MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus thuringiensis str. 97-27

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 595198 595199 BT9727_0001 BT9727_0002 dnaA dnaN TRUE 0.671 179.000 0.328 1.000 Y NA
 595199 595200 BT9727_0002 BT9727_0003 dnaN   FALSE 0.347 116.000 0.103 1.000   NA
 595200 595201 BT9727_0003 BT9727_0004   recF TRUE 0.672 13.000 0.209 1.000   NA
 595201 595202 BT9727_0004 BT9727_0005 recF gyrB TRUE 0.967 39.000 0.249 0.005 Y NA
 595202 595203 BT9727_0005 BT9727_0006 gyrB gyrA TRUE 0.942 89.000 0.306 0.001 Y NA
 595203 5459410 BT9727_0006 rRNA-16SrRNA_1 gyrA   FALSE 0.001 269.000 0.000 NA   NA
 5459410 5459411 rRNA-16SrRNA_1 tRNA-Ile-2     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 5459411 5459412 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459412 5459413 tRNA-Ala-5 rRNA-23SrRNA_1     FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 5459413 5459414 rRNA-23SrRNA_1 rRNA-5SrRNA_1     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 595210 595211 BT9727_0009 BT9727_0010 guaB dacA TRUE 0.667 105.000 0.304 1.000 N NA
 595211 595212 BT9727_0010 BT9727_0011 dacA pdx1 FALSE 0.334 162.000 0.017 1.000 N NA
 595212 595213 BT9727_0011 BT9727_0012 pdx1 guaA TRUE 0.958 19.000 0.488 NA Y NA
 595213 595214 BT9727_0012 BT9727_0013 guaA serS FALSE 0.033 328.000 0.010 NA N NA
 595214 5459415 BT9727_0013 tRNA-Ser-5 serS   FALSE 0.009 157.000 0.000 NA   NA
 5459415 595216 tRNA-Ser-5 BT9727_0014     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 595217 595218 BT9727_0015 BT9727_0016 dck dgk TRUE 0.978 3.000 0.255 0.001 Y NA
 595218 595219 BT9727_0016 BT9727_0017 dgk pncA FALSE 0.512 126.000 0.058 1.000 N NA
 595220 595221 BT9727_0018 BT9727_0019   dnaX FALSE 0.015 477.000 0.000 1.000 N NA
 595221 595222 BT9727_0019 BT9727_0020 dnaX   FALSE 0.474 23.000 0.071 NA   NA
 595222 595223 BT9727_0020 BT9727_0021   recR TRUE 0.781 15.000 0.604 NA   NA
 595223 595224 BT9727_0021 BT9727_0022 recR   FALSE 0.447 15.000 0.071 NA   NA
 595224 595225 BT9727_0022 BT9727_0023   bofA FALSE 0.111 216.000 0.417 NA   NA
 595225 5459416 BT9727_0023 rRNA-16SrRNA_2 bofA   FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5459416 5459417 rRNA-16SrRNA_2 tRNA-Ile-4     FALSE 0.011 148.000 0.000 NA   NA
 5459417 5459418 tRNA-Ile-4 tRNA-Ala-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459418 5459419 tRNA-Ala-1 rRNA-23SrRNA_2     FALSE 0.022 92.000 0.000 NA   NA
 5459419 5459420 rRNA-23SrRNA_2 rRNA-5SrRNA_2     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459420 595231 rRNA-5SrRNA_2 BT9727_0025   cad FALSE 0.000 440.000 0.000 NA   NA
 595231 595232 BT9727_0025 BT9727_0026 cad tmk TRUE 0.805 2.000 0.009 1.000 N NA
 595232 595233 BT9727_0026 BT9727_0027 tmk holB TRUE 0.759 36.000 0.009 1.000 N NA
 595233 595234 BT9727_0027 BT9727_0028 holB   TRUE 0.760 -3.000 0.372 NA   NA
 595234 595235 BT9727_0028 BT9727_0029     TRUE 0.605 0.000 0.183 NA   NA
 595235 595236 BT9727_0029 BT9727_0030     FALSE 0.362 121.000 0.193 1.000   NA
 595236 595237 BT9727_0030 BT9727_0031     TRUE 0.797 -13.000 0.209 1.000   NA
 595237 595238 BT9727_0031 BT9727_0032     TRUE 0.742 -31.000 0.041 1.000   NA
 595240 595241 BT9727_0034 BT9727_0035 metS tatD FALSE 0.329 166.000 0.221 NA N NA
 595241 595242 BT9727_0035 BT9727_0036 tatD rnmV FALSE 0.390 215.000 0.058 NA Y NA
 595242 595243 BT9727_0036 BT9727_0037 rnmV ksgA TRUE 0.863 -3.000 0.093 1.000 N NA
 595243 595244 BT9727_0037 BT9727_0038 ksgA   FALSE 0.146 111.000 0.022 NA   NA
 595244 595245 BT9727_0038 BT9727_0039   veg FALSE 0.038 239.000 0.116 NA   NA
 595245 595246 BT9727_0039 BT9727_0040 veg ispE FALSE 0.004 459.000 0.046 NA   NA
 595246 595247 BT9727_0040 BT9727_0041 ispE purR TRUE 0.727 55.000 0.062 1.000 N NA
 595247 595248 BT9727_0041 BT9727_0042 purR purR FALSE 0.507 123.000 0.227 NA N NA
 595248 595249 BT9727_0042 BT9727_0043 purR spoVG FALSE 0.471 153.000 0.377 NA N NA
 595249 595250 BT9727_0043 BT9727_0044 spoVG gcaD FALSE 0.167 325.000 0.014 1.000 Y NA
 595250 595251 BT9727_0044 BT9727_0045 gcaD prs TRUE 0.820 19.000 0.069 1.000 N NA
 595251 595252 BT9727_0045 BT9727_0046 prs spoVC TRUE 0.629 73.000 0.010 1.000 N NA
 595252 595253 BT9727_0046 BT9727_0047 spoVC   FALSE 0.235 71.000 0.033 NA   NA
 595253 595254 BT9727_0047 BT9727_0048   mfd FALSE 0.184 100.000 0.035 NA   NA
 595254 595255 BT9727_0048 BT9727_0049 mfd spoVT TRUE 0.728 137.000 0.026 NA Y NA
 595255 595256 BT9727_0049 BT9727_0050 spoVT   FALSE 0.042 231.000 0.147 NA   NA
 595256 595257 BT9727_0050 BT9727_0051     TRUE 0.592 13.000 0.058 1.000   NA
 595257 595258 BT9727_0051 BT9727_0052   hslR FALSE 0.583 15.000 0.054 1.000   NA
 595258 595259 BT9727_0052 BT9727_0053 hslR   FALSE 0.453 41.000 0.108 NA   NA
 595259 595260 BT9727_0053 BT9727_0054     TRUE 0.874 -3.000 0.774 NA   NA
 595260 595261 BT9727_0054 BT9727_0055   divIC FALSE 0.556 -3.000 0.074 NA   NA
 595261 595262 BT9727_0055 BT9727_0056 divIC   TRUE 0.645 88.000 0.134 1.000 N NA
 595262 5459421 BT9727_0056 tRNA-Met-1     FALSE 0.008 161.000 0.000 NA   NA
 5459421 5459422 tRNA-Met-1 tRNA-Glu-7     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459422 595265 tRNA-Glu-7 BT9727_0057   spoIIE FALSE 0.001 302.000 0.000 NA   NA
 595265 595266 BT9727_0057 BT9727_0058 spoIIE mesJ FALSE 0.134 234.000 0.041 1.000 N NA
 595266 595267 BT9727_0058 BT9727_0059 mesJ hprT TRUE 0.921 -3.000 0.067 0.050 N NA
 595267 595268 BT9727_0059 BT9727_0060 hprT ftsH TRUE 0.666 86.000 0.192 1.000 N NA
 595268 595269 BT9727_0060 BT9727_0061 ftsH   FALSE 0.143 225.000 0.029 1.000 N NA
 595269 595270 BT9727_0061 BT9727_0062   hslO TRUE 0.811 7.000 0.060 1.000 N NA
 595270 595271 BT9727_0062 BT9727_0063 hslO cysK FALSE 0.572 105.000 0.053 1.000 N NA
 595271 595272 BT9727_0063 BT9727_0064 cysK pabB FALSE 0.432 221.000 0.107 1.000 Y NA
 595272 595273 BT9727_0064 BT9727_0065 pabB pabA TRUE 0.981 6.000 0.452 0.001 Y NA
 595273 595274 BT9727_0065 BT9727_0066 pabA pabC TRUE 0.977 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 595274 595275 BT9727_0066 BT9727_0067 pabC sul TRUE 0.977 -7.000 0.519 1.000 Y NA
 595275 595276 BT9727_0067 BT9727_0068 sul folB TRUE 0.955 1.000 0.176 1.000 Y NA
 595276 595277 BT9727_0068 BT9727_0069 folB folK TRUE 0.960 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 595277 595278 BT9727_0069 BT9727_0070 folK   TRUE 0.888 -48.000 0.027 1.000 N NA
 595278 595279 BT9727_0070 BT9727_0071     TRUE 0.789 24.000 0.016 1.000 N NA
 595279 595280 BT9727_0071 BT9727_0072   lysS TRUE 0.675 160.000 0.021 1.000 Y NA
 595280 5459423 BT9727_0072 rRNA-16SrRNA_3 lysS   FALSE 0.000 401.000 0.000 NA   NA
 5459423 5459424 rRNA-16SrRNA_3 rRNA-23SrRNA_3     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459424 5459425 rRNA-23SrRNA_3 rRNA-5SrRNA_3     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459425 5459426 rRNA-5SrRNA_3 tRNA-Val-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459426 5459427 tRNA-Val-5 tRNA-Thr-1     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459427 5459428 tRNA-Thr-1 tRNA-Lys-4     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459428 5459429 tRNA-Lys-4 tRNA-Leu-8     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 5459429 5459430 tRNA-Leu-8 tRNA-Gly-2     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 5459430 5459431 tRNA-Gly-2 tRNA-Leu-6     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459431 5459432 tRNA-Leu-6 tRNA-Arg-5     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459432 5459433 tRNA-Arg-5 tRNA-Pro-2     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459433 5459434 tRNA-Pro-2 tRNA-Ala-3     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 5459434 5459435 tRNA-Ala-3 rRNA-16SrRNA_4     FALSE 0.020 102.000 0.000 NA   NA
 5459435 5459436 rRNA-16SrRNA_4 rRNA-23SrRNA_4     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459436 5459437 rRNA-23SrRNA_4 rRNA-5SrRNA_4     FALSE 0.041 48.000 0.000 NA   NA
 5459437 595296 rRNA-5SrRNA_4 BT9727_0075   ctsR FALSE 0.004 204.000 0.000 NA   NA
 595296 595297 BT9727_0075 BT9727_0076 ctsR   FALSE 0.320 174.000 0.681 NA   NA
 595297 595298 BT9727_0076 BT9727_0077   karG TRUE 0.884 5.000 0.848 1.000   NA
 595298 595299 BT9727_0077 BT9727_0078 karG clpC TRUE 0.884 23.000 0.425 1.000 N NA
 595299 595300 BT9727_0078 BT9727_0079 clpC radA TRUE 0.912 97.000 0.062 0.011 Y NA
 595300 595301 BT9727_0079 BT9727_0080 radA   TRUE 0.670 4.000 0.126 1.000   NA
 595301 595302 BT9727_0080 BT9727_0081     FALSE 0.119 161.000 0.088 NA   NA
 595302 595303 BT9727_0081 BT9727_0082   ispD FALSE 0.507 17.000 0.108 NA   NA
 595303 595304 BT9727_0082 BT9727_0083 ispD ispF TRUE 0.876 115.000 0.419 1.000 Y NA
 595304 595305 BT9727_0083 BT9727_0084 ispF gltX TRUE 0.626 90.000 0.076 1.000 N NA
 595305 595306 BT9727_0084 BT9727_0085 gltX cysE FALSE 0.023 433.000 0.008 1.000 N NA
 595306 595307 BT9727_0085 BT9727_0086 cysE cysS TRUE 0.937 -19.000 0.039 0.050 N NA
 595307 595308 BT9727_0086 BT9727_0087 cysS   TRUE 0.677 3.000 0.129 1.000   NA
 595308 595309 BT9727_0087 BT9727_0088     TRUE 0.894 -3.000 0.150 0.003   NA
 595309 595310 BT9727_0088 BT9727_0089     FALSE 0.528 4.000 0.109 NA   NA
 595310 595311 BT9727_0089 BT9727_0090   spo0H FALSE 0.532 68.000 0.361 NA   NA
 595311 595312 BT9727_0090 BT9727_0091 spo0H secE FALSE 0.040 314.000 0.000 1.000 N NA
 595312 595313 BT9727_0091 BT9727_0092 secE nusG TRUE 0.777 119.000 0.843 1.000 N NA
 595313 595314 BT9727_0092 BT9727_0093 nusG rplK FALSE 0.563 168.000 0.681 1.000 N NA
 595314 595315 BT9727_0093 BT9727_0094 rplK rplA TRUE 0.861 177.000 0.838 0.017 Y NA
 595315 595316 BT9727_0094 BT9727_0095 rplA rplJ FALSE 0.585 233.000 0.302 0.017 Y NA
 595316 595317 BT9727_0095 BT9727_0096 rplJ rplL TRUE 0.971 68.000 0.884 0.013 Y NA
 595317 595318 BT9727_0096 BT9727_0097 rplL   TRUE 0.871 77.000 0.050 1.000 Y NA
 595318 595319 BT9727_0097 BT9727_0098   rpoB FALSE 0.064 294.000 0.008 1.000 N NA
 595319 595320 BT9727_0098 BT9727_0099 rpoB rpoC TRUE 0.984 38.000 0.851 0.001 Y NA
 595320 595321 BT9727_0099 BT9727_0100 rpoC   FALSE 0.559 81.000 0.065 NA N NA
 595321 595322 BT9727_0100 BT9727_0101   rpsl TRUE 0.820 115.000 0.239 NA Y NA
 595322 595323 BT9727_0101 BT9727_0102 rpsl rpsG TRUE 0.972 30.000 0.224 0.002 Y NA
 595323 595324 BT9727_0102 BT9727_0103 rpsG fusA TRUE 0.623 208.000 0.579 1.000 Y NA
 595324 595325 BT9727_0103 BT9727_0104 fusA tufA TRUE 0.930 118.000 0.400 0.001 Y NA
 595325 595326 BT9727_0104 BT9727_0105 tufA rpsJ FALSE 0.145 399.000 0.318 1.000 Y NA
 595326 595327 BT9727_0105 BT9727_0106 rpsJ rplC TRUE 0.975 35.000 0.467 0.017 Y NA
 595327 595328 BT9727_0106 BT9727_0107 rplC rplD TRUE 0.979 26.000 0.544 0.013 Y NA
 595328 595329 BT9727_0107 BT9727_0108 rplD rplW TRUE 0.978 0.000 0.307 0.013 Y NA
 595329 595330 BT9727_0108 BT9727_0109 rplW rplB TRUE 0.984 29.000 0.849 0.017 Y NA
 595330 595331 BT9727_0109 BT9727_0110 rplB rpsS TRUE 0.973 61.000 0.820 0.017 Y NA
 595331 595332 BT9727_0110 BT9727_0111 rpsS rplV TRUE 0.984 18.000 0.769 0.017 Y NA
 595332 595333 BT9727_0111 BT9727_0112 rplV rpsC TRUE 0.984 4.000 0.719 0.017 Y NA
 595333 595334 BT9727_0112 BT9727_0113 rpsC rplP TRUE 0.986 2.000 0.828 0.017 Y NA
 595334 595335 BT9727_0113 BT9727_0114 rplP rpmC TRUE 0.992 -34.000 0.802 0.013 Y NA
 595335 595336 BT9727_0114 BT9727_0115 rpmC rpsQ TRUE 0.985 21.000 0.828 0.013 Y NA
 595336 595337 BT9727_0115 BT9727_0116 rpsQ rplN TRUE 0.979 44.000 0.791 0.017 Y NA
 595337 595338 BT9727_0116 BT9727_0117 rplN rplX TRUE 0.960 39.000 0.071 0.017 Y NA
 595338 595339 BT9727_0117 BT9727_0118 rplX rplE TRUE 0.965 27.000 0.057 0.013 Y NA
 595339 595340 BT9727_0118 BT9727_0119 rplE rpsN TRUE 0.976 34.000 0.496 0.013 Y NA
 595340 595341 BT9727_0119 BT9727_0120 rpsN rpsH TRUE 0.977 30.000 0.473 0.013 Y NA
 595341 595342 BT9727_0120 BT9727_0121 rpsH rplF TRUE 0.983 33.000 0.808 0.013 Y NA
 595342 595343 BT9727_0121 BT9727_0122 rplF rplR TRUE 0.983 32.000 0.815 0.013 Y NA
 595343 595344 BT9727_0122 BT9727_0123 rplR rplR TRUE 0.985 22.000 0.814 0.017 Y NA
 595344 595345 BT9727_0123 BT9727_0124 rplR rpmD TRUE 0.982 14.000 0.789 0.017 Y NA
 595345 595346 BT9727_0124 BT9727_0125 rpmD rplO TRUE 0.982 34.000 0.653 0.002 Y NA
 595346 595347 BT9727_0125 BT9727_0126 rplO secY TRUE 0.933 0.000 0.730 1.000 N NA
 595347 595348 BT9727_0126 BT9727_0127 secY adk TRUE 0.769 57.000 0.241 1.000 N NA
 595348 595349 BT9727_0127 BT9727_0128 adk map TRUE 0.881 0.000 0.290 1.000 N NA
 595349 595350 BT9727_0128 BT9727_0129 map infA TRUE 0.898 69.000 0.160 1.000 Y NA
 595350 595351 BT9727_0129 BT9727_0130 infA rpsM TRUE 0.762 171.000 0.075 0.018 Y NA
 595351 595352 BT9727_0130 BT9727_0131 rpsM rpsK TRUE 0.984 25.000 0.810 0.013 Y NA
 595352 595353 BT9727_0131 BT9727_0132 rpsK rpoA FALSE 0.367 181.000 0.308 1.000 N NA
 595353 595354 BT9727_0132 BT9727_0133 rpoA rplQ TRUE 0.920 36.000 0.873 1.000 N NA
 595354 595355 BT9727_0133 BT9727_0134 rplQ   TRUE 0.770 44.000 0.074 1.000 N NA
 595355 595356 BT9727_0134 BT9727_0135     TRUE 0.991 -24.000 0.713 0.031 Y NA
 595356 595357 BT9727_0135 BT9727_0136     TRUE 0.968 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 595357 595358 BT9727_0136 BT9727_0137   truA TRUE 0.817 15.000 0.170 1.000 N NA
 595358 595359 BT9727_0137 BT9727_0138 truA rplM TRUE 0.722 153.000 0.052 1.000 Y NA
 595359 595360 BT9727_0138 BT9727_0139 rplM   TRUE 0.982 22.000 0.601 0.013 Y NA
 595360 595361 BT9727_0139 BT9727_0140     FALSE 0.068 163.000 0.021 NA   NA
 595361 595362 BT9727_0140 BT9727_0141   cwlD FALSE 0.416 67.000 0.211 NA   NA
 595362 595363 BT9727_0141 BT9727_0142 cwlD mrp FALSE 0.507 145.000 0.211 1.000 N NA
 595367 5459438 BT9727_0146 rRNA-16SrRNA_5     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 5459438 5459439 rRNA-16SrRNA_5 rRNA-23SrRNA_5     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459439 5459440 rRNA-23SrRNA_5 rRNA-5SrRNA_5     FALSE 0.023 86.000 0.000 NA   NA
 5459440 5459441 rRNA-5SrRNA_5 tRNA-Asn-3     FALSE 0.055 10.000 0.000 NA   NA
 5459441 5459442 tRNA-Asn-3 tRNA-Thr-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459442 5459443 tRNA-Thr-3 tRNA-Glu-4     FALSE 0.058 22.000 0.000 NA   NA
 5459443 5459444 tRNA-Glu-4 tRNA-Val-6     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459444 5459445 tRNA-Val-6 tRNA-Tyr-2     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 5459445 5459446 tRNA-Tyr-2 tRNA-Gln-4     FALSE 0.032 63.000 0.000 NA   NA
 5459446 5459447 tRNA-Gln-4 tRNA-Lys-1     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459447 5459448 tRNA-Lys-1 tRNA-Gly-6     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459448 5459449 tRNA-Gly-6 tRNA-Ala-2     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459449 595380 tRNA-Ala-2 BT9727_0148   garK FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 595380 595381 BT9727_0148 BT9727_0149 garK rocF FALSE 0.132 210.000 0.000 1.000 N NA
 595381 595382 BT9727_0149 BT9727_0150 rocF   FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 595382 595383 BT9727_0150 BT9727_0151     TRUE 0.839 -7.000 0.502 NA   NA
 595383 595384 BT9727_0151 BT9727_0152   glmM TRUE 0.640 -7.000 0.150 NA   NA
 595384 595385 BT9727_0152 BT9727_0153 glmM glmS FALSE 0.020 486.000 0.030 1.000 N NA
 595387 595388 BT9727_0155 BT9727_0156   gntR FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 595388 595389 BT9727_0156 BT9727_0157 gntR gntK TRUE 0.945 -7.000 0.680 1.000 N NA
 595389 595390 BT9727_0157 BT9727_0158 gntK gntP TRUE 0.903 117.000 0.696 1.000 Y NA
 595390 595391 BT9727_0158 BT9727_0159 gntP gntZ FALSE 0.247 265.000 0.000 1.000 Y NA
 595391 595392 BT9727_0159 BT9727_0160 gntZ   FALSE 0.047 340.000 0.047 1.000 N NA
 595392 595393 BT9727_0160 BT9727_0161     FALSE 0.216 119.000 0.100 NA   NA
 595394 595395 BT9727_0162 BT9727_0163     FALSE 0.002 241.000 0.000 NA   NA
 595398 595399 BT9727_0166 BT9727_0167     FALSE 0.199 133.000 0.137 NA   NA
 595399 595400 BT9727_0167 BT9727_0168     TRUE 0.677 -3.000 0.052 1.000   NA
