MicrobesOnline Operon Predictions for Parachlamydia sp. UWE25

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 545356 545357 pc0002 pc0003     FALSE 0.098 309.000 0.000 NA   NA
 545357 545358 pc0003 pc0004     FALSE 0.097 404.000 0.000 NA   NA
 545359 545360 pc0005 pc0006     FALSE 0.128 734.000 0.000 NA   NA
 545360 545361 pc0006 pc0007     FALSE 0.181 146.000 0.000 NA   NA
 545362 545363 pc0008 pc0009 recC recB TRUE 0.976 12.000 0.000 0.003 Y NA
 545363 545364 pc0009 pc0010 recB recD TRUE 0.937 -3.000 0.000 0.003   NA
 545364 545365 pc0010 pc0011 recD   FALSE 0.123 691.000 0.000 NA   NA
 545367 545368 pc0013 pc0014 ssuA ssuB TRUE 0.983 -13.000 0.271 1.000 Y NA
 545368 545369 pc0014 pc0015 ssuB ssuC TRUE 0.990 -3.000 0.446 1.000 Y NA
 545370 545371 pc0016 pc0017 glmU rfaF FALSE 0.221 459.000 0.000 1.000 N NA
 545372 545373 pc0018 pc0019   ruvC TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545373 545374 pc0019 pc0020 ruvC ruvA TRUE 0.993 19.000 0.011 0.022 Y NA
 545375 545376 pc0021 pc0022 nth thdF TRUE 0.976 -15.000 0.007 0.034   NA
 545378 545379 pc0024 pc0025 ahpC   FALSE 0.220 229.000 0.000 1.000   NA
 545379 545380 pc0025 pct01   tRNA-Arg TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 545380 545381 pct01 pc0026 tRNA-Arg   FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 545382 545383 pc0027 pc0028 prmA   FALSE 0.103 461.000 0.000 NA   NA
 545384 545385 pc0029 pc0030   groEl FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 545385 545386 pc0030 pc0031 groEl groEs TRUE 0.941 25.000 0.000 0.011 Y NA
 545386 545387 pc0031 pc0032 groEs   FALSE 0.246 91.000 0.000 NA   NA
 545388 545389 pc0033 pc0034 putA mutD TRUE 0.660 -115.000 0.000 1.000 N NA
 545389 545390 pc0034 pc0035 mutD   FALSE 0.193 267.000 0.000 1.000   NA
 545395 545396 pc0040 pc0041     TRUE 0.582 90.000 0.000 0.045   NA
 545396 545397 pc0041 pc0042     TRUE 0.592 87.000 0.000 0.045   NA
 545397 545398 pc0042 pc0043     FALSE 0.097 382.000 0.000 NA   NA
 545398 545399 pc0043 pc0044     FALSE 0.281 79.000 0.000 NA   NA
 545399 545400 pc0044 pc0045     TRUE 0.565 95.000 0.000 0.045   NA
 545400 545401 pc0045 pc0046     FALSE 0.313 317.000 0.000 0.045   NA
 545403 545404 pc0048 pc0049     FALSE 0.265 993.000 0.000 1.000   NA
 545404 545405 pc0049 pc0050     FALSE 0.236 791.000 0.000 1.000   NA
 545405 545406 pc0050 pc0051     FALSE 0.239 816.000 0.000 1.000   NA
 545406 545407 pc0051 pc0052     FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 545407 545408 pc0052 pc0053     FALSE 0.226 103.000 0.000 NA   NA
 545408 545409 pc0053 pc0054     TRUE 0.733 47.000 0.000 0.045   NA
 545409 545410 pc0054 pc0055     TRUE 0.483 -40.000 0.000 NA   NA
 545410 545411 pc0055 pc0056     FALSE 0.096 352.000 0.000 NA   NA
 545411 545412 pc0056 pc0057     TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 545412 545413 pc0057 pc0058     FALSE 0.330 275.000 0.000 0.045   NA
 545413 545414 pc0058 pc0059     TRUE 0.726 48.000 0.000 0.045   NA
 545414 545415 pc0059 pc0060     FALSE 0.250 896.000 0.000 1.000   NA
 545415 545416 pc0060 pc0061     FALSE 0.162 1200.000 0.000 NA   NA
 545416 545417 pc0061 pc0062     FALSE 0.097 322.000 0.000 NA   NA
 545417 545418 pc0062 pc0063     FALSE 0.123 677.000 0.000 NA   NA
 545418 545419 pc0063 pc0064     FALSE 0.156 1002.000 0.000 NA   NA
 545419 545420 pc0064 pc0065     FALSE 0.110 264.000 0.000 NA   NA
 545420 545421 pc0065 pc0066     TRUE 0.475 -48.000 0.000 NA   NA
 545421 545422 pc0066 pc0067     TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 545422 545423 pc0067 pc0068     FALSE 0.182 282.000 0.000 1.000   NA
 545423 545424 pc0068 pc0069   aspC FALSE 0.178 297.000 0.000 1.000   NA
 545424 545425 pc0069 pc0070 aspC   FALSE 0.165 172.000 0.000 NA   NA
 545427 545428 pc0071 pc0072 topA dprA TRUE 0.938 82.000 0.238 1.000 Y NA
 545428 545429 pc0072 pc0073 dprA aroB TRUE 0.794 139.000 0.005 1.000 N NA
 545429 545430 pc0073 pc0074 aroB   FALSE 0.178 151.000 0.000 NA   NA
 545433 545434 pc0077 pc0078 parB copA TRUE 0.861 18.000 0.000 1.000 N NA
 545434 545435 pc0078 pc0079 copA   TRUE 0.737 -25.000 0.000 1.000 N NA
 545435 545436 pc0079 pc0080     TRUE 0.428 43.000 0.000 NA   NA
 545436 545437 pc0080 pc0081     TRUE 0.415 45.000 0.000 NA   NA
 545438 545439 pc0082 pc0083   gpsA TRUE 0.831 5.000 0.000 NA N NA
 545439 545440 pc0083 pc0084 gpsA   FALSE 0.124 231.000 0.000 NA   NA
 545440 545441 pc0084 pc0085     FALSE 0.325 65.000 0.000 NA   NA
 545441 545442 pc0085 pc0086     FALSE 0.229 221.000 0.000 1.000   NA
 545443 545444 pc0087 pc0088     FALSE 0.096 338.000 0.000 NA   NA
 545444 545445 pc0088 pc0089   mutY FALSE 0.312 138.000 0.000 1.000   NA
 545445 545446 pc0089 pc0090 mutY   FALSE 0.120 239.000 0.000 NA   NA
 545450 545451 pc0094 pc0095 napA nqrA TRUE 0.493 79.000 0.000 1.000 N NA
 545452 545453 pc0096 pc0097 oppF oppD TRUE 0.937 -3.000 0.000 0.003   NA
 545454 545455 pc0098 pc0099     TRUE 0.893 54.000 0.937 NA   NA
 545455 545456 pc0099 pc0100     TRUE 0.459 38.000 0.000 NA   NA
 545457 545458 pc0101 pc0102 oppC dppB TRUE 0.840 -30.000 0.000 0.026   NA
 545458 545459 pc0102 pc0103 dppB oppA TRUE 0.993 4.000 0.318 0.026   NA
 545459 545460 pc0103 pc0104 oppA   TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 545460 545461 pc0104 pc0105     TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 545463 545464 pc0107 pc0108   fliY FALSE 0.173 367.000 0.000 1.000   NA
 545465 545466 pc0109 pc0110 glgC   TRUE 0.909 70.000 0.070 1.000   NA
 545467 545468 pc0111 pc0112 nrdD   FALSE 0.167 167.000 0.000 NA   NA
 545468 545469 pc0112 pc0113     TRUE 0.639 -7.000 0.000 NA   NA
 545469 545470 pc0113 pc0114   batE FALSE 0.120 239.000 0.000 NA   NA
 545470 545471 pc0114 pc0115 batE   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545471 545472 pc0115 pc0116     TRUE 0.424 44.000 0.000 NA   NA
 545472 545473 pc0116 pc0117     TRUE 0.472 -49.000 0.000 NA   NA
 545473 545474 pc0117 pc0118     TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 545474 545475 pc0118 pc0119   batA FALSE 0.170 163.000 0.000 NA   NA
 545478 545479 pc0122 pc0123   rfbA FALSE 0.262 84.000 0.000 NA   NA
 545479 545480 pc0123 pc0124 rfbA rfbC TRUE 0.868 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 545480 545481 pc0124 pc0125 rfbC rfbD TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 545481 545482 pc0125 pc0126 rfbD rfbB TRUE 0.996 3.000 0.455 0.006 Y NA
 545483 545484 pc0127 pc0128 emrB emrA TRUE 0.863 2.000 0.000 1.000   NA
 545484 545485 pc0128 pc0129 emrA   TRUE 0.782 23.000 0.000 1.000   NA
 545485 545486 pc0129 pc0130     FALSE 0.289 76.000 0.000 NA   NA
 545486 545487 pc0130 pc0131   rluA TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545488 545489 pc0132 pc0133 rpsT   FALSE 0.309 141.000 0.000 1.000   NA
 545489 545490 pc0133 pc0134     TRUE 0.634 -51.000 0.000 1.000   NA
 545490 545491 pc0134 pc0135     TRUE 0.707 30.000 0.000 1.000   NA
 545491 545492 pc0135 pct03   tRNA-Gly FALSE 0.281 79.000 0.000 NA   NA
 545492 545493 pct03 pc0136 tRNA-Gly rpsB FALSE 0.188 137.000 0.000 NA   NA
 545493 545494 pc0136 pc0137 rpsB tsf TRUE 0.992 2.000 0.748 1.000 Y NA
 545494 545495 pc0137 pc0138 tsf   FALSE 0.184 459.000 0.000 1.000   NA
 545497 545498 pc0140 pc0141 pcnB   TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 545498 545499 pc0141 pc0142     FALSE 0.319 135.000 0.000 1.000   NA
 545499 545500 pc0142 pc0143   eno TRUE 0.859 14.000 0.000 1.000   NA
 545500 545501 pc0143 pc0144 eno   TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 545504 545505 pc0147 pc0148   aspH FALSE 0.348 57.000 0.000 NA   NA
 545508 545509 pc0151 pc0152 lpdA lipA TRUE 0.971 24.000 0.009 1.000 N NA
 545509 545510 pc0152 pc0153 lipA   TRUE 0.850 15.000 0.000 1.000   NA
 545510 545511 pc0153 pc0154     FALSE 0.392 751.000 0.000 0.044   NA
 545513 545514 pc0156 pc0157     FALSE 0.216 112.000 0.000 NA   NA
 545515 545516 pc0158 pc0159     FALSE 0.198 130.000 0.000 NA   NA
 545516 545517 pc0159 pc0160   yjbC TRUE 0.916 7.000 0.000 NA Y NA
 545518 545519 pc0161 pc0162 pgmA nifS TRUE 0.988 7.000 0.021 1.000 N NA
 545519 545520 pc0162 pc0163 nifS   TRUE 0.988 2.000 0.138 1.000 N NA
 545521 545522 pc0164 pc0165   birA FALSE 0.100 436.000 0.000 NA   NA
 545523 545524 pc0166 pc0167 rodA   TRUE 0.742 15.000 0.000 NA   NA
 545524 545525 pc0167 pc0168   tyrP_1 FALSE 0.132 219.000 0.000 NA   NA
 545525 545526 pc0168 pc0169 tyrP_1 tyrP_2 TRUE 0.953 23.000 0.000 0.006 Y NA
 545526 545527 pc0169 pc0170 tyrP_2 trpS TRUE 0.848 20.000 0.000 1.000 N NA
 545527 545528 pc0170 pc0171 trpS   FALSE 0.394 90.000 0.000 1.000   NA
 545528 545529 pc0171 pc0172     FALSE 0.369 370.000 0.000 0.011   NA
 545529 545530 pc0172 pc0173     FALSE 0.368 368.000 0.000 0.011   NA
 545530 545531 pc0173 pc0174   uvrB FALSE 0.214 237.000 0.000 1.000   NA
 545532 545533 pc0175 pc0176   dinG FALSE 0.097 383.000 0.000 NA   NA
 545533 545534 pc0176 pc0177 dinG sigA TRUE 0.689 65.000 0.000 1.000 Y NA
 545535 545536 pc0178 pc0179     FALSE 0.236 95.000 0.000 NA   NA
 545537 545538 pc0180 pc0181   wzt TRUE 0.898 5.000 0.000 1.000 N NA
 545538 545539 pc0181 pc0182 wzt wzm TRUE 0.990 8.000 0.621 1.000 N NA
 545539 545540 pc0182 pc0183 wzm   FALSE 0.210 117.000 0.000 NA   NA
 545543 545544 pc0186 pc0187 wza wzc TRUE 0.640 68.000 0.000 0.084   NA
 545544 545545 pc0187 pc0188 wzc   TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 545545 545546 pc0188 pc0189   sufB FALSE 0.100 290.000 0.000 NA   NA
 545546 545547 pc0189 pc0190 sufB sufC TRUE 0.921 108.000 0.466 1.000 Y NA
 545547 545548 pc0190 pc0191 sufC sufD TRUE 0.975 -39.000 0.482 1.000 Y NA
 545548 545549 pc0191 pc0192 sufD sufS TRUE 0.988 3.000 0.101 1.000 N NA
 545549 545550 pc0192 pc0193 sufS   TRUE 0.834 6.000 0.000 NA N NA
 545551 545552 pc0194 pc0195   npr FALSE 0.118 620.000 0.000 NA   NA
 545552 545553 pc0195 pc0196 npr glpQ FALSE 0.215 235.000 0.000 1.000   NA
 545553 545554 pc0196 pc0197 glpQ   FALSE 0.150 197.000 0.000 NA   NA
 545555 545556 pc0198 pc0199 ppaB ppaA TRUE 0.903 -3.000 0.000 0.063   NA
 545557 545558 pc0200 pc0201 yscT sctS TRUE 0.950 85.000 0.875 0.084 Y NA
 545558 545559 pc0201 pc0202 sctS yscR TRUE 0.995 15.000 0.700 0.013 Y NA
 545559 545560 pc0202 pc0203 yscR yscL TRUE 0.993 11.000 0.700 1.000 Y NA
 545560 545561 pc0203 pc0204 yscL   TRUE 0.976 -3.000 0.556 NA   NA
 545561 545562 pc0204 pc0205   yscJ TRUE 0.955 27.000 0.875 NA   NA
 545562 545563 pc0205 pc0206 yscJ rs10 FALSE 0.221 280.000 0.000 1.000 N NA
 545563 545564 pc0206 pc0207 rs10 fusA TRUE 0.986 18.000 0.007 1.000 Y NA
 545564 545565 pc0207 pc0208 fusA rpsG TRUE 0.990 13.000 0.008 1.000 Y NA
 545565 545566 pc0208 pc0209 rpsG rs12 TRUE 0.935 167.000 0.029 0.007 Y NA
 545566 545567 pc0209 pc0210 rs12   FALSE 0.159 636.000 0.000 NA N NA
 545567 545568 pc0210 pc0211     TRUE 0.976 -3.000 0.570 NA   NA
 545568 545569 pc0211 pc0212     FALSE 0.179 148.000 0.000 NA   NA
 545570 545571 pc0213 pc0214   tsp FALSE 0.159 1135.000 0.000 NA   NA
 545575 545576 pc0217 pc0218 rplU r(p)l27 TRUE 0.991 -10.000 0.667 0.031 Y NA
 545576 545577 pc0218 pc0219 r(p)l27 yhbZ TRUE 0.863 119.000 0.335 1.000   NA
 545578 545579 pc0220 pc0221   rho FALSE 0.098 304.000 0.000 NA   NA
 545579 545580 pc0221 pc0222 rho yacE TRUE 0.956 34.000 0.013 1.000 N NA
 545580 545581 pc0222 pc0223 yacE polA TRUE 0.979 -6.000 0.068 1.000 N NA
 545581 545582 pc0223 pc0224 polA sohB TRUE 0.966 24.000 0.006 1.000 N NA
 545583 545584 pc0225 pc0226   yvgR TRUE 0.903 9.000 0.000 1.000 N NA
 545586 545587 pc0228 pc0229   murA FALSE 0.162 178.000 0.000 NA   NA
 545587 545588 pc0229 pc0230 murA yodO FALSE 0.343 156.000 0.000 1.000 N NA
 545590 545591 pc0232 pc0233 clpB   FALSE 0.097 395.000 0.000 NA   NA
 545591 545592 pc0233 pc0234   yjeE TRUE 0.914 40.000 0.010 NA   NA
 545592 545593 pc0234 pc0235 yjeE   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545593 545594 pc0235 pc0236   dnaQ_2 TRUE 0.945 6.000 0.000 0.032   NA
 545594 545595 pc0236 pc0237 dnaQ_2   TRUE 0.871 16.000 0.000 1.000 N NA
 545595 545596 pc0237 pc0238   hisH TRUE 0.991 4.000 0.488 NA Y NA
 545596 545597 pc0238 pc0239 hisH pgk FALSE 0.303 94.000 0.000 NA N NA
 545597 545598 pc0239 pc0240 pgk ntt_3 FALSE 0.231 522.000 0.000 1.000 N NA
 545598 545599 pc0240 pc0241 ntt_3 ntt_2 TRUE 0.749 125.000 0.000 0.003 Y NA
 545600 545601 pc0242 pc0243 pgsA   TRUE 0.421 213.000 0.000 0.083 N NA
 545601 545602 pc0243 pc0244   gltX TRUE 0.511 74.000 0.000 1.000 N NA
 545602 545603 pc0244 pc0245 gltX   FALSE 0.098 308.000 0.000 NA   NA
 545603 545604 pc0245 pc0246   tsp FALSE 0.246 91.000 0.000 NA   NA
 545606 545607 pc0248 pc0249   recJ TRUE 0.853 -3.000 0.000 1.000 N NA
 545608 545609 pc0250 pc0251 ntt_1 secDf FALSE 0.180 442.000 0.000 1.000   NA
 545610 545611 pc0252 pc0253     FALSE 0.098 406.000 0.000 NA   NA
 545612 545613 pc0254 pc0255     TRUE 0.535 -24.000 0.000 NA   NA
