MicrobesOnline Operon Predictions for Pyrococcus abyssi GE5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 4595 4596 PAB2353 PAB2352 rpl11P   FALSE 0.550 12.000 0.038 1.000 N NA
 4596 4597 PAB2352 PAB3002     TRUE 0.975 5.000 0.506 1.000 N NA
 4597 4598 PAB3002 PAB2351   ftsZ-1 FALSE 0.334 53.000 0.272 1.000 N NA
 4598 4599 PAB2351 PAB2350 ftsZ-1   FALSE 0.069 69.000 0.044 NA   NA
 4599 4600 PAB2350 PAB2349     FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 4601 402686 PAB0004 PABt01   tRNA-Pro FALSE 0.128 40.000 0.000 NA   NA
 402686 4602 PABt01 PAB0005 tRNA-Pro   FALSE 0.007 788.000 0.000 NA   NA
 4602 4603 PAB0005 PAB0006     FALSE 0.013 278.000 0.000 NA   NA
 4604 4605 PAB2347 PAB2346 nadC   TRUE 0.691 4.000 0.002 1.000   NA
 4605 4606 PAB2346 PAB2345     TRUE 0.737 2.000 0.003 1.000   NA
 4606 4607 PAB2345 PAB2344     FALSE 0.279 13.000 0.003 NA   NA
 4607 4608 PAB2344 PAB2343     FALSE 0.101 32.000 0.006 NA   NA
 4608 4609 PAB2343 PAB2342     TRUE 0.799 -3.000 0.009 1.000   NA
 4613 4614 PAB2340 PAB2339     TRUE 0.979 -13.000 0.667 NA   NA
 4614 4615 PAB2339 PAB2338     FALSE 0.085 49.000 0.000 NA   NA
 4615 4616 PAB2338 PAB2337     TRUE 0.778 7.000 0.051 1.000 N NA
 4616 4617 PAB2337 PAB2336     FALSE 0.041 79.000 0.000 1.000 N NA
 4617 4618 PAB2336 PAB2335     TRUE 0.996 6.000 0.368 0.042 Y NA
 4618 4619 PAB2335 PAB2334     TRUE 0.999 -3.000 0.897 0.042 Y NA
 4619 4620 PAB2334 PAB2333     TRUE 0.960 40.000 0.674 0.042 Y NA
 4622 4623 PAB3009 PAB0018a     TRUE 0.997 1.000 0.511 1.000 Y NA
 4624 4625 PAB0018 PAB0019 ubiA   TRUE 0.794 1.000 0.026 NA   NA
 4625 4626 PAB0019 PAB2354   putP-3 FALSE 0.015 244.000 0.000 NA   NA
 4627 4628 PAB2330 PAB2329 aor-3   TRUE 0.957 -9.000 0.222 1.000   NA
 4628 4629 PAB2329 PAB2328     FALSE 0.010 589.000 0.000 1.000   NA
 4629 4630 PAB2328 PAB2327     FALSE 0.040 102.000 0.000 1.000   NA
 4632 1793214 PAB2326 PAB2325     FALSE 0.011 338.000 0.000 NA   NA
 1793214 4634 PAB2325 PAB2324     TRUE 0.948 -30.000 0.500 NA   NA
 4634 4635 PAB2324 PAB2323     FALSE 0.019 116.000 0.000 NA N NA
 4635 4636 PAB2323 PAB2322     FALSE 0.260 27.000 0.000 NA   NA
 4636 4637 PAB2322 PAB2321     FALSE 0.028 323.000 0.082 NA   NA
 4637 4638 PAB2321 PAB2320   cobS-1 FALSE 0.021 109.000 0.000 NA N NA
 4638 4639 PAB2320 PAB3017 cobS-1   TRUE 0.707 -3.000 0.003 NA   NA
 4639 4640 PAB3017 PAB2319     TRUE 0.890 -7.000 0.062 NA   NA
 4641 4642 PAB0025 PAB0026 cbib hisC TRUE 0.874 -15.000 0.084 1.000 N NA
 4643 4644 PAB2318 PAB2317     FALSE 0.168 33.000 0.032 1.000 N NA
 4644 4645 PAB2317 PAB2316   rpoL TRUE 0.791 -24.000 0.003 0.058 N NA
 4645 4646 PAB2316 PAB2315 rpoL   FALSE 0.343 -40.000 0.008 NA   NA
 4646 4647 PAB2315 PAB2314     TRUE 0.961 -3.000 0.163 NA   NA
 4647 4648 PAB2314 PAB2313     FALSE 0.560 -33.000 0.023 1.000   NA
 4648 4649 PAB2313 PAB2312     TRUE 0.951 9.000 0.333 1.000   NA
 4649 4650 PAB2312 PAB2311     TRUE 0.996 4.000 0.167 0.025 Y NA
 4650 4651 PAB2311 PAB2310     FALSE 0.044 92.000 0.034 1.000   NA
 4653 4654 PAB2307 PAB2306     FALSE 0.102 35.000 0.018 1.000 N NA
 4654 4655 PAB2306 PAB2305     TRUE 0.995 6.000 0.720 NA Y NA
 4655 4656 PAB2305 PAB2304     FALSE 0.045 79.000 0.000 NA   NA
 4656 4657 PAB2304 PAB2303     FALSE 0.075 62.000 0.000 1.000   NA
 4658 4659 PAB2302 PAB2301     TRUE 0.864 -22.000 0.000 0.049 N NA
 4660 4661 PAB0033 PAB0034 rps15P recJ-like TRUE 0.725 19.000 0.177 1.000 N NA
 4661 4662 PAB0034 PAB0035 recJ-like rps3AE FALSE 0.015 226.000 0.000 1.000 N NA
 4663 4664 PAB2299 PAB3022     FALSE 0.034 82.000 0.028 NA   NA
 4664 4665 PAB3022 PAB2298     FALSE 0.449 14.000 0.034 NA   NA
 4666 1793217 PAB0036 PABsnRNA44     TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793217 4667 PABsnRNA44 PAB0037     TRUE 0.660 -22.000 0.000 NA   NA
 4667 1793219 PAB0037 PABsnRNA21     FALSE 0.018 202.000 0.000 NA   NA
 4668 4669 PAB2294 PAB2293     FALSE 0.037 56.000 0.012 NA   NA
 4674 4675 PAB0041 PAB0042     FALSE 0.028 62.000 0.007 NA   NA
 4675 4676 PAB0042 PAB0043     TRUE 0.894 -82.000 0.375 NA   NA
 1793222 4678 PABsnRNA20 PAB0044     FALSE 0.108 42.000 0.000 NA   NA
 4678 4679 PAB0044 PAB0045     FALSE 0.299 24.000 0.000 NA   NA
 4679 4680 PAB0045 PAB0046     TRUE 0.868 -3.000 0.038 NA   NA
 4681 4682 PAB2288 PAB2287     FALSE 0.014 261.000 0.000 NA   NA
 4683 4684 PAB0049 PAB0050   speB FALSE 0.024 64.000 0.010 1.000 N NA
 4684 1793224 PAB0050 PAB0051 speB   TRUE 0.731 -3.000 0.010 NA   NA
 4688 4689 PAB0053 PAB0054     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 4689 4690 PAB0054 PAB0055     TRUE 0.829 -76.000 0.222 NA   NA
 4690 4691 PAB0055 PAB0056     TRUE 0.950 -10.000 0.222 NA   NA
 4691 4692 PAB0056 PAB0057   ppsA FALSE 0.032 117.000 0.042 1.000 N NA
 4692 4693 PAB0057 PAB0058 ppsA   FALSE 0.114 45.000 0.000 1.000   NA
 4693 4694 PAB0058 PAB0059     TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.048   NA
 4694 4695 PAB0059 PAB0060     FALSE 0.032 75.000 0.008 1.000   NA
 4695 4696 PAB0060 PAB0061     FALSE 0.038 87.000 0.000 NA   NA
 4696 4697 PAB0061 PAB0062     FALSE 0.174 35.000 0.000 NA   NA
 4697 4698 PAB0062 PAB0063   cca TRUE 0.991 1.000 0.096 1.000 Y NA
 4701 4702 PAB2278 PAB2277 icc   TRUE 0.983 -3.000 0.348 1.000   NA
 4703 4704 PAB0066 PAB0067     TRUE 0.755 4.000 0.019 1.000   NA
 4704 4705 PAB0067 PAB0068   rfcS TRUE 0.803 28.000 0.000 1.000 Y NA
 4705 4706 PAB0068 PAB0069 rfcS rfcL TRUE 0.936 12.000 0.000 1.000 Y NA
 4707 4708 PAB2273 PAB2272 moaA   FALSE 0.060 70.000 0.039 NA   NA
 4709 4710 PAB0070 PAB0071     TRUE 0.751 -70.000 0.107 NA   NA
 4711 4712 PAB2271 PAB3032     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 4712 4713 PAB3032 PAB2270     FALSE 0.026 123.000 0.000 NA   NA
 4713 4714 PAB2270 PAB2269     TRUE 0.902 -19.000 0.136 1.000   NA
 4714 4715 PAB2269 PAB2404     FALSE 0.033 138.000 0.038 1.000   NA
 4715 4716 PAB2404 PAB2266     TRUE 0.996 0.000 0.056 0.003 Y NA
 4716 4717 PAB2266 PAB2265     TRUE 0.989 0.000 0.063 1.000 Y NA
 4717 4718 PAB2265 PAB2264   mtaP FALSE 0.007 800.000 0.000 1.000 N NA
 4719 4720 PAB0075 PAB0076     TRUE 0.976 10.000 0.925 NA   NA
 4722 1793226 PAB0078 PABsnRNA3     TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793226 4723 PABsnRNA3 PAB0079     TRUE 0.660 -22.000 0.000 NA   NA
 4724 4725 PAB2261 PAB2260   cbiO TRUE 0.999 -3.000 0.530 0.002 Y NA
 4726 4727 PAB0081 PAB0082     TRUE 0.929 12.000 0.400 1.000   NA
 4727 4728 PAB0082 PAB0083     FALSE 0.030 136.000 0.000 1.000   NA
 4728 4729 PAB0083 PAB0084   napA-1 FALSE 0.092 54.000 0.000 1.000   NA
 4729 4730 PAB0084 PAB0085 napA-1   FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 4730 4731 PAB0085 PAB0086     FALSE 0.560 21.000 0.077 NA   NA
 4733 4734 PAB0087 PAB0088 pbp   FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 4734 4735 PAB0088 PAB0089     FALSE 0.128 40.000 0.000 NA   NA
 4735 4736 PAB0089 PAB0090   ndaD FALSE 0.017 207.000 0.000 NA   NA
 4736 4737 PAB0090 PAB0091 ndaD dppA-1 FALSE 0.233 28.000 0.000 1.000 N NA
 4737 4738 PAB0091 PAB0092 dppA-1 dppB-1 TRUE 0.950 16.000 0.000 0.040 Y NA
 4738 4739 PAB0092 PAB0093 dppB-1 dppC-1 TRUE 0.991 2.000 0.000 0.040 Y NA
 4739 4740 PAB0093 PAB0094 dppC-1 dppD-1 TRUE 0.982 2.000 0.000 1.000 Y NA
 4740 4741 PAB0094 PAB0095 dppD-1 dppF-1 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 11541471 4735   PAB0089     FALSE NA 7346.000 0.000 NA   NA
 11683834 4735   PAB0089     FALSE NA 7346.000 0.000 NA   NA
 11826226 4735   PAB0089     FALSE NA 7346.000 0.000 NA   NA
 11541472 4735   PAB0089     FALSE NA 7376.000 0.000 NA   NA
 11683835 4735   PAB0089     FALSE NA 7376.000 0.000 NA   NA
 11826227 4735   PAB0089     FALSE NA 7376.000 0.000 NA   NA
 11541473 4735   PAB0089     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11683836 4735   PAB0089     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11826228 4735   PAB0089     FALSE NA 7415.000 0.000 NA   NA
 11541474 4735   PAB0089     FALSE NA 7445.000 0.000 NA   NA
 11683837 4735   PAB0089     FALSE NA 7445.000 0.000 NA   NA
 11826229 4735   PAB0089     FALSE NA 7445.000 0.000 NA   NA
 11541475 4735   PAB0089     FALSE NA 7482.000 0.000 NA   NA
 11683838 4735   PAB0089     FALSE NA 7482.000 0.000 NA   NA
 11826230 4735   PAB0089     FALSE NA 7482.000 0.000 NA   NA
 11541476 4735   PAB0089     FALSE NA 7512.000 0.000 NA   NA
 11683839 4735   PAB0089     FALSE NA 7512.000 0.000 NA   NA
 11826231 4735   PAB0089     FALSE NA 7512.000 0.000 NA   NA
 11541477 4735   PAB0089     FALSE NA 7549.000 0.000 NA   NA
 11683840 4735   PAB0089     FALSE NA 7549.000 0.000 NA   NA
 11826232 4735   PAB0089     FALSE NA 7549.000 0.000 NA   NA
 11541478 4735   PAB0089     FALSE NA 7579.000 0.000 NA   NA
 11683841 4735   PAB0089     FALSE NA 7579.000 0.000 NA   NA
 11826233 4735   PAB0089     FALSE NA 7579.000 0.000 NA   NA
 11541479 4735   PAB0089     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 11683842 4735   PAB0089     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 11826234 4735   PAB0089     FALSE NA 7619.000 0.000 NA   NA
 11541480 4735   PAB0089     FALSE NA 7649.000 0.000 NA   NA
 11683843 4735   PAB0089     FALSE NA 7649.000 0.000 NA   NA
 11826235 4735   PAB0089     FALSE NA 7649.000 0.000 NA   NA
 11541481 4735   PAB0089     FALSE NA 7686.000 0.000 NA   NA
 11683844 4735   PAB0089     FALSE NA 7686.000 0.000 NA   NA
 11826236 4735   PAB0089     FALSE NA 7686.000 0.000 NA   NA
 11541482 4735   PAB0089     FALSE NA 7716.000 0.000 NA   NA
 11683845 4735   PAB0089     FALSE NA 7716.000 0.000 NA   NA
 11826237 4735   PAB0089     FALSE NA 7716.000 0.000 NA   NA
 11541483 4735   PAB0089     FALSE NA 7753.000 0.000 NA   NA
 11683846 4735   PAB0089     FALSE NA 7753.000 0.000 NA   NA
 11826238 4735   PAB0089     FALSE NA 7753.000 0.000 NA   NA
 11541484 4735   PAB0089     FALSE NA 7783.000 0.000 NA   NA
 11683847 4735   PAB0089     FALSE NA 7783.000 0.000 NA   NA
 11826239 4735   PAB0089     FALSE NA 7783.000 0.000 NA   NA
 11541485 4735   PAB0089     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11683848 4735   PAB0089     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11826240 4735   PAB0089     FALSE NA 7820.000 0.000 NA   NA
 11541486 4735   PAB0089     FALSE NA 7850.000 0.000 NA   NA
 11683849 4735   PAB0089     FALSE NA 7850.000 0.000 NA   NA
 11826241 4735   PAB0089     FALSE NA 7850.000 0.000 NA   NA
 11541487 4735   PAB0089     FALSE NA 7887.000 0.000 NA   NA
 11683850 4735   PAB0089     FALSE NA 7887.000 0.000 NA   NA
 11826242 4735   PAB0089     FALSE NA 7887.000 0.000 NA   NA
 11541488 4735   PAB0089     FALSE NA 7917.000 0.000 NA   NA
 11683851 4735   PAB0089     FALSE NA 7917.000 0.000 NA   NA
 11826243 4735   PAB0089     FALSE NA 7917.000 0.000 NA   NA
 11541489 4735   PAB0089     FALSE NA 7954.000 0.000 NA   NA
 11683852 4735   PAB0089     FALSE NA 7954.000 0.000 NA   NA
 11826244 4735   PAB0089     FALSE NA 7954.000 0.000 NA   NA
 11541490 4735   PAB0089     FALSE NA 7984.000 0.000 NA   NA
 11683853 4735   PAB0089     FALSE NA 7984.000 0.000 NA   NA
 11826245 4735   PAB0089     FALSE NA 7984.000 0.000 NA   NA
 11541491 4735   PAB0089     FALSE NA 8021.000 0.000 NA   NA
 11683854 4735   PAB0089     FALSE NA 8021.000 0.000 NA   NA
 11826246 4735   PAB0089     FALSE NA 8021.000 0.000 NA   NA
 11541492 4735   PAB0089     FALSE NA 8051.000 0.000 NA   NA
 11683855 4735   PAB0089     FALSE NA 8051.000 0.000 NA   NA
 11826247 4735   PAB0089     FALSE NA 8051.000 0.000 NA   NA
 11541493 4735   PAB0089     FALSE NA 8088.000 0.000 NA   NA
 11683856 4735   PAB0089     FALSE NA 8088.000 0.000 NA   NA
 11826248 4735   PAB0089     FALSE NA 8088.000 0.000 NA   NA
 11541494 4735   PAB0089     FALSE NA 8118.000 0.000 NA   NA
 11683857 4735   PAB0089     FALSE NA 8118.000 0.000 NA   NA
 11826249 4735   PAB0089     FALSE NA 8118.000 0.000 NA   NA
 11541495 4735   PAB0089     FALSE NA 8155.000 0.000 NA   NA
 11683858 4735   PAB0089     FALSE NA 8155.000 0.000 NA   NA
 11826250 4735   PAB0089     FALSE NA 8155.000 0.000 NA   NA
 11541496 4735   PAB0089     FALSE NA 8185.000 0.000 NA   NA
 11683859 4735   PAB0089     FALSE NA 8185.000 0.000 NA   NA
 11826251 4735   PAB0089     FALSE NA 8185.000 0.000 NA   NA
 11541497 4735   PAB0089     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11683860 4735   PAB0089     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11826252 4735   PAB0089     FALSE NA 8222.000 0.000 NA   NA
 11541498 4735   PAB0089     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11683861 4735   PAB0089     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11826253 4735   PAB0089     FALSE NA 8252.000 0.000 NA   NA
 11541499 4735   PAB0089     FALSE NA 8289.000 0.000 NA   NA
 11683862 4735   PAB0089     FALSE NA 8289.000 0.000 NA   NA
 11826254 4735   PAB0089     FALSE NA 8289.000 0.000 NA   NA
 11541500 4735   PAB0089     FALSE NA 8319.000 0.000 NA   NA
 11683863 4735   PAB0089     FALSE NA 8319.000 0.000 NA   NA
 11826255 4735   PAB0089     FALSE NA 8319.000 0.000 NA   NA
 11541501 4735   PAB0089     FALSE NA 8355.000 0.000 NA   NA
 11683864 4735   PAB0089     FALSE NA 8355.000 0.000 NA   NA
 11826256 4735   PAB0089     FALSE NA 8355.000 0.000 NA   NA
 11541502 4735   PAB0089     FALSE NA 8385.000 0.000 NA   NA
 11683865 4735   PAB0089     FALSE NA 8385.000 0.000 NA   NA
 11826257 4735   PAB0089     FALSE NA 8385.000 0.000 NA   NA
 11541503 4735   PAB0089     FALSE NA 8430.000 0.000 NA   NA
 11683866 4735   PAB0089     FALSE NA 8430.000 0.000 NA   NA
 11826258 4735   PAB0089     FALSE NA 8430.000 0.000 NA   NA
 11541504 4735   PAB0089     FALSE NA 8460.000 0.000 NA   NA
 11683867 4735   PAB0089     FALSE NA 8460.000 0.000 NA   NA
 11826259 4735   PAB0089     FALSE NA 8460.000 0.000 NA   NA
 11541505 4735   PAB0089     FALSE NA 8496.000 0.000 NA   NA
