MicrobesOnline Operon Predictions for Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1783087 1783088 CHU_0001 CHU_0002     TRUE 0.996 -3.000 0.118 NA Y NA
 1783088 1783089 CHU_0002 CHU_0003     FALSE 0.157 140.000 0.000 1.000 N NA
 1783089 1783090 CHU_0003 CHU_0004     TRUE 0.945 2.000 0.000 1.000   NA
 1783090 1783091 CHU_0004 CHU_0005   dedA TRUE 0.983 10.000 0.048 NA   NA
 1783091 1783092 CHU_0005 CHU_0006 dedA aroE TRUE 0.747 77.000 0.052 NA   NA
 1783094 1783095 CHU_0008 CHU_0009 uvrB dnaQ FALSE 0.236 220.000 0.000 0.065 Y NA
 1783095 1783096 CHU_0009 CHU_0010 dnaQ   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783097 1783098 CHU_0011 CHU_0012     FALSE 0.397 60.000 0.000 NA N NA
 1783098 1783099 CHU_0012 CHU_0013   nagA TRUE 0.440 149.000 0.032 1.000 N NA
 1783100 1783101 CHU_0014 CHU_0015 mutL   TRUE 0.973 18.000 0.063 1.000   NA
 1783101 1783102 CHU_0015 CHU_0016     TRUE 0.996 17.000 0.817 0.069   NA
 1783102 1783103 CHU_0016 CHU_0017   paaG TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1783103 1783104 CHU_0017 CHU_0018 paaG cap TRUE 0.994 3.000 0.085 1.000   NA
 1783104 1783105 CHU_0018 CHU_0019 cap dut TRUE 0.975 14.000 0.042 1.000   NA
 1783105 1783106 CHU_0019 CHU_0020 dut rfbA TRUE 0.641 88.000 0.029 1.000 N NA
 1783106 1783107 CHU_0020 CHU_0021 rfbA   TRUE 0.975 -13.000 0.085 1.000   NA
 1783107 1783108 CHU_0021 CHU_0022     TRUE 0.924 -37.000 0.055 NA   NA
 1783108 1783109 CHU_0022 CHU_0023   yibP TRUE 0.966 -28.000 0.155 NA   NA
 1783109 1783110 CHU_0023 CHU_0024 yibP tatA TRUE 0.555 87.000 0.014 1.000 N NA
 1783110 1783111 CHU_0024 CHU_0025 tatA gatA TRUE 0.979 4.000 0.011 1.000 N NA
 1783111 1783112 CHU_0025 CHU_0026 gatA mltD TRUE 0.949 -10.000 0.018 1.000 N NA
 1783112 1783113 CHU_0026 CHU_0027 mltD maeB TRUE 0.780 52.000 0.022 1.000 N NA
 1783113 1783114 CHU_0027 CHU_0028 maeB ruvA TRUE 0.981 -3.000 0.033 1.000 N NA
 1783114 1783115 CHU_0028 CHU_0029 ruvA sprA TRUE 0.970 10.000 0.018 NA   NA
 1783115 1783116 CHU_0029 CHU_0030 sprA gcvH TRUE 0.848 61.000 0.072 NA   NA
 1783116 1783117 CHU_0030 CHU_0031 gcvH   TRUE 0.869 -34.000 0.020 NA   NA
 1783117 1783118 CHU_0031 CHU_0032   iap FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1783118 1783119 CHU_0032 CHU_0033 iap   FALSE 0.019 688.000 0.000 NA   NA
 1783119 1783120 CHU_0033 CHU_0034     FALSE 0.094 174.000 0.000 NA   NA
 1783120 1783121 CHU_0034 CHU_0035     TRUE 0.986 -10.000 0.182 NA   NA
 1783121 1783122 CHU_0035 CHU_0036   coiA FALSE 0.164 115.000 0.000 NA   NA
 1783122 1783123 CHU_0036 CHU_0037 coiA   TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783123 1783124 CHU_0037 CHU_0038     TRUE 0.997 5.000 0.400 1.000   NA
 1783124 1783125 CHU_0038 CHU_0039     TRUE 0.993 -13.000 0.714 NA   NA
 1783125 1783126 CHU_0039 CHU_0040     TRUE 0.992 -10.000 0.429 NA   NA
 1783126 1783127 CHU_0040 CHU_0041     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783127 1783128 CHU_0041 CHU_0042     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783128 1783129 CHU_0042 CHU_0043     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783133 1783134 CHU_0047 CHU_0048     FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1783136 1783137 CHU_0050 CHU_0051 pinQ tnpX FALSE 0.100 707.000 0.000 0.002 Y NA
 1783138 1783139 CHU_0052 CHU_0053 degQ dhaL TRUE 0.722 75.000 0.032 1.000 N NA
 1783139 1783140 CHU_0053 CHU_0054 dhaL atoC TRUE 0.716 76.000 0.032 1.000 N NA
 1783141 1783142 CHU_0055 CHU_0056     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1783142 1426502 CHU_0056 CHU_tAla01     FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1426502 1783143 CHU_tAla01 CHU_0057   nlpC TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783144 1783145 CHU_0058 CHU_0059 asnB gmd FALSE 0.267 94.000 0.000 1.000 N NA
 1783145 1783146 CHU_0059 CHU_0060 gmd wcaG TRUE 0.987 6.000 0.000 0.006 Y NA
 1783146 1783147 CHU_0060 CHU_0061 wcaG   TRUE 0.813 42.000 0.000 1.000 Y NA
 1783147 1783148 CHU_0061 CHU_0062     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783148 1783149 CHU_0062 CHU_0063     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783153 1783154 CHU_0067 CHU_0068 frvX adk FALSE 0.186 121.000 0.000 1.000 N NA
 1783154 1783155 CHU_0068 CHU_0069 adk yhbZ FALSE 0.340 195.000 0.040 1.000   NA
 1783155 1783156 CHU_0069 CHU_0070 yhbZ grpE TRUE 0.432 91.000 0.006 1.000   NA
 1783156 1783157 CHU_0070 CHU_0071 grpE dnaJ TRUE 0.999 4.000 0.168 0.011 Y NA
 1783159 1783160 CHU_0073 CHU_0074 thrA thrB TRUE 0.768 95.000 0.023 1.000 Y NA
 1783160 1783161 CHU_0074 CHU_0075 thrB thrC TRUE 0.915 102.000 0.233 1.000 Y NA
 1783162 1783163 CHU_0076 CHU_0077     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1783163 1783164 CHU_0077 CHU_0078     TRUE 0.683 27.000 0.000 NA   NA
 1783166 1783167 CHU_0080 CHU_0081 rfaQ   TRUE 0.966 17.000 0.037 1.000 N NA
 1783168 1783169 CHU_0082 CHU_0083   pyrR FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1783169 1783170 CHU_0083 CHU_0084 pyrR pyrB TRUE 0.993 9.000 0.034 1.000 Y NA
 1783172 1783173 CHU_0086 CHU_0087 cmk ispH TRUE 0.895 48.000 0.070 1.000 N NA
 1783173 1783174 CHU_0087 CHU_0088 ispH   TRUE 0.747 49.000 0.016 NA   NA
 1783174 1783175 CHU_0088 CHU_0089     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1783175 1783176 CHU_0089 CHU_0090     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1783176 1783177 CHU_0090 CHU_0091     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1783177 1783178 CHU_0091 CHU_0092     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1783179 1783180 CHU_0093 CHU_0094 trxA dnaE TRUE 0.822 61.000 0.047 1.000   NA
 1783180 1783181 CHU_0094 CHU_0095 dnaE   FALSE 0.136 156.000 0.000 1.000   NA
 1783182 1783183 CHU_0096 CHU_0097 rpmH rnpA TRUE 0.977 45.000 0.787 1.000   NA
 1783183 1783184 CHU_0097 CHU_0098 rnpA prc TRUE 0.830 46.000 0.029 1.000 N NA
 1783184 1783185 CHU_0098 CHU_0099 prc   TRUE 0.597 83.000 0.009 0.037 N NA
 1783185 1783186 CHU_0099 CHU_0100     TRUE 0.936 15.000 0.010 NA   NA
 1783186 1426547 CHU_0100 CHU_r16S01     FALSE 0.019 665.000 0.000 NA   NA
 1426547 1426548 CHU_r16S01 CHU_r23S01     FALSE 0.023 428.000 0.000 NA   NA
 1426548 1426549 CHU_r23S01 CHU_r5S01     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1783188 1783189 CHU_0103 CHU_0104 barA   TRUE 0.983 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1783190 1783191 CHU_0105 CHU_0106   yvqE TRUE 0.985 7.000 0.000 0.029 Y NA
 1783193 1783194 CHU_0108 CHU_0109 sodA   TRUE 0.648 56.000 0.007 1.000 N NA
 1783194 1783195 CHU_0109 CHU_0110     TRUE 0.970 2.000 0.007 NA   NA
 1783196 1783197 CHU_0111 CHU_0112 aspS   FALSE 0.109 177.000 0.000 1.000 N NA
 1783198 1783199 CHU_0113 CHU_0114 secDF   FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1783199 1783200 CHU_0114 CHU_0115   udk TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783200 1783201 CHU_0115 CHU_0116 udk yggV TRUE 0.984 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 1783202 1783203 CHU_0117 CHU_0118 rpsP rimM TRUE 0.996 19.000 0.342 0.020 Y NA
 1783203 1783204 CHU_0118 CHU_0119 rimM trmD TRUE 0.998 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 1783204 1783205 CHU_0119 CHU_0120 trmD rplS TRUE 0.956 94.000 0.567 1.000 Y NA
 1783206 1426570 CHU_0121 CHU_tPhe01     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1783207 1783208 CHU_0122 CHU_0123 ydbK ykgE TRUE 0.510 95.000 0.000 NA Y NA
 1783208 1783209 CHU_0123 CHU_0124 ykgE   TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783209 1783210 CHU_0124 CHU_0125   pal FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1783210 1783211 CHU_0125 CHU_0126 pal purM FALSE 0.298 86.000 0.000 1.000   NA
 1783211 1783212 CHU_0126 CHU_0127 purM dapF TRUE 0.601 38.000 0.000 1.000 N NA
 1783212 1783213 CHU_0127 CHU_0128 dapF secA FALSE 0.354 109.000 0.007 1.000 N NA
 1783213 1783214 CHU_0128 CHU_0129 secA   TRUE 0.938 -10.000 0.015 NA   NA
 1783214 1783215 CHU_0129 CHU_0130   ammA TRUE 0.994 2.000 0.100 NA   NA
 1783215 1783216 CHU_0130 CHU_0131 ammA   TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783217 1783218 CHU_0132 CHU_0133     FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1783218 1783219 CHU_0133 CHU_0134     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783219 1783220 CHU_0134 CHU_0135   tolA FALSE 0.140 134.000 0.000 NA   NA
 1783220 1783221 CHU_0135 CHU_0136 tolA metX FALSE 0.309 76.000 0.000 NA N NA
 1783223 1783224 CHU_0138 CHU_0139   asd FALSE 0.155 123.000 0.000 NA   NA
 1783225 1783226 CHU_0140 CHU_0141     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1783226 1783227 CHU_0141 CHU_0142     TRUE 0.962 10.000 0.011 NA N NA
 1783227 1783228 CHU_0142 CHU_0143   rluB TRUE 0.921 -22.000 0.031 NA N NA
 1783228 1783229 CHU_0143 CHU_0144 rluB   TRUE 0.561 42.000 0.000 1.000   NA
 1783229 1783230 CHU_0144 CHU_0145     FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783232 1426597 CHU_0147 CHU_tGly01 mutS   FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1426597 1426598 CHU_tGly01 CHU_tLeu01     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1426598 1783233 CHU_tLeu01 CHU_0148   cheY FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 1783233 1783234 CHU_0148 CHU_0149 cheY bphO TRUE 0.917 10.000 0.000 1.000 N NA
 1783234 1783235 CHU_0149 CHU_0150 bphO barA TRUE 0.987 13.000 0.103 1.000 N NA
 1783235 1426602 CHU_0150 CHU_r16S02 barA   FALSE 0.019 663.000 0.000 NA   NA
 1426602 1426603 CHU_r16S02 CHU_tIle01     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1426603 1426604 CHU_tIle01 CHU_tAla02     FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1426604 1426605 CHU_tAla02 CHU_r23S02     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1426605 1426606 CHU_r23S02 CHU_r5S02     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1426606 1783236 CHU_r5S02 CHU_0152     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1783236 1783237 CHU_0152 CHU_0153     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783238 1783239 CHU_0154 CHU_0155     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1783240 1783241 CHU_0156 CHU_0157   mltD FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1783241 1783242 CHU_0157 CHU_0158 mltD uvrA TRUE 0.414 89.000 0.006 NA N NA
 1783242 1783243 CHU_0158 CHU_0159 uvrA   FALSE 0.151 126.000 0.000 NA   NA
 1783243 1783244 CHU_0159 CHU_0160     FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1783244 1783245 CHU_0160 CHU_0161   cusA FALSE 0.311 75.000 0.000 NA   NA
 1783245 1783246 CHU_0161 CHU_0162 cusA   TRUE 0.997 -3.000 0.636 1.000 N NA
 1783247 1783248 CHU_0163 CHU_0164 pepN   TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783248 1783249 CHU_0164 CHU_0165   hemN FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1783250 1783251 CHU_0166 CHU_0167     TRUE 0.904 26.000 0.000 1.000 Y NA
 1783251 1783252 CHU_0167 CHU_0168     TRUE 0.742 -18.000 0.000 NA   NA
 1783252 1783253 CHU_0168 CHU_0169   hemD TRUE 0.831 32.000 0.014 NA   NA
 1783253 1783254 CHU_0169 CHU_0170 hemD   TRUE 0.641 126.000 0.089 NA   NA
 1783254 1783255 CHU_0170 CHU_0171   gldK TRUE 0.641 175.000 0.222 NA   NA
 1783255 1783256 CHU_0171 CHU_0172 gldK gldL TRUE 0.831 73.000 0.094 NA   NA
 1783256 1783257 CHU_0172 CHU_0173 gldL gldM TRUE 0.968 58.000 0.955 NA   NA
 1783257 1783258 CHU_0173 CHU_0174 gldM   TRUE 0.951 18.000 0.030 NA   NA
 1783259 1783260 CHU_0175 CHU_0176 uvrC   TRUE 0.971 6.000 0.007 1.000 N NA
 1783260 1783261 CHU_0176 CHU_0177   sprE TRUE 0.970 35.000 0.300 1.000   NA
 1783262 1783263 CHU_0178 CHU_0179   atpB FALSE 0.031 318.000 0.000 NA   NA
 1783263 1783264 CHU_0179 CHU_0180 atpB atpE TRUE 0.981 40.000 0.628 0.004   NA
 1783264 1783265 CHU_0180 CHU_0181 atpE atpF TRUE 0.938 78.000 0.402 0.004   NA
 1783265 1783266 CHU_0181 CHU_0182 atpF atpH TRUE 0.998 11.000 0.222 0.004 Y NA
 1783266 1783267 CHU_0182 CHU_0183 atpH atpA TRUE 0.999 13.000 0.864 0.004 Y NA
 1783267 1783268 CHU_0183 CHU_0184 atpA atpG TRUE 1.000 4.000 0.846 0.004 Y NA
 1783268 1783269 CHU_0184 CHU_0185 atpG   FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1783269 1783270 CHU_0185 CHU_0186   sun TRUE 0.564 -57.000 0.000 NA   NA
 1783270 1783271 CHU_0186 CHU_0187 sun ompA FALSE 0.186 106.000 0.000 NA N NA
 1783272 1783273 CHU_0188 CHU_0189     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783273 1783274 CHU_0189 CHU_0190   moxR FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783274 1783275 CHU_0190 CHU_0191 moxR surA TRUE 0.997 0.000 0.360 1.000   NA
 1783275 1783276 CHU_0191 CHU_0192 surA   TRUE 0.844 128.000 0.080 0.006 Y NA
 1783276 1783277 CHU_0192 CHU_0193     TRUE 0.815 126.000 0.400 NA N NA
 1783277 1783278 CHU_0193 CHU_0194   spoIIAA TRUE 0.999 1.000 0.600 NA Y NA
 1783278 1783279 CHU_0194 CHU_0195 spoIIAA rsbU TRUE 0.987 44.000 0.615 1.000 Y NA
 1783279 1783280 CHU_0195 CHU_0196 rsbU guaB TRUE 0.795 21.000 0.000 1.000 N NA
 1783281 1783282 CHU_0197 CHU_0198   ybiL FALSE 0.123 148.000 0.000 NA N NA
 1783282 1783283 CHU_0198 CHU_0199 ybiL   FALSE 0.033 312.000 0.000 NA   NA
 1783283 1783284 CHU_0199 CHU_0200     TRUE 0.609 -40.000 0.000 NA   NA
 1783285 1783286 CHU_0201 CHU_0202   hemG TRUE 0.490 52.000 0.000 1.000 N NA
 1783287 1783288 CHU_0203 CHU_0204 ribD   TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1783288 1783289 CHU_0204 CHU_0205   yeeZ TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1426664 1783293 CHU_tVal01 CHU_0209     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783293 1783294 CHU_0209 CHU_0210     TRUE 0.540 -69.000 0.000 NA   NA
 1783294 1783295 CHU_0210 CHU_0211   atoS FALSE 0.023 680.000 0.000 1.000   NA
 1783295 1783296 CHU_0211 CHU_0212 atoS   TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1783299 1783300 CHU_0215 CHU_0216     FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1783301 1783302 CHU_0217 CHU_0218 ompA ybiT FALSE 0.054 253.000 0.000 1.000   NA
 1783305 1783306 CHU_0221 CHU_0223   atoS FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1783308 1783309 CHU_0224 CHU_0225     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783309 1783310 CHU_0225 CHU_0226     FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1783310 1783311 CHU_0226 CHU_0227     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783311 1783312 CHU_0227 CHU_0228     TRUE 0.998 2.000 0.748 NA   NA
 1783314 1783315 CHU_0230 CHU_0231     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 1783317 1783318 CHU_0233 CHU_0234 hsp20   FALSE 0.029 341.000 0.000 NA   NA
 1783320 1783321 CHU_0236 CHU_0237 tpn   FALSE 0.021 485.000 0.000 NA   NA
 1783321 1783322 CHU_0237 CHU_0238     FALSE 0.025 387.000 0.000 NA   NA
 1783323 1783324 CHU_0239 CHU_0240 thiS thiC TRUE 0.995 4.000 0.029 1.000 Y NA
 1783324 1783325 CHU_0240 CHU_0241 thiC thiD FALSE 0.382 176.000 0.004 1.000 Y NA
 1783325 1783326 CHU_0241 CHU_0242 thiD thiE TRUE 0.997 7.000 0.094 1.000 Y NA
 1783326 1783327 CHU_0242 CHU_0243 thiE thiG TRUE 0.727 163.000 0.044 0.004 Y NA
 1783327 1783328 CHU_0243 CHU_0244 thiG thiH TRUE 0.999 3.000 0.277 0.004 Y NA
 1783328 1783329 CHU_0244 CHU_0245 thiH thiF FALSE 0.144 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1783331 1783332 CHU_0247 CHU_0248     FALSE 0.049 241.000 0.000 NA   NA
 1783335 1783336 CHU_0251 CHU_0252 gap ycfQ FALSE 0.208 108.000 0.000 1.000   NA
 1783336 1783337 CHU_0252 CHU_0253 ycfQ   FALSE 0.119 168.000 0.000 1.000   NA
 1783337 1783338 CHU_0253 CHU_0254   lytT FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000   NA
 1783338 1783339 CHU_0254 CHU_0255 lytT ypdA TRUE 0.969 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 1783339 1783340 CHU_0255 CHU_0256 ypdA   FALSE 0.144 149.000 0.000 1.000 N NA
