MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 632359 632360 GBAA0001 GBAA0002 dnaA dnaN-1 TRUE 0.715 179.000 0.328 1.000 Y NA
 632360 632361 GBAA0002 GBAA0003 dnaN-1   FALSE 0.470 128.000 0.103 1.000   NA
 632361 632362 GBAA0003 GBAA0004   recF TRUE 0.736 13.000 0.209 1.000   NA
 632362 632363 GBAA0004 GBAA0005 recF gyrB TRUE 0.967 39.000 0.249 0.005 Y NA
 632363 632364 GBAA0005 GBAA0006 gyrB gyrA TRUE 0.942 89.000 0.306 0.001 Y NA
 632364 632365 GBAA0006 Ba16SA gyrA   FALSE 0.020 269.000 0.000 NA   NA
 632365 5451156 Ba16SA tRNA-Ile-1     FALSE 0.145 151.000 0.000 NA   NA
 5451156 5451157 tRNA-Ile-1 tRNA-Ala-1     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451157 632368 tRNA-Ala-1 Ba23SA     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 632368 632369 Ba23SA Ba5SA     FALSE 0.382 49.000 0.000 NA   NA
 632370 632371 GBAA0008 GBAA0009 guaB dacA TRUE 0.759 114.000 0.304 1.000 N NA
 632371 632372 GBAA0009 GBAA0010 dacA   FALSE 0.460 162.000 0.017 1.000 N NA
 632372 632373 GBAA0010 GBAA0011     TRUE 0.966 19.000 0.488 NA Y NA
 632373 632374 GBAA0011 GBAA0012   serS FALSE 0.058 328.000 0.010 NA N NA
 632374 5451158 GBAA0012 tRNA-Ser-1 serS   FALSE 0.122 157.000 0.000 NA   NA
 5451158 632376 tRNA-Ser-1 GBAA0013     FALSE 0.523 8.000 0.000 NA   NA
 632377 632378 GBAA0014 GBAA0015     TRUE 0.980 3.000 0.255 0.001 Y NA
 632378 632379 GBAA0015 GBAA0016     TRUE 0.703 126.000 0.058 1.000 N NA
 632380 632381 GBAA0017 GBAA0018     FALSE 0.427 -10.000 0.004 NA   NA
 632381 632382 GBAA0018 GBAA0019   dnaX FALSE 0.036 477.000 0.000 1.000 N NA
 632382 632383 GBAA0019 GBAA0020 dnaX   TRUE 0.630 23.000 0.071 NA   NA
 632383 632384 GBAA0020 GBAA0021   recR TRUE 0.823 15.000 0.604 NA   NA
 632384 632385 GBAA0021 GBAA0022 recR   TRUE 0.621 15.000 0.071 NA   NA
 632385 632386 GBAA0022 GBAA0024   bofA FALSE 0.113 215.000 0.417 NA   NA
 632386 632387 GBAA0024 Ba16SB bofA   FALSE 0.025 246.000 0.000 NA   NA
 632387 5451159 Ba16SB tRNA-Ile-2     FALSE 0.145 151.000 0.000 NA   NA
 5451159 5451160 tRNA-Ile-2 tRNA-Ala-2     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451160 632390 tRNA-Ala-2 Ba23SB     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 632390 632391 Ba23SB Ba5SB     FALSE 0.382 49.000 0.000 NA   NA
 632391 632392 Ba5SB GBAA0025     FALSE 0.059 191.000 0.000 NA   NA
 632392 632393 GBAA0025 GBAA0026   cad-1 FALSE 0.573 72.000 0.400 NA   NA
 632393 632394 GBAA0026 GBAA0027 cad-1 tmk TRUE 0.890 2.000 0.009 1.000 N NA
 632394 632395 GBAA0027 GBAA0028 tmk holB TRUE 0.847 36.000 0.009 1.000 N NA
 632395 632396 GBAA0028 GBAA0029 holB   TRUE 0.714 -3.000 0.372 NA   NA
 632396 632397 GBAA0029 GBAA0030     TRUE 0.631 15.000 0.183 NA   NA
 632397 632398 GBAA0030 GBAA0031     FALSE 0.497 121.000 0.193 1.000   NA
 632398 632399 GBAA0031 GBAA0032     FALSE 0.569 -13.000 0.209 1.000   NA
 632399 632400 GBAA0032 GBAA0033     FALSE 0.439 -31.000 0.041 1.000   NA
 632402 632403 GBAA0036 GBAA0037 metS   FALSE 0.396 166.000 0.221 NA N NA
 632403 632404 GBAA0037 GBAA0038     FALSE 0.463 215.000 0.058 NA Y NA
 632404 632405 GBAA0038 GBAA0039   ksgA TRUE 0.867 -3.000 0.093 1.000 N NA
 632405 632406 GBAA0039 GBAA0040 ksgA   FALSE 0.371 111.000 0.022 NA   NA
 632406 632407 GBAA0040 GBAA0041     FALSE 0.047 239.000 0.116 NA   NA
 632407 632408 GBAA0041 GBAA0042   sspF FALSE 0.394 92.000 0.163 NA   NA
 632408 632409 GBAA0042 GBAA0043 sspF ispE FALSE 0.129 197.000 0.024 1.000   NA
 632409 632410 GBAA0043 GBAA0044 ispE purR TRUE 0.809 55.000 0.062 1.000 N NA
 632410 632411 GBAA0044 GBAA0045 purR   FALSE 0.303 -13.000 0.000 NA   NA
 632411 632412 GBAA0045 GBAA0046     FALSE 0.480 17.000 0.000 NA   NA
 632412 632413 GBAA0046 GBAA0047   spoVG FALSE 0.549 153.000 0.377 NA N NA
 632413 632414 GBAA0047 GBAA0048 spoVG gcaD FALSE 0.236 323.000 0.014 1.000 Y NA
 632414 632415 GBAA0048 GBAA0049 gcaD prs TRUE 0.874 19.000 0.069 1.000 N NA
 632415 632416 GBAA0049 GBAA0050 prs spoVC TRUE 0.750 73.000 0.010 1.000 N NA
 632416 632417 GBAA0050 GBAA0051 spoVC   FALSE 0.419 71.000 0.033 NA   NA
 632417 632418 GBAA0051 GBAA0052   mfd FALSE 0.377 106.000 0.035 NA   NA
 632418 632419 GBAA0052 GBAA0053 mfd spoVT TRUE 0.855 136.000 0.026 NA Y NA
 632419 632420 GBAA0053 GBAA0054 spoVT   FALSE 0.053 231.000 0.147 NA   NA
 632420 632421 GBAA0054 GBAA0055     TRUE 0.726 13.000 0.058 1.000   NA
 632421 632422 GBAA0055 GBAA0056     TRUE 0.723 15.000 0.054 1.000   NA
 632422 632423 GBAA0056 GBAA0057     FALSE 0.484 59.000 0.108 NA   NA
 632423 632424 GBAA0057 GBAA0058     TRUE 0.854 -3.000 0.774 NA   NA
 632424 632425 GBAA0058 GBAA0059   divIC-1 TRUE 0.608 -3.000 0.074 NA   NA
 632425 632426 GBAA0059 GBAA0060 divIC-1   TRUE 0.733 88.000 0.134 1.000 N NA
 632426 5451161 GBAA0060 tRNA-Met-1     FALSE 0.110 161.000 0.000 NA   NA
 5451161 5451162 tRNA-Met-1 tRNA-Glu-1     FALSE 0.477 14.000 0.000 NA   NA
 5451162 632429 tRNA-Glu-1 GBAA0061   spoIIE FALSE 0.009 353.000 0.000 NA   NA
 632429 632430 GBAA0061 GBAA0062 spoIIE   FALSE 0.179 234.000 0.041 1.000 N NA
 632430 632431 GBAA0062 GBAA_0063   hpt-1 TRUE 0.922 0.000 0.067 0.047 N NA
 632431 632432 GBAA_0063 GBAA0064 hpt-1 ftsH TRUE 0.740 86.000 0.192 1.000 N NA
 632432 632433 GBAA0064 GBAA0065 ftsH   FALSE 0.196 225.000 0.029 1.000 N NA
 632433 632434 GBAA0065 GBAA0066   hslO TRUE 0.894 7.000 0.060 1.000 N NA
 632434 632435 GBAA0066 GBAA0067 hslO cysK-1 TRUE 0.728 105.000 0.053 1.000 N NA
 632435 632436 GBAA0067 GBAA0068 cysK-1 pabB FALSE 0.486 221.000 0.107 1.000 Y NA
 632436 632437 GBAA0068 GBAA0069 pabB pabA-1 TRUE 0.984 6.000 0.452 0.001 Y NA
 632437 632438 GBAA0069 GBAA0070 pabA-1 pabC TRUE 0.962 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 632438 632439 GBAA0070 GBAA0071 pabC folP TRUE 0.958 -7.000 0.519 1.000 Y NA
 632439 632440 GBAA0071 GBAA0072 folP folB TRUE 0.968 1.000 0.176 1.000 Y NA
 632440 632441 GBAA0072 GBAA0073 folB folK TRUE 0.959 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 632441 632442 GBAA0073 GBAA0074 folK   TRUE 0.649 -48.000 0.027 1.000 N NA
 632442 632443 GBAA0074 GBAA0075     TRUE 0.818 48.000 0.016 1.000 N NA
 632443 632444 GBAA0075 GBAA0076   lysS TRUE 0.768 160.000 0.021 1.000 Y NA
 632444 632445 GBAA0076 Ba16SC lysS   FALSE 0.007 401.000 0.000 NA   NA
 632445 5451163 Ba16SC Ba23SC     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 5451163 632447 Ba23SC Ba5SC     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 632447 632448 Ba5SC GBAA0077   ctsR FALSE 0.043 207.000 0.000 NA   NA
 632448 632449 GBAA0077 GBAA0078 ctsR   FALSE 0.350 174.000 0.681 NA   NA
 632449 632450 GBAA0078 GBAA0079     TRUE 0.920 5.000 0.848 1.000   NA
 632450 632451 GBAA0079 GBAA0080     TRUE 0.908 23.000 0.425 1.000 N NA
 632451 632452 GBAA0080 GBAA0081   radA TRUE 0.927 97.000 0.062 0.012 Y NA
 632452 632453 GBAA0081 GBAA0082 radA   TRUE 0.777 4.000 0.126 1.000   NA
 632453 632454 GBAA0082 GBAA0083     FALSE 0.181 161.000 0.088 NA   NA
 632454 632455 GBAA0083 GBAA0084   ispD TRUE 0.621 17.000 0.108 NA   NA
 632455 632456 GBAA0084 GBAA0085 ispD ispF TRUE 0.923 115.000 0.419 1.000 Y NA
 632456 632457 GBAA0085 GBAA0086 ispF gltX TRUE 0.729 90.000 0.076 1.000 N NA
 632457 632458 GBAA0086 GBAA0088 gltX cysE FALSE 0.045 433.000 0.008 1.000 N NA
 632458 632459 GBAA0088 GBAA0089 cysE cysS TRUE 0.796 -19.000 0.039 0.047 N NA
 632459 632460 GBAA0089 GBAA0090 cysS   TRUE 0.773 3.000 0.129 1.000   NA
 632460 632461 GBAA0090 GBAA0091     TRUE 0.834 -3.000 0.150 0.003   NA
 632461 632462 GBAA0091 GBAA0092     TRUE 0.682 4.000 0.109 NA   NA
 632462 632463 GBAA0092 GBAA0093   sigH FALSE 0.562 68.000 0.361 NA   NA
 632463 632464 GBAA0093 GBAA0094 sigH rpmG-1 FALSE 0.502 132.000 0.282 1.000   NA
 632464 632465 GBAA0094 GBAA0095 rpmG-1   TRUE 0.710 33.000 0.080 1.000   NA
 632465 632466 GBAA0095 GBAA0096   nusG TRUE 0.841 132.000 0.843 1.000 N NA
 632466 632467 GBAA0096 GBAA0097 nusG rplK TRUE 0.613 168.000 0.681 1.000 N NA
 632467 632468 GBAA0097 GBAA0098 rplK rplA TRUE 0.860 178.000 0.838 0.019 Y NA
 632468 632469 GBAA0098 GBAA0099 rplA rplJ FALSE 0.551 233.000 0.302 0.019 Y NA
 632469 632470 GBAA0099 GBAA0100 rplJ rplL TRUE 0.972 68.000 0.884 0.015 Y NA
 632470 632471 GBAA0100 GBAA0101 rplL   TRUE 0.916 75.000 0.050 1.000 Y NA
 632471 632472 GBAA0101 GBAA0102   rpoB FALSE 0.098 293.000 0.008 1.000 N NA
 632472 632473 GBAA0102 GBAA0103 rpoB rpoC TRUE 0.975 65.000 0.851 0.001 Y NA
 632473 632474 GBAA0103 GBAA0104 rpoC   TRUE 0.674 114.000 0.065 NA N NA
 632474 632475 GBAA0104 GBAA0105   rpsL TRUE 0.890 115.000 0.239 NA Y NA
 632475 632476 GBAA0105 GBAA0106 rpsL rpsG TRUE 0.973 30.000 0.224 0.002 Y NA
 632476 632477 GBAA0106 GBAA0107 rpsG fusA TRUE 0.646 208.000 0.579 1.000 Y NA
 632477 632478 GBAA0107 GBAA0108 fusA tuf TRUE 0.944 118.000 0.400 0.001 Y NA
 632478 632479 GBAA0108 GBAA0109 tuf rpsJ FALSE 0.183 399.000 0.318 1.000 Y NA
 632479 632480 GBAA0109 GBAA0110 rpsJ rplC TRUE 0.975 35.000 0.467 0.019 Y NA
 632480 632481 GBAA0110 GBAA0111 rplC rplD TRUE 0.981 26.000 0.544 0.015 Y NA
 632481 632482 GBAA0111 GBAA0112 rplD rplW TRUE 0.978 0.000 0.307 0.015 Y NA
 632482 632483 GBAA0112 GBAA0113 rplW rplB TRUE 0.985 29.000 0.849 0.019 Y NA
 632483 632484 GBAA0113 GBAA0114 rplB rpsS TRUE 0.973 61.000 0.820 0.019 Y NA
 632484 632485 GBAA0114 GBAA0115 rpsS rplV TRUE 0.984 18.000 0.769 0.019 Y NA
 632485 632486 GBAA0115 GBAA0116 rplV rpsC TRUE 0.987 4.000 0.719 0.019 Y NA
 632486 632487 GBAA0116 GBAA0117 rpsC rplP TRUE 0.988 2.000 0.828 0.019 Y NA
 632487 632488 GBAA0117 GBAA0118 rplP rpmC TRUE 0.973 -10.000 0.802 0.015 Y NA
 632488 632489 GBAA0118 GBAA0119 rpmC rpsQ TRUE 0.985 21.000 0.828 0.015 Y NA
 632489 632490 GBAA0119 GBAA0120 rpsQ rplN TRUE 0.979 44.000 0.791 0.019 Y NA
 632490 632491 GBAA0120 GBAA0121 rplN rplX TRUE 0.964 39.000 0.071 0.019 Y NA
 632491 632492 GBAA0121 GBAA0122 rplX rplE TRUE 0.972 27.000 0.057 0.015 Y NA
 632492 632493 GBAA0122 GBAA0123 rplE rpsN TRUE 0.976 34.000 0.496 0.015 Y NA
 632493 632494 GBAA0123 GBAA0124 rpsN rpsH TRUE 0.978 30.000 0.473 0.015 Y NA
 632494 632495 GBAA0124 GBAA0125 rpsH rplF TRUE 0.984 33.000 0.808 0.015 Y NA
 632495 632496 GBAA0125 GBAA0126 rplF rplR TRUE 0.984 32.000 0.815 0.015 Y NA
 632496 632497 GBAA0126 GBAA0127 rplR rpsE TRUE 0.985 22.000 0.814 0.019 Y NA
 632497 632498 GBAA0127 GBAA0128 rpsE rpmD TRUE 0.984 14.000 0.789 0.019 Y NA
 632498 632499 GBAA0128 GBAA0129 rpmD rplO TRUE 0.981 34.000 0.653 0.002 Y NA
 632499 632500 GBAA0129 GBAA0130 rplO secY-1 TRUE 0.945 0.000 0.730 1.000 N NA
 632500 632501 GBAA0130 GBAA0131 secY-1 adk TRUE 0.812 57.000 0.241 1.000 N NA
 632501 632502 GBAA0131 GBAA0132 adk maP-1 TRUE 0.902 0.000 0.290 1.000 N NA
 632502 632503 GBAA0132 GBAA0133 maP-1 infA TRUE 0.924 69.000 0.160 1.000 Y NA
 632503 632504 GBAA0133 GBAA0134 infA rpmJ TRUE 0.719 36.000 0.257 1.000   NA
 632504 632505 GBAA0134 GBAA0135 rpmJ rpsM TRUE 0.839 22.000 0.194 0.015   NA
 632505 632506 GBAA0135 GBAA0136 rpsM rpsK TRUE 0.985 25.000 0.810 0.015 Y NA
 632506 632507 GBAA0136 GBAA0137 rpsK rpoA FALSE 0.410 181.000 0.308 1.000 N NA
 632507 632508 GBAA0137 GBAA0138 rpoA rplQ TRUE 0.936 36.000 0.873 1.000 N NA
 632508 632509 GBAA0138 GBAA0139 rplQ   TRUE 0.729 104.000 0.074 1.000 N NA
 632509 632510 GBAA0139 GBAA0140     TRUE 0.954 -24.000 0.713 0.030 Y NA
 632510 632511 GBAA0140 GBAA0141     TRUE 0.925 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 632511 10141458 GBAA0141 GBAA_0142   truA-1 TRUE 0.875 15.000 0.170 1.000 N NA
 10141458 632512 GBAA_0142 GBAA0143 truA-1 rplM TRUE 0.809 153.000 0.052 1.000 Y NA
 632512 632513 GBAA0143 GBAA0144 rplM rpsI TRUE 0.982 22.000 0.601 0.015 Y NA
 632513 632514 GBAA0144 GBAA0145 rpsI   FALSE 0.156 163.000 0.021 NA   NA
 632514 632515 GBAA0145 GBAA0146   cwlD FALSE 0.471 67.000 0.211 NA   NA
 632515 632516 GBAA0146 GBAA0147 cwlD   TRUE 0.623 145.000 0.211 1.000 N NA
 632520 632521 GBAA0151 GBAA0152     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 632521 632522 GBAA0152 Ba16SD     FALSE 0.398 -4.000 0.000 NA   NA
 632522 5451164 Ba16SD Ba23SD     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 5451164 632524 Ba23SD Ba5SD     FALSE 0.268 87.000 0.000 NA   NA
 632524 5451165 Ba5SD tRNA-Asn-1     FALSE 0.512 10.000 0.000 NA   NA
 5451165 5451166 tRNA-Asn-1 tRNA-Thr-1     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 5451166 5451167 tRNA-Thr-1 tRNA-Glu-2     FALSE 0.487 25.000 0.000 NA   NA
 5451167 5451168 tRNA-Glu-2 tRNA-Val-1     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451168 5451169 tRNA-Val-1 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 5451169 5451170 tRNA-Tyr-1 tRNA-Gln-1     FALSE 0.323 66.000 0.000 NA   NA
 5451170 5451171 tRNA-Gln-1 tRNA-Lys-1     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451171 5451172 tRNA-Lys-1 tRNA-Gly-1     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451172 5451173 tRNA-Gly-1 tRNA-Ala-3     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 5451173 10141459 tRNA-Ala-3 GBAA_0153     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 10141459 632534 GBAA_0153 GBAA0154   rocF FALSE 0.041 210.000 0.000 NA   NA
 632534 632535 GBAA0154 GBAA0155 rocF   FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 632535 632536 GBAA0155 GBAA0156     TRUE 0.716 -7.000 0.502 NA   NA
 632536 632537 GBAA0156 GBAA0157   glmM FALSE 0.519 -7.000 0.150 NA   NA
 632537 632538 GBAA0157 GBAA0158 glmM   FALSE 0.016 288.000 0.000 NA   NA
 632538 632539 GBAA0158 GBAA0159   glmS TRUE 0.584 13.000 0.008 NA   NA
 632539 632540 GBAA0159 GBAA0160 glmS   FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 632540 632541 GBAA0160 GBAA0161   gntR FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 632541 10141460 GBAA0161 GBAA_0162 gntR   FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 10141460 632542 GBAA_0162 GBAA0163   gntP-1 FALSE 0.249 120.000 0.000 NA   NA
 632542 632543 GBAA0163 GBAA0164 gntP-1 yqjI FALSE 0.326 265.000 0.000 1.000 Y NA
 632543 632544 GBAA0164 GBAA0165 yqjI   FALSE 0.070 343.000 0.047 1.000 N NA
 632544 632545 GBAA0165 GBAA0166     FALSE 0.373 119.000 0.100 NA   NA
 632546 632547 GBAA0167 GBAA0168     FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 632547 632548 GBAA0168 GBAA0169     TRUE 0.901 0.000 0.750 1.000   NA
 632548 632550 GBAA0169 GBAA_0171     FALSE 0.195 141.000 0.000 NA   NA
 632550 632549 GBAA_0171 GBAA0170     FALSE 0.175 -962.000 0.000 NA   NA
 632551 632552 GBAA0173 GBAA0174     TRUE 0.944 -25.000 0.846 1.000 Y NA
 632552 632553 GBAA0174 GBAA0175     TRUE 0.977 13.000 0.880 NA Y NA
 632553 632554 GBAA0175 GBAA0176     FALSE 0.073 280.000 0.000 NA N NA
 632555 632556 GBAA0177 GBAA0178     FALSE 0.340 133.000 0.137 NA   NA
