MicrobesOnline Operon Predictions for Renibacterium salmoninarum ATCC 33209

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3396257 3396258 RSal33209_0001 RSal33209_0002 dnaA   FALSE 0.250 317.000 0.328 1.000 Y NA
 3396258 3396259 RSal33209_0002 RSal33209_0003     FALSE 0.474 44.000 0.024 1.000 N NA
 3396259 3396260 RSal33209_0003 RSal33209_0004   recF TRUE 0.916 2.000 0.029 1.000 N NA
 3396260 3396261 RSal33209_0004 RSal33209_0005 recF   TRUE 0.803 -19.000 0.099 NA   NA
 3396261 3396262 RSal33209_0005 RSal33209_0006     FALSE 0.034 259.000 0.022 NA   NA
 3396262 3396263 RSal33209_0006 RSal33209_0007     TRUE 0.974 79.000 0.306 0.002 Y NA
 3396263 3396264 RSal33209_0007 RSal33209_0008     TRUE 0.778 -13.000 0.053 NA   NA
 3396264 3396265 RSal33209_0008 RSal33209_0009     FALSE 0.157 77.000 0.000 NA   NA
 3396265 3396266 RSal33209_0009 RSal33209_0010     FALSE 0.403 27.000 0.000 NA   NA
 3396266 3396267 RSal33209_0010 RSal33209_0011     TRUE 0.566 11.000 0.000 NA   NA
 3396267 3396268 RSal33209_0011 RSal33209_0012     FALSE 0.048 155.000 0.000 NA   NA
 3396269 3396270 RSal33209_0013 RSal33209_0014     TRUE 0.535 47.000 0.078 NA   NA
 3396271 3396272 RSal33209_0015 RSal33209_0016     TRUE 0.898 13.000 0.182 1.000   NA
 3396272 3396273 RSal33209_0016 RSal33209_0017     FALSE 0.052 187.000 0.000 1.000   NA
 3396274 3396275 RSal33209_0018 RSal33209_0019     TRUE 0.578 22.000 0.000 1.000   NA
 3396276 3396277 RSal33209_0020 RSal33209_0021     TRUE 0.912 -3.000 0.038 NA   NA
 3396277 3396278 RSal33209_0021 RSal33209_0022     TRUE 0.981 -3.000 0.571 NA N NA
 3396286 3396287 RSal33209_0030 RSal33209_0031     TRUE 0.932 39.000 0.000 0.002   NA
 3396287 3396288 RSal33209_0031 RSal33209_0032     TRUE 0.984 -7.000 0.000 0.002   NA
 3396288 3396289 RSal33209_0032 RSal33209_0033     FALSE 0.108 108.000 0.000 NA   NA
 3396290 3396291 RSal33209_0034 RSal33209_0035     FALSE 0.104 110.000 0.000 NA   NA
 3396291 3396292 RSal33209_0035 RSal33209_0036     FALSE 0.063 137.000 0.000 NA   NA
 3396292 3396293 RSal33209_0036 RSal33209_0037     FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 3396293 3396294 RSal33209_0037 RSal33209_0038     TRUE 0.974 25.000 0.000 0.001   NA
 3396296 3396297 RSal33209_0040 RSal33209_0041     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 3396298 3396299 RSal33209_0042 RSal33209_0043     TRUE 0.968 -3.000 0.261 NA   NA
 3396299 3396300 RSal33209_0043 RSal33209_0044     FALSE 0.531 72.000 0.174 NA   NA
 3396303 3396304 RSal33209_0047 RSal33209_0048 sixA   FALSE 0.433 25.000 0.000 NA   NA
 3396305 3396306 RSal33209_0049 RSal33209_0050     FALSE 0.009 714.000 0.000 NA   NA
 3396306 3396307 RSal33209_0050 RSal33209_0051     TRUE 0.993 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 3396308 3396309 RSal33209_0052 RSal33209_0053     FALSE 0.159 73.000 0.000 NA   NA
 3396309 3396310 RSal33209_0053 RSal33209_0054     TRUE 0.989 -3.000 0.056 0.067   NA
 3396310 3396311 RSal33209_0054 RSal33209_0055     TRUE 0.971 -3.000 0.208 1.000   NA
 3396313 3396314 RSal33209_0057 RSal33209_0058     FALSE 0.181 57.000 0.000 NA   NA
 3396315 3396316 RSal33209_0059 RSal33209_0060     TRUE 0.804 5.000 0.000 1.000   NA
 3396317 3396318 RSal33209_0061 RSal33209_0062     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 3396318 3396319 RSal33209_0062 RSal33209_0063     TRUE 0.918 22.000 0.596 NA   NA
 3396319 3396320 RSal33209_0063 RSal33209_0064     FALSE 0.153 85.000 0.000 NA   NA
 3396322 3396323 RSal33209_0066 RSal33209_0067     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396326 3396327 RSal33209_0070 RSal33209_0071     FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 3396328 3396329 RSal33209_0072 RSal33209_0073     FALSE 0.030 197.000 0.000 NA   NA
 3396330 3396331 RSal33209_0074 RSal33209_0075     FALSE 0.080 177.000 0.030 NA   NA
 3396331 3396332 RSal33209_0075 RSal33209_0076     TRUE 0.902 -3.000 0.030 NA   NA
 3396334 3396335 RSal33209_0078 RSal33209_0079     TRUE 0.795 10.000 0.015 1.000 N NA
 3396338 3396339 RSal33209_0082 RSal33209_0083     TRUE 0.918 35.000 0.000 0.005   NA
 3396339 3396340 RSal33209_0083 RSal33209_0084     FALSE 0.289 51.000 0.000 1.000   NA
 3396340 3396341 RSal33209_0084 RSal33209_0085     TRUE 0.991 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 3396342 3396343 RSal33209_0086 RSal33209_0087     FALSE 0.519 -15.000 0.000 NA   NA
 3396344 3396345 RSal33209_0088 RSal33209_0089     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3396345 3396346 RSal33209_0089 RSal33209_0090     FALSE 0.132 147.000 0.043 NA   NA
 3396346 3396347 RSal33209_0090 RSal33209_0091     FALSE 0.489 19.000 0.000 NA   NA
 3396347 3396348 RSal33209_0091 RSal33209_0092     TRUE 0.804 5.000 0.000 1.000   NA
 3396348 3396349 RSal33209_0092 RSal33209_0093     FALSE 0.450 23.000 0.000 NA   NA
 3396349 3396350 RSal33209_0093 RSal33209_0094     TRUE 0.892 4.000 0.052 NA   NA
 3396355 3396356 RSal33209_0099 RSal33209_0100 relB relE TRUE 0.979 -3.000 0.490 NA   NA
 3396358 3396359 RSal33209_0102 RSal33209_0103     FALSE 0.183 56.000 0.000 NA   NA
 3396360 3396361 RSal33209_0104 RSal33209_0105     TRUE 0.944 28.000 0.000 0.004   NA
 3396361 3396362 RSal33209_0105 RSal33209_0106     TRUE 0.987 4.000 0.000 0.004   NA
 3396362 3396363 RSal33209_0106 RSal33209_0107     FALSE 0.023 300.000 0.000 1.000   NA
 3396363 3396364 RSal33209_0107 RSal33209_0108     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 3396364 3396365 RSal33209_0108 RSal33209_0109     FALSE 0.024 221.000 0.000 NA   NA
 3396365 3396366 RSal33209_0109 RSal33209_0110     TRUE 0.771 8.000 0.000 1.000   NA
 3396366 3396367 RSal33209_0110 RSal33209_0111     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002   NA
 3396368 3396369 RSal33209_0112 RSal33209_0113     FALSE 0.219 48.000 0.000 NA   NA
 3396369 3396370 RSal33209_0113 RSal33209_0114     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 3396370 3396371 RSal33209_0114 RSal33209_0115     FALSE 0.015 295.000 0.000 NA   NA
 3396371 3396372 RSal33209_0115 RSal33209_0116     TRUE 0.603 -9.000 0.000 NA   NA
 3396372 3396373 RSal33209_0116 RSal33209_0117     TRUE 0.546 112.000 0.429 NA   NA
 3396373 3396374 RSal33209_0117 RSal33209_0118     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396374 3396375 RSal33209_0118 RSal33209_0119     FALSE 0.188 54.000 0.000 NA   NA
 3396375 3396376 RSal33209_0119 RSal33209_0120     FALSE 0.453 -33.000 0.000 NA   NA
 3396376 3396377 RSal33209_0120 RSal33209_0121     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396377 3396378 RSal33209_0121 RSal33209_0122     TRUE 0.942 0.000 0.000 NA Y NA
 3396378 3396379 RSal33209_0122 RSal33209_0123     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 3396379 3396380 RSal33209_0123 RSal33209_0124     FALSE 0.158 75.000 0.000 NA   NA
 3396380 3396381 RSal33209_0124 RSal33209_0125   dps FALSE 0.326 46.000 0.000 1.000   NA
 3396384 3396385 RSal33209_0128 RSal33209_0129     FALSE 0.174 64.000 0.000 NA   NA
 3396385 3396386 RSal33209_0129 RSal33209_0130     FALSE 0.230 76.000 0.000 1.000   NA
 3396386 3396387 RSal33209_0130 RSal33209_0131   msa1 FALSE 0.008 990.000 0.000 NA   NA
 3396387 3396388 RSal33209_0131 RSal33209_0132 msa1   TRUE 0.566 11.000 0.000 NA   NA
 3396388 3396389 RSal33209_0132 RSal33209_0133     FALSE 0.029 200.000 0.000 NA   NA
 3396389 3396390 RSal33209_0133 RSal33209_0134     TRUE 0.919 29.000 0.000 0.029   NA
 3396391 3396392 RSal33209_0135 RSal33209_0136     TRUE 0.982 10.000 0.308 0.098   NA
 3396392 3396393 RSal33209_0136 RSal33209_0137     FALSE 0.031 194.000 0.000 NA   NA
 3396394 3396395 RSal33209_0138 RSal33209_0139     TRUE 0.930 48.000 0.000 0.005 Y NA
 3396395 3396396 RSal33209_0139 RSal33209_0140     FALSE 0.008 984.000 0.000 NA   NA
 3396396 3396397 RSal33209_0140 RSal33209_0141     FALSE 0.377 29.000 0.000 NA   NA
 3396397 3396398 RSal33209_0141 RSal33209_0142     FALSE 0.501 17.000 0.000 NA   NA
 3396398 3396399 RSal33209_0142 RSal33209_0143     FALSE 0.020 240.000 0.000 NA   NA
 3396401 3396402 RSal33209_0145 RSal33209_0146     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 3396402 3396403 RSal33209_0146 RSal33209_0147     FALSE 0.224 85.000 0.000 1.000   NA
 3396403 3396404 RSal33209_0147 RSal33209_0148     FALSE 0.144 813.000 0.000 0.021   NA
 3396405 3396406 RSal33209_0149 RSal33209_0150     FALSE 0.067 133.000 0.000 NA   NA
 3396406 3396407 RSal33209_0150 RSal33209_0151     FALSE 0.155 82.000 0.000 NA   NA
 3396407 3396408 RSal33209_0151 RSal33209_0152     TRUE 0.878 -7.000 0.082 NA   NA
 3396411 3396412 RSal33209_0155 RSal33209_0156     FALSE 0.103 133.000 0.000 1.000   NA
 3396412 3396413 RSal33209_0156 RSal33209_0157     TRUE 0.843 40.000 0.000 0.062   NA
 3396413 3396414 RSal33209_0157 RSal33209_0158     TRUE 0.979 3.000 0.000 0.062   NA
 3396414 3396415 RSal33209_0158 RSal33209_0159     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 3396415 3396416 RSal33209_0159 RSal33209_0160     FALSE 0.188 54.000 0.000 NA   NA
 3396417 3396418 RSal33209_0161 RSal33209_0162     FALSE 0.077 273.000 0.000 1.000 Y NA
 3396418 3396419 RSal33209_0162 RSal33209_0163     TRUE 0.955 67.000 0.450 0.070 Y NA
 3396419 3396420 RSal33209_0163 RSal33209_0164     TRUE 0.996 -7.000 0.818 0.070 Y NA
 3396421 3396422 RSal33209_0165 RSal33209_0166 frnE   FALSE 0.208 91.000 0.000 1.000 N NA
 3396424 3396425 RSal33209_0168 RSal33209_0169     FALSE 0.063 170.000 0.000 1.000   NA
 3396425 3396426 RSal33209_0169 RSal33209_0170     TRUE 0.983 13.000 0.000 0.001   NA
 3396427 3396428 RSal33209_0171 RSal33209_0172     TRUE 0.678 -6.000 0.000 NA   NA
 3396431 3396432 RSal33209_0175 RSal33209_0176     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 3396432 3396433 RSal33209_0176 RSal33209_0177     TRUE 0.567 23.000 0.000 1.000   NA
 3396433 3396434 RSal33209_0177 RSal33209_0178     TRUE 0.910 47.000 0.000 0.002   NA
 3396434 3396435 RSal33209_0178 RSal33209_0179     TRUE 0.989 5.000 0.000 0.002   NA
 3396435 3396436 RSal33209_0179 RSal33209_0180     FALSE 0.195 96.000 0.000 1.000   NA
 3396436 3396437 RSal33209_0180 RSal33209_0181     TRUE 0.909 16.000 0.300 1.000 N NA
 3396437 3396438 RSal33209_0181 RSal33209_0182     TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.090   NA
 3396438 3396439 RSal33209_0182 RSal33209_0183     TRUE 0.993 4.000 0.000 0.001   NA
 3396439 3396440 RSal33209_0183 RSal33209_0184     TRUE 0.979 19.000 0.000 0.001   NA
 3396440 3396441 RSal33209_0184 RSal33209_0185     FALSE 0.347 180.000 0.500 1.000   NA
 3396443 3396444 RSal33209_0187 RSal33209_0188     FALSE 0.311 35.000 0.000 NA   NA
 3396444 3396445 RSal33209_0188 RSal33209_0189     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.097   NA
 3396445 3396446 RSal33209_0189 RSal33209_0190     FALSE 0.219 48.000 0.000 NA   NA
 3396446 3396447 RSal33209_0190 RSal33209_0191     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396447 3396448 RSal33209_0191 RSal33209_0192     FALSE 0.258 57.000 0.000 1.000 N NA
 3396448 3396449 RSal33209_0192 RSal33209_0193     FALSE 0.181 57.000 0.000 NA   NA
 3396449 3396450 RSal33209_0193 RSal33209_0194     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 3396450 3396451 RSal33209_0194 RSal33209_0195     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396451 3396452 RSal33209_0195 RSal33209_0196     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 3396453 3396454 RSal33209_0197 RSal33209_0198     TRUE 0.984 0.000 0.500 1.000 N NA
 3396454 3396455 RSal33209_0198 RSal33209_0199     FALSE 0.073 128.000 0.000 NA   NA
 3396455 3396456 RSal33209_0199 RSal33209_0200     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396457 3396458 RSal33209_0201 RSal33209_0202     FALSE 0.070 130.000 0.000 NA   NA
 3396458 3396459 RSal33209_0202 RSal33209_0203     FALSE 0.120 102.000 0.000 NA   NA
 3396459 3396460 RSal33209_0203 RSal33209_0204     TRUE 0.965 7.000 0.000 0.070   NA
 3396460 3396461 RSal33209_0204 RSal33209_0205     TRUE 0.891 27.000 0.000 0.070   NA
 3396464 3396465 RSal33209_0208 RSal33209_0209     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3396465 3396466 RSal33209_0209 RSal33209_0210   blaB TRUE 0.985 -3.000 0.636 1.000   NA
 3396470 3396471 RSal33209_0214 RSal33209_0215     FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000 N NA
 3396471 3396472 RSal33209_0215 RSal33209_0216     TRUE 0.990 -3.000 0.367 1.000 Y NA
 3396472 3396473 RSal33209_0216 RSal33209_0217     FALSE 0.146 90.000 0.000 NA   NA
 3396473 3396474 RSal33209_0217 RSal33209_0218     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 3396476 3396477 RSal33209_0220 RSal33209_0221     FALSE 0.031 242.000 0.000 1.000   NA
 3396478 3396479 RSal33209_0222 RSal33209_0223     FALSE 0.160 72.000 0.000 NA   NA
 3396479 3396480 RSal33209_0223 RSal33209_0224     FALSE 0.037 178.000 0.000 NA   NA
 3396480 3396481 RSal33209_0224 RSal33209_0225     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3396481 3396482 RSal33209_0225 RSal33209_0226     FALSE 0.218 88.000 0.000 1.000   NA
 3396483 3396484 RSal33209_0227 RSal33209_0228     TRUE 0.671 25.000 0.044 NA   NA
 3396485 3396486 RSal33209_0229 RSal33209_0230   oppA.1 TRUE 0.604 19.000 0.000 1.000   NA
 3396486 3396487 RSal33209_0230 RSal33209_0231 oppA.1 oppA.2 TRUE 0.744 53.000 0.000 0.070   NA
 3396489 3396490 RSal33209_0233 RSal33209_0234     TRUE 0.973 12.000 0.000 0.003   NA
 3396490 3396491 RSal33209_0234 RSal33209_0235     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396491 3396492 RSal33209_0235 RSal33209_0236     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3396493 3396494 RSal33209_0237 RSal33209_0238     TRUE 0.678 -6.000 0.000 NA   NA
 3396496 3396497 RSal33209_0240 RSal33209_0241     FALSE 0.135 95.000 0.000 NA   NA
 3396497 3396498 RSal33209_0241 RSal33209_0242     FALSE 0.091 116.000 0.000 NA   NA
 3396498 3396499 RSal33209_0242 RSal33209_0243     FALSE 0.116 104.000 0.000 NA   NA
 3396501 3396502 RSal33209_0245 RSal33209_0246     FALSE 0.028 205.000 0.000 NA   NA
 3396502 3396503 RSal33209_0246 RSal33209_0247     FALSE 0.010 587.000 0.000 NA   NA
 3396503 3396504 RSal33209_0247 RSal33209_0248   livH.1 FALSE 0.072 353.000 0.180 NA   NA
 3396504 3396505 RSal33209_0248 RSal33209_0249 livH.1 livH.2 TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.069   NA
 3396505 3396506 RSal33209_0249 RSal33209_0250 livH.2 livM TRUE 0.995 -3.000 0.361 0.069   NA
 3396506 3396507 RSal33209_0250 RSal33209_0251 livM livG TRUE 0.993 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3396507 3396508 RSal33209_0251 RSal33209_0252 livG livF TRUE 0.978 -13.000 0.000 0.025 Y NA
 3396509 3396510 RSal33209_0253 RSal33209_0255     FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 3396511 3396512 RSal33209_0254 RSal33209_0256     FALSE 0.167 69.000 0.000 NA   NA
 3396512 3396513 RSal33209_0256 RSal33209_0257     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3396513 3396514 RSal33209_0257 RSal33209_0258     TRUE 0.977 7.000 0.800 1.000   NA
 3396515 3396516 RSal33209_0259 RSal33209_0260     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 3396518 3396519 RSal33209_0262 RSal33209_0263 chvE   TRUE 0.917 41.000 0.800 NA Y NA
 3396519 3396520 RSal33209_0263 RSal33209_0264     TRUE 0.959 28.000 0.800 1.000 Y NA
 3396520 3396521 RSal33209_0264 RSal33209_0265     TRUE 0.751 113.000 0.500 1.000 Y NA
 3396521 3396522 RSal33209_0265 RSal33209_0266     FALSE 0.318 47.000 0.000 1.000   NA
 3396524 3396525 RSal33209_0268 RSal33209_0269     FALSE 0.016 501.000 0.000 1.000   NA
 3396526 3396527 RSal33209_0270 RSal33209_0271     FALSE 0.026 266.000 0.000 1.000 N NA
 3396527 3396528 RSal33209_0271 RSal33209_0272     TRUE 0.961 3.000 0.187 1.000 N NA
 3396530 3396531 RSal33209_0274 RSal33209_0275     FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3396531 3396532 RSal33209_0275 RSal33209_0276     FALSE 0.519 -15.000 0.000 NA   NA
 3396532 3396533 RSal33209_0276 RSal33209_0277   nodI FALSE 0.195 96.000 0.000 1.000   NA
 3396533 3396534 RSal33209_0277 RSal33209_0278 nodI nodJ.1 TRUE 0.785 -7.000 0.024 NA   NA
 3396534 3396535 RSal33209_0278 RSal33209_0279 nodJ.1 nodJ.2 TRUE 0.630 44.000 0.133 NA   NA
 3396535 3396536 RSal33209_0279 RSal33209_0280 nodJ.2   FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3396536 3396537 RSal33209_0280 RSal33209_0281     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 3396537 3396538 RSal33209_0281 RSal33209_0282     FALSE 0.176 61.000 0.000 NA   NA
 3396538 3396539 RSal33209_0282 RSal33209_0283     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3396542 3396543 RSal33209_0286 RSal33209_0287     TRUE 0.965 -13.000 0.000 0.009   NA
 3396543 3396544 RSal33209_0287 RSal33209_0288     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.012   NA
 3396545 3396546 RSal33209_0289 RSal33209_0290     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396546 3396547 RSal33209_0290 RSal33209_0291     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396547 3396548 RSal33209_0291 RSal33209_0292     FALSE 0.319 45.000 0.008 NA   NA
