MicrobesOnline Operon Predictions for Haloarcula marismortui ATCC 43049

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 749845 749846 rrlB-2 rrlA-2     FALSE 0.052 140.000 0.000 NA   NA
 749846 749847 rrlA-2 rrs-2     FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 749851 749852 rrnB0006 rrnB0007     FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 749857 749858 rrnB0013 rrnB0014     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749858 749859 rrnB0014 rrnB0015     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749860 749861 rrnB0016 rrnB0017     FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 749862 749863 rrnB0018 rrnB0019 flaA1   FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 749865 749866 rrnB0021 rrnB0022     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 749867 749868 rrnB0023 rrnB0024     FALSE 0.018 233.000 0.000 NA   NA
 749872 749873 rrnB0028 rrnB0029 tnp yhcR4 FALSE 0.018 297.000 0.000 1.000   NA
 749873 749874 rrnB0029 rrnB0030 yhcR4   FALSE 0.005 532.000 0.000 NA   NA
 749877 749878 rrnB0034 rrnB0036   nadC2 TRUE 0.734 61.000 1.000 NA   NA
 749878 749879 rrnB0036 rrnB0037 nadC2   FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 749879 749880 rrnB0037 rrnB0038   usp11 FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 749882 749883 rrnB0041 rrnB0042 xseA2 exoVIIB TRUE 0.991 -3.000 0.412 0.002   NA
 749883 749884 rrnB0042 rrnB0043 exoVIIB   FALSE 0.004 647.000 0.000 NA   NA
 749888 749889 rrnB0047 rrnB0049   apbE TRUE 0.544 6.000 0.000 NA   NA
 749889 749890 rrnB0049 rrnB0050 apbE   FALSE 0.448 -16.000 0.000 NA   NA
 749890 749891 rrnB0050 rrnB0051     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749892 749893 rrnB0052 rrnB0053     TRUE 0.617 4.000 0.000 NA   NA
 749893 749894 rrnB0053 rrnB0055     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 749894 749895 rrnB0055 rrnB0056     FALSE 0.070 93.000 0.000 NA   NA
 749895 749896 rrnB0056 rrnB0058     TRUE 0.976 -3.000 0.214 NA   NA
 749896 749897 rrnB0058 rrnB0059     FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 749897 749898 rrnB0059 rrnB0060     FALSE 0.004 591.000 0.000 NA   NA
 749898 749899 rrnB0060 rrnB0061     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 749899 749900 rrnB0061 rrnB0062   parA3 TRUE 0.962 -7.000 0.500 NA   NA
 749900 749901 rrnB0062 rrnB0063 parA3 cdc6a FALSE 0.003 550.000 0.000 1.000 N NA
 749902 749903 rrnB0064 rrnB0065     FALSE 0.090 58.000 0.000 NA   NA
 749904 749905 rrnB0067 rrnB0068     FALSE 0.480 77.000 0.286 NA   NA
 749905 749906 rrnB0068 rrnB0069     TRUE 0.852 17.000 0.091 NA   NA
 749906 749907 rrnB0069 rrnB0070   speE TRUE 0.966 0.000 0.058 NA   NA
 749911 749912 rrnB0074 rrnB0077     FALSE 0.003 1159.000 0.000 NA   NA
 749913 749914 rrnB0076 rrnB0078     FALSE 0.008 354.000 0.000 NA   NA
 749914 749915 rrnB0078 rrnB0079     FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 749915 749916 rrnB0079 rrnB0080     FALSE 0.082 64.000 0.000 NA   NA
 749917 749918 rrnB0081 rrnB0082     FALSE 0.497 -10.000 0.000 NA   NA
 749918 749919 rrnB0082 rrnB0083   ski-1 FALSE 0.003 753.000 0.000 NA   NA
 749920 749921 rrnB0084 rrnB0085     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 749921 749922 rrnB0085 rrnB0086     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 749922 749923 rrnB0086 rrnB0087   ski-2 FALSE 0.494 84.000 0.333 NA   NA
 749923 749924 rrnB0087 rrnB0089 ski-2   TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749926 749927 rrnB0093 rrnB0094   tnp FALSE 0.082 64.000 0.000 NA   NA
 749927 749928 rrnB0094 rrnB0095 tnp aldY6 FALSE 0.004 474.000 0.000 1.000 N NA
 749930 749931 rrnB0097 rrnB0098 hcp7   FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 749931 749932 rrnB0098 rrnB0099     FALSE 0.069 80.000 0.000 NA   NA
 749932 749933 rrnB0099 rrnB0100     FALSE 0.040 158.000 0.000 NA   NA
 749933 749934 rrnB0100 rrnB0102   suhB2 FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 749934 749935 rrnB0102 rrnB0103 suhB2 rbsB-3 FALSE 0.464 130.000 0.000 1.000 Y NA
 749935 749936 rrnB0103 rrnB0104 rbsB-3 malFG-9 TRUE 0.954 25.000 0.065 0.049 Y NA
 749936 749937 rrnB0104 rrnB0105 malFG-9 malFG-10 TRUE 0.995 2.000 0.400 0.049 Y NA
 749937 749938 rrnB0105 rrnB0106 malFG-10 ugpC2 TRUE 0.876 56.000 0.400 0.049 Y NA
 749938 749939 rrnB0106 rrnB0107 ugpC2   FALSE 0.105 82.000 0.000 1.000   NA
 749940 749941 rrnB0108 rrnB0109     FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 749941 749942 rrnB0109 rrnB0111     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749942 749943 rrnB0111 rrnB0112     FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 749943 749944 rrnB0112 rrnB0113   gatA2 FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 749944 749945 rrnB0113 rrnB0114 gatA2   FALSE 0.017 241.000 0.000 NA   NA
 749946 749947 trn49 rrnB0115     FALSE 0.004 617.000 0.000 NA   NA
 749947 749948 rrnB0115 rrnB0116     FALSE 0.003 1293.000 0.000 NA   NA
 749949 749950 rrnB0117 rrnB0118     TRUE 0.608 73.000 0.600 NA   NA
 749951 749952 rrnB0120 rrnB0121     FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 749954 749955 rrnB0123 rrnB0124     TRUE 0.780 1.000 0.000 NA   NA
 749955 749956 rrnB0124 rrnB0127     FALSE 0.010 321.000 0.000 NA   NA
 749956 749957 rrnB0127 rrnB0129     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 749957 749958 rrnB0129 rrnB0130     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 749960 749961 rrnB0133 rrnB0134     FALSE 0.161 136.000 0.000 0.084   NA
 749961 749962 rrnB0134 rrnB0136     FALSE 0.499 8.000 0.000 NA   NA
 749964 749965 rrnB0138 rrnB0140     FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 749965 749966 rrnB0140 rrnB0142     FALSE 0.003 1300.000 0.000 NA   NA
 749966 749967 rrnB0142 rrnB0143   tnp TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 749967 749968 rrnB0143 rrnB0145 tnp   FALSE 0.090 58.000 0.000 NA   NA
 749968 749969 rrnB0145 rrnB0146   tnp FALSE 0.021 274.000 0.000 1.000   NA
 749969 749970 rrnB0146 rrnB0147 tnp   FALSE 0.004 580.000 0.000 NA   NA
 749970 749971 rrnB0147 rrnB0148   tfbC FALSE 0.007 382.000 0.000 NA   NA
 749971 749972 rrnB0148 rrnB0151 tfbC   FALSE 0.007 548.000 0.000 1.000   NA
 749972 749973 rrnB0151 rrnB0152     TRUE 0.960 -10.000 0.750 NA   NA
 749975 749976 rrnB0155 rrnB0156     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 749976 749977 rrnB0156 rrnB0157     FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 749977 749978 rrnB0157 rrnB0158     FALSE 0.090 58.000 0.000 NA   NA
 749978 749979 rrnB0158 rrnB0160     FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 749979 749980 rrnB0160 rrnB0161     FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 749981 749982 rrnB0162 rrnB0163     FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 749982 749983 rrnB0163 rrnB0164     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 749983 749984 rrnB0164 rrnB0166     FALSE 0.005 469.000 0.000 NA   NA
 749984 749985 rrnB0166 rrnB0167   cbp TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 749986 749987 rrnB0168 rrnB0169     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 749987 749988 rrnB0169 rrnB0170     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 749989 749990 rrnB0171 rrnB0172     TRUE 0.791 50.000 1.000 NA   NA
 749992 749993 rrnB0175 rrnB0176 imd2   FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 749993 749994 rrnB0176 rrnB0177     FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 749994 749995 rrnB0177 rrnB0179     FALSE 0.004 744.000 0.000 NA   NA
 749998 749999 rrnB0181 rrnB0183   tnp FALSE 0.152 45.000 0.000 NA   NA
 750001 750002 rrnB0185 rrnB0186     FALSE 0.052 139.000 0.000 NA   NA
 750002 750003 rrnB0186 rrnB0187     TRUE 0.965 -3.000 0.042 1.000   NA
 750003 750004 rrnB0187 rrnB0188     TRUE 0.981 0.000 0.286 NA   NA
 750005 750006 rrnB0189 rrnB0190     FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 750006 750007 rrnB0190 rrnB0191     FALSE 0.091 280.000 0.091 NA   NA
 750008 750009 rrnB0192 rrnB0193 usp1   FALSE 0.068 84.000 0.000 NA   NA
 750010 750011 rrnB0195 rrnB0196     FALSE 0.003 1410.000 0.000 NA   NA
 750011 750012 rrnB0196 rrnB0197   lpdA3 FALSE 0.399 -34.000 0.000 NA   NA
 750012 750013 rrnB0197 rrnB0198 lpdA3 pdhC1 TRUE 0.984 0.000 0.000 1.000 Y NA
 750013 750014 rrnB0198 rrnB0199 pdhC1 pdhB2 TRUE 0.905 -91.000 0.000 0.097 Y NA
 750014 750015 rrnB0199 rrnB0200 pdhB2 pdhA2 TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 750015 750016 rrnB0200 rrnB0202 pdhA2 livF-8 FALSE 0.003 667.000 0.000 1.000 N NA
 750016 750017 rrnB0202 rrnB0203 livF-8 livG-8 TRUE 0.994 -3.000 0.089 0.031 Y NA
 750017 750018 rrnB0203 rrnB0204 livG-8 livM-7 TRUE 0.960 -82.000 0.286 1.000 Y NA
 750018 750019 rrnB0204 rrnB0205 livM-7 livH-8 TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 750019 750020 rrnB0205 rrnB0206 livH-8 aspC1 FALSE 0.143 294.000 0.000 1.000 Y NA
 750020 750021 rrnB0206 rrnB0207 aspC1   FALSE 0.270 185.000 0.000 NA Y NA
 750021 750022 rrnB0207 rrnB0208     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 750023 750024 rrnB0209 rrnB0210 ilvB3 galE10 TRUE 0.642 62.000 0.625 1.000 N NA
 750024 750025 rrnB0210 rrnB0212 galE10 pepB5 FALSE 0.049 115.000 0.000 1.000 N NA
 750025 750026 rrnB0212 rrnB0214 pepB5   FALSE 0.385 87.000 0.211 NA N NA
 750026 750027 rrnB0214 rrnB0215     FALSE 0.150 158.000 0.034 NA N NA
 750027 750028 rrnB0215 rrnB0217   acs2 FALSE 0.021 54.000 0.000 NA N NA
 750029 750030 rrnB0218 rrnB0219 npdG-2 gabD FALSE 0.085 135.000 0.000 1.000   NA
 750031 750032 rrnB0220 rrnB0221     TRUE 0.977 2.000 0.333 NA   NA
 750032 750033 rrnB0221 rrnB0222   kdgR2 FALSE 0.005 1325.000 0.000 1.000   NA
 750034 750035 rrnB0224 rrnB0225 livF-9 livG-10 TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.031 Y NA
 750035 750036 rrnB0225 rrnB0227 livG-10 livH-9 TRUE 0.992 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 750036 750037 rrnB0227 rrnB0228 livH-9   TRUE 0.985 9.000 0.600 1.000 Y NA
 750037 750038 rrnB0228 rrnB0229   pga-1 FALSE 0.090 130.000 0.000 1.000   NA
 750038 750039 rrnB0229 rrnB0230 pga-1 pga-2 FALSE 0.104 208.000 0.000 0.001   NA
 750039 750040 rrnB0230 rrnB0231 pga-2 paaK2 FALSE 0.036 208.000 0.000 1.000   NA
 750044 750045 rrnB0237 rrnB0238 ech4 hbd3 TRUE 0.995 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 750047 750048 rrnB0241 rrnB0242 acaA acaB2 TRUE 0.991 -3.000 0.040 1.000 Y NA
 750051 750052 rrnB0245 rrnB0246 maoC2 aldY5 FALSE 0.097 148.000 0.000 0.096 N NA
 750053 750054 rrnB0247 rrnB0248     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 750054 750055 rrnB0248 rrnB0249   paaC TRUE 0.888 -7.000 0.035 NA   NA
 750055 750056 rrnB0249 rrnB0250 paaC pacF TRUE 0.992 0.000 0.943 NA   NA
 750056 750057 rrnB0250 rrnB0252 pacF paaA TRUE 0.971 6.000 0.920 NA   NA
 750058 750059 rrnB0253 rrnB0254 boa-12 ech6 TRUE 0.555 74.000 0.429 NA   NA
 750061 750062 rrnB0257 rrnB0259 citE2 fapS FALSE 0.134 43.000 0.000 1.000 N NA
 750063 750064 rrnB0260 rrnB0261 maoC3 pccB TRUE 0.977 4.000 0.033 1.000 Y NA
 750064 750065 rrnB0261 rrnB0263 pccB accC1 TRUE 0.991 3.000 0.273 1.000 Y NA
 750065 750066 rrnB0263 rrnB0264 accC1 acdH TRUE 0.997 0.000 0.750 1.000 Y NA
 750066 750067 rrnB0264 rrnB0265 acdH acs4 TRUE 0.899 46.000 0.400 1.000 Y NA
 750067 750068 rrnB0265 rrnB0266 acs4   TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 750068 750069 rrnB0266 rrnB0267   ubiD FALSE 0.132 390.000 0.667 NA   NA
 750069 750070 rrnB0267 rrnB0268 ubiD   TRUE 0.977 4.000 0.833 NA   NA
 750071 750072 rrnB0269 rrnB0270   zntA2 TRUE 0.561 60.000 0.333 NA   NA
 750073 750074 rrnB0271 rrnB0272     FALSE 0.021 220.000 0.000 NA   NA
 750077 750078 rrnB0275 rrnB0277   trxA5 FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000 N NA
 750078 750079 rrnB0277 rrnB0278 trxA5   FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 750080 750081 rrnB0280 rrnB0281     TRUE 0.811 12.000 0.026 NA   NA
 750081 750082 rrnB0281 rrnB0282     TRUE 0.974 -3.000 0.179 NA   NA
 750082 750083 rrnB0282 rrnB0283   guaA4 FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000 N NA
 750083 750084 rrnB0283 rrnB0284 guaA4   FALSE 0.183 42.000 0.000 NA   NA
 750084 750085 rrnB0284 rrnB0285     TRUE 0.967 2.000 0.159 NA   NA
 750086 750087 rrnB0286 rrnB0287     TRUE 0.958 7.000 0.545 1.000   NA
 750087 750088 rrnB0287 rrnB0288     TRUE 0.988 0.000 0.545 NA   NA
 750088 750089 rrnB0288 rrnB0290   phoT1 TRUE 0.917 20.000 0.455 NA   NA
 750091 750092 rrnB0292 rrnB0294     TRUE 0.617 4.000 0.000 NA   NA
 750092 750093 rrnB0294 rrnB0295     FALSE 0.049 177.000 0.000 1.000   NA
 750094 750095 rrnB0296 rrnB0297 kinA2 rre-2 TRUE 0.967 -7.000 0.000 0.017 Y NA
 750095 750096 rrnB0297 rrnB0299 rre-2 oye TRUE 0.966 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 750096 750097 rrnB0299 rrnB0301 oye hlx2 TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.028 Y NA
 750097 750098 rrnB0301 rrnB0302 hlx2 rre-3 TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 750099 750100 rrnB0303 rrnB0304 tnp   FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 750102 750103 rrnB0306 rrnB0307     FALSE 0.018 237.000 0.000 NA   NA
 750104 750105 rrnB0308 rrnB0309   acaB1 TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 750105 750106 rrnB0309 rrnB0310 acaB1 fmn FALSE 0.013 239.000 0.000 1.000 N NA
 750107 750108 rrnB0311 rrnB0312 ugpB ugpA TRUE 0.996 0.000 0.312 0.048 Y NA
 750108 750109 rrnB0312 rrnB0314 ugpA ugpE TRUE 0.988 -19.000 0.812 0.048 Y NA
 750109 750110 rrnB0314 rrnB0315 ugpE msmX-3 TRUE 0.982 10.000 0.312 0.048 Y NA
 750110 750111 rrnB0315 rrnB0316 msmX-3 glpQ1 FALSE 0.009 294.000 0.000 1.000 N NA
 750112 750113 rrnB0317 rrnB0318 araL2 mgtC2 FALSE 0.502 122.000 0.400 NA   NA
 750114 750115 rrnB0319 rrnB0320 phnD1 phnC2 TRUE 0.987 16.000 0.667 0.002 Y NA
 750115 750116 rrnB0320 rrnB0321 phnC2 phnE TRUE 0.992 6.000 0.667 0.002 Y NA
 750116 750117 rrnB0321 rrnB0322 phnE phnD2 TRUE 0.998 0.000 0.915 0.002 Y NA
 750118 750119 rrnB0323 rrnB0324   pqsH FALSE 0.090 130.000 0.000 1.000   NA
 750120 750121 rrnB0325 rrnB0326 ftsZ2 cpdB1 FALSE 0.026 171.000 0.000 1.000 N NA
 750123 750124 rrnB0328 rrnB0330     FALSE 0.005 523.000 0.000 NA   NA
 750125 750126 rrnB0331 rrnB0333     FALSE 0.246 35.000 0.000 NA   NA
 750126 750127 rrnB0333 rrnB0334     FALSE 0.038 163.000 0.000 NA   NA
 750128 750129 rrnB0335 rrnB0336 parA5   TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 746659 746660 rrnAC0001 rrnAC0002 birA accC2 FALSE 0.248 62.000 0.008 1.000 N NA
 746660 746661 rrnAC0002 rrnAC0003 accC2   FALSE 0.451 140.000 0.400 NA   NA
 746661 746662 rrnAC0003 rrnAC0004   accA TRUE 0.984 3.000 0.833 NA   NA
 746665 746666 rrnAC0008 rrnAC0009     FALSE 0.063 122.000 0.000 NA   NA
 746667 746668 rrnAC0010 rrnAC0011 nac ywfD1 FALSE 0.031 224.000 0.000 1.000   NA
 746668 746669 rrnAC0011 rrnAC0012 ywfD1 adh11 FALSE 0.416 96.000 0.070 0.055 N NA
 746670 746671 rrnAC0013 rrnAC0014 htr sop2 TRUE 0.983 3.000 0.667 1.000   NA
 746672 746673 rrnAC0015 rrnAC0016   tfbA FALSE 0.049 144.000 0.000 NA   NA
 746674 746675 rrnAC0017 rrnAC0018   trmH TRUE 0.969 -3.000 0.095 NA   NA
 746677 746678 rrnAC0020 rrnAC0022     FALSE 0.085 62.000 0.000 NA   NA
 746684 746685 rrnAC0029 rrnAC0030   yurM TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.047 Y NA
 746685 746686 rrnAC0030 rrnAC0031 yurM ugpC3 TRUE 0.987 18.000 0.833 0.047 Y NA
 746687 746688 rrnAC0032 rrnAC0034 rad2   FALSE 0.369 89.000 0.063 1.000   NA
 746691 746692 rrnAC0037 rrnAC0038   ocd1 TRUE 0.618 118.000 0.727 NA   NA