 632556 632557 GBAA0178 GBAA0179     TRUE 0.710 -3.000 0.052 1.000   NA
 632557 632558 GBAA0179 GBAA0180     FALSE 0.390 79.000 0.026 NA   NA
 632558 632559 GBAA0180 GBAA0181     FALSE 0.353 128.000 0.104 NA   NA
 632559 632560 GBAA0181 GBAA0183     FALSE 0.024 251.000 0.000 NA   NA
 632562 632563 GBAA0185 GBAA0186     TRUE 0.986 17.000 0.909 0.049 Y NA
 632563 632564 GBAA0186 GBAA0187     TRUE 0.876 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 632564 632565 GBAA0187 GBAA0188     TRUE 0.971 -3.000 0.233 0.004 Y NA
 632565 632566 GBAA0188 GBAA0189     TRUE 0.964 14.000 0.292 1.000 Y NA
 632568 632569 GBAA0191 GBAA0192     TRUE 0.620 19.000 0.105 NA   NA
 632569 632570 GBAA0192 GBAA_0193     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632571 632572 GBAA0194 GBAA0195     FALSE 0.214 388.000 0.000 0.001 Y NA
 632572 632573 GBAA0195 GBAA0196     FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000   NA
 632573 632574 GBAA0196 GBAA_0197     TRUE 0.694 2.000 0.000 1.000   NA
 632575 632576 GBAA0198 GBAA0199     TRUE 0.577 -7.000 0.286 NA   NA
 632577 632578 GBAA0200 GBAA0202   modB FALSE 0.126 287.000 0.000 0.084 N NA
 632581 632582 GBAA0206 GBAA0207     TRUE 0.838 13.000 0.667 NA   NA
 632582 632583 GBAA0207 GBAA0208     FALSE 0.302 142.000 0.167 NA   NA
 632584 632585 GBAA0210 GBAA0211     TRUE 0.811 22.000 0.556 NA   NA
 632587 632588 GBAA0213 GBAA0216     FALSE 0.036 475.000 0.000 1.000 N NA
 632588 632589 GBAA0216 GBAA0217     FALSE 0.548 149.000 0.778 NA   NA
 632589 632590 GBAA0217 GBAA0218     TRUE 0.697 119.000 0.778 NA   NA
 632590 632591 GBAA0218 GBAA0219     TRUE 0.598 138.000 0.667 NA   NA
 632591 632592 GBAA0219 GBAA0221     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 632592 632593 GBAA0221 GBAA0222     FALSE 0.456 59.000 0.019 NA   NA
 632597 632598 GBAA0226 GBAA0228     FALSE 0.005 643.000 0.000 NA   NA
 632600 632601 GBAA0230 GBAA0231     FALSE 0.015 298.000 0.000 NA   NA
 632601 632602 GBAA0231 GBAA0232     TRUE 0.944 109.000 0.444 0.049 Y NA
 632602 632603 GBAA0232 GBAA0233     TRUE 0.985 13.000 0.850 0.049 Y NA
 632603 632604 GBAA0233 GBAA0234     TRUE 0.981 11.000 0.750 1.000 Y NA
 632604 632605 GBAA0234 GBAA0235     TRUE 0.979 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 632606 632607 GBAA0238 GBAA0239     FALSE 0.405 43.000 0.000 NA   NA
 632607 632608 GBAA0239 GBAA0240   hppD FALSE 0.013 311.000 0.000 NA   NA
 632608 632609 GBAA0240 GBAA0241 hppD   TRUE 0.778 67.000 0.118 1.000 N NA
 632609 632610 GBAA0241 GBAA0242     TRUE 0.877 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 632610 632611 GBAA0242 GBAA0243     TRUE 0.588 13.000 0.013 NA   NA
 632611 632612 GBAA0243 GBAA0244     FALSE 0.268 111.000 0.000 NA   NA
 632612 10141464 GBAA0244 GBAA_0245     FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 10141464 632613 GBAA_0245 GBAA0246   murF FALSE 0.338 61.000 0.000 NA   NA
 632613 632614 GBAA0246 GBAA0247 murF   FALSE 0.089 305.000 0.004 1.000 N NA
 632614 632615 GBAA0247 GBAA0248     TRUE 0.898 97.000 0.013 1.000 Y NA
 632617 632618 GBAA0250 GBAA0251 acpS   TRUE 0.660 94.000 0.038 NA N NA
 632618 632619 GBAA0251 GBAA0252   dal-1 TRUE 0.883 119.000 0.194 NA Y NA
 632619 632620 GBAA0252 GBAA0253 dal-1   FALSE 0.071 310.000 0.108 NA N NA
 632620 632621 GBAA0253 GBAA0254     TRUE 0.884 5.000 0.260 NA N NA
 632621 632622 GBAA0254 GBAA0255     TRUE 0.771 68.000 0.045 1.000 N NA
 632624 5451174 GBAA0257 tRNA-Asn-2     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 5451174 5451175 tRNA-Asn-2 tRNA-Ser-2     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 5451175 5451176 tRNA-Ser-2 tRNA-Glu-3     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451176 5451177 tRNA-Glu-3 tRNA-Val-2     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 5451177 5451178 tRNA-Val-2 tRNA-Asp-1     FALSE 0.388 47.000 0.000 NA   NA
 5451178 5451179 tRNA-Asp-1 tRNA-Gln-2     FALSE 0.264 89.000 0.000 NA   NA
 5451179 5451180 tRNA-Gln-2 tRNA-Lys-2     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451180 5451181 tRNA-Lys-2 tRNA-Leu-1     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 5451181 5451182 tRNA-Leu-1 tRNA-Arg-1     FALSE 0.256 96.000 0.000 NA   NA
 5451182 5451183 tRNA-Arg-1 tRNA-Pro-1     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 5451183 5451184 tRNA-Pro-1 tRNA-Gly-2     FALSE 0.535 2.000 0.000 NA   NA
 5451184 632636 tRNA-Gly-2 Ba16SE     FALSE 0.262 104.000 0.000 NA   NA
 632636 632637 Ba16SE Ba23SE     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 632637 632638 Ba23SE Ba5SE     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 632638 5451185 Ba5SE tRNA-Met-2     FALSE 0.480 13.000 0.000 NA   NA
 5451185 5451186 tRNA-Met-2 tRNA-Asp-2     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 5451186 632641 tRNA-Asp-2 GBAA0258     FALSE 0.083 175.000 0.000 NA   NA
 632641 632642 GBAA0258 GBAA0259     FALSE 0.412 -19.000 0.217 NA   NA
 632642 632643 GBAA0259 GBAA0260   rimI TRUE 0.727 20.000 0.127 1.000   NA
 632643 632644 GBAA0260 GBAA0261 rimI gcP TRUE 0.756 0.000 0.090 1.000   NA
 632647 632648 GBAA0264 GBAA0265     TRUE 0.608 -3.000 0.080 NA   NA
 632649 632650 GBAA0266 GBAA0267 groES groEL TRUE 0.979 39.000 0.674 0.006 Y NA
 632650 632651 GBAA0267 GBAA0268 groEL guaA FALSE 0.041 408.000 0.000 1.000 N NA
 632651 632652 GBAA0268 GBAA0270 guaA   FALSE 0.015 385.000 0.000 1.000   NA
 632652 632653 GBAA0270 GBAA0271     FALSE 0.384 145.000 0.146 1.000   NA
 632653 632654 GBAA0271 GBAA0272     TRUE 0.965 -16.000 0.800 0.021 Y NA
 632654 632655 GBAA0272 Ba16SF     FALSE 0.012 323.000 0.000 NA   NA
 632655 632656 Ba16SF Ba23SF     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 632656 632657 Ba23SF Ba5SF     FALSE 0.379 50.000 0.000 NA   NA
 632658 632659 GBAA0273 GBAA0274     FALSE 0.029 233.000 0.000 NA   NA
 632659 632660 GBAA0274 GBAA0275     TRUE 0.706 27.000 0.002 1.000   NA
 632660 632661 GBAA0275 GBAA0276     FALSE 0.014 304.000 0.000 NA   NA
 632662 632664 GBAA0278 GBAA_0280     FALSE 0.473 68.000 0.000 1.000   NA
 632664 632663 GBAA_0280 GBAA0279     FALSE 0.184 -434.000 0.000 NA   NA
 632665 632666 GBAA0281 Ba16SG     FALSE 0.398 -4.000 0.000 NA   NA
 632666 632667 Ba16SG Ba23SG     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 632667 632668 Ba23SG Ba5SG     FALSE 0.375 51.000 0.000 NA   NA
 632669 632670 GBAA0283 GBAA0284 bacA-1   TRUE 0.647 18.000 0.240 NA   NA
 632670 632671 GBAA0284 GBAA0285     FALSE 0.549 -16.000 0.400 NA   NA
 632671 632672 GBAA0285 GBAA0286     TRUE 0.851 69.000 0.556 1.000 N NA
 632672 632673 GBAA0286 GBAA0287     TRUE 0.954 59.000 0.538 1.000 Y NA
 632674 632675 Ba16SH Ba23SH     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 632675 632676 Ba23SH Ba5SH     FALSE 0.375 51.000 0.000 NA   NA
 632676 632677 Ba5SH GBAA0288   purE FALSE 0.005 699.000 0.000 NA   NA
 632677 632678 GBAA0288 GBAA0289 purE purK TRUE 0.972 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 632678 632679 GBAA0289 GBAA0290 purK purB TRUE 0.958 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 632679 632680 GBAA0290 GBAA0291 purB purC TRUE 0.906 89.000 0.072 1.000 Y NA
 632680 632681 GBAA0291 GBAA0292 purC   TRUE 0.955 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 632681 632682 GBAA0292 GBAA0293   purQ TRUE 0.983 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 632682 632683 GBAA0293 GBAA0294 purQ purL TRUE 0.948 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 632683 632684 GBAA0294 GBAA0295 purL purF TRUE 0.918 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 632684 632685 GBAA0295 GBAA0296 purF purM TRUE 0.910 107.000 0.248 1.000 Y NA
 632685 632686 GBAA0296 GBAA0297 purM purN TRUE 0.972 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 632686 632687 GBAA0297 GBAA0298 purN purH TRUE 0.963 25.000 0.225 1.000 Y NA
 632687 632688 GBAA0298 GBAA0299 purH purD TRUE 0.900 122.000 0.238 1.000 Y NA
 632689 632690 GBAA0300 GBAA0301     TRUE 0.805 17.000 0.549 NA   NA
 632690 632691 GBAA0301 GBAA0302     FALSE 0.041 210.000 0.000 NA   NA
 632692 632693 GBAA0304 GBAA0305   pcrA TRUE 0.615 13.000 0.049 NA   NA
 632693 632694 GBAA0305 GBAA0306 pcrA ligA TRUE 0.972 16.000 0.103 0.012 Y NA
 632694 632695 GBAA0306 GBAA0307 ligA   TRUE 0.585 17.000 0.009 NA   NA
 632695 632696 GBAA0307 GBAA0308     TRUE 0.710 96.000 0.800 NA   NA
 632696 632697 GBAA0308 GBAA0309     FALSE 0.319 154.000 0.205 1.000   NA
 632697 632698 GBAA0309 GBAA0310     FALSE 0.107 186.000 0.051 NA   NA
 632700 632701 GBAA0312 GBAA0313     TRUE 0.932 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 632701 632702 GBAA0313 GBAA0314     TRUE 0.956 22.000 0.233 NA Y NA
 632703 632704 GBAA0315 GBAA0316     TRUE 0.776 59.000 0.750 NA   NA
 632704 10141466 GBAA0316 GBAA_0317     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 10141466 632705 GBAA_0317 GBAA0318     FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 10141467 632706 GBAA_0319 GBAA0320   gatC FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 632706 632707 GBAA0320 GBAA0321 gatC gatA TRUE 0.983 16.000 0.643 0.001 Y NA
 632707 632708 GBAA0321 GBAA0322 gatA gatB TRUE 0.980 15.000 0.492 0.001 Y NA
 632708 632709 GBAA0322 GBAA0323 gatB   FALSE 0.043 471.000 0.034 1.000 N NA
 632709 632710 GBAA0323 GBAA0324     FALSE 0.405 140.000 0.028 1.000   NA
 632710 632711 GBAA0324 GBAA0325   gabT FALSE 0.296 155.000 0.045 1.000   NA
 632711 632712 GBAA0325 GBAA0326 gabT   TRUE 0.787 113.000 0.409 1.000 N NA
 632712 632713 GBAA0326 GBAA0327   gabD TRUE 0.886 -7.000 0.583 1.000 N NA
 632713 632714 GBAA0327 GBAA0328 gabD   TRUE 0.828 48.000 0.157 1.000 N NA
 632715 632716 GBAA0329 GBAA0330 ampS   TRUE 0.736 117.000 0.258 1.000 N NA
 632716 632717 GBAA0330 GBAA0331     TRUE 0.871 152.000 0.300 0.014 Y NA
 632717 632718 GBAA0331 GBAA0332     FALSE 0.143 240.000 0.000 1.000 N NA
 632719 632720 GBAA0333 GBAA0334     TRUE 0.897 97.000 0.008 1.000 Y NA
 632720 632721 GBAA0334 GBAA0335     FALSE 0.018 276.000 0.000 NA   NA
 632721 632722 GBAA0335 GBAA0336     FALSE 0.017 279.000 0.000 NA   NA
 632722 632723 GBAA0336 GBAA0337     FALSE 0.370 95.000 0.043 NA   NA
 632724 632725 GBAA0338 GBAA0339     TRUE 0.631 15.000 0.189 NA   NA
 632728 632729 GBAA0342 GBAA0343 amhX   FALSE 0.261 152.000 0.263 NA   NA
 632730 632731 GBAA0344 GBAA0345 ahpF ahpC TRUE 0.973 15.000 0.551 1.000 Y NA
 632732 632733 GBAA0346 GBAA0347     TRUE 0.720 13.000 0.042 1.000   NA
 632733 632734 GBAA0347 GBAA0348   fucA TRUE 0.801 55.000 0.017 1.000 N NA
 632735 632736 GBAA0349 GBAA0350     TRUE 0.979 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 632736 632737 GBAA0350 GBAA0351     TRUE 0.939 73.000 0.487 1.000 Y NA
 632740 10141468 GBAA0354 GBAA_0355     FALSE 0.028 236.000 0.000 NA   NA
 10141468 632741 GBAA_0355 GBAA0356     FALSE 0.332 63.000 0.000 NA   NA
 632741 632742 GBAA0356 GBAA0357     FALSE 0.514 -7.000 0.133 NA   NA
 632742 632743 GBAA0357 GBAA0358     FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 632743 10141469 GBAA0358 GBAA_0359     FALSE 0.019 273.000 0.000 NA   NA
 10141469 632744 GBAA_0359 GBAA0360     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 632746 632747 GBAA0362 GBAA0363     FALSE 0.367 123.000 0.068 NA   NA
 632748 632749 GBAA0364 GBAA0365     TRUE 0.621 144.000 0.053 1.000 N NA
 10141470 10141471 GBAA_5743 GBAA_0367     TRUE 0.922 -22.000 0.130 0.060 Y NA
 10141471 632751 GBAA_0367 GBAA0368     TRUE 0.911 122.000 0.348 1.000 Y NA
 632751 632752 GBAA0368 GBAA0369     FALSE 0.430 170.000 0.133 1.000 N NA
 632753 632754 GBAA0370 GBAA0371     FALSE 0.148 237.000 0.000 1.000 N NA
 632754 632755 GBAA0371 GBAA0372     TRUE 0.718 173.000 0.167 1.000 Y NA
 632755 632756 GBAA0372 GBAA0373     TRUE 0.860 5.000 0.610 NA   NA
 632756 632757 GBAA0373 GBAA0374     FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 632759 632760 GBAA0376 GBAA0377 thiM thiE TRUE 0.972 17.000 0.061 0.004 Y NA
 632762 632763 GBAA0379 GBAA0380     FALSE 0.021 264.000 0.000 NA   NA
 632763 632764 GBAA0380 GBAA0381     FALSE 0.459 -28.000 0.364 NA   NA
 632764 632765 GBAA0381 GBAA0382     TRUE 0.968 -3.000 0.584 NA Y NA
 632765 632766 GBAA0382 GBAA0383     TRUE 0.966 -3.000 0.554 NA Y NA
 632766 632767 GBAA0383 GBAA0384     FALSE 0.059 292.000 0.000 0.029   NA
 632769 632770 GBAA0386 GBAA0387     TRUE 0.646 11.000 0.065 NA   NA
 632770 632771 GBAA0387 GBAA0388     TRUE 0.605 14.000 0.037 NA   NA
 632771 632772 GBAA0388 GBAA0389     FALSE 0.017 283.000 0.000 NA   NA
 632772 632773 GBAA0389 GBAA0390     TRUE 0.789 67.000 0.714 1.000   NA
 632773 632774 GBAA0390 GBAA0391     TRUE 0.584 114.000 0.333 1.000   NA
 632774 632775 GBAA0391 GBAA0392     TRUE 0.626 13.000 0.143 NA   NA
 632776 632777 GBAA0393 GBAA0394     FALSE 0.516 109.000 0.068 1.000   NA
 632778 632779 GBAA0395 GBAA0396   proS-1 FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 632781 632782 GBAA0398 GBAA0399     TRUE 0.696 129.000 0.145 1.000 N NA
 632782 632783 GBAA0399 GBAA0400     TRUE 0.977 24.000 0.364 0.003 Y NA
 632783 632784 GBAA0400 GBAA0401     TRUE 0.956 81.000 0.571 0.003 Y NA
 632784 632785 GBAA0401 GBAA0402     TRUE 0.788 74.000 0.308 1.000 N NA
 632785 632786 GBAA0402 GBAA0403     FALSE 0.435 110.000 0.256 NA   NA
 632786 632787 GBAA0403 GBAA0404     TRUE 0.853 19.000 0.727 NA   NA
 632788 632789 GBAA0405 GBAA0406     FALSE 0.099 192.000 0.125 NA   NA
 632790 632791 GBAA0407 GBAA0408     FALSE 0.477 54.000 0.019 NA   NA
 632791 632792 GBAA0408 GBAA0409     TRUE 0.620 39.000 0.273 NA   NA
 632794 632795 GBAA0411 GBAA0412     FALSE 0.353 123.000 0.039 NA   NA
 632795 10141472 GBAA0412 GBAA_0413   sipS-1 FALSE 0.030 230.000 0.000 NA   NA
 632798 632799 GBAA0416 GBAA0417     FALSE 0.394 107.000 0.129 NA   NA
 632799 632800 GBAA0417 GBAA0418     FALSE 0.232 151.000 0.111 NA   NA
 632801 632802 GBAA0419 GBAA0420 cax   FALSE 0.420 82.000 0.212 NA   NA
 632804 632805 GBAA0422 GBAA0423   fumA FALSE 0.075 207.000 0.093 NA   NA
 632805 632806 GBAA0423 GBAA0424 fumA   TRUE 0.706 127.000 0.185 1.000 N NA
 632806 10141473 GBAA0424 GBAA_0425     FALSE 0.386 48.000 0.000 NA   NA
 10141473 632807 GBAA_0425 GBAA0426     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 632808 632809 GBAA0427 GBAA0428     FALSE 0.027 716.000 0.000 1.000 N NA
 632810 632811 GBAA0429 GBAA0430     TRUE 0.829 -3.000 0.667 NA   NA
 632811 632812 GBAA0430 GBAA0431     FALSE 0.094 168.000 0.000 NA   NA
 632814 632815 GBAA0433 GBAA0434     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 632815 632816 GBAA0434 GBAA0435     FALSE 0.394 45.000 0.000 NA   NA
 632816 632817 GBAA0435 GBAA0436     FALSE 0.234 -27.000 0.000 NA   NA
