 0.887 42.000 0.500 0.087 N NA
 1807816 1807817 AAur_1076 AAur_1077     TRUE 0.973 0.000 0.077 0.087 N NA
 1807817 1807818 AAur_1077 AAur_1078     TRUE 0.709 48.000 0.096 0.087 N NA
 1807818 1807819 AAur_1078 AAur_1079     TRUE 0.993 -3.000 0.667 0.087 N NA
 1807819 1807820 AAur_1079 AAur_1080     TRUE 0.993 -3.000 0.909 1.000   NA
 1807820 1807821 AAur_1080 AAur_1081   kgtP TRUE 0.944 10.000 0.455 1.000   NA
 1807821 1807822 AAur_1081 AAur_1082 kgtP   FALSE 0.235 165.000 0.222 1.000 N NA
 1807822 1807823 AAur_1082 AAur_1083     FALSE 0.031 163.000 0.000 NA   NA
 1807825 1807826 AAur_1084 AAur_1086     FALSE 0.226 58.000 0.000 1.000 N NA
 1807826 1807827 AAur_1086 AAur_1087   bioD TRUE 0.672 9.000 0.000 1.000 N NA
 1807827 1807828 AAur_1087 AAur_1088 bioD bioF TRUE 0.983 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 1807828 1807829 AAur_1088 AAur_1089 bioF bioA TRUE 0.973 9.000 0.033 0.017 Y NA
 1807836 1807837 AAur_1096 AAur_1097     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 1807837 1807838 AAur_1097 AAur_1098     FALSE 0.148 60.000 0.000 NA   NA
 1807838 1807839 AAur_1098 AAur_1099     FALSE 0.053 158.000 0.000 1.000 N NA
 1807839 1807840 AAur_1099 AAur_1100     FALSE 0.208 197.000 0.400 1.000 N NA
 1807840 1807841 AAur_1100 AAur_1101     FALSE 0.062 270.000 0.214 NA N NA
 1807841 1807842 AAur_1101 AAur_1102     TRUE 0.982 4.000 0.143 NA Y NA
 1807842 1807843 AAur_1102 AAur_1103   rpiB TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1807843 1807844 AAur_1103 AAur_1104 rpiB   TRUE 0.946 3.000 0.105 1.000 N NA
 1807844 1807845 AAur_1104 AAur_1105     TRUE 0.960 20.000 0.158 0.060 Y NA
 1807845 1807846 AAur_1105 AAur_1106     FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1807846 1807847 AAur_1106 AAur_1107     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807847 1807848 AAur_1107 AAur_1109     TRUE 0.975 4.000 0.042 1.000 Y NA
 1807850 1807851 AAur_1110 AAur_1111     FALSE 0.077 133.000 0.000 1.000   NA
 1807854 1807855 AAur_1114 AAur_1115     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807855 1807856 AAur_1115 AAur_1116     FALSE 0.026 174.000 0.000 NA   NA
 1807857 1807858 AAur_1117 AAur_1118 add   FALSE 0.049 146.000 0.000 NA   NA
 1807858 1807859 AAur_1118 AAur_1119     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1807859 1807860 AAur_1119 AAur_1120     FALSE 0.260 52.000 0.000 1.000 N NA
 1807860 1807861 AAur_1120 AAur_1122     TRUE 0.963 -3.000 0.089 1.000 N NA
 1807862 1807863 AAur_1121 AAur_1123 rbsK   FALSE 0.360 36.000 0.000 1.000 N NA
 1807864 1807865 AAur_1124 AAur_1125     FALSE 0.477 83.000 0.167 1.000 N NA
 1807867 1807868 AAur_1127 AAur_1128     TRUE 0.899 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1807868 1807869 AAur_1128 AAur_1129     TRUE 0.936 75.000 0.800 0.075 Y NA
 1807869 1807870 AAur_1129 AAur_1130     TRUE 0.995 6.000 0.818 0.075 Y NA
 1807870 1807871 AAur_1130 AAur_1132     TRUE 0.893 6.000 0.091 NA   NA
 1807872 1807873 AAur_1131 AAur_1133     FALSE 0.007 305.000 0.000 1.000   NA
 1807873 1807874 AAur_1133 AAur_1134     FALSE 0.102 82.000 0.000 NA   NA
 1807874 1807875 AAur_1134 AAur_1135     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807875 1807876 AAur_1135 AAur_1136     FALSE 0.104 80.000 0.000 NA   NA
 1807878 1807879 AAur_1138 AAur_1139     FALSE 0.252 53.000 0.000 1.000 N NA
 1807880 1807881 AAur_1140 AAur_1141     FALSE 0.295 29.000 0.000 NA   NA
 1807881 1807882 AAur_1141 AAur_1142     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 1807882 1807883 AAur_1142 AAur_1143     FALSE 0.398 24.000 0.000 1.000   NA
 1807885 1807886 AAur_1145 AAur_1146     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1807886 1807887 AAur_1146 AAur_1147     FALSE 0.232 57.000 0.000 1.000 N NA
 1807887 1807888 AAur_1147 AAur_1148     FALSE 0.214 60.000 0.000 1.000 N NA
 1807888 1807889 AAur_1148 AAur_1149     TRUE 0.684 27.000 0.071 1.000   NA
 1807889 1807890 AAur_1149 AAur_1150     FALSE 0.361 29.000 0.000 1.000   NA
 1807891 1807892 AAur_1151 AAur_1152     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 1807892 1807893 AAur_1152 AAur_1153     FALSE 0.229 44.000 0.000 NA   NA
 1807893 1807894 AAur_1153 AAur_1154     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807894 1807895 AAur_1154 AAur_1155     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807895 1807896 AAur_1155 AAur_1156     FALSE 0.157 69.000 0.000 1.000   NA
 1807896 1807897 AAur_1156 AAur_1157     FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000   NA
 1807897 1807898 AAur_1157 AAur_1158     FALSE 0.495 137.000 0.000 0.079 Y NA
 1807898 1807899 AAur_1158 AAur_1159     FALSE 0.551 125.000 0.000 0.079 Y NA
 1807901 1807902 AAur_1161 AAur_1162     FALSE 0.089 99.000 0.000 NA   NA
 1807902 1807903 AAur_1162 AAur_1163     FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 1807903 1807904 AAur_1163 AAur_1164     TRUE 0.895 15.000 0.423 NA   NA
 1807904 1807905 AAur_1164 AAur_1165     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 1807906 1807907 AAur_1166 AAur_1167     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1807908 1807909 AAur_1168 AAur_1169     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 1807909 1807910 AAur_1169 AAur_1170     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1807910 1807911 AAur_1170 AAur_1171     FALSE 0.002 668.000 0.000 NA   NA
 1807911 1807912 AAur_1171 AAur_1172     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1807913 1807914 AAur_1173 AAur_1174     FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 1807915 1807916 AAur_1175 AAur_1176     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1807916 1807917 AAur_1176 AAur_1177     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 1807918 1807919 AAur_1178 AAur_1180     FALSE 0.449 22.000 0.000 1.000 N NA
 1807920 1807921 AAur_1179 AAur_1181     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 1807921 1807922 AAur_1181 AAur_1182     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1807922 1807923 AAur_1182 AAur_1183     TRUE 0.989 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 1807923 1807924 AAur_1183 AAur_1184     FALSE 0.002 667.000 0.000 1.000   NA
 1807924 1807925 AAur_1184 AAur_1185     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1807925 1807926 AAur_1185 AAur_1186     FALSE 0.307 105.000 0.000 0.009 N NA
 1807927 1807928 AAur_1187 AAur_1188     FALSE 0.057 134.000 0.000 NA   NA
 1807928 1807929 AAur_1188 AAur_1189     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 1807929 1807930 AAur_1189 AAur_1190     FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1807930 1807931 AAur_1190 AAur_1191     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 1807934 1807935 AAur_1194 AAur_1195     FALSE 0.116 100.000 0.000 1.000   NA
 1807935 1807936 AAur_1195 AAur_1196     TRUE 0.809 -25.000 0.052 NA   NA
 1807937 1807938 AAur_1197 AAur_1198   purH FALSE 0.005 361.000 0.000 1.000   NA
 1807939 1807940 AAur_1199 AAur_1200     FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1807942 1807943 AAur_1202 AAur_1203 soxA phnE FALSE 0.140 92.000 0.000 1.000 N NA
 1807943 1807944 AAur_1203 AAur_1204 phnE phnC TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1807944 1807945 AAur_1204 AAur_1205 phnC phnD TRUE 0.992 0.000 0.029 0.001 Y NA
 1807945 1807946 AAur_1205 AAur_1206 phnD   FALSE 0.325 43.000 0.000 1.000 N NA
 1807947 1807948 AAur_1207 AAur_1208     TRUE 0.930 -3.000 0.024 1.000   NA
 1807948 1807949 AAur_1208 AAur_1209     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1807950 1807951 AAur_1210 AAur_1211     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 1807951 1807952 AAur_1211 AAur_1212     TRUE 0.996 3.000 1.000 1.000 Y NA
 1807952 1807953 AAur_1212 AAur_1213     FALSE 0.032 173.000 0.000 NA N NA
 1807953 1807954 AAur_1213 AAur_1214     TRUE 0.959 43.000 0.800 NA Y NA
 1807954 1807955 AAur_1214 AAur_1215     TRUE 0.960 45.000 0.800 1.000 Y NA
 1807955 1807956 AAur_1215 AAur_1216     TRUE 0.783 131.000 0.500 1.000 Y NA
 1807958 1807959 AAur_1217 AAur_1219   alr TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1807960 1807961 AAur_1220 AAur_1221     TRUE 0.823 72.000 0.250 1.000 Y NA
 1807962 1807963 AAur_1222 AAur_1223     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1807963 1807964 AAur_1223 AAur_1224     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1807964 1807965 AAur_1224 AAur_1225     FALSE 0.145 74.000 0.000 1.000   NA
 1807965 1807966 AAur_1225 AAur_1226   purU TRUE 0.774 22.000 0.118 1.000 N NA
 1807967 1807968 AAur_1227 AAur_1228 glyA   FALSE 0.278 150.000 0.187 1.000 N NA