 595400 595401 BT9727_0168 BT9727_0169     FALSE 0.206 76.000 0.026 NA   NA
 595401 595402 BT9727_0169 BT9727_0170   tcaB FALSE 0.218 119.000 0.104 NA   NA
 595402 595403 BT9727_0170 BT9727_0171 tcaB   FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 595405 595406 BT9727_0173 BT9727_0174 oppB oppC TRUE 0.985 18.000 0.909 0.050 Y NA
 595406 595407 BT9727_0174 BT9727_0175 oppC oppD TRUE 0.975 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 595407 595408 BT9727_0175 BT9727_0176 oppD oppF TRUE 0.980 -3.000 0.233 0.004 Y NA
 595408 595409 BT9727_0176 BT9727_0177 oppF oppA TRUE 0.949 14.000 0.292 1.000 Y NA
 595411 595412 BT9727_0179 BT9727_0180     FALSE 0.311 276.000 0.000 0.065 Y NA
 595412 595413 BT9727_0180 BT9727_0181     FALSE 0.554 59.000 0.333 NA   NA
 595414 595415 BT9727_0182 BT9727_0183 oppA oppA FALSE 0.182 388.000 0.000 0.001 Y NA
 595415 595416 BT9727_0183 BT9727_0184 oppA   FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000   NA
 595416 595417 BT9727_0184 BT9727_0185   proC TRUE 0.825 2.000 0.471 1.000   NA
 595419 595420 BT9727_0187 BT9727_0188 glcU modB FALSE 0.089 302.000 0.000 0.085 N NA
 595420 595421 BT9727_0188 BT9727_0189 modB modA TRUE 0.981 6.000 0.430 0.001 Y NA
 595424 595425 BT9727_0192 BT9727_0193     FALSE 0.000 534.000 0.000 NA   NA
 595425 595426 BT9727_0193 BT9727_0194     FALSE 0.015 475.000 0.000 1.000 N NA
 595426 595427 BT9727_0194 BT9727_0195     FALSE 0.472 150.000 0.778 NA   NA
 595427 595428 BT9727_0195 BT9727_0196     FALSE 0.583 119.000 0.778 NA   NA
 595428 595429 BT9727_0196 BT9727_0197     FALSE 0.483 138.000 0.667 NA   NA
 595429 595430 BT9727_0197 BT9727_0198     FALSE 0.000 743.000 0.000 NA   NA
 595430 595431 BT9727_0198 BT9727_0199     FALSE 0.177 97.000 0.028 NA   NA
 595435 595436 BT9727_0203 BT9727_0204     FALSE 0.215 125.000 0.140 NA   NA
 595436 595437 BT9727_0204 BT9727_0205   oppA FALSE 0.002 898.000 0.000 1.000   NA
 595437 595438 BT9727_0205 BT9727_0206 oppA oppB TRUE 0.929 104.000 0.444 0.050 Y NA
 595438 595439 BT9727_0206 BT9727_0207 oppB oppC TRUE 0.983 16.000 0.850 0.050 Y NA
 595439 595440 BT9727_0207 BT9727_0208 oppC oppD TRUE 0.971 11.000 0.750 1.000 Y NA
 595440 595441 BT9727_0208 BT9727_0209 oppD oppF TRUE 0.986 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 595445 595446 BT9727_0213 BT9727_0214 hppD   TRUE 0.710 67.000 0.118 1.000 N NA
 595446 595447 BT9727_0214 BT9727_0215     TRUE 0.972 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 595447 595448 BT9727_0215 BT9727_0216     FALSE 0.097 234.000 0.000 1.000 N NA
 595448 595449 BT9727_0216 BT9727_0217   ddl FALSE 0.023 383.000 0.000 1.000 N NA
 595449 595450 BT9727_0217 BT9727_0218 ddl murF TRUE 0.943 61.000 0.044 0.007 Y NA
 595450 595451 BT9727_0218 BT9727_0219 murF deaD FALSE 0.055 306.000 0.004 1.000 N NA
 595451 595452 BT9727_0219 BT9727_0220 deaD   TRUE 0.838 97.000 0.013 1.000 Y NA
 595454 595455 BT9727_0222 BT9727_0223 acpS   FALSE 0.510 94.000 0.038 NA N NA
 595455 595456 BT9727_0223 BT9727_0224   alr TRUE 0.802 119.000 0.194 NA Y NA
 595456 595457 BT9727_0224 BT9727_0225 alr   FALSE 0.050 310.000 0.108 NA N NA
 595457 595458 BT9727_0225 BT9727_0226     TRUE 0.818 5.000 0.260 NA N NA
 595458 595459 BT9727_0226 BT9727_0227     TRUE 0.698 62.000 0.045 1.000 N NA
 595459 595460 BT9727_0227 BT9727_0228     FALSE 0.013 370.000 0.215 NA   NA
 595460 5459450 BT9727_0228 tRNA-Asn-1     FALSE 0.017 115.000 0.000 NA   NA
 5459450 5459451 tRNA-Asn-1 tRNA-Ser-2     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459451 5459452 tRNA-Ser-2 tRNA-Glu-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459452 5459453 tRNA-Glu-1 tRNA-Val-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459453 5459454 tRNA-Val-3 tRNA-Asp-4     FALSE 0.043 44.000 0.000 NA   NA
 5459454 5459455 tRNA-Asp-4 tRNA-Gln-3     FALSE 0.023 85.000 0.000 NA   NA
 5459455 5459456 tRNA-Gln-3 tRNA-Lys-5     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459456 5459457 tRNA-Lys-5 tRNA-Leu-5     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459457 5459458 tRNA-Leu-5 tRNA-Arg-3     FALSE 0.022 93.000 0.000 NA   NA
 5459458 595470 tRNA-Arg-3 tRNA-Pro-4     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 595470 5459459 tRNA-Pro-4 tRNA-Gly-3     FALSE 0.070 -1.000 0.000 NA   NA
 5459459 5459460 tRNA-Gly-3 rRNA-16SrRNA_6     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459460 5459461 rRNA-16SrRNA_6 rRNA-23SrRNA_6     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459461 5459462 rRNA-23SrRNA_6 rRNA-5SrRNA_6     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459462 5459463 rRNA-5SrRNA_6 tRNA-Met-4     FALSE 0.055 10.000 0.000 NA   NA
 5459463 5459464 tRNA-Met-4 tRNA-Asp-1     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459464 595477 tRNA-Asp-1 BT9727_0230     FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 595477 595478 BT9727_0230 BT9727_0231     TRUE 0.722 -19.000 0.217 NA   NA
 595478 595479 BT9727_0231 BT9727_0232   rimI TRUE 0.630 14.000 0.127 1.000   NA
 595479 595480 BT9727_0232 BT9727_0233 rimI gcP TRUE 0.687 0.000 0.090 1.000   NA
 595483 595484 BT9727_0236 BT9727_0237     FALSE 0.564 -3.000 0.080 NA   NA
 595485 595486 BT9727_0238 BT9727_0239 groES groEL TRUE 0.979 39.000 0.674 0.006 Y NA
 595486 595487 BT9727_0239 BT9727_0240 groEL guaA FALSE 0.022 399.000 0.000 1.000 N NA
 595487 595488 BT9727_0240 BT9727_0241 guaA   FALSE 0.005 385.000 0.000 1.000   NA
 595488 595489 BT9727_0241 BT9727_0242     FALSE 0.276 145.000 0.146 1.000   NA
 595489 595490 BT9727_0242 BT9727_0243     TRUE 0.991 -16.000 0.800 0.023 Y NA
 595490 5459465 BT9727_0243 rRNA-16SrRNA_7     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5459465 5459466 rRNA-16SrRNA_7 rRNA-23SrRNA_7     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459466 5459467 rRNA-23SrRNA_7 rRNA-5SrRNA_7     FALSE 0.041 48.000 0.000 NA   NA
 5459467 595494 rRNA-5SrRNA_7 BT9727_0245     FALSE 0.000 724.000 0.000 NA   NA
 595494 595495 BT9727_0245 BT9727_0246   frnE FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 595495 5459468 BT9727_0246 rRNA-16SrRNA_8 frnE   FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 5459468 5459469 rRNA-16SrRNA_8 rRNA-23SrRNA_8     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459469 5459470 rRNA-23SrRNA_8 rRNA-5SrRNA_8     FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 5459470 595499 rRNA-5SrRNA_8 BT9727_0248   galE FALSE 0.000 486.000 0.000 NA   NA
 595499 595500 BT9727_0248 BT9727_0249 galE galE FALSE 0.139 239.000 0.000 0.001   NA
 595500 5459471 BT9727_0249 rRNA-16SrRNA_9 galE   FALSE 0.000 1135.000 0.000 NA   NA
 595504 595505 BT9727_0251 BT9727_0252 bacA bcrB TRUE 0.606 18.000 0.240 NA   NA
 595505 595506 BT9727_0252 BT9727_0253 bcrB bcrA TRUE 0.818 -16.000 0.400 NA   NA
 595506 595507 BT9727_0253 BT9727_0254 bcrA   TRUE 0.820 69.000 0.556 1.000 N NA
 595507 595508 BT9727_0254 BT9727_0255     TRUE 0.981 -19.000 0.538 1.000 Y NA
 5459473 5459474 rRNA-16SrRNA_10 rRNA-23SrRNA_9     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 5459474 3396254 rRNA-23SrRNA_9 BT9727_r02     FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 3396254 595511 BT9727_r02 BT9727_0257     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 3396255 5459475 BT9727_r01 rRNA-23SrRNA_10     FALSE 0.008 159.000 0.000 NA   NA
 5459475 5459476 rRNA-23SrRNA_10 rRNA-5SrRNA_10     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 5459476 595515 rRNA-5SrRNA_10 BT9727_0260   purE FALSE 0.000 724.000 0.000 NA   NA
 595515 595516 BT9727_0260 BT9727_0261 purE purK TRUE 0.978 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 595516 595517 BT9727_0261 BT9727_0262 purK purB TRUE 0.954 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 595517 595518 BT9727_0262 BT9727_0263 purB purC TRUE 0.862 89.000 0.072 1.000 Y NA
 595518 595519 BT9727_0263 BT9727_0264 purC purS TRUE 0.976 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 595519 595520 BT9727_0264 BT9727_0265 purS purQ TRUE 0.988 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 595520 595521 BT9727_0265 BT9727_0266 purQ purL TRUE 0.988 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 595521 595522 BT9727_0266 BT9727_0267 purL purF TRUE 0.971 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 595522 595523 BT9727_0267 BT9727_0268 purF purM TRUE 0.858 107.000 0.248 1.000 Y NA
 595523 595524 BT9727_0268 BT9727_0269 purM purN TRUE 0.981 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 595524 595525 BT9727_0269 BT9727_0270 purN purH TRUE 0.949 25.000 0.225 1.000 Y NA
 595525 595526 BT9727_0270 BT9727_0271 purH purD TRUE 0.834 121.000 0.238 1.000 Y NA
 595527 595528 BT9727_0272 BT9727_0273     FALSE 0.003 210.000 0.000 NA   NA
 595529 595530 BT9727_0274 BT9727_0275   pcrA FALSE 0.466 1.000 0.049 NA   NA
 595530 595531 BT9727_0275 BT9727_0276 pcrA ligA TRUE 0.967 16.000 0.103 0.012 Y NA
 595531 595532 BT9727_0276 BT9727_0277 ligA   FALSE 0.314 17.000 0.009 NA   NA
 595532 595533 BT9727_0277 BT9727_0278     TRUE 0.657 96.000 0.800 NA   NA
 595533 595534 BT9727_0278 BT9727_0279   rocA FALSE 0.262 154.000 0.205 1.000   NA
 595536 595537 BT9727_0281 BT9727_0282     TRUE 0.970 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 595537 595538 BT9727_0282 BT9727_0283     TRUE 0.941 22.000 0.233 NA Y NA
 595539 595540 BT9727_0284 BT9727_0285   arsA TRUE 0.886 -22.000 0.636 NA   NA
 595540 595541 BT9727_0285 BT9727_0286 arsA   TRUE 0.818 77.000 0.667 1.000 N NA
 595542 595543 BT9727_0287 BT9727_0288   gatC FALSE 0.087 142.000 0.009 NA   NA
 595543 595544 BT9727_0288 BT9727_0289 gatC gatA TRUE 0.983 16.000 0.643 0.001 Y NA
 595544 595545 BT9727_0289 BT9727_0290 gatA gatB TRUE 0.979 15.000 0.492 0.001 Y NA
 595545 595546 BT9727_0290 BT9727_0291 gatB   FALSE 0.022 471.000 0.034 1.000 N NA
 595546 595547 BT9727_0291 BT9727_0292     FALSE 0.221 140.000 0.028 1.000   NA
 595547 595548 BT9727_0292 BT9727_0293   gabT FALSE 0.188 155.000 0.045 1.000   NA
 595548 595549 BT9727_0293 BT9727_0294 gabT   TRUE 0.686 113.000 0.409 1.000 N NA
 595549 595550 BT9727_0294 BT9727_0295   gadD TRUE 0.937 -7.000 0.583 1.000 N NA
 595550 595551 BT9727_0295 BT9727_0296 gadD   TRUE 0.774 48.000 0.157 1.000 N NA
 595552 595553 BT9727_0297 BT9727_0298 ampS   FALSE 0.417 117.000 0.258 1.000   NA
 595556 595557 BT9727_0301 BT9727_0302     TRUE 0.837 97.000 0.008 1.000 Y NA
 595557 595558 BT9727_0302 BT9727_0303     FALSE 0.046 301.000 0.000 1.000 N NA
 595558 595559 BT9727_0303 BT9727_0304     FALSE 0.177 78.000 0.014 NA   NA
 595559 595560 BT9727_0304 BT9727_0305     FALSE 0.000 402.000 0.000 NA   NA
 595560 595561 BT9727_0305 BT9727_0306     FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 595562 595563 BT9727_0307 BT9727_0308     TRUE 0.811 15.000 0.189 0.088   NA
 595566 595567 BT9727_0311 BT9727_0312 amhX   FALSE 0.217 152.000 0.263 NA   NA
 595568 595569 BT9727_0313 BT9727_0314 ahpF ahpC TRUE 0.962 15.000 0.551 1.000 Y NA
 595570 595571 BT9727_0315 BT9727_0316 mtrK   FALSE 0.586 10.000 0.042 1.000   NA
 595571 595572 BT9727_0316 BT9727_0317   fucA TRUE 0.700 55.000 0.017 1.000 N NA
 595573 595574 BT9727_0318 BT9727_0319 fhuG fhuB TRUE 0.981 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 595574 595575 BT9727_0319 BT9727_0320 fhuB fhuD TRUE 0.924 73.000 0.487 1.000 Y NA
 595578 595579 BT9727_0323 BT9727_0324   cotB FALSE 0.002 236.000 0.000 NA   NA
 595579 595580 BT9727_0324 BT9727_0325 cotB cotB FALSE 0.058 21.000 0.000 NA   NA
 595580 595581 BT9727_0325 BT9727_0326 cotB   FALSE 0.008 163.000 0.000 NA   NA
 595581 595582 BT9727_0326 BT9727_0327     FALSE 0.002 236.000 0.000 NA   NA
 595582 595583 BT9727_0327 BT9727_0328     FALSE 0.000 816.000 0.000 NA   NA
 595585 595586 BT9727_0330 BT9727_0331     FALSE 0.184 122.000 0.068 NA   NA
 595587 595588 BT9727_0332 BT9727_0333     FALSE 0.516 49.000 0.053 1.000   NA
 595590 595591 BT9727_0335 BT9727_0336     TRUE 0.842 146.000 0.130 0.062 Y NA
 595591 595592 BT9727_0336 BT9727_0337   glnQ TRUE 0.852 122.000 0.348 1.000 Y NA
 595592 595593 BT9727_0337 BT9727_0338 glnQ mcp FALSE 0.344 171.000 0.133 1.000 N NA
 595594 595595 BT9727_0339 BT9727_0340 mcpA argR FALSE 0.432 154.000 0.139 1.000 N NA
 595595 595596 BT9727_0340 BT9727_0341 argR arcA FALSE 0.056 281.000 0.000 1.000 N NA
 595596 595597 BT9727_0341 BT9727_0342 arcA arcB TRUE 0.942 31.000 0.146 1.000 Y NA
 595597 595598 BT9727_0342 BT9727_0343 arcB arcD TRUE 0.862 100.000 0.188 1.000 Y NA
 595598 595599 BT9727_0343 BT9727_0344 arcD arcC TRUE 0.969 38.000 0.818 1.000 Y NA
 595599 595600 BT9727_0344 BT9727_0345 arcC   FALSE 0.232 200.000 0.088 1.000 N NA
 595600 595601 BT9727_0345 BT9727_0346     FALSE 0.172 152.000 0.176 NA   NA
 595601 595602 BT9727_0346 BT9727_0347     FALSE 0.000 390.000 0.000 NA   NA
 595602 595603 BT9727_0347 BT9727_0348   ptsG FALSE 0.510 206.000 0.167 1.000 Y NA
 595603 595604 BT9727_0348 BT9727_0349 ptsG   TRUE 0.806 5.000 0.610 NA   NA
 595604 595605 BT9727_0349 BT9727_0350     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 595607 595608 BT9727_0352 BT9727_0353 thiM thiE TRUE 0.968 17.000 0.061 0.004 Y NA
 595610 595611 BT9727_0355 BT9727_0356 cheW   FALSE 0.002 264.000 0.000 NA   NA
 595611 595612 BT9727_0356 BT9727_0357     TRUE 0.824 -52.000 0.364 NA   NA
 595612 595613 BT9727_0357 BT9727_0358     TRUE 0.971 -3.000 0.584 NA Y NA
 595613 595614 BT9727_0358 BT9727_0359     TRUE 0.970 -3.000 0.554 NA Y NA
 595614 595615 BT9727_0359 BT9727_0360     FALSE 0.245 68.000 0.032 NA   NA
 595615 595616 BT9727_0360 BT9727_0361     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 595618 595619 BT9727_0363 BT9727_0364     FALSE 0.451 11.000 0.065 NA   NA
 595619 595620 BT9727_0364 BT9727_0365     FALSE 0.375 14.000 0.037 NA   NA
 595620 595621 BT9727_0365 BT9727_0366     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 595621 595622 BT9727_0366 BT9727_0367     TRUE 0.763 67.000 0.714 1.000   NA
 595622 595623 BT9727_0367 BT9727_0368     TRUE 0.653 57.000 0.333 1.000   NA
 595623 595624 BT9727_0368 BT9727_0369     FALSE 0.417 52.000 0.143 NA   NA
 595625 595626 BT9727_0370 BT9727_0371     FALSE 0.336 109.000 0.068 1.000   NA
 595627 595628 BT9727_0372 BT9727_0373   proS FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 595630 595631 BT9727_0375 BT9727_0376   terD FALSE 0.533 129.000 0.145 1.000 N NA
 595631 595632 BT9727_0376 BT9727_0377 terD terD TRUE 0.978 18.000 0.364 0.003 Y NA
 595632 595633 BT9727_0377 BT9727_0378 terD   TRUE 0.956 81.000 0.571 0.003 Y NA
 595633 595634 BT9727_0378 BT9727_0379     TRUE 0.742 74.000 0.308 1.000 N NA
 595634 595635 BT9727_0379 BT9727_0380     FALSE 0.326 110.000 0.256 NA   NA
 595635 595636 BT9727_0380 BT9727_0381     TRUE 0.834 19.000 0.727 NA   NA
 595637 595638 BT9727_0382 BT9727_0383 pacL   FALSE 0.074 192.000 0.125 NA   NA
 595639 595640 BT9727_0384 BT9727_0385 ptp   FALSE 0.256 54.000 0.019 NA   NA
 595640 595641 BT9727_0385 BT9727_0386   rbn TRUE 0.630 7.000 0.273 NA   NA
 595642 595643 BT9727_0387 BT9727_0388     FALSE 0.324 34.000 0.018 NA   NA
 595644 595645 BT9727_0389 BT9727_0390     FALSE 0.148 123.000 0.039 NA   NA
 595650 595651 BT9727_0395 BT9727_0396     FALSE 0.000 409.000 0.000 NA   NA
 595652 595653 BT9727_0397 BT9727_0398     FALSE 0.356 82.000 0.212 NA   NA
 595655 595656 BT9727_0400 BT9727_0401   fumA FALSE 0.055 207.000 0.093 NA   NA
 595656 595657 BT9727_0401 BT9727_0402 fumA   FALSE 0.554 127.000 0.185 1.000 N NA
 595657 595658 BT9727_0402 BT9727_0403   alkA TRUE 0.740 60.000 0.160 1.000 N NA
 595658 595659 BT9727_0403 BT9727_0404 alkA   TRUE 0.825 11.000 0.164 1.000 N NA
 595659 595660 BT9727_0404 BT9727_0405   truA TRUE 0.941 57.000 0.016 0.018 Y NA
 595661 595662 BT9727_0406 BT9727_0407   rocR FALSE 0.432 84.000 0.304 NA   NA
 595663 595664 BT9727_0408 BT9727_0409   rocE FALSE 0.562 107.000 0.636 NA   NA
 595664 595665 BT9727_0409 BT9727_0410 rocE argE TRUE 0.876 96.000 0.259 1.000 Y NA
