MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodobacter sphaeroides 2.4.1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1138444 1138445 RSP_4294 RSP_4324     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1138445 1138446 RSP_4324 RSP_4325     FALSE 0.253 48.000 0.000 NA   NA
 1138446 1138447 RSP_4325 RSP_4295     FALSE 0.020 245.000 0.000 NA   NA
 1138447 1138448 RSP_4295 RSP_4293     FALSE 0.163 100.000 0.000 NA   NA
 1138448 1138449 RSP_4293 RSP_4307     FALSE 0.262 46.000 0.000 NA   NA
 1138451 1138452 RSP_1427 RSP_1428     FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 1138452 1138453 RSP_1428 RSP_1430     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 1138454 1138455 RSP_1432 RSP_1433     FALSE 0.005 411.000 0.000 NA   NA
 1138455 1138456 RSP_1433 RSP_1434     FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1138456 1138457 RSP_1434 RSP_1435     FALSE 0.324 16.000 0.000 1.000 N NA
 1138459 1138460 RSP_1437 RSP_1438     TRUE 0.987 -3.000 0.109 1.000 Y NA
 1138460 1138461 RSP_1438 RSP_1439     TRUE 0.996 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 1138461 1138462 RSP_1439 RSP_1440     TRUE 0.989 -6.000 0.286 1.000 Y NA
 1138463 1138464 RSP_1441 RSP_1442     TRUE 0.839 118.000 0.333 NA Y NA
 1138464 1138465 RSP_1442 RSP_1443     TRUE 0.862 68.000 0.074 0.079 Y NA
 1138465 1138466 RSP_1443 RSP_1444     TRUE 0.992 -3.000 0.074 0.079 Y NA
 1138466 1138467 RSP_1444 RSP_1445     TRUE 0.988 20.000 0.600 0.079 Y NA
 1138467 1138468 RSP_1445 RSP_1446     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA Y NA
 1138468 1138469 RSP_1446 RSP_1447     TRUE 0.866 27.000 0.375 NA N NA
 1138469 1138470 RSP_1447 RSP_1448     FALSE 0.115 55.000 0.000 1.000 N NA
 1138472 1138473 RSP_1450 RSP_1451     FALSE 0.095 73.000 0.000 1.000 N NA
 1138473 1138474 RSP_1451 RSP_1452     TRUE 0.897 79.000 0.163 0.079 Y NA
 1138474 1138475 RSP_1452 RSP_1453     TRUE 0.994 0.000 0.163 0.079 Y NA
 1138475 1138476 RSP_1453 RSP_1454     TRUE 0.989 2.000 0.636 1.000   NA
 1138476 1138477 RSP_1454 RSP_1455     TRUE 0.964 -7.000 0.231 1.000   NA
 1138477 1138478 RSP_1455 RSP_1456     TRUE 0.989 -3.000 0.714 NA N NA
 1138478 1138479 RSP_1456 RSP_1457     TRUE 0.996 -3.000 0.647 NA Y NA
 1138480 1138481 RSP_1458 RSP_6001     FALSE 0.029 225.000 0.000 NA   NA
 1138482 1138483 RSP_1459 RSP_1460     FALSE 0.126 142.000 0.010 NA   NA
 1138483 1138484 RSP_1460 RSP_1461   kdtA TRUE 0.918 12.000 0.198 NA   NA
 1138484 1138485 RSP_1461 RSP_1462 kdtA lpxK TRUE 0.979 0.000 0.046 1.000 Y NA
 1138486 1138487 RSP_1463 RSP_1464     TRUE 0.969 -3.000 0.235 NA N NA
 1138487 1138488 RSP_1464 RSP_1465     TRUE 0.977 -3.000 0.233 NA   NA
 1138489 1138490 RSP_1466 RSP_1467     FALSE 0.480 38.000 0.027 1.000   NA
 1138491 1138492 RSP_1468 RSP_1470   rnhB TRUE 0.693 89.000 0.048 1.000 Y NA
 1138492 1138493 RSP_1470 RSP_1471 rnhB   FALSE 0.074 156.000 0.000 NA   NA
 1138494 1138495 RSP_6002 RSP_1472     TRUE 0.945 -28.000 0.205 NA   NA
 1138497 1138498 RSP_1474 RSP_1475 nspC   TRUE 0.947 37.000 0.444 NA Y NA
 1138499 1138500 RSP_1476 RSP_6210     FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1138500 1138501 RSP_6210 RSP_1478     TRUE 0.760 27.000 0.111 NA   NA
 1138501 1138502 RSP_1478 RSP_1479   OppC TRUE 0.956 2.000 0.115 1.000   NA
 1138502 1138503 RSP_1479 RSP_1480 OppC OppB TRUE 0.998 -7.000 0.870 0.079 Y NA
 1138503 1138504 RSP_1480 RSP_1481 OppB OppA TRUE 0.921 57.000 0.192 0.079 Y NA
 1138504 1138505 RSP_1481 RSP_6240 OppA   FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1138505 1138506 RSP_6240 RSP_6004     TRUE 0.807 1.000 0.000 NA   NA
 1138508 1138509 RSP_1484 RSP_1485     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1138510 1138511 RSP_1486 RSP_1487     FALSE 0.207 67.000 0.000 NA   NA
 1138511 1138512 RSP_1487 RSP_1488     TRUE 0.892 2.000 0.031 NA   NA
 1138512 1138513 RSP_1488 RSP_1489     FALSE 0.110 132.000 0.000 NA   NA
 1138513 1138514 RSP_1489 RSP_1490     TRUE 0.970 4.000 0.222 1.000   NA
 1138514 1138515 RSP_1490 RSP_1491     TRUE 0.966 -3.000 0.148 NA   NA
 1138517 1138518 RSP_1493 RSP_1494     FALSE 0.354 123.000 0.110 1.000 N NA
 1138518 1138519 RSP_1494 RSP_1495     TRUE 0.898 11.000 0.157 1.000 N NA
 1138519 1138520 RSP_1495 RSP_1497     FALSE 0.169 132.000 0.043 1.000 N NA
 1138523 1138524 RSP_1499 RSP_1500     FALSE 0.380 112.000 0.103 1.000 N NA
 1138524 1138525 RSP_1500 RSP_1501     TRUE 0.993 -10.000 0.621 1.000 Y NA
 1138526 1138527 RSP_1502 RSP_1503     FALSE 0.240 52.000 0.000 NA   NA
 1138530 1138531 RSP_1505 RSP_1507     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1138531 1138532 RSP_1507 RSP_4318     FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 1138532 1138533 RSP_4318 RSP_1508     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 1138533 1138534 RSP_1508 RSP_6207     TRUE 0.964 11.000 0.408 NA   NA
 1138534 1138535 RSP_6207 RSP_6208     TRUE 0.708 68.000 0.263 NA   NA
 1138536 1138537 RSP_1509 RSP_1510     TRUE 0.924 -3.000 0.070 1.000 N NA
 1138537 1138538 RSP_1510 RSP_1511     TRUE 0.983 4.000 0.456 NA   NA
 1138538 1138539 RSP_1511 RSP_1512     TRUE 0.960 0.000 0.122 NA   NA
 1138539 1138540 RSP_1512 RSP_1513   trpB FALSE 0.010 308.000 0.000 NA   NA
 1138542 1138543 RSP_1515 RSP_1516     TRUE 0.918 -3.000 0.031 1.000   NA
 1138544 1138545 RSP_1517 RSP_1518 spbA prrA FALSE 0.081 236.000 0.000 0.095   NA
 1138545 1138546 RSP_1518 RSP_1519 prrA prrC TRUE 0.970 -7.000 0.286 1.000   NA
 1138547 1138548 RSP_1520 RSP_1521 prrB   TRUE 0.568 127.000 0.050 0.015   NA
 1138548 1138549 RSP_1521 RSP_1522     FALSE 0.018 284.000 0.003 1.000   NA
 1138549 1138550 RSP_1522 RSP_1523     TRUE 0.885 -7.000 0.047 NA   NA
 1138550 1138551 RSP_1523 RSP_1524     TRUE 0.980 -18.000 0.642 NA   NA
 1138551 1138552 RSP_1524 RSP_1525     TRUE 0.943 -7.000 0.196 1.000 N NA
 1138552 1138553 RSP_1525 RSP_1527     TRUE 0.990 29.000 0.863 0.052 Y NA
 1138553 1138554 RSP_1527 RSP_1529   trxA TRUE 0.673 59.000 0.173 1.000   NA
 1138556 1138557 RSP_1531 RSP_1532     TRUE 0.997 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 1138558 1138559 RSP_1533 RSP_1534     TRUE 0.576 0.000 0.000 NA N NA
 1138559 1138560 RSP_1534 RSP_1535     TRUE 0.927 61.000 0.500 NA Y NA
 1138560 1138561 RSP_1535 RSP_6005     TRUE 0.931 -19.000 0.000 NA Y NA
 1138561 1138562 RSP_6005 RSP_1536     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.046 Y NA
 1138563 1138564 RSP_1537 RSP_1538     FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1138565 1138566 RSP_1539 RSP_1540     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 1138566 1138567 RSP_1540 RSP_1541     TRUE 0.983 -10.000 0.627 1.000   NA
 1138567 1138568 RSP_1541 RSP_1542     TRUE 0.989 -3.000 0.680 1.000 N NA
 1138568 1138569 RSP_1542 RSP_1543     FALSE 0.013 286.000 0.000 NA   NA
 1138569 1138570 RSP_1543 RSP_1544     TRUE 0.988 2.000 0.620 NA   NA
 1138570 1138571 RSP_1544 RSP_1545     TRUE 0.991 0.000 0.713 NA   NA
 1138571 1138572 RSP_1545 RSP_1546   bfr FALSE 0.050 179.000 0.017 1.000 N NA
 1138572 1138573 RSP_1546 RSP_1547 bfr   TRUE 0.798 -10.000 0.013 NA   NA
 1138573 1138574 RSP_1547 RSP_1548     FALSE 0.331 82.000 0.033 NA   NA
 1138574 1138575 RSP_1548 RSP_6006     FALSE 0.428 54.000 0.043 NA   NA
 1138579 1138580 RSP_1552 RSP_1553     FALSE 0.198 117.000 0.013 NA   NA
 1138580 1138581 RSP_1553 RSP_1554     TRUE 0.954 -3.000 0.091 NA   NA
 1138582 1138583 RSP_1555 RSP_1556   puc2B FALSE 0.024 244.000 0.000 1.000   NA
 1138583 1138584 RSP_1556 RSP_6158 puc2B puc2A TRUE 0.898 14.000 0.000 0.003   NA
 1138584 1138585 RSP_6158 RSP_1559 puc2A icd FALSE 0.005 445.000 0.000 1.000   NA
 1138586 1138587 RSP_1558 RSP_1561     TRUE 0.980 -3.000 0.345 1.000 N NA
 1138587 1138588 RSP_1561 RSP_1562     TRUE 0.771 133.000 0.065 0.029 Y NA
 1138588 1138589 RSP_1562 RSP_1563     FALSE 0.131 67.000 0.007 NA N NA
 1138589 1138590 RSP_1563 RSP_1564     FALSE 0.296 53.000 0.007 NA   NA
 1138590 1138591 RSP_1564 RSP_1565   appA FALSE 0.315 92.000 0.034 NA   NA
 1138593 1138594 RSP_1567 RSP_1568     FALSE 0.467 68.000 0.100 1.000 N NA
 1138594 1138595 RSP_1568 RSP_1569     TRUE 0.933 -3.000 0.082 1.000 N NA
 1138595 1138596 RSP_1569 RSP_1570   purK TRUE 0.789 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1138596 1138597 RSP_1570 RSP_1571 purK purE TRUE 0.995 -7.000 0.201 0.001 Y NA
 1138597 1138598 RSP_1571 RSP_6218 purE   FALSE 0.057 236.000 0.044 NA   NA
 1138599 1138600 RSP_1572 RSP_1573     TRUE 0.994 -3.000 0.955 NA   NA
 1138600 1138601 RSP_1573 RSP_1574     FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 1138602 1138603 RSP_1575 RSP_1576 sopT trxB FALSE 0.079 135.000 0.008 1.000 N NA
 1138605 1138606 RSP_1578 RSP_1579     TRUE 0.947 4.000 0.107 NA   NA
 1138606 1138607 RSP_1579 RSP_1580   lgt TRUE 0.970 -3.000 0.170 NA   NA
 1138608 1138609 RSP_1581 RSP_1582     FALSE 0.005 414.000 0.000 NA   NA
 1138609 1138610 RSP_1582 RSP_1583   cheY3 TRUE 0.934 -3.000 0.056 NA   NA
 1138610 1138611 RSP_1583 RSP_1584 cheY3 cheA2 TRUE 0.982 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 1138611 1138612 RSP_1584 RSP_1585 cheA2 cheW2 TRUE 0.999 -3.000 0.808 0.010 Y NA
 1138612 1138613 RSP_1585 RSP_1586 cheW2 cheW3 TRUE 0.864 124.000 0.130 0.010 Y NA
 1138613 1138614 RSP_1586 RSP_1587 cheW3 cheR2 TRUE 0.994 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 1138614 1138615 RSP_1587 RSP_1588 cheR2 cheB1 TRUE 0.996 3.000 0.672 1.000 Y NA
 1138615 1138616 RSP_1588 RSP_1589 cheB1 tlpC TRUE 0.937 -3.000 0.059 NA   NA
 1138616 1138617 RSP_1589 RSP_1591 tlpC   FALSE 0.387 48.000 0.025 NA   NA
 1138618 1138619 RSP_1590 RSP_6007     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA   NA
 1138619 1138620 RSP_6007 RSP_1592   acsA FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 1138620 1138621 RSP_1592 RSP_1593 acsA   FALSE 0.273 137.000 0.018 0.083 N NA
 1138622 1138623 RSP_1594 RSP_1595 cdd   TRUE 0.991 2.000 0.242 1.000 Y NA
 1138623 1138624 RSP_1595 RSP_1596   deoB TRUE 0.991 0.000 0.875 1.000 N NA
 1138624 1138625 RSP_1596 RSP_1597 deoB add TRUE 0.978 -3.000 0.325 1.000 N NA
 1138625 1138626 RSP_1597 RSP_1598 add   TRUE 0.963 -7.000 0.030 1.000 Y NA
 1138626 1138627 RSP_1598 RSP_6008     FALSE 0.313 67.000 0.021 NA   NA
 1138628 1138629 RSP_6009 RSP_1599     TRUE 0.772 81.000 0.407 NA   NA
 1138631 1138632 RSP_1601 RSP_1602     FALSE 0.026 174.000 0.000 1.000 N NA
 1138632 1138633 RSP_1602 RSP_1604     TRUE 0.972 25.000 0.571 NA Y NA
 1138633 1138634 RSP_1604 RSP_1605     TRUE 0.897 70.000 0.364 NA Y NA
 1138634 1138635 RSP_1605 RSP_1606     TRUE 0.746 24.000 0.130 1.000 N NA
 1138635 1138636 RSP_1606 RSP_1607     TRUE 0.867 113.000 0.087 0.006 Y NA
 1138637 1138638 RSP_1608 RSP_1609     TRUE 0.971 -7.000 0.147 0.046 N NA
 1138638 1138639 RSP_1609 RSP_1610     TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 1138639 1138640 RSP_1610 RSP_1611     FALSE 0.426 77.000 0.091 1.000 N NA
 1138640 1138641 RSP_1611 RSP_1612     TRUE 0.991 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 1138641 1138642 RSP_1612 RSP_1613     FALSE 0.036 211.000 0.000 NA   NA
 1138642 1138643 RSP_1613 RSP_1614     TRUE 0.787 104.000 0.588 NA   NA
 1138643 1138644 RSP_1614 RSP_1615     TRUE 0.986 -3.000 0.433 NA   NA
 1138645 1138646 RSP_1616 RSP_4302     FALSE 0.035 213.000 0.000 NA   NA
 1138646 1138647 RSP_4302 RSP_1618     FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1138650 1138651 RSP_1620 RSP_1621     FALSE 0.023 238.000 0.000 NA   NA
 1138651 1138652 RSP_1621 RSP_1623     TRUE 0.949 -6.000 0.146 NA   NA
 1138653 1138654 RSP_1622 RSP_1624     TRUE 0.880 22.000 0.231 1.000   NA
 1138654 1138655 RSP_1624 RSP_1625     FALSE 0.034 214.000 0.000 NA   NA
 1138655 1138656 RSP_1625 RSP_1626     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1138656 1138657 RSP_1626 RSP_1627     FALSE 0.264 54.000 0.000 1.000   NA
 1138658 1138659 RSP_1628 RSP_1629     TRUE 0.895 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1138660 1138661 RSP_1630 RSP_1631     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1138661 1138662 RSP_1631 RSP_1632     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1138662 1138663 RSP_1632 RSP_1633     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138663 1138664 RSP_1633 RSP_1635     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1138664 1138665 RSP_1635 RSP_1636     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138665 1138666 RSP_1636 RSP_1637     FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 1138666 1138667 RSP_1637 RSP_1638     FALSE 0.186 84.000 0.000 NA   NA
 1138667 1138668 RSP_1638 RSP_1639     TRUE 0.988 3.000 0.625 NA   NA
 1138668 1138669 RSP_1639 RSP_6012     TRUE 0.893 10.000 0.077 NA   NA
 1138669 1138670 RSP_6012 RSP_6013     TRUE 0.896 4.000 0.038 NA   NA
 1138670 1138671 RSP_6013 RSP_1640     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 1138671 1138672 RSP_1640 RSP_1641     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138672 1138673 RSP_1641 RSP_1643     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138673 1138674 RSP_1643 RSP_1644     TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1138674 1138675 RSP_1644 RSP_1645     FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 1138677 1138678 RSP_1647 RSP_1648     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138678 1138679 RSP_1648 RSP_1649     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 1138679 1138680 RSP_1649 RSP_1650     FALSE 0.009 319.000 0.000 NA   NA
 1138680 1138681 RSP_1650 RSP_1651     TRUE 0.959 -13.000 0.264 NA   NA
 1138681 1138682 RSP_1651 RSP_1652     FALSE 0.110 265.000 0.208 NA   NA
 1138682 1138683 RSP_1652 RSP_1653     FALSE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 1138683 1138684 RSP_1653 RSP_1654     FALSE 0.212 65.000 0.000 NA   NA
 1138684 1138685 RSP_1654 RSP_6014     FALSE 0.037 209.000 0.000 NA   NA
 1138685 1138686 RSP_6014 RSP_1655     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1138687 1138688 RSP_6209 RSP_1656     FALSE 0.013 285.000 0.000 NA   NA
 1138688 1138689 RSP_1656 RSP_1657     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138689 1138690 RSP_1657 RSP_1658     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138690 1138691 RSP_1658 RSP_1659     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138691 1138692 RSP_1659 RSP_1660     FALSE 0.130 123.000 0.000 NA   NA
 1138692 1138693 RSP_1660 RSP_1661     FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 1138693 1138694 RSP_1661 RSP_6015     FALSE 0.192 76.000 0.000 NA   NA
 1138694 1138695 RSP_6015 RSP_1662     TRUE 0.646 12.000 0.000 1.000   NA
 1138698 1138699 RSP_1664 RSP_1665     TRUE 0.966 -3.000 0.146 NA   NA
 1138699 1138700 RSP_1665 RSP_1666   LytB TRUE 0.831 11.000 0.076 1.000 N NA
 1138700 1138701 RSP_1666 RSP_1667 LytB   FALSE 0.274 151.000 0.091 NA   NA
 1138702 1138703 RSP_1668 RSP_1669 FolK rpoZ FALSE 0.293 85.000 0.049 1.000 N NA
 1138703 1138704 RSP_1669 RSP_1670 rpoZ spoT/relA TRUE 0.944 31.000 0.291 1.000 Y NA
