MicrobesOnline Operon Predictions for Bradyrhizobium sp. BTAi1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6831603 6831604 BBta_0001 BBta_0002 dnaA dnaN FALSE 0.376 296.000 0.328 1.000 Y NA
 6831604 6831605 BBta_0002 BBta_0003 dnaN   TRUE 0.756 72.000 0.000 1.000 Y NA
 6831605 6831606 BBta_0003 BBta_0004   recF TRUE 0.871 64.000 0.000 0.010 Y NA
 6831606 6831607 BBta_0004 BBta_0005 recF   TRUE 0.662 113.000 0.000 NA Y NA
 6831607 6831608 BBta_0005 BBta_0006     TRUE 0.872 36.000 0.000 NA Y NA
 6831608 6831609 BBta_0006 BBta_0007     TRUE 0.863 -16.000 0.000 NA   NA
 6831609 6831610 BBta_0007 BBta_0008   gyrB FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 6831610 6831611 BBta_0008 BBta_0009 gyrB   FALSE 0.341 41.000 0.000 NA   NA
 6831613 6831614 BBta_0011 BBta_0012 murA   FALSE 0.217 141.000 0.010 NA   NA
 6831619 6831620 BBta_0017 BBta_0018     FALSE 0.157 142.000 0.000 1.000 N NA
 6831621 6831622 BBta_0019 BBta_0020     FALSE 0.468 43.000 0.016 NA   NA
 6831625 6831626 BBta_0024 BBta_0025     FALSE 0.269 122.000 0.009 1.000   NA
 6831626 6831627 BBta_0025 BBta_0026     FALSE 0.298 63.000 0.000 1.000   NA
 6831627 6831628 BBta_0026 BBta_0027     FALSE 0.172 112.000 0.000 1.000 N NA
 6831631 6831632 BBta_0030 BBta_0031     FALSE 0.028 247.000 0.000 NA   NA
 6831633 6831634 BBta_0032 BBta_0034 gabD   TRUE 0.796 169.000 0.889 NA   NA
 6831637 6831638 BBta_0037 BBta_0038   trpS TRUE 0.591 50.000 0.078 1.000   NA
 6831638 6831639 BBta_0038 BBta_0039 trpS   FALSE 0.225 133.000 0.004 1.000 N NA
 6831639 6831640 BBta_0039 BBta_0040     FALSE 0.289 109.000 0.026 1.000 N NA
 6831642 6831643 BBta_0042 BBta_0043     TRUE 0.982 -3.000 0.209 1.000   NA
 6831643 6831644 BBta_0043 BBta_0044     TRUE 0.601 44.000 0.061 1.000   NA
 6831644 6831645 BBta_0044 BBta_0045     TRUE 0.888 10.000 0.082 1.000   NA
 6831645 6831646 BBta_0045 BBta_0046     TRUE 0.655 56.000 0.008 0.035   NA
 6831646 6831647 BBta_0046 BBta_0047     TRUE 0.947 5.000 0.220 1.000 N NA
 6831647 6831648 BBta_0047 BBta_0048     TRUE 0.778 66.000 0.457 NA   NA
 6831648 6831649 BBta_0048 BBta_0049     TRUE 0.960 3.000 0.222 NA   NA
 6831649 6831650 BBta_0049 BBta_0050   lnt TRUE 0.980 -3.000 0.213 NA   NA
 6831650 6831651 BBta_0050 BBta_0051 lnt   FALSE 0.176 234.000 0.231 1.000 N NA
 6831651 6831652 BBta_0051 BBta_0052     FALSE 0.004 506.000 0.000 1.000 N NA
 6831652 6831653 BBta_0052 BBta_0053   trmB TRUE 0.953 -3.000 0.006 1.000   NA
 6831653 6831654 BBta_0053 BBta_0054 trmB   FALSE 0.005 608.000 0.011 NA   NA
 6831654 6831655 BBta_0054 BBta_0055   nusA TRUE 0.975 15.000 0.759 NA   NA
 6831655 6831656 BBta_0055 BBta_0056 nusA   TRUE 0.900 70.000 0.323 NA Y NA
 6831656 6831657 BBta_0056 BBta_0057   infB FALSE 0.467 77.000 0.171 NA N NA
 6831657 6831658 BBta_0057 BBta_0058 infB rbfA TRUE 0.889 163.000 0.530 1.000 Y NA
 6831658 6831659 BBta_0058 BBta_0059 rbfA truB TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 6831659 6831660 BBta_0059 BBta_0060 truB rpsO TRUE 0.992 3.000 0.211 1.000 Y NA
 6831660 6831661 BBta_0060 BBta_0062 rpsO pnp FALSE 0.248 363.000 0.335 1.000 Y NA
 6831661 6831662 BBta_0062 BBta_0063 pnp   FALSE 0.075 208.000 0.000 1.000   NA
 6831662 6831663 BBta_0063 BBta_0064     TRUE 0.553 116.000 0.286 NA   NA
 6831663 6831664 BBta_0064 BBta_0065     TRUE 0.853 68.000 0.667 NA   NA
 6831665 6831666 BBta_0066 BBta_0067 fabI   FALSE 0.264 55.000 0.000 NA   NA
 6831666 6831667 BBta_0067 BBta_0068   fabB TRUE 0.576 16.000 0.000 NA   NA
 6831667 6831668 BBta_0068 BBta_0069 fabB fabA TRUE 0.909 101.000 0.451 1.000 Y NA
 6831673 6831674 BBta_0075 BBta_0076     FALSE 0.434 30.000 0.000 NA   NA
 6831674 6831675 BBta_0076 BBta_0077     FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 6831675 6831676 BBta_0077 BBta_0078     FALSE 0.169 360.000 0.000 0.004 Y NA
 6831677 6831678 BBta_0079 BBta_0080   mutM FALSE 0.301 72.000 0.003 1.000 N NA
 6831679 6831680 BBta_0081 BBta_0082 ubiE ubiB TRUE 0.975 -3.000 0.115 1.000   NA
 6831680 6831681 BBta_0082 BBta_0083 ubiB coaBC FALSE 0.160 196.000 0.025 1.000   NA
 6831681 6831682 BBta_0083 BBta_0084 coaBC dut TRUE 0.980 -3.000 0.201 1.000 N NA
 6831682 6831683 BBta_0084 BBta_0085 dut   FALSE 0.123 189.000 0.002 1.000 N NA
 6831683 6831684 BBta_0085 BBta_0086     TRUE 0.946 -3.000 0.015 NA   NA
 6831684 6831685 BBta_0086 BBta_0087     FALSE 0.032 292.000 0.026 NA   NA
 6831685 6831686 BBta_0087 BBta_0088     FALSE 0.227 149.000 0.025 NA   NA
 6831686 6831687 BBta_0088 BBta_0089     FALSE 0.312 182.000 0.196 1.000 N NA
 6831687 6831688 BBta_0089 BBta_0090     TRUE 1.000 -3.000 0.863 0.001 Y NA
 6831688 6831689 BBta_0090 BBta_0091   trxA FALSE 0.452 102.000 0.173 1.000 N NA
 6831689 6831690 BBta_0091 BBta_0092 trxA ligC FALSE 0.154 144.000 0.000 1.000 N NA
 6831691 6831692 BBta_0093 BBta_0094     TRUE 0.785 13.000 0.009 1.000   NA
 6831692 6831693 BBta_0094 BBta_0095   accD TRUE 0.990 -3.000 0.383 1.000 N NA
 6831693 6831694 BBta_0095 BBta_0096 accD trpA TRUE 0.538 95.000 0.232 1.000 N NA
 6831694 6831695 BBta_0096 BBta_0097 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.000 Y NA
 6831695 6831696 BBta_0097 BBta_0098 trpB trpF TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 6831696 6831697 BBta_0098 BBta_0099 trpF   FALSE 0.301 79.000 0.017 NA   NA
 6831697 6831698 BBta_0099 BBta_0101   ihfB FALSE 0.410 79.000 0.085 NA   NA
 6831698 6831699 BBta_0101 BBta_0102 ihfB   FALSE 0.298 170.000 0.142 1.000 N NA
 6831699 6831700 BBta_0102 BBta_0103   rpsA FALSE 0.094 231.000 0.057 1.000 N NA
 6831700 6831701 BBta_0103 BBta_0104 rpsA cmk FALSE 0.165 251.000 0.281 1.000 N NA
 6831701 6831702 BBta_0104 BBta_0105 cmk aroA TRUE 0.981 -3.000 0.209 1.000 N NA
 6831703 6831704 BBta_0106 BBta_tRNA1     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 6831704 6831705 BBta_tRNA1 BBta_0107     FALSE 0.027 249.000 0.000 NA   NA
 6831707 6831708 BBta_0109 BBta_0110 ohr   FALSE 0.298 151.000 0.067 1.000 N NA
 6831708 6831709 BBta_0110 BBta_0111     FALSE 0.300 192.000 0.214 1.000 N NA
 6831709 6831710 BBta_0111 BBta_0112     TRUE 0.877 70.000 0.063 0.080 Y NA
 6831710 6831711 BBta_0112 BBta_0113     TRUE 0.998 0.000 0.559 0.080 Y NA
 6831711 6831712 BBta_0113 BBta_0114   ugpC TRUE 0.929 138.000 0.464 0.080 Y NA
 6831712 6831713 BBta_0114 BBta_0115 ugpC   FALSE 0.271 134.000 0.056 NA N NA
 6831713 6831714 BBta_0115 BBta_0116     TRUE 0.926 59.000 0.955 NA   NA
 6831714 6831715 BBta_0116 BBta_0117     FALSE 0.249 125.000 0.022 NA   NA
 6831715 6831716 BBta_0117 BBta_0118     FALSE 0.125 177.000 0.000 1.000   NA
 6831717 6831718 BBta_0119 BBta_0120 ptsN   FALSE 0.087 326.000 0.353 NA N NA
 6831718 6831719 BBta_0120 BBta_0121   rpoN FALSE 0.380 73.000 0.070 NA N NA
 6831719 6831720 BBta_0121 BBta_0122 rpoN   FALSE 0.105 212.000 0.011 1.000   NA
 6831720 6831721 BBta_0122 BBta_0123     FALSE 0.190 159.000 0.015 NA   NA
 6831721 6831722 BBta_0123 BBta_0124     TRUE 0.887 5.000 0.048 NA   NA
 6831722 6831723 BBta_0124 BBta_0125     FALSE 0.314 163.000 0.151 NA   NA
 6831724 6831725 BBta_0128 BBta_0129     TRUE 0.946 112.000 0.756 NA Y NA
 6831725 6831726 BBta_0129 BBta_0130     TRUE 0.996 -9.000 0.341 NA Y NA
 6831728 6831729 BBta_0132 BBta_0133   ftsK TRUE 0.854 12.000 0.081 1.000 N NA
 6831729 6831730 BBta_0133 BBta_0134 ftsK   FALSE 0.183 182.000 0.035 1.000 N NA
 6831732 6831733 BBta_0136 BBta_0138     FALSE 0.117 196.000 0.013 NA   NA
 6831733 6831734 BBta_0138 BBta_0139     TRUE 0.615 141.000 0.375 NA   NA
 6831735 6831736 BBta_0140 BBta_0141 coaA hisE TRUE 0.685 34.000 0.086 1.000 N NA
 6831736 6831737 BBta_0141 BBta_0142 hisE hisF TRUE 0.899 81.000 0.105 0.003 Y NA
 6831737 6831738 BBta_0142 BBta_0143 hisF   TRUE 0.909 0.000 0.002 NA   NA
 6831738 6831739 BBta_0143 BBta_0144     TRUE 0.923 65.000 1.000 NA   NA
 6831739 6831740 BBta_0144 BBta_0145   hisA TRUE 0.937 -3.000 0.003 NA   NA
 6831740 6831741 BBta_0145 BBta_0146 hisA hisH TRUE 0.922 60.000 0.070 0.003 Y NA
 6831741 6831742 BBta_0146 BBta_0147 hisH   TRUE 0.991 -3.000 0.417 NA   NA
 6831742 6831743 BBta_0147 BBta_0148   hisB TRUE 0.671 26.000 0.041 NA   NA
 6831744 6831745 BBta_0149 BBta_0150 hslV   TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6831745 6831746 BBta_0150 BBta_0151     TRUE 0.949 -27.000 0.103 NA   NA
 6831746 6831747 BBta_0151 BBta_0152   hslU TRUE 0.800 10.000 0.007 1.000 N NA
 6831747 6831748 BBta_0152 BBta_0153 hslU   FALSE 0.032 238.000 0.000 NA   NA
 6831749 6831750 BBta_0154 BBta_0155     TRUE 0.933 13.000 0.332 NA   NA
 6831750 6831751 BBta_0155 BBta_0156     TRUE 0.553 156.000 0.324 1.000   NA
 6831753 6831754 BBta_0158 BBta_0159 dnaQ coaE TRUE 0.690 34.000 0.092 1.000 N NA
 6831754 6831755 BBta_0159 BBta_0160 coaE   FALSE 0.483 35.000 0.011 NA N NA
 6831755 6831756 BBta_0160 BBta_0161     FALSE 0.476 71.000 0.135 NA   NA
 6831757 6831758 BBta_0162 BBta_0163   rho FALSE 0.064 237.000 0.024 NA   NA
 6831758 6831759 BBta_0163 BBta_0164 rho trmE FALSE 0.018 409.000 0.050 1.000   NA
 6831759 6831760 BBta_0164 BBta_0165 trmE gidA FALSE 0.161 256.000 0.266 1.000   NA
 6831760 6831761 BBta_0165 BBta_0166 gidA gidB TRUE 0.961 12.000 0.466 1.000 N NA
 6831761 6831762 BBta_0166 BBta_0167 gidB parA TRUE 0.878 30.000 0.339 1.000 N NA
 6831762 6831763 BBta_0167 BBta_0168 parA parB TRUE 0.802 160.000 0.827 1.000 N NA
 6831764 6831765 BBta_0169 BBta_0170 holA   TRUE 0.786 19.000 0.097 NA   NA
 6831765 6831766 BBta_0170 BBta_0171   leuS TRUE 0.952 -13.000 0.090 NA   NA
 6831770 6831771 BBta_0175 BBta_0176     TRUE 0.665 23.000 0.024 NA   NA
 6831772 6831773 BBta_0177 BBta_0178     TRUE 0.852 93.000 0.261 NA Y NA
 6831774 6831775 BBta_0179 BBta_0180   gshB FALSE 0.160 139.000 0.000 1.000 N NA
 6831775 6831776 BBta_0180 BBta_0181 gshB   TRUE 0.661 34.000 0.064 1.000 N NA
 6831776 6831777 BBta_0181 BBta_0182     TRUE 0.968 -13.000 0.165 1.000   NA
 6831779 6831780 BBta_0184 BBta_0185     TRUE 0.973 -13.000 0.218 1.000 N NA
 6831780 6831781 BBta_0185 BBta_0186   rph TRUE 0.985 -3.000 0.262 1.000 N NA
 6831782 6831783 BBta_0187 BBta_0188 hrcA grpE FALSE 0.378 133.000 0.120 1.000 N NA
 6831784 6831785 BBta_0189 BBta_0190     FALSE 0.104 167.000 0.000 NA   NA
 6831786 6831787 BBta_0191 BBta_0192 dnaK dnaJ TRUE 0.902 143.000 0.236 0.002 Y NA
 6831787 6831788 BBta_0192 BBta_0193 dnaJ pmtA FALSE 0.124 214.000 0.057 1.000 N NA
 6831788 6831789 BBta_0193 BBta_0194 pmtA   TRUE 0.721 46.000 0.208 1.000   NA
 6831789 6831790 BBta_0194 BBta_0195   pyrF TRUE 0.862 7.000 0.012 1.000   NA
 6831790 6831791 BBta_0195 BBta_0196 pyrF   FALSE 0.485 51.000 0.044 NA   NA
 6831791 6831792 BBta_0196 BBta_0197   dapB FALSE 0.251 94.000 0.010 NA   NA
 6831792 6831793 BBta_0197 BBta_0198 dapB gpmA TRUE 0.693 25.000 0.038 1.000 N NA
 6831794 6831795 BBta_0199 BBta_0200     FALSE 0.092 249.000 0.142 NA   NA
 6831796 6831797 BBta_0201 BBta_0202 nth   FALSE 0.059 211.000 0.000 1.000 N NA
 6831797 6831798 BBta_0202 BBta_0203     TRUE 0.690 33.000 0.059 1.000   NA
 6831798 6831799 BBta_0203 BBta_0204     TRUE 0.984 -3.000 0.044 0.056   NA
 6831800 6831801 BBta_0205 BBta_0206   actP FALSE 0.174 206.000 0.000 0.056 N NA
 6831805 6831806 BBta_0210 BBta_0211     TRUE 0.702 34.000 0.077 1.000   NA
 6831806 6831807 BBta_0211 BBta_0212   pheT TRUE 0.951 -3.000 0.003 1.000   NA
 6831807 6831808 BBta_0212 BBta_0213 pheT   TRUE 0.708 19.000 0.005 1.000   NA
 6831808 6831809 BBta_0213 BBta_0214   pheS FALSE 0.275 99.000 0.003 1.000   NA
 6831809 6831810 BBta_0214 BBta_0215 pheS rplT TRUE 0.808 143.000 0.202 1.000 Y NA
 6831810 6831811 BBta_0215 BBta_0216 rplT rpmI TRUE 0.983 78.000 0.928 0.008 Y NA
 6831815 6831816 BBta_0221 BBta_0222     FALSE 0.417 156.000 0.213 1.000 N NA
 6831823 6831824 BBta_0228 BBta_0229 sdhC sdhD TRUE 0.988 21.000 0.291 0.000 Y NA
 6831824 6831825 BBta_0229 BBta_0230 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 6831825 6831826 BBta_0230 BBta_0231 sdhA sdhB TRUE 0.990 34.000 0.604 0.001 Y NA
 6831826 6831827 BBta_0231 BBta_0232 sdhB   FALSE 0.233 132.000 0.006 1.000 N NA
 6831827 6831828 BBta_0232 BBta_0233     TRUE 0.786 58.000 0.250 0.097   NA
 6831828 6831829 BBta_0233 BBta_0234     FALSE 0.142 138.000 0.000 NA   NA
 6831829 6831830 BBta_0234 BBta_0235     FALSE 0.175 86.000 0.000 NA   NA
 6831830 6831831 BBta_0235 BBta_0236     TRUE 0.957 0.000 0.125 NA   NA
 6831831 6831832 BBta_0236 BBta_0237     FALSE 0.010 334.000 0.000 NA   NA
 6831833 6831834 BBta_0238 BBta_0239 argG   FALSE 0.300 93.000 0.008 1.000   NA
 6831834 6831835 BBta_0239 BBta_0240     FALSE 0.309 46.000 0.000 NA   NA
 6831835 6831836 BBta_0240 BBta_0241     FALSE 0.153 165.000 0.002 NA   NA
 6831836 6831837 BBta_0241 BBta_0242     FALSE 0.234 117.000 0.012 NA   NA
 6831838 6831839 BBta_0243 BBta_0244     FALSE 0.005 547.000 0.000 1.000   NA
 6831839 6831840 BBta_0244 BBta_0245     TRUE 0.775 143.000 0.667 NA   NA
 6831841 6831842 BBta_0247 BBta_0248   phhB FALSE 0.373 97.000 0.094 NA   NA
 6831843 6831844 BBta_0249 BBta_0250     FALSE 0.290 149.000 0.038 1.000   NA
 6831846 6831847 BBta_0252 BBta_0253     FALSE 0.400 82.000 0.069 1.000 N NA
 6831847 6831848 BBta_0253 BBta_0254     TRUE 0.981 -19.000 0.299 1.000   NA
 6831848 6831849 BBta_0254 BBta_0255     TRUE 0.953 -3.000 0.030 NA   NA
 6831849 6831850 BBta_0255 BBta_0256     FALSE 0.296 49.000 0.000 NA   NA
 6831850 6831851 BBta_0256 BBta_0257     FALSE 0.264 55.000 0.000 NA   NA
 6831851 6831852 BBta_0257 BBta_0258     FALSE 0.469 26.000 0.000 NA   NA
 6831852 6831853 BBta_0258 BBta_0259     TRUE 0.988 11.000 1.000 NA   NA
 6831853 6831854 BBta_0259 BBta_0260   typA FALSE 0.040 226.000 0.000 NA   NA
 6831854 6831855 BBta_0260 BBta_0261 typA   FALSE 0.082 213.000 0.003 1.000 N NA
 6831856 6831857 BBta_0262 BBta_0263     TRUE 0.882 9.000 0.092 NA   NA
 6831857 6831858 BBta_0263 BBta_0264     FALSE 0.064 200.000 0.000 NA   NA
 6831858 6831859 BBta_0264 BBta_0265     TRUE 0.922 0.000 0.014 NA   NA
 6831859 6831860 BBta_0265 BBta_0266     TRUE 0.939 14.000 0.375 NA   NA
 6831861 6831862 BBta_0267 BBta_0268   ppa FALSE 0.144 203.000 0.048 1.000 N NA
 6831863 6831864 BBta_0269 BBta_0270 folD   FALSE 0.042 270.000 0.029 NA   NA
 6831864 6831865 BBta_0270 BBta_0271     TRUE 0.890 14.000 0.220 NA   NA
 6831867 6831868 BBta_0273 BBta_0274     FALSE 0.410 82.000 0.057 1.000   NA
 6831868 6831869 BBta_0274 BBta_0275     FALSE 0.108 218.000 0.057 NA   NA
 6831869 6831870 BBta_0275 BBta_0276     FALSE 0.311 145.000 0.077 NA   NA
 6831870 6831871 BBta_0276 BBta_0277     FALSE 0.081 229.000 0.012 1.000   NA
 6831873 6831874 BBta_0279 BBta_0280     FALSE 0.144 129.000 0.000 NA   NA
 6831878 6831879 BBta_0285 BBta_tRNA52     FALSE 0.009 352.000 0.000 NA   NA
 6831879 6831880 BBta_tRNA52 BBta_0286     FALSE 0.118 156.000 0.000 NA   NA
 6831880 6831881 BBta_0286 BBta_0287     TRUE 0.894 8.000 0.108 NA   NA
 6831881 6831882 BBta_0287 BBta_0288     TRUE 0.538 51.000 0.077 NA   NA
 6831883 6831884 BBta_0289 BBta_0290   gpsA FALSE 0.101 232.000 0.070 1.000 N NA
 6831884 6831885 BBta_0290 BBta_0291 gpsA   FALSE 0.104 215.000 0.042 NA   NA
 6831886 6831887 BBta_0292 BBta_0293 amtB2   TRUE 0.724 40.000 0.197 1.000 N NA
