MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria innocua Clip11262

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 159079 159080 lin0001 lin0002 dnaA dnaN FALSE 0.327 194.000 0.328 1.000 Y NA
 159080 159081 lin0002 lin0003 dnaN   FALSE 0.112 109.000 0.009 1.000 N NA
 159081 159082 lin0003 lin0004     FALSE 0.076 180.000 0.024 1.000   NA
 159082 159083 lin0004 lin0005   RecF TRUE 0.949 7.000 0.209 1.000   NA
 159083 159084 lin0005 lin0006 RecF gyrB TRUE 0.904 49.000 0.249 0.005 Y NA
 159084 159085 lin0006 lin0007 gyrB gyrA TRUE 0.818 95.000 0.306 0.002 Y NA
 159085 159086 lin0007 lin0008 gyrA   FALSE 0.074 135.000 0.010 1.000 N NA
 159086 159087 lin0008 lin0009     TRUE 0.903 16.000 0.075 0.067 N NA
 159087 159088 lin0009 lin0010     FALSE 0.069 142.000 0.018 1.000 N NA
 159088 159089 lin0010 lin0011     TRUE 0.995 -91.000 0.281 0.005 Y NA
 159089 159090 lin0011 lin0012     TRUE 0.995 -22.000 0.312 0.006 Y NA
 159090 159091 lin0012 lin0013   qoxA FALSE 0.007 344.000 0.000 1.000 N NA
 159091 159092 lin0013 lin0014 qoxA qoxB TRUE 0.988 18.000 0.489 0.003 Y NA
 159092 159093 lin0014 lin0015 qoxB qoxC TRUE 0.996 -12.000 0.957 0.030 Y NA
 159093 159094 lin0015 lin0016 qoxC qoxD TRUE 0.994 2.000 0.959 1.000 Y NA
 159094 159095 lin0016 lin0017 qoxD   FALSE 0.056 169.000 0.082 1.000 N NA
 159097 159098 lin0019 lin0020     TRUE 0.914 16.000 0.213 0.090 N NA
 159098 159099 lin0020 lin0021     TRUE 0.995 0.000 0.417 0.035 Y NA
 159099 159100 lin0021 lin0022     TRUE 0.972 23.000 0.733 0.035 Y NA
 159100 159101 lin0022 lin0023     TRUE 0.996 -25.000 0.733 0.035 Y NA
 159101 159102 lin0023 lin0024     TRUE 0.719 28.000 0.400 1.000   NA
 159102 159103 lin0024 lin0025     TRUE 0.451 55.000 0.100 1.000   NA
 159103 159104 lin0025 lin0026     FALSE 0.018 205.000 0.000 1.000 N NA
 159104 159105 lin0026 lin0027     FALSE 0.203 82.000 0.125 NA N NA
 159105 159106 lin0027 lin0028     FALSE 0.030 233.000 0.000 NA   NA
 159107 159108 lin0029 lin0030     TRUE 0.906 17.000 0.286 1.000   NA
 159109 159110 lin0031 lin0032     TRUE 0.971 -3.000 0.529 1.000   NA
 159110 159111 lin0032 lin0033     TRUE 0.959 13.000 0.800 1.000   NA
 159111 159112 lin0033 lin0034     TRUE 0.967 1.000 0.450 1.000   NA
 159112 159113 lin0034 lin0035     FALSE 0.041 203.000 0.000 NA   NA
 159113 159114 lin0035 lin0036     FALSE 0.326 79.000 0.090 NA   NA
 159114 159115 lin0036 lin0037   rpsF FALSE 0.010 280.000 0.000 1.000 N NA
 159115 159116 lin0037 lin0038 rpsF ssb FALSE 0.241 56.000 0.012 1.000 N NA
 159116 159117 lin0038 lin0039 ssb rpsR FALSE 0.294 44.000 0.012 1.000 N NA
 159117 159118 lin0039 lin0040 rpsR   FALSE 0.096 156.000 0.012 1.000   NA
 159118 159119 lin0040 lin0041     FALSE 0.026 256.000 0.000 1.000   NA
 159119 159120 lin0041 lin0042     TRUE 0.960 -16.000 0.300 NA   NA
 159120 159121 lin0042 lin0043     FALSE 0.324 96.000 0.312 NA   NA
 159121 159122 lin0043 lin0044     TRUE 0.980 19.000 0.875 1.000 Y NA
 159122 159123 lin0044 lin0045     TRUE 0.414 167.000 0.344 1.000 Y NA
 159123 159124 lin0045 lin0046   rplI TRUE 0.882 3.000 0.011 1.000 N NA
 159124 159125 lin0046 lin0047 rplI dnaC TRUE 0.535 25.000 0.064 1.000 N NA
 159125 159126 lin0047 lin0048 dnaC purA FALSE 0.017 259.000 0.018 1.000 N NA
 159126 159127 lin0048 lin0049 purA   FALSE 0.016 326.000 0.000 1.000   NA
 159127 159128 lin0049 lin0050     FALSE 0.154 149.000 0.265 NA   NA
 159128 159129 lin0050 lin0051     TRUE 0.958 -10.000 0.204 NA   NA
 159129 159130 lin0051 lin0052     TRUE 0.893 18.000 0.289 NA   NA
 159130 159131 lin0052 lin0053     TRUE 0.870 22.000 0.833 NA   NA
 159131 159132 lin0053 lin0054     TRUE 0.949 14.000 0.623 NA   NA
 159132 159133 lin0054 lin0055     TRUE 0.822 20.000 0.057 NA   NA
 159133 159134 lin0055 lin0056     TRUE 0.965 -7.000 0.357 NA   NA
 159134 159135 lin0056 lin0057     TRUE 0.972 -3.000 0.643 NA   NA
 159135 159136 lin0057 lin0058     TRUE 0.966 1.000 0.444 NA   NA
 159136 159137 lin0058 lin0059     TRUE 0.948 14.000 0.600 NA   NA
 159137 159138 lin0059 lin0060     TRUE 0.939 15.000 0.500 NA   NA
 159138 159139 lin0060 lin0061     FALSE 0.009 641.000 0.000 NA   NA
 159139 159140 lin0061 lin0062     FALSE 0.064 169.000 0.000 NA   NA
 159140 1789923 lin0062 lin0063     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 1789923 159141 lin0063 lin0064     TRUE 0.890 13.000 0.000 NA   NA
 159141 159142 lin0064 lin0065     FALSE 0.219 138.000 0.500 NA   NA
 159142 159143 lin0065 lin0066     FALSE 0.025 258.000 0.000 NA   NA
 159143 159144 lin0066 lin0067     FALSE 0.011 428.000 0.000 NA   NA
 159144 159145 lin0067 lin0068     TRUE 0.942 -3.000 0.312 1.000 N NA
 159147 398352 lin0070 lint01   tRNA-Lys FALSE 0.211 86.000 0.000 NA   NA
 159148 159149 lin0071 lin0072     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 159149 159150 lin0072 lin0073     FALSE 0.013 379.000 0.000 NA   NA
 159153 159154 lin0076 lin0077     TRUE 0.899 12.000 0.000 NA   NA
 159154 159155 lin0077 lin0078     TRUE 0.971 -3.000 0.600 NA   NA
 159157 159158 lin0080 lin0081     FALSE 0.244 119.000 0.000 0.073   NA
 159158 159159 lin0081 lin0082     TRUE 0.950 7.000 0.000 0.073   NA
 159159 159160 lin0082 lin0083     TRUE 0.851 16.000 0.000 NA   NA
 159160 159161 lin0083 lin0084     FALSE 0.030 233.000 0.000 NA   NA
 159161 159162 lin0084 lin0085     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.073 Y NA
 159162 159163 lin0085 lin0086     TRUE 0.943 21.000 0.000 NA Y NA
 159163 159164 lin0086 lin0087     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159164 159165 lin0087 lin0088     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 159165 159166 lin0088 lin0089     TRUE 0.973 -3.000 0.667 NA   NA
 159166 159167 lin0089 lin0090     TRUE 0.962 -3.000 0.250 NA   NA
 159167 159168 lin0090 lin0091     FALSE 0.131 127.000 0.000 NA   NA
 159168 159169 lin0091 lin0092     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159169 159170 lin0092 lin0093     TRUE 0.971 -3.000 0.600 NA   NA
 159170 159171 lin0093 lin0094     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159171 159172 lin0094 lin0095     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 159172 159173 lin0095 lin0096     TRUE 0.961 -3.000 0.222 NA   NA
 159173 159174 lin0096 lin0097     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159174 159175 lin0097 lin0098     TRUE 0.885 19.000 0.333 NA   NA
 159175 159176 lin0098 lin0099     TRUE 0.959 -55.000 0.333 NA   NA
 159176 159177 lin0099 lin0100     TRUE 0.961 4.000 0.400 NA   NA
 159177 159178 lin0100 lin0101     FALSE 0.197 141.000 0.400 NA   NA
 159178 159179 lin0101 lin0102     FALSE 0.038 210.000 0.000 NA   NA
 159179 159180 lin0102 lin0103     FALSE 0.317 59.000 0.000 NA   NA
 159180 159181 lin0103 lin0104     TRUE 0.458 58.000 0.200 NA   NA
 159181 159182 lin0104 lin0105     TRUE 0.979 -31.000 0.154 0.002   NA
 159182 159183 lin0105 lin0106     TRUE 0.932 13.000 0.154 NA   NA
 159183 159184 lin0106 lin0107     TRUE 0.950 1.000 0.067 NA   NA
 159184 159185 lin0107 lin0108     TRUE 0.535 79.000 0.133 0.005   NA
 159185 159186 lin0108 lin0109     TRUE 0.608 24.000 0.000 NA   NA
 159186 159187 lin0109 lin0110     TRUE 0.961 0.000 0.250 NA   NA
 159187 159188 lin0110 lin0111     TRUE 0.957 2.000 0.214 NA   NA
 159188 159189 lin0111 lin0112     TRUE 0.965 0.000 0.357 NA   NA
 159189 159190 lin0112 lin0113     TRUE 0.961 0.000 0.250 NA   NA
 159190 159191 lin0113 lin0114     TRUE 0.964 0.000 0.312 NA   NA
 159191 159192 lin0114 lin0115     TRUE 0.958 3.000 0.286 NA   NA
 159192 1789924 lin0115 lin0116     TRUE 0.926 -10.000 0.000 NA   NA
 1789924 159193 lin0116 lin0117     TRUE 0.344 53.000 0.000 NA   NA
 159193 159194 lin0117 lin0118     TRUE 0.963 6.000 0.600 NA   NA
 159194 159195 lin0118 lin0119     TRUE 0.959 11.000 0.600 NA   NA
 159195 159196 lin0119 lin0120     TRUE 0.973 -3.000 0.667 NA   NA
 159196 159197 lin0120 lin0121     TRUE 0.976 0.000 1.000 NA   NA
 159197 159198 lin0121 lin0122     TRUE 0.963 1.000 0.333 NA   NA
 159198 159199 lin0122 lin0123     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159199 159200 lin0123 lin0124     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159200 159201 lin0124 lin0125     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 159201 159202 lin0125 lin0126     TRUE 0.652 37.000 0.500 NA   NA
 159202 159203 lin0126 lin0127     TRUE 0.945 13.000 0.364 NA   NA
 159203 159204 lin0127 lin0128     TRUE 0.954 0.000 0.103 NA   NA
 159204 159205 lin0128 lin0129     TRUE 0.680 25.000 0.069 NA   NA
 159205 159206 lin0129 lin0130     FALSE 0.008 1025.000 0.000 NA   NA
 159206 159207 lin0130 lin0131     FALSE 0.012 411.000 0.000 NA   NA
 159207 159208 lin0131 lin0132     TRUE 0.366 114.000 1.000 NA   NA
 159208 159209 lin0132 lin0133     TRUE 0.975 -3.000 0.818 NA   NA
 159209 159210 lin0133 lin0134     TRUE 0.426 57.000 0.079 NA   NA
 159210 159211 lin0134 lin0135     TRUE 0.968 12.000 0.088 0.008   NA
 159211 159212 lin0135 lin0136     TRUE 0.975 -3.000 0.009 0.008   NA
 159212 159213 lin0136 lin0137     TRUE 0.997 -3.000 0.846 0.008 Y NA
 159213 159214 lin0137 lin0138     TRUE 0.994 1.000 0.009 0.008 Y NA
 159214 159215 lin0138 lin0139     TRUE 0.992 13.000 0.143 0.008 Y NA
 159215 159216 lin0139 lin0140     TRUE 0.957 -3.000 0.143 NA   NA
 159216 159217 lin0140 lin0141     FALSE 0.157 144.000 0.200 NA   NA
 159217 159218 lin0141 lin0142     FALSE 0.169 162.000 0.667 NA   NA
 159218 159219 lin0142 lin0143     FALSE 0.019 297.000 0.000 NA   NA
 159219 159220 lin0143 lin0144     TRUE 0.970 24.000 0.943 0.034 Y NA
 159220 159221 lin0144 lin0145     TRUE 0.978 22.000 0.812 0.034 Y NA
 159221 159222 lin0145 lin0146     FALSE 0.274 127.000 0.583 NA   NA
 159222 159223 lin0146 lin0147     FALSE 0.163 135.000 0.081 NA   NA
 159224 159225 lin0148 lin0149     FALSE 0.276 107.000 0.235 NA   NA
 159226 159227 lin0150 lin0151     TRUE 0.958 14.000 0.115 0.028   NA
 159227 159228 lin0151 lin0152     FALSE 0.341 95.000 0.385 NA   NA
 159228 159229 lin0152 lin0153     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 159230 159231 lin0154 lin0155     FALSE 0.050 190.000 0.000 NA   NA
 159231 159232 lin0155 lin0156     TRUE 0.997 -7.000 0.941 0.010 Y NA
 159233 159234 lin0157 lin0158     FALSE 0.038 150.000 0.000 NA N NA
 159235 159236 lin0159 lin0160     FALSE 0.060 174.000 0.000 NA   NA
 159236 159237 lin0160 lin0161     TRUE 0.957 6.000 0.364 NA   NA
 159238 159239 lin0162 lin0163 lmaD lmaC TRUE 0.965 12.000 0.917 NA   NA
 159239 159240 lin0163 lin0164 lmaC lmaB FALSE 0.021 280.000 0.000 NA   NA
 159240 159241 lin0164 lin0165 lmaB lmaA TRUE 0.927 13.000 0.093 NA   NA
 159241 159242 lin0165 lin0166 lmaA   TRUE 0.488 48.000 0.134 NA   NA
 159242 159243 lin0166 lin0167     TRUE 0.373 111.000 0.929 NA   NA
 159243 159244 lin0167 lin0168     TRUE 0.969 -13.000 0.625 NA   NA
 159244 159245 lin0168 lin0169     TRUE 0.972 -3.000 0.625 NA   NA
 159245 159246 lin0169 lin0170     TRUE 0.968 10.000 1.000 NA   NA
 159246 159247 lin0170 lin0171     TRUE 0.973 -10.000 0.833 NA   NA
 159247 159248 lin0171 lin0172     TRUE 0.952 15.000 0.900 NA   NA
 159248 159249 lin0172 lin0173     TRUE 0.949 15.000 0.800 NA   NA
 159249 159250 lin0173 lin0174     TRUE 0.974 -3.000 0.727 NA   NA
 159250 159251 lin0174 lin0175     TRUE 0.908 19.000 0.667 NA   NA
 159251 159252 lin0175 lin0176     TRUE 0.971 -19.000 0.750 NA   NA
 159256 159257 lin0180 lin0181     TRUE 0.939 12.000 0.168 NA   NA
 159257 159258 lin0181 lin0182     FALSE 0.016 326.000 0.000 1.000   NA
 159258 159259 lin0182 lin0183     TRUE 0.801 102.000 0.688 0.040 Y NA
 159259 159260 lin0183 lin0184     TRUE 0.994 11.000 0.786 0.062 Y NA
 159260 159261 lin0184 lin0185     FALSE 0.073 202.000 0.214 NA   NA
 159261 159262 lin0185 lin0186     TRUE 0.974 1.000 0.833 NA   NA
 159262 159263 lin0186 lin0187     TRUE 0.960 -3.000 0.200 NA   NA
 159263 159264 lin0187 lin0188     TRUE 0.608 24.000 0.000 NA   NA
 159264 159265 lin0188 lin0189     TRUE 0.732 21.000 0.000 NA   NA
 159267 159268 lin0191 lin0192     TRUE 0.985 14.000 0.212 1.000 Y NA
 159268 159269 lin0192 lin0193     TRUE 0.993 -51.000 0.673 1.000 Y NA
 159271 159272 lin0195 lin0196     TRUE 0.491 45.000 0.066 1.000   NA
 159272 159273 lin0196 lin0197     FALSE 0.055 237.000 0.000 0.064   NA
 159273 159274 lin0197 lin0198     TRUE 0.884 17.000 0.101 NA   NA
 159274 159275 lin0198 lin0199     TRUE 0.911 16.000 0.200 NA   NA
 159275 159276 lin0199 lin0200     TRUE 0.783 22.000 0.600 1.000 N NA
 159276 159277 lin0200 lin0201     TRUE 0.982 15.000 0.167 NA Y NA
 159277 159278 lin0201 lin0202     FALSE 0.038 211.000 0.000 NA   NA
 159278 159279 lin0202 lin0203     FALSE 0.254 188.000 0.818 0.002   NA
 159281 159282 lin0205 lin0206     TRUE 0.957 6.000 0.372 NA   NA
 159282 159283 lin0206 lin0207     TRUE 0.942 11.000 0.183 NA   NA
 159283 159284 lin0207 lin0208     TRUE 0.455 58.000 0.193 NA   NA
 159284 159285 lin0208 lin0209     TRUE 0.957 -16.000 0.209 1.000   NA
 159285 159286 lin0209 lin0210     TRUE 0.952 -3.000 0.041 1.000   NA
 159288 159289 lin0212 lin0213     TRUE 0.463 69.000 0.474 NA   NA
 159291 159292 lin0215 lin0216   metS FALSE 0.192 72.000 0.016 1.000 N NA
 159292 159293 lin0216 lin0217 metS   FALSE 0.047 164.000 0.014 1.000 N NA
 159293 159294 lin0217 lin0218     TRUE 0.889 35.000 0.257 1.000 Y NA
 159294 159295 lin0218 lin0219     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.062 Y NA
 159295 159296 lin0219 lin0220     TRUE 0.930 28.000 0.053 0.062 Y NA
 159296 159297 lin0220 lin0221     TRUE 0.722 83.000 0.237 1.000 Y NA
 159297 159298 lin0221 lin0222     TRUE 0.995 3.000 0.444 0.010 Y NA
 159298 159299 lin0222 lin0223     TRUE 0.994 4.000 0.237 0.029 Y NA
 159299 159300 lin0223 lin0224     FALSE 0.124 100.000 0.015 NA N NA
 159300 159301 lin0224 lin0225     FALSE 0.023 292.000 0.007 NA   NA
 159301 159302 lin0225 lin0226     FALSE 0.232 102.000 0.024 1.000   NA
 159302 159303 lin0226 lin0227   ksgA TRUE 0.888 -7.000 0.003 1.000 N NA
 159303 159304 lin0227 lin0228 ksgA   FALSE 0.190 120.000 0.035 NA   NA