 545613 545614 pc0255 pc0256   ytgA TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545614 545615 pc0256 pc0257 ytgA ytgB TRUE 0.976 -25.000 0.898 1.000 Y NA
 545615 545616 pc0257 pc0258 ytgB ytgC TRUE 0.992 2.000 0.432 1.000 Y NA
 545616 545617 pc0258 pc0259 ytgC ytgD TRUE 0.992 -10.000 0.443 0.007 Y NA
 545617 545618 pc0259 pc0260 ytgD dxr TRUE 0.877 84.000 0.008 1.000 N NA
 545618 545619 pc0260 pc0261 dxr   TRUE 0.936 49.000 0.568 1.000   NA
 545619 545620 pc0261 pc0262     FALSE 0.190 502.000 0.000 1.000   NA
 545620 545621 pc0262 pc0263     FALSE 0.111 559.000 0.000 NA   NA
 545624 545625 pc0266 pc0267 ptsN ptsN TRUE 0.908 319.000 0.231 0.002 Y NA
 545625 545626 pc0267 pc0268 ptsN dut TRUE 0.825 135.000 0.008 1.000 N NA
 545626 545627 pc0268 pc0269 dut accD TRUE 0.987 9.000 0.008 1.000 N NA
 545627 545628 pc0269 pc0270 accD sodM FALSE 0.281 213.000 0.000 1.000 N NA
 545628 545629 pc0270 pc0271 sodM   FALSE 0.283 212.000 0.000 1.000 N NA
 545629 545630 pc0271 pc0272   hemC TRUE 0.992 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 545630 545631 pc0272 pc0273 hemC sms TRUE 0.948 -34.000 0.007 1.000 N NA
 545631 545632 pc0273 pc0274 sms rnc TRUE 0.966 25.000 0.007 1.000 N NA
 545633 545634 pc0275 pc0276     FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 545636 545637 pc0278 pc0279     TRUE 0.432 -141.000 0.000 NA   NA
 545637 545638 pc0279 pc0280     FALSE 0.293 75.000 0.000 NA   NA
 545638 545639 pc0280 pc0281   gcvT TRUE 0.476 68.000 0.000 1.000   NA
 545639 545640 pc0281 pc0282 gcvT gcvH TRUE 0.995 -3.000 0.202 0.002 Y NA
 545640 545641 pc0282 pc0283 gcvH gcvP1 TRUE 0.992 1.000 0.130 1.000 Y NA
 545641 545642 pc0283 pc0284 gcvP1 gcvP2 TRUE 0.994 23.000 0.316 0.002 Y NA
 545645 545646 pc0287 pc0288 cadA czcA TRUE 0.879 -43.000 0.000 0.063 Y NA
 545646 545647 pc0288 pc0289 czcA czcB TRUE 0.893 3.000 0.000 1.000 N NA
 545647 545648 pc0289 pc0290 czcB czcC TRUE 0.942 5.000 0.000 1.000 Y NA
 545650 545651 pc0292 pc0293     FALSE 0.096 347.000 0.000 NA   NA
 545651 545652 pc0293 pc0294     TRUE 0.540 -22.000 0.000 NA   NA
 545652 545653 pc0294 pc0295     FALSE 0.132 764.000 0.000 NA   NA
 545653 545654 pc0295 pc0296     FALSE 0.096 353.000 0.000 NA   NA
 545654 545655 pc0296 pc0297     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545655 545656 pc0297 pc0298   nqrE FALSE 0.112 569.000 0.000 NA   NA
 545656 545657 pc0298 pc0299 nqrE nqrD TRUE 0.989 31.000 0.034 0.005 Y NA
 545657 545658 pc0299 pc0300 nqrD nqrC TRUE 0.996 10.000 0.034 0.005 Y NA
 545658 545659 pc0300 pc0301 nqrC nqrB TRUE 0.987 -13.000 0.093 0.002   NA
 545659 545660 pc0301 pc0302 nqrB   FALSE 0.110 264.000 0.000 NA   NA
 545661 545662 pc0303 pc0304     FALSE 0.299 73.000 0.000 NA   NA
 545662 545663 pc0304 pc0305   comF TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 545664 545665 pc0306 pc0307 corA dnaA FALSE 0.332 167.000 0.000 1.000 N NA
 545667 545668 pc0309 pc0310     TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 545669 545670 pc0311 pc0312 mraW   TRUE 0.977 9.000 0.007 NA   NA
 545670 545671 pc0312 pc0313   pbp2 TRUE 0.983 5.000 0.135 NA   NA
 545671 545672 pc0313 pc0314 pbp2 murE TRUE 0.990 16.000 0.022 1.000 Y NA
 545672 545673 pc0314 pc0315 murE amiA TRUE 0.977 29.000 0.014 1.000 Y NA
 545673 545674 pc0315 pc0316 amiA   FALSE 0.330 126.000 0.000 1.000   NA
 545677 545678 pc0318 pc0319 plsC cmk TRUE 0.983 15.000 0.008 1.000 N NA
 545678 545679 pc0319 pc0320 cmk cdsA TRUE 0.917 53.000 0.008 1.000 N NA
 545679 545680 pc0320 pc0321 cdsA uppS TRUE 0.971 -94.000 0.400 1.000 Y NA
 545680 545681 pc0321 pc0322 uppS lepA TRUE 0.478 82.000 0.000 1.000 N NA
 545681 545682 pc0322 pct06 lepA tRNA-Leu FALSE 0.211 116.000 0.000 NA   NA
 545685 545686 pc0325 pc0326   ykuE TRUE 0.818 187.000 0.316 1.000   NA
 545686 545687 pc0326 pc0327 ykuE ispD TRUE 0.983 2.000 0.010 1.000   NA
 545687 545688 pc0327 pc0328 ispD truA TRUE 0.964 -13.000 0.007 1.000 N NA
 545690 545691 pc0330 pct07   tRNA-Leu FALSE 0.375 50.000 0.000 NA   NA
 545691 545692 pct07 pc0331 tRNA-Leu   FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 545692 545693 pc0331 pc0332     FALSE 0.130 742.000 0.000 NA   NA
 545694 545695 pc0333 pc0334   ppaA FALSE 0.097 323.000 0.000 NA   NA
 545695 545696 pc0334 pc0335 ppaA ppaA FALSE 0.347 609.000 0.000 0.061   NA
 545696 545697 pc0335 pc0336 ppaA ppa FALSE 0.366 721.000 0.000 0.061   NA
 545697 545698 pc0336 pc0337 ppa   FALSE 0.097 404.000 0.000 NA   NA
 545698 545699 pc0337 pc0338     FALSE 0.274 81.000 0.000 NA   NA
 545699 545700 pc0338 pc0339     FALSE 0.120 239.000 0.000 NA   NA
 545700 545701 pc0339 pct08   tRNA-Arg TRUE 0.742 15.000 0.000 NA   NA
 545702 545703 pc0340 pct09   tRNA-Leu FALSE 0.364 52.000 0.000 NA   NA
 545703 545704 pct09 pc0341 tRNA-Leu   FALSE 0.199 127.000 0.000 NA   NA
 545705 545706 pc0342 pc0343     FALSE 0.096 330.000 0.000 NA   NA
 545706 545707 pc0343 pc0344     FALSE 0.186 139.000 0.000 NA   NA
 545708 545709 pc0345 pc0346 nfo asnS FALSE 0.371 135.000 0.000 1.000 N NA
 545713 545714 pc0350 pc0351 gyrB gyrA TRUE 0.969 81.000 0.110 0.004 Y NA
 545714 545715 pc0351 pc0352 gyrA   FALSE 0.349 114.000 0.000 1.000   NA
 545715 545716 pc0352 pc0353     FALSE 0.220 108.000 0.000 NA   NA
 545716 545717 pc0353 pc0354     FALSE 0.112 258.000 0.000 NA   NA
 545717 545718 pc0354 pc0355   rluD TRUE 0.730 16.000 0.000 NA   NA
 545718 545719 pc0355 pc0356 rluD dtd TRUE 0.924 17.000 0.000 1.000 Y NA
 545719 545720 pc0356 pc0357 dtd   FALSE 0.226 224.000 0.000 1.000   NA
 545721 545722 pc0358 pct10   tRNA-Arg TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 545722 545723 pct10 pc0359 tRNA-Arg   FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 545723 545724 pc0359 pc0360     TRUE 0.653 -6.000 0.000 NA   NA
 545725 545726 pc0361 pc0362 folK kdsA TRUE 0.753 30.000 0.000 1.000 N NA
 545726 545727 pc0362 pc0363 kdsA   TRUE 0.787 10.000 0.000 NA   NA
 545727 545728 pc0363 pc0364     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545728 545729 pc0364 pc0365     TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 545730 545731 pc0366 pc0367 ndk pabA TRUE 0.753 30.000 0.000 1.000 N NA
 545731 545732 pc0367 pc0368 pabA ndk TRUE 0.890 13.000 0.000 1.000 N NA
 545733 545734 pc0369 pc0370 pheT   TRUE 0.659 22.000 0.000 NA   NA
 545735 545736 pc0371 pc0372 fdxC   TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 545737 545738 pc0373 pc0374     FALSE 0.114 588.000 0.000 NA   NA
 545740 545741 pc0376 pc0377     TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 545746 545747 pc0382 pc0383   mip TRUE 0.484 81.000 0.000 1.000 N NA
 545747 545748 pc0383 pc0384 mip aspS TRUE 0.610 48.000 0.000 1.000 N NA
 545748 545749 pc0384 pc0385 aspS hisS TRUE 0.908 166.000 0.009 0.049 Y NA
 545749 545750 pc0385 pc0386 hisS   FALSE 0.112 259.000 0.000 NA   NA
 545751 545752 pc0387 pc0388 uhpC   FALSE 0.162 1220.000 0.000 NA   NA
 545752 545753 pc0388 pc0389   dnaE FALSE 0.096 334.000 0.000 NA   NA
 545753 545754 pc0389 pc0390 dnaE   FALSE 0.370 99.000 0.000 1.000   NA
 545754 545755 pc0390 pc0391     TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 545755 545756 pc0391 pc0392   rsbW TRUE 0.977 16.000 0.875 NA   NA
 545759 545760 pc0395 pc0396 ksgA   TRUE 0.880 9.000 0.000 1.000   NA
 545760 545761 pc0396 pc0397   rsmB TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 545762 545763 pc0398 pc0399 ddlA zip FALSE 0.330 126.000 0.000 1.000   NA
 545763 545764 pc0399 pc0400 zip cutE FALSE 0.176 310.000 0.000 1.000   NA
 545764 545765 pc0400 pc0401 cutE envA TRUE 0.885 136.000 0.012 1.000 Y NA
 545765 545766 pc0401 pc0402 envA fabZ TRUE 0.984 0.000 0.012 1.000 N NA
 545766 545767 pc0402 pc0403 fabZ lpxA TRUE 0.942 47.000 0.048 1.000 N NA
 545767 545768 pc0403 pc0404 lpxA fmt TRUE 0.981 0.000 0.007 1.000 N NA
 545769 545770 pc0405 pc0406     FALSE 0.174 156.000 0.000 NA   NA
 545770 545771 pc0406 pc0407     TRUE 0.415 45.000 0.000 NA   NA
 545772 545773 pc0408 pc0409     TRUE 0.439 41.000 0.000 NA   NA
 545773 545774 pc0409 pc0410     TRUE 0.439 41.000 0.000 NA   NA
 545774 545775 pc0410 pc0411     FALSE 0.214 114.000 0.000 NA   NA
 545775 545776 pc0411 pc0412   rplC FALSE 0.151 979.000 0.000 NA   NA
 545776 545777 pc0412 pc0413 rplC rplD TRUE 0.989 27.000 0.020 0.029 Y NA
 545777 545778 pc0413 pc0414 rplD rplW TRUE 0.994 15.000 0.013 0.029 Y NA
 545778 545779 pc0414 pc0415 rplW rplB TRUE 0.994 18.000 0.849 0.035 Y NA
 545779 545780 pc0415 pc0416 rplB rpsS TRUE 0.995 3.000 0.820 0.040 Y NA
 545780 545781 pc0416 pc0417 rpsS rplV TRUE 0.995 12.000 0.769 0.040 Y NA
 545781 545782 pc0417 pc0418 rplV rpsC TRUE 0.996 12.000 0.719 0.040 Y NA
 545782 545783 pc0418 pc0419 rpsC rplP TRUE 0.995 3.000 0.828 0.040 Y NA
 545783 545784 pc0419 pc0420 rplP rpmC TRUE 0.993 7.000 0.802 0.029   NA
 545784 545785 pc0420 pc0421 rpmC rpsQ TRUE 0.992 3.000 0.828 0.029   NA
 545785 545786 pc0421 pc0422 rpsQ rplN TRUE 0.921 191.000 0.791 0.040 Y NA
 545786 545787 pc0422 pc0423 rplN rplX TRUE 0.992 21.000 0.810 0.040 Y NA
 545787 545788 pc0423 pc0424 rplX rplE TRUE 0.995 14.000 0.758 0.029 Y NA
 545788 545789 pc0424 pc0425 rplE rpsH TRUE 0.995 15.000 0.059 0.029 Y NA
 545789 545790 pc0425 pc0426 rpsH rplF TRUE 0.995 16.000 0.808 0.029 Y NA
 545790 545791 pc0426 pc0427 rplF rplR TRUE 0.994 17.000 0.815 0.029 Y NA
 545791 545792 pc0427 pc0428 rplR rpsE TRUE 0.983 36.000 0.814 0.040 Y NA
 545792 545793 pc0428 pc0429 rpsE rplO TRUE 0.996 9.000 0.148 0.040 Y NA
 545793 545794 pc0429 pc0430 rplO secY TRUE 0.779 240.000 0.730 1.000 N NA
 545794 545795 pc0430 pc0431 secY rpsM TRUE 0.847 120.000 0.011 1.000 N NA
 545795 545796 pc0431 pc0432 rpsM rpsK TRUE 0.994 19.000 0.810 0.029 Y NA
 545796 545797 pc0432 pc0433 rpsK rpoA TRUE 0.856 151.000 0.308 1.000 N NA
 545797 545798 pc0433 pc0434 rpoA rplQ TRUE 0.989 11.000 0.873 1.000 N NA
 545798 545799 pc0434 pc0435 rplQ gapA TRUE 0.745 932.000 0.006 1.000 N NA
 545801 545802 pc0437 pct11   tRNA-Leu FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 545804 545805 pc0439 pc0440     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 545806 545807 pc0441 pc0442   dapF TRUE 0.744 134.000 0.008 NA   NA
 545807 545808 pc0442 pc0443 dapF clpP TRUE 0.984 9.000 0.006 1.000 N NA
 545808 545809 pc0443 pc0444 clpP glyA TRUE 0.866 120.000 0.051 1.000 N NA
 545809 545810 pc0444 pc0445 glyA   FALSE 0.174 390.000 0.000 1.000   NA
 545812 545813 pc0447 pc0448     FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 545813 545814 pc0448 pc0449   folE FALSE 0.278 80.000 0.000 NA   NA
 545814 545815 pc0449 pc0450 folE trmH TRUE 0.902 8.000 0.000 1.000 N NA
 545815 545816 pc0450 pc0451 trmH   TRUE 0.548 49.000 0.000 1.000   NA
 545816 545817 pc0451 pc0452     FALSE 0.185 279.000 0.000 1.000   NA
 545817 545818 pc0452 pc0453   yaeC FALSE 0.167 227.000 0.000 NA N NA
 545818 545819 pc0453 pc0454 yaeC yaeE TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA Y NA
 545819 545820 pc0454 pc0455 yaeE abc TRUE 0.950 63.000 0.074 1.000 Y NA
 545820 545821 pc0455 pc0456 abc   FALSE 0.210 117.000 0.000 NA   NA
 545821 545822 pc0456 pc0457     FALSE 0.217 111.000 0.000 NA   NA
 545822 545823 pc0457 pc0458   xerC FALSE 0.117 248.000 0.000 NA   NA
 545823 545824 pc0458 pc0459 xerC elaC TRUE 0.940 37.000 0.009 1.000   NA
 545824 545825 pc0459 pc0460 elaC glpG TRUE 0.863 2.000 0.000 1.000   NA
 545825 545826 pc0460 pc0461 glpG rfaE TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000   NA
 545826 545827 pc0461 pc0462 rfaE lon TRUE 0.850 15.000 0.000 1.000   NA
 545828 545829 pc0463 pc0464     FALSE 0.344 59.000 0.000 NA   NA
 545829 545830 pc0464 pc0465   dgt FALSE 0.139 210.000 0.000 NA   NA
 545830 545831 pc0465 pc0466 dgt   TRUE 0.895 12.000 0.000 1.000 N NA
 545831 545832 pc0466 pc0467   rpsU TRUE 0.715 206.000 0.006 1.000   NA
 545832 545833 pc0467 pc0468 rpsU dnaJ TRUE 0.819 186.000 0.412 1.000   NA
 545834 545835 pc0469 pc0470   ftsK TRUE 0.678 387.000 0.016 1.000   NA
 545835 545836 pc0470 pc0471 ftsK bacA TRUE 0.674 -66.000 0.000 1.000 N NA
 545836 545837 pc0471 pct12 bacA tRNA-His FALSE 0.185 141.000 0.000 NA   NA
 545837 545838 pct12 pc0472 tRNA-His   FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 545839 545840 pc0473 pc0474   hprK TRUE 0.789 9.000 0.000 NA   NA
 545840 545841 pc0474 pc0475 hprK ptsH TRUE 0.958 36.000 0.036 1.000 N NA
 545841 545842 pc0475 pc0476 ptsH ptsI TRUE 0.996 4.000 0.026 0.005 Y NA
 545843 545844 pc0477 pc0478   dnaX TRUE 0.750 899.000 0.411 NA   NA
 545846 545847 pc0480 pc0481     FALSE 0.400 88.000 0.000 1.000   NA
 545847 545848 pc0481 pc0482     FALSE 0.230 99.000 0.000 NA   NA
 545848 545849 pc0482 pc0483     TRUE 0.684 252.000 0.750 NA   NA
 545850 545851 pc0484 pc0485 phoH ntt_4 FALSE 0.208 186.000 0.000 NA N NA
 545851 545852 pc0485 pc0486 ntt_4   FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 545852 545853 pc0486 pc0487   mutT FALSE 0.100 435.000 0.000 NA   NA
 545854 545855 pc0488 pc0489     TRUE 0.459 38.000 0.000 NA   NA
