MicrobesOnline Operon Predictions for Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 608963 608964 Lxx00010 Lxx00020 dnaA dnaN FALSE 0.496 437.000 0.328 1.000 Y NA
 608964 608965 Lxx00020 Lxx00030 dnaN gnd TRUE 0.595 38.000 0.006 1.000 N NA
 608965 608966 Lxx00030 Lxx00040 gnd recF TRUE 0.882 7.000 0.009 1.000 N NA
 608966 608967 Lxx00040 Lxx00050 recF   TRUE 0.982 -3.000 0.099 NA   NA
 608967 608968 Lxx00050 Lxx00060   gyrB FALSE 0.362 124.000 0.022 NA   NA
 608968 608969 Lxx00060 Lxx00070 gyrB gyrA TRUE 0.978 44.000 0.306 0.003 Y NA
 608969 608970 Lxx00070 Lxx00080 gyrA   TRUE 0.955 -10.000 0.053 NA   NA
 608970 608971 Lxx00080 Lxx00090   Ile TRUE 0.554 58.000 0.000 NA   NA
 608971 608972 Lxx00090 Lxx00100 Ile Ala TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 608972 1799820 Lxx00100 Lxx00110 Ala   FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 1799820 1799821 Lxx00110 Lxx00120   apaLI FALSE 0.019 807.000 0.000 NA   NA
 608976 608977 Lxx00160 Lxx00170 ppiB yggP TRUE 0.948 24.000 0.182 1.000   NA
 608979 608980 Lxx00190 Lxx00200   trpG FALSE 0.279 160.000 0.046 NA N NA
 608981 608982 Lxx00210 Lxx00220 pknB pknA TRUE 0.980 73.000 0.368 0.002 Y NA
 608982 608983 Lxx00220 Lxx00230 pknA   TRUE 0.988 -3.000 0.162 0.006 N NA
 608983 608984 Lxx00230 Lxx00240   ftsW TRUE 0.860 35.000 0.070 1.000 N NA
 608984 608985 Lxx00240 Lxx00250 ftsW   TRUE 0.985 2.000 0.180 1.000 N NA
 608985 608986 Lxx00250 Lxx00260     TRUE 0.988 4.000 0.267 NA   NA
 608986 608987 Lxx00260 Lxx00270     TRUE 0.996 -3.000 0.629 NA   NA
 608988 608989 Lxx00280 Lxx00290 Leu   FALSE 0.027 488.000 0.000 NA   NA
 608991 608992 Lxx00320 Lxx00330   araH TRUE 0.999 3.000 0.800 1.000 Y NA
 608992 608993 Lxx00330 Lxx00340 araH   TRUE 0.990 68.000 0.800 NA Y NA
 608993 1799822 Lxx00340 Lxx00350   tnp FALSE 0.031 398.000 0.000 NA   NA
 1799822 608994 Lxx00350 Lxx00370 tnp   FALSE 0.018 1275.000 0.000 NA   NA
 608994 608995 Lxx00370 Lxx00380     FALSE 0.019 1317.000 0.000 1.000   NA
 608996 608997 Lxx00390 Lxx00400 5 lysL TRUE 0.875 8.000 0.000 NA   NA
 608997 608998 Lxx00400 Lxx00410 lysL   FALSE 0.021 710.000 0.000 NA   NA
 608999 609000 Lxx00420 Lxx00440 tnp mut FALSE 0.017 1845.000 0.000 NA   NA
 609001 609002 Lxx00450 Lxx00460     FALSE 0.035 369.000 0.000 1.000   NA
 609004 609005 Lxx00490 Lxx00500     FALSE 0.257 133.000 0.000 1.000   NA
 609006 1799823 Lxx00510 Lxx00520     FALSE 0.420 104.000 0.000 NA   NA
 1799823 609007 Lxx00520 Lxx00540     TRUE 0.665 31.000 0.000 NA   NA
 609007 609008 Lxx00540 Lxx00550     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.043 Y NA
 609009 609010 Lxx00570 Lxx00600 tnp   FALSE 0.017 1953.000 0.000 NA   NA
 609011 609012 Lxx00610 Lxx00620 kdgK   TRUE 0.985 -3.000 0.130 1.000 N NA
 609012 609013 Lxx00620 Lxx00630     TRUE 0.984 12.000 0.348 NA N NA
 609013 1799826 Lxx00630 Lxx00633     FALSE 0.354 115.000 0.000 NA   NA
 1799826 1799827 Lxx00633 Lxx00636     FALSE 0.542 82.000 0.000 NA   NA
 1799827 609014 Lxx00636 Lxx00640     TRUE 0.819 13.000 0.000 NA   NA
 609014 609015 Lxx00640 Lxx00660     FALSE 0.038 316.000 0.000 NA   NA
 609015 609016 Lxx00660 Lxx00670     FALSE 0.516 86.000 0.000 NA   NA
 609017 609018 Lxx00680 Lxx00690 crcB crcB TRUE 0.998 -3.000 0.452 0.082 Y NA
 609018 609019 Lxx00690 Lxx00710 crcB   FALSE 0.487 93.000 0.000 1.000   NA
 609020 609021 Lxx00700 Lxx00730     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609022 609023 Lxx00740 Lxx00750     FALSE 0.054 244.000 0.000 NA   NA
 609023 609024 Lxx00750 Lxx00760     FALSE 0.116 525.000 0.000 NA Y NA
 609025 609026 Lxx00800 Lxx00810 mtlD   TRUE 0.962 13.000 0.019 1.000 Y NA
 609026 609027 Lxx00810 Lxx00820   EIIBC-Mtl TRUE 0.988 -3.000 0.025 0.004 Y NA
 609027 609028 Lxx00820 Lxx00830 EIIBC-Mtl ptsI TRUE 0.986 -3.000 0.016 0.009 Y NA
 609028 609029 Lxx00830 Lxx00840 ptsI ptsH TRUE 0.976 60.000 0.286 0.009 Y NA
 609029 609030 Lxx00840 Lxx00850 ptsH   TRUE 0.982 -7.000 0.000 0.009 Y NA
 1799829 1799830 Lxx00860 Lxx00875     FALSE 0.028 453.000 0.000 NA   NA
 1799830 609031 Lxx00875 Lxx00880     FALSE 0.543 68.000 0.000 NA   NA
 609031 609032 Lxx00880 Lxx00900     FALSE 0.034 441.000 0.000 1.000 N NA
 609033 609034 Lxx00910 Lxx00920     TRUE 0.611 38.000 0.000 NA   NA
 609034 609035 Lxx00920 Lxx00930     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609037 609038 Lxx00950 Lxx00960   dinF FALSE 0.019 1007.000 0.000 NA   NA
 609039 609040 Lxx00970 Lxx00980     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609040 609041 Lxx00980 Lxx00990     FALSE 0.022 677.000 0.000 NA   NA
 609041 609042 Lxx00990 Lxx01000     FALSE 0.523 85.000 0.000 NA   NA
 609042 609043 Lxx01000 Lxx01010     TRUE 0.791 17.000 0.000 NA   NA
 609043 609044 Lxx01010 Lxx01020     FALSE 0.087 201.000 0.000 1.000 N NA
 609045 609046 Lxx01030 Lxx01050 glyS hemA TRUE 0.596 77.000 0.000 1.000 N NA
 609047 609048 Lxx01040 Lxx01060 hemE hemG TRUE 0.992 -3.000 0.049 0.002 Y NA
 609048 609049 Lxx01060 Lxx01080 hemG   FALSE 0.029 436.000 0.000 NA   NA
 609049 1799831 Lxx01080 Lxx01085     TRUE 0.548 64.000 0.000 NA   NA
 1799831 609050 Lxx01085 Lxx01090   hemZ TRUE 0.686 28.000 0.000 NA   NA
 609050 609051 Lxx01090 Lxx01100 hemZ hemC TRUE 0.985 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 609051 609052 Lxx01100 Lxx01110 hemC hemD TRUE 0.997 -3.000 0.205 0.004 Y NA
 609052 609053 Lxx01110 Lxx01120 hemD hemB TRUE 0.964 28.000 0.071 0.004 Y NA
 609053 609054 Lxx01120 Lxx01130 hemB hemL TRUE 0.975 21.000 0.067 0.004 Y NA
 609054 609055 Lxx01130 Lxx01140 hemL   FALSE 0.165 155.000 0.000 1.000   NA
 609055 609056 Lxx01140 Lxx01150     FALSE 0.022 719.000 0.000 1.000   NA
 609056 609057 Lxx01150 Lxx01160     TRUE 0.588 41.000 0.000 NA   NA
 609058 609059 Lxx01180 Lxx01190   adhT FALSE 0.522 64.000 0.012 NA   NA
 609060 609061 Lxx01200 Lxx01210     TRUE 0.548 64.000 0.000 NA   NA
 609061 609062 Lxx01210 Lxx01220     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609063 609064 Lxx01230 Lxx01250     TRUE 0.894 4.000 0.000 NA   NA
 609064 1799833 Lxx01250 Lxx01260   prpD FALSE 0.534 83.000 0.000 NA   NA
 1799833 609065 Lxx01260 Lxx01280 prpD prpB TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609065 1799834 Lxx01280 Lxx01290 prpB gltA TRUE 0.643 33.000 0.000 NA   NA
 1799834 1799835 Lxx01290 Lxx01310 gltA radC TRUE 0.889 -28.000 0.000 NA   NA
 609067 609068 Lxx01330 Lxx01340 gpm dsbE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA N NA
 609068 609069 Lxx01340 Lxx01350 dsbE ccdA TRUE 0.980 2.000 0.000 1.000 Y NA
 609069 609070 Lxx01350 Lxx01360 ccdA resB TRUE 0.983 -16.000 0.033 NA Y NA
 609070 609071 Lxx01360 Lxx01370 resB ccsA TRUE 0.645 199.000 0.213 NA Y NA
 609071 609072 Lxx01370 Lxx01380 ccsA   FALSE 0.020 750.000 0.000 NA   NA
 609072 609073 Lxx01380 Lxx01390     FALSE 0.025 553.000 0.000 NA   NA
 609073 609074 Lxx01390 Lxx01400     FALSE 0.221 137.000 0.000 NA   NA
 609074 609075 Lxx01400 Lxx01410     FALSE 0.546 74.000 0.000 NA   NA
 609075 609076 Lxx01410 Lxx01420     TRUE 0.993 -16.000 0.500 NA   NA
 609078 609079 Lxx01440 Lxx01450 menB menE TRUE 0.971 13.000 0.193 1.000 N NA
 609079 609080 Lxx01450 Lxx01460 menE menA TRUE 0.608 126.000 0.075 1.000 N NA
 609082 609083 Lxx01480 Lxx01490   menD TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 609083 609084 Lxx01490 Lxx01500 menD   FALSE 0.073 206.000 0.000 1.000   NA
 609084 609085 Lxx01500 Lxx01520   xbaIM FALSE 0.047 303.000 0.000 0.090   NA
 609085 609086 Lxx01520 Lxx01530 xbaIM   TRUE 0.640 36.000 0.000 1.000   NA
 609086 609087 Lxx01530 Lxx01540     TRUE 0.558 71.000 0.000 1.000   NA
 609087 1799836 Lxx01540 Lxx01560   tcr TRUE 0.886 -118.000 0.000 NA   NA
 1799836 1799837 Lxx01560 Lxx01570 tcr   FALSE 0.018 1228.000 0.000 NA   NA
 1799837 609088 Lxx01570 Lxx01585   tnp FALSE 0.335 118.000 0.000 NA   NA
 609089 1799838 Lxx01600 Lxx01603 scrK tnp FALSE 0.018 1235.000 0.000 NA   NA
 1799838 609090 Lxx01603 Lxx01610 tnp Met FALSE 0.018 1223.000 0.000 NA   NA
 609090 609091 Lxx01610 Lxx01620 Met Thr TRUE 0.654 32.000 0.000 NA   NA
 609091 1799839 Lxx01620 Lxx01625 Thr   TRUE 0.903 -9.000 0.000 NA   NA
 1799839 1799840 Lxx01625 Lxx01628   tnp FALSE 0.403 107.000 0.000 NA   NA
 1799840 609092 Lxx01628 Lxx01640 tnp   FALSE 0.335 118.000 0.000 NA   NA
 609092 609093 Lxx01640 Lxx01650   upp FALSE 0.037 408.000 0.000 1.000 N NA
 609095 609096 Lxx01680 Lxx01690     FALSE 0.129 163.000 0.000 NA   NA
 609096 609097 Lxx01690 Lxx01700     FALSE 0.142 159.000 0.000 NA   NA
 609097 609098 Lxx01700 Lxx01710     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799841 609100 Lxx01725 Lxx01730   trkA FALSE 0.039 312.000 0.000 NA   NA
 609100 609101 Lxx01730 Lxx01740 trkA trkH TRUE 0.998 -7.000 0.585 0.005 Y NA
 609102 609103 Lxx01750 Lxx01760 arsR   TRUE 0.625 96.000 0.039 1.000   NA
 609103 609104 Lxx01760 Lxx01770     FALSE 0.043 285.000 0.000 NA   NA
 609104 609105 Lxx01770 Lxx01780     TRUE 0.906 -3.000 0.007 NA   NA
 609106 609107 Lxx01790 Lxx01800 gntR gntR TRUE 0.965 12.000 0.000 0.056 Y NA
 609107 609108 Lxx01800 Lxx01810 gntR menF FALSE 0.031 502.000 0.000 1.000 N NA
 609109 609110 Lxx01820 Lxx01830 ubiE hepB TRUE 0.941 18.000 0.006 1.000 Y NA
 609110 609111 Lxx01830 Lxx01840 hepB frp TRUE 0.883 19.000 0.039 1.000 N NA
 1799842 609112 Lxx01850 Lxx01880     FALSE 0.030 416.000 0.000 NA   NA
 609113 1799843 Lxx01890 Lxx01900 Tyr wecB FALSE 0.022 687.000 0.000 NA   NA
 1799843 1799844 Lxx01900 Lxx01920 wecB   FALSE 0.025 553.000 0.000 NA   NA
 1799844 609114 Lxx01920 Lxx01930     FALSE 0.060 223.000 0.000 NA   NA
 609114 609115 Lxx01930 Lxx01940     FALSE 0.031 412.000 0.000 NA   NA
 609115 609116 Lxx01940 Lxx01950     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609116 1799845 Lxx01950 Lxx01960     TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 1799845 609117 Lxx01960 Lxx01970     FALSE 0.039 310.000 0.000 NA   NA
 609117 609118 Lxx01970 Lxx01980     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609118 609119 Lxx01980 Lxx01990     FALSE 0.021 688.000 0.000 NA   NA
 609119 609120 Lxx01990 Lxx02000     FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 609120 1799846 Lxx02000 Lxx02005     FALSE 0.299 125.000 0.000 NA   NA
 1799847 609121 Lxx02010 Lxx02020     FALSE 0.387 109.000 0.000 NA   NA
 609122 1799848 Lxx02030 Lxx02035 suhB tnp FALSE 0.120 167.000 0.000 NA   NA
 609123 609124 Lxx02040 Lxx02050     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609124 609125 Lxx02050 Lxx02060     FALSE 0.167 151.000 0.000 NA   NA
 609125 609126 Lxx02060 Lxx02070     TRUE 0.563 78.000 0.000 1.000   NA
 609127 609128 Lxx02080 Lxx02090   ponA TRUE 0.600 58.000 0.000 1.000 N NA
 609128 609129 Lxx02090 Lxx02100 ponA   TRUE 0.563 86.000 0.000 1.000 N NA
 609129 609130 Lxx02100 Lxx02110   ptrB FALSE 0.063 250.000 0.000 1.000 N NA
 1799849 609131 Lxx02120 Lxx02130   pimB FALSE 0.065 212.000 0.000 NA   NA
 609131 609132 Lxx02130 Lxx02140 pimB pimA TRUE 0.930 125.000 0.273 0.008 Y NA
 609132 609133 Lxx02140 Lxx02142 pimA   FALSE 0.224 138.000 0.000 1.000   NA
 609133 1799850 Lxx02142 Lxx02145   tnp FALSE 0.023 604.000 0.000 NA   NA
 609134 609135 Lxx02160 Lxx02170 Arg   FALSE 0.023 595.000 0.000 NA   NA
 609135 609136 Lxx02170 Lxx02180     FALSE 0.117 168.000 0.000 NA   NA
 609137 609138 Lxx02190 Lxx02200 treY treZ TRUE 0.997 -3.000 0.263 0.011 Y NA
 609138 609139 Lxx02200 Lxx02210 treZ treX TRUE 0.874 80.000 0.000 0.006 Y NA
 1799852 1799853 Lxx02235 Lxx02250   dtxR FALSE 0.323 121.000 0.000 NA   NA
 1799853 609142 Lxx02250 Lxx02260 dtxR   FALSE 0.027 469.000 0.000 NA   NA
 609142 1799854 Lxx02260 Lxx02270   tpase2 FALSE 0.544 71.000 0.000 NA   NA
 1799854 1799855 Lxx02270 Lxx02290 tpase2 tpase1 FALSE 0.136 161.000 0.000 NA   NA
 1799855 609143 Lxx02290 Lxx02300 tpase1   FALSE 0.246 133.000 0.000 NA   NA
 609143 609144 Lxx02300 Lxx02310     FALSE 0.019 948.000 0.000 NA   NA
 609144 609145 Lxx02310 Lxx02320   Ser FALSE 0.020 791.000 0.000 NA   NA
 609145 609146 Lxx02320 Lxx02330 Ser Ser FALSE 0.037 327.000 0.000 NA   NA
 609146 609147 Lxx02330 Lxx02340 Ser   TRUE 0.637 34.000 0.000 NA   NA
 609147 609148 Lxx02340 Lxx02350     FALSE 0.253 132.000 0.000 NA   NA
 609148 609149 Lxx02350 Lxx02360     FALSE 0.395 108.000 0.000 NA   NA
 609149 609150 Lxx02360 Lxx02390   serS TRUE 0.980 -3.000 0.084 1.000   NA
 609150 609151 Lxx02390 Lxx02400 serS pheA FALSE 0.049 284.000 0.013 1.000 N NA
 609152 609153 Lxx02380 Lxx02410 pgm   TRUE 0.584 47.000 0.000 NA N NA
 609153 1799856 Lxx02410 Lxx02420     FALSE 0.051 252.000 0.000 NA   NA
 1799857 609154 Lxx02430 Lxx02440 vanY   TRUE 0.588 41.000 0.000 NA   NA
 609154 1799858 Lxx02440 Lxx02450   tnp FALSE 0.020 750.000 0.000 NA   NA
 609155 609156 Lxx02460 Lxx02470     FALSE 0.021 709.000 0.000 NA   NA
 609156 609157 Lxx02470 Lxx02480   5 TRUE 0.875 8.000 0.000 NA   NA
 609157 609158 Lxx02480 Lxx02495 5   FALSE 0.016 2118.000 0.000 NA   NA
 609158 609159 Lxx02495 Lxx02510     FALSE 0.020 882.000 0.000 1.000   NA
 609160 609161 Lxx02520 Lxx02540     FALSE 0.028 446.000 0.000 NA   NA
 609161 609162 Lxx02540 Lxx02550     TRUE 0.594 49.000 0.000 1.000 N NA
 609164 609165 Lxx02560 Lxx02580   tcrA TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 609166 609167 Lxx02570 Lxx02590   malE FALSE 0.034 531.000 0.000 0.040 N NA
 609167 609168 Lxx02590 Lxx02600 malE palF TRUE 0.959 60.000 0.154 0.040 Y NA
 609168 609169 Lxx02600 Lxx02610 palF palG TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.040 Y NA
 609169 1799859 Lxx02610 Lxx02620 palG   FALSE 0.023 583.000 0.000 NA   NA
 1799859 609170 Lxx02620 Lxx02630     FALSE 0.084 187.000 0.000 NA   NA
 609170 1799860 Lxx02630 Lxx02650     FALSE 0.523 85.000 0.000 NA   NA
 1799860 1799861 Lxx02650 Lxx02660     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 1799861 1799862 Lxx02660 Lxx02680     FALSE 0.017 1757.000 0.000 NA   NA
 1799862 609171 Lxx02680 Lxx02690     FALSE 0.221 137.000 0.000 NA   NA
 609172 609173 Lxx02700 Lxx02710 pimH marR TRUE 0.989 -3.000 0.208 1.000   NA
 1799864 609175 Lxx02750 Lxx02770 gabD   TRUE 0.550 54.000 0.000 NA   NA
 609176 609177 Lxx02780 Lxx02790 katA fur TRUE 0.986 14.000 0.143 1.000 Y NA
 609177 609178 Lxx02790 Lxx02800 fur   FALSE 0.414 167.000 0.000 1.000 Y NA
 609179 609180 Lxx02810 Lxx02820     TRUE 0.997 -3.000 0.222 NA Y NA
 609180 609181 Lxx02820 Lxx02830   murB TRUE 0.670 35.000 0.014 1.000 N NA
 609181 609182 Lxx02830 Lxx02840 murB   TRUE 0.553 57.000 0.000 NA   NA
 609183 609184 Lxx02880 Lxx02890 Trp secE TRUE 0.618 37.000 0.000 NA   NA
 609184 609185 Lxx02890 Lxx02900 secE nusG TRUE 0.980 44.000 0.843 1.000 N NA
 609185 609186 Lxx02900 Lxx02910 nusG rplK TRUE 0.929 121.000 0.681 1.000 N NA
 609186 609187 Lxx02910 Lxx02920 rplK rplA TRUE 0.992 75.000 0.838 0.037 Y NA
 609187 609188 Lxx02920 Lxx02930 rplA   FALSE 0.025 575.000 0.000 1.000   NA
