MicrobesOnline Operon Predictions for Chromobacterium violaceum ATCC 12472

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 515152 515153 CV0001 CV0002 dnaA dnaN TRUE 0.969 43.000 0.328 1.000 Y NA
 515153 515154 CV0002 CV_0003 dnaN gyrB TRUE 0.733 131.000 0.114 1.000 Y NA
 515156 515157 CV0005 CV0006     TRUE 0.805 23.000 0.026 NA   NA
 515157 515158 CV0006 CV0007     TRUE 0.997 2.000 0.684 NA   NA
 515158 515159 CV0007 CV0008     FALSE 0.013 411.000 0.000 NA   NA
 515159 515160 CV0008 CV0009     FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 515160 515161 CV0009 CV0010     FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 515162 515163 CV0011 CV0012     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515163 515164 CV0012 CV0013     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 515164 515165 CV0013 CV0014     FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 515165 515166 CV0014 CV0015     FALSE 0.053 186.000 0.000 NA   NA
 515166 515167 CV0015 CV0016     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 515169 515170 CV0018 CV0019     TRUE 0.991 4.000 0.019 0.003 Y NA
 515170 515171 CV0019 CV0020     TRUE 0.718 16.000 0.000 1.000 N NA
 515171 515172 CV0020 CV0021     TRUE 0.963 -7.000 0.000 1.000 N NA
 515173 515174 CV0022 CV0023     FALSE 0.098 146.000 0.000 NA   NA
 515174 515175 CV0023 CV0024     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 515175 515176 CV0024 CV0025     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 515176 515177 CV0025 CV0026     TRUE 0.428 43.000 0.000 NA   NA
 515177 515178 CV0026 CV0027     FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 515181 515182 CV0030 CV0031   tar FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 515182 515183 CV0031 CV0032 tar   FALSE 0.041 218.000 0.000 1.000 N NA
 515184 515185 CV0033 CV0034   nadV TRUE 0.749 51.000 0.078 1.000 N NA
 515185 515186 CV0034 CV0035 nadV   FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 515186 515187 CV0035 CV0036     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 515188 515189 CV0037 CV0038     FALSE 0.378 51.000 0.000 NA   NA
 515189 515190 CV0038 CV0039     FALSE 0.186 92.000 0.000 NA   NA
 515195 515196 CV0044 CV0045 cysE   FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 515196 515197 CV0045 CV0046   pleD FALSE 0.072 167.000 0.000 NA   NA
 515198 515199 CV0047 CV0048     TRUE 0.963 -7.000 0.000 1.000 N NA
 515199 515200 CV0048 CV0049   gcvA FALSE 0.047 206.000 0.000 1.000 N NA
 515200 515201 CV0049 CV0050 gcvA hemY FALSE 0.017 363.000 0.000 1.000 N NA
 515201 515202 CV0050 CV0051 hemY hemX TRUE 0.999 4.000 0.765 1.000 Y NA
 515202 515203 CV0051 CV0052 hemX hemD TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 515203 515204 CV0052 CV0053 hemD   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515204 515205 CV0053 CV_0054   hemC TRUE 0.501 33.000 0.000 NA   NA
 515207 515208 CV0056 CV0057   lasB FALSE 0.345 95.000 0.000 0.036   NA
 515208 515209 CV0057 CV0058 lasB   TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 515209 515210 CV0058 CV0059   pdxH FALSE 0.026 262.000 0.000 NA   NA
 515210 515211 CV0059 CV0060 pdxH   FALSE 0.189 101.000 0.000 1.000   NA
 515211 515212 CV0060 CV0061     FALSE 0.111 146.000 0.000 1.000   NA
 515214 515215 CV0063 CV0064     TRUE 0.995 -3.000 0.265 NA   NA
 515215 515216 CV0064 CV0065     FALSE 0.157 115.000 0.000 NA   NA
 515216 515217 CV0065 CV0066     FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 515217 515218 CV0066 CV0067   hemL FALSE 0.091 150.000 0.000 NA   NA
 515218 515219 CV0067 CV0068 hemL   FALSE 0.223 84.000 0.000 1.000 N NA
 515219 515220 CV0068 CV0069     TRUE 0.977 2.000 0.000 1.000 Y NA
 515220 515221 CV0069 CV0070     FALSE 0.035 220.000 0.000 NA   NA
 515222 515223 CV0071 CV0072     FALSE 0.165 103.000 0.000 NA   NA
 515224 515225 CV0073 CV0074 pilR pilS TRUE 0.999 -7.000 0.556 1.000 Y NA
 515225 515226 CV0074 CV0075 pilS parC TRUE 0.953 0.000 0.003 1.000 N NA
 515229 515230 CV0078 CV0079   hemA FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 515230 515231 CV0079 CV0080 hemA prfA TRUE 0.992 0.000 0.171 0.044 N NA
 515232 515233 CV0081 CV0082     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA   NA
 515233 515234 CV0082 CV0083     TRUE 0.966 10.000 0.135 NA   NA
 515234 515235 CV0083 CV0084     TRUE 0.992 0.000 0.271 NA   NA
 515236 515237 CV0085 CV0086     FALSE 0.131 131.000 0.000 NA   NA
 515237 515238 CV0086 CV0087     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 515238 515239 CV0087 CV0088     TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 515243 515244 CV0092 CV0093   fadD1 FALSE 0.026 276.000 0.000 1.000 N NA
 515246 515247 CV0095 CV0096     FALSE 0.168 101.000 0.000 NA   NA
 515248 515249 CV0097 CV0098     FALSE 0.015 357.000 0.000 NA   NA
 515249 515250 CV0098 CV0099   pntB FALSE 0.083 156.000 0.000 NA   NA
 515250 515251 CV0099 CV0100 pntB   TRUE 0.981 3.000 0.040 0.001   NA
 515251 515252 CV0100 CV0101   pntA TRUE 1.000 -7.000 0.829 0.001   NA
 515252 515253 CV0101 CV0102 pntA   FALSE 0.016 383.000 0.000 1.000 N NA
 515254 515255 CV0103 CV0104     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515255 515256 CV0104 CV0105     FALSE 0.364 53.000 0.000 NA   NA
 515256 515257 CV0105 CV0106     TRUE 0.605 61.000 0.041 NA   NA
 515257 515258 CV0106 CV0107   tolR FALSE 0.173 118.000 0.000 1.000   NA
 515258 515259 CV0107 CV0108 tolR   TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 515259 515260 CV0108 CV0109   tolB TRUE 0.748 29.000 0.000 0.013   NA
 515260 515261 CV0109 CV0110 tolB pal TRUE 0.988 14.000 0.592 1.000 N NA
 515261 515262 CV0110 CV0111 pal   TRUE 0.601 118.000 0.167 1.000   NA
 515263 515264 CV0112 CV0113 glpR1   FALSE 0.046 208.000 0.000 1.000 N NA
 515264 515265 CV0113 CV0114     TRUE 0.608 25.000 0.000 1.000 N NA
 515265 515266 CV0114 CV0115   argH FALSE 0.171 121.000 0.000 1.000 N NA
 515266 515267 CV0115 CV0116 argH   TRUE 0.596 78.000 0.000 1.000 Y NA
 515267 515268 CV0116 CV0117   gltL FALSE 0.114 273.000 0.000 1.000 Y NA
 515268 515269 CV0117 CV0118 gltL gltK TRUE 0.966 6.000 0.000 1.000 Y NA
 515269 515270 CV0118 CV0119 gltK gltJ TRUE 1.000 -3.000 0.933 0.012 Y NA
 515270 515271 CV0119 CV0120 gltJ   TRUE 0.470 144.000 0.000 0.080 Y NA
 515271 515272 CV0120 CV0121   ksgA FALSE 0.075 172.000 0.000 1.000 N NA
 515272 515273 CV0121 CV0122 ksgA   FALSE 0.187 102.000 0.000 1.000 N NA
 515274 515275 CV0123 CV0124     FALSE 0.159 112.000 0.000 NA   NA
 515275 515276 CV0124 CV0125   cafA TRUE 0.979 15.000 0.417 NA N NA
 515276 515277 CV0125 CV0126 cafA   FALSE 0.010 760.000 0.000 1.000 N NA
 515277 515278 CV0126 CV0127     FALSE 0.013 438.000 0.000 1.000 N NA
 515278 515279 CV0127 CV0128     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 515280 515281 CV0129 CV0130     FALSE 0.055 183.000 0.000 NA   NA
 515281 515282 CV0130 CV0131     FALSE 0.198 97.000 0.000 1.000 N NA
 515283 515284 CV0132 CV0133     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 515284 515285 CV0133 CV0134     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 515285 515286 CV0134 CV0135     TRUE 0.649 21.000 0.000 1.000   NA
 515286 515287 CV0135 CV0136   glpR2 FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 515287 515288 CV0136 CV0137 glpR2   FALSE 0.160 110.000 0.000 NA N NA
 515288 515289 CV0137 CV0138     FALSE 0.017 326.000 0.000 NA   NA
 515289 515290 CV0138 CV0139     FALSE 0.012 429.000 0.000 NA   NA
 515290 515291 CV0139 CV0140     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 515294 515295 CV0143 CV0144 eda edd TRUE 0.967 65.000 0.523 1.000 Y NA
 515296 515297 CV0145 CV0146 zwf pgl FALSE 0.277 172.000 0.000 1.000 Y NA
 515297 515298 CV0146 CV0147 pgl glk TRUE 0.979 14.000 0.117 1.000 Y NA
 515298 515299 CV0147 CV0148 glk   TRUE 0.987 -7.000 0.035 1.000 N NA
 515299 515300 CV0148 CV0149   pgi2 TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000 N NA
 515301 515302 CV0150 CV0151   thiD TRUE 0.999 -16.000 0.209 1.000 Y NA
 515303 515304 CV0152 CV0153 rubB   TRUE 0.962 0.000 0.000 0.020 N NA
 515304 515305 CV0153 CV0154     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 515305 515306 CV0154 CV0155     FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 515306 515307 CV0155 CV0156     TRUE 0.612 42.000 0.008 NA   NA
 515307 515308 CV0156 CV0157     FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 515308 515309 CV0157 CV0158   sorA FALSE 0.205 81.000 0.000 NA   NA
 515309 515310 CV0158 CV0159 sorA sorB TRUE 0.995 -3.000 0.153 0.057   NA
 515310 515311 CV0159 CV0160 sorB   FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 515311 515312 CV0160 CV0161   purE FALSE 0.145 126.000 0.000 NA   NA
 515312 515313 CV0161 CV0162 purE purK TRUE 0.998 0.000 0.201 0.001 Y NA
 515313 515314 CV0162 CV0163 purK fofB TRUE 0.821 9.000 0.000 NA N NA
 515314 515315 CV0163 CV0164 fofB alkD TRUE 0.910 0.000 0.000 NA N NA
 515315 515316 CV0164 CV0165 alkD purC TRUE 0.617 24.000 0.000 1.000 N NA
 515316 515317 CV0165 CV0166 purC rimJ FALSE 0.111 146.000 0.000 1.000 N NA
 515317 515318 CV0166 CV0167 rimJ   FALSE 0.123 134.000 0.000 NA N NA
 515321 515322 CV0170 CV0171     FALSE 0.016 351.000 0.000 NA   NA
 515324 515325 CV0173 CV0174 aroG dksA FALSE 0.252 134.000 0.010 1.000 N NA
 515325 515326 CV0174 CV0175 dksA   FALSE 0.024 284.000 0.000 1.000 N NA
 515326 515327 CV0175 CV0176     FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 515327 515328 CV0176 CV0177   proC TRUE 0.933 10.000 0.039 NA   NA
 515328 515329 CV0177 CV0178 proC   TRUE 0.900 55.000 0.357 NA   NA
 515330 515331 CV0179 CV0180 pilT pilU2 TRUE 0.852 63.000 0.012 0.053 Y NA
 515331 515332 CV0180 CV0181 pilU2   FALSE 0.213 89.000 0.000 1.000 N NA
 515332 515333 CV0181 CV0182     TRUE 0.892 35.000 0.000 0.016 Y NA
 515333 515334 CV0182 CV0183   ligT TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N NA
 515335 515336 CV0184 CV0185   moaE TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515336 515337 CV0185 CV0186 moaE moaD TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 515337 515338 CV0186 CV0187 moaD agaY FALSE 0.024 288.000 0.000 1.000 N NA
 515338 515339 CV0187 CV0188 agaY   FALSE 0.417 85.000 0.021 1.000 N NA
 515339 515340 CV0188 CV0189   pgk FALSE 0.035 235.000 0.000 1.000 N NA
 515340 515341 CV0189 CV0190 pgk   FALSE 0.234 308.000 0.017 0.004 Y NA
 515341 515342 CV0190 CV0191   tktA TRUE 0.752 95.000 0.066 1.000 Y NA
 515344 515345 CV0193 CV0194 mdmC   TRUE 0.649 21.000 0.000 1.000   NA
 515345 515346 CV0194 CV0195     FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 515347 515348 CV0196 CV0197     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 515348 515349 CV0197 CV0198     FALSE 0.278 67.000 0.000 NA   NA
 515349 515350 CV0198 CV0199     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 515351 515352 CV0200 CV0201     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515352 515353 CV0201 CV0202     FALSE 0.421 44.000 0.000 NA   NA
 515353 515354 CV0202 CV0203     TRUE 0.960 -10.000 0.000 NA   NA
 515355 515356 CV0204 CV0205   uvrD FALSE 0.160 128.000 0.000 1.000 N NA
 515356 515357 CV0205 CV0206 uvrD   FALSE 0.290 115.000 0.007 1.000 N NA
 515357 515358 CV0206 CV0207     TRUE 0.997 -12.000 0.028 0.028 Y NA
 515358 515359 CV0207 CV0208     FALSE 0.041 1084.000 0.000 1.000 Y NA
 515360 515361 CV0209 CV0210 ohr2   TRUE 0.553 87.000 0.086 1.000 N NA
 515361 515362 CV0210 CV0211     FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 515363 515364 CV0212 CV0213   qor FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 515365 515366 CV0214 CV0215     TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 515367 515368 CV0216 CV0217 ompR ompB TRUE 0.762 52.000 0.000 1.000 Y NA
 515368 515369 CV0217 CV0218 ompB   FALSE 0.012 478.000 0.000 1.000 N NA
 515370 515371 CV0219 CV0220     TRUE 0.449 69.000 0.011 NA   NA
 515371 515372 CV0220 CV0221     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 515372 515373 CV0221 CV0222     FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 515374 515375 CV0223 CV0224     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515376 515377 CV0225 CV0226   rfaC TRUE 0.994 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 515378 515379 CV0227 CV0228     FALSE 0.139 129.000 0.000 NA   NA
 515379 515380 CV0228 CV0229     FALSE 0.183 93.000 0.000 NA N NA
 515381 515382 CV0230 CV0231     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515382 515383 CV0231 CV0232   ung FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 515383 515384 CV0232 CV0233 ung   FALSE 0.202 149.000 0.016 NA N NA
 515384 515385 CV0233 CV0234   pcm2 TRUE 0.985 3.000 0.200 NA N NA
 515386 515387 CV0235 CV0236 thiC   FALSE 0.164 104.000 0.000 NA   NA
 515387 515388 CV0236 CV0237     FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 515388 515389 CV0237 CV0238     FALSE 0.023 274.000 0.000 NA   NA
 515389 515390 CV0238 CV0239     TRUE 0.501 33.000 0.000 NA   NA
 515391 515392 CV0240 CV0241     TRUE 0.670 68.000 0.000 1.000 Y NA
 515393 515394 CV0242 CV0243     FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 515394 515395 CV0243 CV0244     FALSE 0.178 96.000 0.000 NA   NA
 515397 515398 CV0246 CV0247     FALSE 0.109 140.000 0.000 NA   NA
 515399 515400 CV0248 CV0249   pykF FALSE 0.201 95.000 0.000 1.000 N NA
 515400 515401 CV0249 CV0250 pykF   FALSE 0.018 313.000 0.000 NA   NA
 515402 515403 CV0251 CV0252 glpK glpF TRUE 0.638 82.000 0.131 1.000 N NA
 515403 515404 CV0252 CV0253 glpF glpT FALSE 0.393 196.000 0.013 0.080 Y NA
 515404 515405 CV0253 CV0254 glpT glpD FALSE 0.075 172.000 0.000 1.000 N NA
 515408 515409 CV0257 CV0258     FALSE 0.022 303.000 0.000 1.000 N NA
 515409 515410 CV0258 CV0259     TRUE 0.977 2.000 0.000 1.000 Y NA
 515410 515411 CV0259 CV0260     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 515411 515412 CV0260 CV0261     TRUE 0.988 10.000 0.067 0.079 Y NA
 515412 515413 CV0261 CV0262     TRUE 0.921 71.000 0.185 0.079 Y NA
 515413 515414 CV0262 CV0263     FALSE 0.335 88.000 0.000 0.092   NA
 515414 515415 CV0263 CV0264     FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 515415 515416 CV0264 CV0265     FALSE 0.198 85.000 0.000 NA   NA
 515417 515418 CV0266 CV0267     FALSE 0.175 98.000 0.000 NA   NA
 515418 515419 CV0267 CV0268     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 515419 515420 CV0268 CV0269     FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 515424 515425 CV0273 CV0274     FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 515425 515426 CV0274 CV0275     FALSE 0.012 437.000 0.000 NA   NA
 515426 515427 CV0275 CV0276     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 515427 515428 CV0276 CV0277     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 515428 515429 CV0277 CV0278     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515429 515430 CV0278 CV0279     TRUE 0.983 -7.000 0.000 0.016   NA
 515430 515431 CV0279 CV0280     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 515431 515432 CV0280 CV0281     FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 515432 515433 CV0281 CV0282     FALSE 0.162 106.000 0.000 NA   NA
 515434 515435 CV0283 CV0284     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 515435 515436 CV0284 CV0285     FALSE 0.378 51.000 0.000 NA   NA
 515437 515438 CV0286 CV0287     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 515438 515439 CV0287 CV0288     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 515439 515440 CV0288 CV0289   gst2 FALSE 0.171 100.000 0.000 NA   NA
 515442 515443 CV0291 CV0292   cpdB TRUE 0.461 38.000 0.000 NA N NA
 515443 515444 CV0292 CV0293 cpdB   FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 515444 515445 CV0293 CV0294   sir2 FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 515445 515446 CV0294 CV0295 sir2   FALSE 0.225 76.000 0.000 NA N NA
 515446 515447 CV0295 CV0296     FALSE 0.159 111.000 0.000 NA   NA
 515449 515450 CV0298 CV0299     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 515453 515454 CV0302 CV0303     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 515456 515457 CV0305 CV0306     TRUE 0.995 2.000 0.455 1.000 N NA
 515457 515458 CV0306 CV0307     TRUE 0.992 2.000 0.223 0.079 N NA
 515458 515459 CV0307 CV0308     FALSE 0.148 206.000 0.053 1.000 N NA
 515460 515461 CV0309 CV0310     TRUE 0.955 20.000 0.273 NA   NA
 515463 515464 CV0312 CV0313     FALSE 0.059 178.000 0.000 NA   NA
 515464 515465 CV0313 CV0314     TRUE 0.956 -6.000 0.000 NA   NA
 515465 515466 CV0314 CV0315     FALSE 0.031 250.000 0.000 1.000 N NA
 515469 515470 CV0318 CV0319     FALSE 0.303 63.000 0.000 NA   NA
 515471 515472 CV0320 CV0321 hutC hutI FALSE 0.239 182.000 0.090 1.000 N NA
 515472 515473 CV0321 CV0322 hutI hutG TRUE 0.777 65.000 0.171 1.000 N NA
 515473 515474 CV0322 CV0323 hutG hutU TRUE 0.964 39.000 0.114 0.001 Y NA
 515474 515475 CV0323 CV0324 hutU   FALSE 0.407 46.000 0.000 NA   NA
 515475 515476 CV0324 CV0325   hutH FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 515478 515479 CV0327 CV0328     FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 515479 515480 CV0328 CV0329     FALSE 0.251 76.000 0.000 1.000   NA
 515480 515481 CV0329 CV0330     FALSE 0.089 202.000 0.000 0.079   NA
 515482 515483 CV0331 CV0332 tyrB2   FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 515484 515485 CV0333 CV0334     TRUE 0.795 19.000 0.000 0.079   NA
 515485 515486 CV0334 CV0335     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515486 515487 CV0335 CV0336     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515488 515489 CV0337 CV0338     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 515489 515490 CV0338 CV0339     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 515490 515491 CV0339 CV0340     FALSE 0.009 712.000 0.000 NA   NA
 515491 515492 CV0340 CV0341     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 515492 515493 CV0341 CV0342     FALSE 0.161 108.000 0.000 NA   NA
 515493 515494 CV0342 CV0343     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 515494 515495 CV0343 CV0344     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515495 515496 CV0344 CV0345     FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 515496 515497 CV0345 CV0346     TRUE 0.994 11.000 0.714 NA   NA
 515497 515498 CV0346 CV0347     TRUE 0.930 14.000 0.095 NA   NA
 515498 515499 CV0347 CV0348     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 515499 515500 CV0348 CV0349     FALSE 0.009 581.000 0.000 NA   NA
 515500 515501 CV0349 CV0350     TRUE 0.877 125.000 0.714 NA   NA
 515501 515502 CV0350 CV0351     TRUE 0.630 70.000 0.088 NA   NA
 515502 515503 CV0351 CV0352     FALSE 0.020 294.000 0.000 NA   NA
 515503 515504 CV0352 CV0353     FALSE 0.010 557.000 0.000 NA   NA
 515504 515505 CV0353 CV0354     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 515505 515506 CV0354 CV0355     FALSE 0.205 81.000 0.000 NA   NA
 515507 515508 CV0356 CV0357   lpcA FALSE 0.135 130.000 0.000 NA N NA
 515509 515510 CV0358 CV0359 aes   FALSE 0.040 220.000 0.000 1.000   NA
 515511 515512 CV0360 CV0361     FALSE 0.160 109.000 0.000 NA   NA
 515512 515513 CV0361 CV0362     FALSE 0.016 351.000 0.000 NA   NA
 515513 515514 CV0362 CV0363     FALSE 0.153 120.000 0.000 NA   NA
 515514 515515 CV0363 CV0364     FALSE 0.278 67.000 0.000 NA   NA
 515516 515517 CV0365 CV0366   suhB2 FALSE 0.173 118.000 0.000 1.000 N NA
 515520 515521 CV0369 CV0370 pyrB pyrI TRUE 0.984 25.000 0.197 0.001 Y NA
 515522 515523 CV0371 CV0372     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 515523 515524 CV0372 CV0373     FALSE 0.278 67.000 0.000 NA   NA
 515524 515525 CV0373 CV0374     FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 515527 515528 CV0376 CV0377     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 515528 515529 CV0377 CV0378     TRUE 0.455 39.000 0.000 NA   NA
 515529 515530 CV0378 CV0379     FALSE 0.161 108.000 0.000 NA   NA
 515530 515531 CV0379 CV0380     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 515531 515532 CV0380 CV0381     FALSE 0.018 351.000 0.000 1.000   NA
 515532 515533 CV0381 CV0382     FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 515534 515535 CV0383 CV0384 rhlE3   FALSE 0.132 136.000 0.000 1.000 N NA
 515537 515538 CV0386 CV0387     FALSE 0.067 989.000 0.000 0.014 Y NA
 515538 515539 CV0387 CV0388     FALSE 0.017 321.000 0.000 NA   NA
 515539 515540 CV0388 CV0389   rsuA FALSE 0.284 66.000 0.000 NA   NA
 515540 515541 CV0389 CV0390 rsuA   FALSE 0.036 231.000 0.000 1.000 N NA
 515541 515542 CV0390 CV0391   ADA TRUE 0.994 -13.000 0.120 1.000 N NA
 515544 515545 CV0393 CV0394 aldB   FALSE 0.039 309.000 0.000 0.078 N NA
 515546 515547 CV0395 CV0396   aer TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.019   NA
 515547 515548 CV0396 CV0397 aer   FALSE 0.056 193.000 0.000 1.000   NA
 515548 515549 CV0397 CV0398   exbD2 FALSE 0.062 184.000 0.000 1.000   NA
 515549 515550 CV0398 CV0399 exbD2   TRUE 0.998 -13.000 0.067 0.090 Y NA
 515550 515551 CV0399 CV0400     TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.017 N NA
 515552 515553 CV0401 CV0402 hslV hslU TRUE 0.988 45.000 0.752 1.000 Y NA
 515554 515555 CV0403 CV0404     FALSE 0.080 158.000 0.000 NA   NA
 515556 515557 CV_rRNA16s1 CV_tRNAIleGAT1 rRNA16S   FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 515557 515558 CV_tRNAIleGAT1 CV_tRNAAlaTGC1     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 515558 515559 CV_tRNAAlaTGC1 CV_rRNA23s1   rRNA23S FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 515559 515560 CV_rRNA23s1 CV_rRNA5s1 rRNA23S rRNA5S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 515561 515562 CV0405 CV0406     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 515563 515564 CV0407 CV0408     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA   NA
 515564 515565 CV0408 CV0409     TRUE 0.997 3.000 0.750 NA   NA
 515565 515566 CV0409 CV0410     TRUE 0.974 3.000 0.100 NA   NA
 515566 515567 CV0410 CV0411     FALSE 0.227 215.000 0.167 NA   NA
 515569 515570 CV0413 CV0414     TRUE 0.509 32.000 0.000 NA   NA
 515570 515571 CV0414 CV0415     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 515571 515572 CV0415 CV0416     TRUE 0.962 -15.000 0.000 NA   NA
 515572 515573 CV0416 CV0417     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 515573 515574 CV0417 CV0418     TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 515574 515575 CV0418 CV0419     TRUE 0.689 16.000 0.000 NA   NA
 515575 515576 CV0419 CV0420     FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 515576 515577 CV0420 CV0421     FALSE 0.400 47.000 0.000 NA   NA
 515577 515578 CV0421 CV0422     TRUE 0.922 17.000 0.111 NA   NA
 515578 515579 CV0422 CV0423     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 515579 515580 CV0423 CV0424     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 515580 515581 CV0424 CV0425     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 515581 515582 CV0425 CV0426     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 515584 515585 CV0428 CV0429     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 515585 515586 CV0429 CV0430     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 515586 515587 CV0430 CV0431     FALSE 0.037 214.000 0.000 NA   NA