 1783340 1783341 CHU_0256 CHU_0257     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1783341 1783342 CHU_0257 CHU_0258     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783342 1783343 CHU_0258 CHU_0259     TRUE 0.978 48.000 1.000 1.000   NA
 1783343 1783344 CHU_0259 CHU_0260     FALSE 0.041 268.000 0.000 NA   NA
 1783344 1783345 CHU_0260 CHU_0261     TRUE 0.966 51.000 0.667 NA   NA
 1783345 1783346 CHU_0261 CHU_0262     TRUE 0.865 121.000 0.667 NA   NA
 1783346 1783347 CHU_0262 CHU_0263     FALSE 0.026 480.000 0.000 1.000   NA
 1783348 1783349 CHU_0264 CHU_0265     TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783349 1783350 CHU_0265 CHU_0266   yajR FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1783351 1783352 CHU_0267 CHU_0268     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783352 1783353 CHU_0268 CHU_0269     FALSE 0.062 209.000 0.000 NA   NA
 1783354 1783355 CHU_0270 CHU_0271     FALSE 0.103 211.000 0.000 0.024   NA
 1783358 1783359 CHU_0275 CHU_0276     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783359 1783360 CHU_0276 CHU_0277     TRUE 0.518 -99.000 0.000 NA   NA
 1783360 1783361 CHU_0277 CHU_0278     FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1783361 1783362 CHU_0278 CHU_0279   ydjH FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1783362 1783363 CHU_0279 CHU_0280 ydjH   FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783363 1783364 CHU_0280 CHU_0281     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783365 1783366 CHU_0282 CHU_0283     TRUE 0.760 157.000 0.400 NA   NA
 1783366 1783367 CHU_0283 CHU_0284     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1783367 1783368 CHU_0284 CHU_0285     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783369 1783370 CHU_0286 CHU_0287     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783370 1783371 CHU_0287 CHU_0288     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783371 1783372 CHU_0288 CHU_0289     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783372 1783373 CHU_0289 CHU_0290     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1783373 1783374 CHU_0290 CHU_0291   gldH TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783374 1783375 CHU_0291 CHU_0292 gldH   TRUE 0.995 2.000 0.138 NA   NA
 1783375 1783376 CHU_0292 CHU_0293     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1783376 1783377 CHU_0293 CHU_0294     FALSE 0.093 175.000 0.000 NA   NA
 1783377 1783378 CHU_0294 CHU_0295     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1783378 1783379 CHU_0295 CHU_0296   purD TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783379 1783380 CHU_0296 CHU_0297 purD recQ FALSE 0.297 143.000 0.008 1.000 N NA
 1783381 1783382 CHU_0298 CHU_0299     TRUE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 1783382 1783383 CHU_0299 CHU_0300   manC FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1783384 1783385 CHU_0301 CHU_0302 gapN   TRUE 0.713 28.000 0.000 1.000 N NA
 1783385 1783386 CHU_0302 CHU_0303   yadF FALSE 0.054 256.000 0.000 1.000 N NA
 1783386 1783387 CHU_0303 CHU_0304 yadF   FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1783387 1783388 CHU_0304 CHU_0305     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783388 1783389 CHU_0305 CHU_0306   trmH FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1783389 1783390 CHU_0306 CHU_0307 trmH   FALSE 0.158 119.000 0.000 NA   NA
 1783391 1783392 CHU_0308 CHU_0309 glgP   FALSE 0.067 203.000 0.000 NA   NA
 1783392 1783393 CHU_0309 CHU_0310     TRUE 0.481 96.000 0.015 NA   NA
 1783393 1783394 CHU_0310 CHU_0311     TRUE 0.979 21.000 0.171 NA   NA
 1783394 1783395 CHU_0311 CHU_0312   fecA TRUE 0.994 -7.000 0.448 1.000   NA
 1783396 1783397 CHU_0313 CHU_0314 rsaD   TRUE 0.683 27.000 0.000 NA   NA
 1783397 1783398 CHU_0314 CHU_0315   yhfE FALSE 0.022 463.000 0.000 NA   NA
 1783399 1783400 CHU_0316 CHU_0317 ppx atoS FALSE 0.062 236.000 0.000 1.000 N NA
 1783401 1783402 CHU_0318 CHU_0319   muiA TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1783403 1783404 CHU_0320 CHU_0321 ybiC ygcC FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783404 1783405 CHU_0321 CHU_0323 ygcC   FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1783405 1783406 CHU_0323 CHU_0324   dnaJ FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783406 1783407 CHU_0324 CHU_0325 dnaJ sotB TRUE 0.832 18.000 0.000 1.000   NA
 1783407 1783408 CHU_0325 CHU_0326 sotB menA TRUE 0.960 5.000 0.000 0.065 N NA
 1783408 1783409 CHU_0326 CHU_0327 menA fabG TRUE 0.941 6.000 0.000 1.000 N NA
 1783409 1783410 CHU_0327 CHU_0328 fabG   FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1783410 1783411 CHU_0328 CHU_0329     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783411 1783412 CHU_0329 CHU_0330     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1783413 1783414 CHU_0331 CHU_0332     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783414 1783415 CHU_0332 CHU_0333   hemA TRUE 0.585 -46.000 0.000 NA   NA
 1783418 1783419 CHU_0336 CHU_0337 atpD atpC TRUE 0.970 70.000 0.837 0.004   NA
 1783421 1783422 CHU_0339 CHU_0340     FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1783423 1783424 CHU_0341 CHU_0342     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783424 1783425 CHU_0342 CHU_0343     TRUE 0.543 -66.000 0.000 NA   NA
 1783426 1783427 CHU_0344 CHU_0345     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783427 1783428 CHU_0345 CHU_0346   rpoE FALSE 0.026 383.000 0.000 NA   NA
 1783428 1783429 CHU_0346 CHU_0347 rpoE   TRUE 0.998 7.000 0.750 NA   NA
 1783429 1783430 CHU_0347 CHU_0348     FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1783430 1783431 CHU_0348 CHU_0349     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1783431 1783432 CHU_0349 CHU_0350     TRUE 0.974 -37.000 0.333 NA   NA
 1783432 1783433 CHU_0350 CHU_0351     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1783436 1783437 CHU_0354 CHU_0355 ch1I lpcA TRUE 0.950 10.000 0.004 1.000 N NA
 1783437 1783438 CHU_0355 CHU_0356 lpcA   FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1783438 1783439 CHU_0356 CHU_0357   psd FALSE 0.175 109.000 0.000 NA   NA
 1783439 1783440 CHU_0357 CHU_0358 psd cdsA TRUE 0.736 98.000 0.052 0.002   NA
 1783440 1783441 CHU_0358 CHU_0359 cdsA   TRUE 0.907 -7.000 0.003 NA   NA
 1783442 1783443 CHU_0360 CHU_0361 yhdG   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1783443 1783444 CHU_0361 CHU_0362   zraR FALSE 0.119 150.000 0.000 NA   NA
 1783448 1783449 CHU_0366 CHU_0367 pdhR   TRUE 0.444 60.000 0.000 1.000 N NA
 1783450 1783451 CHU_0368 CHU_0369 gltP aroC TRUE 0.960 -7.000 0.018 1.000 N NA
 1783451 1783452 CHU_0369 CHU_0370 aroC   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783454 1783455 CHU_0372 CHU_0373 yjeS ruvB TRUE 0.981 4.000 0.012 1.000 N NA
 1783456 1783457 CHU_0374 CHU_0375     TRUE 0.996 6.000 0.273 1.000   NA
 1783458 1783459 CHU_0376 CHU_0377     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783459 1783460 CHU_0377 CHU_0378     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783460 1783461 CHU_0378 CHU_0379   tpn FALSE 0.018 916.000 0.000 NA   NA
 1783461 1783462 CHU_0379 CHU_0380 tpn   FALSE 0.018 1057.000 0.000 NA   NA
 1783462 1783463 CHU_0380 CHU_0381     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783465 1783466 CHU_0383 CHU_0384   fabF TRUE 0.996 4.000 0.190 NA   NA
 1783466 1783467 CHU_0384 CHU_0385 fabF dltC TRUE 0.998 4.000 0.476 1.000   NA
 1783467 1783468 CHU_0385 CHU_0386 dltC   TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1783468 1783469 CHU_0386 CHU_0387   yadG TRUE 0.981 2.000 0.000 NA Y NA
 1783469 1783470 CHU_0387 CHU_0388 yadG   TRUE 0.989 -12.000 0.320 NA   NA
 1783470 1783471 CHU_0388 CHU_0389     TRUE 0.986 -34.000 0.800 NA   NA
 1783471 1783472 CHU_0389 CHU_0390   fabH TRUE 0.967 40.000 0.438 NA   NA
 1783472 1783473 CHU_0390 CHU_0391 fabH   TRUE 0.998 6.000 0.656 NA   NA
 1783473 1783474 CHU_0391 CHU_0392     TRUE 0.989 10.000 0.094 NA   NA
 1783474 1783475 CHU_0392 CHU_0393     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1783476 1783477 CHU_0394 CHU_0395     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783478 1783479 CHU_0396 CHU_0397 ycaK   TRUE 0.795 74.000 0.068 NA   NA
 1783479 1783480 CHU_0397 CHU_0398     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783481 1783482 CHU_0399 CHU_0400   otsA TRUE 0.993 19.000 0.195 1.000 Y NA
 1783483 1783484 CHU_0401 CHU_0402   folA TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783484 1783485 CHU_0402 CHU_0403 folA   TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783485 1783486 CHU_0403 CHU_0404     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1783486 1783487 CHU_0404 CHU_0405     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783487 1783488 CHU_0405 CHU_0406     TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1783488 1783489 CHU_0406 CHU_0407     TRUE 0.989 -27.000 1.000 NA   NA
 1783489 1783490 CHU_0407 CHU_0408     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1783490 1783491 CHU_0408 CHU_0409     FALSE 0.304 85.000 0.000 1.000   NA
 1783492 1783493 CHU_0410 CHU_0411     FALSE 0.110 160.000 0.000 NA   NA
 1783495 1783496 CHU_0413 CHU_0414   blc FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1783496 1783497 CHU_0414 CHU_0415 blc   TRUE 0.823 40.000 0.000 1.000 Y NA
 1783497 1783498 CHU_0415 CHU_0416   yiaD TRUE 0.503 101.000 0.000 1.000 Y NA
 1783499 1783500 CHU_0417 CHU_0418     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1783500 1783501 CHU_0418 CHU_0419     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1783503 1783504 CHU_0421 CHU_0422     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783504 1783505 CHU_0422 CHU_0424     FALSE 0.305 76.000 0.000 NA   NA
 1783507 1783508 CHU_0425 CHU_0427     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783509 1783510 CHU_0428 CHU_0429 yhbW   FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783510 1783511 CHU_0429 CHU_0430     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783511 1783512 CHU_0430 CHU_0431     TRUE 0.585 -46.000 0.000 NA   NA
 1783512 1783513 CHU_0431 CHU_0432   damX FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1783513 1783514 CHU_0432 CHU_0433 damX   FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1783515 1783516 CHU_0434 CHU_0435     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783516 1783517 CHU_0435 CHU_0436     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1783517 1783518 CHU_0436 CHU_0437     FALSE 0.204 99.000 0.000 NA   NA
 1783518 1783519 CHU_0437 CHU_0439     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1783526 1783527 CHU_0445 CHU_0446     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1783527 1783528 CHU_0446 CHU_0447     FALSE 0.026 380.000 0.000 NA   NA
 1783528 1783529 CHU_0447 CHU_0448     TRUE 0.484 46.000 0.000 NA   NA
 1783532 1783533 CHU_0451 CHU_0452 nrdA nrdB TRUE 0.976 60.000 0.250 0.001 Y NA
 1783534 1783535 CHU_0453 CHU_0454 rplU rpmA TRUE 0.995 28.000 0.667 0.019 Y NA
 1783535 1783536 CHU_0454 CHU_0455 rpmA   FALSE 0.187 157.000 0.000 0.019   NA
 1783536 1783537 CHU_0455 CHU_0456     FALSE 0.263 94.000 0.000 1.000   NA
 1783538 1783539 CHU_0457 CHU_0458     TRUE 0.985 -3.000 0.056 NA   NA
 1783541 1783542 CHU_0460 CHU_0461   ispA TRUE 0.945 28.000 0.058 1.000   NA
 1783542 1783543 CHU_0461 CHU_0462 ispA rnr TRUE 0.797 45.000 0.018 1.000 N NA
 1783543 1783544 CHU_0462 CHU_0463 rnr yliA TRUE 0.926 9.000 0.000 1.000   NA
 1783544 1783545 CHU_0463 CHU_0464 yliA   FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1783545 1783546 CHU_0464 CHU_0466   lipB TRUE 0.683 61.000 0.016 NA   NA
 1783547 1783548 CHU_0465 CHU_0467   manA FALSE 0.377 72.000 0.000 1.000 N NA
 1783549 1783550 CHU_0468 CHU_0469     FALSE 0.073 196.000 0.000 NA   NA
 1783550 1783551 CHU_0469 CHU_0470   nagZ FALSE 0.165 116.000 0.000 NA N NA
 1783551 1783552 CHU_0470 CHU_0471 nagZ   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1783552 1783553 CHU_0471 CHU_0472   pgi FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1783553 1783554 CHU_0472 CHU_0473 pgi   TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783555 1783556 CHU_0474 CHU_0475     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1783556 1783557 CHU_0475 CHU_0476     TRUE 0.513 -132.000 0.000 NA   NA
 1783558 1783559 CHU_0477 CHU_0478 htpG   FALSE 0.048 244.000 0.000 NA   NA
 1783559 1783560 CHU_0478 CHU_0479     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783560 1783561 CHU_0479 CHU_0480     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1783561 1783562 CHU_0480 CHU_0481     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1783562 1783563 CHU_0481 CHU_0482   ompA FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783563 1783564 CHU_0482 CHU_0484 ompA   FALSE 0.070 199.000 0.000 NA   NA
 1783565 1783566 CHU_0483 CHU_0485 truA natA TRUE 0.876 -7.000 0.000 1.000   NA
 1783566 1783567 CHU_0485 CHU_0486 natA natB TRUE 0.996 -3.000 0.619 NA   NA
 1783568 1783569 CHU_0487 CHU_0488   pyrR TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783570 1783571 CHU_0489 CHU_0490 rpmE   TRUE 0.814 72.000 0.063 1.000   NA
 1783571 1783572 CHU_0490 CHU_0491     TRUE 0.983 2.000 0.018 1.000   NA
 1783572 1783573 CHU_0491 CHU_0492   hemC TRUE 0.958 0.000 0.002 1.000 N NA
 1783573 1783574 CHU_0492 CHU_0493 hemC ppiC FALSE 0.073 342.000 0.007 1.000 N NA
 1783574 1783575 CHU_0493 CHU_0494 ppiC rfbD TRUE 0.463 246.000 0.179 1.000 N NA
 1783575 1783576 CHU_0494 CHU_0495 rfbD   FALSE 0.028 434.000 0.000 1.000 N NA
 1783576 1783577 CHU_0495 CHU_0496     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783577 1783578 CHU_0496 CHU_0497     FALSE 0.024 413.000 0.000 NA   NA
 1783580 1783581 CHU_0499 CHU_0500     FALSE 0.040 269.000 0.000 NA   NA
 1783581 1783582 CHU_0500 CHU_0501     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1783582 1783583 CHU_0501 CHU_0502     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1783586 1783587 CHU_0506 CHU_0507 rsaD   TRUE 0.944 10.000 0.005 NA   NA
 1783588 1783589 CHU_0508 CHU_0509   nuoI TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1783589 1783590 CHU_0509 CHU_0510 nuoI hycG TRUE 0.992 24.000 0.168 0.005 Y NA
 1783590 1783591 CHU_0510 CHU_0511 hycG nuoC TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.005 Y NA
 1783591 1783592 CHU_0511 CHU_0512 nuoC nuoD TRUE 0.990 44.000 0.618 0.011 Y NA
 1783592 1783593 CHU_0512 CHU_0513 nuoD   TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783593 1783594 CHU_0513 CHU_0514     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1783596 1783597 CHU_0516 CHU_0517     TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1783597 1783598 CHU_0517 CHU_0519     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1783598 1783599 CHU_0519 CHU_0520     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783599 1783600 CHU_0520 CHU_0521     TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1783600 1783601 CHU_0521 CHU_0522     FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1783601 1783602 CHU_0522 CHU_0523   ccpA TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783602 1783603 CHU_0523 CHU_0524 ccpA   TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783603 1783604 CHU_0524 CHU_0525     TRUE 0.659 -30.000 0.000 NA   NA
 1783604 1783605 CHU_0525 CHU_0526     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 1783606 1783607 CHU_0527 CHU_0528     FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1783607 1783608 CHU_0528 CHU_0529     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783608 1783609 CHU_0529 CHU_0530     FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1783609 1783610 CHU_0530 CHU_0531     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1783611 1783612 CHU_0532 CHU_0533     FALSE 0.046 250.000 0.000 NA   NA
