MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma pulmonis UAB CTIP

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 114737 114738 MYPU_0010 MYPU_0020     TRUE 0.443 134.000 0.004 1.000 Y NA
 114738 114739 MYPU_0020 MYPU_0030     TRUE 0.992 2.000 0.005 1.000   NA
 114739 114740 MYPU_0030 MYPU_0040     TRUE 0.942 3.000 0.000 1.000   NA
 114742 114743 MYPU_0060 MYPU_0070     TRUE 0.999 0.000 0.778 NA   NA
 114743 114744 MYPU_0070 MYPU_0080     TRUE 0.997 1.000 0.111 NA   NA
 114744 114745 MYPU_0080 MYPU_0090   rplK FALSE 0.116 163.000 0.000 1.000 N NA
 114745 114746 MYPU_0090 MYPU_0100 rplK   TRUE 0.999 0.000 0.838 1.000 Y NA
 114747 114748 MYPU_0110 MYPU_0120     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 114749 114750 MYPU_0130 MYPU_0140     FALSE 0.203 46.000 0.000 NA   NA
 114750 114751 MYPU_0140 MYPU_0150     TRUE 0.919 1.000 0.000 NA N NA
 114751 114752 MYPU_0150 MYPU_0160     TRUE 0.805 4.000 0.000 NA   NA
 114752 114753 MYPU_0160 MYPU_0170     TRUE 0.723 164.000 0.273 NA   NA
 114753 114754 MYPU_0170 MYPU_0180     FALSE 0.084 314.000 0.000 1.000 N NA
 114754 114755 MYPU_0180 MYPU_0190     FALSE 0.040 501.000 0.000 NA   NA
 114755 114756 MYPU_0190 MYPU_0200     FALSE 0.041 1182.000 0.000 NA   NA
 114756 114757 MYPU_0200 MYPU_0210     FALSE 0.054 177.000 0.000 NA   NA
 114757 114758 MYPU_0210 MYPU_0220     TRUE 0.526 21.000 0.000 1.000   NA
 114758 114759 MYPU_0220 MYPU_0230     FALSE 0.095 253.000 0.000 1.000   NA
 114759 114760 MYPU_0230 MYPU_0240     FALSE 0.060 157.000 0.000 NA   NA
 114760 114761 MYPU_0240 MYPU_0250     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 114761 114762 MYPU_0250 MYPU_0260     TRUE 0.897 4.000 0.000 1.000 N NA
 114762 114763 MYPU_0260 MYPU_0270     TRUE 0.948 -60.000 0.000 0.058 Y NA
 114763 114764 MYPU_0270 MYPU_0280     TRUE 0.998 -40.000 0.204 0.058 Y NA
 114764 114765 MYPU_0280 MYPU_0290     TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 114765 114766 MYPU_0290 MYPU_0300     FALSE 0.206 44.000 0.000 NA   NA
 114766 114767 MYPU_0300 MYPU_0310     FALSE 0.042 305.000 0.000 NA   NA
 114767 114768 MYPU_0310 MYPU_0320     TRUE 0.996 -34.000 0.333 NA   NA
 114768 114769 MYPU_0320 MYPU_0330     TRUE 0.994 -82.000 0.400 NA   NA
 114769 114770 MYPU_0330 MYPU_0340     TRUE 0.283 26.000 0.000 NA   NA
 114770 114771 MYPU_0340 MYPU_0350     TRUE 0.972 0.000 0.000 1.000   NA
 114771 114772 MYPU_0350 MYPU_0360     TRUE 0.973 4.000 0.000 0.006   NA
 114772 114773 MYPU_0360 MYPU_0370     TRUE 0.971 4.000 0.000 0.008   NA
 114773 114774 MYPU_0370 MYPU_0380     TRUE 0.774 24.000 0.000 0.008   NA
 114774 114775 MYPU_0380 MYPU_0390     FALSE 0.094 256.000 0.000 1.000   NA
 114775 114776 MYPU_0390 MYPU_0400     TRUE 0.983 -25.000 0.000 0.012   NA
 114776 114777 MYPU_0400 MYPU_0410     TRUE 0.325 57.000 0.000 1.000   NA
 114778 114779 MYPU_0420 MYPU_0430     TRUE 0.905 -18.000 0.000 NA   NA
 114779 114780 MYPU_0430 MYPU_0440     TRUE 0.969 -52.000 0.000 0.008   NA
 114781 114782 MYPU_0450 MYPU_0460     TRUE 0.425 29.000 0.000 1.000 N NA
 114784 114785 MYPU_0480 MYPU_0490     TRUE 0.656 91.000 0.015 NA   NA
 114785 114786 MYPU_0490 MYPU_0500     TRUE 0.997 -7.000 0.100 NA   NA
 114786 114787 MYPU_0500 MYPU_0510     TRUE 0.978 13.000 0.604 NA   NA
 114787 114788 MYPU_0510 MYPU_0520     TRUE 0.995 -16.000 0.015 1.000 N NA
 114788 114789 MYPU_0520 MYPU_0530     TRUE 0.975 17.000 0.254 1.000   NA
 114789 114790 MYPU_0530 MYPU_0540     TRUE 0.997 -7.000 0.016 1.000   NA
 114790 400985 MYPU_0540 MYPU_TRNA_HIS   tRNA-His FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 114791 114792 MYPU_0550 MYPU_0560     TRUE 0.729 6.000 0.000 NA   NA
 114793 114794 MYPU_0570 MYPU_0580     FALSE 0.040 776.000 0.000 NA   NA
 114794 114795 MYPU_0580 MYPU_0590     FALSE 0.044 258.000 0.000 NA   NA
 114795 114796 MYPU_0590 MYPU_0600     TRUE 0.914 -15.000 0.000 NA   NA
 114796 114797 MYPU_0600 MYPU_0610     FALSE 0.040 672.000 0.000 NA   NA
 114797 114798 MYPU_0610 MYPU_0620     TRUE 0.331 21.000 0.000 NA   NA
 114798 114799 MYPU_0620 MYPU_0630     FALSE 0.047 237.000 0.000 NA   NA
 114799 114800 MYPU_0630 MYPU_0640     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 114800 114801 MYPU_0640 MYPU_0650     TRUE 0.367 16.000 0.000 NA N NA
 114801 114802 MYPU_0650 MYPU_0660     TRUE 0.380 15.000 0.000 NA N NA
 114802 114803 MYPU_0660 MYPU_0670     FALSE 0.087 362.000 0.000 1.000   NA
 114807 114808 MYPU_0710 MYPU_0720     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 114809 114810 MYPU_0730 MYPU_0740     FALSE 0.041 354.000 0.000 NA   NA
 114811 114812 MYPU_0750 MYPU_0760     FALSE 0.040 849.000 0.000 NA   NA
 114812 114813 MYPU_0760 MYPU_0770     TRUE 0.757 -88.000 0.000 NA   NA
 114813 114814 MYPU_0770 MYPU_0780     TRUE 0.618 55.000 0.000 0.017   NA
 114816 114817 MYPU_0800 MYPU_0810     FALSE 0.267 28.000 0.000 NA   NA
 114817 114818 MYPU_0810 MYPU_0820     TRUE 0.292 194.000 0.000 0.015   NA
 114818 114819 MYPU_0820 MYPU_0830     TRUE 0.372 37.000 0.000 1.000 Y NA
 114820 114821 MYPU_0840 MYPU_0850     FALSE 0.039 295.000 0.000 NA N NA
 114823 114824 MYPU_0870 MYPU_0880     TRUE 0.843 -36.000 0.000 NA   NA
 114824 114825 MYPU_0880 MYPU_0890     TRUE 0.997 -22.000 0.060 1.000   NA
 114825 114826 MYPU_0890 MYPU_0900     TRUE 0.704 7.000 0.000 NA   NA
 114826 114827 MYPU_0900 MYPU_0910     FALSE 0.149 75.000 0.000 NA   NA
 114830 114831 MYPU_0940 MYPU_0950     FALSE 0.259 27.000 0.000 NA N NA
 114834 114835 MYPU_0980 MYPU_0990     TRUE 0.894 -19.000 0.000 NA N NA
 114835 114836 MYPU_0990 MYPU_1000     TRUE 0.985 1.000 0.000 0.054 N NA
 114836 114837 MYPU_1000 MYPU_1010     TRUE 1.000 0.000 0.400 0.054 Y NA
 114841 114842 MYPU_1050 MYPU_1060     TRUE 0.999 0.000 0.081 0.078 Y NA
 114842 114843 MYPU_1060 MYPU_1070     FALSE 0.253 79.000 0.000 1.000 N NA
 114843 114844 MYPU_1070 MYPU_1080     TRUE 0.860 3.000 0.000 NA Y NA
 114844 114845 MYPU_1080 MYPU_1090     FALSE 0.227 37.000 0.000 NA   NA