 632817 632818 GBAA0436 GBAA0437     FALSE 0.475 30.000 0.000 NA   NA
 632818 632819 GBAA0437 GBAA0438     FALSE 0.371 126.000 0.182 NA   NA
 632819 632820 GBAA0438 GBAA0439     FALSE 0.345 -31.000 0.182 NA   NA
 632820 632821 GBAA0439 GBAA0440     FALSE 0.479 16.000 0.000 NA   NA
 632821 632822 GBAA0440 GBAA0441     FALSE 0.487 25.000 0.000 NA   NA
 632822 10141474 GBAA0441 GBAA_5740     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 10141474 632823 GBAA_5740 GBAA0442     FALSE 0.492 12.000 0.000 NA   NA
 632823 632824 GBAA0442 GBAA0443     FALSE 0.479 16.000 0.000 NA   NA
 632824 632825 GBAA0443 GBAA0444     FALSE 0.430 38.000 0.000 NA   NA
 632825 632826 GBAA0444 GBAA0445     FALSE 0.405 43.000 0.000 NA   NA
 632826 632827 GBAA0445 GBAA0446     FALSE 0.050 200.000 0.000 NA   NA
 632827 632828 GBAA0446 GBAA0447     FALSE 0.430 38.000 0.000 NA   NA
 632828 632829 GBAA0447 GBAA0448     FALSE 0.480 13.000 0.000 NA   NA
 632829 632830 GBAA0448 GBAA0449     FALSE 0.486 26.000 0.000 NA   NA
 632830 632831 GBAA0449 GBAA0450     FALSE 0.399 44.000 0.000 NA   NA
 632831 632832 GBAA0450 GBAA0452     FALSE 0.006 487.000 0.000 NA   NA
 632832 632833 GBAA0452 GBAA0453     FALSE 0.464 32.000 0.000 NA   NA
 632833 632834 GBAA0453 GBAA0454     FALSE 0.266 106.000 0.000 NA   NA
 632834 632835 GBAA0454 GBAA0455     FALSE 0.059 191.000 0.000 NA   NA
 632835 632836 GBAA0455 GBAA0456     FALSE 0.258 116.000 0.000 NA   NA
 632836 632837 GBAA0456 GBAA0457     FALSE 0.482 28.000 0.000 NA   NA
 632837 10141475 GBAA0457 GBAA_0458     FALSE 0.517 0.000 0.000 NA   NA
 10141475 632838 GBAA_0458 GBAA0459     FALSE 0.223 133.000 0.000 NA   NA
 632840 632841 GBAA0461 GBAA0462 54   FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632841 632842 GBAA0462 GBAA0463     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632842 632843 GBAA0463 GBAA0464     FALSE 0.258 101.000 0.000 NA   NA
 632843 632844 GBAA0464 GBAA0465     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632844 10141476 GBAA0465 GBAA_0466     FALSE 0.019 271.000 0.000 NA   NA
 10141476 632845 GBAA_0466 GBAA0467     FALSE 0.201 -52.000 0.000 NA   NA
 632845 632846 GBAA0467 GBAA0468     TRUE 0.613 19.000 0.048 NA   NA
 632846 632847 GBAA0468 GBAA0469     FALSE 0.479 16.000 0.000 NA   NA
 632847 632848 GBAA0469 GBAA0470     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632848 632849 GBAA0470 GBAA0471     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632849 632850 GBAA0471 GBAA0472     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 632850 632851 GBAA0472 GBAA0473     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632851 632852 GBAA0473 GBAA0474     FALSE 0.528 1.000 0.000 NA   NA
 632852 632853 GBAA0474 GBAA0475     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 632853 632854 GBAA0475 GBAA0476     FALSE 0.268 111.000 0.000 NA   NA
 632854 632855 GBAA0476 GBAA0477     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 632855 632856 GBAA0477 GBAA0478     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632856 632857 GBAA0478 GBAA0479     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 632857 632858 GBAA0479 GBAA0480     FALSE 0.323 66.000 0.000 NA   NA
 632858 632859 GBAA0480 GBAA0481     FALSE 0.310 69.000 0.000 NA   NA
 632859 632860 GBAA0481 GBAA0482     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 632860 632861 GBAA0482 GBAA0483     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 632861 632862 GBAA0483 GBAA0484     FALSE 0.297 73.000 0.000 NA   NA
 632862 632863 GBAA0484 GBAA0485     FALSE 0.517 0.000 0.000 NA   NA
 632865 632866 GBAA0488 GBAA0489   rocR-1 FALSE 0.480 84.000 0.304 NA   NA
 632867 632868 GBAA0490 GBAA0492     TRUE 0.655 105.000 0.636 NA   NA
 632868 632869 GBAA0492 GBAA0493     TRUE 0.907 96.000 0.259 1.000 Y NA
 632871 632872 GBAA0495 GBAA0496     FALSE 0.565 115.000 0.462 NA   NA
 632873 632874 GBAA0497 GBAA0498     FALSE 0.424 39.000 0.000 NA   NA
 632874 632875 GBAA0498 GBAA0499   glsA-1 FALSE 0.290 -15.000 0.000 NA   NA
 632876 632877 GBAA0500 GBAA0501     FALSE 0.389 142.000 0.032 1.000   NA
 632877 632878 GBAA0501 GBAA0502     FALSE 0.124 255.000 0.000 1.000 N NA
 632878 632879 GBAA0502 GBAA0503     FALSE 0.317 154.000 0.385 NA   NA
 632879 632880 GBAA0503 GBAA0504     TRUE 0.845 17.000 0.692 NA   NA
 632880 632881 GBAA0504 GBAA0505     TRUE 0.638 -25.000 0.667 NA   NA
 632881 10141478 GBAA0505 GBAA_0506     FALSE 0.332 -10.000 0.000 NA   NA
 10141478 632882 GBAA_0506 GBAA0507     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 632882 632883 GBAA0507 GBAA0508     FALSE 0.506 -7.000 0.050 NA   NA
 632883 632884 GBAA0508 GBAA0509   pfl FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 632884 632885 GBAA0509 GBAA0510 pfl pflA TRUE 0.770 70.000 0.135 1.000 N NA
 632885 632886 GBAA0510 GBAA0511 pflA   FALSE 0.040 413.000 0.000 1.000 N NA
 632887 632888 GBAA0512 GBAA0513     TRUE 0.598 111.000 0.500 NA   NA
 632888 632889 GBAA0513 GBAA0514     FALSE 0.108 242.000 0.000 NA N NA
 632889 632890 GBAA0514 GBAA0515     FALSE 0.422 141.000 0.200 1.000   NA
 632891 632892 GBAA0516 GBAA0517     TRUE 0.612 16.000 0.045 NA   NA
 632893 632894 GBAA0518 GBAA0519     TRUE 0.717 44.000 0.480 NA   NA
 632899 632900 GBAA0524 GBAA0526     FALSE 0.155 189.000 0.364 NA   NA
 632900 632901 GBAA0526 GBAA0527     FALSE 0.051 233.000 0.058 NA   NA
 632901 632902 GBAA0527 GBAA0528     TRUE 0.765 55.000 0.077 NA N NA
 632903 632904 GBAA0529 GBAA0530     FALSE 0.038 261.000 0.066 NA   NA
 632904 632905 GBAA0530 GBAA0531   hemL-1 FALSE 0.277 200.000 0.036 1.000 N NA
 632906 632907 GBAA0532 GBAA0533     TRUE 0.694 -7.000 0.488 NA   NA
 632907 632908 GBAA0533 GBAA0534     TRUE 0.830 5.000 0.500 NA   NA
 632908 632909 GBAA0534 GBAA0535     FALSE 0.442 73.000 0.188 NA   NA
 632909 632910 GBAA0535 GBAA0536   bcP FALSE 0.506 45.000 0.015 NA   NA
 632910 632911 GBAA0536 GBAA0537 bcP   FALSE 0.099 292.000 0.005 1.000 N NA
 632913 632914 GBAA0539 Ba16SI     FALSE 0.398 -4.000 0.000 NA   NA
 632914 632915 Ba16SI Ba23SI     FALSE 0.087 172.000 0.000 NA   NA
 632915 632916 Ba23SI Ba5SI     FALSE 0.258 101.000 0.000 NA   NA
 632916 5451187 Ba5SI tRNA-Asn-3     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451187 5451188 tRNA-Asn-3 tRNA-Ser-3     FALSE 0.541 3.000 0.000 NA   NA
 5451188 5451189 tRNA-Ser-3 tRNA-Glu-4     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 5451189 5451190 tRNA-Glu-4 tRNA-Val-3     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451190 5451191 tRNA-Val-3 tRNA-Met-3     FALSE 0.487 25.000 0.000 NA   NA
 5451191 5451192 tRNA-Met-3 tRNA-Asp-3     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 5451192 5451193 tRNA-Asp-3 tRNA-Phe-1     FALSE 0.512 10.000 0.000 NA   NA
 5451193 5451194 tRNA-Phe-1 tRNA-Thr-2     FALSE 0.478 19.000 0.000 NA   NA
 5451194 5451195 tRNA-Thr-2 tRNA-Tyr-2     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 5451195 5451196 tRNA-Tyr-2 tRNA-Trp-1     FALSE 0.523 8.000 0.000 NA   NA
 5451196 5451197 tRNA-Trp-1 tRNA-His-1     FALSE 0.479 20.000 0.000 NA   NA
 5451197 5451198 tRNA-His-1 tRNA-Gln-3     FALSE 0.328 64.000 0.000 NA   NA
 5451198 5451199 tRNA-Gln-3 tRNA-Gly-3     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451199 5451200 tRNA-Gly-3 tRNA-Cys-1     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 5451200 5451201 tRNA-Cys-1 tRNA-Leu-2     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 632933 632934 GBAA0541 GBAA0542     FALSE 0.339 118.000 0.008 NA   NA
 632934 632935 GBAA0542 GBAA0543     FALSE 0.012 487.000 0.000 1.000   NA
 632935 632936 GBAA0543 GBAA0544     FALSE 0.160 188.000 0.123 1.000   NA
 632936 5451202 GBAA0544 tRNA-Gly-4     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 5451202 632938 tRNA-Gly-4 GBAA0545     FALSE 0.051 199.000 0.000 NA   NA
 632938 632939 GBAA0545 GBAA0546     FALSE 0.548 45.000 0.174 NA   NA
 632939 632940 GBAA0546 GBAA0547     FALSE 0.485 59.000 0.097 NA   NA
 632940 632941 GBAA0547 GBAA0548     TRUE 0.687 128.000 0.016 1.000 N NA
 632943 632944 GBAA0550 GBAA0551     FALSE 0.036 446.000 0.683 NA   NA
 632944 632945 GBAA0551 GBAA0552     FALSE 0.158 162.000 0.018 NA   NA
 632945 632946 GBAA0552 GBAA0553     FALSE 0.454 155.000 0.500 1.000   NA
 632948 632949 GBAA0555 GBAA0556     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 632949 632950 GBAA0556 GBAA0557     TRUE 0.774 13.000 0.464 NA   NA
 632950 632951 GBAA0557 GBAA0558     FALSE 0.028 237.000 0.000 NA   NA
 632951 632952 GBAA0558 GBAA0559     TRUE 0.904 152.000 0.600 0.016 Y NA
 632952 10141479 GBAA0559 GBAA_0560     FALSE 0.517 0.000 0.000 NA   NA
 632954 632955 GBAA0562 GBAA0563     FALSE 0.331 135.000 0.125 NA   NA
 632955 632956 GBAA0563 GBAA0564     FALSE 0.006 536.000 0.000 NA   NA
 632956 632957 GBAA0564 GBAA0565     FALSE 0.005 559.000 0.000 NA   NA
 632957 632958 GBAA0565 GBAA0566     TRUE 0.683 -36.000 0.262 1.000 N NA
 632958 632959 GBAA0566 GBAA0567     TRUE 0.979 0.000 0.391 0.046 Y NA
 632959 632960 GBAA0567 GBAA0568     TRUE 0.984 -3.000 0.848 0.046 Y NA
 632960 632961 GBAA0568 GBAA0569     TRUE 0.983 22.000 0.708 0.046 Y NA
 632961 632962 GBAA0569 GBAA0570     FALSE 0.013 416.000 0.000 1.000   NA
 632962 632963 GBAA0570 GBAA0571     FALSE 0.334 150.000 0.091 1.000   NA
 632963 632964 GBAA0571 GBAA0572     TRUE 0.974 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 632964 632965 GBAA0572 GBAA0573     FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 632965 632966 GBAA0573 GBAA0574     TRUE 0.820 14.000 0.600 NA   NA
 632966 632967 GBAA0574 GBAA0575     FALSE 0.023 254.000 0.000 NA   NA
 632967 632968 GBAA0575 GBAA0576     TRUE 0.938 79.000 0.229 0.006 Y NA
 632968 632969 GBAA0576 GBAA0577     TRUE 0.970 30.000 0.229 0.087 Y NA
 632969 632970 GBAA0577 GBAA0578     TRUE 0.720 123.000 0.243 1.000 N NA
 632970 632971 GBAA0578 GBAA0579     TRUE 0.947 60.000 0.432 1.000 Y NA
 632972 632973 GBAA0580 GBAA0581     FALSE 0.540 116.000 0.429 NA   NA
 632975 632976 GBAA0583 GBAA0584     FALSE 0.573 147.000 0.636 1.000   NA
 632976 632977 GBAA0584 GBAA0585     TRUE 0.959 66.000 0.727 1.000 Y NA
 632979 632980 GBAA0587 GBAA0588   fdhD-1 FALSE 0.161 229.000 0.000 1.000 N NA
 632981 10141480 GBAA0589 GBAA_0590     FALSE 0.480 13.000 0.000 NA   NA
 10141480 632982 GBAA_0590 GBAA0591     FALSE 0.057 193.000 0.000 NA   NA
 632982 632983 GBAA0591 GBAA0592   ald-1 FALSE 0.050 368.000 0.000 1.000 N NA
 632983 632984 GBAA0592 GBAA0593 ald-1   TRUE 0.952 104.000 0.889 1.000 Y NA
 632984 632985 GBAA0593 GBAA0594     FALSE 0.111 267.000 0.000 1.000 N NA
 632985 632986 GBAA0594 GBAA0595     TRUE 0.880 25.000 0.203 1.000 N NA
 632988 632989 GBAA0597 GBAA0598     TRUE 0.699 3.000 0.231 NA   NA
 632989 632990 GBAA0598 GBAA0599     FALSE 0.191 167.000 0.273 NA   NA
 632992 632993 GBAA0602 GBAA0603     TRUE 0.853 16.000 0.727 NA   NA
 632994 632995 GBAA0604 GBAA0605     FALSE 0.117 235.000 0.000 NA N NA
 632995 632996 GBAA0605 GBAA0606     FALSE 0.116 276.000 0.333 NA N NA
 632997 632998 GBAA0607 GBAA0608     FALSE 0.360 108.000 0.010 NA   NA
 632998 632999 GBAA0608 GBAA0609   aspA-1 FALSE 0.419 84.000 0.222 NA   NA
 633001 633002 GBAA0612 GBAA0613   sspH TRUE 0.679 46.000 0.261 1.000   NA
 633003 633004 GBAA0614 GBAA0615     FALSE 0.047 382.000 0.000 1.000 N NA
 633005 633006 GBAA0616 GBAA0617     TRUE 0.971 -3.000 0.273 0.046 Y NA
 633006 633007 GBAA0617 GBAA0618     TRUE 0.964 13.000 0.273 1.000 Y NA
 633009 633010 GBAA0620 GBAA0621     TRUE 0.833 45.000 0.165 1.000 N NA
 633010 633011 GBAA0621 GBAA0622     TRUE 0.775 66.000 0.025 1.000 N NA
 633012 633013 GBAA0623 GBAA0624     TRUE 0.898 4.000 0.822 NA   NA
 633013 633014 GBAA0624 GBAA0625   cls-1 FALSE 0.476 128.000 0.156 1.000   NA
 633015 633016 GBAA0626 GBAA0627     TRUE 0.750 31.000 0.429 NA   NA
 633016 633017 GBAA0627 GBAA0628     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 633019 633020 GBAA0630 GBAA0631 treR treB TRUE 0.666 138.000 0.115 1.000 N NA
 633020 633021 GBAA0631 GBAA0632 treB treC TRUE 0.976 14.000 0.650 1.000 Y NA
 633022 633023 GBAA0633 GBAA0634 gerKC gerKB TRUE 0.838 -19.000 0.833 0.009   NA
 633023 633024 GBAA0634 GBAA0635 gerKB gerKA TRUE 0.737 -19.000 0.412 0.009   NA
 633025 633026 GBAA0636 GBAA0637     TRUE 0.740 24.000 0.385 NA   NA
 633026 633027 GBAA0637 GBAA0638     FALSE 0.531 128.000 0.462 NA   NA
 633027 633028 GBAA0638 GBAA0639     TRUE 0.883 134.000 0.093 1.000 Y NA
 633028 633029 GBAA0639 GBAA0640     TRUE 0.968 13.000 0.389 1.000 Y NA
 633029 633030 GBAA0640 GBAA0641     TRUE 0.950 63.000 0.280 0.058 Y NA
 633030 633031 GBAA0641 GBAA0642     TRUE 0.989 1.000 0.947 0.006 Y NA
 633031 633032 GBAA0642 GBAA0643     TRUE 0.583 205.000 0.000 0.079 Y NA
 633032 633033 GBAA0643 GBAA0644     TRUE 0.714 -25.000 0.242 1.000 N NA
 633033 633034 GBAA0644 GBAA0645     TRUE 0.791 62.000 0.111 1.000 N NA
 633034 633035 GBAA0645 GBAA0646     FALSE 0.398 177.000 0.079 1.000 N NA
 633035 633036 GBAA0646 GBAA0647     FALSE 0.005 611.000 0.000 NA   NA
 633039 633040 GBAA0650 GBAA0651     TRUE 0.974 12.000 0.538 1.000 Y NA
 10141481 633041 GBAA_0652 GBAA0653     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 633041 633042 GBAA0653 GBAA0654     TRUE 0.869 66.000 0.615 1.000 N NA
 633042 633043 GBAA0654 GBAA0655     FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 633044 633045 GBAA0656 GBAA0657     TRUE 0.971 15.000 0.195 0.046 Y NA
 633045 633046 GBAA0657 GBAA0658     TRUE 0.983 19.000 0.727 0.046 Y NA
 633046 633047 GBAA0658 GBAA0659     TRUE 0.882 15.000 0.727 1.000   NA
 633047 10141482 GBAA0659 GBAA_0660     TRUE 0.796 -13.000 0.477 0.003   NA
 10141482 633048 GBAA_0660 GBAA0661   glpT FALSE 0.093 285.000 0.000 1.000 N NA
 633049 10141483 GBAA0662 GBAA_0663     FALSE 0.479 20.000 0.000 NA   NA
 10141483 633050 GBAA_0663 GBAA0664   rbsR FALSE 0.209 138.000 0.000 NA   NA
 633050 633051 GBAA0664 GBAA0665 rbsR rbsK TRUE 0.873 14.000 0.109 1.000 N NA
 633051 633052 GBAA0665 GBAA0666 rbsK rbsD TRUE 0.959 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 633052 633053 GBAA0666 GBAA0667 rbsD rbsA TRUE 0.904 118.000 0.243 1.000 Y NA
 633053 633054 GBAA0667 GBAA0668 rbsA rbsC TRUE 0.982 3.000 0.358 0.001 Y NA
 633054 633055 GBAA0668 GBAA0669 rbsC rbsB TRUE 0.986 15.000 0.847 0.001 Y NA
 633055 633056 GBAA0669 GBAA0670 rbsB   TRUE 0.954 35.000 0.032 1.000 Y NA
 633056 633057 GBAA0670 GBAA0672     FALSE 0.024 317.000 0.000 1.000   NA
 633057 633058 GBAA0672 GBAA0673     FALSE 0.012 319.000 0.000 NA   NA
 633060 633061 GBAA0675 GBAA0676     FALSE 0.372 119.000 0.059 NA   NA
 633061 633062 GBAA0676 GBAA0677   plC FALSE 0.023 254.000 0.000 NA   NA
 633062 633063 GBAA0677 GBAA0678 plC spH FALSE 0.510 59.000 0.000 1.000   NA
