MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma pneumoniae M129

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 13457 13458 MPN001 MPN002 dnaN xdj1 TRUE 0.974 4.000 0.038 1.000 N NA
 13458 13459 MPN002 MPN003 xdj1 gyrB FALSE 0.217 102.000 0.003 1.000 N NA
 13459 13460 MPN003 MPN004 gyrB gyrA TRUE 0.995 0.000 0.306 0.009 Y NA
 13460 13461 MPN004 MPN005 gyrA serS TRUE 0.809 -28.000 0.006 1.000 N NA
 13461 13462 MPN005 MPN006 serS   TRUE 0.923 5.000 0.002 1.000 N NA
 13462 13463 MPN006 MPN007   holB TRUE 0.925 -27.000 0.254 1.000 N NA
 13463 13464 MPN007 MPN008 holB thdF TRUE 0.968 2.000 0.008 1.000   NA
 13464 13465 MPN008 MPN009 thdF yabD TRUE 0.948 0.000 0.005 NA   NA
 13465 13466 MPN009 MPN010 yabD   FALSE 0.052 197.000 0.000 NA   NA
 13467 13468 MPN011 MPN012   D12_orf235 TRUE 0.510 25.000 0.000 NA   NA
 13469 13470 MPN013 MPN014   dnaE FALSE 0.146 102.000 0.000 NA   NA
 13471 13472 MPN015 MPN016   rimK TRUE 0.995 0.000 0.219 0.044 Y NA
 13472 13473 MPN016 MPN017 rimK mtd1 TRUE 0.934 -25.000 0.009 1.000 Y NA
 13473 400984 MPN017 MPNt01 mtd1 tRNA-Ala FALSE 0.177 85.000 0.000 NA   NA
 400984 400983 MPNt01 MPNt02 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.869 6.000 0.000 NA   NA
 13474 13475 MPN018 MPN019 pmd1 msbA TRUE 0.962 -88.000 0.500 0.007 Y NA
 13475 13476 MPN019 MPN020 msbA yb95 TRUE 0.957 10.000 0.400 1.000 N NA
 13476 13477 MPN020 MPN021 yb95 dnaJ TRUE 0.397 46.000 0.000 1.000 N NA
 13477 13478 MPN021 MPN022 dnaJ pip TRUE 0.796 -16.000 0.000 1.000   NA
 13478 13479 MPN022 MPN023 pip metS TRUE 0.954 0.000 0.003 0.094   NA
 13479 13480 MPN023 MPN024 metS rpoE TRUE 0.725 21.000 0.003 1.000 N NA
 13480 13481 MPN024 MPN025 rpoE tsr TRUE 0.980 0.000 0.060 1.000 N NA
 13481 13482 MPN025 MPN026 tsr yyaF TRUE 0.968 1.000 0.006 1.000 N NA
 13484 13485 MPN028 MPN029 trsB efp TRUE 0.590 21.000 0.002 NA N NA
 13485 13486 MPN029 MPN030 efp   TRUE 0.612 -82.000 0.002 1.000 N NA
 13486 13487 MPN030 MPN031     TRUE 0.988 0.000 0.667 NA   NA
 13488 13489 MPN032 MPN033   upp TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 13489 13490 MPN033 MPN034 upp polC TRUE 0.462 40.000 0.002 1.000 N NA
 13491 13492 MPN035 MPN036     FALSE 0.063 172.000 0.000 NA   NA
 13492 13493 MPN036 MPN037     FALSE 0.067 168.000 0.000 NA   NA
 13497 13498 MPN041 MPN042     FALSE 0.253 62.000 0.000 NA   NA
 13498 13499 MPN042 MPN043   glpF FALSE 0.031 324.000 0.000 NA   NA
 13501 13502 MPN045 MPN046 hisS aspS TRUE 0.964 -28.000 0.161 0.091 Y NA
 13502 13503 MPN046 MPN047 aspS   TRUE 0.733 -24.000 0.002 1.000 N NA
 13503 13504 MPN047 MPN048     FALSE 0.021 589.000 0.000 NA   NA
 13504 13505 MPN048 MPN049     FALSE 0.057 177.000 0.000 NA   NA
 13506 13507 MPN050 MPN051 glpK glpD TRUE 0.978 -9.000 0.643 1.000   NA
 13508 13509 MPN052 MPN053   ptsH TRUE 0.821 18.000 0.015 1.000   NA
 13509 13510 MPN053 MPN054 ptsH   FALSE 0.019 1539.000 0.000 NA   NA
 13510 13511 MPN054 MPN055   potA FALSE 0.019 1406.000 0.000 NA   NA
 13511 13512 MPN055 MPN056 potA potB TRUE 0.997 2.000 0.928 0.040 Y NA
 13512 13513 MPN056 MPN057 potB potI TRUE 0.993 -7.000 0.492 0.040 Y NA
 13513 13514 MPN057 MPN058 potI   TRUE 0.982 -15.000 0.253 0.080 Y NA
 13514 13515 MPN058 MPN059   gcp TRUE 0.945 0.000 0.000 1.000 N NA
 13515 13516 MPN059 MPN060 gcp metX TRUE 0.813 -16.000 0.000 1.000 N NA
 13518 13519 MPN062 MPN063 deoD deoC TRUE 0.995 4.000 0.600 1.000 Y NA
 13519 13520 MPN063 MPN064 deoC deoA TRUE 0.965 -13.000 0.013 1.000 Y NA
 13520 13521 MPN064 MPN065 deoA cdd TRUE 0.959 11.000 0.018 1.000 Y NA
 13521 13522 MPN065 MPN066 cdd cpsG TRUE 0.948 -10.000 0.032 1.000 N NA
 13523 13524 MPN067 MPN068 nusG SecE TRUE 0.976 8.000 0.843 1.000 N NA
 13524 13525 MPN068 MPN069 SecE rpmG2 TRUE 0.967 6.000 0.080 1.000 N NA
 13525 13526 MPN069 MPN070 rpmG2   TRUE 0.666 16.000 0.000 NA   NA
 13526 13527 MPN070 MPN071   yabC TRUE 0.797 -13.000 0.000 NA   NA
 13527 13528 MPN071 MPN072 yabC yabF TRUE 0.828 -18.000 0.004 1.000   NA
 13528 13529 MPN072 MPN073 yabF prs TRUE 0.902 -21.000 0.040 1.000 N NA
 13529 13530 MPN073 MPN074 prs   TRUE 0.590 -193.000 0.002 1.000 N NA
 13532 13533 MPN076 MPN077 uhpT   FALSE 0.049 206.000 0.000 NA   NA
 13533 400982 MPN077 MPNt03   tRNA-Ser FALSE 0.046 213.000 0.000 NA   NA
 13534 13535 MPN078 MPN079 fruA fruK TRUE 0.981 -7.000 0.015 1.000 Y NA
 13535 13536 MPN079 MPN080 fruK   FALSE 0.052 237.000 0.000 1.000   NA
 13536 13537 MPN080 MPN081   glnQ TRUE 0.939 0.000 0.000 1.000   NA
 13537 13538 MPN081 MPN082 glnQ tklB TRUE 0.685 21.000 0.000 1.000 N NA
 13538 13539 MPN082 MPN083 tklB   TRUE 0.936 10.000 0.118 1.000   NA
 13539 13540 MPN083 MPN084     TRUE 0.833 50.000 1.000 0.024   NA
 13540 13541 MPN084 MPN085     FALSE 0.131 107.000 0.000 NA   NA
 13541 13542 MPN085 MPN086     FALSE 0.036 262.000 0.000 NA   NA
 13542 13543 MPN086 MPN087     FALSE 0.063 172.000 0.000 NA   NA
 13543 13544 MPN087 MPN088     FALSE 0.019 1015.000 0.000 NA   NA
 13544 13545 MPN088 MPN089   hsdS FALSE 0.023 492.000 0.000 NA   NA
 13545 13546 MPN089 MPN090 hsdS   FALSE 0.079 155.000 0.000 NA   NA
 13546 13547 MPN090 MPN091     FALSE 0.192 77.000 0.000 NA   NA
 13547 13548 MPN091 MPN092     FALSE 0.032 318.000 0.000 NA   NA
 13548 13549 MPN092 MPN093     TRUE 0.536 -145.000 0.000 NA   NA