 114847 114848 MYPU_1110 MYPU_1120     FALSE 0.238 36.000 0.000 NA   NA
 114848 114849 MYPU_1120 MYPU_1130     FALSE 0.175 58.000 0.000 NA   NA
 114849 114850 MYPU_1130 MYPU_1140     TRUE 0.996 -15.000 0.020 1.000 Y NA
 114850 114851 MYPU_1140 MYPU_1150     TRUE 0.996 0.000 0.019 NA   NA
 114851 114852 MYPU_1150 MYPU_1160     TRUE 0.996 -43.000 0.570 NA   NA
 114852 114853 MYPU_1160 MYPU_1170     TRUE 0.993 1.000 0.011 NA N NA
 114854 114855 MYPU_1180 MYPU_1190     TRUE 0.999 -6.000 0.012 0.004 Y NA
 114855 114856 MYPU_1190 MYPU_1200     TRUE 0.971 -6.000 0.000 1.000   NA
 114860 114861 MYPU_1240 MYPU_1250     TRUE 0.585 10.000 0.000 NA   NA
 114862 114863 MYPU_1260 MYPU_1270     TRUE 0.763 94.000 0.080 NA   NA
 114863 114864 MYPU_1270 MYPU_1280     TRUE 0.967 9.000 0.009 1.000 N NA
 114864 114865 MYPU_1280 MYPU_1290     FALSE 0.133 139.000 0.000 1.000 N NA
 114865 114866 MYPU_1290 MYPU_1300     FALSE 0.099 237.000 0.000 1.000   NA
 114866 114867 MYPU_1300 MYPU_1310     TRUE 0.993 -12.000 0.005 1.000   NA
 114868 114869 MYPU_1320 MYPU_1330     FALSE 0.158 72.000 0.000 NA   NA
 114870 114871 MYPU_1340 MYPU_1350     FALSE 0.041 1052.000 0.000 NA   NA
 114871 114872 MYPU_1350 MYPU_1360     TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 114874 400987 MYPU_1380 MYPU_TRNA_CYS   tRNA-Cys FALSE 0.098 107.000 0.000 NA   NA
 400987 400988 MYPU_TRNA_CYS MYPU_TRNA_ARG_1 tRNA-Cys tRNA-Arg TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 400988 400989 MYPU_TRNA_ARG_1 MYPU_TRNA_ARG_2 tRNA-Arg tRNA-Arg TRUE 0.317 22.000 0.000 NA   NA
 400989 114875 MYPU_TRNA_ARG_2 MYPU_1390 tRNA-Arg   FALSE 0.111 98.000 0.000 NA   NA
 114875 114876 MYPU_1390 MYPU_1400     TRUE 0.507 110.000 0.004 1.000 N NA
 114876 114877 MYPU_1400 MYPU_1410     TRUE 0.331 21.000 0.000 NA   NA
 114877 114878 MYPU_1410 MYPU_1420     FALSE 0.206 44.000 0.000 NA   NA
 114878 114879 MYPU_1420 MYPU_1430     TRUE 0.890 -52.000 0.000 1.000 N NA
 114880 114881 MYPU_1440 MYPU_1450     FALSE 0.253 79.000 0.000 1.000 N NA
 114882 114883 MYPU_1460 MYPU_1470     FALSE 0.081 118.000 0.000 NA   NA
 114883 114884 MYPU_1470 MYPU_1480     FALSE 0.043 290.000 0.000 NA   NA
 114884 114885 MYPU_1480 MYPU_1490     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 114885 114886 MYPU_1490 MYPU_1500     TRUE 0.925 -10.000 0.000 NA   NA
 114886 114887 MYPU_1500 MYPU_1510     FALSE 0.175 58.000 0.000 NA   NA
 114888 114889 MYPU_1520 MYPU_1530     TRUE 0.993 -16.000 0.007 1.000 N NA
 114889 114890 MYPU_1530 MYPU_1540     TRUE 0.963 28.000 0.787 1.000   NA
 114890 114891 MYPU_1540 MYPU_1550     FALSE 0.102 220.000 0.000 1.000   NA
 114891 114892 MYPU_1550 MYPU_1560     TRUE 0.301 64.000 0.000 1.000 N NA
 114892 114893 MYPU_1560 MYPU_1570     TRUE 0.398 36.000 0.000 1.000 N NA
 114894 114895 MYPU_1580 MYPU_1590     TRUE 0.805 4.000 0.000 NA   NA
 114895 114896 MYPU_1590 MYPU_1600     TRUE 0.859 -31.000 0.000 NA   NA
 114896 114897 MYPU_1600 MYPU_1610     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 114897 114898 MYPU_1610 MYPU_1620     TRUE 0.995 3.000 0.021 1.000   NA
 114898 114899 MYPU_1620 MYPU_1630     TRUE 0.997 0.000 0.020 1.000 N NA
 114900 401013 MYPU_1640 MYPU_TRNA_TRP_1   tRNA-Trp TRUE 0.873 -27.000 0.000 NA   NA
 401013 114901 MYPU_TRNA_TRP_1 MYPU_1650 tRNA-Trp   TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 114901 114902 MYPU_1650 MYPU_1660     TRUE 0.803 9.000 0.000 1.000   NA
 114903 114904 MYPU_1670 MYPU_1680     TRUE 0.981 -34.000 0.007 NA   NA
 114904 114905 MYPU_1680 MYPU_1690     TRUE 0.793 9.000 0.000 1.000 N NA
 114905 114906 MYPU_1690 MYPU_1700     TRUE 0.837 -37.000 0.000 NA   NA
 114906 114907 MYPU_1700 MYPU_1710     TRUE 0.925 1.000 0.000 NA   NA
 114907 114908 MYPU_1710 MYPU_1720     TRUE 0.990 -31.000 0.010 1.000 N NA
 114908 114909 MYPU_1720 MYPU_1730     TRUE 0.922 92.000 0.045 0.004 Y NA
 114909 114910 MYPU_1730 MYPU_1740     TRUE 0.851 77.000 0.053 1.000 N NA
 114912 114913 MYPU_1760 MYPU_1770     TRUE 0.461 27.000 0.000 1.000   NA
 114913 114914 MYPU_1770 MYPU_1780     TRUE 0.757 59.000 0.009 1.000 Y NA
 114914 114915 MYPU_1780 MYPU_1790     TRUE 0.901 -49.000 0.000 1.000   NA
 114915 114916 MYPU_1790 MYPU_1800     TRUE 0.375 41.000 0.000 1.000   NA
 114916 114917 MYPU_1800 MYPU_1810     TRUE 0.995 -36.000 0.080 1.000   NA
 114917 114918 MYPU_1810 MYPU_1820     TRUE 0.999 0.000 0.843 1.000 N NA
 114918 400990 MYPU_1820 MYPU_TRNA_TYR   tRNA-Tyr FALSE 0.142 78.000 0.000 NA   NA
 400990 400991 MYPU_TRNA_TYR MYPU_TRNA_GLN tRNA-Tyr tRNA-Gln TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 400991 114919 MYPU_TRNA_GLN MYPU_1830 tRNA-Gln   TRUE 0.465 13.000 0.000 NA   NA
 114919 114920 MYPU_1830 MYPU_1840     FALSE 0.123 150.000 0.000 1.000 N NA
 114920 114921 MYPU_1840 MYPU_1850     FALSE 0.153 130.000 0.000 1.000   NA
 114921 114922 MYPU_1850 MYPU_1860     TRUE 0.281 254.000 0.000 0.007   NA
 114922 114923 MYPU_1860 MYPU_1870     TRUE 0.859 -31.000 0.000 NA   NA
 114923 114924 MYPU_1870 MYPU_1880     FALSE 0.124 88.000 0.000 NA   NA
 114927 114928 MYPU_1910 MYPU_1920     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 114928 114929 MYPU_1920 MYPU_1930     FALSE 0.049 215.000 0.000 NA   NA
 114929 114930 MYPU_1930 MYPU_1940     TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 114930 114931 MYPU_1940 MYPU_1950     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 114931 114932 MYPU_1950 MYPU_1960     TRUE 0.881 -25.000 0.000 NA   NA
 114932 114933 MYPU_1960 MYPU_1970     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 114934 114935 MYPU_1980 MYPU_1990     FALSE 0.105 202.000 0.000 1.000   NA
 114935 114936 MYPU_1990 MYPU_2000     TRUE 0.998 -31.000 0.643 1.000   NA
 114936 114937 MYPU_2000 MYPU_2010     TRUE 0.999 -70.000 0.492 0.003 Y NA
 114937 114938 MYPU_2010 MYPU_2020     TRUE 0.995 0.000 0.006 1.000   NA
 114938 114939 MYPU_2020 MYPU_2030     FALSE 0.120 164.000 0.000 1.000   NA