 159304 159305 lin0228 lin0229     FALSE 0.143 139.000 0.046 NA   NA
 159305 159306 lin0229 lin0230     TRUE 0.742 22.000 0.005 1.000   NA
 159306 159307 lin0230 lin0231     FALSE 0.094 164.000 0.029 1.000   NA
 159307 159308 lin0231 lin0232     FALSE 0.088 173.000 0.058 NA   NA
 159308 159309 lin0232 lin0233     TRUE 0.495 49.000 0.182 NA   NA
 159309 159310 lin0233 lin0234     TRUE 0.992 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 159310 159311 lin0234 lin0235     FALSE 0.004 687.000 0.000 1.000 N NA
 159311 159312 lin0235 lin0236     TRUE 0.765 119.000 0.250 0.001 Y NA
 159312 159313 lin0236 lin0237   gcaD FALSE 0.081 389.000 0.014 1.000 Y NA
 159313 159314 lin0237 lin0238 gcaD prs FALSE 0.310 51.000 0.069 1.000 N NA
 159314 159315 lin0238 lin0239 prs   FALSE 0.014 361.000 0.000 NA   NA
 159316 159317 lin0240 lin0241     FALSE 0.280 67.000 0.000 NA   NA
 159317 159318 lin0241 lin0242   ldh FALSE 0.321 77.000 0.051 NA   NA
 159319 159320 lin0243 lin0244 ctc   FALSE 0.247 91.000 0.013 1.000   NA
 159320 159321 lin0244 lin0245   pth FALSE 0.208 107.000 0.011 1.000   NA
 159321 159322 lin0245 lin0246 pth mfd FALSE 0.128 124.000 0.137 1.000 N NA
 159322 159323 lin0246 lin0247 mfd   TRUE 0.584 31.000 0.033 1.000   NA
 159323 159324 lin0247 lin0248     TRUE 0.722 23.000 0.034 1.000   NA
 159324 159325 lin0248 lin0249     FALSE 0.025 226.000 0.053 1.000 N NA
 159325 159326 lin0249 lin0250     FALSE 0.077 151.000 0.134 1.000 N NA
 159326 159327 lin0250 lin0251     FALSE 0.123 111.000 0.031 1.000 N NA
 159327 159328 lin0251 lin0252   ftsH FALSE 0.012 348.000 0.051 1.000 N NA
 159328 159329 lin0252 lin0253 ftsH   FALSE 0.114 116.000 0.029 1.000 N NA
 159329 159330 lin0253 lin0254     TRUE 0.822 16.000 0.060 1.000 N NA
 159330 159331 lin0254 lin0255   cysK FALSE 0.123 117.000 0.053 1.000 N NA
 159331 159332 lin0255 lin0256 cysK sul FALSE 0.004 898.000 0.000 1.000 N NA
 159332 159333 lin0256 lin0257 sul folA TRUE 0.984 14.000 0.176 1.000 Y NA
 159333 159334 lin0257 lin0258 folA folK TRUE 0.991 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 159334 159335 lin0258 lin0259 folK   FALSE 0.190 76.000 0.025 1.000 N NA
 159335 159336 lin0259 lin0260   lysS TRUE 0.576 115.000 0.032 1.000 Y NA
 159336 1789925 lin0260 linr01 lysS   FALSE 0.010 446.000 0.000 NA   NA
 1789925 1789926 linr01 linr02     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 1789926 1789927 linr02 linr03     FALSE 0.227 81.000 0.000 NA   NA
 1789927 398353 linr03 lint02   tRNA-Val TRUE 0.827 17.000 0.000 NA   NA
 398353 398354 lint02 lint03 tRNA-Val tRNA-Thr TRUE 0.908 8.000 0.000 NA   NA
 398354 398355 lint03 lint04 tRNA-Thr tRNA-Lys TRUE 0.412 41.000 0.000 NA   NA
 398355 398356 lint04 lint05 tRNA-Lys tRNA-Leu TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 398356 398357 lint05 lint06 tRNA-Leu tRNA-Gly TRUE 0.899 12.000 0.000 NA   NA
 398357 398358 lint06 lint07 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.696 22.000 0.000 NA   NA
 398358 398359 lint07 lint08 tRNA-Leu tRNA-Arg TRUE 0.890 13.000 0.000 NA   NA
 398359 398360 lint08 lint09 tRNA-Arg tRNA-Pro TRUE 0.903 11.000 0.000 NA   NA
 398360 398361 lint09 lint10 tRNA-Pro tRNA-Ala TRUE 0.759 20.000 0.000 NA   NA
 398361 1789928 lint10 linr04 tRNA-Ala   FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 1789928 1789929 linr04 linr05     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 1789929 1789930 linr05 linr06     FALSE 0.227 81.000 0.000 NA   NA
 1789930 159337 linr06 lin0261     FALSE 0.086 149.000 0.000 NA   NA
 159337 159338 lin0261 lin0262     TRUE 0.956 13.000 0.681 NA   NA
 159338 159339 lin0262 lin0263     TRUE 0.976 -3.000 0.848 1.000   NA
 159339 159340 lin0263 lin0264   clpC TRUE 0.594 29.000 0.425 1.000 N NA
 159340 159341 lin0264 lin0265 clpC   TRUE 0.529 155.000 0.062 0.013 Y NA
 159341 159342 lin0265 lin0266     FALSE 0.159 134.000 0.056 NA   NA
 159342 159343 lin0266 lin0267     TRUE 0.835 20.000 0.108 NA   NA
 159343 159344 lin0267 lin0268     TRUE 0.993 -7.000 0.419 1.000 Y NA
 159344 159345 lin0268 lin0269   gltX TRUE 0.759 19.000 0.076 1.000 N NA
 159345 159346 lin0269 lin0270 gltX cysE FALSE 0.007 399.000 0.008 1.000 N NA
 159346 159347 lin0270 lin0271 cysE cysS TRUE 0.940 7.000 0.035 0.051 N NA
 159347 159348 lin0271 lin0272 cysS   TRUE 0.950 4.000 0.129 1.000   NA
 159348 159349 lin0272 lin0273     TRUE 0.980 0.000 0.150 0.004   NA
 159349 159350 lin0273 lin0274     TRUE 0.950 3.000 0.109 NA   NA
 159350 159351 lin0274 lin0275   sigH TRUE 0.383 81.000 0.361 NA   NA
 159351 159352 lin0275 lin0276 sigH   FALSE 0.198 104.000 0.282 1.000 N NA
 159352 159353 lin0276 lin0277   secE TRUE 0.728 20.000 0.080 1.000 N NA
 159353 159354 lin0277 lin0278 secE nusG FALSE 0.211 130.000 0.843 1.000 N NA
 159354 159355 lin0278 lin0279 nusG   TRUE 0.387 55.000 0.011 NA   NA
 159355 159356 lin0279 lin0280   rplK FALSE 0.157 127.000 0.009 NA   NA
 159356 159357 lin0280 lin0281 rplK rplA TRUE 0.937 40.000 0.838 0.029 Y NA
 159357 159358 lin0281 lin0282 rplA rplJ FALSE 0.295 248.000 0.302 0.029 Y NA
 159358 159359 lin0282 lin0283 rplJ rplL TRUE 0.869 79.000 0.884 0.022 Y NA
 159359 159360 lin0283 lin0284 rplL   TRUE 0.453 143.000 0.050 1.000 Y NA
 159360 159361 lin0284 lin0285   rpoB FALSE 0.006 570.000 0.008 1.000 N NA
 159361 159362 lin0285 lin0286 rpoB rpoC TRUE 0.630 170.000 0.851 0.002 Y NA
 159362 159363 lin0286 lin0287 rpoC   FALSE 0.299 76.000 0.010 1.000   NA
 159363 159364 lin0287 lin0288     TRUE 0.482 66.000 0.458 1.000   NA
 159364 159365 lin0288 lin0289     FALSE 0.065 163.000 0.125 1.000 N NA
 159365 159366 lin0289 lin0290     FALSE 0.034 224.000 0.000 1.000   NA
 159366 159367 lin0290 lin0291     FALSE 0.263 101.000 0.091 1.000   NA
 159367 159368 lin0291 lin0292     TRUE 0.938 7.000 0.545 1.000 N NA
 159368 159369 lin0292 lin0293     TRUE 0.371 71.000 0.647 1.000 N NA
 159369 159370 lin0293 lin0294     FALSE 0.292 84.000 0.529 1.000 N NA
 159371 159372 lin0295 lin0296     FALSE 0.191 135.000 0.235 NA   NA
 159372 159373 lin0296 lin0297     TRUE 0.961 1.000 0.265 NA   NA
 159373 159374 lin0297 lin0298     TRUE 0.347 120.000 0.917 1.000   NA
 159376 159377 lin0300 lin0301     FALSE 0.028 242.000 0.000 NA   NA
 159377 159378 lin0301 lin0302     TRUE 0.948 17.000 0.308 0.025   NA
 159381 159382 lin0305 lin0306     TRUE 0.935 -7.000 0.240 1.000 N NA
 159382 159383 lin0306 lin0307     FALSE 0.013 238.000 0.000 1.000 N NA
 159383 159384 lin0307 lin0308     TRUE 0.955 2.000 0.182 NA   NA
 159385 159386 lin0309 lin0310     FALSE 0.137 150.000 0.169 NA   NA
 159386 159387 lin0310 lin0311     FALSE 0.307 91.000 0.169 1.000   NA
 159387 159388 lin0311 lin0312     TRUE 0.994 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 159388 159389 lin0312 lin0313     TRUE 0.988 15.000 0.880 NA Y NA
 159390 159391 lin0314 lin0315     FALSE 0.017 212.000 0.000 1.000 N NA
 159391 159392 lin0315 lin0316     TRUE 0.481 184.000 0.597 0.082 Y NA
 159392 159393 lin0316 lin0317     TRUE 0.971 -3.000 0.575 NA   NA
 159393 159394 lin0317 lin0318     TRUE 0.973 3.000 0.890 NA   NA
 159394 159395 lin0318 lin0319     FALSE 0.231 118.000 0.176 NA   NA
 159395 159396 lin0319 lin0320     FALSE 0.244 98.000 0.030 1.000   NA
 159396 159397 lin0320 lin0321     FALSE 0.009 685.000 0.000 NA   NA
 159399 159400 lin0323 lin0324     FALSE 0.038 211.000 0.000 NA   NA
 159401 159402 lin0325 lin0326     TRUE 0.358 99.000 0.348 0.029 N NA
 159402 159403 lin0326 lin0327     TRUE 0.995 5.000 0.565 0.029 Y NA
 159403 159404 lin0327 lin0328     TRUE 0.984 17.000 0.786 1.000 Y NA
 159404 159405 lin0328 lin0329     TRUE 0.994 -7.000 0.714 1.000 Y NA
 159406 159407 lin0330 lin0331     TRUE 0.471 34.000 0.000 NA   NA
 159411 159412 lin0335 lin0336     TRUE 0.931 15.000 0.333 NA   NA
 159412 159413 lin0336 lin0337     FALSE 0.024 263.000 0.000 NA   NA
 159413 159414 lin0337 lin0338     TRUE 0.380 46.000 0.000 NA   NA
 159414 159415 lin0338 lin0339     TRUE 0.396 74.000 0.250 NA   NA
 159415 159416 lin0339 lin0340     FALSE 0.035 223.000 0.000 1.000   NA
 159416 159417 lin0340 lin0341     TRUE 0.904 -7.000 0.029 1.000 N NA
 159417 159418 lin0341 lin0342     TRUE 0.995 -3.000 0.044 0.004 Y NA
 159418 159419 lin0342 lin0343     TRUE 0.995 -3.000 0.142 0.004 Y NA
 159420 159421 lin0344 lin0345     FALSE 0.039 208.000 0.000 NA   NA
 159422 159423 lin0346 lin0347     FALSE 0.100 167.000 0.094 NA   NA
 159425 159426 lin0349 lin0350     FALSE 0.023 266.000 0.000 NA   NA
 159426 159427 lin0350 lin0351     FALSE 0.276 163.000 0.778 0.024   NA
 159427 159428 lin0351 lin0352     FALSE 0.066 213.000 0.200 1.000   NA
 159428 159429 lin0352 lin0353     FALSE 0.253 138.000 0.800 NA   NA
 159431 159432 lin0355 lin0356     TRUE 0.970 1.000 0.636 NA   NA
 159432 159433 lin0356 lin0357     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 159433 159434 lin0357 lin0358     FALSE 0.144 122.000 0.000 1.000   NA
 159435 159436 lin0359 lin0360     TRUE 0.404 66.000 0.167 NA   NA
 159436 159437 lin0360 lin0361     TRUE 0.993 2.000 0.750 1.000 Y NA
 159437 159438 lin0361 lin0362     TRUE 0.377 47.000 0.192 1.000 N NA
 159438 159439 lin0362 lin0363     TRUE 0.598 25.000 0.212 1.000 N NA
 159439 159440 lin0363 lin0364     TRUE 0.989 7.000 0.208 1.000 Y NA
 159440 159441 lin0364 lin0365     TRUE 0.990 4.000 0.147 1.000 Y NA
 159441 159442 lin0365 lin0366     TRUE 0.974 22.000 0.162 0.003 Y NA
 159442 159443 lin0366 lin0367     TRUE 0.858 22.000 0.667 NA   NA
 159443 159444 lin0367 lin0368     TRUE 0.945 16.000 0.889 NA   NA
 159444 159445 lin0368 lin0369     TRUE 0.417 85.000 0.667 NA   NA
 159446 159447 lin0370 lin0371     TRUE 0.416 66.000 0.182 1.000   NA
 159447 159448 lin0371 lin0372     FALSE 0.280 99.000 0.145 1.000   NA
 159450 159451 lin0374 lin0375     FALSE 0.166 173.000 0.095 0.028   NA
 159451 159452 lin0375 lin0376     FALSE 0.084 201.000 0.308 1.000   NA
 159452 159453 lin0376 lin0377     TRUE 0.993 14.000 0.692 0.029 Y NA
 159453 159454 lin0377 lin0378     TRUE 0.994 0.000 0.846 1.000 Y NA
 159454 159455 lin0378 lin0379     TRUE 0.841 57.000 0.500 1.000 Y NA
 159456 159457 lin0380 lin0381     TRUE 0.993 -3.000 0.393 NA Y NA
 159457 159458 lin0381 lin0382     FALSE 0.220 74.000 0.066 1.000 N NA
 159459 159460 lin0383 lin0384     FALSE 0.088 129.000 0.024 NA N NA
 159460 159461 lin0384 lin0385     TRUE 0.990 -3.000 0.040 NA Y NA
 159461 159462 lin0385 lin0386     TRUE 0.982 18.000 0.812 NA Y NA
 159462 159463 lin0386 lin0387     FALSE 0.220 73.000 0.072 NA N NA
 159463 159464 lin0387 lin0388     FALSE 0.234 97.000 0.013 1.000   NA
 159464 159465 lin0388 lin0389     TRUE 0.509 37.000 0.013 1.000   NA
 159467 159468 lin0391 lin0392     TRUE 0.994 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 159468 159469 lin0392 lin0393     TRUE 0.989 18.000 0.846 0.029 Y NA
 159469 159470 lin0393 lin0394     TRUE 0.424 87.000 0.750 NA   NA
 159472 159473 lin0396 lin0397     FALSE 0.010 524.000 0.000 NA   NA
 159473 159474 lin0397 lin0398     TRUE 0.975 -9.000 1.000 NA   NA
 159474 159475 lin0398 lin0399     TRUE 0.921 3.000 0.000 NA   NA
 159477 159478 lin0401 lin0402     TRUE 0.871 13.000 0.071 1.000 N NA
 159478 159479 lin0402 lin0403     TRUE 0.975 17.000 0.109 1.000 Y NA
 159479 159480 lin0403 lin0404     TRUE 0.879 12.000 0.064 1.000 N NA
 159480 159481 lin0404 lin0405     FALSE 0.171 132.000 0.081 NA   NA
 159481 159482 lin0405 lin0406     TRUE 0.445 65.000 0.286 NA   NA
 159484 159485 lin0408 lin0409     FALSE 0.177 165.000 0.846 NA   NA
 159485 159486 lin0409 lin0410     TRUE 0.954 -3.000 0.086 NA   NA
 159486 159487 lin0410 lin0411     TRUE 0.524 35.000 0.016 NA   NA
 159487 159488 lin0411 lin0412     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 159488 159489 lin0412 lin0413     TRUE 0.466 62.000 0.300 NA   NA
 159491 159492 lin0415 lin0416     FALSE 0.325 122.000 0.818 1.000   NA
 159492 159493 lin0416 lin0417     TRUE 0.916 18.000 0.636 NA   NA
 159493 159494 lin0417 lin0418     TRUE 0.916 18.000 0.625 NA   NA
 159494 159495 lin0418 lin0419     TRUE 0.994 -15.000 0.800 1.000 Y NA
 159495 159496 lin0419 lin0420     FALSE 0.030 233.000 0.000 NA   NA
 159496 159497 lin0420 lin0421     FALSE 0.100 170.000 0.120 NA   NA
 159497 159498 lin0421 lin0422     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.029 Y NA
 159498 159499 lin0422 lin0423     TRUE 0.995 4.000 0.800 0.029 Y NA
 159499 159500 lin0423 lin0424     TRUE 0.957 22.000 0.300 1.000 Y NA
 159500 159501 lin0424 lin0425     TRUE 0.492 33.000 0.207 1.000 N NA
 159501 159502 lin0425 lin0426     FALSE 0.201 134.000 0.276 NA   NA
 159502 159503 lin0426 lin0427     TRUE 0.974 -9.000 0.846 NA   NA
 159503 159504 lin0427 lin0428     FALSE 0.329 108.000 0.550 NA   NA
 159504 159505 lin0428 lin0429     TRUE 0.838 16.000 0.110 1.000 N NA
 159505 159506 lin0429 lin0430     TRUE 0.385 69.000 0.120 1.000   NA
 159506 159507 lin0430 lin0431     TRUE 0.944 13.000 0.333 NA   NA
 159508 159509 lin0432 lin0433     FALSE 0.042 201.000 0.000 NA   NA
 159510 159511 lin0434 lin0435     TRUE 0.647 27.000 0.066 NA   NA
 159511 159512 lin0435 lin0436     FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000 N NA
 159512 159513 lin0436 lin0437     FALSE 0.189 127.000 0.571 1.000 N NA
 159513 159514 lin0437 lin0438     TRUE 0.954 2.000 0.167 NA   NA
 159517 159518 lin0441 lin0442     TRUE 0.967 -3.000 0.389 NA   NA
 159518 159519 lin0442 lin0443     TRUE 0.954 3.000 0.200 NA   NA
 159519 159520 lin0443 lin0444     FALSE 0.054 180.000 0.150 1.000 N NA
 159521 159522 lin0445 lin0446     TRUE 0.967 0.000 0.222 0.028 N NA
 159522 159523 lin0446 lin0448     FALSE 0.136 330.000 0.000 0.028 Y NA
 159523 159524 lin0448 lin0449     TRUE 0.985 16.000 0.600 1.000 Y NA
 159526 159527 lin0451 lin0452     TRUE 0.930 14.000 0.200 1.000   NA
 159527 159528 lin0452 lin0453     FALSE 0.235 112.000 0.111 NA   NA
 159528 159529 lin0453 lin0454     FALSE 0.026 254.000 0.000 NA   NA
 159529 159530 lin0454 lin0455     FALSE 0.009 613.000 0.000 NA   NA