 13549 13550 MPN093 MPN094     FALSE 0.026 434.000 0.000 NA   NA
 13550 1791080 MPN094 MPNr01     FALSE 0.019 1603.000 0.000 NA   NA
 1791080 1791081 MPNr01 MPNr02     FALSE 0.043 233.000 0.000 NA   NA
 1791081 406448 MPNr02 MPNr03   rrf TRUE 0.386 38.000 0.000 NA   NA
 406448 13551 MPNr03 MPN095 rrf   FALSE 0.055 184.000 0.000 NA   NA
 13551 13552 MPN095 MPN096     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 13552 13553 MPN096 MPN097     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 13553 13554 MPN097 MPN098     FALSE 0.033 298.000 0.000 NA   NA
 13554 13555 MPN098 MPN099     FALSE 0.020 686.000 0.000 NA   NA
 13555 13556 MPN099 MPN100     FALSE 0.031 339.000 0.000 NA   NA
 13556 13557 MPN100 MPN101     FALSE 0.025 457.000 0.000 NA   NA
 13557 13558 MPN101 MPN102     FALSE 0.020 816.000 0.000 NA   NA
 13560 13561 MPN104 MPN105   pheS FALSE 0.025 834.000 0.000 1.000   NA
 13561 13562 MPN105 MPN106 pheS pheT TRUE 0.996 3.000 0.574 0.006 Y NA
 13562 13563 MPN106 MPN107 pheT   FALSE 0.138 113.000 0.000 NA N NA
 13563 13564 MPN107 MPN108     TRUE 0.981 2.000 0.000 NA Y NA
 13564 13565 MPN108 MPN109     FALSE 0.020 680.000 0.000 NA   NA
 13565 13566 MPN109 MPN110     TRUE 0.589 -76.000 0.000 NA   NA
 13566 13567 MPN110 MPN111     FALSE 0.023 504.000 0.000 NA   NA
 13567 13568 MPN111 MPN112     FALSE 0.020 860.000 0.000 NA   NA
 13568 13569 MPN112 MPN113     FALSE 0.022 549.000 0.000 NA   NA
 13569 13570 MPN113 MPN114   cpt2 TRUE 0.867 -10.000 0.000 1.000   NA
 13570 13571 MPN114 MPN115 cpt2 infC FALSE 0.202 90.000 0.000 1.000   NA
 13571 13572 MPN115 MPN116 infC rpmI TRUE 0.993 6.000 0.652 1.000 Y NA
 13572 13573 MPN116 MPN117 rpmI rpLT TRUE 0.988 11.000 0.928 0.079 Y NA
 13575 13576 MPN119 MPN120   grpE TRUE 0.858 23.000 0.125 0.019   NA
 13576 13577 MPN120 MPN121 grpE   TRUE 0.979 0.000 0.125 NA   NA
 13578 13579 MPN122 MPN123 parB parC TRUE 0.996 0.000 0.552 0.008 Y NA
 13581 13582 MPN125 MPN126 uvrC   TRUE 0.432 36.000 0.002 1.000   NA
 13582 13583 MPN126 MPN127     FALSE 0.027 392.000 0.000 NA   NA
 13583 13584 MPN127 MPN128     FALSE 0.019 1457.000 0.000 NA   NA
 13584 13585 MPN128 MPN129     FALSE 0.020 700.000 0.000 NA   NA
 13585 13586 MPN129 MPN130     FALSE 0.019 961.000 0.000 NA   NA
 13586 13587 MPN130 MPN131     FALSE 0.021 604.000 0.000 NA   NA
 13587 13588 MPN131 MPN132     FALSE 0.032 316.000 0.000 NA   NA
 13588 13589 MPN132 MPN133     FALSE 0.025 458.000 0.000 NA   NA
 13589 13590 MPN133 MPN134   ugpC TRUE 0.861 24.000 0.200 1.000 N NA
 13590 13591 MPN134 MPN135 ugpC ugpA TRUE 0.985 -7.000 0.611 0.037 N NA
 13591 13592 MPN135 MPN136 ugpA ugpE TRUE 0.968 -28.000 0.204 0.037 Y NA
 13593 13594 MPN137 MPN138     FALSE 0.039 249.000 0.000 NA   NA
 13594 13595 MPN138 MPN139     FALSE 0.042 237.000 0.000 NA   NA
 13596 13597 MPN140 MPN141 orf4 P1 TRUE 0.913 13.000 0.167 NA   NA
 13597 13598 MPN141 MPN142 P1 orf6 TRUE 0.983 6.000 1.000 NA   NA
 13598 13599 MPN142 MPN143 orf6   FALSE 0.120 117.000 0.000 NA   NA
 13599 13600 MPN143 MPN144     FALSE 0.021 574.000 0.000 NA   NA
 13600 13601 MPN144 MPN145     FALSE 0.030 352.000 0.000 NA   NA
 13601 13602 MPN145 MPN146     FALSE 0.032 318.000 0.000 NA   NA
 13602 13603 MPN146 MPN147     TRUE 0.829 7.000 0.000 NA   NA
 13603 13604 MPN147 MPN148     FALSE 0.022 543.000 0.000 NA   NA
 13604 13605 MPN148 MPN149     FALSE 0.021 553.000 0.000 NA   NA
 13605 13606 MPN149 MPN150     TRUE 0.531 -172.000 0.000 NA   NA
 13606 13607 MPN150 MPN151     FALSE 0.024 483.000 0.000 NA   NA
 13607 13608 MPN151 MPN152     FALSE 0.035 283.000 0.000 NA   NA
 13608 13609 MPN152 MPN153     FALSE 0.060 176.000 0.000 NA   NA
 13609 13610 MPN153 MPN154   nusA FALSE 0.178 77.000 0.002 NA N NA
 13610 13611 MPN154 MPN155 nusA infB FALSE 0.193 281.000 0.342 1.000 N NA
 13611 13612 MPN155 MPN156 infB rbfA TRUE 0.996 3.000 0.530 1.000 Y NA
 13612 13613 MPN156 MPN157 rbfA   TRUE 0.647 16.000 0.002 NA   NA
 13613 13614 MPN157 MPN158   yaaC TRUE 0.769 13.000 0.003 NA   NA
 13614 13615 MPN158 MPN159 yaaC hlyC TRUE 0.607 26.000 0.003 1.000   NA
 13615 13616 MPN159 MPN160 hlyC   TRUE 0.921 -13.000 0.043 NA   NA
 13616 13617 MPN160 MPN161     FALSE 0.198 154.000 0.033 NA   NA
 13617 13618 MPN161 MPN162     TRUE 0.262 122.000 0.033 NA   NA
 13618 13619 MPN162 MPN163     FALSE 0.040 247.000 0.000 NA   NA
 13619 13620 MPN163 MPN164   rpsJ FALSE 0.135 94.000 0.002 NA   NA
 13620 13621 MPN164 MPN165 rpsJ rplC TRUE 0.976 14.000 0.467 1.000 Y NA
 13621 13622 MPN165 MPN166 rplC rplD TRUE 0.996 0.000 0.544 0.075 Y NA
 13622 13623 MPN166 MPN167 rplD rplW TRUE 0.995 3.000 0.307 0.075 Y NA
 13623 13624 MPN167 MPN168 rplW rplB TRUE 0.997 0.000 0.849 0.069 Y NA
 13624 13625 MPN168 MPN169 rplB rpsS TRUE 0.997 0.000 0.820 1.000 Y NA
 13625 13626 MPN169 MPN170 rpsS rplV TRUE 0.970 -73.000 0.769 1.000 Y NA
 13626 13627 MPN170 MPN171 rplV rpsC TRUE 0.997 2.000 0.719 1.000 Y NA
 13627 13628 MPN171 MPN172 rpsC rplP TRUE 0.997 0.000 0.828 1.000 Y NA
 13628 13629 MPN172 MPN173 rplP rpmC TRUE 0.997 0.000 0.802 0.075 Y NA
 13629 13630 MPN173 MPN174 rpmC rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.828 0.075 Y NA
 13630 13631 MPN174 MPN175 rpsQ rplN TRUE 0.996 4.000 0.791 1.000 Y NA
 13631 13632 MPN175 MPN176 rplN rplX TRUE 0.996 0.000 0.810 1.000 Y NA
 13632 13633 MPN176 MPN177 rplX rplE TRUE 0.997 3.000 0.758 0.075 Y NA