 114939 114940 MYPU_2030 MYPU_2040     TRUE 0.997 -25.000 0.323 NA Y NA
 114940 114941 MYPU_2040 MYPU_2050     TRUE 0.996 -27.000 0.171 NA N NA
 114942 114943 MYPU_2060 MYPU_2070     FALSE 0.060 157.000 0.000 NA   NA
 114943 114944 MYPU_2070 MYPU_2080     FALSE 0.041 351.000 0.000 NA   NA
 114945 114946 MYPU_2090 MYPU_2100     TRUE 0.934 -7.000 0.000 NA   NA
 114946 114947 MYPU_2100 MYPU_2110     FALSE 0.040 408.000 0.000 NA   NA
 114947 114948 MYPU_2110 MYPU_2120     TRUE 0.303 23.000 0.000 NA   NA
 114948 114949 MYPU_2120 MYPU_2130     TRUE 0.748 -166.000 0.000 NA   NA
 114949 114950 MYPU_2130 MYPU_2140     FALSE 0.040 487.000 0.000 NA   NA
 114952 114953 MYPU_2160 MYPU_2170     TRUE 0.942 3.000 0.000 1.000   NA
 114953 114954 MYPU_2170 MYPU_2180     FALSE 0.129 153.000 0.000 1.000   NA
 114955 114956 MYPU_2190 MYPU_2200     TRUE 0.999 0.000 0.626 1.000 N NA
 114957 114958 MYPU_2210 MYPU_2220     TRUE 0.999 0.000 0.125 1.000 N NA
 114958 114959 MYPU_2220 MYPU_2230     FALSE 0.083 337.000 0.000 1.000 N NA
 114960 114961 MYPU_2240 MYPU_2250     TRUE 0.995 6.000 0.467 1.000   NA
 1791084 3385515 MYPU_RRNA_5S MYPU_r01     FALSE 0.056 173.000 0.000 NA   NA
 3385515 114962 MYPU_r01 MYPU_2260     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 114962 114963 MYPU_2260 MYPU_2270     TRUE 0.796 33.000 0.012 NA   NA
 114963 114964 MYPU_2270 MYPU_2280     FALSE 0.072 134.000 0.000 NA   NA
 114964 114965 MYPU_2280 MYPU_2290     FALSE 0.042 314.000 0.000 NA   NA
 114965 114966 MYPU_2290 MYPU_2300     TRUE 0.938 24.000 1.000 NA   NA
 114966 114967 MYPU_2300 MYPU_2310     TRUE 0.894 52.000 1.000 NA   NA
 114967 114968 MYPU_2310 MYPU_2320     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 114968 114969 MYPU_2320 MYPU_2330     TRUE 0.969 13.000 1.000 NA   NA
 114969 114970 MYPU_2330 MYPU_2340     FALSE 0.057 168.000 0.000 NA   NA
 114970 114971 MYPU_2340 MYPU_2350     TRUE 0.401 15.000 0.000 NA   NA
 114971 114972 MYPU_2350 MYPU_2360     FALSE 0.214 548.000 0.000 0.023 Y NA
 114972 114973 MYPU_2360 MYPU_2370     TRUE 0.825 135.000 0.286 1.000 Y NA
 114973 114974 MYPU_2370 MYPU_2380     TRUE 0.998 1.000 0.111 1.000 Y NA
 114974 114975 MYPU_2380 MYPU_2390     TRUE 0.985 2.000 0.000 0.033   NA
 114975 114976 MYPU_2390 MYPU_2400     FALSE 0.092 282.000 0.000 1.000   NA
 114977 114978 MYPU_2410 MYPU_2420     FALSE 0.165 67.000 0.000 NA   NA
 114982 114983 MYPU_2460 MYPU_2470     FALSE 0.130 141.000 0.000 1.000 N NA
 114984 114985 MYPU_2480 MYPU_2490     TRUE 0.361 18.000 0.000 NA   NA
 114986 114987 MYPU_2500 MYPU_2510     FALSE 0.041 320.000 0.000 NA   NA
 400992 400993 MYPU_TRNA_LEU_2 MYPU_TRNA_LYS tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.729 6.000 0.000 NA   NA
 400993 114988 MYPU_TRNA_LYS MYPU_2520 tRNA-Lys   FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 114988 114989 MYPU_2520 MYPU_2530     FALSE 0.229 90.000 0.000 1.000 N NA
 114989 114990 MYPU_2530 MYPU_2540     TRUE 0.985 -31.000 0.010 NA   NA
 114990 114991 MYPU_2540 MYPU_2550     TRUE 0.639 39.000 0.004 NA   NA
 114991 114992 MYPU_2550 MYPU_2560     TRUE 0.303 23.000 0.000 NA   NA
 114992 114993 MYPU_2560 MYPU_2570     FALSE 0.154 67.000 0.000 NA N NA
 114993 114994 MYPU_2570 MYPU_2580     TRUE 0.989 -22.000 0.004 1.000 N NA
 114994 114995 MYPU_2580 MYPU_2590     TRUE 0.275 74.000 0.000 1.000 N NA
 114995 114996 MYPU_2590 MYPU_2600     TRUE 0.998 -19.000 0.652 1.000 Y NA
 114996 114997 MYPU_2600 MYPU_2610     TRUE 0.984 17.000 0.928 0.061 Y NA
 114997 114998 MYPU_2610 MYPU_2620     FALSE 0.040 444.000 0.000 NA   NA
 114998 114999 MYPU_2620 MYPU_2630     TRUE 0.998 -7.000 0.778 NA   NA
 114999 115000 MYPU_2630 MYPU_2640     FALSE 0.207 102.000 0.000 1.000   NA
 115001 115002 MYPU_2650 MYPU_2660     TRUE 0.999 -31.000 0.837 0.023 Y NA
 115002 115003 MYPU_2660 MYPU_2670     TRUE 0.994 12.000 0.724 0.023 Y NA
 115003 115004 MYPU_2670 MYPU_2680     TRUE 1.000 0.000 0.846 0.023 Y NA
 115004 115005 MYPU_2680 MYPU_2690     TRUE 0.999 3.000 0.864 0.023 Y NA
 115005 115006 MYPU_2690 MYPU_2700     TRUE 0.981 13.000 0.022 0.023 Y NA
 115006 115007 MYPU_2700 MYPU_2710     TRUE 1.000 0.000 0.500 0.023 Y NA
 115007 115008 MYPU_2710 MYPU_2720     TRUE 0.956 51.000 0.085 0.023 Y NA
 115008 115009 MYPU_2720 MYPU_2730     TRUE 0.910 -16.000 0.000 NA   NA
 115009 115010 MYPU_2730 MYPU_2740     FALSE 0.096 108.000 0.000 NA   NA
 115012 115013 MYPU_2760 MYPU_2770     TRUE 0.423 14.000 0.000 NA   NA
 115013 115014 MYPU_2770 MYPU_2780     TRUE 0.718 11.000 0.000 1.000 N NA
 115016 115017 MYPU_2800 MYPU_2810     TRUE 0.361 18.000 0.000 NA   NA
 115018 115019 MYPU_2820 MYPU_2830     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115019 115020 MYPU_2830 MYPU_2840     TRUE 0.999 -13.000 0.222 0.047   NA
 115020 115021 MYPU_2840 MYPU_2850     TRUE 0.998 2.000 0.250 1.000   NA
 115021 115022 MYPU_2850 MYPU_2860     TRUE 1.000 -7.000 0.312 0.006 Y NA
 115023 115024 MYPU_2870 MYPU_2880     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 115024 115025 MYPU_2880 MYPU_2890     FALSE 0.133 145.000 0.000 1.000   NA
 115025 115026 MYPU_2890 MYPU_2900     TRUE 0.965 46.000 0.884 0.060 Y NA
 115026 115027 MYPU_2900 MYPU_2910     FALSE 0.115 93.000 0.000 NA   NA
 115027 115028 MYPU_2910 MYPU_2920     TRUE 0.465 13.000 0.000 NA   NA
 115028 115029 MYPU_2920 MYPU_2930     TRUE 0.345 101.000 0.000 0.085   NA
 401012 115031 MYPU_TRNA_GLY MYPU_2950 tRNA-Gly   FALSE 0.100 106.000 0.000 NA   NA
 115031 115032 MYPU_2950 MYPU_2960     FALSE 0.219 38.000 0.000 NA   NA
 115032 115033 MYPU_2960 MYPU_2970     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 115033 115034 MYPU_2970 MYPU_2980     FALSE 0.246 80.000 0.000 1.000 N NA
 115036 115037 MYPU_3000 MYPU_3010     TRUE 0.997 -10.000 0.040 1.000   NA
 115037 115038 MYPU_3010 MYPU_3020     TRUE 0.566 67.000 0.000 0.030   NA
 115039 115040 MYPU_3030 MYPU_3040     TRUE 0.999 -7.000 0.014 0.005 Y NA
 115040 115041 MYPU_3040 MYPU_3050     TRUE 0.859 -31.000 0.000 NA   NA