 1783612 1783613 CHU_0533 CHU_0534     FALSE 0.281 81.000 0.000 NA   NA
 1783613 1783614 CHU_0534 CHU_0535     FALSE 0.035 296.000 0.000 NA   NA
 1783614 1783615 CHU_0535 CHU_0536     FALSE 0.030 334.000 0.000 NA   NA
 1783615 1783616 CHU_0536 CHU_0537     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 1783616 1783617 CHU_0537 CHU_0538   acrB TRUE 0.969 53.000 0.750 1.000 N NA
 1783617 1783618 CHU_0538 CHU_0539 acrB cusC TRUE 0.998 7.000 0.500 0.027 N NA
 1783618 1783619 CHU_0539 CHU_0540 cusC   FALSE 0.276 92.000 0.000 1.000 N NA
 1783619 1783620 CHU_0540 CHU_0541     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1783620 1783621 CHU_0541 CHU_0542   ptpA TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1783621 1783622 CHU_0542 CHU_0543 ptpA   FALSE 0.136 156.000 0.000 1.000   NA
 1783622 1783623 CHU_0543 CHU_0544     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1783623 1783624 CHU_0544 CHU_0545     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1783624 1783625 CHU_0545 CHU_0546   ragA FALSE 0.051 264.000 0.000 1.000   NA
 1783625 1783626 CHU_0546 CHU_0547 ragA   TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783626 1783627 CHU_0547 CHU_0548     FALSE 0.058 217.000 0.000 NA   NA
 1783627 1783628 CHU_0548 CHU_0549     TRUE 0.983 37.000 1.000 NA   NA
 1783628 1783629 CHU_0549 CHU_0550     TRUE 0.990 -7.000 0.222 NA   NA
 1783629 1783630 CHU_0550 CHU_0551     TRUE 0.959 36.000 0.222 NA   NA
 1783630 1783631 CHU_0551 CHU_0552     TRUE 0.978 24.000 0.222 NA   NA
 1783631 1783632 CHU_0552 CHU_0553   ragA FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1783632 1783633 CHU_0553 CHU_0554 ragA   TRUE 0.992 20.000 0.667 NA   NA
 1783633 1783634 CHU_0554 CHU_0555     TRUE 0.978 37.000 0.667 NA   NA
 1783634 1783635 CHU_0555 CHU_0556     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783635 1783636 CHU_0556 CHU_0557     TRUE 0.994 19.000 1.000 NA   NA
 1783636 1783637 CHU_0557 CHU_0558     TRUE 0.786 19.000 0.000 NA   NA
 1783637 1783638 CHU_0558 CHU_0559   cyc TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1783638 1783639 CHU_0559 CHU_0560 cyc soxD TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.013   NA
 1783639 1783640 CHU_0560 CHU_0561 soxD soxC TRUE 0.997 -3.000 0.588 0.045   NA
 1783640 1783641 CHU_0561 CHU_0562 soxC pys TRUE 0.910 40.000 0.045 0.039   NA
 1783641 1783642 CHU_0562 CHU_0563 pys   TRUE 0.989 9.000 0.068 NA   NA
 1783642 1783643 CHU_0563 CHU_0564     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783643 1783644 CHU_0564 CHU_0565   bcp TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783644 1783645 CHU_0565 CHU_0566 bcp   FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1783646 1783647 CHU_0567 CHU_0568   tpn FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783647 1783648 CHU_0568 CHU_0569 tpn   FALSE 0.025 386.000 0.000 NA   NA
 1783651 1783652 CHU_0572 CHU_0573     FALSE 0.152 144.000 0.000 1.000 N NA
 1783653 1783654 CHU_0574 CHU_0575     FALSE 0.065 206.000 0.000 NA   NA
 1783654 1783655 CHU_0575 CHU_0576   pepN TRUE 0.653 29.000 0.000 NA   NA
 1783656 1783657 CHU_0577 CHU_0578 pyrH frr TRUE 0.966 51.000 0.626 1.000 N NA
 1783659 1783660 CHU_0579 CHU_0581   tufB FALSE 0.101 167.000 0.000 NA   NA
 1783660 1783661 CHU_0581 CHU_0582 tufB   FALSE 0.236 92.000 0.000 NA   NA
 1783661 1783662 CHU_0582 CHU_0583     FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 1783662 1783663 CHU_0583 CHU_0584     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1783664 1783665 CHU_0585 CHU_0586     FALSE 0.025 394.000 0.000 NA   NA
 1783665 1783666 CHU_0586 CHU_0587   chuA TRUE 0.983 9.000 0.036 NA   NA
 1783669 1783670 CHU_0590 CHU_0591 iscS   TRUE 0.958 -22.000 0.070 1.000 N NA
 1783670 1783671 CHU_0591 CHU_0592   alcA TRUE 0.997 2.000 0.070 NA Y NA
 1783671 1783672 CHU_0592 CHU_0593 alcA   TRUE 0.992 0.000 0.095 NA   NA
 1783672 1783673 CHU_0593 CHU_0594     TRUE 0.515 -118.000 0.000 NA   NA
 1783674 1783675 CHU_0595 CHU_0596 ompA   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1783675 1783676 CHU_0596 CHU_0597     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1783676 1783677 CHU_0597 CHU_0598   nadD FALSE 0.022 463.000 0.000 NA   NA
 1783677 1783678 CHU_0598 CHU_0599 nadD gmk TRUE 0.833 59.000 0.050 1.000 N NA
 1783678 1783679 CHU_0599 CHU_0600 gmk   TRUE 0.968 6.000 0.008 NA   NA
 1783679 1783680 CHU_0600 CHU_0601   rpoE TRUE 0.992 12.000 0.244 NA   NA
 1783681 1783682 CHU_0602 CHU_0603     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1783683 1783684 CHU_0604 CHU_0605 wcaL lgtF TRUE 0.995 4.000 0.040 NA Y NA
 1783684 1783685 CHU_0605 CHU_0606 lgtF   TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 1783685 1783686 CHU_0606 CHU_0607     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1783686 1783687 CHU_0607 CHU_0608     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1783687 1783688 CHU_0608 CHU_0609     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1783688 1783689 CHU_0609 CHU_0610   sahH TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1783689 1783690 CHU_0610 CHU_0611 sahH birA FALSE 0.176 317.000 0.005 1.000 Y NA
 1783691 1783692 CHU_0612 CHU_0613   ftsH TRUE 0.954 27.000 0.084 NA   NA
 1783692 1783693 CHU_0613 CHU_0614 ftsH   TRUE 0.993 9.000 0.145 1.000   NA
 1783693 1783694 CHU_0614 CHU_0615   lpxH TRUE 0.905 -16.000 0.010 1.000   NA
 1783694 1783695 CHU_0615 CHU_0616 lpxH   TRUE 0.882 -33.000 0.023 NA   NA
 1783695 1783696 CHU_0616 CHU_0617     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783696 1783697 CHU_0617 CHU_0618     TRUE 0.568 -55.000 0.000 NA   NA
 1783699 1427072 CHU_0620 CHU_tArg01     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1427072 1783700 CHU_tArg01 CHU_0621     FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783700 1783701 CHU_0621 CHU_0622     FALSE 0.259 86.000 0.000 NA   NA
 1783701 1783702 CHU_0622 CHU_0623     FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 1783702 1783703 CHU_0623 CHU_0624     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783703 1783704 CHU_0624 CHU_0625     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1783704 1783705 CHU_0625 CHU_0626     FALSE 0.046 251.000 0.000 NA   NA
 1783705 1783706 CHU_0626 CHU_0627   miaE FALSE 0.171 130.000 0.000 1.000   NA
 1783706 1783707 CHU_0627 CHU_0628 miaE   FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1783707 1783708 CHU_0628 CHU_0629     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 1783709 1783710 CHU_0630 CHU_0632   prc TRUE 0.845 -40.000 0.017 NA   NA
 1783711 1783712 CHU_0631 CHU_0633     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 1783713 1783714 CHU_0634 CHU_0635   cysN FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783714 1783715 CHU_0635 CHU_0636 cysN cysD TRUE 0.989 31.000 0.731 0.001 N NA
 1783715 1783716 CHU_0636 CHU_0637 cysD cysC TRUE 0.988 20.000 0.343 1.000 N NA
 1783717 1783718 CHU_0638 CHU_0639 cysQ   FALSE 0.042 265.000 0.000 NA   NA
 1783718 1783719 CHU_0639 CHU_0640     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783720 1783721 CHU_0641 CHU_0642     FALSE 0.104 179.000 0.000 1.000   NA
 1783721 1783722 CHU_0642 CHU_0643     TRUE 0.995 9.000 0.294 NA   NA
 1783722 1783723 CHU_0643 CHU_0644     FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1783723 1783724 CHU_0644 CHU_0645     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1783724 1783725 CHU_0645 CHU_0646   hemB TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783725 1783726 CHU_0646 CHU_0647 hemB hemL FALSE 0.124 166.000 0.000 1.000 N NA
 1783727 1783728 CHU_0648 CHU_0649 rpmB rpmG TRUE 0.997 6.000 0.332 0.018   NA
 1783728 1783729 CHU_0649 CHU_0650 rpmG   TRUE 0.983 13.000 0.079 NA   NA
 1783729 1783730 CHU_0650 CHU_0651   ftsY TRUE 0.556 109.000 0.041 NA   NA
 1783730 1783731 CHU_0651 CHU_0652 ftsY   TRUE 0.630 -82.000 0.002 NA   NA
 1783731 1783732 CHU_0652 CHU_0653   yliG TRUE 0.960 13.000 0.019 NA   NA
 1783732 1783733 CHU_0653 CHU_0654 yliG pip TRUE 0.916 10.000 0.000 1.000   NA
 1783733 1783734 CHU_0654 CHU_0655 pip dbpA FALSE 0.062 234.000 0.000 1.000   NA
 1783735 1783736 CHU_0656 CHU_0657   galK TRUE 0.988 7.000 0.006 1.000 Y NA
 1783736 1783737 CHU_0657 CHU_0658 galK glmU TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1783738 1783739 CHU_0659 CHU_0660 fimZ   FALSE 0.029 342.000 0.000 NA   NA
 1783739 1783740 CHU_0660 CHU_0661     TRUE 0.612 32.000 0.000 NA   NA
 1783740 1783741 CHU_0661 CHU_0662     TRUE 0.647 -33.000 0.000 NA   NA
 1783741 1783742 CHU_0662 CHU_0663     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783742 1783743 CHU_0663 CHU_0664     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783743 1783744 CHU_0664 CHU_0665     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1783744 1783745 CHU_0665 CHU_0666     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 1783745 1783746 CHU_0666 CHU_0667     TRUE 0.985 24.000 0.436 NA N NA
 1783746 1783747 CHU_0667 CHU_0668     TRUE 0.993 18.000 0.713 NA   NA
 1783747 1783748 CHU_0668 CHU_0669     TRUE 0.996 3.000 0.171 NA   NA
 1783748 1783749 CHU_0669 CHU_0670     FALSE 0.335 78.000 0.000 1.000   NA
 1783751 1783752 CHU_0672 CHU_0673     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783755 1783756 CHU_0676 CHU_0677     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1783756 1783757 CHU_0677 CHU_0678   fnr FALSE 0.050 237.000 0.000 NA   NA
 1783757 1783758 CHU_0678 CHU_0679 fnr   FALSE 0.044 258.000 0.000 NA   NA
 1783759 1783760 CHU_0680 CHU_0681     FALSE 0.065 206.000 0.000 NA   NA
 1783760 1783761 CHU_0681 CHU_0682     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783761 1783762 CHU_0682 CHU_0683     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783763 1783764 CHU_0684 CHU_0685 cysM cysE TRUE 0.646 192.000 0.042 0.001 Y NA
 1783765 1783766 CHU_0686 CHU_0687   ygfA TRUE 0.937 -7.000 0.009 NA   NA
 1783766 1783767 CHU_0687 CHU_0688 ygfA yiaD TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1783768 1783769 CHU_0689 CHU_0690 ctpA   FALSE 0.033 312.000 0.000 NA   NA
 1783770 1783771 CHU_0691 CHU_0692     TRUE 0.967 0.000 0.008 NA N NA
 1783771 1783772 CHU_0692 CHU_0693   def FALSE 0.270 176.000 0.015 1.000 N NA
 1783772 1783773 CHU_0693 CHU_0694 def ybdL FALSE 0.164 136.000 0.000 1.000 N NA
 1783773 1783774 CHU_0694 CHU_0695 ybdL yafV TRUE 0.929 -12.000 0.011 1.000   NA
 1783774 1783775 CHU_0695 CHU_0696 yafV   TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783775 1783776 CHU_0696 CHU_0697   pgdA FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1783778 1783779 CHU_0699 CHU_0700 murF   TRUE 0.484 46.000 0.000 NA   NA
 1783779 1783780 CHU_0700 CHU_0701     FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1783781 1783782 CHU_0702 CHU_0703 pobR   TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1783782 1783783 CHU_0703 CHU_0704   yjjG TRUE 0.950 18.000 0.024 1.000   NA
 1783783 1783784 CHU_0704 CHU_0705 yjjG   TRUE 0.986 2.000 0.031 NA   NA
 1783784 1783785 CHU_0705 CHU_0706   arsR TRUE 0.584 85.000 0.021 NA N NA
 1783786 1783787 CHU_0707 CHU_0708     FALSE 0.022 468.000 0.000 NA   NA
 1783788 1783789 CHU_0709 CHU_0710     FALSE 0.019 645.000 0.000 NA   NA
 1783789 1783790 CHU_0710 CHU_0711     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783790 1783791 CHU_0711 CHU_0712     TRUE 0.647 -33.000 0.000 NA   NA
 1783791 1783792 CHU_0712 CHU_0713     FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 1783792 1783793 CHU_0713 CHU_0714     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1783793 1783794 CHU_0714 CHU_0715     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783794 1783795 CHU_0715 CHU_0716     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1783795 1783796 CHU_0716 CHU_0717   aroA FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1783796 1783797 CHU_0717 CHU_0718 aroA aroB TRUE 0.952 -13.000 0.002 1.000 Y NA
 1783797 1783798 CHU_0718 CHU_0719 aroB pheB TRUE 0.668 87.000 0.000 0.002 Y NA
 1783799 1783800 CHU_0720 CHU_0721 pdh   FALSE 0.052 261.000 0.000 1.000   NA
 1783800 1783801 CHU_0721 CHU_0722     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1783801 1783802 CHU_0722 CHU_0723   norM TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1783802 1783803 CHU_0723 CHU_0724 norM   FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1783803 1783804 CHU_0724 CHU_0725     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1783806 1783807 CHU_0726 CHU_0728     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1783807 1783808 CHU_0728 CHU_0729     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783808 1783809 CHU_0729 CHU_0730     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1783811 1783812 CHU_0731 CHU_0733   yncD FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1783812 1783813 CHU_0733 CHU_0734 yncD rluD FALSE 0.335 78.000 0.000 1.000   NA
 1783813 1783814 CHU_0734 CHU_0735 rluD   FALSE 0.132 139.000 0.000 NA   NA
 1783814 1783815 CHU_0735 CHU_0736     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783815 1783816 CHU_0736 CHU_0737     TRUE 0.477 47.000 0.000 NA   NA
 1783816 1783817 CHU_0737 CHU_0738     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1783817 1783818 CHU_0738 CHU_0739     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1783823 1783824 CHU_0744 CHU_0745   chpA FALSE 0.048 272.000 0.000 1.000   NA
 1783824 1783825 CHU_0745 CHU_0746 chpA   TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 1783825 1783826 CHU_0746 CHU_0747     FALSE 0.043 260.000 0.000 NA   NA
 1783826 1783827 CHU_0747 CHU_0748     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1783827 1783828 CHU_0748 CHU_0749     TRUE 0.664 -28.000 0.000 NA   NA
 1783829 1783830 CHU_0750 CHU_0751     TRUE 0.991 23.000 0.827 NA N NA
 1783830 1783831 CHU_0751 CHU_0752   pccB FALSE 0.148 418.000 0.053 NA N NA
 1783831 1783832 CHU_0752 CHU_0753 pccB   TRUE 0.671 70.000 0.022 NA   NA
 1783832 1783833 CHU_0753 CHU_0754   msrB FALSE 0.044 256.000 0.000 NA   NA
 1783834 1783835 CHU_0755 CHU_0756   smt TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783835 1783836 CHU_0756 CHU_0757 smt   TRUE 0.474 53.000 0.000 1.000   NA
 1783836 1783837 CHU_0757 CHU_0758     TRUE 0.797 83.000 0.081 1.000   NA
 1783838 1783839 CHU_0759 CHU_0760   divIVA TRUE 0.864 26.000 0.011 NA   NA
 1783839 1783840 CHU_0760 CHU_0761 divIVA folQ TRUE 0.973 0.000 0.012 NA   NA
 1783842 1783843 CHU_0763 CHU_0764   pheA TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1783843 1783844 CHU_0764 CHU_0765 pheA   TRUE 0.983 -22.000 0.083 1.000 Y NA
 1783844 1783845 CHU_0765 CHU_0766     FALSE 0.170 112.000 0.000 NA   NA
 1783845 1783846 CHU_0766 CHU_0767     FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1783846 1783847 CHU_0767 CHU_0768     FALSE 0.137 198.000 0.000 0.001   NA
 1783849 1783850 CHU_0770 CHU_0771     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1783850 1783851 CHU_0771 CHU_0772     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783853 1783854 CHU_0774 CHU_0775 hemE   TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1783854 1783855 CHU_0775 CHU_0776   ybiF TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1783855 1783856 CHU_0776 CHU_0777 ybiF   FALSE 0.151 126.000 0.000 NA   NA
 1783857 1783858 CHU_0778 CHU_0779     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1783859 1783860 CHU_0780 CHU_0781 rpoE   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783860 1783861 CHU_0781 CHU_0782     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1783862 1783863 CHU_0783 CHU_0784 rfaE aspB TRUE 0.901 -21.000 0.017 NA N NA
