MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus thermophilus LMG 18311

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 928153 928154 stu0001 stu0002 dnaA dnaN TRUE 0.777 155.000 0.328 1.000 Y NA
 928154 928155 stu0002 stu0003 dnaN   TRUE 0.697 51.000 0.009 NA   NA
 928155 928156 stu0003 stu0004     TRUE 0.323 213.000 0.064 NA   NA
 928156 928157 stu0004 stu0005   pth TRUE 0.871 73.000 0.184 1.000 Y NA
 928157 928158 stu0005 stu0006 pth trcF TRUE 0.984 -7.000 0.137 1.000 N NA
 928158 928159 stu0006 stu0007 trcF   FALSE 0.227 186.000 0.024 1.000 N NA
 928159 928160 stu0007 stu0008   divIC TRUE 0.976 -16.000 0.053 1.000 N NA
 928160 928161 stu0008 stu0009 divIC   TRUE 0.318 128.000 0.011 1.000 N NA
 928161 928162 stu0009 stu0010     TRUE 0.954 0.000 0.014 1.000 N NA
 928162 928163 stu0010 stu0011   hpt TRUE 0.865 82.000 0.067 0.069 N NA
 928163 928164 stu0011 stu0012 hpt ftsH TRUE 0.956 16.000 0.192 1.000 N NA
 928165 928166 stu0013 stu0014     TRUE 0.836 79.000 0.667 NA   NA
 928166 928167 stu0014 stu0015     TRUE 0.993 -82.000 0.667 NA   NA
 928168 928169 stu0016 stu0017     FALSE 0.091 200.000 0.000 NA   NA
 928169 928170 stu0017 stu0018     TRUE 0.920 -24.000 0.000 NA   NA
 928170 928171 stu0018 stu0019     TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 928171 928172 stu0019 stu_r01     FALSE 0.049 402.000 0.000 NA   NA
 928172 928173 stu_r01 stu_t01     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928173 928174 stu_t01 stu_r02     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 928174 928175 stu_r02 stu_r03     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928175 928176 stu_r03 stu_t02     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928176 928177 stu_t02 stu_t03     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928177 928178 stu_t03 stu_t04     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 928178 928179 stu_t04 stu_t05     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928179 928180 stu_t05 stu_t06     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928180 928181 stu_t06 stu_t07     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928181 928182 stu_t07 stu_t08     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928182 928183 stu_t08 stu_t09     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928183 928184 stu_t09 stu_t10     TRUE 0.851 8.000 0.000 NA   NA
 928184 928185 stu_t10 stu_t11     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928185 928186 stu_t11 stu_t12     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928186 928187 stu_t12 stu_t13     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 928187 928188 stu_t13 stu_t14     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 928188 928189 stu_t14 stu_t15     TRUE 0.873 4.000 0.000 NA   NA
 928189 928190 stu_t15 stu_t16     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 928190 928191 stu_t16 stu_t17     TRUE 0.632 34.000 0.000 NA   NA
 928191 928192 stu_t17 stu_t18     TRUE 0.865 5.000 0.000 NA   NA
 928192 928193 stu_t18 stu0020   mreC TRUE 0.411 57.000 0.000 NA   NA
 928193 928194 stu0020 stu0021 mreC mreD TRUE 0.999 -52.000 0.550 0.005   NA
 928194 928195 stu0021 stu0022 mreD pcsB TRUE 0.560 85.000 0.021 NA   NA
 928195 928196 stu0022 stu0023 pcsB prsA1 TRUE 0.383 202.000 0.107 NA   NA
 928197 928198 stu0024 stu0025     FALSE 0.220 123.000 0.000 NA   NA
 928199 928200 stu0026 stu0027 araT recO TRUE 0.958 -13.000 0.012 1.000 N NA
 928200 928201 stu0027 stu0028 recO plsX FALSE 0.138 216.000 0.011 1.000 N NA
 928201 928202 stu0028 stu0029 plsX acpP1 TRUE 0.996 0.000 0.017 0.009   NA
 928202 928203 stu0029 stu0030 acpP1 purC FALSE 0.152 286.000 0.017 1.000   NA
 928203 928204 stu0030 stu0031 purC purL TRUE 0.945 32.000 0.043 1.000 Y NA
 928204 928205 stu0031 stu0032 purL purF TRUE 0.523 169.000 0.024 1.000 Y NA
 928205 928206 stu0032 stu0033 purF purM TRUE 0.971 31.000 0.248 1.000 Y NA
 928206 928207 stu0033 stu0034 purM purN TRUE 0.999 0.000 0.238 0.003 Y NA
 928207 928208 stu0034 stu0035 purN purH TRUE 0.983 18.000 0.225 1.000 Y NA
 928208 928209 stu0035 stu0036 purH   FALSE 0.095 171.000 0.000 1.000   NA
 928209 928210 stu0036 stu0037     TRUE 0.443 54.000 0.000 NA   NA
 928210 928211 stu0037 stu0038     TRUE 0.480 50.000 0.000 NA   NA
 928213 928214 stu0040 stu0041 purD purE TRUE 0.347 334.000 0.044 1.000 Y NA
 928214 928215 stu0041 stu0042 purE purK TRUE 0.999 -13.000 0.008 0.002 Y NA
 928215 928216 stu0042 stu0043 purK   FALSE 0.072 193.000 0.000 1.000   NA
 928216 928217 stu0043 stu0044     TRUE 0.307 72.000 0.000 NA   NA
 928217 928218 stu0044 stu0045   purB FALSE 0.125 279.000 0.002 NA   NA
 928219 928220 stu0046 stu0047 tnp1239 argS FALSE 0.023 558.000 0.000 1.000 N NA
 928221 928222 stu0048 stu0049 argR   TRUE 0.981 0.000 0.054 NA   NA
 928222 928223 stu0049 stu0050   mutS1 TRUE 0.980 -7.000 0.031 NA   NA
 928224 928225 stu0051 stu0052     TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 928226 928227 stu0053 stu0054   mutL TRUE 0.456 52.000 0.000 NA   NA
 928227 928228 stu0054 stu0055 mutL   FALSE 0.211 127.000 0.000 NA   NA
 928228 928229 stu0055 stu0056   ruvA FALSE 0.157 152.000 0.000 NA   NA
 928229 928230 stu0056 stu0057 ruvA tag TRUE 0.973 7.000 0.012 1.000 Y NA
 928230 928231 stu0057 stu0059 tag cinA TRUE 0.429 96.000 0.011 1.000   NA
 928231 928232 stu0059 stu0060 cinA recA TRUE 0.889 36.000 0.083 1.000   NA
 928232 928233 stu0060 stu0061 recA trmA FALSE 0.163 177.000 0.004 1.000 N NA
 928233 928234 stu0061 stu_r04 trmA   FALSE 0.048 417.000 0.000 NA   NA
 928234 928235 stu_r04 stu_t19     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928235 928236 stu_t19 stu_r05     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 928236 928237 stu_r05 stu_r06     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928237 928238 stu_r06 stu_t20     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928238 928239 stu_t20 stu_t21     TRUE 0.865 5.000 0.000 NA   NA
 928239 928240 stu_t21 stu_t22     TRUE 0.632 34.000 0.000 NA   NA
 928240 928241 stu_t22 stu_t23     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928241 928242 stu_t23 stu_t24     TRUE 0.847 9.000 0.000 NA   NA
 928242 928243 stu_t24 stu_t25     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 928243 928244 stu_t25 stu_t26     TRUE 0.873 4.000 0.000 NA   NA
 928244 928245 stu_t26 stu_t27     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928245 928246 stu_t27 stu_t28     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928246 928247 stu_t28 stu_t29     TRUE 0.825 12.000 0.000 NA   NA
 928247 928248 stu_t29 stu_t30     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928248 928249 stu_t30 stu_t31     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 928249 928250 stu_t31 stu0062   polC TRUE 0.466 51.000 0.000 NA   NA
 928250 928251 stu0062 stu0063 polC pepS FALSE 0.070 164.000 0.000 1.000 N NA
 928251 928252 stu0063 stu0064 pepS   TRUE 0.955 20.000 0.190 1.000   NA
 928252 928253 stu0064 stu0065     FALSE 0.067 203.000 0.000 1.000   NA
 928253 928254 stu0065 stu0066     TRUE 0.741 118.000 0.414 1.000   NA
 928255 928256 stu0067 stu0068     TRUE 0.718 105.000 0.000 0.026   NA
 928256 928257 stu0068 stu0069     TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 928257 928258 stu0069 stu0070     FALSE 0.211 127.000 0.000 NA   NA
 928258 928259 stu0070 stu0071     FALSE 0.079 218.000 0.000 NA   NA
 928259 928260 stu0071 stu0072     TRUE 0.982 -3.000 0.048 NA   NA
 928261 928262 stu_t32 stu0073   rpsB FALSE 0.055 315.000 0.000 NA   NA
 928262 928263 stu0073 stu0074 rpsB tsf TRUE 0.889 111.000 0.748 1.000 Y NA
 928265 928266 stu0076 stu0077 ctsR clpC TRUE 0.984 1.000 0.188 NA N NA
 928267 928268 stu0078 stu0079     TRUE 0.895 62.000 0.000 0.005   NA
 928268 928269 stu0079 stu0080   dacA1 TRUE 0.441 353.000 0.000 0.005   NA
 928270 928271 stu0081 stu0082 pnpA   TRUE 0.935 9.000 0.009 NA   NA
 928271 928272 stu0082 stu0083   cysE1 TRUE 0.769 64.000 0.097 NA   NA
 928272 928273 stu0083 stu0084 cysE1 cysS TRUE 0.441 382.000 0.035 0.066 N NA
 928273 928274 stu0084 stu0085 cysS   TRUE 0.986 -7.000 0.129 1.000   NA
 928274 928275 stu0085 stu0086     FALSE 0.061 283.000 0.000 NA   NA
 928275 928276 stu0086 stu0087     FALSE 0.289 76.000 0.000 NA   NA
 928276 928277 stu0087 stu0088   trmH FALSE 0.051 362.000 0.000 NA   NA
 928277 928278 stu0088 stu0089 trmH   TRUE 0.980 3.000 0.109 NA   NA
 928278 928279 stu0089 stu0090     TRUE 0.960 9.000 0.036 NA   NA
 928279 928280 stu0090 stu0091     FALSE 0.057 301.000 0.000 NA   NA
 928280 928281 stu0091 stu0092   panE TRUE 0.536 179.000 0.250 NA   NA
 928281 928282 stu0092 stu0093 panE rplM FALSE 0.043 209.000 0.000 1.000 N NA
 928282 928283 stu0093 stu0094 rplM rpsI TRUE 0.996 28.000 0.601 0.031 Y NA
 928285 928286 stu0096 stu0097     FALSE 0.068 250.000 0.000 NA   NA
 928286 928287 stu0097 stu0098   labB TRUE 0.488 179.000 0.154 NA   NA
 928287 928288 stu0098 stu0099 labB labC TRUE 0.919 38.000 0.154 NA   NA
 928288 928289 stu0099 stu0100 labC labT TRUE 0.977 24.000 1.000 NA   NA
 928289 928290 stu0100 stu0101 labT   FALSE 0.046 618.000 0.000 NA   NA
 928291 928292 stu0102 stu0103 int   FALSE 0.047 481.000 0.000 NA   NA
 928292 928293 stu0103 stu0106     FALSE 0.069 247.000 0.000 NA   NA
 928293 928294 stu0106 stu0107     FALSE 0.047 508.000 0.000 NA   NA
 928294 928295 stu0107 stu0108     TRUE 0.708 25.000 0.000 NA   NA
 928296 928297 stu0110 stu0112     FALSE 0.039 322.000 0.000 NA N NA
 928297 928298 stu0112 stu0113     TRUE 0.983 12.000 0.569 NA   NA
 928298 928299 stu0113 stu0114     TRUE 0.456 117.000 0.012 NA   NA
 928299 928300 stu0114 stu0115     FALSE 0.220 123.000 0.000 NA   NA
 928300 928301 stu0115 stu0116   dacB TRUE 0.922 -13.000 0.000 NA   NA
 928301 928302 stu0116 stu0117 dacB mur3 TRUE 0.984 -3.000 0.174 1.000 N NA
 928302 928303 stu0117 stu0118 mur3 hrcA FALSE 0.159 190.000 0.009 1.000 N NA
 928303 928304 stu0118 stu0119 hrcA grpE TRUE 0.976 -16.000 0.051 1.000 N NA
 928304 928305 stu0119 stu0120 grpE dnaK TRUE 0.942 129.000 0.026 0.009 Y NA
 928305 928306 stu0120 stu0121 dnaK dnaJ TRUE 0.889 427.000 0.196 0.004 Y NA
 928306 928307 stu0121 stu0122 dnaJ truA TRUE 0.309 106.000 0.004 1.000 N NA
 928307 928308 stu0122 stu0123 truA thiD TRUE 0.977 -7.000 0.058 1.000 N NA
 928308 928309 stu0123 stu0124 thiD   TRUE 0.765 91.000 0.276 NA   NA
 928309 928310 stu0124 stu_r07     FALSE 0.050 385.000 0.000 NA   NA
 928310 928311 stu_r07 stu_t33     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928311 928312 stu_t33 stu_r08     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 928312 928313 stu_r08 stu_r09     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928313 928314 stu_r09 stu_t34     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928314 928315 stu_t34 stu_t35     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928315 928316 stu_t35 stu_t36     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 928316 928317 stu_t36 stu_t37     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928317 928318 stu_t37 stu_t38     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928318 928319 stu_t38 stu_t39     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928319 928320 stu_t39 stu_t40     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928320 928321 stu_t40 stu_t41     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928321 928322 stu_t41 stu_t42     TRUE 0.851 8.000 0.000 NA   NA
 928322 928323 stu_t42 stu_r10     FALSE 0.197 130.000 0.000 NA   NA
 928323 928324 stu_r10 stu_t43     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928324 928325 stu_t43 stu_r11     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 928325 928326 stu_r11 stu_r12     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928326 928327 stu_r12 stu_t44     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928327 928328 stu_t44 stu0125   amiA2 FALSE 0.045 755.000 0.000 NA   NA
 928330 928331 stu0127 stu0128   cfa FALSE 0.202 94.000 0.000 1.000   NA
 928335 928336 stu0132 stu0133 ropA rpoE FALSE 0.207 158.000 0.005 1.000 N NA
 928336 928337 stu0133 stu0134 rpoE pyrG FALSE 0.164 251.000 0.029 1.000 N NA
 928337 928338 stu0134 stu0135 pyrG   FALSE 0.252 95.000 0.000 NA   NA
 928338 928339 stu0135 stu0136     TRUE 0.952 16.000 0.065 NA   NA
 928339 928340 stu0136 stu0137   prmA TRUE 0.951 0.000 0.004 1.000   NA
 928340 928341 stu0137 stu0138 prmA   TRUE 0.988 1.000 0.227 NA   NA
 928341 928342 stu0138 stu0139     FALSE 0.126 295.000 0.004 NA   NA
 928342 928343 stu0139 stu0140     TRUE 0.993 20.000 0.030 0.003   NA
 928343 928344 stu0140 stu0141     TRUE 0.998 -16.000 0.030 0.003   NA
 928344 928345 stu0141 stu0142     TRUE 0.995 12.000 0.030 0.003   NA
 928345 928346 stu0142 stu0143     TRUE 0.899 -10.000 0.000 1.000   NA
 928348 928349 stu0145 stu0146 relA dtd TRUE 0.962 13.000 0.177 1.000 N NA
 928349 928350 stu0146 stu0147 dtd   FALSE 0.048 441.000 0.000 NA   NA
 928350 928351 stu0147 stu0148     FALSE 0.150 155.000 0.000 NA   NA
 928351 928352 stu0148 stu0149     FALSE 0.093 196.000 0.000 NA   NA
 928352 928353 stu0149 stu0150   ilvA FALSE 0.057 300.000 0.000 NA   NA
 928354 928355 stu0151 stu0152 defB   TRUE 0.525 102.000 0.034 NA N NA
 928356 928357 stu0153 stu0154   rpsO FALSE 0.217 149.000 0.003 1.000 N NA
 928359 928360 stu0156 stu0157     FALSE 0.261 87.000 0.000 NA   NA
 928361 928362 stu0158 stu0159     TRUE 0.996 0.000 0.758 1.000 Y NA
 928365 928366 stu0162 stu0163 mecA rgpG TRUE 0.982 4.000 0.267 NA N NA
 928366 928367 stu0163 stu0164 rgpG   TRUE 0.345 128.000 0.013 1.000 N NA
 928367 928368 stu0164 stu0165     TRUE 0.956 37.000 0.139 1.000 Y NA
 928368 928369 stu0165 stu0166   nifS1 TRUE 0.885 54.000 0.606 1.000 N NA
 928369 928370 stu0166 stu0167 nifS1 nifU TRUE 0.987 -34.000 0.292 1.000 N NA
 928370 928371 stu0167 stu0168 nifU   TRUE 0.968 80.000 0.152 0.002 N NA
 928371 928372 stu0168 stu0169     FALSE 0.060 284.000 0.000 NA   NA
 928372 928373 stu0169 stu0170     TRUE 0.919 -25.000 0.000 NA   NA
 928373 928374 stu0170 stu0171     TRUE 0.995 -10.000 0.021 0.042   NA
 928374 928375 stu0171 stu0172     TRUE 0.877 130.000 0.134 0.042   NA
 928375 928376 stu0172 stu0173     TRUE 0.987 -19.000 0.000 0.042   NA
 928376 928377 stu0173 stu0174     TRUE 0.892 -28.000 0.000 1.000   NA
 928377 928378 stu0174 stu0175     TRUE 0.668 30.000 0.000 NA   NA