 11683868 4735   PAB0089     FALSE NA 8496.000 0.000 NA   NA
 11826260 4735   PAB0089     FALSE NA 8496.000 0.000 NA   NA
 11541506 4735   PAB0089     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 11683869 4735   PAB0089     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 11826261 4735   PAB0089     FALSE NA 8526.000 0.000 NA   NA
 11541507 4735   PAB0089     FALSE NA 8563.000 0.000 NA   NA
 11683870 4735   PAB0089     FALSE NA 8563.000 0.000 NA   NA
 11826262 4735   PAB0089     FALSE NA 8563.000 0.000 NA   NA
 11541508 4735   PAB0089     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11683871 4735   PAB0089     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11826263 4735   PAB0089     FALSE NA 8593.000 0.000 NA   NA
 11541509 4735   PAB0089     FALSE NA 8630.000 0.000 NA   NA
 11683872 4735   PAB0089     FALSE NA 8630.000 0.000 NA   NA
 11826264 4735   PAB0089     FALSE NA 8630.000 0.000 NA   NA
 11541510 4735   PAB0089     FALSE NA 8660.000 0.000 NA   NA
 11683873 4735   PAB0089     FALSE NA 8660.000 0.000 NA   NA
 11826265 4735   PAB0089     FALSE NA 8660.000 0.000 NA   NA
 11541511 4735   PAB0089     FALSE NA 8697.000 0.000 NA   NA
 11683874 4735   PAB0089     FALSE NA 8697.000 0.000 NA   NA
 11826266 4735   PAB0089     FALSE NA 8697.000 0.000 NA   NA
 11541512 4735   PAB0089     FALSE NA 8727.000 0.000 NA   NA
 11683875 4735   PAB0089     FALSE NA 8727.000 0.000 NA   NA
 11826267 4735   PAB0089     FALSE NA 8727.000 0.000 NA   NA
 11541513 4735   PAB0089     FALSE NA 8764.000 0.000 NA   NA
 11683876 4735   PAB0089     FALSE NA 8764.000 0.000 NA   NA
 11826268 4735   PAB0089     FALSE NA 8764.000 0.000 NA   NA
 11541514 4735   PAB0089     FALSE NA 8794.000 0.000 NA   NA
 11683877 4735   PAB0089     FALSE NA 8794.000 0.000 NA   NA
 11826269 4735   PAB0089     FALSE NA 8794.000 0.000 NA   NA
 11541515 4735   PAB0089     FALSE NA 8831.000 0.000 NA   NA
 11683878 4735   PAB0089     FALSE NA 8831.000 0.000 NA   NA
 11826270 4735   PAB0089     FALSE NA 8831.000 0.000 NA   NA
 402731 402730 PABt02 PABt03 tRNA-Gly tRNA-Phe TRUE 0.693 8.000 0.000 NA   NA
 4743 4744 PAB2253 PAB2252     TRUE 0.933 -16.000 0.233 NA   NA
 4746 4747 PAB2251 PAB2250     TRUE 0.902 -3.000 0.051 NA   NA
 4748 4749 PAB0102 PAB0103     TRUE 0.858 20.000 0.211 0.048 N NA
 4757 4758 PAB0108 PAB3048     FALSE 0.552 -31.000 0.019 1.000   NA
 4758 4759 PAB3048 PAB0109   bchP TRUE 0.955 -3.000 0.034 0.064   NA
 4760 4761 PAB2244 PAB2243 nadE   TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 4762 4763 PAB0110 PAB0111 moaE   FALSE 0.016 92.000 0.008 NA   NA
 4763 4764 PAB0111 PAB0112     FALSE 0.249 84.000 0.333 NA   NA
 4764 4765 PAB0112 PAB0113     TRUE 0.981 12.000 0.333 NA Y NA
 4765 4766 PAB0113 PAB0114     FALSE 0.175 145.000 0.375 NA   NA
 4766 4767 PAB0114 PAB0115     TRUE 0.899 -22.000 0.195 NA   NA
 4767 4768 PAB0115 PAB0116     FALSE 0.386 31.000 0.073 NA   NA
 4768 4769 PAB0116 PAB0117   fucA TRUE 0.709 -34.000 0.051 1.000   NA
 4771 4772 PAB0118 PAB0119 amyA malE FALSE 0.291 101.000 0.000 1.000 Y NA
 4772 4773 PAB0119 PAB0120 malE malC TRUE 0.981 22.000 0.885 1.000 Y NA
 4773 4774 PAB0120 PAB0121 malC malG TRUE 0.999 -3.000 0.520 0.036 Y NA
 4774 4775 PAB0121 PAB0122 malG apu TRUE 0.990 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 4775 4776 PAB0122 PAB0123 apu msmK TRUE 0.663 41.000 0.050 1.000 Y NA
 4777 1793227 PAB2236 PAB2235     TRUE 0.985 -52.000 0.085 0.001 Y NA
 4779 4780 PAB0124 PAB0125     FALSE 0.116 71.000 0.069 1.000   NA
 4781 4782 PAB2234 PAB2233     FALSE 0.095 63.000 0.045 1.000   NA
 4782 4783 PAB2233 PAB2232     FALSE 0.257 61.000 0.045 0.024 N NA
 4783 4784 PAB2232 PAB2231     TRUE 0.996 12.000 0.789 0.036 Y NA
 4784 4785 PAB2231 PAB2230     TRUE 0.999 0.000 0.775 0.036 Y NA
 4785 4786 PAB2230 PAB2439     TRUE 0.998 5.000 0.625 0.036 Y NA
 4786 4787 PAB2439 PAB2227     FALSE 0.045 106.000 0.051 1.000 N NA
 4787 4788 PAB2227 PAB2402     FALSE 0.012 289.000 0.000 1.000 N NA
 4788 4789 PAB2402 PAB2224     TRUE 0.773 -12.000 0.000 NA   NA
 4789 4790 PAB2224 PAB3055     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 4793 4794 PAB0130 PAB0131     TRUE 0.975 -3.000 0.286 NA   NA
 4796 1793228 PAB0133 PABr02     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 1793228 402687 PABr02 PABt04   tRNA-Ala FALSE 0.057 65.000 0.000 NA   NA
 402687 1793230 PABt04 PABr03 tRNA-Ala   FALSE 0.022 148.000 0.000 NA   NA
 1793230 4797 PABr03 PAB0137     FALSE 0.031 107.000 0.000 NA   NA
 4797 4798 PAB0137 PAB0138     TRUE 0.925 -3.000 0.071 NA   NA
 4798 4799 PAB0138 PAB0139   lysS FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 4799 4800 PAB0139 PAB0140 lysS   TRUE 0.646 4.000 0.013 NA   NA
 4802 4803 PAB0141 PAB0142     TRUE 0.975 -7.000 0.375 NA   NA
 4803 4804 PAB0142 PAB0143   iorB-2 TRUE 0.939 12.000 0.046 NA Y NA
 4806 4807 PAB0144 PAB0145   asnA-2 FALSE 0.133 55.000 0.081 NA N NA
 4807 4808 PAB0145 PAB0146 asnA-2   TRUE 0.924 0.000 0.081 1.000 N NA
 4808 4809 PAB0146 PAB2355   bioB-like TRUE 0.936 -10.000 0.125 1.000   NA
 4810 4811 PAB2401 PAB2207     TRUE 0.995 -13.000 1.000 0.004   NA
 4812 4813 PAB0149 PAB0150     TRUE 0.955 -46.000 0.875 NA   NA
 4814 4815 PAB2205 PAB2400   purC FALSE 0.039 46.000 0.004 NA   NA
 4816 4817 PAB0151 PAB0152 purF   TRUE 0.699 -18.000 0.000 NA   NA
 1793232 1793233 PABsnRNA19 PABsnRNA10     FALSE 0.026 122.000 0.000 NA   NA
 4819 4820 PAB2202 PAB2201     FALSE 0.399 13.000 0.011 1.000   NA
 4820 4821 PAB2201 PAB2200     FALSE 0.030 78.000 0.005 1.000   NA
 4821 4822 PAB2200 PAB2199   psmB TRUE 0.984 3.000 0.625 1.000   NA
 4823 4824 PAB0154 PAB0155 tldD tldE TRUE 0.974 -3.000 0.280 NA   NA
 4824 4825 PAB0155 PAB0156 tldE   FALSE 0.263 56.000 0.200 NA   NA
 4828 1793234 PAB2197 PAB2196     TRUE 0.665 -7.000 0.010 NA   NA
 1793234 4830 PAB2196 PAB2195     TRUE 0.753 -3.000 0.014 NA   NA
 4831 4832 PAB0159 PAB0160     FALSE 0.166 25.000 0.012 NA   NA
 4832 1793235 PAB0160 PABsnRNA33     TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793235 4833 PABsnRNA33 PAB0161     FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 4833 4834 PAB0161 PAB0162     FALSE 0.358 47.000 0.250 NA   NA
 4834 4835 PAB0162 PAB0163   noxC TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 4835 4836 PAB0163 PAB0164 noxC radA FALSE 0.011 309.000 0.000 1.000 N NA
 4836 4837 PAB0164 PAB0165 radA   TRUE 0.741 8.000 0.000 1.000   NA
 4837 4838 PAB0165 PAB0166     FALSE 0.385 19.000 0.000 NA   NA
 4838 1793236 PAB0166 PABsnRNA43     TRUE 0.606 11.000 0.000 NA   NA
 4840 4841 PAB0168 PAB2356   asnS-like FALSE 0.028 144.000 0.044 1.000 N NA
 4841 4842 PAB2356 PAB2405 asnS-like gptA FALSE 0.153 44.000 0.046 1.000   NA
 4843 4844 PAB2438 PAB2398     TRUE 0.976 -16.000 0.057 1.000 Y NA
 4844 4845 PAB2398 PAB2187   mcmA2 FALSE 0.172 56.000 0.094 1.000 N NA
 4848 4849 PAB0174 PAB0175   folp TRUE 0.827 2.000 0.028 1.000   NA
 4849 4850 PAB0175 PAB0176 folp   FALSE 0.012 202.000 0.000 NA N NA
 4851 1793238 PAB2437 PAB2181     FALSE 0.447 12.000 0.000 NA N NA
 1793238 4853 PAB2181 PAB2180     TRUE 0.949 4.000 0.227 1.000 N NA
 4854 4855 PAB0178 PAB0179     FALSE 0.011 353.000 0.000 NA   NA
 4856 4857 PAB2178 PAB2177     FALSE 0.360 51.000 0.286 1.000 N NA
 4857 4858 PAB2177 PAB2176     FALSE 0.092 54.000 0.000 1.000   NA
 4858 4859 PAB2176 PAB2175     TRUE 0.984 -3.000 0.385 1.000   NA
 4859 4860 PAB2175 PAB2174     TRUE 0.991 10.000 0.152 0.035 Y NA
 4861 4862 PAB0180 PAB2406   glpk TRUE 0.774 27.000 0.010 1.000 Y NA
 4862 4863 PAB2406 PAB0182 glpk   FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 4863 4864 PAB0182 PAB0183   glpA FALSE 0.022 144.000 0.000 NA   NA
 4864 4865 PAB0183 PAB0184 glpA   TRUE 0.962 0.000 0.167 1.000   NA
 4865 4866 PAB0184 PAB0185     TRUE 0.967 -3.000 0.214 NA   NA
 4866 4867 PAB0185 PAB7067   rpl37AE FALSE 0.032 61.000 0.012 NA   NA
 4867 4868 PAB7067 PAB3072 rpl37AE   TRUE 0.928 7.000 0.234 1.000 N NA
 4868 4869 PAB3072 PAB2357     FALSE 0.287 43.000 0.142 1.000 N NA
 4869 4870 PAB2357 PAB3073     TRUE 0.953 -22.000 0.424 NA   NA
 4870 4871 PAB3073 PAB0187   fus FALSE 0.036 81.000 0.030 NA   NA
 4871 4872 PAB0187 PAB0188 fus   FALSE 0.070 51.000 0.030 NA   NA
 4872 4873 PAB0188 PAB0189   imp1 TRUE 0.976 3.000 0.400 NA   NA
 4873 4874 PAB0189 PAB0190 imp1   TRUE 0.855 -3.000 0.037 1.000 N NA
 1793240 4878 PAB2166 PAB2165     TRUE 0.868 9.000 0.100 NA   NA
 4878 4879 PAB2165 PAB2164     TRUE 0.983 -6.000 0.150 0.021   NA
 4879 4880 PAB2164 PAB2163     TRUE 0.991 2.000 0.375 0.021   NA
 4880 4881 PAB2163 PAB2162     FALSE 0.282 10.000 0.009 NA N NA
 4881 4882 PAB2162 PAB2161     FALSE 0.017 43.000 0.003 NA N NA
 4885 4886 PAB2158 PAB2157     FALSE 0.476 -78.000 0.000 NA   NA
 4886 4887 PAB2157 PAB3079     FALSE 0.011 341.000 0.000 NA   NA
 4887 4888 PAB3079 PAB2154     TRUE 0.688 -19.000 0.000 NA   NA
 4888 4889 PAB2154 PAB2152     FALSE 0.053 69.000 0.000 NA   NA
 4889 4890 PAB2152 PAB2150     FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 4890 4891 PAB2150 PAB2149     TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.049 Y NA
 4891 4892 PAB2149 PAB2148     FALSE 0.201 178.000 0.000 1.000 Y NA
 4892 4893 PAB2148 PAB2147     TRUE 0.996 -10.000 0.176 0.005 Y NA
 4894 4895 PAB0203 PAB0204 sucC-like   FALSE 0.256 92.000 0.375 NA   NA
 4895 4896 PAB0204 PAB0205     FALSE 0.199 82.000 0.250 NA   NA
 4896 4897 PAB0205 PAB0206     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 4899 4900 PAB0207 PAB0208 gph   FALSE 0.014 341.000 0.000 1.000   NA
 4900 4901 PAB0208 PAB3084     FALSE 0.146 32.000 0.023 1.000 N NA
 4901 1793242 PAB3084 PABsnRNA37     TRUE 0.611 -27.000 0.000 NA   NA
 1793242 4902 PABsnRNA37 PAB0209     TRUE 0.840 0.000 0.000 NA   NA
 1793243 4904 PABsnRNA35 PAB0211     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 4904 4905 PAB0211 PAB0212   soxA FALSE 0.142 52.000 0.053 1.000   NA
 4905 4906 PAB0212 PAB0213 soxA   TRUE 0.992 -3.000 0.316 0.020   NA
 4906 4907 PAB0213 PAB3086     TRUE 0.981 -3.000 0.368 NA   NA
 4907 4908 PAB3086 PAB0214   soxB TRUE 0.973 -3.000 0.263 NA   NA
 4909 1793244 PAB2141 PAB2140     TRUE 0.973 -7.000 0.329 1.000   NA
 1793244 4911 PAB2140 PAB2139   secY FALSE 0.166 62.000 0.110 1.000 N NA
 4911 4912 PAB2139 PAB2138 secY rpl15P FALSE 0.119 49.000 0.051 1.000 N NA
 4912 4913 PAB2138 PAB2137 rpl15P rpl30P TRUE 0.993 12.000 0.471 0.044 Y NA
 4913 4914 PAB2137 PAB2136 rpl30P rps5P TRUE 0.995 11.000 0.475 0.044 Y NA
 4914 4915 PAB2136 PAB2135 rps5P rpl18P TRUE 0.995 -3.000 0.072 0.044 Y NA
 4915 4916 PAB2135 PAB2134 rpl18P rpl19E TRUE 0.969 15.000 0.079 0.035 Y NA
 4916 4917 PAB2134 PAB2133 rpl19E rpl32E TRUE 0.996 10.000 0.529 0.035 Y NA
 4917 4918 PAB2133 PAB2132 rpl32E rpl6P TRUE 0.995 11.000 0.465 0.035 Y NA
 4918 4919 PAB2132 PAB2131 rpl6P   TRUE 0.983 11.000 0.068 0.035 Y NA
 4919 4920 PAB2131 PAB7080   rps14P TRUE 0.996 10.000 0.473 0.035 Y NA
 4920 4921 PAB7080 PAB2130 rps14P rpl5P TRUE 0.998 4.000 0.496 0.035 Y NA
 4921 4922 PAB2130 PAB2397 rpl5P rps4E TRUE 0.983 11.000 0.073 0.035 Y NA
 4922 4923 PAB2397 PAB2128 rps4E rpl24P TRUE 0.998 0.000 0.478 0.044 Y NA
 4923 4924 PAB2128 PAB2436 rpl24P rpl14P TRUE 0.995 11.000 0.472 0.044 Y NA
 4924 4925 PAB2436 PAB2127 rpl14P rps17P TRUE 0.997 6.000 0.506 0.035 Y NA
 4925 4926 PAB2127 PAB2126 rps17P   TRUE 0.997 -6.000 0.468 1.000 Y NA
 4926 4927 PAB2126 PAB7082     TRUE 0.938 -114.000 0.070 1.000 Y NA
 4927 1793245 PAB7082 PAB8082   rpmC TRUE 0.955 10.000 0.023 1.000 Y NA
 1793245 4929 PAB8082 PAB2125 rpmC rps3P TRUE 0.991 -13.000 0.074 0.044 Y NA
 4929 4930 PAB2125 PAB2396 rps3P rpl22P TRUE 0.991 5.000 0.074 0.044 Y NA
 4930 4931 PAB2396 PAB2123 rpl22P rps19P TRUE 0.993 11.000 0.355 0.044 Y NA
 4931 4932 PAB2123 PAB2122 rps19P rpl2P TRUE 0.979 11.000 0.051 0.044 Y NA
 4932 4933 PAB2122 PAB7083 rpl2P rpl23P TRUE 0.996 12.000 0.849 0.035 Y NA
 4933 4934 PAB7083 PAB2121 rpl23P rpl4P TRUE 0.991 6.000 0.075 0.035 Y NA
 4934 4935 PAB2121 PAB2120 rpl4P rpl3P TRUE 0.997 11.000 0.885 0.035 Y NA
 4935 4936 PAB2120 PAB2119 rpl3P   TRUE 0.975 2.000 0.359 NA   NA
 4936 4937 PAB2119 PAB2118     FALSE 0.023 140.000 0.000 NA   NA
 4937 4938 PAB2118 PAB2117     FALSE 0.053 69.000 0.000 NA   NA
 4938 4939 PAB2117 PAB2116     FALSE 0.093 55.000 0.044 NA   NA
 4940 4941 PAB3089 PAB0223 han1   FALSE 0.036 70.000 0.010 1.000   NA
 1793246 4944 PAB0225 PAB0226   thii TRUE 0.781 -3.000 0.018 NA   NA
 4944 1793247 PAB0226 PAB0227 thii   TRUE 0.720 -3.000 0.007 NA   NA
 4946 4947 PAB2113 PAB2112     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.005   NA
 4948 4949 PAB0231 PAB0232 pyrG   FALSE 0.558 -13.000 0.003 NA   NA
 4950 4951 PAB2111 PAB2110     FALSE 0.024 136.000 0.000 NA   NA
 4951 4952 PAB2110 PAB2109     TRUE 0.871 3.000 0.056 NA   NA
 4953 4954 PAB0239 PAB0240     TRUE 0.982 -3.000 0.340 1.000   NA
 4954 4955 PAB0240 PAB0241     TRUE 0.928 -3.000 0.073 NA   NA
 4956 4957 PAB2107 PAB2106   mvaA FALSE 0.045 84.000 0.041 1.000 N NA
 4957 4958 PAB2106 PAB2105 mvaA minD-3 TRUE 0.718 14.000 0.110 1.000 N NA
 4961 4962 PAB0245 PAB0246     TRUE 0.931 -3.000 0.077 NA   NA
 4964 4965 PAB0247 PAB0248   trkH FALSE 0.099 50.000 0.033 1.000   NA
 4965 4966 PAB0248 PAB0249 trkH   TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 4966 4967 PAB0249 PAB0250     FALSE 0.011 108.000 0.006 1.000 N NA
 4968 4969 PAB2098 PAB2097     TRUE 0.924 -7.000 0.082 1.000   NA
 4969 4970 PAB2097 PAB2096     TRUE 0.983 -3.000 0.086 0.009   NA
 4971 4972 PAB0252 PAB0253   ksgA TRUE 0.987 -3.000 0.049 NA Y NA
 4974 4975 PAB0254 PAB0255   xerD-like TRUE 0.640 -31.000 0.000 1.000   NA
 4975 1793248 PAB0255 PAB2407 xerD-like   TRUE 0.671 -25.000 0.033 1.000   NA
 4977 4978 PAB2092 PAB7092     TRUE 0.946 12.000 0.050 1.000 Y NA