 1783864 1783865 CHU_0785 CHU_0786 yajF   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1783865 1783866 CHU_0786 CHU_0787     FALSE 0.183 106.000 0.000 NA   NA
 1783866 1783867 CHU_0787 CHU_0788     FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1783867 1783868 CHU_0788 CHU_0789     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1783868 1783869 CHU_0789 CHU_0790     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1783871 1783872 CHU_0792 CHU_0793     FALSE 0.117 170.000 0.000 1.000   NA
 1783872 1783873 CHU_0793 CHU_0794     FALSE 0.027 363.000 0.000 NA   NA
 1783873 1783874 CHU_0794 CHU_0795     TRUE 0.545 39.000 0.000 NA N NA
 1783875 1783876 CHU_0796 CHU_0797   ftnA TRUE 0.576 -49.000 0.000 NA   NA
 1783876 1783877 CHU_0797 CHU_0798 ftnA   TRUE 0.669 195.000 0.423 NA   NA
 1783877 1783878 CHU_0798 CHU_0799     FALSE 0.034 302.000 0.000 NA   NA
 1783878 1783879 CHU_0799 CHU_0800     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1783879 1783880 CHU_0800 CHU_0801     FALSE 0.055 249.000 0.000 1.000   NA
 1783880 1783881 CHU_0801 CHU_0802     TRUE 0.998 12.000 0.429 1.000 Y NA
 1783884 1783885 CHU_0805 CHU_0806     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783885 1783886 CHU_0806 CHU_0807     FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783887 1783888 CHU_0808 CHU_0809     FALSE 0.111 159.000 0.000 NA   NA
 1783888 1783889 CHU_0809 CHU_0810   ydcN FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 1783892 1783893 CHU_0813 CHU_0814     FALSE 0.044 255.000 0.000 NA   NA
 1783893 1783894 CHU_0814 CHU_0815     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783894 1783895 CHU_0815 CHU_0816     FALSE 0.181 107.000 0.000 NA   NA
 1783895 1783896 CHU_0816 CHU_0817     FALSE 0.190 103.000 0.000 NA   NA
 1783896 1783897 CHU_0817 CHU_0818     FALSE 0.081 187.000 0.000 NA   NA
 1783897 1783898 CHU_0818 CHU_0819     FALSE 0.038 286.000 0.000 NA   NA
 1783898 1783899 CHU_0819 CHU_0821   nhaA FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1783900 1783901 CHU_0822 CHU_0823     FALSE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 1783901 1783902 CHU_0823 CHU_0824     TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1783904 1783905 CHU_0826 CHU_0827     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1783906 1783907 CHU_0828 CHU_0829   czcC FALSE 0.203 110.000 0.000 1.000   NA
 1783907 1783908 CHU_0829 CHU_0830 czcC czcB TRUE 0.937 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 1783908 1783909 CHU_0830 CHU_0831 czcB czcA TRUE 0.996 4.000 0.200 1.000 N NA
 1783911 1783912 CHU_0833 CHU_0834 galE   FALSE 0.027 362.000 0.000 NA   NA
 1783912 1783913 CHU_0834 CHU_0835     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1783913 1783914 CHU_0835 CHU_0837     FALSE 0.031 319.000 0.000 NA   NA
 1783914 1783915 CHU_0837 CHU_0838     FALSE 0.022 475.000 0.000 NA   NA
 1783915 1783916 CHU_0838 CHU_0839     FALSE 0.020 533.000 0.000 NA   NA
 1783916 1783917 CHU_0839 CHU_0841     FALSE 0.021 484.000 0.000 NA   NA
 1783917 1783918 CHU_0841 CHU_0843     FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1783918 1783919 CHU_0843 CHU_0844     TRUE 0.992 4.000 0.069 NA   NA
 1783919 1783920 CHU_0844 CHU_0845   wza FALSE 0.139 135.000 0.000 NA   NA
 1783920 1783921 CHU_0845 CHU_0846 wza wzc TRUE 0.997 23.000 0.750 0.088 Y NA
 1783921 1783922 CHU_0846 CHU_0847 wzc   TRUE 0.937 22.000 0.000 0.088 Y NA
 1783922 1783923 CHU_0847 CHU_0848   rgpD TRUE 0.998 10.000 0.366 1.000 Y NA
 1783923 1783924 CHU_0848 CHU_0849 rgpD lacA TRUE 0.497 51.000 0.000 1.000   NA
 1783924 1783925 CHU_0849 CHU_0850 lacA rfbB TRUE 0.994 -3.000 0.182 1.000   NA
 1783925 1783926 CHU_0850 CHU_0851 rfbB   TRUE 0.990 -24.000 0.217 1.000 Y NA
 1783926 1783927 CHU_0851 CHU_0852     TRUE 0.967 11.000 0.000 NA Y NA
 1783927 1783928 CHU_0852 CHU_0853     TRUE 0.731 53.000 0.000 NA Y NA
 1783928 1783929 CHU_0853 CHU_0854     TRUE 0.528 -79.000 0.000 NA   NA
 1783931 1783932 CHU_0855 CHU_0857     TRUE 0.578 52.000 0.000 0.025   NA
 1783932 1783933 CHU_0857 CHU_0858     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.025   NA
 1783933 1783934 CHU_0858 CHU_0859     TRUE 0.505 50.000 0.000 1.000   NA
 1783934 1783935 CHU_0859 CHU_0860     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1783935 1783936 CHU_0860 CHU_0861     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1783936 1783937 CHU_0861 CHU_0862     TRUE 0.848 -10.000 0.000 1.000   NA
 1783937 1783938 CHU_0862 CHU_0863     FALSE 0.027 363.000 0.000 NA N NA
 1783938 1783939 CHU_0863 CHU_0864     TRUE 0.970 -3.000 0.000 NA Y NA
 1783939 1783940 CHU_0864 CHU_0865     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1783940 1783941 CHU_0865 CHU_0866     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1783941 1783942 CHU_0866 CHU_0867     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1783942 1783943 CHU_0867 CHU_0868   wcaL TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1783943 1783944 CHU_0868 CHU_0869 wcaL   TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.025 Y NA
 1783944 1783945 CHU_0869 CHU_0870   wcaL FALSE 0.248 215.000 0.000 0.025 Y NA
 1783946 1783947 CHU_0871 CHU_0872     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783947 1783948 CHU_0872 CHU_0873     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1783948 1783949 CHU_0873 CHU_0874     FALSE 0.030 335.000 0.000 NA   NA
 1783949 1783950 CHU_0874 CHU_0876     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1783950 1783951 CHU_0876 CHU_0878     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1783952 1783953 CHU_0879 CHU_0880 wza wzc TRUE 0.958 17.000 0.000 0.088 Y NA
 1783953 1783954 CHU_0880 CHU_0881 wzc   FALSE 0.335 93.000 0.000 0.088   NA
 1783954 1783955 CHU_0881 CHU_0882     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783955 1783956 CHU_0882 CHU_0883     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1783956 1783957 CHU_0883 CHU_0884     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1783957 1783958 CHU_0884 CHU_0885     TRUE 0.914 22.000 0.000 NA Y NA
 1783958 1783959 CHU_0885 CHU_0886     TRUE 0.747 25.000 0.000 1.000 N NA
 1783960 1783961 CHU_0887 CHU_0888     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1783961 1783962 CHU_0888 CHU_0889     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1783963 1783964 CHU_0890 CHU_0891     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA   NA
 1783964 1783965 CHU_0891 CHU_0892     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1783965 1783966 CHU_0892 CHU_0893     TRUE 0.959 -12.000 0.000 0.004 Y NA
 1783966 1783967 CHU_0893 CHU_0894     TRUE 0.725 -25.000 0.000 1.000 N NA
 1783967 1783968 CHU_0894 CHU_0895     TRUE 0.988 3.000 0.000 0.025 Y NA
 1783968 1783969 CHU_0895 CHU_0896     TRUE 0.955 -7.000 0.000 NA Y NA
 1783969 1783970 CHU_0896 CHU_0897     TRUE 0.854 14.000 0.000 NA N NA
 1783970 1783971 CHU_0897 CHU_0898     TRUE 0.419 159.000 0.000 0.004 Y NA
 1783972 1783973 CHU_0899 CHU_0900     FALSE 0.122 166.000 0.000 1.000   NA
 1783973 1783974 CHU_0900 CHU_0901   ugd FALSE 0.212 210.000 0.000 1.000 Y NA
 1783975 1783976 CHU_0902 CHU_0903     FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1783976 1783977 CHU_0903 CHU_0904     FALSE 0.040 272.000 0.000 NA   NA
 1783977 1783978 CHU_0904 CHU_0905     FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1783978 1783979 CHU_0905 CHU_0906     FALSE 0.026 380.000 0.000 NA   NA
 1783979 1783980 CHU_0906 CHU_0907     FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1783981 1783982 CHU_0908 CHU_0909     TRUE 0.986 -7.000 0.105 1.000   NA
 1783982 1427356 CHU_0909 CHU_tMet01     FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1427356 1783983 CHU_tMet01 CHU_0910     FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   NA
 1783985 1783986 CHU_0912 CHU_0913 ycdQ wca FALSE 0.393 60.000 0.000 NA   NA
 1783986 1783987 CHU_0913 CHU_0914 wca yneI FALSE 0.135 158.000 0.000 1.000 N NA
 1783988 1783989 CHU_0915 CHU_0916 glnB amtB TRUE 0.955 47.000 0.300 1.000 N NA
 1783989 1783990 CHU_0916 CHU_0917 amtB   FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1783990 1783991 CHU_0917 CHU_0918     FALSE 0.144 131.000 0.000 NA   NA
 1783992 1427367 CHU_0919 CHU_0920     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1427367 1783993 CHU_0920 CHU_0922     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1783993 1783994 CHU_0922 CHU_0923     TRUE 0.940 17.000 0.017 NA   NA
 1783994 1783995 CHU_0923 CHU_0924   ddlA TRUE 0.990 2.000 0.043 1.000   NA
 1783995 1783996 CHU_0924 CHU_0925 ddlA   TRUE 0.869 32.000 0.019 1.000 N NA
 1783996 1783997 CHU_0925 CHU_0926   mrp TRUE 0.996 4.000 0.219 1.000 N NA
 1783998 1783999 CHU_0927 CHU_0928 dnaG rfaG TRUE 0.653 33.000 0.000 1.000 N NA
 1783999 1784000 CHU_0928 CHU_0929 rfaG   TRUE 0.984 8.000 0.000 0.025 Y NA
 1784000 1784001 CHU_0929 CHU_0930     TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.025 Y NA
 1784001 1784002 CHU_0930 CHU_0931   ribA TRUE 0.822 37.000 0.014 1.000 N NA
 1784002 1784003 CHU_0931 CHU_0932 ribA surE TRUE 0.597 38.000 0.000 1.000   NA
 1784003 1784004 CHU_0932 CHU_0933 surE   FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 1784004 1784005 CHU_0933 CHU_0934   guaA FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1784005 1784006 CHU_0934 CHU_0935 guaA   TRUE 0.802 -43.000 0.008 1.000   NA
 1784006 1784007 CHU_0935 CHU_0936   hemL TRUE 0.966 -10.000 0.035 1.000   NA
 1784007 1784008 CHU_0936 CHU_0937 hemL proC TRUE 0.536 46.000 0.000 1.000 N NA
 1784008 1784009 CHU_0937 CHU_0938 proC   TRUE 0.526 47.000 0.000 1.000   NA
 1784009 1784010 CHU_0938 CHU_0939     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784011 1784012 CHU_0940 CHU_0941 ycdC acrD TRUE 0.466 55.000 0.000 1.000 N NA
 1784012 1784013 CHU_0941 CHU_0942 acrD acrA TRUE 0.994 16.000 0.629 1.000 N NA
 1784013 1427389 CHU_0942 CHU_0943 acrA   TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1427389 1784014 CHU_0943 CHU_0945   gldC FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 1784016 1784017 CHU_0947 CHU_0948 ribF truB TRUE 0.987 -3.000 0.062 1.000 N NA
 1784017 1784018 CHU_0948 CHU_0949 truB bacA TRUE 0.980 17.000 0.084 1.000 N NA
 1784018 1784019 CHU_0949 CHU_0950 bacA   TRUE 0.997 3.000 0.398 NA   NA
 1784019 1784020 CHU_0950 CHU_0951   ftsX TRUE 0.993 9.000 0.155 NA   NA
 1784020 1784021 CHU_0951 CHU_0952 ftsX   TRUE 0.592 52.000 0.005 NA   NA
 1784021 1784022 CHU_0952 CHU_0953   rpoE TRUE 0.998 3.000 0.750 NA   NA
 1784022 1784023 CHU_0953 CHU_0954 rpoE slyA TRUE 0.643 87.000 0.000 0.035 Y NA
 1784023 1784024 CHU_0954 CHU_0955 slyA folE TRUE 0.898 12.000 0.000 1.000 N NA
 1784024 1784025 CHU_0955 CHU_0956 folE ygcM TRUE 0.989 -37.000 0.317 1.000 Y NA
 1784026 1784027 CHU_0957 CHU_0958 cysH rfaD TRUE 0.895 20.000 0.006 1.000 N NA
 1784027 1784028 CHU_0958 CHU_0959 rfaD amyA TRUE 0.914 28.000 0.000 0.032 Y NA
 1784028 1784029 CHU_0959 CHU_0960 amyA fucP TRUE 0.829 39.000 0.000 1.000 Y NA
 1784030 1784031 CHU_0961 CHU_0962   comB FALSE 0.139 153.000 0.000 1.000   NA
 1784031 1784032 CHU_0962 CHU_0963 comB   FALSE 0.056 247.000 0.000 1.000   NA
 1784032 1784033 CHU_0963 CHU_0964     TRUE 0.406 57.000 0.000 NA   NA
 1784033 1784034 CHU_0964 CHU_0965     TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1784034 1784035 CHU_0965 CHU_0966     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784035 1784036 CHU_0966 CHU_0967     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784036 1784037 CHU_0967 CHU_0968     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784037 1784038 CHU_0968 CHU_0969   fabA TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784038 1784039 CHU_0969 CHU_0970 fabA   FALSE 0.199 112.000 0.000 1.000   NA
 1784039 1784040 CHU_0970 CHU_0971     FALSE 0.061 210.000 0.000 NA   NA
 1784040 1784041 CHU_0971 CHU_0972     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1784041 1784042 CHU_0972 CHU_0973     TRUE 0.466 157.000 0.051 NA   NA
 1784042 1784043 CHU_0973 CHU_0974     TRUE 0.996 6.000 0.226 NA   NA
 1784043 1784044 CHU_0974 CHU_0975     TRUE 0.996 4.000 0.236 NA   NA
 1784044 1784045 CHU_0975 CHU_0976   sufD TRUE 0.602 160.000 0.101 1.000 N NA
 1784045 1784046 CHU_0976 CHU_0977 sufD sufC TRUE 0.997 16.000 0.482 1.000 Y NA
 1784046 1784047 CHU_0977 CHU_0978 sufC sufB TRUE 0.883 166.000 0.466 1.000 Y NA
 1784047 1784048 CHU_0978 CHU_0979 sufB asnC FALSE 0.059 244.000 0.000 1.000 N NA
 1784048 1784049 CHU_0979 CHU_0980 asnC   FALSE 0.029 406.000 0.000 1.000   NA
 1784049 1784050 CHU_0980 CHU_0981     TRUE 0.608 37.000 0.000 1.000   NA
 1784050 1784051 CHU_0981 CHU_0982     TRUE 0.560 -58.000 0.000 NA   NA
 1784051 1784052 CHU_0982 CHU_0983     TRUE 0.868 -6.000 0.000 NA   NA
 1784052 1784053 CHU_0983 CHU_0984     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784053 1784054 CHU_0984 CHU_0985     TRUE 0.608 37.000 0.000 1.000   NA
 1784055 1784056 CHU_0986 CHU_0987   yigR TRUE 0.621 178.000 0.174 1.000   NA
 1784057 1784058 CHU_0988 CHU_0989     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1784058 1784059 CHU_0989 CHU_0990     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784061 1784062 CHU_0992 CHU_0993 arcB   TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1784062 1784063 CHU_0993 CHU_0994   maoC TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784063 1784064 CHU_0994 CHU_0995 maoC serC TRUE 0.961 2.000 0.000 0.051 N NA
 1784064 1784065 CHU_0995 CHU_0996 serC serA TRUE 0.592 139.000 0.009 0.051 Y NA
 1784072 1784073 CHU_1003 CHU_1004   glpD FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784074 1784075 CHU_1005 CHU_1006 ugpQ rhlE FALSE 0.028 433.000 0.000 1.000 N NA
 1784076 1427453 CHU_1007 CHU_tHis01 pyrC   FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1427453 1784077 CHU_tHis01 CHU_1008     TRUE 0.506 43.000 0.000 NA   NA
 1784078 1784079 CHU_1009 CHU_1010     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784082 1784083 CHU_1013 CHU_1014 yhaH yhaH TRUE 0.614 46.000 0.000 0.056   NA
 1784084 1784085 CHU_1015 CHU_1016 yncD   FALSE 0.193 102.000 0.000 NA   NA
 1784085 1784086 CHU_1016 CHU_1017     FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1784086 1784087 CHU_1017 CHU_1018     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1784087 1784088 CHU_1018 CHU_1019   ykgF FALSE 0.029 342.000 0.000 NA   NA
 1784088 1784089 CHU_1019 CHU_1020 ykgF yfbL TRUE 0.993 5.000 0.073 1.000   NA
 1784090 1784091 CHU_1021 CHU_1022 gcvP   FALSE 0.027 467.000 0.000 1.000 N NA
 1784091 1784092 CHU_1022 CHU_1023     TRUE 0.996 13.000 0.667 1.000   NA
 1784092 1784093 CHU_1023 CHU_1024   yqiK FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1784093 1784094 CHU_1024 CHU_1025 yqiK   TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784094 1784095 CHU_1025 CHU_1026     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1784095 1784096 CHU_1026 CHU_1027     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1784096 1784097 CHU_1027 CHU_1028     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1784097 1784098 CHU_1028 CHU_1029     TRUE 0.586 229.000 0.409 NA   NA
 1784099 1784100 CHU_1030 CHU_1031     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1784101 1784102 CHU_1032 CHU_1033   qor FALSE 0.154 142.000 0.000 1.000 N NA
 1784102 1784103 CHU_1033 CHU_1034 qor   FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784104 1784105 CHU_1035 CHU_1036   lpxA TRUE 0.996 0.000 0.219 1.000 N NA
 1784105 1784106 CHU_1036 CHU_1037 lpxA lpxC TRUE 0.997 3.000 0.091 1.000 Y NA
 1784106 1784107 CHU_1037 CHU_1038 lpxC lpxD TRUE 0.998 10.000 0.148 0.002 Y NA