 13633 13634 MPN177 MPN178 rplE rpsN TRUE 0.996 2.000 0.496 0.075 Y NA
 13634 13635 MPN178 MPN179 rpsN rpsH TRUE 0.994 -6.000 0.473 0.075 Y NA
 13635 13636 MPN179 MPN180 rpsH rplF TRUE 0.992 7.000 0.808 0.075 Y NA
 13636 13637 MPN180 MPN181 rplF rplR TRUE 0.997 1.000 0.815 0.075 Y NA
 13637 13638 MPN181 MPN182 rplR rpsE TRUE 0.996 4.000 0.814 1.000 Y NA
 13638 13639 MPN182 MPN183 rpsE rplO TRUE 0.992 4.000 0.148 1.000 Y NA
 13639 13640 MPN183 MPN184 rplO secY TRUE 0.948 0.000 0.003 1.000 N NA
 13640 13641 MPN184 MPN185 secY adk TRUE 0.951 -6.000 0.007 1.000 N NA
 13641 13642 MPN185 MPN186 adk map TRUE 0.979 0.000 0.041 1.000 N NA
 13642 13643 MPN186 MPN187 map infA TRUE 0.992 0.000 0.051 1.000 Y NA
 13643 13644 MPN187 MPN188 infA rpmJ TRUE 0.929 11.000 0.104 1.000   NA
 13644 13645 MPN188 MPN189 rpmJ rpsM TRUE 0.985 0.000 0.194 0.075   NA
 13645 13646 MPN189 MPN190 rpsM rpsK TRUE 0.997 0.000 0.810 0.075 Y NA
 13646 13647 MPN190 MPN191 rpsK rpoA TRUE 0.977 6.000 0.308 1.000 N NA
 13647 13648 MPN191 MPN192 rpoA rplQ TRUE 0.992 3.000 0.873 1.000 N NA
 13648 13649 MPN192 MPN193 rplQ CbiO TRUE 0.929 -16.000 0.074 1.000 N NA
 13649 13650 MPN193 MPN194 CbiO hisP TRUE 0.991 -12.000 0.713 0.004 Y NA
 13650 13651 MPN194 MPN195 hisP   TRUE 0.988 -7.000 0.095 1.000 Y NA
 13651 13652 MPN195 MPN196   tRNA-His TRUE 0.969 -7.000 0.076 1.000 N NA
 13652 13653 MPN196 MPN197 tRNA-His pepF TRUE 0.945 -7.000 0.009 1.000 N NA
 13653 13654 MPN197 MPN198 pepF mte1 TRUE 0.988 0.000 0.500 1.000   NA
 13654 13655 MPN198 MPN199 mte1   TRUE 0.522 94.000 0.500 NA   NA
 13655 13656 MPN199 MPN200     FALSE 0.034 284.000 0.000 NA   NA
 13656 13657 MPN200 MPN201     FALSE 0.024 474.000 0.000 NA   NA
 13657 13658 MPN201 MPN202     FALSE 0.024 480.000 0.000 NA   NA
 13658 13659 MPN202 MPN203     TRUE 0.575 -81.000 0.000 NA   NA
 13659 13660 MPN203 MPN204     FALSE 0.029 363.000 0.000 NA   NA
 13660 13661 MPN204 MPN205     FALSE 0.024 461.000 0.000 NA   NA
 13663 13664 MPN207 MPN208 ptsG rpsB FALSE 0.029 610.000 0.000 1.000 N NA
 13664 13665 MPN208 MPN209 rpsB mgtA TRUE 0.893 -7.000 0.002 1.000 N NA
 13665 13666 MPN209 MPN210 mgtA secA TRUE 0.923 -13.000 0.017 0.070 N NA
 13666 13667 MPN210 MPN211 secA uvrB TRUE 0.820 -25.000 0.004 0.006 N NA
 13667 13668 MPN211 MPN212 uvrB   TRUE 0.916 3.000 0.002 NA   NA
 13668 13669 MPN212 MPN213     TRUE 0.513 105.000 0.667 NA   NA
 13671 13672 MPN215 MPN216 oppB amiD TRUE 0.993 -7.000 0.500 0.035 Y NA
 13672 13673 MPN216 MPN217 amiD oppD TRUE 0.996 2.000 0.500 1.000 Y NA
 13673 13674 MPN217 MPN218 oppD oppF TRUE 0.943 -37.000 0.750 0.004   NA
 13674 13675 MPN218 MPN219 oppF rplK TRUE 0.280 56.000 0.002 1.000   NA
 13675 13676 MPN219 MPN220 rplK rplA TRUE 0.997 0.000 0.838 1.000 Y NA
 13676 13677 MPN220 MPN221 rplA pth TRUE 0.982 0.000 0.003 1.000 Y NA
 13677 13678 MPN221 MPN222 pth yacA TRUE 0.960 -7.000 0.025 1.000 N NA
 13678 13679 MPN222 MPN223 yacA   TRUE 0.947 1.000 0.002 1.000 N NA
 13679 13680 MPN223 MPN224   lgt TRUE 0.973 -10.000 0.494 1.000 N NA
 13680 13681 MPN224 MPN225 lgt rpsL TRUE 0.667 29.000 0.008 1.000 N NA
 13681 13682 MPN225 MPN226 rpsL rpsG TRUE 0.864 54.000 0.224 0.016 Y NA
 13682 13683 MPN226 MPN227 rpsG fus TRUE 0.959 23.000 0.579 1.000 Y NA
 13683 13684 MPN227 MPN228 fus rpsF TRUE 0.590 57.000 0.002 1.000 Y NA
 13684 13685 MPN228 MPN229 rpsF ssb TRUE 0.951 0.000 0.003 1.000 N NA
 13685 13686 MPN229 MPN230 ssb rpsR TRUE 0.895 -10.000 0.003 1.000 N NA
 13686 13687 MPN230 MPN231 rpsR rplI TRUE 0.996 3.000 0.499 0.074 Y NA
 13687 13688 MPN231 MPN232 rplI dnaB TRUE 0.838 -13.000 0.002 1.000 N NA
 13688 13689 MPN232 MPN233 dnaB   TRUE 0.985 4.000 0.667 NA   NA
 13689 13690 MPN233 MPN234     FALSE 0.020 728.000 0.000 NA   NA
 13690 13691 MPN234 MPN235   ung TRUE 0.510 25.000 0.000 NA   NA
 13691 13692 MPN235 MPN236 ung   FALSE 0.223 198.000 0.188 1.000 N NA
 13692 13693 MPN236 MPN237     TRUE 0.984 3.000 0.003 1.000 Y NA
 13693 13694 MPN237 MPN238   PET112 TRUE 0.990 -10.000 0.492 0.004 Y NA
 13694 13695 MPN238 MPN239 PET112   TRUE 0.728 -25.000 0.002 1.000   NA
 13695 13696 MPN239 MPN240   trxB TRUE 0.949 -7.000 0.017 1.000   NA
 13696 13697 MPN240 MPN241 trxB   TRUE 0.923 -10.000 0.018 NA   NA
 13697 13698 MPN241 MPN242     TRUE 0.422 33.000 0.000 NA   NA
 13698 13699 MPN242 MPN243   vacB TRUE 0.795 11.000 0.000 1.000   NA
 13699 13700 MPN243 MPN244 vacB   TRUE 0.950 0.000 0.005 NA   NA
 13702 13703 MPN246 MPN247 gmk ptc1 TRUE 0.987 0.000 0.333 1.000 N NA
 13703 13704 MPN247 MPN248 ptc1   TRUE 0.986 -9.000 0.093 1.000 Y NA
 13704 13705 MPN248 MPN249   yjeQ TRUE 0.922 -13.000 0.024 1.000   NA
 13705 13706 MPN249 MPN250 yjeQ pgiB TRUE 0.705 22.000 0.004 1.000   NA
 13706 13707 MPN250 MPN251 pgiB cfxE TRUE 0.935 -22.000 0.007 1.000 Y NA
 13707 13708 MPN251 MPN252 cfxE asnS TRUE 0.905 7.000 0.005 1.000 N NA
 13708 13709 MPN252 MPN253 asnS pgsA TRUE 0.789 -43.000 0.007 1.000 N NA
 13709 13710 MPN253 MPN254 pgsA   TRUE 0.585 22.000 0.002 NA   NA
 13710 13711 MPN254 MPN255     TRUE 0.896 26.000 1.000 NA   NA
 13711 13712 MPN255 MPN256     TRUE 0.985 -7.000 1.000 NA   NA
 13712 13713 MPN256 MPN257   galE TRUE 0.959 -19.000 1.000 NA   NA
 13713 13714 MPN257 MPN258 galE yjcW TRUE 0.832 15.000 0.012 1.000   NA
