MicrobesOnline Operon Predictions for Mycoplasma synoviae 53

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 867972 867973 MS53_ MS_0002 dnaA dnaN FALSE 0.087 155.000 0.000 1.000 Y NA
 867973 867974 MS_0002 MS_0003 dnaN   TRUE 0.757 7.000 0.000 1.000   NA
 867975 867976 MS_0004 MS_0005 polC cdsA TRUE 0.985 7.000 0.011 1.000 N NA
 867976 867977 MS_0005 MS_0006 cdsA   TRUE 0.975 9.000 0.004 1.000 N NA
 867977 867978 MS_0006 MS_0007     TRUE 0.997 -3.000 0.025 1.000 N NA
 867979 867980 MS_0008 MS53_0688     FALSE 0.209 74.000 0.000 NA   NA
 867980 867981 MS53_0688 MS53_0689     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 867981 867982 MS53_0689 MS53_0690     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 867982 867983 MS53_0690 MS53_0691     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 867983 867984 MS53_0691 MS53_0692     TRUE 0.807 6.000 0.000 NA   NA
 867986 867987 MS_0010 MS_0011 rpsP trmD TRUE 0.998 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 867987 867988 MS_0011 MS_0012 trmD rplS TRUE 0.997 2.000 0.567 1.000 Y NA
 867988 867989 MS_0012 MS_0013 rplS   TRUE 0.262 39.000 0.000 1.000   NA
 867989 867990 MS_0013 MS_0014     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 867990 867991 MS_0014 MS53_0015   gcp TRUE 0.993 -6.000 0.012 0.005 Y NA
 867992 867993 MS_0016 MS_0017     TRUE 0.999 0.000 0.222 NA   NA
 867993 867994 MS_0017 MS_0018     TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 867994 867995 MS_0018 MS_0019   def TRUE 0.403 23.000 0.000 0.009   NA
 867996 867997 MS_0020 MS_0021   ffh TRUE 0.493 25.000 0.000 1.000   NA
 867998 867999 MS_0022 MS_0023 uvrA glpQ FALSE 0.229 43.000 0.000 1.000 N NA
 867999 868000 MS_0023 MS_0024 glpQ rpiR FALSE 0.091 570.000 0.000 1.000 N NA
 868001 868002 MS_0025 MS_0026   sgaT-1 TRUE 0.994 18.000 0.118 1.000   NA
 868002 868003 MS_0026 MS_0027 sgaT-1   TRUE 0.955 59.000 0.431 0.025   NA
 868003 868004 MS_0027 MS_0028   sgaA TRUE 0.995 12.000 0.279 0.016 Y NA
 868004 868005 MS_0028 MS_0029 sgaA sgaH TRUE 0.995 10.000 0.066 1.000 Y NA
 868005 868006 MS_0029 MS53_0030 sgaH sgaU TRUE 0.999 -22.000 0.750 1.000 Y NA
 868006 868007 MS53_0030 MS53_0031 sgaU araD TRUE 0.998 0.000 0.750 1.000 Y NA
 868007 868008 MS53_0031 MS_0032 araD   TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 868009 868010 MS53_0033 MS_0034     FALSE 0.126 303.000 0.000 NA   NA
 868010 868011 MS_0034 MS_0035     TRUE 0.826 10.000 0.000 NA   NA
 868011 868012 MS_0035 MS_0036     FALSE 0.129 261.000 0.000 NA   NA
 868015 868016 MS_0039 MS_0040   sipS FALSE 0.099 294.000 0.000 1.000   NA
 868016 868017 MS_0040 MS_0041 sipS   TRUE 0.969 43.000 0.333 0.083   NA
 868017 868018 MS_0041 MS_0042     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 868018 868019 MS_0042 MS_0043     TRUE 0.995 12.000 1.000 NA   NA
 868019 868020 MS_0043 MS_0044     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 868020 868021 MS_0044 MS_0045     TRUE 0.352 35.000 0.000 NA   NA
 868021 868022 MS_0045 MS_0046     TRUE 0.297 44.000 0.000 NA   NA
 868022 868023 MS_0046 MS_0047   fusA FALSE 0.126 523.000 0.000 NA   NA
 868023 868024 MS_0047 MS_0048 fusA rpsG TRUE 0.997 7.000 0.579 1.000 Y NA
 868024 868025 MS_0048 MS_0049 rpsG rpsL TRUE 0.966 34.000 0.224 0.018 Y NA
 868025 868026 MS_0049 MS_0050 rpsL   FALSE 0.127 110.000 0.000 1.000   NA
 868026 868027 MS_0050 MS_0051     TRUE 0.997 -7.000 0.016 1.000   NA
 868027 868028 MS_0051 MS_0052   tmk TRUE 0.997 4.000 0.254 1.000   NA
 868028 868029 MS_0052 MS_0053 tmk recR TRUE 0.987 8.000 0.015 1.000 N NA
 868029 868030 MS_0053 MS_0054 recR   TRUE 0.999 0.000 0.604 NA   NA
 868030 868031 MS_0054 MS_0055   dnaX TRUE 0.975 34.000 0.100 NA   NA
 868031 868032 MS_0055 MS_0056 dnaX   TRUE 0.888 55.000 0.015 NA   NA
 868033 868034 MS_0057 MS_0058 parC uvrB TRUE 0.701 7.000 0.000 1.000 Y NA
 868034 868035 MS_0058 MS_0059 uvrB   TRUE 0.767 15.000 0.000 NA   NA
 868035 868036 MS_0059 MS_0060   lplA TRUE 0.998 10.000 0.333 NA   NA
 868036 868037 MS_0060 MS_0061 lplA   TRUE 0.998 3.000 0.400 NA   NA
 868038 868039 MS53_0693 MS_0062     TRUE 0.563 25.000 0.000 NA   NA
 868039 868040 MS_0062 MS_0063     TRUE 0.633 22.000 0.000 NA   NA
 868040 868041 MS_0063 MS_0064     TRUE 0.776 14.000 0.000 NA   NA
 868041 868042 MS_0064 MS_0065     TRUE 0.308 41.000 0.000 NA   NA
 868045 868046 MS_0068 MS53_0694     TRUE 0.338 37.000 0.000 NA   NA
 868047 868048 MS_0069 MS_0070     TRUE 0.305 42.000 0.000 NA   NA
 868048 868049 MS_0070 MS_0071   rpsT FALSE 0.177 91.000 0.000 NA   NA
 868050 868051 MS_0072 MS_0073     TRUE 0.586 24.000 0.000 NA   NA
 868051 868052 MS_0073 MS_0074     TRUE 0.997 12.000 0.163 NA   NA
 868052 868053 MS_0074 MS_0075     TRUE 0.610 23.000 0.000 NA   NA
 868053 868054 MS_0075 MS_0076   rplM FALSE 0.167 103.000 0.000 NA   NA
 868054 868055 MS_0076 MS53_0077 rplM rpsI TRUE 0.998 0.000 0.601 0.075 Y NA
 868055 868056 MS53_0077 MS53_0695 rpsI   TRUE 0.380 33.000 0.000 NA   NA
 868056 868057 MS53_0695 MS_0078   aldA FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 868057 868058 MS_0078 MS_0079 aldA   FALSE 0.107 141.000 0.000 1.000 N NA
 868059 868060 MS53_0696 MS53_0697     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 868061 868062 MS_0080 MS_0081     TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868063 868064 MS_0082 MS_0083 rbfA deoB TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000 N NA
 868066 868067 MS_0085 MS_0086     TRUE 0.999 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 868067 868068 MS_0086 MS_0087     TRUE 0.997 14.000 0.467 1.000   NA
 868070 868071 MS_0089 MS_0090     TRUE 0.931 -6.000 0.000 NA   NA
 868071 868072 MS_0090 MS_0091   gatB TRUE 0.994 -7.000 0.006 1.000   NA
 868072 868073 MS_0091 MS_0092 gatB gatA TRUE 0.999 -7.000 0.492 0.006 Y NA
 868073 868074 MS_0092 MS_0093 gatA gatC TRUE 0.998 0.000 0.643 0.006 Y NA
 868074 868075 MS_0093 MS_0094 gatC rluC TRUE 0.978 7.000 0.007 1.000 Y NA