 633063 633064 GBAA0678 GBAA0679 spH   FALSE 0.268 108.000 0.000 NA   NA
 633064 633065 GBAA0679 GBAA0680     TRUE 0.827 -12.000 0.571 NA N NA
 633068 633069 GBAA0683 GBAA0684     TRUE 0.684 133.000 0.085 1.000 N NA
 633070 633071 GBAA0685 GBAA0686     TRUE 0.741 113.000 0.233 1.000 N NA
 633071 633072 GBAA0686 GBAA0687     TRUE 0.705 -7.000 0.500 NA   NA
 633072 633073 GBAA0687 GBAA0688     TRUE 0.687 48.000 0.438 NA   NA
 633075 633076 GBAA0690 GBAA0691 brnQ-1   FALSE 0.327 136.000 0.121 NA   NA
 633077 633078 GBAA0692 GBAA0693     FALSE 0.184 182.000 0.171 1.000   NA
 633079 633080 GBAA0694 GBAA0695     TRUE 0.711 132.000 0.750 1.000   NA
 633080 633081 GBAA0695 GBAA0696     TRUE 0.779 5.000 0.375 NA   NA
 633082 633083 GBAA0697 GBAA0698     TRUE 0.619 15.000 0.125 NA   NA
 633083 633084 GBAA0698 GBAA0699     FALSE 0.434 72.000 0.062 NA   NA
 633084 633085 GBAA0699 GBAA0700   qoxD FALSE 0.235 222.000 0.000 0.079 N NA
 633085 633086 GBAA0700 GBAA0701 qoxD qoxC TRUE 0.985 1.000 0.959 1.000 Y NA
 633086 633087 GBAA0701 GBAA0702 qoxC qoxB TRUE 0.986 14.000 0.957 0.041 Y NA
 633087 633088 GBAA0702 GBAA0703 qoxB qoxA TRUE 0.970 34.000 0.234 0.007 Y NA
 633088 633089 GBAA0703 GBAA0704 qoxA   FALSE 0.017 282.000 0.000 NA   NA
 633090 10141484 GBAA0705 GBAA_0706     TRUE 0.645 133.000 0.727 NA   NA
 10141484 633091 GBAA_0706 GBAA0707     TRUE 0.727 2.000 0.286 NA   NA
 633091 633092 GBAA0707 GBAA0708     TRUE 0.778 -3.000 0.500 NA   NA
 633092 633093 GBAA0708 GBAA0709   gerLA FALSE 0.464 145.000 0.353 1.000   NA
 633093 633094 GBAA0709 GBAA0710 gerLA gerLB TRUE 0.809 94.000 0.706 0.009   NA
 633094 633095 GBAA0710 GBAA0711 gerLB gerLC TRUE 0.693 -16.000 0.235 0.009   NA
 633095 633096 GBAA0711 GBAA0712 gerLC   TRUE 0.797 12.000 0.500 NA   NA
 10141485 633097 GBAA_0713 GBAA0714     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 633098 633099 GBAA0715 GBAA0716     TRUE 0.922 71.000 0.206 1.000 Y NA
 633099 633100 GBAA0716 GBAA0717     TRUE 0.990 3.000 0.907 0.002 Y NA
 633100 633101 GBAA0717 GBAA0718     FALSE 0.081 201.000 0.048 NA   NA
 5451203 5451204 Ba16SJ Ba23SJ     FALSE 0.076 179.000 0.000 NA   NA
 5451204 5451205 Ba23SJ Ba5SJ     FALSE 0.259 102.000 0.000 NA   NA
 5451205 5451206 Ba5SJ tRNA-Val-4     FALSE 0.537 6.000 0.000 NA   NA
 5451206 5451207 tRNA-Val-4 tRNA-Gln-4     FALSE 0.492 12.000 0.000 NA   NA
 5451207 5451208 tRNA-Gln-4 tRNA-Lys-3     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 5451208 5451209 tRNA-Lys-3 tRNA-Leu-3     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 5451209 5451210 tRNA-Leu-3 tRNA-Gly-5     FALSE 0.475 30.000 0.000 NA   NA
 5451210 5451211 tRNA-Gly-5 tRNA-Leu-4     FALSE 0.480 17.000 0.000 NA   NA
 5451211 5451212 tRNA-Leu-4 tRNA-Arg-2     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 5451212 5451213 tRNA-Arg-2 tRNA-Pro-2     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 5451213 5451214 tRNA-Pro-2 tRNA-Ala-4     FALSE 0.480 17.000 0.000 NA   NA
 5451214 5451215 tRNA-Ala-4 tRNA-Ser-4     FALSE 0.481 21.000 0.000 NA   NA
 5451215 5451216 tRNA-Ser-4 tRNA-Ser-5     FALSE 0.360 55.000 0.000 NA   NA
 5451216 5451217 tRNA-Ser-5 tRNA-Met-4     FALSE 0.481 21.000 0.000 NA   NA
 5451217 5451218 tRNA-Met-4 tRNA-Asp-4     FALSE 0.546 5.000 0.000 NA   NA
 5451218 5451219 tRNA-Asp-4 tRNA-Phe-2     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451219 5451220 tRNA-Phe-2 tRNA-Thr-3     FALSE 0.512 10.000 0.000 NA   NA
 5451220 5451221 tRNA-Thr-3 tRNA-Trp-2     FALSE 0.529 7.000 0.000 NA   NA
 5451221 5451222 tRNA-Trp-2 tRNA-Ile-3     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 5451222 5451223 tRNA-Ile-3 tRNA-Asn-4     FALSE 0.517 9.000 0.000 NA   NA
 5451223 5451224 tRNA-Asn-4 tRNA-Glu-5     FALSE 0.535 2.000 0.000 NA   NA
 5451224 633125 tRNA-Glu-5 GBAA0720     FALSE 0.205 139.000 0.000 NA   NA
 633125 633126 GBAA0720 GBAA0721     FALSE 0.015 295.000 0.000 NA   NA
 633127 633128 GBAA0722 GBAA0723     TRUE 0.788 15.000 0.500 NA   NA
 633128 633129 GBAA0723 GBAA0724     TRUE 0.884 6.000 0.750 NA   NA
 633130 633131 GBAA0725 GBAA0726     TRUE 0.682 -31.000 0.145 1.000 N NA
 633131 633132 GBAA0726 GBAA0727     TRUE 0.983 0.000 0.826 1.000 Y NA
 633132 633133 GBAA0727 GBAA0728     TRUE 0.968 -3.000 0.135 0.046 Y NA
 633133 633134 GBAA0728 GBAA0729   tenI TRUE 0.884 11.000 0.054 1.000 N NA
 633134 633135 GBAA0729 GBAA0730 tenI goxB TRUE 0.820 -7.000 0.194 1.000 N NA
 633135 633136 GBAA0730 GBAA0731 goxB   TRUE 0.879 16.000 0.239 1.000 N NA
 633136 633137 GBAA0731 GBAA0732   thiG TRUE 0.969 3.000 0.054 1.000 Y NA
 633137 633138 GBAA0732 GBAA0733 thiG   TRUE 0.953 -7.000 0.012 0.031 Y NA
 633138 633139 GBAA0733 GBAA0734   thiD-1 TRUE 0.962 16.000 0.195 1.000 Y NA
 633139 633140 GBAA0734 GBAA0735 thiD-1   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 633140 633141 GBAA0735 GBAA0736     FALSE 0.219 -31.000 0.000 NA   NA
 633141 633142 GBAA0736 GBAA0737     TRUE 0.677 30.000 0.286 NA   NA
 633142 633143 GBAA0737 GBAA0738     FALSE 0.010 346.000 0.000 NA   NA
 633143 633144 GBAA0738 GBAA0739   kdpA FALSE 0.443 97.000 0.286 NA   NA
 633144 633145 GBAA0739 GBAA0740 kdpA kdpB TRUE 0.973 14.000 0.035 0.001 Y NA
 633145 633146 GBAA0740 GBAA0741 kdpB kdpC TRUE 0.987 17.000 0.877 0.001 Y NA
 633146 633147 GBAA0741 GBAA0742 kdpC kdpD TRUE 0.613 57.000 0.066 1.000   NA
 633149 633150 GBAA0744 GBAA0745     TRUE 0.625 129.000 0.500 1.000   NA
 633150 633151 GBAA0745 GBAA0746     TRUE 0.721 17.000 0.357 NA   NA
 633153 10141486 GBAA0748 GBAA_0749     FALSE 0.318 67.000 0.000 NA   NA
 10141486 633154 GBAA_0749 GBAA0750     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 633154 633155 GBAA0750 GBAA0751     TRUE 0.695 105.000 0.727 NA   NA
 633156 633157 GBAA0752 GBAA0753 scrK scrB TRUE 0.959 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 633157 633158 GBAA0753 GBAA0754 scrB scrA TRUE 0.961 18.000 0.100 1.000 Y NA
 633158 633159 GBAA0754 GBAA0755 scrA scrR TRUE 0.693 129.000 0.113 1.000 N NA
 633159 633160 GBAA0755 GBAA0756 scrR   FALSE 0.373 118.000 0.056 NA   NA
 633160 633161 GBAA0756 GBAA0757     FALSE 0.436 73.000 0.148 NA   NA
 633161 633162 GBAA0757 GBAA0758     TRUE 0.838 13.000 0.073 0.005   NA
 633162 633163 GBAA0758 GBAA0759     FALSE 0.163 166.000 0.127 NA   NA
 633163 633164 GBAA0759 GBAA0760     FALSE 0.493 117.000 0.364 NA   NA
 633164 10141487 GBAA0760 GBAA_0761   gerYB FALSE 0.391 46.000 0.000 NA   NA
 10141487 633165 GBAA_0761 GBAA0762 gerYB gerYC FALSE 0.480 13.000 0.000 NA   NA
 633165 633166 GBAA0762 GBAA0763 gerYC gerYA TRUE 0.845 84.000 0.867 0.009   NA
 633166 633168 GBAA0763 GBAA_0765 gerYA   FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 633168 633167 GBAA_0765 GBAA0764     FALSE 0.188 -245.000 0.000 NA   NA
 633169 633170 GBAA0766 GBAA0767   spoVR FALSE 0.355 116.000 0.019 NA   NA
 633170 633171 GBAA0767 GBAA0768 spoVR   FALSE 0.363 108.000 0.014 NA   NA
 633173 633174 GBAA0771 GBAA0772     TRUE 0.668 134.000 0.800 NA   NA
 633174 633175 GBAA0772 GBAA0773     FALSE 0.492 12.000 0.000 NA   NA
 633175 633176 GBAA0773 GBAA0774     FALSE 0.259 102.000 0.000 NA   NA
 633176 633177 GBAA0774 GBAA0775     FALSE 0.112 186.000 0.143 NA   NA
 633177 633178 GBAA0775 GBAA0776     FALSE 0.390 89.000 0.127 NA   NA
 633178 633179 GBAA0776 GBAA0777     TRUE 0.721 39.000 0.286 1.000   NA
 633179 633180 GBAA0777 GBAA0778     TRUE 0.708 35.000 0.207 1.000   NA
 633180 633181 GBAA0778 GBAA0779     TRUE 0.756 59.000 0.154 NA N NA
 633181 10141488 GBAA0779 GBAA_0780     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 10141488 633182 GBAA_0780 GBAA0781     FALSE 0.452 34.000 0.000 NA   NA
 633183 633184 GBAA0782 GBAA0783     FALSE 0.533 146.000 0.667 NA   NA
 633186 633187 GBAA0785 GBAA0787     FALSE 0.064 331.000 0.000 1.000 N NA
 633188 633189 GBAA0789 GBAA0790     FALSE 0.555 73.000 0.149 1.000   NA
 633189 633190 GBAA0790 GBAA0791   celC-1 TRUE 0.813 112.000 0.149 0.006 N NA
 633190 633191 GBAA0791 GBAA0792 celC-1 celA-1 TRUE 0.988 2.000 0.778 0.005 Y NA
 633191 633192 GBAA0792 GBAA0793 celA-1 celB-1 TRUE 0.956 83.000 0.583 0.005 Y NA
 633192 633193 GBAA0793 GBAA0794 celB-1   TRUE 0.609 -24.000 0.583 NA   NA
 633193 633194 GBAA0794 GBAA0795     TRUE 0.749 -10.000 0.700 NA   NA
 633195 633196 GBAA0796 GBAA0797     FALSE 0.024 571.000 0.000 NA N NA
 633196 633197 GBAA0797 GBAA0798     TRUE 0.982 3.000 0.889 NA Y NA
 633197 633198 GBAA0798 GBAA0799     TRUE 0.943 -3.000 0.889 1.000 N NA
 633199 10141489 GBAA0800 GBAA_0801     FALSE 0.489 89.000 0.333 NA   NA
 10141489 10141490 GBAA_0801 GBAA_5742     TRUE 0.605 166.000 0.875 0.045   NA
 633200 633201 GBAA0802 GBAA0803 brnQ-2 cotJC FALSE 0.180 219.000 0.000 1.000 N NA
 633201 633202 GBAA0803 GBAA0804 cotJC cotJB TRUE 0.819 13.000 0.438 1.000   NA
 633202 633203 GBAA0804 GBAA0805 cotJB cotJA TRUE 0.788 -3.000 0.516 NA   NA
 633204 633205 GBAA0806 GBAA0807     TRUE 0.659 15.000 0.259 NA   NA
 633207 633208 GBAA0809 GBAA0810     TRUE 0.745 11.000 0.368 NA   NA
 633208 633209 GBAA0810 GBAA0811     TRUE 0.593 105.000 0.500 NA   NA
 633209 633210 GBAA0811 GBAA0812     TRUE 0.839 21.000 0.667 NA   NA
 633210 633211 GBAA0812 GBAA0813     FALSE 0.479 29.000 0.000 NA   NA
 633211 633212 GBAA0813 GBAA0814     FALSE 0.306 70.000 0.000 NA   NA
 633212 633213 GBAA0814 GBAA0815     FALSE 0.011 336.000 0.000 NA   NA
 633213 633214 GBAA0815 GBAA0816     FALSE 0.479 131.000 0.400 NA   NA
 633214 633215 GBAA0816 GBAA0817     TRUE 0.808 13.000 0.556 NA   NA
 633217 633218 GBAA0819 GBAA0820     TRUE 0.684 126.000 0.778 NA   NA
 633218 633219 GBAA0820 GBAA0821     TRUE 0.657 30.000 0.259 NA   NA
 633219 633220 GBAA0821 GBAA0822     FALSE 0.475 156.000 0.156 0.001   NA
 633220 633221 GBAA0822 GBAA0823     TRUE 0.792 25.000 0.344 1.000   NA
 633221 633222 GBAA0823 GBAA0824     TRUE 0.716 49.000 0.357 1.000   NA
 633222 633223 GBAA0824 GBAA0825     FALSE 0.180 161.000 0.113 NA   NA
 633223 633224 GBAA0825 GBAA0827     FALSE 0.327 156.000 0.429 NA   NA
 633224 633225 GBAA0827 GBAA0828     TRUE 0.813 0.000 0.500 NA   NA
 633227 633228 GBAA0830 GBAA0831     TRUE 0.685 129.000 0.027 1.000 N NA
 633228 633229 GBAA0831 GBAA0832     FALSE 0.052 359.000 0.000 1.000 N NA
 633229 633230 GBAA0832 GBAA0833     TRUE 0.988 3.000 0.846 0.077 Y NA
 633230 633231 GBAA0833 GBAA0834     TRUE 0.781 133.000 0.538 1.000 N NA
 633231 633232 GBAA0834 GBAA0835   blT FALSE 0.203 211.000 0.000 1.000 N NA
 633234 633235 GBAA0837 GBAA0838     TRUE 0.667 20.000 0.267 NA   NA
 633238 633239 GBAA0841 GBAA0842     FALSE 0.027 238.000 0.000 NA   NA
 633239 633240 GBAA0842 GBAA0843     TRUE 0.739 24.000 0.176 1.000   NA
 633240 633241 GBAA0843 GBAA0844     FALSE 0.215 205.000 0.160 NA N NA
 633241 633242 GBAA0844 GBAA0845     TRUE 0.782 61.000 0.320 NA N NA
 633243 633244 GBAA0847 GBAA0848 racE-1   FALSE 0.353 113.000 0.005 NA   NA
 633246 633247 GBAA0851 GBAA0852     FALSE 0.026 243.000 0.000 NA   NA
 633247 10141491 GBAA0852 GBAA_0853     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 10141491 633248 GBAA_0853 GBAA0855     FALSE 0.019 273.000 0.000 NA   NA
 633248 633249 GBAA0855 GBAA0856     TRUE 0.949 -22.000 0.594 0.045 Y NA
 633249 633250 GBAA0856 GBAA0857     TRUE 0.971 29.000 0.481 1.000 Y NA
 633253 633254 GBAA0860 GBAA0861     TRUE 0.817 21.000 0.583 NA   NA
 633255 633256 GBAA0862 GBAA0863     FALSE 0.375 142.000 0.321 NA   NA
 633257 633258 GBAA0864 GBAA0865     TRUE 0.807 22.000 0.545 NA   NA
 633259 633260 GBAA0866 GBAA0867 alsS alsD TRUE 0.893 17.000 0.323 1.000 N NA
 633261 633262 GBAA0868 GBAA0869     TRUE 0.586 22.000 0.005 NA   NA
 633263 633264 GBAA0870 GBAA0871     FALSE 0.012 485.000 0.000 1.000   NA
 633265 633266 GBAA0872 GBAA0873     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 633267 633268 GBAA0875 GBAA0876     FALSE 0.100 315.000 0.000 0.081 N NA
 633270 633271 GBAA0878 GBAA0879     FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 633271 633272 GBAA0879 GBAA0880     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 633273 633274 GBAA0881 GBAA0882   secA-1 TRUE 0.798 15.000 0.519 NA   NA
 633275 633276 GBAA0883 GBAA0884   csaB FALSE 0.393 142.000 0.040 1.000   NA
 633276 633277 GBAA0884 GBAA0885 csaB sap FALSE 0.005 676.000 0.000 NA   NA
 633277 633278 GBAA0885 GBAA0887 sap eag FALSE 0.005 722.000 0.000 NA   NA
 633279 633280 GBAA0888 GBAA0889     TRUE 0.748 25.000 0.400 NA   NA
 633281 633282 GBAA0890 GBAA0891     TRUE 0.737 10.000 0.333 NA   NA
 633282 633283 GBAA0891 GBAA0892     FALSE 0.367 53.000 0.000 NA   NA
 633285 633286 GBAA0894 GBAA0895     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 633288 633289 GBAA0897 GBAA0898     FALSE 0.143 240.000 0.000 1.000 N NA
 633289 633290 GBAA0898 GBAA0899     FALSE 0.176 232.000 0.318 NA N NA
 633292 633293 GBAA0901 GBAA0902     TRUE 0.961 20.000 0.109 1.000 Y NA
 633293 10141492 GBAA0902 GBAA_0903     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 10141492 633294 GBAA_0903 GBAA0904     FALSE 0.005 671.000 0.000 NA   NA
 633294 633295 GBAA0904 GBAA0905     FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 633295 633296 GBAA0905 GBAA0906     TRUE 0.577 52.000 0.286 NA   NA
 633297 633298 GBAA0908 GBAA0909     TRUE 0.969 60.000 0.688 0.045 Y NA
 633298 633299 GBAA0909 GBAA0910     TRUE 0.987 7.000 0.786 0.045 Y NA
 633299 10141494 GBAA0910 GBAA_0911     FALSE 0.484 27.000 0.000 NA   NA
 10141494 633300 GBAA_0911 GBAA0912     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 633300 633301 GBAA0912 GBAA0913     FALSE 0.416 -15.000 0.051 NA   NA
 633301 10141495 GBAA0913 GBAA_0914     FALSE 0.066 185.000 0.000 NA   NA
 10141495 633302 GBAA_0914 GBAA0915     FALSE 0.091 170.000 0.000 NA   NA
 633302 633303 GBAA0915 GBAA0916     FALSE 0.091 170.000 0.000 NA   NA
 633303 633304 GBAA0916 GBAA0917     TRUE 0.693 37.000 0.375 NA   NA
 633304 633305 GBAA0917 GBAA0918     FALSE 0.290 -15.000 0.000 NA   NA
 633305 633306 GBAA0918 GBAA0919     TRUE 0.587 68.000 0.400 NA   NA
 633307 633308 GBAA0920 GBAA0921     FALSE 0.012 316.000 0.000 NA   NA
 633309 633310 GBAA0923 GBAA0924     TRUE 0.984 19.000 0.833 0.083 Y NA
 633310 633311 GBAA0924 GBAA0925     TRUE 0.854 -3.000 0.611 1.000   NA
 633311 633312 GBAA0925 GBAA0926     FALSE 0.063 224.000 0.000 1.000   NA
 633312 633313 GBAA0926 GBAA0927     TRUE 0.715 100.000 0.026 1.000 N NA
 633313 633314 GBAA0927 GBAA0928     TRUE 0.635 -28.000 0.684 NA   NA
 633314 633315 GBAA0928 GBAA0929     FALSE 0.010 344.000 0.000 NA   NA
 633315 633316 GBAA0929 GBAA0930     TRUE 0.899 4.000 0.833 NA   NA
 633316 633317 GBAA0930 GBAA0931     TRUE 0.796 9.000 0.455 NA   NA
 633317 633318 GBAA0931 GBAA0932     FALSE 0.555 54.000 0.267 NA   NA