 13714 13715 MPN258 MPN259 yjcW   TRUE 0.922 17.000 0.438 1.000   NA
 13715 13716 MPN259 MPN260   rbsC TRUE 0.991 0.000 0.720 0.035   NA
 13716 13717 MPN260 MPN261 rbsC topA TRUE 0.454 37.000 0.002 1.000   NA
 13717 13718 MPN261 MPN262 topA A65_orf475 TRUE 0.837 -10.000 0.002 NA   NA
 13718 13719 MPN262 MPN263 A65_orf475 trx FALSE 0.230 66.000 0.000 NA   NA
 13719 13720 MPN263 MPN264 trx   TRUE 0.780 12.000 0.000 1.000   NA
 13722 13723 MPN266 MPN267 ygl1   TRUE 0.987 0.000 0.333 1.000 N NA
 13723 13724 MPN267 MPN268     TRUE 0.995 0.000 0.261 1.000 Y NA
 13724 13725 MPN268 MPN269   ysr1 TRUE 0.955 -10.000 0.087 1.000   NA
 13725 13726 MPN269 MPN270 ysr1   TRUE 0.926 3.000 0.000 NA   NA
 13726 13727 MPN270 MPN271     FALSE 0.036 262.000 0.000 NA   NA
 13727 13728 MPN271 MPN272     FALSE 0.019 1706.000 0.000 NA   NA
 13729 13730 MPN273 MPN274 hit1 A65_orf266 TRUE 0.777 -31.000 0.011 NA   NA
 13733 13734 MPN277 MPN278 lysS yefE TRUE 0.727 -40.000 0.003 1.000 N NA
 13734 13735 MPN278 MPN279 yefE lepA TRUE 0.979 0.000 0.002 1.000 Y NA
 13735 13736 MPN279 MPN280 lepA   FALSE 0.111 131.000 0.002 1.000   NA
 13736 13737 MPN280 MPN281     FALSE 0.047 211.000 0.000 NA   NA
 13737 13738 MPN281 MPN282     FALSE 0.029 355.000 0.000 NA   NA
 13738 13739 MPN282 MPN283     FALSE 0.019 1211.000 0.000 NA   NA
 13739 13740 MPN283 MPN284     FALSE 0.019 944.000 0.000 NA   NA
 13740 13741 MPN284 MPN285   prrB FALSE 0.025 459.000 0.000 NA   NA
 13741 13742 MPN285 MPN286 prrB   FALSE 0.140 103.000 0.000 NA   NA
 13742 13743 MPN286 MPN287     FALSE 0.020 731.000 0.000 NA   NA
 13743 13744 MPN287 MPN288     FALSE 0.021 596.000 0.000 NA   NA
 13744 13745 MPN288 MPN289   hsdS1B FALSE 0.202 90.000 0.000 1.000   NA
 13745 13746 MPN289 MPN290 hsdS1B   FALSE 0.135 139.000 0.000 0.034   NA
 13747 13748 MPN291 MPN292   yceC TRUE 0.866 -16.000 0.006 1.000 N NA
 13748 13749 MPN292 MPN293 yceC lsp TRUE 0.973 0.000 0.018 1.000 N NA
 13750 13751 MPN294 MPN295     TRUE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 13751 13752 MPN295 MPN296   rpsU TRUE 0.988 0.000 0.667 NA   NA
 13752 13753 MPN296 MPN297 rpsU   TRUE 0.903 25.000 1.000 NA   NA
 13753 13754 MPN297 MPN298     TRUE 0.940 3.000 0.003 NA   NA
 13754 13755 MPN298 MPN299   plsB TRUE 0.974 -12.000 0.020 1.000 Y NA
 13755 13756 MPN299 MPN300 plsB dyr TRUE 0.976 1.000 0.019 1.000   NA
 13756 13757 MPN300 MPN301 dyr ypuH TRUE 0.950 -16.000 0.570 NA   NA
 13757 13758 MPN301 MPN302 ypuH pfk TRUE 0.698 20.000 0.003 NA N NA
 13758 13759 MPN302 MPN303 pfk pyk TRUE 0.985 6.000 0.027 0.013 Y NA
 13759 400948 MPN303 MPNt05 pyk tRNA-Cys TRUE 0.367 40.000 0.000 NA   NA
 400948 400949 MPNt05 MPNt06 tRNA-Cys tRNA-Pro TRUE 0.296 52.000 0.000 NA   NA
 400949 400950 MPNt06 MPNt07 tRNA-Pro tRNA-Met TRUE 0.893 5.000 0.000 NA   NA
 400950 400951 MPNt07 MPNt08 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.753 11.000 0.000 NA   NA
 400951 400952 MPNt08 MPNt09 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.355 41.000 0.000 NA   NA
 400952 400953 MPNt09 MPNt10 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.721 13.000 0.000 NA   NA
 400953 400954 MPNt10 MPNt11 tRNA-Met tRNA-Asp TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 400954 400955 MPNt11 MPNt12 tRNA-Asp tRNA-Phe TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 400955 13760 MPNt12 MPN304 tRNA-Phe arcA FALSE 0.052 197.000 0.000 NA   NA
 13760 13761 MPN304 MPN305 arcA arcA TRUE 0.651 -99.000 0.000 0.005   NA
 13761 13762 MPN305 MPN306 arcA argI FALSE 0.189 248.000 0.286 1.000   NA
 13762 13763 MPN306 MPN307 argI arcC TRUE 0.995 3.000 0.312 1.000 Y NA
 13763 13764 MPN307 MPN308 arcC   TRUE 0.994 3.000 0.188 1.000 Y NA
 13764 13765 MPN308 MPN309   P65 FALSE 0.125 134.000 0.000 1.000   NA
 13765 13766 MPN309 MPN310 P65   TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 13766 13767 MPN310 MPN311     TRUE 0.684 15.000 0.000 NA   NA
 13767 13768 MPN311 MPN312     TRUE 0.837 -10.000 0.000 NA   NA
 400956 13770 MPNt13 MPN314 tRNA-Arg yabB FALSE 0.037 255.000 0.000 NA   NA
 13770 13771 MPN314 MPN315 yabB yabC TRUE 0.971 -10.000 0.635 NA   NA
 13771 13772 MPN315 MPN316 yabC   TRUE 0.919 3.000 0.002 NA   NA
 13772 13773 MPN316 MPN317   ftsZ TRUE 0.983 6.000 1.000 NA   NA
 13773 13774 MPN317 MPN318 ftsZ   TRUE 0.855 43.000 1.000 1.000 N NA
 13774 13775 MPN318 MPN319   gap1 TRUE 0.985 -25.000 1.000 0.007 Y NA
 13775 13776 MPN319 MPN320 gap1 thyA FALSE 0.032 495.000 0.000 1.000 N NA
 13776 13777 MPN320 MPN321 thyA dhfr TRUE 0.989 2.000 0.295 1.000 N NA
 13777 13778 MPN321 MPN322 dhfr nrdF TRUE 0.908 7.000 0.005 1.000 N NA
 13778 13779 MPN322 MPN323 nrdF   TRUE 0.996 3.000 0.643 0.005 Y NA
 13779 13780 MPN323 MPN324   nrdE TRUE 0.971 24.000 1.000 0.005 Y NA
 13780 13781 MPN324 MPN325 nrdE rplU FALSE 0.112 147.000 0.002 1.000 N NA
 13781 13782 MPN325 MPN326 rplU ysxB TRUE 0.989 -7.000 0.208 NA Y NA
 13782 13783 MPN326 MPN327 ysxB rpmA TRUE 0.989 -7.000 0.203 NA Y NA
 13783 13784 MPN327 MPN328 rpmA nfo TRUE 0.920 -7.000 0.003 1.000 N NA
 13784 13785 MPN328 MPN329 nfo   TRUE 0.791 -46.000 0.008 1.000 N NA
 13785 13786 MPN329 MPN330     TRUE 0.962 -10.000 0.300 NA   NA
 13786 13787 MPN330 MPN331   tig TRUE 0.588 25.000 0.004 NA   NA
 13787 13788 MPN331 MPN332 tig lon TRUE 0.662 71.000 0.014 1.000 Y NA