 1138704 1138705 RSP_1670 RSP_1671 spoT/relA   TRUE 0.806 17.000 0.086 NA   NA
 1138705 1138706 RSP_1671 RSP_1672   pdxJ FALSE 0.548 37.000 0.050 NA   NA
 1138706 1138707 RSP_1672 RSP_1673 pdxJ   TRUE 0.833 32.000 0.326 1.000 N NA
 1138707 1138708 RSP_1673 RSP_1674     TRUE 0.675 21.000 0.070 1.000 N NA
 1138708 1138709 RSP_1674 RSP_1675   rnc TRUE 0.915 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1138709 1138710 RSP_1675 RSP_1676 rnc era TRUE 0.973 -7.000 0.098 0.050   NA
 1138710 1138711 RSP_1676 RSP_1677 era   TRUE 0.847 22.000 0.182 NA   NA
 1138711 1138712 RSP_1677 RSP_1678     FALSE 0.430 37.000 0.020 NA   NA
 1138713 1138714 RSP_1679 RSP_1680   pckA FALSE 0.001 736.000 0.000 1.000 N NA
 1138715 1138716 RSP_1681 RSP_1682     TRUE 0.982 23.000 0.829 1.000 Y NA
 1138716 1138717 RSP_1682 RSP_1683     TRUE 0.993 -3.000 0.304 0.012   NA
 1138717 1138718 RSP_1683 RSP_1684     TRUE 0.852 22.000 0.194 NA   NA
 1138718 1138719 RSP_1684 RSP_1685     TRUE 0.970 -3.000 0.171 NA   NA
 1138719 1138720 RSP_1685 RSP_1686     TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1138720 1138721 RSP_1686 RSP_1688     FALSE 0.041 144.000 0.000 1.000 N NA
 1138724 1138725 RSP_1690 RSP_1691 etfA etfB TRUE 0.998 0.000 0.452 0.020 Y NA
 1138725 1138726 RSP_1691 RSP_1692 etfB pduO FALSE 0.224 131.000 0.030 1.000   NA
 1138726 1138727 RSP_1692 RSP_6016 pduO   TRUE 0.966 0.000 0.156 NA   NA
 1138727 1138728 RSP_6016 RSP_1694     FALSE 0.356 168.000 0.231 NA   NA
 1138728 1138729 RSP_1694 RSP_1695     FALSE 0.011 301.000 0.000 NA   NA
 1138730 1138731 RSP_1696 RSP_1697     FALSE 0.180 129.000 0.017 NA   NA
 1138731 1138732 RSP_1697 RSP_1707   tufA FALSE 0.235 101.000 0.016 NA   NA
 1138732 1138733 RSP_1707 RSP_1706 tufA   FALSE 0.080 168.000 0.002 1.000   NA
 1138733 1138734 RSP_1706 RSP_4298     FALSE 0.193 75.000 0.000 NA   NA
 1138734 1138735 RSP_4298 RSP_1705     FALSE 0.172 93.000 0.000 NA   NA
 1138735 1138736 RSP_1705 RSP_1704     TRUE 0.620 163.000 0.843 1.000 N NA
 1138736 1138737 RSP_1704 RSP_1703   rplK TRUE 0.795 93.000 0.681 1.000 N NA
 1138737 1138738 RSP_1703 RSP_1702 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.020 Y NA
 1138738 1138739 RSP_1702 RSP_1701 rplA rplJ TRUE 0.614 239.000 0.302 0.020 Y NA
 1138739 1138740 RSP_1701 RSP_1700 rplJ rplL TRUE 0.979 70.000 0.884 0.015 Y NA
 1138740 1138741 RSP_1700 RSP_1699 rplL rpoB FALSE 0.154 245.000 0.223 1.000   NA
 1138741 1138742 RSP_1699 RSP_1712 rpoB rpoC TRUE 0.956 82.000 0.851 0.001   NA
 1138742 1138743 RSP_1712 RSP_1711 rpoC   FALSE 0.059 192.000 0.006 NA   NA
 1138743 1138744 RSP_1711 RSP_1710   rpsL FALSE 0.035 213.000 0.000 NA   NA
 1138744 1138745 RSP_1710 RSP_1709 rpsL rpsG TRUE 0.995 13.000 0.620 0.003 Y NA
 1138745 1138746 RSP_1709 RSP_1708 rpsG fusA1 TRUE 0.919 25.000 0.114 1.000 Y NA
 1138746 1138747 RSP_1708 RSP_1714 fusA1 tufA TRUE 0.923 75.000 0.102 0.001 Y NA
 1138747 1138748 RSP_1714 RSP_1715 tufA rpsJ TRUE 0.888 73.000 0.318 1.000 Y NA
 1138748 1138749 RSP_1715 RSP_1716 rpsJ rplC TRUE 0.989 14.000 0.307 0.020 Y NA
 1138749 1138750 RSP_1716 RSP_1717 rplC rplD TRUE 0.996 -10.000 0.486 0.015 Y NA
 1138750 1138751 RSP_1717 RSP_1718 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.015 Y NA
 1138751 1138752 RSP_1718 RSP_1719 rplW rplB TRUE 0.963 123.000 0.849 0.014 Y NA
 1138752 1138753 RSP_1719 RSP_1720 rplB rpsS TRUE 0.998 4.000 0.820 0.020 Y NA
 1138753 1138754 RSP_1720 RSP_1721 rpsS rplV TRUE 0.993 4.000 0.119 0.020 Y NA
 1138754 1138755 RSP_1721 RSP_1722 rplV rpsC TRUE 0.994 0.000 0.109 0.020 Y NA
 1138755 1138756 RSP_1722 RSP_1723 rpsC rplP TRUE 0.995 15.000 0.828 0.020 Y NA
 1138756 1138757 RSP_1723 RSP_1724 rplP rpmC TRUE 0.783 240.000 0.802 0.015 Y NA
 1138757 1138758 RSP_1724 RSP_6017 rpmC rpsQ TRUE 0.995 14.000 0.828 0.015 Y NA
 1138758 1138759 RSP_6017 RSP_1725 rpsQ rplN TRUE 0.974 74.000 0.791 0.020 Y NA
 1138759 1138760 RSP_1725 RSP_1726 rplN rplX TRUE 0.999 0.000 0.810 0.020 Y NA
 1138760 1138761 RSP_1726 RSP_1727 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.015 Y NA
 1138761 1138762 RSP_1727 RSP_1728 rplE rpsN TRUE 0.985 20.000 0.309 0.015 Y NA
 1138762 1138763 RSP_1728 RSP_1729 rpsN rpsH TRUE 0.990 13.000 0.295 0.015 Y NA
 1138763 1138764 RSP_1729 RSP_1730 rpsH rplF TRUE 0.997 11.000 0.808 0.015 Y NA
 1138764 1138765 RSP_1730 RSP_1731 rplF rplR TRUE 0.996 12.000 0.815 0.015 Y NA
 1138765 1138766 RSP_1731 RSP_1732 rplR rpsE TRUE 0.996 12.000 0.814 0.020 Y NA
 1138766 1138767 RSP_1732 RSP_1733 rpsE rpmD TRUE 0.995 13.000 0.789 0.020 Y NA
 1138767 1138768 RSP_1733 RSP_1734 rpmD rplO TRUE 0.929 157.000 0.653 0.002 Y NA
 1138768 1138769 RSP_1734 RSP_1735 rplO secY TRUE 0.793 101.000 0.730 1.000 N NA
 1138769 1138770 RSP_1735 RSP_1736 secY adk TRUE 0.682 11.000 0.026 1.000 N NA
 1138770 1138771 RSP_1736 RSP_1737 adk rpsM FALSE 0.041 175.000 0.007 1.000 N NA
 1138771 1138772 RSP_1737 RSP_1738 rpsM rpsK TRUE 0.995 14.000 0.810 0.015 Y NA
 1138772 1138773 RSP_1738 RSP_1739 rpsK rpoA TRUE 0.593 116.000 0.308 1.000 N NA
 1138773 1138774 RSP_1739 RSP_1740 rpoA rplQ TRUE 0.823 101.000 0.873 1.000 N NA
 1138774 1138775 RSP_1740 RSP_1741 rplQ   FALSE 0.007 259.000 0.000 1.000 N NA
 1138775 1138776 RSP_1741 RSP_1742     FALSE 0.227 56.000 0.019 1.000 N NA
 1138776 1138777 RSP_1742 RSP_1743     FALSE 0.446 39.000 0.051 1.000 N NA
 1138777 1138778 RSP_1743 RSP_1744     FALSE 0.308 32.000 0.019 NA N NA
 1138778 1138779 RSP_1744 RSP_1745     TRUE 0.903 -3.000 0.059 NA N NA
 1138779 1138780 RSP_1745 RSP_1746     TRUE 0.813 0.000 0.024 NA N NA
 1138780 1138781 RSP_1746 RSP_1747   bztA FALSE 0.044 227.000 0.048 NA N NA
 1138781 1138782 RSP_1747 RSP_1748 bztA bztB TRUE 0.793 149.000 0.202 0.077 Y NA
 1138782 1138783 RSP_1748 RSP_1749 bztB bztC TRUE 0.999 2.000 0.815 0.011 Y NA
 1138783 1138784 RSP_1749 RSP_1750 bztC bztD TRUE 0.989 13.000 0.734 1.000 Y NA
 1138784 1138785 RSP_1750 RSP_1751 bztD   FALSE 0.016 210.000 0.000 1.000 N NA
 1138785 1138786 RSP_1751 RSP_1752     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 1138786 1138787 RSP_1752 RSP_1753     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 1138787 1138788 RSP_1753 RSP_1754     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 1138790 1138791 RSP_1756 RSP_1757 panB panC TRUE 0.998 0.000 0.395 0.001 Y NA
 1138793 1138794 RSP_1759 RSP_1760     TRUE 0.975 8.000 0.411 NA   NA
 1138795 1138796 RSP_1761 RSP_1762 pheT   FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 1138796 1138797 RSP_1762 RSP_1763   pheS FALSE 0.361 34.000 0.002 NA   NA
 1138797 1138798 RSP_1763 RSP_1764 pheS rplT FALSE 0.202 205.000 0.000 1.000 Y NA
 1138798 1138799 RSP_1764 RSP_1765 rplT rpmI TRUE 0.958 13.000 0.000 0.015 Y NA
 1138799 1138800 RSP_1765 RSP_1766 rpmI pykA FALSE 0.090 116.000 0.003 1.000 N NA
 1138802 1138803 RSP_1768 RSP_1769     TRUE 0.981 3.000 0.233 0.081 N NA
 1138803 1138804 RSP_1769 RSP_1770     TRUE 0.688 111.000 0.344 NA   NA
 1138807 1138808 RSP_1772 RSP_1773 accA   TRUE 0.740 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1138808 1138809 RSP_1773 RSP_1774     FALSE 0.043 139.000 0.000 1.000 N NA
 1138810 1138811 RSP_1775 RSP_1776   greA TRUE 0.829 11.000 0.048 NA   NA
 1138812 1138813 RSP_1777 RSP_1778     FALSE 0.009 524.000 0.091 1.000 N NA
 1138813 1138814 RSP_1778 RSP_1779   ispE TRUE 0.913 -7.000 0.107 1.000 N NA
 1138814 1138815 RSP_1779 RSP_1780 ispE   FALSE 0.091 142.000 0.000 NA   NA
 1138816 1138817 RSP_1781 RSP_1782     TRUE 0.980 -7.000 0.488 NA   NA
 1138819 1138820 RSP_1784 RSP_1785     FALSE 0.022 373.000 0.000 0.092   NA
 1138821 1138822 RSP_1786 RSP_1787 fruB fruK TRUE 0.991 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 1138822 1138823 RSP_1787 RSP_1788 fruK fruA TRUE 0.996 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 1138824 1138825 RSP_1789 RSP_1790     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1138829 1138830 RSP_1795 RSP_1796 serS sodC FALSE 0.096 107.000 0.003 1.000 N NA
 1138831 1138832 RSP_1797 RSP_1798 YajC SecD TRUE 0.941 16.000 0.099 NA Y NA
 1138832 1138833 RSP_1798 RSP_1799 SecD secF TRUE 0.995 10.000 0.244 0.001 Y NA
 1138833 1138834 RSP_1799 RSP_1800 secF   FALSE 0.143 176.000 0.052 NA   NA
 1138834 1138835 RSP_1800 RSP_1801   ccmA FALSE 0.509 68.000 0.085 NA   NA
 1138835 1138836 RSP_1801 RSP_1802 ccmA ccmB TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 1138836 1138837 RSP_1802 RSP_1803 ccmB ccmC TRUE 0.980 49.000 0.501 0.001 Y NA
 1138837 1138838 RSP_1803 RSP_1804 ccmC ccmD TRUE 0.989 -3.000 0.501 1.000   NA
 1138838 1138839 RSP_1804 RSP_1805 ccmD ccmG TRUE 0.939 -7.000 0.108 1.000   NA
 1138842 1138843 RSP_6019 RSP_1808   trpS TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138845 1138846 RSP_1810 RSP_1811 mviN glnD TRUE 0.953 -3.000 0.081 1.000   NA
 1138846 1138847 RSP_1811 RSP_1812 glnD   TRUE 0.773 -16.000 0.043 NA N NA
 1138848 1138849 RSP_1813 RSP_1814     TRUE 0.971 -3.000 0.165 1.000   NA
 1138849 1138850 RSP_1814 RSP_1815   gshB FALSE 0.416 53.000 0.064 1.000 N NA
 1138851 1138852 RSP_1816 RSP_1817     FALSE 0.178 89.000 0.000 NA   NA
 1138852 1138853 RSP_1817 RSP_1818   feoB TRUE 0.979 7.000 0.455 NA   NA
 1138853 1138854 RSP_1818 RSP_1819 feoB feoA1 TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 1138854 1138855 RSP_1819 RSP_6020 feoA1 feoA2 TRUE 0.987 7.000 0.049 0.017 Y NA
 1138855 1138856 RSP_6020 RSP_1820 feoA2   FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000   NA
 1138856 1138857 RSP_1820 RSP_1821     FALSE 0.238 184.000 0.143 1.000   NA
 1138862 1138863 RSP_1826 RSP_1827 coxII cox10 TRUE 0.605 71.000 0.064 0.065 N NA
 1138863 1138864 RSP_1827 RSP_6021 cox10   TRUE 0.925 2.000 0.059 NA   NA
 1138864 1138865 RSP_6021 RSP_1828   cox11 TRUE 0.950 -3.000 0.083 NA   NA
 1138865 1138866 RSP_1828 RSP_1829 cox11 coxIII TRUE 0.902 28.000 0.536 1.000 N NA
 1138866 1138867 RSP_1829 RSP_1830 coxIII surf-1 FALSE 0.161 201.000 0.096 NA   NA
 1138867 1138868 RSP_1830 RSP_1831 surf-1 thrC TRUE 0.787 12.000 0.040 NA   NA
 1138868 1138869 RSP_1831 RSP_1832 thrC   TRUE 0.965 -3.000 0.129 1.000   NA
 1138869 1138870 RSP_1832 RSP_1833     TRUE 0.991 0.000 0.674 1.000   NA
 1138870 1138871 RSP_1833 RSP_1834     FALSE 0.022 335.000 0.049 NA   NA
 1138871 1138872 RSP_1834 RSP_1835     TRUE 0.645 33.000 0.070 NA   NA
 1138873 1138874 RSP_1836 RSP_1837 apt   TRUE 0.989 5.000 0.026 0.004 Y NA
 1138874 1138875 RSP_1837 RSP_1838     FALSE 0.016 305.000 0.005 1.000   NA
 1138876 1138877 RSP_1839 RSP_1840     FALSE 0.224 219.000 0.237 NA   NA
 1138878 1138879 RSP_1841 RSP_1842     TRUE 0.858 12.000 0.082 NA   NA
 1138879 1138880 RSP_1842 RSP_1843   ftsY FALSE 0.199 116.000 0.013 NA   NA
 1138882 1138883 RSP_1845 RSP_1846 xseA   FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 1138886 1138887 RSP_1849 RSP_1850   ptsI TRUE 0.631 25.000 0.069 1.000 N NA
 1138887 1138888 RSP_1850 RSP_1851 ptsI metZ FALSE 0.053 159.000 0.007 1.000 N NA
 1138888 1138889 RSP_1851 RSP_1852 metZ   FALSE 0.421 96.000 0.065 1.000   NA
 1138889 1138890 RSP_1852 RSP_1853   TrkH2 FALSE 0.276 51.000 0.000 1.000   NA
 1138890 1138891 RSP_1853 RSP_1854 TrkH2 trkH3 TRUE 0.887 43.000 0.000 0.003 Y NA
 1138893 1138894 RSP_1856 RSP_1857 glyQ   TRUE 0.921 -3.000 0.041 NA   NA
 1138894 1138895 RSP_1857 RSP_1858   glyS TRUE 0.879 4.000 0.028 NA   NA
 1138895 1138896 RSP_1858 RSP_1859 glyS ppdK FALSE 0.169 119.000 0.030 1.000 N NA
 1138896 1138897 RSP_1859 RSP_1860 ppdK   FALSE 0.360 218.000 0.630 1.000 N NA
 1138897 1138898 RSP_1860 RSP_1861     TRUE 0.800 100.000 0.750 1.000 N NA
 1138898 1138899 RSP_1861 RSP_1862     TRUE 0.768 46.000 0.036 1.000 Y NA
 1138899 1138900 RSP_1862 RSP_1863     TRUE 0.973 -3.000 0.260 1.000 N NA
 1138900 1138901 RSP_1863 RSP_1864     FALSE 0.188 99.000 0.003 NA   NA
 1138903 1138904 RSP_1866 RSP_1867     TRUE 0.999 -3.000 0.964 0.022 Y NA
 1138904 1138905 RSP_1867 RSP_1868     FALSE 0.161 178.000 0.098 1.000 N NA
 1138906 1138907 RSP_1869 RSP_6022     FALSE 0.353 52.000 0.021 NA   NA
 1138907 1138908 RSP_6022 RSP_1870     FALSE 0.240 81.000 0.007 NA   NA
 1138910 1138911 RSP_1872 RSP_1873     FALSE 0.041 234.000 0.020 NA   NA
 1138911 1138912 RSP_1873 RSP_1874   carA FALSE 0.188 82.000 0.000 NA   NA
 1138914 1138915 RSP_1876 RSP_1877   coxI TRUE 0.740 14.000 0.036 NA   NA
 1138915 1138916 RSP_1877 RSP_1878 coxI lipB FALSE 0.003 415.000 0.003 1.000 N NA
 1138917 1138918 RSP_1880 RSP_4338     FALSE 0.133 122.000 0.000 NA   NA
 1138918 1138919 RSP_4338 RSP_1882     FALSE 0.012 290.000 0.000 NA   NA
 1138919 1138920 RSP_1882 RSP_1883     TRUE 0.827 55.000 0.108 1.000 Y NA
 1138920 1138921 RSP_1883 RSP_1884     TRUE 0.864 52.000 0.048 0.076 Y NA
 1138921 1138922 RSP_1884 RSP_1886     TRUE 0.943 79.000 0.386 0.076 Y NA
 1138922 1138923 RSP_1886 RSP_1887     FALSE 0.030 180.000 0.002 1.000 N NA
 1138923 1138924 RSP_1887 RSP_1888     FALSE 0.272 75.000 0.008 1.000   NA
 1138925 1138926 RSP_1889 RSP_6024     FALSE 0.431 131.000 0.149 NA   NA
 1138929 1138930 RSP_1892 RSP_1893     TRUE 0.645 89.000 0.294 1.000 N NA
 1138930 1138931 RSP_1893 RSP_1894     FALSE 0.005 439.000 0.000 1.000   NA
 1138931 1138932 RSP_1894 RSP_1895     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 1138934 1138935 RSP_1897 RSP_1898 mgtE   TRUE 0.849 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1138936 1138937 RSP_1899 RSP_1900     TRUE 0.950 16.000 0.467 1.000   NA
 1138937 1138938 RSP_1900 RSP_1901     TRUE 0.990 3.000 0.733 1.000   NA
 1138938 1138939 RSP_1901 RSP_1902     TRUE 0.901 38.000 0.200 0.011   NA
 1138939 1138940 RSP_1902 RSP_1903     TRUE 0.963 7.000 0.220 1.000   NA
 1138940 1138941 RSP_1903 RSP_1904     TRUE 0.999 4.000 0.838 0.009 Y NA
 1138941 1138942 RSP_1904 RSP_1905     TRUE 0.996 8.000 0.968 1.000 Y NA
 1138942 1138943 RSP_1905 RSP_1907     TRUE 0.984 21.000 0.833 1.000 Y NA
 1138943 1138944 RSP_1907 RSP_1908     FALSE 0.032 347.000 0.149 1.000 N NA
 1138944 1138945 RSP_1908 RSP_1909     TRUE 0.979 6.000 0.511 1.000 N NA
 1138945 1138946 RSP_1909 RSP_1910     FALSE 0.273 254.000 0.190 NA Y NA
 1138946 1138947 RSP_1910 RSP_6219     FALSE 0.477 70.000 0.074 NA   NA
 1138947 1138948 RSP_6219 RSP_6025     FALSE 0.047 190.000 0.000 NA   NA
 1138950 1138951 RSP_1912 RSP_1913     TRUE 0.781 44.000 0.087 0.080   NA
 1138951 1138952 RSP_1913 RSP_1914     TRUE 0.987 16.000 0.200 0.001 Y NA
 1138953 1138954 RSP_4301 RSP_1915     FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 1138955 1138956 RSP_6026 RSP_1916     TRUE 0.936 -6.000 0.091 1.000   NA
 1138956 1138957 RSP_1916 RSP_1917     TRUE 0.912 -3.000 0.033 NA   NA
 1138958 1138959 RSP_1918 RSP_1919     FALSE 0.438 28.000 0.005 NA   NA
 1138960 1138961 RSP_1920 RSP_1921     TRUE 0.574 51.000 0.080 1.000   NA
 1138963 1138964 RSP_1923 RSP_1924 bioB   TRUE 0.872 -3.000 0.009 NA   NA
 1138964 1138965 RSP_1924 RSP_1925     FALSE 0.230 204.000 0.192 NA   NA
 1138966 1138967 RSP_1926 RSP_1927     FALSE 0.351 81.000 0.031 1.000   NA
 1138968 1138969 RSP_1928 RSP_1929 dnaB pyrE FALSE 0.020 269.000 0.031 1.000 N NA
 1138969 1138970 RSP_1929 RSP_1930 pyrE pyrC TRUE 0.832 43.000 0.072 1.000 Y NA
