MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium acetobutylicum ATCC 824

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 117647 117648 CAC0001 CAC0002 dnaA dnaN TRUE 0.872 257.000 0.328 1.000 Y 0.811
 117648 117649 CAC0002 CAC0003 dnaN   TRUE 0.979 31.000 0.103 1.000   0.581
 117649 117650 CAC0003 CAC0004   recF TRUE 0.813 46.000 0.209 1.000   0.186
 117650 117651 CAC0004 CAC0005 recF   TRUE 0.919 -49.000 0.024 NA   0.238
 117651 117652 CAC0005 CAC0006   gyrB TRUE 0.953 23.000 0.017 NA   0.511
 117652 117653 CAC0006 CAC0007 gyrB gyrA TRUE 0.977 26.000 0.306 0.002 Y 0.200
 117653 1787208 CAC0007 CACr001 gyrA   FALSE 0.034 435.000 0.000 NA   NA
 1787208 407385 CACr001 CACr002   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407385 1787209 CACr002 CACr003 rrl   FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 1787209 1787210 CACr003 CACt001     TRUE 0.713 4.000 0.000 NA   NA
 1787210 1787211 CACt001 CACt002     TRUE 0.707 5.000 0.000 NA   NA
 1787211 117654 CACt002 CAC0008     FALSE 0.174 88.000 0.000 NA   NA
 117654 117655 CAC0008 CAC0009     FALSE 0.486 74.000 0.029 1.000   0.250
 117655 117656 CAC0009 CAC0010     TRUE 0.950 26.000 0.021 1.000   0.507
 117656 117657 CAC0010 CAC0011     FALSE 0.277 107.000 0.016 NA   0.287
 117657 117658 CAC0011 CAC0012     TRUE 0.966 30.000 0.214 NA   0.488
 117658 117659 CAC0012 CAC0013     TRUE 0.985 10.000 0.370 NA   0.512
 117659 117660 CAC0013 CAC0014     FALSE 0.045 433.000 0.000 NA   0.320
 117660 117661 CAC0014 CAC0015   serA TRUE 0.994 26.000 0.110 0.085 Y 0.975
 117661 117662 CAC0015 CAC0016 serA   TRUE 0.927 77.000 0.072 1.000   0.914
 117662 117663 CAC0016 CAC0017   serS TRUE 0.966 23.000 0.000 1.000   0.959
 117663 117664 CAC0017 CAC0018 serS   TRUE 0.736 110.000 0.000 1.000   0.647
 117666 117667 CAC0020 CAC0021   serS FALSE 0.040 244.000 0.000 1.000   0.265
 117669 1787212 CAC0023 CACt003     FALSE 0.080 138.000 0.000 NA   NA
 1787212 1787213 CACt003 CACt004     FALSE 0.512 36.000 0.000 NA   NA
 1787213 117670 CACt004 CAC0024     FALSE 0.214 79.000 0.000 NA   NA
 117670 1787214 CAC0024 CACt005     FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 1787214 117671 CACt005 CAC0025   dcd FALSE 0.077 143.000 0.000 NA   NA
 117671 117672 CAC0025 CAC0026 dcd   TRUE 0.939 22.000 0.000 NA   0.530
 117672 117673 CAC0026 CAC0027   pyrE TRUE 0.979 19.000 0.000 NA   0.739
 117675 117676 CAC0029 CAC0030     TRUE 0.960 -22.000 0.000 NA   0.468
 117679 117680 CAC0033 CAC0034     FALSE 0.348 155.000 0.205 NA   0.264
 1787215 117681 CACt006 CAC0035     FALSE 0.038 336.000 0.000 NA   NA
 117681 117682 CAC0035 CAC0036     TRUE 0.993 28.000 0.182 NA Y 0.669
 117682 117683 CAC0036 CAC0037     TRUE 0.965 34.000 0.000 NA N 0.755
 117683 117684 CAC0037 CAC0038     TRUE 0.978 19.000 0.000 NA   0.706
 117684 117685 CAC0038 CAC0039     TRUE 0.946 44.000 0.000 NA   0.657
 117685 117686 CAC0039 CAC0040     FALSE 0.005 150.000 0.000 NA   0.194
 117686 117687 CAC0040 CAC0041     FALSE 0.332 208.000 0.000 NA   0.533
 117687 117688 CAC0041 CAC0042     TRUE 0.950 31.000 0.000 NA   0.595
 117688 117689 CAC0042 CAC0043     FALSE 0.077 28.000 0.000 NA   -0.124
 117689 117690 CAC0043 CAC0044     TRUE 0.977 10.000 0.000 NA   0.638
 117690 117691 CAC0044 CAC0045     FALSE 0.561 234.000 0.000 NA   0.788
 117691 117692 CAC0045 CAC0046     TRUE 0.974 26.000 0.000 NA   0.752
 117692 117693 CAC0046 CAC0047     TRUE 0.904 25.000 0.000 NA   0.494
 117693 117694 CAC0047 CAC0048     TRUE 0.968 31.000 0.000 NA   0.723
 117694 117695 CAC0048 CAC0049     TRUE 0.973 26.000 0.000 NA   0.828
 117695 117696 CAC0049 CAC0050     FALSE 0.112 175.000 0.000 NA   0.358
 117696 117697 CAC0050 CAC0051     TRUE 0.988 -3.000 0.000 NA   0.690
 117697 117698 CAC0051 CAC0052     FALSE 0.553 208.000 0.000 NA   0.686
 10693740 117700 CA_C0054 CAC0055     FALSE 0.054 202.000 0.000 NA   NA
 117700 117701 CAC0055 CAC0056     FALSE 0.003 289.000 0.000 NA   0.017
 117701 117702 CAC0056 CAC0057     TRUE 0.983 -3.000 0.000 NA   0.952
 117702 117703 CAC0057 CAC0058     TRUE 0.993 22.000 0.250 NA   0.859
 117703 117704 CAC0058 CAC0059     TRUE 0.976 21.000 0.000 NA   0.689
 117704 117705 CAC0059 CAC0060     FALSE 0.596 154.000 0.000 NA   0.637
 117705 117706 CAC0060 CAC0061     TRUE 0.921 64.000 0.000 NA   0.740
 117706 117707 CAC0061 CAC0062     TRUE 0.980 3.000 0.000 NA   0.904
 117707 117708 CAC0062 CAC0063     TRUE 0.996 1.000 0.455 NA   0.839
 117708 117709 CAC0063 CAC0064     TRUE 0.973 15.000 0.000 NA   0.641
 117709 117710 CAC0064 CAC0065     TRUE 0.663 143.000 0.000 NA   0.835
 117710 117711 CAC0065 CAC0066     FALSE 0.594 123.000 0.000 NA   0.585
 117711 117712 CAC0066 CAC0067     TRUE 0.944 4.000 0.000 NA   0.509
 117712 117713 CAC0067 CAC0068     TRUE 0.979 16.000 0.000 NA   0.811
 117713 117714 CAC0068 CAC0069     FALSE 0.336 194.000 0.000 NA   0.528
 117718 10693741 CAC0073 CA_C0074     FALSE 0.040 305.000 0.000 NA   NA
 117722 117723 CAC0078 CAC0079 agrB   TRUE 0.991 -31.000 0.000 NA   0.874
 117723 117724 CAC0079 CAC0080   agrC FALSE 0.006 127.000 0.000 NA   0.107
 117724 117725 CAC0080 CAC0081 agrC agrA TRUE 0.998 -7.000 0.875 1.000 Y 0.564
 117725 117726 CAC0081 CAC0082 agrA   FALSE 0.012 89.000 0.000 NA N 0.124
 117726 117727 CAC0082 CAC0083     FALSE 0.002 342.000 0.000 NA N 0.114
 117727 117728 CAC0083 CAC0084     FALSE 0.283 280.000 0.000 1.000   0.527
 117728 117729 CAC0084 CAC0085     FALSE 0.554 64.000 0.000 NA   0.396
 117731 117732 CAC0087 CAC0088     FALSE 0.013 86.000 0.000 1.000 N -0.151
 117732 117733 CAC0088 CAC0089   serA TRUE 0.965 34.000 0.000 1.000 N 0.704
 117733 117734 CAC0089 CAC0090 serA   FALSE 0.324 443.000 0.000 1.000 N 0.580
 117734 117735 CAC0090 CAC0091   ilvC FALSE 0.002 673.000 0.000 1.000 N -0.210
 117735 117736 CAC0091 CAC0092 ilvC   FALSE 0.473 269.000 0.000 NA   0.643
 117738 117739 CAC0094 CAC0095   hemA FALSE 0.236 177.000 0.000 1.000 N 0.454
 117739 117740 CAC0095 CAC0096 hemA hemW TRUE 0.995 -36.000 0.018 1.000 Y 0.581
 117740 117741 CAC0096 CAC0097 hemW hemC TRUE 0.966 9.000 0.009 1.000 Y 0.440
 117741 117742 CAC0097 CAC0098 hemC hemD TRUE 0.996 0.000 0.031 1.000 Y 0.764
 117742 117743 CAC0098 CAC0099 hemD hemL TRUE 0.994 -10.000 0.000 1.000 Y 0.679
 117743 117744 CAC0099 CAC0100 hemL hemB TRUE 0.994 18.000 0.026 0.002 Y 0.600
 117744 117745 CAC0100 CAC0101 hemB   FALSE 0.022 485.000 0.000 NA   0.263
 117745 117746 CAC0101 CAC0102     FALSE 0.002 360.000 0.000 NA   -0.201
 117746 117747 CAC0102 CAC0103   cysC TRUE 0.973 10.000 0.000 1.000 N 0.947
 117747 117748 CAC0103 CAC0104 cysC   TRUE 0.983 11.000 0.031 1.000 N 0.960
 117748 117749 CAC0104 CAC0105     TRUE 0.999 -10.000 0.484 0.045 Y 0.763
 117749 117750 CAC0105 CAC0106     TRUE 0.992 -58.000 0.000 1.000 N 0.843
 117750 117751 CAC0106 CAC0107     TRUE 0.990 37.000 0.271 1.000 Y 0.934
 117751 117752 CAC0107 CAC0108     TRUE 0.999 -88.000 0.446 1.000 Y 0.910
 117752 117753 CAC0108 CAC0109   cysD TRUE 0.968 13.000 0.000 1.000 N 0.940
 117753 117754 CAC0109 CAC0110 cysD cysN TRUE 0.997 14.000 0.830 0.001 N 0.961
 117754 117755 CAC0110 CAC0111 cysN   FALSE 0.002 428.000 0.000 1.000 N 0.092
 117755 117756 CAC0111 CAC0112   glnQ TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y 0.889
 117756 117757 CAC0112 CAC0113 glnQ   FALSE 0.198 127.000 0.000 1.000 N 0.387
 117757 117758 CAC0113 CAC0114     TRUE 0.905 30.000 0.000 NA   0.518
 117758 117759 CAC0114 CAC0115     FALSE 0.464 80.000 0.000 NA   0.415
 117759 117760 CAC0115 CAC0116     TRUE 0.948 85.000 0.312 NA N 0.859
 117760 117761 CAC0116 CAC0117   121 FALSE 0.075 230.000 0.000 1.000 N 0.330
 117761 117762 CAC0117 CAC0118 121 cheA TRUE 0.998 23.000 0.750 0.023 Y 0.797
 117762 117763 CAC0118 CAC0119 cheA cheW TRUE 0.990 54.000 0.750 0.020 Y 0.556
 117763 117764 CAC0119 CAC0120 cheW   TRUE 0.999 1.000 0.500 0.018 Y 0.702
 117764 117765 CAC0120 CAC0121   cheR TRUE 0.991 0.000 0.000 1.000 Y 0.650
 117765 117766 CAC0121 CAC0122 cheR cheY FALSE 0.015 158.000 0.000 1.000 Y -0.099
 117766 117767 CAC0122 CAC0123 cheY   FALSE 0.097 184.000 0.000 1.000 N 0.339
 117767 1787216 CAC0123 CACt007     FALSE 0.493 39.000 0.000 NA   NA
 1787217 1787218 CACt008 CACs001     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 1787218 117769 CACs001 CAC0125   dnaX FALSE 0.056 192.000 0.000 NA   NA
 117769 117770 CAC0125 CAC0126 dnaX   FALSE 0.383 99.000 0.100 NA   0.208
 117770 117771 CAC0126 CAC0127   recR FALSE 0.630 93.000 0.604 NA   0.219
 117771 117772 CAC0127 CAC0128 recR   TRUE 0.963 61.000 0.071 NA   0.689
 117772 117773 CAC0128 CAC0129   bofA TRUE 0.994 8.000 0.417 NA   0.608
 117774 10693742 CAC0130 CA_C0131     FALSE 0.096 122.000 0.000 NA   NA
 10693742 117775 CA_C0131 CAC0132     FALSE 0.043 273.000 0.000 NA   NA
 117775 117776 CAC0132 CAC0133     FALSE 0.247 298.000 0.000 NA   0.521
 117776 117777 CAC0133 CAC0134     TRUE 0.734 83.000 0.000 NA   0.562
 117777 117778 CAC0134 CAC0135     FALSE 0.056 364.000 0.000 NA   0.336
 117778 117779 CAC0135 CAC0136     TRUE 0.903 68.000 0.000 NA   0.693
 117779 117780 CAC0136 CAC0137     TRUE 0.991 -85.000 0.000 NA   0.657
 117781 117782 CAC0138 CAC0139     TRUE 0.990 -19.000 0.000 NA   0.881
 117782 117783 CAC0139 CAC0140     TRUE 0.974 24.000 0.000 NA   0.859
 117783 117784 CAC0140 CAC0141     TRUE 0.970 29.000 0.000 NA   0.816
 117785 117786 CAC0142 CAC0143     TRUE 0.957 -73.000 0.000 NA   0.443
 117787 117788 CAC0144 CAC0145 sfsa   TRUE 0.893 57.000 0.015 NA   0.528
 117789 117790 CAC0146 CAC0147     TRUE 0.998 -19.000 0.750 NA   0.754
 117791 117792 CAC0148 CAC0149     FALSE 0.002 534.000 0.000 NA   -0.365
 117793 117794 CAC0150 CAC0151     TRUE 0.974 21.000 0.000 NA   0.657
 117795 1787219 CAC0152 CACr004     FALSE 0.034 435.000 0.000 NA   NA
 1787219 407386 CACr004 CACr005   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407386 1787220 CACr005 CACr006 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787220 1787221 CACr006 CACr007     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 1787221 407387 CACr007 CACr008   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407387 1787222 CACr008 CACr009 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787222 1787223 CACr009 CACr010     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 1787223 407388 CACr010 CACr011   rrl FALSE 0.061 178.000 0.000 NA   NA
 407388 1787224 CACr011 CACr012 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787224 1787225 CACr012 CACt009     TRUE 0.700 6.000 0.000 NA   NA
 1787225 117796 CACt009 CAC0153     FALSE 0.265 71.000 0.000 NA   NA
 117796 117797 CAC0153 CAC0154   MtlA FALSE 0.003 261.000 0.000 1.000   -0.214
 117797 117798 CAC0154 CAC0155 MtlA MtlR TRUE 0.994 22.000 0.336 0.011 N 0.569
 117798 117799 CAC0155 CAC0156 MtlR MltF TRUE 0.995 -7.000 0.115 0.011 N 0.542
 117799 117800 CAC0156 CAC0157 MltF MtlD TRUE 0.990 2.000 0.043 1.000 Y 0.560
 117800 117801 CAC0157 CAC0158 MtlD glmS FALSE 0.002 571.000 0.000 1.000 N 0.158
 117801 117802 CAC0158 CAC0159 glmS   FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   -0.053
 117802 117803 CAC0159 CAC0160     FALSE 0.109 271.000 0.000 NA   0.398
 117804 117805 CAC0161 CAC0162     FALSE 0.002 575.000 0.000 1.000 N 0.028
 10693743 117806 CA_C0163 CAC0164     FALSE 0.035 386.000 0.000 NA   NA
 117806 117807 CAC0164 CAC0165     TRUE 0.995 20.000 0.667 NA   0.779
 117809 117810 CAC0167 CAC0168     FALSE 0.057 71.000 0.000 1.000   0.198
 117810 117811 CAC0168 CAC0169     FALSE 0.004 177.000 0.000 1.000   0.179
 117811 117812 CAC0169 CAC0170     TRUE 0.984 23.000 0.000 NA Y 0.692
 117812 117813 CAC0170 CAC0171     TRUE 0.973 20.000 0.000 NA N 0.642
 117813 117814 CAC0171 CAC0172     TRUE 0.948 22.000 0.125 NA   0.389
 117814 10693744 CAC0172 CA_C0173     FALSE 0.111 112.000 0.000 NA   NA
 117816 117817 CAC0175 CAC0176   appA TRUE 0.933 54.000 0.000 1.000   0.880
 117817 117818 CAC0176 CAC0177 appA appB FALSE 0.605 141.000 0.000 0.032 Y 0.473
 117818 117819 CAC0177 CAC0178 appB appC TRUE 0.995 12.000 0.667 0.049 Y 0.509
 117819 117820 CAC0178 CAC0179 appC appD TRUE 0.987 12.000 0.000 1.000 Y 0.698
 117820 117821 CAC0179 CAC0180 appD appF TRUE 0.996 1.000 0.000 0.004 Y 0.795
 117821 117822 CAC0180 CAC0181 appF   FALSE 0.614 187.000 0.000 1.000 N 0.742
 117822 117823 CAC0181 CAC0182     TRUE 0.972 9.000 0.000 1.000 N 0.598
 117823 117824 CAC0182 CAC0183     TRUE 0.993 14.000 0.067 1.000 Y 0.699
 117824 117825 CAC0183 CAC0184     TRUE 0.986 1.000 0.000 1.000   0.697
 117825 117826 CAC0184 CAC0185     TRUE 0.990 -13.000 0.000 NA   0.676
 117827 117828 CAC0186 CAC0187   nagB FALSE 0.003 249.000 0.000 1.000   -0.042
 117828 117829 CAC0187 CAC0188 nagB nagA TRUE 0.998 -19.000 0.000 0.001 Y 0.714
 117829 117830 CAC0188 CAC0189 nagA   TRUE 0.994 14.000 0.545 1.000 N 0.663
 117830 117831 CAC0189 CAC0190     FALSE 0.010 96.000 0.000 1.000 N -0.413
 117832 117833 CAC0191 CAC0192     TRUE 0.980 17.000 0.000 1.000 N 0.750
 117834 117835 CAC0193 CAC0194     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y 0.907
 117835 117836 CAC0194 CAC0195     FALSE 0.196 307.000 0.000 NA N 0.497
 117837 117838 CAC0196 CAC0197     FALSE 0.004 180.000 0.000 1.000 N -0.337
 117838 117839 CAC0197 CAC0198     TRUE 0.992 22.000 0.294 NA   0.892
 117839 117840 CAC0198 CAC0199     TRUE 0.696 23.000 0.000 NA   0.319
 117840 117841 CAC0199 CAC0200     FALSE 0.046 448.000 0.000 NA   0.323
 117843 117844 CAC0202 CAC0203     TRUE 0.808 97.000 0.000 NA N 0.749
 117845 117846 CAC0204 CAC0205 srta   FALSE 0.530 137.000 0.000 NA   0.573
 117847 117848 CAC0206 CAC0207     FALSE 0.003 208.000 0.000 NA   -0.331
 117848 117849 CAC0207 CAC0208     FALSE 0.003 232.000 0.000 NA   -0.103
 117849 117850 CAC0208 CAC0209     TRUE 0.867 79.000 0.000 NA   0.708
 117851 117852 CAC0210 CAC0211 bioB bioY TRUE 0.983 21.000 0.018 NA   0.902
 117855 117856 CAC0214 CAC0215     TRUE 0.995 -9.000 0.228 0.003 Y 0.408
 117856 117857 CAC0215 CAC0216     TRUE 0.959 2.000 0.000 0.004 Y 0.287
 117857 117858 CAC0216 CAC0217   pheA FALSE 0.007 113.000 0.000 1.000 N -0.285
 10693745 117859 CA_C0218 CAC0219     FALSE 0.128 105.000 0.000 NA   NA
 117860 117861 CAC0220 CAC0221     FALSE 0.097 125.000 0.000 NA   0.296
 117861 117862 CAC0221 CAC0222   exoA FALSE 0.084 129.000 0.000 1.000 N 0.281
 117862 117863 CAC0222 CAC0223 exoA   FALSE 0.053 487.000 0.000 1.000 Y 0.197
 117863 117864 CAC0223 CAC0224     TRUE 0.894 18.000 0.000 1.000 N 0.448
 117864 117865 CAC0224 CAC0225     TRUE 0.989 -3.000 0.095 1.000 Y 0.476