 1807968 1807969 AAur_1228 AAur_1229     FALSE 0.239 119.000 0.036 1.000 N NA
 1807969 1807970 AAur_1229 AAur_1230     TRUE 0.564 50.000 0.024 0.093   NA
 1807970 1807971 AAur_1230 AAur_1231     TRUE 0.983 -3.000 0.133 0.005   NA
 1807972 1807973 AAur_1232 AAur_1233     TRUE 0.775 41.000 0.286 1.000   NA
 1807974 1807975 AAur_1234 AAur_1235     FALSE 0.135 81.000 0.000 1.000   NA
 1807975 1807976 AAur_1235 AAur_1236   xth TRUE 0.682 11.000 0.008 1.000   NA
 1807976 1807977 AAur_1236 AAur_1237 xth trpS TRUE 0.641 21.000 0.026 1.000 N NA
 1807977 1807978 AAur_1237 AAur_1238 trpS   TRUE 0.613 116.000 0.047 1.000 Y NA
 1807978 1807979 AAur_1238 AAur_1239     FALSE 0.478 86.000 0.194 1.000   NA
 1807980 1807981 AAur_1240 AAur_1241     FALSE 0.243 132.000 0.080 1.000   NA
 1807983 1807984 AAur_1243 AAur_1244   sdhB FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 1807984 1807985 AAur_1244 AAur_1245 sdhB sdhA TRUE 0.998 0.000 0.604 0.001 Y NA
 1807985 1807986 AAur_1245 AAur_1246 sdhA   TRUE 0.845 152.000 0.705 0.001 Y NA
 1807986 1807987 AAur_1246 AAur_1247   sdhC TRUE 0.991 4.000 0.157 0.001 Y NA
 1807988 1807989 AAur_1248 AAur_1249     FALSE 0.336 111.000 0.092 1.000   NA
 1807989 1807990 AAur_1249 AAur_1250     FALSE 0.272 85.000 0.033 1.000   NA
 1807990 1807991 AAur_1250 AAur_1251   ohr TRUE 0.590 53.000 0.120 1.000 N NA
 1807991 1807992 AAur_1251 AAur_1252 ohr   TRUE 0.965 -3.000 0.115 1.000   NA
 1807992 1807993 AAur_1252 AAur_1253     FALSE 0.108 114.000 0.000 1.000   NA
 1807993 1807994 AAur_1253 AAur_1254     TRUE 0.637 118.000 0.647 1.000   NA
 1807994 1807995 AAur_1254 AAur_1255     FALSE 0.151 158.000 0.078 1.000   NA
 1807995 1807996 AAur_1255 AAur_1256     FALSE 0.035 330.000 0.078 0.074   NA
 1807996 1807997 AAur_1256 AAur_1257   cdd TRUE 0.977 -3.000 0.230 1.000   NA
 1807997 1807998 AAur_1257 AAur_1258 cdd   TRUE 0.993 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 1807998 1807999 AAur_1258 AAur_1259     FALSE 0.183 90.000 0.013 NA   NA
 1807999 1808000 AAur_1259 AAur_1260     FALSE 0.192 193.000 0.400 NA   NA
 1808000 1808001 AAur_1260 AAur_1261   add FALSE 0.546 29.000 0.034 NA   NA
 1808001 1808002 AAur_1261 AAur_1262 add   TRUE 0.743 -22.000 0.008 1.000   NA
 1808002 1808003 AAur_1262 AAur_1263   eno FALSE 0.189 117.000 0.018 1.000   NA
 1808003 1808004 AAur_1263 AAur_1264 eno   FALSE 0.125 133.000 0.003 1.000 N NA
 1808004 1808005 AAur_1264 AAur_1265     TRUE 0.798 6.000 0.018 NA   NA
 1808005 1808006 AAur_1265 AAur_1266     TRUE 0.975 -3.000 0.243 NA   NA
 1808006 1808007 AAur_1266 AAur_1267     TRUE 0.920 -3.000 0.026 NA   NA
 1808007 1808008 AAur_1267 AAur_1268     TRUE 0.807 39.000 0.348 1.000   NA
 1808008 1808009 AAur_1268 AAur_1269     FALSE 0.389 104.000 0.130 1.000   NA
 1808009 1808010 AAur_1269 AAur_1270     FALSE 0.341 22.000 0.000 NA   NA
 1808010 1808011 AAur_1270 AAur_1271   braC FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 1808011 1808012 AAur_1271 AAur_1272 braC   FALSE 0.098 113.000 0.000 NA N NA
 1808013 1808014 AAur_1273 AAur_1274     TRUE 0.998 -3.000 0.582 0.025 Y NA
 1808014 1808015 AAur_1274 AAur_1275     TRUE 0.937 39.000 0.361 1.000 Y NA
 1808015 1808016 AAur_1275 AAur_1276     TRUE 0.989 10.000 0.528 0.074 Y NA
 1808018 1808019 AAur_1278 AAur_1279   galK FALSE 0.276 64.000 0.006 1.000 N NA
 1808019 1808020 AAur_1279 AAur_1280 galK galT TRUE 0.991 -3.000 0.370 0.001 N NA
 1808021 1808022 AAur_1281 AAur_1282     FALSE 0.438 84.000 0.174 NA   NA
 1808022 1808023 AAur_1282 AAur_1283   ilvA TRUE 0.872 4.000 0.041 NA   NA
 1808023 1808024 AAur_1283 AAur_1284 ilvA   TRUE 0.602 15.000 0.009 1.000   NA
 1808025 1808026 AAur_1285 AAur_1286     FALSE 0.286 153.000 0.292 NA   NA
 1808027 1808028 AAur_1287 AAur_1288     TRUE 0.581 32.000 0.056 NA   NA
 1808028 1808029 AAur_1288 AAur_1289     TRUE 0.725 -28.000 0.017 NA   NA
 1808031 1808032 AAur_1291 AAur_1292 uppS   TRUE 0.581 44.000 0.058 1.000 N NA
 1808033 1808034 AAur_1293 AAur_1294     FALSE 0.110 183.000 0.107 NA   NA
 1808035 1808036 AAur_1295 AAur_1296     FALSE 0.008 676.000 0.060 1.000   NA
 1808037 1808038 AAur_1297 AAur_1298     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808038 1808039 AAur_1298 AAur_1299   fumC FALSE 0.091 95.000 0.000 NA   NA
 1808039 1808040 AAur_1299 AAur_1300 fumC   FALSE 0.336 88.000 0.058 1.000 N NA
 1808040 1808041 AAur_1300 AAur_1301     FALSE 0.310 71.000 0.050 NA   NA
 1808043 1808044 AAur_1303 AAur_1304   manA TRUE 0.883 4.000 0.035 1.000   NA
 1808044 1808045 AAur_1304 AAur_1305 manA   FALSE 0.467 51.000 0.058 NA   NA
 1808045 1808046 AAur_1305 AAur_1306   purE FALSE 0.529 21.000 0.007 NA N NA
 1808046 1808047 AAur_1306 AAur_1307 purE purK TRUE 0.995 -3.000 0.141 0.001 Y NA
 1808050 1808051 AAur_1310 AAur_1311     TRUE 0.823 12.000 0.125 NA   NA
 1808051 1808052 AAur_1311 AAur_1312     TRUE 0.974 -7.000 0.606 NA   NA
 1808054 1808055 AAur_1314 AAur_1315     FALSE 0.090 146.000 0.009 NA   NA
 1808055 1808056 AAur_1315 AAur_1316   ahcY FALSE 0.338 46.000 0.007 NA   NA
 1808056 1808057 AAur_1316 AAur_1317 ahcY   FALSE 0.063 129.000 0.000 NA   NA
 1808057 1808058 AAur_1317 AAur_1318     FALSE 0.235 43.000 0.000 NA   NA
 1808058 1808059 AAur_1318 AAur_1319     FALSE 0.244 41.000 0.000 NA   NA
 1808061 1808062 AAur_1321 AAur_1323     TRUE 0.710 -70.000 0.023 NA   NA
 1808063 1808064 AAur_1322 AAur_1324     FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 1808064 1808065 AAur_1324 AAur_1325     TRUE 0.821 2.000 0.000 1.000   NA
 1808065 1808066 AAur_1325 AAur_1326     FALSE 0.325 150.000 0.333 NA   NA
 1808066 1808067 AAur_1326 AAur_1327     FALSE 0.021 187.000 0.000 NA   NA
 1808067 1808068 AAur_1327 AAur_1328     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 1808068 1808069 AAur_1328 AAur_1329     TRUE 0.842 11.000 0.088 1.000 N NA
 1808070 1808071 AAur_1330 AAur_1331     FALSE 0.126 161.000 0.004 0.085   NA
 1808072 1808073 AAur_1332 AAur_1333     TRUE 0.991 -3.000 0.837 NA   NA
 1808073 1808074 AAur_1333 AAur_1334     TRUE 0.948 14.000 0.867 NA   NA
 1808075 1808076 AAur_1335 AAur_1336     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 1808076 1808077 AAur_1336 AAur_1337   ksgA FALSE 0.484 27.000 0.003 1.000   NA
 1808077 1808078 AAur_1337 AAur_1338 ksgA ispE TRUE 0.641 36.000 0.068 1.000 N NA
 1808078 1808079 AAur_1338 AAur_1339 ispE   TRUE 0.697 36.000 0.045 0.092   NA
 1808080 1808081 AAur_1340 AAur_1341     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 1808082 1808083 AAur_1342 AAur_1343     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1808083 1808084 AAur_1343 AAur_1344   prs TRUE 0.919 -3.000 0.007 1.000 N NA
 1808084 1808085 AAur_1344 AAur_1345 prs   FALSE 0.007 323.000 0.000 1.000 N NA
 1808085 1808086 AAur_1345 AAur_1346   pth TRUE 0.871 120.000 0.496 0.020 Y NA
 1808086 1808087 AAur_1346 AAur_1347 pth   FALSE 0.111 142.000 0.002 1.000 N NA
 1808087 1808088 AAur_1347 AAur_1348     TRUE 0.870 36.000 0.000 0.022 Y NA
 1808088 1808089 AAur_1348 AAur_1349     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 1808089 1808090 AAur_1349 AAur_1350   sufS FALSE 0.064 128.000 0.000 NA   NA
 1808090 1808091 AAur_1350 AAur_1351 sufS   TRUE 0.587 69.000 0.249 1.000 N NA
 1808092 1808093 AAur_1352 AAur_1353 nhaA   FALSE 0.176 150.000 0.091 NA   NA
 1808093 1808094 AAur_1353 AAur_1354     TRUE 0.964 2.000 0.211 NA   NA
 1808094 1808095 AAur_1354 AAur_1355     FALSE 0.385 48.000 0.022 NA   NA
 1808096 1808097 AAur_1356 AAur_1357 mfd   FALSE 0.165 77.000 0.003 NA   NA
 1808098 1808099 AAur_1358 AAur_1359   deoC FALSE 0.320 54.000 0.017 NA   NA
 1808099 1808100 AAur_1359 AAur_1360 deoC   FALSE 0.153 116.000 0.013 NA   NA
 1808100 1808101 AAur_1360 AAur_1361     FALSE 0.023 183.000 0.000 NA   NA
 1808102 1808103 AAur_1362 AAur_1363     FALSE 0.047 165.000 0.000 1.000 N NA
 1808103 1808104 AAur_1363 AAur_1364     TRUE 0.983 -3.000 0.360 1.000 N NA
 1808104 1808105 AAur_1364 AAur_1365     TRUE 0.968 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1808105 1808106 AAur_1365 AAur_1367     FALSE 0.085 128.000 0.000 1.000   NA
 1808108 1808109 AAur_1368 AAur_1369     FALSE 0.001 1711.000 0.000 NA   NA
 1808109 1808110 AAur_1369 AAur_1370     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1808110 1808111 AAur_1370 AAur_1371     TRUE 0.998 -3.000 0.545 0.007 Y NA
 1808111 1808112 AAur_1371 AAur_1372     TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1808112 1808113 AAur_1372 AAur_1373     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1808114 1808115 AAur_1374 AAur_1375   acsA FALSE 0.003 407.000 0.000 NA   NA