 6831887 6831888 BBta_0293 BBta_0294   amtB1 FALSE 0.007 420.000 0.000 1.000 N NA
 6831888 6831889 BBta_0294 BBta_0295 amtB1 glnK1 FALSE 0.415 85.000 0.095 1.000 N NA
 6831893 6831894 BBta_0299 BBta_0300     TRUE 0.876 3.000 0.004 NA   NA
 6831894 6831895 BBta_0300 BBta_0301     FALSE 0.353 57.000 0.005 NA   NA
 6831896 6831897 BBta_0302 BBta_0303     FALSE 0.012 319.000 0.000 NA   NA
 6831897 6831898 BBta_0303 BBta_0304     TRUE 0.835 12.000 0.067 NA   NA
 6831899 6831900 BBta_0305 BBta_0306     TRUE 0.689 55.000 0.222 1.000   NA
 6831902 6831903 BBta_0307 BBta_0308   pncB FALSE 0.274 114.000 0.007 1.000   NA
 6831903 6831904 BBta_0308 BBta_0309 pncB   FALSE 0.257 99.000 0.007 1.000 N NA
 6831905 6831906 BBta_0311 BBta_0312     FALSE 0.277 143.000 0.036 1.000 N NA
 6831907 6831908 BBta_0313 BBta_0314 panE   FALSE 0.247 118.000 0.011 1.000 N NA
 6831908 6831909 BBta_0314 BBta_0315     TRUE 0.756 72.000 0.000 1.000 Y NA
 6831909 6831910 BBta_0315 BBta_0316     FALSE 0.399 107.000 0.120 1.000 N NA
 6831910 6831911 BBta_0316 BBta_0317     FALSE 0.384 142.000 0.158 NA   NA
 6831917 6831918 BBta_0323 BBta_0324 purH   FALSE 0.263 159.000 0.068 NA   NA
 6831918 6831919 BBta_0324 BBta_0325     FALSE 0.081 242.000 0.071 NA   NA
 6831921 6831922 BBta_0327 BBta_0328     TRUE 0.989 0.000 0.203 0.001 N NA
 6831922 6831923 BBta_0328 BBta_0329     TRUE 0.980 -3.000 0.214 NA   NA
 6831923 6831924 BBta_0329 BBta_0330     TRUE 0.566 146.000 0.333 NA   NA
 6831924 6831925 BBta_0330 BBta_0331     FALSE 0.293 168.000 0.143 NA   NA
 6831925 6831926 BBta_0331 BBta_0332     FALSE 0.093 176.000 0.000 NA   NA
 6831926 6831927 BBta_0332 BBta_0333   acsA FALSE 0.296 49.000 0.000 NA   NA
 6831930 6831931 BBta_0336 BBta_0337     FALSE 0.062 208.000 0.000 1.000 N NA
 6831931 6831932 BBta_0337 BBta_0338     TRUE 0.970 15.000 0.476 0.082   NA
 6831935 6831936 BBta_0342 BBta_0343     FALSE 0.038 229.000 0.000 NA   NA
 6831937 6831938 BBta_0344 BBta_0345 asd   FALSE 0.433 43.000 0.005 NA   NA
 6831941 6831942 BBta_0348 BBta_0349     TRUE 0.822 40.000 0.333 NA   NA
 6831942 6831943 BBta_0349 BBta_0350     TRUE 0.524 111.000 0.250 NA   NA
 6831943 6831944 BBta_0350 BBta_0351   leuD FALSE 0.324 86.000 0.038 NA   NA
 6831944 6831945 BBta_0351 BBta_0352 leuD   FALSE 0.395 94.000 0.112 NA   NA
 6831946 6831947 BBta_0353 BBta_0355     FALSE 0.019 279.000 0.000 NA   NA
 6831947 6831948 BBta_0355 BBta_0357     FALSE 0.180 83.000 0.000 NA   NA
 6831951 6831952 BBta_0362 BBta_0363   leuC FALSE 0.074 192.000 0.000 NA   NA
 6831952 6831953 BBta_0363 BBta_0364 leuC rplS FALSE 0.012 403.000 0.008 1.000 N NA
 6831953 6831954 BBta_0364 BBta_0365 rplS trmD TRUE 0.927 108.000 0.567 1.000 Y NA
 6831954 6831955 BBta_0365 BBta_0366 trmD rimM TRUE 0.913 168.000 0.672 1.000 Y NA
 6831955 6831956 BBta_0366 BBta_0367 rimM rpsP TRUE 0.925 129.000 0.342 0.008 Y NA
 6831956 6831957 BBta_0367 BBta_0368 rpsP ffh TRUE 0.618 140.000 0.361 1.000 N NA
 6831959 6831960 BBta_0370 BBta_0371     TRUE 0.944 6.000 0.235 NA   NA
 6831961 6831962 BBta_0372 BBta_0373 dapF   TRUE 0.971 -3.000 0.109 1.000 N NA
 6831964 6831965 BBta_0375 BBta_0376 ftsY   FALSE 0.358 87.000 0.050 1.000 N NA
 6831966 6831967 BBta_0377 BBta_0378 ccmG ccmD TRUE 0.979 -3.000 0.172 1.000   NA
 6831967 6831968 BBta_0378 BBta_0379 ccmD ccmC TRUE 0.989 2.000 0.501 1.000   NA
 6831968 6831969 BBta_0379 BBta_0380 ccmC ccmB TRUE 0.962 93.000 0.501 0.001 Y NA
 6831969 6831970 BBta_0380 BBta_0381 ccmB ccmA FALSE 0.461 386.000 0.503 0.002 Y NA
 6831971 6831972 BBta_0382 BBta_0383 acnA   FALSE 0.156 190.000 0.038 NA   NA
 6831972 6831973 BBta_0383 BBta_0384     FALSE 0.005 427.000 0.000 NA   NA
 6831974 6831975 BBta_0385 BBta_0386 pat   FALSE 0.205 183.000 0.069 NA   NA
 6831975 6831976 BBta_0386 BBta_0387     FALSE 0.068 264.000 0.101 NA   NA
 6831976 6831977 BBta_0387 BBta_0388     TRUE 0.999 -3.000 0.626 NA Y NA
 6831978 6831979 BBta_0389 BBta_0390 tesA   FALSE 0.157 206.000 0.077 1.000 N NA
 6831979 6831980 BBta_0390 BBta_0391     FALSE 0.106 205.000 0.021 NA   NA
 6831980 6831981 BBta_0391 BBta_0392   mdh FALSE 0.081 226.000 0.032 NA   NA
 6831981 6831982 BBta_0392 BBta_0393 mdh sucC TRUE 0.777 123.000 0.113 1.000 Y NA
 6831982 6831983 BBta_0393 BBta_0394 sucC sucD TRUE 0.958 57.000 0.256 0.000 Y NA
 6831983 6831984 BBta_0394 BBta_0395 sucD sucA TRUE 0.762 142.000 0.092 1.000 Y NA
 6831984 6831985 BBta_0395 BBta_0396 sucA sucB TRUE 0.935 137.000 0.667 1.000 Y NA
 6831985 6831986 BBta_0396 BBta_0397 sucB   FALSE 0.345 68.000 0.013 1.000 N NA
 6831986 6831987 BBta_0397 BBta_0398   lpd FALSE 0.492 46.000 0.023 1.000 N NA
 6831987 6831988 BBta_0398 BBta_0399 lpd   FALSE 0.246 130.000 0.021 NA   NA
 6831989 6831990 BBta_0400 BBta_0401   xerC FALSE 0.301 81.000 0.020 NA   NA
 6831993 6831994 BBta_0405 BBta_0406 atpH atpA TRUE 0.999 0.000 0.864 0.003 Y NA
 6831994 6831995 BBta_0406 BBta_0407 atpA atpG TRUE 0.969 154.000 0.846 0.003 Y NA
 6831995 6831996 BBta_0407 BBta_0408 atpG atpD TRUE 0.974 91.000 0.724 0.003 Y NA
 6831996 6831997 BBta_0408 BBta_0409 atpD atpC TRUE 0.977 100.000 0.837 0.003 Y NA
 6831997 6831998 BBta_0409 BBta_0410 atpC   FALSE 0.169 165.000 0.003 1.000 N NA
 6831999 6832000 BBta_0411 BBta_0412 nudH nudH TRUE 0.813 140.000 0.010 0.021 Y NA
 6832000 6832001 BBta_0412 BBta_0413 nudH   FALSE 0.477 78.000 0.109 1.000   NA
 6832001 6832002 BBta_0413 BBta_0414   ctpA FALSE 0.373 176.000 0.210 1.000   NA
 6832002 6832003 BBta_0414 BBta_0415 ctpA   TRUE 0.820 84.000 0.408 0.025 N NA
 6832003 6832004 BBta_0415 BBta_0416     FALSE 0.341 103.000 0.067 NA   NA
 6832004 6832005 BBta_0416 BBta_0417     TRUE 0.591 99.000 0.307 NA   NA
 6832005 6832006 BBta_0417 BBta_0418   nadD FALSE 0.204 216.000 0.221 NA   NA
 6832006 6832007 BBta_0418 BBta_0419 nadD proA FALSE 0.444 109.000 0.170 1.000 N NA
 6832007 6832008 BBta_0419 BBta_0420 proA   FALSE 0.185 80.000 0.000 NA   NA
 6832008 6832009 BBta_0420 BBta_0421     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832009 6832010 BBta_0421 BBta_0422   proB FALSE 0.169 91.000 0.000 NA   NA
 6832010 6832011 BBta_0422 BBta_0423 proB obgE FALSE 0.322 158.000 0.087 1.000   NA
 6832013 6832014 BBta_0425 BBta_0426   rpmA TRUE 0.724 144.000 0.035 1.000 Y NA
 6832014 6832015 BBta_0426 BBta_0427 rpmA rplU TRUE 0.964 134.000 0.667 0.008 Y NA
 6832016 6832017 BBta_0428 BBta_0429     FALSE 0.004 487.000 0.000 NA   NA
 6832017 6832018 BBta_0429 BBta_tRNA5     FALSE 0.032 239.000 0.000 NA   NA
 6832019 6832020 BBta_0430 BBta_0431     TRUE 0.592 62.000 0.167 1.000   NA
 6832020 6832021 BBta_0431 BBta_0432     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 6832021 6832022 BBta_0432 BBta_0433     FALSE 0.345 169.000 0.200 NA   NA
 6832022 6832023 BBta_0433 BBta_0434     TRUE 0.622 68.000 0.250 NA   NA
 6832023 6832024 BBta_0434 BBta_0435     FALSE 0.162 130.000 0.000 1.000 N NA
 6832025 6832026 BBta_0436 BBta_0437     TRUE 0.970 2.000 0.000 0.000   NA
 6832026 6832027 BBta_0437 BBta_0438     FALSE 0.047 236.000 0.000 1.000   NA
 6832027 6832028 BBta_0438 BBta_0439     TRUE 0.551 70.000 0.000 0.011   NA
 6832028 6832029 BBta_0439 BBta_0440     TRUE 0.730 38.000 0.000 0.011   NA
 6832029 6832030 BBta_0440 BBta_0441     FALSE 0.038 336.000 0.000 0.054   NA
 6832034 6832035 BBta_0445 BBta_0446 cbbF cbbP TRUE 0.831 27.000 0.017 0.011 N NA
 6832035 6832036 BBta_0446 BBta_0447 cbbP cbbT TRUE 0.963 -3.000 0.051 1.000 N NA
 6832036 6832037 BBta_0447 BBta_0448 cbbT cbbG TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6832037 6832038 BBta_0448 BBta_0449 cbbG cbbK TRUE 0.996 -3.000 0.006 0.003 Y NA
 6832038 6832039 BBta_0449 BBta_0450 cbbK cbbA TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 6832039 6832040 BBta_0450 BBta_0451 cbbA rbcL TRUE 0.932 20.000 0.000 1.000 Y NA
 6832040 6832041 BBta_0451 BBta_0452 rbcL cbbS TRUE 0.994 11.000 1.000 0.001 N NA
 6832041 6832042 BBta_0452 BBta_0453 cbbS   FALSE 0.424 91.000 0.085 1.000   NA
 6832042 6832043 BBta_0453 BBta_0454   rpe TRUE 0.954 -3.000 0.008 1.000   NA
 6832043 6832044 BBta_0454 BBta_0455 rpe   TRUE 0.989 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 6832044 6832045 BBta_0455 BBta_0456   cbbZ FALSE 0.176 147.000 0.000 1.000   NA
 6832045 6832046 BBta_0456 BBta_0457 cbbZ   TRUE 0.987 -3.000 0.029 0.002   NA
 6832046 6832047 BBta_0457 BBta_0458     FALSE 0.303 96.000 0.012 1.000   NA
 6832047 6832048 BBta_0458 BBta_0460   hupU FALSE 0.010 498.000 0.040 1.000 N NA
 6832048 6832049 BBta_0460 BBta_0461 hupU hupL TRUE 0.989 47.000 0.750 0.001 Y NA
 6832049 6832050 BBta_0461 BBta_0462 hupL   FALSE 0.439 80.000 0.128 NA   NA
 6832050 6832051 BBta_0462 BBta_0463     TRUE 0.956 41.000 1.000 NA   NA
 6832051 6832052 BBta_0463 BBta_0464     FALSE 0.134 213.000 0.082 NA   NA
 6832052 6832053 BBta_0464 BBta_0465     FALSE 0.144 132.000 0.000 NA   NA
 6832053 6832054 BBta_0465 BBta_0466     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 6832054 6832055 BBta_0466 BBta_0467     FALSE 0.264 55.000 0.000 NA   NA
 6832055 6832056 BBta_0467 BBta_0468     TRUE 0.689 10.000 0.000 NA   NA
 6832056 6832057 BBta_0468 BBta_0469     TRUE 0.610 14.000 0.000 NA   NA
 6832057 6832058 BBta_0469 BBta_0470     TRUE 0.679 81.000 0.361 NA   NA
 6832058 6832059 BBta_0470 BBta_0471   hypF TRUE 0.926 -18.000 0.025 NA   NA
 6832059 6832060 BBta_0471 BBta_0472 hypF   FALSE 0.299 96.000 0.036 NA   NA
 6832060 6832061 BBta_0472 BBta_0473   lpcA FALSE 0.474 110.000 0.207 NA   NA
 6832061 6832062 BBta_0473 BBta_0474 lpcA hypD TRUE 0.955 -3.000 0.025 1.000 N NA
 6832062 6832063 BBta_0474 BBta_0475 hypD hypE TRUE 0.998 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 6832063 6832064 BBta_0475 BBta_0476 hypE hypA TRUE 0.817 13.000 0.029 1.000   NA
 6832066 6832067 BBta_0478 BBta_0479 hypB hupE TRUE 0.575 189.000 0.061 NA Y NA
 6832067 6832068 BBta_0479 BBta_0480 hupE   FALSE 0.009 323.000 0.000 NA N NA
 6832068 6832069 BBta_0480 BBta_0481     TRUE 0.990 -49.000 0.087 NA Y NA
 6832074 6832075 BBta_0486 BBta_0487     TRUE 0.965 10.000 0.438 1.000 N NA
 6832075 6832076 BBta_0487 BBta_0488   idhA TRUE 0.603 21.000 0.000 1.000   NA
 6832076 6832077 BBta_0488 BBta_0489 idhA   FALSE 0.004 514.000 0.000 NA   NA
 6832078 6832079 BBta_0490 BBta_0492     FALSE 0.016 292.000 0.000 NA   NA
 6832079 6832080 BBta_0492 BBta_0493     FALSE 0.016 290.000 0.000 NA   NA
 6832082 6832083 BBta_0495 BBta_0496     TRUE 0.998 -3.000 0.348 0.078 Y NA
 6832083 6832084 BBta_0496 BBta_0497     TRUE 0.998 -3.000 0.308 0.078 Y NA
 6832084 6832085 BBta_0497 BBta_0498     TRUE 0.998 0.000 0.423 0.078 Y NA
 6832085 6832086 BBta_0498 BBta_0499     TRUE 0.977 5.000 0.462 1.000 N NA
 6832091 6832092 BBta_0504 BBta_0505     FALSE 0.351 139.000 0.111 NA   NA
 6832092 6832093 BBta_0505 BBta_0506     TRUE 0.975 -3.000 0.167 NA   NA
 6832094 6832095 BBta_0509 BBta_0510     FALSE 0.378 71.000 0.044 NA   NA
 6832095 6832096 BBta_0510 BBta_0511     FALSE 0.146 119.000 0.000 NA   NA
 6832096 6832097 BBta_0511 BBta_0512   ipdC FALSE 0.368 80.000 0.057 NA   NA
 6832100 6832101 BBta_0515 BBta_0516     FALSE 0.031 240.000 0.000 NA   NA
 6832101 6832102 BBta_0516 BBta_0517     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.024 Y NA
 6832102 6832103 BBta_0517 BBta_0518     FALSE 0.402 244.000 0.000 0.024 Y NA
 6832103 6832104 BBta_0518 BBta_0519     FALSE 0.320 230.000 0.000 1.000 Y NA
 6832105 6832106 BBta_0521 BBta_0522     FALSE 0.027 280.000 0.000 1.000   NA
 6832106 6832107 BBta_0522 BBta_0523   flbT FALSE 0.084 203.000 0.000 1.000   NA
 6832107 6832108 BBta_0523 BBta_0524 flbT cheA FALSE 0.239 256.000 0.000 1.000 Y NA
 6832108 6832109 BBta_0524 BBta_0525 cheA cheW TRUE 0.959 26.000 0.009 0.017 Y NA
 6832109 6832110 BBta_0525 BBta_0526 cheW cheY TRUE 0.992 31.000 1.000 1.000 Y NA
 6832110 6832111 BBta_0526 BBta_0527 cheY cheR TRUE 0.992 30.000 1.000 1.000 Y NA
 6832111 6832112 BBta_0527 BBta_0528 cheR   TRUE 0.804 34.000 0.250 NA   NA
 6832112 6832113 BBta_0528 BBta_0529     FALSE 0.323 193.000 0.250 NA   NA
 6832113 6832114 BBta_0529 BBta_0530     FALSE 0.081 498.000 0.000 0.024 Y NA
 6832115 6832116 BBta_0531 BBta_0532     TRUE 0.983 8.000 0.000 0.024 Y NA
 6832117 6832118 BBta_0533 BBta_0534     TRUE 0.974 55.000 0.500 0.017 Y NA
 6832120 6832121 BBta_0536 BBta_0537     TRUE 0.999 0.000 0.800 NA Y NA
 6832121 6832122 BBta_0537 BBta_0538     TRUE 0.991 12.000 0.500 1.000 Y NA
 6832122 6832123 BBta_0538 BBta_0539     TRUE 0.982 -3.000 0.222 1.000 N NA
 6832123 6832124 BBta_0539 BBta_0540     FALSE 0.431 220.000 0.600 NA N NA
 6832124 6832125 BBta_0540 BBta_0541     FALSE 0.023 242.000 0.000 NA N NA
 6832128 6832129 BBta_0544 BBta_0545     FALSE 0.303 161.000 0.108 1.000 N NA
 6832129 6832130 BBta_0545 BBta_0546     TRUE 0.606 181.000 0.538 NA   NA
 6832132 6832133 BBta_0549 BBta_0551     FALSE 0.078 188.000 0.000 NA   NA
 6832133 6832134 BBta_0551 BBta_0553     FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 6832135 6832136 BBta_0554 BBta_0555     FALSE 0.340 182.000 0.200 1.000   NA
 6832136 6832137 BBta_0555 BBta_0556     FALSE 0.424 173.000 0.250 1.000   NA
 6832137 6832138 BBta_0556 BBta_0557     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA   NA
 6832139 6832140 BBta_0558 BBta_0559     FALSE 0.010 311.000 0.000 NA N NA
 6832141 6832142 BBta_0560 BBta_0561     FALSE 0.035 274.000 0.015 NA   NA
 6832144 6832145 BBta_0563 BBta_0564     TRUE 0.983 9.000 0.681 NA   NA
 6832145 6832146 BBta_0564 BBta_0565     TRUE 0.740 24.000 0.081 NA   NA
 6832146 6832147 BBta_0565 BBta_0566   hmgA TRUE 0.972 -3.000 0.085 1.000   NA
 6832147 6832148 BBta_0566 BBta_0567 hmgA fahA TRUE 0.863 127.000 0.316 1.000 Y NA
 6832149 6832150 BBta_0568 BBta_0569     FALSE 0.310 90.000 0.035 NA   NA
 6832152 6832153 BBta_0571 BBta_0572     TRUE 0.499 212.000 0.068 1.000 Y NA
 6832153 6832154 BBta_0572 BBta_0573     TRUE 0.991 20.000 0.525 0.081 Y NA
 6832154 6832155 BBta_0573 BBta_0574     TRUE 0.846 114.000 0.125 0.081 Y NA
 6832156 6832157 BBta_0575 BBta_0576     FALSE 0.016 392.000 0.037 1.000 N NA
 6832157 6832158 BBta_0576 BBta_0577   otsB TRUE 0.981 7.000 0.063 1.000 Y NA
 6832158 6832159 BBta_0577 BBta_0578 otsB otsA FALSE 0.221 333.000 0.000 0.001 Y NA
 6832161 6832162 BBta_tRNA6 BBta_0580     FALSE 0.192 77.000 0.000 NA   NA
 6832162 6832163 BBta_0580 BBta_0581     FALSE 0.069 197.000 0.000 NA   NA
 6832163 6832164 BBta_0581 BBta_0583     FALSE 0.144 135.000 0.000 NA   NA
 6832164 6832165 BBta_0583 BBta_0584     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6832165 6832166 BBta_0584 BBta_0586     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 6832167 6832168 BBta_0587 BBta_0588     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 6832169 6832170 BBta_0589 BBta_0592     TRUE 0.689 10.000 0.000 NA   NA
 6832170 6832171 BBta_0592 BBta_0593     FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 6832171 6832172 BBta_0593 BBta_0595     FALSE 0.040 226.000 0.000 NA   NA
 6832172 6832173 BBta_0595 BBta_0596     TRUE 0.814 51.000 0.000 NA Y NA
 6832173 6832174 BBta_0596 BBta_0597     FALSE 0.434 30.000 0.000 NA   NA
 6832175 6832176 BBta_0598 BBta_0599     FALSE 0.133 91.000 0.000 NA N NA