 4979 4980 PAB0257 PAB0258 gap   FALSE 0.042 69.000 0.027 NA   NA
 4982 4983 PAB2358 PAB0260 thiL ogt FALSE 0.523 -13.000 0.004 1.000 N NA
 4983 4984 PAB0260 PAB2408 ogt   TRUE 0.890 -12.000 0.067 1.000   NA
 4984 4985 PAB2408 PAB0262     FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 4985 1793250 PAB0262 PAB0263     FALSE 0.013 286.000 0.000 NA   NA
 4987 4988 PAB7094 PAB2086     FALSE 0.158 88.000 0.214 1.000 N NA
 4988 4989 PAB2086 PAB2085   aor-1 FALSE 0.030 100.000 0.000 1.000 N NA
 4989 4990 PAB2085 PAB2084 aor-1   TRUE 0.998 2.000 0.500 0.033 Y NA
 4990 4991 PAB2084 PAB2083     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 4992 4993 PAB0268 PAB0269     FALSE 0.385 19.000 0.000 NA   NA
 4994 4995 PAB2081 PAB2080     FALSE 0.024 187.000 0.000 1.000   NA
 4995 4996 PAB2080 PAB2079     FALSE 0.008 567.000 0.000 NA   NA
 4996 4997 PAB2079 PAB3103     TRUE 0.948 -30.000 0.500 NA   NA
 4997 4998 PAB3103 PAB2078     FALSE 0.007 731.000 0.000 NA   NA
 4998 4999 PAB2078 PAB2077     FALSE 0.007 908.000 0.000 NA   NA
 4999 5000 PAB2077 PAB2076     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5001 5002 PAB0274 PAB0275     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5002 5003 PAB0275 PAB0276     FALSE 0.039 85.000 0.000 NA   NA
 5005 5006 PAB0277 PAB0278     TRUE 0.633 12.000 0.039 1.000   NA
 5007 5008 PAB2074 PAB2073     FALSE 0.108 53.000 0.039 1.000   NA
 5012 5013 PAB2071 PAB2069     TRUE 0.949 -13.000 0.000 0.005   NA
 5013 5014 PAB2069 PAB2068   drrA-2 FALSE 0.299 33.000 0.049 1.000   NA
 5014 5015 PAB2068 PAB2067 drrA-2   TRUE 0.646 32.000 0.300 NA   NA
 5015 5016 PAB2067 PAB2066     TRUE 0.982 4.000 0.667 NA   NA
 5016 5017 PAB2066 PAB2065     TRUE 0.934 19.000 1.000 NA   NA
 5017 5018 PAB2065 PAB2064     FALSE 0.009 448.000 0.000 NA   NA
 5018 5019 PAB2064 PAB2063     FALSE 0.013 294.000 0.000 NA   NA
 5019 5020 PAB2063 PAB2062     TRUE 0.736 9.000 0.043 NA   NA
 5022 5023 PAB0282 PAB0283   pimT-like TRUE 0.959 -3.000 0.151 NA   NA
 5023 1793255 PAB0283 PABsnRNA30 pimT-like   TRUE 0.818 2.000 0.000 NA   NA
 1793255 402689 PABsnRNA30 PABt06   tRNA-Val FALSE 0.066 59.000 0.000 NA   NA
 1793256 402690 PABr04 PABt07   tRNA-Asp FALSE 0.402 18.000 0.000 NA   NA
 402690 5025 PABt07 PAB0284 tRNA-Asp   FALSE 0.260 27.000 0.000 NA   NA
 5029 5030 PAB0286 PAB0287 leuA-2 leuC-2 TRUE 0.993 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 5030 5031 PAB0287 PAB0288 leuC-2 leuD-2 TRUE 0.999 -3.000 0.417 0.003 Y NA
 5031 5032 PAB0288 PAB0289 leuD-2 leuB-2 TRUE 0.995 -12.000 0.087 0.004 Y NA
 5032 5033 PAB0289 PAB0290 leuB-2 rimK FALSE 0.016 207.000 0.000 1.000 N NA
 5033 5034 PAB0290 PAB0291 rimK argC TRUE 0.910 -3.000 0.060 1.000 N NA
 5034 5035 PAB0291 PAB0292 argC argB TRUE 0.996 -3.000 0.058 0.003 Y NA
 5035 5036 PAB0292 PAB2440 argB argD-1 TRUE 0.973 6.000 0.039 1.000 Y NA
 5036 5037 PAB2440 PAB0294 argD-1 argE TRUE 0.987 -19.000 0.243 1.000 Y NA
 5037 1793258 PAB0294 PAB0294.1n argE   FALSE 0.034 93.000 0.000 NA   NA
 1793258 5038 PAB0294.1n PAB0295   tkt1 TRUE 0.954 -16.000 0.333 NA   NA
 5038 5039 PAB0295 PAB0296 tkt1 tkt2 TRUE 0.988 13.000 0.156 0.001 Y NA
 5039 5040 PAB0296 PAB0297 tkt2 aroG TRUE 0.846 -31.000 0.156 1.000 N NA
 5040 5041 PAB0297 PAB0298 aroG aroB TRUE 0.990 -12.000 0.002 0.004 Y NA
 5041 5042 PAB0298 PAB0299 aroB aroD TRUE 0.994 -3.000 0.002 0.004 Y NA
 5042 5043 PAB0299 PAB0300 aroD aroE TRUE 0.990 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 5043 5044 PAB0300 PAB0301 aroE thrB-2 TRUE 0.985 -22.000 0.066 0.042 Y NA
 5044 5045 PAB0301 PAB0302 thrB-2 tmpC-like FALSE 0.098 44.000 0.026 1.000   NA
 5045 5046 PAB0302 PAB0303 tmpC-like rbsA TRUE 0.632 45.000 0.667 1.000   NA
 5046 5047 PAB0303 PAB0304 rbsA rbsC-1 TRUE 0.899 -7.000 0.058 1.000   NA
 5047 5048 PAB0304 PAB0305 rbsC-1 rbsC-2 TRUE 0.974 -3.000 0.058 0.034   NA
 5048 5049 PAB0305 PAB0306 rbsC-2 aroA FALSE 0.161 29.000 0.002 1.000   NA
 5049 5050 PAB0306 PAB0307 aroA aroC TRUE 0.983 -10.000 0.057 1.000 Y NA
 5051 5052 PAB2049 PAB2048 trpA trpB-1 TRUE 0.994 -7.000 0.030 0.002 Y NA
 5052 5053 PAB2048 PAB2047 trpB-1 trpF TRUE 0.991 -13.000 0.000 0.003 Y NA
 5053 5054 PAB2047 PAB2046 trpF trpG TRUE 0.985 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5054 5055 PAB2046 PAB2045 trpG trpE TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 5055 5056 PAB2045 PAB2044 trpE trpD TRUE 0.987 -18.000 0.015 0.002 Y NA
 5056 5057 PAB2044 PAB2043 trpD   TRUE 0.993 -6.000 0.216 1.000 Y NA
 5057 1793259 PAB2043 PAB2042     FALSE 0.049 73.000 0.000 NA   NA
 1793259 5059 PAB2042 PAB2041     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5059 5060 PAB2041 PAB2040   aif2G FALSE 0.049 56.000 0.021 NA   NA
 5060 5061 PAB2040 PAB2039 aif2G   FALSE 0.045 70.000 0.032 1.000 N NA
 5062 5063 PAB0311 PAB0312 pfpI   FALSE 0.051 59.000 0.026 NA   NA
 5063 5064 PAB0312 PAB0313     TRUE 0.779 -7.000 0.029 NA   NA
 5064 5065 PAB0313 PAB3117   hpyA1-2 FALSE 0.011 228.000 0.000 NA N NA
 5065 5066 PAB3117 PAB0314 hpyA1-2   FALSE 0.103 49.000 0.044 1.000 N NA
 5066 5067 PAB0314 PAB0315     FALSE 0.015 485.000 0.059 1.000 N NA
 5067 5068 PAB0315 PAB0316     TRUE 0.996 0.000 0.081 0.005 Y NA
 5068 5069 PAB0316 PAB0317   mpg FALSE 0.047 71.000 0.000 1.000 N NA
 5069 5070 PAB0317 PAB0318 mpg pmm-like FALSE 0.507 -85.000 0.031 1.000   NA
 5070 5071 PAB0318 PAB0319 pmm-like tmk TRUE 0.680 13.000 0.062 1.000   NA
 5071 5072 PAB0319 PAB0320 tmk srp54 FALSE 0.052 39.000 0.003 1.000 N NA
 5072 5073 PAB0320 PAB7115 srp54   TRUE 0.776 0.000 0.007 1.000   NA
 5073 5074 PAB7115 PAB0321     FALSE 0.316 13.000 0.011 NA   NA
 5074 5075 PAB0321 PAB0322     FALSE 0.039 50.000 0.008 NA   NA
 402691 1793260 PABt08 PABsnRNA11 tRNA-Val   FALSE 0.050 72.000 0.000 NA   NA
 1793260 5077 PABsnRNA11 PAB0323   gltX FALSE 0.009 447.000 0.000 NA   NA
 5077 5078 PAB0323 PAB0324 gltX   TRUE 0.626 -25.000 0.000 NA   NA
 5078 5079 PAB0324 PAB0325     FALSE 0.015 118.000 0.014 NA   NA
 5080 5081 PAB2031 PAB2030 fum-2 fum-1 TRUE 0.999 -9.000 0.667 0.001 Y NA
 5082 5083 PAB0328 PAB0329     FALSE 0.009 473.000 0.000 NA   NA
 5083 5084 PAB0329 PAB0330     TRUE 0.965 -3.000 0.200 NA   NA
 5084 5085 PAB0330 PAB0331     TRUE 0.957 -6.000 0.200 NA   NA
 1793267 5087 PABsnRNA32 PAB0333     FALSE 0.047 76.000 0.000 NA   NA
 5087 5088 PAB0333 PAB0334     TRUE 0.919 -7.000 0.087 NA   NA
 5088 5089 PAB0334 PAB0335     TRUE 0.905 2.000 0.071 NA   NA
 5089 5090 PAB0335 PAB0336     FALSE 0.026 114.000 0.031 NA   NA
 5090 5091 PAB0336 PAB0337     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 5094 5095 PAB7122 PAB2025   dpa TRUE 0.633 -7.000 0.003 NA   NA
 11541516 5093   PAB0339     FALSE NA 1421.000 0.000 NA   NA
 11683879 5093   PAB0339     FALSE NA 1421.000 0.000 NA   NA
 11826271 5093   PAB0339     FALSE NA 1421.000 0.000 NA   NA
 11541517 5093   PAB0339     FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11683880 5093   PAB0339     FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11826272 5093   PAB0339     FALSE NA 1450.000 0.000 NA   NA
 11541518 5093   PAB0339     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11683881 5093   PAB0339     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11826273 5093   PAB0339     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11541519 5093   PAB0339     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11683882 5093   PAB0339     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11826274 5093   PAB0339     FALSE NA 1516.000 0.000 NA   NA
 11541520 5093   PAB0339     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11683883 5093   PAB0339     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11826275 5093   PAB0339     FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11541521 5093   PAB0339     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11683884 5093   PAB0339     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11826276 5093   PAB0339     FALSE NA 1571.000 0.000 NA   NA
 11541522 5093   PAB0339     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11683885 5093   PAB0339     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11826277 5093   PAB0339     FALSE NA 1614.000 0.000 NA   NA
 11541523 5093   PAB0339     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11683886 5093   PAB0339     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11826278 5093   PAB0339     FALSE NA 1643.000 0.000 NA   NA
 11541524 5093   PAB0339     FALSE NA 1684.000 0.000 NA   NA
 11683887 5093   PAB0339     FALSE NA 1684.000 0.000 NA   NA
 11826279 5093   PAB0339     FALSE NA 1684.000 0.000 NA   NA
 11541525 5093   PAB0339     FALSE NA 1713.000 0.000 NA   NA
 11683888 5093   PAB0339     FALSE NA 1713.000 0.000 NA   NA
 11826280 5093   PAB0339     FALSE NA 1713.000 0.000 NA   NA
 11541526 5093   PAB0339     FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11683889 5093   PAB0339     FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11826281 5093   PAB0339     FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11541527 5093   PAB0339     FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11683890 5093   PAB0339     FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11826282 5093   PAB0339     FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11541528 5093   PAB0339     FALSE NA 1818.000 0.000 NA   NA
 11683891 5093   PAB0339     FALSE NA 1818.000 0.000 NA   NA
 11826283 5093   PAB0339     FALSE NA 1818.000 0.000 NA   NA
 11541529 5093   PAB0339     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11683892 5093   PAB0339     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11826284 5093   PAB0339     FALSE NA 1847.000 0.000 NA   NA
 11541530 5093   PAB0339     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 11683893 5093   PAB0339     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 11826285 5093   PAB0339     FALSE NA 1891.000 0.000 NA   NA
 5096 5097 PAB0341 PAB2359 korD korA-1 TRUE 0.996 3.000 0.096 0.004 Y NA
 5097 5098 PAB2359 PAB0344 korA-1 korB-1 TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.004 Y NA
 5098 5099 PAB0344 PAB0345 korB-1 korG-1 TRUE 0.996 4.000 0.106 0.004 Y NA
 5099 5100 PAB0345 PAB0346 korG-1 korA-2 TRUE 0.997 -3.000 0.091 0.004 Y NA
 5100 5101 PAB0346 PAB0347 korA-2 korB-2 TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 5101 5102 PAB0347 PAB0348 korB-2 korG-2 TRUE 0.996 -12.000 0.190 0.004 Y NA
 5102 5103 PAB0348 PAB0349 korG-2   FALSE 0.028 80.000 0.023 1.000 N NA
 5104 5105 PAB2022 PAB2021     TRUE 0.837 -13.000 0.055 NA   NA
 5105 5106 PAB2021 PAB2020     TRUE 0.983 -3.000 0.400 NA   NA
 5106 5107 PAB2020 PAB2019     TRUE 0.889 -40.000 0.296 NA   NA
 5107 5108 PAB2019 PAB2018   glyA FALSE 0.107 51.000 0.037 1.000   NA
 5109 5110 PAB0350 PAB0351     TRUE 0.996 2.000 0.440 1.000 Y NA
 5110 5111 PAB0351 PAB0352   rnhB TRUE 0.888 -3.000 0.048 1.000 N NA
 5112 5113 PAB2015 PAB2014   moeA-2 FALSE 0.080 57.000 0.043 1.000 N NA
 5113 5114 PAB2014 PAB2013 moeA-2   FALSE 0.085 42.000 0.029 1.000 N NA
 5115 5116 PAB0356 PAB0357 trub   TRUE 0.677 -21.000 0.000 NA   NA
 5117 5118 PAB2010 PAB2009     FALSE 0.057 65.000 0.000 NA   NA
 5119 402692 PAB0359 PABt09   tRNA-Ser TRUE 0.743 -14.000 0.000 NA   NA
 402692 5120 PABt09 PAB0360 tRNA-Ser rps13P FALSE 0.235 29.000 0.000 NA   NA
 5120 5121 PAB0360 PAB0361 rps13P rps4P TRUE 0.989 20.000 0.512 0.025 Y NA
 5121 5122 PAB0361 PAB0362 rps4P rps11P TRUE 0.995 -3.000 0.073 0.041 Y NA
 5122 5123 PAB0362 PAB2410 rps11P rpoD FALSE 0.284 33.000 0.058 1.000 N NA
 5123 402693 PAB2410 PABt10 rpoD tRNA-Leu TRUE 0.760 5.000 0.000 NA   NA
 402693 5124 PABt10 PAB0364 tRNA-Leu rpl18E FALSE 0.048 75.000 0.000 NA   NA
 5124 5125 PAB0364 PAB0365 rpl18E rpl13P TRUE 0.989 7.000 0.075 0.041 Y NA
 5125 5126 PAB0365 PAB0366 rpl13P rps9P TRUE 0.990 17.000 0.515 0.041 Y NA
 5126 5127 PAB0366 PAB7131 rps9P rpoN TRUE 0.566 45.000 0.536 1.000 N NA
 5127 402694 PAB7131 PABt11 rpoN tRNA-Pro FALSE 0.299 24.000 0.000 NA   NA
 402694 5128 PABt11 PAB7132 tRNA-Pro rpoK FALSE 0.357 21.000 0.000 NA   NA
 5128 5129 PAB7132 PAB0367 rpoK eno-like TRUE 0.834 7.000 0.073 1.000 N NA
 5129 5130 PAB0367 PAB0368 eno-like rps2P FALSE 0.223 16.000 0.008 1.000 N NA
 5130 5131 PAB0368 PAB0369 rps2P thrC-like FALSE 0.048 40.000 0.003 1.000 N NA
 5131 5132 PAB0369 PAB0370 thrC-like   FALSE 0.135 35.000 0.014 1.000   NA
 5132 5133 PAB0370 PAB0371     TRUE 0.800 3.000 0.000 NA   NA
 5133 5134 PAB0371 PAB0372   mvk TRUE 0.732 3.000 0.000 NA N NA
 5134 5135 PAB0372 PAB0373 mvk argB-like TRUE 0.967 -3.000 0.185 1.000   NA
 5136 5137 PAB2002 PAB2001 lig   FALSE 0.065 42.000 0.020 1.000 N NA
 5138 5139 PAB0376 PAB0377   spoIIM-like TRUE 0.979 -3.000 0.333 NA   NA
 5141 5142 PAB0378 PAB0379   wlbD TRUE 0.998 -3.000 0.538 1.000 Y NA
 5145 5146 PAB0380 PAB0381 glyS   FALSE 0.003 810.000 0.006 NA   NA
 5149 5150 PAB1992 PAB1991     FALSE 0.015 138.000 0.002 1.000   NA
 5150 5151 PAB1991 PAB1990     FALSE 0.145 26.000 0.008 NA   NA
 5151 5152 PAB1990 PAB1989   ino1 FALSE 0.047 55.000 0.019 NA   NA
 5153 5154 PAB0383 PAB0384     TRUE 0.979 0.000 0.010 NA Y NA
 5154 5155 PAB0384 PAB0385     TRUE 0.745 -13.000 0.044 NA N NA
 5158 5159 PAB1982 PAB1981 deoA   FALSE 0.306 31.000 0.042 1.000   NA
 5160 5161 PAB0389 PAB0390   napA-2 TRUE 0.878 -45.000 0.250 1.000   NA
 5161 1793272 PAB0390 PABsnRNA38 napA-2   TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793272 5162 PABsnRNA38 PAB0391   gdh FALSE 0.015 242.000 0.000 NA   NA
 5162 5163 PAB0391 PAB0392 gdh   FALSE 0.053 108.000 0.062 1.000 N NA
 5163 1793273 PAB0392 PABsnRNA40     TRUE 0.800 3.000 0.000 NA   NA
 1793273 5164 PABsnRNA40 PAB0393   fbp FALSE 0.058 64.000 0.000 NA   NA
 5164 5165 PAB0393 PAB0394 fbp   TRUE 0.873 -3.000 0.031 1.000   NA
 5166 5167 PAB1975 PAB1974   htpX FALSE 0.052 43.000 0.016 1.000 N NA