 159530 159531 lin0455 lin0456     FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 159531 159532 lin0456 lin0457     FALSE 0.022 272.000 0.000 NA   NA
 159535 159536 lin0460 lin0461     FALSE 0.195 127.000 0.086 1.000   NA
 159537 159538 lin0462 lin0463     FALSE 0.204 139.000 0.407 NA   NA
 159540 159541 lin0465 lin0466     FALSE 0.056 180.000 0.000 NA   NA
 159542 159543 lin0467 lin0468     TRUE 0.856 20.000 0.250 NA   NA
 159543 159544 lin0468 lin0469     FALSE 0.159 139.000 0.119 NA   NA
 159544 159545 lin0469 lin0470     TRUE 0.972 -3.000 0.642 NA   NA
 159545 159546 lin0470 lin0471     TRUE 0.967 5.000 0.714 NA   NA
 159547 159548 lin0472 lin0473     FALSE 0.163 133.000 0.522 1.000 N NA
 159548 159549 lin0473 lin0474     TRUE 0.972 1.000 0.731 NA   NA
 159549 159550 lin0474 lin0475     TRUE 0.955 -7.000 0.115 NA   NA
 159550 159551 lin0475 lin0476     FALSE 0.008 747.000 0.000 NA   NA
 159551 159552 lin0476 lin0477     FALSE 0.010 449.000 0.000 NA   NA
 159552 159553 lin0477 lin0478     FALSE 0.011 439.000 0.000 NA   NA
 159553 159554 lin0478 lin0479     FALSE 0.009 569.000 0.000 NA   NA
 159554 159555 lin0479 lin0480     TRUE 0.692 28.000 0.286 NA   NA
 159555 1789931 lin0480 lin0481     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 1789931 159556 lin0481 lin0482     FALSE 0.016 326.000 0.000 NA   NA
 159556 159557 lin0482 lin0483     FALSE 0.290 110.000 0.344 NA   NA
 159557 159558 lin0483 lin0484     FALSE 0.099 151.000 0.009 NA   NA
 159558 159559 lin0484 lin0485     FALSE 0.243 89.000 0.011 NA   NA
 159559 159560 lin0485 lin0486     FALSE 0.339 81.000 0.182 NA   NA
 159560 159561 lin0486 lin0487     FALSE 0.307 86.000 0.133 NA   NA
 159561 159562 lin0487 lin0488     FALSE 0.154 168.000 0.014 0.027   NA
 159562 159563 lin0488 lin0489   rpmF FALSE 0.209 65.000 0.012 1.000 N NA
 159563 159564 lin0489 lin0490 rpmF   FALSE 0.137 92.000 0.011 1.000 N NA
 159566 159567 lin0492 lin0493     FALSE 0.175 100.000 0.143 1.000 N NA
 159567 159568 lin0493 lin0494     TRUE 0.768 66.000 0.113 1.000 Y NA
 159568 159569 lin0494 lin0495     TRUE 0.632 97.000 0.025 1.000 Y NA
 159569 159570 lin0495 lin0496     TRUE 0.361 186.000 0.379 1.000 Y NA
 159570 159571 lin0496 lin0497     TRUE 0.376 75.000 0.196 NA   NA
 159571 159572 lin0497 lin0498     FALSE 0.105 164.000 0.098 NA   NA
 159572 159573 lin0498 lin0499     TRUE 0.994 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 159573 159574 lin0499 lin0500     TRUE 0.995 7.000 0.889 0.028 Y NA
 159574 159575 lin0500 lin0501     FALSE 0.265 109.000 0.800 1.000 N NA
 159575 159576 lin0501 lin0502     TRUE 0.944 4.000 0.556 1.000 N NA
 159576 159577 lin0502 lin0503     TRUE 0.635 28.000 0.556 1.000 N NA
 159577 159578 lin0503 lin0504     TRUE 0.936 17.000 0.900 NA   NA
 159578 159579 lin0504 lin0505     TRUE 0.950 11.000 0.321 NA   NA
 159579 159580 lin0505 lin0506     TRUE 0.949 -3.000 0.429 1.000 N NA
 159580 159581 lin0506 lin0507     TRUE 0.886 16.000 0.417 1.000 N NA
 159581 159582 lin0507 lin0508     TRUE 0.985 15.000 0.000 0.032 Y NA
 159582 159583 lin0508 lin0509   prs FALSE 0.049 140.000 0.000 1.000 N NA
 159583 159584 lin0509 lin0510 prs   FALSE 0.010 465.000 0.000 NA   NA
 159584 159585 lin0510 lin0511     FALSE 0.322 79.000 0.077 NA   NA
 159586 159587 lin0512 lin0513     TRUE 0.939 6.000 0.058 NA   NA
 159588 159589 lin0514 lin0515     TRUE 0.393 76.000 0.250 1.000   NA
 159590 159591 lin0516 lin0517     FALSE 0.164 90.000 0.059 NA N NA
 159591 159592 lin0517 lin0518     FALSE 0.011 422.000 0.000 NA   NA
 159593 159594 lin0519 lin0520     FALSE 0.206 132.000 0.268 NA   NA
 159594 159595 lin0520 lin0521     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 159595 159596 lin0521 lin0522     TRUE 0.863 48.000 0.028 0.067 Y NA
 159596 159597 lin0522 lin0523     TRUE 0.993 -3.000 0.011 0.067 Y NA
 159597 159598 lin0523 lin0524     FALSE 0.233 83.000 0.000 0.067 N NA
 159599 159600 lin0525 lin0526     FALSE 0.309 60.000 0.167 1.000 N NA
 159601 159602 lin0527 lin0528     FALSE 0.293 107.000 0.314 NA   NA
 159603 159604 lin0529 lin0530     FALSE 0.038 152.000 0.000 1.000 N NA
 159605 159606 lin0531 lin0532     TRUE 0.951 -7.000 0.062 NA   NA
 159606 159607 lin0532 lin0533     TRUE 0.942 11.000 0.180 NA   NA
 159607 159608 lin0533 lin0534     TRUE 0.914 16.000 0.230 NA   NA
 159608 159609 lin0534 lin0535     TRUE 0.937 14.000 0.333 NA   NA
 159609 159610 lin0535 lin0536     TRUE 0.470 60.000 0.244 1.000   NA
 159610 159611 lin0536 lin0537     FALSE 0.333 78.000 0.074 1.000   NA
 159611 159612 lin0537 lin0538     TRUE 0.902 19.000 0.569 NA   NA
 159614 159615 lin0540 lin0541     FALSE 0.213 104.000 0.360 1.000 N NA
 159615 159616 lin0541 lin0542     TRUE 0.982 -7.000 0.280 0.006   NA
 159619 159620 lin0545 lin0546     FALSE 0.177 112.000 0.258 1.000 N NA
 159620 159621 lin0546 lin0547     TRUE 0.975 20.000 0.065 0.032 Y NA
 159621 159622 lin0547 lin0548     TRUE 0.968 22.000 0.125 0.032 Y NA
 159622 159623 lin0548 lin0549     TRUE 0.510 25.000 0.042 NA N NA
 159623 159624 lin0549 lin0550     FALSE 0.270 55.000 0.042 NA N NA
 159624 159625 lin0550 lin0551     FALSE 0.011 259.000 0.000 1.000 N NA
 159626 159627 lin0552 lin0553     TRUE 0.732 21.000 0.000 NA   NA
 159627 159628 lin0553 lin0554     TRUE 0.910 20.000 1.000 1.000   NA
 159628 159629 lin0554 lin0555     TRUE 0.523 47.000 0.222 NA   NA
 159629 159630 lin0555 lin0556     TRUE 0.463 80.000 0.800 NA   NA
 159630 159631 lin0556 lin0557     FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 159631 159632 lin0557 lin0558     TRUE 0.517 29.000 0.000 NA   NA
 159632 159633 lin0558 lin0559     TRUE 0.517 29.000 0.000 NA   NA
 159633 159634 lin0559 lin0560     TRUE 0.349 52.000 0.000 NA   NA
 159634 159635 lin0560 lin0561     FALSE 0.237 79.000 0.000 NA   NA
 159637 159638 lin0563 lin0564     TRUE 0.451 36.000 0.176 1.000 N NA
 159638 159639 lin0564 lin0565     FALSE 0.209 130.000 0.833 1.000 N NA
 159639 159640 lin0565 lin0566     TRUE 0.995 1.000 0.167 0.004 Y NA
 159643 159644 lin0569 lin0570     FALSE 0.056 535.000 0.000 1.000 Y NA
 159644 159645 lin0570 lin0571     TRUE 0.995 1.000 0.152 0.005 Y NA
 159645 159646 lin0571 lin0572   hisF TRUE 0.996 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 159646 159647 lin0572 lin0573 hisF hisA TRUE 0.994 -10.000 0.013 0.005 Y NA
 159647 159648 lin0573 lin0574 hisA hisH TRUE 0.994 -21.000 0.051 0.005 Y NA
 159648 159649 lin0574 lin0575 hisH hisB TRUE 0.995 1.000 0.125 0.005 Y NA
 159649 159650 lin0575 lin0576 hisB hisD TRUE 0.995 1.000 0.096 0.005 Y NA
 159650 159651 lin0576 lin0577 hisD hisG TRUE 0.996 -3.000 0.254 0.005 Y NA
 159651 159652 lin0577 lin0578 hisG hisZ TRUE 0.995 0.000 0.239 0.005 Y NA
 159657 159658 lin0583 lin0584     TRUE 0.492 44.000 0.545 1.000 N NA
 159658 159659 lin0584 lin0585     FALSE 0.011 425.000 0.000 NA   NA
 159660 159661 lin0586 lin0587     TRUE 0.942 14.000 0.433 NA   NA
 159662 159663 lin0588 lin0589     TRUE 0.792 23.000 0.345 NA   NA
 159664 159665 lin0590 lin0591   iap FALSE 0.296 89.000 0.125 NA   NA
 159666 159667 lin0592 lin0593     FALSE 0.254 116.000 0.256 NA   NA
 159667 159668 lin0593 lin0594     FALSE 0.024 261.000 0.000 NA   NA
 159668 159669 lin0594 lin0595     TRUE 0.383 70.000 0.154 NA   NA
 159669 159670 lin0595 lin0596     TRUE 0.915 18.000 0.615 NA   NA
 159670 159671 lin0596 lin0597     FALSE 0.192 113.000 0.014 NA   NA
 159671 159672 lin0597 lin0598     FALSE 0.132 138.000 0.015 NA   NA
 159672 159673 lin0598 lin0599     TRUE 0.973 -3.000 0.688 NA   NA
 159673 159674 lin0599 lin0600     TRUE 0.962 -3.000 0.210 1.000   NA
 159674 159675 lin0600 lin0601     FALSE 0.214 126.000 0.194 NA   NA
 159675 159676 lin0601 lin0602     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 159677 159678 lin0603 lin0604     TRUE 0.973 17.000 0.027 1.000 Y NA
 159680 159681 lin0606 lin0607     TRUE 0.358 76.000 0.117 1.000   NA
 159682 159683 lin0608 lin0609     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 159683 159684 lin0609 lin0610     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 159684 159685 lin0610 lin0611     FALSE 0.226 106.000 0.038 NA   NA
 159686 159687 lin0612 lin0613     TRUE 0.621 53.000 1.000 NA   NA
 159687 159688 lin0613 lin0614     FALSE 0.120 151.000 0.077 NA   NA
 159689 159690 lin0615 lin0616     TRUE 0.810 20.000 0.419 1.000 N NA
 159690 159691 lin0616 lin0617     TRUE 0.997 -3.000 0.784 0.009 Y NA
 159691 159692 lin0617 lin0618     FALSE 0.151 114.000 0.159 1.000 N NA
 159693 159694 lin0619 lin0620     FALSE 0.070 165.000 0.000 1.000   NA
 159695 159696 lin0621 lin0622     TRUE 0.938 -3.000 0.250 1.000 N NA
 159696 159697 lin0622 lin0623     FALSE 0.205 95.000 0.222 1.000 N NA
 159700 159701 lin0626 lin0627     FALSE 0.298 110.000 0.389 NA   NA
 159702 159703 lin0628 lin0629     TRUE 0.463 56.000 0.185 NA   NA
 159703 159704 lin0629 lin0630     FALSE 0.298 96.000 0.204 NA   NA
 159704 159705 lin0630 lin0631     TRUE 0.384 84.000 0.440 NA   NA
 159705 159706 lin0631 lin0632     TRUE 0.947 16.000 1.000 NA   NA
 159707 159708 lin0633 lin0634     TRUE 0.631 37.000 0.353 1.000   NA
 159708 159709 lin0634 lin0635     TRUE 0.358 83.000 0.294 NA   NA
 159710 159711 lin0636 lin0637     TRUE 0.390 96.000 0.700 NA   NA
 159711 159712 lin0637 lin0638     TRUE 0.539 43.000 0.196 NA   NA
 159712 159713 lin0638 lin0639     TRUE 0.413 87.000 0.065 0.060   NA
 159713 159714 lin0639 lin0640     FALSE 0.282 112.000 0.306 1.000   NA
 159714 159715 lin0640 lin0641     TRUE 0.927 14.000 0.161 1.000   NA
 159716 159717 lin0642 lin0643     TRUE 0.367 65.000 0.041 NA   NA
 159717 159718 lin0643 lin0644     FALSE 0.024 266.000 0.000 1.000   NA
 159718 159719 lin0644 lin0645     FALSE 0.227 99.000 0.018 NA   NA
 159719 159720 lin0645 lin0646     FALSE 0.151 144.000 0.167 NA   NA
 159722 159723 lin0648 lin0649     TRUE 0.391 90.000 0.571 1.000   NA
 159725 159726 lin0651 lin0652     TRUE 0.700 24.000 0.545 1.000 N NA
 159726 159727 lin0652 lin0653     TRUE 0.545 42.000 0.174 1.000   NA
 159727 159728 lin0653 lin0654     TRUE 0.513 47.000 0.174 1.000   NA
 159729 159730 lin0655 lin0656     TRUE 0.956 -13.000 0.183 NA   NA
 159731 159732 lin0657 lin0658     FALSE 0.317 74.000 0.026 NA   NA
 159734 159735 lin0660 lin0661     FALSE 0.020 286.000 0.000 NA   NA
 159735 159736 lin0661 lin0662     FALSE 0.095 145.000 0.000 1.000   NA
 159738 159739 lin0664 lin0665     FALSE 0.022 276.000 0.000 1.000   NA
 159740 159741 lin0666 lin0667   thiD TRUE 0.423 63.000 0.143 1.000   NA
 159741 159742 lin0667 lin0668 thiD   TRUE 0.694 26.000 0.157 1.000   NA
 159743 159744 lin0669 lin0670     TRUE 0.957 -3.000 0.139 NA   NA
 159744 159745 lin0670 lin0671     TRUE 0.929 10.000 0.029 NA   NA
 159745 159746 lin0671 lin0672     FALSE 0.202 114.000 0.024 1.000   NA
 159746 159747 lin0672 lin0673     TRUE 0.994 -7.000 0.688 1.000 Y NA
 159747 159748 lin0673 lin0674     FALSE 0.011 259.000 0.000 1.000 N NA
 159748 159749 lin0674 lin0675     TRUE 0.875 18.000 0.135 NA   NA
 159749 159750 lin0675 lin0676     FALSE 0.192 124.000 0.073 NA   NA
 159750 159751 lin0676 lin0677     FALSE 0.008 793.000 0.000 NA   NA
 159751 159752 lin0677 lin0678     TRUE 0.453 36.000 0.000 NA   NA
 159752 159753 lin0678 lin0679     FALSE 0.008 1181.000 0.000 NA   NA
 159753 159754 lin0679 lin0680     FALSE 0.163 144.000 0.000 0.080   NA
 159755 159756 lin0681 lin0682     TRUE 0.878 21.000 0.667 NA   NA
 159757 159758 lin0683 lin0684     TRUE 0.952 -7.000 0.073 NA   NA
 159758 159759 lin0684 lin0685     TRUE 0.992 13.000 0.162 0.003 Y NA
 159759 159760 lin0685 lin0686     TRUE 0.993 3.000 0.181 0.079 Y NA
 159760 159761 lin0686 lin0687     TRUE 0.987 16.000 0.259 0.079 Y NA
 159761 159762 lin0687 lin0688     TRUE 0.910 47.000 0.207 0.003 Y NA
 159762 159763 lin0688 lin0689     TRUE 0.972 22.000 0.440 0.079 Y NA
 159763 159764 lin0689 lin0690     TRUE 0.990 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 159764 159765 lin0690 lin0691     TRUE 0.897 29.000 0.084 1.000 Y NA
 159765 159766 lin0691 lin0692     TRUE 0.688 25.000 0.092 NA   NA
 159766 159767 lin0692 lin0693     TRUE 0.640 27.000 0.050 NA   NA
 159767 159768 lin0693 lin0694   motB TRUE 0.991 -40.000 0.257 1.000 Y NA
 159768 159769 lin0694 lin0695 motB   TRUE 0.943 10.000 0.175 NA   NA
 159769 159770 lin0695 lin0696     TRUE 0.805 23.000 0.450 NA   NA
 159770 159771 lin0696 lin0697     TRUE 0.881 13.000 0.117 1.000 N NA
 159771 159772 lin0697 lin0698   flaA FALSE 0.157 237.000 0.000 1.000 Y NA
 159772 159773 lin0698 lin0699 flaA cheY FALSE 0.010 275.000 0.000 1.000 N NA
 159773 159774 lin0699 lin0700 cheY cheA TRUE 0.979 20.000 0.154 0.011 Y NA
 159774 159775 lin0700 lin0701 cheA   TRUE 0.992 13.000 0.059 0.004 Y NA
 159775 159776 lin0701 lin0702     TRUE 0.901 19.000 0.550 NA   NA
 159776 159777 lin0702 lin0703     TRUE 0.944 16.000 0.846 NA   NA
 159777 159778 lin0703 lin0704     TRUE 0.949 2.000 0.064 1.000   NA
 159778 159779 lin0704 lin0705     TRUE 0.963 20.000 0.117 1.000 Y NA
 159779 159780 lin0705 lin0706     TRUE 0.968 14.000 0.293 0.007   NA
 159780 159781 lin0706 lin0707     TRUE 0.912 21.000 0.079 0.002   NA
 159781 159782 lin0707 lin0708     TRUE 0.996 3.000 0.508 0.002 Y NA
 159782 159783 lin0708 lin0709     TRUE 0.938 6.000 0.052 NA   NA
 159783 159784 lin0709 lin0710     TRUE 0.848 23.000 0.917 NA   NA
 159784 159785 lin0710 lin0711     FALSE 0.240 107.000 0.083 NA   NA
 159785 159786 lin0711 lin0712     TRUE 0.936 10.000 0.076 NA   NA
 159786 159787 lin0712 lin0713     TRUE 0.894 20.000 0.688 NA   NA
 159787 159788 lin0713 lin0714     TRUE 0.994 12.000 0.177 0.001 Y NA
 159788 159789 lin0714 lin0715     TRUE 0.989 12.000 0.292 1.000 Y NA
 159789 159790 lin0715 lin0716     TRUE 0.988 19.000 0.608 0.002 Y NA
 159790 159791 lin0716 lin0717     TRUE 0.950 -28.000 0.127 NA   NA
 159791 159792 lin0717 lin0718     TRUE 0.794 21.000 0.040 NA   NA
 159792 159793 lin0718 lin0719     TRUE 0.995 12.000 0.804 0.005 Y NA
 159793 159794 lin0719 lin0720     TRUE 0.986 17.000 0.068 0.005 Y NA
 159794 159795 lin0720 lin0721     TRUE 0.844 68.000 0.076 0.007 Y NA