 868075 868076 MS_0094 MS53_0095 rluC scpB TRUE 0.994 0.000 0.011 NA N NA
 868076 868077 MS53_0095 MS_0096 scpB   TRUE 0.999 -10.000 0.570 NA   NA
 868077 868078 MS_0096 MS_0097   plsC TRUE 0.998 -10.000 0.019 NA   NA
 868078 868079 MS_0097 MS_0098 plsC acpS TRUE 0.968 24.000 0.020 1.000 Y NA
 868079 868080 MS_0098 MS_0099 acpS   TRUE 0.963 18.000 0.003 NA   NA
 868080 868081 MS_0099 MS_0100   gltX TRUE 0.997 -10.000 0.017 NA   NA
 868083 868084 MS_0102 MS_0103     TRUE 0.243 31.000 0.000 0.044 N NA
 868084 868085 MS_0103 MS_0104     TRUE 0.998 0.000 0.400 0.044 Y NA
 868085 868086 MS_0104 MS_0105     TRUE 0.605 3.000 0.000 0.044 Y NA
 868086 868087 MS_0105 MS_0106   pgmB FALSE 0.111 158.000 0.000 1.000   NA
 868087 868088 MS_0106 MS_0107 pgmB   TRUE 0.999 -4.000 0.357 1.000   NA
 868088 868089 MS_0107 MS_0108     TRUE 0.989 18.000 0.061 0.017 Y NA
 868089 868090 MS_0108 MS_0109     FALSE 0.123 101.000 0.000 1.000 N NA
 868090 868091 MS_0109 MS_0110     TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 868091 868092 MS_0110 MS_0111     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA N NA
 868092 868093 MS_0111 MS_0112     TRUE 0.829 2.000 0.000 NA N NA
 868093 868094 MS_0112 MS_0113     TRUE 0.915 -7.000 0.000 1.000   NA
 868094 868095 MS_0113 MS_0114   pgk TRUE 0.479 26.000 0.000 1.000   NA
 868096 868097 MS_0115 MS_0116     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868097 868098 MS_0116 MS_0117     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 868099 868100 MS_0118 MS_0119   rpe TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 868100 868101 MS_0119 MS53_0120 rpe   TRUE 0.996 -13.000 0.012 1.000   NA
 868101 868102 MS53_0120 MS_0121   pknB TRUE 0.997 0.000 0.024 1.000   NA
 868102 868103 MS_0121 MS_0122 pknB prpC TRUE 0.992 20.000 0.130 1.000 Y NA
 868103 868104 MS_0122 MS_0123 prpC gmk TRUE 0.995 -7.000 0.008 1.000 N NA
 868104 868105 MS_0123 MS_0124 gmk rpmG TRUE 0.589 85.000 0.002 1.000 N NA
 868105 868106 MS_0124 MS_0125 rpmG nfo TRUE 0.794 33.000 0.002 1.000 N NA
 868106 868107 MS_0125 MS_0126 nfo   TRUE 0.920 -12.000 0.000 1.000   NA
 868107 868108 MS_0126 MS_0127     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 868109 868110 MS53_0128 MS_0129 secA   TRUE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 868110 868111 MS_0129 MS_0130   bcrA TRUE 0.999 0.000 0.250 NA   NA
 868111 868112 MS_0130 MS_0131 bcrA   TRUE 0.999 -7.000 0.250 NA   NA
 868112 868113 MS_0131 MS_0132     TRUE 0.938 -10.000 0.000 NA   NA
 868113 868114 MS_0132 MS_0133     TRUE 0.999 -10.000 1.000 NA   NA
 868114 868115 MS_0133 MS_0134     TRUE 0.938 -10.000 0.000 NA   NA
 868117 868118 MS_0136 MS_0137 xylF mglA TRUE 0.934 61.000 0.048 1.000   NA
 868118 868119 MS_0137 MS_0138 mglA   TRUE 0.984 32.000 0.438 1.000   NA
 868119 868120 MS_0138 MS_0139     TRUE 0.998 0.000 0.720 0.043   NA
 868120 868121 MS_0139 MS_0140   dgk TRUE 0.771 3.000 0.000 1.000   NA
 868121 868122 MS_0140 MS_0141 dgk   TRUE 0.999 -9.000 0.400 0.008 Y NA
 868123 868124 MS_0142 MS_0143 engA cmk TRUE 0.998 -3.000 0.060 1.000   NA
 868124 868125 MS_0143 MS_0144 cmk   TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 868126 868127 MS_0145 MS_0146 ftsY   TRUE 0.999 -7.000 0.081 1.000   NA
 868129 868130 MS_0148 MS_0149 ppa pepP TRUE 0.754 3.000 0.000 1.000 N NA
 868130 868131 MS_0149 MS_0150 pepP prsA FALSE 0.144 64.000 0.000 1.000 Y NA
 868131 868132 MS_0150 MS_0151 prsA gidB TRUE 0.876 38.000 0.009 1.000 N NA
 868133 868134 MS_0152 MS_0153   pepA-1 FALSE 0.083 137.000 0.000 0.086 N NA
 868134 868135 MS_0153 MS_0154 pepA-1 pepA TRUE 0.938 69.000 0.333 0.004 Y NA
 868136 868137 MS_0155 MS_0156     TRUE 0.826 10.000 0.000 NA   NA
 868137 868138 MS_0156 MS_0157     TRUE 0.938 -10.000 0.000 NA   NA
 868138 868139 MS_0157 MS_0158     FALSE 0.126 464.000 0.000 NA   NA
 868139 868140 MS_0158 MS_0159   atpA-2 TRUE 0.999 0.000 0.667 NA   NA
 868140 868141 MS_0159 MS_0160 atpA-2 atpD-2 TRUE 0.748 0.000 0.000 0.025 Y NA
 868142 868143 MS_0161 MS_0162     FALSE 0.126 380.000 0.000 NA   NA
 868144 868145 MS_0163 MS_0164 rpmF ruvA TRUE 0.615 73.000 0.002 1.000 N NA
 868145 868146 MS_0164 MS_0165 ruvA ruvB TRUE 0.995 14.000 0.549 0.014 Y NA
 868148 868149 MS_0167 MS_0168 secD obg FALSE 0.149 50.000 0.000 0.018   NA
 868149 868150 MS_0168 MS_0169 obg trpS TRUE 0.874 0.000 0.000 1.000   NA
 868150 868151 MS_0169 MS_0170 trpS thrS TRUE 0.992 0.000 0.014 0.086 Y NA
 868151 868152 MS_0170 MS_0171 thrS   TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868152 868153 MS_0171 MS_0172     FALSE 0.225 66.000 0.000 NA   NA
 868154 868155 MS_0173 MS_0174 hit   TRUE 0.998 0.000 0.032 NA   NA
 868155 868156 MS_0174 MS_0175     TRUE 0.999 0.000 0.222 NA   NA
 868158 868159 MS53_0698 MS_0177     FALSE 0.136 198.000 0.000 NA   NA
 868159 868160 MS_0177 MS_0178     TRUE 0.868 -36.000 0.000 0.012   NA
 868160 868161 MS_0178 MS_0179     FALSE 0.102 251.000 0.000 1.000   NA
 868161 868162 MS_0179 MS_0180     TRUE 0.977 30.000 0.273 0.004 Y NA
 868162 868163 MS_0180 MS_0181   tktA TRUE 0.244 39.000 0.000 1.000 N NA
 868163 868164 MS_0181 MS_0182 tktA hemK TRUE 0.979 9.000 0.005 1.000 N NA
 868164 868165 MS_0182 MS_0183 hemK prfA TRUE 0.997 0.000 0.081 0.085 Y NA
 868165 868166 MS_0183 MS53_0699 prfA   FALSE 0.242 56.000 0.000 NA   NA
 868166 868167 MS53_0699 MS53_0700     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 868168 868169 MS_0184 MS_0185 oppB oppC TRUE 0.916 51.000 1.000 0.042 Y NA
 868169 868170 MS_0185 MS_0186 oppC   TRUE 0.705 6.000 0.000 1.000 Y NA
 868170 868171 MS_0186 MS_0187   oppD TRUE 0.995 7.000 0.769 0.008 Y NA
 868171 868172 MS_0187 MS_0188 oppD   TRUE 0.773 11.000 0.000 1.000   NA
 868172 868173 MS_0188 MS_0189     FALSE 0.181 89.000 0.000 NA   NA
 868173 868174 MS_0189 MS_0190     TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 868175 868176 MS_0191 MS_0192     TRUE 0.825 9.000 0.000 NA   NA