 1138971 1138972 RSP_1931 RSP_1932     TRUE 0.800 105.000 0.645 NA   NA
 1138972 1138973 RSP_1932 RSP_6241     FALSE 0.314 73.000 0.026 NA   NA
 1138973 1138974 RSP_6241 RSP_1933     FALSE 0.034 215.000 0.000 NA   NA
 1138974 1138975 RSP_1933 RSP_1934     FALSE 0.142 116.000 0.000 NA   NA
 1138975 1138976 RSP_1934 RSP_1935     TRUE 0.878 41.000 0.533 NA   NA
 1138976 1138977 RSP_1935 RSP_1936     TRUE 0.986 0.000 0.447 NA   NA
 1138980 1138981 RSP_1939 RSP_1940     TRUE 0.615 63.000 0.144 NA   NA
 1138981 1138982 RSP_1940 RSP_1941   cysH TRUE 0.965 -3.000 0.139 NA   NA
 1138982 1138983 RSP_1941 RSP_1942 cysH   TRUE 0.557 29.000 0.059 1.000 N NA
 1138983 1138984 RSP_1942 RSP_1943     TRUE 0.953 27.000 0.919 NA   NA
 1138984 1138985 RSP_1943 RSP_1944     TRUE 0.980 -3.000 0.282 NA   NA
 1138987 1138988 RSP_1946 RSP_1947   cbbJ FALSE 0.006 329.000 0.005 1.000 N NA
 1138988 1138989 RSP_1947 RSP_1948 cbbJ   FALSE 0.323 112.000 0.049 NA   NA
 1138989 1138990 RSP_1948 RSP_1949     TRUE 0.669 84.000 0.240 NA   NA
 1138992 1138993 RSP_1951 RSP_1952     TRUE 0.895 34.000 0.500 NA   NA
 1138993 1138994 RSP_1952 RSP_1953     FALSE 0.008 591.000 0.000 0.049 N NA
 1138995 1138996 RSP_1954 RSP_1955     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 1138996 1138997 RSP_1955 RSP_1956     FALSE 0.003 487.000 0.000 NA   NA
 1138998 1138999 RSP_1957 RSP_1958     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1138999 1139000 RSP_1958 RSP_1959     FALSE 0.093 140.000 0.000 NA   NA
 1139000 1139001 RSP_1959 RSP_1960     TRUE 0.688 -60.000 0.000 NA   NA
 1139002 1139003 RSP_1961 RSP_1962     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 1139004 1139005 RSP_1963 RSP_1964     FALSE 0.382 28.000 0.000 NA   NA
 1139006 1139007 RSP_1965 RSP_1967     FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 1139011 1139012 RSP_1969 RSP_1970 purM   TRUE 0.969 39.000 0.230 0.002 Y NA
 1139012 1139013 RSP_1970 RSP_1971   rnd FALSE 0.270 97.000 0.049 1.000 N NA
 1139016 1139017 RSP_1974 RSP_1975     TRUE 0.649 61.000 0.168 NA   NA
 1139017 1139018 RSP_1975 RSP_1976   cobT TRUE 0.943 0.000 0.107 1.000 N NA
 1139018 1139019 RSP_1976 RSP_6027 cobT   FALSE 0.335 52.000 0.016 NA   NA
 1139019 1139020 RSP_6027 RSP_6028     TRUE 0.993 2.000 1.000 NA   NA
 1139020 1139021 RSP_6028 RSP_1977   cobS TRUE 0.890 -3.000 0.019 NA   NA
 1139021 1139022 RSP_1977 RSP_1978 cobS   TRUE 0.692 46.000 0.148 1.000   NA
 1139024 1139025 RSP_1980 RSP_1981 glcB   FALSE 0.258 43.000 0.015 1.000 N NA
 1139026 1139027 RSP_1982 RSP_1983   sqdA FALSE 0.167 134.000 0.012 1.000   NA
 1139027 1139028 RSP_1983 RSP_1984 sqdA   FALSE 0.093 188.000 0.024 1.000   NA
 1139029 1139030 RSP_1985 RSP_1986   gatB FALSE 0.083 162.000 0.004 NA   NA
 1139032 1139033 RSP_1988 RSP_1989   valS FALSE 0.232 67.000 0.002 NA   NA
 1139033 1139034 RSP_1989 RSP_1990 valS   FALSE 0.092 119.000 0.004 1.000 N NA
 1139035 1139036 RSP_1991 RSP_1992     FALSE 0.548 79.000 0.120 NA   NA
 1139037 1139038 RSP_1993 RSP_1994   gltA FALSE 0.003 333.000 0.000 NA N NA
 1139038 1139039 RSP_1994 RSP_1995 gltA gltX FALSE 0.426 107.000 0.127 1.000 N NA
 1139041 1139042 RSP_1997 RSP_1998 lexA   TRUE 0.664 57.000 0.232 1.000 N NA
 1139042 1139043 RSP_1998 RSP_2000     TRUE 0.995 -3.000 0.093 0.004 Y NA
 1139043 1139044 RSP_2000 RSP_6214   trpC TRUE 0.945 0.000 0.113 1.000 N NA
 1139044 1139045 RSP_6214 RSP_2001 trpC trpD TRUE 0.944 31.000 0.293 1.000 Y NA
 1139045 1139046 RSP_2001 RSP_2002 trpD trpG TRUE 0.984 -3.000 0.070 1.000 Y NA
 1139048 1139049 RSP_2004 RSP_2005 trpE ybaU TRUE 0.904 11.000 0.106 1.000   NA
 1139052 1139053 RSP_2008 RSP_2009 argD argF TRUE 0.619 114.000 0.038 1.000 Y NA
 1139054 1139055 RSP_2010 RSP_2011     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 1139055 1139056 RSP_2011 RSP_2012     FALSE 0.225 26.000 0.000 1.000 N NA
 1139056 1139057 RSP_2012 RSP_2013     FALSE 0.021 479.000 0.000 1.000 Y NA
 1139057 1139058 RSP_2013 RSP_2014     FALSE 0.357 46.000 0.015 NA   NA
 1139059 1139060 RSP_2015 RSP_2016 argK rpmB FALSE 0.026 214.000 0.008 1.000 N NA
 1139060 1139061 RSP_2016 RSP_6029 rpmB   FALSE 0.046 191.000 0.000 NA   NA
 1139061 1139062 RSP_6029 RSP_2017     TRUE 0.592 30.000 0.045 NA   NA
 1139063 1139064 RSP_2018 RSP_2019     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1139064 1139065 RSP_2019 RSP_2020     FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 1139065 1139066 RSP_2020 RSP_2021   shp FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1139066 1139067 RSP_2021 RSP_2022 shp   TRUE 0.938 4.000 0.000 0.068   NA
 1139067 1139068 RSP_2022 RSP_2023     FALSE 0.047 190.000 0.000 NA   NA
 1139073 1139074 RSP_2028 RSP_2029   ucpA TRUE 0.987 -3.000 0.440 NA   NA
 1139076 1139077 RSP_2032 RSP_2033     FALSE 0.456 21.000 0.000 NA   NA
 1139077 1139078 RSP_2033 RSP_2034     FALSE 0.195 73.000 0.000 NA   NA
 1139078 1139079 RSP_2034 RSP_6030     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139081 1139082 RSP_2036 RSP_2037     FALSE 0.218 62.000 0.000 NA   NA
 1139082 1139083 RSP_2037 RSP_2038     FALSE 0.004 469.000 0.000 NA   NA
 1139083 1139084 RSP_2038 RSP_2039   linC FALSE 0.079 239.000 0.000 0.079   NA
 1139084 1139085 RSP_2039 RSP_2040 linC   FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1139085 1139086 RSP_2040 RSP_2041     FALSE 0.139 118.000 0.000 NA   NA
 1139086 1139087 RSP_2041 RSP_2043     FALSE 0.116 130.000 0.000 NA   NA
 1139089 1139090 RSP_2044 RSP_2045     FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 1139090 1139091 RSP_2045 RSP_2046     FALSE 0.461 119.000 0.130 NA   NA
 1139091 1139092 RSP_2046 RSP_2047     TRUE 0.987 -3.000 0.444 NA   NA
 1139092 1139093 RSP_2047 RSP_2048     TRUE 0.982 -7.000 0.500 1.000   NA
 1139094 1139095 RSP_2049 RSP_2050     TRUE 0.895 13.000 0.154 NA   NA
 1139095 1139096 RSP_2050 RSP_2052     FALSE 0.261 55.000 0.000 1.000   NA
 1139098 1139099 RSP_2054 RSP_2055     FALSE 0.099 137.000 0.000 NA   NA
 1139099 1139100 RSP_2055 RSP_2056     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1139100 1139101 RSP_2056 RSP_2057     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1139101 1139102 RSP_2057 RSP_2058     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139102 1139103 RSP_2058 RSP_2059     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1139103 1139104 RSP_2059 RSP_2061     FALSE 0.127 124.000 0.000 NA   NA
 1139104 1139105 RSP_2061 RSP_2062     FALSE 0.103 135.000 0.000 NA   NA
 1139105 1139106 RSP_2062 RSP_2063     TRUE 0.990 -3.000 0.625 NA   NA
 1139106 1139107 RSP_2063 RSP_2064     TRUE 0.893 10.000 0.077 NA   NA
 1139107 1139108 RSP_2064 RSP_2065     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1139108 1139109 RSP_2065 RSP_2066     TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1139109 1139110 RSP_2066 RSP_6031     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139110 1139111 RSP_6031 RSP_6032     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139111 1139112 RSP_6032 RSP_2067     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1139112 1139113 RSP_2067 RSP_2068     TRUE 0.891 13.000 0.148 NA   NA
 1139113 1139114 RSP_2068 RSP_2069     TRUE 0.964 -3.000 0.138 NA   NA
 1139114 1139115 RSP_2069 RSP_2070     TRUE 0.972 0.000 0.207 NA   NA
 1139115 1139116 RSP_2070 RSP_2071     TRUE 0.975 2.000 0.273 NA   NA
 1139116 1139117 RSP_2071 RSP_2072     FALSE 0.278 43.000 0.000 NA   NA
 1139117 1139118 RSP_2072 RSP_6033     FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 1139118 1139119 RSP_6033 RSP_2073     TRUE 0.975 -3.000 0.222 NA   NA
 1139119 1139120 RSP_2073 RSP_2074     FALSE 0.040 204.000 0.000 NA   NA
 1139120 1139121 RSP_2074 RSP_6034     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 1139121 1139122 RSP_6034 RSP_6035     FALSE 0.073 158.000 0.000 NA   NA
 1139125 1139126 RSP_2077 RSP_2078     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139126 1139127 RSP_2078 RSP_2079     FALSE 0.130 123.000 0.000 NA   NA
 1139127 1139128 RSP_2079 RSP_6036     FALSE 0.219 76.000 0.000 1.000   NA
 1139128 1139129 RSP_6036 RSP_2080     TRUE 0.844 0.000 0.000 1.000   NA
 1139130 1139131 RSP_4297 RSP_2081     FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1139131 1139132 RSP_2081 RSP_2082     FALSE 0.023 317.000 0.033 1.000   NA
 1139133 1139134 RSP_2083 RSP_2084 uvrB   FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 1139135 1139136 RSP_2085 RSP_2086     FALSE 0.320 101.000 0.043 NA   NA
 1139137 1139138 RSP_2087 RSP_6220     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 1139139 1139140 RSP_2088 RSP_4344 lepA   FALSE 0.005 408.000 0.000 NA   NA
 1139140 1139141 RSP_4344 RSP_2090   pycA FALSE 0.004 454.000 0.000 NA   NA
 1139143 1139144 RSP_2091 RSP_6037     FALSE 0.002 921.000 0.000 NA   NA
 1139145 1139146 RSP_2093 RSP_2095     FALSE 0.002 901.000 0.000 NA   NA
 1139146 1139147 RSP_2095 RSP_6038     TRUE 0.987 4.000 0.635 NA   NA
 1139147 1139148 RSP_6038 RSP_2097     TRUE 0.946 1.000 0.089 NA   NA
 1139148 1139149 RSP_2097 RSP_2098   ftsI TRUE 0.982 -3.000 0.315 NA   NA
 1139149 1139150 RSP_2098 RSP_2099 ftsI murE TRUE 0.944 15.000 0.091 1.000 Y NA
 1139150 1139151 RSP_2099 RSP_2100 murE murF TRUE 0.970 89.000 0.569 0.002 Y NA
 1139151 1139152 RSP_2100 RSP_2101 murF mraY TRUE 0.992 13.000 0.309 0.004 Y NA
 1139152 1139153 RSP_2101 RSP_2102 mraY   FALSE 0.186 97.000 0.002 NA   NA
 1139153 1139154 RSP_2102 RSP_2103   murD FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 1139154 1139155 RSP_2103 RSP_2104 murD   FALSE 0.283 57.000 0.002 1.000   NA
 1139157 1139158 RSP_2106 RSP_2107 ftsW murG TRUE 0.882 2.000 0.050 1.000 N NA
 1139158 1139159 RSP_2107 RSP_2108 murG murC TRUE 0.978 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 1139159 1139160 RSP_2108 RSP_2109 murC   TRUE 0.611 14.000 0.004 NA   NA
 1139160 1139161 RSP_2109 RSP_2110   murB TRUE 0.867 -3.000 0.007 NA   NA
 1139161 1139162 RSP_2110 RSP_2111 murB ddlA TRUE 0.952 40.000 0.135 0.004 Y NA
 1139162 1139163 RSP_2111 RSP_2112 ddlA ftsQ TRUE 0.989 -12.000 0.372 NA Y NA
 1139163 1139164 RSP_2112 RSP_2113 ftsQ ftsA TRUE 0.950 -3.000 0.137 NA N NA
 1139164 1139165 RSP_2113 RSP_2114 ftsA ftsZ1 FALSE 0.468 180.000 0.114 1.000 Y NA
 1139165 1139166 RSP_2114 RSP_2115 ftsZ1 envA FALSE 0.106 228.000 0.134 1.000 N NA
 1139166 1139167 RSP_2115 RSP_2117 envA comL FALSE 0.373 115.000 0.064 1.000   NA
 1139167 1139168 RSP_2117 RSP_2118 comL recN TRUE 0.772 28.000 0.117 1.000   NA
 1139169 1139170 RSP_2119 RSP_2120     TRUE 0.963 -3.000 0.130 NA   NA
 1139170 1139171 RSP_2120 RSP_2121     FALSE 0.242 136.000 0.053 NA   NA
 1139171 1139172 RSP_2121 RSP_2122   mtbC FALSE 0.382 205.000 0.436 NA   NA
 1139174 1139175 RSP_2124 RSP_2125     FALSE 0.220 212.000 0.205 NA   NA
 1139176 1139177 RSP_2126 RSP_2127 purC purS TRUE 0.981 15.000 0.460 1.000 Y NA
 1139177 1139178 RSP_2127 RSP_2128 purS purQ TRUE 0.822 232.000 0.656 0.001 Y NA
 1139178 1139179 RSP_2128 RSP_2129 purQ   FALSE 0.359 48.000 0.043 1.000 N NA
 1139179 1139180 RSP_2129 RSP_2130     TRUE 0.995 10.000 0.964 1.000 Y NA
 1139180 1139181 RSP_2130 RSP_2131   rne FALSE 0.001 507.000 0.000 1.000 N NA
 1139183 1139184 RSP_2134 RSP_2136 ccdA   TRUE 0.911 29.000 0.474 1.000   NA
 1139185 1139186 RSP_2135 RSP_2137     TRUE 0.986 -3.000 0.425 NA   NA
 1139186 1139187 RSP_2137 RSP_2138   fumC TRUE 0.908 0.000 0.033 NA   NA
 1139187 1139188 RSP_2138 RSP_2139 fumC   FALSE 0.162 167.000 0.054 NA   NA
 1139188 1139189 RSP_2139 RSP_2140     FALSE 0.232 103.000 0.016 NA   NA
 1139189 1139190 RSP_2140 RSP_4341   ssrA FALSE 0.282 42.000 0.000 NA   NA
 1139190 1139191 RSP_4341 RSP_2141 ssrA   FALSE 0.003 564.000 0.000 NA   NA
 1139192 1139193 RSP_2142 RSP_2143     FALSE 0.098 152.000 0.029 1.000 N NA
 1139193 1139194 RSP_2143 RSP_2144   cfaS FALSE 0.440 34.000 0.041 1.000 N NA
 1139194 1139195 RSP_2144 RSP_2145 cfaS trgA TRUE 0.909 26.000 0.435 NA   NA
 1139195 1139196 RSP_2145 RSP_2146 trgA trgB TRUE 0.962 0.000 0.132 NA   NA
 1139196 1139197 RSP_2146 RSP_2147 trgB cysK FALSE 0.044 333.000 0.114 1.000   NA
 1139197 1139198 RSP_2147 RSP_2148 cysK   TRUE 0.928 4.000 0.114 NA N NA
 1139198 1139199 RSP_2148 RSP_2149     TRUE 0.967 0.000 0.159 NA   NA
 1139200 1139201 RSP_2150 RSP_2151   yohD TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139201 1139202 RSP_2151 RSP_2152 yohD   TRUE 0.897 -3.000 0.023 NA   NA
 1139202 1139203 RSP_2152 RSP_2153     TRUE 0.887 0.000 0.013 1.000   NA
 1139203 1139204 RSP_2153 RSP_2154     FALSE 0.106 134.000 0.000 NA   NA
 1139204 1139205 RSP_2154 RSP_2155   hisD TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1139205 1139206 RSP_2155 RSP_2156 hisD   TRUE 0.955 10.000 0.038 1.000 Y NA
 1139206 1139207 RSP_2156 RSP_2157     TRUE 0.996 -3.000 0.300 0.073 Y NA
 1139207 1139208 RSP_2157 RSP_2158     FALSE 0.155 560.000 0.385 0.073 Y NA
 1139208 1139209 RSP_2158 RSP_2159     TRUE 0.969 20.000 0.154 0.073 Y NA
 1139209 1139210 RSP_2159 RSP_2160   gno FALSE 0.093 77.000 0.000 1.000 N NA
 1139210 1139211 RSP_2160 RSP_2161 gno bcrC FALSE 0.050 196.000 0.000 1.000   NA
 1139212 1139213 RSP_2163 RSP_4345     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1139215 1139216 RSP_2166 RSP_2167 putA   TRUE 0.903 31.000 0.459 1.000   NA
 1139216 1139217 RSP_2167 RSP_2168     TRUE 0.969 -3.000 0.151 1.000   NA
 1139218 1139219 RSP_2169 RSP_2170 suhB   FALSE 0.069 132.000 0.003 1.000 N NA
 1139219 1139220 RSP_2170 RSP_2171   metR FALSE 0.101 128.000 0.012 1.000 N NA
 1139222 1139223 RSP_2173 RSP_2174     TRUE 0.908 14.000 0.211 NA   NA
 1139223 1139224 RSP_2174 RSP_2175     TRUE 0.993 -25.000 0.729 1.000 Y NA
 1139224 1139225 RSP_2175 RSP_2176C   gabT FALSE 0.013 303.000 0.000 1.000   NA
 1139225 1139226 RSP_2176C RSP_2176N gabT gabT TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.001   NA
 1139227 1139228 RSP_2177 RSP_2178   topA FALSE 0.339 248.000 0.238 1.000 Y NA
 1139229 1139230 RSP_2179 RSP_2180 proV proW TRUE 0.997 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 1139230 1139231 RSP_2180 RSP_2181 proW proX TRUE 0.939 105.000 0.469 0.073 Y NA
 1139232 1139233 RSP_2182 RSP_2183 betI betB TRUE 0.984 -3.000 0.459 1.000 N NA
 1139233 1139234 RSP_2183 RSP_2184 betB betA TRUE 0.974 10.000 0.634 1.000 N NA
 1139234 1139235 RSP_2184 RSP_2185 betA   FALSE 0.164 79.000 0.012 1.000 N NA
 1139236 1139237 RSP_2186 RSP_2187     TRUE 0.800 62.000 0.377 1.000   NA
 1139237 1139238 RSP_2187 RSP_2188     FALSE 0.415 37.000 0.016 NA   NA
 1139239 1139240 RSP_2189 RSP_6040 pccB   FALSE 0.181 152.000 0.044 NA   NA
 1139240 1139241 RSP_6040 RSP_2190     FALSE 0.028 422.000 0.161 NA   NA
 1139241 1139242 RSP_2190 RSP_6221     FALSE 0.010 315.000 0.000 NA   NA
 1139242 1139243 RSP_6221 RSP_2191   pccA FALSE 0.238 96.000 0.014 NA   NA
 1139245 1139246 RSP_2192 RSP_2193 mcmA gcvT FALSE 0.001 564.000 0.000 1.000 N NA
 1139246 1139247 RSP_2193 RSP_2194 gcvT gcvH TRUE 0.994 9.000 0.202 0.002 Y NA
 1139247 1139248 RSP_2194 RSP_2195 gcvH gcvP TRUE 0.985 4.000 0.130 1.000 Y NA
 1139249 1139250 RSP_2196 RSP_2197     TRUE 0.879 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1139250 1139251 RSP_2197 RSP_2198     FALSE 0.331 71.000 0.022 1.000   NA