 633318 633319 GBAA0932 GBAA0933     FALSE 0.088 201.000 0.200 NA   NA
 633319 633320 GBAA0933 GBAA0934     TRUE 0.594 -3.000 0.041 NA   NA
 633320 633321 GBAA0934 GBAA0935     FALSE 0.457 33.000 0.000 NA   NA
 633321 633322 GBAA0935 GBAA0936     FALSE 0.238 127.000 0.000 NA   NA
 633322 633323 GBAA0936 GBAA0937     FALSE 0.484 22.000 0.000 NA   NA
 633330 633331 GBAA0945 GBAA0946     FALSE 0.379 -18.000 0.023 NA   NA
 633331 633332 GBAA0946 GBAA0947     FALSE 0.487 -7.000 0.023 NA   NA
 633332 633333 GBAA0947 GBAA0948     FALSE 0.048 201.000 0.000 NA   NA
 633335 633336 GBAA0950 GBAA0951     FALSE 0.186 181.000 0.375 NA   NA
 633337 633338 GBAA0952 GBAA0953     FALSE 0.378 117.000 0.109 NA   NA
 633339 633340 GBAA0954 GBAA0955     TRUE 0.810 58.000 0.244 1.000 N NA
 633340 633341 GBAA0955 GBAA0956     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 633342 633343 GBAA0957 GBAA0958     FALSE 0.019 272.000 0.000 NA   NA
 633343 633344 GBAA0958 GBAA0959   pssA TRUE 0.801 44.000 0.000 1.000 N NA
 633344 633345 GBAA0959 GBAA0960 pssA   TRUE 0.713 24.000 0.013 1.000   NA
 633345 633346 GBAA0960 GBAA0961     FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 633346 633347 GBAA0961 GBAA0962     FALSE 0.008 376.000 0.000 NA   NA
 633348 633349 GBAA0963 GBAA0964     TRUE 0.928 20.000 0.625 1.000 N NA
 633353 633354 GBAA0969 GBAA0971     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 633355 633356 GBAA0972 GBAA0973     FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 633356 633357 GBAA0973 GBAA0975     FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 633361 633362 GBAA0980 GBAA0981     FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   NA
 633362 633363 GBAA0981 GBAA0982     FALSE 0.301 141.000 0.114 NA   NA
 633363 633364 GBAA0982 GBAA0983     TRUE 0.780 17.000 0.486 NA   NA
 633365 633366 GBAA0984 GBAA0985     FALSE 0.030 232.000 0.000 NA   NA
 633367 633368 GBAA0986 GBAA0987     TRUE 0.823 51.000 0.875 NA   NA
 633368 633369 GBAA0987 GBAA0988     TRUE 0.624 76.000 0.500 NA   NA
 633371 633372 GBAA0990 GBAA0991 rsbV rsbW TRUE 0.982 7.000 0.714 1.000 Y NA
 633372 633373 GBAA0991 GBAA0992 rsbW sigB TRUE 0.829 -34.000 0.838 1.000 N NA
 633373 633374 GBAA0992 GBAA0993 sigB   TRUE 0.764 70.000 0.038 1.000 N NA
 633374 633375 GBAA0993 GBAA0994     FALSE 0.393 176.000 0.032 1.000 N NA
 633376 633377 GBAA0995 GBAA0996     TRUE 0.962 17.000 0.169 1.000 Y NA
 633377 633378 GBAA0996 GBAA0997     FALSE 0.044 206.000 0.000 NA   NA
 633379 633380 GBAA0998 GBAA0999     TRUE 0.782 40.000 0.600 NA   NA
 633380 633381 GBAA0999 GBAA1000     TRUE 0.718 61.000 0.600 NA   NA
 633381 633382 GBAA1000 GBAA1001     FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 633382 633383 GBAA1001 GBAA1002     FALSE 0.022 260.000 0.000 NA   NA
 633384 633385 GBAA1003 GBAA1004     FALSE 0.377 118.000 0.068 NA   NA
 633385 633386 GBAA1004 GBAA1005     FALSE 0.231 129.000 0.000 NA   NA
 633389 633390 GBAA1008 GBAA1009     TRUE 0.692 -3.000 0.330 NA   NA
 633390 633391 GBAA1009 GBAA1010     FALSE 0.005 639.000 0.000 NA   NA
 633391 633392 GBAA1010 GBAA1011     FALSE 0.094 168.000 0.000 NA   NA
 633392 633393 GBAA1011 GBAA1012     TRUE 0.623 42.000 0.291 NA   NA
 633393 633394 GBAA1012 GBAA1013     FALSE 0.188 177.000 0.016 1.000   NA
 633394 633395 GBAA1013 GBAA1014     TRUE 0.824 49.000 0.133 1.000 N NA
 633395 633396 GBAA1014 GBAA1015     FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 633396 633397 GBAA1015 GBAA1016     TRUE 0.657 44.000 0.368 NA   NA
 633397 633398 GBAA1016 GBAA1017     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 633398 633399 GBAA1017 GBAA1018     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 633399 633400 GBAA1018 GBAA1019     FALSE 0.031 228.000 0.000 NA   NA
 633400 633401 GBAA1019 GBAA1020     FALSE 0.475 81.000 0.292 NA   NA
 633401 633402 GBAA1020 GBAA1021     FALSE 0.059 225.000 0.167 NA   NA
 633402 633403 GBAA1021 GBAA1022     FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 633403 633404 GBAA1022 GBAA1023     FALSE 0.190 -215.000 0.000 NA   NA
 633404 633405 GBAA1023 GBAA1024   glpP FALSE 0.382 98.000 0.083 NA   NA
 633405 633406 GBAA1024 GBAA1025 glpP glpF FALSE 0.193 229.000 0.083 1.000 N NA
 633406 633407 GBAA1025 GBAA1026 glpF glpK TRUE 0.873 14.000 0.057 1.000 N NA
 633407 633408 GBAA1026 GBAA1027 glpK glpD TRUE 0.916 134.000 0.013 0.001 Y NA
 633410 633411 GBAA1030 GBAA1031     FALSE 0.541 -6.000 0.080 NA   NA
 633411 633412 GBAA1031 GBAA1032     FALSE 0.225 154.000 0.182 NA   NA
 633412 633413 GBAA1032 GBAA1033     TRUE 0.975 5.000 0.533 NA Y NA
 633413 633414 GBAA1033 GBAA1034     TRUE 0.750 80.000 0.389 NA N NA
 633416 633417 GBAA1036 GBAA1037     FALSE 0.241 162.000 0.333 NA   NA
 633417 633418 GBAA1037 GBAA1038     TRUE 0.930 23.000 0.333 0.005 N NA
 633419 633420 GBAA1039 GBAA1040     TRUE 0.595 88.000 0.500 NA   NA
 633420 633421 GBAA1040 GBAA1041   prsA-1 FALSE 0.016 378.000 0.000 1.000   NA
 633421 633422 GBAA1041 GBAA1043 prsA-1   FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 633424 633425 GBAA1045 GBAA1046 hpr   FALSE 0.026 299.000 0.063 NA   NA
 633425 633426 GBAA1046 GBAA1047     FALSE 0.133 178.000 0.137 NA   NA
 633427 633428 GBAA1048 GBAA1049 ecsA ecsB TRUE 0.791 -7.000 0.271 NA N NA
 633428 633429 GBAA1049 GBAA1050 ecsB ecsC TRUE 0.684 14.000 0.292 NA   NA
 633431 633432 GBAA1052 GBAA1053     TRUE 0.881 9.000 0.778 NA   NA
 633432 633433 GBAA1053 GBAA1054     TRUE 0.727 80.000 0.778 NA   NA
 633433 10141496 GBAA1054 GBAA_1055     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 10141496 633434 GBAA_1055 GBAA1056     FALSE 0.264 105.000 0.000 NA   NA
 633434 633435 GBAA1056 GBAA1057     TRUE 0.658 10.000 0.150 NA   NA
 633435 10141497 GBAA1057 GBAA_1058     FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 10141497 633436 GBAA_1058 GBAA1059     FALSE 0.419 40.000 0.000 NA   NA
 633436 633437 GBAA1059 GBAA1061     FALSE 0.005 692.000 0.000 NA   NA
 633438 633439 GBAA1063 GBAA1064     FALSE 0.014 303.000 0.000 NA   NA
 633439 633440 GBAA1064 GBAA1065     FALSE 0.528 74.000 0.333 NA   NA
 633440 633441 GBAA1065 GBAA1066     TRUE 0.802 -7.000 0.778 NA   NA
 633443 633444 GBAA1069 GBAA1070 pbpF hemE FALSE 0.364 180.000 0.020 1.000 N NA
 633444 633445 GBAA1070 GBAA1071 hemE hemH-1 TRUE 0.961 15.000 0.131 1.000 Y NA
 633445 633446 GBAA1071 GBAA1072 hemH-1 hemY-1 TRUE 0.921 71.000 0.069 1.000 Y NA
 633448 633449 GBAA1075 GBAA1076     FALSE 0.144 179.000 0.250 NA   NA
 633451 633452 GBAA1078 GBAA1079 blaI   TRUE 0.976 15.000 0.833 NA Y NA
 633452 633453 GBAA1079 GBAA1080     FALSE 0.430 214.000 0.000 NA Y NA
 633453 633454 GBAA1080 GBAA1081     FALSE 0.071 215.000 0.000 1.000   NA
 633454 633455 GBAA1081 GBAA1082     FALSE 0.319 147.000 0.300 NA   NA
 633455 633456 GBAA1082 GBAA1083     TRUE 0.866 22.000 0.778 NA   NA
 633458 633459 GBAA1085 GBAA1086     FALSE 0.177 238.000 0.150 1.000 N NA
 633461 633462 GBAA1088 GBAA1089     TRUE 0.760 10.000 0.200 1.000   NA
 633462 633463 GBAA1089 GBAA1090     FALSE 0.040 255.000 0.098 NA   NA
 633463 633464 GBAA1090 GBAA1091     FALSE 0.450 162.000 0.778 NA   NA
 633464 633465 GBAA1091 GBAA1092     FALSE 0.022 258.000 0.000 NA   NA
 633465 633466 GBAA1092 GBAA1093     FALSE 0.303 71.000 0.000 NA   NA
 633466 633467 GBAA1093 GBAA1094     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 633467 633468 GBAA1094 GBAA1095     FALSE 0.523 8.000 0.000 NA   NA
 633468 633469 GBAA1095 GBAA1096     FALSE 0.399 44.000 0.000 NA   NA
 633469 633470 GBAA1096 GBAA1097     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 633470 633471 GBAA1097 GBAA1098     FALSE 0.218 135.000 0.000 NA   NA
 633471 633472 GBAA1098 GBAA1099     TRUE 0.666 -7.000 0.429 NA   NA
 633472 633473 GBAA1099 GBAA1100     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 633473 10141499 GBAA1100 GBAA_1102     FALSE 0.011 327.000 0.000 NA   NA
 10141499 633474 GBAA_1102 GBAA1103     FALSE 0.310 69.000 0.000 NA   NA
 633474 633475 GBAA1103 GBAA1106     FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 633477 10141500 GBAA1109 GBAA_1110     FALSE 0.161 147.000 0.000 NA   NA
 10141500 633478 GBAA_1110 GBAA1111     FALSE 0.037 216.000 0.000 NA   NA
 633479 633480 GBAA1112 GBAA1113     TRUE 0.756 6.000 0.333 NA   NA
 633481 633482 GBAA1114 GBAA1116     FALSE 0.554 60.000 0.294 NA   NA
 633482 633483 GBAA1116 GBAA1117     FALSE 0.516 126.000 0.429 NA   NA
 633484 633485 GBAA1118 GBAA1119     TRUE 0.976 10.000 0.533 1.000 Y NA
 633486 633487 GBAA1120 GBAA1121     TRUE 0.669 15.000 0.273 NA   NA
 633487 633488 GBAA1121 GBAA1122     TRUE 0.779 32.000 0.500 NA   NA
 633488 633489 GBAA1122 GBAA1123     TRUE 0.797 12.000 0.500 NA   NA
 633489 633490 GBAA1123 GBAA1124     FALSE 0.299 135.000 0.009 NA   NA
 633490 633491 GBAA1124 GBAA1125     TRUE 0.731 137.000 0.022 0.099 N NA
 633491 633492 GBAA1125 GBAA1126     FALSE 0.127 213.000 0.000 0.099   NA
 633492 633493 GBAA1126 GBAA1127     TRUE 0.618 78.000 0.500 NA   NA
 633493 633494 GBAA1127 GBAA1129     FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 633494 633495 GBAA1129 GBAA1130     FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 633495 633496 GBAA1130 GBAA1131   aceB FALSE 0.110 184.000 0.044 NA   NA
 633496 633497 GBAA1131 GBAA1132 aceB aceA TRUE 0.962 24.000 0.084 1.000 Y NA
 633499 633500 GBAA1135 GBAA1136 cspA-1   FALSE 0.484 27.000 0.000 NA   NA
 633502 633503 GBAA1138 GBAA1139     FALSE 0.030 274.000 0.033 NA   NA
 633503 633504 GBAA1139 GBAA1140   sipT FALSE 0.523 57.000 0.246 NA   NA
 633504 633505 GBAA1140 GBAA1141 sipT addB TRUE 0.721 117.000 0.086 1.000 N NA
 633505 633506 GBAA1141 GBAA1142 addB addA TRUE 0.976 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 633506 633507 GBAA1142 GBAA1143 addA   TRUE 0.819 13.000 0.035 0.041   NA
 633508 633509 GBAA1144 GBAA1145 gerPF-1 gerPE FALSE 0.569 43.000 0.222 NA   NA
 633509 633510 GBAA1145 GBAA1146 gerPE gerPD TRUE 0.689 16.000 0.296 NA   NA
 633510 633511 GBAA1146 GBAA1147 gerPD gerPC TRUE 0.627 7.000 0.003 NA   NA
 633511 633512 GBAA1147 GBAA1148 gerPC gerPB FALSE 0.411 67.000 0.003 NA   NA
 633512 633513 GBAA1148 GBAA1149 gerPB gerPA TRUE 0.879 15.000 0.889 NA   NA
 633513 10141501 GBAA1149 GBAA_1150 gerPA   FALSE 0.256 97.000 0.000 NA   NA
 633515 633516 GBAA1153 GBAA1154   rocD FALSE 0.368 106.000 0.023 NA   NA
 633519 633520 GBAA1157 GBAA1158 asnO-1 hemH-2 FALSE 0.314 189.000 0.011 1.000 N NA
 633520 633521 GBAA1158 GBAA1159 hemH-2 katB TRUE 0.786 60.000 0.013 1.000 N NA
 633522 633523 GBAA1161 GBAA1162     FALSE 0.239 -25.000 0.000 NA   NA
 633523 633524 GBAA1162 GBAA1163     FALSE 0.046 251.000 0.000 1.000   NA
 633526 633527 GBAA1167 GBAA1168     FALSE 0.144 178.000 0.000 1.000   NA
 633528 633529 GBAA1169 GBAA1170 prsA-2   FALSE 0.528 129.000 0.467 NA   NA
 633531 633532 GBAA1172 GBAA1173     TRUE 0.891 1.000 0.826 NA   NA
 633532 633533 GBAA1173 GBAA1174     FALSE 0.551 106.000 0.429 NA   NA
 633534 633535 GBAA1175 GBAA1177   clpB FALSE 0.060 211.000 0.009 NA   NA
 633537 633538 GBAA1180 GBAA1181     FALSE 0.494 57.000 0.065 NA   NA
 633538 633539 GBAA1181 GBAA1182     FALSE 0.507 54.000 0.065 NA   NA
 633539 633540 GBAA1182 GBAA1183     FALSE 0.086 173.000 0.000 NA   NA
 633540 633541 GBAA1183 GBAA1184   fabH FALSE 0.255 117.000 0.000 NA   NA
 633541 633542 GBAA1184 GBAA1185 fabH fabF TRUE 0.959 32.000 0.076 1.000 Y NA
 633542 633543 GBAA1185 GBAA1186 fabF   TRUE 0.671 107.000 0.039 NA N NA
 633543 633544 GBAA1186 GBAA1187     FALSE 0.367 143.000 0.321 NA   NA
 633545 633546 GBAA1188 GBAA1189 trpS   FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 633547 633548 GBAA1191 GBAA1192     TRUE 0.915 128.000 0.031 0.043 Y NA
 633548 633549 GBAA1192 GBAA1193     TRUE 0.969 -3.000 0.165 0.043 Y NA
 633549 633550 GBAA1193 GBAA1194     TRUE 0.978 19.000 0.706 1.000 Y NA
 633550 633551 GBAA1194 GBAA1195     TRUE 0.817 -7.000 0.375 0.003   NA
 633557 633558 GBAA1202 GBAA1203   mecA TRUE 0.605 -3.000 0.059 NA   NA
 633558 633559 GBAA1203 GBAA1204 mecA cls-2 TRUE 0.746 73.000 0.314 NA N NA
 633559 633560 GBAA1204 GBAA1205 cls-2   FALSE 0.415 82.000 0.189 NA   NA
 633560 633561 GBAA1205 GBAA1206   pepF-1 TRUE 0.648 51.000 0.398 NA   NA
 633562 633563 GBAA1207 GBAA1208     FALSE 0.030 230.000 0.000 NA   NA
 633563 633564 GBAA1208 GBAA1209     TRUE 0.659 0.000 0.138 NA   NA
 633564 633565 GBAA1209 GBAA1210     FALSE 0.185 181.000 0.063 1.000   NA
 633566 633567 GBAA1211 GBAA1212     TRUE 0.670 31.000 0.283 NA   NA
 633567 633568 GBAA1212 GBAA1213     TRUE 0.882 19.000 0.725 1.000   NA
 633568 10141503 GBAA1213 GBAA_1214     TRUE 0.913 16.000 0.480 1.000 N NA
 633569 633570 GBAA1215 GBAA_1216     FALSE 0.179 -617.000 0.000 NA   NA
 633570 633571 GBAA_1216 GBAA1217     FALSE 0.195 141.000 0.000 NA   NA
 633571 10141504 GBAA1217 GBAA_1218     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 10141504 633572 GBAA_1218 GBAA1219     FALSE 0.183 143.000 0.000 NA   NA
 633572 633573 GBAA1219 GBAA1220     TRUE 0.693 7.000 0.242 NA   NA
 633573 633574 GBAA1220 GBAA1221     FALSE 0.483 128.000 0.212 1.000   NA
 633574 633575 GBAA1221 GBAA1222     FALSE 0.488 123.000 0.154 1.000   NA
 633576 633577 GBAA1224 GBAA1225     FALSE 0.448 138.000 0.222 1.000   NA
 633577 633578 GBAA1225 GBAA1226     TRUE 0.754 -3.000 0.444 NA   NA
 633578 633579 GBAA1226 GBAA1227     TRUE 0.776 13.000 0.471 NA   NA
 633579 633580 GBAA1227 GBAA1228     TRUE 0.774 15.000 0.471 NA   NA
 633580 633581 GBAA1228 GBAA1229   rfbC TRUE 0.966 9.000 0.096 1.000 Y NA
 633581 633582 GBAA1229 GBAA1230 rfbC rfbB TRUE 0.962 17.000 0.183 1.000 Y NA
 633582 633583 GBAA1230 GBAA1231 rfbB rfbD TRUE 0.974 12.000 0.088 0.002 Y NA
 633583 633584 GBAA1231 GBAA1232 rfbD fabI TRUE 0.735 109.000 0.082 1.000 N NA
 633584 633585 GBAA1232 GBAA1233 fabI   FALSE 0.302 141.000 0.129 NA   NA
 633587 633588 GBAA1235 GBAA1236     FALSE 0.551 102.000 0.438 NA   NA
 633589 633590 GBAA1237 GBAA1238   cotZ-2 FALSE 0.094 168.000 0.000 NA   NA
 633590 633591 GBAA1238 GBAA1239 cotZ-2   TRUE 0.575 143.000 0.700 NA   NA
 633591 633592 GBAA1239 GBAA1240     FALSE 0.155 193.000 0.222 1.000   NA
 633592 633593 GBAA1240 GBAA1241     TRUE 0.778 2.000 0.213 1.000   NA
 633593 633594 GBAA1241 GBAA1242     TRUE 0.699 93.000 0.287 NA N NA
 633595 633596 GBAA1243 GBAA1244     FALSE 0.278 149.000 0.267 NA   NA
 633597 633598 GBAA1245 GBAA1246     FALSE 0.034 271.000 0.130 NA   NA
 633599 633600 GBAA1247 GBAA1248   trpE FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 633600 633601 GBAA1248 GBAA1249 trpE pabA-2 TRUE 0.975 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 633601 633602 GBAA1249 GBAA1250 pabA-2 trpD TRUE 0.958 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 633602 633603 GBAA1250 GBAA1251 trpD   TRUE 0.969 2.000 0.216 1.000 Y NA