 115041 115042 MYPU_3050 MYPU_3060     TRUE 0.893 -22.000 0.000 NA   NA
 115042 115043 MYPU_3060 MYPU_3070     TRUE 0.965 -10.000 0.000 1.000   NA
 115043 115044 MYPU_3070 MYPU_3080     FALSE 0.092 111.000 0.000 NA   NA
 115046 115047 MYPU_3100 MYPU_3110     FALSE 0.219 38.000 0.000 NA   NA
 115047 115048 MYPU_3110 MYPU_3120     FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 115048 115049 MYPU_3120 MYPU_3130     FALSE 0.124 158.000 0.000 1.000   NA
 115049 115050 MYPU_3130 MYPU_3140     FALSE 0.103 205.000 0.000 1.000   NA
 115050 115051 MYPU_3140 MYPU_3150     TRUE 0.995 1.000 0.010 1.000 Y NA
 115052 115053 MYPU_3160 MYPU_3170     TRUE 0.868 -28.000 0.000 NA   NA
 115053 115054 MYPU_3170 MYPU_3180     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 115054 115055 MYPU_3180 MYPU_3190     FALSE 0.041 318.000 0.000 NA   NA
 115055 115056 MYPU_3190 MYPU_3200     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 115056 115057 MYPU_3200 MYPU_3210     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 115057 115058 MYPU_3210 MYPU_3220     TRUE 0.988 3.000 0.005 1.000 N NA
 115058 115059 MYPU_3220 MYPU_3230     FALSE 0.267 28.000 0.000 NA   NA
 115060 115061 MYPU_3240 MYPU_3250     FALSE 0.149 75.000 0.000 NA   NA
 115061 115062 MYPU_3250 MYPU_3260     TRUE 0.684 116.000 0.061 NA   NA
 115063 115064 MYPU_3270 MYPU_3280     FALSE 0.163 69.000 0.000 NA   NA
 115064 115065 MYPU_3280 MYPU_3290     TRUE 0.490 70.000 0.000 0.058 Y NA
 115065 115066 MYPU_3290 MYPU_3300   rplU TRUE 0.993 12.000 0.667 0.058 Y NA
 115066 115067 MYPU_3300 MYPU_3310 rplU   FALSE 0.047 232.000 0.000 NA   NA
 115067 115068 MYPU_3310 MYPU_3320     FALSE 0.142 78.000 0.000 NA   NA
 115068 115069 MYPU_3320 MYPU_3330     TRUE 0.998 -40.000 0.161 0.066 Y NA
 115069 115070 MYPU_3330 MYPU_3340     FALSE 0.127 85.000 0.000 NA   NA
 115071 115072 MYPU_3350 MYPU_3360     TRUE 0.946 -22.000 0.000 1.000 N NA
 115072 115073 MYPU_3360 MYPU_3370     TRUE 0.956 2.000 0.000 1.000 N NA
 115074 115075 MYPU_3380 MYPU_3390     FALSE 0.183 53.000 0.000 NA   NA
 115078 115079 MYPU_3420 MYPU_3430     FALSE 0.040 264.000 0.000 NA N NA
 115079 115080 MYPU_3430 MYPU_3440     TRUE 0.870 87.000 0.667 NA Y NA
 115080 115081 MYPU_3440 MYPU_3450     TRUE 0.891 -49.000 0.000 1.000 Y NA
 115082 115083 MYPU_3460 MYPU_3470     FALSE 0.131 147.000 0.000 1.000   NA
 115083 115084 MYPU_3470 MYPU_3480     TRUE 0.997 9.000 0.574 0.003 Y NA
 115084 115085 MYPU_3480 MYPU_3490     FALSE 0.267 28.000 0.000 NA   NA
 115085 115086 MYPU_3490 MYPU_3500     FALSE 0.055 174.000 0.000 NA   NA
 115087 115088 MYPU_3510 MYPU_3520     TRUE 0.999 -25.000 0.143 0.045 N NA
 115088 115089 MYPU_3520 MYPU_3530     TRUE 0.424 33.000 0.000 1.000   NA
 115089 115090 MYPU_3530 MYPU_3540     FALSE 0.158 72.000 0.000 NA   NA
 115090 400994 MYPU_3540 MYPU_TRNA_PRO   tRNA-Pro TRUE 0.753 -92.000 0.000 NA   NA
 400994 400995 MYPU_TRNA_PRO MYPU_TRNA_ALA tRNA-Pro tRNA-Ala TRUE 0.704 7.000 0.000 NA   NA
 400995 400996 MYPU_TRNA_ALA MYPU_TRNA_MET_1 tRNA-Ala tRNA-Met TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 400996 400997 MYPU_TRNA_MET_1 MYPU_TRNA_MET_2 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.227 37.000 0.000 NA   NA
 400997 400998 MYPU_TRNA_MET_2 MYPU_TRNA_SER_1 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 400998 400999 MYPU_TRNA_SER_1 MYPU_TRNA_MET_3 tRNA-Ser tRNA-Met FALSE 0.202 47.000 0.000 NA   NA
 400999 401000 MYPU_TRNA_MET_3 MYPU_TRNA_ASP tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.805 4.000 0.000 NA   NA
 401000 401001 MYPU_TRNA_ASP MYPU_TRNA_PHE tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 401001 115091 MYPU_TRNA_PHE MYPU_3550 tRNA-Phe   FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 115091 115092 MYPU_3550 MYPU_3560     TRUE 0.934 -7.000 0.000 NA   NA
 115092 115093 MYPU_3560 MYPU_3570     TRUE 0.998 -16.000 0.600 NA   NA
 115093 115094 MYPU_3570 MYPU_3580     TRUE 0.340 20.000 0.000 NA   NA
 115096 115097 MYPU_3600 MYPU_3610     TRUE 0.863 112.000 0.286 1.000 Y NA
 115097 115098 MYPU_3610 MYPU_3620     TRUE 0.996 4.000 0.364 1.000 Y NA
 115098 115099 MYPU_3620 MYPU_3630     TRUE 0.740 10.000 0.000 1.000 Y NA
 115099 115100 MYPU_3630 MYPU_3640     TRUE 0.828 7.000 0.000 1.000 Y NA
 115101 115102 MYPU_3650 MYPU_3660     FALSE 0.053 182.000 0.000 NA   NA
 115102 115103 MYPU_3660 MYPU_3670     FALSE 0.165 67.000 0.000 NA   NA
 115103 115104 MYPU_3670 MYPU_3680     TRUE 0.792 -52.000 0.000 NA   NA
 115104 115105 MYPU_3680 MYPU_3690     TRUE 0.357 49.000 0.000 1.000   NA
 115105 115106 MYPU_3690 MYPU_3700     FALSE 0.040 735.000 0.000 NA   NA
 115108 115109 MYPU_3720 MYPU_3730     TRUE 1.000 -7.000 0.552 0.006 Y NA
 115109 115110 MYPU_3730 MYPU_3740     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 115110 115111 MYPU_3740 MYPU_3750     FALSE 0.158 72.000 0.000 NA   NA
 115111 115112 MYPU_3750 MYPU_3760     TRUE 0.321 138.000 0.000 0.027 N NA
 115112 115113 MYPU_3760 MYPU_3770     TRUE 0.893 -22.000 0.000 NA   NA
 115113 115114 MYPU_3770 MYPU_3780     FALSE 0.219 38.000 0.000 NA   NA
 115114 115115 MYPU_3780 MYPU_3790     TRUE 0.644 40.000 0.004 NA   NA
 115115 115116 MYPU_3790 MYPU_3800     TRUE 0.749 73.000 0.009 1.000   NA
 115117 115118 MYPU_3810 MYPU_3820     TRUE 0.465 13.000 0.000 NA   NA
 115118 115119 MYPU_3820 MYPU_3830     TRUE 0.868 -28.000 0.000 NA   NA
 115119 115120 MYPU_3830 MYPU_3840     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115120 115121 MYPU_3840 MYPU_3850     TRUE 0.902 -19.000 0.000 NA   NA
 115122 115123 MYPU_3860 MYPU_3870     TRUE 0.999 -9.000 0.713 1.000 Y NA
 115123 115124 MYPU_3870 MYPU_3880     TRUE 0.930 32.000 0.095 1.000 Y NA
 115124 115125 MYPU_3880 MYPU_3890     TRUE 0.964 8.000 0.005 1.000 N NA
 115125 115126 MYPU_3890 MYPU_3900     TRUE 0.967 -7.000 0.000 1.000 N NA
 115127 115128 MYPU_3910 MYPU_3920     TRUE 0.865 10.000 0.000 0.081   NA