 928378 928379 stu0175 stu0176     TRUE 0.920 -22.000 0.000 NA   NA
 928379 928380 stu0176 stu0177     TRUE 0.882 -105.000 0.000 1.000   NA
 928380 928381 stu0177 stu0178   optF TRUE 0.999 2.000 0.619 0.004   NA
 928381 928382 stu0178 stu0179 optF   FALSE 0.077 222.000 0.000 NA   NA
 928382 928383 stu0179 stu0180   hslO FALSE 0.214 126.000 0.000 NA   NA
 928383 928384 stu0180 stu0181 hslO nifR TRUE 0.968 -82.000 0.034 1.000 N NA
 928384 928385 stu0181 stu0182 nifR   FALSE 0.051 350.000 0.000 NA   NA
 928385 928386 stu0182 stu0183     FALSE 0.063 270.000 0.000 NA   NA
 928386 928387 stu0183 stu0184     TRUE 0.903 1.000 0.000 NA   NA
 928387 928388 stu0184 stu0185   adcR FALSE 0.254 94.000 0.000 NA   NA
 928388 928389 stu0185 stu0186 adcR adcC TRUE 0.964 2.000 0.038 1.000 N NA
 928389 928390 stu0186 stu0187 adcC adcB TRUE 0.996 -34.000 0.673 1.000 Y NA
 928390 928391 stu0187 stu0188 adcB mleP FALSE 0.106 162.000 0.000 1.000   NA
 928391 928392 stu0188 stu0189 mleP   FALSE 0.181 115.000 0.000 1.000   NA
 928392 928393 stu0189 stu0190     TRUE 0.927 114.000 0.119 0.013   NA
 928393 928394 stu0190 stu0191     TRUE 0.994 16.000 0.119 0.013   NA
 928394 928395 stu0191 stu0192     TRUE 0.991 -49.000 0.000 0.013   NA
 928395 928396 stu0192 stu0193     TRUE 0.858 41.000 0.034 NA   NA
 928396 928397 stu0193 stu0194   pgi FALSE 0.263 85.000 0.000 NA   NA
 928397 928398 stu0194 stu0195 pgi   FALSE 0.103 188.000 0.000 NA   NA
 928398 928399 stu0195 stu0196   yajC FALSE 0.214 126.000 0.000 NA   NA
 928399 928400 stu0196 stu0197 yajC uppS TRUE 0.337 129.000 0.007 NA N NA
 928400 928401 stu0197 stu0198 uppS cdsA TRUE 0.983 13.000 0.113 1.000 Y NA
 928401 928402 stu0198 stu0199 cdsA eep TRUE 0.919 17.000 0.040 1.000 N NA
 928402 928403 stu0199 stu0200 eep proS TRUE 0.664 71.000 0.095 1.000 N NA
 928403 928404 stu0200 stu0201 proS   FALSE 0.035 578.000 0.000 1.000   NA
 928404 928405 stu0201 stu0202     TRUE 0.984 0.000 0.143 1.000   NA
 928405 928406 stu0202 stu0203   groES TRUE 0.301 168.000 0.020 1.000   NA
 928406 928407 stu0203 stu0204 groES groEL TRUE 0.985 49.000 0.032 0.009 Y NA
 928407 928408 stu0204 stu0205 groEL   FALSE 0.149 133.000 0.000 1.000   NA
 928408 928409 stu0205 stu0206     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 928409 928410 stu0206 stu0207     TRUE 0.402 58.000 0.000 NA   NA
 928411 928412 stu0208 stu0209     FALSE 0.046 591.000 0.000 NA   NA
 928412 928413 stu0209 stu0210     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 928413 928414 stu0210 stu0211     FALSE 0.055 321.000 0.000 NA   NA
 928415 928416 stu0212 stu0213 pbp2A rpmGC TRUE 0.820 49.000 0.111 1.000 N NA
 928416 928417 stu0213 stu0214 rpmGC secE TRUE 0.957 9.000 0.080 1.000 N NA
 928417 928418 stu0214 stu0215 secE nusG TRUE 0.534 197.000 0.843 1.000 N NA
 928418 928419 stu0215 stu0216 nusG   FALSE 0.175 122.000 0.000 1.000   NA
 928420 928421 stu0217 stu0218     TRUE 0.360 253.000 0.000 0.027   NA
 928421 928422 stu0218 stu0219     TRUE 0.894 -25.000 0.000 1.000   NA
 928423 928424 stu0220 stu0221 leuS   FALSE 0.259 89.000 0.000 NA   NA
 928424 928425 stu0221 stu0222     TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 928427 928428 stu0224 stu0225     TRUE 0.913 -49.000 0.000 NA   NA
 928428 928429 stu0225 stu0226   pncB FALSE 0.042 294.000 0.000 NA N NA
 928429 928430 stu0226 stu0227 pncB nadE TRUE 0.999 12.000 0.194 0.003 Y NA
 928430 928431 stu0227 stu0228 nadE   TRUE 0.734 16.000 0.000 1.000   NA
 928431 928432 stu0228 stu0229   pepC FALSE 0.189 102.000 0.000 1.000   NA
 928433 928434 stu0230 stu0231 pbp1A recU TRUE 0.989 0.000 0.319 1.000   NA
 928435 928436 stu0232 stu0233     TRUE 0.793 109.000 0.579 NA   NA
 928436 928437 stu0233 stu0234     FALSE 0.046 527.000 0.000 NA   NA
 928437 928438 stu0234 stu0235     TRUE 0.968 3.000 0.029 NA   NA
 928438 928439 stu0235 stu0237   snf FALSE 0.231 111.000 0.000 NA   NA
 928439 928440 stu0237 stu0238 snf   TRUE 0.565 156.000 0.151 NA   NA
 928440 928441 stu0238 stu0239   murC TRUE 0.933 12.000 0.013 NA   NA
 928441 928442 stu0239 stu0240 murC   TRUE 0.478 86.000 0.014 1.000   NA
 928442 928443 stu0240 stu0241   pabC TRUE 0.681 100.000 0.120 NA   NA
 928443 928444 stu0241 stu0242 pabC greA TRUE 0.671 84.000 0.079 NA   NA
 928444 928445 stu0242 stu0243 greA   FALSE 0.049 405.000 0.000 NA   NA
 928445 928446 stu0243 stu0244     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928447 928448 stu0245 stu0246   acyP TRUE 0.658 87.000 0.154 1.000 N NA
 928449 928450 stu0247 stu0248 spoU   FALSE 0.189 102.000 0.000 1.000   NA
 928450 928451 stu0248 stu0249     TRUE 0.632 34.000 0.000 NA   NA
 928452 928453 stu0250 stu0251     FALSE 0.050 375.000 0.000 NA   NA
 928456 928457 stu0254 stu0255   glr TRUE 0.621 66.000 0.014 NA   NA
 928457 928458 stu0255 stu0256 glr   TRUE 0.973 -7.000 0.034 1.000 N NA
 928458 928459 stu0256 stu0257     TRUE 0.983 -18.000 0.085 1.000   NA
 928459 928460 stu0257 stu0258     TRUE 0.981 -3.000 0.065 1.000   NA
 928460 928461 stu0258 stu0259   xer2 TRUE 0.983 -46.000 0.111 1.000   NA
 928461 928462 stu0259 stu0260 xer2   TRUE 0.971 0.000 0.017 NA   NA
 928462 928463 stu0260 stu0261     TRUE 0.993 -7.000 0.570 NA   NA
 928463 928464 stu0261 stu0262   rluB TRUE 0.866 51.000 0.224 NA N NA
 928464 928465 stu0262 stu0263 rluB   TRUE 0.972 -3.000 0.014 NA   NA
 928466 928467 stu0264 stu0265 trkH1 trkA1 TRUE 0.999 7.000 0.163 0.005 Y NA
 928467 928468 stu0265 stu0266 trkA1 tnp1239 FALSE 0.124 121.000 0.000 1.000 N NA
 928469 928470 stu0267 stu0268     FALSE 0.073 234.000 0.000 NA   NA
 928470 928471 stu0268 stu0269     TRUE 0.990 3.000 0.600 NA   NA
 928471 928472 stu0269 stu0270   plcR FALSE 0.066 206.000 0.000 1.000   NA
 928472 928473 stu0270 stu0271 plcR   FALSE 0.089 175.000 0.000 1.000   NA
 928473 928474 stu0271 stu0272     TRUE 0.969 31.000 0.000 0.004   NA
 928474 928475 stu0272 stu0273     TRUE 0.954 31.000 0.000 0.013   NA
 928475 928476 stu0273 stu0274     TRUE 0.674 22.000 0.000 1.000   NA
 928476 928477 stu0274 stu0275     TRUE 0.821 6.000 0.000 1.000   NA
 928477 928478 stu0275 stu0276     FALSE 0.184 108.000 0.000 1.000   NA
 928480 928481 stu0280 stu0281 ureI ureA TRUE 0.903 25.000 0.040 1.000   NA
 928481 928482 stu0281 stu0282 ureA ureB TRUE 0.998 12.000 0.054 0.002 Y NA
 928482 928483 stu0282 stu0283 ureB ureC TRUE 0.998 16.000 0.045 0.002 Y NA
 928483 928484 stu0283 stu0284 ureC ureE TRUE 0.934 141.000 0.087 0.002 N NA
 928484 928485 stu0284 stu0285 ureE ureF TRUE 1.000 -10.000 0.460 0.005 Y NA
 928485 928486 stu0285 stu0286 ureF ureG TRUE 0.997 30.000 0.439 0.005 Y NA
 928486 928487 stu0286 stu0287 ureG ureD TRUE 0.999 2.000 0.337 0.005 Y NA
 928487 928488 stu0287 stu0288 ureD cbiM TRUE 0.925 4.000 0.010 1.000 N NA
 928488 928489 stu0288 stu0289 cbiM   TRUE 0.999 -3.000 0.115 0.004 Y NA
 928489 928490 stu0289 stu0290     TRUE 0.996 2.000 0.682 1.000 Y NA
 928490 928491 stu0290 stu0291     FALSE 0.069 165.000 0.000 1.000 N NA
 928491 928492 stu0291 stu0292   pps FALSE 0.051 190.000 0.000 1.000 N NA
 928492 928493 stu0292 stu0293 pps   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 928493 928494 stu0293 stu0294     TRUE 0.633 26.000 0.000 1.000   NA
 928496 928497 stu0296 stu0297     TRUE 0.546 160.000 0.222 NA N NA
 928497 928498 stu0297 stu0298     TRUE 0.377 61.000 0.000 NA   NA
 928498 928499 stu0298 stu0299     TRUE 0.333 58.000 0.000 1.000   NA
 928499 928500 stu0299 stu0300     FALSE 0.210 85.000 0.000 1.000   NA
 928500 928501 stu0300 stu0301     TRUE 0.898 -7.000 0.000 1.000   NA
 928501 928502 stu0301 stu0302     TRUE 0.997 0.000 0.938 1.000 Y NA
 928502 928503 stu0302 stu0303   dctA TRUE 0.561 123.000 0.000 0.091 N NA
 928503 928504 stu0303 stu0304 dctA   TRUE 0.312 153.000 0.007 NA   NA
 928504 928505 stu0304 stu0305     TRUE 0.862 33.000 0.020 NA   NA
 928505 928506 stu0305 stu0306     TRUE 0.966 10.000 0.068 NA   NA
 928506 928507 stu0306 stu0307     FALSE 0.241 100.000 0.000 NA   NA
 928507 928508 stu0307 stu0308     TRUE 0.620 36.000 0.000 NA   NA
 928508 928509 stu0308 stu0309     TRUE 0.350 56.000 0.000 1.000   NA
 928509 928510 stu0309 stu0310     TRUE 0.922 -7.000 0.000 NA   NA
 928510 928511 stu0310 stu0311     TRUE 0.921 -21.000 0.000 NA   NA
 928511 928512 stu0311 stu0312   tkt FALSE 0.026 351.000 0.000 1.000 N NA
 928513 928514 stu0313 stu0314 trkA2 trkH2 TRUE 0.979 40.000 0.000 0.005 Y NA
 928514 928515 stu0314 stu0315 trkH2 gidB TRUE 0.607 49.000 0.006 1.000 N NA
 928516 928517 stu0316 stu0317   rr01 TRUE 0.346 156.000 0.014 NA   NA
 928517 928518 stu0317 stu0318 rr01 hk01 TRUE 0.999 -3.000 0.438 0.090 Y NA
 928518 928519 stu0318 stu0319 hk01   TRUE 0.360 122.000 0.007 NA N NA
 928519 928520 stu0319 stu0320   dnaB TRUE 0.984 -3.000 0.109 NA N NA
 928520 928521 stu0320 stu0321 dnaB dnaI TRUE 0.996 4.000 0.817 NA Y NA
 928521 928522 stu0321 stu0322 dnaI   TRUE 0.393 106.000 0.008 1.000   NA
 928523 928524 stu0324 stu0325     TRUE 0.993 -16.000 0.500 NA   NA
 928526 928527 stu0328 stu0329   serS FALSE 0.050 363.000 0.000 NA   NA
 928527 928528 stu0329 stu0330 serS   FALSE 0.171 209.000 0.003 NA   NA
 928528 928529 stu0330 stu0331   manN TRUE 0.828 79.000 0.583 NA   NA
 928529 928530 stu0331 stu0332 manN manM TRUE 0.999 15.000 0.812 0.015 Y NA
 928530 928531 stu0332 stu0333 manM manL TRUE 0.990 68.000 0.943 0.015 Y NA
 928534 928535 stu0336 stu0337     FALSE 0.146 272.000 0.008 NA   NA
 928535 928536 stu0337 stu0338     TRUE 0.981 -7.000 0.033 NA   NA
 928536 928537 stu0338 stu0339     TRUE 0.981 9.000 0.283 NA   NA
 928537 928538 stu0339 stu0340     FALSE 0.220 123.000 0.000 NA   NA
 928538 928539 stu0340 stu0341   nusA TRUE 0.882 66.000 0.759 NA   NA
 928539 928540 stu0341 stu0342 nusA   TRUE 0.987 18.000 0.323 NA Y NA
 928540 928541 stu0342 stu0343     TRUE 0.991 -7.000 0.408 NA N NA
 928541 928542 stu0343 stu0344   infB TRUE 0.984 19.000 0.223 NA Y NA
 928542 928543 stu0344 stu0345 infB rbfA TRUE 0.888 94.000 0.530 1.000 Y NA
 928543 928544 stu0345 stu0346 rbfA   TRUE 0.348 65.000 0.000 NA   NA
 928544 928545 stu0346 stu0347     TRUE 0.922 -16.000 0.000 NA   NA
 928545 928546 stu0347 stu0348   murO FALSE 0.050 375.000 0.000 NA   NA
 928548 928549 stu0350 stu0351     TRUE 0.934 24.000 0.000 0.089   NA
 928549 928550 stu0351 stu0352   metB1 FALSE 0.037 407.000 0.000 1.000   NA
 928550 928551 stu0352 stu0353 metB1   TRUE 0.999 -31.000 0.082 0.015 Y NA
 928551 928552 stu0353 stu0354     FALSE 0.060 284.000 0.000 NA   NA
 928552 928553 stu0354 stu0355   upp FALSE 0.197 130.000 0.000 NA   NA
 928553 928554 stu0355 stu0356 upp clpP FALSE 0.280 138.000 0.010 1.000 N NA
 928554 928555 stu0356 stu0357 clpP   TRUE 0.639 87.000 0.055 NA   NA
 928555 928556 stu0357 stu0358     TRUE 0.993 -7.000 0.500 NA   NA
 928556 928557 stu0358 stu0359   livJ TRUE 0.521 157.000 0.109 NA   NA
 928557 928558 stu0359 stu0360 livJ livH TRUE 0.949 44.000 0.150 1.000 Y NA
 928558 928559 stu0360 stu0361 livH livM TRUE 0.998 4.000 0.363 0.041 Y NA
 928559 928560 stu0361 stu0362 livM livG TRUE 0.994 3.000 0.349 1.000 Y NA
 928560 928561 stu0362 stu0363 livG livF TRUE 0.999 0.000 0.128 0.027 Y NA
 928561 928562 stu0363 stu0364 livF   TRUE 0.569 154.000 0.214 1.000   NA
 928562 928563 stu0364 stu0365     TRUE 0.985 -55.000 0.000 0.050   NA
 928564 928565 stu0366 stu0367 cysM1   TRUE 0.547 96.000 0.033 1.000   NA
 928566 928567 stu0368 stu0369 comFA comFC TRUE 0.985 -25.000 0.130 1.000   NA
 928567 928568 stu0369 stu0370 comFC   TRUE 0.682 79.000 0.080 NA   NA
 928568 928569 stu0370 stu_r13     FALSE 0.049 405.000 0.000 NA   NA
 928569 928570 stu_r13 stu_t45     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 928570 928571 stu_t45 stu_r14     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 928571 928572 stu_r14 stu_r15     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928572 928573 stu_r15 stu_t46     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928573 928574 stu_t46 stu_t47     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 928574 928575 stu_t47 stu_t48     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 928575 928576 stu_t48 stu_t49     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 928576 928577 stu_t49 stu_t50     TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928577 928578 stu_t50 stu_t51     TRUE 0.851 8.000 0.000 NA   NA
 928578 928579 stu_t51 stu0372   ppaC FALSE 0.258 90.000 0.000 NA   NA
 928579 928580 stu0372 stu0373 ppaC   TRUE 0.722 54.000 0.015 NA   NA
 928581 928582 stu0374 stu0375   recX TRUE 0.629 71.000 0.025 NA   NA
 928583 928584 stu0376 stu0377   asnA FALSE 0.137 99.000 0.000 1.000 N NA
 928586 928587 stu0379 stu0380   phaB TRUE 0.367 213.000 0.000 0.050   NA
 928587 928588 stu0380 stu0381 phaB   TRUE 0.577 104.000 0.098 1.000 N NA
 928588 928589 stu0381 stu0382   fabH TRUE 0.975 0.000 0.070 1.000 N NA
 928589 928590 stu0382 stu0384 fabH acpP2 TRUE 0.958 64.000 0.065 0.008   NA
 928590 928591 stu0384 stu0385 acpP2 fabK TRUE 0.693 106.000 0.216 1.000   NA
 928591 928592 stu0385 stu0386 fabK fabD TRUE 0.950 17.000 0.099 1.000   NA
 928592 928593 stu0386 stu0387 fabD fabG TRUE 0.999 13.000 0.432 0.008 Y NA
 928593 928594 stu0387 stu0388 fabG fabF TRUE 0.856 62.000 0.056 1.000 Y NA
 928594 928595 stu0388 stu0389 fabF accB TRUE 0.987 4.000 0.074 1.000 Y NA
 928595 928596 stu0389 stu0390 accB fabZ TRUE 0.999 -3.000 0.047 0.008 Y NA
 928596 928597 stu0390 stu0391 fabZ accC TRUE 0.735 120.000 0.045 1.000 Y NA
 928597 928598 stu0391 stu0392 accC accD TRUE 0.999 6.000 0.090 0.003 Y NA
 928598 928599 stu0392 stu0393 accD accA TRUE 1.000 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 928601 928602 stu0395 stu0396   tnp1216 TRUE 0.503 151.000 0.000 0.099   NA
 928602 928603 stu0396 stu0397 tnp1216   FALSE 0.037 414.000 0.000 1.000   NA
 928605 928606 stu0399 stu0400 fruR fruB TRUE 0.997 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 928606 928607 stu0400 stu0401 fruB   TRUE 0.983 30.000 0.816 1.000 Y NA
 928607 928608 stu0401 stu0405     TRUE 0.997 -3.000 0.037 0.012   NA
 928608 928609 stu0405 stu0406     TRUE 0.960 55.000 0.037 0.012   NA
 928609 928610 stu0406 stu0407     TRUE 0.997 -7.000 0.037 0.012   NA
 928610 928611 stu0407 stu0408   gor FALSE 0.124 150.000 0.000 1.000   NA
 928612 928613 stu0409 stu0410 folC1   TRUE 0.918 46.000 0.308 NA   NA
 928614 928615 stu0411 stu0412 nifS2 thiI TRUE 0.854 55.000 0.349 1.000 N NA