 5167 5168 PAB1974 PAB1973 htpX   TRUE 0.953 10.000 0.446 1.000 N NA
 5168 5169 PAB1973 PAB1972     FALSE 0.143 45.000 0.054 NA   NA
 5169 5170 PAB1972 PAB1971     TRUE 0.959 5.000 0.311 NA   NA
 5172 1793274 PAB1970 PAB1969 trpB-2   FALSE 0.014 121.000 0.014 NA   NA
 5174 5175 PAB0399 PAB0400 hypA mrp-like TRUE 0.989 0.000 0.667 1.000   NA
 5181 5182 PAB1962 PAB1961     TRUE 0.987 -12.000 1.000 NA   NA
 5182 5183 PAB1961 PAB1960     TRUE 0.988 -12.000 1.000 1.000   NA
 5184 5185 PAB2441 PAB0405 aif1A   TRUE 0.862 6.000 0.080 1.000 N NA
 5185 5186 PAB0405 PAB0406     TRUE 0.945 -27.000 0.387 1.000   NA
 5186 5187 PAB0406 PAB0407   top6B TRUE 0.856 10.000 0.086 1.000   NA
 5187 5188 PAB0407 PAB2411 top6B top6A TRUE 0.996 -25.000 0.328 0.001 Y NA
 5188 5189 PAB2411 PAB2412 top6A   TRUE 0.740 7.000 0.039 NA   NA
 5189 5190 PAB2412 PAB2413     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 5190 5191 PAB2413 PAB0411     TRUE 0.926 -10.000 0.120 NA   NA
 5192 5193 PAB1956 PAB1955     TRUE 0.943 -7.000 0.150 NA   NA
 5196 5197 PAB3148 PAB0415     TRUE 0.606 11.000 0.000 NA   NA
 5197 5198 PAB0415 PAB0416     FALSE 0.057 65.000 0.000 NA   NA
 5200 5201 PAB0417 PAB0418 psmA   TRUE 0.647 28.000 0.274 NA N NA
 5201 5202 PAB0418 PAB0419     TRUE 0.996 -3.000 0.335 NA Y NA
 5202 5203 PAB0419 PAB0420   rph TRUE 0.993 -25.000 0.266 0.024 Y NA
 5203 5204 PAB0420 PAB0421 rph   TRUE 0.997 -7.000 0.143 0.001 Y NA
 5204 402695 PAB0421 PABt12   tRNA-Thr FALSE 0.037 91.000 0.000 NA   NA
 402695 402696 PABt12 PABt13 tRNA-Thr tRNA-Pro TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 402696 5205 PABt13 PAB0422 tRNA-Pro   FALSE 0.031 105.000 0.000 NA   NA
 5205 402697 PAB0422 PABt14   tRNA-Thr FALSE 0.080 51.000 0.000 NA   NA
 402697 5206 PABt14 PAB7151 tRNA-Thr rpoH FALSE 0.028 115.000 0.000 NA   NA
 5206 5207 PAB7151 PAB0423 rpoH rpoB TRUE 0.971 18.000 0.083 0.007 Y NA
 5207 5208 PAB0423 PAB0424 rpoB rpoA1 TRUE 0.995 4.000 0.086 0.007 Y NA
 5208 5209 PAB0424 PAB0425 rpoA1 rpoA2 TRUE 0.961 6.000 0.075 0.007   NA
 5209 5210 PAB0425 PAB7152 rpoA2 rpl30E TRUE 0.805 4.000 0.030 1.000   NA
 5210 5211 PAB7152 PAB0426 rpl30E nusA TRUE 0.810 9.000 0.068 1.000 N NA
 5211 5212 PAB0426 PAB0427 nusA rps12P TRUE 0.714 11.000 0.057 1.000 N NA
 5212 5213 PAB0427 PAB0428 rps12P rps7P TRUE 0.998 5.000 0.410 0.005 Y NA
 5213 5214 PAB0428 PAB0429 rps7P   FALSE 0.281 29.000 0.000 1.000   NA
 5214 5215 PAB0429 PAB0430     TRUE 0.869 7.000 0.078 1.000   NA
 5216 5217 PAB1947 PAB1946     TRUE 0.706 10.000 0.041 NA   NA
 5220 5221 PAB0432 PAB7155     TRUE 0.986 2.000 0.667 NA   NA
 5221 5222 PAB7155 PAB0433     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 5222 5223 PAB0433 PAB0434     TRUE 0.946 -12.000 0.217 NA   NA
 5223 5224 PAB0434 PAB0435     TRUE 0.985 -7.000 0.742 1.000 N NA
 5225 5226 PAB1944 PAB1943     TRUE 0.810 0.000 0.017 1.000   NA
 5226 5227 PAB1943 PAB1942     TRUE 0.854 -3.000 0.035 NA   NA
 5228 1793278 PAB0437 PAB0438     FALSE 0.554 41.000 0.375 NA   NA
 1793278 402698 PAB0438 PABt15   tRNA-Leu FALSE 0.174 35.000 0.000 NA   NA
 402698 5230 PABt15 PAB0439 tRNA-Leu   FALSE 0.402 18.000 0.000 NA   NA
 5231 5232 PAB1940 PAB1939     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.007   NA
 5232 5233 PAB1939 PAB1938     FALSE 0.275 68.000 0.250 1.000   NA
 5234 5235 PAB8160 PAB7160 snrnp rpl37E TRUE 0.924 12.000 0.439 1.000 N NA
 5236 5237 PAB1937 PAB1936   pyrD FALSE 0.016 94.000 0.014 1.000 N NA
 5238 5239 PAB0443 PAB0444 neac   TRUE 0.956 -3.000 0.139 NA   NA
 5239 5240 PAB0444 PAB0445     TRUE 0.965 -16.000 0.455 NA   NA
 5240 5241 PAB0445 PAB2414   agpa TRUE 0.822 -3.000 0.017 1.000   NA
 5242 5243 PAB1933 PAB1932     TRUE 0.991 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 5243 5244 PAB1932 PAB1931     FALSE 0.068 73.000 0.038 1.000   NA
 5244 5245 PAB1931 PAB1930     FALSE 0.022 148.000 0.025 1.000   NA
 5245 5246 PAB1930 PAB1929     FALSE 0.078 61.000 0.000 1.000   NA
 5248 5249 PAB1928 PAB1927     TRUE 0.900 11.000 0.250 NA   NA
 5249 5250 PAB1927 PAB1926     FALSE 0.392 54.000 0.333 NA   NA
 5250 5251 PAB1926 PAB1925     TRUE 0.733 6.000 0.034 NA   NA
 5251 5252 PAB1925 PAB1924   drrB FALSE 0.342 38.000 0.000 0.067 N NA
 5252 5253 PAB1924 PAB1923 drrB drrA-1 TRUE 0.984 -3.000 0.222 0.067 N NA
 5253 5254 PAB1923 PAB1922 drrA-1   TRUE 0.969 -13.000 0.484 NA N NA
 5254 5255 PAB1922 PAB1921     FALSE 0.011 221.000 0.000 NA N NA
 5256 5257 PAB0458 PAB0459   nth TRUE 0.584 -31.000 0.000 NA   NA
 5259 5260 PAB0460 PAB7165 rpl7AE rps28E TRUE 0.937 48.000 0.602 0.032 Y NA
 5260 5261 PAB7165 PAB8165 rps28E rpl24E TRUE 0.998 6.000 0.761 0.032 Y NA
 5261 5262 PAB8165 PAB0461 rpl24E   FALSE 0.071 53.000 0.000 1.000 N NA
 402729 402728 PABt16 PABt17 tRNA-Met tRNA-Asn TRUE 0.686 9.000 0.000 NA   NA
 402728 5263 PABt17 PAB1919 tRNA-Asn   FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 1793280 1793281 PABsnRNA12 PABsnRNA39     FALSE 0.426 16.000 0.000 NA   NA
 1793281 5264 PABsnRNA39 PAB0462     FALSE 0.055 68.000 0.000 NA   NA
 5264 5265 PAB0462 PAB0463     FALSE 0.029 112.000 0.000 NA   NA
 5265 1793282 PAB0463 PAB0463.1n     FALSE 0.032 104.000 0.000 NA   NA
 1793283 1793284 PAB0463.2n PAB0463.3n     FALSE 0.027 119.000 0.000 NA   NA
 1793284 5266 PAB0463.3n PAB1916     FALSE 0.021 171.000 0.000 NA   NA
 1793285 5267 PABsnRNA13 PAB0465   tuf FALSE 0.021 164.000 0.000 NA   NA
 5267 5268 PAB0465 PAB0466 tuf rps10P TRUE 0.724 37.000 0.047 1.000 Y NA
 5268 402699 PAB0466 PABt18 rps10P tRNA-Ser FALSE 0.145 38.000 0.000 NA   NA
 5270 5271 PAB0467 PAB0468   pelA TRUE 0.617 10.000 0.018 1.000   NA
 5271 5272 PAB0468 PAB0469 pelA argS FALSE 0.371 13.000 0.003 1.000   NA
 1793286 5274 PAB0469.1n PAB1907     TRUE 0.812 13.000 0.194 NA   NA
 5274 402727 PAB1907 PABt19   tRNA-Met FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 5275 5276 PAB0472 PAB0473     TRUE 0.921 5.000 0.136 NA   NA
 5276 5277 PAB0473 PAB0474     TRUE 0.844 6.000 0.064 NA   NA
 5277 5278 PAB0474 PAB0475     FALSE 0.047 46.000 0.017 1.000 N NA
 5282 5283 PAB1904 PAB1903     TRUE 0.817 -3.000 0.026 NA   NA
 5283 5284 PAB1903 PAB1902     TRUE 0.642 3.000 0.013 1.000 N NA
 5284 5285 PAB1902 PAB1901   asnA TRUE 0.999 -3.000 0.301 0.001 Y NA
 5285 5286 PAB1901 PAB1900 asnA   FALSE 0.038 50.000 0.012 1.000 N NA
 5286 1793288 PAB1900 PAB1900.1n     FALSE 0.385 19.000 0.000 NA   NA
 5289 5290 PAB0485 PAB3171     TRUE 0.998 -3.000 0.409 0.038 Y NA
 5290 5291 PAB3171 PAB0486     TRUE 0.996 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 5291 1793290 PAB0486 PAB0486.1n     TRUE 0.996 -3.000 0.345 NA Y NA
 1793290 5292 PAB0486.1n PAB2415     TRUE 0.993 4.000 0.303 NA Y NA
 5292 5293 PAB2415 PAB0488     TRUE 0.995 -3.000 0.273 NA Y NA
 5293 5294 PAB0488 PAB2416   nuoN TRUE 0.997 -3.000 0.086 0.015 Y NA
 5294 5295 PAB2416 PAB0490 nuoN nuoM TRUE 0.998 -3.000 0.162 0.004 Y NA
 5295 5296 PAB0490 PAB0492 nuoM nuoH TRUE 0.998 4.000 0.531 0.015 Y NA
 5296 5297 PAB0492 PAB0493 nuoH nuoB TRUE 0.999 2.000 0.667 0.015 Y NA
 5297 5298 PAB0493 PAB0494 nuoB nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.468 0.007 Y NA
 5298 5299 PAB0494 PAB0495 nuoC nuoD TRUE 0.998 2.000 0.447 0.015 Y NA
 5299 5300 PAB0495 PAB0496 nuoD nuoI TRUE 0.999 -3.000 0.360 0.015 Y NA
 5303 5304 PAB1895 PAB1894     FALSE 0.036 92.000 0.037 1.000 N NA
 5304 5305 PAB1894 PAB1893     TRUE 0.996 -3.000 0.111 0.055 Y NA
 5305 5306 PAB1893 PAB1892     TRUE 0.998 5.000 1.000 0.055 Y NA
 5306 5307 PAB1892 PAB1891     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.015 Y NA
 5307 5308 PAB1891 PAB1890     TRUE 0.998 -3.000 0.320 0.007 Y NA
 5308 5309 PAB1890 PAB1889     TRUE 0.960 5.000 0.320 NA   NA
 5309 5310 PAB1889 PAB1888     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5310 1793291 PAB1888 PAB1887     TRUE 0.999 -3.000 0.889 0.015 Y NA
 1793291 5312 PAB1887 PAB1886     TRUE 0.995 -12.000 0.471 NA Y NA
 5312 1793292 PAB1886 PAB1886.1n     TRUE 0.982 -7.000 0.529 NA   NA
 1793292 5313 PAB1886.1n PAB1885     FALSE 0.015 244.000 0.000 NA   NA
 5313 1793294 PAB1885 PAB3177     TRUE 0.998 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 1793294 5315 PAB3177 PAB1884     TRUE 0.998 -24.000 1.000 0.038 Y NA
 5316 5317 PAB0500 PAB0501 trxB gabT FALSE 0.074 96.000 0.081 1.000 N NA
 5318 5319 PAB1881 PAB1880     FALSE 0.538 -40.000 0.000 NA   NA
 5319 5320 PAB1880 PAB2394     FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 5321 5322 PAB0502 PAB0503     TRUE 0.960 -9.000 0.273 NA   NA
 5322 5323 PAB0503 PAB0504     TRUE 0.953 -46.000 0.833 NA   NA
 5323 5324 PAB0504 PAB0505     TRUE 0.710 32.000 0.375 NA   NA
 5326 5327 PAB1876 PAB1875   dppF TRUE 0.733 29.000 0.333 1.000   NA
 5327 5328 PAB1875 PAB1874 dppF   TRUE 0.993 11.000 0.267 0.006 Y NA
 5328 5329 PAB1874 PAB1873   dppC TRUE 0.991 -16.000 0.302 1.000 Y NA
 5329 5330 PAB1873 PAB1872 dppC   TRUE 0.993 11.000 0.302 0.031 Y NA
 5330 5331 PAB1872 PAB1871   dppA TRUE 0.701 131.000 0.308 0.031 Y NA
 5331 5332 PAB1871 PAB1870 dppA pyrH FALSE 0.014 233.000 0.000 1.000 N NA
 5332 5333 PAB1870 PAB1869 pyrH   FALSE 0.248 13.000 0.003 1.000 N NA
 5333 5334 PAB1869 PAB1868     TRUE 0.843 5.000 0.045 1.000   NA
 5334 5335 PAB1868 PAB1867     TRUE 0.875 6.000 0.073 1.000   NA
 5335 5336 PAB1867 PAB1866     FALSE 0.081 79.000 0.061 NA   NA
 5336 5337 PAB1866 PAB1865     TRUE 0.917 -3.000 0.061 NA   NA
 5337 5338 PAB1865 PAB1864   slyD FALSE 0.227 37.000 0.053 NA   NA
 5340 5341 PAB1862 PAB1861     FALSE 0.079 52.000 0.000 NA   NA
 5341 5342 PAB1861 PAB1860     FALSE 0.084 173.000 0.182 NA   NA
 5342 5343 PAB1860 PAB1859     TRUE 0.879 2.000 0.053 NA   NA
 5344 5345 PAB0512 PAB0513 apbA   TRUE 0.740 -3.000 0.027 NA N NA
 5345 5346 PAB0513 PAB0514   serA-like TRUE 0.911 -3.000 0.073 NA N NA
 5347 5348 PAB1857 PAB1856     FALSE 0.046 55.000 0.003 1.000   NA
 5348 5349 PAB1856 PAB1855     TRUE 0.996 -7.000 0.466 1.000 Y NA
 5350 5351 PAB0517 PAB0518     TRUE 0.962 -15.000 0.364 NA   NA
 5352 5353 PAB1854 PAB1853 aif5A   FALSE 0.041 46.000 0.007 NA   NA
 5353 5354 PAB1853 PAB1852     FALSE 0.355 50.000 0.261 NA   NA
 5355 5356 PAB3187 PAB0520     TRUE 0.773 -12.000 0.000 NA   NA
 5356 5357 PAB0520 PAB0521     FALSE 0.017 210.000 0.000 NA   NA
 5357 5358 PAB0521 PAB0522   rpi TRUE 0.640 4.000 0.012 NA   NA
 5358 5359 PAB0522 PAB0523 rpi   FALSE 0.449 1.000 0.005 NA N NA
 1793296 5361 PAB1851 PAB1850     FALSE 0.094 138.000 0.171 NA   NA
 5363 5364 PAB1848 PAB2446     TRUE 0.920 4.000 0.109 NA   NA
 5364 5365 PAB2446 PAB1845     TRUE 0.935 2.000 0.091 1.000   NA
 5365 5366 PAB1845 PAB1844     TRUE 0.948 5.000 0.250 NA   NA
 5366 5367 PAB1844 PAB1843   soxB FALSE 0.196 124.000 0.375 NA   NA
 5367 5368 PAB1843 PAB1842 soxB   TRUE 0.995 5.000 0.875 0.002   NA
 5368 5369 PAB1842 PAB1841   putP-2 FALSE 0.399 83.000 0.625 1.000   NA
 5369 5370 PAB1841 PAB1840 putP-2   TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 5371 5372 PAB0531 PAB0532     FALSE 0.008 589.000 0.000 NA   NA
 5373 5374 PAB1839 PAB1838     TRUE 0.960 7.000 0.011 1.000 Y NA
 5375 5376 PAB0535 PAB0536   thi1 FALSE 0.127 31.000 0.012 NA   NA
 5376 5377 PAB0536 PAB0537 thi1   FALSE 0.243 395.000 0.000 0.008 Y NA
 5377 5378 PAB0537 PAB0538   hisH-like TRUE 0.944 31.000 0.488 NA Y NA
 5378 5379 PAB0538 PAB0539 hisH-like   FALSE 0.055 68.000 0.000 NA   NA
 5379 5380 PAB0539 PAB0540     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5380 5381 PAB0540 PAB2442   fdhA-like FALSE 0.083 50.000 0.000 NA   NA
 5381 5382 PAB2442 PAB0543 fdhA-like   TRUE 0.823 -3.000 0.017 1.000   NA
 5382 5383 PAB0543 PAB0545     TRUE 0.958 -6.000 0.045 0.031 N NA
 5384 5385 PAB1835 PAB1834     FALSE 0.020 175.000 0.000 NA   NA
 5386 5387 PAB0547 PAB2417   guaA-C TRUE 0.739 2.000 0.004 1.000   NA
 5387 5388 PAB2417 PAB0549 guaA-C guaA-N TRUE 0.986 10.000 0.019 0.001 Y NA
 5390 1793301 PAB0550 PABsnRNA14     FALSE 0.018 206.000 0.000 NA   NA
 5391 5392 PAB2392 PAB1827     TRUE 0.978 6.000 0.727 NA   NA
 5392 5393 PAB1827 PAB1826     TRUE 0.991 0.000 0.889 NA   NA
 5393 5394 PAB1826 PAB1825     TRUE 0.990 -3.000 0.778 NA   NA
 5394 5395 PAB1825 PAB1824     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 5395 5396 PAB1824 PAB1823     TRUE 0.965 -31.000 0.875 NA   NA
 5396 5397 PAB1823 PAB1822     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5397 5398 PAB1822 PAB1821     TRUE 0.834 34.000 1.000 NA   NA
 5398 5399 PAB1821 PAB1820   ftsZ-3 TRUE 0.931 -52.000 0.533 NA   NA
 5399 5400 PAB1820 PAB1819 ftsZ-3   TRUE 0.868 13.000 0.267 1.000   NA
 5400 5401 PAB1819 PAB1818     FALSE 0.446 50.000 0.333 1.000   NA
 5401 5402 PAB1818 PAB1817   lhr-1 FALSE 0.092 73.000 0.053 1.000   NA
 5403 5404 PAB0552 PAB0553     TRUE 0.944 -3.000 0.082 1.000   NA
 5405 5406 PAB1814 PAB1813   rps19E FALSE 0.014 324.000 0.000 1.000   NA
 5406 1793304 PAB1813 PAB1812 rps19E   TRUE 0.981 4.000 0.056 NA Y NA
 5411 5412 PAB1809 PAB1808     FALSE 0.247 69.000 0.250 NA   NA
 5416 5417 PAB1807 PAB1806     FALSE 0.191 33.000 0.000 NA   NA
 5419 5420 PAB1804 PAB1803     TRUE 0.934 7.000 0.250 NA   NA
 5420 5421 PAB1803 PAB1802     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 1793306 402700 PAB1802.1n PABt20   tRNA-Lys FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 402700 5422 PABt20 PAB0562 tRNA-Lys   FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 5422 5423 PAB0562 PAB0563     FALSE 0.147 42.000 0.038 1.000   NA
 5425 5426 PAB0564 PAB7211   rpl40E FALSE 0.007 371.000 0.000 NA N NA
 5427 1793308 PAB1800 PABr05 mcmA1   FALSE 0.040 83.000 0.000 NA   NA
 1793308 5428 PABr05 PAB1799     FALSE 0.035 92.000 0.000 NA   NA
 5428 5429 PAB1799 PAB1798     FALSE 0.020 158.000 0.000 1.000 N NA
 5429 5430 PAB1798 PAB2391     FALSE 0.468 -28.000 0.030 NA N NA