 117865 117866 CAC0225 CAC0226     FALSE 0.393 103.000 0.000 1.000 N 0.439
 117866 117867 CAC0226 CAC0227     TRUE 0.995 -13.000 0.667 NA   0.541
 1787226 407389 CACr013 CACr014   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407389 1787227 CACr014 CACr015 rrl   FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 1787227 1787228 CACr015 CACt010     TRUE 0.692 8.000 0.000 NA   NA
 1787228 117869 CACt010 CAC0229     FALSE 0.149 96.000 0.000 NA   NA
 117869 117870 CAC0229 CAC0230     TRUE 0.997 0.000 0.375 NA   0.811
 117870 117871 CAC0230 CAC0231     FALSE 0.014 196.000 0.000 NA   0.224
 117871 117872 CAC0231 CAC0232   fruB TRUE 0.981 15.000 0.000 1.000 Y 0.942
 117872 117873 CAC0232 CAC0233 fruB   TRUE 0.986 5.000 0.000 1.000 Y 0.946
 117873 117874 CAC0233 CAC0234     TRUE 0.980 67.000 0.091 0.011 Y 0.952
 117876 117877 CAC0236 CAC0237     TRUE 0.983 20.000 0.000 NA Y 0.633
 117877 117878 CAC0237 CAC0238     TRUE 0.991 -3.000 0.000 NA Y 0.647
 117878 117879 CAC0238 CAC0239     TRUE 0.989 11.000 0.500 NA N 0.542
 117879 117880 CAC0239 CAC0240     TRUE 0.990 -19.000 1.000 0.023 Y -0.009
 117880 117881 CAC0240 CAC0241     FALSE 0.102 176.000 0.000 1.000 N 0.341
 117881 117882 CAC0241 CAC0242     TRUE 0.988 12.000 0.105 NA N 0.924
 117882 117883 CAC0242 CAC0243     TRUE 0.992 -3.000 0.000 NA Y 0.861
 117883 117884 CAC0243 CAC0244     FALSE 0.004 180.000 0.000 NA N 0.038
 117884 117885 CAC0244 CAC0245     TRUE 0.989 -7.000 0.647 NA N 0.422
 117885 117886 CAC0245 CAC0246     FALSE 0.436 41.000 0.000 1.000   0.264
 117886 117887 CAC0246 CAC0247     TRUE 0.987 -10.000 0.000 NA   0.629
 117887 117888 CAC0247 CAC0248     FALSE 0.623 102.000 0.000 NA   0.553
 117890 117891 CAC0250 CAC0251     FALSE 0.160 425.000 0.000 NA   0.478
 117893 117894 CAC0253 CAC0254 nifH nifHD TRUE 0.759 144.000 0.040 1.000 N 0.641
 117894 117895 CAC0254 CAC0255 nifHD nifHD TRUE 0.999 12.000 0.860 0.001 Y 0.650
 117895 117896 CAC0255 CAC0256 nifHD nifD TRUE 0.994 22.000 0.294 1.000 N 0.801
 117896 117897 CAC0256 CAC0257 nifD nifK TRUE 0.998 0.000 0.902 0.002 Y 0.551
 117897 117898 CAC0257 CAC0258 nifK nifE TRUE 0.973 97.000 0.380 0.002 Y 0.593
 117898 117899 CAC0258 CAC0259 nifE   TRUE 0.998 16.000 0.342 0.002 Y 0.848
 117899 117900 CAC0259 CAC0260   nifV TRUE 0.895 17.000 0.000 1.000 N 0.447
 117900 117901 CAC0260 CAC0261 nifV nifV TRUE 0.985 -19.000 0.081 1.000 Y 0.366
 117901 117902 CAC0261 CAC0262 nifV   FALSE 0.455 76.000 0.000 1.000 N 0.397
 117902 117903 CAC0262 CAC0263   serB FALSE 0.003 251.000 0.000 1.000 N -0.181
 117903 117904 CAC0263 CAC0264 serB   FALSE 0.032 565.000 0.000 NA   0.293
 117904 117905 CAC0264 CAC0265     TRUE 0.950 48.000 0.000 NA   0.781
 117905 117906 CAC0265 CAC0266     TRUE 0.994 3.000 0.165 1.000 N 0.894
 117906 117907 CAC0266 CAC0267     FALSE 0.166 182.000 0.000 1.000 N 0.406
 117907 117908 CAC0267 CAC0268     FALSE 0.628 71.000 0.000 1.000 N 0.450
 117908 117909 CAC0268 CAC0269     TRUE 0.998 -43.000 0.426 NA   0.851
 117911 117912 CAC0271 CAC0272     FALSE 0.005 143.000 0.000 1.000   -0.071
 117912 117913 CAC0272 CAC0273     FALSE 0.008 445.000 0.000 1.000 Y -0.074
 117913 117914 CAC0273 CAC0274   ansB FALSE 0.216 515.000 0.000 1.000 Y 0.441
 117914 117915 CAC0274 CAC0275 ansB   FALSE 0.005 153.000 0.000 1.000   0.011
 117915 1787229 CAC0275 CACr016     FALSE 0.032 565.000 0.000 NA   NA
 1787229 407390 CACr016 CACr017   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407390 1787230 CACr017 CACr018 rrl   FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 1787230 1787231 CACr018 CACt011     TRUE 0.700 6.000 0.000 NA   NA
 117920 117921 CAC0280 CAC0281     TRUE 0.987 21.000 0.024 1.000 N 0.742
 117921 117922 CAC0281 CAC0282     TRUE 0.957 35.000 0.000 1.000 N 0.645
 117923 117924 CAC0283 CAC0284     FALSE 0.010 98.000 0.000 1.000 N 0.095
 117924 117925 CAC0284 CAC0285     TRUE 0.976 25.000 0.000 1.000 N 0.737
 117926 117927 CAC0286 CAC0287     TRUE 0.995 6.000 0.667 NA   0.912
 117927 117928 CAC0287 CAC0288     TRUE 0.993 1.000 0.111 NA   0.904
 117929 117930 CAC0289 CAC0290     TRUE 0.995 14.000 0.118 1.000 Y 0.733
 117930 1787232 CAC0290 CACr019     FALSE 0.031 611.000 0.000 NA   NA
 1787232 407391 CACr019 CACr020   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407391 1787233 CACr020 CACr021 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787233 1787234 CACr021 CACr022     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 1787234 407392 CACr022 CACr023   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407392 1787235 CACr023 CACr024 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787235 1787236 CACr024 CACr025     FALSE 0.037 354.000 0.000 NA   NA
 1787236 407393 CACr025 CACr026   rrl FALSE 0.061 178.000 0.000 NA   NA
 407393 1787237 CACr026 CACr027 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787237 1787238 CACr027 CACt012     TRUE 0.692 8.000 0.000 NA   NA
 1787238 1787239 CACt012 CACt013     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 1787239 117931 CACt013 CAC0291     FALSE 0.070 155.000 0.000 NA   NA
 117931 117932 CAC0291 CAC0292     FALSE 0.173 -3.000 0.000 NA   0.139
 117933 117934 CAC0293 CAC0294     TRUE 0.960 19.000 0.039 NA N 0.507
 117934 117935 CAC0294 CAC0295     FALSE 0.201 121.000 0.013 NA   0.270
 117936 117937 CAC0296 CAC0297 csfB   TRUE 0.961 24.000 0.120 NA   0.448
 117937 117938 CAC0297 CAC0298     FALSE 0.564 19.000 0.000 NA N 0.273
 117938 117939 CAC0298 CAC0299     FALSE 0.019 74.000 0.000 NA   -0.223
 117939 117940 CAC0299 CAC0300     TRUE 0.981 18.000 0.018 NA   0.615
 117940 117941 CAC0300 CAC0301     TRUE 0.996 2.000 0.372 NA   0.805
 117941 117942 CAC0301 CAC0302     TRUE 0.875 14.000 0.005 NA   0.378
 117942 117943 CAC0302 CAC0303     TRUE 0.660 116.000 0.154 1.000   0.445
 117943 117944 CAC0303 CAC0304   motA FALSE 0.024 258.000 0.000 1.000   0.236
 117944 117945 CAC0304 CAC0305 motA motB TRUE 0.996 3.000 0.144 1.000 Y 0.899
 117945 117946 CAC0305 CAC0306 motB   FALSE 0.621 111.000 0.006 1.000   0.522
 117946 117947 CAC0306 CAC0307     TRUE 0.994 13.000 0.078 0.008   0.639
 117947 117948 CAC0307 CAC0308     FALSE 0.193 145.000 0.000 NA   0.402
 117948 117949 CAC0308 CAC0309     TRUE 0.807 86.000 0.000 NA   0.630
 117952 117953 CAC0312 CAC0313     TRUE 0.992 11.000 0.160 NA   0.865
 117954 117955 CAC0314 CAC0315     TRUE 0.976 12.000 0.000 1.000   0.891
 117955 117956 CAC0315 CAC0316   argF/I FALSE 0.425 183.000 0.000 1.000   0.558
 117956 117957 CAC0316 CAC0317 argF/I   FALSE 0.003 242.000 0.000 1.000 N 0.089
 117957 117958 CAC0317 CAC0318     TRUE 0.924 19.000 0.000 1.000 N 0.504
 117958 117959 CAC0318 CAC0319     TRUE 0.977 22.000 0.000 1.000 N 0.703
 117959 117960 CAC0319 CAC0320     TRUE 0.995 14.000 0.571 NA Y 0.611
 117960 117961 CAC0320 CAC0321     FALSE 0.016 80.000 0.000 NA N -0.123
 117961 117962 CAC0321 CAC0322     FALSE 0.598 324.000 0.000 NA Y 0.700
 117962 117963 CAC0322 CAC0323     FALSE 0.169 292.000 0.000 NA Y 0.375
 117964 117965 CAC0324 CAC0325     FALSE 0.023 936.000 0.000 NA   0.268
 117965 117966 CAC0325 CAC0326     TRUE 0.909 68.000 0.000 NA   0.734
 117967 117968 CAC0327 CAC0328     FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   -0.022
 117970 117971 CAC0330 CAC0331     FALSE 0.287 363.000 0.000 NA   0.554
 117973 117974 CAC0333 CAC0334     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.496
 117974 117975 CAC0334 CAC0335     FALSE 0.002 335.000 0.000 NA   0.088
 117975 117976 CAC0335 CAC0336     TRUE 0.979 7.000 0.000 NA   0.647
 117976 117977 CAC0336 CAC0337     TRUE 0.991 -10.000 0.000 NA   0.760
 117977 117978 CAC0337 CAC0338     FALSE 0.472 399.000 0.000 NA   0.736
 117978 117979 CAC0338 CAC0339     FALSE 0.422 10.000 0.000 NA N 0.240
 117979 10693746 CAC0339 CA_C0340     FALSE 0.056 194.000 0.000 NA   NA
 10693746 117980 CA_C0340 CAC0341     TRUE 0.841 -247.000 0.000 NA   NA
 117980 117981 CAC0341 CAC0342     TRUE 0.849 46.000 0.000 NA   0.513
 117981 117982 CAC0342 CAC0343     FALSE 0.034 57.000 0.000 NA   0.039
 117982 117983 CAC0343 CAC0344     FALSE 0.047 758.000 0.000 NA   0.334
 117983 117984 CAC0344 CAC0345     FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   -0.267
 117984 117985 CAC0345 CAC0346     FALSE 0.016 175.000 0.000 NA   0.224
 117985 117986 CAC0346 CAC0347     FALSE 0.173 -3.000 0.000 NA   0.101
 117986 117987 CAC0347 CAC0348     FALSE 0.011 93.000 0.000 NA   0.062
 117987 117988 CAC0348 CAC0349     FALSE 0.002 667.000 0.000 NA   -0.101
 117988 117989 CAC0349 CAC0350     TRUE 0.898 66.000 0.000 NA   0.647
 117989 117990 CAC0350 CAC0351     FALSE 0.373 104.000 0.000 NA   0.435
 117991 117992 CAC0352 CAC0353     FALSE 0.369 87.000 0.000 NA   0.397
 117992 117993 CAC0353 CAC0354     FALSE 0.003 283.000 0.000 NA   0.185
 117993 117994 CAC0354 CAC0355     FALSE 0.002 322.000 0.000 NA   0.116
 117994 117995 CAC0355 CAC0356     FALSE 0.271 37.000 0.000 1.000   0.221
 117995 117996 CAC0356 CAC0357     FALSE 0.362 132.000 0.000 NA   0.499
 117996 117997 CAC0357 CAC0358     TRUE 0.896 42.000 0.057 NA   0.427
 117997 117998 CAC0358 CAC0359     FALSE 0.481 96.000 0.000 1.000   0.466
 117999 118000 CAC0360 CAC0361   kduD FALSE 0.002 313.000 0.000 1.000 N -0.270
 118000 118001 CAC0361 CAC0362 kduD   FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   0.220
 118001 118002 CAC0362 CAC0363     TRUE 0.697 135.000 0.000 NA   0.778
 118002 118003 CAC0363 CAC0364     TRUE 0.980 19.000 0.000 1.000   0.731
 118003 118004 CAC0364 CAC0365     FALSE 0.119 341.000 0.000 1.000   0.414
 118004 118005 CAC0365 CAC0366     FALSE 0.130 97.000 0.000 1.000   0.266
 118005 118006 CAC0366 CAC0367   rocB FALSE 0.090 24.000 0.000 1.000   0.106
 118006 118007 CAC0367 CAC0368 rocB   TRUE 0.947 67.000 0.000 1.000 Y 0.772
 118009 118010 CAC0370 CAC0371     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA N 0.179
 118010 118011 CAC0371 CAC0372     TRUE 0.993 28.000 0.500 1.000 Y 0.592
 118011 118012 CAC0372 CAC0373     FALSE 0.217 143.000 0.000 1.000 N 0.413
 118012 118013 CAC0373 CAC0374     FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   -0.190
 118015 118016 CAC0376 CAC0377     TRUE 0.987 21.000 0.000 1.000 Y 0.750
 118016 118017 CAC0377 CAC0378   glnQ TRUE 0.995 12.000 0.158 1.000 Y 0.860
 118017 118018 CAC0378 CAC0379 glnQ   FALSE 0.016 80.000 0.000 1.000 N -0.376
 118018 118019 CAC0379 CAC0380     FALSE 0.092 189.000 0.000 1.000 N 0.335
 118020 118021 CAC0381 CAC0382   levR FALSE 0.006 129.000 0.000 1.000 N -0.204
 118022 118023 CAC0383 CAC0384   licB TRUE 0.991 26.000 0.000 0.011 Y 0.808
 118023 118024 CAC0384 CAC0385 licB   TRUE 0.980 25.000 0.000 1.000 Y 0.923
 118024 118025 CAC0385 CAC0386   licC TRUE 0.952 57.000 0.000 1.000 Y 0.897
 118025 118026 CAC0386 CAC0387 licC   FALSE 0.605 184.000 0.000 NA   0.815
 118028 118029 CAC0389 CAC0390     TRUE 0.990 -12.000 0.000 NA   0.688
 118029 118030 CAC0390 CAC0391     TRUE 0.998 21.000 0.600 0.001 Y 0.919
 118032 118033 CAC0393 CAC0394 kdgR kdgA TRUE 0.823 94.000 0.000 1.000 N 0.804
 118033 118034 CAC0394 CAC0395 kdgA kdgK FALSE 0.129 286.000 0.000 1.000 Y 0.300
 118034 118035 CAC0395 CAC0396 kdgK   TRUE 0.965 5.000 0.048 1.000 Y 0.371
 118035 118036 CAC0396 CAC0397     TRUE 0.996 6.000 0.545 1.000 N 0.702
 118036 118037 CAC0397 CAC0398     FALSE 0.399 271.000 0.000 NA   0.592
 118037 118038 CAC0398 CAC0399     FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   0.260
 118038 118039 CAC0399 CAC0400     TRUE 0.825 17.000 0.000 NA   0.392
 118039 118040 CAC0400 CAC0401     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   -0.130
 118040 118041 CAC0401 CAC0402     FALSE 0.521 265.000 0.000 NA   0.827
 118043 118044 CAC0404 CAC0405     TRUE 0.978 11.000 0.000 NA   0.677
 118044 118045 CAC0405 CAC0406     TRUE 0.976 22.000 0.000 NA   0.690
 118045 118046 CAC0406 CAC0407     TRUE 0.909 11.000 0.000 NA   0.465
 118046 118047 CAC0407 CAC0408     TRUE 0.959 26.000 0.000 1.000 N 0.972
 118047 118048 CAC0408 CAC0409     TRUE 0.975 10.000 0.000 NA   0.925
 118048 118049 CAC0409 CAC0410     FALSE 0.098 15.000 0.000 NA   0.181
 118049 118050 CAC0410 CAC0411     TRUE 0.674 73.000 0.000 NA   0.496
 118050 118051 CAC0411 CAC0412     FALSE 0.634 128.000 0.000 NA   0.618
 118051 118052 CAC0412 CAC0413     TRUE 0.977 -13.000 0.000 NA   0.543
 118052 118053 CAC0413 CAC0414     FALSE 0.117 531.000 0.000 NA   0.436
 118053 118054 CAC0414 CAC0415     FALSE 0.569 221.000 0.000 NA   0.796
 118054 118055 CAC0415 CAC0416     TRUE 0.981 24.000 0.000 0.012   0.604
 118055 118056 CAC0416 CAC0417     FALSE 0.117 199.000 0.000 1.000   0.366
 118058 118059 CAC0419 CAC0420     FALSE 0.068 198.000 0.000 NA   0.312
 118061 118062 CAC0422 CAC0423 licT   FALSE 0.005 141.000 0.000 1.000   0.050
 118062 118063 CAC0423 CAC0424     TRUE 0.814 76.000 0.000 1.000 Y 0.524
 118063 118064 CAC0424 CAC0425   sacA TRUE 0.788 1.000 0.000 1.000 Y 0.149
 118064 118065 CAC0425 CAC0426 sacA   FALSE 0.047 81.000 0.000 1.000   0.201
 118065 118066 CAC0426 CAC0427     TRUE 0.663 155.000 0.000 1.000   0.736
 118066 118067 CAC0427 CAC0428     TRUE 0.996 23.000 0.848 0.047 Y 0.536
 118067 118068 CAC0428 CAC0429     TRUE 0.993 33.000 0.708 0.047 Y 0.531
 118068 118069 CAC0429 CAC0430     TRUE 0.946 11.000 0.104 1.000 N 0.363
 118072 118073 CAC0433 CAC0434     FALSE 0.054 40.000 0.000 1.000 N 0.172
 118073 118074 CAC0434 CAC0435     TRUE 0.726 122.000 0.000 NA   0.803
 118075 118076 CAC0436 CAC0437     FALSE 0.041 294.000 0.000 1.000 N 0.285
 118084 118085 CAC0445 CAC0446     TRUE 0.958 17.000 0.000 1.000   0.562
 118085 118086 CAC0446 CAC0447   feoA FALSE 0.014 84.000 0.000 1.000 N -0.073
 118086 118087 CAC0447 CAC0448 feoA feoB TRUE 0.997 0.000 0.308 1.000 Y 0.662
 118087 118088 CAC0448 CAC0449 feoB   TRUE 0.863 81.000 0.000 1.000   0.699
 118088 118089 CAC0449 CAC0450     FALSE 0.063 121.000 0.000 1.000   0.247
 118089 118090 CAC0450 CAC0451     TRUE 0.933 1.000 0.000 1.000 Y 0.360
 118092 118093 CAC0453 CAC0454     TRUE 0.992 -3.000 0.750 NA Y 0.402
 118093 118094 CAC0454 CAC0455     FALSE 0.007 113.000 0.000 NA   0.114
 118095 118096 CAC0456 CAC0457 lonA   TRUE 0.936 69.000 0.036 1.000 N 0.895
 118096 118097 CAC0457 CAC0458     FALSE 0.004 187.000 0.000 1.000   -0.007
 118097 118098 CAC0458 CAC0459     FALSE 0.004 191.000 0.000 1.000   0.107
 118099 118100 CAC0460 CAC0461     TRUE 0.968 27.000 0.000 1.000   0.639
 118100 118101 CAC0461 CAC0462     TRUE 0.926 64.000 0.000 1.000   0.785
 118105 118106 CAC0466 CAC0467     TRUE 0.937 43.000 0.000 NA   0.938
 118106 118107 CAC0467 CAC0468     TRUE 0.971 13.000 0.000 NA   0.911