 746693 746694 rrnAC0039 rrnAC0040     FALSE 0.520 75.000 0.294 1.000   NA
 746694 746695 rrnAC0040 rrnAC0041   srp19 TRUE 0.967 -3.000 0.098 1.000 N NA
 746698 746699 rrnAC0044 rrnAC0045 ctaB trp4 TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 746699 746700 rrnAC0045 rrnAC0046 trp4   TRUE 0.637 32.000 0.016 NA   NA
 746700 746701 rrnAC0046 rrnAC0047     FALSE 0.067 110.000 0.000 NA   NA
 746701 746702 rrnAC0047 rrnAC0048     FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 746702 746703 rrnAC0048 rrnAC0049     TRUE 0.997 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 746705 746706 rrnAC0051 rrnAC0052   dpd TRUE 0.971 0.000 0.089 NA   NA
 746706 746707 rrnAC0052 rrnAC0053 dpd citG FALSE 0.376 120.000 0.163 1.000 N NA
 746707 746708 rrnAC0053 rrnAC0054 citG   TRUE 0.982 -3.000 0.288 1.000   NA
 746708 746709 rrnAC0054 rrnAC0055   rps17E FALSE 0.177 192.000 0.064 1.000   NA
 746710 746711 rrnAC0056 rrnAC0057 mrp1   FALSE 0.090 199.000 0.007 NA   NA
 746712 746713 trn1 rrnAC0058   rps13P FALSE 0.377 22.000 0.000 NA   NA
 746713 746714 rrnAC0058 rrnAC0059 rps13P rps4P TRUE 0.997 0.000 0.512 0.012 Y NA
 746714 746715 rrnAC0059 rrnAC0061 rps4P rps11P TRUE 0.994 -3.000 0.073 0.026 Y NA
 746715 746716 rrnAC0061 rrnAC0062 rps11P rpoD TRUE 0.908 4.000 0.058 1.000 N NA
 746716 748036 rrnAC0062 trn2 rpoD   FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 748036 746718 trn2 rrnAC0064   rpl18E FALSE 0.347 25.000 0.000 NA   NA
 746718 746719 rrnAC0064 rrnAC0065 rpl18E rpl13P TRUE 0.994 -3.000 0.075 0.026 Y NA
 746719 746720 rrnAC0065 rrnAC0066 rpl13P rps9P TRUE 0.994 -6.000 0.515 0.026 Y NA
 746720 746721 rrnAC0066 rrnAC0067 rps9P rpoN TRUE 0.935 13.000 0.536 1.000 N NA
 746721 746722 rrnAC0067 rrnAC0068 rpoN rpoK TRUE 0.994 -3.000 0.064 0.006 Y NA
 746722 746723 rrnAC0068 rrnAC0069 rpoK eno TRUE 0.947 3.000 0.100 1.000 N NA
 746723 746724 rrnAC0069 rrnAC0070 eno rps2P TRUE 0.942 -3.000 0.017 1.000 N NA
 746724 746725 rrnAC0070 rrnAC0071 rps2P   FALSE 0.205 100.000 0.002 NA   NA
 746725 746726 rrnAC0071 rrnAC0072     TRUE 0.740 59.000 1.000 NA   NA
 746726 746727 rrnAC0072 rrnAC0073   cyc FALSE 0.496 71.000 0.286 NA   NA
 746727 746728 rrnAC0073 rrnAC0074 cyc   FALSE 0.023 205.000 0.000 NA   NA
 746728 746729 rrnAC0074 rrnAC0075   htlD TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 746729 746730 rrnAC0075 rrnAC0077 htlD mvk FALSE 0.058 68.000 0.000 1.000 N NA
 746730 746731 rrnAC0077 rrnAC0078 mvk argB1 TRUE 0.978 -3.000 0.185 1.000   NA
 746731 746732 rrnAC0078 rrnAC0079 argB1   FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 746732 746733 rrnAC0079 rrnAC0080     FALSE 0.019 229.000 0.000 NA   NA
 746733 746734 rrnAC0080 rrnAC0081   idsA TRUE 0.946 5.000 0.258 1.000   NA
 746734 746735 rrnAC0081 rrnAC0082 idsA   TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 746735 746736 rrnAC0082 rrnAC0083   arsA1 FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 746736 746737 rrnAC0083 rrnAC0085 arsA1 gltX FALSE 0.022 181.000 0.000 1.000 N NA
 746739 746740 rrnAC0087 rrnAC0088 hsp5 lipC FALSE 0.010 145.000 0.000 NA N NA
 746740 746741 rrnAC0088 rrnAC0089 lipC ferB TRUE 0.543 50.000 0.182 1.000 N NA
 746741 746742 rrnAC0089 rrnAC0090 ferB etfB2 FALSE 0.324 205.000 0.000 0.023 Y NA
 746742 746743 rrnAC0090 rrnAC0091 etfB2 etfA1 TRUE 0.986 3.000 0.082 NA Y NA
 746743 746744 rrnAC0091 rrnAC0094 etfA1 ydiS TRUE 0.977 -7.000 0.082 NA Y NA
 746744 746745 rrnAC0094 rrnAC0095 ydiS   TRUE 0.957 12.000 0.857 NA   NA
 746745 746746 rrnAC0095 rrnAC0096   hat-1 FALSE 0.504 69.000 0.286 NA   NA
 746747 746748 rrnAC0097 rrnAC0098 mer3 alkK1 FALSE 0.015 76.000 0.000 NA N NA
 746748 746749 rrnAC0098 rrnAC0099 alkK1   FALSE 0.062 124.000 0.000 NA   NA
 746749 746750 rrnAC0099 rrnAC0100     TRUE 0.947 -3.000 0.017 NA   NA
 746750 746751 rrnAC0100 rrnAC0101     TRUE 0.945 -3.000 0.013 NA   NA
 746752 746753 rrnAC0102 rrnAC0103 npd rpl7AE FALSE 0.035 214.000 0.000 1.000   NA
 746753 10697734 rrnAC0103 rrnAC3655 rpl7AE   TRUE 0.987 12.000 0.602 0.021 Y NA
 10697734 746754 rrnAC3655 rrnAC0104   rpl24E TRUE 0.996 3.000 0.761 0.021 Y NA
 746754 746755 rrnAC0104 rrnAC0106 rpl24E ndk TRUE 0.963 0.000 0.054 1.000 N NA
 746755 746756 rrnAC0106 rrnAC0107 ndk   FALSE 0.218 66.000 0.002 1.000 N NA
 746757 746758 rrnAC0108 rrnAC0109   msrB FALSE 0.004 622.000 0.000 NA   NA
 746758 746759 rrnAC0109 rrnAC0110 msrB betA FALSE 0.043 130.000 0.000 1.000 N NA
 746759 746760 rrnAC0110 rrnAC0111 betA   TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 746760 746761 rrnAC0111 rrnAC0112     FALSE 0.391 -40.000 0.000 NA   NA
 746761 746762 rrnAC0112 trn3     FALSE 0.017 240.000 0.000 NA   NA
 746762 746763 trn3 rrnAC0113   pai1 FALSE 0.265 33.000 0.000 NA   NA
 746763 746764 rrnAC0113 rrnAC0114 pai1 guaB5 FALSE 0.460 104.000 0.267 NA   NA
 746764 746765 rrnAC0114 rrnAC0115 guaB5   FALSE 0.433 59.000 0.093 NA   NA
 746765 746766 rrnAC0115 rrnAC0116     FALSE 0.426 -25.000 0.000 NA   NA
 746766 746767 rrnAC0116 rrnAC0117     FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 746767 746768 rrnAC0117 rrnAC0119     FALSE 0.142 46.000 0.000 NA   NA
 746768 746769 rrnAC0119 trn4     FALSE 0.007 379.000 0.000 NA   NA
 746769 746770 trn4 rrnAC0120     FALSE 0.321 27.000 0.000 NA   NA
 746772 746773 rrnAC0123 rrnAC0124 udg2 aroC TRUE 0.887 2.000 0.002 NA N NA
 746773 746774 rrnAC0124 rrnAC0126 aroC   FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 746774 746775 rrnAC0126 rrnAC0127   aroA FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 746776 746777 rrnAC0128 rrnAC0129 sdr zip TRUE 0.631 46.000 0.150 1.000   NA
 746778 746779 rrnAC0130 rrnAC0131 htl   TRUE 0.939 7.000 0.000 1.000 Y NA
 746779 746780 rrnAC0131 rrnAC0132     FALSE 0.023 261.000 0.000 1.000   NA
 746780 746781 rrnAC0132 rrnAC0133     FALSE 0.323 63.000 0.027 NA   NA
 746782 746783 rrnAC0134 rrnAC0135 ilvB1   FALSE 0.246 35.000 0.000 NA   NA
 746787 746788 rrnAC0139 rrnAC0140     FALSE 0.463 11.000 0.000 NA   NA
 746789 746790 rrnAC0141 rrnAC0143 sdhA2 nhaC2 FALSE 0.458 132.000 0.000 1.000 Y NA
 746790 746791 rrnAC0143 rrnAC0145 nhaC2 potA3 FALSE 0.018 203.000 0.000 1.000 N NA
 746791 746792 rrnAC0145 rrnAC0146 potA3 cysT2 FALSE 0.084 308.000 0.045 0.047 N NA
 746792 746793 rrnAC0146 rrnAC0147 cysT2 tppA TRUE 0.731 61.000 0.697 0.047 N NA
 746793 746794 rrnAC0147 rrnAC0148 tppA   FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 746798 746799 rrnAC0153 rrnAC0154     FALSE 0.463 11.000 0.000 NA   NA
 746799 746800 rrnAC0154 rrnAC0155   epf2b FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 746802 746803 rrnAC0158 rrnAC0159     TRUE 0.740 59.000 1.000 NA   NA
 746803 746804 rrnAC0159 rrnAC0160     FALSE 0.070 93.000 0.000 NA   NA
 746804 746805 rrnAC0160 rrnAC0161     FALSE 0.072 75.000 0.000 NA   NA
 746806 746807 rrnAC0163 rrnAC0165     FALSE 0.069 95.000 0.000 NA   NA
 746807 746808 rrnAC0165 rrnAC0166   proS FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 746810 746811 rrnAC0168 rrnAC0169   gltB FALSE 0.066 155.000 0.000 1.000   NA
 746811 746812 rrnAC0169 rrnAC0170 gltB   FALSE 0.006 181.000 0.000 NA N NA
 746812 746813 rrnAC0170 rrnAC0171     FALSE 0.016 68.000 0.000 NA N NA
 746814 746815 rrnAC0172 rrnAC0173   bglX-1 FALSE 0.006 184.000 0.000 NA N NA
 746817 746818 rrnAC0176 rrnAC0178   pop FALSE 0.370 73.000 0.051 1.000   NA
 746822 746823 rrnAC0182 rrnAC0183 ubiE2 htr FALSE 0.104 102.000 0.000 1.000   NA
 746823 746824 rrnAC0183 rrnAC0184 htr folP FALSE 0.040 138.000 0.000 1.000 N NA
 746824 746825 rrnAC0184 rrnAC0185 folP   FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 746825 746826 rrnAC0185 rrnAC0187     FALSE 0.004 616.000 0.000 NA   NA
 746826 746827 rrnAC0187 rrnAC0188     FALSE 0.497 -10.000 0.000 NA   NA
 746827 746828 rrnAC0188 rrnAC0189   purH FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 746829 746830 rrnAC0190 rrnAC0191   adh3 FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 746830 746831 rrnAC0191 rrnAC0192 adh3 purB FALSE 0.089 131.000 0.000 1.000   NA
 746831 746832 rrnAC0192 rrnAC0194 purB yfmO2 FALSE 0.052 94.000 0.000 1.000 N NA
 746832 746833 rrnAC0194 rrnAC0195 yfmO2   FALSE 0.107 93.000 0.000 1.000   NA
 746834 746835 rrnAC0196 rrnAC0198 argE odc TRUE 0.989 0.000 0.003 1.000 Y NA
 746835 746836 rrnAC0198 rrnAC0199 odc   FALSE 0.084 136.000 0.000 1.000   NA
 746836 746837 rrnAC0199 rrnAC0200     FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 746837 746838 rrnAC0200 rrnAC0201   aldY2 TRUE 0.525 98.000 0.400 NA   NA
 746840 746841 rrnAC0203 rrnAC0204   dapD FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 746843 746844 rrnAC0206 rrnAC0207 dapB dapA1 TRUE 0.992 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 746845 746846 rrnAC0208 rrnAC0210     FALSE 0.003 920.000 0.000 NA   NA
 746846 746847 rrnAC0210 rrnAC0211     FALSE 0.064 120.000 0.000 NA   NA
 746849 746850 rrnAC0214 rrnAC0215   pimT FALSE 0.206 203.000 0.306 NA N NA
 746850 746851 rrnAC0215 rrnAC0216 pimT   FALSE 0.082 64.000 0.000 NA   NA
 746852 746853 rrnAC0217 rrnAC0218   rpoM FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 746853 746854 rrnAC0218 rrnAC0219 rpoM   FALSE 0.014 117.000 0.000 NA N NA
 746855 746856 rrnAC0220 rrnAC0221     FALSE 0.031 178.000 0.000 NA   NA
 746857 746858 rrnAC0222 rrnAC0223   camH3 FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 746858 746859 rrnAC0223 rrnAC0224 camH3 aglA1 FALSE 0.106 81.000 0.000 1.000   NA
 746859 746860 rrnAC0224 rrnAC0225 aglA1   FALSE 0.457 99.000 0.286 1.000 N NA
 746860 746861 rrnAC0225 rrnAC0226   iunH2 FALSE 0.043 131.000 0.000 1.000 N NA
 746861 746862 rrnAC0226 rrnAC0227 iunH2 ocd3 FALSE 0.049 117.000 0.000 1.000 N NA
 746862 746863 rrnAC0227 rrnAC0228 ocd3   FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 746863 746864 rrnAC0228 rrnAC0229   nhaC1 TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 746867 746868 rrnAC0232 rrnAC0233   ykfB2 TRUE 0.960 -3.000 0.046 NA   NA
 746874 746875 rrnAC0240 rrnAC0241 qacE hadL FALSE 0.105 82.000 0.000 1.000   NA
 746877 746878 rrnAC0244 rrnAC0245 cat trkA4 TRUE 0.543 4.000 0.000 1.000 N NA
 746880 746881 rrnAC0247 rrnAC0248     FALSE 0.037 205.000 0.000 1.000   NA
 746883 746884 rrnAC0250 rrnAC0251   yvrO-2 TRUE 0.862 -3.000 0.000 1.000   NA
 746884 746885 rrnAC0251 rrnAC0252 yvrO-2 abcS-2 TRUE 0.980 -10.000 0.400 NA Y NA
 746886 746887 rrnAC0253 rrnAC0254   metE FALSE 0.004 749.000 0.000 NA   NA
 746887 746888 rrnAC0254 rrnAC0255 metE   TRUE 0.990 3.000 0.039 0.001 Y NA
 746888 746889 rrnAC0255 rrnAC0256   hemK FALSE 0.063 63.000 0.000 1.000 N NA
 746889 746890 rrnAC0256 rrnAC0257 hemK ksgA TRUE 0.978 2.000 0.000 1.000 Y NA
 746890 746891 rrnAC0257 rrnAC0258 ksgA   TRUE 0.659 81.000 0.049 NA Y NA
 746891 746892 rrnAC0258 rrnAC0259   rpb4 FALSE 0.434 176.000 0.730 NA   NA
 746892 746893 rrnAC0259 rrnAC0260 rpb4 rpl21E TRUE 0.986 -3.000 0.479 1.000   NA
 746893 746894 rrnAC0260 rrnAC0261 rpl21E eef1b TRUE 0.633 114.000 0.018 1.000 Y NA
 746894 746895 rrnAC0261 rrnAC0262 eef1b   TRUE 0.978 -30.000 0.511 1.000 Y NA
 746895 746896 rrnAC0262 rrnAC0263     FALSE 0.284 73.000 0.024 NA   NA
 746896 746897 rrnAC0263 rrnAC0264   hbd-1 TRUE 0.959 -3.000 0.043 NA   NA
 746898 746899 rrnAC0265 rrnAC0266 apl   FALSE 0.312 93.000 0.044 NA   NA
 746901 746902 rrnAC0268 rrnAC0269 yrbE gbp1 FALSE 0.188 48.000 0.000 1.000   NA
 746904 746905 rrnAC0272 rrnAC0273 hisD phoD FALSE 0.009 285.000 0.000 1.000 N NA
 746905 746906 rrnAC0273 rrnAC0274 phoD   FALSE 0.083 63.000 0.000 NA   NA
 746907 746908 rrnAC0275 rrnAC0276 ddeA   TRUE 0.658 48.000 0.333 NA   NA
 746908 746909 rrnAC0276 rrnAC0277     TRUE 0.979 -3.000 0.286 NA   NA
 746909 746910 rrnAC0277 rrnAC0278     TRUE 0.535 61.000 0.286 NA   NA
 746910 746911 rrnAC0278 rrnAC0279     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   NA
 746911 746912 rrnAC0279 rrnAC0280     FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 746912 746913 rrnAC0280 rrnAC0281     FALSE 0.399 163.000 0.455 NA   NA
 746918 746919 rrnAC0286 rrnAC0287     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 746920 746921 rrnAC0288 rrnAC0289   eif2BD1 FALSE 0.067 103.000 0.000 NA   NA
 746924 746925 rrnAC0292 rrnAC0293 pri1   TRUE 0.974 -3.000 0.173 NA   NA
 746925 746926 rrnAC0293 rrnAC0294     FALSE 0.067 104.000 0.000 NA   NA
 746928 746929 rrnAC0297 rrnAC0298   zntA3 FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 746932 746933 rrnAC0301 rrnAC0302   ilvD FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000 N NA
 746934 746935 rrnAC0303 rrnAC0304 ghmP yqjM1 FALSE 0.188 48.000 0.000 1.000   NA
 746936 746937 rrnAC0305 rrnAC0306     FALSE 0.067 107.000 0.000 NA   NA
 746937 746938 rrnAC0306 rrnAC0307   purD1 FALSE 0.107 92.000 0.000 1.000   NA
 746938 746939 rrnAC0307 rrnAC0311 purD1   FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 746941 746942 rrnAC0313 rrnAC0314 rpoM   TRUE 0.865 33.000 0.500 NA   NA
 746942 746943 rrnAC0314 rrnAC0316     TRUE 0.977 -7.000 1.000 NA   NA
 746943 746944 rrnAC0316 rrnAC0317   htlC FALSE 0.494 134.000 0.474 NA   NA
 746944 746945 rrnAC0317 rrnAC0318 htlC   FALSE 0.068 82.000 0.000 NA   NA
 746945 746946 rrnAC0318 rrnAC0320   ubiA TRUE 0.945 -7.000 0.283 NA   NA
 746946 746947 rrnAC0320 rrnAC0321 ubiA crtI2 TRUE 0.920 4.000 0.087 1.000 N NA
 746948 746949 rrnAC0322 rrnAC0323 pepQ   FALSE 0.009 459.000 0.000 1.000   NA
 746950 746951 rrnAC0324 rrnAC0325     FALSE 0.121 306.000 0.308 NA   NA
 746952 746953 rrnAC0326 rrnAC0327 fofB   FALSE 0.071 149.000 0.000 1.000   NA
 746955 746956 rrnAC0329 rrnAC0330 leuA2 ilvB2 FALSE 0.111 346.000 0.000 1.000 Y NA
 746956 746957 rrnAC0330 rrnAC0331 ilvB2 ilvN TRUE 0.990 3.000 0.054 0.002 Y NA
 746957 746958 rrnAC0331 rrnAC0332 ilvN ilvC TRUE 0.980 -7.000 0.011 0.002 Y NA
 746958 746959 rrnAC0332 rrnAC0333 ilvC   TRUE 0.850 -7.000 0.008 NA   NA
 746959 746960 rrnAC0333 rrnAC0334   leuC TRUE 0.958 -3.000 0.040 NA   NA
 746960 746961 rrnAC0334 rrnAC0336 leuC leuD TRUE 0.996 -3.000 0.268 0.001 Y NA
 746961 746962 rrnAC0336 rrnAC0338 leuD   FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 746962 746963 rrnAC0338 rrnAC0339   htlD FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 746963 746964 rrnAC0339 rrnAC0340 htlD ipmD FALSE 0.005 391.000 0.000 1.000 N NA
 746964 746965 rrnAC0340 rrnAC0341 ipmD deoR2 FALSE 0.318 89.000 0.062 1.000 N NA
 746965 746966 rrnAC0341 rrnAC0342 deoR2 pfk4 TRUE 0.989 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 746967 746968 rrnAC0343 rrnAC0345   fba TRUE 0.901 4.000 0.036 NA   NA
 746973 746974 rrnAC0350 rrnAC0351   ubiA TRUE 0.709 53.000 0.667 NA   NA
 746976 746977 rrnAC0354 rrnAC0355     FALSE 0.073 73.000 0.000 NA   NA
 746977 746978 rrnAC0355 rrnAC0356   htlD FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 746979 746980 rrnAC0357 rrnAC0358 dcuC imp-1 TRUE 0.839 37.000 0.500 NA   NA
 746980 746981 rrnAC0358 rrnAC0359 imp-1   FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 746981 746982 rrnAC0359 rrnAC0361   hlx7 FALSE 0.381 97.000 0.143 1.000 N NA
 746984 746985 rrnAC0363 rrnAC0365   asd FALSE 0.250 92.000 0.014 NA   NA
 746985 746986 rrnAC0365 rrnAC0366 asd   FALSE 0.250 69.000 0.009 NA   NA
 746986 746987 rrnAC0366 rrnAC0367   dbp FALSE 0.097 55.000 0.000 NA   NA
 746987 746988 rrnAC0367 rrnAC0369 dbp tnp FALSE 0.135 59.000 0.000 1.000   NA
 746989 746990 rrnAC0370 rrnAC0371 lbp htr FALSE 0.317 3.000 0.000 NA N NA
 746990 746991 rrnAC0371 rrnAC0372 htr   FALSE 0.091 57.000 0.000 NA   NA
 746993 746994 rrnAC0374 rrnAC0375   ssrA TRUE 0.990 -3.000 0.769 NA   NA