 6832177 6832178 BBta_0600 BBta_0601     TRUE 0.539 19.000 0.000 NA   NA
 6832178 6832179 BBta_0601 BBta_0602     FALSE 0.102 168.000 0.000 NA   NA
 6832184 6832185 BBta_0608 BBta_0609     FALSE 0.175 86.000 0.000 NA   NA
 6832185 6832186 BBta_0609 BBta_0610     TRUE 0.846 77.000 0.200 NA Y NA
 6832186 6832187 BBta_0610 BBta_0611     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 6832190 6832191 BBta_0614 BBta_0615     FALSE 0.198 117.000 0.000 1.000   NA
 6832191 6832192 BBta_0615 BBta_0616     TRUE 0.883 -67.000 0.000 1.000   NA
 6832192 6832193 BBta_0616 BBta_0617     TRUE 0.882 -7.000 0.000 NA   NA
 6832193 6832194 BBta_0617 BBta_0618     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832194 6832195 BBta_0618 BBta_0619     FALSE 0.024 239.000 0.000 NA N NA
 6832197 6832198 BBta_0622 BBta_0623 tyrB   FALSE 0.021 284.000 0.000 1.000 N NA
 6832198 6832199 BBta_0623 BBta_0625     FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 6832199 6832200 BBta_0625 BBta_0626     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832200 6832201 BBta_0626 BBta_0627     FALSE 0.004 532.000 0.000 NA   NA
 6832201 6832202 BBta_0627 BBta_0628     FALSE 0.178 146.000 0.000 1.000   NA
 6832202 6832203 BBta_0628 BBta_0629     FALSE 0.003 1204.000 0.000 1.000   NA
 6832203 6832204 BBta_0629 BBta_0631     FALSE 0.054 228.000 0.000 1.000   NA
 6832204 6832205 BBta_0631 BBta_0632     TRUE 0.985 -3.000 0.250 1.000   NA
 6832205 6832206 BBta_0632 BBta_0633     TRUE 0.988 11.000 0.333 1.000 Y NA
 6832206 6832207 BBta_0633 BBta_0634     TRUE 0.739 45.000 0.222 1.000   NA
 6832207 6832208 BBta_0634 BBta_0635     TRUE 0.756 60.000 0.333 1.000   NA
 6832208 6832209 BBta_0635 BBta_0636     TRUE 0.979 -3.000 0.222 NA N NA
 6832209 6832210 BBta_0636 BBta_0637     FALSE 0.113 126.000 0.000 NA N NA
 6832212 6832213 BBta_0640 BBta_0641     TRUE 0.924 4.000 0.105 NA   NA
 6832213 6832214 BBta_0641 BBta_0642     FALSE 0.090 179.000 0.000 NA   NA
 6832214 6832215 BBta_0642 BBta_0643     TRUE 0.648 124.000 0.000 NA Y NA
 6832215 6832216 BBta_0643 BBta_0644     FALSE 0.002 644.000 0.000 NA N NA
 6832217 6832218 BBta_0645 BBta_0646     TRUE 0.863 5.000 0.021 NA   NA
 6832219 6832220 BBta_0647 BBta_0648 mtaP mtnA TRUE 0.774 15.000 0.034 1.000 N NA
 6832222 6832223 BBta_0650 BBta_0651     FALSE 0.436 102.000 0.130 1.000   NA
 6832224 6832225 BBta_0652 BBta_0653     TRUE 0.979 -10.000 0.061 0.023 N NA
 6832226 6832227 BBta_0654 BBta_0655     TRUE 0.582 235.000 0.367 NA Y NA
 6832227 6832228 BBta_0655 BBta_0656     TRUE 0.992 35.000 0.888 0.077 Y NA
 6832228 6832229 BBta_0656 BBta_0657     TRUE 0.977 11.000 0.639 1.000   NA
 6832229 6832230 BBta_0657 BBta_0658     TRUE 0.761 181.000 0.600 0.039   NA
 6832230 6832231 BBta_0658 BBta_0659   fmdA TRUE 0.836 36.000 0.312 1.000 N NA
 6832231 6832232 BBta_0659 BBta_0660 fmdA   TRUE 0.714 100.000 0.478 NA   NA
 6832233 6832234 BBta_0661 BBta_0662     FALSE 0.454 56.000 0.045 NA   NA
 6832234 6832235 BBta_0662 BBta_0663     FALSE 0.290 114.000 0.041 NA   NA
 6832235 6832236 BBta_0663 BBta_0664     TRUE 0.826 103.000 0.741 NA   NA
 6832238 6832239 BBta_0666 BBta_0667     FALSE 0.332 76.000 0.046 NA N NA
 6832240 6832241 BBta_0668 BBta_0669     FALSE 0.451 262.000 0.070 0.008 Y NA
 6832241 6832242 BBta_0669 BBta_0670     TRUE 0.958 0.000 0.105 1.000 N NA
 6832242 6832243 BBta_0670 BBta_0671     FALSE 0.487 131.000 0.222 1.000 N NA
 6832245 6832246 BBta_0673 BBta_0674     TRUE 0.634 108.000 0.161 0.033   NA
 6832246 6832247 BBta_0674 BBta_0675     TRUE 0.681 173.000 0.102 1.000 Y NA
 6832247 6832248 BBta_0675 BBta_0676     TRUE 0.968 18.000 0.184 1.000 Y NA
 6832249 6832250 BBta_0677 BBta_0678     TRUE 0.829 35.000 0.067 0.028   NA
 6832250 6832251 BBta_0678 BBta_0679     FALSE 0.012 349.000 0.000 1.000   NA
 6832251 6832252 BBta_0679 BBta_0680     TRUE 0.987 13.000 1.000 1.000   NA
 6832252 6832253 BBta_0680 BBta_0681     TRUE 0.696 98.000 0.222 0.033   NA
 6832255 6832256 BBta_0683 BBta_0684     TRUE 0.743 25.000 0.098 NA   NA
 6832256 6832257 BBta_0684 BBta_0685     TRUE 0.992 -10.000 0.627 NA   NA
 6832257 6832258 BBta_0685 BBta_0686     TRUE 0.995 -3.000 0.680 NA N NA
 6832260 6832261 BBta_0688 BBta_0689     FALSE 0.276 148.000 0.057 NA   NA
 6832261 6832262 BBta_0689 BBta_0691     FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 6832262 6832263 BBta_0691 BBta_0692     FALSE 0.321 103.000 0.025 1.000   NA
 6832263 6832264 BBta_0692 BBta_0693     TRUE 0.897 11.000 0.182 NA   NA
 6832264 6832265 BBta_0693 BBta_0694     TRUE 0.623 63.000 0.227 NA   NA
 6832265 6832266 BBta_0694 BBta_0695     TRUE 0.987 -3.000 0.318 NA   NA
 6832266 6832267 BBta_0695 BBta_0696     TRUE 0.815 16.000 0.109 NA   NA
 6832267 6832268 BBta_0696 BBta_0697     TRUE 0.869 24.000 0.281 NA   NA
 6832273 6832274 BBta_0702 BBta_0703     TRUE 0.968 147.000 0.808 0.008 Y NA
 6832275 6832276 BBta_0704 BBta_0705   aapJ FALSE 0.002 939.000 0.000 1.000 N NA
 6832276 6832277 BBta_0705 BBta_0706 aapJ   TRUE 0.498 67.000 0.140 NA   NA
 6832277 6832278 BBta_0706 BBta_0707     FALSE 0.031 241.000 0.000 NA   NA
 6832278 6832279 BBta_0707 BBta_0708     TRUE 0.998 -3.000 0.324 0.080 Y NA
 6832279 6832280 BBta_0708 BBta_0709     FALSE 0.009 365.000 0.000 1.000 N NA
 6832280 6832281 BBta_0709 BBta_0710     TRUE 0.596 220.000 0.150 0.094 Y NA
 6832281 6832282 BBta_0710 BBta_0711     TRUE 0.999 -3.000 0.414 0.023 Y NA
 6832282 6832283 BBta_0711 BBta_0712     TRUE 0.997 -30.000 0.310 0.014 Y NA
 6832284 6832285 BBta_0714 BBta_0715     TRUE 0.926 0.000 0.019 NA   NA
 6832285 6832286 BBta_0715 BBta_0716     FALSE 0.036 231.000 0.000 NA   NA
 6832286 6832287 BBta_0716 BBta_0717     TRUE 0.936 148.000 0.556 0.077 Y NA
 6832287 6832288 BBta_0717 BBta_0718     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.077 Y NA
 6832288 6832289 BBta_0718 BBta_0719     TRUE 0.843 142.000 0.818 1.000   NA
 6832289 6832290 BBta_0719 BBta_0720     TRUE 0.936 13.000 0.333 NA   NA
 6832290 6832291 BBta_0720 BBta_0721     TRUE 0.940 -16.000 0.054 NA   NA
 6832291 6832292 BBta_0721 BBta_0722     TRUE 0.965 -19.000 0.189 NA   NA
 6832292 6832293 BBta_0722 BBta_0723     TRUE 0.966 4.000 0.300 NA   NA
 6832294 6832295 BBta_0724 BBta_0726     FALSE 0.163 121.000 0.000 1.000 N NA
 6832295 6832296 BBta_0726 BBta_0727     TRUE 0.656 113.000 0.400 NA   NA
 6832296 6832297 BBta_0727 BBta_0728     FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 6832298 6832299 BBta_0729 BBta_0730   fdxB TRUE 0.975 9.000 0.385 0.080 N NA
 6832299 6832300 BBta_0730 BBta_0731 fdxB   TRUE 0.784 52.000 0.385 NA N NA
 6832300 6832301 BBta_0731 BBta_0732     FALSE 0.066 399.000 0.000 NA Y NA
 6832301 6832302 BBta_0732 BBta_0733     TRUE 0.898 143.000 0.500 NA Y NA
 6832302 6832303 BBta_0733 BBta_0734     TRUE 0.997 -3.000 0.130 0.077 Y NA
 6832303 6832304 BBta_0734 BBta_0735     TRUE 0.994 -7.000 0.174 1.000 Y NA
 6832304 6832305 BBta_0735 BBta_0736     TRUE 0.996 17.000 0.800 0.039 Y NA
 6832305 6832306 BBta_0736 BBta_0737     FALSE 0.010 334.000 0.000 NA   NA
 6832308 6832309 BBta_miscRNA9 BBta_0739     FALSE 0.194 76.000 0.000 NA   NA
 6832311 6832312 BBta_0741 BBta_0742     TRUE 0.999 0.000 0.797 1.000 Y NA
 6832312 6832313 BBta_0742 BBta_0743     TRUE 0.632 42.000 0.105 1.000 N NA
 6832313 6832314 BBta_0743 BBta_0744     FALSE 0.389 141.000 0.162 NA   NA
 6832314 6832315 BBta_0744 BBta_0745     FALSE 0.190 78.000 0.000 NA   NA
 6832317 6832318 BBta_0747 BBta_0748     TRUE 0.752 121.000 0.095 NA Y NA
 6832318 6832319 BBta_0748 BBta_0749     TRUE 0.744 115.000 0.063 NA Y NA
 6832319 6832320 BBta_0749 BBta_0750   boxB TRUE 0.886 132.000 1.000 1.000   NA
 6832321 6832322 BBta_0751 BBta_0752     TRUE 0.526 110.000 0.240 1.000 N NA
 6832323 6832324 BBta_0753 BBta_0754     TRUE 0.991 5.000 0.846 NA   NA
 6832324 6832325 BBta_0754 BBta_0756     FALSE 0.029 485.000 0.286 NA   NA
 6832325 6832326 BBta_0756 BBta_0757   phoR TRUE 0.754 30.000 0.167 NA   NA
 6832328 6832329 BBta_0759 BBta_0760 argD argF TRUE 0.978 9.000 0.058 1.000 Y NA
 6832329 6832330 BBta_0760 BBta_0761 argF hslO FALSE 0.026 335.000 0.052 1.000 N NA
 6832330 6832331 BBta_0761 BBta_0762 hslO   FALSE 0.076 190.000 0.000 NA   NA
 6832331 6832332 BBta_0762 BBta_0763     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 6832334 6832335 BBta_0765 BBta_0766     TRUE 0.991 0.000 0.538 NA   NA
 6832335 6832336 BBta_0766 BBta_0767     TRUE 0.965 15.000 0.583 1.000   NA
 6832341 6832342 BBta_0772 BBta_0773     TRUE 0.827 39.000 0.333 NA   NA
 6832342 6832343 BBta_0773 BBta_0774     TRUE 0.641 53.000 0.200 NA   NA
 6832343 6832344 BBta_0774 BBta_0775   ogt2 TRUE 0.709 77.000 0.375 1.000 N NA
 6832344 6832345 BBta_0775 BBta_0776 ogt2   FALSE 0.058 205.000 0.000 NA   NA
 6832346 6832347 BBta_tRNA7 BBta_0777   idnO FALSE 0.063 201.000 0.000 NA   NA
 6832348 6832349 BBta_0778 BBta_0779     FALSE 0.032 247.000 0.000 1.000 N NA
 6832349 6832350 BBta_0779 BBta_0780     FALSE 0.069 197.000 0.000 NA   NA
 6832351 6832352 BBta_0781 BBta_0784     FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 6832352 6832353 BBta_0784 BBta_0785     FALSE 0.144 134.000 0.000 NA   NA
 6832353 6832354 BBta_0785 BBta_0786     FALSE 0.129 148.000 0.000 NA   NA
 6832354 6832355 BBta_0786 BBta_0787     TRUE 0.763 22.000 0.095 NA   NA
 6832355 6832356 BBta_0787 BBta_0788     FALSE 0.362 98.000 0.048 1.000   NA
 6832356 6832357 BBta_0788 BBta_0789     FALSE 0.025 266.000 0.000 1.000 N NA
 6832357 6832358 BBta_0789 BBta_0790   lysK FALSE 0.203 82.000 0.000 1.000 N NA
 6832360 6832361 BBta_0792 BBta_0793   pyrD TRUE 0.969 -3.000 0.108 NA   NA
 6832364 6832365 BBta_0796 BBta_0797     TRUE 0.816 14.000 0.071 NA   NA
 6832365 6832366 BBta_0797 BBta_0798     FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 6832366 6832367 BBta_0798 BBta_0799     TRUE 0.996 -3.000 0.751 1.000 N NA
 6832368 6832369 BBta_0800 BBta_0801     FALSE 0.351 109.000 0.081 NA   NA
 6832369 6832370 BBta_0801 BBta_0802     FALSE 0.082 219.000 0.020 NA   NA
 6832370 6832371 BBta_0802 BBta_0803     TRUE 0.948 17.000 0.460 1.000   NA
 6832374 6832375 BBta_0806 BBta_0807     TRUE 0.985 -3.000 0.274 NA   NA
 6832375 6832376 BBta_0807 BBta_0808     FALSE 0.089 180.000 0.000 NA   NA
 6832376 6832377 BBta_0808 BBta_0809     TRUE 0.997 -3.000 0.900 NA N NA
 6832377 6832378 BBta_0809 BBta_0810     TRUE 0.750 8.000 0.000 1.000 N NA
 6832378 6832379 BBta_0810 BBta_0811     FALSE 0.122 153.000 0.000 NA   NA
 6832379 6832380 BBta_0811 BBta_0812     FALSE 0.117 157.000 0.000 NA   NA
 6832380 6832381 BBta_0812 BBta_0813     FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   NA
 6832382 6832383 BBta_0814 BBta_0815     FALSE 0.332 130.000 0.080 NA   NA
 6832383 6832384 BBta_0815 BBta_0816     TRUE 0.866 84.000 0.247 1.000 Y NA
 6832384 6832385 BBta_0816 BBta_0817     TRUE 0.587 272.000 0.562 1.000 Y NA
 6832387 6832388 BBta_0819 BBta_0820   gshA FALSE 0.380 97.000 0.082 1.000 N NA
 6832388 6832389 BBta_0820 BBta_0821 gshA   FALSE 0.054 285.000 0.057 1.000   NA
 6832390 6832391 BBta_0822 BBta_0823     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 6832391 6832392 BBta_0823 BBta_0824   lepB1 FALSE 0.374 37.000 0.000 NA   NA
 6832392 6832393 BBta_0824 BBta_0825 lepB1 tldD TRUE 0.948 -3.000 0.018 NA   NA
 6832396 6832397 BBta_0828 BBta_0829 coxB coxA TRUE 0.982 68.000 0.741 0.001 Y NA
 6832397 6832398 BBta_0829 BBta_0830 coxA coxE TRUE 0.575 129.000 0.153 0.054 N NA
 6832398 6832399 BBta_0830 BBta_0831 coxE coxF TRUE 0.698 21.000 0.033 NA   NA
 6832399 6832400 BBta_0831 BBta_0832 coxF coxG TRUE 0.672 27.000 0.046 NA   NA
 6832400 6832401 BBta_0832 BBta_0833 coxG coxC TRUE 0.777 88.000 0.536 1.000 N NA
 6832401 6832402 BBta_0833 BBta_0834 coxC   FALSE 0.382 109.000 0.122 NA   NA
 6832402 6832403 BBta_0834 BBta_0835     FALSE 0.054 329.000 0.220 NA   NA
 6832403 6832404 BBta_0835 BBta_0836     FALSE 0.480 72.000 0.143 NA   NA
 6832404 6832405 BBta_0836 BBta_0837     TRUE 0.769 26.000 0.099 1.000   NA
 6832407 6832408 BBta_0839 BBta_0840 thrC   TRUE 0.964 0.000 0.129 1.000   NA
 6832408 6832409 BBta_0840 BBta_0841     TRUE 0.828 102.000 0.674 1.000   NA
 6832409 6832410 BBta_0841 BBta_0842     FALSE 0.205 194.000 0.120 NA   NA
 6832411 6832412 BBta_0843 BBta_0844 atpF atpB' TRUE 0.999 0.000 0.863 0.003 Y NA
 6832412 6832413 BBta_0844 BBta_0845 atpB'   TRUE 0.931 29.000 0.278 0.003   NA
 6832413 6832414 BBta_0845 BBta_0846   atpB TRUE 0.955 41.000 0.628 0.003   NA
 6832414 6832415 BBta_0846 BBta_0847 atpB   FALSE 0.172 89.000 0.000 NA   NA
 6832416 6832417 BBta_0848 BBta_0849     TRUE 0.551 103.000 0.267 NA   NA
 6832417 6832418 BBta_0849 BBta_0850     TRUE 0.625 25.000 0.015 NA   NA
 6832420 6832421 BBta_0852 BBta_0853     FALSE 0.023 944.000 0.000 NA Y NA
 6832421 6832422 BBta_0853 BBta_0854     TRUE 0.989 0.000 0.478 NA   NA
 6832422 6832423 BBta_0854 BBta_0855     TRUE 0.851 47.000 0.474 NA   NA
 6832423 6832424 BBta_0855 BBta_0856     TRUE 0.592 15.000 0.000 NA   NA
 6832424 6832425 BBta_0856 BBta_0857     FALSE 0.144 126.000 0.000 NA   NA
 6832426 6832427 BBta_0858 BBta_0859     TRUE 0.868 0.000 0.000 NA   NA
 6832427 6832428 BBta_0859 BBta_0860     FALSE 0.096 233.000 0.000 0.093 N NA
 6832428 6832429 BBta_0860 BBta_0861   hemA FALSE 0.107 240.000 0.133 1.000 N NA
 6832429 6832430 BBta_0861 BBta_0862 hemA   FALSE 0.033 236.000 0.000 NA   NA
 6832430 6832431 BBta_0862 BBta_0863     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 6832431 6832432 BBta_0863 BBta_0864     TRUE 0.521 75.000 0.000 0.020   NA
 6832432 6832433 BBta_0864 BBta_0865     FALSE 0.428 160.000 0.214 1.000   NA
 6832433 6832434 BBta_0865 BBta_0866     FALSE 0.038 236.000 0.000 1.000 N NA
 6832434 6832435 BBta_0866 BBta_0867     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 6832436 6832437 BBta_0868 BBta_0869     TRUE 0.955 192.000 1.000 0.016 Y NA
 6832438 6832439 BBta_0870 BBta_0871     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.002 Y NA
 6832439 6832440 BBta_0871 BBta_0872     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.079 Y NA
 6832445 6832446 BBta_0877 BBta_0878     FALSE 0.048 464.000 0.444 NA N NA
 6832448 6832449 BBta_0880 BBta_0881     TRUE 0.606 62.000 0.200 1.000 N NA
 6832450 6832451 BBta_0882 BBta_0883     TRUE 0.829 63.000 0.500 1.000   NA
 6832452 6832453 BBta_0884 BBta_0885 rbtD   FALSE 0.192 126.000 0.000 1.000   NA
 6832455 6832456 BBta_0888 BBta_0889     TRUE 0.689 10.000 0.000 NA   NA
 6832456 6832457 BBta_0889 BBta_0892   poxB FALSE 0.002 881.000 0.000 NA   NA
 6832459 6832460 BBta_0893 BBta_0894     FALSE 0.479 25.000 0.000 NA   NA
 6832460 6832461 BBta_0894 BBta_0895   murA FALSE 0.220 142.000 0.004 1.000 N NA
 6832461 6832462 BBta_0895 BBta_0896 murA   TRUE 0.767 25.000 0.138 NA   NA
 6832462 6832463 BBta_0896 BBta_0897   hisD FALSE 0.380 95.000 0.096 NA   NA
 6832463 6832464 BBta_0897 BBta_0898 hisD   TRUE 0.974 -3.000 0.157 NA   NA
 6832464 6832465 BBta_0898 BBta_0899     TRUE 0.908 55.000 0.768 NA   NA
 6832465 6832466 BBta_0899 BBta_0900     FALSE 0.125 181.000 0.013 NA N NA
 6832466 6832467 BBta_0900 BBta_0901     TRUE 0.540 54.000 0.102 NA   NA