 515587 515588 CV0431 CV0432     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 515589 515590 CV0433 CV0434 oprM acrD TRUE 0.997 -7.000 0.204 0.077 N NA
 515590 515591 CV0434 CV0435 acrD   TRUE 0.991 21.000 0.945 1.000 N NA
 515592 515593 CV0436 CV0437 acrR   FALSE 0.219 86.000 0.000 1.000 N NA
 515593 515594 CV0437 CV0438     TRUE 0.997 -3.000 0.170 1.000 Y NA
 515594 515595 CV0438 CV0439     TRUE 0.820 33.000 0.077 NA N NA
 515595 515596 CV0439 CV0440   murA TRUE 0.960 11.000 0.129 NA N NA
 515596 515597 CV0440 CV0441 murA T9J2 FALSE 0.118 142.000 0.000 1.000   NA
 515598 515599 CV0442 CV0443   phnA FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000   NA
 515599 515600 CV0443 CV0444 phnA vacJ FALSE 0.219 77.000 0.000 NA N NA
 515600 515601 CV0444 CV0445 vacJ   TRUE 0.942 3.000 0.012 NA   NA
 515601 515602 CV0445 CV0446     TRUE 0.959 0.000 0.012 NA   NA
 515602 515603 CV0446 CV0447     FALSE 0.421 72.000 0.010 NA   NA
 515603 515604 CV0447 CV0448     TRUE 0.989 12.000 0.562 NA   NA
 515604 515605 CV0448 CV0449     TRUE 0.967 5.000 0.000 NA Y NA
 515605 515606 CV0449 CV0450   dapD FALSE 0.017 362.000 0.000 1.000 N NA
 515606 515607 CV0450 CV0451 dapD dapC TRUE 0.889 68.000 0.149 1.000 Y NA
 515608 515609 CV0452 CV0453     TRUE 0.461 38.000 0.000 NA   NA
 515610 515611 CV0454 CV0455     FALSE 0.014 374.000 0.000 NA   NA
 515611 515612 CV0455 CV0456     TRUE 0.943 2.000 0.008 NA   NA
 515613 515614 CV0457 CV0458     FALSE 0.030 238.000 0.000 NA   NA
 515616 515617 CV0460 CV0461     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515617 515618 CV0461 CV0462     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 515620 515621 CV0464 CV0465     TRUE 0.910 1.000 0.000 1.000   NA
 515621 515622 CV0465 CV0466     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 N NA
 515625 515626 CV0469 CV0470     FALSE 0.315 61.000 0.000 NA   NA
 515628 515629 CV0472 CV0473     TRUE 0.992 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 515629 515630 CV0473 CV0474     FALSE 0.008 1148.000 0.000 NA   NA
 515630 515631 CV0474 CV0475   soj FALSE 0.400 47.000 0.000 NA   NA
 515631 515632 CV0475 CV0476 soj   TRUE 0.502 73.000 0.036 NA   NA
 515633 515634 CV0477 CV0478 recQ argJ FALSE 0.341 78.000 0.003 1.000 N NA
 515634 515635 CV0478 CV_rRNA16s2 argJ rRNA16S FALSE 0.011 449.000 0.000 NA   NA
 515635 515636 CV_rRNA16s2 CV_tRNAIleGAT2 rRNA16S   FALSE 0.101 144.000 0.000 NA   NA
 515636 515637 CV_tRNAIleGAT2 CV_tRNAAlaTGC2     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 515637 515638 CV_tRNAAlaTGC2 CV_rRNA23s2   rRNA23S FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 515638 515639 CV_rRNA23s2 CV_rRNA5s2 rRNA23S rRNA5S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 515639 515640 CV_rRNA5s2 CV0479 rRNA5S   FALSE 0.028 245.000 0.000 NA   NA
 515640 515641 CV0479 CV0480     TRUE 0.996 -3.000 0.083 NA Y NA
 515641 515642 CV0480 CV0481     TRUE 0.945 30.000 0.333 NA   NA
 515642 515643 CV0481 CV0482     FALSE 0.031 542.000 0.038 NA   NA
 515643 515644 CV0482 CV0483   pilE3 TRUE 0.939 27.000 0.058 NA Y NA
 515644 515645 CV0483 CV0484 pilE3   TRUE 0.936 13.000 0.000 NA Y NA
 515645 515646 CV0484 CV0485     FALSE 0.151 122.000 0.000 NA   NA
 515646 515647 CV0485 CV0486   birA TRUE 0.801 18.000 0.005 1.000   NA
 515647 515648 CV0486 CV0487 birA   TRUE 0.992 -3.000 0.147 1.000 N NA
 515648 515649 CV0487 CV0488     TRUE 0.951 0.000 0.005 NA   NA
 515649 515650 CV0488 CV0489     TRUE 0.468 37.000 0.000 NA   NA
 515650 515651 CV0489 CV0490   speB FALSE 0.040 208.000 0.000 NA   NA
 515652 515653 CV0491 CV0492 cobS gpmA TRUE 0.980 -12.000 0.003 1.000 N NA
 515653 515654 CV0492 CV0493 gpmA cobT TRUE 0.980 18.000 0.500 1.000 N NA
 515655 515656 CV0494 CV0495   cobU TRUE 0.973 11.000 0.018 1.000 Y NA
 515656 515657 CV0495 CV0496 cobU   TRUE 0.983 -3.000 0.041 1.000 N NA
 515657 515658 CV0496 CV0497     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 515658 515659 CV0497 CV0498     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515659 515660 CV0498 CV0499     FALSE 0.095 228.000 0.034 NA   NA
 515660 515661 CV0499 CV0500     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515663 515664 CV0502 CV0503     TRUE 0.739 33.000 0.026 NA   NA
 515664 515665 CV0503 CV0504     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 515665 515666 CV0504 CV0505   leuS FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 515666 515667 CV0505 CV0506 leuS rlpB TRUE 0.680 82.000 0.182 NA N NA
 515667 515668 CV0506 CV_0507 rlpB holA TRUE 0.996 -19.000 0.199 NA N NA
 515670 515671 CV0509 CV0510     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 515671 515672 CV0510 CV0511     FALSE 0.028 267.000 0.000 1.000   NA
 515674 515675 CV0513 CV0514 hlyB   TRUE 0.998 7.000 0.426 0.013 Y NA
 515675 515676 CV0514 CV0515     TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000 N NA
 515676 515677 CV0515 CV0516     TRUE 0.626 23.000 0.000 1.000 N NA
 515678 515679 CV0517 CV0518     TRUE 0.855 64.000 0.307 NA   NA
 515679 515680 CV0518 CV0519     TRUE 0.483 78.000 0.044 NA   NA
 515680 515681 CV0519 CV0520     TRUE 0.984 -3.000 0.045 1.000 N NA
 515683 515684 CV0522 CV0523     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 515685 515686 CV0524 CV0525     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 515686 515687 CV0525 CV0526   aceE FALSE 0.165 103.000 0.000 NA   NA
 515687 515688 CV0526 CV0527 aceE aceF TRUE 0.657 121.000 0.031 1.000 Y NA
 515688 515689 CV0527 CV0528 aceF lpdA1 TRUE 0.856 153.000 0.463 1.000 Y NA
 515689 515690 CV0528 CV0529 lpdA1   FALSE 0.008 820.000 0.000 NA   NA
 515690 515691 CV0529 CV0530     FALSE 0.027 254.000 0.000 NA   NA
 515693 515694 CV0532 CV0533     FALSE 0.025 283.000 0.000 1.000   NA
 515694 515695 CV0533 CV0534     TRUE 0.994 5.000 0.575 NA   NA
 515695 515696 CV0534 CV0535     FALSE 0.080 159.000 0.000 NA   NA
 515696 515697 CV0535 CV0536     TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 515699 515700 CV0538 CV0539     FALSE 0.178 96.000 0.000 NA   NA
 515700 515701 CV0539 CV0540     TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 N NA
 515701 515702 CV0540 CV0541     TRUE 0.795 75.000 0.286 NA   NA
 515704 515705 CV0543 CV0544   NifR3 FALSE 0.008 1314.000 0.000 NA   NA
 515705 515706 CV0544 CV0545 NifR3 fis TRUE 0.845 46.000 0.161 1.000 N NA
 515706 515707 CV0545 CV0546 fis purH FALSE 0.263 178.000 0.101 1.000 N NA
 515707 515708 CV0546 CV0547 purH purD TRUE 0.829 131.000 0.238 1.000 Y NA
 515710 515711 CV0549 CV0550     FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 515711 515712 CV0550 CV0551   tolQ TRUE 0.706 27.000 0.006 NA N NA
 515712 515713 CV0551 CV0552 tolQ   FALSE 0.340 62.000 0.000 1.000   NA
 515714 515715 CV0553 CV0554     FALSE 0.053 313.000 0.000 0.002   NA
 515716 515717 CV0555 CV0556   nagA TRUE 0.992 -3.000 0.146 1.000 N NA
 515717 515718 CV0556 CV0557 nagA   TRUE 0.994 -7.000 0.146 1.000 N NA
 515718 515719 CV0557 CV0558     TRUE 0.697 89.000 0.200 1.000 N NA
 515719 515720 CV0558 CV0559   nagE TRUE 0.939 77.000 0.258 0.005 Y NA
 515720 515721 CV0559 CV0560 nagE gapA FALSE 0.152 230.000 0.000 1.000 Y NA
 515723 515724 CV0562 CV0563 phoB phoR TRUE 0.989 0.000 0.010 1.000 Y NA
 515724 515725 CV0563 CV0564 phoR talA FALSE 0.201 95.000 0.000 1.000 N NA
 515728 515729 CV0567 CV0568     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515729 515730 CV0568 CV0569     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515730 515731 CV0569 CV0570     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515732 515733 CV0571 CV0572     FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 515735 515736 CV0574 CV0575 proS   TRUE 0.975 0.000 0.053 NA   NA
 515736 515737 CV0575 CV0576   mntH TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 515740 515741 CV0579 CV0580     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 515743 515744 CV0582 CV0583     TRUE 0.996 -3.000 0.310 NA   NA
 515744 515745 CV0583 CV0584     TRUE 0.989 -7.000 0.064 NA   NA
 515745 515746 CV0584 CV0585     TRUE 0.982 -3.000 0.039 NA   NA
 515747 515748 CV0586 CV0587 ilvI ilvH TRUE 0.997 11.000 0.371 0.001 Y NA
 515748 515749 CV0587 CV0588 ilvH ilvC TRUE 0.949 48.000 0.092 0.001 Y NA
 515749 515750 CV0588 CV0589 ilvC   FALSE 0.058 179.000 0.000 NA   NA
 515750 515751 CV0589 CV0590     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 515752 515753 CV0591 CV0592 psd   FALSE 0.062 184.000 0.000 1.000   NA
 515754 515755 CV0593 CV0594     TRUE 0.999 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 515755 515756 CV0594 CV0595   leuA FALSE 0.014 435.000 0.000 1.000 N NA
 515757 515758 CV0596 CV0597     FALSE 0.095 148.000 0.000 NA   NA
 515759 515760 CV0598 CV0599 bioD coxB FALSE 0.071 175.000 0.000 1.000 N NA
 515760 515761 CV0599 CV0600 coxB coxA TRUE 0.998 14.000 0.741 0.003 Y NA
 515761 515762 CV0600 CV0601 coxA ctaG TRUE 0.980 11.000 0.268 1.000 N NA
 515762 515763 CV0601 CV0602 ctaG   TRUE 0.970 -3.000 0.007 NA   NA
 515763 515764 CV0602 CV0603   coxC TRUE 0.883 11.000 0.007 NA   NA
 515764 515765 CV0603 CV0604 coxC   FALSE 0.128 203.000 0.041 NA   NA
 515765 515766 CV0604 CV0605     TRUE 0.999 -13.000 0.722 NA   NA
 515766 515767 CV0605 CV0606   ctaA TRUE 0.883 48.000 0.255 NA   NA
 515767 515768 CV0606 CV0607 ctaA ctaB TRUE 0.999 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 515768 515769 CV0607 CV0608 ctaB   TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 515769 515770 CV0608 CV0609     FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 515770 515771 CV0609 CV0610   hisG TRUE 0.623 33.000 0.002 NA N NA
 515771 515772 CV0610 CV0611 hisG hisD TRUE 0.927 91.000 0.254 0.004 Y NA
 515772 515773 CV0611 CV0612 hisD   FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 515773 515774 CV0612 CV0613   hisC FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 515774 515775 CV0613 CV0614 hisC hisB TRUE 0.998 5.000 0.341 0.004 Y NA
 515775 515776 CV0614 CV0615 hisB   TRUE 0.988 -3.000 0.000 NA Y NA
 515776 515777 CV0615 CV0616   hisH TRUE 0.967 5.000 0.000 NA Y NA
 515777 515778 CV0616 CV_0617 hisH hisA TRUE 0.979 22.000 0.120 0.004 Y NA
 515778 515779 CV_0617 CV0618 hisA hisF TRUE 0.967 73.000 0.433 0.004 Y NA
 515779 515780 CV0618 CV0619 hisF   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515780 515781 CV0619 CV0620   hisI TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515781 515782 CV0620 CV0621 hisI hisE TRUE 0.830 135.000 0.152 0.004 Y NA
 515782 515783 CV0621 CV0622 hisE   TRUE 0.910 17.000 0.079 1.000 N NA
 515783 515784 CV0622 CV0623   tatA TRUE 0.818 36.000 0.080 1.000 N NA
 515784 515785 CV0623 CV0624 tatA tatB TRUE 0.952 16.000 0.000 0.013 Y NA
 515785 515786 CV0624 CV0625 tatB tatC TRUE 0.988 -3.000 0.000 NA Y NA
 515786 515787 CV0625 CV0626 tatC   TRUE 0.973 -3.000 0.010 NA   NA
 515787 515788 CV0626 CV0627   tap FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 515789 515790 CV0628 CV0629     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 515790 515791 CV0629 CV0630   mdlB FALSE 0.109 140.000 0.000 NA   NA
 515791 515792 CV0630 CV0631 mdlB mdlA TRUE 0.999 11.000 0.911 0.004 Y NA
 515792 515793 CV0631 CV0632 mdlA   FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 515793 515794 CV0632 CV0633   nuoA1 FALSE 0.053 186.000 0.000 NA   NA
 515797 515798 CV0636 CV0637     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 515799 515800 CV0638 CV0639     TRUE 0.998 -10.000 0.500 NA   NA
 515800 515801 CV0639 CV0640     FALSE 0.009 615.000 0.000 NA   NA
 515801 515802 CV0640 CV0641     FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 515802 515803 CV0641 CV0642     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 515803 515804 CV0642 CV0643     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515806 515807 CV0645 CV0646     TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000   NA
 515807 515808 CV0646 CV0647     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 515808 515809 CV0647 CV0648     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 515809 515810 CV0648 CV0649     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515810 515811 CV0649 CV0650     FALSE 0.014 384.000 0.000 NA   NA
 515811 515812 CV0650 CV0651   intB FALSE 0.033 227.000 0.000 NA   NA
 515812 515813 CV0651 CV_tRNALeuCAA intB   FALSE 0.059 178.000 0.000 NA   NA
 515813 515814 CV_tRNALeuCAA CV0652     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 515815 515816 CV0653 CV0654     TRUE 0.992 -3.000 0.172 NA   NA
 515816 515817 CV0654 CV0655   gmhA TRUE 0.925 25.000 0.187 1.000 N NA
 515817 515818 CV0655 CV0656 gmhA   TRUE 0.996 2.000 0.613 NA   NA
 515819 515820 CV0657 CV0658     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA   NA
 515820 515821 CV0658 CV0659     TRUE 0.521 55.000 0.007 NA   NA
 515821 515822 CV0659 CV0660     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 515823 515824 CV_0661 CV0662 gidA gidB TRUE 0.997 -3.000 0.466 1.000 N NA
 515824 515825 CV0662 CV0663 gidB parA TRUE 0.996 -3.000 0.339 1.000 N NA
 515825 515826 CV0663 CV0664 parA parB TRUE 0.958 65.000 0.827 1.000 N NA
 515826 515827 CV0664 CV0665 parB   FALSE 0.381 92.000 0.016 1.000   NA
 515827 515828 CV0665 CV0666   atpB TRUE 0.984 11.000 0.330 1.000   NA
 515828 515829 CV0666 CV0667 atpB atpE TRUE 0.981 65.000 0.557 0.004 Y NA
 515829 515830 CV0667 CV0668 atpE atpF TRUE 0.966 122.000 0.666 0.004 Y NA
 515830 515831 CV0668 CV0669 atpF atpH TRUE 0.996 8.000 0.242 0.004 Y NA
 515831 515832 CV0669 CV0670 atpH atpA TRUE 0.999 9.000 0.864 0.004 Y NA
 515832 515833 CV0670 CV_0671 atpA atpG TRUE 0.995 41.000 0.846 0.004 Y NA
 515833 515834 CV_0671 CV0672 atpG atpD TRUE 0.993 42.000 0.724 0.004 Y NA
 515834 515835 CV0672 CV0673 atpD atpC TRUE 0.999 12.000 0.837 0.004 Y NA
 515835 515836 CV0673 CV0674 atpC glmU TRUE 0.540 82.000 0.067 1.000 N NA
 515838 515839 CV0676 CV0677 srlR glmS TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N NA
 515840 515841 CV0678 CV0679     FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 515841 515842 CV0679 CV0680     FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 515845 515846 CV0683 CV0684     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 515846 515847 CV0684 CV0685     TRUE 0.932 65.000 0.625 NA   NA
 515847 515848 CV0685 CV0686     TRUE 0.971 53.000 0.875 NA   NA
 515848 515849 CV0686 CV0687     TRUE 0.955 53.000 0.667 NA   NA
 515850 515851 CV0688 CV0689     TRUE 0.964 12.000 0.167 1.000   NA
 515851 515852 CV0689 CV0690   hpnA FALSE 0.011 571.000 0.000 1.000   NA
 515856 515857 CV0694 CV0695   bdhA TRUE 0.977 10.000 0.200 1.000   NA
 515857 515858 CV0695 CV0696 bdhA gcvA FALSE 0.046 208.000 0.000 1.000 N NA
 515860 515861 CV0698 CV0699     FALSE 0.267 73.000 0.000 1.000 N NA
 515862 515863 CV0700 CV0701     TRUE 0.710 53.000 0.058 1.000   NA
 515863 515864 CV0701 CV0702   rhaR FALSE 0.084 165.000 0.000 1.000   NA
 515864 515865 CV0702 CV0703 rhaR   TRUE 0.853 106.000 0.581 NA N NA
 515865 515866 CV0703 CV0704     TRUE 0.998 -3.000 0.651 NA   NA
 515866 515867 CV0704 CV0705     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 515867 515868 CV0705 CV0706     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 515869 515870 CV0707 CV0708     FALSE 0.035 219.000 0.000 NA   NA
 515870 515871 CV0708 CV0709     TRUE 0.996 8.000 0.750 1.000 N NA
 515871 515872 CV0709 CV0710     TRUE 0.982 35.000 0.833 1.000 N NA
 515873 515874 CV0711 CV0712     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 515874 515875 CV0712 CV0713     FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 515878 515879 CV0716 CV0717     FALSE 0.017 324.000 0.000 NA   NA
 515879 515880 CV0717 CV0718     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 515880 515881 CV0718 CV0719   mmr FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 515883 515884 CV0721 CV0722     TRUE 0.980 33.000 0.800 NA   NA
 515884 515885 CV0722 CV0723     TRUE 0.985 26.000 0.800 NA   NA
 515885 515886 CV0723 CV0724     TRUE 0.981 32.000 0.800 NA   NA
 515886 515887 CV0724 CV0725     TRUE 0.833 79.000 0.400 NA   NA
 515887 515888 CV0725 CV0726     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 515888 515889 CV0726 CV0727     FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 515889 515890 CV0727 CV0728     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 515890 515891 CV0728 CV0729   phaZ2 TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 515891 515892 CV0729 CV0730 phaZ2   TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 515892 515893 CV0730 CV0731     FALSE 0.142 128.000 0.000 NA   NA
 515893 515894 CV0731 CV0732     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 515894 515895 CV0732 CV0733     TRUE 0.961 29.000 0.444 NA   NA
 515895 515896 CV0733 CV0734     FALSE 0.162 106.000 0.000 NA   NA
 515896 515897 CV0734 CV0735     FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 515897 515898 CV0735 CV0736     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 515898 515899 CV0736 CV0737     FALSE 0.042 203.000 0.000 NA   NA
 515899 515900 CV0737 CV0738     TRUE 0.527 112.000 0.105 1.000 N NA
 515902 515903 CV0739 CV0740   adhC TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000   NA
 515904 515905 CV0741 CV0742     TRUE 0.569 29.000 0.000 1.000   NA
 515910 515911 CV0747 CV0748     TRUE 0.876 50.000 0.227 1.000 N NA
 515911 515912 CV0748 CV0749     TRUE 0.997 -3.000 0.473 NA N NA
 515912 515913 CV0749 CV0750     TRUE 0.996 6.000 0.351 NA Y NA
 515913 515914 CV0750 CV0751     TRUE 0.808 133.000 0.545 1.000   NA
 515914 515915 CV0751 CV0752     TRUE 0.770 51.000 0.095 1.000   NA
 515916 515917 CV0753 CV0754     FALSE 0.156 116.000 0.000 NA   NA
 515917 515918 CV0754 CV0755     TRUE 0.979 27.000 0.667 NA   NA
 515918 515919 CV0755 CV0756     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 515920 515921 CV0757 CV0758 hemF   FALSE 0.177 114.000 0.000 1.000 N NA
 515921 515922 CV0758 CV0759     FALSE 0.040 219.000 0.000 1.000   NA
 515922 515923 CV0759 CV0760     FALSE 0.199 96.000 0.000 1.000   NA
 515923 515924 CV0760 CV0761     TRUE 0.992 4.000 0.133 1.000 Y NA
 515927 515928 CV0764 CV0765     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 515929 515930 CV0766 CV0767   emrA TRUE 0.933 70.000 0.667 1.000   NA
 515930 515931 CV0767 CV0768 emrA   TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000 N NA
 515931 515932 CV0768 CV0769   emrR TRUE 0.484 79.000 0.039 1.000 N NA
 515932 515933 CV0769 CV0770 emrR   FALSE 0.058 190.000 0.000 1.000 N NA
 515935 515936 CV0772 CV0773   kpsD TRUE 0.998 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 515936 515937 CV0773 CV0774 kpsD   TRUE 0.608 25.000 0.000 1.000   NA
 515937 515938 CV0774 CV0775     FALSE 0.017 321.000 0.000 NA   NA
 515938 515939 CV0775 CV0776   thrB FALSE 0.082 157.000 0.000 NA   NA
 515939 515940 CV0776 CV0777 thrB   TRUE 0.973 11.000 0.204 NA   NA
 515940 515941 CV0777 CV0778     FALSE 0.097 288.000 0.095 NA   NA
 515942 515943 CV0779 CV0780 polA   FALSE 0.056 182.000 0.000 NA   NA
 515943 515944 CV0780 CV0781     FALSE 0.178 96.000 0.000 NA   NA
 515944 515945 CV0781 CV0782     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515946 515947 CV0783 CV0784 ampG   FALSE 0.186 92.000 0.000 NA   NA
 515947 515948 CV0784 CV0785     TRUE 0.564 26.000 0.000 NA   NA
 515948 515949 CV0785 CV0786     TRUE 0.998 -3.000 0.509 NA   NA
 515950 515951 CV0787 CV0788     FALSE 0.408 77.000 0.011 1.000   NA
 515951 515952 CV0788 CV0789     FALSE 0.221 85.000 0.000 1.000   NA
 515952 515953 CV0789 CV0790     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.053   NA
 515953 515954 CV0790 CV0791     FALSE 0.314 66.000 0.000 1.000   NA
 515955 515956 CV0792 CV0793     FALSE 0.314 61.000 0.000 NA N NA
 515956 515957 CV0793 CV0794     TRUE 0.994 -3.000 0.233 NA N NA
 515957 515958 CV0794 CV0795     TRUE 0.913 93.000 0.775 NA   NA
 515958 515959 CV0795 CV0796     TRUE 0.787 100.000 0.386 NA   NA
 515959 515960 CV0796 CV0797     FALSE 0.036 218.000 0.000 NA N NA
 515960 515961 CV0797 CV0798   fsr FALSE 0.196 98.000 0.000 1.000 N NA
 515963 515964 CV0800 CV0801     FALSE 0.051 191.000 0.000 NA   NA
 515965 515966 CV0802 CV0803     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 515966 515967 CV0803 CV0804     TRUE 0.900 23.000 0.111 1.000 N NA
 515967 515968 CV0804 CV0805     TRUE 0.981 0.000 0.091 NA N NA
 515968 515969 CV0805 CV0806     TRUE 0.985 -3.000 0.061 NA   NA
 515969 515970 CV0806 CV0807     FALSE 0.021 735.000 0.000 0.036   NA
 515971 515972 CV0808 CV0809   wrbA FALSE 0.114 191.000 0.000 0.034   NA
 515974 515975 CV0811 CV0812     TRUE 0.483 35.000 0.000 NA   NA
 515976 515977 CV0813 CV0814 cobA2   FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000 N NA
 515977 515978 CV0814 CV0815   ptsH TRUE 0.999 -13.000 0.261 0.005 Y NA
 515978 515979 CV0815 CV0816 ptsH   TRUE 0.755 175.000 0.205 0.005 Y NA
 515979 515980 CV0816 CV0817     TRUE 0.476 41.000 0.000 1.000 N NA
 515980 515981 CV0817 CV0818     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 515981 515982 CV0818 CV0819     FALSE 0.278 67.000 0.000 NA   NA
 515982 515983 CV0819 CV0820     TRUE 0.960 -10.000 0.000 NA   NA
 515984 515985 CV0821 CV0822 rfaB rfaQ TRUE 0.972 4.000 0.000 1.000 Y NA
 515986 515987 CV0823 CV0824   rfbU FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 515987 515988 CV0824 CV0825 rfbU msbA TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000 N NA
 515989 515990 CV0826 CV0827   aroB FALSE 0.090 159.000 0.000 1.000   NA
 515990 515991 CV0827 CV0828 aroB aroK TRUE 0.997 0.000 0.208 1.000 Y NA
 515991 515992 CV0828 CV0829 aroK pilQ TRUE 0.935 35.000 0.319 1.000 N NA
 515992 515993 CV0829 CV0830 pilQ pilP TRUE 0.999 -3.000 0.668 NA Y NA
 515993 515994 CV0830 CV0831 pilP pilO TRUE 0.996 15.000 0.680 NA Y NA
 515994 515995 CV0831 CV0832 pilO pilN TRUE 0.999 3.000 0.770 NA Y NA
 515995 515996 CV0832 CV0833 pilN pilM TRUE 0.999 1.000 0.616 NA Y NA
 515997 515998 CV0834 CV0835 mrcA icc FALSE 0.176 116.000 0.000 1.000   NA
 515998 515999 CV0835 CV0836 icc   FALSE 0.169 123.000 0.000 1.000   NA
 516000 516001 CV0837 CV0838     FALSE 0.008 1462.000 0.000 NA   NA
 516005 516006 CV0842 CV0843     FALSE 0.013 395.000 0.000 NA   NA
 516006 516007 CV0843 CV0844     FALSE 0.079 160.000 0.000 NA   NA
 516007 516008 CV0844 CV0845     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 516010 516011 CV_tRNAArgCCT CV0847   ispB TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 516012 516013 CV0848 CV0849 rplU rpmA TRUE 0.998 13.000 0.667 0.013 Y NA
 516013 516014 CV0849 CV0850 rpmA   TRUE 0.722 130.000 0.335 1.000   NA
 516014 516015 CV0850 CV0851     TRUE 0.961 -13.000 0.000 NA   NA
 516015 516016 CV0851 CV0852   argT FALSE 0.120 135.000 0.000 NA   NA
 516016 516017 CV0852 CV0853 argT hisQ1 TRUE 0.509 137.000 0.000 0.073 Y NA
 516017 516018 CV0853 CV0854 hisQ1 hisM1 TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.011 Y NA
 516018 516019 CV0854 CV0855 hisM1 hisP TRUE 0.993 22.000 0.643 1.000 Y NA
 516020 516021 CV0856 CV0857     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516021 516022 CV0857 CV0858     FALSE 0.315 61.000 0.000 NA   NA
