MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsia typhi str. wilmington

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 614106 614107 RT0001 RT0002   trxA TRUE 0.751 162.000 0.053 NA   NA
 614107 614108 RT0002 RT0003 trxA wzt TRUE 0.990 11.000 0.778 1.000   NA
 614108 614109 RT0003 RT0004 wzt wzm TRUE 0.984 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 614109 614110 RT0004 RT0005 wzm   TRUE 0.967 -3.000 0.088 1.000 N NA
 614111 614112 RT0006 RT0007 lpxA fabZ TRUE 0.982 10.000 0.264 1.000 N NA
 614112 614113 RT0007 RT0008 fabZ lpxD TRUE 0.817 181.000 0.212 1.000 N NA
 614113 614114 RT0008 RT0009 lpxD   FALSE 0.060 382.000 0.000 NA   NA
 614115 614116 RT0010 RT0011     TRUE 0.855 -3.000 0.006 1.000   NA
 614117 614118 RT0012 RT0013   znuA TRUE 0.891 -12.000 0.008 NA   NA
 614118 614119 RT0013 RT0014 znuA pcnB TRUE 0.941 -3.000 0.023 1.000 N NA
 614120 614121 RT0015 RT0016 sca1   FALSE 0.416 109.000 0.000 NA   NA
 1759813 614122 RTPG01 RT0017   ruvC TRUE 0.753 2.000 0.000 NA   NA
 614122 614123 RT0017 RT0018 ruvC   TRUE 0.834 59.000 0.007 1.000   NA
 614123 614124 RT0018 RT0019   rnc TRUE 0.986 -7.000 0.098 0.036   NA
 614124 614125 RT0019 RT0020 rnc lepB TRUE 0.906 0.000 0.010 1.000 N NA
 614125 614126 RT0020 RT0021 lepB nuoF TRUE 0.564 189.000 0.021 1.000 N NA
 614126 614127 RT0021 RT0022 nuoF secF TRUE 0.642 170.000 0.015 1.000 N NA
 614129 614130 RT0024 RT0025 rplS trmD TRUE 0.992 17.000 0.567 1.000 Y NA
 614130 614131 RT0025 RT0026 trmD ackA FALSE 0.077 417.000 0.000 1.000 N NA
 614131 614132 RT0026 RT0027 ackA pta TRUE 0.977 2.000 0.143 1.000 Y NA
 614132 614133 RT0027 RT0028 pta   FALSE 0.086 391.000 0.000 1.000 N NA
 614133 614134 RT0028 RT0029     TRUE 0.986 125.000 0.875 0.008 Y NA
 614134 614135 RT0029 RT0030     TRUE 0.980 162.000 0.750 0.008 Y NA
 614135 614136 RT0030 RT0031     TRUE 0.997 4.000 1.000 0.008 Y NA
 614136 614137 RT0031 RT0032     TRUE 0.998 -13.000 1.000 0.008 Y NA
 614137 614138 RT0032 RT0033   virB4a TRUE 0.937 119.000 0.421 1.000 Y NA
 614138 614139 RT0033 RT0034 virB4a virB3 TRUE 0.936 173.000 0.789 NA Y NA
 614139 1759814 RT0034 RTPG02 virB3   TRUE 0.802 12.000 0.000 NA   NA
 1759814 614140 RTPG02 RT0035   engB TRUE 0.840 -109.000 0.000 NA   NA
 614140 614141 RT0035 RT0036 engB   FALSE 0.084 279.000 0.000 NA   NA
 614141 614142 RT0036 RT0037   rpmE FALSE 0.408 111.000 0.000 NA   NA
 614142 614143 RT0037 RT0038 rpmE rpmB TRUE 0.967 -3.000 0.009 0.062 Y NA
 614143 614144 RT0038 RT0039 rpmB   FALSE 0.045 1283.000 0.003 NA   NA
 614144 614145 RT0039 RT0040   mkl TRUE 0.943 2.000 0.050 NA   NA
 614145 614146 RT0040 RT0041 mkl   TRUE 0.979 6.000 0.178 NA Y NA
 614146 614147 RT0041 RT0042   alr TRUE 0.627 157.000 0.012 NA N NA
 614147 614148 RT0042 RT0043 alr   FALSE 0.046 778.000 0.000 NA N NA
 614148 614149 RT0043 RT0044   vacJ TRUE 0.971 20.000 0.070 NA N NA
 614149 614150 RT0044 RT0045 vacJ   TRUE 0.952 5.000 0.049 1.000   NA
 614151 614152 RT0046 RT0047 aatA   TRUE 0.798 119.000 0.062 NA   NA
 614152 614153 RT0047 RT0048   waaA TRUE 0.969 -3.000 0.179 NA   NA
 1759815 614154 RTPG03 RT0049   tsf FALSE 0.090 264.000 0.000 NA   NA
 614154 614155 RT0049 RT0050 tsf rpsB TRUE 0.950 157.000 0.748 1.000 Y NA
 614155 614156 RT0050 RT0051 rpsB cysS FALSE 0.112 405.000 0.000 1.000 Y NA
 614158 614159 RT0053 RT0054 secG   TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 614159 614160 RT0054 RT0055   proP1 FALSE 0.390 140.000 0.000 NA   NA
 614160 614161 RT0055 RT0056 proP1   TRUE 0.988 -13.000 0.556 1.000   NA
 614162 614163 RT0057 RT0058   pntB TRUE 0.793 129.000 0.046 1.000 N NA
 614163 614164 RT0058 RT0059 pntB   TRUE 0.930 57.000 0.047 NA   NA
 614165 614166 RT0060 RT0061   czcR TRUE 0.942 4.000 0.038 1.000   NA
 614166 614167 RT0061 RT0062 czcR secB FALSE 0.393 183.000 0.005 1.000 N NA
 614167 614168 RT0062 RT0063 secB dcd TRUE 0.529 189.000 0.015 1.000 N NA
 614170 614171 RT0065 RT0066 parC   FALSE 0.520 135.000 0.007 NA   NA
 614171 614172 RT0066 RT0067   argS TRUE 0.765 71.000 0.008 NA   NA
 614172 614173 RT0067 RT0068 argS dgtP TRUE 0.966 9.000 0.062 1.000 N NA
 614175 614176 RT0070 RT0071 kdsA   TRUE 0.898 36.000 0.011 NA   NA
 614176 614177 RT0071 RT0072     TRUE 0.895 3.000 0.013 NA   NA
 614177 614178 RT0072 RT0073   parB TRUE 0.653 177.000 0.006 0.058   NA
 614178 614179 RT0073 RT0074 parB parA TRUE 0.992 -13.000 0.827 1.000 N NA
 614179 614180 RT0074 RT0075 parA gidB TRUE 0.982 -3.000 0.339 1.000 N NA
 614180 614181 RT0075 RT0076 gidB gidA TRUE 0.988 -16.000 0.466 1.000 N NA
 614181 614182 RT0076 RT0077 gidA ndk TRUE 0.884 4.000 0.007 1.000 N NA
 614182 614183 RT0077 RT0078 ndk glpT TRUE 0.607 139.000 0.007 1.000 N NA
 614183 614184 RT0078 RT0079 glpT tlcA TRUE 0.992 70.000 0.875 0.055 N NA
 1759816 614185 RTPG04 RT0080     FALSE 0.035 1266.000 0.000 NA   NA
 1759817 614186 RTPG05 RT0081   pgsA TRUE 0.792 10.000 0.000 NA   NA
 614186 614187 RT0081 RT0082 pgsA yidC TRUE 0.896 0.000 0.008 1.000 N NA
 614187 614188 RT0082 RT0083 yidC   TRUE 0.549 170.000 0.008 1.000 N NA
 614189 614190 RT0084 RT0085 lgt   TRUE 0.977 -21.000 0.170 NA   NA
 614191 614192 RT0086 RT0087 sdhB ftsH FALSE 0.168 239.000 0.000 1.000 N NA
 614192 614193 RT0087 RT0088 ftsH mesJ TRUE 0.969 51.000 0.145 1.000 N NA
 614193 614194 RT0088 RT0089 mesJ rplI TRUE 0.643 173.000 0.002 0.094 N NA
 614194 614195 RT0089 RT0090 rplI rpsR TRUE 0.995 12.000 0.499 0.060 Y NA
 614195 614196 RT0090 RT0091 rpsR rpsF TRUE 0.994 25.000 0.319 0.060 Y NA
 614197 614198 RT0092 RT0093 aco1 gcp TRUE 0.566 118.000 0.005 1.000 N NA
 614200 1759818 RT0095 RTPG06 phbB   FALSE 0.378 124.000 0.000 NA   NA
 1759818 614201 RTPG06 RT0096     TRUE 0.785 8.000 0.000 NA   NA
 614204 1759820 RT0099 RTPG08     FALSE 0.037 1850.000 0.000 NA   NA
 1759820 614205 RTPG08 RT0100   recF TRUE 0.809 24.000 0.000 NA   NA
 614205 614206 RT0100 RT0101 recF   FALSE 0.133 243.000 0.000 1.000   NA
 614208 614209 RT0103 RT0104     TRUE 0.919 59.000 0.043 NA   NA
 614209 614210 RT0104 RT0105   atpB TRUE 0.971 5.000 0.195 NA   NA
 614210 614211 RT0105 RT0106 atpB atpE TRUE 0.995 34.000 0.628 0.013   NA
 614211 614212 RT0106 RT0107 atpE atpX TRUE 0.993 13.000 0.278 0.013   NA
 614212 614213 RT0107 RT0108 atpX atpF TRUE 0.997 5.000 0.863 0.013 Y NA