 746995 746996 rrnAC0376 rrnAC0377   yckA-1 FALSE 0.174 43.000 0.000 NA   NA
 746996 746997 rrnAC0377 rrnAC0379 yckA-1 glnQ2 TRUE 0.993 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 746997 746998 rrnAC0379 rrnAC0380 glnQ2 glnP TRUE 0.993 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 746998 746999 rrnAC0380 rrnAC0381 glnP glnH1 TRUE 0.986 5.000 0.244 0.053 Y NA
 746999 747000 rrnAC0381 rrnAC0382 glnH1 gabT TRUE 0.575 60.000 0.000 1.000 Y NA
 747000 747001 rrnAC0382 rrnAC0383 gabT arg2 TRUE 0.644 95.000 0.017 1.000 Y NA
 747001 747002 rrnAC0383 rrnAC0384 arg2 gdhA1 TRUE 0.962 7.000 0.011 1.000 Y NA
 747002 747003 rrnAC0384 rrnAC0385 gdhA1 arcR1 FALSE 0.003 718.000 0.000 1.000 N NA
 747004 747005 rrnAC0387 rrnAC0389   pcy FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 747005 747006 rrnAC0389 rrnAC0390 pcy nosZ TRUE 0.991 2.000 0.012 0.011 Y NA
 747006 747007 rrnAC0390 rrnAC0391 nosZ   TRUE 0.827 31.000 0.281 NA   NA
 747007 747008 rrnAC0391 rrnAC0392   nosD2 TRUE 0.964 -3.000 0.068 NA   NA
 747008 747009 rrnAC0392 rrnAC0394 nosD2 nosF-1 TRUE 0.942 -61.000 1.000 1.000 N NA
 747009 747010 rrnAC0394 rrnAC0396 nosF-1 nosY1 TRUE 0.966 -3.000 0.077 NA   NA
 747011 747012 rrnAC0397 rrnAC0399     TRUE 0.703 40.000 0.167 NA   NA
 747012 747013 rrnAC0399 rrnAC0400     FALSE 0.034 173.000 0.000 NA   NA
 747016 747017 rrnAC0404 rrnAC0405 htr12   FALSE 0.021 55.000 0.000 NA N NA
 747017 747018 rrnAC0405 rrnAC0407   fbr3 TRUE 0.617 4.000 0.000 NA   NA
 747019 747020 rrnAC0408 rrnAC0409   lemA TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747021 747022 rrnAC0410 rrnAC0411 ark-4 rre-1 TRUE 0.966 -7.000 0.000 0.026 Y NA
 747022 747023 rrnAC0411 rrnAC0412 rre-1 kinA6 TRUE 0.980 3.000 0.000 0.016 Y NA
 747023 747024 rrnAC0412 rrnAC0413 kinA6 oye TRUE 0.611 97.000 0.000 0.006 Y NA
 747024 747025 rrnAC0413 rrnAC0414 oye   FALSE 0.083 51.000 0.000 1.000 N NA
 747026 747027 rrnAC0415 rrnAC0416 rhoM doxD4 FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 747028 747029 rrnAC0417 rrnAC0418     FALSE 0.133 47.000 0.000 NA   NA
 747032 747033 rrnAC0421 rrnAC0423 gtr-2   FALSE 0.007 541.000 0.000 1.000   NA
 747033 747034 rrnAC0423 rrnAC0424     FALSE 0.442 46.000 0.000 0.002   NA
 747034 747035 rrnAC0424 rrnAC0425     FALSE 0.114 50.000 0.000 NA   NA
 747036 747037 rrnAC0426 rrnAC0427     TRUE 0.980 -3.000 0.250 1.000   NA
 747037 747038 rrnAC0427 rrnAC0428   yidJ TRUE 0.801 36.000 0.250 1.000   NA
 747039 747040 rrnAC0429 rrnAC0430 lpg3 exoM TRUE 0.987 4.000 0.364 NA Y NA
 747042 747043 rrnAC0432 rrnAC0433     FALSE 0.373 129.000 0.167 NA   NA
 747043 747044 rrnAC0433 rrnAC0434   act FALSE 0.066 112.000 0.000 NA   NA
 747044 747045 rrnAC0434 rrnAC0435 act   FALSE 0.019 58.000 0.000 NA N NA
 747046 747047 rrnAC0436 rrnAC0437 traB   TRUE 0.962 0.000 0.022 1.000   NA
 747047 747048 rrnAC0437 rrnAC0438   purM FALSE 0.305 61.000 0.006 1.000   NA
 747049 747050 rrnAC0439 rrnAC0440     FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 747050 747051 rrnAC0440 rrnAC0441     FALSE 0.447 71.000 0.196 NA   NA
 747052 747053 rrnAC0442 rrnAC0443 psmA3   FALSE 0.024 203.000 0.000 NA   NA
 747053 747054 rrnAC0443 rrnAC0444   manB2 FALSE 0.152 45.000 0.000 NA   NA
 747054 747055 rrnAC0444 rrnAC0446 manB2 cdd FALSE 0.461 65.000 0.217 1.000 N NA
 747055 747056 rrnAC0446 rrnAC0448 cdd udp2 TRUE 0.990 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 747057 747058 rrnAC0450 rrnAC0451 yjlD1   FALSE 0.337 145.000 0.192 NA   NA
 747059 747060 rrnAC0452 rrnAC0453 galE arg1 FALSE 0.062 64.000 0.000 1.000 N NA
 747061 747062 rrnAC0455 rrnAC0456 gyrA gyrB TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.002 Y NA
 747063 747064 rrnAC0457 rrnAC0459 top6B top6A TRUE 0.986 2.000 0.328 0.002   NA
 747065 747066 rrnAC0460 rrnAC0461 pknA2   FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 747066 747067 rrnAC0461 rrnAC0462     FALSE 0.069 91.000 0.000 NA   NA
 747067 747068 rrnAC0462 rrnAC0463   ligA FALSE 0.297 64.000 0.020 NA   NA
 747068 747069 rrnAC0463 rrnAC0464 ligA   TRUE 0.531 39.000 0.020 1.000 N NA
 747069 747070 rrnAC0464 rrnAC0466   gspE4 TRUE 0.995 2.000 0.643 1.000 Y NA
 747070 747071 rrnAC0466 rrnAC0468 gspE4   FALSE 0.489 134.000 0.444 NA   NA
 747074 747075 rrnAC0472 rrnAC0474 sucC sucD TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 747075 747076 rrnAC0474 rrnAC0475 sucD   FALSE 0.125 44.000 0.000 1.000 N NA
 747076 747077 rrnAC0475 rrnAC0476     FALSE 0.016 248.000 0.000 NA   NA
 747077 747078 rrnAC0476 rrnAC0477     FALSE 0.069 91.000 0.000 NA   NA
 747080 747081 rrnAC0479 rrnAC0480 trp5   TRUE 0.991 1.000 0.864 1.000   NA
 747081 747082 rrnAC0480 rrnAC0481     FALSE 0.440 188.000 0.950 NA   NA
 747082 747083 rrnAC0481 rrnAC0482   yajO TRUE 0.858 44.000 0.105 NA Y NA
 747083 747084 rrnAC0482 rrnAC0483 yajO   FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 747086 747087 rrnAC0485 rrnAC0486 yqjF   FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 747087 747088 rrnAC0486 rrnAC0487   htlD FALSE 0.068 82.000 0.000 NA   NA
 747088 747089 rrnAC0487 rrnAC0488 htlD araL1 TRUE 0.726 37.000 0.167 1.000 N NA
 747089 747090 rrnAC0488 rrnAC0489 araL1 pip FALSE 0.120 67.000 0.000 1.000   NA
 747090 747091 rrnAC0489 rrnAC0491 pip   FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 747091 747092 rrnAC0491 rrnAC0492     TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 747092 747093 rrnAC0492 rrnAC0494     FALSE 0.067 102.000 0.000 NA   NA
 747093 747094 rrnAC0494 rrnAC0495     TRUE 0.646 129.000 1.000 NA   NA
 747094 747095 rrnAC0495 rrnAC0496   sirR TRUE 0.614 81.000 0.667 NA   NA
 747095 747096 rrnAC0496 rrnAC0497 sirR   FALSE 0.018 234.000 0.000 NA   NA
 747096 747097 rrnAC0497 rrnAC0498     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 747098 747099 rrnAC0500 rrnAC0501 zurM zurA TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 747099 747100 rrnAC0501 rrnAC0502 zurA ycdH TRUE 0.995 3.000 1.000 1.000 Y NA
 747101 747102 rrnAC0503 rrnAC0504   copA4 FALSE 0.284 130.000 0.068 1.000 N NA
 747102 747103 rrnAC0504 rrnAC0505 copA4   FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 747109 747110 rrnAC0512 rrnAC0513 tyrA   TRUE 0.941 -3.000 0.010 NA   NA
 747110 747111 rrnAC0513 rrnAC0514   surE TRUE 0.759 37.000 0.231 NA   NA
 747111 747112 rrnAC0514 rrnAC0516 surE   TRUE 0.902 8.000 0.154 NA   NA
 747114 747115 rrnAC0518 rrnAC0519     FALSE 0.065 118.000 0.000 NA   NA
 747116 747117 rrnAC0520 rrnAC0521     TRUE 0.528 42.000 0.023 NA   NA
 747117 747118 rrnAC0521 rrnAC0522   bcp-1 FALSE 0.507 48.000 0.045 1.000   NA
 747118 747119 rrnAC0522 rrnAC0523 bcp-1   FALSE 0.087 60.000 0.000 NA   NA
 747120 747121 rrnAC0524 trn5     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 747121 747122 trn5 rrnAC0525     FALSE 0.004 582.000 0.000 NA   NA
 747123 747124 rrnAC0526 rrnAC0527     FALSE 0.068 85.000 0.000 NA   NA
 747124 747125 rrnAC0527 rrnAC0528   cheC1 TRUE 0.607 49.000 0.250 NA   NA
 747126 747127 rrnAC0529 rrnAC0531 hisC2   FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 747127 747128 rrnAC0531 rrnAC0532   pgsA TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747128 747129 rrnAC0532 rrnAC0534 pgsA tnp FALSE 0.028 164.000 0.000 1.000 N NA
 747129 747130 rrnAC0534 rrnAC0535 tnp   FALSE 0.022 181.000 0.000 1.000 N NA
 747137 747138 trn6 rrnAC0542     FALSE 0.047 147.000 0.000 NA   NA
 747138 747139 rrnAC0542 rrnAC0543   tyrS TRUE 0.789 13.000 0.005 1.000   NA
 747140 747141 rrnAC0544 rrnAC0545 tnp pfk1 FALSE 0.038 141.000 0.000 1.000 N NA
 747141 747142 rrnAC0545 rrnAC0546 pfk1 pykA TRUE 0.782 59.000 0.154 1.000 Y NA
 747142 747143 rrnAC0546 rrnAC0547 pykA glcK TRUE 0.771 53.000 0.059 1.000 Y NA
 747144 747145 rrnAC0548 rrnAC0549 cdc6j   FALSE 0.083 63.000 0.000 NA   NA
 747145 747146 rrnAC0549 rrnAC0550   glpK TRUE 0.877 4.000 0.013 NA   NA
 747146 747147 rrnAC0550 rrnAC0552 glpK htr FALSE 0.171 129.000 0.004 1.000 N NA
 747148 747149 rrnAC0554 rrnAC0555 gpdA gpdB TRUE 0.968 -10.000 0.650 0.001 N NA
 747149 747150 rrnAC0555 rrnAC0556 gpdB gpdC TRUE 0.991 -3.000 0.547 0.001 N NA
 747151 747152 rrnAC0557 rrnAC0558     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 747152 747153 rrnAC0558 rrnAC0559   xop2 FALSE 0.114 72.000 0.000 1.000   NA
 747153 747154 rrnAC0559 rrnAC0561 xop2 usp14 FALSE 0.070 150.000 0.000 1.000   NA
 747154 747155 rrnAC0561 rrnAC0562 usp14 pepC FALSE 0.051 98.000 0.000 1.000 N NA
 747156 747157 rrnAC0564 rrnAC0565     FALSE 0.006 417.000 0.000 NA   NA
 747157 747158 rrnAC0565 rrnAC0566   livK-1 FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 747158 747159 rrnAC0566 rrnAC0567 livK-1 livG-2 TRUE 0.985 3.000 0.071 NA Y NA
 747159 747160 rrnAC0567 rrnAC0568 livG-2 livF-2 FALSE 0.364 261.000 0.046 0.028 Y NA
 747160 747161 rrnAC0568 rrnAC0569 livF-2 livH-2 TRUE 0.997 -3.000 0.746 0.028 Y NA
 747161 747162 rrnAC0569 rrnAC0570 livH-2 livM-2 TRUE 0.541 182.000 0.060 0.044 Y NA
 747162 747163 rrnAC0570 rrnAC0571 livM-2   TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747163 747164 rrnAC0571 rrnAC0572   catD TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747164 747165 rrnAC0572 rrnAC0573 catD fadD1 TRUE 0.911 -7.000 0.046 1.000   NA
 747165 747166 rrnAC0573 rrnAC0574 fadD1 htlD FALSE 0.227 31.000 0.000 1.000 N NA
 747167 747168 rrnAC0575 rrnAC0576 dgoA4   FALSE 0.067 108.000 0.000 NA   NA
 747169 747170 rrnAC0578 rrnAC0579     TRUE 0.711 61.000 0.833 NA   NA
 747171 747172 rrnAC0581 rrnAC0582 tnp   TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747172 747173 rrnAC0582 rrnAC0583     FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 747175 747176 rrnAC0585 rrnAC0586     FALSE 0.295 30.000 0.000 NA   NA
 747176 747177 rrnAC0586 rrnAC0588     TRUE 0.526 151.000 0.750 NA   NA
 747177 747178 rrnAC0588 rrnAC0589     FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 747180 747181 rrnAC0591 rrnAC0592     TRUE 0.758 2.000 0.000 NA   NA
 747181 747182 rrnAC0592 rrnAC0593     FALSE 0.377 22.000 0.000 NA   NA
 747182 747183 rrnAC0593 rrnAC0594     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 747183 747184 rrnAC0594 rrnAC0595     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747184 747185 rrnAC0595 rrnAC0596     FALSE 0.477 -12.000 0.000 NA   NA
 747185 747186 rrnAC0596 rrnAC0597     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747186 747187 rrnAC0597 rrnAC0598     TRUE 0.758 2.000 0.000 NA   NA
 747187 747188 rrnAC0598 rrnAC0599     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 747188 747189 rrnAC0599 rrnAC0600     FALSE 0.497 -10.000 0.000 NA   NA
 747189 747190 rrnAC0600 rrnAC0601     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747190 747191 rrnAC0601 rrnAC0602     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747191 747192 rrnAC0602 rrnAC0603     FALSE 0.437 15.000 0.000 NA   NA
 747192 747193 rrnAC0603 rrnAC0604     TRUE 0.963 6.000 0.667 NA   NA
 747193 747194 rrnAC0604 rrnAC0605     FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 747194 747195 rrnAC0605 rrnAC0606     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747195 747196 rrnAC0606 rrnAC0607     FALSE 0.013 281.000 0.000 NA   NA
 747196 747197 rrnAC0607 rrnAC0608     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747197 747198 rrnAC0608 rrnAC0609     TRUE 0.966 5.000 0.667 NA   NA
 747198 747199 rrnAC0609 rrnAC0610     TRUE 0.982 -6.000 1.000 NA   NA
 747199 747200 rrnAC0610 rrnAC0612     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747200 747201 rrnAC0612 rrnAC0613     FALSE 0.005 458.000 0.000 NA   NA
 747201 747202 rrnAC0613 rrnAC0614     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747202 747203 rrnAC0614 rrnAC0615     FALSE 0.052 140.000 0.000 NA   NA
 747203 747204 rrnAC0615 trn7     FALSE 0.035 171.000 0.000 NA   NA
 747204 747205 trn7 rrnAC0616   pecE FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 747206 747207 rrnAC0617 rrnAC0619 rad25   FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 747207 747208 rrnAC0619 rrnAC0620     FALSE 0.022 214.000 0.000 NA   NA
 747209 747210 rrnAC0622 rrnAC0623     TRUE 0.651 -6.000 0.000 NA   NA
 747210 747211 rrnAC0623 rrnAC0624     FALSE 0.027 189.000 0.000 NA   NA
 747211 747212 rrnAC0624 rrnAC0625     FALSE 0.005 511.000 0.000 NA   NA
 747214 747215 rrnAC0627 rrnAC0628   sun TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 747216 747217 rrnAC0629 rrnAC0630   sppA TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747217 747218 rrnAC0630 rrnAC0631 sppA   FALSE 0.019 522.000 0.011 NA   NA
 747218 747219 rrnAC0631 rrnAC0632     TRUE 0.645 36.000 0.039 NA   NA
 747222 747223 rrnAC0635 rrnAC0637 gloA2 mcmA1 FALSE 0.354 83.000 0.053 1.000   NA
 747227 747228 rrnAC0641 rrnAC0642 livF-3 livG-3 TRUE 0.966 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 747228 747229 rrnAC0642 rrnAC0645 livG-3 livM-3 TRUE 0.978 2.000 0.000 1.000 Y NA
 747229 747230 rrnAC0645 rrnAC0646 livM-3 livH-3 TRUE 0.993 0.000 0.030 0.044 Y NA
 747230 747231 rrnAC0646 rrnAC0647 livH-3 abcS-1 TRUE 0.965 10.000 0.090 NA Y NA
 747232 747233 rrnAC0648 rrnAC0650 bdhA acs1 TRUE 0.659 145.000 0.061 0.087 Y NA
 747234 747235 rrnAC0651 rrnAC0652     FALSE 0.025 253.000 0.000 1.000   NA
 747235 747236 rrnAC0652 rrnAC0653   cysH FALSE 0.008 469.000 0.000 1.000   NA
 747238 747239 rrnAC0655 rrnAC0656   ferA3 FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 747240 747241 rrnAC0657 rrnAC0658     FALSE 0.028 241.000 0.000 1.000   NA
 747242 747243 rrnAC0659 rrnAC0660 ama rps10p-2 TRUE 0.522 56.000 0.154 1.000   NA
 747247 747248 rrnAC0664 rrnAC0665   abcP-2 FALSE 0.101 53.000 0.000 NA   NA
 747248 747249 rrnAC0665 rrnAC0666 abcP-2   TRUE 0.991 0.000 0.035 1.000 Y NA
 747251 747252 rrnAC0668 rrnAC0669   polX TRUE 0.894 -7.000 0.041 NA   NA
 747255 747256 rrnAC0674 rrnAC0675 htlD   FALSE 0.033 219.000 0.000 1.000   NA
 747256 747257 rrnAC0675 rrnAC0676   nfi TRUE 0.965 -3.000 0.045 1.000   NA
 747257 747258 rrnAC0676 rrnAC0677 nfi yusZ4 FALSE 0.331 56.000 0.026 1.000 N NA
 747259 747260 rrnAC0678 rrnAC0680 arsA2 rad3a FALSE 0.010 272.000 0.000 1.000 N NA
 747260 747261 rrnAC0680 rrnAC0681 rad3a tbpE FALSE 0.504 141.000 0.000 0.052 Y NA
 747261 747262 rrnAC0681 rrnAC0682 tbpE   FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 747262 747263 rrnAC0682 rrnAC0683     FALSE 0.075 71.000 0.000 NA   NA
 747264 747265 rrnAC0684 rrnAC0685 mamA1 mamB TRUE 0.899 3.000 0.000 0.001 N NA
 747265 747266 rrnAC0685 rrnAC0687 mamB mal TRUE 0.973 -88.000 0.651 1.000 Y NA
 747266 747267 rrnAC0687 rrnAC0688 mal   TRUE 0.855 -85.000 0.125 0.087 N NA
 747267 747268 rrnAC0688 rrnAC0690   citE1 TRUE 0.987 -3.000 0.625 1.000 N NA
 747269 747270 rrnAC0691 rrnAC0692 aspC4   FALSE 0.506 39.000 0.008 NA   NA
 747271 747272 rrnAC0693 rrnAC0695 cinA   TRUE 0.758 37.000 0.229 NA   NA
 747273 747274 rrnAC0696 rrnAC0698   nusG FALSE 0.004 609.000 0.000 NA   NA
 747274 747275 rrnAC0698 rrnAC0700 nusG secE TRUE 0.958 5.000 0.506 1.000 N NA
 747275 747276 rrnAC0700 rrnAC0701 secE htr18 FALSE 0.093 150.000 0.000 0.099 N NA
 747276 747277 rrnAC0701 rrnAC0702 htr18   FALSE 0.432 -3.000 0.000 NA N NA
 747277 747278 rrnAC0702 rrnAC0703   ftsZ1 FALSE 0.012 129.000 0.000 NA N NA
 747278 747279 rrnAC0703 rrnAC0704 ftsZ1   FALSE 0.441 104.000 0.245 NA   NA
 747279 747280 rrnAC0704 rrnAC0706   nce1 TRUE 0.965 0.000 0.053 NA   NA
 747281 747282 rrnAC0707 rrnAC0708 aroE   FALSE 0.164 51.000 0.000 1.000   NA
 747282 747283 rrnAC0708 rrnAC0709   trpE1 FALSE 0.115 71.000 0.000 1.000   NA