 516022 516023 CV0858 CV0859     FALSE 0.142 128.000 0.000 NA   NA
 516024 516025 CV0860 CV0861     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 516028 516029 CV0864 CV0865     FALSE 0.208 92.000 0.000 1.000   NA
 516031 516032 CV0867 CV0868 sodB2   FALSE 0.079 160.000 0.000 NA   NA
 516032 516033 CV0868 CV0869     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 516036 516037 CV0872 CV0873     FALSE 0.011 486.000 0.000 NA   NA
 516038 516039 CV0874 CV0875     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516040 516041 CV0876 CV0877 prlC xthA FALSE 0.081 253.000 0.029 1.000 N NA
 516041 516042 CV0877 CV0878 xthA rsbR FALSE 0.105 149.000 0.000 1.000 N NA
 516042 516043 CV0878 CV0879 rsbR   TRUE 0.912 44.000 0.082 NA Y NA
 516043 516044 CV0879 CV0880   rsbT TRUE 0.992 12.000 0.320 NA Y NA
 516044 516045 CV0880 CV0881 rsbT   TRUE 0.992 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 516045 516046 CV0881 CV0882     FALSE 0.072 381.000 0.000 1.000 Y NA
 516046 516047 CV0882 CV0883     TRUE 0.946 17.000 0.000 0.025 Y NA
 516047 516048 CV0883 CV0884     FALSE 0.178 96.000 0.000 NA   NA
 516048 516049 CV0884 CV0885     FALSE 0.037 216.000 0.000 NA   NA
 516051 516052 CV0887 CV0888     FALSE 0.072 168.000 0.000 NA   NA
 516053 516054 CV0889 CV0890     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 516055 516056 CV0891 CV0892 qseB qseC TRUE 0.999 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 516057 516058 CV0893 CV0894     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 516058 516059 CV0894 CV0895   oprC FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 516060 516061 CV0896 CV0897   hydG TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 516061 516062 CV0897 CV0898 hydG alkK FALSE 0.170 122.000 0.000 1.000 N NA
 516062 516063 CV0898 CV0899 alkK   FALSE 0.027 273.000 0.000 1.000 N NA
 516063 516064 CV0899 CV0900     FALSE 0.214 89.000 0.000 1.000   NA
 516065 516066 CV0901 CV0902   vanX TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 516066 516067 CV0902 CV0903 vanX   FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 516067 516068 CV0903 CV0904     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516068 516069 CV0904 CV0905     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516069 516070 CV0905 CV0906   phaJ TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 516070 516071 CV0906 CV0907 phaJ   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516071 516072 CV0907 CV0908     TRUE 0.449 40.000 0.000 NA   NA
 516074 516075 CV0910 CV0911   dnaE FALSE 0.030 261.000 0.000 1.000 N NA
 516077 516078 CV0913 CV0914     FALSE 0.148 125.000 0.000 NA   NA
 516078 516079 CV0914 CV0915     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 516079 516080 CV0915 CV0916   maeB TRUE 0.628 58.000 0.043 NA   NA
 516080 516081 CV0916 CV0917 maeB   FALSE 0.203 156.000 0.019 1.000 N NA
 516081 516082 CV0917 CV0918   dctQ TRUE 1.000 -3.000 0.882 NA Y NA
 516082 516083 CV0918 CV0919 dctQ   TRUE 0.864 61.000 0.076 NA Y NA
 516084 516085 CV0920 CV_tRNAAlaCGC     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 516085 516086 CV_tRNAAlaCGC CV0921   chrB FALSE 0.016 330.000 0.000 NA   NA
 516086 516087 CV0921 CV0922 chrB chrA TRUE 0.952 13.000 0.143 NA   NA
 516089 516090 CV0924 CV0925   potF2 FALSE 0.295 104.000 0.006 1.000 N NA
 516090 516091 CV0925 CV0926 potF2   FALSE 0.301 68.000 0.000 1.000 N NA
 516091 516092 CV0926 CV0927     TRUE 0.994 -3.000 0.218 1.000 N NA
 516092 516093 CV0927 CV0928     TRUE 0.945 0.000 0.002 NA N NA
 516095 516096 CV0930 CV0931     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 516096 516097 CV0931 CV0932     FALSE 0.171 100.000 0.000 NA   NA
 516097 516098 CV0932 CV0933   recG FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 516099 516100 CV0934 CV0935 pitA pstB FALSE 0.222 247.000 0.000 0.002 Y NA
 516100 516101 CV0935 CV0936 pstB pstA TRUE 0.999 4.000 0.526 0.002 Y NA
 516101 516102 CV0936 CV0937 pstA pstC TRUE 0.999 2.000 0.537 0.002 Y NA
 516102 516103 CV0937 CV0938 pstC pstS TRUE 0.811 84.000 0.020 0.002 Y NA
 516104 516105 CV0939 CV0940 tpiA secG TRUE 0.950 2.000 0.009 1.000 N NA
 516105 516106 CV0940 CV_tRNALeuGAG secG   TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 516106 516107 CV_tRNALeuGAG CV0941   nuoA2 FALSE 0.186 92.000 0.000 NA   NA
 516107 516108 CV0941 CV0942 nuoA2 nuoB2 TRUE 1.000 -9.000 0.507 0.002 Y NA
 516108 516109 CV0942 CV0943 nuoB2 nuoC TRUE 0.996 11.000 0.328 0.002 Y NA
 516109 516110 CV0943 CV0944 nuoC nuoD TRUE 1.000 -7.000 0.483 0.005 Y NA
 516110 516111 CV0944 CV0945 nuoD nuoE TRUE 0.999 0.000 0.355 0.005 Y NA
 516111 516112 CV0945 CV0946 nuoE nuoF TRUE 0.999 0.000 0.343 0.005 Y NA
 516112 516113 CV0946 CV0947 nuoF nuoG TRUE 0.998 4.000 0.395 0.005 Y NA
 516113 516114 CV0947 CV0948 nuoG nuoH TRUE 0.999 4.000 0.515 0.005 Y NA
 516114 516115 CV0948 CV0949 nuoH nuoI TRUE 0.994 21.000 0.500 0.005 Y NA
 516115 516116 CV0949 CV0950 nuoI nuoJ TRUE 0.998 10.000 0.442 0.005 Y NA
 516116 516117 CV0950 CV0951 nuoJ nuoK TRUE 0.992 29.000 0.484 0.002 Y NA
 516117 516118 CV0951 CV0952 nuoK nuoL TRUE 0.989 34.000 0.451 0.005 Y NA
 516118 516119 CV0952 CV0953 nuoL nuoM TRUE 0.970 41.000 0.175 0.002 Y NA
 516119 516120 CV0953 CV0954 nuoM nuoN TRUE 0.991 22.000 0.340 0.002 Y NA
 516120 516121 CV0954 CV0955 nuoN   TRUE 0.972 11.000 0.202 NA   NA
 516121 516122 CV0955 CV0956   rna FALSE 0.095 148.000 0.000 NA   NA
 516123 516124 CV0957 CV0958     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516124 516125 CV0958 CV0959     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 516127 516128 CV0961 CV0962 htrB   TRUE 0.999 -3.000 0.255 0.001 Y NA
 516131 516132 CV0965 CV0966 ahcY metF TRUE 0.436 123.000 0.061 1.000 N NA
 516132 516133 CV0966 CV0967 metF   TRUE 0.534 53.000 0.007 NA   NA
 516135 516136 CV0969 CV0970 hpd hmgA FALSE 0.399 122.000 0.044 1.000 N NA
 516136 516137 CV0970 CV0971 hmgA   TRUE 0.627 176.000 0.195 1.000 Y NA
 516137 516138 CV0971 CV0972     TRUE 0.993 5.000 0.495 1.000 N NA
 516138 516139 CV0972 CV_tRNAPheGAA1     FALSE 0.083 156.000 0.000 NA   NA
 516139 516140 CV_tRNAPheGAA1 CV_tRNAPheGAA2     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 516141 516142 CV0973 CV0974     FALSE 0.088 162.000 0.000 1.000 N NA
 516142 516143 CV0974 CV0975     FALSE 0.262 74.000 0.000 1.000   NA
 516143 516144 CV0975 CV0976     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 516145 516146 CV0977 CV0978   cfa FALSE 0.123 140.000 0.000 1.000   NA
 516147 516148 CV0979 CV0980 ptsG   TRUE 0.766 175.000 0.222 0.005 Y NA
 516148 516149 CV0980 CV0981     FALSE 0.012 432.000 0.000 NA   NA
 516151 516152 CV0983 CV0984   prmA TRUE 0.985 -3.000 0.058 NA   NA
 516152 516153 CV0984 CV0985 prmA accC TRUE 0.987 0.000 0.152 1.000 N NA
 516153 516154 CV0985 CV0986 accC accB TRUE 0.916 124.000 0.275 0.001 Y NA
 516154 516155 CV0986 CV0987 accB aroQ TRUE 0.918 36.000 0.254 1.000 N NA
 516156 516157 CV0988 CV0989 queA ubiE FALSE 0.018 346.000 0.000 1.000 N NA
 516159 516160 CV0991 CV0992 aarF ndh FALSE 0.047 205.000 0.000 1.000   NA
 516160 516161 CV0992 CV0993 ndh pcaK FALSE 0.011 573.000 0.000 1.000 N NA
 516163 516164 CV_0995 CV0996   metL TRUE 0.756 117.000 0.102 1.000 Y NA
 516164 516165 CV0996 CV0997 metL thrC FALSE 0.245 325.000 0.125 1.000 Y NA
 516167 516168 CV0999 CV1000   flgM TRUE 0.779 90.000 0.330 NA   NA
 516168 516169 CV1000 CV1001 flgM   TRUE 0.941 38.000 0.211 0.003   NA
 516169 516170 CV1001 CV1002     FALSE 0.123 140.000 0.000 1.000   NA
 516170 516171 CV1002 CV1003   rhlE4 FALSE 0.142 184.000 0.021 1.000 N NA
 516172 516173 CV1004 CV1005     FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 516173 516174 CV1005 CV1006     FALSE 0.087 154.000 0.000 NA   NA
 516176 516177 CV1008 CV1009   cheB2 TRUE 0.936 20.000 0.000 0.025 Y NA
 516177 516178 CV1009 CV1010 cheB2   TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 516178 516179 CV1010 CV1011     TRUE 0.625 74.000 0.000 1.000 Y NA
 516179 516180 CV1011 CV1012   cheW3 TRUE 0.901 32.000 0.000 0.018 Y NA
 516180 516181 CV1012 CV1013 cheW3   TRUE 0.931 22.000 0.000 0.018 Y NA
 516181 516182 CV1013 CV1014   cheA2 TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 516182 516183 CV1014 CV1015 cheA2   TRUE 0.960 -10.000 0.000 NA   NA
 516183 516184 CV1015 CV1016   cheY2 TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 516184 516185 CV1016 CV1017 cheY2   TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 516186 516187 CV1018 CV_tRNASerGCT lysC   FALSE 0.303 63.000 0.000 NA   NA
 516187 516188 CV_tRNASerGCT CV_tRNAArgACG1     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 516188 516189 CV_tRNAArgACG1 CV_tRNAGluTTC1     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516190 516191 CV1019 CV_tRNAGluTTC2     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 516191 516192 CV_tRNAGluTTC2 CV_tRNAArgACG2     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516192 516193 CV_tRNAArgACG2 CV_tRNAGluTTC3     TRUE 0.827 8.000 0.000 NA   NA
 516193 516194 CV_tRNAGluTTC3 CV_tRNAArgACG3     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 516196 516197 CV1021 CV1022 motA2 fliA1 TRUE 0.531 97.000 0.089 1.000 N NA
 516197 516198 CV1022 CV1023 fliA1 fleN TRUE 0.993 -3.000 0.193 NA N NA
 516198 516199 CV1023 CV1024 fleN flhF TRUE 0.991 -9.000 0.083 NA N NA
 516199 516200 CV1024 CV1025 flhF flhA TRUE 0.953 14.000 0.005 1.000 Y NA
 516200 516201 CV1025 CV1026 flhA flhB1 TRUE 0.986 7.000 0.012 0.015 Y NA
 516202 516203 CV1027 CV1028 thyA folA TRUE 0.991 -3.000 0.134 1.000 N NA
 516204 516205 CV1029 CV1030     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 516205 516206 CV1030 CV1031   ubiG FALSE 0.126 133.000 0.000 NA   NA
 516206 516207 CV1031 CV1032 ubiG   TRUE 0.971 5.000 0.104 1.000 N NA
 516208 516209 CV1033 CV1034     FALSE 0.427 163.000 0.000 0.013 Y NA
 516210 516211 CV1035 CV1036   rtcR FALSE 0.090 151.000 0.000 NA   NA
 516212 516213 CV1037 CV1038 rtcb   TRUE 0.843 43.000 0.154 NA   NA
 516213 516214 CV1038 CV1039     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 516214 516215 CV1039 CV1040     TRUE 0.997 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 516215 516216 CV1040 CV1041     TRUE 0.906 72.000 0.571 NA N NA
 516216 516217 CV1041 CV1042     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516218 516219 CV1043 CV1044     FALSE 0.039 211.000 0.000 NA   NA
 516219 516220 CV1044 CV1045     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516222 516223 CV1047 CV1048     FALSE 0.031 232.000 0.000 NA   NA
 516223 516224 CV1048 CV1049     FALSE 0.021 286.000 0.000 NA   NA
 516225 516226 CV1050 CV1051     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 516226 516227 CV1051 CV1052     FALSE 0.090 151.000 0.000 NA   NA
 516227 516228 CV1052 CV1053     FALSE 0.131 131.000 0.000 NA   NA
 516229 516230 CV1054 CV1055     FALSE 0.009 688.000 0.000 NA   NA
 516231 516232 CV1056 CV1057     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 516232 516233 CV1057 CV1058     TRUE 0.963 -31.000 0.000 NA   NA
 516234 516235 CV1059 CV1060   lysS FALSE 0.157 114.000 0.000 NA   NA
 516235 516236 CV1060 CV1061 lysS prfB TRUE 0.885 90.000 0.162 0.039 Y NA
 516236 516237 CV1061 CV1062 prfB mdh FALSE 0.020 320.000 0.000 1.000 N NA
 516238 516239 CV1063 CV1064     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 516239 516240 CV1064 CV1065   sdhC TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 516240 516241 CV1065 CV1066 sdhC sdhD TRUE 1.000 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 516241 516242 CV1066 CV1067 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 516242 516243 CV1067 CV1068 sdhA sdhB TRUE 0.997 15.000 0.604 0.002 Y NA
 516243 516244 CV1068 CV1069 sdhB   TRUE 0.992 -3.000 0.151 1.000   NA
 516244 516245 CV1069 CV1070   gtlA TRUE 0.874 34.000 0.136 1.000   NA
 516245 516246 CV1070 CV1071 gtlA sucA TRUE 0.588 132.000 0.020 1.000 Y NA
 516246 516247 CV1071 CV1072 sucA sucB TRUE 0.983 53.000 0.667 1.000 Y NA
 516247 516248 CV1072 CV1073 sucB   FALSE 0.338 57.000 0.000 NA   NA
 516248 516249 CV1073 CV1074   lpdA2 TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 516249 516250 CV1074 CV1075 lpdA2 sucC TRUE 0.536 164.000 0.069 1.000 Y NA
 516250 516251 CV1075 CV1076 sucC sucD TRUE 0.996 28.000 0.806 0.001 Y NA
 516252 516253 CV1077 CV1078   emrY TRUE 0.441 46.000 0.000 1.000 N NA
 516254 516255 CV1079 CV1080     FALSE 0.184 104.000 0.000 1.000 N NA
 516255 516256 CV1080 CV1081     FALSE 0.166 279.000 0.000 0.018 Y NA
 516256 516257 CV1081 CV1082     FALSE 0.171 100.000 0.000 NA   NA
 516258 516259 CV1083 CV1084     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 516259 516260 CV1084 CV1085   udk FALSE 0.142 128.000 0.000 NA   NA
 516260 516261 CV1085 CV1086 udk   FALSE 0.208 92.000 0.000 1.000 N NA
 516261 516262 CV1086 CV1087     FALSE 0.126 139.000 0.000 1.000   NA
 516262 516263 CV1087 CV1088   fdx2 TRUE 0.843 131.000 0.625 1.000   NA
 516263 516264 CV1088 CV1089 fdx2 hscA TRUE 0.996 10.000 0.794 1.000 N NA
 516264 516265 CV1089 CV1090 hscA   TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 516265 516266 CV1090 CV1091   hscB TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 516266 516267 CV1091 CV1092 hscB   TRUE 0.889 74.000 0.500 1.000   NA
 516267 516268 CV1092 CV1093   nifU TRUE 0.988 14.000 0.359 0.001   NA
 516268 516269 CV1093 CV1094 nifU nifS TRUE 0.920 57.000 0.448 1.000 N NA
 516269 516270 CV1094 CV1095 nifS   TRUE 0.891 32.000 0.160 1.000 N NA
 516271 516272 CV1096 CV1097     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA N NA
 516272 516273 CV1097 CV1098   dppB FALSE 0.093 416.000 0.000 0.071 Y NA
 516273 516274 CV1098 CV1099 dppB dppC TRUE 0.998 14.000 0.779 0.071 Y NA
 516274 516275 CV1099 CV1100 dppC dppD TRUE 0.997 11.000 0.560 1.000 Y NA
 516275 516276 CV1100 CV1101 dppD dppF TRUE 0.999 -7.000 0.377 0.001 Y NA
 516276 516277 CV1101 CV1102 dppF   FALSE 0.159 112.000 0.000 NA   NA
 516277 516278 CV1102 CV1103   kdtB FALSE 0.139 129.000 0.000 NA   NA
 516278 516279 CV1103 CV1104 kdtB   FALSE 0.205 81.000 0.000 NA   NA
 516279 516280 CV1104 CV1105   gltS FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 516280 516281 CV1105 CV1106 gltS trxC FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000 N NA
 516281 516282 CV1106 CV1107 trxC   TRUE 0.555 91.000 0.000 1.000 Y NA
 516282 516283 CV1107 CV1108     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 516283 516284 CV1108 CV_rRNA16s3   rRNA16S FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 516284 516285 CV_rRNA16s3 CV_tRNAIleGAT3 rRNA16S   FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 516285 516286 CV_tRNAIleGAT3 CV_tRNAAlaTGC3     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 516286 516287 CV_tRNAAlaTGC3 CV_rRNA23s3   rRNA23S FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 516287 516288 CV_rRNA23s3 CV_rRNA5s3 rRNA23S rRNA5S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 516288 516289 CV_rRNA5s3 CV1109 rRNA5S   FALSE 0.049 193.000 0.000 NA   NA
 516290 516291 CV1110 CV1111   pssA FALSE 0.189 101.000 0.000 1.000 N NA
 516292 516293 CV1112 CV1113   parE TRUE 0.589 115.000 0.005 1.000 Y NA
 516294 516295 CV1114 CV1115     FALSE 0.281 71.000 0.000 1.000   NA
 516296 516297 CV1116 CV1117     FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000 N NA
 516297 516298 CV1117 CV1118     TRUE 0.999 -3.000 0.357 0.001 Y NA
 516298 516299 CV1118 CV1119     TRUE 0.463 43.000 0.000 1.000   NA
 516301 516302 CV1121 CV1122 acnA1 hemE FALSE 0.059 189.000 0.000 1.000 N NA
 516302 516303 CV1122 CV1123 hemE   FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 516303 516304 CV1123 CV1124   priA FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 516304 516305 CV1124 CV1125 priA dacB TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000 N NA
 516305 516306 CV1125 CV1126 dacB grxC TRUE 0.619 51.000 0.015 1.000 N NA
 516306 516307 CV1126 CV1127 grxC secB TRUE 0.680 108.000 0.221 1.000 N NA
 516307 516308 CV1127 CV1128 secB   TRUE 0.942 9.000 0.046 NA   NA
 516308 516309 CV1128 CV1129   gpsA TRUE 0.962 10.000 0.118 NA   NA
 516310 516311 CV1130 CV1131 folE   FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 516311 516312 CV1131 CV1132   ubiF FALSE 0.345 56.000 0.000 NA   NA
 516312 516313 CV1132 CV1133 ubiF   TRUE 0.441 46.000 0.000 1.000 N NA
 516314 516315 CV1134 CV1135     FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 516315 516316 CV1135 CV1136     FALSE 0.214 78.000 0.000 NA N NA
 516316 516317 CV1136 CV1137   adhE FALSE 0.045 367.000 0.000 0.001 N NA
 516317 516318 CV1137 CV1138 adhE proY FALSE 0.017 370.000 0.000 1.000 N NA
 516321 516322 CV1141 CV1142     FALSE 0.052 188.000 0.000 NA   NA
 516324 516325 CV1144 CV1145     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 516325 516326 CV1145 CV1146   mfd FALSE 0.058 191.000 0.000 1.000 N NA
 516326 516327 CV1146 CV1147 mfd   FALSE 0.056 182.000 0.000 NA   NA
 516328 516329 CV1148 CV1149     FALSE 0.256 75.000 0.000 1.000 N NA
 516331 516332 CV1151 CV1152     TRUE 0.996 8.000 0.840 NA   NA
 516336 516337 CV1156 CV1157     FALSE 0.272 68.000 0.000 NA N NA
 516338 516339 CV1158 CV1159     TRUE 0.757 55.000 0.103 1.000   NA
 516339 516340 CV1159 CV1160     TRUE 0.991 -3.000 0.133 NA   NA
 516340 516341 CV1160 CV1161     TRUE 0.964 15.000 0.044 NA Y NA
 516341 516342 CV1161 CV1162     FALSE 0.177 114.000 0.000 1.000 N NA
 516345 516346 CV1165 CV1166     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 516349 516350 CV1169 CV1170     TRUE 0.960 2.000 0.030 NA   NA
 516350 516351 CV1170 CV1171     TRUE 0.607 125.000 0.000 0.014 Y NA
 516351 516352 CV1171 CV1172     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.002   NA
 516352 516353 CV1172 CV1173     TRUE 0.989 4.000 0.167 0.002   NA
 516353 516354 CV1173 CV1174     TRUE 0.991 16.000 0.525 0.002 N NA
 516355 516356 CV1175 CV1176   pepN FALSE 0.355 95.000 0.000 0.018   NA
 516357 516358 CV1177 CV1178     FALSE 0.160 109.000 0.000 NA   NA
 516359 516360 CV1179 CV1180   estX FALSE 0.324 59.000 0.000 NA N NA
 516360 516361 CV1180 CV1181 estX   FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 516361 516362 CV1181 CV1182     FALSE 0.011 481.000 0.000 NA   NA
 516362 516363 CV1182 CV1183     FALSE 0.171 100.000 0.000 NA N NA
 516364 516365 CV1184 CV1185 eutC eutB TRUE 1.000 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 516365 516366 CV1185 CV1186 eutB   TRUE 0.999 -3.000 0.407 1.000 Y NA
 516367 516368 CV1187 CV1188 aroC   FALSE 0.139 129.000 0.000 NA N NA
 516369 516370 CV1189 CV1190     TRUE 0.982 4.000 0.000 0.024 Y NA
 516371 516372 CV1191 CV1192 ureJ   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516374 516375 CV1194 CV1195     TRUE 0.991 11.000 0.403 0.070 N NA
 516375 516376 CV1195 CV1196     TRUE 0.997 -3.000 0.313 0.070 N NA
 516376 516377 CV1196 CV_1197     TRUE 0.999 0.000 0.903 1.000 Y NA
 516378 516379 CV_tRNASerCGA CV1198     FALSE 0.152 121.000 0.000 NA   NA
 516381 516382 CV1200 CV1201     TRUE 0.689 16.000 0.000 NA   NA
 516382 516383 CV1201 CV1202     TRUE 0.991 3.000 0.329 NA   NA
 516383 516384 CV1202 CV1203   murI FALSE 0.321 65.000 0.000 1.000   NA
 516384 516385 CV1203 CV1204 murI mrp TRUE 0.686 18.000 0.000 1.000 N NA
 516386 516387 CV1205 CV1206   metG FALSE 0.276 145.000 0.036 1.000 N NA
 516387 516388 CV1206 CV1207 metG   FALSE 0.011 452.000 0.000 NA   NA
 516388 516389 CV1207 CV1208     FALSE 0.085 155.000 0.000 NA   NA
 516389 516390 CV1208 CV1209     TRUE 0.962 -19.000 0.000 NA   NA
 516390 516391 CV1209 CV_tRNAMetCAT1     FALSE 0.155 117.000 0.000 NA   NA
 516392 516393 CV1210 CV1211     FALSE 0.099 145.000 0.000 NA   NA
 516393 516394 CV1211 CV1212     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 516396 516397 CV1214 CV1215     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 516397 516398 CV1215 CV1216     FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 516398 516399 CV1216 CV1217     FALSE 0.014 379.000 0.000 NA   NA
 516399 516400 CV1217 CV1218     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 516401 516402 CV1219 CV1220     TRUE 0.553 31.000 0.000 1.000   NA
 516402 516403 CV1220 CV1221     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 516403 516404 CV1221 CV1222     FALSE 0.410 73.000 0.000 0.070   NA
 516406 516407 CV1224 CV1225     TRUE 0.434 287.000 0.664 NA   NA
 516407 516408 CV1225 CV1226     TRUE 0.999 -3.000 0.891 NA   NA
 516408 516409 CV1226 CV1227     TRUE 0.996 11.000 0.948 NA   NA
 516409 516410 CV1227 CV1228     TRUE 0.997 12.000 0.711 NA Y NA
 516410 516411 CV1228 CV1229     TRUE 0.999 2.000 0.773 NA Y NA
 516411 516412 CV1229 CV1230     TRUE 0.998 13.000 0.882 NA Y NA
 516412 516413 CV1230 CV1231     FALSE 0.012 435.000 0.000 NA   NA
 11450944 516409   CV1227     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11593307 516409   CV1227     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11735699 516409   CV1227     FALSE NA 2175.000 0.000 NA   NA
 11450945 516409   CV1227     FALSE NA 2207.000 0.000 NA   NA
 11593308 516409   CV1227     FALSE NA 2207.000 0.000 NA   NA
 11735700 516409   CV1227     FALSE NA 2207.000 0.000 NA   NA
 11450946 516409   CV1227     FALSE NA 2261.000 0.000 NA   NA
 11593309 516409   CV1227     FALSE NA 2261.000 0.000 NA   NA
 11735701 516409   CV1227     FALSE NA 2261.000 0.000 NA   NA
 11450947 516409   CV1227     FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11593310 516409   CV1227     FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11735702 516409   CV1227     FALSE NA 2293.000 0.000 NA   NA
 11450948 516409   CV1227     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11593311 516409   CV1227     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11735703 516409   CV1227     FALSE NA 2328.000 0.000 NA   NA
 11450949 516409   CV1227     FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11593312 516409   CV1227     FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11735704 516409   CV1227     FALSE NA 2360.000 0.000 NA   NA
 11450950 516409   CV1227     FALSE NA 2393.000 0.000 NA   NA
 11593313 516409   CV1227     FALSE NA 2393.000 0.000 NA   NA
 11735705 516409   CV1227     FALSE NA 2393.000 0.000 NA   NA
 11450951 516409   CV1227     FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11593314 516409   CV1227     FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11735706 516409   CV1227     FALSE NA 2425.000 0.000 NA   NA
 11450952 516409   CV1227     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11593315 516409   CV1227     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11735707 516409   CV1227     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11450953 516409   CV1227     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11593316 516409   CV1227     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11735708 516409   CV1227     FALSE NA 2492.000 0.000 NA   NA
 11450954 516409   CV1227     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11593317 516409   CV1227     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11735709 516409   CV1227     FALSE NA 2526.000 0.000 NA   NA
 11450955 516409   CV1227     FALSE NA 2558.000 0.000 NA   NA