 614214 614215 RT0109 RT0110   mrp TRUE 0.935 0.000 0.025 NA N NA
 614216 614217 RT0111 RT0112 hflK hflC TRUE 0.984 152.000 0.947 0.025 Y NA
 614217 614218 RT0112 RT0113 hflC   TRUE 0.992 16.000 0.084 0.025 Y NA
 614218 614219 RT0113 RT0114     TRUE 0.765 99.000 0.023 NA   NA
 614219 614220 RT0114 RT0115   sdhC TRUE 0.729 142.000 0.026 NA   NA
 614220 614221 RT0115 RT0116 sdhC sdhD TRUE 0.969 158.000 0.291 0.003 Y NA
 614221 614222 RT0116 RT0117 sdhD sdhA TRUE 0.984 140.000 0.705 0.006 Y NA
 614222 614223 RT0117 RT0118 sdhA glnP TRUE 0.574 136.000 0.006 1.000 N NA
 614223 614224 RT0118 RT0119 glnP rpsL TRUE 0.771 161.000 0.044 1.000 N NA
 614224 614225 RT0119 RT0120 rpsL rpsG TRUE 0.986 33.000 0.029 0.012 Y NA
 614225 614226 RT0120 RT0121 rpsG fusA TRUE 0.982 13.000 0.114 1.000 Y NA
 614226 614227 RT0121 RT0122 fusA   FALSE 0.388 144.000 0.000 NA   NA
 614227 614228 RT0122 RT0123   secE FALSE 0.322 168.000 0.000 NA   NA
 614228 614229 RT0123 RT0124 secE nusG TRUE 0.993 16.000 0.843 1.000 N NA
 614229 614230 RT0124 RT0125 nusG rplK TRUE 0.908 178.000 0.681 1.000 N NA
 614230 614231 RT0125 RT0126 rplK rplA TRUE 0.996 3.000 0.838 0.080 Y NA
 614231 614232 RT0126 RT0127 rplA rplJ TRUE 0.975 90.000 0.302 0.080 Y NA
 614232 614233 RT0127 RT0128 rplJ rplL TRUE 0.968 181.000 0.884 0.059 Y NA
 614233 614234 RT0128 RT0129 rplL rpoB FALSE 0.305 825.000 0.223 1.000   NA
 614234 614235 RT0129 RT0130 rpoB rpoC TRUE 0.885 302.000 0.851 0.003   NA
 614235 614236 RT0130 RT0131 rpoC pepA FALSE 0.052 1033.000 0.000 1.000 N NA
 614236 614237 RT0131 RT0132 pepA   TRUE 0.883 95.000 0.061 1.000 N NA
 614237 614238 RT0132 RT0133     TRUE 0.847 102.000 0.082 NA   NA
 614238 614239 RT0133 RT0134   aspS TRUE 0.685 72.000 0.005 NA   NA
 614240 614241 RT0135 RT0136     TRUE 0.909 100.000 0.250 1.000   NA
 614241 614242 RT0136 RT0137   dapB FALSE 0.280 201.000 0.006 1.000   NA
 614242 614243 RT0137 RT0138 dapB   FALSE 0.219 263.000 0.011 1.000   NA
 614243 614244 RT0138 RT0139   glnH TRUE 0.980 -15.000 0.250 1.000   NA
 614244 614245 RT0139 RT0140 glnH gatB FALSE 0.513 165.000 0.005 1.000 N NA
 614245 614246 RT0140 RT0141 gatB gatA TRUE 0.977 155.000 0.492 0.004 Y NA
 614246 614247 RT0141 RT0142 gatA gatC TRUE 0.996 3.000 0.643 0.004 Y NA
 614247 614248 RT0142 RT0143 gatC frr FALSE 0.108 504.000 0.002 1.000 Y NA
 614248 614249 RT0143 RT0144 frr pyrH TRUE 0.874 187.000 0.626 1.000 N NA
 614249 614250 RT0144 RT0145 pyrH   TRUE 0.872 4.000 0.008 1.000   NA
 614250 614251 RT0145 RT0146   emrB TRUE 0.978 -16.000 0.171 1.000   NA
 614253 614254 RT0148 RT0149     FALSE 0.054 412.000 0.000 NA   NA
 614254 614255 RT0149 RT0150   omp1 FALSE 0.389 143.000 0.000 NA   NA
 614255 614256 RT0150 RT0151 omp1   FALSE 0.446 230.000 0.016 1.000 Y NA
 614257 614258 RT0152 RT0153 nusB ftsJ TRUE 0.900 -3.000 0.010 NA N NA
 614258 614259 RT0153 RT0154 ftsJ   FALSE 0.041 578.000 0.000 NA   NA
 614260 614261 RT0155 RT0156     TRUE 0.793 31.000 0.000 NA   NA
 614261 614262 RT0156 RT0157     TRUE 0.974 -6.000 0.250 NA   NA
 614262 614263 RT0157 RT0158     FALSE 0.515 102.000 0.004 NA   NA
 614263 1759821 RT0158 RTPG09     TRUE 0.752 0.000 0.000 NA   NA
 614265 614266 RT0160 RT0161   acrD TRUE 0.968 43.000 0.179 NA   NA
 614267 614268 RT0162 RT0163 hupA holB TRUE 0.807 111.000 0.020 1.000 Y NA
 614268 614269 RT0163 RT0164 holB ffh FALSE 0.061 553.000 0.000 1.000 N NA
 614272 614273 RT0167 RT0168 gltP cutA TRUE 0.936 38.000 0.017 1.000 N NA
 614273 614274 RT0168 RT0169 cutA   TRUE 0.948 22.000 0.017 1.000 N NA
 614274 614275 RT0169 RT0170   sucB TRUE 0.629 168.000 0.013 1.000 N NA
 614275 614276 RT0170 RT0171 sucB sucA TRUE 0.991 40.000 0.667 1.000 Y NA
 614276 614277 RT0171 RT0172 sucA   FALSE 0.110 360.000 0.003 1.000 N NA
 614277 614278 RT0172 RT0173   recN TRUE 0.596 114.000 0.006 1.000 N NA
 614278 614279 RT0173 RT0174 recN   TRUE 0.971 8.000 0.117 1.000   NA
 614279 614280 RT0174 RT0175   dnaJ FALSE 0.060 439.000 0.000 1.000   NA
 614280 614281 RT0175 RT0176 dnaJ dnaK TRUE 0.965 122.000 0.236 0.009 Y NA
 614282 614283 RT0177 RT0178     FALSE 0.036 951.000 0.000 NA   NA
 614283 614284 RT0178 RT0179     TRUE 0.966 8.000 0.097 NA   NA
 614284 614285 RT0179 RT0180   coq7 TRUE 0.597 127.000 0.007 1.000 N NA
 614285 1759822 RT0180 RTPG10 coq7   FALSE 0.043 533.000 0.000 NA   NA
 1759822 614286 RTPG10 RT0181     FALSE 0.378 124.000 0.000 NA   NA
 614288 614289 RT0183 RT0184 dapD   TRUE 0.563 81.000 0.000 NA   NA
 614290 614291 RT0185 RT0186 pbpC   FALSE 0.052 1445.000 0.000 1.000 N NA
 614291 614292 RT0186 RT0187     TRUE 0.972 5.000 0.200 NA   NA
 614292 614293 RT0187 RT0188     TRUE 0.988 5.000 0.778 NA   NA
 614293 614294 RT0188 RT0189   fdxB TRUE 0.954 -3.000 0.068 NA   NA
 614294 614295 RT0189 RT0190 fdxB hscA TRUE 0.948 65.000 0.091 1.000 N NA
 614295 614296 RT0190 RT0191 hscA hscB TRUE 0.991 -9.000 0.634 1.000 Y NA
 614299 614300 RT0194 RT0195 grxC1   TRUE 0.912 95.000 0.068 1.000 Y NA
 614300 614301 RT0195 RT0196   gyrA FALSE 0.052 1267.000 0.000 1.000 N NA
 614301 1759823 RT0196 RTPG11 gyrA   FALSE 0.040 587.000 0.000 NA   NA
 1759823 614302 RTPG11 RT0197   def FALSE 0.045 515.000 0.000 NA   NA
 614302 614303 RT0197 RT0198 def fmt TRUE 0.959 -3.000 0.008 0.089 Y NA
 614303 614304 RT0198 RT0199 fmt   FALSE 0.147 221.000 0.000 NA   NA
 614304 614305 RT0199 RT0200     FALSE 0.061 375.000 0.000 NA   NA
 1759824 614307 RTPG12 RT0202     TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 614308 614309 RT0203 RT0204   queA FALSE 0.046 634.000 0.000 1.000   NA
 614309 614310 RT0204 RT0205 queA   FALSE 0.068 488.000 0.000 1.000 N NA
 614311 614312 RT0206 RT0207   cydA TRUE 0.898 165.000 0.500 NA   NA
 614312 614313 RT0207 RT0208 cydA cydB TRUE 0.943 132.000 0.095 0.044 Y NA
 614313 614314 RT0208 RT0209 cydB   FALSE 0.119 260.000 0.000 NA N NA
 614314 614315 RT0209 RT0210   mpp TRUE 0.723 139.000 0.025 NA   NA
 614315 614316 RT0210 RT0211 mpp purC TRUE 0.642 122.000 0.011 1.000   NA
 614316 1759825 RT0211 RTPG13 purC   FALSE 0.351 160.000 0.000 NA   NA
 1759825 614317 RTPG13 RT0212   thrS TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 614318 614319 RT0213 RT0214     FALSE 0.036 1362.000 0.000 NA   NA
 614319 614320 RT0214 RT0215     TRUE 0.974 53.000 0.375 NA   NA