 1784107 1784108 CHU_1038 CHU_1039 lpxD   TRUE 0.971 27.000 0.154 1.000   NA
 1784110 1784111 CHU_1041 CHU_1042 cab   TRUE 0.995 10.000 0.074 1.000 Y NA
 1784111 1784112 CHU_1042 CHU_1043     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784112 1784113 CHU_1043 CHU_1044     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1784113 1784114 CHU_1044 CHU_1045   recR TRUE 0.935 -3.000 0.002 NA N NA
 1784114 1784115 CHU_1045 CHU_1046 recR   TRUE 0.760 41.000 0.011 NA   NA
 1784117 1784118 CHU_1048 CHU_1049     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1784120 1784121 CHU_1051 CHU_1052     TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1784122 1784123 CHU_1053 CHU_1054 phrB   TRUE 0.995 0.000 0.124 0.017   NA
 1784123 1784124 CHU_1054 CHU_1055     TRUE 0.462 168.000 0.034 0.017   NA
 1784124 1784125 CHU_1055 CHU_1056     TRUE 0.959 -7.000 0.018 1.000   NA
 1784125 1784126 CHU_1056 CHU_1057   fabG TRUE 0.990 8.000 0.042 0.036   NA
 1784126 1784127 CHU_1057 CHU_1058 fabG   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784128 1784129 CHU_1059 CHU_1060 folE rmeD TRUE 0.843 73.000 0.091 1.000 N NA
 1784130 1784131 CHU_1061 CHU_1062   xylR FALSE 0.130 160.000 0.000 1.000   NA
 1784133 1784134 CHU_1064 CHU_1065 pacS   FALSE 0.057 219.000 0.000 NA   NA
 1784134 1784135 CHU_1065 CHU_1066     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1784137 1784138 CHU_1068 CHU_1069 yhfC   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784139 1784140 CHU_1070 CHU_1071     FALSE 0.046 248.000 0.000 NA   NA
 1784140 1784141 CHU_1071 CHU_1072     FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1784141 1784142 CHU_1072 CHU_1073   ybgC TRUE 0.978 9.000 0.026 NA   NA
 1784142 1784143 CHU_1073 CHU_1074 ybgC   TRUE 0.969 -49.000 0.302 1.000   NA
 1784143 1784144 CHU_1074 CHU_1075     FALSE 0.063 231.000 0.000 1.000   NA
 1784144 1784145 CHU_1075 CHU_1076   yciO FALSE 0.085 183.000 0.000 NA N NA
 1784147 1784148 CHU_1077 CHU_1079   clpA FALSE 0.366 153.000 0.026 NA   NA
 1784148 1784149 CHU_1079 CHU_1080 clpA   FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 1784149 1784150 CHU_1080 CHU_1081     TRUE 0.993 -7.000 0.412 NA   NA
 1784150 1784151 CHU_1081 CHU_1082     FALSE 0.020 498.000 0.000 NA   NA
 1784152 1784153 CHU_1083 CHU_1084     FALSE 0.114 156.000 0.000 NA   NA
 1784153 1784154 CHU_1084 CHU_1085   fabG TRUE 0.741 137.000 0.237 NA   NA
 1784159 1784160 CHU_1090 CHU_1091   hdhA FALSE 0.333 72.000 0.000 NA N NA
 1784160 1784161 CHU_1091 CHU_1092 hdhA arcB FALSE 0.068 226.000 0.000 1.000 N NA
 1784161 1784162 CHU_1092 CHU_1093 arcB   FALSE 0.027 361.000 0.000 NA   NA
 1784162 1784163 CHU_1093 CHU_1094     TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1784163 1784164 CHU_1094 CHU_1095     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784164 1784165 CHU_1095 CHU_1096     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784165 1784166 CHU_1096 CHU_1097   araC TRUE 0.584 35.000 0.000 NA   NA
 1784166 1784167 CHU_1097 CHU_1098 araC   TRUE 0.402 67.000 0.000 1.000   NA
 1784167 1784168 CHU_1098 CHU_1099     TRUE 0.718 -21.000 0.000 NA   NA
 1784168 1784169 CHU_1099 CHU_1101     FALSE 0.397 59.000 0.000 NA   NA
 1784169 1784170 CHU_1101 CHU_1102     FALSE 0.370 64.000 0.000 NA   NA
 1784170 1784171 CHU_1102 CHU_1103     FALSE 0.020 528.000 0.000 NA   NA
 1784171 1784172 CHU_1103 CHU_1104     FALSE 0.232 93.000 0.000 NA   NA
 1784172 1784173 CHU_1104 CHU_1105     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784175 1784176 CHU_1107 CHU_1108     FALSE 0.052 233.000 0.000 NA   NA
 1784176 1784177 CHU_1108 CHU_1109   smtB FALSE 0.162 116.000 0.000 NA   NA
 1784177 1784178 CHU_1109 CHU_1110 smtB   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784178 1784179 CHU_1110 CHU_1111     TRUE 0.977 25.000 0.222 NA   NA
 1784180 1784181 CHU_1113 CHU_1114 ptpA   TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1784182 1784183 CHU_1115 CHU_1116     TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784185 1784186 CHU_1118 CHU_1119     FALSE 0.316 74.000 0.000 NA   NA
 1784188 1784189 CHU_1121 CHU_1122     TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1784189 1784190 CHU_1122 CHU_1123     FALSE 0.316 74.000 0.000 NA   NA
 1784190 1784191 CHU_1123 CHU_1124     FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1784191 1784192 CHU_1124 CHU_1125     FALSE 0.107 162.000 0.000 NA   NA
 1784193 1784194 CHU_1126 CHU_1127     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 1784194 1784195 CHU_1127 CHU_1128     TRUE 0.794 73.000 0.064 NA   NA
 1784195 1784196 CHU_1128 CHU_1129     TRUE 0.887 22.000 0.010 NA   NA
 1784196 1784197 CHU_1129 CHU_1130   pheS FALSE 0.362 98.000 0.006 NA   NA
 1784198 1784199 CHU_1131 CHU_1132 barA crp TRUE 0.998 15.000 0.462 0.060 Y NA
 1784199 1784200 CHU_1132 CHU_1133 crp copA TRUE 0.820 29.000 0.006 1.000 N NA
 1784200 1784201 CHU_1133 CHU_1134 copA   FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1784201 1784202 CHU_1134 CHU_1135   uspA FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784204 1784205 CHU_1137 CHU_1138   cyo TRUE 0.994 6.000 0.133 NA N NA
 1784205 1784206 CHU_1138 CHU_1139 cyo   TRUE 0.985 4.000 0.027 NA   NA
 1784206 1784207 CHU_1139 CHU_1140   cytC TRUE 0.976 14.000 0.053 NA   NA
 1784207 1784208 CHU_1140 CHU_1141 cytC   TRUE 0.995 30.000 0.774 0.015 Y NA
 1784208 1784209 CHU_1141 CHU_1142     TRUE 0.995 11.000 0.489 NA   NA
 1784209 1784210 CHU_1142 CHU_1143     TRUE 0.977 23.000 0.177 NA   NA
 1784210 1784211 CHU_1143 CHU_1144   hemN TRUE 0.959 -9.000 0.029 NA   NA
 1784211 1784212 CHU_1144 CHU_1145 hemN yegM FALSE 0.119 170.000 0.000 1.000 N NA
 1784212 1784213 CHU_1145 CHU_1146 yegM acrB TRUE 0.997 12.000 0.814 0.084 N NA
 1784213 1784214 CHU_1146 CHU_1147 acrB   FALSE 0.028 358.000 0.000 NA   NA
 1784216 1784217 CHU_1148 CHU_1150     FALSE 0.056 223.000 0.000 NA   NA
 1784218 1784219 CHU_1151 CHU_1152 yaeJ   TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784219 1784220 CHU_1152 CHU_1153     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1784220 1784221 CHU_1153 CHU_1154   hat FALSE 0.234 100.000 0.000 1.000   NA
 1784221 1784222 CHU_1154 CHU_1155 hat   FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 1784222 1784223 CHU_1155 CHU_1156     FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1784223 1784224 CHU_1156 CHU_1157     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784224 1784225 CHU_1157 CHU_1158     FALSE 0.018 1041.000 0.000 NA   NA
 1784225 1784226 CHU_1158 CHU_1159     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784226 1784227 CHU_1159 CHU_1160     FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1784229 1784230 CHU_1162 CHU_1163     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 1784230 1784231 CHU_1163 CHU_1164   amiA FALSE 0.074 195.000 0.000 NA   NA
 1784231 1784232 CHU_1164 CHU_1165 amiA   TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784233 1784234 CHU_1166 CHU_1167     FALSE 0.025 386.000 0.000 NA   NA
 1784234 1784235 CHU_1167 CHU_1168     FALSE 0.025 389.000 0.000 NA   NA
 1784238 1784239 CHU_1171 CHU_1172     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784239 1784240 CHU_1172 CHU_1173     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1784240 1784241 CHU_1173 CHU_1174     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784241 1784242 CHU_1174 CHU_1175     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784242 1784243 CHU_1175 CHU_1176     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 1784243 1784244 CHU_1176 CHU_1177     FALSE 0.117 153.000 0.000 NA   NA
 1784244 1784245 CHU_1177 CHU_1178     FALSE 0.023 441.000 0.000 NA   NA
 1784246 1784247 CHU_1179 CHU_1180     FALSE 0.113 158.000 0.000 NA   NA
 1784248 1784249 CHU_1181 CHU_1182 uhpA   TRUE 0.980 -19.000 0.200 1.000   NA
 1784250 1784251 CHU_1183 CHU_1184     TRUE 0.996 11.000 0.667 NA   NA
 1784251 1784252 CHU_1184 CHU_1185     FALSE 0.085 198.000 0.000 1.000   NA
 1784253 1784254 CHU_1186 CHU_1187     TRUE 0.975 -40.000 0.400 NA   NA
 1784254 1784255 CHU_1187 CHU_1188     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784255 1784256 CHU_1188 CHU_1189     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784256 1784257 CHU_1189 CHU_1190     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1784259 1784260 CHU_1192 CHU_1193 pbpC   TRUE 0.944 5.000 0.000 1.000   NA
 1784260 1784261 CHU_1193 CHU_1194   gidB TRUE 0.428 62.000 0.000 1.000   NA
 1784261 1784262 CHU_1194 CHU_1195 gidB rpoE TRUE 0.661 62.000 0.010 1.000 N NA
 1784262 1784263 CHU_1195 CHU_1196 rpoE   TRUE 0.990 -9.000 0.281 NA N NA
 1784264 1784265 CHU_1197 CHU_1198 tgt   TRUE 0.992 10.000 0.124 1.000   NA
 1784265 1784266 CHU_1198 CHU_1199   yggB FALSE 0.183 121.000 0.000 1.000   NA
 1784266 1784267 CHU_1199 CHU_1200 yggB   FALSE 0.027 362.000 0.000 NA   NA
 1784267 1784268 CHU_1200 CHU_1201     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784268 1784269 CHU_1201 CHU_1202     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1784269 1784270 CHU_1202 CHU_1203     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784270 1784271 CHU_1203 CHU_1204     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784272 1784273 CHU_1206 CHU_1208     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784273 1784274 CHU_1208 CHU_1209     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784274 1784275 CHU_1209 CHU_1210   ispE TRUE 0.595 -43.000 0.000 NA   NA
 1784276 1784277 CHU_1211 CHU_1212 wcaJ   TRUE 0.995 5.000 0.153 NA   NA
 1784277 1784278 CHU_1212 CHU_1213     TRUE 0.995 0.000 0.148 1.000   NA
 1784278 1784279 CHU_1213 CHU_1214     FALSE 0.051 263.000 0.000 1.000   NA
 1784280 1784281 CHU_1215 CHU_1216 evgS   TRUE 0.936 -3.000 0.000 0.099   NA
 1784281 1784282 CHU_1216 CHU_1217     TRUE 0.998 -7.000 0.522 0.099 Y NA
 1784282 1784283 CHU_1217 CHU_1218     TRUE 0.991 -31.000 0.454 NA Y NA
 1784283 1784284 CHU_1218 CHU_1219     TRUE 0.995 19.000 0.361 NA Y NA
 1784284 1784285 CHU_1219 CHU_1220   phoB TRUE 0.978 7.000 0.000 NA Y NA
 1784285 1784286 CHU_1220 CHU_1221 phoB   FALSE 0.023 651.000 0.000 1.000 N NA
 1784286 1784287 CHU_1221 CHU_1222   cpxA FALSE 0.162 137.000 0.000 1.000 N NA
 1784287 1784288 CHU_1222 CHU_1223 cpxA   FALSE 0.069 220.000 0.000 1.000 N NA
 1784288 1784289 CHU_1223 CHU_1224     TRUE 0.997 0.000 0.574 NA   NA
 1784289 1784290 CHU_1224 CHU_1225     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784290 1784291 CHU_1225 CHU_1226     TRUE 0.552 54.000 0.000 0.049   NA
 1784291 1784292 CHU_1226 CHU_1227     TRUE 0.815 -13.000 0.000 1.000   NA
 1784292 1784293 CHU_1227 CHU_1228   icd FALSE 0.187 118.000 0.000 1.000   NA
 1784295 1784296 CHU_1230 CHU_1231 pqqL   FALSE 0.126 145.000 0.000 NA   NA
 1784296 1784297 CHU_1231 CHU_1232     FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1784297 1784298 CHU_1232 CHU_1233   dnaX FALSE 0.093 285.000 0.009 NA   NA
 1784299 1784300 CHU_1234 CHU_1235     FALSE 0.024 425.000 0.000 NA   NA
 1784300 1784301 CHU_1235 CHU_1237     TRUE 0.986 5.000 0.000 0.059 Y NA
 1784301 1784302 CHU_1237 CHU_1238     FALSE 0.036 1224.000 0.000 0.001   NA
 1784302 1784303 CHU_1238 CHU_1239     FALSE 0.040 479.000 0.000 0.009   NA
 1784303 1784304 CHU_1239 CHU_1240     FALSE 0.373 173.000 0.000 0.009 Y NA
 1784304 1784305 CHU_1240 CHU_1241     FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784305 1784306 CHU_1241 CHU_1242     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784306 1784307 CHU_1242 CHU_1243   ipyR FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784307 1784308 CHU_1243 CHU_1244 ipyR   FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784308 1784309 CHU_1244 CHU_1245     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784309 1784310 CHU_1245 CHU_1246   adhP TRUE 0.522 48.000 0.000 1.000 N NA
 1784310 1784311 CHU_1246 CHU_1247 adhP yjhC TRUE 0.411 65.000 0.000 1.000   NA
 1784311 1784312 CHU_1247 CHU_1248 yjhC   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784313 1784314 CHU_1249 CHU_1251     FALSE 0.055 226.000 0.000 NA   NA
 1784315 1784316 CHU_1250 CHU_1252   mrcA FALSE 0.142 133.000 0.000 NA   NA
 1784316 1784317 CHU_1252 CHU_1253 mrcA   FALSE 0.028 349.000 0.000 NA   NA
 1784317 1784318 CHU_1253 CHU_1254     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784318 1784319 CHU_1254 CHU_1255   livG TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784319 1784320 CHU_1255 CHU_1256 livG livH TRUE 0.888 178.000 0.654 1.000 Y NA
 1784320 1784321 CHU_1256 CHU_1257 livH livM TRUE 0.996 27.000 0.758 0.023 Y NA
 1784321 1784322 CHU_1257 CHU_1258 livM livG TRUE 0.961 12.000 0.013 1.000   NA
 1784322 1784323 CHU_1258 CHU_1259 livG livF TRUE 0.811 58.000 0.025 0.015   NA
 1784323 1784324 CHU_1259 CHU_1260 livF ureA TRUE 0.718 109.000 0.025 1.000 Y NA
 1784324 1784325 CHU_1260 CHU_1261 ureA ureC TRUE 0.999 13.000 0.667 0.001 Y NA
 1784325 1784326 CHU_1261 CHU_1262 ureC ureF FALSE 0.154 189.000 0.000 0.001 N NA
 1784326 1784327 CHU_1262 CHU_1263 ureF ureG TRUE 0.991 13.000 0.027 0.002 Y NA
 1784329 1784330 CHU_1265 CHU_1266 narQ yfiK TRUE 0.758 64.000 0.000 0.023 Y NA
 1784331 1784332 CHU_1267 CHU_1268     FALSE 0.252 88.000 0.000 NA   NA
 1784333 1784334 CHU_1269 CHU_1270 hisC hisB TRUE 0.995 22.000 0.341 0.004 Y NA
 1784334 1784335 CHU_1270 CHU_1271 hisB hisH TRUE 0.883 123.000 0.128 0.004 Y NA
 1784335 1784336 CHU_1271 CHU_1272 hisH hisA TRUE 0.978 51.000 0.210 0.004 Y NA
 1784336 1784337 CHU_1272 CHU_1273 hisA hisF TRUE 0.948 107.000 0.433 0.004 Y NA
 1784337 1784338 CHU_1273 CHU_1274 hisF pdh TRUE 0.695 67.000 0.000 1.000 Y NA
 1784340 1784341 CHU_1276 CHU_1277     FALSE 0.278 82.000 0.000 NA   NA
 1784341 1784342 CHU_1277 CHU_1278     TRUE 0.759 21.000 0.000 NA   NA
 1784342 1784343 CHU_1278 CHU_1279     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784343 1784344 CHU_1279 CHU_1280   cel FALSE 0.115 155.000 0.000 NA   NA
 1784344 1784345 CHU_1280 CHU_1281 cel   TRUE 0.505 -217.000 0.000 NA   NA
 1784346 1784347 CHU_1282 CHU_1283     TRUE 0.978 5.000 0.011 1.000   NA
 1784352 1784353 CHU_1288 CHU_1289   thyA FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784354 1784355 CHU_1290 CHU_1292     FALSE 0.029 338.000 0.000 NA   NA
 1784357 1784358 CHU_1293 CHU_1294     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784358 1784359 CHU_1294 CHU_1295     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 1784359 1784360 CHU_1295 CHU_1296     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 1784360 1784361 CHU_1296 CHU_1297   dfr FALSE 0.023 450.000 0.000 NA   NA
 1784361 1784362 CHU_1297 CHU_1298 dfr araC TRUE 0.449 59.000 0.000 1.000 N NA
 1784362 1784363 CHU_1298 CHU_1299 araC   FALSE 0.020 568.000 0.000 NA   NA
 1784363 1784364 CHU_1299 CHU_1300     FALSE 0.061 210.000 0.000 NA   NA
 1784364 1784365 CHU_1300 CHU_1301     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1784365 1784366 CHU_1301 CHU_1302   pabC FALSE 0.025 399.000 0.000 NA   NA
 1784366 1784367 CHU_1302 CHU_1303 pabC   FALSE 0.340 70.000 0.000 NA   NA
 1784367 1784368 CHU_1303 CHU_1304     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784368 1784369 CHU_1304 CHU_1305     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784369 1784370 CHU_1305 CHU_1306     FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 1784372 1784373 CHU_1308 CHU_1309 maf   TRUE 0.925 0.000 0.000 NA N NA
 1784374 1784375 CHU_1310 CHU_1311 kbl   TRUE 0.745 102.000 0.102 1.000   NA
 1784376 1784377 CHU_1312 CHU_1313 dapA ligA TRUE 0.589 92.000 0.023 1.000 N NA
 1784380 1784381 CHU_1316 CHU_1317 uhpB uhpA TRUE 0.987 4.000 0.000 0.023 Y NA