 11593318 516409   CV1227     FALSE NA 2558.000 0.000 NA   NA
 11735710 516409   CV1227     FALSE NA 2558.000 0.000 NA   NA
 11450956 516409   CV1227     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11593319 516409   CV1227     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11735711 516409   CV1227     FALSE NA 2592.000 0.000 NA   NA
 11450957 516409   CV1227     FALSE NA 2624.000 0.000 NA   NA
 11593320 516409   CV1227     FALSE NA 2624.000 0.000 NA   NA
 11735712 516409   CV1227     FALSE NA 2624.000 0.000 NA   NA
 11450958 516409   CV1227     FALSE NA 2660.000 0.000 NA   NA
 11593321 516409   CV1227     FALSE NA 2660.000 0.000 NA   NA
 11735713 516409   CV1227     FALSE NA 2660.000 0.000 NA   NA
 11450959 516409   CV1227     FALSE NA 2692.000 0.000 NA   NA
 11593322 516409   CV1227     FALSE NA 2692.000 0.000 NA   NA
 11735714 516409   CV1227     FALSE NA 2692.000 0.000 NA   NA
 11450960 516409   CV1227     FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11593323 516409   CV1227     FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11735715 516409   CV1227     FALSE NA 2726.000 0.000 NA   NA
 11450961 516409   CV1227     FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11593324 516409   CV1227     FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11735716 516409   CV1227     FALSE NA 2758.000 0.000 NA   NA
 11450962 516409   CV1227     FALSE NA 2793.000 0.000 NA   NA
 11593325 516409   CV1227     FALSE NA 2793.000 0.000 NA   NA
 11735717 516409   CV1227     FALSE NA 2793.000 0.000 NA   NA
 11450963 516409   CV1227     FALSE NA 2825.000 0.000 NA   NA
 11593326 516409   CV1227     FALSE NA 2825.000 0.000 NA   NA
 11735718 516409   CV1227     FALSE NA 2825.000 0.000 NA   NA
 11450964 516409   CV1227     FALSE NA 2859.000 0.000 NA   NA
 11593327 516409   CV1227     FALSE NA 2859.000 0.000 NA   NA
 11735719 516409   CV1227     FALSE NA 2859.000 0.000 NA   NA
 11450965 516409   CV1227     FALSE NA 2891.000 0.000 NA   NA
 11593328 516409   CV1227     FALSE NA 2891.000 0.000 NA   NA
 11735720 516409   CV1227     FALSE NA 2891.000 0.000 NA   NA
 11450966 516409   CV1227     FALSE NA 2924.000 0.000 NA   NA
 11593329 516409   CV1227     FALSE NA 2924.000 0.000 NA   NA
 11735721 516409   CV1227     FALSE NA 2924.000 0.000 NA   NA
 11450967 516409   CV1227     FALSE NA 2956.000 0.000 NA   NA
 11593330 516409   CV1227     FALSE NA 2956.000 0.000 NA   NA
 11735722 516409   CV1227     FALSE NA 2956.000 0.000 NA   NA
 11450968 516409   CV1227     FALSE NA 2991.000 0.000 NA   NA
 11593331 516409   CV1227     FALSE NA 2991.000 0.000 NA   NA
 11735723 516409   CV1227     FALSE NA 2991.000 0.000 NA   NA
 11450969 516409   CV1227     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11593332 516409   CV1227     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11735724 516409   CV1227     FALSE NA 3023.000 0.000 NA   NA
 11450970 516409   CV1227     FALSE NA 3059.000 0.000 NA   NA
 11593333 516409   CV1227     FALSE NA 3059.000 0.000 NA   NA
 11735725 516409   CV1227     FALSE NA 3059.000 0.000 NA   NA
 11450971 516409   CV1227     FALSE NA 3091.000 0.000 NA   NA
 11593334 516409   CV1227     FALSE NA 3091.000 0.000 NA   NA
 11735726 516409   CV1227     FALSE NA 3091.000 0.000 NA   NA
 11450972 516409   CV1227     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11593335 516409   CV1227     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11735727 516409   CV1227     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11450973 516409   CV1227     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11593336 516409   CV1227     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11735728 516409   CV1227     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11450974 516409   CV1227     FALSE NA 3194.000 0.000 NA   NA
 11593337 516409   CV1227     FALSE NA 3194.000 0.000 NA   NA
 11735729 516409   CV1227     FALSE NA 3194.000 0.000 NA   NA
 11450975 516409   CV1227     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11593338 516409   CV1227     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11735730 516409   CV1227     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11450976 516409   CV1227     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11593339 516409   CV1227     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11735731 516409   CV1227     FALSE NA 3260.000 0.000 NA   NA
 11450977 516409   CV1227     FALSE NA 3292.000 0.000 NA   NA
 11593340 516409   CV1227     FALSE NA 3292.000 0.000 NA   NA
 11735732 516409   CV1227     FALSE NA 3292.000 0.000 NA   NA
 11450978 516409   CV1227     FALSE NA 3325.000 0.000 NA   NA
 11593341 516409   CV1227     FALSE NA 3325.000 0.000 NA   NA
 11735733 516409   CV1227     FALSE NA 3325.000 0.000 NA   NA
 11450979 516409   CV1227     FALSE NA 3357.000 0.000 NA   NA
 11593342 516409   CV1227     FALSE NA 3357.000 0.000 NA   NA
 11735734 516409   CV1227     FALSE NA 3357.000 0.000 NA   NA
 11450980 516409   CV1227     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11593343 516409   CV1227     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11735735 516409   CV1227     FALSE NA 3391.000 0.000 NA   NA
 11450981 516409   CV1227     FALSE NA 3423.000 0.000 NA   NA
 11593344 516409   CV1227     FALSE NA 3423.000 0.000 NA   NA
 11735736 516409   CV1227     FALSE NA 3423.000 0.000 NA   NA
 11450982 516409   CV1227     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11593345 516409   CV1227     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11735737 516409   CV1227     FALSE NA 3458.000 0.000 NA   NA
 11450983 516409   CV1227     FALSE NA 3490.000 0.000 NA   NA
 11593346 516409   CV1227     FALSE NA 3490.000 0.000 NA   NA
 11735738 516409   CV1227     FALSE NA 3490.000 0.000 NA   NA
 11450984 516409   CV1227     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11593347 516409   CV1227     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11735739 516409   CV1227     FALSE NA 3524.000 0.000 NA   NA
 11450985 516409   CV1227     FALSE NA 3556.000 0.000 NA   NA
 11593348 516409   CV1227     FALSE NA 3556.000 0.000 NA   NA
 11735740 516409   CV1227     FALSE NA 3556.000 0.000 NA   NA
 11450986 516409   CV1227     FALSE NA 3590.000 0.000 NA   NA
 11593349 516409   CV1227     FALSE NA 3590.000 0.000 NA   NA
 11735741 516409   CV1227     FALSE NA 3590.000 0.000 NA   NA
 11450987 516409   CV1227     FALSE NA 3622.000 0.000 NA   NA
 11593350 516409   CV1227     FALSE NA 3622.000 0.000 NA   NA
 11735742 516409   CV1227     FALSE NA 3622.000 0.000 NA   NA
 11450988 516409   CV1227     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11593351 516409   CV1227     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11735743 516409   CV1227     FALSE NA 3656.000 0.000 NA   NA
 11450989 516409   CV1227     FALSE NA 3688.000 0.000 NA   NA
 11593352 516409   CV1227     FALSE NA 3688.000 0.000 NA   NA
 11735744 516409   CV1227     FALSE NA 3688.000 0.000 NA   NA
 11450990 516409   CV1227     FALSE NA 3723.000 0.000 NA   NA
 11593353 516409   CV1227     FALSE NA 3723.000 0.000 NA   NA
 11735745 516409   CV1227     FALSE NA 3723.000 0.000 NA   NA
 11450991 516409   CV1227     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11593354 516409   CV1227     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11735746 516409   CV1227     FALSE NA 3755.000 0.000 NA   NA
 11450992 516409   CV1227     FALSE NA 3788.000 0.000 NA   NA
 11593355 516409   CV1227     FALSE NA 3788.000 0.000 NA   NA
 11735747 516409   CV1227     FALSE NA 3788.000 0.000 NA   NA
 11450993 516409   CV1227     FALSE NA 3820.000 0.000 NA   NA
 11593356 516409   CV1227     FALSE NA 3820.000 0.000 NA   NA
 11735748 516409   CV1227     FALSE NA 3820.000 0.000 NA   NA
 11450994 516409   CV1227     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11593357 516409   CV1227     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11735749 516409   CV1227     FALSE NA 3853.000 0.000 NA   NA
 11450995 516409   CV1227     FALSE NA 3885.000 0.000 NA   NA
 11593358 516409   CV1227     FALSE NA 3885.000 0.000 NA   NA
 11735750 516409   CV1227     FALSE NA 3885.000 0.000 NA   NA
 11450996 516409   CV1227     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 11593359 516409   CV1227     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 11735751 516409   CV1227     FALSE NA 3918.000 0.000 NA   NA
 516415 516416 CV1233 CV1234     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516416 516417 CV1234 CV1235     TRUE 0.986 4.000 0.222 1.000   NA
 516417 516418 CV1235 CV1236     FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 516420 516421 CV1238 CV1239     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 516421 516422 CV1239 CV1240     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 516422 516423 CV1240 CV1241     FALSE 0.019 305.000 0.000 NA   NA
 516424 516425 CV1242 CV1243     FALSE 0.015 354.000 0.000 NA   NA
 516425 516426 CV1243 CV1244     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 516426 516427 CV1244 CV1245     FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 516427 516428 CV1245 CV1246     FALSE 0.016 345.000 0.000 NA   NA
 516430 516431 CV1248 CV1249     FALSE 0.017 364.000 0.000 1.000   NA
 516431 516432 CV1249 CV1250     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 516433 516434 CV1251 CV1252     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 516435 516436 CV1253 CV1254 mltD gloB TRUE 0.466 170.000 0.233 1.000   NA
 516437 516438 CV1255 CV1256   rnhA TRUE 0.958 11.000 0.111 1.000   NA
 516438 516439 CV1256 CV1257 rnhA dnaQ TRUE 0.949 53.000 0.248 1.000 Y NA
 516439 516440 CV1257 CV1258 dnaQ ispD TRUE 0.841 14.000 0.004 1.000 N NA
 516440 516441 CV1258 CV1259 ispD ispF TRUE 0.991 18.000 0.419 1.000 Y NA
 516441 516442 CV1259 CV1260 ispF rpiA FALSE 0.125 173.000 0.005 1.000 N NA
 516442 516443 CV1260 CV1261 rpiA phoU FALSE 0.335 117.000 0.024 NA N NA
 516443 516444 CV1261 CV1262 phoU ppx TRUE 0.577 142.000 0.050 NA Y NA
 516444 516445 CV1262 CV1263 ppx corA TRUE 0.887 35.000 0.010 1.000 Y NA
 516447 516448 CV1265 CV1266 copA   TRUE 0.970 37.000 0.167 0.008 Y NA
 516449 516450 CV1267 CV1268     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 516450 516451 CV1268 CV1269     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 516455 516456 CV1273 CV1274 glnP   TRUE 1.000 -3.000 0.692 0.067 Y NA
 516456 516457 CV1274 CV1275     TRUE 0.951 77.000 0.395 0.078 Y NA
 516457 516458 CV1275 CV1276   lgt FALSE 0.132 136.000 0.000 1.000 N NA
 516460 516461 CV1278 CV1279     TRUE 1.000 -3.000 0.869 0.067 Y NA
 516461 516462 CV1279 CV1280     FALSE 0.114 144.000 0.000 1.000   NA
 516465 516466 CV1283 CV1284     FALSE 0.198 85.000 0.000 NA   NA
 516466 516467 CV1284 CV1285     TRUE 0.656 64.000 0.066 1.000   NA
 516467 516468 CV1285 CV1286   glyA FALSE 0.183 105.000 0.000 1.000   NA
 516468 516469 CV1286 CV1287 glyA   FALSE 0.332 143.000 0.069 NA N NA
 516469 516470 CV1287 CV1288     FALSE 0.407 46.000 0.000 NA N NA
 516470 516471 CV1288 CV1289     TRUE 0.984 3.000 0.000 0.014 Y NA
 516471 516472 CV1289 CV1290   ribD TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 516472 516473 CV1290 CV1291 ribD   FALSE 0.175 98.000 0.000 NA   NA
 516473 516474 CV1291 CV1292   ctaQ FALSE 0.093 149.000 0.000 NA   NA
 516476 516477 CV1294 CV1295 fimA ecpD TRUE 0.632 73.000 0.000 1.000 Y NA
 516477 516478 CV1295 CV1296 ecpD fimD TRUE 0.982 54.000 0.667 1.000 Y NA
 516478 516479 CV1296 CV1297 fimD   TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 516480 516481 CV1298 CV1299     FALSE 0.013 412.000 0.000 NA   NA
 516481 516482 CV1299 CV1300   betA TRUE 0.989 -3.000 0.094 1.000 N NA
 516483 516484 CV1301 CV1302     TRUE 0.905 10.000 0.000 0.061 N NA
 516486 516487 CV1304 CV1305   uvrC TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 516487 516488 CV1305 CV1306 uvrC pgsA TRUE 0.703 99.000 0.227 1.000 N NA
 516488 516489 CV1306 CV_tRNAGlyGCC1 pgsA   FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 516489 516490 CV_tRNAGlyGCC1 CV_tRNAGlyGCC2     TRUE 0.584 24.000 0.000 NA   NA
 516490 516491 CV_tRNAGlyGCC2 CV_tRNAGlyGCC3     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 516491 516492 CV_tRNAGlyGCC3 CV_tRNAGlyGCC4     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 516492 516493 CV_tRNAGlyGCC4 CV_tRNAGlyGCC5     TRUE 0.525 30.000 0.000 NA   NA
 516493 516494 CV_tRNAGlyGCC5 CV_tRNACysGCA     FALSE 0.407 46.000 0.000 NA   NA
 516494 516495 CV_tRNACysGCA CV1307     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 516495 516496 CV1307 CV1308   spvC FALSE 0.038 212.000 0.000 NA   NA
 516496 516497 CV1308 CV1309 spvC   FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 516497 516498 CV1309 CV1310   ampC FALSE 0.229 188.000 0.000 1.000 Y NA
 516498 516499 CV1310 CV1311 ampC   FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 516500 516501 CV1312 CV1313     FALSE 0.126 133.000 0.000 NA   NA
 516503 516504 CV1315 CV1316     FALSE 0.012 431.000 0.000 NA   NA
 516505 516506 CV_tRNALeuTAA CV1317     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 516506 516507 CV1317 CV1318   hptG FALSE 0.267 69.000 0.000 NA   NA
 516507 516508 CV1318 CV1319 hptG   FALSE 0.163 105.000 0.000 NA   NA
 516508 516509 CV1319 CV1320     FALSE 0.303 63.000 0.000 NA   NA
 516511 516512 CV1322 CV1323     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 516512 516513 CV1323 CV1324     FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000   NA
 516513 516514 CV1324 CV1325     TRUE 0.719 16.000 0.000 1.000   NA
 516514 516515 CV1325 CV1326     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 516516 516517 CV1327 CV1328 upk   FALSE 0.075 172.000 0.000 1.000 N NA
 516517 516518 CV1328 CV1329   sbcB FALSE 0.077 171.000 0.000 1.000 N NA
 516518 516519 CV1329 CV1330 sbcB   FALSE 0.024 284.000 0.000 1.000 N NA
 516519 516520 CV1330 CV1331   pcaD TRUE 0.728 38.000 0.027 1.000   NA
 516521 516522 CV1332 CV1333   potG FALSE 0.013 438.000 0.000 1.000 N NA
 516522 516523 CV1333 CV1334 potG ordL TRUE 0.740 56.000 0.000 1.000 Y NA
 516523 516524 CV1334 CV1335 ordL   FALSE 0.062 175.000 0.000 NA   NA
 516524 516525 CV1335 CV1336     TRUE 0.997 0.000 0.600 NA   NA
 516525 516526 CV1336 CV1337     FALSE 0.010 547.000 0.000 NA   NA
 516526 516527 CV1337 CV1338     FALSE 0.031 232.000 0.000 NA   NA
 516528 516529 CV1339 CV1340     FALSE 0.011 546.000 0.000 1.000   NA
 516529 516530 CV1340 CV1341     FALSE 0.120 141.000 0.000 1.000   NA
 516530 516531 CV1341 CV1342   mutL FALSE 0.179 111.000 0.000 1.000   NA
 516531 516532 CV1342 CV1343 mutL dedA FALSE 0.381 69.000 0.002 NA   NA
 516532 516533 CV1343 CV1344 dedA secF FALSE 0.393 75.000 0.010 NA   NA
 516533 516534 CV1344 CV1345 secF secD TRUE 0.998 4.000 0.332 0.001 Y NA
 516534 516535 CV1345 CV1346 secD   TRUE 0.850 66.000 0.083 NA Y NA
 516535 516536 CV1346 CV1347   tgt TRUE 0.652 139.000 0.325 NA N NA
 516537 516538 CV_tRNAValGAC CV1348   thrS FALSE 0.055 183.000 0.000 NA   NA
 516538 516539 CV1348 CV1349 thrS infC TRUE 0.838 100.000 0.186 1.000 Y NA
 516539 516540 CV1349 CV1350 infC rpmI TRUE 0.902 154.000 0.652 1.000 Y NA
 516540 516541 CV1350 CV1351 rpmI rplT TRUE 0.999 14.000 0.928 0.012 Y NA
 516541 516542 CV1351 CV1352 rplT pheS TRUE 0.771 140.000 0.202 1.000 Y NA
 516542 516543 CV1352 CV1353 pheS pheT TRUE 0.996 19.000 0.574 0.001 Y NA
 516543 516544 CV1353 CV1354 pheT ihfA TRUE 0.775 72.000 0.208 1.000 N NA
 516544 516545 CV1354 CV1355 ihfA   TRUE 0.996 2.000 0.535 1.000 N NA
 516545 516546 CV1355 CV_tRNAProGGG     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 516546 516547 CV_tRNAProGGG CV1356     TRUE 0.963 -39.000 0.000 NA   NA
 516547 516548 CV1356 CV1357     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 516548 516549 CV1357 CV1358     FALSE 0.427 48.000 0.000 1.000   NA
 516550 516551 CV1359 CV1360   mscL FALSE 0.080 159.000 0.000 NA   NA
 516551 516552 CV1360 CV1361 mscL   FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 516552 516553 CV1361 CV_tRNAAsnGTT1     FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 516553 516554 CV_tRNAAsnGTT1 CV_tRNAAsnGTT2     TRUE 0.501 33.000 0.000 NA   NA
 516554 516555 CV_tRNAAsnGTT2 CV_tRNAAsnGTT3     TRUE 0.509 32.000 0.000 NA   NA
 516556 516557 CV1362 CV1363     FALSE 0.194 99.000 0.000 1.000   NA
 516557 516558 CV1363 CV1364     FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 516559 516560 CV1365 CV1366     TRUE 0.564 57.000 0.017 NA   NA
 516561 516562 CV1367 CV1368 phbF   FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 516562 516563 CV1368 CV1369     FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 516565 516566 CV1371 CV1372     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 516566 516567 CV1372 CV1373     FALSE 0.057 180.000 0.000 NA   NA
 516567 516568 CV1373 CV1374     FALSE 0.152 130.000 0.000 1.000 N NA
 516569 516570 CV1375 CV1376 serS   TRUE 0.981 3.000 0.078 0.086 N NA
 516570 516571 CV1376 CV1377     FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 516571 516572 CV1377 CV1378   efp FALSE 0.019 303.000 0.000 NA   NA
 11450997 516570   CV1376     FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11593360 516570   CV1376     FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11735752 516570   CV1376     FALSE NA 324.000 0.000 NA   NA
 11450998 516570   CV1376     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11593361 516570   CV1376     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11735753 516570   CV1376     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11450999 516570   CV1376     FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11593362 516570   CV1376     FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11735754 516570   CV1376     FALSE NA 387.000 0.000 NA   NA
 11451000 516570   CV1376     FALSE NA 416.000 0.000 NA   NA
 11593363 516570   CV1376     FALSE NA 416.000 0.000 NA   NA
 11735755 516570   CV1376     FALSE NA 416.000 0.000 NA   NA
 11451001 516570   CV1376     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11593364 516570   CV1376     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11735756 516570   CV1376     FALSE NA 448.000 0.000 NA   NA
 11451002 516570   CV1376     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11593365 516570   CV1376     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11735757 516570   CV1376     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11451003 516570   CV1376     FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11593366 516570   CV1376     FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11735758 516570   CV1376     FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11451004 516570   CV1376     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11593367 516570   CV1376     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11735759 516570   CV1376     FALSE NA 538.000 0.000 NA   NA
 11451005 516570   CV1376     FALSE NA 570.000 0.000 NA   NA
 11593368 516570   CV1376     FALSE NA 570.000 0.000 NA   NA
 11735760 516570   CV1376     FALSE NA 570.000 0.000 NA   NA
 11451006 516570   CV1376     FALSE NA 599.000 0.000 NA   NA
 11593369 516570   CV1376     FALSE NA 599.000 0.000 NA   NA
 11735761 516570   CV1376     FALSE NA 599.000 0.000 NA   NA
 11451007 516570   CV1376     FALSE NA 631.000 0.000 NA   NA
 11593370 516570   CV1376     FALSE NA 631.000 0.000 NA   NA
 11735762 516570   CV1376     FALSE NA 631.000 0.000 NA   NA
 11451008 516570   CV1376     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11593371 516570   CV1376     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11735763 516570   CV1376     FALSE NA 660.000 0.000 NA   NA
 11451009 516570   CV1376     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11593372 516570   CV1376     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11735764 516570   CV1376     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11451010 516570   CV1376     FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 11593373 516570   CV1376     FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 11735765 516570   CV1376     FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 11451011 516570   CV1376     FALSE NA 753.000 0.000 NA   NA
 11593374 516570   CV1376     FALSE NA 753.000 0.000 NA   NA
 11735766 516570   CV1376     FALSE NA 753.000 0.000 NA   NA
 11451012 516570   CV1376     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11593375 516570   CV1376     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11735767 516570   CV1376     FALSE NA 782.000 0.000 NA   NA
 11451013 516570   CV1376     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11593376 516570   CV1376     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11735768 516570   CV1376     FALSE NA 814.000 0.000 NA   NA
 11451014 516570   CV1376     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11593377 516570   CV1376     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11735769 516570   CV1376     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11451015 516570   CV1376     FALSE NA 875.000 0.000 NA   NA
 11593378 516570   CV1376     FALSE NA 875.000 0.000 NA   NA
 11735770 516570   CV1376     FALSE NA 875.000 0.000 NA   NA
 11451016 516570   CV1376     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11593379 516570   CV1376     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11735771 516570   CV1376     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11451017 516570   CV1376     FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11593380 516570   CV1376     FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11735772 516570   CV1376     FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11451018 516570   CV1376     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11593381 516570   CV1376     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11735773 516570   CV1376     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11451019 516570   CV1376     FALSE NA 997.000 0.000 NA   NA
 11593382 516570   CV1376     FALSE NA 997.000 0.000 NA   NA
 11735774 516570   CV1376     FALSE NA 997.000 0.000 NA   NA
 11451020 516570   CV1376     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11593383 516570   CV1376     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11735775 516570   CV1376     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11451021 516570   CV1376     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11593384 516570   CV1376     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11735776 516570   CV1376     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11451022 516570   CV1376     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11593385 516570   CV1376     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11735777 516570   CV1376     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11451023 516570   CV1376     FALSE NA 1119.000 0.000 NA   NA
 11593386 516570   CV1376     FALSE NA 1119.000 0.000 NA   NA
 11735778 516570   CV1376     FALSE NA 1119.000 0.000 NA   NA