 928615 928616 stu0412 stu0413 thiI   FALSE 0.131 106.000 0.000 1.000 N NA
 928616 928617 stu0413 stu0414     TRUE 0.990 -7.000 0.200 NA   NA
 928617 928618 stu0414 stu0416     FALSE 0.056 313.000 0.000 NA   NA
 928618 928619 stu0416 stu0417   rplU FALSE 0.076 229.000 0.000 NA   NA
 928619 928620 stu0417 stu0418 rplU rpmA TRUE 0.995 37.000 0.667 0.029 Y NA
 928620 928621 stu0418 stu0419 rpmA   TRUE 0.680 59.000 0.000 NA Y NA
 928621 928622 stu0419 stu0420     TRUE 0.910 -100.000 0.000 NA   NA
 928622 928623 stu0420 stu0421     FALSE 0.090 201.000 0.000 NA   NA
 928623 928624 stu0421 stu0422     TRUE 0.984 2.000 0.139 NA   NA
 928624 928625 stu0422 stu0423     TRUE 0.922 -7.000 0.000 NA   NA
 928625 928626 stu0423 stu0424   dapB TRUE 0.573 61.000 0.002 NA   NA
 928626 928627 stu0424 stu0425 dapB papL TRUE 0.960 -3.000 0.015 1.000 N NA
 928627 928628 stu0425 stu0426 papL   TRUE 0.624 78.000 0.056 1.000   NA
 928629 928630 stu0427 stu0428     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 928630 928631 stu0428 stu0429   nadR FALSE 0.108 130.000 0.000 1.000 N NA
 928632 928633 stu0430 stu0431 gdhA defA FALSE 0.200 259.000 0.056 1.000 N NA
 928633 928634 stu0431 stu0432 defA   FALSE 0.221 192.000 0.028 1.000 N NA
 928634 928635 stu0432 stu0433   lmrA1 TRUE 0.980 4.000 0.296 1.000 N NA
 928635 928636 stu0433 stu0434 lmrA1 lmrA2 TRUE 1.000 -10.000 1.000 0.012 Y NA
 928636 928637 stu0434 stu0435 lmrA2   FALSE 0.148 156.000 0.000 NA   NA
 928637 928638 stu0435 stu0437     FALSE 0.047 496.000 0.000 NA   NA
 928638 928639 stu0437 stu0438   pyrH FALSE 0.040 332.000 0.000 1.000   NA
 928639 928640 stu0438 stu0439 pyrH rrf TRUE 0.974 15.000 0.626 1.000 N NA
 928640 928641 stu0439 stu0440 rrf   TRUE 0.730 49.000 0.012 NA   NA
 928641 928642 stu0440 stu0441     TRUE 0.942 9.000 0.013 NA   NA
 928642 928643 stu0441 stu0442   pcsB FALSE 0.071 241.000 0.000 NA   NA
 928643 928644 stu0442 stu0446 pcsB   FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 928644 928645 stu0446 stu0447   phoH FALSE 0.270 80.000 0.000 NA   NA
 928645 928646 stu0447 stu0448 phoH   FALSE 0.044 1208.000 0.000 NA   NA
 928646 928647 stu0448 stu0449     FALSE 0.047 471.000 0.000 NA   NA
 928647 928648 stu0449 stu0450     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 928648 928649 stu0450 stu0451   metS FALSE 0.094 194.000 0.000 NA   NA
 928651 928652 stu0453 stu0454 coiA pepB TRUE 0.976 11.000 0.204 NA   NA
 928652 928653 stu0454 stu0455 pepB   FALSE 0.269 183.000 0.024 1.000   NA
 928653 928654 stu0455 stu0456   prtM TRUE 0.303 62.000 0.000 1.000   NA
 928654 928655 stu0456 stu0457 prtM alaS FALSE 0.040 342.000 0.000 1.000   NA
 928655 928656 stu0457 stu0458 alaS   FALSE 0.106 162.000 0.000 1.000   NA
 928656 928657 stu0458 stu0459     TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 928657 928658 stu0459 stu0460     FALSE 0.211 127.000 0.000 NA   NA
 928658 928659 stu0460 stu0461   cbpD3 FALSE 0.061 280.000 0.000 NA   NA
 928659 928660 stu0461 stu0462 cbpD3   FALSE 0.149 133.000 0.000 1.000   NA
 928660 928661 stu0462 stu0463   aspC3 TRUE 0.981 10.000 0.429 1.000   NA
 928661 928662 stu0463 stu0464 aspC3 argC TRUE 0.409 129.000 0.000 1.000 Y NA
 928662 928663 stu0464 stu0465 argC argJ TRUE 0.997 29.000 0.303 0.005 Y NA
 928663 928664 stu0465 stu0466 argJ argB TRUE 0.996 27.000 0.067 0.005 Y NA
 928664 928665 stu0466 stu0467 argB argD TRUE 0.993 4.000 0.322 1.000 Y NA
 928667 928668 stu0469 stu0470 hom thrB TRUE 0.762 84.000 0.036 1.000 Y NA
 928668 928669 stu0470 stu0471 thrB   TRUE 0.953 -52.000 0.005 1.000   NA
 928669 928670 stu0471 stu0472     FALSE 0.083 182.000 0.000 1.000   NA
 928670 928671 stu0472 stu0473     FALSE 0.189 135.000 0.000 NA   NA
 928671 928672 stu0473 stu0474     FALSE 0.047 470.000 0.000 NA   NA
 928672 928673 stu0474 stu0475     TRUE 0.995 -16.000 0.000 0.003   NA
 928673 928674 stu0475 stu0476     TRUE 0.584 41.000 0.000 NA   NA
 928674 928675 stu0476 stu0477   valS FALSE 0.152 231.000 0.002 NA   NA
 928675 928676 stu0477 stu0478 valS atpE FALSE 0.088 177.000 0.000 1.000   NA
 928676 928677 stu0478 stu0479 atpE atpB TRUE 0.991 35.000 0.189 0.005   NA
 928677 928678 stu0479 stu0480 atpB atpF TRUE 0.996 21.000 0.032 0.005 Y NA
 928678 928679 stu0480 stu0481 atpF atpH TRUE 0.999 0.000 0.222 0.005 Y NA
 928679 928680 stu0481 stu0482 atpH atpA TRUE 0.999 16.000 0.864 0.005 Y NA
 928680 928681 stu0482 stu0483 atpA atpG TRUE 0.999 19.000 0.846 0.005 Y NA
 928681 928682 stu0483 stu0484 atpG atpD TRUE 0.989 77.000 0.724 0.005 Y NA
 928682 928683 stu0484 stu0485 atpD atpC TRUE 0.999 13.000 0.837 0.005 Y NA
 928683 928684 stu0485 stu0486 atpC ftsW FALSE 0.037 237.000 0.000 1.000 N NA
 928684 928685 stu0486 stu0487 ftsW tufA FALSE 0.037 238.000 0.000 1.000 N NA
 928685 928686 stu0487 stu0488 tufA tpi FALSE 0.096 249.000 0.003 1.000 N NA
 928686 928687 stu0488 stu0489 tpi tmk FALSE 0.037 238.000 0.000 1.000 N NA
 928687 928688 stu0489 stu0490 tmk dnaH TRUE 0.974 9.000 0.254 1.000 N NA
 928688 928689 stu0490 stu0491 dnaH sip TRUE 0.992 -3.000 0.372 NA   NA
 928689 928690 stu0491 stu0492 sip   TRUE 0.990 -13.000 0.183 NA   NA
 928690 928691 stu0492 stu0493     TRUE 0.973 3.000 0.043 NA   NA
 928691 928692 stu0493 stu0494   amtB FALSE 0.205 90.000 0.000 1.000   NA
 928692 928693 stu0494 stu0495 amtB gnlB TRUE 0.983 -55.000 0.160 1.000 N NA
 928693 928694 stu0495 stu0496 gnlB mur1 FALSE 0.138 98.000 0.000 1.000 N NA
 928694 928695 stu0496 stu0497 mur1   TRUE 0.899 -13.000 0.000 1.000   NA
 928695 928696 stu0497 stu0499     FALSE 0.047 504.000 0.000 NA   NA
 928696 928697 stu0499 stu0500     TRUE 0.982 8.000 0.273 NA   NA
 928697 928698 stu0500 stu0501   nagA TRUE 0.750 67.000 0.090 NA   NA
 928698 928699 stu0501 stu0502 nagA   FALSE 0.236 105.000 0.000 NA   NA
 928699 928700 stu0502 stu0503     TRUE 0.909 -127.000 0.000 NA   NA
 928700 928701 stu0503 stu0504     TRUE 0.922 -16.000 0.000 NA   NA
 928701 928702 stu0504 stu0505   glyQ FALSE 0.045 675.000 0.000 NA   NA
 928702 928703 stu0505 stu0507 glyQ glyS TRUE 0.961 284.000 0.651 0.001 Y NA
 928703 928704 stu0507 stu0508 glyS   TRUE 0.940 13.000 0.020 NA   NA
 928704 928705 stu0508 stu0509   cycA FALSE 0.137 162.000 0.000 NA   NA
 928707 928708 stu0511 stu0512     TRUE 0.980 13.000 0.000 0.012   NA
 928708 928709 stu0512 stu0513     TRUE 0.932 45.000 0.000 0.012   NA
 928709 928710 stu0513 stu0514     TRUE 0.997 -22.000 0.000 0.012 Y NA
 928712 928713 stu0516 stu0517     TRUE 0.620 36.000 0.000 NA   NA
 928713 928714 stu0517 stu0518     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 928714 928715 stu0518 stu0519     FALSE 0.167 146.000 0.000 NA   NA
 928715 928716 stu0519 stu0520     FALSE 0.233 107.000 0.000 NA   NA
 928716 928717 stu0520 stu0521   lspA TRUE 0.963 9.000 0.119 1.000 N NA
 928717 928718 stu0521 stu0522 lspA rluD TRUE 0.980 -16.000 0.082 1.000 N NA
 928718 928719 stu0522 stu0523 rluD pyrR TRUE 0.406 145.000 0.048 1.000 N NA
 928719 928720 stu0523 stu0524 pyrR pyrP TRUE 0.453 314.000 0.140 1.000 Y NA
 928720 928721 stu0524 stu0525 pyrP pyrB TRUE 0.963 25.000 0.064 1.000 Y NA
 928721 928722 stu0525 stu0526 pyrB carA TRUE 0.547 153.000 0.014 1.000 Y NA
 928722 928723 stu0526 stu0527 carA carB TRUE 0.919 345.000 0.117 0.001 Y NA
 928723 928724 stu0527 stu0528 carB   FALSE 0.050 377.000 0.000 NA   NA
 928724 928725 stu0528 stu0529     FALSE 0.047 471.000 0.000 NA   NA
 928725 928726 stu0529 stu0530     FALSE 0.182 138.000 0.000 NA   NA
 928726 928727 stu0530 stu0531     TRUE 0.922 -7.000 0.000 NA   NA
 928727 928728 stu0531 stu0532     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 928728 928729 stu0532 stu0533     TRUE 0.847 9.000 0.000 NA   NA
 928729 928730 stu0533 stu0535     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 928730 928731 stu0535 stu0536   rplJ FALSE 0.059 291.000 0.000 NA   NA
 928731 928732 stu0536 stu0537 rplJ rplL TRUE 0.984 75.000 0.884 0.028 Y NA
 928732 928733 stu0537 stu0538 rplL   FALSE 0.022 1254.000 0.000 1.000 N NA
 928733 928734 stu0538 stu0539     TRUE 0.999 13.000 0.846 0.012 Y NA
 928737 928738 stu0542 stu0543 hk02 rr02 TRUE 0.996 0.000 0.400 NA Y NA
 928739 928740 stu0545 stu0546     TRUE 0.841 -39.000 0.000 1.000 N NA
 928740 928741 stu0546 stu0547     TRUE 0.985 2.000 0.167 NA   NA
 928741 928742 stu0547 stu0548     FALSE 0.101 189.000 0.000 NA   NA
 928742 928743 stu0548 stu0549     FALSE 0.144 158.000 0.000 NA   NA
 928743 928744 stu0549 stu0550     TRUE 0.963 14.000 0.103 NA   NA
 928744 928745 stu0550 stu0551     FALSE 0.274 79.000 0.000 NA   NA
 928745 928746 stu0551 stu0552     FALSE 0.256 92.000 0.000 NA   NA
 928746 928747 stu0552 stu0553   rsuA1 FALSE 0.270 80.000 0.000 NA   NA
 928747 928748 stu0553 stu0554 rsuA1 hipO1 FALSE 0.055 236.000 0.000 1.000   NA
 928748 928749 stu0554 stu0555 hipO1   FALSE 0.036 433.000 0.000 1.000   NA
 928749 928750 stu0555 stu0556     TRUE 0.997 -25.000 0.000 0.001   NA
 928750 928751 stu0556 stu0557     TRUE 0.325 709.000 0.000 0.018   NA
 928753 928754 stu0559 stu0560 mvaK1 mvaD TRUE 1.000 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 928754 928755 stu0560 stu0561 mvaD mvaK2 TRUE 1.000 -7.000 0.312 0.005 Y NA
 928755 928756 stu0561 stu0562 mvaK2 idi TRUE 0.802 50.000 0.097 1.000 N NA
 928756 928757 stu0562 stu0563 idi gcaD FALSE 0.023 549.000 0.000 1.000 N NA
 928757 928758 stu0563 stu0564 gcaD   TRUE 0.470 76.000 0.015 1.000 N NA
 928758 928759 stu0564 stu0565     TRUE 0.963 4.000 0.025 NA   NA
 928759 928760 stu0565 stu0566   pfs TRUE 0.695 68.000 0.041 NA   NA
 928760 928761 stu0566 stu0567 pfs   FALSE 0.045 919.000 0.000 NA   NA
 928761 928762 stu0567 stu0568     FALSE 0.194 131.000 0.000 NA   NA
 928762 928763 stu0568 stu0569     FALSE 0.170 125.000 0.000 1.000   NA
 928763 928764 stu0569 stu0570     TRUE 0.999 1.000 0.413 0.015 Y NA
 928764 928765 stu0570 stu0571     FALSE 0.063 272.000 0.000 NA   NA
 928765 928766 stu0571 stu0572   thrS TRUE 0.382 154.000 0.018 NA   NA
 928766 928767 stu0572 stu0573 thrS   TRUE 0.480 50.000 0.000 NA   NA
 928767 928768 stu0573 stu0574     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 928769 928770 stu0575 stu0576 hlyIII mvaA FALSE 0.034 618.000 0.000 1.000   NA
 928770 928771 stu0576 stu0577 mvaA mvaS TRUE 0.995 -7.000 0.183 1.000 Y NA
 928772 928773 stu0578 stu0579 thyA folA TRUE 0.685 108.000 0.295 1.000 N NA
 928773 928774 stu0579 stu0580 folA   TRUE 0.962 5.000 0.030 NA   NA
 928774 928775 stu0580 stu0581   clpX TRUE 0.906 18.000 0.012 NA   NA
 928775 928776 stu0581 stu0582 clpX   TRUE 0.953 10.000 0.043 1.000   NA
 928776 928777 stu0582 stu0583   rocE TRUE 0.827 55.000 0.000 0.063   NA
 928777 928778 stu0583 stu0584 rocE mmuM TRUE 0.993 -6.000 0.093 1.000 Y NA
 928778 928779 stu0584 stu0585 mmuM   FALSE 0.230 113.000 0.000 NA   NA
 928779 928780 stu0585 stu0586     TRUE 0.307 72.000 0.000 NA   NA
 928782 928783 stu0588 stu0589 parE parC TRUE 0.926 574.000 0.552 0.003 Y NA
 928783 928784 stu0589 stu0590 parC bcaT TRUE 0.390 164.000 0.086 1.000 N NA
 928784 928785 stu0590 stu0591 bcaT   TRUE 0.638 119.000 0.095 NA   NA
 928785 928786 stu0591 stu_t52     TRUE 0.377 61.000 0.000 NA   NA
 928786 928787 stu_t52 stu_t53     TRUE 0.326 69.000 0.000 NA   NA
 928787 928788 stu_t53 stu0592   rpsA FALSE 0.223 121.000 0.000 NA   NA
 928788 928789 stu0592 stu_t54 rpsA   TRUE 0.326 69.000 0.000 NA   NA
 928789 928790 stu_t54 stu0593     FALSE 0.045 688.000 0.000 NA   NA
 928790 928791 stu0593 stu0594     FALSE 0.144 158.000 0.000 NA   NA
 928791 928792 stu0594 stu0595     FALSE 0.083 212.000 0.000 NA   NA
 928792 928793 stu0595 stu0596   murN FALSE 0.250 96.000 0.000 NA   NA
 928793 928794 stu0596 stu0597 murN   FALSE 0.047 275.000 0.000 1.000   NA
 928794 928795 stu0597 stu0598     TRUE 0.788 16.000 0.000 NA   NA
 928795 928796 stu0598 stu0599     FALSE 0.230 112.000 0.000 NA   NA
 928797 928798 stu0600 stu0601     TRUE 0.971 10.000 0.114 NA   NA
 928798 928799 stu0601 stu0602   clpE TRUE 0.458 143.000 0.079 1.000 N NA
 928800 928801 stu0603 stu0604 argF   TRUE 0.703 69.000 0.052 NA   NA
 928801 928802 stu0604 stu0605     FALSE 0.242 266.000 0.044 NA   NA
 928802 928803 stu0605 stu0606     TRUE 0.996 0.000 0.640 1.000 Y NA
 928803 928804 stu0606 stu0607   feoA FALSE 0.248 174.000 0.022 1.000 N NA
 928804 928805 stu0607 stu0608 feoA feoB TRUE 0.997 -3.000 0.871 1.000 Y NA
 928805 928806 stu0608 stu0609 feoB   FALSE 0.049 387.000 0.000 NA   NA
 928806 928807 stu0609 stu0610     FALSE 0.069 248.000 0.000 NA   NA
 928807 928808 stu0610 stu0611   folD FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 928808 928809 stu0611 stu0612 folD   TRUE 0.958 4.000 0.030 NA N NA
 928809 928810 stu0612 stu0613   pbp2B FALSE 0.169 122.000 0.000 NA N NA
 928810 928811 stu0613 stu0614 pbp2B recR TRUE 0.370 110.000 0.013 1.000 N NA
 928811 928812 stu0614 stu0615 recR   FALSE 0.135 143.000 0.000 1.000   NA
 928812 928813 stu0615 stu0616     TRUE 0.669 108.000 0.000 0.043   NA
 928813 928814 stu0616 stu0617     FALSE 0.078 220.000 0.000 NA   NA
 928814 928815 stu0617 stu0618   dgk TRUE 0.981 -19.000 0.035 NA   NA
 928815 928816 stu0618 stu0619 dgk era TRUE 0.936 19.000 0.063 1.000   NA
 928816 928817 stu0619 stu0620 era mutM TRUE 0.668 47.000 0.004 1.000   NA
 928817 928818 stu0620 stu0621 mutM coaE TRUE 0.977 -24.000 0.066 1.000 N NA
 928818 928819 stu0621 stu0622 coaE pmrA TRUE 0.587 51.000 0.007 1.000 N NA
 928819 928820 stu0622 stu0623 pmrA rpmGA TRUE 0.957 -10.000 0.012 1.000 N NA
 928820 928821 stu0623 stu0624 rpmGA secG TRUE 0.690 45.000 0.012 1.000 N NA
 928821 928822 stu0624 stu0625 secG rnr TRUE 0.708 59.000 0.064 1.000 N NA
 928822 928823 stu0625 stu0626 rnr ssrA TRUE 0.987 22.000 0.143 0.032 N NA
 928823 928824 stu0626 stu0627 ssrA pplB FALSE 0.118 154.000 0.000 1.000   NA
 928824 928825 stu0627 stu0628 pplB   TRUE 0.982 2.000 0.151 1.000   NA
 928827 928828 stu0630 stu0631 ccpA   TRUE 0.393 59.000 0.000 NA   NA
 928828 928829 stu0631 stu0632     FALSE 0.234 106.000 0.000 NA   NA
 928829 928830 stu0632 stu0633   grk TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928834 928835 stu0637 stu0638   aroD TRUE 0.987 -3.000 0.125 NA   NA
 928835 928836 stu0638 stu0639 aroD aroE TRUE 0.996 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 928836 928837 stu0639 stu0640 aroE aroB TRUE 0.963 13.000 0.010 1.000 Y NA
 928837 928838 stu0640 stu0641 aroB aroF TRUE 0.999 1.000 0.110 0.005 Y NA