 5431 5432 PAB0568 PAB7213 aif2A   TRUE 0.990 11.000 0.519 NA Y NA
 5432 5433 PAB7213 PAB0569     TRUE 0.977 -3.000 0.305 NA   NA
 5433 5434 PAB0569 PAB0570   nB FALSE 0.029 57.000 0.002 NA   NA
 1793309 5436 PAB1796 PAB1795     TRUE 0.911 -19.000 0.158 1.000   NA
 5436 5437 PAB1795 PAB1794     FALSE 0.123 80.000 0.105 NA   NA
 5439 5440 PAB1792 PAB1791 mae   TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 Y NA
 5440 5441 PAB1791 PAB1790     FALSE 0.084 57.000 0.000 1.000   NA
 5441 5442 PAB1790 PAB1789     FALSE 0.389 22.000 0.000 1.000   NA
 5443 5444 PAB0575 PAB0576 rpl15E   FALSE 0.078 36.000 0.012 1.000 N NA
 5446 5447 PAB0577 PAB0578     TRUE 0.587 70.000 0.026 0.029 Y NA
 5447 5448 PAB0578 PAB0579     TRUE 0.999 6.000 0.838 0.005 Y NA
 5448 402701 PAB0579 PABt21   tRNA-Leu FALSE 0.128 40.000 0.000 NA   NA
 5449 5450 PAB7217 PAB1787     FALSE 0.489 37.000 0.222 NA   NA
 5450 5451 PAB1787 PAB1786     TRUE 0.998 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 5451 5452 PAB1786 PAB1785     TRUE 0.994 11.000 0.875 1.000 Y NA
 5452 5453 PAB1785 PAB1784     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.053   NA
 5454 5455 PAB0581 PAB0582     FALSE 0.090 46.000 0.000 NA   NA
 5457 5458 PAB8218 PAB7218     FALSE 0.029 112.000 0.000 NA   NA
 5459 5460 PAB1781 PAB1780 pepQ-3   FALSE 0.007 776.000 0.000 NA   NA
 5460 5461 PAB1780 PAB1779     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5462 5463 PAB0588 PAB0589     TRUE 0.971 -3.000 0.250 NA   NA
 5463 5464 PAB0589 PAB0590     TRUE 0.972 -16.000 0.583 NA   NA
 5464 5465 PAB0590 PAB0591     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5465 5466 PAB0591 PAB0592     TRUE 0.941 2.000 0.000 0.099   NA
 5466 5467 PAB0592 PAB0593   cpa FALSE 0.162 185.000 0.182 0.099   NA
 5467 5468 PAB0593 PAB0594 cpa   FALSE 0.012 320.000 0.000 NA   NA
 5469 5470 PAB1772 PAB1771     TRUE 0.948 6.000 0.292 1.000 N NA
 5470 5471 PAB1771 PAB1770     TRUE 0.963 3.000 0.292 1.000 N NA
 5471 5472 PAB1770 PAB1769   mmdA TRUE 0.979 10.000 0.333 0.004 N NA
 5475 5476 PAB0597 PAB0598   rr FALSE 0.508 81.000 0.000 0.053 Y NA
 5476 5477 PAB0598 PAB7224 rr rd TRUE 0.756 80.000 0.188 0.017 Y NA
 5477 5478 PAB7224 PAB0599 rd   TRUE 0.995 2.000 0.111 0.053 Y NA
 5479 5480 PAB1765 PAB1764     FALSE 0.026 121.000 0.000 NA   NA
 5481 5482 PAB0600 PAB0601   ubiE FALSE 0.157 40.000 0.000 1.000   NA
 5482 5483 PAB0601 PAB0602 ubiE   FALSE 0.312 23.000 0.000 NA   NA
 5486 5487 PAB1761 PAB2390     TRUE 0.645 25.000 0.154 1.000   NA
 5488 5489 PAB0605 PAB0606 metB   TRUE 0.992 -3.000 0.125 NA Y NA
 5489 5490 PAB0606 PAB2361   metE-like2 TRUE 0.973 -7.000 0.007 NA Y NA
 5490 5491 PAB2361 PAB0608 metE-like2 metE-like1 TRUE 0.995 2.000 0.039 0.001 Y NA
 5493 5494 PAB0609 PAB0610 putP-1 hom FALSE 0.473 57.000 0.000 1.000 Y NA
 5495 5496 PAB1756 PAB1755     FALSE 0.009 451.000 0.000 NA   NA
 5496 5497 PAB1755 PAB1754     FALSE 0.059 63.000 0.000 NA   NA
 5497 5498 PAB1754 PAB1753     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 5498 5499 PAB1753 PAB2389     TRUE 0.703 1.000 0.011 NA   NA
 5499 5500 PAB2389 PAB1751     TRUE 0.976 -3.000 0.258 1.000   NA
 5501 5502 PAB0614 PAB0615     FALSE 0.335 26.000 0.044 NA   NA
 5505 5506 PAB1748 PAB1747     FALSE 0.402 18.000 0.000 NA   NA
 5506 5507 PAB1747 PAB1746     FALSE 0.385 19.000 0.000 NA   NA
 5508 5509 PAB0618 PAB0619     TRUE 0.972 0.000 0.286 NA   NA
 5509 5510 PAB0619 PAB0620     FALSE 0.107 39.000 0.014 1.000   NA
 5510 5511 PAB0620 PAB0621     FALSE 0.074 54.000 0.000 NA   NA
 5511 5512 PAB0621 PAB0622     FALSE 0.017 214.000 0.000 NA   NA
 5512 5513 PAB0622 PAB0623     FALSE 0.010 372.000 0.000 NA   NA
 5513 5514 PAB0623 PAB0624     FALSE 0.047 76.000 0.000 NA   NA
 402702 402703 PABt22 PABt23 tRNA-Thr tRNA-Ser FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 402703 402704 PABt23 PABt24 tRNA-Ser tRNA-Cys FALSE 0.451 14.000 0.000 NA   NA
 402704 5516 PABt24 PAB0625 tRNA-Cys   FALSE 0.018 199.000 0.000 NA   NA
 5516 5517 PAB0625 PAB0626   pacS TRUE 0.966 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5518 5519 PAB1741 PAB1740     FALSE 0.018 198.000 0.000 NA   NA
 5520 5521 PAB0627 PAB0628 appA appB-2 TRUE 0.898 39.000 0.133 0.030 Y NA
 5521 5522 PAB0628 PAB2363 appB-2 appC-2 TRUE 0.999 1.000 0.933 0.030 Y NA
 5522 5523 PAB2363 PAB0630 appC-2 appF-2 TRUE 0.997 2.000 0.700 1.000 Y NA
 5523 5524 PAB0630 PAB0631 appF-2 appF-3 TRUE 0.999 0.000 0.900 0.006 Y NA
 5524 5525 PAB0631 PAB0632 appF-3 celB-like TRUE 0.768 4.000 0.000 1.000 N NA
 5525 5526 PAB0632 PAB0633 celB-like   FALSE 0.046 91.000 0.000 1.000   NA
 5526 5527 PAB0633 PAB0634     FALSE 0.052 428.000 0.000 0.013   NA
 5527 1793316 PAB0634 PABsnRNA36     FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 1793316 5528 PABsnRNA36 PAB0635     TRUE 0.818 2.000 0.000 NA   NA
 5529 5530 PAB1738 PAB1737     TRUE 0.976 1.000 0.143 0.052 N NA
 5531 5532 PAB0638 PAB0639 hydB-2 hydG-2 TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.052   NA
 5532 5533 PAB0639 PAB0640 hydG-2 hydD-2 TRUE 0.998 0.000 0.714 1.000 Y NA
 5533 5534 PAB0640 PAB0641 hydD-2 hydA-2 TRUE 0.997 -6.000 0.625 1.000 Y NA
 5535 5536 PAB1736 PAB2388     TRUE 0.842 0.000 0.026 1.000   NA
 5537 1793317 PAB0642 PAB0643     TRUE 0.931 -16.000 0.222 NA   NA
 1793317 5539 PAB0643 PAB0644     TRUE 0.977 0.000 0.333 NA   NA
 5539 5540 PAB0644 PAB0645     FALSE 0.013 387.000 0.000 1.000   NA
 5540 5541 PAB0645 PAB0646   aspS FALSE 0.407 62.000 0.020 1.000 Y NA
 5541 5542 PAB0646 PAB0647 aspS aor-2 FALSE 0.012 122.000 0.013 1.000 N NA
 5542 5543 PAB0647 PAB3241 aor-2 moaD-like FALSE 0.322 34.000 0.076 1.000 N NA
 5543 5544 PAB3241 PAB0648 moaD-like cmo TRUE 0.969 1.000 0.240 1.000   NA
 5544 5545 PAB0648 PAB0649 cmo   TRUE 0.942 -3.000 0.080 1.000   NA
 5547 5548 PAB0651 PAB0652     TRUE 0.933 -7.000 0.119 1.000 N NA
 5548 5549 PAB0652 PAB0653   cyaB-like1 TRUE 0.953 4.000 0.250 1.000 N NA
 5550 5551 PAB1728 PAB1727 tyrS   TRUE 0.778 6.000 0.000 1.000   NA
 5553 1793319 PAB1726 PAB1725     FALSE 0.023 61.000 0.003 1.000 N NA
 1793319 5555 PAB1725 PAB1724   proS TRUE 0.921 -3.000 0.003 0.098 N NA
 5557 5558 PAB1723 PAB1722     FALSE 0.265 52.000 0.167 NA   NA
 5558 5559 PAB1722 PAB1721     TRUE 0.879 -3.000 0.042 NA   NA
 5559 402726 PAB1721 PABt25   tRNA-Tyr FALSE 0.248 28.000 0.000 NA   NA
 5560 5561 PAB0657 PAB0658     TRUE 0.599 -13.000 0.011 NA   NA
 5562 5563 PAB1720 PAB1719     FALSE 0.065 36.000 0.004 1.000 N NA
 5564 5565 PAB0660 PAB0661     TRUE 0.990 2.000 1.000 NA   NA
 5565 5566 PAB0661 PAB2364   metS FALSE 0.033 74.000 0.008 1.000   NA
 5566 1793320 PAB2364 PABsnRNA27 metS   TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 5567 5568 PAB1717 PAB1716     FALSE 0.117 17.000 0.007 NA N NA
 5568 5569 PAB1716 PAB1715     TRUE 0.910 7.000 0.165 NA   NA
 5569 5570 PAB1715 PAB1714     FALSE 0.230 33.000 0.042 NA   NA
 5570 5571 PAB1714 PAB1713     TRUE 0.997 -9.000 0.780 1.000 Y NA
 5571 5572 PAB1713 PAB2445     TRUE 0.936 7.000 0.229 1.000   NA
 5573 5574 PAB0664 PAB0665     FALSE 0.542 12.000 0.000 NA   NA
 5575 5576 PAB1709 PAB1708     FALSE 0.285 25.000 0.000 NA   NA
 5576 5577 PAB1708 PAB1707     FALSE 0.119 44.000 0.000 1.000   NA
 5579 1793322 PAB1706 PAB1705     FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 1793322 5581 PAB1705 PAB1704     FALSE 0.055 68.000 0.000 NA   NA
 5581 5582 PAB1704 PAB1703     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.097   NA
 5582 5583 PAB1703 PAB1702     FALSE 0.389 22.000 0.000 1.000   NA
 5583 5584 PAB1702 PAB1701   truA FALSE 0.011 472.000 0.000 1.000   NA
 5585 5586 PAB0672 PAB0673     TRUE 0.633 10.000 0.030 NA   NA
 5586 5587 PAB0673 PAB0674     FALSE 0.036 83.000 0.030 NA   NA
 5587 5588 PAB0674 PAB0675     FALSE 0.174 81.000 0.214 1.000 N NA
 5588 5589 PAB0675 PAB0676   hemv-3 TRUE 0.956 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5589 5590 PAB0676 PAB0677 hemv-3 hemU-1 TRUE 0.991 6.000 0.302 1.000 Y NA
 5590 5591 PAB0677 PAB0678 hemU-1 hemV-1 TRUE 0.994 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 5592 5594 PAB1699 PAB1698     TRUE 0.715 -3.000 0.006 NA   NA
 5594 5595 PAB1698 PAB1697     TRUE 0.818 2.000 0.000 NA   NA
 5595 5596 PAB1697 PAB1696     TRUE 0.990 0.000 0.800 NA   NA
 5596 5597 PAB1696 PAB1695     TRUE 0.570 27.000 0.111 1.000   NA
 5597 5598 PAB1695 PAB1694     TRUE 0.981 -3.000 0.333 1.000   NA
 5598 5599 PAB1694 PAB1693     FALSE 0.019 192.000 0.000 NA   NA
 5599 5600 PAB1693 PAB1692     FALSE 0.008 567.000 0.000 NA   NA
 5600 5602 PAB1692 PAB1691     FALSE 0.022 145.000 0.000 NA   NA
 5602 5603 PAB1691 PAB1690     TRUE 0.940 -28.000 0.417 NA   NA
 5603 5604 PAB1690 PAB1689     TRUE 0.987 -3.000 0.556 NA   NA
 5604 5605 PAB1689 PAB1688     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 5605 5606 PAB1688 PAB1687     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 5606 5607 PAB1687 PAB1686     TRUE 0.990 -31.000 0.600 NA Y NA
 5607 5608 PAB1686 PAB1685     TRUE 0.984 1.000 0.500 NA   NA
 5609 5610 PAB0685 PAB0686     TRUE 0.944 4.000 0.200 NA   NA
 5610 5611 PAB0686 PAB0687     FALSE 0.010 383.000 0.000 NA   NA
 5613 5614 PAB0689 PAB0690     FALSE 0.030 110.000 0.000 NA   NA
 5614 1793325 PAB0690 PABsnRNA25     TRUE 0.693 8.000 0.000 NA   NA
 1793325 5615 PABsnRNA25 PAB0691     FALSE 0.117 41.000 0.000 NA   NA
 5616 5617 PAB2433 PAB1679   pgk TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5617 5618 PAB1679 PAB1678 pgk asd FALSE 0.081 47.000 0.000 1.000 N NA
 5618 5619 PAB1678 PAB1677 asd thrC-2 TRUE 0.995 -3.000 0.011 0.002 Y NA
 5619 5620 PAB1677 PAB1676 thrC-2   TRUE 0.974 -9.000 0.011 1.000 Y NA
 5620 5621 PAB1676 PAB1675   lysC TRUE 0.979 -55.000 0.333 1.000 Y NA
 5621 5622 PAB1675 PAB1674 lysC   TRUE 0.964 41.000 0.500 0.001 Y NA
 5622 5623 PAB1674 PAB1673     FALSE 0.015 222.000 0.000 1.000 N NA
 5624 5625 PAB2365 PAB2366 phoX phoA TRUE 0.993 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5625 5626 PAB2366 PAB0696 phoA   TRUE 0.892 12.000 0.333 NA N NA
 5626 5627 PAB0696 PAB0697     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA Y NA
 5627 5628 PAB0697 PAB0698   pstC TRUE 0.800 -3.000 0.000 NA N NA
 5628 5629 PAB0698 PAB0699 pstC pstA TRUE 0.998 -13.000 0.404 0.003 Y NA
 5629 5630 PAB0699 PAB0700 pstA pstB TRUE 0.986 -84.000 0.161 0.003 Y NA
 5630 5631 PAB0700 PAB0701 pstB   TRUE 0.992 -3.000 0.105 NA Y NA
 5631 5632 PAB0701 PAB0702   phoU TRUE 0.972 5.000 0.000 NA Y NA
 5633 1793326 PAB1672 PAB1672.1n     TRUE 0.584 -31.000 0.000 NA   NA
 1793326 5634 PAB1672.1n PAB1671     FALSE 0.023 141.000 0.000 NA   NA
 5634 5635 PAB1671 PAB1670     FALSE 0.009 487.000 0.000 NA   NA
 5635 5636 PAB1670 PAB1669     TRUE 0.738 -15.000 0.000 NA   NA
 5636 5637 PAB1669 PAB1668     TRUE 0.925 -13.000 0.154 NA   NA
 5638 5639 PAB0703 PAB3259     TRUE 0.953 -3.000 0.119 NA   NA
 5639 5640 PAB3259 PAB0704     FALSE 0.503 -40.000 0.030 NA   NA
 5640 5641 PAB0704 PAB0705     TRUE 0.958 -15.000 0.333 NA   NA
 5642 5643 PAB1666 PAB1665     TRUE 0.854 2.000 0.035 1.000   NA
 5644 5645 PAB0707 PAB3260     FALSE 0.027 95.000 0.038 NA N NA
 5645 5646 PAB3260 PAB0708   feoB TRUE 0.997 2.000 0.667 1.000 Y NA
 5647 5648 PAB1663 PAB1662     TRUE 0.604 4.000 0.005 NA   NA
 5648 5650 PAB1662 PAB1661     FALSE 0.038 87.000 0.000 NA   NA
 5650 402724 PAB1661 PABt27   tRNA-Ala FALSE 0.046 78.000 0.000 NA   NA
 5651 5652 PAB0711 PAB0712     TRUE 0.626 -25.000 0.000 NA   NA
 5652 1793327 PAB0712 PABsnRNA1     TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793327 5653 PABsnRNA1 PAB0713     TRUE 0.660 -22.000 0.000 NA   NA
 5653 5654 PAB0713 PAB0714     FALSE 0.105 43.000 0.028 1.000   NA
 5655 5656 PAB1660 PAB1659     FALSE 0.042 90.000 0.030 1.000   NA
 5657 5658 PAB1658 PAB1657     TRUE 0.922 -3.000 0.067 NA   NA
 5659 5660 PAB0718 PAB0719 iorA-2   FALSE 0.115 47.000 0.048 1.000 N NA
 5662 5663 PAB0720 PAB0721     TRUE 0.807 -3.000 0.023 NA   NA
 5663 5664 PAB0721 PAB0722   hflX-like FALSE 0.236 25.000 0.015 1.000   NA
 5665 5666 PAB1652 PAB1651     FALSE 0.015 311.000 0.000 1.000   NA
 5666 5667 PAB1651 PAB1650     TRUE 0.579 33.000 0.250 NA   NA
 5667 5668 PAB1650 PAB1649     FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 5669 5670 PAB0723 PAB0724 argE-like   FALSE 0.058 61.000 0.000 1.000 N NA
 5671 5672 PAB1646 PAB1645 thiD thiE TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5672 5673 PAB1645 PAB2432 thiE thiM TRUE 0.996 -10.000 0.146 0.008 Y NA
 5673 5674 PAB2432 PAB1643 thiM   TRUE 0.718 -3.000 0.012 1.000 N NA
 5674 5675 PAB1643 PAB1642     TRUE 0.582 -37.000 0.049 NA N NA
 5675 5676 PAB1642 PAB1641     TRUE 0.972 -16.000 0.050 NA Y NA
 5676 5677 PAB1641 PAB1640     FALSE 0.049 72.000 0.033 NA   NA
 5677 5678 PAB1640 PAB1639     TRUE 0.988 -6.000 0.750 NA   NA
 5678 5679 PAB1639 PAB1638     FALSE 0.029 65.000 0.011 NA   NA
 5682 5683 PAB2420 PAB0728     TRUE 0.743 2.000 0.005 1.000   NA
 5683 5684 PAB0728 PAB0729   traB FALSE 0.430 -31.000 0.014 NA   NA
 5685 5686 PAB1635 PAB2430   pyrE TRUE 0.605 -28.000 0.000 NA   NA
 5687 5688 PAB0731 PAB0732 rpl21E   TRUE 0.969 7.000 0.479 1.000   NA
 5688 5689 PAB0732 PAB0733     FALSE 0.484 -31.000 0.021 NA   NA
 5693 5694 PAB0736 PAB0737     FALSE 0.455 70.000 0.600 1.000   NA
 5695 5696 PAB1632 PAB1631     TRUE 0.818 2.000 0.000 NA   NA
 5697 1793331 PAB0739 PABsnRNA46 adk   TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 1793331 5698 PABsnRNA46 PAB0740   tgtA TRUE 0.840 0.000 0.000 NA   NA
 5698 5699 PAB0740 PAB0741 tgtA   FALSE 0.011 354.000 0.000 NA   NA
 5699 5700 PAB0741 PAB7281     FALSE 0.049 74.000 0.000 NA   NA
 1793332 5702 PABsnRNA24 PAB0742   pflX FALSE 0.145 38.000 0.000 NA   NA
 5702 5703 PAB0742 PAB0743 pflX   TRUE 0.763 3.000 0.028 NA   NA
 5703 5704 PAB0743 PAB0744   lhr-2 FALSE 0.012 139.000 0.012 NA   NA