 11451024 516570   CV1376     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11593387 516570   CV1376     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11735779 516570   CV1376     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11451025 516570   CV1376     FALSE NA 1180.000 0.000 NA   NA
 11593388 516570   CV1376     FALSE NA 1180.000 0.000 NA   NA
 11735780 516570   CV1376     FALSE NA 1180.000 0.000 NA   NA
 11451026 516570   CV1376     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11593389 516570   CV1376     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11735781 516570   CV1376     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11451027 516570   CV1376     FALSE NA 1241.000 0.000 NA   NA
 11593390 516570   CV1376     FALSE NA 1241.000 0.000 NA   NA
 11735782 516570   CV1376     FALSE NA 1241.000 0.000 NA   NA
 11451028 516570   CV1376     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11593391 516570   CV1376     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11735783 516570   CV1376     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11451029 516570   CV1376     FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11593392 516570   CV1376     FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11735784 516570   CV1376     FALSE NA 1302.000 0.000 NA   NA
 11451030 516570   CV1376     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11593393 516570   CV1376     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11735785 516570   CV1376     FALSE NA 1331.000 0.000 NA   NA
 11451031 516570   CV1376     FALSE NA 1364.000 0.000 NA   NA
 11593394 516570   CV1376     FALSE NA 1364.000 0.000 NA   NA
 11735786 516570   CV1376     FALSE NA 1364.000 0.000 NA   NA
 11451032 516570   CV1376     FALSE NA 1393.000 0.000 NA   NA
 11593395 516570   CV1376     FALSE NA 1393.000 0.000 NA   NA
 11735787 516570   CV1376     FALSE NA 1393.000 0.000 NA   NA
 11451033 516570   CV1376     FALSE NA 1425.000 0.000 NA   NA
 11593396 516570   CV1376     FALSE NA 1425.000 0.000 NA   NA
 11735788 516570   CV1376     FALSE NA 1425.000 0.000 NA   NA
 11451034 516570   CV1376     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11593397 516570   CV1376     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11735789 516570   CV1376     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11451035 516570   CV1376     FALSE NA 1486.000 0.000 NA   NA
 11593398 516570   CV1376     FALSE NA 1486.000 0.000 NA   NA
 11735790 516570   CV1376     FALSE NA 1486.000 0.000 NA   NA
 11451036 516570   CV1376     FALSE NA 1515.000 0.000 NA   NA
 11593399 516570   CV1376     FALSE NA 1515.000 0.000 NA   NA
 11735791 516570   CV1376     FALSE NA 1515.000 0.000 NA   NA
 11451037 516570   CV1376     FALSE NA 1547.000 0.000 NA   NA
 11593400 516570   CV1376     FALSE NA 1547.000 0.000 NA   NA
 11735792 516570   CV1376     FALSE NA 1547.000 0.000 NA   NA
 11451038 516570   CV1376     FALSE NA 1576.000 0.000 NA   NA
 11593401 516570   CV1376     FALSE NA 1576.000 0.000 NA   NA
 11735793 516570   CV1376     FALSE NA 1576.000 0.000 NA   NA
 11451039 516570   CV1376     FALSE NA 1608.000 0.000 NA   NA
 11593402 516570   CV1376     FALSE NA 1608.000 0.000 NA   NA
 11735794 516570   CV1376     FALSE NA 1608.000 0.000 NA   NA
 516572 516573 CV1378 CV1379 efp   TRUE 0.655 64.000 0.074 NA   NA
 516574 516575 CV1380 CV1381   creB TRUE 0.992 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 516575 516576 CV1381 CV1382 creB   TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 516576 516577 CV1382 CV1383     FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 11451040 516578   CV1384     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11593403 516578   CV1384     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11735795 516578   CV1384     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11451041 516578   CV1384     FALSE NA 581.000 0.000 NA   NA
 11593404 516578   CV1384     FALSE NA 581.000 0.000 NA   NA
 11735796 516578   CV1384     FALSE NA 581.000 0.000 NA   NA
 11451042 516578   CV1384     FALSE NA 552.000 0.000 NA   NA
 11593405 516578   CV1384     FALSE NA 552.000 0.000 NA   NA
 11735797 516578   CV1384     FALSE NA 552.000 0.000 NA   NA
 11451043 516578   CV1384     FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11593406 516578   CV1384     FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11735798 516578   CV1384     FALSE NA 520.000 0.000 NA   NA
 11451044 516578   CV1384     FALSE NA 491.000 0.000 NA   NA
 11593407 516578   CV1384     FALSE NA 491.000 0.000 NA   NA
 11735799 516578   CV1384     FALSE NA 491.000 0.000 NA   NA
 11451045 516578   CV1384     FALSE NA 459.000 0.000 NA   NA
 11593408 516578   CV1384     FALSE NA 459.000 0.000 NA   NA
 11735800 516578   CV1384     FALSE NA 459.000 0.000 NA   NA
 11451046 516578   CV1384     FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11593409 516578   CV1384     FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11735801 516578   CV1384     FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11451047 516578   CV1384     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11593410 516578   CV1384     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11735802 516578   CV1384     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11451048 516578   CV1384     FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11593411 516578   CV1384     FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11735803 516578   CV1384     FALSE NA 369.000 0.000 NA   NA
 11451049 516578   CV1384     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11593412 516578   CV1384     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11735804 516578   CV1384     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11451050 516578   CV1384     FALSE NA 308.000 0.000 NA   NA
 11593413 516578   CV1384     FALSE NA 308.000 0.000 NA   NA
 11735805 516578   CV1384     FALSE NA 308.000 0.000 NA   NA
 11451051 516578   CV1384     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11593414 516578   CV1384     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11735806 516578   CV1384     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11451052 516578   CV1384     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11593415 516578   CV1384     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11735807 516578   CV1384     FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11451053 516578   CV1384     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11593416 516578   CV1384     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11735808 516578   CV1384     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11451054 516578   CV1384     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11593417 516578   CV1384     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11735809 516578   CV1384     FALSE NA 186.000 0.000 NA   NA
 11451055 516578   CV1384     FALSE NA 154.000 0.000 NA   NA
 11593418 516578   CV1384     FALSE NA 154.000 0.000 NA   NA
 11735810 516578   CV1384     FALSE NA 154.000 0.000 NA   NA
 11451056 516578   CV1384     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11593419 516578   CV1384     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11735811 516578   CV1384     FALSE NA 125.000 0.000 NA   NA
 11451057 516578   CV1384     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11593420 516578   CV1384     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11735812 516578   CV1384     FALSE NA 92.000 0.000 NA   NA
 11451058 516578   CV1384     FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11593421 516578   CV1384     FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11735813 516578   CV1384     FALSE NA 63.000 0.000 NA   NA
 11451059 516578   CV1384     FALSE NA 31.000 0.000 NA   NA
 11593422 516578   CV1384     FALSE NA 31.000 0.000 NA   NA
 11735814 516578   CV1384     FALSE NA 31.000 0.000 NA   NA
 11451060 516578   CV1384     FALSE NA 2.000 0.000 NA   NA
 11593423 516578   CV1384     FALSE NA 2.000 0.000 NA   NA
 11735815 516578   CV1384     FALSE NA 2.000 0.000 NA   NA
 11451061 516578   CV1384     FALSE NA -30.000 0.000 NA   NA
 11593424 516578   CV1384     FALSE NA -30.000 0.000 NA   NA
 11735816 516578   CV1384     FALSE NA -30.000 0.000 NA   NA
 11451062 516578   CV1384     FALSE NA -59.000 0.000 NA   NA
 11593425 516578   CV1384     FALSE NA -59.000 0.000 NA   NA
 11735817 516578   CV1384     FALSE NA -59.000 0.000 NA   NA
 11451063 516578   CV1384     FALSE NA -92.000 0.000 NA   NA
 11593426 516578   CV1384     FALSE NA -92.000 0.000 NA   NA
 11735818 516578   CV1384     FALSE NA -92.000 0.000 NA   NA
 11451064 516578   CV1384     FALSE NA -121.000 0.000 NA   NA
 11593427 516578   CV1384     FALSE NA -121.000 0.000 NA   NA
 11735819 516578   CV1384     FALSE NA -121.000 0.000 NA   NA
 11451065 516578   CV1384     FALSE NA -153.000 0.000 NA   NA
 11593428 516578   CV1384     FALSE NA -153.000 0.000 NA   NA
 11735820 516578   CV1384     FALSE NA -153.000 0.000 NA   NA
 11451066 516578   CV1384     FALSE NA -182.000 0.000 NA   NA
 11593429 516578   CV1384     FALSE NA -182.000 0.000 NA   NA
 11735821 516578   CV1384     FALSE NA -182.000 0.000 NA   NA
 11451067 516578   CV1384     FALSE NA -214.000 0.000 NA   NA
 11593430 516578   CV1384     FALSE NA -214.000 0.000 NA   NA
 11735822 516578   CV1384     FALSE NA -214.000 0.000 NA   NA
 11451068 516578   CV1384     FALSE NA -243.000 0.000 NA   NA
 11593431 516578   CV1384     FALSE NA -243.000 0.000 NA   NA
 11735823 516578   CV1384     FALSE NA -243.000 0.000 NA   NA
 11451069 516578   CV1384     FALSE NA -275.000 0.000 NA   NA
 11593432 516578   CV1384     FALSE NA -275.000 0.000 NA   NA
 11735824 516578   CV1384     FALSE NA -275.000 0.000 NA   NA
 11451070 516578   CV1384     FALSE NA -257.000 0.000 NA   NA
 11593433 516578   CV1384     FALSE NA -257.000 0.000 NA   NA
 11735825 516578   CV1384     FALSE NA -257.000 0.000 NA   NA
 11451071 516578   CV1384     FALSE NA -228.000 0.000 NA   NA
 11593434 516578   CV1384     FALSE NA -228.000 0.000 NA   NA
 11735826 516578   CV1384     FALSE NA -228.000 0.000 NA   NA
 11451072 516578   CV1384     FALSE NA -196.000 0.000 NA   NA
 11593435 516578   CV1384     FALSE NA -196.000 0.000 NA   NA
 11735827 516578   CV1384     FALSE NA -196.000 0.000 NA   NA
 11451073 516578   CV1384     FALSE NA -167.000 0.000 NA   NA
 11593436 516578   CV1384     FALSE NA -167.000 0.000 NA   NA
 11735828 516578   CV1384     FALSE NA -167.000 0.000 NA   NA
 11451074 516578   CV1384     FALSE NA -134.000 0.000 NA   NA
 11593437 516578   CV1384     FALSE NA -134.000 0.000 NA   NA
 11735829 516578   CV1384     FALSE NA -134.000 0.000 NA   NA
 11451075 516578   CV1384     FALSE NA -105.000 0.000 NA   NA
 11593438 516578   CV1384     FALSE NA -105.000 0.000 NA   NA
 11735830 516578   CV1384     FALSE NA -105.000 0.000 NA   NA
 11451076 516578   CV1384     FALSE NA -72.000 0.000 NA   NA
 11593439 516578   CV1384     FALSE NA -72.000 0.000 NA   NA
 11735831 516578   CV1384     FALSE NA -72.000 0.000 NA   NA
 11451077 516578   CV1384     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11593440 516578   CV1384     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11735832 516578   CV1384     FALSE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11451078 516578   CV1384     FALSE NA -10.000 0.000 NA   NA
 11593441 516578   CV1384     FALSE NA -10.000 0.000 NA   NA
 11735833 516578   CV1384     FALSE NA -10.000 0.000 NA   NA
 516579 516580 CV1385 CV1386     TRUE 0.998 -7.000 0.550 NA   NA
 516580 516581 CV1386 CV1387     FALSE 0.029 240.000 0.000 NA   NA
 516581 516582 CV1387 CV1388     FALSE 0.034 221.000 0.000 NA   NA
 516582 516583 CV1388 CV1389     TRUE 0.998 3.000 0.857 NA   NA
 516584 516585 CV1390 CV1391     FALSE 0.378 51.000 0.000 NA   NA
 516586 516587 CV1392 CV1393     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 516588 516589 CV1394 CV1395   galM FALSE 0.234 79.000 0.000 1.000   NA
 516589 516590 CV1395 CV1396 galM   FALSE 0.302 63.000 0.000 NA N NA
 516590 516591 CV1396 CV1397     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516591 516592 CV1397 CV1398     TRUE 0.892 27.000 0.125 1.000   NA
 516592 516593 CV1398 CV1399     FALSE 0.152 184.000 0.027 1.000 N NA
 516593 516594 CV1399 CV1400     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 516594 516595 CV1400 CV1401     TRUE 0.979 -7.000 0.005 1.000 N NA
 516595 516596 CV1401 CV1402     TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000   NA
 516596 516597 CV1402 CV1403     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 516597 516598 CV1403 CV1404   aspB TRUE 0.967 -19.000 0.000 1.000 N NA
 516598 516599 CV1404 CV1405 aspB   TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N NA
 516599 516600 CV1405 CV1406   DegT TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 516600 516601 CV1406 CV1407 DegT   TRUE 0.686 18.000 0.000 1.000   NA
 516601 516602 CV1407 CV1408   sdaA2 FALSE 0.014 434.000 0.000 1.000   NA
 516602 516603 CV1408 CV1409 sdaA2 sdaC FALSE 0.178 211.000 0.000 1.000 Y NA
 516603 516604 CV1409 CV1410 sdaC   FALSE 0.009 579.000 0.000 NA   NA
 516605 516606 CV1411 CV1412   pflB FALSE 0.027 272.000 0.000 1.000 N NA
 516606 516607 CV1412 CV1413 pflB pflA FALSE 0.407 85.000 0.018 1.000 N NA
 516607 516608 CV1413 CV1414 pflA   FALSE 0.178 112.000 0.000 1.000 N NA
 516608 516609 CV1414 CV1415   ggt FALSE 0.166 125.000 0.000 1.000 N NA
 516609 516610 CV1415 CV1416 ggt   TRUE 0.528 34.000 0.000 1.000   NA
 516610 516611 CV1416 CV1417   nahY FALSE 0.162 127.000 0.000 1.000   NA
 516612 516613 CV1418 CV1419     TRUE 0.988 10.000 0.268 0.027   NA
 516613 516614 CV1419 CV1420     FALSE 0.196 86.000 0.000 NA   NA
 516614 516615 CV1420 CV1421     FALSE 0.052 189.000 0.000 NA   NA
 516615 516616 CV1421 CV1422     FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 516616 516617 CV1422 CV1423   ogt FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 516617 516618 CV1423 CV1424 ogt pfkB FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000 N NA
 516618 516619 CV1424 CV1425 pfkB   FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 516620 516621 CV1426 CV1427     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 516622 516623 CV1428 CV1429     FALSE 0.203 82.000 0.000 NA   NA
 516623 516624 CV1429 CV1430     FALSE 0.016 344.000 0.000 NA   NA
 516624 516625 CV1430 CV1431     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 516625 516626 CV1431 CV1432     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 516627 516628 CV1433 CV1434     FALSE 0.131 131.000 0.000 NA   NA
 516630 516631 CV1436 CV1437   mmsA2 TRUE 0.544 32.000 0.000 1.000 N NA
 516631 516632 CV1437 CV1438 mmsA2   FALSE 0.047 205.000 0.000 1.000   NA
 516632 516633 CV1438 CV1439     FALSE 0.315 61.000 0.000 NA   NA
 516634 516635 CV1440 CV1441     FALSE 0.031 254.000 0.000 1.000   NA
 516637 516638 CV1443 CV1444     FALSE 0.011 448.000 0.000 NA   NA
 516640 516641 CV1446 CV1447 nrdE   FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 516645 516646 CV1451 CV1452     TRUE 0.637 22.000 0.000 1.000 N NA
 516648 516649 CV1454 CV1455     FALSE 0.026 260.000 0.000 NA N NA
 516649 516650 CV1455 CV1456   dapE FALSE 0.191 139.000 0.005 NA N NA
 516650 516651 CV1456 CV1457 dapE   TRUE 0.996 -3.000 0.292 1.000 N NA
 516651 516652 CV1457 CV1458   pilU1 TRUE 0.630 46.000 0.011 1.000 N NA
 516652 516653 CV1458 CV1459 pilU1 fadD2 FALSE 0.171 121.000 0.000 1.000 N NA
 516654 516655 CV1460 CV1461   nusA TRUE 0.963 53.000 0.759 NA   NA
 516655 516656 CV1461 CV1462 nusA infB TRUE 0.933 40.000 0.342 1.000 N NA
 516656 516657 CV1462 CV1463 infB rbfA TRUE 0.841 171.000 0.530 1.000 Y NA
 516657 516658 CV1463 CV1464 rbfA truB TRUE 0.999 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 516658 516659 CV1464 CV1465 truB rpsO TRUE 0.867 93.000 0.211 1.000 Y NA
 516659 516660 CV1465 CV1466 rpsO pnp TRUE 0.763 171.000 0.335 1.000 Y NA
 516660 516661 CV1466 CV1467 pnp   FALSE 0.048 196.000 0.000 NA   NA
 516662 516663 CV1468 CV1469     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 516663 516664 CV1469 CV1470     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516664 516665 CV1470 CV1471     FALSE 0.220 77.000 0.000 NA   NA
 516665 516666 CV1471 CV1472     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 516667 516668 CV1473 CV1474     FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 516668 516669 CV1474 CV1475     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 516669 516670 CV1475 CV1476     FALSE 0.012 428.000 0.000 NA   NA
 516670 516671 CV1476 CV1477     FALSE 0.128 132.000 0.000 NA   NA
 516671 516672 CV1477 CV1478     FALSE 0.065 173.000 0.000 NA   NA
 516672 516673 CV1478 CV1479     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516673 516674 CV1479 CV1480     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 516675 516676 CV1481 CV1482 aroF entA FALSE 0.100 153.000 0.000 1.000 N NA
 516676 516677 CV1482 CV1483 entA entB TRUE 0.986 3.000 0.024 1.000 Y NA
 516677 516678 CV1483 CV1484 entB entE TRUE 0.991 6.000 0.138 1.000 Y NA
 516678 516679 CV1484 CV1485 entE entC TRUE 0.998 -3.000 0.276 1.000 Y NA
 516679 516680 CV1485 CV1486 entC entF FALSE 0.258 213.000 0.000 0.016 Y NA
 516680 516681 CV1486 CV1487 entF   FALSE 0.010 823.000 0.000 1.000 N NA
 516681 516682 CV1487 CV1488   fecD TRUE 1.000 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 516682 516683 CV1488 CV1489 fecD   TRUE 0.997 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 516683 516684 CV1489 CV1490     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 516684 516685 CV1490 CV1491     FALSE 0.156 116.000 0.000 NA   NA
 516686 516687 CV1492 CV1493     FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 516689 516690 CV1495 CV_1496   argD FALSE 0.018 346.000 0.000 1.000 N NA
 516690 516691 CV_1496 CV1497 argD aruF TRUE 0.677 142.000 0.111 1.000 Y NA
 516691 516692 CV1497 CV1498 aruF astA TRUE 0.990 12.000 0.111 0.001 Y NA
 516692 516693 CV1498 CV1499 astA aruD TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N NA
 516693 516694 CV1499 CV1500 aruD aruB TRUE 0.982 11.000 0.306 1.000 N NA
 516694 516695 CV1500 CV1501 aruB   FALSE 0.150 123.000 0.000 NA   NA
 516697 516698 CV1503 CV1504 livH livM TRUE 0.992 17.000 0.333 0.061 Y NA
 516698 516699 CV1504 CV1505 livM livG TRUE 0.990 3.000 0.061 1.000 Y NA
 516699 516700 CV1505 CV1506 livG livF TRUE 0.997 -3.000 0.061 0.013 Y NA
 516703 516704 CV1509 CV1510     FALSE 0.042 204.000 0.000 NA   NA
 516706 516707 CV1512 CV1513   phoA2 TRUE 0.938 53.000 0.526 NA   NA
 516707 516708 CV1513 CV1514 phoA2 phoA1 TRUE 0.999 0.000 0.600 0.001 Y NA
 516708 516709 CV1514 CV1515 phoA1   TRUE 0.563 26.000 0.000 NA N NA
 516709 516710 CV1515 CV1516   hrpA FALSE 0.062 175.000 0.000 NA N NA
 516710 516711 CV1516 CV1517 hrpA   FALSE 0.307 67.000 0.000 1.000 N NA
 516712 516713 CV1518 CV1519     TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 516715 516716 CV1521 CV1522     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.017   NA
 516716 516717 CV1522 CV1523   narP TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.027   NA
 516718 516719 CV1524 CV1525     FALSE 0.012 519.000 0.000 1.000 N NA
 516722 516723 CV1528 CV1529     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516724 516725 CV1530 CV1531 pta ackA TRUE 0.750 14.000 0.000 1.000   NA
 516726 516727 CV1532 CV1533     FALSE 0.220 77.000 0.000 NA   NA
 516727 516728 CV1533 CV1534     TRUE 0.616 21.000 0.000 NA   NA
 516728 516729 CV1534 CV1535     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 516729 516730 CV1535 CV1536     TRUE 0.759 49.000 0.091 NA   NA
 516730 516731 CV1536 CV1537     FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 516731 516732 CV1537 CV_rRNA16s4   rRNA16S FALSE 0.011 441.000 0.000 NA   NA
 516732 516733 CV_rRNA16s4 CV_tRNAIleGAT4 rRNA16S   FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 516733 516734 CV_tRNAIleGAT4 CV_tRNAAlaTGC4     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 516734 516735 CV_tRNAAlaTGC4 CV_rRNA23s4   rRNA23S FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 516735 516736 CV_rRNA23s4 CV_rRNA5s4 rRNA23S rRNA5S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 516736 3356081 CV_rRNA5s4 CV_r01 rRNA5S   FALSE 0.187 91.000 0.000 NA   NA
 3356081 516737 CV_r01 CV1538   putA FALSE 0.013 418.000 0.000 NA   NA
 516737 516738 CV1538 CV1539 putA   TRUE 0.605 132.000 0.222 NA N NA
 516740 516741 CV1541 CV1542     TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 516741 516742 CV1542 CV1543     TRUE 0.569 29.000 0.000 1.000   NA
 516742 516743 CV1543 CV1544     TRUE 0.750 14.000 0.000 1.000   NA
 516743 516744 CV1544 CV1545     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 516744 516745 CV1545 CV1546     TRUE 0.879 25.000 0.000 1.000 Y NA
 516745 516746 CV1546 CV1547   fdxA2 TRUE 0.462 43.000 0.000 1.000 N NA
 516746 516747 CV1547 CV1548 fdxA2   TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 516747 516748 CV1548 CV1549     FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 516748 516749 CV1549 CV1550     FALSE 0.033 224.000 0.000 NA   NA
 516749 516750 CV1550 CV1551     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 516750 516751 CV1551 CV1552     FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 516751 516752 CV1552 CV1553     FALSE 0.159 112.000 0.000 NA   NA
 516752 516753 CV1553 CV1554     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA N NA
 516754 516755 CV1555 CV1556   cobB TRUE 0.981 -3.000 0.027 1.000 N NA
 516755 516756 CV1556 CV1557 cobB btuR TRUE 0.996 0.000 0.069 0.006 Y NA
 516756 516757 CV1557 CV1558 btuR btuC TRUE 0.544 32.000 0.000 1.000 N NA
 516757 516758 CV1558 CV1559 btuC   TRUE 0.996 21.000 0.875 1.000 Y NA
 516758 516759 CV1559 CV1560     TRUE 0.997 3.000 0.368 1.000 Y NA
 516759 516760 CV1560 CV1561   cobW TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 516760 516761 CV1561 CV1562 cobW cbiJ TRUE 0.976 -3.000 0.017 NA   NA
 516761 516762 CV1562 CV1563 cbiJ cbiG TRUE 0.429 515.000 0.352 0.006 Y NA
 516762 516763 CV1563 CV1564 cbiG cbiF TRUE 0.999 -3.000 0.397 0.006 Y NA
 516763 516764 CV1564 CV1565 cbiF cbiL TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.006 Y NA
 516764 516765 CV1565 CV1566 cbiL cbiD TRUE 0.997 -3.000 0.056 0.006 Y NA
 516765 516766 CV1566 CV1567 cbiD cbiC TRUE 0.989 -3.000 0.016 0.006   NA
 516766 516767 CV1567 CV1568 cbiC cobL TRUE 0.992 -3.000 0.065 0.006   NA
 516767 516768 CV1568 CV1569 cobL cobA1 TRUE 0.579 82.000 0.000 1.000 Y NA
 516768 516769 CV1569 CV1570 cobA1   TRUE 0.977 2.000 0.000 1.000 Y NA
 516769 516770 CV1570 CV1571   cobN TRUE 0.994 -3.000 0.086 0.001   NA
 516770 516771 CV1571 CV1572 cobN   TRUE 0.983 -3.000 0.045 NA   NA
 516771 516772 CV1572 CV1573   hoxN TRUE 0.983 -3.000 0.045 NA N NA
 516772 516773 CV1573 CV1574 hoxN cobC FALSE 0.032 246.000 0.000 1.000 N NA
 516773 516774 CV1574 CV1575 cobC cobD TRUE 0.999 -7.000 0.463 0.006 N NA
 516776 516777 CV1577 CV1578 cysQ   FALSE 0.328 64.000 0.000 1.000 N NA
 516778 516779 CV1579 CV1580     TRUE 0.582 81.000 0.000 1.000 Y NA
 516779 516780 CV1580 CV1581     FALSE 0.069 393.000 0.000 1.000 Y NA