 633603 633604 GBAA1251 GBAA1252   trpF TRUE 0.973 -3.000 0.264 0.002 Y NA
 633604 633605 GBAA1252 GBAA1253 trpF trpB TRUE 0.976 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 633605 633606 GBAA1253 GBAA1254 trpB trpA TRUE 0.981 4.000 0.248 0.001 Y NA
 633606 633607 GBAA1254 GBAA1255 trpA   FALSE 0.393 75.000 0.015 NA   NA
 633607 633608 GBAA1255 GBAA1256     FALSE 0.385 115.000 0.119 NA   NA
 633608 633609 GBAA1256 GBAA1257     FALSE 0.394 92.000 0.167 NA   NA
 633611 633612 GBAA1259 GBAA1260     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 633612 633613 GBAA1260 GBAA1261     FALSE 0.290 76.000 0.000 NA   NA
 633613 633614 GBAA1261 GBAA1262     FALSE 0.282 79.000 0.000 NA   NA
 633614 633615 GBAA1262 GBAA1263     TRUE 0.656 2.000 0.033 NA   NA
 633615 633616 GBAA1263 GBAA1264     FALSE 0.503 102.000 0.098 1.000   NA
 633616 633617 GBAA1264 GBAA1265     FALSE 0.288 145.000 0.208 NA   NA
 633618 633619 GBAA1266 GBAA1267     TRUE 0.866 17.000 0.786 NA   NA
 633619 633620 GBAA1267 GBAA1268     TRUE 0.847 -3.000 0.733 NA   NA
 633620 633621 GBAA1268 GBAA1269   odhB FALSE 0.332 125.000 0.014 NA   NA
 633621 633622 GBAA1269 GBAA1270 odhB odhA TRUE 0.925 136.000 0.667 1.000 Y NA
 633623 633624 GBAA1271 GBAA1272     TRUE 0.901 3.000 0.875 NA   NA
 633624 633625 GBAA1272 GBAA1273     TRUE 0.838 29.000 0.667 NA   NA
 633625 633626 GBAA1273 GBAA1274     TRUE 0.610 135.000 0.667 NA   NA
 633626 633627 GBAA1274 GBAA1275     TRUE 0.656 58.000 0.444 NA   NA
 633627 633628 GBAA1275 GBAA1276     FALSE 0.137 153.000 0.000 NA   NA
 633628 633629 GBAA1276 GBAA1277     FALSE 0.218 135.000 0.000 NA   NA
 633629 633630 GBAA1277 GBAA1278     FALSE 0.479 18.000 0.000 NA   NA
 633630 633631 GBAA1278 GBAA1279     FALSE 0.430 38.000 0.000 NA   NA
 633631 633632 GBAA1279 GBAA1280     FALSE 0.405 43.000 0.000 NA   NA
 5451225 633634 tRNA-Val-5 GBAA1281     FALSE 0.061 189.000 0.000 NA   NA
 633634 633635 GBAA1281 GBAA1282     FALSE 0.031 278.000 0.103 NA   NA
 633635 633636 GBAA1282 GBAA1283     FALSE 0.091 170.000 0.000 NA   NA
 633637 633638 GBAA1284 GBAA1286     FALSE 0.463 156.000 0.700 NA   NA
 633638 633639 GBAA1286 GBAA1287   sipW FALSE 0.267 195.000 0.320 0.036   NA
 633639 633640 GBAA1287 GBAA1288 sipW   FALSE 0.561 63.000 0.320 NA   NA
 633640 10141505 GBAA1288 GBAA_1289     FALSE 0.450 162.000 0.778 NA   NA
 10141505 633641 GBAA_1289 GBAA1290     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 633642 633643 GBAA1292 GBAA1293 sinR   TRUE 0.747 80.000 0.389 0.004   NA
 633644 633645 GBAA1295 GBAA1296   ywdH FALSE 0.217 172.000 0.069 1.000   NA
 633645 633646 GBAA1296 GBAA1297 ywdH potA FALSE 0.166 227.000 0.000 1.000 N NA
 633646 633647 GBAA1297 GBAA1298 potA potB TRUE 0.983 -3.000 0.789 0.042 Y NA
 633647 633648 GBAA1298 GBAA1299 potB potC TRUE 0.978 7.000 0.286 0.042 Y NA
 633648 633649 GBAA1299 GBAA1300 potC potD TRUE 0.963 39.000 0.067 0.042 Y NA
 633649 633650 GBAA1300 GBAA1301 potD   TRUE 0.746 90.000 0.267 1.000 N NA
 633650 633651 GBAA1301 GBAA1302     TRUE 0.590 111.000 0.333 1.000   NA
 633651 633652 GBAA1302 GBAA1303     FALSE 0.481 101.000 0.333 NA   NA
 633652 10141506 GBAA1303 GBAA_1304     FALSE 0.382 99.000 0.089 NA   NA
 10141506 633653 GBAA_1304 GBAA1305     FALSE 0.386 92.000 0.089 NA   NA
 633654 633655 GBAA1306 GBAA1308     FALSE 0.006 466.000 0.000 NA   NA
 633655 633656 GBAA1308 GBAA1309   glcD TRUE 0.976 -3.000 0.342 0.001 Y NA
 633656 633657 GBAA1309 GBAA1310 glcD   TRUE 0.729 118.000 0.247 1.000 N NA
 633658 633659 GBAA1311 GBAA1312     TRUE 0.723 -7.000 0.543 NA   NA
 633659 633660 GBAA1312 GBAA1313     TRUE 0.981 4.000 0.621 1.000 Y NA
 633660 633661 GBAA1313 GBAA1314     FALSE 0.117 261.000 0.000 1.000 N NA
 633661 633662 GBAA1314 GBAA1315     FALSE 0.509 168.000 0.395 1.000 N NA
 633662 633663 GBAA1315 GBAA1316     TRUE 0.982 17.000 0.947 1.000 Y NA
 633663 633664 GBAA1316 GBAA1317     TRUE 0.915 0.000 0.500 0.001   NA
 633664 633665 GBAA1317 GBAA1318   comC FALSE 0.493 113.000 0.022 1.000   NA
 633665 633666 GBAA1318 GBAA_1319 comC   FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 633666 633667 GBAA_1319 GBAA1320     FALSE 0.193 -182.000 0.000 NA   NA
 633668 633669 GBAA1321 GBAA1322     FALSE 0.523 204.000 0.000 1.000 Y NA
 633669 633670 GBAA1322 GBAA1323     FALSE 0.314 295.000 0.000 0.072 Y NA
 633670 633671 GBAA1323 GBAA1324     TRUE 0.640 115.000 0.455 1.000   NA
 633671 633672 GBAA1324 GBAA1326     FALSE 0.555 148.000 0.615 1.000   NA
 633672 633673 GBAA1326 GBAA1327     TRUE 0.644 102.000 0.615 NA   NA
 633673 633674 GBAA1327 GBAA1328     TRUE 0.601 43.000 0.273 NA   NA
 633675 633676 GBAA1329 GBAA1330     FALSE 0.385 150.000 0.450 NA   NA
 633676 633677 GBAA1330 GBAA1331   phaC TRUE 0.939 83.000 0.161 0.001 Y NA
 633677 633678 GBAA1331 GBAA1332 phaC   TRUE 0.721 96.000 0.113 1.000 N NA
 633678 633679 GBAA1332 GBAA1333     TRUE 0.877 24.000 0.096 1.000 N NA
 633681 633682 GBAA1335 GBAA1337     FALSE 0.031 229.000 0.000 NA   NA
 633682 10141507 GBAA1337 GBAA_1338     FALSE 0.481 21.000 0.000 NA   NA
 10141507 633683 GBAA_1338 GBAA_1339     FALSE 0.528 1.000 0.000 NA   NA
 633683 633684 GBAA_1339 GBAA1340   phnX TRUE 0.649 22.000 0.000 1.000   NA
 633684 633685 GBAA1340 GBAA1341 phnX   TRUE 0.845 16.000 0.315 0.076   NA
 633685 633686 GBAA1341 GBAA1342     TRUE 0.949 -3.000 0.029 NA Y NA
 633686 633687 GBAA1342 GBAA1343     TRUE 0.797 41.000 0.029 NA N NA
 633687 633688 GBAA1343 GBAA1344     TRUE 0.636 72.000 0.500 NA   NA
 633688 10141508 GBAA1344 GBAA_1345     FALSE 0.125 156.000 0.000 NA   NA
 10141508 633689 GBAA_1345 GBAA1346     FALSE 0.172 -1628.000 0.000 NA   NA
 633689 10141509 GBAA1346 GBAA_1347     FALSE 0.016 286.000 0.000 NA   NA
 10141509 633690 GBAA_1347 GBAA1348     FALSE 0.239 126.000 0.000 NA   NA
 633693 633694 GBAA1352 GBAA1353     FALSE 0.482 161.000 0.129 1.000 N NA
 633694 633695 GBAA1353 GBAA1354     FALSE 0.315 139.000 0.114 NA   NA
 633695 633696 GBAA1354 GBAA1355     FALSE 0.536 103.000 0.417 NA   NA
 633698 633699 GBAA1359 GBAA1360     TRUE 0.756 0.000 0.062 1.000   NA
 633699 633700 GBAA1360 GBAA1361     TRUE 0.833 -7.000 0.280 1.000 N NA
 633700 633701 GBAA1361 GBAA1362     TRUE 0.726 19.000 0.101 1.000   NA
 633703 633704 GBAA1364 GBAA1365     FALSE 0.393 89.000 0.140 NA   NA
 633706 633707 GBAA1367 GBAA1368     TRUE 0.648 27.000 0.229 NA   NA
 633707 633708 GBAA1368 GBAA1369   nrdI FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 633708 633709 GBAA1369 GBAA_1371 nrdI nrdE TRUE 0.918 -13.000 0.333 NA Y NA
 633709 633710 GBAA_1371 GBAA1372 nrdE nrdF FALSE 0.211 2516.000 0.625 0.001 Y NA
 633710 633711 GBAA1372 GBAA1373 nrdF   FALSE 0.185 217.000 0.000 1.000 N NA
 633711 633712 GBAA1373 GBAA1374     TRUE 0.879 -3.000 0.280 1.000 N NA
 633712 633713 GBAA1374 GBAA1375     TRUE 0.856 -3.000 0.778 NA   NA
 633713 633714 GBAA1375 GBAA1376     TRUE 0.699 111.000 0.727 NA   NA
 633714 633715 GBAA1376 GBAA1377     TRUE 0.801 0.000 0.471 NA   NA
 633715 633716 GBAA1377 GBAA1378     FALSE 0.076 203.000 0.040 NA   NA
 633717 633718 GBAA1379 GBAA1380     FALSE 0.422 101.000 0.258 NA   NA
 633719 633720 GBAA1381 GBAA1382     FALSE 0.526 -7.000 0.194 NA   NA
 633720 633721 GBAA1382 GBAA1383     FALSE 0.395 87.000 0.127 NA   NA
 633724 633725 GBAA1386 GBAA1387 dltD-1 dltC TRUE 0.714 -3.000 0.064 1.000   NA
 633725 633726 GBAA1387 GBAA1388 dltC dltB TRUE 0.575 69.000 0.387 NA   NA
 633726 633727 GBAA1388 GBAA1389 dltB dltA TRUE 0.879 -3.000 0.435 NA N NA
 633727 633728 GBAA1389 GBAA1390 dltA   TRUE 0.805 13.000 0.549 NA   NA
 633729 633730 GBAA1392 GBAA1393 amaA   FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 633730 633731 GBAA1393 GBAA1394     TRUE 0.706 23.000 0.316 NA   NA
 633731 633732 GBAA1394 GBAA1395     TRUE 0.660 52.000 0.421 NA   NA
 633732 633733 GBAA1395 GBAA1396     FALSE 0.492 100.000 0.357 NA   NA
 633736 633737 GBAA1399 GBAA1400     TRUE 0.837 19.000 0.667 NA   NA
 633741 633742 GBAA1404 GBAA1405     FALSE 0.428 67.000 0.022 NA   NA
 633743 633744 GBAA1406 GBAA1407     TRUE 0.649 137.000 0.778 NA   NA
 633748 633749 GBAA1411 GBAA1412     TRUE 0.708 85.000 0.750 NA   NA
 633750 633751 GBAA1413 GBAA1414     FALSE 0.388 118.000 0.195 NA   NA
 633752 633753 GBAA1415 GBAA1416   ilvE-1 FALSE 0.378 120.000 0.150 NA   NA
 633753 633754 GBAA1416 GBAA1417 ilvE-1 ilvB-1 FALSE 0.223 316.000 0.000 1.000 Y NA
 633754 633755 GBAA1417 GBAA1418 ilvB-1 ilvN TRUE 0.973 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 633755 633756 GBAA1418 GBAA1419 ilvN ilvC-1 TRUE 0.974 27.000 0.130 0.002 Y NA
 633756 633757 GBAA1419 GBAA1420 ilvC-1 leuA TRUE 0.968 2.000 0.103 1.000 Y NA
 633757 633758 GBAA1420 GBAA1421 leuA leuB TRUE 0.940 78.000 0.041 0.001 Y NA
 633758 633759 GBAA1421 GBAA1422 leuB leuC TRUE 0.977 0.000 0.080 0.001 Y NA
 633759 633760 GBAA1422 GBAA1423 leuC leuD TRUE 0.948 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 633760 633761 GBAA1423 GBAA1424 leuD   FALSE 0.231 311.000 0.000 1.000 Y NA
 633761 633762 GBAA1424 GBAA1425   hisG TRUE 0.928 -24.000 0.239 0.003 Y NA
 633762 633763 GBAA1425 GBAA1426 hisG hisD TRUE 0.975 12.000 0.254 0.003 Y NA
 633763 633764 GBAA1426 GBAA1427 hisD hisB TRUE 0.976 0.000 0.096 0.003 Y NA
 633764 633765 GBAA1427 GBAA1428 hisB hisH TRUE 0.977 1.000 0.125 0.003 Y NA
 633765 633766 GBAA1428 GBAA1429 hisH hisA TRUE 0.921 -27.000 0.124 0.003 Y NA
 633766 633767 GBAA1429 GBAA1430 hisA hisF TRUE 0.970 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 633767 10141511 GBAA1430 GBAA_1431 hisF hisE TRUE 0.977 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 10141511 10141512 GBAA_1431 GBAA_5744 hisE   TRUE 0.975 11.000 0.152 0.003 Y NA
 10141512 633768 GBAA_5744 GBAA1432     TRUE 0.973 12.000 0.016 0.003 Y NA
 633768 633769 GBAA1432 GBAA1433     TRUE 0.749 68.000 0.750 NA   NA
 633769 633770 GBAA1433 GBAA1434     FALSE 0.256 147.000 0.096 NA   NA
 633771 633772 GBAA1435 GBAA1436     FALSE 0.350 182.000 0.011 1.000 N NA
 633773 633774 GBAA1437 GBAA1438   lysA FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 633774 633775 GBAA1438 GBAA1439 lysA   FALSE 0.015 297.000 0.000 NA   NA
 633775 633776 GBAA1439 GBAA1440   cysH FALSE 0.361 87.000 0.011 NA   NA
 633776 633777 GBAA1440 GBAA1441 cysH sat TRUE 0.848 39.000 0.065 1.000 N NA
 633777 633778 GBAA1441 GBAA1442 sat cysC TRUE 0.974 13.000 0.101 0.001 Y NA
 633778 633779 GBAA1442 GBAA1443 cysC nirA TRUE 0.963 12.000 0.067 1.000 Y NA
 633779 633780 GBAA1443 GBAA1444 nirA   TRUE 0.845 11.000 0.647 NA   NA
 633780 633781 GBAA1444 GBAA1445   cysG FALSE 0.454 87.000 0.281 NA   NA
 633781 633782 GBAA1445 GBAA1446 cysG   TRUE 0.799 2.000 0.281 1.000   NA
 633782 633783 GBAA1446 GBAA1447     FALSE 0.571 -25.000 0.375 1.000   NA
 633783 633784 GBAA1447 GBAA1448     FALSE 0.013 422.000 0.000 1.000   NA
 633786 633787 GBAA1450 GBAA1451     TRUE 0.675 68.000 0.556 NA   NA
 633787 633788 GBAA1451 GBAA1452     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 633788 633789 GBAA1452 GBAA1453     FALSE 0.052 229.000 0.046 NA   NA
 633789 633790 GBAA1453 GBAA1454     TRUE 0.720 51.000 0.514 NA   NA
 633790 633791 GBAA1454 GBAA1455     FALSE 0.395 107.000 0.135 NA   NA
 633791 633792 GBAA1455 GBAA1456     TRUE 0.658 0.000 0.080 NA   NA
 633792 633793 GBAA1456 GBAA1457     TRUE 0.984 -3.000 0.853 0.018 Y NA
 633793 633794 GBAA1457 GBAA1458     FALSE 0.456 67.000 0.075 NA   NA
 633800 633801 GBAA1465 GBAA1466     FALSE 0.387 115.000 0.092 NA   NA
 633801 633802 GBAA1466 GBAA1467   hmp FALSE 0.181 160.000 0.049 NA   NA
 633805 633806 GBAA1470 GBAA1471     FALSE 0.462 130.000 0.136 1.000   NA
 633806 633807 GBAA1471 GBAA1472     TRUE 0.956 12.000 0.100 NA Y NA
 633809 633811 GBAA1475 GBAA1477     FALSE 0.015 396.000 0.250 NA   NA
 633810 633809 GBAA_1476 GBAA1475     FALSE 0.189 -227.000 0.000 NA   NA
 633811 10141513 GBAA1477 GBAA_1478     FALSE 0.032 226.000 0.000 NA   NA
 633813 633814 GBAA1480 GBAA1481     TRUE 0.574 120.000 0.500 NA   NA
 633814 633815 GBAA1481 GBAA1482     TRUE 0.614 108.000 0.389 1.000   NA
 633815 633816 GBAA1482 GBAA1483   deoD FALSE 0.505 157.000 0.040 1.000 N NA
 633817 633818 GBAA1484 GBAA1485     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 633820 633821 GBAA1487 GBAA1488     TRUE 0.765 22.000 0.435 NA   NA
 633821 633822 GBAA1488 GBAA1489     FALSE 0.392 106.000 0.101 NA   NA
 633822 633823 GBAA1489 GBAA1490     TRUE 0.732 113.000 0.101 1.000 N NA
 633823 633824 GBAA1490 GBAA1491   spmA TRUE 0.656 -7.000 0.252 1.000   NA
 633824 633825 GBAA1491 GBAA1492 spmA   TRUE 0.909 -3.000 0.655 0.003   NA
 633825 10141514 GBAA1492 GBAA_1493   rluB FALSE 0.044 290.000 0.063 1.000   NA
 10141514 633826 GBAA_1493 GBAA1494 rluB resA TRUE 0.722 95.000 0.069 1.000 N NA
 633826 633827 GBAA1494 GBAA1495 resA resB TRUE 0.907 122.000 0.306 1.000 Y NA
 633827 633828 GBAA1495 GBAA1496 resB resC TRUE 0.964 15.000 0.278 1.000 Y NA
 633828 633829 GBAA1496 GBAA1497 resC resD FALSE 0.098 303.000 0.178 1.000 N NA
 633829 633830 GBAA1497 GBAA1498 resD resE TRUE 0.982 0.000 0.511 0.078 Y NA
 633830 633831 GBAA1498 GBAA1499 resE   FALSE 0.551 138.000 0.046 0.097   NA
 633831 633832 GBAA1499 GBAA1500     FALSE 0.516 85.000 0.108 1.000   NA
 633836 633837 GBAA1504 GBAA1505   recQ-1 FALSE 0.470 -10.000 0.103 NA   NA
 633837 633838 GBAA1505 GBAA1506 recQ-1   TRUE 0.668 0.000 0.192 NA   NA
 633838 633839 GBAA1506 GBAA1507     TRUE 0.708 23.000 0.320 NA   NA
 633839 10141515 GBAA1507 GBAA_1508     FALSE 0.318 67.000 0.000 NA   NA
 10141515 633840 GBAA_1508 GBAA1509     FALSE 0.517 0.000 0.000 NA   NA
 633840 633841 GBAA1509 GBAA1510     TRUE 0.764 78.000 0.417 NA N NA
 633841 633842 GBAA1510 GBAA1511   gdhA FALSE 0.108 269.000 0.222 NA N NA
 633842 633843 GBAA1511 GBAA1512 gdhA   FALSE 0.437 79.000 0.233 NA   NA
 633843 633844 GBAA1512 GBAA1513     TRUE 0.674 96.000 0.700 NA   NA
 633844 633845 GBAA1513 GBAA1514     TRUE 0.700 86.000 0.727 NA   NA
 633845 633846 GBAA1514 GBAA1515     FALSE 0.219 170.000 0.044 1.000   NA
 633848 633849 GBAA1517 GBAA1518   cmk FALSE 0.321 129.000 0.016 NA   NA
 633849 633850 GBAA1518 GBAA1519 cmk rpsA FALSE 0.075 334.000 0.047 1.000 N NA
 633850 633851 GBAA1519 GBAA1520 rpsA   TRUE 0.874 13.000 0.061 1.000 N NA
 633853 633854 GBAA1522 GBAA1523     TRUE 0.731 -7.000 0.567 NA   NA
 633854 633855 GBAA1523 GBAA1524     TRUE 0.819 -3.000 0.633 NA   NA
 633855 633856 GBAA1524 GBAA1525     FALSE 0.332 125.000 0.014 NA   NA
 633856 633857 GBAA1525 GBAA1526   gpsA TRUE 0.727 19.000 0.068 1.000   NA