 159795 159796 lin0721 lin0722     TRUE 0.994 4.000 0.056 0.007 Y NA
 159796 159797 lin0722 lin0723     TRUE 0.966 -13.000 0.471 NA   NA
 159797 159798 lin0723 lin0724     TRUE 0.957 -3.000 0.129 NA   NA
 159798 159799 lin0724 lin0725     TRUE 0.794 17.000 0.076 NA N NA
 159799 159800 lin0725 lin0726     TRUE 0.905 14.000 0.021 NA   NA
 159800 159801 lin0726 lin0727     FALSE 0.142 121.000 0.000 NA   NA
 159801 159802 lin0727 lin0728     TRUE 0.964 -7.000 0.342 NA   NA
 159804 159805 lin0730 lin0731     FALSE 0.093 162.000 0.400 1.000 N NA
 159805 159806 lin0731 lin0732     TRUE 0.941 14.000 0.391 1.000   NA
 159808 159809 lin0734 lin0735     FALSE 0.110 113.000 0.014 1.000 N NA
 159809 159810 lin0735 lin0736     FALSE 0.279 86.000 0.049 NA   NA
 159810 159811 lin0736 lin0737     TRUE 0.921 14.000 0.111 NA   NA
 159811 159812 lin0737 lin0738     FALSE 0.088 148.000 0.000 NA   NA
 159812 159813 lin0738 lin0739     FALSE 0.030 236.000 0.000 NA   NA
 159817 159818 lin0743 lin0744     TRUE 0.955 -16.000 0.750 1.000 N NA
 159818 159819 lin0744 lin0745     TRUE 0.974 -3.000 0.750 NA   NA
 159819 159820 lin0745 lin0746     TRUE 0.868 15.000 0.000 NA   NA
 159820 1789932 lin0746 lin0747     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 1789932 159821 lin0747 lin0748     TRUE 0.517 29.000 0.000 NA   NA
 159821 159822 lin0748 lin0749     FALSE 0.096 143.000 0.000 NA   NA
 159822 159823 lin0749 lin0750     TRUE 0.957 -28.000 0.850 1.000 N NA
 159823 159824 lin0750 lin0751     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 159824 159825 lin0751 lin0752     FALSE 0.131 127.000 0.000 NA   NA
 159825 159826 lin0752 lin0753     TRUE 0.986 -3.000 0.526 0.004   NA
 159826 159827 lin0753 lin0754     TRUE 0.947 8.000 0.200 1.000   NA
 159827 159828 lin0754 lin0755     TRUE 0.942 10.000 0.123 1.000   NA
 159828 159829 lin0755 lin0756     FALSE 0.016 327.000 0.000 1.000   NA
 159829 159830 lin0756 lin0757     FALSE 0.338 66.000 0.010 1.000   NA
 159830 159831 lin0757 lin0758     TRUE 0.964 -3.000 0.265 1.000   NA
 159831 159832 lin0758 lin0759     FALSE 0.217 153.000 0.111 0.023   NA
 159832 159833 lin0759 lin0760     TRUE 0.878 17.000 0.056 1.000   NA
 159833 159834 lin0760 lin0761     TRUE 0.991 12.000 0.167 0.057 Y NA
 159834 159835 lin0761 lin0762     TRUE 0.978 21.000 0.500 0.057 Y NA
 159835 159836 lin0762 lin0763     TRUE 0.990 4.000 0.222 1.000 Y NA
 159838 159839 lin0765 lin0766     TRUE 0.728 35.000 1.000 NA   NA
 159841 159842 lin0768 lin0769     TRUE 0.545 52.000 0.423 NA   NA
 159845 159846 lin0772 lin0773     FALSE 0.024 263.000 0.000 NA   NA
 159846 159847 lin0773 lin0774     FALSE 0.331 117.000 0.755 NA   NA
 159847 159848 lin0774 lin0775     TRUE 0.987 19.000 0.939 0.031 Y NA
 159848 159849 lin0775 lin0776     TRUE 0.525 162.000 0.234 0.031 Y NA
 159849 159850 lin0776 lin0777     TRUE 0.996 0.000 0.550 0.031 Y NA
 159850 159851 lin0777 lin0778     FALSE 0.023 289.000 0.000 0.038 N NA
 159852 159853 lin0779 lin0780     FALSE 0.063 194.000 0.421 1.000 N NA
 159853 159854 lin0780 lin0781     FALSE 0.023 265.000 0.000 NA   NA
 159855 159856 lin0782 lin0783     TRUE 0.636 26.000 0.018 1.000   NA
 159857 159858 lin0784 lin0785     FALSE 0.334 100.000 0.429 NA   NA
 159859 159860 lin0786 lin0787     FALSE 0.211 115.000 0.059 NA   NA
 159860 159861 lin0787 lin0788     FALSE 0.265 88.000 0.026 1.000   NA
 159861 159862 lin0788 lin0789     FALSE 0.210 110.000 0.028 NA   NA
 159864 159865 lin0791 lin0792     FALSE 0.007 358.000 0.000 1.000 N NA
 159866 159867 lin0793 lin0794     FALSE 0.131 151.000 0.155 NA   NA
 159867 159868 lin0794 lin0795     FALSE 0.191 130.000 0.113 1.000   NA
 159868 159869 lin0795 lin0796     FALSE 0.018 210.000 0.000 1.000 N NA
 159869 159870 lin0796 lin0797     TRUE 0.875 16.000 0.326 1.000 N NA
 159870 159871 lin0797 lin0798     TRUE 0.996 0.000 0.928 0.036 Y NA
 159871 159872 lin0798 lin0799     TRUE 0.996 -3.000 0.492 0.036 Y NA
 159872 159873 lin0799 lin0800     TRUE 0.995 -3.000 0.253 0.036 Y NA
 159873 159874 lin0800 lin0801     FALSE 0.006 387.000 0.000 1.000 N NA
 159874 159875 lin0801 lin0802     TRUE 0.838 61.000 0.643 NA Y NA
 159875 159876 lin0802 lin0803     FALSE 0.015 340.000 0.000 NA   NA
 159876 159877 lin0803 lin0804     FALSE 0.043 200.000 0.000 NA   NA
 159878 159879 lin0805 lin0806     FALSE 0.323 85.000 0.167 1.000   NA
 159880 159881 lin0807 lin0808     FALSE 0.336 68.000 0.016 1.000   NA
 159881 159882 lin0808 lin0809     FALSE 0.156 138.000 0.089 NA   NA
 159882 159883 lin0809 lin0810     TRUE 0.440 85.000 0.818 NA   NA
 159883 159884 lin0810 lin0811     FALSE 0.035 222.000 0.000 1.000   NA
 159884 159885 lin0811 lin0812     TRUE 0.899 16.000 0.072 1.000   NA
 159887 159888 lin0814 lin0815     TRUE 0.927 15.000 0.265 NA   NA
 159888 159889 lin0815 lin0816     FALSE 0.259 112.000 0.220 NA   NA
 159889 159890 lin0816 lin0817     TRUE 0.900 17.000 0.244 NA   NA
 159892 159893 lin0819 lin0820     FALSE 0.271 111.000 0.265 NA   NA
 159893 159894 lin0820 lin0821     TRUE 0.502 42.000 0.065 NA   NA
 159894 159895 lin0821 lin0822     FALSE 0.058 197.000 0.013 1.000   NA
 159895 159896 lin0822 lin0823     TRUE 0.868 15.000 0.000 NA   NA
 159896 159897 lin0823 lin0824   nifJ FALSE 0.101 156.000 0.032 NA   NA
 159898 159899 lin0825 lin0826 fbp   FALSE 0.262 113.000 0.222 1.000   NA
 159903 159904 lin0830 lin0831     FALSE 0.159 132.000 0.462 1.000 N NA
 159905 159906 lin0832 lin0833     FALSE 0.012 398.000 0.000 NA   NA
 159906 159907 lin0833 lin0834     TRUE 0.963 -16.000 0.396 NA   NA
 159907 159908 lin0834 lin0835     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 159910 159911 lin0837 lin0838     FALSE 0.011 256.000 0.000 NA N NA
 159911 159912 lin0838 lin0839     FALSE 0.127 97.000 0.008 1.000 N NA
 159912 159913 lin0839 lin0840     FALSE 0.040 171.000 0.009 1.000 N NA
 159913 159914 lin0840 lin0841     TRUE 0.995 -7.000 0.414 0.056 Y NA
 159916 159917 lin0843 lin0844     FALSE 0.032 226.000 0.000 NA   NA
 159917 159918 lin0844 lin0845     TRUE 0.362 82.000 0.297 NA   NA
 159918 159919 lin0845 lin0846     TRUE 0.891 17.000 0.706 1.000 N NA
 159919 159920 lin0846 lin0847     TRUE 0.996 3.000 0.941 0.079 Y NA
 159920 159921 lin0847 lin0848   ddlA FALSE 0.060 151.000 0.027 1.000 N NA
 159921 159922 lin0848 lin0849 ddlA murF TRUE 0.855 64.000 0.046 0.005 Y NA
 159922 159923 lin0849 lin0850 murF   TRUE 0.422 67.000 0.216 1.000   NA
 159925 159926 lin0852 lin0853     TRUE 0.996 -3.000 0.733 0.036 Y NA
 159926 159927 lin0853 lin0854     TRUE 0.996 -13.000 0.711 0.036 Y NA
 159927 159928 lin0854 lin0855     TRUE 0.979 16.000 0.100 1.000 Y NA
 159928 159929 lin0855 lin0856     TRUE 0.961 2.000 0.300 NA   NA
 159929 159930 lin0856 lin0857     TRUE 0.847 22.000 0.529 NA   NA
 159930 159931 lin0857 lin0858     TRUE 0.993 -3.000 0.529 NA Y NA
 159931 159932 lin0858 lin0859     FALSE 0.005 452.000 0.000 1.000 N NA
 159932 159933 lin0859 lin0860     FALSE 0.013 444.000 0.004 NA   NA
 159935 159936 lin0862 lin0863     TRUE 0.879 17.000 0.074 NA   NA
 159938 159939 lin0865 lin0866     TRUE 0.392 44.000 0.000 NA   NA
 159939 159940 lin0866 lin0867     TRUE 0.931 -7.000 0.000 1.000   NA
 159940 159941 lin0867 lin0868     TRUE 0.868 15.000 0.000 NA   NA
 159943 159944 lin0870 lin0871     FALSE 0.018 208.000 0.000 1.000 N NA
 159944 159945 lin0871 lin0872     TRUE 0.951 15.000 0.600 0.027 N NA
 159945 159946 lin0872 lin0873     TRUE 0.996 1.000 0.733 0.027 Y NA
 159946 159947 lin0873 lin0874     TRUE 0.982 21.000 0.786 0.027 Y NA
 159947 159948 lin0874 lin0875     TRUE 0.951 23.000 0.440 1.000 Y NA
 159948 159949 lin0875 lin0876     TRUE 0.949 0.000 0.480 1.000 N NA
 159949 159950 lin0876 lin0877     TRUE 0.911 18.000 0.542 NA   NA
 159950 1789933 lin0877 lin0878     TRUE 0.922 -21.000 0.000 NA   NA
 1789933 159951 lin0878 lin0879     FALSE 0.153 115.000 0.000 NA   NA
 159953 159954 lin0881 lin0882     TRUE 0.960 -7.000 0.216 NA   NA
 159954 159955 lin0882 lin0883     FALSE 0.133 151.000 0.170 NA   NA
 159955 159956 lin0883 lin0884     TRUE 0.891 2.000 0.017 1.000 N NA
 159956 159957 lin0884 lin0885     TRUE 0.766 19.000 0.093 1.000 N NA
 159957 159958 lin0885 lin0886     FALSE 0.036 206.000 0.108 1.000 N NA
 159958 159959 lin0886 lin0887     TRUE 0.958 4.000 0.260 0.064 N NA
 159959 159960 lin0887 lin0888   RsbR FALSE 0.165 252.000 0.032 NA Y NA
 159960 159961 lin0888 lin0889 RsbR rsbS TRUE 0.990 6.000 0.258 NA Y NA
 159961 159962 lin0889 lin0890 rsbS rsbT TRUE 0.991 3.000 0.320 NA Y NA
 159962 159963 lin0890 lin0891 rsbT rsbU TRUE 0.982 17.000 0.617 1.000 Y NA
 159963 159964 lin0891 lin0892 rsbU rsbV TRUE 0.494 150.000 0.440 1.000 Y NA
 159964 159965 lin0892 lin0893 rsbV rsbW TRUE 0.993 -16.000 0.714 1.000 Y NA
 159965 159966 lin0893 lin0894 rsbW sigB TRUE 0.957 -22.000 0.838 1.000 N NA
 159966 159967 lin0894 lin0895 sigB rsbX TRUE 0.961 1.000 0.243 1.000   NA
 159967 159968 lin0895 lin0896 rsbX   FALSE 0.042 204.000 0.000 1.000   NA
 159968 159969 lin0896 lin0897     FALSE 0.214 68.000 0.027 1.000 N NA
 159969 159970 lin0897 lin0898     TRUE 0.960 0.000 0.215 NA   NA
 159970 398362 lin0898 lint12   tRNA-Ser FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 398362 159971 lint12 lin0899 tRNA-Ser   FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 159971 159972 lin0899 lin0900     FALSE 0.152 142.000 0.123 NA   NA
 159972 159973 lin0900 lin0901     FALSE 0.255 81.000 0.286 1.000 N NA
 159973 398363 lin0901 lint13   tRNA-Glu FALSE 0.042 201.000 0.000 NA   NA
 398363 398364 lint13 lint14 tRNA-Glu tRNA-Asp TRUE 0.551 27.000 0.000 NA   NA
 398364 159974 lint14 lin0902 tRNA-Asp   FALSE 0.129 128.000 0.000 NA   NA
 159974 159975 lin0902 lin0903     FALSE 0.207 117.000 0.061 NA   NA
 159975 1789934 lin0903 lin0904     TRUE 0.921 -31.000 0.000 NA   NA
 1789934 159976 lin0904 lin0905     FALSE 0.121 131.000 0.000 NA   NA
 159976 159977 lin0905 lin0906     TRUE 0.462 36.000 0.000 1.000   NA
 159977 159978 lin0906 lin0907     TRUE 0.398 29.000 0.006 1.000 N NA
 159980 159981 lin0909 lin0910     TRUE 0.964 3.000 0.474 NA   NA
 159981 159982 lin0910 lin0911     FALSE 0.319 102.000 0.368 NA   NA
 159982 159983 lin0911 lin0912     FALSE 0.268 115.000 0.310 NA   NA
 159983 159984 lin0912 lin0913     FALSE 0.015 224.000 0.000 1.000 N NA
 159984 159985 lin0913 lin0914     FALSE 0.141 142.000 0.533 1.000 N NA
 159985 159986 lin0914 lin0915     TRUE 0.963 5.000 0.522 NA   NA
 159986 1789935 lin0915 lin0916     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 1789935 159987 lin0916 lin0917     TRUE 0.868 15.000 0.000 NA   NA
 159987 159988 lin0917 lin0918     TRUE 0.987 12.000 0.143 1.000 Y NA
 159988 159989 lin0918 lin0919     FALSE 0.237 73.000 0.100 1.000 N NA
 159989 159990 lin0919 lin0920     FALSE 0.020 291.000 0.000 1.000   NA
 159990 159991 lin0920 lin0921     FALSE 0.213 122.000 0.139 NA   NA
 159991 159992 lin0921 lin0922     TRUE 0.917 19.000 0.841 NA   NA
 159992 159993 lin0922 lin0923     FALSE 0.257 89.000 0.026 NA   NA
 159993 159994 lin0923 lin0924     FALSE 0.117 116.000 0.036 1.000 N NA
 159994 159995 lin0924 lin0925     TRUE 0.957 0.000 0.713 1.000 N NA
 159995 159996 lin0925 lin0926     TRUE 0.740 20.000 0.110 1.000 N NA
 159998 159999 lin0928 lin0929     FALSE 0.121 108.000 0.027 NA N NA
 159999 160000 lin0929 lin0930     FALSE 0.212 120.000 0.100 NA   NA
 160000 160001 lin0930 lin0931     TRUE 0.702 25.000 0.113 1.000   NA
 398365 160003 lint15 lin0933 tRNA-Gly   FALSE 0.186 98.000 0.000 NA   NA
 160003 160004 lin0933 lin0935     FALSE 0.088 543.000 0.000 0.025 Y NA
 160005 160006 lin0936 lin0937     FALSE 0.258 86.000 0.018 NA   NA
 160006 160007 lin0937 lin0938     TRUE 0.913 13.000 0.016 NA   NA
 160007 160008 lin0938 lin0939     FALSE 0.305 91.000 0.188 NA   NA
 160008 1789936 lin0939 lin0940     TRUE 0.903 11.000 0.000 NA   NA
 1789936 160009 lin0940 lin0941     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 160010 160011 lin0942 lin0943 fri   FALSE 0.030 235.000 0.000 NA   NA
 160011 160012 lin0943 lin0944     FALSE 0.287 115.000 0.409 NA   NA
 160012 160013 lin0944 lin0945     TRUE 0.957 10.000 0.481 NA   NA
 160014 160015 lin0946 lin0947     TRUE 0.929 -3.000 0.162 1.000 N NA
 160017 160018 lin0949 lin0950     TRUE 0.853 20.000 0.222 NA   NA
 160019 160020 lin0951 lin0952     TRUE 0.399 95.000 0.733 NA   NA
 160020 160021 lin0952 lin0953     FALSE 0.058 219.000 0.167 NA   NA
 160021 160022 lin0953 lin0954     TRUE 0.917 16.000 0.270 NA   NA
 160022 160023 lin0954 lin0955     FALSE 0.042 189.000 0.083 NA N NA
 160023 160024 lin0955 lin0956     TRUE 0.990 16.000 0.194 0.002 Y NA
 160024 160025 lin0956 lin0957     TRUE 0.827 16.000 0.075 1.000 N NA
 160025 160026 lin0957 lin0958     FALSE 0.123 135.000 0.245 1.000 N NA
 160026 160027 lin0958 lin0959     FALSE 0.149 114.000 0.149 1.000 N NA
 160027 160028 lin0959 lin0960     TRUE 0.992 14.000 0.156 0.002 Y NA
 160028 160029 lin0960 lin0961   lemA FALSE 0.270 83.000 0.020 NA   NA
 160029 160030 lin0961 lin0962 lemA   TRUE 0.770 23.000 0.222 NA   NA
 160031 160032 lin0963 lin0964     FALSE 0.042 246.000 0.071 1.000   NA
 160032 160033 lin0964 lin0965     TRUE 0.886 17.000 0.096 1.000   NA
 160034 160035 lin0966 lin0967     TRUE 0.728 32.000 0.725 1.000   NA
 160035 160036 lin0967 lin0968     TRUE 0.842 19.000 0.480 1.000 N NA
 160036 160037 lin0968 lin0969     FALSE 0.231 78.000 0.141 1.000 N NA
 160038 160039 lin0970 lin0971 dltD dltC TRUE 0.967 0.000 0.409 1.000   NA
 160039 160040 lin0971 lin0972 dltC dltB TRUE 0.753 25.000 0.387 NA   NA
 160040 160041 lin0972 lin0973 dltB dltA TRUE 0.947 -3.000 0.435 NA N NA
 160043 160044 lin0975 lin0976     TRUE 0.890 17.000 0.159 NA   NA
 160045 160046 lin0977 lin0978     FALSE 0.041 194.000 0.086 1.000 N NA
 160046 160047 lin0978 lin0979     TRUE 0.963 -3.000 0.860 1.000 N NA
 160049 160050 lin0981 lin0982     TRUE 0.880 13.000 0.106 1.000 N NA
 160050 160051 lin0982 lin0983     FALSE 0.111 137.000 0.216 NA N NA
 160051 160052 lin0983 lin0984     TRUE 0.962 -3.000 0.235 NA   NA