 545855 545856 pc0489 pc0490     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545859 545860 pc0493 pc0494   ileS FALSE 0.117 609.000 0.000 NA   NA
 545860 545861 pc0494 pc0495 ileS   FALSE 0.199 127.000 0.000 NA   NA
 545862 545863 pc0496 pc0497 lepB   TRUE 0.658 419.000 0.333 NA   NA
 545866 545867 pc0500 pc0501     FALSE 0.258 86.000 0.000 NA   NA
 545867 545868 pc0501 pct13   tRNA-Met FALSE 0.348 57.000 0.000 NA   NA
 545870 545871 pc0503 pc0504 alkA   FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 545871 545872 pc0504 pc0505     TRUE 0.525 32.000 0.000 NA   NA
 545872 545873 pc0505 pc0506     FALSE 0.097 327.000 0.000 NA   NA
 545873 545874 pc0506 pc0507     TRUE 0.602 -12.000 0.000 NA   NA
 545874 545875 pc0507 pc0508     TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 545875 545876 pc0508 pc0509     FALSE 0.101 445.000 0.000 NA   NA
 545876 545877 pc0509 pc0510     FALSE 0.296 74.000 0.000 NA   NA
 545878 545879 pc0511 pc0512     FALSE 0.197 131.000 0.000 NA   NA
 545880 545881 pc0513 pc0514     FALSE 0.198 128.000 0.000 NA   NA
 545881 545882 pc0514 pc0515     FALSE 0.107 269.000 0.000 NA   NA
 545882 545883 pc0515 pc0516     FALSE 0.116 600.000 0.000 NA   NA
 545883 545884 pc0516 pc0517     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 545884 545885 pc0517 pc0518   ada FALSE 0.096 359.000 0.000 NA   NA
 545885 545886 pc0518 pc0519 ada vatB FALSE 0.237 799.000 0.000 1.000   NA
 545886 545887 pc0519 pc0520 vatB   FALSE 0.193 267.000 0.000 1.000   NA
 545887 545888 pc0520 pc0521     FALSE 0.158 1059.000 0.000 NA   NA
 545888 545889 pc0521 pc0522     FALSE 0.166 2381.000 0.000 NA   NA
 545889 545890 pc0522 pc0523     FALSE 0.099 430.000 0.000 NA   NA
 545890 545891 pc0523 pc0524     FALSE 0.107 503.000 0.000 NA   NA
 545892 545893 pc0525 pc0526     FALSE 0.096 347.000 0.000 NA   NA
 545894 545895 pc0527 pc0528     TRUE 0.918 15.000 0.000 0.075   NA
 545895 545896 pc0528 pc0529     FALSE 0.169 164.000 0.000 NA   NA
 545899 545900 pc0532 pc0533     FALSE 0.096 362.000 0.000 NA   NA
 545901 545902 pc0534 pc0535     FALSE 0.103 471.000 0.000 NA   NA
 545902 545903 pc0535 pc0536     FALSE 0.105 495.000 0.000 NA   NA
 545903 545904 pc0536 pc0537     FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 545904 545905 pc0537 pc0538   rtxA FALSE 0.171 160.000 0.000 NA   NA
 545906 545907 pc0539 pc0540     FALSE 0.096 346.000 0.000 NA   NA
 545907 545908 pc0540 pc0541   def FALSE 0.238 94.000 0.000 NA   NA
 545909 545910 pc0542 pc0543   mocA FALSE 0.115 589.000 0.000 NA   NA
 545912 545913 pc0545 pc0546   map FALSE 0.157 189.000 0.000 NA   NA
 545914 545915 pc0547 pc0548   rf-2 FALSE 0.260 85.000 0.000 NA   NA
 545916 545917 pc0549 pc0550   acrA FALSE 0.174 325.000 0.000 1.000   NA
 545917 545918 pc0550 pc0551 acrA acrB TRUE 0.983 -3.000 0.833 1.000 N NA
 545918 545919 pc0551 pc0552 acrB oprK TRUE 0.994 8.000 0.111 0.023 N NA
 545920 545921 pc0553 pc0554     FALSE 0.340 119.000 0.000 1.000   NA
 545921 545922 pc0554 pc0555   rfbB TRUE 0.989 18.000 0.030 1.000 Y NA
 545922 545923 pc0555 pc0556 rfbB   FALSE 0.096 354.000 0.000 NA   NA
 545926 545927 pc0559 pc0560 nuoA nuoB TRUE 0.993 -9.000 0.498 0.004 Y NA
 545927 545928 pc0560 pc0561 nuoB nuoC TRUE 0.995 -3.000 0.691 0.004 Y NA
 545928 545929 pc0561 pc0562 nuoC nuoD TRUE 0.991 -16.000 0.299 0.010 Y NA
 545929 545930 pc0562 pc0563 nuoD nuoE TRUE 0.987 36.000 0.161 0.007 Y NA
 545930 545931 pc0563 pc0564 nuoE nuoF TRUE 0.993 -7.000 0.163 0.007 Y NA
 545931 545932 pc0564 pc0565 nuoF nuoG TRUE 0.996 4.000 0.753 0.010 Y NA
 545932 545933 pc0565 pc0566 nuoG nuoH TRUE 0.995 -3.000 0.151 0.010 Y NA
 545933 545934 pc0566 pc0567 nuoH nuoI TRUE 0.983 44.000 0.221 0.010 Y NA
 545934 545935 pc0567 pc0568 nuoI nuoJ TRUE 0.996 4.000 0.210 0.010 Y NA
 545935 545936 pc0568 pc0569 nuoJ nuoK TRUE 0.996 0.000 0.306 0.004 Y NA
 545936 545937 pc0569 pc0570 nuoK nuoL TRUE 0.971 2.000 0.000 0.010 Y NA
 545937 545938 pc0570 pc0571 nuoL nuoM TRUE 0.955 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 545938 545939 pc0571 pc0572 nuoM nuoN TRUE 0.995 -3.000 0.033 0.003 Y NA
 545941 545942 pc0574 pc0575     FALSE 0.111 261.000 0.000 NA   NA
 545942 545943 pc0575 pc0576     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 545949 545950 pc0582 pc0583   pckI TRUE 0.980 11.000 0.011 NA   NA
 545950 545951 pc0583 pc0584 pckI   TRUE 0.673 82.000 0.000 0.035 N NA
 545951 545952 pc0584 pc0585     TRUE 0.788 -6.000 0.000 1.000   NA
 545952 545953 pc0585 pc0586     FALSE 0.226 224.000 0.000 1.000   NA
 545953 545954 pc0586 pc0587     TRUE 0.839 21.000 0.000 1.000 N NA
 545956 545957 pc0589 pc0590 tyrP_3   TRUE 0.725 17.000 0.000 NA   NA
 545957 545958 pc0590 pc0591   dnaK TRUE 0.973 20.000 0.800 NA   NA
 545959 545960 pc0592 pc0593     FALSE 0.223 105.000 0.000 NA   NA
 545961 545962 pc0594 pct14 infA tRNA-Thr FALSE 0.229 100.000 0.000 NA   NA
 545962 545963 pct14 pc0595 tRNA-Thr tufA FALSE 0.344 59.000 0.000 NA   NA
 545963 545964 pc0595 pct15 tufA tRNA-Trp FALSE 0.335 61.000 0.000 NA   NA
 545964 545965 pct15 pc0596 tRNA-Trp   TRUE 0.525 32.000 0.000 NA   NA
 545965 545966 pc0596 pc0597   secE TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 545966 545967 pc0597 pc0598 secE nusG TRUE 0.916 61.000 0.843 1.000   NA
 545967 545968 pc0598 pc0599 nusG nusG TRUE 0.972 -30.000 0.004 0.002   NA
 545968 545969 pc0599 pc0600 nusG rplK TRUE 0.792 227.000 0.681 1.000 N NA
 545969 545970 pc0600 pc0601 rplK rplA TRUE 0.996 11.000 0.838 0.038 Y NA
 545970 545971 pc0601 pc0602 rplA rplJ TRUE 0.993 5.000 0.302 1.000 Y NA
 545971 545972 pc0602 pc0603 rplJ rplL TRUE 0.948 61.000 0.884 1.000 Y NA
 545972 545973 pc0603 pc0604 rplL rpoB TRUE 0.761 496.000 0.223 1.000 N NA
 545973 545974 pc0604 pc0605 rpoB rpoC TRUE 0.954 124.000 0.851 0.002 Y NA
 545974 545975 pc0605 pc0606 rpoC pal FALSE 0.212 409.000 0.000 1.000 N NA
 545978 545979 pc0609 pc0610   maf TRUE 0.892 23.000 0.000 0.038   NA
 545979 545980 pc0610 pc0611 maf   TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 545981 545982 pc0612 pc0613     FALSE 0.299 73.000 0.000 NA   NA
 545982 545983 pc0613 pc0614     FALSE 0.211 116.000 0.000 NA   NA
 545984 545985 pc0615 pc0616   omcB FALSE 0.106 270.000 0.000 NA   NA
 545985 545986 pc0616 pc0617 omcB omcA FALSE 0.096 343.000 0.000 NA   NA
 545986 545987 pc0617 pc0618 omcA   FALSE 0.096 370.000 0.000 NA   NA
 545987 545988 pc0618 pc0619   dxs TRUE 0.598 50.000 0.000 1.000 N NA
 545988 545989 pc0619 pc0620 dxs xseB TRUE 0.879 93.000 0.020 1.000 N NA
 545989 545990 pc0620 pc0621 xseB xseA TRUE 0.994 -7.000 0.412 0.001 Y NA
 545992 545993 pc0623 pc0624 nfi   TRUE 0.480 36.000 0.000 NA   NA
 545994 545995 pc0625 pc0626     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 545995 545996 pc0626 pc0627     TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 545997 545998 pc0628 pct16   tRNA-Ser FALSE 0.097 324.000 0.000 NA   NA
 546000 546001 pc0630 pc0631   alr TRUE 0.638 45.000 0.000 1.000 N NA
 546003 546004 pc0633 pc0634 acrD   TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA Y NA
 546004 546005 pc0634 pc0635   tolC TRUE 0.888 2.000 0.000 1.000 N NA
 546005 546006 pc0635 pc0636 tolC   FALSE 0.173 338.000 0.000 1.000   NA
 546006 546007 pc0636 pc0637     TRUE 0.991 0.000 0.631 0.056   NA
 546008 546009 pc0638 pc0639     TRUE 0.530 -25.000 0.000 NA   NA
 546009 546010 pc0639 pc0640   ftsH TRUE 0.736 327.000 0.145 1.000 N NA
 546011 546012 pc0641 pc0642   cps TRUE 0.917 10.000 0.000 NA Y NA
 546012 546013 pc0642 pc0643 cps pnp FALSE 0.155 603.000 0.000 NA N NA
 546013 546014 pc0643 pc0644 pnp rpsO TRUE 0.844 600.000 0.335 1.000 Y NA
 546014 546015 pc0644 pc0645 rpsO   FALSE 0.308 981.000 0.000 1.000 N NA
 546015 546016 pc0645 pc0646     FALSE 0.244 207.000 0.000 1.000   NA
 546017 546018 pc0647 pc0648     TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 546018 546019 pc0648 pc0649     TRUE 0.919 40.000 0.013 NA   NA
 546021 546022 pc0651 pc0652 rpmE prfA TRUE 0.788 225.000 0.005 1.000 Y NA
 546022 546023 pc0652 pc0653 prfA hemK TRUE 0.992 9.000 0.009 1.000 Y NA
 546023 546024 pc0653 pc0654 hemK ffh TRUE 0.740 202.000 0.005 1.000 N NA
 546024 546025 pc0654 pc0655 ffh rpsP TRUE 0.979 -9.000 0.361 1.000 N NA
 546025 546026 pc0655 pc0656 rpsP trmD TRUE 0.993 7.000 0.033 1.000 Y NA
 546026 546027 pc0656 pc0657 trmD rplS TRUE 0.929 92.000 0.567 1.000 Y NA
 546027 546028 pc0657 pc0658 rplS rnh TRUE 0.871 116.000 0.066 1.000 N NA
 546028 546029 pc0658 pc0659 rnh   FALSE 0.177 152.000 0.000 NA   NA
 546029 546030 pc0659 pc0660     FALSE 0.137 212.000 0.000 NA   NA
 546032 546033 pc0662 pc0663 gmk   TRUE 0.749 25.000 0.000 1.000   NA
 546033 546034 pc0663 pc0664     TRUE 0.742 15.000 0.000 NA   NA
 546034 546035 pc0664 pc0665   metG TRUE 0.540 -22.000 0.000 NA   NA
 546036 546037 pc0666 pc0667 rpmB   TRUE 0.639 -7.000 0.000 NA   NA
 546037 546038 pc0667 pc0668     TRUE 0.561 -18.000 0.000 NA   NA
 546038 546039 pc0668 pc0669   gatB FALSE 0.173 346.000 0.000 1.000   NA
 546039 546040 pc0669 pc0670 gatB gatA TRUE 0.995 -3.000 0.492 0.002 Y NA
 546040 546041 pc0670 pc0671 gatA gatC TRUE 0.996 17.000 0.643 0.002 Y NA
 546042 546043 pc0672 pc0673 phrB   FALSE 0.328 127.000 0.000 1.000   NA
 546044 546045 pc0674 pc0675     FALSE 0.097 319.000 0.000 NA   NA
 546047 546048 pc0677 pc0678 recN   TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 546048 546049 pc0678 pc0679   rnhB FALSE 0.236 95.000 0.000 NA   NA
 546050 546051 pc0680 pc0681     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546052 546053 pc0682 pc0683 truA   TRUE 0.603 -27.000 0.000 NA N NA
 546053 546054 pc0683 pc0684     TRUE 0.966 32.000 0.017 NA Y NA
 546054 546055 pc0684 pc0685   aspC FALSE 0.200 989.000 0.000 NA N NA
 546055 546056 pc0685 pc0686 aspC dapA TRUE 0.972 -34.000 0.024 1.000 Y NA
 546056 546057 pc0686 pc0687 dapA dapB TRUE 0.985 22.000 0.013 1.000 Y NA
 546057 546058 pc0687 pc0688 dapB   TRUE 0.895 12.000 0.000 1.000 N NA
 546058 546059 pc0688 pc0689   recD TRUE 0.877 0.000 0.000 1.000 N NA
 546060 546061 pc0690 pc0691 dnaG   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546061 546062 pc0691 pc0692     FALSE 0.144 204.000 0.000 NA   NA
 546063 546064 pc0693 pc0694 glyS   FALSE 0.101 287.000 0.000 NA   NA
 546065 546066 pc0695 pc0696     FALSE 0.138 211.000 0.000 NA   NA
 546066 546067 pc0696 pc0697   uvrC TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 546068 546069 pc0698 pc0699     TRUE 0.491 35.000 0.000 NA   NA
 546069 546070 pc0699 pc0700     FALSE 0.301 72.000 0.000 NA   NA
 546071 546072 pct17 pc0701 tRNA-Val thrS FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 546072 546073 pc0701 pc0702 thrS infC TRUE 0.991 2.000 0.021 1.000 Y NA
 546073 546074 pc0702 pc0703 infC rpmI TRUE 0.959 51.000 0.652 1.000 Y NA
 546074 546075 pc0703 pc0704 rpmI rplT TRUE 0.927 170.000 0.928 0.027 Y NA
 546075 546076 pc0704 pc0705 rplT pheS TRUE 0.900 143.000 0.202 1.000 Y NA
 546076 546077 pc0705 pc0706 pheS   TRUE 0.911 20.000 0.000 1.000 Y NA
 546077 546078 pc0706 pc0707   waaC TRUE 0.853 -3.000 0.000 1.000 N NA
 546079 546080 pc0708 pc0709     TRUE 0.817 289.000 0.154 0.037   NA
 546080 546081 pc0709 pc0710     TRUE 0.858 747.000 0.154 0.037   NA
 546081 546082 pc0710 pc0711     TRUE 0.815 429.000 0.154 0.037   NA
 546082 546083 pc0711 pc0712     TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 546083 546084 pc0712 pc0713     FALSE 0.122 664.000 0.000 NA   NA
 546084 546085 pc0713 pc0714     TRUE 0.887 176.000 0.154 0.037   NA
 546085 546086 pc0714 pc0715   sugE FALSE 0.240 819.000 0.000 1.000   NA
 546086 546087 pc0715 pc0716 sugE   FALSE 0.209 341.000 0.000 1.000 N NA
 546088 546089 pc0717 pc0718     TRUE 0.688 1177.000 0.007 NA   NA
 546089 546090 pc0718 pc0719     TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 546090 546091 pc0719 pc0720     FALSE 0.247 249.000 0.000 1.000 N NA
 546091 546092 pc0720 pc0721   nifS TRUE 0.957 -49.000 0.041 1.000 N NA
 546093 546094 pc0722 pc0723     FALSE 0.289 76.000 0.000 NA   NA
 546095 546096 pct18 pc0724 tRNA-Leu   FALSE 0.104 483.000 0.000 NA   NA
 546096 546097 pc0724 pc0725   udhA FALSE 0.104 275.000 0.000 NA   NA
 546097 546098 pc0725 pc0726 udhA   FALSE 0.168 165.000 0.000 NA   NA
 546098 546099 pc0726 pc0727     FALSE 0.098 311.000 0.000 NA   NA
 546100 546101 pc0728 pc0729 clpB   FALSE 0.139 821.000 0.000 NA   NA
 546102 546103 pc0730 pc0731     FALSE 0.098 304.000 0.000 NA   NA
 546103 546104 pc0731 pc0732     FALSE 0.099 302.000 0.000 NA   NA
 546105 546106 pc0733 pc0734     FALSE 0.196 553.000 0.000 1.000   NA
 546110 546111 pc0738 pc0739   rhs FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 546113 546114 pc0741 pc0742     TRUE 0.600 42.000 0.000 1.000   NA
 546116 546117 pc0744 pc0745   malQ FALSE 0.113 256.000 0.000 NA   NA
 546117 546118 pc0745 pc0746 malQ scc1 TRUE 0.613 -90.000 0.000 1.000   NA