 516780 516781 CV1581 CV1582     FALSE 0.073 676.000 0.000 0.016 Y NA
 516783 516784 CV1584 CV1585 trxA rho TRUE 0.468 126.000 0.087 1.000   NA
 516784 516785 CV1585 CV1586 rho   FALSE 0.177 113.000 0.000 1.000 N NA
 516786 516787 CV1587 CV1588   nadC FALSE 0.009 911.000 0.000 1.000 N NA
 516788 516789 CV1589 CV1590     FALSE 0.278 67.000 0.000 NA   NA
 516790 516791 CV1591 CV1592   murB TRUE 0.456 44.000 0.000 1.000   NA
 516791 516792 CV1592 CV1593 murB   TRUE 0.974 -3.000 0.008 1.000 N NA
 516792 516793 CV1593 CV1594     FALSE 0.178 149.000 0.009 NA   NA
 516793 516794 CV1594 CV1595   kdpE FALSE 0.022 281.000 0.000 NA   NA
 516794 516795 CV1595 CV1596 kdpE kdpD TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 516795 516796 CV1596 CV1597 kdpD kdpC TRUE 0.921 7.000 0.009 1.000 N NA
 516796 516797 CV1597 CV1598 kdpC kdpB TRUE 0.997 28.000 0.877 0.001 Y NA
 516797 516798 CV1598 CV1599 kdpB kdpA TRUE 0.985 25.000 0.201 0.001 Y NA
 516798 516799 CV1599 CV1600 kdpA   FALSE 0.010 515.000 0.000 NA   NA
 516801 516802 CV1602 CV1603     FALSE 0.204 94.000 0.000 1.000   NA
 516802 516803 CV1603 CV1604   alaS FALSE 0.176 115.000 0.000 1.000   NA
 516803 516804 CV1604 CV1605 alaS   FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 516804 516805 CV1605 CV1606   oraA TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516805 516806 CV1606 CV1607 oraA recA TRUE 0.993 0.000 0.296 1.000   NA
 516807 516808 CV1608 CV1609 hrcA mltB TRUE 0.641 32.000 0.003 NA N NA
 516808 516809 CV1609 CV1610 mltB dnaX FALSE 0.176 97.000 0.000 NA N NA
 516809 516810 CV1610 CV1611 dnaX   TRUE 0.997 -3.000 0.411 NA   NA
 516810 516811 CV1611 CV1612   recR TRUE 0.843 128.000 0.604 NA   NA
 516811 516812 CV1612 CV1613 recR   FALSE 0.027 270.000 0.000 1.000   NA
 516813 516814 CV1614 CV1615 lolA   FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 516814 516815 CV1615 CV1616   nadE FALSE 0.159 111.000 0.000 NA   NA
 516816 516817 CV1617 CV_tRNASerGGA1     FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 516817 516818 CV_tRNASerGGA1 CV_tRNASerGGA2     FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 516818 516819 CV_tRNASerGGA2 CV1618     FALSE 0.015 361.000 0.000 NA   NA
 516819 516820 CV1618 CV1619     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 516820 516821 CV1619 CV1620     FALSE 0.022 280.000 0.000 NA   NA
 516821 516822 CV1620 CV1621     TRUE 0.732 74.000 0.000 0.016 Y NA
 516824 516825 CV1623 CV1624   fdhD TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516826 516827 CV1625 CV1626 mobA   FALSE 0.235 74.000 0.000 NA N NA
 516827 516828 CV1626 CV1627   acrE TRUE 0.989 10.000 0.436 NA N NA
 516828 516829 CV1627 CV1628 acrE   TRUE 0.814 77.000 0.088 1.000 Y NA
 516829 516830 CV1628 CV1629     FALSE 0.209 141.000 0.000 0.060 N NA
 516830 516831 CV1629 CV1630     TRUE 0.491 95.000 0.062 1.000 N NA
 516832 516833 CV1631 CV1632   pcnB FALSE 0.102 151.000 0.000 1.000 N NA
 516833 516834 CV1632 CV1633 pcnB folK TRUE 0.995 -3.000 0.234 1.000 N NA
 516834 516835 CV1633 CV1634 folK dgk TRUE 0.986 -3.000 0.063 1.000 N NA
 516835 516836 CV1634 CV1635 dgk panB TRUE 0.720 50.000 0.055 1.000 N NA
 516836 516837 CV1635 CV1636 panB panC TRUE 0.993 20.000 0.395 0.001 Y NA
 516837 516838 CV1636 CV1637 panC panD TRUE 0.984 25.000 0.342 1.000 Y NA
 516841 516842 CV1640 CV1641 menG aceA FALSE 0.243 130.000 0.008 NA N NA
 516843 516844 CV1642 CV1643 grpE dnaK TRUE 0.766 115.000 0.030 0.007 Y NA
 516844 516845 CV1643 CV1644 dnaK desD FALSE 0.172 120.000 0.000 1.000 N NA
 516845 516846 CV1644 CV1645 desD dnaJ TRUE 0.749 14.000 0.000 1.000 N NA
 516847 516848 CV1646 CV1647     FALSE 0.042 203.000 0.000 NA   NA
 516849 516850 CV1648 CV1649 hemB   FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 516850 516851 CV1649 CV1650   kbl FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 516851 516852 CV1650 CV1651 kbl tdh TRUE 0.944 53.000 0.547 1.000 N NA
 516854 516855 CV1653 CV1654 hemG glyQ TRUE 0.588 27.000 0.000 1.000 N NA
 516855 516856 CV1654 CV1655 glyQ   FALSE 0.421 65.000 0.003 NA   NA
 516856 516857 CV1655 CV1656   glyS TRUE 0.796 16.000 0.003 NA   NA
 516857 516858 CV1656 CV1657 glyS   TRUE 0.553 112.000 0.123 1.000 N NA
 516858 516859 CV1657 CV1658     TRUE 0.969 17.000 0.310 1.000 N NA
 516859 516860 CV1658 CV1659     TRUE 0.891 14.000 0.034 NA   NA
 516860 516861 CV1659 CV1660   gloA TRUE 0.882 20.000 0.071 NA   NA
 516861 516862 CV1660 CV1661 gloA   TRUE 0.565 54.000 0.009 1.000 N NA
 516863 516864 CV1662 CV1663 cstA1   FALSE 0.157 129.000 0.000 1.000   NA
 516864 516865 CV1663 CV1664     FALSE 0.221 85.000 0.000 1.000   NA
 516865 516866 CV1664 CV1665     TRUE 1.000 -6.000 0.877 0.027 Y NA
 516868 516869 CV1667 CV1668     FALSE 0.017 321.000 0.000 NA   NA
 516869 516870 CV1668 CV1669     FALSE 0.020 289.000 0.000 NA   NA
 516871 516872 CV1670 CV1671     FALSE 0.239 78.000 0.000 1.000   NA
 516872 516873 CV1671 CV1672     TRUE 0.689 16.000 0.000 NA   NA
 516873 516874 CV1672 CV1673     FALSE 0.128 132.000 0.000 NA   NA
 516874 516875 CV1673 CV1674     TRUE 0.978 10.000 0.000 0.001 Y NA
 516875 516876 CV1674 CV1675     FALSE 0.011 566.000 0.000 1.000 N NA
 516879 516880 CV1678 CV1679     TRUE 0.991 20.000 0.360 0.060 Y NA
 516880 516881 CV1679 CV1680     TRUE 0.999 -3.000 0.774 0.060   NA
 516881 516882 CV1680 CV1681     TRUE 0.898 64.000 0.301 0.060   NA
 516882 516883 CV1681 CV1682   hcnC FALSE 0.065 180.000 0.000 1.000 N NA
 516883 516884 CV1682 CV1683 hcnC hcnB TRUE 0.991 2.000 0.136 0.001   NA
 516884 516885 CV1683 CV1684 hcnB hcnA TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.001   NA
 516886 516887 CV1685 CV1686     TRUE 0.468 37.000 0.000 NA   NA
 516887 516888 CV1686 CV1687   ansA FALSE 0.203 82.000 0.000 NA   NA
 516890 516891 CV1689 CV1690   nadR FALSE 0.421 44.000 0.000 NA   NA
 516891 516892 CV1690 CV1691 nadR   FALSE 0.046 208.000 0.000 1.000   NA
 516892 516893 CV1691 CV1692     TRUE 0.938 2.000 0.005 NA   NA
 516893 516894 CV1692 CV1693     TRUE 0.979 -13.000 0.005 NA   NA
 516894 516895 CV1693 CV1694     TRUE 0.958 19.000 0.281 NA   NA
 516895 516896 CV1694 CV1695     TRUE 0.876 26.000 0.104 NA   NA
 516896 516897 CV1695 CV1696     TRUE 0.586 78.000 0.013 0.005   NA
 516897 516898 CV1696 CV1697   trpS1 TRUE 0.706 74.000 0.158 1.000   NA
 516899 516900 CV1698 CV1699     FALSE 0.071 175.000 0.000 1.000 N NA
 516900 516901 CV1699 CV1700     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA N NA
 516902 516903 CV1701 CV1702   flgC2 TRUE 0.999 4.000 0.972 0.006 Y NA
 516903 516904 CV1702 CV1703 flgC2 flgD2 TRUE 1.000 -3.000 0.914 NA Y NA
 516904 516905 CV1703 CV1704 flgD2 flgE2 TRUE 0.997 19.000 0.970 NA Y NA
 516905 516906 CV1704 CV1705 flgE2 flgF2 TRUE 0.999 5.000 1.000 0.006 Y NA
 516906 516907 CV1705 CV1706 flgF2 flgG2 TRUE 0.998 25.000 0.971 0.001 Y NA
 516907 516908 CV1706 CV1707 flgG2 flgH2 TRUE 1.000 -3.000 0.941 0.009 Y NA
 516908 516909 CV1707 CV1708 flgH2 flgI2 TRUE 0.999 9.000 0.912 0.011 Y NA
 516909 516910 CV1708 CV_1709 flgI2 flgK FALSE 0.032 438.000 0.000 0.006   NA
 516910 516911 CV_1709 CV1710 flgK flgL2 TRUE 0.996 10.000 0.576 0.002   NA
 516911 516912 CV1710 CV1711 flgL2   TRUE 0.996 4.000 0.667 NA   NA
 516912 516913 CV1711 CV1712     FALSE 0.154 118.000 0.000 NA   NA
 516913 516914 CV1712 CV1713   asnB FALSE 0.084 165.000 0.000 1.000 N NA
 516919 516920 CV1718 CV1719     FALSE 0.239 78.000 0.000 1.000   NA
 516920 516921 CV1719 CV1720     FALSE 0.060 187.000 0.000 1.000   NA
 516922 516923 CV1721 CV1722     FALSE 0.028 246.000 0.000 NA   NA
 516923 516924 CV1722 CV1723     FALSE 0.042 204.000 0.000 NA   NA
 516926 516927 CV1725 CV1726     FALSE 0.253 71.000 0.000 NA   NA
 516930 516931 CV1729 CV1730     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 516933 516934 CV1732 CV1733     FALSE 0.114 138.000 0.000 NA   NA
 516935 516936 CV1734 CV1735   cydC TRUE 0.996 -3.000 0.229 0.070 N NA
 516936 516937 CV1735 CV1736 cydC hylD TRUE 0.964 33.000 0.385 0.060 N NA
 516937 516938 CV1736 CV1737 hylD   FALSE 0.030 236.000 0.000 NA   NA
 516940 516941 CV1739 CV1740     FALSE 0.103 143.000 0.000 NA   NA
 516941 516942 CV1740 CV1741     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.060   NA
 516942 516943 CV1741 CV1742   glnS FALSE 0.189 101.000 0.000 1.000   NA
 516943 516944 CV1742 CV1743 glnS ushA FALSE 0.196 98.000 0.000 1.000 N NA
 516944 516945 CV1743 CV1744 ushA   FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 516945 516946 CV1744 CV1745   pfkA FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 516946 516947 CV1745 CV1746 pfkA cysS FALSE 0.107 148.000 0.000 1.000 N NA
 516947 516948 CV1746 CV1747 cysS rpmE TRUE 0.583 109.000 0.003 1.000 Y NA
 516948 516949 CV1747 CV1748 rpmE   FALSE 0.290 116.000 0.010 NA N NA
 516950 516951 CV1749 CV1750     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 516951 516952 CV1750 CV1751     FALSE 0.018 310.000 0.000 NA   NA
 516952 516953 CV1751 CV1752     TRUE 0.996 0.000 0.468 NA   NA
 516953 516954 CV1752 CV1753     TRUE 0.999 -3.000 0.787 NA   NA
 516954 516955 CV1753 CV1754     TRUE 0.999 -10.000 0.895 NA   NA
 516955 516956 CV1754 CV1755     TRUE 0.502 216.000 0.528 NA   NA
 516956 516957 CV1755 CV1756     TRUE 0.998 -3.000 0.707 NA   NA
 516957 516958 CV1756 CV1757     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 516958 516959 CV1757 CV1758     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 516959 516960 CV1758 CV1759   mvaB TRUE 0.474 113.000 0.024 0.058 N NA
 516960 516961 CV1759 CV1760 mvaB   TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 516961 516962 CV1760 CV1761     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 516962 516963 CV1761 CV1762     TRUE 0.518 35.000 0.000 1.000   NA
 516963 516964 CV1762 CV1763     TRUE 0.969 14.000 0.008 0.058 Y NA
 516964 516965 CV1763 CV1764     TRUE 0.968 11.000 0.006 1.000 Y NA
 516965 516966 CV1764 CV1765     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 516966 516967 CV1765 CV1766     FALSE 0.109 140.000 0.000 NA   NA
 516967 516968 CV1766 CV1767     FALSE 0.175 117.000 0.000 1.000   NA
 516970 516971 CV1769 CV1770     TRUE 0.666 107.000 0.205 1.000 N NA
 516971 516972 CV1770 CV_1771     TRUE 0.999 0.000 0.744 0.026 Y NA
 516972 516973 CV_1771 CV1772     FALSE 0.085 155.000 0.000 NA   NA
 516975 516976 CV1774 CV1775   gst3 TRUE 0.978 17.000 0.439 1.000 N NA
 516976 516977 CV1775 CV1776 gst3   FALSE 0.177 114.000 0.000 1.000 N NA
 516979 516980 CV1778 CV1779     FALSE 0.307 67.000 0.000 1.000   NA
 516981 516982 CV1780 CV1781     FALSE 0.061 176.000 0.000 NA   NA
 516982 516983 CV1781 CV1782     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 516984 516985 CV1783 CV1784     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 516985 516986 CV1784 CV1785     FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 516987 516988 CV1786 CV1787   mutT TRUE 0.897 8.000 0.004 NA   NA
 516988 516989 CV1787 CV1788 mutT   TRUE 0.610 38.000 0.004 NA   NA
 516989 516990 CV1788 CV1789   prkA FALSE 0.019 303.000 0.000 NA   NA
 516990 516991 CV1789 CV1790 prkA   TRUE 0.784 155.000 0.683 NA   NA
 516991 516992 CV1790 CV1791     TRUE 0.999 -3.000 0.761 NA   NA
 516993 516994 CV1792 CV1793     FALSE 0.253 71.000 0.000 NA   NA
 516994 516995 CV1793 CV1794   hmuU TRUE 0.992 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 516995 516996 CV1794 CV1795 hmuU dapB TRUE 0.607 39.000 0.002 1.000 N NA
 516996 516997 CV1795 CV1796 dapB omlA TRUE 0.985 -3.000 0.049 1.000 N NA
 516998 516999 CV1797 CV1798 fur aat TRUE 0.973 -3.000 0.006 1.000 N NA
 516999 517000 CV1798 CV1799 aat ate1 TRUE 0.999 -13.000 0.285 1.000 Y NA
 517001 517002 CV1800 CV1801     FALSE 0.114 138.000 0.000 NA   NA
 517002 517003 CV1801 CV1802     FALSE 0.011 453.000 0.000 NA   NA
 517003 517004 CV1802 CV1803     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 517005 517006 CV1804 CV1805   mmdA FALSE 0.301 68.000 0.000 1.000 N NA
 517006 517007 CV1805 CV1806 mmdA   TRUE 0.901 148.000 0.600 1.000 Y NA
 517007 517008 CV1806 CV1807     TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 517008 517009 CV1807 CV1808     TRUE 0.955 12.000 0.025 0.001   NA
 517009 517010 CV1808 CV1809     FALSE 0.343 126.000 0.025 1.000   NA
 517011 517012 CV1810 CV1811   slyB FALSE 0.172 119.000 0.000 1.000 N NA
 517012 517013 CV1811 CV1812 slyB pyrD TRUE 0.739 23.000 0.003 1.000 N NA
 517013 517014 CV1812 CV1813 pyrD   FALSE 0.267 73.000 0.000 1.000 N NA
 517014 517015 CV1813 CV1814   motB1 TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 517015 517016 CV1814 CV1815 motB1 sohB TRUE 0.718 16.000 0.000 1.000 N NA
 517016 517017 CV1815 CV1816 sohB   TRUE 0.888 44.000 0.218 1.000 N NA
 517017 517018 CV1816 CV1817     TRUE 0.995 -6.000 0.199 1.000   NA
 517018 517019 CV1817 CV1818   rluC TRUE 0.995 0.000 0.389 1.000   NA
 517019 517020 CV1818 CV1819 rluC   FALSE 0.042 203.000 0.000 NA   NA
 517021 517022 CV1820 CV_tRNAAsnGTT4     FALSE 0.182 94.000 0.000 NA   NA
 517024 517025 CV1822 CV1823     FALSE 0.346 135.000 0.011 0.097   NA
 517025 517026 CV1823 CV1824     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 517029 517030 CV1827 CV1828 cbl cysA TRUE 0.985 -3.000 0.053 1.000 N NA
 517030 517031 CV1828 CV1829 cysA cysW TRUE 0.999 2.000 0.587 1.000 Y NA
 517031 517032 CV1829 CV1830 cysW cysU TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.000 N NA
 517035 517036 CV1833 CV1834     FALSE 0.364 53.000 0.000 NA   NA
 517041 517042 CV1839 CV1840   phnM TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 517042 517043 CV1840 CV1841 phnM phnL TRUE 0.993 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 517043 517044 CV1841 CV1842 phnL phnK TRUE 0.999 5.000 0.859 0.012 Y NA
 517044 517045 CV1842 CV1843 phnK phnJ TRUE 1.000 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 517045 517046 CV1843 CV1844 phnJ phnI TRUE 1.000 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 517046 517047 CV1844 CV1845 phnI phnH TRUE 1.000 2.000 0.960 0.001 Y NA
 517047 517048 CV1845 CV1846 phnH phnG TRUE 1.000 2.000 0.967 0.001 Y NA
 517049 517050 CV1847 CV1848 phnF   TRUE 0.981 0.000 0.096 NA   NA
 517050 517051 CV1848 CV1849   phnN TRUE 0.997 -10.000 0.296 NA   NA
 517052 517053 CV1850 CV1851     TRUE 0.651 99.000 0.000 0.014 Y NA
 517053 517054 CV1851 CV1852     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.097 Y NA
 517057 517058 CV1855 CV1856     FALSE 0.395 76.000 0.000 0.057 N NA
 517058 517059 CV1856 CV1857     TRUE 0.999 -6.000 0.857 0.057 N NA
 517059 517060 CV1857 CV1858     FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 517060 517061 CV1858 CV1859     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 517061 517062 CV1859 CV1860     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 517062 517063 CV1860 CV1861     FALSE 0.077 171.000 0.000 1.000 N NA
 517063 517064 CV1861 CV1862   xylB FALSE 0.046 675.000 0.000 1.000 Y NA
 517067 517068 CV1865 CV1866     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 517069 517070 CV1867 CV1868     FALSE 0.400 47.000 0.000 NA   NA
 517070 517071 CV1868 CV1869     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 517071 517072 CV1869 CV1870     FALSE 0.328 186.000 0.000 0.020 Y NA
 517072 517073 CV1870 CV1871     FALSE 0.008 851.000 0.000 NA   NA
 517073 517074 CV1871 CV1872     TRUE 0.689 16.000 0.000 NA   NA
 517074 517075 CV1872 CV1873     FALSE 0.267 69.000 0.000 NA   NA
 517075 517076 CV1873 CV1874     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 517076 517077 CV1874 CV1875     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 517077 517078 CV1875 CV1876     FALSE 0.008 843.000 0.000 NA   NA
 517078 517079 CV1876 CV1877     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 517079 517080 CV1877 CV1878     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 517080 517081 CV1878 CV1879     FALSE 0.057 181.000 0.000 NA   NA
 517082 517083 CV1880 CV1881 cynS cynT TRUE 0.732 73.000 0.011 1.000 Y NA
 517086 517087 CV1884 CV1885 hipO   TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 517087 517088 CV1885 CV1886     FALSE 0.009 674.000 0.000 NA   NA
 517088 517089 CV1886 CV1887   rhsA FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 517089 517090 CV1887 CV1888 rhsA   FALSE 0.008 882.000 0.000 NA   NA
 517091 517092 CV1889 CV1890 ssb   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517095 517096 CV1893 CV1894 uvrA   FALSE 0.424 62.000 0.002 NA   NA
 517096 517097 CV1894 CV1895     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 517097 517098 CV1895 CV1896     FALSE 0.117 136.000 0.000 NA   NA
 517099 517100 CV1897 CV1898 chiA infA1 FALSE 0.049 203.000 0.000 1.000   NA
 517100 517101 CV1898 CV1899 infA1   TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 517101 517102 CV1899 CV1900     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 517103 517104 CV1901 CV1902     FALSE 0.194 99.000 0.000 1.000 N NA
 517104 517105 CV1902 CV1903     FALSE 0.022 279.000 0.000 NA   NA
 517105 517106 CV1903 CV1904     TRUE 0.961 -13.000 0.000 NA   NA
 517106 517107 CV1904 CV1905     TRUE 0.990 -7.000 0.062 1.000   NA
 517107 517108 CV1905 CV1906     TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 517108 517109 CV1906 CV1907     TRUE 0.988 0.000 0.182 NA   NA
 517109 517110 CV1907 CV1908   fbpA FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 517110 517111 CV1908 CV1909 fbpA fbpB TRUE 0.985 72.000 0.844 0.057 Y NA
 517111 517112 CV1909 CV1910 fbpB   TRUE 0.983 2.000 0.070 0.057 N NA
 517113 517114 CV1911 CV1912     FALSE 0.049 194.000 0.000 NA   NA
 517114 517115 CV1912 CV1913   lrp FALSE 0.169 123.000 0.000 1.000   NA
 517116 517117 CV1914 CV1915 dadA2 alr TRUE 0.973 4.000 0.099 1.000 N NA
 517119 517120 CV1917 CV1918 shlB   FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 517120 517121 CV1918 CV1919     FALSE 0.179 111.000 0.000 1.000   NA
 517124 517125 CV1922 CV1923     TRUE 0.608 25.000 0.000 1.000 N NA
 517127 517128 CV_tRNAHisGTG1 CV_tRNAHisGTG2     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 517128 517129 CV_tRNAHisGTG2 CV_tRNAHisGTG3     FALSE 0.407 46.000 0.000 NA   NA
 517129 517130 CV_tRNAHisGTG3 CV_tRNAArgTCT     TRUE 0.543 28.000 0.000 NA   NA
 517130 517131 CV_tRNAArgTCT CV_tRNAProTGG     TRUE 0.643 19.000 0.000 NA   NA
 517132 517133 CV1925 CV1926 folD purU FALSE 0.158 175.000 0.019 1.000 N NA
 517133 517134 CV1926 CV1927 purU   TRUE 0.918 8.000 0.012 NA   NA
 517135 517136 CV1928 CV1929     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000 N NA
 517136 517137 CV1929 CV1930     FALSE 0.160 110.000 0.000 NA   NA
 517137 517138 CV1930 CV1931   nupC FALSE 0.407 46.000 0.000 NA   NA
 517138 517139 CV1931 CV1932 nupC   FALSE 0.028 268.000 0.000 1.000 N NA
 517141 517142 CV1934 CV1935 metY   TRUE 0.638 103.000 0.000 0.014 Y NA
 517143 517144 CV1936 CV1937   gltX FALSE 0.211 90.000 0.000 1.000 N NA
 517145 517146 CV1938 CV1939     FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 517146 517147 CV1939 CV1940   crcB FALSE 0.115 137.000 0.000 NA   NA
 517149 517150 CV1942 CV1943     FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 517152 517153 CV1945 CV1946 tag   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517154 517155 CV1947 CV1948 czcR   TRUE 0.970 11.000 0.000 0.020 Y NA
 517156 517157 CV1949 CV1950     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 517158 517159 CV1951 CV1952     FALSE 0.251 76.000 0.000 1.000   NA
 517159 517160 CV1952 CV1953     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 517160 517161 CV1953 CV1954     FALSE 0.117 136.000 0.000 NA   NA
 517161 517162 CV1954 CV1955     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 517164 517165 CV1957 CV1958 potF3 potH FALSE 0.308 189.000 0.000 0.056 Y NA
 517165 517166 CV1958 CV1959 potH potI TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.056 Y NA
 517166 517167 CV1959 CV1960 potI   FALSE 0.364 53.000 0.000 NA   NA
 517169 517170 CV1962 CV1963 argS   FALSE 0.164 104.000 0.000 NA   NA
 517171 517172 CV1964 CV1965     TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000   NA
 517174 517175 CV1967 CV1968     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 517176 517177 CV1969 CV1970     FALSE 0.030 236.000 0.000 NA   NA
 517177 517178 CV1970 CV1971     FALSE 0.158 157.000 0.000 0.095   NA
 517178 517179 CV1971 CV1972   exbB1 TRUE 0.682 40.000 0.000 0.012   NA
 517179 517180 CV1972 CV1973 exbB1 exbD5 TRUE 0.976 7.000 0.000 0.066 Y NA
 517180 517181 CV1973 CV1974 exbD5 exbD3 TRUE 0.968 11.000 0.000 0.056 Y NA
 517181 517182 CV1974 CV1975 exbD3 nolF FALSE 0.316 95.000 0.000 0.095 N NA
 517182 517183 CV1975 CV1976 nolF nolG TRUE 0.995 11.000 0.824 NA N NA
 517185 517186 CV1978 CV1979 hbpA   TRUE 0.963 23.000 0.048 0.056 Y NA
 517186 517187 CV1979 CV1980     TRUE 0.992 17.000 0.738 0.056   NA
 517187 517188 CV1980 CV1981     TRUE 0.922 16.000 0.091 1.000   NA
 517188 517189 CV1981 CV1982     FALSE 0.011 531.000 0.000 1.000   NA
 517189 517190 CV1982 CV1983     FALSE 0.224 135.000 0.000 0.095   NA
 517190 517191 CV1983 CV1984   exbB2 TRUE 0.682 40.000 0.000 0.012   NA
 517191 517192 CV1984 CV1985 exbB2 exbD1 TRUE 0.976 7.000 0.000 0.066 Y NA
 517192 517193 CV1985 CV1986 exbD1 exbD4 TRUE 0.968 11.000 0.000 0.056 Y NA
 517193 517194 CV1986 CV1987 exbD4   FALSE 0.373 77.000 0.000 0.095 N NA
 517194 517195 CV1987 CV1988   endA FALSE 0.015 399.000 0.000 1.000 N NA
 517196 517197 CV1989 CV1990     FALSE 0.061 176.000 0.000 NA   NA
 517197 517198 CV1990 CV1991   dinG FALSE 0.154 118.000 0.000 NA   NA
 517199 517200 CV1992 CV1993   argI FALSE 0.224 191.000 0.000 1.000 Y NA
 517200 517201 CV1993 CV1994 argI argG TRUE 0.908 49.000 0.088 1.000 Y NA
 517201 517202 CV1994 CV1995 argG   FALSE 0.234 79.000 0.000 1.000   NA
 517202 517203 CV1995 CV1996     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 517205 517206 CV1998 CV1999     FALSE 0.009 776.000 0.000 NA   NA
 517206 517207 CV1999 CV2000   hslO TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 517207 517208 CV2000 CV2001 hslO   FALSE 0.015 414.000 0.000 1.000   NA
 517209 517210 CV2002 CV2003     FALSE 0.011 472.000 0.000 NA   NA
 517211 517212 CV2004 CV2005   ribA FALSE 0.319 60.000 0.000 NA N NA
 517212 517213 CV2005 CV2006 ribA   FALSE 0.009 604.000 0.000 NA   NA
 517213 517214 CV2006 CV2007   aniA FALSE 0.012 439.000 0.000 NA   NA
 517214 517215 CV2007 CV2008 aniA   TRUE 0.993 -3.000 0.194 NA   NA
 517215 517216 CV2008 CV2009     TRUE 0.997 -3.000 0.483 NA   NA
 517219 517220 CV2012 CV2013     FALSE 0.013 400.000 0.000 NA   NA
 517220 517221 CV2013 CV2014     FALSE 0.114 138.000 0.000 NA   NA
 517221 517222 CV2014 CV2015     TRUE 0.860 6.000 0.000 1.000   NA
 517224 517225 CV2017 CV2018     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 517225 517226 CV2018 CV2019     FALSE 0.045 210.000 0.000 1.000 N NA
 517226 517227 CV2019 CV2020     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 517227 517228 CV2020 CV2021     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 517229 517230 CV2022 CV2023 ald   TRUE 0.796 19.000 0.006 1.000   NA
 517230 517231 CV2023 CV2024     FALSE 0.178 113.000 0.000 1.000   NA
 517231 517232 CV2024 CV2025     FALSE 0.164 126.000 0.000 1.000 N NA
 517232 517233 CV2025 CV2026   motA1 FALSE 0.073 174.000 0.000 1.000 N NA