 3396548 3396549 RSal33209_0292 RSal33209_0293     FALSE 0.497 42.000 0.026 1.000 N NA
 3396549 3396550 RSal33209_0293 RSal33209_0294     TRUE 0.955 6.000 0.047 1.000 Y NA
 3396550 3396551 RSal33209_0294 RSal33209_0295     TRUE 0.738 41.000 0.194 1.000   NA
 3396551 3396552 RSal33209_0295 RSal33209_0296     TRUE 0.987 7.000 0.000 0.002   NA
 3396552 3396553 RSal33209_0296 RSal33209_0297     FALSE 0.093 139.000 0.000 1.000   NA
 3396553 3396554 RSal33209_0297 RSal33209_0298     FALSE 0.250 65.000 0.000 1.000   NA
 3396555 3396556 RSal33209_0299 RSal33209_0300     FALSE 0.033 236.000 0.000 1.000   NA
 3396556 3396557 RSal33209_0300 RSal33209_0301     TRUE 0.999 0.000 0.604 0.002 Y NA
 3396557 3396558 RSal33209_0301 RSal33209_0302     TRUE 0.981 95.000 0.705 0.002 Y NA
 3396558 3396559 RSal33209_0302 RSal33209_0303     TRUE 0.999 2.000 0.157 0.001 Y NA
 3396560 3396561 RSal33209_0304 RSal33209_0305     TRUE 0.783 7.000 0.000 1.000   NA
 3396561 3396562 RSal33209_0305 RSal33209_0306     FALSE 0.249 66.000 0.000 1.000   NA
 3396563 3396564 RSal33209_0307 RSal33209_0308     TRUE 0.913 31.000 0.000 0.022   NA
 3396565 3396566 RSal33209_0309 RSal33209_0310     FALSE 0.295 50.000 0.000 1.000   NA
 3396566 3396567 RSal33209_0310 RSal33209_0311     TRUE 0.898 43.000 0.000 0.004   NA
 3396567 3396568 RSal33209_0311 RSal33209_0312     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3396568 3396569 RSal33209_0312 RSal33209_0313     TRUE 0.741 -7.000 0.000 1.000   NA
 3396571 3396572 RSal33209_0315 RSal33209_0316     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3396572 3396573 RSal33209_0316 RSal33209_0317     TRUE 0.875 -7.000 0.078 NA   NA
 3396573 3396574 RSal33209_0317 RSal33209_0318     TRUE 0.678 -6.000 0.000 NA   NA
 3396574 3396575 RSal33209_0318 RSal33209_0319     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396575 3396576 RSal33209_0319 RSal33209_0320     FALSE 0.176 61.000 0.000 NA   NA
 3396576 3396577 RSal33209_0320 RSal33209_0321     FALSE 0.412 149.000 0.000 0.069   NA
 3396577 3396578 RSal33209_0321 RSal33209_0322     TRUE 0.794 6.000 0.000 1.000   NA
 3396578 3396579 RSal33209_0322 RSal33209_0323     TRUE 0.975 62.000 0.385 0.001   NA
 3396579 3396580 RSal33209_0323 RSal33209_0324     TRUE 0.998 7.000 0.385 0.001   NA
 3396580 3396581 RSal33209_0324 RSal33209_0325     TRUE 0.954 29.000 0.000 0.002   NA
 3396581 3396582 RSal33209_0325 RSal33209_0326     FALSE 0.090 117.000 0.000 NA   NA
 3396582 3396583 RSal33209_0326 RSal33209_0327     TRUE 0.647 25.000 0.034 NA   NA
 3396583 3396584 RSal33209_0327 RSal33209_0328   mazG TRUE 0.814 9.000 0.008 1.000   NA
 3396584 3396585 RSal33209_0328 RSal33209_0329 mazG   FALSE 0.499 -16.000 0.000 NA   NA
 3396585 3396586 RSal33209_0329 RSal33209_0330     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3396588 3396589 RSal33209_0332 RSal33209_0333     TRUE 0.580 94.000 0.241 1.000 N NA
 3396589 3396590 RSal33209_0333 RSal33209_0334     FALSE 0.394 51.000 0.038 NA   NA
 3396590 3396591 RSal33209_0334 RSal33209_0335     TRUE 0.967 -3.000 0.243 NA   NA
 3396591 3396592 RSal33209_0335 RSal33209_0336     FALSE 0.471 45.000 0.026 1.000 N NA
 3396592 3396593 RSal33209_0336 RSal33209_0337     TRUE 0.859 32.000 0.348 1.000 N NA
 3396594 3396595 RSal33209_0338 RSal33209_0339     FALSE 0.155 82.000 0.000 NA   NA
 3396597 3396598 RSal33209_0341 RSal33209_0342     FALSE 0.047 156.000 0.000 NA   NA
 3396598 3396599 RSal33209_0342 RSal33209_0343     FALSE 0.429 34.000 0.000 1.000   NA
 3396604 3396605 RSal33209_0348 RSal33209_0349     FALSE 0.339 54.000 0.010 1.000 N NA
 3396605 3396606 RSal33209_0349 RSal33209_0350     FALSE 0.144 91.000 0.000 NA   NA
 3396606 3396607 RSal33209_0350 RSal33209_0351     FALSE 0.106 109.000 0.000 NA   NA
 3396607 3396608 RSal33209_0351 RSal33209_0352     FALSE 0.044 164.000 0.000 NA   NA
 3396608 3396609 RSal33209_0352 RSal33209_0353     TRUE 0.998 13.000 0.382 0.001 Y NA
 3396609 3396610 RSal33209_0353 RSal33209_0354     FALSE 0.062 170.000 0.000 1.000 N NA
 3396610 3396611 RSal33209_0354 RSal33209_0355     TRUE 0.967 12.000 0.000 0.008   NA
 3396613 3396614 RSal33209_0357 RSal33209_0358     FALSE 0.181 116.000 0.029 NA   NA
 3396614 3396615 RSal33209_0358 RSal33209_0359     TRUE 0.724 -13.000 0.029 NA   NA
 3396615 3396616 RSal33209_0359 RSal33209_0360     TRUE 0.915 -7.000 0.179 NA   NA
 3396616 3396617 RSal33209_0360 RSal33209_0361   iolD.1 FALSE 0.343 120.000 0.098 1.000   NA
 3396617 3396618 RSal33209_0361 RSal33209_0362 iolD.1 iolD.2 TRUE 0.965 19.000 0.000 0.003   NA
 3396618 3396619 RSal33209_0362 RSal33209_0363 iolD.2 iolE.1 FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000   NA
 3396619 3396620 RSal33209_0363 RSal33209_0364 iolE.1 iolE.2 FALSE 0.211 49.000 0.000 NA   NA
 3396620 3396621 RSal33209_0364 RSal33209_0365 iolE.2   FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3396622 3396623 RSal33209_0366 RSal33209_0367 iolB   TRUE 0.856 8.000 0.026 1.000 N NA
 3396623 3396624 RSal33209_0367 RSal33209_0368     FALSE 0.132 96.000 0.000 NA   NA
 3396624 3396625 RSal33209_0368 RSal33209_0369     FALSE 0.125 100.000 0.000 NA   NA
 3396625 3396626 RSal33209_0369 RSal33209_0370     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.095   NA
 3396626 3396627 RSal33209_0370 RSal33209_0371     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396627 3396628 RSal33209_0371 RSal33209_0372     FALSE 0.495 18.000 0.000 NA   NA
 3396629 3396630 RSal33209_0373 RSal33209_0374     FALSE 0.499 -16.000 0.000 NA   NA
 3396630 3396631 RSal33209_0374 RSal33209_0375     TRUE 0.984 -3.000 0.532 1.000   NA
 3396632 3396633 RSal33209_0376 RSal33209_0377     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3396633 3396634 RSal33209_0377 RSal33209_0378     TRUE 0.962 9.000 0.571 NA   NA
 3396635 3396636 RSal33209_0379 RSal33209_0380     TRUE 0.991 35.000 0.909 0.012 Y NA
 3396637 3396638 RSal33209_0381 RSal33209_0382     TRUE 0.678 -6.000 0.000 NA   NA
 3396638 3396639 RSal33209_0382 RSal33209_0383     FALSE 0.170 67.000 0.000 NA   NA
 3396639 3396640 RSal33209_0383 RSal33209_0385     FALSE 0.029 201.000 0.000 NA   NA
 3396641 3396642 RSal33209_0384 RSal33209_0386     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396642 3396643 RSal33209_0386 RSal33209_0387     TRUE 0.850 11.000 0.093 NA   NA
 3396644 3396645 RSal33209_0388 RSal33209_0389     TRUE 0.954 37.000 0.000 0.001   NA
 3396645 3396646 RSal33209_0389 RSal33209_0390     FALSE 0.013 330.000 0.000 NA   NA
 3396646 3396647 RSal33209_0390 RSal33209_0391     FALSE 0.015 304.000 0.000 NA   NA
 3396647 3396648 RSal33209_0391 RSal33209_0392     TRUE 0.957 40.000 0.286 0.032   NA
 3396648 3396649 RSal33209_0392 RSal33209_0393     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.095   NA
 3396650 3396651 RSal33209_0394 RSal33209_0395 phnC phnE TRUE 0.998 2.000 0.176 0.002 Y NA
 3396652 3396653 RSal33209_0396 RSal33209_0397     TRUE 0.798 25.000 0.130 NA   NA
 3396653 3396654 RSal33209_0397 RSal33209_0398     TRUE 0.931 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3396654 3396655 RSal33209_0398 RSal33209_0399     FALSE 0.086 146.000 0.000 1.000   NA
 3396656 3396657 RSal33209_0400 RSal33209_0401     TRUE 0.974 25.000 0.000 0.001   NA
 3396657 3396658 RSal33209_0401 RSal33209_0402     TRUE 0.877 10.000 0.095 NA   NA
 3396662 3396663 RSal33209_0406 RSal33209_0407 senX3 regX3 TRUE 0.970 12.000 0.437 1.000 Y NA
 3396663 3396664 RSal33209_0407 RSal33209_0408 regX3   FALSE 0.180 502.000 0.000 0.080 Y NA
 3396664 3396665 RSal33209_0408 RSal33209_0409     FALSE 0.091 234.000 0.068 1.000 N NA
 3396665 3396666 RSal33209_0409 RSal33209_0410     TRUE 0.966 -15.000 0.419 1.000 Y NA
 3396666 3396667 RSal33209_0410 RSal33209_0411     FALSE 0.266 112.000 0.037 1.000 N NA
 3396667 3396668 RSal33209_0411 RSal33209_0412   trmH TRUE 0.968 5.000 0.088 1.000 Y NA
 3396668 3396669 RSal33209_0412 RSal33209_0413 trmH   TRUE 0.844 4.000 0.003 1.000 N NA
 3396669 3396670 RSal33209_0413 RSal33209_0414     FALSE 0.352 113.000 0.082 1.000 N NA
 3396670 3396671 RSal33209_0414 RSal33209_0415     TRUE 0.922 -3.000 0.052 NA   NA
 3396671 3396672 RSal33209_0415 RSal33209_0416     FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 3396672 3396673 RSal33209_0416 RSal33209_0417     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.095   NA
 3396673 3396674 RSal33209_0417 RSal33209_0418     TRUE 0.957 40.000 0.286 0.032   NA
 3396675 3396676 RSal33209_0419 RSal33209_0420 nrdI.1   FALSE 0.022 225.000 0.000 NA N NA
 3396677 3396678 RSal33209_0421 RSal33209_0422     FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3396678 3396679 RSal33209_0422 RSal33209_0423     TRUE 0.986 -3.000 0.857 NA   NA
 3396679 3396680 RSal33209_0423 RSal33209_0424     TRUE 0.998 -3.000 0.818 0.068 Y NA
 3396680 3396681 RSal33209_0424 RSal33209_0425     FALSE 0.014 728.000 0.000 1.000   NA
 3396681 3396682 RSal33209_0425 RSal33209_0426     TRUE 0.963 53.000 0.544 0.009   NA
 3396682 3396683 RSal33209_0426 RSal33209_0427     TRUE 0.981 20.000 0.009 0.001   NA
 3396683 3396684 RSal33209_0427 RSal33209_0428     TRUE 0.995 0.000 0.075 0.009   NA
 3396686 3396687 RSal33209_0430 RSal33209_0431     FALSE 0.009 604.000 0.000 NA   NA
 3396687 3396688 RSal33209_0431 RSal33209_0432     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 3396688 3396689 RSal33209_0432 RSal33209_0433     FALSE 0.150 87.000 0.000 NA   NA
 3396689 3396690 RSal33209_0433 RSal33209_0434     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA   NA
 3396690 3396691 RSal33209_0434 RSal33209_0435     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.094   NA
 3396691 3396692 RSal33209_0435 RSal33209_0436     FALSE 0.161 107.000 0.000 1.000 N NA
 3396692 3396693 RSal33209_0436 RSal33209_0437     FALSE 0.112 128.000 0.000 1.000   NA
 3396693 3396694 RSal33209_0437 RSal33209_0438     FALSE 0.394 264.000 0.003 0.002   NA
 3396694 3396695 RSal33209_0438 RSal33209_0439     FALSE 0.059 176.000 0.000 1.000   NA
 3396695 3396696 RSal33209_0439 RSal33209_0440     TRUE 0.946 25.000 0.000 0.010   NA
 3396697 3396698 RSal33209_0441 RSal33209_0442     FALSE 0.113 105.000 0.000 NA   NA
 3396698 3396699 RSal33209_0442 RSal33209_0443     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 3396699 3396700 RSal33209_0443 RSal33209_0444     FALSE 0.139 93.000 0.000 NA   NA
 3396700 3396701 RSal33209_0444 RSal33209_0445     FALSE 0.259 134.000 0.000 1.000 Y NA
 3396701 3396702 RSal33209_0445 RSal33209_0446     TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 3396702 3396703 RSal33209_0446 RSal33209_0447     FALSE 0.306 36.000 0.000 NA   NA
 3396704 3396705 RSal33209_0448 RSal33209_0449     TRUE 0.971 27.000 0.000 0.004 Y NA
 3396705 3396706 RSal33209_0449 RSal33209_0450     FALSE 0.167 69.000 0.000 NA   NA
 3396709 3396710 RSal33209_0453 RSal33209_0455     TRUE 0.967 -6.000 0.000 0.063   NA
 3396711 3396712 RSal33209_0454 RSal33209_0456     FALSE 0.089 118.000 0.000 NA   NA
 3396712 3396713 RSal33209_0456 RSal33209_0457   tetA.1 TRUE 0.546 155.000 0.000 0.008   NA
 3396713 3396714 RSal33209_0457 RSal33209_0458 tetA.1   TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396714 3396715 RSal33209_0458 RSal33209_0459   tetB FALSE 0.144 91.000 0.000 NA   NA
 3396715 3396716 RSal33209_0459 RSal33209_0460 tetB   TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3396717 3396718 RSal33209_0461 RSal33209_0462 cutC   FALSE 0.147 89.000 0.000 NA   NA
 3396718 3396719 RSal33209_0462 RSal33209_0463     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396719 3396720 RSal33209_0463 RSal33209_0464     TRUE 0.850 -9.000 0.071 NA   NA
 3396720 3396721 RSal33209_0464 RSal33209_0465     FALSE 0.051 151.000 0.000 NA   NA
 3396721 3396722 RSal33209_0465 RSal33209_0466     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 3396722 3396723 RSal33209_0466 RSal33209_0467     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA   NA
 3396723 3396724 RSal33209_0467 RSal33209_0468     TRUE 0.984 -3.000 0.750 NA   NA
 3396724 3396725 RSal33209_0468 RSal33209_0469     TRUE 0.938 -15.000 0.667 NA   NA
 3396725 3396726 RSal33209_0469 RSal33209_0470     TRUE 0.980 -3.000 0.500 NA   NA
 3396727 3396728 RSal33209_0471 RSal33209_0472     FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 3396729 3396730 RSal33209_0473 RSal33209_0474     FALSE 0.254 42.000 0.000 NA N NA
 3396730 3396731 RSal33209_0474 RSal33209_0475     TRUE 0.668 29.000 0.062 NA N NA
 3396732 3396733 RSal33209_0476 RSal33209_0477     FALSE 0.180 58.000 0.000 NA   NA
 3396733 3396734 RSal33209_0477 RSal33209_0478     TRUE 0.585 56.000 0.196 NA   NA
 3396734 3396735 RSal33209_0478 RSal33209_0479     FALSE 0.211 155.000 0.138 NA   NA
 3396737 3396738 RSal33209_0481 RSal33209_0482   groEL FALSE 0.012 369.000 0.000 NA   NA
 3396741 3396742 RSal33209_0485 RSal33209_0486 phoR   TRUE 0.971 21.000 0.824 1.000 Y NA
 3396742 3396743 RSal33209_0486 RSal33209_0487     FALSE 0.276 68.000 0.020 NA   NA
 3396743 3396744 RSal33209_0487 RSal33209_0488     FALSE 0.499 -16.000 0.000 NA   NA
 3396744 3396745 RSal33209_0488 RSal33209_0489     FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 3396745 3396746 RSal33209_0489 RSal33209_0490     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3396746 3396747 RSal33209_0490 RSal33209_0491     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 3396747 3396748 RSal33209_0491 RSal33209_0492     FALSE 0.011 431.000 0.000 NA   NA
 3396748 3396749 RSal33209_0492 RSal33209_0493     FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3396750 3396751 RSal33209_0494 RSal33209_0495     TRUE 0.884 23.000 0.317 NA   NA
 3396752 3396753 RSal33209_0496 RSal33209_0497     TRUE 0.964 31.000 0.000 0.001   NA
 3396754 3396755 RSal33209_0498 RSal33209_0499     FALSE 0.026 270.000 0.000 1.000 N NA
 3396755 3396756 RSal33209_0499 RSal33209_0500     FALSE 0.048 352.000 0.000 NA Y NA
 3396756 3396757 RSal33209_0500 RSal33209_0501     TRUE 0.550 105.000 0.333 NA   NA
 3396757 3396758 RSal33209_0501 RSal33209_0502     FALSE 0.015 288.000 0.000 NA   NA
 3396758 3396759 RSal33209_0502 RSal33209_0503     FALSE 0.499 -16.000 0.000 NA   NA
 3396759 3396760 RSal33209_0503 RSal33209_0504     FALSE 0.252 43.000 0.000 NA   NA
 3396760 3396761 RSal33209_0504 RSal33209_0505     TRUE 0.947 -3.000 0.094 NA   NA
 3396761 3396762 RSal33209_0505 RSal33209_0506   moeA.1 TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3396763 3396764 RSal33209_0507 RSal33209_0508     TRUE 0.963 25.000 0.000 0.002   NA
 3396764 3396765 RSal33209_0508 RSal33209_0510     TRUE 0.926 41.000 0.000 0.002   NA
 3396766 3396767 RSal33209_0509 RSal33209_0511 fdhD.1 fdhD.2 TRUE 0.980 -10.000 0.000 0.002   NA
 3396767 3396768 RSal33209_0511 RSal33209_0512 fdhD.2   FALSE 0.214 90.000 0.000 1.000   NA
 3396771 3396772 RSal33209_0515 RSal33209_0516     TRUE 0.991 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 3396774 3396775 RSal33209_0518 RSal33209_0519     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3396776 3396777 RSal33209_0520 RSal33209_0521     FALSE 0.244 80.000 0.015 NA   NA
 3396777 3396778 RSal33209_0521 RSal33209_0522     TRUE 0.877 -3.000 0.015 NA   NA
 3396778 3396779 RSal33209_0522 RSal33209_0523     FALSE 0.476 102.000 0.213 NA   NA
 3396779 3396780 RSal33209_0523 RSal33209_0524     FALSE 0.176 61.000 0.000 NA   NA
 3396780 3396781 RSal33209_0524 RSal33209_0525     FALSE 0.039 174.000 0.000 NA   NA
 3396783 3396784 RSal33209_0527 RSal33209_0528     TRUE 0.862 85.000 0.748 1.000 Y NA
 3396784 3396785 RSal33209_0528 RSal33209_0529     FALSE 0.177 353.000 0.000 0.047   NA
 3396785 3396786 RSal33209_0529 RSal33209_0530     FALSE 0.458 -21.000 0.000 NA   NA
 3396786 3396787 RSal33209_0530 RSal33209_0531     FALSE 0.012 376.000 0.000 NA   NA
 3396787 3396788 RSal33209_0531 RSal33209_0532     TRUE 0.805 51.000 0.626 1.000 N NA
 3396788 3396789 RSal33209_0532 RSal33209_0533     TRUE 0.954 0.000 0.076 1.000 N NA
 3396789 3396790 RSal33209_0533 RSal33209_0534     TRUE 0.940 2.000 0.090 NA   NA
 3396791 3396792 RSal33209_0535 RSal33209_0536     TRUE 0.817 43.000 0.000 0.067   NA
 3396792 3396793 RSal33209_0536 RSal33209_0537     TRUE 0.979 -3.000 0.486 NA   NA
 3396793 3396794 RSal33209_0537 RSal33209_0538     TRUE 0.952 -3.000 0.114 NA   NA
 3396794 3396795 RSal33209_0538 RSal33209_0539     TRUE 0.996 -6.000 0.167 0.012 Y NA
 3396796 3396797 RSal33209_0540 RSal33209_0541     TRUE 0.979 -3.000 0.484 NA   NA
 3396798 3396799 RSal33209_0542 RSal33209_0543     FALSE 0.106 109.000 0.000 NA   NA
 3396799 3396800 RSal33209_0543 RSal33209_0544     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 3396800 3396801 RSal33209_0544 RSal33209_0545     FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 3396802 3396803 RSal33209_0546 RSal33209_0547     TRUE 0.999 0.000 0.889 0.003 Y NA