 595668 595669 BT9727_0413 BT9727_0414   glsA FALSE 0.169 176.000 0.320 NA   NA
 595670 595671 BT9727_0415 BT9727_0416 nagE pbpX FALSE 0.104 228.000 0.000 1.000 N NA
 595671 595672 BT9727_0416 BT9727_0417 pbpX   FALSE 0.359 84.000 0.222 NA   NA
 595672 595673 BT9727_0417 BT9727_0418     FALSE 0.151 167.000 0.231 NA   NA
 595673 595674 BT9727_0418 BT9727_0419     TRUE 0.899 -31.000 0.692 NA   NA
 595674 595675 BT9727_0419 BT9727_0420     TRUE 0.795 14.000 0.667 NA   NA
 595675 595676 BT9727_0420 BT9727_0421     TRUE 0.975 -10.000 0.533 NA Y NA
 595676 595677 BT9727_0421 BT9727_0422   galE TRUE 0.957 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 595677 595678 BT9727_0422 BT9727_0423 galE   FALSE 0.582 -19.000 0.050 NA   NA
 595678 595679 BT9727_0423 BT9727_0424   pflB FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 595679 595680 BT9727_0424 BT9727_0425 pflB pflA TRUE 0.699 70.000 0.135 1.000 N NA
 595680 595681 BT9727_0425 BT9727_0426 pflA ugtP FALSE 0.020 413.000 0.000 1.000 N NA
 595682 595683 BT9727_0427 BT9727_0428   hutI FALSE 0.061 242.000 0.000 NA N NA
 595683 595684 BT9727_0428 BT9727_0429 hutI   FALSE 0.313 141.000 0.200 1.000   NA
 595685 595686 BT9727_0430 BT9727_0431 recX   FALSE 0.412 10.000 0.045 NA   NA
 595686 595687 BT9727_0431 BT9727_0432     FALSE 0.005 541.000 0.116 NA   NA
 595691 595692 BT9727_0436 BT9727_0437 sspE   FALSE 0.152 189.000 0.364 NA   NA
 595692 595693 BT9727_0437 BT9727_0438     FALSE 0.030 233.000 0.058 NA   NA
 595693 595694 BT9727_0438 BT9727_0439     TRUE 0.669 55.000 0.077 NA N NA
 595695 595696 BT9727_0440 BT9727_0441   gltB FALSE 0.023 261.000 0.066 NA   NA
 595696 595697 BT9727_0441 BT9727_0442 gltB gsaB FALSE 0.212 199.000 0.036 1.000 N NA
 595698 595699 BT9727_0443 BT9727_0444     TRUE 0.829 -7.000 0.488 NA   NA
 595699 595700 BT9727_0444 BT9727_0445     TRUE 0.768 5.000 0.500 NA   NA
 595700 595701 BT9727_0445 BT9727_0446   lctB FALSE 0.373 73.000 0.188 NA   NA
 595701 595702 BT9727_0446 BT9727_0447 lctB bcp FALSE 0.278 45.000 0.015 NA   NA
 595702 595703 BT9727_0447 BT9727_0448 bcp perR FALSE 0.064 293.000 0.005 1.000 N NA
 5459477 5459478 rRNA-16SrRNA_11 rRNA-23SrRNA_11     FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 5459478 5459479 rRNA-23SrRNA_11 rRNA-5SrRNA_11     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459479 5459480 rRNA-5SrRNA_11 tRNA-Asn-4     FALSE 0.055 9.000 0.000 NA   NA
 5459480 5459481 tRNA-Asn-4 tRNA-Ser-3     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 5459481 5459482 tRNA-Ser-3 tRNA-Glu-3     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 5459482 5459483 tRNA-Glu-3 tRNA-Val-4     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 5459483 5459484 tRNA-Val-4 tRNA-Met-3     FALSE 0.058 22.000 0.000 NA   NA
 5459484 5459485 tRNA-Met-3 tRNA-Asp-5     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459485 5459486 tRNA-Asp-5 tRNA-Phe-2     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 5459486 5459487 tRNA-Phe-2 tRNA-Thr-5     FALSE 0.054 16.000 0.000 NA   NA
 5459487 5459488 tRNA-Thr-5 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459488 5459489 tRNA-Tyr-1 tRNA-Trp-2     FALSE 0.059 5.000 0.000 NA   NA
 5459489 5459490 tRNA-Trp-2 tRNA-His-1     FALSE 0.056 17.000 0.000 NA   NA
 5459490 5459491 tRNA-His-1 tRNA-Gln-2     FALSE 0.033 61.000 0.000 NA   NA
 5459491 595720 tRNA-Gln-2 tRNA-Gly-9     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 595720 5459492 tRNA-Gly-9 tRNA-Cys-1     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 5459492 5459493 tRNA-Cys-1 tRNA-Leu-2     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 595724 595725 BT9727_0453 BT9727_0454   mutT FALSE 0.072 151.000 0.008 NA   NA
 595725 595726 BT9727_0454 BT9727_0455 mutT   FALSE 0.003 487.000 0.000 1.000   NA
 595726 595727 BT9727_0455 BT9727_0456   bdbD FALSE 0.146 182.000 0.123 1.000   NA
 595727 5459494 BT9727_0456 tRNA-Gly-8 bdbD   FALSE 0.017 116.000 0.000 NA   NA
 5459494 595729 tRNA-Gly-8 BT9727_0457     FALSE 0.004 196.000 0.000 NA   NA
 595729 595730 BT9727_0457 BT9727_0458     FALSE 0.476 45.000 0.174 NA   NA
 595730 595731 BT9727_0458 BT9727_0459   cspR FALSE 0.374 59.000 0.097 NA   NA
 595731 595732 BT9727_0459 BT9727_0460 cspR   FALSE 0.475 128.000 0.016 1.000 N NA
 595732 595733 BT9727_0460 BT9727_0461   prkA FALSE 0.092 392.000 0.000 1.000 Y NA
 595733 595734 BT9727_0461 BT9727_0462 prkA   FALSE 0.027 446.000 0.683 NA   NA
 595734 595735 BT9727_0462 BT9727_0463     FALSE 0.172 87.000 0.018 NA   NA
 595735 595736 BT9727_0463 BT9727_0464     FALSE 0.369 162.000 0.500 1.000   NA
 595738 595739 BT9727_0466 BT9727_0467 colA   FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 595739 595740 BT9727_0467 BT9727_0468     TRUE 0.730 13.000 0.464 NA   NA
 595740 595741 BT9727_0468 BT9727_0469   cheW FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 595741 595742 BT9727_0469 BT9727_0470 cheW citS TRUE 0.896 152.000 0.600 0.016 Y NA
 595742 595743 BT9727_0470 BT9727_0471 citS   TRUE 0.985 0.000 0.818 0.087 Y NA
 595745 595746 BT9727_0473 BT9727_0474     FALSE 0.198 132.000 0.125 NA   NA
 595746 595747 BT9727_0474 BT9727_0475     FALSE 0.000 410.000 0.000 NA   NA
 595747 595748 BT9727_0475 BT9727_0476   glpP FALSE 0.000 559.000 0.000 NA   NA
 595748 595749 BT9727_0476 BT9727_0477 glpP   TRUE 0.920 -36.000 0.262 1.000 N NA
 595749 595750 BT9727_0477 BT9727_0478     TRUE 0.979 0.000 0.391 0.048 Y NA
 595750 595751 BT9727_0478 BT9727_0479     TRUE 0.988 -3.000 0.848 0.048 Y NA
 595751 595752 BT9727_0479 BT9727_0480     TRUE 0.982 22.000 0.708 0.048 Y NA
 595752 595753 BT9727_0480 BT9727_0481   pphA FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 595753 595754 BT9727_0481 BT9727_0482 pphA llrF FALSE 0.238 150.000 0.091 1.000   NA
 595754 595755 BT9727_0482 BT9727_0483 llrF   TRUE 0.976 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 595755 595756 BT9727_0483 BT9727_0484     FALSE 0.003 207.000 0.000 NA   NA
 595756 595757 BT9727_0484 BT9727_0485     TRUE 0.792 8.000 0.600 NA   NA
 595757 595758 BT9727_0485 BT9727_0486   mcpA FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 595758 595759 BT9727_0486 BT9727_0487 mcpA   TRUE 0.935 79.000 0.229 0.006 Y NA
 595759 595760 BT9727_0487 BT9727_0488     TRUE 0.976 -3.000 0.229 0.087 Y NA
 595760 595761 BT9727_0488 BT9727_0489   maeN FALSE 0.584 123.000 0.243 1.000 N NA
 595761 595762 BT9727_0489 BT9727_0490 maeN sfcA TRUE 0.935 60.000 0.432 1.000 Y NA
 595763 595764 BT9727_0491 BT9727_0492     FALSE 0.438 116.000 0.429 NA   NA
 595766 595767 BT9727_0494 BT9727_0495     FALSE 0.505 147.000 0.636 1.000   NA
 595767 595768 BT9727_0495 BT9727_0496   llrF TRUE 0.948 66.000 0.727 1.000 Y NA
 595768 595769 BT9727_0496 BT9727_0497 llrF   FALSE 0.010 834.000 0.000 1.000 N NA
 595769 595770 BT9727_0497 BT9727_0498   fdhD FALSE 0.102 229.000 0.000 1.000 N NA
 595771 595772 BT9727_0499 BT9727_0500 fdhF   TRUE 0.744 13.000 0.500 NA   NA
 595772 595773 BT9727_0500 BT9727_0502   glpQ FALSE 0.141 157.000 0.143 NA   NA
 595773 595774 BT9727_0502 BT9727_0503 glpQ ald FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000 N NA
 595774 595775 BT9727_0503 BT9727_0504 ald   TRUE 0.927 104.000 0.889 1.000 Y NA
 595775 595776 BT9727_0504 BT9727_0505   arsR FALSE 0.067 267.000 0.000 1.000 N NA
 595776 595777 BT9727_0505 BT9727_0506 arsR   TRUE 0.837 25.000 0.203 1.000 N NA
 595779 595780 BT9727_0508 BT9727_0509 nprR npr FALSE 0.012 295.000 0.000 1.000   NA
 595782 595783 BT9727_0511 BT9727_0512     TRUE 0.819 16.000 0.727 NA   NA
 595785 595786 BT9727_0514 BT9727_0515     TRUE 0.887 135.000 0.333 0.052 Y NA
 595787 595788 BT9727_0516 BT9727_0517 lytR nupC FALSE 0.120 264.000 0.333 NA N NA
 595789 595790 BT9727_0518 BT9727_0519 gloA   FALSE 0.127 108.000 0.010 NA   NA
 595790 595791 BT9727_0519 BT9727_0520   aspA FALSE 0.156 163.000 0.222 NA   NA
 595793 595794 BT9727_0522 BT9727_0523 arsR sspH FALSE 0.394 123.000 0.261 1.000   NA
 595795 595796 BT9727_0524 BT9727_0525 ptr2 fecB FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 595797 595798 BT9727_0526 BT9727_0527   fecD TRUE 0.978 -3.000 0.273 0.048 Y NA
 595798 595799 BT9727_0527 BT9727_0528 fecD fecE TRUE 0.948 13.000 0.273 1.000 Y NA
 595801 595802 BT9727_0530 BT9727_0531 bioF   TRUE 0.784 45.000 0.165 1.000 N NA
 595802 595803 BT9727_0531 BT9727_0532   pyrE FALSE 0.580 89.000 0.009 1.000 N NA
 595803 595804 BT9727_0532 BT9727_0533 pyrE   TRUE 0.866 -13.000 0.012 1.000 N NA
 595805 595806 BT9727_0534 BT9727_0535   norQ TRUE 0.855 4.000 0.822 NA   NA
 595806 595807 BT9727_0535 BT9727_0536 norQ cls FALSE 0.324 128.000 0.156 1.000   NA
 595808 595809 BT9727_0537 BT9727_0538     TRUE 0.715 31.000 0.429 NA   NA
 595809 595810 BT9727_0538 BT9727_0539     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 595812 595813 BT9727_0541 BT9727_0542 treR treB FALSE 0.490 142.000 0.115 1.000 N NA
 595813 595814 BT9727_0542 BT9727_0543 treB treC TRUE 0.966 14.000 0.650 1.000 Y NA
 595815 595816 BT9727_0544 BT9727_0545 gerKC gerKB TRUE 0.964 -19.000 0.833 0.009   NA
 595816 595817 BT9727_0545 BT9727_0546 gerKB gerKA TRUE 0.940 -19.000 0.412 0.009   NA
 595818 595819 BT9727_0547 BT9727_0548     TRUE 0.705 24.000 0.385 NA   NA
 595819 595820 BT9727_0548 BT9727_0549   alsT FALSE 0.299 158.000 0.462 NA   NA
 595820 595821 BT9727_0549 BT9727_0551 alsT glnQ TRUE 0.792 134.000 0.093 1.000 Y NA
 595821 595822 BT9727_0551 BT9727_0552 glnQ glnH TRUE 0.955 13.000 0.389 1.000 Y NA
 595822 595823 BT9727_0552 BT9727_0553 glnH glnP TRUE 0.948 63.000 0.280 0.060 Y NA
 595823 595824 BT9727_0553 BT9727_0554 glnP glnP TRUE 0.988 1.000 0.947 0.007 Y NA
 595824 595825 BT9727_0554 BT9727_0555 glnP rocE FALSE 0.543 205.000 0.000 0.082 Y NA
 595825 595826 BT9727_0555 BT9727_0556 rocE   TRUE 0.914 -25.000 0.242 1.000 N NA
 595826 595827 BT9727_0556 BT9727_0557     TRUE 0.722 63.000 0.111 1.000 N NA
 595827 595828 BT9727_0557 BT9727_0558   rpoD FALSE 0.301 178.000 0.079 1.000 N NA
 595828 595829 BT9727_0558 BT9727_0559 rpoD   TRUE 0.672 -34.000 0.100 NA   NA
 595832 595833 BT9727_0562 BT9727_0563 lcoS lcoR TRUE 0.963 12.000 0.538 1.000 Y NA
 595834 595835 BT9727_0564 BT9727_0565     FALSE 0.428 158.000 0.778 NA   NA
 595835 595836 BT9727_0565 BT9727_0566   uspA TRUE 0.841 66.000 0.615 1.000 N NA
 595837 595838 BT9727_0567 BT9727_0568 oppA oppC TRUE 0.964 15.000 0.195 0.048 Y NA
 595838 595839 BT9727_0568 BT9727_0569 oppC oppB TRUE 0.983 19.000 0.727 0.048 Y NA
 595839 595840 BT9727_0569 BT9727_0570 oppB oppF TRUE 0.850 15.000 0.727 1.000   NA
 595840 595841 BT9727_0570 BT9727_0571 oppF oppD TRUE 0.947 -13.000 0.477 0.003   NA
 595841 595842 BT9727_0571 BT9727_0572 oppD glpT FALSE 0.054 285.000 0.000 1.000 N NA
 595843 595844 BT9727_0573 BT9727_0574     TRUE 0.876 20.000 0.351 1.000 N NA
 595844 595845 BT9727_0574 BT9727_0575   rbsR FALSE 0.587 138.000 0.333 1.000 N NA
 595845 595846 BT9727_0575 BT9727_0576 rbsR rbsK TRUE 0.807 14.000 0.109 1.000 N NA
 595846 595847 BT9727_0576 BT9727_0577 rbsK rbsD TRUE 0.961 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 595847 595848 BT9727_0577 BT9727_0578 rbsD rbsA TRUE 0.953 19.000 0.243 1.000 Y NA
 595848 595849 BT9727_0578 BT9727_0579 rbsA rbsC TRUE 0.980 3.000 0.358 0.002 Y NA
 595849 595850 BT9727_0579 BT9727_0580 rbsC rbsB TRUE 0.985 15.000 0.847 0.002 Y NA
 595850 595851 BT9727_0580 BT9727_0581 rbsB tal TRUE 0.931 35.000 0.032 1.000 Y NA
 595851 595852 BT9727_0581 BT9727_0582 tal inA FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000   NA
 595852 595853 BT9727_0582 BT9727_0583 inA   FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 595855 595856 BT9727_0585 BT9727_0586 adhB   FALSE 0.180 119.000 0.059 NA   NA
 595856 595857 BT9727_0586 BT9727_0587   plc FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 595857 595858 BT9727_0587 BT9727_0588 plc spH TRUE 0.797 -61.000 0.125 1.000   NA
 595858 595859 BT9727_0588 BT9727_0589 spH   FALSE 0.206 108.000 0.063 NA   NA
 595859 595860 BT9727_0589 BT9727_0590     TRUE 0.926 -12.000 0.571 NA N NA
 595863 595864 BT9727_0593 BT9727_0594 bacA mcpC FALSE 0.510 133.000 0.085 1.000 N NA
 595865 595866 BT9727_0595 BT9727_0596     TRUE 0.639 104.000 0.233 1.000 N NA
 595866 595867 BT9727_0596 BT9727_0597     TRUE 0.834 -7.000 0.500 NA   NA
 595867 595868 BT9727_0597 BT9727_0598     FALSE 0.442 117.000 0.438 NA   NA
 595870 595871 BT9727_0600 BT9727_0601 brnQ   FALSE 0.189 136.000 0.121 NA   NA
 595872 595873 BT9727_0602 BT9727_0603   proY FALSE 0.157 182.000 0.171 1.000   NA
 595874 595875 BT9727_0604 BT9727_0605     FALSE 0.583 138.000 0.750 1.000   NA
 595875 595876 BT9727_0605 BT9727_0606     TRUE 0.710 5.000 0.375 NA   NA
 595877 595878 BT9727_0607 BT9727_0608     FALSE 0.491 15.000 0.125 NA   NA
 595878 595879 BT9727_0608 BT9727_0609   napA FALSE 0.283 72.000 0.062 NA   NA
 595879 595880 BT9727_0609 BT9727_0610 napA qoxD FALSE 0.202 223.000 0.000 0.081 N NA
 595880 595881 BT9727_0610 BT9727_0611 qoxD qoxC TRUE 0.979 1.000 0.959 1.000 Y NA
 595881 595882 BT9727_0611 BT9727_0612 qoxC qoxB TRUE 0.983 14.000 0.957 0.041 Y NA
 595882 595883 BT9727_0612 BT9727_0613 qoxB qoxA TRUE 0.972 25.000 0.234 0.007 Y NA
 595883 595884 BT9727_0613 BT9727_0614 qoxA   FALSE 0.001 282.000 0.000 NA   NA
 595885 595886 BT9727_0615 BT9727_0616   amaA FALSE 0.526 132.000 0.727 NA   NA
 595886 595887 BT9727_0616 BT9727_0617 amaA   TRUE 0.669 2.000 0.286 NA   NA
 595887 595888 BT9727_0617 BT9727_0618     TRUE 0.813 -3.000 0.500 NA   NA
 595888 595889 BT9727_0618 BT9727_0619   gerLA FALSE 0.520 102.000 0.353 1.000   NA
 595889 595890 BT9727_0619 BT9727_0620 gerLA gerLB TRUE 0.936 1.000 0.706 0.009   NA
 595890 595891 BT9727_0620 BT9727_0621 gerLB gerLC TRUE 0.925 -25.000 0.235 0.009   NA
 595892 595893 BT9727_0622 BT9727_0623 feoB feoB TRUE 0.955 -22.000 0.556 0.003   NA
 595893 595894 BT9727_0623 BT9727_0624 feoB feoA TRUE 0.772 -3.000 0.250 1.000   NA
 595895 595896 BT9727_0625 BT9727_0626 pstS pstC TRUE 0.904 68.000 0.206 1.000 Y NA
 595896 595897 BT9727_0626 BT9727_0627 pstC pstA TRUE 0.988 3.000 0.907 0.002 Y NA
 595897 595898 BT9727_0627 BT9727_0628 pstA   FALSE 0.058 186.000 0.048 NA   NA
 5459495 5459496 rRNA-16SrRNA_12 rRNA-23SrRNA_12     FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 5459496 5459497 rRNA-23SrRNA_12 rRNA-5SrRNA_12     FALSE 0.020 101.000 0.000 NA   NA
 5459497 595903 rRNA-5SrRNA_12 tRNA-Val-7     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 595903 5459498 tRNA-Val-7 tRNA-Tyr-3     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459498 5459499 tRNA-Tyr-3 tRNA-Gln-1     FALSE 0.055 9.000 0.000 NA   NA
 5459499 595906 tRNA-Gln-1 tRNA-Lys-6     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 595906 5459500 tRNA-Lys-6 tRNA-Leu-1     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 5459500 5459501 tRNA-Leu-1 tRNA-Gly-4     FALSE 0.055 27.000 0.000 NA   NA
 5459501 5459502 tRNA-Gly-4 tRNA-Leu-7     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459502 5459503 tRNA-Leu-7 tRNA-Arg-1     FALSE 0.066 1.000 0.000 NA   NA
 5459503 5459504 tRNA-Arg-1 tRNA-Pro-3     FALSE 0.056 8.000 0.000 NA   NA
 5459504 5459505 tRNA-Pro-3 tRNA-Ala-6     FALSE 0.051 14.000 0.000 NA   NA
 5459505 5459506 tRNA-Ala-6 tRNA-Ser-6     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 5459506 5459507 tRNA-Ser-6 tRNA-Ser-1     FALSE 0.037 53.000 0.000 NA   NA
 5459507 5459508 tRNA-Ser-1 tRNA-Met-6     FALSE 0.058 18.000 0.000 NA   NA
 5459508 5459509 tRNA-Met-6 tRNA-Asp-3     FALSE 0.064 2.000 0.000 NA   NA
 5459509 5459510 tRNA-Asp-3 tRNA-Phe-1     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459510 595918 tRNA-Phe-1 tRNA-Thr-6     FALSE 0.057 7.000 0.000 NA   NA
 595918 5459511 tRNA-Thr-6 tRNA-Trp-1     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 5459511 5459512 tRNA-Trp-1 tRNA-Ile-3     FALSE 0.054 11.000 0.000 NA   NA
 5459512 5459513 tRNA-Ile-3 tRNA-Asn-5     FALSE 0.058 6.000 0.000 NA   NA