 1784383 1784384 CHU_1319 CHU_1320   napA TRUE 0.850 46.000 0.035 1.000 N NA
 1784384 1784385 CHU_1320 CHU_1321 napA norV TRUE 0.968 -7.000 0.000 0.040 Y NA
 1784385 1784386 CHU_1321 CHU_1322 norV moaA TRUE 0.850 -10.000 0.000 1.000 N NA
 1784386 1784387 CHU_1322 CHU_1323 moaA   TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1784387 1784388 CHU_1323 CHU_1324   moaE TRUE 0.980 -40.000 0.501 1.000   NA
 1784388 1784389 CHU_1324 CHU_1325 moaE   TRUE 0.780 22.000 0.000 1.000   NA
 1784389 1784390 CHU_1325 CHU_1326   mobA FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1784390 1784391 CHU_1326 CHU_1327 mobA   TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784391 1784392 CHU_1327 CHU_1328     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1784393 1784394 CHU_1329 CHU_1330 moeA moaC TRUE 0.992 2.000 0.006 0.002 Y NA
 1784394 1784395 CHU_1330 CHU_1331 moaC nirD FALSE 0.041 307.000 0.000 1.000 N NA
 1784395 1784396 CHU_1331 CHU_1332 nirD nirB TRUE 0.992 23.000 0.500 0.001 N NA
 1784397 1784398 CHU_1333 CHU_1334 folE   TRUE 0.790 50.000 0.027 NA   NA
 1784399 1784400 CHU_1335 CHU_1336     FALSE 0.040 476.000 0.000 0.009   NA
 1784402 1784403 CHU_1338 CHU_1339   phnA FALSE 0.322 82.000 0.000 1.000 N NA
 1784405 1784406 CHU_1341 CHU_1342 alf   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784406 1784407 CHU_1342 CHU_1343     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784407 1784408 CHU_1343 CHU_1344     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1784408 1784409 CHU_1344 CHU_1345   glgB FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784409 1784410 CHU_1345 CHU_1346 glgB   FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 1784410 1784411 CHU_1346 CHU_1347     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784411 1784412 CHU_1347 CHU_1348   mpl TRUE 0.984 0.000 0.026 1.000 N NA
 1784413 1784414 CHU_1349 CHU_1350 dnaB   FALSE 0.239 122.000 0.000 0.050   NA
 1784414 1784415 CHU_1350 CHU_1351     TRUE 0.709 -58.000 0.000 0.008   NA
 1784415 1784416 CHU_1351 CHU_1352     TRUE 0.709 -58.000 0.000 0.008   NA
 1784417 1784418 CHU_1353 CHU_1354 trxA   FALSE 0.077 206.000 0.000 1.000   NA
 1784419 1784420 CHU_1355 CHU_1356 arcB narL TRUE 0.955 0.000 0.000 0.022   NA
 1784421 1784422 CHU_1357 CHU_1358 ybbK   FALSE 0.107 177.000 0.000 1.000   NA
 1784423 1784424 CHU_1359 CHU_1360 fixA fixB TRUE 0.994 30.000 0.509 0.014 Y NA
 1784424 1784425 CHU_1360 CHU_1361 fixB   TRUE 0.987 14.000 0.125 1.000   NA
 1784427 1784428 CHU_1363 CHU_1364   dacB TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784431 1784432 CHU_1367 CHU_1368 ygjT dedA FALSE 0.221 95.000 0.000 NA   NA
 1784432 1784433 CHU_1368 CHU_1369 dedA nuoN TRUE 0.996 1.000 0.240 NA   NA
 1784433 1784434 CHU_1369 CHU_1370 nuoN nuoM TRUE 0.996 20.000 0.370 0.002 Y NA
 1784434 1784435 CHU_1370 CHU_1371 nuoM nuoL TRUE 0.996 15.000 0.198 0.002 Y NA
 1784435 1784436 CHU_1371 CHU_1372 nuoL nuoK TRUE 0.998 20.000 0.790 0.009 Y NA
 1784436 1784437 CHU_1372 CHU_1373 nuoK nuoJ TRUE 0.998 13.000 0.306 0.004 Y NA
 1784437 1784438 CHU_1373 CHU_1374 nuoJ nuoI TRUE 0.995 19.000 0.210 0.009 Y NA
 1784438 1784439 CHU_1374 CHU_1375 nuoI nuoH TRUE 0.997 12.000 0.221 0.009 Y NA
 1784439 1784440 CHU_1375 CHU_1376 nuoH nuoG TRUE 0.992 -16.000 0.515 0.009   NA
 1784440 1784441 CHU_1376 CHU_1377 nuoG nuoF TRUE 0.982 15.000 0.054 0.009   NA
 1784441 1784442 CHU_1377 CHU_1378 nuoF nuoE TRUE 0.997 0.000 0.054 0.008 Y NA
 1784442 1784443 CHU_1378 CHU_1379 nuoE nuoD TRUE 0.996 13.000 0.097 0.008 Y NA
 1784443 1784444 CHU_1379 CHU_1380 nuoD nuoC TRUE 0.966 51.000 0.096 0.009 Y NA
 1784444 1784445 CHU_1380 CHU_1381 nuoC   TRUE 0.995 -10.000 0.125 0.004 Y NA
 1784445 1784446 CHU_1381 CHU_1382   nuoA TRUE 0.983 61.000 0.498 0.004 Y NA
 1784447 1784448 CHU_1383 CHU_1384     FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1784449 1784450 CHU_1386 CHU_1387   rfaD FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1784451 1784452 CHU_1388 CHU_1389 yadT fecD TRUE 0.996 -3.000 0.120 1.000 Y NA
 1784452 1784453 CHU_1389 CHU_1390 fecD ygcM TRUE 0.917 50.000 0.115 1.000 N NA
 1784453 1784454 CHU_1390 CHU_1391 ygcM lpxB TRUE 0.659 65.000 0.012 1.000 N NA
 1784455 1784456 CHU_1392 CHU_1393     FALSE 0.029 339.000 0.000 NA   NA
 1784458 1784459 CHU_1395 CHU_1396   rnc TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1784459 1784460 CHU_1396 CHU_1397 rnc fabF TRUE 0.997 4.000 0.245 1.000 N NA
 1784460 1784461 CHU_1397 CHU_1398 fabF acpP TRUE 0.944 39.000 0.034 1.000 Y NA
 1784462 1784463 CHU_1399 CHU_1400   pykF TRUE 0.997 7.000 0.559 NA   NA
 1784463 1784464 CHU_1400 CHU_1401 pykF cel FALSE 0.365 147.000 0.000 1.000 Y NA
 1784464 1784465 CHU_1401 CHU_1402 cel   FALSE 0.076 193.000 0.000 NA   NA
 1784465 1784466 CHU_1402 CHU_1403   gntT TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1784466 1784467 CHU_1403 CHU_1404 gntT gnd TRUE 0.744 55.000 0.000 1.000 Y NA
 1784468 1784469 CHU_1405 CHU_1406     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784469 1784470 CHU_1406 CHU_1407     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 1784470 1784471 CHU_1407 CHU_1408   caiA FALSE 0.116 157.000 0.000 NA N NA
 1784472 1784473 CHU_1409 CHU_1410     TRUE 0.942 1.000 0.000 1.000   NA
 1784473 1784474 CHU_1410 CHU_1411     FALSE 0.297 132.000 0.007 1.000   NA
 1784474 1784475 CHU_1411 CHU_1412     FALSE 0.062 560.000 0.015 NA   NA
 1784475 1784476 CHU_1412 CHU_1413   gyrB FALSE 0.349 88.000 0.002 NA   NA
 1784476 1784477 CHU_1413 CHU_1414 gyrB ppk TRUE 0.483 85.000 0.007 1.000 N NA
 1784479 1784480 CHU_1416 CHU_1417     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784480 1784481 CHU_1417 CHU_1418     FALSE 0.401 81.000 0.000 0.047   NA
 1784481 1784482 CHU_1418 CHU_1419     TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1784483 1784484 CHU_1420 CHU_1421     FALSE 0.149 127.000 0.000 NA   NA
 1784484 1784485 CHU_1421 CHU_1422     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784485 1784486 CHU_1422 CHU_1423     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1784486 1784487 CHU_1423 CHU_1424     FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1784487 1784488 CHU_1424 CHU_1425   fabG TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1784488 1784489 CHU_1425 CHU_1426 fabG   FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784489 1784490 CHU_1426 CHU_1427     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1784490 1784491 CHU_1427 CHU_1428     FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1784491 1784492 CHU_1428 CHU_1429   tolB TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784492 1784493 CHU_1429 CHU_1430 tolB   FALSE 0.072 197.000 0.000 NA   NA
 1784493 1784494 CHU_1430 CHU_1431     FALSE 0.144 131.000 0.000 NA   NA
 1784494 1784495 CHU_1431 CHU_1432     FALSE 0.361 66.000 0.000 NA   NA
 1784496 1784497 CHU_1433 CHU_1434 metH metH TRUE 0.990 13.000 0.024 0.001 Y NA
 1784497 1784498 CHU_1434 CHU_1435 metH metF FALSE 0.330 745.000 0.057 0.002 Y NA
 1784498 1784499 CHU_1435 CHU_1436 metF leuA TRUE 0.993 0.000 0.025 1.000 Y NA
 1784499 1784500 CHU_1436 CHU_1437 leuA ykgE TRUE 0.936 31.000 0.070 NA N NA
 1784500 1784501 CHU_1437 CHU_1438 ykgE   TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784501 1784502 CHU_1438 CHU_1439     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1784503 1784504 CHU_1440 CHU_1441     TRUE 0.542 62.000 0.000 0.008   NA
 1784504 1784505 CHU_1441 CHU_1442   pepN FALSE 0.129 161.000 0.000 1.000   NA
 1784505 1784506 CHU_1442 CHU_1443 pepN dnaJ TRUE 0.832 -12.000 0.000 1.000   NA
 1784506 1784507 CHU_1443 CHU_1444 dnaJ dprA FALSE 0.251 96.000 0.000 1.000   NA
 1784507 1784508 CHU_1444 CHU_1445 dprA   FALSE 0.083 316.000 0.008 1.000 N NA
 1784509 1784510 CHU_1446 CHU_1447 alaS gatB TRUE 0.957 22.000 0.008 1.000 Y NA
 1784510 1784511 CHU_1447 CHU_1448 gatB ccmG TRUE 0.945 5.000 0.000 1.000 N NA
 1784511 1784512 CHU_1448 CHU_1449 ccmG   TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784513 1784514 CHU_1450 CHU_1451     FALSE 0.039 274.000 0.000 NA   NA
 1784514 1784515 CHU_1451 CHU_1452     TRUE 0.840 122.000 0.500 NA   NA
 1784515 1784516 CHU_1452 CHU_1453     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1784516 1784517 CHU_1453 CHU_1454     FALSE 0.087 179.000 0.000 NA   NA
 1784518 1784519 CHU_1455 CHU_1456 rhlE   FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784519 1784520 CHU_1456 CHU_1457     FALSE 0.031 320.000 0.000 NA   NA
 1784520 1784521 CHU_1457 CHU_1458     TRUE 0.885 96.000 0.250 0.003   NA
 1784521 1784522 CHU_1458 CHU_1459   tatA FALSE 0.286 89.000 0.000 1.000   NA
 1784522 1784523 CHU_1459 CHU_1460 tatA tatC TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784526 1784527 CHU_1463 CHU_1464 xis   TRUE 0.457 50.000 0.000 NA   NA
 1784527 1784528 CHU_1464 CHU_1465   sms TRUE 0.640 30.000 0.000 NA   NA
 1784528 1784529 CHU_1465 CHU_1466 sms dpnA TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000   NA
 1784529 1784530 CHU_1466 CHU_1467 dpnA   FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784530 1784531 CHU_1467 CHU_1468   dpn TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784531 1784532 CHU_1468 CHU_1469 dpn   TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784532 1784533 CHU_1469 CHU_1470     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1784533 1784534 CHU_1470 CHU_1471     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784534 1784535 CHU_1471 CHU_1472   flgJ FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784535 1784536 CHU_1472 CHU_1473 flgJ   TRUE 0.845 17.000 0.000 1.000   NA
 1784536 1784537 CHU_1473 CHU_1474     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1784537 1784538 CHU_1474 CHU_1475     TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1784538 1784539 CHU_1475 CHU_1476     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784539 1784540 CHU_1476 CHU_1477     FALSE 0.269 84.000 0.000 NA   NA
 1784540 1784541 CHU_1477 CHU_1478     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784541 1784542 CHU_1478 CHU_1479     TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 1784542 1784543 CHU_1479 CHU_1480     TRUE 0.767 -15.000 0.000 NA   NA
 1784543 1784544 CHU_1480 CHU_1481     FALSE 0.376 63.000 0.000 NA   NA
 1784544 1784545 CHU_1481 CHU_1482     FALSE 0.129 142.000 0.000 NA   NA
 1784545 1784546 CHU_1482 CHU_1483     TRUE 0.934 2.000 0.000 NA   NA
 1784546 1784547 CHU_1483 CHU_1484     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784547 1784548 CHU_1484 CHU_1485     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784548 1784549 CHU_1485 CHU_1486     FALSE 0.290 79.000 0.000 NA   NA
 1784549 1784550 CHU_1486 CHU_1487     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1784550 1784551 CHU_1487 CHU_1488     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784551 1784552 CHU_1488 CHU_1489     FALSE 0.066 205.000 0.000 NA   NA
 1784552 1784553 CHU_1489 CHU_1490     TRUE 0.996 2.000 0.231 NA   NA
 1784554 1784555 CHU_1491 CHU_1492 umuD umuC TRUE 0.946 2.000 0.000 1.000 N NA
 1784555 1784556 CHU_1492 CHU_1493 umuC   FALSE 0.037 293.000 0.000 NA   NA
 1784557 1784558 CHU_1494 CHU_1495 radC   FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784559 1784560 CHU_1496 CHU_1497     FALSE 0.036 331.000 0.000 1.000   NA
 1784561 1784562 CHU_1498 CHU_1499   copA TRUE 0.911 15.000 0.000 0.005   NA
 1784562 1784563 CHU_1499 CHU_1500 copA   FALSE 0.367 94.000 0.000 0.005 N NA
 1784563 1784564 CHU_1500 CHU_1501   cusB TRUE 0.945 5.000 0.000 1.000 N NA
 1784564 1784565 CHU_1501 CHU_1502 cusB cusB TRUE 0.997 22.000 0.667 0.006 Y NA
 1784565 1784566 CHU_1502 CHU_1503 cusB   TRUE 0.997 17.000 0.667 1.000 Y NA
 1784566 1784567 CHU_1503 CHU_1504   cusA TRUE 0.997 9.000 0.636 1.000 N NA
 1784567 1784568 CHU_1504 CHU_1505 cusA   FALSE 0.212 97.000 0.000 NA   NA
 1784568 1784569 CHU_1505 CHU_1506     TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1784569 1784570 CHU_1506 CHU_1507     FALSE 0.034 303.000 0.000 NA   NA
 1784572 1784573 CHU_1509 CHU_1510   zntA TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784573 1784574 CHU_1510 CHU_1511 zntA yegM TRUE 0.426 63.000 0.000 1.000 N NA
 1784574 1784575 CHU_1511 CHU_1512 yegM   TRUE 0.998 8.000 0.636 1.000 N NA
 1784576 1784577 CHU_1513 CHU_1514     TRUE 0.930 51.000 0.167 1.000   NA
 1784577 1784578 CHU_1514 CHU_1515     TRUE 0.669 31.000 0.000 1.000   NA
 1784578 1784579 CHU_1515 CHU_1516     TRUE 0.996 3.000 0.167 1.000   NA
 1784580 1784581 CHU_1517 CHU_1518 accA   TRUE 0.964 -3.000 0.010 1.000   NA
 1784581 1784582 CHU_1518 CHU_1519     TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1784582 1784583 CHU_1519 CHU_1520     FALSE 0.028 355.000 0.000 NA   NA
 1784583 1784584 CHU_1520 CHU_1521     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784584 1784585 CHU_1521 CHU_1522     TRUE 0.745 22.000 0.000 NA   NA
 1784585 1784586 CHU_1522 CHU_1523     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1784586 1784587 CHU_1523 CHU_1524     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784587 1784588 CHU_1524 CHU_1525     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784588 1784589 CHU_1525 CHU_1526     TRUE 0.933 5.000 0.000 NA   NA
 1784590 1784591 CHU_1527 CHU_1528   tpn FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784593 1784594 CHU_1530 CHU_1531   efp FALSE 0.018 1420.000 0.000 NA   NA
 1784595 1784596 CHU_1532 CHU_1533     FALSE 0.053 231.000 0.000 NA   NA
 1784596 1784597 CHU_1533 CHU_1534     FALSE 0.135 137.000 0.000 NA   NA
 1784598 1784599 CHU_1535 CHU_1536   tyrS TRUE 0.926 9.000 0.000 1.000   NA
 1784600 1784601 CHU_1537 CHU_1538     TRUE 0.469 76.000 0.003 1.000   NA
 1784601 1784602 CHU_1538 CHU_1539     TRUE 0.990 -7.000 0.175 1.000   NA
 1784602 1784603 CHU_1539 CHU_1540     TRUE 0.995 1.000 0.159 NA   NA
 1784603 1784604 CHU_1540 CHU_1541     TRUE 0.839 52.000 0.048 NA   NA
 1784604 1784605 CHU_1541 CHU_1542   folC TRUE 0.990 4.000 0.051 NA   NA
 1784605 1784606 CHU_1542 CHU_1543 folC trmB TRUE 0.985 5.000 0.024 1.000   NA
 1784608 1784609 CHU_1545 CHU_1546 gldA gldF TRUE 0.993 9.000 0.163 NA   NA
 1784609 1784610 CHU_1546 CHU_1547 gldF gldG TRUE 0.995 -6.000 0.635 NA   NA
 1784610 1784611 CHU_1547 CHU_1548 gldG   TRUE 0.987 9.000 0.058 NA   NA
 1784611 1784612 CHU_1548 CHU_1549   dnaN FALSE 0.385 82.000 0.002 NA   NA
 1784612 1784613 CHU_1549 CHU_1550 dnaN   FALSE 0.097 171.000 0.000 NA   NA
 1784614 1784615 CHU_1551 CHU_1552   murA TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784615 1784616 CHU_1552 CHU_1553 murA   TRUE 0.996 0.000 0.354 NA   NA
 1784616 1784617 CHU_1553 CHU_1554   uvrD TRUE 0.966 28.000 0.156 NA   NA
 1784618 1784619 CHU_1555 CHU_1556     FALSE 0.401 58.000 0.000 NA   NA
 1784620 1784621 CHU_1557 CHU_1558     FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784625 1784626 CHU_1562 CHU_1563   purB TRUE 0.940 6.000 0.000 1.000   NA
 1784627 1784628 CHU_1564 CHU_1565 paaE pepF TRUE 0.927 9.000 0.000 1.000 N NA
 1784630 1784631 CHU_1567 CHU_1568     TRUE 0.993 4.000 0.083 NA   NA
 1784632 1784633 CHU_1569 CHU_1570 folA fmt TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784633 1784634 CHU_1570 CHU_1571 fmt   TRUE 0.451 80.000 0.006 NA   NA
 1784636 1784637 CHU_1573 CHU_1574 lgtD   TRUE 0.488 93.000 0.014 NA N NA
 1784640 1784641 CHU_1577 CHU_1579 argS btuE FALSE 0.248 127.000 0.002 1.000 N NA
 1784641 1784642 CHU_1579 CHU_1580 btuE pphA FALSE 0.214 106.000 0.000 1.000   NA
 1784642 1784643 CHU_1580 CHU_1581 pphA glgA TRUE 0.845 17.000 0.000 1.000   NA
 1784643 1784644 CHU_1581 CHU_1582 glgA   FALSE 0.055 227.000 0.000 NA   NA
 1784645 1784646 CHU_1583 CHU_1584   dmpI TRUE 0.911 9.000 0.000 NA   NA