 118107 118108 CAC0468 CAC0469   spmA FALSE 0.626 186.000 0.000 1.000   0.761
 118108 118109 CAC0469 CAC0470 spmA spmB TRUE 0.998 12.000 0.655 0.002   0.825
 118109 118110 CAC0470 CAC0471 spmB   FALSE 0.042 309.000 0.000 1.000   0.282
 118110 118111 CAC0471 CAC0472   dnaK TRUE 0.997 3.000 0.250 1.000 Y 0.679
 118111 118112 CAC0472 CAC0473 dnaK dnaK TRUE 0.998 15.000 0.250 0.003 Y 0.779
 118112 118113 CAC0473 CAC0474 dnaK   FALSE 0.527 95.000 0.000 NA   0.500
 118113 118114 CAC0474 CAC0475     FALSE 0.069 31.000 0.000 NA   0.091
 118114 118115 CAC0475 CAC0476   pepT FALSE 0.086 25.000 0.000 1.000 N 0.146
 118115 118116 CAC0476 CAC0477 pepT   FALSE 0.319 178.000 0.000 1.000   0.509
 118116 118117 CAC0477 CAC0478     FALSE 0.015 81.000 0.000 1.000   -0.097
 118117 118118 CAC0478 CAC0479     TRUE 0.993 17.000 0.569 1.000   0.595
 118118 118119 CAC0479 CAC0480   nrdD FALSE 0.002 457.000 0.000 1.000   -0.050
 118119 118120 CAC0480 CAC0481 nrdD nrdG TRUE 0.909 78.000 0.315 1.000 N 0.526
 118122 118123 CAC0483 CAC0484     FALSE 0.353 77.000 0.000 NA   0.357
 118123 118124 CAC0484 CAC0485     FALSE 0.271 161.000 0.000 1.000   0.464
 118124 118125 CAC0485 CAC0486     FALSE 0.013 87.000 0.000 NA   -0.232
 118127 118128 CAC0488 CAC0489     FALSE 0.638 233.000 0.020 NA   0.670
 118128 118129 CAC0489 CAC0490     TRUE 0.991 2.000 0.020 NA N 0.803
 118129 118130 CAC0490 CAC0491     TRUE 0.922 44.000 0.064 NA N 0.492
 118130 118131 CAC0491 CAC0492     TRUE 0.767 130.000 0.068 NA Y 0.538
 118131 118132 CAC0492 CAC0493     TRUE 0.741 118.000 0.571 1.000 N 0.442
 118132 118133 CAC0493 CAC0494     TRUE 0.995 -40.000 0.039 1.000 N 0.901
 118133 118134 CAC0494 CAC0495   thiC FALSE 0.203 84.000 0.000 1.000 N 0.291
 118134 118135 CAC0495 CAC0496 thiC   TRUE 0.660 154.000 0.000 NA   0.757
 118135 118136 CAC0496 CAC0497   ftsE FALSE 0.519 124.000 0.010 NA   0.506
 118136 118137 CAC0497 CAC0498 ftsE ftsX TRUE 0.998 -10.000 0.431 NA Y 0.784
 118137 118138 CAC0498 CAC0499 ftsX   FALSE 0.005 292.000 0.015 NA N -0.012
 118138 118139 CAC0499 CAC0500     TRUE 0.843 156.000 0.060 0.011 N 0.626
 118141 118142 CAC0502 CAC0503 uvrB uvrA TRUE 0.998 0.000 0.154 0.001 Y 0.621
 118142 118143 CAC0503 CAC0504 uvrA   FALSE 0.023 69.000 0.005 NA N -0.372
 118143 118144 CAC0504 CAC0505     TRUE 0.989 12.000 0.047 NA N 0.760
 118144 118145 CAC0505 CAC0506     TRUE 0.986 2.000 0.285 1.000 N 0.487
 118145 118146 CAC0506 CAC0507     TRUE 0.983 10.000 0.026 NA   0.598
 118146 118147 CAC0507 CAC0508   uvrC TRUE 0.975 14.000 0.005 NA   0.601
 118147 118148 CAC0508 CAC0509 uvrC   TRUE 0.922 5.000 0.004 0.051 N 0.275
 118148 118149 CAC0509 CAC0510   murB TRUE 0.849 54.000 0.009 1.000 N 0.475
 118149 118150 CAC0510 CAC0511 murB   FALSE 0.236 155.000 0.080 NA   0.249
 118150 118151 CAC0511 CAC0512     TRUE 0.995 -3.000 0.259 NA   0.607
 118151 118152 CAC0512 CAC0513     TRUE 0.994 2.000 0.470 NA   0.580
 118152 118153 CAC0513 CAC0514     TRUE 0.982 4.000 0.012 1.000   0.576
 118153 118154 CAC0514 CAC0515     FALSE 0.101 16.000 0.000 NA   0.054
 118154 118155 CAC0515 CAC0516   dnaE TRUE 0.981 8.000 0.002 NA   0.607
 118155 118156 CAC0516 CAC0517 dnaE pfk FALSE 0.044 257.000 0.029 1.000 N 0.082
 118156 118157 CAC0517 CAC0518 pfk pykA TRUE 0.957 90.000 0.008 0.004 Y 0.694
 118157 118158 CAC0518 CAC0519 pykA pyrC FALSE 0.040 286.000 0.000 1.000 N 0.282
 118161 118162 CAC0523 CAC0524     FALSE 0.002 373.000 0.000 1.000 N -0.314
 118162 118163 CAC0524 CAC0525     TRUE 0.999 -13.000 0.583 1.000 Y 0.691
 118163 118164 CAC0525 CAC0526     TRUE 0.945 83.000 0.333 1.000 N 0.625
 118164 118165 CAC0526 CAC0527     TRUE 0.998 -3.000 0.700 NA Y 0.751
 118165 118166 CAC0527 CAC0528     FALSE 0.002 471.000 0.000 NA   -0.055
 118166 118167 CAC0528 CAC0529     FALSE 0.002 1360.000 0.000 NA   0.053
 118167 118168 CAC0529 CAC0530     FALSE 0.369 136.000 0.229 NA   0.236
 118168 118169 CAC0530 CAC0531     FALSE 0.008 108.000 0.000 NA   -0.114
 118169 118170 CAC0531 CAC0532     FALSE 0.110 348.000 0.000 1.000 N 0.409
 118170 118171 CAC0532 CAC0533   glvA TRUE 0.865 78.000 0.309 1.000 Y 0.366
 118171 118172 CAC0533 CAC0534 glvA pps FALSE 0.124 252.000 0.000 1.000 Y 0.280
 118172 118173 CAC0534 CAC0535 pps   FALSE 0.004 173.000 0.000 1.000   -0.061
 118173 118174 CAC0535 CAC0536   dltE FALSE 0.098 87.000 0.000 1.000   0.234
 118174 118175 CAC0536 CAC0537 dltE   FALSE 0.004 158.000 0.000 1.000   -0.148
 118175 118176 CAC0537 CAC0538     FALSE 0.003 238.000 0.000 1.000   0.144
 118176 118177 CAC0538 CAC0539   manB FALSE 0.104 471.000 0.000 0.001 Y -0.202
 118177 118178 CAC0539 CAC0540 manB   TRUE 0.989 41.000 0.000 0.001 Y 0.792
 118178 118179 CAC0540 CAC0541     FALSE 0.038 137.000 0.000 1.000 N 0.236
 118179 118180 CAC0541 CAC0542     FALSE 0.005 239.000 0.000 1.000 N 0.198
 118180 118181 CAC0542 CAC0543     FALSE 0.457 195.000 0.000 0.017 Y 0.423
 118183 118184 CAC0545 CAC0546     FALSE 0.012 89.000 0.000 NA   0.130
 118184 118185 CAC0546 CAC0547     FALSE 0.041 165.000 0.000 NA   0.259
 118186 118187 CAC0548 CAC0549     TRUE 0.956 25.000 0.000 1.000   0.574
 118188 118189 CAC0550 CAC0551     FALSE 0.440 836.000 0.000 NA   0.810
 118189 118190 CAC0551 CAC0552     FALSE 0.528 270.000 0.000 NA   0.733
 118190 118191 CAC0552 CAC0553     TRUE 0.708 119.000 0.000 NA   0.679
 118191 118192 CAC0553 CAC0554   lyc TRUE 0.979 16.000 0.000 NA   0.719
 118192 118193 CAC0554 CAC0555 lyc   FALSE 0.004 164.000 0.000 1.000   -0.301
 118193 118194 CAC0555 CAC0556     FALSE 0.006 126.000 0.000 NA   0.037
 118194 118195 CAC0556 CAC0557     FALSE 0.026 128.000 0.000 NA   0.228
 118195 118196 CAC0557 CAC0558     FALSE 0.002 629.000 0.000 NA   -0.215
 118196 118197 CAC0558 CAC0559     FALSE 0.379 83.000 0.000 NA   0.392
 118197 118198 CAC0559 CAC0560     TRUE 0.995 -49.000 0.600 1.000 N 0.509
 118198 118199 CAC0560 CAC0561     FALSE 0.002 818.000 0.000 1.000   0.128
 118200 118201 CAC0562 CAC0563     TRUE 0.995 -18.000 0.179 NA   0.973
 118202 118203 CAC0564 CAC0565     TRUE 0.996 -16.000 0.000 0.022 Y 0.938
 118203 118204 CAC0565 CAC0566     TRUE 0.911 47.000 0.000 1.000 N 0.573
 118204 118205 CAC0566 CAC0567     FALSE 0.243 105.000 0.000 0.078   0.230
 118207 118208 CAC0569 CAC0570 sacT   FALSE 0.484 152.000 0.273 1.000   0.347
 118208 118209 CAC0570 CAC0571     FALSE 0.005 185.000 0.000 NA N 0.213
 118209 118210 CAC0571 CAC0572     TRUE 0.997 -7.000 0.400 NA   0.763
 118210 118211 CAC0572 CAC0573     TRUE 0.980 12.000 0.000 NA   0.767
 118211 118212 CAC0573 CAC0574     FALSE 0.160 210.000 0.000 NA   0.421
 118212 10693748 CAC0574 CA_C0575     TRUE 0.746 1.000 0.000 NA   NA
 118213 118214 CAC0576 CAC0577     FALSE 0.004 161.000 0.000 NA   0.193
 118214 118215 CAC0577 CAC0578   metH FALSE 0.387 407.000 0.000 1.000 N 0.612
 118216 118217 CAC0579 CAC0580 prkA   TRUE 0.995 5.000 0.683 NA   0.942
 118217 118218 CAC0580 CAC0581   spoVR TRUE 0.997 -3.000 0.761 NA   0.945
 118218 118219 CAC0581 CAC0582 spoVR   FALSE 0.002 339.000 0.000 NA   0.027
 118219 118220 CAC0582 CAC0583     TRUE 0.969 24.000 0.000 1.000 Y 0.554
 118220 118221 CAC0583 CAC0584     TRUE 0.978 31.000 0.000 1.000 Y 0.877
 118221 118222 CAC0584 CAC0585     FALSE 0.575 106.000 0.000 1.000 N 0.536
 118222 118223 CAC0585 CAC0586     TRUE 0.988 -18.000 0.000 NA N 0.630
 118223 118224 CAC0586 CAC0587     FALSE 0.004 178.000 0.000 NA N 0.048
 118224 118225 CAC0587 CAC0588     TRUE 0.990 19.000 0.182 NA   0.926
 118227 118228 CAC0590 CAC0591 ribD ribB TRUE 0.997 7.000 0.456 1.000 Y 0.870
 118228 118229 CAC0591 CAC0592 ribB ribA TRUE 0.979 41.000 0.026 1.000 Y 0.933
 118229 118230 CAC0592 CAC0593 ribA ribH TRUE 0.995 17.000 0.022 0.002 Y 0.930
 118230 118231 CAC0593 CAC0594 ribH   TRUE 0.908 84.000 0.000 1.000 Y 0.788
 118231 118232 CAC0594 CAC0595     TRUE 0.998 0.000 0.488 NA Y 0.815
 118232 118233 CAC0595 CAC0596   gerKA FALSE 0.032 177.000 0.000 NA   0.249
 118233 118234 CAC0596 CAC0597 gerKA gerKB TRUE 0.996 -7.000 0.500 0.007   0.491
 118234 118235 CAC0597 CAC0598 gerKB gerKC TRUE 0.929 -13.000 0.000 0.007   0.223
 118235 118236 CAC0598 CAC0599 gerKC   FALSE 0.076 190.000 0.000 1.000   0.303
 118236 118237 CAC0599 CAC0600     TRUE 0.887 18.000 0.158 NA   0.176
 118237 118238 CAC0600 CAC0601     FALSE 0.002 905.000 0.000 NA   0.060
 118238 118239 CAC0601 CAC0602   ftsH FALSE 0.396 75.000 0.000 NA   0.372
 118239 118240 CAC0602 CAC0603 ftsH   TRUE 0.999 -45.000 0.583 0.015   0.758
 118240 118241 CAC0603 CAC0604     FALSE 0.226 61.000 0.000 1.000   0.240
 118241 118242 CAC0604 CAC0605     FALSE 0.227 30.000 0.000 1.000   0.205
 118244 118245 CAC0607 CAC0608   lisA FALSE 0.016 444.000 0.000 1.000 Y 0.007
 118245 118246 CAC0608 CAC0609 lisA   FALSE 0.002 330.000 0.003 1.000 N -0.013
 118247 118248 CAC0610 CAC0611     TRUE 0.987 15.000 0.029 NA   0.833
 118248 118249 CAC0611 CAC0612     TRUE 0.998 -7.000 0.869 NA   0.882
 118249 118250 CAC0612 CAC0613     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   -0.085
 118250 118251 CAC0613 CAC0614     TRUE 0.994 20.000 0.400 NA   0.683
 10693749 118252 CA_C0615 CAC0616     FALSE 0.081 137.000 0.000 NA   NA
 118252 118253 CAC0616 CAC0617     FALSE 0.550 235.000 0.000 NA   0.718
 118254 118255 CAC0618 CAC0619     TRUE 0.990 -10.000 0.876 1.000 Y 0.281
 118255 118256 CAC0619 CAC0620     TRUE 0.987 20.000 0.528 NA Y 0.464
 118256 118257 CAC0620 CAC0621     FALSE 0.567 72.000 0.000 NA Y 0.334
 118260 118261 CAC0624 CAC0625     FALSE 0.030 61.000 0.000 NA   -0.207
 118261 118262 CAC0625 CAC0626   trpS FALSE 0.002 390.000 0.000 1.000   -0.131
 118262 118263 CAC0626 CAC0627 trpS   FALSE 0.445 145.000 0.000 1.000 N 0.538
 118263 118264 CAC0627 CAC0628     FALSE 0.005 135.000 0.000 1.000 N -0.051
 118266 118267 CAC0630 CAC0631     FALSE 0.027 197.000 0.000 1.000 N 0.239
 118268 118269 CAC0632 CAC0633     TRUE 0.842 83.000 0.000 1.000   0.660
 118272 118273 CAC0636 CAC0637   tyrS TRUE 0.745 40.000 0.000 1.000 N 0.403
 118273 118274 CAC0637 CAC0638 tyrS   FALSE 0.003 241.000 0.000 NA   -0.213
 118274 118275 CAC0638 CAC0639     FALSE 0.202 47.000 0.033 NA   -0.135
 118275 118276 CAC0639 CAC0640     TRUE 0.681 5.000 0.000 1.000   0.267
 118280 118281 CAC0644 CAC0645 gerKA   TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.007   0.737
 118282 1787240 CAC0646 CACt014 leuS   FALSE 0.037 337.000 0.000 NA   NA
 1787240 118283 CACt014 CAC0647     FALSE 0.265 71.000 0.000 NA   NA
 118283 118284 CAC0647 CAC0648     TRUE 0.967 21.000 0.000 NA   0.603
 118284 118285 CAC0648 CAC0649     FALSE 0.010 98.000 0.000 NA   0.028
 118285 118286 CAC0649 CAC0650     TRUE 0.934 0.000 0.098 NA   0.246
 118287 118288 CAC0651 CAC0652     FALSE 0.151 55.000 0.000 NA   0.229
 118288 118289 CAC0652 CAC0653     FALSE 0.003 247.000 0.000 NA N -0.022
 118289 118290 CAC0653 CAC0654     TRUE 0.995 -6.000 0.079 1.000 Y 0.582
 118290 118291 CAC0654 CAC0655     FALSE 0.045 1096.000 0.000 NA   0.331
 118292 118293 CAC0656 CAC0657     TRUE 0.974 36.000 0.000 NA Y 0.685
 118294 118295 CAC0658 CAC0659     TRUE 0.959 37.000 0.000 1.000   0.874
 118295 118296 CAC0659 CAC0660     TRUE 0.782 83.000 0.000 NA   0.989
 118296 118297 CAC0660 CAC0661     FALSE 0.455 205.000 0.000 NA   0.984
 118297 118298 CAC0661 CAC0662     TRUE 0.721 187.000 0.000 0.046 N 0.726
 118298 118299 CAC0662 CAC0663     TRUE 0.950 31.000 0.000 NA   0.970
 118299 118300 CAC0663 CAC0664     FALSE 0.440 239.000 0.000 NA   0.956
 118300 118301 CAC0664 CAC0665     TRUE 0.954 124.000 0.667 0.030 Y 0.961
 118301 118302 CAC0665 CAC0666     TRUE 0.998 4.000 0.667 0.030 Y 0.933
 118302 118303 CAC0666 CAC0667     TRUE 0.991 12.000 0.333 NA N 0.947
 118303 118304 CAC0667 CAC0668     TRUE 0.994 6.000 0.333 NA   0.927
 118305 118306 CAC0669 CAC0670     FALSE 0.006 124.000 0.000 NA   -0.421
 118306 118307 CAC0670 CAC0671     TRUE 0.993 11.000 0.137 NA   0.726
 118308 118309 CAC0672 CAC0673     TRUE 0.922 22.000 0.000 1.000 N 0.503
 118309 118310 CAC0673 CAC0674     TRUE 0.994 2.000 0.146 0.001 Y 0.431
 118310 118311 CAC0674 CAC0675     FALSE 0.033 58.000 0.000 NA   -0.020
 118313 118314 CAC0677 CAC0678     TRUE 0.971 49.000 0.222 NA   0.582
 118314 118315 CAC0678 CAC0679     FALSE 0.149 220.000 0.094 1.000   0.174
 118315 118316 CAC0679 CAC0680     TRUE 0.816 105.000 0.281 NA   0.519
 118317 118318 CAC0681 CAC0682 nrgB nrgA FALSE 0.208 130.000 0.259 1.000 N -0.404
 118319 118320 CAC0683 CAC0684     TRUE 0.743 98.000 0.000 NA   0.614
 118320 118321 CAC0684 CAC0685     TRUE 0.955 13.000 0.000 1.000   0.560
 118321 118322 CAC0685 CAC0686     FALSE 0.002 319.000 0.000 1.000 N 0.136
 118322 118323 CAC0686 CAC0687   cysE FALSE 0.002 337.000 0.000 1.000 N -0.144
 118323 118324 CAC0687 CAC0688 cysE   FALSE 0.528 257.000 0.000 1.000 N 0.836
 118324 118325 CAC0688 CAC0689   ntH TRUE 0.990 1.000 0.011 1.000 N 0.863
 118327 1787241 CAC0691 CACt015     FALSE 0.247 74.000 0.000 NA   NA
 1787241 118328 CACt015 CAC0692   uxaC FALSE 0.032 510.000 0.000 NA   NA
 118328 118329 CAC0692 CAC0693 uxaC   FALSE 0.481 170.000 0.235 1.000 N 0.393
 118329 118330 CAC0693 CAC0694     TRUE 0.916 50.000 0.231 1.000 N 0.414
 118330 118331 CAC0694 CAC0695     FALSE 0.528 143.000 0.000 1.000 Y 0.516
 118331 118332 CAC0695 CAC0696     TRUE 0.993 22.000 0.046 1.000 Y 0.758
 118332 118333 CAC0696 CAC0697     TRUE 0.836 106.000 0.000 1.000 Y 0.668
 118333 118334 CAC0697 CAC0698     FALSE 0.004 168.000 0.000 1.000   -0.117
 118334 118335 CAC0698 CAC0699     TRUE 0.825 56.000 0.027 1.000   0.420
 118335 118336 CAC0699 CAC0700   cspR FALSE 0.096 140.000 0.007 1.000 N 0.201
 118336 118337 CAC0700 CAC0701 cspR   TRUE 0.916 17.000 0.016 NA   0.404
 118337 118338 CAC0701 CAC0702     FALSE 0.003 247.000 0.000 NA   0.139
 118338 118339 CAC0702 CAC0703     FALSE 0.507 85.000 0.097 1.000   0.231
 118339 118340 CAC0703 CAC0704     TRUE 0.993 -13.000 0.438 1.000   0.498
 118340 118341 CAC0704 CAC0705     TRUE 0.998 -7.000 0.720 0.030   0.629
 118341 118342 CAC0705 CAC0706     FALSE 0.002 348.000 0.000 1.000   0.088
 118342 118343 CAC0706 CAC0707   rpoN FALSE 0.122 276.000 0.000 1.000 N 0.406
 118343 118344 CAC0707 CAC0708 rpoN   FALSE 0.187 141.000 0.034 1.000 Y 0.015
 118344 118345 CAC0708 CAC0709   gapC TRUE 0.803 146.000 0.067 1.000 N 0.693
 118345 118346 CAC0709 CAC0710 gapC pgk TRUE 0.747 131.000 0.005 0.004 Y 0.477
 118346 118347 CAC0710 CAC0711 pgk tpi TRUE 0.803 199.000 0.141 1.000 Y 0.592
 118347 118348 CAC0711 CAC0712 tpi pgm TRUE 0.876 189.000 0.138 1.000 Y 0.774
 118348 118349 CAC0712 CAC0713 pgm eno TRUE 0.862 122.000 0.016 1.000 Y 0.689