 6832467 6832468 BBta_0901 BBta_tRNA8     FALSE 0.094 175.000 0.000 NA   NA
 6832468 6832469 BBta_tRNA8 BBta_0902     FALSE 0.002 781.000 0.000 NA   NA
 6832470 6832471 BBta_0904 BBta_0905     FALSE 0.298 63.000 0.000 1.000   NA
 6832472 6832473 BBta_0906 BBta_0907 aqpZ   FALSE 0.146 120.000 0.000 NA   NA
 6832474 6832475 BBta_0908 BBta_0909 ubiG   TRUE 0.565 29.000 0.006 NA   NA
 6832475 6832476 BBta_0909 BBta_0910     TRUE 0.975 -3.000 0.167 NA   NA
 6832476 6832477 BBta_0910 BBta_0911     FALSE 0.419 112.000 0.167 NA   NA
 6832477 6832478 BBta_0911 BBta_0912     FALSE 0.366 150.000 0.167 NA   NA
 6832478 6832479 BBta_0912 BBta_0913     TRUE 0.590 132.000 0.333 NA   NA
 6832480 6832481 BBta_0914 BBta_0915     FALSE 0.270 205.000 0.236 1.000 N NA
 6832481 6832482 BBta_0915 BBta_0916     FALSE 0.146 555.000 0.306 0.076 Y NA
 6832482 6832483 BBta_0916 BBta_0917     TRUE 0.998 5.000 0.918 0.076 Y NA
 6832483 6832484 BBta_0917 BBta_0918     TRUE 0.987 19.000 0.373 0.076 Y NA
 6832484 6832485 BBta_0918 BBta_0919     TRUE 0.564 48.000 0.070 1.000 N NA
 6832485 6832486 BBta_0919 BBta_0920     TRUE 0.679 31.000 0.061 1.000 N NA
 6832486 6832487 BBta_0920 BBta_0921     TRUE 0.949 0.000 0.061 1.000 N NA
 6832487 6832488 BBta_0921 BBta_0922   glgC TRUE 0.691 149.000 0.016 1.000 Y NA
 6832488 6832489 BBta_0922 BBta_0923 glgC glgA TRUE 0.995 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 6832493 6832494 BBta_0928 BBta_0929     TRUE 0.798 24.000 0.158 1.000 N NA
 6832495 6832496 BBta_0930 BBta_0931     TRUE 0.880 2.000 0.000 1.000   NA
 6832496 6832497 BBta_0931 BBta_0932     FALSE 0.176 166.000 0.031 NA N NA
 6832498 6832499 BBta_0933 BBta_0934     FALSE 0.469 26.000 0.000 NA   NA
 6832501 6832502 BBta_0936 BBta_0937     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 6832502 6832503 BBta_0937 BBta_0938     TRUE 0.706 153.000 0.588 NA   NA
 6832503 6832504 BBta_0938 BBta_0939     TRUE 0.991 -3.000 0.433 NA   NA
 6832504 6832505 BBta_0939 BBta_0940     TRUE 0.695 21.000 0.031 NA   NA
 6832507 6832508 BBta_0942 BBta_0943     FALSE 0.042 243.000 0.000 1.000   NA
 6832510 6832511 BBta_0945 BBta_0946     FALSE 0.160 183.000 0.028 NA   NA
 6832513 6832514 BBta_0948 BBta_0949 ispH thrB FALSE 0.479 160.000 0.251 1.000   NA
 6832514 6832515 BBta_0949 BBta_0950 thrB rnhA TRUE 0.974 -3.000 0.104 1.000   NA
 6832516 6832517 BBta_0951 BBta_0952   fadD FALSE 0.147 202.000 0.048 1.000 N NA
 6832517 6832518 BBta_0952 BBta_0953 fadD   FALSE 0.200 200.000 0.125 1.000 N NA
 6832518 6832519 BBta_0953 BBta_0954     FALSE 0.328 175.000 0.188 1.000 N NA
 6832519 6832520 BBta_0954 BBta_0955     TRUE 0.586 88.000 0.143 0.087 N NA
 6832521 6832522 BBta_0956 BBta_0957     FALSE 0.234 104.000 0.007 NA   NA
 6832522 6832523 BBta_0957 BBta_0958     FALSE 0.285 90.000 0.021 NA   NA
 6832523 6832524 BBta_0958 BBta_0959     TRUE 0.945 0.000 0.059 NA   NA
 6832524 6832525 BBta_0959 BBta_0960     FALSE 0.287 158.000 0.093 NA   NA
 6832526 6832527 BBta_0961 BBta_0962     FALSE 0.135 303.000 0.000 NA Y NA
 6832527 6832528 BBta_0962 BBta_0963     TRUE 0.642 140.000 0.000 NA Y NA
 6832528 6832529 BBta_0963 BBta_0964     TRUE 0.885 107.000 1.000 NA   NA
 6832530 6832531 BBta_0965 BBta_0966 minC minD TRUE 0.984 20.000 0.466 1.000 Y NA
 6832531 6832532 BBta_0966 BBta_0967 minD minE TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 6832532 6832533 BBta_0967 BBta_0968 minE   TRUE 0.858 4.000 0.005 NA   NA
 6832535 6832536 BBta_0970 BBta_0971     FALSE 0.003 616.000 0.000 NA   NA
 6832538 6832539 BBta_0973 BBta_0974     FALSE 0.242 60.000 0.000 NA   NA
 6832539 6832540 BBta_0974 BBta_0975     FALSE 0.396 85.000 0.091 NA   NA
 6832540 6832541 BBta_0975 BBta_0976     TRUE 0.668 182.000 0.667 NA   NA
 6832542 6832543 BBta_0977 BBta_0978     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 6832544 6832545 BBta_0979 BBta_0980 nadE   FALSE 0.025 254.000 0.000 NA   NA
 6832547 6832548 BBta_0982 BBta_0983     FALSE 0.102 168.000 0.000 NA   NA
 6832548 6832549 BBta_0983 BBta_0984     FALSE 0.365 113.000 0.105 NA   NA
 6832550 6832551 BBta_0985 BBta_0986     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 6832552 6832553 BBta_0987 BBta_0988     FALSE 0.341 41.000 0.000 NA   NA
 6832553 6832554 BBta_0988 BBta_0989     FALSE 0.034 235.000 0.000 NA   NA
 6832555 6832556 BBta_0990 BBta_0991     FALSE 0.119 155.000 0.000 NA   NA
 6832557 6832558 BBta_0992 BBta_0993     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 6832558 6832559 BBta_0993 BBta_0994     FALSE 0.254 57.000 0.000 NA   NA
 6832561 6832562 BBta_0996 BBta_0997     FALSE 0.011 341.000 0.000 1.000 N NA
 6832564 6832565 BBta_0999 BBta_1000     TRUE 0.868 0.000 0.000 NA   NA
 6832566 6832567 BBta_1001 BBta_1002     FALSE 0.426 31.000 0.000 NA   NA
 6832567 6832568 BBta_1002 BBta_1003     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 6832568 6832569 BBta_1003 BBta_1004     TRUE 0.822 91.000 0.000 0.015 Y NA
 6832569 6832570 BBta_1004 BBta_1005     TRUE 0.959 2.000 0.193 NA   NA
 6832570 6832571 BBta_1005 BBta_1006     TRUE 0.955 -7.000 0.070 NA   NA
 6832571 6832572 BBta_1006 BBta_1007     TRUE 0.863 22.000 0.250 NA   NA
 6832572 6832573 BBta_1007 BBta_1008     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832574 6832575 BBta_1009 BBta_1010     TRUE 0.681 154.000 0.045 NA Y NA
 6832575 6832576 BBta_1010 BBta_1011     TRUE 0.762 7.000 0.000 1.000 N NA
 6832577 6832578 BBta_1012 BBta_1013     FALSE 0.456 96.000 0.182 NA   NA
 6832578 6832579 BBta_1013 BBta_1014     FALSE 0.258 182.000 0.130 1.000 N NA
 6832580 6832581 BBta_1015 BBta_1016     FALSE 0.464 66.000 0.074 1.000 N NA
 6832582 6832583 BBta_1017 BBta_1018     FALSE 0.292 130.000 0.050 NA   NA
 6832584 6832585 BBta_1019 BBta_1020     TRUE 0.924 64.000 1.000 NA   NA
 6832585 6832586 BBta_1020 BBta_1021     FALSE 0.008 368.000 0.000 NA   NA
 6832587 6832588 BBta_1022 BBta_1023     FALSE 0.115 158.000 0.000 NA   NA
 6832590 6832591 BBta_1026 BBta_1027     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 6832592 6832593 BBta_1028 BBta_1029     TRUE 0.554 50.000 0.087 NA   NA
 6832594 6832595 BBta_1030 BBta_1031     FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 6832595 6832596 BBta_1031 BBta_1032     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 6832596 6832597 BBta_1032 BBta_1033     FALSE 0.002 1062.000 0.000 NA   NA
 6832597 6832598 BBta_1033 BBta_1034     TRUE 0.852 51.000 0.500 NA   NA
 6832598 6832599 BBta_1034 BBta_1035     TRUE 0.923 39.000 0.667 NA   NA
 6832602 6832603 BBta_1038 BBta_1039     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 6832603 6832604 BBta_1039 BBta_1040     FALSE 0.173 88.000 0.000 NA   NA
 6832604 6832605 BBta_1040 BBta_1041     FALSE 0.063 201.000 0.000 NA   NA
 6832605 6832606 BBta_1041 BBta_1042     FALSE 0.314 45.000 0.000 NA   NA
 6832606 6832607 BBta_1042 BBta_1043     FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 6832607 6832608 BBta_1043 BBta_1044     FALSE 0.144 133.000 0.000 NA   NA
 6832610 6832611 BBta_1046 BBta_1048     FALSE 0.031 241.000 0.000 NA   NA
 6832611 6832612 BBta_1048 BBta_1049     TRUE 0.700 102.000 0.457 NA   NA
 6832612 6832613 BBta_1049 BBta_1050     TRUE 0.964 -3.000 0.065 NA   NA
 6832613 6832614 BBta_1050 BBta_1051     FALSE 0.151 114.000 0.000 NA   NA
 6832616 6832617 BBta_1054 BBta_1055     FALSE 0.139 142.000 0.000 NA   NA
 6832617 6832618 BBta_1055 BBta_1056     FALSE 0.296 49.000 0.000 NA   NA
 6832618 6832619 BBta_1056 BBta_1057     FALSE 0.021 270.000 0.000 NA   NA
 6832620 6832621 BBta_1059 BBta_1060     FALSE 0.095 174.000 0.000 NA   NA
 6832621 6832622 BBta_1060 BBta_1061     FALSE 0.164 95.000 0.000 NA   NA
 6832622 6832623 BBta_1061 BBta_1062     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 6832627 6832628 BBta_1066 BBta_1067     FALSE 0.341 41.000 0.000 NA   NA
 6832628 6832629 BBta_1067 BBta_1068     FALSE 0.479 25.000 0.000 NA   NA
 6832630 6832631 BBta_1069 BBta_1070   rfbC FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 6832631 6832632 BBta_1070 BBta_1071 rfbC rfbB TRUE 0.997 -3.000 0.337 1.000 Y NA
 6832632 6832633 BBta_1071 BBta_1072 rfbB rfbD TRUE 0.990 4.000 0.000 0.003 Y NA
 6832633 6832634 BBta_1072 BBta_1073 rfbD rfbA TRUE 0.983 9.000 0.000 0.004 Y NA
 6832634 6832635 BBta_1073 BBta_1074 rfbA   FALSE 0.069 411.000 0.000 1.000 Y NA
 6832635 6832636 BBta_1074 BBta_1075     TRUE 0.797 55.000 0.000 NA Y NA
 6832636 6832637 BBta_1075 BBta_1076     FALSE 0.264 55.000 0.000 NA   NA
 6832637 6832638 BBta_1076 BBta_1077     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832640 6832641 BBta_1079 BBta_1080     FALSE 0.190 78.000 0.000 NA   NA
 6832641 6832642 BBta_1080 BBta_1082     FALSE 0.004 501.000 0.000 1.000 N NA
 6832642 6832643 BBta_1082 BBta_1084     FALSE 0.002 914.000 0.000 NA   NA
 6832643 6832644 BBta_1084 BBta_1085     FALSE 0.037 230.000 0.000 NA   NA
 6832644 6832645 BBta_1085 BBta_1086     TRUE 0.796 84.000 0.059 1.000 Y NA
 6832645 6832646 BBta_1086 BBta_1087     TRUE 0.863 56.000 0.059 1.000 Y NA
 6832646 6832647 BBta_1087 BBta_1088     TRUE 0.997 3.000 0.286 0.002 Y NA
 6832647 6832648 BBta_1088 BBta_1089     TRUE 0.995 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 6832648 6832649 BBta_1089 BBta_1090     TRUE 0.971 2.000 0.250 1.000 N NA
 6832649 6832650 BBta_1090 BBta_1091     FALSE 0.496 27.000 0.000 1.000 N NA
 6832650 6832651 BBta_1091 BBta_1092     FALSE 0.397 75.000 0.091 NA N NA
 6832651 6832652 BBta_1092 BBta_1093   pvdA TRUE 0.832 14.000 0.136 NA N NA
 6832652 6832653 BBta_1093 BBta_1094 pvdA   FALSE 0.074 192.000 0.000 NA   NA
 6832656 6832657 BBta_1096 BBta_1097     FALSE 0.336 93.000 0.056 NA   NA
 6832658 6832659 BBta_1098 BBta_1099     FALSE 0.150 115.000 0.000 NA   NA
 6832659 6832660 BBta_1099 BBta_1100     TRUE 0.982 -3.000 0.231 NA   NA
 6832660 6832661 BBta_1100 BBta_1101     FALSE 0.309 46.000 0.000 NA   NA
 6832661 6832662 BBta_1101 BBta_1102     TRUE 0.780 33.000 0.182 1.000   NA
 6832663 6832664 BBta_1103 BBta_1104     FALSE 0.381 91.000 0.087 NA   NA
 6832664 6832665 BBta_1104 BBta_1105     TRUE 0.992 5.000 0.917 NA   NA
 6832665 6832666 BBta_1105 BBta_1106     FALSE 0.121 154.000 0.000 NA   NA
 6832666 6832667 BBta_1106 BBta_1107     FALSE 0.016 290.000 0.000 NA   NA
 6832667 6832668 BBta_1107 BBta_1108     FALSE 0.219 159.000 0.034 NA   NA
 6832668 6832669 BBta_1108 BBta_1109     TRUE 0.982 -16.000 0.333 NA   NA
 6832669 6832670 BBta_1109 BBta_1110     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 6832670 6832671 BBta_1110 BBta_1111     TRUE 0.970 -3.000 0.118 NA   NA
 6832671 6832672 BBta_1111 BBta_1112     FALSE 0.396 69.000 0.039 1.000 N NA
 6832672 6832673 BBta_1112 BBta_1113     FALSE 0.465 71.000 0.100 1.000 N NA
 6832674 6832675 BBta_1114 BBta_1115   tynA TRUE 0.843 -66.000 0.000 NA   NA
 6832676 6832677 BBta_1117 BBta_1118     TRUE 0.572 161.000 0.400 NA   NA
 6832680 6832681 BBta_1121 BBta_1122     FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 6832682 6832683 BBta_1123 BBta_1124     FALSE 0.075 172.000 0.000 NA N NA
 6832683 6832684 BBta_1124 BBta_1125     TRUE 0.986 -3.000 0.303 NA   NA
 6832687 6832688 BBta_1128 BBta_1129 ycdM   TRUE 0.880 -3.000 0.000 NA N NA
 6832688 6832689 BBta_1129 BBta_1130     FALSE 0.490 95.000 0.043 0.085 N NA
 6832690 6832691 BBta_1131 BBta_1132     FALSE 0.045 218.000 0.000 NA   NA
 6832691 6832692 BBta_1132 BBta_1133     FALSE 0.385 69.000 0.044 NA   NA
 6832692 6832693 BBta_1133 BBta_1134     FALSE 0.239 105.000 0.009 NA   NA
 6832694 6832695 BBta_1135 BBta_1136     FALSE 0.009 535.000 0.022 1.000   NA
 6832697 6832698 BBta_1138 BBta_1139     TRUE 0.818 19.000 0.156 NA   NA
 6832698 6832699 BBta_1139 BBta_1140   etfB FALSE 0.308 118.000 0.028 1.000   NA
 6832699 6832700 BBta_1140 BBta_1141 etfB etfA TRUE 0.997 0.000 0.242 0.021 Y NA
 6832700 6832701 BBta_1141 BBta_1142 etfA hbdA FALSE 0.385 99.000 0.092 1.000 N NA
 6832701 6832702 BBta_1142 BBta_1143 hbdA   FALSE 0.286 86.000 0.018 NA   NA
 6832704 6832705 BBta_1145 BBta_1146 argH   FALSE 0.178 84.000 0.000 NA   NA
 6832705 6832706 BBta_1146 BBta_1147   lysA FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 6832707 6832708 BBta_1148 BBta_1149     TRUE 0.551 18.000 0.000 NA   NA
 6832709 6832710 BBta_1150 BBta_1151   argC FALSE 0.201 83.000 0.000 1.000 N NA
 6832711 6832712 BBta_1152 BBta_1153     FALSE 0.210 102.000 0.000 1.000   NA
 6832713 6832714 BBta_1154 BBta_1155     FALSE 0.259 74.000 0.000 1.000   NA
 6832715 6832716 BBta_1156 BBta_1157 vsr   TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832716 6832717 BBta_1157 BBta_1158     TRUE 0.851 -31.000 0.000 NA   NA
 6832717 6832718 BBta_1158 BBta_1159     TRUE 0.968 -3.000 0.079 1.000 N NA
 6832722 6832723 BBta_1164 BBta_1165     FALSE 0.452 28.000 0.000 NA   NA
 6832724 6832725 BBta_1166 BBta_1167     TRUE 0.504 26.000 0.000 1.000 N NA
 6832725 6832726 BBta_1167 BBta_1168     FALSE 0.210 79.000 0.000 1.000 N NA
 6832726 6832727 BBta_1168 BBta_1169     TRUE 0.997 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 6832727 6832728 BBta_1169 BBta_1170     TRUE 0.989 19.000 0.667 NA Y NA
 6832728 6832729 BBta_1170 BBta_1171     TRUE 0.561 42.000 0.077 NA N NA
 6832729 6832730 BBta_1171 BBta_1172     TRUE 0.697 65.000 0.192 0.085 N NA
 6832731 6832732 BBta_1174 BBta_1175     TRUE 0.534 55.000 0.104 NA   NA
 6832733 6832734 BBta_1176 BBta_1177 ftsE ftsX TRUE 0.990 2.000 0.139 NA Y NA
 6832734 6832735 BBta_1177 BBta_1178 ftsX   FALSE 0.136 305.000 0.417 NA   NA
 6832735 6832736 BBta_1178 BBta_1179     TRUE 0.912 13.000 0.250 NA   NA
 6832739 6832740 BBta_1182 BBta_1183 tyrC hisC TRUE 0.996 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 6832740 6832741 BBta_1183 BBta_1184 hisC   TRUE 0.918 38.000 0.084 1.000 Y NA
 6832742 6832743 BBta_1186 BBta_1187 metX   TRUE 0.982 4.000 0.509 NA N NA
 6832751 6832752 BBta_rRNA16S1 BBta_tRNA9     FALSE 0.036 231.000 0.000 NA   NA
 6832752 6832753 BBta_tRNA9 BBta_tRNA10     FALSE 0.136 144.000 0.000 NA   NA
 6832753 6832754 BBta_tRNA10 BBta_rRNA23S1     FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 6832754 10702155 BBta_rRNA23S1 BBta_miscRNA8     TRUE 0.834 -170.000 0.000 NA   NA
 10702155 6832755 BBta_miscRNA8 BBta_rRNA5S1     FALSE 0.002 2785.000 0.000 NA   NA
 6832755 6832756 BBta_rRNA5S1 BBta_1200     FALSE 0.032 239.000 0.000 NA   NA
 6832757 6832758 BBta_1201 BBta_1202     FALSE 0.173 205.000 0.125 NA   NA
 6832758 6832759 BBta_1202 BBta_1203     TRUE 0.518 73.000 0.182 NA   NA
 6832761 6832762 BBta_1205 BBta_1206     TRUE 0.696 34.000 0.070 1.000   NA
 6832762 6832763 BBta_1206 BBta_1207     FALSE 0.393 125.000 0.140 1.000 N NA
 6832763 6832764 BBta_1207 BBta_1208     TRUE 0.727 78.000 0.385 1.000   NA
 6832766 6832767 BBta_1210 BBta_1211     FALSE 0.263 127.000 0.007 1.000   NA
 6832769 6832770 BBta_1213 BBta_1214     TRUE 0.505 180.000 0.381 1.000 N NA
 6832771 6832772 BBta_tRNA11 BBta_1215     FALSE 0.034 235.000 0.000 NA   NA
 6832773 6832774 BBta_1217 BBta_1218     TRUE 0.877 -9.000 0.000 NA   NA
 6832776 6832777 BBta_1220 BBta_1221     FALSE 0.154 110.000 0.000 NA   NA