 928838 928839 stu0641 stu0642 aroF tyrA TRUE 0.922 30.000 0.010 1.000 Y NA
 928839 928840 stu0642 stu0643 tyrA   TRUE 0.964 10.000 0.058 NA   NA
 928840 928841 stu0643 stu0644   hdhL TRUE 0.723 56.000 0.022 NA   NA
 928841 928842 stu0644 stu0645 hdhL aroA TRUE 0.337 81.000 0.002 1.000 N NA
 928842 928843 stu0645 stu0646 aroA aroK TRUE 0.987 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 928843 928844 stu0646 stu0647 aroK pheA TRUE 0.989 -9.000 0.025 1.000 Y NA
 928844 928845 stu0647 stu0649 pheA   TRUE 0.936 12.000 0.025 NA N NA
 928846 928847 stu0650 stu0651 eetB   TRUE 0.916 16.000 0.032 1.000 N NA
 928847 928848 stu0651 stu0652   mip TRUE 0.922 40.000 0.200 NA   NA
 928849 928850 stu0653 stu0654     FALSE 0.071 195.000 0.000 1.000   NA
 928850 928851 stu0654 stu0655     FALSE 0.037 386.000 0.000 1.000   NA
 928851 928852 stu0655 stu0656     FALSE 0.045 881.000 0.000 NA   NA
 928852 928853 stu0656 stu0657     FALSE 0.066 257.000 0.000 NA   NA
 928853 928854 stu0657 stu0658     TRUE 0.401 178.000 0.062 NA   NA
 928854 928855 stu0658 stu0659     TRUE 0.993 2.000 0.876 NA   NA
 928855 928856 stu0659 stu0660     TRUE 0.981 -3.000 0.044 NA   NA
 11476358 928850   stu0654     FALSE NA 8205.000 0.000 NA   NA
 11618721 928850   stu0654     FALSE NA 8205.000 0.000 NA   NA
 11761113 928850   stu0654     FALSE NA 8205.000 0.000 NA   NA
 11476359 928850   stu0654     FALSE NA 8241.000 0.000 NA   NA
 11618722 928850   stu0654     FALSE NA 8241.000 0.000 NA   NA
 11761114 928850   stu0654     FALSE NA 8241.000 0.000 NA   NA
 11476360 928850   stu0654     FALSE NA 8271.000 0.000 NA   NA
 11618723 928850   stu0654     FALSE NA 8271.000 0.000 NA   NA
 11761115 928850   stu0654     FALSE NA 8271.000 0.000 NA   NA
 928857 928858 stu0661 stu0662     TRUE 0.994 0.000 0.841 NA   NA
 928859 928860 stu0663 stu0664 tex   TRUE 0.990 -13.000 0.215 NA   NA
 928860 928861 stu0664 stu0665     TRUE 0.712 67.000 0.051 NA   NA
 928861 928862 stu0665 stu0666   ptsK TRUE 0.674 129.000 0.017 NA Y NA
 928862 928863 stu0666 stu0667 ptsK lgt TRUE 0.989 0.000 0.494 1.000 N NA
 928863 928864 stu0667 stu0668 lgt   TRUE 0.919 30.000 0.079 NA   NA
 928864 928865 stu0668 stu0669     TRUE 0.973 13.000 0.206 NA   NA
 928867 928868 stu0671 stu0672     TRUE 0.985 79.000 0.156 0.003 Y NA
 928869 928870 stu0674 stu0675 bioY1   FALSE 0.252 95.000 0.000 NA   NA
 928873 928874 stu0678 stu0679     TRUE 0.764 19.000 0.000 NA   NA
 928875 928876 stu0680 stu0681     TRUE 0.788 91.000 0.043 NA Y NA
 928876 928877 stu0681 stu0692   lysS FALSE 0.033 638.000 0.000 NA N NA
 928878 928879 stu0693 stu0694     FALSE 0.091 200.000 0.000 NA   NA
 928879 928880 stu0694 stu0695     TRUE 0.992 -10.000 0.333 NA   NA
 928880 928881 stu0695 stu0696     FALSE 0.054 325.000 0.000 NA   NA
 928882 928883 stu0697 stu0698 gpmC   TRUE 0.963 3.000 0.018 NA   NA
 928883 928884 stu0698 stu0699     FALSE 0.229 115.000 0.000 NA   NA
 928884 928885 stu0699 stu0700     FALSE 0.096 192.000 0.000 NA   NA
 928885 928886 stu0700 stu0701     FALSE 0.066 256.000 0.000 NA   NA
 928887 928888 stu0702 stu0704     FALSE 0.045 760.000 0.000 NA   NA
 928888 928889 stu0704 stu0705   hsdR1 FALSE 0.049 260.000 0.000 1.000   NA
 928889 928890 stu0705 stu0706 hsdR1   TRUE 0.923 -10.000 0.000 NA   NA
 928890 928891 stu0706 stu0707     TRUE 0.903 1.000 0.000 NA   NA
 928891 928892 stu0707 stu0708   hsdS1 TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928892 928893 stu0708 stu0709 hsdS1   TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 928893 928894 stu0709 stu0710     TRUE 0.627 35.000 0.000 NA   NA
 928894 928895 stu0710 stu0711   hsdM1 TRUE 0.751 43.000 0.011 1.000   NA
 928895 928896 stu0711 stu0712 hsdM1   FALSE 0.086 207.000 0.000 NA   NA
 928896 928897 stu0712 stu0713     FALSE 0.103 188.000 0.000 NA   NA
 928897 928898 stu0713 stu0714   lemA FALSE 0.158 151.000 0.000 NA   NA
 928898 928899 stu0714 stu0715 lemA htpX TRUE 0.987 2.000 0.222 NA   NA
 928899 928900 stu0715 stu0716 htpX   FALSE 0.226 118.000 0.000 NA   NA
 928900 928901 stu0716 stu0717     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 928901 928902 stu0717 stu0718   ppc FALSE 0.118 174.000 0.000 NA   NA
 928902 928903 stu0718 stu0719 ppc holA FALSE 0.197 68.000 0.000 1.000 N NA
 928903 928904 stu0719 stu0720 holA sodA TRUE 0.743 38.000 0.012 1.000 N NA
 928904 928905 stu0720 stu0721 sodA   FALSE 0.197 97.000 0.000 1.000   NA
 928907 928908 stu0723 stu0724 dpr fur TRUE 0.490 89.000 0.000 1.000 Y NA
 928908 928909 stu0724 stu0725 fur   FALSE 0.082 214.000 0.000 NA   NA
 928909 928910 stu0725 stu0726     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 928910 928911 stu0726 stu0727     FALSE 0.239 101.000 0.000 NA   NA
 928911 928912 stu0727 stu0728   glcK TRUE 0.993 -7.000 0.496 NA   NA
 928912 928913 stu0728 stu0729 glcK typA FALSE 0.099 138.000 0.000 1.000 N NA
 928913 928914 stu0729 stu0730 typA   TRUE 0.892 24.000 0.015 NA   NA
 928914 928915 stu0730 stu0731   murD TRUE 0.408 123.000 0.006 NA   NA
 928915 928916 stu0731 stu0732 murD murG TRUE 0.986 4.000 0.060 1.000 Y NA
 928916 928917 stu0732 stu0733 murG divIB TRUE 0.985 10.000 0.072 NA Y NA
 928917 928918 stu0733 stu0734 divIB ftsA TRUE 0.722 124.000 0.389 NA N NA
 928918 928919 stu0734 stu0735 ftsA ftsZ TRUE 0.979 29.000 0.460 1.000 Y NA
 928919 928920 stu0735 stu0736 ftsZ   TRUE 0.968 3.000 0.030 NA   NA
 928920 928921 stu0736 stu0737     TRUE 0.981 5.000 0.194 NA   NA
 928921 928922 stu0737 stu0738     TRUE 0.987 4.000 0.370 NA   NA
 928922 928923 stu0738 stu0739     TRUE 0.988 0.000 0.287 1.000   NA
 928923 928924 stu0739 stu0740   divIVA TRUE 0.488 244.000 0.579 NA   NA
 928924 928925 stu0740 stu0741 divIVA ileS FALSE 0.147 248.000 0.012 NA N NA
 928928 928929 stu0746 stu0747 rpmE2 apbE TRUE 0.312 106.000 0.004 1.000 N NA
 928929 928930 stu0747 stu0748 apbE   TRUE 0.980 -19.000 0.053 1.000   NA
 928930 928931 stu0748 stu0749     TRUE 0.476 81.000 0.013 1.000   NA
 928932 928933 stu0750 stu0751 add tdk FALSE 0.296 229.000 0.004 1.000 Y NA
 928933 928934 stu0751 stu0752 tdk prfA TRUE 0.852 37.000 0.062 1.000 N NA
 928934 928935 stu0752 stu0753 prfA hemK TRUE 0.998 -3.000 0.084 0.051 Y NA
 928935 928936 stu0753 stu0754 hemK   TRUE 0.991 -13.000 0.029 NA Y NA
 928936 928937 stu0754 stu0755   glyA TRUE 0.466 95.000 0.015 NA N NA
 928937 928938 stu0755 stu0756 glyA   TRUE 0.974 7.000 0.103 NA   NA
 928938 928939 stu0756 stu0757     TRUE 0.986 -52.000 0.128 NA   NA
 928939 928940 stu0757 stu0758     TRUE 0.898 33.000 0.053 NA   NA
 928940 928941 stu0758 stu0759     TRUE 1.000 -133.000 0.895 0.010 Y NA
 928941 928942 stu0759 stu0760   dltX TRUE 0.576 42.000 0.000 NA   NA
 928942 928943 stu0760 stu0761 dltX dltA TRUE 0.847 9.000 0.000 NA   NA
 928943 928944 stu0761 stu0762 dltA dltB TRUE 0.991 -3.000 0.435 NA N NA
 928944 928945 stu0762 stu0763 dltB dltC TRUE 0.974 18.000 0.387 NA   NA
 928945 928946 stu0763 stu0764 dltC dltD TRUE 0.992 -7.000 0.409 NA   NA
 928947 928948 stu0765 stu0766     TRUE 0.835 64.000 0.000 0.020   NA
 928948 928949 stu0766 stu0767     TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 928949 928950 stu0767 stu0768     TRUE 0.393 59.000 0.000 NA   NA
 928950 928951 stu0768 stu0769     TRUE 0.922 -7.000 0.000 NA   NA
 928951 928952 stu0769 stu0770   pacL1 FALSE 0.091 198.000 0.000 NA   NA
 928952 928953 stu0770 stu0771 pacL1 pabB FALSE 0.060 177.000 0.000 1.000 N NA
 928954 928955 stu0784 stu0785   metE FALSE 0.059 289.000 0.000 NA   NA
 928955 928956 stu0785 stu0786 metE metF TRUE 0.966 129.000 0.050 0.003 Y NA
 928957 928958 stu0787 stu0788 pgmA   TRUE 0.689 83.000 0.098 NA   NA
 928958 928959 stu0788 stu0789   dfp1 TRUE 0.894 25.000 0.019 NA   NA
 928959 928960 stu0789 stu0790 dfp1 dfp2 TRUE 0.965 -37.000 0.013 1.000   NA
 928961 928962 stu0791 stu0792 fhs   FALSE 0.041 324.000 0.000 1.000   NA
 928962 928963 stu0792 stu0793     TRUE 0.515 128.000 0.030 NA   NA
 928963 928964 stu0793 stu0794     FALSE 0.278 78.000 0.000 NA   NA
 928964 928965 stu0794 stu0795     TRUE 0.896 2.000 0.000 NA   NA
 928966 928967 stu0796 stu0797 tnpSth1 tnpSth1 TRUE 0.992 15.000 0.250 0.081   NA
 928967 928968 stu0797 stu0798 tnpSth1 rpsT FALSE 0.212 82.000 0.000 1.000   NA
 928968 928969 stu0798 stu0799 rpsT coaA TRUE 0.501 69.000 0.014 1.000 N NA
 928970 928971 stu0800 stu0801     TRUE 0.734 16.000 0.000 1.000   NA
 928971 928972 stu0801 stu0802     TRUE 0.980 82.000 0.385 0.002   NA
 928972 928973 stu0802 stu0803     TRUE 0.999 -19.000 0.385 0.002   NA
 928973 928974 stu0803 stu0804     TRUE 0.998 18.000 0.385 0.002   NA
 928974 928975 stu0804 stu0806     FALSE 0.040 340.000 0.000 1.000   NA
 928975 928976 stu0806 stu0807   cdd TRUE 0.894 -25.000 0.000 1.000   NA
 928976 928977 stu0807 stu0808 cdd   FALSE 0.248 72.000 0.000 1.000   NA
 928977 928978 stu0808 stu0809     TRUE 0.430 99.000 0.012 1.000   NA
 928978 928979 stu0809 stu0810     TRUE 0.992 -7.000 0.438 1.000   NA
 928979 928980 stu0810 stu0811     TRUE 0.998 2.000 0.720 0.033   NA
 928982 928983 stu0813 stu0814     TRUE 0.943 64.000 0.009 0.004   NA
 928983 928984 stu0814 stu0815     FALSE 0.200 196.000 0.006 NA   NA
 928984 928985 stu0815 stu0817   aspC1 TRUE 0.982 5.000 0.205 NA   NA
 928985 928986 stu0817 stu0818 aspC1 asnS TRUE 0.858 37.000 0.068 1.000 N NA
 928986 928987 stu0818 stu0819 asnS   TRUE 0.693 27.000 0.000 NA   NA
 928988 928989 stu0821 stu0822     FALSE 0.260 88.000 0.000 NA   NA
 928989 928990 stu0822 stu0823     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 928991 928992 stu0824 stu0825     FALSE 0.242 174.000 0.005 NA   NA
 928992 928993 stu0825 stu0826   ptpS TRUE 0.978 0.000 0.062 1.000   NA
 928993 928994 stu0826 stu0827 ptpS   TRUE 0.988 -7.000 0.280 1.000 N NA
 928994 928995 stu0827 stu0828     TRUE 0.690 75.000 0.101 1.000   NA
 928995 928996 stu0828 stu0829     FALSE 0.045 820.000 0.000 NA   NA
 928996 928997 stu0829 stu0830     FALSE 0.087 205.000 0.000 NA   NA
 928997 928998 stu0830 stu0831     TRUE 0.980 -19.000 0.030 NA   NA
 928998 928999 stu0831 stu0832     TRUE 0.990 -3.000 0.214 NA   NA
 928999 929000 stu0832 stu0833     TRUE 0.992 -3.000 0.470 NA   NA
 929000 929001 stu0833 stu0835     FALSE 0.171 289.000 0.015 NA   NA
 929001 929002 stu0835 stu0836     TRUE 0.998 7.000 0.200 0.002   NA
 929002 929003 stu0836 stu0837   cspA FALSE 0.044 291.000 0.000 1.000   NA
 929003 929004 stu0837 stu0838 cspA cspB TRUE 0.580 214.000 0.000 0.037 Y NA
 929004 929005 stu0838 stu0839 cspB tnp1191 FALSE 0.223 298.000 0.000 0.081 N NA
 929006 929007 stu0840 stu0841 copB   FALSE 0.075 191.000 0.000 1.000   NA
 929007 929008 stu0841 stu0842     TRUE 0.924 42.000 0.000 0.022   NA
 929008 929009 stu0842 stu0843     TRUE 0.941 33.000 0.000 0.022   NA
 929009 929010 stu0843 stu0844     TRUE 0.854 47.000 0.000 0.081   NA
 929011 929012 stu0846 stu0847 cysM2 metB2 TRUE 0.998 22.000 0.690 0.012 Y NA
 929012 929013 stu0847 stu0848 metB2 cysE2 TRUE 0.991 -58.000 0.076 1.000 Y NA
 929013 929014 stu0848 stu0849 cysE2 tnp1191 FALSE 0.024 497.000 0.000 1.000 N NA
 929015 929016 stu0850 stu0851     TRUE 0.897 70.000 0.000 0.003   NA
 929016 929017 stu0851 stu0852     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.081   NA
 929018 929019 stu0855 stu0856     FALSE 0.046 616.000 0.000 NA   NA
 929019 929020 stu0856 stu0857     FALSE 0.111 180.000 0.000 NA   NA
 929022 929023 stu0860 stu0861 adcA   FALSE 0.079 218.000 0.000 NA   NA
 929024 929025 stu0863 stu0864     TRUE 0.911 -60.000 0.000 NA   NA
 929025 929026 stu0864 stu0865     TRUE 0.990 -25.000 0.000 0.022   NA
 929026 929027 stu0865 stu0866     TRUE 0.919 -25.000 0.000 NA   NA
 929027 929028 stu0866 stu0868     FALSE 0.055 318.000 0.000 NA   NA
 929029 929030 stu0869 stu0870 mur2   TRUE 0.825 12.000 0.000 NA   NA
 929030 929031 stu0870 stu0871     TRUE 0.873 4.000 0.000 NA   NA
 929033 929034 stu0873 stu0874 glmS phnA TRUE 0.327 118.000 0.008 1.000 N NA
 929034 929035 stu0874 stu0875 phnA   FALSE 0.196 194.000 0.018 1.000 N NA
 929035 929036 stu0875 stu0876     TRUE 0.987 9.000 0.130 1.000 Y NA
 929036 929037 stu0876 stu0877     TRUE 0.985 13.000 0.154 1.000 Y NA
 929037 929038 stu0877 stu0879     FALSE 0.036 463.000 0.000 1.000   NA
 929038 929039 stu0879 stu0880     FALSE 0.034 772.000 0.000 1.000   NA
 929039 929040 stu0880 stu0881     TRUE 0.988 14.000 0.012 0.018   NA
 929040 929041 stu0881 stu0882     TRUE 0.956 46.000 0.012 0.019   NA
 929042 929043 stu0884 stu0885 sthIR sthIM TRUE 0.997 2.000 0.400 0.080   NA
 929043 929044 stu0885 stu0886 sthIM guaA FALSE 0.039 223.000 0.000 1.000 N NA
 929045 929046 stu0887 stu0888     TRUE 0.922 67.000 0.032 0.025   NA
 929046 929047 stu0888 stu0889   ffh TRUE 0.919 33.000 0.151 1.000   NA
 929047 929048 stu0889 stu0890 ffh   TRUE 0.576 42.000 0.000 NA   NA
 929048 929049 stu0890 stu0891     TRUE 0.943 24.000 0.107 NA   NA
 929049 929050 stu0891 stu0892     FALSE 0.200 95.000 0.000 1.000   NA
 929050 929051 stu0892 stu0893     FALSE 0.162 128.000 0.000 1.000   NA
 929051 929052 stu0893 stu0894   rnhA TRUE 0.986 -28.000 0.148 1.000   NA
 929052 929053 stu0894 stu0895 rnhA   TRUE 0.779 11.000 0.000 NA N NA
 929053 929054 stu0895 stu0896   dprA FALSE 0.262 68.000 0.000 NA N NA
 929054 929055 stu0896 stu0897 dprA topA TRUE 0.715 168.000 0.238 1.000 Y NA
 929056 929057 stu0898 stu0899 tnpSth1 tnpSth1 TRUE 0.992 15.000 0.250 0.080   NA
 929058 929059 stu0900 stu0901   rr04 TRUE 0.901 36.000 0.074 NA   NA
 929059 929060 stu0901 stu0902 rr04 hk04 TRUE 0.997 -27.000 0.741 1.000 Y NA
 929060 929061 stu0902 stu0903 hk04 gid FALSE 0.134 101.000 0.000 1.000 N NA
 929062 929063 stu0904 stu0905     TRUE 0.610 37.000 0.000 NA   NA
 929064 929065 stu0906 stu0907 ndk   TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA N NA
 929065 929066 stu0907 stu0909     FALSE 0.109 181.000 0.000 NA   NA
 929066 929067 stu0909 stu0910     FALSE 0.214 276.000 0.051 1.000   NA
 929067 929068 stu0910 stu0911   lepA FALSE 0.037 388.000 0.000 1.000   NA
 929068 929069 stu0911 stu0912 lepA   FALSE 0.049 406.000 0.000 NA   NA
 929071 929072 stu0914 stu0915     TRUE 0.360 63.000 0.000 NA   NA
 929072 929073 stu0915 stu0916     FALSE 0.232 109.000 0.000 NA   NA
 929073 929074 stu0916 stu0917     TRUE 0.377 325.000 0.000 0.014   NA
 929074 929075 stu0917 stu0918     TRUE 0.384 60.000 0.000 NA   NA
 929075 929076 stu0918 stu0919     TRUE 0.547 45.000 0.000 NA   NA