 633857 633858 GBAA1526 GBAA1527 gpsA   FALSE 0.365 117.000 0.039 NA   NA
 633858 633859 GBAA1527 GBAA1528     FALSE 0.020 267.000 0.000 NA   NA
 633859 633860 GBAA1528 GBAA1529     TRUE 0.702 101.000 0.771 NA   NA
 633860 633861 GBAA1529 GBAA1530   spoIVA FALSE 0.046 243.000 0.081 NA   NA
 633861 633862 GBAA1530 GBAA1531 spoIVA hup-1 FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 633862 633863 GBAA1531 GBAA1532 hup-1 mtrA TRUE 0.715 121.000 0.154 1.000 N NA
 633863 633864 GBAA1532 GBAA1533 mtrA   FALSE 0.059 261.000 0.114 1.000   NA
 633864 633865 GBAA1533 GBAA1534   menG TRUE 0.878 30.000 0.708 1.000   NA
 633865 633866 GBAA1534 GBAA1535 menG hepT TRUE 0.969 32.000 0.476 1.000 Y NA
 633866 633867 GBAA1535 GBAA1536 hepT   TRUE 0.704 125.000 0.054 1.000 N NA
 633867 633868 GBAA1536 GBAA1537   aroF-1 FALSE 0.120 271.000 0.002 1.000 N NA
 633868 633869 GBAA1537 GBAA1538 aroF-1 aroB TRUE 0.977 0.000 0.110 0.001 Y NA
 633869 633870 GBAA1538 GBAA1539 aroB hisC-1 TRUE 0.881 132.000 0.009 1.000 Y NA
 633870 633871 GBAA1539 GBAA1541 hisC-1   FALSE 0.025 313.000 0.000 1.000   NA
 633871 633872 GBAA1541 GBAA1542     FALSE 0.551 74.000 0.375 NA   NA
 633872 633873 GBAA1542 GBAA1543     FALSE 0.426 154.000 0.583 NA   NA
 633873 633874 GBAA1543 GBAA1544   qcrA FALSE 0.144 216.000 0.540 NA   NA
 633874 633875 GBAA1544 GBAA1545 qcrA qcrB TRUE 0.898 1.000 0.447 0.037   NA
 633875 633876 GBAA1545 GBAA1546 qcrB qcrC TRUE 0.773 44.000 0.095 0.037   NA
 633876 633877 GBAA1546 GBAA1547 qcrC   FALSE 0.507 43.000 0.005 NA   NA
 633877 633878 GBAA1547 GBAA1548     FALSE 0.523 -6.000 0.036 NA   NA
 633878 633879 GBAA1548 GBAA1549     TRUE 0.627 26.000 0.104 NA   NA
 633879 633880 GBAA1549 GBAA1550     FALSE 0.394 108.000 0.104 NA   NA
 633880 633881 GBAA1550 GBAA1551     FALSE 0.386 113.000 0.050 NA   NA
 633881 633882 GBAA1551 GBAA1552     FALSE 0.483 102.000 0.020 1.000   NA
 633884 633885 GBAA1554 GBAA1555   dapB TRUE 0.647 0.000 0.044 NA   NA
 633885 633886 GBAA1555 GBAA1556 dapB mgsA TRUE 0.909 15.000 0.044 0.039 N NA
 633886 633887 GBAA1556 GBAA1557 mgsA   TRUE 0.635 12.000 0.081 NA   NA
 633887 633888 GBAA1557 GBAA1558     TRUE 0.622 -3.000 0.210 NA   NA
 633888 633889 GBAA1558 GBAA1559   pcnB TRUE 0.766 -13.000 0.126 1.000 N NA
 633889 633890 GBAA1559 GBAA1560 pcnB birA TRUE 0.755 -15.000 0.134 1.000 N NA
 633892 633893 GBAA1562 GBAA1563 panB panC TRUE 0.977 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 633893 633894 GBAA1563 GBAA1564 panC panD TRUE 0.967 13.000 0.342 1.000 Y NA
 633894 633895 GBAA1564 GBAA1565 panD   TRUE 0.692 129.000 0.053 1.000 N NA
 633895 633896 GBAA1565 GBAA1566     FALSE 0.041 251.000 0.056 NA   NA
 633896 633897 GBAA1566 GBAA1567     TRUE 0.721 8.000 0.289 NA   NA
 633897 633898 GBAA1567 GBAA1568   aspB TRUE 0.792 19.000 0.367 1.000   NA
 633898 633899 GBAA1568 GBAA1569 aspB dnaD TRUE 0.654 122.000 0.072 NA N NA
 633899 633900 GBAA1569 GBAA1570 dnaD nth TRUE 0.953 16.000 0.075 NA Y NA
 633900 633901 GBAA1570 GBAA1571 nth   TRUE 0.668 4.000 0.034 NA   NA
 633902 633903 GBAA1572 GBAA1573   recU TRUE 0.577 66.000 0.056 1.000   NA
 633906 633907 GBAA1577 GBAA1578     TRUE 0.627 16.000 0.148 NA   NA
 633909 633910 GBAA1580 GBAA1581     FALSE 0.276 155.000 0.318 NA   NA
 633910 633911 GBAA1581 GBAA1582     FALSE 0.499 56.000 0.074 NA   NA
 633911 633912 GBAA1582 GBAA1583     TRUE 0.619 98.000 0.579 NA   NA
 633912 633913 GBAA1583 GBAA1584     FALSE 0.005 659.000 0.000 NA   NA
 633913 633914 GBAA1584 GBAA1585     FALSE 0.440 62.000 0.014 NA   NA
 633914 633915 GBAA1585 GBAA1586     FALSE 0.351 138.000 0.250 NA   NA
 633915 633916 GBAA1586 GBAA1587     TRUE 0.732 106.000 0.118 1.000 N NA
 633916 633917 GBAA1587 GBAA1588     FALSE 0.559 46.000 0.000 1.000   NA
 633919 633920 GBAA1590 GBAA1591 maP-2 xpt FALSE 0.066 326.000 0.000 1.000 N NA
 633920 633921 GBAA1591 GBAA1592 xpt pbuX TRUE 0.970 4.000 0.056 1.000 Y NA
 633922 633923 GBAA1593 GBAA1594     FALSE 0.102 164.000 0.000 NA   NA
 633926 633927 GBAA1597 GBAA1598     TRUE 0.628 22.000 0.069 NA   NA
 633927 633928 GBAA1598 GBAA1599     TRUE 0.670 3.000 0.046 NA   NA
 633930 633931 GBAA1601 GBAA1602     TRUE 0.710 88.000 0.765 NA   NA
 633931 633932 GBAA1602 GBAA1603     TRUE 0.807 -3.000 0.588 NA   NA
 633932 633933 GBAA1603 GBAA1605     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 633933 633934 GBAA1605 GBAA1606     FALSE 0.465 131.000 0.157 1.000   NA
 633934 633935 GBAA1606 GBAA1607     FALSE 0.015 357.000 0.039 NA   NA
 633935 633936 GBAA1607 GBAA1608     FALSE 0.010 337.000 0.000 NA   NA
 633936 633937 GBAA1608 GBAA1609     TRUE 0.949 1.000 0.750 1.000 N NA
 633937 633938 GBAA1609 GBAA_1610     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 633938 633939 GBAA_1610 GBAA1611     FALSE 0.185 -422.000 0.000 NA   NA
 633939 633940 GBAA1611 GBAA1612     TRUE 0.850 19.000 0.714 NA   NA
 633940 633941 GBAA1612 GBAA1613     TRUE 0.825 43.000 0.625 1.000   NA
 633941 633942 GBAA1613 GBAA1614     TRUE 0.831 4.000 0.500 NA   NA
 633942 633943 GBAA1614 GBAA1615     FALSE 0.351 -25.000 0.046 NA   NA
 633943 10141516 GBAA1615 GBAA_1616     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 10141516 633944 GBAA_1616 GBAA1617     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 633949 633950 GBAA1622 GBAA1623   rnhA TRUE 0.761 8.000 0.133 1.000   NA
 633950 633951 GBAA1623 GBAA1624 rnhA   TRUE 0.770 70.000 0.076 1.000 N NA
 633952 633953 GBAA1625 GBAA1626     FALSE 0.293 144.000 0.200 NA   NA
 633953 633954 GBAA1626 GBAA1627     TRUE 0.843 13.000 0.680 NA   NA
 633955 633956 GBAA1628 GBAA1629   cspB-1 TRUE 0.632 120.000 0.619 NA   NA
 633957 633958 GBAA1630 GBAA1631     FALSE 0.385 140.000 0.308 NA   NA
 633958 633959 GBAA1631 GBAA1632     TRUE 0.789 20.000 0.500 NA   NA
 633959 633960 GBAA1632 GBAA1633     FALSE 0.450 80.000 0.259 NA   NA
 633960 633961 GBAA1633 GBAA1634     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 633961 633962 GBAA1634 GBAA1635     TRUE 0.811 3.000 0.455 NA   NA
 633962 633963 GBAA1635 GBAA1636     FALSE 0.218 187.000 0.364 1.000   NA
 633963 633964 GBAA1636 GBAA1637     FALSE 0.517 0.000 0.000 NA   NA
 633964 633965 GBAA1637 GBAA1638     FALSE 0.303 -13.000 0.000 NA   NA
 633967 633968 GBAA_1640 GBAA1641     FALSE 0.404 98.000 0.000 1.000   NA
 633968 633969 GBAA1641 GBAA1642     TRUE 0.675 139.000 0.250 1.000 N NA
 633971 633972 GBAA1644 GBAA1645     FALSE 0.394 -19.000 0.100 NA   NA
 633972 633973 GBAA1645 GBAA1646     FALSE 0.332 146.000 0.300 NA   NA
 633973 633974 GBAA1646 GBAA1647     FALSE 0.033 273.000 0.143 NA   NA
 633974 633975 GBAA1647 GBAA1648     FALSE 0.529 51.000 0.190 NA   NA
 633976 633977 GBAA1649 GBAA1650     FALSE 0.344 125.000 0.031 NA   NA
 633977 633978 GBAA1650 GBAA1651     TRUE 0.711 20.000 0.333 NA   NA
 633978 633979 GBAA1651 GBAA1652     FALSE 0.348 129.000 0.118 NA   NA
 633979 633980 GBAA1652 GBAA1653     TRUE 0.667 8.000 0.147 NA   NA
 633980 633981 GBAA1653 GBAA1654     FALSE 0.222 167.000 0.333 NA   NA
 633982 633983 GBAA1655 GBAA1656   hfq-1 TRUE 0.812 48.000 0.778 NA   NA
 633985 633986 GBAA1658 GBAA1659     TRUE 0.963 23.000 0.192 1.000 Y NA
 633986 633987 GBAA1659 GBAA1660     FALSE 0.563 151.000 0.143 1.000 N NA
 633987 10141517 GBAA1660 GBAA_1661     FALSE 0.228 130.000 0.000 NA   NA
 10141517 633988 GBAA_1661 GBAA1662     FALSE 0.084 174.000 0.000 NA   NA
 633988 633989 GBAA1662 GBAA1663     TRUE 0.716 30.000 0.042 1.000   NA
 633989 633990 GBAA1663 GBAA1664     TRUE 0.881 28.000 0.889 NA   NA
 633991 633992 GBAA1665 GBAA1666 cheR   FALSE 0.533 45.000 0.053 NA   NA
 633993 633994 GBAA1667 GBAA1668     TRUE 0.619 17.000 0.056 NA   NA
 633994 633995 GBAA1668 GBAA1669     TRUE 0.612 18.000 0.045 NA   NA
 633995 10141518 GBAA1669 GBAA_1670     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 10141518 633996 GBAA_1670 GBAA1671     FALSE 0.479 20.000 0.000 NA   NA
 633996 633997 GBAA1671 GBAA1672     TRUE 0.971 23.000 0.000 0.001 Y NA
 633997 633998 GBAA1672 GBAA1673     FALSE 0.332 -10.000 0.000 NA   NA
 633998 633999 GBAA1673 GBAA1674   flgB FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 633999 634000 GBAA1674 GBAA1675 flgB flgC TRUE 0.986 21.000 0.804 0.002 Y NA
 634000 634001 GBAA1675 GBAA1676 flgC   TRUE 0.973 17.000 0.068 0.002 Y NA
 634001 10141519 GBAA1676 GBAA_1677     FALSE 0.486 23.000 0.000 NA   NA
 10141519 634002 GBAA_1677 GBAA1679   fliG FALSE 0.477 14.000 0.000 NA   NA
 634002 634003 GBAA1679 GBAA1680 fliG   TRUE 0.620 -13.000 0.471 NA   NA
 634003 634004 GBAA1680 GBAA1681     TRUE 0.606 -3.000 0.129 NA   NA
 634004 10141520 GBAA1681 GBAA_1682     FALSE 0.255 117.000 0.000 NA   NA
 10141520 634005 GBAA_1682 GBAA1683     FALSE 0.371 -7.000 0.000 NA   NA
 634005 634006 GBAA1683 GBAA1684     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 634006 634007 GBAA1684 GBAA1685     TRUE 0.675 4.000 0.047 NA   NA
 634007 634008 GBAA1685 GBAA1686     TRUE 0.625 22.000 0.117 NA   NA
 634008 634009 GBAA1686 GBAA1687     FALSE 0.534 50.000 0.195 NA   NA
 634009 634010 GBAA1687 GBAA_1688     FALSE 0.013 308.000 0.000 NA   NA
 634010 634011 GBAA_1688 GBAA1689     FALSE 0.186 -317.000 0.000 NA   NA
 634011 10141521 GBAA1689 GBAA_1690     FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 10141521 634012 GBAA_1690 GBAA1692     FALSE 0.005 637.000 0.000 NA   NA
 634012 634013 GBAA1692 GBAA1693     FALSE 0.004 1079.000 0.000 NA   NA
 634013 634014 GBAA1693 GBAA1694     FALSE 0.290 -15.000 0.000 NA   NA
 634014 634015 GBAA1694 GBAA1695     FALSE 0.370 52.000 0.000 NA   NA
 634015 634016 GBAA1695 GBAA1696     FALSE 0.205 139.000 0.000 NA   NA
 634016 634017 GBAA1696 GBAA1697     FALSE 0.258 116.000 0.000 NA   NA
 634017 634018 GBAA1697 GBAA1698     FALSE 0.029 233.000 0.000 NA   NA
 634018 634019 GBAA1698 GBAA_1699     FALSE 0.004 1252.000 0.000 NA   NA
 634019 10141522 GBAA_1699 GBAA_1700     FALSE 0.182 -522.000 0.000 NA   NA
 10141522 634020 GBAA_1700 GBAA1701     FALSE 0.005 606.000 0.000 NA   NA
 634020 10141523 GBAA1701 GBAA_1702     FALSE 0.013 310.000 0.000 NA   NA
 10141523 634021 GBAA_1702 GBAA1703     FALSE 0.258 101.000 0.000 NA   NA
 634021 634022 GBAA1703 GBAA1704     FALSE 0.419 40.000 0.000 NA   NA
 634022 10141524 GBAA1704 GBAA_1705     FALSE 0.062 188.000 0.000 NA   NA
 634024 10141525 GBAA1707 GBAA_1708     FALSE 0.332 63.000 0.000 NA   NA
 10141525 10141526 GBAA_1708 GBAA_1709     FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 10141526 634025 GBAA_1709 GBAA1710     FALSE 0.504 11.000 0.000 NA   NA
 634025 634026 GBAA1710 GBAA1711     TRUE 0.742 13.000 0.400 NA   NA
 634026 634027 GBAA1711 GBAA1712     TRUE 0.608 -3.000 0.073 NA   NA
 634027 634028 GBAA1712 GBAA1713     TRUE 0.970 34.000 0.162 0.003 Y NA
 634028 634029 GBAA1713 GBAA1714   fliR TRUE 0.970 16.000 0.181 0.092 Y NA
 634029 634030 GBAA1714 GBAA1715 fliR   TRUE 0.974 11.000 0.259 0.092 Y NA
 634030 634031 GBAA1715 GBAA1716   flhA TRUE 0.974 24.000 0.207 0.003 Y NA
 634031 634032 GBAA1716 GBAA_1717 flhA   FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 634032 634033 GBAA_1717 GBAA1718     FALSE 0.177 -812.000 0.000 NA   NA
 634033 634034 GBAA1718 GBAA1719     TRUE 0.657 43.000 0.045 1.000   NA
 634034 634035 GBAA1719 GBAA1720     FALSE 0.504 118.000 0.200 1.000   NA
 634035 634036 GBAA1720 GBAA1721     TRUE 0.821 18.000 0.600 NA   NA
 634036 634037 GBAA1721 GBAA1722     TRUE 0.773 -7.000 0.133 NA N NA
 634037 634038 GBAA1722 GBAA1723     TRUE 0.591 -9.000 0.338 NA   NA
 634038 634039 GBAA1723 GBAA1724     FALSE 0.459 63.000 0.044 NA   NA
 634039 634040 GBAA1724 GBAA1725     FALSE 0.469 88.000 0.300 NA   NA
 634040 634041 GBAA1725 GBAA1726     TRUE 0.639 -13.000 0.500 NA   NA
 634042 634043 GBAA1727 GBAA1728     TRUE 0.770 3.000 0.051 1.000   NA
 634043 634044 GBAA1728 GBAA1729     FALSE 0.151 189.000 0.034 1.000   NA
 634044 634045 GBAA1729 GBAA1730     TRUE 0.591 67.000 0.231 1.000   NA
 634046 634047 GBAA1731 GBAA1732     TRUE 0.694 106.000 0.571 1.000   NA
 634049 634050 GBAA1734 GBAA1735     TRUE 0.931 13.000 0.419 0.040 N NA
 634050 634051 GBAA1735 GBAA1736     TRUE 0.984 13.000 0.750 0.040 Y NA
 634051 634052 GBAA1736 GBAA1737     TRUE 0.900 0.000 0.278 1.000 N NA
 634052 634053 GBAA1737 GBAA1738     TRUE 0.650 21.000 0.241 NA   NA
 634054 634055 GBAA1741 GBAA1742     FALSE 0.273 160.000 0.375 NA   NA
 634055 634056 GBAA1742 GBAA1743     TRUE 0.661 102.000 0.500 1.000   NA
 634056 634057 GBAA1743 GBAA1744     FALSE 0.521 51.000 0.143 NA   NA
 634057 634058 GBAA1744 GBAA1745     FALSE 0.193 159.000 0.143 NA   NA
 634058 634059 GBAA1745 GBAA1746     FALSE 0.506 90.000 0.368 NA   NA
 634060 634061 GBAA1747 GBAA1748     TRUE 0.601 33.000 0.096 NA   NA
 634061 10141528 GBAA1748 GBAA_1749     FALSE 0.281 -16.000 0.000 NA   NA
 10141528 634062 GBAA_1749 GBAA1751   asnO-2 FALSE 0.004 995.000 0.000 NA   NA
 634063 634064 GBAA1753 GBAA1754     TRUE 0.822 -3.000 0.643 NA   NA
 634066 634067 GBAA1756 GBAA1757     FALSE 0.092 194.000 0.049 NA   NA
 634068 634069 GBAA1758 GBAA1759     TRUE 0.877 17.000 0.194 1.000 N NA
 634069 634070 GBAA1759 GBAA1760     FALSE 0.117 183.000 0.097 NA   NA
 634071 634072 GBAA1762 GBAA1763     TRUE 0.857 14.000 0.750 NA   NA
 634072 634073 GBAA1763 GBAA1764     FALSE 0.392 113.000 0.125 NA   NA
 634073 634074 GBAA1764 GBAA1766   nhaC-2 FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 634074 634075 GBAA1766 GBAA1767 nhaC-2 fumC FALSE 0.368 256.000 0.003 1.000 Y NA
 634077 634078 GBAA1769 GBAA1770     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 634078 10141529 GBAA1770 GBAA_1772     FALSE 0.074 180.000 0.000 NA   NA
 10141529 634079 GBAA_1772 GBAA1773     FALSE 0.208 -36.000 0.000 NA   NA
 634081 634082 GBAA1775 GBAA1776     FALSE 0.395 108.000 0.125 NA   NA
 634082 634083 GBAA1776 GBAA1777     TRUE 0.881 5.000 0.250 NA N NA
 634083 634084 GBAA1777 GBAA1778   ccdA-1 TRUE 0.928 54.000 0.171 NA Y NA
 634084 634085 GBAA1778 GBAA1779 ccdA-1   TRUE 0.962 19.000 0.241 1.000 Y NA
 634085 634086 GBAA1779 GBAA1780     TRUE 0.706 18.000 0.011 1.000   NA
 634088 634089 GBAA1782 GBAA1783     FALSE 0.541 3.000 0.000 NA   NA
 634089 634090 GBAA1783 GBAA1784   dsdA FALSE 0.025 248.000 0.000 NA   NA
 634090 634091 GBAA1784 GBAA1785 dsdA   FALSE 0.101 191.000 0.065 NA   NA
 634092 634093 GBAA1786 GBAA1787     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 634093 634094 GBAA1787 GBAA1788     TRUE 0.725 -3.000 0.393 NA   NA
 634094 634095 GBAA1788 GBAA1789     TRUE 0.758 -3.000 0.455 NA   NA
 634096 634097 GBAA1791 GBAA1792     TRUE 0.989 5.000 0.857 0.017 Y NA
 634097 634098 GBAA1792 GBAA1793     TRUE 0.868 118.000 0.667 0.093 N NA
 634098 634099 GBAA1793 GBAA1794     TRUE 0.823 38.000 0.250 NA N NA