 6832777 6832778 BBta_1221 BBta_1222     FALSE 0.007 373.000 0.000 NA   NA
 6832778 6832779 BBta_1222 BBta_1223     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6832779 6832780 BBta_1223 BBta_1224     TRUE 0.956 52.000 0.500 NA Y NA
 6832780 6832781 BBta_1224 BBta_1225     FALSE 0.461 27.000 0.000 NA   NA
 6832781 6832782 BBta_1225 BBta_1226     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 6832782 6832783 BBta_1226 BBta_1227     FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 6832783 6832784 BBta_1227 BBta_1228     FALSE 0.383 36.000 0.000 NA   NA
 6832785 6832786 BBta_1229 BBta_1230     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6832786 6832787 BBta_1230 BBta_1231     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 6832787 6832788 BBta_1231 BBta_1232     FALSE 0.002 785.000 0.000 NA   NA
 6832788 6832789 BBta_1232 BBta_1233     FALSE 0.172 89.000 0.000 NA   NA
 6832791 6832792 BBta_1235 BBta_1236     FALSE 0.039 336.000 0.000 0.051   NA
 6832792 6832793 BBta_1236 BBta_1237     TRUE 0.838 -117.000 0.000 NA   NA
 6832794 6832795 BBta_1238 BBta_1239     TRUE 0.951 -3.000 0.024 NA   NA
 6832796 6832797 BBta_1240 BBta_1241     FALSE 0.251 77.000 0.000 1.000   NA
 6832800 6832801 BBta_1244 BBta_1245     FALSE 0.144 133.000 0.000 NA   NA
 6832801 6832802 BBta_1245 BBta_1246     FALSE 0.110 162.000 0.000 NA   NA
 6832802 6832803 BBta_1246 BBta_1247     TRUE 0.839 2.000 0.000 NA   NA
 6832805 6832806 BBta_1248 BBta_1249 aatB   TRUE 0.860 13.000 0.121 1.000 N NA
 6832806 6832807 BBta_1249 BBta_1250     TRUE 0.508 54.000 0.069 NA   NA
 6832808 6832809 BBta_1251 BBta_1252     TRUE 0.791 102.000 0.000 0.061 Y NA
 6832809 6832810 BBta_1252 BBta_1253     FALSE 0.093 185.000 0.000 1.000 N NA
 6832810 6832811 BBta_1253 BBta_1254     TRUE 0.965 13.000 0.027 1.000 Y NA
 6832811 6832812 BBta_1254 BBta_1255     TRUE 0.703 97.000 0.000 1.000 Y NA
 6832812 6832813 BBta_1255 BBta_1256     TRUE 0.726 80.000 0.429 NA   NA
 6832813 6832814 BBta_1256 BBta_1257     TRUE 0.958 6.000 0.308 NA   NA
 6832814 6832815 BBta_1257 BBta_1258     TRUE 0.994 10.000 0.615 1.000 Y NA
 6832815 6832816 BBta_1258 BBta_1259     TRUE 0.955 23.000 0.125 1.000 Y NA
 6832816 6832817 BBta_1259 BBta_1260     FALSE 0.068 540.000 0.125 1.000 Y NA
 6832818 6832819 BBta_1261 BBta_1262     TRUE 0.507 16.000 0.000 NA N NA
 6832819 6832820 BBta_1262 BBta_1263     TRUE 0.986 -3.000 0.286 1.000 N NA
 6832820 6832821 BBta_1263 BBta_1264     TRUE 0.990 9.000 0.357 1.000 Y NA
 6832821 6832822 BBta_1264 BBta_1265     TRUE 0.990 10.000 0.400 NA Y NA
 6832824 6832825 BBta_1267 BBta_1268     TRUE 0.977 4.000 0.217 0.046   NA
 6832825 6832826 BBta_1268 BBta_1269     TRUE 0.774 6.000 0.000 1.000 N NA
 6832826 6832827 BBta_1269 BBta_1270     TRUE 0.975 0.000 0.231 1.000 N NA
 6832827 6832828 BBta_1270 BBta_1271     TRUE 0.613 20.000 0.000 1.000   NA
 6832830 6832831 BBta_1273 BBta_1274     FALSE 0.061 203.000 0.000 NA   NA
 6832831 6832832 BBta_1274 BBta_1275     FALSE 0.013 310.000 0.000 NA   NA
 6832832 6832833 BBta_1275 BBta_1276     FALSE 0.037 252.000 0.000 1.000   NA
 6832833 6832834 BBta_1276 BBta_1277   gspD TRUE 0.993 -28.000 0.667 1.000   NA
 6832835 6832836 BBta_1278 BBta_1279 gspE gspF TRUE 0.993 9.000 0.500 1.000 Y NA
 6832836 6832837 BBta_1279 BBta_1280 gspF gspG TRUE 0.994 21.000 0.667 0.002 Y NA
 6832837 6832838 BBta_1280 BBta_1281 gspG   TRUE 0.976 -7.000 0.000 0.002   NA
 6832838 6832839 BBta_1281 BBta_1282     TRUE 0.882 -7.000 0.000 NA   NA
 6832839 6832840 BBta_1282 BBta_1283     TRUE 0.868 0.000 0.000 NA   NA
 6832840 6832841 BBta_1283 BBta_1284     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 6832841 6832842 BBta_1284 BBta_1285     TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
 6832842 6832843 BBta_1285 BBta_1286     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA   NA
 6832843 6832844 BBta_1286 BBta_1287     TRUE 0.675 114.000 0.429 NA   NA
 6832845 6832846 BBta_1288 BBta_1289     FALSE 0.296 49.000 0.000 NA   NA
 6832846 6832847 BBta_1289 BBta_1290     TRUE 0.982 -3.000 0.240 NA   NA
 6832847 6832848 BBta_1290 BBta_1291     TRUE 0.816 35.000 0.280 NA   NA
 6832848 6832849 BBta_1291 BBta_1292     TRUE 0.995 -3.000 0.640 NA   NA
 6832850 6832851 BBta_1293 BBta_1294     FALSE 0.320 117.000 0.065 NA   NA
 6832851 6832852 BBta_1294 BBta_1295     TRUE 0.699 171.000 0.667 NA   NA
 6832853 6832854 BBta_1296 BBta_1297     FALSE 0.125 151.000 0.000 NA   NA
 6832854 6832855 BBta_1297 BBta_1298     TRUE 0.995 -7.000 0.760 NA N NA
 6832856 6832857 BBta_1299 BBta_1300     TRUE 0.972 28.000 1.000 NA   NA
 6832857 6832858 BBta_1300 BBta_1301     TRUE 0.989 10.000 1.000 NA   NA
 6832858 6832859 BBta_1301 BBta_1303     FALSE 0.002 856.000 0.000 NA   NA
 6832859 6832860 BBta_1303 BBta_1304     TRUE 0.977 11.000 0.667 NA   NA
 6832860 6832861 BBta_1304 BBta_1305     FALSE 0.003 541.000 0.000 NA   NA
 6832861 6832862 BBta_1305 BBta_1306     FALSE 0.046 217.000 0.000 NA   NA
 6832863 6832864 BBta_1307 BBta_1308   exbD TRUE 0.974 27.000 1.000 1.000 N NA
 6832864 6832865 BBta_1308 BBta_1309 exbD   TRUE 0.999 4.000 1.000 0.085 Y NA
 6832867 6832868 BBta_1313 BBta_1314     TRUE 0.857 102.000 0.800 1.000   NA
 6832868 6832869 BBta_1314 BBta_1315   atzD FALSE 0.007 453.000 0.000 1.000   NA
 6832870 6832871 BBta_1316 BBta_1317     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 6832871 6832872 BBta_1317 BBta_1318     FALSE 0.145 123.000 0.000 NA   NA
 6832872 6832873 BBta_1318 BBta_1319     FALSE 0.246 137.000 0.022 NA   NA
 6832874 6832875 BBta_1320 BBta_1321     TRUE 0.708 124.000 0.500 NA   NA
 6832875 6832876 BBta_1321 BBta_1322     FALSE 0.020 272.000 0.000 NA   NA
 6832876 6832877 BBta_1322 BBta_1323     TRUE 0.974 -3.000 0.160 NA   NA
 6832877 6832878 BBta_1323 BBta_1324     TRUE 0.551 52.000 0.079 1.000 N NA
 6832879 6832880 BBta_1325 BBta_1326   htpG FALSE 0.234 69.000 0.000 1.000 N NA
 6832887 6832888 BBta_1333 BBta_1334     FALSE 0.043 221.000 0.000 NA   NA
 6832889 6832890 BBta_1335 BBta_1337 sodB crcB FALSE 0.098 196.000 0.011 NA N NA
 6832890 6832891 BBta_1337 BBta_1338 crcB   FALSE 0.372 67.000 0.033 NA   NA
 6832891 6832892 BBta_1338 BBta_1339     TRUE 0.921 3.000 0.058 NA   NA
 6832892 6832893 BBta_1339 BBta_1340     TRUE 0.998 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 6832893 6832894 BBta_1340 BBta_1341     TRUE 0.989 12.000 0.400 1.000 Y NA
 6832894 6832895 BBta_1341 BBta_1342     FALSE 0.412 86.000 0.112 NA   NA
 6832895 6832896 BBta_1342 BBta_1343     TRUE 0.960 0.000 0.141 NA   NA
 6832896 6832897 BBta_1343 BBta_1344     FALSE 0.303 85.000 0.026 NA   NA
 6832898 6832899 BBta_1345 BBta_1346 hss   FALSE 0.432 58.000 0.061 NA N NA
 6832899 6832900 BBta_1346 BBta_1348     FALSE 0.029 246.000 0.000 NA   NA
 6832900 6832901 BBta_1348 BBta_1349     FALSE 0.360 194.000 0.257 1.000   NA
 6832901 6832902 BBta_1349 BBta_1350     FALSE 0.003 677.000 0.000 NA   NA
 6832903 6832904 BBta_1351 BBta_1352 dcp   TRUE 0.773 19.000 0.077 NA   NA
 6832904 6832905 BBta_1352 BBta_1353     TRUE 0.991 -3.000 0.420 NA   NA
 6832906 6832907 BBta_1354 BBta_1355   shc FALSE 0.020 286.000 0.000 1.000 N NA
 6832907 6832908 BBta_1355 BBta_1356 shc   FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 6832909 6832910 BBta_1357 BBta_1359 hemH   FALSE 0.180 191.000 0.092 NA N NA
 6832910 6832911 BBta_1359 BBta_1360     TRUE 0.980 15.000 0.313 NA Y NA
 6832913 6832914 BBta_1362 BBta_1363 kpsF   FALSE 0.162 135.000 0.000 1.000 N NA
 6832914 6832915 BBta_1363 BBta_1364     TRUE 0.997 16.000 1.000 0.084 Y NA
 6832915 6832916 BBta_1364 BBta_1366     FALSE 0.028 847.000 0.000 1.000 Y NA
 6832916 6832917 BBta_1366 BBta_1367     FALSE 0.292 55.000 0.000 1.000 N NA
 6832917 6832918 BBta_1367 BBta_1368     TRUE 0.947 68.000 0.533 1.000 Y NA
 6832918 6832919 BBta_1368 BBta_1369     TRUE 0.999 -3.000 0.618 1.000 Y NA
 6832920 6832921 BBta_1370 BBta_1371 gltD gltB FALSE 0.305 375.000 0.236 0.001 Y NA
 6832924 6832925 BBta_1374 BBta_1375     FALSE 0.203 82.000 0.000 1.000 N NA
 6832926 6832927 BBta_1376 BBta_1377     FALSE 0.150 115.000 0.000 NA   NA
 6832930 6832931 BBta_1380 BBta_1381     TRUE 0.966 34.000 1.000 NA   NA
 6832932 6832933 BBta_1382 BBta_1383     FALSE 0.492 164.000 0.286 1.000   NA
 6832933 6832934 BBta_1383 BBta_1384     TRUE 0.967 115.000 0.667 0.002 Y NA
 6832938 6832939 BBta_1388 BBta_1389     FALSE 0.128 198.000 0.017 1.000 N NA
 6832939 6832940 BBta_1389 BBta_1390     FALSE 0.005 478.000 0.000 1.000 N NA
 6832941 6832942 BBta_1391 BBta_tRNA13     FALSE 0.147 118.000 0.000 NA   NA
 6832943 6832944 BBta_1392 BBta_1394     FALSE 0.004 517.000 0.000 NA   NA
 6832944 6832945 BBta_1394 BBta_1395     TRUE 0.873 -10.000 0.000 NA   NA
 6832948 6832949 BBta_1398 BBta_1399     FALSE 0.402 34.000 0.000 NA   NA
 6832949 6832950 BBta_1399 BBta_1400     FALSE 0.119 155.000 0.000 NA   NA
 6832951 6832952 BBta_1401 BBta_1402     FALSE 0.350 40.000 0.000 NA   NA
 6832953 6832954 BBta_1403 BBta_1404     FALSE 0.003 573.000 0.000 NA   NA
 6832954 6832955 BBta_1404 BBta_1405     FALSE 0.491 24.000 0.000 NA   NA
 6832955 6832956 BBta_1405 BBta_1406     FALSE 0.023 262.000 0.000 NA   NA
 6832957 6832958 BBta_1408 BBta_1409     TRUE 0.842 -73.000 0.000 NA   NA
 6832958 6832959 BBta_1409 BBta_1411   adc FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 6832959 6832960 BBta_1411 BBta_1412 adc   TRUE 0.922 37.000 0.600 1.000   NA
 6832960 6832961 BBta_1412 BBta_1413     FALSE 0.009 405.000 0.000 1.000   NA
 6832961 6832962 BBta_1413 BBta_1414     FALSE 0.114 159.000 0.000 NA   NA
 6832962 6832963 BBta_1414 BBta_1415     FALSE 0.032 239.000 0.000 NA   NA
 6832963 6832964 BBta_1415 BBta_1416     TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 6832965 6832966 BBta_1417 BBta_1419     FALSE 0.104 167.000 0.000 NA   NA
 6832966 6832967 BBta_1419 BBta_1420     TRUE 0.707 9.000 0.000 NA   NA
 6832969 6832970 BBta_1422 BBta_1423     TRUE 0.964 -3.000 0.095 NA N NA
 6832970 6832971 BBta_1423 BBta_1424     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.011 Y NA
 6832971 6832972 BBta_1424 BBta_1425     TRUE 0.992 -177.000 0.739 NA N NA
 6832972 6832973 BBta_1425 BBta_1427     FALSE 0.367 30.000 0.000 NA N NA
 6832973 6832974 BBta_1427 BBta_1428     FALSE 0.051 211.000 0.000 NA   NA
 6832974 6832975 BBta_1428 BBta_1430     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 6832976 6832977 BBta_1432 BBta_1433     FALSE 0.143 411.000 0.455 0.003   NA
 6832977 6832978 BBta_1433 BBta_1434     FALSE 0.452 458.000 0.697 0.003 Y NA
 6832978 6832979 BBta_1434 BBta_1435     TRUE 0.999 1.000 0.727 0.003 Y NA
 6832979 6832980 BBta_1435 BBta_1436     TRUE 0.998 10.000 0.818 0.003 Y NA
 6832980 6832981 BBta_1436 BBta_1438     FALSE 0.100 246.000 0.151 NA   NA
 6832981 6832982 BBta_1438 BBta_1439     TRUE 0.996 -3.000 0.671 NA   NA
 6832982 6832983 BBta_1439 BBta_1440   atpD TRUE 0.998 -3.000 0.129 0.003 Y NA
 6832983 6832984 BBta_1440 BBta_1442 atpD   FALSE 0.003 806.000 0.000 1.000 N NA
 6832985 6832986 BBta_1443 BBta_1444     TRUE 0.984 -3.000 0.261 NA   NA
 6832986 6832987 BBta_1444 BBta_1446     FALSE 0.003 681.000 0.000 NA   NA
 6832988 6832989 BBta_1447 BBta_1448     FALSE 0.003 688.000 0.000 NA   NA
 6832989 6832990 BBta_1448 BBta_1449     FALSE 0.383 36.000 0.000 NA   NA
 6832991 6832992 BBta_1451 BBta_1452 mgtA   FALSE 0.153 112.000 0.000 NA   NA
 6832994 6832995 BBta_1454 BBta_1455     TRUE 0.922 4.000 0.000 0.073 N NA
 6832995 6832996 BBta_1455 BBta_1456     TRUE 0.947 15.000 0.000 1.000 Y NA
 6832996 6832997 BBta_1456 BBta_1457     FALSE 0.193 130.000 0.000 1.000   NA
 6832997 6832998 BBta_1457 BBta_1458     TRUE 0.986 -3.000 0.080 0.050   NA
 6832998 6832999 BBta_1458 BBta_1459     FALSE 0.185 80.000 0.000 NA   NA
 6832999 6833000 BBta_1459 BBta_1460     FALSE 0.104 167.000 0.000 NA   NA
 6833000 6833001 BBta_1460 BBta_1461     FALSE 0.154 110.000 0.000 NA   NA
 6833002 6833003 BBta_1462 BBta_1463     TRUE 0.958 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6833006 6833007 BBta_1467 BBta_1468     FALSE 0.104 167.000 0.000 NA   NA
 6833007 6833008 BBta_1468 BBta_1469     FALSE 0.079 271.000 0.000 0.050   NA
 6833008 6833009 BBta_1469 BBta_1470     TRUE 0.970 -10.000 0.000 0.010   NA
 6833009 6833010 BBta_1470 BBta_1471     TRUE 0.947 4.000 0.000 0.010   NA
 6833010 6833011 BBta_1471 BBta_1472     TRUE 0.952 11.000 0.375 NA   NA
 6833011 6833012 BBta_1472 BBta_1473     FALSE 0.225 64.000 0.000 NA   NA
 6833012 6833013 BBta_1473 BBta_1474     FALSE 0.123 152.000 0.000 NA   NA
 6833013 6833014 BBta_1474 BBta_1475     FALSE 0.071 194.000 0.000 NA   NA
 6833014 6833015 BBta_1475 BBta_1476     FALSE 0.014 303.000 0.000 NA   NA
 6833016 6833017 BBta_1477 BBta_1478     TRUE 0.840 -88.000 0.000 NA   NA
 6833017 6833018 BBta_1478 BBta_1479     TRUE 0.829 -450.000 0.000 NA   NA
 6833021 6833022 BBta_1482 BBta_1483     FALSE 0.148 117.000 0.000 NA   NA
 6833022 6833023 BBta_1483 BBta_1484     FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 6833025 6833026 BBta_1486 BBta_1487     FALSE 0.022 266.000 0.000 NA   NA
 6833026 6833027 BBta_1487 BBta_1488     FALSE 0.144 133.000 0.000 NA   NA
 6833027 6833028 BBta_1488 BBta_1489     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6833030 6833031 BBta_1491 BBta_1492     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 6833031 6833032 BBta_1492 BBta_1493     TRUE 0.984 -36.000 0.000 NA Y NA
 6833032 6833033 BBta_1493 BBta_1494     TRUE 0.758 10.000 0.000 1.000   NA
 6833035 6833036 BBta_1496 BBta_1497     FALSE 0.299 125.000 0.056 NA   NA
 6833038 6833039 BBta_1499 BBta_1500   trbB FALSE 0.005 430.000 0.000 NA   NA
 6833039 6833040 BBta_1500 BBta_1501 trbB trbC TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 6833040 6833041 BBta_1501 BBta_1502 trbC trbD TRUE 0.986 0.000 0.000 NA Y NA
 6833041 6833042 BBta_1502 BBta_1503 trbD trbE TRUE 0.964 9.000 0.000 NA Y NA
 6833042 6833043 BBta_1503 BBta_1504 trbE   TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 6833043 6833044 BBta_1504 BBta_1505     FALSE 0.072 378.000 0.000 NA Y NA
 6833044 6833045 BBta_1505 BBta_1506     TRUE 0.986 0.000 0.000 NA Y NA
 6833045 6833046 BBta_1506 BBta_1507   trbG TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 6833046 6833047 BBta_1507 BBta_1508 trbG   TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y NA
 6833047 6833048 BBta_1508 BBta_1509     FALSE 0.286 51.000 0.000 NA   NA
 6833050 6833051 BBta_1511 BBta_1512     TRUE 0.961 -39.000 0.000 0.031   NA
 6833051 6833052 BBta_1512 BBta_1513     FALSE 0.086 182.000 0.000 NA   NA
 6833052 6833053 BBta_1513 BBta_1514     TRUE 0.956 19.000 0.111 NA Y NA
 6833053 6833054 BBta_1514 BBta_1515     TRUE 0.914 98.000 0.472 1.000 Y NA
 6833054 6833055 BBta_1515 BBta_1516     TRUE 0.990 -31.000 0.069 NA Y NA
 6833055 6833056 BBta_1516 BBta_1517     TRUE 0.951 20.000 0.080 NA Y NA
 6833056 6833057 BBta_1517 BBta_1519     FALSE 0.040 511.000 0.000 NA Y NA
 6833057 6833058 BBta_1519 BBta_1520     TRUE 0.851 11.000 0.071 NA   NA
 6833058 6833059 BBta_1520 BBta_1521     FALSE 0.005 427.000 0.000 NA   NA