 929076 929077 stu0919 stu0920     FALSE 0.089 202.000 0.000 NA   NA
 929077 929078 stu0920 stu0921   speB TRUE 0.893 -3.000 0.000 1.000   NA
 929078 929079 stu0921 stu0922 speB   TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 929079 929080 stu0922 stu0923   als FALSE 0.069 248.000 0.000 NA   NA
 929080 929081 stu0923 stu0924 als aldB TRUE 0.925 16.000 0.044 1.000 N NA
 929082 929083 stu0925 stu0926     TRUE 0.922 -13.000 0.000 NA   NA
 929083 929084 stu0926 stu0927     FALSE 0.080 217.000 0.000 NA   NA
 929084 929085 stu0927 stu0928     TRUE 0.920 -22.000 0.000 NA   NA
 929087 929088 stu0930 stu0931     TRUE 0.595 39.000 0.000 NA   NA
 929089 929090 stu0932 stu0934     FALSE 0.182 112.000 0.000 1.000   NA
 929090 929091 stu0934 stu0935     TRUE 0.998 1.000 0.004 0.001   NA
 929091 929092 stu0935 stu0936   adhB FALSE 0.140 97.000 0.000 1.000 N NA
 929092 929093 stu0936 stu0937 adhB   FALSE 0.048 414.000 0.000 NA   NA
 929093 929094 stu0937 stu0938     FALSE 0.274 79.000 0.000 NA   NA
 929094 929095 stu0938 stu0940     FALSE 0.048 462.000 0.000 NA   NA
 929095 929096 stu0940 stu0941     FALSE 0.052 346.000 0.000 NA   NA
 929098 929099 stu0943 stu0944     TRUE 0.567 43.000 0.000 NA   NA
 929100 929101 stu0946 stu0947     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003   NA
 929101 929102 stu0947 stu0948     TRUE 0.962 42.000 0.000 0.003   NA
 929105 929106 stu0951 stu0953   thiJ FALSE 0.063 267.000 0.000 NA   NA
 929106 929107 stu0953 stu0954 thiJ pyrK FALSE 0.070 242.000 0.000 NA   NA
 929107 929108 stu0954 stu0955 pyrK pyrDb TRUE 0.969 19.000 0.592 1.000 N NA
 929108 929109 stu0955 stu0956 pyrDb   FALSE 0.178 139.000 0.000 NA   NA
 929109 929110 stu0956 stu0957     TRUE 0.922 -15.000 0.000 NA   NA
 929110 929111 stu0957 stu0958     TRUE 0.990 0.000 0.280 NA   NA
 929111 929112 stu0958 stu0959     FALSE 0.046 556.000 0.000 NA   NA
 11476425 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2538.000 0.000 NA   NA
 11618788 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2538.000 0.000 NA   NA
 11761180 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2538.000 0.000 NA   NA
 11476426 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2574.000 0.000 NA   NA
 11618789 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2574.000 0.000 NA   NA
 11761181 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2574.000 0.000 NA   NA
 11476427 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2610.000 0.000 NA   NA
 11618790 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2610.000 0.000 NA   NA
 11761182 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2610.000 0.000 NA   NA
 11476428 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2646.000 0.000 NA   NA
 11618791 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2646.000 0.000 NA   NA
 11761183 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2646.000 0.000 NA   NA
 11476429 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2681.000 0.000 NA   NA
 11618792 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2681.000 0.000 NA   NA
 11761184 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2681.000 0.000 NA   NA
 11476430 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2717.000 0.000 NA   NA
 11618793 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2717.000 0.000 NA   NA
 11761185 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2717.000 0.000 NA   NA
 11476431 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11618794 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11761186 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2755.000 0.000 NA   NA
 11476432 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2791.000 0.000 NA   NA
 11618795 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2791.000 0.000 NA   NA
 11761187 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2791.000 0.000 NA   NA
 11476433 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2827.000 0.000 NA   NA
 11618796 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2827.000 0.000 NA   NA
 11761188 929107   stu0954   pyrK FALSE NA 2827.000 0.000 NA   NA
 929112 929113 stu0959 stu0960     TRUE 0.987 -19.000 0.102 NA   NA
 929113 929114 stu0960 stu0961     TRUE 0.986 4.000 0.347 NA   NA
 929114 929115 stu0961 stu0962     TRUE 0.991 0.000 0.453 NA   NA
 929115 929116 stu0962 stu0963     TRUE 0.996 2.000 0.547 NA Y NA
 929116 929117 stu0963 stu0964     TRUE 0.995 3.000 0.597 NA Y NA
 929117 929118 stu0964 stu0965     TRUE 0.401 155.000 0.026 NA   NA
 929118 929119 stu0965 stu0966     TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 929119 929120 stu0966 stu0967   pyrF FALSE 0.091 200.000 0.000 NA   NA
 929120 929121 stu0967 stu0968 pyrF pyrE TRUE 0.827 89.000 0.133 1.000 Y NA
 929121 929122 stu0968 stu0969 pyrE   FALSE 0.054 241.000 0.000 1.000   NA
 929124 929125 stu0971 stu0973 tnp1239   FALSE 0.045 286.000 0.000 1.000   NA
 929125 929126 stu0973 stu0974     TRUE 0.680 89.000 0.136 1.000   NA
 929126 929127 stu0974 stu0975     TRUE 0.993 20.000 0.091 0.009   NA
 929127 929128 stu0975 stu0976     TRUE 0.865 139.000 0.125 0.032   NA
 929128 929129 stu0976 stu0977     TRUE 0.970 -30.000 0.013 NA   NA
 929129 929130 stu0977 stu0978     FALSE 0.197 130.000 0.000 NA   NA
 929130 929131 stu0978 stu0979     FALSE 0.298 74.000 0.000 NA   NA
 929131 929132 stu0979 stu0980     TRUE 0.832 11.000 0.000 NA   NA
 929133 929134 stu0981 stu0982     FALSE 0.076 225.000 0.000 NA   NA
 929134 929135 stu0982 stu0983   thdF FALSE 0.228 116.000 0.000 NA   NA
 929135 929136 stu0983 stu0984 thdF dagA FALSE 0.157 129.000 0.000 1.000   NA
 929137 929138 stu0986 stu0987 pcrA cysD FALSE 0.147 88.000 0.000 1.000 N NA
 929138 929139 stu0987 stu0988 cysD   TRUE 0.377 61.000 0.000 NA   NA
 929139 929140 stu0988 stu0989     TRUE 0.879 46.000 0.111 NA   NA
 929140 929141 stu0989 stu0990   psaD TRUE 0.348 65.000 0.000 NA   NA
 929141 929142 stu0990 stu0991 psaD hsdS2 FALSE 0.173 123.000 0.000 1.000   NA
 929142 929143 stu0991 stu0992 hsdS2   TRUE 0.743 21.000 0.000 NA   NA
 929143 929144 stu0992 stu0993     TRUE 0.973 14.000 0.229 NA   NA
 929144 929145 stu0993 stu0994     FALSE 0.212 375.000 0.057 NA   NA
 929145 929146 stu0994 stu0995   truB TRUE 0.404 122.000 0.005 NA   NA
 929146 929147 stu0995 stu0996 truB ribC TRUE 0.988 -3.000 0.308 1.000 N NA
 929147 929148 stu0996 stu0997 ribC   TRUE 0.508 71.000 0.017 1.000 N NA
 929148 929149 stu0997 stu0998     TRUE 0.989 -7.000 0.169 NA   NA
 929149 929150 stu0998 stu0999   suhB TRUE 0.992 -10.000 0.337 NA   NA
 929150 929151 stu0999 stu1000 suhB   TRUE 0.862 52.000 0.229 NA N NA
 929151 929152 stu1000 stu1001   pstS TRUE 0.725 101.000 0.303 NA N NA
 929152 929153 stu1001 stu1002 pstS pstC1 TRUE 0.992 3.000 0.206 1.000 Y NA
 929153 929154 stu1002 stu1003 pstC1 pstC2 TRUE 1.000 -28.000 0.907 0.003 Y NA
 929154 929155 stu1003 stu1004 pstC2 pstB1 TRUE 0.999 11.000 0.490 0.003 Y NA
 929155 929156 stu1004 stu1005 pstB1 pstB2 TRUE 0.999 13.000 0.542 0.001 Y NA
 929156 929157 stu1005 stu1006 pstB2 phoU TRUE 0.983 25.000 0.413 NA Y NA
 929157 929158 stu1006 stu1007 phoU pepN TRUE 0.513 134.000 0.067 NA N NA
 929159 929160 stu1008 stu1009 xer1 lplA FALSE 0.039 225.000 0.000 1.000 N NA
 929161 929162 stu1010 stu1011     TRUE 0.326 69.000 0.000 NA   NA
 929163 929164 stu1012 stu1013 glgP malQ TRUE 0.999 2.000 0.289 0.016 Y NA
 929164 929165 stu1013 stu1014 malQ malR TRUE 0.517 184.000 0.538 1.000 N NA
 929166 929167 stu1015 stu1016     FALSE 0.122 172.000 0.000 NA   NA
 929167 929168 stu1016 stu1017     TRUE 0.983 14.000 0.690 NA   NA
 929169 929170 stu1020 stu1021 tatA tatC TRUE 0.990 13.000 0.312 NA Y NA
 929170 929171 stu1021 stu1022 tatC   TRUE 0.978 -13.000 0.040 NA N NA
 929171 929172 stu1022 stu1023     TRUE 0.994 -58.000 0.119 NA Y NA
 929172 929173 stu1023 stu1024     TRUE 0.995 6.000 0.812 NA Y NA
 929173 929174 stu1024 stu1025   fatB FALSE 0.164 307.000 0.000 NA Y NA
 929174 929175 stu1025 stu1026 fatB fatA TRUE 0.980 12.000 0.055 1.000 Y NA
 929175 929176 stu1026 stu1027 fatA fatC TRUE 0.997 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 929176 929177 stu1027 stu1028 fatC fatD TRUE 0.999 -21.000 0.870 0.031 Y NA
 929177 929178 stu1028 stu1029 fatD   FALSE 0.047 478.000 0.000 NA   NA
 929178 929179 stu1029 stu1031     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 929179 929180 stu1031 stu1032     TRUE 0.353 64.000 0.000 NA   NA
 929180 929181 stu1032 stu1033     TRUE 0.911 -67.000 0.000 NA   NA
 929181 929182 stu1033 stu1034     TRUE 0.961 19.000 0.160 NA   NA
 929184 929185 stu1041 stu1042     TRUE 0.865 2.000 0.000 1.000   NA
 929185 929186 stu1042 stu1043   tyrSE FALSE 0.023 794.000 0.000 1.000 N NA
 929188 929189 stu1045 stu1046 tnp1193   FALSE 0.035 485.000 0.000 1.000   NA
 929189 929190 stu1046 stu1047     FALSE 0.228 116.000 0.000 NA   NA
 929190 929191 stu1047 stu1048   acoL FALSE 0.055 317.000 0.000 NA   NA
 929191 929192 stu1048 stu1049 acoL acoC FALSE 0.278 171.000 0.000 1.000 Y NA
 929192 929193 stu1049 stu1050 acoC acoB TRUE 0.723 158.000 0.000 0.039 Y NA
 929193 929194 stu1050 stu1051 acoB acoA TRUE 1.000 10.000 0.769 0.001 Y NA
 929194 929195 stu1051 stu1052 acoA   FALSE 0.047 490.000 0.000 NA   NA
 929195 929196 stu1052 stu1053     FALSE 0.066 256.000 0.000 NA   NA
 929196 929197 stu1053 stu1054   pyrC FALSE 0.096 192.000 0.000 NA   NA
 929197 929198 stu1054 stu1055 pyrC ung TRUE 0.841 20.000 0.009 1.000 N NA
 929199 929200 stu1056 stu1057     FALSE 0.062 273.000 0.000 NA   NA
 929200 929201 stu1057 stu1058     TRUE 0.989 -19.000 0.182 NA   NA
 929201 929202 stu1058 stu1059     TRUE 0.995 22.000 0.182 0.004   NA
 929203 929204 stu1060 stu1061     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.002   NA
 929204 929205 stu1061 stu1062     FALSE 0.148 135.000 0.000 1.000   NA
 929205 929206 stu1062 stu1063     TRUE 0.961 18.000 0.137 NA   NA
 929206 929207 stu1063 stu1064     FALSE 0.069 248.000 0.000 NA   NA
 929207 929208 stu1064 stu1065     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003   NA
 929208 929209 stu1065 stu1066     TRUE 0.968 36.000 0.000 0.003   NA
 929209 929210 stu1066 stu1067     TRUE 0.977 27.000 0.000 0.003   NA
 929210 929211 stu1067 stu1068     FALSE 0.070 244.000 0.000 NA   NA
 929211 929212 stu1068 stu1069     FALSE 0.274 79.000 0.000 NA   NA
 929212 929213 stu1069 stu1070     TRUE 0.708 25.000 0.000 NA   NA
 929213 929214 stu1070 stu1071     FALSE 0.250 96.000 0.000 NA   NA
 929215 929216 stu1075 stu1086   tnp1193 FALSE 0.134 163.000 0.000 NA   NA
 929219 929220 stu1089 stu1090     TRUE 0.319 70.000 0.000 NA   NA
 929220 929221 stu1090 stu1091   epsK FALSE 0.044 1201.000 0.000 NA   NA
 929221 929222 stu1091 stu1092 epsK eps15 TRUE 0.899 -13.000 0.000 1.000   NA
 929222 929223 stu1092 stu1094 eps15 eps14 FALSE 0.183 111.000 0.000 1.000   NA
 929225 929226 stu1095 stu1096 eps13 eps12 TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 929226 929227 stu1096 stu1097 eps12 eps11 FALSE 0.049 397.000 0.000 NA   NA
 929227 929228 stu1097 stu1098 eps11 eps10 TRUE 0.708 25.000 0.000 NA   NA
 929228 929229 stu1098 stu1099 eps10 eps9 TRUE 0.452 53.000 0.000 NA   NA
 929229 929230 stu1099 stu1100 eps9 eps15 FALSE 0.047 472.000 0.000 NA   NA
 929230 929231 stu1100 stu1101 eps15   TRUE 0.610 37.000 0.000 NA   NA
 929231 929232 stu1101 stu1102     FALSE 0.045 642.000 0.000 NA   NA
 929232 929233 stu1102 stu1103   eps4 FALSE 0.173 143.000 0.000 NA   NA
 929233 929234 stu1103 stu1104 eps4 eps3 FALSE 0.188 103.000 0.000 1.000   NA
 929234 929235 stu1104 stu1105 eps3 eps2 TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 929235 929236 stu1105 stu1106 eps2   TRUE 0.847 9.000 0.000 NA   NA
 929236 929237 stu1106 stu1107     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 929237 929238 stu1107 stu1108   epsE FALSE 0.089 202.000 0.000 NA   NA
 929238 929239 stu1108 stu1109 epsE epsD TRUE 0.758 57.000 0.067 NA N NA
 929239 929240 stu1109 stu1110 epsD epsC TRUE 0.982 10.000 0.800 1.000 N NA
 929240 929241 stu1110 stu1111 epsC epsB TRUE 0.993 9.000 0.636 1.000 Y NA
 929241 929242 stu1111 stu1112 epsB epsA TRUE 0.989 1.000 0.583 1.000 N NA
 929242 929243 stu1112 stu1113 epsA deoD FALSE 0.026 346.000 0.000 1.000 N NA
 929243 929244 stu1113 stu1114 deoD   FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 929244 929245 stu1114 stu1115     TRUE 0.978 -3.000 0.029 NA   NA
 929245 929246 stu1115 stu1116     FALSE 0.035 498.000 0.000 1.000   NA
 929246 929247 stu1116 stu1117   punA FALSE 0.197 359.000 0.067 1.000   NA
 929247 929248 stu1117 stu1118 punA   TRUE 0.951 21.000 0.125 NA   NA
 929248 929249 stu1118 stu1119     TRUE 0.921 -19.000 0.000 NA   NA
 929249 929250 stu1119 stu1120   deoB TRUE 0.987 -31.000 0.120 NA   NA
 929250 929251 stu1120 stu1121 deoB rpiA TRUE 0.665 126.000 0.018 1.000 Y NA
 929251 929252 stu1121 stu1122 rpiA   FALSE 0.059 291.000 0.000 NA   NA
 929252 929253 stu1122 stu1123     TRUE 0.343 66.000 0.000 NA   NA
 929253 929254 stu1123 stu1124   tnp1193 FALSE 0.230 112.000 0.000 NA   NA
 929254 929255 stu1124 stu1125 tnp1193   FALSE 0.035 512.000 0.000 1.000   NA
 929255 929256 stu1125 stu1126     FALSE 0.051 358.000 0.000 NA   NA
 929256 929257 stu1126 stu1127   pepV TRUE 0.705 57.000 0.031 NA N NA
 929259 929260 stu1129 stu1130     FALSE 0.150 155.000 0.000 NA   NA
 929260 929261 stu1130 stu1132   rplT FALSE 0.047 466.000 0.000 NA   NA
 929261 929262 stu1132 stu1133 rplT rpmI TRUE 0.992 57.000 0.928 0.022 Y NA
 929262 929263 stu1133 stu1134 rpmI infC TRUE 0.974 39.000 0.652 1.000 Y NA
 929263 929264 stu1134 stu1135 infC cmk FALSE 0.225 160.000 0.010 1.000 N NA
 929264 929265 stu1135 stu1136 cmk   TRUE 0.841 21.000 0.002 1.000   NA
 929267 929268 stu1138 stu1139   pepT TRUE 0.771 57.000 0.051 NA   NA
 929268 929269 stu1139 stu1140 pepT sipB TRUE 0.445 209.000 0.000 0.024   NA
 929269 929270 stu1140 stu1141 sipB   FALSE 0.173 123.000 0.000 1.000   NA
 929270 929271 stu1141 stu1142     TRUE 0.991 -40.000 0.324 NA   NA
 929271 929272 stu1142 stu1143   mutT TRUE 0.965 11.000 0.074 NA   NA
 929272 929273 stu1143 stu1144 mutT ftsX FALSE 0.079 156.000 0.000 1.000 N NA
 929273 929274 stu1144 stu1145 ftsX ftsE TRUE 0.996 -43.000 0.431 1.000 Y NA
 929274 929275 stu1145 stu1146 ftsE prfB TRUE 0.604 73.000 0.053 1.000 N NA
 929275 929276 stu1146 stu1148 prfB   FALSE 0.262 138.000 0.006 1.000 N NA