 609188 1799866 Lxx02930 Lxx02940     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609189 609190 Lxx02950 Lxx02960     FALSE 0.076 203.000 0.000 1.000   NA
 1799867 1799868 Lxx02965 Lxx02980   malF FALSE 0.061 219.000 0.000 NA   NA
 1799868 1799869 Lxx02980 Lxx03000 malF malG FALSE 0.395 108.000 0.000 NA   NA
 609191 609192 Lxx03010 Lxx03020 thuA   TRUE 0.993 4.000 0.500 NA   NA
 609192 609193 Lxx03020 Lxx03030     FALSE 0.437 100.000 0.000 NA   NA
 609194 609195 Lxx03040 Lxx03050     TRUE 0.996 -3.000 0.571 NA   NA
 609195 1799870 Lxx03050 Lxx03060     FALSE 0.038 319.000 0.000 NA   NA
 1799870 1799871 Lxx03060 Lxx03080     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609196 609197 Lxx03100 Lxx03110     TRUE 0.949 18.000 0.000 1.000 Y NA
 609198 609199 Lxx03120 Lxx03130     TRUE 0.950 39.000 0.074 0.076 Y NA
 609199 609200 Lxx03130 Lxx03140     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 609200 609201 Lxx03140 Lxx03150   rplJ FALSE 0.059 234.000 0.000 1.000   NA
 609201 609202 Lxx03150 Lxx03160 rplJ rplL TRUE 0.997 23.000 0.884 0.028 Y NA
 609204 609205 Lxx03180 Lxx03190   novA TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609206 609207 Lxx03200 Lxx03210   sirR FALSE 0.029 438.000 0.000 NA   NA
 609207 609208 Lxx03210 Lxx03220 sirR   TRUE 0.650 34.000 0.000 1.000   NA
 609210 609211 Lxx03240 Lxx03250     FALSE 0.047 268.000 0.000 NA   NA
 609211 609212 Lxx03250 Lxx03260     TRUE 0.716 30.000 0.000 0.036   NA
 609213 1799872 Lxx03270 Lxx03280     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609214 609215 Lxx03300 Lxx03310     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609215 609216 Lxx03310 Lxx03320     FALSE 0.025 532.000 0.000 NA   NA
 609216 609217 Lxx03320 Lxx03330     FALSE 0.020 765.000 0.000 NA   NA
 609218 609219 Lxx03340 Lxx03350     TRUE 0.665 31.000 0.000 NA   NA
 609220 609221 Lxx03360 Lxx03370 xylB xylA TRUE 0.909 11.000 0.027 0.017   NA
 609221 609222 Lxx03370 Lxx03380 xylA   TRUE 0.889 -33.000 0.000 NA   NA
 609222 609223 Lxx03380 Lxx03390   Ser TRUE 0.554 59.000 0.000 NA   NA
 609224 609225 Lxx03400 Lxx03410   pta TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 609225 609226 Lxx03410 Lxx03420 pta ackA TRUE 0.988 -3.000 0.185 1.000   NA
 609226 609227 Lxx03420 Lxx03430 ackA dnaZ FALSE 0.053 274.000 0.000 1.000 N NA
 609227 609228 Lxx03430 Lxx03440 dnaZ recR TRUE 0.984 4.000 0.028 0.018 Y NA
 609228 609229 Lxx03440 Lxx03450 recR lysC TRUE 0.560 74.000 0.010 1.000 N NA
 609229 609230 Lxx03450 Lxx03460 lysC asd TRUE 0.950 75.000 0.119 1.000 Y NA
 609230 609231 Lxx03460 Lxx03470 asd mqoA FALSE 0.135 148.000 0.003 1.000   NA
 609231 609232 Lxx03470 Lxx03480 mqoA   FALSE 0.120 158.000 0.006 1.000   NA
 609232 609233 Lxx03480 Lxx03490     FALSE 0.052 251.000 0.000 NA   NA
 609233 1799873 Lxx03490 Lxx03500     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799873 609234 Lxx03500 Lxx03510   tdk FALSE 0.548 52.000 0.000 NA   NA
 609234 609235 Lxx03510 Lxx03520 tdk udgA FALSE 0.467 104.000 0.000 1.000 N NA
 609235 1799874 Lxx03520 Lxx03530 udgA   FALSE 0.042 290.000 0.000 NA   NA
 1799874 1799875 Lxx03530 Lxx03540     TRUE 0.887 -48.000 0.000 NA   NA
 1799875 609236 Lxx03540 Lxx03550   msuE FALSE 0.548 76.000 0.000 NA   NA
 609237 609238 Lxx03555 Lxx03560     FALSE 0.035 346.000 0.000 NA   NA
 609238 609239 Lxx03560 Lxx03565     FALSE 0.020 863.000 0.000 1.000   NA
 609239 609240 Lxx03565 Lxx03570     FALSE 0.035 369.000 0.000 1.000   NA
 609240 609241 Lxx03570 Lxx03580   Pro FALSE 0.018 1152.000 0.000 NA   NA
 609241 609242 Lxx03580 Lxx03590 Pro   FALSE 0.358 114.000 0.000 NA   NA
 609242 609243 Lxx03590 Lxx03600   ponA TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 609244 609245 Lxx03620 Lxx03610     TRUE 0.979 0.000 0.094 NA   NA
 1799877 609246 Lxx03650 Lxx03670 tadA   FALSE 0.547 51.000 0.000 NA   NA
 609246 609247 Lxx03670 Lxx03680     FALSE 0.429 102.000 0.000 NA   NA
 609247 609248 Lxx03680 Lxx03690     FALSE 0.016 4491.000 0.000 NA   NA
 609248 1799878 Lxx03690 Lxx03695     FALSE 0.058 227.000 0.000 NA   NA
 1799878 609249 Lxx03695 Lxx03700   tpase FALSE 0.038 320.000 0.000 NA   NA
 609249 1799879 Lxx03700 Lxx03710 tpase   FALSE 0.534 83.000 0.000 NA   NA
 609252 609253 Lxx03750 Lxx03760 lysL   TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 609253 609254 Lxx03760 Lxx03770     FALSE 0.019 957.000 0.000 NA   NA
 609254 609255 Lxx03770 Lxx03780     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609255 1799880 Lxx03780 Lxx03795   tnp FALSE 0.024 570.000 0.000 NA   NA
 1799880 609256 Lxx03795 Lxx03800 tnp   FALSE 0.020 798.000 0.000 NA   NA
 609256 609257 Lxx03800 Lxx03820   26 TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609257 609258 Lxx03820 Lxx03830 26   TRUE 0.579 42.000 0.000 NA   NA
 609258 609259 Lxx03830 Lxx03840     FALSE 0.032 388.000 0.000 NA   NA
 609259 609260 Lxx03840 Lxx03850     FALSE 0.036 334.000 0.000 NA   NA
 609260 609261 Lxx03850 Lxx03860     FALSE 0.019 864.000 0.000 NA   NA
 609261 609262 Lxx03860 Lxx03865     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609262 609263 Lxx03865 Lxx03880     FALSE 0.044 283.000 0.000 NA   NA
 609263 609264 Lxx03880 Lxx03890     TRUE 0.700 184.000 0.667 NA   NA
 609264 609265 Lxx03890 Lxx03900     TRUE 0.760 22.000 0.000 NA   NA
 609265 609266 Lxx03900 Lxx03905     FALSE 0.090 183.000 0.000 NA   NA
 609266 609267 Lxx03905 Lxx03910   5 FALSE 0.434 101.000 0.000 NA   NA
 609267 609268 Lxx03910 Lxx03920 5 5 TRUE 0.551 63.000 0.000 NA   NA
 609268 1799881 Lxx03920 Lxx03930 5 tpase2 FALSE 0.061 219.000 0.000 NA   NA
 1799881 1799882 Lxx03930 Lxx03950 tpase2 tpase1 FALSE 0.214 138.000 0.000 NA   NA
 1799882 609269 Lxx03950 Lxx03960 tpase1 4 FALSE 0.034 363.000 0.000 NA   NA
 609269 609270 Lxx03960 Lxx03970 4   FALSE 0.017 1368.000 0.000 NA   NA
 609270 609271 Lxx03970 Lxx03980     FALSE 0.027 465.000 0.000 NA   NA
 609271 609272 Lxx03980 Lxx03990     FALSE 0.034 360.000 0.000 NA   NA
 1799883 609273 Lxx04000 Lxx04010 trbB   FALSE 0.188 146.000 0.000 NA   NA
 609273 609274 Lxx04010 Lxx04020     TRUE 0.722 82.000 0.046 NA   NA
 609274 609275 Lxx04020 Lxx04030     TRUE 0.791 17.000 0.000 NA   NA
 609275 609276 Lxx04030 Lxx04040     FALSE 0.086 186.000 0.000 NA   NA
 609278 609279 Lxx04060 Lxx04070 topA tmk TRUE 0.939 -3.000 0.015 1.000 N NA
 609279 609280 Lxx04070 Lxx04080 tmk   TRUE 0.752 41.000 0.037 1.000 N NA
 609280 609281 Lxx04080 Lxx04090   slpE TRUE 0.984 -3.000 0.130 NA   NA
 609281 609282 Lxx04090 Lxx04100 slpE   TRUE 0.548 64.000 0.000 NA   NA
 609282 609283 Lxx04100 Lxx04110   Thr TRUE 0.618 37.000 0.000 NA   NA
 609283 609284 Lxx04110 Lxx04115 Thr   FALSE 0.126 164.000 0.000 NA   NA
 609285 609286 Lxx04120 Lxx04130     FALSE 0.546 81.000 0.000 NA   NA
 609287 1799884 Lxx04140 Lxx04160 pbp   FALSE 0.018 1284.000 0.000 NA   NA
 1799884 1799885 Lxx04160 Lxx04180   fadA FALSE 0.094 179.000 0.000 NA   NA
 1799885 609288 Lxx04180 Lxx04210 fadA fadB TRUE 0.588 41.000 0.000 NA   NA
 609288 609289 Lxx04210 Lxx04220 fadB   TRUE 0.553 61.000 0.000 NA   NA
 609292 1799886 Lxx04250 Lxx04260     FALSE 0.387 109.000 0.000 NA   NA
 609295 1799887 Lxx04280 Lxx04285 tnp tnp FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 1799887 609296 Lxx04285 Lxx04320 tnp tnp FALSE 0.018 1219.000 0.000 NA   NA
 609296 609297 Lxx04320 Lxx04330 tnp   FALSE 0.057 231.000 0.000 NA   NA
 609298 609299 Lxx04340 Lxx04350 ribH ribA TRUE 0.985 -3.000 0.011 0.004 Y NA
 609299 609300 Lxx04350 Lxx04360 ribA ribC TRUE 0.985 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 609300 609301 Lxx04360 Lxx04370 ribC ribD TRUE 0.998 2.000 0.456 1.000 Y NA
 609302 609303 Lxx04380 Lxx04400     FALSE 0.021 720.000 0.000 NA   NA
 609303 609304 Lxx04400 Lxx04410   glpF FALSE 0.023 616.000 0.000 NA   NA
 609304 609305 Lxx04410 Lxx04420 glpF glpk TRUE 0.881 85.000 0.174 1.000 N NA
 609305 609306 Lxx04420 Lxx04430 glpk   FALSE 0.261 131.000 0.000 NA   NA
 609307 609308 Lxx04440 Lxx04450   trpS TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 609308 609309 Lxx04450 Lxx04460 trpS   TRUE 0.764 32.000 0.026 1.000 N NA
 609309 1799888 Lxx04460 Lxx04470     TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 1799888 609310 Lxx04470 Lxx04490     TRUE 0.549 78.000 0.000 NA   NA
 609310 609311 Lxx04490 Lxx04500     FALSE 0.129 163.000 0.000 NA   NA
 609311 609312 Lxx04500 Lxx04510   sdhB FALSE 0.053 246.000 0.000 NA   NA
 609312 609313 Lxx04510 Lxx04520 sdhB sdhA TRUE 0.999 0.000 0.604 0.003 Y NA
 609313 609314 Lxx04520 Lxx04530 sdhA sdhD TRUE 0.996 23.000 0.705 0.003 Y NA
 609314 609315 Lxx04530 Lxx04540 sdhD sdhC TRUE 0.995 2.000 0.157 0.001 Y NA
 1799889 609318 Lxx04560 Lxx04580   corA FALSE 0.059 225.000 0.000 NA   NA
 609318 609319 Lxx04580 Lxx04600 corA   FALSE 0.043 296.000 0.000 1.000   NA
 609319 609320 Lxx04600 Lxx04610   rbsA TRUE 0.964 83.000 0.647 1.000   NA
 609320 609321 Lxx04610 Lxx04620 rbsA   FALSE 0.181 237.000 0.078 1.000   NA
 609321 609322 Lxx04620 Lxx04630     FALSE 0.120 375.000 0.078 0.038   NA
 609322 609323 Lxx04630 Lxx04640   cdd TRUE 0.990 -3.000 0.230 1.000   NA
 609323 609324 Lxx04640 Lxx04650 cdd deoA TRUE 0.991 13.000 0.221 1.000 Y NA
 609324 609325 Lxx04650 Lxx04660 deoA add TRUE 0.990 2.000 0.062 1.000 Y NA
 609325 609326 Lxx04660 Lxx04670 add   TRUE 0.753 25.000 0.013 1.000 N NA
 609326 609327 Lxx04670 Lxx04680     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.008 Y NA
 609328 609329 Lxx04690 Lxx04700 cpsG deoD TRUE 0.991 -3.000 0.235 1.000 N NA
 609330 1799890 Lxx04710 Lxx04720 lpdA   TRUE 0.875 8.000 0.000 NA   NA
 609331 609332 Lxx04730 Lxx04750 accC   TRUE 0.663 80.000 0.026 NA N NA
 1799891 1799892 Lxx04740 Lxx04760     TRUE 0.571 43.000 0.000 NA   NA
 1799892 609333 Lxx04760 Lxx04770     TRUE 0.897 -13.000 0.000 NA   NA
 609333 609334 Lxx04770 Lxx04780     TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 609335 609336 Lxx04790 Lxx04810   pccB TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609339 609340 Lxx04830 Lxx04850 purK purE TRUE 0.956 67.000 0.141 0.001 Y NA
 609340 609341 Lxx04850 Lxx04860 purE   TRUE 0.905 -3.000 0.007 NA   NA
 609341 1799893 Lxx04860 Lxx04870     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 609342 609343 Lxx04890 Lxx04900   strL TRUE 0.978 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 609343 609344 Lxx04900 Lxx04910 strL   TRUE 0.986 12.000 0.083 0.003 Y NA
 609345 609346 Lxx04920 Lxx04930 rmlC rmlA TRUE 0.988 17.000 0.200 1.000 Y NA
 609348 609349 Lxx04950 Lxx04960 wbbX galE TRUE 0.940 -7.000 0.030 NA   NA
 609349 609350 Lxx04960 Lxx04970 galE   TRUE 0.965 11.000 0.000 NA Y NA
 609350 609351 Lxx04970 Lxx04980     FALSE 0.035 358.000 0.000 NA   NA
 609351 1799894 Lxx04980 Lxx04990   ytcB FALSE 0.221 137.000 0.000 NA   NA
 609352 609353 Lxx05010 Lxx05020 rfbB rfbA TRUE 0.997 11.000 0.548 1.000 Y NA
 609353 609354 Lxx05020 Lxx05030 rfbA   TRUE 0.734 116.000 0.000 1.000 Y NA
 609355 609356 Lxx05050 Lxx05060     FALSE 0.516 86.000 0.000 NA   NA
 609357 609358 Lxx05070 Lxx05080 wbjD wbjB TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 609358 609359 Lxx05080 Lxx05090 wbjB rfbD TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 609359 609360 Lxx05090 Lxx05100 rfbD bplE TRUE 0.962 12.000 0.000 1.000 Y NA
 609360 609361 Lxx05100 Lxx05110 bplE   TRUE 0.891 -22.000 0.000 NA   NA
 609361 609362 Lxx05110 Lxx05120     FALSE 0.026 489.000 0.000 NA   NA
 609362 609363 Lxx05120 Lxx05130   ycbB TRUE 0.995 0.000 0.568 NA   NA
 609365 609366 Lxx05150 Lxx05160 exoQ exoQ TRUE 0.968 46.000 0.667 NA   NA
 609366 609367 Lxx05160 Lxx05180 exoQ manA TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609369 609370 Lxx05210 Lxx05220 exoB whiB FALSE 0.057 245.000 0.000 1.000   NA
 609370 1799896 Lxx05220 Lxx05230 whiB   FALSE 0.543 67.000 0.000 NA   NA
 1799896 1799897 Lxx05230 Lxx05240     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 609373 609374 Lxx05280 Lxx05290   manB TRUE 0.974 26.000 0.460 NA   NA
 609374 1799899 Lxx05290 Lxx05300 manB ahcY TRUE 0.724 25.000 0.000 NA   NA
 1799900 609375 Lxx05310 Lxx05320 moxR2   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609375 609376 Lxx05320 Lxx05330     TRUE 0.720 206.000 0.841 NA   NA
 609376 609377 Lxx05330 Lxx05340     TRUE 0.994 5.000 0.628 NA   NA
 609378 609379 Lxx05350 Lxx05360 mtrA   TRUE 0.951 17.000 0.000 1.000 Y NA
 609379 609380 Lxx05360 Lxx05370   lpqB TRUE 0.626 36.000 0.000 NA   NA
 609380 609381 Lxx05370 Lxx05380 lpqB comF FALSE 0.080 190.000 0.000 NA   NA
 609381 609382 Lxx05380 Lxx05390 comF   FALSE 0.164 239.000 0.072 NA   NA
 609382 609383 Lxx05390 Lxx05400   secA FALSE 0.240 212.000 0.094 NA N NA
 609383 609384 Lxx05400 Lxx05410 secA   FALSE 0.310 124.000 0.000 NA   NA
 609384 609385 Lxx05410 Lxx05430   tnp FALSE 0.036 334.000 0.000 NA   NA
 609385 609386 Lxx05430 Lxx05440 tnp   TRUE 0.884 6.000 0.000 NA   NA
 609386 609387 Lxx05440 Lxx05450   pon1 FALSE 0.041 295.000 0.000 NA   NA
 609387 609388 Lxx05450 Lxx05460 pon1   FALSE 0.030 420.000 0.000 NA   NA
 609388 1799901 Lxx05460 Lxx05470     TRUE 0.596 40.000 0.000 NA   NA
 1799901 609389 Lxx05470 Lxx05500     FALSE 0.028 450.000 0.000 NA   NA
 609391 609392 Lxx05510 Lxx05520     TRUE 0.809 14.000 0.000 NA   NA
 609393 1799902 Lxx05530 Lxx05540 tpase2 tpase1 FALSE 0.024 558.000 0.000 NA   NA
 1799902 609394 Lxx05540 Lxx05560 tpase1   FALSE 0.087 185.000 0.000 NA   NA
 1799903 609395 Lxx05570 Lxx05580     TRUE 0.654 32.000 0.000 NA   NA
 609398 609399 Lxx05620 Lxx05640   recN TRUE 0.978 -7.000 0.094 1.000 N NA
 609399 609400 Lxx05640 Lxx05650 recN pyrG FALSE 0.015 2910.000 0.006 1.000 N NA
 609400 609401 Lxx05650 Lxx05660 pyrG mutT TRUE 0.964 0.000 0.055 1.000   NA
 609401 609402 Lxx05660 Lxx05670 mutT   TRUE 0.973 -3.000 0.063 1.000   NA
 609402 609403 Lxx05670 Lxx05680   parA FALSE 0.384 149.000 0.058 1.000 N NA
 609403 609404 Lxx05680 Lxx05690 parA   TRUE 0.961 -16.000 0.065 NA   NA
 609404 609405 Lxx05690 Lxx05700     TRUE 0.994 -10.000 0.570 NA   NA
 609405 609406 Lxx05700 Lxx05710   rsuA TRUE 0.987 -10.000 0.224 NA N NA
 609406 609407 Lxx05710 Lxx05720 rsuA tyrA TRUE 0.921 10.000 0.030 1.000 N NA
 609407 609408 Lxx05720 Lxx05730 tyrA cmk TRUE 0.960 -3.000 0.032 1.000 N NA
 609408 609409 Lxx05730 Lxx05740 cmk   TRUE 0.772 53.000 0.060 1.000   NA
 609409 609410 Lxx05740 Lxx05750     TRUE 0.775 19.000 0.000 NA   NA
 609410 609411 Lxx05750 Lxx05760   Pro FALSE 0.047 268.000 0.000 NA   NA
 609412 609413 Lxx05765 Lxx05770     FALSE 0.061 251.000 0.000 0.079   NA
 609413 609414 Lxx05770 Lxx05780     FALSE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 609414 1799905 Lxx05780 Lxx05785   tnp FALSE 0.023 616.000 0.000 NA   NA
 1799906 609415 Lxx05800 Lxx05820   malG TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609415 609416 Lxx05820 Lxx05830 malG   TRUE 0.972 55.000 0.708 0.037   NA
 609417 609418 Lxx05840 Lxx05860     FALSE 0.053 249.000 0.000 NA   NA
 609418 1799907 Lxx05860 Lxx05880     FALSE 0.020 750.000 0.000 NA   NA