 3396803 3396804 RSal33209_0547 RSal33209_0548     TRUE 0.995 10.000 0.818 0.085 Y NA
 3396806 3396807 RSal33209_0550 RSal33209_0551     TRUE 0.994 12.000 0.136 0.003 Y NA
 3396807 3396808 RSal33209_0551 RSal33209_0552     TRUE 0.985 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 3396808 3396809 RSal33209_0552 RSal33209_0553     TRUE 0.882 16.000 0.025 1.000 Y NA
 3396809 3396810 RSal33209_0553 RSal33209_0554     TRUE 0.999 2.000 0.308 0.001 Y NA
 3396810 3396811 RSal33209_0554 RSal33209_0555     TRUE 0.969 -16.000 0.043 0.085 Y NA
 3396811 3396812 RSal33209_0555 RSal33209_0556     TRUE 0.974 3.000 0.326 1.000 N NA
 3396812 3396813 RSal33209_0556 RSal33209_0557     FALSE 0.014 677.000 0.000 1.000 N NA
 3396813 3396814 RSal33209_0557 RSal33209_0558     TRUE 0.998 -7.000 0.176 0.001 Y NA
 3396814 3396815 RSal33209_0558 RSal33209_0559     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 3396815 3396816 RSal33209_0559 RSal33209_0560     FALSE 0.155 82.000 0.000 NA   NA
 3396816 3396817 RSal33209_0560 RSal33209_0561     TRUE 0.993 4.000 0.000 0.001   NA
 3396817 3396818 RSal33209_0561 RSal33209_0562     FALSE 0.466 31.000 0.000 1.000   NA
 3396819 3396820 RSal33209_0563 RSal33209_0564     FALSE 0.011 409.000 0.000 NA   NA
 3396820 3396821 RSal33209_0564 RSal33209_0565     FALSE 0.329 33.000 0.000 NA   NA
 3396821 3396822 RSal33209_0565 RSal33209_0566     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.092   NA
 3396823 3396824 RSal33209_0567 RSal33209_0568     FALSE 0.318 132.000 0.129 1.000 N NA
 3396824 3396825 RSal33209_0568 RSal33209_0569     TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.003 Y NA
 3396825 3396826 RSal33209_0569 RSal33209_0570     TRUE 0.998 0.000 0.860 0.085 Y NA
 3396827 3396828 RSal33209_0571 RSal33209_0572     FALSE 0.176 61.000 0.000 NA   NA
 3396829 3396830 RSal33209_0573 RSal33209_0574     TRUE 0.936 32.000 0.000 0.003   NA
 3396830 3396831 RSal33209_0574 RSal33209_0575     FALSE 0.239 70.000 0.000 1.000   NA
 3396834 3396835 RSal33209_0578 RSal33209_0579     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.092   NA
 3396835 3396836 RSal33209_0579 RSal33209_0580     FALSE 0.309 48.000 0.000 1.000   NA
 3396836 3396837 RSal33209_0580 RSal33209_0581     TRUE 0.952 126.000 0.375 0.002 Y NA
 3396837 3396838 RSal33209_0581 RSal33209_0582     TRUE 0.940 9.000 0.292 NA   NA
 3396838 3396839 RSal33209_0582 RSal33209_0583     FALSE 0.219 48.000 0.000 NA   NA
 3396839 3396840 RSal33209_0583 RSal33209_0584     FALSE 0.015 628.000 0.000 1.000   NA
 3396840 3396841 RSal33209_0584 RSal33209_0585     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396841 3396842 RSal33209_0585 RSal33209_0586     TRUE 0.986 -3.000 0.918 NA   NA
 3396842 3396843 RSal33209_0586 RSal33209_0587     TRUE 0.824 5.000 0.019 NA   NA
 3396843 3396844 RSal33209_0587 RSal33209_0588     FALSE 0.059 427.000 0.157 NA   NA
 3396844 3396845 RSal33209_0588 RSal33209_0589     TRUE 0.684 93.000 0.000 0.066   NA
 3396846 3396847 RSal33209_0590 RSal33209_0591     FALSE 0.309 48.000 0.000 1.000   NA
 3396847 3396848 RSal33209_0591 RSal33209_0592     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.092   NA
 3396851 3396852 RSal33209_0595 RSal33209_0596     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3396854 3396855 RSal33209_0598 RSal33209_0599     TRUE 0.995 7.000 0.839 0.059 N NA
 3396855 3396856 RSal33209_0599 RSal33209_0600     TRUE 0.982 -3.000 0.419 1.000   NA
 3396856 3396857 RSal33209_0600 RSal33209_0601     TRUE 0.759 35.000 0.157 1.000   NA
 3396857 3396858 RSal33209_0601 RSal33209_0602     TRUE 0.707 55.000 0.070 1.000 Y NA
 3396860 3396861 RSal33209_0604 RSal33209_0605     FALSE 0.150 87.000 0.000 NA   NA
 3396861 3396862 RSal33209_0605 RSal33209_0606     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 3396862 3396863 RSal33209_0606 RSal33209_0607     FALSE 0.125 100.000 0.000 NA   NA
 3396863 3396864 RSal33209_0607 RSal33209_0608     FALSE 0.155 81.000 0.000 NA   NA
 3396864 3396865 RSal33209_0608 RSal33209_0609     TRUE 0.969 11.000 0.000 0.007   NA
 3396867 3396868 RSal33209_0611 RSal33209_0612     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 3396868 3396869 RSal33209_0612 RSal33209_0613     FALSE 0.058 176.000 0.000 1.000 N NA
 3396869 3396870 RSal33209_0613 RSal33209_0614     TRUE 0.956 53.000 0.667 0.044   NA
 3396872 3396873 RSal33209_0616 RSal33209_0617     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.092   NA
 3396874 3396875 RSal33209_0618 RSal33209_0619     TRUE 0.956 25.000 0.000 0.003   NA
 3396877 3396878 RSal33209_0621 RSal33209_0622     FALSE 0.381 72.000 0.060 NA N NA
 3396878 3396879 RSal33209_0622 RSal33209_0623     TRUE 0.984 -3.000 0.760 NA N NA
 3396879 3396880 RSal33209_0623 RSal33209_0624     FALSE 0.495 18.000 0.000 NA   NA
 3396880 3396881 RSal33209_0624 RSal33209_0625     TRUE 0.544 -13.000 0.000 NA   NA
 3396881 3396882 RSal33209_0625 RSal33209_0626     FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 3396882 3396883 RSal33209_0626 RSal33209_0627     FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 3396884 3396885 RSal33209_0628 RSal33209_0629     FALSE 0.079 123.000 0.000 NA   NA
 3396885 3396886 RSal33209_0629 RSal33209_0630     FALSE 0.184 85.000 0.002 NA   NA
 3396886 3396887 RSal33209_0630 RSal33209_0631     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 3396887 3396888 RSal33209_0631 RSal33209_0632     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.092   NA
 3396888 3396889 RSal33209_0632 RSal33209_0633     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396890 3396891 RSal33209_0634 RSal33209_0635     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3396891 3396892 RSal33209_0635 RSal33209_0636     TRUE 0.575 51.000 0.088 1.000 N NA
 3396892 3396893 RSal33209_0636 RSal33209_0637     FALSE 0.300 49.000 0.000 1.000   NA
 3396893 3396894 RSal33209_0637 RSal33209_0638     FALSE 0.185 55.000 0.000 NA   NA
 3396894 3396895 RSal33209_0638 RSal33209_0639     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3396895 3396896 RSal33209_0639 RSal33209_0640     FALSE 0.154 84.000 0.000 NA   NA
 3396896 3396897 RSal33209_0640 RSal33209_0641     FALSE 0.203 76.000 0.005 NA   NA
 3396897 3396898 RSal33209_0641 RSal33209_0642     FALSE 0.225 113.000 0.022 1.000   NA
 3396899 3396900 RSal33209_0643 RSal33209_0644     FALSE 0.175 63.000 0.000 NA   NA
 3396900 3396901 RSal33209_0644 RSal33209_0645     TRUE 0.986 2.000 0.000 0.020   NA
 3396904 3396905 RSal33209_0648 RSal33209_0649     TRUE 0.705 15.000 0.010 1.000   NA
 3396906 3396907 RSal33209_0650 RSal33209_0651     TRUE 0.957 0.000 0.083 1.000   NA
 3396908 3396909 RSal33209_0652 RSal33209_0653     TRUE 0.693 7.000 0.000 NA   NA
 3396909 3396910 RSal33209_0653 RSal33209_0654   nusA TRUE 0.982 2.000 0.759 NA   NA
 3396910 3396911 RSal33209_0654 RSal33209_0655 nusA   TRUE 0.724 102.000 0.323 NA Y NA
 3396911 3396912 RSal33209_0655 RSal33209_0656     FALSE 0.342 121.000 0.171 NA N NA
 3396912 3396913 RSal33209_0656 RSal33209_0657     TRUE 0.954 26.000 0.530 1.000 Y NA
 3396915 3396916 RSal33209_0659 RSal33209_0660     TRUE 0.919 61.000 0.003 0.001   NA
 3396916 3396917 RSal33209_0660 RSal33209_0661     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3396917 3396918 RSal33209_0661 RSal33209_0662     TRUE 0.878 12.000 0.167 NA   NA
 3396918 3396919 RSal33209_0662 RSal33209_0663     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3396919 3396920 RSal33209_0663 RSal33209_0664     FALSE 0.045 201.000 0.000 1.000   NA
 3396920 3396921 RSal33209_0664 RSal33209_0665     FALSE 0.309 48.000 0.000 1.000   NA
 3396921 3396922 RSal33209_0665 RSal33209_0666     TRUE 0.866 86.000 0.308 0.091   NA
 3396922 3396923 RSal33209_0666 RSal33209_0667     FALSE 0.012 380.000 0.000 NA   NA
 3396923 3396924 RSal33209_0667 RSal33209_0668     FALSE 0.259 42.000 0.000 NA   NA
 3396924 3396925 RSal33209_0668 RSal33209_0669     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 3396925 3396926 RSal33209_0669 RSal33209_0670     TRUE 0.565 -12.000 0.000 NA   NA
 3396926 3396927 RSal33209_0670 RSal33209_0671     FALSE 0.030 198.000 0.000 NA   NA
 3396927 3396928 RSal33209_0671 RSal33209_0672     FALSE 0.371 119.000 0.011 1.000 Y NA
 3396928 3396929 RSal33209_0672 RSal33209_0673     TRUE 0.949 5.000 0.171 1.000   NA
 3396930 3396931 RSal33209_0674 RSal33209_0675     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.091   NA
 3396931 3396932 RSal33209_0675 RSal33209_0676     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3396932 3396933 RSal33209_0676 RSal33209_0677   moaD FALSE 0.185 55.000 0.000 NA   NA
 3396933 3396934 RSal33209_0677 RSal33209_0678 moaD   TRUE 0.971 5.000 0.410 1.000   NA
 3396935 3396936 RSal33209_0679 RSal33209_0680     TRUE 0.999 0.000 0.578 0.001 N NA
 3396938 3396939 RSal33209_0682 RSal33209_0683     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 3396940 3396941 RSal33209_0684 RSal33209_0685     FALSE 0.089 224.000 0.083 NA   NA
 3396941 3396942 RSal33209_0685 RSal33209_0686     TRUE 0.951 -3.000 0.109 NA   NA
 3396943 3396944 RSal33209_0687 RSal33209_0688     TRUE 0.936 -19.000 0.191 1.000 Y NA
 3396944 3396945 RSal33209_0688 RSal33209_0689     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3396946 3396947 RSal33209_0690 RSal33209_0691     TRUE 0.728 -12.000 0.005 1.000   NA
 3396947 3396948 RSal33209_0691 RSal33209_0692     TRUE 0.916 69.000 0.005 0.001   NA
 3396949 3396950 RSal33209_0693 RSal33209_0694 moeA.2   TRUE 0.991 -12.000 0.019 0.002 Y NA
 3396950 3396951 RSal33209_0694 RSal33209_0695     TRUE 0.997 -3.000 0.014 0.002 Y NA
 3396951 3396952 RSal33209_0695 RSal33209_0696     TRUE 0.991 -10.000 0.013 0.002 Y NA
 3396952 3396953 RSal33209_0696 RSal33209_0697     FALSE 0.374 46.000 0.004 1.000 N NA
 3396953 3396954 RSal33209_0697 RSal33209_0698     TRUE 0.924 0.000 0.027 1.000   NA
 3396956 3396957 RSal33209_0700 RSal33209_0701     FALSE 0.160 72.000 0.000 NA   NA
 3396957 3396958 RSal33209_0701 RSal33209_0702     TRUE 0.971 -3.000 0.206 1.000   NA
 3396958 3396959 RSal33209_0702 RSal33209_0703     FALSE 0.064 136.000 0.000 NA   NA
 3396959 3396960 RSal33209_0703 RSal33209_0704     FALSE 0.019 244.000 0.000 NA   NA
 3396961 3396962 RSal33209_0705 RSal33209_0707     TRUE 0.983 -3.000 0.675 NA   NA
 3396965 3396966 RSal33209_0709 RSal33209_0710     TRUE 0.584 151.000 0.000 0.004   NA
 3396966 3396967 RSal33209_0710 RSal33209_0711   ftsK FALSE 0.079 150.000 0.000 1.000 N NA
 3396968 3396969 RSal33209_0712 RSal33209_0713     FALSE 0.416 26.000 0.000 NA   NA
 3396969 3396970 RSal33209_0713 RSal33209_0714     TRUE 0.991 7.000 0.000 0.001   NA
 3396970 3396971 RSal33209_0714 RSal33209_0715     FALSE 0.071 158.000 0.000 1.000   NA
 3396972 3396973 RSal33209_0716 RSal33209_0717     TRUE 0.719 10.000 0.000 1.000   NA
 3396973 3396974 RSal33209_0717 RSal33209_0718   cinA TRUE 0.958 -3.000 0.151 NA   NA
 3396974 3396975 RSal33209_0718 RSal33209_0719 cinA   FALSE 0.329 95.000 0.057 NA   NA
 3396977 3396978 RSal33209_0721 RSal33209_0722   recA FALSE 0.069 173.000 0.017 NA   NA
 3396978 3396979 RSal33209_0722 RSal33209_0723 recA recX.1 FALSE 0.257 184.000 0.296 1.000   NA
 3396979 3396980 RSal33209_0723 RSal33209_0724 recX.1 recX.2 FALSE 0.181 57.000 0.000 NA   NA
 3396980 3396981 RSal33209_0724 RSal33209_0725 recX.2   FALSE 0.164 70.000 0.000 NA   NA
 3396981 3396982 RSal33209_0725 RSal33209_0726     FALSE 0.180 58.000 0.000 NA   NA
 3396982 3396983 RSal33209_0726 RSal33209_0727     TRUE 0.923 10.000 0.028 1.000 Y NA
 3396983 3396984 RSal33209_0727 RSal33209_0728     TRUE 0.721 29.000 0.062 1.000 N NA
 3396984 3396985 RSal33209_0728 RSal33209_0729     FALSE 0.275 129.000 0.000 1.000 Y NA
 3396987 3396988 RSal33209_0731 RSal33209_0732     TRUE 0.854 7.000 0.019 1.000   NA
 3396990 3396991 RSal33209_0734 RSal33209_0735     FALSE 0.165 116.000 0.004 1.000   NA
 3396991 3396992 RSal33209_0735 RSal33209_0736     TRUE 0.990 31.000 0.341 0.004 Y NA
 3396992 3396993 RSal33209_0736 RSal33209_0737     TRUE 0.997 -3.000 0.046 0.004 Y NA
 3396993 3396994 RSal33209_0737 RSal33209_0738     TRUE 0.895 1.000 0.028 NA   NA
 3396994 3396995 RSal33209_0738 RSal33209_0739     TRUE 0.544 34.000 0.038 NA   NA
 3396995 3396996 RSal33209_0739 RSal33209_0740     TRUE 0.965 -3.000 0.215 NA   NA
 3396996 3396997 RSal33209_0740 RSal33209_0741     FALSE 0.511 59.000 0.111 NA   NA
 3397001 3397002 RSal33209_0745 RSal33209_0746     TRUE 0.737 123.000 0.652 1.000 Y NA
 3397002 3397003 RSal33209_0746 RSal33209_0747     TRUE 0.974 94.000 0.928 0.017 Y NA
 3397003 3397004 RSal33209_0747 RSal33209_0748     TRUE 0.936 59.000 0.057 0.015 Y NA
 3397005 3397006 RSal33209_0749 RSal33209_0750     FALSE 0.008 962.000 0.000 NA   NA
 3397008 3397009 RSal33209_0752 RSal33209_0753     FALSE 0.021 235.000 0.000 NA   NA
 3397009 3397010 RSal33209_0753 RSal33209_0754     FALSE 0.225 73.000 0.009 NA   NA
 3397011 3397012 RSal33209_0755 RSal33209_0756     TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000   NA
 3397012 3397013 RSal33209_0756 RSal33209_0757     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.090   NA
 3397015 3397016 RSal33209_0758 RSal33209_0760     FALSE 0.391 28.000 0.000 NA   NA
 3397016 3397017 RSal33209_0760 RSal33209_0761     TRUE 0.999 0.000 0.574 0.002 Y NA
 3397017 3397018 RSal33209_0761 RSal33209_0762     FALSE 0.271 54.000 0.000 1.000   NA
 3397019 3397020 RSal33209_0763 RSal33209_0764     TRUE 0.887 31.000 0.000 0.061   NA
 3397022 3397023 RSal33209_0766 RSal33209_0767     FALSE 0.377 29.000 0.000 NA   NA
 3397023 3397024 RSal33209_0767 RSal33209_0768     FALSE 0.016 498.000 0.000 1.000   NA
 3397024 3397025 RSal33209_0768 RSal33209_0769     TRUE 0.976 -13.000 0.000 0.002   NA
 3397025 3397026 RSal33209_0769 RSal33209_0770     TRUE 0.986 -3.000 0.667 1.000   NA
 3397026 3397027 RSal33209_0770 RSal33209_0771     TRUE 0.867 50.000 0.000 0.005   NA
 3397027 3397028 RSal33209_0771 RSal33209_0772     TRUE 0.813 88.000 0.000 0.005   NA
 3397028 3397029 RSal33209_0772 RSal33209_0773     TRUE 0.933 -3.000 0.038 1.000   NA
 3397029 3397030 RSal33209_0773 RSal33209_0774     TRUE 0.926 28.000 0.000 0.021   NA
 3397030 3397031 RSal33209_0774 RSal33209_0775     FALSE 0.012 371.000 0.000 NA   NA
 3397031 3397032 RSal33209_0775 RSal33209_0776     FALSE 0.041 169.000 0.000 NA   NA
 3397033 3397034 RSal33209_0777 RSal33209_0778   argJ TRUE 0.999 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 3397034 3397035 RSal33209_0778 RSal33209_0779 argJ   TRUE 0.999 -3.000 0.239 0.002 Y NA
 3397035 3397036 RSal33209_0779 RSal33209_0780     TRUE 0.981 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 3397036 3397037 RSal33209_0780 RSal33209_0781     TRUE 0.980 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 3397037 3397038 RSal33209_0781 RSal33209_0782   argR TRUE 0.956 -3.000 0.088 1.000 N NA
 3397038 3397039 RSal33209_0782 RSal33209_0783 argR   FALSE 0.420 75.000 0.054 1.000 N NA
 3397039 3397040 RSal33209_0783 RSal33209_0784     TRUE 0.987 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 3397040 3397041 RSal33209_0784 RSal33209_0785     FALSE 0.244 90.000 0.003 1.000 N NA
 3397041 3397042 RSal33209_0785 RSal33209_0786     TRUE 0.664 53.000 0.214 1.000   NA
 3397042 3397043 RSal33209_0786 RSal33209_0787     FALSE 0.146 113.000 0.000 1.000   NA
 3397043 3397044 RSal33209_0787 RSal33209_0788     FALSE 0.353 31.000 0.000 NA   NA
 3397044 3397045 RSal33209_0788 RSal33209_0789     TRUE 0.986 -3.000 0.920 NA   NA
 3397046 3397047 RSal33209_0790 RSal33209_0791     TRUE 0.617 17.000 0.000 1.000   NA
 3397047 3397048 RSal33209_0791 RSal33209_0792     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397048 3397049 RSal33209_0792 RSal33209_0793     FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3397049 3397050 RSal33209_0793 RSal33209_0794     FALSE 0.219 48.000 0.000 NA   NA
 3397050 3397051 RSal33209_0794 RSal33209_0795     TRUE 0.997 -3.000 0.082 0.013 Y NA
 3397051 3397052 RSal33209_0795 RSal33209_0796     TRUE 0.957 17.000 0.000 0.013   NA
 3397053 3397054 RSal33209_0797 RSal33209_0798     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3397056 3397057 RSal33209_0800 RSal33209_0801     FALSE 0.238 92.000 0.002 1.000   NA
 3397057 3397058 RSal33209_0801 RSal33209_0802     TRUE 0.952 15.000 0.074 0.096   NA
 3397060 3397061 RSal33209_0804 RSal33209_0805     FALSE 0.009 604.000 0.000 NA   NA
 3397061 3397062 RSal33209_0805 RSal33209_0806     FALSE 0.025 218.000 0.000 NA   NA
 3397062 3397063 RSal33209_0806 RSal33209_0807     FALSE 0.179 59.000 0.000 NA   NA
 3397063 3397064 RSal33209_0807 RSal33209_0808     FALSE 0.137 94.000 0.000 NA   NA
 3397064 3397065 RSal33209_0808 RSal33209_0809     TRUE 0.980 -3.000 0.500 NA   NA
 3397065 3397066 RSal33209_0809 RSal33209_0810     TRUE 0.831 5.000 0.021 NA   NA
 3397066 3397067 RSal33209_0810 RSal33209_0811     TRUE 0.824 2.000 0.003 NA   NA