 929278 929279 stu1149 stu1150 nfrA pacL2 FALSE 0.129 109.000 0.000 1.000 N NA
 929279 929280 stu1150 stu1151 pacL2   FALSE 0.064 266.000 0.000 NA   NA
 929280 929281 stu1151 stu1152     FALSE 0.256 92.000 0.000 NA   NA
 929281 929282 stu1152 stu1153     FALSE 0.056 314.000 0.000 NA   NA
 929283 929284 stu1154 stu1155   murM TRUE 0.989 2.000 0.500 1.000   NA
 929285 929286 stu1158 stu1159 vicX hk05 TRUE 0.978 -12.000 0.038 1.000   NA
 929286 929287 stu1159 stu1160 hk05 rr05 TRUE 1.000 -7.000 0.597 0.008 Y NA
 929288 929289 stu1161 stu1162     TRUE 0.987 12.000 0.185 1.000 Y NA
 929289 929290 stu1162 stu1163     TRUE 0.997 18.000 0.400 0.031 Y NA
 929290 929291 stu1163 stu1164     TRUE 0.999 12.000 0.947 0.011 Y NA
 929292 929293 stu1165 stu1166 endA epuA TRUE 0.838 62.000 0.237 NA   NA
 929293 929294 stu1166 stu1167 epuA murA TRUE 0.982 2.000 0.110 NA   NA
 929294 929295 stu1167 stu1168 murA   TRUE 0.877 55.000 0.279 NA   NA
 929295 929296 stu1168 stu1169   galE2 FALSE 0.103 188.000 0.000 NA   NA
 929296 929297 stu1169 stu1170 galE2   TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 929297 929298 stu1170 stu1171     TRUE 0.788 16.000 0.000 NA   NA
 929298 929299 stu1171 stu1172   metK FALSE 0.044 1002.000 0.000 NA   NA
 929301 929302 stu1174 stu1175 dnaX   TRUE 0.971 0.000 0.030 NA N NA
 929302 929303 stu1175 stu1177   miaA TRUE 0.538 36.000 0.000 NA N NA
 929304 929305 stu1176 stu1178     TRUE 0.452 53.000 0.000 NA   NA
 929306 929307 stu_t55 stu1179   rplS TRUE 0.466 51.000 0.000 NA   NA
 929307 929308 stu1179 stu1180 rplS   FALSE 0.289 128.000 0.006 1.000 N NA
 929308 929309 stu1180 stu1181   aroH TRUE 0.957 10.000 0.094 1.000 N NA
 929309 929310 stu1181 stu1182 aroH   FALSE 0.170 75.000 0.000 1.000 N NA
 929310 929311 stu1182 stu1183   fld TRUE 0.300 51.000 0.000 1.000 N NA
 929311 929312 stu1183 stu1184 fld   FALSE 0.065 260.000 0.000 NA   NA
 929312 929313 stu1184 stu1185     TRUE 0.970 12.000 0.130 NA   NA
 929313 929314 stu1185 stu1186   estA TRUE 0.713 120.000 0.217 NA   NA
 929314 929315 stu1186 stu1187 estA   TRUE 0.667 125.000 0.143 NA   NA
 929315 929316 stu1187 stu1188     FALSE 0.282 181.000 0.026 1.000   NA
 929316 929317 stu1188 stu1189     TRUE 0.994 -3.000 0.895 1.000   NA
 929317 929318 stu1189 stu1190     TRUE 0.982 10.000 0.368 NA   NA
 929318 929319 stu1190 stu1191     FALSE 0.185 137.000 0.000 NA   NA
 929319 929320 stu1191 stu1192     FALSE 0.089 202.000 0.000 NA   NA
 929320 929321 stu1192 stu1193     TRUE 0.916 -37.000 0.000 NA   NA
 929321 929322 stu1193 stu1194     FALSE 0.252 95.000 0.000 NA   NA
 929322 929323 stu1194 stu1195     FALSE 0.137 162.000 0.000 NA   NA
 929323 929324 stu1195 stu1196   pyk FALSE 0.045 892.000 0.000 NA   NA
 929324 929325 stu1196 stu1197 pyk pfk TRUE 0.987 70.000 0.261 0.005 Y NA
 929325 929326 stu1197 stu1198 pfk dnaE TRUE 0.843 45.000 0.098 1.000 N NA
 929326 929327 stu1198 stu1199 dnaE   FALSE 0.116 153.000 0.000 NA N NA
 929327 929328 stu1199 stu1200   leuD TRUE 0.460 97.000 0.015 NA N NA
 929328 929329 stu1200 stu1201 leuD leuC TRUE 0.999 10.000 0.477 0.001 Y NA
 929329 929330 stu1201 stu1202 leuC leuB TRUE 0.741 305.000 0.000 0.002 Y NA
 929330 929331 stu1202 stu1203 leuB leuA TRUE 0.998 4.000 0.005 0.002 Y NA
 929331 929332 stu1203 stu1204 leuA gpmA FALSE 0.029 299.000 0.000 1.000 N NA
 929334 929335 stu1208 stu1209   hstH FALSE 0.256 92.000 0.000 NA   NA
 929335 929336 stu1209 stu1210 hstH   TRUE 0.635 137.000 0.156 NA   NA
 929336 929337 stu1210 stu1211     TRUE 0.994 -7.000 0.828 NA   NA
 929337 929338 stu1211 stu1212     TRUE 0.828 62.000 0.203 NA   NA
 929338 929339 stu1212 stu1213   recN TRUE 0.525 71.000 0.006 NA   NA
 929339 929340 stu1213 stu1214 recN   TRUE 0.944 9.000 0.037 1.000 N NA
 929340 929341 stu1214 stu1215     TRUE 0.972 -52.000 0.048 1.000 N NA
 929341 929342 stu1215 stu1216   ispA TRUE 0.977 -7.000 0.058 1.000 N NA
 929342 929343 stu1216 stu1217 ispA xseB TRUE 0.978 0.000 0.100 1.000 N NA
 929343 929344 stu1217 stu1218 xseB xseA TRUE 1.000 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 929344 929345 stu1218 stu1219 xseA   FALSE 0.101 189.000 0.000 NA   NA
 929345 929346 stu1219 stu1220   nth FALSE 0.046 633.000 0.000 NA   NA
 929346 929347 stu1220 stu1221 nth dnaD TRUE 0.987 -15.000 0.007 NA Y NA
 929347 929348 stu1221 stu1222 dnaD metA TRUE 0.566 72.000 0.021 NA N NA
 929348 929349 stu1222 stu1223 metA apt FALSE 0.193 171.000 0.009 1.000 N NA
 929349 929350 stu1223 stu1224 apt recJ TRUE 0.593 115.000 0.128 1.000 N NA
 929350 929351 stu1224 stu1225 recJ   TRUE 0.924 13.000 0.016 1.000   NA
 929351 929352 stu1225 stu1226   elaC TRUE 0.980 0.000 0.074 1.000   NA
 929352 929353 stu1226 stu1227 elaC   TRUE 0.872 31.000 0.022 NA   NA
 929353 929354 stu1227 stu1228   hflX TRUE 0.974 -7.000 0.014 NA   NA
 929354 929355 stu1228 stu1229 hflX rodA TRUE 0.654 120.000 0.000 0.049   NA
 929355 929356 stu1229 stu1230 rodA   FALSE 0.159 150.000 0.000 NA   NA
 929356 929357 stu1230 stu1231     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 929357 929358 stu1231 stu1232   hisK FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 929358 929359 stu1232 stu1233 hisK   TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 929359 929360 stu1233 stu1234     TRUE 0.992 -13.000 0.330 NA   NA
 929360 929361 stu1234 stu1235     TRUE 0.968 2.000 0.055 1.000 N NA
 929361 929362 stu1235 stu1236   hemN TRUE 0.972 1.000 0.060 1.000 N NA
 929362 929363 stu1236 stu1237 hemN   FALSE 0.063 269.000 0.000 NA   NA
 929365 929366 stu1239 stu1240     FALSE 0.112 179.000 0.000 NA   NA
 929366 929367 stu1240 stu1241     TRUE 0.743 21.000 0.000 NA   NA
 929367 929368 stu1241 stu1242   rmlB FALSE 0.134 163.000 0.000 NA   NA
 929368 929369 stu1242 stu1243 rmlB rmlC TRUE 0.507 430.000 0.350 1.000 Y NA
 929369 929370 stu1243 stu1244 rmlC rmlA TRUE 0.993 0.000 0.149 1.000 Y NA
 929370 929371 stu1244 stu1245 rmlA   FALSE 0.227 232.000 0.059 1.000 N NA
 929371 929372 stu1245 stu1246     TRUE 0.686 55.000 0.018 1.000   NA
 929372 929373 stu1246 stu1247     TRUE 0.995 -229.000 0.000 0.003   NA
 929373 929374 stu1247 stu1248     FALSE 0.201 209.000 0.011 NA   NA
 929374 929375 stu1248 stu1249     TRUE 0.991 -10.000 0.283 NA   NA
 929375 929376 stu1249 stu1250     FALSE 0.245 98.000 0.000 NA   NA
 929376 929377 stu1250 stu1251     TRUE 0.851 3.000 0.000 1.000   NA
 929377 929378 stu1251 stu1252     TRUE 0.380 224.000 0.150 NA   NA
 929378 929379 stu1252 stu1253     TRUE 0.993 -3.000 0.502 NA   NA
 929380 929381 stu1254 stu1255   cobQ TRUE 0.992 0.000 0.796 1.000   NA
 929382 929383 stu1256 stu1257     TRUE 0.980 -3.000 0.035 NA   NA
 929383 929384 stu1257 stu1259     FALSE 0.035 526.000 0.000 1.000   NA
 929384 929385 stu1259 stu1260   udk TRUE 0.538 37.000 0.000 1.000   NA
 929387 929388 stu1263 stu1264 gapN ptsI FALSE 0.207 218.000 0.035 1.000 N NA
 929388 929389 stu1264 stu1265 ptsI ptsH TRUE 0.999 5.000 0.240 0.010 Y NA
 929389 929390 stu1265 stu1266 ptsH icd FALSE 0.033 262.000 0.000 1.000 N NA
 929390 929391 stu1266 stu1267 icd gltA TRUE 0.982 15.000 0.140 1.000 Y NA
 929391 929392 stu1267 stu1268 gltA citB TRUE 0.982 2.000 0.013 1.000 Y NA
 929393 929394 stu1269 stu1270 nrdH nrdE TRUE 0.765 87.000 0.562 1.000 N NA
 929394 929395 stu1270 stu1271 nrdE nrdF TRUE 0.983 159.000 0.500 0.001 Y NA
 929395 929396 stu1271 stu1272 nrdF   FALSE 0.042 316.000 0.000 1.000   NA
 929396 929397 stu1272 stu1273     TRUE 0.543 144.000 0.000 0.074   NA
 929397 929398 stu1273 stu1274     TRUE 0.881 54.000 0.000 0.020   NA
 929399 929400 stu1275 stu1276     FALSE 0.271 197.000 0.024 NA   NA
 929400 929401 stu1276 stu1277     TRUE 0.916 25.000 0.039 NA   NA
 929401 929402 stu1277 stu1278     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 929402 929403 stu1278 stu1279   gyrA TRUE 0.840 33.000 0.013 NA   NA
 929405 929406 stu1281 stu1282 nox   FALSE 0.043 304.000 0.000 1.000   NA
 929406 929407 stu1282 stu1283     TRUE 0.675 71.000 0.040 NA   NA
 929407 929408 stu1283 stu1284   pdxK TRUE 0.621 137.000 0.142 NA   NA
 929408 929409 stu1284 stu1285 pdxK   TRUE 0.968 1.000 0.016 NA   NA
 929409 929410 stu1285 stu1286     FALSE 0.182 138.000 0.000 NA   NA
 929411 929412 stu1287 stu1288     TRUE 0.671 127.000 0.231 1.000   NA
 929413 929414 stu1289 stu1290     FALSE 0.257 91.000 0.000 NA   NA
 929414 929415 stu1290 stu1292   pheT FALSE 0.053 336.000 0.000 NA   NA
 929415 929416 stu1292 stu1293 pheT   FALSE 0.126 259.000 0.007 1.000   NA
 929416 929417 stu1293 stu1294   pheS TRUE 0.885 17.000 0.009 1.000   NA
 929417 929418 stu1294 stu1295 pheS smc FALSE 0.023 620.000 0.000 1.000 N NA
 929418 929419 stu1295 stu1296 smc rncS TRUE 0.974 3.000 0.120 1.000 N NA
 929419 929420 stu1296 stu1297 rncS dapA FALSE 0.106 131.000 0.000 1.000 N NA
 929420 929421 stu1297 stu1298 dapA asd TRUE 0.389 302.000 0.063 1.000 Y NA
 929421 929422 stu1298 stu1300 asd alkD FALSE 0.045 290.000 0.000 1.000   NA
 929422 929423 stu1300 stu1301 alkD   FALSE 0.038 362.000 0.000 1.000   NA
 929424 929425 stu1302 stu1303     FALSE 0.226 118.000 0.000 NA   NA
 929425 929426 stu1303 stu1304     TRUE 0.922 -7.000 0.000 NA   NA
 929427 929428 stu1305 stu1306 cls uvrC FALSE 0.053 188.000 0.000 1.000 N NA
 929428 929429 stu1306 stu1307 uvrC   TRUE 0.527 60.000 0.002 1.000   NA
 929431 929432 stu1309 stu1310 proWX proV TRUE 0.996 -58.000 0.778 1.000 Y NA
 929432 929433 stu1310 stu1311 proV proWY TRUE 0.972 12.000 0.312 1.000 N NA
 929433 929434 stu1311 stu1312 proWY proWZ TRUE 0.998 -3.000 0.435 0.030 N NA
 929434 929435 stu1312 stu1313 proWZ hutH TRUE 0.658 57.000 0.000 1.000 Y NA
 929435 929436 stu1313 stu1314 hutH   TRUE 0.730 23.000 0.000 NA   NA
 929436 929437 stu1314 stu1315   hutU TRUE 0.781 17.000 0.000 NA   NA
 929438 929439 stu1316 stu1317 sdaB sdaA TRUE 0.999 13.000 0.221 0.001 Y NA
 929440 929441 stu1318 stu1319     FALSE 0.187 136.000 0.000 NA   NA
 929441 929442 stu1319 stu1320     TRUE 0.985 -3.000 0.083 NA   NA
 929442 929443 stu1320 stu1321     TRUE 0.917 -30.000 0.000 NA   NA
 929443 929444 stu1321 stu1322     TRUE 0.417 186.000 0.098 NA   NA
 929444 929445 stu1322 stu1323     TRUE 0.985 -22.000 0.073 NA   NA
 929445 929446 stu1323 stu1324     TRUE 0.946 16.000 0.073 1.000   NA
 929446 929447 stu1324 stu1325   rr06 FALSE 0.035 542.000 0.000 1.000   NA
 929447 929448 stu1325 stu1326 rr06 hk06 TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.008 Y NA
 929448 929449 stu1326 stu1327 hk06   TRUE 0.993 -13.000 0.500 NA   NA
 929449 929450 stu1327 stu1328     TRUE 0.988 -3.000 0.136 NA   NA
 929450 929451 stu1328 stu1329     FALSE 0.107 183.000 0.000 NA   NA
 929451 929452 stu1329 stu1330     FALSE 0.157 152.000 0.000 NA   NA
 929452 929453 stu1330 stu1331     FALSE 0.130 146.000 0.000 1.000   NA
 929453 929454 stu1331 stu1332     FALSE 0.127 168.000 0.000 NA   NA
 929454 929455 stu1332 stu1333     FALSE 0.263 85.000 0.000 NA   NA
 929455 929456 stu1333 stu1334     TRUE 0.991 2.000 0.855 1.000   NA
 929456 929457 stu1334 stu1335   hk07 TRUE 0.639 145.000 0.492 1.000 N NA
 929457 929458 stu1335 stu1336 hk07 rr07 TRUE 0.997 -10.000 0.812 1.000 Y NA
 929459 929460 stu1337 stu1338     TRUE 0.993 -22.000 0.000 0.008   NA
 929460 929461 stu1338 stu1339     FALSE 0.206 89.000 0.000 1.000   NA
 929461 929462 stu1339 stu1340     TRUE 0.978 6.000 0.000 0.030   NA
 929462 929463 stu1340 stu1342   norM TRUE 0.615 128.000 0.000 0.066   NA
 929464 929465 stu1343 stu1355 msrA1 tnpSth1 FALSE 0.154 80.000 0.000 1.000 N NA
 929465 929466 stu1355 stu1356 tnpSth1 tnpSth1 TRUE 0.992 15.000 0.250 0.073   NA
 929466 929467 stu1356 stu1357 tnpSth1 brnQ TRUE 0.522 39.000 0.000 1.000   NA
 929467 929468 stu1357 stu1358 brnQ   FALSE 0.062 214.000 0.000 1.000   NA
 929468 929469 stu1358 stu1359     TRUE 0.996 -25.000 0.000 0.002   NA
 929471 929472 stu1361 stu1363     FALSE 0.036 426.000 0.000 1.000   NA
 929472 929473 stu1363 stu1364     FALSE 0.111 180.000 0.000 NA   NA
 929473 929474 stu1364 stu1365     FALSE 0.162 148.000 0.000 NA   NA
 929474 929475 stu1365 stu1366     FALSE 0.127 168.000 0.000 NA   NA
 929475 929476 stu1366 stu1367     FALSE 0.108 182.000 0.000 NA   NA
 929476 929477 stu1367 stu1368   celB TRUE 0.922 -13.000 0.000 NA   NA
 929477 929478 stu1368 stu1369 celB   FALSE 0.052 189.000 0.000 1.000 N NA
 929478 929479 stu1369 stu1370     TRUE 0.307 72.000 0.000 NA   NA
 929479 929480 stu1370 stu1371     FALSE 0.085 208.000 0.000 NA   NA
 929480 929481 stu1371 stu1373     FALSE 0.244 73.000 0.000 1.000   NA
 929481 929482 stu1373 stu1375   sthII FALSE 0.039 350.000 0.000 1.000   NA
 929482 929483 stu1375 stu1376 sthII llaBIIM TRUE 0.971 7.000 0.083 NA   NA
 929487 929488 stu1380 stu1381     TRUE 0.939 46.000 0.000 0.006   NA
 929488 929489 stu1381 stu1382     TRUE 0.768 80.000 0.333 1.000   NA
 929491 929492 stu1384 stu1385   umuC1 TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 929492 929493 stu1385 stu1386 umuC1   FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 929494 929495 stu1387 stu1388     FALSE 0.068 249.000 0.000 NA   NA
 929495 929496 stu1388 stu1389     FALSE 0.084 211.000 0.000 NA   NA
 929496 929497 stu1389 stu1390     FALSE 0.060 286.000 0.000 NA   NA
 929498 929499 stu1391 stu1392     FALSE 0.046 558.000 0.000 NA   NA
 929501 929502 stu1394 stu1395 sbcC sbcD TRUE 0.997 -3.000 0.669 1.000 Y NA
 929502 929503 stu1395 stu1397 sbcD lacZ FALSE 0.023 836.000 0.000 1.000 N NA
 929503 929504 stu1397 stu1398 lacZ lacS TRUE 0.985 4.000 0.043 1.000 Y NA
 929504 929505 stu1398 stu1399 lacS galM TRUE 0.461 103.000 0.000 1.000 Y NA
 929505 929506 stu1399 stu1400 galM galE1 TRUE 0.882 70.000 0.000 0.003 N NA
 929506 929507 stu1400 stu1401 galE1 galT TRUE 0.993 30.000 0.204 0.003 N NA
 929507 929508 stu1401 stu1402 galT galK TRUE 0.999 -7.000 0.107 0.003 Y NA
 929510 929511 stu1405 stu1406     FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 929511 929512 stu1406 stu1407     TRUE 0.996 -37.000 0.000 0.002   NA
 929512 929513 stu1407 stu1408     TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 929515 929516 stu1410 stu1411     TRUE 0.654 31.000 0.000 NA   NA
 929516 929517 stu1411 stu1412     TRUE 0.976 -114.000 0.048 1.000   NA
 929518 929519 stu1413 stu1414     TRUE 0.342 57.000 0.000 1.000   NA
 929519 929520 stu1414 stu1415     FALSE 0.058 298.000 0.000 NA   NA
 929521 929522 stu1416 stu1417 ftsK trxB2 FALSE 0.083 153.000 0.000 1.000 N NA