 609420 609421 Lxx05890 Lxx05895 mscL   TRUE 0.586 33.000 0.007 NA   NA
 609421 609422 Lxx05895 Lxx05900     TRUE 0.871 20.000 0.041 NA   NA
 609423 609424 Lxx05910 Lxx05920 galU rimJ TRUE 0.829 23.000 0.024 1.000 N NA
 609424 609425 Lxx05920 Lxx05930 rimJ   TRUE 0.678 83.000 0.037 NA   NA
 609425 609426 Lxx05930 Lxx05940   Ala TRUE 0.554 58.000 0.000 NA   NA
 609428 609429 Lxx05960 Lxx05970 tnp   FALSE 0.028 585.000 0.000 1.000 N NA
 609429 609430 Lxx05970 Lxx05980   pheS TRUE 0.885 82.000 0.026 1.000 Y NA
 609430 609431 Lxx05980 Lxx05990 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.001 Y NA
 609432 609433 Lxx06000 Lxx06010     FALSE 0.017 1909.000 0.000 NA   NA
 609434 609435 Lxx06030 Lxx06040 argC argJ TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.003 Y NA
 609435 609436 Lxx06040 Lxx06050 argJ argB TRUE 0.996 2.000 0.239 0.003 Y NA
 609436 609437 Lxx06050 Lxx06060 argB argD TRUE 0.994 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 609437 609438 Lxx06060 Lxx06070 argD argF TRUE 0.978 22.000 0.091 1.000 Y NA
 609438 609439 Lxx06070 Lxx06080 argF argH TRUE 0.884 33.000 0.003 1.000 Y NA
 609439 609440 Lxx06080 Lxx06090 argH   TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 609440 609441 Lxx06090 Lxx06100   alkA TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 609442 609443 Lxx06110 Lxx06120     TRUE 0.724 25.000 0.000 NA   NA
 609443 609444 Lxx06120 Lxx06130     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609445 609446 Lxx06140 Lxx06150 tyrS   TRUE 0.611 38.000 0.000 NA   NA
 609446 609447 Lxx06150 Lxx06160     TRUE 0.571 43.000 0.000 NA   NA
 609447 609448 Lxx06160 Lxx06170   tlyA TRUE 0.595 52.000 0.000 1.000 N NA
 609449 609450 Lxx06180 Lxx06190   flgL TRUE 0.942 60.000 0.385 NA   NA
 609450 1799908 Lxx06190 Lxx06200 flgL flgK TRUE 0.899 3.000 0.000 NA   NA
 1799908 609451 Lxx06200 Lxx06210 flgK   FALSE 0.037 329.000 0.000 NA   NA
 1799909 609452 Lxx06205 Lxx06230 tnp fliA FALSE 0.020 756.000 0.000 NA   NA
 609452 609453 Lxx06230 Lxx06240 fliA fliC FALSE 0.070 226.000 0.000 1.000 N NA
 609453 1799910 Lxx06240 Lxx06260 fliC fliD FALSE 0.084 187.000 0.000 NA   NA
 1799910 609454 Lxx06260 Lxx06280 fliD fliS TRUE 0.709 26.000 0.000 NA   NA
 609454 609455 Lxx06280 Lxx06290 fliS   TRUE 0.680 29.000 0.000 NA   NA
 609455 609456 Lxx06290 Lxx06300     FALSE 0.126 164.000 0.000 NA   NA
 609456 609457 Lxx06300 Lxx06310   flgC TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609457 609458 Lxx06310 Lxx06330 flgC fliE TRUE 0.994 0.000 0.108 0.003 Y NA
 609458 609459 Lxx06330 Lxx06320 fliE fliF TRUE 0.996 0.000 0.208 0.004 Y NA
 609459 609460 Lxx06320 Lxx06340 fliF fliG TRUE 0.762 230.000 0.477 0.004 Y NA
 609460 609461 Lxx06340 Lxx06350 fliG   TRUE 0.914 -10.000 0.019 NA   NA
 609461 609462 Lxx06350 Lxx06360   fliI TRUE 0.984 -3.000 0.125 NA   NA
 609462 1799911 Lxx06360 Lxx06380 fliI   FALSE 0.032 389.000 0.000 NA   NA
 1799911 1799912 Lxx06380 Lxx06390   fliK TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799912 609463 Lxx06390 Lxx06400 fliK flgD TRUE 0.791 17.000 0.000 NA   NA
 609463 609464 Lxx06400 Lxx06410 flgD   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609464 609465 Lxx06410 Lxx06420   flgE TRUE 0.748 23.000 0.000 NA   NA
 609465 609466 Lxx06420 Lxx06430 flgE fliO TRUE 0.983 83.000 0.545 NA Y NA
 609466 609467 Lxx06430 Lxx06440 fliO motA TRUE 0.859 53.000 0.000 NA Y NA
 609467 1799913 Lxx06440 Lxx06450 motA flhA TRUE 0.562 44.000 0.000 NA   NA
 1799913 609468 Lxx06450 Lxx06470 flhA csrA TRUE 0.618 37.000 0.000 NA   NA
 609468 1799914 Lxx06470 Lxx06480 csrA   FALSE 0.035 356.000 0.000 NA   NA
 1799915 609469 Lxx06490 Lxx06510 merA   FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 609469 609470 Lxx06510 Lxx06520   arg1 TRUE 0.762 41.000 0.040 1.000 N NA
 609470 1799916 Lxx06520 Lxx06540 arg1   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609472 609473 Lxx06560 Lxx06570 msrB msrA TRUE 0.998 -3.000 0.404 0.002 Y NA
 609473 609474 Lxx06570 Lxx06590 msrA   FALSE 0.036 420.000 0.000 1.000 N NA
 609474 609475 Lxx06590 Lxx06580   fruK TRUE 0.984 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 609475 609476 Lxx06580 Lxx06600 fruK   TRUE 0.965 33.000 0.112 1.000 Y NA
 609476 609477 Lxx06600 Lxx06610     TRUE 0.680 29.000 0.000 NA   NA
 609477 609478 Lxx06610 Lxx06620   gntR TRUE 0.549 78.000 0.000 NA   NA
 1799918 609479 Lxx06630 Lxx06640   pgk FALSE 0.021 699.000 0.000 NA   NA
 609479 1799919 Lxx06640 Lxx06650 pgk   TRUE 0.748 23.000 0.000 NA   NA
 1799919 609480 Lxx06650 Lxx06680     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609480 609481 Lxx06680 Lxx06690     TRUE 0.991 -3.000 0.261 NA   NA
 1799920 609482 Lxx06700 Lxx06720   malF TRUE 0.802 15.000 0.000 NA   NA
 609482 609483 Lxx06720 Lxx06730 malF malG TRUE 0.999 -3.000 0.805 0.036 Y NA
 609483 609484 Lxx06730 Lxx06740 malG   TRUE 0.965 27.000 0.079 NA Y NA
 1799921 1799922 Lxx06750 Lxx06760 metG   FALSE 0.042 289.000 0.000 NA   NA
 609487 609488 Lxx06800 Lxx06820 argS   FALSE 0.351 93.000 0.002 NA   NA
 609489 609490 Lxx06832 Lxx06835     TRUE 0.988 1.000 0.044 NA Y NA
 609490 609491 Lxx06835 Lxx06840     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799923 1799924 Lxx06845 Lxx06847 tnp trpE FALSE 0.019 829.000 0.000 NA   NA
 1799924 1799925 Lxx06847 Lxx06853 trpE pabA TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 1799925 609492 Lxx06853 Lxx06860 pabA lysA FALSE 0.025 546.000 0.000 NA   NA
 609492 609493 Lxx06860 Lxx06870 lysA thrA TRUE 0.993 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 609493 609494 Lxx06870 Lxx06880 thrA thrC TRUE 0.995 2.000 0.194 1.000 Y NA
 609494 609495 Lxx06880 Lxx06890 thrC thrB TRUE 0.996 0.000 0.221 1.000 Y NA
 609495 609496 Lxx06890 Lxx06900 thrB rho FALSE 0.080 209.000 0.000 1.000 N NA
 609496 609497 Lxx06900 Lxx06910 rho prfA TRUE 0.570 87.000 0.017 1.000 N NA
 609498 1799926 Lxx06920 Lxx06930 cysE cysK TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 609501 609502 Lxx06950 Lxx06970   rfe TRUE 0.903 5.000 0.000 NA N NA
 609502 609503 Lxx06970 Lxx06980 rfe   TRUE 0.947 -3.000 0.026 NA   NA
 609503 609504 Lxx06980 Lxx06990   atpB FALSE 0.078 171.000 0.004 NA   NA
 609504 609505 Lxx06990 Lxx07000 atpB atpE TRUE 0.968 52.000 0.628 0.005   NA
 609505 609506 Lxx07000 Lxx07010 atpE atpF TRUE 0.910 33.000 0.121 0.005   NA
 609506 609507 Lxx07010 Lxx07020 atpF atpH TRUE 0.992 0.000 0.067 0.005 Y NA
 609507 609508 Lxx07020 Lxx07030 atpH atpA TRUE 0.996 27.000 0.864 0.005 Y NA
 609508 609509 Lxx07030 Lxx07040 atpA atpG TRUE 0.993 44.000 0.846 0.005 Y NA
 609509 609510 Lxx07040 Lxx07050 atpG atpD TRUE 0.995 26.000 0.724 0.005 Y NA
 609510 609511 Lxx07050 Lxx07060 atpD atpC TRUE 0.999 3.000 0.837 0.005 Y NA
 609511 609512 Lxx07060 Lxx07070 atpC   TRUE 0.758 23.000 0.000 1.000   NA
 609512 609513 Lxx07070 Lxx07080     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 609514 609515 Lxx07090 Lxx07100 tagI ada TRUE 0.983 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 609515 1799927 Lxx07100 Lxx07110 ada   FALSE 0.165 152.000 0.000 NA   NA
 1799927 609516 Lxx07110 Lxx07120     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609517 609518 Lxx07130 Lxx07140 nusA   TRUE 0.975 54.000 0.323 NA Y NA
 609518 609519 Lxx07140 Lxx07150   infB TRUE 0.885 73.000 0.171 NA N NA
 609519 609520 Lxx07150 Lxx07160 infB rbfA TRUE 0.985 77.000 0.530 1.000 Y NA
 609520 1799928 Lxx07160 Lxx07170 rbfA   FALSE 0.544 71.000 0.000 NA   NA
 609521 609522 Lxx07190 Lxx07200 nth panE TRUE 0.597 54.000 0.000 1.000 N NA
 609522 609523 Lxx07200 Lxx07210 panE   FALSE 0.520 87.000 0.000 1.000   NA
 609523 609524 Lxx07210 Lxx07220     FALSE 0.034 380.000 0.000 1.000   NA
 609524 609525 Lxx07220 Lxx07230   yhfR TRUE 0.946 -3.000 0.024 1.000   NA
 1799930 609526 Lxx07245 Lxx07247     TRUE 0.760 22.000 0.000 NA   NA
 609527 609528 Lxx07250 Lxx07270 truB   FALSE 0.028 445.000 0.000 NA   NA
 609528 609529 Lxx07270 Lxx07280   ribF TRUE 0.909 -3.000 0.008 NA   NA
 609529 609530 Lxx07280 Lxx07290 ribF   TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 609530 609531 Lxx07290 Lxx07300   sorC TRUE 0.589 82.000 0.000 1.000 N NA
 609531 1799931 Lxx07300 Lxx07310 sorC   TRUE 0.886 -139.000 0.000 NA   NA
 1799931 1799932 Lxx07310 Lxx07320   ald5 TRUE 0.887 -51.000 0.000 NA   NA
 1799932 609532 Lxx07320 Lxx07340 ald5   FALSE 0.049 260.000 0.000 NA   NA
 609532 1799933 Lxx07340 Lxx07360   cbrB FALSE 0.094 179.000 0.000 NA   NA
 1799933 1799934 Lxx07360 Lxx07370 cbrB   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799934 609533 Lxx07370 Lxx07390     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609533 609534 Lxx07390 Lxx07400     TRUE 0.610 40.000 0.000 1.000   NA
 609535 609536 Lxx07410 Lxx07420     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 609537 609538 Lxx07430 Lxx07440   ctpA TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 609538 609539 Lxx07440 Lxx07450 ctpA   FALSE 0.205 149.000 0.000 1.000 N NA
 609540 609541 Lxx07470 Lxx07480   grx FALSE 0.037 347.000 0.000 1.000   NA
 609542 609543 Lxx07485 Lxx07490     FALSE 0.018 1175.000 0.000 NA   NA
 609544 609545 Lxx07500 Lxx07510     TRUE 0.996 -3.000 0.143 0.017 Y NA
 1799935 609546 Lxx07520 Lxx07530   pfkA FALSE 0.171 150.000 0.000 NA   NA
 609546 609547 Lxx07530 Lxx07540 pfkA   TRUE 0.632 37.000 0.000 1.000   NA
 609547 609548 Lxx07540 Lxx07550     FALSE 0.482 91.000 0.000 NA   NA
 609548 1799936 Lxx07550 Lxx07545   tnp FALSE 0.041 294.000 0.000 NA   NA
 609551 609552 Lxx07610 Lxx07620     TRUE 0.686 28.000 0.000 NA   NA
 609552 1799937 Lxx07620 Lxx07630     FALSE 0.090 183.000 0.000 NA   NA
 1799937 609553 Lxx07630 Lxx07640     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 609553 609554 Lxx07640 Lxx07650     FALSE 0.026 489.000 0.000 NA   NA
 609554 609555 Lxx07650 Lxx07660     TRUE 0.674 30.000 0.000 NA   NA
 609556 609557 Lxx07670 Lxx07680   trsE FALSE 0.037 321.000 0.000 NA   NA
 609557 609558 Lxx07680 Lxx07690 trsE trsK FALSE 0.045 273.000 0.000 NA   NA
 609558 1799938 Lxx07690 Lxx07695 trsK   FALSE 0.020 791.000 0.000 NA   NA
 609559 609560 Lxx07700 Lxx07715 rlx   FALSE 0.026 523.000 0.000 NA   NA
 1799939 1799940 Lxx07720 Lxx07730     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 1799940 609561 Lxx07730 Lxx07740     FALSE 0.050 255.000 0.000 NA   NA
 609562 609563 Lxx07750 Lxx07755 pglA   FALSE 0.028 554.000 0.000 NA N NA
 609563 609564 Lxx07755 Lxx07770   tnp FALSE 0.028 563.000 0.000 NA N NA
 609564 609565 Lxx07770 Lxx07780 tnp   FALSE 0.019 850.000 0.000 NA   NA
 609566 609567 Lxx07795 Lxx07798     FALSE 0.016 2742.000 0.000 NA   NA
 609567 609568 Lxx07798 Lxx07810   Gly FALSE 0.152 156.000 0.000 NA   NA
 609569 609570 Lxx07820 Lxx07830 Pro tig TRUE 0.551 55.000 0.000 NA   NA
 609570 609571 Lxx07830 Lxx07840 tig   TRUE 0.561 74.000 0.000 1.000   NA
 609571 609572 Lxx07840 Lxx07850   clpP FALSE 0.329 123.000 0.000 1.000   NA
 609572 609573 Lxx07850 Lxx07860 clpP clpP TRUE 0.988 42.000 0.512 0.001 Y NA
 609573 609574 Lxx07860 Lxx07870 clpP clpX FALSE 0.545 161.000 0.039 1.000 Y NA
 1799942 609575 Lxx07880 Lxx07900 dcp   FALSE 0.148 157.000 0.000 NA   NA
 609575 609576 Lxx07900 Lxx07910     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 609576 609577 Lxx07910 Lxx07920     TRUE 0.654 40.000 0.000 0.005   NA
 609577 609578 Lxx07920 Lxx07930   valS TRUE 0.813 18.000 0.000 1.000 N NA
 609578 1799943 Lxx07930 Lxx07940 valS proP FALSE 0.299 125.000 0.000 NA   NA
 609579 609580 Lxx07960 Lxx07970   ileS TRUE 0.634 41.000 0.000 1.000 N NA
 609580 609581 Lxx07970 Lxx07980 ileS folC TRUE 0.959 -3.000 0.031 1.000 N NA
 609581 609582 Lxx07980 Lxx07990 folC   TRUE 0.985 -3.000 0.156 NA   NA
 609582 609583 Lxx07990 Lxx08000   ndk TRUE 0.943 -3.000 0.024 NA   NA
 609587 609588 Lxx08040 Lxx08050 rplU rpmA TRUE 0.994 30.000 0.667 0.024 Y NA
 609588 609589 Lxx08050 Lxx08060 rpmA obg TRUE 0.922 88.000 0.335 1.000   NA
 609589 609590 Lxx08060 Lxx08070 obg proB TRUE 0.989 -3.000 0.206 1.000   NA
 609590 609591 Lxx08070 Lxx08080 proB proA TRUE 0.994 11.000 0.281 0.002 Y NA
 609591 609592 Lxx08080 Lxx08090 proA   FALSE 0.437 59.000 0.002 NA   NA
 609592 609593 Lxx08090 Lxx08100   nadD TRUE 0.755 12.000 0.002 NA   NA
 609593 609594 Lxx08100 Lxx08110 nadD   TRUE 0.885 -3.000 0.002 NA   NA
 609594 609595 Lxx08110 Lxx08120     FALSE 0.427 50.000 0.002 NA   NA
 609595 609596 Lxx08120 Lxx08130     FALSE 0.432 62.000 0.002 NA   NA
 609596 609597 Lxx08130 Lxx08140   Ala FALSE 0.403 107.000 0.000 NA   NA
 609597 609598 Lxx08140 Lxx08150 Ala lytR FALSE 0.261 131.000 0.000 NA   NA
 609598 609599 Lxx08150 Lxx08160 lytR   FALSE 0.062 243.000 0.000 NA N NA
 609602 609603 Lxx08190 Lxx08200     FALSE 0.051 252.000 0.000 NA   NA
 609603 609604 Lxx08200 Lxx08210   Leu FALSE 0.048 267.000 0.000 NA   NA
 1799944 1799945 Lxx08220 Lxx08240 argE bacA TRUE 0.871 9.000 0.000 NA   NA
 609606 609607 Lxx08260 Lxx08280   gcd14 TRUE 0.927 -3.000 0.014 1.000   NA
 609607 609608 Lxx08280 Lxx08290 gcd14 aceF TRUE 0.551 63.000 0.000 NA   NA
 609608 609609 Lxx08290 Lxx08300 aceF   TRUE 0.555 45.000 0.000 NA   NA
 609609 609610 Lxx08300 Lxx08310     TRUE 0.997 14.000 0.767 NA Y NA
 609610 609611 Lxx08310 Lxx08320   tatE FALSE 0.038 363.000 0.000 NA N NA
 609611 609612 Lxx08320 Lxx08330 tatE tatC TRUE 0.858 44.000 0.012 NA Y NA
 609612 609613 Lxx08330 Lxx08340 tatC   TRUE 0.876 57.000 0.166 NA   NA
 609613 609614 Lxx08340 Lxx08350   lnt TRUE 0.947 -7.000 0.035 1.000   NA
 609615 609616 Lxx08360 Lxx08370     FALSE 0.025 772.000 0.021 NA   NA
 609616 609617 Lxx08370 Lxx08380     FALSE 0.040 299.000 0.000 NA   NA
 609618 609619 Lxx08390 Lxx08400 fabG yuxL TRUE 0.958 -3.000 0.029 1.000 N NA
 609621 609622 Lxx08452 Lxx08457   tnp FALSE 0.017 1439.000 0.000 NA   NA
 1799947 1799948 Lxx08460 Lxx08470   frnE FALSE 0.063 214.000 0.000 NA   NA
 1799948 609623 Lxx08470 Lxx08490 frnE nifR3 FALSE 0.048 266.000 0.000 NA   NA
 609623 609624 Lxx08490 Lxx08500 nifR3 dgt TRUE 0.906 -10.000 0.011 1.000 N NA
 609624 609625 Lxx08500 Lxx08510 dgt   FALSE 0.548 80.000 0.000 NA   NA
 609625 609626 Lxx08510 Lxx08520   dnaG TRUE 0.680 29.000 0.000 NA   NA
 609626 609627 Lxx08520 Lxx08530 dnaG oppA FALSE 0.086 203.000 0.000 1.000 N NA
 609627 609628 Lxx08530 Lxx08540 oppA dppB TRUE 0.886 94.000 0.044 0.034 Y NA
 609628 609629 Lxx08540 Lxx08550 dppB dppC TRUE 0.981 83.000 0.435 0.034 Y NA
 609629 609630 Lxx08550 Lxx08560 dppC dppD TRUE 0.988 -3.000 0.185 1.000   NA
 609630 609631 Lxx08560 Lxx08570 dppD oppF TRUE 0.886 10.000 0.000 0.024   NA
 609631 609632 Lxx08570 Lxx08580 oppF serA FALSE 0.311 128.000 0.000 1.000 N NA
 609632 609633 Lxx08580 Lxx08590 serA Asn TRUE 0.548 79.000 0.000 NA   NA
 609633 1799949 Lxx08590 Lxx08600 Asn   FALSE 0.049 261.000 0.000 NA   NA
 609635 609636 Lxx08620 Lxx08630     TRUE 0.878 91.000 0.213 1.000   NA
 609636 609637 Lxx08630 Lxx08640   Met TRUE 0.903 -9.000 0.000 NA   NA