 3397067 3397068 RSal33209_0811 RSal33209_0812     TRUE 0.933 7.000 0.120 1.000 N NA
 3397068 3397069 RSal33209_0812 RSal33209_0813   recN TRUE 0.825 22.000 0.094 1.000 N NA
 3397071 3397072 RSal33209_0815 RSal33209_0816     TRUE 0.935 2.000 0.055 1.000 N NA
 3397072 3397073 RSal33209_0816 RSal33209_0817     TRUE 0.889 24.000 0.063 1.000 Y NA
 3397073 3397074 RSal33209_0817 RSal33209_0818     FALSE 0.083 147.000 0.000 1.000 N NA
 3397074 3397075 RSal33209_0818 RSal33209_0819     TRUE 0.719 10.000 0.000 1.000   NA
 3397077 3397078 RSal33209_0821 RSal33209_0822     FALSE 0.073 128.000 0.000 NA   NA
 3397078 3397079 RSal33209_0822 RSal33209_0823     FALSE 0.035 181.000 0.000 NA   NA
 3397080 3397081 RSal33209_0824 RSal33209_0825     TRUE 0.963 -7.000 0.502 1.000 N NA
 3397081 3397082 RSal33209_0825 RSal33209_0826     TRUE 0.970 1.000 0.218 1.000   NA
 3397082 3397083 RSal33209_0826 RSal33209_0827     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397083 3397084 RSal33209_0827 RSal33209_0828     FALSE 0.071 128.000 0.000 NA N NA
 3397084 3397085 RSal33209_0828 RSal33209_0829     TRUE 0.976 -3.000 0.348 NA N NA
 3397085 3397086 RSal33209_0829 RSal33209_0830     FALSE 0.077 278.000 0.130 NA N NA
 3397087 3397088 RSal33209_0831 RSal33209_0832     TRUE 0.881 11.000 0.163 NA   NA
 3397088 3397089 RSal33209_0832 RSal33209_0833     TRUE 0.911 63.000 0.000 0.001   NA
 3397089 3397090 RSal33209_0833 RSal33209_0834     TRUE 0.694 52.000 0.259 1.000   NA
 3397090 3397091 RSal33209_0834 RSal33209_0835     TRUE 0.954 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3397091 3397092 RSal33209_0835 RSal33209_0836     TRUE 0.974 15.000 0.000 0.002   NA
 3397094 3397095 RSal33209_0838 RSal33209_0839     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.090   NA
 3397095 3397096 RSal33209_0839 RSal33209_0840     FALSE 0.063 170.000 0.000 1.000   NA
 3397096 3397097 RSal33209_0840 RSal33209_0841     TRUE 0.667 9.000 0.000 NA   NA
 3397097 3397098 RSal33209_0841 RSal33209_0842     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397098 3397099 RSal33209_0842 RSal33209_0843     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 3397099 3397100 RSal33209_0843 RSal33209_0844     TRUE 0.715 10.000 0.000 1.000 N NA
 3397101 3397102 RSal33209_0845 RSal33209_0846     FALSE 0.300 49.000 0.000 1.000   NA
 3397103 3397104 RSal33209_0847 RSal33209_0848     FALSE 0.461 22.000 0.000 NA   NA
 3397104 3397105 RSal33209_0848 RSal33209_0849     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3397107 3397108 RSal33209_0851 RSal33209_0852     FALSE 0.226 82.000 0.000 1.000   NA
 3397108 3397109 RSal33209_0852 RSal33209_0853     FALSE 0.361 41.000 0.000 1.000 N NA
 3397109 3397110 RSal33209_0853 RSal33209_0854     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 3397113 3397114 RSal33209_0857 RSal33209_0858 yajQ   FALSE 0.128 99.000 0.000 NA   NA
 3397116 3397117 RSal33209_0860 RSal33209_0861     FALSE 0.093 115.000 0.000 NA   NA
 3397117 3397118 RSal33209_0861 RSal33209_0862     FALSE 0.177 60.000 0.000 NA   NA
 3397120 3397121 RSal33209_0864 RSal33209_0865     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397121 3397122 RSal33209_0865 RSal33209_0866     FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3397123 3397124 RSal33209_0867 RSal33209_0868     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397124 3397125 RSal33209_0868 RSal33209_0869     TRUE 0.908 38.000 0.000 0.007   NA
 3397127 3397128 RSal33209_0871 RSal33209_0872     TRUE 0.903 -3.000 0.011 1.000   NA
 3397129 3397130 RSal33209_0873 RSal33209_0874     TRUE 0.700 38.000 0.004 1.000 Y NA
 3397131 3397132 RSal33209_0875 RSal33209_0876     TRUE 0.894 10.000 0.084 1.000 N NA
 3397133 3397134 RSal33209_0877 RSal33209_0878     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397134 3397135 RSal33209_0878 RSal33209_0879     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3397135 3397136 RSal33209_0879 RSal33209_0880     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3397137 3397138 RSal33209_0881 RSal33209_0882     TRUE 0.639 14.000 0.000 1.000   NA
 3397139 3397140 RSal33209_0883 RSal33209_0884     TRUE 0.719 5.000 0.000 NA   NA
 3397140 3397141 RSal33209_0884 RSal33209_0885     FALSE 0.193 53.000 0.000 NA   NA
 3397141 3397142 RSal33209_0885 RSal33209_0886     FALSE 0.084 146.000 0.000 1.000 N NA
 3397143 3397144 RSal33209_0887 RSal33209_0888 rtcB   FALSE 0.162 71.000 0.000 NA   NA
 3397144 3397145 RSal33209_0888 RSal33209_0889     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 3397145 3397146 RSal33209_0889 RSal33209_0890     FALSE 0.501 17.000 0.000 NA   NA
 3397147 3397148 RSal33209_0891 RSal33209_0892     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 3397149 3397150 RSal33209_0893 RSal33209_0894     FALSE 0.225 79.000 0.000 1.000 N NA
 3397150 3397151 RSal33209_0894 RSal33209_0895     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397151 3397152 RSal33209_0895 RSal33209_0896     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397152 3397153 RSal33209_0896 RSal33209_0897     TRUE 0.943 63.000 0.087 0.017 Y NA
 3397153 3397154 RSal33209_0897 RSal33209_0898     FALSE 0.030 244.000 0.000 1.000 N NA
 3397156 3397157 RSal33209_0900 RSal33209_0901     TRUE 0.979 9.000 0.000 0.009   NA
 3397158 3397159 RSal33209_0902 RSal33209_0903     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3397159 3397160 RSal33209_0903 RSal33209_0904     FALSE 0.350 43.000 0.000 1.000   NA
 3397160 3397161 RSal33209_0904 RSal33209_0905     FALSE 0.015 598.000 0.000 1.000   NA
 3397162 3397163 RSal33209_0906 RSal33209_0907     TRUE 0.865 -18.000 0.039 NA Y NA
 3397163 3397164 RSal33209_0907 RSal33209_0908     TRUE 0.964 -3.000 0.037 NA Y NA
 3397164 3397165 RSal33209_0908 RSal33209_0909     FALSE 0.030 196.000 0.000 NA   NA
 3397165 3397166 RSal33209_0909 RSal33209_0910     FALSE 0.027 209.000 0.000 NA   NA
 3397166 3397167 RSal33209_0910 RSal33209_0911     TRUE 0.971 19.000 0.000 0.002   NA
 3397167 3397168 RSal33209_0911 RSal33209_0912     TRUE 0.961 26.000 0.000 0.002   NA
 3397168 3397169 RSal33209_0912 RSal33209_0913     TRUE 0.990 11.000 0.124 0.002   NA
 3397169 3397170 RSal33209_0913 RSal33209_0914     TRUE 0.982 13.000 0.027 0.002   NA
 3397170 3397171 RSal33209_0914 RSal33209_0915     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.002 Y NA
 3397171 3397172 RSal33209_0915 RSal33209_0916   kdpD TRUE 0.848 37.000 0.009 0.075 N NA
 3397172 3397173 RSal33209_0916 RSal33209_0917 kdpD kdpE TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3397175 3397176 RSal33209_0919 RSal33209_0920     FALSE 0.186 100.000 0.000 1.000   NA
 3397176 3397177 RSal33209_0920 RSal33209_0921     TRUE 0.857 65.000 0.000 0.003   NA
 3397179 3397180 RSal33209_0923 RSal33209_0924     FALSE 0.026 276.000 0.000 1.000   NA
 3397180 3397181 RSal33209_0924 RSal33209_0925     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 3397181 3397182 RSal33209_0925 RSal33209_0926     FALSE 0.172 66.000 0.000 NA   NA
 3397184 3397185 RSal33209_0928 RSal33209_0929     FALSE 0.159 74.000 0.000 NA   NA
 3397187 3397188 RSal33209_0930 RSal33209_0932     TRUE 0.960 33.000 0.000 0.001   NA
 3397189 3397190 RSal33209_0933 RSal33209_0934     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3397191 3397192 RSal33209_0935 RSal33209_0936     TRUE 0.697 17.000 0.031 NA   NA
 3397192 3397193 RSal33209_0936 RSal33209_0937     FALSE 0.400 47.000 0.031 NA   NA
 3397195 3397196 RSal33209_0939 RSal33209_0940     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397196 3397197 RSal33209_0940 RSal33209_0941     FALSE 0.157 76.000 0.000 NA   NA
 3397197 3397198 RSal33209_0941 RSal33209_0942     FALSE 0.198 52.000 0.000 NA   NA
 3397198 3397199 RSal33209_0942 RSal33209_0943     TRUE 0.991 0.000 0.600 NA Y NA
 3397199 3397200 RSal33209_0943 RSal33209_0944     TRUE 0.898 1.000 0.011 1.000 N NA
 3397200 3397201 RSal33209_0944 RSal33209_0945     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA N NA
 3397202 3397203 RSal33209_0946 RSal33209_0947     FALSE 0.298 37.000 0.000 NA   NA
 3397203 3397204 RSal33209_0947 RSal33209_0948     TRUE 0.960 -3.000 0.167 NA   NA
 3397204 3397205 RSal33209_0948 RSal33209_0949     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3397205 3397206 RSal33209_0949 RSal33209_0950     FALSE 0.461 31.000 0.000 1.000 N NA
 3397206 3397207 RSal33209_0950 RSal33209_0951     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.088   NA
 3397207 3397208 RSal33209_0951 RSal33209_0952     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397209 3397210 RSal33209_0953 RSal33209_0954     FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3397210 3397211 RSal33209_0954 RSal33209_0955     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 3397212 3397213 RSal33209_0956 RSal33209_0957     TRUE 0.887 67.000 0.005 0.002 N NA
 3397213 3397214 RSal33209_0957 RSal33209_0958     TRUE 0.975 -3.000 0.295 1.000 N NA
 3397214 3397215 RSal33209_0958 RSal33209_0959     FALSE 0.179 59.000 0.000 NA   NA
 3397215 3397216 RSal33209_0959 RSal33209_0960     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397216 3397217 RSal33209_0960 RSal33209_0961     FALSE 0.022 232.000 0.000 NA   NA
 3397217 3397218 RSal33209_0961 RSal33209_0962     FALSE 0.053 149.000 0.000 NA   NA
 3397218 3397219 RSal33209_0962 RSal33209_0963     FALSE 0.144 91.000 0.000 NA   NA
 3397219 3397220 RSal33209_0963 RSal33209_0964     FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 3397220 3397221 RSal33209_0964 RSal33209_0965     TRUE 0.944 0.000 0.056 1.000 N NA
 3397221 3397222 RSal33209_0965 RSal33209_0966     FALSE 0.352 74.000 0.026 1.000   NA
 3397222 3397223 RSal33209_0966 RSal33209_0967   glnR.1 FALSE 0.117 125.000 0.000 1.000   NA
 3397223 3397224 RSal33209_0967 RSal33209_0969 glnR.1 glnR.2 FALSE 0.094 114.000 0.000 NA   NA
 3397225 3397226 RSal33209_0968 RSal33209_0970     FALSE 0.329 129.000 0.200 NA   NA
 3397226 3397227 RSal33209_0970 RSal33209_0971     TRUE 0.646 14.000 0.013 NA   NA
 3397228 3397229 RSal33209_0972 RSal33209_0973     FALSE 0.141 115.000 0.000 1.000   NA
 3397231 3397232 RSal33209_0975 RSal33209_0976 pspC.1   TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397232 3397233 RSal33209_0976 RSal33209_0977   pspC.2 FALSE 0.525 14.000 0.000 NA   NA
 3397234 3397235 RSal33209_0978 RSal33209_0979     FALSE 0.448 211.000 0.797 NA Y NA
 3397235 3397236 RSal33209_0979 RSal33209_0980     FALSE 0.185 55.000 0.000 NA   NA
 3397236 3397237 RSal33209_0980 RSal33209_0981     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 3397237 3397238 RSal33209_0981 RSal33209_0982     TRUE 0.901 20.000 0.000 0.088   NA
 3397238 3397239 RSal33209_0982 RSal33209_0983     TRUE 0.882 66.000 0.000 0.030 Y NA
 3397241 3397242 RSal33209_0985 RSal33209_0986   secE FALSE 0.198 52.000 0.000 NA   NA
 3397242 3397243 RSal33209_0986 RSal33209_0987 secE nusG TRUE 0.786 75.000 0.843 1.000 N NA
 3397243 3397244 RSal33209_0987 RSal33209_0988 nusG   TRUE 0.596 123.000 0.681 1.000 N NA
 3397244 3397245 RSal33209_0988 RSal33209_0989     TRUE 0.966 104.000 0.838 0.021 Y NA
 3397245 3397246 RSal33209_0989 RSal33209_0990     FALSE 0.285 64.000 0.002 1.000   NA
 3397246 3397247 RSal33209_0990 RSal33209_0991     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.012   NA
 3397247 3397248 RSal33209_0991 RSal33209_0992     TRUE 0.818 69.000 0.000 0.012   NA
 3397248 3397249 RSal33209_0992 RSal33209_0993     FALSE 0.157 76.000 0.000 NA   NA
 3397249 3397250 RSal33209_0993 RSal33209_0994     FALSE 0.010 498.000 0.000 NA   NA
 3397250 3397251 RSal33209_0994 RSal33209_0995     TRUE 0.971 100.000 0.884 0.016 Y NA
 3397252 3397253 RSal33209_0996 RSal33209_0997     FALSE 0.262 120.000 0.000 NA Y NA
 3397253 3397254 RSal33209_0997 RSal33209_0998     TRUE 0.998 3.000 0.938 0.063 Y NA
 3397254 3397255 RSal33209_0998 RSal33209_0999     FALSE 0.254 59.000 0.000 1.000 N NA
 3397255 3397256 RSal33209_0999 RSal33209_1000     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.088   NA
 3397257 3397258 RSal33209_1001 RSal33209_1002     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 3397258 3397259 RSal33209_1002 RSal33209_1003     TRUE 0.969 3.000 0.326 NA   NA
 3397259 3397260 RSal33209_1003 RSal33209_1004     TRUE 0.981 -3.000 0.372 1.000   NA
 3397260 3397261 RSal33209_1004 RSal33209_1005     FALSE 0.238 100.000 0.010 1.000 N NA
 3397262 3397263 RSal33209_1006 RSal33209_1007     TRUE 0.943 13.000 0.000 0.062   NA
 3397263 3397264 RSal33209_1007 RSal33209_1008     FALSE 0.229 77.000 0.000 1.000   NA
 3397264 3397265 RSal33209_1008 RSal33209_1009     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397265 3397266 RSal33209_1009 RSal33209_1010     FALSE 0.075 126.000 0.000 NA   NA
 3397266 3397267 RSal33209_1010 RSal33209_1011     TRUE 0.955 22.000 0.000 0.005   NA
 3397267 3397268 RSal33209_1011 RSal33209_1012     TRUE 0.946 -3.000 0.092 NA N NA
 3397268 3397269 RSal33209_1012 RSal33209_1013     FALSE 0.011 433.000 0.000 NA N NA
 3397269 3397270 RSal33209_1013 RSal33209_1014     FALSE 0.066 134.000 0.000 NA   NA
 3397271 3397272 RSal33209_1015 RSal33209_1016     TRUE 0.997 9.000 0.800 0.063 Y NA
 3397272 3397273 RSal33209_1016 RSal33209_1017     TRUE 0.987 -10.000 0.079 0.063 Y NA
 3397273 3397274 RSal33209_1017 RSal33209_1018     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397274 3397275 RSal33209_1018 RSal33209_1019     FALSE 0.284 39.000 0.000 NA   NA
 3397275 3397276 RSal33209_1019 RSal33209_1020     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 3397277 3397278 RSal33209_1021 RSal33209_1022     FALSE 0.233 73.000 0.000 1.000   NA
 3397278 3397279 RSal33209_1022 RSal33209_1023     FALSE 0.177 60.000 0.000 NA   NA
 3397279 3397280 RSal33209_1023 RSal33209_1024     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397280 3397281 RSal33209_1024 RSal33209_1025     FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3397281 3397282 RSal33209_1025 RSal33209_1026     TRUE 0.788 -7.000 0.006 1.000 N NA
 3397282 3397283 RSal33209_1026 RSal33209_1027     FALSE 0.228 79.000 0.000 1.000   NA
 3397283 3397284 RSal33209_1027 RSal33209_1028     TRUE 0.958 40.000 0.286 0.030   NA
 3397284 3397285 RSal33209_1028 RSal33209_1029     TRUE 0.983 10.000 0.308 0.088   NA
 3397286 3397287 RSal33209_1030 RSal33209_1031     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 3397288 3397289 RSal33209_1032 RSal33209_1033     FALSE 0.017 263.000 0.000 NA   NA
 3397289 3397290 RSal33209_1033 RSal33209_1034     FALSE 0.391 28.000 0.000 NA   NA
 3397292 3397293 RSal33209_1036 RSal33209_1037     FALSE 0.045 201.000 0.000 1.000   NA
 3397293 3397294 RSal33209_1037 RSal33209_1038     TRUE 0.814 74.000 0.000 0.009   NA
 3397297 3397298 RSal33209_1041 RSal33209_1042     FALSE 0.391 81.000 0.043 1.000 N NA
 3397298 3397299 RSal33209_1042 RSal33209_1043     TRUE 0.553 439.000 0.020 0.001 Y NA
 3397299 3397300 RSal33209_1043 RSal33209_1044     TRUE 0.999 4.000 0.380 0.001 Y NA
 3397300 3397301 RSal33209_1044 RSal33209_1045     TRUE 0.982 44.000 0.071 0.001 Y NA
 3397301 3397302 RSal33209_1045 RSal33209_1046     FALSE 0.274 139.000 0.006 1.000 Y NA
 3397302 3397303 RSal33209_1046 RSal33209_1047     FALSE 0.439 33.000 0.000 1.000   NA
 3397303 3397304 RSal33209_1047 RSal33209_1048     TRUE 0.982 2.000 0.000 0.059   NA
 3397304 3397305 RSal33209_1048 RSal33209_1049     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3397305 3397306 RSal33209_1049 RSal33209_1050     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397306 3397307 RSal33209_1050 RSal33209_1051     FALSE 0.251 61.000 0.000 1.000 N NA
 3397308 3397309 RSal33209_1052 RSal33209_1053     TRUE 0.873 32.000 0.121 1.000 Y NA
 3397309 3397310 RSal33209_1053 RSal33209_1054     FALSE 0.200 94.000 0.000 1.000 N NA
 3397310 3397311 RSal33209_1054 RSal33209_1055     TRUE 0.968 -12.000 0.000 0.073 Y NA
 3397311 3397312 RSal33209_1055 RSal33209_1056     TRUE 0.982 2.000 0.516 1.000   NA
 3397312 3397313 RSal33209_1056 RSal33209_1057     FALSE 0.429 34.000 0.000 1.000   NA
 3397313 3397314 RSal33209_1057 RSal33209_1058     FALSE 0.020 237.000 0.000 NA   NA
 3397314 3397315 RSal33209_1058 RSal33209_1059     FALSE 0.458 -21.000 0.000 NA   NA
 3397316 3397317 RSal33209_1060 RSal33209_1061     TRUE 0.596 105.000 0.083 1.000 Y NA
 3397317 3397318 RSal33209_1061 RSal33209_1062     FALSE 0.136 134.000 0.010 1.000 N NA
 3397318 3397319 RSal33209_1062 RSal33209_1063     TRUE 0.768 26.000 0.070 1.000 N NA
 3397319 3397320 RSal33209_1063 RSal33209_1064     FALSE 0.138 157.000 0.035 1.000   NA
 3397321 3397322 RSal33209_1065 RSal33209_1066     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397323 3397324 RSal33209_1067 RSal33209_1068     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.087   NA
 3397324 3397325 RSal33209_1068 RSal33209_1069   ftsY FALSE 0.235 70.000 0.000 1.000 N NA