 546118 546119 pc0746 pc0747 scc1   TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 546119 546120 pc0747 pc0748     FALSE 0.177 152.000 0.000 NA   NA
 546120 546121 pc0748 pc0749   sctV TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 546121 546122 pc0749 pc0750 sctV sctU TRUE 0.989 32.000 0.219 0.011 Y NA
 546123 546124 pc0751 pc0752     TRUE 0.459 38.000 0.000 NA   NA
 546124 546125 pc0752 pc0753     TRUE 0.767 28.000 0.000 1.000 N NA
 546125 546126 pc0753 pc0754     FALSE 0.374 96.000 0.000 1.000   NA
 546127 546128 pc0755 pc0756     TRUE 0.548 -21.000 0.000 NA   NA
 546128 546129 pc0756 pc0757     FALSE 0.134 215.000 0.000 NA   NA
 546129 546130 pc0757 pc0758   ribF FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 546130 546131 pc0758 pc0759 ribF truB TRUE 0.988 14.000 0.308 1.000 N NA
 546131 546132 pc0759 pc0760 truB rbfA TRUE 0.969 -100.000 0.111 1.000 Y NA
 546132 546133 pc0760 pc0761 rbfA   TRUE 0.993 6.000 0.530 1.000 Y NA
 546133 546134 pc0761 pc0762   nusA TRUE 0.994 5.000 0.342 0.028 N NA
 546134 546135 pc0762 pc0763 nusA   FALSE 0.172 159.000 0.000 NA   NA
 546135 546136 pc0763 pc0764   rpsA TRUE 0.645 23.000 0.000 NA   NA
 546137 546138 pc0765 pc0766 lysC   FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 546140 546141 pc0768 pc0769 rpe efp TRUE 0.938 38.000 0.007 1.000 N NA
 546141 546142 pc0769 pc0770 efp   TRUE 0.480 36.000 0.000 NA   NA
 546142 546143 pc0770 pc0771   accB TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 546143 546144 pc0771 pc0772 accB accC TRUE 0.996 10.000 0.011 0.003 Y NA
 546144 546145 pc0772 pc0773 accC   FALSE 0.096 347.000 0.000 NA   NA
 546145 546146 pc0773 pc0774     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 546147 546148 pc0775 pc0776     FALSE 0.114 253.000 0.000 NA   NA
 546148 546149 pc0776 pct19   tRNA-Asp FALSE 0.196 132.000 0.000 NA   NA
 546149 546150 pct19 pct20 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 546151 546152 pc0777 pc0778   exoD TRUE 0.714 18.000 0.000 NA   NA
 546152 546153 pc0778 pc0779 exoD   FALSE 0.098 307.000 0.000 NA   NA
 546155 546156 pc0781 pc0782 pgi   FALSE 0.162 178.000 0.000 NA   NA
 546156 546157 pc0782 pc0783   xerD TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546158 546159 pc0784 pc0785     FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 546159 546160 pc0785 pc0786     TRUE 0.540 -22.000 0.000 NA   NA
 546161 546162 pc0787 pc0788 lcrH   FALSE 0.098 419.000 0.000 NA   NA
 546162 546163 pc0788 pc0789   adh3 FALSE 0.258 86.000 0.000 NA   NA
 546164 546165 pc0790 pc0791     FALSE 0.364 52.000 0.000 NA   NA
 546165 546166 pc0791 pc0792     TRUE 0.853 -3.000 0.000 1.000 N NA
 546166 546167 pc0792 pc0793   mscL TRUE 0.843 31.000 0.000 1.000 Y NA
 546167 546168 pc0793 pc0794 mscL   FALSE 0.214 421.000 0.000 1.000 N NA
 546168 546169 pc0794 pc0795     TRUE 0.909 -36.000 0.005 NA   NA
 546170 546171 pc0796 pc0797     FALSE 0.244 207.000 0.000 1.000   NA
 546171 546172 pc0797 pc0798     FALSE 0.164 176.000 0.000 NA   NA
 546172 546173 pc0798 pc0799     FALSE 0.115 599.000 0.000 NA   NA
 546175 546176 pc0801 pc0802 tpiA secG TRUE 0.982 -3.000 0.024 1.000 N NA
 546178 546179 pc0804 pc0805     FALSE 0.111 564.000 0.000 NA   NA
 546179 546180 pc0805 pc0806     TRUE 0.404 46.000 0.000 NA   NA
 546181 546182 pc0807 pc0808     FALSE 0.236 95.000 0.000 NA   NA
 546184 546185 pc0810 pc0811 tdh   TRUE 0.789 238.000 0.547 1.000 N NA
 546185 546186 pc0811 pc0812     TRUE 0.404 46.000 0.000 NA   NA
 546187 546188 pc0813 pc0814     FALSE 0.161 179.000 0.000 NA   NA
 546189 546190 pc0815 pc0816 lolD   TRUE 0.884 1.000 0.000 1.000 N NA
 546190 546191 pc0816 pc0817   rpmG TRUE 0.740 26.000 0.000 1.000   NA
 546191 546192 pc0817 pc0818 rpmG   FALSE 0.340 119.000 0.000 1.000   NA
 546192 546193 pc0818 pc0819   devB TRUE 0.638 45.000 0.000 1.000 N NA
 546193 546194 pc0819 pc0820 devB   TRUE 0.820 146.000 0.007 NA Y NA
 546194 546195 pc0820 pc0821   zwf TRUE 0.809 233.000 0.583 NA Y NA
 546197 546198 pc0823 pc0824   pyrG TRUE 0.936 38.000 0.006 1.000 N NA
 546198 546199 pc0824 pc0825 pyrG kdsB TRUE 0.960 -30.000 0.018 1.000 N NA
 546200 546201 pc0826 pc0827   gseA FALSE 0.391 91.000 0.000 1.000   NA
 546201 546202 pc0827 pct21 gseA tRNA-Met FALSE 0.224 104.000 0.000 NA   NA
 546202 546203 pct21 pct22 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 546203 546204 pct22 pc0828 tRNA-Met   TRUE 0.459 -57.000 0.000 NA   NA
 546207 546208 pc0831 pc0832     FALSE 0.318 67.000 0.000 NA   NA
 546208 546209 pc0832 pc0833     TRUE 0.783 11.000 0.000 NA   NA
 546210 546211 pc0834 pc0835     FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 546211 546212 pc0835 pc0836     FALSE 0.352 56.000 0.000 NA   NA
 546212 546213 pc0836 pc0837     FALSE 0.170 163.000 0.000 NA   NA
 546213 546214 pc0837 pc0838     FALSE 0.110 556.000 0.000 NA   NA
 546214 546215 pc0838 pc0839     FALSE 0.096 344.000 0.000 NA   NA
 546215 546216 pc0839 pc0840     FALSE 0.108 534.000 0.000 NA   NA
 546216 546217 pc0840 pc0841     FALSE 0.122 235.000 0.000 NA   NA
 546217 546218 pc0841 pc0842     FALSE 0.106 501.000 0.000 NA   NA
 546218 546219 pc0842 pc0843     FALSE 0.135 786.000 0.000 NA   NA
 546219 546220 pc0843 pc0844     TRUE 0.470 37.000 0.000 NA   NA
 546220 546221 pc0844 pc0845     FALSE 0.149 941.000 0.000 NA   NA
 546221 546222 pc0845 pc0846     FALSE 0.122 653.000 0.000 NA   NA
 546223 546224 pc0847 pc0848     TRUE 0.783 11.000 0.000 NA   NA
 546227 546228 pc0851 pc0852     TRUE 0.431 499.000 0.000 0.003   NA
 546228 546229 pc0852 pc0853     TRUE 0.948 0.000 0.000 0.003   NA
 546230 546231 pc0854 pc0855     FALSE 0.120 239.000 0.000 NA   NA
 546232 546233 pc0856 pc0857 pcm   TRUE 0.535 -24.000 0.000 NA   NA
 546233 546234 pc0857 pc0858     FALSE 0.133 768.000 0.000 NA   NA
 546235 546236 pct23 pct24 tRNA-Tyr tRNA-Thr TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 546236 546237 pct24 pc0859 tRNA-Thr   FALSE 0.226 103.000 0.000 NA   NA
 546238 546239 pc0860 pc0861     FALSE 0.357 54.000 0.000 NA   NA
 546239 546240 pc0861 pc0862     TRUE 0.985 8.000 0.350 NA   NA
 546242 546243 pc0864 pc0865 surE acnB FALSE 0.326 131.000 0.000 1.000   NA
 546244 546245 pc0866 pc0867     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546246 546247 pc0868 pc0869     FALSE 0.103 472.000 0.000 NA   NA
 546249 546250 pc0871 pc0872 potA potB TRUE 0.972 -52.000 0.156 1.000 Y NA
 546250 546251 pc0872 pc0873 potB potC TRUE 0.994 -3.000 0.944 0.021 Y NA
 546251 546252 pc0873 pc0874 potC potD TRUE 0.996 3.000 0.111 0.021 Y NA
 546253 546254 pc0875 pc0876     FALSE 0.128 225.000 0.000 NA   NA
 546255 546256 pc0877 pc0878 mgtE sdaB FALSE 0.232 267.000 0.000 1.000 N NA
 546256 546257 pc0878 pc0879 sdaB   FALSE 0.374 96.000 0.000 1.000   NA
 546257 546258 pc0879 pc0880   pfkA TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000   NA
 546258 546259 pc0880 pc0881 pfkA   FALSE 0.226 103.000 0.000 NA   NA
 546259 546260 pc0881 pc0882   aroA FALSE 0.202 123.000 0.000 NA   NA
 546260 546261 pc0882 pc0883 aroA aroL TRUE 0.953 -66.000 0.002 1.000 Y NA
 546261 546262 pc0883 pc0884 aroL aroC TRUE 0.980 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 546262 546263 pc0884 pc0885 aroC   FALSE 0.175 316.000 0.000 1.000   NA
 546263 546264 pc0885 pc0886     FALSE 0.364 52.000 0.000 NA   NA
 546264 546265 pc0886 pc0887     FALSE 0.211 116.000 0.000 NA   NA
 546265 546266 pc0887 pc0888     FALSE 0.096 369.000 0.000 NA   NA
 546267 546268 pc0889 pc0890 ribH ribA TRUE 0.988 31.000 0.012 0.003 Y NA
 546268 546269 pc0890 pc0891 ribA ribC TRUE 0.992 8.000 0.011 1.000 Y NA
 546269 546270 pc0891 pc0892 ribC mutM TRUE 0.839 21.000 0.000 1.000 N NA
 546272 546273 pc0894 pc0895     FALSE 0.105 494.000 0.000 NA   NA
 546273 546274 pc0895 pc0896     TRUE 0.522 176.000 0.000 0.035 N NA
 546276 546277 pc0898 pc0899 rbn   FALSE 0.188 271.000 0.000 1.000   NA
 546278 546279 pc0900 pc0901     TRUE 0.954 31.000 0.307 NA   NA
 546280 546281 pc0902 pc0903     TRUE 0.708 -78.000 0.000 NA Y NA
 546285 546286 pc0907 pc0908     FALSE 0.113 573.000 0.000 NA   NA
 546286 546287 pc0908 pc0909     TRUE 0.742 15.000 0.000 NA   NA
 546288 546289 pc0910 pc0911     FALSE 0.177 152.000 0.000 NA   NA
 546290 546291 pc0912 pc0913     TRUE 0.503 -31.000 0.000 NA   NA
 546291 546292 pc0913 pc0914   czcD TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 546292 546293 pc0914 pc0915 czcD kefC TRUE 0.945 9.000 0.000 1.000 Y NA
 546293 546294 pc0915 pc0916 kefC   FALSE 0.265 191.000 0.000 1.000   NA
 546294 546295 pc0916 pc0917     FALSE 0.117 247.000 0.000 NA   NA
 546295 546296 pc0917 pc0918     FALSE 0.180 147.000 0.000 NA   NA
 546296 546297 pc0918 pc0919     FALSE 0.104 276.000 0.000 NA   NA
 546298 546299 pc0920 pc0921     FALSE 0.248 135.000 0.000 NA N NA
 546299 546300 pc0921 pc0922     TRUE 0.659 22.000 0.000 NA   NA
 546300 546301 pc0922 pc0923     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 546302 546303 pc0924 pc0925     TRUE 0.491 35.000 0.000 NA   NA
 546303 546304 pc0925 pc0926     TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 546304 546305 pc0926 pc0927     FALSE 0.128 225.000 0.000 NA   NA
 546305 546306 pc0927 pc0928   trpD TRUE 0.876 11.000 0.000 1.000   NA
 546308 546309 pc0930 pc0931 cynT   FALSE 0.266 83.000 0.000 NA   NA
 546309 546310 pc0931 pc0932     FALSE 0.160 182.000 0.000 NA   NA
 546310 546311 pc0932 pc0933   dhnA FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 546311 546312 pc0933 pc0934 dhnA   TRUE 0.941 6.000 0.000 0.040   NA
 546312 546313 pc0934 pc0935   glk TRUE 0.777 -7.000 0.000 1.000   NA
 546313 546314 pc0935 pc0936 glk   FALSE 0.176 307.000 0.000 1.000   NA
 546314 546315 pc0936 pc0937     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546315 546316 pc0937 pc0938     TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 546322 546323 pc0944 pc0945     TRUE 0.499 34.000 0.000 NA   NA
 546323 546324 pc0945 pc0946     FALSE 0.096 346.000 0.000 NA   NA
 546324 546325 pc0946 pc0947   trxA FALSE 0.101 287.000 0.000 NA   NA
 546325 546326 pc0947 pc0948 trxA   FALSE 0.300 149.000 0.000 1.000   NA
 546326 546327 pc0948 pc0949     TRUE 0.976 -9.000 0.460 1.000   NA
 546327 546328 pc0949 pc0950   lig TRUE 0.981 -13.000 0.214 0.065   NA
 546328 546329 pc0950 pc0951 lig   TRUE 0.984 -3.000 0.751 1.000 N NA
 546329 546330 pc0951 pc0952     TRUE 0.782 26.000 0.000 1.000 N NA
 546330 546331 pc0952 pc0953   yciF TRUE 0.597 112.000 0.000 0.015   NA
 546331 546332 pc0953 pc0954 yciF   FALSE 0.155 191.000 0.000 NA   NA
 546333 546334 pc0955 pc0956 ftn   FALSE 0.284 78.000 0.000 NA   NA
 546335 546336 pc0957 pc0958   dcd TRUE 0.699 19.000 0.000 NA   NA
 546339 546340 pc0961 pc0962     FALSE 0.181 146.000 0.000 NA   NA
 546341 546342 pc0963 pc0964   msrA FALSE 0.096 360.000 0.000 NA   NA
 546344 546345 pc0966 pc0967     FALSE 0.143 844.000 0.000 NA   NA
 546345 546346 pc0967 pc0968     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546346 546347 pc0968 pc0969     FALSE 0.115 589.000 0.000 NA   NA
 546347 546348 pc0969 pc0970     FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 546350 546351 pc0972 pc0973     TRUE 0.582 27.000 0.000 NA   NA
 546351 546352 pc0973 pc0974     FALSE 0.293 75.000 0.000 NA   NA
 546352 546353 pc0974 pc0975   umuC TRUE 0.457 88.000 0.000 1.000 N NA
 546353 546354 pc0975 pc0976 umuC umuD TRUE 0.409 110.000 0.000 1.000 N NA
 546354 546355 pc0976 pc0977 umuD   FALSE 0.172 159.000 0.000 NA   NA
 546355 546356 pc0977 pc0978     FALSE 0.222 106.000 0.000 NA   NA
 546356 546357 pc0978 pc0979     FALSE 0.096 371.000 0.000 NA   NA
 546360 546361 pc0982 pc0983     FALSE 0.185 141.000 0.000 NA   NA
 546363 546364 pc0985 pc0986     TRUE 0.495 -34.000 0.000 NA   NA
 546364 546365 pc0986 pc0987     FALSE 0.393 207.000 0.000 0.064   NA
 546365 546366 pc0987 pc0988     TRUE 0.676 21.000 0.000 NA   NA
 546366 546367 pc0988 pc0989     FALSE 0.104 490.000 0.000 NA   NA
 546367 546368 pc0989 pc0990     TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 546368 546369 pc0990 pc0991     FALSE 0.097 321.000 0.000 NA   NA
 546369 546370 pc0991 pc0992     FALSE 0.096 380.000 0.000 NA   NA
 546370 546371 pc0992 pc0993     FALSE 0.327 497.000 0.000 0.049   NA
 546372 546373 pc0994 pc0995     TRUE 0.498 124.000 0.000 0.064   NA
 546373 546374 pc0995 pc0996     TRUE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 546374 546375 pc0996 pc0997     FALSE 0.146 201.000 0.000 NA   NA
 546377 546378 pc0999 pc1000     FALSE 0.286 164.000 0.000 1.000   NA
 546378 546379 pc1000 pc1001     TRUE 0.919 15.000 0.000 0.064   NA
 546380 546381 pc1002 pc1003     FALSE 0.131 746.000 0.000 NA   NA
 546381 546382 pc1003 pc1004     TRUE 0.875 28.000 0.000 0.020   NA
 546382 546383 pc1004 pc1005     TRUE 0.881 -6.000 0.000 0.064   NA
 546384 546385 pc1006 pc1007     FALSE 0.162 178.000 0.000 NA   NA
 546385 546386 pc1007 pc1008     FALSE 0.141 827.000 0.000 NA   NA
 546386 546387 pc1008 pc1009     FALSE 0.274 81.000 0.000 NA   NA