 1784646 1784647 CHU_1584 CHU_1585 dmpI   FALSE 0.304 85.000 0.000 1.000   NA
 1784647 1784648 CHU_1585 CHU_1586   fabF FALSE 0.318 82.000 0.000 1.000   NA
 1784649 1784650 CHU_1587 CHU_1588 hslV arsC TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784650 1784651 CHU_1588 CHU_1589 arsC   TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1784651 1784652 CHU_1589 CHU_1590     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA   NA
 1784652 1784653 CHU_1590 CHU_1591     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1784655 1784656 CHU_1593 CHU_1594     FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1784657 1784658 CHU_1595 CHU_1596     FALSE 0.217 96.000 0.000 NA   NA
 1784658 1784659 CHU_1596 CHU_1597     TRUE 0.996 0.000 0.280 NA   NA
 1784659 1784660 CHU_1597 CHU_1598   deaD TRUE 0.968 3.000 0.006 NA   NA
 1784660 1784661 CHU_1598 CHU_1599 deaD ydgR FALSE 0.042 302.000 0.000 1.000 N NA
 1784661 1784662 CHU_1599 CHU_1600 ydgR pfkB FALSE 0.395 69.000 0.000 1.000 N NA
 1784662 1784663 CHU_1600 CHU_1601 pfkB   TRUE 0.770 23.000 0.000 1.000 N NA
 1784664 1784665 CHU_1602 CHU_1603 trmU   TRUE 0.961 1.000 0.004 NA   NA
 1784665 1784666 CHU_1603 CHU_1604     TRUE 0.730 -19.000 0.000 NA   NA
 1784666 1784667 CHU_1604 CHU_1605   rpe TRUE 0.764 37.000 0.007 1.000   NA
 1784667 1784668 CHU_1605 CHU_1606 rpe   TRUE 0.893 25.000 0.013 1.000 N NA
 1784668 1784669 CHU_1606 CHU_1607     FALSE 0.047 402.000 0.000 0.006 N NA
 1784669 1784670 CHU_1607 CHU_1608     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1784670 1784671 CHU_1608 CHU_1609     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784673 1784674 CHU_1611 CHU_1612 3mgh   FALSE 0.081 188.000 0.000 NA   NA
 1784674 1784675 CHU_1612 CHU_1613   ppiA FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1784675 1784676 CHU_1613 CHU_1614 ppiA gyrB FALSE 0.030 402.000 0.000 1.000 N NA
 1784676 1784677 CHU_1614 CHU_1615 gyrB ybgR FALSE 0.162 137.000 0.000 1.000 N NA
 1784677 1784678 CHU_1615 CHU_1616 ybgR fecI FALSE 0.076 209.000 0.000 1.000 N NA
 1784678 1784679 CHU_1616 CHU_1617 fecI   TRUE 0.958 53.000 0.595 NA   NA
 1784679 1784680 CHU_1617 CHU_1618     TRUE 0.899 10.000 0.000 NA   NA
 1784681 1784682 CHU_1620 CHU_1621     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784682 1784683 CHU_1621 CHU_1622   accC FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1784683 1784684 CHU_1622 CHU_1623 accC accB TRUE 0.981 36.000 0.101 0.001 Y NA
 1784684 1784685 CHU_1623 CHU_1624 accB   TRUE 0.739 85.000 0.003 0.006 Y NA
 1784685 1784686 CHU_1624 CHU_1625   plsX TRUE 0.979 17.000 0.009 0.006 Y NA
 1784686 1784687 CHU_1625 CHU_1625a plsX rpmF TRUE 0.997 5.000 0.418 1.000 N NA
 1784687 1784688 CHU_1625a CHU_1626 rpmF   TRUE 0.996 11.000 0.599 NA   NA
 1784688 1784689 CHU_1626 CHU_1627   pdxA TRUE 0.630 95.000 0.042 NA   NA
 1784690 1784691 CHU_1628 CHU_1629 ksgA   TRUE 0.989 6.000 0.047 1.000 N NA
 1784691 1784692 CHU_1629 CHU_1630   ldhA TRUE 0.993 7.000 0.078 0.046 N NA
 1784692 1784693 CHU_1630 CHU_1631 ldhA greA FALSE 0.385 129.000 0.014 1.000 N NA
 1784693 1784694 CHU_1631 CHU_1632 greA ycfF TRUE 0.992 9.000 0.108 1.000 N NA
 1784696 1784697 CHU_1634 CHU_1635     TRUE 0.625 31.000 0.000 NA   NA
 1784697 1784698 CHU_1635 CHU_1636     TRUE 0.694 26.000 0.000 NA   NA
 1784698 1784699 CHU_1636 CHU_1637   barA TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784701 1784702 CHU_1639 CHU_1640 gyrA   FALSE 0.299 77.000 0.000 NA   NA
 1784702 1784703 CHU_1640 CHU_1641     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1784703 1784704 CHU_1641 CHU_1642     TRUE 0.948 3.000 0.000 1.000   NA
 1784704 1784705 CHU_1642 CHU_1643   thrS FALSE 0.373 72.000 0.000 1.000   NA
 1784705 1784706 CHU_1643 CHU_1644 thrS infC TRUE 0.886 90.000 0.080 1.000 Y NA
 1784706 1784707 CHU_1644 CHU_1644a infC rpmI TRUE 0.993 29.000 0.652 1.000 Y NA
 1784707 1784708 CHU_1644a CHU_1645 rpmI rplT TRUE 0.972 99.000 0.928 0.015 Y NA
 1784708 1784709 CHU_1645 CHU_1646 rplT   FALSE 0.130 141.000 0.000 NA   NA
 1784710 1784711 CHU_1647 CHU_1648     TRUE 0.522 -82.000 0.000 NA   NA
 1784711 1428091 CHU_1648 CHU_tMet02     FALSE 0.104 165.000 0.000 NA   NA
 1784712 1784713 CHU_1649 CHU_1650 msrA   TRUE 0.437 52.000 0.000 NA   NA
 1784713 1784714 CHU_1650 CHU_1651     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784714 1784715 CHU_1651 CHU_1653     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784717 1784718 CHU_1655 CHU_1656 cel gluP FALSE 0.147 146.000 0.000 1.000   NA
 1784718 1784719 CHU_1656 CHU_1657 gluP nlpC FALSE 0.108 163.000 0.000 NA N NA
 1784719 1784720 CHU_1657 CHU_1658 nlpC   FALSE 0.144 133.000 0.000 NA N NA
 1784722 1784723 CHU_1660 CHU_1661 nagB gdh FALSE 0.224 103.000 0.000 1.000 N NA
 1784723 1784724 CHU_1661 CHU_1662 gdh crcB FALSE 0.134 159.000 0.000 1.000 N NA
 1784724 1784725 CHU_1662 CHU_1663 crcB rcsC FALSE 0.130 187.000 0.000 0.077 N NA
 1784725 1784726 CHU_1663 CHU_1664 rcsC   FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 1784726 1784727 CHU_1664 CHU_1665     TRUE 0.426 53.000 0.000 NA   NA
 1784727 1784728 CHU_1665 CHU_1666     FALSE 0.147 129.000 0.000 NA   NA
 1784729 1784730 CHU_1667 CHU_1668 purL   FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 1784730 1784731 CHU_1668 CHU_1669     FALSE 0.099 170.000 0.000 NA   NA
 1784731 1784732 CHU_1669 CHU_1670   murI TRUE 0.803 -12.000 0.000 NA   NA
 1784733 1784734 CHU_1671 CHU_1672     TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784734 1784735 CHU_1672 CHU_1673     FALSE 0.023 439.000 0.000 NA   NA
 1784735 1784736 CHU_1673 CHU_1674     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1784737 1784738 CHU_1675 CHU_1676     FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784741 1784742 CHU_1679 CHU_1680 dinB dnaQ TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1784743 1784744 CHU_1681 CHU_1682   gyrA FALSE 0.153 317.000 0.031 1.000   NA
 1428125 1428126 CHU_tThr01 CHU_tThr02     FALSE 0.049 242.000 0.000 NA   NA
 1784745 1784746 CHU_1683 CHU_1684 rfaQ   FALSE 0.286 80.000 0.000 NA   NA
 1784746 1784747 CHU_1684 CHU_1685     TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1784748 1784749 CHU_1686 CHU_1687   fklB FALSE 0.122 167.000 0.000 1.000 N NA
 1784749 1784750 CHU_1687 CHU_1688 fklB   FALSE 0.106 163.000 0.000 NA   NA
 1784750 1784751 CHU_1688 CHU_1689     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784751 1784752 CHU_1689 CHU_1690     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1784752 1784753 CHU_1690 CHU_1691   yfeW FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1784754 1784755 CHU_1692 CHU_1693     TRUE 0.990 -16.000 0.636 NA   NA
 1784755 1784756 CHU_1693 CHU_1694     TRUE 0.993 -13.000 0.727 NA   NA
 1784756 1784757 CHU_1694 CHU_1695     TRUE 0.986 -27.000 0.667 NA   NA
 1784757 1784758 CHU_1695 CHU_1696     TRUE 0.992 -13.000 0.667 NA   NA
 1784758 1784759 CHU_1696 CHU_1697     FALSE 0.061 211.000 0.000 NA   NA
 1784759 1428142 CHU_1697 CHU_r5S03     FALSE 0.050 237.000 0.000 NA   NA
 1428142 1428143 CHU_r5S03 CHU_r23S03     FALSE 0.028 344.000 0.000 NA   NA
 1428143 1428144 CHU_r23S03 CHU_r16S03     FALSE 0.023 428.000 0.000 NA   NA
 1428144 1784760 CHU_r16S03 CHU_1699     FALSE 0.018 904.000 0.000 NA   NA
 1784760 1784761 CHU_1699 CHU_1700   ybgR FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1784761 1784762 CHU_1700 CHU_1701 ybgR purA FALSE 0.114 174.000 0.000 1.000 N NA
 1784762 1784763 CHU_1701 CHU_1702 purA   TRUE 0.974 5.000 0.008 1.000 N NA
 1784763 1784764 CHU_1702 CHU_1703   furR TRUE 0.901 68.000 0.127 0.054 N NA
 1784764 1784765 CHU_1703 CHU_1704 furR relA TRUE 0.971 40.000 0.468 1.000 N NA
 1428151 1784766 CHU_tLeu02 CHU_1705   tig FALSE 0.255 87.000 0.000 NA   NA
 1784766 1784767 CHU_1705 CHU_1706 tig clpP TRUE 0.824 97.000 0.047 1.000 Y NA
 1784767 1784768 CHU_1706 CHU_1707 clpP clpX TRUE 0.803 120.000 0.069 1.000 Y NA
 1784768 1784769 CHU_1707 CHU_1708 clpX   FALSE 0.023 623.000 0.000 1.000   NA
 1784769 1784770 CHU_1708 CHU_1709     TRUE 0.576 -49.000 0.000 NA   NA
 1784771 1784772 CHU_1710 CHU_1711 ompA   FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784776 1784777 CHU_1715 CHU_1716   folD TRUE 0.449 120.000 0.020 1.000 N NA
 1784777 1784778 CHU_1716 CHU_1717 folD lepA FALSE 0.143 233.000 0.009 1.000 N NA
 1784779 1784780 CHU_1718 CHU_1719     TRUE 0.877 12.000 0.000 NA   NA
 1784781 1784782 CHU_1720 CHU_1721     FALSE 0.334 71.000 0.000 NA   NA
 1784784 1784785 CHU_1723 CHU_1724     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784785 1784786 CHU_1724 CHU_1725     TRUE 0.419 54.000 0.000 NA   NA
 1784786 1784787 CHU_1725 CHU_1726     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1784789 1784790 CHU_1728 CHU_1729     FALSE 0.197 101.000 0.000 NA   NA
 1784790 1784791 CHU_1729 CHU_1730     TRUE 0.769 45.000 0.016 NA   NA
 1784791 1784792 CHU_1730 CHU_1731   yobV TRUE 0.891 80.000 0.286 NA   NA
 1784792 1784793 CHU_1731 CHU_1732 yobV   FALSE 0.244 90.000 0.000 NA   NA
 1784793 1784794 CHU_1732 CHU_1733     FALSE 0.240 91.000 0.000 NA   NA
 1784794 1784795 CHU_1733 CHU_1734   glnA FALSE 0.057 219.000 0.000 NA   NA
 1784795 1784796 CHU_1734 CHU_1735 glnA glnA FALSE 0.095 244.000 0.000 0.001   NA
 1784797 1784798 CHU_1736 CHU_1737     TRUE 0.751 50.000 0.008 0.045 N NA
 1784798 1784799 CHU_1737 CHU_1738     FALSE 0.346 69.000 0.000 NA   NA
 1784801 1784802 CHU_1740 CHU_1741   yneH FALSE 0.167 133.000 0.000 1.000   NA
 1784803 1784804 CHU_1742 CHU_1743     TRUE 0.991 8.000 0.091 NA   NA
 1784804 1784805 CHU_1743 CHU_1744     FALSE 0.036 295.000 0.000 NA   NA
 1784805 1784806 CHU_1744 CHU_1745     FALSE 0.043 262.000 0.000 NA   NA
 1784806 1784807 CHU_1745 CHU_1746     FALSE 0.086 180.000 0.000 NA   NA
 1784810 1784811 CHU_1749 CHU_1750     FALSE 0.123 147.000 0.000 NA   NA
 1784811 1784812 CHU_1750 CHU_1751     FALSE 0.154 124.000 0.000 NA   NA
 1784813 1784814 CHU_1752 CHU_1753   dfr TRUE 0.440 60.000 0.000 1.000   NA
 1784814 1784815 CHU_1753 CHU_1754 dfr   FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 1784815 1784816 CHU_1754 CHU_1755   pdhC TRUE 0.664 -28.000 0.000 NA   NA
 1784816 1784817 CHU_1755 CHU_1756 pdhC gpm FALSE 0.065 229.000 0.000 1.000 N NA
 1784818 1784819 CHU_1757 CHU_1758   entC TRUE 0.991 2.000 0.011 NA Y NA
 1784819 1784820 CHU_1758 CHU_1759 entC menD TRUE 0.993 22.000 0.281 1.000 Y NA
 1784821 1784822 CHU_1760 CHU_1761     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1784822 1784823 CHU_1761 CHU_1762     FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784824 1784825 CHU_1763 CHU_1764     FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1784826 1784827 CHU_1765 CHU_1766     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1784827 1784828 CHU_1766 CHU_1767     TRUE 0.705 25.000 0.000 NA   NA
 1784828 1784829 CHU_1767 CHU_1768     TRUE 0.755 -16.000 0.000 NA   NA
 1784829 1784830 CHU_1768 CHU_1769     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1784830 1784831 CHU_1769 CHU_1770   ybhF TRUE 0.548 -64.000 0.000 NA   NA
 1784833 1784834 CHU_1772 CHU_1773     TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784835 1784836 CHU_1774 CHU_1775   pdxH TRUE 0.550 38.000 0.000 NA   NA
 1784837 1784838 CHU_1776 CHU_1777     TRUE 0.994 3.000 0.095 NA   NA
 1784838 1784839 CHU_1777 CHU_1778   trxB TRUE 0.967 11.000 0.015 1.000   NA
 1784840 1784841 CHU_1779 CHU_1780     TRUE 0.853 -7.000 0.000 NA   NA
 1784841 1784842 CHU_1780 CHU_1781     FALSE 0.120 149.000 0.000 NA   NA
 1784842 1784843 CHU_1781 CHU_1782     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1784844 1784845 CHU_1783 CHU_1784 nhaP   FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 1784845 1784846 CHU_1784 CHU_1785   rpoD FALSE 0.131 140.000 0.000 NA   NA
 1784846 1784847 CHU_1785 CHU_1786 rpoD pnp TRUE 0.607 76.000 0.014 1.000 N NA
 1784847 1784848 CHU_1786 CHU_1787 pnp rpsO TRUE 0.919 112.000 0.335 1.000 Y NA
 1784848 1784849 CHU_1787 CHU_1788 rpsO   TRUE 0.472 97.000 0.012 1.000   NA
 1784849 1784850 CHU_1788 CHU_1789     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1784850 1784851 CHU_1789 CHU_1790     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784851 1784852 CHU_1790 CHU_1791     FALSE 0.055 226.000 0.000 NA   NA
 1784852 1784853 CHU_1791 CHU_1792     TRUE 0.995 -3.000 0.098 NA Y NA
 1784853 1784854 CHU_1792 CHU_1793   pyrC TRUE 0.925 0.000 0.000 NA N NA
 1784854 1784855 CHU_1793 CHU_1794 pyrC   TRUE 0.988 5.000 0.039 NA   NA
 1784857 1784858 CHU_1796 CHU_1797 ompA   TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1784859 1784860 CHU_1798 CHU_1799     FALSE 0.387 61.000 0.000 NA   NA
 1784860 1784861 CHU_1799 CHU_1800     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784861 1784862 CHU_1800 CHU_1801     TRUE 0.500 44.000 0.000 NA   NA
 1784863 1784864 CHU_1802 CHU_1803     TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1784864 1784865 CHU_1803 CHU_1804   lpxK TRUE 0.767 51.000 0.022 NA   NA
 1784866 1784867 CHU_1805 CHU_1806     TRUE 0.997 1.000 0.342 NA   NA
 1784867 1784868 CHU_1806 CHU_1807     TRUE 0.864 13.000 0.000 NA   NA
 1784868 1784869 CHU_1807 CHU_1808   pabB TRUE 0.914 -3.000 0.000 1.000   NA
 1784869 1784870 CHU_1808 CHU_1809 pabB   TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 1784871 1784872 CHU_1810 CHU_1811   mhpC FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784872 1784873 CHU_1811 CHU_1812 mhpC oahS TRUE 0.440 60.000 0.000 1.000   NA
 1784874 1784875 CHU_1813 CHU_1814     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1784875 1784876 CHU_1814 CHU_1815   sufS TRUE 0.939 -64.000 0.132 NA   NA
 1784876 1784877 CHU_1815 CHU_1816 sufS cysE TRUE 0.964 29.000 0.033 1.000 Y NA
 1784878 1784879 CHU_1817 CHU_1818     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784879 1784880 CHU_1818 CHU_1819   deaD FALSE 0.134 138.000 0.000 NA   NA
 1784881 1784882 CHU_1820 CHU_1821 yeeF miaB FALSE 0.112 175.000 0.000 1.000 N NA
 1784882 1784883 CHU_1821 CHU_1822 miaB   TRUE 0.688 80.000 0.031 1.000   NA
 1784883 1784884 CHU_1822 CHU_1823     TRUE 0.984 -25.000 0.505 NA   NA
 1784884 1784885 CHU_1823 CHU_1824     TRUE 0.987 -22.000 0.641 NA   NA
 1784885 1784886 CHU_1824 CHU_1825     TRUE 0.991 7.000 0.069 1.000   NA
 1784888 1784889 CHU_1827 CHU_1828 groES groEL TRUE 0.988 56.000 0.774 0.008 Y NA
 1784889 1784890 CHU_1828 CHU_1829 groEL   FALSE 0.103 166.000 0.000 NA   NA
 1784890 1784891 CHU_1829 CHU_1830   yqaB FALSE 0.161 117.000 0.000 NA   NA
 1784891 1784892 CHU_1830 CHU_1831 yqaB   TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784896 1784897 CHU_1834 CHU_1836     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784898 1784899 CHU_1837 CHU_1838     TRUE 0.962 2.000 0.000 0.022   NA
 1784899 1784900 CHU_1838 CHU_1839     FALSE 0.037 293.000 0.000 NA   NA
 1784900 1784901 CHU_1839 CHU_1840     FALSE 0.082 186.000 0.000 NA   NA
 1784901 1784902 CHU_1840 CHU_1841   cvrA FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 1784902 1784903 CHU_1841 CHU_1842 cvrA cel FALSE 0.085 201.000 0.000 1.000 N NA
 1784903 1784904 CHU_1842 CHU_1843 cel fecE FALSE 0.313 84.000 0.000 1.000 N NA
 1784904 1784905 CHU_1843 CHU_1844 fecE   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784906 1784907 CHU_1845 CHU_1846     FALSE 0.121 148.000 0.000 NA   NA
 1784907 1784908 CHU_1846 CHU_1847     TRUE 0.492 45.000 0.000 NA   NA
 1784908 1784909 CHU_1847 CHU_1848     TRUE 0.595 -43.000 0.000 NA   NA
 1784910 1784911 CHU_1849 CHU_1850     FALSE 0.148 128.000 0.000 NA   NA
 1784912 1784913 CHU_1851 CHU_1852 rpsT   FALSE 0.322 73.000 0.000 NA   NA
 1784913 1784914 CHU_1852 CHU_1854     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1784915 1784916 CHU_1855 CHU_1856     FALSE 0.069 202.000 0.000 NA   NA