 3397325 3397326 RSal33209_1069 RSal33209_1070 ftsY   FALSE 0.291 190.000 0.004 0.074   NA
 3397326 3397327 RSal33209_1070 RSal33209_1071     TRUE 0.874 100.000 0.000 0.001   NA
 3397327 3397328 RSal33209_1071 RSal33209_1072     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3397330 3397331 RSal33209_1074 RSal33209_1075     TRUE 0.693 7.000 0.000 NA   NA
 3397331 3397332 RSal33209_1075 RSal33209_1076     TRUE 0.536 21.000 0.004 NA   NA
 3397333 3397334 RSal33209_1077 RSal33209_1078   thiC FALSE 0.014 764.000 0.000 1.000   NA
 3397335 3397336 RSal33209_1079 RSal33209_1080     FALSE 0.071 129.000 0.000 NA   NA
 3397336 3397337 RSal33209_1080 RSal33209_1081     FALSE 0.053 168.000 0.003 NA   NA
 3397337 3397338 RSal33209_1081 RSal33209_1082     TRUE 0.979 2.000 0.385 1.000   NA
 3397338 3397339 RSal33209_1082 RSal33209_1083   rimM TRUE 0.838 35.000 0.324 1.000   NA
 3397339 3397340 RSal33209_1083 RSal33209_1084 rimM   TRUE 0.992 1.000 0.672 1.000 Y NA
 3397340 3397341 RSal33209_1084 RSal33209_1085     FALSE 0.480 197.000 0.567 1.000 Y NA
 3397341 3397342 RSal33209_1085 RSal33209_1086     TRUE 0.675 16.000 0.005 1.000 N NA
 3397342 3397343 RSal33209_1086 RSal33209_1087     TRUE 0.999 1.000 0.800 0.001 Y NA
 3397343 3397344 RSal33209_1087 RSal33209_1088     FALSE 0.316 55.000 0.005 1.000 N NA
 3397344 3397345 RSal33209_1088 RSal33209_1089     TRUE 0.881 8.000 0.067 NA   NA
 3397345 3397346 RSal33209_1089 RSal33209_1090     FALSE 0.097 169.000 0.036 NA   NA
 3397346 3397347 RSal33209_1090 RSal33209_1091     TRUE 0.939 -3.000 0.050 1.000   NA
 3397347 3397348 RSal33209_1091 RSal33209_1092     TRUE 0.950 39.000 0.000 0.001   NA
 3397349 3397350 RSal33209_1093 RSal33209_1094     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.087   NA
 3397351 3397352 RSal33209_1095 RSal33209_1096     FALSE 0.253 60.000 0.000 1.000 N NA
 3397352 3397353 RSal33209_1096 RSal33209_1097     FALSE 0.226 77.000 0.000 1.000 N NA
 3397353 3397354 RSal33209_1097 RSal33209_1098     FALSE 0.045 186.000 0.005 NA   NA
 3397355 3397356 RSal33209_1099 RSal33209_1100     TRUE 0.598 119.000 0.178 1.000 Y NA
 3397356 3397357 RSal33209_1100 RSal33209_1101     TRUE 0.928 130.000 0.307 0.003 Y NA
 3397357 3397358 RSal33209_1101 RSal33209_1102     TRUE 0.988 0.000 0.294 1.000 Y NA
 3397358 3397359 RSal33209_1102 RSal33209_1103     TRUE 0.533 114.000 0.441 NA N NA
 3397360 3397361 RSal33209_1104 RSal33209_1105     FALSE 0.164 70.000 0.000 NA   NA
 3397363 3397364 RSal33209_1107 RSal33209_1108     TRUE 0.934 14.000 0.575 NA   NA
 3397364 3397365 RSal33209_1108 RSal33209_1109     FALSE 0.011 430.000 0.000 NA   NA
 3397365 3397366 RSal33209_1109 RSal33209_1110     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3397368 3397369 RSal33209_1112 RSal33209_1113     FALSE 0.225 84.000 0.000 1.000   NA
 3397369 3397370 RSal33209_1113 RSal33209_1114     FALSE 0.211 49.000 0.000 NA   NA
 3397370 3397371 RSal33209_1114 RSal33209_1115     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 3397372 3397373 RSal33209_1116 RSal33209_1117   traA.1 FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 3397373 3397374 RSal33209_1117 RSal33209_1118 traA.1 traA.2 FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 3397377 3397378 RSal33209_1121 RSal33209_1122     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.087   NA
 3397379 3397380 RSal33209_1123 RSal33209_1124     FALSE 0.137 94.000 0.000 NA   NA
 3397380 3397381 RSal33209_1124 RSal33209_1125     FALSE 0.156 80.000 0.000 NA   NA
 3397382 3397383 RSal33209_1126 RSal33209_1127     FALSE 0.036 225.000 0.000 1.000   NA
 3397383 3397384 RSal33209_1127 RSal33209_1128     FALSE 0.220 87.000 0.000 1.000   NA
 3397384 3397385 RSal33209_1128 RSal33209_1129     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.055   NA
 3397386 3397387 RSal33209_1130 RSal33209_1131   corA FALSE 0.038 221.000 0.000 1.000   NA
 3397387 3397388 RSal33209_1131 RSal33209_1132 corA   TRUE 0.944 15.000 0.600 1.000 N NA
 3397389 3397390 RSal33209_1133 RSal33209_1134     TRUE 0.598 105.000 0.333 1.000   NA
 3397390 3397391 RSal33209_1134 RSal33209_1135     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3397392 3397393 RSal33209_1136 RSal33209_1137     TRUE 0.794 6.000 0.000 1.000   NA
 3397393 3397394 RSal33209_1137 RSal33209_1139     TRUE 0.984 2.000 0.000 0.042   NA
 3397397 3397398 RSal33209_1141 RSal33209_1142     FALSE 0.046 157.000 0.000 NA   NA
 3397398 3397399 RSal33209_1142 RSal33209_1143     FALSE 0.391 28.000 0.000 NA   NA
 3397399 3397400 RSal33209_1143 RSal33209_1144     FALSE 0.020 367.000 0.000 1.000   NA
 3397400 3397401 RSal33209_1144 RSal33209_1145     TRUE 0.972 16.000 0.694 1.000 Y NA
 3397401 3397402 RSal33209_1145 RSal33209_1146     TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.062 Y NA
 3397402 3397403 RSal33209_1146 RSal33209_1147     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.062 N NA
 3397405 3397406 RSal33209_1148 RSal33209_1150     FALSE 0.250 65.000 0.000 1.000   NA
 3397406 3397407 RSal33209_1150 RSal33209_1151     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.087   NA
 3397407 3397408 RSal33209_1151 RSal33209_1152     FALSE 0.058 143.000 0.000 NA   NA
 3397409 3397410 RSal33209_1153 RSal33209_1154     TRUE 0.999 -3.000 0.412 0.001 Y NA
 3397411 3397412 RSal33209_1155 RSal33209_1156     FALSE 0.183 56.000 0.000 NA   NA
 3397414 3397415 RSal33209_1158 RSal33209_1159     FALSE 0.170 67.000 0.000 NA   NA
 3397415 3397416 RSal33209_1159 RSal33209_1160     TRUE 0.892 8.000 0.077 NA   NA
 3397416 3397417 RSal33209_1160 RSal33209_1161     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 3397419 3397420 RSal33209_1163 RSal33209_1164 oppA.3 oppB.1 TRUE 0.673 194.000 0.132 0.062 Y NA
 3397420 3397421 RSal33209_1164 RSal33209_1165 oppB.1 oppC TRUE 0.998 -3.000 0.522 0.062 Y NA
 3397425 3397426 RSal33209_1169 RSal33209_1170     TRUE 0.613 15.000 0.008 NA   NA
 3397426 3397427 RSal33209_1170 RSal33209_1171     FALSE 0.010 479.000 0.000 NA   NA
 3397427 3397428 RSal33209_1171 RSal33209_1172     FALSE 0.164 70.000 0.000 NA   NA
 3397429 3397430 RSal33209_1173 RSal33209_1175     FALSE 0.129 98.000 0.000 NA   NA
 3397431 3397432 RSal33209_1174 RSal33209_1176     FALSE 0.449 76.000 0.064 1.000 N NA
 3397435 3397436 RSal33209_1179 RSal33209_1181     TRUE 0.780 29.000 0.169 NA   NA
 3397438 3397439 RSal33209_1182 RSal33209_1183 gluD   TRUE 0.742 67.000 0.000 0.062 N NA
 3397439 3397440 RSal33209_1183 RSal33209_1184   gluA FALSE 0.375 108.000 0.000 1.000 Y NA
 3397441 3397442 RSal33209_1185 RSal33209_1186     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397442 3397443 RSal33209_1186 RSal33209_1187     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397443 3397444 RSal33209_1187 RSal33209_1188     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 3397444 3397445 RSal33209_1188 RSal33209_1189     FALSE 0.385 53.000 0.042 NA   NA
 3397447 3397448 RSal33209_1191 RSal33209_1192     TRUE 0.851 7.000 0.037 NA   NA
 3397448 3397449 RSal33209_1192 RSal33209_1193     FALSE 0.444 69.000 0.081 NA   NA
 3397450 3397451 RSal33209_1194 RSal33209_1195     TRUE 0.978 0.000 0.389 NA   NA
 3397451 3397452 RSal33209_1195 RSal33209_1196     TRUE 0.966 -7.000 0.806 NA   NA
 3397456 3397457 RSal33209_1200 RSal33209_1201     TRUE 0.949 9.000 0.055 1.000 Y NA
 3397457 3397458 RSal33209_1201 RSal33209_1202     FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 3397458 3397459 RSal33209_1202 RSal33209_1203     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 3397459 3397460 RSal33209_1203 RSal33209_1204     FALSE 0.400 37.000 0.000 1.000 N NA
 3397462 3397463 RSal33209_1206 RSal33209_1207     TRUE 0.979 18.000 0.000 0.001   NA
 3397464 3397465 RSal33209_1208 RSal33209_1209     TRUE 0.974 25.000 0.000 0.001   NA
 3397465 3397466 RSal33209_1209 RSal33209_1210   thiS TRUE 0.941 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3397466 3397467 RSal33209_1210 RSal33209_1211 thiS thiG TRUE 0.973 4.000 0.104 1.000 Y NA
 3397468 3397469 RSal33209_1212 RSal33209_1213     TRUE 0.923 2.000 0.060 NA   NA
 3397469 3397470 RSal33209_1213 RSal33209_1214     TRUE 0.730 57.000 0.518 NA   NA
 3397472 3397473 RSal33209_1216 RSal33209_1217     FALSE 0.016 285.000 0.000 NA   NA
 3397473 3397474 RSal33209_1217 RSal33209_1218     FALSE 0.099 112.000 0.000 NA   NA
 3397475 3397476 RSal33209_1219 RSal33209_1220     TRUE 0.976 40.000 0.013 0.001 Y NA
 3397476 3397477 RSal33209_1220 RSal33209_1221     FALSE 0.286 53.000 0.014 NA   NA
 3397477 3397478 RSal33209_1221 RSal33209_1222     TRUE 0.908 -3.000 0.034 NA   NA
 3397478 3397479 RSal33209_1222 RSal33209_1223     TRUE 0.655 47.000 0.015 1.000 Y NA
 3397479 3397480 RSal33209_1223 RSal33209_1224     TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 3397480 3397481 RSal33209_1224 RSal33209_1225     TRUE 0.998 -3.000 0.071 0.002 Y NA
 3397481 3397482 RSal33209_1225 RSal33209_1226     FALSE 0.344 82.000 0.052 NA N NA
 3397482 3397483 RSal33209_1226 RSal33209_1227     TRUE 0.880 -3.000 0.018 NA N NA
 3397484 3397485 RSal33209_1228 RSal33209_1229     FALSE 0.022 228.000 0.000 NA N NA
 3397485 3397486 RSal33209_1229 RSal33209_1230     TRUE 0.845 32.000 0.106 NA Y NA
 3397486 3397487 RSal33209_1230 RSal33209_1231     TRUE 0.981 -3.000 0.106 1.000 Y NA
 3397487 3397488 RSal33209_1231 RSal33209_1232     FALSE 0.042 207.000 0.000 1.000 N NA
 3397489 3397490 RSal33209_1233 RSal33209_1234     TRUE 0.997 -3.000 0.102 0.012 Y NA
 3397490 3397491 RSal33209_1234 RSal33209_1235     TRUE 0.999 -3.000 0.493 0.003 Y NA
 3397493 3397494 RSal33209_1237 RSal33209_1238     TRUE 0.939 -7.000 0.044 1.000 Y NA
 3397494 3397495 RSal33209_1238 RSal33209_1239     TRUE 0.909 -3.000 0.014 1.000   NA
 3397496 3397497 RSal33209_1240 RSal33209_1241     TRUE 0.667 9.000 0.000 NA   NA
 3397498 3397499 RSal33209_1242 RSal33209_1243     FALSE 0.135 174.000 0.053 1.000   NA
 3397499 3397500 RSal33209_1243 RSal33209_1244     FALSE 0.061 138.000 0.000 NA   NA
 3397501 3397502 RSal33209_1245 RSal33209_1246     TRUE 0.838 57.000 0.000 0.009   NA
 3397502 3397503 RSal33209_1246 RSal33209_1247     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397504 3397505 RSal33209_1248 RSal33209_1249     TRUE 0.544 -13.000 0.000 NA   NA
 3397506 3397507 RSal33209_1250 RSal33209_1251     FALSE 0.089 118.000 0.000 NA   NA
 3397508 3397509 RSal33209_1252 RSal33209_1253     FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 3397510 3397511 RSal33209_1254 RSal33209_1255     FALSE 0.011 447.000 0.000 NA   NA
 3397511 3397512 RSal33209_1255 RSal33209_1256     TRUE 0.801 5.000 0.000 1.000 N NA
 3397514 3397515 RSal33209_1258 RSal33209_1259     TRUE 0.821 4.000 0.000 1.000   NA
 3397515 3397516 RSal33209_1259 RSal33209_1260     TRUE 0.959 37.000 0.008 0.001   NA
 3397516 3397517 RSal33209_1260 RSal33209_1261     TRUE 0.953 40.000 0.004 0.001   NA
 3397519 3397520 RSal33209_1263 RSal33209_1264     FALSE 0.185 55.000 0.000 NA   NA
 3397520 3397521 RSal33209_1264 RSal33209_1265     FALSE 0.045 158.000 0.000 NA   NA
 3397521 3397522 RSal33209_1265 RSal33209_1266     FALSE 0.212 149.000 0.111 NA   NA
 3397523 3397524 RSal33209_1267 RSal33209_1268     FALSE 0.329 33.000 0.000 NA   NA
 3397525 3397526 RSal33209_1269 RSal33209_1270     TRUE 0.954 -15.000 0.811 1.000   NA
 3397526 3397527 RSal33209_1270 RSal33209_1271     FALSE 0.030 246.000 0.000 1.000   NA
 3397527 3397528 RSal33209_1271 RSal33209_1272     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.085   NA
 3397528 3397529 RSal33209_1272 RSal33209_1273     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397530 3397531 RSal33209_1274 RSal33209_1275     TRUE 0.996 22.000 0.877 0.005 Y NA
 3397531 3397532 RSal33209_1275 RSal33209_1276     FALSE 0.084 120.000 0.000 NA   NA
 3397532 3397533 RSal33209_1276 RSal33209_1277     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 3397534 3397535 RSal33209_1278 RSal33209_1279 tipA.1 tipA.2 FALSE 0.416 26.000 0.000 NA   NA
 3397535 3397536 RSal33209_1279 RSal33209_1280 tipA.2   FALSE 0.099 112.000 0.000 NA   NA
 3397536 3397537 RSal33209_1280 RSal33209_1281     TRUE 0.948 2.000 0.121 NA   NA
 3397537 3397538 RSal33209_1281 RSal33209_1282     TRUE 0.719 5.000 0.000 NA   NA
 3397538 3397539 RSal33209_1282 RSal33209_1283     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397539 3397540 RSal33209_1283 RSal33209_1284     FALSE 0.433 25.000 0.000 NA   NA
 3397540 3397541 RSal33209_1284 RSal33209_1285   cspR FALSE 0.358 42.000 0.000 1.000   NA
 3397541 3397542 RSal33209_1285 RSal33209_1286 cspR   FALSE 0.236 71.000 0.000 1.000   NA
 3397543 3397544 RSal33209_1287 RSal33209_1288     FALSE 0.179 102.000 0.000 1.000   NA
 3397544 3397545 RSal33209_1288 RSal33209_1289     TRUE 0.999 5.000 0.643 0.001 Y NA
 3397545 3397546 RSal33209_1289 RSal33209_1290     TRUE 0.999 0.000 0.492 0.001 Y NA
 3397546 3397547 RSal33209_1290 RSal33209_1291     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 3397548 3397549 RSal33209_1292 RSal33209_1293     FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 3397551 3397552 RSal33209_1295 RSal33209_1296     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.085   NA
 3397553 3397554 RSal33209_1297 RSal33209_1298     TRUE 0.783 54.000 0.000 0.054   NA
 3397554 3397555 RSal33209_1298 RSal33209_1299     TRUE 0.743 77.000 0.000 0.054   NA
 3397557 3397558 RSal33209_1301 RSal33209_1302     TRUE 0.758 64.000 0.547 1.000 N NA
 3397558 3397559 RSal33209_1302 RSal33209_1303     FALSE 0.205 93.000 0.000 1.000   NA
 3397559 3397560 RSal33209_1303 RSal33209_1304     TRUE 0.908 68.000 0.000 0.001   NA
 3397560 3397561 RSal33209_1304 RSal33209_1305     FALSE 0.479 20.000 0.000 NA   NA
 3397561 3397562 RSal33209_1305 RSal33209_1306     FALSE 0.177 60.000 0.000 NA   NA
 3397562 3397563 RSal33209_1306 RSal33209_1307     TRUE 0.792 41.000 0.400 NA N NA
 3397563 3397564 RSal33209_1307 RSal33209_1308   dppB.1 FALSE 0.186 285.000 0.000 0.061   NA
 3397564 3397565 RSal33209_1308 RSal33209_1309 dppB.1 dppB.2 TRUE 0.959 10.000 0.000 0.061   NA
 3397565 3397566 RSal33209_1309 RSal33209_1310 dppB.2 dppC.1 TRUE 0.984 0.000 0.000 0.061   NA
 3397566 3397567 RSal33209_1310 RSal33209_1311 dppC.1 dppD FALSE 0.450 32.000 0.000 1.000   NA
 3397567 3397568 RSal33209_1311 RSal33209_1312 dppD oppF TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397568 3397569 RSal33209_1312 RSal33209_1313 oppF dppF.1 FALSE 0.507 28.000 0.000 1.000   NA
 3397569 3397570 RSal33209_1313 RSal33209_1314 dppF.1   FALSE 0.124 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3397570 3397571 RSal33209_1314 RSal33209_1315     TRUE 0.940 -19.000 0.000 0.040   NA
 3397571 3397572 RSal33209_1315 RSal33209_1316     TRUE 0.908 68.000 0.000 0.001   NA
 3397572 3397573 RSal33209_1316 RSal33209_1317     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397573 3397574 RSal33209_1317 RSal33209_1318     TRUE 0.667 9.000 0.000 NA   NA
 3397574 3397575 RSal33209_1318 RSal33209_1319     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397576 3397577 RSal33209_1320 RSal33209_1321     FALSE 0.507 66.000 0.000 1.000 Y NA
 3397578 3397579 RSal33209_1322 RSal33209_1323     TRUE 0.979 5.000 0.237 1.000 Y NA
 3397579 3397580 RSal33209_1323 RSal33209_1324     TRUE 0.966 -3.000 0.160 1.000 N NA
 3397580 3397581 RSal33209_1324 RSal33209_1325     TRUE 0.972 -3.000 0.233 1.000 N NA
 3397582 3397583 RSal33209_1326 RSal33209_1327     FALSE 0.162 71.000 0.000 NA   NA
 3397583 3397584 RSal33209_1327 RSal33209_1328     TRUE 0.565 -12.000 0.000 NA   NA
 3397584 3397585 RSal33209_1328 RSal33209_1329     FALSE 0.284 39.000 0.000 NA   NA
 3397586 3397587 RSal33209_1330 RSal33209_1331     TRUE 0.741 45.000 0.259 1.000 N NA
 3397587 3397588 RSal33209_1331 RSal33209_1332     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3397588 3397589 RSal33209_1332 RSal33209_1333     FALSE 0.132 198.000 0.000 1.000 Y NA
 3397590 3397591 RSal33209_1334 RSal33209_1335     FALSE 0.116 104.000 0.000 NA   NA
 3397591 3397592 RSal33209_1335 RSal33209_1336     FALSE 0.211 49.000 0.000 NA   NA
 3397592 3397593 RSal33209_1336 RSal33209_1337     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397594 3397595 RSal33209_1338 RSal33209_1339 capE   TRUE 0.992 4.000 0.100 0.015   NA
 3397596 3397597 RSal33209_1340 RSal33209_1341     TRUE 0.998 -3.000 0.043 0.001 Y NA
 3397597 3397598 RSal33209_1341 RSal33209_1342     FALSE 0.479 78.000 0.000 1.000 Y NA
 3397598 3397599 RSal33209_1342 RSal33209_1343     FALSE 0.227 75.000 0.000 1.000 N NA
 3397599 3397600 RSal33209_1343 RSal33209_1344     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.085   NA
 3397600 3397601 RSal33209_1344 RSal33209_1345     TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000   NA
 3397601 3397602 RSal33209_1345 RSal33209_1346     TRUE 0.994 3.000 0.000 0.001   NA
 3397603 3397604 RSal33209_1347 RSal33209_1348 cpaF   TRUE 0.898 32.000 0.000 0.043   NA
 3397604 3397605 RSal33209_1348 RSal33209_1349   tadB TRUE 0.986 0.000 0.667 1.000   NA