 546387 546388 pc1009 pc1010     FALSE 0.098 415.000 0.000 NA   NA
 546388 546389 pc1010 pc1011     TRUE 0.710 -19.000 0.000 1.000   NA
 546389 546390 pc1011 pc1012     FALSE 0.100 290.000 0.000 NA   NA
 546391 546392 pc1013 pc1014     TRUE 0.570 -16.000 0.000 NA   NA
 546392 546393 pc1014 pc1015     TRUE 0.768 48.000 0.000 0.020   NA
 546393 546394 pc1015 pc1016     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 546394 546395 pc1016 pc1017     FALSE 0.214 114.000 0.000 NA   NA
 546395 546396 pc1017 pc1018     TRUE 0.968 -7.000 0.600 NA   NA
 546396 546397 pc1018 pc1019     FALSE 0.121 238.000 0.000 NA   NA
 546397 546398 pc1019 pc1020     FALSE 0.207 119.000 0.000 NA   NA
 546399 546400 pc1021 pc1022 doc   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546400 546401 pc1022 pc1023     FALSE 0.096 357.000 0.000 NA   NA
 546402 546403 pc1024 pc1025     FALSE 0.096 380.000 0.000 NA   NA
 546405 546406 pc1027 pc1028     FALSE 0.122 649.000 0.000 NA   NA
 546406 546407 pc1028 pc1029     TRUE 0.919 15.000 0.000 0.064   NA
 546408 546409 pc1030 pc1031     FALSE 0.119 628.000 0.000 NA   NA
 546409 546410 pc1031 pc1032     FALSE 0.344 571.000 0.000 0.048   NA
 546410 546411 pc1032 pc1033     FALSE 0.325 275.000 0.000 0.048   NA
 546411 546412 pc1033 pc1034     FALSE 0.108 512.000 0.000 NA   NA
 546412 546413 pc1034 pc1035   soj TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 546415 546416 pc1037 pcr01     FALSE 0.101 288.000 0.000 NA   NA
 546416 546417 pcr01 pcr02     FALSE 0.195 133.000 0.000 NA   NA
 546417 546418 pcr02 pcr03     FALSE 0.096 341.000 0.000 NA   NA
 546418 546419 pcr03 pc1038     FALSE 0.127 733.000 0.000 NA   NA
 546419 546420 pc1038 pc1039     FALSE 0.316 68.000 0.000 NA   NA
 546424 546425 pc1043 pc1044     TRUE 0.659 22.000 0.000 NA   NA
 546425 546426 pc1044 pc1045     TRUE 0.503 -31.000 0.000 NA   NA
 546429 546430 pc1048 pc1049 vacB   FALSE 0.203 122.000 0.000 NA   NA
 546430 546431 pc1049 pc1050     TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 546431 546432 pc1050 pc1051     TRUE 0.478 -43.000 0.000 NA   NA
 546434 546435 pc1053 pc1054     TRUE 0.603 232.000 0.006 NA   NA
 546435 546436 pc1054 pc1055     TRUE 0.649 374.000 0.222 NA   NA
 546436 546437 pc1055 pc1056     FALSE 0.109 537.000 0.000 NA   NA
 546437 546438 pc1056 pc1057     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 546440 546441 pc1059 pc1060   ubiE TRUE 0.415 45.000 0.000 NA   NA
 546441 546442 pc1060 pc1061 ubiE   TRUE 0.499 34.000 0.000 NA   NA
 546443 546444 pc1062 pc1063 menE menA TRUE 0.983 19.000 0.075 1.000 N NA
 546444 546445 pc1063 pc1064 menA menB TRUE 0.994 21.000 0.049 0.002 Y NA
 546446 546447 pc1065 pc1066     FALSE 0.125 715.000 0.000 NA   NA
 546448 546449 pc1067 pc1068   menD TRUE 0.981 0.000 0.355 NA   NA
 546449 546450 pc1068 pc1069 menD menF TRUE 0.989 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 546450 546451 pc1069 pc1070 menF   FALSE 0.252 201.000 0.000 1.000   NA
 546451 546452 pc1070 pc1071     FALSE 0.244 92.000 0.000 NA   NA
 546452 546453 pc1071 pc1072   holB FALSE 0.118 613.000 0.000 NA   NA
 546453 546454 pc1072 pc1073 holB tmk TRUE 0.984 -3.000 0.254 1.000 N NA
 546454 546455 pc1073 pc1074 tmk gyrA TRUE 0.984 3.000 0.007 1.000 N NA
 546455 546456 pc1074 pc1075 gyrA gyrB TRUE 0.968 88.000 0.306 0.003 Y NA
 546456 546457 pc1075 pc1076 gyrB   TRUE 0.933 36.000 0.028 NA   NA
 546457 546458 pc1076 pc1077     FALSE 0.096 334.000 0.000 NA   NA
 546458 546459 pc1077 pc1078   lytB FALSE 0.301 72.000 0.000 NA   NA
 546459 546460 pc1078 pc1079 lytB wzb TRUE 0.522 71.000 0.000 1.000 N NA
 546460 546461 pc1079 pc1080 wzb   TRUE 0.652 76.000 0.000 1.000 Y NA
 546462 546463 pc1081 pc1082 yidC dnaA TRUE 0.884 66.000 0.002 1.000 N NA
 546463 546464 pc1082 pct25 dnaA tRNA-Pro FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 546464 546465 pct25 pc1083 tRNA-Pro lgt FALSE 0.322 66.000 0.000 NA   NA
 546465 546466 pc1083 pc1084 lgt fdiV FALSE 0.377 132.000 0.000 1.000 N NA
 546466 546467 pc1084 pc1085 fdiV   FALSE 0.188 137.000 0.000 NA   NA
 546467 546468 pc1085 pc1086     FALSE 0.107 506.000 0.000 NA   NA
 546468 546469 pc1086 pc1087     TRUE 0.676 21.000 0.000 NA   NA
 546470 546471 pc1088 pc1089 dld1 sucB TRUE 0.988 21.000 0.253 1.000 Y NA
 546471 546472 pc1089 pc1090 sucB sucA TRUE 0.972 -54.000 0.667 1.000 Y NA
 546473 546474 pc1091 pc1092     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546476 546477 pc1094 pc1095     FALSE 0.129 224.000 0.000 NA   NA
 546477 546478 pc1095 pc1096   hemN TRUE 0.944 -16.000 0.008 NA   NA
 546478 546479 pc1096 pc1097 hemN   FALSE 0.236 213.000 0.000 1.000   NA
 546479 546480 pc1097 pc1098     TRUE 0.714 18.000 0.000 NA   NA
 546481 546482 pc1099 pc1100     TRUE 0.979 0.000 0.007 1.000   NA
 546482 546483 pc1100 pc1101     FALSE 0.221 107.000 0.000 NA   NA
 546483 546484 pc1101 pc1102   asd FALSE 0.102 281.000 0.000 NA   NA
 546484 546485 pc1102 pc1103 asd pepA TRUE 0.969 6.000 0.000 0.039 Y NA
 546485 546486 pc1103 pc1104 pepA ssb TRUE 0.738 257.000 0.013 1.000 N NA
 546486 546487 pc1104 pc1105 ssb   FALSE 0.175 317.000 0.000 1.000   NA
 546489 546490 pc1107 pc1108   ruvB TRUE 0.932 31.000 0.007 NA   NA
 546491 546492 pc1109 pc1110   lcrH FALSE 0.375 50.000 0.000 NA   NA
 546492 546493 pc1110 pc1111 lcrH   TRUE 0.787 10.000 0.000 NA   NA
 546493 546494 pc1111 pc1112     TRUE 0.525 32.000 0.000 NA   NA
 546499 546500 pc1117 pc1118     FALSE 0.287 163.000 0.000 1.000   NA
 546500 546501 pc1118 pc1119     FALSE 0.103 279.000 0.000 NA   NA
 546502 546503 pc1120 pc1121   yedO TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 546503 546504 pc1121 pc1122 yedO   FALSE 0.173 158.000 0.000 NA   NA
 546507 546508 pc1125 pc1126 hlyE   FALSE 0.096 359.000 0.000 NA   NA
 546508 546509 pc1126 pc1127     FALSE 0.102 457.000 0.000 NA   NA
 546511 546512 pc1129 pc1130     FALSE 0.156 1012.000 0.000 NA   NA
 546513 546514 pc1131 pc1132   proC FALSE 0.182 449.000 0.000 1.000   NA
 546514 546515 pc1132 pc1133 proC ppiB TRUE 0.409 110.000 0.000 1.000 N NA
 546515 546516 pc1133 pc1134 ppiB   FALSE 0.180 440.000 0.000 1.000   NA
 546516 546517 pc1134 pc1135     FALSE 0.277 1224.000 0.000 1.000   NA
 546517 546518 pc1135 pc1136     FALSE 0.313 69.000 0.000 NA   NA
 546518 546519 pc1136 pc1137     TRUE 0.499 34.000 0.000 NA   NA
 546521 546522 pc1139 pc1140     FALSE 0.111 260.000 0.000 NA   NA
 546522 546523 pc1140 pc1141     TRUE 0.523 -27.000 0.000 NA   NA
 546523 546524 pc1141 pc1142     FALSE 0.375 725.000 0.000 0.047   NA
 546526 546527 pc1144 pc1145     FALSE 0.104 482.000 0.000 NA   NA
 546527 546528 pc1145 pc1146     FALSE 0.169 164.000 0.000 NA   NA
 546528 546529 pc1146 pc1147     FALSE 0.097 322.000 0.000 NA   NA
 546529 546530 pc1147 pc1148     FALSE 0.394 47.000 0.000 NA   NA
 546530 546531 pc1148 pc1149     TRUE 0.714 18.000 0.000 NA   NA
 546531 546532 pc1149 pc1150     TRUE 0.561 29.000 0.000 NA   NA
 546535 546536 pc1153 pc1154     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 546536 546537 pc1154 pc1155     FALSE 0.204 121.000 0.000 NA   NA
 546537 546538 pc1155 pc1156   fabG TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 546538 546539 pc1156 pc1157 fabG folB TRUE 0.877 0.000 0.000 1.000 N NA
 546539 546540 pc1157 pc1158 folB   TRUE 0.777 -7.000 0.000 1.000   NA
 546541 546542 pc1159 pc1160     TRUE 0.600 303.000 0.012 NA   NA
 546542 546543 pc1160 pc1161   dnaQ TRUE 0.882 67.000 0.050 NA   NA
 546543 546544 pc1161 pc1162 dnaQ   TRUE 0.853 -3.000 0.000 1.000 N NA
 546545 546546 pc1163 pc1164 msbA accA TRUE 0.987 8.000 0.010 1.000 N NA
 546546 546547 pc1164 pc1165 accA   FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 546549 546550 pc1167 pc1168   himD FALSE 0.134 215.000 0.000 NA   NA
 546550 546551 pc1168 pc1169 himD tyrS FALSE 0.265 226.000 0.000 1.000 N NA
 546552 546553 pc1170 pc1171   osmY FALSE 0.122 237.000 0.000 NA   NA
 546553 546554 pc1171 pc1172 osmY   FALSE 0.112 258.000 0.000 NA   NA
 546556 546557 pc1174 pc1175   rpiA TRUE 0.561 29.000 0.000 NA   NA
 546557 546558 pc1175 pc1176 rpiA   TRUE 0.780 118.000 0.011 NA   NA
 546560 546561 pc1178 pc1179 pepF hypA TRUE 0.814 207.000 0.188 1.000 N NA
 546561 546562 pc1179 pc1180 hypA groEl TRUE 0.990 31.000 0.412 0.008 Y NA
 546562 546563 pc1180 pct26 groEl tRNA-Asn FALSE 0.165 172.000 0.000 NA   NA
 546563 546564 pct26 pc1181 tRNA-Asn   FALSE 0.117 606.000 0.000 NA   NA
 546564 546565 pc1181 pc1182   topI FALSE 0.330 388.000 0.000 1.000 Y NA
 546566 546567 pc1183 pc1184 wbdA   FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 546568 546569 pc1185 pc1186     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 546569 546570 pc1186 pc1187     FALSE 0.149 198.000 0.000 NA   NA
 546572 546573 pc1189 pc1190 cyoA cyoB TRUE 0.977 8.000 0.000 0.004 Y NA
 546573 546574 pc1190 pc1191 cyoB cyoC TRUE 0.996 9.000 0.267 0.022 Y NA
 546574 546575 pc1191 pc1192 cyoC cyoD TRUE 0.996 1.000 0.400 0.022 Y NA
 546575 546576 pc1192 pc1193 cyoD cyoE TRUE 0.981 -7.000 0.007 0.047 N NA
 546576 546577 pc1193 pc1194 cyoE   FALSE 0.129 741.000 0.000 NA   NA
 546577 546578 pc1194 pc1195     FALSE 0.108 267.000 0.000 NA   NA
 546578 546579 pc1195 pc1196     FALSE 0.110 263.000 0.000 NA   NA
 546579 546580 pc1196 pc1197     FALSE 0.177 424.000 0.000 1.000   NA
 546582 546583 pc1199 pc1200     TRUE 0.836 104.000 0.333 NA   NA
 546584 546585 pc1201 pc1202     FALSE 0.385 214.000 0.000 0.061   NA
 546585 546586 pc1202 pc1203     FALSE 0.281 79.000 0.000 NA   NA
 546586 546587 pc1203 pc1204     FALSE 0.168 165.000 0.000 NA   NA
 546587 546588 pc1204 pc1205     TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 546589 546590 pc1206 pc1207     FALSE 0.099 299.000 0.000 NA   NA
 546594 546595 pc1211 pc1212 cnp   FALSE 0.269 82.000 0.000 NA   NA
 546595 546596 pc1212 pc1213     FALSE 0.104 481.000 0.000 NA   NA
 546596 546597 pc1213 pc1214     FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 546597 546598 pc1214 pc1215     TRUE 0.421 641.000 0.000 0.019   NA
 546598 546599 pc1215 pc1216     FALSE 0.290 159.000 0.000 1.000   NA
 546599 546600 pc1216 pc1217   glnQ TRUE 0.912 70.000 0.660 1.000   NA
 546600 546601 pc1217 pc1218 glnQ   TRUE 0.984 -3.000 0.213 1.000 N NA
 546601 546602 pc1218 pc1219   oprM TRUE 0.995 4.000 0.182 0.061 Y NA
 546602 546603 pc1219 pc1220 oprM dhcR7 TRUE 0.527 111.000 0.000 0.061   NA
 546603 546604 pc1220 pc1221 dhcR7 mutS FALSE 0.267 190.000 0.000 1.000   NA
 546604 546605 pc1221 pc1222 mutS   FALSE 0.150 197.000 0.000 NA   NA
 546605 546606 pc1222 pc1223     FALSE 0.124 231.000 0.000 NA   NA
 546606 546607 pc1223 pc1224     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 546607 546608 pc1224 pc1225   priA TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 546608 546609 pc1225 pc1226 priA   FALSE 0.209 336.000 0.000 1.000 N NA
 546609 546610 pc1226 pc1227     FALSE 0.352 56.000 0.000 NA   NA
 546610 546611 pc1227 pc1228   lysS TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 546611 546612 pc1228 pc1229 lysS   TRUE 0.439 41.000 0.000 NA   NA
 546614 546615 pc1231 pc1232     TRUE 0.676 21.000 0.000 NA   NA
 546616 546617 pc1233 pc1234     FALSE 0.097 323.000 0.000 NA   NA
 546617 546618 pc1234 pc1235   cysS TRUE 0.783 11.000 0.000 NA   NA
 546618 546619 pc1235 pc1236 cysS aas FALSE 0.293 205.000 0.000 1.000 N NA
 546619 546620 pc1236 pc1237 aas mutT FALSE 0.209 332.000 0.000 1.000 N NA
 546620 546621 pc1237 pc1238 mutT fabF TRUE 0.916 78.000 0.333 1.000 N NA
 546621 546622 pc1238 pc1239 fabF   TRUE 0.814 83.000 0.008 NA   NA
 546622 546623 pc1239 pc1240   glnA FALSE 0.098 304.000 0.000 NA   NA
 546623 546624 pc1240 pc1241 glnA   FALSE 0.228 223.000 0.000 1.000   NA
 546624 546625 pc1241 pc1242     FALSE 0.241 93.000 0.000 NA   NA
 546625 546626 pc1242 pc1243   miaA FALSE 0.107 510.000 0.000 NA   NA
 546626 546627 pc1243 pc1244 miaA spoIiaa TRUE 0.842 149.000 0.040 1.000 N NA
 546629 546630 pc1246 pc1247   murC TRUE 0.411 136.000 0.000 NA Y NA
 546630 546631 pc1247 pc1248 murC murG TRUE 0.993 3.000 0.270 1.000 Y NA
 546631 546632 pc1248 pc1249 murG ftsW TRUE 0.969 -18.000 0.037 1.000 N NA
 546632 546633 pc1249 pc1250 ftsW lytF TRUE 0.878 7.000 0.000 1.000   NA
 546633 546634 pc1250 pc1251 lytF murD TRUE 0.635 37.000 0.000 1.000   NA
 546634 546635 pc1251 pc1252 murD mraY TRUE 0.996 15.000 0.647 0.006 Y NA
 546635 546636 pc1252 pc1253 mraY murF TRUE 0.992 24.000 0.018 0.006 Y NA
 546636 546637 pc1253 pc1254 murF   TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 546638 546639 pc1255 pc1256   ipgD FALSE 0.174 331.000 0.000 1.000   NA
 546639 546640 pc1256 pct27 ipgD tRNA-Cys FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 546640 546641 pct27 pc1257 tRNA-Cys   FALSE 0.278 80.000 0.000 NA   NA
 546641 546642 pc1257 pc1258     FALSE 0.125 230.000 0.000 NA   NA
 546642 546643 pc1258 pc1259   groEl FALSE 0.177 152.000 0.000 NA   NA