 118349 118350 CAC0713 CAC0714 eno secG FALSE 0.130 125.000 0.006 1.000 N 0.226
 118350 118351 CAC0714 CAC0715 secG vacB FALSE 0.193 119.000 0.064 1.000 N 0.136
 118351 118352 CAC0715 CAC0716 vacB smpB FALSE 0.344 132.000 0.143 0.022 N -0.031
 118352 118353 CAC0716 CAC0717 smpB   FALSE 0.012 90.000 0.000 1.000   0.047
 118353 118354 CAC0717 CAC0718     FALSE 0.022 1385.000 0.000 1.000   0.252
 118356 10693750 CAC0720 CA_C0721     TRUE 0.746 1.000 0.000 NA   NA
 118362 118363 CAC0727 CAC0728 yifK   FALSE 0.624 153.000 0.000 1.000   0.649
 118365 118366 CAC0730 CAC0731     FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   0.124
 118366 118367 CAC0731 CAC0732     TRUE 0.997 2.000 0.636 1.000   0.702
 118367 118368 CAC0732 CAC0733     TRUE 0.998 -10.000 0.500 1.000   0.719
 118368 118369 CAC0733 CAC0734     TRUE 0.996 11.000 0.577 1.000   0.780
 118369 118370 CAC0734 CAC0735     TRUE 0.994 0.000 0.105 NA   0.684
 118371 118372 CAC0736 CAC0737     FALSE 0.022 170.000 0.000 1.000   0.218
 118373 118374 CAC0738 CAC0739     FALSE 0.089 212.000 0.000 NA   0.351
 118374 118375 CAC0739 CAC0740     FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   0.273
 118375 118376 CAC0740 CAC0741     FALSE 0.039 220.000 0.000 NA   0.272
 118376 118377 CAC0741 CAC0742     FALSE 0.003 217.000 0.000 1.000   0.014
 118377 118378 CAC0742 CAC0743     FALSE 0.003 238.000 0.000 1.000 N -0.360
 118382 118383 CAC0747 CAC0748     FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   0.276
 118383 118384 CAC0748 CAC0749     TRUE 0.942 54.000 0.000 1.000   0.723
 118384 118385 CAC0749 CAC0750     FALSE 0.134 75.000 0.000 NA   0.249
 118387 118388 CAC0752 CAC0753     TRUE 0.994 3.000 0.094 NA   0.762
 118388 118389 CAC0753 CAC0754     FALSE 0.238 308.000 0.000 NA   0.520
 118390 118391 CAC0755 CAC0756     TRUE 0.963 17.000 0.000 NA   0.585
 118392 118393 CAC0757 CAC0758     FALSE 0.010 213.000 0.000 NA   0.218
 118393 118394 CAC0758 CAC0759     TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   0.351
 118394 118395 CAC0759 CAC0760     TRUE 0.966 5.000 0.379 NA   0.327
 118395 118396 CAC0760 CAC0761     FALSE 0.005 153.000 0.000 NA   -0.057
 118397 118398 CAC0762 CAC0763     FALSE 0.532 145.000 0.462 1.000 N 0.338
 118399 118400 CAC0764 CAC0765     FALSE 0.067 219.000 0.000 0.021   0.120
 118400 118401 CAC0765 CAC0766     TRUE 0.850 88.000 0.000 1.000   0.787
 118401 118402 CAC0766 CAC0767     TRUE 0.979 44.000 0.067 1.000   0.736
 118402 118403 CAC0767 CAC0768     FALSE 0.057 188.000 0.000 1.000   0.276
 118403 118404 CAC0768 CAC0769     FALSE 0.004 159.000 0.000 1.000   0.137
 118404 118405 CAC0769 CAC0770     TRUE 0.883 28.000 0.062 1.000   0.313
 118405 118406 CAC0770 CAC0771     FALSE 0.002 309.000 0.000 1.000 N -0.419
 118406 118407 CAC0771 CAC0772     TRUE 0.995 -3.000 0.115 0.011 Y 0.484
 118407 118408 CAC0772 CAC0773     TRUE 0.964 19.000 0.682 1.000 Y 0.167
 118408 118409 CAC0773 CAC0774     FALSE 0.379 47.000 0.000 NA   0.274
 118409 118410 CAC0774 CAC0775     TRUE 0.961 25.000 0.066 NA   0.506
 118410 118411 CAC0775 CAC0776     TRUE 0.920 21.000 0.210 1.000   0.223
 118411 118412 CAC0776 CAC0777     FALSE 0.005 136.000 0.000 1.000   -0.019
 118412 118413 CAC0777 CAC0778     FALSE 0.004 155.000 0.000 1.000   0.047
 118415 118416 CAC0780 CAC0781 tyrZ   FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   0.207
 118416 118417 CAC0781 CAC0782     TRUE 0.979 16.000 0.000 NA   0.780
 118418 118419 CAC0783 CAC0784     TRUE 0.989 -10.000 0.000 NA   0.678
 118421 118422 CAC0786 CAC0787     TRUE 0.907 68.000 0.000 NA   0.821
 118422 118423 CAC0787 CAC0788     FALSE 0.453 323.000 0.000 NA   0.656
 118423 118424 CAC0788 CAC0789   fhuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.030 Y 0.898
 118424 118425 CAC0789 CAC0790 fhuB fhuD TRUE 0.892 83.000 0.000 1.000 Y 0.891
 118425 118426 CAC0790 CAC0791 fhuD hfuC TRUE 0.989 1.000 0.000 1.000 Y 0.912
 118427 118428 CAC0792 CAC0793     FALSE 0.004 163.000 0.000 1.000   0.106
 118430 118431 CAC0795 CAC0796     FALSE 0.002 441.000 0.000 NA   -0.283
 118431 118432 CAC0796 CAC0797     TRUE 0.904 14.000 0.000 NA N 0.481
 118432 118433 CAC0797 CAC0798     TRUE 0.991 2.000 0.011 1.000 N 0.753
 118433 118434 CAC0798 CAC0799   psd TRUE 0.993 2.000 0.130 0.003 Y 0.443
 118434 118435 CAC0799 CAC0800 psd ubiA TRUE 0.994 -7.000 0.020 1.000 N 0.703
 118435 118436 CAC0800 CAC0801 ubiA   TRUE 0.987 12.000 0.020 1.000 N 0.718
 118436 118437 CAC0801 CAC0802     TRUE 0.986 -12.000 0.000 NA   0.609
 118437 118438 CAC0802 CAC0803     TRUE 0.777 50.000 0.000 NA   0.467
 118438 118439 CAC0803 CAC0804     FALSE 0.002 341.000 0.000 NA   -0.409
 118439 118440 CAC0804 CAC0805     FALSE 0.003 270.000 0.000 NA N -0.584
 118442 118443 CAC0807 CAC0808   hybG FALSE 0.003 234.000 0.000 NA N -0.066
 118443 118444 CAC0808 CAC0809 hybG hypE TRUE 0.983 44.000 0.024 NA Y 0.765
 118444 118445 CAC0809 CAC0810 hypE hypF TRUE 0.964 25.000 0.079 1.000 Y 0.406
 118445 118446 CAC0810 CAC0811 hypF   TRUE 0.991 0.000 0.023 1.000 Y 0.568
 118446 118447 CAC0811 CAC0812     FALSE 0.037 319.000 0.000 NA   0.288
 118447 118448 CAC0812 CAC0813     FALSE 0.077 155.000 0.000 NA   0.298
 118449 118450 CAC0814 CAC0815     FALSE 0.285 164.000 0.000 NA N 0.493
 118450 118451 CAC0815 CAC0816     TRUE 0.962 39.000 0.000 1.000   0.815
 118452 118453 CAC0817 CAC0818     FALSE 0.138 201.000 0.000 NA   0.400
 118453 118454 CAC0818 CAC0819     FALSE 0.205 204.000 0.000 1.000 N 0.448
 118454 118455 CAC0819 CAC0820     FALSE 0.003 231.000 0.000 NA   0.179
 118455 118456 CAC0820 CAC0821     FALSE 0.004 182.000 0.000 NA   -0.586
 118456 118457 CAC0821 CAC0822     TRUE 0.941 20.000 0.000 1.000 N 0.526
 118457 118458 CAC0822 CAC0823     TRUE 0.994 2.000 0.100 1.000 Y 0.592
 118458 118459 CAC0823 CAC0824     FALSE 0.142 106.000 0.000 1.000   0.291
 118460 118461 CAC0825 CAC0826     FALSE 0.394 332.000 0.000 0.004 Y 0.421
 118461 118462 CAC0826 CAC0827     FALSE 0.115 284.000 0.000 1.000 Y 0.280
 118462 118463 CAC0827 CAC0828     FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   -0.331
 118464 118465 CAC0829 CAC0830     FALSE 0.101 17.000 0.000 NA N 0.110
 118465 118466 CAC0830 CAC0831     TRUE 0.990 -7.000 0.932 0.021 Y 0.108
 118466 118467 CAC0831 CAC0832     FALSE 0.027 64.000 0.000 NA N 0.181
 118467 118468 CAC0832 CAC0833     FALSE 0.043 119.000 0.000 NA N 0.247
 118468 118469 CAC0833 CAC0834     TRUE 0.907 71.000 0.000 1.000   0.771
 118469 118470 CAC0834 CAC0835     TRUE 0.986 0.000 0.000 NA   0.698
 118470 118471 CAC0835 CAC0836     FALSE 0.004 165.000 0.000 NA N -0.196
 118472 118473 CAC0837 CAC0838 potD potC TRUE 0.998 -3.000 0.131 0.030 Y 0.767
 118473 118474 CAC0838 CAC0839 potC potB TRUE 0.999 -6.000 0.492 0.030 Y 0.692
 118474 118475 CAC0839 CAC0840 potB potA TRUE 0.999 -13.000 0.928 1.000 Y 0.712
 118475 118476 CAC0840 CAC0841 potA   TRUE 0.992 31.000 0.326 1.000   0.807
 118477 118478 CAC0842 CAC0843     FALSE 0.003 267.000 0.000 NA   -0.048
 118478 118479 CAC0843 CAC0844     TRUE 0.991 18.000 0.329 NA   0.605
 118482 118483 CAC0847 CAC0848     TRUE 0.926 27.000 0.000 NA   0.529
 118483 118484 CAC0848 CAC0849     FALSE 0.276 210.000 0.000 NA   0.512
 118485 118486 CAC0850 CAC0851     TRUE 0.987 17.000 0.000 0.035   0.698
 118487 118488 CAC0852 CAC0853     FALSE 0.019 237.000 0.000 1.000 N 0.230
 118489 118490 CAC0854 CAC0855 tet   TRUE 0.672 35.000 0.000 1.000   0.344
 118490 118491 CAC0855 CAC0856     FALSE 0.005 153.000 0.000 1.000   -0.048
 118493 118494 CAC0858 CAC0859     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   -0.035
 118494 118495 CAC0859 CAC0860     FALSE 0.009 103.000 0.000 NA   -0.030
 118495 118496 CAC0860 CAC0861     FALSE 0.020 72.000 0.000 1.000 N -0.084
 118496 118497 CAC0861 CAC0862     TRUE 0.998 -7.000 0.667 NA   0.803
 118497 118498 CAC0862 CAC0863     TRUE 0.974 23.000 0.167 NA   0.502
 118498 118499 CAC0863 CAC0864     FALSE 0.565 101.000 0.000 0.013 Y 0.307
 118499 118500 CAC0864 CAC0865     TRUE 0.991 -7.000 0.800 0.021 Y 0.162
 118500 118501 CAC0865 CAC0866     TRUE 0.968 74.000 0.600 1.000 N 0.646
 118501 118502 CAC0866 CAC0867     TRUE 0.997 10.000 1.000 NA Y 0.899
 118502 118503 CAC0867 CAC0868     TRUE 0.996 1.000 0.400 NA   0.678
 118507 118508 CAC0872 CAC0873   xpt TRUE 0.984 15.000 0.032 1.000 Y 0.556
 118508 118509 CAC0873 CAC0874 xpt   FALSE 0.010 96.000 0.000 NA   -0.031
 118509 118510 CAC0874 CAC0875     FALSE 0.005 146.000 0.000 NA   -0.699
 118510 118511 CAC0875 CAC0876     FALSE 0.197 158.000 0.000 NA N 0.421
 118511 118512 CAC0876 CAC0877   cfa TRUE 0.969 25.000 0.000 1.000 N 0.908
 118512 118513 CAC0877 CAC0878 cfa   FALSE 0.203 275.000 0.000 1.000 N 0.480
 118513 118514 CAC0878 CAC0879     TRUE 0.991 13.000 0.000 0.003 Y 0.941
 118514 118515 CAC0879 CAC0880     TRUE 0.981 14.000 0.000 1.000 Y 0.934
 118517 118518 CAC0882 CAC0883     FALSE 0.005 146.000 0.000 1.000   0.000
 118520 118521 CAC0885 CAC0886     FALSE 0.004 160.000 0.000 NA   -0.191
 118521 118522 CAC0886 CAC0887   adeC FALSE 0.008 110.000 0.000 NA   0.104
 118522 118523 CAC0887 CAC0888 adeC   FALSE 0.004 192.000 0.000 1.000 N -0.009
 118524 118525 CAC0889 CAC0890     TRUE 0.998 -3.000 0.957 NA   0.687
 118526 118527 CAC0891 CAC0892     TRUE 0.674 113.000 0.000 NA   0.610
 118527 118528 CAC0892 CAC0893     TRUE 0.983 27.000 0.008 1.000 Y 0.951
 118528 118529 CAC0893 CAC0894   aroB TRUE 0.993 -3.000 0.011 1.000 Y 0.951
 118529 118530 CAC0894 CAC0895 aroB aroA TRUE 0.989 15.000 0.051 1.000 Y 0.968
 118530 118531 CAC0895 CAC0896 aroA aroC TRUE 0.997 -22.000 0.057 1.000 Y 0.920
 118531 118532 CAC0896 CAC0897 aroC aro TRUE 0.993 14.000 0.003 0.002 Y 0.611
 118532 118533 CAC0897 CAC0898 aro aroK TRUE 0.997 -3.000 0.069 1.000 Y 0.726
 118533 118534 CAC0898 CAC0899 aroK   TRUE 0.994 0.000 0.015 1.000 Y 0.877
 118536 118537 CAC0901 CAC0902     FALSE 0.008 108.000 0.000 NA   -0.197
 118537 118538 CAC0902 CAC0903     TRUE 0.962 33.000 0.000 NA   0.865
 118540 118541 CAC0905 CAC0906     TRUE 0.941 50.000 0.000 1.000   0.670
 118541 118542 CAC0906 CAC0907     TRUE 0.979 17.000 0.000 NA   0.741
 118544 118545 CAC0909 CAC0910     FALSE 0.002 547.000 0.000 1.000 N 0.131
 118545 118546 CAC0910 CAC0911     TRUE 0.954 88.000 0.061 0.004   0.856
 118546 118547 CAC0911 CAC0912     TRUE 0.923 82.000 0.000 0.004   0.863
 118547 118548 CAC0912 CAC0913     TRUE 0.736 121.000 0.000 0.004   0.561
 118548 118549 CAC0913 CAC0914     TRUE 0.983 36.000 0.000 0.004   0.774
 118549 118550 CAC0914 CAC0915     TRUE 0.927 13.000 0.000 0.004   0.374
 118550 118551 CAC0915 CAC0916     TRUE 0.971 31.000 0.000 0.004   0.567
 118551 118552 CAC0916 CAC0917     TRUE 0.964 57.000 0.000 0.004   0.658
 118552 118553 CAC0917 CAC0918     TRUE 0.990 18.000 0.000 0.004   0.799
 118553 118554 CAC0918 CAC0919     TRUE 0.927 84.000 0.000 0.004   0.798
 118556 118557 CAC0921 CAC0922     FALSE 0.044 342.000 0.000 NA   0.306
 118557 118558 CAC0922 CAC0923     FALSE 0.528 193.000 0.000 NA   0.630
 118558 118559 CAC0923 CAC0924     FALSE 0.173 -3.000 0.000 NA   0.197
 118559 118560 CAC0924 CAC0925     FALSE 0.464 80.000 0.000 NA   0.415
 118560 118561 CAC0925 CAC0926     TRUE 0.975 -45.000 0.000 0.011   0.402
 118561 118562 CAC0926 CAC0927     TRUE 0.905 22.000 0.000 NA   0.477
 118562 118563 CAC0927 CAC0928     TRUE 0.961 38.000 0.000 NA   0.737
 118563 118564 CAC0928 CAC0929     FALSE 0.002 700.000 0.000 NA   -0.346
 118564 118565 CAC0929 CAC0930   metB TRUE 0.987 18.000 0.021 1.000 N 0.796
 118565 118566 CAC0930 CAC0931 metB   TRUE 0.998 0.000 0.101 0.016 Y 0.813
 118566 118567 CAC0931 CAC0932     FALSE 0.121 588.000 0.000 NA   0.443
 118567 118568 CAC0932 CAC0933   xylR FALSE 0.508 306.000 0.000 NA   0.798
 118570 118571 CAC0935 CAC0936 hisZ hisG TRUE 0.999 -13.000 0.239 0.005 Y 0.765
 118571 118572 CAC0936 CAC0937 hisG hisD TRUE 0.998 3.000 0.254 0.005 Y 0.953
 118572 118573 CAC0937 CAC0938 hisD hisB TRUE 0.996 13.000 0.096 0.005 Y 0.911
 118573 118574 CAC0938 CAC0939 hisB hisH TRUE 0.996 15.000 0.125 0.005 Y 0.616
 118574 118575 CAC0939 CAC0940 hisH hisA TRUE 0.998 2.000 0.124 0.005 Y 0.810
 118575 118576 CAC0940 CAC0941 hisA hisF TRUE 0.999 6.000 0.433 0.005 Y 0.825
 118576 118577 CAC0941 CAC0942 hisF hisI_1 TRUE 0.998 19.000 0.430 0.005 Y 0.827
 118577 118578 CAC0942 CAC0943 hisI_1 his_2 TRUE 0.998 0.000 0.152 0.005 Y 0.679
 118578 118579 CAC0943 CAC0944 his_2 tkt FALSE 0.017 78.000 0.000 1.000 N -0.055
 118579 118580 CAC0944 CAC0945 tkt ssb FALSE 0.005 147.000 0.000 1.000 N -0.065
 118580 118581 CAC0945 CAC0946 ssb   FALSE 0.012 173.000 0.000 1.000   0.199
 118581 118582 CAC0946 CAC0947     FALSE 0.005 154.000 0.000 1.000   -0.242
 118582 118583 CAC0947 CAC0948     FALSE 0.002 688.000 0.000 NA   -0.065
 118583 118584 CAC0948 CAC0949     TRUE 0.983 2.000 0.000 NA   0.651
 118584 118585 CAC0949 CAC0950     TRUE 0.751 113.000 0.000 NA   0.731
 118585 118586 CAC0950 CAC0951     FALSE 0.255 177.000 0.034 NA   0.361
 118588 118589 CAC0953 CAC0954     TRUE 0.978 16.000 0.000 NA   0.704
 118591 118592 CAC0956 CAC0957     FALSE 0.003 201.000 0.000 NA   -0.589
 118592 118593 CAC0957 CAC0958     TRUE 0.988 20.000 0.000 0.022   0.808
 118593 118594 CAC0958 CAC0959   clpB FALSE 0.375 62.000 0.000 1.000   0.292
 118594 118595 CAC0959 CAC0960 clpB   FALSE 0.587 111.000 0.003 1.000 N 0.517
 118596 118597 CAC0961 CAC0962     TRUE 0.994 16.000 0.796 1.000   0.598
 118598 118599 CAC0963 CAC0964 bacA   FALSE 0.200 148.000 0.333 NA   -0.243
 118599 1787242 CAC0964 CACr028     FALSE 0.033 485.000 0.000 NA   NA
 1787242 407394 CACr028 CACr029   rrl FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 407394 1787243 CACr029 CACr030 rrl   FALSE 0.235 75.000 0.000 NA   NA
 1787243 1787244 CACr030 CACt016     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 1787244 118600 CACt016 CAC0965     FALSE 0.360 59.000 0.000 NA   NA
 118600 118601 CAC0965 CAC0966     FALSE 0.093 187.000 0.000 NA   0.343
 118601 118602 CAC0966 CAC0967     FALSE 0.267 91.000 0.000 NA   0.356
 118604 118605 CAC0969 CAC0970     FALSE 0.002 348.000 0.000 NA   -0.321
 118605 118606 CAC0970 CAC0971   citB TRUE 0.989 21.000 0.027 0.074 N 0.937
 118606 118607 CAC0971 CAC0972 citB citC TRUE 0.979 67.000 0.054 0.074 Y 0.882
 118607 118608 CAC0972 CAC0973 citC argG FALSE 0.036 171.000 0.000 1.000 Y 0.035
 118608 118609 CAC0973 CAC0974 argG argH TRUE 0.998 0.000 0.278 1.000 Y 0.846
 118609 118610 CAC0974 CAC0975 argH   FALSE 0.582 214.000 0.000 1.000   0.812