 5459513 5459514 tRNA-Asn-5 tRNA-Glu-5     FALSE 0.070 -1.000 0.000 NA   NA
 5459514 595923 tRNA-Glu-5 BT9727_0631     FALSE 0.014 127.000 0.000 NA   NA
 595923 595924 BT9727_0631 BT9727_0632     FALSE 0.001 295.000 0.000 NA   NA
 595925 595926 BT9727_0633 BT9727_0634     TRUE 0.835 6.000 0.750 NA   NA
 595927 595928 BT9727_0635 BT9727_0636 tenA   TRUE 0.905 -31.000 0.145 1.000 N NA
 595928 595929 BT9727_0636 BT9727_0637     TRUE 0.978 0.000 0.826 1.000 Y NA
 595929 595930 BT9727_0637 BT9727_0638     TRUE 0.975 -3.000 0.135 0.047 Y NA
 595930 595931 BT9727_0638 BT9727_0639   thiE TRUE 0.800 11.000 0.054 1.000 N NA
 595931 595932 BT9727_0639 BT9727_0640 thiE goxB TRUE 0.890 -7.000 0.194 1.000 N NA
 595932 595933 BT9727_0640 BT9727_0641 goxB thiS TRUE 0.838 16.000 0.239 1.000 N NA
 595933 595934 BT9727_0641 BT9727_0642 thiS thiG TRUE 0.956 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 595934 595935 BT9727_0642 BT9727_0643 thiG thiF TRUE 0.975 -7.000 0.012 0.045 Y NA
 595935 595936 BT9727_0643 BT9727_0644 thiF thiD TRUE 0.945 16.000 0.195 1.000 Y NA
 595936 595937 BT9727_0644 BT9727_0645 thiD   FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 595939 595940 BT9727_0647 BT9727_0648 kdpA kdpB TRUE 0.969 11.000 0.035 0.001 Y NA
 595940 595941 BT9727_0648 BT9727_0649 kdpB kdpC TRUE 0.987 17.000 0.877 0.001 Y NA
 595941 595942 BT9727_0649 BT9727_0650 kdpC kdpD FALSE 0.499 57.000 0.066 1.000   NA
 595944 595945 BT9727_0652 BT9727_0653     FALSE 0.510 129.000 0.500 1.000   NA
 595945 595946 BT9727_0653 BT9727_0654     FALSE 0.116 193.000 0.286 NA   NA
 595946 595947 BT9727_0654 BT9727_0655     TRUE 0.592 119.000 0.800 NA   NA
 595947 595948 BT9727_0655 BT9727_0656     TRUE 0.819 1.000 0.600 NA   NA
 595948 595949 BT9727_0656 BT9727_0657     TRUE 0.862 1.000 0.800 NA   NA
 595949 595950 BT9727_0657 BT9727_0658     TRUE 0.870 -19.000 0.571 NA   NA
 595951 595952 BT9727_0659 BT9727_0660 rbsC rbsA TRUE 0.993 -16.000 0.952 0.002 Y NA
 595952 595953 BT9727_0660 BT9727_0661 rbsA rbsB TRUE 0.960 0.000 0.403 NA Y NA
 595953 595954 BT9727_0661 BT9727_0662 rbsB   FALSE 0.001 287.000 0.000 NA   NA
 595955 595956 BT9727_0663 BT9727_0664     TRUE 0.593 67.000 0.438 NA   NA
 595956 595957 BT9727_0664 BT9727_0665     TRUE 0.747 56.000 0.727 NA   NA
 595958 595959 BT9727_0666 BT9727_0667 scrK scrB TRUE 0.960 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 595959 595960 BT9727_0667 BT9727_0668 scrB scrA TRUE 0.946 18.000 0.100 1.000 Y NA
 595960 595961 BT9727_0668 BT9727_0669 scrA scrR FALSE 0.527 129.000 0.113 1.000 N NA
 595961 595962 BT9727_0669 BT9727_0670 scrR   FALSE 0.180 118.000 0.056 NA   NA
 595962 595963 BT9727_0670 BT9727_0671   trxA FALSE 0.341 73.000 0.148 NA   NA
 595963 595964 BT9727_0671 BT9727_0672 trxA dsbB TRUE 0.833 13.000 0.073 0.005   NA
 595964 595965 BT9727_0672 BT9727_0673 dsbB   FALSE 0.117 166.000 0.127 NA   NA
 595965 595966 BT9727_0673 BT9727_0674     FALSE 0.385 118.000 0.364 NA   NA
 595966 595967 BT9727_0674 BT9727_0675     TRUE 0.675 46.000 0.444 NA   NA
 595967 595968 BT9727_0675 BT9727_0676   gerAC TRUE 0.910 13.000 0.600 0.009   NA
 595968 595969 BT9727_0676 BT9727_0677 gerAC gerA TRUE 0.953 -3.000 0.867 0.009   NA
 595969 595970 BT9727_0677 BT9727_0678 gerA   FALSE 0.418 127.000 0.462 NA   NA
 595971 595972 BT9727_0679 BT9727_0680   spoVR FALSE 0.136 116.000 0.019 NA   NA
 595972 595973 BT9727_0680 BT9727_0681 spoVR   FALSE 0.135 108.000 0.014 NA   NA
 595973 595974 BT9727_0681 BT9727_0682     FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 595974 595975 BT9727_0682 BT9727_0683     TRUE 0.776 -9.000 0.333 NA   NA
 595975 595976 BT9727_0683 BT9727_0684   ndh FALSE 0.000 477.000 0.000 NA   NA
 595976 595977 BT9727_0684 BT9727_0685 ndh   FALSE 0.084 186.000 0.143 NA   NA
 595977 595978 BT9727_0685 BT9727_0686     FALSE 0.289 89.000 0.127 NA   NA
 595978 595979 BT9727_0686 BT9727_0687     TRUE 0.692 39.000 0.286 1.000   NA
 595979 595980 BT9727_0687 BT9727_0688     TRUE 0.671 32.000 0.207 1.000   NA
 595980 595981 BT9727_0688 BT9727_0689     TRUE 0.768 31.000 0.154 NA N NA
 595981 595982 BT9727_0689 BT9727_0690     TRUE 0.947 15.000 0.410 NA Y NA
 595982 595983 BT9727_0690 BT9727_0691     FALSE 0.440 61.000 0.211 NA   NA
 595983 595984 BT9727_0691 BT9727_0692     FALSE 0.532 34.000 0.184 NA   NA
 595985 595986 BT9727_0693 BT9727_0694     FALSE 0.432 149.000 0.667 NA   NA
 595986 595987 BT9727_0694 BT9727_0695   trk FALSE 0.015 388.000 0.000 NA N NA
 595987 595988 BT9727_0695 BT9727_0696 trk   FALSE 0.242 267.000 0.000 1.000 Y NA
 595988 595989 BT9727_0696 BT9727_0697   norA FALSE 0.035 331.000 0.000 1.000 N NA
 595990 595991 BT9727_0698 BT9727_0699   licT FALSE 0.476 73.000 0.149 1.000   NA
 595991 595992 BT9727_0699 BT9727_0700 licT celC TRUE 0.761 112.000 0.149 0.006 N NA
 595992 595993 BT9727_0700 BT9727_0701 celC celA TRUE 0.986 2.000 0.778 0.006 Y NA
 595993 595994 BT9727_0701 BT9727_0702 celA celB TRUE 0.954 83.000 0.583 0.006 Y NA
 595994 595995 BT9727_0702 BT9727_0703 celB   TRUE 0.877 -24.000 0.583 NA   NA
 595995 595996 BT9727_0703 BT9727_0704     TRUE 0.885 -10.000 0.700 NA   NA
 595997 595998 BT9727_0706 BT9727_0707     FALSE 0.008 571.000 0.000 NA N NA
 595998 595999 BT9727_0707 BT9727_0708     TRUE 0.973 3.000 0.889 NA Y NA
 595999 596000 BT9727_0708 BT9727_0709     TRUE 0.949 -3.000 0.889 1.000 N NA
 596001 596002 BT9727_0710 BT9727_0711   oppB FALSE 0.446 88.000 0.333 NA   NA
 596002 596003 BT9727_0711 BT9727_0712 oppB oppC TRUE 0.986 2.000 0.875 0.047 Y NA
 596004 596005 BT9727_0713 BT9727_0714 brnQ cotJC FALSE 0.112 219.000 0.000 1.000 N NA
 596005 596006 BT9727_0714 BT9727_0715 cotJC cotJB TRUE 0.783 13.000 0.438 1.000   NA
 596006 596007 BT9727_0715 BT9727_0716 cotJB cotJA TRUE 0.820 -3.000 0.516 NA   NA
 596008 596009 BT9727_0717 BT9727_0718     TRUE 0.593 15.000 0.259 NA   NA
 596011 596012 BT9727_0720 BT9727_0721   dedA TRUE 0.687 11.000 0.368 NA   NA
 596012 596013 BT9727_0721 BT9727_0722 dedA   FALSE 0.489 111.000 0.500 NA   NA
 596013 596014 BT9727_0722 BT9727_0723     TRUE 0.817 21.000 0.667 NA   NA
 596014 596015 BT9727_0723 BT9727_0724     FALSE 0.043 44.000 0.000 NA   NA
 596017 596018 BT9727_0726 BT9727_0727     FALSE 0.505 80.000 0.400 NA   NA
 596020 596021 BT9727_0729 BT9727_0730 napA   FALSE 0.561 126.000 0.778 NA   NA
 596021 596022 BT9727_0730 BT9727_0731     TRUE 0.602 30.000 0.259 NA   NA
 596022 596023 BT9727_0731 BT9727_0732     FALSE 0.518 155.000 0.156 0.001   NA
 596023 596024 BT9727_0732 BT9727_0733   scrA TRUE 0.762 24.000 0.344 1.000   NA
 596024 596025 BT9727_0733 BT9727_0734 scrA   TRUE 0.693 49.000 0.357 1.000   NA
 596025 596026 BT9727_0734 BT9727_0735   yfiD FALSE 0.126 161.000 0.113 NA   NA
 596026 596027 BT9727_0735 BT9727_0736 yfiD   FALSE 0.292 156.000 0.429 NA   NA
 596027 596028 BT9727_0736 BT9727_0737     TRUE 0.794 0.000 0.500 NA   NA
 596030 596031 BT9727_0739 BT9727_0740     FALSE 0.480 129.000 0.027 1.000 N NA
 596031 596032 BT9727_0740 BT9727_0741     FALSE 0.009 1016.000 0.000 1.000 N NA
 596032 596033 BT9727_0741 BT9727_0742     TRUE 0.984 3.000 0.846 0.080 Y NA
 596033 596034 BT9727_0742 BT9727_0743     TRUE 0.676 130.000 0.538 1.000 N NA
 596034 596035 BT9727_0743 BT9727_0744   blT FALSE 0.128 211.000 0.000 1.000 N NA
 596037 596038 BT9727_0746 BT9727_0747     TRUE 0.634 20.000 0.267 NA   NA
 596041 596042 BT9727_0750 BT9727_0751     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 596042 596043 BT9727_0751 BT9727_0752   katB TRUE 0.676 24.000 0.176 1.000   NA
 596043 596044 BT9727_0752 BT9727_0753 katB   FALSE 0.182 204.000 0.160 NA N NA
 596044 596045 BT9727_0753 BT9727_0754   arcD TRUE 0.737 61.000 0.320 NA N NA
 596046 596047 BT9727_0755 BT9727_0756 racE   FALSE 0.115 113.000 0.005 NA   NA
 596049 596050 BT9727_0758 BT9727_0759     TRUE 0.989 -3.000 0.844 0.005 Y NA
 596050 596051 BT9727_0759 BT9727_0760     FALSE 0.126 272.000 0.000 0.059 N NA
 596051 596052 BT9727_0760 BT9727_0761     TRUE 0.980 5.000 0.594 0.047 Y NA
 596052 596053 BT9727_0761 BT9727_0762     TRUE 0.961 29.000 0.481 1.000 Y NA
 596056 596057 BT9727_0765 BT9727_0766 yheD yheC TRUE 0.793 21.000 0.583 NA   NA
 596058 596059 BT9727_0767 BT9727_0768 yheB yheA FALSE 0.290 143.000 0.321 NA   NA
 596060 596061 BT9727_0769 BT9727_0770     TRUE 0.779 22.000 0.545 NA   NA
 596062 596063 BT9727_0771 BT9727_0772 alsS alsD TRUE 0.864 17.000 0.323 1.000 N NA
 596066 596067 BT9727_0775 BT9727_0776     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596068 596069 BT9727_0777 BT9727_0778 hemN fadD FALSE 0.078 315.000 0.000 0.084 N NA
 596071 596072 BT9727_0780 BT9727_0781     FALSE 0.002 244.000 0.000 NA   NA
 596072 596073 BT9727_0781 BT9727_0782     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 596074 596075 BT9727_0783 BT9727_0784   secA TRUE 0.777 5.000 0.519 NA   NA
 596076 596077 BT9727_0785 BT9727_0786 csaA csaB FALSE 0.344 89.000 0.032 1.000   NA
 596079 596080 BT9727_0788 BT9727_0789 lytB/lytA   FALSE 0.000 542.000 0.000 NA   NA
 596082 596083 BT9727_0791 BT9727_0792 crt   FALSE 0.380 102.000 0.292 NA   NA
 596083 596084 BT9727_0792 BT9727_0793     TRUE 0.776 18.000 0.538 NA   NA
 596084 596085 BT9727_0793 BT9727_0795   yhfE FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 596085 596086 BT9727_0795 BT9727_0796 yhfE   FALSE 0.096 235.000 0.000 1.000 N NA
 596086 596087 BT9727_0796 BT9727_0797     FALSE 0.527 133.000 0.318 NA N NA
 596089 596090 BT9727_0799 BT9727_0800 prdF arcB TRUE 0.947 20.000 0.109 1.000 Y NA
 596090 596091 BT9727_0800 BT9727_0801 arcB   FALSE 0.005 185.000 0.000 NA   NA
 596091 596092 BT9727_0801 BT9727_0802     FALSE 0.009 157.000 0.000 NA   NA
 596092 596093 BT9727_0802 BT9727_0803     TRUE 0.727 38.000 0.500 NA   NA
 596093 596094 BT9727_0803 BT9727_0804     FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 596094 596095 BT9727_0804 BT9727_0805     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 596095 596096 BT9727_0805 BT9727_0806     TRUE 0.705 2.000 0.333 NA   NA
 596096 596097 BT9727_0806 BT9727_0807     TRUE 0.618 43.000 0.333 NA   NA
 596097 596098 BT9727_0807 BT9727_0808     FALSE 0.109 -46.000 0.000 NA   NA
 596100 596101 BT9727_0810 BT9727_0811     FALSE 0.023 84.000 0.000 NA   NA
 596101 596102 BT9727_0811 BT9727_0812     FALSE 0.019 106.000 0.000 NA   NA
 596102 596103 BT9727_0812 BT9727_0813     FALSE 0.579 35.000 0.250 NA   NA
 596103 596104 BT9727_0813 BT9727_0814     FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 596104 596105 BT9727_0814 BT9727_0815     FALSE 0.046 40.000 0.000 NA   NA
 596105 596106 BT9727_0815 BT9727_0816   syd FALSE 0.000 468.000 0.000 NA   NA
 596106 596107 BT9727_0816 BT9727_0817 syd   FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 596107 596108 BT9727_0817 BT9727_0818     FALSE 0.000 437.000 0.000 NA   NA
 596108 596109 BT9727_0818 BT9727_0819     FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 596109 596110 BT9727_0819 BT9727_0820     FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 596112 596113 BT9727_0822 BT9727_0823 oppA oppB TRUE 0.970 56.000 0.688 0.046 Y NA
 596113 596114 BT9727_0823 BT9727_0824 oppB oppC TRUE 0.983 7.000 0.786 0.046 Y NA
 596114 596115 BT9727_0824 BT9727_0825 oppC oppD TRUE 0.952 27.000 0.286 1.000 Y NA
 596115 596116 BT9727_0825 BT9727_0826 oppD oppF TRUE 0.989 -16.000 0.436 0.002 Y NA
 596116 596117 BT9727_0826 BT9727_0827 oppF   FALSE 0.011 447.000 0.000 NA N NA
 596117 596118 BT9727_0827 BT9727_0828     FALSE 0.357 70.000 0.154 NA   NA
 596118 596119 BT9727_0828 BT9727_0829     TRUE 0.825 44.000 1.000 NA   NA
 596119 596120 BT9727_0829 BT9727_0830     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 596120 596121 BT9727_0830 BT9727_0831     TRUE 0.883 0.000 1.000 NA   NA
 596121 596122 BT9727_0831 BT9727_0832     FALSE 0.408 15.000 0.053 NA   NA
 596122 596123 BT9727_0832 BT9727_0833     FALSE 0.482 0.000 0.053 NA   NA
 596123 596124 BT9727_0833 BT9727_0834     TRUE 0.873 3.000 1.000 NA   NA
 596124 596125 BT9727_0834 BT9727_0835     FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 596127 596128 BT9727_0837 BT9727_0838 citS citT TRUE 0.983 20.000 0.833 0.083 Y NA
 596128 596129 BT9727_0838 BT9727_0839 citT   TRUE 0.917 -72.000 0.611 1.000   NA
 596135 596136 BT9727_0845 BT9727_0846     FALSE 0.013 134.000 0.000 NA   NA
 596136 596137 BT9727_0846 BT9727_0847     FALSE 0.515 53.000 0.267 NA   NA
 596137 596138 BT9727_0847 BT9727_0848     FALSE 0.089 193.000 0.200 NA   NA
 596138 596139 BT9727_0848 BT9727_0849   dnaB FALSE 0.545 -12.000 0.041 NA   NA
 596141 596142 BT9727_0851 BT9727_0852     FALSE 0.029 69.000 0.000 NA   NA
 596145 596146 BT9727_0855 BT9727_0856     FALSE 0.514 -18.000 0.023 NA   NA
 596146 596147 BT9727_0856 BT9727_0857     FALSE 0.477 -7.000 0.023 NA   NA
 596147 596148 BT9727_0857 BT9727_0858     FALSE 0.000 710.000 0.000 NA   NA
 596148 596149 BT9727_0858 BT9727_0859     TRUE 0.683 6.000 0.333 NA   NA
 596150 596151 BT9727_0860 BT9727_0861     FALSE 0.217 76.000 0.000 1.000   NA
 596152 596153 BT9727_0862 BT9727_0864     FALSE 0.034 58.000 0.000 NA   NA
 596154 596155 BT9727_0865 BT9727_0866     FALSE 0.051 15.000 0.000 NA   NA
 596155 596156 BT9727_0866 BT9727_0867     FALSE 0.053 31.000 0.000 NA   NA
 596156 5459515 BT9727_0867 tRNA-Cys-2     FALSE 0.001 276.000 0.000 NA   NA
 5459515 596158 tRNA-Cys-2 BT9727_0868     FALSE 0.000 418.000 0.000 NA   NA
 596160 596161 BT9727_0870 BT9727_0871     FALSE 0.228 117.000 0.109 NA   NA
 596161 596162 BT9727_0871 BT9727_0872     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 596163 596164 BT9727_0874 BT9727_0875     FALSE 0.001 291.000 0.000 NA   NA
 596165 596166 BT9727_0876 BT9727_0877 licT bglP FALSE 0.293 147.000 0.208 1.000   NA
 596166 596167 BT9727_0877 BT9727_0878 bglP bglH TRUE 0.869 96.000 0.208 1.000 Y NA
 596167 596168 BT9727_0878 BT9727_0879 bglH marR FALSE 0.482 159.000 0.333 1.000 N NA
 596168 596169 BT9727_0879 BT9727_0880 marR pssA TRUE 0.789 20.000 0.004 1.000 N NA
 596169 596170 BT9727_0880 BT9727_0881 pssA atpI FALSE 0.551 23.000 0.013 1.000   NA
 596171 596172 BT9727_0882 BT9727_0883   lytB FALSE 0.112 -118.000 0.000 NA   NA
 596172 596173 BT9727_0883 BT9727_0885 lytB   FALSE 0.019 103.000 0.000 NA   NA
 596175 596176 BT9727_0887 BT9727_0888 dhaL   TRUE 0.913 20.000 0.625 1.000 N NA
 596177 596178 BT9727_0889 BT9727_0890 dhaL   FALSE 0.027 223.000 0.000 1.000   NA
 596181 596182 BT9727_0893 BT9727_0894     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 596182 596183 BT9727_0894 BT9727_0896   tnpA TRUE 0.688 56.000 0.400 1.000   NA
 596184 596185 BT9727_0895 BT9727_0897     FALSE 0.001 311.000 0.000 NA   NA
 596185 596186 BT9727_0897 BT9727_0898     FALSE 0.000 815.000 0.000 NA   NA
 596188 596189 BT9727_0900 BT9727_0901     FALSE 0.198 130.000 0.114 NA   NA
 596189 596190 BT9727_0901 BT9727_0902     TRUE 0.732 14.000 0.486 NA   NA
 596190 596191 BT9727_0902 BT9727_0903     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 596192 596193 BT9727_0905 BT9727_0906     FALSE 0.002 232.000 0.000 NA   NA
 596194 596195 BT9727_0907 BT9727_0908 yflT   TRUE 0.794 51.000 0.875 NA   NA
 596195 596196 BT9727_0908 BT9727_0909   ydaS FALSE 0.580 76.000 0.500 NA   NA
 596198 596199 BT9727_0911 BT9727_0912 rsbV rsbW TRUE 0.971 7.000 0.714 1.000 Y NA
 596199 596200 BT9727_0912 BT9727_0913 rsbW sigB TRUE 0.963 -37.000 0.838 1.000 N NA
 596200 596201 BT9727_0913 BT9727_0914 sigB   TRUE 0.662 70.000 0.038 1.000 N NA
 596201 596202 BT9727_0914 BT9727_0915   rsbU FALSE 0.285 176.000 0.032 1.000 N NA
 596203 596204 BT9727_0916 BT9727_0917 cheR   TRUE 0.946 17.000 0.169 1.000 Y NA
 596204 596205 BT9727_0917 BT9727_0918     FALSE 0.036 206.000 0.000 1.000   NA
 596206 596207 BT9727_0919 BT9727_0920     TRUE 0.689 61.000 0.600 NA   NA
 596207 596208 BT9727_0920 BT9727_0921     FALSE 0.012 143.000 0.000 NA   NA