 160052 160053 lin0984 lin0985     TRUE 0.960 -3.000 0.189 NA   NA
 160053 160054 lin0985 lin0986     TRUE 0.975 -7.000 0.849 1.000   NA
 160054 160055 lin0986 lin0987     FALSE 0.273 82.000 0.014 1.000   NA
 160055 160056 lin0987 lin0988     FALSE 0.116 110.000 0.017 1.000 N NA
 160056 160057 lin0988 lin0989     TRUE 0.457 53.000 0.625 1.000 N NA
 160057 160058 lin0989 lin0990     FALSE 0.010 281.000 0.000 1.000 N NA
 160058 160059 lin0990 lin0991     TRUE 0.756 105.000 0.381 0.077 Y NA
 160059 160060 lin0991 lin0992     TRUE 0.857 41.000 0.151 1.000 Y NA
 160061 160062 lin0993 lin0994     TRUE 0.674 30.000 0.303 NA   NA
 160064 160065 lin0996 lin0997 clpE   FALSE 0.107 164.000 0.115 NA   NA
 160067 160068 lin0999 lin1000     FALSE 0.279 104.000 0.214 NA   NA
 160069 160070 lin1001 lin1002 ptsH   TRUE 0.994 0.000 0.140 0.026 Y NA
 160070 160071 lin1002 lin1003     FALSE 0.234 113.000 0.121 NA   NA
 160071 160072 lin1003 lin1004     TRUE 0.923 13.000 0.058 NA   NA
 160074 160075 lin1006 lin1007     FALSE 0.017 313.000 0.000 NA   NA
 160075 160076 lin1007 lin1008     FALSE 0.045 217.000 0.017 NA   NA
 160076 160077 lin1008 lin1009     TRUE 0.992 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 160077 160078 lin1009 lin1010     TRUE 0.347 48.000 0.121 1.000 N NA
 160078 160079 lin1010 lin1011     TRUE 0.484 63.000 0.372 1.000   NA
 160081 160082 lin1013 lin1014 gbuA gbuB TRUE 0.994 -7.000 0.042 0.006 Y NA
 160082 160083 lin1014 lin1015 gbuB gbuC TRUE 0.991 14.000 0.179 0.006 Y NA
 160083 160084 lin1015 lin1016 gbuC   FALSE 0.155 115.000 0.192 1.000 N NA
 160084 160085 lin1016 lin1017     FALSE 0.127 113.000 0.047 1.000 N NA
 160085 160086 lin1017 lin1018     FALSE 0.300 80.000 0.031 1.000   NA
 160086 160087 lin1018 lin1019     FALSE 0.148 136.000 0.038 NA   NA
 160087 160088 lin1019 lin1020     TRUE 0.973 -3.000 0.679 NA   NA
 160088 160089 lin1020 lin1021     TRUE 0.997 -3.000 0.853 0.010 Y NA
 160089 160090 lin1021 lin1022     TRUE 0.792 19.000 0.194 1.000 N NA
 160090 160091 lin1022 lin1023     FALSE 0.151 145.000 0.184 NA   NA
 160091 160092 lin1023 lin1024     TRUE 0.976 -3.000 0.900 NA   NA
 160093 160094 lin1025 lin1026     FALSE 0.233 109.000 0.076 NA   NA
 160094 160095 lin1026 lin1027     TRUE 0.961 7.000 0.576 NA   NA
 160097 160098 lin1029 lin1030     FALSE 0.343 67.000 0.026 NA   NA
 160098 160099 lin1030 lin1031     TRUE 0.941 -19.000 0.024 NA   NA
 160099 160100 lin1031 lin1032     TRUE 0.951 3.000 0.103 1.000   NA
 160101 160102 lin1033 lin1034     FALSE 0.152 95.000 0.036 1.000 N NA
 160102 160103 lin1034 lin1035     TRUE 0.994 -21.000 0.002 0.003 Y NA
 160103 160104 lin1035 lin1036     TRUE 0.995 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 160104 160105 lin1036 lin1037     TRUE 0.996 -16.000 0.501 0.003 Y NA
 160105 160106 lin1037 lin1038     TRUE 0.993 13.000 0.175 0.003 Y NA
 160106 160107 lin1038 lin1039     TRUE 0.942 29.000 0.071 0.003 Y NA
 160108 160109 lin1040 lin1041     TRUE 0.986 12.000 0.044 1.000 Y NA
 160112 160113 lin1044 lin1045 pdhA PdhB TRUE 0.996 3.000 0.484 0.002 Y NA
 160113 160114 lin1045 lin1046 PdhB pdhC TRUE 0.791 111.000 0.883 0.057 Y NA
 160114 160115 lin1046 lin1047 pdhC PdhD TRUE 0.993 5.000 0.948 1.000 Y NA
 160115 160116 lin1047 lin1048 PdhD   FALSE 0.078 187.000 0.079 NA   NA
 160116 160117 lin1048 lin1049     FALSE 0.196 129.000 0.158 NA   NA
 160117 160118 lin1049 lin1050     TRUE 0.950 0.000 0.048 NA   NA
 160118 160119 lin1050 lin1051     TRUE 0.820 21.000 0.145 NA   NA
 160120 160121 lin1052 lin1053     FALSE 0.042 201.000 0.000 NA   NA
 160122 160123 lin1054 lin1055     FALSE 0.035 192.000 0.024 1.000 N NA
 160123 160124 lin1055 lin1056     FALSE 0.069 182.000 0.010 1.000   NA
 160126 160127 lin1058 lin1059     FALSE 0.115 173.000 0.300 NA   NA
 160127 160128 lin1059 lin1060   pycA FALSE 0.017 275.000 0.046 1.000 N NA
 160128 160129 lin1060 lin1061 pycA   FALSE 0.059 153.000 0.028 1.000 N NA
 160129 160130 lin1061 lin1062     FALSE 0.009 282.000 0.000 1.000 N NA
 160130 160131 lin1062 lin1063     TRUE 0.990 13.000 0.808 1.000 Y NA
 160131 160132 lin1063 lin1064     FALSE 0.024 188.000 0.000 1.000 N NA
 160134 160135 lin1066 lin1067     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 160135 160136 lin1067 lin1068     FALSE 0.207 88.000 0.000 NA   NA
 160136 160137 lin1068 lin1069     TRUE 0.975 -3.000 0.800 NA   NA
 160139 160140 lin1071 lin1072     TRUE 0.943 -7.000 0.367 1.000 N NA
 160140 160141 lin1072 lin1073     FALSE 0.104 141.000 0.222 NA N NA
 160141 160142 lin1073 lin1074     TRUE 0.992 0.000 0.250 NA Y NA
 160142 160143 lin1074 lin1075     TRUE 0.992 13.000 0.069 0.001 Y NA
 160143 160144 lin1075 lin1076   tagD TRUE 0.880 65.000 0.244 0.002 Y NA
 160144 160145 lin1076 lin1077 tagD   FALSE 0.124 118.000 0.064 1.000 N NA
 160145 160146 lin1077 lin1078     TRUE 0.993 12.000 0.194 0.003 Y NA
 160146 160147 lin1078 lin1079     TRUE 0.921 13.000 0.037 1.000   NA
 160147 160148 lin1079 lin1080     TRUE 0.416 61.000 0.083 1.000   NA
 160148 160149 lin1080 lin1081   guaA FALSE 0.081 129.000 0.004 1.000 N NA
 160149 160150 lin1081 lin1082 guaA   FALSE 0.090 147.000 0.000 NA   NA
 160150 160151 lin1082 lin1083     FALSE 0.099 142.000 0.000 NA   NA
 160151 160152 lin1083 lin1084     FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 160152 160153 lin1084 lin1085     TRUE 0.973 1.000 0.800 NA   NA
 160153 160154 lin1085 lin1086     TRUE 0.960 -3.000 0.200 NA   NA
 160154 160155 lin1086 lin1087     TRUE 0.890 13.000 0.000 NA   NA
 160155 160156 lin1087 lin1088     FALSE 0.337 86.000 0.250 NA   NA
 160156 160157 lin1088 lin1089     TRUE 0.969 -10.000 0.583 NA   NA
 160157 160158 lin1089 lin1090     FALSE 0.012 404.000 0.000 NA   NA
 160158 160159 lin1090 lin1091     FALSE 0.042 202.000 0.000 NA   NA
 160159 160160 lin1091 lin1092     FALSE 0.063 171.000 0.000 NA   NA
 160160 160161 lin1092 lin1093     TRUE 0.955 -10.000 0.161 NA   NA
 160162 160163 lin1094 lin1095     TRUE 0.949 -27.000 0.082 1.000   NA
 160163 160164 lin1095 lin1096     TRUE 0.953 -3.000 0.057 1.000   NA
 160165 160166 lin1097 lin1098     TRUE 0.996 2.000 0.576 0.009 Y NA
 160168 160169 lin1100 lin1101     FALSE 0.018 311.000 0.000 1.000   NA
 160170 160171 lin1102 lin1103     TRUE 0.398 65.000 0.111 NA   NA
 160171 160172 lin1103 lin1104     FALSE 0.193 128.000 0.111 NA   NA
 160173 160174 lin1105 lin1106     FALSE 0.146 119.000 0.179 1.000 N NA
 160174 160175 lin1106 lin1107     TRUE 0.992 -3.000 0.289 NA Y NA
 160175 160176 lin1107 lin1108     FALSE 0.102 148.000 0.316 NA N NA
 160176 160177 lin1108 lin1109     TRUE 0.989 6.000 0.200 1.000 Y NA
 160177 160178 lin1109 lin1110     TRUE 0.691 25.000 0.100 NA   NA
 160178 160179 lin1110 lin1111     TRUE 0.959 -7.000 0.205 NA   NA
 160179 160180 lin1111 lin1112     TRUE 0.989 2.000 0.046 1.000 Y NA
 160180 160181 lin1112 lin1113     TRUE 0.898 1.000 0.023 1.000 N NA
 160183 160184 lin1115 lin1116     TRUE 0.928 -7.000 0.200 NA N NA
 160184 160185 lin1116 lin1117     TRUE 0.780 19.000 0.150 1.000 N NA
 160185 160186 lin1117 lin1118     TRUE 0.807 38.000 0.455 0.001   NA
 160186 160187 lin1118 lin1119     TRUE 0.969 17.000 0.759 0.001   NA
 160187 160188 lin1119 lin1120     TRUE 0.597 45.000 0.500 NA   NA
 160188 160189 lin1120 lin1121     TRUE 0.964 -3.000 0.295 NA   NA
 160189 160190 lin1121 lin1122     TRUE 0.946 13.000 0.387 NA   NA
 160190 160191 lin1122 lin1123     TRUE 0.938 26.000 0.645 NA Y NA
 160191 160192 lin1123 lin1124     TRUE 0.991 4.000 0.364 NA Y NA
 160192 160193 lin1124 lin1125     TRUE 0.772 21.000 0.364 NA N NA
 160193 160194 lin1125 lin1126     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 160194 160195 lin1126 lin1127     TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 160195 160196 lin1127 lin1128     TRUE 0.927 15.000 0.268 NA   NA
 160196 160197 lin1128 lin1129     TRUE 0.940 7.000 0.073 1.000   NA
 160197 160198 lin1129 lin1130     TRUE 0.987 16.000 0.222 0.056 Y NA
 160198 160199 lin1130 lin1131   glpF TRUE 0.606 28.000 0.407 1.000 N NA
 160199 160200 lin1131 lin1132 glpF AckA2 FALSE 0.331 68.000 0.375 1.000 N NA
 160200 160201 lin1132 lin1133 AckA2 cobD TRUE 0.901 14.000 0.346 1.000 N NA
 160201 160202 lin1133 lin1134 cobD   TRUE 0.937 -10.000 0.300 1.000 N NA
 160202 160203 lin1134 lin1135   pduQ FALSE 0.004 591.000 0.000 1.000 N NA
 160203 160204 lin1135 lin1136 pduQ   FALSE 0.010 275.000 0.000 1.000 N NA
 160204 160205 lin1136 lin1137     TRUE 0.993 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 160205 160206 lin1137 lin1138   eutA FALSE 0.155 91.000 0.041 NA N NA
 160206 160207 lin1138 lin1139 eutA eutB TRUE 0.864 42.000 0.286 NA Y NA
 160207 160208 lin1139 lin1140 eutB eutC TRUE 0.982 20.000 0.119 0.001 Y NA
 160208 160209 lin1140 lin1141 eutC   TRUE 0.955 23.000 0.617 1.000 Y NA
 160209 160210 lin1141 lin1142     TRUE 0.900 15.000 0.468 NA N NA
 160210 160211 lin1142 lin1143     TRUE 0.993 0.000 0.442 NA Y NA
 160211 160212 lin1143 lin1144     TRUE 0.903 32.000 0.349 NA Y NA
 160212 160213 lin1144 lin1145     FALSE 0.081 166.000 0.357 NA N NA
 160213 160214 lin1145 lin1146     TRUE 0.916 13.000 0.452 NA N NA
 160214 160215 lin1146 lin1147     TRUE 0.589 45.000 0.459 NA   NA
 160215 160216 lin1147 lin1148     TRUE 0.938 15.000 0.487 NA   NA
 160216 160217 lin1148 lin1149     TRUE 0.992 -7.000 0.385 NA Y NA
 160217 160218 lin1149 lin1150     TRUE 0.893 16.000 0.552 NA N NA
 160218 160219 lin1150 lin1151     TRUE 0.994 -7.000 0.759 1.000 Y NA
 160221 160222 lin1153 lin1154   cbiA FALSE 0.015 332.000 0.000 NA   NA
 160222 160223 lin1154 lin1155 cbiA   TRUE 0.995 -3.000 0.124 0.011 Y NA
 160223 160224 lin1155 lin1156     TRUE 0.991 13.000 0.107 0.011 Y NA
 160224 160225 lin1156 lin1157   cbiD TRUE 0.988 16.000 0.168 0.011 Y NA
 160225 160226 lin1157 lin1158 cbiD cbiE TRUE 0.995 -3.000 0.126 0.011 Y NA
 160226 160227 lin1158 lin1159 cbiE   TRUE 0.996 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 160227 160228 lin1159 lin1160   cbiF TRUE 0.993 6.000 0.056 0.011 Y NA
 160228 160229 lin1160 lin1161 cbiF cbiG TRUE 0.995 -13.000 0.397 0.011 Y NA
 160229 160230 lin1161 lin1162 cbiG cbiH TRUE 0.996 -3.000 0.352 0.011 Y NA
 160230 160231 lin1162 lin1163 cbiH   TRUE 0.996 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 160231 160232 lin1163 lin1164     TRUE 0.990 0.000 0.042 1.000 Y NA
 160232 160233 lin1164 lin1165   cbiK TRUE 0.991 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 160233 160234 lin1165 lin1166 cbiK cbiL TRUE 0.990 -7.000 0.048 1.000 Y NA
 160234 160235 lin1166 lin1167 cbiL   TRUE 0.370 81.000 0.058 0.011 N NA
 160235 160236 lin1167 lin1168     TRUE 0.997 -3.000 0.861 0.011 Y NA
 160236 160237 lin1168 lin1169   cbiQ TRUE 0.997 -13.000 0.804 0.002 Y NA
 160237 160238 lin1169 lin1170 cbiQ   TRUE 0.993 13.000 0.152 0.002 Y NA
 160238 160239 lin1170 lin1171   cbiP TRUE 0.906 0.000 0.033 1.000 N NA
 160239 160240 lin1171 lin1172 cbiP   TRUE 0.971 -36.000 0.021 0.011   NA
 160241 160242 lin1173 lin1174     TRUE 0.941 15.000 0.545 NA   NA
 160243 160244 lin1175 lin1176     FALSE 0.298 31.000 0.000 NA N NA
 160244 160245 lin1176 lin1177     TRUE 0.967 3.000 0.600 NA   NA
 160245 160246 lin1177 lin1178     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA   NA
 160246 160247 lin1178 lin1179     FALSE 0.180 297.000 0.000 0.004 Y NA
 160247 160248 lin1179 lin1180     FALSE 0.172 112.000 0.237 1.000 N NA
 160248 160249 lin1180 lin1181     TRUE 0.475 26.000 0.022 1.000 N NA
 160251 160252 lin1183 lin1184   pheS FALSE 0.006 366.000 0.000 NA N NA
 160252 160253 lin1184 lin1185 pheS pheT TRUE 0.997 0.000 0.574 0.001 Y NA
 160253 160254 lin1185 lin1186 pheT   FALSE 0.050 155.000 0.009 1.000 N NA
 160254 160255 lin1186 lin1187     TRUE 0.909 14.000 0.438 1.000 N NA
 160255 160256 lin1187 lin1188     FALSE 0.190 97.000 0.182 1.000 N NA
 160256 160257 lin1188 lin1189     TRUE 0.908 16.000 0.154 1.000   NA
 160257 160258 lin1189 lin1190     FALSE 0.221 106.000 0.022 1.000   NA
 160260 160261 lin1192 lin1193     TRUE 0.953 0.000 0.091 NA   NA
 160261 160262 lin1193 lin1194     FALSE 0.274 93.000 0.066 1.000   NA
 160262 160263 lin1194 lin1195     TRUE 0.938 23.000 0.114 1.000 Y NA
 160263 160264 lin1195 lin1196   trxA FALSE 0.176 81.000 0.031 1.000 N NA
 160264 160265 lin1196 lin1197 trxA uvrC FALSE 0.172 76.000 0.008 1.000 N NA
 160265 160266 lin1197 lin1198 uvrC   FALSE 0.035 183.000 0.009 1.000 N NA
 160268 160269 lin1200 lin1201 racE   TRUE 0.864 13.000 0.048 1.000 N NA
 160269 160270 lin1201 lin1202     TRUE 0.927 4.000 0.262 1.000 N NA
 160270 160271 lin1202 lin1203     TRUE 0.550 38.000 0.085 1.000   NA
 160271 398366 lin1203 lint16   tRNA-Arg FALSE 0.162 111.000 0.000 NA   NA
 398366 160272 lint16 lin1204 tRNA-Arg   FALSE 0.008 1279.000 0.000 NA   NA
 160272 160273 lin1204 lin1205     FALSE 0.045 243.000 0.115 NA   NA
 160274 160275 lin1206 lin1207     FALSE 0.269 118.000 0.364 NA   NA
 160276 160277 lin1208 lin1209     FALSE 0.045 196.000 0.000 NA   NA
 160277 160278 lin1209 lin1210     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 160278 160279 lin1210 lin1211     TRUE 0.908 8.000 0.000 NA   NA
 160279 160280 lin1211 lin1212     FALSE 0.011 437.000 0.000 NA   NA
 160282 160283 lin1214 lin1215     FALSE 0.059 454.000 0.000 1.000 Y NA
 160284 160285 lin1216 lin1217     TRUE 0.962 -3.000 0.239 NA   NA
 160287 160288 lin1219 lin1220     FALSE 0.016 329.000 0.000 NA   NA
 160290 160291 lin1222 lin1223     TRUE 0.978 19.000 0.650 1.000 Y NA
 160295 160296 lin1227 lin1228 proA proB TRUE 0.996 -16.000 0.281 0.002 Y NA
 160296 160297 lin1228 lin1229 proB   FALSE 0.137 136.000 0.015 NA   NA
 160297 160298 lin1229 lin1230     TRUE 0.378 80.000 0.306 NA   NA
 160298 160299 lin1230 lin1231     FALSE 0.017 317.000 0.000 1.000   NA
 160299 160300 lin1231 lin1232     FALSE 0.246 77.000 0.000 NA   NA
 160300 160301 lin1232 lin1233     TRUE 0.397 43.000 0.000 NA   NA
 160301 160302 lin1233 lin1234     TRUE 0.685 17.000 0.000 1.000 N NA
 160303 160304 lin1235 lin1236     FALSE 0.246 77.000 0.000 NA   NA