 1808115 1808116 AAur_1375 AAur_1376 acsA   FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1808116 1808117 AAur_1376 AAur_1377     FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 1808117 1808118 AAur_1377 AAur_1378   maoII FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 1808118 1808119 AAur_1378 AAur_1379 maoII   FALSE 0.090 96.000 0.000 NA   NA
 1808119 1808120 AAur_1379 AAur_1380     FALSE 0.234 133.000 0.097 NA   NA
 1808120 1808121 AAur_1380 AAur_1381     FALSE 0.011 284.000 0.000 1.000 N NA
 1808121 1808122 AAur_1381 AAur_1382     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 1808122 1808123 AAur_1382 AAur_1383     FALSE 0.084 112.000 0.000 NA   NA
 1808123 1808124 AAur_1383 AAur_1384     TRUE 0.601 30.000 0.000 0.054   NA
 1808124 1808125 AAur_1384 AAur_1385     FALSE 0.189 51.000 0.000 NA   NA
 1808125 1808126 AAur_1385 AAur_1386     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 1808129 1808130 AAur_1389 AAur_1390     FALSE 0.322 25.000 0.000 NA   NA
 1808130 1808131 AAur_1390 AAur_1391     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808132 1808133 AAur_1392 AAur_1393     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808133 1808134 AAur_1393 AAur_1394     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1808136 1808137 AAur_1396 AAur_1397   cobA TRUE 0.928 13.000 0.039 1.000 Y NA
 1808137 1808138 AAur_1397 AAur_1398 cobA nirB TRUE 0.884 10.000 0.122 1.000 N NA
 1808140 1808141 AAur_1400 AAur_1401     TRUE 0.645 102.000 0.000 0.026 Y NA
 1808141 1808142 AAur_1401 AAur_1402   sacB FALSE 0.329 35.000 0.000 1.000   NA
 1808142 1808143 AAur_1402 AAur_1403 sacB   FALSE 0.003 460.000 0.000 1.000   NA
 1808145 1808146 AAur_1405 AAur_1406     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1808146 1808147 AAur_1406 AAur_1407     TRUE 0.937 -3.000 0.046 NA   NA
 1808147 1808148 AAur_1407 AAur_1408     TRUE 0.958 1.000 0.138 NA   NA
 1808150 1808151 AAur_1410 AAur_1411 accA maf FALSE 0.192 118.000 0.026 NA N NA
 1808151 1808152 AAur_1411 AAur_1412 maf   FALSE 0.038 184.000 0.004 NA   NA
 1808152 1808153 AAur_1412 AAur_1413     TRUE 0.977 2.000 0.357 1.000   NA
 1808153 1808154 AAur_1413 AAur_1414     FALSE 0.025 176.000 0.000 NA   NA
 1808154 1808155 AAur_1414 AAur_1415     FALSE 0.093 93.000 0.000 NA   NA
 1808155 1808156 AAur_1415 AAur_1416     FALSE 0.001 1098.000 0.000 NA   NA
 1808156 1808157 AAur_1416 AAur_1417     FALSE 0.343 67.000 0.056 NA   NA
 1808157 1808158 AAur_1417 AAur_1418     TRUE 0.978 -3.000 0.294 NA   NA
 1808159 1808160 AAur_1419 AAur_1420     FALSE 0.265 68.000 0.008 1.000 N NA
 1808160 1808161 AAur_1420 AAur_1421     TRUE 0.787 -7.000 0.005 NA   NA
 1808161 1808162 AAur_1421 AAur_1422     TRUE 0.907 -10.000 0.125 NA   NA
 1808162 1808163 AAur_1422 AAur_1423     FALSE 0.054 282.000 0.188 1.000   NA
 1808163 1808164 AAur_1423 AAur_1424     FALSE 0.467 158.000 0.750 1.000   NA
 1808164 1808165 AAur_1424 AAur_1425     FALSE 0.396 89.000 0.115 1.000   NA
 1808165 1808166 AAur_1425 AAur_1426     TRUE 0.695 110.000 0.808 NA   NA
 1808166 1808167 AAur_1426 AAur_1427     TRUE 0.992 -3.000 0.880 NA   NA
 1808167 1808168 AAur_1427 AAur_1428     TRUE 0.886 -10.000 0.083 NA   NA
 1808168 1808169 AAur_1428 AAur_1429     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1808169 1808170 AAur_1429 AAur_1430     TRUE 0.932 -13.000 0.250 NA   NA
 1808170 1808171 AAur_1430 AAur_1431     TRUE 0.988 -3.000 0.625 NA   NA
 1808171 1808172 AAur_1431 AAur_1432     TRUE 0.767 46.000 0.375 NA   NA
 1808172 1808173 AAur_1432 AAur_1433     TRUE 0.977 -3.000 0.273 NA   NA
 1808173 1808174 AAur_1433 AAur_1434   ligA FALSE 0.319 38.000 0.000 1.000   NA
 1808174 1808175 AAur_1434 AAur_1435 ligA suhB TRUE 0.918 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1808175 1808176 AAur_1435 AAur_1436 suhB   FALSE 0.481 11.000 0.000 NA   NA
 1808177 1808178 AAur_1437 AAur_1438   ntaA TRUE 0.992 0.000 0.222 NA Y NA
 1808178 1808179 AAur_1438 AAur_1439 ntaA   TRUE 0.828 35.000 0.400 NA N NA
 1808179 1808180 AAur_1439 AAur_1440     TRUE 0.986 -24.000 0.550 1.000 Y NA
 1808180 1808181 AAur_1440 AAur_1441     TRUE 0.993 3.000 0.478 NA Y NA
 1808182 1808183 AAur_1442 AAur_1443     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1808184 1808185 AAur_1444 AAur_1445     TRUE 0.993 -7.000 0.455 0.091 Y NA
 1808188 1808189 AAur_1448 AAur_1449 gatC gatA TRUE 0.995 6.000 0.643 0.001 Y NA
 1808189 1808190 AAur_1449 AAur_1450 gatA gatB TRUE 0.997 0.000 0.492 0.001 Y NA
 1808190 1808191 AAur_1450 AAur_1452 gatB   FALSE 0.086 108.000 0.000 NA   NA
 1808193 1808194 AAur_1453 AAur_1454     TRUE 0.965 42.000 0.571 0.073 Y NA
 1808194 1808195 AAur_1454 AAur_1455     TRUE 0.926 67.000 0.571 0.073 Y NA
 1808195 1808196 AAur_1455 AAur_1456     TRUE 0.832 57.000 0.750 1.000 N NA
 1808196 1808197 AAur_1456 AAur_1457     TRUE 0.917 27.000 0.750 1.000   NA
 1808199 1808200 AAur_1459 AAur_1460 tdh kbl TRUE 0.749 63.000 0.547 1.000 N NA
 1808200 1808201 AAur_1460 AAur_1461 kbl   FALSE 0.002 685.000 0.000 1.000   NA
 1808201 1808202 AAur_1461 AAur_1462     TRUE 0.601 30.000 0.000 0.054   NA
 1808202 1808203 AAur_1462 AAur_1463     FALSE 0.248 54.000 0.000 1.000 N NA
 1808203 1808204 AAur_1463 AAur_1464   hutI TRUE 0.675 12.000 0.008 1.000 N NA
 1808206 1808207 AAur_1466 AAur_1467   glk TRUE 0.705 52.000 0.259 1.000 N NA
 1808207 1808208 AAur_1467 AAur_1468 glk   TRUE 0.994 -3.000 0.296 NA Y NA
 1808208 1808209 AAur_1468 AAur_1469     TRUE 0.995 -3.000 0.455 NA Y NA
 1808209 1808210 AAur_1469 AAur_1470     TRUE 0.916 24.000 0.087 1.000 Y NA
 1808214 1808215 AAur_1474 AAur_1475   metX FALSE 0.259 295.000 0.542 1.000 Y NA
 1808216 1808217 AAur_1476 AAur_1477     FALSE 0.304 81.000 0.059 NA   NA
 1808217 1808218 AAur_1477 AAur_1478     TRUE 0.604 30.000 0.059 NA   NA
 1808221 1808222 AAur_1481 AAur_1482   glyS FALSE 0.076 149.000 0.006 NA   NA
 1808222 1808223 AAur_1482 AAur_1483 glyS   TRUE 0.872 3.000 0.011 1.000   NA
 1808223 1808224 AAur_1483 AAur_1484     FALSE 0.015 212.000 0.000 NA   NA
 1808224 1808225 AAur_1484 AAur_1485     FALSE 0.217 46.000 0.000 NA   NA
 1808225 1808226 AAur_1485 AAur_1486     FALSE 0.149 90.000 0.003 NA   NA
 1808226 1808227 AAur_1486 AAur_1487     FALSE 0.286 65.000 0.011 1.000 N NA
 1808227 1808228 AAur_1487 AAur_1488   dnaG FALSE 0.405 59.000 0.037 1.000 N NA
 1808228 1808229 AAur_1488 AAur_1489 dnaG   FALSE 0.173 54.000 0.000 NA   NA
 1808229 1808230 AAur_1489 AAur_1490     FALSE 0.079 117.000 0.000 NA   NA
 1808231 1808232 AAur_1491 AAur_1492     FALSE 0.223 45.000 0.000 NA   NA
 1808232 1808233 AAur_1492 AAur_1493     FALSE 0.335 23.000 0.000 NA   NA
 1808233 1808234 AAur_1493 AAur_1494     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 1808234 1808235 AAur_1494 AAur_1495     TRUE 0.899 18.000 0.500 NA   NA
 1808236 1808237 AAur_1496 AAur_1497     FALSE 0.358 48.000 0.015 NA   NA
 1808237 1808238 AAur_1497 AAur_1498     TRUE 0.902 0.000 0.015 NA   NA
 1808238 1808239 AAur_1498 AAur_1499     FALSE 0.431 108.000 0.213 NA   NA
 1808239 1808240 AAur_1499 AAur_1500     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1808241 1808242 AAur_1501 AAur_1502     FALSE 0.021 188.000 0.000 NA   NA
 1808243 1808244 AAur_1503 AAur_1504 rpsB tsf FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 1808244 1808245 AAur_1504 AAur_1505 tsf pyrH TRUE 0.863 29.000 0.416 1.000 N NA
 1808245 1808246 AAur_1505 AAur_1506 pyrH frr TRUE 0.676 102.000 0.626 1.000 N NA
 1808246 1808247 AAur_1506 AAur_1507 frr   TRUE 0.957 0.000 0.076 1.000 N NA
 1808247 1808248 AAur_1507 AAur_1508     TRUE 0.711 22.000 0.090 NA   NA
 1808249 1808250 AAur_1509 AAur_1510     FALSE 0.017 202.000 0.000 NA   NA
 1808250 1808251 AAur_1510 AAur_1511     TRUE 0.985 -3.000 0.486 NA   NA
 1808251 1808252 AAur_1511 AAur_1512     TRUE 0.960 -3.000 0.114 NA   NA
 1808252 1808253 AAur_1512 AAur_1513     TRUE 0.949 31.000 0.167 0.010 Y NA
 1808254 1808255 AAur_1514 AAur_1515     TRUE 0.985 -3.000 0.484 NA   NA
 1808256 1808257 AAur_1516 AAur_1517     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 1808257 1808258 AAur_1517 AAur_1518     FALSE 0.239 42.000 0.000 NA   NA
 1808258 1808259 AAur_1518 AAur_1519     FALSE 0.053 142.000 0.000 NA   NA
 1808259 1808260 AAur_1519 AAur_1520     FALSE 0.226 149.000 0.150 NA   NA
 1808261 1808262 AAur_1521 AAur_1522     TRUE 0.998 0.000 0.889 0.003 Y NA
 1808262 1808263 AAur_1522 AAur_1523     TRUE 0.998 -3.000 0.818 0.083 Y NA
 1808264 1808265 AAur_1524 AAur_1525     FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000   NA
 1808265 1808266 AAur_1525 AAur_1526     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 1808266 1808267 AAur_1526 AAur_1527     FALSE 0.103 81.000 0.000 NA   NA