 596210 596211 BT9727_0923 BT9727_0924 mrsR2 mrsK2 TRUE 0.959 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 596211 596212 BT9727_0924 BT9727_0925 mrsK2 mrsF TRUE 0.670 76.000 0.111 1.000 N NA
 596212 596213 BT9727_0925 BT9727_0926 mrsF mrsG TRUE 0.794 0.000 0.500 NA   NA
 596213 596214 BT9727_0926 BT9727_0927 mrsG mrsE TRUE 0.713 13.000 0.429 NA   NA
 596218 596219 BT9727_0931 BT9727_0932   yhaN TRUE 0.736 -3.000 0.330 NA   NA
 596219 596220 BT9727_0932 BT9727_0933 yhaN   FALSE 0.589 42.000 0.291 NA   NA
 596220 596221 BT9727_0933 BT9727_0934     FALSE 0.012 295.000 0.000 1.000   NA
 596221 596222 BT9727_0934 BT9727_0935     FALSE 0.000 504.000 0.000 NA   NA
 596222 596223 BT9727_0935 BT9727_0936     TRUE 0.598 52.000 0.368 NA   NA
 596223 596224 BT9727_0936 BT9727_0937     FALSE 0.002 256.000 0.000 NA   NA
 596224 596225 BT9727_0937 BT9727_0938     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 596225 596226 BT9727_0938 BT9727_0939     FALSE 0.002 228.000 0.000 NA   NA
 596226 596227 BT9727_0939 BT9727_0940   yhaL FALSE 0.427 81.000 0.292 NA   NA
 596227 596228 BT9727_0940 BT9727_0941 yhaL   FALSE 0.107 176.000 0.167 NA   NA
 596228 596229 BT9727_0941 BT9727_0942     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 596229 596230 BT9727_0942 BT9727_0943     TRUE 0.750 29.000 0.500 NA   NA
 596230 596231 BT9727_0943 BT9727_0944     FALSE 0.000 532.000 0.000 NA   NA
 596231 596232 BT9727_0944 BT9727_0945   glpP TRUE 0.855 98.000 0.083 1.000 Y NA
 596232 596233 BT9727_0945 BT9727_0946 glpP glpF FALSE 0.186 214.000 0.083 1.000 N NA
 596233 596234 BT9727_0946 BT9727_0947 glpF glpK TRUE 0.791 14.000 0.057 1.000 N NA
 596234 596235 BT9727_0947 BT9727_0948 glpK glpD TRUE 0.874 134.000 0.013 0.001 Y NA
 596237 596238 BT9727_0950 BT9727_0951     TRUE 0.649 -28.000 0.080 NA   NA
 596240 596241 BT9727_0953 BT9727_0954     TRUE 0.960 5.000 0.533 NA Y NA
 596241 596242 BT9727_0954 BT9727_0955     TRUE 0.845 8.000 0.389 NA N NA
 596244 596245 BT9727_0957 BT9727_0958     FALSE 0.219 162.000 0.333 NA   NA
 596245 596246 BT9727_0958 BT9727_0959     TRUE 0.933 23.000 0.333 0.005 N NA
 596247 596248 BT9727_0960 BT9727_0961   uvrD FALSE 0.549 88.000 0.500 NA   NA
 596248 596249 BT9727_0961 BT9727_0962 uvrD prsA FALSE 0.004 461.000 0.000 1.000   NA
 596251 596252 BT9727_0964 BT9727_0965 hpr yhaH FALSE 0.015 299.000 0.063 NA   NA
 596252 596253 BT9727_0965 BT9727_0966 yhaH hit FALSE 0.106 172.000 0.137 NA   NA
 596253 596254 BT9727_0966 BT9727_0967 hit   FALSE 0.069 156.000 0.011 NA   NA
 596255 596256 BT9727_0968 BT9727_0969 ecsA ecsB TRUE 0.874 -7.000 0.271 NA N NA
 596256 596257 BT9727_0969 BT9727_0970 ecsB ecsC TRUE 0.623 14.000 0.292 NA   NA
 596257 596258 BT9727_0970 BT9727_0971 ecsC   FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 596258 596259 BT9727_0971 BT9727_0972     TRUE 0.913 -39.000 0.778 NA   NA
 596259 596260 BT9727_0972 BT9727_0973   ydbS TRUE 0.679 80.000 0.778 NA   NA
 596260 596261 BT9727_0973 BT9727_0974 ydbS   TRUE 0.852 -16.000 0.500 NA   NA
 596261 596262 BT9727_0974 BT9727_0975     FALSE 0.000 926.000 0.000 NA   NA
 596262 596263 BT9727_0975 BT9727_0976     FALSE 0.000 714.000 0.000 NA   NA
 596265 596266 BT9727_0978 BT9727_0979     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   NA
 596266 596267 BT9727_0979 BT9727_0980   ydbS FALSE 0.485 75.000 0.333 NA   NA
 596267 596268 BT9727_0980 BT9727_0981 ydbS ydbT TRUE 0.891 -7.000 0.778 NA   NA
 596270 596271 BT9727_0983 BT9727_0984 pbpF hemE FALSE 0.260 180.000 0.020 1.000 N NA
 596271 596272 BT9727_0984 BT9727_0985 hemE hemH TRUE 0.940 15.000 0.131 1.000 Y NA
 596272 596273 BT9727_0985 BT9727_0986 hemH hemY TRUE 0.945 20.000 0.069 1.000 Y NA
 596275 596276 BT9727_0988 BT9727_0989     FALSE 0.199 154.000 0.250 NA   NA
 596278 596279 BT9727_0991 BT9727_0992   yhgE FALSE 0.003 215.000 0.000 NA   NA
 596279 596280 BT9727_0992 BT9727_0993 yhgE   FALSE 0.275 144.000 0.300 NA   NA
 596280 596281 BT9727_0993 BT9727_0994     TRUE 0.842 21.000 0.778 NA   NA
 596282 596283 BT9727_0995 BT9727_0996     FALSE 0.385 65.000 0.160 NA   NA
 596283 596284 BT9727_0996 BT9727_0997     FALSE 0.000 583.000 0.000 NA   NA
 596284 596285 BT9727_0997 BT9727_0998     FALSE 0.383 93.000 0.273 NA   NA
 596286 596287 BT9727_0999 BT9727_1000 cytR yhfI FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000   NA
 596287 596288 BT9727_1000 BT9727_1001 yhfI lplA TRUE 0.681 10.000 0.200 1.000   NA
 596288 596289 BT9727_1001 BT9727_1002 lplA   FALSE 0.030 253.000 0.098 NA   NA
 596289 596290 BT9727_1002 BT9727_1003   fadD FALSE 0.408 162.000 0.778 NA   NA
 596290 596291 BT9727_1003 BT9727_1004 fadD   FALSE 0.297 113.000 0.222 NA   NA
 596291 596292 BT9727_1004 BT9727_1005     FALSE 0.483 90.000 0.400 NA   NA
 596292 596293 BT9727_1005 BT9727_1006     FALSE 0.036 54.000 0.000 NA   NA
 596295 596296 BT9727_1009 BT9727_1010   ydhJ FALSE 0.071 215.000 0.055 1.000   NA
 596297 596298 BT9727_1011 BT9727_1012 yhdL sigM TRUE 0.683 6.000 0.333 NA   NA
 596299 596300 BT9727_1013 BT9727_1014     FALSE 0.521 60.000 0.294 NA   NA
 596300 596301 BT9727_1014 BT9727_1015     FALSE 0.401 126.000 0.429 NA   NA
 596302 596303 BT9727_1016 BT9727_1017 mrsK2 mrsR2 TRUE 0.964 10.000 0.533 1.000 Y NA
 596304 596305 BT9727_1018 BT9727_1019     TRUE 0.658 2.000 0.273 NA   NA
 596305 596306 BT9727_1019 BT9727_1020     TRUE 0.742 -3.000 0.333 NA   NA
 596306 596307 BT9727_1020 BT9727_1021   yhfN FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 596307 596308 BT9727_1021 BT9727_1022 yhfN yxxF FALSE 0.137 96.000 0.006 NA   NA
 596308 596309 BT9727_1022 BT9727_1023 yxxF   FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 596311 596312 BT9727_1025 BT9727_1026   aceB FALSE 0.004 200.000 0.000 NA   NA
 596312 596313 BT9727_1026 BT9727_1027 aceB aceA TRUE 0.944 24.000 0.084 1.000 Y NA
 596316 596317 BT9727_1030 BT9727_1031     FALSE 0.002 258.000 0.000 NA   NA
 596318 596319 BT9727_1032 BT9727_1033 comK comP FALSE 0.017 374.000 0.000 NA N NA
 596319 596320 BT9727_1033 BT9727_1035 comP comA TRUE 0.943 45.000 0.000 0.021 Y NA
 596320 596321 BT9727_1035 BT9727_1036 comA   FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 596321 596322 BT9727_1036 BT9727_1037     TRUE 0.683 18.000 0.333 NA   NA
 596322 596323 BT9727_1037 BT9727_1038   yhjE FALSE 0.000 442.000 0.000 NA   NA
 596323 596324 BT9727_1038 BT9727_1039 yhjE sipT FALSE 0.479 57.000 0.246 NA   NA
 596324 596325 BT9727_1039 BT9727_1040 sipT addB FALSE 0.563 117.000 0.086 1.000 N NA
 596325 596326 BT9727_1040 BT9727_1041 addB addA TRUE 0.984 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 596326 596327 BT9727_1041 BT9727_1042 addA   TRUE 0.787 13.000 0.035 0.049   NA
 596328 596329 BT9727_1043 BT9727_1044 gerPF gerPE FALSE 0.522 43.000 0.222 NA   NA
 596329 596330 BT9727_1044 BT9727_1045 gerPE gerPD TRUE 0.640 16.000 0.296 NA   NA
 596330 596331 BT9727_1045 BT9727_1046 gerPD gerPC FALSE 0.301 7.000 0.003 NA   NA
 596331 596332 BT9727_1046 BT9727_1047 gerPC gerPB FALSE 0.178 68.000 0.003 NA   NA
 596332 596333 BT9727_1047 BT9727_1048 gerPB gerPA TRUE 0.844 15.000 0.889 NA   NA
 596333 596334 BT9727_1048 BT9727_1049 gerPA   FALSE 0.400 97.000 0.296 NA   NA
 596336 596337 BT9727_1051 BT9727_1052   rocD FALSE 0.154 106.000 0.023 NA   NA
 596340 596341 BT9727_1055 BT9727_1056 asnO hemH FALSE 0.225 189.000 0.011 1.000 N NA
 596341 596342 BT9727_1056 BT9727_1057 hemH katB TRUE 0.682 60.000 0.013 1.000 N NA
 596344 596345 BT9727_1058 BT9727_1060     FALSE 0.100 -19.000 0.000 NA   NA
 596345 596346 BT9727_1060 BT9727_1061     FALSE 0.020 251.000 0.000 1.000   NA
 596347 596348 BT9727_1062 BT9727_1063     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596348 596349 BT9727_1063 BT9727_1064     FALSE 0.014 133.000 0.000 NA   NA
 596353 596354 BT9727_1068 BT9727_1069     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 596354 596355 BT9727_1069 BT9727_1070     FALSE 0.053 12.000 0.000 NA   NA
 596356 596357 BT9727_1071 BT9727_1072   clpB FALSE 0.023 212.000 0.009 NA   NA
 596359 596360 BT9727_1074 BT9727_1075     FALSE 0.340 57.000 0.065 NA   NA
 596360 596361 BT9727_1075 BT9727_1076   comZ FALSE 0.466 6.000 0.065 NA   NA
 596361 596362 BT9727_1076 BT9727_1077 comZ fabH1 FALSE 0.000 391.000 0.000 NA   NA
 596362 596363 BT9727_1077 BT9727_1078 fabH1 fabF TRUE 0.938 32.000 0.076 1.000 Y NA
 596363 596364 BT9727_1078 BT9727_1079 fabF   FALSE 0.472 107.000 0.039 NA N NA
 596364 596365 BT9727_1079 BT9727_1080     FALSE 0.287 144.000 0.321 NA   NA
 596366 596367 BT9727_1081 BT9727_1082 trpS   FALSE 0.000 398.000 0.000 NA   NA
 596368 596369 BT9727_1083 BT9727_1084 oppA oppB TRUE 0.861 128.000 0.031 0.044 Y NA
 596369 596370 BT9727_1084 BT9727_1085 oppB oppC TRUE 0.976 -3.000 0.165 0.044 Y NA
 596370 596371 BT9727_1085 BT9727_1086 oppC oppD TRUE 0.972 19.000 0.706 1.000 Y NA
 596371 596372 BT9727_1086 BT9727_1087 oppD oppF TRUE 0.932 -7.000 0.375 0.003   NA
 596378 596379 BT9727_1093 BT9727_1094 mecA cls TRUE 0.692 73.000 0.314 NA N NA
 596379 596380 BT9727_1094 BT9727_1095 cls coiA FALSE 0.340 82.000 0.189 NA   NA
 596380 596381 BT9727_1095 BT9727_1096 coiA pepF TRUE 0.614 52.000 0.398 NA   NA
 596382 596383 BT9727_1097 BT9727_1098     FALSE 0.570 0.000 0.138 NA   NA
 596383 596384 BT9727_1098 BT9727_1099     FALSE 0.130 181.000 0.063 1.000   NA
 596385 596386 BT9727_1100 BT9727_1101     TRUE 0.641 22.000 0.283 NA   NA
 596386 596387 BT9727_1101 BT9727_1102   ppnK TRUE 0.867 19.000 0.725 1.000   NA
 596387 596388 BT9727_1102 BT9727_1103 ppnK rluD TRUE 0.886 16.000 0.480 1.000 N NA
 596389 596390 BT9727_1104 BT9727_1105   prpA FALSE 0.207 141.000 0.017 1.000   NA
 596390 596391 BT9727_1105 BT9727_1106 prpA ftsW FALSE 0.376 75.000 0.028 1.000   NA
 596391 596392 BT9727_1106 BT9727_1107 ftsW   FALSE 0.232 143.000 0.238 NA   NA
 596392 596393 BT9727_1107 BT9727_1108     TRUE 0.604 7.000 0.242 NA   NA
 596393 596394 BT9727_1108 BT9727_1109   cloP FALSE 0.354 128.000 0.212 1.000   NA
 596394 596395 BT9727_1109 BT9727_1110 cloP bclA FALSE 0.334 123.000 0.154 1.000   NA
 596396 596397 BT9727_1111 BT9727_1112     FALSE 0.280 152.000 0.222 1.000   NA
 596397 596398 BT9727_1112 BT9727_1113     TRUE 0.796 -3.000 0.444 NA   NA
 596398 596399 BT9727_1113 BT9727_1114     TRUE 0.732 13.000 0.471 NA   NA
 596399 596400 BT9727_1114 BT9727_1115   rfbA TRUE 0.729 15.000 0.471 NA   NA
 596400 596401 BT9727_1115 BT9727_1116 rfbA rfbC TRUE 0.943 9.000 0.096 1.000 Y NA
 596401 596402 BT9727_1116 BT9727_1117 rfbC rfbB TRUE 0.947 17.000 0.183 1.000 Y NA
 596402 596403 BT9727_1117 BT9727_1118 rfbB rbfD TRUE 0.969 12.000 0.088 0.002 Y NA
 596403 596404 BT9727_1118 BT9727_1119 rbfD fabI FALSE 0.580 109.000 0.082 1.000 N NA
 596404 596405 BT9727_1119 BT9727_1120 fabI   FALSE 0.181 142.000 0.129 NA   NA
 596407 596408 BT9727_1122 BT9727_1123     FALSE 0.482 102.000 0.438 NA   NA
 596409 596410 BT9727_1125 BT9727_1126 exsF cotZ FALSE 0.007 168.000 0.000 NA   NA
 596410 596411 BT9727_1126 BT9727_1127 cotZ pcrA FALSE 0.476 144.000 0.700 NA   NA
 596411 596412 BT9727_1127 BT9727_1128 pcrA   FALSE 0.443 100.000 0.222 1.000   NA
 596412 596413 BT9727_1128 BT9727_1129     TRUE 0.720 2.000 0.213 1.000   NA
 596413 596414 BT9727_1129 BT9727_1131     TRUE 0.628 93.000 0.287 NA N NA
 596415 596416 BT9727_1130 BT9727_1132     FALSE 0.226 149.000 0.267 NA   NA
 596417 596418 BT9727_1133 BT9727_1134   opuE FALSE 0.025 271.000 0.130 NA   NA
 596419 596420 BT9727_1135 BT9727_1136   trpE FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 596420 596421 BT9727_1136 BT9727_1137 trpE pabA TRUE 0.983 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 596421 596422 BT9727_1137 BT9727_1138 pabA trpD TRUE 0.956 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 596422 596423 BT9727_1138 BT9727_1139 trpD trpC TRUE 0.955 2.000 0.216 1.000 Y NA
 596423 596424 BT9727_1139 BT9727_1140 trpC trpF TRUE 0.982 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 596424 596425 BT9727_1140 BT9727_1141 trpF trpB TRUE 0.985 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 596425 596426 BT9727_1141 BT9727_1142 trpB trpA TRUE 0.977 4.000 0.248 0.001 Y NA
 596426 596427 BT9727_1142 BT9727_1143 trpA   FALSE 0.188 75.000 0.015 NA   NA
 596427 596428 BT9727_1143 BT9727_1145   lldP FALSE 0.236 115.000 0.119 NA   NA
 596428 596429 BT9727_1145 BT9727_1146 lldP   FALSE 0.304 93.000 0.167 NA   NA
 596433 596434 BT9727_1150 BT9727_1151     FALSE 0.379 102.000 0.098 1.000   NA
 596434 596435 BT9727_1151 BT9727_1152     FALSE 0.210 145.000 0.208 NA   NA
 596436 596437 BT9727_1153 BT9727_1154   noxC FALSE 0.388 93.000 0.077 1.000   NA
 596437 596438 BT9727_1154 BT9727_1155 noxC   TRUE 0.839 17.000 0.786 NA   NA
 596438 596439 BT9727_1155 BT9727_1156     TRUE 0.869 -3.000 0.733 NA   NA
 596439 596440 BT9727_1156 BT9727_1157   odhB FALSE 0.113 125.000 0.014 NA   NA
 596440 596441 BT9727_1157 BT9727_1158 odhB odhA TRUE 0.878 134.000 0.667 1.000 Y NA
 596442 596443 BT9727_1159 BT9727_1160     TRUE 0.865 3.000 0.875 NA   NA
 596443 596444 BT9727_1160 BT9727_1161     TRUE 0.803 29.000 0.667 NA   NA
 596444 596445 BT9727_1161 BT9727_1162     FALSE 0.490 135.000 0.667 NA   NA
 596445 596446 BT9727_1162 BT9727_1163     TRUE 0.748 19.000 0.444 NA   NA
 596446 596447 BT9727_1163 BT9727_1164     FALSE 0.494 73.000 0.333 NA   NA
 596447 596448 BT9727_1164 BT9727_1165     FALSE 0.301 153.000 0.417 NA   NA
 5459516 596450 tRNA-Val-2 BT9727_1166     FALSE 0.005 190.000 0.000 NA   NA
 596450 596451 BT9727_1166 BT9727_1167     FALSE 0.022 279.000 0.103 NA   NA
 596452 596453 BT9727_1168 BT9727_1169   dacF FALSE 0.410 156.000 0.700 NA   NA
 596453 596454 BT9727_1169 BT9727_1170 dacF sigW FALSE 0.331 194.000 0.320 0.036   NA
 596454 596455 BT9727_1170 BT9727_1171 sigW calY FALSE 0.528 63.000 0.320 NA   NA
 596455 596456 BT9727_1171 BT9727_1172 calY   FALSE 0.476 149.000 0.778 NA   NA
 596456 596457 BT9727_1172 BT9727_1173   calY FALSE 0.001 274.000 0.000 NA   NA
 596459 596460 BT9727_1175 BT9727_1176 ina   FALSE 0.154 172.000 0.069 1.000   NA
 596460 596461 BT9727_1176 BT9727_1177   potA FALSE 0.105 227.000 0.000 1.000 N NA
 596461 596462 BT9727_1177 BT9727_1178 potA potB TRUE 0.988 -3.000 0.789 0.044 Y NA
 596462 596463 BT9727_1178 BT9727_1179 potB potC TRUE 0.972 7.000 0.286 0.044 Y NA
 596463 596464 BT9727_1179 BT9727_1180 potC potD TRUE 0.957 39.000 0.067 0.044 Y NA
 596464 596465 BT9727_1180 BT9727_1181 potD pbpB TRUE 0.684 90.000 0.267 1.000 N NA
 596465 596466 BT9727_1181 BT9727_1182 pbpB   FALSE 0.484 111.000 0.333 1.000   NA
 596466 596467 BT9727_1182 BT9727_1183     FALSE 0.416 101.000 0.333 NA   NA
 596467 596468 BT9727_1183 BT9727_1184   rluD FALSE 0.254 100.000 0.089 NA   NA
 596468 596469 BT9727_1184 BT9727_1185 rluD   FALSE 0.268 92.000 0.089 NA   NA
 596470 596471 BT9727_1186 BT9727_1187   glcF FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 596471 596472 BT9727_1187 BT9727_1188 glcF glcD TRUE 0.984 -3.000 0.342 0.001 Y NA
 596472 596473 BT9727_1188 BT9727_1189 glcD cdaR TRUE 0.605 118.000 0.247 1.000 N NA
 596474 596475 BT9727_1190 BT9727_1191   resD TRUE 0.844 -7.000 0.543 NA   NA
 596475 596476 BT9727_1191 BT9727_1192 resD resE TRUE 0.970 4.000 0.621 1.000 Y NA
 596476 596477 BT9727_1192 BT9727_1193 resE   FALSE 0.073 261.000 0.000 1.000 N NA
 596477 596478 BT9727_1193 BT9727_1194     FALSE 0.462 168.000 0.395 1.000 N NA
 596478 596479 BT9727_1194 BT9727_1195     TRUE 0.976 17.000 0.947 1.000 Y NA
 596479 596480 BT9727_1195 BT9727_1196     TRUE 0.933 0.000 0.500 0.001   NA
 596480 596481 BT9727_1196 BT9727_1197   comC FALSE 0.279 113.000 0.022 1.000   NA
 596481 596482 BT9727_1197 BT9727_1198 comC   FALSE 0.284 15.000 0.005 NA   NA
 596483 596484 BT9727_1199 BT9727_1200 nirC   FALSE 0.434 204.000 0.000 1.000 Y NA
 596484 596485 BT9727_1200 BT9727_1201   ktrB FALSE 0.273 295.000 0.000 0.075 Y NA
 596485 596486 BT9727_1201 BT9727_1202 ktrB sasP-C3 FALSE 0.541 115.000 0.455 1.000   NA
 596486 596487 BT9727_1202 BT9727_1203 sasP-C3 crt FALSE 0.491 148.000 0.615 1.000   NA