 1139251 1139252 RSP_2198 RSP_2199     TRUE 0.565 27.000 0.023 1.000   NA
 1139252 1139253 RSP_2199 RSP_2200     TRUE 0.884 19.000 0.287 1.000 N NA
 1139253 1139254 RSP_2200 RSP_2201     TRUE 0.913 122.000 0.250 0.007 Y NA
 1139255 1139256 RSP_2202 RSP_2203     TRUE 0.997 -3.000 0.845 NA Y NA
 1139256 1139257 RSP_2203 RSP_2204     TRUE 0.884 -7.000 0.082 NA N NA
 1139258 1139259 RSP_2205 RSP_2206     TRUE 0.990 -3.000 0.632 NA   NA
 1139259 1139260 RSP_2206 RSP_2207   deoD FALSE 0.423 86.000 0.057 1.000   NA
 1139260 1139261 RSP_2207 RSP_2208 deoD   TRUE 0.886 2.000 0.021 1.000   NA
 1139261 1139262 RSP_2208 RSP_2209     TRUE 0.996 -3.000 0.720 0.073   NA
 1139262 1139263 RSP_2209 RSP_2210     TRUE 0.972 0.000 0.184 1.000   NA
 1139263 1139264 RSP_2210 RSP_2211     TRUE 0.989 1.000 0.586 1.000   NA
 1139264 1139265 RSP_2211 RSP_2212   rimI FALSE 0.174 154.000 0.038 1.000   NA
 1139265 1139266 RSP_2212 RSP_2213 rimI   TRUE 0.976 -3.000 0.209 1.000   NA
 1139266 1139267 RSP_2213 RSP_2214     TRUE 0.968 -10.000 0.061 1.000 Y NA
 1139267 1139268 RSP_2214 RSP_2215     FALSE 0.381 147.000 0.151 1.000   NA
 1139268 1139269 RSP_2215 RSP_2216   ilvE FALSE 0.456 110.000 0.093 1.000   NA
 1139269 1139270 RSP_2216 RSP_2217 ilvE   TRUE 0.572 71.000 0.115 1.000   NA
 1139272 1139273 RSP_2219 RSP_2220     FALSE 0.066 299.000 0.214 1.000 N NA
 1139273 1139274 RSP_2220 RSP_6042     FALSE 0.504 60.000 0.071 NA   NA
 1139274 1139275 RSP_6042 RSP_2221   purB FALSE 0.136 127.000 0.002 NA   NA
 1139275 1139276 RSP_2221 RSP_2222 purB   FALSE 0.172 108.000 0.002 NA   NA
 1139276 1139277 RSP_2222 RSP_2223     FALSE 0.280 98.000 0.029 NA   NA
 1139277 1139278 RSP_2223 RSP_2224     TRUE 0.977 4.000 0.442 NA N NA
 1139280 1139281 RSP_2226 RSP_2227 glgX glgC TRUE 0.991 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1139281 1139282 RSP_2227 RSP_2228 glgC   FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 1139283 1139284 RSP_2229 RSP_2230     TRUE 0.729 20.000 0.051 1.000   NA
 1139284 1139285 RSP_2230 RSP_2231     FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 1139286 1139287 RSP_2232 RSP_2234     TRUE 0.932 33.000 0.748 1.000   NA
 1139287 1139288 RSP_2234 RSP_2235     FALSE 0.265 83.000 0.008 1.000   NA
 1139289 1139290 RSP_2236 RSP_2237     TRUE 0.983 -3.000 0.441 1.000 N NA
 1139290 1139291 RSP_2237 RSP_2238     TRUE 0.969 14.000 0.700 1.000   NA
 1139293 1139294 RSP_2239 RSP_2240     FALSE 0.056 189.000 0.003 NA   NA
 1139295 1139296 RSP_2241 RSP_2242 hisI hisF TRUE 0.995 -3.000 0.105 0.003 Y NA
 1139296 1139297 RSP_2242 RSP_2243 hisF hisA TRUE 0.930 135.000 0.433 0.003 Y NA
 1139299 1139300 RSP_2245 RSP_2246 hisH hisB TRUE 0.993 0.000 0.049 0.003 Y NA
 1139302 1139303 RSP_2249 RSP_2250     TRUE 0.745 31.000 0.125 NA   NA
 1139303 1139304 RSP_2250 RSP_2251     TRUE 0.938 -7.000 0.120 NA   NA
 1139304 1139305 RSP_2251 RSP_2252     FALSE 0.136 228.000 0.122 1.000   NA
 1139305 1139306 RSP_2252 RSP_2253     TRUE 0.982 -3.000 0.311 NA   NA
 1139307 1139308 RSP_2254 RSP_2255     FALSE 0.289 106.000 0.060 1.000 N NA
 1139309 1139310 RSP_2256 RSP_2257 dtd   TRUE 0.798 0.000 0.013 1.000 N NA
 1139310 1139311 RSP_2257 RSP_2258   purC FALSE 0.443 14.000 0.004 1.000 N NA
 1139311 1139312 RSP_2258 RSP_2259 purC   FALSE 0.271 67.000 0.004 1.000   NA
 1139312 1139313 RSP_2259 RSP_2260   ydjG TRUE 0.842 5.000 0.008 1.000   NA
 1139313 1139314 RSP_2260 RSP_2261 ydjG ydjI TRUE 0.963 2.000 0.167 NA   NA
 1139314 1139315 RSP_2261 RSP_2262 ydjI   FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 1139315 1139316 RSP_2262 RSP_2263     TRUE 0.801 16.000 0.074 NA   NA
 1139316 1139317 RSP_2263 RSP_2264   telA TRUE 0.916 13.000 0.214 NA   NA
 1139317 1139318 RSP_2264 RSP_2265 telA   FALSE 0.399 149.000 0.198 NA   NA
 1139318 1139319 RSP_2265 RSP_2266   rluB FALSE 0.133 185.000 0.059 NA   NA
 1139322 1139323 RSP_6222 RSP_6043   gatC FALSE 0.380 44.000 0.010 1.000   NA
 1139323 1139324 RSP_6043 RSP_2270 gatC gatA TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.002 Y NA
 1139324 1139325 RSP_2270 RSP_2271 gatA   TRUE 0.809 -52.000 0.027 NA   NA
 1139325 1139326 RSP_2271 RSP_2272   ampD TRUE 0.969 4.000 0.226 NA   NA
 1139326 1139327 RSP_2272 RSP_4342 ampD rnpB FALSE 0.267 45.000 0.000 NA   NA
 1139328 1139329 RSP_2273 RSP_2274     TRUE 0.985 -3.000 0.479 1.000 N NA
 1139329 1139330 RSP_2274 RSP_2275     TRUE 0.904 87.000 0.464 NA Y NA
 1139330 1139331 RSP_2275 RSP_2276     TRUE 0.940 61.000 0.651 NA Y NA
 1139331 1139332 RSP_2276 RSP_2277     TRUE 0.997 4.000 0.556 0.072 Y NA
 1139332 1139333 RSP_2277 RSP_2278     TRUE 0.826 135.000 0.421 1.000 Y NA
 1139333 1139334 RSP_2278 RSP_2279     FALSE 0.140 289.000 0.474 1.000 N NA
 1139335 1139336 RSP_2280 RSP_2281     TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.020 Y NA
 1139338 1139339 RSP_2283 RSP_2284 rpsD   FALSE 0.015 244.000 0.007 1.000 N NA
 1139339 1139340 RSP_2284 RSP_6215     TRUE 0.990 0.000 0.198 1.000 Y NA
 1139340 1139341 RSP_6215 RSP_2285     TRUE 0.879 6.000 0.038 NA   NA
 1139343 1139344 RSP_2287 RSP_2288     TRUE 0.683 74.000 0.243 NA   NA
 1139344 1139345 RSP_2288 RSP_2289     TRUE 0.926 4.000 0.068 NA   NA
 1139345 1139346 RSP_2289 RSP_2291     FALSE 0.010 332.000 0.000 1.000   NA
 1139347 1139348 RSP_2292 RSP_2293   clpA FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 1139348 1139349 RSP_2293 RSP_2294 clpA gloB FALSE 0.152 167.000 0.041 1.000   NA
 1139350 1139351 RSP_2295 RSP_2296   atpH FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 1139351 1139352 RSP_2296 RSP_2297 atpH atpA TRUE 0.999 1.000 0.864 0.005 Y NA
 1139352 1139353 RSP_2297 RSP_2298 atpA atpG TRUE 0.993 23.000 0.846 0.005 Y NA
 1139353 1139354 RSP_2298 RSP_2299 atpG atpD TRUE 0.994 18.000 0.724 0.005 Y NA
 1139354 1139355 RSP_2299 RSP_2300 atpD atpC TRUE 0.998 10.000 0.837 0.005 Y NA
 1139356 1139357 RSP_2301 RSP_2302 prsA   FALSE 0.466 132.000 0.007 1.000 Y NA
 1139357 1139358 RSP_2302 RSP_2303     TRUE 0.948 0.000 0.082 NA   NA
 1139358 1139359 RSP_2303 RSP_2304   ribF FALSE 0.505 40.000 0.044 NA   NA
 1139359 1139360 RSP_2304 RSP_2305 ribF   FALSE 0.511 28.000 0.044 1.000 N NA
 1139360 1139361 RSP_2305 RSP_2306     FALSE 0.274 226.000 0.216 0.077 N NA
 1139361 1139362 RSP_2306 RSP_2307     FALSE 0.093 151.000 0.025 1.000 N NA
 1139365 1139366 RSP_2310 RSP_2311 groES groEL TRUE 0.924 96.000 0.209 0.006 Y NA
 1139368 1139369 RSP_2313 RSP_2314     FALSE 0.010 328.000 0.000 1.000   NA
 1139369 1139370 RSP_2314 RSP_2315     TRUE 0.718 91.000 0.333 NA   NA
 1139371 1139372 RSP_2316 RSP_2317 dadA   FALSE 0.304 47.000 0.029 1.000 N NA
 1139372 1139373 RSP_2317 RSP_2318     TRUE 0.998 -3.000 0.706 0.043 Y NA
 1139373 1139374 RSP_2318 RSP_2319   glnA TRUE 0.935 13.000 0.361 1.000 N NA
 1139374 1139375 RSP_2319 RSP_2320 glnA   TRUE 0.662 76.000 0.289 1.000 N NA
 1139375 1139376 RSP_2320 RSP_2321     TRUE 0.959 57.000 0.938 NA Y NA
 1139376 1139377 RSP_2321 RSP_2322     TRUE 0.997 0.000 0.865 NA Y NA
 1139377 1139378 RSP_2322 RSP_2323     TRUE 0.939 5.000 0.162 NA N NA
 1139380 1139381 RSP_2325 RSP_2326 rodA pbpA TRUE 0.898 8.000 0.094 1.000 N NA
 1139381 1139382 RSP_2326 RSP_2327 pbpA   TRUE 0.984 -3.000 0.351 NA   NA
 1139382 1139383 RSP_2327 RSP_2328   mreC TRUE 0.865 -7.000 0.034 NA   NA
 1139383 1139384 RSP_2328 RSP_2329 mreC mreB TRUE 0.903 34.000 0.689 1.000 N NA
 1139393 1139394 RSP_2336 RSP_2337     FALSE 0.422 75.000 0.059 NA   NA
 1139394 1139395 RSP_2337 RSP_2338     TRUE 0.762 86.000 0.400 NA   NA
 1139396 1139397 RSP_2339 RSP_2340     FALSE 0.214 64.000 0.000 NA   NA
 1139397 1139398 RSP_2340 RSP_2341     FALSE 0.043 162.000 0.004 1.000 N NA
 1139398 1139399 RSP_2341 RSP_2342   gpt TRUE 0.614 29.000 0.076 1.000 N NA
 1139399 1139400 RSP_2342 RSP_2343 gpt   TRUE 0.802 10.000 0.048 1.000 N NA
 1139400 1139401 RSP_2343 RSP_2344   fabI1 TRUE 0.960 2.000 0.207 1.000 N NA
 1139402 1139403 RSP_2345 RSP_2346 pdxH   FALSE 0.222 117.000 0.046 1.000 N NA
 1139403 1139404 RSP_2346 RSP_2347     TRUE 0.908 15.000 0.226 NA   NA
 1139404 1139405 RSP_2347 RSP_4313     FALSE 0.005 389.000 0.000 NA   NA
 1139406 1139407 RSP_2348 RSP_6223     FALSE 0.122 127.000 0.000 NA   NA
 1139407 1139408 RSP_6223 RSP_2349     FALSE 0.116 130.000 0.000 NA   NA
 1139408 1139409 RSP_2349 RSP_2350     FALSE 0.193 75.000 0.000 NA   NA
 1139409 1139410 RSP_2350 RSP_2351     FALSE 0.002 717.000 0.000 NA   NA
 1139410 1139411 RSP_2351 RSP_2352     TRUE 0.943 13.000 0.333 NA   NA
 1139411 1139412 RSP_2352 RSP_2353     TRUE 0.660 78.000 0.222 NA   NA
 1139412 1139413 RSP_2353 RSP_6046     TRUE 0.987 -3.000 0.444 NA   NA
 1139413 1139414 RSP_6046 RSP_6047     TRUE 0.991 3.000 0.818 NA   NA
 1139414 1139415 RSP_6047 RSP_2354     TRUE 0.972 -7.000 0.333 NA   NA
 1139417 1139418 RSP_2355 RSP_2357     TRUE 0.989 3.000 0.714 NA   NA
 1139418 1139419 RSP_2357 RSP_2358     TRUE 0.979 0.000 0.286 NA   NA
 1139419 1139420 RSP_2358 RSP_2359     FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 1139420 1139421 RSP_2359 RSP_2360     TRUE 0.980 -3.000 0.286 NA   NA
 1139421 1139422 RSP_2360 RSP_2361     TRUE 0.686 75.000 0.250 NA   NA
 1139423 1139424 RSP_2362 RSP_2363     FALSE 0.020 194.000 0.000 1.000 N NA
 1139424 1139425 RSP_2363 RSP_2364   fucA TRUE 0.598 5.000 0.000 1.000 N NA
 1139425 1139426 RSP_2364 RSP_2365 fucA   TRUE 0.604 66.000 0.000 NA Y NA
 1139426 1139427 RSP_2365 RSP_2366     FALSE 0.541 184.000 0.222 NA Y NA
 1139427 1139428 RSP_2366 RSP_2368     TRUE 0.963 7.000 0.222 1.000   NA
 1139428 1139429 RSP_2368 RSP_2367     TRUE 0.996 4.000 1.000 0.071   NA
 1139429 1139430 RSP_2367 RSP_2370     TRUE 0.936 16.000 0.087 NA Y NA
 1139430 1139431 RSP_2370 RSP_2371     TRUE 0.873 11.000 0.130 NA N NA
 1139431 1139432 RSP_2371 RSP_2372     FALSE 0.045 254.000 0.000 0.076 N NA
 1139432 1139433 RSP_2372 RSP_2373     TRUE 0.678 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1139433 1139434 RSP_2373 RSP_2374     FALSE 0.025 233.000 0.000 NA   NA
 1139434 1139435 RSP_2374 RSP_2375     FALSE 0.224 87.000 0.006 NA   NA
 1139435 1139436 RSP_2375 RSP_2376   kbl FALSE 0.322 45.000 0.006 NA   NA
 1139436 1139437 RSP_2376 RSP_2377 kbl tdh TRUE 0.986 0.000 0.547 1.000 N NA
 1139438 1139439 RSP_2378 RSP_2379 cypC   FALSE 0.280 111.000 0.034 NA   NA
 1139439 1139440 RSP_2379 RSP_2380   catC FALSE 0.475 36.000 0.029 NA   NA
 1139440 1139441 RSP_2380 RSP_6048 catC   FALSE 0.204 122.000 0.019 NA   NA
 1139442 1139443 RSP_2381 RSP_6049     FALSE 0.195 73.000 0.000 NA   NA
 1139444 1139445 RSP_2382 RSP_2383     TRUE 0.975 0.000 0.231 NA   NA
 1139445 1139446 RSP_2383 RSP_6050     TRUE 0.902 -13.000 0.077 NA   NA
 1139450 1139451 RSP_2386 RSP_2387     FALSE 0.177 112.000 0.004 NA   NA
 1139451 1139452 RSP_2387 RSP_2388     FALSE 0.306 72.000 0.023 NA   NA
 1139453 1139454 RSP_2389 RSP_2390   acuC1 FALSE 0.415 29.000 0.033 NA N NA
 1139454 1139455 RSP_2390 RSP_2391 acuC1   TRUE 0.709 -3.000 0.005 NA N NA
 1139456 1139457 RSP_2392 RSP_2394   kdtA FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 1139459 1139460 RSP_2396 RSP_2397     FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 1139460 1139461 RSP_2397 RSP_2398     TRUE 0.987 28.000 0.769 0.071 Y NA
 1139461 1139462 RSP_2398 RSP_2399     TRUE 0.998 -7.000 0.909 0.071 Y NA
 1139462 1139463 RSP_2399 RSP_2400     TRUE 0.993 2.000 0.364 1.000 Y NA
 1139463 1139464 RSP_2400 RSP_2401     FALSE 0.085 91.000 0.000 1.000 N NA
 1139465 1139466 RSP_2402 RSP_2403     TRUE 0.926 -13.000 0.172 1.000 N NA
 1139466 1139467 RSP_2403 RSP_2404     TRUE 0.997 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 1139467 1139468 RSP_2404 RSP_2405     TRUE 0.997 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 1139468 1139469 RSP_2405 RSP_2406     TRUE 0.983 -3.000 0.308 1.000   NA
 1139470 1139471 RSP_2407 RSP_2408     TRUE 0.633 44.000 0.100 NA   NA
 1139472 1139473 RSP_2409 RSP_2410 rluD rpoH1 FALSE 0.115 161.000 0.046 1.000 N NA
 1139474 1139475 RSP_2411 RSP_2412   pepF FALSE 0.137 85.000 0.006 1.000 N NA
 1139475 1139476 RSP_2412 RSP_2413 pepF lig2 FALSE 0.078 172.000 0.032 1.000 N NA
 1139476 1139477 RSP_2413 RSP_2414 lig2   TRUE 0.990 -3.000 0.751 1.000 N NA
 1139478 1139479 RSP_2415 RSP_2416     TRUE 0.986 8.000 0.805 NA   NA
 1139479 1139480 RSP_2416 RSP_2417     TRUE 0.984 -3.000 0.365 NA   NA
 1139480 1139481 RSP_2417 RSP_2420     TRUE 0.847 32.000 0.383 NA N NA
 1139482 1139483 RSP_2418 RSP_2419 pldB   TRUE 0.898 -3.000 0.016 1.000   NA
 1139484 1139485 RSP_2421 RSP_2422   mgpS FALSE 0.211 85.000 0.000 1.000   NA
 1139485 1139486 RSP_2422 RSP_2423 mgpS   TRUE 0.791 6.000 0.000 1.000   NA
 1139486 1139487 RSP_2423 RSP_2424     FALSE 0.360 55.000 0.050 1.000 N NA
 1139487 1139488 RSP_2424 RSP_2425     FALSE 0.006 280.000 0.000 1.000 N NA
 1139491 1139492 RSP_2429 RSP_6052     TRUE 0.669 115.000 0.333 NA   NA
 1139494 1139495 RSP_2431 RSP_2432     FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1139495 1139496 RSP_2432 RSP_2433   cheY2 TRUE 0.964 -3.000 0.133 NA   NA
 1139496 1139497 RSP_2433 RSP_2434 cheY2 cheR1 TRUE 0.969 -22.000 0.078 1.000 Y NA
 1139497 1139498 RSP_2434 RSP_2435 cheR1 cheW1 TRUE 0.988 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 1139498 1139499 RSP_2435 RSP_2436 cheW1 cheA1 TRUE 0.995 2.000 0.178 0.009 Y NA
 1139499 1139500 RSP_2436 RSP_2437 cheA1 cheY1 TRUE 0.994 8.000 0.711 1.000 Y NA
 1139500 1139501 RSP_2437 RSP_2438 cheY1 cheX TRUE 0.980 -9.000 0.525 NA   NA
 1139501 1139502 RSP_2438 RSP_2439 cheX cheD TRUE 0.920 -3.000 0.040 NA   NA
 1139502 1139503 RSP_2439 RSP_2440 cheD mcpA TRUE 0.592 123.000 0.040 1.000 Y NA
 1139503 1139504 RSP_2440 RSP_2441 mcpA tlpS FALSE 0.156 107.000 0.000 NA   NA
 1139504 1139505 RSP_2441 RSP_2442 tlpS mcpB TRUE 0.865 104.000 1.000 NA   NA
 1139505 1139506 RSP_2442 RSP_2443 mcpB cheY5 TRUE 0.708 89.000 0.056 1.000 Y NA
 1139506 1139507 RSP_2443 RSP_2444 cheY5   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139508 1139509 RSP_2445 RSP_2446     TRUE 0.998 -3.000 0.544 0.005 Y NA
 1139509 1139510 RSP_2446 RSP_2448   glgB1 TRUE 0.991 -3.000 0.022 0.005 Y NA
 1139510 1139511 RSP_2448 RSP_2449 glgB1   TRUE 0.996 -3.000 0.121 0.003 Y NA
 1139511 1139512 RSP_2449 RSP_2450     TRUE 0.992 -3.000 0.027 0.003 Y NA
 1139512 1139513 RSP_2450 RSP_2451     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.005 Y NA
 1139513 1139514 RSP_2451 RSP_2452     TRUE 0.996 -3.000 0.141 0.005 Y NA
 1139515 1139516 RSP_2453 RSP_2454   purF FALSE 0.435 120.000 0.100 1.000   NA
 1139516 1139517 RSP_2454 RSP_2455 purF   FALSE 0.532 85.000 0.101 1.000   NA
 1139517 1139518 RSP_2455 RSP_2456   radA TRUE 0.814 19.000 0.094 1.000   NA
 1139518 1139519 RSP_2456 RSP_2457 radA   FALSE 0.147 133.000 0.010 NA   NA
 1139519 1139520 RSP_2457 RSP_2458     TRUE 0.932 1.000 0.065 NA   NA
 1139520 1139521 RSP_2458 RSP_2459     TRUE 0.990 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 1139521 1139522 RSP_2459 RSP_2460   alr TRUE 0.929 -3.000 0.077 1.000 N NA