 1808268 1808269 AAur_1528 AAur_1529   accA TRUE 0.659 126.000 0.136 1.000 Y NA
 1808269 1808270 AAur_1529 AAur_1530 accA   TRUE 0.993 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 1808270 1808271 AAur_1530 AAur_1531     TRUE 0.845 38.000 0.025 1.000 Y NA
 1808271 1808272 AAur_1531 AAur_1532     TRUE 0.997 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 1808272 1808273 AAur_1532 AAur_1533     TRUE 0.991 -3.000 0.043 0.083 Y NA
 1808273 1808274 AAur_1533 AAur_1534     TRUE 0.797 41.000 0.326 1.000 N NA
 1808275 1808276 AAur_1535 AAur_1536     TRUE 0.968 -15.000 0.688 NA   NA
 1808276 1808277 AAur_1536 AAur_1537     TRUE 0.906 6.000 0.120 NA   NA
 1808277 1808278 AAur_1537 AAur_1538     TRUE 0.776 14.000 0.080 1.000   NA
 1808278 1808279 AAur_1538 AAur_1539     TRUE 0.998 0.000 0.900 0.072 Y NA
 1808279 1808280 AAur_1539 AAur_1540     TRUE 0.996 5.000 0.900 0.072 Y NA
 1808283 1808284 AAur_1543 AAur_1544 dxr   TRUE 0.680 33.000 0.088 1.000 N NA
 1808284 1808285 AAur_1544 AAur_1545     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1808285 1808286 AAur_1545 AAur_1546   ispG FALSE 0.302 49.000 0.005 NA   NA
 1808286 1808287 AAur_1546 AAur_1547 ispG   TRUE 0.731 11.000 0.022 1.000   NA
 1808287 1808288 AAur_1547 AAur_1548     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 1808289 1808290 AAur_1549 AAur_1550     TRUE 0.876 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1808290 1808291 AAur_1550 AAur_1551     TRUE 0.993 9.000 0.713 0.090 Y NA
 1808292 1808293 AAur_1552 AAur_1553   proS FALSE 0.013 218.000 0.000 NA   NA
 1808293 1808294 AAur_1553 AAur_1554 proS   TRUE 0.914 -3.000 0.010 1.000   NA
 1808295 1808296 AAur_1555 AAur_1556 sph   FALSE 0.530 50.000 0.087 NA   NA
 1808296 1808297 AAur_1556 AAur_1557     FALSE 0.448 52.000 0.056 NA   NA
 1808298 1808299 AAur_1558 AAur_1559   nusA TRUE 0.990 0.000 0.759 NA   NA
 1808299 1808300 AAur_1559 AAur_1560 nusA   TRUE 0.801 89.000 0.323 NA Y NA
 1808300 1808301 AAur_1560 AAur_1561   infB FALSE 0.231 153.000 0.171 NA N NA
 1808301 1808302 AAur_1561 AAur_1562 infB   TRUE 0.873 78.000 0.530 1.000 Y NA
 1808302 1808303 AAur_1562 AAur_1563   guaD FALSE 0.542 89.000 0.000 1.000 Y NA
 1808305 1808306 AAur_1565 AAur_1566 truB   TRUE 0.843 3.000 0.010 NA   NA
 1808306 1808307 AAur_1566 AAur_1567     TRUE 0.950 3.000 0.167 NA   NA
 1808307 1808308 AAur_1567 AAur_1568   ribF FALSE 0.168 90.000 0.008 NA   NA
 1808308 1808309 AAur_1568 AAur_1569 ribF rpsO FALSE 0.186 160.000 0.119 1.000 N NA
 1808309 1808310 AAur_1569 AAur_1570 rpsO   FALSE 0.127 241.000 0.011 1.000 Y NA
 1808310 1808311 AAur_1570 AAur_1571     FALSE 0.474 79.000 0.171 1.000   NA
 1808311 1808312 AAur_1571 AAur_1572     FALSE 0.174 89.000 0.010 NA   NA
 1808313 1808314 AAur_1573 AAur_1574   moaA TRUE 0.964 5.000 0.410 1.000   NA
 1808315 1808316 AAur_1575 AAur_1576     TRUE 0.979 -13.000 0.191 1.000 Y NA
 1808316 1808317 AAur_1576 AAur_1577     TRUE 0.932 -3.000 0.026 1.000   NA
 1808317 1808318 AAur_1577 AAur_1578   moeA TRUE 0.575 60.000 0.176 1.000   NA
 1808318 1808319 AAur_1578 AAur_1579 moeA moaC TRUE 0.978 -12.000 0.019 0.002 Y NA
 1808319 1808320 AAur_1579 AAur_1580 moaC   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808320 1808321 AAur_1580 AAur_1581   moaE TRUE 0.630 -10.000 0.000 NA   NA
 1808321 1808322 AAur_1581 AAur_1582 moaE dapB FALSE 0.346 52.000 0.004 1.000 N NA
 1808322 1808323 AAur_1582 AAur_1584 dapB   TRUE 0.854 5.000 0.027 1.000   NA
 1808325 1808326 AAur_1585 AAur_1586   dapA FALSE 0.509 105.000 0.333 NA   NA
 1808326 1808327 AAur_1586 AAur_1587 dapA   TRUE 0.933 7.000 0.206 1.000   NA
 1808327 1808328 AAur_1587 AAur_1588     TRUE 0.750 13.000 0.052 1.000   NA
 1808328 1808329 AAur_1588 AAur_1589   pgsA TRUE 0.691 39.000 0.025 0.058 N NA
 1808329 1808330 AAur_1589 AAur_1590 pgsA   FALSE 0.223 150.000 0.151 NA   NA
 1808330 1808331 AAur_1590 AAur_1591     FALSE 0.041 231.000 0.057 NA   NA
 1808333 1808334 AAur_1593 AAur_1594   recA FALSE 0.019 259.000 0.017 NA   NA
 1808334 1808335 AAur_1594 AAur_1595 recA   TRUE 0.949 -10.000 0.296 1.000   NA
 1808335 1808336 AAur_1595 AAur_1596   miaB TRUE 0.918 0.000 0.016 1.000   NA
 1808336 1808337 AAur_1596 AAur_1597 miaB miaA TRUE 0.900 20.000 0.028 1.000 Y NA
 1808337 1808338 AAur_1597 AAur_1599 miaA dapF TRUE 0.562 47.000 0.062 1.000 N NA
 1808340 1808341 AAur_1600 AAur_1601     TRUE 0.851 -7.000 0.019 1.000   NA
 1808343 1808344 AAur_1603 AAur_1604   hisC FALSE 0.205 79.000 0.006 1.000   NA
 1808344 1808345 AAur_1604 AAur_1605 hisC hisB TRUE 0.950 47.000 0.341 0.003 Y NA
 1808345 1808346 AAur_1605 AAur_1606 hisB hisH TRUE 0.993 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 1808346 1808347 AAur_1606 AAur_1607 hisH   TRUE 0.908 1.000 0.028 NA   NA
 1808347 1808348 AAur_1607 AAur_1608     FALSE 0.423 50.000 0.038 NA   NA
 1808348 1808349 AAur_1608 AAur_1609     TRUE 0.971 0.000 0.215 NA   NA
 1808349 1808350 AAur_1609 AAur_1610     FALSE 0.542 52.000 0.111 NA   NA
 1808352 1808353 AAur_1612 AAur_1613 infC rpmI TRUE 0.852 118.000 0.652 1.000 Y NA
 1808353 1808354 AAur_1613 AAur_1614 rpmI rplT TRUE 0.924 120.000 0.928 0.012 Y NA
 1808354 1808355 AAur_1614 AAur_1615 rplT   TRUE 0.936 27.000 0.057 0.011 Y NA
 1808355 1808356 AAur_1615 AAur_1616     FALSE 0.227 101.000 0.019 1.000 N NA
 1808361 1808362 AAur_1620 AAur_1622     TRUE 0.872 3.000 0.022 NA   NA
 1808363 1808364 AAur_1623 AAur_1624 pheS pheT TRUE 0.997 3.000 0.574 0.001 Y NA
 1808364 1808365 AAur_1624 AAur_1625 pheT   FALSE 0.018 227.000 0.000 1.000 N NA
 1808365 1808366 AAur_1625 AAur_1626     FALSE 0.093 131.000 0.000 1.000 N NA
 1808367 1808368 AAur_1627 AAur_1628     TRUE 0.942 13.000 0.667 1.000   NA
 1808368 1808369 AAur_1628 AAur_1629     FALSE 0.261 112.000 0.038 1.000 N NA
 1808369 1808370 AAur_1629 AAur_1630     FALSE 0.267 86.000 0.025 1.000 N NA
 1808371 1808372 AAur_1631 AAur_1632 argC argJ TRUE 0.997 -3.000 0.303 0.001 Y NA
 1808372 1808373 AAur_1632 AAur_1633 argJ argB TRUE 0.992 5.000 0.239 0.001 Y NA
 1808373 1808374 AAur_1633 AAur_1634 argB argD TRUE 0.991 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 1808374 1808375 AAur_1634 AAur_1635 argD argF TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1808375 1808376 AAur_1635 AAur_1636 argF argR TRUE 0.960 0.000 0.088 1.000 N NA
 1808376 1808377 AAur_1636 AAur_1637 argR argG FALSE 0.365 72.000 0.054 1.000 N NA
 1808377 1808378 AAur_1637 AAur_1638 argG argH TRUE 0.994 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 1808378 1808379 AAur_1638 AAur_1639 argH   FALSE 0.133 83.000 0.000 1.000   NA
 1808381 1808382 AAur_1641 AAur_1642     FALSE 0.241 132.000 0.005 0.053   NA
 1808382 1808383 AAur_1642 AAur_1643   tyrS TRUE 0.733 38.000 0.074 0.090   NA
 1808384 1808385 AAur_1644 AAur_1645     FALSE 0.144 61.000 0.000 NA   NA
 1808386 1808387 AAur_1646 AAur_1647 rrsD rrlD FALSE 0.002 600.000 0.000 NA   NA
 1808387 1808388 AAur_1647 AAur_1648 rrlD rrfD FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1808388 1808389 AAur_1648 AAur_1649 rrfD   FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 1808389 1808390 AAur_1649 AAur_1650     TRUE 0.969 -7.000 0.500 NA   NA
 1808390 1808391 AAur_1650 AAur_1651     TRUE 0.727 10.000 0.021 NA   NA
 1808391 1808392 AAur_1651 AAur_1652     TRUE 0.785 4.000 0.003 NA   NA
 1808392 1808393 AAur_1652 AAur_1653   ppnK TRUE 0.820 14.000 0.120 1.000 N NA
 1808393 1808394 AAur_1653 AAur_1654 ppnK recN TRUE 0.929 4.000 0.094 1.000 N NA
 1808394 1808395 AAur_1654 AAur_1655 recN pyrG FALSE 0.147 128.000 0.006 1.000 N NA
 1808395 1808396 AAur_1655 AAur_1656 pyrG   FALSE 0.353 76.000 0.055 1.000 N NA
 1808396 1808397 AAur_1656 AAur_1657   xerD TRUE 0.983 3.000 0.063 1.000 Y NA
 1808400 1808401 AAur_1660 AAur_1661 gltA prpB TRUE 0.682 78.000 0.502 1.000 N NA
 1808401 1808402 AAur_1661 AAur_1662 prpB   TRUE 0.971 1.000 0.218 1.000   NA
 1808402 1808403 AAur_1662 AAur_1663     TRUE 0.687 11.000 0.010 1.000   NA
 1808403 1808404 AAur_1663 AAur_1664     FALSE 0.178 69.000 0.000 1.000 N NA
 1808404 1808405 AAur_1664 AAur_1665     FALSE 0.227 143.000 0.079 1.000 N NA
 1808405 1808406 AAur_1665 AAur_1666     TRUE 0.751 58.000 0.000 0.090 Y NA
 1808406 1808407 AAur_1666 AAur_1667     TRUE 0.995 -3.000 0.222 0.090 Y NA
 1808408 1808409 AAur_1668 AAur_1669     FALSE 0.028 255.000 0.021 1.000 N NA
 1808409 1808410 AAur_1669 AAur_1670   scpA TRUE 0.864 7.000 0.065 NA   NA
 1808410 1808411 AAur_1670 AAur_1671 scpA   TRUE 0.972 -7.000 0.570 NA   NA
 1808411 1808412 AAur_1671 AAur_1672     FALSE 0.274 152.000 0.224 NA N NA
 1808412 1808413 AAur_1672 AAur_1673     TRUE 0.885 4.000 0.030 1.000 N NA