 596487 596488 BT9727_1203 BT9727_1204 crt phaP FALSE 0.571 102.000 0.615 NA   NA
 596488 596489 BT9727_1204 BT9727_1205 phaP phaQ FALSE 0.565 43.000 0.273 NA   NA
 596490 596491 BT9727_1206 BT9727_1207 phaR phaB FALSE 0.326 152.000 0.450 NA   NA
 596491 596492 BT9727_1207 BT9727_1208 phaB phaC TRUE 0.936 83.000 0.161 0.001 Y NA
 596492 596493 BT9727_1208 BT9727_1209 phaC   TRUE 0.626 96.000 0.113 1.000 N NA
 596493 596494 BT9727_1209 BT9727_1210   ktrB TRUE 0.821 24.000 0.096 1.000 N NA
 596496 596497 BT9727_1212 BT9727_1213 afuA   TRUE 0.951 -78.000 0.111 0.044 N NA
 596497 596498 BT9727_1213 BT9727_1214   afuB TRUE 0.903 7.000 0.125 0.044 N NA
 596498 596499 BT9727_1214 BT9727_1215 afuB phnX TRUE 0.640 22.000 0.079 1.000   NA
 596499 596500 BT9727_1215 BT9727_1216 phnX phnW TRUE 0.852 16.000 0.315 0.079   NA
 596500 596501 BT9727_1216 BT9727_1217 phnW lys1 TRUE 0.944 -3.000 0.029 NA Y NA
 596501 596502 BT9727_1217 BT9727_1218 lys1   TRUE 0.687 41.000 0.029 NA N NA
 596502 596503 BT9727_1218 BT9727_1219     TRUE 0.601 72.000 0.500 NA   NA
 596503 596504 BT9727_1219 BT9727_1220   inlA FALSE 0.447 133.000 0.556 NA   NA
 596504 596505 BT9727_1220 BT9727_1221 inlA   FALSE 0.020 249.000 0.000 1.000   NA
 596505 596506 BT9727_1221 BT9727_1222     FALSE 0.291 126.000 0.267 NA   NA
 596510 596511 BT9727_1226 BT9727_1227   pepF FALSE 0.393 161.000 0.129 1.000 N NA
 596511 596512 BT9727_1227 BT9727_1228 pepF   FALSE 0.184 139.000 0.114 NA   NA
 596514 596515 BT9727_1230 BT9727_1231   ygcM TRUE 0.661 0.000 0.062 1.000   NA
 596515 596516 BT9727_1231 BT9727_1232 ygcM   TRUE 0.903 -7.000 0.280 1.000 N NA
 596516 596517 BT9727_1232 BT9727_1233   folE TRUE 0.658 19.000 0.101 1.000   NA
 596521 596522 BT9727_1237 BT9727_1238     FALSE 0.585 27.000 0.229 NA   NA
 596522 596523 BT9727_1238 BT9727_1239   nrdIB FALSE 0.000 477.000 0.000 NA   NA
 596523 596524 BT9727_1239 BT9727_1240 nrdIB nrdE FALSE 0.095 -13.000 0.000 NA   NA
 596524 596525 BT9727_1240 BT9727_1241 nrdE nrdE FALSE 0.024 473.000 0.000 0.001   NA
 596525 596526 BT9727_1241 BT9727_1242 nrdE nrdF TRUE 0.957 94.000 0.625 0.001 Y NA
 596526 596527 BT9727_1242 BT9727_1243 nrdF   FALSE 0.115 217.000 0.000 1.000 N NA
 596527 596528 BT9727_1243 BT9727_1244     TRUE 0.890 -3.000 0.280 1.000 N NA
 596528 596529 BT9727_1244 BT9727_1245     TRUE 0.876 -3.000 0.778 NA   NA
 596529 596530 BT9727_1245 BT9727_1246   bcrA TRUE 0.812 15.000 0.727 NA   NA
 596530 596531 BT9727_1246 BT9727_1247 bcrA bcrB TRUE 0.784 0.000 0.471 NA   NA
 596531 596532 BT9727_1247 BT9727_1248 bcrB   FALSE 0.042 203.000 0.040 NA   NA
 596533 596534 BT9727_1249 BT9727_1250   lrpC FALSE 0.352 101.000 0.258 NA   NA
 596535 596536 BT9727_1251 BT9727_1252     TRUE 0.686 -10.000 0.194 NA   NA
 596536 596537 BT9727_1252 BT9727_1253   sseB FALSE 0.293 87.000 0.127 NA   NA
 596540 596541 BT9727_1256 BT9727_1257 dltD dltC TRUE 0.690 -3.000 0.064 1.000   NA
 596541 596542 BT9727_1257 BT9727_1258 dltC dltB FALSE 0.545 69.000 0.387 NA   NA
 596542 596543 BT9727_1258 BT9727_1259 dltB dltA TRUE 0.892 -3.000 0.435 NA N NA
 596543 596544 BT9727_1259 BT9727_1260 dltA dltX TRUE 0.761 13.000 0.549 NA   NA
 596545 596546 BT9727_1261 BT9727_1262 amaA fldA FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000   NA
 596546 596547 BT9727_1262 BT9727_1263 fldA   TRUE 0.723 25.000 0.421 NA   NA
 596549 596550 BT9727_1265 BT9727_1266     FALSE 0.002 249.000 0.000 NA   NA
 596553 596554 BT9727_1269 BT9727_1271     FALSE 0.229 67.000 0.022 NA   NA
 596560 596561 BT9727_1277 BT9727_1278     FALSE 0.266 118.000 0.195 NA   NA
 596562 596563 BT9727_1279 BT9727_1280   ilvE FALSE 0.187 142.000 0.150 NA   NA
 596563 596564 BT9727_1280 BT9727_1281 ilvE alsS FALSE 0.164 308.000 0.000 1.000 Y NA
 596564 596565 BT9727_1281 BT9727_1282 alsS ilvH TRUE 0.982 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 596565 596566 BT9727_1282 BT9727_1283 ilvH ilvC TRUE 0.971 27.000 0.130 0.002 Y NA
 596566 596567 BT9727_1283 BT9727_1284 ilvC leuA TRUE 0.951 2.000 0.103 1.000 Y NA
 596567 596568 BT9727_1284 BT9727_1285 leuA leuB TRUE 0.932 78.000 0.041 0.001 Y NA
 596568 596569 BT9727_1285 BT9727_1286 leuB leuC TRUE 0.977 0.000 0.080 0.001 Y NA
 596569 596570 BT9727_1286 BT9727_1287 leuC leuD TRUE 0.990 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 596570 596571 BT9727_1287 BT9727_1288 leuD hisZ FALSE 0.160 311.000 0.000 1.000 Y NA
 596571 596572 BT9727_1288 BT9727_1289 hisZ hisG TRUE 0.986 -24.000 0.239 0.004 Y NA
 596572 596573 BT9727_1289 BT9727_1290 hisG hisD TRUE 0.972 12.000 0.254 0.004 Y NA
 596573 596574 BT9727_1290 BT9727_1291 hisD hisB TRUE 0.975 0.000 0.096 0.004 Y NA
 596574 596575 BT9727_1291 BT9727_1292 hisB hisH TRUE 0.974 1.000 0.125 0.004 Y NA
 596575 596576 BT9727_1292 BT9727_1293 hisH hisA TRUE 0.984 -27.000 0.124 0.004 Y NA
 596576 596577 BT9727_1293 BT9727_1294 hisA hisF TRUE 0.986 -6.000 0.433 0.004 Y NA
 596577 596578 BT9727_1294 BT9727_1295 hisF hisI TRUE 0.984 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 596578 596579 BT9727_1295 BT9727_1296 hisI hisE TRUE 0.969 11.000 0.152 0.004 Y NA
 596579 596580 BT9727_1296 BT9727_1297 hisE hisK TRUE 0.964 12.000 0.016 0.004 Y NA
 596580 596581 BT9727_1297 BT9727_1298 hisK serA FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 596582 596583 BT9727_1299 BT9727_1300 pssA   FALSE 0.249 182.000 0.011 1.000 N NA
 596584 596585 BT9727_1301 BT9727_1302   lysA FALSE 0.000 457.000 0.000 NA   NA
 596585 596586 BT9727_1302 BT9727_1303 lysA cysH FALSE 0.058 530.000 0.000 1.000 Y NA
 596586 596587 BT9727_1303 BT9727_1304 cysH sat TRUE 0.780 39.000 0.065 1.000 N NA
 596587 596588 BT9727_1304 BT9727_1305 sat   TRUE 0.970 13.000 0.101 0.001 Y NA
 596588 596589 BT9727_1305 BT9727_1306   nirA TRUE 0.939 12.000 0.067 1.000 Y NA
 596589 596590 BT9727_1306 BT9727_1307 nirA   TRUE 0.800 11.000 0.647 NA   NA
 596590 596591 BT9727_1307 BT9727_1308   cysG FALSE 0.402 87.000 0.281 NA   NA
 596591 596592 BT9727_1308 BT9727_1309 cysG   TRUE 0.753 2.000 0.281 1.000   NA
 596592 596593 BT9727_1309 BT9727_1310   cysG TRUE 0.868 -25.000 0.375 1.000   NA
 596593 596594 BT9727_1310 BT9727_1311 cysG   FALSE 0.004 420.000 0.000 1.000   NA
 596595 596596 BT9727_1312 BT9727_1313     TRUE 0.888 135.000 0.333 0.048 Y NA
 596596 596597 BT9727_1313 BT9727_1314     FALSE 0.058 276.000 0.000 1.000 N NA
 596598 596599 BT9727_1315 BT9727_1316 gltT   TRUE 0.642 68.000 0.556 NA   NA
 596599 596600 BT9727_1316 BT9727_1317   nhaC FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 596600 596601 BT9727_1317 BT9727_1318 nhaC yvqI FALSE 0.029 229.000 0.046 NA   NA
 596601 596602 BT9727_1318 BT9727_1319 yvqI   TRUE 0.687 51.000 0.514 NA   NA
 596602 596603 BT9727_1319 BT9727_1320   yvqF FALSE 0.253 107.000 0.135 NA   NA
 596603 596604 BT9727_1320 BT9727_1321 yvqF   FALSE 0.534 0.000 0.080 NA   NA
 596604 596605 BT9727_1321 BT9727_1322     TRUE 0.989 -3.000 0.853 0.020 Y NA
 596605 596606 BT9727_1322 BT9727_1323     FALSE 0.173 133.000 0.075 NA   NA
 596612 596613 BT9727_1329 BT9727_1330     FALSE 0.485 16.000 0.092 NA   NA
 596613 596614 BT9727_1330 BT9727_1331   hmp FALSE 0.094 160.000 0.049 NA   NA
 596617 596618 BT9727_1334 BT9727_1335   pit FALSE 0.347 118.000 0.136 1.000   NA
 596618 596619 BT9727_1335 BT9727_1336 pit ykaA TRUE 0.929 12.000 0.100 NA Y NA
 596621 596622 BT9727_1338 BT9727_1339     FALSE 0.099 196.000 0.250 NA   NA
 596622 596623 BT9727_1339 BT9727_1340     FALSE 0.047 190.000 0.000 1.000   NA
 596625 596626 BT9727_1342 BT9727_1343     FALSE 0.458 120.000 0.500 NA   NA
 596626 596627 BT9727_1343 BT9727_1344     FALSE 0.549 99.000 0.389 1.000   NA
 596627 596628 BT9727_1344 BT9727_1345   deoD FALSE 0.374 157.000 0.040 1.000 N NA
 596629 596630 BT9727_1346 BT9727_1347     FALSE 0.000 393.000 0.000 NA   NA
 596632 596633 BT9727_1349 BT9727_1350     TRUE 0.739 22.000 0.435 NA   NA
 596633 596634 BT9727_1350 BT9727_1351   sodF FALSE 0.245 106.000 0.101 NA   NA
 596634 596635 BT9727_1351 BT9727_1352 sodF dacB FALSE 0.581 112.000 0.101 1.000 N NA
 596635 596636 BT9727_1352 BT9727_1353 dacB spmA TRUE 0.799 -7.000 0.252 1.000   NA
 596636 596637 BT9727_1353 BT9727_1354 spmA spmB TRUE 0.945 -3.000 0.655 0.003   NA
 596637 596638 BT9727_1354 BT9727_1355 spmB rluB FALSE 0.031 290.000 0.063 1.000   NA
 596638 596639 BT9727_1355 BT9727_1356 rluB resA TRUE 0.612 95.000 0.069 1.000 N NA
 596639 596640 BT9727_1356 BT9727_1357 resA resB TRUE 0.845 122.000 0.306 1.000 Y NA
 596640 596641 BT9727_1357 BT9727_1358 resB resC TRUE 0.948 15.000 0.278 1.000 Y NA
 596641 596642 BT9727_1358 BT9727_1359 resC resD FALSE 0.078 303.000 0.178 1.000 N NA
 596642 596643 BT9727_1359 BT9727_1360 resD resE TRUE 0.970 0.000 0.111 0.078 Y NA
 596643 596644 BT9727_1360 BT9727_1361 resE yvqK FALSE 0.287 138.000 0.108 1.000   NA
 596644 596645 BT9727_1361 BT9727_1362 yvqK   FALSE 0.420 86.000 0.108 1.000   NA
 596649 596650 BT9727_1366 BT9727_1367   recQ TRUE 0.633 -10.000 0.103 NA   NA
 596650 596651 BT9727_1367 BT9727_1368 recQ   TRUE 0.611 0.000 0.192 NA   NA
 596651 596652 BT9727_1368 BT9727_1369     TRUE 0.643 14.000 0.320 NA   NA
 596652 596653 BT9727_1369 BT9727_1370     FALSE 0.586 58.000 0.233 1.000   NA
 596653 596654 BT9727_1370 BT9727_1371     TRUE 0.842 -3.000 0.433 1.000   NA
 596654 596655 BT9727_1371 BT9727_1372     TRUE 0.710 78.000 0.417 NA N NA
 596655 596656 BT9727_1372 BT9727_1373   gdhA FALSE 0.092 268.000 0.222 NA N NA
 596656 596657 BT9727_1373 BT9727_1374 gdhA   FALSE 0.380 79.000 0.233 NA   NA
 596657 596658 BT9727_1374 BT9727_1375     TRUE 0.624 94.000 0.700 NA   NA
 596658 596659 BT9727_1375 BT9727_1376     TRUE 0.663 80.000 0.727 NA   NA
 596659 596660 BT9727_1376 BT9727_1377   trxB FALSE 0.310 110.000 0.044 1.000   NA
 596662 596663 BT9727_1379 BT9727_1380 cmk rpsA FALSE 0.049 334.000 0.047 1.000 N NA
 596663 596664 BT9727_1380 BT9727_1381 rpsA fni TRUE 0.796 13.000 0.061 1.000 N NA
 596666 596667 BT9727_1383 BT9727_1384   yphB TRUE 0.850 -7.000 0.567 NA   NA
 596667 596668 BT9727_1384 BT9727_1385 yphB   TRUE 0.848 -3.000 0.633 NA   NA
 596668 596669 BT9727_1385 BT9727_1386     FALSE 0.112 125.000 0.014 NA   NA
 596669 596670 BT9727_1386 BT9727_1387   gpsA TRUE 0.634 19.000 0.068 1.000   NA
 596670 596671 BT9727_1387 BT9727_1388 gpsA yjcC FALSE 0.176 106.000 0.039 NA   NA
 596671 596672 BT9727_1388 BT9727_1389 yjcC yphE FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   NA
 596672 596673 BT9727_1389 BT9727_1390 yphE   TRUE 0.732 65.000 0.771 NA   NA
 596673 596674 BT9727_1390 BT9727_1391   spoIVA FALSE 0.032 243.000 0.081 NA   NA
 596674 596675 BT9727_1391 BT9727_1392 spoIVA hup FALSE 0.001 299.000 0.000 NA   NA
 596675 596676 BT9727_1392 BT9727_1393 hup mtrA FALSE 0.559 121.000 0.154 1.000 N NA
 596676 596677 BT9727_1393 BT9727_1394 mtrA hepS FALSE 0.101 205.000 0.114 1.000   NA
 596677 596678 BT9727_1394 BT9727_1395 hepS menG TRUE 0.852 30.000 0.708 1.000   NA
 596678 596679 BT9727_1395 BT9727_1396 menG hepT TRUE 0.963 23.000 0.476 1.000 Y NA
 596679 596680 BT9727_1396 BT9727_1397 hepT ndk FALSE 0.512 125.000 0.054 1.000 N NA
 596680 596681 BT9727_1397 BT9727_1398 ndk aroC FALSE 0.079 271.000 0.002 1.000 N NA
 596681 596682 BT9727_1398 BT9727_1399 aroC aroB TRUE 0.977 0.000 0.110 0.001 Y NA
 596682 596683 BT9727_1399 BT9727_1400 aroB hisC TRUE 0.771 132.000 0.009 1.000 Y NA
 596683 596684 BT9727_1400 BT9727_1401 hisC   FALSE 0.009 313.000 0.000 1.000   NA
 596684 596685 BT9727_1401 BT9727_1402   ypiB FALSE 0.517 74.000 0.375 NA   NA
 596685 596686 BT9727_1402 BT9727_1403 ypiB ypiF FALSE 0.373 154.000 0.583 NA   NA
 596686 596687 BT9727_1403 BT9727_1404 ypiF qcrA FALSE 0.404 144.000 0.540 NA   NA
 596687 596688 BT9727_1404 BT9727_1405 qcrA qcrB TRUE 0.907 1.000 0.447 0.037   NA
 596688 596689 BT9727_1405 BT9727_1406 qcrB qcrC TRUE 0.788 44.000 0.095 0.037   NA
 596689 596690 BT9727_1406 BT9727_1407 qcrC ypjA FALSE 0.173 129.000 0.069 NA   NA
 596690 596691 BT9727_1407 BT9727_1408 ypjA   FALSE 0.502 26.000 0.104 NA   NA
 596691 596692 BT9727_1408 BT9727_1409     FALSE 0.242 108.000 0.104 NA   NA
 596692 596693 BT9727_1409 BT9727_1410   yugP FALSE 0.185 110.000 0.050 NA   NA
 596693 596694 BT9727_1410 BT9727_1411 yugP ung FALSE 0.299 102.000 0.020 1.000   NA
 596696 596697 BT9727_1413 BT9727_1414 ypjD dapB FALSE 0.464 0.000 0.044 NA   NA
 596697 596698 BT9727_1414 BT9727_1415 dapB mgsA TRUE 0.882 15.000 0.044 0.043 N NA
 596698 596699 BT9727_1415 BT9727_1416 mgsA ypjG FALSE 0.472 12.000 0.081 NA   NA
 596699 596700 BT9727_1416 BT9727_1417 ypjG   TRUE 0.651 -3.000 0.210 NA   NA
 596700 596701 BT9727_1417 BT9727_1418   pcnB TRUE 0.892 -13.000 0.126 1.000 N NA
 596701 596702 BT9727_1418 BT9727_1419 pcnB birA TRUE 0.894 -15.000 0.134 1.000 N NA
 596704 596705 BT9727_1421 BT9727_1422 panB panC TRUE 0.985 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 596705 596706 BT9727_1422 BT9727_1423 panC panD TRUE 0.953 13.000 0.342 1.000 Y NA
 596706 596707 BT9727_1423 BT9727_1424 panD dinG FALSE 0.499 129.000 0.053 1.000 N NA
 596707 596708 BT9727_1424 BT9727_1425 dinG ypmB FALSE 0.019 429.000 0.296 1.000   NA
 596708 596709 BT9727_1425 BT9727_1426 ypmB aspB TRUE 0.776 19.000 0.367 1.000   NA
 596709 596710 BT9727_1426 BT9727_1427 aspB dnaD FALSE 0.453 122.000 0.072 NA N NA
 596710 596711 BT9727_1427 BT9727_1428 dnaD nth TRUE 0.927 16.000 0.075 NA Y NA
 596711 596712 BT9727_1428 BT9727_1429 nth   FALSE 0.410 4.000 0.034 NA   NA
 596713 596714 BT9727_1430 BT9727_1431   recU FALSE 0.454 66.000 0.056 1.000   NA
 596715 596716 BT9727_1432 BT9727_1433     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 596716 596717 BT9727_1433 BT9727_1434   yppE FALSE 0.513 16.000 0.148 NA   NA
 596719 596720 BT9727_1436 BT9727_1437   cotD FALSE 0.233 156.000 0.318 NA   NA
 596720 596721 BT9727_1437 BT9727_1438 cotD ypsA FALSE 0.356 57.000 0.074 NA   NA
 596721 596722 BT9727_1438 BT9727_1439 ypsA divIVA FALSE 0.563 98.000 0.579 NA   NA
 596722 596723 BT9727_1439 BT9727_1440 divIVA   FALSE 0.000 659.000 0.000 NA   NA
 596723 596724 BT9727_1440 BT9727_1441     FALSE 0.222 62.000 0.014 NA   NA
 596724 596725 BT9727_1441 BT9727_1442   dinG FALSE 0.252 138.000 0.250 NA   NA
 596725 596726 BT9727_1442 BT9727_1443 dinG   TRUE 0.597 106.000 0.118 1.000 N NA
 596726 596727 BT9727_1443 BT9727_1444     FALSE 0.465 48.000 0.014 1.000   NA
 596729 596730 BT9727_1446 BT9727_1447 map xpt FALSE 0.037 325.000 0.000 1.000 N NA
 596730 596731 BT9727_1447 BT9727_1448 xpt pbuX TRUE 0.945 4.000 0.056 1.000 Y NA
 596732 596733 BT9727_1449 BT9727_1450     FALSE 0.007 166.000 0.000 NA   NA
 596736 596737 BT9727_1453 BT9727_1454     FALSE 0.474 22.000 0.069 NA   NA
 596737 596738 BT9727_1454 BT9727_1455     FALSE 0.445 3.000 0.046 NA   NA
 596738 596739 BT9727_1455 BT9727_1456     FALSE 0.006 1000.000 0.000 NA N NA
 596741 596742 BT9727_1458 BT9727_1459     TRUE 0.844 4.000 0.765 NA   NA
 596742 596743 BT9727_1459 BT9727_1460     TRUE 0.837 -3.000 0.588 NA   NA
 596743 596744 BT9727_1460 BT9727_1461     FALSE 0.000 693.000 0.000 NA   NA
 596744 596745 BT9727_1461 BT9727_1462     FALSE 0.317 131.000 0.157 1.000   NA
 596745 596746 BT9727_1462 BT9727_1463     FALSE 0.010 828.000 0.000 1.000 N NA
 596746 596747 BT9727_1463 BT9727_1464     TRUE 0.932 1.000 0.750 1.000 N NA
 596747 596748 BT9727_1464 BT9727_1465   cpsD TRUE 0.927 -7.000 0.625 NA N NA
 596748 596749 BT9727_1465 BT9727_1466 cpsD   TRUE 0.904 19.000 0.714 NA N NA
 596749 596750 BT9727_1466 BT9727_1467     TRUE 0.842 25.000 0.625 1.000   NA
 596750 596751 BT9727_1467 BT9727_1468     TRUE 0.773 4.000 0.500 NA   NA
 596751 596752 BT9727_1468 BT9727_1469     FALSE 0.585 -25.000 0.046 NA   NA
 596752 596753 BT9727_1469 BT9727_1470     FALSE 0.507 -3.000 0.050 NA   NA
 596753 596754 BT9727_1470 BT9727_1471     FALSE 0.237 75.000 0.041 NA   NA
 596759 596760 BT9727_1478 BT9727_1479   rnhA FALSE 0.517 8.000 0.133 NA   NA