 1139523 1139524 RSP_2461 RSP_2463 fabG acpP TRUE 0.829 179.000 0.321 0.004 Y NA
 1139524 1139525 RSP_2463 RSP_2464 acpP fabF FALSE 0.049 497.000 0.106 1.000 Y NA
 1139525 1139526 RSP_2464 RSP_2465 fabF   TRUE 0.964 -3.000 0.134 NA   NA
 1139526 1139527 RSP_2465 RSP_2466     FALSE 0.199 110.000 0.009 NA   NA
 1139527 1139528 RSP_2466 RSP_2467     TRUE 0.870 47.000 0.571 NA   NA
 1139528 1139529 RSP_2467 RSP_2468     TRUE 0.683 73.000 0.242 NA   NA
 1139529 1139530 RSP_2468 RSP_2469     TRUE 0.973 2.000 0.242 NA   NA
 1139530 1139531 RSP_2469 RSP_2470     TRUE 0.987 5.000 0.688 NA   NA
 1139531 1139532 RSP_2470 RSP_2471     TRUE 0.838 66.000 0.578 NA   NA
 1139532 1139533 RSP_2471 RSP_2472     TRUE 0.804 95.000 0.600 NA   NA
 1139533 1139534 RSP_2472 RSP_6053     TRUE 0.978 0.000 0.267 NA   NA
 1139534 1139535 RSP_6053 RSP_6054     TRUE 0.981 -3.000 0.291 NA   NA
 1139535 1139536 RSP_6054 RSP_2473     TRUE 0.821 38.000 0.299 NA   NA
 1139536 1139537 RSP_2473 RSP_2474     TRUE 0.989 0.000 0.577 NA   NA
 1139537 1139538 RSP_2474 RSP_2475     TRUE 0.706 23.000 0.062 NA   NA
 1139538 1139539 RSP_2475 RSP_2476     TRUE 0.981 10.000 0.678 NA   NA
 1139539 1139540 RSP_2476 RSP_2477     TRUE 0.987 0.000 0.475 NA   NA
 1139540 1139541 RSP_2477 RSP_2478     TRUE 0.993 -3.000 0.929 NA   NA
 1139541 1139542 RSP_2478 RSP_2479     TRUE 0.993 0.000 0.871 NA   NA
 1139542 1139543 RSP_2479 RSP_2480     TRUE 0.964 4.000 0.194 NA   NA
 1139543 1139544 RSP_2480 RSP_2481   cysE TRUE 0.913 -7.000 0.071 NA   NA
 1139545 1139546 RSP_4050 RSP_4049 pdhB pdhAb TRUE 0.981 11.000 0.254 1.000 Y NA
 1139546 1139547 RSP_4049 RSP_4047 pdhAb pdhAa TRUE 0.994 14.000 0.456 0.001 Y NA
 1139547 1139548 RSP_4047 RSP_4046 pdhAa   FALSE 0.096 223.000 0.104 1.000 N NA
 1139548 1139549 RSP_4046 RSP_4045   fbaB FALSE 0.009 279.000 0.004 1.000 N NA
 1139549 1139550 RSP_4045 RSP_4044 fbaB pgk TRUE 0.562 102.000 0.004 1.000 Y NA
 1139551 1139552 RSP_4043 RSP_4042     TRUE 0.997 -10.000 0.551 0.002 Y NA
 1139557 1139558 RSP_2491 RSP_2492 eno   FALSE 0.439 35.000 0.018 NA   NA
 1139558 1139559 RSP_2492 RSP_2494   fur FALSE 0.373 65.000 0.035 NA   NA
 1139560 1139561 RSP_2495 RSP_2496 nrd   FALSE 0.007 373.000 0.000 1.000   NA
 1139562 1139563 RSP_2497 RSP_2498     TRUE 0.731 8.000 0.000 NA   NA
 1139565 1139566 RSP_2501 RSP_2502   glmS FALSE 0.003 361.000 0.000 1.000 N NA
 1139566 1139567 RSP_2502 RSP_2503 glmS glmU TRUE 0.984 0.000 0.083 1.000 Y NA
 1139572 1139573 RSP_2508 RSP_2509 mccB mccA TRUE 0.926 97.000 0.158 0.001 Y NA
 1139573 1139574 RSP_2509 RSP_2510 mccA hmgL TRUE 0.975 -7.000 0.229 0.075 N NA
 1139574 1139575 RSP_2510 RSP_2511 hmgL   TRUE 0.947 13.000 0.218 0.075 N NA
 1139575 1139576 RSP_2511 RSP_2512   nuoA FALSE 0.030 221.000 0.018 1.000 N NA
 1139576 1139577 RSP_2512 RSP_2513 nuoA nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.396 0.005 Y NA
 1139577 1139578 RSP_2513 RSP_2514 nuoB nuoC TRUE 0.993 11.000 0.262 0.005 Y NA
 1139578 1139579 RSP_2514 RSP_2515 nuoC nuoD TRUE 0.997 5.000 0.483 0.011 Y NA
 1139579 1139580 RSP_2515 RSP_2516 nuoD nuoE TRUE 0.997 0.000 0.355 0.011 Y NA
 1139580 1139581 RSP_2516 RSP_2517 nuoE   TRUE 0.873 0.000 0.012 NA   NA
 1139581 1139582 RSP_2517 RSP_2518   nuoF TRUE 0.845 11.000 0.056 NA   NA
 1139582 1139583 RSP_2518 RSP_2519 nuoF   TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1139583 1139584 RSP_2519 RSP_2521   nuoG FALSE 0.071 160.000 0.000 NA   NA
 1139584 1139585 RSP_2521 RSP_2520 nuoG   TRUE 0.927 4.000 0.069 NA   NA
 1139585 1139586 RSP_2520 RSP_2522   nuoH TRUE 0.659 28.000 0.060 NA   NA
 1139586 1139587 RSP_2522 RSP_2523 nuoH nuoI TRUE 0.998 2.000 0.500 0.011 Y NA
 1139587 1139588 RSP_2523 RSP_2524 nuoI   TRUE 0.932 -3.000 0.046 1.000   NA
 1139588 1139589 RSP_2524 RSP_2525   nuoJ TRUE 0.946 -3.000 0.066 1.000   NA
 1139589 1139590 RSP_2525 RSP_2526 nuoJ nuoK TRUE 0.900 160.000 0.484 0.005 Y NA
 1139590 1139591 RSP_2526 RSP_2527 nuoK nuoL TRUE 0.997 6.000 0.451 0.011 Y NA
 1139591 1139592 RSP_2527 RSP_2529 nuoL nuoM TRUE 0.997 0.000 0.251 0.003 Y NA
 1139592 1139593 RSP_2529 RSP_2530 nuoM nuoN TRUE 0.995 11.000 0.453 0.003 Y NA
 1139593 1139594 RSP_2530 RSP_2532 nuoN birA TRUE 0.916 17.000 0.372 1.000 N NA
 1139594 1139595 RSP_2532 RSP_2533 birA   TRUE 0.824 11.000 0.071 1.000 N NA
 1139595 1139596 RSP_2533 RSP_2534     TRUE 0.952 -3.000 0.080 1.000   NA
 1139597 1139598 RSP_2536 RSP_2537 rhlE prfC FALSE 0.154 226.000 0.000 1.000 Y NA
 1139599 1139600 RSP_2538 RSP_2539 fabG   TRUE 0.575 37.000 0.088 1.000 N NA
 1139600 1139601 RSP_2539 RSP_2540   tatA FALSE 0.318 168.000 0.176 1.000   NA
 1139601 1139602 RSP_2540 RSP_6059 tatA tatB TRUE 0.985 11.000 0.353 0.007   NA
 1139602 1139603 RSP_6059 RSP_2541 tatB tatC TRUE 0.996 -3.000 0.535 NA Y NA
 1139603 1139604 RSP_2541 RSP_2542 tatC   TRUE 0.948 -3.000 0.078 NA   NA
 1139605 1139606 RSP_2543 RSP_2544     FALSE 0.235 124.000 0.057 1.000 N NA
 1139606 1139607 RSP_2544 RSP_2545   surE TRUE 0.968 -3.000 0.147 1.000   NA
 1139608 1139609 RSP_2547 RSP_2548 exoY exoF TRUE 0.840 72.000 0.611 1.000   NA
 1139610 1139611 RSP_2549 RSP_2550 exoQ exoK TRUE 0.845 17.000 0.200 NA N NA
 1139613 1139614 RSP_2552 RSP_2553 exoU   TRUE 0.980 -3.000 0.286 NA   NA
 1139615 1139616 RSP_2554 RSP_2555     TRUE 0.817 87.000 0.600 NA   NA
 1139616 1139617 RSP_2555 RSP_2556     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 1139617 1139618 RSP_2556 RSP_2557   asnB TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139618 1139619 RSP_2557 RSP_2558 asnB   TRUE 0.993 -3.000 0.875 1.000   NA
 1139619 1139620 RSP_2558 RSP_2559     FALSE 0.510 66.000 0.073 1.000   NA
 1139621 1139622 RSP_6060 RSP_2561   exoP FALSE 0.006 373.000 0.000 NA   NA
 1139622 1139623 RSP_2561 RSP_2562 exoP exoM TRUE 0.554 51.000 0.080 NA   NA
 1139623 1139624 RSP_2562 RSP_2563 exoM exoA TRUE 0.965 -3.000 0.143 NA   NA
 1139624 1139625 RSP_2563 RSP_2564 exoA exoL TRUE 0.965 -3.000 0.143 NA   NA
 1139625 1139626 RSP_2564 RSP_2565 exoL ugpG TRUE 0.723 22.000 0.065 NA   NA
 1139626 1139627 RSP_2565 RSP_2567 ugpG sqdC FALSE 0.042 356.000 0.000 1.000 Y NA
 1139627 1139628 RSP_2567 RSP_2568 sqdC sqdD TRUE 0.993 -15.000 0.696 1.000 Y NA
 1139628 1139629 RSP_2568 RSP_2569 sqdD sqdB TRUE 0.808 55.000 0.086 1.000 Y NA
 1139629 1139630 RSP_2569 RSP_2570 sqdB pfpI FALSE 0.143 147.000 0.014 1.000   NA
 1139631 1139632 RSP_2571 RSP_2572   crpK FALSE 0.145 155.000 0.065 NA N NA
 1139632 1139633 RSP_2572 RSP_2573 crpK   TRUE 0.699 154.000 0.286 NA Y NA
 1139635 1139636 RSP_2575 RSP_2576   adhI FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 1139636 1139637 RSP_2576 RSP_2577 adhI cycI TRUE 0.818 130.000 0.333 1.000 Y NA
 1139637 1139638 RSP_2577 RSP_2578 cycI xoxF FALSE 0.097 210.000 0.000 0.064 N NA
 1139638 1139639 RSP_2578 RSP_2579 xoxF cycB TRUE 0.737 164.000 0.571 0.064   NA
 1139639 1139640 RSP_2579 RSP_2580 cycB xoxJ TRUE 0.975 -12.000 0.419 1.000   NA
 1139640 1139641 RSP_2580 RSP_2581 xoxJ   TRUE 0.988 -3.000 0.488 1.000   NA
 1139641 1139642 RSP_2581 RSP_2582     FALSE 0.327 109.000 0.049 NA   NA
 1139642 1139643 RSP_2582 RSP_2583     TRUE 0.906 45.000 0.793 NA   NA
 1139643 1139644 RSP_2583 RSP_2584     TRUE 0.701 27.000 0.074 NA   NA
 1139644 1139645 RSP_2584 RSP_2585     FALSE 0.524 16.000 0.000 NA   NA
 1139645 1139646 RSP_2585 RSP_2586     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139646 1139647 RSP_2586 RSP_2587     TRUE 0.988 -3.000 0.635 1.000 N NA
 1139647 1139648 RSP_2587 RSP_2588     TRUE 0.957 10.000 0.281 NA   NA
 1139650 1139651 RSP_2590 RSP_2591   flhR FALSE 0.221 167.000 0.091 NA   NA
 1139651 1139652 RSP_2591 RSP_2592 flhR   TRUE 0.956 11.000 0.333 NA   NA
 1139652 1139653 RSP_2592 RSP_2593   flhS TRUE 0.965 -10.000 0.294 NA   NA
 1139653 1139654 RSP_2593 RSP_2594 flhS   TRUE 0.962 5.000 0.200 NA   NA
 1139654 1139655 RSP_2594 RSP_2595     TRUE 0.990 -3.000 0.600 NA   NA
 1139656 1139657 RSP_2596 RSP_2597     TRUE 0.985 -3.000 0.087 NA Y NA
 1139657 1139658 RSP_2597 RSP_2598     TRUE 0.949 20.000 0.200 NA Y NA
 1139658 1139659 RSP_2598 RSP_2599   phoB FALSE 0.103 114.000 0.005 1.000 N NA
 1139659 1139660 RSP_2599 RSP_2600 phoB phoU TRUE 0.933 0.000 0.096 NA N NA
 1139660 1139661 RSP_2600 RSP_2601 phoU pstB TRUE 0.977 11.000 0.222 NA Y NA
 1139661 1139662 RSP_2601 RSP_2602 pstB pstA TRUE 0.996 11.000 0.402 0.001 Y NA
 1139662 1139663 RSP_2602 RSP_2603 pstA pstC TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.001 Y NA
 1139663 1139664 RSP_2603 RSP_2604 pstC pstS TRUE 0.812 59.000 0.107 NA Y NA
 1139664 1139665 RSP_2604 RSP_2605 pstS   FALSE 0.006 376.000 0.000 NA   NA
 1139665 1139666 RSP_2605 RSP_2606     TRUE 0.762 11.000 0.022 NA   NA
 1139666 1139667 RSP_2606 RSP_2607     TRUE 0.702 37.000 0.111 1.000   NA
 1139669 1139670 RSP_2609 RSP_4331 dcd   FALSE 0.210 66.000 0.000 NA   NA
 1139670 1139671 RSP_4331 RSP_2610     FALSE 0.189 81.000 0.000 NA   NA
 1139671 1139672 RSP_2610 RSP_2611   ihfA TRUE 0.816 7.000 0.005 1.000   NA
 1139672 1139673 RSP_2611 RSP_2612 ihfA fabH TRUE 0.560 91.000 0.207 1.000 N NA
 1139673 1139674 RSP_2612 RSP_2613 fabH plsX TRUE 0.997 7.000 0.380 0.004 Y NA
 1139674 1139675 RSP_2613 RSP_2614 plsX rpmF TRUE 0.887 26.000 0.418 1.000 N NA
 1139675 1139676 RSP_2614 RSP_2615 rpmF   FALSE 0.530 178.000 0.599 NA   NA
 1139681 1139682 RSP_2620 RSP_2621   ctrA TRUE 0.628 96.000 0.213 1.000   NA
 1139682 1139683 RSP_2621 RSP_2622 ctrA ligA FALSE 0.178 94.000 0.022 1.000 N NA
 1139683 1139684 RSP_2622 RSP_2623N ligA recG TRUE 0.991 -3.000 0.029 0.011 Y NA
 1139684 1139685 RSP_2623N RSP_2624 recG   FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 1139688 1139689 RSP_2628 RSP_2629 gltX/glnS gid TRUE 0.850 -15.000 0.033 1.000   NA
 1139689 1139690 RSP_2629 RSP_2630 gid gyrA TRUE 0.713 4.000 0.005 1.000 N NA
 1139693 1139694 RSP_2633 RSP_2634 ccmF ccmH TRUE 0.997 -3.000 0.963 NA Y NA
 1139694 1139695 RSP_2634 RSP_2635 ccmH phaB/echH FALSE 0.037 210.000 0.000 NA   NA
 1139696 1139697 RSP_2636 RSP_2637 ilvH   TRUE 0.931 83.000 0.146 0.001 Y NA
 1139697 1139698 RSP_2637 RSP_2638     FALSE 0.005 295.000 0.000 1.000 N NA
 1139698 1139699 RSP_2638 RSP_2639     FALSE 0.001 490.000 0.000 1.000 N NA
 1139699 1139700 RSP_2639 RSP_2640     FALSE 0.496 107.000 0.128 NA   NA
 1139700 1139701 RSP_2640 RSP_2641     FALSE 0.082 310.000 0.240 NA   NA
 1139701 1139702 RSP_2641 RSP_2642     FALSE 0.008 439.000 0.025 NA   NA
 1139703 1139704 RSP_2643 RSP_2644 glnE   TRUE 0.883 -13.000 0.060 NA   NA
 1139705 1139706 RSP_2645 RSP_2646 eda edd FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 1139707 1139708 RSP_2647 RSP_2648     TRUE 0.964 -3.000 0.138 NA   NA
 1139709 1139710 RSP_2649 RSP_2650     FALSE 0.364 63.000 0.031 NA   NA
 1139710 1139711 RSP_2650 RSP_6205     FALSE 0.543 23.000 0.015 NA   NA
 1139711 1139712 RSP_6205 RSP_2651     TRUE 0.969 -3.000 0.160 NA   NA
 1139712 1139713 RSP_2651 RSP_2652     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 1139713 1139714 RSP_2652 RSP_2653     FALSE 0.488 39.000 0.030 1.000   NA
 1139715 1139716 RSP_2654 RSP_2656   nahG FALSE 0.454 96.000 0.131 1.000 N NA
 1139717 1139718 RSP_2655 RSP_2657   xthA FALSE 0.083 143.000 0.023 NA N NA
 1139718 1139719 RSP_2657 RSP_2658 xthA   FALSE 0.352 77.000 0.038 NA   NA
 1139720 1139721 RSP_2659 RSP_2660 dgt   TRUE 0.619 17.000 0.009 1.000   NA
 1139722 1139723 RSP_2661 RSP_2662   glpK TRUE 0.974 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 1139723 1139724 RSP_2662 RSP_2663 glpK   FALSE 0.008 389.000 0.034 1.000 N NA
 1139724 1139725 RSP_2663 RSP_2664     TRUE 0.856 62.000 0.640 NA   NA
 1139725 1139726 RSP_2664 RSP_2665     TRUE 0.991 2.000 0.854 NA   NA
 1139726 1139727 RSP_2665 RSP_2666     TRUE 0.985 38.000 0.922 0.069 Y NA
 1139727 1139728 RSP_2666 RSP_2667     TRUE 0.998 0.000 0.847 0.069 Y NA
 1139728 1139729 RSP_2667 RSP_2669     TRUE 0.997 11.000 0.865 0.005 Y NA
 1139729 1139730 RSP_2669 RSP_2670   glpD FALSE 0.342 130.000 0.125 1.000 N NA
 1139730 1139731 RSP_2670 RSP_2671 glpD   FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 1139733 1139734 RSP_2673 RSP_2674     FALSE 0.041 203.000 0.000 NA   NA
 1139734 1139735 RSP_2674 RSP_2675     FALSE 0.002 637.000 0.000 NA   NA
 1139735 1139736 RSP_2675 RSP_2676     TRUE 0.768 123.000 0.667 NA   NA
 1139736 1139737 RSP_2676 RSP_6064     FALSE 0.002 1006.000 0.000 NA   NA
 1139739 1139740 RSP_2678 RSP_2679     TRUE 0.952 -3.000 0.087 NA   NA
 1139740 1139741 RSP_2679 RSP_6225     FALSE 0.002 771.000 0.000 NA   NA
 1139742 1139743 RSP_2681 RSP_2682 rpoE fabD FALSE 0.012 230.000 0.000 1.000 N NA
 1139744 1139745 RSP_2683 RSP_2684     TRUE 0.914 -3.000 0.035 NA   NA
 1139745 1139746 RSP_2684 RSP_2685     TRUE 0.874 -3.000 0.035 1.000 N NA
 1139747 1139748 RSP_2686 RSP_2687   fbcQ FALSE 0.483 80.000 0.083 NA   NA
 1139748 1139749 RSP_2687 RSP_2688 fbcQ soxD TRUE 0.618 40.000 0.083 NA   NA
 1139749 1139750 RSP_2688 RSP_2689 soxD soxA TRUE 0.998 -3.000 0.889 0.001   NA
 1139750 1139751 RSP_2689 RSP_2690 soxA   TRUE 0.996 -7.000 0.778 0.001   NA
 1139755 1139756 RSP_2695 RSP_2696     FALSE 0.301 86.000 0.020 1.000   NA
 1139756 1139757 RSP_2696 RSP_2697     FALSE 0.163 100.000 0.000 NA   NA
 1139757 1139758 RSP_2697 RSP_2698     TRUE 0.687 46.000 0.154 NA   NA
 1139758 1139759 RSP_2698 RSP_2699     TRUE 0.700 59.000 0.203 1.000   NA
 1139760 1139761 RSP_2700 RSP_2701     TRUE 0.941 -7.000 0.115 1.000   NA
 1139761 1139762 RSP_2701 RSP_2702     TRUE 0.997 0.000 0.478 0.069 Y NA
 1139762 1139763 RSP_2702 RSP_2703     TRUE 0.992 4.000 0.130 0.069 Y NA
 1139763 1139764 RSP_2703 RSP_2704   miaA FALSE 0.004 322.000 0.000 1.000 N NA
 1139765 1139766 RSP_2705 RSP_2706 pyrH frr TRUE 0.790 86.000 0.626 1.000 N NA
 1139766 1139767 RSP_2706 RSP_2707 frr uppS TRUE 0.745 70.000 0.409 1.000 N NA
 1139767 1139768 RSP_2707 RSP_2708 uppS cdsA TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 1139768 1139769 RSP_2708 RSP_2709 cdsA dxr TRUE 0.989 9.000 0.372 1.000 Y NA
 1139769 1139770 RSP_2709 RSP_2710 dxr   TRUE 0.979 7.000 0.568 1.000 N NA
 1139770 1139771 RSP_2710 RSP_6065     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 1139771 1139772 RSP_6065 RSP_2711     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1139772 1139773 RSP_2711 RSP_6204     TRUE 0.992 0.000 0.241 1.000 Y NA
 1139773 1139774 RSP_6204 RSP_2712   fabZ FALSE 0.438 86.000 0.102 1.000 N NA
 1139774 1139775 RSP_2712 RSP_2714 fabZ lpxA TRUE 0.806 31.000 0.264 1.000 N NA
 1139775 1139776 RSP_2714 RSP_2715 lpxA   TRUE 0.989 -3.000 0.552 NA   NA
 1139776 1139777 RSP_2715 RSP_2716   lpxB TRUE 0.970 -3.000 0.173 NA   NA
 1139777 1139778 RSP_2716 RSP_2717 lpxB   FALSE 0.169 124.000 0.003 1.000   NA
 1139778 1139779 RSP_2717 RSP_2718     FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000   NA
 1139779 1139780 RSP_2718 RSP_2719     FALSE 0.011 234.000 0.000 1.000 N NA
 1139780 1139781 RSP_2719 RSP_2720     FALSE 0.016 374.000 0.079 1.000 N NA
 1139783 1139784 RSP_2722 RSP_2723 cysS   FALSE 0.128 126.000 0.021 1.000 N NA
 1139784 1139785 RSP_2723 RSP_2724     TRUE 0.805 -3.000 0.013 1.000 N NA