 6833060 6833061 BBta_1522 BBta_1523     FALSE 0.117 157.000 0.000 NA   NA
 6833061 6833062 BBta_1523 BBta_1525     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6833062 6833063 BBta_1525 BBta_1526     TRUE 0.853 -28.000 0.000 NA   NA
 6833064 6833065 BBta_1527 BBta_1528     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 6833065 6833066 BBta_1528 BBta_1529     FALSE 0.259 56.000 0.000 NA   NA
 6833069 6833070 BBta_1532 BBta_1533     FALSE 0.007 384.000 0.000 NA   NA
 6833070 6833071 BBta_1533 BBta_1534     TRUE 0.807 57.000 0.000 1.000 Y NA
 6833072 6833073 BBta_1536 BBta_1537     FALSE 0.144 135.000 0.000 NA   NA
 6833073 6833074 BBta_1537 BBta_1538     FALSE 0.016 294.000 0.000 NA   NA
 6833074 6833075 BBta_1538 BBta_1539     TRUE 0.791 29.000 0.000 0.010   NA
 6833075 6833076 BBta_1539 BBta_1540     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.050   NA
 6833077 6833078 BBta_1541 BBta_1542     FALSE 0.002 837.000 0.000 NA   NA
 6833078 6833079 BBta_1542 BBta_1543     FALSE 0.113 160.000 0.000 NA   NA
 6833079 6833080 BBta_1543 BBta_1544     FALSE 0.382 47.000 0.000 1.000   NA
 6833081 6833082 BBta_1545 BBta_1546     FALSE 0.277 58.000 0.000 1.000 N NA
 6833082 6833083 BBta_1546 BBta_1547     TRUE 0.610 14.000 0.000 NA   NA
 6833083 6833084 BBta_1547 BBta_1548     FALSE 0.153 112.000 0.000 NA   NA
 6833086 6833087 BBta_1550 BBta_1551     FALSE 0.004 524.000 0.000 NA   NA
 6833088 6833089 BBta_1552 BBta_1553     FALSE 0.015 456.000 0.000 0.072 N NA
 6833089 6833090 BBta_1553 BBta_1554     FALSE 0.158 102.000 0.000 NA   NA
 6833090 6833091 BBta_1554 BBta_1555   mntR FALSE 0.004 485.000 0.000 NA   NA
 6833092 6833093 BBta_1556 BBta_1557 mntH   FALSE 0.038 229.000 0.000 NA   NA
 6833093 6833094 BBta_1557 BBta_1558     FALSE 0.004 476.000 0.000 NA   NA
 6833094 6833095 BBta_1558 BBta_1559     TRUE 0.839 -90.000 0.000 NA   NA
 6833097 6833098 BBta_1561 BBta_1562     FALSE 0.374 37.000 0.000 NA   NA
 6833098 6833099 BBta_1562 BBta_1563     FALSE 0.021 270.000 0.000 NA   NA
 6833102 6833103 BBta_1566 BBta_1567     FALSE 0.198 74.000 0.000 NA   NA
 6833103 6833104 BBta_1567 BBta_1568     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6833104 6833105 BBta_1568 BBta_1569     FALSE 0.374 37.000 0.000 NA   NA
 6833105 6833106 BBta_1569 BBta_1570     FALSE 0.125 151.000 0.000 NA   NA
 6833108 6833109 BBta_1573 BBta_1574     FALSE 0.024 260.000 0.000 NA   NA
 6833110 6833111 BBta_1575 BBta_1576     FALSE 0.084 183.000 0.000 NA   NA
 6833112 6833113 BBta_1577 BBta_1578     TRUE 0.847 -45.000 0.000 NA   NA
 6833116 6833117 BBta_1582 BBta_1583     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6833117 6833118 BBta_1583 BBta_1584     TRUE 0.830 46.000 0.000 NA Y NA
 6833118 6833119 BBta_1584 BBta_1585     TRUE 0.838 -106.000 0.000 NA   NA
 6833122 6833123 BBta_1588 BBta_1589     FALSE 0.213 68.000 0.000 NA   NA
 6833123 6833124 BBta_1589 BBta_1590     TRUE 0.872 36.000 0.000 NA Y NA
 6833124 6833125 BBta_1590 BBta_1591     FALSE 0.163 71.000 0.000 NA N NA
 6833125 6833126 BBta_1591 BBta_1592     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6833126 6833127 BBta_1592 BBta_1593     FALSE 0.392 35.000 0.000 NA   NA
 6833127 6833128 BBta_1593 BBta_1594     TRUE 0.893 49.000 0.600 1.000   NA
 6833128 6833129 BBta_1594 BBta_1595     TRUE 0.965 23.000 0.417 0.001   NA
 6833129 6833130 BBta_1595 BBta_1596     TRUE 0.986 10.000 0.462 0.001   NA
 6833130 6833131 BBta_1596 BBta_1597     TRUE 0.972 20.000 0.462 0.001   NA
 6833131 6833132 BBta_1597 BBta_1598     TRUE 0.963 31.000 0.833 1.000   NA
 6833132 6833133 BBta_1598 BBta_1599   fdxB FALSE 0.006 471.000 0.000 1.000   NA
 6833133 6833134 BBta_1599 BBta_1600 fdxB   TRUE 0.505 53.000 0.053 1.000 N NA
 6833134 6833135 BBta_1600 BBta_1601     TRUE 0.965 -3.000 0.070 NA   NA
 6833135 6833136 BBta_1601 BBta_1602     TRUE 0.983 -3.000 0.250 NA   NA
 6833136 6833137 BBta_1602 BBta_1603     TRUE 0.854 24.000 0.250 NA   NA
 6833137 6833138 BBta_1603 BBta_1604     TRUE 0.921 24.000 0.444 NA   NA
 6833138 6833139 BBta_1604 BBta_1605     TRUE 0.893 41.000 0.241 0.001   NA
 6833139 6833140 BBta_1605 BBta_1606     TRUE 0.600 70.000 0.207 1.000   NA
 6833140 6833141 BBta_1606 BBta_1607     FALSE 0.398 203.000 0.375 1.000 N NA
 6833141 6833142 BBta_1607 BBta_1608     FALSE 0.341 41.000 0.000 NA   NA
 6833143 6833144 BBta_1609 BBta_1610     FALSE 0.004 533.000 0.000 1.000 N NA
 6833145 6833146 BBta_1611 BBta_1612     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.072 Y NA
 6833146 6833147 BBta_1612 BBta_1613     TRUE 0.999 -30.000 1.000 1.000 Y NA
 6833147 6833148 BBta_1613 BBta_1614     TRUE 0.908 98.000 0.438 1.000 Y NA
 6833148 6833149 BBta_1614 BBta_1615     FALSE 0.008 330.000 0.000 NA N NA
 6833151 6833152 BBta_1617 BBta_1618     FALSE 0.027 251.000 0.000 NA   NA
 6833152 6833153 BBta_1618 BBta_1619     FALSE 0.102 324.000 0.361 1.000 N NA
 6833154 6833155 BBta_1620 BBta_1621     FALSE 0.146 119.000 0.000 NA   NA
 6833156 6833157 BBta_1622 BBta_1623     FALSE 0.151 114.000 0.000 NA   NA
 6833157 6833158 BBta_1623 BBta_1624     TRUE 0.994 -13.000 0.700 NA   NA
 6833160 6833161 BBta_1627 BBta_1628     FALSE 0.141 140.000 0.000 NA   NA
 6833162 6833163 BBta_1630 BBta_1631     FALSE 0.092 177.000 0.000 NA   NA
 6833164 6833165 BBta_1632 BBta_1633     FALSE 0.019 307.000 0.000 1.000   NA
 6833165 6833166 BBta_1633 BBta_1634     FALSE 0.235 187.000 0.081 1.000   NA
 6833166 6833167 BBta_1634 BBta_1635     FALSE 0.090 187.000 0.000 1.000 N NA
 6833167 6833168 BBta_1635 BBta_1636     FALSE 0.006 487.000 0.000 1.000   NA
 6833169 6833170 BBta_1637 BBta_1638     TRUE 0.778 53.000 0.355 NA   NA
 6833170 6833171 BBta_1638 BBta_1639     FALSE 0.013 310.000 0.000 NA   NA
 6833171 6833172 BBta_1639 BBta_1640     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 6833173 6833174 BBta_1641 BBta_1642     FALSE 0.334 148.000 0.069 1.000   NA
 6833175 6833176 BBta_1643 BBta_1644     FALSE 0.357 148.000 0.133 1.000 N NA
 6833176 6833177 BBta_1644 BBta_1646     FALSE 0.028 833.000 0.000 1.000 Y NA
 6833177 6833178 BBta_1646 BBta_1647     TRUE 0.675 124.000 0.000 1.000 Y NA
 6833178 6833179 BBta_1647 BBta_1648     FALSE 0.347 116.000 0.087 NA   NA
 6833180 6833181 BBta_1649 BBta_1650   wrbA FALSE 0.377 79.000 0.061 NA   NA
 6833181 6833182 BBta_1650 BBta_1651 wrbA   TRUE 0.808 37.000 0.286 NA   NA
 6833184 6833185 BBta_1653 BBta_1654     TRUE 0.924 -10.000 0.013 NA   NA
 6833185 6833186 BBta_1654 BBta_1655     TRUE 0.503 81.000 0.012 0.082   NA
 6833187 6833188 BBta_1656 BBta_1657 rpmJ   FALSE 0.340 137.000 0.055 1.000   NA
 6833188 6833189 BBta_1657 BBta_1658     FALSE 0.382 122.000 0.143 NA   NA
 6833193 6833194 BBta_1662 BBta_1663 glcD glcE TRUE 0.983 26.000 0.266 0.001 Y NA
 6833194 6833195 BBta_1663 BBta_1664 glcE glcF TRUE 0.998 -3.000 0.227 0.001 Y NA
 6833195 6833196 BBta_1664 BBta_1665 glcF   FALSE 0.194 76.000 0.000 NA   NA
 6833196 6833197 BBta_1665 BBta_1666     FALSE 0.005 461.000 0.000 NA   NA
 6833199 6833200 BBta_1668 BBta_1669 glcA   FALSE 0.087 248.000 0.118 NA   NA
 6833201 6833202 BBta_1670 BBta_1671   groEL TRUE 0.811 141.000 0.750 NA   NA
 6833202 6833203 BBta_1671 BBta_1672 groEL groES TRUE 0.954 120.000 0.833 1.000 Y NA
 6833207 6833208 BBta_1677 BBta_1678     FALSE 0.052 294.000 0.122 NA   NA
 6833208 6833209 BBta_1678 BBta_1679     TRUE 0.991 -3.000 0.412 NA   NA
 6833209 6833210 BBta_1679 BBta_1680   hisG FALSE 0.276 71.000 0.012 NA N NA
 6833210 6833211 BBta_1680 BBta_1681 hisG hisZ TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.000 Y NA
 6833211 6833212 BBta_1681 BBta_1682 hisZ   FALSE 0.244 119.000 0.018 NA   NA
 6833213 6833214 BBta_1683 BBta_1684     FALSE 0.008 360.000 0.000 NA   NA
 6833214 6833215 BBta_1684 BBta_1685   ubiA TRUE 0.949 -3.000 0.020 NA   NA
 6833217 6833218 BBta_1687 BBta_1688     TRUE 0.589 59.000 0.182 NA   NA
 6833218 6833219 BBta_1688 BBta_1689     TRUE 0.838 58.000 0.515 NA   NA
 6833219 6833220 BBta_1689 BBta_1690     TRUE 0.844 18.000 0.185 NA   NA
 6833220 6833221 BBta_1690 BBta_1691   kdtA TRUE 0.972 -7.000 0.197 NA   NA
 6833221 6833222 BBta_1691 BBta_1692 kdtA lpxK TRUE 0.992 -7.000 0.037 1.000 Y NA
 6833226 6833227 BBta_1696 BBta_1697     TRUE 0.842 14.000 0.125 NA   NA
 6833227 6833228 BBta_1697 BBta_1698     TRUE 0.986 6.000 0.714 NA   NA
 6833228 6833229 BBta_1698 BBta_1699   purD FALSE 0.289 69.000 0.003 NA   NA
 6833231 6833232 BBta_1701 BBta_1702     TRUE 0.875 10.000 0.079 1.000 N NA
 6833235 6833236 BBta_1705 BBta_1706     TRUE 0.956 39.000 0.972 NA   NA
 6833236 6833237 BBta_1706 BBta_1707     TRUE 0.581 52.000 0.137 NA   NA
 6833237 6833238 BBta_1707 BBta_1708     TRUE 0.677 32.000 0.043 1.000   NA
 6833238 6833239 BBta_1708 BBta_1709     FALSE 0.193 130.000 0.000 1.000   NA
 6833239 6833240 BBta_1709 BBta_1710     FALSE 0.016 291.000 0.000 NA   NA
 6833242 6833243 BBta_1712 BBta_1713     TRUE 0.997 -3.000 0.598 0.004   NA
 6833243 6833244 BBta_1713 BBta_1714     FALSE 0.240 173.000 0.083 NA   NA
 6833244 6833245 BBta_1714 BBta_1715   lspA FALSE 0.340 199.000 0.294 NA   NA
 6833245 6833246 BBta_1715 BBta_1716 lspA ileS FALSE 0.094 227.000 0.045 1.000 N NA
 6833246 6833247 BBta_1716 BBta_1717 ileS ribF FALSE 0.091 222.000 0.029 1.000 N NA
 6833249 6833250 BBta_1719 BBta_1720     TRUE 0.811 16.000 0.135 NA N NA
 6833250 6833251 BBta_1720 BBta_1721     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 6833251 6833252 BBta_1721 BBta_1722     FALSE 0.053 209.000 0.000 NA   NA
 6833252 6833253 BBta_1722 BBta_1723     FALSE 0.012 333.000 0.000 1.000 N NA
 6833253 6833254 BBta_1723 BBta_1724   moaE TRUE 0.952 -3.000 0.017 1.000 N NA
 6833254 6833255 BBta_1724 BBta_1725 moaE moaD TRUE 0.991 25.000 0.501 0.002 Y NA
 6833255 6833256 BBta_1725 BBta_1726 moaD   TRUE 0.969 -3.000 0.082 1.000 N NA
 6833256 6833257 BBta_1726 BBta_1727     FALSE 0.019 305.000 0.000 1.000   NA
 6833257 6833258 BBta_1727 BBta_1728   uvrC FALSE 0.192 126.000 0.000 1.000   NA
 6833260 6833261 BBta_1730 BBta_1731 cspA   FALSE 0.026 252.000 0.000 NA   NA
 6833261 6833262 BBta_1731 BBta_1732     FALSE 0.280 124.000 0.042 NA   NA
 6833262 6833263 BBta_1732 BBta_1733     FALSE 0.374 135.000 0.137 NA   NA
 6833264 6833265 BBta_1734 BBta_1735     TRUE 0.783 82.000 0.550 NA   NA
 6833266 6833267 BBta_1736 BBta_1737     FALSE 0.464 319.000 0.592 1.000 Y NA
 6833267 6833268 BBta_1737 BBta_1738     TRUE 0.998 -3.000 0.392 0.087 Y NA
 6833269 6833270 BBta_1739 BBta_1740   hisS FALSE 0.009 365.000 0.000 1.000 N NA
 6833270 6833271 BBta_1740 BBta_1741 hisS   FALSE 0.324 109.000 0.029 1.000   NA
 6833271 6833272 BBta_1741 BBta_1742     FALSE 0.085 222.000 0.030 NA   NA
 6833273 6833274 BBta_1743 BBta_1744 proC   FALSE 0.412 184.000 0.308 NA   NA
 6833275 6833276 BBta_miscRNA13 BBta_1745     FALSE 0.192 77.000 0.000 NA   NA
 6833276 6833277 BBta_1745 BBta_1746   coxC FALSE 0.075 172.000 0.000 NA N NA
 6833277 6833278 BBta_1746 BBta_1747 coxC coxM FALSE 0.006 362.000 0.000 NA N NA
 6833278 6833279 BBta_1747 BBta_1748 coxM coxS TRUE 0.854 193.000 0.333 0.003 Y NA
 6833279 6833280 BBta_1748 BBta_1749 coxS coxL TRUE 0.998 -3.000 0.154 0.003 Y NA
 6833280 6833281 BBta_1749 BBta_1750 coxL coxD FALSE 0.304 243.000 0.462 1.000   NA
 6833281 6833282 BBta_1750 BBta_1751 coxD coxE TRUE 0.882 87.000 0.900 NA   NA
 6833282 6833283 BBta_1751 BBta_1752 coxE coxF TRUE 0.934 28.000 0.581 NA   NA
 6833284 6833285 BBta_1753 BBta_1754     FALSE 0.009 320.000 0.000 NA N NA
 6833285 6833286 BBta_1754 BBta_1755     TRUE 0.998 -3.000 0.273 0.071 Y NA
 6833286 6833287 BBta_1755 BBta_1756     TRUE 0.998 -3.000 0.231 0.071 Y NA
 6833287 6833288 BBta_1756 BBta_1757     FALSE 0.345 150.000 0.125 1.000 N NA
 6833289 6833290 BBta_1759 BBta_1760     FALSE 0.269 54.000 0.000 NA   NA
 6833291 6833292 BBta_1761 BBta_1762 prs   FALSE 0.372 165.000 0.209 NA   NA
 6833292 6833293 BBta_1762 BBta_1763     FALSE 0.114 196.000 0.010 NA   NA
 6833293 6833294 BBta_1763 BBta_1764     TRUE 0.643 39.000 0.107 NA   NA
 6833294 6833295 BBta_1764 BBta_1765   lgt TRUE 0.975 -3.000 0.170 NA   NA
 6833296 6833297 BBta_1766 BBta_1767     FALSE 0.017 288.000 0.000 NA   NA
 6833297 6833298 BBta_1767 BBta_1768   pth TRUE 0.961 73.000 0.496 0.012 Y NA
 6833298 6833299 BBta_1768 BBta_1769 pth   TRUE 0.930 40.000 0.184 1.000 Y NA
 6833301 6833302 BBta_1771 BBta_1772     TRUE 0.998 0.000 0.433 0.045 Y NA
 6833303 6833304 BBta_1773 BBta_1774     TRUE 0.619 151.000 0.417 NA   NA
 6833304 6833305 BBta_1774 BBta_1775     TRUE 0.590 127.000 0.333 NA   NA
 6833305 6833306 BBta_1775 BBta_1776     FALSE 0.339 188.000 0.250 NA   NA
 6833306 6833307 BBta_1776 BBta_1777     FALSE 0.244 121.000 0.019 NA   NA
 6833308 6833309 BBta_1778 BBta_1779     FALSE 0.055 207.000 0.000 NA   NA
 6833309 6833310 BBta_1779 BBta_1781     FALSE 0.002 1353.000 0.000 NA   NA
 6833311 6833312 BBta_1782 BBta_1783     FALSE 0.127 181.000 0.002 NA   NA
 6833312 6833313 BBta_1783 BBta_1784     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 6833313 6833314 BBta_1784 BBta_1785     TRUE 0.644 121.000 0.400 NA   NA
 6833315 6833316 BBta_1786 BBta_1787     TRUE 0.881 8.000 0.073 NA   NA
 6833316 6833317 BBta_1787 BBta_1788     TRUE 0.517 52.000 0.067 NA   NA
 6833320 6833321 BBta_1791 BBta_1792     TRUE 0.941 24.000 0.556 NA   NA
 6833322 6833323 BBta_1793 BBta_1794     TRUE 0.961 -3.000 0.054 NA   NA
 6833323 6833324 BBta_1794 BBta_1795     FALSE 0.293 112.000 0.041 NA   NA
 6833325 6833326 BBta_1796 BBta_1797     FALSE 0.326 89.000 0.043 NA   NA
 6833326 6833327 BBta_1797 BBta_1798     TRUE 0.919 68.000 1.000 NA   NA
 6833327 6833328 BBta_1798 BBta_1799     FALSE 0.054 208.000 0.000 NA   NA
 6833328 6833329 BBta_1799 BBta_1800     FALSE 0.199 194.000 0.107 NA   NA
 6833330 6833331 BBta_1801 BBta_1802 aatA   FALSE 0.311 122.000 0.062 NA   NA
 6833331 6833332 BBta_1802 BBta_1803     FALSE 0.282 184.000 0.182 NA   NA
 6833332 6833333 BBta_1803 BBta_1805   fusA FALSE 0.024 258.000 0.000 NA   NA
 6833333 6833334 BBta_1805 BBta_1806 fusA   FALSE 0.017 301.000 0.000 1.000 N NA
 6833334 6833335 BBta_1806 BBta_1807     FALSE 0.411 148.000 0.167 1.000   NA
 6833335 6833336 BBta_1807 BBta_1808     FALSE 0.332 93.000 0.023 1.000   NA
 6833336 6833337 BBta_1808 BBta_1809   aroE FALSE 0.268 98.000 0.011 1.000 N NA
 6833337 6833338 BBta_1809 BBta_1810 aroE   FALSE 0.207 107.000 0.000 1.000   NA
 6833338 6833339 BBta_1810 BBta_1811     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6833339 6833340 BBta_1811 BBta_1812     FALSE 0.030 242.000 0.000 NA   NA
 6833340 6833341 BBta_1812 BBta_1813     FALSE 0.016 290.000 0.000 NA   NA
 6833341 6833342 BBta_1813 BBta_1814     FALSE 0.133 146.000 0.000 NA   NA
 6833344 6833345 BBta_1817 BBta_1818 glmM   FALSE 0.004 518.000 0.000 1.000 N NA
 6833345 6833346 BBta_1818 BBta_1819     TRUE 0.770 154.000 0.412 0.007   NA
 6833346 6833347 BBta_1819 BBta_1820     FALSE 0.449 84.000 0.098 1.000   NA
 6833347 6833348 BBta_1820 BBta_1821     TRUE 0.674 35.000 0.061 1.000   NA
 6833349 6833350 BBta_1822 BBta_1823     TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 6833351 6833352 BBta_1824 BBta_1825   serC FALSE 0.223 143.000 0.014 NA   NA