 3397605 3397606 RSal33209_1349 RSal33209_1350 tadB   TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397606 3397607 RSal33209_1350 RSal33209_1351     TRUE 0.994 3.000 0.000 0.001   NA
 3397607 3397608 RSal33209_1351 RSal33209_1352     TRUE 0.983 1.000 0.758 NA   NA
 3397608 3397609 RSal33209_1352 RSal33209_1353     TRUE 0.953 3.000 0.185 NA   NA
 3397609 3397610 RSal33209_1353 RSal33209_1354     TRUE 0.901 -19.000 0.364 NA   NA
 3397610 3397611 RSal33209_1354 RSal33209_1355     FALSE 0.040 172.000 0.000 NA   NA
 3397611 3397612 RSal33209_1355 RSal33209_1356     FALSE 0.459 27.000 0.002 NA   NA
 3397612 3397613 RSal33209_1356 RSal33209_1357   ftsE FALSE 0.267 119.000 0.053 1.000 N NA
 3397613 3397614 RSal33209_1357 RSal33209_1358 ftsE ftsX TRUE 0.991 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3397614 3397615 RSal33209_1358 RSal33209_1359 ftsX   TRUE 0.844 23.000 0.016 1.000 Y NA
 3397615 3397616 RSal33209_1359 RSal33209_1360     FALSE 0.361 49.000 0.007 1.000 N NA
 3397616 3397617 RSal33209_1360 RSal33209_1361     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3397617 3397618 RSal33209_1361 RSal33209_1362     FALSE 0.015 294.000 0.000 NA   NA
 3397619 3397620 RSal33209_1363 RSal33209_1364     FALSE 0.141 92.000 0.000 NA   NA
 3397620 3397621 RSal33209_1364 RSal33209_1365     FALSE 0.137 94.000 0.000 NA   NA
 3397621 3397622 RSal33209_1365 RSal33209_1366     FALSE 0.252 43.000 0.000 NA   NA
 3397622 3397623 RSal33209_1366 RSal33209_1367     TRUE 0.693 7.000 0.000 NA   NA
 3397623 3397624 RSal33209_1367 RSal33209_1368     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397625 3397626 RSal33209_1369 RSal33209_1370     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.084   NA
 3397626 3397627 RSal33209_1370 RSal33209_1371     FALSE 0.290 38.000 0.000 NA   NA
 3397627 3397628 RSal33209_1371 RSal33209_1372     FALSE 0.160 72.000 0.000 NA   NA
 3397629 3397630 RSal33209_1373 RSal33209_1374     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.072 Y NA
 3397630 3397631 RSal33209_1374 RSal33209_1375     TRUE 0.692 84.000 0.375 1.000 N NA
 3397631 3397632 RSal33209_1375 RSal33209_1376   mntH FALSE 0.372 40.000 0.000 1.000 N NA
 3397632 3397633 RSal33209_1376 RSal33209_1377 mntH   FALSE 0.220 87.000 0.000 1.000   NA
 3397633 3397634 RSal33209_1377 RSal33209_1378     FALSE 0.507 28.000 0.000 1.000   NA
 3397634 3397635 RSal33209_1378 RSal33209_1379     TRUE 0.940 35.000 0.000 0.002   NA
 3397635 3397636 RSal33209_1379 RSal33209_1380     FALSE 0.073 155.000 0.000 1.000 N NA
 3397636 3397637 RSal33209_1380 RSal33209_1381     FALSE 0.484 47.000 0.033 1.000   NA
 3397637 3397638 RSal33209_1381 RSal33209_1382     FALSE 0.151 174.000 0.063 1.000   NA
 3397638 3397639 RSal33209_1382 RSal33209_1383     TRUE 0.884 0.000 0.017 NA   NA
 3397640 3397641 RSal33209_1384 RSal33209_1385     TRUE 0.985 -3.000 0.808 NA   NA
 3397642 3397643 RSal33209_1386 RSal33209_1387     TRUE 0.951 0.000 0.101 NA   NA
 3397643 3397644 RSal33209_1387 RSal33209_1388     FALSE 0.470 21.000 0.000 NA   NA
 3397644 3397645 RSal33209_1388 RSal33209_1389     FALSE 0.049 154.000 0.000 NA   NA
 3397645 3397646 RSal33209_1389 RSal33209_1390     FALSE 0.180 178.000 0.167 NA   NA
 3397646 3397647 RSal33209_1390 RSal33209_1391     FALSE 0.318 85.000 0.019 1.000   NA
 3397648 3397649 RSal33209_1392 RSal33209_1393     FALSE 0.335 45.000 0.000 1.000   NA
 3397649 3397650 RSal33209_1393 RSal33209_1394     FALSE 0.466 31.000 0.000 1.000   NA
 3397650 3397651 RSal33209_1394 RSal33209_1395     FALSE 0.211 49.000 0.000 NA   NA
 3397651 3397652 RSal33209_1395 RSal33209_1396     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3397652 3397653 RSal33209_1396 RSal33209_1397     TRUE 0.986 -3.000 0.857 NA   NA
 3397653 3397654 RSal33209_1397 RSal33209_1398     FALSE 0.283 136.000 0.167 NA   NA
 3397654 3397655 RSal33209_1398 RSal33209_1399     TRUE 0.923 26.000 0.204 1.000 Y NA
 3397655 3397656 RSal33209_1399 RSal33209_1400     TRUE 0.973 30.000 0.291 0.089 Y NA
 3397658 3397659 RSal33209_1402 RSal33209_1403     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397661 3397662 RSal33209_1404 RSal33209_1406     TRUE 0.614 -16.000 0.000 1.000   NA
 3397662 3397663 RSal33209_1406 RSal33209_1407     TRUE 0.995 1.000 0.008 0.001   NA
 3397663 3397664 RSal33209_1407 RSal33209_1408     FALSE 0.346 64.000 0.017 1.000   NA
 3397664 3397665 RSal33209_1408 RSal33209_1409     TRUE 0.856 9.000 0.028 1.000   NA
 3397666 3397667 RSal33209_1410 RSal33209_1411     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 3397667 3397668 RSal33209_1411 RSal33209_1412     TRUE 0.949 -3.000 0.100 NA   NA
 3397668 3397669 RSal33209_1412 RSal33209_1413   hrpA FALSE 0.090 140.000 0.000 1.000 N NA
 3397669 3397670 RSal33209_1413 RSal33209_1414 hrpA   TRUE 0.647 13.000 0.000 1.000 N NA
 3397671 3397672 RSal33209_1415 RSal33209_1416     FALSE 0.158 75.000 0.000 NA   NA
 3397672 3397673 RSal33209_1416 RSal33209_1417     FALSE 0.298 37.000 0.000 NA   NA
 3397674 3397675 RSal33209_1418 RSal33209_1419     FALSE 0.154 84.000 0.000 NA   NA
 3397675 3397676 RSal33209_1419 RSal33209_1420     FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3397676 3397677 RSal33209_1420 RSal33209_1421     TRUE 0.959 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3397677 3397678 RSal33209_1421 RSal33209_1422     TRUE 0.982 0.000 0.389 1.000   NA
 3397679 3397680 RSal33209_1423 RSal33209_1424     TRUE 0.544 -13.000 0.000 NA   NA
 3397680 3397681 RSal33209_1424 RSal33209_1425     FALSE 0.519 -15.000 0.000 NA   NA
 3397681 3397682 RSal33209_1425 RSal33209_1426     FALSE 0.022 230.000 0.000 NA   NA
 3397682 3397683 RSal33209_1426 RSal33209_1427     FALSE 0.266 55.000 0.000 1.000   NA
 3397683 3397684 RSal33209_1427 RSal33209_1428     TRUE 0.939 3.000 0.071 1.000 N NA
 3397684 3397685 RSal33209_1428 RSal33209_1429     TRUE 0.667 77.000 0.071 1.000 Y NA
 3397685 3397686 RSal33209_1429 RSal33209_1430     TRUE 0.970 9.000 0.194 1.000 Y NA
 3397686 3397687 RSal33209_1430 RSal33209_1431     TRUE 0.984 2.000 0.221 1.000 Y NA
 3397687 3397688 RSal33209_1431 RSal33209_1432     FALSE 0.152 252.000 0.000 0.089 N NA
 3397688 3397689 RSal33209_1432 RSal33209_1433     FALSE 0.200 116.000 0.017 1.000 N NA
 3397689 3397690 RSal33209_1433 RSal33209_1434     TRUE 0.968 4.000 0.069 1.000 Y NA
 3397690 3397691 RSal33209_1434 RSal33209_1435     TRUE 0.991 0.000 0.583 NA Y NA
 3397691 3397692 RSal33209_1435 RSal33209_1436     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397694 3397695 RSal33209_1438 RSal33209_1439     TRUE 0.961 1.000 0.014 1.000 Y NA
 3397695 3397696 RSal33209_1439 RSal33209_1440     FALSE 0.101 111.000 0.000 NA   NA
 3397696 3397697 RSal33209_1440 RSal33209_1441     FALSE 0.473 -19.000 0.000 NA   NA
 3397697 3397698 RSal33209_1441 RSal33209_1442     FALSE 0.172 104.000 0.011 NA   NA
 3397698 3397699 RSal33209_1442 RSal33209_1443     TRUE 0.962 85.000 0.628 0.003   NA
 3397699 3397700 RSal33209_1443 RSal33209_1444     TRUE 0.933 59.000 0.121 0.003   NA
 3397700 3397701 RSal33209_1444 RSal33209_1445     TRUE 0.998 0.000 0.067 0.003 Y NA
 3397701 3397702 RSal33209_1445 RSal33209_1446     TRUE 0.982 87.000 0.864 0.003 Y NA
 3397702 3397703 RSal33209_1446 RSal33209_1447     TRUE 0.982 85.000 0.846 0.003 Y NA
 3397703 3397704 RSal33209_1447 RSal33209_1448     TRUE 0.981 84.000 0.724 0.003 Y NA
 3397704 3397705 RSal33209_1448 RSal33209_1449     TRUE 0.999 1.000 0.837 0.003 Y NA
 3397705 3397706 RSal33209_1449 RSal33209_1450     TRUE 0.863 8.000 0.054 NA   NA
 3397707 3397708 RSal33209_1451 RSal33209_1452     FALSE 0.059 175.000 0.000 1.000 N NA
 3397708 3397709 RSal33209_1452 RSal33209_1453     FALSE 0.484 37.000 0.030 NA N NA
 3397712 3397713 RSal33209_1456 RSal33209_1457     TRUE 0.778 15.000 0.061 NA   NA
 3397713 3397714 RSal33209_1457 RSal33209_1458     TRUE 0.880 7.000 0.035 1.000 N NA
 3397714 3397715 RSal33209_1458 RSal33209_1459     FALSE 0.445 61.000 0.051 1.000 N NA
 3397715 3397716 RSal33209_1459 RSal33209_1460     TRUE 0.929 -15.000 0.508 NA   NA
 3397716 3397717 RSal33209_1460 RSal33209_1461     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 3397717 3397718 RSal33209_1461 RSal33209_1462     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3397718 3397719 RSal33209_1462 RSal33209_1463     FALSE 0.385 77.000 0.062 NA   NA
 3397719 3397720 RSal33209_1463 RSal33209_1464     TRUE 0.798 -15.000 0.071 NA   NA
 3397720 3397721 RSal33209_1464 RSal33209_1465     TRUE 0.618 51.000 0.198 NA   NA
 3397722 3397723 RSal33209_1466 RSal33209_1467     FALSE 0.247 65.000 0.000 1.000 N NA
 3397723 3397724 RSal33209_1467 RSal33209_1468     TRUE 0.686 30.000 0.053 1.000 N NA
 3397725 3397726 RSal33209_1469 RSal33209_1470 clpS   TRUE 0.967 -7.000 0.823 NA   NA
 3397726 3397727 RSal33209_1470 RSal33209_1471     TRUE 0.870 -3.000 0.013 NA   NA
 3397727 3397728 RSal33209_1471 RSal33209_1472     TRUE 0.942 -3.000 0.054 1.000   NA
 3397728 3397729 RSal33209_1472 RSal33209_1473     TRUE 0.588 46.000 0.070 1.000   NA
 3397729 3397730 RSal33209_1473 RSal33209_1474     TRUE 0.928 0.000 0.030 1.000 N NA
 3397731 3397732 RSal33209_1475 RSal33209_1476     FALSE 0.174 64.000 0.000 NA   NA
 3397732 3397733 RSal33209_1476 RSal33209_1477     TRUE 0.992 2.000 0.000 0.002   NA
 3397736 3397737 RSal33209_1480 RSal33209_1481     FALSE 0.287 214.000 0.571 1.000   NA
 3397737 3397738 RSal33209_1481 RSal33209_1482     TRUE 0.986 -3.000 0.857 NA   NA
 3397741 3397742 RSal33209_1485 RSal33209_1486     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397743 3397744 RSal33209_1487 RSal33209_1488     FALSE 0.153 85.000 0.000 NA   NA
 3397744 3397745 RSal33209_1488 RSal33209_1489     TRUE 0.874 86.000 0.308 0.083   NA
 3397745 3397746 RSal33209_1489 RSal33209_1490     FALSE 0.252 43.000 0.000 NA   NA
 3397749 3397750 RSal33209_1493 RSal33209_1494 smc.1   TRUE 0.974 -3.000 0.312 NA   NA
 3397750 3397751 RSal33209_1494 RSal33209_1495     FALSE 0.174 64.000 0.000 NA   NA
 3397752 3397753 RSal33209_1496 RSal33209_1497     FALSE 0.335 45.000 0.000 1.000   NA
 3397753 3397754 RSal33209_1497 RSal33209_1498     TRUE 0.993 1.000 0.000 0.002   NA
 3397754 3397755 RSal33209_1498 RSal33209_1499     TRUE 0.948 48.000 0.075 0.002   NA
 3397755 3397756 RSal33209_1499 RSal33209_1500     FALSE 0.018 393.000 0.000 1.000   NA
 3397757 3397758 RSal33209_1501 RSal33209_1502     FALSE 0.326 46.000 0.000 1.000   NA
 3397758 3397759 RSal33209_1502 RSal33209_1503     TRUE 0.902 73.000 0.000 0.001   NA
 3397759 3397760 RSal33209_1503 RSal33209_1504     TRUE 0.973 -3.000 0.245 1.000   NA
 3397760 3397761 RSal33209_1504 RSal33209_1505     FALSE 0.378 93.000 0.051 1.000 N NA
 3397761 3397762 RSal33209_1505 RSal33209_1506     TRUE 0.970 -3.000 0.208 1.000 N NA
 3397762 3397763 RSal33209_1506 RSal33209_1507     TRUE 0.976 -3.000 0.304 1.000 N NA
 3397763 3397764 RSal33209_1507 RSal33209_1508     FALSE 0.071 157.000 0.000 1.000 N NA
 3397764 3397765 RSal33209_1508 RSal33209_1509     FALSE 0.150 112.000 0.000 1.000   NA
 3397765 3397766 RSal33209_1509 RSal33209_1510     TRUE 0.931 0.000 0.032 1.000   NA
 3397766 3397767 RSal33209_1510 RSal33209_1511     TRUE 0.949 14.000 0.667 1.000   NA
 3397767 3397768 RSal33209_1511 RSal33209_1512     TRUE 0.998 -7.000 0.750 0.003 Y NA
 3397768 3397769 RSal33209_1512 RSal33209_1513     FALSE 0.353 42.000 0.000 1.000 N NA
 3397770 3397771 RSal33209_1514 RSal33209_1515     TRUE 0.956 17.000 0.000 0.014   NA
 3397771 3397772 RSal33209_1515 RSal33209_1516     FALSE 0.089 144.000 0.000 1.000   NA
 3397772 3397773 RSal33209_1516 RSal33209_1517     TRUE 0.635 27.000 0.019 1.000 N NA
 3397773 3397774 RSal33209_1517 RSal33209_1518     TRUE 0.945 8.000 0.210 1.000   NA
 3397774 3397775 RSal33209_1518 RSal33209_1519     TRUE 0.974 27.000 0.009 0.001   NA
 3397775 3397776 RSal33209_1519 RSal33209_1520     FALSE 0.010 467.000 0.000 NA   NA
 3397776 3397777 RSal33209_1520 RSal33209_1521     FALSE 0.101 111.000 0.000 NA   NA
 3397779 3397780 RSal33209_1523 RSal33209_1524     FALSE 0.489 19.000 0.000 NA   NA
 3397781 3397782 RSal33209_1525 RSal33209_1526     TRUE 0.654 37.000 0.095 NA   NA
 3397782 3397783 RSal33209_1526 RSal33209_1527     TRUE 0.877 10.000 0.095 NA   NA
 3397783 3397784 RSal33209_1527 RSal33209_1528     TRUE 0.590 -19.000 0.000 1.000   NA
 3397784 3397785 RSal33209_1528 RSal33209_1529     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397785 3397786 RSal33209_1529 RSal33209_1530     TRUE 0.617 109.000 0.122 1.000 Y NA
 3397786 3397787 RSal33209_1530 RSal33209_1531     TRUE 0.998 -3.000 0.654 0.070 Y NA
 3397787 3397788 RSal33209_1531 RSal33209_1532     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3397788 3397789 RSal33209_1532 RSal33209_1533     FALSE 0.461 22.000 0.000 NA   NA
 3397789 3397790 RSal33209_1533 RSal33209_1534     FALSE 0.031 256.000 0.015 NA   NA
 3397791 3397792 RSal33209_1535 RSal33209_1536     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 3397794 3397795 RSal33209_1537 RSal33209_1539     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3397795 3397796 RSal33209_1539 RSal33209_1540     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.083   NA
 3397796 3397797 RSal33209_1540 RSal33209_1541     FALSE 0.009 683.000 0.000 NA   NA
 3397798 3397799 RSal33209_1542 RSal33209_1543     FALSE 0.155 81.000 0.000 NA   NA
 3397800 3397801 RSal33209_1544 RSal33209_1545     FALSE 0.061 138.000 0.000 NA   NA
 3397802 3397803 RSal33209_1546 RSal33209_1547     FALSE 0.382 50.000 0.032 NA   NA
 3397803 3397804 RSal33209_1547 RSal33209_1548     FALSE 0.360 53.000 0.032 NA   NA
 3397804 3397805 RSal33209_1548 RSal33209_1549     TRUE 0.682 61.000 0.355 NA   NA
 3397805 3397806 RSal33209_1549 RSal33209_1550     TRUE 0.971 6.000 0.652 NA N NA
 3397806 3397807 RSal33209_1550 RSal33209_1551     FALSE 0.258 59.000 0.000 1.000   NA
 3397807 3397808 RSal33209_1551 RSal33209_1552     FALSE 0.113 105.000 0.000 NA   NA
 3397809 3397810 RSal33209_1553 RSal33209_1554     FALSE 0.239 45.000 0.000 NA   NA
 3397813 3397814 RSal33209_1557 RSal33209_1558     FALSE 0.508 16.000 0.000 NA   NA
 3397814 3397815 RSal33209_1558 RSal33209_1559     TRUE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 3397815 3397816 RSal33209_1559 RSal33209_1560     FALSE 0.064 136.000 0.000 NA   NA
 3397816 3397817 RSal33209_1560 RSal33209_1561     FALSE 0.063 137.000 0.000 NA   NA
 3397818 3397819 RSal33209_1562 RSal33209_1563     TRUE 0.994 2.000 0.000 0.001   NA
 3397819 3397820 RSal33209_1563 RSal33209_1564     FALSE 0.117 125.000 0.000 1.000   NA
 3397820 3397821 RSal33209_1564 RSal33209_1565     TRUE 0.565 -12.000 0.000 NA   NA
 3397822 3397823 RSal33209_1566 RSal33209_1567     FALSE 0.091 116.000 0.000 NA   NA
 3397825 3397826 RSal33209_1569 RSal33209_1570     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397829 3397830 RSal33209_1573 RSal33209_1574     TRUE 0.599 29.000 0.036 NA   NA
 3397832 3397833 RSal33209_1576 RSal33209_1577     TRUE 0.842 92.000 0.070 0.040   NA
 3397833 3397834 RSal33209_1577 RSal33209_1578     TRUE 0.925 85.000 0.351 0.040   NA
 3397834 3397835 RSal33209_1578 RSal33209_1579     TRUE 0.994 -15.000 0.457 0.040 Y NA
 3397836 3397837 RSal33209_1580 RSal33209_1581     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397837 3397838 RSal33209_1581 RSal33209_1582     FALSE 0.014 322.000 0.000 NA   NA
 3397838 3397839 RSal33209_1582 RSal33209_1583     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.001   NA
 3397839 3397840 RSal33209_1583 RSal33209_1584     TRUE 0.997 13.000 0.284 0.001 Y NA
 3397840 3397841 RSal33209_1584 RSal33209_1585     FALSE 0.060 179.000 0.014 NA   NA
 3397841 3397842 RSal33209_1585 RSal33209_1586     FALSE 0.107 134.000 0.014 NA   NA
 3397845 3397846 RSal33209_1589 RSal33209_1590     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA Y NA
 3397847 3397848 RSal33209_1591 RSal33209_1592   recO TRUE 0.954 0.000 0.076 1.000 N NA
 3397848 3397849 RSal33209_1592 RSal33209_1593 recO   FALSE 0.253 97.000 0.011 1.000 N NA
 3397853 3397854 RSal33209_1597 RSal33209_1598     TRUE 0.719 10.000 0.000 1.000   NA
 3397854 3397855 RSal33209_1598 RSal33209_1599     TRUE 0.961 32.000 0.000 0.001   NA
 3397855 3397856 RSal33209_1599 RSal33209_1600     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397856 3397857 RSal33209_1600 RSal33209_1601     TRUE 0.874 100.000 0.000 0.001   NA
 3397860 3397861 RSal33209_1604 RSal33209_1605     FALSE 0.176 102.000 0.000 1.000 N NA
 3397861 3397862 RSal33209_1605 RSal33209_1606     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 3397862 3397863 RSal33209_1606 RSal33209_1607     FALSE 0.219 48.000 0.000 NA   NA
 3397863 3397864 RSal33209_1607 RSal33209_1608     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.082   NA
 3397864 3397865 RSal33209_1608 RSal33209_1609     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 3397865 3397866 RSal33209_1609 RSal33209_1610     TRUE 0.979 2.000 0.568 NA   NA