 1139785 1139786 RSP_2724 RSP_2725     TRUE 0.860 -3.000 0.030 1.000 N NA
 1139788 1139789 RSP_2727 RSP_2728     TRUE 0.942 -3.000 0.069 NA   NA
 1139789 1139790 RSP_2728 RSP_2729     FALSE 0.005 531.000 0.018 NA   NA
 1139790 1139791 RSP_2729 RSP_2730     FALSE 0.005 295.000 0.000 1.000 N NA
 1139791 1139792 RSP_2730 RSP_2731   ArsH FALSE 0.013 283.000 0.000 NA   NA
 1139792 1139793 RSP_2731 RSP_2732 ArsH   TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 1139793 1139794 RSP_2732 RSP_2734   zwf FALSE 0.033 217.000 0.000 NA   NA
 1139794 1139795 RSP_2734 RSP_2735 zwf pgl TRUE 0.860 39.000 0.092 1.000 Y NA
 1139795 1139796 RSP_2735 RSP_2736 pgl pgi TRUE 0.926 20.000 0.089 1.000 Y NA
 1139798 1139799 RSP_2738 RSP_2739     TRUE 0.930 11.000 0.197 NA   NA
 1139799 1139800 RSP_2739 RSP_6066     TRUE 0.922 -3.000 0.042 NA   NA
 1139800 1139801 RSP_6066 RSP_2740     FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 1139801 1139802 RSP_2740 RSP_2741     TRUE 0.986 -3.000 0.519 1.000 N NA
 1139807 1139808 RSP_2746 RSP_2747     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1139808 1139809 RSP_2747 RSP_2748     FALSE 0.024 235.000 0.000 NA   NA
 1139810 1139811 RSP_2749 RSP_2750     FALSE 0.016 267.000 0.000 NA   NA
 1139811 1139812 RSP_2750 RSP_2751     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139812 1139813 RSP_2751 RSP_2753     TRUE 0.760 -6.000 0.000 NA   NA
 1139813 1139814 RSP_2753 RSP_6068     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139814 1139815 RSP_6068 RSP_2754     TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 1139815 1139816 RSP_2754 RSP_2755     FALSE 0.077 154.000 0.000 NA   NA
 1139816 1139817 RSP_2755 RSP_2756     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139817 1139818 RSP_2756 RSP_6069     FALSE 0.003 546.000 0.000 NA   NA
 1139818 1139819 RSP_6069 RSP_2757     FALSE 0.541 15.000 0.000 NA   NA
 1139819 1139820 RSP_2757 RSP_2758     TRUE 0.762 6.000 0.000 NA   NA
 1139820 1139821 RSP_2758 RSP_2759     TRUE 0.985 -7.000 0.667 NA   NA
 1139821 1139822 RSP_2759 RSP_2760     TRUE 0.981 -7.000 0.500 NA   NA
 1139822 1139823 RSP_2760 RSP_2761     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139825 1139826 RSP_2763 RSP_2764     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 1139826 1139827 RSP_2764 RSP_2765     FALSE 0.003 529.000 0.000 NA   NA
 1139827 1139828 RSP_2765 RSP_6070     FALSE 0.002 1292.000 0.000 NA   NA
 1139829 1139830 RSP_4305 RSP_6242     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1139830 1139831 RSP_6242 RSP_2766     FALSE 0.190 80.000 0.000 NA   NA
 1139831 1139832 RSP_2766 RSP_2768     FALSE 0.176 135.000 0.018 1.000   NA
 1139832 1139833 RSP_2768 RSP_2769     TRUE 0.972 -3.000 0.179 1.000   NA
 1139833 1139834 RSP_2769 RSP_2770     TRUE 0.971 -13.000 0.391 NA   NA
 1139835 1139836 RSP_2771 RSP_2772   ftsJ TRUE 0.759 -3.000 0.011 NA N NA
 1139838 1139839 RSP_2774 RSP_2775   lpxD FALSE 0.524 49.000 0.057 1.000   NA
 1139839 1139840 RSP_2775 RSP_2776 lpxD acpP FALSE 0.379 34.000 0.029 1.000 N NA
 1139840 1139841 RSP_2776 RSP_2777 acpP   TRUE 0.973 12.000 0.212 1.000 Y NA
 1139842 1139843 RSP_2778 RSP_2779   catA FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 1139845 1139846 RSP_2781 RSP_2782   aqpZ FALSE 0.031 162.000 0.000 1.000 N NA
 1139848 1139849 RSP_2784 RSP_2785 cycG CycF TRUE 0.997 4.000 0.364 0.014 Y NA
 1139849 1139850 RSP_2785 RSP_2786 CycF HPRT FALSE 0.004 407.000 0.006 1.000 N NA
 1139851 1139852 RSP_2787 RSP_2788     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1139855 1139856 RSP_2862 RSP_2861   TSF FALSE 0.002 387.000 0.000 1.000 N NA
 1139856 1139857 RSP_2861 RSP_2860 TSF rpsB TRUE 0.940 82.000 0.748 1.000 Y NA
 1139858 1139859 RSP_6216 RSP_2858     TRUE 0.948 -3.000 0.131 NA N NA
 1139862 1139863 RSP_2855 RSP_2854     TRUE 0.834 11.000 0.087 NA N NA
 1139863 1139864 RSP_2854 RSP_2853     TRUE 0.933 0.000 0.087 1.000 N NA
 1139865 1139866 RSP_2852 RSP_2851     TRUE 0.956 -3.000 0.147 1.000 N NA
 1139867 1139868 RSP_2850 RSP_2849 mfd   FALSE 0.309 77.000 0.026 NA   NA
 1139869 1139870 RSP_2848 RSP_2847 hemB   FALSE 0.267 115.000 0.033 NA   NA
 1139873 1139874 RSP_2844 RSP_2843   hfq FALSE 0.525 95.000 0.115 1.000   NA
 1139874 1139875 RSP_2843 RSP_2842 hfq trkH1 FALSE 0.438 158.000 0.252 1.000   NA
 1139875 1139876 RSP_2842 RSP_2841 trkH1 trkA TRUE 0.994 2.000 0.089 0.004 Y NA
 1139876 1139877 RSP_2841 RSP_2840 trkA ntrX FALSE 0.470 55.000 0.085 1.000 N NA
 1139877 1139878 RSP_2840 RSP_2839 ntrX ntrY TRUE 0.998 -3.000 0.533 0.022 Y NA
 1139878 1139879 RSP_2839 RSP_2838 ntrY ntrC TRUE 0.943 52.000 0.205 0.022 Y NA
 1139879 1139880 RSP_2838 RSP_2837 ntrC ntrB TRUE 0.996 0.000 0.297 0.082 Y NA
 1139880 1139881 RSP_2837 RSP_2836 ntrB nifR3 TRUE 0.940 -3.000 0.094 1.000 N NA
 1139882 1139883 RSP_2835 RSP_6071 ispD ispF TRUE 0.882 109.000 0.419 1.000 Y NA
 1139883 1139884 RSP_6071 RSP_2834 ispF pgpA TRUE 0.971 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 1139884 1139885 RSP_2834 RSP_2833 pgpA cinA TRUE 0.954 -3.000 0.091 NA   NA
 1139887 1139888 RSP_4327 RSP_4346     FALSE 0.175 91.000 0.000 NA   NA
 1139889 1139890 RSP_2831 RSP_2830 cobO   TRUE 0.710 -3.000 0.005 NA N NA
 1139891 1139892 RSP_2829 RSP_2828   cobW TRUE 0.974 -3.000 0.211 NA   NA
 1139892 1139893 RSP_2828 RSP_2827 cobW cobN TRUE 0.968 4.000 0.204 1.000   NA
 1139893 1139894 RSP_2827 RSP_6217 cobN cobH TRUE 0.905 0.000 0.025 1.000   NA
 1139894 1139895 RSP_6217 RSP_2826 cobH cobI TRUE 0.996 0.000 0.191 0.009 Y NA
 1139895 1139896 RSP_2826 RSP_2824 cobI cobJ TRUE 0.995 -3.000 0.138 0.009 Y NA
 1139898 1139899 RSP_2823 RSP_2822 cobL cobE TRUE 0.988 -3.000 0.139 0.009   NA
 1139899 1139900 RSP_2822 RSP_2821 cobE cobM TRUE 0.995 -3.000 0.397 0.009   NA
 1139900 1139901 RSP_2821 RSP_2820 cobM cobA TRUE 0.971 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 1139901 1139902 RSP_2820 RSP_2819 cobA cobF TRUE 0.770 91.000 0.106 1.000 Y NA
 1139903 1139904 RSP_2818 RSP_2817 aroB aroK TRUE 0.989 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 1139905 1139906 RSP_2816 RSP_2815   xerD TRUE 0.912 0.000 0.038 NA   NA
 1139906 1139907 RSP_2815 RSP_2814 xerD corB FALSE 0.226 69.000 0.025 1.000 N NA
 1139910 1139911 RSP_2813 RSP_2812 mttB   FALSE 0.193 116.000 0.011 NA   NA
 1139911 1139912 RSP_2812 RSP_2811     TRUE 0.919 3.000 0.054 NA   NA
 1139912 1139913 RSP_2811 RSP_2810     TRUE 0.991 4.000 0.294 NA Y NA
 1139913 1139914 RSP_2810 RSP_2809     TRUE 0.990 0.000 0.206 NA Y NA
 1139915 1139916 RSP_2808 RSP_2807     TRUE 0.774 5.000 0.000 NA   NA
 1139917 1139918 RSP_4328 RSP_2806   lon FALSE 0.004 455.000 0.000 NA   NA
 1139918 1139919 RSP_2806 RSP_2805 lon nemA FALSE 0.007 262.000 0.000 1.000 N NA
 1139919 1139920 RSP_2805 RSP_2804 nemA tgt FALSE 0.116 107.000 0.007 1.000 N NA
 1139920 1139921 RSP_2804 RSP_2803 tgt   FALSE 0.029 166.000 0.003 NA N NA
 1139921 1139922 RSP_2803 RSP_2802     TRUE 0.986 8.000 1.000 NA N NA
 1139923 1139924 RSP_2801 RSP_6075 tetR   FALSE 0.002 580.000 0.000 NA   NA
 1139924 1139925 RSP_6075 RSP_2800   acoR TRUE 0.711 45.000 0.176 NA   NA
 1139926 1139927 RSP_2799 RSP_2798   groEL3 FALSE 0.276 51.000 0.000 1.000   NA
 1139927 1139928 RSP_2798 RSP_2797 groEL3   TRUE 0.724 84.000 0.300 1.000   NA
 1139928 1139929 RSP_2797 RSP_2796     TRUE 0.956 5.000 0.150 1.000   NA
 1139929 1139930 RSP_2796 RSP_2795     TRUE 0.663 61.000 0.167 1.000   NA
 1139930 1139931 RSP_2795 RSP_2794     TRUE 0.990 12.000 0.708 0.006   NA
 1139931 1139932 RSP_2794 RSP_2793     TRUE 0.915 31.000 0.542 1.000   NA
 1139932 1139933 RSP_2793 RSP_2792     TRUE 0.837 71.000 0.591 1.000   NA
 1139934 1139935 RSP_2791 RSP_2790     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139935 1139936 RSP_2790 RSP_2789     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1139936 1139937 RSP_2789 RSP_6076     TRUE 0.615 30.000 0.051 NA   NA
 1139937 1139938 RSP_6076 RSP_2867   rpoN4 FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1139939 1139940 RSP_2868 RSP_2869     FALSE 0.029 194.000 0.004 1.000 N NA
 1139940 1139941 RSP_2869 RSP_2870   aglK FALSE 0.001 530.000 0.000 1.000 N NA
 1139941 1139942 RSP_2870 RSP_2871 aglK aglG TRUE 0.953 25.000 0.097 0.068 Y NA
 1139942 1139943 RSP_2871 RSP_2872 aglG aglF TRUE 0.998 0.000 0.693 0.068 Y NA
 1139943 1139944 RSP_2872 RSP_2873 aglF aglE TRUE 0.964 77.000 0.670 0.068 Y NA
 1139945 1139946 RSP_2874 RSP_2875   glk TRUE 0.973 19.000 0.385 1.000 Y NA
 1139947 1139948 RSP_2876 RSP_2877   coxL TRUE 0.996 11.000 0.525 0.001 Y NA
 1139948 1139949 RSP_2877 RSP_2878 coxL coxS TRUE 0.989 29.000 0.512 0.001 Y NA
 1139949 1139950 RSP_2878 RSP_2879 coxS   TRUE 0.665 29.000 0.068 NA   NA
 1139950 1139951 RSP_2879 RSP_2880   gfdS FALSE 0.409 133.000 0.143 NA   NA
 1139951 1139952 RSP_2880 RSP_2881 gfdS gfdT TRUE 0.601 71.000 0.154 NA   NA
 1139952 1139953 RSP_2881 RSP_2882 gfdT   TRUE 0.862 98.000 0.923 NA   NA
 1139953 1139954 RSP_2882 RSP_2883   pgm FALSE 0.004 320.000 0.000 1.000 N NA
 1139954 1139955 RSP_2883 RSP_2884 pgm glgX TRUE 0.973 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 1139955 1139956 RSP_2884 RSP_2885 glgX glgA TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 1139956 1139957 RSP_2885 RSP_2886 glgA glgC TRUE 0.748 97.000 0.094 1.000 Y NA
 1139957 1139958 RSP_2886 RSP_2887 glgC glgP FALSE 0.012 767.000 0.000 1.000 Y NA
 1139960 1139961 RSP_2889 RSP_2890     TRUE 0.597 159.000 0.200 0.003 N NA
 1139962 1139963 RSP_2891 RSP_2892     FALSE 0.161 101.000 0.000 NA   NA
 1139965 1139966 RSP_2895 RSP_2896     TRUE 0.945 4.000 0.102 NA   NA
 1139966 1139967 RSP_2896 RSP_2897     FALSE 0.552 98.000 0.156 NA   NA
 1139968 1139969 RSP_2898 RSP_2899     TRUE 0.557 104.000 0.230 1.000 N NA
 1139970 1139971 RSP_2900 RSP_2901     TRUE 0.995 -3.000 0.631 0.057   NA
 1139971 1139972 RSP_2901 RSP_2902     TRUE 0.968 0.000 0.153 1.000   NA
 1139972 1139973 RSP_2902 RSP_2903     TRUE 0.844 17.000 0.181 1.000 N NA
 1139973 1139974 RSP_2903 RSP_2904   pdxA1 TRUE 0.836 -3.000 0.022 1.000 N NA
 1139974 1139975 RSP_2904 RSP_2905 pdxA1 ksgA TRUE 0.570 78.000 0.197 1.000 N NA
 1139976 1139977 RSP_6078 RSP_2906     FALSE 0.029 258.000 0.021 NA   NA
 1139977 1139978 RSP_2906 RSP_2907   prfA TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 1139978 1139979 RSP_2907 RSP_2908 prfA   FALSE 0.110 147.000 0.006 NA   NA
 1139979 1139980 RSP_2908 RSP_2909     TRUE 0.924 6.000 0.078 NA   NA
 1139980 1139981 RSP_2909 RSP_2910     FALSE 0.077 273.000 0.124 1.000   NA
 1139982 1139983 RSP_2912 RSP_2913     FALSE 0.027 263.000 0.011 1.000   NA
 1139983 1139984 RSP_2913 RSP_2914     FALSE 0.012 227.000 0.000 1.000 N NA
 1139987 1139988 RSP_2917 RSP_2918     FALSE 0.319 83.000 0.023 1.000   NA
 1139988 1139989 RSP_2918 RSP_2919     TRUE 0.912 -3.000 0.027 1.000   NA
 1139989 1139990 RSP_2919 RSP_2920     TRUE 0.971 5.000 0.276 NA   NA
 1139993 1139994 RSP_2922 RSP_2923     FALSE 0.167 178.000 0.118 NA N NA
 1139994 1139995 RSP_2923 RSP_2924     TRUE 0.812 129.000 0.333 NA Y NA
 1139995 1139996 RSP_2924 RSP_2925     TRUE 0.960 93.000 0.582 0.026 Y NA
 1139996 1139997 RSP_2925 RSP_2926     TRUE 0.988 4.000 0.190 1.000 Y NA
 1139997 1139998 RSP_2926 RSP_2927     TRUE 0.998 -3.000 0.775 0.068 Y NA
 1139998 1139999 RSP_2927 RSP_2928     TRUE 0.927 5.000 0.075 NA   NA
 1140000 1140001 RSP_2930 RSP_4326     FALSE 0.002 820.000 0.000 NA   NA
 1140003 1140004 RSP_2932 RSP_2933 hutC hutF TRUE 0.865 0.000 0.033 1.000 N NA
 1140005 1140006 RSP_2934 RSP_2935 hutI hutH TRUE 0.985 0.000 0.192 0.033 N NA
 1140006 1140007 RSP_2935 RSP_2936 hutH hutU TRUE 0.995 11.000 0.315 0.001 Y NA
 1140007 1140008 RSP_2936 RSP_2937 hutU   FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 1140009 1140010 RSP_6080 RSP_2939     FALSE 0.007 356.000 0.000 NA   NA
 1140010 1140011 RSP_2939 RSP_2940     TRUE 0.989 -3.000 0.570 NA   NA
 1140011 1140012 RSP_2940 RSP_2941     TRUE 0.932 -7.000 0.103 NA   NA
 1140012 1140013 RSP_2941 RSP_2942     TRUE 0.951 -3.000 0.085 NA   NA
 1140013 1140014 RSP_2942 RSP_2943   argS FALSE 0.312 71.000 0.025 NA   NA
 1140014 1140015 RSP_2943 RSP_6081 argS   FALSE 0.231 67.000 0.002 NA   NA
 1140015 1140016 RSP_6081 RSP_2944     TRUE 0.974 -9.000 0.389 NA   NA
 1140016 1140017 RSP_2944 RSP_2945   cycJ FALSE 0.157 161.000 0.036 1.000   NA
 1140017 1140018 RSP_2945 RSP_2946 cycJ argC FALSE 0.505 23.000 0.032 1.000 N NA
 1140018 1140019 RSP_2946 RSP_2947 argC   FALSE 0.442 25.000 0.025 1.000 N NA
 1140019 1140020 RSP_2947 RSP_2948     FALSE 0.066 138.000 0.005 1.000 N NA
 1140021 1140022 RSP_2950 RSP_2951   purL FALSE 0.003 368.000 0.000 1.000 N NA
 1140022 1140023 RSP_2951 RSP_2952 purL   FALSE 0.069 234.000 0.093 NA N NA
 1140023 1140024 RSP_2952 RSP_2953     TRUE 0.622 60.000 0.216 NA N NA
 1140025 1140026 RSP_2954 RSP_2955     TRUE 0.826 -7.000 0.017 NA   NA
 1140028 1140029 RSP_2957 RSP_2958     FALSE 0.400 26.000 0.000 NA   NA
 1140030 1140031 RSP_2959 RSP_6082 gapB   FALSE 0.037 209.000 0.000 NA   NA
 1140032 1140033 RSP_2960 RSP_2961     TRUE 0.582 70.000 0.121 1.000   NA
 1140033 1140034 RSP_2961 RSP_2965     TRUE 0.731 55.000 0.229 1.000   NA
 1140035 1140036 RSP_2962 RSP_2963     FALSE 0.001 525.000 0.000 1.000 N NA
 1140036 1140037 RSP_2963 RSP_2964     FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 1140038 1140039 RSP_2966 RSP_2967 uvrA   FALSE 0.114 117.000 0.010 1.000 N NA
 1140039 1140040 RSP_2967 RSP_2968     FALSE 0.040 203.000 0.017 1.000 N NA
 1140040 1140041 RSP_2968 RSP_2969     FALSE 0.474 77.000 0.070 1.000   NA
 1140041 1140042 RSP_2969 RSP_2970     FALSE 0.068 207.000 0.017 1.000   NA
 1140042 1140043 RSP_2970 RSP_2971     FALSE 0.134 80.000 0.005 1.000 N NA
 1140043 1140044 RSP_2971 RSP_2972     FALSE 0.281 86.000 0.021 NA   NA
 1140045 1140046 RSP_2973 RSP_2974     FALSE 0.003 411.000 0.002 1.000 N NA
 1140046 1140047 RSP_2974 RSP_2975     TRUE 0.970 -10.000 0.484 NA N NA
 1140048 1140049 RSP_2976 RSP_2977   prfB FALSE 0.008 370.000 0.006 NA   NA
 1140049 1140050 RSP_2977 RSP_2978 prfB mrcA FALSE 0.226 109.000 0.041 1.000 N NA
 1140050 1140051 RSP_2978 RSP_2979 mrcA amiC TRUE 0.892 92.000 0.396 1.000 Y NA
 1140051 1140052 RSP_2979 RSP_2980 amiC aspAT FALSE 0.463 49.000 0.072 1.000 N NA
 1140054 1140055 RSP_2982 RSP_2983 gcpE   FALSE 0.523 131.000 0.233 NA   NA
 1140055 1140056 RSP_2983 RSP_2984   hemA FALSE 0.116 198.000 0.057 NA   NA
 1140056 1140057 RSP_2984 RSP_2985 hemA   FALSE 0.301 135.000 0.077 NA   NA
 1140058 1140059 RSP_2986 RSP_2987     TRUE 0.929 -3.000 0.043 1.000   NA
 1140060 1140061 RSP_4317 RSP_4316     FALSE 0.315 36.000 0.000 NA   NA
 1140061 1140062 RSP_4316 RSP_2988     FALSE 0.176 90.000 0.000 NA   NA
 1140064 1140065 RSP_2990 RSP_2991     FALSE 0.540 156.000 0.417 NA   NA
 1140065 1140066 RSP_2991 RSP_2992     FALSE 0.475 143.000 0.250 NA   NA
 1140066 1140067 RSP_2992 RSP_2993     TRUE 0.713 72.000 0.286 NA   NA
 1140067 1140068 RSP_2993 RSP_2994     TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140068 1140069 RSP_2994 RSP_6243     FALSE 0.002 1034.000 0.000 NA   NA