 546645 546646 pc1261 pc1262   pgm FALSE 0.148 935.000 0.000 NA   NA
 546647 546648 pc1263 pc1264   neuB FALSE 0.230 220.000 0.000 1.000   NA
 546648 546649 pc1264 pc1265 neuB deaD TRUE 0.903 9.000 0.000 1.000 N NA
 546649 546650 pc1265 pc1266 deaD   TRUE 0.729 -15.000 0.000 1.000   NA
 546650 546651 pc1266 pc1267     TRUE 0.705 -21.000 0.000 1.000   NA
 546652 546653 pc1268 pc1269   lexA TRUE 0.877 6.000 0.000 1.000   NA
 546655 546656 pc1271 pc1272     FALSE 0.265 993.000 0.000 1.000   NA
 546658 546659 pc1274 pc1275     TRUE 0.789 9.000 0.000 NA   NA
 546659 546660 pc1275 pc1276     FALSE 0.105 493.000 0.000 NA   NA
 546663 546664 pc1279 pc1280     FALSE 0.105 273.000 0.000 NA   NA
 546667 546668 pc1283 pc1284     FALSE 0.100 294.000 0.000 NA   NA
 546668 546669 pc1284 pc1285     FALSE 0.244 92.000 0.000 NA   NA
 546669 546670 pc1285 pc1286     FALSE 0.195 133.000 0.000 NA   NA
 546671 546672 pc1287 pc1288     TRUE 0.645 23.000 0.000 NA   NA
 546674 546675 pc1290 pc1291   htrA FALSE 0.144 204.000 0.000 NA   NA
 546675 546676 pc1291 pc1292 htrA   FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 546676 546677 pc1292 pc1293     FALSE 0.096 353.000 0.000 NA   NA
 546678 546679 pc1294 pc1295     FALSE 0.166 169.000 0.000 NA   NA
 546680 546681 pc1296 pc1297   sucD TRUE 0.821 -3.000 0.000 1.000   NA
 546681 546682 pc1297 pc1298 sucD sucC TRUE 0.997 4.000 0.467 0.001 Y NA
 546683 546684 pc1299 pc1300 ftsY   FALSE 0.322 66.000 0.000 NA   NA
 546689 546690 pc1305 pc1306 tyrP_4 glmS TRUE 0.776 27.000 0.000 1.000 N NA
 546690 546691 pc1306 pc1307 glmS pgm TRUE 0.969 28.000 0.030 1.000 N NA
 546692 546693 pc1308 pc1309 pcnB   TRUE 0.710 -19.000 0.000 1.000   NA
 546693 546694 pc1309 pc1310   dpm1 FALSE 0.231 98.000 0.000 NA   NA
 546694 546695 pc1310 pc1311 dpm1   TRUE 0.774 12.000 0.000 NA   NA
 546695 546696 pc1311 pc1312   lpxB TRUE 0.941 -3.000 0.000 0.001   NA
 546696 546697 pc1312 pc1313 lpxB   TRUE 0.570 -16.000 0.000 NA   NA
 546698 546699 pc1314 pc1315 plsX rpmF TRUE 0.983 21.000 0.418 1.000 N NA
 546699 546700 pc1315 pc1316 rpmF   TRUE 0.936 27.000 0.005 NA   NA
 546701 546702 pc1317 pc1318 cafA ats1 TRUE 0.984 1.000 0.019 1.000   NA
 546702 546703 pc1318 pc1319 ats1   FALSE 0.135 214.000 0.000 NA   NA
 546703 546704 pc1319 pc1320     FALSE 0.125 229.000 0.000 NA   NA
 546704 546705 pc1320 pc1321     FALSE 0.330 126.000 0.000 1.000   NA
 546705 546706 pc1321 pc1322     FALSE 0.165 172.000 0.000 NA   NA
 546706 546707 pc1322 pc1323     FALSE 0.096 351.000 0.000 NA   NA
 546708 546709 pc1324 pc1325 proS pabC FALSE 0.352 147.000 0.000 1.000 N NA
 546709 546710 pc1325 pc1326 pabC   TRUE 0.540 -22.000 0.000 NA   NA
 546710 546711 pc1326 pc1327   pabB FALSE 0.187 138.000 0.000 NA   NA
 546711 546712 pc1327 pc1328 pabB   FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 546712 546713 pc1328 pc1329     TRUE 0.447 40.000 0.000 NA   NA
 546713 546714 pc1329 pc1330     TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000   NA
 546714 546715 pc1330 pc1331   prfB TRUE 0.987 0.000 0.006 1.000 Y NA
 546716 546717 pc1332 pc1333     FALSE 0.249 884.000 0.000 1.000   NA
 546717 546718 pc1333 pc1334   tpx FALSE 0.187 493.000 0.000 1.000   NA
 546718 546719 pc1334 pc1335 tpx   TRUE 0.416 83.000 0.000 1.000   NA
 546719 546720 pc1335 pc1336   aac TRUE 0.571 46.000 0.000 1.000   NA
 546721 546722 pc1337 pc1338   tag FALSE 0.175 154.000 0.000 NA   NA
 546722 546723 pc1338 pc1339 tag   FALSE 0.102 285.000 0.000 NA   NA
 546723 546724 pc1339 pc1340     FALSE 0.117 246.000 0.000 NA   NA
 546725 546726 pc1341 pc1342     FALSE 0.118 618.000 0.000 NA   NA
 546727 546728 pc1343 pc1344 ntt_5 arsC FALSE 0.295 203.000 0.000 1.000 N NA
 546729 546730 pc1345 pc1346     TRUE 0.756 14.000 0.000 NA   NA
 546731 546732 pc1347 pc1348   nrdA FALSE 0.099 426.000 0.000 NA   NA
 546732 546733 pc1348 pc1349 nrdA nrdB TRUE 0.997 12.000 0.250 0.001 Y NA
 546733 546734 pc1349 pc1350 nrdB   TRUE 0.589 -13.000 0.000 NA   NA
 546734 546735 pc1350 pc1351     FALSE 0.164 1277.000 0.000 NA   NA
 546735 546736 pc1351 pc1352     TRUE 0.561 -18.000 0.000 NA   NA
 546737 546738 pc1353 pc1354     FALSE 0.097 381.000 0.000 NA   NA
 546739 546740 pc1355 pc1356     TRUE 0.523 -27.000 0.000 NA   NA
 546740 546741 pc1356 pc1357     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 546742 546743 pc1358 pc1359     FALSE 0.238 94.000 0.000 NA   NA
 546743 546744 pc1359 pc1360     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546744 546745 pc1360 pc1361     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546748 546749 pc1364 pc1365     TRUE 0.940 25.000 0.000 0.014 Y NA
 546750 546751 pc1366 pc1367   rpsD FALSE 0.164 174.000 0.000 NA   NA
 546751 546752 pc1367 pc1368 rpsD   TRUE 0.828 91.000 0.020 NA   NA
 546752 546753 pc1368 pc1369     FALSE 0.230 99.000 0.000 NA   NA
 546754 546755 pc1370 pc1371   pckG TRUE 0.900 11.000 0.000 1.000 N NA
 546755 546756 pc1371 pc1372 pckG mreB TRUE 0.970 25.000 0.011 1.000 N NA
 546756 546757 pc1372 pc1373 mreB   FALSE 0.296 74.000 0.000 NA   NA
 546757 546758 pc1373 pc1374     FALSE 0.115 252.000 0.000 NA   NA
 546759 546760 pct28 pct29 tRNA-Gly tRNA-Gly FALSE 0.251 89.000 0.000 NA   NA
 546760 546761 pct29 pc1375 tRNA-Gly tig TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 546761 546762 pc1375 pc1376 tig clpP TRUE 0.821 438.000 0.351 1.000 Y NA
 546762 546763 pc1376 pc1377 clpP clpX TRUE 0.849 239.000 0.352 1.000 Y NA
 546763 546764 pc1377 pc1378 clpX   FALSE 0.260 195.000 0.000 1.000   NA
 546766 546767 pc1380 pc1381     FALSE 0.293 75.000 0.000 NA   NA
 546767 546768 pc1381 pc1382     FALSE 0.238 94.000 0.000 NA   NA
 546768 546769 pc1382 pc1383     FALSE 0.251 89.000 0.000 NA   NA
 546769 546770 pc1383 pc1384   lcrH FALSE 0.197 131.000 0.000 NA   NA
 546770 546771 pc1384 pc1385 lcrH   TRUE 0.856 119.000 0.125 1.000   NA
 546771 546772 pc1385 pc1386   lcrH TRUE 0.865 13.000 0.000 1.000   NA
 546772 546773 pc1386 pc1387 lcrH   TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 546773 546774 pc1387 pc1388     TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 546774 546775 pc1388 pc1389     TRUE 0.525 32.000 0.000 NA   NA
 546775 546776 pc1389 pc1390     FALSE 0.116 250.000 0.000 NA   NA
 546776 546777 pc1390 pc1391     FALSE 0.231 98.000 0.000 NA   NA
 546777 546778 pc1391 pc1392     TRUE 0.917 47.000 0.171 NA   NA
 546778 546779 pc1392 pc1393     FALSE 0.253 88.000 0.000 NA   NA
 546779 546780 pc1393 pc1394     TRUE 0.880 9.000 0.000 1.000   NA
 546780 546781 pc1394 pc1395     FALSE 0.098 310.000 0.000 NA   NA
 546781 546782 pc1395 pc1396     FALSE 0.181 146.000 0.000 NA   NA
 546782 546783 pc1396 pc1397   sctN FALSE 0.346 58.000 0.000 NA   NA
 546783 546784 pc1397 pc1398 sctN   TRUE 0.979 14.000 0.875 NA   NA
 546784 546785 pc1398 pc1399     FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 546785 546786 pc1399 pc1400   sctQ FALSE 0.098 305.000 0.000 NA   NA
 546786 546787 pc1400 pc1401 sctQ pkn TRUE 0.916 76.000 0.583 1.000 N NA
 546787 546788 pc1401 pc1402 pkn   FALSE 0.254 280.000 0.000 NA Y NA
 546789 546790 pc1403 pc1404     TRUE 0.783 6.000 0.000 NA   NA
 546790 546791 pc1404 pc1405     FALSE 0.096 338.000 0.000 NA   NA
 546792 546793 pc1406 pc1407     FALSE 0.355 55.000 0.000 NA   NA
 546793 546794 pc1407 pc1408     TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 546795 546796 pc1409 pc1410     FALSE 0.118 242.000 0.000 NA   NA
 546797 546798 pc1411 pc1412     FALSE 0.097 388.000 0.000 NA   NA
 546799 546800 pc1413 pc1414     TRUE 0.589 -13.000 0.000 NA   NA
 546801 546802 pc1415 pc1416     FALSE 0.096 379.000 0.000 NA   NA
 546802 546803 pc1416 pc1417     FALSE 0.106 270.000 0.000 NA   NA
 546803 546804 pc1417 pc1418     FALSE 0.112 569.000 0.000 NA   NA
 546804 546805 pc1418 pc1419     FALSE 0.185 475.000 0.000 1.000   NA
 546807 546808 pc1421 pc1422     TRUE 0.659 22.000 0.000 NA   NA
 546808 546809 pc1422 pc1423   traE TRUE 0.960 9.000 0.000 0.003   NA
 546809 546810 pc1423 pc1424 traE   TRUE 0.951 1.000 0.000 0.003   NA
 546810 546811 pc1424 pc1425   traB TRUE 0.464 71.000 0.000 1.000   NA
 546812 546813 pc1426 pc1427     TRUE 0.689 75.000 0.000 0.018   NA
 546814 546815 pc1428 pc1429     TRUE 0.639 -7.000 0.000 NA   NA
 546815 546816 pc1429 pc1430   traC TRUE 0.762 2.000 0.000 NA   NA
 546816 546817 pc1430 pc1431 traC traF TRUE 0.602 -12.000 0.000 NA   NA
 546817 546818 pc1431 pc1432 traF traW TRUE 0.577 -15.000 0.000 NA   NA
 546818 546819 pc1432 pc1433 traW trbC TRUE 0.789 9.000 0.000 NA   NA
 546819 546820 pc1433 pc1434 trbC traU TRUE 0.882 69.000 0.800 NA   NA
 546820 546821 pc1434 pc1435 traU   TRUE 0.459 -57.000 0.000 NA   NA
 546821 546822 pc1435 pc1436     FALSE 0.244 92.000 0.000 NA   NA
 546822 546823 pc1436 pc1437   traN FALSE 0.214 114.000 0.000 NA   NA
 546823 546824 pc1437 pc1438 traN traF TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546824 546825 pc1438 pc1439 traF traH TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546825 546826 pc1439 pc1440 traH traG TRUE 0.783 11.000 0.000 NA   NA
 546826 546827 pc1440 pc1441 traG traD TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546827 546828 pc1441 pc1442 traD   FALSE 0.335 61.000 0.000 NA   NA
 546828 546829 pc1442 pc1443     TRUE 0.968 -7.000 0.600 NA   NA
 546829 546830 pc1443 pc1444     TRUE 0.577 133.000 0.000 0.009   NA
 546830 546831 pc1444 pc1445     FALSE 0.161 179.000 0.000 NA   NA
 546831 546832 pc1445 pc1446     FALSE 0.171 162.000 0.000 NA   NA
 546832 546833 pc1446 pc1447     FALSE 0.100 292.000 0.000 NA   NA
 546833 546834 pc1447 pc1448     TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 546835 546836 pc1449 pc1450     FALSE 0.152 194.000 0.000 NA   NA
 546836 546837 pc1450 pc1451     FALSE 0.156 190.000 0.000 NA   NA
 546838 546839 pc1452 pc1453     FALSE 0.195 547.000 0.000 1.000   NA
 546839 546840 pc1453 pc1454     FALSE 0.123 233.000 0.000 NA   NA
 546841 546842 pc1455 pc1456   doc FALSE 0.225 739.000 0.000 1.000   NA
 546842 546843 pc1456 pc1457 doc   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546843 546844 pc1457 pc1458     FALSE 0.096 357.000 0.000 NA   NA
 546844 546845 pc1458 pc1459     FALSE 0.107 269.000 0.000 NA   NA
 546845 546846 pc1459 pc1460     FALSE 0.176 153.000 0.000 NA   NA
 546846 546847 pc1460 pc1461     FALSE 0.211 630.000 0.000 1.000   NA
 546851 546852 pc1465 pc1466     FALSE 0.145 202.000 0.000 NA   NA
 546852 546853 pc1466 pc1467     TRUE 0.438 -115.000 0.000 NA   NA
 546854 546855 pc1468 pc1469   tnpR FALSE 0.096 375.000 0.000 NA   NA
 546855 546856 pc1469 pc1470 tnpR tnpA TRUE 0.754 -148.000 0.000 0.056   NA
 546856 546857 pc1470 pc1471 tnpA tnpA TRUE 0.838 35.000 0.000 0.018   NA
 546857 546858 pc1471 pc1472 tnpA   FALSE 0.146 201.000 0.000 NA   NA
 546858 546859 pc1472 pc1473   doc TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546859 546860 pc1473 pc1474 doc   FALSE 0.222 106.000 0.000 NA   NA
 546860 546861 pc1474 pc1475   gspD FALSE 0.130 743.000 0.000 NA   NA
 546861 546862 pc1475 pc1476 gspD   TRUE 0.821 -3.000 0.000 1.000   NA
 546862 546863 pc1476 pc1477     TRUE 0.762 2.000 0.000 NA   NA
 546865 546866 pc1479 pc1480     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546866 546867 pc1480 pc1481     TRUE 0.865 13.000 0.000 1.000   NA
 546867 546868 pc1481 pc1482     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 546868 546869 pc1482 pc1483     TRUE 0.561 -18.000 0.000 NA   NA
 546870 546871 pc1484 pc1485   dnaK TRUE 0.455 191.000 0.000 0.092 N NA
 546871 546872 pc1485 pc1486 dnaK ald TRUE 0.627 46.000 0.000 1.000 N NA
 546872 546873 pc1486 pc1487 ald smc TRUE 0.733 32.000 0.000 1.000 N NA
 546874 546875 pc1488 pc1489 serS   FALSE 0.218 701.000 0.000 1.000   NA
 546875 546876 pc1489 pc1490     FALSE 0.343 117.000 0.000 1.000   NA
 546878 546879 pc1492 pc1493     FALSE 0.155 191.000 0.000 NA   NA
 546879 546880 pc1493 pc1494     TRUE 0.602 25.000 0.000 NA   NA
 546880 546881 pc1494 pc1495     FALSE 0.099 428.000 0.000 NA   NA
 546881 546882 pc1495 pc1496   gdhB FALSE 0.202 580.000 0.000 1.000   NA
 546882 546883 pc1496 pc1497 gdhB hrcA FALSE 0.356 109.000 0.000 1.000   NA
 546883 546884 pc1497 pc1498 hrcA grpE TRUE 0.959 38.000 0.286 1.000 N NA
 546884 546885 pc1498 pc1499 grpE dnaK TRUE 0.995 16.000 0.224 0.007 Y NA
 546885 546886 pc1499 pc1500 dnaK   FALSE 0.173 157.000 0.000 NA   NA
 546888 546889 pc1502 pc1503 oppA oppB TRUE 0.997 9.000 0.318 0.017 Y NA
 546889 546890 pc1503 pc1504 oppB oppC TRUE 0.960 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 546890 546891 pc1504 pc1505 oppC oppD TRUE 0.945 9.000 0.000 1.000 Y NA
 546891 546892 pc1505 pc1506 oppD dppF TRUE 0.952 -10.000 0.000 0.002 Y NA
 546892 546893 pc1506 pc1507 dppF   FALSE 0.242 825.000 0.000 1.000   NA
 546893 546894 pc1507 pc1508     FALSE 0.318 410.000 0.000 0.043   NA
 546894 546895 pc1508 pc1509     FALSE 0.326 287.000 0.000 0.043   NA
 546895 546896 pc1509 pc1510     FALSE 0.385 733.000 0.000 0.043   NA