 160304 160305 lin1236 lin1237     TRUE 0.890 13.000 0.000 NA   NA
 160305 160306 lin1237 lin1238     TRUE 0.976 -6.000 1.000 NA   NA
 160306 160307 lin1238 lin1239     FALSE 0.084 150.000 0.000 NA   NA
 160307 160308 lin1239 lin1240     FALSE 0.011 423.000 0.000 NA   NA
 160308 160309 lin1240 lin1241     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 160309 160310 lin1241 lin1242     TRUE 0.940 4.000 0.040 NA   NA
 160310 160311 lin1242 lin1243     TRUE 0.936 -61.000 0.011 1.000   NA
 160311 160312 lin1243 lin1244     TRUE 0.916 12.000 0.005 NA   NA
 160312 160313 lin1244 lin1245     TRUE 0.957 -124.000 0.286 NA   NA
 160313 160314 lin1245 lin1246     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 160314 160315 lin1246 lin1247     TRUE 0.920 -43.000 0.000 NA   NA
 160315 160316 lin1247 lin1248     TRUE 0.923 -19.000 0.000 NA   NA
 160316 160317 lin1248 lin1249     TRUE 0.749 22.000 0.018 NA   NA
 160317 160318 lin1249 lin1250     TRUE 0.564 41.000 0.222 NA   NA
 160318 160319 lin1250 lin1251     TRUE 0.968 -40.000 0.667 NA   NA
 160319 160320 lin1251 lin1252     TRUE 0.951 12.000 0.400 NA   NA
 160320 160321 lin1252 lin1253     TRUE 0.974 -3.000 0.714 NA   NA
 160321 160322 lin1253 lin1254     FALSE 0.029 237.000 0.000 NA   NA
 160322 160323 lin1254 lin1255     TRUE 0.940 13.000 0.000 0.061   NA
 160323 160324 lin1255 lin1256     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 160326 160327 lin1258 lin1259     FALSE 0.242 78.000 0.000 NA   NA
 160327 160328 lin1259 lin1260     TRUE 0.894 13.000 0.000 1.000   NA
 160328 160329 lin1260 lin1261     FALSE 0.009 650.000 0.000 NA   NA
 160329 160330 lin1261 lin1262     FALSE 0.290 65.000 0.000 NA   NA
 160330 160331 lin1262 lin1263     TRUE 0.366 48.000 0.000 NA   NA
 160331 160332 lin1263 lin1264     FALSE 0.124 130.000 0.000 NA   NA
 160332 160333 lin1264 lin1265     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 160333 160334 lin1265 lin1266     TRUE 0.344 53.000 0.000 NA   NA
 160334 160335 lin1266 lin1267     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 160335 160336 lin1267 lin1268     TRUE 0.926 -10.000 0.000 NA   NA
 160336 160337 lin1268 lin1269     TRUE 0.925 -13.000 0.000 NA   NA
 160337 160338 lin1269 lin1270     FALSE 0.013 378.000 0.000 NA   NA
 160338 160339 lin1270 lin1271     TRUE 0.851 16.000 0.000 NA   NA
 160339 160340 lin1271 lin1272     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 160340 160341 lin1272 lin1273     TRUE 0.899 12.000 0.000 NA   NA
 160341 160342 lin1273 lin1274     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 160342 160343 lin1274 lin1275     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 160343 160344 lin1275 lin1276     TRUE 0.955 10.000 0.400 NA   NA
 160344 160345 lin1276 lin1277     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 160345 160346 lin1277 lin1278     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 160346 160347 lin1278 lin1279     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 160347 160348 lin1279 lin1280     FALSE 0.253 75.000 0.000 NA   NA
 160348 1789937 lin1280 lin1281     TRUE 0.927 -9.000 0.000 NA   NA
 1789937 160349 lin1281 lin1282     TRUE 0.851 16.000 0.000 NA   NA
 160349 160350 lin1282 lin1283     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 160350 160351 lin1283 lin1284     TRUE 0.903 11.000 0.000 NA   NA
 160351 160352 lin1284 lin1285     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 160352 160353 lin1285 lin1286     TRUE 0.926 15.000 0.250 NA   NA
 160353 160354 lin1286 lin1287     TRUE 0.958 1.000 0.208 NA   NA
 160354 160355 lin1287 lin1288     TRUE 0.962 11.000 0.708 NA   NA
 160355 160356 lin1288 lin1289     TRUE 0.957 -3.000 0.118 NA   NA
 160356 160357 lin1289 lin1290     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 160357 160358 lin1290 lin1291     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 160358 160359 lin1291 lin1292     TRUE 0.508 30.000 0.000 NA   NA
 160359 160360 lin1292 lin1293     TRUE 0.497 31.000 0.000 NA   NA
 160360 160361 lin1293 lin1294     TRUE 0.922 -24.000 0.000 NA   NA
 160361 160362 lin1294 lin1295     FALSE 0.196 94.000 0.000 NA   NA
 160362 160363 lin1295 lin1296     TRUE 0.962 3.000 0.400 NA   NA
 160364 160365 lin1297 lin1298     TRUE 0.678 28.000 0.222 NA   NA
 160365 160366 lin1298 lin1299     TRUE 0.950 14.000 0.667 NA   NA
 160367 160368 lin1300 lin1301     TRUE 0.844 22.000 0.500 NA   NA
 160368 160369 lin1301 lin1302     FALSE 0.013 371.000 0.000 NA   NA
 160369 160370 lin1302 lin1303     FALSE 0.024 262.000 0.000 NA   NA
 160370 160371 lin1303 lin1304     TRUE 0.935 16.000 0.600 NA   NA
 160371 160372 lin1304 lin1305     FALSE 0.025 256.000 0.000 NA   NA
 160372 160373 lin1305 lin1306   tig FALSE 0.193 115.000 0.014 1.000   NA
 160373 160374 lin1306 lin1307 tig clpX TRUE 0.443 185.000 0.033 0.003 Y NA
 160374 160375 lin1307 lin1308 clpX   FALSE 0.096 120.000 0.009 1.000 N NA
 160375 160376 lin1308 lin1309     TRUE 0.951 36.000 0.643 0.001 Y NA
 160376 160377 lin1309 lin1310     TRUE 0.844 103.000 0.769 0.001 Y NA
 160377 160378 lin1310 lin1311     TRUE 0.957 10.000 0.023 0.073   NA
 160378 160379 lin1311 lin1312   rnhB TRUE 0.959 -3.000 0.148 1.000   NA
 160379 160380 lin1312 lin1313 rnhB   TRUE 0.489 135.000 0.037 1.000 Y NA
 160380 160381 lin1313 lin1314   topA FALSE 0.178 270.000 0.238 1.000 Y NA
 160381 160382 lin1314 lin1315 topA gid FALSE 0.282 64.000 0.137 1.000 N NA
 160382 160383 lin1315 lin1316 gid codV FALSE 0.018 284.000 0.105 1.000 N NA
 160383 160384 lin1316 lin1317 codV clpQ TRUE 0.676 22.000 0.113 1.000 N NA
 160384 160385 lin1317 lin1318 clpQ clpY TRUE 0.989 14.000 0.752 1.000 Y NA
 160385 160386 lin1318 lin1319 clpY codY TRUE 0.718 21.000 0.131 1.000 N NA
 160386 160387 lin1319 lin1320 codY   FALSE 0.119 154.000 0.076 1.000   NA
 160387 160388 lin1320 lin1321     TRUE 0.742 23.000 0.096 NA   NA
 160388 160389 lin1321 lin1322     TRUE 0.949 3.000 0.105 NA   NA
 160391 160392 lin1324 lin1325   parE FALSE 0.081 176.000 0.030 1.000   NA
 160392 160393 lin1325 lin1326 parE parC TRUE 0.997 -3.000 0.552 0.002 Y NA
 160393 160394 lin1326 lin1327 parC   FALSE 0.172 81.000 0.026 1.000 N NA
 160394 160395 lin1327 lin1328     FALSE 0.015 352.000 0.000 1.000   NA
 160397 160398 lin1330 lin1331   glpD FALSE 0.173 224.000 0.000 1.000 Y NA
 160398 160399 lin1331 lin1332 glpD miaA FALSE 0.087 125.000 0.004 1.000 N NA
 160399 160400 lin1332 lin1333 miaA   FALSE 0.228 122.000 0.192 1.000   NA
 160400 160401 lin1333 lin1334     FALSE 0.210 108.000 0.014 1.000   NA
 160401 160402 lin1334 lin1335     TRUE 0.952 -7.000 0.065 1.000   NA
 160402 160403 lin1335 lin1336   glnR FALSE 0.033 202.000 0.046 1.000 N NA
 160403 160404 lin1336 lin1337 glnR glnA FALSE 0.269 71.000 0.192 1.000 N NA
 160404 160405 lin1337 lin1338 glnA   FALSE 0.101 143.000 0.212 1.000 N NA
 160406 160407 lin1339 lin1340     TRUE 0.443 30.000 0.043 1.000 N NA
 160408 160409 lin1341 lin1342     TRUE 0.363 93.000 0.480 NA   NA
 160409 160410 lin1342 lin1343   tkt FALSE 0.182 147.000 0.440 NA   NA
 160410 160411 lin1343 lin1344 tkt   FALSE 0.035 223.000 0.000 1.000   NA
 160412 160413 lin1345 lin1346     TRUE 0.612 23.000 0.087 1.000 N NA
 160413 160414 lin1346 lin1347     TRUE 0.963 10.000 0.692 1.000   NA
 160414 160415 lin1347 lin1348     TRUE 0.955 -10.000 0.123 1.000   NA
 160415 160416 lin1348 lin1349     TRUE 0.950 -43.000 0.137 NA   NA
 160417 160418 lin1350 lin1351 smbA frr TRUE 0.955 0.000 0.626 1.000 N NA
 160418 160419 lin1351 lin1352 frr   FALSE 0.042 230.000 0.409 1.000 N NA
 160419 160420 lin1352 lin1353   cdsA TRUE 0.984 14.000 0.113 1.000 Y NA
 160420 160421 lin1353 lin1354 cdsA   TRUE 0.981 15.000 0.071 1.000 Y NA
 160421 160422 lin1354 lin1355     TRUE 0.917 14.000 0.568 1.000 N NA
 160422 160423 lin1355 lin1356   proS TRUE 0.392 40.000 0.095 1.000 N NA
 160423 160424 lin1356 lin1357 proS polC FALSE 0.262 106.000 0.070 0.044 N NA
 160424 160425 lin1357 lin1358 polC   FALSE 0.078 182.000 0.059 NA   NA
 160425 160426 lin1358 lin1359   nusA TRUE 0.743 30.000 0.759 NA   NA
 160426 160427 lin1359 lin1360 nusA   TRUE 0.984 15.000 0.323 NA Y NA
 160427 160428 lin1360 lin1361     TRUE 0.944 -7.000 0.408 NA N NA
 160428 160429 lin1361 lin1362   infB TRUE 0.943 23.000 0.223 1.000 Y NA
 160429 160430 lin1362 lin1363 infB   TRUE 0.956 -3.000 0.102 NA   NA
 160430 160431 lin1363 lin1364   rbfA TRUE 0.902 16.000 0.113 NA   NA
 160431 160432 lin1364 lin1365 rbfA truB TRUE 0.661 97.000 0.111 1.000 Y NA
 160432 160433 lin1365 lin1366 truB ribC FALSE 0.304 71.000 0.308 1.000 N NA
 160433 160434 lin1366 lin1367 ribC rpsO FALSE 0.101 137.000 0.119 1.000 N NA
 160434 160435 lin1367 lin1368 rpsO pnpA FALSE 0.214 248.000 0.335 1.000 Y NA
 160436 160437 lin1369 lin1370     FALSE 0.086 164.000 0.014 NA   NA
 160437 160438 lin1370 lin1371     TRUE 0.610 28.000 0.031 NA   NA
 160439 160440 lin1372 lin1373 rpmG   FALSE 0.276 56.000 0.045 1.000 N NA
 160440 160441 lin1373 lin1374     FALSE 0.246 99.000 0.037 1.000   NA
 160441 160442 lin1374 lin1375     TRUE 0.944 13.000 0.347 NA   NA
 160442 160443 lin1375 lin1376     TRUE 0.767 25.000 0.496 NA   NA
 160443 160444 lin1376 lin1377     FALSE 0.090 171.000 0.058 NA   NA
 160445 160446 lin1378 lin1379     TRUE 0.960 0.000 0.214 NA   NA
 160446 160447 lin1379 lin1380     TRUE 0.954 -37.000 0.196 NA   NA
 160447 160448 lin1380 lin1381     TRUE 0.957 -7.000 0.164 NA   NA
 160448 160449 lin1381 lin1382     TRUE 0.992 -3.000 0.320 NA Y NA
 160449 160450 lin1382 lin1383   comGB TRUE 0.995 14.000 0.861 0.001 Y NA
 160450 160451 lin1383 lin1384 comGB comGA TRUE 0.993 -22.000 0.639 1.000 Y NA
 160452 160453 lin1385 lin1386     TRUE 0.989 16.000 0.092 0.002 Y NA
 160453 160454 lin1386 lin1387     TRUE 0.996 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 160455 160456 lin1388 lin1389     TRUE 0.372 62.000 0.029 NA   NA
 160456 160457 lin1389 lin1390     TRUE 0.923 14.000 0.140 NA   NA
 160458 160459 lin1391 lin1392   efp FALSE 0.173 103.000 0.160 1.000 N NA
 160459 160460 lin1392 lin1393 efp   FALSE 0.067 160.000 0.120 1.000 N NA
 160460 160461 lin1393 lin1394     TRUE 0.991 14.000 0.086 0.002 Y NA
 160461 160462 lin1394 lin1395     TRUE 0.962 3.000 0.373 NA   NA
 160462 160463 lin1395 lin1396     TRUE 0.567 31.000 0.023 NA   NA
 160463 160464 lin1396 lin1397   folD FALSE 0.165 92.000 0.056 1.000 N NA
 160464 160465 lin1397 lin1398 folD   TRUE 0.750 19.000 0.058 1.000 N NA
 160465 160466 lin1398 lin1399     TRUE 0.996 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 160466 160467 lin1399 lin1400     TRUE 0.912 3.000 0.100 1.000 N NA
 160467 160468 lin1400 lin1401   cspL FALSE 0.040 199.000 0.108 1.000 N NA
 160468 160469 lin1401 lin1402 cspL tktB FALSE 0.046 165.000 0.015 1.000 N NA
 160469 160470 lin1402 lin1403 tktB   TRUE 0.791 19.000 0.189 1.000 N NA
 160470 160471 lin1403 lin1404     FALSE 0.041 191.000 0.064 1.000 N NA
 160471 160472 lin1404 lin1405   recN TRUE 0.592 23.000 0.056 1.000 N NA
 160472 160473 lin1405 lin1406 recN   FALSE 0.085 130.000 0.013 1.000 N NA
 160473 160474 lin1406 lin1407     TRUE 0.579 137.000 0.562 1.000 Y NA
 160474 160475 lin1407 lin1408     TRUE 0.989 14.000 0.078 0.044 Y NA
 160475 160476 lin1408 lin1409     TRUE 0.937 25.000 0.414 1.000 Y NA
 160476 160477 lin1409 lin1410   BfmBAB TRUE 0.992 17.000 0.897 0.002 Y NA
 160477 160478 lin1410 lin1411 BfmBAB   TRUE 0.951 31.000 0.882 0.054 Y NA
 160478 160479 lin1411 lin1412     FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000 N NA
 160479 160480 lin1412 lin1413     FALSE 0.070 145.000 0.035 1.000 N NA
 160480 160481 lin1413 lin1414   lisR FALSE 0.036 190.000 0.025 1.000 N NA
 160481 160482 lin1414 lin1415 lisR lisK TRUE 0.995 -3.000 0.438 0.071 Y NA
 160483 160484 lin1416 lin1417     TRUE 0.699 37.000 0.833 NA   NA
 160484 160485 lin1417 lin1418     FALSE 0.303 86.000 0.115 NA   NA
 160486 160487 lin1419 lin1420     TRUE 0.497 40.000 0.026 NA   NA
 160489 160490 lin1422 lin1423     FALSE 0.113 151.000 0.042 NA   NA
 160492 160493 lin1425 lin1426 tcsA   FALSE 0.016 434.000 0.048 1.000   NA
 160493 160494 lin1426 lin1427     TRUE 0.968 -7.000 0.438 1.000   NA
 160494 160495 lin1427 lin1428     TRUE 0.985 -3.000 0.720 0.033   NA
 160495 160496 lin1428 lin1429     FALSE 0.215 118.000 0.077 1.000   NA
 160496 160497 lin1429 lin1430     TRUE 0.986 -19.000 0.872 0.005   NA
 160497 160498 lin1430 lin1431     FALSE 0.333 100.000 0.397 1.000   NA
 160498 160499 lin1431 lin1432     TRUE 0.512 49.000 0.213 1.000   NA
 160499 160500 lin1432 lin1433     FALSE 0.286 90.000 0.077 1.000   NA
 160500 160501 lin1433 lin1434   cinA TRUE 0.402 67.000 0.151 1.000   NA
 160501 160502 lin1434 lin1435 cinA recA FALSE 0.036 270.000 0.083 1.000   NA
 160502 160503 lin1435 lin1436 recA   FALSE 0.024 301.000 0.018 1.000   NA
 160503 160504 lin1436 lin1437     FALSE 0.192 116.000 0.016 1.000   NA
 160504 160505 lin1437 lin1438     TRUE 0.937 5.000 0.026 1.000   NA
 160505 160506 lin1438 lin1439     TRUE 0.868 17.000 0.031 NA   NA
 160506 160507 lin1439 lin1440   mutS FALSE 0.212 110.000 0.031 NA   NA
 160507 160508 lin1440 lin1441 mutS mutL TRUE 0.983 20.000 0.220 0.001 Y NA
 160508 160509 lin1441 lin1442 mutL   TRUE 0.682 20.000 0.020 1.000 N NA
 160509 160510 lin1442 lin1443   pflB FALSE 0.005 426.000 0.000 1.000 N NA
 160510 160511 lin1443 lin1444 pflB pflC FALSE 0.230 78.000 0.135 1.000 N NA
 160513 160514 lin1446 lin1447     FALSE 0.152 132.000 0.024 NA   NA
 160514 160515 lin1447 lin1448     TRUE 0.953 1.000 0.107 NA   NA
 160515 160516 lin1448 lin1449     TRUE 0.437 40.000 0.214 1.000 N NA
 160517 160518 lin1450 lin1451     TRUE 0.789 19.000 0.000 NA   NA
 160518 160519 lin1451 lin1452     FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 160519 160520 lin1452 lin1453     FALSE 0.063 171.000 0.000 NA   NA
 160522 160523 lin1455 lin1456     FALSE 0.334 70.000 0.029 NA   NA
 160523 160524 lin1456 lin1457     TRUE 0.852 19.000 0.068 1.000   NA
 160524 160525 lin1457 lin1458     TRUE 0.425 63.000 0.152 1.000   NA