 517233 517234 CV2026 CV2027 motA1 motB2 TRUE 0.961 19.000 0.065 1.000 Y NA
 517234 517235 CV2027 CV2028 motB2   TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 517235 517236 CV2028 CV2029     TRUE 0.992 -13.000 0.100 NA   NA
 517236 517237 CV2029 CV2030     TRUE 0.428 66.000 0.005 NA   NA
 517238 517239 CV2031 CV2032   cca TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517239 517240 CV2032 CV2033 cca   TRUE 0.970 2.000 0.054 1.000 N NA
 517240 517241 CV2033 CV2034   sltY TRUE 0.943 35.000 0.110 1.000 Y NA
 517241 517242 CV2034 CV2035 sltY   FALSE 0.135 130.000 0.000 NA N NA
 517243 517244 CV2036 CV2037     TRUE 0.623 155.000 0.204 0.003 N NA
 517244 517245 CV2037 CV2038     FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 517246 517247 CV2039 CV2040     FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 517247 517248 CV2040 CV2041   fixS FALSE 0.054 184.000 0.000 NA N NA
 517248 517249 CV2041 CV2042 fixS   TRUE 0.999 0.000 0.713 NA Y NA
 517255 517256 CV2048 CV2049     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 517256 517257 CV2049 CV2050     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 517259 517260 CV2052 CV2053     FALSE 0.145 126.000 0.000 NA   NA
 517260 517261 CV2053 CV2054   acnA2 TRUE 0.956 57.000 0.733 NA   NA
 517261 517262 CV2054 CV2055 acnA2   TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 517262 517263 CV2055 CV2056   prpC FALSE 0.345 56.000 0.000 NA   NA
 517263 517264 CV2056 CV2057 prpC prpB TRUE 0.946 48.000 0.502 1.000 N NA
 517265 517266 CV2058 CV2059 rpoE   TRUE 0.997 3.000 0.705 NA N NA
 517266 517267 CV2059 CV2060   mucB TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 517267 517268 CV2060 CV2061 mucB mucD FALSE 0.026 259.000 0.000 NA N NA
 517268 517269 CV2061 CV2062 mucD   TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 517269 517270 CV2062 CV2063   lepA FALSE 0.091 158.000 0.000 1.000   NA
 517270 517271 CV2063 CV2064 lepA lepB TRUE 0.988 1.000 0.187 1.000   NA
 517271 517272 CV2064 CV2065 lepB   TRUE 0.837 41.000 0.133 NA   NA
 517272 517273 CV2065 CV2066   rnc TRUE 0.936 8.000 0.033 NA   NA
 517273 517274 CV2066 CV2067 rnc era TRUE 0.991 -3.000 0.058 0.037   NA
 517274 517275 CV2067 CV2068 era   TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517275 517276 CV2068 CV2069   recO TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517276 517277 CV2069 CV2070 recO pdxJ TRUE 0.912 26.000 0.166 1.000 N NA
 517277 517278 CV2070 CV2071 pdxJ   TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517278 517279 CV2071 CV2072   acpS TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517279 517280 CV2072 CV2073 acpS   TRUE 0.464 125.000 0.081 1.000 N NA
 517280 517281 CV2073 CV2074     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 517281 517282 CV2074 CV2075     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 517282 517283 CV2075 CV2076     FALSE 0.383 55.000 0.000 1.000   NA
 517283 517284 CV2076 CV2077     FALSE 0.204 94.000 0.000 1.000   NA
 517287 517288 CV2080 CV2081   mmsB FALSE 0.132 136.000 0.000 1.000 N NA
 517288 517289 CV2081 CV2082 mmsB paaG TRUE 0.994 23.000 0.687 1.000 Y NA
 517289 517290 CV2082 CV2083 paaG   TRUE 0.992 41.000 0.627 0.002 Y NA
 517290 517291 CV2083 CV2084   caiA TRUE 0.860 110.000 0.242 1.000 Y NA
 517291 517292 CV2084 CV2085 caiA mmsA1 TRUE 0.468 71.000 0.013 1.000 N NA
 517292 517293 CV2085 CV2086 mmsA1 paaH TRUE 0.484 40.000 0.000 1.000 N NA
 517294 517295 CV2087 CV2088   atoB TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000 N NA
 517295 517296 CV2088 CV2089 atoB   FALSE 0.014 430.000 0.000 1.000 N NA
 517297 517298 CV2090 CV2091     FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 517298 517299 CV2091 CV2092   rfaF TRUE 0.983 -22.000 0.008 1.000 N NA
 517299 517300 CV2092 CV2093 rfaF   TRUE 0.551 118.000 0.138 NA   NA
 517300 517301 CV2093 CV2094   ilvE TRUE 0.749 77.000 0.223 NA   NA
 517301 517302 CV2094 CV2095 ilvE glnE TRUE 0.481 112.000 0.078 1.000 N NA
 517303 517304 CV2096 CV2097     TRUE 0.996 -3.000 0.358 NA   NA
 517304 517305 CV2097 CV2098     TRUE 0.982 9.000 0.259 NA   NA
 517305 517306 CV2098 CV2099     FALSE 0.022 279.000 0.000 NA   NA
 517306 517307 CV2099 CV2100     FALSE 0.011 440.000 0.000 NA   NA
 517309 517310 CV2102 CV2103     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 517310 517311 CV2103 CV2104   cysC FALSE 0.037 215.000 0.000 NA   NA
 517311 517312 CV2104 CV2105 cysC   TRUE 0.992 -16.000 0.087 1.000   NA
 517312 517313 CV2105 CV2106     FALSE 0.405 52.000 0.000 1.000   NA
 517313 517314 CV2106 CV2107     FALSE 0.120 135.000 0.000 NA   NA
 517314 517315 CV2107 CV2108     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517315 517316 CV2108 CV2109     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517316 517317 CV2109 CV2110     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517318 517319 CV2111 CV2112     FALSE 0.085 155.000 0.000 NA   NA
 517319 517320 CV2112 CV2113     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 517320 517321 CV2113 CV2114     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517321 517322 CV2114 CV2115     FALSE 0.009 652.000 0.000 NA   NA
 517322 517323 CV2115 CV2116     FALSE 0.013 394.000 0.000 NA   NA
 517323 517324 CV2116 CV2117     FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 517324 517325 CV2117 CV2118     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 517325 517326 CV2118 CV2119     TRUE 0.996 -12.000 0.231 NA   NA
 517326 517327 CV2119 CV2120     TRUE 0.993 0.000 0.308 NA   NA
 517327 517328 CV2120 CV2121     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517331 517332 CV2124 CV2125     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517332 517333 CV2125 CV2126     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 517334 517335 CV2127 CV2128     TRUE 0.974 3.000 0.100 NA   NA
 517335 517336 CV2128 CV2129     TRUE 0.997 2.000 0.750 NA   NA
 517336 517337 CV2129 CV2130     TRUE 0.966 48.000 0.750 NA   NA
 517337 517338 CV2130 CV2131     TRUE 0.978 0.000 0.073 NA   NA
 517338 517339 CV2131 CV2132     TRUE 0.988 2.000 0.220 NA   NA
 517339 517340 CV2132 CV2133     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517340 517341 CV2133 CV2134     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 517341 517342 CV2134 CV2135     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 517342 517343 CV2135 CV2136     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA   NA
 517343 517344 CV2136 CV2137     FALSE 0.013 397.000 0.000 NA   NA
 517344 517345 CV2137 CV2138     TRUE 0.999 -3.000 0.818 NA   NA
 517345 517346 CV2138 CV2139     TRUE 0.997 -7.000 0.300 NA   NA
 517346 517347 CV2139 CV2140     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517347 517348 CV2140 CV2141     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517348 517349 CV2141 CV2142     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517349 517350 CV2142 CV2143     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 517350 517351 CV2143 CV2144     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517351 517352 CV2144 CV2145     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 517352 517353 CV2145 CV2146     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 517353 517354 CV2146 CV2147     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517354 517355 CV2147 CV2148     FALSE 0.160 110.000 0.000 NA   NA
 517355 517356 CV2148 CV2149     FALSE 0.378 51.000 0.000 NA   NA
 517356 517357 CV2149 CV2150     TRUE 0.441 135.000 0.111 NA   NA
 517360 517361 CV2153 CV2154     TRUE 0.996 -3.000 0.300 NA   NA
 517361 517362 CV2154 CV2155     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 517362 517363 CV2155 CV2156     TRUE 0.937 12.000 0.080 NA   NA
 517363 517364 CV2156 CV2157     TRUE 0.993 12.000 0.571 0.029   NA
 517364 517365 CV2157 CV2158     TRUE 0.969 2.000 0.057 NA   NA
 517365 517366 CV2158 CV2159     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 517366 517367 CV2159 CV2160     TRUE 0.956 -6.000 0.000 NA   NA
 517367 517368 CV2160 CV2161     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517368 517369 CV2161 CV2162     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 517369 517370 CV2162 CV2163   hupB2 FALSE 0.400 47.000 0.000 NA   NA
 517370 517371 CV2163 CV2164 hupB2   FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 517371 517372 CV2164 CV2165     TRUE 0.986 -3.000 0.071 NA   NA
 517372 517373 CV2165 CV2166     FALSE 0.082 157.000 0.000 NA   NA
 517374 517375 CV2167 CV2168 maeN leuD1 TRUE 0.641 63.000 0.054 1.000 N NA
 517375 517376 CV2168 CV2169 leuD1 leuC2 TRUE 0.998 -3.000 0.116 0.001 Y NA
 517378 517379 CV2171 CV2172   algC FALSE 0.213 89.000 0.000 1.000 N NA
 517379 517380 CV2172 CV2173 algC trpD FALSE 0.363 58.000 0.000 1.000 N NA
 517380 517381 CV2173 CV2174 trpD   TRUE 0.842 13.000 0.004 NA   NA
 517381 517382 CV2174 CV2175   pabA TRUE 0.962 0.000 0.017 NA   NA
 517382 517383 CV2175 CV2176 pabA   FALSE 0.013 401.000 0.000 NA N NA
 517384 517385 CV2177 CV2178     FALSE 0.313 66.000 0.000 1.000 N NA
 517386 517387 CV2179 CV2180 trpE gph TRUE 0.645 130.000 0.233 1.000   NA
 517387 517388 CV2180 CV2181 gph   TRUE 0.545 56.000 0.000 0.055   NA
 517388 517389 CV2181 CV2182   rpe TRUE 0.476 41.000 0.000 1.000 N NA
 517390 517391 CV2183 CV2184 apaG   FALSE 0.059 177.000 0.000 NA N NA
 517391 517392 CV2184 CV2185     FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 517393 517394 CV2186 CV2187     FALSE 0.152 121.000 0.000 NA   NA
 517394 517395 CV2187 CV2188   pphA FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 517395 517396 CV2188 CV2189 pphA   TRUE 0.608 25.000 0.000 1.000   NA
 517396 517397 CV2189 CV2190     TRUE 0.578 28.000 0.000 1.000   NA
 517397 517398 CV2190 CV2191     FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 517398 517399 CV2191 CV2192   rluD TRUE 0.995 -10.000 0.168 NA   NA
 517402 517403 CV2195 CV2196   rpsB FALSE 0.091 150.000 0.000 NA   NA
 517403 517404 CV2196 CV2197 rpsB tsf TRUE 0.973 74.000 0.748 1.000 Y NA
 517404 517405 CV2197 CV2198 tsf pyrH TRUE 0.469 92.000 0.047 1.000 N NA
 517405 517406 CV2198 CV2199 pyrH frr TRUE 0.552 76.000 0.058 1.000 N NA
 517406 517407 CV2199 CV2200 frr uppS TRUE 0.989 10.000 0.409 1.000 N NA
 517407 517408 CV2200 CV2201 uppS cdsA TRUE 0.997 5.000 0.400 1.000 Y NA
 517408 517409 CV2201 CV2202 cdsA dxr TRUE 0.990 17.000 0.372 1.000 Y NA
 517409 517410 CV2202 CV2203 dxr   TRUE 0.999 -6.000 0.568 1.000 N NA
 517410 517411 CV2203 CV2204     TRUE 0.992 10.000 0.204 1.000 Y NA
 517411 517412 CV2204 CV2205   ompH TRUE 0.988 19.000 0.354 1.000 Y NA
 517412 517413 CV2205 CV2206 ompH lpxD TRUE 0.988 52.000 0.814 1.000 Y NA
 517413 517414 CV2206 CV2207 lpxD fabZ TRUE 0.999 -7.000 0.796 1.000 N NA
 517414 517415 CV2207 CV2208 fabZ lpxA TRUE 0.998 3.000 0.850 1.000 N NA
 517415 517416 CV2208 CV2209 lpxA lpxB TRUE 0.987 17.000 0.289 1.000 Y NA
 517416 517417 CV2209 CV2210 lpxB rnhB TRUE 0.995 -9.000 0.186 1.000 N NA
 517417 517418 CV2210 CV2211 rnhB   TRUE 0.983 2.000 0.004 NA Y NA
 517418 517419 CV2211 CV2212     TRUE 0.525 30.000 0.000 NA   NA
 517420 517421 CV2213 CV2214     TRUE 0.869 5.000 0.000 1.000   NA
 517421 517422 CV2214 CV2215     TRUE 0.588 27.000 0.000 1.000   NA
 517422 517423 CV2215 CV2216     FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 517424 517425 CV2217 CV2218     FALSE 0.021 314.000 0.000 1.000   NA
 517425 517426 CV2218 CV2219     TRUE 0.766 76.000 0.143 0.040   NA
 517426 517427 CV2219 CV2220     TRUE 0.952 34.000 0.429 NA   NA
 517429 517430 CV2222 CV2223     FALSE 0.010 514.000 0.000 NA   NA
 517430 517431 CV2223 CV2224     FALSE 0.171 121.000 0.000 1.000   NA
 517431 517432 CV2224 CV2225     FALSE 0.333 63.000 0.000 1.000 N NA
 517432 517433 CV2225 CV2226   nasT FALSE 0.189 101.000 0.000 1.000 N NA
 517433 517434 CV2226 CV2227 nasT nasF TRUE 0.978 10.000 0.218 NA   NA
 517434 517435 CV2227 CV2228 nasF nasA FALSE 0.106 141.000 0.000 NA   NA
 517435 517436 CV2228 CV2229 nasA napA FALSE 0.179 170.000 0.022 1.000 N NA
 517438 517439 CV2231 CV2232 fes   FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 517439 517440 CV2232 CV2233   cbsF FALSE 0.393 48.000 0.000 NA   NA
 517441 517442 CV2234 CV2235 fepC fepG TRUE 0.995 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 517442 517443 CV2235 CV2236 fepG fepD TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.055 Y NA
 517445 517446 CV2238 CV2239   fepB FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 517447 517448 CV2240 CV2241   acrB TRUE 0.967 4.000 0.067 1.000 N NA
 517448 517449 CV2241 CV2242 acrB ibeB TRUE 0.996 -3.000 0.200 0.055 N NA
 517450 517451 CV2243 CV2244   nfnB TRUE 0.455 39.000 0.000 NA N NA
 517451 517452 CV2244 CV2245 nfnB nemA2 TRUE 0.929 22.000 0.000 0.026 Y NA
 517453 517454 CV2246 CV2247   talC TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 517454 517455 CV2247 CV2248 talC fucP TRUE 0.902 20.000 0.000 1.000 Y NA
 517455 517456 CV2248 CV2249 fucP   FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 517458 517459 CV2251 CV2252 fhuA   FALSE 0.031 233.000 0.000 NA   NA
 517461 517462 CV2254 CV2255   maa FALSE 0.013 411.000 0.000 NA   NA
 517462 517463 CV2255 CV2256 maa argD TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000   NA
 517463 517464 CV2256 CV2257 argD   TRUE 0.631 71.000 0.000 NA Y NA
 517464 517465 CV2257 CV2258     TRUE 0.521 96.000 0.000 NA Y NA
 517465 517466 CV2258 CV2259     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 517466 517467 CV2259 CV2260     TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 517467 517468 CV2260 CV2261     TRUE 0.661 20.000 0.000 1.000   NA
 517468 517469 CV2261 CV2262     FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 517469 517470 CV2262 CV2263     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 517470 517471 CV2263 CV2264     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 517471 517472 CV2264 CV2265     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 517472 517473 CV2265 CV2266     FALSE 0.014 371.000 0.000 NA   NA
 517474 517475 CV2267 CV2268     FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 517475 517476 CV2268 CV2269     FALSE 0.018 315.000 0.000 NA   NA
 517477 517478 CV2270 CV2271     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 517478 517479 CV2271 CV2272     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 517479 517480 CV2272 CV2273     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 517484 517485 CV2277 CV2278     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA   NA
 517486 517487 CV2279 CV2280     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 517487 517488 CV2280 CV2281     TRUE 0.876 68.000 0.400 NA   NA
 517490 517491 CV2283 CV2284   nrdB FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 517491 517492 CV2284 CV2285 nrdB   FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 517492 517493 CV2285 CV2286     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 517493 517494 CV2286 CV2287   nrdA FALSE 0.036 217.000 0.000 NA   NA
 517494 517495 CV2287 CV2288 nrdA   FALSE 0.011 445.000 0.000 NA   NA
 517496 517497 CV2289 CV2290     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 517497 517498 CV2290 CV2291     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 517502 517503 CV2295 CV2296     TRUE 0.994 1.000 0.135 1.000 Y NA
 517503 517504 CV2296 CV2297     TRUE 0.981 25.000 0.308 NA Y NA
 517504 517505 CV2297 CV2298   gyrA FALSE 0.022 281.000 0.000 NA N NA
 517505 517506 CV2298 CV2299 gyrA   TRUE 0.943 0.000 0.002 NA N NA
 517506 517507 CV2299 CV2300     TRUE 1.000 -3.000 0.845 NA Y NA
 517507 517508 CV2300 CV2301   serC FALSE 0.216 131.000 0.004 NA N NA
 517509 517510 CV2302 CV2303     FALSE 0.016 344.000 0.000 NA   NA
 517510 517511 CV2303 CV2304   mccF FALSE 0.189 90.000 0.000 NA N NA
 517511 517512 CV2304 CV2305 mccF   FALSE 0.139 129.000 0.000 NA N NA
 517513 517514 CV2306 CV2307 cysD cysN TRUE 0.971 0.000 0.000 0.000 N NA
 517516 517517 CV2309 CV2310 frwC frwB TRUE 0.984 33.000 0.278 0.002 Y NA
 517517 517518 CV2310 CV2311 frwB ptsA TRUE 0.979 44.000 0.286 0.002 Y NA
 517518 517519 CV2311 CV2312 ptsA manA TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 517519 517520 CV2312 CV2313 manA   TRUE 0.456 44.000 0.000 1.000   NA
 517521 517522 CV2314 CV2315     FALSE 0.027 253.000 0.000 NA   NA
 517526 517527 CV2319 CV2320     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517527 517528 CV2320 CV_tRNASerTGA     FALSE 0.038 212.000 0.000 NA   NA
 517528 517529 CV_tRNASerTGA CV2321   recN FALSE 0.400 47.000 0.000 NA   NA
 517529 517530 CV2321 CV2322 recN   TRUE 0.935 20.000 0.170 1.000 N NA
 517530 517531 CV2322 CV2323     TRUE 0.831 10.000 0.000 1.000 N NA
 517531 517532 CV2323 CV2324     TRUE 0.995 0.000 0.059 0.073 Y NA
 517532 517533 CV2324 CV2325   msrA FALSE 0.009 1119.000 0.000 1.000 N NA
 517533 517534 CV2325 CV2326 msrA   FALSE 0.141 128.000 0.000 NA N NA
 517534 517535 CV2326 CV2327     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 517535 517536 CV2327 CV2328     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 517537 517538 CV2329 CV2330     FALSE 0.048 204.000 0.000 1.000 N NA
 517539 517540 CV2331 CV2332   umuD TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 517541 517542 CV2333 CV2334   map2 TRUE 0.997 -3.000 0.410 NA   NA
 517542 517543 CV2334 CV2335 map2   TRUE 0.865 4.000 0.000 NA N NA
 517544 517545 CV2336 CV2337     FALSE 0.016 329.000 0.000 NA   NA
 517545 517546 CV2337 CV2338     TRUE 0.952 1.000 0.000 0.055   NA
 517546 517547 CV2338 CV2339     TRUE 0.635 42.000 0.000 0.055   NA
 517548 517549 CV2340 CV2341     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA   NA
 517552 517553 CV2344 CV2345     FALSE 0.020 315.000 0.000 1.000   NA
 517553 517554 CV2345 CV2346     TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000   NA
 517555 517556 CV2347 CV2348   mglA TRUE 0.858 112.000 0.586 1.000   NA
 517556 517557 CV2348 CV2349 mglA   TRUE 0.698 81.000 0.184 1.000   NA
 517557 517558 CV2349 CV2350     TRUE 0.998 2.000 0.720 0.054   NA
 517558 517559 CV2350 CV2351   moeA FALSE 0.214 89.000 0.000 1.000   NA
 517560 517561 CV2352 CV2353   dsbD FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 517562 517563 CV2354 CV2355   pheA FALSE 0.117 136.000 0.000 NA   NA
 517563 517564 CV2355 CV2356 pheA   TRUE 0.867 11.000 0.003 NA   NA
 517564 517565 CV2356 CV2357     TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 517565 517566 CV2357 CV2358     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517566 517567 CV2358 CV2359     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA N NA
 517567 517568 CV2359 CV2360     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 517568 517569 CV2360 CV2361   mtrA FALSE 0.023 293.000 0.000 1.000   NA
 517569 517570 CV2361 CV2362 mtrA fkpA FALSE 0.412 51.000 0.000 1.000   NA
 517571 517572 CV2363 CV2364   phaB FALSE 0.308 62.000 0.000 NA N NA
 517572 517573 CV2364 CV2365 phaB   FALSE 0.164 126.000 0.000 1.000   NA
 517573 517574 CV2365 CV2366     TRUE 0.982 -3.000 0.034 1.000   NA
 517574 517575 CV2366 CV2367     TRUE 0.986 -3.000 0.059 1.000 N NA
 517576 517577 CV2368 CV2369 orn pgi1 FALSE 0.400 73.000 0.005 1.000 N NA
 517577 517578 CV2369 CV2370 pgi1 cinA TRUE 0.995 -10.000 0.200 NA   NA
 517578 517579 CV2370 CV2371 cinA   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517580 517581 CV2372 CV2373 xerC   TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000   NA
 517581 517582 CV2373 CV2374     TRUE 0.474 65.000 0.010 NA   NA
 517582 517583 CV2374 CV2375     TRUE 0.859 19.000 0.042 NA   NA
 517585 517586 CV2377 CV2378     FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 517587 517588 CV2379 CV2380 argE   FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000   NA
 517590 517591 CV2382 CV2383 tyrB1   FALSE 0.016 350.000 0.000 NA   NA
 517592 517593 CV2384 CV2385     TRUE 0.573 70.000 0.045 1.000 N NA
 517593 517594 CV2385 CV2386   prfC TRUE 0.902 8.000 0.003 1.000 N NA
 517595 517596 CV2387 CV2388 ribE   TRUE 0.964 -3.000 0.002 NA   NA
 517596 517597 CV2388 CV2389   ribAB TRUE 0.777 30.000 0.034 NA   NA
 517597 517598 CV2389 CV2390 ribAB ribH TRUE 0.910 61.000 0.051 0.002 Y NA
 517598 517599 CV2390 CV2391 ribH nusB TRUE 0.829 77.000 0.347 1.000 N NA
 517599 517600 CV2391 CV2392 nusB thiL FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000 N NA
 517600 517601 CV2392 CV2393 thiL pgpA TRUE 0.983 -16.000 0.008 1.000 N NA
 517601 517602 CV2393 CV2394 pgpA   FALSE 0.139 134.000 0.000 1.000 N NA
 517603 517604 CV2395 CV2396     FALSE 0.274 72.000 0.000 1.000 N NA
 517604 517605 CV2396 CV2397   map1 TRUE 0.441 46.000 0.000 1.000 N NA
 517605 517606 CV2397 CV2398 map1   FALSE 0.231 80.000 0.000 1.000 N NA
 517608 517609 CV2400 CV2401 evgS rcsB TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 517609 517610 CV2401 CV2402 rcsB   FALSE 0.095 148.000 0.000 NA   NA
 517611 517612 CV2403 CV2404     FALSE 0.010 505.000 0.000 NA   NA
 517612 517613 CV2404 CV2405     FALSE 0.168 101.000 0.000 NA   NA
 517613 517614 CV2405 CV2406     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 517614 517615 CV2406 CV2407     TRUE 0.584 24.000 0.000 NA   NA
 517616 517617 CV2408 CV2409     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 517620 517621 CV2412 CV2413 nrdD nrdG TRUE 0.991 8.000 0.464 1.000 N NA
 517621 517622 CV2413 CV2414 nrdG   FALSE 0.087 163.000 0.000 1.000   NA
 517622 517623 CV2414 CV2415     FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 517623 517624 CV2415 CV2416     TRUE 0.564 26.000 0.000 NA   NA
 517625 517626 CV2417 CV2418     TRUE 0.998 -6.000 0.400 NA   NA
 517626 517627 CV2418 CV2419     TRUE 0.998 5.000 1.000 NA   NA
 517627 517628 CV2419 CV2420   prgK TRUE 0.996 -7.000 0.238 1.000   NA
 517628 517629 CV2420 CV2421 prgK prgJ TRUE 0.996 -3.000 0.286 1.000   NA
 517629 517630 CV2421 CV2422 prgJ prgI TRUE 0.979 45.000 0.667 0.004   NA
 517630 517631 CV2422 CV2423 prgI prgH TRUE 0.985 19.000 0.667 NA   NA
 517631 517632 CV2423 CV2424 prgH gstA FALSE 0.059 177.000 0.000 NA   NA
 517633 517634 CV2425 CV2426     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 517638 517639 CV2430 CV2431     FALSE 0.043 202.000 0.000 NA   NA
 517639 517640 CV2431 CV2432     FALSE 0.378 51.000 0.000 NA   NA
 517640 517641 CV2432 CV2433     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 517641 517642 CV2433 CV2434     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 517642 517643 CV2434 CV2435     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 517644 517645 CV2436 CV2437     TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 517646 517647 CV2438 CV2439 arsR arsC TRUE 0.701 17.000 0.000 1.000 N NA
 517647 517648 CV2439 CV2440 arsC arsB TRUE 0.434 47.000 0.000 1.000 N NA
 517649 517650 CV2441 CV2442     FALSE 0.011 443.000 0.000 NA   NA
 517650 517651 CV2442 CV2443     FALSE 0.009 765.000 0.000 NA   NA
 517652 517653 CV2444 CV2445     FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 517653 517654 CV2445 CV2446     FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 517654 517655 CV2446 CV2447     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA N NA