 118611 118612 CAC0976 CAC0977   asnC TRUE 0.925 81.000 0.043 NA   0.787
 118613 118614 CAC0978 CAC0979     FALSE 0.303 125.000 0.018 1.000   0.344
 118614 118615 CAC0979 CAC0980   pflB FALSE 0.003 247.000 0.000 1.000   0.081
 118615 118616 CAC0980 CAC0981 pflB pflA TRUE 0.993 11.000 0.163 1.000 N 0.852
 118618 118619 CAC0983 CAC0984     FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   0.145
 118619 118620 CAC0984 CAC0985     TRUE 0.998 0.000 0.511 1.000 Y 0.820
 118620 118621 CAC0985 CAC0986     TRUE 0.993 23.000 0.154 NA Y 0.921
 118621 118622 CAC0986 CAC0987     FALSE 0.239 359.000 0.000 NA   0.525
 118622 118623 CAC0987 CAC0988     TRUE 0.988 -13.000 0.000 NA   0.639
 118623 118624 CAC0988 CAC0989     TRUE 0.716 68.000 0.000 NA   0.500
 118626 118627 CAC0991 CAC0992     TRUE 0.977 15.000 0.000 NA   0.842
 118628 118629 CAC0993 CAC0994 dacF   FALSE 0.003 284.000 0.000 NA   -0.143
 118629 118630 CAC0994 CAC0995     FALSE 0.462 148.000 0.000 NA   0.554
 118631 118632 CAC0996 CAC0997   ndk TRUE 0.930 54.000 0.000 NA   0.662
 118632 118633 CAC0997 CAC0998 ndk   FALSE 0.059 185.000 0.000 1.000 N 0.286
 118633 118634 CAC0998 CAC0999   thrC TRUE 0.994 18.000 0.125 1.000 Y 0.874
 118634 118635 CAC0999 CAC1000 thrC   TRUE 0.927 59.000 0.000 NA   0.856
 118636 118637 CAC1001 CAC1002     FALSE 0.101 16.000 0.000 1.000 N 0.112
 118638 118639 CAC1003 CAC1004     FALSE 0.002 315.000 0.000 NA   -0.030
 118639 118640 CAC1004 CAC1005     TRUE 0.771 26.000 0.000 NA   0.379
 118641 118642 CAC1006 CAC1007     FALSE 0.091 346.000 0.000 1.000   0.386
 118644 118645 CAC1009 CAC1010     TRUE 0.728 122.000 0.000 1.000   0.710
 118648 118649 CAC1013 CAC1014     TRUE 0.960 15.000 0.079 1.000   0.450
 118649 118650 CAC1014 CAC1015     TRUE 0.849 20.000 0.078 1.000   0.179
 118650 118651 CAC1015 CAC1016     TRUE 0.991 13.000 0.137 1.000   0.667
 118653 118654 CAC1018 CAC1019     TRUE 0.994 11.000 0.312 1.000   0.684
 118654 118655 CAC1019 CAC1020     FALSE 0.627 115.000 0.250 NA   0.399
 118655 118656 CAC1020 CAC1021     TRUE 0.799 -103.000 0.063 NA   -0.159
 118656 118657 CAC1021 CAC1022     FALSE 0.004 162.000 0.000 1.000 N -0.076
 118658 118659 CAC1023 CAC1024 nadC nadB TRUE 0.996 -19.000 0.046 1.000 Y 0.943
 118659 118660 CAC1024 CAC1025 nadB nadA TRUE 0.991 8.000 0.042 1.000 Y 0.951
 118661 118662 CAC1026 CAC1027     FALSE 0.003 208.000 0.000 1.000   -0.475
 118664 118665 CAC1029 CAC1030     TRUE 0.997 16.000 0.195 0.008 Y 0.950
 118665 118666 CAC1030 CAC1031   feoB TRUE 0.991 27.000 0.164 1.000 Y 0.966
 118666 118667 CAC1031 CAC1032 feoB   TRUE 0.925 48.000 0.000 NA   0.943
 118667 118668 CAC1032 CAC1033     FALSE 0.548 154.000 0.000 NA   0.603
 118671 118672 CAC1036 CAC1037 pykA   FALSE 0.623 82.000 0.000 1.000 Y 0.412
 118675 118676 CAC1040 CAC1041   argS FALSE 0.003 298.000 0.000 1.000 N -0.034
 118676 118677 CAC1041 CAC1042 argS   TRUE 0.971 10.000 0.000 NA   0.601
 118677 118678 CAC1042 CAC1043     FALSE 0.005 142.000 0.000 NA   -0.034
 118678 118679 CAC1043 CAC1044     FALSE 0.475 400.000 0.000 1.000   0.825
 118683 118684 CAC1048 CAC1049     FALSE 0.003 281.000 0.000 NA   -0.293
 118686 118687 CAC1051 CAC1052     TRUE 0.997 0.000 0.313 NA Y 0.935
 118687 118688 CAC1052 CAC1053     FALSE 0.061 231.000 0.000 1.000 N 0.304
 118690 118691 CAC1055 CA_C1056     FALSE 0.086 130.000 0.000 NA   NA
 118691 118692 CA_C1056 CAC1057     FALSE 0.033 463.000 0.000 NA   NA
 118692 118693 CAC1057 CAC1058     FALSE 0.477 21.000 0.000 NA   0.249
 118693 10693751 CAC1058 CA_C1059     FALSE 0.043 268.000 0.000 NA   NA
 10693751 118694 CA_C1059 CAC1060     FALSE 0.493 39.000 0.000 NA   NA
 118694 118695 CAC1060 CAC1061     FALSE 0.038 542.000 0.000 NA   0.306
 118695 118696 CAC1061 CAC1062     TRUE 0.910 -22.000 0.000 NA   0.367
 118696 118697 CAC1062 CAC1063     FALSE 0.004 158.000 0.000 NA   -0.331
 118697 118698 CAC1063 CAC1064     FALSE 0.095 383.000 0.000 0.011   0.230
 118698 118699 CAC1064 CAC1065     FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   0.023
 118699 118700 CAC1065 CAC1066     FALSE 0.002 877.000 0.000 NA   0.111
 118700 118701 CAC1066 CAC1067     FALSE 0.487 295.000 0.000 NA   0.687
 118701 118702 CAC1067 CAC1068     TRUE 0.823 106.000 0.000 0.011   0.606
 118702 10693752 CAC1068 CA_C1069     TRUE 0.746 1.000 0.000 NA   NA
 118703 118704 CAC1070 CAC1071     TRUE 0.962 34.000 0.000 NA   0.684
 118705 118706 CAC1072 CAC1073     TRUE 0.956 27.000 0.000 NA   0.979
 118706 118707 CAC1073 CAC1074     TRUE 0.987 -16.000 0.000 NA   0.943
 118709 118710 CAC1076 CAC1077     FALSE 0.006 123.000 0.000 NA   -0.113
 118711 118712 CAC1078 CAC1079     FALSE 0.133 194.000 0.000 NA   0.394
 118713 118714 CAC1080 CAC1081     TRUE 0.948 75.000 0.000 0.001   0.826
 118714 118715 CAC1081 CAC1082     FALSE 0.003 285.000 0.000 NA   -0.171
 118715 118716 CAC1082 CAC1083     FALSE 0.159 167.000 0.000 NA   0.399
 118716 118717 CAC1083 CAC1084     FALSE 0.002 320.000 0.000 NA   -0.305
 118717 118718 CAC1084 CAC1085     TRUE 0.997 7.000 0.091 0.037 Y 0.803
 118718 118719 CAC1085 CAC1086   xylR TRUE 0.743 169.000 0.000 1.000 Y 0.760
 118719 118720 CAC1086 CAC1087 xylR   FALSE 0.063 229.000 0.000 NA   0.316
 118720 118721 CAC1087 CAC1088   glpX FALSE 0.147 213.000 0.000 NA   0.414
 118721 118722 CAC1088 CAC1089 glpX   TRUE 0.955 39.000 0.007 1.000 N 0.587
 118722 118723 CAC1089 CAC1090     FALSE 0.190 -7.000 0.006 1.000 N -0.037
 118723 118724 CAC1090 CAC1091     FALSE 0.294 31.000 0.002 1.000 N 0.100
 118725 118726 CAC1092 CAC1093     FALSE 0.017 76.000 0.000 NA   -0.063
 118726 118727 CAC1093 CAC1094     FALSE 0.017 76.000 0.000 NA   0.148
 118728 118729 CAC1095 CAC1096     TRUE 0.885 20.000 0.556 NA   -0.181
 118731 118732 CAC1098 CAC1099 polA   TRUE 0.961 22.000 0.068 1.000 N 0.475
 118732 118733 CAC1099 CAC1100     TRUE 0.992 1.000 0.058 NA N 0.678
 118733 1787245 CAC1100 CACt017     FALSE 0.043 268.000 0.000 NA   NA
 1787245 118734 CACt017 CAC1101     FALSE 0.163 91.000 0.000 NA   NA
 118734 118735 CAC1101 CAC1102     FALSE 0.004 175.000 0.000 NA   -0.179
 118735 118736 CAC1102 CAC1103     TRUE 0.738 119.000 0.000 NA   0.771
 118737 118738 CAC1104 CAC1105     TRUE 0.976 13.000 0.000 NA   0.843
 118738 118739 CAC1105 CAC1106     TRUE 0.970 13.000 0.000 NA   0.920
 118739 118740 CAC1106 CAC1107     TRUE 0.934 53.000 0.000 NA   0.865
 118740 118741 CAC1107 CAC1108     TRUE 0.890 69.000 0.000 NA   0.883
 118741 118742 CAC1108 CAC1109     TRUE 0.978 16.000 0.000 NA   0.825
 118742 118743 CAC1109 CAC1110     TRUE 0.983 4.000 0.000 NA   0.701
 118743 118744 CAC1110 CAC1111     TRUE 0.980 12.000 0.000 NA   0.762
 118744 118745 CAC1111 CAC1112     FALSE 0.002 325.000 0.000 NA   0.054
 118745 118746 CAC1112 CAC1113     TRUE 0.860 81.000 0.000 NA   0.708
 118746 118747 CAC1113 CAC1114     TRUE 0.927 5.000 0.000 NA   0.475
 118747 118748 CAC1114 CAC1115     TRUE 0.981 11.000 0.000 NA   0.806
 118748 118749 CAC1115 CAC1116     TRUE 0.978 12.000 0.000 NA   0.693
 118749 118750 CAC1116 CAC1117     TRUE 0.981 11.000 0.000 NA   0.750
 118750 118751 CAC1117 CAC1118     TRUE 0.955 45.000 0.000 NA   0.763
 118751 118752 CAC1118 CAC1119     TRUE 0.983 6.000 0.000 NA   0.815
 118752 118753 CAC1119 CAC1120     TRUE 0.899 51.000 0.000 NA   0.577
 10693753 118755 CA_C1122 CAC1123     TRUE 0.835 -42.000 0.000 NA   NA
 118755 118756 CAC1123 CAC1124     TRUE 0.926 62.000 0.000 NA   0.805
 118756 118757 CAC1124 CAC1125     TRUE 0.811 35.000 0.000 NA   0.434
 118757 118758 CAC1125 CAC1126     TRUE 0.956 5.000 0.000 NA   0.533
 118758 118759 CAC1126 CAC1127     TRUE 0.984 -3.000 0.000 NA   0.933
 118759 118760 CAC1127 CAC1128     TRUE 0.975 14.000 0.000 NA   0.864
 118760 118761 CAC1128 CAC1129     TRUE 0.978 14.000 0.000 NA   0.797
 118761 118762 CAC1129 CAC1130     TRUE 0.922 62.000 0.000 NA   0.701
 118762 118763 CAC1130 CAC1131     TRUE 0.935 43.000 0.000 NA   0.943
 118763 118764 CAC1131 CAC1132     TRUE 0.948 48.000 0.000 NA   0.816
 118764 118765 CAC1132 CAC1133     FALSE 0.195 74.000 0.000 NA   0.268
 118765 118766 CAC1133 CAC1134     FALSE 0.624 -7.000 0.000 NA   0.242
 118766 118767 CAC1134 CAC1135     TRUE 0.986 1.000 0.000 NA   0.814
 118767 118768 CAC1135 CAC1136     TRUE 0.900 65.000 0.000 NA   0.895
 118768 118769 CAC1136 CAC1137     TRUE 0.973 23.000 0.000 NA   0.665
 118769 118770 CAC1137 CAC1138     TRUE 0.748 113.000 0.000 NA   0.714
 118770 118771 CAC1138 CAC1139     FALSE 0.342 49.000 0.000 NA   0.267
 118771 118772 CAC1139 CAC1140     TRUE 0.927 43.000 0.000 NA   0.590
 118772 118773 CAC1140 CAC1141     TRUE 0.991 -10.000 0.000 NA   0.798
 118773 118774 CAC1141 CAC1142   uvrD TRUE 0.966 29.000 0.000 NA   0.664
 118774 118775 CAC1142 CAC1143 uvrD recD TRUE 0.826 63.000 0.000 1.000 Y 0.470
 118775 10693754 CAC1143 CA_C1144 recD   FALSE 0.040 300.000 0.000 NA   NA
 118776 118777 CAC1145 CAC1146     FALSE 0.449 650.000 0.000 NA   0.746
 118777 118778 CAC1146 CAC1147     TRUE 0.939 54.000 0.000 NA   0.813
 118778 118779 CAC1147 CAC1148     TRUE 0.926 61.000 0.000 NA   0.825
 118779 118780 CAC1148 CAC1149     TRUE 0.965 32.000 0.000 NA   0.699
 118780 118781 CAC1149 CAC1150     TRUE 0.952 47.000 0.000 NA   0.781
 118781 118782 CAC1150 CAC1151     TRUE 0.851 85.000 0.000 NA   0.740
 118782 118783 CAC1151 CAC1152     TRUE 0.883 30.000 0.000 NA   0.491
 118783 118784 CAC1152 CAC1153     TRUE 0.749 57.000 0.000 NA   0.470
 118784 118785 CAC1153 CAC1154     FALSE 0.190 33.000 0.000 NA   0.219
 118785 118786 CAC1154 CAC1155     TRUE 0.881 48.000 0.000 NA   0.545
 118786 118787 CAC1155 CAC1156     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   0.517
 118787 118788 CAC1156 CAC1157     FALSE 0.116 265.000 0.000 NA   0.401
 118788 118789 CAC1157 CAC1158     TRUE 0.957 1.000 0.000 NA   0.520
 118789 118790 CAC1158 CAC1159     TRUE 0.683 49.000 0.000 NA   0.404
 118790 118791 CAC1159 CAC1160     FALSE 0.021 71.000 0.000 NA   0.008
 118791 118792 CAC1160 CAC1161     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   0.011
 118792 118793 CAC1161 CAC1162     TRUE 0.950 -3.000 0.000 NA   0.478
 118793 118794 CAC1162 CAC1163     TRUE 0.969 21.000 0.000 NA   0.610
 118794 118795 CAC1163 CAC1164     FALSE 0.147 89.000 0.000 NA   0.279
 118795 118796 CAC1164 CAC1165     TRUE 0.958 32.000 0.000 NA   0.631
 118796 118797 CAC1165 CAC1166     FALSE 0.631 109.000 0.000 NA   0.574
 118797 118798 CAC1166 CAC1167     TRUE 0.945 44.000 0.000 NA   0.648
 118798 118799 CAC1167 CAC1168     FALSE 0.504 282.000 0.000 NA   0.699
 118799 118800 CAC1168 CAC1169     FALSE 0.190 -7.000 0.000 NA   -0.093
 118800 118801 CAC1169 CAC1170   xerD FALSE 0.510 150.000 0.000 NA   0.579
 118801 118802 CAC1170 CAC1171 xerD   TRUE 0.693 77.000 0.000 NA   0.521
 118802 118803 CAC1171 CAC1172     TRUE 0.991 -16.000 0.000 NA   0.818
 118803 118804 CAC1172 CAC1173     TRUE 0.976 21.000 0.000 NA   0.688
 118804 118805 CAC1173 CAC1174     FALSE 0.008 107.000 0.000 NA   -0.067
 118805 118806 CAC1174 CAC1175     TRUE 0.788 97.000 0.000 NA   0.872
 118806 118807 CAC1175 CAC1176     FALSE 0.153 281.000 0.000 NA   0.441
 118807 118808 CAC1176 CAC1177     TRUE 0.987 1.000 0.000 NA   0.794
 118808 118809 CAC1177 CAC1178     TRUE 0.978 15.000 0.000 NA   0.741
 118809 118810 CAC1178 CAC1179     TRUE 0.979 2.000 0.000 NA   0.614
 118810 118811 CAC1179 CAC1180     TRUE 0.976 20.000 0.000 NA   0.680
 118811 118812 CAC1180 CAC1181     TRUE 0.804 60.000 0.000 NA   0.519
 118812 118813 CAC1181 CAC1182     TRUE 0.909 69.000 0.000 NA   0.773
 118813 118814 CAC1182 CAC1183     TRUE 0.684 42.000 0.000 NA   0.388
 118814 118815 CAC1183 CAC1184     TRUE 0.898 41.000 0.000 NA   0.540
 118815 118816 CAC1184 CAC1185     FALSE 0.200 228.000 0.000 NA   0.464
 118816 118817 CAC1185 CAC1186     TRUE 0.703 130.000 0.000 NA   0.749
 118817 118818 CAC1186 CAC1187     TRUE 0.987 0.000 0.000 NA   0.733
 118818 118819 CAC1187 CAC1188     FALSE 0.530 250.000 0.000 NA   0.704
 118819 118820 CAC1188 CAC1189     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   0.393
 118820 118821 CAC1189 CAC1190     TRUE 0.937 42.000 0.000 NA   0.609
 118821 118822 CAC1190 CAC1191     TRUE 0.974 21.000 0.000 NA   0.653
 118822 118823 CAC1191 CAC1192     TRUE 0.902 52.000 0.000 NA   0.584
 118823 118824 CAC1192 CAC1193     TRUE 0.935 37.000 0.000 NA   0.586
 118824 118825 CAC1193 CAC1194     TRUE 0.988 -28.000 0.000 NA   0.615
 118825 118826 CAC1194 CAC1195   ligA FALSE 0.489 121.000 0.000 NA   0.532
 118826 118827 CAC1195 CAC1196 ligA   FALSE 0.033 58.000 0.000 NA   -0.171
 118827 118828 CAC1196 CAC1197     TRUE 0.968 26.000 0.000 NA   0.647
 118828 118829 CAC1197 CAC1198   recJ TRUE 0.975 -18.000 0.000 NA Y 0.460
 118829 118830 CAC1198 CAC1199 recJ   FALSE 0.256 299.000 0.000 NA   0.524
 118830 118831 CAC1199 CAC1200     FALSE 0.203 256.000 0.000 NA   0.479
 118831 118832 CAC1200 CAC1201     TRUE 0.977 19.000 0.000 NA   0.702
 118832 118833 CAC1201 CAC1202     FALSE 0.005 144.000 0.000 NA   -0.074
 118833 118834 CAC1202 CAC1203     TRUE 0.763 111.000 0.000 NA   0.792
 118834 118835 CAC1203 CAC1204     TRUE 0.991 -16.000 0.000 NA   0.813
 118835 118836 CAC1204 CAC1205     TRUE 0.991 -28.000 0.000 NA   0.829
 118836 118837 CAC1205 CAC1206     TRUE 0.927 35.000 0.000 NA   0.564
 118837 118838 CAC1206 CAC1207     TRUE 0.901 69.000 0.000 NA   0.698
 118838 118839 CAC1207 CAC1208     TRUE 0.797 51.000 0.000 NA   0.490
 118839 118840 CAC1208 CAC1209   nrdD TRUE 0.961 31.000 0.000 NA   0.641
 118840 118841 CAC1209 CAC1210 nrdD dut TRUE 0.982 10.000 0.000 1.000 Y 0.588
 118841 118842 CAC1210 CAC1211 dut   TRUE 0.940 55.000 0.000 NA   0.787
 118842 118843 CAC1211 CAC1212     TRUE 0.961 39.000 0.000 NA   0.766
 118843 118844 CAC1212 CAC1213     FALSE 0.477 282.000 0.000 NA   0.881
 118844 118845 CAC1213 CAC1214     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   -0.140
 118845 118846 CAC1214 CAC1215     FALSE 0.004 164.000 0.000 NA   0.179
 118846 118847 CAC1215 CAC1216     FALSE 0.022 303.000 0.000 NA   0.251
 118847 118848 CAC1216 CAC1217     TRUE 0.987 0.000 0.000 NA   0.831
 118848 118849 CAC1217 CAC1218     TRUE 0.990 -7.000 0.000 NA   0.800
 118849 118850 CAC1218 CAC1219     TRUE 0.663 79.000 0.000 NA   0.515
 118850 118851 CAC1219 CAC1220     FALSE 0.333 32.000 0.000 NA   0.241
 118851 118852 CAC1220 CAC1221     TRUE 0.985 -3.000 0.000 NA   0.623
 118852 118853 CAC1221 CAC1222     FALSE 0.335 110.000 0.000 NA   0.431
 118853 118854 CAC1222 CAC1223   dnaE TRUE 0.725 298.000 0.000 0.046 Y 0.850
 118854 118855 CAC1223 CAC1224 dnaE   FALSE 0.527 254.000 0.000 0.046   0.577