 609639 609640 Lxx08660 Lxx08670 mutT3   TRUE 0.590 66.000 0.000 1.000 N NA
 609640 609641 Lxx08670 Lxx08680     TRUE 0.554 59.000 0.000 NA   NA
 609644 609645 Lxx08710 Lxx08720 glbO mscS TRUE 0.974 2.000 0.083 1.000   NA
 609645 609646 Lxx08720 Lxx08730 mscS chiR TRUE 0.602 45.000 0.000 1.000 N NA
 609646 609647 Lxx08730 Lxx08740 chiR chiS TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 609647 609648 Lxx08740 Lxx08745 chiS   FALSE 0.150 159.000 0.000 1.000   NA
 609648 609649 Lxx08745 Lxx08750   spaF TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 609649 609650 Lxx08750 Lxx08760 spaF pepN FALSE 0.426 110.000 0.000 1.000 N NA
 609651 609652 Lxx08770 Lxx08780 rpiB   TRUE 0.994 0.000 0.398 1.000 N NA
 609654 1799950 Lxx08800 Lxx08810 proP   FALSE 0.030 421.000 0.000 NA   NA
 1799950 609655 Lxx08810 Lxx08820     FALSE 0.017 1764.000 0.000 NA   NA
 609655 609656 Lxx08820 Lxx08825     FALSE 0.409 113.000 0.000 0.073   NA
 609656 609657 Lxx08825 Lxx08830     FALSE 0.017 1432.000 0.000 NA   NA
 609657 609658 Lxx08830 Lxx08840     FALSE 0.017 1981.000 0.000 NA   NA
 609658 609659 Lxx08840 Lxx08850     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 609659 1799951 Lxx08850 Lxx08860     FALSE 0.548 76.000 0.000 NA   NA
 1799951 609660 Lxx08860 Lxx08880   pitA FALSE 0.299 125.000 0.000 NA   NA
 609660 609661 Lxx08880 Lxx08890 pitA   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609663 609664 Lxx08900 Lxx08920   micA TRUE 0.561 74.000 0.000 1.000   NA
 609664 609665 Lxx08920 Lxx08930 micA aspA FALSE 0.033 391.000 0.000 1.000   NA
 609667 609668 Lxx08950 Lxx08960   fkb FALSE 0.109 173.000 0.000 1.000   NA
 609669 609670 Lxx08980 Lxx08990   rpsO FALSE 0.248 138.000 0.000 1.000 N NA
 609670 609671 Lxx08990 Lxx09000 rpsO   TRUE 0.581 75.000 0.000 NA N NA
 609674 609675 Lxx09050 Lxx09060 dapE   FALSE 0.517 53.000 0.011 NA   NA
 609675 609676 Lxx09060 Lxx09070     TRUE 0.649 68.000 0.028 NA   NA
 1799954 609678 Lxx09090 Lxx09100 tatB   FALSE 0.024 565.000 0.000 NA   NA
 609679 609680 Lxx09110 Lxx09120     TRUE 0.992 -7.000 0.389 NA   NA
 609680 609681 Lxx09120 Lxx09130     TRUE 0.996 -13.000 0.806 NA   NA
 609684 609685 Lxx09150 Lxx09155     FALSE 0.543 69.000 0.000 NA   NA
 609688 609689 Lxx09200 Lxx09210     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 609690 609691 Lxx09220 Lxx09230     TRUE 0.992 27.000 0.493 0.004 Y NA
 1799955 609692 Lxx09235 Lxx09240   mphA TRUE 0.562 44.000 0.000 NA   NA
 609693 609694 Lxx09250 Lxx09260 nudC   TRUE 0.990 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 609695 609696 Lxx09270 Lxx09280     FALSE 0.505 87.000 0.000 NA   NA
 609697 609698 Lxx09290 Lxx09300     TRUE 0.597 111.000 0.053 1.000   NA
 609700 1799956 Lxx09320 Lxx09330   carB FALSE 0.052 250.000 0.000 NA   NA
 1799956 609701 Lxx09330 Lxx09350 carB   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609701 609702 Lxx09350 Lxx09360     FALSE 0.205 149.000 0.000 1.000 N NA
 609702 1799957 Lxx09360 Lxx09370     FALSE 0.547 51.000 0.000 NA   NA
 1799957 609703 Lxx09370 Lxx09390   tnp FALSE 0.061 218.000 0.000 NA   NA
 609703 1799958 Lxx09390 Lxx09405 tnp   FALSE 0.018 1163.000 0.000 NA   NA
 1799958 609704 Lxx09405 Lxx09410     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 609704 1799959 Lxx09410 Lxx09415     TRUE 0.734 24.000 0.000 NA   NA
 1799959 1799960 Lxx09415 Lxx09420   encM FALSE 0.037 324.000 0.000 NA   NA
 1799960 609705 Lxx09420 Lxx09440 encM   FALSE 0.468 94.000 0.000 NA   NA
 609707 609708 Lxx09450 Lxx09460     FALSE 0.017 1351.000 0.000 NA   NA
 609708 609709 Lxx09460 Lxx09470   csd FALSE 0.018 1197.000 0.000 NA   NA
 609709 609710 Lxx09470 Lxx09480 csd nifU TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 N NA
 609710 1799961 Lxx09480 Lxx09490 nifU opuAA FALSE 0.040 299.000 0.000 NA   NA
 1799963 609711 Lxx09510 Lxx09520 opuAA opuAB FALSE 0.449 97.000 0.000 NA   NA
 609712 1799964 Lxx09540 Lxx09550 phrB   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609713 609714 Lxx09570 Lxx09580 Glu   FALSE 0.026 521.000 0.000 NA   NA
 609714 609715 Lxx09580 Lxx09600     FALSE 0.017 1596.000 0.000 NA   NA
 609715 609716 Lxx09600 Lxx09610     TRUE 0.915 32.000 0.000 0.016 Y NA
 609716 609717 Lxx09610 Lxx09620     FALSE 0.527 84.000 0.000 NA   NA
 609717 609718 Lxx09620 Lxx09630     FALSE 0.041 293.000 0.000 NA   NA
 609718 1799965 Lxx09630 Lxx09640     TRUE 0.603 39.000 0.000 NA   NA
 1799965 609719 Lxx09640 Lxx09660   leuC FALSE 0.112 170.000 0.000 NA   NA
 609719 609720 Lxx09660 Lxx09680 leuC leuD TRUE 0.998 0.000 0.477 0.001 Y NA
 609720 609721 Lxx09680 Lxx09670 leuD murA TRUE 0.979 -3.000 0.074 1.000 N NA
 609721 609722 Lxx09670 Lxx09690 murA plsC TRUE 0.969 20.000 0.236 1.000 N NA
 609722 609723 Lxx09690 Lxx09700 plsC gpdA TRUE 0.953 41.000 0.380 1.000 N NA
 609723 609724 Lxx09700 Lxx09710 gpdA ddlA TRUE 0.793 95.000 0.088 1.000 N NA
 609728 609729 Lxx09750 Lxx09760 recG coaD TRUE 0.559 87.000 0.015 1.000 N NA
 609729 609730 Lxx09760 Lxx09770 coaD   FALSE 0.047 206.000 0.004 NA   NA
 609730 609731 Lxx09770 Lxx09790   rpmF TRUE 0.995 3.000 0.599 NA   NA
 609731 609732 Lxx09790 Lxx09780 rpmF rnc TRUE 0.914 12.000 0.044 1.000   NA
 609732 609733 Lxx09780 Lxx09800 rnc mutM TRUE 0.966 -22.000 0.068 1.000 N NA
 609733 609734 Lxx09800 Lxx09812 mutM   FALSE 0.023 692.000 0.000 1.000   NA
 609734 1799966 Lxx09812 Lxx09815   tnp FALSE 0.023 594.000 0.000 NA   NA
 609735 609736 Lxx09820 Lxx09830 qcrB qcrA TRUE 0.998 -3.000 0.457 0.032 Y NA
 609736 609737 Lxx09830 Lxx09840 qcrA qcrC TRUE 0.781 109.000 0.000 0.032 Y NA
 609737 609738 Lxx09840 Lxx09850 qcrC ctaE TRUE 0.940 24.000 0.000 0.032 Y NA
 609739 609740 Lxx09860 Lxx09870 trpD dak1 TRUE 0.625 42.000 0.000 1.000 N NA
 609740 609741 Lxx09870 Lxx09880 dak1 dak2 TRUE 0.951 31.000 0.242 0.001   NA
 609741 609742 Lxx09880 Lxx09890 dak2 hpr TRUE 0.995 -3.000 0.442 1.000   NA
 609745 609746 Lxx09920 Lxx09930 folA thyA TRUE 0.993 -3.000 0.295 1.000 N NA
 609747 609748 Lxx09940 Lxx09950     TRUE 0.972 29.000 0.468 NA   NA
 609749 609750 Lxx09955 Lxx09960 rnpB glk FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 609750 609751 Lxx09960 Lxx09980 glk ampM TRUE 0.833 94.000 0.142 1.000 N NA
 609751 609752 Lxx09980 Lxx09990 ampM   FALSE 0.036 335.000 0.000 NA   NA
 609752 609753 Lxx09990 Lxx10000   panB FALSE 0.035 354.000 0.000 NA   NA
 609754 609755 Lxx10010 Lxx10020 glnA glnE TRUE 0.787 40.000 0.046 1.000 N NA
 609759 609760 Lxx10100 Lxx10130   lipA TRUE 0.723 88.000 0.059 NA   NA
 609760 609761 Lxx10130 Lxx10110 lipA lipB TRUE 0.998 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 609763 609764 Lxx10140 Lxx10150 pdhB   TRUE 0.975 87.000 0.379 1.000 Y NA
 609764 609765 Lxx10150 Lxx10160   pep TRUE 0.785 105.000 0.095 0.040 N NA
 609766 609767 Lxx10170 Lxx10180     TRUE 0.894 37.000 0.140 1.000   NA
 609767 609768 Lxx10180 Lxx10190   hrdB FALSE 0.055 271.000 0.000 1.000 N NA
 609768 609769 Lxx10190 Lxx10200 hrdB murC TRUE 0.908 5.000 0.015 1.000 N NA
 609769 609770 Lxx10200 Lxx10210 murC cobQ TRUE 0.997 -3.000 0.796 1.000   NA
 609771 609772 Lxx10220 Lxx10230     TRUE 0.921 2.000 0.000 0.032   NA
 609772 1799968 Lxx10230 Lxx10240     TRUE 0.900 -10.000 0.000 NA   NA
 1799968 609773 Lxx10240 Lxx10270   dapA TRUE 0.766 21.000 0.000 NA   NA
 609773 609774 Lxx10270 Lxx10280 dapA nhaC TRUE 0.597 47.000 0.000 1.000 N NA
 609775 609776 Lxx10290 Lxx10300     TRUE 0.709 26.000 0.000 NA   NA
 609776 609777 Lxx10300 Lxx10310     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609778 609779 Lxx10340 Lxx10330 alr alr TRUE 0.941 -3.000 0.000 0.002   NA
 609779 609780 Lxx10330 Lxx10335 alr   TRUE 0.626 36.000 0.000 NA   NA
 609787 609788 Lxx10390 Lxx10410 dut   FALSE 0.499 138.000 0.078 NA   NA
 609788 609789 Lxx10410 Lxx10420     TRUE 0.975 9.000 0.169 NA   NA
 609789 609790 Lxx10420 Lxx10430     TRUE 0.550 47.000 0.000 NA   NA
 609790 609791 Lxx10430 Lxx10440     FALSE 0.541 101.000 0.019 0.050 N NA
 609791 609792 Lxx10440 Lxx10450   dxs TRUE 0.552 78.000 0.008 1.000 N NA
 1799969 609793 Lxx10460 Lxx10470 paaH fadB FALSE 0.019 862.000 0.000 NA   NA
 609793 609794 Lxx10470 Lxx10480 fadB atoB TRUE 0.998 8.000 0.812 NA Y NA
 609794 609795 Lxx10480 Lxx10490 atoB   TRUE 0.695 71.000 0.032 NA N NA
 609795 609796 Lxx10490 Lxx10500     TRUE 0.978 -7.000 0.115 NA   NA
 609797 609798 Lxx10540 Lxx10550   sseA TRUE 0.993 -3.000 0.351 NA   NA
 609799 609800 Lxx10560 Lxx10570   amt FALSE 0.069 212.000 0.000 1.000   NA
 609800 609801 Lxx10570 Lxx10580 amt amt FALSE 0.283 214.000 0.000 0.001 Y NA
 609801 1799971 Lxx10580 Lxx10590 amt   FALSE 0.545 72.000 0.000 NA   NA
 609804 609805 Lxx10630 Lxx10640 Gly Cys FALSE 0.545 65.000 0.000 NA   NA
 609805 609806 Lxx10640 Lxx10650 Cys Val TRUE 0.771 20.000 0.000 NA   NA
 609806 609807 Lxx10650 Lxx10660 Val   FALSE 0.067 209.000 0.000 NA   NA
 609807 1799973 Lxx10660 Lxx10670     TRUE 0.886 -134.000 0.000 NA   NA
 1799973 609808 Lxx10670 Lxx10690   thrS TRUE 0.909 -4.000 0.000 NA   NA
 609808 609809 Lxx10690 Lxx10700 thrS   TRUE 0.911 60.000 0.208 1.000 N NA
 609810 609811 Lxx10710 Lxx10730 pdxY   TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 609812 609813 Lxx10720 Lxx10740     TRUE 0.984 -10.000 0.030 NA Y NA
 609813 609814 Lxx10740 Lxx10750     TRUE 0.744 65.000 0.055 NA   NA
 609814 609815 Lxx10750 Lxx10760   ruvC TRUE 0.977 13.000 0.277 NA   NA
 609815 609816 Lxx10760 Lxx10780 ruvC ruvA TRUE 0.998 -3.000 0.451 0.015 Y NA
 609816 609817 Lxx10780 Lxx10770 ruvA ruvB TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.003 Y NA
 609817 609818 Lxx10770 Lxx10790 ruvB yajC TRUE 0.787 72.000 0.063 NA N NA
 609818 609819 Lxx10790 Lxx10800 yajC secD TRUE 0.776 131.000 0.062 NA Y NA
 609819 609820 Lxx10800 Lxx10810 secD secF TRUE 0.998 0.000 0.336 0.001 Y NA
 609820 609821 Lxx10810 Lxx10820 secF glpE TRUE 0.593 40.000 0.009 NA N NA
 609821 609822 Lxx10820 Lxx10830 glpE relA TRUE 0.642 65.000 0.024 NA N NA
 609823 609824 Lxx10840 Lxx10850     FALSE 0.090 183.000 0.000 NA   NA
 609824 609825 Lxx10850 Lxx10860   ppiB TRUE 0.843 49.000 0.103 NA   NA
 609826 609827 Lxx10870 Lxx10880   rpsD FALSE 0.078 184.000 0.005 1.000 N NA
 609827 609828 Lxx10880 Lxx10890 rpsD   FALSE 0.326 109.000 0.007 NA   NA
 609828 609829 Lxx10890 Lxx10900     TRUE 0.552 62.000 0.000 NA   NA
 609829 609830 Lxx10900 Lxx10910   alaS TRUE 0.620 45.000 0.023 NA   NA
 609830 609831 Lxx10910 Lxx10920 alaS   TRUE 0.977 4.000 0.103 1.000 N NA
 609831 609832 Lxx10920 Lxx10930     FALSE 0.037 788.000 0.039 NA   NA
 609832 609833 Lxx10930 Lxx10940   aroE FALSE 0.058 458.000 0.045 NA   NA
 609833 609834 Lxx10940 Lxx10950 aroE aroC TRUE 0.888 42.000 0.021 1.000 Y NA
 609834 609835 Lxx10950 Lxx10960 aroC aroK TRUE 0.918 41.000 0.041 1.000 Y NA
 609835 609836 Lxx10960 Lxx10970 aroK aroB TRUE 0.995 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 609836 609837 Lxx10970 Lxx10980 aroB   FALSE 0.376 111.000 0.000 NA   NA
 609837 609838 Lxx10980 Lxx10990   aroD TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609838 609839 Lxx10990 Lxx11000 aroD efp FALSE 0.395 103.000 0.005 1.000 N NA
 609839 609840 Lxx11000 Lxx11010 efp nusB TRUE 0.978 0.000 0.078 1.000 N NA
 609840 609841 Lxx11010 Lxx11020 nusB pknE TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA N NA
 609841 1799974 Lxx11020 Lxx11030 pknE rhsB FALSE 0.516 86.000 0.000 NA   NA
 1799974 609842 Lxx11030 Lxx11050 rhsB   FALSE 0.017 1622.000 0.000 NA   NA
 609842 609843 Lxx11050 Lxx11060   pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 609843 609844 Lxx11060 Lxx11070 pyrB pyrC TRUE 0.994 18.000 0.452 1.000 Y NA
 609844 609845 Lxx11070 Lxx11080 pyrC   TRUE 0.718 87.000 0.057 NA   NA
 609845 609846 Lxx11080 Lxx11090   carA TRUE 0.954 -10.000 0.050 NA   NA
 609846 609847 Lxx11090 Lxx11100 carA carB TRUE 0.998 0.000 0.345 0.001 Y NA
 609847 609848 Lxx11100 Lxx11110 carB pyrF TRUE 0.977 -3.000 0.075 1.000   NA
 609848 609849 Lxx11110 Lxx11120 pyrF gmk FALSE 0.079 191.000 0.013 1.000   NA
 609849 609850 Lxx11120 Lxx11130 gmk rpoZ TRUE 0.946 89.000 0.471 1.000 N NA
 609850 609851 Lxx11130 Lxx11140 rpoZ dfp TRUE 0.884 87.000 0.192 1.000 N NA
 609851 609852 Lxx11140 Lxx11150 dfp metK TRUE 0.929 42.000 0.059 1.000 Y NA
 609852 609853 Lxx11150 Lxx11160 metK priA TRUE 0.968 3.000 0.068 1.000 N NA
 609853 609854 Lxx11160 Lxx11170 priA fmt TRUE 0.575 50.000 0.012 1.000 N NA
 609854 1799975 Lxx11170 Lxx11180 fmt sun TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799975 609855 Lxx11180 Lxx11200 sun   FALSE 0.232 135.000 0.000 NA   NA
 609855 609856 Lxx11200 Lxx11210   hisE TRUE 0.938 3.000 0.026 1.000 N NA
 609856 609857 Lxx11210 Lxx11220 hisE hisG TRUE 0.944 49.000 0.081 0.005 Y NA
 609857 609858 Lxx11220 Lxx11230 hisG hisF TRUE 0.983 0.000 0.008 0.005 Y NA
 609858 609859 Lxx11230 Lxx11240 hisF hisI TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 609859 609860 Lxx11240 Lxx11250 hisI trpE TRUE 0.914 48.000 0.050 1.000 Y NA
 609860 609861 Lxx11250 Lxx11260 trpE   TRUE 0.996 -10.000 0.690 NA   NA
 609861 609862 Lxx11260 Lxx11270     TRUE 0.801 94.000 0.109 NA   NA
 609862 609863 Lxx11270 Lxx11280   trpC TRUE 0.988 5.000 0.286 NA   NA
 609863 609864 Lxx11280 Lxx11290 trpC trpB TRUE 0.987 0.000 0.025 0.002 Y NA
 609864 609865 Lxx11290 Lxx11300 trpB trpA TRUE 0.996 -3.000 0.153 0.002 Y NA
 609865 609866 Lxx11300 Lxx11310 trpA lgt FALSE 0.547 82.000 0.009 1.000 N NA
 609866 609867 Lxx11310 Lxx11320 lgt gltB TRUE 0.614 156.000 0.222 1.000 N NA
 609867 609868 Lxx11320 Lxx11330 gltB gltD TRUE 0.899 43.000 0.022 0.001 Y NA
 609868 609869 Lxx11330 Lxx11340 gltD pyk TRUE 0.702 65.000 0.031 1.000 N NA
 609870 609871 Lxx11350 Lxx11360     FALSE 0.052 251.000 0.000 NA   NA
 609876 609877 Lxx11410 Lxx11420 polA   TRUE 0.665 31.000 0.000 NA   NA
 609877 609878 Lxx11420 Lxx11430   rpsA FALSE 0.031 394.000 0.000 NA   NA
 609878 609879 Lxx11430 Lxx11440 rpsA   FALSE 0.475 113.000 0.024 1.000 N NA
 609879 609880 Lxx11440 Lxx11450   uvrB TRUE 0.678 78.000 0.026 1.000 N NA
 609882 609883 Lxx11470 Lxx11480 uvrA uvrC TRUE 0.980 11.000 0.043 0.002 Y NA
 609883 609884 Lxx11480 Lxx11490 uvrC   TRUE 0.768 88.000 0.073 NA   NA
 609884 609885 Lxx11490 Lxx11500     TRUE 0.814 57.000 0.076 NA   NA
 609885 609886 Lxx11500 Lxx11510   sodA FALSE 0.504 81.000 0.009 NA   NA
 609886 609887 Lxx11510 Lxx11520 sodA gap TRUE 0.628 103.000 0.041 1.000 N NA
 609887 609888 Lxx11520 Lxx11530 gap   TRUE 0.975 16.000 0.055 0.005 Y NA
 609888 609889 Lxx11530 Lxx11540   tpiA TRUE 0.991 3.000 0.075 1.000 Y NA
 609889 609890 Lxx11540 Lxx11550 tpiA secG TRUE 0.781 68.000 0.064 1.000   NA
 609890 609891 Lxx11550 Lxx11560 secG   TRUE 0.751 31.000 0.027 NA   NA
 609892 609893 Lxx11570 Lxx11580 pgl opcA TRUE 0.932 135.000 0.463 NA Y NA
 609893 609894 Lxx11580 Lxx11590 opcA zwf TRUE 0.999 -3.000 0.583 NA Y NA
 609894 609895 Lxx11590 Lxx11600 zwf pgiA TRUE 0.957 27.000 0.061 1.000 Y NA
 609895 609896 Lxx11600 Lxx11610 pgiA tal2 TRUE 0.988 -3.000 0.025 0.039 Y NA