 596760 596761 BT9727_1479 BT9727_1480 rnhA   TRUE 0.685 70.000 0.076 1.000 N NA
 596762 596763 BT9727_1481 BT9727_1482     FALSE 0.179 153.000 0.200 NA   NA
 596764 596765 BT9727_1483 BT9727_1484   cspB FALSE 0.516 120.000 0.619 NA   NA
 596766 596767 BT9727_1485 BT9727_1486     FALSE 0.294 139.000 0.308 NA   NA
 596767 596768 BT9727_1486 BT9727_1487     TRUE 0.768 20.000 0.500 NA   NA
 596768 596769 BT9727_1487 BT9727_1488     FALSE 0.398 80.000 0.259 NA   NA
 596769 596770 BT9727_1488 BT9727_1489     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 596770 596771 BT9727_1489 BT9727_1490     TRUE 0.762 3.000 0.455 NA   NA
 596771 596772 BT9727_1490 BT9727_1491   bioA FALSE 0.204 190.000 0.364 1.000   NA
 596772 596773 BT9727_1491 BT9727_1492 bioA   TRUE 0.610 85.000 0.444 1.000   NA
 596775 596776 BT9727_1494 BT9727_1495     FALSE 0.429 98.000 0.188 1.000   NA
 596776 596777 BT9727_1495 BT9727_1496     FALSE 0.544 139.000 0.250 1.000 N NA
 596779 596780 BT9727_1498 BT9727_1499     FALSE 0.267 146.000 0.300 NA   NA
 596780 596781 BT9727_1499 BT9727_1500     FALSE 0.025 274.000 0.143 NA   NA
 596781 596782 BT9727_1500 BT9727_1501     FALSE 0.460 51.000 0.190 NA   NA
 596782 596783 BT9727_1501 BT9727_1502     FALSE 0.201 189.000 0.500 NA   NA
 596783 596784 BT9727_1502 BT9727_1503     TRUE 0.865 -7.000 0.625 NA   NA
 596785 596786 BT9727_1504 BT9727_1505     FALSE 0.272 125.000 0.235 NA   NA
 596786 596787 BT9727_1505 BT9727_1506     TRUE 0.687 20.000 0.333 NA   NA
 596787 596788 BT9727_1506 BT9727_1507     FALSE 0.201 129.000 0.118 NA   NA
 596788 596789 BT9727_1507 BT9727_1508     FALSE 0.524 8.000 0.147 NA   NA
 596789 596790 BT9727_1508 BT9727_1509     FALSE 0.197 169.000 0.333 NA   NA
 596791 596792 BT9727_1510 BT9727_1511   hfq TRUE 0.781 49.000 0.778 NA   NA
 596792 596793 BT9727_1511 BT9727_1512 hfq   FALSE 0.015 125.000 0.000 NA   NA
 596793 596794 BT9727_1512 BT9727_1513     FALSE 0.444 75.000 0.286 NA   NA
 596796 596797 BT9727_1515 BT9727_1516 motA motB TRUE 0.949 23.000 0.192 1.000 Y NA
 596797 596798 BT9727_1516 BT9727_1517 motB cheY FALSE 0.450 151.000 0.143 1.000 N NA
 596798 596799 BT9727_1517 BT9727_1518 cheY cheA TRUE 0.877 130.000 0.154 0.020 Y NA
 596799 596800 BT9727_1518 BT9727_1519 cheA cheC TRUE 0.753 174.000 0.036 0.005 Y NA
 596800 596801 BT9727_1519 BT9727_1520 cheC   FALSE 0.397 30.000 0.042 NA   NA
 596801 596802 BT9727_1520 BT9727_1521     TRUE 0.851 28.000 0.889 NA   NA
 596803 596804 BT9727_1522 BT9727_1523 cheR   FALSE 0.432 25.000 0.053 NA   NA
 596805 596806 BT9727_1524 BT9727_1525     FALSE 0.438 17.000 0.056 NA   NA
 596806 596807 BT9727_1525 BT9727_1526   flgK FALSE 0.426 18.000 0.045 NA   NA
 596807 596808 BT9727_1526 BT9727_1527 flgK flgL TRUE 0.650 206.000 0.028 0.001 Y NA
 596808 596809 BT9727_1527 BT9727_1528 flgL fliD TRUE 0.956 21.000 0.292 1.000 Y NA
 596809 596810 BT9727_1528 BT9727_1529 fliD fliS TRUE 0.984 23.000 0.608 0.001 Y NA
 596810 596811 BT9727_1529 BT9727_1530 fliS   TRUE 0.650 -16.000 0.101 NA   NA
 596811 596812 BT9727_1530 BT9727_1531   flgB FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 596812 596813 BT9727_1531 BT9727_1532 flgB flgC TRUE 0.986 21.000 0.804 0.002 Y NA
 596813 596814 BT9727_1532 BT9727_1533 flgC fliE TRUE 0.970 17.000 0.068 0.002 Y NA
 596814 596815 BT9727_1533 BT9727_1534 fliE fliF TRUE 0.969 23.000 0.076 0.004 Y NA
 596815 596816 BT9727_1534 BT9727_1535 fliF fliG TRUE 0.965 14.000 0.056 0.004 Y NA
 596816 596817 BT9727_1535 BT9727_1536 fliG   TRUE 0.839 -13.000 0.471 NA   NA
 596817 596818 BT9727_1536 BT9727_1537   fliI TRUE 0.596 -3.000 0.129 NA   NA
 596818 596819 BT9727_1537 BT9727_1538 fliI   FALSE 0.189 117.000 0.061 NA   NA
 596819 596820 BT9727_1538 BT9727_1539     FALSE 0.087 -7.000 0.000 NA   NA
 596820 596821 BT9727_1539 BT9727_1540   flgD FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 596821 596822 BT9727_1540 BT9727_1541 flgD flgE FALSE 0.519 22.000 0.117 NA   NA
 596822 596823 BT9727_1541 BT9727_1542 flgE   FALSE 0.468 50.000 0.195 NA   NA
 596823 596824 BT9727_1542 BT9727_1543     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 596824 596825 BT9727_1543 BT9727_1544   cheV FALSE 0.165 121.000 0.050 NA   NA
 596825 596826 BT9727_1544 BT9727_1545 cheV   FALSE 0.000 626.000 0.000 NA   NA
 596827 596828 BT9727_1546 BT9727_1547 fliC hag FALSE 0.137 240.000 0.000 0.001   NA
 596829 596830 BT9727_1548 BT9727_1549 slt fliN FALSE 0.349 63.000 0.083 NA   NA
 596830 596831 BT9727_1549 BT9727_1550 fliN fliM TRUE 0.853 15.000 0.079 0.001   NA
 596831 596832 BT9727_1550 BT9727_1551 fliM fliN TRUE 0.968 11.000 0.032 0.001 Y NA
 596832 596833 BT9727_1551 BT9727_1552 fliN fliN TRUE 0.695 13.000 0.400 NA   NA
 596833 596834 BT9727_1552 BT9727_1553 fliN fliP FALSE 0.554 -3.000 0.073 NA   NA
 596834 596835 BT9727_1553 BT9727_1554 fliP fliQ TRUE 0.968 34.000 0.162 0.003 Y NA
 596835 596836 BT9727_1554 BT9727_1555 fliQ fliR TRUE 0.945 16.000 0.181 1.000 Y NA
 596836 596837 BT9727_1555 BT9727_1556 fliR flhB TRUE 0.950 11.000 0.259 1.000 Y NA
 596837 596838 BT9727_1556 BT9727_1557 flhB flhA TRUE 0.972 24.000 0.207 0.003 Y NA
 596838 596839 BT9727_1557 BT9727_1558 flhA flhF TRUE 0.958 15.000 0.440 1.000 Y NA
 596839 596840 BT9727_1558 BT9727_1559 flhF flhG TRUE 0.923 43.000 0.045 1.000 Y NA
 596840 596841 BT9727_1559 BT9727_1560 flhG   FALSE 0.378 118.000 0.200 1.000   NA
 596841 596842 BT9727_1560 BT9727_1561     TRUE 0.798 18.000 0.600 NA   NA
 596842 596843 BT9727_1561 BT9727_1562   azlC TRUE 0.846 -7.000 0.133 NA N NA
 596843 596844 BT9727_1562 BT9727_1563 azlC   TRUE 0.782 -9.000 0.338 NA   NA
 596845 596846 BT9727_1564 BT9727_1565     FALSE 0.551 1.000 0.114 NA   NA
 596846 596847 BT9727_1565 BT9727_1566   yqjZ TRUE 0.627 3.000 0.051 1.000   NA
 596847 596848 BT9727_1566 BT9727_1567 yqjZ   FALSE 0.004 433.000 0.000 1.000   NA
 596849 596850 BT9727_1568 BT9727_1569     TRUE 0.680 76.000 0.571 1.000   NA
 596852 596853 BT9727_1571 BT9727_1572     TRUE 0.963 -22.000 0.419 0.042 N NA
 596853 596854 BT9727_1572 BT9727_1573     TRUE 0.981 13.000 0.750 0.042 Y NA
 596854 596855 BT9727_1573 BT9727_1574     TRUE 0.923 -51.000 0.278 1.000 N NA
 596855 596856 BT9727_1574 BT9727_1575     TRUE 0.609 21.000 0.241 NA   NA
 596858 596859 BT9727_1577 BT9727_1578     TRUE 0.593 102.000 0.500 1.000   NA
 596859 596860 BT9727_1578 BT9727_1579   ynaE FALSE 0.421 51.000 0.143 NA   NA
 596860 596861 BT9727_1579 BT9727_1580 ynaE gpm FALSE 0.135 159.000 0.143 NA   NA
 596861 596862 BT9727_1580 BT9727_1581 gpm   FALSE 0.462 90.000 0.368 NA   NA
 596863 596864 BT9727_1582 BT9727_1583     FALSE 0.463 37.000 0.096 NA   NA
 596864 596865 BT9727_1583 BT9727_1584     TRUE 0.734 -16.000 0.247 NA   NA
 596868 596869 BT9727_1587 BT9727_1588     TRUE 0.851 -3.000 0.643 NA   NA
 596869 596870 BT9727_1588 BT9727_1589   topB FALSE 0.000 930.000 0.000 NA   NA
 596870 596871 BT9727_1589 BT9727_1590 topB   FALSE 0.041 47.000 0.000 NA   NA
 596873 596874 BT9727_1592 BT9727_1593     TRUE 0.750 21.000 0.000 0.046   NA
 596874 596875 BT9727_1593 BT9727_1594     FALSE 0.000 599.000 0.000 NA   NA
 596875 596876 BT9727_1594 BT9727_1595     FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   NA
 596878 596879 BT9727_1597 BT9727_1598     FALSE 0.000 963.000 0.000 NA   NA
 596879 596880 BT9727_1598 BT9727_1599     FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   NA
 596880 596881 BT9727_1599 BT9727_1600     FALSE 0.578 4.000 0.188 NA   NA
 596881 596882 BT9727_1600 BT9727_1601     TRUE 0.745 5.000 0.438 NA   NA
 596882 596883 BT9727_1601 BT9727_1602     FALSE 0.000 478.000 0.000 NA   NA
 596883 596884 BT9727_1602 BT9727_1603     FALSE 0.000 1303.000 0.000 NA   NA
 596884 596885 BT9727_1603 BT9727_1604     FALSE 0.006 179.000 0.000 NA   NA
 596885 596886 BT9727_1604 BT9727_1605     FALSE 0.023 85.000 0.000 NA   NA
 596889 596890 BT9727_1608 BT9727_1609 gntR   TRUE 0.790 17.000 0.194 NA N NA
 596890 596891 BT9727_1609 BT9727_1611   cobW FALSE 0.082 183.000 0.097 NA   NA
 596892 596893 BT9727_1610 BT9727_1612 ycgR ycgQ TRUE 0.830 17.000 0.750 NA   NA
 596893 596894 BT9727_1612 BT9727_1613 ycgQ   FALSE 0.241 113.000 0.125 NA   NA
 596894 596895 BT9727_1613 BT9727_1614   nhaC FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 596896 596897 BT9727_1615 BT9727_1616     TRUE 0.893 -40.000 0.462 1.000   NA
 596899 596900 BT9727_1618 BT9727_1619     FALSE 0.001 362.000 0.000 NA   NA
 596901 596902 BT9727_1620 BT9727_1621   matE FALSE 0.267 99.000 0.111 NA   NA
 596904 596905 BT9727_1623 BT9727_1624     FALSE 0.248 108.000 0.125 NA   NA
 596905 596906 BT9727_1624 BT9727_1625     TRUE 0.814 5.000 0.250 NA N NA
 596906 596907 BT9727_1625 BT9727_1626   ccdA TRUE 0.902 54.000 0.171 NA Y NA
 596907 596908 BT9727_1626 BT9727_1627 ccdA   TRUE 0.952 19.000 0.241 1.000 Y NA
 596908 596909 BT9727_1627 BT9727_1628   lgt FALSE 0.521 15.000 0.011 1.000   NA
 596911 596912 BT9727_1630 BT9727_1631   dsdA FALSE 0.002 248.000 0.000 NA   NA
 596912 596913 BT9727_1631 BT9727_1632 dsdA   FALSE 0.140 146.000 0.065 NA   NA
 596914 596915 BT9727_1633 BT9727_1634     FALSE 0.551 -3.000 0.071 NA   NA
 596915 596916 BT9727_1634 BT9727_1635     TRUE 0.795 -7.000 0.393 NA   NA
 596916 596917 BT9727_1635 BT9727_1636   sigW TRUE 0.799 -3.000 0.455 NA   NA
 596918 596919 BT9727_1637 BT9727_1638     TRUE 0.985 5.000 0.857 0.020 Y NA
 596919 596920 BT9727_1638 BT9727_1639     TRUE 0.824 118.000 0.667 0.100 N NA
 596920 596921 BT9727_1639 BT9727_1640     TRUE 0.779 38.000 0.250 NA N NA
 596921 596922 BT9727_1640 BT9727_1641     TRUE 0.946 2.000 0.227 NA Y NA
 596922 596923 BT9727_1641 BT9727_1642   cls TRUE 0.607 106.000 0.160 1.000 N NA
 596923 596924 BT9727_1642 BT9727_1643 cls   FALSE 0.001 353.000 0.000 NA   NA
 596924 596925 BT9727_1643 BT9727_1644     FALSE 0.068 0.000 0.000 NA   NA
 596925 596926 BT9727_1644 BT9727_1645   yeeF FALSE 0.076 -3.000 0.000 NA   NA
 596926 596927 BT9727_1645 BT9727_1646 yeeF   FALSE 0.046 41.000 0.000 NA   NA
 596929 596930 BT9727_1648 BT9727_1649 gltT aspA TRUE 0.734 25.000 0.000 1.000 N NA
 596930 596931 BT9727_1649 BT9727_1650 aspA   TRUE 0.636 55.000 0.000 1.000 N NA
 596931 596932 BT9727_1650 BT9727_1651     TRUE 0.700 66.000 0.500 1.000   NA
 596932 596933 BT9727_1651 BT9727_1652     TRUE 0.851 3.000 0.600 1.000   NA
 596933 596934 BT9727_1652 BT9727_1653     TRUE 0.826 118.000 0.113 1.000 Y NA
 596934 596935 BT9727_1653 BT9727_1654     FALSE 0.001 294.000 0.000 NA   NA
 596937 596938 BT9727_1655 BT9727_1657 asnA   FALSE 0.016 333.000 0.016 1.000   NA
 596940 596941 BT9727_1659 BT9727_1660 yndG yndH TRUE 0.737 4.000 0.417 NA   NA
 596941 596942 BT9727_1660 BT9727_1661 yndH yndJ TRUE 0.719 6.000 0.400 NA   NA
 596944 596945 BT9727_1663 BT9727_1664     FALSE 0.040 49.000 0.000 NA   NA
 596945 596946 BT9727_1664 BT9727_1665     TRUE 0.692 -7.000 0.222 NA   NA
 596948 596949 BT9727_1667 BT9727_1668 cstA   FALSE 0.161 90.000 0.015 NA   NA
 596949 596950 BT9727_1668 BT9727_1669     FALSE 0.065 177.000 0.044 NA   NA
 596950 596951 BT9727_1669 BT9727_1670     FALSE 0.530 36.000 0.194 NA   NA
 596951 596952 BT9727_1670 BT9727_1671     FALSE 0.142 204.000 0.000 0.072   NA
 596954 596955 BT9727_1673 BT9727_1674   hflX FALSE 0.003 484.000 0.000 1.000   NA
 596956 596957 BT9727_1675 BT9727_1676 oppA oppA FALSE 0.457 117.000 0.000 0.042   NA
 596958 596959 BT9727_1677 BT9727_1678 fsr cysK TRUE 0.803 11.000 0.059 1.000 N NA
 596959 596960 BT9727_1678 BT9727_1679 cysK   FALSE 0.449 78.000 0.143 1.000   NA
 596960 596961 BT9727_1679 BT9727_1680     TRUE 0.730 82.000 0.778 1.000   NA
 596965 596966 BT9727_1684 BT9727_1685 yraL   FALSE 0.194 180.000 0.412 NA   NA
 596966 596967 BT9727_1685 BT9727_1686     FALSE 0.413 111.000 0.375 NA   NA
 596968 596969 BT9727_1687 BT9727_1688   msrB FALSE 0.291 67.000 0.056 NA   NA
 596969 596970 BT9727_1688 BT9727_1689 msrB   TRUE 0.655 92.000 0.194 1.000 N NA
 596971 596972 BT9727_1690 BT9727_1691 ilvE ilvB TRUE 0.937 23.000 0.017 1.000 Y NA
 596972 596973 BT9727_1691 BT9727_1692 ilvB   TRUE 0.902 -12.000 0.006 0.001   NA
 596973 596974 BT9727_1692 BT9727_1693   ilvC FALSE 0.508 15.000 0.003 1.000   NA
 596974 596975 BT9727_1693 BT9727_1694 ilvC ilvD TRUE 0.955 47.000 0.022 0.002 Y NA
 596975 596976 BT9727_1694 BT9727_1695 ilvD ilvA TRUE 0.931 32.000 0.012 1.000 Y NA
 596978 596979 BT9727_1697 BT9727_1698 ydfK   FALSE 0.405 4.000 0.032 NA   NA
 596979 596980 BT9727_1698 BT9727_1699     FALSE 0.166 169.000 0.075 1.000   NA
 596982 596983 BT9727_1701 BT9727_1702   pfs FALSE 0.449 115.000 0.000 1.000 N NA
 596983 596984 BT9727_1702 BT9727_1703 pfs   FALSE 0.007 169.000 0.000 NA   NA
 596984 596985 BT9727_1703 BT9727_1704     FALSE 0.477 128.000 0.588 NA   NA
 596985 596986 BT9727_1704 BT9727_1705     FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000   NA
 596986 596987 BT9727_1705 BT9727_1706   yunG FALSE 0.562 28.000 0.207 NA   NA
 596987 596988 BT9727_1706 BT9727_1707 yunG   FALSE 0.294 72.000 0.069 NA   NA
 596990 596991 BT9727_1709 BT9727_1710 oppA   FALSE 0.000 514.000 0.000 NA   NA
 596991 596992 BT9727_1710 BT9727_1711     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 596992 596993 BT9727_1711 BT9727_1712     FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 596993 596994 BT9727_1712 BT9727_1713     FALSE 0.055 277.000 0.000 0.075   NA
 596996 596997 BT9727_1715 BT9727_1716   vanS TRUE 0.982 -70.000 0.455 1.000 Y NA
 596997 596998 BT9727_1716 BT9727_1717 vanS   FALSE 0.435 83.000 0.143 1.000   NA
 597002 597003 BT9727_1721 BT9727_1722     FALSE 0.036 54.000 0.000 NA   NA
 597003 597004 BT9727_1722 BT9727_1723   panE FALSE 0.001 284.000 0.000 NA   NA
 597004 597005 BT9727_1723 BT9727_1724 panE   FALSE 0.000 614.000 0.000 NA   NA
 597005 597006 BT9727_1724 BT9727_1725     FALSE 0.534 -126.000 0.019 NA   NA
 597006 597007 BT9727_1725 BT9727_1726     TRUE 0.717 65.000 0.019 0.005   NA
 597007 597008 BT9727_1726 BT9727_1727   nheA FALSE 0.003 594.000 0.000 1.000   NA
 597008 597009 BT9727_1727 BT9727_1728 nheA   TRUE 0.903 32.000 0.500 0.004   NA
 597009 597010 BT9727_1728 BT9727_1729   nheC TRUE 0.787 108.000 0.625 0.004   NA
 597010 597011 BT9727_1729 BT9727_1730 nheC   FALSE 0.231 163.000 0.222 1.000   NA
 597011 597012 BT9727_1730 BT9727_1731   deoR FALSE 0.029 358.000 0.000 1.000 N NA
 597012 597013 BT9727_1731 BT9727_1732 deoR deoC FALSE 0.068 306.000 0.077 1.000 N NA
 597013 597014 BT9727_1732 BT9727_1733 deoC nupC TRUE 0.832 103.000 0.026 1.000 Y NA
 597014 597015 BT9727_1733 BT9727_1734 nupC pyn TRUE 0.929 37.000 0.031 1.000 Y NA
 597015 597016 BT9727_1734 BT9727_1735 pyn cdd TRUE 0.932 34.000 0.031 1.000 Y NA
 597016 597017 BT9727_1735 BT9727_1736 cdd ccdC FALSE 0.483 42.000 0.167 NA   NA
 597018 597019 BT9727_1737 BT9727_1738 ynzC ccdA FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 597019 597020 BT9727_1738 BT9727_1739 ccdA   TRUE 0.807 52.000 0.750 1.000   NA
 597021 597022 BT9727_1740 BT9727_1741 pepP   FALSE 0.518 118.000 0.027 1.000 N NA
 597022 597023 BT9727_1741 BT9727_1742     FALSE 0.012 606.000 0.000 1.000 N NA
 597025 597026 BT9727_1744 BT9727_1745 topB   FALSE 0.001 374.000 0.000 NA   NA
 597026 597027 BT9727_1745 BT9727_1746     FALSE 0.062 3.000 0.000 NA   NA
 597027 597028 BT9727_1746 BT9727_1747     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 597028 597029 BT9727_1747 BT9727_1748     FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 597031 597032 BT9727_1750 BT9727_1751 azr brnQ FALSE 0.093 240.000 0.000 1.000 N NA
 597032 597033 BT9727_1751 BT9727_1752 brnQ   FALSE 0.319 84.000 0.010 1.000   NA
 597033 597034 BT9727_1752 BT9727_1753     FALSE 0.007 345.000 0.000 1.000   NA
 597034 597035 BT9727_1753 BT9727_1754   ycnI FALSE 0.534 113.000 0.600 NA   NA
 597036 597037 BT9727_1755 BT9727_1756     FALSE 0.101 177.000 0.158 NA   NA
 597038 597039 BT9727_1757 BT9727_1758     TRUE 0.834 121.000 0.389 NA Y NA
 597039 597040 BT9727_1758 BT9727_1759     TRUE 0.630 72.000 0.158 NA N NA