 118855 118856 CAC1224 CAC1225     FALSE 0.494 141.000 0.000 NA   0.562
 118856 118857 CAC1225 CAC1226   sigA TRUE 0.976 24.000 0.000 NA   0.712
 118857 118858 CAC1226 CAC1227 sigA   TRUE 0.989 -7.000 0.000 NA   0.704
 118858 118859 CAC1227 CAC1228   cisA FALSE 0.219 87.000 0.000 NA   0.314
 118859 118860 CAC1228 CAC1229 cisA   FALSE 0.005 136.000 0.000 NA   -0.524
 118860 118861 CAC1229 CAC1230     FALSE 0.007 117.000 0.000 NA   -0.528
 118861 118862 CAC1230 CAC1231     FALSE 0.576 47.000 0.000 NA   0.349
 118862 118863 CAC1231 CAC1232     FALSE 0.178 495.000 0.000 1.000   0.495
 118863 118864 CAC1232 CAC1233   chev FALSE 0.112 594.000 0.000 1.000 N 0.426
 118864 118865 CAC1233 CAC1234 chev pheB FALSE 0.002 540.000 0.000 1.000   0.122
 118865 118866 CAC1234 CAC1235 pheB thrB TRUE 0.985 24.000 0.011 1.000   0.810
 118866 118867 CAC1235 CAC1236 thrB   FALSE 0.038 166.000 0.000 NA   0.255
 118867 118868 CAC1236 CAC1237     FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   0.418
 118868 118869 CAC1237 CAC1238     TRUE 0.899 100.000 0.364 NA   0.584
 118869 118870 CAC1238 CAC1239     FALSE 0.225 138.000 0.357 NA   -0.178
 118870 118871 CAC1239 CAC1240   maf TRUE 0.920 5.000 0.026 NA   0.359
 118871 118872 CAC1240 CAC1241 maf radc TRUE 0.887 19.000 0.074 NA N 0.268
 118872 118873 CAC1241 CAC1242 radc mreB TRUE 0.985 27.000 0.040 1.000 N 0.706
 118873 118874 CAC1242 CAC1243 mreB mreC TRUE 0.996 9.000 0.689 1.000 N 0.776
 118874 118875 CAC1243 CAC1244 mreC   TRUE 0.998 11.000 0.550 0.003   0.774
 118875 118876 CAC1244 CAC1245   pbpA TRUE 0.990 19.000 0.089 1.000   0.667
 118876 118877 CAC1245 CAC1246 pbpA pbpA FALSE 0.057 337.000 0.000 0.003   0.032
 118877 118878 CAC1246 CAC1247 pbpA pbpA FALSE 0.271 195.000 0.000 0.003   0.337
 118878 118879 CAC1247 CAC1248 pbpA minC FALSE 0.044 165.000 0.060 1.000 N -0.330
 118879 118880 CAC1248 CAC1249 minC minD TRUE 0.819 366.000 0.368 1.000 Y 0.636
 118880 10693755 CAC1249 CA_C1250 minD   TRUE 0.692 8.000 0.000 NA   NA
 10693755 118881 CA_C1250 CAC1251   rodA FALSE 0.281 69.000 0.000 NA   NA
 118881 118882 CAC1251 CAC1252 rodA   FALSE 0.003 276.000 0.000 1.000 N -0.028
 118882 118883 CAC1252 CAC1253     TRUE 0.994 28.000 0.135 0.005   0.640
 118883 118884 CAC1253 CAC1254     FALSE 0.497 78.000 0.098 1.000   0.175
 118884 118885 CAC1254 CAC1255     TRUE 0.998 -31.000 0.420 NA   0.736
 118885 118886 CAC1255 CAC1256     TRUE 0.930 34.000 0.180 NA   0.389
 118886 118887 CAC1256 CAC1257   rpl21 FALSE 0.299 129.000 0.018 0.020 Y -0.208
 118887 118888 CAC1257 CAC1258 rpl21   TRUE 0.996 3.000 0.208 NA Y 0.873
 118888 118889 CAC1258 CAC1259   rpl27 TRUE 0.996 4.000 0.203 NA Y 0.878
 118889 118890 CAC1259 CAC1260 rpl27 obg FALSE 0.315 139.000 0.335 1.000   0.104
 118890 118891 CAC1260 CAC1261 obg   TRUE 0.986 14.000 0.046 NA   0.667
 118891 118892 CAC1261 CAC1262     TRUE 0.908 21.000 0.150 NA N 0.244
 118892 118893 CAC1262 CAC1263     TRUE 0.934 17.000 0.199 1.000 Y 0.100
 118893 118894 CAC1263 CAC1264   lytR TRUE 0.990 9.000 0.033 NA N 0.771
 118894 118895 CAC1264 CAC1265 lytR   TRUE 0.993 16.000 0.231 NA N 0.696
 118895 118896 CAC1265 CAC1266     TRUE 0.957 4.000 0.047 NA Y 0.330
 118898 118899 CAC1268 CAC1269 comEA   FALSE 0.473 137.000 0.000 NA N 0.552
 118899 118900 CAC1269 CAC1270     FALSE 0.403 59.000 0.000 NA   0.306
 118900 118901 CAC1270 CAC1271     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA   0.528
 118901 118902 CAC1271 CAC1272     FALSE 0.126 34.000 0.011 NA   -0.004
 118902 118903 CAC1272 CAC1273     TRUE 0.926 -3.000 0.163 NA   0.123
 118905 118906 CAC1275 CAC1276   SpoIIP TRUE 0.934 57.000 0.521 NA   0.441
 118906 118907 CAC1276 CAC1277 SpoIIP   TRUE 0.968 52.000 0.038 NA   0.739
 118907 118908 CAC1277 CAC1278   lepA FALSE 0.409 101.000 0.002 NA   0.396
 118908 118909 CAC1278 CAC1279 lepA hemN TRUE 0.665 159.000 0.083 1.000 N 0.555
 118909 118910 CAC1279 CAC1280 hemN hrcA FALSE 0.042 187.000 0.062 1.000 N -0.323
 118910 118911 CAC1280 CAC1281 hrcA grpE TRUE 0.991 20.000 0.286 1.000 N 0.940
 118911 118912 CAC1281 CAC1282 grpE dnaK TRUE 0.997 21.000 0.224 0.005 Y 0.929
 118912 118913 CAC1282 CAC1283 dnaK dnaJ TRUE 0.956 126.000 0.196 0.003 Y 0.884
 118913 118914 CAC1283 CAC1284 dnaJ prmA TRUE 0.811 167.000 0.133 1.000 N 0.686
 118914 118915 CAC1284 CAC1285 prmA   TRUE 0.980 17.000 0.227 NA   0.511
 118915 118916 CAC1285 CAC1286     TRUE 0.995 0.000 0.163 NA   0.866
 118916 118917 CAC1286 CAC1287     TRUE 0.785 49.000 0.051 1.000 N 0.322
 118917 118918 CAC1287 CAC1288   rpsU TRUE 0.807 148.000 0.071 1.000   0.691
 118918 118919 CAC1288 CAC1289 rpsU   TRUE 0.995 21.000 0.150 0.026   0.830
 118919 118920 CAC1289 CAC1290     FALSE 0.021 100.000 0.029 NA   -0.443
 118920 118921 CAC1290 CAC1291     TRUE 0.998 -10.000 0.851 NA   0.837
 118921 118922 CAC1291 CAC1292     TRUE 0.798 50.000 0.032 NA   0.380
 118922 118923 CAC1292 CAC1293     TRUE 0.992 18.000 0.182 NA   0.669
 118923 118924 CAC1293 CAC1294   dgkA/pgpB TRUE 0.942 26.000 0.023 NA   0.488
 118924 118925 CAC1294 CAC1295 dgkA/pgpB   FALSE 0.585 109.000 0.005 1.000   0.508
 118925 10693756 CAC1295 CA_C1296     FALSE 0.360 59.000 0.000 NA   NA
 10693756 118926 CA_C1296 CAC1309     TRUE 0.841 -656.000 0.000 NA   NA
 118926 118927 CAC1309 CAC1297     TRUE 0.883 6.000 0.007 NA   0.336
 118929 118930 CAC1299 CAC1300 dnaG sigA TRUE 0.981 25.000 0.209 1.000 N 0.535
 118930 118931 CAC1300 CAC1301 sigA   FALSE 0.012 123.000 0.026 NA   -0.224
 118931 118932 CAC1301 CAC1302     TRUE 0.916 22.000 0.028 NA   0.395
 118932 118933 CAC1302 CAC1303     TRUE 0.923 -9.000 0.283 NA   -0.163
 118933 118934 CAC1303 CAC1304     FALSE 0.538 198.000 0.342 NA   0.433
 118934 118935 CAC1304 CAC1305     FALSE 0.002 812.000 0.000 NA   -0.360
 118935 118936 CAC1305 CAC1306     TRUE 0.996 16.000 1.000 NA   0.730
 118936 118937 CAC1306 CAC1307     TRUE 0.645 118.000 0.000 NA   0.605
 118937 118938 CAC1307 CAC1308     FALSE 0.407 459.000 0.000 NA   0.644
 10693757 118940 CA_C1311 CAC1312     FALSE 0.045 256.000 0.000 NA   NA
 118940 118941 CAC1312 CAC1313     TRUE 0.847 18.000 0.000 NA   0.406
 118942 118943 CAC1314 CAC1315     TRUE 0.964 14.000 0.000 NA   0.964
 118946 118947 CAC1318 CAC1319   glpF FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   0.036
 118947 118948 CAC1319 CAC1320 glpF glpP FALSE 0.263 77.000 0.013 1.000 N 0.179
 118948 118949 CAC1320 CAC1321 glpP glpK TRUE 0.816 31.000 0.004 1.000 N 0.355
 118949 118950 CAC1321 CAC1322 glpK glpA FALSE 0.357 232.000 0.006 1.000   0.509
 118950 118951 CAC1322 CAC1323 glpA   TRUE 0.995 17.000 0.476 1.000   0.694
 118951 118952 CAC1323 CAC1324     TRUE 0.978 2.000 0.417 NA   0.389
 118952 118953 CAC1324 CAC1325     FALSE 0.002 376.000 0.000 NA   -0.009
 118955 10693758 CAC1327 CA_C1328     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 10693758 118956 CA_C1328 CAC1329     FALSE 0.066 163.000 0.000 NA   NA
 118956 118957 CAC1329 CAC1330     FALSE 0.190 191.000 0.000 1.000   0.424
 118958 118959 CAC1331 CAC1332   uxuA TRUE 0.986 2.000 0.000 1.000 N 0.760
 118960 118961 CAC1333 CAC1334     FALSE 0.044 203.000 0.000 1.000   0.263
 118963 118964 CAC1336 CAC1337     TRUE 0.986 17.000 0.031 NA   0.871
 118964 118965 CAC1337 CAC1338     TRUE 0.960 25.000 0.062 NA   0.504
 118966 118967 CAC1339 CAC1340 araE araR FALSE 0.011 270.000 0.032 1.000 N -0.390
 118968 118969 CAC1341 CAC1342 araD araA TRUE 0.994 18.000 0.063 1.000 Y 0.796
 118969 118970 CAC1342 CAC1343 araA   FALSE 0.637 264.000 0.000 1.000 Y 0.691
 118970 118971 CAC1343 CAC1344   xylB TRUE 0.646 174.000 0.000 1.000 Y 0.604
 118971 118972 CAC1344 CAC1345 xylB xylT TRUE 0.852 205.000 0.136 1.000 Y 0.851
 118972 118973 CAC1345 CAC1346 xylT araA TRUE 0.977 52.000 0.040 1.000 Y 0.659
 118973 118974 CAC1346 CAC1347 araA   TRUE 0.742 173.000 0.008 1.000 Y 0.615
 118974 118975 CAC1347 CAC1348     TRUE 0.991 18.000 0.016 1.000 Y 0.831
 118975 118976 CAC1348 CAC1349   galM TRUE 0.985 16.000 0.000 1.000 Y 0.890
 118976 118977 CAC1349 CAC1350 galM   FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   -0.305
 118978 118979 CAC1351 CAC1352     TRUE 0.980 12.000 0.000 1.000 N 0.801
 118979 118980 CAC1352 CAC1353     FALSE 0.018 210.000 0.000 1.000 N 0.227
 118982 118983 CAC1355 CAC1356   thiH FALSE 0.030 186.000 0.000 1.000   0.234
 118984 118985 CAC1357 CAC1358     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA   -0.470
 118985 118986 CAC1358 CAC1359     FALSE 0.076 198.000 0.000 NA   0.325
 118986 118987 CAC1359 CAC1360   bioY FALSE 0.004 186.000 0.000 NA   -0.247
 118987 118988 CAC1360 CAC1361 bioY bioD TRUE 0.990 0.000 0.048 NA   0.963
 118988 118989 CAC1361 CAC1362 bioD bioA TRUE 0.996 23.000 0.124 0.002 Y 0.969
 118989 118990 CAC1362 CAC1363 bioA sodC FALSE 0.589 136.000 0.000 1.000 N 0.963
 118990 118991 CAC1363 CAC1364 sodC   TRUE 0.820 93.000 0.000 1.000   0.698
 118991 118992 CAC1364 CAC1365   cbiM FALSE 0.002 499.000 0.000 1.000   -0.270
 118992 118993 CAC1365 CAC1366 cbiM   TRUE 0.954 3.000 0.000 NA   0.523
 118993 118994 CAC1366 CAC1367   cbiQ TRUE 0.909 13.000 0.000 NA   0.484
 118994 118995 CAC1367 CAC1368 cbiQ cbiO TRUE 0.980 58.000 0.000 0.002 Y 0.691
 118995 118996 CAC1368 CAC1369 cbiO hisC TRUE 0.992 -30.000 0.000 1.000 N 0.826
 118996 118997 CAC1369 CAC1370 hisC cbiG TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 N 0.460
 118997 118998 CAC1370 CAC1371 cbiG   TRUE 0.969 -3.000 0.006 1.000 N 0.479
 118998 118999 CAC1371 CAC1372   cobT TRUE 0.987 -3.000 0.023 1.000 N 0.571
 118999 119000 CAC1372 CAC1373 cobT cbiK TRUE 0.986 17.000 0.000 1.000 Y 0.699
 119000 119001 CAC1373 CAC1374 cbiK cbiP TRUE 0.996 -15.000 0.003 1.000 Y 0.690
 119001 119002 CAC1374 CAC1375 cbiP cobB TRUE 0.998 -3.000 0.021 0.004 Y 0.879
 119002 119003 CAC1375 CAC1376 cobB cbiC/cobH TRUE 0.997 11.000 0.097 0.010 Y 0.758
 119003 119004 CAC1376 CAC1377 cbiC/cobH cbiD TRUE 0.997 15.000 0.168 0.010 Y 0.829
 119004 119005 CAC1377 CAC1378 cbiD cbiT TRUE 0.996 2.000 0.008 0.010 Y 0.878
 119005 119006 CAC1378 CAC1379 cbiT cobI/cbiL TRUE 0.996 3.000 0.007 0.010 Y 0.872
 119006 119007 CAC1379 CAC1380 cobI/cbiL cbiF/cobM TRUE 0.998 12.000 0.291 0.001 Y 0.634
 119007 119008 CAC1380 CAC1381 cbiF/cobM cbiJ/cobK TRUE 0.993 -3.000 0.076 0.010 Y 0.448
 119008 119009 CAC1381 CAC1382 cbiJ/cobK cbiH/cobJ TRUE 0.998 13.000 0.423 0.010 Y 0.646
 119009 119010 CAC1382 CAC1383 cbiH/cobJ CobU/CobP TRUE 0.989 18.000 0.008 1.000 Y 0.651
 119010 119011 CAC1383 CAC1384 CobU/CobP cobS TRUE 0.866 17.000 0.046 1.000 Y 0.063
 119011 119012 CAC1384 CAC1385 cobS cobC TRUE 0.806 5.000 0.018 1.000 N 0.208
 119012 119013 CAC1385 CAC1386 cobC   FALSE 0.071 30.000 0.000 1.000   -0.230
 119013 119014 CAC1386 CAC1387     FALSE 0.002 414.000 0.000 1.000   -0.305
 119014 119015 CAC1387 CAC1388   manC FALSE 0.002 377.000 0.000 1.000   -0.082
 119015 119016 CAC1388 CAC1389 manC   FALSE 0.003 295.000 0.000 NA   0.165
 119016 119017 CAC1389 CAC1390   purE FALSE 0.003 288.000 0.000 NA N -0.220
 119017 119018 CAC1390 CAC1391 purE purC TRUE 0.993 2.000 0.035 1.000 Y 0.948
 119018 119019 CAC1391 CAC1392 purC purF TRUE 0.921 105.000 0.082 1.000 Y 0.880
 119019 119020 CAC1392 CAC1393 purF purM TRUE 0.995 24.000 0.248 1.000 Y 0.880
 119020 119021 CAC1393 CAC1394 purM PurN TRUE 0.999 -12.000 0.238 0.001 Y 0.937
 119021 119022 CAC1394 CAC1395 PurN purH TRUE 0.985 53.000 0.225 1.000 Y 0.911
 119022 119023 CAC1395 CAC1396 purH purD TRUE 0.848 240.000 0.238 1.000 Y 0.889
 119023 119024 CAC1396 CAC1397 purD   FALSE 0.511 245.000 0.000 NA N 0.682
 119024 119025 CAC1397 CAC1398     TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA   0.262
 119025 119026 CAC1398 CAC1399     TRUE 0.985 -28.000 0.364 NA   0.355
 119026 119027 CAC1399 CAC1400     TRUE 0.997 13.000 0.584 NA Y 0.801
 119027 119028 CAC1400 CAC1401     TRUE 0.999 -40.000 0.554 NA Y 0.640
 119030 119031 CAC1403 CAC1404     FALSE 0.198 96.000 0.000 1.000   0.308
 119031 119032 CAC1404 CAC1405   bglA FALSE 0.065 145.000 0.000 1.000 Y 0.093
 119032 119033 CAC1405 CAC1406 bglA   FALSE 0.126 312.000 0.000 1.000   0.415
 119033 119034 CAC1406 CAC1407     FALSE 0.154 164.000 0.208 1.000   -0.211
 119034 119035 CAC1407 CAC1408     TRUE 0.921 63.000 0.000 1.000 Y 0.584
 119037 119038 CAC1410 CAC1411     TRUE 0.979 17.000 0.000 NA   0.785
 119038 119039 CAC1411 CAC1412   cdrC TRUE 0.810 94.000 0.000 NA N 0.824
 119039 119040 CAC1412 CAC1413 cdrC   TRUE 0.875 71.000 0.000 NA   0.904
 119040 119041 CAC1413 CAC1414     TRUE 0.974 25.000 0.000 NA   0.705
 119041 119042 CAC1414 CAC1415     FALSE 0.016 115.000 0.000 1.000 N 0.202
 119042 119043 CAC1415 CAC1416     FALSE 0.004 186.000 0.000 1.000 N 0.132
 119043 119044 CAC1416 CAC1417     FALSE 0.071 30.000 0.000 NA   0.105
 119044 119045 CAC1417 CAC1418     TRUE 0.717 20.000 0.000 NA   0.323
 119045 119046 CAC1418 CAC1419     FALSE 0.126 5.000 0.000 NA N -0.190
 119046 119047 CAC1419 CAC1420     FALSE 0.008 110.000 0.000 NA   0.088
 119047 119048 CAC1420 CAC1421     TRUE 0.991 3.000 0.217 1.000   0.567
 119048 119049 CAC1421 CAC1422     TRUE 0.801 34.000 0.000 0.069   0.300
 119049 119050 CAC1422 CAC1423     FALSE 0.316 78.000 0.000 0.069   0.183
 119050 119051 CAC1423 CAC1424     FALSE 0.226 91.000 0.000 1.000   0.316
 119051 119052 CAC1424 CAC1425     TRUE 0.950 -19.000 0.000 1.000   0.427
 119052 119053 CAC1425 CAC1426     FALSE 0.003 209.000 0.000 NA N -0.002
 119053 119054 CAC1426 CAC1427   gabT FALSE 0.262 194.000 0.000 NA N 0.499
 119054 119055 CAC1427 CAC1428 gabT   FALSE 0.002 385.000 0.000 NA   -0.308
 119057 119058 CAC1430 CAC1431   rpiA TRUE 0.962 28.000 0.000 1.000 Y 0.551
 119058 119059 CAC1431 CAC1432 rpiA   FALSE 0.137 63.000 0.000 1.000 N 0.225
 119059 119060 CAC1432 CAC1433     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   -0.136
 119062 119063 CAC1435 CAC1436     FALSE 0.002 490.000 0.000 NA   -0.180
 119063 119064 CAC1436 CAC1437     FALSE 0.585 168.000 0.000 NA   0.656
 119064 119065 CAC1437 CAC1438     FALSE 0.165 168.000 0.000 NA   0.402
 119065 119066 CAC1438 CAC1439     TRUE 0.989 -64.000 0.000 NA   0.612
 119066 119067 CAC1439 CAC1440     TRUE 0.979 20.000 0.000 NA   0.804
 119067 119068 CAC1440 CAC1441     TRUE 0.974 1.000 1.000 NA   0.253
 119068 119069 CAC1441 CAC1442     FALSE 0.007 116.000 0.000 NA   0.133
 119069 119070 CAC1442 CAC1443     FALSE 0.106 218.000 0.000 NA   0.379
 119070 119071 CAC1443 CAC1444     FALSE 0.003 254.000 0.000 NA   -0.308
 119071 119072 CAC1444 CAC1445     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   -0.384