 5705 5706 PAB1625 PAB1624     FALSE 0.034 94.000 0.000 NA   NA
 5706 5707 PAB1624 PAB1623     FALSE 0.447 10.000 0.004 NA   NA
 5707 5708 PAB1623 PAB1622     TRUE 0.944 -16.000 0.286 NA   NA
 5708 5710 PAB1622 PAB1621     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 1793334 5711 PAB1622a.1n PAB0746     FALSE 0.199 32.000 0.033 NA   NA
 5711 1793335 PAB0746 PAB0747     TRUE 0.762 -34.000 0.082 NA   NA
 5713 5714 PAB1620 PAB1619     TRUE 0.563 -34.000 0.000 NA   NA
 5715 5716 PAB0749 PAB0750 rps8E asnB FALSE 0.013 114.000 0.012 1.000 N NA
 5718 5719 PAB0751 PAB0752     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5719 5720 PAB0752 PAB0753     TRUE 0.661 10.000 0.000 NA   NA
 5720 5721 PAB0753 PAB0754     FALSE 0.145 38.000 0.000 NA   NA
 5721 5722 PAB0754 PAB0755   infB FALSE 0.095 53.000 0.000 1.000   NA
 11541531 5723   PAB1613     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11683894 5723   PAB1613     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11826286 5723   PAB1613     FALSE NA 378.000 0.000 NA   NA
 11541532 5723   PAB1613     FALSE NA 341.000 0.000 NA   NA
 11683895 5723   PAB1613     FALSE NA 341.000 0.000 NA   NA
 11826287 5723   PAB1613     FALSE NA 341.000 0.000 NA   NA
 11541533 5723   PAB1613     FALSE NA 316.000 0.000 NA   NA
 11683896 5723   PAB1613     FALSE NA 316.000 0.000 NA   NA
 11826288 5723   PAB1613     FALSE NA 316.000 0.000 NA   NA
 11541534 5723   PAB1613     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11683897 5723   PAB1613     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11826289 5723   PAB1613     FALSE NA 274.000 0.000 NA   NA
 11541535 5723   PAB1613     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 11683898 5723   PAB1613     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 11826290 5723   PAB1613     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 5723 5724 PAB1613 PAB1612     FALSE 0.138 57.000 0.088 NA N NA
 5725 5726 PAB0757 PAB0758   htpX TRUE 0.639 1.000 0.005 1.000 N NA
 5726 1793337 PAB0758 PABsnRNA2 htpX   FALSE 0.014 254.000 0.000 NA   NA
 1793337 5728 PABsnRNA2 PAB0759     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5728 5729 PAB0759 PAB0760     TRUE 0.789 -3.000 0.019 NA   NA
 5729 5730 PAB0760 PAB0761     TRUE 0.864 5.000 0.071 1.000 N NA
 5730 5731 PAB0761 PAB0762     TRUE 0.676 25.000 0.231 1.000 N NA
 1793338 5734 PAB7289 PAB0763 rpL34E cmk TRUE 0.937 4.000 0.168 1.000 N NA
 5734 5735 PAB0763 PAB7290 cmk rpl14E FALSE 0.114 79.000 0.095 1.000 N NA
 5735 5736 PAB7290 PAB0764 rpl14E   FALSE 0.026 48.000 0.015 NA N NA
 5736 5737 PAB0764 PAB0765     TRUE 0.808 7.000 0.057 NA   NA
 402723 402722 PABt29 PABt30 tRNA-Ile tRNA-Glu TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 5739 5740 PAB1606 PAB1605     FALSE 0.058 61.000 0.000 1.000 N NA
 5740 5741 PAB1605 PAB1604     FALSE 0.295 23.000 0.000 1.000 N NA
 5742 5743 PAB0770 PAB0771 ugd   TRUE 0.994 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 5743 5744 PAB0771 PAB0772     TRUE 0.967 -7.000 0.300 NA   NA
 5744 5745 PAB0772 PAB0773     FALSE 0.273 79.000 0.333 NA   NA
 5745 5746 PAB0773 PAB0774   aspB-like1 TRUE 0.982 3.000 0.044 1.000 Y NA
 5746 5747 PAB0774 PAB0775 aspB-like1   TRUE 0.960 -3.000 0.131 1.000   NA
 5747 5748 PAB0775 PAB0776     TRUE 0.962 1.000 0.052 0.049   NA
 5748 5749 PAB0776 PAB0777     FALSE 0.007 1479.000 0.000 NA   NA
 5750 5751 PAB1599 PAB1598     FALSE 0.007 729.000 0.000 NA   NA
 5751 5752 PAB1598 PAB1597     FALSE 0.007 1803.000 0.000 NA   NA
 5752 5753 PAB1597 PAB1596     FALSE 0.011 509.000 0.000 1.000   NA
 5753 5754 PAB1596 PAB1595   sat FALSE 0.125 32.000 0.018 1.000 N NA
 5755 5756 PAB0780 PAB0781   cysC TRUE 0.818 10.000 0.065 1.000   NA
 5756 5757 PAB0781 PAB0782 cysC   TRUE 0.729 10.000 0.038 1.000   NA
 5757 5758 PAB0782 PAB0783     TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5758 5759 PAB0783 PAB0784   graD-3 FALSE 0.057 78.000 0.000 1.000   NA
 5759 5760 PAB0784 PAB0785 graD-3 rfbB TRUE 0.975 12.000 0.217 1.000 Y NA
 5760 1793347 PAB0785 PAB0785.1n rfbB   FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 1793347 5761 PAB0785.1n PAB7298     FALSE 0.013 268.000 0.000 NA   NA
 5761 5762 PAB7298 PAB0786     TRUE 0.937 1.000 0.100 NA   NA
 5762 5763 PAB0786 PAB0787   rfbC FALSE 0.196 57.000 0.115 NA   NA
 5763 5764 PAB0787 PAB0788 rfbC   FALSE 0.008 634.000 0.000 NA   NA
 5764 5765 PAB0788 PAB0789     TRUE 0.952 -3.000 0.118 NA   NA
 5765 5766 PAB0789 PAB0790     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA N NA
 5766 5767 PAB0790 PAB3293     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 5767 5768 PAB3293 PAB2422     FALSE 0.025 178.000 0.000 1.000   NA
 5768 5769 PAB2422 PAB0793     FALSE 0.010 561.000 0.000 1.000   NA
 5770 5771 PAB1592 PAB1590     FALSE 0.007 971.000 0.000 NA   NA
 5772 5773 PAB0795 PAB0796     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 5774 5775 PAB1589 PAB1588     FALSE 0.090 46.000 0.000 NA   NA
 5775 5776 PAB1588 PAB1587     FALSE 0.414 17.000 0.000 NA   NA
 5776 5777 PAB1587 PAB1586     FALSE 0.024 182.000 0.000 1.000   NA
 5777 5778 PAB1586 PAB1585     FALSE 0.080 51.000 0.000 NA   NA
 5778 5779 PAB1585 PAB1584     FALSE 0.009 445.000 0.000 NA   NA
 5779 5780 PAB1584 PAB1583     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 5780 5781 PAB1583 PAB1582     FALSE 0.030 108.000 0.000 NA   NA
 5781 5782 PAB1582 PAB3298     FALSE 0.008 567.000 0.000 NA   NA
 5783 5784 PAB0798 PAB0800 for   FALSE 0.219 34.000 0.000 1.000   NA
 5784 5785 PAB0800 PAB0801     FALSE 0.335 25.000 0.000 1.000   NA
 5785 5786 PAB0801 PAB0802     TRUE 0.944 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5786 5787 PAB0802 PAB3299     TRUE 0.989 -24.000 0.104 0.034 Y NA
 5787 5788 PAB3299 PAB0803     TRUE 0.997 -7.000 0.655 1.000 Y NA
 5788 5789 PAB0803 PAB0804     TRUE 0.977 -19.000 0.092 NA Y NA
 5789 5790 PAB0804 PAB0805     TRUE 0.922 -3.000 0.067 NA   NA
 5790 1793357 PAB0805 PAB7306     TRUE 0.920 3.000 0.093 NA   NA
 1793357 5792 PAB7306 PAB0806     TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.013 Y NA
 5792 5793 PAB0806 PAB0807     FALSE 0.010 402.000 0.000 NA   NA
 5794 5795 PAB1581 PAB1580   rbcL FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 5795 5796 PAB1580 PAB1579 rbcL   FALSE 0.284 29.000 0.035 1.000   NA
 5796 5797 PAB1579 PAB1578     TRUE 0.905 -3.000 0.044 1.000   NA
 5797 5798 PAB1578 PAB1577     TRUE 0.878 -3.000 0.044 1.000 N NA
 5798 5799 PAB1577 PAB1576     TRUE 0.975 -22.000 0.800 1.000   NA
 5800 5801 PAB7309 PAB0809   napA-4 TRUE 0.956 2.000 0.211 NA   NA
 5801 5802 PAB0809 PAB0810 napA-4   FALSE 0.468 23.000 0.064 NA   NA
 5802 5803 PAB0810 PAB0811   rad32 TRUE 0.937 -13.000 0.207 NA   NA
 5803 5804 PAB0811 PAB0812 rad32   TRUE 0.993 5.000 0.331 1.000 Y NA
 5804 5805 PAB0812 PAB0813     TRUE 0.825 21.000 0.339 NA   NA
 5805 402706 PAB0813 PABt31   tRNA-Gly FALSE 0.096 44.000 0.000 NA   NA
 5806 5807 PAB1571 PAB1570     FALSE 0.010 411.000 0.000 NA   NA
 5807 5808 PAB1570 PAB1569     FALSE 0.018 199.000 0.000 NA   NA
 5808 5809 PAB1569 PAB1566     FALSE 0.012 453.000 0.000 1.000   NA
 5809 5810 PAB1566 PAB1564     FALSE 0.008 576.000 0.000 NA   NA
 5811 5812 PAB0816 PAB0817     TRUE 0.987 -3.000 0.088 0.001   NA
 5812 5813 PAB0817 PAB0818   manC TRUE 0.891 -3.000 0.038 1.000   NA
 5813 5814 PAB0818 PAB0819 manC pmm TRUE 0.875 2.000 0.054 1.000 N NA
 5815 5816 PAB1562 PAB1561     FALSE 0.087 47.000 0.000 NA   NA
 5817 1793364 PAB0820 PABsnRNA28     FALSE 0.090 46.000 0.000 NA   NA
 5818 5819 PAB1560 PAB1559 hypF hypD FALSE 0.287 92.000 0.023 1.000 Y NA
 5819 5820 PAB1559 PAB7315 hypD hypC TRUE 0.996 1.000 0.363 NA Y NA
 5821 5822 PAB0821 PAB0822     TRUE 0.979 6.000 0.750 NA   NA
 5823 5824 PAB1558 PAB1557     FALSE 0.117 41.000 0.000 NA   NA
 5824 5825 PAB1557 PAB1556     FALSE 0.108 42.000 0.000 NA   NA
 5825 1793365 PAB1556 PAB1556.1n     TRUE 0.969 -3.000 0.222 NA   NA
 1793365 5826 PAB1556.1n PAB1555     TRUE 0.863 -13.000 0.068 NA   NA
 5826 5827 PAB1555 PAB1554     FALSE 0.050 313.000 0.057 0.058 N NA
 5828 5829 PAB0824 PAB0825     FALSE 0.053 62.000 0.030 NA   NA
 5829 1793367 PAB0825 PABsnRNA23     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 1793367 5830 PABsnRNA23 PAB0826     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 5830 5831 PAB0826 PAB0827     TRUE 0.699 -18.000 0.000 NA   NA
 5831 5832 PAB0827 PAB0828     TRUE 0.916 -31.000 0.333 1.000 N NA
 5832 5833 PAB0828 PAB0829   purB FALSE 0.233 28.000 0.000 1.000 N NA
 5833 5834 PAB0829 PAB0830 purB   FALSE 0.010 256.000 0.000 NA N NA
 5834 5835 PAB0830 PAB0831     FALSE 0.101 43.000 0.000 NA   NA
 5836 5837 PAB1548 PAB1547     TRUE 0.990 2.000 0.912 NA   NA
 5839 5840 PAB1546 PAB1545     TRUE 0.926 -52.000 0.500 NA   NA
 5841 5842 PAB0833 PAB0834     FALSE 0.027 119.000 0.000 NA   NA
 5843 1793368 PAB1544 PAB1543     TRUE 0.985 -3.000 0.130 0.024   NA
 5845 5846 PAB0835 PAB2423   top-RG FALSE 0.032 66.000 0.017 NA   NA
 5846 5847 PAB2423 PAB0838 top-RG   FALSE 0.021 192.000 0.050 NA N NA
 5848 5849 PAB1540 PAB1539     TRUE 0.944 -3.000 0.082 1.000   NA
 5849 5850 PAB1539 PAB1538     TRUE 0.735 6.000 0.000 NA   NA
 5850 5851 PAB1538 PAB1537     TRUE 0.711 -25.000 0.048 NA   NA
 5851 5852 PAB1537 PAB1536   hemV-2 FALSE 0.299 43.000 0.048 0.090 N NA
 5852 5853 PAB1536 PAB1535 hemV-2 hemU-2 TRUE 0.988 -7.000 0.082 1.000 Y NA
 5853 5854 PAB1535 PAB2428 hemU-2   TRUE 0.742 19.000 0.029 0.027   NA
 5854 5855 PAB2428 PAB1533     FALSE 0.071 50.000 0.029 NA   NA
 5855 5856 PAB1533 PAB1532     FALSE 0.008 533.000 0.000 NA   NA
 5856 5857 PAB1532 PAB1531     TRUE 0.947 -16.000 0.300 NA   NA
 5857 5858 PAB1531 PAB3319     TRUE 0.907 -3.000 0.056 NA   NA
 5858 5859 PAB3319 PAB1530   alkA TRUE 0.907 -3.000 0.056 NA   NA
 1793371 5860 PABsnRNA22 PAB0842     FALSE 0.108 42.000 0.000 NA   NA
 5861 5862 PAB2386 PAB1527     TRUE 0.889 40.000 0.385 1.000 Y NA
 5863 5864 PAB0846 PAB0847     TRUE 0.784 -10.000 0.000 NA   NA
 5864 5865 PAB0847 PAB0848   moxR-3 TRUE 0.854 -16.000 0.077 NA   NA
 5865 5866 PAB0848 PAB0849 moxR-3   TRUE 0.921 7.000 0.205 NA   NA
 5866 5867 PAB0849 PAB0850     TRUE 0.990 -3.000 0.778 NA   NA
 5868 5869 PAB1524 PAB1523   aspB-2 FALSE 0.200 36.000 0.000 1.000   NA
 5869 5870 PAB1523 PAB1522 aspB-2   FALSE 0.144 49.000 0.059 NA   NA
 1793372 5871 PAB1522.1n PAB0851   ftsZ-2 TRUE 0.790 20.000 0.286 1.000 N NA
 5871 5872 PAB0851 PAB0852 ftsZ-2 soj TRUE 0.694 49.000 0.125 1.000 Y NA
 5872 5873 PAB0852 PAB0853 soj   TRUE 0.972 -16.000 0.583 NA   NA
 5873 5874 PAB0853 PAB0854     FALSE 0.164 100.000 0.250 NA   NA
 5874 5875 PAB0854 PAB0855   iorA-1 TRUE 0.997 1.000 0.636 1.000 Y NA
 5875 5876 PAB0855 PAB0857 iorA-1 iorB-1 TRUE 0.998 -3.000 0.138 0.002 Y NA
 5877 5878 PAB1518 PAB1517     TRUE 0.843 -7.000 0.000 1.000   NA
 1793373 1793374 PABsnRNA34 PAB1517.1n     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 1793374 5879 PAB1517.1n PAB0859     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 402721 5880 PABt32 PAB1516 tRNA-Arg   FALSE 0.024 134.000 0.000 NA   NA
 5881 5882 PAB0861 PAB0862     FALSE 0.164 36.000 0.000 NA   NA
 5882 5883 PAB0862 PAB0863     FALSE 0.128 40.000 0.000 NA   NA
 5888 5889 PAB1512 PAB1511     TRUE 0.974 -7.000 0.333 1.000   NA
 5889 5890 PAB1511 PAB1510     TRUE 0.966 5.000 0.333 1.000   NA
 5893 5894 PAB0869 PAB0870     TRUE 0.828 -3.000 0.018 1.000   NA
 5895 5896 PAB1507 PAB1506     FALSE 0.513 -21.000 0.017 1.000 N NA
 5896 5897 PAB1506 PAB1505     TRUE 0.686 2.000 0.016 1.000 N NA
 5897 5898 PAB1505 PAB1504     TRUE 0.881 -3.000 0.000 1.000   NA
 5900 5901 PAB1503 PAB1502   argF FALSE 0.009 160.000 0.003 NA   NA
 5901 5902 PAB1502 PAB1501 argF dph5 FALSE 0.009 132.000 0.004 1.000 N NA
 1793376 5903 PABsnRNA4 PAB0873     FALSE 0.055 68.000 0.000 NA   NA
 5904 5905 PAB1499 PAB1498 pyrI pyrB TRUE 0.998 1.000 0.197 0.001 Y NA
 5906 5907 PAB7338 PAB0874     TRUE 0.880 3.000 0.050 1.000   NA
 5907 5908 PAB0874 PAB0875     FALSE 0.020 179.000 0.000 NA   NA
 5908 5909 PAB0875 PAB0876     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 5909 5910 PAB0876 PAB0877     TRUE 0.855 -73.000 0.273 NA   NA
 5910 5911 PAB0877 PAB0878     TRUE 0.677 14.000 0.083 NA   NA
 5913 5914 PAB0880 PAB0881   serS FALSE 0.259 17.000 0.012 NA   NA
 5914 5915 PAB0881 PAB0882 serS   TRUE 0.629 -15.000 0.018 NA   NA
 5916 5917 PAB1493 PAB1492     FALSE 0.148 24.000 0.002 NA   NA
 5918 5919 PAB0883 PAB2444 mgtE-like aIF-2BI FALSE 0.527 5.000 0.004 1.000 N NA
 5919 5920 PAB2444 PAB0885 aIF-2BI   FALSE 0.023 91.000 0.004 1.000   NA
 5921 5922 PAB1490 PAB1489 thrS ndk FALSE 0.324 33.000 0.002 0.089 N NA
 5922 5923 PAB1489 PAB2385 ndk   FALSE 0.045 229.000 0.000 0.089 N NA
 5924 5925 PAB0887 PAB0888   ilvB FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 5925 5926 PAB0888 PAB0889 ilvB ilvC TRUE 0.993 2.000 0.003 0.002 Y NA
 5926 5927 PAB0889 PAB0890 ilvC leuA-1 TRUE 0.865 31.000 0.103 1.000 Y NA
 5927 5928 PAB0890 PAB0891 leuA-1 leuC-1 TRUE 0.888 41.000 0.086 0.003 Y NA
 5928 5929 PAB0891 PAB0892 leuC-1 leuD-1 TRUE 0.999 -3.000 0.615 0.002 Y NA
 5929 5930 PAB0892 PAB2424 leuD-1 leuB-1 TRUE 0.994 -3.000 0.146 1.000 Y NA
 5930 5931 PAB2424 PAB0894 leuB-1 leuA-3 TRUE 0.955 -22.000 0.022 1.000 Y NA
 5931 5932 PAB0894 PAB0895 leuA-3 ilvD TRUE 0.972 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 5932 5933 PAB0895 PAB0896 ilvD   FALSE 0.321 26.000 0.000 1.000   NA
 5933 5934 PAB0896 PAB0897     FALSE 0.207 32.000 0.000 NA   NA
 5934 5935 PAB0897 PAB0898     TRUE 0.892 -37.000 0.286 NA   NA
 5935 5936 PAB0898 PAB0899     FALSE 0.039 85.000 0.000 NA   NA
 5936 5937 PAB0899 PAB0900     TRUE 0.965 -24.000 0.667 NA   NA
 5937 402707 PAB0900 PABt33   tRNA-Ala FALSE 0.024 136.000 0.000 NA   NA