 115128 115129 MYPU_3920 MYPU_3930     FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 115131 115132 MYPU_3950 MYPU_3960     TRUE 0.877 177.000 0.714 0.081   NA
 115132 115133 MYPU_3960 MYPU_3970     FALSE 0.252 275.000 0.000 0.010 Y NA
 115133 115134 MYPU_3970 MYPU_3980     TRUE 0.667 40.000 0.000 0.010 Y NA
 115134 115135 MYPU_3980 MYPU_3990     FALSE 0.161 427.000 0.000 0.081   NA
 115135 115136 MYPU_3990 MYPU_4000     TRUE 0.865 10.000 0.000 0.081   NA
 115137 115138 MYPU_4010 MYPU_4020     FALSE 0.221 97.000 0.000 1.000   NA
 115139 115140 MYPU_4030 MYPU_4040     FALSE 0.052 187.000 0.000 NA   NA
 115140 115141 MYPU_4040 MYPU_4050     FALSE 0.196 107.000 0.000 1.000   NA
 115142 115143 MYPU_4060 MYPU_4070     TRUE 0.776 115.000 0.200 NA   NA
 115143 115144 MYPU_4070 MYPU_4080     TRUE 0.998 2.000 0.600 NA   NA
 115144 115145 MYPU_4080 MYPU_4090     FALSE 0.048 216.000 0.000 NA   NA
 115145 115146 MYPU_4090 MYPU_4100     FALSE 0.106 101.000 0.000 NA   NA
 115146 115147 MYPU_4100 MYPU_4110     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.043 Y NA
 115147 115148 MYPU_4110 MYPU_4120     TRUE 0.998 3.000 0.692 1.000 Y NA
 115148 115149 MYPU_4120 MYPU_4130     TRUE 0.999 -25.000 0.769 0.006 Y NA
 115149 115150 MYPU_4130 MYPU_4140     TRUE 0.968 18.000 0.167 1.000   NA
 115150 115151 MYPU_4140 MYPU_4150     TRUE 0.842 7.000 0.000 1.000   NA
 115151 115152 MYPU_4150 MYPU_4160     FALSE 0.040 412.000 0.000 NA   NA
 115152 115153 MYPU_4160 MYPU_4170     TRUE 0.512 12.000 0.000 NA   NA
 115153 115154 MYPU_4170 MYPU_4180     FALSE 0.041 326.000 0.000 NA   NA
 115154 115155 MYPU_4180 MYPU_4190     FALSE 0.040 404.000 0.000 NA   NA
 115155 115156 MYPU_4190 MYPU_4200     FALSE 0.108 100.000 0.000 NA   NA
 115157 115158 MYPU_4210 MYPU_4220     TRUE 0.470 72.000 0.000 0.078   NA
 115158 115159 MYPU_4220 MYPU_4230     TRUE 0.998 -10.000 0.013 0.078   NA
 115159 115160 MYPU_4230 MYPU_4240     TRUE 1.000 -7.000 0.492 0.043 Y NA
 115160 115161 MYPU_4240 MYPU_4250     TRUE 0.999 -10.000 0.928 0.043 Y NA
 115161 115162 MYPU_4250 MYPU_4260     FALSE 0.078 123.000 0.000 NA   NA
 115162 115163 MYPU_4260 MYPU_4270     FALSE 0.180 55.000 0.000 NA   NA
 115163 115164 MYPU_4270 MYPU_4280     FALSE 0.099 237.000 0.000 1.000   NA
 115164 115165 MYPU_4280 MYPU_4290     TRUE 0.999 -6.000 0.579 1.000 Y NA
 115165 115166 MYPU_4290 MYPU_4300     TRUE 0.970 57.000 0.224 0.012 Y NA
 115167 115168 MYPU_4310 MYPU_4320     TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.013 Y NA
 115168 115169 MYPU_4320 MYPU_4330     TRUE 0.946 4.000 0.000 0.079 Y NA
 115170 115171 MYPU_4340 MYPU_4350     FALSE 0.043 284.000 0.000 NA   NA
 401003 115172 MYPU_TRNA_THR_1 MYPU_4360 tRNA-Thr   FALSE 0.040 404.000 0.000 NA   NA
 115172 115173 MYPU_4360 MYPU_4370     TRUE 0.546 11.000 0.000 NA   NA
 115173 115174 MYPU_4370 MYPU_4380     FALSE 0.056 173.000 0.000 NA   NA
 115176 115177 MYPU_4400 MYPU_4410     TRUE 0.996 -43.000 0.571 NA N NA
 115177 115178 MYPU_4410 MYPU_4420     TRUE 0.998 3.000 0.214 1.000 N NA
 115178 115179 MYPU_4420 MYPU_4430     TRUE 0.970 19.000 0.250 1.000 N NA
 115179 115180 MYPU_4430 MYPU_4440     FALSE 0.096 108.000 0.000 NA   NA
 115180 115181 MYPU_4440 MYPU_4450     TRUE 0.803 -49.000 0.000 NA   NA
 115181 115182 MYPU_4450 MYPU_4460     TRUE 0.984 -13.000 0.002 NA   NA
 115182 115183 MYPU_4460 MYPU_4470     TRUE 0.401 15.000 0.000 NA   NA
 115183 115184 MYPU_4470 MYPU_4480     TRUE 0.910 -16.000 0.000 NA   NA
 115184 115185 MYPU_4480 MYPU_4490     TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 115185 115186 MYPU_4490 MYPU_4500     TRUE 0.999 -12.000 1.000 0.020 Y NA
 115186 115187 MYPU_4500 MYPU_4510     TRUE 0.495 22.000 0.000 1.000 N NA
 115189 115190 MYPU_4530 MYPU_4540     TRUE 0.995 -61.000 0.205 1.000 N NA
 115190 115191 MYPU_4540 MYPU_4550     FALSE 0.053 183.000 0.000 NA   NA
 115191 115192 MYPU_4550 MYPU_4560     FALSE 0.048 231.000 0.000 NA   NA
 115192 115193 MYPU_4560 MYPU_4570     TRUE 0.465 13.000 0.000 NA   NA
 115193 115194 MYPU_4570 MYPU_4580     FALSE 0.077 127.000 0.000 NA   NA
 115194 115195 MYPU_4580 MYPU_4590     TRUE 0.997 3.000 0.138 1.000 Y NA
 115195 115196 MYPU_4590 MYPU_4600     FALSE 0.079 120.000 0.000 NA   NA
 115196 115197 MYPU_4600 MYPU_4610     TRUE 0.770 -75.000 0.000 NA   NA
 115197 115198 MYPU_4610 MYPU_4620     TRUE 0.901 42.000 0.163 NA   NA
 115198 115199 MYPU_4620 MYPU_4630     TRUE 0.966 5.000 0.003 1.000 N NA
 115199 115200 MYPU_4630 MYPU_4640     FALSE 0.051 195.000 0.000 NA   NA
 115200 115201 MYPU_4640 MYPU_4650     FALSE 0.040 462.000 0.000 NA   NA
 115201 115202 MYPU_4650 MYPU_4660     FALSE 0.045 252.000 0.000 NA   NA
 115203 115204 MYPU_4670 MYPU_4680     TRUE 0.999 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 115204 115205 MYPU_4680 MYPU_4690     TRUE 0.998 0.000 0.033 1.000 Y NA
 115206 115207 MYPU_4700 MYPU_4710     TRUE 0.328 52.000 0.000 1.000 N NA
 115208 115209 MYPU_4720 MYPU_4730     TRUE 0.313 64.000 0.000 1.000   NA
 115210 115211 MYPU_4740 MYPU_4750     FALSE 0.169 64.000 0.000 NA   NA
 115212 115213 MYPU_4760 MYPU_4770     TRUE 0.751 140.000 0.267 NA   NA
 115213 115214 MYPU_4770 MYPU_4780     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 115214 115215 MYPU_4780 MYPU_4790     FALSE 0.044 257.000 0.000 NA   NA
 115215 115216 MYPU_4790 MYPU_4800     TRUE 0.998 2.000 0.074 0.077 Y NA
 115216 115217 MYPU_4800 MYPU_4810     FALSE 0.101 221.000 0.000 1.000   NA
 115217 115218 MYPU_4810 MYPU_4820     TRUE 0.999 0.000 0.400 NA   NA
 115220 115221 MYPU_4840 MYPU_4850     TRUE 0.531 19.000 0.000 1.000 N NA
 115221 115222 MYPU_4850 MYPU_4860     TRUE 0.994 0.000 0.004 1.000   NA
 115224 115225 MYPU_4880 MYPU_4890     TRUE 0.823 52.000 0.014 1.000 N NA
 115225 115226 MYPU_4890 MYPU_4900     FALSE 0.197 99.000 0.000 1.000 Y NA
 115226 115227 MYPU_4900 MYPU_4910     FALSE 0.237 164.000 0.000 0.060 N NA
 115227 115228 MYPU_4910 MYPU_4920     FALSE 0.227 37.000 0.000 NA   NA
 115228 115229 MYPU_4920 MYPU_4930     TRUE 0.401 15.000 0.000 NA   NA