 614321 614322 RT0216 RT0217 tolC   TRUE 0.965 2.000 0.146 NA   NA
 614322 614323 RT0217 RT0218     TRUE 0.805 133.000 0.073 NA   NA
 614323 614324 RT0218 RT0219   parE FALSE 0.510 182.000 0.016 NA   NA
 614324 614325 RT0219 RT0220 parE ctp TRUE 0.741 109.000 0.015 1.000 N NA
 614325 614326 RT0220 RT0221 ctp   FALSE 0.189 226.000 0.000 1.000 N NA
 614326 614327 RT0221 RT0222     TRUE 0.672 200.000 0.143 1.000   NA
 614327 614328 RT0222 RT0223     TRUE 0.988 13.000 0.583 NA   NA
 614328 614329 RT0223 RT0224     TRUE 0.921 0.000 0.022 NA   NA
 614329 614330 RT0224 RT0225   rplM FALSE 0.275 199.000 0.006 1.000   NA
 614330 614331 RT0225 RT0226 rplM rpsI TRUE 0.992 7.000 0.231 0.056 Y NA
 614331 614332 RT0226 RT0227 rpsI   TRUE 0.780 36.000 0.000 NA   NA
 614333 614334 RT0228 RT0229 invA   TRUE 0.943 30.000 0.017 1.000 N NA
 614335 614336 RT0230 RT0231 efp suhB TRUE 0.961 10.000 0.047 1.000 N NA
 614336 614337 RT0231 RT0232 suhB   FALSE 0.209 211.000 0.005 NA   NA
 614337 614338 RT0232 RT0233   psd TRUE 0.925 34.000 0.018 NA   NA
 614338 614339 RT0233 RT0234 psd pssA TRUE 0.977 136.000 0.466 0.007 Y NA
 614339 614340 RT0234 RT0235 pssA emrA TRUE 0.969 12.000 0.013 0.068 N NA
 614341 614342 RT0236 RT0237     TRUE 0.924 -3.000 0.022 NA   NA
 614343 614344 RT0238 RT0239   murC FALSE 0.507 164.000 0.006 NA N NA
 614344 614345 RT0239 RT0240 murC murB TRUE 0.992 11.000 0.108 0.014 Y NA
 614345 614346 RT0240 RT0241 murB ddlB TRUE 0.958 112.000 0.135 0.014 Y NA
 614346 614347 RT0241 RT0242 ddlB ftsQ TRUE 0.985 -3.000 0.372 NA Y NA
 614347 614348 RT0242 RT0243 ftsQ ftsA TRUE 0.723 190.000 0.137 NA N NA
 614349 614350 RT0244 RT0245   cycM TRUE 0.928 -10.000 0.014 NA N NA
 614350 614351 RT0245 RT0246 cycM lpxC FALSE 0.053 921.000 0.000 1.000 N NA
 614351 614352 RT0246 RT0247 lpxC   FALSE 0.379 174.000 0.005 NA   NA
 614353 1759826 RT0248 RTPG14 rne   FALSE 0.039 626.000 0.000 NA   NA
 1759826 614354 RTPG14 RT0249   rluC FALSE 0.423 107.000 0.000 NA   NA
 614354 614355 RT0249 RT0250 rluC pbpE TRUE 0.963 77.000 0.412 1.000 N NA
 614355 614356 RT0250 RT0251 pbpE xthA1 TRUE 0.966 9.000 0.063 1.000 N NA
 614356 614357 RT0251 RT0252 xthA1 pdhA TRUE 0.829 92.000 0.018 1.000 N NA
 614357 614358 RT0252 RT0253 pdhA pdhB TRUE 0.970 171.000 0.456 0.004 Y NA
 614360 614361 RT0255 RT0256   icd TRUE 0.845 109.000 0.062 1.000 N NA
 614361 614362 RT0256 RT0257 icd   TRUE 0.883 97.000 0.069 1.000 N NA
 614362 614363 RT0257 RT0258     TRUE 0.920 100.000 0.184 NA Y NA
 614363 614364 RT0258 RT0259   ccmB TRUE 0.982 -19.000 0.292 NA   NA
 614364 614365 RT0259 RT0260 ccmB   TRUE 0.975 68.000 0.700 NA   NA
 614365 614366 RT0260 RT0261   petA TRUE 0.993 17.000 0.875 NA   NA
 614366 614367 RT0261 RT0262 petA petB TRUE 0.986 7.000 0.021 0.004 Y NA
 614367 614368 RT0262 RT0263 petB fbcH TRUE 0.823 455.000 0.630 0.004 Y NA
 614368 614369 RT0263 RT0264 fbcH   FALSE 0.057 507.000 0.000 NA N NA
 614371 614372 RT0266 RT0267 lepA   FALSE 0.056 403.000 0.000 NA   NA
 614373 614374 RT0268 RT0269     TRUE 0.987 23.000 0.500 NA   NA
 614376 614377 RT0271 RT0272 rodA ptrB TRUE 0.731 98.000 0.010 1.000 N NA
 614377 614378 RT0272 RT0273 ptrB   TRUE 0.972 71.000 0.538 1.000 N NA
 614378 614379 RT0273 RT0274     FALSE 0.227 653.000 0.000 0.010 Y NA
 614379 614380 RT0274 RT0275     TRUE 0.987 52.000 0.067 0.010 Y NA
 614380 614381 RT0275 RT0276     TRUE 0.814 318.000 0.426 0.026 Y NA
 614381 614382 RT0276 RT0277   trbG TRUE 0.825 118.000 0.065 NA N NA
 614382 614383 RT0277 RT0278 trbG   TRUE 0.986 2.000 0.455 NA Y NA
 614384 614385 RT0279 RT0280     TRUE 0.973 51.000 0.316 NA   NA
 614385 614386 RT0280 RT0281   virB9 TRUE 0.984 -13.000 0.421 NA   NA
 614386 614387 RT0281 RT0282 virB9 virB10 TRUE 0.948 83.000 0.421 NA   NA
 614387 614388 RT0282 RT0283 virB10 virB11 TRUE 0.987 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 614388 614389 RT0283 RT0284 virB11 virD4 TRUE 0.638 323.000 0.405 1.000 Y NA
 614389 614390 RT0284 RT0285 virD4 gppA TRUE 0.964 9.000 0.054 1.000 N NA
 614390 614391 RT0285 RT0286 gppA   FALSE 0.036 1638.000 0.000 NA   NA
 614391 614392 RT0286 RT0287     TRUE 0.992 -16.000 0.875 NA   NA
 614392 614393 RT0287 RT0288   cysQ TRUE 0.942 3.000 0.048 NA   NA
 614394 614395 RT0289 RT0290 mutS rpiB FALSE 0.210 219.000 0.000 1.000 N NA
 614396 614397 RT0291 RT0292 nlpD thyA FALSE 0.055 693.000 0.000 1.000 N NA
 614397 614398 RT0292 RT0293 thyA tolB TRUE 0.626 172.000 0.014 1.000 N NA
 614401 614402 RT0296 RT0297 trmU   TRUE 0.690 130.000 0.014 1.000 N NA
 614402 614403 RT0297 RT0298   hisS TRUE 0.856 64.000 0.008 1.000 N NA
 614403 614404 RT0298 RT0299 hisS tolQ FALSE 0.053 1766.000 0.000 1.000 N NA
 614404 614405 RT0299 RT0300 tolQ tolR TRUE 0.984 0.000 0.059 0.049 Y NA
 614405 614406 RT0300 RT0301 tolR   TRUE 0.976 -10.000 0.240 NA   NA
 614408 614409 RT0303 RT0304 proP2 aprE TRUE 0.935 135.000 0.273 0.095   NA
 614409 614410 RT0304 RT0305 aprE aprD TRUE 0.885 193.000 0.267 0.014   NA
 614410 614411 RT0305 RT0306 aprD asd TRUE 0.911 8.000 0.011 1.000   NA
 614411 614412 RT0306 RT0307 asd pkcI TRUE 0.925 -7.000 0.012 1.000 N NA
 614412 614413 RT0307 RT0308 pkcI   TRUE 0.639 108.000 0.010 NA   NA
 614414 614415 RT0309 RT0310 hslV hslU TRUE 0.991 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 614415 614416 RT0310 RT0311 hslU lpxB FALSE 0.056 652.000 0.000 1.000 N NA
 614416 614417 RT0311 RT0312 lpxB   FALSE 0.043 531.000 0.000 NA   NA
 614417 614418 RT0312 RT0313   cyaY TRUE 0.930 -34.000 0.012 NA   NA
 614418 614419 RT0313 RT0314 cyaY   FALSE 0.193 257.000 0.008 NA   NA
 614419 614420 RT0314 RT0315     FALSE 0.064 354.000 0.000 NA   NA
 614421 614422 RT0316 RT0317 gltX1 topA TRUE 0.681 97.000 0.007 1.000 N NA
 614422 614423 RT0317 RT0318 topA tdpX1 FALSE 0.052 1124.000 0.000 1.000 N NA
 614423 614424 RT0318 RT0319 tdpX1   TRUE 0.862 82.000 0.014 1.000 Y NA
 614424 614425 RT0319 RT0320     FALSE 0.061 435.000 0.000 1.000   NA
 614426 1759829 RT0321 RTPG17     TRUE 0.780 36.000 0.000 NA   NA
 1759829 614427 RTPG17 RT0322   rmlD FALSE 0.037 810.000 0.000 NA   NA
 614427 614428 RT0322 RT0323 rmlD   TRUE 0.993 33.000 0.271 0.003   NA
 614428 614429 RT0323 RT0324   rffE TRUE 0.973 -7.000 0.148 1.000   NA
 614429 614430 RT0324 RT0325 rffE   TRUE 0.927 -3.000 0.023 NA   NA