 1140069 1140070 RSP_6243 RSP_6244     FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 1140070 1140071 RSP_6244 RSP_6245     FALSE 0.451 46.000 0.038 NA   NA
 1140071 1140072 RSP_6245 RSP_6246     TRUE 0.807 1.000 0.000 NA   NA
 1140072 1140073 RSP_6246 RSP_6247     TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140073 1140074 RSP_6247 RSP_2995     FALSE 0.418 24.000 0.000 NA   NA
 1140074 1140075 RSP_2995 RSP_2996     FALSE 0.498 73.000 0.087 NA   NA
 1140075 1140076 RSP_2996 RSP_2997     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140076 1140077 RSP_2997 RSP_2998     FALSE 0.289 40.000 0.000 NA   NA
 1140077 1140078 RSP_2998 RSP_2999     TRUE 0.980 -13.000 0.600 NA   NA
 1140078 1140079 RSP_2999 RSP_3000     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 1140079 1140080 RSP_3000 RSP_3001     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1140080 1140081 RSP_3001 RSP_6248     TRUE 0.597 82.000 0.000 0.005   NA
 1140081 1140082 RSP_6248 RSP_6249     TRUE 0.692 -31.000 0.000 NA   NA
 1140082 1140083 RSP_6249 RSP_6250     FALSE 0.002 971.000 0.000 NA   NA
 1140083 1140084 RSP_6250 RSP_0002   spbB FALSE 0.002 3503.000 0.000 NA   NA
 1140084 1140085 RSP_0002 RSP_0003 spbB   FALSE 0.121 228.000 0.000 0.044   NA
 1140085 1140086 RSP_0003 RSP_0004     TRUE 0.690 -37.000 0.000 NA   NA
 1140087 1140088 RSP_0005 RSP_0006 guaA   FALSE 0.005 467.000 0.005 1.000   NA
 1140088 1140089 RSP_0006 RSP_0007     TRUE 0.773 79.000 0.381 1.000   NA
 1140089 1140090 RSP_0007 RSP_0008     FALSE 0.464 53.000 0.080 1.000 N NA
 1140090 1140091 RSP_0008 RSP_0009     FALSE 0.342 33.000 0.000 NA   NA
 1140091 1140092 RSP_0009 RSP_0010     FALSE 0.486 29.000 0.016 NA   NA
 1140092 1140093 RSP_0010 RSP_0011     TRUE 0.894 -10.000 0.056 1.000   NA
 1140093 1140094 RSP_0011 RSP_0013     TRUE 0.866 41.000 0.444 1.000   NA
 1140094 1140095 RSP_0013 RSP_0014     TRUE 0.985 -3.000 0.356 1.000   NA
 1140096 1140097 RSP_0015 RSP_0016     TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 1140097 1140098 RSP_0016 RSP_0017     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.067 Y NA
 1140098 1140099 RSP_0017 RSP_0018     FALSE 0.071 428.000 0.133 1.000 Y NA
 1140101 1140102 RSP_0020 RSP_0021   rpsI FALSE 0.008 341.000 0.000 NA   NA
 1140102 1140103 RSP_0021 RSP_0022 rpsI   TRUE 0.996 4.000 0.231 0.013 Y NA
 1140103 1140104 RSP_0022 RSP_6083     FALSE 0.039 205.000 0.000 NA   NA
 1140106 1140107 RSP_0025 RSP_0026     TRUE 0.943 -3.000 0.100 1.000 N NA
 1140107 1140108 RSP_0026 RSP_0027     FALSE 0.195 198.000 0.133 NA   NA
 1140109 1140110 RSP_0028 RSP_0029     FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000   NA
 1140111 1140112 RSP_0030 RSP_6084     TRUE 0.606 47.000 0.095 NA   NA
 1140114 1140115 RSP_0032 RSP_0033 fliA   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140115 1140116 RSP_0033 RSP_0034   flhA TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140117 1140118 RSP_0035 RSP_6086     TRUE 0.932 -3.000 0.052 NA   NA
 1140118 1140119 RSP_6086 RSP_0036   flgA TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 1140119 1140120 RSP_0036 RSP_0037 flgA flgM TRUE 0.579 22.000 0.021 NA   NA
 1140120 1140121 RSP_0037 RSP_6087 flgM   FALSE 0.504 29.000 0.021 NA   NA
 1140122 1140123 RSP_6088 RSP_6089     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140124 1140125 RSP_6090 RSP_0038     FALSE 0.234 54.000 0.000 NA   NA
 1140126 1140127 RSP_0039 RSP_0040   fliS TRUE 0.955 -3.000 0.095 NA   NA
 1140127 1140128 RSP_0040 RSP_0041 fliS   FALSE 0.013 284.000 0.000 NA   NA
 1140128 1140129 RSP_0041 RSP_0042   cheA3 TRUE 0.648 138.000 0.500 NA   NA
 1140129 1140130 RSP_0042 RSP_0043 cheA3 cheY6 TRUE 0.978 27.000 0.750 1.000 Y NA
 1140130 1140131 RSP_0043 RSP_0044 cheY6 tlpT TRUE 0.666 204.000 0.500 1.000 Y NA
 1140131 1140132 RSP_0044 RSP_0045 tlpT slp TRUE 0.921 -3.000 0.069 1.000 N NA
 1140132 1140133 RSP_0045 RSP_0046 slp cheW4 TRUE 0.771 13.000 0.069 1.000 N NA
 1140133 1140134 RSP_0046 RSP_0047 cheW4 cheB2 TRUE 0.971 19.000 0.083 0.009 Y NA
 1140134 1140135 RSP_0047 RSP_0048 cheB2 cheR3 TRUE 0.985 0.000 0.083 1.000 Y NA
 1140135 1140136 RSP_0048 RSP_0049 cheR3 cheA4 TRUE 0.979 -3.000 0.250 1.000   NA
 1140136 1140137 RSP_0049 RSP_6091 cheA4   FALSE 0.468 145.000 0.250 NA   NA
 1140138 1140139 RSP_0051 RSP_0052 torF fliE TRUE 0.907 14.000 0.273 1.000 N NA
 1140139 1140140 RSP_0052 RSP_0053 fliE fliF1 TRUE 0.959 20.000 0.040 0.008 Y NA
 1140140 1140141 RSP_0053 RSP_0054 fliF1 fliG TRUE 0.996 2.000 0.220 0.008 Y NA
 1140141 1140142 RSP_0054 RSP_0055 fliG fliH TRUE 0.997 4.000 0.320 0.005 Y NA
 1140142 1140143 RSP_0055 RSP_0056 fliH fliI TRUE 0.973 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 1140143 1140144 RSP_0056 RSP_0057 fliI fliJ TRUE 0.961 2.000 0.154 NA   NA
 1140144 1140145 RSP_0057 RSP_0058 fliJ fliK FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 1140145 1140146 RSP_0058 RSP_0059 fliK fliL TRUE 0.683 11.000 0.000 1.000   NA
 1140146 1140147 RSP_0059 RSP_0060 fliL fliM TRUE 0.990 4.000 0.016 0.001 Y NA
 1140147 1140148 RSP_0060 RSP_0061 fliM fliN FALSE 0.445 157.000 0.020 0.001   NA
 1140148 1140149 RSP_0061 RSP_0062 fliN fliO TRUE 0.667 132.000 0.443 1.000   NA
 1140149 1140150 RSP_0062 RSP_0063 fliO fliP TRUE 0.914 -3.000 0.029 1.000   NA
 1140150 1140151 RSP_0063 RSP_0064 fliP fliQ TRUE 0.996 0.000 0.177 0.008 Y NA
 1140151 1140152 RSP_0064 RSP_0065 fliQ fliR TRUE 0.997 0.000 0.215 0.002 Y NA
 1140152 1140153 RSP_0065 RSP_0066 fliR flhB TRUE 0.975 -13.000 0.111 1.000 Y NA
 1140153 1140154 RSP_0066 RSP_0067 flhB   TRUE 0.871 54.000 0.667 NA   NA
 1140154 1140155 RSP_0067 RSP_6092     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 1140156 1140157 RSP_0068 RSP_0069 rpoN2 fliC FALSE 0.448 176.000 0.500 1.000 N NA
 1140159 1140160 RSP_0071 RSP_0072 fleQ   TRUE 0.851 25.000 0.222 NA   NA
 1140160 1140161 RSP_0072 RSP_0073   flgL TRUE 0.976 7.000 0.375 NA   NA
 1140161 1140162 RSP_0073 RSP_0074 flgL flgK1 TRUE 0.997 8.000 0.357 0.001 Y NA
 1140162 1140163 RSP_0074 RSP_6093 flgK1 flgJ TRUE 0.594 108.000 0.217 NA   NA
 1140163 1140164 RSP_6093 RSP_0076 flgJ flgI TRUE 0.959 0.000 0.117 NA   NA
 1140164 1140165 RSP_0076 RSP_0077 flgI flgH TRUE 0.996 -3.000 0.149 0.010 Y NA
 1140165 1140166 RSP_0077 RSP_0078 flgH flgG TRUE 0.995 8.000 0.260 0.008 Y NA
 1140166 1140167 RSP_0078 RSP_0079 flgG flgF TRUE 0.863 54.000 0.174 1.000 Y NA
 1140167 1140168 RSP_0079 RSP_0080 flgF flgE TRUE 0.993 9.000 0.594 1.000 Y NA
 1140168 1140169 RSP_0080 RSP_0081 flgE flgD TRUE 0.981 25.000 0.875 NA Y NA
 1140169 1140170 RSP_0081 RSP_0082 flgD flgC TRUE 0.987 2.000 0.174 NA Y NA
 1140170 1140171 RSP_0082 RSP_0083 flgC flgB TRUE 0.997 0.000 0.222 0.005 Y NA
 1140173 1140174 RSP_0085 RSP_0086     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140177 1140178 RSP_0089 RSP_0090   smoC TRUE 0.968 -3.000 0.145 1.000   NA
 1140178 1140179 RSP_0090 RSP_0091 smoC smoE TRUE 0.557 108.000 0.236 1.000 N NA
 1140179 1140180 RSP_0091 RSP_0092 smoE smoF TRUE 0.919 102.000 0.306 0.066 Y NA
 1140180 1140181 RSP_0092 RSP_0093 smoF smoG TRUE 0.998 2.000 0.918 0.066 Y NA
 1140181 1140182 RSP_0093 RSP_0094 smoG smoK TRUE 0.995 8.000 0.373 0.066 Y NA
 1140182 1140183 RSP_0094 RSP_0095 smoK smoS TRUE 0.973 2.000 0.309 1.000 N NA
 1140183 1140184 RSP_0095 RSP_0096 smoS mtlK TRUE 0.835 54.000 0.235 0.039 N NA
 1140184 1140185 RSP_0096 RSP_4304 mtlK   FALSE 0.034 215.000 0.000 NA   NA
 1140185 1140186 RSP_4304 RSP_0097   smoM FALSE 0.033 217.000 0.000 NA   NA
 1140187 1140188 RSP_6094 RSP_0099     TRUE 0.995 -3.000 0.465 NA Y NA
 1140189 1140190 RSP_0100 RSP_0101 nuoA nuoB TRUE 0.998 -3.000 0.377 0.005 Y NA
 1140190 1140191 RSP_0101 RSP_0102 nuoB nuoCD TRUE 0.999 -3.000 0.691 0.005 Y NA
 1140191 1140192 RSP_0102 RSP_0103 nuoCD nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.407 0.011 Y NA
 1140192 1140193 RSP_0103 RSP_0104 nuoE nuoF TRUE 0.997 -3.000 0.236 0.011 Y NA
 1140193 1140194 RSP_0104 RSP_0105 nuoF nuoG TRUE 0.996 -3.000 0.184 0.011 Y NA
 1140194 1140195 RSP_0105 RSP_0106 nuoG nuoH TRUE 0.861 197.000 0.664 0.011 Y NA
 1140195 1140196 RSP_0106 RSP_0107 nuoH nuoI TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 1140196 1140197 RSP_0107 RSP_0108 nuoI nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.428 0.011 Y NA
 1140197 1140198 RSP_0108 RSP_0109 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.269 0.005 Y NA
 1140198 1140199 RSP_0109 RSP_0110 nuoK nuoL TRUE 0.988 2.000 0.016 0.011 Y NA
 1140199 1140200 RSP_0110 RSP_0111N nuoL nuoM TRUE 0.730 -9.000 0.000 NA   NA
 1140200 1140201 RSP_0111N RSP_0111C nuoM nuoM FALSE 0.273 44.000 0.000 NA   NA
 1140201 1140202 RSP_0111C RSP_0112 nuoM nuoN TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140202 1140203 RSP_0112 RSP_0113 nuoN   FALSE 0.297 33.000 0.011 1.000 N NA
 1140203 1140204 RSP_0113 RSP_0114     TRUE 0.894 -3.000 0.022 NA   NA
 1140205 1140206 RSP_0115 RSP_0116     FALSE 0.400 26.000 0.000 NA   NA
 1140206 1140207 RSP_0116 RSP_0117     TRUE 0.971 11.000 0.542 NA   NA
 1140207 1140208 RSP_0117 RSP_0118     TRUE 0.999 -3.000 0.792 0.003 Y NA
 1140208 1140209 RSP_0118 RSP_0119     FALSE 0.019 335.000 0.000 0.099 N NA
 1140209 1140210 RSP_0119 RSP_6095     FALSE 0.019 253.000 0.000 NA   NA
 1140211 1140212 RSP_6096 RSP_0122   cerR TRUE 0.923 111.000 0.286 0.019 Y NA
 1140212 1140213 RSP_0122 RSP_6213 cerR cerA FALSE 0.445 22.000 0.000 NA   NA
 1140213 1140214 RSP_6213 RSP_0123 cerA cerI TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140214 1140215 RSP_0123 RSP_0124 cerI   FALSE 0.508 115.000 0.154 NA   NA
 1140215 1140216 RSP_0124 RSP_0125   opgG FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA
 1140216 1140217 RSP_0125 RSP_0126 opgG   TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140217 1140218 RSP_0126 RSP_0127   opgH TRUE 0.788 4.000 0.000 NA   NA
 1140218 1140219 RSP_0127 RSP_0128 opgH opgC TRUE 0.972 -7.000 0.333 NA   NA
 1140219 1140220 RSP_0128 RSP_4296 opgC   FALSE 0.220 61.000 0.000 NA   NA
 1140220 1140221 RSP_4296 RSP_0129   metN FALSE 0.005 390.000 0.000 NA   NA
 1140221 1140222 RSP_0129 RSP_0130 metN metI TRUE 0.995 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 1140222 1140223 RSP_0130 RSP_0132 metI metQ TRUE 0.918 29.000 0.164 NA Y NA
 1140223 1140224 RSP_0132 RSP_0133 metQ   FALSE 0.007 236.000 0.000 NA N NA
 1140226 1140227 RSP_0134 RSP_0135     TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1140227 1140228 RSP_0135 RSP_0136     FALSE 0.137 119.000 0.000 NA   NA
 1140229 1140230 RSP_4322 RSP_0137     FALSE 0.147 113.000 0.000 NA   NA
 1140230 1140231 RSP_0137 RSP_0138     FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1140232 1140233 RSP_0139 RSP_0140     TRUE 0.985 21.000 0.319 0.013 Y NA
 1140233 1140234 RSP_0140 RSP_0141     TRUE 0.993 13.000 0.499 0.013 Y NA
 1140235 1140236 RSP_0142 RSP_4321     FALSE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 1140238 1140239 RSP_0144 RSP_0145     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140240 1140241 RSP_0146 RSP_0147 glnB glnA TRUE 0.810 82.000 0.145 1.000 Y NA
 1140242 1140243 RSP_0148 RSP_0149     TRUE 0.997 -3.000 0.273 0.018 Y NA
 1140243 1140244 RSP_0149 RSP_0150     TRUE 0.994 -3.000 0.341 1.000 Y NA
 1140245 1140246 RSP_0152 RSP_0151     TRUE 0.970 -3.000 0.172 NA   NA
 1140247 1140248 RSP_0153 RSP_0154     FALSE 0.218 147.000 0.056 NA   NA
 1140248 1140249 RSP_0154 RSP_0155     TRUE 0.993 -3.000 0.287 1.000 Y NA
 1140249 1140250 RSP_0155 RSP_0156     TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 1140250 1140251 RSP_0156 RSP_6098     FALSE 0.127 124.000 0.000 NA   NA
 1140251 1140252 RSP_6098 RSP_0157     FALSE 0.038 208.000 0.000 NA   NA
 1140252 1140253 RSP_0157 RSP_0158     TRUE 0.897 14.000 0.238 1.000 N NA
 1140253 1140254 RSP_0158 RSP_0159   galE-2 TRUE 0.993 -16.000 0.667 1.000 Y NA
 1140254 1140255 RSP_0159 RSP_0160 galE-2   TRUE 0.993 -7.000 0.143 0.004 Y NA
 1140256 1140257 RSP_0161 RSP_0162     FALSE 0.140 117.000 0.000 NA   NA
 1140258 1140259 RSP_0163 RSP_0164     FALSE 0.388 153.000 0.200 NA   NA
 1140263 1140264 RSP_6099 RSP_0169     TRUE 0.623 125.000 0.328 NA   NA
 1140264 1140265 RSP_0169 RSP_0170     TRUE 0.985 0.000 0.406 NA   NA
 1140265 1140266 RSP_0170 RSP_0171     TRUE 0.986 -3.000 0.429 NA   NA
 1140266 1140267 RSP_0171 RSP_0172     FALSE 0.520 162.000 0.397 1.000   NA
 1140267 1140268 RSP_0172 RSP_0173     FALSE 0.208 137.000 0.033 1.000   NA
 1140268 1140269 RSP_0173 RSP_0174   ucpA TRUE 0.987 10.000 0.143 0.070 Y NA
 1140273 1140274 RSP_0179 RSP_0180     TRUE 0.965 30.000 0.539 NA Y NA
 1140274 1140275 RSP_0180 RSP_0181     TRUE 0.999 -3.000 0.855 0.066 Y NA
 1140275 1140276 RSP_0181 RSP_0182     FALSE 0.153 109.000 0.000 NA   NA
 1140276 1140277 RSP_0182 RSP_6100     FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1140277 1140278 RSP_6100 RSP_0183   dht TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140278 1140279 RSP_0183 RSP_0184 dht   FALSE 0.502 75.000 0.137 1.000 N NA
 1140280 1140281 RSP_0185 RSP_0186     TRUE 0.576 190.000 0.042 0.005 Y NA
 1140282 1140283 RSP_0187 RSP_0188     FALSE 0.256 73.000 0.010 NA   NA
 1140283 1140284 RSP_0188 RSP_0189     FALSE 0.306 64.000 0.017 NA   NA
 1140285 1140286 RSP_0190 RSP_0191 accB accC TRUE 0.994 8.000 0.153 0.001 Y NA
 1140286 1140287 RSP_0191 RSP_0192 accC aat TRUE 0.765 20.000 0.114 1.000 N NA
 1140288 1140289 RSP_0193 RSP_0194     TRUE 0.959 -3.000 0.108 NA   NA
 1140289 1140290 RSP_0194 RSP_0195     TRUE 0.971 0.000 0.199 NA   NA
 1140290 1140291 RSP_0195 RSP_0196   clpX FALSE 0.098 125.000 0.009 1.000 N NA
 1140291 1140292 RSP_0196 RSP_0197 clpX clpP TRUE 0.836 125.000 0.352 1.000 Y NA
 1140292 1140293 RSP_0197 RSP_0198 clpP   FALSE 0.040 167.000 0.004 1.000 N NA
 1140294 1140295 RSP_0200 RSP_0201     TRUE 0.995 -3.000 0.627 0.066   NA
 1140295 1140296 RSP_0201 RSP_6101     TRUE 0.990 -3.000 0.602 1.000   NA
 1140296 1140297 RSP_6101 RSP_0202     FALSE 0.108 133.000 0.000 NA   NA
 1140299 1140300 RSP_0204 RSP_4299     FALSE 0.222 60.000 0.000 NA   NA
 1140300 1140301 RSP_4299 RSP_0205     FALSE 0.418 24.000 0.000 NA   NA
 1140302 1140303 RSP_0206 RSP_0207     TRUE 0.888 36.000 0.500 NA   NA
 1140303 1140304 RSP_0207 RSP_0208     TRUE 0.986 2.000 0.500 NA   NA
 1140304 1140305 RSP_0208 RSP_0209     TRUE 0.976 2.000 0.286 NA   NA
 1140305 1140306 RSP_0209 RSP_0211     TRUE 0.946 0.000 0.080 NA   NA
 1140306 1140307 RSP_0211 RSP_0212     FALSE 0.345 87.000 0.040 NA   NA
 1140307 1140308 RSP_0212 RSP_0213     TRUE 0.730 -9.000 0.000 NA   NA
 1140308 1140309 RSP_0213 RSP_0214     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140309 1140310 RSP_0214 RSP_0215     FALSE 0.066 163.000 0.000 NA   NA
 1140310 1140311 RSP_0215 RSP_0216     FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 1140311 1140312 RSP_0216 RSP_6102     FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 1140312 1140313 RSP_6102 RSP_0217   int FALSE 0.466 20.000 0.000 NA   NA
 1140316 1140317 RSP_0219 RSP_0220     FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 1140317 1140318 RSP_0220 RSP_6103     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1140318 1140319 RSP_6103 RSP_0221     FALSE 0.171 94.000 0.000 NA   NA