 609896 609897 Lxx11610 Lxx11620 tal2 tktA1 TRUE 0.968 32.000 0.135 1.000 Y NA
 609900 609901 Lxx11650 Lxx11660 sufB sufD TRUE 0.976 44.000 0.266 0.002 Y NA
 609901 609902 Lxx11660 Lxx11670 sufD   TRUE 0.972 0.000 0.063 1.000 N NA
 609902 609903 Lxx11670 Lxx11680   sufC TRUE 0.957 3.000 0.046 1.000 N NA
 609903 609904 Lxx11680 Lxx11690 sufC   TRUE 0.886 10.000 0.021 NA   NA
 609904 609905 Lxx11690 Lxx11700   ybiT FALSE 0.434 107.000 0.019 NA   NA
 609906 609907 Lxx11710 Lxx11715     TRUE 0.972 -3.000 0.062 NA   NA
 609907 609908 Lxx11715 Lxx11730     TRUE 0.995 0.000 0.562 NA   NA
 609910 609911 Lxx11750 Lxx11760 serB glgC TRUE 0.916 -13.000 0.015 1.000 N NA
 1799976 609912 Lxx11770 Lxx11780 glgA   TRUE 0.643 33.000 0.000 NA   NA
 609912 609913 Lxx11780 Lxx11800   rpmE FALSE 0.295 120.000 0.004 1.000 N NA
 609914 609915 Lxx11810 Lxx11820     FALSE 0.110 171.000 0.000 NA   NA
 609915 609916 Lxx11820 Lxx11830   palI FALSE 0.523 62.000 0.005 1.000 N NA
 609917 609918 Lxx11840 Lxx11850   mtfB TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 N NA
 1799977 1799978 Lxx11858 Lxx11859 tnp tnp FALSE 0.060 221.000 0.000 NA   NA
 1799978 609919 Lxx11859 Lxx11870 tnp gpm FALSE 0.063 214.000 0.000 NA   NA
 609919 609920 Lxx11870 Lxx11890 gpm   TRUE 0.575 48.000 0.012 1.000 N NA
 609921 609922 Lxx11880 Lxx11900 spoU pbpA FALSE 0.537 86.000 0.012 1.000 N NA
 609922 609923 Lxx11900 Lxx11910 pbpA   TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 609923 609924 Lxx11910 Lxx11920     FALSE 0.018 1047.000 0.000 NA   NA
 609928 609929 Lxx11960 Lxx11970 amn   FALSE 0.089 187.000 0.000 1.000   NA
 609930 609931 Lxx11980 Lxx11990 bioA asnC TRUE 0.995 3.000 0.590 1.000 N NA
 609932 609933 Lxx12000 Lxx12010     TRUE 0.878 78.000 0.000 0.001 Y NA
 609935 609936 Lxx12015 Lxx12030     TRUE 0.978 33.000 0.667 NA   NA
 609936 609937 Lxx12030 Lxx12040     FALSE 0.208 262.000 0.000 1.000 Y NA
 609937 609938 Lxx12040 Lxx12050     TRUE 0.971 -27.000 0.091 NA   NA
 609938 609939 Lxx12050 Lxx12060     TRUE 0.958 95.000 0.731 NA   NA
 609939 609940 Lxx12060 Lxx12070     TRUE 0.973 72.000 0.808 NA   NA
 609940 609941 Lxx12070 Lxx12080     TRUE 0.998 -3.000 0.880 NA   NA
 609941 609942 Lxx12080 Lxx12090     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 609943 609944 Lxx12100 Lxx12110 ald   FALSE 0.202 265.000 0.000 NA Y NA
 609944 609945 Lxx12110 Lxx12130   goaG TRUE 0.990 -3.000 0.044 NA Y NA
 609947 609948 Lxx12140 Lxx12150 plsC   TRUE 0.550 47.000 0.000 NA   NA
 609948 609949 Lxx12150 Lxx12170   gabT TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 609950 609951 Lxx12160 Lxx12180 fkpA dxr TRUE 0.899 0.000 0.002 1.000 N NA
 609951 609952 Lxx12180 Lxx12190 dxr   TRUE 0.842 74.000 0.088 1.000 N NA
 609952 609953 Lxx12190 Lxx12200   gcpE TRUE 0.818 51.000 0.072 1.000 N NA
 609953 609954 Lxx12200 Lxx12210 gcpE proS TRUE 0.672 107.000 0.066 1.000   NA
 609955 609956 Lxx12220 Lxx12230     FALSE 0.056 235.000 0.000 NA   NA
 609957 609958 Lxx12240 Lxx12250   proV FALSE 0.096 190.000 0.000 1.000 N NA
 609958 609959 Lxx12250 Lxx12260 proV proW TRUE 0.999 -3.000 0.694 1.000 Y NA
 609959 609960 Lxx12260 Lxx12270 proW proZ TRUE 0.999 -3.000 0.918 0.032 Y NA
 609960 609961 Lxx12270 Lxx12280 proZ proX TRUE 0.995 6.000 0.667 0.032 N NA
 609962 609963 Lxx12290 Lxx12310     TRUE 0.997 5.000 0.850 1.000 N NA
 609964 609965 Lxx12300 Lxx12320 cydA cydB TRUE 0.998 14.000 0.925 0.031 Y NA
 609965 609966 Lxx12320 Lxx12330 cydB cydD TRUE 0.994 2.000 0.151 1.000 Y NA
 609966 609967 Lxx12330 Lxx12340 cydD cydC TRUE 0.998 -13.000 0.631 0.006 Y NA
 609969 609970 Lxx12360 Lxx12370 trpE leuS FALSE 0.427 89.000 0.002 1.000 N NA
 609970 609971 Lxx12370 Lxx12380 leuS   FALSE 0.033 390.000 0.000 1.000   NA
 609971 609972 Lxx12380 Lxx12390     TRUE 0.674 30.000 0.000 NA   NA
 609972 1799979 Lxx12390 Lxx12400     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799979 609973 Lxx12400 Lxx12420     TRUE 0.748 23.000 0.000 NA   NA
 609973 1799980 Lxx12420 Lxx12413   ilvE TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799980 609974 Lxx12413 Lxx12415 ilvE tnp FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 609974 609975 Lxx12415 Lxx12440 tnp rpsB FALSE 0.020 751.000 0.000 NA   NA
 609975 609976 Lxx12440 Lxx12450 rpsB tsf TRUE 0.990 43.000 0.748 1.000 Y NA
 609976 609977 Lxx12450 Lxx12460 tsf pyrH TRUE 0.895 114.000 0.416 1.000 N NA
 609977 609978 Lxx12460 Lxx12470 pyrH frr TRUE 0.967 45.000 0.626 1.000 N NA
 609978 609979 Lxx12470 Lxx12480 frr cdsA TRUE 0.823 82.000 0.076 1.000 N NA
 609979 609980 Lxx12480 Lxx12490 cdsA   TRUE 0.948 13.000 0.090 NA   NA
 609980 609981 Lxx12490 Lxx12500     TRUE 0.837 72.000 0.095 NA   NA
 609981 609982 Lxx12500 Lxx12510     TRUE 0.775 19.000 0.000 NA   NA
 609982 609983 Lxx12510 Lxx12520     TRUE 0.942 16.000 0.092 NA   NA
 609984 609985 Lxx12530 Lxx12540     FALSE 0.185 229.000 0.077 1.000   NA
 609986 609987 Lxx12550 Lxx12560   trxA TRUE 0.751 24.000 0.017 NA   NA
 609988 609989 Lxx12570 Lxx12580 glgB   TRUE 0.987 -3.000 0.159 0.009   NA
 609991 609992 Lxx12620 Lxx12630     TRUE 0.809 14.000 0.000 NA   NA
 609992 609993 Lxx12630 Lxx12640     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 609993 609994 Lxx12640 Lxx12650     FALSE 0.019 831.000 0.000 NA   NA
 609994 1799982 Lxx12650 Lxx12660     TRUE 0.819 13.000 0.000 NA   NA
 609998 609999 Lxx12700 Lxx12710 aceE   TRUE 0.909 11.000 0.028 1.000 N NA
 609999 610000 Lxx12710 Lxx12720   fabD TRUE 0.945 86.000 0.441 1.000 N NA
 610000 610001 Lxx12720 Lxx12730 fabD fabH TRUE 0.993 12.000 0.294 1.000 Y NA
 610001 610002 Lxx12730 Lxx12740 fabH acpP TRUE 0.979 43.000 0.307 0.003 Y NA
 610002 610003 Lxx12740 Lxx12750 acpP fabF TRUE 0.958 82.000 0.178 1.000 Y NA
 610005 610006 Lxx12760 Lxx12780 tesB   FALSE 0.020 761.000 0.000 NA   NA
 610007 610008 Lxx12790 Lxx12800     FALSE 0.060 223.000 0.000 NA   NA
 610008 610009 Lxx12800 Lxx12810     TRUE 0.906 11.000 0.031 1.000   NA
 610009 610010 Lxx12810 Lxx12820     FALSE 0.137 151.000 0.007 NA   NA
 610010 610011 Lxx12820 Lxx12825     TRUE 0.931 2.000 0.025 NA   NA
 610011 610012 Lxx12825 Lxx12840     FALSE 0.026 515.000 0.000 NA   NA
 610014 610015 Lxx12860 Lxx12870     TRUE 0.655 38.000 0.000 1.000 N NA
 610016 610017 Lxx12880 Lxx12890 pimH   FALSE 0.043 286.000 0.000 NA   NA
 1799983 610018 Lxx12892 Lxx12895 pat-1   FALSE 0.050 254.000 0.000 NA   NA
 610018 610019 Lxx12895 Lxx12900   Arg FALSE 0.031 414.000 0.000 NA   NA
 610020 1799984 Lxx12905 Lxx12910     FALSE 0.024 580.000 0.000 NA   NA
 1799984 610021 Lxx12910 Lxx12930     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610021 1799985 Lxx12930 Lxx12940     FALSE 0.029 437.000 0.000 NA   NA
 1799985 610022 Lxx12940 Lxx12950     FALSE 0.029 428.000 0.000 NA   NA
 610022 610023 Lxx12950 Lxx12955     FALSE 0.031 394.000 0.000 NA   NA
 610023 1799986 Lxx12955 Lxx12960     FALSE 0.476 92.000 0.000 NA   NA
 1799986 610024 Lxx12960 Lxx12970   tpase FALSE 0.042 290.000 0.000 NA   NA
 610024 610025 Lxx12970 Lxx12980 tpase   TRUE 0.580 83.000 0.000 0.067   NA
 610025 610026 Lxx12980 Lxx12990     FALSE 0.023 595.000 0.000 NA   NA
 610026 610027 Lxx12990 Lxx13000     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610029 610030 Lxx13020 Lxx13030   tnp FALSE 0.326 127.000 0.000 0.015   NA
 610031 610032 Lxx13040 Lxx13050     TRUE 0.911 -7.000 0.000 1.000   NA
 610032 610033 Lxx13050 Lxx13060   Gln FALSE 0.098 176.000 0.000 NA   NA
 610033 610034 Lxx13060 Lxx13070 Gln   FALSE 0.437 100.000 0.000 NA   NA
 610034 610035 Lxx13070 Lxx13080   gltS TRUE 0.882 5.000 0.006 1.000 N NA
 610035 610036 Lxx13080 Lxx13090 gltS   TRUE 0.809 68.000 0.070 1.000 N NA
 610036 610037 Lxx13090 Lxx13100     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 610037 610038 Lxx13100 Lxx13110     FALSE 0.104 176.000 0.000 1.000   NA
 610038 610039 Lxx13110 Lxx13120   ilvE FALSE 0.079 198.000 0.000 1.000   NA
 610039 610040 Lxx13120 Lxx13130 ilvE leuB TRUE 0.974 23.000 0.083 1.000 Y NA
 610040 610041 Lxx13130 Lxx13140 leuB serA FALSE 0.206 373.000 0.039 1.000 Y NA
 610041 610042 Lxx13140 Lxx13150 serA   FALSE 0.372 112.000 0.000 NA   NA
 610042 610043 Lxx13150 Lxx13160     TRUE 0.549 77.000 0.000 NA   NA
 610043 610044 Lxx13160 Lxx13170   ilvC FALSE 0.037 345.000 0.000 1.000   NA
 610044 610045 Lxx13170 Lxx13180 ilvC ilvN TRUE 0.939 64.000 0.071 0.002 Y NA
 610045 610046 Lxx13180 Lxx13200 ilvN ilvB TRUE 0.997 4.000 0.380 0.001 Y NA
 610046 610047 Lxx13200 Lxx13210 ilvB ilvD TRUE 0.888 58.000 0.020 0.002 Y NA
 610047 610048 Lxx13210 Lxx13220 ilvD otsB TRUE 0.803 99.000 0.000 1.000 Y NA
 610048 610049 Lxx13220 Lxx13230 otsB otsA TRUE 0.988 37.000 0.471 0.002 Y NA
 610049 610050 Lxx13230 Lxx13240 otsA   FALSE 0.029 469.000 0.000 1.000   NA
 610050 610051 Lxx13240 Lxx13260   arsB FALSE 0.165 155.000 0.000 1.000   NA
 610053 610054 Lxx13300 Lxx13310     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610054 610055 Lxx13310 Lxx13320     TRUE 0.997 -3.000 0.823 NA   NA
 1799988 610056 Lxx13325 Lxx13330   scG FALSE 0.136 161.000 0.000 NA   NA
 1799989 610057 Lxx13340 Lxx13360     FALSE 0.019 877.000 0.000 NA   NA
 610058 610059 Lxx13380 Lxx13390   Lys FALSE 0.026 523.000 0.000 NA   NA
 610062 610063 Lxx13410 Lxx13420 natA   TRUE 0.934 2.000 0.027 NA   NA
 610063 610064 Lxx13420 Lxx13430   add FALSE 0.025 650.000 0.000 NA N NA
 610064 610065 Lxx13430 Lxx13440 add   TRUE 0.595 76.000 0.000 1.000 N NA
 1799990 610068 Lxx13465 Lxx13468 tnp ssrA FALSE 0.029 434.000 0.000 NA   NA
 610068 610069 Lxx13468 Lxx13470 ssrA   FALSE 0.045 272.000 0.000 NA   NA
 610069 610070 Lxx13470 Lxx13480     FALSE 0.543 66.000 0.000 NA   NA
 610070 610071 Lxx13480 Lxx13490   smpB TRUE 0.600 58.000 0.000 1.000 N NA
 610071 610072 Lxx13490 Lxx13500 smpB ftsX TRUE 0.721 74.000 0.038 1.000 N NA
 610072 610073 Lxx13500 Lxx13510 ftsX ftsE TRUE 0.995 -3.000 0.431 1.000 N NA
 610073 610074 Lxx13510 Lxx13520 ftsE prfB TRUE 0.711 92.000 0.053 1.000 N NA
 610075 610076 Lxx13530 Lxx13540 Leu rsP FALSE 0.030 418.000 0.000 NA   NA
 610076 610077 Lxx13540 Lxx13550 rsP   FALSE 0.548 52.000 0.000 NA   NA
 610077 610078 Lxx13550 Lxx13560     FALSE 0.028 449.000 0.000 NA   NA
 610079 610080 Lxx13570 Lxx13580     TRUE 0.991 0.000 0.262 1.000 N NA
 610080 610081 Lxx13580 Lxx13590   murI TRUE 0.774 43.000 0.048 1.000 N NA
 610083 610084 Lxx13610 Lxx13620     TRUE 0.760 64.000 0.059 NA   NA
 610084 610085 Lxx13620 Lxx13640   natA TRUE 0.989 12.000 0.508 NA   NA
 1799991 610086 Lxx13650 Lxx13670 glmU rfbA TRUE 0.550 54.000 0.000 NA   NA
 610086 610087 Lxx13670 Lxx13680 rfbA   TRUE 0.998 0.000 0.462 1.000 Y NA
 610087 610088 Lxx13680 Lxx13690     TRUE 0.845 110.000 0.250 NA   NA
 610088 610089 Lxx13690 Lxx13700     FALSE 0.429 102.000 0.000 NA   NA
 610089 610090 Lxx13700 Lxx13710     TRUE 0.617 39.000 0.000 1.000   NA
 610090 610091 Lxx13710 Lxx13720   exoA FALSE 0.429 114.000 0.020 NA N NA
 610091 610092 Lxx13720 Lxx13730 exoA   TRUE 0.914 3.000 0.020 NA   NA
 610092 610093 Lxx13730 Lxx13740     TRUE 0.995 -7.000 0.600 NA   NA
 1799992 1799993 Lxx13750 Lxx13760     FALSE 0.025 526.000 0.000 NA   NA
 1799993 610094 Lxx13760 Lxx13770   tnp FALSE 0.066 211.000 0.000 NA   NA
 1799994 610095 Lxx13775 Lxx13780   tpase FALSE 0.038 320.000 0.000 NA   NA
 610098 610099 Lxx13830 Lxx13840     FALSE 0.017 1575.000 0.000 NA   NA
 610099 610100 Lxx13840 Lxx13850     FALSE 0.019 922.000 0.000 NA   NA
 610100 610101 Lxx13850 Lxx13860     FALSE 0.142 159.000 0.000 NA   NA
 610101 610102 Lxx13860 Lxx13870     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 610102 610103 Lxx13870 Lxx13880   tpase1 TRUE 0.551 55.000 0.000 NA   NA
 610103 1799996 Lxx13880 Lxx13890 tpase1 tpase1 TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1799996 610104 Lxx13890 Lxx13900 tpase1 tpase2 FALSE 0.073 202.000 0.000 NA   NA
 610106 610107 Lxx13920 Lxx13930     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 610107 610108 Lxx13930 Lxx13940     FALSE 0.030 416.000 0.000 NA   NA
 610108 610109 Lxx13940 Lxx13950     FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 610109 1799997 Lxx13950 Lxx13960     FALSE 0.277 127.000 0.000 NA   NA
 1799997 610110 Lxx13960 Lxx13990     FALSE 0.027 486.000 0.000 NA   NA
 610110 610111 Lxx13990 Lxx14000     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610111 610112 Lxx14000 Lxx14010     FALSE 0.182 148.000 0.000 NA   NA
 610113 610114 Lxx14024 Lxx14026     FALSE 0.225 324.000 0.040 NA Y NA
 610115 610116 Lxx14028 Lxx14030     FALSE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 610116 610117 Lxx14030 Lxx14040   yfP FALSE 0.049 294.000 0.000 1.000 N NA
 610117 1799998 Lxx14040 Lxx14050 yfP   TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 1799998 610118 Lxx14050 Lxx14070   y4fN TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610118 610119 Lxx14070 Lxx14080 y4fN   TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 610119 610120 Lxx14080 Lxx14090     TRUE 0.654 32.000 0.000 NA   NA
 610120 610121 Lxx14090 Lxx14110     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610121 610122 Lxx14110 Lxx14120     FALSE 0.395 108.000 0.000 NA   NA
 610122 610123 Lxx14120 Lxx14130   lsr2 FALSE 0.024 582.000 0.000 NA   NA
 610124 610125 Lxx14140 Lxx14150 His   FALSE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 610125 610126 Lxx14150 Lxx14160     TRUE 0.870 11.000 0.000 1.000 N NA
 610127 610128 Lxx14170 Lxx14180 trxA   FALSE 0.162 153.000 0.000 NA   NA
 610128 610129 Lxx14180 Lxx14190     FALSE 0.077 195.000 0.000 NA   NA
 610130 610131 Lxx14200 Lxx14210     FALSE 0.546 81.000 0.000 NA   NA
 610131 610132 Lxx14210 Lxx14220     TRUE 0.847 -16.000 0.004 NA   NA
 610132 610133 Lxx14220 Lxx14230     TRUE 0.981 15.000 0.372 1.000   NA
 610133 610134 Lxx14230 Lxx14240   ykoE TRUE 0.988 6.000 0.326 NA   NA
 610134 610135 Lxx14240 Lxx14250 ykoE   FALSE 0.064 213.000 0.000 NA   NA
 610138 1799999 Lxx14275 Lxx14280     FALSE 0.548 76.000 0.000 NA   NA
 1799999 1800000 Lxx14280 Lxx14305   tnp FALSE 0.103 173.000 0.000 NA   NA
 610139 610140 Lxx14310 Lxx14320     FALSE 0.261 131.000 0.000 NA   NA
 610141 610142 Lxx14340 Lxx14350 gatB gatA TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 610142 610143 Lxx14350 Lxx14360 gatA gatC TRUE 0.996 18.000 0.643 0.002 Y NA
 610143 610144 Lxx14360 Lxx14370 gatC   FALSE 0.050 253.000 0.000 NA   NA
 610144 610145 Lxx14370 Lxx14380   ligA FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 610145 610146 Lxx14380 Lxx14390 ligA trmU FALSE 0.521 81.000 0.005 1.000 N NA
 610146 610147 Lxx14390 Lxx14400 trmU   TRUE 0.552 46.000 0.000 NA   NA
 610147 610148 Lxx14400 Lxx14420   nifS TRUE 0.819 13.000 0.000 NA   NA
 610149 610150 Lxx14410 Lxx14430 treX tnp FALSE 0.056 246.000 0.000 1.000   NA
 610150 1800002 Lxx14430 Lxx14435 tnp tnp FALSE 0.020 776.000 0.000 NA   NA
 1800002 610151 Lxx14435 Lxx14450 tnp   FALSE 0.020 754.000 0.000 NA   NA