 1808413 1808414 AAur_1673 AAur_1674   cmk TRUE 0.938 0.000 0.032 1.000 N NA
 1808414 1808415 AAur_1674 AAur_1675 cmk   TRUE 0.880 -7.000 0.030 1.000 N NA
 1808415 1808416 AAur_1675 AAur_1676     FALSE 0.240 86.000 0.021 1.000   NA
 1808416 1808417 AAur_1676 AAur_1677     FALSE 0.053 142.000 0.000 NA   NA
 1808419 1808420 AAur_1679 AAur_1680   gcvH FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 1808420 1808421 AAur_1680 AAur_1681 gcvH   FALSE 0.336 138.000 0.242 NA   NA
 1808421 1808422 AAur_1681 AAur_1682     TRUE 0.920 21.000 0.707 NA   NA
 1808422 1808423 AAur_1682 AAur_1683     TRUE 0.962 0.000 0.133 NA   NA
 1808423 1808424 AAur_1683 AAur_1684     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 1808429 1808430 AAur_1689 AAur_1690     TRUE 0.603 -13.000 0.000 NA   NA
 1808430 1808431 AAur_1690 AAur_1691     TRUE 0.735 3.000 0.000 NA   NA
 1808432 1808433 AAur_1692 AAur_1693     FALSE 0.442 67.000 0.082 1.000 N NA
 1808434 1808435 AAur_1694 AAur_1695     FALSE 0.352 75.000 0.053 1.000 N NA
 1808437 1808438 AAur_1697 AAur_1698     TRUE 0.976 -3.000 0.250 NA   NA
 1808439 1808440 AAur_1699 AAur_1700     FALSE 0.087 239.000 0.257 NA   NA
 1808440 1808441 AAur_1700 AAur_1701     FALSE 0.002 497.000 0.000 NA   NA
 1808441 1808442 AAur_1701 AAur_1702     TRUE 0.878 32.000 0.635 NA   NA
 1808442 1808443 AAur_1702 AAur_1703     TRUE 0.881 -3.000 0.003 NA   NA
 1808443 1808444 AAur_1703 AAur_1704     FALSE 0.392 43.000 0.013 NA   NA
 1808444 1808445 AAur_1704 AAur_1705   murE TRUE 0.705 139.000 0.333 1.000 Y NA
 1808445 1808446 AAur_1705 AAur_1706 murE murF TRUE 0.992 7.000 0.367 0.001 Y NA
 1808446 1808447 AAur_1706 AAur_1707 murF mraY TRUE 0.994 -3.000 0.071 0.004 Y NA
 1808447 1808448 AAur_1707 AAur_1708 mraY murD TRUE 0.998 -3.000 0.647 0.004 Y NA
 1808448 1808449 AAur_1708 AAur_1709 murD ftsW TRUE 0.969 3.000 0.081 0.003 N NA
 1808449 1808450 AAur_1709 AAur_1710 ftsW murG TRUE 0.928 7.000 0.167 1.000 N NA
 1808450 1808451 AAur_1710 AAur_1711 murG murC TRUE 0.994 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 1808451 1808452 AAur_1711 AAur_1712 murC   TRUE 0.981 -7.000 0.134 NA Y NA
 1808452 1808453 AAur_1712 AAur_1713   ftsZ FALSE 0.057 217.000 0.067 NA N NA
 1808453 1808454 AAur_1713 AAur_1714 ftsZ   TRUE 0.677 26.000 0.082 NA   NA
 1808454 1808455 AAur_1714 AAur_1715     TRUE 0.889 -7.000 0.061 NA   NA
 1808455 1808456 AAur_1715 AAur_1716     TRUE 0.652 87.000 0.581 NA   NA
 1808456 1808457 AAur_1716 AAur_1717     FALSE 0.387 108.000 0.165 NA   NA
 1808457 1808458 AAur_1717 AAur_1718     FALSE 0.164 157.000 0.114 NA   NA
 1808458 1808459 AAur_1718 AAur_1719   lspA FALSE 0.260 132.000 0.119 NA   NA
 1808459 1808460 AAur_1719 AAur_1720 lspA   TRUE 0.915 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1808460 1808461 AAur_1720 AAur_1721   dnaE FALSE 0.370 55.000 0.014 1.000 N NA
 1808463 1808464 AAur_1723 AAur_1724   hisD TRUE 0.856 5.000 0.042 NA   NA
 1808464 1808465 AAur_1724 AAur_1725 hisD nrdR FALSE 0.056 175.000 0.011 NA N NA
 1808466 1808467 AAur_1726 AAur_1727   ppgK FALSE 0.263 92.000 0.028 1.000 N NA
 1808467 1808468 AAur_1727 AAur_1728 ppgK map TRUE 0.579 58.000 0.142 1.000 N NA
 1808471 1808472 AAur_1731 AAur_1733 glnA   TRUE 0.846 10.000 0.065 1.000 N NA
 1808474 1808475 AAur_1734 AAur_1735     TRUE 0.968 -3.000 0.167 NA   NA
 1808475 1808476 AAur_1735 AAur_1736     FALSE 0.088 101.000 0.000 NA   NA
 1808479 1808480 AAur_1739 AAur_1740     TRUE 0.606 -33.000 0.000 1.000   NA
 1808480 1808481 AAur_1740 AAur_1741     TRUE 0.602 30.000 0.000 0.052   NA
 1808481 1808482 AAur_1741 AAur_1742     FALSE 0.007 273.000 0.000 NA   NA
 1808486 1808487 AAur_1746 AAur_1747   lipA FALSE 0.274 96.000 0.059 NA   NA
 1808487 1808488 AAur_1747 AAur_1748 lipA lipB TRUE 0.997 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 1808494 1808495 AAur_1754 AAur_1755     FALSE 0.155 147.000 0.057 NA   NA
 1808495 1808496 AAur_1755 AAur_1756   lpdA TRUE 0.805 113.000 0.379 1.000 Y NA
 1808496 1808497 AAur_1756 AAur_1757 lpdA   FALSE 0.281 158.000 0.095 0.030 N NA
 1808498 1808499 AAur_1758 AAur_1759     TRUE 0.712 36.000 0.140 1.000   NA
 1808499 1808500 AAur_1759 AAur_1760     FALSE 0.085 110.000 0.000 NA   NA
 1808500 1808501 AAur_1760 AAur_1761   rpoD FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 1808506 1808507 AAur_1766 AAur_1767     TRUE 0.981 6.000 0.850 1.000 N NA
 1808508 1808509 AAur_1768 AAur_1769   cydB TRUE 0.988 19.000 0.925 0.046 Y NA
 1808509 1808510 AAur_1769 AAur_1770 cydB cydD TRUE 0.591 8.000 0.000 NA   NA
 1808510 1808511 AAur_1770 AAur_1771 cydD   FALSE 0.527 10.000 0.000 NA   NA
 1808515 1808516 AAur_1775 AAur_1776     TRUE 0.696 58.000 0.393 NA   NA
 1808516 1808517 AAur_1776 AAur_1777     TRUE 0.974 -3.000 0.224 NA   NA
 1808517 1808518 AAur_1777 AAur_1778   tdk TRUE 0.870 -7.000 0.030 1.000   NA
 1808522 1808523 AAur_1782 AAur_1783     FALSE 0.262 120.000 0.078 NA   NA
 1808523 1808524 AAur_1783 AAur_1785     FALSE 0.024 367.000 0.169 NA   NA
 1808525 1808526 AAur_1784 AAur_1786 trkA trkA TRUE 0.992 0.000 0.029 0.002 Y NA
 1808527 1808528 AAur_1787 AAur_1788     TRUE 0.954 1.000 0.082 1.000 N NA
 1808528 1808529 AAur_1788 AAur_1789   acnA FALSE 0.016 244.000 0.000 1.000 N NA
 1808529 1808530 AAur_1789 AAur_1790 acnA dxs FALSE 0.084 189.000 0.051 1.000 N NA
 1808530 1808531 AAur_1790 AAur_1791 dxs   TRUE 0.924 -3.000 0.029 NA   NA
 1808531 1808532 AAur_1791 AAur_1792     TRUE 0.916 -3.000 0.022 NA   NA
 1808532 1808533 AAur_1792 AAur_1793     TRUE 0.580 31.000 0.054 NA   NA
 1808533 1808534 AAur_1793 AAur_1794     FALSE 0.433 58.000 0.054 1.000   NA
 1808535 1808536 AAur_1795 AAur_1796     TRUE 0.997 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 1808536 1808537 AAur_1796 AAur_1797     FALSE 0.063 195.000 0.032 1.000 N NA
 1808537 1808538 AAur_1797 AAur_1798     FALSE 0.384 81.000 0.115 NA   NA
 1808538 1808539 AAur_1798 AAur_1799     FALSE 0.217 68.000 0.010 NA   NA
 1808539 1808540 AAur_1799 AAur_1800     TRUE 0.713 11.000 0.010 1.000 N NA
 1808540 1808541 AAur_1800 AAur_1801     TRUE 0.760 54.000 0.500 NA   NA
 1808541 1808542 AAur_1801 AAur_1802   msrB FALSE 0.087 156.000 0.024 NA   NA
 1808542 1808543 AAur_1802 AAur_1803 msrB   FALSE 0.238 111.000 0.048 NA   NA
 1808545 1808546 AAur_1805 AAur_1806   sufE FALSE 0.408 34.000 0.008 NA   NA
 1808546 1808547 AAur_1806 AAur_1807 sufE sseA TRUE 0.685 57.000 0.351 NA   NA
 1808549 1808550 AAur_1809 AAur_1810     FALSE 0.058 133.000 0.000 NA   NA
 1808550 1808551 AAur_1810 AAur_1811     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 1808551 1808552 AAur_1811 AAur_1812     FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 1808552 1808553 AAur_1812 AAur_1813     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 1808553 1808554 AAur_1813 AAur_1814     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1808554 1808555 AAur_1814 AAur_1815     FALSE 0.156 58.000 0.000 NA   NA
 1808555 1808556 AAur_1815 AAur_1816     FALSE 0.252 39.000 0.000 NA   NA
 1808556 1808557 AAur_1816 AAur_1817     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808558 1808559 AAur_1818 AAur_1819     FALSE 0.113 73.000 0.000 NA   NA
 1808559 1808560 AAur_1819 AAur_1820     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 1808560 1808561 AAur_1820 AAur_1821   def FALSE 0.554 51.000 0.088 1.000   NA
 1808561 1808562 AAur_1821 AAur_1822 def fmt TRUE 0.992 -3.000 0.031 0.019 Y NA
 1808562 1808563 AAur_1822 AAur_1823 fmt   TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 1808563 1808564 AAur_1823 AAur_1824   rpe FALSE 0.475 56.000 0.056 1.000 N NA
 1808564 1808565 AAur_1824 AAur_1825 rpe   FALSE 0.007 323.000 0.000 1.000 N NA
 1808565 1808566 AAur_1825 AAur_1826   ribD TRUE 0.984 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 1808566 1808567 AAur_1826 AAur_1827 ribD ribE TRUE 0.995 0.000 0.456 1.000 Y NA
 1808567 1808568 AAur_1827 AAur_1828 ribE   TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808568 1808569 AAur_1828 AAur_1829   ribH FALSE 0.376 17.000 0.000 NA   NA
 1808569 1808570 AAur_1829 AAur_1830 ribH hisE TRUE 0.618 28.000 0.034 1.000 N NA
 1808570 1808571 AAur_1830 AAur_1831 hisE hisG TRUE 0.807 85.000 0.081 0.003 Y NA
 1808571 1808572 AAur_1831 AAur_1832 hisG hisF TRUE 0.806 61.000 0.008 0.003 Y NA
 1808574 1808575 AAur_1834 AAur_1835 hisI trpE TRUE 0.769 59.000 0.050 1.000 Y NA
 1808575 1808576 AAur_1835 AAur_1836 trpE   TRUE 0.989 -3.000 0.690 NA   NA
 1808576 1808577 AAur_1836 AAur_1837     FALSE 0.245 133.000 0.109 NA   NA
 1808577 1808578 AAur_1837 AAur_1838   trpC TRUE 0.965 3.000 0.300 NA   NA