 546897 546898 pc1511 pc1512 clpC hemG FALSE 0.210 328.000 0.000 1.000 N NA
 546898 546899 pc1512 pc1513 hemG hemE TRUE 0.956 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 546899 546900 pc1513 pc1514 hemE tkt TRUE 0.726 -28.000 0.000 1.000 N NA
 546901 546902 pc1515 pc1516     FALSE 0.137 814.000 0.000 NA   NA
 546902 546903 pc1516 pc1517     TRUE 0.570 28.000 0.000 NA   NA
 546903 546904 pc1517 pc1518     TRUE 0.480 36.000 0.000 NA   NA
 546904 546905 pc1518 pc1519   alaS FALSE 0.157 1045.000 0.000 NA   NA
 546908 546909 pc1522 pc1523     FALSE 0.182 144.000 0.000 NA   NA
 546909 546910 pc1523 pc1524     FALSE 0.110 551.000 0.000 NA   NA
 546911 546912 pc1525 pc1526 lcrH   TRUE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 546913 546914 pc1527 pc1528 amn   TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 546915 546916 pc1529 pc1530 efp lysS TRUE 0.978 46.000 0.082 0.035 Y NA
 546920 546921 pc1534 pc1535 yabJ htpG TRUE 0.648 28.000 0.000 NA N NA
 546921 546922 pc1535 pc1536 htpG   TRUE 0.876 11.000 0.000 1.000   NA
 546922 546923 pc1536 pc1537     FALSE 0.182 144.000 0.000 NA   NA
 546923 546924 pc1537 pc1538     FALSE 0.158 187.000 0.000 NA   NA
 546924 546925 pc1538 pc1539     FALSE 0.098 307.000 0.000 NA   NA
 546925 546926 pc1539 pc1540     FALSE 0.125 230.000 0.000 NA   NA
 546926 546927 pc1540 pc1541     TRUE 0.789 9.000 0.000 NA   NA
 546927 546928 pc1541 pc1542     FALSE 0.096 330.000 0.000 NA   NA
 546929 546930 pc1543 pc1544 yajC ygcA TRUE 0.743 147.000 0.007 NA N NA
 546930 546931 pc1544 pc1545 ygcA hctA TRUE 0.805 184.000 0.048 1.000   NA
 546932 546933 pc1546 pc1547   exbB TRUE 0.618 -73.000 0.000 1.000   NA
 546933 546934 pc1547 pc1548 exbB exbD TRUE 0.995 0.000 0.773 0.029 Y NA
 546934 546935 pc1548 pc1549 exbD   TRUE 0.762 2.000 0.000 NA   NA
 546935 546936 pc1549 pc1550     TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 546936 546937 pc1550 pc1551     FALSE 0.174 155.000 0.000 NA   NA
 546938 546939 pc1552 pcr04     FALSE 0.287 77.000 0.000 NA   NA
 546939 546940 pcr04 pcr05     FALSE 0.195 133.000 0.000 NA   NA
 546940 546941 pcr05 pcr06     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 546942 546943 pc1553 pc1554     FALSE 0.096 359.000 0.000 NA   NA
 546943 546944 pc1554 pc1555     FALSE 0.133 218.000 0.000 NA   NA
 546945 546946 pc1556 pc1557   hemH FALSE 0.317 187.000 0.000 1.000 N NA
 546946 546947 pc1557 pc1558 hemH clpB TRUE 0.676 21.000 0.000 NA   NA
 546947 546948 pc1558 pc1559 clpB deaD FALSE 0.100 289.000 0.000 NA   NA
 546948 546949 pc1559 pc1560 deaD   FALSE 0.134 777.000 0.000 NA   NA
 546951 546952 pc1562 pc1563     TRUE 0.910 -3.000 0.000 0.042   NA
 546952 546953 pc1563 pc1564     FALSE 0.099 298.000 0.000 NA   NA
 546955 546956 pc1566 pc1567     TRUE 0.759 -10.000 0.000 1.000   NA
 546956 546957 pc1567 pc1568     TRUE 0.972 -21.000 0.006 0.026   NA
 546957 546958 pc1568 pc1569   rimL TRUE 0.740 119.000 0.006 NA   NA
 546958 546959 pc1569 pc1570 rimL   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 546960 546961 pc1571 pc1572 rnr   TRUE 0.426 81.000 0.000 1.000   NA
 546961 546962 pc1572 pc1573   rf-3 TRUE 0.439 78.000 0.000 1.000   NA
 546963 546964 pc1574 pc1575     FALSE 0.204 121.000 0.000 NA   NA
 546965 546966 pc1576 pc1577 suhB   FALSE 0.241 93.000 0.000 NA   NA
 546966 546967 pc1577 pc1578     TRUE 0.645 23.000 0.000 NA   NA
 546968 546969 pc1579 pc1580 yohI   TRUE 0.405 63.000 0.000 NA N NA
 546973 546974 pc1584 pc1585     FALSE 0.134 215.000 0.000 NA   NA
 546976 546977 pc1587 pc1588 hldE hldD TRUE 0.849 -6.000 0.000 NA Y NA
 546977 546978 pc1588 pc1589 hldD   FALSE 0.387 122.000 0.000 1.000 N NA
 546978 546979 pc1589 pc1590     TRUE 0.918 50.000 0.007 1.000 N NA
 546979 546980 pc1590 pc1591   rpsR TRUE 0.992 24.000 0.499 0.021 Y NA
 546980 546981 pc1591 pc1592 rpsR rpsF TRUE 0.996 12.000 0.319 0.021 Y NA
 546981 546982 pc1592 pc1593 rpsF spoVc TRUE 0.996 11.000 0.029 0.033 Y NA
 546982 546983 pc1593 pc1594 spoVc ctc TRUE 0.956 96.000 0.496 0.033 Y NA
 546983 546984 pc1594 pc1595 ctc prsA TRUE 0.837 166.000 0.074 1.000 N NA
 546984 546985 pc1595 pct30 prsA tRNA-Gln TRUE 0.714 18.000 0.000 NA   NA
 546986 546987 pc1596 pc1597 glgA pgsA TRUE 0.850 103.000 0.008 1.000 N NA
 546988 546989 pc1598 pc1599 dagA   FALSE 0.313 69.000 0.000 NA   NA
 546993 546994 pc1603 pc1604   rpmH TRUE 0.969 27.000 0.787 1.000   NA
 546995 546996 pc1605 pc1606 rpmJ   TRUE 0.993 11.000 0.013 0.021   NA
 546998 546999 pc1608 pc1609     TRUE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 547000 547001 pc1610 pc1611     FALSE 0.097 329.000 0.000 NA   NA
 547002 547003 pc1612 pc1613     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 547003 547004 pc1613 pc1614     FALSE 0.098 409.000 0.000 NA   NA
 547004 547005 pc1614 pc1615     FALSE 0.102 449.000 0.000 NA   NA
 547005 547006 pc1615 pc1616     FALSE 0.108 532.000 0.000 NA   NA
 547006 547007 pc1616 pc1617     FALSE 0.112 570.000 0.000 NA   NA
 547009 547010 pc1619 pc1620     FALSE 0.147 919.000 0.000 NA   NA
 547012 547013 pc1622 pc1623   nusB FALSE 0.097 324.000 0.000 NA   NA
 547013 547014 pc1623 pc1624 nusB murB TRUE 0.952 -31.000 0.008 1.000 N NA
 547014 547015 pc1624 pc1625 murB   TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000   NA
 547015 547016 pc1625 pc1626   folC TRUE 0.875 5.000 0.000 1.000   NA
 547016 547017 pc1626 pc1627 folC   FALSE 0.139 210.000 0.000 NA   NA
 547018 547019 pc1628 pc1629   cydB FALSE 0.115 251.000 0.000 NA   NA
 547019 547020 pc1629 pc1630 cydB cydA TRUE 0.965 83.000 0.622 0.020 Y NA
 547020 547021 pc1630 pc1631 cydA   TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 547022 547023 pc1632 pc1633 folP   FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 547023 547024 pc1633 pc1634     TRUE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 547025 547026 pc1635 pc1636   pyk TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 547028 547029 pc1638 pc1639     FALSE 0.340 60.000 0.000 NA   NA
 547030 547031 pc1640 pc1641   uvrA FALSE 0.102 452.000 0.000 NA   NA
 547031 547032 pc1641 pc1642 uvrA   FALSE 0.109 266.000 0.000 NA   NA
 547034 547035 pc1644 pc1645     FALSE 0.102 452.000 0.000 NA   NA
 547035 547036 pc1645 pc1646   mutT TRUE 0.868 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 547040 547041 pc1650 pc1651     FALSE 0.129 224.000 0.000 NA   NA
 547043 547044 pc1653 pc1654   valS FALSE 0.151 958.000 0.000 NA   NA
 547045 547046 pc1655 pc1656   dagA FALSE 0.099 424.000 0.000 NA   NA
 547046 547047 pc1656 pc1657 dagA dagA TRUE 0.975 2.000 0.000 0.002 Y NA
 547048 547049 pc1658 pc1659 aroF   TRUE 0.548 -21.000 0.000 NA   NA
 547050 547051 pc1660 pc1661 fumC   TRUE 0.878 7.000 0.000 1.000   NA
 547053 547054 pc1663 pc1664 menC   FALSE 0.133 774.000 0.000 NA   NA
 547054 547055 pc1664 pc1665     FALSE 0.119 240.000 0.000 NA   NA
 547055 547056 pc1665 pc1666     TRUE 0.788 8.000 0.000 NA   NA
 547056 547057 pc1666 pc1667   atpC FALSE 0.194 545.000 0.000 1.000   NA
 547057 547058 pc1667 pc1668 atpC atpD TRUE 0.995 18.000 0.837 0.006 Y NA
 547058 547059 pc1668 pc1669 atpD atpG TRUE 0.981 47.000 0.724 0.006 Y NA
 547059 547060 pc1669 pc1670 atpG atpA TRUE 0.995 18.000 0.846 0.006 Y NA
 547060 547061 pc1670 pc1671 atpA atpH TRUE 0.996 9.000 0.864 0.006 Y NA
 547061 547062 pc1671 pc1672 atpH atpF TRUE 0.995 -3.000 0.242 0.006 Y NA
 547062 547063 pc1672 pc1673 atpF atpE TRUE 0.996 8.000 0.014 0.006 Y NA
 547063 547064 pc1673 pc1674 atpE atpB TRUE 0.957 93.000 0.015 0.006 Y NA
 547064 547065 pc1674 pc1675 atpB   TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 547065 547066 pc1675 pc1676   ntpK FALSE 0.110 264.000 0.000 NA   NA
 547066 547067 pc1676 pc1677 ntpK ntpI TRUE 0.991 18.000 0.848 0.008   NA
 547067 547068 pc1677 pc1678 ntpI ntpD TRUE 0.993 -7.000 0.270 0.008 Y NA
 547068 547069 pc1678 pc1679 ntpD atpB TRUE 0.995 15.000 0.903 0.007 Y NA
 547069 547070 pc1679 pc1680 atpB ntpA TRUE 0.995 18.000 0.806 0.003 Y NA
 547070 547071 pc1680 pc1681 ntpA   TRUE 0.982 2.000 0.633 NA   NA
 547071 547072 pc1681 pc1682   ntpE TRUE 0.762 2.000 0.000 NA   NA
 547073 547074 pc1683 pc1684     TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 547074 547075 pc1684 pc1685     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 547075 547076 pc1685 pc1686     FALSE 0.107 509.000 0.000 NA   NA
 547076 547077 pc1686 pc1687     FALSE 0.096 334.000 0.000 NA   NA
 547078 547079 pc1688 pc1689     FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 547080 547081 pc1690 pc1691   talB TRUE 0.676 21.000 0.000 NA   NA
 547082 547083 pc1692 pc1693     TRUE 0.714 18.000 0.000 NA   NA
 547083 547084 pc1693 pc1694     FALSE 0.099 421.000 0.000 NA   NA
 547085 547086 pc1695 pc1696 rkpK crtE TRUE 0.853 -3.000 0.000 1.000 N NA
 547086 547087 pc1696 pc1697 crtE exoY FALSE 0.216 171.000 0.000 NA N NA
 547087 547088 pc1697 pc1698 exoY   FALSE 0.251 89.000 0.000 NA   NA
 547088 547089 pc1698 pc1699     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 547091 547092 pc1701 pc1702 folD apbE TRUE 0.988 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 547094 547095 pc1704 pc1705   dnaN FALSE 0.256 87.000 0.000 NA   NA
 547095 547096 pc1705 pc1706 dnaN recF TRUE 0.994 9.000 0.318 1.000 Y NA
 547096 547097 pc1706 pc1707 recF   FALSE 0.326 177.000 0.000 1.000 N NA
 547097 547098 pc1707 pc1708     FALSE 0.249 90.000 0.000 NA   NA
 547100 547101 pc1710 pc1711   acpS FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 547102 547103 pc1712 pc1713   trxB TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 547104 547105 pc1714 pc1715   putP FALSE 0.100 432.000 0.000 NA   NA
 547105 547106 pc1715 pc1716 putP   FALSE 0.100 440.000 0.000 NA   NA
 547107 547108 pc1717 pc1718 acpP fabG TRUE 0.920 166.000 0.007 0.005 Y NA
 547108 547109 pc1718 pc1719 fabG fabD TRUE 0.970 70.000 0.019 0.005 Y NA
 547109 547110 pc1719 pc1720 fabD fabH TRUE 0.984 -36.000 0.009 0.005 Y NA
 547110 547111 pc1720 pc1721 fabH   FALSE 0.205 120.000 0.000 NA   NA
 547112 547113 pc1722 pc1723     FALSE 0.173 158.000 0.000 NA   NA
 547113 547114 pc1723 pc1724   recR FALSE 0.306 71.000 0.000 NA   NA
 547116 547117 pc1726 pc1727 omp85   TRUE 0.924 96.000 0.175 1.000 Y NA
 547117 547118 pc1727 pc1728   lpxD TRUE 0.881 152.000 0.018 1.000 Y NA
 547119 547120 pc1729 pc1730 ptc1   FALSE 0.096 357.000 0.000 NA   NA
 547120 547121 pc1730 pc1731   pdhC FALSE 0.109 539.000 0.000 NA   NA
 547121 547122 pc1731 pc1732 pdhC pdhB TRUE 0.996 13.000 0.254 0.032 Y NA
 547122 547123 pc1732 pc1733 pdhB pdhA TRUE 0.997 12.000 0.456 0.001 Y NA
 547123 547124 pc1733 pc1734 pdhA aaaT FALSE 0.332 314.000 0.000 1.000 Y NA
 547124 547125 pc1734 pc1735 aaaT   FALSE 0.161 179.000 0.000 NA   NA
 547125 547126 pc1735 pc1736     FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 547126 547127 pc1736 pc1737     TRUE 0.765 13.000 0.000 NA   NA
 547127 547128 pc1737 pc1738     TRUE 0.930 42.000 0.258 NA   NA
 547128 547129 pc1738 pc1739     TRUE 0.973 -3.000 0.037 NA   NA
 547129 547130 pc1739 pc1740     FALSE 0.099 421.000 0.000 NA   NA
 547130 547131 pc1740 pc1741     FALSE 0.097 400.000 0.000 NA   NA
 547132 547133 pc1742 pc1743     FALSE 0.216 112.000 0.000 NA   NA
 547134 547135 pc1744 pc1745     FALSE 0.185 141.000 0.000 NA   NA
 547136 547137 pc1746 pc1747     FALSE 0.101 445.000 0.000 NA   NA
 547139 547140 pc1749 pc1750     TRUE 0.983 12.000 0.212 NA   NA
 547140 547141 pc1750 pc1751     FALSE 0.102 281.000 0.000 NA   NA
 547141 547142 pc1751 pc1752     FALSE 0.100 435.000 0.000 NA   NA
 547142 547143 pc1752 pc1753     TRUE 0.868 115.000 0.012 NA Y NA
 547143 547144 pc1753 pc1754     TRUE 0.991 6.000 0.200 NA Y NA
 547144 547145 pc1754 pc1755     TRUE 0.757 20.000 0.000 NA N NA
 547146 547147 pc1756 pc1757 rpsI rl13 TRUE 0.995 18.000 0.601 0.020 Y NA
 547149 547150 pc1759 pc1760 sodC dnlJ FALSE 0.308 194.000 0.000 1.000 N NA
 547150 547151 pc1760 pc1761 dnlJ glgB FALSE 0.241 256.000 0.000 1.000 N NA
 547151 547152 pc1761 pc1762 glgB   TRUE 0.924 45.000 0.636 NA   NA
 547152 547153 pc1762 pc1763   yqeV TRUE 0.858 69.000 0.010 NA   NA
 547153 547154 pc1763 pc1764 yqeV   FALSE 0.152 194.000 0.000 NA   NA
 547154 547155 pc1764 pc1765   radC FALSE 0.151 196.000 0.000 NA   NA
 547155 547156 pc1765 pc1766 radC   TRUE 0.880 8.000 0.000 1.000   NA
 547156 547157 pc1766 pc1767   phnP TRUE 0.983 4.000 0.008 1.000   NA
 547157 547158 pc1767 pc1768 phnP   FALSE 0.299 73.000 0.000 NA   NA
 547160 547161 pc1770 pc1771   gltA FALSE 0.274 81.000 0.000 NA   NA
 547161 547162 pc1771 pc1772 gltA mdh TRUE 0.719 54.000 0.000 1.000 Y NA
 547164 547165 pc1774 pcr07     FALSE 0.118 241.000 0.000 NA   NA
 547165 547166 pcr07 pcr08     FALSE 0.195 133.000 0.000 NA   NA
 547166 547167 pcr08 pcr09     FALSE 0.096 341.000 0.000 NA   NA
 547168 547169 pc1775 pc1776     TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 547169 547170 pc1776 pc1777     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 547171 547172 pc1778 pc1779     FALSE 0.098 309.000 0.000 NA   NA