 6833352 6833353 BBta_1825 BBta_1826 serC serA FALSE 0.328 265.000 0.140 1.000 Y NA
 6833353 6833354 BBta_1826 BBta_1827 serA   FALSE 0.102 198.000 0.004 NA   NA
 6833354 6833355 BBta_1827 BBta_1828     FALSE 0.005 450.000 0.000 NA   NA
 6833356 6833357 BBta_1829 BBta_1830     TRUE 0.903 8.000 0.167 NA N NA
 6833357 6833358 BBta_1830 BBta_1831   ooxA TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA N NA
 6833358 6833359 BBta_1831 BBta_1832 ooxA   FALSE 0.383 36.000 0.000 NA   NA
 6833359 6833360 BBta_1832 BBta_1833   ooxB TRUE 0.506 32.000 0.000 1.000   NA
 6833360 6833361 BBta_1833 BBta_1834 ooxB   TRUE 0.989 12.000 0.400 1.000 Y NA
 6833361 6833362 BBta_1834 BBta_1835     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.071 Y NA
 6833362 6833363 BBta_1835 BBta_1836     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.071 Y NA
 6833363 6833364 BBta_1836 BBta_1837     TRUE 0.861 216.000 0.667 0.071 Y NA
 6833365 6833366 BBta_1838 BBta_1839   ftsH FALSE 0.180 98.000 0.000 1.000 N NA
 6833366 6833367 BBta_1839 BBta_1840 ftsH   FALSE 0.340 110.000 0.061 1.000 N NA
 6833368 6833369 BBta_1841 BBta_1842     FALSE 0.316 99.000 0.049 NA   NA
 6833370 6833371 BBta_1843 BBta_1844     TRUE 0.932 38.000 0.667 1.000   NA
 6833372 6833373 BBta_1845 BBta_1846     FALSE 0.134 145.000 0.000 NA   NA
 6833374 6833375 BBta_1847 BBta_1848     TRUE 0.998 -3.000 0.484 NA Y NA
 6833375 6833376 BBta_1848 BBta_1849   lolD TRUE 0.993 -7.000 0.647 NA N NA
 6833376 6833377 BBta_1849 BBta_1850 lolD purA FALSE 0.013 325.000 0.000 1.000 N NA
 6833377 6833378 BBta_1850 BBta_1851 purA   FALSE 0.476 37.000 0.002 NA   NA
 6833378 6833379 BBta_1851 BBta_1852     TRUE 0.885 55.000 0.667 NA   NA
 6833379 6833380 BBta_1852 BBta_1853     FALSE 0.450 49.000 0.022 NA   NA
 6833381 6833382 BBta_1854 BBta_1855   msrB FALSE 0.006 399.000 0.000 NA   NA
 6833382 6833383 BBta_1855 BBta_1856 msrB msrA TRUE 0.884 106.000 0.087 0.001 Y NA
 6833385 6833386 BBta_1858 BBta_1859     FALSE 0.276 148.000 0.027 1.000   NA
 6833386 6833387 BBta_1859 BBta_1860   napC FALSE 0.045 238.000 0.000 1.000   NA
 6833387 6833388 BBta_1860 BBta_1861 napC napB TRUE 0.998 -3.000 0.490 NA Y NA
 6833388 6833389 BBta_1861 BBta_1862 napB napA TRUE 0.984 27.000 0.643 NA Y NA
 6833389 6833390 BBta_1862 BBta_1863 napA   TRUE 0.841 16.000 0.182 NA N NA
 6833390 6833391 BBta_1863 BBta_1864     TRUE 0.791 18.000 0.130 NA N NA
 6833392 6833393 BBta_1865 BBta_1866   ssuD TRUE 0.653 35.000 0.065 1.000 N NA
 6833393 6833394 BBta_1866 BBta_1867 ssuD   TRUE 0.964 -3.000 0.057 1.000 N NA
 6833394 6833395 BBta_1867 BBta_1868     TRUE 0.992 10.000 0.472 1.000 Y NA
 6833395 6833396 BBta_1868 BBta_1869     FALSE 0.342 99.000 0.036 1.000   NA
 6833396 6833397 BBta_1869 BBta_1870     TRUE 0.610 82.000 0.286 NA   NA
 6833398 6833399 BBta_1871 BBta_1872   flbD FALSE 0.341 41.000 0.000 NA   NA
 6833399 6833400 BBta_1872 BBta_1873 flbD fliN TRUE 0.836 54.000 0.484 1.000 N NA
 6833400 6833401 BBta_1873 BBta_1874 fliN fliH TRUE 0.708 31.000 0.111 NA   NA
 6833401 6833402 BBta_1874 BBta_1875 fliH fliG TRUE 0.949 0.000 0.071 NA   NA
 6833402 6833403 BBta_1875 BBta_1876 fliG fliF TRUE 0.988 47.000 0.762 0.004 Y NA
 6833403 6833404 BBta_1876 BBta_1878 fliF   FALSE 0.024 876.000 0.000 NA Y NA
 6833404 6833405 BBta_1878 BBta_1880     TRUE 0.964 13.000 0.050 NA Y NA
 6833406 6833407 BBta_1881 BBta_1882 mnmA   TRUE 0.692 22.000 0.024 1.000 N NA
 6833410 6833411 BBta_1884 BBta_1886     FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 6833411 6833412 BBta_1886 BBta_1888     FALSE 0.002 921.000 0.000 NA   NA
 6833412 6833413 BBta_1888 BBta_1889   cpo FALSE 0.356 90.000 0.033 1.000   NA
 6833416 6833417 BBta_1892 BBta_1894     FALSE 0.131 172.000 0.000 1.000   NA
 6833417 6833418 BBta_1894 BBta_1895     TRUE 0.958 -13.000 0.000 0.073   NA
 6833418 6833419 BBta_1895 BBta_1896     FALSE 0.210 69.000 0.000 NA   NA
 6833419 6833420 BBta_1896 BBta_1897     FALSE 0.216 67.000 0.000 NA   NA
 6833420 6833421 BBta_1897 BBta_1899     FALSE 0.144 126.000 0.000 NA   NA
 6833421 6833422 BBta_1899 BBta_1900     FALSE 0.274 53.000 0.000 NA   NA
 6833422 6833423 BBta_1900 BBta_1901     FALSE 0.038 229.000 0.000 NA   NA
 6833423 6833424 BBta_1901 BBta_1902     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 6833424 6833425 BBta_1902 BBta_1903     TRUE 0.835 -160.000 0.000 NA   NA
 6833425 6833426 BBta_1903 BBta_1904     TRUE 0.855 -25.000 0.000 NA   NA
 6833426 6833427 BBta_1904 BBta_1905     FALSE 0.002 829.000 0.000 NA   NA
 6833427 6833428 BBta_1905 BBta_1906     TRUE 0.973 73.000 1.000 NA Y NA
 6833428 6833429 BBta_1906 BBta_1907     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.070 Y NA
 6833429 6833430 BBta_1907 BBta_1908     TRUE 0.998 12.000 1.000 0.070 Y NA
 6833430 6833431 BBta_1908 BBta_1909     FALSE 0.496 27.000 0.000 1.000 N NA
 6833431 6833432 BBta_1909 BBta_1910     TRUE 0.998 3.000 0.512 0.073 Y NA
 6833432 6833433 BBta_1910 BBta_1911     TRUE 0.982 10.000 0.025 0.073 Y NA
 6833433 6833434 BBta_1911 BBta_1912     TRUE 0.609 16.000 0.000 1.000 N NA
 6833439 6833440 BBta_1917 BBta_1918     TRUE 0.916 14.000 0.250 1.000   NA
 6833441 6833442 BBta_1919 BBta_1920     TRUE 0.836 14.000 0.064 1.000   NA
 6833442 6833443 BBta_1920 BBta_1921     FALSE 0.495 167.000 0.300 1.000   NA
 6833443 6833444 BBta_1921 BBta_1922     TRUE 0.812 52.000 0.375 1.000   NA
 6833444 6833445 BBta_1922 BBta_1923     TRUE 0.945 82.000 0.450 0.070 Y NA
 6833445 6833446 BBta_1923 BBta_1924     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.070 Y NA
 6833446 6833447 BBta_1924 BBta_1925     TRUE 0.995 1.000 0.900 1.000   NA
 6833450 6833451 BBta_1928 BBta_1929     FALSE 0.064 206.000 0.000 1.000 N NA
 6833454 6833455 BBta_1933 BBta_1934     TRUE 0.938 24.000 0.526 NA   NA
 6833455 6833456 BBta_1934 BBta_1935     TRUE 0.994 -16.000 0.737 NA   NA
 6833456 6833457 BBta_1935 BBta_1936     TRUE 0.888 40.000 0.529 NA N NA
 6833457 6833458 BBta_1936 BBta_1937     TRUE 0.804 53.000 0.429 NA N NA
 6833458 6833459 BBta_1937 BBta_1938     TRUE 0.837 17.000 0.167 NA   NA
 6833459 6833460 BBta_1938 BBta_1939     TRUE 0.953 0.000 0.091 NA   NA
 6833460 6833461 BBta_1939 BBta_1940     TRUE 0.986 4.000 0.609 1.000 N NA
 6833463 6833464 BBta_1942 BBta_1943     TRUE 0.999 0.000 0.786 0.001 Y NA
 6833464 6833465 BBta_1943 BBta_1944     TRUE 0.998 11.000 0.901 0.001 Y NA
 6833465 6833466 BBta_1944 BBta_1945   glnA TRUE 0.929 80.000 0.493 1.000 Y NA
 6833467 6833468 BBta_1946 BBta_1947 soxG soxA TRUE 0.995 -7.000 0.444 0.002   NA
 6833468 6833469 BBta_1947 BBta_1948 soxA soxD TRUE 0.996 -3.000 0.433 0.001   NA
 6833469 6833470 BBta_1948 BBta_1949 soxD soxB TRUE 0.998 9.000 0.875 0.001 Y NA
 6833471 6833472 BBta_1950 BBta_1951     FALSE 0.249 169.000 0.067 1.000 N NA
 6833472 6833473 BBta_1951 BBta_1952     TRUE 0.675 199.000 0.833 NA N NA
 6833473 6833474 BBta_1952 BBta_1953     FALSE 0.015 275.000 0.000 NA N NA
 6833474 6833475 BBta_1953 BBta_1954     TRUE 0.969 63.000 0.750 1.000 Y NA
 6833475 6833476 BBta_1954 BBta_1955     TRUE 0.998 3.000 0.500 0.070 Y NA
 6833476 6833477 BBta_1955 BBta_1956     TRUE 0.980 4.000 0.429 1.000   NA
 6833477 6833478 BBta_1956 BBta_1957     TRUE 0.995 0.000 0.500 0.036   NA
 6833478 6833479 BBta_1957 BBta_1958   amiE FALSE 0.356 93.000 0.037 1.000   NA
 6833479 6833480 BBta_1958 BBta_1959 amiE ureE FALSE 0.254 76.000 0.000 1.000   NA
 6833480 6833481 BBta_1959 BBta_1960 ureE   TRUE 0.997 4.000 0.460 0.006 Y NA
 6833481 6833482 BBta_1960 BBta_1961   ureAB TRUE 0.908 13.000 0.011 0.006 N NA
 6833482 6833483 BBta_1961 BBta_1962 ureAB ureC TRUE 0.994 22.000 0.667 0.001 Y NA
 6833483 6833484 BBta_1962 BBta_1963 ureC ureG TRUE 0.996 5.000 1.000 0.006 N NA
 6833484 6833485 BBta_1963 BBta_1964 ureG   TRUE 0.994 -34.000 0.012 0.006 Y NA
 6833486 6833487 BBta_1965 BBta_1966     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 6833487 6833488 BBta_1966 BBta_1967     FALSE 0.067 198.000 0.000 NA   NA
 6833488 6833489 BBta_1967 BBta_1968     FALSE 0.153 112.000 0.000 NA   NA
 6833489 6833490 BBta_1968 BBta_1970     FALSE 0.017 300.000 0.000 1.000 N NA
 6833491 6833492 BBta_1971 BBta_1972     FALSE 0.138 143.000 0.000 NA   NA
 6833492 6833493 BBta_1972 BBta_1974     FALSE 0.006 451.000 0.000 1.000 N NA
 6833494 6833495 BBta_1975 BBta_1976     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 6833495 6833496 BBta_1976 BBta_1977     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 6833496 6833497 BBta_1977 BBta_1978     TRUE 0.878 54.000 0.000 0.070 Y NA
 6833497 6833498 BBta_1978 BBta_1979     FALSE 0.170 114.000 0.000 1.000 N NA
 6833498 6833499 BBta_1979 BBta_1980     FALSE 0.178 101.000 0.000 1.000 N NA
 6833499 6833500 BBta_1980 BBta_1981     TRUE 0.696 33.000 0.087 1.000 N NA
 6833500 6833501 BBta_1981 BBta_1982     TRUE 0.698 11.000 0.000 1.000 N NA
 6833502 6833503 BBta_1983 BBta_1984   pcaC FALSE 0.041 224.000 0.000 NA   NA
 6833503 6833504 BBta_1984 BBta_1985 pcaC   TRUE 0.974 -3.000 0.105 1.000   NA
 6833504 6833505 BBta_1985 BBta_1986   pstS FALSE 0.002 1025.000 0.000 1.000 N NA
 6833505 6833506 BBta_1986 BBta_1987 pstS pstC TRUE 0.906 96.000 0.178 0.001 Y NA
 6833506 6833507 BBta_1987 BBta_1988 pstC pstA TRUE 0.998 4.000 0.537 0.001 Y NA
 6833507 6833508 BBta_1988 BBta_1989 pstA pstB TRUE 0.994 18.000 0.526 0.001 Y NA
 6833508 6833509 BBta_1989 BBta_1990 pstB phoU TRUE 0.927 34.000 0.126 NA Y NA
 6833509 6833510 BBta_1990 BBta_1991 phoU phoB TRUE 0.797 17.000 0.128 NA N NA
 6833510 6833511 BBta_1991 BBta_1992 phoB   FALSE 0.287 96.000 0.005 1.000   NA
 6833511 6833512 BBta_1992 BBta_1993   hupN FALSE 0.119 181.000 0.000 1.000   NA
 6833512 6833513 BBta_1993 BBta_1994 hupN hupU TRUE 0.799 15.000 0.056 1.000 N NA
 6833513 6833514 BBta_1994 BBta_1995 hupU hupV TRUE 0.996 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 6833514 6833515 BBta_1995 BBta_1996 hupV hupS TRUE 0.528 226.000 0.000 0.001 Y NA
 6833515 6833516 BBta_1996 BBta_1997 hupS hupL TRUE 0.974 22.000 0.042 0.001 Y NA
 6833516 6833517 BBta_1997 BBta_1998 hupL hupC TRUE 0.990 14.000 0.355 0.073 Y NA
 6833517 6833518 BBta_1998 BBta_1999 hupC hupD TRUE 0.974 14.000 0.177 1.000 Y NA
 6833518 6833519 BBta_1999 BBta_2000 hupD hupF TRUE 0.642 29.000 0.058 NA N NA
 6833519 6833520 BBta_2000 BBta_2001 hupF hupG FALSE 0.029 245.000 0.000 NA   NA
 6833520 6833521 BBta_2001 BBta_2002 hupG hupH TRUE 0.996 -3.000 0.769 NA   NA
 6833521 6833522 BBta_2002 BBta_2003 hupH hupI TRUE 0.981 -3.000 0.219 NA   NA
 6833522 6833523 BBta_2003 BBta_2004 hupI hupJ TRUE 0.983 -3.000 0.247 NA   NA
 6833523 6833524 BBta_2004 BBta_2005 hupJ hupK TRUE 0.961 -3.000 0.055 NA   NA
 6833524 6833525 BBta_2005 BBta_2006 hupK hypA TRUE 0.978 2.000 0.071 0.006   NA
 6833525 6833526 BBta_2006 BBta_2007 hypA hypB TRUE 0.991 0.000 0.286 0.006   NA
 6833526 6833527 BBta_2007 BBta_2008 hypB hypF TRUE 0.993 -3.000 0.018 1.000 Y NA
 6833527 6833528 BBta_2008 BBta_2009 hypF hypC TRUE 0.942 24.000 0.069 NA Y NA
 6833528 6833529 BBta_2009 BBta_2010 hypC hypD TRUE 0.999 -3.000 0.917 NA Y NA
 6833529 6833530 BBta_2010 BBta_2011 hypD hypE TRUE 0.995 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 6833530 6833531 BBta_2011 BBta_2012 hypE hoxA TRUE 0.828 10.000 0.024 1.000 N NA
 6833531 6833532 BBta_2012 BBta_2013 hoxA   TRUE 0.995 -25.000 0.200 0.086 Y NA
 6833533 6833534 BBta_2014 BBta_2015     TRUE 0.985 80.000 1.000 0.003 Y NA
 6833535 6833536 BBta_2016 BBta_2017     TRUE 0.571 101.000 0.286 NA   NA
 6833536 6833537 BBta_2017 BBta_2018     TRUE 0.892 100.000 0.750 0.073   NA
 6833537 6833538 BBta_2018 BBta_2019     TRUE 0.996 -3.000 0.750 NA   NA
 6833538 6833539 BBta_2019 BBta_2020     TRUE 0.708 133.000 0.500 NA   NA
 6833539 6833540 BBta_2020 BBta_2021     FALSE 0.109 187.000 0.000 1.000   NA
 6833540 6833541 BBta_2021 BBta_2023     TRUE 1.000 -3.000 0.920 0.003 Y NA
 6833541 6833542 BBta_2023 BBta_2024     FALSE 0.004 559.000 0.000 1.000 N NA
 6833542 6833543 BBta_2024 BBta_2025     TRUE 0.955 28.000 0.200 1.000 Y NA
 6833543 6833544 BBta_2025 BBta_2026     TRUE 0.729 40.000 0.200 1.000 N NA
 6833544 6833545 BBta_2026 BBta_2027     TRUE 0.586 39.000 0.025 1.000   NA
 6833545 6833546 BBta_2027 BBta_2028     TRUE 0.668 29.000 0.025 1.000   NA
 6833548 6833549 BBta_2030 BBta_2031 cyoA cyoB TRUE 0.995 25.000 0.915 0.014 Y NA
 6833549 6833550 BBta_2031 BBta_2032 cyoB cyoC TRUE 0.999 -3.000 0.847 0.073 Y NA
 6833550 6833551 BBta_2032 BBta_2033 cyoC cyoD TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.073 Y NA
 6833551 6833552 BBta_2033 BBta_2034 cyoD   TRUE 0.995 0.000 0.849 NA   NA
 6833552 6833553 BBta_2034 BBta_2035   regB TRUE 0.660 47.000 0.188 NA   NA
 6833553 6833554 BBta_2035 BBta_2036 regB regA TRUE 0.998 -10.000 0.682 1.000 Y NA
 6833555 6833556 BBta_2038 BBta_2039     FALSE 0.307 108.000 0.048 NA   NA
 6833556 6833557 BBta_2039 BBta_2040     TRUE 0.996 -3.000 0.739 NA N NA
 6833557 6833558 BBta_2040 BBta_2041     TRUE 0.999 -3.000 0.826 0.011 Y NA
 6833560 6833561 BBta_2044 BBta_2045     FALSE 0.002 869.000 0.000 NA   NA
 6833563 6833564 BBta_2047 BBta_2048     TRUE 0.719 31.000 0.107 1.000 N NA
 6833564 6833565 BBta_2048 BBta_2049     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.072 Y NA
 6833567 6833568 BBta_2051 BBta_2052 dppF dppD TRUE 0.999 -3.000 0.377 0.004 Y NA
 6833568 6833569 BBta_2052 BBta_2053 dppD dppC TRUE 0.983 28.000 0.560 1.000 Y NA
 6833569 6833570 BBta_2053 BBta_2054 dppC dppB TRUE 0.999 -3.000 0.779 0.070 Y NA
 6833570 6833571 BBta_2054 BBta_2056 dppB dppA TRUE 0.575 208.000 0.015 0.070 Y NA
 6833571 6833572 BBta_2056 BBta_2057 dppA   FALSE 0.025 286.000 0.000 1.000   NA
 6833572 6833573 BBta_2057 BBta_2058     TRUE 0.673 80.000 0.318 1.000   NA
 6833573 6833574 BBta_2058 BBta_2059     TRUE 0.998 -10.000 0.923 0.070   NA
 6833574 6833575 BBta_2059 BBta_2060     TRUE 0.988 -16.000 0.418 1.000   NA
 6833576 6833577 BBta_2061 BBta_2062     FALSE 0.002 849.000 0.000 NA   NA
 6833580 6833581 BBta_2065 BBta_2066     TRUE 0.764 5.000 0.000 NA   NA
 6833581 6833582 BBta_2066 BBta_2067     FALSE 0.393 61.000 0.028 NA   NA
 6833583 6833584 BBta_2068 BBta_2069 dgoK dgoA TRUE 0.993 2.000 0.205 1.000 Y NA
 6833584 6833585 BBta_2069 BBta_2070 dgoA   FALSE 0.170 114.000 0.000 1.000 N NA
 6833585 6833586 BBta_2070 BBta_2071     FALSE 0.044 432.000 0.333 NA   NA
 6833588 6833589 BBta_2073 BBta_2074 serA   TRUE 0.679 22.000 0.004 1.000   NA
 6833590 6833591 BBta_2075 BBta_2076     TRUE 0.969 -3.000 0.111 NA   NA
 6833591 6833592 BBta_2076 BBta_2077     TRUE 0.918 12.000 0.250 NA   NA
 6833592 6833593 BBta_2077 BBta_2078   modC FALSE 0.059 204.000 0.000 NA   NA
 6833593 6833594 BBta_2078 BBta_2079 modC modB TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 6833594 6833595 BBta_2079 BBta_2080 modB modA TRUE 0.993 27.000 0.660 0.001 Y NA
 6833595 6833596 BBta_2080 BBta_2081 modA bam FALSE 0.022 278.000 0.000 1.000 N NA
 6833596 6833597 BBta_2081 BBta_2082 bam   TRUE 0.782 23.000 0.083 1.000   NA
 6833599 6833600 BBta_2084 BBta_2085     TRUE 0.647 52.000 0.200 NA   NA
 6833601 6833602 BBta_2086 BBta_2087 norE   TRUE 0.924 4.000 0.107 NA   NA