 929522 929523 stu1417 stu1418 trxB2 trmD TRUE 0.933 2.000 0.007 1.000 N NA
 929523 929524 stu1418 stu1419 trmD rimM TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 929524 929525 stu1419 stu_t56 rimM   FALSE 0.081 216.000 0.000 NA   NA
 929525 929526 stu_t56 stu_t57     TRUE 0.668 30.000 0.000 NA   NA
 929526 929527 stu_t57 stu1420   rr08 FALSE 0.061 283.000 0.000 NA   NA
 929527 929528 stu1420 stu1421 rr08 hk08 TRUE 1.000 -10.000 0.853 0.008 Y NA
 929528 929529 stu1421 stu1422 hk08   TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 929529 929530 stu1422 stu1423     FALSE 0.064 266.000 0.000 NA   NA
 929530 929531 stu1423 stu1424     FALSE 0.074 232.000 0.000 NA   NA
 929531 929532 stu1424 stu1425   pknB FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 929532 929533 stu1425 stu1426 pknB pppL TRUE 0.996 0.000 0.704 1.000 Y NA
 929533 929534 stu1426 stu1427 pppL sunL TRUE 0.977 -37.000 0.074 1.000 N NA
 929534 929535 stu1427 stu1428 sunL fmt TRUE 0.996 -19.000 0.305 1.000 Y NA
 929535 929536 stu1428 stu1429 fmt priA TRUE 0.922 18.000 0.052 1.000 N NA
 929536 929537 stu1429 stu1430 priA rpoZ TRUE 0.748 142.000 0.032 0.072 N NA
 929537 929538 stu1430 stu1431 rpoZ gmk TRUE 0.960 22.000 0.471 1.000 N NA
 929538 929539 stu1431 stu1432 gmk ftsY FALSE 0.038 233.000 0.000 1.000 N NA
 929539 929540 stu1432 stu1433 ftsY   TRUE 0.979 14.000 0.007 0.065   NA
 929540 929541 stu1433 stu1434     TRUE 0.998 -7.000 0.250 0.036   NA
 929542 929543 stu1435 stu1436     TRUE 0.981 5.000 0.412 1.000 N NA
 929543 929544 stu1436 stu1437     TRUE 0.986 6.000 0.471 NA   NA
 929545 929546 stu1438 stu1439 amiF1 amiE TRUE 0.999 -22.000 0.095 0.002 Y NA
 929546 929547 stu1439 stu1440 amiE amiD TRUE 0.992 10.000 0.650 1.000 Y NA
 929547 929548 stu1440 stu1441 amiD amiC TRUE 0.999 0.000 0.278 0.029 Y NA
 929548 929549 stu1441 stu1442 amiC   TRUE 0.986 62.000 0.600 0.029 Y NA
 929551 929552 stu1445 stu1446 amiA3   FALSE 0.088 204.000 0.000 NA   NA
 929552 929553 stu1446 stu1447     FALSE 0.298 74.000 0.000 NA   NA
 929553 929554 stu1447 stu1449     FALSE 0.233 107.000 0.000 NA   NA
 929556 929557 stu1451 stu1452     TRUE 0.855 7.000 0.000 NA   NA
 929557 929558 stu1452 stu1453     TRUE 0.920 -24.000 0.000 NA   NA
 929558 929559 stu1453 stu1454     FALSE 0.241 100.000 0.000 NA   NA
 929559 929560 stu1454 stu1455   pta TRUE 0.679 29.000 0.000 NA   NA
 929560 929561 stu1455 stu1456 pta   TRUE 0.941 14.000 0.067 1.000 N NA
 929561 929562 stu1456 stu1457   ppnK TRUE 0.984 -3.000 0.150 1.000 N NA
 929562 929563 stu1457 stu1459 ppnK   TRUE 0.993 -31.000 0.725 1.000   NA
 929564 929565 stu1458 stu1460   prsA2 FALSE 0.265 323.000 0.145 1.000   NA
 929565 929566 stu1460 stu1461 prsA2 nifS3 TRUE 0.988 4.000 0.089 1.000 Y NA
 929566 929567 stu1461 stu1462 nifS3   TRUE 0.985 2.000 0.166 NA   NA
 929567 929568 stu1462 stu1463     TRUE 0.636 109.000 0.083 NA   NA
 929568 929569 stu1463 stu1464     TRUE 0.993 -7.000 0.714 1.000   NA
 929570 929571 stu1465 stu1467 radC rgpF TRUE 0.411 49.000 0.000 NA N NA
 929571 929572 stu1467 stu1468 rgpF rgpE TRUE 0.992 -3.000 0.385 NA   NA
 929572 929573 stu1468 stu1469 rgpE rgpD TRUE 0.963 20.000 0.222 NA   NA
 929573 929574 stu1469 stu1470 rgpD rgpC TRUE 0.996 0.000 0.500 1.000 Y NA
 929574 929575 stu1470 stu1471 rgpC rgpB TRUE 0.991 -37.000 0.289 NA   NA
 929575 929576 stu1471 stu1472 rgpB rgpA TRUE 0.991 -3.000 0.289 NA   NA
 929576 929577 stu1472 stu1473 rgpA rgpX2 TRUE 0.531 91.000 0.000 NA Y NA
 929577 929578 stu1473 stu1480 rgpX2 rgpX3 TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 929578 929579 stu1480 stu1481 rgpX3   TRUE 0.982 -7.000 0.044 NA   NA
 929579 929580 stu1481 stu1482     TRUE 0.981 6.000 0.212 NA   NA
 929580 929581 stu1482 stu1483   rmlD TRUE 0.778 83.000 0.030 NA Y NA
 929581 929582 stu1483 stu1484 rmlD   TRUE 0.420 56.000 0.000 NA   NA
 929582 929583 stu1484 stu1485     TRUE 0.559 101.000 0.030 NA   NA
 929583 929584 stu1485 stu1486     TRUE 0.360 63.000 0.000 NA   NA
 929584 929585 stu1486 stu1487     FALSE 0.053 334.000 0.000 NA   NA
 929585 929586 stu1487 stu1488   rpoD TRUE 0.924 24.000 0.044 NA   NA
 929586 929587 stu1488 stu1489 rpoD dnaG TRUE 0.977 4.000 0.209 1.000 N NA
 929587 929588 stu1489 stu1490 dnaG rpsU FALSE 0.038 371.000 0.000 1.000   NA
 929588 929589 stu1490 stu1492 rpsU   FALSE 0.250 195.000 0.027 1.000   NA
 929589 929590 stu1492 stu1493     TRUE 0.824 93.000 0.133 1.000 Y NA
 929590 929591 stu1493 stu1494     FALSE 0.132 344.000 0.000 1.000 Y NA
 929591 929592 stu1494 stu1495     TRUE 0.998 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 929592 929593 stu1495 stu1496     FALSE 0.044 207.000 0.000 1.000 N NA
 929593 929594 stu1496 stu1497   uvrB TRUE 0.373 45.000 0.000 1.000 N NA
 929594 929595 stu1497 stu1498 uvrB   FALSE 0.192 132.000 0.000 NA   NA
 929595 929596 stu1498 stu1499     FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 929596 929597 stu1499 stu1500     FALSE 0.074 232.000 0.000 NA   NA
 929598 929599 stu1501 stu1502 gnlP gnlQ TRUE 0.995 0.000 0.326 1.000 Y NA
 929600 929601 stu1503 stu1504   obgE FALSE 0.280 167.000 0.009 NA   NA
 929601 929602 stu1504 stu1505 obgE rsuA2 FALSE 0.042 310.000 0.000 1.000   NA
 929602 929603 stu1505 stu1506 rsuA2   TRUE 0.903 1.000 0.000 NA   NA
 929603 929604 stu1506 stu1507     FALSE 0.187 136.000 0.000 NA   NA
 929605 929606 stu1508 stu1509     FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 929606 929607 stu1509 stu1510     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 929609 929610 stu1512 stu1513     TRUE 0.865 2.000 0.000 1.000   NA
 929610 929611 stu1513 stu1514     FALSE 0.061 282.000 0.000 NA   NA
 929611 929612 stu1514 stu1515     TRUE 0.693 27.000 0.000 NA   NA
 929615 929616 stu1518 stu1519   serB FALSE 0.083 212.000 0.000 NA   NA
 929616 929617 stu1519 stu1520 serB ezrA TRUE 0.337 112.000 0.009 1.000 N NA
 929617 929618 stu1520 stu1521 ezrA gyrB TRUE 0.327 127.000 0.011 1.000 N NA
 929618 929619 stu1521 stu1522 gyrB   TRUE 0.959 1.000 0.013 1.000   NA
 929619 929620 stu1522 stu1523     TRUE 0.511 41.000 0.000 1.000   NA
 929620 929621 stu1523 stu1524     TRUE 0.984 -34.000 0.121 1.000   NA
 929621 929622 stu1524 stu_t58     FALSE 0.206 128.000 0.000 NA   NA
 929622 929623 stu_t58 stu1525     TRUE 0.402 58.000 0.000 NA   NA
 929623 929624 stu1525 stu1526     TRUE 0.873 35.000 0.050 1.000   NA
 929624 929625 stu1526 stu1527   serA FALSE 0.110 324.000 0.009 1.000   NA
 929625 929626 stu1527 stu1528 serA   TRUE 0.979 19.000 0.013 0.036   NA
 929626 929627 stu1528 stu1529   serC TRUE 0.917 12.000 0.012 1.000   NA
 929627 929628 stu1529 stu1530 serC   FALSE 0.114 154.000 0.000 NA N NA
 929628 929629 stu1530 stu1531     TRUE 0.921 -19.000 0.000 NA   NA
 929631 929632 stu1533 stu1534     TRUE 0.921 55.000 0.024 0.064   NA
 929632 929633 stu1534 stu1535   potD FALSE 0.254 348.000 0.000 0.064   NA
 929633 929634 stu1535 stu1536 potD potC TRUE 0.999 -10.000 0.253 0.029 Y NA
 929634 929635 stu1536 stu1537 potC potB TRUE 0.999 -27.000 0.492 0.029 Y NA
 929635 929636 stu1537 stu1538 potB potA TRUE 0.999 -37.000 0.928 0.029 Y NA
 929636 929637 stu1538 stu1539 potA murB TRUE 0.795 45.000 0.041 1.000 N NA
 929637 929638 stu1539 stu1540 murB folK TRUE 0.344 115.000 0.010 1.000 N NA
 929638 929639 stu1540 stu1541 folK folQ TRUE 0.994 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 929641 929642 stu1543 stu1544 folP folE TRUE 0.959 29.000 0.073 1.000 Y NA
 929642 929643 stu1544 stu1545 folE   FALSE 0.090 146.000 0.000 1.000 N NA
 929643 929644 stu1545 stu1546   folC2 FALSE 0.212 64.000 0.000 1.000 N NA
 929644 929645 stu1546 stu1547 folC2   FALSE 0.135 143.000 0.000 1.000   NA
 929645 929646 stu1547 stu1548   rpsP TRUE 0.978 12.000 0.385 1.000   NA
 929647 929648 stu1549 stu1550 tehB exoA FALSE 0.022 1154.000 0.000 1.000 N NA
 929648 929649 stu1550 stu1551 exoA   FALSE 0.298 74.000 0.000 NA   NA
 929650 929651 stu1552 stu1553     FALSE 0.075 191.000 0.000 1.000   NA
 929651 929652 stu1553 stu1554   ligA TRUE 0.912 10.000 0.013 1.000 N NA
 929652 929653 stu1554 stu1555 ligA   TRUE 0.699 51.000 0.010 NA   NA
 929653 929654 stu1555 stu1556     FALSE 0.274 79.000 0.000 NA   NA
 929654 929655 stu1556 stu1557   pepM TRUE 0.988 2.000 0.373 1.000   NA
 929655 929656 stu1557 stu1558 pepM   TRUE 0.892 44.000 0.235 1.000 N NA
 929656 929657 stu1558 stu1559     TRUE 0.989 -25.000 0.342 1.000 N NA
 929657 929658 stu1559 stu1560   murZ TRUE 0.900 24.000 0.052 1.000 N NA
 929658 929659 stu1560 stu1561 murZ comEC FALSE 0.227 77.000 0.000 1.000   NA
 929659 929660 stu1561 stu1562 comEC comEA TRUE 0.997 -10.000 0.130 0.047   NA
 929660 929661 stu1562 stu1563 comEA   TRUE 0.383 108.000 0.014 1.000 N NA
 929662 929663 stu1564 stu1565     TRUE 0.964 45.000 0.000 0.002   NA
 929663 929664 stu1565 stu1566     TRUE 0.408 50.000 0.000 1.000   NA
 929664 929665 stu1566 stu1567     TRUE 0.980 4.000 0.209 1.000   NA
 929666 929667 stu1568 stu1569 rheA corA1 FALSE 0.051 191.000 0.000 1.000 N NA
 929667 929668 stu1569 stu1570 corA1   TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 929669 929670 stu1571 stu1572     FALSE 0.048 451.000 0.000 NA   NA
 929670 929671 stu1572 stu1573     FALSE 0.227 117.000 0.000 NA   NA
 929672 929673 stu1574 stu1575 prfC   FALSE 0.039 351.000 0.000 1.000   NA
 929673 929674 stu1575 stu1576   murF TRUE 0.572 89.000 0.039 1.000   NA
 929675 929676 stu1577 stu1578     TRUE 0.917 -31.000 0.000 NA   NA
 929677 929678 stu1579 stu1580     TRUE 0.971 43.000 0.671 1.000 Y NA
 929678 929679 stu1580 stu1581     TRUE 0.996 -61.000 0.773 1.000 Y NA
 929679 929680 stu1581 stu1582     TRUE 1.000 -58.000 0.841 0.011 Y NA
 929680 929681 stu1582 stu1583   ddlA FALSE 0.027 325.000 0.000 1.000 N NA
 929681 929682 stu1583 stu1584 ddlA copZ FALSE 0.072 162.000 0.000 1.000 N NA
 929682 929683 stu1584 stu1585 copZ copA TRUE 0.801 75.000 0.048 1.000 Y NA
 929683 929684 stu1585 stu1586 copA copY TRUE 0.963 4.000 0.064 1.000 N NA
 929684 929685 stu1586 stu1587 copY trpA FALSE 0.092 144.000 0.000 1.000 N NA
 929685 929686 stu1587 stu1588 trpA trpB TRUE 0.999 4.000 0.248 0.001 Y NA
 929686 929687 stu1588 stu1589 trpB trpF TRUE 1.000 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 929687 929688 stu1589 stu1590 trpF trpC TRUE 1.000 -43.000 0.264 0.002 Y NA
 929688 929689 stu1590 stu1591 trpC trpD TRUE 0.995 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 929689 929690 stu1591 stu1592 trpD trpG TRUE 0.715 91.000 0.018 1.000 Y NA
 929690 929691 stu1592 stu1593 trpG trpE TRUE 1.000 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 929691 929692 stu1593 stu1594 trpE   TRUE 0.815 62.000 0.022 1.000 Y NA
 929692 929693 stu1594 stu1595     FALSE 0.046 586.000 0.000 NA   NA
 929693 929694 stu1595 stu1596   ctpE FALSE 0.266 82.000 0.000 NA   NA
 929694 929695 stu1596 stu1597 ctpE   FALSE 0.074 233.000 0.000 NA   NA
 929697 929698 stu1599 stu1600     FALSE 0.234 106.000 0.000 NA   NA
 929698 929699 stu1600 stu1601   dnaQ TRUE 0.459 164.000 0.156 1.000 N NA
 929699 929700 stu1601 stu1602 dnaQ   TRUE 0.878 50.000 0.000 0.028   NA
 929704 929705 stu_t59 stu1606     TRUE 0.384 60.000 0.000 NA   NA
 929705 929706 stu1606 stu1607     TRUE 0.975 10.000 0.154 NA   NA
 929706 929707 stu1607 stu1608     TRUE 0.781 58.000 0.107 NA N NA
 929707 929708 stu1608 stu1609     TRUE 0.987 -3.000 0.167 NA N NA
 929709 929710 stu1610 stu1611 hit   TRUE 0.983 -3.000 0.063 NA   NA
 929711 929712 stu1612 stu1613     TRUE 0.319 70.000 0.000 NA   NA
 929712 929713 stu1613 stu1614   clpL FALSE 0.046 553.000 0.000 NA   NA
 929713 929714 stu1614 stu1615 clpL   FALSE 0.045 715.000 0.000 NA   NA
 929714 929715 stu1615 stu1616     TRUE 0.973 7.000 0.094 NA   NA
 929715 929716 stu1616 stu1617     TRUE 0.374 196.000 0.085 NA   NA
 929716 929717 stu1617 stu1618     TRUE 0.950 24.000 0.149 NA   NA
 929717 929718 stu1618 stu1619     TRUE 0.994 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 929718 929719 stu1619 stu1620     TRUE 0.659 104.000 0.150 NA N NA
 929719 929720 stu1620 stu1621     FALSE 0.295 239.000 0.068 NA   NA
 929720 929721 stu1621 stu1622     TRUE 0.991 0.000 0.555 1.000   NA
 929721 929722 stu1622 stu1623     TRUE 0.378 137.000 0.015 1.000   NA
 929722 929723 stu1623 stu1624     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 929723 929724 stu1624 stu1625   gatB TRUE 0.418 98.000 0.002 NA   NA
 929724 929725 stu1625 stu1626 gatB gatA TRUE 1.000 0.000 0.492 0.001 Y NA
 929725 929726 stu1626 stu1627 gatA gatC TRUE 1.000 0.000 0.643 0.001 Y NA
 929726 929727 stu1627 stu1628 gatC   FALSE 0.177 140.000 0.000 NA   NA
 929727 929728 stu1628 stu1629     TRUE 0.814 13.000 0.000 NA   NA
 929728 929729 stu1629 stu1630     FALSE 0.042 316.000 0.000 1.000   NA
 929729 929730 stu1630 stu1631     TRUE 0.954 84.000 0.061 0.003   NA
 929730 929731 stu1631 stu1632   msrA2 FALSE 0.048 266.000 0.000 1.000   NA
 929731 929732 stu1632 stu1633 msrA2   TRUE 0.893 -6.000 0.000 NA N NA
 929732 929733 stu1633 stu1634   entB FALSE 0.171 120.000 0.000 NA N NA
 929733 929734 stu1634 stu1635 entB codY TRUE 0.699 63.000 0.083 1.000 N NA
 929734 929735 stu1635 stu1636 codY aspC2 FALSE 0.132 260.000 0.015 1.000 N NA
 929736 929737 stu1637 stu1638     FALSE 0.040 334.000 0.000 1.000   NA
 929738 929739 stu1639 stu1640   pflA FALSE 0.087 206.000 0.000 NA   NA
 929739 929740 stu1640 stu1641 pflA hlyX FALSE 0.153 996.000 0.028 NA   NA
 929742 929743 stu1643 stu1644 nha   TRUE 0.975 9.000 0.136 NA   NA
 929743 929744 stu1644 stu1645     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 929744 929745 stu1645 stu1646     TRUE 0.992 -3.000 0.408 NA   NA
 929745 929746 stu1646 stu1647     FALSE 0.210 85.000 0.000 1.000   NA
 929746 929747 stu1647 stu1648   kdtB TRUE 0.976 -22.000 0.052 1.000 N NA
 929747 929748 stu1648 stu1649 kdtB   TRUE 0.931 34.000 0.367 1.000 N NA
 929748 929749 stu1649 stu1650   trxB1 FALSE 0.094 142.000 0.000 1.000 N NA
 929749 929750 stu1650 stu1651 trxB1   TRUE 0.774 66.000 0.117 NA   NA
 929750 929751 stu1651 stu1652     TRUE 0.484 215.000 0.364 NA   NA
 929751 929752 stu1652 stu1653     TRUE 0.995 0.000 0.310 1.000 Y NA
 929752 929753 stu1653 stu1654     TRUE 0.909 169.000 0.143 0.029 Y NA
 929753 929754 stu1654 stu1655     FALSE 0.048 436.000 0.000 NA   NA
 929754 929755 stu1655 stu1656   dinP FALSE 0.058 298.000 0.000 NA   NA
 929756 929757 stu1657 stu1658 pfl cah FALSE 0.033 263.000 0.000 1.000 N NA