 614430 614431 RT0325 RT0326     TRUE 0.967 29.000 0.091 NA   NA
 614431 614432 RT0326 RT0327     TRUE 0.992 -3.000 0.444 0.016   NA
 614432 614433 RT0327 RT0328     TRUE 0.968 -13.000 0.080 1.000   NA
 614433 614434 RT0328 RT0329     TRUE 0.957 -3.000 0.080 NA   NA
 614434 614435 RT0329 RT0330     TRUE 0.977 -24.000 0.064 NA Y NA
 614436 614437 RT0331 RT0332     TRUE 0.913 101.000 0.312 NA   NA
 614437 614438 RT0332 RT0333     TRUE 0.970 10.000 0.129 NA   NA
 614441 614442 RT0336 RT0337 asmA rimM FALSE 0.052 563.000 0.000 NA N NA
 614443 614444 RT0338 RT0339   xseB TRUE 0.886 15.000 0.007 NA   NA
 614445 614446 RT0340 RT0341 mpg   FALSE 0.116 261.000 0.002 NA   NA
 614446 614447 RT0341 RT0342   nuoE TRUE 0.891 15.000 0.007 NA   NA
 614447 614448 RT0342 RT0343 nuoE nuoD TRUE 0.981 96.000 0.355 0.011 Y NA
 614448 614449 RT0343 RT0344 nuoD nuoC TRUE 0.960 174.000 0.483 0.025 Y NA
 614449 614450 RT0344 RT0345 nuoC nuoB TRUE 0.995 -13.000 0.328 0.009 Y NA
 614450 614451 RT0345 RT0346 nuoB nuoA TRUE 0.996 5.000 0.507 0.009 Y NA
 614451 614452 RT0346 RT0347 nuoA   TRUE 0.755 127.000 0.031 NA N NA
 614452 614453 RT0347 RT0348     TRUE 0.952 1.000 0.066 NA   NA
 614454 614455 RT0349 RT0350   xerD TRUE 0.792 32.000 0.000 NA   NA
 614455 614456 RT0350 RT0351 xerD   TRUE 0.736 81.000 0.008 NA   NA
 614456 614457 RT0351 RT0352     TRUE 0.885 120.000 0.286 NA   NA
 614459 614460 RT0354 RT0355 lnt   FALSE 0.037 1894.000 0.000 NA   NA
 614460 614461 RT0355 RT0356     TRUE 0.984 5.000 0.545 NA   NA
 614461 614462 RT0356 RT0357     TRUE 0.982 -3.000 0.455 1.000   NA
 614464 614465 RT0359 RT0360 lysS   TRUE 0.941 30.000 0.021 1.000   NA
 614465 614466 RT0360 RT0361   tme TRUE 0.840 109.000 0.071 1.000   NA
 614466 614467 RT0361 RT0362 tme   FALSE 0.103 265.000 0.000 1.000   NA
 614467 614468 RT0362 RT0363   proP3 FALSE 0.057 474.000 0.000 1.000   NA
 614469 1759831 RT0364 RTPG19     FALSE 0.048 480.000 0.000 NA   NA
 1759831 614470 RTPG19 RT0365   mdh TRUE 0.753 -2.000 0.000 NA   NA
 614470 614471 RT0365 RT0366 mdh tlcB FALSE 0.077 676.000 0.000 1.000 Y NA
 614471 614472 RT0366 RT0367 tlcB pyrG FALSE 0.355 245.000 0.000 0.048 N NA
 614472 614473 RT0367 RT0368 pyrG kdsB TRUE 0.951 23.000 0.019 1.000 N NA
 614474 614475 RT0369 RT0370     TRUE 0.819 16.000 0.000 NA   NA
 614475 1759832 RT0370 RTPG20     FALSE 0.042 552.000 0.000 NA   NA
 1759832 614476 RTPG20 RT0371   folE TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 614476 614477 RT0371 RT0372 folE proS TRUE 0.805 145.000 0.008 0.067 N NA
 614477 1759833 RT0372 RTPG21 proS   TRUE 0.753 2.000 0.000 NA   NA
 1759833 614478 RTPG21 RT0373     TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 614478 614479 RT0373 RT0374   ruvA TRUE 0.854 6.000 0.007 NA   NA
 614479 614480 RT0374 RT0375 ruvA ruvB TRUE 0.994 64.000 0.549 0.007 Y NA
 614480 614481 RT0375 RT0376 ruvB msbA1 TRUE 0.898 -7.000 0.007 1.000 N NA
 614481 614482 RT0376 RT0377 msbA1 dacF FALSE 0.052 1355.000 0.000 1.000 N NA
 614483 614484 RT0378 RT0379 rlpA   TRUE 0.953 -22.000 0.029 NA   NA
 614484 614485 RT0379 RT0380   ispA FALSE 0.400 194.000 0.014 NA   NA
 614485 614486 RT0380 RT0381 ispA   TRUE 0.955 29.000 0.027 1.000 N NA
 614486 614487 RT0381 RT0382     TRUE 0.987 10.000 0.629 NA   NA
 614487 614488 RT0382 RT0383     FALSE 0.075 321.000 0.000 NA   NA
 614489 614490 RT0384 RT0385 pcaH tlpA TRUE 0.611 185.000 0.026 1.000 N NA
 614490 614491 RT0385 RT0386 tlpA   TRUE 0.965 -7.000 0.042 1.000 Y NA
 614491 614492 RT0386 RT0387   dut TRUE 0.897 2.000 0.008 1.000 N NA
 614492 614493 RT0387 RT0388 dut   TRUE 0.568 146.000 0.006 1.000 N NA
 614493 614494 RT0388 RT0389     TRUE 0.908 64.000 0.041 NA   NA
 614494 614495 RT0389 RT0390   ldcA TRUE 0.931 109.000 0.571 NA   NA
 614496 614497 RT0391 RT0392     FALSE 0.062 421.000 0.000 1.000   NA
 614497 1759834 RT0392 RTPG22     FALSE 0.062 369.000 0.000 NA   NA
 1759834 1759835 RTPG22 RTPG23     FALSE 0.363 155.000 0.000 NA   NA
 614498 614499 RT0393 RT0394   lspA TRUE 0.915 132.000 0.031 0.034 Y NA
 614499 614500 RT0394 RT0395 lspA   TRUE 0.962 21.000 0.054 NA   NA
 614500 614501 RT0395 RT0396   murD FALSE 0.454 165.000 0.006 NA   NA
 614501 614502 RT0396 RT0397 murD ftsW TRUE 0.993 41.000 0.297 0.004 N NA
 614502 614503 RT0397 RT0398 ftsW murG TRUE 0.988 -3.000 0.647 1.000 N NA
 614503 614504 RT0398 RT0399 murG   FALSE 0.101 255.000 0.000 NA   NA
 614506 614507 RT0401 RT0402 dapF miaB1 TRUE 0.980 -25.000 0.109 1.000 N NA
 614507 614508 RT0402 RT0403 miaB1 pheS TRUE 0.668 124.000 0.007 1.000 Y NA
 614508 614509 RT0403 RT0404 pheS pheT TRUE 0.996 -3.000 0.574 0.003 Y NA
 614509 614510 RT0404 RT0405 pheT dnaN TRUE 0.928 5.000 0.015 1.000 N NA
 614510 614511 RT0405 RT0406 dnaN   FALSE 0.083 346.000 0.002 NA   NA
 614511 614512 RT0406 RT0407   leuS TRUE 0.916 65.000 0.051 NA   NA
 614513 614514 RT0408 RT0409 rnd1   TRUE 0.683 138.000 0.015 1.000   NA
 614514 614515 RT0409 RT0410   cdsA TRUE 0.913 -3.000 0.011 1.000 N NA
 614515 614516 RT0410 RT0411 cdsA uppS TRUE 0.991 -40.000 0.400 1.000 Y NA
 614516 614517 RT0411 RT0412 uppS envZ TRUE 0.571 151.000 0.006 1.000 N NA
 614517 614518 RT0412 RT0413 envZ ompR TRUE 0.993 -22.000 0.592 1.000 Y NA
 614519 614520 RT0414 RT0415 ilvE dapA TRUE 0.623 232.000 0.087 1.000 Y NA
 614520 614521 RT0415 RT0416 dapA smpB TRUE 0.898 -3.000 0.008 1.000 N NA
 614521 614522 RT0416 RT0417 smpB   TRUE 0.677 145.000 0.007 1.000 Y NA
 614523 614524 RT0418 RT0419   sucD FALSE 0.085 278.000 0.000 NA   NA
 614524 614525 RT0419 RT0420 sucD sucC TRUE 0.972 138.000 0.256 0.003 Y NA
 614525 614526 RT0420 RT0421 sucC   TRUE 0.522 151.000 0.006 1.000   NA
 614526 614527 RT0421 RT0422   rbfA FALSE 0.093 295.000 0.000 1.000   NA
 614527 614528 RT0422 RT0423 rbfA   TRUE 0.852 4.000 0.007 NA   NA
 614529 614530 RT0424 RT0425   recR FALSE 0.490 148.000 0.006 NA   NA
 614530 614531 RT0425 RT0426 recR   TRUE 0.603 84.000 0.003 NA   NA
 614533 614534 RT0428 RT0429   gpsA TRUE 0.787 103.000 0.029 1.000   NA
 614534 614535 RT0429 RT0430 gpsA   FALSE 0.046 631.000 0.000 1.000   NA
 614535 614536 RT0430 RT0431     TRUE 0.950 58.000 0.096 NA   NA
 614536 614537 RT0431 RT0432   trxB1 FALSE 0.516 133.000 0.007 NA   NA
 614537 614538 RT0432 RT0433 trxB1   FALSE 0.045 1447.000 0.000 NA N NA