 634099 634100 GBAA1794 GBAA1795     TRUE 0.963 2.000 0.227 NA Y NA
 634100 634101 GBAA1795 GBAA1796     TRUE 0.733 105.000 0.160 1.000 N NA
 634103 634104 GBAA1799 GBAA1800   aspA-2 TRUE 0.936 25.000 0.700 1.000 N NA
 634104 634105 GBAA1800 GBAA1801 aspA-2 ykwA TRUE 0.881 55.000 0.583 1.000 N NA
 634105 634106 GBAA1801 GBAA1802 ykwA   TRUE 0.726 66.000 0.500 1.000   NA
 634106 634107 GBAA1802 GBAA1803     TRUE 0.887 3.000 0.600 1.000   NA
 634107 634108 GBAA1803 GBAA1804     TRUE 0.900 118.000 0.113 1.000 Y NA
 634109 634110 GBAA1805 GBAA1807     FALSE 0.006 523.000 0.000 NA   NA
 634111 10141530 GBAA1808 GBAA_1809 asnA   FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 634112 634113 GBAA1810 GBAA1811   dapG-1 FALSE 0.009 350.000 0.000 NA   NA
 634113 634114 GBAA1811 GBAA1812 dapG-1   FALSE 0.331 121.000 0.005 NA   NA
 10141531 634115 GBAA_1813 GBAA1814     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 634115 634116 GBAA1814 GBAA1815     TRUE 0.784 6.000 0.400 NA   NA
 634118 634119 GBAA1817 GBAA1818     FALSE 0.191 254.000 0.000 0.004 N NA
 634119 634120 GBAA1818 GBAA1819     TRUE 0.636 196.000 0.333 1.000 Y NA
 634120 634121 GBAA1819 GBAA1820     TRUE 0.640 29.000 0.222 NA   NA
 634123 634124 GBAA1822 GBAA1823     FALSE 0.357 90.000 0.015 NA   NA
 634124 634125 GBAA1823 GBAA1824     FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 634125 10141532 GBAA1824 GBAA_1825     FALSE 0.405 43.000 0.000 NA   NA
 634127 634128 GBAA1827 GBAA1828     FALSE 0.012 484.000 0.000 1.000   NA
 634129 634130 GBAA1830 GBAA1831 fsR cysK-2 TRUE 0.884 11.000 0.059 1.000 N NA
 634130 634131 GBAA1831 GBAA1832 cysK-2   FALSE 0.542 77.000 0.143 1.000   NA
 634131 634132 GBAA1832 GBAA1833     TRUE 0.695 120.000 0.778 NA   NA
 634136 634137 GBAA1837 GBAA1838     FALSE 0.201 181.000 0.412 NA   NA
 634137 634138 GBAA1838 GBAA1839     TRUE 0.712 11.000 0.300 NA   NA
 634138 634139 GBAA1839 GBAA1840     FALSE 0.422 -16.000 0.188 NA   NA
 634139 634140 GBAA1840 GBAA_1841     FALSE 0.015 297.000 0.000 NA   NA
 634142 634143 GBAA1843 GBAA1844     FALSE 0.063 187.000 0.000 NA   NA
 634143 634144 GBAA1844 GBAA1845     TRUE 0.846 31.000 0.714 NA   NA
 634145 634146 GBAA1846 GBAA1847 msrA-1   TRUE 0.730 92.000 0.194 1.000 N NA
 634147 634148 GBAA1849 GBAA1850 ilvE-2 ilvB-2 TRUE 0.961 23.000 0.017 1.000 Y NA
 634148 10141534 GBAA1850 GBAA_1851 ilvB-2   FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 10141534 634149 GBAA_1851 GBAA1852   ilvC-2 FALSE 0.477 15.000 0.000 NA   NA
 634149 634150 GBAA1852 GBAA1853 ilvC-2 ilvD TRUE 0.961 47.000 0.022 0.001 Y NA
 634150 634151 GBAA1853 GBAA1854 ilvD ilvA TRUE 0.957 32.000 0.012 1.000 Y NA
 634153 634154 GBAA1856 GBAA1857     TRUE 0.666 4.000 0.032 NA   NA
 634154 634155 GBAA1857 GBAA1858     FALSE 0.233 168.000 0.075 1.000   NA
 634157 634158 GBAA1860 GBAA1861     FALSE 0.007 425.000 0.000 NA   NA
 634158 634159 GBAA1861 GBAA1862     TRUE 0.598 128.000 0.588 NA   NA
 634159 634160 GBAA1862 GBAA1863     FALSE 0.077 211.000 0.000 1.000   NA
 634160 634161 GBAA1863 GBAA1864     TRUE 0.639 28.000 0.207 NA   NA
 634161 634162 GBAA1864 GBAA1865     FALSE 0.436 72.000 0.069 NA   NA
 634163 634164 GBAA1866 GBAA1867     FALSE 0.027 340.000 0.333 NA   NA
 10141535 634165 GBAA_1868 GBAA1869     FALSE 0.006 514.000 0.000 NA   NA
 634165 634166 GBAA1869 GBAA1870     FALSE 0.332 -10.000 0.000 NA   NA
 634166 634167 GBAA1870 GBAA1871     FALSE 0.256 95.000 0.000 NA   NA
 634167 634168 GBAA1871 GBAA1872     FALSE 0.508 80.000 0.333 NA   NA
 634168 634169 GBAA1872 GBAA1873     FALSE 0.426 135.000 0.333 NA   NA
 634169 634170 GBAA1873 GBAA1874     FALSE 0.512 52.000 0.095 NA   NA
 634170 634171 GBAA1874 GBAA1875     FALSE 0.057 288.000 0.000 0.072   NA
 634173 10141536 GBAA1877 GBAA_1878     FALSE 0.211 -34.000 0.000 NA   NA
 10141536 634174 GBAA_1878 GBAA1879     FALSE 0.125 156.000 0.000 NA   NA
 634178 10141537 GBAA1884 GBAA_1886     FALSE 0.005 613.000 0.000 NA   NA
 10141537 634179 GBAA_1886 GBAA1887     FALSE 0.005 594.000 0.000 NA   NA
 634179 634180 GBAA1887 GBAA1888     TRUE 0.893 32.000 0.500 0.002   NA
 634180 10141538 GBAA1888 GBAA_1889     FALSE 0.268 108.000 0.000 NA   NA
 10141538 634181 GBAA_1889 GBAA1890     FALSE 0.029 234.000 0.000 NA   NA
 634181 634182 GBAA1890 GBAA1891     FALSE 0.053 358.000 0.000 1.000 N NA
 634182 634183 GBAA1891 GBAA1892   dra FALSE 0.094 306.000 0.077 1.000 N NA
 634183 634184 GBAA1892 GBAA1893 dra   TRUE 0.902 103.000 0.026 1.000 Y NA
 634184 634185 GBAA1893 GBAA1894   pyn-1 TRUE 0.953 37.000 0.031 1.000 Y NA
 634185 634186 GBAA1894 GBAA1895 pyn-1 cdd-1 TRUE 0.956 34.000 0.031 1.000 Y NA
 634186 634187 GBAA1895 GBAA1896 cdd-1   FALSE 0.565 42.000 0.167 NA   NA
 634190 634191 GBAA1899 GBAA1900     TRUE 0.833 52.000 0.750 1.000   NA
 634192 634193 GBAA1901 GBAA1902     TRUE 0.710 118.000 0.027 1.000 N NA
 634193 634194 GBAA1902 GBAA1903     FALSE 0.030 606.000 0.000 1.000 N NA
 634196 634197 GBAA1905 GBAA1906 topB-2   FALSE 0.035 269.000 0.065 NA   NA
 634199 10141539 GBAA1908 GBAA_1909     FALSE 0.027 240.000 0.000 NA   NA
 10141539 634200 GBAA_1909 GBAA1910     FALSE 0.271 84.000 0.000 NA   NA
 634200 634201 GBAA1910 GBAA1912     FALSE 0.057 345.000 0.000 1.000 N NA
 634201 634202 GBAA1912 GBAA1913     TRUE 0.643 113.000 0.600 NA   NA
 634203 634204 GBAA1914 GBAA1915     FALSE 0.111 187.000 0.158 NA   NA
 634205 634206 GBAA1916 GBAA1917     TRUE 0.900 121.000 0.389 NA Y NA
 634206 634207 GBAA1917 GBAA1918     TRUE 0.716 72.000 0.158 NA N NA
 634207 634208 GBAA1918 GBAA1919     TRUE 0.734 58.000 0.123 0.035   NA
 634210 634211 GBAA1921 GBAA1922     FALSE 0.128 179.000 0.128 NA   NA
 634213 634214 GBAA1924 GBAA1925     FALSE 0.441 104.000 0.273 NA   NA
 634216 634217 GBAA1927 GBAA1928     TRUE 0.873 13.000 0.052 1.000 N NA
 634217 634218 GBAA1928 GBAA1929     TRUE 0.980 5.000 0.333 0.071 Y NA
 634218 634219 GBAA1929 GBAA1930     TRUE 0.953 15.000 0.121 NA Y NA
 634219 634220 GBAA1930 GBAA1931     FALSE 0.190 212.000 0.054 NA N NA
 634220 634221 GBAA1931 GBAA1932     FALSE 0.477 14.000 0.000 NA   NA
 634221 634222 GBAA1932 GBAA1933     FALSE 0.219 -31.000 0.000 NA   NA
 634222 634223 GBAA1933 GBAA1934     TRUE 0.956 -22.000 0.708 0.024 Y NA
 634223 634224 GBAA1934 GBAA1935     TRUE 0.979 22.000 0.746 1.000 Y NA
 634224 634225 GBAA1935 GBAA1936     TRUE 0.986 2.000 0.687 0.039 Y NA
 634227 634228 GBAA1938 GBAA1939     TRUE 0.578 37.000 0.111 NA   NA
 634228 634229 GBAA1939 GBAA1940     TRUE 0.891 2.000 0.647 1.000   NA
 634229 634230 GBAA1940 GBAA1941     FALSE 0.549 94.000 0.286 1.000   NA
 634230 634231 GBAA1941 GBAA1942     TRUE 0.674 121.000 0.259 NA N NA
 634231 634232 GBAA1942 GBAA1943   cydA-1 FALSE 0.087 618.000 0.000 NA Y NA
 634232 634233 GBAA1943 GBAA1944 cydA-1 cydB-1 TRUE 0.940 -13.000 0.051 0.035 Y NA
 634233 634234 GBAA1944 GBAA1945 cydB-1   TRUE 0.967 0.000 0.151 1.000 Y NA
 634234 634235 GBAA1945 GBAA1946     TRUE 0.978 3.000 0.168 0.004 Y NA
 634235 634236 GBAA1946 GBAA1947     FALSE 0.029 233.000 0.000 NA   NA
 634236 634237 GBAA1947 GBAA1948     FALSE 0.496 91.000 0.353 NA   NA
 634239 634240 GBAA1950 GBAA1951     FALSE 0.048 248.000 0.000 1.000   NA
 634240 634241 GBAA1951 GBAA1952     FALSE 0.004 916.000 0.000 NA   NA
 10141540 634243 GBAA_1954 GBAA1955     FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 634243 634244 GBAA1955 GBAA1956     TRUE 0.973 15.000 0.538 1.000 Y NA
 634246 634247 GBAA1958 GBAA1959     FALSE 0.255 117.000 0.000 NA   NA
 634247 634248 GBAA1959 GBAA1960     FALSE 0.195 141.000 0.000 NA   NA
 634248 634249 GBAA1960 GBAA1961     FALSE 0.377 118.000 0.136 NA   NA
 634249 634250 GBAA1961 GBAA1962     FALSE 0.310 69.000 0.000 NA   NA
 634250 634251 GBAA1962 GBAA1963     FALSE 0.547 4.000 0.000 NA   NA
 634253 634254 GBAA1965 GBAA1968   hom-1 FALSE 0.009 964.000 0.000 1.000   NA
 634254 634255 GBAA1968 GBAA1969 hom-1 thrC TRUE 0.938 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 634255 634256 GBAA1969 GBAA1970 thrC thrB TRUE 0.959 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 634256 634257 GBAA1970 GBAA1971 thrB   FALSE 0.339 120.000 0.011 NA   NA
 634257 634258 GBAA1971 GBAA1972     FALSE 0.036 217.000 0.000 NA   NA
 634258 634259 GBAA1972 GBAA1973     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 634259 634260 GBAA1973 GBAA1974     FALSE 0.199 160.000 0.222 NA   NA
 634260 634261 GBAA1974 GBAA1975     TRUE 0.716 14.000 0.038 1.000   NA
 634261 634262 GBAA1975 GBAA1976     TRUE 0.969 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 634262 634263 GBAA1976 GBAA1977     TRUE 0.724 101.000 0.129 1.000 N NA
 634263 634264 GBAA1977 GBAA1978     TRUE 0.619 15.000 0.111 NA   NA
 634264 634265 GBAA1978 GBAA1979     FALSE 0.185 160.000 0.111 NA   NA
 634265 634266 GBAA1979 GBAA1980     FALSE 0.493 98.000 0.049 1.000   NA
 634266 634267 GBAA1980 GBAA1981     FALSE 0.032 285.000 0.000 1.000   NA
 634267 634268 GBAA1981 GBAA1982     TRUE 0.957 59.000 0.163 0.000 Y NA
 634268 634269 GBAA1982 GBAA1983     TRUE 0.929 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 634269 634270 GBAA1983 GBAA1984     TRUE 0.789 -3.000 0.526 NA   NA
 634270 634271 GBAA1984 GBAA1985     TRUE 0.820 24.000 0.583 NA   NA
 634271 634272 GBAA1985 GBAA1986     TRUE 0.708 38.000 0.412 NA   NA
 634272 634273 GBAA1986 GBAA1987     FALSE 0.362 126.000 0.137 NA   NA
 634273 10141541 GBAA1987 GBAA_1988     FALSE 0.028 236.000 0.000 NA   NA
 634275 634276 GBAA1990 GBAA1991     FALSE 0.480 13.000 0.000 NA   NA
 634277 634278 GBAA1992 GBAA1993     TRUE 0.686 91.000 0.714 NA   NA
 634279 634280 GBAA1994 GBAA1995     FALSE 0.374 146.000 0.375 NA   NA
 634280 634281 GBAA1995 GBAA1996     TRUE 0.734 104.000 0.875 NA   NA
 634281 634282 GBAA1996 GBAA1997     TRUE 0.856 32.000 0.778 NA   NA
 10141542 634284 GBAA_1999 GBAA2000     FALSE 0.255 117.000 0.000 NA   NA
 634284 634285 GBAA2000 GBAA2001     FALSE 0.076 275.000 0.000 NA N NA
 634287 634288 GBAA2003 GBAA2004     FALSE 0.340 203.000 0.429 1.000 N NA
 634289 634290 GBAA2005 GBAA2006     TRUE 0.880 13.000 0.889 NA   NA
 634291 634292 GBAA2007 GBAA2008     FALSE 0.333 135.000 0.091 NA   NA
 634292 634293 GBAA2008 GBAA2009     FALSE 0.084 205.000 0.000 1.000   NA
 634293 634294 GBAA2009 GBAA2010     FALSE 0.236 197.000 0.667 NA   NA
 634294 634295 GBAA2010 GBAA2011     FALSE 0.024 251.000 0.000 NA   NA
 634297 634298 GBAA2013 GBAA2014 dpS   FALSE 0.393 107.000 0.111 NA   NA
 634298 634299 GBAA2014 GBAA2015     FALSE 0.033 225.000 0.000 NA   NA
 634300 634301 GBAA2016 GBAA2017     TRUE 0.574 106.000 0.467 NA   NA
 634302 634303 GBAA2018 GBAA2019     TRUE 0.839 85.000 0.636 1.000 N NA
 634308 634309 GBAA2024 GBAA2025     FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 634309 634310 GBAA2025 GBAA2026     FALSE 0.161 147.000 0.000 NA   NA
 634311 634312 GBAA2027 GBAA2028     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 634312 634313 GBAA2028 GBAA2029     FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 634313 634314 GBAA2029 GBAA2031     FALSE 0.004 2229.000 0.000 NA   NA
 634318 634319 GBAA2036 GBAA2037     FALSE 0.481 116.000 0.333 NA   NA
 634321 634322 GBAA2039 GBAA2040 ogt-1   TRUE 0.658 8.000 0.054 NA   NA
 634322 634323 GBAA2040 GBAA2041     FALSE 0.494 77.000 0.296 NA   NA
 634323 634324 GBAA2041 GBAA2042   fosB-1 TRUE 0.921 59.000 0.129 NA Y NA
 634324 634325 GBAA2042 GBAA2043 fosB-1   FALSE 0.405 43.000 0.000 NA   NA
 634325 634326 GBAA2043 GBAA2044     FALSE 0.315 142.000 0.000 1.000   NA
 634328 634329 GBAA2046 GBAA2047 cotH   TRUE 0.676 106.000 0.062 NA N NA
 634329 634330 GBAA2047 GBAA2048     FALSE 0.391 105.000 0.062 NA   NA
 634330 634331 GBAA2048 GBAA2049     TRUE 0.589 103.000 0.500 NA   NA
 634331 634332 GBAA2049 GBAA2050     FALSE 0.244 185.000 0.033 0.089   NA
 634332 634333 GBAA2050 GBAA2051     FALSE 0.085 199.000 0.053 NA   NA
 634333 634334 GBAA2051 GBAA2052     TRUE 0.900 4.000 0.841 NA   NA
 634334 634335 GBAA2052 GBAA2053     FALSE 0.096 196.000 0.195 NA   NA
 634335 634336 GBAA2053 GBAA2054     FALSE 0.126 454.000 0.000 1.000 Y NA
 634336 10141543 GBAA2054 GBAA_2055     FALSE 0.464 32.000 0.000 NA   NA
 10141543 634337 GBAA_2055 GBAA2056     FALSE 0.063 187.000 0.000 NA   NA
 634337 634338 GBAA2056 GBAA2057     FALSE 0.406 102.000 0.227 NA   NA
 634339 634340 GBAA2058 GBAA2059     TRUE 0.656 2.000 0.034 NA   NA
 634340 634341 GBAA2059 GBAA2060     FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 634342 634343 GBAA2061 GBAA2063   brnQ-4 FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 634343 634344 GBAA2063 GBAA2064 brnQ-4 csaA FALSE 0.560 67.000 0.032 1.000   NA
 634344 634345 GBAA2064 GBAA2065 csaA   TRUE 0.603 18.000 0.032 NA   NA
 634346 634347 GBAA2066 GBAA2067     TRUE 0.694 5.000 0.200 NA   NA
 634348 634349 GBAA2068 GBAA2069 spoIIP   FALSE 0.095 224.000 0.214 1.000   NA
 634349 634350 GBAA2069 GBAA2070     TRUE 0.926 12.000 0.571 1.000 N NA
 634350 634351 GBAA2070 GBAA2071     TRUE 0.825 24.000 0.444 1.000   NA
 634351 634352 GBAA2071 GBAA2072     FALSE 0.199 185.000 0.286 1.000   NA
 634354 634355 GBAA2074 GBAA2075     TRUE 0.965 3.000 0.259 NA Y NA
 634355 634356 GBAA2075 GBAA2076     TRUE 0.724 107.000 0.021 1.000 N NA
 634356 634357 GBAA2076 GBAA2077     TRUE 0.824 7.000 0.368 1.000   NA
 634360 634361 GBAA2080 GBAA2081     TRUE 0.638 -7.000 0.185 1.000   NA
 634361 634362 GBAA2081 GBAA2082     TRUE 0.648 24.000 0.222 NA   NA
 634363 634364 GBAA2083 GBAA2084     FALSE 0.386 168.000 0.700 NA   NA
 634366 10141544 GBAA2086 GBAA_2087     FALSE 0.154 148.000 0.000 NA   NA
 634368 634369 GBAA2089 GBAA2090     FALSE 0.259 -21.000 0.000 NA   NA
 634369 634370 GBAA2090 GBAA2091     FALSE 0.463 -3.000 0.000 NA   NA
 634370 634371 GBAA2091 GBAA2092     FALSE 0.413 79.000 0.090 NA   NA
 634371 634372 GBAA2092 GBAA2093     FALSE 0.481 21.000 0.000 NA   NA
 634372 634373 GBAA2093 GBAA2094     FALSE 0.528 1.000 0.000 NA   NA
 634373 634374 GBAA2094 GBAA2095     FALSE 0.335 62.000 0.000 NA   NA
 634374 634375 GBAA2095 GBAA2096     FALSE 0.375 51.000 0.000 NA   NA
 634375 634376 GBAA2096 GBAA2097     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 634377 634378 GBAA2098 GBAA2099     FALSE 0.104 163.000 0.000 NA   NA
 634378 634379 GBAA2099 GBAA2100     FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 634380 634381 GBAA2101 GBAA2102     FALSE 0.107 191.000 0.216 NA   NA
 634381 634382 GBAA2102 GBAA2103     FALSE 0.530 52.000 0.216 NA   NA
 634382 634383 GBAA2103 GBAA2104     TRUE 0.779 70.000 0.889 NA   NA
 634385 634386 GBAA2106 GBAA2107   fhs TRUE 0.596 64.000 0.200 1.000   NA
 634386 634387 GBAA2107 GBAA2109 fhs   FALSE 0.041 638.000 0.000 0.090 N NA