 868177 868178 MS_0193 MS_0194 nagB nagA FALSE 0.182 50.000 0.000 1.000 Y NA
 868180 868181 MS_0196 MS_0197     TRUE 0.997 0.000 0.029 NA Y NA
 868181 868182 MS_0197 MS_0198   nanA TRUE 0.990 20.000 0.043 1.000 N NA
 868183 868184 MS_0199 MS_0200   gap FALSE 0.138 179.000 0.000 NA   NA
 868184 868185 MS_0200 MS_0201 gap   FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 868185 868187 MS_0201 MS_0203     FALSE 0.127 542.000 0.000 NA   NA
 868187 868188 MS_0203 MS_0204     FALSE 0.142 155.000 0.000 NA   NA
 868188 868189 MS_0204 MS_0205     FALSE 0.142 155.000 0.000 NA   NA
 868189 868190 MS_0205 MS_0206     FALSE 0.126 324.000 0.000 NA   NA
 868190 868191 MS_0206 MS_0207     TRUE 0.272 51.000 0.000 NA   NA
 868191 868192 MS_0207 MS_0208     TRUE 0.938 -10.000 0.000 NA   NA
 868192 868193 MS_0208 MS_0209     TRUE 0.257 54.000 0.000 NA   NA
 868193 868194 MS_0209 MS_0210     TRUE 0.272 51.000 0.000 NA   NA
 868194 868195 MS_0210 MS_0211     FALSE 0.140 164.000 0.000 NA   NA
 868195 868199 MS_0211 MS_0215     FALSE 0.127 697.000 0.000 NA   NA
 868199 868200 MS_0215 MS_0216     TRUE 0.257 54.000 0.000 NA   NA
 868200 868201 MS_0216 MS_0217     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 868201 868203 MS_0217 MS_0219     FALSE 0.126 353.000 0.000 NA   NA
 868203 868204 MS_0219 MS_0220     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868204 868205 MS_0220 MS_0221     FALSE 0.135 209.000 0.000 NA   NA
 868205 868206 MS_0221 MS_0222     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868206 868207 MS_0222 MS_0223     TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 868207 868208 MS_0223 MS_0224     FALSE 0.198 80.000 0.000 NA   NA
 868208 868209 MS_0224 MS_0225     TRUE 0.338 37.000 0.000 NA   NA
 868209 868210 MS_0225 MS_0226     TRUE 0.272 51.000 0.000 NA   NA
 868210 868211 MS_0226 MS_0227     TRUE 0.633 22.000 0.000 NA   NA
 868211 868212 MS_0227 MS_0228     TRUE 0.938 -19.000 0.000 NA   NA
 868212 868213 MS_0228 MS_0229     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868213 868214 MS_0229 MS_0230     FALSE 0.242 56.000 0.000 NA   NA
 868214 868215 MS_0230 MS_0231     TRUE 0.257 54.000 0.000 NA   NA
 868215 868216 MS_0231 MS_0232     TRUE 0.938 -19.000 0.000 NA   NA
 868216 868217 MS_0232 MS_0233     FALSE 0.146 148.000 0.000 NA   NA
 868217 868218 MS_0233 MS_0234     TRUE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 868218 868219 MS_0234 MS_0235     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868219 868220 MS_0235 MS_0236     FALSE 0.191 84.000 0.000 NA   NA
 868220 868221 MS_0236 MS_0237     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 868221 868222 MS_0237 MS_0238     TRUE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 868222 868223 MS_0238 MS_0239     FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 868223 868224 MS_0239 MS_0240     FALSE 0.126 312.000 0.000 NA   NA
 868224 868225 MS_0240 MS_0241     TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868225 868226 MS_0241 MS_0242     TRUE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 868226 868227 MS_0242 MS_0243     FALSE 0.127 680.000 0.000 NA   NA
 868227 868228 MS_0243 MS_0244     TRUE 0.266 52.000 0.000 NA   NA
 868228 868229 MS_0244 MS_0245     FALSE 0.127 294.000 0.000 NA   NA
 868229 868230 MS_0245 MS_0246     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868230 868231 MS_0246 MS_0247     TRUE 0.938 -21.000 0.000 NA   NA
 868231 868232 MS_0247 MS_0248     TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868232 868233 MS_0248 MS_0249     FALSE 0.126 312.000 0.000 NA   NA
 868233 868234 MS_0249 MS_0250     TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868234 868235 MS_0250 MS_0251     TRUE 0.272 51.000 0.000 NA   NA
 868235 868236 MS_0251 MS_0252     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868236 868237 MS_0252 MS_0253     FALSE 0.126 324.000 0.000 NA   NA
 868237 868238 MS_0253 MS_0254     FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 868238 868239 MS_0254 MS_0255     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868239 868240 MS_0255 MS_0256     TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868240 868241 MS_0256 MS_0257     TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868241 868242 MS_0257 MS_0258     TRUE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 868242 868243 MS_0258 MS_0259     TRUE 0.380 33.000 0.000 NA   NA
 868243 868244 MS_0259 MS_0260     TRUE 0.380 33.000 0.000 NA   NA
 868244 868245 MS_0260 MS_0261     FALSE 0.206 76.000 0.000 NA   NA
 868245 868246 MS_0261 MS_0262     FALSE 0.126 312.000 0.000 NA   NA
 868246 868247 MS_0262 MS_0263     TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868247 868248 MS_0263 MS_0264     FALSE 0.126 500.000 0.000 NA   NA
 868248 868249 MS_0264 MS_0265     TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868249 868250 MS_0265 MS_0266     TRUE 0.938 -19.000 0.000 NA   NA
 868250 868251 MS_0266 MS_0267     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868252 868253 MS_0268 MS_0269 vlhA   TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868253 868254 MS_0269 MS_0270   gapA FALSE 0.151 138.000 0.000 NA   NA
 868254 868255 MS_0270 MS_0271 gapA uvrC FALSE 0.093 252.000 0.000 1.000 N NA
 868255 868256 MS_0271 MS_0272 uvrC pdhA TRUE 0.662 54.000 0.002 1.000 N NA
 868256 868257 MS_0272 MS_0273 pdhA pdhB TRUE 0.999 -3.000 0.458 0.004 Y NA
 868257 868258 MS_0273 MS_0274 pdhB pdhC TRUE 0.978 21.000 0.026 0.041 Y NA
 868258 868259 MS_0274 MS_0275 pdhC pdhD TRUE 0.992 2.000 0.022 1.000 Y NA
 868262 868263 MS53_0278 MS_0279     TRUE 0.563 25.000 0.000 NA   NA
 868264 868265 MS53_0280 MS53_0281     FALSE 0.145 149.000 0.000 NA   NA
 868266 868267 MS_0282 MS_0283 licA   FALSE 0.090 344.000 0.000 1.000 N NA
 868268 868269 MS_0284 MS_0285     TRUE 0.949 69.000 0.091 NA   NA