 614538 614539 RT0433 RT0434   uvrD TRUE 0.932 21.000 0.012 NA N NA
 614539 614540 RT0434 RT0435 uvrD   FALSE 0.035 1104.000 0.000 NA   NA
 614542 614543 RT0437 RT0438 lon sca3 FALSE 0.047 599.000 0.000 1.000   NA
 614544 614545 RT0439 RT0440 idi   FALSE 0.036 1531.000 0.000 NA   NA
 614545 614546 RT0440 RT0441   glmU FALSE 0.152 219.000 0.000 NA   NA
 614546 614547 RT0441 RT0442 glmU   TRUE 0.863 0.000 0.008 NA   NA
 614547 614548 RT0442 RT0443   rpmJ TRUE 0.948 19.000 0.024 NA   NA
 614549 614550 RT0444 RT0445     TRUE 0.968 5.000 0.146 NA   NA
 614550 614551 RT0445 RT0446     FALSE 0.037 1955.000 0.000 NA   NA
 614551 614552 RT0446 RT0447   pdhD1 TRUE 0.643 136.000 0.012 1.000   NA
 614552 614553 RT0447 RT0448 pdhD1   TRUE 0.531 127.000 0.004 1.000 N NA
 614554 614555 RT0449 RT0450 rnd2   TRUE 0.926 12.000 0.015 NA   NA
 614556 614557 RT0451 RT0452     FALSE 0.042 1256.000 0.000 1.000   NA
 614557 614558 RT0452 RT0453   hemC FALSE 0.052 1074.000 0.000 1.000 N NA
 614559 614560 RT0454 RT0455   trpS TRUE 0.700 59.000 0.000 NA   NA
 614561 614562 RT0456 RT0457 plsC   TRUE 0.951 60.000 0.092 NA N NA
 614562 614563 RT0457 RT0458     FALSE 0.058 393.000 0.000 NA   NA
 614564 614565 RT0459 RT0460     TRUE 0.942 -7.000 0.036 NA   NA
 614565 614566 RT0460 RT0461     TRUE 0.956 -16.000 0.045 NA   NA
 614566 614567 RT0461 RT0462   ampG1 FALSE 0.095 287.000 0.000 1.000   NA
 614568 614569 RT0463 RT0464   tlcC TRUE 0.978 69.000 0.667 1.000 N NA
 614569 614570 RT0464 RT0465 tlcC   TRUE 0.934 128.000 0.778 NA   NA
 614570 614571 RT0465 RT0466   ispB TRUE 0.798 80.000 0.014 NA   NA
 614571 614572 RT0466 RT0467 ispB   TRUE 0.801 27.000 0.000 NA   NA
 614573 614574 RT0468 RT0469     TRUE 0.682 63.000 0.000 NA   NA
 614574 614575 RT0469 RT0470   potE TRUE 0.953 73.000 0.136 1.000 Y NA
 614575 614576 RT0470 RT0471 potE iscA2 FALSE 0.356 203.000 0.013 NA   NA
 614576 614577 RT0471 RT0472 iscA2 iscU TRUE 0.948 4.000 0.056 NA   NA
 614577 614578 RT0472 RT0473 iscU iscS1 TRUE 0.983 47.000 0.448 1.000 N NA
 614578 614579 RT0473 RT0474 iscS1 iscS2 TRUE 0.982 67.000 0.052 0.003 Y NA
 614579 1759836 RT0474 RTPG24 iscS2   TRUE 0.761 -3.000 0.000 NA   NA
 1759836 614580 RTPG24 RT0475     FALSE 0.340 164.000 0.000 NA   NA
 614580 614581 RT0475 RT0476     FALSE 0.042 555.000 0.000 NA   NA
 614581 614582 RT0476 RT0477     FALSE 0.270 178.000 0.000 NA   NA
 614583 614584 RT0478 RT0479 ppdK addA FALSE 0.074 1018.000 0.000 1.000 Y NA
 614584 614585 RT0479 RT0480 addA   FALSE 0.122 237.000 0.000 NA   NA
 1759837 614589 RTPG25 RT0484     TRUE 0.625 70.000 0.000 NA   NA
 614590 614591 RT0485 RT0486 sca4 tlcD FALSE 0.116 242.000 0.000 NA   NA
 614592 614593 RT0487 RT0488 truB rpsO TRUE 0.985 26.000 0.211 1.000 Y NA
 614593 614594 RT0488 RT0489 rpsO pnp TRUE 0.928 146.000 0.335 1.000 Y NA
 614594 614595 RT0489 RT0490 pnp   FALSE 0.393 184.000 0.006 1.000 N NA
 614595 614596 RT0490 RT0491     TRUE 0.967 7.000 0.115 NA   NA
 614596 614597 RT0491 RT0492     TRUE 0.978 -34.000 0.144 NA   NA
 614597 614598 RT0492 RT0493     TRUE 0.925 113.000 0.543 NA   NA
 614598 614599 RT0493 RT0494   exoC TRUE 0.636 117.000 0.009 1.000   NA
 614599 614600 RT0494 RT0495 exoC miaA FALSE 0.111 449.000 0.007 1.000 N NA
 1759838 614601 RTPG26 RT0496     TRUE 0.753 -2.000 0.000 NA   NA
 614601 614602 RT0496 RT0497   nrdB TRUE 0.920 67.000 0.065 NA   NA
 614602 614603 RT0497 RT0498 nrdB nrdA TRUE 0.959 166.000 0.161 0.002 Y NA
 614604 614605 RT0499 RT0500   trxB2 FALSE 0.046 504.000 0.000 NA   NA
 614605 614606 RT0500 RT0501 trxB2 folD TRUE 0.580 191.000 0.026 1.000 N NA
 614607 614608 RT0502 RT0503     FALSE 0.157 211.000 0.000 NA   NA
 614610 614611 RT0505 RT0506     FALSE 0.087 275.000 0.000 NA   NA
 614611 614612 RT0506 RT0507   clpP FALSE 0.142 223.000 0.000 NA   NA
 614612 614613 RT0507 RT0508 clpP rpsA TRUE 0.625 156.000 0.009 1.000 N NA
 614613 614614 RT0508 RT0509 rpsA cmk TRUE 0.631 251.000 0.281 1.000 N NA
 1759839 614616 RTPG27 RT0511   ihfB FALSE 0.040 609.000 0.000 NA   NA
 614616 614617 RT0511 RT0512 ihfB   TRUE 0.971 0.000 0.142 1.000 N NA
 614617 614618 RT0512 RT0513   rho TRUE 0.554 139.000 0.005 1.000 N NA
 614618 614619 RT0513 RT0514 rho   FALSE 0.100 335.000 0.000 1.000 N NA
 614619 614620 RT0514 RT0515   recJ TRUE 0.890 27.000 0.005 1.000 N NA
 614620 614621 RT0515 RT0516 recJ prfA TRUE 0.594 105.000 0.005 1.000 N NA
 614621 614622 RT0516 RT0517 prfA pdhC FALSE 0.392 182.000 0.005 1.000 N NA
 614622 614623 RT0517 RT0518 pdhC infC TRUE 0.557 122.000 0.005 1.000 N NA
 614623 614624 RT0518 RT0519 infC   TRUE 0.829 51.000 0.007 NA   NA
 614624 614625 RT0519 RT0520     TRUE 0.980 -25.000 0.194 NA   NA
 614625 614626 RT0520 RT0521   birA FALSE 0.049 467.000 0.000 NA   NA
 614626 614627 RT0521 RT0522 birA   FALSE 0.258 186.000 0.000 1.000   NA
 614627 614628 RT0522 RT0523   sodB TRUE 0.853 49.000 0.007 1.000   NA
 614628 614629 RT0523 RT0524 sodB folC TRUE 0.793 94.000 0.013 1.000 N NA
 614629 614630 RT0524 RT0525 folC   FALSE 0.037 2300.000 0.000 NA   NA
 614632 614633 RT0527 RT0528   hemB TRUE 0.823 77.000 0.017 NA   NA
 614633 614634 RT0528 RT0529 hemB priA FALSE 0.054 704.000 0.000 1.000 N NA
 614635 614636 RT0530 RT0531 ubiX dnaB FALSE 0.052 1228.000 0.000 1.000 N NA
 614636 1759840 RT0531 RTPG28 dnaB   FALSE 0.035 1166.000 0.000 NA   NA
 1759840 614637 RTPG28 RT0532   rluB TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 614637 614638 RT0532 RT0533 rluB   FALSE 0.066 508.000 0.000 1.000 N NA
 614638 614639 RT0533 RT0534   radA TRUE 0.678 95.000 0.005 1.000 N NA
 614639 614640 RT0534 RT0535 radA   TRUE 0.843 -3.000 0.007 NA   NA
 614640 614641 RT0535 RT0536     TRUE 0.855 49.000 0.008 NA   NA
 614641 614642 RT0536 RT0537     FALSE 0.061 552.000 0.000 1.000 N NA
 614643 1759841 RT0538 RTPG29     TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 1759841 614644 RTPG29 RT0539   infB TRUE 0.753 -2.000 0.000 NA   NA
 614644 614645 RT0539 RT0540 infB nusA TRUE 0.722 228.000 0.342 1.000 N NA
 614645 614646 RT0540 RT0541 nusA   TRUE 0.904 175.000 0.759 NA   NA
 614646 1759842 RT0541 RTPG30     TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 1759842 614647 RTPG30 RT0542     TRUE 0.753 -2.000 0.000 NA   NA
 614647 614648 RT0542 RT0543   tlyA FALSE 0.041 562.000 0.000 NA   NA