 13788 13789 MPN332 MPN333 lon F10_orf750 FALSE 0.054 195.000 0.000 NA   NA
 13789 13790 MPN333 MPN334 F10_orf750 bcrA TRUE 0.926 3.000 0.000 NA   NA
 13790 13791 MPN334 MPN335 bcrA   TRUE 0.797 -13.000 0.000 NA   NA
 13793 13794 MPN337 MPN338     TRUE 0.988 3.000 0.600 NA   NA
 13794 13795 MPN338 MPN339     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 13795 13796 MPN339 MPN340   pcrA TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 13796 13797 MPN340 MPN341 pcrA mutB1 TRUE 0.614 63.000 0.000 0.004 Y NA
 13797 13798 MPN341 MPN342 mutB1 hsdM FALSE 0.142 141.000 0.000 0.071 N NA
 13798 13799 MPN342 MPN343 hsdM   FALSE 0.218 379.000 0.028 0.071 Y NA
 13799 13800 MPN343 MPN344     FALSE 0.044 223.000 0.000 NA   NA
 13800 13801 MPN344 MPN345   hsdR FALSE 0.019 945.000 0.000 NA   NA
 13801 13802 MPN345 MPN346 hsdR   FALSE 0.109 130.000 0.000 NA   NA
 13802 13803 MPN346 MPN347   hsdR FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 13803 13804 MPN347 MPN348 hsdR   FALSE 0.024 955.000 0.000 1.000   NA
 13804 13805 MPN348 MPN349     TRUE 0.953 -10.000 0.077 1.000   NA
 13806 13807 MPN350 MPN351 ygiH   TRUE 0.934 6.000 0.008 1.000   NA
 13807 13808 MPN351 MPN352   sigA TRUE 0.919 -16.000 0.053 1.000   NA
 13808 13809 MPN352 MPN353 sigA dnaE TRUE 0.613 53.000 0.045 1.000 N NA
 13809 13810 MPN353 MPN354 dnaE grs1 TRUE 0.849 -16.000 0.004 1.000 N NA
 13810 13811 MPN354 MPN355 grs1 yacO TRUE 0.844 22.000 0.002 1.000 Y NA
 13811 13812 MPN355 MPN356 yacO cysS TRUE 0.993 3.000 0.088 1.000 Y NA
 13812 13813 MPN356 MPN357 cysS lig TRUE 0.760 -19.000 0.002 1.000 N NA
 13813 400980 MPN357 MPNt14 lig tRNA-Gly FALSE 0.239 64.000 0.000 NA   NA
 13814 400957 MPN358 MPNt15   tRNA-Arg TRUE 0.935 1.000 0.000 NA   NA
 400957 400958 MPNt15 MPNt16 tRNA-Arg tRNA-Trp FALSE 0.206 74.000 0.000 NA   NA
 400958 13815 MPNt16 MPN359 tRNA-Trp   TRUE 0.799 8.000 0.000 NA   NA
 13815 13816 MPN359 MPN360   rpmE TRUE 0.386 45.000 0.004 NA   NA
 13816 13817 MPN360 MPN361 rpmE prfA TRUE 0.994 1.000 0.110 1.000 Y NA
 13817 13818 MPN361 MPN362 prfA   TRUE 0.979 0.000 0.002 1.000 Y NA
 13818 13819 MPN362 MPN363     TRUE 0.507 132.000 1.000 NA   NA
 13819 13820 MPN363 MPN364     TRUE 0.376 39.000 0.000 NA   NA
 13820 13821 MPN364 MPN365     FALSE 0.030 344.000 0.000 NA   NA
 13821 13822 MPN365 MPN366     FALSE 0.180 84.000 0.000 NA   NA
 13822 13823 MPN366 MPN367     TRUE 0.599 -69.000 0.000 NA   NA
 13823 13824 MPN367 MPN368     FALSE 0.020 689.000 0.000 NA   NA
 13829 13830 MPN373 MPN374     FALSE 0.019 1029.000 0.000 NA   NA
 13830 13831 MPN374 MPN375     FALSE 0.030 346.000 0.000 NA   NA
 13831 13832 MPN375 MPN376     FALSE 0.028 379.000 0.000 NA   NA
 13832 400979 MPN376 MPNt17   tRNA-Arg FALSE 0.036 265.000 0.000 NA   NA
 13833 13834 MPN377 MPN378   dnaE TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 13834 13835 MPN378 MPN379 dnaE polA TRUE 0.992 4.000 0.119 0.014 Y NA
 13835 13836 MPN379 MPN380 polA fpg TRUE 0.988 0.000 0.010 1.000 Y NA
 13836 13837 MPN380 MPN381 fpg yidA FALSE 0.122 146.000 0.003 1.000   NA
 13837 13838 MPN381 MPN382 yidA   TRUE 0.899 -6.000 0.002 1.000   NA
 13839 13840 MPN383 MPN384 yidA leuS TRUE 0.930 3.000 0.002 1.000   NA
 13840 13841 MPN384 MPN385 leuS   TRUE 0.921 1.000 0.002 NA   NA
 13841 13842 MPN385 MPN386   yaaF TRUE 0.804 35.000 0.500 NA   NA
 13842 407665 MPN386 MPNs01 yaaF ffs TRUE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 407665 13843 MPNs01 MPN387 ffs   TRUE 0.510 25.000 0.000 NA   NA
 13843 13844 MPN387 MPN388     TRUE 0.879 -7.000 0.000 NA   NA
 13844 13845 MPN388 MPN389   lplA FALSE 0.038 251.000 0.000 NA   NA
 13845 13846 MPN389 MPN390 lplA pdhD TRUE 0.836 27.000 0.200 1.000 N NA
 13846 13847 MPN390 MPN391 pdhD pdhC TRUE 0.995 1.000 0.214 1.000 Y NA
 13847 1791082 MPN391 MPNs02 pdhC   TRUE 0.312 47.000 0.000 NA   NA
 1791082 13848 MPNs02 MPN392   pdhB FALSE 0.253 62.000 0.000 NA   NA
 13848 13849 MPN392 MPN393 pdhB pdhA TRUE 0.962 22.000 0.458 0.003 Y NA
 13849 13850 MPN393 MPN394 pdhA nox TRUE 0.814 21.000 0.020 1.000   NA
 13850 13851 MPN394 MPN395 nox apt TRUE 0.276 68.000 0.002 1.000   NA
 13851 13852 MPN395 MPN396 apt F11_orf887 TRUE 0.481 35.000 0.004 NA   NA
 13854 13855 MPN398 MPN399     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 13855 13856 MPN399 MPN400     FALSE 0.253 62.000 0.000 NA   NA
 13856 400978 MPN400 MPNt18   tRNA-Gly FALSE 0.034 288.000 0.000 NA   NA
 400978 400977 MPNt18 MPNt19 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.829 7.000 0.000 NA   NA
 400977 400976 MPNt19 MPNt20 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.935 1.000 0.000 NA   NA
 400976 400975 MPNt20 MPNt21 tRNA-Lys tRNA-Gln TRUE 0.335 44.000 0.000 NA   NA
 400975 400974 MPNt21 MPNt22 tRNA-Gln tRNA-Tyr TRUE 0.869 6.000 0.000 NA   NA
 400974 13857 MPNt22 MPN401 tRNA-Tyr greA TRUE 0.449 30.000 0.000 NA   NA
 13858 13859 MPN402 MPN403 proS   FALSE 0.089 145.000 0.000 NA   NA
 13859 13860 MPN403 MPN404     TRUE 0.947 -19.000 0.667 NA   NA
 13860 13861 MPN404 MPN405     TRUE 0.978 7.000 1.000 NA   NA
 13861 13862 MPN405 MPN406     TRUE 0.574 35.000 0.013 NA   NA
 13862 400959 MPN406 MPNt23   tRNA-SeC TRUE 0.855 -9.000 0.000 NA   NA
 13864 13865 MPN408 MPN409     FALSE 0.211 73.000 0.000 NA   NA
 13865 13866 MPN409 MPN410     FALSE 0.029 363.000 0.000 NA   NA