 597040 597041 BT9727_1759 BT9727_1760     TRUE 0.750 58.000 0.123 0.036   NA
 597041 597042 BT9727_1760 BT9727_1761   gatA FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000   NA
 597042 597043 BT9727_1761 BT9727_1762 gatA ydbI FALSE 0.092 179.000 0.128 NA   NA
 597045 597046 BT9727_1764 BT9727_1765   cobW FALSE 0.351 105.000 0.273 NA   NA
 597046 597047 BT9727_1765 BT9727_1766 cobW   FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 597047 597048 BT9727_1766 BT9727_1767   livG TRUE 0.915 90.000 0.750 NA Y NA
 597048 597049 BT9727_1767 BT9727_1768 livG livF TRUE 0.991 -22.000 0.708 0.026 Y NA
 597049 597050 BT9727_1768 BT9727_1769 livF livH TRUE 0.972 22.000 0.746 1.000 Y NA
 597050 597051 BT9727_1769 BT9727_1770 livH livM TRUE 0.984 2.000 0.687 0.042 Y NA
 597055 597056 BT9727_1774 BT9727_1775     FALSE 0.006 368.000 0.000 1.000   NA
 597056 597057 BT9727_1775 BT9727_1776     FALSE 0.533 120.000 0.259 NA N NA
 597057 597058 BT9727_1776 BT9727_1777   cydA FALSE 0.040 618.000 0.000 NA Y NA
 597058 597059 BT9727_1777 BT9727_1778 cydA cydB TRUE 0.979 -13.000 0.051 0.036 Y NA
 597059 597060 BT9727_1778 BT9727_1779 cydB cydD TRUE 0.955 0.000 0.151 1.000 Y NA
 597060 597061 BT9727_1779 BT9727_1780 cydD cydC TRUE 0.974 3.000 0.168 0.004 Y NA
 597061 597062 BT9727_1780 BT9727_1781 cydC   FALSE 0.002 233.000 0.000 NA   NA
 597062 597063 BT9727_1781 BT9727_1782     FALSE 0.452 91.000 0.353 NA   NA
 597065 597066 BT9727_1784 BT9727_1785 dacA   FALSE 0.021 248.000 0.000 1.000   NA
 597070 597071 BT9727_1789 BT9727_1790     TRUE 0.877 2.000 0.306 1.000 N NA
 597071 597072 BT9727_1790 BT9727_1791     TRUE 0.962 15.000 0.538 1.000 Y NA
 597074 597075 BT9727_1793 BT9727_1794 fabG aadK FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 597075 597076 BT9727_1794 BT9727_1795 aadK pdaA FALSE 0.232 118.000 0.136 NA   NA
 597076 597077 BT9727_1795 BT9727_1796 pdaA   TRUE 0.596 69.000 0.467 NA   NA
 597079 597080 BT9727_1797 BT9727_1799   hom FALSE 0.002 967.000 0.000 1.000   NA
 597080 597081 BT9727_1799 BT9727_1800 hom thrC TRUE 0.959 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 597081 597082 BT9727_1800 BT9727_1801 thrC thrB TRUE 0.963 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 597082 597083 BT9727_1801 BT9727_1802 thrB   FALSE 0.112 121.000 0.011 NA   NA
 597083 597084 BT9727_1802 BT9727_1803     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   NA
 597084 597085 BT9727_1803 BT9727_1804     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 597085 597086 BT9727_1804 BT9727_1805     FALSE 0.267 164.000 0.444 NA   NA
 597086 597087 BT9727_1805 BT9727_1806   phoP FALSE 0.585 14.000 0.057 1.000   NA
 597087 597088 BT9727_1806 BT9727_1807 phoP   TRUE 0.973 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 597088 597089 BT9727_1807 BT9727_1808     TRUE 0.616 101.000 0.129 1.000 N NA
 597089 597090 BT9727_1808 BT9727_1809     FALSE 0.486 15.000 0.111 NA   NA
 597090 597091 BT9727_1809 BT9727_1810   sapB FALSE 0.127 160.000 0.111 NA   NA
 597091 597092 BT9727_1810 BT9727_1811 sapB   FALSE 0.353 95.000 0.049 1.000   NA
 597092 597093 BT9727_1811 BT9727_1812     FALSE 0.011 299.000 0.000 1.000   NA
 597093 597094 BT9727_1812 BT9727_1813     TRUE 0.954 65.000 0.163 0.000 Y NA
 597094 597095 BT9727_1813 BT9727_1814     TRUE 0.974 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 597095 597096 BT9727_1814 BT9727_1815     TRUE 0.821 -3.000 0.526 NA   NA
 597096 597097 BT9727_1815 BT9727_1816     TRUE 0.778 16.000 0.583 NA   NA
 597097 597098 BT9727_1816 BT9727_1817     TRUE 0.683 38.000 0.412 NA   NA
 597098 597099 BT9727_1817 BT9727_1818   sspA FALSE 0.224 120.000 0.137 NA   NA
 597099 597100 BT9727_1818 BT9727_1819 sspA   FALSE 0.192 169.000 0.167 1.000   NA
 597101 597102 BT9727_1820 BT9727_1821     FALSE 0.004 427.000 0.000 1.000   NA
 597103 597104 BT9727_1822 BT9727_1823     FALSE 0.309 146.000 0.375 NA   NA
 597104 597105 BT9727_1823 BT9727_1824     TRUE 0.654 104.000 0.875 NA   NA
 597105 597106 BT9727_1824 BT9727_1825     TRUE 0.826 32.000 0.778 NA   NA
 597108 597109 BT9727_1827 BT9727_1828   abrB FALSE 0.336 117.000 0.286 NA   NA
 597109 597110 BT9727_1828 BT9727_1829 abrB isp FALSE 0.040 275.000 0.000 NA N NA
 597112 597113 BT9727_1831 BT9727_1832     TRUE 0.841 49.000 0.429 1.000 N NA
 597114 597115 BT9727_1833 BT9727_1834     TRUE 0.846 13.000 0.889 NA   NA
 597116 597117 BT9727_1835 BT9727_1836   yloQ FALSE 0.181 135.000 0.091 NA   NA
 597117 597118 BT9727_1836 BT9727_1837 yloQ mcpA FALSE 0.037 205.000 0.000 1.000   NA
 597118 597119 BT9727_1837 BT9727_1838 mcpA   FALSE 0.236 195.000 0.667 NA   NA
 597119 597120 BT9727_1838 BT9727_1839     FALSE 0.002 252.000 0.000 NA   NA
 597122 597123 BT9727_1841 BT9727_1842 dps   FALSE 0.246 107.000 0.111 NA   NA
 597123 597124 BT9727_1842 BT9727_1843     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 597125 597126 BT9727_1844 BT9727_1845     FALSE 0.483 106.000 0.467 NA   NA
 597127 597128 BT9727_1846 BT9727_1847     TRUE 0.815 76.000 0.636 1.000 N NA
 597131 597132 BT9727_1850 BT9727_1851 bltD znuA FALSE 0.499 136.000 0.083 1.000 N NA
 597135 597136 BT9727_1854 BT9727_1855 ogt   FALSE 0.434 8.000 0.054 NA   NA
 597136 597137 BT9727_1855 BT9727_1856   oppA FALSE 0.287 139.000 0.296 NA   NA
 597137 597138 BT9727_1856 BT9727_1857 oppA fosB TRUE 0.893 59.000 0.129 NA Y NA
 597138 597139 BT9727_1857 BT9727_1858 fosB   FALSE 0.369 13.000 0.032 NA   NA
 597139 597140 BT9727_1858 BT9727_1859   pgm FALSE 0.419 13.000 0.056 NA   NA
 597142 597143 BT9727_1862 BT9727_1863 cotH   FALSE 0.495 106.000 0.062 NA N NA
 597143 597144 BT9727_1863 BT9727_1864     FALSE 0.210 105.000 0.062 NA   NA
 597144 597145 BT9727_1864 BT9727_1865     FALSE 0.511 103.000 0.500 NA   NA
 597145 597146 BT9727_1865 BT9727_1866   corA FALSE 0.235 185.000 0.033 0.099   NA
 597146 597147 BT9727_1866 BT9727_1867 corA   FALSE 0.049 199.000 0.053 NA   NA
 597147 597148 BT9727_1867 BT9727_1868   ycgQ TRUE 0.857 4.000 0.841 NA   NA
 597148 597149 BT9727_1868 BT9727_1869 ycgQ   FALSE 0.096 187.000 0.195 NA   NA
 597149 597150 BT9727_1869 BT9727_1870   cls FALSE 0.128 425.000 0.000 0.039 Y NA
 597150 597151 BT9727_1870 BT9727_1871 cls   TRUE 0.833 31.000 0.800 NA   NA
 597151 597152 BT9727_1871 BT9727_1872     FALSE 0.252 154.000 0.333 NA   NA
 597152 597153 BT9727_1872 BT9727_1873     FALSE 0.323 103.000 0.227 NA   NA
 597154 597155 BT9727_1874 BT9727_1875     FALSE 0.424 2.000 0.034 NA   NA
 597155 597156 BT9727_1875 BT9727_1876     FALSE 0.003 209.000 0.000 NA   NA
 597157 597158 BT9727_1877 BT9727_1878   brnQ FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 597158 597159 BT9727_1878 BT9727_1879 brnQ csaA FALSE 0.418 67.000 0.032 1.000   NA
 597159 597160 BT9727_1879 BT9727_1880 csaA   FALSE 0.392 18.000 0.032 NA   NA
 597161 597162 BT9727_1881 BT9727_1882     TRUE 0.690 -10.000 0.200 NA   NA
 597163 597164 BT9727_1883 BT9727_1884 spoIIP   FALSE 0.063 215.000 0.214 NA   NA
 597164 597165 BT9727_1884 BT9727_1885     TRUE 0.897 12.000 0.571 1.000 N NA
 597165 597166 BT9727_1885 BT9727_1886     TRUE 0.800 24.000 0.444 1.000   NA
 597166 597167 BT9727_1886 BT9727_1887   gatA FALSE 0.188 185.000 0.286 1.000   NA
 597169 597170 BT9727_1889 BT9727_1890     TRUE 0.947 3.000 0.259 NA Y NA
 597170 597171 BT9727_1890 BT9727_1891     FALSE 0.549 105.000 0.021 1.000 N NA
 597171 597172 BT9727_1891 BT9727_1892     TRUE 0.771 7.000 0.368 1.000   NA
 597175 597176 BT9727_1895 BT9727_1896     TRUE 0.789 -13.000 0.185 1.000   NA
 597176 597177 BT9727_1896 BT9727_1897     FALSE 0.587 24.000 0.222 NA   NA
 597178 597179 BT9727_1898 BT9727_1899   yqfU FALSE 0.353 168.000 0.700 NA   NA
 597181 597182 BT9727_1901 BT9727_1902     FALSE 0.210 148.000 0.043 1.000   NA
 597182 597183 BT9727_1902 BT9727_1903     TRUE 0.887 -28.000 0.000 0.002   NA
 597184 597185 BT9727_1904 BT9727_1906     FALSE 0.105 -28.000 0.000 NA   NA
 597186 597187 BT9727_1907 BT9727_1908     FALSE 0.546 89.000 0.000 0.024   NA
 597187 597188 BT9727_1908 BT9727_1909     FALSE 0.476 13.000 0.090 NA   NA
 597188 597189 BT9727_1909 BT9727_1910     TRUE 0.758 -3.000 0.368 NA   NA
 597189 597190 BT9727_1910 BT9727_1911     FALSE 0.514 32.000 0.158 NA   NA
 597190 597191 BT9727_1911 BT9727_1912   yfjA FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 597191 597192 BT9727_1912 BT9727_1913 yfjA   FALSE 0.188 128.000 0.082 NA   NA
 597192 597193 BT9727_1913 BT9727_1914     TRUE 0.675 -28.000 0.122 NA   NA
 597193 597194 BT9727_1914 BT9727_1915     FALSE 0.547 5.000 0.158 NA   NA
 597194 597195 BT9727_1915 BT9727_1916     TRUE 0.721 73.000 0.833 NA   NA
 597195 597196 BT9727_1916 BT9727_1917     TRUE 0.764 40.000 0.623 NA   NA
 597196 597197 BT9727_1917 BT9727_1918     FALSE 0.381 13.000 0.038 NA   NA
 597197 597198 BT9727_1918 BT9727_1919     FALSE 0.060 4.000 0.000 NA   NA
 597198 597199 BT9727_1919 BT9727_1920     FALSE 0.052 13.000 0.000 NA   NA
 597199 597200 BT9727_1920 BT9727_1921     FALSE 0.052 32.000 0.000 NA   NA
 597200 597201 BT9727_1921 BT9727_1923     FALSE 0.017 113.000 0.000 NA   NA
 597201 597202 BT9727_1923 BT9727_1924     TRUE 0.813 -3.000 0.500 NA   NA
 597202 597203 BT9727_1924 BT9727_1925     FALSE 0.000 712.000 0.000 NA   NA
 597203 597204 BT9727_1925 BT9727_1926     FALSE 0.019 104.000 0.000 NA   NA
 597204 597205 BT9727_1926 BT9727_1927     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 597205 597206 BT9727_1927 BT9727_1928     FALSE 0.000 418.000 0.000 NA   NA
 597206 597207 BT9727_1928 BT9727_1929     FALSE 0.032 63.000 0.000 NA   NA
 597207 597208 BT9727_1929 BT9727_1930     FALSE 0.448 153.000 0.750 NA   NA
 597210 597211 BT9727_1932 BT9727_1933     FALSE 0.346 89.000 0.216 NA   NA
 597211 597212 BT9727_1933 BT9727_1934     FALSE 0.474 52.000 0.216 NA   NA
 597212 597213 BT9727_1934 BT9727_1935     TRUE 0.757 67.000 0.889 NA   NA
 597215 597216 BT9727_1937 BT9727_1938   fhs TRUE 0.739 64.000 0.200 1.000 N NA
 597216 597217 BT9727_1938 BT9727_1939 fhs   FALSE 0.480 79.000 0.355 NA   NA
 597217 597218 BT9727_1939 BT9727_1940     FALSE 0.481 20.000 0.070 NA   NA
 597218 597219 BT9727_1940 BT9727_1941     FALSE 0.107 143.000 0.026 NA   NA
 597219 597220 BT9727_1941 BT9727_1942     FALSE 0.457 56.000 0.211 NA   NA
 597221 597222 BT9727_1943 BT9727_1944   qor FALSE 0.581 30.000 0.233 NA   NA
 597223 597224 BT9727_1945 BT9727_1946     TRUE 0.880 -3.000 0.800 NA   NA
 597225 597226 BT9727_1947 BT9727_1948     FALSE 0.436 32.000 0.064 NA   NA
 597226 597227 BT9727_1948 BT9727_1949     FALSE 0.242 89.000 0.064 NA   NA
 597229 597230 BT9727_1951 BT9727_1952   yeaD TRUE 0.851 -3.000 0.642 NA   NA
 597230 597231 BT9727_1952 BT9727_1953 yeaD moxR TRUE 0.851 0.000 0.714 NA   NA
 597232 597233 BT9727_1954 BT9727_1955 narG narH TRUE 0.989 -10.000 0.429 0.000 Y NA
 597233 597234 BT9727_1955 BT9727_1956 narH narJ TRUE 0.986 20.000 0.750 0.001 Y NA
 597234 597235 BT9727_1956 BT9727_1957 narJ narI TRUE 0.978 21.000 0.294 0.001 Y NA
 597237 597238 BT9727_1959 BT9727_1960 moaA moeB TRUE 0.983 18.000 0.778 0.039 Y NA
 597238 597239 BT9727_1960 BT9727_1961 moeB moeA TRUE 0.954 42.000 0.500 1.000 Y NA
 597239 597240 BT9727_1961 BT9727_1962 moeA moaE TRUE 0.953 45.000 0.006 0.004 Y NA
 597240 597241 BT9727_1962 BT9727_1963 moaE moaD TRUE 0.986 -3.000 0.501 0.004 Y NA
 597241 597242 BT9727_1963 BT9727_1964 moaD narK TRUE 0.605 81.000 0.021 1.000 N NA
 597242 597243 BT9727_1964 BT9727_1965 narK   FALSE 0.029 353.000 0.000 0.070   NA
 597244 597245 BT9727_1966 BT9727_1967     TRUE 0.754 -7.000 0.143 1.000   NA
 597245 597246 BT9727_1967 BT9727_1968     TRUE 0.825 -3.000 0.381 1.000   NA
 597246 597247 BT9727_1968 BT9727_1969   nasE TRUE 0.707 62.000 0.061 1.000 N NA
 597247 597248 BT9727_1969 BT9727_1970 nasE nirB TRUE 0.921 16.000 0.091 0.000 N NA
 597248 597249 BT9727_1970 BT9727_1971 nirB scdA FALSE 0.088 211.000 0.000 NA N NA
 597254 597255 BT9727_1976 BT9727_1977   spoVS FALSE 0.000 700.000 0.000 NA   NA
 597259 597260 BT9727_1981 BT9727_1982     TRUE 0.653 -3.000 0.031 1.000   NA
 597260 597261 BT9727_1982 BT9727_1983     FALSE 0.199 76.000 0.022 NA   NA
 597261 597262 BT9727_1983 BT9727_1984     FALSE 0.191 106.000 0.049 NA   NA
 597262 597263 BT9727_1984 BT9727_1985   ssb FALSE 0.393 159.000 0.700 NA   NA
 597264 597265 BT9727_1986 BT9727_1987     FALSE 0.564 117.000 0.088 1.000 N NA
 597266 597267 BT9727_1988 BT9727_1989     FALSE 0.395 4.000 0.028 NA   NA
 597267 597268 BT9727_1989 BT9727_1990     FALSE 0.194 84.000 0.028 NA   NA
 597268 597269 BT9727_1990 BT9727_1991   pcmT FALSE 0.390 50.000 0.081 NA   NA
 597269 597270 BT9727_1991 BT9727_1992 pcmT argS FALSE 0.011 301.000 0.000 1.000   NA
 597270 597271 BT9727_1992 BT9727_1993 argS   FALSE 0.237 134.000 0.032 1.000   NA
 597271 597272 BT9727_1993 BT9727_1994     FALSE 0.005 382.000 0.000 1.000   NA
 597272 597273 BT9727_1994 BT9727_1995   ileS FALSE 0.005 392.000 0.000 1.000   NA
 597273 597274 BT9727_1995 BT9727_1996 ileS   FALSE 0.037 326.000 0.000 1.000 N NA
 597276 597277 BT9727_1998 BT9727_1999 murF aspS FALSE 0.051 387.000 0.000 0.040 N NA
 597277 597278 BT9727_1999 BT9727_2000 aspS   FALSE 0.003 481.000 0.000 1.000   NA
 597278 597279 BT9727_2000 BT9727_2001   pip TRUE 0.638 41.000 0.206 1.000   NA
 597280 597281 BT9727_2002 BT9727_2003     FALSE 0.477 33.000 0.095 NA   NA
 597282 597283 BT9727_2004 BT9727_2005 gph gntP FALSE 0.033 210.000 0.000 1.000   NA
 597283 597284 BT9727_2005 BT9727_2006 gntP gbsB TRUE 0.858 53.000 0.583 1.000 N NA
 597284 597285 BT9727_2006 BT9727_2007 gbsB racD FALSE 0.416 148.000 0.032 1.000 N NA
 597285 597286 BT9727_2007 BT9727_2008 racD   FALSE 0.196 88.000 0.032 NA   NA
 597286 597287 BT9727_2008 BT9727_2009     FALSE 0.590 -3.000 0.113 NA   NA
 597288 597289 BT9727_2010 BT9727_2011     FALSE 0.557 30.000 0.027 1.000   NA
 597290 597291 BT9727_2012 BT9727_2013     TRUE 0.755 -7.000 0.308 NA   NA
 597291 597292 BT9727_2013 BT9727_2014   ypjP FALSE 0.001 283.000 0.000 NA   NA
 597292 597293 BT9727_2014 BT9727_2015 ypjP gph FALSE 0.197 101.000 0.045 NA   NA
 597293 597294 BT9727_2015 BT9727_2016 gph   TRUE 0.619 2.000 0.038 1.000   NA
 597294 597295 BT9727_2016 BT9727_2017     FALSE 0.472 13.000 0.085 NA   NA
 597297 597298 BT9727_2019 BT9727_2020 ramA thyA FALSE 0.264 107.000 0.004 1.000   NA
 597298 597299 BT9727_2020 BT9727_2021 thyA dfrA TRUE 0.865 20.000 0.295 1.000 N NA
 597299 597300 BT9727_2021 BT9727_2022 dfrA pbp3 FALSE 0.361 156.000 0.015 1.000 N NA
 597300 597301 BT9727_2022 BT9727_2023 pbp3   TRUE 0.609 63.000 0.000 1.000 N NA
 597301 597302 BT9727_2023 BT9727_2024     TRUE 0.889 135.000 0.333 0.044 Y NA
 597302 597303 BT9727_2024 BT9727_2025   yvaB FALSE 0.084 249.000 0.000 1.000 N NA
 597303 597304 BT9727_2025 BT9727_2026 yvaB plsC TRUE 0.847 112.000 0.206 1.000 Y NA
 597306 597307 BT9727_2028 BT9727_2029 tatA tatC TRUE 0.944 43.000 0.500 NA Y NA
 597307 597308 BT9727_2029 BT9727_2030 tatC ypmP FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 597308 597309 BT9727_2030 BT9727_2031 ypmP   FALSE 0.376 153.000 0.577 NA   NA
 597313 597314 BT9727_2035 BT9727_2036 asnB   FALSE 0.404 94.000 0.108 1.000   NA
 597314 597315 BT9727_2036 BT9727_2037     TRUE 0.749 49.000 0.667 NA   NA
 597315 597316 BT9727_2037 BT9727_2038     FALSE 0.000 434.000 0.000 NA   NA
 597316 597317 BT9727_2038 BT9727_2039   daaA TRUE 0.736 132.000 0.778 1.000 N NA
 597317 597318 BT9727_2039 BT9727_2040 daaA   TRUE 0.635 99.000 0.175 1.000 N NA
 597318 597319 BT9727_2040 BT9727_2041     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 597319 597320 BT9727_2041 BT9727_2042     FALSE 0.455 68.000 0.263 NA   NA
 597320 597321 BT9727_2042 BT9727_2043   pncA FALSE 0.169 112.000 0.039 NA   NA
 597323 597324 BT9727_2045 BT9727_2046 hsp   FALSE 0.031 300.000 0.000 NA N NA
 597324 597325 BT9727_2046 BT9727_2047   yhcY FALSE 0.554 151.000 0.400 1.000 N NA
 597325 597326 BT9727_2047 BT9727_2048 yhcY yhcZ TRUE 0.968 14.000 0.250 0.019 Y