 614648 614649 RT0543 RT0544 tlyA tyrS TRUE 0.848 153.000 0.008 0.037 Y NA
 614650 614651 RT0545 RT0546     FALSE 0.036 1029.000 0.000 NA   NA
 614652 614653 RT0547 RT0548 fadB   FALSE 0.052 1486.000 0.000 1.000 N NA
 614653 614654 RT0548 RT0549     TRUE 0.973 -25.000 0.057 1.000 N NA
 614655 614656 RT0550 RT0551 ntrX   TRUE 0.949 -19.000 0.027 NA   NA
 614657 614658 RT0552 RT0553   ftsI1 FALSE 0.107 249.000 0.000 NA   NA
 614658 614659 RT0553 RT0554 ftsI1   TRUE 0.966 -10.000 0.091 NA   NA
 614659 614660 RT0554 RT0555   ftsI2 FALSE 0.045 512.000 0.000 NA   NA
 614660 614661 RT0555 RT0556 ftsI2   TRUE 0.792 125.000 0.065 NA   NA
 614661 614662 RT0556 RT0557   mraW TRUE 0.651 192.000 0.089 NA   NA
 614662 614663 RT0557 RT0558 mraW mraZ TRUE 0.986 0.000 0.635 1.000   NA
 614665 614666 RT0560 RT0561 uvrC   TRUE 0.534 106.000 0.006 NA   NA
 614666 614667 RT0561 RT0562     FALSE 0.035 1165.000 0.000 NA   NA
 614667 614668 RT0562 RT0563     TRUE 0.789 33.000 0.000 NA   NA
 614668 614669 RT0563 RT0564   secA FALSE 0.036 882.000 0.000 NA   NA
 614671 614672 RT0566 RT0567 acpS rpoZ TRUE 0.904 1.000 0.009 1.000 N NA
 614672 614673 RT0567 RT0568 rpoZ murA TRUE 0.601 157.000 0.008 1.000 N NA
 614673 614674 RT0568 RT0569 murA gyrB TRUE 0.574 109.000 0.004 1.000 N NA
 614675 614676 RT0570 RT0571     FALSE 0.247 182.000 0.000 NA   NA
 614676 614677 RT0571 RT0572   mgtE FALSE 0.109 247.000 0.000 NA   NA
 614677 614678 RT0572 RT0573 mgtE   FALSE 0.035 1200.000 0.000 NA   NA
 614678 614679 RT0573 RT0574     FALSE 0.035 1091.000 0.000 NA   NA
 614679 614680 RT0574 RT0575   secD TRUE 0.941 -16.000 0.009 NA Y NA
 614680 614681 RT0575 RT0576 secD   TRUE 0.871 160.000 0.263 1.000   NA
 614681 614682 RT0576 RT0577   ccmE TRUE 0.751 102.000 0.018 1.000   NA
 614682 614683 RT0577 RT0578 ccmE ppa TRUE 0.685 128.000 0.013 1.000 N NA
 614683 614684 RT0578 RT0579 ppa   TRUE 0.823 55.000 0.006 1.000   NA
 614684 614685 RT0579 RT0580     TRUE 0.920 -19.000 0.012 NA   NA
 614685 614686 RT0580 RT0581     TRUE 0.963 75.000 0.500 NA   NA
 614688 614689 RT0583 RT0584 mraY murF TRUE 0.906 168.000 0.037 0.012 Y NA
 614689 614690 RT0584 RT0585 murF murE TRUE 0.977 71.000 0.051 0.007 Y NA
 614690 614691 RT0585 RT0586 murE mfd TRUE 0.667 102.000 0.007 1.000 N NA
 614691 614692 RT0586 RT0587 mfd   TRUE 0.955 2.000 0.078 NA   NA
 614693 614694 RT0588 RT0589   dnaA FALSE 0.477 97.000 0.000 NA   NA
 614694 614695 RT0589 RT0590 dnaA   FALSE 0.044 2079.000 0.000 1.000   NA
 614696 614697 RT0591 RT0592 bcr1   FALSE 0.123 824.000 0.000 0.084 N NA
 614697 614698 RT0592 RT0593   pth FALSE 0.412 519.000 0.184 1.000 Y NA
 614698 614699 RT0593 RT0594 pth rplY TRUE 0.886 224.000 0.496 0.074 Y NA
 614699 614700 RT0594 RT0595 rplY   FALSE 0.204 235.000 0.002 1.000 N NA
 614701 614702 RT0596 RT0597 rpmI rplT TRUE 0.998 16.000 0.928 0.048 Y NA
 614702 614703 RT0597 RT0598 rplT rpmH TRUE 0.768 126.000 0.007 0.048   NA
 614703 614704 RT0598 RT0599 rpmH rnpA TRUE 0.997 20.000 0.787 0.002   NA
 614705 1759844 RT0600 RTPG32     FALSE 0.039 622.000 0.000 NA   NA
 1759844 614706 RTPG32 RT0601     FALSE 0.477 97.000 0.000 NA   NA
 614706 614707 RT0601 RT0602     FALSE 0.037 695.000 0.000 NA   NA
 614707 614708 RT0602 RT0603   ntrY FALSE 0.037 1855.000 0.000 NA   NA
 614708 614709 RT0603 RT0604 ntrY rpsU FALSE 0.168 222.000 0.000 1.000   NA
 614710 614711 RT0605 RT0606   ileS FALSE 0.046 633.000 0.000 1.000   NA
 614711 614712 RT0606 RT0607 ileS   FALSE 0.043 532.000 0.000 NA   NA
 614713 614714 RT0608 RT0609 pccA pccB TRUE 0.976 98.000 0.157 0.002 Y NA
 614715 614716 RT0610 RT0611   aas FALSE 0.047 482.000 0.000 NA   NA
 614718 614719 RT0613 RT0614 ubiG gltX2 TRUE 0.629 121.000 0.008 1.000 N NA
 614719 614720 RT0614 RT0615 gltX2 spoTb FALSE 0.037 2314.000 0.000 NA   NA
 614721 614722 RT0616 RT0617 spoTc groEL FALSE 0.043 906.000 0.000 1.000   NA
 614722 614723 RT0617 RT0618 groEL groES TRUE 0.990 21.000 0.050 0.013 Y NA
 614723 614724 RT0618 RT0619 groES rph FALSE 0.053 1749.000 0.000 1.000 N NA
 614725 614726 RT0620 RT0621 grpE   TRUE 0.735 147.000 0.034 NA   NA
 614726 614727 RT0621 RT0622     TRUE 0.984 15.000 0.362 NA   NA
 614728 614729 RT0623 RT0624     FALSE 0.066 350.000 0.000 NA   NA
 614729 614730 RT0624 RT0625   rpsT TRUE 0.633 69.000 0.000 NA   NA
 614730 614731 RT0625 RT0626 rpsT rplQ TRUE 0.975 20.000 0.008 0.047 Y NA
 614731 614732 RT0626 RT0627 rplQ rpoA TRUE 0.993 13.000 0.873 1.000 N NA
 614732 614733 RT0627 RT0628 rpoA rpsK TRUE 0.986 19.000 0.308 1.000 N NA
 614733 614734 RT0628 RT0629 rpsK rpsM TRUE 0.997 26.000 0.810 0.047 Y NA
 614734 614735 RT0629 RT0630 rpsM adk TRUE 0.914 58.000 0.017 1.000 N NA
 614735 614736 RT0630 RT0631 adk secY TRUE 0.984 16.000 0.241 1.000 N NA
 614736 614737 RT0631 RT0632 secY rplO TRUE 0.989 5.000 0.730 1.000 N NA
 614737 614738 RT0632 RT0633 rplO rpmD TRUE 0.997 14.000 0.653 0.008 Y NA
 614738 614739 RT0633 RT0634 rpmD rpsE TRUE 0.996 38.000 0.789 0.064 Y NA
 614739 614740 RT0634 RT0635 rpsE rplR TRUE 0.997 17.000 0.814 0.064 Y NA
 614740 614741 RT0635 RT0636 rplR rplF TRUE 0.997 16.000 0.815 0.047 Y NA
 614741 614742 RT0636 RT0637 rplF rpsH TRUE 0.997 9.000 0.808 0.047 Y NA
 614742 614743 RT0637 RT0638 rpsH rpsN TRUE 0.995 19.000 0.295 0.047 Y NA
 614743 614744 RT0638 RT0639 rpsN rplE TRUE 0.995 18.000 0.309 0.047 Y NA
 614744 614745 RT0639 RT0640 rplE rplX TRUE 0.997 -13.000 0.758 0.047 Y NA
 614745 614746 RT0640 RT0641 rplX rplN TRUE 0.996 -3.000 0.810 0.064 Y NA
 614746 614747 RT0641 RT0642 rplN rpsQ TRUE 0.994 61.000 0.791 0.064 Y NA
 614747 614748 RT0642 RT0643 rpsQ rpmC TRUE 0.997 -13.000 0.828 0.047 Y NA
 614748 614749 RT0643 RT0644 rpmC rplP TRUE 0.996 -7.000 0.802 0.047 Y NA
 614749 614750 RT0644 RT0645 rplP rpsC TRUE 0.997 15.000 0.828 0.064 Y NA
 614750 614751 RT0645 RT0646 rpsC rplV TRUE 0.987 2.000 0.109 0.064 Y NA
 614751 614752 RT0646 RT0647 rplV rpsS TRUE 0.990 9.000 0.119 0.064 Y NA
 614752 614753 RT0647 RT0648 rpsS rplB TRUE 0.997 25.000 0.820 0.064 Y NA
 614753 614754 RT0648 RT0649 rplB rplW TRUE 0.996 1.000 0.849 0.036 Y NA
 614754 614755 RT0649 RT0650 rplW rplD TRUE 0.995 -3.000 0.513 0.047 Y NA
 614755 614756 RT0650 RT0651 rplD rplC TRUE 0.878 240.000 0.486 0.047 Y NA
 614756 614757 RT0651 RT0652 rplC rpsJ TRUE 0.991 1.000 0.307 0.064 Y NA