 13868 13869 MPN412 MPN413     FALSE 0.192 77.000 0.000 NA   NA
 13869 13870 MPN413 MPN414     FALSE 0.129 110.000 0.000 NA   NA
 13870 13871 MPN414 MPN415   P37 FALSE 0.038 251.000 0.000 NA   NA
 13871 13872 MPN415 MPN416 P37 P29 TRUE 0.974 -7.000 0.200 1.000   NA
 13872 13873 MPN416 MPN417 P29 P69 TRUE 0.991 -7.000 0.231 1.000 Y NA
 13874 13875 MPN419 MPN418   alaS TRUE 0.978 0.000 0.032 1.000 N NA
 13875 13876 MPN418 MPN420 alaS glpQ TRUE 0.362 52.000 0.002 1.000 N NA
 13876 13877 MPN420 MPN421 glpQ   TRUE 0.982 -7.000 0.778 NA   NA
 13877 13878 MPN421 MPN422     FALSE 0.126 131.000 0.003 NA   NA
 13878 13879 MPN422 MPN423     TRUE 0.946 1.000 0.003 NA   NA
 13879 13880 MPN423 MPN424   ylxM TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 13880 13881 MPN424 MPN425 ylxM ftsY TRUE 0.914 -19.000 0.081 1.000   NA
 13881 13882 MPN425 MPN426 ftsY   TRUE 0.971 6.000 0.165 1.000 N NA
 13884 13885 MPN428 MPN429 pta pgk TRUE 0.421 38.000 0.002 1.000 N NA
 13885 13886 MPN429 MPN430 pgk gap TRUE 0.986 3.000 0.004 0.012 Y NA
 13886 13887 MPN430 MPN431 gap   TRUE 0.808 31.000 0.200 1.000 N NA
 13887 13888 MPN431 MPN432   artP TRUE 0.993 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 13888 13889 MPN432 MPN433 artP cbiO TRUE 0.973 -105.000 1.000 0.023 Y NA
 13889 13890 MPN433 MPN434 cbiO dnaK FALSE 0.086 158.000 0.002 1.000 N NA
 13890 13891 MPN434 MPN435 dnaK   TRUE 0.298 56.000 0.003 NA   NA
 13891 13892 MPN435 MPN436     TRUE 0.945 10.000 0.333 NA   NA
 13892 13893 MPN436 MPN437     FALSE 0.033 309.000 0.000 NA   NA
 13893 13894 MPN437 MPN438     FALSE 0.045 218.000 0.000 NA   NA
 13894 13895 MPN438 MPN439     TRUE 0.274 56.000 0.000 NA   NA
 13895 13896 MPN439 MPN440     FALSE 0.077 156.000 0.000 NA   NA
 13898 13899 MPN442 MPN443   deaD TRUE 0.886 -15.000 0.018 NA   NA
 13899 13900 MPN443 MPN444 deaD   TRUE 0.917 7.000 0.018 NA   NA
 13902 13903 MPN446 MPN447 rpsD hmw1 TRUE 0.494 23.000 0.002 NA   NA
 13903 13904 MPN447 MPN448 hmw1   TRUE 0.621 64.000 0.400 NA   NA
 13904 13905 MPN448 MPN449   orf8 TRUE 0.693 51.000 0.400 NA   NA
 13905 13906 MPN449 MPN450 orf8 orf7 TRUE 0.720 12.000 0.002 NA   NA
 13906 13907 MPN450 MPN451 orf7 come3 TRUE 0.827 -121.000 0.163 NA   NA
 13907 13908 MPN451 MPN452 come3 hmw3 TRUE 0.363 40.000 0.002 NA   NA
 13908 13909 MPN452 MPN453 hmw3   TRUE 0.941 14.000 0.667 NA   NA
 13909 13910 MPN453 MPN454     TRUE 0.932 21.000 1.000 NA   NA
 13910 13911 MPN454 MPN455   ctaD TRUE 0.648 89.000 1.000 NA   NA
 400960 400961 MPNt24 MPNt25 tRNA-Ser tRNA-Ser TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 13913 13914 MPN457 MPN458     TRUE 0.612 -58.000 0.000 NA   NA
 13914 13915 MPN458 MPN459     TRUE 0.582 -79.000 0.000 NA   NA
 13915 400973 MPN459 MPNt27   tRNA-Leu FALSE 0.071 160.000 0.000 NA   NA
 400973 400972 MPNt27 MPNt28 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.893 5.000 0.000 NA   NA
 400972 400971 MPNt28 MPNt29 tRNA-Lys tRNA-Thr TRUE 0.721 13.000 0.000 NA   NA
 400971 400970 MPNt29 MPNt30 tRNA-Thr tRNA-Val TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 400970 400969 MPNt30 MPNt31 tRNA-Val tRNA-Thr TRUE 0.799 8.000 0.000 NA   NA
 400969 400968 MPNt31 MPNt32 tRNA-Thr tRNA-Glu TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 400968 400967 MPNt32 MPNt33 tRNA-Glu tRNA-Asn TRUE 0.782 9.000 0.000 NA   NA
 400967 13916 MPNt33 MPN460 tRNA-Asn ktrB TRUE 0.469 28.000 0.000 NA   NA
 13917 13918 MPN461 MPN462 ktrA   FALSE 0.082 152.000 0.000 NA   NA
 13918 13919 MPN462 MPN463     FALSE 0.200 75.000 0.000 NA   NA
 13919 13920 MPN463 MPN464     FALSE 0.033 294.000 0.000 NA   NA
 13921 13922 MPN465 MPN466     TRUE 0.335 44.000 0.000 NA   NA
 13922 13923 MPN466 MPN467     TRUE 0.449 30.000 0.000 NA   NA
 13925 13926 MPN469 MPN470   pepX TRUE 0.440 41.000 0.005 NA   NA
 13926 13927 MPN470 MPN471 pepX rpmG TRUE 0.970 0.000 0.014 1.000 N NA
 13927 13928 MPN471 MPN472 rpmG degV TRUE 0.641 19.000 0.002 NA   NA
 13928 13929 MPN472 MPN473 degV lip2 TRUE 0.978 6.000 0.667 NA   NA
 13929 13930 MPN473 MPN474 lip2   TRUE 0.833 -13.000 0.000 1.000   NA
 13930 13931 MPN474 MPN475     FALSE 0.037 357.000 0.000 1.000   NA
 13931 13932 MPN475 MPN476   cmk TRUE 0.982 2.000 0.060 1.000   NA
 13932 13933 MPN476 MPN477 cmk   TRUE 0.491 27.000 0.002 NA   NA
 13933 13934 MPN477 MPN478     TRUE 0.928 3.000 0.002 NA   NA
 13934 13935 MPN478 MPN479     TRUE 0.911 4.000 0.002 NA   NA
 13935 13936 MPN479 MPN480   valS TRUE 0.548 28.000 0.002 1.000 N NA
 13936 13937 MPN480 MPN481 valS yihA TRUE 0.876 -16.000 0.013 1.000   NA
 13937 13938 MPN481 MPN482 yihA   TRUE 0.868 8.000 0.007 NA   NA
 13940 13941 MPN484 MPN485     FALSE 0.027 417.000 0.000 NA   NA
 13942 13943 MPN486 MPN487   nifS FALSE 0.050 204.000 0.000 NA   NA
 13943 13944 MPN487 MPN488 nifS   TRUE 0.981 3.000 0.053 1.000 N NA
 13945 13946 MPN489 MPN490   recA FALSE 0.023 516.000 0.000 NA   NA
 13948 13949 MPN492 MPN493 yjfW yjfV TRUE 0.971 -64.000 0.750 1.000 Y NA
 13949 13950 MPN493 MPN494 yjfV yjfU TRUE 0.994 2.000 0.066 1.000 Y NA
 13950 13951 MPN494 MPN495 yjfU   TRUE 0.996 2.000 0.279 0.011 Y NA
 13951 13952 MPN495 MPN496   yjfS TRUE 0.989 3.000 0.431 0.015   NA
 13952 13953 MPN496 MPN497 yjfS   FALSE 0.034 428.000 0.000 1.000   NA
 13954 13955 MPN498 MPN499 araD   TRUE 0.888 -46.000 0.286 NA   NA