 1784916 1784917 CHU_1856 CHU_1857     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1784917 1784918 CHU_1857 CHU_1858     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1784918 1784919 CHU_1858 CHU_1859     FALSE 0.020 496.000 0.000 NA   NA
 1784921 1784922 CHU_1861 CHU_1862 hisD hisG TRUE 0.758 214.000 0.171 0.004 Y NA
 1784923 1784924 CHU_1863 CHU_1864     TRUE 0.964 12.000 0.020 NA   NA
 1784924 1784925 CHU_1864 CHU_1865   yebU TRUE 0.923 7.000 0.000 NA   NA
 1784927 1784928 CHU_1867 CHU_1868     TRUE 0.998 2.000 0.875 NA   NA
 1784928 1784929 CHU_1868 CHU_1869     TRUE 0.983 -9.000 0.106 NA   NA
 1784929 1784930 CHU_1869 CHU_1870     TRUE 0.972 -16.000 0.106 NA   NA
 1784933 1784934 CHU_1873 CHU_1874   yeeB FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1784934 1784935 CHU_1874 CHU_1875 yeeB glk FALSE 0.238 99.000 0.000 1.000   NA
 1784935 1784936 CHU_1875 CHU_1876 glk nhaA FALSE 0.160 138.000 0.000 1.000 N NA
 1784938 1784939 CHU_1878 CHU_1879     FALSE 0.357 67.000 0.000 NA   NA
 1784941 1784942 CHU_1881 CHU_1882 lexA   TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1784943 1784944 CHU_1883 CHU_1884     FALSE 0.143 132.000 0.000 NA   NA
 1784945 1784946 CHU_1885 CHU_1886 rhlE ymdC FALSE 0.285 90.000 0.000 1.000 N NA
 1784946 1784947 CHU_1886 CHU_1887 ymdC   TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1784947 1784948 CHU_1887 CHU_1888   mrcA FALSE 0.045 452.000 0.000 0.003 N NA
 1784948 1784949 CHU_1888 CHU_1889 mrcA   FALSE 0.263 94.000 0.000 1.000   NA
 1784949 1784950 CHU_1889 CHU_1890     FALSE 0.107 177.000 0.000 1.000   NA
 1784951 1784952 CHU_1891 CHU_1892 ycgM   TRUE 0.948 -37.000 0.087 1.000   NA
 1784952 1784953 CHU_1892 CHU_1893   bcp TRUE 0.975 -3.000 0.021 1.000   NA
 1784953 1784954 CHU_1893 CHU_1894 bcp tktA TRUE 0.923 14.000 0.004 1.000 N NA
 1784954 1784955 CHU_1894 CHU_1895 tktA tktC TRUE 0.987 29.000 0.117 0.001 Y NA
 1784955 1784956 CHU_1895 CHU_1896 tktC fabH FALSE 0.180 126.000 0.000 1.000 N NA
 1784956 1784957 CHU_1896 CHU_1897 fabH menB FALSE 0.351 76.000 0.000 1.000 N NA
 1784957 1784958 CHU_1897 CHU_1898 menB   TRUE 0.513 42.000 0.000 NA   NA
 1784960 1784961 CHU_1900 CHU_1901   arcB TRUE 0.859 40.000 0.000 0.020 Y NA
 1784962 1784963 CHU_1902 CHU_1903     FALSE 0.033 308.000 0.000 NA   NA
 1784963 1784964 CHU_1903 CHU_1904     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 1784965 1784966 CHU_1905 CHU_1906     FALSE 0.039 280.000 0.000 NA   NA
 1784967 1428354 CHU_1907 CHU_tPro01     FALSE 0.026 375.000 0.000 NA   NA
 1428354 1428355 CHU_tPro01 CHU_tArg02     FALSE 0.329 72.000 0.000 NA   NA
 1428355 1428356 CHU_tArg02 CHU_tPro02     FALSE 0.273 83.000 0.000 NA   NA
 1428356 1428357 CHU_tPro02 CHU_tSer02     FALSE 0.227 94.000 0.000 NA   NA
 1784968 1784969 CHU_1908 CHU_1909   batC TRUE 0.975 0.000 0.015 NA   NA
 1784969 1784970 CHU_1909 CHU_1910 batC atoB FALSE 0.100 183.000 0.000 1.000   NA
 1784970 1784971 CHU_1910 CHU_1911 atoB   TRUE 0.986 4.000 0.030 NA   NA
 1784971 1784972 CHU_1911 CHU_1912   purC FALSE 0.153 125.000 0.000 NA   NA
 1784972 1784973 CHU_1912 CHU_1913 purC spoIIA TRUE 0.890 32.000 0.028 1.000 N NA
 1784973 1784974 CHU_1913 CHU_1914 spoIIA   TRUE 0.987 6.000 0.033 1.000   NA
 1784974 1784975 CHU_1914 CHU_1915     TRUE 0.908 -16.000 0.014 NA   NA
 1784977 1784978 CHU_1917 CHU_1918   hemF TRUE 0.968 7.000 0.006 1.000 N NA
 1784978 1784979 CHU_1918 CHU_1919 hemF ybjG TRUE 0.967 0.000 0.006 1.000   NA
 1784979 1784980 CHU_1919 CHU_1920 ybjG   TRUE 0.414 55.000 0.000 NA   NA
 1784981 1784982 CHU_1921 CHU_1922     TRUE 0.668 28.000 0.000 NA   NA
 1784982 1784983 CHU_1922 CHU_1923     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1784983 1784984 CHU_1923 CHU_1924     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1784984 1784985 CHU_1924 CHU_1925     TRUE 0.927 66.000 0.286 1.000 N NA
 1784985 1784986 CHU_1925 CHU_1926   ribE FALSE 0.193 116.000 0.000 1.000 N NA
 1784986 1784987 CHU_1926 CHU_1927 ribE   FALSE 0.164 117.000 0.000 NA N NA
 1784988 1784989 CHU_1928 CHU_1929 pcm yciA TRUE 0.963 -3.000 0.011 NA N NA
 1784989 1784990 CHU_1929 CHU_1930 yciA   FALSE 0.063 208.000 0.000 NA   NA
 1784990 1784991 CHU_1930 CHU_1931     TRUE 0.784 -13.000 0.000 NA   NA
 1784993 1784994 CHU_1933 CHU_1934     FALSE 0.124 146.000 0.000 NA   NA
 1784994 1784995 CHU_1934 CHU_1935     FALSE 0.022 460.000 0.000 NA   NA
 1784995 1784996 CHU_1935 CHU_1936     FALSE 0.265 85.000 0.000 NA   NA
 1785002 1785003 CHU_1942 CHU_1943     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1785004 1785005 CHU_1944 CHU_1946 yliI   FALSE 0.105 164.000 0.000 NA   NA
 1785006 1785007 CHU_1945 CHU_1947     TRUE 0.462 49.000 0.000 NA   NA
 1785008 1785009 CHU_1948 CHU_1949     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1785009 1428400 CHU_1949 CHU_tCys01     FALSE 0.059 214.000 0.000 NA   NA
 1428400 1785010 CHU_tCys01 CHU_1950     TRUE 0.772 20.000 0.000 NA   NA
 1785010 1785011 CHU_1950 CHU_1951   rpsA TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 1785013 1785014 CHU_1953 CHU_1954   nlpC FALSE 0.096 173.000 0.000 NA   NA
 1785014 1785015 CHU_1954 CHU_1955 nlpC smpB FALSE 0.077 191.000 0.000 NA   NA
 1785015 1785016 CHU_1955 CHU_1957 smpB gcp TRUE 0.988 3.000 0.002 1.000 Y NA
 1785017 1785018 CHU_1956 CHU_1958   phrB TRUE 0.775 31.000 0.006 NA   NA
 1785018 1785019 CHU_1958 CHU_1959 phrB   TRUE 0.928 6.000 0.000 NA   NA
 1785020 1785021 CHU_1960 CHU_1961   mscL TRUE 0.857 23.000 0.007 NA   NA
 1785022 1785023 CHU_1962 CHU_1963     TRUE 0.977 10.000 0.029 NA   NA
 1785023 1785024 CHU_1963 CHU_1964     TRUE 0.595 34.000 0.000 NA   NA
 1785024 1785025 CHU_1964 CHU_1965   atoC FALSE 0.024 410.000 0.000 NA   NA
 1785026 1785027 CHU_1966 CHU_1967 nrtD msmK TRUE 0.983 44.000 0.250 0.013 Y NA
 1785027 1785028 CHU_1967 CHU_1968 msmK nrtB TRUE 0.977 64.000 0.549 1.000 Y NA
 1785028 1785029 CHU_1968 CHU_1969 nrtB nrtA TRUE 0.974 76.000 0.767 NA Y NA
 1785029 1785030 CHU_1969 CHU_1970 nrtA   TRUE 0.755 64.000 0.033 NA   NA
 1785030 1785031 CHU_1970 CHU_1971   crp FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 1785031 1785032 CHU_1971 CHU_1973 crp   FALSE 0.194 114.000 0.000 1.000   NA
 1785033 1785034 CHU_1972 CHU_1974     FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1785034 1785035 CHU_1974 CHU_1975   trxC FALSE 0.079 189.000 0.000 NA   NA
 1785035 1785036 CHU_1975 CHU_1976 trxC   TRUE 0.962 72.000 0.677 0.004   NA
 1785037 1785038 CHU_1977 CHU_1978   flu FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1785038 1785039 CHU_1978 CHU_1979 flu chaA FALSE 0.059 240.000 0.000 1.000   NA
 1785039 1785040 CHU_1979 CHU_1980 chaA   TRUE 0.514 99.000 0.000 1.000 Y NA
 1785041 1785042 CHU_1981 CHU_1982 atoC kdpA FALSE 0.037 327.000 0.000 1.000 N NA
 1785042 1785043 CHU_1982 CHU_1983 kdpA kdpB TRUE 0.997 12.000 0.145 0.001 Y NA
 1785043 1785044 CHU_1983 CHU_1984 kdpB kdpC TRUE 0.999 14.000 0.877 0.001 Y NA
 1785044 1785045 CHU_1984 CHU_1985 kdpC   TRUE 0.923 27.000 0.031 1.000   NA
 1785045 1785046 CHU_1985 CHU_1986   kdpD TRUE 0.997 1.000 0.286 1.000   NA
 1785046 1785047 CHU_1986 CHU_1987 kdpD covS TRUE 0.996 1.000 0.122 0.011   NA
 1785048 1785049 CHU_1988 CHU_1989 atoS   FALSE 0.057 246.000 0.000 1.000 N NA
 1785049 1785050 CHU_1989 CHU_1990   yohF TRUE 0.974 31.000 0.286 1.000 N NA
 1785050 1785051 CHU_1990 CHU_1991 yohF   TRUE 0.783 22.000 0.000 1.000 N NA
 1785051 1785052 CHU_1991 CHU_1992   tktA FALSE 0.037 332.000 0.000 1.000 N NA
 1785055 1785056 CHU_1995 CHU_1996 alaDH   TRUE 0.937 0.000 0.000 1.000 N NA
 1785059 1785060 CHU_1999 CHU_2000     FALSE 0.108 161.000 0.000 NA   NA
 1785060 1785061 CHU_2000 CHU_2001     TRUE 0.457 56.000 0.000 1.000   NA
 1785061 1785062 CHU_2001 CHU_2002   dcd FALSE 0.158 138.000 0.000 1.000   NA
 1785062 1785063 CHU_2002 CHU_2003 dcd   FALSE 0.115 207.000 0.005 NA   NA
 1785063 1785064 CHU_2003 CHU_2004   pfs FALSE 0.067 203.000 0.000 NA   NA
 1785065 1785066 CHU_2005 CHU_2006 apt   FALSE 0.084 183.000 0.000 NA   NA
 1785067 1785068 CHU_2007 CHU_2008 ydgJ yiaD TRUE 0.940 6.000 0.000 1.000   NA
 1785068 1785069 CHU_2008 CHU_2009 yiaD   TRUE 0.573 36.000 0.000 NA   NA
 1785069 1785070 CHU_2009 CHU_2010     TRUE 0.830 16.000 0.000 NA   NA
 1785070 1785071 CHU_2010 CHU_2011     TRUE 0.923 0.000 0.000 NA   NA
 1785071 1785072 CHU_2011 CHU_2012     FALSE 0.081 188.000 0.000 NA   NA
 1785072 1785073 CHU_2012 CHU_2013     TRUE 0.760 126.000 0.224 NA   NA
 1785073 1785074 CHU_2013 CHU_2014     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785074 1785075 CHU_2014 CHU_2015   tonB TRUE 0.818 17.000 0.000 NA   NA
 1785075 1785076 CHU_2015 CHU_2016 tonB   TRUE 0.962 4.000 0.000 0.072 N NA
 1785076 1785077 CHU_2016 CHU_2017     TRUE 0.997 7.000 0.275 0.021   NA
 1785077 1785078 CHU_2017 CHU_2018   exbB TRUE 0.995 20.000 0.980 0.027   NA
 1785079 1785080 CHU_2019 CHU_2020 paaH   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 1785081 1785082 CHU_2021 CHU_2022 dps dapD FALSE 0.050 267.000 0.000 1.000 N NA
 1785083 1785084 CHU_2023 CHU_2024     FALSE 0.396 173.000 0.036 1.000 N NA
 1785084 1785085 CHU_2024 CHU_2025   mtsA TRUE 0.923 38.000 0.071 1.000 N NA
 1785085 1785086 CHU_2025 CHU_2026 mtsA   TRUE 0.930 160.000 0.898 1.000 Y NA
 1785086 1785087 CHU_2026 CHU_2027   troC TRUE 0.915 145.000 0.432 0.086 Y NA
 1785087 1785088 CHU_2027 CHU_2028 troC mntD TRUE 0.885 184.000 0.443 0.003 Y NA
 1785088 1785089 CHU_2028 CHU_2029 mntD   FALSE 0.339 78.000 0.000 1.000 N NA
 1785089 1785090 CHU_2029 CHU_2030   trmE TRUE 0.947 4.000 0.000 1.000   NA
 1785090 1785091 CHU_2030 CHU_2031 trmE   FALSE 0.168 113.000 0.000 NA   NA
 1785091 1785092 CHU_2031 CHU_2032     FALSE 0.021 488.000 0.000 NA   NA
 1785092 1428484 CHU_2032 CHU_2033     TRUE 0.803 18.000 0.000 NA   NA
 1428484 1785093 CHU_2033 CHU_2036   crtB TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785093 1785094 CHU_2036 CHU_2037 crtB   TRUE 0.977 5.000 0.014 NA   NA
 1785094 1785095 CHU_2037 CHU_2038   crtZ TRUE 0.656 90.000 0.041 NA   NA
 1785095 1785096 CHU_2038 CHU_2039 crtZ   TRUE 0.938 -142.000 0.164 NA   NA
 1785097 1785098 CHU_2040 CHU_2041     FALSE 0.086 256.000 0.000 0.003 N NA
 1785098 1785099 CHU_2041 CHU_2042     FALSE 0.094 242.000 0.000 0.003 N NA
 1785099 1785100 CHU_2042 CHU_2043     FALSE 0.098 235.000 0.000 0.003 N NA
 1785100 1785101 CHU_2043 CHU_2044     TRUE 0.774 64.000 0.000 0.003 Y NA
 1785101 1785102 CHU_2044 CHU_2045     FALSE 0.041 268.000 0.000 NA   NA
 1785103 1785104 CHU_2046 CHU_2047     TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 1785104 1785105 CHU_2047 CHU_2048     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 1785106 1785107 CHU_2049 CHU_2050 rsaD   FALSE 0.039 274.000 0.000 NA   NA
 1785107 1785108 CHU_2050 CHU_2051     TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785108 1785109 CHU_2051 CHU_2052     FALSE 0.188 104.000 0.000 NA   NA
 1785110 1785111 CHU_2053 CHU_2054     TRUE 0.898 -3.000 0.000 NA   NA
 1785111 1785112 CHU_2054 CHU_2055     TRUE 0.937 3.000 0.000 NA   NA
 1785113 1785114 CHU_2056 CHU_2057   atoS FALSE 0.120 167.000 0.000 1.000   NA
 1785117 1785118 CHU_2060 CHU_2061   xthA TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 1785118 1785119 CHU_2061 CHU_2062 xthA   FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 1785119 1785120 CHU_2062 CHU_2063   ucpA FALSE 0.018 743.000 0.000 NA   NA
 1785120 1785121 CHU_2063 CHU_2064 ucpA   FALSE 0.092 227.000 0.000 0.030   NA
 1785122 1785123 CHU_2065 CHU_2066 ordL   FALSE 0.083 201.000 0.000 1.000   NA
 1785127 1785128 CHU_2070 CHU_2071     FALSE 0.166 114.000 0.000 NA   NA
 1785129 1785130 CHU_2072 CHU_2073     TRUE 0.705 -22.000 0.000 NA   NA
 1785131 1785132 CHU_2074 CHU_2075     FALSE 0.116 154.000 0.000 NA   NA
 1785132 1785133 CHU_2075 CHU_2076   dps FALSE 0.020 538.000 0.000 NA   NA
 1785133 1785134 CHU_2076 CHU_2077 dps arcB FALSE 0.072 214.000 0.000 1.000 N NA
 1785134 1785135 CHU_2077 CHU_2078 arcB cheB TRUE 0.815 -13.000 0.000 1.000   NA
 1785135 1785136 CHU_2078 CHU_2079 cheB cheR TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 1785136 1785137 CHU_2079 CHU_2080 cheR   FALSE 0.267 187.000 0.000 1.000 Y NA
 1785139 1785140 CHU_2082 CHU_2084 cheY rcsC TRUE 0.985 7.000 0.000 0.020 Y NA
 1785141 1785142 CHU_2083 CHU_2085   ompR FALSE 0.118 152.000 0.000 NA   NA
 1785142 1785143 CHU_2085 CHU_2086 ompR   FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 1785146 1785147 CHU_2089 CHU_2090     TRUE 0.919 8.000 0.000 NA   NA
 1785147 1785148 CHU_2090 CHU_2091     TRUE 0.626 -37.000 0.000 NA   NA
 1785152 1785153 CHU_2095 CHU_2096 nfsA   FALSE 0.318 145.000 0.015 NA   NA
 1785153 1785154 CHU_2096 CHU_2097     FALSE 0.089 178.000 0.000 NA   NA
 1785154 1785155 CHU_2097 CHU_2098   emrR TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA   NA
 1785157 1785158 CHU_2100 CHU_2101   dgt TRUE 0.540 39.000 0.000 NA   NA
 1785158 1785159 CHU_2101 CHU_2102 dgt   TRUE 0.469 48.000 0.000 NA   NA
 1785159 1785160 CHU_2102 CHU_2103   cel FALSE 0.365 65.000 0.000 NA   NA
 1785160 1785161 CHU_2103 CHU_2104 cel   TRUE 0.522 41.000 0.000 NA   NA
 1785161 1785162 CHU_2104 CHU_2105   xynT FALSE 0.178 108.000 0.000 NA   NA
 1785162 1785163 CHU_2105 CHU_2106 xynT   FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 1785165 1785166 CHU_2108 CHU_2109     TRUE 0.990 -7.000 0.209 NA   NA
 1785166 1785167 CHU_2109 CHU_2110   fabZ TRUE 0.994 1.000 0.140 NA   NA
 1785167 1785168 CHU_2110 CHU_2111 fabZ   TRUE 0.993 2.000 0.087 NA   NA
 1785168 1785169 CHU_2111 CHU_2112     TRUE 0.955 -22.000 0.074 NA   NA
 1785169 1785170 CHU_2112 CHU_2113   yheN TRUE 0.992 -7.000 0.235 1.000 N NA
 1785170 1785171 CHU_2113 CHU_2114 yheN fabF TRUE 0.985 -13.000 0.200 1.000 N NA
 1785171 1785172 CHU_2114 CHU_2115 fabF fabG TRUE 0.999 -6.000 0.619 0.003 Y NA
 1785172 1785173 CHU_2115 CHU_2116 fabG acpP TRUE 0.990 19.000 0.381 1.000   NA
 1785173 1785174 CHU_2116 CHU_2117 acpP   TRUE 0.997 2.000 0.294 NA   NA
 1785174 1785175 CHU_2117 CHU_2118   fabF TRUE 0.997 5.000 0.353 NA   NA
 1785175 1785176 CHU_2118 CHU_2119 fabF   TRUE 0.996 4.000 0.174 NA   NA
 1785176 1785177 CHU_2119 CHU_2120     TRUE 0.992 5.000 0.083 NA   NA
 1785177 1785178 CHU_2120 CHU_2121     TRUE 0.918 29.000 0.042 NA   NA
 1785178 1785179 CHU_2121 CHU_2122     TRUE 0.907 32.000 0.036 1.000   NA
 1785179 1785180 CHU_2122 CHU_2123     TRUE 0.597 94.000 0.027 1.000   NA
 1785180 1785181 CHU_2123 CHU_2124   hutH TRUE 0.995 5.000 0.116 1.000 N NA
 1785181 1785182 CHU_2124 CHU_2125 hutH paaK TRUE 0.484 169.000 0.057 1.000 N NA
 1785182 1785183 CHU_2125 CHU_2126 paaK acpS TRUE 0.988 1.000 0.035 1.000 N NA
 1785183 1785184 CHU_2126 CHU_2127 acpS   TRUE 0.982 -3.000 0.035 1.000   NA
 1785185 1785186 CHU_2128 CHU_2129     TRUE 0.638 -34.000 0.000 NA   NA
 1785187 1785188 CHU_2130 CHU_2131     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 1785188 1785189 CHU_2131 CHU_2132     TRUE 0.561 37.000 0.000 NA   NA
 1785190 1785191 CHU_2133 CHU_2134     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785191 1785192 CHU_2134 CHU_2135     TRUE 0.991 -10.000 0.419 NA   NA
 1785192 1785193 CHU_2135 CHU_2136   yieN TRUE 0.996 0.000 0.302 NA   NA
 1785193 1785194 CHU_2136 CHU_2137 yieN   TRUE 0.997 -3.000 0.648 NA   NA
 1785197 1785198 CHU_2140 CHU_2141 tfdD   FALSE 0.046 281.000 0.000 1.000   NA
 1785198 1785199 CHU_2141 CHU_2142     FALSE 0.140 152.000 0.000 1.000   NA
 1785199 1785200 CHU_2142 CHU_2143   ate TRUE 0.724 27.000 0.000 1.000   NA
 1785200 1785201 CHU_2143 CHU_2144 ate   TRUE 0.684 30.000 0.000 1.000   NA
 1785203 1785204 CHU_2146 CHU_2147     TRUE 0.937 4.000 0.000 NA   NA
 1785204