 747283 747284 rrnAC0709 rrnAC0710 trpE1 trpD2 TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.002 Y NA
 747284 747285 rrnAC0710 rrnAC0711 trpD2 ilvE2 TRUE 0.958 -15.000 0.037 1.000 Y NA
 747285 747286 rrnAC0711 rrnAC0713 ilvE2   FALSE 0.308 84.000 0.056 1.000 N NA
 747290 747291 rrnAC0718 rrnAC0719 porA porB TRUE 0.995 -3.000 0.138 0.001 Y NA
 747291 747292 rrnAC0719 rrnAC0720 porB ubiE3 FALSE 0.012 250.000 0.000 1.000 N NA
 747292 747293 rrnAC0720 rrnAC0721 ubiE3 phr1 FALSE 0.052 80.000 0.000 1.000 N NA
 747294 747295 rrnAC0722 rrnAC0723 mop   FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 747295 747296 rrnAC0723 rrnAC0724     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747296 747297 rrnAC0724 rrnAC0725     FALSE 0.077 69.000 0.000 NA   NA
 747298 747299 rrnAC0726 rrnAC0727     FALSE 0.340 55.000 0.026 1.000 N NA
 747299 747300 rrnAC0727 rrnAC0728     TRUE 0.637 42.000 0.092 NA   NA
 747301 747302 rrnAC0729 rrnAC0730     TRUE 0.959 11.000 0.889 NA   NA
 747302 747303 rrnAC0730 rrnAC0731     FALSE 0.381 112.000 0.127 NA   NA
 747303 747304 rrnAC0731 rrnAC0732   petB1 TRUE 0.950 5.000 0.145 0.050   NA
 747304 747305 rrnAC0732 rrnAC0733 petB1   TRUE 0.942 4.000 0.040 0.050   NA
 747305 747306 rrnAC0733 rrnAC0734     TRUE 0.949 2.000 0.040 NA   NA
 747306 747307 rrnAC0734 rrnAC0735   hcp8 TRUE 0.980 0.000 0.250 NA   NA
 747307 747308 rrnAC0735 rrnAC0736 hcp8   FALSE 0.497 65.000 0.250 NA   NA
 747309 747310 rrnAC0737 rrnAC0738   usp29 FALSE 0.069 88.000 0.000 NA   NA
 747312 747313 rrnAC0740 rrnAC0741 hat1 hat2 FALSE 0.308 56.000 0.000 0.009   NA
 747318 747319 rrnAC0745 rrnAC0748 yyaI guaB3 FALSE 0.008 517.000 0.000 1.000   NA
 747320 747321 rrnAC0749 rrnAC0750     TRUE 0.807 42.000 0.538 NA   NA
 747321 747322 rrnAC0750 trn9     FALSE 0.097 55.000 0.000 NA   NA
 747322 747323 trn9 rrnAC0751   icfA1 FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 747324 747325 rrnAC0752 rrnAC0753   aroK TRUE 0.996 -3.000 0.214 0.002 Y NA
 747326 747327 rrnAC0754 rrnAC0755 trkA1 trkH3 TRUE 0.996 2.000 0.429 0.009 Y NA
 747328 747329 rrnAC0756 rrnAC0757   trkH2 FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 747330 747331 rrnAC0758 rrnAC0759 usp17 cat TRUE 0.988 -3.000 0.333 0.015   NA
 747332 747333 rrnAC0760 rrnAC0761     FALSE 0.082 64.000 0.000 NA   NA
 747333 747334 rrnAC0761 rrnAC0762     FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 747334 747335 rrnAC0762 rrnAC0764   csg3 FALSE 0.424 17.000 0.000 NA   NA
 747335 747336 rrnAC0764 rrnAC0766 csg3   TRUE 0.568 44.000 0.038 1.000   NA
 747336 747337 rrnAC0766 rrnAC0767     FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 747338 747339 rrnAC0768 rrnAC0769     FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 747340 747341 rrnAC0770 rrnAC0771 acdB paaH TRUE 0.708 106.000 0.100 1.000 Y NA
 747344 747345 rrnAC0774 rrnAC0775   gdhA2 FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 747345 747346 rrnAC0775 rrnAC0776 gdhA2   FALSE 0.082 64.000 0.000 NA   NA
 747346 747347 rrnAC0776 rrnAC0777     FALSE 0.004 562.000 0.000 NA   NA
 747349 747350 rrnAC0779 rrnAC0780 acdE acdF TRUE 0.942 1.000 0.000 0.003   NA
 747351 747352 rrnAC0781 rrnAC0783 usp30   FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 747353 747354 rrnAC0784 rrnAC0785 doxD1   TRUE 0.939 15.000 0.600 NA   NA
 747354 747355 rrnAC0785 rrnAC0786     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 747355 747356 rrnAC0786 rrnAC0788   pssA FALSE 0.073 73.000 0.000 NA   NA
 747356 747357 rrnAC0788 rrnAC0789 pssA   FALSE 0.124 126.000 0.000 0.098 N NA
 747359 747360 rrnAC0791 rrnAC0792   cdc48b TRUE 0.988 0.000 0.583 NA   NA
 747362 747363 rrnAC0794 rrnAC0795 htlD   FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 747364 747365 rrnAC0796 rrnAC0797 hat4 purF FALSE 0.069 57.000 0.000 1.000 N NA
 747365 747366 rrnAC0797 rrnAC0798 purF snp FALSE 0.115 185.000 0.020 1.000 N NA
 747366 747367 rrnAC0798 rrnAC0799 snp cdlM FALSE 0.285 72.000 0.032 1.000 N NA
 747368 747369 rrnAC0800 rrnAC0801     FALSE 0.426 -25.000 0.000 NA   NA
 747370 747371 rrnAC0802 rrnAC0803     FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 747375 747376 rrnAC0808 rrnAC0810   nitA FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 747376 747377 rrnAC0810 rrnAC0811 nitA   TRUE 0.974 -3.000 0.182 NA   NA
 747377 747378 rrnAC0811 rrnAC0812     TRUE 0.634 68.000 0.647 NA   NA
 747378 747379 rrnAC0812 rrnAC0813     FALSE 0.459 64.000 0.167 NA   NA
 747382 747383 rrnAC0816 rrnAC0817 tnp   FALSE 0.426 -25.000 0.000 NA   NA
 747384 747385 rrnAC0818 rrnAC0819     FALSE 0.049 144.000 0.000 NA   NA
 747385 747386 rrnAC0819 rrnAC0821     FALSE 0.340 99.000 0.071 NA   NA
 747386 747387 rrnAC0821 rrnAC0822   mogA FALSE 0.040 197.000 0.000 1.000   NA
 747387 747388 rrnAC0822 trn10 mogA   FALSE 0.068 81.000 0.000 NA   NA
 747388 747389 trn10 rrnAC0823     FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 747390 747391 rrnAC0824 rrnAC0825 livH-4 livM TRUE 0.907 -102.000 0.000 0.043 Y NA
 747391 747392 rrnAC0825 rrnAC0827 livM livG-4 TRUE 0.991 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 747392 747393 rrnAC0827 rrnAC0829 livG-4 livF-4 TRUE 0.993 -3.000 0.038 0.027 Y NA
 747394 747395 rrnAC0830 rrnAC0831   sodA FALSE 0.027 189.000 0.000 NA   NA
 747395 747396 rrnAC0831 rrnAC0832 sodA phrB1 FALSE 0.098 181.000 0.008 1.000 N NA
 747397 747398 rrnAC0833 rrnAC0834 ech2   FALSE 0.044 150.000 0.000 NA   NA
 747399 747400 rrnAC0835 rrnAC0836   csg2 TRUE 0.528 72.000 0.360 NA   NA
 747401 747402 rrnAC0837 rrnAC0838 menF menD TRUE 0.941 -51.000 0.033 1.000 Y NA
 747403 747404 rrnAC0839 rrnAC0840 dnaJ   FALSE 0.088 59.000 0.000 NA   NA
 747406 747407 rrnAC0842 rrnAC0843 cinR menE FALSE 0.003 820.000 0.000 NA   NA
 747407 747408 rrnAC0843 rrnAC0844 menE ykfB1 TRUE 0.857 -70.000 0.104 0.085 N NA
 747408 747409 rrnAC0844 rrnAC0845 ykfB1 menA TRUE 0.959 -3.000 0.055 1.000 N NA
 747410 747411 rrnAC0847 rrnAC0848 alkK3 htlD FALSE 0.088 160.000 0.000 0.073 N NA
 747412 747413 rrnAC0849 rrnAC0850     FALSE 0.078 67.000 0.000 NA   NA
 747413 747414 rrnAC0850 rrnAC0851     FALSE 0.070 92.000 0.000 NA   NA
 747414 747415 rrnAC0851 rrnAC0852     TRUE 0.954 -7.000 0.385 NA   NA
 747415 747416 rrnAC0852 rrnAC0853     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 747419 747420 rrnAC0856 rrnAC0857     TRUE 0.951 -3.000 0.023 NA   NA
 747420 747421 rrnAC0857 rrnAC0858     FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 747421 747422 rrnAC0858 rrnAC0859   folA1 TRUE 0.741 -3.000 0.000 1.000 N NA
 747422 747423 rrnAC0859 rrnAC0860 folA1   FALSE 0.074 72.000 0.000 NA   NA
 747423 747424 rrnAC0860 rrnAC0861   tfeA FALSE 0.027 188.000 0.000 NA   NA
 747424 747425 rrnAC0861 rrnAC0862 tfeA   TRUE 0.974 0.000 0.131 NA   NA
 747425 747426 rrnAC0862 rrnAC0863     TRUE 0.927 10.000 0.353 NA   NA
 747426 747427 rrnAC0863 rrnAC0864   nop56/58 FALSE 0.068 82.000 0.000 NA   NA
 747427 747428 rrnAC0864 rrnAC0865 nop56/58 fib TRUE 0.996 -3.000 0.720 NA Y NA
 747428 747429 rrnAC0865 rrnAC0866 fib gcs2 FALSE 0.331 108.000 0.040 1.000   NA
 747429 747430 rrnAC0866 rrnAC0867 gcs2   TRUE 0.597 112.000 0.538 1.000   NA
 747430 747431 rrnAC0867 rrnAC0868   coaD2 FALSE 0.115 71.000 0.000 1.000   NA
 747433 747434 trn11 rrnAC0871     FALSE 0.006 449.000 0.000 NA   NA
 747436 747437 rrnAC0872 rrnAC0874   acdA TRUE 0.715 38.000 0.176 1.000 N NA
 747437 747438 rrnAC0874 rrnAC0875 acdA   FALSE 0.335 187.000 0.417 1.000   NA
 747442 747443 rrnAC0880 rrnAC0881 coxA4   TRUE 0.966 4.000 0.500 NA   NA
 747445 747446 rrnAC0883 rrnAC0884 bioB gdhA3 TRUE 0.919 3.000 0.008 1.000   NA
 747446 747447 rrnAC0884 rrnAC0885 gdhA3 bioF TRUE 0.946 22.000 0.833 1.000   NA
 747447 747448 rrnAC0885 rrnAC0886 bioF   FALSE 0.004 612.000 0.000 NA   NA
 747449 747450 rrnAC0887 rrnAC0888 cbiA1 scs TRUE 0.974 -3.000 0.177 NA   NA
 747451 747452 rrnAC0889 rrnAC0890   frt FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 747454 747455 rrnAC0892 rrnAC0893     FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 747455 747456 rrnAC0893 rrnAC0894   cpdB2 FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 747457 747458 rrnAC0895 rrnAC0896   acaB3 TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 747458 747459 rrnAC0896 rrnAC0897 acaB3   FALSE 0.352 -76.000 0.000 NA   NA
 747459 747460 rrnAC0897 rrnAC0899     FALSE 0.021 219.000 0.000 NA   NA
 747462 747463 rrnAC0901 rrnAC0903   accA TRUE 0.989 2.000 1.000 NA   NA
 747463 747464 rrnAC0903 rrnAC0904 accA fabG1 TRUE 0.996 2.000 0.667 1.000 Y NA
 747465 747466 rrnAC0905 rrnAC0906   ibp TRUE 0.854 38.000 0.571 1.000   NA
 747466 747467 rrnAC0906 rrnAC0907 ibp sfuB TRUE 0.995 2.000 0.286 0.042 Y NA
 747467 747468 rrnAC0907 rrnAC0908 sfuB potA4 TRUE 0.973 0.000 0.037 0.042 N NA
 747468 747469 rrnAC0908 rrnAC0910 potA4   TRUE 0.962 -3.000 0.055 NA   NA
 747469 747470 rrnAC0910 rrnAC0911     TRUE 0.891 10.000 0.143 NA   NA
 747471 747472 rrnAC0912 rrnAC0913 gtr-3   FALSE 0.025 50.000 0.000 NA N NA
 747472 747473 rrnAC0913 rrnAC0914   trmB1 FALSE 0.069 434.000 0.000 NA Y NA
 747473 747474 rrnAC0914 rrnAC0915 trmB1   FALSE 0.007 174.000 0.000 NA N NA
 747474 747475 rrnAC0915 rrnAC0917   sorD FALSE 0.010 277.000 0.000 1.000 N NA
 747475 747476 rrnAC0917 rrnAC0918 sorD gfo4 TRUE 0.913 -34.000 0.200 0.049   NA
 747476 747477 rrnAC0918 rrnAC0919 gfo4   TRUE 0.892 26.000 0.444 NA   NA
 747477 747478 rrnAC0919 rrnAC0920   msmX-2 TRUE 0.979 2.000 0.400 NA   NA
 747478 747479 rrnAC0920 rrnAC0921 msmX-2 malFG-4 TRUE 0.993 5.000 0.750 0.042 Y NA
 747479 747480 rrnAC0921 rrnAC0922 malFG-4 malFG-5 TRUE 0.997 2.000 1.000 0.042 Y NA
 747480 747481 rrnAC0922 rrnAC0923 malFG-5 rbsB-2 TRUE 0.899 79.000 1.000 0.042 Y NA
 747481 747482 rrnAC0923 rrnAC0924 rbsB-2   FALSE 0.004 233.000 0.000 NA N NA
 747482 747483 rrnAC0924 rrnAC0925   yajO2 FALSE 0.018 61.000 0.000 NA N NA
 747484 747485 rrnAC0926 rrnAC0927   pyrE2 FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 747485 747486 rrnAC0927 rrnAC0928 pyrE2   FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 747486 747487 rrnAC0928 rrnAC0929   acaB4 FALSE 0.292 154.000 0.154 NA   NA
 747487 747488 rrnAC0929 rrnAC0930 acaB4   TRUE 0.987 -3.000 0.583 NA   NA
 747489 747490 rrnAC0931 rrnAC0933   argK FALSE 0.360 108.000 0.062 1.000   NA
 747490 747491 rrnAC0933 rrnAC0934 argK mcmA3 TRUE 0.944 -3.000 0.019 1.000 N NA
 747492 747493 rrnAC0935 rrnAC0936 gtr-8   TRUE 0.978 3.000 0.568 NA   NA
 747493 747494 rrnAC0936 rrnAC0937   ybaN TRUE 0.882 -7.000 0.027 NA   NA
 747494 747495 rrnAC0937 rrnAC0938 ybaN   FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 747496 747497 rrnAC0939 rrnAC0940 dpm6   FALSE 0.174 43.000 0.000 NA   NA
 747497 747498 rrnAC0940 rrnAC0942   htr FALSE 0.011 136.000 0.000 NA N NA
 747498 747499 rrnAC0942 rrnAC0943 htr   FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 747499 747500 rrnAC0943 rrnAC0944     FALSE 0.067 104.000 0.000 NA   NA
 747500 747501 rrnAC0944 rrnAC0945     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 747501 747502 rrnAC0945 rrnAC0946     TRUE 0.751 41.000 0.308 NA   NA
 747503 747504 rrnAC0948 rrnAC0949     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747504 747505 rrnAC0949 rrnAC0950     TRUE 0.991 0.000 0.750 NA   NA
 747505 747506 rrnAC0950 rrnAC0951     TRUE 0.990 1.000 0.750 1.000   NA
 747506 747507 rrnAC0951 rrnAC0952   moxR1 FALSE 0.103 108.000 0.000 1.000   NA
 747507 747508 rrnAC0952 rrnAC0953 moxR1   FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 747508 747509 rrnAC0953 rrnAC0954   hel FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 747510 747511 rrnAC0955 rrnAC0956     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 747513 747514 rrnAC0958 rrnAC0959 icfA2 yprA3 FALSE 0.107 94.000 0.000 1.000   NA
 747515 747516 rrnAC0960 rrnAC0961 dapA2   FALSE 0.508 71.000 0.250 1.000   NA
 747519 747520 rrnAC0964 rrnAC0965 kinA7 pelA FALSE 0.277 119.000 0.018 1.000   NA
 747520 747521 rrnAC0965 rrnAC0966 pelA   FALSE 0.241 86.000 0.012 NA   NA
 747521 747522 rrnAC0966 rrnAC0967   hypE FALSE 0.052 139.000 0.000 NA   NA
 747522 747523 rrnAC0967 rrnAC0969 hypE   FALSE 0.109 46.000 0.000 1.000 N NA
 747523 747524 rrnAC0969 rrnAC0970   aor3 TRUE 0.609 37.000 0.013 1.000   NA
 747524 747525 rrnAC0970 rrnAC0971 aor3 csg4 FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 747528 747529 rrnAC0975 rrnAC0976   htr8 FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 747530 747531 rrnAC0977 rrnAC0979     FALSE 0.191 41.000 0.000 NA   NA
 747531 747532 rrnAC0979 rrnAC0980     TRUE 0.524 65.000 0.300 NA   NA
 747532 747533 rrnAC0980 rrnAC0981     TRUE 0.863 27.000 0.333 NA   NA
 747533 747534 rrnAC0981 rrnAC0982   ssuE1 FALSE 0.005 555.000 0.000 NA   NA
 747534 747535 rrnAC0982 rrnAC0983 ssuE1   FALSE 0.067 109.000 0.000 NA   NA
 747535 747536 rrnAC0983 rrnAC0984   mamA2 FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 747538 747539 rrnAC0986 rrnAC0987 nce2 mutY FALSE 0.096 48.000 0.000 1.000 N NA
 747539 747540 rrnAC0987 rrnAC0988 mutY htlD FALSE 0.046 125.000 0.000 1.000 N NA
 747546 747547 rrnAC0995 rrnAC0996 mutT6 folD1 TRUE 0.941 1.000 0.021 1.000 N NA
 747547 747548 rrnAC0996 rrnAC0998 folD1   FALSE 0.344 76.000 0.067 NA   NA
 747548 747549 rrnAC0998 rrnAC0999   glyA FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 747550 747551 rrnAC1000 rrnAC1001     FALSE 0.007 379.000 0.000 NA   NA
 747551 747552 rrnAC1001 rrnAC1002     TRUE 0.841 32.000 0.353 NA   NA
 747553 747554 rrnAC1003 rrnAC1004   suhB1 FALSE 0.407 104.000 0.167 NA   NA
 747554 747555 rrnAC1004 rrnAC1006 suhB1   TRUE 0.701 72.000 1.000 NA   NA
 747556 747557 rrnAC1007 rrnAC1008     FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 747559 747560 rrnAC1010 rrnAC1011 rfbB1 rffG TRUE 0.943 -27.000 0.000 0.001 Y NA
 747560 747561 rrnAC1011 rrnAC1012 rffG   FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 747562 747563 rrnAC1013 rrnAC1014     FALSE 0.004 2547.000 0.000 1.000   NA
 747563 747564 rrnAC1014 rrnAC1015   gtr-7 FALSE 0.005 1216.000 0.000 1.000   NA
 747564 747565 rrnAC1015 rrnAC1016 gtr-7   FALSE 0.054 135.000 0.000 NA   NA
 747567 747568 rrnAC1018 rrnAC1019   dpm1 FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 747571 747572 rrnAC1022 rrnAC1023     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747572 747573 rrnAC1023 rrnAC1024     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747574 747575 rrnAC1025 rrnAC1026 moxR6   TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747575 747576 rrnAC1026 rrnAC1027     TRUE 0.987 0.000 0.500 NA   NA
 747576 747577 rrnAC1027 rrnAC1028   lolC FALSE 0.069 97.000 0.000 NA   NA
 747577 747578 rrnAC1028 rrnAC1029 lolC   TRUE 0.944 8.000 0.400 1.000   NA
 747578 747579 rrnAC1029 rrnAC1030   nps FALSE 0.310 28.000 0.000 NA   NA
 747579 747580 rrnAC1030 rrnAC1031 nps   FALSE 0.013 278.000 0.000 NA   NA
 747581 747582 rrnAC1032 rrnAC1033     FALSE 0.066 114.000 0.000 NA   NA
 747583 747584 rrnAC1034 rrnAC1035     FALSE 0.025 198.000 0.000 NA   NA
 747584 747585 rrnAC1035 rrnAC1036     FALSE 0.009 328.000 0.000 NA   NA
 747585 747586 rrnAC1036 trn13     FALSE 0.004 738.000 0.000 NA   NA
 747587 747588 rrnAC1037 rrnAC1038     TRUE 0.579 46.000 0.113 NA   NA
 747589 747590 rrnAC1039 rrnAC1041 yafB-2   FALSE 0.009 338.000 0.000 NA   NA
 747590 747591 rrnAC1041 rrnAC1042   msbA-2 FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 747592 747593 rrnAC1043 rrnAC1044 lgtD   FALSE 0.004 223.000 0.000 NA N NA
 747593 747594 rrnAC1044 rrnAC1045     FALSE 0.005 518.000 0.000 NA   NA