 13955 13956 MPN499 MPN500     FALSE 0.084 148.000 0.000 NA   NA
 13956 13957 MPN500 MPN501     FALSE 0.028 366.000 0.000 NA   NA
 13957 13958 MPN501 MPN502     FALSE 0.025 445.000 0.000 NA   NA
 13958 13959 MPN502 MPN503     FALSE 0.021 555.000 0.000 NA   NA
 13959 13960 MPN503 MPN504     FALSE 0.021 570.000 0.000 NA   NA
 13962 13963 MPN506 MPN507     FALSE 0.142 120.000 0.000 1.000   NA
 13964 13965 MPN508 MPN509     FALSE 0.022 547.000 0.000 NA   NA
 13965 13966 MPN509 MPN510     FALSE 0.019 1030.000 0.000 NA   NA
 13966 13967 MPN510 MPN511     FALSE 0.020 612.000 0.000 NA   NA
 13967 13968 MPN511 MPN512     TRUE 0.433 31.000 0.000 NA   NA
 13968 13969 MPN512 MPN513     FALSE 0.020 778.000 0.000 NA   NA
 13969 13970 MPN513 MPN514     FALSE 0.022 517.000 0.000 NA   NA
 13970 13971 MPN514 MPN515   rpoC FALSE 0.069 162.000 0.000 NA   NA
 13971 13972 MPN515 MPN516 rpoC rpoB TRUE 0.996 4.000 0.851 0.004 Y NA
 13972 13973 MPN516 MPN517 rpoB   FALSE 0.173 93.000 0.002 1.000   NA
 13973 13974 MPN517 MPN518     FALSE 0.019 1093.000 0.000 NA   NA
 13974 13975 MPN518 MPN519   lip3 TRUE 0.991 3.000 1.000 NA   NA
 13975 13976 MPN519 MPN520 lip3 ileS FALSE 0.170 118.000 0.003 1.000 N NA
 13977 13978 MPN521 MPN522 ygl3   TRUE 0.924 -9.000 0.007 1.000   NA
 13978 400963 MPN522 MPNt34   tRNA-His TRUE 0.449 30.000 0.000 NA   NA
 13979 400966 MPN523 MPNt35   tRNA-Leu TRUE 0.684 15.000 0.000 NA   NA
 400966 13980 MPNt35 MPN524 tRNA-Leu   FALSE 0.023 490.000 0.000 NA   NA
 13981 13982 MPN525 MPN526     TRUE 0.845 -19.000 0.016 NA   NA
 13982 400964 MPN526 MPNt36   tRNA-Leu TRUE 0.262 60.000 0.000 NA   NA
 13984 13985 MPN528 MPN528a ppa   TRUE 0.905 9.000 0.014 0.060   NA
 13988 13989 MPN531 MPN532 clpB licA FALSE 0.175 176.000 0.051 NA N NA
 13989 13990 MPN532 MPN533 licA ackA TRUE 0.923 8.000 0.032 NA N NA
 13991 13992 MPN534 MPN535   ruvA TRUE 0.869 6.000 0.000 NA   NA
 13992 13993 MPN535 MPN536 ruvA ruvB TRUE 0.978 -25.000 0.549 0.004 Y NA
 13995 13996 MPN538 MPN539 rplJ rplL TRUE 0.945 38.000 0.884 0.056 Y NA
 13996 13997 MPN539 MPN540 rplL rpmF TRUE 0.961 7.000 0.003 0.076 Y NA
 13999 14000 MPN542 MPN543   fmt TRUE 0.925 5.000 0.005 NA   NA
 14000 14001 MPN543 MPN544 fmt   TRUE 0.910 0.000 0.002 NA   NA
 14002 14003 MPN545 MPN546 rnc plsX TRUE 0.947 -10.000 0.029 1.000 N NA
 14003 14004 MPN546 MPN547 plsX   TRUE 0.973 0.000 0.021 1.000   NA
 14004 14005 MPN547 MPN548     TRUE 0.436 55.000 0.006 1.000   NA
 14005 14006 MPN548 MPN549     TRUE 0.932 -13.000 0.039 1.000   NA
 14006 14007 MPN549 MPN550     TRUE 0.945 -7.000 0.014 1.000   NA
 14007 14008 MPN550 MPN551     TRUE 0.897 -13.000 0.011 1.000   NA
 14008 14009 MPN551 MPN552     TRUE 0.949 7.000 0.133 NA   NA
 14009 14010 MPN552 MPN553   thrSv TRUE 0.931 -7.000 0.012 NA   NA
 14010 14011 MPN553 MPN554 thrSv   TRUE 0.964 0.000 0.018 NA   NA
 14011 14012 MPN554 MPN555     TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 14012 14013 MPN555 MPN556   argS TRUE 0.402 43.000 0.000 1.000   NA
 14014 14015 MPN557 MPN558 gidA gidB TRUE 0.980 -7.000 0.466 1.000 N NA
 14015 14016 MPN558 MPN559 gidB   TRUE 0.610 -46.000 0.002 NA   NA
 400965 14017 MPNt37 MPN560 tRNA-Arg arcA TRUE 0.935 2.000 0.000 NA   NA
 14019 14020 MPN562 MPN563 outB obg TRUE 0.889 -7.000 0.002 1.000   NA
 14020 14021 MPN563 MPN564 obg adh FALSE 0.063 204.000 0.000 1.000   NA
 14021 14022 MPN564 MPN565 adh   FALSE 0.045 214.000 0.000 NA   NA
 14022 14023 MPN565 MPN566   glpQ TRUE 0.291 170.000 0.500 NA   NA
 14023 14024 MPN566 MPN567 glpQ P200 TRUE 0.908 4.000 0.000 NA   NA
 14024 14025 MPN567 MPN568 P200 spg FALSE 0.153 100.000 0.000 NA   NA
 14025 14026 MPN568 MPN569 spg   TRUE 0.805 -12.000 0.002 NA   NA
 14026 14027 MPN569 MPN570     FALSE 0.104 122.000 0.002 NA   NA
 14027 14028 MPN570 MPN571   lcnDR3 TRUE 0.980 2.000 0.077 NA   NA
 14028 14029 MPN571 MPN572 lcnDR3   TRUE 0.432 104.000 0.077 0.016 N NA
 14029 14030 MPN572 MPN573   groEL TRUE 0.907 14.000 0.062 1.000 N NA
 14030 14031 MPN573 MPN574 groEL groES TRUE 0.994 3.000 0.094 0.013 Y NA
 14031 14032 MPN574 MPN575 groES   FALSE 0.055 188.000 0.000 NA   NA
 14032 14033 MPN575 MPN576   glyA FALSE 0.026 435.000 0.000 NA   NA
 14033 14034 MPN576 MPN577 glyA   FALSE 0.086 162.000 0.000 1.000   NA
 14036 14037 MPN579 MPN580     FALSE 0.091 142.000 0.000 NA   NA
 14037 14038 MPN580 MPN581     TRUE 0.265 68.000 0.000 1.000   NA
 14038 14039 MPN581 MPN582     FALSE 0.085 176.000 0.000 0.027   NA
 14039 14040 MPN582 MPN583     FALSE 0.026 438.000 0.000 NA   NA
 14040 14041 MPN583 MPN584     FALSE 0.023 504.000 0.000 NA   NA
 14041 14042 MPN584 MPN585     FALSE 0.253 62.000 0.000 NA   NA
 14042 14043 MPN585 MPN586     FALSE 0.206 74.000 0.000 NA   NA
 14043 14044 MPN586 MPN587     TRUE 0.541 -124.000 0.000 NA   NA
 14044 14045 MPN587 MPN588     TRUE 0.265 58.000 0.000 NA   NA
 14045 14046 MPN588 MPN589     FALSE 0.066 213.000 0.000 0.016   NA
 14046 14047 MPN589 MPN590     FALSE 0.131 141.000 0.000 0.027   NA
 14047 14048 MPN590 MPN591     FALSE 0.094 157.000 0.000 1.000   NA
 14048 14049 MPN591 MPN592     FALSE 0.032 523.000 0.000 0.016   NA
 14049 14050 MPN592 MPN593     FALSE 0.150 101.000 0.000 NA   NA
 14050 14051 MPN593 MPN594     FALSE 0.043 226.000 0.000 NA   NA
 14051 14052 MPN594 MPN595   lacA TRUE 0.568 -82.000 0.000 NA   NA