 610151 610152 Lxx14450 Lxx14445     FALSE 0.018 1223.000 0.000 NA   NA
 610152 1800003 Lxx14445 Lxx14446   pabA TRUE 0.897 -13.000 0.000 NA   NA
 1800004 610153 Lxx14455 Lxx14457     FALSE 0.548 76.000 0.000 NA   NA
 610153 610154 Lxx14457 Lxx14460   uppS FALSE 0.034 361.000 0.000 NA   NA
 610154 610155 Lxx14460 Lxx14470 uppS recO TRUE 0.980 -3.000 0.076 1.000 N NA
 610157 610158 Lxx14490 Lxx14500 leuA lysX FALSE 0.115 166.000 0.013 NA   NA
 610158 610159 Lxx14500 Lxx14510 lysX   TRUE 0.817 153.000 0.647 NA   NA
 610159 610160 Lxx14510 Lxx14520     FALSE 0.403 107.000 0.000 NA   NA
 610160 610161 Lxx14520 Lxx14530     FALSE 0.301 168.000 0.069 1.000   NA
 610161 610162 Lxx14530 Lxx14540     TRUE 0.922 99.000 0.400 1.000 N NA
 610162 610163 Lxx14540 Lxx14550   baeS TRUE 0.999 3.000 1.000 0.014 Y NA
 610163 1800005 Lxx14550 Lxx14560 baeS abfB FALSE 0.020 798.000 0.000 NA   NA
 1800005 610164 Lxx14560 Lxx14580 abfB era FALSE 0.019 943.000 0.000 NA   NA
 610164 610165 Lxx14580 Lxx14590 era tlyC TRUE 0.981 -3.000 0.089 1.000   NA
 610165 610166 Lxx14590 Lxx14600 tlyC ybeY TRUE 0.906 49.000 0.222 NA   NA
 610166 610167 Lxx14600 Lxx14610 ybeY phoH TRUE 0.995 -3.000 0.457 NA   NA
 610167 610168 Lxx14610 Lxx14620 phoH   TRUE 0.945 -13.000 0.032 1.000 N NA
 610168 610169 Lxx14620 Lxx14630     TRUE 0.955 -3.000 0.034 NA   NA
 610169 610170 Lxx14630 Lxx14640   dnaJ TRUE 0.960 2.000 0.058 NA   NA
 610170 610171 Lxx14640 Lxx14650 dnaJ hrcA TRUE 0.778 71.000 0.059 1.000 N NA
 610173 610174 Lxx14670 Lxx14680 hemN   TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610174 610175 Lxx14680 Lxx14690   lepA FALSE 0.082 188.000 0.000 NA   NA
 610176 610177 Lxx14700 Lxx14710   rpsT FALSE 0.450 107.000 0.000 1.000 N NA
 610178 1800006 Lxx14720 Lxx14725   comE FALSE 0.489 90.000 0.000 NA   NA
 1800006 1800007 Lxx14725 Lxx14740 comE   FALSE 0.017 1332.000 0.000 NA   NA
 1800007 1800008 Lxx14740 Lxx14744   ilvE FALSE 0.033 370.000 0.000 NA   NA
 1800008 1800009 Lxx14744 Lxx14748 ilvE tnp FALSE 0.022 633.000 0.000 NA   NA
 1800009 610179 Lxx14748 Lxx14750 tnp   FALSE 0.063 214.000 0.000 NA   NA
 1800011 610180 Lxx14760 Lxx14770   smf FALSE 0.160 154.000 0.000 NA   NA
 610180 610181 Lxx14770 Lxx14780 smf comM FALSE 0.023 467.000 0.003 1.000 N NA
 610181 610182 Lxx14780 Lxx14785 comM   TRUE 0.915 0.000 0.004 0.065 N NA
 610182 610183 Lxx14785 Lxx14800     FALSE 0.297 146.000 0.036 NA   NA
 610183 610184 Lxx14800 Lxx14810   rnhB TRUE 0.930 13.000 0.067 NA   NA
 610184 610185 Lxx14810 Lxx14820 rnhB rplS FALSE 0.173 225.000 0.066 1.000 N NA
 610187 610188 Lxx14850 Lxx14870 trmD   TRUE 0.782 23.000 0.000 1.000 N NA
 610190 610191 Lxx14880 Lxx14890 rimM   TRUE 0.991 2.000 0.324 1.000   NA
 610191 610192 Lxx14890 Lxx14900   rpsP TRUE 0.991 5.000 0.385 1.000   NA
 610193 610194 Lxx14910 Lxx14920     FALSE 0.272 131.000 0.000 1.000   NA
 610194 610195 Lxx14920 Lxx14930   tnp FALSE 0.020 833.000 0.000 1.000   NA
 610195 610196 Lxx14930 Lxx14940 tnp   TRUE 0.884 6.000 0.000 NA   NA
 610197 610198 Lxx14950 Lxx14960 ffh   TRUE 0.562 44.000 0.000 NA   NA
 610198 610199 Lxx14960 Lxx14970   ftsY TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610199 610200 Lxx14970 Lxx14990 ftsY smc TRUE 0.850 97.000 0.165 0.011 N NA
 610202 610203 Lxx15000 Lxx15010 livF   TRUE 0.913 4.000 0.000 0.021   NA
 610203 610204 Lxx15010 Lxx15020     TRUE 0.605 62.000 0.000 0.021   NA
 610204 610205 Lxx15020 Lxx15030     FALSE 0.018 1096.000 0.000 NA   NA
 610205 610206 Lxx15030 Lxx15040   ctaD TRUE 0.883 95.000 0.250 NA   NA
 610206 610207 Lxx15040 Lxx15050 ctaD ctaC TRUE 0.973 84.000 0.284 0.002 Y NA
 610207 610208 Lxx15050 Lxx15060 ctaC   FALSE 0.183 147.000 0.014 NA   NA
 610208 610209 Lxx15060 Lxx15080     FALSE 0.464 79.000 0.005 NA   NA
 610210 610211 Lxx15070 Lxx15090     TRUE 0.928 2.000 0.024 NA   NA
 610212 610213 Lxx15100 Lxx15110 pyrD   TRUE 0.647 27.000 0.004 NA N NA
 610213 610214 Lxx15110 Lxx15120   hisD TRUE 0.604 39.000 0.011 NA N NA
 1800012 610216 Lxx15145 Lxx15160   dnaE FALSE 0.277 127.000 0.000 NA   NA
 610216 610217 Lxx15160 Lxx15170 dnaE rlu FALSE 0.310 128.000 0.014 1.000 N NA
 610217 610218 Lxx15170 Lxx15175 rlu lspA TRUE 0.976 0.000 0.073 1.000 N NA
 610218 610219 Lxx15175 Lxx15190 lspA   TRUE 0.861 71.000 0.119 NA N NA
 610219 610220 Lxx15190 Lxx15200     FALSE 0.524 145.000 0.114 NA   NA
 610220 610221 Lxx15200 Lxx15210     TRUE 0.867 83.000 0.165 NA   NA
 610221 610222 Lxx15210 Lxx15220     TRUE 0.951 88.000 0.581 NA   NA
 610222 610223 Lxx15220 Lxx15230   ftsZ TRUE 0.648 26.000 0.006 NA   NA
 610223 610224 Lxx15230 Lxx15240 ftsZ ftsQ FALSE 0.247 181.000 0.067 NA N NA
 610224 610225 Lxx15240 Lxx15250 ftsQ murC TRUE 0.939 88.000 0.134 NA Y NA
 610225 610226 Lxx15250 Lxx15260 murC murG TRUE 0.972 60.000 0.270 1.000 Y NA
 610226 610227 Lxx15260 Lxx15270 murG ftsW TRUE 0.987 -3.000 0.167 1.000 N NA
 610227 610228 Lxx15270 Lxx15280 ftsW murD TRUE 0.974 -40.000 0.081 0.005 N NA
 610228 610229 Lxx15280 Lxx15290 murD murX TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.007 Y NA
 610229 610230 Lxx15290 Lxx15300 murX murF TRUE 0.993 -3.000 0.071 0.007 Y NA
 610230 610231 Lxx15300 Lxx15310 murF murE TRUE 0.998 1.000 0.367 0.002 Y NA
 610231 610232 Lxx15310 Lxx15320 murE   TRUE 0.994 12.000 0.333 1.000 Y NA
 610232 610233 Lxx15320 Lxx15330     TRUE 0.936 24.000 0.144 NA   NA
 610233 610234 Lxx15330 Lxx15340   mraW TRUE 0.885 12.000 0.028 NA   NA
 610234 610235 Lxx15340 Lxx15350 mraW   TRUE 0.942 104.000 0.635 NA   NA
 610235 610236 Lxx15350 Lxx15360     FALSE 0.036 344.000 0.000 NA   NA
 610239 610240 Lxx15390 Lxx15400   pkaF TRUE 0.584 86.000 0.021 1.000   NA
 610241 610242 Lxx15410 Lxx15420 aro plsC FALSE 0.535 138.000 0.082 1.000 N NA
 610242 610243 Lxx15420 Lxx15430 plsC glkA TRUE 0.905 43.000 0.182 1.000 N NA
 610245 610246 Lxx15450 Lxx15460     TRUE 0.594 51.000 0.000 1.000 N NA
 610246 610247 Lxx15460 Lxx15470   pycA FALSE 0.547 59.000 0.007 1.000 N NA
 610249 610250 Lxx15490 Lxx15500     TRUE 0.930 77.000 0.060 0.004 Y NA
 610250 610251 Lxx15500 Lxx15505     TRUE 0.996 0.000 0.707 NA   NA
 610251 610252 Lxx15505 Lxx15520   pgsA FALSE 0.330 125.000 0.019 NA   NA
 610253 610254 Lxx15530 Lxx15550     TRUE 0.902 -13.000 0.000 1.000   NA
 610257 610258 Lxx15580 Lxx15590 crtEb lctB TRUE 0.990 -3.000 0.217 NA   NA
 610258 610259 Lxx15590 Lxx15600 lctB crtYe TRUE 0.993 -3.000 0.333 NA   NA
 610259 610260 Lxx15600 Lxx15610 crtYe crtI TRUE 0.991 -3.000 0.242 NA   NA
 610260 610261 Lxx15610 Lxx15620 crtI crtB TRUE 0.970 -3.000 0.050 1.000 N NA
 610261 610262 Lxx15620 Lxx15630 crtB crtE TRUE 0.942 -3.000 0.018 1.000 N NA
 610266 610267 Lxx15670 Lxx15680     FALSE 0.093 192.000 0.000 0.052   NA
 1800013 1800014 Lxx15690 Lxx15740     FALSE 0.023 605.000 0.000 NA   NA
 610268 610269 Lxx15760 Lxx15770   proV TRUE 0.997 15.000 0.674 1.000 Y NA
 610269 610270 Lxx15770 Lxx15780 proV   TRUE 0.992 5.000 0.114 NA Y NA
 610270 610271 Lxx15780 Lxx15790     FALSE 0.057 232.000 0.000 NA   NA
 610272 610273 Lxx15800 Lxx15810   tnp FALSE 0.019 887.000 0.000 NA   NA
 610274 610275 Lxx15820 Lxx15830   hisA TRUE 0.985 -16.000 0.215 NA   NA
 610275 610276 Lxx15830 Lxx15840 hisA hisH TRUE 0.985 47.000 0.491 0.005 Y NA
 610276 610277 Lxx15840 Lxx15850 hisH hisB TRUE 0.991 -3.000 0.046 0.005 Y NA
 610277 610278 Lxx15850 Lxx15860 hisB hisC1 TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.005 Y NA
 610278 610279 Lxx15860 Lxx15870 hisC1   FALSE 0.022 717.000 0.000 1.000   NA
 1800015 1800016 Lxx15900 Lxx15930 metE metF TRUE 0.909 -4.000 0.000 NA   NA
 1800016 610283 Lxx15930 Lxx15960 metF hflX FALSE 0.017 1409.000 0.000 NA   NA
 610285 610286 Lxx15970 Lxx15980 dapF miaA TRUE 0.965 3.000 0.062 1.000 N NA
 610286 610287 Lxx15980 Lxx15990 miaA   TRUE 0.671 135.000 0.028 1.000 Y NA
 610287 610288 Lxx15990 Lxx16000     FALSE 0.290 129.000 0.016 1.000   NA
 610288 1800017 Lxx16000 Lxx15995   tnp FALSE 0.024 558.000 0.000 NA   NA
 1800017 610289 Lxx15995 Lxx16020 tnp   FALSE 0.050 256.000 0.000 NA   NA
 610289 610290 Lxx16020 Lxx16030   recA TRUE 0.654 32.000 0.000 NA   NA
 610290 610291 Lxx16030 Lxx16040 recA   FALSE 0.354 118.000 0.017 NA   NA
 610291 610292 Lxx16040 Lxx16050     TRUE 0.881 48.000 0.177 NA   NA
 610292 610293 Lxx16050 Lxx16060     FALSE 0.357 148.000 0.057 NA   NA
 610293 610294 Lxx16060 Lxx16070   pgsA TRUE 0.929 26.000 0.151 NA   NA
 610294 610295 Lxx16070 Lxx16080 pgsA ftsK TRUE 0.697 56.000 0.025 0.046 N NA
 610295 610296 Lxx16080 Lxx16090 ftsK   FALSE 0.090 309.000 0.052 1.000   NA
 610296 1800018 Lxx16090 Lxx16100   dapA FALSE 0.543 69.000 0.000 NA   NA
 610297 610298 Lxx16110 Lxx16130     TRUE 0.678 31.000 0.000 1.000   NA
 610299 610300 Lxx16140 Lxx16160   dapB TRUE 0.632 37.000 0.000 1.000   NA
 610300 610301 Lxx16160 Lxx16170 dapB   FALSE 0.028 557.000 0.000 NA N NA
 610301 610302 Lxx16170 Lxx16180   pepR FALSE 0.485 55.000 0.007 NA   NA
 610305 610306 Lxx16220 Lxx16230 gltA2   FALSE 0.217 191.000 0.064 1.000 N NA
 610306 610307 Lxx16230 Lxx16240     TRUE 0.913 2.000 0.012 1.000 N NA
 610307 610308 Lxx16240 Lxx16250     FALSE 0.516 86.000 0.000 NA   NA
 610309 610310 Lxx16260 Lxx16270     TRUE 0.960 45.000 0.180 NA Y NA
 610310 610311 Lxx16270 Lxx16280     TRUE 0.998 8.000 0.812 NA Y NA
 610312 1800020 Lxx16290 Lxx16300   dppD FALSE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 1800020 1800021 Lxx16300 Lxx16320 dppD dppC TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800021 610313 Lxx16320 Lxx16340 dppC dppB FALSE 0.047 268.000 0.000 NA   NA
 610313 610314 Lxx16340 Lxx16350 dppB dppA TRUE 0.946 64.000 0.088 0.029 Y NA
 610314 610315 Lxx16350 Lxx16360 dppA dppF FALSE 0.038 344.000 0.000 1.000   NA
 610317 610318 Lxx16380 Lxx16390 oppC oppB TRUE 0.984 0.000 0.000 0.029 Y NA
 610318 610319 Lxx16390 Lxx16400 oppB oppA FALSE 0.226 259.000 0.000 0.029 Y NA
 1800022 1800023 Lxx16420 Lxx16430 gcvP gcvH FALSE 0.030 418.000 0.000 NA   NA
 1800023 1800024 Lxx16430 Lxx16440 gcvH gcvT FALSE 0.077 196.000 0.000 NA   NA
 610321 610322 Lxx16460 Lxx16470   fabG5 TRUE 0.562 80.000 0.000 1.000   NA
 610322 610323 Lxx16470 Lxx16480 fabG5   FALSE 0.132 162.000 0.000 NA   NA
 610323 1800025 Lxx16480 Lxx16485     FALSE 0.148 157.000 0.000 NA   NA
 1800025 610324 Lxx16485 Lxx16490   nadA FALSE 0.543 70.000 0.000 NA   NA
 610324 1800026 Lxx16490 Lxx16500 nadA nadB FALSE 0.033 369.000 0.000 NA   NA
 1800026 610325 Lxx16500 Lxx16510 nadB nadC TRUE 0.908 -6.000 0.000 NA   NA
 610325 610326 Lxx16510 Lxx16520 nadC iscS TRUE 0.947 -3.000 0.021 1.000 N NA
 610326 1800027 Lxx16520 Lxx16530 iscS   FALSE 0.545 65.000 0.000 NA   NA
 1800027 610327 Lxx16530 Lxx16560     FALSE 0.412 106.000 0.000 NA   NA
 610327 610328 Lxx16560 Lxx16565   tnp FALSE 0.197 142.000 0.000 NA   NA
 610329 610330 Lxx16580 Lxx16590     TRUE 0.553 61.000 0.000 NA   NA
 610330 610331 Lxx16590 Lxx16600     FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 610331 610332 Lxx16600 Lxx16610     FALSE 0.046 269.000 0.000 NA   NA
 610332 1800028 Lxx16610 Lxx16620     FALSE 0.420 104.000 0.000 NA   NA
 610333 610334 Lxx16640 Lxx16650     FALSE 0.507 95.000 0.000 1.000 N NA
 610334 610335 Lxx16650 Lxx16660     FALSE 0.546 50.000 0.000 NA   NA
 610337 610338 Lxx16680 Lxx16690 fba   TRUE 0.665 31.000 0.000 NA   NA
 1800029 1800030 Lxx16710 Lxx16730     FALSE 0.017 1342.000 0.000 NA   NA
 610341 610342 Lxx16750 Lxx16770 xseA xseB TRUE 0.998 2.000 0.412 0.001 Y NA
 610342 610343 Lxx16770 Lxx16790 xseB cynT FALSE 0.026 650.000 0.000 1.000 N NA
 610343 610344 Lxx16790 Lxx16800 cynT   TRUE 0.825 37.000 0.058 1.000 N NA
 610345 610346 Lxx16820 Lxx16830   phoH FALSE 0.316 123.000 0.000 NA   NA
 610346 610347 Lxx16830 Lxx16840 phoH   FALSE 0.078 212.000 0.000 1.000 N NA
 610347 610348 Lxx16840 Lxx16850   uppS FALSE 0.192 157.000 0.000 0.044 N NA
 610352 610353 Lxx16900 Lxx16910 ilvA   TRUE 0.709 54.000 0.041 NA   NA
 610353 1800031 Lxx16910 Lxx16920     FALSE 0.033 374.000 0.000 NA   NA
 1800031 1800032 Lxx16920 Lxx16930     FALSE 0.025 527.000 0.000 NA   NA
 610354 610355 Lxx16940 Lxx16950   ftsW FALSE 0.017 1599.000 0.000 NA   NA
 610355 610356 Lxx16950 Lxx16960 ftsW   TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 1800033 610357 Lxx16970 Lxx16980 htpX   FALSE 0.077 196.000 0.000 NA   NA
 610360 610361 Lxx17010 Lxx17020   Leu FALSE 0.527 84.000 0.000 NA   NA
 1800034 610362 Lxx17040 Lxx17050   rbsK FALSE 0.023 620.000 0.000 NA   NA
 610362 610363 Lxx17050 Lxx17060 rbsK   TRUE 0.943 35.000 0.250 NA N NA
 610363 610364 Lxx17060 Lxx17070     FALSE 0.314 201.000 0.167 NA   NA
 610364 610365 Lxx17070 Lxx17080     FALSE 0.038 315.000 0.000 NA   NA
 610365 610366 Lxx17080 Lxx17090     FALSE 0.361 200.000 0.200 NA   NA
 610366 610367 Lxx17090 Lxx17100     TRUE 0.983 35.000 0.320 0.029 Y NA
 610367 1800035 Lxx17100 Lxx17110     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800035 610368 Lxx17110 Lxx17130     FALSE 0.299 125.000 0.000 NA   NA
 610370 610371 Lxx17150 Lxx17160     TRUE 0.948 40.000 0.348 1.000   NA
 610371 610372 Lxx17160 Lxx17170     TRUE 0.901 -21.000 0.018 NA   NA
 610372 610373 Lxx17170 Lxx17180     TRUE 0.958 -3.000 0.038 NA   NA
 610373 610374 Lxx17180 Lxx17190     FALSE 0.372 112.000 0.000 NA   NA
 610374 610375 Lxx17190 Lxx17200   eno FALSE 0.201 141.000 0.000 NA   NA
 610377 610378 Lxx17220 Lxx17230 hisS   TRUE 0.558 91.000 0.000 0.095 N NA
 610378 610379 Lxx17230 Lxx17240   fepD TRUE 0.996 5.000 0.286 1.000 Y NA
 610379 610380 Lxx17240 Lxx17250 fepD   FALSE 0.448 161.000 0.000 1.000 Y NA
 610380 610381 Lxx17250 Lxx17260     TRUE 0.557 69.000 0.000 1.000   NA
 610383 610384 Lxx17290 Lxx17300 pth rplY TRUE 0.997 9.000 0.496 0.032 Y NA
 610384 610385 Lxx17300 Lxx17310 rplY   FALSE 0.329 123.000 0.000 1.000   NA
 610385 1800038 Lxx17310 Lxx17320   uxuB TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800038 610386 Lxx17320 Lxx17340 uxuB   TRUE 0.782 18.000 0.000 NA   NA
 610386 610387 Lxx17340 Lxx17360   bplA TRUE 0.843 51.000 0.103 NA   NA
 610388 610389 Lxx17350 Lxx17370 uxaC   FALSE 0.021 742.000 0.000 NA   NA
 610389 610390 Lxx17370 Lxx17380   gnd TRUE 0.548 79.000 0.000 NA   NA
 610390 610391 Lxx17380 Lxx17390 gnd   FALSE 0.326 106.000 0.005 NA   NA
 610392 610393 Lxx17400 Lxx17410   malE TRUE 0.890 6.000 0.000 1.000   NA
 610393 610394 Lxx17410 Lxx17420 malE psrA FALSE 0.226 143.000 0.000 1.000 N NA
 610394 610395 Lxx17420 Lxx17430 psrA glmU TRUE 0.897 1.000 0.005 1.000 N NA
 610395 610396 Lxx17430 Lxx17440 glmU Gln TRUE 0.760 22.000 0.000 NA   NA
 610397 610398 Lxx17450 Lxx17460 marR tagF TRUE 0.581 83.000 0.000 1.000 N NA
 610398 610399 Lxx17460 Lxx17470 tagF   FALSE 0.459 98.000 0.000 1.000   NA
 610400 610401 Lxx17480 Lxx17490 ispE ksgA TRUE 0.784 86.000 0.068 1.000 N NA
 610401 610402 Lxx17490 Lxx17510 ksgA   TRUE 0.939 -3.000 0.018 NA N NA
 610402 610403 Lxx17510 Lxx17520   metG TRUE 0.990 -3.000 0.221 NA N NA