 747595 747596 rrnAC1046 rrnAC1047     FALSE 0.011 304.000 0.000 NA   NA
 747596 747597 rrnAC1047 rrnAC1048     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 747597 747598 rrnAC1048 rrnAC1049     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747598 747599 rrnAC1049 rrnAC1050     FALSE 0.064 119.000 0.000 NA   NA
 747599 747600 rrnAC1050 rrnAC1051     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747600 747601 rrnAC1051 rrnAC1052     FALSE 0.010 326.000 0.000 NA   NA
 747602 747603 rrnAC1053 rrnAC1054 cdc6i tnp FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 747603 747604 rrnAC1054 rrnAC1055 tnp   FALSE 0.017 242.000 0.000 NA   NA
 747604 747605 rrnAC1055 rrnAC1056     FALSE 0.008 361.000 0.000 NA   NA
 747605 747606 rrnAC1056 rrnAC1057   stbB TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747607 747608 rrnAC1059 rrnAC1060     FALSE 0.042 156.000 0.000 NA   NA
 747608 747609 rrnAC1060 rrnAC1061   trwB1 FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 747609 747610 rrnAC1061 rrnAC1062 trwB1   TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747610 747611 rrnAC1062 rrnAC1063     TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 747611 747612 rrnAC1063 rrnAC1064     FALSE 0.003 1289.000 0.000 NA   NA
 747612 747613 rrnAC1064 rrnAC1065     TRUE 0.749 33.000 0.110 NA   NA
 747614 747615 rrnAC1067 rrnAC1068 prk1 prkA TRUE 0.991 0.000 0.044 NA Y NA
 747615 747616 rrnAC1068 rrnAC1069 prkA   TRUE 0.961 -9.000 0.683 NA   NA
 747616 747617 rrnAC1069 rrnAC1070   spoVR TRUE 0.990 -3.000 0.761 NA   NA
 747617 747618 rrnAC1070 rrnAC1071 spoVR   FALSE 0.103 110.000 0.000 1.000   NA
 747618 747619 rrnAC1071 rrnAC1072   cyp2 FALSE 0.107 95.000 0.000 1.000   NA
 747619 747620 rrnAC1072 rrnAC1073 cyp2   FALSE 0.088 59.000 0.000 NA   NA
 747622 747623 rrnAC1075 rrnAC1076   capB TRUE 0.903 -30.000 0.333 NA   NA
 747623 747624 rrnAC1076 rrnAC1077 capB   TRUE 0.924 10.000 0.333 NA   NA
 747627 747628 rrnAC1080 rrnAC1081   rffH1 FALSE 0.421 140.000 0.333 NA   NA
 747628 747629 rrnAC1081 rrnAC1082 rffH1   FALSE 0.104 105.000 0.000 1.000   NA
 747629 747630 rrnAC1082 trn14     FALSE 0.004 728.000 0.000 NA   NA
 747630 747631 trn14 rrnAC1083   hbd1 FALSE 0.040 158.000 0.000 NA   NA
 747633 747634 rrnAC1085 rrnAC1086 tnp   FALSE 0.340 -91.000 0.000 NA   NA
 747635 747636 rrnAC1087 rrnAC1088 cysE2 alkA FALSE 0.378 46.000 0.009 1.000 N NA
 747638 747639 rrnAC1090 rrnAC1091   sdhC FALSE 0.386 100.000 0.083 1.000   NA
 747639 747640 rrnAC1091 rrnAC1092 sdhC   TRUE 0.986 0.000 0.125 0.001   NA
 747640 747641 rrnAC1092 rrnAC1093   sdhB TRUE 0.961 4.000 0.092 0.002   NA
 747647 747648 rrnAC1101 rrnAC1102   cbiA2 TRUE 0.989 3.000 0.031 0.013 Y NA
 747648 747649 rrnAC1102 rrnAC1103 cbiA2   FALSE 0.112 73.000 0.000 1.000   NA
 747649 747650 rrnAC1103 rrnAC1105     TRUE 0.960 3.000 0.143 1.000   NA
 747651 747652 rrnAC1106 rrnAC1107   trkH1 FALSE 0.070 150.000 0.000 1.000   NA
 747652 747653 rrnAC1107 rrnAC1109 trkH1 purD2 FALSE 0.005 380.000 0.000 1.000 N NA
 747654 747655 rrnAC1110 rrnAC1111     FALSE 0.097 55.000 0.000 NA   NA
 747656 747657 rrnAC1112 rrnAC1113   bglX-2 FALSE 0.103 110.000 0.000 1.000   NA
 747657 747658 rrnAC1113 rrnAC1114 bglX-2 htlD FALSE 0.056 72.000 0.000 1.000 N NA
 747659 747660 rrnAC1115 rrnAC1116     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 747662 747663 rrnAC1118 rrnAC1119 hlx1   TRUE 0.978 -13.000 0.429 NA Y NA
 747663 747664 rrnAC1119 rrnAC1121   thyX FALSE 0.014 83.000 0.000 NA N NA
 747664 747665 rrnAC1121 rrnAC1123 thyX   FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 747665 747666 rrnAC1123 rrnAC1124   eif2B2 FALSE 0.101 53.000 0.000 NA   NA
 747667 747668 rrnAC1125 rrnAC1126   tfbH FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 747668 747669 rrnAC1126 rrnAC1127 tfbH   FALSE 0.005 515.000 0.000 NA   NA
 747669 747670 rrnAC1127 rrnAC1128     FALSE 0.447 13.000 0.000 NA   NA
 747671 747672 rrnAC1129 rrnAC1130 trxB3   FALSE 0.456 63.000 0.154 NA   NA
 747673 747674 rrnAC1131 rrnAC1132 ribG   FALSE 0.511 45.000 0.039 NA   NA
 747675 747676 rrnAC1133 rrnAC1135 rpaA   TRUE 0.970 -3.000 0.111 NA   NA
 747676 747677 rrnAC1135 rrnAC1137   yhcR1 FALSE 0.480 49.000 0.064 NA   NA
 747680 747681 rrnAC1140 rrnAC1142   oye FALSE 0.041 157.000 0.000 NA   NA
 747682 747683 rrnAC1143 rrnAC1144   mutS3 FALSE 0.239 36.000 0.000 NA   NA
 747684 747685 rrnAC1145 rrnAC1146 blp   FALSE 0.013 280.000 0.000 NA   NA
 747685 747686 rrnAC1146 rrnAC1147     FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 747686 747687 rrnAC1147 rrnAC1149   ctpB FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 747687 747688 rrnAC1149 rrnAC1150 ctpB   TRUE 0.942 -3.000 0.011 NA   NA
 747688 747689 rrnAC1150 rrnAC1151     TRUE 0.758 2.000 0.000 NA   NA
 747690 747691 rrnAC1152 rrnAC1153 hcp5 coxB2 TRUE 0.849 5.000 0.000 0.010   NA
 747691 747692 rrnAC1153 rrnAC1154 coxB2 coxA3 TRUE 0.994 0.000 0.667 0.003   NA
 747692 747693 rrnAC1154 rrnAC1155 coxA3   FALSE 0.359 24.000 0.000 NA   NA
 747694 747695 rrnAC1156 rrnAC1157     FALSE 0.191 41.000 0.000 NA   NA
 747695 747696 rrnAC1157 rrnAC1158     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 747696 747697 rrnAC1158 rrnAC1159   pknA1 TRUE 0.989 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 747697 747698 rrnAC1159 rrnAC1160 pknA1   TRUE 0.651 57.000 0.667 NA N NA
 747698 747699 rrnAC1160 rrnAC1161     FALSE 0.063 122.000 0.000 NA   NA
 747699 747700 rrnAC1161 rrnAC1162     TRUE 0.922 -10.000 0.278 NA   NA
 747700 747701 rrnAC1162 rrnAC1163   estA FALSE 0.069 97.000 0.000 NA   NA
 747704 747705 rrnAC1166 rrnAC1167 ogg acyP FALSE 0.292 54.000 0.011 1.000 N NA
 747705 747706 rrnAC1167 rrnAC1168 acyP   FALSE 0.285 47.000 0.004 NA N NA
 747707 747708 rrnAC1169 rrnAC1171 hflX katG2 FALSE 0.006 629.000 0.000 1.000   NA
 747710 747711 rrnAC1173 rrnAC1174   psmA4 FALSE 0.220 88.000 0.024 NA N NA
 747711 747712 rrnAC1174 rrnAC1175 psmA4 rpp14 TRUE 0.949 3.000 0.121 1.000 N NA
 747712 747713 rrnAC1175 rrnAC1176 rpp14   FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 747713 747714 rrnAC1176 rrnAC1177   rnp30 FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 747714 747715 rrnAC1177 rrnAC1178 rnp30   TRUE 0.994 0.000 0.286 NA Y NA
 747715 747716 rrnAC1178 rrnAC1179     TRUE 0.924 8.000 0.286 NA   NA
 747718 747719 rrnAC1181 rrnAC1182   thiC FALSE 0.018 298.000 0.000 1.000   NA
 747720 747721 rrnAC1183 rrnAC1184   cysT1 TRUE 0.859 -25.000 0.193 NA N NA
 747722 747723 rrnAC1186 rrnAC1187 moaE moaC TRUE 0.627 74.000 0.000 0.004 Y NA
 747723 747724 rrnAC1187 rrnAC1188 moaC moaB1 TRUE 0.898 45.000 0.109 0.004 Y NA
 747724 747725 rrnAC1188 rrnAC1189 moaB1   FALSE 0.067 108.000 0.000 NA   NA
 747725 747726 rrnAC1189 rrnAC1190     FALSE 0.052 140.000 0.000 NA   NA
 747726 747727 rrnAC1190 rrnAC1191     FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 747727 747728 rrnAC1191 rrnAC1193   boa FALSE 0.106 86.000 0.000 1.000   NA
 747729 747730 rrnAC1194 rrnAC1195   petA TRUE 0.979 -3.000 0.261 NA   NA
 747730 747731 rrnAC1195 rrnAC1196 petA petB2 TRUE 0.996 0.000 0.261 0.059 Y NA
 747731 747732 rrnAC1196 rrnAC1197 petB2   TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 747732 747733 rrnAC1197 rrnAC1199   narG TRUE 0.969 -7.000 0.667 NA   NA
 747733 747734 rrnAC1199 rrnAC1200 narG narH TRUE 0.997 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 747734 747735 rrnAC1200 rrnAC1202 narH   TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747735 747736 rrnAC1202 rrnAC1203     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 747736 747737 rrnAC1203 rrnAC1204   narJ TRUE 0.984 0.000 0.381 NA   NA
 747737 747738 rrnAC1204 rrnAC1205 narJ   TRUE 0.976 -3.000 0.214 NA   NA
 747738 747739 rrnAC1205 rrnAC1206   prp TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747739 747740 rrnAC1206 rrnAC1208 prp mrp2 TRUE 0.635 3.000 0.000 1.000 N NA
 747740 747741 rrnAC1208 rrnAC1209 mrp2   FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 747742 747743 rrnAC1210 rrnAC1211 rbnBN1   FALSE 0.032 223.000 0.000 1.000   NA
 747743 747744 rrnAC1211 rrnAC1213   moz TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 747744 747745 rrnAC1213 rrnAC1214 moz hmoA TRUE 0.997 0.000 1.000 NA Y NA
 747745 747746 rrnAC1214 rrnAC1215 hmoA dmsA TRUE 0.995 3.000 1.000 1.000 Y NA
 747746 747747 rrnAC1215 rrnAC1216 dmsA   TRUE 0.972 -7.000 0.750 NA   NA
 747747 747748 rrnAC1216 rrnAC1217     FALSE 0.176 253.000 0.333 NA   NA
 747749 747750 rrnAC1218 rrnAC1219     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 747750 747751 rrnAC1219 rrnAC1220     FALSE 0.099 54.000 0.000 NA   NA
 747751 747752 rrnAC1220 rrnAC1221     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747752 747753 rrnAC1221 rrnAC1222   moxR4 TRUE 0.990 -3.000 0.800 NA   NA
 747753 747754 rrnAC1222 rrnAC1223 moxR4   TRUE 0.874 41.000 1.000 NA   NA
 747755 747756 rrnAC1224 rrnAC1225 pyrI pyrB TRUE 0.996 -3.000 0.197 0.001 Y NA
 747756 747757 rrnAC1225 rrnAC1226 pyrB   FALSE 0.040 159.000 0.000 NA   NA
 747758 747759 rrnAC1227 rrnAC1228 minD2   TRUE 0.830 29.000 0.333 NA N NA
 747760 747761 rrnAC1229 rrnAC1230   slyD FALSE 0.037 167.000 0.000 NA   NA
 747761 747762 rrnAC1230 rrnAC1231 slyD ilvA1 FALSE 0.052 80.000 0.000 1.000 N NA
 747763 747764 rrnAC1232 rrnAC1233 cytH metK FALSE 0.414 60.000 0.093 1.000 N NA
 747764 747765 rrnAC1233 rrnAC1234 metK thiI FALSE 0.344 48.000 0.009 1.000 N NA
 747765 747766 rrnAC1234 rrnAC1235 thiI   TRUE 0.656 28.000 0.011 NA   NA
 747767 747768 rrnAC1236 rrnAC1238 cysK1 nikR FALSE 0.051 101.000 0.000 1.000 N NA
 747768 747769 rrnAC1238 rrlB-3 nikR   FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 747769 747770 rrlB-3 rrlA-3     FALSE 0.052 140.000 0.000 NA   NA
 747770 747771 rrlA-3 rrs-3     FALSE 0.007 376.000 0.000 NA   NA
 747773 747774 rrnAC1241 rrnAC1242 eif1A2   FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 747776 747777 rrnAC1244 rrnAC1245     TRUE 0.990 -3.000 0.833 NA   NA
 747777 747778 rrnAC1245 rrnAC1246     TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 747778 747779 rrnAC1246 rrnAC1247     TRUE 0.968 -6.000 0.429 NA   NA
 747779 747780 rrnAC1247 rrnAC1248     TRUE 0.982 3.000 0.714 NA   NA
 747780 747781 rrnAC1248 rrnAC1249     TRUE 0.581 58.000 0.364 NA   NA
 747781 747782 rrnAC1249 rrnAC1250   gspE2 TRUE 0.996 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 747782 747783 rrnAC1250 rrnAC1251 gspE2 aspB1 FALSE 0.221 138.000 0.033 1.000 N NA
 747783 747784 rrnAC1251 rrnAC1252 aspB1 lrp TRUE 0.990 -3.000 0.894 1.000 N NA
 747785 747786 rrnAC1253 rrnAC1254     FALSE 0.262 74.000 0.016 NA   NA
 747788 747789 rrnAC1256 rrnAC1257     FALSE 0.109 51.000 0.000 NA   NA
 747789 747790 rrnAC1257 rrnAC1258   cheC2 FALSE 0.237 101.000 0.012 NA   NA
 747790 747791 rrnAC1258 rrnAC1259 cheC2 alkK2 FALSE 0.014 103.000 0.000 NA N NA
 11427084 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7116.000 0.000 NA   NA
 11569447 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7116.000 0.000 NA   NA
 11711839 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7116.000 0.000 NA   NA
 11427085 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11569448 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11711840 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7135.000 0.000 NA   NA
 11427086 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7182.000 0.000 NA   NA
 11569449 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7182.000 0.000 NA   NA
 11711841 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7182.000 0.000 NA   NA
 11427087 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7201.000 0.000 NA   NA
 11569450 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7201.000 0.000 NA   NA
 11711842 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7201.000 0.000 NA   NA
 11427088 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11569451 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11711843 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7246.000 0.000 NA   NA
 11427089 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7265.000 0.000 NA   NA
 11569452 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7265.000 0.000 NA   NA
 11711844 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7265.000 0.000 NA   NA
 11427090 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11569453 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11711845 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11427091 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7320.000 0.000 NA   NA
 11569454 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7320.000 0.000 NA   NA
 11711846 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7320.000 0.000 NA   NA
 11427092 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11569455 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11711847 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11427093 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7375.000 0.000 NA   NA
 11569456 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7375.000 0.000 NA   NA
 11711848 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7375.000 0.000 NA   NA
 11427094 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11569457 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11711849 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7411.000 0.000 NA   NA
 11427095 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7430.000 0.000 NA   NA
 11569458 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7430.000 0.000 NA   NA
 11711850 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7430.000 0.000 NA   NA
 11427096 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11569459 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11711851 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7472.000 0.000 NA   NA
 11427097 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11569460 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11711852 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11427098 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7533.000 0.000 NA   NA
 11569461 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7533.000 0.000 NA   NA
 11711853 747786   rrnAC1254     FALSE NA 7533.000 0.000 NA   NA
 747796 747797 rrnAC1264 rrnAC1266     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 747798 747799 rrnAC1267 rrnAC1268 korA korB TRUE 0.995 4.000 0.923 0.001 Y NA
 747799 747800 rrnAC1268 rrnAC1269 korB asnC2 FALSE 0.397 85.000 0.167 1.000 N NA
 747800 747801 rrnAC1269 rrnAC1272 asnC2   TRUE 0.687 36.000 0.042 1.000   NA
 747801 747802 rrnAC1272 rrnAC1274   guaB2 TRUE 0.752 39.000 0.209 1.000   NA
 747802 747803 rrnAC1274 rrnAC1275 guaB2 mcmA2 FALSE 0.428 76.000 0.039 0.079   NA
 747806 747807 rrnAC1278 rrnAC1279 coxA1   FALSE 0.275 168.000 0.200 NA   NA
 747807 747808 rrnAC1279 rrnAC1280     TRUE 0.612 64.000 0.500 NA   NA
 747811 747812 rrnAC1283 rrnAC1284 purA   FALSE 0.227 114.000 0.011 NA   NA
 747814 747815 rrnAC1287 rrnAC1288 htpX5   FALSE 0.003 879.000 0.000 NA   NA
 747816 747817 rrnAC1289 rrnAC1290     FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 747818 747819 rrnAC1291 rrnAC1292   cysS FALSE 0.354 48.000 0.006 NA   NA
 747819 747820 rrnAC1292 rrnAC1293 cysS   FALSE 0.067 106.000 0.000 NA   NA
 747820 747821 rrnAC1293 rrnAC1295     TRUE 0.722 44.000 0.333 NA   NA
 747821 747822 rrnAC1295 rrnAC1296   corA FALSE 0.032 357.000 0.010 NA   NA
 747824 747825 rrnAC1298 rrnAC1299 moeA2 moeA3 TRUE 0.678 174.000 0.250 0.004 Y NA