 14052 14053 MPN595 MPN596 lacA   TRUE 0.971 0.000 0.031 NA   NA
 14053 14054 MPN596 MPN597   atpC TRUE 0.918 0.000 0.002 NA   NA
 14054 14055 MPN597 MPN598 atpC atpD TRUE 0.997 3.000 0.837 0.011 Y NA
 14055 14056 MPN598 MPN599 atpD atpG TRUE 0.997 0.000 0.724 0.011 Y NA
 14056 14057 MPN599 MPN600 atpG atpA TRUE 0.997 0.000 0.846 0.011 Y NA
 14057 14058 MPN600 MPN601 atpA atpH TRUE 0.997 3.000 0.864 0.011 Y NA
 14058 14059 MPN601 MPN602 atpH atpF TRUE 0.986 -7.000 0.022 0.011 Y NA
 14059 14060 MPN602 MPN603 atpF atpE TRUE 0.996 3.000 0.500 0.011 Y NA
 14060 14061 MPN603 MPN604 atpE atpB TRUE 0.994 3.000 0.085 0.011 Y NA
 14061 14062 MPN604 MPN605 atpB   TRUE 0.728 -34.000 0.005 NA   NA
 14062 14063 MPN605 MPN606   eno TRUE 0.894 6.000 0.003 NA   NA
 14065 14066 MPN608 MPN609 phoU pstB TRUE 0.992 3.000 0.097 NA Y NA
 14066 14067 MPN609 MPN610 pstB pstA TRUE 0.982 -15.000 0.226 0.004 Y NA
 14067 14068 MPN610 MPN611 pstA   TRUE 0.995 0.000 0.467 1.000 Y NA
 14068 14069 MPN611 MPN612     FALSE 0.041 242.000 0.000 NA   NA
 14069 14070 MPN612 MPN613     TRUE 0.554 115.000 1.000 NA   NA
 14070 14071 MPN613 MPN614     TRUE 0.605 -64.000 0.000 NA   NA
 14071 14072 MPN614 MPN615   hsdS FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 14072 14073 MPN615 MPN616 hsdS rpsI FALSE 0.037 430.000 0.000 1.000 N NA
 14073 14074 MPN616 MPN617 rpsI rplM TRUE 0.993 6.000 0.601 0.054 Y NA
 14074 14075 MPN617 MPN618 rplM dnaX TRUE 0.480 31.000 0.002 1.000 N NA
 14075 14076 MPN618 MPN619 dnaX uvrA TRUE 0.935 9.000 0.002 1.000 Y NA
 14076 14077 MPN619 MPN620 uvrA   TRUE 0.733 -22.000 0.003 NA   NA
 14077 14078 MPN620 MPN621     TRUE 0.760 46.000 0.667 NA   NA
 14078 14079 MPN621 MPN622   rpsO TRUE 0.877 5.000 0.002 NA   NA
 14080 14081 MPN623 MPN624 deaD rpmB TRUE 0.916 22.000 0.018 1.000 Y NA
 14081 14082 MPN624 MPN625 rpmB   TRUE 0.632 44.000 0.027 1.000 N NA
 14082 14083 MPN625 MPN626     TRUE 0.345 135.000 0.167 1.000   NA
 14084 14085 MPN627 MPN628 ptsI pgm TRUE 0.978 5.000 0.003 0.058 Y NA
 14085 14086 MPN628 MPN629 pgm tim TRUE 0.989 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 14086 14087 MPN629 MPN630 tim yfiB TRUE 0.405 53.000 0.007 NA   NA
 14088 14089 MPN631 MPN632 tsf pyrH TRUE 0.990 2.000 0.416 1.000 N NA
 14089 14090 MPN632 MPN633 pyrH   FALSE 0.140 103.000 0.000 NA   NA
 14090 14091 MPN633 MPN634     FALSE 0.184 82.000 0.000 NA   NA
 14091 14092 MPN634 MPN635     FALSE 0.021 556.000 0.000 NA   NA
 14092 14093 MPN635 MPN636   frr FALSE 0.192 77.000 0.000 NA   NA
 14093 14094 MPN636 MPN637 frr cdsA TRUE 0.975 0.000 0.020 1.000 N NA
 14094 14095 MPN637 MPN638 cdsA   TRUE 0.720 20.000 0.003 1.000 N NA
 14096 14097 MPN639 MPN640     TRUE 0.799 8.000 0.000 NA   NA
 14097 14098 MPN640 MPN641     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 14098 14099 MPN641 MPN642     TRUE 0.991 3.000 1.000 NA   NA
 14099 14100 MPN642 MPN643     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 14100 14101 MPN643 MPN644     TRUE 0.926 -79.000 1.000 NA   NA
 14101 14102 MPN644 MPN645     TRUE 0.926 3.000 0.000 NA   NA
 14102 14103 MPN645 MPN646     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 14103 14104 MPN646 MPN647     TRUE 0.916 23.000 1.000 NA   NA
 14104 14105 MPN647 MPN648     FALSE 0.126 111.000 0.000 NA   NA
 14105 14106 MPN648 MPN649     FALSE 0.019 887.000 0.000 NA   NA
 14106 14107 MPN649 MPN650     TRUE 0.774 -15.000 0.000 NA   NA
 14108 14109 MPN651 MPN652 mtlA mtlD TRUE 0.972 -13.000 0.025 1.000 Y NA
 14109 14110 MPN652 MPN653 mtlD mtlF TRUE 0.955 -19.000 0.019 1.000 Y NA
 14113 14114 MPN656 MPN657     TRUE 0.735 -31.000 0.005 NA   NA
 14114 14115 MPN657 MPN658   rplS TRUE 0.639 16.000 0.002 NA   NA
 14115 14116 MPN658 MPN659 rplS trmD TRUE 0.983 -16.000 0.567 1.000 Y NA
 14116 14117 MPN659 MPN660 trmD rpsP TRUE 0.742 66.000 0.033 1.000 Y NA
 14117 14118 MPN660 MPN661 rpsP K05_orf499 TRUE 0.307 64.000 0.000 1.000 N NA
 14118 14119 MPN661 MPN662 K05_orf499 pilB TRUE 0.988 1.000 0.222 1.000 N NA
 14119 14120 MPN662 MPN663 pilB   TRUE 0.696 -36.000 0.000 1.000   NA
 14120 14121 MPN663 MPN664   degV TRUE 0.968 7.000 0.571 NA   NA
 14121 14122 MPN664 MPN665 degV tuf FALSE 0.085 159.000 0.003 NA   NA
 14123 14124 MPN666 MPN667   gtaB TRUE 0.935 -12.000 0.062 NA   NA
 14127 14128 MPN670 MPN671   ftsH FALSE 0.021 553.000 0.000 NA   NA
 14128 14129 MPN671 MPN672 ftsH hpt FALSE 0.243 181.000 0.192 1.000 N NA
 14129 14130 MPN672 MPN673 hpt   TRUE 0.963 0.000 0.006 1.000 N NA
 14134 14135 MPN677 MPN678   gltX TRUE 0.893 -19.000 0.028 1.000   NA
 14135 14136 MPN678 MPN679 gltX ksgA TRUE 0.936 -13.000 0.002 1.000 Y NA
 14136 14137 MPN679 MPN680 ksgA   TRUE 0.937 -7.000 0.005 1.000 N NA
 14137 14138 MPN680 MPN681   rnpA TRUE 0.894 -19.000 0.021 1.000 N NA
 14138 14139 MPN681 MPN682 rnpA rpmH TRUE 0.980 -10.000 0.787 0.003   NA
 14139 14140 MPN682 MPN683 rpmH devA TRUE 0.604 23.000 0.002 1.000   NA
 14140 14141 MPN683 MPN684 devA   TRUE 0.986 2.000 0.167 1.000   NA
 14141 14142 MPN684 MPN685   cysA TRUE 0.970 6.000 0.167 1.000   NA
 14142 14143 MPN685 MPN686 cysA dnaA TRUE 0.278 68.000 0.002 1.000 N NA
 14143 14144 MPN686 MPN687 dnaA   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 14144 14145 MPN687 MPN688   soj TRUE 0.797 -13.000 0.000 NA   NA