 868275 868276 MS_0291 MS_0292     TRUE 0.504 273.000 0.005 0.004   NA
 868276 868277 MS_0292 MS_0293     TRUE 0.984 4.000 0.007 NA   NA
 868277 868278 MS_0293 MS_0294     TRUE 0.981 35.000 0.273 NA   NA
 868279 868280 MS53_0295 MS_0296   pfk FALSE 0.127 280.000 0.000 NA   NA
 868280 868281 MS_0296 MS_0297 pfk folD TRUE 0.894 -3.000 0.000 1.000 N NA
 868281 868282 MS_0297 MS_0298 folD valS TRUE 0.993 -12.000 0.004 1.000 N NA
 868283 868284 MS_0299 MS_0300     TRUE 0.493 24.000 0.000 1.000 N NA
 868284 868285 MS_0300 MS_0301   vacB FALSE 0.134 87.000 0.000 1.000 N NA
 868285 868286 MS_0301 MS_0302 vacB   TRUE 0.993 -10.000 0.004 1.000   NA
 868286 868287 MS_0302 MS_0303   metG TRUE 0.989 2.000 0.011 1.000   NA
 868287 868288 MS_0303 MS_0304 metG   TRUE 0.992 -4.000 0.003 NA   NA
 868289 868290 MS_0305 MS_0306 glyA pheT TRUE 0.989 3.000 0.019 1.000 N NA
 868290 868291 MS_0306 MS_0307 pheT ung TRUE 0.996 5.000 0.125 1.000 N NA
 868291 868292 MS_0307 MS_0308 ung pheS TRUE 0.966 4.000 0.003 1.000 N NA
 868293 868294 MS_0309 MS_0310 upp   TRUE 0.963 21.000 0.006 NA   NA
 868294 868295 MS_0310 MS_0311   leuS TRUE 0.978 9.000 0.003 NA   NA
 868295 868296 MS_0311 MS_0312 leuS lon TRUE 0.702 40.000 0.002 1.000 N NA
 868296 868297 MS_0312 MS_0313 lon   FALSE 0.126 440.000 0.000 NA   NA
 868297 868299 MS_0313 MS_0315     FALSE 0.127 546.000 0.000 NA   NA
 868299 868300 MS_0315 MS_0316     FALSE 0.126 415.000 0.000 NA   NA
 868301 868302 MS_0317 MS_0318 gyrA rluB FALSE 0.117 110.000 0.000 1.000 N NA
 868302 868303 MS_0318 MS_0319 rluB   TRUE 0.963 12.000 0.002 1.000 N NA
 868303 868304 MS_0319 MS_0320   dinP TRUE 0.981 2.000 0.006 1.000 N NA
 868304 868305 MS_0320 MS_0321 dinP nifU TRUE 0.804 59.000 0.008 1.000 N NA
 868305 868306 MS_0321 MS_0322 nifU nifS TRUE 0.993 17.000 0.053 1.000 N NA
 868306 868307 MS_0322 MS_0323 nifS   TRUE 0.865 1.000 0.000 NA   NA
 868307 868308 MS_0323 MS_0324     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868308 868309 MS_0324 MS_0325     TRUE 0.996 9.000 0.041 NA   NA
 868310 868311 MS_0326 MS53_0701     FALSE 0.135 213.000 0.000 NA   NA
 868312 868313 MS53_0327 MS_0328     FALSE 0.126 369.000 0.000 NA   NA
 868314 868315 MS_0329 MS_0330     TRUE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 868315 868316 MS_0330 MS_0331   ugpA TRUE 0.957 53.000 0.611 0.036 N NA
 868316 868317 MS_0331 MS53_0332 ugpA ugpE TRUE 0.999 -58.000 0.204 0.036 Y NA
 868317 868318 MS53_0332 MS_0333 ugpE   FALSE 0.128 278.000 0.000 NA   NA
 868318 868319 MS_0333 MS_0334     TRUE 0.747 17.000 0.000 NA   NA
 868319 868320 MS_0334 MS_0335     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 868320 868321 MS_0335 MS_0336     TRUE 0.874 0.000 0.000 1.000   NA
 868321 868322 MS_0336 MS_0337     TRUE 0.999 -4.000 0.583 0.012   NA
 868322 868323 MS_0337 MS_0338     FALSE 0.140 91.000 0.000 1.000   NA
 868323 868324 MS_0338 MS_0339     TRUE 0.744 8.000 0.000 1.000 N NA
 868325 868326 MS_0340 MS_0341 ftsZ   FALSE 0.145 149.000 0.000 NA   NA
 868326 868327 MS_0341 MS_0342   yabC TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 868327 868328 MS_0342 MS_0343 yabC   TRUE 0.999 -10.000 0.635 NA   NA
 868328 868329 MS_0343 MS_0344     FALSE 0.152 127.000 0.000 NA   NA
 868329 868330 MS_0344 MS_0345   oppF-1 TRUE 0.762 8.000 0.000 1.000   NA
 868330 868331 MS_0345 MS_0346 oppF-1 oppD-1 TRUE 0.946 55.000 0.312 0.007 Y NA
 868331 868332 MS_0346 MS_0347 oppD-1 oppC-1 TRUE 0.998 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 868332 868333 MS_0347 MS_0348 oppC-1 oppB-1 TRUE 0.993 12.000 0.889 0.036 Y NA
 868333 868334 MS_0348 MS_0349 oppB-1   TRUE 0.825 9.000 0.000 NA   NA
 868334 868335 MS_0349 MS_0350   pepF TRUE 0.352 35.000 0.000 NA   NA
 868335 868336 MS_0350 MS_0351 pepF dnaK FALSE 0.099 179.000 0.000 1.000 N NA
 868336 868337 MS_0351 MS_0352 dnaK grpE TRUE 0.553 102.000 0.005 0.007 Y NA
 868337 868338 MS_0352 MS_0353 grpE hrcA TRUE 0.996 -7.000 0.015 1.000 N NA
 868338 868339 MS_0353 MS_0354 hrcA fba FALSE 0.147 79.000 0.000 1.000 N NA
 868339 868340 MS_0354 MS_0355 fba   TRUE 0.995 8.000 0.036 NA   NA
 868340 868341 MS_0355 MS_0356   argS TRUE 0.812 33.000 0.002 NA   NA
 868342 868343 MS_0357 MS_0358 cysS   TRUE 0.959 21.000 0.009 1.000 Y NA
 868343 868344 MS_0358 MS_0359     TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868344 868345 MS_0359 MS_0360     FALSE 0.138 185.000 0.000 NA   NA
 868345 868346 MS_0360 MS_0361   nusG TRUE 0.997 2.000 0.843 1.000   NA
 868346 868347 MS_0361 MS_0362 nusG trmE TRUE 0.341 32.000 0.000 1.000   NA
 868347 868348 MS_0362 MS_0363 trmE   TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868348 868349 MS_0363 MS_0364   ksgA TRUE 0.982 0.000 0.002 NA N NA
 868350 868351 MS_0365 MS_0366     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868351 868352 MS_0366 MS_0367     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 868352 868353 MS_0367 MS_0368   tpx TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868353 868354 MS_0368 MS_0369 tpx   TRUE 0.767 15.000 0.000 NA   NA
 868354 868355 MS_0369 MS_0370     FALSE 0.136 201.000 0.000 NA   NA
 868356 868357 MS_0371 MS53_0702     TRUE 0.297 44.000 0.000 NA   NA
 868358 868359 MS_0372 MS_0373     TRUE 0.980 10.000 0.003 NA   NA
 868360 868361 MS_0374 MS_0375   trmU FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 868361 868362 MS_0375 MS_0376 trmU alaS TRUE 0.978 9.000 0.007 0.070 Y NA
 868362 868363 MS_0376 MS_0377 alaS   TRUE 0.981 24.000 0.032 1.000 N NA
 868363 868364 MS_0377 MS_0378     TRUE 0.978 8.000 0.004 NA   NA
 868364 868365 MS_0378 MS_0379   greA TRUE 0.936 55.000 0.031 NA   NA
 868365 868366 MS_0379 MS_0380 greA   TRUE 0.956 33.000 0.031 1.000 N NA
 868366 868367 MS_0380 MS_0381   hpt TRUE 0.997 -4.000 0.021 1.000 Y NA
 868367 868368 MS_0381 MS_0382 hpt lip3 FALSE 0.131 106.000 0.000 1.000   NA
 868368 868369 MS_0382 MS_0383 lip3   TRUE 0.915 -7.000 0.000 1.000   NA