 402707 402708 PABt33 PABt34 tRNA-Ala tRNA-Val FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 5938 5939 PAB1478 PAB1477     TRUE 0.947 -19.000 0.308 1.000   NA
 5939 5940 PAB1477 PAB1476     FALSE 0.278 31.000 0.037 1.000   NA
 5940 5941 PAB1476 PAB1475     TRUE 0.997 2.000 0.110 0.004 Y NA
 5941 5942 PAB1475 PAB1474     TRUE 0.988 12.000 0.148 0.004 Y NA
 5942 5943 PAB1474 PAB1473     TRUE 0.985 29.000 0.667 0.004 Y NA
 5943 5944 PAB1473 PAB1472     TRUE 0.998 6.000 0.750 0.004 Y NA
 5944 5945 PAB1472 PAB1471     TRUE 0.999 2.000 0.889 0.004 Y NA
 5945 5946 PAB1471 PAB1470     TRUE 0.990 29.000 1.000 0.004 Y NA
 5947 5948 PAB0906 PAB0907 acaA acaB TRUE 0.991 11.000 0.565 1.000 Y NA
 5948 5949 PAB0907 PAB0908 acaB acaC TRUE 0.987 2.000 0.756 NA   NA
 5949 5950 PAB0908 PAB0909 acaC vhtD FALSE 0.314 23.000 0.035 NA   NA
 5950 1793378 PAB0909 PAB7348 vhtD   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 1793378 5952 PAB7348 PAB0910     TRUE 0.913 2.000 0.078 NA   NA
 5952 5953 PAB0910 PAB0911     TRUE 0.832 1.000 0.000 NA   NA
 5953 5954 PAB0911 PAB0912   racD-1 TRUE 0.910 -3.000 0.047 1.000   NA
 5956 5957 PAB1466 PAB1465   pol30 FALSE 0.509 32.000 0.151 NA   NA
 5957 5958 PAB1465 PAB1464 pol30   FALSE 0.020 151.000 0.000 1.000 N NA
 5959 5960 PAB2425 PAB0916   nfi FALSE 0.556 -19.000 0.030 NA N NA
 5960 5961 PAB0916 PAB0917 nfi   FALSE 0.424 -40.000 0.022 1.000 N NA
 5961 5962 PAB0917 PAB2426   pheS FALSE 0.069 215.000 0.000 0.024 N NA
 5962 5963 PAB2426 PAB2427 pheS pheT TRUE 0.972 16.000 0.046 0.001 Y NA
 5964 5965 PAB2383 PAB2382     FALSE 0.081 60.000 0.000 1.000   NA
 5965 5966 PAB2382 PAB1459     FALSE 0.023 72.000 0.013 1.000 N NA
 5966 5967 PAB1459 PAB1458     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 5967 5968 PAB1458 PAB1457     TRUE 0.983 13.000 0.467 1.000 Y NA
 5968 5969 PAB1457 PAB1456     TRUE 0.991 -3.000 0.875 NA   NA
 5969 5970 PAB1456 PAB1455     TRUE 0.955 5.000 0.286 NA   NA
 5971 5972 PAB0921 PAB0922     TRUE 0.741 -52.000 0.091 NA   NA
 5972 5973 PAB0922 PAB0923     TRUE 0.768 12.000 0.091 NA   NA
 5974 5975 PAB1452 PAB1451     FALSE 0.083 41.000 0.000 NA N NA
 5975 5976 PAB1451 PAB1450     FALSE 0.011 364.000 0.000 NA   NA
 5976 5977 PAB1450 PAB1449     FALSE 0.528 -43.000 0.000 NA   NA
 5978 5979 PAB0926 PAB0927     FALSE 0.044 68.000 0.016 1.000   NA
 5979 5980 PAB0927 PAB0929     TRUE 0.983 6.000 0.937 NA   NA
 5980 5981 PAB0929 PAB0930     FALSE 0.013 291.000 0.000 NA   NA
 5984 5985 PAB1446 PAB1445     TRUE 0.823 -6.000 0.037 1.000 N NA
 5985 5986 PAB1445 PAB1444     FALSE 0.040 53.000 0.017 1.000 N NA
 5986 5987 PAB1444 PAB1443     FALSE 0.026 63.000 0.011 1.000 N NA
 5987 5988 PAB1443 PAB1442     TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 5988 5989 PAB1442 PAB1441     TRUE 0.676 10.000 0.037 NA   NA
 5991 5992 PAB1440 PAB1439     TRUE 0.939 2.000 0.118 NA   NA
 5992 5993 PAB1439 PAB1438     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.004 Y NA
 5994 5995 PAB0938 PAB0939     FALSE 0.150 37.000 0.033 NA   NA
 5995 5996 PAB0939 PAB0940     FALSE 0.078 59.000 0.041 NA   NA
 5996 5997 PAB0940 PAB0941     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 1793381 5999 PAB3357 PAB1436 moaD moeA-1 TRUE 0.974 -13.000 0.031 1.000 Y NA
 6000 6001 PAB1435 PAB1434     TRUE 0.784 2.000 0.017 1.000   NA
 6001 6002 PAB1434 PAB1433     FALSE 0.050 42.000 0.007 NA   NA
 6005 6006 PAB0944 PAB2372     FALSE 0.145 75.000 0.118 NA   NA
 6007 6008 PAB1430 PAB1429 topA   TRUE 0.870 -3.000 0.038 NA   NA
 6008 402719 PAB1429 PABt37   tRNA-Lys FALSE 0.028 116.000 0.000 NA   NA
 6009 6010 PAB0950 PAB0951     TRUE 0.897 7.000 0.131 NA   NA
 6011 6012 PAB1428 PAB1427   rps6E FALSE 0.033 98.000 0.000 NA   NA
 6015 6016 PAB0954 PAB0955 minD-2   TRUE 0.988 3.000 0.286 0.005   NA
 6016 6017 PAB0955 PAB0956     FALSE 0.287 44.000 0.143 NA   NA
 6017 6018 PAB0956 PAB2373   cdc21 TRUE 0.954 -7.000 0.211 NA   NA
 6018 6019 PAB2373 PAB0959 cdc21   FALSE 0.333 44.000 0.211 1.000 N NA
 6019 1793383 PAB0959 PABsnRNA5     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 6020 6021 PAB0960 PAB0961     FALSE 0.255 100.000 0.015 1.000 Y NA
 1793384 6023 PAB1422 PAB1421     FALSE 0.538 -40.000 0.000 NA   NA
 6026 6027 PAB1419 PAB1418     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.022 N NA
 6027 6028 PAB1418 PAB2381     TRUE 0.995 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 6028 6029 PAB2381 PAB2380     TRUE 0.778 6.000 0.000 1.000   NA
 6030 6031 PAB0965 PAB0966     TRUE 0.736 -39.000 0.077 NA   NA
 6031 1793386 PAB0966 PABsnRNA42     TRUE 0.829 -4.000 0.000 NA   NA
 1793386 6032 PABsnRNA42 PAB0967     FALSE 0.357 21.000 0.000 NA   NA
 6032 6033 PAB0967 PAB0968     FALSE 0.117 41.000 0.000 NA   NA
 6034 6035 PAB1413 PAB1412     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6035 402717 PAB1412 PABt39   tRNA-Leu FALSE 0.008 678.000 0.000 NA   NA
 402717 6036 PABt39 PAB1411 tRNA-Leu   FALSE 0.034 93.000 0.000 NA   NA
 6036 6037 PAB1411 PAB1410     TRUE 0.949 -25.000 0.000 NA Y NA
 6037 6038 PAB1410 PAB1409     FALSE 0.027 152.000 0.000 1.000   NA
 6038 1793387 PAB1409 PAB1409.1n     FALSE 0.016 218.000 0.000 NA   NA
 1793387 1793388 PAB1409.1n PAB1409.2n     TRUE 0.935 -70.000 0.667 NA   NA
 1793388 1793389 PAB1409.2n PAB1409.3n     FALSE 0.031 107.000 0.000 NA   NA
 6039 6040 PAB0973 PAB0974     FALSE 0.036 114.000 0.000 1.000   NA
 6040 6041 PAB0974 PAB0975     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 6041 6042 PAB0975 PAB0976     FALSE 0.070 56.000 0.000 NA   NA
 402716 6043 PABt40 PAB1403 tRNA-Gln   FALSE 0.039 85.000 0.000 NA   NA
 6043 6044 PAB1403 PAB1402     TRUE 0.979 6.000 0.667 1.000   NA
 6044 6045 PAB1402 PAB1401     TRUE 0.989 11.000 0.400 1.000 Y NA
 6045 6046 PAB1401 PAB1400     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 6046 6047 PAB1400 PAB1399     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 6047 6048 PAB1399 PAB1398     FALSE 0.140 248.000 0.000 NA Y NA
 6048 6049 PAB1398 PAB1396     FALSE 0.008 533.000 0.000 1.000 N NA
 6049 6050 PAB1396 PAB1395     TRUE 0.998 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 6050 6051 PAB1395 PAB1394     TRUE 0.998 1.000 0.750 1.000 Y NA
 6051 6052 PAB1394 PAB1393     TRUE 0.998 4.000 1.000 1.000 Y NA
 6052 6053 PAB1393 PAB1392     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6053 6054 PAB1392 PAB1391     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.004 Y NA
 6054 6055 PAB1391 PAB1390     TRUE 0.987 13.000 0.667 1.000 Y NA
 6055 6056 PAB1390 PAB1389     TRUE 0.982 13.000 0.750 0.002   NA
 6057 6058 PAB0980 PAB0981     FALSE 0.208 182.000 0.545 NA   NA
 6058 6059 PAB0981 PAB0982     TRUE 0.940 15.000 0.889 NA   NA
 6059 6060 PAB0982 PAB0983     TRUE 0.713 40.000 0.750 NA   NA
 6060 6061 PAB0983 PAB0984     TRUE 0.985 -9.000 0.750 NA   NA
 6061 6062 PAB0984 PAB0985     TRUE 0.987 -7.000 0.800 NA   NA
 6063 6064 PAB1388 PAB1387     TRUE 0.941 4.000 0.184 NA   NA
 6064 6065 PAB1387 PAB1386     TRUE 0.996 4.000 0.578 1.000 Y NA
 6065 6066 PAB1386 PAB1385     TRUE 0.997 2.000 0.547 1.000 Y NA
 6066 6067 PAB1385 PAB1384     TRUE 0.984 14.000 0.622 1.000 Y NA
 6067 6068 PAB1384 PAB1383     TRUE 0.997 -21.000 0.355 0.003 Y NA
 6068 6069 PAB1383 PAB1382     TRUE 0.960 19.000 0.273 1.000 Y NA
 6069 6070 PAB1382 PAB1381     TRUE 0.996 4.000 0.500 1.000 Y NA
 6070 6071 PAB1381 PAB1380     TRUE 0.980 12.000 0.300 1.000 Y NA
 6071 6072 PAB1380 PAB1379     TRUE 0.998 11.000 0.857 0.003 Y NA
 6072 6073 PAB1379 PAB1378     TRUE 0.686 68.000 0.000 0.003 Y NA
 6073 6074 PAB1378 PAB1377     FALSE 0.026 116.000 0.000 1.000 N NA
 6074 6075 PAB1377 PAB1376     FALSE 0.471 11.000 0.017 NA   NA
 6077 6078 PAB1374 PAB7382     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 6078 6079 PAB7382 PAB1373     FALSE 0.271 26.000 0.000 NA   NA
 6079 6080 PAB1373 PAB1372   ahcY FALSE 0.009 527.000 0.000 NA   NA
 6080 6081 PAB1372 PAB1371 ahcY   TRUE 0.600 12.000 0.000 1.000   NA
 6083 1793395 PAB0998 PABsnRNA41     FALSE 0.007 1151.000 0.000 NA   NA
 402714 6084 PABt42 PAB1370 tRNA-Gly   FALSE 0.048 75.000 0.000 NA   NA
 6086 6087 PAB1369 PAB1368     TRUE 0.876 9.000 0.091 1.000   NA
 6087 1793396 PAB1368 PAB1367     TRUE 0.892 -16.000 0.091 1.000   NA
 1793396 6089 PAB1367 PAB1366     TRUE 0.922 -16.000 0.159 1.000   NA
 6089 1793397 PAB1366 PAB1365     TRUE 0.791 -52.000 0.136 NA   NA
 1793397 6091 PAB1365 PAB1364     TRUE 0.699 12.000 0.065 NA   NA
 6091 1793398 PAB1364 PAB1363     FALSE 0.065 50.000 0.026 NA   NA
 1793398 6093 PAB1363 PAB1362     FALSE 0.234 45.000 0.100 NA   NA
 6093 6094 PAB1362 PAB1361     FALSE 0.098 52.000 0.000 1.000   NA
 6094 6095 PAB1361 PAB1360     TRUE 0.563 -34.000 0.000 NA   NA
 6095 6096 PAB1360 PAB1359     FALSE 0.043 80.000 0.000 NA   NA
 6097 6098 PAB3384 PAB7387 rpl39E rpl31E TRUE 0.995 11.000 0.434 0.026 Y NA
 6098 6099 PAB7387 PAB1005 rpl31E eif-6 TRUE 0.813 60.000 0.474 1.000 Y NA
 6099 6100 PAB1005 PAB7388 eif-6 rplXA TRUE 0.973 14.000 0.324 1.000 Y NA
 6100 6101 PAB7388 PAB1006 rplXA   TRUE 0.808 22.000 0.348 1.000 N NA
 6102 6103 PAB1357 PAB1356     FALSE 0.107 44.000 0.041 1.000 N NA
 6103 6104 PAB1356 PAB1355     FALSE 0.098 52.000 0.000 1.000   NA
 6104 6105 PAB1355 PAB1354   moaB FALSE 0.056 79.000 0.000 1.000   NA
 6106 6107 PAB1008 PAB2375     TRUE 0.860 10.000 0.111 1.000 N NA
 6107 6108 PAB2375 PAB1010     TRUE 0.856 14.000 0.278 1.000   NA
 6108 6109 PAB1010 PAB1011     TRUE 0.872 10.000 0.125 NA   NA
 6109 6110 PAB1011 PAB1012     FALSE 0.498 -18.000 0.005 NA   NA
 6113 6114 PAB1349 PAB1348     TRUE 0.963 -6.000 0.044 0.010 N NA
 6114 6115 PAB1348 PAB1347   dppF TRUE 0.565 -52.000 0.044 1.000 N NA
 6115 6116 PAB1347 PAB1346 dppF dppD TRUE 0.999 0.000 0.900 0.005 Y NA
 6116 6117 PAB1346 PAB1345 dppD   TRUE 0.993 2.000 0.200 1.000 Y NA
 6117 6118 PAB1345 PAB1344   dppB TRUE 0.999 3.000 1.000 0.026 Y NA
 6118 6119 PAB1344 PAB1343 dppB   TRUE 0.839 41.000 0.067 0.026 Y NA
 6120 6121 PAB2376 PAB1019 bgal   FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 6123 6124 PAB1020 PAB1021     FALSE 0.527 11.000 0.027 1.000 N NA
 6125 6126 PAB1338 PAB1337     TRUE 0.936 15.000 0.833 NA   NA
 6126 6127 PAB1337 PAB1336   tlpC TRUE 0.609 43.000 0.600 NA   NA
 6127 6128 PAB1336 PAB1335 tlpC   TRUE 0.884 17.000 0.021 1.000 Y NA
 6128 6129 PAB1335 PAB1334     TRUE 0.961 -16.000 0.021 NA Y NA
 6129 1793400 PAB1334 PAB1333     TRUE 0.998 -3.000 0.625 NA Y NA
 1793400 6131 PAB1333 PAB1332   cheA TRUE 0.966 -22.000 0.059 NA Y NA
 6131 6132 PAB1332 PAB1331 cheA cheB TRUE 0.995 -37.000 0.390 0.002 Y NA
 6132 6133 PAB1331 PAB1330 cheB cheY TRUE 0.986 11.000 0.047 0.001 Y NA
 6133 6134 PAB1330 PAB1329 cheY cheR TRUE 0.996 -15.000 0.833 1.000 Y NA
 6135 6136 PAB1026 PAB1027   cheW TRUE 0.991 13.000 0.308 0.004 Y NA
 6136 6137 PAB1027 PAB1028 cheW   FALSE 0.058 64.000 0.000 NA   NA
 6137 6138 PAB1028 PAB1029     FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 6138 6139 PAB1029 PAB1030     TRUE 0.744 13.000 0.103 NA   NA
 6140 6141 PAB1325 PAB1324     TRUE 0.985 -3.000 0.036 NA Y NA
 402710 6142 PABt43 PAB1031 tRNA-Gln   FALSE 0.007 827.000 0.000 NA   NA
 6142 6143 PAB1031 PAB1032     FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 6143 6144 PAB1032 PAB1033     FALSE 0.480 49.000 0.400 NA   NA
 6144 6145 PAB1033 PAB1035     FALSE 0.007 776.000 0.000 NA   NA
 6145 6146 PAB1035 PAB1036     FALSE 0.060 62.000 0.000 NA   NA
 6146 6147 PAB1036 PAB1037     FALSE 0.424 11.000 0.011 NA   NA
 6148 6149 PAB1320 PAB1319     FALSE 0.148 80.000 0.004 0.021   NA
 6149 6150 PAB1319 PAB3393     TRUE 0.718 3.000 0.005 1.000   NA
 6150 6151 PAB3393 PAB1318     FALSE 0.548 10.000 0.002 1.000   NA
 6151 6152 PAB1318 PAB1317     TRUE 0.941 -3.000 0.088 NA   NA
 6153 6154 PAB1039 PAB1040     TRUE 0.882 5.000 0.080 NA   NA
 6154 6155 PAB1040 PAB1041   pgsA-like TRUE 0.665 -64.000 0.068 NA   NA
 6155 1793404 PAB1041 PABsnRNA6 pgsA-like   TRUE 0.800 3.000 0.000 NA   NA
 6156 6157 PAB1316 PAB1315     FALSE 0.138 39.000 0.025 1.000   NA
 6157 6158 PAB1315 PAB1314     FALSE 0.030 88.000 0.038 NA N NA
 6158 6159 PAB1314 PAB1313   lon FALSE 0.012 201.000 0.000 NA N NA
 6163 6164 PAB1311 PAB1310     TRUE 0.991 -3.000 0.800 NA   NA
 6164 6165 PAB1310 PAB1309     TRUE 0.678 32.000 0.333 NA   NA
 6167 6168 PAB1308 PAB1307     FALSE 0.185 46.000 0.081 1.000 N NA
 6168 6169 PAB1307 PAB1306     TRUE 0.901 -3.000 0.054 1.000 N NA
 6169 6170 PAB1306 PAB1305     TRUE 0.851 2.000 0.000 1.000   NA
 6172 6173 PAB1303 PAB1302     FALSE 0.041 63.000 0.000 NA N NA
 6173 6174 PAB1302 PAB1301     TRUE 0.587 6.000 0.028 NA N NA
 6174 6175 PAB1301 PAB1300     TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6175 6176 PAB1300 PAB1299     TRUE 0.844 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6178 6179 PAB1297 PAB1296     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6179 6180 PAB1296 PAB1295     TRUE 0.986 -13.000 1.000 NA   NA
 6180 6181 PAB1295 PAB1294     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6182 6183 PAB1054 PAB1055     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 6183 6184 PAB1055 PAB1056     TRUE 0.606 11.000 0.000 NA   NA
 6184 6185 PAB1056 PAB1057   nrd FALSE 0.019 169.000 0.000 1.000 N NA
 6186 6187 PAB1292 PAB1291 glnA   FALSE 0.010 434.000 0.000 NA   NA
 6187 6188 PAB1291 PAB1290     TRUE 0.896 0.000 0.054 NA   NA
 6189 6190 PAB1059 PAB1060 bchP-like   TRUE 0.751 12.000 0.083 NA   NA
 6190 6191 PAB1060 PAB1061     TRUE 0.838 -3.000 0.030 NA   NA
 6191 6192 PAB1061 PAB1062     TRUE 0.943 0.000 0.106 NA   NA
 6192 6193 PAB1062 PAB1063     TRUE 0.923 -7.000 0.081 1.000   NA
 6193 6194 PAB1063 PAB1064     FALSE 0.037 69.000 0.035 NA N NA
 6195 6196 PAB1288 PAB1287     TRUE 0.693 -10.000 0.003 1.000   NA