 614757 614758 RT0652 RT0653 rpsJ tuf TRUE 0.955 94.000 0.318 1.000 Y NA
 614758 614759 RT0653 RT0654 tuf   TRUE 0.546 83.000 0.000 NA   NA
 614759 614760 RT0654 RT0655     FALSE 0.489 96.000 0.000 NA   NA
 614761 1759845 RT0656 RTPG33     TRUE 0.608 72.000 0.000 NA   NA
 1759845 614762 RTPG33 RT0657   fumC TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 614762 614763 RT0657 RT0658 fumC ftsZ FALSE 0.093 353.000 0.000 1.000 N NA
 614764 614765 RT0659 RT0660   ampG2 TRUE 0.895 40.000 0.011 NA   NA
 614765 614766 RT0660 RT0661 ampG2 rhlE TRUE 0.946 81.000 0.333 NA   NA
 614766 614767 RT0661 RT0662 rhlE cspA FALSE 0.110 411.000 0.000 1.000 Y NA
 614768 614769 RT0663 RT0664     FALSE 0.037 2001.000 0.000 NA   NA
 614769 614770 RT0664 RT0665     FALSE 0.071 333.000 0.000 NA   NA
 614771 614772 RT0666 RT0667 ksgA   TRUE 0.559 110.000 0.006 1.000   NA
 614772 614773 RT0667 RT0668   ostA TRUE 0.553 201.000 0.051 1.000   NA
 1759846 614774 RTPG34 RT0669   xseA TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 614774 614775 RT0669 RT0670 xseA   TRUE 0.813 39.000 0.002 NA   NA
 614775 614776 RT0670 RT0671   xthA2 FALSE 0.036 1329.000 0.000 NA   NA
 614776 614777 RT0671 RT0672 xthA2   TRUE 0.671 194.000 0.138 NA   NA
 614777 614778 RT0672 RT0673   engA TRUE 0.817 3.000 0.005 NA   NA
 614779 614780 RT0674 RT0675   ubiE TRUE 0.966 -3.000 0.115 1.000   NA
 614780 614781 RT0675 RT0676 ubiE   FALSE 0.098 342.000 0.000 1.000 N NA
 614781 614782 RT0676 RT0677     FALSE 0.056 517.000 0.000 NA N NA
 614782 614783 RT0677 RT0678   metS TRUE 0.880 123.000 0.221 NA N NA
 614783 614784 RT0678 RT0679 metS tmk TRUE 0.897 -3.000 0.008 1.000 N NA
 614787 614788 RT0682 RT0683 valS   TRUE 0.891 -37.000 0.003 NA N NA
 614788 614789 RT0683 RT0684   rmuC TRUE 0.647 67.000 0.000 NA   NA
 614789 614790 RT0684 RT0685 rmuC   TRUE 0.563 81.000 0.000 NA   NA
 614792 614793 RT0687 RT0688 clpX rimJ TRUE 0.591 114.000 0.006 1.000 N NA
 614793 614794 RT0688 RT0689 rimJ exsB TRUE 0.922 -3.000 0.017 1.000   NA
 614795 614796 RT0690 RT0691   msbA2 FALSE 0.382 146.000 0.000 NA   NA
 614796 614797 RT0691 RT0692 msbA2   FALSE 0.130 230.000 0.000 NA   NA
 614797 614798 RT0692 RT0693   bcr2 FALSE 0.043 531.000 0.000 NA   NA
 614798 614799 RT0693 RT0694 bcr2   TRUE 0.898 103.000 0.020 0.042 N NA
 614799 614800 RT0694 RT0695     TRUE 0.988 -7.000 0.620 1.000 N NA
 614800 614801 RT0695 RT0696     FALSE 0.306 206.000 0.009 NA   NA
 614801 614802 RT0696 RT0697     FALSE 0.087 992.000 0.012 NA   NA
 614802 614803 RT0697 RT0698   ccmF TRUE 0.946 -7.000 0.028 NA N NA
 614804 614805 RT0699 RT0700 ompB spoTd FALSE 0.048 580.000 0.000 1.000   NA
 614805 614806 RT0700 RT0701 spoTd   FALSE 0.077 351.000 0.000 1.000   NA
 614806 614807 RT0701 RT0702     TRUE 0.851 45.000 0.006 1.000   NA
 614807 614808 RT0702 RT0703   ihfA FALSE 0.172 220.000 0.000 1.000   NA
 614809 614810 RT0704 RT0705 lpxL lpxK TRUE 0.975 -25.000 0.044 1.000 Y NA
 614810 1759849 RT0705 RTPG37 lpxK   TRUE 0.753 1.000 0.000 NA   NA
 1759849 1759850 RTPG37 RTPG38     TRUE 0.780 -7.000 0.000 NA   NA
 1759850 614811 RTPG38 RT0706   lig FALSE 0.074 322.000 0.000 NA   NA
 614811 614812 RT0706 RT0707 lig tgt TRUE 0.551 144.000 0.004 1.000 N NA
 614814 614815 RT0709 RT0710     TRUE 0.982 9.000 0.400 NA   NA
 614815 614816 RT0710 RT0711     FALSE 0.057 402.000 0.000 NA   NA
 614816 614817 RT0711 RT0712     TRUE 0.978 22.000 0.199 NA   NA
 614817 614818 RT0712 RT0713   rnhA TRUE 0.931 -12.000 0.012 1.000 N NA
 614818 614819 RT0713 RT0714 rnhA   TRUE 0.914 11.000 0.012 NA   NA
 614819 614820 RT0714 RT0715     FALSE 0.264 179.000 0.000 NA   NA
 614821 614822 RT0716 RT0717   coaE TRUE 0.847 -6.000 0.006 NA   NA
 614822 614823 RT0717 RT0718 coaE dnaQ TRUE 0.973 -12.000 0.092 1.000 N NA
 614823 1759851 RT0718 RTPG39 dnaQ   FALSE 0.384 136.000 0.000 NA   NA
 1759851 614824 RTPG39 RT0719     TRUE 0.737 51.000 0.000 NA   NA
 614824 614825 RT0719 RT0720   fabD FALSE 0.052 1183.000 0.000 1.000 N NA
 614825 614826 RT0720 RT0721 fabD   FALSE 0.036 952.000 0.000 NA   NA
 1759852 614827 RTPG40 RT0722   fadA TRUE 0.753 -2.000 0.000 NA   NA
 614827 614828 RT0722 RT0723 fadA   TRUE 0.971 -3.000 0.085 NA Y NA
 614830 614831 RT0725 RT0726 tlyC   TRUE 0.980 17.000 0.222 NA   NA
 614831 614832 RT0726 RT0727   lipA TRUE 0.523 101.000 0.004 NA   NA
 614832 614833 RT0727 RT0728 lipA glyA TRUE 0.915 -7.000 0.009 1.000 N NA
 614833 614834 RT0728 RT0729 glyA   TRUE 0.930 80.000 0.182 NA   NA
 614834 614835 RT0729 RT0730   grxC2 TRUE 0.918 136.000 0.538 NA   NA
 1759853 614837 RTPG41 RT0732     TRUE 0.593 76.000 0.000 NA   NA
 614840 614841 RT0735 RT0736 pgpA rplU FALSE 0.485 167.000 0.004 1.000 N NA
 614841 614842 RT0736 RT0737 rplU rpmA TRUE 0.997 25.000 0.667 0.045 Y NA
 614842 614843 RT0737 RT0738 rpmA lysC FALSE 0.143 255.000 0.000 1.000 N NA
 614843 614844 RT0738 RT0739 lysC   FALSE 0.068 401.000 0.000 1.000   NA
 614845 614846 RT0740 RT0741 proP5   FALSE 0.071 325.000 0.000 NA   NA
 614846 614847 RT0741 RT0742     TRUE 0.868 3.000 0.008 NA   NA
 614847 614848 RT0742 RT0743     TRUE 0.967 14.000 0.077 NA   NA
 614848 614849 RT0743 RT0744     TRUE 0.963 4.000 0.115 NA   NA
 614850 614851 RT0745 RT0746 thdF   FALSE 0.083 285.000 0.000 NA   NA
 614851 614852 RT0746 RT0747   recA FALSE 0.036 1525.000 0.000 NA   NA
 614852 614853 RT0747 RT0748 recA fabG TRUE 0.896 2.000 0.008 1.000 N NA
 614853 614854 RT0748 RT0749 fabG acpP TRUE 0.968 162.000 0.321 0.007 Y NA
 614854 614855 RT0749 RT0750 acpP fabF TRUE 0.978 34.000 0.106 1.000 Y NA
 614855 614856 RT0750 RT0751 fabF   FALSE 0.037 719.000 0.000 NA   NA
 614857 614858 RT0752 RT0753 gmk   TRUE 0.581 120.000 0.008 1.000   NA
 614858 614859 RT0753 RT0754   mreC FALSE 0.045 672.000 0.000 1.000   NA
 614859 614860 RT0754 RT0755 mreC mreB TRUE 0.988 3.000 0.689 1.000 N NA
 614860 614861 RT0755 RT0756 mreB   FALSE 0.510 139.000 0.005 1.000   NA
 614861 614862 RT0756 RT0757     TRUE 0.762 42.000 0.000 NA   NA
 614862 614863 RT0757 RT0758   pal FALSE 0.059 391.000 0.000 NA   NA
 614863 614864 RT0758 RT0759 pal fabH FALSE 0.104 324.000 0.000 1.000 N NA
 614864 614865 RT0759 RT0760 fabH rpmF TRUE 0.943 14.000 0.014 1.000 N NA
 614866 614867 RT0761 RT0762   ftsY FALSE 0.447 177.000 0.005 1.000 N NA