 868369 868370 MS_0383 MS_0384     TRUE 0.896 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 868370 868371 MS_0384 MS_0385     TRUE 0.999 -19.000 0.400 NA Y NA
 868371 868372 MS_0385 MS_0386     TRUE 0.819 11.000 0.000 NA   NA
 868373 868374 MS_0387 MS_0388 era cdd TRUE 0.988 17.000 0.021 1.000   NA
 868374 868375 MS_0388 MS_0389 cdd   TRUE 0.867 32.000 0.003 NA   NA
 868375 868376 MS_0389 MS_0390     TRUE 0.809 8.000 0.000 NA   NA
 868376 868377 MS_0390 MS_0391     TRUE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 868378 868379 MS_0392 MS_0393 rpiB cls TRUE 0.754 3.000 0.000 1.000 N NA
 868379 868380 MS_0393 MS_0394 cls ptsH TRUE 0.901 57.000 0.023 1.000 N NA
 868381 868382 MS_0395 MS_0396   comEB TRUE 0.291 35.000 0.000 1.000   NA
 868382 868383 MS_0396 MS_0397 comEB folA TRUE 0.994 -3.000 0.009 1.000 N NA
 868383 868384 MS_0397 MS_0398 folA thyA TRUE 0.999 0.000 0.295 1.000 N NA
 868385 868386 MS_0399 MS_0400 nrdF nrdI TRUE 0.995 18.000 0.643 NA Y NA
 868386 868387 MS_0400 MS_0401 nrdI nrdE TRUE 0.985 23.000 1.000 NA Y NA
 868388 868389 MS_0402 MS_0403     FALSE 0.188 85.000 0.000 NA   NA
 868389 868390 MS_0403 MS_0404   atpC TRUE 0.278 37.000 0.000 1.000   NA
 868390 868391 MS_0404 MS_0405 atpC atpD TRUE 0.997 0.000 0.837 0.020 Y NA
 868391 868392 MS_0405 MS_0406 atpD atpG TRUE 0.995 8.000 0.724 0.020 Y NA
 868392 868393 MS_0406 MS_0407 atpG atpA TRUE 0.998 -7.000 0.846 0.020 Y NA
 868393 868394 MS_0407 MS_0408 atpA atpH TRUE 0.998 -10.000 0.864 0.020 Y NA
 868394 868395 MS_0408 MS_0409 atpH atpF TRUE 0.995 0.000 0.022 0.020 Y NA
 868395 868396 MS_0409 MS_0410 atpF atpE TRUE 0.965 39.000 0.500 0.020 Y NA
 868396 868397 MS_0410 MS_0411 atpE atpB TRUE 0.948 37.000 0.085 0.020 Y NA
 868397 868398 MS_0411 MS_0412 atpB   TRUE 0.786 13.000 0.000 NA   NA
 868399 868400 MS_0413 MS_0414 rpsB tsf TRUE 0.998 0.000 0.748 1.000 Y NA
 868402 868403 MS_0416 MS_0417   rsuA TRUE 0.786 13.000 0.000 NA   NA
 868404 868405 MS_0418 MS_0419     FALSE 0.175 93.000 0.000 NA   NA
 868406 868407 MS_0420 MS_0421 rplJ rplL TRUE 0.956 37.000 0.884 1.000 Y NA
 868410 868411 MS_0424 MS_0425 hlyC dnaB TRUE 0.527 27.000 0.000 NA   NA
 868411 868412 MS_0425 MS_0426 dnaB rplI TRUE 0.670 17.000 0.000 1.000 N NA
 868412 868413 MS_0426 MS_0427 rplI   TRUE 0.999 -19.000 0.119 1.000 N NA
 868413 868414 MS_0427 MS_0428     TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 868414 868415 MS_0428 MS_0429     TRUE 0.362 34.000 0.000 NA   NA
 868415 868416 MS_0429 MS_0430     TRUE 0.819 11.000 0.000 NA   NA
 868416 868417 MS_0430 MS_0431   efp FALSE 0.127 697.000 0.000 NA   NA
 868417 868418 MS_0431 MS53_0703 efp   FALSE 0.164 108.000 0.000 NA   NA
 868419 868420 MS_0432 MS53_0704     TRUE 0.819 11.000 0.000 NA   NA
 868421 868422 MS_0433 MS_0434     TRUE 0.995 20.000 0.304 NA N NA
 868422 868423 MS_0434 MS_0435     FALSE 0.076 140.000 0.000 0.060 N NA
 868423 868424 MS_0435 MS_0436   aspS TRUE 0.411 28.000 0.000 1.000 N NA
 868424 868425 MS_0436 MS_0437 aspS hisS TRUE 0.993 17.000 0.161 0.068 Y NA
 868425 868426 MS_0437 MS_0438 hisS   TRUE 0.938 -19.000 0.000 NA   NA
 868426 868427 MS_0438 MS53_0439     FALSE 0.131 246.000 0.000 NA   NA
 868428 868429 MS_0440 MS_0441     TRUE 0.549 26.000 0.000 NA   NA
 868429 868430 MS_0441 MS_0442     TRUE 0.804 7.000 0.000 NA   NA
 868430 868431 MS_0442 MS_0443     FALSE 0.129 258.000 0.000 NA   NA
 868432 868433 MS53_0444 MS_0445   deoC FALSE 0.126 314.000 0.000 NA   NA
 868433 868434 MS_0445 MS_0446 deoC deoA TRUE 0.998 0.000 0.106 1.000 Y NA
 868434 868435 MS_0446 MS_0447 deoA deoD TRUE 0.993 2.000 0.022 1.000 Y NA
 868436 868437 MS_0448 MS_0449 fpg   TRUE 0.762 5.000 0.000 1.000   NA
 868438 868439 MS_0450 MS_0451     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868440 868441 MS_0452 MS_0453 glyS dnaG TRUE 0.989 7.000 0.019 1.000 N NA
 868441 868443 MS_0453 MS_0455 dnaG rpoD TRUE 0.910 924.000 0.205 1.000 N NA
 868443 868444 MS_0455 MS_0456 rpoD   TRUE 0.991 5.000 0.016 NA   NA
 868444 868445 MS_0456 MS_0457     TRUE 0.266 52.000 0.000 NA   NA
 868445 868446 MS_0457 MS_0458     FALSE 0.141 160.000 0.000 NA   NA
 868446 868447 MS_0458 MS_0459     TRUE 0.997 14.000 0.667 NA   NA
 868447 868448 MS_0459 MS53_0460     FALSE 0.128 273.000 0.000 NA   NA
 868448 868449 MS53_0460 MS53_0705     TRUE 0.248 55.000 0.000 NA   NA
 868449 868450 MS53_0705 MS53_0706     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868450 868451 MS53_0706 MS53_0707     TRUE 0.313 40.000 0.000 NA   NA
 868451 868452 MS53_0707 MS53_0708     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868452 868453 MS53_0708 MS53_0709     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868453 868454 MS53_0709 MS_0461   ldh FALSE 0.150 140.000 0.000 NA   NA
 868455 868456 MS_0462 MS_0463     TRUE 0.809 8.000 0.000 NA   NA
 868456 868457 MS_0463 MS_0464   atpD-3 FALSE 0.103 237.000 0.000 1.000   NA
 868457 868458 MS_0464 MS_0465 atpD-3 atpA-3 TRUE 0.739 0.000 0.000 0.019 Y NA
 868458 868459 MS_0465 MS_0466 atpA-3   TRUE 0.938 -10.000 0.000 NA   NA
 868459 868460 MS_0466 MS_0467     TRUE 0.937 -9.000 0.000 NA   NA
 868460 868461 MS_0467 MS_0468     TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868461 868462 MS_0468 MS_0469     TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868462 868463 MS_0469 MS_0470     TRUE 0.819 11.000 0.000 NA   NA
 868463 868464 MS_0470 MS_0471     TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868464 868465 MS_0471 MS_0472     TRUE 0.495 29.000 0.000 NA   NA
 868465 868467 MS_0472 MS_0474     FALSE 0.128 1019.000 0.000 NA   NA
 868467 868468 MS_0474 MS_0475     FALSE 0.098 348.000 0.000 1.000   NA
 868468 868469 MS_0475 MS_0476     TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 868469 868470 MS_0476 MS_0477   rpmE FALSE 0.148 144.000 0.000 NA   NA
 868470 868471 MS_0477 MS_0478 rpmE rpsD TRUE 0.958 8.000 0.003 0.076 Y NA
 868472 868473 MS_0479 MS_0480   smpB TRUE 0.938 -19.000 0.000 NA   NA