 119072 119073 CAC1445 CAC1446     FALSE 0.002 696.000 0.000 NA   -0.160
 119073 119074 CAC1446 CAC1447     FALSE 0.190 -7.000 0.000 NA   0.105
 119074 119075 CAC1447 CAC1448   tetP/tetQ TRUE 0.996 -16.000 0.429 1.000   0.568
 119075 119076 CAC1448 CAC1449 tetP/tetQ   FALSE 0.002 321.000 0.000 NA   -0.409
 119076 119077 CAC1449 CAC1450     FALSE 0.216 302.000 0.000 NA   0.508
 119079 119080 CAC1452 CAC1453   rbsB FALSE 0.007 119.000 0.000 NA N -0.269
 119080 119081 CAC1453 CAC1454 rbsB   TRUE 0.977 11.000 0.833 NA N 0.395
 119081 119082 CAC1454 CAC1455     TRUE 0.999 -3.000 0.941 0.019 Y 0.603
 119082 119083 CAC1455 CAC1456     TRUE 0.997 -3.000 0.696 1.000 N 0.679
 119083 119084 CAC1456 CAC1457     FALSE 0.408 300.000 0.217 1.000 Y 0.318
 119084 119085 CAC1457 CAC1458     TRUE 0.998 12.000 0.643 0.009 Y 0.747
 119085 119086 CAC1458 CAC1459     TRUE 0.998 33.000 0.643 0.009 Y 0.753
 119086 119087 CAC1459 CAC1460     TRUE 0.999 2.000 0.905 0.009 Y 0.702
 119087 119088 CAC1460 CAC1461     TRUE 0.962 19.000 0.095 NA   0.459
 119088 119089 CAC1461 CAC1462     FALSE 0.223 285.000 0.000 NA   0.508
 119089 119090 CAC1462 CAC1463     FALSE 0.384 207.000 0.000 1.000   0.553
 119090 119091 CAC1463 CAC1464     FALSE 0.008 266.000 0.000 1.000 N 0.207
 119091 119092 CAC1464 CAC1465     TRUE 0.927 14.000 0.571 1.000 N 0.144
 119094 119095 CAC1467 CAC1468     TRUE 0.985 4.000 0.000 1.000   0.742
 119095 119096 CAC1468 CAC1469     TRUE 0.654 47.000 0.000 1.000   0.377
 119096 119097 CAC1469 CAC1470     FALSE 0.003 293.000 0.000 NA   -0.264
 119097 119098 CAC1470 CAC1471   arbA TRUE 0.885 62.000 0.000 NA   0.971
 119100 119101 CAC1473 CAC1474     TRUE 0.976 11.000 0.435 0.041 N 0.295
 119101 119102 CAC1474 CAC1475     TRUE 0.993 26.000 0.312 1.000 N 0.816
 119102 119103 CAC1475 CAC1476     TRUE 0.991 -3.000 0.778 1.000 Y 0.358
 119111 119112 CAC1484 CAC1485     FALSE 0.002 311.000 0.000 1.000 N -0.131
 119112 119113 CAC1485 CAC1486     FALSE 0.007 112.000 0.000 NA   0.083
 119113 119114 CAC1486 CAC1487     FALSE 0.589 192.000 0.000 NA   0.707
 119115 119116 CAC1488 CAC1489     TRUE 0.969 1.000 0.038 NA   0.467
 119117 119118 CAC1490 CAC1491     TRUE 0.992 0.000 0.111 NA   0.594
 119118 119119 CAC1491 CAC1492     FALSE 0.124 107.000 0.000 NA   0.293
 119119 119120 CAC1492 CAC1493     FALSE 0.097 125.000 0.000 NA   0.296
 119120 119121 CAC1493 CAC1494     TRUE 0.988 -18.000 0.000 NA   0.622
 119121 119122 CAC1494 CAC1495     TRUE 0.785 88.000 0.000 NA   0.613
 119122 119123 CAC1495 CAC1496     FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   -0.094
 119123 119124 CAC1496 CAC1497     TRUE 0.995 -10.000 0.111 NA   0.647
 119124 119125 CAC1497 CAC1498     TRUE 0.782 94.000 0.000 NA   0.641
 119125 119126 CAC1498 CAC1499     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   -0.551
 119128 119129 CAC1501 CAC1502     FALSE 0.148 185.000 0.258 NA   -0.205
 119129 10693759 CAC1502 CA_C1503     TRUE 0.822 -18.000 0.000 NA   NA
 10693759 119130 CA_C1503 CAC1504     FALSE 0.037 349.000 0.000 NA   NA
 119130 119131 CAC1504 CAC1505     FALSE 0.007 115.000 0.000 NA   -0.159
 119131 119132 CAC1505 CAC1506   phoP FALSE 0.203 148.000 0.333 NA   -0.205
 119132 119133 CAC1506 CAC1507 phoP phoR TRUE 0.992 1.000 0.833 1.000 Y 0.423
 119135 119136 CAC1509 CAC1510     TRUE 0.990 -7.000 0.000 NA   0.792
 119136 119137 CAC1510 CAC1511     FALSE 0.008 111.000 0.000 NA   0.085
 119137 119138 CAC1511 CAC1512   nirC TRUE 0.661 71.000 0.152 1.000 N 0.229
 119138 119139 CAC1512 CAC1513 nirC asrA TRUE 0.986 3.000 0.174 1.000   0.521
 119139 119140 CAC1513 CAC1514 asrA asrB TRUE 0.984 -7.000 0.750 0.032   0.149
 119140 119141 CAC1514 CAC1515 asrB asrC TRUE 0.998 12.000 0.720 0.032 Y 0.751
 119141 119142 CAC1515 CAC1516 asrC   FALSE 0.013 85.000 0.000 1.000 N -0.243
 119142 119143 CAC1516 CAC1517     TRUE 0.996 14.000 0.235 1.000 Y 0.706
 119143 119144 CAC1517 CAC1518     FALSE 0.312 113.000 0.353 1.000 N -0.087
 119144 119145 CAC1518 CAC1519     TRUE 0.998 -13.000 0.286 1.000   0.781
 119146 119147 CAC1520 CAC1521     TRUE 0.912 13.000 0.370 NA   0.145
 119147 119148 CAC1521 CAC1522     FALSE 0.562 119.000 0.000 NA   0.563
 119149 119150 CAC1523 CAC1524     FALSE 0.004 170.000 0.000 NA   -0.425
 119150 119151 CAC1524 CAC1525     TRUE 0.682 81.000 0.000 NA   0.526
 119151 119152 CAC1525 CAC1526     FALSE 0.002 344.000 0.000 NA   0.010
 119153 119154 CAC1527 CAC1528     FALSE 0.442 60.000 0.000 NA   0.328
 119155 119156 CAC1529 CAC1530     TRUE 0.960 22.000 0.231 1.000   0.387
 119156 119157 CAC1530 CAC1531     FALSE 0.013 85.000 0.000 1.000   0.064
 119157 119158 CAC1531 CAC1532     FALSE 0.002 304.000 0.000 NA   -0.254
 119158 119159 CAC1532 CAC1533     TRUE 0.912 68.000 0.000 NA   0.777
 119160 119161 CAC1534 CAC1535     TRUE 0.997 0.000 0.636 1.000 N 0.736
 119161 119162 CAC1535 CAC1536     TRUE 0.992 1.000 0.118 1.000 N 0.599
 119163 119164 CAC1537 CAC1538     FALSE 0.006 128.000 0.000 NA   -0.417
 119164 119165 CAC1538 CAC1539     FALSE 0.002 655.000 0.000 1.000   0.020
 119165 119166 CAC1539 CAC1540     TRUE 0.791 81.000 0.036 1.000 N 0.514
 119166 119167 CAC1540 CAC1541     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   -0.170
 119167 119168 CAC1541 CAC1542     FALSE 0.003 236.000 0.000 NA   0.065
 119168 119169 CAC1542 CAC1543     FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   -0.328
 119169 119170 CAC1543 CAC1544     FALSE 0.579 164.000 0.000 1.000 N 0.635
 119170 119171 CAC1544 CAC1545   deoC TRUE 0.941 70.000 0.000 1.000 Y 0.750
 119171 119172 CAC1545 CAC1546 deoC deoA TRUE 0.971 46.000 0.000 1.000 Y 0.809
 119172 119173 CAC1546 CAC1547 deoA trxA FALSE 0.003 197.000 0.000 1.000 N -0.043
 119173 119174 CAC1547 CAC1548 trxA trxB TRUE 0.987 14.000 0.000 1.000 Y 0.787
 119174 119175 CAC1548 CAC1549 trxB bsaA TRUE 0.946 66.000 0.000 1.000 Y 0.710
 119177 119178 CAC1551 CAC1552     TRUE 0.645 164.000 0.000 1.000 N 0.753
 119178 119179 CAC1552 CAC1553     TRUE 0.998 -3.000 0.462 1.000 Y 0.705
 119180 119181 CAC1554 CAC1555     FALSE 0.496 141.000 0.000 1.000   0.556
 119181 119182 CAC1555 CAC1556     FALSE 0.013 133.000 0.000 1.000   0.196
 119183 119184 CAC1557 CAC1558     TRUE 0.985 -16.000 0.000 1.000 N 0.589
 119186 119187 CAC1560 CAC1561     FALSE 0.456 410.000 0.000 1.000   0.861
 119187 119188 CAC1561 CAC1562     TRUE 0.992 15.000 0.250 NA   0.885
 119188 119189 CAC1562 CAC1563     FALSE 0.411 332.000 0.000 NA   0.925
 119189 119190 CAC1563 CAC1564     FALSE 0.427 379.000 0.000 NA   0.891
 119190 119191 CAC1564 CAC1565     TRUE 0.995 22.000 0.667 NA   0.824
 119191 119192 CAC1565 CAC1566     TRUE 0.966 33.000 0.000 NA   0.821
 119192 119193 CAC1566 CAC1567     FALSE 0.274 205.000 0.000 NA   0.509
 119193 119194 CAC1567 CAC1568     FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   -0.172
 119196 119197 CAC1570 CAC1571 bsaA   TRUE 0.996 5.000 0.000 0.001 Y 0.804
 119197 119198 CAC1571 CAC1572     FALSE 0.003 211.000 0.000 1.000 N 0.170
 119198 119199 CAC1572 CAC1573     FALSE 0.003 241.000 0.000 NA   0.106
 119199 119200 CAC1573 CAC1574     FALSE 0.268 119.000 0.000 NA   0.417
 119200 119201 CAC1574 CAC1575     FALSE 0.003 263.000 0.000 NA   0.148
 119201 119202 CAC1575 CAC1576     TRUE 0.980 12.000 0.000 NA   0.778
 119202 119203 CAC1576 CAC1577     FALSE 0.005 137.000 0.000 NA   -0.107
 119205 119206 CAC1579 CAC1580     TRUE 0.652 126.000 0.000 NA   0.630
 119206 119207 CAC1580 CAC1581     FALSE 0.021 71.000 0.000 NA   -0.158
 119207 119208 CAC1581 CAC1582     TRUE 0.998 6.000 0.667 NA Y 0.745
 119212 119213 CAC1586 CAC1587     TRUE 0.997 14.000 0.229 0.091 Y 0.706
 119214 119215 CAC1588 CAC1589   malS FALSE 0.182 123.000 0.000 1.000 N 0.364
 119215 119216 CAC1589 CAC1590 malS   TRUE 0.978 23.000 0.000 1.000 N 0.767
 119216 119217 CAC1590 CAC1591     FALSE 0.153 135.000 0.000 NA   0.363
 119217 119218 CAC1591 CAC1592     TRUE 0.993 13.000 0.182 NA   0.765
 119218 119219 CAC1592 CAC1593     FALSE 0.481 108.000 0.000 NA   0.510
 119219 119220 CAC1593 CAC1594   rpsD FALSE 0.048 148.000 0.000 1.000 N 0.253
 119223 119224 CAC1597 CAC1598     TRUE 0.987 0.000 0.000 NA   0.813
 119224 119225 CAC1598 CAC1599     FALSE 0.026 96.000 0.000 NA   0.213
 119225 119226 CAC1599 CAC1600     FALSE 0.082 432.000 0.000 NA   0.393
 119226 119227 CAC1600 CAC1601     TRUE 0.828 28.000 0.000 0.015   0.266
 119227 119228 CAC1601 CAC1602     FALSE 0.005 136.000 0.000 NA   0.033
 119228 119229 CAC1602 CAC1603     TRUE 0.950 45.000 0.000 NA   0.848
 119229 119230 CAC1603 CAC1604     FALSE 0.306 164.000 0.000 1.000 N 0.497
 119230 119231 CAC1604 CAC1605   arbA TRUE 0.939 50.000 0.000 1.000 N 0.669
 119232 119233 CAC1606 CAC1607     TRUE 0.978 20.000 0.000 NA   0.728
 119235 119236 CAC1609 CAC1610   brnQ FALSE 0.439 150.000 0.000 1.000   0.537
 119237 119238 CAC1611 CAC1612     TRUE 0.998 -58.000 0.120 0.004   0.650
 119238 119239 CAC1612 CAC1613     FALSE 0.389 112.000 0.000 1.000   0.461
 119240 119241 CAC1614 CAC1615     TRUE 0.931 5.000 0.000 NA   0.484
 119241 119242 CAC1615 CAC1616     FALSE 0.007 118.000 0.000 NA   -0.299
 119243 119244 CAC1617 CAC1618     FALSE 0.005 149.000 0.000 NA   -0.632
 119244 119245 CAC1618 CAC1619     TRUE 0.880 34.000 0.000 NA   0.506
 119245 119246 CAC1619 CAC1620     FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   0.157
 119246 119247 CAC1620 CAC1621     FALSE 0.003 216.000 0.000 1.000   0.026
 119247 119248 CAC1621 CAC1622     TRUE 0.986 13.000 0.021 1.000 N 0.818
 119248 119249 CAC1622 CAC1623     FALSE 0.643 49.000 0.000 1.000   0.380
 119249 119250 CAC1623 CAC1624     TRUE 0.761 107.000 0.000 NA   0.843
 119250 119251 CAC1624 CAC1625     FALSE 0.099 19.000 0.000 NA   0.166
 119251 119252 CAC1625 CAC1626     TRUE 0.946 -3.000 0.062 1.000 N 0.302
 119252 119253 CAC1626 CAC1627   gyrB FALSE 0.006 128.000 0.000 1.000 N -0.133
 119253 119254 CAC1627 CAC1628 gyrB gyrA TRUE 0.999 21.000 0.552 0.001 Y 0.741
 119254 119255 CAC1628 CAC1629 gyrA   FALSE 0.164 13.000 0.020 NA   -0.106
 119255 119256 CAC1629 CAC1630     FALSE 0.348 66.000 0.012 NA   0.195
 119256 119257 CAC1630 CAC1631     TRUE 0.947 15.000 0.000 1.000   0.536
 119258 119259 CAC1632 CAC1633     FALSE 0.006 121.000 0.000 1.000   -0.012
 119262 119263 CAC1636 CAC1637     TRUE 0.987 -7.000 0.000 NA   0.644
 119263 119264 CAC1637 CAC1638     TRUE 0.940 14.000 0.000 NA   0.533
 119264 119265 CAC1638 CAC1639     TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA   0.430
 119265 119266 CAC1639 CAC1640     TRUE 0.992 -88.000 0.000 NA   0.706
 119266 119267 CAC1640 CAC1641     FALSE 0.101 16.000 0.000 NA   0.125
 119267 10693760 CAC1641 CA_C1642     FALSE 0.033 443.000 0.000 NA   NA
 10693760 119268 CA_C1642 CAC1643     TRUE 0.672 11.000 0.000 NA   NA
 119268 119269 CAC1643 CAC1644     FALSE 0.002 695.000 0.000 NA   -0.181
 119269 119270 CAC1644 CAC1645     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   0.254
 119270 119271 CAC1645 CAC1646     FALSE 0.266 585.000 0.000 NA   0.558
 119271 119272 CAC1646 CAC1647     TRUE 0.969 18.000 0.600 NA   0.374
 119272 119273 CAC1647 CAC1648     FALSE 0.009 102.000 0.000 NA   0.151
 119273 119274 CAC1648 CAC1649     TRUE 0.871 78.000 0.000 NA   0.711
 119274 119275 CAC1649 CAC1650     FALSE 0.004 189.000 0.000 NA   0.087
 119276 119277 CAC1651 CAC1652   aspA TRUE 0.973 15.000 0.171 1.000   0.473
 119278 119279 CAC1653 CAC1654     TRUE 0.858 67.000 0.000 1.000   0.582
 119279 119280 CAC1654 CAC1655   purQ/purL FALSE 0.013 210.000 0.000 1.000   0.206
 119280 119281 CAC1655 CAC1656 purQ/purL   FALSE 0.002 314.000 0.000 NA   -0.171
 119281 119282 CAC1656 CAC1657     FALSE 0.016 79.000 0.000 NA   0.086
 119282 119283 CAC1657 CAC1658     TRUE 0.648 90.000 0.000 NA   0.535
 119283 119284 CAC1658 CAC1659     FALSE 0.051 42.000 0.000 NA   -0.065
 119284 119285 CAC1659 CAC1660     FALSE 0.432 112.000 0.000 NA   0.497
 119285 119286 CAC1660 CAC1661     FALSE 0.007 116.000 0.000 1.000 N -0.184
 119286 119287 CAC1661 CAC1662     FALSE 0.006 125.000 0.000 NA   -0.033
 119287 119288 CAC1662 CAC1663     TRUE 0.865 68.000 0.000 NA   0.602
 119290 119291 CAC1665 CAC1666     FALSE 0.622 105.000 0.000 NA   0.560
 119291 119292 CAC1666 CAC1667     TRUE 0.996 -58.000 0.055 NA   0.767
 119292 119293 CAC1667 CAC1668     TRUE 0.971 28.000 0.000 NA   0.815
 119295 119296 CAC1670 CAC1671     TRUE 0.821 14.000 0.000 1.000 N 0.390
 119296 119297 CAC1671 CAC1672     TRUE 0.972 0.000 0.000 0.007 Y 0.360
 119297 119298 CAC1672 CAC1673   gltA FALSE 0.005 154.000 0.000 1.000 N -0.153
 119298 119299 CAC1673 CAC1674 gltA gltB TRUE 0.998 13.000 0.099 0.001 Y 0.749
 119299 119300 CAC1674 CAC1675 gltB   FALSE 0.005 150.000 0.000 NA N -0.277
 119300 119301 CAC1675 CAC1676     FALSE 0.008 108.000 0.000 NA   0.073
 119301 119302 CAC1676 CAC1677     TRUE 0.985 -16.000 0.209 NA   0.407
 119302 119303 CAC1677 CAC1678   alaS FALSE 0.019 276.000 0.015 NA   0.058
 119303 119304 CAC1678 CAC1679 alaS   FALSE 0.250 86.000 0.110 NA   -0.138
 119304 119305 CAC1679 CAC1680     TRUE 0.906 78.000 0.537 NA   0.509
 119305 119306 CAC1680 CAC1681     TRUE 0.986 53.000 0.651 NA   0.826
 119306 119307 CAC1681 CAC1682     TRUE 0.974 27.000 0.000 NA   0.787
 119307 119308 CAC1682 CAC1683     TRUE 0.902 69.000 0.289 1.000   0.466
 119308 119309 CAC1683 CAC1684     FALSE 0.031 198.000 0.004 1.000   0.111
 119309 119310 CAC1684 CAC1685     TRUE 0.985 21.000 0.012 NA   0.717
 119310 119311 CAC1685 CAC1686     TRUE 0.989 16.000 0.067 NA   0.848
 119311 119312 CAC1686 CAC1687     TRUE 0.997 -7.000 0.146 1.000   0.813
 119312 119313 CAC1687 CAC1688     FALSE 0.302 64.000 0.008 1.000 N 0.160
 119313 119314 CAC1688 CAC1689   sigK TRUE 0.780 182.000 0.087 1.000 N 0.699
 119314 119315 CAC1689 CAC1690 sigK pilT FALSE 0.007 255.000 0.025 1.000 N -0.236
 119315 119316 CAC1690 CAC1691 pilT   TRUE 0.708 140.000 0.042 NA N 0.593
 119316 119317 CAC1691 CAC1692   ftsA FALSE 0.322 154.000 0.008 NA N 0.427
 119317 119318 CAC1692 CAC1693 ftsA ftsZ TRUE 0.994 17.000 0.460 1.000 Y 0.563
 119318 119319 CAC1693 CAC1694 ftsZ   FALSE 0.023 216.000 0.024 1.000   -0.052
 119319 119320 CAC1694 CAC1695   sigE TRUE 0.994 15.000 0.856 1.000   0.921
 119320 119321 CAC1695 CAC1696 sigE sigG TRUE 0.991 74.000 0.602 0.008 Y 0.827
 119321 119322 CAC1696 CAC1697 sigG   TRUE 0.716 196.000 0.060 NA   0.882
 119322 119323 CAC1697 CAC1698     TRUE 0.748 65.000 0.013 NA   0.425
 119323 119324 CAC1698 CAC1699     FALSE 0.003 268.000 0.013 NA   -0.239