 547173 547174 pc1780 pc1781     TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 547177 547178 pc1784 pc1785   gltT TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 547178 547179 pc1785 pc1786 gltT lpxK TRUE 0.928 51.000 0.013 1.000 N NA
 547179 547180 pc1786 pc1787 lpxK gmhA TRUE 0.497 78.000 0.000 1.000 N NA
 547181 547182 pc1788 pc1789     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 547182 547183 pc1789 pc1790     FALSE 0.107 268.000 0.000 NA   NA
 547184 547185 pc1791 pc1792 rlu rlmB TRUE 0.969 2.000 0.000 0.024 Y NA
 547185 547186 pc1792 pc1793 rlmB   TRUE 0.984 11.000 0.213 NA   NA
 547188 547189 pc1795 pc1796     TRUE 0.516 -28.000 0.000 NA   NA
 547189 547190 pc1796 pc1797   lspA TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 547190 547191 pc1797 pc1798 lspA dksA TRUE 0.985 17.000 0.038 1.000 N NA
 547191 547192 pc1798 pc1799 dksA   TRUE 0.900 50.000 0.009 NA N NA
 547197 547198 pc1804 pc1805 shsP znuA FALSE 0.150 258.000 0.000 NA N NA
 547198 547199 pc1805 pc1806 znuA znuC TRUE 0.993 10.000 0.509 1.000 Y NA
 547199 547200 pc1806 pc1807 znuC znuB TRUE 0.979 -136.000 0.616 0.084 Y NA
 547201 547202 pct31 pc1808 tRNA-Ser   FALSE 0.171 161.000 0.000 NA   NA
 547202 547203 pc1808 pc1809   ndh FALSE 0.124 713.000 0.000 NA   NA
 547204 547205 pc1810 pct32 dnaB tRNA-Ser FALSE 0.301 72.000 0.000 NA   NA
 547205 547206 pct32 pc1811 tRNA-Ser   FALSE 0.161 179.000 0.000 NA   NA
 547207 547208 pc1812 pc1813     FALSE 0.237 807.000 0.000 1.000   NA
 547210 547211 pc1815 pc1816 fbp   FALSE 0.364 52.000 0.000 NA   NA
 547211 547212 pc1816 pc1817     FALSE 0.187 138.000 0.000 NA   NA
 547212 547213 pc1817 pc1818     FALSE 0.198 128.000 0.000 NA   NA
 547213 547214 pc1818 pc1819     FALSE 0.123 234.000 0.000 NA   NA
 547214 547215 pc1819 pc1820   dinP FALSE 0.324 132.000 0.000 1.000   NA
 547215 547216 pc1820 pc1821 dinP   FALSE 0.163 177.000 0.000 NA   NA
 547216 547217 pc1821 pc1822   panF FALSE 0.116 250.000 0.000 NA   NA
 547217 547218 pc1822 pc1823 panF   FALSE 0.101 444.000 0.000 NA   NA
 547218 547219 pc1823 pc1824     FALSE 0.149 199.000 0.000 NA   NA
 547219 547220 pc1824 pc1825   nagA TRUE 0.787 10.000 0.000 NA   NA
 547222 547223 pc1827 pc1828     FALSE 0.151 196.000 0.000 NA   NA
 547224 547225 pc1829 pc1830     TRUE 0.902 8.000 0.000 1.000 N NA
 547225 547226 pc1830 pc1831     TRUE 0.821 -3.000 0.000 1.000   NA
 547226 547227 pc1831 pc1832     FALSE 0.176 407.000 0.000 1.000   NA
 547227 547228 pc1832 pc1833     FALSE 0.222 731.000 0.000 1.000   NA
 547231 547232 pc1836 pc1837 hctB   FALSE 0.107 268.000 0.000 NA   NA
 547232 547233 pc1837 pc1838   lplA FALSE 0.159 184.000 0.000 NA   NA
 547233 547234 pc1838 pc1839 lplA gidA TRUE 0.966 25.000 0.008 1.000 N NA
 547234 547235 pc1839 pc1840 gidA   FALSE 0.258 954.000 0.000 1.000   NA
 547235 547236 pc1840 pc1841   sdhB FALSE 0.365 103.000 0.000 1.000   NA
 547236 547237 pc1841 pc1842 sdhB sdhA TRUE 0.996 15.000 0.231 0.002 Y NA
 547237 547238 pc1842 pc1843 sdhA sdhC TRUE 0.996 15.000 0.179 0.002 Y NA
 547238 547239 pc1843 pc1844 sdhC tatD TRUE 0.633 244.000 0.007 NA N NA
 547239 547240 pc1844 pc1845 tatD dsbD TRUE 0.955 -12.000 0.008 NA N NA
 547241 547242 pc1846 pc1847   tolQ FALSE 0.252 201.000 0.000 1.000   NA
 547242 547243 pc1847 pc1848 tolQ tolR TRUE 0.995 15.000 0.583 0.027 Y NA
 547243 547244 pc1848 pc1849 tolR tolA TRUE 0.787 10.000 0.000 NA   NA
 547244 547245 pc1849 pc1850 tolA tolB FALSE 0.331 62.000 0.000 NA   NA
 547245 547246 pc1850 pc1851 tolB pal TRUE 0.714 302.000 0.750 1.000   NA
 547246 547247 pc1851 pc1852 pal   TRUE 0.759 -10.000 0.000 1.000   NA
 547247 547248 pc1852 pc1853   murI TRUE 0.445 76.000 0.000 1.000   NA
 547249 547250 pc1854 pc1855   phoB FALSE 0.170 163.000 0.000 NA   NA
 547251 547252 pc1856 pc1857     TRUE 0.412 84.000 0.000 1.000   NA
 547252 547253 pc1857 pc1858     FALSE 0.386 48.000 0.000 NA   NA
 547253 547254 pc1858 pc1859     TRUE 0.615 -10.000 0.000 NA   NA
 547254 547255 pc1859 pc1860     FALSE 0.096 330.000 0.000 NA   NA
 547257 547258 pc1862 pc1863     TRUE 0.499 34.000 0.000 NA   NA
 547258 547259 pc1863 pc1864     TRUE 0.561 29.000 0.000 NA   NA
 547259 547260 pc1864 pc1865     FALSE 0.211 116.000 0.000 NA   NA
 547260 547261 pc1865 pc1866     TRUE 0.983 7.000 0.042 NA   NA
 547263 547264 pc1868 pc1869     TRUE 0.459 38.000 0.000 NA   NA
 547264 547265 pc1869 pc1870     FALSE 0.143 861.000 0.000 NA   NA
 547265 547266 pc1870 pc1871     FALSE 0.262 84.000 0.000 NA   NA
 547266 547267 pc1871 pc1872     FALSE 0.112 569.000 0.000 NA   NA
 547268 547269 pc1873 pc1874     TRUE 0.876 11.000 0.000 1.000   NA
 547269 547270 pc1874 pc1875     TRUE 0.904 71.000 0.848 1.000   NA
 547270 547271 pc1875 pct33   tRNA-Lys FALSE 0.097 391.000 0.000 NA   NA
 547271 547272 pct33 pct34 tRNA-Lys tRNA-Glu TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 547272 547273 pct34 pc1876 tRNA-Glu rrf FALSE 0.220 108.000 0.000 NA   NA
 547273 547274 pc1876 pc1877 rrf pyrH TRUE 0.982 12.000 0.002 1.000 N NA
 547274 547275 pc1877 pc1878 pyrH   FALSE 0.141 838.000 0.000 NA   NA
 547275 547276 pc1878 pc1879     FALSE 0.328 63.000 0.000 NA   NA
 547277 547278 pc1880 pc1881   phoR FALSE 0.337 163.000 0.000 1.000 N NA
 547278 547279 pc1881 pc1882 phoR   TRUE 0.652 64.000 0.000 0.083   NA
 547279 547280 pc1882 pc1883     TRUE 0.975 -3.000 0.764 NA   NA
 547280 547281 pc1883 pc1884     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 547282 547283 pc1885 pc1886     FALSE 0.278 176.000 0.000 1.000   NA
 547283 547284 pc1886 pc1887     TRUE 0.996 10.000 0.035 0.005 Y NA
 547284 547285 pc1887 pc1888     TRUE 0.987 -3.000 0.042 0.083   NA
 547285 547286 pc1888 pc1889     TRUE 0.982 -3.000 0.145 1.000   NA
 547286 547287 pc1889 pc1890     FALSE 0.261 122.000 0.000 NA N NA
 547287 547288 pc1890 pc1891     FALSE 0.352 56.000 0.000 NA   NA
 547288 547289 pc1891 pc1892     TRUE 0.462 -55.000 0.000 NA   NA
 547289 547290 pc1892 pc1893     TRUE 0.503 -31.000 0.000 NA   NA
 547290 547291 pc1893 pc1894     TRUE 0.483 -40.000 0.000 NA   NA
 547291 547292 pc1894 pc1895     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 547292 547293 pc1895 pc1896   gspF TRUE 0.699 19.000 0.000 NA   NA
 547293 547294 pc1896 pc1897 gspF gspE TRUE 0.996 3.000 0.035 0.002 Y NA
 547294 547295 pc1897 pc1898 gspE gspD TRUE 0.983 -13.000 0.467 1.000 Y NA
 547295 547296 pc1898 pc1899 gspD   TRUE 0.782 163.000 0.467 NA   NA
 547298 547299 pc1901 pc1902 rpoN   FALSE 0.146 902.000 0.000 NA   NA
 547299 547300 pc1902 pc1903     TRUE 0.424 44.000 0.000 NA   NA
 547300 547301 pc1903 pc1904     TRUE 0.754 1.000 0.000 NA   NA
 547304 547305 pc1907 pc1908     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 547305 547306 pc1908 pc1909     FALSE 0.105 495.000 0.000 NA   NA
 547306 547307 pc1909 pc1910     TRUE 0.700 -3.000 0.000 NA   NA
 547307 547308 pc1910 pc1911     FALSE 0.127 226.000 0.000 NA   NA
 547309 547310 pc1912 pc1913     TRUE 0.639 -7.000 0.000 NA   NA
 547311 547312 pc1914 pc1915     FALSE 0.346 490.000 0.000 0.038   NA
 547312 547313 pc1915 pc1916     TRUE 0.443 946.000 0.000 0.038   NA
 547314 547315 pc1917 pc1918     FALSE 0.263 992.000 0.000 1.000   NA
 547315 547316 pc1918 pc1919     TRUE 0.425 826.000 0.000 0.038   NA
 547316 547317 pc1919 pc1920     TRUE 0.832 -27.000 0.000 0.038   NA
 547317 547318 pc1920 pc1921     FALSE 0.097 405.000 0.000 NA   NA
 547319 547320 pc1922 pc1923     TRUE 0.503 -31.000 0.000 NA   NA
 547320 547321 pc1923 pc1924     FALSE 0.165 1514.000 0.000 NA   NA
 547321 547322 pc1924 pc1925     FALSE 0.202 580.000 0.000 1.000   NA
 547322 547323 pc1925 pc1926     FALSE 0.201 577.000 0.000 1.000   NA
 547323 547324 pc1926 pc1927     TRUE 0.631 81.000 0.000 0.038   NA
 547324 547325 pc1927 pc1928     FALSE 0.394 716.000 0.000 0.038   NA
 547326 547327 pc1929 pc1930     TRUE 0.625 102.000 0.000 0.009   NA
 547327 547328 pc1930 pc1931     TRUE 0.683 58.000 0.000 0.050   NA
 547328 547329 pc1931 pc1932     TRUE 0.776 4.000 0.000 NA   NA
 547331 547332 pc1934 pc1935     TRUE 0.929 0.000 0.000 0.038   NA
 547332 547333 pc1935 pc1936     FALSE 0.103 462.000 0.000 NA   NA
 547335 547336 pc1938 pc1939     TRUE 0.589 -13.000 0.000 NA   NA
 547337 547338 pc1940 pc1941     TRUE 0.570 -16.000 0.000 NA   NA
 547339 547340 pc1942 pc1943     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 547340 547341 pc1943 pc1944     FALSE 0.114 254.000 0.000 NA   NA
 547342 547343 pc1945 pc1946     FALSE 0.096 339.000 0.000 NA   NA
 547346 547347 pc1949 pc1950     FALSE 0.128 225.000 0.000 NA   NA
 547348 547349 pc1951 pc1952     FALSE 0.131 221.000 0.000 NA   NA
 547350 547351 pc1953 pc1954     FALSE 0.246 839.000 0.000 1.000   NA
 547351 547352 pc1954 pc1955     FALSE 0.384 642.000 0.000 0.038   NA
 547352 547353 pc1955 pc1956     FALSE 0.385 648.000 0.000 0.038   NA
 547355 547356 pc1958 pc1959     FALSE 0.099 427.000 0.000 NA   NA
 547359 547360 pc1962 pc1963     TRUE 0.922 15.000 0.000 0.050   NA
 547361 547362 pc1964 pc1965     FALSE 0.097 321.000 0.000 NA   NA
 547362 547363 pc1965 pc1966     FALSE 0.182 450.000 0.000 1.000   NA
 547364 547365 pc1967 pc1968     FALSE 0.153 192.000 0.000 NA   NA
 547365 547366 pc1968 pc1969     FALSE 0.111 558.000 0.000 NA   NA
 547366 547367 pc1969 pc1970     FALSE 0.098 304.000 0.000 NA   NA
 547369 547370 pc1972 pc1973     FALSE 0.219 109.000 0.000 NA   NA
 547371 547372 pc1974 pc1975   hemF TRUE 0.614 40.000 0.000 1.000   NA
 547372 547373 pc1975 pc1976 hemF   FALSE 0.134 778.000 0.000 NA   NA
 547373 547374 pc1976 pc1977   fixO FALSE 0.153 193.000 0.000 NA   NA
 547374 547375 pc1977 pc1978 fixO fixN TRUE 0.779 60.000 0.000 0.001   NA
 547375 547376 pc1978 pc1979 fixN   FALSE 0.142 206.000 0.000 NA   NA
 547377 547378 pc1980 pc1981     FALSE 0.101 443.000 0.000 NA   NA
 547379 547380 pc1982 pc1983   talB FALSE 0.322 66.000 0.000 NA   NA
 547380 547381 pc1983 pc1984 talB   FALSE 0.253 239.000 0.000 1.000 N NA
 547381 547382 pc1984 pc1985     FALSE 0.104 275.000 0.000 NA   NA
 547382 547383 pc1985 pc1986     FALSE 0.173 158.000 0.000 NA   NA
 547383 547384 pc1986 pc1987     FALSE 0.132 219.000 0.000 NA   NA
 547384 547385 pc1987 pc1988     FALSE 0.309 141.000 0.000 1.000   NA
 547386 547387 pc1989 pc1990     TRUE 0.770 3.000 0.000 NA   NA
 547387 547388 pc1990 pc1991     TRUE 0.624 24.000 0.000 NA   NA
 547388 547389 pc1991 pc1992     TRUE 0.555 -19.000 0.000 NA   NA
 547389 547390 pc1992 pc1993     TRUE 0.942 6.000 0.000 0.038   NA
 547390 547391 pc1993 pc1994     FALSE 0.096 336.000 0.000 NA   NA
 547391 547392 pc1994 pc1995   recA FALSE 0.192 135.000 0.000 NA   NA
 547393 547394 pc1996 pc1997 ispA glmU TRUE 0.732 261.000 0.054 1.000   NA
 547395 547396 pc1998 pc1999 rumA mgtC FALSE 0.207 119.000 0.000 NA   NA
 547397 547398 pc2000 pc2001     FALSE 0.137 212.000 0.000 NA   NA
 547398 547399 pc2001 pc2002     TRUE 0.602 -12.000 0.000 NA   NA
 547399 547400 pc2002 pc2003     FALSE 0.352 56.000 0.000 NA   NA
 547400 547401 pc2003 pc2004   cbbY TRUE 0.849 32.000 0.000 0.023   NA
 547403 547404 pc2006 pc2007     FALSE 0.262 84.000 0.000 NA   NA
 547404 547405 pc2007 pct35   tRNA-Pro FALSE 0.173 157.000 0.000 NA   NA
 547405 547406 pct35 pc2008 tRNA-Pro   TRUE 0.789 9.000 0.000 NA   NA
 547406 547407 pc2008 pc2009     FALSE 0.375 50.000 0.000 NA   NA
 547407 547408 pc2009 pc2010     FALSE 0.160 1175.000 0.000 NA   NA
 547408 547409 pc2010 pc2011     FALSE 0.103 279.000 0.000 NA   NA
 547409 547410 pc2011 pc2012   ung FALSE 0.226 103.000 0.000 NA   NA
 547410 547411 pc2012 pc2013 ung   TRUE 0.742 0.000 0.000 NA   NA
 547411 547412 pc2013 pc2014   parA TRUE 0.879 66.000 0.875 NA   NA
 547412 547413 pc2014 pc2015 parA thrS TRUE 0.988 4.000 0.035 1.000 N NA
 547415 547416 pc2017 pc2018     FALSE 0.119 630.000 0.000 NA   NA
 547417 547418 pc2019 pc2020     FALSE 0.101 442.000 0.000 NA   NA
 11495434 547418   pc2020     FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11637797 547418   pc2020     FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11780189 547418   pc2020     FALSE NA 1840.000 0.000 NA   NA
 11495435 547418   pc2020     FALSE NA 1812.000 0.000 NA   NA
 11637798 547418   pc2020     FALSE NA 1812.000 0.000 NA   NA
 11780190 547418   pc2020     FALSE NA 1812.000 0.000 NA   NA
 11495436 547418   pc2020     FALSE NA 1765.000 0.000 NA   NA
 11637799 547418   pc2020     FALSE NA 1765.000 0.000 NA   NA
 11780191 547418   pc2020     FALSE NA 1765.000 0.000 NA   NA
 547418 547419 pc2020 pc2021     TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 547420 547421 pc2022 pc2023     FALSE 0.236 95.000 0.000 NA   NA
 547422 547423 pc2024 pc2025     TRUE 0.589 -13.000 0.000 NA   NA
 547423 547424 pc2025 pc2026     FALSE 0.159 1110.000 0.000 NA   NA
 547427 547428 pc2029 pc2030     FALSE 0.096 352.000 0.000 NA   NA