 868474 868475 MS_0481 MS_0482     TRUE 0.280 50.000 0.000 NA   NA
 868475 868476 MS_0482 MS_0483   pgiB TRUE 0.764 9.000 0.000 1.000 N NA
 868476 868477 MS_0483 MS_0484 pgiB rpoC FALSE 0.164 76.000 0.000 1.000   NA
 868477 868478 MS_0484 MS_0485 rpoC rpoB TRUE 0.998 -7.000 0.851 0.005   NA
 868478 868479 MS_0485 MS_0486 rpoB tpiA FALSE 0.100 174.000 0.000 1.000 N NA
 868485 868486 MS_0492 MS53_0710 proS   TRUE 0.257 54.000 0.000 NA   NA
 868486 868487 MS53_0710 MS53_0711     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 868489 868490 MS_0494 MS_0495 pgsA   TRUE 0.984 5.000 0.007 NA   NA
 868490 868491 MS_0495 MS_0496     TRUE 0.809 8.000 0.000 NA   NA
 868491 868492 MS_0496 MS_0497   mgtE TRUE 0.458 30.000 0.000 NA   NA
 868492 868493 MS_0497 MS_0498 mgtE   TRUE 0.998 11.000 0.600 NA   NA
 868493 868494 MS_0498 MS_0499     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868495 868496 MS_0500 MS_0501 pepO   FALSE 0.193 82.000 0.000 NA   NA
 868496 868497 MS_0501 MS_0502     FALSE 0.226 65.000 0.000 NA   NA
 868499 868500 MS_0503 MS_0504     FALSE 0.179 90.000 0.000 NA   NA
 868500 868501 MS_0504 MS_0505   thiI TRUE 0.937 -9.000 0.000 NA   NA
 868502 868503 MS_0506 MS_0507     TRUE 0.875 78.000 1.000 0.009 Y NA
 868504 868505 MS_0508 MS_0509 potA potB TRUE 0.935 41.000 0.928 0.032 Y NA
 868505 868506 MS_0509 MS_0510 potB potC TRUE 0.966 38.000 0.492 0.032 Y NA
 868506 868507 MS_0510 MS_0511 potC   TRUE 0.996 -3.000 0.010 NA   NA
 868509 868510 MS_0513 MS_0514     TRUE 0.806 -7.000 0.000 0.009 Y NA
 868510 868511 MS_0514 MS_0515   gidA TRUE 0.783 2.000 0.000 1.000 N NA
 868511 868512 MS_0515 MS_0516 gidA   TRUE 0.996 -10.000 0.010 NA   NA
 868512 868513 MS_0516 MS_0517     FALSE 0.140 163.000 0.000 NA   NA
 868514 868515 MS_0518 MS_0519 ktrA ktrB TRUE 0.994 12.000 0.123 0.005 Y NA
 868515 868516 MS_0519 MS_0520 ktrB   TRUE 0.297 44.000 0.000 NA   NA
 868517 868518 MS_0521 MS_0522 tdk nox FALSE 0.135 98.000 0.000 1.000   NA
 868518 868519 MS_0522 MS_0523 nox ptsI FALSE 0.111 86.000 0.000 0.064   NA
 868520 868521 MS_0524 MS_0525 fmt   TRUE 0.816 3.000 0.000 NA   NA
 868521 868522 MS_0525 MS_0526     FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 868522 868523 MS_0526 MS_0527     FALSE 0.171 98.000 0.000 NA   NA
 868523 868524 MS_0527 MS_0528     TRUE 0.380 33.000 0.000 NA   NA
 868524 868525 MS_0528 MS_0529   dnaE TRUE 0.998 -3.000 0.119 0.012 Y NA
 868525 868526 MS_0529 MS_0530 dnaE   TRUE 0.760 16.000 0.000 NA   NA
 868526 868527 MS_0530 MS_0531   topA TRUE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 868528 868529 MS_0532 MS_0533 rpsF ssb TRUE 0.979 11.000 0.006 1.000 N NA
 868529 868530 MS_0533 MS_0534 ssb rpsR TRUE 0.992 0.000 0.008 1.000 N NA
 868530 868531 MS_0534 MS_0535 rpsR   FALSE 0.126 97.000 0.000 1.000 N NA
 868531 868532 MS_0535 MS_0536     TRUE 0.816 1.000 0.000 1.000 N NA
 868532 868533 MS_0536 MS_0537     TRUE 0.997 12.000 0.417 1.000 N NA
 868533 868534 MS_0537 MS_0538     TRUE 0.825 9.000 0.000 NA   NA
 868534 868535 MS_0538 MS_0539     TRUE 0.996 10.000 1.000 NA   NA
 868535 868536 MS_0539 MS_0540     FALSE 0.127 679.000 0.000 NA   NA
 868536 868537 MS_0540 MS_0541     FALSE 0.127 281.000 0.000 NA   NA
 868537 868538 MS_0541 MS_0542     FALSE 0.134 216.000 0.000 NA   NA
 868539 868540 MS_0543 MS_0544   pcrA TRUE 0.993 -3.000 0.005 NA   NA
 868540 868541 MS_0544 MS_0545 pcrA   TRUE 0.946 37.000 0.022 NA   NA
 868541 868542 MS_0545 MS_0546     TRUE 0.999 -3.000 0.200 NA   NA
 868542 868543 MS_0546 MS_0547     TRUE 0.563 25.000 0.000 NA   NA
 868543 868544 MS_0547 MS53_0713     TRUE 0.689 20.000 0.000 NA   NA
 868544 868545 MS53_0713 MS_0548     FALSE 0.126 313.000 0.000 NA   NA
 868547 868548 MS_0550 MS53_0551 rpmA rplU TRUE 0.996 5.000 0.667 0.052 Y NA
 868550 868551 MS_0553 MS53_0714     FALSE 0.132 231.000 0.000 NA   NA
 868551 868552 MS53_0714 MS_0554     FALSE 0.126 331.000 0.000 NA   NA
 868552 868553 MS_0554 MS_0555     FALSE 0.133 224.000 0.000 NA   NA
 868553 868554 MS_0555 MS_0556     FALSE 0.133 228.000 0.000 NA   NA
 868554 868555 MS_0556 MS_0557     FALSE 0.132 234.000 0.000 NA   NA
 868555 868556 MS_0557 MS_0558   ileS TRUE 0.997 -7.000 0.019 1.000 N NA
 868556 868557 MS_0558 MS53_0715 ileS   FALSE 0.154 125.000 0.000 NA   NA
 868557 868558 MS53_0715 MS53_0716     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 868558 868559 MS53_0716 MS53_0717     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868559 868560 MS53_0717 MS53_0718     TRUE 0.819 11.000 0.000 NA   NA
 868560 868561 MS53_0718 MS53_0719     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868561 868562 MS53_0719 MS53_0720     TRUE 0.786 13.000 0.000 NA   NA
 868562 868563 MS53_0720 MS53_0721     TRUE 0.810 4.000 0.000 NA   NA
 868563 868564 MS53_0721 MS53_0722     TRUE 0.807 6.000 0.000 NA   NA
 868564 868565 MS53_0722 MS_0559     FALSE 0.163 109.000 0.000 NA   NA
 868565 868566 MS_0559 MS53_0723     FALSE 0.137 186.000 0.000 NA   NA
 868566 868567 MS53_0723 MS53_0724     FALSE 0.129 260.000 0.000 NA   NA
 868567 868568 MS53_0724 MS_0560     FALSE 0.134 216.000 0.000 NA   NA
 868568 868569 MS_0560 MS_0561   recA TRUE 0.963 20.000 0.006 1.000   NA
 868569 868570 MS_0561 MS_0562 recA rpsO FALSE 0.127 93.000 0.000 1.000 N NA
 868570 868571 MS_0562 MS_0563 rpsO ribF TRUE 0.792 89.000 0.013 1.000 N NA
 868571 868572 MS_0563 MS_0564 ribF   TRUE 0.997 0.000 0.037 1.000   NA
 868572 868573 MS_0564 MS_0565   truB TRUE 0.993 2.000 0.022 1.000   NA
 868573 868574 MS_0565 MS_0566 truB   TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868575 868576 MS_0567 MS_0568 lig   TRUE 0.908 -7.000 0.000 1.000 N NA
 868576 868577 MS_0568 MS_0569     TRUE 0.994 -10.000 0.014 0.004 Y NA
 868577 868578 MS_0569 MS_0570     TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868579 868580 MS53_0571 MS_0572 scr mgtA TRUE 0.633 22.000 0.000 NA   NA