 1808578 1808579 AAur_1838 AAur_1839 trpC trpB TRUE 0.798 106.000 0.101 0.002 Y NA
 1808579 1808580 AAur_1839 AAur_1840 trpB trpA TRUE 0.995 0.000 0.153 0.001 Y NA
 1808580 1808581 AAur_1840 AAur_1841 trpA lgt FALSE 0.454 49.000 0.026 1.000 N NA
 1808581 1808582 AAur_1841 AAur_1842 lgt gltB FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 1808582 1808583 AAur_1842 AAur_1843 gltB   TRUE 0.984 -7.000 0.022 0.001 Y NA
 1808583 1808584 AAur_1843 AAur_1844   pyk FALSE 0.424 55.000 0.031 1.000 N NA
 1808588 1808589 AAur_1848 AAur_1849 xfp   FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 1808590 1808591 AAur_1850 AAur_1851     FALSE 0.177 53.000 0.000 NA   NA
 1808593 1808594 AAur_1853 AAur_1854     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1808594 1808595 AAur_1854 AAur_1855     FALSE 0.003 578.000 0.000 1.000   NA
 1808595 1808596 AAur_1855 AAur_1856   metE TRUE 0.893 3.000 0.025 1.000   NA
 1808596 1808597 AAur_1856 AAur_1857 metE   TRUE 0.925 21.000 0.775 NA   NA
 1808598 1808599 AAur_1858 AAur_1859     FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 1808599 1808600 AAur_1859 AAur_1860     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808600 1808601 AAur_1860 AAur_1861     FALSE 0.002 562.000 0.000 NA   NA
 1808601 1808602 AAur_1861 AAur_1862     FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 1808602 1808603 AAur_1862 AAur_1863     FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 1808603 1808604 AAur_1863 AAur_1864     FALSE 0.050 144.000 0.000 NA   NA
 1808605 1808606 AAur_1865 AAur_1866     TRUE 0.958 12.000 0.950 NA   NA
 1808606 1808607 AAur_1866 AAur_1867   fdhA TRUE 0.794 55.000 0.000 0.020 Y NA
 1808607 1808608 AAur_1867 AAur_1868 fdhA   FALSE 0.002 720.000 0.000 NA   NA
 1808610 1808611 AAur_1870 AAur_1871     FALSE 0.018 197.000 0.000 NA   NA
 1808611 1808612 AAur_1871 AAur_1872     FALSE 0.055 137.000 0.000 NA   NA
 1808612 1808613 AAur_1872 AAur_1873     FALSE 0.009 276.000 0.000 NA N NA
 1808613 1808614 AAur_1873 AAur_1874     FALSE 0.398 24.000 0.000 1.000   NA
 1808615 1808616 AAur_1875 AAur_1876   dnaK FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 1808616 1808617 AAur_1876 AAur_1877 dnaK grpE TRUE 0.988 9.000 0.292 0.006 Y NA
 1808617 1808618 AAur_1877 AAur_1878 grpE   TRUE 0.992 -7.000 0.271 0.006 Y NA
 1808618 1808619 AAur_1878 AAur_1879     TRUE 0.973 -3.000 0.209 NA   NA
 1808619 1808620 AAur_1879 AAur_1880   clpB TRUE 0.900 -3.000 0.011 NA   NA
 1808620 1808621 AAur_1880 AAur_1881 clpB trx TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1808621 1808622 AAur_1881 AAur_1882 trx   FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 1808622 1808623 AAur_1882 AAur_1883     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 1808624 1808625 AAur_1884 AAur_1885     FALSE 0.063 284.000 0.000 NA Y NA
 1808626 1808627 AAur_1886 AAur_1887     TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.045   NA
 1808627 1808628 AAur_1887 AAur_1888   rbsC FALSE 0.280 45.000 0.000 1.000   NA
 1808628 1808629 AAur_1888 AAur_1889 rbsC rbsB TRUE 0.617 66.000 0.000 1.000 Y NA
 1808629 1808630 AAur_1889 AAur_1890 rbsB   FALSE 0.540 78.000 0.000 NA Y NA
 1808630 1808631 AAur_1890 AAur_1891     TRUE 0.954 -7.000 0.000 NA Y NA
 1808631 1808632 AAur_1891 AAur_1892     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA Y NA
 1808632 1808633 AAur_1892 AAur_1893     TRUE 0.819 27.000 0.000 NA Y NA
 1808633 1808634 AAur_1893 AAur_1894   ppsA FALSE 0.029 410.000 0.000 NA Y NA
 1808634 1808635 AAur_1894 AAur_1895 ppsA   TRUE 0.805 34.000 0.342 NA   NA
 1808635 1808636 AAur_1895 AAur_1896     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 1808638 1808639 AAur_1898 AAur_1899   oxdA TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 1808639 1808640 AAur_1899 AAur_1900 oxdA   FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1808641 1808642 AAur_1901 AAur_1902     FALSE 0.075 146.000 0.000 1.000 N NA
 1808642 1808643 AAur_1902 AAur_1903   tdh FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000 N NA
 1808643 1808644 AAur_1903 AAur_1904 tdh   FALSE 0.389 43.000 0.013 NA   NA
 1808644 1808645 AAur_1904 AAur_1905     TRUE 0.935 -43.000 0.429 NA   NA
 1808645 1808646 AAur_1905 AAur_1906   kdgT TRUE 0.923 9.000 0.222 1.000   NA
 1808647 1808648 AAur_1907 AAur_1908     FALSE 0.002 689.000 0.000 1.000   NA
 1808648 1808649 AAur_1908 AAur_1909     FALSE 0.129 87.000 0.000 1.000   NA
 1808649 1808650 AAur_1909 AAur_1910     FALSE 0.082 114.000 0.000 NA   NA
 1808651 1808652 AAur_1911 AAur_1912   aceE FALSE 0.005 412.000 0.000 1.000 N NA
 1808652 1808653 AAur_1912 AAur_1913 aceE   FALSE 0.257 38.000 0.000 NA   NA
 1808653 1808654 AAur_1913 AAur_1914     FALSE 0.481 -94.000 0.000 NA   NA
 1808654 1808655 AAur_1914 AAur_1915     TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1808655 1808656 AAur_1915 AAur_1916     TRUE 0.933 -64.000 0.188 0.070 N NA
 1808656 1808657 AAur_1916 AAur_1917     TRUE 0.995 -3.000 0.156 0.070 Y NA
 1808658 1808659 AAur_1918 AAur_1919     FALSE 0.012 223.000 0.000 NA   NA
 1808659 1808660 AAur_1919 AAur_1920     FALSE 0.076 119.000 0.000 NA   NA
 1808660 1808661 AAur_1920 AAur_1921     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA   NA
 1808661 1808662 AAur_1921 AAur_1922     TRUE 0.987 7.000 0.188 0.045 Y NA
 1808662 1808663 AAur_1922 AAur_1923     TRUE 0.996 -3.000 0.222 0.045 Y NA
 1808663 1808664 AAur_1923 AAur_1924     TRUE 0.647 -13.000 0.000 NA N NA
 1808664 1808665 AAur_1924 AAur_1925     FALSE 0.052 149.000 0.000 NA N NA
 1808665 1808666 AAur_1925 AAur_1926     FALSE 0.485 43.000 0.031 NA N NA
 1808666 1808667 AAur_1926 AAur_1927     TRUE 0.656 7.000 0.000 NA N NA
 1808667 1808668 AAur_1927 AAur_1928     FALSE 0.328 24.000 0.000 NA   NA
 1808668 1808669 AAur_1928 AAur_1929     FALSE 0.512 -55.000 0.000 NA   NA
 1808669 1808670 AAur_1929 AAur_1930     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000   NA
 1808670 1808671 AAur_1930 AAur_1931     TRUE 0.788 74.000 0.053 0.056 Y NA
 1808671 1808672 AAur_1931 AAur_1932     TRUE 0.649 34.000 0.068 1.000 N NA
 1808672 1808673 AAur_1932 AAur_1933     FALSE 0.496 -70.000 0.000 NA   NA
 1808673 1808674 AAur_1933 AAur_1934     TRUE 0.674 -7.000 0.000 NA   NA
 1808674 1808675 AAur_1934 AAur_1935     TRUE 0.974 4.000 0.588 NA   NA
 1808677 1808678 AAur_1937 AAur_1938     FALSE 0.247 50.000 0.000 1.000   NA
 1808681 1808682 AAur_1941 AAur_1942 mmsA   FALSE 0.160 199.000 0.000 1.000 Y NA
 1808682 1808683 AAur_1942 AAur_1943     FALSE 0.165 56.000 0.000 NA   NA
 1808683 1808684 AAur_1943 AAur_1944     FALSE 0.279 31.000 0.000 NA   NA
 1808684 1808685 AAur_1944 AAur_1945     TRUE 0.990 0.000 0.810 NA   NA
 1808685 1808686 AAur_1945 AAur_1946     TRUE 0.898 25.000 0.608 NA   NA
 1808688 1808689 AAur_1948 AAur_1949     TRUE 0.944 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1808689 1808690 AAur_1949 AAur_1950     FALSE 0.003 412.000 0.000 NA   NA
 1808690 1808691 AAur_1950 AAur_1951     FALSE 0.027 173.000 0.000 NA   NA
 1808692 1808693 AAur_1952 AAur_1953 rbsR   TRUE 0.597 78.000 0.333 1.000 N NA
 1808693 1808694 AAur_1953 AAur_1954     TRUE 0.875 126.000 0.643 0.070 Y NA
 1808694 1808695 AAur_1954 AAur_1955     TRUE 0.989 11.000 0.632 0.070 Y NA
 1808695 1808696 AAur_1955 AAur_1956     TRUE 0.994 -3.000 0.316 1.000 Y NA
 1808696 1808697 AAur_1956 AAur_1957     TRUE 0.993 -3.000 0.050 0.002 Y NA
 1808697 1808698 AAur_1957 AAur_1958     TRUE 0.951 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1808698 1808699 AAur_1958 AAur_1959     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.024 Y NA
 1808699 1808700 AAur_1959 AAur_1960     TRUE 0.827 28.000 0.000 1.000 Y NA
 1808702 1808703 AAur_1962 AAur_1963 mntB   TRUE 0.960 3.000 0.238 NA   NA
 1808703 1808704 AAur_1963 AAur_1964     TRUE 0.970 -3.000 0.185 NA   NA
 1808704 1808705 AAur_1964 AAur_1965     TRUE 0.751 51.000 0.412 NA   NA
 1808706 1808707 AAur_1966 AAur_1967     TRUE 0.908 13.000 0.429 NA   NA
 1808708 1808709 AAur_1968 AAur_1969     FALSE 0.079 143.000 0.000 1.000 N NA
 1808709 1808710 AAur_1969 AAur_1970     TRUE 0.869 31.000 0.000 0.070 Y NA
 1808710 1808711 AAur_1970 AAur_1971     TRUE 0.992 -16.000 0.556 0.070 Y NA
 1808711 1808712 AAur_1971 AAur_1972     TRUE 0.621 -25.000 0.000 1.000   NA
 1808713 1808714 AAur_1973 AAur_1974     FALSE 0.248 40.000 0.000 NA   NA
 1808714 1808715 AAur_1974 AAur_1975     TRUE 0.940 10.000 0.474 NA   NA
 1808716 1808717 AAur_1976 AAur_1977     FALSE 0.220 97.000 0.021 1.000   NA
 1808717 1808718 AAur_1977 AAur_1978     TRUE 0.972 -3.000 0.179 1.000   NA
 1808718 1808719 AAur_1978 AAur_1979     TRUE 0.943 7.000 0.098 0.040   NA