 115229 115230 MYPU_4930 MYPU_4940     TRUE 0.999 0.000 0.635 NA   NA
 115231 115232 MYPU_4950 MYPU_4960     TRUE 1.000 0.000 0.601 0.052 Y NA
 115232 401004 MYPU_4960 MYPU_TRNA_ILE   tRNA-Ile FALSE 0.134 80.000 0.000 NA   NA
 401004 115233 MYPU_TRNA_ILE MYPU_4970 tRNA-Ile   FALSE 0.158 72.000 0.000 NA   NA
 115233 115234 MYPU_4970 MYPU_4980     TRUE 0.808 -43.000 0.000 NA N NA
 115234 115235 MYPU_4980 MYPU_4990     TRUE 0.923 -7.000 0.000 NA Y NA
 115236 115237 MYPU_5000 MYPU_5010     TRUE 0.998 -16.000 0.500 NA   NA
 115237 115238 MYPU_5010 MYPU_5020     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA   NA
 115238 115239 MYPU_5020 MYPU_5030     TRUE 0.811 -46.000 0.000 NA   NA
 115239 115240 MYPU_5030 MYPU_5040     TRUE 0.378 17.000 0.000 NA   NA
 115240 115241 MYPU_5040 MYPU_5050     FALSE 0.227 37.000 0.000 NA   NA
 115243 115244 MYPU_5070 MYPU_5080     FALSE 0.040 525.000 0.000 NA   NA
 115244 115245 MYPU_5080 MYPU_5090     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 115245 115246 MYPU_5090 MYPU_5100     FALSE 0.054 181.000 0.000 NA   NA
 115246 115247 MYPU_5100 MYPU_5110     FALSE 0.045 248.000 0.000 NA   NA
 115247 115248 MYPU_5110 MYPU_5120     TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 115248 115249 MYPU_5120 MYPU_5130     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115249 115250 MYPU_5130 MYPU_5140     FALSE 0.077 127.000 0.000 NA   NA
 115250 115251 MYPU_5140 MYPU_5150     TRUE 0.955 11.000 0.024 NA   NA
 115251 115252 MYPU_5150 MYPU_5160     TRUE 0.998 -16.000 0.100 1.000 N NA
 115252 115253 MYPU_5160 MYPU_5170     TRUE 0.996 -37.000 0.119 1.000 N NA
 115257 115258 MYPU_5210 MYPU_5220     TRUE 0.843 -36.000 0.000 NA   NA
 115259 115260 MYPU_5230 MYPU_5240     FALSE 0.042 302.000 0.000 NA   NA
 115260 115261 MYPU_5240 MYPU_5250     FALSE 0.040 509.000 0.000 NA   NA
 115262 115263 MYPU_5260 MYPU_5270     FALSE 0.040 545.000 0.000 NA   NA
 115267 115268 MYPU_5310 MYPU_5320     TRUE 0.384 37.000 0.000 1.000 N NA
 115268 115269 MYPU_5320 MYPU_5330     TRUE 0.998 3.000 0.748 1.000 Y NA
 115270 115271 MYPU_5340 MYPU_5350     TRUE 0.999 -7.000 0.667 NA   NA
 115272 115273 MYPU_5360 MYPU_5370     FALSE 0.111 91.000 0.000 NA N NA
 115273 115274 MYPU_5370 MYPU_5380     TRUE 0.996 -46.000 0.295 1.000 N NA
 115275 115276 MYPU_5390 MYPU_5400     TRUE 0.999 4.000 0.643 0.004 Y NA
 115276 115277 MYPU_5400 MYPU_5410     TRUE 0.980 34.000 1.000 0.004 Y NA
 115277 115278 MYPU_5410 MYPU_5420     FALSE 0.255 31.000 0.000 NA   NA
 115278 115279 MYPU_5420 MYPU_5430     FALSE 0.209 42.000 0.000 NA   NA
 115280 115281 MYPU_5440 MYPU_5450     FALSE 0.138 140.000 0.000 1.000   NA
 115281 115282 MYPU_5450 MYPU_5460     TRUE 0.999 3.000 0.851 0.003   NA
 115282 115283 MYPU_5460 MYPU_5470     FALSE 0.101 197.000 0.000 1.000 N NA
 115283 115284 MYPU_5470 MYPU_5480     TRUE 0.267 76.000 0.000 1.000 N NA
 115284 115285 MYPU_5480 MYPU_5490     TRUE 0.823 84.000 0.037 1.000   NA
 115285 115286 MYPU_5490 MYPU_5500     TRUE 0.996 -16.000 0.022 1.000   NA
 115286 401011 MYPU_5500 MYPU_TRNA_LEU_3   tRNA-Leu FALSE 0.145 77.000 0.000 NA   NA
 401011 401010 MYPU_TRNA_LEU_3 MYPU_TRNA_THR_2 tRNA-Leu tRNA-Thr TRUE 0.283 26.000 0.000 NA   NA
 401010 401009 MYPU_TRNA_THR_2 MYPU_TRNA_VAL tRNA-Thr tRNA-Val TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 401009 401008 MYPU_TRNA_VAL MYPU_TRNA_GLU tRNA-Val tRNA-Glu TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 401008 401007 MYPU_TRNA_GLU MYPU_TRNA_ASN tRNA-Glu tRNA-Asn TRUE 0.749 5.000 0.000 NA   NA
 401007 115287 MYPU_TRNA_ASN MYPU_5510 tRNA-Asn   FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 115287 115288 MYPU_5510 MYPU_5520     TRUE 0.823 69.000 0.021 1.000 Y NA
 115288 115289 MYPU_5520 MYPU_5530     TRUE 0.968 12.000 0.031 1.000 N NA
 115289 115290 MYPU_5530 MYPU_5540     FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 115290 115291 MYPU_5540 MYPU_5550     TRUE 0.912 2.000 0.000 NA   NA
 115291 115292 MYPU_5550 MYPU_5560     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115292 115293 MYPU_5560 MYPU_5570     TRUE 0.998 -7.000 0.032 1.000 N NA
 115293 115294 MYPU_5570 MYPU_5580     TRUE 0.889 37.000 0.007 0.057 Y NA
 115294 115295 MYPU_5580 MYPU_5590     TRUE 0.316 63.000 0.000 1.000   NA
 115295 115296 MYPU_5590 MYPU_5600     FALSE 0.097 247.000 0.000 1.000   NA
 115296 115297 MYPU_5600 MYPU_5610     TRUE 0.999 0.000 0.873 1.000 N NA
 115297 115298 MYPU_5610 MYPU_5620     TRUE 0.995 5.000 0.308 1.000 N NA
 115298 115299 MYPU_5620 MYPU_5630     TRUE 0.998 4.000 0.810 0.050 Y NA
 115299 115300 MYPU_5630 MYPU_5640     TRUE 0.996 7.000 0.194 0.050   NA
 115300 115301 MYPU_5640 MYPU_5650     TRUE 0.869 83.000 0.104 1.000   NA
 115301 115302 MYPU_5650 MYPU_5660     TRUE 0.998 0.000 0.051 1.000 Y NA
 115302 115303 MYPU_5660 MYPU_5670     TRUE 0.998 0.000 0.041 1.000 N NA
 115303 115304 MYPU_5670 MYPU_5680     TRUE 0.997 -6.000 0.019 1.000 N NA
 115304 115305 MYPU_5680 MYPU_5690     TRUE 0.989 3.000 0.005 1.000 N NA
 115305 115306 MYPU_5690 MYPU_5700     TRUE 0.984 14.000 0.148 0.069 Y NA
 115306 115307 MYPU_5700 MYPU_5710     TRUE 0.999 0.000 0.814 0.069 Y NA
 115307 115308 MYPU_5710 MYPU_5720     TRUE 0.991 13.000 0.815 0.050 Y NA
 115308 115309 MYPU_5720 MYPU_5730     TRUE 0.998 4.000 0.808 0.050 Y NA
 115309 115310 MYPU_5730 MYPU_5740     TRUE 0.998 4.000 0.473 0.050 Y NA
 115310 115311 MYPU_5740 MYPU_5750     TRUE 0.995 10.000 0.496 0.050 Y NA
 115311 115312 MYPU_5750 MYPU_5760     TRUE 0.999 3.000 0.758 0.050 Y NA
 115312 115313 MYPU_5760 MYPU_5770   rplN TRUE 0.993 11.000 0.810 0.069 Y NA
 115313 115314 MYPU_5770 MYPU_5780 rplN   TRUE 0.999 2.000 0.791 0.069 Y NA
 115314 115315 MYPU_5780 MYPU_5790     TRUE 0.999 0.000 0.828 0.050 Y NA
 115315 115316 MYPU_5790 MYPU_5800     TRUE 0.999 2.000 0.802 0.050 Y NA
 115316 115317 MYPU_5800 MYPU_5810     TRUE 0.999 0.000 0.828 0.069 Y NA