 610403 610404 Lxx17520 Lxx17530 metG   FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 610407 610408 Lxx17590 Lxx17600     FALSE 0.061 229.000 0.000 1.000   NA
 1800040 610409 Lxx17610 Lxx17630   gpoA TRUE 0.579 42.000 0.000 NA   NA
 610409 610410 Lxx17630 Lxx17640 gpoA pabC FALSE 0.034 441.000 0.000 1.000 N NA
 610410 610411 Lxx17640 Lxx17650 pabC   FALSE 0.240 134.000 0.000 NA   NA
 610411 1800041 Lxx17650 Lxx17660   hrpA FALSE 0.548 48.000 0.000 NA   NA
 610412 610413 Lxx17690 Lxx17700 soxA cysM2 TRUE 0.583 77.000 0.000 NA N NA
 610413 610414 Lxx17700 Lxx17710 cysM2   FALSE 0.543 66.000 0.000 NA   NA
 610414 1800042 Lxx17710 Lxx17720     FALSE 0.129 163.000 0.000 NA   NA
 1800042 610415 Lxx17720 Lxx17730     TRUE 0.903 -9.000 0.000 NA   NA
 610415 610416 Lxx17730 Lxx17740     FALSE 0.335 118.000 0.000 NA   NA
 610416 610417 Lxx17740 Lxx17750     FALSE 0.542 82.000 0.000 NA   NA
 610417 1800043 Lxx17750 Lxx17760   sseA FALSE 0.055 241.000 0.000 NA   NA
 1800043 610418 Lxx17760 Lxx17770 sseA nrdB FALSE 0.055 241.000 0.000 NA   NA
 610418 610419 Lxx17770 Lxx17790 nrdB nrdA TRUE 0.832 125.000 0.064 0.001 Y NA
 610420 610421 Lxx17780 Lxx17800     FALSE 0.023 596.000 0.000 NA   NA
 610421 610422 Lxx17800 Lxx17810     FALSE 0.033 408.000 0.000 1.000   NA
 610422 610423 Lxx17810 Lxx17820   pepQ TRUE 0.902 6.000 0.000 1.000 N NA
 610424 610425 Lxx17840 Lxx17850   Arg FALSE 0.082 188.000 0.000 NA   NA
 610425 610426 Lxx17850 Lxx17860 Arg   TRUE 0.551 55.000 0.000 NA   NA
 610426 610427 Lxx17860 Lxx17870     FALSE 0.037 378.000 0.000 NA N NA
 610427 610428 Lxx17870 Lxx17880     FALSE 0.027 571.000 0.000 NA N NA
 610429 610430 Lxx17890 Lxx17900 serC   FALSE 0.182 148.000 0.000 NA   NA
 610431 610432 Lxx17910 Lxx17920   cspB TRUE 0.989 -16.000 0.317 NA   NA
 610433 610434 Lxx17930 Lxx17940     TRUE 0.848 23.000 0.038 NA   NA
 610434 610435 Lxx17940 Lxx17950   xpbC TRUE 0.982 7.000 0.206 NA   NA
 610436 610437 Lxx17960 Lxx17980 ribG folP TRUE 0.971 17.000 0.052 1.000 Y NA
 610438 610439 Lxx17970 Lxx17990 phoP phoR TRUE 0.993 40.000 0.824 1.000 Y NA
 610439 610440 Lxx17990 Lxx18000 phoR   FALSE 0.024 755.000 0.000 1.000 N NA
 610441 610442 Lxx18010 Lxx18020 groEL csp FALSE 0.053 274.000 0.000 1.000 N NA
 610442 610443 Lxx18020 Lxx18030 csp   FALSE 0.107 172.000 0.000 NA   NA
 610443 610444 Lxx18030 Lxx18040     FALSE 0.043 284.000 0.000 NA   NA
 610445 610446 Lxx18050 Lxx18060     TRUE 0.918 -3.000 0.006 1.000 N NA
 610451 610452 Lxx18120 Lxx18130     TRUE 0.998 -3.000 0.455 0.064 Y NA
 610453 610454 Lxx18140 Lxx18150 citM   TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 610455 610456 Lxx18170 Lxx18180 Thr   FALSE 0.548 48.000 0.000 NA   NA
 610457 610458 Lxx18160 Lxx18190 palK   TRUE 0.918 54.000 0.233 0.094   NA
 610460 610461 Lxx18210 Lxx18220     TRUE 0.999 -3.000 0.625 0.013 Y NA
 610462 610463 Lxx18230 Lxx18240   cysS TRUE 0.994 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 610463 610464 Lxx18240 Lxx18250 cysS ispF TRUE 0.842 11.000 0.007 1.000 N NA
 610464 610465 Lxx18250 Lxx18260 ispF   TRUE 0.765 91.000 0.068 1.000 N NA
 610467 610468 Lxx18280 Lxx18290 regX3   TRUE 0.998 -3.000 0.437 1.000 Y NA
 610470 610471 Lxx18310 Lxx18320   gpm FALSE 0.032 378.000 0.000 NA   NA
 610473 610474 Lxx18340 Lxx18350     TRUE 0.900 2.000 0.013 NA   NA
 610474 610475 Lxx18350 Lxx18360     TRUE 0.771 20.000 0.000 NA   NA
 610476 1800044 Lxx18370 Lxx18385 glnR ppk TRUE 0.552 56.000 0.000 NA   NA
 1800044 1800045 Lxx18385 Lxx18400 ppk   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800045 610477 Lxx18400 Lxx18420   pstS FALSE 0.387 109.000 0.000 NA   NA
 610477 610478 Lxx18420 Lxx18430 pstS pstC TRUE 0.979 97.000 0.529 0.003 Y NA
 610478 610479 Lxx18430 Lxx18440 pstC pstA TRUE 0.996 0.000 0.172 0.003 Y NA
 610479 610480 Lxx18440 Lxx18450 pstA pstB TRUE 0.983 42.000 0.373 0.003 Y NA
 610481 610482 Lxx18460 Lxx18470     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 610482 610483 Lxx18470 Lxx18480     FALSE 0.136 161.000 0.000 NA   NA
 610483 610484 Lxx18480 Lxx18490     FALSE 0.062 215.000 0.000 NA   NA
 610486 610487 Lxx18520 Lxx18530     FALSE 0.489 90.000 0.000 NA   NA
 1800046 1800047 Lxx18560 Lxx18580 galT galK TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610492 610493 Lxx18620 Lxx18630   folD TRUE 0.555 45.000 0.000 NA   NA
 610493 610494 Lxx18630 Lxx18640 folD glyA TRUE 0.876 90.000 0.187 1.000 N NA
 610495 610496 Lxx18650 Lxx18660   cpsC FALSE 0.026 709.000 0.000 1.000 N NA
 610497 610498 Lxx18670 Lxx18680     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 610498 610499 Lxx18680 Lxx18690     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 610499 610500 Lxx18690 Lxx18700     FALSE 0.114 169.000 0.000 NA   NA
 610500 610501 Lxx18700 Lxx18710     FALSE 0.036 339.000 0.000 NA   NA
 610504 610505 Lxx18740 Lxx18750     FALSE 0.055 241.000 0.000 NA   NA
 610506 610507 Lxx18760 Lxx18770 tnp copS FALSE 0.073 218.000 0.000 1.000 N NA
 610507 610508 Lxx18770 Lxx18780 copS cutR TRUE 0.997 15.000 0.750 1.000 Y NA
 610509 610510 Lxx18790 Lxx18800     FALSE 0.387 109.000 0.000 NA   NA
 610510 610511 Lxx18800 Lxx18810     FALSE 0.050 258.000 0.000 NA   NA
 610511 610512 Lxx18810 Lxx18820     FALSE 0.023 595.000 0.000 NA   NA
 610512 610513 Lxx18820 Lxx18830     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610514 610515 Lxx18840 Lxx18850 rplT rpmI TRUE 0.995 32.000 0.928 0.019 Y NA
 610515 610516 Lxx18850 Lxx18860 rpmI infC TRUE 0.999 0.000 0.652 1.000 Y NA
 1800049 610517 Lxx18870 Lxx18880     FALSE 0.040 304.000 0.000 NA   NA
 610517 610518 Lxx18880 Lxx18890   ung TRUE 0.735 36.000 0.025 1.000 N NA
 610518 610519 Lxx18890 Lxx18900 ung gpt TRUE 0.890 6.000 0.000 1.000   NA
 610519 610520 Lxx18900 Lxx18910 gpt   FALSE 0.107 172.000 0.000 NA   NA
 610520 610521 Lxx18910 Lxx18920     TRUE 0.665 31.000 0.000 NA   NA
 610521 610522 Lxx18920 Lxx18930   cysD FALSE 0.543 66.000 0.000 NA   NA
 610523 610524 Lxx18940 Lxx18950   metA TRUE 0.667 32.000 0.000 1.000   NA
 610524 610525 Lxx18950 Lxx18960 metA   TRUE 0.826 16.000 0.000 1.000 N NA
 610525 610526 Lxx18960 Lxx18970     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610526 610527 Lxx18970 Lxx18980     TRUE 0.985 36.000 1.000 NA   NA
 1800050 1800051 Lxx18990 Lxx19010     TRUE 0.643 33.000 0.000 NA   NA
 1800051 1800052 Lxx19010 Lxx19040     FALSE 0.545 72.000 0.000 NA   NA
 610528 610529 Lxx19030 Lxx19050     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610530 610531 Lxx19070 Lxx19080     FALSE 0.548 48.000 0.000 NA   NA
 610531 610532 Lxx19080 Lxx19090     TRUE 0.734 24.000 0.000 NA   NA
 610533 610534 Lxx19100 Lxx19110   ubiB TRUE 0.891 9.000 0.000 0.042   NA
 610535 610536 Lxx19120 Lxx19130     TRUE 0.986 38.000 1.000 0.025   NA
 610536 610537 Lxx19130 Lxx19150   guaB FALSE 0.069 229.000 0.000 0.042   NA
 610540 610541 Lxx19180 Lxx19200 aroA   TRUE 0.970 0.000 0.063 1.000   NA
 610541 610542 Lxx19200 Lxx19210   bcp TRUE 0.735 25.000 0.000 1.000   NA
 610543 610544 Lxx19220 Lxx19230 dppF moaD TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 610544 610545 Lxx19230 Lxx19250 moaD dppB FALSE 0.112 578.000 0.000 1.000 Y NA
 610545 1800053 Lxx19250 Lxx19260 dppB   FALSE 0.482 91.000 0.000 NA   NA
 1800053 610546 Lxx19260 Lxx19270     FALSE 0.020 775.000 0.000 NA   NA
 610546 610547 Lxx19270 Lxx19280     FALSE 0.030 421.000 0.000 NA   NA
 610550 610551 Lxx19300 Lxx19310     TRUE 0.917 78.000 0.259 NA   NA
 610551 610552 Lxx19310 Lxx19330   lacC TRUE 0.997 -3.000 0.296 NA Y NA
 610552 610553 Lxx19330 Lxx19340 lacC agaY TRUE 0.994 16.000 0.455 NA Y NA
 610553 610554 Lxx19340 Lxx19350 agaY   TRUE 0.994 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 610554 610555 Lxx19350 Lxx19360   nagA TRUE 0.887 39.000 0.000 1.000 Y NA
 610555 610556 Lxx19360 Lxx19370 nagA   FALSE 0.058 241.000 0.000 1.000   NA
 610556 610557 Lxx19370 Lxx19380     FALSE 0.192 145.000 0.000 NA   NA
 610559 610560 Lxx19400 Lxx19410 purU   TRUE 0.809 14.000 0.000 NA   NA
 610563 610564 Lxx19440 Lxx19450     FALSE 0.053 246.000 0.000 NA   NA
 610564 610565 Lxx19450 Lxx19460     FALSE 0.182 148.000 0.000 NA   NA
 610565 610566 Lxx19460 Lxx19470     TRUE 0.552 46.000 0.000 NA   NA
 610566 610567 Lxx19470 Lxx19480   nagB FALSE 0.047 268.000 0.000 NA   NA
 610567 610568 Lxx19480 Lxx19490 nagB icd FALSE 0.031 522.000 0.000 1.000 N NA
 610569 610570 Lxx19500 Lxx19510 speG   TRUE 0.909 -16.000 0.019 1.000   NA
 610570 610571 Lxx19510 Lxx19520     TRUE 0.580 55.000 0.019 NA   NA
 1800054 610572 Lxx19530 Lxx19540     FALSE 0.065 212.000 0.000 NA   NA
 610572 610573 Lxx19540 Lxx19550     FALSE 0.548 76.000 0.000 NA   NA
 610573 610574 Lxx19550 Lxx19560   narP TRUE 0.960 14.000 0.000 0.011 Y NA
 610574 610575 Lxx19560 Lxx19570 narP   FALSE 0.045 272.000 0.000 NA   NA
 610575 610576 Lxx19570 Lxx19580   tetR TRUE 0.923 51.000 0.286 NA   NA
 610576 610577 Lxx19580 Lxx19582 tetR   FALSE 0.018 1060.000 0.000 NA   NA
 610577 610578 Lxx19582 Lxx19584     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 610578 610579 Lxx19584 Lxx19590   pimB FALSE 0.017 1956.000 0.000 NA   NA
 610579 1800055 Lxx19590 Lxx19610 pimB   FALSE 0.543 70.000 0.000 NA   NA
 1800055 610580 Lxx19610 Lxx19630   ddaH FALSE 0.022 632.000 0.000 NA   NA
 610580 610581 Lxx19630 Lxx19650 ddaH purH FALSE 0.028 583.000 0.000 1.000 N NA
 610581 610582 Lxx19650 Lxx19640 purH purN TRUE 0.997 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 610582 610583 Lxx19640 Lxx19660 purN   TRUE 0.579 42.000 0.000 NA   NA
 610583 610584 Lxx19660 Lxx19690     FALSE 0.017 1404.000 0.000 NA   NA
 610584 610585 Lxx19690 Lxx19700   sucD FALSE 0.403 107.000 0.000 NA   NA
 610585 610586 Lxx19700 Lxx19720 sucD sucC TRUE 0.990 27.000 0.382 0.001 Y NA
 610588 610589 Lxx19740 Lxx19750 uvrD glpQ FALSE 0.087 177.000 0.005 1.000 N NA
 610590 610591 Lxx19760 Lxx19770     TRUE 0.554 59.000 0.000 NA   NA
 610592 610593 Lxx19780 Lxx19790 guaA   FALSE 0.347 113.000 0.013 NA   NA
 610593 610594 Lxx19790 Lxx19800     TRUE 0.982 5.000 0.198 NA   NA
 610594 610595 Lxx19800 Lxx19810   yhaU TRUE 0.715 91.000 0.061 NA   NA
 610595 610596 Lxx19810 Lxx19820 yhaU   TRUE 0.996 4.000 0.286 1.000 Y NA
 610596 610597 Lxx19820 Lxx19830   glpD FALSE 0.212 148.000 0.000 1.000 N NA
 610597 610598 Lxx19830 Lxx19840 glpD guaB TRUE 0.926 36.000 0.038 1.000 Y NA
 610598 610599 Lxx19840 Lxx19850 guaB   TRUE 0.899 3.000 0.000 NA   NA
 610599 610600 Lxx19850 Lxx19860   guaB FALSE 0.152 156.000 0.000 NA   NA
 610604 610605 Lxx19900 Lxx19910   gcp FALSE 0.067 172.000 0.002 NA   NA
 610605 610606 Lxx19910 Lxx19920 gcp   TRUE 0.969 -3.000 0.056 1.000   NA
 610606 610607 Lxx19920 Lxx19930     TRUE 0.836 33.000 0.062 1.000   NA
 610607 610608 Lxx19930 Lxx19940     TRUE 0.980 10.000 0.217 NA   NA
 610608 610609 Lxx19940 Lxx19950   alr TRUE 0.912 9.000 0.028 NA   NA
 610609 610610 Lxx19950 Lxx19960 alr acpS TRUE 0.946 -3.000 0.021 1.000 N NA
 610610 610611 Lxx19960 Lxx19980 acpS glmS TRUE 0.951 6.000 0.048 1.000 N NA
 610612 610613 Lxx19970 Lxx19990 coaA   TRUE 0.563 78.000 0.000 1.000   NA
 610613 610614 Lxx19990 Lxx20000     TRUE 0.606 53.000 0.000 0.014   NA
 610615 610616 Lxx20010 Lxx20020 mrsA rpsI TRUE 0.883 28.000 0.068 1.000 N NA
 610616 610617 Lxx20020 Lxx20030 rpsI rplM TRUE 0.987 51.000 0.601 0.019 Y NA
 610617 610618 Lxx20030 Lxx20040 rplM truA FALSE 0.238 382.000 0.058 1.000 Y NA
 610620 610621 Lxx20060 Lxx20070   rplQ FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 610621 610622 Lxx20070 Lxx20080 rplQ rpoA TRUE 0.980 53.000 0.873 1.000 N NA
 610622 610623 Lxx20080 Lxx20090 rpoA rpsK TRUE 0.957 32.000 0.308 1.000 N NA
 610623 610624 Lxx20090 Lxx20100 rpsK rpsM TRUE 0.995 30.000 0.810 0.019 Y NA
 610624 610625 Lxx20100 Lxx20105 rpsM rpmJ TRUE 0.615 150.000 0.194 0.019   NA
 610625 610626 Lxx20105 Lxx20110 rpmJ infA TRUE 0.918 81.000 0.257 1.000   NA
 610626 610627 Lxx20110 Lxx20120 infA map TRUE 0.550 139.000 0.008 1.000 Y NA
 610627 610628 Lxx20120 Lxx20130 map adk TRUE 0.994 8.000 0.606 1.000 N NA
 610628 610629 Lxx20130 Lxx20140 adk secY TRUE 0.956 6.000 0.057 1.000 N NA
 610629 610630 Lxx20140 Lxx20150 secY rplO TRUE 0.972 81.000 0.730 1.000 N NA
 610630 610631 Lxx20150 Lxx20160 rplO rpmD TRUE 0.999 0.000 0.653 0.003 Y NA
 610631 610632 Lxx20160 Lxx20170 rpmD   TRUE 0.999 0.000 0.789 0.026 Y NA
 610632 610633 Lxx20170 Lxx20180   rplR TRUE 0.995 27.000 0.814 0.026 Y NA
 610633 610634 Lxx20180 Lxx20190 rplR rplF TRUE 0.999 3.000 0.815 0.019 Y NA
 610634 610635 Lxx20190 Lxx20200 rplF rpsH TRUE 0.999 7.000 0.808 0.019 Y NA
 610635 610636 Lxx20200 Lxx20210 rpsH rplE TRUE 0.845 117.000 0.059 0.019 Y NA
 610636 610637 Lxx20210 Lxx20220 rplE rplX TRUE 0.999 0.000 0.758 0.019 Y NA
 610637 610638 Lxx20220 Lxx20230 rplX rplN TRUE 0.999 4.000 0.810 0.026 Y NA
 610638 610639 Lxx20230 Lxx20240 rplN rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.791 0.026 Y NA
 610639 610640 Lxx20240 Lxx20250 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.019 Y NA
 610640 610641 Lxx20250 Lxx20260 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.019 Y NA
 610641 610642 Lxx20260 Lxx20270 rplP rpsC TRUE 0.999 3.000 0.828 0.026 Y NA
 610642 610643 Lxx20270 Lxx20280 rpsC rplV TRUE 0.999 0.000 0.719 0.026 Y NA
 610643 610644 Lxx20280 Lxx20290 rplV rpsS TRUE 0.995 26.000 0.769 0.026 Y NA
 610644 610645 Lxx20290 Lxx20300 rpsS rplB TRUE 0.996 25.000 0.820 0.026 Y NA
 610645 610646 Lxx20300 Lxx20310 rplB rplW TRUE 0.996 25.000 0.849 0.016 Y NA
 610646 610647 Lxx20310 Lxx20320 rplW rplD TRUE 0.998 0.000 0.513 0.019 Y NA
 610647 610648 Lxx20320 Lxx20330 rplD rplC TRUE 0.997 5.000 0.361 0.019 Y NA
 610648 610649 Lxx20330 Lxx20340 rplC rpsJ TRUE 0.995 15.000 0.467 0.026 Y NA
 610649 610650 Lxx20340 Lxx20370 rpsJ   FALSE 0.045 323.000 0.000 1.000 N NA
 610650 610651 Lxx20370 Lxx20375     FALSE 0.545 65.000 0.000 NA   NA
 610651 610652 Lxx20375 Lxx20380     FALSE 0.017 1371.000 0.000 NA   NA
 610652 610653 Lxx20380 Lxx20390   tufA FALSE 0.246 133.000 0.000 NA   NA
 610653 610654 Lxx20390 Lxx20400 tufA fusA TRUE 0.936 133.000 0.400 0.001 Y NA
 610654 610655 Lxx20400 Lxx20410 fusA rpsG TRUE 0.979 97.000 0.579 1.000 Y NA
 610655 610656 Lxx20410 Lxx20420 rpsG rpsL TRUE 0.999 0.000 0.620 0.004 Y NA
 610656 610657 Lxx20420 Lxx20430 rpsL   FALSE 0.034 360.000 0.000 NA   NA
 610657 610658 Lxx20430 Lxx20440     TRUE 0.809 14.000 0.000 NA   NA
 610658 610659 Lxx20440 Lxx20450   mtsC FALSE 0.165 152.000 0.000 NA   NA
 610659 1800056 Lxx20450 Lxx20460 mtsC mtsB TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800056 610660 Lxx20460 Lxx20480 mtsB   FALSE 0.543 66.000 0.000 NA   NA
 610660 1800057 Lxx20480 Lxx20490   psaA FALSE 0.076 197.000 0.000 NA   NA
 1800057 610661 Lxx20490 Lxx20520 psaA   FALSE 0.022 639.000 0.000 NA   NA
 610661 610662 Lxx20520 Lxx20530     FALSE 0.460 95.000 0.000 NA   NA
 610662 610663 Lxx20530 Lxx20540     FALSE 0.482 91.000 0.000 NA   NA