 1140319 1140320 RSP_0221 RSP_0223     TRUE 0.946 14.000 0.394 NA   NA
 1140320 1140321 RSP_0223 RSP_0224     TRUE 0.983 6.000 0.515 NA   NA
 1140322 1140323 RSP_4314 RSP_6104     FALSE 0.002 1046.000 0.000 NA   NA
 1140324 1140325 RSP_0226 RSP_0227     TRUE 0.851 -3.000 0.000 1.000   NA
 1140325 1140326 RSP_0227 RSP_0229     TRUE 0.950 -13.000 0.044 0.055   NA
 1140327 1140328 RSP_0228 RSP_0230 hmuS   FALSE 0.208 87.000 0.000 1.000   NA
 1140328 1140329 RSP_0230 RSP_6105     FALSE 0.342 33.000 0.000 NA   NA
 1140329 1140330 RSP_6105 RSP_0231   motB FALSE 0.097 138.000 0.000 NA   NA
 1140330 1140331 RSP_0231 RSP_0233 motB motA TRUE 0.743 10.000 0.030 1.000 N NA
 1140331 1140332 RSP_0233 RSP_0234 motA tlpL FALSE 0.051 512.000 0.000 0.009 Y NA
 1140332 1140333 RSP_0234 RSP_6106 tlpL   FALSE 0.005 401.000 0.000 NA   NA
 1140335 1140336 RSP_0236 RSP_0237   argE TRUE 0.990 0.000 0.182 1.000 Y NA
 1140336 1140337 RSP_0237 RSP_0238 argE   FALSE 0.226 135.000 0.045 NA   NA
 1140337 1140338 RSP_0238 RSP_0239   PntB FALSE 0.019 285.000 0.012 NA   NA
 1140338 1140339 RSP_0239 RSP_0240 PntB pntA TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 1140339 1140340 RSP_0240 RSP_0241 pntA   FALSE 0.194 139.000 0.071 NA N NA
 1140341 1140342 RSP_0242 RSP_0243     FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 1140343 1140344 RSP_0244 RSP_0245     FALSE 0.033 227.000 0.000 1.000   NA
 1140345 1140346 RSP_0246 RSP_0247     TRUE 0.827 -10.000 0.017 1.000   NA
 1140349 1140350 RSP_0250 RSP_0251     TRUE 0.785 131.000 0.852 NA   NA
 1140350 1140351 RSP_0251 RSP_0252     TRUE 0.570 48.000 0.121 1.000 N NA
 1140353 1140354 RSP_0254 RSP_0255 dxsA pufX FALSE 0.456 174.000 0.385 NA   NA
 1140354 1140355 RSP_0255 RSP_0256 pufX pufM TRUE 0.883 13.000 0.132 NA   NA
 1140355 1140356 RSP_0256 RSP_0257 pufM pufL TRUE 0.996 -7.000 0.895 0.003   NA
 1140356 1140357 RSP_0257 RSP_0258 pufL pufA TRUE 0.923 124.000 0.829 0.003   NA
 1140357 1140358 RSP_0258 RSP_6108 pufA pufB TRUE 0.992 14.000 0.946 0.003   NA
 1140358 1140359 RSP_6108 RSP_6109 pufB pufK TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140359 1140360 RSP_6109 RSP_0259 pufK pufQ FALSE 0.207 67.000 0.000 NA   NA
 1140360 1140361 RSP_0259 RSP_0260 pufQ bchZ TRUE 0.993 -3.000 0.231 0.002   NA
 1140361 1140362 RSP_0260 RSP_0261 bchZ bchY TRUE 0.997 0.000 0.632 0.002   NA
 1140362 1140363 RSP_0261 RSP_0262 bchY bchX TRUE 0.927 76.000 0.491 0.002   NA
 1140363 1140364 RSP_0262 RSP_0263 bchX bchC TRUE 0.997 -3.000 0.882 0.002 N NA
 1140364 1140365 RSP_0263 RSP_0264 bchC crtF TRUE 0.653 153.000 0.627 1.000   NA
 1140365 1140366 RSP_0264 RSP_0265 crtF crtE TRUE 0.850 53.000 0.500 1.000   NA
 1140367 1140368 RSP_0266 RSP_0267 crtD ctrC TRUE 0.932 66.000 0.434 0.001   NA
 1140369 1140370 RSP_0269 RSP_0270 tspO crtB FALSE 0.504 32.000 0.050 1.000 N NA
 1140370 1140371 RSP_0270 RSP_0271 crtB crtI TRUE 0.978 -3.000 0.332 1.000 N NA
 1140372 1140373 RSP_0272 RSP_0273 crtA bchI TRUE 0.949 5.000 0.131 NA   NA
 1140373 1140374 RSP_0273 RSP_0274 bchI bchD TRUE 0.998 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 1140374 1140375 RSP_0274 RSP_0275 bchD bchO TRUE 0.962 3.000 0.152 1.000   NA
 1140376 1140377 RSP_0276 RSP_0277   bchP TRUE 0.880 3.000 0.050 1.000 N NA
 1140377 1140378 RSP_0277 RSP_0278 bchP   TRUE 0.978 3.000 0.314 NA   NA
 1140378 1140379 RSP_0278 RSP_0279   bchG TRUE 0.990 -3.000 0.640 NA   NA
 1140379 1140380 RSP_0279 RSP_0280 bchG bchJ TRUE 0.764 74.000 0.060 0.002   NA
 1140380 1140381 RSP_0280 RSP_0281 bchJ bchE TRUE 0.977 7.000 0.368 1.000   NA
 1140381 1140382 RSP_0281 RSP_0282 bchE ppsR FALSE 0.186 148.000 0.035 1.000   NA
 1140382 1140383 RSP_0282 RSP_0283 ppsR ppaA TRUE 0.797 59.000 0.357 1.000   NA
 1140384 1140385 RSP_0284 RSP_0285 bchF bchN TRUE 0.995 -3.000 0.311 0.001   NA
 1140385 1140386 RSP_0285 RSP_0286 bchN bchB TRUE 0.976 71.000 0.591 0.001 Y NA
 1140386 1140387 RSP_0286 RSP_0287 bchB bchH TRUE 0.984 -10.000 0.278 0.004 N NA
 1140387 1140388 RSP_0287 RSP_0288 bchH bchL TRUE 0.890 62.000 0.344 0.004 N NA
 1140388 1140389 RSP_0288 RSP_0289 bchL bchM TRUE 0.898 44.000 0.274 0.004 N NA
 1140389 1140390 RSP_0289 RSP_0290 bchM   TRUE 0.960 -3.000 0.111 NA   NA
 1140390 1140391 RSP_0290 RSP_0291   puhA TRUE 0.926 19.000 0.382 NA   NA
 1140391 1140392 RSP_0291 RSP_0292 puhA   TRUE 0.809 128.000 0.912 NA   NA
 1140392 1140393 RSP_0292 RSP_0293     TRUE 0.809 77.000 0.515 NA   NA
 1140393 1140394 RSP_0293 RSP_6110     TRUE 0.930 22.000 0.481 NA   NA
 1140394 1140395 RSP_6110 RSP_0294     TRUE 0.984 -3.000 0.361 NA   NA
 1140395 1140396 RSP_0294 RSP_0295     TRUE 0.789 62.000 0.375 NA   NA
 1140396 1140397 RSP_0295 RSP_0296   cycA FALSE 0.008 340.000 0.000 NA   NA
 1140398 1140399 RSP_0297 RSP_0298     TRUE 0.996 -3.000 0.731 0.025   NA
 1140399 1140400 RSP_0298 RSP_0299     TRUE 0.993 -3.000 0.823 1.000   NA
 1140400 1140401 RSP_0299 RSP_0300     FALSE 0.177 367.000 0.121 0.065 Y NA
 1140401 1140402 RSP_0300 RSP_0301     TRUE 0.830 64.000 0.150 NA Y NA
 1140402 1140403 RSP_0301 RSP_0302   ureG FALSE 0.007 300.000 0.010 NA N NA
 1140403 1140404 RSP_0302 RSP_0303 ureG ureF TRUE 0.997 -3.000 0.283 0.003 Y NA
 1140404 1140405 RSP_0303 RSP_0304 ureF ureE TRUE 0.998 -3.000 0.330 0.003 Y NA
 1140405 1140406 RSP_0304 RSP_0305 ureE   TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140406 1140407 RSP_0305 RSP_6111   ureC TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140409 1140410 RSP_0307 RSP_0308   ureB FALSE 0.496 25.000 0.010 NA   NA
 1140410 1140411 RSP_0308 RSP_0309 ureB ureA TRUE 0.982 51.000 0.595 0.001 Y NA
 1140411 1140412 RSP_0309 RSP_0310 ureA ureD TRUE 0.987 12.000 0.664 0.003 N NA
 1140413 1140414 RSP_0311 RSP_0312     TRUE 0.762 35.000 0.176 NA   NA
 1140414 1140415 RSP_0312 RSP_0313     FALSE 0.220 61.000 0.000 NA   NA
 1140415 1140416 RSP_0313 RSP_0314   pucB TRUE 0.746 -7.000 0.000 NA   NA
 1140416 1140417 RSP_0314 RSP_6256 pucB pucA TRUE 0.991 16.000 1.000 0.003   NA
 1140417 1140418 RSP_6256 RSP_0315 pucA pucC FALSE 0.273 195.000 0.222 NA   NA
 1140418 1140419 RSP_0315 RSP_0316 pucC   FALSE 0.003 500.000 0.000 NA   NA
 1140420 1140421 RSP_0317 RSP_0318 hemN   FALSE 0.343 74.000 0.034 NA   NA
 1140421 1140422 RSP_0318 RSP_0319     TRUE 0.913 -3.000 0.034 NA   NA
 1140422 1140423 RSP_0319 RSP_0320   NnrT TRUE 0.984 -3.000 0.364 NA   NA
 1140423 1140424 RSP_0320 RSP_0321 NnrT norD TRUE 0.940 2.000 0.082 NA   NA
 1140424 1140425 RSP_0321 RSP_0322 norD norQ TRUE 0.996 5.000 0.590 0.001   NA
 1140425 1140426 RSP_0322 RSP_0323 norQ norB TRUE 0.997 -3.000 0.529 0.001   NA
 1140426 1140427 RSP_0323 RSP_0324 norB norC TRUE 0.991 14.000 0.794 0.001   NA
 1140428 1140429 RSP_0325 RSP_0326     FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 1140431 1140432 RSP_0328 RSP_0329 nnrS   FALSE 0.141 134.000 0.041 NA N NA
 1140433 1140434 RSP_0330 RSP_0331     FALSE 0.470 23.000 0.000 1.000   NA
 1140434 1140435 RSP_0331 RSP_0332     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 1140435 1140436 RSP_0332 RSP_0333     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 1140436 1140437 RSP_0333 RSP_0334     TRUE 0.944 34.000 1.000 NA   NA
 1140439 1140440 RSP_0337 RSP_0338     TRUE 0.987 -3.000 0.446 1.000   NA
 1140440 1140441 RSP_0338 RSP_0339     FALSE 0.240 75.000 0.002 1.000   NA
 1140441 1140442 RSP_0339 RSP_0340     FALSE 0.078 161.000 0.002 NA   NA
 1140442 1140443 RSP_0340 RSP_0341     FALSE 0.067 190.000 0.012 NA   NA
 1140443 1140444 RSP_0341 RSP_0342     TRUE 0.967 0.000 0.151 1.000   NA
 1140444 1140445 RSP_0342 RSP_0343     TRUE 0.933 92.000 0.976 0.065   NA
 1140445 1140446 RSP_0343 RSP_0344     TRUE 0.988 -10.000 0.864 1.000   NA
 1140446 1140447 RSP_0344 RSP_0345     TRUE 0.990 -3.000 0.591 1.000   NA
 1140448 1140449 RSP_0346 RSP_0347     TRUE 0.656 155.000 0.301 0.065   NA
 1140449 1140450 RSP_0347 RSP_0348     TRUE 0.996 -3.000 0.774 0.065   NA
 1140450 1140451 RSP_0348 RSP_0349     TRUE 0.988 17.000 0.461 0.065 Y NA
 1140451 1140452 RSP_0349 RSP_0350     FALSE 0.438 54.000 0.045 NA   NA
 1140452 1140453 RSP_0350 RSP_0351     TRUE 0.963 4.000 0.182 NA   NA
 1140455 1140456 RSP_0353 RSP_0354     FALSE 0.014 279.000 0.000 NA   NA
 1140457 1140458 RSP_0355 RSP_0356     TRUE 0.757 153.000 0.084 0.008 Y NA
 1140458 1140459 RSP_0356 RSP_0357     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.008 Y NA
 1140459 1140460 RSP_0357 RSP_0358   gor FALSE 0.285 56.000 0.032 1.000 N NA
 1140460 1140461 RSP_0358 RSP_0359 gor cbbI TRUE 0.799 5.000 0.026 1.000 N NA
 1140461 1140462 RSP_0359 RSP_0360 cbbI   FALSE 0.371 29.000 0.000 NA   NA
 1140463 1140464 RSP_0361 RSP_0362 sda   FALSE 0.505 17.000 0.000 NA   NA
 1140464 1140465 RSP_0362 RSP_0364     TRUE 0.829 -3.000 0.000 NA   NA
 1140466 1140467 RSP_0363 RSP_0365     FALSE 0.240 52.000 0.000 NA   NA
 1140467 1140468 RSP_0365 RSP_6113     FALSE 0.159 103.000 0.000 NA   NA
 1140468 1140469 RSP_6113 RSP_0366     FALSE 0.322 80.000 0.030 NA   NA
 1140470 1140471 RSP_0367 RSP_0368     FALSE 0.173 163.000 0.083 1.000 N NA
 1140471 1140472 RSP_0368 RSP_0369     FALSE 0.061 179.000 0.003 NA   NA
 1140472 1140473 RSP_0369 RSP_0370     FALSE 0.277 81.000 0.017 NA   NA
 1140473 1140474 RSP_0370 RSP_0371     FALSE 0.421 164.000 0.290 NA   NA
 1140474 1140475 RSP_0371 RSP_0372     TRUE 0.964 43.000 0.774 1.000 Y NA
 1140475 1140476 RSP_0372 RSP_0373     TRUE 0.980 40.000 0.724 0.078 Y NA
 1140476 1140477 RSP_0373 RSP_0374     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.065 Y NA
 1140477 1140478 RSP_0374 RSP_0375     TRUE 0.994 5.000 0.481 1.000 Y NA
 1140478 1140479 RSP_0375 RSP_0376     TRUE 0.690 60.000 0.278 1.000 N NA
 1140479 1140480 RSP_0376 RSP_0377     TRUE 0.970 5.000 0.329 1.000 N NA
 1140480 1140481 RSP_0377 RSP_0378     TRUE 0.997 -3.000 0.706 1.000 Y NA
 1140481 1140482 RSP_0378 RSP_0379     FALSE 0.005 305.000 0.000 1.000 N NA
 1140483 1140484 RSP_0380 RSP_0381     FALSE 0.193 127.000 0.021 NA   NA
 1140484 1140485 RSP_0381 RSP_0382     FALSE 0.184 154.000 0.049 NA   NA
 1140488 1140489 RSP_0385 RSP_0386     FALSE 0.001 510.000 0.000 1.000 N NA
 1140490 1140491 RSP_0387 RSP_0388     FALSE 0.253 67.000 0.006 NA   NA
 1140491 1140492 RSP_0388 RSP_0389   folA FALSE 0.388 34.000 0.005 NA   NA
 1140492 1140493 RSP_0389 RSP_0390 folA   TRUE 0.975 0.000 0.295 1.000 N NA
 1140495 1140496 RSP_0393 RSP_0394     TRUE 0.895 15.000 0.277 NA N NA
 1140496 1140497 RSP_0394 RSP_0396     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 1140497 1140498 RSP_0396 RSP_0395   rpoD TRUE 0.659 12.000 0.004 NA   NA
 1140498 1140499 RSP_0395 RSP_0397 rpoD dnaG TRUE 0.614 105.000 0.299 1.000 N NA
 1140499 1140500 RSP_0397 RSP_0398 dnaG   FALSE 0.079 123.000 0.002 1.000 N NA
 1140501 1140502 RSP_0399 RSP_0400     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 1140502 1140503 RSP_0400 RSP_0401     TRUE 0.948 4.000 0.111 NA   NA
 1140505 1140506 RSP_0403 RSP_0404     FALSE 0.505 63.000 0.112 1.000 N NA
 1140506 1140507 RSP_0404 RSP_0405     TRUE 0.908 -3.000 0.055 1.000 N NA
 1140507 1140508 RSP_0405 RSP_4312     FALSE 0.198 71.000 0.000 NA   NA
 1140509 1140510 RSP_0406 RSP_0407     FALSE 0.026 213.000 0.008 1.000 N NA
 1140511 1140512 RSP_0408 RSP_0409     TRUE 0.967 -3.000 0.154 NA   NA
 1140513 1140514 RSP_0410 RSP_6114     TRUE 0.972 0.000 0.192 1.000   NA
 1140514 1140515 RSP_6114 RSP_0411     FALSE 0.477 64.000 0.067 NA   NA
 1140515 1140516 RSP_0411 RSP_0412     FALSE 0.199 122.000 0.017 NA   NA
 1140516 1140517 RSP_0412 RSP_6115     TRUE 0.603 56.000 0.118 NA   NA
 1140519 1140520 RSP_0414 RSP_6227     TRUE 0.977 2.000 0.292 NA   NA
 1140520 1140521 RSP_6227 RSP_0415     TRUE 0.951 2.000 0.109 NA   NA
 1140521 1140522 RSP_0415 RSP_0416     FALSE 0.093 77.000 0.000 1.000 N NA
 1140523 1140524 RSP_0418 RSP_0419     TRUE 0.967 -31.000 0.362 NA   NA
 1140525 1140526 RSP_0420 RSP_0421     TRUE 0.878 16.000 0.167 NA   NA
 1140526 1140527 RSP_0421 RSP_0422     TRUE 0.958 -12.000 0.250 NA   NA
 1140527 1140528 RSP_0422 RSP_0423     FALSE 0.257 79.000 0.012 NA   NA
 1140529 1140530 RSP_0424 RSP_0425   metG FALSE 0.089 144.000 0.000 NA   NA
 1140531 1140532 RSP_0426 RSP_0427     FALSE 0.365 74.000 0.041 NA   NA
 1140532 1140533 RSP_0427 RSP_0428     FALSE 0.007 344.000 0.000 NA   NA
 1140537 1140538 RSP_0431 RSP_0432     TRUE 0.938 10.000 0.176 NA   NA
 1140538 1140539 RSP_0432 RSP_0433     TRUE 0.994 -3.000 0.964 NA   NA
 1140539 1140540 RSP_0433 RSP_0434   SufD TRUE 0.800 2.000 0.000 NA   NA
 1140540 1140541 RSP_0434 RSP_0437 SufD SufC TRUE 0.822 0.000 0.000 NA   NA
 1140541 1140542 RSP_0437 RSP_0439 SufC   TRUE 0.734 10.000 0.004 NA   NA
 1140542 1140543 RSP_0439 RSP_0440   sufB FALSE 0.361 35.000 0.003 NA   NA
 1140543 1140544 RSP_0440 RSP_0442 sufB   FALSE 0.464 76.000 0.109 1.000 N NA
 1140544 1140545 RSP_0442 RSP_0443     FALSE 0.536 83.000 0.183 NA N NA
 1140546 1140547 RSP_0444 RSP_0445     TRUE 0.905 -3.000 0.022 1.000   NA
 1140547 1140548 RSP_0445 RSP_0446     FALSE 0.343 85.000 0.031 1.000   NA
 1140548 1140549 RSP_0446 RSP_0447     FALSE 0.013 311.000 0.008 NA   NA
 1140549 1140550 RSP_0447 RSP_0448     FALSE 0.186 100.000 0.002 NA   NA
 1140551 1140552 RSP_0449 RSP_0450     FALSE 0.200 156.000 0.060 NA   NA
 1140552 1140553 RSP_0450 RSP_0451   alaS TRUE 0.879 2.000 0.024 NA   NA
 1140553 1140554 RSP_0451 RSP_0452 alaS recA FALSE 0.307 87.000 0.054 1.000 N NA
 1140556 1140557 RSP_0454 RSP_0455     FALSE 0.228 100.000 0.045 NA N NA
 1140559 1140560 RSP_0456 RSP_0458     TRUE 0.969 2.000 0.208 NA   NA
 1140562 1140563 RSP_0460 RSP_0461     TRUE 0.931 -7.000 0.165 NA N NA
 1140565 1140566 RSP_0463 RSP_0464     FALSE 0.081 131.000 0.006 1.000 N NA
 1140566 1140567 RSP_0464 RSP_0465     TRUE 0.999 5.000 0.948 0.004 Y NA
 1140567 1140568 RSP_0465 RSP_0466     TRUE 0.980 0.000 0.381 1.000 N NA
 1140569 1140570 RSP_0467 RSP_0468 ubiD   TRUE 0.980 -3.000 0.051 NA Y NA
 1140571 1140572 RSP_0469 RSP_0470     FALSE 0.212 84.000 0.000 1.000   NA
 1140573 1140574 RSP_6116 RSP_0472     FALSE 0.249 105.000 0.022 NA   NA
 1140574 1140575 RSP_0472 RSP_0473     TRUE 0.934 -3.000 0.055 NA   NA
 1140575 1140576 RSP_0473 RSP_0474   cycP FALSE 0.014 220.000 0.000 1.000 N NA
 1140576 1140577 RSP_0474 RSP_0475 cycP   TRUE 0.987 4.000 0.035 0.058 Y NA
 1140582 1140583 RSP_0480 RSP_0481 uxuB   TRUE 0.949 17.000 0.318 0.068 N NA
 1140583 1140584 RSP_0481 RSP_0482   kduI TRUE 0.986 -3.000 0.529 1.000 N NA
 1140584 1140585 RSP_0482 RSP_0483 kduI   FALSE 0.235 142.000 0.059 NA   NA
 1140585 1140586 RSP_0483 RSP_0484     TRUE 0.883 8.000 0.050 NA   NA
 1140586 1140587 RSP_0484 RSP_0485     TRUE 0.993 3.000 0.390 NA Y NA
 1140587 1140588 RSP_0485 RSP_0487     TRUE 0.947 63.000 0.756 NA Y NA
 1140588 1140589 RSP_0487 RSP_0488   uxaC TRUE 0.916 26.000 0.115 1.000 Y NA
 1140590 1140591 RSP_0489 RSP_0490     FALSE 0.358 139.000 0.182 1.000 N NA
 1140591 1140592 RSP_0490 RSP_0491   hupT FALSE 0.002 427.000 0.000 1.000 N NA
 1140592