 747825 747826 rrnAC1299 rrnAC1300 moeA3 adh9 FALSE 0.028 164.000 0.000 1.000 N NA
 747827 747828 rrnAC1301 rrnAC1302 yjlD2 thuA FALSE 0.003 272.000 0.000 NA N NA
 747829 747830 rrnAC1303 rrnAC1304     FALSE 0.133 47.000 0.000 NA   NA
 747832 747833 rrnAC1307 rrnAC1308     TRUE 0.881 11.000 0.220 NA N NA
 747836 747837 rrnAC1311 rrnAC1312 recJ1 cysT3 FALSE 0.143 56.000 0.000 1.000   NA
 747837 747838 rrnAC1312 rrnAC1314 cysT3 moaA FALSE 0.079 52.000 0.000 1.000 N NA
 747841 747842 rrnAC1318 rrnAC1319 aor2   TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747842 747843 rrnAC1319 rrnAC1321     FALSE 0.429 16.000 0.000 NA   NA
 747843 747844 rrnAC1321 rrnAC1322     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747844 747845 rrnAC1322 rrnAC1323     FALSE 0.068 84.000 0.000 NA   NA
 747845 747846 rrnAC1323 rrnAC1324     FALSE 0.152 45.000 0.000 NA   NA
 747848 747849 rrnAC1326 rrnAC1327     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747852 747853 rrnAC1330 rrnAC1331 torD fixX TRUE 0.984 -3.000 0.222 0.057   NA
 747854 747855 rrnAC1332 rrnAC1333 fdhF fdoH TRUE 0.950 12.000 0.000 0.001 Y NA
 747855 747856 rrnAC1333 rrnAC1334 fdoH   TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 747856 747857 rrnAC1334 rrnAC1335     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 747860 747861 rrnAC1338 rrnAC1339 arcR-6   FALSE 0.016 322.000 0.000 1.000   NA
 747861 747862 rrnAC1339 rrnAC1340     FALSE 0.005 503.000 0.000 NA   NA
 747865 747866 rrnAC1344 trn16     FALSE 0.072 75.000 0.000 NA   NA
 747866 747867 trn16 rrnAC1345     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 747867 747868 rrnAC1345 rrnAC1346   kinA1 FALSE 0.004 628.000 0.000 NA   NA
 747869 747870 rrnAC1347 rrnAC1348     TRUE 0.934 -3.000 0.021 NA N NA
 747870 747871 rrnAC1348 rrnAC1349   rnp TRUE 0.760 53.000 0.070 NA Y NA
 747875 747876 rrnAC1353 rrnAC1354   htpX6 FALSE 0.183 42.000 0.000 NA   NA
 747876 747877 rrnAC1354 rrnAC1355 htpX6 gatA1 FALSE 0.052 92.000 0.000 1.000 N NA
 747877 747878 rrnAC1355 rrnAC1356 gatA1 gatC TRUE 0.997 1.000 0.643 0.001 Y NA
 747879 747880 rrnAC1357 rrnAC1358 tfbB mutT5 TRUE 0.646 44.000 0.188 1.000 N NA
 747881 747882 rrnAC1359 rrnAC1361 asnB   TRUE 0.970 0.000 0.086 NA   NA
 747882 747883 rrnAC1361 rrnAC1363   nirJ FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 747883 747884 rrnAC1363 rrnAC1364 nirJ   TRUE 0.972 -3.000 0.151 NA   NA
 747884 747885 rrnAC1364 rrnAC1365     FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 747888 747889 rrnAC1368 rrnAC1369 trp-6 ccmB TRUE 0.984 -3.000 0.196 0.003 N NA
 747890 747891 rrnAC1370 rrnAC1371 ccmF trxA7 TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 747891 747892 rrnAC1371 rrnAC1372 trxA7 ccpA TRUE 0.535 50.000 0.014 0.019   NA
 747893 747894 rrnAC1373 rrnAC1374 ccmC   TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 747895 747896 rrnAC1375 rrnAC1376 soxA2 ccmE TRUE 0.767 18.000 0.005 1.000   NA
 747899 747900 rrnAC1379 rrnAC1380     TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 747900 747901 rrnAC1380 rrnAC1381     FALSE 0.043 154.000 0.000 NA   NA
 747903 747904 rrnAC1383 rrnAC1384   gluTR TRUE 0.966 -3.000 0.048 1.000   NA
 747905 747906 rrnAC1385 rrnAC1386     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747907 747908 rrnAC1387 rrnAC1388     FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 747911 747912 rrnAC1391 rrnAC1392     TRUE 0.617 4.000 0.000 NA   NA
 747912 747913 rrnAC1392 rrnAC1393     FALSE 0.069 94.000 0.000 NA   NA
 747914 747915 rrnAC1394 rrnAC1395 hisF   FALSE 0.102 113.000 0.000 1.000   NA
 747916 747917 rrnAC1396 rrnAC1397 rpoL   FALSE 0.106 80.000 0.000 1.000   NA
 747917 747918 rrnAC1397 rrnAC1398     TRUE 0.862 -3.000 0.000 1.000   NA
 747919 747920 rrnAC1399 rrnAC1400 cyoC   TRUE 0.705 43.000 0.250 NA   NA
 747920 747921 rrnAC1400 rrnAC1401     TRUE 0.589 55.000 0.333 NA   NA
 747921 747922 rrnAC1401 rrnAC1402   adh4 FALSE 0.041 157.000 0.000 NA   NA
 747923 747924 rrnAC1403 trn17     FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 747924 747925 trn17 rrnAC1404   usp28 FALSE 0.069 79.000 0.000 NA   NA
 747925 747926 rrnAC1404 rrnAC1405 usp28   FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 747928 747929 rrnAC1407 rrnAC1408 cyo   FALSE 0.235 148.000 0.050 NA   NA
 747929 747930 rrnAC1408 rrnAC1409   gloA1 FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 747930 747931 rrnAC1409 rrnAC1410 gloA1   FALSE 0.421 73.000 0.154 NA   NA
 747931 747932 rrnAC1410 rrnAC1411   drg FALSE 0.286 131.000 0.058 NA   NA
 747933 747934 rrnAC1412 rrnAC1414   rpl11P FALSE 0.171 136.000 0.003 NA   NA
 747934 747935 rrnAC1414 rrnAC1415 rpl11P rpl1P TRUE 0.662 245.000 0.838 0.017 Y NA
 747935 747936 rrnAC1415 rrnAC1417 rpl1P rpl10E TRUE 0.993 2.000 0.076 0.017 Y NA
 747936 747937 rrnAC1417 rrnAC1418 rpl10E rpL12P TRUE 0.987 18.000 0.758 0.017 Y NA
 747938 747939 rrnAC1419 trn18     FALSE 0.013 278.000 0.000 NA   NA
 747940 747941 rrnAC1420 rrnAC1421     TRUE 0.984 2.000 0.600 NA   NA
 747941 747942 rrnAC1421 rrnAC1422     FALSE 0.412 150.000 0.400 NA   NA
 747942 747943 rrnAC1422 rrnAC1423     FALSE 0.006 426.000 0.000 NA   NA
 747944 747945 rrnAC1424 rrnAC1425     FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 747946 747947 rrnAC1426 rrnAC1427 rps15P recJ2 TRUE 0.962 1.000 0.073 NA   NA
 747947 747948 rrnAC1427 rrnAC1428 recJ2   TRUE 0.990 -3.000 0.769 NA   NA
 747948 747949 rrnAC1428 rrnAC1429   rps3AE TRUE 0.905 -7.000 0.059 NA   NA
 747950 747951 rrnAC1430 rrnAC1431 fbr2 purK FALSE 0.052 90.000 0.000 1.000 N NA
 747951 747952 rrnAC1431 rrnAC1432 purK dpm5 TRUE 0.656 26.000 0.011 1.000 N NA
 747953 747954 rrnAC1433 rrnAC1434 ribE aspC3 TRUE 0.950 -3.000 0.029 1.000 N NA
 747957 747958 rrnAC1437 rrnAC1438   taqD FALSE 0.199 40.000 0.000 NA   NA
 747958 747959 rrnAC1438 rrnAC1439 taqD   FALSE 0.072 75.000 0.000 NA   NA
 747961 747962 rrnAC1442 rrnAC1443 pld   FALSE 0.253 43.000 0.000 1.000   NA
 747963 747964 rrnAC1444 rrnAC1445 xup   FALSE 0.023 207.000 0.000 NA   NA
 747964 747965 rrnAC1445 rrnAC1446   purE FALSE 0.133 47.000 0.000 NA   NA
 747965 747966 rrnAC1446 rrnAC1447 purE nolB FALSE 0.513 37.000 0.008 1.000 N NA
 747966 747967 rrnAC1447 rrnAC1448 nolB nuoB TRUE 0.987 -7.000 0.168 0.003 Y NA
 747967 747968 rrnAC1448 rrnAC1449 nuoB ndHG5 TRUE 0.986 7.000 0.279 0.003 Y NA
 747968 747969 rrnAC1449 rrnAC1450 ndHG5 ndhG4 TRUE 0.997 0.000 0.600 0.006 Y NA
 747969 747970 rrnAC1450 rrnAC1451 ndhG4 nolD TRUE 0.947 44.000 0.600 0.006 Y NA
 747970 747971 rrnAC1451 rrnAC1452 nolD ndhG6 FALSE 0.117 293.000 0.035 0.006   NA
 747971 747972 rrnAC1452 rrnAC1453 ndhG6   TRUE 0.980 -3.000 0.061 0.006   NA
 747972 747973 rrnAC1453 rrnAC1454   nolC FALSE 0.461 93.000 0.039 0.006   NA
 747973 747974 rrnAC1454 rrnAC1455 nolC nuoL2 TRUE 0.990 4.000 0.253 0.006 Y NA
 747974 747975 rrnAC1455 rrnAC1456 nuoL2 ndhD TRUE 0.994 1.000 0.050 0.002 Y NA
 747975 747976 rrnAC1456 rrnAC1458 ndhD ndhG3 TRUE 0.997 1.000 0.462 0.002 Y NA
 747978 747979 rrnAC1460 trn19     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 747980 747981 rrnAC1461 rrnAC1462     FALSE 0.068 84.000 0.000 NA   NA
 747981 747982 rrnAC1462 rrnAC1463     TRUE 0.812 0.000 0.000 NA   NA
 747983 747984 rrnAC1464 rrnAC1465     FALSE 0.067 108.000 0.000 NA   NA
 747985 747986 rrnAC1466 rrnAC1467     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 747986 747987 rrnAC1467 rrnAC1468   tnp FALSE 0.003 1160.000 0.000 NA   NA
 747988 747989 rrnAC1469 rrnAC1470   trxB2 FALSE 0.091 57.000 0.000 NA   NA
 747989 747990 rrnAC1470 rrnAC1471 trxB2 doxD5 FALSE 0.069 95.000 0.000 NA   NA
 747991 747992 rrnAC1472 rrnAC1473 acrR   FALSE 0.066 112.000 0.000 NA   NA
 747992 747993 rrnAC1473 rrnAC1474     FALSE 0.097 55.000 0.000 NA   NA
 747993 747994 rrnAC1474 rrnAC1475     FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 748000 748001 rrnAC1481 rrnAC1482   fapE2 TRUE 0.529 141.000 0.556 1.000   NA
 748002 748003 rrnAC1483 rrnAC1484 parA4 cheW2 TRUE 0.988 -3.000 0.667 1.000 N NA
 748006 748007 rrnAC1489 rrnAC1490 dmd cadT FALSE 0.104 103.000 0.000 1.000   NA
 748007 748008 rrnAC1490 rrnAC1491 cadT msrA2 FALSE 0.093 127.000 0.000 1.000   NA
 748009 748010 rrnAC1492 rrnAC1493     TRUE 0.556 69.000 0.400 NA   NA
 748010 748011 rrnAC1493 rrnAC1494   htlD TRUE 0.796 39.000 0.400 NA   NA
 748012 748013 rrnAC1495 rrnAC1497 oye3 nifS FALSE 0.053 77.000 0.000 1.000 N NA
 748013 748014 rrnAC1497 rrnAC1498 nifS gcvP1 TRUE 0.978 -46.000 0.316 0.001 Y NA
 748014 748015 rrnAC1498 rrnAC1499 gcvP1 gcvH TRUE 0.678 109.000 0.054 1.000 Y NA
 748015 748016 rrnAC1499 rrnAC1500 gcvH gcvT TRUE 0.993 -3.000 0.017 0.002 Y NA
 748016 748017 rrnAC1500 rrnAC1501 gcvT   FALSE 0.035 147.000 0.000 1.000 N NA
 748021 748022 rrnAC1505 rrnAC1507 pstB1 pstA2 TRUE 0.983 4.000 0.020 0.003 Y NA
 748022 748023 rrnAC1507 rrnAC1508 pstA2 pstC1 TRUE 0.982 20.000 0.485 0.003 Y NA
 748023 748024 rrnAC1508 rrnAC1509 pstC1 phoX TRUE 0.718 52.000 0.005 1.000 Y NA
 748027 748028 rrnAC1512 rrnAC1513     TRUE 0.979 0.000 0.229 NA   NA
 748030 748031 rrnAC1515 rrnAC1516 pyrF   FALSE 0.265 33.000 0.000 NA   NA
 748032 748033 rrnAC1517 rrnAC1518 trpG1 trpE2 TRUE 0.996 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 748033 748034 rrnAC1518 rrnAC1519 trpE2 trpF TRUE 0.991 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 748034 748035 rrnAC1519 rrnAC1520 trpF trpD3 TRUE 0.991 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 10149659 748037 trn20 rrnAC1521     FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 748038 748039 rrnAC1522 rrnAC1523     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 748041 748042 rrnAC1526 rrnAC1527 yfmJ2 cdc48d FALSE 0.044 187.000 0.000 1.000   NA
 748043 748044 rrnAC1528 rrnAC1529     FALSE 0.133 47.000 0.000 NA   NA
 748046 748047 rrnAC1531 rrnAC1532   radB FALSE 0.137 187.000 0.034 NA   NA
 748048 748049 rrnAC1533 rrnAC1534 phoU2   FALSE 0.067 102.000 0.000 NA   NA
 748049 748050 rrnAC1534 rrnAC1536   trkA2 FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 748050 748051 rrnAC1536 rrnAC1537 trkA2   FALSE 0.069 91.000 0.000 NA   NA
 748051 748052 rrnAC1537 rrnAC1538     FALSE 0.015 255.000 0.000 NA   NA
 748052 748053 rrnAC1538 rrnAC1539     FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 748053 748054 rrnAC1539 rrnAC1540     FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 748054 748055 rrnAC1540 rrnAC1541     FALSE 0.103 109.000 0.000 1.000   NA
 748056 748057 rrnAC1542 rrnAC1543     TRUE 0.791 50.000 1.000 NA   NA
 748057 748058 rrnAC1543 rrnAC1544   spoVT FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 748058 748059 rrnAC1544 rrnAC1545 spoVT   FALSE 0.389 21.000 0.000 NA   NA
 748061 748062 rrnAC1547 rrnAC1548     FALSE 0.019 228.000 0.000 NA   NA
 748062 748063 rrnAC1548 rrnAC1549     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 748064 748065 rrnAC1550 rrnAC1551     FALSE 0.072 74.000 0.000 NA   NA
 748065 748066 rrnAC1551 rrnAC1552     FALSE 0.389 21.000 0.000 NA   NA
 748066 748067 rrnAC1552 rrnAC1553     FALSE 0.068 100.000 0.000 NA   NA
 748067 748068 rrnAC1553 rrnAC1555     FALSE 0.050 143.000 0.000 NA   NA
 748068 748069 rrnAC1555 rrnAC1556     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 748070 748071 rrnAC1557 rrnAC1558     TRUE 0.942 -7.000 0.250 NA   NA
 748071 748072 rrnAC1558 rrnAC1559   tnp FALSE 0.003 1386.000 0.000 NA   NA
 748072 748073 rrnAC1559 rrnAC1560 tnp tnp FALSE 0.003 899.000 0.000 NA   NA
 748073 748074 rrnAC1560 rrnAC1561 tnp   FALSE 0.484 91.000 0.000 NA Y NA
 748074 748075 rrnAC1561 rrnAC1562     FALSE 0.003 2681.000 0.000 NA   NA
 748075 748076 rrnAC1562 rrnAC1563     TRUE 0.572 152.000 1.000 NA   NA
 748077 748078 rrnAC1564 rrnAC1565   tnp FALSE 0.003 1186.000 0.000 NA   NA
 748078 748079 rrnAC1565 rrnAC1566 tnp   FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 748079 748080 rrnAC1566 rrnAC1567     TRUE 0.780 1.000 0.000 NA   NA
 748081 748082 rrnAC1568 rrnAC1569 cdc6g cdc6f FALSE 0.009 340.000 0.000 NA   NA
 748082 748083 rrnAC1569 rrnAC1570 cdc6f trp-7 FALSE 0.019 230.000 0.000 NA   NA
 748083 748084 rrnAC1570 rrnAC1571 trp-7 wcaH FALSE 0.149 41.000 0.000 1.000 N NA
 748084 748085 rrnAC1571 rrnAC1572 wcaH rfbB2 FALSE 0.055 73.000 0.000 1.000 N NA
 748085 748086 rrnAC1572 rrnAC1573 rfbB2 galE8 TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 748087 748088 rrnAC1574 rrnAC1575     FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 748088 748089 rrnAC1575 rrnAC1576     FALSE 0.003 1699.000 0.000 NA   NA
 748089 748090 rrnAC1576 rrnAC1577   tnp FALSE 0.007 591.000 0.000 1.000   NA
 748090 748091 rrnAC1577 rrnAC1578 tnp   FALSE 0.080 65.000 0.000 NA   NA
 748092 748093 rrnAC1579 rrnAC1580   tnp FALSE 0.003 2030.000 0.000 NA   NA
 748093 748094 rrnAC1580 rrnAC1581 tnp   TRUE 0.780 1.000 0.000 NA   NA
 748095 748096 rrnAC1582 rrnAC1583   icsA FALSE 0.003 1652.000 0.000 NA   NA
 748096 748097 rrnAC1583 rrnAC1584 icsA lpb2 TRUE 0.813 43.000 0.000 0.016 Y NA
 748098 748099 rrnAC1585 rrnAC1586 graD4a   FALSE 0.023 205.000 0.000 NA   NA
 748100 748101 rrnAC1587 rrnAC1588 glmS1   FALSE 0.003 829.000 0.000 NA   NA
 748101 748102 rrnAC1588 rrnAC1589   secY FALSE 0.003 1143.000 0.000 NA   NA
 748102 748103 rrnAC1589 rrnAC1590 secY rpl15P TRUE 0.924 7.000 0.261 1.000 N NA
 748103 748104 rrnAC1590 rrnAC1591 rpl15P rpl30P TRUE 0.997 0.000 0.471 0.002 Y NA
 748104 748105 rrnAC1591 rrnAC1592 rpl30P rps5P TRUE 0.997 0.000 0.475 0.021 Y NA
 748105 748106 rrnAC1592 rrnAC1593 rps5P rpl18P TRUE 0.994 -3.000 0.072 0.021 Y NA
 748106 748107 rrnAC1593 rrnAC1594 rpl18P rpl19E TRUE 0.995 0.000 0.079 0.017 Y NA
 748107 748108 rrnAC1594 rrnAC1595 rpl19E rpl32E TRUE 0.994 0.000 0.033 0.017 Y NA
 748108 748109 rrnAC1595 rrnAC1596 rpl32E rpl6P TRUE 0.994 0.000 0.055 0.017 Y NA
 748109 748110 rrnAC1596 rrnAC1597 rpl6P rps8P TRUE 0.990 3.000 0.068 0.017 Y NA
 748110 10697735 rrnAC1597 rrnAC3653 rps8P   TRUE 0.995 3.000 0.473 0.017 Y NA
 10697735 748111 rrnAC3653 rrnAC1598   rpl5P TRUE 0.997 -3.000 0.496 0.017 Y NA
 748111 748112 rrnAC1598 rrnAC1600 rpl5P rps4E TRUE 0.994 -3.000 0.073 0.017 Y NA
 748112 748113 rrnAC1600 rrnAC1601 rps4E rpl24P TRUE 0.997 -3.000 0.478 0.021 Y NA
 748113 748114 rrnAC1601 rrnAC1602 rpl24P rpl14P TRUE 0.990 5.000 0.472 0.021 Y NA
 748114 748115 rrnAC1602 rrnAC1603 rpl14P rps17P TRUE 0.997 0.000 0.506 0.017 Y NA
 748115 748116 rrnAC1603 rrnAC1604 rps17P rpl29P FALSE 0.214 275.000 0.000 0.017 Y NA
 748116 748117 rrnAC1604 rrnAC1605 rpl29P rps3P TRUE 0.994 -3.000 0.074 0.021 Y NA
 748117 748118 rrnAC1605 rrnAC1606 rps3P rpl22P TRUE 0.995 0.000 0.074 0.021 Y NA
 748118 748119 rrnAC1606 rrnAC1607 rpl22P rps19P TRUE 0.994 3.000 0.355 0.021 Y NA
 748119 748120 rrnAC1607 rrnAC1608 rps19P rpl2P TRUE 0.994 -3.000 0.051 0.021 Y NA
 748120 748121 rrnAC1608 rrnAC1609 rpl2P rpl23P TRUE 0.996 3.000 0.849 0.017 Y NA
 748121 748122 rrnAC1609 rrnAC1610 rpl23P rpl4 TRUE 0.994 -3.000 0.075 0.017 Y NA
 748122 748123 rrnAC1610 rrnAC1611 rpl4 rpl3 TRUE 0.995 4.000 0.885 0.017 Y NA
 748123 748124 rrnAC1611 rrnAC1612 rpl3   TRUE 0.949 5.000 0.359 NA   NA
 748125 748126 trn21 rrnAC1613     FALSE 0.005 464.000 0.000 NA   NA
 748126 748127 rrnAC1613 rrnAC1615     FALSE 0.068 100.000 0.000 NA   NA
 748127 748128 rrnAC1615 rrnAC1616   mch TRUE 0.697 25.000 0.012 NA   NA
 748128 748129 rrnAC1616 rrnAC1617 mch   TRUE 0.919 4.000 0.070 NA   NA
 748130 748131 rrnAC1619 rrnAC1620 gbp2   FALSE 0.028 460.000 0.012 1.000   NA
 748131 748132 rrnAC1620 rrnAC1621     FALSE 0.306 38.000 0.000 1.000   NA