 610663 1800058 Lxx20540 Lxx20560     FALSE 0.112 170.000 0.000 NA   NA
 1800058 610664 Lxx20560 Lxx20580     FALSE 0.027 487.000 0.000 NA   NA
 610664 610665 Lxx20580 Lxx20595   rpmJ FALSE 0.021 693.000 0.000 NA   NA
 610666 1800060 Lxx20610 Lxx20615 tnp tnp FALSE 0.018 1219.000 0.000 NA   NA
 1800060 610667 Lxx20615 Lxx20630 tnp rpoC FALSE 0.020 787.000 0.000 NA   NA
 610667 610668 Lxx20630 Lxx20640 rpoC rpoB TRUE 0.993 48.000 0.851 0.001 Y NA
 610670 610671 Lxx20660 Lxx20670     TRUE 0.983 1.000 0.167 NA   NA
 610671 610672 Lxx20670 Lxx20680     FALSE 0.482 94.000 0.000 1.000   NA
 610672 610673 Lxx20680 Lxx20690     FALSE 0.023 618.000 0.000 NA   NA
 610673 1800061 Lxx20690 Lxx20710     FALSE 0.020 787.000 0.000 NA   NA
 1800061 610674 Lxx20710 Lxx20740     FALSE 0.023 620.000 0.000 NA   NA
 610677 610678 Lxx20780 Lxx20790 rhlE   TRUE 0.554 59.000 0.000 NA   NA
 610680 1800062 Lxx20810 Lxx20820   lhr FALSE 0.546 50.000 0.000 NA   NA
 1800062 610681 Lxx20820 Lxx20840 lhr   TRUE 0.862 10.000 0.000 NA   NA
 610681 610682 Lxx20840 Lxx20850   cpsA FALSE 0.074 212.000 0.000 NA N NA
 610682 610683 Lxx20850 Lxx20860 cpsA   FALSE 0.065 212.000 0.000 NA   NA
 610685 610686 Lxx20880 Lxx20870 bioY menE TRUE 0.985 -3.000 0.144 NA   NA
 610686 610687 Lxx20870 Lxx20900 menE yhfS TRUE 0.995 -7.000 0.576 1.000   NA
 610687 610688 Lxx20900 Lxx20910 yhfS cbiO TRUE 0.980 -3.000 0.071 0.019 N NA
 610688 610689 Lxx20910 Lxx20920 cbiO cbiQ TRUE 0.999 -6.000 0.729 1.000 Y NA
 610689 610690 Lxx20920 Lxx20930 cbiQ   TRUE 0.945 -3.000 0.024 1.000   NA
 610690 610691 Lxx20930 Lxx20940     FALSE 0.098 180.000 0.000 1.000   NA
 610693 610694 Lxx20960 Lxx20970 lytR   FALSE 0.547 75.000 0.000 NA   NA
 610694 610695 Lxx20970 Lxx20980   feoA FALSE 0.175 149.000 0.000 NA   NA
 610695 610696 Lxx20980 Lxx20990 feoA feoB TRUE 0.986 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 610696 610697 Lxx20990 Lxx21000 feoB   FALSE 0.521 93.000 0.000 1.000 N NA
 610698 610699 Lxx21010 Lxx21020     TRUE 0.993 -3.000 0.369 NA   NA
 610700 610701 Lxx21030 Lxx21040     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610701 610702 Lxx21040 Lxx21050     FALSE 0.043 287.000 0.000 NA   NA
 610703 610704 Lxx21060 Lxx21070     FALSE 0.022 675.000 0.000 NA   NA
 610704 610705 Lxx21070 Lxx21080     FALSE 0.068 208.000 0.000 NA   NA
 610705 610706 Lxx21080 Lxx21100   wecB TRUE 0.989 -3.000 0.040 NA Y NA
 610706 610707 Lxx21100 Lxx21090 wecB   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610707 610708 Lxx21090 Lxx21110     FALSE 0.044 281.000 0.000 NA   NA
 610708 1800063 Lxx21110 Lxx21120     FALSE 0.068 207.000 0.000 NA   NA
 610709 610710 Lxx21130 Lxx21140 lepB   FALSE 0.017 2053.000 0.000 1.000   NA
 610711 610712 Lxx21160 Lxx21170 tnp   FALSE 0.445 98.000 0.000 NA   NA
 610713 610714 Lxx21180 Lxx21190 mtgC   TRUE 0.870 10.000 0.014 1.000   NA
 610714 610715 Lxx21190 Lxx21200     FALSE 0.019 936.000 0.000 NA   NA
 610717 610718 Lxx21220 Lxx21230     TRUE 0.737 26.000 0.000 NA N NA
 610718 610719 Lxx21230 Lxx21240     TRUE 0.906 -10.000 0.000 1.000   NA
 610719 610720 Lxx21240 Lxx21250     TRUE 0.911 -7.000 0.000 1.000   NA
 610720 610721 Lxx21250 Lxx21260     FALSE 0.335 118.000 0.000 NA   NA
 610721 610722 Lxx21260 Lxx21270   Ser FALSE 0.017 1664.000 0.000 NA   NA
 610724 610725 Lxx21290 Lxx21300     FALSE 0.152 156.000 0.000 NA   NA
 610725 610726 Lxx21300 Lxx21310   radA FALSE 0.201 141.000 0.000 NA   NA
 610726 610727 Lxx21310 Lxx21320 radA   FALSE 0.500 83.000 0.011 NA   NA
 610727 610728 Lxx21320 Lxx21330     TRUE 0.727 22.000 0.009 NA   NA
 610728 610729 Lxx21330 Lxx21340   clpC FALSE 0.469 102.000 0.014 1.000 N NA
 610729 610730 Lxx21340 Lxx21350 clpC   FALSE 0.240 134.000 0.000 NA   NA
 610730 610731 Lxx21350 Lxx21360   cls FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 610731 1800065 Lxx21360 Lxx21375 cls tnp FALSE 0.022 662.000 0.000 NA   NA
 1800065 610732 Lxx21375 Lxx21380 tnp   FALSE 0.059 225.000 0.000 NA   NA
 610734 610735 Lxx21400 Lxx21410 lysS panC TRUE 0.579 43.000 0.009 1.000 N NA
 610735 610736 Lxx21410 Lxx21420 panC   FALSE 0.465 136.000 0.067 NA   NA
 610736 610737 Lxx21420 Lxx21430     TRUE 0.971 -3.000 0.062 NA   NA
 610737 610738 Lxx21430 Lxx21440     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610738 610739 Lxx21440 Lxx21460   folK FALSE 0.036 337.000 0.000 NA   NA
 610739 610740 Lxx21460 Lxx21470 folK folB TRUE 0.993 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 610740 610741 Lxx21470 Lxx21480 folB folP TRUE 0.997 -16.000 0.471 1.000 Y NA
 610741 610742 Lxx21480 Lxx21490 folP folE TRUE 0.981 -15.000 0.023 1.000 Y NA
 610742 610743 Lxx21490 Lxx21500 folE ftsH TRUE 0.818 12.000 0.006 1.000 N NA
 610743 610744 Lxx21500 Lxx21510 ftsH hpt TRUE 0.884 85.000 0.180 1.000 N NA
 610744 610745 Lxx21510 Lxx21520 hpt   TRUE 0.958 17.000 0.137 0.032 N NA
 610747 610748 Lxx21540 Lxx21550     FALSE 0.545 65.000 0.000 NA   NA
 610749 610750 Lxx21560 Lxx21570 Glu Asp FALSE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 610750 610751 Lxx21570 Lxx21580 Asp Phe TRUE 0.552 56.000 0.000 NA   NA
 610752 610753 Lxx21555 Lxx21590     FALSE 0.059 225.000 0.000 NA   NA
 610753 610754 Lxx21590 Lxx21600   int FALSE 0.028 459.000 0.000 NA   NA
 610754 1800066 Lxx21600 Lxx21610 int   FALSE 0.030 417.000 0.000 NA   NA
 610756 610757 Lxx21640 Lxx21650     TRUE 0.577 67.000 0.000 NA N NA
 610757 610758 Lxx21650 Lxx21660     FALSE 0.516 86.000 0.000 NA   NA
 610758 610759 Lxx21660 Lxx21670     FALSE 0.205 140.000 0.000 NA   NA
 610759 1800067 Lxx21670 Lxx21675     FALSE 0.017 1547.000 0.000 NA   NA
 1800067 610760 Lxx21675 Lxx21680     FALSE 0.024 568.000 0.000 NA   NA
 610761 610762 Lxx21690 Lxx21700     FALSE 0.034 362.000 0.000 NA   NA
 610762 610763 Lxx21700 Lxx21710   asn FALSE 0.050 258.000 0.000 NA   NA
 610765 610766 Lxx21730 Lxx21740     TRUE 0.709 26.000 0.000 NA   NA
 610766 610767 Lxx21740 Lxx21750     FALSE 0.497 95.000 0.019 NA   NA
 610767 1800068 Lxx21750 Lxx21760     FALSE 0.052 251.000 0.000 NA   NA
 1800068 610768 Lxx21760 Lxx21780   tagA TRUE 0.554 59.000 0.000 NA   NA
 610768 610769 Lxx21780 Lxx21790 tagA   TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610772 610773 Lxx21820 Lxx21830 acx2 recQ FALSE 0.082 206.000 0.000 1.000 N NA
 610774 610775 Lxx21840 Lxx21850 ansP   FALSE 0.497 88.000 0.000 NA   NA
 610775 610776 Lxx21850 Lxx21860     TRUE 0.991 4.000 0.375 NA   NA
 610776 610777 Lxx21860 Lxx21870     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 610779 1800069 Lxx21890 Lxx21900     FALSE 0.348 116.000 0.000 NA   NA
 1800069 610780 Lxx21900 Lxx21915     TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 610780 610781 Lxx21915 Lxx21930     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610783 610784 Lxx21960 Lxx21950     TRUE 0.982 0.000 0.105 1.000 N NA
 610784 610785 Lxx21950 Lxx21970   argG FALSE 0.040 363.000 0.000 1.000 N NA
 610788 610789 Lxx22000 Lxx22010 cutS cutR TRUE 0.901 197.000 1.000 1.000 Y NA
 610790 610791 Lxx22020 Lxx22050     FALSE 0.018 1100.000 0.000 NA   NA
 610791 610792 Lxx22050 Lxx22040     TRUE 0.999 6.000 1.000 1.000 Y NA
 610794 610795 Lxx22070 Lxx22090     FALSE 0.022 683.000 0.000 NA   NA
 610798 610799 Lxx22120 Lxx22130     FALSE 0.026 490.000 0.000 NA   NA
 610799 610800 Lxx22130 Lxx22150     FALSE 0.019 1002.000 0.000 NA   NA
 610801 1800070 Lxx22140 Lxx22160 hutH hutU TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 1800070 1800071 Lxx22160 Lxx22190 hutU hutI TRUE 0.916 0.000 0.000 NA   NA
 1800071 610802 Lxx22190 Lxx22210 hutI   FALSE 0.039 314.000 0.000 NA   NA
 610802 610803 Lxx22210 Lxx22220   rbsA TRUE 0.935 141.000 0.600 NA Y NA
 610803 1800072 Lxx22220 Lxx22230 rbsA   TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 1800072 610804 Lxx22230 Lxx22250   rbsC FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 610805 610806 Lxx22255 Lxx22260 rin   TRUE 0.553 61.000 0.000 NA   NA
 610806 610807 Lxx22260 Lxx22270     FALSE 0.017 1660.000 0.000 NA   NA
 610807 1800073 Lxx22270 Lxx22275     FALSE 0.022 650.000 0.000 NA   NA
 1800073 1800074 Lxx22275 Lxx22280     FALSE 0.543 66.000 0.000 NA   NA
 1800074 610808 Lxx22280 Lxx22290   tnp TRUE 0.554 58.000 0.000 NA   NA
 1800075 1800076 Lxx22300 Lxx22320   tnp FALSE 0.022 635.000 0.000 NA   NA
 610809 610810 Lxx22340 Lxx22350   o375 FALSE 0.032 386.000 0.000 NA   NA
 610810 610811 Lxx22350 Lxx22360 o375   FALSE 0.039 306.000 0.000 NA   NA
 610811 610812 Lxx22360 Lxx22370     FALSE 0.492 210.000 0.400 NA   NA
 610813 610814 Lxx22380 Lxx22390   tpase TRUE 0.580 83.000 0.000 0.057   NA
 610815 610816 Lxx22400 Lxx22410 cspA   TRUE 0.929 0.000 0.000 1.000 N NA
 610816 610817 Lxx22410 Lxx22430   tnp FALSE 0.452 100.000 0.000 1.000   NA
 610819 610820 Lxx22450 Lxx22460     FALSE 0.197 146.000 0.000 1.000   NA
 610820 610821 Lxx22460 Lxx22470   dcsA FALSE 0.434 104.000 0.000 1.000   NA
 610822 610823 Lxx22480 Lxx22490     FALSE 0.183 291.000 0.000 1.000 Y NA
 1800078 610824 Lxx22500 Lxx22520     FALSE 0.037 325.000 0.000 NA   NA
 610824 610825 Lxx22520 Lxx22540   tnp FALSE 0.053 246.000 0.000 NA   NA
 610825 1800079 Lxx22540 Lxx22550 tnp   FALSE 0.460 95.000 0.000 NA   NA
 1800079 610826 Lxx22550 Lxx22560   pntA TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610826 610827 Lxx22560 Lxx22570 pntA   TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.001   NA
 610827 610828 Lxx22570 Lxx22580   pntB TRUE 0.994 -3.000 0.321 0.001   NA
 610830 610831 Lxx22600 Lxx22610 aldA adh TRUE 0.811 15.000 0.000 1.000   NA
 610831 610832 Lxx22610 Lxx22620 adh   TRUE 0.854 11.000 0.000 1.000   NA
 610832 610833 Lxx22620 Lxx22630     FALSE 0.021 690.000 0.000 NA   NA
 610834 610835 Lxx22650 Lxx22655     FALSE 0.035 359.000 0.000 NA   NA
 610836 610837 Lxx22660 Lxx22670     TRUE 0.579 42.000 0.000 NA   NA
 610838 610839 Lxx22675 Lxx22677 celA   FALSE 0.021 1049.000 0.000 NA N NA
 610839 610840 Lxx22677 Lxx22678     TRUE 0.998 -3.000 0.429 NA Y NA
 1800080 610841 Lxx22690 Lxx22700 tpase1 tpase1 FALSE 0.024 558.000 0.000 NA   NA
 610841 610842 Lxx22700 Lxx22708 tpase1   FALSE 0.031 475.000 0.000 NA N NA
 610846 610847 Lxx22750 Lxx22760 purM purF FALSE 0.441 436.000 0.248 1.000 Y NA
 610847 610848 Lxx22760 Lxx22770 purF   TRUE 0.760 22.000 0.000 NA   NA
 610848 610849 Lxx22770 Lxx22790     TRUE 0.748 23.000 0.000 NA   NA
 610850 610851 Lxx22780 Lxx22800 purD purC TRUE 0.836 96.000 0.021 0.086 Y NA
 610852 610853 Lxx22810 Lxx22820 albF   TRUE 0.959 30.000 0.333 NA   NA
 610855 1800082 Lxx22840 Lxx22850     FALSE 0.098 176.000 0.000 NA   NA
 610856 610857 Lxx22880 Lxx22890     TRUE 0.830 12.000 0.000 NA   NA
 610858 610859 Lxx22900 Lxx22910   adh FALSE 0.090 183.000 0.000 NA   NA
 610859 610860 Lxx22910 Lxx22920 adh   FALSE 0.229 165.000 0.042 1.000   NA
 610860 1800083 Lxx22920 Lxx22930     FALSE 0.323 121.000 0.000 NA   NA
 610861 610862 Lxx22960 Lxx22970 pur purQ TRUE 0.999 0.000 0.656 0.001 Y NA
 610862 610863 Lxx22970 Lxx22980 purQ   FALSE 0.197 142.000 0.000 NA   NA
 610863 610864 Lxx22980 Lxx22990     TRUE 0.633 35.000 0.000 NA   NA
 610864 610865 Lxx22990 Lxx23000     FALSE 0.546 81.000 0.000 NA   NA
 1800084 1800085 Lxx23010 Lxx23025 bglX   FALSE 0.018 1224.000 0.000 NA   NA
 610866 610867 Lxx23040 Lxx23050   dppA TRUE 0.887 54.000 0.167 1.000 N NA
 610867 1800086 Lxx23050 Lxx23060 dppA dppB TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 1800086 610868 Lxx23060 Lxx23070 dppB dppC FALSE 0.028 451.000 0.000 NA   NA
 610868 1800087 Lxx23070 Lxx23080 dppC oppA TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610869 610870 Lxx23100 Lxx23110     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610871 610872 Lxx23120 Lxx23130     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610872 610873 Lxx23130 Lxx23140   purL TRUE 0.554 58.000 0.000 NA   NA
 610874 610875 Lxx23150 Lxx23160     TRUE 0.548 64.000 0.000 NA   NA
 610875 1800088 Lxx23160 Lxx23170   mrcA TRUE 0.571 43.000 0.000 NA   NA
 1800088 610876 Lxx23170 Lxx23190 mrcA mrc FALSE 0.441 99.000 0.000 NA   NA
 610877 610878 Lxx23180 Lxx23200     TRUE 0.991 8.000 0.462 NA   NA
 610878 610879 Lxx23200 Lxx23210     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 610879 610880 Lxx23210 Lxx23220     TRUE 0.603 39.000 0.000 NA   NA
 610880 610881 Lxx23220 Lxx23240     FALSE 0.039 312.000 0.000 NA   NA
 610882 610883 Lxx23250 Lxx23260 tyrA   TRUE 0.792 18.000 0.000 1.000   NA
 610883 610884 Lxx23260 Lxx23280   phnL TRUE 0.998 -3.000 0.811 0.018   NA
 610887 610888 Lxx23300 Lxx23320     FALSE 0.021 710.000 0.000 NA   NA
 610888 610889 Lxx23320 Lxx23330     TRUE 0.550 47.000 0.000 NA   NA
 610891 1800089 Lxx23350 Lxx23360 nagD   TRUE 0.709 26.000 0.000 NA   NA
 610892 610893 Lxx23380 Lxx23400   pyrE FALSE 0.480 60.000 0.006 NA   NA
 1800090 1800091 Lxx23395 Lxx23410   bglx TRUE 0.885 -144.000 0.000 NA   NA
 1800091 1800092 Lxx23410 Lxx23415 bglx   FALSE 0.543 67.000 0.000 NA   NA
 1800092 610895 Lxx23415 Lxx23430     TRUE 0.890 -27.000 0.000 NA   NA
 610895 610896 Lxx23430 Lxx23450   lacF FALSE 0.084 187.000 0.000 NA   NA
 610896 610897 Lxx23450 Lxx23460 lacF   TRUE 0.553 57.000 0.000 NA   NA
 610897 610898 Lxx23460 Lxx23470     FALSE 0.232 135.000 0.000 NA   NA
 610898 610899 Lxx23470 Lxx23480     FALSE 0.065 216.000 0.000 1.000   NA
 610899 610900 Lxx23480 Lxx23490     FALSE 0.101 178.000 0.000 1.000   NA
 610900 1800093 Lxx23490 Lxx23510     FALSE 0.429 102.000 0.000 NA   NA
 1800093 610901 Lxx23510 Lxx23530     FALSE 0.039 314.000 0.000 NA   NA
 610901 1800094 Lxx23530 Lxx23540     FALSE 0.029 430.000 0.000 NA   NA
 1800094 1800095 Lxx23540 Lxx23560   ugpA FALSE 0.052 251.000 0.000 NA   NA
 1800095 610902 Lxx23560 Lxx23570 ugpA   FALSE 0.042 288.000 0.000 NA   NA
 610903 610904 Lxx23580 Lxx23590 purR   FALSE 0.024 632.000 0.000 1.000   NA
 610905 610906 Lxx23600 Lxx23620 adh2 gntR TRUE 0.870 11.000 0.000 1.000 N NA
 610906 610907 Lxx23620 Lxx23630 gntR clpB FALSE 0.040 371.000 0.000 1.000 N NA
 610907 610908 Lxx23630 Lxx23640 clpB   TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 610908 610909 Lxx23640 Lxx23660   proY FALSE 0.017 1356.000 0.000 NA   NA
 610909 610910 Lxx23660 Lxx23680 proY   FALSE 0.041 360.000 0.000 0.040   NA
 610910 610911 Lxx23680 Lxx23670     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 610911 610912 Lxx23670 Lxx23690     TRUE 0.989 -3.000 0.200 NA   NA
 610912 610913 Lxx23690 Lxx23700     TRUE 0.832 106.000 0.200 NA   NA
 610913 610914 Lxx23700 Lxx23710     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 610914 610915 Lxx23710 Lxx23720   lepB FALSE 0.065 244.000 0.000 1.000 N NA
 610916 610917 Lxx23750 Lxx23760 hspR dnaJ TRUE 0.984 11.000 0.286 1.000 N NA
 610917 610918 Lxx23760 Lxx23770 dnaJ grpE TRUE 0.943 113.000 0.248 0.006 Y NA
 610918 610919 Lxx23770 Lxx23780 grpE dnaK TRUE 0.994 -3.000 0.074 0.006 Y NA
 610920 610921 Lxx23790 Lxx23800     TRUE 0.562 44.000 0.000 NA   NA