 929757 929758 stu1658 stu1659 cah   TRUE 0.719 18.000 0.000 1.000   NA
 929759 929760 stu1660 stu1661     TRUE 0.950 19.000 0.000 0.070   NA
 929760 929761 stu1661 stu1662     TRUE 0.994 5.000 0.000 0.001   NA
 929761 929762 stu1662 stu1663   int TRUE 0.372 482.000 0.000 0.010   NA
 929762 929763 stu1663 stu1664 int   FALSE 0.078 220.000 0.000 NA   NA
 929763 929764 stu1664 stu1665     FALSE 0.289 76.000 0.000 NA   NA
 929764 929765 stu1665 stu1666     TRUE 0.987 -3.000 0.127 NA   NA
 929765 929766 stu1666 stu1667     FALSE 0.068 202.000 0.000 1.000   NA
 929766 929767 stu1667 stu1668   cppA TRUE 0.992 -15.000 0.326 NA   NA
 929771 929772 stu1673 stu1674 blpX   FALSE 0.216 125.000 0.000 NA   NA
 929772 929773 stu1674 stu1675   blpI FALSE 0.054 322.000 0.000 NA   NA
 929773 929774 stu1675 stu1676 blpI blpT FALSE 0.131 165.000 0.000 NA   NA
 929775 929776 stu1677 stu1678 tnpSth1 tnpSth1 TRUE 0.992 15.000 0.250 0.070   NA
 929777 929778 stu1680 stu1681     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 929778 929779 stu1681 stu1682     FALSE 0.214 126.000 0.000 NA   NA
 929779 929780 stu1682 stu1683     TRUE 0.873 4.000 0.000 NA   NA
 929780 929781 stu1683 stu1684     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 929781 929782 stu1684 stu1685   blpU FALSE 0.078 220.000 0.000 NA   NA
 929783 929784 stu1686 stu1687 rr09 hk09 TRUE 0.971 0.000 0.000 NA Y NA
 929785 929786 stu1688 stu1689 blpC   TRUE 0.798 15.000 0.000 NA   NA
 929786 929787 stu1689 stu1690     FALSE 0.206 128.000 0.000 NA   NA
 929787 929788 stu1690 stu1691   blpA TRUE 0.788 16.000 0.000 NA   NA
 929790 929791 stu1693 stu1694     TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.009 Y NA
 929791 929792 stu1694 stu1695     TRUE 0.346 599.000 0.045 NA Y NA
 929792 929793 stu1695 stu1696     TRUE 0.961 2.000 0.012 NA   NA
 929793 929794 stu1696 stu1697     TRUE 0.958 4.000 0.016 NA   NA
 929794 929795 stu1697 stu1698     TRUE 0.888 55.000 0.347 NA   NA
 929795 929796 stu1698 stu1699   rheB FALSE 0.023 849.000 0.000 1.000 N NA
 929796 929797 stu1699 stu1700 rheB mraY TRUE 0.407 75.000 0.007 1.000 N NA
 929797 929798 stu1700 stu1701 mraY pbp2X TRUE 0.987 2.000 0.038 1.000 Y NA
 929798 929799 stu1701 stu1702 pbp2X ftsL TRUE 0.983 4.000 0.456 1.000 N NA
 929799 929800 stu1702 stu1703 ftsL mraW TRUE 0.968 3.000 0.077 1.000 N NA
 929800 929801 stu1703 stu1704 mraW   TRUE 0.443 54.000 0.000 NA   NA
 929801 929802 stu1704 stu1707     FALSE 0.063 268.000 0.000 NA   NA
 929802 929803 stu1707 stu1708     FALSE 0.062 274.000 0.000 NA   NA
 929803 929804 stu1708 stu1709     FALSE 0.078 220.000 0.000 NA   NA
 929804 929805 stu1709 stu1710   proA FALSE 0.050 381.000 0.000 NA   NA
 929805 929806 stu1710 stu1711 proA proB TRUE 1.000 2.000 0.281 0.002 Y NA
 929806 929807 stu1711 stu1712 proB   TRUE 0.411 121.000 0.006 NA   NA
 929807 929808 stu1712 stu1713     TRUE 0.988 3.000 0.341 NA   NA
 929808 929809 stu1713 stu1714     TRUE 0.887 -46.000 0.000 1.000   NA
 929811 929812 stu1716 stu1717 rexA rexB TRUE 0.998 -10.000 0.070 0.069 Y NA
 929812 929813 stu1717 stu1718 rexB   FALSE 0.045 689.000 0.000 NA   NA
 929813 929814 stu1718 stu1719     FALSE 0.052 343.000 0.000 NA   NA
 929814 929815 stu1719 stu1720     FALSE 0.079 218.000 0.000 NA   NA
 929815 929816 stu1720 stu1721     FALSE 0.048 462.000 0.000 NA   NA
 929816 929817 stu1721 stu1722     TRUE 0.922 -13.000 0.000 NA   NA
 929817 929818 stu1722 stu1723     TRUE 0.384 60.000 0.000 NA   NA
 929820 929821 stu1725 stu1726 recG alr TRUE 0.503 129.000 0.078 1.000 N NA
 929821 929822 stu1726 stu1727 alr acpS TRUE 0.925 21.000 0.093 1.000 N NA
 929822 929823 stu1727 stu1728 acpS aroG1 TRUE 0.772 4.000 0.000 1.000 N NA
 929823 929824 stu1728 stu1729 aroG1 aroG2 TRUE 0.948 98.000 0.000 0.001 Y NA
 929824 929825 stu1729 stu1730 aroG2 secA TRUE 0.854 24.000 0.017 1.000 N NA
 929825 929826 stu1730 stu1731 secA   FALSE 0.107 183.000 0.000 NA   NA
 929826 929827 stu1731 stu1732   pmi1 FALSE 0.261 87.000 0.000 NA   NA
 929827 929828 stu1732 stu1733 pmi1 scrK TRUE 0.922 66.000 0.333 NA Y NA
 929828 929829 stu1733 stu1734 scrK scrA TRUE 0.698 185.000 0.235 NA Y NA
 929830 929831 stu1735 stu1736 scrB   TRUE 0.984 9.000 0.571 1.000   NA
 929831 929832 stu1736 stu1737     FALSE 0.254 94.000 0.000 NA   NA
 929833 929834 stu1738 stu1739 nusB   TRUE 0.991 -7.000 0.265 NA   NA
 929834 929835 stu1739 stu1740   efp TRUE 0.898 29.000 0.031 NA   NA
 929835 929836 stu1740 stu1741 efp comEB TRUE 0.313 113.000 0.005 1.000 N NA
 929836 929837 stu1741 stu1742 comEB pepP TRUE 0.941 4.000 0.018 1.000 N NA
 929837 929838 stu1742 stu1743 pepP   FALSE 0.099 190.000 0.000 NA   NA
 929838 929839 stu1743 stu1744     TRUE 0.547 45.000 0.000 NA   NA
 929839 929840 stu1744 stu1745     FALSE 0.192 132.000 0.000 NA   NA
 929840 929841 stu1745 stu1746     FALSE 0.053 340.000 0.000 NA   NA
 929841 929842 stu1746 stu1747     FALSE 0.137 162.000 0.000 NA   NA
 929842 929843 stu1747 stu1748   uvrA FALSE 0.254 94.000 0.000 NA   NA
 929844 929845 stu1749 stu1750 corA2   TRUE 0.715 71.000 0.072 NA   NA
 929845 929846 stu1750 stu1751     FALSE 0.227 117.000 0.000 NA   NA
 929847 929848 stu1752 stu1753 rpsR ssbB TRUE 0.718 42.000 0.012 1.000 N NA
 929848 929849 stu1753 stu1754 ssbB rpsF TRUE 0.897 12.000 0.012 1.000 N NA
 929850 929851 stu1755 stu1756     TRUE 0.601 38.000 0.000 NA   NA
 929851 929852 stu1756 stu1757   mutY FALSE 0.045 665.000 0.000 NA   NA
 929853 929854 stu1758 stu1759     FALSE 0.237 103.000 0.000 NA   NA
 929854 929855 stu1759 stu1760     TRUE 0.884 3.000 0.000 NA   NA
 929855 929856 stu1760 stu1761   polA FALSE 0.046 588.000 0.000 NA   NA
 929858 929859 stu1763 stu1764     TRUE 0.975 -3.000 0.019 NA   NA
 929860 929861 stu1765 stu1766 rnhB sipA TRUE 0.940 19.000 0.080 1.000   NA
 929861 929862 stu1766 stu1767 sipA recD TRUE 0.756 62.000 0.099 1.000   NA
 929863 929864 stu1768 stu1769     TRUE 0.992 -13.000 0.338 NA   NA
 929864 929865 stu1769 stu1770   gcp TRUE 0.674 46.000 0.004 NA N NA
 929865 929866 stu1770 stu1771 gcp rimI TRUE 0.972 0.000 0.030 1.000   NA
 929866 929867 stu1771 stu1772 rimI   TRUE 0.987 -40.000 0.209 1.000   NA
 929868 929869 stu1773 stu1774     TRUE 0.988 5.000 0.576 NA   NA
 929870 929871 stu1775 stu1776   gnlA FALSE 0.049 411.000 0.000 NA   NA
 929871 929872 stu1776 stu1777 gnlA gnlR TRUE 0.941 22.000 0.179 1.000 N NA
 929872 929873 stu1777 stu1778 gnlR   TRUE 0.502 174.000 0.154 NA   NA
 929874 929875 stu1779 stu1780     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 929875 929876 stu1780 stu1781     FALSE 0.058 298.000 0.000 NA   NA
 929877 929878 stu1782 stu1783 pgk   FALSE 0.050 253.000 0.000 1.000   NA
 929879 929880 stu1784 stu1785     TRUE 0.360 63.000 0.000 NA   NA
 929880 929881 stu1785 stu1786     TRUE 0.920 -24.000 0.000 NA   NA
 929881 929882 stu1786 stu1787     TRUE 0.806 14.000 0.000 NA   NA
 929883 929884 stu1788 stu1789 gapA1 fus FALSE 0.075 160.000 0.000 1.000 N NA
 929884 929885 stu1789 stu1790 fus rpsG TRUE 0.670 221.000 0.579 1.000 Y NA
 929885 929886 stu1790 stu1791 rpsG rpsL TRUE 0.998 19.000 0.224 0.004 Y NA
 929886 929887 stu1791 stu1792 rpsL tnp1239 FALSE 0.038 230.000 0.000 1.000 N NA
 929887 929888 stu1792 stu1793 tnp1239 purR TRUE 0.350 192.000 0.000 0.068 N NA
 929888 929889 stu1793 stu1794 purR cbf TRUE 0.588 94.000 0.052 1.000   NA
 929889 929890 stu1794 stu1795 cbf   TRUE 0.979 -22.000 0.030 NA   NA
 929890 929891 stu1795 stu1796     TRUE 0.972 2.000 0.030 NA   NA
 929891 929892 stu1796 stu1797   rpe TRUE 0.985 -7.000 0.166 1.000 N NA
 929892 929893 stu1797 stu1798 rpe   TRUE 0.987 -52.000 0.213 1.000   NA
 929895 929896 stu1799 stu1800 ksgA   TRUE 0.465 145.000 0.093 1.000 N NA
 929896 929897 stu1800 stu1801   tatD TRUE 0.993 -7.000 0.058 NA Y NA
 929897 929898 stu1801 stu1802 tatD   TRUE 0.648 54.000 0.004 NA   NA
 929898 929899 stu1802 stu1803   trxA1 TRUE 0.595 39.000 0.000 NA   NA
 929901 929902 stu1805 stu_t61 bta   FALSE 0.233 107.000 0.000 NA   NA
 929902 929903 stu_t61 stu_r16     TRUE 0.860 6.000 0.000 NA   NA
 929903 929904 stu_r16 stu_r17     FALSE 0.283 77.000 0.000 NA   NA
 929904 929905 stu_r17 stu_t62     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 929905 929906 stu_t62 stu_r18     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 929906 929907 stu_r18 stu1806   tgt FALSE 0.045 723.000 0.000 NA   NA
 929907 929908 stu1806 stu1807 tgt tnp657 FALSE 0.034 253.000 0.000 1.000 N NA
 929908 929909 stu1807 stu1808 tnp657 rpmH FALSE 0.087 178.000 0.000 1.000   NA
 929909 929910 stu1808 stu1809 rpmH jag FALSE 0.079 888.000 0.002 1.000   NA
 929910 929911 stu1809 stu1810 jag   TRUE 0.962 12.000 0.106 1.000   NA
 929911 929912 stu1810 stu1811   rnpA TRUE 0.508 115.000 0.052 1.000 N NA
 929912 929913 stu1811 stu1812 rnpA argH TRUE 0.356 85.000 0.005 1.000 N NA
 929913 929914 stu1812 stu1813 argH argG TRUE 0.584 239.000 0.278 1.000 Y NA
 929914 929915 stu1813 stu1814 argG gltX FALSE 0.022 903.000 0.000 1.000 N NA
 929915 929916 stu1814 stu1815 gltX   FALSE 0.053 341.000 0.000 NA   NA
 929916 929917 stu1815 stu1816     TRUE 0.918 -3.000 0.000 NA   NA
 929917 929918 stu1816 stu1817   rplA FALSE 0.204 92.000 0.000 1.000   NA
 929918 929919 stu1817 stu1818 rplA rplK TRUE 0.979 100.000 0.838 0.026 Y NA
 929921 929922 stu1820 stu1821     FALSE 0.127 168.000 0.000 NA   NA
 929922 929923 stu1821 stu1822     TRUE 0.921 -6.000 0.000 NA   NA
 929923 929924 stu1822 stu1823   radA FALSE 0.053 340.000 0.000 NA   NA
 929924 929925 stu1823 stu1824 radA dut FALSE 0.143 292.000 0.028 1.000 N NA
 929926 929927 stu1825 stu1826     TRUE 0.987 -3.000 0.118 NA   NA
 929927 929928 stu1826 stu1827     TRUE 0.966 28.000 0.588 NA   NA
 929928 929929 stu1827 stu1828     TRUE 0.722 24.000 0.000 NA   NA
 929929 929930 stu1828 stu1829     FALSE 0.086 207.000 0.000 NA   NA
 929930 929931 stu1829 stu1830     FALSE 0.260 88.000 0.000 NA   NA
 929931 929932 stu1830 stu1831     TRUE 0.847 9.000 0.000 NA   NA
 929932 929933 stu1831 stu1832   gpsA FALSE 0.074 233.000 0.000 NA   NA
 929933 929934 stu1832 stu1833 gpsA galU TRUE 0.904 19.000 0.032 1.000 N NA
 929935 929936 stu1834 stu1835 tnpSth1 tnpSth1 TRUE 0.993 15.000 0.250 0.068   NA
 929936 929937 stu1835 stu1836 tnpSth1   TRUE 0.456 46.000 0.000 1.000   NA
 929937 929938 stu1836 stu1837     TRUE 0.978 -9.000 0.037 1.000   NA
 929938 929939 stu1837 stu1838   hipO3 TRUE 0.489 69.000 0.006 1.000   NA
 929939 929940 stu1838 stu1839 hipO3 dapD TRUE 0.779 79.000 0.372 1.000   NA
 929940 929941 stu1839 stu1840 dapD   FALSE 0.209 86.000 0.000 1.000   NA
 929941 929942 stu1840 stu1841     TRUE 0.921 -6.000 0.000 NA   NA
 929942 929943 stu1841 stu1842   rrmA FALSE 0.241 100.000 0.000 NA   NA
 929945 929946 stu1844 stu1845   ssbA FALSE 0.023 760.000 0.000 1.000 N NA
 929946 929947 stu1845 stu1846 ssbA   FALSE 0.045 205.000 0.000 1.000 N NA
 929947 929948 stu1846 stu1847     TRUE 0.953 15.000 0.057 NA   NA
 929948 929949 stu1847 stu1848     FALSE 0.182 138.000 0.000 NA   NA
 929949 929950 stu1848 stu1849   trxA2 TRUE 0.976 10.000 0.239 1.000   NA
 929950 929951 stu1849 stu1850 trxA2   TRUE 0.988 -3.000 0.140 NA   NA
 929952 929953 stu1851 stu1852 pepA proC TRUE 0.934 16.000 0.041 NA N NA
 929954 929955 stu1853 stu1854     FALSE 0.077 222.000 0.000 NA   NA
 929955 929956 stu1854 stu1855     FALSE 0.298 74.000 0.000 NA   NA
 929956 929957 stu1855 stu1856     FALSE 0.101 189.000 0.000 NA   NA
 929957 929958 stu1856 stu1857   ackA FALSE 0.252 237.000 0.094 1.000 N NA
 929958 929959 stu1857 stu1858 ackA   TRUE 0.914 29.000 0.130 1.000 N NA
 929959 929960 stu1858 stu1859     TRUE 0.877 45.000 0.087 NA   NA
 929960 929961 stu1859 stu1860     TRUE 0.990 -22.000 0.232 NA   NA
 929961 929962 stu1860 stu1861     TRUE 0.990 -40.000 0.250 NA   NA
 929962 929963 stu1861 stu1862   comGD TRUE 0.994 -28.000 0.786 NA   NA
 929963 929964 stu1862 stu1863 comGD comGC TRUE 0.986 -40.000 0.110 NA   NA
 929964 929965 stu1863 stu1864 comGC comGB TRUE 1.000 -3.000 0.861 0.001 Y NA
 929965 929966 stu1864 stu1865 comGB comGA TRUE 0.996 -124.000 0.639 1.000 Y NA
 929966 929967 stu1865 stu1866 comGA   TRUE 0.677 81.000 0.083 NA   NA
 929967 929968 stu1866 stu1867   rpoC FALSE 0.293 159.000 0.007 NA   NA
 929968 929969 stu1867 stu1868 rpoC rpoB TRUE 0.992 101.000 0.851 0.002 Y NA
 929969 929970 stu1868 stu1869 rpoB pbp1B FALSE 0.026 362.000 0.000 1.000 N NA
 929972 929973 stu1871 stu1872 ilvC ilvN TRUE 0.987 76.000 0.130 0.002 Y NA
 929973 929974 stu1872 stu1873 ilvN ilvB TRUE 1.000 -7.000 0.249 0.001 Y NA
 929974 929975 stu1873 stu1874 ilvB   TRUE 0.979 116.000 0.089 0.002 Y NA
 929975 929976 stu1874 stu1875     FALSE 0.037 400.000 0.000 1.000   NA
 929976 929977 stu1875 stu1876   asp TRUE 0.992 0.000 0.567 NA   NA
 929977 929978 stu1876 stu1877 asp norN FALSE 0.231 110.000 0.000 NA   NA
 929978 929979 stu1877 stu1878 norN thrC FALSE 0.249 58.000 0.000 1.000 N NA
 929979 929980 stu1878 stu1879 thrC   FALSE 0.034 679.000 0.000 1.000   NA
 929980 929981 stu1879 stu1880     TRUE 0.996 -7.000 0.000 0.002   NA
 929981 929982 stu1880 stu1881     TRUE 0.995 -16.000 0.000 0.004   NA
 929982 929983 stu1881 stu1882     TRUE 0.993 1.000 0.000 0.004   NA
 929983 929984 stu1882 stu1883     TRUE 0.999 -3.000 0.069 0.002   NA
 929984 929985 stu1883 stu1884     TRUE 0.571 308.000 0.000 0.002   NA
 929985 929986 stu1884 stu1885   pepO FALSE 0.139 139.000 0.000 1.000   NA
 929986 929987 stu1885 stu1886 pepO   FALSE 0.214 81.000 0.000 1.000   NA
 929987 929988 stu1886 stu1887     TRUE 0.992 14.000 0.014 0.006   NA
 929988 929989 stu1887 stu1888     FALSE 0.098 168.000 0.000 1.000   NA
 929989 929990 stu1888 stu1889     TRUE 0.992 -126.000 0.000 0.008   NA
 929990 929991 stu1889 stu1890     TRUE 0.961 31.000 0.000 0.008   NA
 929991 929992 stu1890 stu1891     TRUE 0.811 97.000 0.000 0.008   NA
 929993 929994 stu1892 stu1893     TRUE 0.360 55.000 0.000 1.000   NA
 929995 929996 stu1894 stu1895     TRUE 0.838 10.000 0.000 NA   NA
 929996 929997 stu1895 stu1896     TRUE 0.639 33.000 0.000 NA   NA
 929998 929999 stu1897 stu1898     FALSE 0.096 192.000 0.000 NA   NA
 930000 930001 stu1899 stu_t63 fba   FALSE 0.160 149.000 0.000 NA   NA
 930001 930002 stu_t63 stu1900     FALSE 0.105 185.000 0.000 NA   NA
 930002 930003 stu1900 stu1901     TRUE 0.402 58.000 0.000 NA   NA
 930003 930004 stu1901 stu1902     TRUE 0.377 61.000 0.000 NA   NA
 930004 930005 stu1902 stu1903