 160525 160526 lin1458 lin1459     TRUE 0.608 28.000 0.021 1.000   NA
 160527 160528 lin1460 lin1461     TRUE 0.972 -3.000 0.218 0.006 N NA
 160529 160530 lin1462 lin1463     FALSE 0.243 138.000 0.700 NA   NA
 160530 160531 lin1463 lin1464   opuCD TRUE 0.346 113.000 0.636 0.052 N NA
 160531 160532 lin1464 lin1465 opuCD opuCC TRUE 0.964 15.000 0.909 0.006 N NA
 160532 160533 lin1465 lin1466 opuCC opuCB TRUE 0.949 2.000 0.000 0.006 N NA
 160533 160534 lin1466 lin1467 opuCB opuCA TRUE 0.992 4.000 0.000 0.006 Y NA
 160534 160535 lin1467 lin1468 opuCA   FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 160535 160536 lin1468 lin1469     FALSE 0.027 248.000 0.000 NA   NA
 160538 160539 lin1471 lin1472     TRUE 0.602 53.000 0.786 1.000   NA
 160539 160540 lin1472 lin1473     FALSE 0.314 88.000 0.167 1.000   NA
 160540 160541 lin1473 lin1474     TRUE 0.822 20.000 0.042 1.000   NA
 160541 160542 lin1474 lin1475     TRUE 0.980 15.000 0.023 1.000 Y NA
 160542 160543 lin1475 lin1476     TRUE 0.986 12.000 0.091 1.000 Y NA
 160543 160544 lin1476 lin1477     FALSE 0.041 199.000 0.136 1.000 N NA
 160544 160545 lin1477 lin1478   sod FALSE 0.122 130.000 0.169 1.000 N NA
 160546 160547 lin1479 lin1480     FALSE 0.049 215.000 0.033 NA   NA
 160547 160548 lin1480 lin1481     TRUE 0.964 -9.000 0.338 NA   NA
 160549 160550 lin1482 lin1483   zurR FALSE 0.096 138.000 0.102 1.000 N NA
 160550 160551 lin1483 lin1484 zurR zurM TRUE 0.992 -19.000 0.480 1.000 Y NA
 160551 160552 lin1484 lin1485 zurM zurA TRUE 0.990 -25.000 0.130 1.000 Y NA
 160552 160553 lin1485 lin1486 zurA   FALSE 0.064 142.000 0.008 1.000 N NA
 160553 160554 lin1486 lin1487     TRUE 0.765 17.000 0.019 1.000 N NA
 160554 160555 lin1487 lin1488     TRUE 0.979 16.000 0.104 1.000 Y NA
 160555 160556 lin1488 lin1489     FALSE 0.077 179.000 0.032 NA   NA
 160556 160557 lin1489 lin1490     TRUE 0.964 -3.000 0.283 NA   NA
 160557 160558 lin1490 lin1491   rpoD TRUE 0.417 68.000 0.239 NA   NA
 160558 160559 lin1491 lin1492 rpoD dnaG FALSE 0.201 95.000 0.209 1.000 N NA
 160559 160560 lin1492 lin1493 dnaG   TRUE 0.813 20.000 0.033 NA   NA
 160560 160561 lin1493 lin1494     FALSE 0.069 188.000 0.029 NA   NA
 160561 160562 lin1494 lin1495   glyS TRUE 0.520 35.000 0.013 NA   NA
 160562 160563 lin1495 lin1496 glyS glyQ TRUE 0.997 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 160563 160564 lin1496 lin1497 glyQ   FALSE 0.016 281.000 0.036 1.000 N NA
 160566 160567 lin1499 lin1500     TRUE 0.948 -3.000 0.019 1.000   NA
 160567 160568 lin1500 lin1501     TRUE 0.550 25.000 0.090 1.000 N NA
 160568 160569 lin1501 lin1502     TRUE 0.951 -22.000 0.123 NA   NA
 160569 160570 lin1502 lin1503     TRUE 0.893 17.000 0.182 NA   NA
 160570 160571 lin1503 lin1504     TRUE 0.910 16.000 0.172 1.000   NA
 160571 160572 lin1504 lin1505     FALSE 0.068 190.000 0.027 1.000   NA
 160572 160573 lin1505 lin1506   rpsU TRUE 0.909 20.000 0.150 0.028   NA
 160573 160574 lin1506 lin1507 rpsU   FALSE 0.057 198.000 0.019 NA   NA
 160574 160575 lin1507 lin1508     TRUE 0.959 1.000 0.227 NA   NA
 160575 160576 lin1508 lin1509   dnaJ FALSE 0.247 73.000 0.133 1.000 N NA
 160576 160577 lin1509 lin1510 dnaJ dnaK TRUE 0.641 143.000 0.196 0.003 Y NA
 160577 160578 lin1510 lin1511 dnaK grpE TRUE 0.936 34.000 0.224 0.006 Y NA
 160578 160579 lin1511 lin1512 grpE hrcA TRUE 0.439 42.000 0.286 1.000 N NA
 160579 160580 lin1512 lin1513 hrcA hemN FALSE 0.078 147.000 0.082 1.000 N NA
 160580 160581 lin1513 lin1514 hemN lepA FALSE 0.071 144.000 0.032 1.000 N NA
 160583 160584 lin1516 lin1517   comEC TRUE 0.400 68.000 0.163 1.000   NA
 160584 160585 lin1517 lin1518 comEC comEB TRUE 0.878 17.000 0.055 1.000   NA
 160585 160586 lin1518 lin1519 comEB comEA FALSE 0.238 72.000 0.095 1.000 N NA
 160586 160587 lin1519 lin1520 comEA   FALSE 0.137 103.000 0.033 1.000 N NA
 160587 160588 lin1520 lin1521     TRUE 0.409 61.000 0.085 NA   NA
 160588 160589 lin1521 lin1522     TRUE 0.947 5.000 0.149 NA   NA
 160589 160590 lin1522 lin1523     TRUE 0.991 -13.000 0.199 1.000 Y NA
 160590 160591 lin1523 lin1524     TRUE 0.774 19.000 0.150 NA N NA
 160591 160592 lin1524 lin1525     TRUE 0.916 0.000 0.089 NA N NA
 160592 160593 lin1525 lin1526     TRUE 0.870 20.000 0.336 1.000   NA
 160593 160594 lin1526 lin1527     TRUE 0.971 -3.000 0.555 1.000   NA
 160596 160597 lin1529 lin1530     TRUE 0.436 51.000 0.041 NA   NA
 160597 160598 lin1530 lin1531     TRUE 0.462 48.000 0.065 NA   NA
 160598 160599 lin1531 lin1532   udk FALSE 0.042 194.000 0.095 1.000 N NA
 160599 160600 lin1532 lin1533 udk   TRUE 0.951 -3.000 0.039 1.000   NA
 160600 160601 lin1533 lin1534     TRUE 0.354 77.000 0.154 NA   NA
 160603 160604 lin1536 lin1537     TRUE 0.937 16.000 0.651 NA   NA
 160604 160605 lin1537 lin1538     TRUE 0.970 -3.000 0.537 NA   NA
 160605 160606 lin1538 lin1539   alaS FALSE 0.283 93.000 0.110 NA   NA
 160606 160607 lin1539 lin1540 alaS   FALSE 0.008 308.000 0.000 1.000 N NA
 160607 160608 lin1540 lin1541     TRUE 0.991 9.000 0.565 1.000 Y NA
 160609 160610 lin1542 lin1543     TRUE 0.994 -3.000 0.586 1.000 Y NA
 160611 160612 lin1544 lin1545     TRUE 0.698 26.000 0.174 1.000   NA
 160612 160613 lin1545 lin1546     TRUE 0.392 44.000 0.000 NA   NA
 160613 160614 lin1546 lin1547     FALSE 0.148 118.000 0.000 NA   NA
 160614 160615 lin1547 lin1548     TRUE 0.757 19.000 0.072 1.000 N NA
 160615 160616 lin1548 lin1549     FALSE 0.006 381.000 0.000 1.000 N NA
 160617 160618 lin1550 lin1551     FALSE 0.012 245.000 0.000 NA N NA
 160618 160619 lin1551 lin1552     TRUE 0.891 14.000 0.259 1.000 N NA
 160619 160620 lin1552 lin1553     FALSE 0.169 150.000 0.407 NA   NA
 160621 160622 lin1554 lin1555 aspS hisS TRUE 0.994 2.000 0.161 0.043 Y NA
 160624 160625 lin1557 lin1558   relA TRUE 0.850 16.000 0.177 1.000 N NA
 160625 160626 lin1558 lin1559 relA apt FALSE 0.033 206.000 0.068 1.000 N NA
 160626 160627 lin1559 lin1560 apt   TRUE 0.921 -10.000 0.128 1.000 N NA
 160627 160628 lin1560 lin1561     FALSE 0.220 105.000 0.026 NA   NA
 160628 160629 lin1561 lin1562     FALSE 0.252 97.000 0.048 NA   NA
 160629 160630 lin1562 lin1563     FALSE 0.255 110.000 0.185 NA   NA
 160630 160631 lin1563 lin1564     FALSE 0.124 141.000 0.013 NA   NA
 160631 160632 lin1564 lin1565     TRUE 0.522 34.000 0.325 1.000 N NA
 160632 160633 lin1565 lin1566     TRUE 0.843 87.000 0.360 0.001 Y NA
 160633 160634 lin1566 lin1567   ruvB TRUE 0.902 4.000 0.069 1.000 N NA
 160634 160635 lin1567 lin1568 ruvB ruvA TRUE 0.992 16.000 0.549 0.002 Y NA
 160635 160636 lin1568 lin1569 ruvA   FALSE 0.086 125.000 0.002 1.000 N NA
 160636 160637 lin1569 lin1570     FALSE 0.326 67.000 0.002 1.000   NA
 160637 160638 lin1570 lin1571     FALSE 0.199 113.000 0.016 1.000   NA
 160638 160639 lin1571 lin1572     FALSE 0.331 68.000 0.012 1.000   NA
 160639 160640 lin1572 lin1573     FALSE 0.092 160.000 0.010 1.000   NA
 160640 160641 lin1573 lin1574     FALSE 0.240 75.000 0.131 1.000 N NA
 160641 160642 lin1574 lin1575   rpmA FALSE 0.006 367.000 0.000 1.000 N NA
 160642 160643 lin1575 lin1576 rpmA   TRUE 0.985 14.000 0.203 NA Y NA
 160643 160644 lin1576 lin1577   rplU TRUE 0.971 19.000 0.208 NA Y NA
 160644 160645 lin1577 lin1578 rplU   TRUE 0.491 157.000 0.011 0.020 Y NA
 160645 160646 lin1578 lin1579   minD FALSE 0.298 53.000 0.060 1.000 N NA
 160646 160647 lin1579 lin1580 minD minC TRUE 0.992 3.000 0.368 1.000 Y NA
 160647 160648 lin1580 lin1581 minC mreD FALSE 0.052 179.000 0.106 1.000 N NA
 160648 160649 lin1581 lin1582 mreD mreC TRUE 0.996 3.000 0.550 0.003 Y NA
 160649 160650 lin1582 lin1583 mreC mreB FALSE 0.312 86.000 0.689 1.000 N NA
 160650 160651 lin1583 lin1584 mreB   FALSE 0.005 453.000 0.000 1.000 N NA
 160651 160652 lin1584 lin1585   comC TRUE 0.847 13.000 0.019 1.000 N NA
 160652 160653 lin1585 lin1586 comC folC FALSE 0.025 214.000 0.016 1.000 N NA
 160653 160654 lin1586 lin1587 folC valS FALSE 0.242 64.000 0.041 1.000 N NA
 160654 160655 lin1587 lin1588 valS hemL FALSE 0.007 322.000 0.000 1.000 N NA
 160655 160656 lin1588 lin1589 hemL hemB TRUE 0.993 13.000 0.126 0.002 Y NA
 160656 160657 lin1589 lin1590 hemB   TRUE 0.995 -3.000 0.042 0.002 Y NA
 160657 160658 lin1590 lin1591   hemC TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 160658 160659 lin1591 lin1592 hemC hemA TRUE 0.994 4.000 0.016 0.002 Y NA
 160659 160660 lin1592 lin1593 hemA   FALSE 0.167 128.000 0.020 1.000   NA
 160660 160661 lin1593 lin1594   thrS FALSE 0.210 106.000 0.010 1.000   NA
 160661 160662 lin1594 lin1595 thrS dnaI FALSE 0.007 351.000 0.000 1.000 N NA
 160662 160663 lin1595 lin1596 dnaI dnaB TRUE 0.992 10.000 0.817 NA Y NA
 160663 160664 lin1596 lin1597 dnaB   TRUE 0.901 6.000 0.109 NA N NA
 160664 160665 lin1597 lin1598     FALSE 0.177 78.000 0.024 NA N NA
 160665 160666 lin1598 lin1599   mutM TRUE 0.797 17.000 0.066 1.000 N NA
 160666 160667 lin1599 lin1600 mutM polA TRUE 0.928 24.000 0.101 1.000 Y NA
 160667 160668 lin1600 lin1601 polA citC FALSE 0.043 166.000 0.008 1.000 N NA
 160668 160669 lin1601 lin1602 citC citZ TRUE 0.964 20.000 0.140 1.000 Y NA
 160669 160670 lin1602 lin1603 citZ   TRUE 0.528 37.000 0.039 NA   NA
 160670 160671 lin1603 lin1604     FALSE 0.103 158.000 0.043 NA   NA
 160671 160672 lin1604 lin1605   pykA FALSE 0.212 120.000 0.082 1.000   NA
 160672 160673 lin1605 lin1606 pykA   FALSE 0.264 282.000 0.261 0.005 Y NA
 160673 160674 lin1606 lin1607   accA FALSE 0.016 285.000 0.047 1.000 N NA
 160674 160675 lin1607 lin1608 accA accD TRUE 0.996 -10.000 0.234 0.001 Y NA
 160675 160676 lin1608 lin1609 accD dnaE FALSE 0.047 216.000 0.003 0.059 N NA
 160676 160677 lin1609 lin1610 dnaE   FALSE 0.217 123.000 0.159 1.000   NA
 160677 160678 lin1610 lin1611     TRUE 0.831 21.000 0.189 1.000   NA
 160678 160679 lin1611 lin1612     TRUE 0.642 26.000 0.024 1.000   NA
 160683 160684 lin1616 lin1617 ackA   TRUE 0.623 24.000 0.217 1.000 N NA
 160684 160685 lin1617 lin1618     FALSE 0.010 444.000 0.000 NA   NA
 160685 160686 lin1618 lin1619     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 160686 160687 lin1619 lin1620     FALSE 0.145 120.000 0.000 NA   NA
 160687 160688 lin1620 lin1621     TRUE 0.877 18.000 0.154 NA   NA
 160688 160689 lin1621 lin1622     TRUE 0.963 -3.000 0.231 1.000   NA
 160690 160691 lin1623 lin1624     TRUE 0.658 37.000 0.500 1.000   NA
 160692 160693 lin1625 lin1626     TRUE 0.387 61.000 0.040 NA   NA
 160693 160694 lin1626 lin1627     TRUE 0.830 20.000 0.087 NA   NA
 160696 160697 lin1629 lin1630 argF argD TRUE 0.989 2.000 0.037 1.000 Y NA
 160697 160698 lin1630 lin1631 argD argB TRUE 0.993 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 160698 160699 lin1631 lin1632 argB argJ TRUE 0.992 13.000 0.067 0.002 Y NA
 160699 160700 lin1632 lin1633 argJ argC TRUE 0.991 16.000 0.303 0.002 Y NA
 160700 160701 lin1633 lin1634 argC   FALSE 0.088 172.000 0.013 0.043 N NA
 160701 160702 lin1634 lin1635     TRUE 0.939 2.000 0.349 1.000 N NA
 160702 160703 lin1635 lin1636     FALSE 0.133 128.000 0.201 1.000 N NA
 160704 160705 lin1637 lin1638   rpsD FALSE 0.022 212.000 0.005 NA N NA
 160706 160707 lin1639 lin1640 tyrS ccpA FALSE 0.007 322.000 0.000 1.000 N NA
 160707 160708 lin1640 lin1641 ccpA aroA FALSE 0.020 235.000 0.017 1.000 N NA
 160708 160709 lin1641 lin1642 aroA   FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 160709 160710 lin1642 lin1643     TRUE 0.798 22.000 0.175 NA   NA
 160712 160713 lin1645 lin1646   murC FALSE 0.060 145.000 0.010 1.000 N NA
 160713 160714 lin1646 lin1647 murC   FALSE 0.036 296.000 0.017 0.004 N NA
 160714 160715 lin1647 lin1648   pheT FALSE 0.029 309.000 0.143 1.000   NA
 160715 160716 lin1648 lin1649 pheT   TRUE 0.961 6.000 0.511 NA   NA
 160716 160717 lin1649 lin1650     TRUE 0.669 35.000 0.500 NA   NA
 160717 160718 lin1650 lin1651     FALSE 0.234 114.000 0.140 NA   NA
 160718 160719 lin1651 lin1652     TRUE 0.960 -7.000 0.224 NA   NA
 160721 160722 lin1654 lin1655     FALSE 0.164 134.000 0.074 NA   NA
 160722 160723 lin1655 lin1656     TRUE 0.423 62.000 0.117 1.000   NA
 160723 160724 lin1656 lin1657     TRUE 0.946 7.000 0.154 1.000   NA
 160724 160725 lin1657 lin1658     FALSE 0.019 204.000 0.000 1.000 N NA
 160725 160726 lin1658 lin1659     TRUE 0.933 3.000 0.297 1.000 N NA
 160726 160727 lin1659 lin1660   daaA FALSE 0.015 224.000 0.000 1.000 N NA
 160727 160728 lin1660 lin1661 daaA   TRUE 0.652 113.000 0.347 1.000 Y NA
 160728 160729 lin1661 lin1662     FALSE 0.272 74.000 0.224 1.000 N NA
 160731 160732 lin1664 lin1665     TRUE 0.978 10.000 0.833 0.070   NA
 160732 160733 lin1665 lin1666     TRUE 0.573 111.000 0.900 0.001   NA
 160733 160734 lin1666 lin1667     TRUE 0.431 85.000 0.750 NA   NA
 160734 160735 lin1667 lin1668   trpA FALSE 0.326 71.000 0.024 NA   NA
 160735 160736 lin1668 lin1669 trpA trpB TRUE 0.996 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 160736 160737 lin1669 lin1670 trpB trpF TRUE 0.996 0.000 0.375 0.002 Y NA
 160737 160738 lin1670 lin1671 trpF trpC TRUE 0.996 -3.000 0.264 0.002 Y NA
 160738 160739 lin1671 lin1672 trpC trpD TRUE 0.992 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 160739 160740 lin1672 lin1673 trpD trpG TRUE 0.988 -28.000 0.018 1.000 Y NA
 160740 160741 lin1673 lin1674 trpG trpE TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 160742 160743 lin1675 lin1676     FALSE 0.303 124.000 0.750 NA   NA
 160743 160744 lin1676 lin1677     TRUE 0.414 84.000 0.625 NA   NA
 160744 160745 lin1677 lin1678     TRUE 0.971 -3.000 0.579 NA   NA
 160746 160747 lin1679 lin1680     TRUE 0.895 0.000 0.019 NA N NA
 160747 160748 lin1680 lin1681     TRUE 0.913 13.000 0.017 NA   NA
 160748 160749 lin1681 lin1682   citB FALSE 0.214 104.000 0.015 NA   NA
 160749 160750 lin1682 lin1683 citB   FALSE 0.047 155.000 0.008 NA N NA
 160750 160751 lin1683 lin1684     TRUE 0.785 24.000 0.500 NA   NA
 160751 160752 lin1684 lin1685     TRUE 0.956 0.000 0.132 NA   NA
 160752 160753 lin1685 lin1686   sbcC TRUE 0.670 84.000 0.023 1.000 Y NA
 160753 160754 lin1686 lin1687 sbcC   TRUE 0.997 -3.000 0.669 0.003 Y NA
 160756 160757 lin1689 lin1690     FALSE 0.140 174.000 0.600 NA   NA