 119324 119325 CAC1699 CAC1700     TRUE 0.983 21.000 0.018 NA   0.897
 119325 119326 CAC1700 CAC1701     TRUE 0.998 2.000 0.110 0.070 Y 0.740
 119326 119327 CAC1701 CAC1702     FALSE 0.006 131.000 0.000 NA   0.174
 119327 119328 CAC1702 CAC1703     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA   0.772
 119328 119329 CAC1703 CAC1704     TRUE 0.915 1.000 0.000 NA   0.425
 119329 119330 CAC1704 CAC1705     FALSE 0.005 149.000 0.000 NA   -0.397
 119330 119331 CAC1705 CAC1706     TRUE 0.947 99.000 0.206 1.000 Y 0.882
 119331 119332 CAC1706 CAC1707     TRUE 0.999 0.000 0.907 0.001 Y 0.830
 119332 119333 CAC1707 CAC1708     TRUE 0.998 12.000 0.112 0.001 Y 0.831
 119333 119334 CAC1708 CAC1709   phoU TRUE 0.991 32.000 0.182 NA Y 0.898
 119334 119335 CAC1709 CAC1710 phoU   FALSE 0.012 177.000 0.028 NA N -0.125
 119335 119336 CAC1710 CAC1711     TRUE 0.990 3.000 0.061 1.000   0.613
 119336 119337 CAC1711 CAC1712   gpsA TRUE 0.994 2.000 0.068 1.000   0.747
 119337 119338 CAC1712 CAC1713 gpsA   FALSE 0.557 82.000 0.060 NA   0.320
 119338 119339 CAC1713 CAC1714   ansA TRUE 0.687 108.000 0.000 NA   0.605
 119339 119340 CAC1714 CAC1715 ansA   FALSE 0.591 112.000 0.000 1.000 Y 0.499
 119340 119341 CAC1715 CAC1716     FALSE 0.005 154.000 0.000 NA   -0.171
 119341 119342 CAC1716 CAC1717     TRUE 0.940 19.000 0.189 NA   0.313
 119342 119343 CAC1717 CAC1718     TRUE 0.995 0.000 0.143 NA   0.736
 119343 119344 CAC1718 CAC1719   rpoZ TRUE 0.988 -19.000 0.471 1.000 N 0.396
 119344 119345 CAC1719 CAC1720 rpoZ   TRUE 0.995 2.000 0.192 1.000 N 0.711
 119345 119346 CAC1720 CAC1721   rpiA TRUE 0.945 28.000 0.099 1.000 N 0.425
 119346 119347 CAC1721 CAC1722 rpiA def TRUE 0.972 19.000 0.010 1.000 N 0.565
 119347 119348 CAC1722 CAC1723 def fmt TRUE 0.942 1.000 0.009 0.024 Y 0.086
 119348 119349 CAC1723 CAC1724 fmt   TRUE 0.835 20.000 0.035 NA   0.248
 119349 119350 CAC1724 CAC1725     TRUE 0.949 15.000 0.076 NA   0.421
 119350 119351 CAC1725 CAC1726     TRUE 0.983 13.000 0.135 1.000   0.552
 119351 119352 CAC1726 CAC1727     TRUE 0.988 -55.000 0.105 1.000   0.466
 119352 119353 CAC1727 CAC1728     TRUE 0.992 -22.000 0.704 1.000 Y 0.332
 119353 119354 CAC1728 CAC1729     TRUE 0.986 24.000 0.196 1.000   0.567
 119354 119355 CAC1729 CAC1730     TRUE 0.997 -3.000 0.213 1.000   0.810
 119355 119356 CAC1730 CAC1731     TRUE 0.995 2.000 0.166 1.000 N 0.702
 119356 119357 CAC1731 CAC1732     FALSE 0.543 45.000 0.005 NA   0.233
 119359 119360 CAC1734 CAC1735     TRUE 0.995 14.000 0.567 NA   0.801
 119360 119361 CAC1735 CAC1736   recG FALSE 0.281 160.000 0.048 1.000   0.333
 119361 119362 CAC1736 CAC1737 recG   TRUE 0.785 78.000 0.016 0.011 Y 0.289
 119362 119363 CAC1737 CAC1738   kdtB TRUE 0.997 -3.000 0.367 1.000 N 0.842
 119363 119364 CAC1738 CAC1739 kdtB   TRUE 0.906 72.000 0.015 NA   0.930
 119365 119366 CAC1740 CAC1741     TRUE 0.670 65.000 0.036 NA   0.331
 119367 119368 CAC1742 CAC1743 pta askA TRUE 0.995 12.000 0.137 1.000 Y 0.809
 119368 119369 CAC1743 CAC1744 askA   FALSE 0.287 202.000 0.061 NA   0.386
 119369 119370 CAC1744 CAC1745   rpmF TRUE 0.995 15.000 0.599 NA   0.689
 119370 119371 CAC1745 CAC1746 rpmF plsX TRUE 0.924 80.000 0.418 1.000 N 0.548
 119371 119372 CAC1746 CAC1747 plsX acpA TRUE 0.749 107.000 0.034 0.004 Y 0.355
 119372 119373 CAC1747 CAC1748 acpA rncS FALSE 0.421 127.000 0.068 0.002 N 0.125
 119373 119374 CAC1748 CAC1749 rncS   TRUE 0.993 1.000 0.064 1.000 Y 0.579
 119374 119375 CAC1749 CAC1750     TRUE 0.713 57.000 0.086 NA   0.246
 119375 119376 CAC1750 CAC1751   smc FALSE 0.528 217.000 0.015 NA   0.579
 119376 119377 CAC1751 CAC1752 smc ftsY TRUE 0.987 30.000 0.165 1.000 N 0.638
 119377 119378 CAC1752 CAC1753 ftsY   FALSE 0.625 78.000 0.081 1.000   0.302
 119378 119379 CAC1753 CAC1754   ffh TRUE 0.993 19.000 0.151 1.000   0.729
 119379 119380 CAC1754 CAC1755 ffh rpsP TRUE 0.781 38.000 0.361 1.000 N -0.142
 119380 119381 CAC1755 CAC1756 rpsP   TRUE 0.994 21.000 0.385 1.000   0.861
 119381 119382 CAC1756 CAC1757     FALSE 0.343 128.000 0.324 1.000   0.117
 119382 119383 CAC1757 CAC1758   trmD TRUE 0.999 -15.000 0.672 1.000 Y 0.878
 119383 119384 CAC1758 CAC1759 trmD rplS TRUE 0.673 128.000 0.567 1.000 Y 0.296
 119384 119385 CAC1759 CAC1760 rplS   TRUE 0.744 49.000 0.006 1.000 N 0.366
 119385 119386 CAC1760 CAC1761     TRUE 0.994 3.000 0.007 0.051   0.816
 119386 119387 CAC1761 CAC1762   rnh TRUE 0.991 23.000 0.148 1.000   0.863
 119391 119392 CAC1766 CAC1767     TRUE 0.972 4.000 0.000 NA   0.584
 119393 10693761 CAC1768 CA_C1769     FALSE 0.031 699.000 0.000 NA   NA
 119394 119395 CAC1770 CAC1771     TRUE 0.971 11.000 0.605 NA   0.361
 119395 119396 CAC1771 CAC1772   sacB1 FALSE 0.254 138.000 0.000 NA   0.433
 119396 119397 CAC1772 CAC1773 sacB1 sacC TRUE 0.869 98.000 0.250 0.033   0.474
 119397 119398 CAC1773 CAC1774 sacC sacB2 TRUE 0.819 67.000 0.000 0.033   0.474
 119398 119399 CAC1774 CAC1775 sacB2   FALSE 0.002 414.000 0.000 1.000   -0.244
 119399 119400 CAC1775 CAC1776     FALSE 0.484 388.000 0.000 1.000   0.725
 119400 119401 CAC1776 CAC1777     FALSE 0.003 252.000 0.000 1.000   0.120
 119401 119402 CAC1777 CAC1778     FALSE 0.624 22.000 0.000 1.000   0.272
 119402 119403 CAC1778 CAC1779     FALSE 0.151 191.000 0.000 NA   0.403
 119403 119404 CAC1779 CAC1780     TRUE 0.968 28.000 0.000 NA   0.673
 119404 119405 CAC1780 CAC1781     TRUE 0.983 2.000 0.000 0.003 Y 0.460
 119405 119406 CAC1781 CAC1782   nadE TRUE 0.940 50.000 0.002 0.003   0.498
 119406 119407 CAC1782 CAC1783 nadE gltT FALSE 0.152 282.000 0.000 1.000   0.428
 119407 119408 CAC1783 CAC1784 gltT smf FALSE 0.002 302.000 0.000 1.000 N -0.192
 119408 119409 CAC1784 CAC1785 smf topA TRUE 0.886 31.000 0.238 1.000 Y -0.084
 119409 119410 CAC1785 CAC1786 topA codY FALSE 0.420 162.000 0.025 1.000 N 0.471
 119410 119411 CAC1786 CAC1787 codY rpsB FALSE 0.221 154.000 0.006 1.000 N 0.355
 119411 119412 CAC1787 CAC1788 rpsB tsf TRUE 0.964 108.000 0.748 1.000 Y 0.759
 119412 119413 CAC1788 CAC1789 tsf smbA/pyrH TRUE 0.971 71.000 0.416 1.000 N 0.686
 119413 119414 CAC1789 CAC1790 smbA/pyrH frr TRUE 0.986 20.000 0.626 1.000 N 0.510
 119414 119415 CAC1790 CAC1791 frr   FALSE 0.559 108.000 0.409 1.000 N 0.253
 119415 119416 CAC1791 CAC1792   cdsA TRUE 0.994 0.000 0.055 1.000 Y 0.604
 119416 119417 CAC1792 CAC1793 cdsA lexA FALSE 0.213 95.000 0.000 1.000 N 0.325
 119417 119418 CAC1793 CAC1794 lexA   FALSE 0.209 90.000 0.000 NA   0.317
 119418 119419 CAC1794 CAC1795     FALSE 0.254 18.000 0.008 NA   0.035
 119419 119420 CAC1795 CAC1796     TRUE 0.994 12.000 0.568 1.000 N 0.621
 119420 119421 CAC1796 CAC1797   gcpE TRUE 0.980 22.000 0.092 1.000 N 0.550
 119421 119422 CAC1797 CAC1798 gcpE   FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   0.069
 119422 119423 CAC1798 CAC1799   nusA TRUE 0.995 14.000 0.759 NA   0.872
 119423 119424 CAC1799 CAC1800 nusA   TRUE 0.991 41.000 0.323 NA Y 0.668
 119424 119425 CAC1800 CAC1801     TRUE 0.997 -7.000 0.408 NA N 0.752
 119425 119426 CAC1801 CAC1802   infB TRUE 0.995 16.000 0.223 NA Y 0.848
 119426 119427 CAC1802 CAC1803 infB rfbA TRUE 0.993 36.000 0.530 1.000 Y 0.921
 119427 119428 CAC1803 CAC1804 rfbA   TRUE 0.997 -13.000 0.173 1.000   0.810
 119428 119429 CAC1804 CAC1805   truB TRUE 0.996 3.000 0.221 1.000   0.770
 119429 119430 CAC1805 CAC1806 truB   TRUE 0.994 12.000 0.308 1.000 N 0.794
 119430 119431 CAC1806 CAC1807   rpsO FALSE 0.606 131.000 0.119 1.000 N 0.467
 119431 119432 CAC1807 CAC1808 rpsO pnpA FALSE 0.624 256.000 0.335 1.000 Y 0.443
 119432 119433 CAC1808 CAC1809 pnpA   FALSE 0.161 123.000 0.003 NA   0.265
 119433 119434 CAC1809 CAC1810   dapG TRUE 0.979 15.000 0.148 NA   0.523
 119434 119435 CAC1810 CAC1811 dapG   TRUE 0.960 63.000 0.080 1.000 N 0.661
 119435 119436 CAC1811 CAC1812     TRUE 0.940 14.000 0.042 1.000 N 0.426
 119436 119437 CAC1812 CAC1813     FALSE 0.473 94.000 0.031 1.000 N 0.348
 119437 119438 CAC1813 CAC1814   pgsA TRUE 0.996 -16.000 0.132 1.000 N 0.647
 119438 119439 CAC1814 CAC1815 pgsA recA FALSE 0.022 158.000 0.022 1.000 N -0.055
 119439 119440 CAC1815 CAC1816 recA   FALSE 0.365 226.000 0.018 1.000   0.490
 119440 119441 CAC1816 CAC1817     FALSE 0.170 198.000 0.016 NA   0.327
 119441 119442 CAC1817 CAC1818     FALSE 0.199 105.000 0.020 NA   0.209
 119442 119443 CAC1818 CAC1819   aspB TRUE 0.794 43.000 0.000 1.000 N 0.444
 119443 119444 CAC1819 CAC1820 aspB   TRUE 0.672 128.000 0.047 1.000 N 0.546
 119444 119445 CAC1820 CAC1821   purB FALSE 0.153 174.000 0.002 1.000 N 0.316
 119445 119446 CAC1821 CAC1822 purB   FALSE 0.235 83.000 0.000 1.000   0.297
 119446 119447 CAC1822 CAC1823     FALSE 0.005 146.000 0.000 NA   0.168
 119447 119448 CAC1823 CAC1824   clpA TRUE 0.996 4.000 0.596 NA   0.641
 119448 119449 CAC1824 CAC1825 clpA metB FALSE 0.003 280.000 0.000 1.000 N -0.224
 119449 119450 CAC1825 CAC1826 metB   FALSE 0.486 315.000 0.000 NA   0.837
 119450 119451 CAC1826 CAC1827     TRUE 0.836 -10.000 0.000 NA   0.308
 119451 119452 CAC1827 CAC1828     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   0.204
 119452 119453 CAC1828 CAC1829     TRUE 0.994 2.000 0.114 NA   0.684
 119453 10693762 CAC1829 CA_C1830     FALSE 0.039 310.000 0.000 NA   NA
 119456 119457 CAC1833 CAC1834     TRUE 0.843 83.000 0.064 1.000   0.536
 119457 119458 CAC1834 CAC1835   miaA TRUE 0.759 61.000 0.192 1.000   0.223
 119458 119459 CAC1835 CAC1836 miaA mutL TRUE 0.987 24.000 0.097 1.000 N 0.625
 119459 119460 CAC1836 CAC1837 mutL mutS TRUE 0.997 19.000 0.220 0.002 Y 0.628
 119460 119461 CAC1837 CAC1838 mutS   TRUE 0.958 31.000 0.041 1.000 N 0.532
 119463 119464 CAC1840 CAC1841     TRUE 0.939 58.000 0.571 NA   0.457
 119464 119465 CAC1841 CAC1842     FALSE 0.499 155.000 0.000 NA   0.579
 119467 119468 CAC1844 CAC1845   motB TRUE 0.897 -30.000 0.000 NA   0.349
 119468 119469 CAC1845 CAC1846 motB motA TRUE 0.989 3.000 0.257 1.000 Y 0.463
 119469 119470 CAC1846 CAC1847 motA lytB/rpsA FALSE 0.003 240.000 0.000 1.000 N 0.174
 119470 119471 CAC1847 CAC1848 lytB/rpsA cmk TRUE 0.927 27.000 0.047 1.000 N 0.420
 119471 119472 CAC1848 CAC1849 cmk   FALSE 0.379 207.000 0.039 1.000   0.463
 119472 119473 CAC1849 CAC1850     TRUE 0.966 64.000 0.124 1.000   0.675
 119473 119474 CAC1850 CAC1851     TRUE 0.731 147.000 0.013 1.000 N 0.671
 119474 119475 CAC1851 CAC1852     TRUE 0.744 45.000 0.000 1.000 N 0.419
 119476 119477 CAC1853 CAC1854     TRUE 0.971 14.000 0.000 1.000   0.620
 119478 119479 CAC1855 CAC1856     FALSE 0.051 42.000 0.000 NA   -0.051
 119479 119480 CAC1856 CAC1857     FALSE 0.101 16.000 0.000 NA   0.163
 119480 119481 CAC1857 CAC1858     TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA   0.685
 119481 119482 CAC1858 CAC1859     TRUE 0.970 12.000 0.000 NA   0.611
 119483 119484 CAC1860 CAC1861     TRUE 0.766 28.000 0.000 0.036   0.230
 119485 119486 CAC1862 CAC1863     FALSE 0.332 28.000 0.000 NA   0.234
 119486 119487 CAC1863 CAC1864     FALSE 0.002 331.000 0.000 NA   -0.345
 119488 119489 CAC1865 CAC1866     FALSE 0.126 111.000 0.000 1.000   0.288
 119489 119490 CAC1866 CAC1867     FALSE 0.200 -10.000 0.000 1.000   0.001
 119492 119493 CAC1869 CAC1870     FALSE 0.007 116.000 0.000 NA   -0.244
 119493 119494 CAC1870 CAC1871     TRUE 0.933 53.000 0.000 NA   0.671
 119494 119495 CAC1871 CAC1872   repB TRUE 0.752 160.000 0.000 0.043   0.824
 119496 119497 CAC1873 CAC1874     TRUE 0.978 15.000 0.000 NA   0.734
 119497 119498 CAC1874 CAC1875     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   -0.072
 119498 119499 CAC1875 CAC1876   lyc TRUE 0.970 20.000 0.000 NA   0.933
 119499 119500 CAC1876 CAC1877 lyc   TRUE 0.970 18.000 0.000 NA   0.925
 119500 119501 CAC1877 CAC1878     TRUE 0.974 12.000 0.000 NA   0.895
 119501 119502 CAC1878 CAC1879     TRUE 0.959 30.000 0.000 NA   0.921
 119502 119503 CAC1879 CAC1880     TRUE 0.960 32.000 0.000 NA   0.896
 119503 119504 CAC1880 CAC1881     TRUE 0.987 -13.000 0.000 NA   0.940
 119504 119505 CAC1881 CAC1882     TRUE 0.972 19.000 0.000 NA   0.911
 119505 119506 CAC1882 CAC1883     TRUE 0.978 2.000 0.000 NA   0.955
 119506 119507 CAC1883 CAC1884     TRUE 0.956 34.000 0.000 NA   0.904
 119507 119508 CAC1884 CAC1885     TRUE 0.971 27.000 0.000 NA   0.836
 119508 119509 CAC1885 CAC1886     TRUE 0.979 54.000 0.400 NA   0.917
 119509 119510 CAC1886 CAC1887     TRUE 0.987 45.000 0.800 NA   0.925
 119510 119511 CAC1887 CAC1888     TRUE 0.983 -3.000 0.000 NA   0.940
 119511 119512 CAC1888 CAC1889     TRUE 0.982 1.000 0.000 NA   0.918
 119512 119513 CAC1889 CAC1890     TRUE 0.995 -37.000 0.071 NA   0.926
 119513 10693763 CAC1890 CA_C1891     FALSE 0.636 14.000 0.000 NA   NA
 10693763 119514 CA_C1891 CAC1892     TRUE 0.806 -10.000 0.000 NA   NA
 119514 119515 CAC1892 CAC1893     TRUE 0.996 2.000 0.846 NA   0.920
 119515 119516 CAC1893 CAC1894     TRUE 0.998 -37.000 0.846 NA   0.913
 119516 119517 CAC1894 CAC1895     TRUE 0.998 -3.000 0.692 NA   0.746
 119517 119518 CAC1895 CAC1896     TRUE 0.997 -25.000 0.267 NA   0.894
 119518 119519 CAC1896 CAC1897     TRUE 0.836 176.000 0.333 NA   0.882
 119519 119520 CAC1897 CAC1898     TRUE 0.982 7.000 0.000 NA   0.839
 119520 119521 CAC1898 CAC1899     TRUE 0.807 95.000 0.000 NA   0.835
 119521 119522 CAC1899 CAC1900     TRUE 0.990 -7.000 0.000 NA   0.760
 119522 119523 CAC1900 CAC1901     TRUE 0.990 -12.000 0.000 NA   0.838
 119523 119524 CAC1901 CAC1902     TRUE 0.965 35.000 0.000 NA   0.775
 119524 119525 CAC1902 CAC1903     TRUE 0.991 -40.000 0.000 NA   0.880
 119525 119526 CAC1903 CAC1904     FALSE 0.512 304.000 0.000 NA   0.753
 119526 119527 CAC1904 CAC1905     TRUE 0.676 145.000 0.000 NA   0.788
 119527 119528 CAC1905 CAC1906     FALSE 0.576 210.000 0.000 NA   0.733
 119528 119529 CAC1906 CAC1907     TRUE 0.973 15.000 0.000 NA   0.648
 119529 119530 CAC1907 CAC1908     TRUE 0.983 6.000 0.000 NA   0.786
 119530 119531 CAC1908 CAC1909   rnd FALSE 0.003 254.000 0.000 NA   0.096
 119531 119532 CAC1909 CAC1910 rnd   TRUE 0.970 13.000 0.000 NA   0.917
 119534 119535 CAC1912 CAC1913     TRUE 0.960 53.000 0.062 NA   0.617
 119535 119536 CAC1913 CAC1914     FALSE 0.056 231.000 0.000 NA   0.302
 119536 119537 CAC1914 CAC1915     FALSE 0.004 173.000 0.000 NA   0.195
 119537 119538 CAC1915 CAC1916     TRUE 0.701 132.000 0.000 NA   0.772
 119538 119539 CAC1916 CAC1917     TRUE 0.950 48.000 0.000 NA   0.749
 119539 119540 CAC1917 CAC1918     TRUE 0.859 83.000 0.000 NA   0.788
 119540 119541 CAC1918 CAC1919     FALSE 0.579 47.000 0.000 NA   0.350
 119541 119542 CAC1919 CAC1920     FALSE 0.126 5.000 0.000 NA   0.138
 119542 119543 CAC1920 CAC1921     TRUE 0.985