 614867 614868 RT0762 RT0763 ftsY polA FALSE 0.505 167.000 0.005 1.000 N NA
 614868 614869 RT0763 RT0764 polA metK FALSE 0.116 287.000 0.000 1.000 N NA
 614870 614871 RT0765 RT0766 dnaE udg TRUE 0.593 135.000 0.007 1.000 N NA
 614872 614873 RT0767 RT0768   ampG3 TRUE 0.964 10.000 0.079 NA   NA
 614873 614874 RT0768 RT0769 ampG3 tatC TRUE 0.645 175.000 0.033 NA   NA
 614874 614875 RT0769 RT0770 tatC serS TRUE 0.971 -22.000 0.065 NA N NA
 614875 614876 RT0770 RT0771 serS virB4b FALSE 0.116 261.000 0.000 NA N NA
 614878 614879 RT0773 RT0774   terC TRUE 0.949 5.000 0.051 NA   NA
 614879 614880 RT0774 RT0775 terC   TRUE 0.971 41.000 0.037 0.078   NA
 614880 614881 RT0775 RT0776     TRUE 0.963 98.000 0.857 1.000   NA
 614881 614882 RT0776 RT0777   nuoJ TRUE 0.849 66.000 0.012 1.000   NA
 614882 614883 RT0777 RT0778 nuoJ nuoK TRUE 0.996 -7.000 0.484 0.008 Y NA
 614883 614884 RT0778 RT0779 nuoK nuoL TRUE 0.994 0.000 0.451 0.021 Y NA
 614884 614885 RT0779 RT0780 nuoL nuoM TRUE 0.965 152.000 0.251 0.008 Y NA
 614885 614886 RT0780 RT0781 nuoM ccmA FALSE 0.091 360.000 0.000 1.000 N NA
 614887 614888 RT0782 RT0783 nuoI nuoH TRUE 0.995 7.000 0.500 0.021 Y NA
 614888 614889 RT0783 RT0784 nuoH nuoG TRUE 0.967 169.000 0.515 0.021 Y NA
 614889 614890 RT0784 RT0785 nuoG   TRUE 0.920 3.000 0.021 NA   NA
 614890 614891 RT0785 RT0786   acnA FALSE 0.484 173.000 0.008 NA   NA
 614891 614892 RT0786 RT0787 acnA atpC TRUE 0.610 159.000 0.005 1.000 Y NA
 614892 614893 RT0787 RT0788 atpC atpD TRUE 0.986 114.000 0.837 0.010 Y NA
 614893 614894 RT0788 RT0789 atpD atpG TRUE 0.985 103.000 0.724 0.010 Y NA
 614894 614895 RT0789 RT0790 atpG atpA TRUE 0.993 78.000 0.846 0.010 Y NA
 614895 614896 RT0790 RT0791 atpA atpH TRUE 0.986 137.000 0.864 0.010 Y NA
 614896 614897 RT0791 RT0792 atpH pdhD2 TRUE 0.670 124.000 0.007 1.000 Y NA
 614897 614898 RT0792 RT0793 pdhD2   FALSE 0.307 251.000 0.014 1.000 N NA
 614898 614899 RT0793 RT0794   mrcA FALSE 0.053 1622.000 0.000 1.000 N NA
 614899 614900 RT0794 RT0795 mrcA miaB2 TRUE 0.865 4.000 0.005 1.000 N NA
 614900 614901 RT0795 RT0796 miaB2   FALSE 0.184 196.000 0.000 NA   NA
 614901 614902 RT0796 RT0797     FALSE 0.055 408.000 0.000 NA   NA
 614902 614903 RT0797 RT0798   kefB TRUE 0.959 -31.000 0.039 NA   NA
 614903 614904 RT0798 RT0799 kefB   TRUE 0.860 -3.000 0.008 NA   NA
 614905 614906 RT0800 RT0801     FALSE 0.036 1586.000 0.000 NA   NA
 614906 614907 RT0801 RT0802   infA TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 614907 614908 RT0802 RT0803 infA   TRUE 0.979 12.000 0.207 NA N NA
 614909 614910 RT0804 RT0805 dksA xerC TRUE 0.864 94.000 0.040 1.000 N NA
 614912 614913 RT0807 RT0808   phbC TRUE 0.776 132.000 0.047 1.000   NA
 614913 614914 RT0808 RT0809 phbC ubiD TRUE 0.890 49.000 0.009 NA N NA
 614914 614915 RT0809 RT0810 ubiD   TRUE 0.704 116.000 0.015 NA N NA
 614915 614916 RT0810 RT0811   ftsK FALSE 0.044 3066.000 0.000 1.000   NA
 614917 614918 RT0812 RT0813 map   FALSE 0.072 451.000 0.000 1.000 N NA
 614918 614919 RT0813 RT0814     TRUE 0.926 -3.000 0.023 NA   NA
 614920 614921 RT0815 RT0816     TRUE 0.578 225.000 0.000 0.004 Y NA
 614921 614922 RT0816 RT0817   fdxA TRUE 0.929 152.000 0.545 1.000 N NA
 614922 614923 RT0817 RT0818 fdxA ccmC TRUE 0.936 5.000 0.018 1.000 N NA
 614923 614924 RT0818 RT0819 ccmC   TRUE 0.680 117.000 0.010 1.000 N NA
 614924 614925 RT0819 RT0820     TRUE 0.959 17.000 0.023 1.000 N NA
 614926 614927 RT0821 RT0822     TRUE 0.789 86.000 0.011 1.000 N NA
 614929 614930 RT0824 RT0825     TRUE 0.813 124.000 0.083 NA   NA
 614932 614933 RT0827 RT0828   htpG TRUE 0.560 152.000 0.008 NA   NA
 614933 614934 RT0828 RT0829 htpG hemA TRUE 0.606 162.000 0.008 1.000 N NA
 614934 614935 RT0829 RT0830 hemA tig FALSE 0.054 804.000 0.000 1.000 N NA
 614936 614937 RT0831 RT0832   gltA FALSE 0.074 421.000 0.002 1.000   NA
 614937 614938 RT0832 RT0833 gltA   FALSE 0.056 641.000 0.000 1.000 N NA
 614939 614940 RT0834 RT0835 rluD   TRUE 0.598 75.000 0.000 NA   NA
 614940 614941 RT0835 RT0836   hemK FALSE 0.077 311.000 0.000 NA   NA
 614942 614943 RT0837 RT0838   glyS TRUE 0.719 149.000 0.013 NA Y NA
 614943 614944 RT0838 RT0839 glyS glyQ TRUE 0.997 -7.000 0.651 0.002 Y NA
 614944 614945 RT0839 RT0840 glyQ   FALSE 0.257 193.000 0.005 NA   NA
 614945 614946 RT0840 RT0841   proP6 TRUE 0.914 9.000 0.014 NA   NA
 614946 614947 RT0841 RT0842 proP6   FALSE 0.181 197.000 0.000 NA   NA
 614947 614948 RT0842 RT0843     TRUE 0.991 10.000 1.000 NA   NA
 614948 614949 RT0843 RT0844     TRUE 0.903 166.000 0.556 NA   NA
 614951 614952 RT0846 RT0847 truA rpoD TRUE 0.659 98.000 0.006 1.000 N NA
 614952 614953 RT0847 RT0848 rpoD dnaG TRUE 0.984 25.000 0.299 1.000 N NA
 614953 614954 RT0848 RT0849 dnaG   TRUE 0.891 0.000 0.008 1.000 N NA
 614956 614957 RT0851 RT0852 pntAB pntA TRUE 0.998 -25.000 0.829 0.003   NA
 614958 614959 RT0853 RT0854     TRUE 0.819 19.000 0.000 NA   NA
 614959 614961 RT0854 RT0855   dnaX FALSE 0.351 160.000 0.000 NA   NA
 614960 614962 RT0856 RT0857 dnaX   FALSE 0.522 341.000 0.411 NA   NA
 614961 614960 RT0855 RT0856 dnaX dnaX TRUE 0.983 -1189.000 0.005 0.003 Y NA
 614963 614964 RT0858 RT0859   glnQ FALSE 0.043 907.000 0.000 1.000   NA
 614964 614965 RT0859 RT0860 glnQ phnP TRUE 0.924 4.000 0.019 1.000   NA
 614966 614967 RT0861 RT0862     TRUE 0.742 88.000 0.009 1.000   NA
 614968 614969 RT0863 RT0864 holC   TRUE 0.766 41.000 0.000 NA   NA
 614969 614970 RT0864 RT0865   dapE FALSE 0.382 146.000 0.000 NA   NA
 614970 614971 RT0865 RT0866 dapE   FALSE 0.035 1168.000 0.000 NA   NA
 614971 614972 RT0866 RT0867   lipB TRUE 0.856 -3.000 0.007 NA   NA
 614972 614973 RT0867 RT0868 lipB   FALSE 0.048 476.000 0.000 NA   NA
 614973 614974 RT0868 RT0869   rpsP FALSE 0.374 131.000 0.000 NA   NA
 614974 614975 RT0869 RT0870 rpsP rpmG TRUE 0.971 7.000 0.008 0.044 Y NA
 614975 614976 RT0870 RT0871 rpmG mutL TRUE 0.536 128.000 0.004 1.000 N NA
 614976 614977 RT0871 RT0872 mutL   TRUE 0.809 -3.000 0.004 NA   NA
 1759854 614978 RTPG42 RT0873   proP7 FALSE 0.165 202.000 0.000 NA   NA
 614978 614979 RT0873 RT0874 proP7 hemF TRUE 0.943 -16.000 0.014 1.000 N NA
 614980 614981 RT0875 RT0876   hemH TRUE 0.952 12.000 0.043 NA   NA
 614981 614982 RT0876 RT0877 hemH hemE TRUE 0.986 -43.000 0.131 1.000 Y NA