 160757 160758 lin1690 lin1691     FALSE 0.195 81.000 0.083 NA N NA
 160758 160759 lin1691 lin1692     TRUE 0.996 -16.000 0.911 0.008 Y NA
 160759 160760 lin1692 lin1693     FALSE 0.011 414.000 0.000 NA   NA
 160760 160761 lin1693 lin1694     TRUE 0.938 16.000 0.667 NA   NA
 160761 160762 lin1694 lin1695     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 160762 160763 lin1695 lin1696     FALSE 0.012 387.000 0.000 NA   NA
 160764 160765 lin1697 lin1698     TRUE 0.736 34.000 1.000 NA   NA
 160765 160766 lin1698 lin1699     TRUE 0.962 5.000 0.500 NA   NA
 160767 160768 lin1700 lin1701     TRUE 0.973 3.000 1.000 NA   NA
 160768 160769 lin1701 lin1702     TRUE 0.963 0.000 0.286 NA   NA
 160769 160770 lin1702 lin1703     TRUE 0.903 11.000 0.000 NA   NA
 160770 160771 lin1703 lin1704     TRUE 0.789 19.000 0.000 NA   NA
 160771 160772 lin1704 lin1705     TRUE 0.922 -24.000 0.000 NA   NA
 160772 160773 lin1705 lin1706     TRUE 0.487 32.000 0.000 NA   NA
 160773 160774 lin1706 lin1707     TRUE 0.508 30.000 0.000 NA   NA
 160774 160775 lin1707 lin1708     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 160775 160776 lin1708 lin1709     TRUE 0.732 21.000 0.000 NA   NA
 160776 160777 lin1709 lin1710     TRUE 0.966 -10.000 0.444 NA   NA
 160777 160778 lin1710 lin1711     TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA   NA
 160778 160779 lin1711 lin1712     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   NA
 160779 160780 lin1712 lin1713     TRUE 0.962 1.000 0.300 NA   NA
 160780 160781 lin1713 lin1714     TRUE 0.971 0.000 0.600 NA   NA
 160781 160782 lin1714 lin1715     TRUE 0.961 0.000 0.250 NA   NA
 160782 160783 lin1715 lin1716     TRUE 0.915 6.000 0.000 1.000   NA
 160783 160784 lin1716 lin1717     TRUE 0.924 2.000 0.000 NA   NA
 160784 160785 lin1717 lin1718     TRUE 0.965 -37.000 0.500 NA   NA
 160785 160786 lin1718 lin1719     TRUE 0.621 53.000 1.000 NA   NA
 160786 160787 lin1719 lin1720     TRUE 0.908 17.000 0.333 NA   NA
 160787 160788 lin1720 lin1721     TRUE 0.953 5.000 0.250 NA   NA
 160788 160789 lin1721 lin1722     TRUE 0.969 -10.000 0.600 NA   NA
 160789 160790 lin1722 lin1723     TRUE 0.972 0.000 0.667 NA   NA
 160790 160791 lin1723 lin1724     TRUE 0.972 0.000 0.667 NA   NA
 160791 160792 lin1724 lin1725     TRUE 0.961 12.000 0.750 NA   NA
 160792 160793 lin1725 lin1726     TRUE 0.751 23.000 0.136 NA   NA
 160793 160794 lin1726 lin1727     TRUE 0.810 21.000 0.091 NA   NA
 160794 160795 lin1727 lin1728     TRUE 0.953 0.000 0.087 NA   NA
 160795 160796 lin1728 lin1729     TRUE 0.466 49.000 0.087 NA   NA
 160796 160797 lin1729 lin1730     TRUE 0.958 -3.000 0.167 NA   NA
 160797 160798 lin1730 lin1731     TRUE 0.964 -7.000 0.333 NA   NA
 160798 160799 lin1731 lin1732     TRUE 0.945 14.000 0.500 NA   NA
 160799 160800 lin1732 lin1733     TRUE 0.965 -22.000 0.500 NA   NA
 160800 160801 lin1733 lin1734     TRUE 0.380 46.000 0.000 NA   NA
 160801 160802 lin1734 lin1735     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 160802 160803 lin1735 lin1736     FALSE 0.302 131.000 1.000 NA   NA
 160803 160804 lin1736 lin1737     TRUE 0.643 48.000 1.000 NA   NA
 160804 160805 lin1737 lin1738     FALSE 0.016 818.000 0.000 0.058   NA
 160805 160806 lin1738 lin1739     TRUE 0.956 13.000 0.667 1.000   NA
 160806 160807 lin1739 lin1740     TRUE 0.457 78.000 0.667 NA   NA
 160807 160808 lin1740 lin1741     TRUE 0.944 12.000 0.250 NA   NA
 160808 160809 lin1741 lin1742     FALSE 0.009 584.000 0.000 NA   NA
 160809 160810 lin1742 lin1743     TRUE 0.941 13.000 0.000 0.057   NA
 160810 160811 lin1743 lin1744     FALSE 0.029 237.000 0.000 NA   NA
 160811 160812 lin1744 lin1745     TRUE 0.974 -3.000 0.714 NA   NA
 160812 160813 lin1745 lin1746     TRUE 0.951 12.000 0.400 NA   NA
 160813 160814 lin1746 lin1747     TRUE 0.968 -40.000 0.667 NA   NA
 160814 160815 lin1747 lin1748     TRUE 0.564 41.000 0.222 NA   NA
 160815 160816 lin1748 lin1749     TRUE 0.749 22.000 0.018 NA   NA
 160816 160817 lin1749 lin1750     TRUE 0.923 -19.000 0.000 NA   NA
 160817 160818 lin1750 lin1751     TRUE 0.920 -43.000 0.000 NA   NA
 160818 160819 lin1751 lin1752     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 160819 160820 lin1752 lin1753     TRUE 0.957 -124.000 0.286 NA   NA
 160820 160821 lin1753 lin1754     TRUE 0.916 12.000 0.005 NA   NA
 160821 160822 lin1754 lin1755     TRUE 0.936 -61.000 0.011 1.000   NA
 160822 160823 lin1755 lin1756     TRUE 0.940 4.000 0.040 NA   NA
 160823 160824 lin1756 lin1757     TRUE 0.920 -55.000 0.000 NA   NA
 160824 160825 lin1757 lin1758     TRUE 0.809 18.000 0.000 NA   NA
 160825 160826 lin1758 lin1759     FALSE 0.058 178.000 0.000 NA   NA
 160826 160827 lin1759 lin1760     FALSE 0.009 627.000 0.000 NA   NA
 160827 160828 lin1760 lin1761     FALSE 0.263 72.000 0.000 NA   NA
 160829 160830 lin1762 lin1763     TRUE 0.439 23.000 0.000 NA N NA
 160830 160831 lin1763 lin1764     TRUE 0.453 36.000 0.000 NA   NA
 160831 160832 lin1764 lin1765     FALSE 0.222 82.000 0.000 NA   NA
 160833 160834 lin1766 lin1767 tsf rpsB TRUE 0.790 80.000 0.748 1.000 Y NA
 160834 160835 lin1767 lin1768 rpsB   FALSE 0.046 195.000 0.000 NA   NA
 160835 160836 lin1768 lin1769   leuS FALSE 0.139 132.000 0.002 NA   NA
 160837 160838 lin1770 lin1771     TRUE 0.968 -3.000 0.408 1.000   NA
 160839 160840 lin1772 lin1773 ansB metK FALSE 0.099 137.000 0.108 1.000 N NA
 160842 160843 lin1775 lin1776     TRUE 0.891 17.000 0.167 NA   NA
 160843 160844 lin1776 lin1777     TRUE 0.508 51.000 0.250 NA   NA
 160845 160846 lin1778 lin1779     FALSE 0.107 149.000 0.007 1.000   NA
 160847 160848 lin1780 lin1781 menE menB TRUE 0.944 16.000 0.193 0.001 N NA
 160848 160849 lin1781 lin1782 menB   TRUE 0.964 -3.000 0.280 1.000   NA
 160849 160850 lin1782 lin1783   menD TRUE 0.963 2.000 0.355 1.000   NA
 160850 160851 lin1783 lin1784 menD menF TRUE 0.991 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 160853 160854 lin1786 lin1787     TRUE 0.991 -3.000 0.162 1.000 Y NA
 160854 160855 lin1787 lin1788     TRUE 0.997 -7.000 0.600 0.001 Y NA
 160855 160856 lin1788 lin1789     TRUE 0.943 22.000 0.017 1.000 Y NA
 160856 160857 lin1789 lin1790     FALSE 0.008 308.000 0.000 1.000 N NA
 160857 398416 lin1790 lint17   tRNA-Glu FALSE 0.295 64.000 0.000 NA   NA
 398416 398415 lint17 lint18 tRNA-Glu tRNA-Ser TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 398415 398414 lint18 lint19 tRNA-Ser tRNA-Asn TRUE 0.443 37.000 0.000 NA   NA
 398414 398413 lint19 lint20 tRNA-Asn tRNA-Ile TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 398413 398412 lint20 lint21 tRNA-Ile tRNA-Gly TRUE 0.551 27.000 0.000 NA   NA
 398412 398411 lint21 lint22 tRNA-Gly tRNA-His TRUE 0.646 23.000 0.000 NA   NA
 398411 398410 lint22 lint23 tRNA-His tRNA-Phe TRUE 0.551 27.000 0.000 NA   NA
 398410 398409 lint23 lint24 tRNA-Phe tRNA-Asp TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 398409 398408 lint24 lint25 tRNA-Asp tRNA-Met TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 398408 398407 lint25 lint26 tRNA-Met tRNA-Ser TRUE 0.397 43.000 0.000 NA   NA
 398407 398406 lint26 lint27 tRNA-Ser tRNA-Met TRUE 0.646 23.000 0.000 NA   NA
 398406 398405 lint27 lint28 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.899 12.000 0.000 NA   NA
 398405 398404 lint28 lint29 tRNA-Met tRNA-Ala FALSE 0.334 55.000 0.000 NA   NA
 398404 398403 lint29 lint30 tRNA-Ala tRNA-Pro TRUE 0.759 20.000 0.000 NA   NA
 398403 398402 lint30 lint31 tRNA-Pro tRNA-Arg TRUE 0.903 11.000 0.000 NA   NA
 398402 398401 lint31 lint32 tRNA-Arg tRNA-Leu TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 398401 398400 lint32 lint33 tRNA-Leu tRNA-Gly TRUE 0.868 15.000 0.000 NA   NA
 398400 398399 lint33 lint34 tRNA-Gly tRNA-Leu TRUE 0.851 16.000 0.000 NA   NA
 398399 398398 lint34 lint35 tRNA-Leu tRNA-Lys TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 398398 398397 lint35 lint36 tRNA-Lys tRNA-Thr TRUE 0.412 41.000 0.000 NA   NA
 398397 398396 lint36 lint37 tRNA-Thr tRNA-Val TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 398396 1789938 lint37 linr07 tRNA-Val   TRUE 0.827 17.000 0.000 NA   NA
 1789938 1789939 linr07 linr08     FALSE 0.227 81.000 0.000 NA   NA
 1789939 1789940 linr08 linr09     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 1789940 160858 linr09 lin1791     FALSE 0.010 453.000 0.000 NA   NA
 160858 160859 lin1791 lin1792     FALSE 0.210 83.000 0.146 1.000 N NA
 160860 160861 lin1793 lin1794 gsaB   FALSE 0.249 106.000 0.102 NA   NA
 160862 160863 lin1795 lin1796     FALSE 0.065 155.000 0.088 NA N NA
 160863 160864 lin1796 lin1797     TRUE 0.877 4.000 0.010 1.000 N NA
 160866 160867 lin1799 lin1800     TRUE 0.919 12.000 0.013 NA   NA
 160867 160868 lin1800 lin1801     TRUE 0.940 2.000 0.015 NA   NA
 160870 160871 lin1803 lin1804     TRUE 0.658 26.000 0.059 NA   NA
 160874 160875 lin1807 lin1808     TRUE 0.714 28.000 0.400 NA   NA
 160876 160877 lin1809 lin1810     TRUE 0.872 21.000 0.579 NA   NA
 160877 160878 lin1810 lin1811     FALSE 0.135 71.000 0.000 NA N NA
 160878 1789941 lin1811 lin1812     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 1789941 160879 lin1812 lin1813     TRUE 0.922 -21.000 0.000 NA   NA
 160879 160880 lin1813 lin1814     TRUE 0.973 17.000 0.041 1.000 Y NA
 160880 160881 lin1814 lin1815     FALSE 0.011 267.000 0.000 1.000 N NA
 160881 160882 lin1815 lin1816     FALSE 0.262 65.000 0.090 1.000 N NA
 160886 160887 lin1820 lin1821     FALSE 0.122 129.000 0.156 1.000 N NA
 160888 160889 lin1822 lin1823     FALSE 0.131 138.000 0.355 1.000 N NA
 160889 160890 lin1823 lin1824     TRUE 0.681 103.000 0.323 1.000 Y NA
 160890 160891 lin1824 lin1825     FALSE 0.016 220.000 0.000 1.000 N NA
 160891 398367 lin1825 lint38   tRNA-Arg FALSE 0.162 111.000 0.000 NA   NA
 160894 160895 lin1828 lin1829     FALSE 0.032 232.000 0.000 1.000   NA
 160895 160896 lin1829 lin1830     TRUE 0.870 22.000 0.800 1.000   NA
 160896 160897 lin1830 lin1831     TRUE 0.890 70.000 1.000 0.023 Y NA
 160897 160898 lin1831 lin1832     FALSE 0.137 158.000 0.167 0.033 N NA
 160898 160899 lin1832 lin1833     TRUE 0.635 135.000 0.026 0.004 Y NA
 160899 160900 lin1833 lin1834     TRUE 0.489 43.000 0.052 NA   NA
 160900 160901 lin1834 lin1835     TRUE 0.952 -7.000 0.071 NA   NA
 160901 160902 lin1835 lin1836     TRUE 0.915 -7.000 0.071 1.000 N NA
 160902 160903 lin1836 lin1837     FALSE 0.229 121.000 0.182 1.000   NA
 160903 160904 lin1837 lin1838     TRUE 0.459 60.000 0.205 1.000   NA
 160904 160905 lin1838 lin1839     TRUE 0.404 48.000 0.293 1.000 N NA
 160905 160906 lin1839 lin1840     TRUE 0.992 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 160907 160908 lin1841 lin1842     TRUE 0.891 61.000 0.660 0.031 Y NA
 160908 160909 lin1842 lin1843     TRUE 0.982 18.000 0.120 0.049 Y NA
 160910 160911 lin1844 lin1845     TRUE 0.992 15.000 0.222 0.001 Y NA
 160913 160914 lin1847 lin1848     TRUE 0.971 3.000 0.091 0.051   NA
 160914 160915 lin1848 lin1849     FALSE 0.141 92.000 0.015 1.000 N NA
 160915 160916 lin1849 lin1850     TRUE 0.990 2.000 0.131 1.000 Y NA
 160916 160917 lin1850 lin1851     TRUE 0.988 11.000 0.136 1.000 Y NA
 160917 160918 lin1851 lin1852     FALSE 0.005 400.000 0.000 1.000 N NA
 160918 160919 lin1852 lin1853   adeC TRUE 0.635 22.000 0.040 1.000 N NA
 160919 160920 lin1853 lin1854 adeC   TRUE 0.796 21.000 0.045 NA   NA
 160920 160921 lin1854 lin1855     TRUE 0.814 21.000 0.104 NA   NA
 160921 160922 lin1855 lin1856     FALSE 0.242 72.000 0.104 1.000 N NA
 160922 160923 lin1856 lin1857     TRUE 0.481 62.000 0.333 1.000   NA
 160923 160924 lin1857 lin1859     TRUE 0.969 -43.000 0.667 1.000   NA
 160924 160925 lin1859 lin1860     FALSE 0.194 130.000 0.167 NA   NA
 160927 160928 lin1862 lin1863     FALSE 0.015 343.000 0.000 NA   NA
 160928 160929 lin1863 lin1864     TRUE 0.712 24.000 0.103 NA   NA
 160929 160930 lin1864 lin1865     FALSE 0.138 148.000 0.132 NA   NA
 160930 160931 lin1865 lin1866   gatB FALSE 0.075 142.000 0.034 1.000 N NA
 160931 160932 lin1866 lin1867 gatB gatA TRUE 0.995 12.000 0.492 0.001 Y NA
 160932 160933 lin1867 lin1868 gatA gatC TRUE 0.973 24.000 0.643 0.001 Y NA
 160933 160934 lin1868 lin1869 gatC   FALSE 0.166 124.000 0.013 NA   NA
 160934 160935 lin1869 lin1870     TRUE 0.944 -3.000 0.010 NA   NA
 160935 160936 lin1870 lin1871   pcrA TRUE 0.956 24.000 0.103 0.013 Y NA
 160936 160937 lin1871 lin1872 pcrA   TRUE 0.380 65.000 0.054 1.000   NA
 160939 160940 lin1874 lin1875     TRUE 0.849 19.000 0.068 NA   NA
 160940 160941 lin1875 lin1876   purD FALSE 0.133 138.000 0.011 1.000   NA
 160941 160942 lin1876 lin1877 purD purH TRUE 0.919 27.000 0.238 1.000 Y NA
 160942 160943 lin1877 lin1878 purH purN TRUE 0.990 6.000 0.225 1.000 Y NA
 160943 160944 lin1878 lin1879 purN purM TRUE 0.996 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 160944 160945 lin1879 lin1880 purM purF TRUE 0.972 19.000 0.248 1.000 Y NA
 160945 160946 lin1880 lin1881 purF purQ TRUE 0.991 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 160946 160947 lin1881 lin1882 purQ purL TRUE 0.996 -7.000 0.346 0.001 Y NA
 160947 160948 lin1882 lin1883 purL   TRUE 0.996 4.000 0.656 0.001 Y NA
 160948 160949 lin1883 lin1884   purC TRUE 0.990 12.000 0.460 1.000 Y NA
 160949 160950 lin1884 lin1885 purC purB TRUE 0.701 81.000 0.072 1.000 Y NA
 160950 160951 lin1885 lin1886 purB purK TRUE 0.963 19.000 0.010 1.000 Y NA
 160951 160952 lin1886 lin1887 purK purE TRUE 0.995 -7.000 0.011 0.001 Y NA
 160952 160953 lin1887 lin1888 purE   FALSE 0.037 214.000 0.000 NA   NA
 160953 1789942 lin1888 linr10     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 1789942 1789943 linr10 linr11     FALSE 0.227 81.000 0.000 NA   NA
 1789943 1789944 linr11 linr12     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 1789944 160954 linr12 lin1889     FALSE 0.015 337.000 0.000 NA   NA
 160955 160956 lin1890 lin1891     TRUE 0.536 51.000 0.367 NA   NA
 160957 160958 lin1892 lin1893     TRUE 0.458 58.000 0.200 NA   NA
 160960 160961 lin1895 lin1896 rplT rpmI TRUE 0.942 40.000 0.928 0.018 Y NA
 160961