 868580 868581 MS_0572 MS_0573 mgtA rplQ FALSE 0.116 113.000 0.000 1.000 N NA
 868581 868582 MS_0573 MS_0574 rplQ rpoA TRUE 0.995 12.000 0.873 1.000 N NA
 868582 868583 MS_0574 MS_0575 rpoA rpsK TRUE 0.994 20.000 0.308 1.000 N NA
 868583 868584 MS_0575 MS_0576 rpsK rpsM TRUE 0.998 0.000 0.810 0.050 Y NA
 868584 868585 MS_0576 MS_0577 rpsM rpmJ TRUE 0.996 4.000 0.194 0.050   NA
 868585 868586 MS_0577 MS_0578 rpmJ infA TRUE 0.996 8.000 0.104 1.000   NA
 868586 868587 MS_0578 MS_0579 infA map TRUE 0.996 1.000 0.051 1.000 Y NA
 868587 868588 MS_0579 MS_0580 map adk TRUE 0.926 62.000 0.041 1.000 N NA
 868588 868589 MS_0580 MS_0581 adk secY TRUE 0.997 -6.000 0.019 1.000 N NA
 868590 868591 MS_0582 MS_0583     TRUE 0.837 153.000 0.021 NA   NA
 868591 868592 MS_0583 MS_0584     TRUE 0.994 17.000 0.876 NA   NA
 868592 868593 MS_0584 MS_0585     TRUE 0.995 3.000 0.033 NA   NA
 868593 868594 MS_0585 MS_0586     FALSE 0.128 1137.000 0.000 NA   NA
 11520303 868594   MS_0586     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11662666 868594   MS_0586     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11805058 868594   MS_0586     FALSE NA 1092.000 0.000 NA   NA
 11520304 868594   MS_0586     FALSE NA 1062.000 0.000 NA   NA
 11662667 868594   MS_0586     FALSE NA 1062.000 0.000 NA   NA
 11805059 868594   MS_0586     FALSE NA 1062.000 0.000 NA   NA
 11520305 868594   MS_0586     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11662668 868594   MS_0586     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11805060 868594   MS_0586     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11520306 868594   MS_0586     FALSE NA 996.000 0.000 NA   NA
 11662669 868594   MS_0586     FALSE NA 996.000 0.000 NA   NA
 11805061 868594   MS_0586     FALSE NA 996.000 0.000 NA   NA
 11520307 868594   MS_0586     FALSE NA 960.000 0.000 NA   NA
 11662670 868594   MS_0586     FALSE NA 960.000 0.000 NA   NA
 11805062 868594   MS_0586     FALSE NA 960.000 0.000 NA   NA
 11520308 868594   MS_0586     FALSE NA 930.000 0.000 NA   NA
 11662671 868594   MS_0586     FALSE NA 930.000 0.000 NA   NA
 11805063 868594   MS_0586     FALSE NA 930.000 0.000 NA   NA
 11520309 868594   MS_0586     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11662672 868594   MS_0586     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11805064 868594   MS_0586     FALSE NA 894.000 0.000 NA   NA
 11520310 868594   MS_0586     FALSE NA 865.000 0.000 NA   NA
 11662673 868594   MS_0586     FALSE NA 865.000 0.000 NA   NA
 11805065 868594   MS_0586     FALSE NA 865.000 0.000 NA   NA
 11520311 868594   MS_0586     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11662674 868594   MS_0586     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11805066 868594   MS_0586     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11520312 868594   MS_0586     FALSE NA 799.000 0.000 NA   NA
 11662675 868594   MS_0586     FALSE NA 799.000 0.000 NA   NA
 11805067 868594   MS_0586     FALSE NA 799.000 0.000 NA   NA
 11520313 868594   MS_0586     FALSE NA 763.000 0.000 NA   NA
 11662676 868594   MS_0586     FALSE NA 763.000 0.000 NA   NA
 11805068 868594   MS_0586     FALSE NA 763.000 0.000 NA   NA
 11520314 868594   MS_0586     FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11662677 868594   MS_0586     FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11805069 868594   MS_0586     FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11520315 868594   MS_0586     FALSE NA 698.000 0.000 NA   NA
 11662678 868594   MS_0586     FALSE NA 698.000 0.000 NA   NA
 11805070 868594   MS_0586     FALSE NA 698.000 0.000 NA   NA
 11520316 868594   MS_0586     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11662679 868594   MS_0586     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11805071 868594   MS_0586     FALSE NA 668.000 0.000 NA   NA
 11520317 868594   MS_0586     FALSE NA 632.000 0.000 NA   NA
 11662680 868594   MS_0586     FALSE NA 632.000 0.000 NA   NA
 11805072 868594   MS_0586     FALSE NA 632.000 0.000 NA   NA
 11520318 868594   MS_0586     FALSE NA 602.000 0.000 NA   NA
 11662681 868594   MS_0586     FALSE NA 602.000 0.000 NA   NA
 11805073 868594   MS_0586     FALSE NA 602.000 0.000 NA   NA
 11520319 868594   MS_0586     FALSE NA 566.000 0.000 NA   NA
 11662682 868594   MS_0586     FALSE NA 566.000 0.000 NA   NA
 11805074 868594   MS_0586     FALSE NA 566.000 0.000 NA   NA
 11520320 868594   MS_0586     FALSE NA 536.000 0.000 NA   NA
 11662683 868594   MS_0586     FALSE NA 536.000 0.000 NA   NA
 11805075 868594   MS_0586     FALSE NA 536.000 0.000 NA   NA
 11520321 868594   MS_0586     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11662684 868594   MS_0586     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11805076 868594   MS_0586     FALSE NA 500.000 0.000 NA   NA
 11520322 868594   MS_0586     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11662685 868594   MS_0586     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11805077 868594   MS_0586     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11520323 868594   MS_0586     FALSE NA 434.000 0.000 NA   NA
 11662686 868594   MS_0586     FALSE NA 434.000 0.000 NA   NA
 11805078 868594   MS_0586     FALSE NA 434.000 0.000 NA   NA
 11520324 868594   MS_0586     FALSE NA 404.000 0.000 NA   NA
 11662687 868594   MS_0586     FALSE NA 404.000 0.000 NA   NA
 11805079 868594   MS_0586     FALSE NA 404.000 0.000 NA   NA
 11520325 868594   MS_0586     FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11662688 868594   MS_0586     FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11805080 868594   MS_0586     FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 868595 868596 MS_0587 MS_0588     FALSE 0.147 146.000 0.000 NA   NA
 868596 868597 MS_0588 MS_0589     TRUE 0.938 -12.000 0.000 NA   NA
 868599 868600 MS_0591 MS_0592 serS parE TRUE 0.783 2.000 0.000 1.000 N NA