 1808719 1808720 AAur_1979 AAur_1980   mmsA TRUE 0.744 46.000 0.250 1.000 N NA
 1808720 1808721 AAur_1980 AAur_1981 mmsA   FALSE 0.543 83.000 0.250 1.000 N NA
 1808721 1808722 AAur_1981 AAur_1982     TRUE 0.724 43.000 0.200 1.000   NA
 1808722 1808723 AAur_1982 AAur_1983     TRUE 0.903 13.000 0.400 NA   NA
 1808724 1808725 AAur_1984 AAur_1985     FALSE 0.085 111.000 0.000 NA   NA
 1808725 1808726 AAur_1985 AAur_1986     TRUE 0.990 -3.000 0.727 NA   NA
 1808727 1808728 AAur_1987 AAur_1988     TRUE 0.726 4.000 0.000 NA N NA
 1808728 1808729 AAur_1988 AAur_1989     TRUE 0.979 -22.000 0.333 NA Y NA
 1808729 1808730 AAur_1989 AAur_1990     TRUE 0.906 12.000 0.333 1.000   NA
 1808730 1808731 AAur_1990 AAur_1991     FALSE 0.109 113.000 0.000 1.000   NA
 1808731 1808732 AAur_1991 AAur_1992     TRUE 0.969 -3.000 0.036 0.045   NA
 1808732 1808733 AAur_1992 AAur_1993     TRUE 0.587 34.000 0.000 0.045   NA
 1808733 1808734 AAur_1993 AAur_1994     TRUE 0.920 -78.000 0.095 0.001   NA
 1808735 1808736 AAur_1995 AAur_1996     FALSE 0.479 46.000 0.026 1.000 N NA
 1808737 1808738 AAur_1997 AAur_1998     FALSE 0.040 152.000 0.000 NA   NA
 1808738 1808739 AAur_1998 AAur_1999     TRUE 0.880 -54.000 0.154 NA N NA
 1808739 1808740 AAur_1999 AAur_2000     TRUE 0.984 -3.000 0.154 0.040 N NA
 1808740 1808741 AAur_2000 AAur_2001     FALSE 0.113 120.000 0.000 1.000 N NA
 1808743 1808744 AAur_2003 AAur_2004     TRUE 0.954 5.000 0.333 NA   NA
 1808745 1808746 AAur_2005 AAur_2006     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 1808748 1808749 AAur_2008 AAur_2009     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 1808753 1808754 AAur_2012 AAur_2014     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808755 1808756 AAur_2015 AAur_2016     TRUE 0.946 45.000 0.577 1.000 Y NA
 1808756 1808757 AAur_2016 AAur_2017     TRUE 0.983 10.000 0.448 1.000 Y NA
 1808757 1808758 AAur_2017 AAur_2018     FALSE 0.088 104.000 0.000 NA   NA
 1808758 1808759 AAur_2018 AAur_2019     FALSE 0.100 85.000 0.000 NA   NA
 1808761 1808762 AAur_2021 AAur_2022     TRUE 0.682 7.000 0.000 1.000   NA
 1808765 1808766 AAur_2024 AAur_2026     FALSE 0.481 18.000 0.000 1.000 N NA
 1808766 1808767 AAur_2026 AAur_2027     FALSE 0.115 72.000 0.000 NA   NA
 1808767 1808768 AAur_2027 AAur_2028     TRUE 0.957 -18.000 0.569 NA   NA
 1808768 1808769 AAur_2028 AAur_2029     TRUE 0.977 4.000 0.633 NA   NA
 1808769 1808770 AAur_2029 AAur_2030     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808770 1808771 AAur_2030 AAur_2031     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808771 1808772 AAur_2031 AAur_2032     FALSE 0.113 108.000 0.000 1.000   NA
 1808775 1808776 AAur_2035 AAur_2036     TRUE 0.888 37.000 0.750 NA   NA
 1808777 1808778 AAur_2037 AAur_2038     FALSE 0.086 109.000 0.000 NA   NA
 1808778 1808779 AAur_2038 AAur_2039     FALSE 0.095 91.000 0.000 NA   NA
 1808780 1808781 AAur_2040 AAur_2041     TRUE 0.579 -64.000 0.000 1.000   NA
 1808782 1808783 AAur_2042 AAur_2043     TRUE 0.958 -73.000 0.714 1.000   NA
 1808784 1808785 AAur_2044 AAur_2045     FALSE 0.357 20.000 0.000 NA   NA
 1808785 1808786 AAur_2045 AAur_2046     TRUE 0.748 4.000 0.000 1.000   NA
 1808788 1808789 AAur_2048 AAur_2049     FALSE 0.407 28.000 0.000 1.000 N NA
 1808790 1808791 AAur_2050 AAur_2051     FALSE 0.348 21.000 0.000 NA   NA
 1808791 1808792 AAur_2051 AAur_2052     TRUE 0.971 -16.000 0.810 NA   NA
 1808792 1808793 AAur_2052 AAur_2053     TRUE 0.985 -3.000 0.471 NA N NA
 1808793 1808794 AAur_2053 AAur_2054     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA N NA
 1808796 1808797 AAur_2056 AAur_2057     TRUE 0.879 -58.000 0.158 NA N NA
 1808797 1808798 AAur_2057 AAur_2058   kynA TRUE 0.831 47.000 0.050 1.000 Y NA
 1808799 1808800 AAur_2059 AAur_2060     FALSE 0.023 182.000 0.000 NA   NA
 1808800 1808801 AAur_2060 AAur_2061     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 1808801 1808802 AAur_2061 AAur_2062     TRUE 0.670 70.000 0.500 NA   NA
 1808802 1808803 AAur_2062 AAur_2063     FALSE 0.303 28.000 0.000 NA   NA
 1808805 1808806 AAur_2065 AAur_2066 polA   FALSE 0.194 85.000 0.005 1.000   NA
 1808806 1808807 AAur_2066 AAur_2067     FALSE 0.240 51.000 0.000 1.000   NA
 1808807 1808808 AAur_2067 AAur_2068   rpsA FALSE 0.035 185.000 0.000 1.000 N NA
 1808810 1808811 AAur_2070 AAur_2071 coaE uvrB TRUE 0.704 30.000 0.026 0.086 N NA
 1808811 1808812 AAur_2071 AAur_2072 uvrB   FALSE 0.076 169.000 0.013 1.000 N NA
 1808812 1808813 AAur_2072 AAur_2074     TRUE 0.767 30.000 0.053 0.056 N NA
 1808814 1808815 AAur_2073 AAur_2075 pip   TRUE 0.789 -31.000 0.031 1.000   NA
 1808815 1808816 AAur_2075 AAur_2076     FALSE 0.551 33.000 0.000 0.080   NA
 1808816 1808817 AAur_2076 AAur_2077     FALSE 0.524 12.000 0.000 1.000   NA
 1808818 1808819 AAur_2078 AAur_2079 tam   FALSE 0.046 158.000 0.000 1.000   NA
 1808819 1808820 AAur_2079 AAur_2080   uvrA FALSE 0.257 66.000 0.004 1.000 N NA
 1808820 1808821 AAur_2080 AAur_2081 uvrA   FALSE 0.163 114.000 0.005 1.000   NA
 1808821 1808822 AAur_2081 AAur_2082     TRUE 0.893 -13.000 0.023 0.080   NA
 1808822 1808823 AAur_2082 AAur_2083   uvrC FALSE 0.319 58.000 0.007 1.000 N NA
 1808823 1808824 AAur_2083 AAur_2084 uvrC   FALSE 0.212 132.000 0.073 NA   NA
 1808824 1808825 AAur_2084 AAur_2085     TRUE 0.975 0.000 0.259 NA   NA
 1808825 1808826 AAur_2085 AAur_2086     TRUE 0.940 10.000 0.470 NA   NA
 1808826 1808827 AAur_2086 AAur_2087   sodA FALSE 0.064 162.000 0.012 NA   NA
 1808827 1808828 AAur_2087 AAur_2088 sodA gap FALSE 0.012 272.000 0.000 1.000 N NA
 1808828 1808829 AAur_2088 AAur_2089 gap pgk TRUE 0.974 10.000 0.055 0.004 Y NA
 1808829 1808830 AAur_2089 AAur_2090 pgk tpiA TRUE 0.724 75.000 0.075 1.000 Y NA
 1808830 1808831 AAur_2090 AAur_2091 tpiA secG TRUE 0.616 37.000 0.064 1.000   NA
 1808832 1808833 AAur_2092 AAur_2093 pgl   TRUE 0.988 -10.000 0.463 NA Y NA
 1808833 1808834 AAur_2093 AAur_2094   zwf TRUE 0.996 -3.000 0.583 NA Y NA
 1808834 1808835 AAur_2094 AAur_2095 zwf pgi TRUE 0.925 16.000 0.061 1.000 Y NA
 1808835 1808836 AAur_2095 AAur_2096 pgi tal TRUE 0.962 7.000 0.025 1.000 Y NA
 1808836 1808837 AAur_2096 AAur_2097 tal tkt TRUE 0.909 33.000 0.135 1.000 Y NA
 1808839 1808840 AAur_2099 AAur_2100     FALSE 0.295 29.000 0.000 NA   NA
 1808840 1808841 AAur_2100 AAur_2101     TRUE 0.597 47.000 0.106 NA N NA
 1808841 1808842 AAur_2101 AAur_2102     TRUE 0.997 -3.000 0.743 NA Y NA
 1808843 1808844 AAur_2103 AAur_2104   sufB TRUE 0.963 0.000 0.100 1.000 N NA
 1808844 1808845 AAur_2104 AAur_2105 sufB sufD TRUE 0.995 3.000 0.266 0.001 Y NA
 1808845 1808846 AAur_2105 AAur_2106 sufD   TRUE 0.717 22.000 0.063 1.000 N NA
 1808846 1808847 AAur_2106 AAur_2107   sufC FALSE 0.552 44.000 0.046 1.000 N NA
 1808847 1808848 AAur_2107 AAur_2108 sufC   TRUE 0.622 14.000 0.021 NA   NA
 1808850 1808851 AAur_2110 AAur_2112     TRUE 0.984 -73.000 0.576 1.000 Y NA
 1808852 1808853 AAur_2111 AAur_2113     TRUE 0.978 -3.000 0.224 1.000 N NA
 1808853 1808854 AAur_2113 AAur_2114     TRUE 0.681 18.000 0.056 NA   NA
 1808856 1808857 AAur_2116 AAur_2117     TRUE 0.756 -16.000 0.017 NA   NA
 1808857 1808858 AAur_2117 AAur_2118     TRUE 0.955 1.000 0.125 NA   NA
 1808858 1808859 AAur_2118 AAur_2119     TRUE 0.987 -3.000 0.562 NA   NA
 1808860 1808861 AAur_2120 AAur_2121 fabG   FALSE 0.542 117.000 0.008 1.000 Y NA
 1808861 1808862 AAur_2121 AAur_2122   rbsA FALSE 0.006 342.000 0.000 1.000 N NA
 1808863 1808864 AAur_2123 AAur_2124   serB FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 1808865 1808866 AAur_2125 AAur_2126     TRUE 0.776 20.000 0.119 1.000   NA
 1808866 1808867 AAur_2126 AAur_2127     TRUE 0.854 8.000 0.052 1.000   NA
 1808867 1808868 AAur_2127 AAur_2128   rpmE TRUE 0.981 1.000 0.008 1.000 Y NA
 1808868 1808869 AAur_2128 AAur_2129 rpmE   FALSE 0.390 50.000 0.010 1.000 N NA
 1808870 1808871 AAur_2130 AAur_2131 pepN   TRUE 0.842 5.000 0.031 NA   NA
 1808872 1808873 AAur_2132 AAur_2133     TRUE 0.960 -67.000 0.805 NA   NA
 1808873 1808874 AAur_2133 AAur_2134     TRUE 0.955 -3.000 0.089 NA   NA
 1808875 1808876 AAur_2135 AAur_2136   glgC FALSE 0.351 65.000 0.032 1.000 N NA
 1808878 1808879 AAur_2138 AAur_2139     FALSE 0.210 47.000 0.000 NA   NA
 1808880 1808881 AAur_2140 AAur_2141     TRUE 0.977 -37.000 0.296 1.000 Y NA
 1808881 1808882 AAur_2141 AAur_2142     TRUE 0.990 -3.000 0.412 0.079   NA
 1808884 1808885 AAur_2144 AAur_2145     TRUE 0.718 29.000 0.100 1.000 N NA
 1808887 1808888 AAur_2147 AAur_2148     TRUE 0.566 9.000 0.000 NA   NA
 1808888 1808889 AAur_2148 AAur_2149     FALSE 0.051 143.000 0.000 NA   NA
 1808889 1808890 AAur_2149 AAur_2150     FALSE 0.389 58.000 0.035 1.000   NA