 748134 748135 rrnAC1623 rrnAC1624   soxA3 FALSE 0.163 44.000 0.000 NA   NA
 748142 748143 rrnAC1631 rrnAC1632     FALSE 0.447 13.000 0.000 NA   NA
 748143 748144 rrnAC1632 rrnAC1633     FALSE 0.021 216.000 0.000 NA   NA
 748146 748147 rrnAC1635 rrnAC1636     FALSE 0.120 49.000 0.000 NA   NA
 748148 748149 rrnAC1637 rrnAC1638     FALSE 0.069 80.000 0.000 NA   NA
 748149 748150 rrnAC1638 rrnAC1639   smc2 TRUE 0.829 -25.000 0.056 NA   NA
 748150 748151 rrnAC1639 rrnAC1640 smc2   FALSE 0.377 22.000 0.000 NA   NA
 748151 748152 rrnAC1640 rrnAC1641     FALSE 0.078 67.000 0.000 NA   NA
 748154 748155 rrnAC1643 rrnAC1644     FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 748157 748158 rrnAC1646 rrnAC1647     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 748158 748159 rrnAC1647 rrnAC1649     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 748161 748162 rrnAC1651 rrnAC1652 yhdG trkA5 TRUE 0.791 3.000 0.000 1.000   NA
 748162 748163 rrnAC1652 rrnAC1653 trkA5 asnC3 FALSE 0.092 128.000 0.000 1.000   NA
 748163 748164 rrnAC1653 rrnAC1654 asnC3   FALSE 0.044 150.000 0.000 NA   NA
 748164 748165 rrnAC1654 rrnAC1655   nosF-2 TRUE 0.986 -3.000 0.500 NA   NA
 748165 748166 rrnAC1655 rrnAC1656 nosF-2   TRUE 0.701 72.000 1.000 NA   NA
 748168 748169 rrnAC1658 rrnAC1659   hop FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 748169 748170 rrnAC1659 rrnAC1660 hop yafB-3 FALSE 0.056 169.000 0.000 1.000   NA
 748170 748171 rrnAC1660 rrnAC1662 yafB-3   FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 748171 748172 rrnAC1662 rrnAC1663   boa FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 748172 748173 rrnAC1663 rrnAC1664 boa   FALSE 0.359 24.000 0.000 NA   NA
 748173 748174 rrnAC1664 rrnAC1665     TRUE 0.989 -3.000 0.750 NA   NA
 748176 748177 rrnAC1667 rrnAC1668   rpoP FALSE 0.355 108.000 0.088 NA   NA
 748177 748178 rrnAC1668 rrnAC1669 rpoP rpl37AE TRUE 0.828 27.000 0.234 1.000 N NA
 748180 748181 rrnAC1671 rrnAC1672     FALSE 0.085 62.000 0.000 NA   NA
 748182 748183 rrnAC1673 rrnAC1674     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 748185 748186 rrnAC1678 rrnAC1680   pfdB FALSE 0.021 220.000 0.000 NA   NA
 748186 748187 rrnAC1680 rrnAC1681 pfdB   TRUE 0.872 5.000 0.026 NA   NA
 748188 748189 rrnAC1682 rrnAC1683     FALSE 0.453 73.000 0.222 NA   NA
 748190 748191 rrnAC1684 rrnAC1686     FALSE 0.163 44.000 0.000 NA   NA
 748191 748192 rrnAC1686 rrnAC1687   boa FALSE 0.107 91.000 0.000 1.000   NA
 748192 748193 rrnAC1687 rrnAC1688 boa   FALSE 0.068 100.000 0.000 NA   NA
 748193 748194 rrnAC1688 rrnAC1689     FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 748195 748196 rrnAC1690 rrnAC1691 leuA1   FALSE 0.138 197.000 0.046 NA   NA
 748197 748198 rrnAC1692 rrnAC1693     FALSE 0.316 161.000 0.250 NA   NA
 748198 748199 rrnAC1693 rrnAC1694   guaA2 FALSE 0.211 70.000 0.003 1.000 N NA
 748199 748200 rrnAC1694 rrnAC1696 guaA2   FALSE 0.284 56.000 0.006 NA   NA
 748203 748204 rrnAC1699 rrnAC1700     TRUE 0.956 7.000 0.500 1.000   NA
 748206 748207 rrnAC1702 rrnAC1703     FALSE 0.113 520.000 0.846 NA   NA
 748207 748208 rrnAC1703 rrnAC1704     FALSE 0.126 48.000 0.000 NA   NA
 748210 748211 rrnAC1706 rrnAC1707 pgp cad FALSE 0.022 538.000 0.008 1.000   NA
 748211 748212 rrnAC1707 rrnAC1708 cad hemA TRUE 0.835 42.000 0.009 1.000 Y NA
 748212 748213 rrnAC1708 rrnAC1709 hemA hemX TRUE 0.991 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 748213 748214 rrnAC1709 rrnAC1711 hemX nirH FALSE 0.437 47.000 0.054 NA N NA
 748216 748217 rrnAC1713 rrnAC1714   cspD5 FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 748217 748218 rrnAC1714 rrnAC1715 cspD5 cspD1 TRUE 0.978 3.000 0.000 0.044 Y NA
 748221 748222 rrnAC1718 rrnAC1719   rimI TRUE 0.952 -3.000 0.024 NA   NA
 748223 748224 rrnAC1720 rrnAC1721 dnaG   FALSE 0.006 179.000 0.000 NA N NA
 748225 748226 rrnAC1722 rrnAC1724 csaA   FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 748226 748227 rrnAC1724 rrnAC1726   panF TRUE 0.783 44.000 0.522 NA   NA
 748227 748228 rrnAC1726 rrnAC1727 panF   FALSE 0.067 103.000 0.000 NA   NA
 748228 748229 rrnAC1727 rrnAC1728     FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 748229 748230 rrnAC1728 rrnAC1729   valS FALSE 0.025 198.000 0.000 NA   NA
 748230 748231 rrnAC1729 rrnAC1730 valS   FALSE 0.070 93.000 0.000 NA   NA
 748233 748234 rrnAC1732 rrnAC1733     FALSE 0.007 333.000 0.000 1.000 N NA
 748236 748237 rrnAC1735 rrnAC1737     TRUE 0.562 47.000 0.114 NA   NA
 748239 748240 rrnAC1739 rrnAC1740   mvaS FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 748241 748242 rrnAC1742 rrnAC1743     FALSE 0.101 53.000 0.000 NA   NA
 748244 748245 rrnAC1745 rrnAC1747 yckA-2 glnQ1 TRUE 0.983 4.000 0.143 1.000 Y NA
 748245 748246 rrnAC1747 rrnAC1749 glnQ1 glnH2 TRUE 0.993 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 748246 748247 rrnAC1749 rrnAC1750 glnH2 argT TRUE 0.989 4.000 0.244 0.043 Y NA
 748247 748248 rrnAC1750 rrnAC1751 argT ccp FALSE 0.241 61.000 0.000 0.084   NA
 748249 748250 rrnAC1752 rrnAC1754 htr15 maeB FALSE 0.120 172.000 0.011 1.000 N NA
 748253 748254 rrnAC1757 rrnAC1758 gptA   FALSE 0.115 71.000 0.000 1.000   NA
 748254 748255 rrnAC1758 rrnAC1759     FALSE 0.042 155.000 0.000 NA   NA
 748255 748256 rrnAC1759 rrnAC1760     TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 748256 748257 rrnAC1760 rrnAC1761   atoE FALSE 0.107 79.000 0.000 1.000   NA
 748260 748261 rrnAC1765 rrnAC1767 tenA tenA-2 TRUE 0.995 -3.000 0.073 0.001 Y NA
 748261 748262 rrnAC1767 rrnAC1769 tenA-2 putP-2 TRUE 0.952 1.000 0.043 1.000 N NA
 748262 748263 rrnAC1769 rrnAC1770 putP-2   TRUE 0.795 -3.000 0.000 NA   NA
 748263 748264 rrnAC1770 rrnAC1771     FALSE 0.068 83.000 0.000 NA   NA
 748265 748266 rrnAC1772 rrnAC1773 psmA1 psmA2 TRUE 0.997 0.000 0.500 0.001 Y NA
 748266 748267 rrnAC1773 rrnAC1774 psmA2   FALSE 0.307 70.000 0.015 1.000   NA
 748268 748269 rrnAC1775 rrnAC1776   dcd FALSE 0.216 115.000 0.007 NA   NA
 748269 748270 rrnAC1776 rrnAC1777 dcd   TRUE 0.955 1.000 0.022 1.000   NA
 748270 748271 rrnAC1777 rrnAC1779   aknG FALSE 0.323 132.000 0.066 1.000   NA
 748272 748273 rrnAC1780 rrnAC1781     FALSE 0.027 190.000 0.000 NA   NA
 748273 748274 rrnAC1781 rrnAC1782   thi1 FALSE 0.056 132.000 0.000 NA   NA
 748274 748275 rrnAC1782 rrnAC1783 thi1   FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 748275 748276 rrnAC1783 rrnAC1784     FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 748276 748277 rrnAC1784 rrnAC1786     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 748278 748279 rrnAC1787 rrnAC1789 hutU hutG TRUE 0.995 -3.000 0.114 0.001 Y NA
 748279 748280 rrnAC1789 rrnAC1790 hutG hutI TRUE 0.972 -3.000 0.171 1.000 N NA
 748280 748281 rrnAC1790 rrnAC1791 hutI hutH TRUE 0.965 -3.000 0.015 0.030 N NA
 748282 748283 rrnAC1792 rrnAC1793 ruvB   TRUE 0.949 -3.000 0.021 NA   NA
 748284 748285 rrnAC1794 rrnAC1795 dapF ppsA FALSE 0.343 70.000 0.031 1.000   NA
 748285 748286 rrnAC1795 rrnAC1797 ppsA htlC FALSE 0.261 59.000 0.021 NA N NA
 748286 748287 rrnAC1797 rrnAC1798 htlC gadD FALSE 0.173 144.000 0.029 NA N NA
 748287 748288 rrnAC1798 rrnAC1800 gadD metS FALSE 0.011 790.000 0.005 1.000 N NA
 748288 748289 rrnAC1800 rrnAC1801 metS   FALSE 0.142 46.000 0.000 NA   NA
 748289 748290 rrnAC1801 rrnAC1802     FALSE 0.073 73.000 0.000 NA   NA
 748290 748291 rrnAC1802 rrnAC1803     TRUE 0.693 72.000 0.071 NA Y NA
 748291 748292 rrnAC1803 rrnAC1805   gntR TRUE 0.563 51.000 0.154 1.000   NA
 748293 748294 rrnAC1806 rrnAC1807 htlD   FALSE 0.025 200.000 0.000 NA   NA
 748296 748297 rrnAC1809 rrnAC1810     FALSE 0.082 325.000 0.150 NA   NA
 748297 748298 rrnAC1810 rrnAC1811     TRUE 0.932 10.000 0.400 NA   NA
 748299 748300 rrnAC1812 rrnAC1813 pnm   FALSE 0.392 94.000 0.127 NA   NA
 748303 748304 rrnAC1816 rrnAC1817     TRUE 0.709 27.000 0.026 NA   NA
 748305 748306 rrnAC1818 rrnAC1820     FALSE 0.022 268.000 0.000 1.000   NA
 748306 748307 rrnAC1820 rrnAC1821   lysE TRUE 0.667 38.000 0.048 1.000   NA
 748310 748311 rrnAC1824 trn24     FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 748311 748312 trn24 rrnAC1825   idr FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 748312 748313 rrnAC1825 rrnAC1826 idr   TRUE 0.990 -3.000 0.733 1.000   NA
 748313 748314 rrnAC1826 rrnAC1827     FALSE 0.004 580.000 0.000 NA   NA
 748314 748315 rrnAC1827 rrnAC1828     FALSE 0.020 225.000 0.000 NA   NA
 748315 748316 rrnAC1828 rrnAC1829     TRUE 0.989 3.000 0.018 0.002 Y NA
 748316 748317 rrnAC1829 rrnAC1830   yurF TRUE 0.945 37.000 0.466 1.000 Y NA
 748317 748318 rrnAC1830 rrnAC1831 yurF polB1 FALSE 0.184 126.000 0.007 1.000 N NA
 748318 748319 rrnAC1831 rrnAC1833 polB1   FALSE 0.003 1367.000 0.000 NA   NA
 748319 748320 rrnAC1833 rrnAC1834     FALSE 0.239 36.000 0.000 NA   NA
 748320 748321 rrnAC1834 rrnAC1835     FALSE 0.005 462.000 0.000 NA   NA
 748321 748322 rrnAC1835 rrnAC1836   tnp FALSE 0.003 2267.000 0.000 NA   NA
 748323 748324 rrnAC1837 rrnAC1838     TRUE 0.811 28.000 0.167 NA   NA
 748325 748326 rrnAC1840 rrnAC1841 smc1 yhcR2 TRUE 0.974 -37.000 0.157 0.001 Y NA
 748326 748327 rrnAC1841 rrnAC1842 yhcR2   FALSE 0.273 85.000 0.025 NA   NA
 748328 748329 rrnAC1843 rrnAC1844     FALSE 0.069 91.000 0.000 NA   NA
 748329 748330 rrnAC1844 rrnAC1845     FALSE 0.295 30.000 0.000 NA   NA
 748330 748331 rrnAC1845 rrnAC1846     TRUE 0.588 -7.000 0.000 NA   NA
 748331 748332 rrnAC1846 rrnAC1848   virB11 FALSE 0.043 154.000 0.000 NA   NA
 748332 748333 rrnAC1848 rrnAC1849 virB11   FALSE 0.093 660.000 0.842 NA   NA
 748333 748334 rrnAC1849 rrnAC1850     TRUE 0.827 35.000 0.389 NA   NA
 748334 748335 rrnAC1850 rrnAC1851     TRUE 0.913 -19.000 0.333 NA   NA
 748335 748336 rrnAC1851 rrnAC1852     TRUE 0.982 -3.000 0.375 NA   NA
 748336 748337 rrnAC1852 rrnAC1853     FALSE 0.159 375.000 0.778 NA   NA
 748337 748338 rrnAC1853 rrnAC1854     TRUE 0.770 45.000 0.538 NA   NA
 748338 748339 rrnAC1854 rrnAC1855     FALSE 0.021 558.000 0.020 NA   NA
 748339 748340 rrnAC1855 rrnAC1856     FALSE 0.383 49.000 0.015 NA   NA
 748340 748341 rrnAC1856 rrnAC1858     FALSE 0.423 73.000 0.103 1.000   NA
 748343 748344 rrnAC1860 rrnAC1861     FALSE 0.265 33.000 0.000 NA   NA
 748344 748345 rrnAC1861 rrnAC1863   mutT4 FALSE 0.349 92.000 0.073 NA   NA
 748345 748346 rrnAC1863 rrnAC1864 mutT4   FALSE 0.337 71.000 0.049 NA   NA
 748346 748347 rrnAC1864 rrnAC1865   soxB TRUE 0.974 1.000 0.217 NA   NA
 748349 748350 rrnAC1868 rrnAC1869   trp1 FALSE 0.076 70.000 0.000 NA   NA
 748350 748351 rrnAC1869 rrnAC1870 trp1 nhaC3 FALSE 0.013 526.000 0.000 0.031 N NA
 748353 748354 rrnAC1872 rrnAC1873   dpg FALSE 0.291 69.000 0.022 NA   NA
 748354 748355 rrnAC1873 rrnAC1875 dpg tfbD FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 748355 748356 rrnAC1875 rrnAC1876 tfbD zim FALSE 0.004 500.000 0.000 1.000 N NA
 748356 748357 rrnAC1876 rrnAC1877 zim aroD TRUE 0.541 37.000 0.013 1.000 N NA
 748357 748358 rrnAC1877 rrnAC1878 aroD   FALSE 0.284 85.000 0.031 NA   NA
 748361 748362 rrnAC1881 rrnAC1884 deoC2 trpA TRUE 0.687 27.000 0.024 1.000 N NA
 748362 748363 rrnAC1884 rrnAC1885 trpA trpB TRUE 0.994 0.000 0.026 0.001 Y NA
 748363 748364 rrnAC1885 rrnAC1886 trpB trpC TRUE 0.990 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 748365 748366 rrnAC1887 rrnAC1888 hat5 gbp5 FALSE 0.104 101.000 0.000 1.000   NA
 748367 748368 rrnAC1890 rrnAC1891     FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 748368 748369 rrnAC1891 rrnAC1892     TRUE 0.970 -3.000 0.118 NA   NA
 748369 748370 rrnAC1892 rrnAC1893   ldc FALSE 0.002 338.000 0.000 NA N NA
 748371 748372 rrnAC1895 rrnAC1896     FALSE 0.452 121.000 0.286 NA   NA
 748372 748373 rrnAC1896 rrnAC1898     FALSE 0.091 57.000 0.000 NA   NA
 748374 748375 rrnAC1899 rrnAC1901   brp FALSE 0.107 79.000 0.000 1.000   NA
 748376 748377 rrnAC1902 rrnAC1903 crtI1 apt2 FALSE 0.048 119.000 0.000 1.000 N NA
 748379 748380 rrnAC1905 rrnAC1906 dsbB1 tas FALSE 0.103 108.000 0.000 1.000   NA
 748381 748382 rrnAC1907 rrnAC1908   nthD FALSE 0.062 123.000 0.000 NA   NA
 748382 748383 rrnAC1908 rrnAC1910 nthD fbr1 FALSE 0.004 440.000 0.000 1.000 N NA
 748383 748384 rrnAC1910 rrnAC1911 fbr1   FALSE 0.070 77.000 0.000 NA   NA
 748384 748385 rrnAC1911 rrnAC1913   nadM TRUE 0.971 0.000 0.088 NA   NA
 748386 748387 rrnAC1914 rrnAC1915 lon   TRUE 0.970 1.000 0.147 NA   NA
 748388 748389 rrnAC1916 rrnAC1917   glpQ2 FALSE 0.352 17.000 0.000 1.000 N NA
 748389 748390 rrnAC1917 rrnAC1918 glpQ2 dhs FALSE 0.050 112.000 0.000 1.000 N NA
 748391 748392 rrnAC1920 rrnAC1921 azlC   FALSE 0.497 -10.000 0.000 NA   NA
 748393 748394 rrnAC1922 rrnAC1923   nif3 TRUE 0.844 5.000 0.010 NA   NA
 748394 748395 rrnAC1923 rrnAC1924 nif3   FALSE 0.105 52.000 0.000 NA   NA
 748395 748396 rrnAC1924 rrnAC1925   mhpC FALSE 0.003 1133.000 0.000 NA   NA
 748398 748399 rrnAC1927 rrnAC1929 speB1 eif5A TRUE 0.924 3.000 0.035 1.000 N NA
 748400 748401 rrnAC1930 rrnAC1931   cobS FALSE 0.124 291.000 0.046 0.012   NA
 748401 748402 rrnAC1931 rrnAC1932 cobS ispD TRUE 0.990 0.000 0.010 1.000 Y NA
 748402 748403 rrnAC1932 rrnAC1934 ispD hisC1 FALSE 0.231 65.000 0.006 1.000 N NA
 748403 748404 rrnAC1934 rrnAC1935 hisC1   TRUE 0.891 -16.000 0.136 1.000   NA
 748404 748405 rrnAC1935 rrnAC1936   cobI FALSE 0.389 70.000 0.061 1.000   NA
 748405 748406 rrnAC1936 rrnAC1938 cobI cobQ FALSE 0.195 371.000 0.007 0.012 Y NA
 748406 748407 rrnAC1938 rrnAC1939 cobQ minD1 FALSE 0.387 61.000 0.003 0.006 N NA
 748407 748408 rrnAC1939 rrnAC1940 minD1   TRUE 0.991 -3.000 0.875 NA   NA
 748409 748410 rrnAC1941 rrnAC1942     FALSE 0.012 296.000 0.000 NA   NA
 748410 748411 rrnAC1942 rrnAC1943   phrB2 FALSE 0.016 69.000 0.000 NA N NA
 748413 748414 rrnAC1945 rrnAC1946     TRUE 0.989 -3.000 0.714 NA   NA
 748414 748415 rrnAC1946 rrnAC1947     TRUE 0.974 -7.000 0.857 NA   NA
 748415 748416 rrnAC1947 rrnAC1948     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 748416 748417 rrnAC1948 rrnAC1950     FALSE 0.003 760.000 0.000 NA   NA
 748417 748418 rrnAC1950 rrnAC1951   gspE1 FALSE 0.483 203.000 0.167 1.000 Y NA
 748419 748420 rrnAC1952 rrnAC1953     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 748420 748421 rrnAC1953 rrnAC1954   yusZ1 FALSE 0.473 125.000 0.286 1.000   NA
 748421 748422 rrnAC1954 rrnAC1955 yusZ1 glpA FALSE 0.026 248.000 0.000 1.000   NA
 748422 748423 rrnAC1955 rrnAC1956 glpA eif2BD2 FALSE 0.052 89.000 0.000 1.000 N NA
 748426 748427 rrnAC1959 rrnAC1960   graD4b FALSE 0.058 130.000 0.000 NA   NA
 748427 748428 rrnAC1960 rrnAC1961 graD4b cga-1 FALSE 0.083 51.000 0.000 1.000 N NA
 748428 748429 rrnAC1961 rrnAC1962 cga-1 malA TRUE 0.794 122.000 0.444 1.000 Y NA
 748435 748436 rrnAC1968 rrnAC1970     FALSE 0.062 124.000 0.000 NA   NA
 748439 748440 rrnAC1973 rrnAC1974 aldY4 aacC FALSE 0.052 95.000 0.000 1.000 N NA
 748441 748442 rrnAC1975 rrnAC1977 adh5 alkK4 FALSE 0.072 148.000 0.000 1.000   NA
 748442 748443 rrnAC1977 rrnAC1978 alkK4   FALSE 0.265 33.000 0.000 NA   NA
 748444 748445 rrnAC1979 rrnAC1980 ech5 aph FALSE 0.238 44.000 0.000 1.000   NA
 748445 748446 rrnAC1980 rrnAC1982 aph hbd2 FALSE 0.056 169.000 0.000 1.000   NA
 748447 748448 rrnAC1983 rrnAC1984 acdI fabG4 FALSE 0.100 367.000 0.000 1.000 Y NA
 748451 748452 rrnAC1987 rrnAC1989 anf livH-5 TRUE 0.982 4.000 0.150 NA Y NA
 748452 748453 rrnAC1989 rrnAC1991 livH-5 livM-4 TRUE 0.989 -7.000 0.350 0.036 Y NA
 748453 748454 rrnAC1991 rrnAC1992 livM-4 livG-5 TRUE 0.744 144.000 0.429 1.000 Y NA
 748454 748455 rrnAC1992 rrnAC1993 livG-5 livF-5 TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.023 Y NA
 748455 748456 rrnAC1993 rrnAC1994 livF-5   FALSE 0.003 882.000 0.000 NA   NA