 868600 868601 MS_0592 MS_0593 parE dnaJ FALSE 0.215 47.000 0.000 1.000 N NA
 868603 868604 MS_0594 MS_0595   rluD TRUE 0.390 30.000 0.000 1.000   NA
 868604 868605 MS_0595 MS_0596 rluD trxB TRUE 0.542 22.000 0.000 1.000 N NA
 868605 868606 MS_0596 MS_0597 trxB lgt TRUE 0.998 0.000 0.101 1.000 N NA
 868606 868607 MS_0597 MS_0598 lgt   FALSE 0.165 107.000 0.000 NA   NA
 868607 868608 MS_0598 MS_0599     TRUE 0.320 39.000 0.000 NA   NA
 868608 868609 MS_0599 MS_0600   rnpA TRUE 0.817 53.000 0.007 1.000 N NA
 868609 868610 MS_0600 MS_0601 rnpA rpmH TRUE 0.996 14.000 0.787 1.000   NA
 868610 868611 MS_0601 MS_0602 rpmH   FALSE 0.134 216.000 0.000 NA   NA
 868613 868614 MS_0604 MS_0605     TRUE 0.995 9.000 0.026 NA   NA
 868615 868616 MS_0606 MS53_0607 infC rpmI TRUE 0.999 0.000 0.652 1.000   NA
 868616 868617 MS53_0607 MS_0608 rpmI rplT TRUE 0.988 20.000 0.928 0.045   NA
 868618 868619 MS_0609 MS_0610   metK TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 868619 868620 MS_0610 MS_0611 metK lysS FALSE 0.112 124.000 0.000 1.000 N NA
 868620 868621 MS_0611 MS_0612 lysS   TRUE 0.989 -4.000 0.003 1.000 N NA
 868621 868622 MS_0612 MS_0613     TRUE 0.926 264.000 0.333 1.000   NA
 868622 868623 MS_0613 MS_0614   ftsH TRUE 0.748 55.000 0.006 0.048   NA
 868623 868624 MS_0614 MS_0615 ftsH   TRUE 0.894 123.000 0.051 1.000 N NA
 868624 868625 MS_0615 MS_0616   pth TRUE 0.991 5.000 0.025 0.072 N NA
 868625 868626 MS_0616 MS_0617 pth recD TRUE 0.989 0.000 0.006 1.000 N NA
 868627 868628 MS_0618 MS_0619   rnhB TRUE 0.953 39.000 0.040 1.000   NA
 868630 868631 MS_0621 MS_0622   tyrS TRUE 0.992 -7.000 0.004 1.000   NA
 868632 868633 MS_0623 MS_0624 rplA rplK TRUE 0.997 0.000 0.838 0.063 Y NA
 868633 868634 MS_0624 MS_0625 rplK rplO FALSE 0.106 58.000 0.000 0.063 Y NA
 868634 868635 MS_0625 MS_0626 rplO rpsE TRUE 0.995 6.000 0.148 0.063 Y NA
 868635 868636 MS_0626 MS_0627 rpsE rplR TRUE 0.872 294.000 0.814 0.063 Y NA
 868636 868637 MS_0627 MS_0628 rplR rplF TRUE 0.993 15.000 0.815 0.045 Y NA
 868637 868638 MS_0628 MS_0629 rplF rpsH TRUE 0.996 9.000 0.808 0.045 Y NA
 868638 868639 MS_0629 MS_0630 rpsH rpsN TRUE 0.996 8.000 0.473 0.045 Y NA
 868639 868640 MS_0630 MS_0631 rpsN rplE TRUE 0.998 0.000 0.496 0.045 Y NA
 868640 868641 MS_0631 MS_0632 rplE rplx TRUE 0.998 -3.000 0.758 0.045 Y NA
 868641 868642 MS_0632 MS_0633 rplx rplN TRUE 0.996 9.000 0.810 0.063 Y NA
 868642 868643 MS_0633 MS_0634 rplN rpsQ TRUE 0.998 0.000 0.791 0.063 Y NA
 868643 868644 MS_0634 MS_0635 rpsQ rpmC TRUE 0.998 -3.000 0.828 0.045 Y NA
 868644 868645 MS_0635 MS_0636 rpmC rplP TRUE 0.998 0.000 0.802 0.045 Y NA
 868645 868646 MS_0636 MS_0637 rplP rpsC TRUE 0.998 -22.000 0.828 0.063 Y NA
 868646 868647 MS_0637 MS_0638 rpsC rplV TRUE 0.998 0.000 0.719 0.063 Y NA
 868647 868648 MS_0638 MS_0639 rplV rpsS TRUE 0.998 0.000 0.769 0.063 Y NA
 868648 868649 MS_0639 MS_0640 rpsS rplB TRUE 0.998 0.000 0.820 0.063 Y NA
 868649 868650 MS_0640 MS_0641 rplB rplW TRUE 0.919 62.000 0.849 0.037 Y NA
 868650 868651 MS_0641 MS_0642 rplW rplD TRUE 0.997 2.000 0.307 0.045 Y NA
 868651 868652 MS_0642 MS_0643 rplD rplC TRUE 0.932 87.000 0.544 0.045 Y NA
 868652 868653 MS_0643 MS_0644 rplC rpsJ TRUE 0.994 18.000 0.467 0.063 Y NA
 868653 868654 MS_0644 MS_0645 rpsJ trxA FALSE 0.102 245.000 0.000 1.000   NA
 868654 868655 MS_0645 MS_0646 trxA   TRUE 0.997 16.000 0.500 NA   NA
 868655 868656 MS_0646 MS_0647     TRUE 0.998 -3.000 0.026 NA   NA
 868656 868657 MS_0647 MS_0648   pyk TRUE 0.902 0.000 0.000 NA   NA
 868657 868658 MS_0648 MS_0649 pyk   FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 868658 868659 MS_0649 MS_0650     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 868659 868660 MS_0650 MS_0651     TRUE 0.990 -7.000 0.002 1.000   NA
 868660 868661 MS_0651 MS_0652   ackA TRUE 0.990 2.000 0.015 1.000 N NA
 868661 868662 MS_0652 MS_0653 ackA pta TRUE 0.998 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 868665 868666 MS_0656 MS_0657 pgm   TRUE 0.493 24.000 0.000 1.000 N NA
 868666 868667 MS_0657 MS_0658     TRUE 0.999 -3.000 0.849 NA   NA
 868667 868668 MS_0658 MS_0659     FALSE 0.154 125.000 0.000 NA   NA
 868668 868669 MS_0659 MS_0660     TRUE 0.999 -9.000 0.713 0.023 Y NA
 868669 868670 MS_0660 MS_0661     TRUE 0.999 -7.000 0.095 1.000 Y NA
 868671 868672 MS_0662 MS53_0726     FALSE 0.198 80.000 0.000 NA   NA
 868672 868673 MS53_0726 MS_0663   ychF TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 868676 868677 MS_0666 MS_0667   tufA TRUE 0.492 191.000 0.002 1.000   NA
 868677 868678 MS_0667 MS_0668 tufA   FALSE 0.153 82.000 0.000 1.000   NA
 868678 868679 MS_0668 MS_0669     FALSE 0.099 292.000 0.000 1.000   NA
 868679 868680 MS_0669 MS_0670     TRUE 0.338 37.000 0.000 NA   NA
 868681 868682 MS53_0727 MS53_0728     FALSE 0.129 259.000 0.000 NA   NA
 868682 868683 MS53_0728 MS_0671     FALSE 0.145 149.000 0.000 NA   NA
 868684 868685 MS_0672 MS_0673     TRUE 0.935 -7.000 0.000 NA   NA
 868685 868686 MS_0673 MS_0674   plsX TRUE 0.996 0.000 0.021 1.000   NA
 868686 868687 MS_0674 MS_0675 plsX rncS TRUE 0.990 3.000 0.020 1.000 N NA
 868687 868688 MS_0675 MS_0676 rncS   TRUE 0.984 8.000 0.009 1.000 N NA
 868688 868689 MS_0676 MS_0677   pyrH FALSE 0.165 68.000 0.000 1.000 N NA
 868689 868690 MS_0677 MS_0678 pyrH frr TRUE 0.997 4.000 0.626 1.000 N NA
 868690 868691 MS_0678 MS_0679 frr   FALSE 0.236 46.000 0.000 1.000   NA
 868692 868693 MS_0680 MS_0681   sgaA-1 TRUE 0.736 13.000 0.000 1.000   NA
 868693 868694 MS_0681 MS_0682 sgaA-1   TRUE 0.999 -7.000 0.279 0.009 Y NA
 868694 868695 MS_0682 MS_0683   sgaT-2 TRUE 0.996 8.000 0.431 0.014   NA
 868696 868697 MS_0684 MS_0685 gyrB nusA FALSE 0.126 97.000 0.000 1.000 N NA
 868697 868698 MS_0685 MS_0686 nusA infB TRUE 0.924 252.000 0.342 1.000 N NA
 868698 868699 MS_0686 MS_0687 infB apt TRUE 0.985 0.000 0.003 1.000 N NA
 868699 867972 MS_0687 MS53_ apt dnaA FALSE 0.178 57.000 0.000 1.000 N NA