 3397867 3397868 RSal33209_1611 RSal33209_1612   capF TRUE 0.999 -3.000 0.477 0.002 Y NA
 3397868 3397869 RSal33209_1612 RSal33209_1613 capF   TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3397869 3397870 RSal33209_1613 RSal33209_1614     TRUE 0.978 -3.000 0.400 NA   NA
 3397870 3397871 RSal33209_1614 RSal33209_1615     TRUE 0.888 -7.000 0.065 1.000 N NA
 3397871 3397872 RSal33209_1615 RSal33209_1616     TRUE 0.997 2.000 0.548 0.087 Y NA
 3397872 3397873 RSal33209_1616 RSal33209_1617   glfT TRUE 0.967 -3.000 0.239 NA   NA
 3397873 3397874 RSal33209_1617 RSal33209_1618 glfT   TRUE 0.950 -3.000 0.105 NA   NA
 3397878 3397879 RSal33209_1622 RSal33209_1623     TRUE 0.732 28.000 0.061 1.000 N NA
 3397879 3397880 RSal33209_1623 RSal33209_1624     TRUE 0.860 12.000 0.077 1.000 N NA
 3397880 3397881 RSal33209_1624 RSal33209_1625     TRUE 0.978 -3.000 0.410 NA   NA
 3397884 3397885 RSal33209_1628 RSal33209_1629     FALSE 0.014 308.000 0.000 NA   NA
 3397885 3397886 RSal33209_1629 RSal33209_1630     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.082   NA
 3397886 3397887 RSal33209_1630 RSal33209_1631   secA FALSE 0.095 137.000 0.000 1.000 N NA
 3397888 3397889 RSal33209_1632 RSal33209_1633     FALSE 0.298 37.000 0.000 NA   NA
 3397889 3397890 RSal33209_1633 RSal33209_1634     TRUE 0.984 10.000 0.308 0.082   NA
 3397890 3397891 RSal33209_1634 RSal33209_1635     FALSE 0.037 178.000 0.000 NA   NA
 3397891 3397892 RSal33209_1635 RSal33209_1636     FALSE 0.246 44.000 0.000 NA   NA
 3397892 3397893 RSal33209_1636 RSal33209_1637     TRUE 0.674 -13.000 0.015 NA   NA
 3397893 3397894 RSal33209_1637 RSal33209_1638     FALSE 0.405 42.000 0.022 NA   NA
 3397894 3397895 RSal33209_1638 RSal33209_1639     FALSE 0.435 67.000 0.072 NA   NA
 3397895 3397896 RSal33209_1639 RSal33209_1640     FALSE 0.282 135.000 0.163 NA   NA
 3397896 3397897 RSal33209_1640 RSal33209_1641   mtrB TRUE 0.979 0.000 0.418 NA   NA
 3397897 3397898 RSal33209_1641 RSal33209_1642 mtrB mtrA TRUE 0.973 17.000 0.772 1.000 Y NA
 3397899 3397900 RSal33209_1643 RSal33209_1644     FALSE 0.012 373.000 0.000 NA   NA
 3397900 3397901 RSal33209_1644 RSal33209_1645     FALSE 0.487 -18.000 0.000 NA   NA
 3397901 3397902 RSal33209_1645 RSal33209_1646     FALSE 0.433 25.000 0.000 NA   NA
 3397902 3397903 RSal33209_1646 RSal33209_1647     TRUE 0.970 -3.000 0.302 NA   NA
 3397903 3397904 RSal33209_1647 RSal33209_1648     TRUE 0.945 12.000 0.648 NA   NA
 3397904 3397905 RSal33209_1648 RSal33209_1649     FALSE 0.232 46.000 0.000 NA   NA
 3397906 3397907 RSal33209_1650 RSal33209_1651 clpP.1 clpP.2 TRUE 1.000 -3.000 0.913 0.001 Y NA
 3397908 3397909 RSal33209_1652 RSal33209_1653     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3397910 3397911 RSal33209_1654 RSal33209_1655     TRUE 0.934 -3.000 0.065 NA   NA
 3397911 3397912 RSal33209_1655 RSal33209_1656     FALSE 0.230 75.000 0.000 1.000   NA
 3397913 3397914 RSal33209_1657 RSal33209_1658     TRUE 0.566 11.000 0.000 NA   NA
 3397915 3397916 RSal33209_1659 RSal33209_1660     TRUE 0.863 44.000 0.000 0.021   NA
 3397916 3397917 RSal33209_1660 RSal33209_1661   dppC.2 TRUE 0.969 -3.000 0.185 1.000   NA
 3397917 3397918 RSal33209_1661 RSal33209_1662 dppC.2 dppC.3 TRUE 0.969 8.000 0.000 0.059   NA
 3397918 3397919 RSal33209_1662 RSal33209_1663 dppC.3 dppB.3 TRUE 0.996 2.000 0.435 0.059   NA
 3397919 3397920 RSal33209_1663 RSal33209_1664 dppB.3 dppB.4 FALSE 0.479 34.000 0.022 NA   NA
 3397921 3397922 RSal33209_1665 RSal33209_1666     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.081   NA
 3397923 3397924 RSal33209_1667 RSal33209_1668 dppB.5   FALSE 0.147 89.000 0.000 NA   NA
 3397924 3397925 RSal33209_1668 RSal33209_1669     TRUE 0.849 40.000 0.000 0.059   NA
 3397925 3397926 RSal33209_1669 RSal33209_1670     TRUE 0.983 1.000 0.000 0.059   NA
 3397926 3397927 RSal33209_1670 RSal33209_1671     TRUE 0.849 40.000 0.000 0.059   NA
 3397927 3397928 RSal33209_1671 RSal33209_1672     FALSE 0.087 145.000 0.000 1.000   NA
 3397928 3397929 RSal33209_1672 RSal33209_1673     FALSE 0.249 63.000 0.000 1.000 N NA
 3397929 3397930 RSal33209_1673 RSal33209_1674     TRUE 0.859 14.000 0.094 1.000 N NA
 3397934 3397935 RSal33209_1678 RSal33209_1679     FALSE 0.026 276.000 0.000 1.000   NA
 3397935 3397936 RSal33209_1679 RSal33209_1680     TRUE 0.867 -3.000 0.000 1.000   NA
 3397936 3397937 RSal33209_1680 RSal33209_1681     FALSE 0.247 67.000 0.000 1.000   NA
 3397937 3397938 RSal33209_1681 RSal33209_1682   fepG.1 TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3397938 3397939 RSal33209_1682 RSal33209_1683 fepG.1 fepD TRUE 0.986 31.000 0.500 0.059 Y NA
 3397940 3397941 RSal33209_1684 RSal33209_1685     FALSE 0.172 66.000 0.000 NA   NA
 3397943 3397944 RSal33209_1687 RSal33209_1688     TRUE 0.955 -19.000 0.000 0.008   NA
 3397945 3397946 RSal33209_1689 RSal33209_1690     TRUE 0.931 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3397946 3397947 RSal33209_1690 RSal33209_1691   tetA.2 FALSE 0.183 100.000 0.000 1.000 N NA
 3397947 3397948 RSal33209_1691 RSal33209_1692 tetA.2   TRUE 0.982 -3.000 0.463 1.000 N NA
 3397948 3397949 RSal33209_1692 RSal33209_1693     TRUE 0.984 -3.000 0.561 1.000 N NA
 3397950 3397951 RSal33209_1694 RSal33209_1695     FALSE 0.525 14.000 0.000 NA   NA
 3397952 3397953 RSal33209_1696 RSal33209_1697     TRUE 0.944 -3.000 0.056 1.000   NA
 3397953 3397954 RSal33209_1697 RSal33209_1698     TRUE 0.946 -3.000 0.062 1.000   NA
 3397954 3397955 RSal33209_1698 RSal33209_1699     TRUE 0.587 64.000 0.217 NA   NA
 3397955 3397956 RSal33209_1699 RSal33209_1700     TRUE 0.898 -3.000 0.028 NA   NA
 3397956 3397957 RSal33209_1700 RSal33209_1701     FALSE 0.481 36.000 0.027 NA N NA
 3397959 3397960 RSal33209_1703 RSal33209_1704     TRUE 0.993 10.000 0.727 0.059   NA
 3397960 3397961 RSal33209_1704 RSal33209_1705     TRUE 0.693 7.000 0.000 NA   NA
 3397961 3397962 RSal33209_1705 RSal33209_1706     TRUE 0.544 -13.000 0.000 NA   NA
 3397962 3397963 RSal33209_1706 RSal33209_1707     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3397964 3397965 RSal33209_1708 RSal33209_1709     FALSE 0.104 110.000 0.000 NA   NA
 3397965 3397966 RSal33209_1709 RSal33209_1710     FALSE 0.382 90.000 0.047 1.000 N NA
 3397967 3397968 RSal33209_1711 RSal33209_1712     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.081   NA
 3397970 3397971 RSal33209_1714 RSal33209_1715     TRUE 0.933 -3.000 0.038 1.000 N NA
 3397971 3397972 RSal33209_1715 RSal33209_1716     TRUE 0.587 21.000 0.000 1.000   NA
 3397972 3397973 RSal33209_1716 RSal33209_1717     TRUE 0.948 40.000 0.000 0.001   NA
 3397973 3397974 RSal33209_1717 RSal33209_1718     FALSE 0.403 88.000 0.000 NA Y NA
 3397974 3397975 RSal33209_1718 RSal33209_1719     TRUE 0.968 -3.000 0.250 NA   NA
 3397976 3397977 RSal33209_1720 RSal33209_1721     FALSE 0.019 357.000 0.000 1.000 N NA
 3397977 3397978 RSal33209_1721 RSal33209_1722     TRUE 0.992 17.000 0.032 0.001 Y NA
 3397978 3397979 RSal33209_1722 RSal33209_1723     TRUE 0.992 13.000 0.056 0.002 Y NA
 3397979 3397980 RSal33209_1723 RSal33209_1724     TRUE 0.982 -3.000 0.108 1.000 Y NA
 3397980 3397981 RSal33209_1724 RSal33209_1725     FALSE 0.522 120.000 0.088 1.000 Y NA
 3397982 3397983 RSal33209_1726 RSal33209_1727     FALSE 0.059 139.000 0.000 NA N NA
 3397983 3397984 RSal33209_1727 RSal33209_1728     TRUE 0.919 3.000 0.066 NA N NA
 3397984 3397985 RSal33209_1728 RSal33209_1729     FALSE 0.029 199.000 0.000 NA   NA
 3397985 3397986 RSal33209_1729 RSal33209_1730     FALSE 0.180 58.000 0.000 NA   NA
 3397986 3397987 RSal33209_1730 RSal33209_1731     TRUE 0.533 26.000 0.000 1.000   NA
 3397988 3397989 RSal33209_1732 RSal33209_1733     TRUE 0.599 29.000 0.017 1.000 N NA
 3397989 3397990 RSal33209_1733 RSal33209_1734     TRUE 0.591 97.000 0.058 1.000 Y NA
 3397991 3397992 RSal33209_1735 RSal33209_1736     FALSE 0.092 231.000 0.068 1.000 N NA
 3397992 3397993 RSal33209_1736 RSal33209_1737     TRUE 0.976 62.000 0.601 0.015 Y NA
 3397994 3397995 RSal33209_1738 RSal33209_1739     TRUE 0.707 6.000 0.000 NA   NA
 3397995 3397996 RSal33209_1739 RSal33209_1740     TRUE 0.994 -3.000 0.250 0.069   NA
 3397996 3397997 RSal33209_1740 RSal33209_1741     FALSE 0.309 48.000 0.000 1.000   NA
 3397997 3397998 RSal33209_1741 RSal33209_1742     TRUE 0.877 86.000 0.308 0.081   NA
 3398003 3398004 RSal33209_1747 RSal33209_1748     TRUE 0.741 4.000 0.000 NA   NA
 3398004 3398005 RSal33209_1748 RSal33209_1749     FALSE 0.342 80.000 0.049 NA   NA
 3398005 3398006 RSal33209_1749 RSal33209_1750     TRUE 0.606 18.000 0.000 1.000 N NA
 3398007 3398008 RSal33209_1751 RSal33209_1752     FALSE 0.420 65.000 0.041 1.000   NA
 3398008 3398009 RSal33209_1752 RSal33209_1753     FALSE 0.167 102.000 0.007 NA   NA
 3398010 3398011 RSal33209_1754 RSal33209_1755     FALSE 0.220 102.000 0.005 1.000   NA
 3398011 3398012 RSal33209_1755 RSal33209_1756     TRUE 0.592 21.000 0.013 NA   NA
 3398012 3398013 RSal33209_1756 RSal33209_1757     TRUE 0.964 0.000 0.198 NA   NA
 3398014 3398015 RSal33209_1758 RSal33209_1759     TRUE 0.988 -7.000 0.000 0.007 Y NA
 3398016 3398017 RSal33209_1760 RSal33209_1761     TRUE 0.838 26.000 0.167 1.000   NA
 3398017 3398018 RSal33209_1761 RSal33209_1762     TRUE 0.760 120.000 0.000 0.002   NA
 3398018 3398019 RSal33209_1762 RSal33209_1763     TRUE 0.800 110.000 0.000 0.002   NA
 3398019 3398020 RSal33209_1763 RSal33209_1764     TRUE 0.551 41.000 0.038 1.000   NA
 3398020 3398021 RSal33209_1764 RSal33209_1765     TRUE 0.882 119.000 0.056 0.001 N NA
 3398023 3398024 RSal33209_1767 RSal33209_1768     FALSE 0.027 261.000 0.000 1.000 N NA
 3398024 3398025 RSal33209_1768 RSal33209_1769     TRUE 0.978 68.000 0.592 0.005 Y NA
 3398027 3398028 RSal33209_1771 RSal33209_1772     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.081   NA
 3398028 3398029 RSal33209_1772 RSal33209_1773   smc.2 FALSE 0.224 85.000 0.000 1.000   NA
 3398029 3398030 RSal33209_1773 RSal33209_1774 smc.2   FALSE 0.255 89.000 0.004 1.000 N NA
 3398030 3398031 RSal33209_1774 RSal33209_1775     TRUE 0.891 -7.000 0.068 1.000 N NA
 3398031 3398032 RSal33209_1775 RSal33209_1776     TRUE 0.767 20.000 0.044 1.000   NA
 3398032 3398033 RSal33209_1776 RSal33209_1777     TRUE 0.738 61.000 0.599 NA   NA
 3398033 3398034 RSal33209_1777 RSal33209_1778     TRUE 0.690 11.000 0.014 NA   NA
 3398035 3398036 RSal33209_1779 RSal33209_1780     FALSE 0.381 54.000 0.020 1.000   NA
 3398037 3398038 RSal33209_1781 RSal33209_1782     TRUE 0.977 28.000 0.044 0.012 Y NA
 3398038 3398039 RSal33209_1782 RSal33209_1783     TRUE 0.891 -13.000 0.144 1.000   NA
 3398039 3398040 RSal33209_1783 RSal33209_1785     TRUE 0.757 -10.000 0.009 1.000   NA
 3398042 3398043 RSal33209_1786 RSal33209_1787     TRUE 0.981 -3.000 0.380 1.000 N NA
 3398043 3398044 RSal33209_1787 RSal33209_1788     TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 3398044 3398045 RSal33209_1788 RSal33209_1789     FALSE 0.278 127.000 0.074 1.000 N NA
 3398045 3398046 RSal33209_1789 RSal33209_1790     TRUE 0.954 149.000 0.477 0.001 Y NA
 3398047 3398048 RSal33209_1791 RSal33209_1792     TRUE 0.567 23.000 0.000 1.000   NA
 3398051 3398052 RSal33209_1795 RSal33209_1796     FALSE 0.135 95.000 0.000 NA   NA
 3398052 3398053 RSal33209_1796 RSal33209_1797     FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 3398053 3398054 RSal33209_1797 RSal33209_1798     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.081   NA
 3398055 3398056 RSal33209_1799 RSal33209_1800     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398057 3398058 RSal33209_1801 RSal33209_1802     TRUE 0.791 6.000 0.000 1.000 N NA
 3398058 3398059 RSal33209_1802 RSal33209_1803     TRUE 0.647 13.000 0.000 1.000 N NA
 3398060 3398061 RSal33209_1804 RSal33209_1805     FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 3398061 3398062 RSal33209_1805 RSal33209_1806     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 3398062 3398063 RSal33209_1806 RSal33209_1807     TRUE 0.982 -6.000 0.000 0.004   NA
 3398064 3398065 RSal33209_1808 RSal33209_1809     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 3398065 3398066 RSal33209_1809 RSal33209_1810     TRUE 0.976 22.000 0.000 0.001   NA
 3398066 3398067 RSal33209_1810 RSal33209_1811     FALSE 0.339 203.000 0.000 0.038   NA
 3398067 3398068 RSal33209_1811 RSal33209_1812     FALSE 0.117 125.000 0.000 1.000   NA
 3398068 3398069 RSal33209_1812 RSal33209_1813     TRUE 0.961 -3.000 0.182 NA   NA
 3398069 3398070 RSal33209_1813 RSal33209_1814     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 3398070 3398071 RSal33209_1814 RSal33209_1815     FALSE 0.298 37.000 0.000 NA   NA
 3398071 3398072 RSal33209_1815 RSal33209_1816     FALSE 0.232 46.000 0.000 NA   NA
 3398072 3398073 RSal33209_1816 RSal33209_1817     FALSE 0.029 248.000 0.000 1.000 N NA
 3398073 3398074 RSal33209_1817 RSal33209_1818     TRUE 0.888 22.000 0.054 1.000 Y NA
 3398074 3398075 RSal33209_1818 RSal33209_1819     TRUE 0.972 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 3398076 3398077 RSal33209_1820 RSal33209_1821     TRUE 0.909 67.000 0.000 0.001   NA
 3398077 3398078 RSal33209_1821 RSal33209_1822     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 3398078 3398079 RSal33209_1822 RSal33209_1823     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398079 3398080 RSal33209_1823 RSal33209_1824     TRUE 0.868 0.000 0.000 1.000 N NA
 3398080 3398081 RSal33209_1824 RSal33209_1825     TRUE 0.737 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3398082 3398083 RSal33209_1826 RSal33209_1827     TRUE 0.990 4.000 0.000 0.002   NA
 3398085 3398086 RSal33209_1829 RSal33209_1830     FALSE 0.144 91.000 0.000 NA   NA
 3398087 3398088 RSal33209_1831 RSal33209_1832     FALSE 0.019 246.000 0.000 NA   NA
 3398093 3398094 RSal33209_1837 RSal33209_1838   igiC FALSE 0.172 171.000 0.000 1.000 Y NA
 3398096 3398097 RSal33209_1840 RSal33209_1841 igiB.1 igiB.2 FALSE 0.229 78.000 0.000 1.000   NA
 3398097 3398098 RSal33209_1841 RSal33209_1842 igiB.2   FALSE 0.086 146.000 0.000 1.000   NA
 3398098 3398099 RSal33209_1842 RSal33209_1843     FALSE 0.066 134.000 0.000 NA   NA
 3398099 3398100 RSal33209_1843 RSal33209_1844     FALSE 0.501 17.000 0.000 NA   NA
 3398101 3398102 RSal33209_1845 RSal33209_1846     TRUE 0.973 16.000 0.000 0.002   NA
 3398102 3398103 RSal33209_1846 RSal33209_1847     FALSE 0.521 82.000 0.109 1.000 N NA
 3398104 3398105 RSal33209_1848 RSal33209_1849     TRUE 0.922 27.000 0.222 1.000 Y NA
 3398105 3398106 RSal33209_1849 RSal33209_1850     TRUE 0.981 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 3398106 3398107 RSal33209_1850 RSal33209_1851     TRUE 0.928 1.000 0.037 1.000 N NA
 3398107 3398108 RSal33209_1851 RSal33209_1852     FALSE 0.132 119.000 0.000 1.000   NA
 3398108 3398109 RSal33209_1852 RSal33209_1853     TRUE 0.961 10.000 0.000 0.054   NA
 3398109 3398110 RSal33209_1853 RSal33209_1854     FALSE 0.228 79.000 0.000 1.000   NA
 3398110 3398111 RSal33209_1854 RSal33209_1855     TRUE 0.944 -12.000 0.000 0.068   NA
 3398111 3398112 RSal33209_1855 RSal33209_1856     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 3398112 3398113 RSal33209_1856 RSal33209_1857     FALSE 0.078 124.000 0.000 NA   NA
 3398113 3398114 RSal33209_1857 RSal33209_1858     TRUE 0.991 -3.000 0.021 0.085 Y NA
 3398115 3398116 RSal33209_1859 RSal33209_1860     TRUE 0.940 3.000 0.111 NA   NA
 3398116 3398117 RSal33209_1860 RSal33209_1861     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398117 3398118 RSal33209_1861 RSal33209_1862     FALSE 0.339 32.000 0.000 NA   NA
 3398118 3398119 RSal33209_1862 RSal33209_1863     TRUE 0.987 -3.000 0.248 1.000 Y NA
 3398119 3398120 RSal33209_1863 RSal33209_1864     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 3398120 3398121 RSal33209_1864 RSal33209_1865     FALSE 0.252 43.000 0.000 NA   NA
 3398121 3398122 RSal33209_1865 RSal33209_1866     FALSE 0.011 425.000 0.000 NA   NA
 3398122 3398123 RSal33209_1866 RSal33209_1867     TRUE 0.966 -3.000 0.233 NA   NA
 3398125 3398126 RSal33209_1869 RSal33209_1870     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 3398129 3398130 RSal33209_1873 RSal33209_1874 tetP.1 tetP.2 TRUE 0.854 52.000 0.000 0.008   NA
 3398130 3398131 RSal33209_1874 RSal33209_1875 tetP.2   FALSE 0.052 150.000 0.000 NA   NA
 3398131 3398132 RSal33209_1875 RSal33209_1876     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398135 3398136 RSal33209_1879 RSal33209_1880     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3398136 3398137 RSal33209_1880 RSal33209_1881     TRUE 0.974 -3.000 0.273 1.000 N NA
 3398137 3398138 RSal33209_1881 RSal33209_1882     FALSE 0.019 379.000 0.000 1.000   NA
 3398138 3398139 RSal33209_1882 RSal33209_1883     FALSE 0.289 51.000 0.000 1.000   NA
 3398139 3398140 RSal33209_1883 RSal33209_1884     FALSE 0.443 24.000 0.000 NA   NA