 748459 748460 rrnAC1997 rrnAC1998 rbnBN2   FALSE 0.011 389.000 0.000 1.000   NA
 748461 748462 rrnAC1999 rrnAC2000 spaT usp9 FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 748464 748465 rrnAC2001 rrnAC2002     FALSE 0.028 239.000 0.000 1.000   NA
 748465 748466 rrnAC2002 rrnAC2004   ftsZ3 TRUE 0.955 3.000 0.089 1.000   NA
 748467 748468 rrnAC2005 rrnAC2006     FALSE 0.069 89.000 0.000 NA   NA
 748468 748469 rrnAC2006 rrnAC2007     FALSE 0.069 89.000 0.000 NA   NA
 748470 748471 rrnAC2009 rrnAC2010     FALSE 0.008 365.000 0.000 NA   NA
 748471 748472 rrnAC2010 rrnAC2011     FALSE 0.206 39.000 0.000 NA   NA
 748472 748473 rrnAC2011 rrnAC2012     TRUE 0.972 -7.000 0.750 NA   NA
 748474 748475 rrnAC2014 rrnAC2015   xthA FALSE 0.269 94.000 0.010 1.000   NA
 748475 748476 rrnAC2015 rrnAC2016 xthA   FALSE 0.191 41.000 0.000 NA   NA
 748478 748479 rrnAC2018 rrnAC2019 katG1 lpl FALSE 0.007 337.000 0.000 1.000 N NA
 748479 748480 rrnAC2019 rrnAC2021 lpl   FALSE 0.006 448.000 0.000 NA   NA
 748480 748481 rrnAC2021 rrnAC2022     FALSE 0.048 145.000 0.000 NA   NA
 748482 748483 rrnAC2023 rrnAC2024 nuoC msrA1 FALSE 0.064 62.000 0.000 1.000 N NA
 748485 748486 rrnAC2026 rrnAC2027   cdc48a TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 748487 748488 rrnAC2028 rrnAC2030   xop1 FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 748489 748490 rrnAC2031 rrnAC2032     FALSE 0.079 66.000 0.000 NA   NA
 748490 748491 rrnAC2032 rrnAC2034   htlA FALSE 0.067 104.000 0.000 NA   NA
 748493 748494 rrnAC2036 rrnAC2037 pkn troR FALSE 0.003 695.000 0.000 1.000 N NA
 748494 748495 rrnAC2037 rrnAC2038 troR nifU2 FALSE 0.437 170.000 0.400 0.007 N NA
 748495 748496 rrnAC2038 rrnAC2039 nifU2 oppA FALSE 0.008 302.000 0.000 1.000 N NA
 748496 748497 rrnAC2039 rrnAC2040 oppA oppB TRUE 0.988 10.000 0.667 0.036 Y NA
 748497 748498 rrnAC2040 rrnAC2041 oppB oppC2 TRUE 0.994 4.000 0.833 0.036 Y NA
 748498 748499 rrnAC2041 rrnAC2042 oppC2 oppD1 TRUE 0.997 0.000 0.833 1.000 Y NA
 748499 748500 rrnAC2042 rrnAC2043 oppD1 oppF TRUE 0.993 -7.000 0.667 0.002 Y NA
 748503 748504 rrnAC2046 rrnAC2047   sppA TRUE 0.979 -7.000 1.000 1.000   NA
 748505 748506 rrnAC2048 rrnAC2049 mocA   TRUE 0.742 27.000 0.025 1.000   NA
 748506 748507 rrnAC2049 rrnAC2050     FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 748508 748509 rrnAC2051 rrnAC2052 tfbF   FALSE 0.072 239.000 0.000 0.008   NA
 748511 748512 rrnAC2054 rrnAC2056   serA3 FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 748515 748516 rrnAC2059 rrnAC2060     FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 748516 748517 rrnAC2060 rrnAC2061     TRUE 0.953 11.000 0.727 NA   NA
 748518 748519 rrnAC2062 rrnAC2064   aor1 FALSE 0.227 37.000 0.000 NA   NA
 748521 748522 rrnAC2066 rrnAC2067 blh crtY TRUE 0.878 -9.000 0.061 NA   NA
 748522 748523 rrnAC2067 rrnAC2069 crtY crtB FALSE 0.436 49.000 0.036 NA   NA
 748523 748524 rrnAC2069 rrnAC2070 crtB boa FALSE 0.024 257.000 0.000 1.000   NA
 748525 748526 rrnAC2071 rrnAC2072   vacB FALSE 0.405 67.000 0.098 NA   NA
 748526 748527 rrnAC2072 rrnAC2073 vacB trp2 FALSE 0.011 401.000 0.000 1.000   NA
 748527 748528 rrnAC2073 rrnAC2074 trp2   TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 748531 748532 rrnAC2078 rrnAC2079     FALSE 0.006 432.000 0.000 NA   NA
 748532 748533 rrnAC2079 rrnAC2080     FALSE 0.005 468.000 0.000 NA   NA
 748534 748535 rrnAC2081 rrnAC2082   dhp TRUE 0.746 39.000 0.250 NA   NA
 748536 748537 rrnAC2083 rrnAC2084 yadH nosF-3 TRUE 0.990 -3.000 0.636 0.097 N NA
 748537 748538 rrnAC2084 rrnAC2085 nosF-3   FALSE 0.259 124.000 0.029 NA   NA
 748542 748543 rrnAC2089 rrnAC2090   moeB FALSE 0.069 96.000 0.000 NA   NA
 748543 748544 rrnAC2090 rrnAC2091 moeB htr FALSE 0.231 83.000 0.014 1.000 N NA
 748544 748545 rrnAC2091 rrnAC2092 htr cxp FALSE 0.401 90.000 0.167 1.000 N NA
 748545 748546 rrnAC2092 rrnAC2094 cxp   FALSE 0.052 89.000 0.000 1.000 N NA
 748546 748547 rrnAC2094 rrnAC2095   argE FALSE 0.021 186.000 0.000 1.000 N NA
 748548 748549 rrnAC2096 rrnAC2098 uvsE   FALSE 0.139 57.000 0.000 1.000   NA
 748549 748550 rrnAC2098 rrnAC2099     FALSE 0.068 99.000 0.000 NA   NA
 748550 748551 rrnAC2099 rrnAC2100   entB1 TRUE 0.977 2.000 0.345 NA   NA
 748553 748554 rrnAC2102 rrnAC2103   rli TRUE 0.968 3.000 0.328 NA   NA
 748555 748556 rrnAC2104 rrnAC2105     FALSE 0.315 69.000 0.034 NA   NA
 748557 748558 rrnAC2106 rrnAC2107     FALSE 0.071 76.000 0.000 NA   NA
 748558 748559 rrnAC2107 rrnAC2108   npdG-1 FALSE 0.114 50.000 0.000 NA   NA
 748559 748560 rrnAC2108 rrnAC2109 npdG-1 htlD FALSE 0.014 340.000 0.000 1.000   NA
 748562 748563 rrnAC2111 rrnAC2112 sec61beta   TRUE 0.556 45.000 0.069 NA   NA
 748563 748564 rrnAC2112 rrnAC2113     TRUE 0.970 -3.000 0.120 NA   NA
 748565 748566 rrnAC2114 rrnAC2115     FALSE 0.097 55.000 0.000 NA   NA
 748567 748568 rrnAC2116 rrnAC2117 uvrA   FALSE 0.068 83.000 0.000 NA   NA
 748568 748569 rrnAC2117 rrnAC2119     FALSE 0.034 173.000 0.000 NA   NA
 748569 748570 rrnAC2119 rrnAC2121     FALSE 0.068 81.000 0.000 NA   NA
 748570 748571 rrnAC2121 rrnAC2123     FALSE 0.191 41.000 0.000 NA   NA
 748573 748574 rrnAC2125 rrnAC2126   bchP FALSE 0.068 82.000 0.000 NA   NA
 748574 748575 rrnAC2126 rrnAC2127 bchP   FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 748577 748578 rrnAC2129 rrnAC2131 sseA2   FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 748578 748579 rrnAC2131 rrnAC2133   epf1 FALSE 0.006 410.000 0.000 NA   NA
 748581 748582 rrnAC2136 rrnAC2137   tcmJ FALSE 0.091 57.000 0.000 NA   NA
 748583 748584 rrnAC2139 rrnAC2140 imd3 sdr2 FALSE 0.105 84.000 0.000 1.000   NA
 748585 748586 rrnAC2141 rrnAC2142 trxA8   FALSE 0.070 78.000 0.000 NA   NA
 748587 748588 rrnAC2143 rrnAC2144 thiE   FALSE 0.037 44.000 0.000 NA N NA
 748588 748589 rrnAC2144 rrnAC2145   phoU1 TRUE 0.989 3.000 0.222 NA Y NA
 748589 748590 rrnAC2145 rrnAC2146 phoU1 pstB2 TRUE 0.990 3.000 0.286 NA Y NA
 748590 748591 rrnAC2146 rrnAC2147 pstB2 pstA1 TRUE 0.983 -7.000 0.038 0.003 Y NA
 748591 748592 rrnAC2147 rrnAC2148 pstA1 pstC2 TRUE 0.995 -3.000 0.198 0.003 Y NA
 748592 748593 rrnAC2148 rrnAC2149 pstC2 yqgG TRUE 0.653 61.000 0.007 NA Y NA
 748595 748596 rrnAC2151 rrnAC2152     FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 748596 748597 rrnAC2152 rrnAC2153   mutT2 TRUE 0.552 39.000 0.020 NA   NA
 748597 748598 rrnAC2153 rrnAC2154 mutT2   TRUE 0.949 -3.000 0.020 NA   NA
 748598 748599 rrnAC2154 rrnAC2155     TRUE 0.980 0.000 0.250 NA   NA
 748599 748600 rrnAC2155 rrnAC2156     TRUE 0.936 24.000 0.833 NA   NA
 748600 748601 rrnAC2156 rrnAC2157   rimI FALSE 0.460 132.000 0.375 NA   NA
 748601 748602 rrnAC2157 rrnAC2158 rimI acnB FALSE 0.031 485.000 0.027 1.000   NA
 748603 748604 rrnAC2159 rrnAC2160 dcd3   FALSE 0.032 223.000 0.000 1.000   NA
 748604 748605 rrnAC2160 rrnAC2161     FALSE 0.020 225.000 0.000 NA   NA
 748605 748606 rrnAC2161 rrnAC2162   mgsA FALSE 0.279 59.000 0.009 NA   NA
 748607 748608 rrnAC2163 rrnAC2164 exsB   TRUE 0.714 20.000 0.004 NA   NA
 748608 748609 rrnAC2164 rrnAC2166   ptpS TRUE 0.973 0.000 0.139 1.000 N NA
 748610 748611 rrnAC2167 rrnAC2168     FALSE 0.058 130.000 0.000 NA   NA
 748611 748612 rrnAC2168 rrnAC2169     FALSE 0.004 556.000 0.000 NA   NA
 748613 748614 rrnAC2170 rrnAC2171 pepB4   FALSE 0.083 63.000 0.000 NA   NA
 748615 748616 rrnAC2172 rrnAC2173 adh14   FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 748617 748618 rrnAC2174 rrnAC2175 fdx seb TRUE 0.809 23.000 0.048 1.000   NA
 748618 748619 rrnAC2175 rrnAC2176 seb galE9 FALSE 0.102 113.000 0.000 1.000   NA
 748619 748620 rrnAC2176 rrnAC2178 galE9 rfbB3 TRUE 0.666 61.000 0.000 0.008 Y NA
 748620 748621 rrnAC2178 trn26 rfbB3   FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 748621 748622 trn26 rrnAC2179   fer2 FALSE 0.152 45.000 0.000 NA   NA
 748622 748623 rrnAC2179 rrnAC2180 fer2 gnd FALSE 0.267 129.000 0.048 1.000 N NA
 748625 748626 rrnAC2183 rrnAC2184 fapJ gspE3 TRUE 0.994 3.000 0.578 1.000 Y NA
 748626 748627 rrnAC2184 rrnAC2186 gspE3 flpH TRUE 0.981 14.000 0.547 1.000 Y NA
 748627 748628 rrnAC2186 rrnAC2187 flpH flaG TRUE 0.994 -3.000 0.243 1.000 Y NA
 748628 748629 rrnAC2187 rrnAC2190 flaG flaF TRUE 0.996 2.000 0.409 0.002 Y NA
 748629 748630 rrnAC2190 rrnAC2191 flaF fapE1 TRUE 0.964 -16.000 0.091 1.000 Y NA
 748630 748631 rrnAC2191 rrnAC2192 fapE1 cheD FALSE 0.197 242.000 0.000 1.000 Y NA
 748631 748632 rrnAC2192 rrnAC2193 cheD cheA1 TRUE 0.991 0.000 0.021 1.000 Y NA
 748632 748633 rrnAC2193 rrnAC2194 cheA1 cheY TRUE 0.980 1.000 0.000 1.000 Y NA
 748633 748634 rrnAC2194 rrnAC2195 cheY   FALSE 0.318 149.000 0.182 NA   NA
 748634 748635 rrnAC2195 rrnAC2197     FALSE 0.018 233.000 0.000 NA   NA
 748635 748636 rrnAC2197 rrnAC2198   flaB FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 748636 748637 rrnAC2198 rrnAC2199 flaB   FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 748637 748638 rrnAC2199 rrnAC2200     FALSE 0.454 84.000 0.250 NA   NA
 748638 748639 rrnAC2200 rrnAC2202   kaiC1 FALSE 0.353 157.000 0.250 1.000   NA
 748639 748640 rrnAC2202 rrnAC2203 kaiC1 cheW1 TRUE 0.762 89.000 0.250 1.000 Y NA
 748641 748642 rrnAC2204 rrnAC2205 cheB cheA3 TRUE 0.997 3.000 1.000 0.007 Y NA
 748642 748643 rrnAC2205 rrnAC2206 cheA3 cheR TRUE 0.996 -3.000 0.556 1.000 Y NA
 748643 748644 rrnAC2206 rrnAC2207 cheR cpcE2 TRUE 0.960 7.000 0.714 1.000 N NA
 748644 748645 rrnAC2207 rrnAC2209 cpcE2   TRUE 0.688 60.000 0.714 NA   NA
 748645 748646 rrnAC2209 rrnAC2211   htlD FALSE 0.068 83.000 0.000 NA   NA
 748646 748647 rrnAC2211 rrnAC2212 htlD rps6E FALSE 0.057 70.000 0.000 1.000 N NA
 748647 748648 rrnAC2212 rrnAC2213 rps6E   FALSE 0.005 535.000 0.000 NA   NA
 748651 748652 rrnAC2216 rrnAC2217   recJ4 FALSE 0.388 80.000 0.125 NA   NA
 748652 748653 rrnAC2217 rrnAC2219 recJ4 phoR FALSE 0.068 85.000 0.000 NA   NA
 748653 748654 rrnAC2219 rrnAC2220 phoR usp5 FALSE 0.048 735.000 0.000 1.000 Y NA
 748656 748657 rrnAC2222 rrnAC2223   usp2 TRUE 0.986 -3.000 0.417 1.000   NA
 748658 748659 rrnAC2224 rrnAC2225     FALSE 0.454 12.000 0.000 NA   NA
 748661 748662 rrnAC2227 rrnAC2228 dppF dppD TRUE 0.766 98.000 0.273 1.000 Y NA
 748662 748663 rrnAC2228 rrnAC2229 dppD dppB1 TRUE 0.983 21.000 0.636 0.035 Y NA
 748663 748664 rrnAC2229 rrnAC2230 dppB1 oppC1 TRUE 0.997 -3.000 0.583 0.035 Y NA
 748664 748665 rrnAC2230 rrnAC2231 oppC1   TRUE 0.987 0.000 0.500 NA   NA
 748666 748667 rrnAC2232 rrnAC2235 pyrC   TRUE 0.696 25.000 0.019 1.000 N NA
 748670 748671 rrnAC2237 rrnAC2239     TRUE 0.985 -7.000 1.000 0.004   NA
 748671 748672 rrnAC2239 rrnAC2240     FALSE 0.021 220.000 0.000 NA   NA
 748672 748673 rrnAC2240 rrnAC2241     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 748673 748674 rrnAC2241 rrnAC2242     FALSE 0.246 35.000 0.000 NA   NA
 748674 748675 rrnAC2242 rrnAC2243     FALSE 0.494 72.000 0.286 NA   NA
 748676 748677 rrnAC2244 rrnAC2245     FALSE 0.035 209.000 0.000 1.000   NA
 748679 748680 rrnAC2247 rrnAC2248 eif2BA csd2 FALSE 0.293 -70.000 0.000 1.000 N NA
 748680 748681 rrnAC2248 rrnAC2249 csd2   FALSE 0.023 205.000 0.000 NA   NA
 748681 748682 rrnAC2249 rrnAC2250     FALSE 0.152 45.000 0.000 NA   NA
 748683 748684 rrnAC2251 rrnAC2252   crcB1 TRUE 0.702 3.000 0.000 NA   NA
 748684 748685 rrnAC2252 rrnAC2253 crcB1 crcB2 TRUE 0.995 0.000 0.120 0.079 Y NA
 748688 748689 rrnAC2256 rrnAC2258 pcm2 pcm1 TRUE 0.680 62.000 0.000 0.001 Y NA
 748689 748690 rrnAC2258 rrnAC2259 pcm1   FALSE 0.136 191.000 0.037 NA   NA
 748694 748695 rrnAC2263 rrnAC2265     FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 748697 748698 rrnAC2267 rrnAC2268 uvrD   FALSE 0.266 82.000 0.022 NA   NA
 748702 748703 rrnAC2273 rrnAC2275     FALSE 0.015 258.000 0.000 NA   NA
 748703 748704 rrnAC2275 rrnAC2277   dox FALSE 0.094 56.000 0.000 NA   NA
 748706 748707 rrnAC2280 rrnAC2281 cbiQ1   TRUE 0.935 4.000 0.145 NA   NA
 748707 748708 rrnAC2281 rrnAC2282   cbiM TRUE 0.962 -3.000 0.058 NA   NA
 748712 748713 rrnAC2286 rrnAC2287     FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 748714 748715 rrnAC2288 rrnAC2289     FALSE 0.215 38.000 0.000 NA   NA
 748715 748716 rrnAC2289 rrnAC2290     TRUE 0.963 6.000 0.667 NA   NA
 748716 748717 rrnAC2290 rrnAC2291     FALSE 0.003 1176.000 0.000 NA   NA
 748717 748718 rrnAC2291 rrnAC2292     FALSE 0.499 8.000 0.000 NA   NA
 748718 748719 rrnAC2292 rrnAC2293     TRUE 0.989 -3.000 0.750 NA   NA
 748719 748720 rrnAC2293 rrnAC2294     TRUE 0.972 -7.000 0.750 NA   NA
 748721 748722 rrnAC2295 rrnAC2296     FALSE 0.015 255.000 0.000 NA   NA
 748722 748723 rrnAC2296 rrnAC2297     TRUE 0.981 3.000 0.667 NA   NA
 748723 748724 rrnAC2297 trn27     FALSE 0.004 594.000 0.000 NA   NA
 748724 748725 trn27 trn28     FALSE 0.029 182.000 0.000 NA   NA
 748727 748728 rrnAC2299 rrnAC2301 aup hpyA TRUE 0.995 1.000 0.600 NA Y NA
 748728 748729 rrnAC2301 rrnAC2302 hpyA rpa FALSE 0.434 56.000 0.093 1.000 N NA
 748729 748730 rrnAC2302 rrnAC2303 rpa   FALSE 0.122 193.000 0.025 NA   NA
 748731 748732 trn29 rrnAC2304     FALSE 0.004 633.000 0.000 NA   NA
 748734 748735 rrnAC2306 rrnAC2307     FALSE 0.329 75.000 0.051 NA   NA
 748735 748736 rrnAC2307 rrnAC2308     FALSE 0.449 106.000 0.250 NA   NA
 748738 748739 rrnAC2310 rrnAC2311 coxB4 coxA2 TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 748739 748740 rrnAC2311 rrnAC2312 coxA2   TRUE 0.955 5.000 0.429 NA   NA
 748741 748742 rrnAC2313 rrnAC2314   trp3 FALSE 0.059 128.000 0.000 NA   NA
 748742 748743 rrnAC2314 rrnAC2315 trp3   TRUE 0.542 40.000 0.020 NA   NA
 748744 748745 trn30 rrnAC2316     FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 748745 748746 rrnAC2316 trn31     FALSE 0.069 90.000 0.000 NA   NA
 748746 748747 trn31 rrnAC2317     FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 748747 748748 rrnAC2317 rrnAC2318   mcm1 FALSE 0.022 212.000 0.000 NA   NA
 748748 748749 rrnAC2318 rrnAC2319 mcm1   FALSE 0.003 1702.000 0.000 NA   NA
 748752 748753 rrnAC2322 rrnAC2323     FALSE 0.030 179.000 0.000 NA   NA
 748754 748755 rrnAC2324 rrnAC2325   repC TRUE 0.895 6.000 0.073 NA   NA
 748756 748757 rrnAC2326 rrnAC2327     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA   NA
 748760 748761 rrnAC2331 rrnAC2332     FALSE 0.067 105.000 0.000 NA   NA
 748764 748765 rrnAC2335 rrnAC2337     FALSE 0.101 53.000 0.000 NA   NA
 748766 748767 rrnAC2338 rrnAC2339 cspD4 cspD3 TRUE 0.979 3.000 0.000 0.041 Y NA
 748768 748769 rrnAC2340 rrnAC2341     FALSE 0.067 108.000 0.000 NA   NA
 748769 748770 rrnAC2341 rrnAC2342     FALSE 0.183 42.000 0.000 NA   NA
 748771 748772 rrnAC2343 rrnAC2345 rfbA   FALSE 0.069 80.000 0.000 NA   NA
 748773 748774 rrnAC2346 rrnAC2347 malG malFG-6 TRUE 0.996 0.000 0.355 0.034 Y NA
 748774 748775 rrnAC2347 rrnAC2349 malFG-6 malE1 TRUE 0.988 10.000 0.885 1.000 Y NA
 748776 748777 rrnAC2350 rrnAC2352 amy ugpC1 TRUE 0.530 72.000 0.000 1.000 Y NA
 748780 748781 rrnAC2355 rrnAC2356   gst1 FALSE 0.356 79.000 0.080 NA   NA
 748782 748783 rrnAC2357 rrnAC2358 rpl10E   FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 748787 748788 rrnAC2363 rrnAC2364 gapA pgk FALSE 0.304 305.000 0.035 0.002 Y NA
 748792 748793 rrnAC2369 rrnAC2371 hisH1 hisI1 FALSE 0.478 37.000 0.012 NA N NA
 748793 748794 rrnAC2371 rrnAC2372 hisI1 htlD FALSE 0.062 64.000 0.000 1.000 N NA
 748797 748798 rrnAC2375 rrnAC2377     FALSE 0.345 62.000 0.036 NA   NA
 748799 748800 rrnAC2378 rrnAC2379 engB   FALSE 0.038 163.000 0.000 NA   NA
 748800 748801 rrnAC2379 rrnAC2380     FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 748801 748802 rrnAC2380 rrnAC2381     TRUE 0.862 -3.000 0.000