 6196 6197 PAB1287 PAB1286     TRUE 0.910 -3.000 0.057 NA   NA
 6199 6200 PAB1285 PAB1284     FALSE 0.405 -7.000 0.004 NA N NA
 6200 6201 PAB1284 PAB1283     TRUE 0.984 6.000 0.103 1.000 Y NA
 6201 6202 PAB1283 PAB1282     TRUE 0.825 22.000 0.375 NA   NA
 6202 6203 PAB1282 PAB1281     FALSE 0.056 117.000 0.071 NA   NA
 6203 6204 PAB1281 PAB1280     TRUE 0.989 -6.000 0.818 NA   NA
 6206 1793409 PAB1279 PAB1278     FALSE 0.043 44.000 0.005 NA   NA
 1793409 6208 PAB1278 PAB1277     TRUE 0.796 -63.000 0.154 NA   NA
 6208 6209 PAB1277 PAB1276   moxR-1 TRUE 0.982 3.000 0.611 NA   NA
 6209 6210 PAB1276 PAB1275 moxR-1   TRUE 0.984 -7.000 0.556 1.000   NA
 6210 6211 PAB1275 PAB1274     TRUE 0.780 -22.000 0.060 NA   NA
 6211 6212 PAB1274 PAB1273     TRUE 0.836 -3.000 0.030 NA   NA
 6212 6213 PAB1273 PAB1272     FALSE 0.215 42.000 0.062 1.000   NA
 6213 6214 PAB1272 PAB1271   purD TRUE 0.679 14.000 0.007 0.084   NA
 6215 6216 PAB1075 PAB1076     TRUE 0.978 4.000 0.500 NA   NA
 6216 6217 PAB1076 PAB1077   purE FALSE 0.038 62.000 0.002 1.000   NA
 6219 6220 PAB1079 PAB1080     FALSE 0.145 38.000 0.000 NA   NA
 6221 6222 PAB1265 PAB1264     FALSE 0.087 47.000 0.000 NA   NA
 6222 6223 PAB1264 PAB1263     FALSE 0.008 547.000 0.000 NA   NA
 6223 6224 PAB1263 PAB1262     TRUE 0.688 -19.000 0.000 NA   NA
 6224 6225 PAB1262 PAB1260     FALSE 0.008 712.000 0.000 NA   NA
 6225 6226 PAB1260 PAB1258     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6226 6227 PAB1258 PAB1257     TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6227 6228 PAB1257 PAB1256     TRUE 0.661 10.000 0.000 NA   NA
 6235 6236 PAB1251 PAB1250     FALSE 0.020 68.000 0.003 1.000 N NA
 6238 6239 PAB7421 PAB1249     FALSE 0.154 32.000 0.011 1.000   NA
 6240 6241 PAB1090 PAB1091     FALSE 0.042 81.000 0.000 NA   NA
 6243 6244 PAB1092 PAB1093     TRUE 0.777 0.000 0.020 NA   NA
 6246 6247 PAB1094 PAB1095     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 6247 1793417 PAB1095 PABsnRNA7     FALSE 0.079 52.000 0.000 NA   NA
 1793417 6248 PABsnRNA7 PAB1096     FALSE 0.076 53.000 0.000 NA   NA
 6249 6250 PAB1245 PAB7424 alaS   FALSE 0.210 35.000 0.000 1.000   NA
 1793418 6251 PABsnRNA16 PAB1098     FALSE 0.072 55.000 0.000 NA   NA
 6251 6252 PAB1098 PAB1099   endA TRUE 0.966 -3.000 0.167 1.000   NA
 6254 1793419 PAB1100 PABsnRNA8 hisS   FALSE 0.181 34.000 0.000 NA   NA
 6256 6257 PAB1101 PAB1102     TRUE 0.978 -3.000 0.286 1.000   NA
 1793421 6259 PAB1241 PAB1240     FALSE 0.551 -25.000 0.024 NA   NA
 6260 6261 PAB1103 PAB1104   ppa FALSE 0.035 65.000 0.021 1.000 N NA
 6261 6262 PAB1104 PAB1105 ppa rpoE1 FALSE 0.292 37.000 0.080 1.000 N NA
 6262 1793422 PAB1105 PAB7428 rpoE1 rpoE2 TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.006 Y NA
 1793422 6264 PAB7428 PAB1106 rpoE2   TRUE 0.988 0.000 0.695 NA   NA
 6264 6265 PAB1106 PAB3419   rps24E TRUE 0.970 -10.000 0.362 NA   NA
 6265 6267 PAB3419 PAB1107 rps24E   FALSE 0.007 728.000 0.000 1.000 N NA
 6267 6268 PAB1107 PAB1108     TRUE 0.973 -3.000 0.273 1.000 N NA
 6269 6270 PAB1237 PAB1236     FALSE 0.120 74.000 0.077 1.000   NA
 6270 6271 PAB1236 PAB1235     FALSE 0.058 39.000 0.007 1.000 N NA
 6271 6272 PAB1235 PAB1234     FALSE 0.407 11.000 0.007 NA   NA
 6275 6276 PAB1111 PAB1112 trpS   FALSE 0.334 22.000 0.000 NA   NA
 6276 6277 PAB1112 PAB1113     FALSE 0.088 51.000 0.037 NA   NA
 6277 6278 PAB1113 PAB1114   prsA TRUE 0.885 6.000 0.091 NA   NA
 6278 6279 PAB1114 PAB1115 prsA graD-2 TRUE 0.953 -3.000 0.133 1.000 N NA
 6279 6280 PAB1115 PAB1116 graD-2   TRUE 0.854 -3.000 0.000 NA   NA
 6281 6283 PAB1230 PAB1229     FALSE 0.476 51.000 0.375 1.000   NA
 6283 1793424 PAB1229 PAB1228     TRUE 0.834 5.000 0.052 NA   NA
 1793424 6285 PAB1228 PAB1227     TRUE 0.839 2.000 0.039 NA   NA
 6285 402713 PAB1227 PABt45   tRNA-Arg FALSE 0.038 86.000 0.000 NA   NA
 402713 6286 PABt45 PAB1226 tRNA-Arg   FALSE 0.260 27.000 0.000 NA   NA
 6288 6289 PAB1225 PAB1224     FALSE 0.023 141.000 0.000 NA   NA
 6289 6290 PAB1224 PAB1223     TRUE 0.990 -6.000 0.800 1.000   NA
 6290 6291 PAB1223 PAB1222   hps FALSE 0.399 40.000 0.200 1.000 N NA
 1793426 6294 PAB7435 PAB1221 rps27E rpl44E TRUE 0.998 -13.000 0.436 0.025 Y NA
 6295 6296 PAB1125 PAB1126   eno FALSE 0.038 36.000 0.009 NA N NA
 6296 6297 PAB1126 PAB1127 eno   FALSE 0.266 36.000 0.060 NA   NA
 6300 6301 PAB1217 PAB1216     FALSE 0.025 128.000 0.000 NA   NA
 6301 1793427 PAB1216 PAB1216.1n     TRUE 0.975 -3.000 0.286 NA   NA
 1793427 6302 PAB1216.1n PAB1215     FALSE 0.068 57.000 0.000 NA   NA
 6303 6304 PAB1130 PAB1131   nadC-like FALSE 0.108 42.000 0.000 NA   NA
 6305 6306 PAB7439 PAB1214 fdxA   FALSE 0.418 106.000 0.375 0.024 N NA
 6306 6307 PAB1214 PAB1213     TRUE 0.988 1.000 0.333 0.044 N NA
 6308 6309 PAB1134 PAB1135     FALSE 0.226 98.000 0.003 NA Y NA
 6309 6310 PAB1135 PAB1136     TRUE 0.983 -21.000 0.190 NA Y NA
 6310 6311 PAB1136 PAB1137     FALSE 0.350 37.000 0.083 1.000   NA
 6313 6314 PAB1138 PAB1139     TRUE 0.995 2.000 0.714 0.019   NA
 6315 6316 PAB1208 PAB1207     FALSE 0.394 37.000 0.036 0.043 N NA
 6316 6317 PAB1207 PAB1206   pcm TRUE 0.624 -12.000 0.016 1.000 N NA
 6317 6318 PAB1206 PAB1205 pcm   TRUE 0.641 -22.000 0.000 1.000 N NA
 6319 6320 PAB1143 PAB1144     FALSE 0.079 21.000 0.003 NA N NA
 6321 6322 PAB1201 PAB1200 purL purQ TRUE 0.592 444.000 0.346 0.001 Y NA
 6322 1793429 PAB1200 PAB3433 purQ   TRUE 0.999 2.000 0.656 0.001 Y NA
 1793429 1793430 PAB3433 PAB1199     FALSE 0.029 54.000 0.006 1.000 N NA
 1793430 6325 PAB1199 PAB1198     TRUE 0.666 -46.000 0.060 NA   NA
 6325 6326 PAB1198 PAB1197     TRUE 0.817 13.000 0.200 NA   NA
 6326 6327 PAB1197 PAB1196     TRUE 0.998 10.000 0.737 0.005 Y NA
 6327 6328 PAB1196 PAB1195   appC TRUE 0.990 10.000 0.370 1.000 Y NA
 6328 6329 PAB1195 PAB1194 appC   TRUE 0.990 23.000 0.814 0.025 Y NA
 6329 6330 PAB1194 PAB1193     FALSE 0.088 187.000 0.034 0.025   NA
 6331 6332 PAB1149 PAB1150 pyrC pyrD-like TRUE 0.599 -22.000 0.029 1.000 N NA
 6332 6333 PAB1150 PAB1151 pyrD-like act-1 TRUE 0.921 5.000 0.109 1.000   NA
 6333 6334 PAB1151 PAB1152 act-1   FALSE 0.329 15.000 0.005 1.000   NA
 6335 6336 PAB1190 PAB1189     TRUE 0.647 -25.000 0.029 1.000   NA
 6336 6337 PAB1189 PAB1188     TRUE 0.967 7.000 0.455 1.000   NA
 6337 6338 PAB1188 PAB2379   atpD FALSE 0.494 49.000 0.019 1.000 Y NA
 6338 6339 PAB2379 PAB1186 atpD atpB TRUE 0.966 24.000 0.119 0.004 Y NA
 6339 6340 PAB1186 PAB2378 atpB atpA TRUE 0.978 -3.000 0.060 0.004 N NA
 6340 6341 PAB2378 PAB1184 atpA atpF TRUE 0.987 7.000 0.462 0.004 N NA
 6341 6342 PAB1184 PAB1183 atpF atpC TRUE 0.999 -3.000 0.462 0.004 Y NA
 6342 6343 PAB1183 PAB1182 atpC atpE TRUE 0.997 3.000 0.236 0.004 Y NA
 6343 6344 PAB1182 PAB1181 atpE   TRUE 0.906 32.000 0.489 0.004   NA
 6344 6345 PAB1181 PAB1180   atpI TRUE 0.995 5.000 0.848 0.004   NA
 6345 6346 PAB1180 PAB1179 atpI   TRUE 0.984 2.000 0.132 0.004   NA
 6346 6347 PAB1179 PAB1178   trkA FALSE 0.028 88.000 0.013 1.000   NA
 6347 6348 PAB1178 PAB1177 trkA   TRUE 0.864 5.000 0.071 1.000 N NA
 6348 6349 PAB1177 PAB1176     TRUE 0.999 -3.000 0.860 0.001 Y NA
 6350 6351 PAB1159 PAB1160 gcp   TRUE 0.775 -6.000 0.024 NA   NA
 6352 6353 PAB1174 PAB1173     TRUE 0.960 3.000 0.257 NA   NA
 6354 6355 PAB1162 PAB1163     TRUE 0.599 -25.000 0.020 1.000   NA
 6355 1793431 PAB1163 PABsnRNA45     TRUE 0.782 4.000 0.000 NA   NA
 1793431 1793432 PABsnRNA45 PABsnRNA9     TRUE 0.708 7.000 0.000 NA   NA
 6356 6357 PAB1172 PAB1171     TRUE 0.999 1.000 0.316 0.001 Y NA
 6357 6358 PAB1171 PAB1170     FALSE 0.041 61.000 0.005 1.000   NA
 6358 402712 PAB1170 PABt46   tRNA-Arg FALSE 0.007 2359.000 0.000 NA   NA
 11541536 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11683899 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11826291 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1954.000 0.000 NA   NA
 11541537 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11683900 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11826292 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1921.000 0.000 NA   NA
 11541538 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1887.000 0.000 NA   NA
 11683901 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1887.000 0.000 NA   NA
 11826293 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1887.000 0.000 NA   NA
 11541539 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11683902 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11826294 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1854.000 0.000 NA   NA
 11541540 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1820.000 0.000 NA   NA
 11683903 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1820.000 0.000 NA   NA
 11826295 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1820.000 0.000 NA   NA
 11541541 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1783.000 0.000 NA   NA
 11683904 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1783.000 0.000 NA   NA
 11826296 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1783.000 0.000 NA   NA
 11541542 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1753.000 0.000 NA   NA
 11683905 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1753.000 0.000 NA   NA
 11826297 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1753.000 0.000 NA   NA
 11541543 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1707.000 0.000 NA   NA
 11683906 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1707.000 0.000 NA   NA
 11826298 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1707.000 0.000 NA   NA
 11541544 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11683907 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11826299 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1677.000 0.000 NA   NA
 11541545 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1640.000 0.000 NA   NA
 11683908 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1640.000 0.000 NA   NA
 11826300 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1640.000 0.000 NA   NA
 11541546 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1610.000 0.000 NA   NA
 11683909 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1610.000 0.000 NA   NA
 11826301 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1610.000 0.000 NA   NA
 11541547 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11683910 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11826302 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11541548 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11683911 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11826303 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1542.000 0.000 NA   NA
 11541549 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1504.000 0.000 NA   NA
 11683912 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1504.000 0.000 NA   NA
 11826304 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1504.000 0.000 NA   NA
 11541550 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11683913 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11826305 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1474.000 0.000 NA   NA
 11541551 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1436.000 0.000 NA   NA
 11683914 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1436.000 0.000 NA   NA
 11826306 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1436.000 0.000 NA   NA
 11541552 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11683915 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11826307 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11541553 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1369.000 0.000 NA   NA
 11683916 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1369.000 0.000 NA   NA
 11826308 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1369.000 0.000 NA   NA
 11541554 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11683917 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11826309 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1339.000 0.000 NA   NA
 11541555 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11683918 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11826310 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11541556 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1272.000 0.000 NA   NA
 11683919 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1272.000 0.000 NA   NA
 11826311 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1272.000 0.000 NA   NA
 11541557 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1236.000 0.000 NA   NA
 11683920 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1236.000 0.000 NA   NA
 11826312 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1236.000 0.000 NA   NA
 11541558 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11683921 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11826313 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1206.000 0.000 NA   NA
 11541559 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11683922 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11826314 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11541560 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1139.000 0.000 NA   NA
 11683923 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1139.000 0.000 NA   NA
 11826315 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1139.000 0.000 NA   NA
 11541561 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1102.000 0.000 NA   NA
 11683924 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1102.000 0.000 NA   NA
 11826316 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1102.000 0.000 NA   NA
 11541562 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1072.000 0.000 NA   NA
 11683925 6359   PAB1164   dcd FALSE NA 1072.000 0.000 NA   NA
&n