 3398140 3398141 RSal33209_1884 RSal33209_1885     TRUE 0.808 0.000 0.000 NA   NA
 3398142 3398143 RSal33209_1886 RSal33209_1887     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398143 3398144 RSal33209_1887 RSal33209_1888     FALSE 0.239 69.000 0.000 1.000 N NA
 3398145 3398146 RSal33209_1889 RSal33209_1890     TRUE 0.785 2.000 0.000 NA   NA
 3398147 3398148 RSal33209_1891 RSal33209_1892     TRUE 0.720 83.000 0.667 NA   NA
 3398148 3398149 RSal33209_1892 RSal33209_1893     FALSE 0.211 49.000 0.000 NA   NA
 3398149 3398150 RSal33209_1893 RSal33209_1894     FALSE 0.193 53.000 0.000 NA   NA
 3398150 3398151 RSal33209_1894 RSal33209_1895     FALSE 0.045 159.000 0.000 NA   NA
 3398152 3398153 RSal33209_1896 RSal33209_1897     FALSE 0.021 235.000 0.000 NA   NA
 3398153 3398154 RSal33209_1897 RSal33209_1898     TRUE 0.985 14.000 0.138 0.068 Y NA
 3398154 3398155 RSal33209_1898 RSal33209_1899     TRUE 0.996 -3.000 0.115 0.068 Y NA
 3398155 3398156 RSal33209_1899 RSal33209_1900     TRUE 0.995 0.000 0.229 0.057 N NA
 3398156 3398157 RSal33209_1900 RSal33209_1901     FALSE 0.056 179.000 0.000 1.000   NA
 3398162 3398163 RSal33209_1906 RSal33209_1907 hspR dnaJ TRUE 0.964 4.000 0.286 1.000 N NA
 3398163 3398164 RSal33209_1907 RSal33209_1908 dnaJ grpE TRUE 0.962 78.000 0.248 0.005 Y NA
 3398164 3398165 RSal33209_1908 RSal33209_1909 grpE dnaK TRUE 0.997 3.000 0.074 0.005 Y NA
 3398167 3398168 RSal33209_1911 RSal33209_1912     TRUE 0.586 40.000 0.050 1.000   NA
 3398168 3398169 RSal33209_1912 RSal33209_1913     FALSE 0.181 153.000 0.059 1.000   NA
 3398169 3398170 RSal33209_1913 RSal33209_1914     FALSE 0.076 153.000 0.000 1.000 N NA
 3398170 3398171 RSal33209_1914 RSal33209_1915     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.080   NA
 3398171 3398172 RSal33209_1915 RSal33209_1916     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3398174 3398175 RSal33209_1918 RSal33209_1919   era FALSE 0.057 144.000 0.000 NA   NA
 3398175 3398176 RSal33209_1919 RSal33209_1920 era   TRUE 0.940 2.000 0.089 NA   NA
 3398176 3398177 RSal33209_1920 RSal33209_1921     TRUE 0.966 -3.000 0.222 NA   NA
 3398177 3398178 RSal33209_1921 RSal33209_1922     TRUE 0.941 -10.000 0.457 NA   NA
 3398178 3398179 RSal33209_1922 RSal33209_1923     TRUE 0.959 38.000 0.010 0.001   NA
 3398181 3398182 RSal33209_1925 RSal33209_1926   dnaJ.2 TRUE 0.878 7.000 0.058 NA   NA
 3398182 3398183 RSal33209_1926 RSal33209_1927 dnaJ.2 hrcA FALSE 0.497 53.000 0.059 1.000 N NA
 3398184 3398185 RSal33209_1928 RSal33209_1929     FALSE 0.494 60.000 0.099 NA   NA
 3398186 3398187 RSal33209_1930 RSal33209_1931   lepA TRUE 0.866 12.000 0.083 1.000 N NA
 3398188 3398189 RSal33209_1932 RSal33209_1933     FALSE 0.078 182.000 0.013 1.000   NA
 3398190 3398191 RSal33209_1934 RSal33209_1935     FALSE 0.501 17.000 0.000 NA   NA
 3398191 3398192 RSal33209_1935 RSal33209_1936     FALSE 0.405 37.000 0.000 1.000   NA
 3398192 3398193 RSal33209_1936 RSal33209_1937     TRUE 0.569 54.000 0.163 NA   NA
 3398193 3398194 RSal33209_1937 RSal33209_1938     TRUE 0.835 18.000 0.130 NA   NA
 3398194 3398195 RSal33209_1938 RSal33209_1939     FALSE 0.236 78.000 0.014 NA   NA
 3398195 3398196 RSal33209_1939 RSal33209_1940     FALSE 0.467 30.000 0.009 NA   NA
 3398197 3398198 RSal33209_1941 RSal33209_1942     FALSE 0.089 118.000 0.000 NA   NA
 3398198 3398199 RSal33209_1942 RSal33209_1943     TRUE 0.929 7.000 0.167 NA   NA
 3398199 3398200 RSal33209_1943 RSal33209_1944     TRUE 0.955 -3.000 0.133 NA   NA
 3398200 3398201 RSal33209_1944 RSal33209_1945     TRUE 0.884 30.000 0.000 0.067   NA
 3398201 3398202 RSal33209_1945 RSal33209_1946     FALSE 0.179 102.000 0.000 1.000   NA
 3398202 3398203 RSal33209_1946 RSal33209_1947     TRUE 0.982 0.000 0.429 1.000   NA
 3398204 3398205 RSal33209_1948 RSal33209_1949     TRUE 0.611 61.000 0.174 1.000 N NA
 3398205 3398206 RSal33209_1949 RSal33209_1950     FALSE 0.351 74.000 0.027 1.000 N NA
 3398207 3398208 RSal33209_1951 RSal33209_1952     TRUE 0.920 10.000 0.167 1.000   NA
 3398208 3398209 RSal33209_1952 RSal33209_1953     TRUE 0.970 -3.000 0.200 1.000   NA
 3398209 3398210 RSal33209_1953 RSal33209_1954     TRUE 0.981 -3.000 0.400 1.000 N NA
 3398211 3398212 RSal33209_1955 RSal33209_1956     FALSE 0.376 90.000 0.068 NA N NA
 3398212 3398213 RSal33209_1956 RSal33209_1957     FALSE 0.517 112.000 0.059 1.000 Y NA
 3398213 3398214 RSal33209_1957 RSal33209_1958     TRUE 0.895 14.000 0.192 1.000 N NA
 3398214 3398215 RSal33209_1958 RSal33209_1959     TRUE 0.936 15.000 0.471 1.000 N NA
 3398215 3398216 RSal33209_1959 RSal33209_1960     TRUE 0.919 4.000 0.054 1.000   NA
 3398216 3398217 RSal33209_1960 RSal33209_1961     FALSE 0.063 137.000 0.000 NA   NA
 3398219 3398220 RSal33209_1963 RSal33209_1964     TRUE 0.999 0.000 0.345 0.001 Y NA
 3398220 3398221 RSal33209_1964 RSal33209_1965     TRUE 0.903 3.000 0.050 NA   NA
 3398221 3398222 RSal33209_1965 RSal33209_1966     TRUE 0.655 29.000 0.057 NA   NA
 3398222 3398223 RSal33209_1966 RSal33209_1967     TRUE 0.991 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3398223 3398224 RSal33209_1967 RSal33209_1968   pyrR TRUE 0.987 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 3398226 3398227 RSal33209_1970 RSal33209_1971 nusB   TRUE 0.942 3.000 0.078 1.000 N NA
 3398227 3398228 RSal33209_1971 RSal33209_1972     FALSE 0.208 66.000 0.003 NA   NA
 3398228 3398229 RSal33209_1972 RSal33209_1973     TRUE 0.543 20.000 0.003 NA   NA
 3398229 3398230 RSal33209_1973 RSal33209_1974     TRUE 0.732 75.000 0.147 1.000 Y NA
 3398230 3398231 RSal33209_1974 RSal33209_1975     TRUE 0.972 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 3398231 3398232 RSal33209_1975 RSal33209_1976     TRUE 0.765 34.000 0.021 1.000 Y NA
 3398232 3398233 RSal33209_1976 RSal33209_1977     TRUE 0.805 -9.000 0.045 NA   NA
 3398233 3398234 RSal33209_1977 RSal33209_1978     FALSE 0.340 69.000 0.039 NA   NA
 3398234 3398235 RSal33209_1978 RSal33209_1979     TRUE 0.960 -3.000 0.103 1.000 N NA
 3398235 3398236 RSal33209_1979 RSal33209_1980     TRUE 0.762 29.000 0.138 NA   NA
 3398236 3398237 RSal33209_1980 RSal33209_1981     TRUE 0.643 52.000 0.250 NA   NA
 3398237 3398238 RSal33209_1981 RSal33209_1982     FALSE 0.030 234.000 0.007 NA   NA
 3398238 3398239 RSal33209_1982 RSal33209_1983     FALSE 0.049 154.000 0.000 NA   NA
 3398245 3398246 RSal33209_1989 RSal33209_1990     TRUE 0.909 59.000 0.020 0.030 Y NA
 3398246 3398247 RSal33209_1990 RSal33209_1991     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398248 3398249 RSal33209_1992 RSal33209_1993     TRUE 0.566 11.000 0.000 NA   NA
 3398249 3398250 RSal33209_1993 RSal33209_1994     FALSE 0.101 111.000 0.000 NA   NA
 3398251 3398252 RSal33209_1995 RSal33209_1996   secF FALSE 0.050 231.000 0.014 1.000 N NA
 3398252 3398253 RSal33209_1996 RSal33209_1997 secF secD TRUE 0.999 0.000 0.336 0.001 Y NA
 3398253 3398254 RSal33209_1997 RSal33209_1998 secD   TRUE 0.686 49.000 0.062 NA Y NA
 3398254 3398255 RSal33209_1998 RSal33209_1999   ruvB FALSE 0.095 196.000 0.063 NA N NA
 3398255 3398256 RSal33209_1999 RSal33209_2000 ruvB ruvA TRUE 0.999 -7.000 0.549 0.001 Y NA
 3398256 3398257 RSal33209_2000 RSal33209_2001 ruvA ruvC TRUE 0.953 114.000 0.451 0.005 Y NA
 3398257 3398258 RSal33209_2001 RSal33209_2002 ruvC   TRUE 0.905 12.000 0.277 NA   NA
 3398258 3398259 RSal33209_2002 RSal33209_2003     TRUE 0.715 23.000 0.055 NA   NA
 3398260 3398261 RSal33209_2004 RSal33209_2005     TRUE 0.539 13.000 0.000 NA   NA
 3398261 3398262 RSal33209_2005 RSal33209_2006     FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 3398262 3398263 RSal33209_2006 RSal33209_2007     TRUE 0.840 3.000 0.000 1.000   NA
 3398264 3398265 RSal33209_2008 RSal33209_2009     FALSE 0.053 419.000 0.000 1.000 Y NA
 3398265 3398266 RSal33209_2009 RSal33209_2010     FALSE 0.108 156.000 0.016 1.000 N NA
 3398266 3398267 RSal33209_2010 RSal33209_2011     TRUE 0.758 34.000 0.140 1.000 N NA
 3398267 3398268 RSal33209_2011 RSal33209_2012     TRUE 0.629 64.000 0.208 1.000 N NA
 3398268 3398269 RSal33209_2012 RSal33209_2013     TRUE 0.606 18.000 0.000 1.000 N NA
 3398270 3398271 RSal33209_2014 RSal33209_2015     TRUE 0.996 -3.000 0.185 0.084 Y NA
 3398275 3398276 RSal33209_2019 RSal33209_2020   pdxR FALSE 0.013 815.000 0.000 1.000 N NA
 3398276 3398277 RSal33209_2020 RSal33209_2021 pdxR   FALSE 0.075 125.000 0.000 NA N NA
 3398277 3398278 RSal33209_2021 RSal33209_2022     TRUE 0.771 60.000 0.259 NA Y NA
 3398278 3398279 RSal33209_2022 RSal33209_2023     FALSE 0.062 187.000 0.021 NA   NA
 3398280 3398281 RSal33209_2024 RSal33209_2025     FALSE 0.018 432.000 0.014 NA   NA
 3398281 3398282 RSal33209_2025 RSal33209_2026     TRUE 0.608 54.000 0.140 1.000   NA
 3398282 3398283 RSal33209_2026 RSal33209_2027   tatC TRUE 0.706 37.000 0.166 NA N NA
 3398283 3398284 RSal33209_2027 RSal33209_2028 tatC tatA TRUE 0.722 15.000 0.035 NA   NA
 3398284 3398285 RSal33209_2028 RSal33209_2029 tatA   TRUE 0.858 31.000 0.444 NA   NA
 3398287 3398288 RSal33209_2031 RSal33209_2032     FALSE 0.300 109.000 0.068 NA   NA
 3398288 3398289 RSal33209_2032 RSal33209_2033     TRUE 0.944 33.000 0.000 0.002   NA
 3398289 3398290 RSal33209_2033 RSal33209_2034     FALSE 0.188 54.000 0.000 NA   NA
 3398290 3398291 RSal33209_2034 RSal33209_2035     TRUE 0.719 43.000 0.271 NA   NA
 3398291 3398292 RSal33209_2035 RSal33209_2036     TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.001 Y NA
 3398292 3398293 RSal33209_2036 RSal33209_2037     TRUE 0.965 7.000 0.512 NA   NA
 3398293 3398294 RSal33209_2037 RSal33209_2038     TRUE 0.643 106.000 0.706 NA   NA
 3398294 3398295 RSal33209_2038 RSal33209_2039     TRUE 0.847 32.000 0.416 NA   NA
 3398295 3398296 RSal33209_2039 RSal33209_2040     FALSE 0.524 103.000 0.215 1.000 N NA
 3398296 3398297 RSal33209_2040 RSal33209_2041     TRUE 0.691 48.000 0.201 1.000   NA
 3398297 3398298 RSal33209_2041 RSal33209_2042     TRUE 0.589 51.000 0.095 1.000   NA
 3398300 3398301 RSal33209_2044 RSal33209_2045   bacA TRUE 0.719 31.000 0.071 1.000 N NA
 3398303 3398304 RSal33209_2047 RSal33209_2048     FALSE 0.029 253.000 0.000 1.000   NA
 3398304 3398305 RSal33209_2048 RSal33209_2049     TRUE 0.995 1.000 0.000 0.001   NA
 3398305 3398306 RSal33209_2049 RSal33209_2050     TRUE 0.978 5.000 0.000 0.038   NA
 3398306 3398307 RSal33209_2050 RSal33209_2051     TRUE 0.961 0.000 0.100 1.000   NA
 3398309 3398310 RSal33209_2053 RSal33209_2054     FALSE 0.326 46.000 0.000 1.000   NA
 3398310 3398311 RSal33209_2054 RSal33209_2055     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.002   NA
 3398311 3398312 RSal33209_2055 RSal33209_2056     TRUE 0.961 26.000 0.000 0.002   NA
 3398314 3398315 RSal33209_2058 RSal33209_2059     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 3398316 3398317 RSal33209_2060 RSal33209_2061     FALSE 0.096 113.000 0.000 NA   NA
 3398317 3398318 RSal33209_2061 RSal33209_2062     TRUE 0.866 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3398318 3398319 RSal33209_2062 RSal33209_2063     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3398319 3398320 RSal33209_2063 RSal33209_2064     FALSE 0.517 15.000 0.000 NA   NA
 3398320 3398321 RSal33209_2064 RSal33209_2065     FALSE 0.416 26.000 0.000 NA   NA
 3398321 3398322 RSal33209_2065 RSal33209_2066     TRUE 0.865 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3398322 3398323 RSal33209_2066 RSal33209_2067   pvcA TRUE 0.974 -3.000 0.074 NA Y NA
 3398324 3398325 RSal33209_2068 RSal33209_2069     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 3398325 3398326 RSal33209_2069 RSal33209_2070     FALSE 0.329 33.000 0.000 NA   NA
 3398326 3398327 RSal33209_2070 RSal33209_2071     TRUE 0.974 -3.000 0.263 1.000   NA
 3398327 3398328 RSal33209_2071 RSal33209_2072     TRUE 0.985 3.000 0.296 1.000 Y NA
 3398329 3398330 RSal33209_2073 RSal33209_2074     TRUE 0.974 -3.000 0.258 1.000   NA
 3398331 3398332 RSal33209_2075 RSal33209_2076     TRUE 0.796 1.000 0.000 NA   NA
 3398332 3398333 RSal33209_2076 RSal33209_2077     TRUE 0.642 -7.000 0.000 NA   NA
 3398336 3398337 RSal33209_2080 RSal33209_2081     FALSE 0.199 128.000 0.032 1.000   NA
 3398338 3398339 RSal33209_2082 RSal33209_2083     TRUE 0.946 -3.000 0.089 NA   NA
 3398339 3398340 RSal33209_2083 RSal33209_2084     TRUE 0.842 43.000 0.805 NA   NA
 3398340 3398341 RSal33209_2084 RSal33209_2085     FALSE 0.433 25.000 0.000 NA   NA
 3398342 3398343 RSal33209_2086 RSal33209_2087     FALSE 0.325 66.000 0.031 NA   NA
 3398343 3398344 RSal33209_2087 RSal33209_2088     TRUE 0.892 53.000 0.000 0.002   NA
 3398344 3398345 RSal33209_2088 RSal33209_2089     FALSE 0.055 147.000 0.000 NA   NA
 3398346 3398347 RSal33209_2090 RSal33209_2091     FALSE 0.095 158.000 0.010 1.000 N NA
 3398347 3398348 RSal33209_2091 RSal33209_2092     FALSE 0.064 169.000 0.000 1.000 N NA
 3398348 3398349 RSal33209_2092 RSal33209_2093     TRUE 0.818 4.000 0.000 1.000 N NA
 3398349 3398350 RSal33209_2093 RSal33209_2094     TRUE 0.882 5.000 0.052 NA   NA
 3398350 3398351 RSal33209_2094 RSal33209_2095     FALSE 0.416 26.000 0.000 NA   NA
 3398353 3398354 RSal33209_2097 RSal33209_2098     TRUE 0.889 47.000 0.008 0.072 Y NA
 3398355 3398356 RSal33209_2099 RSal33209_2100     TRUE 0.981 -3.000 0.562 NA   NA
 3398356 3398357 RSal33209_2100 RSal33209_2101     TRUE 0.955 0.000 0.125 NA   NA
 3398357 3398358 RSal33209_2101 RSal33209_2102     TRUE 0.717 -10.000 0.017 NA   NA
 3398359 3398360 RSal33209_2103 RSal33209_2104     FALSE 0.365 30.000 0.000 NA   NA
 3398360 3398361 RSal33209_2104 RSal33209_2105     FALSE 0.146 90.000 0.000 NA   NA
 3398362 3398363 RSal33209_2106 RSal33209_2107     TRUE 0.928 0.000 0.056 NA   NA
 3398363 3398364 RSal33209_2107 RSal33209_2108     TRUE 0.970 1.000 0.224 1.000 N NA
 3398365 3398366 RSal33209_2109 RSal33209_2110     TRUE 0.844 86.000 0.576 1.000 Y NA
 3398367 3398368 RSal33209_2111 RSal33209_2112     TRUE 0.575 -21.000 0.000 1.000   NA
 3398368 3398369 RSal33209_2112 RSal33209_2113     TRUE 0.568 -52.000 0.000 1.000   NA
 3398369 3398370 RSal33209_2113 RSal33209_2114     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.078   NA
 3398371 3398372 RSal33209_2115 RSal33209_2116     TRUE 0.832 21.000 0.003 1.000 Y NA
 3398372 3398373 RSal33209_2116 RSal33209_2117     FALSE 0.257 77.000 0.002 1.000 N NA
 3398373 3398374 RSal33209_2117 RSal33209_2118     TRUE 0.564 110.000 0.308 1.000 N NA
 3398374 3398375 RSal33209_2118 RSal33209_2119     TRUE 0.991 34.000 0.810 0.014 Y NA
 3398375 3398376 RSal33209_2119 RSal33209_2120     TRUE 0.673 184.000 0.194 0.014   NA
 3398376 3398377 RSal33209_2120 RSal33209_2121     FALSE 0.443 43.000 0.013 1.000   NA
 3398377 3398378 RSal33209_2121 RSal33209_2122     FALSE 0.022 285.000 0.007 NA N NA
 3398379 3398380 RSal33209_2123 RSal33209_2124 ugpA ugpE TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.056 Y NA
 3398380 3398381 RSal33209_2124 RSal33209_2125 ugpE   TRUE 0.951 44.000 0.333 0.056   NA
 3398381 3398382 RSal33209_2125 RSal33209_2126     FALSE 0.329 33.000 0.000 NA   NA
 3398383 3398384 RSal33209_2127 RSal33209_2128     FALSE 0.016 273.000 0.000 NA   NA
 3398384 3398385 RSal33209_2128 RSal33209_2129     FALSE 0.125 100.000 0.000 NA   NA
 3398385 3398386 RSal33209_2129 RSal33209_2130     TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3398386 3398387 RSal33209_2130 RSal33209_2131     TRUE 0.966 33.000 0.150 0.072 Y NA
 3398387 3398388 RSal33209_2131 RSal33209_2132     TRUE 0.982 -3.000 0.600 NA   NA
 3398388 3398389 RSal33209_2132 RSal33209_2133     TRUE 0.981 2.000 0.667 NA   NA
 3398389 3398390 RSal33209_2133 RSal33209_2134     FALSE 0.198 52.000 0.000 NA   NA
 3398390 3398391 RSal33209_2134 RSal33209_2135     FALSE 0.091 116.000 0.000 NA   NA
 3398391 3398392 RSal33209_2135 RSal33209_2136     FALSE 0.042 207.000 0.000 1.000 N NA
 3398392 3398393 RSal33209_2136 RSal33209_2137     TRUE 0.985 10.000 0.308 0.078   NA
 3398393 3398394 RSal33209_2137 RSal33209_2138     TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000   NA
 3398394 3398395 RSal33209_2138 RSal33209_2139     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.036   NA
 3398395 3398396 RSal33209_2139 RSal33209_2140     TRUE 0.562 133.000 0.000 0.036   NA
 3398396 3398397 RSal33209_2140 RSal33209_2141     TRUE 0.994 3.000 0.000 0.001   NA
 3398399 3398400 RSal33209_2143 RSal33209_2144   secY TRUE 0.944 -3.000 0.057 1.000 N NA
 3398400 3398401 RSal33209_2144 RSal33209_2145 secY   TRUE 0.711 101.000 0.730 1.000 N NA
 3398401 3398402 RSal33209_2145 RSal33209_2146     TRUE 0.999 3.000 0.653 0.002 Y NA
 3398402 3398403 RSal33209_2146 RSal33209_2147     TRUE 0.999 0.000 0.789 0.019 Y NA
 3398403 3398404 RSal33209_2147 RSal33209_2148     TRUE 0.999 -3.000 0.814 0.019 Y NA
 3398404 3398405 RSal33209_2148 RSal33209_2149     TRUE 0.999 3.000 0.815 0.014 Y NA
 3398405 3398406 RSal33209_2149 RSal33209_2150     TRUE 0.995 19.000 0.808 0.014 Y NA
 3398406 3398407 RSal33209_2150 RSal33209_2151     TRUE 0.915 95.000 0.059 0.014 Y