 115319 115320 MYPU_5830 MYPU_5840     TRUE 0.999 0.000 0.769 0.069 Y NA
 115320 115321 MYPU_5840 MYPU_5850     TRUE 0.999 0.000 0.820 0.069 Y NA
 115321 115322 MYPU_5850 MYPU_5860     TRUE 0.960 72.000 0.849 0.039 Y NA
 115322 115323 MYPU_5860 MYPU_5870     TRUE 1.000 0.000 0.307 0.050 Y NA
 115325 115326 MYPU_5890 MYPU_5900     TRUE 0.915 119.000 0.467 0.069 Y NA
 115326 115327 MYPU_5900 MYPU_5910     FALSE 0.041 354.000 0.000 NA   NA
 115327 115328 MYPU_5910 MYPU_5920     FALSE 0.041 885.000 0.000 NA   NA
 115329 115330 MYPU_5930 MYPU_5940     TRUE 0.921 47.000 0.118 1.000   NA
 115330 115331 MYPU_5940 MYPU_5950     TRUE 0.979 43.000 0.431 0.016   NA
 115331 115332 MYPU_5950 MYPU_5960     TRUE 1.000 0.000 0.279 0.015 Y NA
 115332 115333 MYPU_5960 MYPU_5970   ulaD TRUE 0.597 14.000 0.000 1.000 Y NA
 115333 115334 MYPU_5970 MYPU_5980 ulaD   TRUE 0.876 -64.000 0.000 1.000 Y NA
 115334 115335 MYPU_5980 MYPU_5990     TRUE 0.999 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 115336 115337 MYPU_6000 MYPU_6010     TRUE 0.326 51.000 0.000 1.000 Y NA
 115337 115338 MYPU_6010 MYPU_6020     TRUE 0.510 20.000 0.000 1.000 Y NA
 115338 115339 MYPU_6020 MYPU_6030     TRUE 0.578 69.000 0.000 0.015 Y NA
 115339 115340 MYPU_6030 MYPU_6040     FALSE 0.102 104.000 0.000 NA   NA
 115340 115341 MYPU_6040 MYPU_6050     FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 115341 115342 MYPU_6050 MYPU_6060     TRUE 0.902 -19.000 0.000 NA   NA
 115342 115343 MYPU_6060 MYPU_6070     FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 115343 115344 MYPU_6070 MYPU_6080     TRUE 0.934 -7.000 0.000 NA   NA
 115344 115345 MYPU_6080 MYPU_6090     FALSE 0.173 115.000 0.000 1.000   NA
 115345 115346 MYPU_6090 MYPU_6100     TRUE 0.916 14.000 0.008 1.000 N NA
 115346 115347 MYPU_6100 MYPU_6110     TRUE 0.948 10.000 0.006 1.000 N NA
 115347 115348 MYPU_6110 MYPU_6120     FALSE 0.140 134.000 0.000 1.000 N NA
 115348 115349 MYPU_6120 MYPU_6130     TRUE 0.801 29.000 0.012 NA N NA
 115350 115351 MYPU_6140 MYPU_6150     TRUE 0.934 -7.000 0.000 NA   NA
 115352 115353 MYPU_6160 MYPU_6170     FALSE 0.041 319.000 0.000 NA   NA
 115353 115354 MYPU_6170 MYPU_6180     TRUE 1.000 0.000 0.720 0.039   NA
 115354 115355 MYPU_6180 MYPU_6190     TRUE 0.999 -7.000 0.438 1.000   NA
 115355 115356 MYPU_6190 MYPU_6200     FALSE 0.235 91.000 0.000 1.000   NA
 115356 115357 MYPU_6200 MYPU_6210     TRUE 0.647 13.000 0.000 1.000 N NA
 115357 115358 MYPU_6210 MYPU_6220     TRUE 0.964 4.000 0.000 0.027 N NA
 115359 115360 MYPU_6230 MYPU_6240     TRUE 0.989 4.000 0.015 1.000   NA
 115361 115362 MYPU_6250 MYPU_6260     TRUE 0.920 9.000 0.000 0.028 N NA
 115362 115363 MYPU_6260 MYPU_6270     TRUE 0.902 -19.000 0.000 NA   NA
 115363 115364 MYPU_6270 MYPU_6280     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 115364 115365 MYPU_6280 MYPU_6290     TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 115365 115366 MYPU_6290 MYPU_6300     FALSE 0.040 691.000 0.000 NA   NA
 115366 115367 MYPU_6300 MYPU_6310     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 115367 115368 MYPU_6310 MYPU_6320     FALSE 0.072 134.000 0.000 NA   NA
 115369 115370 MYPU_6330 MYPU_6340     TRUE 0.997 4.000 0.061 0.016 Y NA
 115370 115371 MYPU_6340 MYPU_6350     TRUE 0.998 -25.000 0.357 1.000   NA
 115371 115372 MYPU_6350 MYPU_6360     FALSE 0.050 201.000 0.000 NA   NA
 115372 115373 MYPU_6360 MYPU_6370     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 115373 115374 MYPU_6370 MYPU_6380     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 115374 115375 MYPU_6380 MYPU_6390     TRUE 0.361 18.000 0.000 NA   NA
 115375 115376 MYPU_6390 MYPU_6400     TRUE 0.999 0.000 0.057 0.038 N NA
 115376 115377 MYPU_6400 MYPU_6410     TRUE 0.999 2.000 0.200 0.038 Y NA
 115377 115378 MYPU_6410 MYPU_6420     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115379 115380 MYPU_6430 MYPU_6440     FALSE 0.042 244.000 0.000 NA N NA
 115381 115382 MYPU_6450 MYPU_6460     TRUE 0.971 9.000 0.013 1.000 Y NA
 115382 115383 MYPU_6460 MYPU_6470     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 115383 115384 MYPU_6470 MYPU_6480     FALSE 0.098 107.000 0.000 NA   NA
 115384 115385 MYPU_6480 MYPU_6490     FALSE 0.042 294.000 0.000 NA   NA
 115385 115386 MYPU_6490 MYPU_6500     FALSE 0.041 945.000 0.000 NA   NA
 115386 115387 MYPU_6500 MYPU_6510     FALSE 0.041 370.000 0.000 NA   NA
 115388 115389 MYPU_6520 MYPU_6530     TRUE 0.546 11.000 0.000 NA   NA
 115389 115390 MYPU_6530 MYPU_6540     FALSE 0.040 496.000 0.000 NA   NA
 115390 115391 MYPU_6540 MYPU_6550     TRUE 0.546 11.000 0.000 NA   NA
 115391 115392 MYPU_6550 MYPU_6560   rpsT FALSE 0.121 155.000 0.000 1.000 N NA
 115393 115394 MYPU_6570 MYPU_6580     TRUE 0.999 -22.000 0.549 0.003 Y NA
 115395 115396 MYPU_6590 MYPU_6600     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 115396 115397 MYPU_6600 MYPU_6610     FALSE 0.087 110.000 0.000 NA N NA
 115398 115399 MYPU_6620 MYPU_6630     TRUE 0.969 25.000 0.667 1.000   NA
 115399 115400 MYPU_6630 MYPU_6640     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 115400 401005 MYPU_6640 MYPU_TRNA_SER_2   tRNA-Ser FALSE 0.200 48.000 0.000 NA   NA
 401005 115401 MYPU_TRNA_SER_2 MYPU_6650 tRNA-Ser   FALSE 0.183 53.000 0.000 NA   NA
 115401 115402 MYPU_6650 MYPU_6660     FALSE 0.082 561.000 0.000 1.000 N NA
 115402 115403 MYPU_6660 MYPU_6670     TRUE 0.900 12.000 0.002 1.000 N NA
 115403 115404 MYPU_6670 MYPU_6680     TRUE 0.986 -84.000 0.019 1.000 N NA
 115405 115406 MYPU_6690 MYPU_6700     FALSE 0.065 143.000 0.000 NA   NA
 115406 1791085 MYPU_6700 MYPU_RRNA_23S     FALSE 0.043 290.000 0.000 NA   NA
 1791085 1791086 MYPU_RRNA_23S MYPU_RRNA_16S     FALSE 0.043 288.000 0.000 NA   NA
 1791086 115407 MYPU_RRNA_16S MYPU_6710     FALSE 0.041 370.000 0.000 NA   NA
 115407 115408 MYPU_6710 MYPU_6720     TRUE 0.381 39.000 0.000 1.000   NA
 115408 115409 MYPU_6720 MYPU_6730     TRUE 0.283 75.000 0.000 1.000   NA