 1808890 1808891 AAur_2150 AAur_2151     TRUE 0.961 -3.000 0.094 1.000   NA
 1808891 1808892 AAur_2151 AAur_2152     TRUE 0.996 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 1808892 1808893 AAur_2152 AAur_2153     TRUE 0.989 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 1808893 1808894 AAur_2153 AAur_2154     TRUE 0.941 -66.000 0.027 1.000 Y NA
 1808894 1808895 AAur_2154 AAur_2155     TRUE 0.972 2.000 0.273 1.000   NA
 1808895 1808896 AAur_2155 AAur_2156     FALSE 0.088 104.000 0.000 NA   NA
 1808896 1808897 AAur_2156 AAur_2157     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808897 1808898 AAur_2157 AAur_2158     TRUE 0.891 -15.000 0.125 NA   NA
 1808898 1808899 AAur_2158 AAur_2159     TRUE 0.945 -12.000 0.333 NA   NA
 1808899 1808900 AAur_2159 AAur_2160     FALSE 0.195 59.000 0.000 1.000   NA
 1808900 1808901 AAur_2160 AAur_2161     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808902 1808903 AAur_2162 AAur_2163     TRUE 0.951 -3.000 0.077 NA   NA
 1808903 1808904 AAur_2163 AAur_2164   rfbC/rfbD FALSE 0.043 162.000 0.000 1.000   NA
 1808904 1808905 AAur_2164 AAur_2165 rfbC/rfbD rfbB TRUE 0.978 4.000 0.000 0.003 Y NA
 1808908 1808909 AAur_2168 AAur_2169     TRUE 0.759 16.000 0.071 1.000 N NA
 1808911 1808912 AAur_2171 AAur_2172     TRUE 0.954 1.000 0.095 1.000   NA
 1808912 1808913 AAur_2172 AAur_2173     TRUE 0.818 22.000 0.201 1.000   NA
 1808913 1808914 AAur_2173 AAur_2174     FALSE 0.482 98.000 0.215 1.000 N NA
 1808914 1808915 AAur_2174 AAur_2175     TRUE 0.983 -3.000 0.416 NA   NA
 1808915 1808916 AAur_2175 AAur_2176     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 1808916 1808917 AAur_2176 AAur_2177     TRUE 0.817 -3.000 0.000 NA   NA
 1808917 1808918 AAur_2177 AAur_2178     TRUE 0.994 -34.000 0.797 0.001 Y NA
 1808918 1808919 AAur_2178 AAur_2179     TRUE 0.969 2.000 0.271 NA   NA
 1808919 1808920 AAur_2179 AAur_2180     FALSE 0.479 46.000 0.047 NA   NA
 1808920 1808921 AAur_2180 AAur_2181     TRUE 0.563 74.000 0.063 0.001   NA
 1808921 1808922 AAur_2181 AAur_2182     FALSE 0.530 48.000 0.068 NA N NA
 1808922 1808923 AAur_2182 AAur_2183     TRUE 0.801 10.000 0.055 NA   NA
 1808923 1808924 AAur_2183 AAur_2184   tatA TRUE 0.826 37.000 0.444 NA   NA
 1808924 1808925 AAur_2184 AAur_2185 tatA tatC TRUE 0.822 7.000 0.035 NA   NA
 1808925 1808926 AAur_2185 AAur_2186 tatC   TRUE 0.772 25.000 0.166 NA N NA
 1808926 1808927 AAur_2186 AAur_2187     TRUE 0.806 17.000 0.140 1.000   NA
 1808927 1808928 AAur_2187 AAur_2188     FALSE 0.007 427.000 0.014 1.000   NA
 1808929 1808930 AAur_2189 AAur_2190     FALSE 0.021 258.000 0.021 NA   NA
 1808930 1808931 AAur_2190 AAur_2191     TRUE 0.775 93.000 0.259 NA Y NA
 1808931 1808932 AAur_2191 AAur_2192     FALSE 0.394 36.000 0.006 NA   NA
 1808936 1808937 AAur_2196 AAur_2197     TRUE 0.966 -55.000 0.133 1.000 Y NA
 1808937 1808938 AAur_2197 AAur_2198     TRUE 0.977 -3.000 0.213 1.000 N NA
 1808940 1808941 AAur_2200 AAur_2201     FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 1808941 1808942 AAur_2201 AAur_2202     FALSE 0.094 92.000 0.000 NA   NA
 1808942 1808943 AAur_2202 AAur_2203     FALSE 0.061 131.000 0.000 NA   NA
 1808944 1808945 AAur_2204 AAur_2205     FALSE 0.418 50.000 0.036 NA   NA
 1808947 1808948 AAur_2207 AAur_2208     TRUE 0.780 89.000 0.070 0.044 Y NA
 1808948 1808949 AAur_2208 AAur_2209     TRUE 0.882 84.000 0.351 0.044 Y NA
 1808949 1808950 AAur_2209 AAur_2210     TRUE 0.989 -31.000 0.457 0.044 Y NA
 1808953 1808954 AAur_2213 AAur_2214   ctaD TRUE 0.976 -3.000 0.250 NA   NA
 1808954 1808955 AAur_2214 AAur_2215 ctaD   TRUE 0.984 11.000 0.284 0.001 Y NA
 1808955 1808956 AAur_2215 AAur_2216     FALSE 0.131 127.000 0.014 NA   NA
 1808956 1808957 AAur_2216 AAur_2217     FALSE 0.063 165.000 0.014 NA   NA
 1808960 1808961 AAur_2220 AAur_2221     TRUE 0.602 10.000 0.000 1.000   NA
 1808961 1808962 AAur_2221 AAur_2222     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA Y NA
 1808963 1808964 AAur_2223 AAur_2224 uppS   TRUE 0.937 3.000 0.076 1.000 N NA
 1808964 1808965 AAur_2224 AAur_2225   leuA TRUE 0.837 5.000 0.011 1.000 N NA
 1808967 1808968 AAur_2227 AAur_2228   era FALSE 0.087 107.000 0.000 NA   NA
 1808968 1808969 AAur_2228 AAur_2229 era   TRUE 0.832 -97.000 0.089 1.000   NA
 1808969 1808970 AAur_2229 AAur_2230     TRUE 0.974 -3.000 0.222 NA   NA
 1808970 1808971 AAur_2230 AAur_2231     TRUE 0.984 -3.000 0.457 NA   NA
 1808973 1808974 AAur_2233 AAur_2234   dnaJ TRUE 0.912 3.000 0.058 NA   NA
 1808974 1808975 AAur_2234 AAur_2235 dnaJ hrcA FALSE 0.522 51.000 0.059 1.000 N NA
 1808976 1808977 AAur_2236 AAur_2237     TRUE 0.590 45.000 0.099 NA   NA
 1808978 1808979 AAur_2238 AAur_2239   lepA TRUE 0.954 1.000 0.083 1.000 N NA
 1808980 1808981 AAur_2240 AAur_2241   rpsT FALSE 0.045 185.000 0.013 NA   NA
 1808982 1808983 AAur_2242 AAur_2243 holA   TRUE 0.897 9.000 0.163 NA   NA
 1808983 1808984 AAur_2243 AAur_2244     TRUE 0.923 -7.000 0.130 NA   NA
 1808984 1808985 AAur_2244 AAur_2245     FALSE 0.210 74.000 0.014 NA   NA
 1808985 1808986 AAur_2245 AAur_2246   leuS TRUE 0.716 9.000 0.009 NA   NA
 1808986 1808987 AAur_2246 AAur_2247 leuS glpK FALSE 0.010 293.000 0.000 1.000 N NA
 1808987 1808988 AAur_2247 AAur_2248 glpK glpF FALSE 0.501 76.000 0.174 1.000 N NA
 1808988 1808989 AAur_2248 AAur_2249 glpF glpD FALSE 0.088 171.000 0.027 1.000 N NA
 1808990 1808991 AAur_2250 AAur_2251     TRUE 0.920 -13.000 0.167 1.000   NA
 1808991 1808992 AAur_2251 AAur_2252     TRUE 0.888 11.000 0.200 1.000   NA
 1808992 1808993 AAur_2252 AAur_2253     TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1808994 1808995 AAur_2254 AAur_2255     TRUE 0.599 -87.000 0.000 1.000 N NA
 1808995 1808996 AAur_2255 AAur_2256   vanA FALSE 0.382 16.000 0.000 NA   NA
 1808998 1808999 AAur_2257 AAur_2259   metK FALSE 0.099 179.000 0.068 NA N NA
 1808999 1809000 AAur_2259 AAur_2260 metK coaBC TRUE 0.702 77.000 0.059 1.000 Y NA
 1809000 1809001 AAur_2260 AAur_2261 coaBC rpoZ TRUE 0.793 28.000 0.192 1.000 N NA
 1809001 1809002 AAur_2261 AAur_2262 rpoZ   TRUE 0.843 40.000 0.471 1.000 N NA
 1809002 1809003 AAur_2262 AAur_2263     TRUE 0.681 22.000 0.054 1.000   NA
 1809003 1809004 AAur_2263 AAur_2264   pyrF FALSE 0.285 74.000 0.029 1.000   NA
 1809004 1809005 AAur_2264 AAur_2265 pyrF carB TRUE 0.978 -7.000 0.075 1.000 Y NA
 1809005 1809006 AAur_2265 AAur_2266 carB carA TRUE 0.997 0.000 0.345 0.001 Y NA
 1809006 1809007 AAur_2266 AAur_2267 carA   TRUE 0.816 -19.000 0.050 NA   NA
 1809007 1809008 AAur_2267 AAur_2268   pyrC TRUE 0.939 0.000 0.057 NA   NA
 1809008 1809009 AAur_2268 AAur_2269 pyrC pyrB TRUE 0.995 0.000 0.452 1.000 Y NA
 1809009 1809010 AAur_2269 AAur_2270 pyrB pyrR TRUE 0.994 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 1809012 1809013 AAur_2272 AAur_2273 nusB efp TRUE 0.958 0.000 0.078 1.000 N NA
 1809013 1809014 AAur_2273 AAur_2274 efp   FALSE 0.071 156.000 0.003 1.000   NA
 1809014 1809015 AAur_2274 AAur_2275   aroB TRUE 0.903 -3.000 0.003 1.000   NA
 1809015 1809016 AAur_2275 AAur_2276 aroB aroK TRUE 0.983 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 1809016 1809017 AAur_2276 AAur_2277 aroK aroF TRUE 0.982 0.000 0.002 1.000 Y NA
 1809017 1809018 AAur_2277 AAur_2278 aroF aroE TRUE 0.945 -36.000 0.021 1.000 Y NA
 1809018 1809019 AAur_2278 AAur_2279 aroE   TRUE 0.855 -9.000 0.045 NA   NA
 1809019 1809020 AAur_2279 AAur_2280     TRUE 0.932 -3.000 0.039 NA   NA
 1809020 1809021 AAur_2280 AAur_2281   alaS TRUE 0.945 3.000 0.103 1.000 N NA
 1809021 1809022 AAur_2281 AAur_2282 alaS   FALSE 0.461 38.000 0.023 NA   NA
 1809022 1809023 AAur_2282 AAur_2283     FALSE 0.402 53.000 0.042 NA   NA
 1809023 1809024 AAur_2283 AAur_2284   rpsD FALSE 0.060 159.000 0.007 NA   NA
 1809024 1809025 AAur_2284 AAur_2285 rpsD   FALSE 0.038 205.000 0.005 1.000 N NA
 1809027 1809028 AAur_2286 AAur_2288   aspS FALSE 0.164 96.000 0.002 1.000   NA
 1809028 1809029 AAur_2288 AAur_2289 aspS   TRUE 0.925 24.000 0.020 0.029 Y NA
 1809030 1809031 AAur_2290 AAur_2291     FALSE 0.422 67.000 0.103 NA   NA
 1809031 1809032 AAur_2291 AAur_2292     FALSE 0.329 104.000 0.103 NA   NA
 1809033 1809034 AAur_2293 AAur_2294   secF FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 1809034 1809035 AAur_2294 AAur_2295 secF secD TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 1809035 1809036 AAur_2295 AAur_2296 secD yajC TRUE 0.618 115.000 0.062 NA Y NA
 1809036 1809037 AAur_2296 AAur_2297 yajC ruvB FALSE 0.294 99.000 0.063 NA N NA
 1809037 1809038 AAur_2297 AAur_2298 ruvB ruvA TRUE 0.995 -7.000 0.549 0.001 Y NA
 1809038 1809039 AAur_2298 AAur_2299 ruvA ruvC TRUE 0.948