 6833602 6833603 BBta_2087 BBta_2088   norC FALSE 0.311 103.000 0.048 NA   NA
 6833603 6833604 BBta_2088 BBta_2089 norC norB TRUE 0.974 38.000 0.794 0.001   NA
 6833604 6833605 BBta_2089 BBta_2090 norB norQ TRUE 0.916 64.000 0.529 0.001   NA
 6833605 6833606 BBta_2090 BBta_2091 norQ norD TRUE 0.994 4.000 0.590 0.001   NA
 6833610 6833611 BBta_2095 BBta_2096     TRUE 0.930 28.000 0.500 1.000   NA
 6833611 6833612 BBta_2096 BBta_2097     TRUE 0.997 -3.000 0.091 0.070 Y NA
 6833612 6833613 BBta_2097 BBta_2098     TRUE 0.997 0.000 0.409 1.000 Y NA
 6833613 6833614 BBta_2098 BBta_2099     TRUE 0.999 2.000 0.900 1.000 Y NA
 6833614 6833615 BBta_2099 BBta_2100     TRUE 0.970 -13.000 0.200 1.000 N NA
 6833615 6833616 BBta_2100 BBta_2101     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.004 N NA
 6833617 6833618 BBta_2102 BBta_2103 upp   FALSE 0.241 140.000 0.020 NA   NA
 6833618 6833619 BBta_2103 BBta_2104     TRUE 0.823 25.000 0.212 NA   NA
 6833620 6833621 BBta_2105 BBta_2106     FALSE 0.335 135.000 0.050 1.000   NA
 6833623 6833624 BBta_2108 BBta_2109 hyuA   FALSE 0.129 233.000 0.154 1.000 N NA
 6833624 6833625 BBta_2109 BBta_2110     TRUE 0.987 2.000 0.500 1.000 N NA
 6833627 6833628 BBta_2112 BBta_2113     TRUE 0.515 83.000 0.222 NA N NA
 6833628 6833629 BBta_2113 BBta_2114     TRUE 0.943 183.000 0.833 0.070 Y NA
 6833629 6833630 BBta_2114 BBta_2115     TRUE 0.997 11.000 0.833 0.070 Y NA
 6833630 6833631 BBta_2115 BBta_2116     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 6833631 6833632 BBta_2116 BBta_2117     TRUE 0.671 121.000 0.400 1.000   NA
 6833633 6833634 BBta_2118 BBta_2119     TRUE 0.854 10.000 0.049 1.000 N NA
 6833635 6833636 BBta_2120 BBta_2121     TRUE 0.970 47.000 0.600 1.000 Y NA
 6833636 6833637 BBta_2121 BBta_2122     TRUE 0.574 19.000 0.000 1.000 N NA
 6833637 6833638 BBta_2122 BBta_2123   uxuA FALSE 0.447 33.000 0.000 1.000 N NA
 6833638 6833639 BBta_2123 BBta_2124 uxuA idnD TRUE 0.564 54.000 0.111 1.000 N NA
 6833639 6833640 BBta_2124 BBta_2125 idnD kdgK TRUE 0.646 48.000 0.167 1.000 N NA
 6833640 6833641 BBta_2125 BBta_2126 kdgK eda TRUE 0.993 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 6833641 6833642 BBta_2126 BBta_2127 eda ytfQ FALSE 0.160 287.000 0.000 NA Y NA
 6833642 6833643 BBta_2127 BBta_2128 ytfQ   TRUE 0.954 94.000 0.804 NA Y NA
 6833643 6833644 BBta_2128 BBta_2129   ytfT TRUE 0.998 -3.000 0.506 1.000 Y NA
 6833644 6833645 BBta_2129 BBta_2130 ytfT   TRUE 0.999 -3.000 0.865 0.070 Y NA
 6833645 6833646 BBta_2130 BBta_2131     TRUE 0.961 -3.000 0.045 1.000 N NA
 6833646 6833647 BBta_2131 BBta_2132     TRUE 0.983 -3.000 0.231 1.000 N NA
 6833647 6833648 BBta_2132 BBta_2133     TRUE 0.991 11.000 0.308 0.080 Y NA
 6833648 6833649 BBta_2133 BBta_2134     TRUE 0.925 3.000 0.034 1.000   NA
 6833649 6833650 BBta_2134 BBta_2135     TRUE 0.927 4.000 0.068 1.000   NA
 6833650 6833651 BBta_2135 BBta_2136     TRUE 0.991 0.000 0.053 1.000 Y NA
 6833651 6833652 BBta_2136 BBta_2137   chvE TRUE 0.736 108.000 0.039 NA Y NA
 6833652 6833653 BBta_2137 BBta_2138 chvE araG TRUE 0.909 110.000 0.500 NA Y NA
 6833653 6833654 BBta_2138 BBta_2139 araG   TRUE 0.995 21.000 0.680 0.002 Y NA
 6833654 6833655 BBta_2139 BBta_2141     FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 6833655 6833656 BBta_2141 BBta_2142   cheY TRUE 0.939 2.000 0.081 NA   NA
 6833656 6833657 BBta_2142 BBta_2143 cheY cheA TRUE 0.993 -9.000 0.133 1.000 Y NA
 6833657 6833658 BBta_2143 BBta_2144 cheA cheW TRUE 0.996 -10.000 0.133 0.015 Y NA
 6833658 6833659 BBta_2144 BBta_2145 cheW   TRUE 0.972 51.000 0.429 0.015 Y NA
 6833659 6833660 BBta_2145 BBta_2146   cheR TRUE 0.845 61.000 0.047 1.000 Y NA
 6833660 6833661 BBta_2146 BBta_2147 cheR cheD TRUE 0.995 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 6833661 6833662 BBta_2147 BBta_2148 cheD cheB TRUE 0.986 10.000 0.267 1.000 Y NA
 6833662 6833663 BBta_2148 BBta_2149 cheB   TRUE 0.995 4.000 0.227 0.015 Y NA
 6833663 6833664 BBta_2149 BBta_2150     TRUE 0.969 12.000 0.041 1.000 Y NA
 6833664 6833665 BBta_2150 BBta_2151     TRUE 0.985 7.000 0.667 1.000   NA
 6833665 6833666 BBta_2151 BBta_2152     TRUE 0.991 -9.000 0.500 1.000   NA
 6833666 6833667 BBta_2152 BBta_2153     TRUE 0.987 2.000 0.500 NA   NA
 6833667 6833668 BBta_2153 BBta_2154     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 6833668 6833669 BBta_2154 BBta_2155     FALSE 0.014 301.000 0.000 NA   NA
 6833669 6833670 BBta_2155 BBta_2157     TRUE 0.926 16.000 0.353 NA   NA
 6833671 6833672 BBta_2158 BBta_2159     TRUE 0.988 -43.000 0.511 NA   NA
 6833672 6833673 BBta_2159 BBta_2161     FALSE 0.012 315.000 0.000 NA   NA
 6833673 6833674 BBta_2161 BBta_2162     TRUE 0.985 3.000 0.500 NA   NA
 6833674 6833675 BBta_2162 BBta_2163     FALSE 0.223 163.000 0.043 NA   NA
 6833676 6833677 BBta_2164 BBta_2165     TRUE 0.500 62.000 0.062 1.000   NA
 6833680 6833681 BBta_2168 BBta_2169     TRUE 0.980 -31.000 0.333 NA   NA
 6833681 6833682 BBta_2169 BBta_2170     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6833682 6833683 BBta_2170 BBta_2171     FALSE 0.285 66.000 0.000 1.000   NA
 6833683 6833684 BBta_2171 BBta_2172     FALSE 0.023 262.000 0.000 NA   NA
 6833684 6833685 BBta_2172 BBta_2173   vanB TRUE 0.988 5.000 0.750 NA   NA
 6833685 6833686 BBta_2173 BBta_2174 vanB ligB FALSE 0.471 72.000 0.000 0.072   NA
 6833688 6833689 BBta_2176 BBta_2179     FALSE 0.003 629.000 0.000 NA   NA
 6833691 6833692 BBta_2181 BBta_2182     FALSE 0.032 239.000 0.000 NA   NA
 6833693 6833694 BBta_2183 BBta_2184     FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 6833694 6833695 BBta_2184 BBta_2185   vanR TRUE 0.952 7.000 0.277 1.000 N NA
 6833695 6833696 BBta_2185 BBta_2186 vanR   TRUE 0.962 11.000 0.450 1.000 N NA
 6833697 6833698 BBta_2187 BBta_2188     FALSE 0.250 139.000 0.025 NA   NA
 6833699 6833700 BBta_2189 BBta_2190 tdcD betA TRUE 0.637 95.000 0.333 1.000 N NA
 6833700 6833701 BBta_2190 BBta_2191 betA hemC TRUE 0.699 16.000 0.003 1.000 N NA
 6833703 6833704 BBta_2193 BBta_2194     FALSE 0.105 166.000 0.000 NA   NA
 6833705 6833706 BBta_2195 BBta_2196     TRUE 0.950 -3.000 0.023 NA   NA
 6833707 6833708 BBta_2197 BBta_2200   fbp FALSE 0.003 845.000 0.000 1.000   NA
 6833711 6833712 BBta_2203 BBta_2204     FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 6833712 6833713 BBta_2204 BBta_2205     FALSE 0.020 272.000 0.000 NA   NA
 6833716 6833717 BBta_2208 BBta_2209     TRUE 0.566 30.000 0.010 NA   NA
 6833717 6833718 BBta_2209 BBta_2210     FALSE 0.223 127.000 0.010 NA   NA
 6833718 6833719 BBta_2210 BBta_2211     TRUE 0.674 50.000 0.182 1.000   NA
 6833719 6833720 BBta_2211 BBta_2213     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   NA
 6833720 6833721 BBta_2213 BBta_2214     FALSE 0.025 236.000 0.000 NA N NA
 6833721 6833722 BBta_2214 BBta_2215     TRUE 0.679 196.000 0.818 NA N NA
 6833722 6833723 BBta_2215 BBta_2216     TRUE 0.968 21.000 0.818 NA N NA
 6833723 6833724 BBta_2216 BBta_2217     TRUE 0.838 103.000 0.727 1.000   NA
 6833724 6833725 BBta_2217 BBta_2218   yciA FALSE 0.018 284.000 0.000 NA   NA
 6833725 6833726 BBta_2218 BBta_2219 yciA   FALSE 0.020 271.000 0.000 NA   NA
 6833726 6833727 BBta_2219 BBta_2220   glpR FALSE 0.209 164.000 0.036 NA   NA
 6833727 6833728 BBta_2220 BBta_2221 glpR glpD FALSE 0.279 165.000 0.089 1.000 N NA
 6833728 6833729 BBta_2221 BBta_2222 glpD   TRUE 0.968 -3.000 0.077 1.000 N NA
 6833729 6833730 BBta_2222 BBta_2223     TRUE 0.997 14.000 0.865 0.003 Y NA
 6833730 6833731 BBta_2223 BBta_2224     TRUE 0.999 4.000 0.847 0.069 Y NA
 6833731 6833732 BBta_2224 BBta_2225     TRUE 0.999 0.000 0.922 0.069 Y NA
 6833732 6833733 BBta_2225 BBta_2226     TRUE 0.745 185.000 0.854 NA   NA
 6833733 6833734 BBta_2226 BBta_2227     TRUE 0.766 125.000 0.640 NA   NA
 6833734 6833735 BBta_2227 BBta_2228   exbB FALSE 0.023 367.000 0.000 0.080 N NA
 6833735 6833736 BBta_2228 BBta_2229 exbB exbD TRUE 0.989 4.000 0.032 0.080 Y NA
 6833736 6833737 BBta_2229 BBta_2230 exbD tonB TRUE 0.975 -3.000 0.154 1.000 N NA
 6833738 6833739 BBta_2231 BBta_2232     TRUE 0.546 94.000 0.250 NA   NA
 6833740 6833741 BBta_2233 BBta_2235     FALSE 0.041 224.000 0.000 NA   NA
 6833743 6833744 BBta_2237 BBta_2238     FALSE 0.012 356.000 0.000 1.000   NA
 6833744 6833745 BBta_2238 BBta_2239     FALSE 0.005 464.000 0.000 NA   NA
 6833746 6833747 BBta_2240 BBta_2241 nemA   FALSE 0.164 218.000 0.000 0.044   NA
 6833747 6833748 BBta_2241 BBta_2242     FALSE 0.134 145.000 0.000 NA   NA
 6833748 6833749 BBta_2242 BBta_2243     FALSE 0.155 108.000 0.000 NA   NA
 6833749 6833750 BBta_2243 BBta_2244   pgm FALSE 0.046 225.000 0.000 1.000 N NA
 6833752 6833753 BBta_2246 BBta_2247   fdh TRUE 0.978 14.000 0.800 NA   NA
 6833753 6833754 BBta_2247 BBta_2248 fdh   FALSE 0.082 185.000 0.000 NA   NA
 6833756 6833757 BBta_2250 BBta_2251 opgH mdoG FALSE 0.481 72.000 0.169 NA N NA
 6833757 6833758 BBta_2251 BBta_2252 mdoG   FALSE 0.053 229.000 0.000 1.000   NA
 6833761 6833762 BBta_2255 BBta_2256     FALSE 0.022 265.000 0.000 NA   NA
 6833764 6833765 BBta_2258 BBta_2259     FALSE 0.388 49.000 0.014 NA N NA
 6833765 6833766 BBta_2259 BBta_2260     FALSE 0.247 110.000 0.014 NA   NA
 6833767 6833768 BBta_2261 BBta_2262     FALSE 0.045 227.000 0.000 1.000 N NA
 6833768 6833769 BBta_2262 BBta_2263   eutC TRUE 0.993 -13.000 0.109 1.000 Y NA
 6833769 6833770 BBta_2263 BBta_2264 eutC eutB TRUE 0.995 30.000 0.859 0.001 Y NA
 6833772 6833773 BBta_2266 BBta_2267     TRUE 0.690 158.000 0.583 NA   NA
 6833773 6833774 BBta_2267 BBta_2268     FALSE 0.149 199.000 0.052 NA   NA
 6833774 6833775 BBta_2268 BBta_2269     TRUE 0.839 146.000 0.876 NA   NA
 6833775 6833776 BBta_2269 BBta_2270     TRUE 0.997 -3.000 0.816 NA   NA
 6833776 6833777 BBta_2270 BBta_2271     TRUE 0.994 0.000 0.697 NA   NA
 6833778 6833779 BBta_2272 BBta_2273     TRUE 0.849 36.000 0.346 NA   NA
 6833779 6833780 BBta_2273 BBta_2274     TRUE 0.961 -3.000 0.056 NA   NA
 6833780 6833781 BBta_2274 BBta_2275     TRUE 0.950 -3.000 0.023 NA   NA
 6833786 6833787 BBta_2281 BBta_2282     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 6833787 6833788 BBta_2282 BBta_2283     TRUE 0.966 -3.000 0.075 NA   NA
 6833788 6833789 BBta_2283 BBta_2284     FALSE 0.470 77.000 0.000 0.043 N NA
 6833790 6833791 BBta_2286 BBta_2287   iorA FALSE 0.007 414.000 0.000 1.000 N NA
 6833791 6833792 BBta_2287 BBta_2288 iorA   TRUE 0.998 13.000 0.875 0.002 Y NA
 6833792 6833793 BBta_2288 BBta_2289     FALSE 0.016 302.000 0.000 1.000 N NA
 6833796 6833797 BBta_2292 BBta_2293     FALSE 0.469 107.000 0.169 1.000   NA
 6833799 6833800 BBta_2295 BBta_2296   hemF FALSE 0.422 56.000 0.006 1.000   NA
 6833800 6833801 BBta_2296 BBta_2297 hemF   TRUE 0.737 105.000 0.012 1.000 Y NA
 6833801 6833802 BBta_2297 BBta_2298     TRUE 0.706 28.000 0.111 NA N NA
 6833802 6833803 BBta_2298 BBta_2299     TRUE 0.883 3.000 0.022 NA N NA
 6833804 6833805 BBta_2300 BBta_2301     TRUE 0.917 63.000 0.045 0.001 Y NA
 6833805 6833806 BBta_2301 BBta_2302     FALSE 0.134 145.000 0.000 NA   NA
 6833806 6833807 BBta_2302 BBta_2303     FALSE 0.125 151.000 0.000 NA   NA
 6833807 6833808 BBta_2303 BBta_2305     FALSE 0.003 645.000 0.000 NA   NA
 6833810 6833811 BBta_2308 BBta_2309   trpE(G) FALSE 0.005 466.000 0.000 1.000 N NA
 6833811 6833812 BBta_2309 BBta_2310 trpE(G) apt FALSE 0.247 136.000 0.013 1.000 N NA
 6833813 6833814 BBta_2311 BBta_2312     TRUE 0.723 57.000 0.308 NA   NA
 6833814 6833815 BBta_2312 BBta_2314     FALSE 0.057 264.000 0.061 NA   NA
 6833815 6833816 BBta_2314 BBta_2315     TRUE 0.842 33.000 0.307 NA   NA
 6833816 6833817 BBta_2315 BBta_2316     FALSE 0.139 180.000 0.008 NA   NA
 6833817 6833818 BBta_2316 BBta_2317     FALSE 0.149 180.000 0.014 NA   NA
 6833818 6833819 BBta_2317 BBta_2318     FALSE 0.300 64.000 0.012 NA N NA
 6833819 6833820 BBta_2318 BBta_2319     FALSE 0.060 255.000 0.039 1.000 N NA
 6833820 6833821 BBta_2319 BBta_2320     TRUE 0.593 120.000 0.333 NA   NA
 6833822 6833823 BBta_2321 BBta_2322 mutY   FALSE 0.246 70.000 0.002 NA N NA
 6833825 6833826 BBta_2325 BBta_2326     FALSE 0.208 106.000 0.000 1.000   NA
 6833826 6833827 BBta_2326 BBta_2327     FALSE 0.098 236.000 0.000 0.071 N NA
 6833827 6833828 BBta_2327 BBta_2328   gst FALSE 0.207 80.000 0.000 1.000 N NA
 6833828 6833829 BBta_2328 BBta_2329 gst   FALSE 0.173 67.000 0.000 NA N NA
 6833829 6833830 BBta_2329 BBta_2330     TRUE 0.985 -3.000 0.294 NA N NA
 6833830 6833831 BBta_2330 BBta_2331     FALSE 0.016 290.000 0.000 NA   NA
 6833833 6833834 BBta_2333 BBta_2334   moaB TRUE 0.806 12.000 0.038 NA   NA
 6833835 6833836 BBta_2335 BBta_2336     FALSE 0.075 191.000 0.000 NA   NA
 6833836 6833837 BBta_2336 BBta_2337     FALSE 0.213 68.000 0.000 NA   NA
 6833837 6833838 BBta_2337 BBta_2338     FALSE 0.144 124.000 0.000 NA   NA
 6833838 6833839 BBta_2338 BBta_2339     TRUE 0.987 9.000 0.846 NA   NA
 6833839 6833840 BBta_2339 BBta_2340   xfp FALSE 0.157 105.000 0.000 NA   NA
 6833841 6833842 BBta_2341 BBta_2342     TRUE 0.642 20.000 0.019 NA N NA
 6833842 6833843 BBta_2342 BBta_2343   rnhB FALSE 0.232 77.000 0.003 NA N NA
 6833843 6833844 BBta_2343 BBta_2344 rnhB   FALSE 0.116 193.000 0.009 NA   NA
 6833846 6833847 BBta_2346 BBta_2347     FALSE 0.062 286.000 0.091 1.000   NA
 6833847 6833848 BBta_2347 BBta_2348   ispE FALSE 0.320 163.000 0.107 1.000   NA
 6833850 6833851 BBta_2350 BBta_2351     TRUE 0.992 -7.000 0.525 1.000   NA
 6833851 6833852 BBta_2351 BBta_2353     FALSE 0.049 294.000 0.061 1.000   NA
 6833852 6833853 BBta_2353 BBta_2354     FALSE 0.316 109.000 0.055 NA   NA
 6833853 6833854 BBta_2354 BBta_2355   glyQ FALSE 0.215 132.000 0.006 NA   NA
 6833854 6833855 BBta_2355 BBta_2356 glyQ   FALSE 0.028 307.000 0.008 1.000   NA
 6833855 6833856 BBta_2356 BBta_2357   glyS TRUE 0.895 4.000 0.013 1.000   NA
 6833858 6833859 BBta_2359 BBta_2360   ppdK FALSE 0.272 112.000 0.028 NA   NA
 6833859 6833860 BBta_2360 BBta_2361 ppdK   FALSE 0.004 614.000 0.000 1.000   NA
 6833862 6833863 BBta_2363 BBta_2364     FALSE 0.425 65.000 0.080 NA N NA
 6833863 6833864 BBta_2364 BBta_2365     FALSE 0.151 114.000 0.000 NA   NA
 6833864 6833865 BBta_2365 BBta_2366     TRUE 0.680 179.000 0.667 NA   NA
 6833865 6833866 BBta_2366 BBta_2367     FALSE 0.003 627.000 0.000 NA   NA
 6833866 6833867 BBta_2367 BBta_2368     TRUE 0.582 205.000 0.000 0.015 Y NA
 6833868 6833869 BBta_2369 BBta_2370     FALSE 0.063 201.000 0.000 NA   NA
 6833869 6833870 BBta_2370 BBta_2372     FALSE 0.007 376.000 0.000 NA   NA
 6833870 6833871 BBta_2372 BBta_2373     TRUE 0.791 4.000 0.000 NA   NA
 6833871 6833872 BBta_2373 BBta_2374   tag TRUE 0.961 -3.000 0.027 1.000   NA
 6833872 6833873 BBta_2374 BBta_2375 tag   TRUE 0.856 11.000 0.047 1.000   NA
 6833875 6833876 BBta_2377 BBta_2379     FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 6833876 6833877 BBta_2379 BBta_2380     TRUE 0.642 152.000 0.462 NA   NA
 6833877 6833878 BBta_2380 BBta_2381     TRUE 0.561 93.000 0.259 NA   NA
 6833878 6833879 BBta_2381 BBta_2382     FALSE 0.440 68.000 0.077 NA   NA
 6833881 6833882 BBta_2384 BBta_2385     TRUE 0.843 10.000 0.020 1.000   NA