 115409 115410 MYPU_6730 MYPU_6740     TRUE 0.997 -22.000 0.081 1.000   NA
 115410 401006 MYPU_6740 MYPU_TRNA_ARG_3   tRNA-Arg FALSE 0.154 73.000 0.000 NA   NA
 115411 115412 MYPU_6750 MYPU_6760     TRUE 0.543 49.000 0.000 0.069 N NA
 115412 115413 MYPU_6760 MYPU_6770     TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.012 Y NA
 115413 115414 MYPU_6770 MYPU_6780     TRUE 0.950 4.000 0.000 0.069 Y NA
 115417 115418 MYPU_6810 MYPU_6820     TRUE 0.999 -9.000 0.017 0.003   NA
 115418 115419 MYPU_6820 MYPU_6830     TRUE 0.410 33.000 0.000 1.000 N NA
 115419 115420 MYPU_6830 MYPU_6840     TRUE 0.996 0.000 0.012 1.000   NA
 115420 115421 MYPU_6840 MYPU_6850     TRUE 0.991 4.000 0.024 1.000   NA
 115421 115422 MYPU_6850 MYPU_6860     TRUE 0.955 22.000 0.130 1.000 Y NA
 115422 115423 MYPU_6860 MYPU_6870     TRUE 0.939 12.000 0.008 1.000 N NA
 115423 115424 MYPU_6870 MYPU_6880     TRUE 0.788 49.000 0.009 1.000 N NA
 115426 115427 MYPU_6900 MYPU_6910     FALSE 0.102 104.000 0.000 NA   NA
 115427 115428 MYPU_6910 MYPU_6920     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 115428 115429 MYPU_6920 MYPU_6930     FALSE 0.178 56.000 0.000 NA   NA
 115429 115430 MYPU_6930 MYPU_6940     FALSE 0.183 53.000 0.000 NA   NA
 115432 115433 MYPU_6960 MYPU_6970     FALSE 0.040 468.000 0.000 NA   NA
 115433 115434 MYPU_6970 MYPU_6980     FALSE 0.238 36.000 0.000 NA   NA
 115434 115435 MYPU_6980 MYPU_6990     FALSE 0.208 98.000 0.000 1.000 N NA
 115435 115436 MYPU_6990 MYPU_7000     TRUE 0.999 2.000 0.750 0.018 Y NA
 115436 115437 MYPU_7000 MYPU_7010     TRUE 0.317 22.000 0.000 NA   NA
 115439 115440 MYPU_7030 MYPU_7040     FALSE 0.075 129.000 0.000 NA   NA
 115441 115442 MYPU_7050 MYPU_7060     TRUE 0.994 3.000 0.052 NA   NA
 115442 115443 MYPU_7060 MYPU_7070     TRUE 0.939 0.000 0.000 NA   NA
 115444 115445 MYPU_7080 MYPU_7090     TRUE 0.942 3.000 0.000 1.000   NA
 115446 115447 MYPU_7100 MYPU_7110     TRUE 0.996 0.000 0.009 1.000 N NA
 115447 115448 MYPU_7110 MYPU_7120     TRUE 0.998 -10.000 0.064 1.000 N NA
 115448 115449 MYPU_7120 MYPU_7130     TRUE 0.998 -13.000 0.101 1.000 N NA
 115449 115450 MYPU_7130 MYPU_7140     FALSE 0.196 103.000 0.000 1.000 N NA
 115451 115452 MYPU_7150 MYPU_7160     TRUE 0.893 -22.000 0.000 NA   NA
 115453 115454 MYPU_7170 MYPU_7180     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 115454 115455 MYPU_7180 MYPU_7190     TRUE 0.952 13.000 0.005 0.053 N NA
 115455 115456 MYPU_7190 MYPU_7200     TRUE 0.999 -7.000 0.119 0.010 Y NA
 115456 115457 MYPU_7200 MYPU_7210     TRUE 0.992 -6.000 0.002 1.000 N NA
 115457 115458 MYPU_7210 MYPU_7220     TRUE 0.653 81.000 0.013 NA   NA
 115458 115459 MYPU_7220 MYPU_7230     TRUE 0.585 10.000 0.000 NA   NA
 115460 115461 MYPU_7240 MYPU_7250     TRUE 0.704 7.000 0.000 NA   NA
 115461 115462 MYPU_7250 MYPU_7260     FALSE 0.082 535.000 0.000 1.000 N NA
 115462 115463 MYPU_7260 MYPU_7270     FALSE 0.093 240.000 0.000 1.000 N NA
 115463 115464 MYPU_7270 MYPU_7280     TRUE 1.000 0.000 0.273 0.003 Y NA
 115465 115466 MYPU_7290 MYPU_7300     TRUE 0.919 -13.000 0.000 NA   NA
 115466 115467 MYPU_7300 MYPU_7310     FALSE 0.074 133.000 0.000 NA   NA
 115467 115468 MYPU_7310 MYPU_7320     FALSE 0.041 368.000 0.000 NA   NA
 115468 115469 MYPU_7320 MYPU_7330     FALSE 0.209 42.000 0.000 NA   NA
 115470 115471 MYPU_7340 MYPU_7350     FALSE 0.046 244.000 0.000 NA   NA
 115471 115472 MYPU_7350 MYPU_7360     FALSE 0.042 297.000 0.000 NA   NA
 115472 115473 MYPU_7360 MYPU_7370     TRUE 0.873 -27.000 0.000 NA   NA
 115473 115474 MYPU_7370 MYPU_7380     FALSE 0.169 64.000 0.000 NA   NA
 115474 115475 MYPU_7380 MYPU_7390     TRUE 0.305 62.000 0.000 1.000 N NA
 115476 115477 MYPU_7400 MYPU_7410     FALSE 0.094 237.000 0.000 1.000 N NA
 115477 115478 MYPU_7410 MYPU_7420     TRUE 0.984 -22.000 0.000 0.008 Y NA
 115480 115481 MYPU_7440 MYPU_7450     FALSE 0.205 45.000 0.000 NA   NA
 115481 115482 MYPU_7450 MYPU_7460     TRUE 0.998 0.000 0.014 0.052 Y NA
 115482 115483 MYPU_7460 MYPU_7470     TRUE 0.805 4.000 0.000 NA   NA
 115483 115484 MYPU_7470 MYPU_7480     FALSE 0.042 300.000 0.000 NA   NA
 115484 115485 MYPU_7480 MYPU_7490     FALSE 0.041 322.000 0.000 NA   NA
 115486 115487 MYPU_7500 MYPU_7510     TRUE 0.997 -13.000 0.025 1.000 Y NA
 115487 115488 MYPU_7510 MYPU_7520     TRUE 0.691 37.000 0.000 0.015   NA
 115490 115491 MYPU_7540 MYPU_7550     TRUE 0.276 27.000 0.000 NA   NA
 115491 115492 MYPU_7550 MYPU_7560     TRUE 0.815 -45.000 0.000 NA   NA
 115492 115493 MYPU_7560 MYPU_7570     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 115493 115494 MYPU_7570 MYPU_7580     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 115494 115495 MYPU_7580 MYPU_7590     FALSE 0.051 195.000 0.000 NA   NA
 115497 115498 MYPU_7610 MYPU_7620     TRUE 0.998 3.000 0.214 1.000 Y NA
 115498 115499 MYPU_7620 MYPU_7630     TRUE 0.777 185.000 0.028 0.027 Y NA
 115499 115500 MYPU_7630 MYPU_7640     TRUE 1.000 0.000 0.458 0.002 Y NA
 115502 115503 MYPU_7660 MYPU_7670     FALSE 0.188 52.000 0.000 NA   NA
 115503 115504 MYPU_7670 MYPU_7680     TRUE 0.767 23.000 0.005 NA   NA
 115504 115505 MYPU_7680 MYPU_7690     TRUE 0.988 -40.000 0.022 NA   NA
 115505 115506 MYPU_7690 MYPU_7700     TRUE 0.997 2.000 0.200 NA   NA
 115506 115507 MYPU_7700 MYPU_7710     TRUE 0.985 3.000 0.007 NA   NA
 115507 115508 MYPU_7710 MYPU_7720     FALSE 0.219 92.000 0.000 1.000 N NA
 115508 115509 MYPU_7720 MYPU_7730     FALSE 0.088 269.000 0.000 1.000 N NA
 115509 115510 MYPU_7730 MYPU_7740     TRUE 0.999 0.000 0.167 1.000   NA
 115510 115511 MYPU_7740 MYPU_7750     FALSE 0.134 144.000 0.000 1.000   NA
 115511 115512 MYPU_7750 MYPU_7760     TRUE 0.317 22.000 0.000 NA   NA
 115514 115515 MYPU_7780 MYPU_7790     FALSE 0.095 203.000 0.000 1.000 Y NA
 115515 115516 MYPU_7790 MYPU_7800     TRUE 0.672 160.000 0.051 1.000 N NA
 115516 115517 MYPU_7800 MYPU_7810     TRUE 0.995 4.000 0.025 0.072 N NA
 115517 115518 MYPU_7810 MYPU_7820     TRUE 0.841 24.000 0.006 1.000 N NA