 517655 517656 CV2447 CV2448     FALSE 0.189 230.000 0.133 1.000   NA
 517656 517657 CV2448 CV2449     TRUE 0.998 -6.000 0.550 NA   NA
 517657 517658 CV2449 CV2450     TRUE 0.984 -3.000 0.054 NA   NA
 517661 517662 CV2453 CV2454   pepQ FALSE 0.017 319.000 0.000 NA   NA
 517662 517663 CV2454 CV2455 pepQ vmrA FALSE 0.313 66.000 0.000 1.000 N NA
 517665 517666 CV2457 CV2458     TRUE 0.983 5.000 0.098 0.003 N NA
 517666 517667 CV2458 CV2459     TRUE 0.993 -3.000 0.113 0.071   NA
 517667 517668 CV2459 CV2460     TRUE 0.912 24.000 0.145 1.000   NA
 517668 517669 CV2460 CV2461     FALSE 0.066 172.000 0.000 NA   NA
 517671 517672 CV2463 CV2464     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 517673 517674 CV2465 CV2466   mxcB TRUE 0.962 -16.000 0.000 NA N NA
 517674 517675 CV2466 CV2467 mxcB   FALSE 0.020 295.000 0.000 NA   NA
 517675 517676 CV2467 CV2468     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 517677 517678 CV2469 CV2470   acnB FALSE 0.169 123.000 0.000 1.000   NA
 517680 517681 CV2472 CV2473 ddlA   FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 517681 517682 CV2473 CV2474     FALSE 0.354 129.000 0.043 NA   NA
 517682 517683 CV2474 CV2475   recJ FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 517683 517684 CV2475 CV2476 recJ   TRUE 0.922 9.000 0.018 NA   NA
 517685 517686 CV2477 CV2478     TRUE 0.778 21.000 0.006 1.000 N NA
 517686 517687 CV2478 CV2479   ftsK TRUE 0.559 50.000 0.004 1.000 N NA
 517687 517688 CV2479 CV2480 ftsK hemH TRUE 0.704 43.000 0.029 1.000 N NA
 517688 517689 CV2480 CV2481 hemH   FALSE 0.023 290.000 0.000 1.000 N NA
 517689 517690 CV2481 CV2482     FALSE 0.038 212.000 0.000 NA   NA
 517690 517691 CV2482 CV2483     FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 517691 517692 CV2483 CV2484     TRUE 0.999 -3.000 0.714 NA   NA
 517693 517694 CV2485 CV2486     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA N NA
 517694 517695 CV2486 CV2487     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA N NA
 517697 517698 CV2489 CV2490     TRUE 0.971 54.000 0.886 NA   NA
 517698 517699 CV2490 CV2491     TRUE 0.981 2.000 0.128 NA   NA
 517699 517700 CV2491 CV2492     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000 N NA
 517701 517702 CV2493 CV2494 ohr1   FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 517702 517703 CV2494 CV2495   fliC2 FALSE 0.012 431.000 0.000 NA   NA
 517703 517704 CV2495 CV2496 fliC2 rnk FALSE 0.088 162.000 0.000 1.000 N NA
 517705 517706 CV2497 CV2498   hik2 TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 517706 517707 CV2498 CV2499 hik2   FALSE 0.009 1028.000 0.000 1.000   NA
 517707 517708 CV2499 CV2500     TRUE 0.571 58.000 0.022 NA   NA
 517708 517709 CV2500 CV2501     TRUE 0.988 0.000 0.179 NA   NA
 517709 517710 CV2501 CV2502   dnaB TRUE 0.874 13.000 0.010 1.000 N NA
 517710 517711 CV2502 CV2503 dnaB   FALSE 0.251 76.000 0.000 1.000   NA
 517713 517714 CV2505 CV2506   cheB1 TRUE 0.999 3.000 0.667 0.019 Y NA
 517714 517715 CV2506 CV2507 cheB1 cheR1 TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 517715 517716 CV2507 CV2508 cheR1 cheW1 TRUE 0.991 16.000 0.400 1.000 Y NA
 517716 517717 CV2508 CV2509 cheW1   TRUE 0.998 12.000 0.600 0.013 Y NA
 517717 517718 CV2509 CV2510   cheA1 TRUE 0.994 31.000 0.667 0.013 Y NA
 517718 517719 CV2510 CV2511 cheA1   TRUE 0.998 -10.000 0.500 NA   NA
 517719 517720 CV2511 CV2512   cheY1 TRUE 0.985 14.000 0.500 NA   NA
 517720 517721 CV2512 CV2513 cheY1   TRUE 0.504 37.000 0.000 1.000   NA
 517721 517722 CV2513 CV2514     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 517722 517723 CV2514 CV2515   purF FALSE 0.145 132.000 0.000 1.000 N NA
 517723 517724 CV2515 CV2516 purF   TRUE 0.724 100.000 0.262 1.000   NA
 517724 517725 CV2516 CV2517   dedD TRUE 0.957 6.000 0.066 NA   NA
 517725 517726 CV2517 CV2518 dedD folC TRUE 0.962 8.000 0.100 NA   NA
 517726 517727 CV2518 CV2519 folC   FALSE 0.011 467.000 0.000 NA   NA
 517728 517729 CV2520 CV2521 abcZ   FALSE 0.179 111.000 0.000 1.000   NA
 517731 517732 CV2523 CV2524     FALSE 0.049 193.000 0.000 NA   NA
 517732 517733 CV2524 CV2525     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517733 517734 CV2525 CV2526     FALSE 0.338 57.000 0.000 NA   NA
 517734 517735 CV2526 CV2527   prtR TRUE 0.890 21.000 0.000 NA Y NA
 517735 517736 CV2527 CV2528 prtR dapF FALSE 0.114 138.000 0.000 NA N NA
 517736 517737 CV2528 CV2529 dapF   TRUE 0.805 57.000 0.175 NA   NA
 517737 517738 CV2529 CV2530     TRUE 0.974 -3.000 0.011 NA   NA
 517742 517743 CV2534 CV2535 narX narL TRUE 1.000 -3.000 0.686 0.024 Y NA
 517745 517746 CV2537 CV2538     FALSE 0.034 223.000 0.000 NA   NA
 517746 517747 CV2538 CV2539     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA   NA
 517748 517749 CV2540 CV2541 narI narJ TRUE 0.936 74.000 0.200 0.001 Y NA
 517749 517750 CV2541 CV2542 narJ narH TRUE 0.994 12.000 0.200 0.001 Y NA
 517750 517751 CV2542 CV2543 narH narG TRUE 0.998 -3.000 0.105 0.000 Y NA
 517751 517752 CV2543 CV2544 narG narK2 FALSE 0.127 284.000 0.125 1.000 N NA
 517752 517753 CV2544 CV2545 narK2 narK1 TRUE 0.993 21.000 0.458 0.054 Y NA
 517753 517754 CV2545 CV2546 narK1   FALSE 0.093 149.000 0.000 NA   NA
 517754 517755 CV2546 CV2547   pqiB TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517755 517756 CV2547 CV2548 pqiB pqiA TRUE 0.998 -10.000 0.400 NA   NA
 517756 517757 CV2548 CV2549 pqiA   TRUE 0.988 -3.000 0.098 NA   NA
 517757 517758 CV2549 CV2550     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 517758 517759 CV2550 CV2551     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 517761 517762 CV2553 CV_tRNAAspGTC1     FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 517762 517763 CV_tRNAAspGTC1 CV_tRNAValTAC1     TRUE 0.827 8.000 0.000 NA   NA
 517763 517764 CV_tRNAValTAC1 CV2554   hupB1 FALSE 0.388 49.000 0.000 NA   NA
 517764 517765 CV2554 CV2555 hupB1 lon FALSE 0.185 174.000 0.033 1.000 N NA
 517767 517768 CV2557 CV2558 clpX clpP TRUE 0.989 17.000 0.352 1.000 Y NA
 517768 517769 CV2558 CV2559 clpP tig TRUE 0.986 22.000 0.351 1.000 Y NA
 517773 517774 CV2563 CV2564     TRUE 0.891 3.000 0.000 1.000   NA
 517774 517775 CV2564 CV2565     FALSE 0.037 230.000 0.000 1.000   NA
 517777 517778 CV2567 CV2568     FALSE 0.314 66.000 0.000 1.000   NA
 517779 517780 CV2569 CV2570 iciA cdd TRUE 0.626 23.000 0.000 1.000 N NA
 517780 517781 CV2570 CV2571 cdd lasA FALSE 0.086 164.000 0.000 1.000   NA
 517784 517785 CV2574 CV2575 sseE sseD TRUE 0.886 62.000 0.375 NA   NA
 517785 517786 CV2575 CV2576 sseD   FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 517786 517787 CV2576 CV2577   sseC TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 517787 517788 CV2577 CV2578 sseC cesD TRUE 0.986 18.000 0.632 1.000   NA
 517788 517789 CV2578 CV2579 cesD   TRUE 0.703 66.000 0.118 NA   NA
 517789 517790 CV2579 CV2580     FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 517790 517791 CV2580 CV2581     TRUE 0.933 31.000 0.286 NA   NA
 517791 517792 CV2581 CV2582     TRUE 0.815 71.000 0.286 NA   NA
 517792 517793 CV2582 CV2583     FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 517794 517795 CV2584 CV2585   ssaG TRUE 0.961 10.000 0.100 1.000   NA
 517795 517796 CV2585 CV2586 ssaG   TRUE 0.998 -3.000 0.650 NA   NA
 517796 517797 CV2586 CV2587     TRUE 0.966 23.000 0.407 NA   NA
 517797 517798 CV2587 CV2588   ssaJ TRUE 0.997 0.000 0.407 0.011   NA
 517798 517799 CV2588 CV2589 ssaJ   TRUE 0.999 -3.000 0.786 NA   NA
 517799 517800 CV2589 CV2590   ssaL FALSE 0.056 182.000 0.000 NA   NA
 517801 517802 CV2591 CV2592   cpbD TRUE 0.510 36.000 0.000 1.000   NA
 517802 517803 CV2592 CV2593 cpbD   FALSE 0.015 413.000 0.000 1.000   NA
 517803 517804 CV2593 CV2594     FALSE 0.114 138.000 0.000 NA   NA
 517804 517805 CV2594 CV2595     FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 517805 517806 CV2595 CV2596     TRUE 0.918 21.000 0.146 NA   NA
 517806 517807 CV2596 CV2597   escC TRUE 0.973 13.000 0.268 NA   NA
 517807 517808 CV2597 CV2598 escC   TRUE 0.991 -3.000 0.143 NA   NA
 517811 517812 CV2601 CV2602 ssaM escV TRUE 0.964 0.000 0.000 0.011   NA
 517812 517813 CV2602 CV2603 escV   TRUE 0.999 2.000 0.647 0.009 Y NA
 517813 517814 CV2603 CV2604     TRUE 0.983 3.000 0.176 NA   NA
 517814 517815 CV2604 CV2605     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 517815 517816 CV2605 CV2606   pscQ TRUE 0.710 71.000 0.154 NA   NA
 517816 517817 CV2606 CV2607 pscQ escR TRUE 0.845 83.000 0.154 1.000 Y NA
 517817 517818 CV2607 CV2608 escR escS TRUE 0.992 16.000 0.273 0.011 Y NA
 517818 517819 CV2608 CV2609 escS escT TRUE 0.999 2.000 0.516 0.054 Y NA
 517819 517820 CV2609 CV2610 escT escU TRUE 0.999 -3.000 0.406 0.054 Y NA
 517820 517821 CV2610 CV2611 escU slt TRUE 0.558 101.000 0.125 NA   NA
 517821 517822 CV2611 CV2612 slt umuC TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 517823 517824 CV2613 CV2614     FALSE 0.065 173.000 0.000 NA   NA
 517824 517825 CV2614 CV2615   iacP FALSE 0.221 85.000 0.000 1.000   NA
 517825 517826 CV2615 CV2616 iacP sipA TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 517826 517827 CV2616 CV2617 sipA sipD TRUE 0.921 20.000 0.143 NA   NA
 517827 517828 CV2617 CV2618 sipD sipC TRUE 0.731 142.000 0.286 0.004   NA
 517828 517829 CV2618 CV2619 sipC sipB FALSE 0.327 209.000 0.125 0.004   NA
 517829 517830 CV2619 CV2620 sipB spaT TRUE 0.997 -3.000 0.375 1.000   NA
 517830 517831 CV2620 CV2621 spaT spaS TRUE 0.794 116.000 0.409 1.000   NA
 517831 517832 CV2621 CV2622 spaS spaR TRUE 0.999 2.000 0.682 0.054 Y NA
 517832 517833 CV2622 CV2623 spaR spaQ TRUE 0.999 4.000 1.000 0.054 Y NA
 517833 517834 CV2623 CV2624 spaQ spaP TRUE 0.979 98.000 0.833 0.011 Y NA
 517834 517835 CV2624 CV2625 spaP spaO TRUE 0.999 -10.000 0.625 1.000   NA
 517835 517836 CV2625 CV2626 spaO spaN TRUE 0.993 -3.000 0.188 NA   NA
 517836 517837 CV2626 CV2627 spaN spaM TRUE 0.999 -12.000 0.571 NA   NA
 517837 517838 CV2627 CV2628 spaM invC TRUE 0.962 -16.000 0.000 NA   NA
 517838 517839 CV2628 CV2629 invC invB TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 517839 517840 CV2629 CV2630 invB invA TRUE 0.981 16.000 0.300 0.011   NA
 517840 517841 CV2630 CV2631 invA invE TRUE 0.875 62.000 0.320 1.000   NA
 517841 517842 CV2631 CV2632 invE invG TRUE 0.994 1.000 0.360 1.000   NA
 517842 517843 CV2632 CV2633 invG invF TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 N NA
 517843 517844 CV2633 CV2634 invF armS FALSE 0.009 867.000 0.000 1.000 N NA
 517844 517845 CV2634 CV2635 armS   TRUE 0.998 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 517846 517847 CV2636 CV2637   dsbG FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 517848 517849 CV2638 CV2639     FALSE 0.016 334.000 0.000 NA   NA
 517850 517851 CV2640 CV2641 hilA iagB TRUE 0.990 0.000 0.200 1.000   NA
 517854 517855 CV2643 CV2644     TRUE 0.895 34.000 0.000 0.018 Y NA
 517855 517856 CV2644 CV2645     TRUE 0.960 8.000 0.000 NA Y NA
 517856 517857 CV2645 CV2646     TRUE 0.660 67.000 0.000 NA Y NA
 517858 517859 CV2647 CV2648   dsdA FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 517859 517860 CV2648 CV2649 dsdA dsdC TRUE 0.944 6.000 0.028 1.000 N NA
 517863 517864 CV2652 CV2653   csaA TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 517864 517865 CV2653 CV2654 csaA   FALSE 0.245 77.000 0.000 1.000   NA
 517865 517866 CV2654 CV2655     FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000   NA
 517866 517867 CV2655 CV2656     FALSE 0.051 200.000 0.000 1.000   NA
 517867 517868 CV2656 CV2657     FALSE 0.126 139.000 0.000 1.000   NA
 517868 517869 CV2657 CV2658     FALSE 0.014 385.000 0.000 NA   NA
 517869 517870 CV2658 CV2659     TRUE 0.461 38.000 0.000 NA   NA
 517870 517871 CV2659 CV2660     FALSE 0.148 125.000 0.000 NA   NA
 517871 517872 CV2660 CV2661     FALSE 0.022 283.000 0.000 NA   NA
 517872 517873 CV2661 CV2662   chaA FALSE 0.008 806.000 0.000 NA   NA
 517874 517875 CV2663 CV2664     FALSE 0.009 661.000 0.000 NA   NA
 517875 517876 CV2664 CV2665     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 517876 517877 CV2665 CV2666     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517881 517882 CV2670 CV2671     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 517882 517883 CV2671 CV2672     FALSE 0.030 237.000 0.000 NA   NA
 517883 517884 CV2672 CV2673     FALSE 0.270 199.000 0.167 NA   NA
 517885 517886 CV2674 CV2675   bscC TRUE 0.865 15.000 0.000 0.010   NA
 517886 517887 CV2675 CV2676 bscC bscZ TRUE 0.982 -3.000 0.035 1.000 N NA
 517887 517888 CV2676 CV2677 bscZ bcsB TRUE 0.921 0.000 0.000 1.000   NA
 517888 517889 CV2677 CV2678 bcsB bscA TRUE 0.761 33.000 0.000 0.001   NA
 517889 517890 CV2678 CV2679 bscA   TRUE 0.998 -3.000 0.545 NA N NA
 517890 517891 CV2679 CV2680   emrE FALSE 0.020 293.000 0.000 NA N NA
 517891 517892 CV2680 CV2681 emrE   TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 517896 517897 CV2685 CV2686     TRUE 0.952 11.000 0.091 1.000   NA
 517897 517898 CV2686 CV2687     TRUE 0.998 14.000 0.738 0.053 Y NA
 517898 517899 CV2687 CV2688     TRUE 0.914 52.000 0.048 0.053 Y NA
 517899 517900 CV2688 CV2689     FALSE 0.065 180.000 0.000 1.000   NA
 517901 517902 CV2690 CV2691 xseB ispA TRUE 0.995 -10.000 0.177 1.000 N NA
 517902 517903 CV2691 CV2692 ispA dxs TRUE 0.922 69.000 0.246 1.000 Y NA
 517904 517905 CV2693 CV2694   pepD FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 517905 517906 CV2694 CV2695 pepD   FALSE 0.148 125.000 0.000 NA   NA
 517906 517907 CV2695 CV2696     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 517907 517908 CV2696 CV2697     TRUE 0.986 0.000 0.140 NA   NA
 517908 517909 CV2697 CV2698     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 517910 517911 CV2699 CV2700     FALSE 0.338 57.000 0.000 NA   NA
 517912 517913 CV2701 CV2702     FALSE 0.162 107.000 0.000 NA   NA
 517913 517914 CV2702 CV2703     FALSE 0.011 444.000 0.000 NA   NA
 517914 517915 CV2703 CV2704     TRUE 0.985 10.000 0.216 0.089 N NA
 517915 517916 CV2704 CV2705     TRUE 0.999 -3.000 0.789 0.089 N NA
 517916 517917 CV2705 CV2706     FALSE 0.215 88.000 0.000 1.000 N NA
 517918 517919 CV2707 CV2708     FALSE 0.064 182.000 0.000 1.000 N NA
 517920 517921 CV2709 CV2710     FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 517921 517922 CV2710 CV2711     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 517924 517925 CV2713 CV2714 lipH   TRUE 0.996 2.000 0.587 1.000   NA
 517925 517926 CV2714 CV2715     FALSE 0.082 168.000 0.000 1.000   NA
 517927 517928 CV2716 CV2717     FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 517928 517929 CV2717 CV2718     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 517930 517931 CV2719 CV2720 fadA fadB TRUE 0.810 195.000 0.588 1.000 Y NA
 517931 517932 CV2720 CV2721 fadB   FALSE 0.064 422.000 0.000 1.000 Y NA
 517932 517933 CV2721 CV2722     FALSE 0.238 178.000 0.000 NA Y NA
 517933 517934 CV2722 CV2723     TRUE 0.484 114.000 0.000 NA Y NA
 517934 517935 CV2723 CV2724     FALSE 0.256 75.000 0.000 1.000 N NA
 517935 517936 CV2724 CV2725   metZ FALSE 0.053 199.000 0.000 1.000 N NA
 517936 517937 CV2725 CV2726 metZ   FALSE 0.085 164.000 0.000 1.000 N NA
 517937 517938 CV2726 CV2727     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 517938 517939 CV2727 CV2728     FALSE 0.072 167.000 0.000 NA   NA
 517939 517940 CV2728 CV2729     FALSE 0.155 117.000 0.000 NA N NA
 517940 517941 CV2729 CV2730   lysP FALSE 0.163 105.000 0.000 NA N NA
 517941 517942 CV2730 CV2731 lysP kup1 FALSE 0.031 249.000 0.000 1.000 N NA
 517943 517944 CV2732 CV2733     TRUE 0.973 16.000 0.350 NA N NA
 517944 517945 CV2733 CV2734     TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y NA
 517946 517947 CV2735 CV2736     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 517947 517948 CV2736 CV2737     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 517949 517950 CV2738 CV2739     TRUE 0.999 -3.000 0.833 NA   NA
 517950 517951 CV2739 CV2740     TRUE 0.992 20.000 1.000 NA   NA
 517953 517954 CV2742 CV2743     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 517955 517956 CV2744 CV2745     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 517957 517958 CV2746 CV2747   kdsA FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 517959 517960 CV2748 CV2749     FALSE 0.045 294.000 0.000 0.053   NA
 517962 517963 CV2751 CV2752     FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000   NA
 517963 517964 CV2752 CV2753     FALSE 0.022 304.000 0.000 1.000   NA
 517965 517966 CV2754 CV2755   nuoB1 TRUE 0.718 44.000 0.038 1.000 N NA
 517968 517969 CV2757 CV2758 gcp   TRUE 0.434 47.000 0.000 1.000   NA
 517969 517970 CV2758 CV2759     TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000   NA
 517971 517972 CV2760 CV2761 accD trpA TRUE 0.760 78.000 0.232 1.000 N NA
 517972 517973 CV2761 CV_2762 trpA trpB TRUE 0.996 12.000 0.344 0.000 Y NA
 517973 517974 CV_2762 CV2763 trpB trpF TRUE 1.000 -13.000 0.375 0.001 Y NA
 517974 517975 CV2763 CV2764 trpF truA TRUE 0.871 35.000 0.139 1.000 N NA
 517975 517976 CV2764 CV2765 truA   FALSE 0.130 169.000 0.003 1.000 N NA
 517976 517977 CV2765 CV2766     FALSE 0.067 1258.000 0.000 0.010 Y NA
 517977 517978 CV2766 CV2767   usg FALSE 0.102 151.000 0.000 1.000 N NA
 517978 517979 CV2767 CV2768 usg asd TRUE 0.748 130.000 0.025 0.000 Y NA
 517979 517980 CV2768 CV2769 asd   FALSE 0.011 488.000 0.000 NA   NA
 517980 517981 CV2769 CV2770     FALSE 0.020 292.000 0.000 NA   NA
 517981 517982 CV2770 CV2771     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 517984 517985 CV2773 CV2774     FALSE 0.017 322.000 0.000 NA   NA
 517985 517986 CV2774 CV2775     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 517986 517987 CV2775 CV2776     FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 517987 517988 CV2776 CV2777     FALSE 0.203 82.000 0.000 NA   NA
 517988 517989 CV2777 CV2778   leuB FALSE 0.033 227.000 0.000 NA   NA
 517989 517990 CV2778 CV2779 leuB   TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 517990 517991 CV2779 CV2780     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 517991 517992 CV2780 CV2781     FALSE 0.166 125.000 0.000 1.000   NA
 517992 517993 CV2781 CV2782   leuD2 FALSE 0.142 133.000 0.000 1.000   NA
 517993 517994 CV2782 CV2783 leuD2   TRUE 0.544 32.000 0.000 1.000   NA
 517994 517995 CV2783 CV2784   leuC1 FALSE 0.152 130.000 0.000 1.000   NA
 517997 517998 CV2786 CV2787     FALSE 0.267 73.000 0.000 1.000 N NA
 517998 517999 CV2787 CV2788     TRUE 0.952 0.000 0.003 1.000 N NA
 518000 518001 CV2789 CV2790 phaC phaA TRUE 0.950 71.000 0.420 1.000 Y NA
 518005 518006 CV2794 CV2795     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 518006 518007 CV2795 CV2796     FALSE 0.010 678.000 0.000 1.000   NA
 518007 518008 CV2796 CV2797     FALSE 0.281 71.000 0.000 1.000 N NA
 518009 518010 CV2798 CV2799     TRUE 0.588 27.000 0.000 1.000   NA
 518010 518011 CV2799 CV2800     FALSE 0.303 63.000 0.000 NA   NA
 518011 518012 CV2800 CV2801     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 518012 518013 CV2801 CV2802     FALSE 0.095 148.000 0.000 NA   NA
 518013 518014 CV2802 CV2803     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 518014 518015 CV2803 CV2804     FALSE 0.021 306.000 0.000 1.000 N NA
 518018 518019 CV2807 CV2808   ampH FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 518020 518021 CV2809 CV2810     TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000 N NA
 518021 518022 CV2810 CV2811     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518022 518023 CV2811 CV2812     FALSE 0.036 218.000 0.000 NA   NA
 518024 518025 CV2813 CV2814 trxB   TRUE 0.744 20.000 0.003 NA   NA
 518025 518026 CV2814 CV2815   bcp FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 518026 518027 CV2815 CV2816 bcp   TRUE 0.656 59.000 0.050 1.000 N NA
 518028 518029 CV2817 CV2818   fmt2 FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 518029 518030 CV2818 CV2819 fmt2   FALSE 0.038 227.000 0.000 1.000 N NA
 518030 518031 CV2819 CV2820     FALSE 0.170 122.000 0.000 1.000   NA
 518031 518032 CV2820 CV2821     FALSE 0.210 91.000 0.000 1.000   NA
 518032 518033 CV2821 CV2822     FALSE 0.088 478.000 0.000 0.016 Y NA
 518033 518034 CV2822 CV2823   dadA1 TRUE 0.523 101.000 0.000 1.000 Y NA
 518034 518035 CV2823 CV2824 dadA1   TRUE 0.880 4.000 0.000 1.000 N NA
 518035 518036 CV2824 CV2825     TRUE 0.554 131.000 0.091 0.052 N NA
 518036 518037 CV2825 CV2826     TRUE 0.939 56.000 0.215 1.000 Y NA
 518039 518040 CV2828 CV2829     FALSE 0.014 371.000 0.000 NA   NA
 518040 518041 CV2829 CV2830     FALSE 0.036 232.000 0.000 1.000   NA
 518042 518043 CV2831 CV2832     TRUE 0.525 30.000 0.000 NA   NA
 518043 518044 CV2832 CV2833     FALSE 0.307 67.000 0.000 1.000   NA
 518044 518045 CV2833 CV2834     TRUE 0.998 -3.000 0.562 NA   NA
 518045 518046 CV2834 CV2835     FALSE 0.008 1048.000 0.000 NA   NA
 518046 518047 CV2835 CV2836     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 518047 518048 CV2836 CV2837     TRUE 0.517 31.000 0.000 NA   NA
 518053 518054 CV2842 CV2843     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 518055 518056 CV2844 CV2845     TRUE 0.943 11.000 0.074 NA   NA
 518056 518057 CV2845 CV2846     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518057 518058 CV2846 CV2847     TRUE 0.994 5.000 0.529 NA   NA
 518058 518059 CV2847 CV2848     TRUE 0.994 15.000 0.800 0.088 N NA
 518059 518060 CV2848 CV2849     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 518061 518062 CV2850 CV2851     FALSE 0.191 89.000 0.000 NA   NA
 518063 518064 CV2852 CV2853   dbpA FALSE 0.011 546.000 0.000 1.000 N NA
 518065 518066 CV2854 CV2855 glpQ tauD FALSE 0.012 494.000 0.000 1.000 N NA
 518066 518067 CV2855 CV2856 tauD tauC TRUE 0.904 37.000 0.214 1.000 N NA
 518067 518068 CV2856 CV2857 tauC tauB TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 518068 518069 CV2857 CV2858 tauB tauA TRUE 0.989 3.000 0.047 1.000 Y NA
 518069 518070 CV2858 CV2859 tauA   FALSE 0.071 175.000 0.000 1.000 N NA
 518074 518075 CV2863 CV2864   aqpZ FALSE 0.045 210.000 0.000 1.000 N NA
 518077 518078 CV2866 CV2867     FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 518078 518079 CV2867 CV2868     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 518079 518080 CV2868 CV2869     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518080 518081 CV2869 CV2870     FALSE 0.016 339.000 0.000 NA   NA
 518081 518082 CV2870 CV2871     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518082 518083 CV2871 CV2872     FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000   NA
 518083 518084 CV2872 CV2873     TRUE 0.468 37.000 0.000 NA   NA
 518085 518086 CV2874 CV2875 sdaA1   FALSE 0.245 77.000 0.000 1.000 N NA
 518089 518090 CV2878 CV2879 flgL1 flgK1 TRUE 0.962 21.000 0.011 0.002 Y NA
 518090 518091 CV2879 CV2880 flgK1 flgJ TRUE 0.992 46.000 0.705 0.003 Y NA
 518091 518092 CV2880 CV2881 flgJ flgI1 TRUE 0.858 65.000 0.012 0.009 Y NA
 518092 518093 CV2881 CV2882 flgI1 flgH1 TRUE 0.960 23.000 0.024 0.009 Y NA
 518093 518094 CV2882 CV2883 flgH1 flgG1 TRUE 0.926 43.000 0.024 0.007 Y NA
 518094 518095 CV2883 CV2884 flgG1 flgF1 TRUE 0.963 34.000 0.080 0.001 Y NA
 518095 518096 CV2884 CV2885 flgF1 flgE1 TRUE 0.945 19.000 0.000 0.005 Y NA
 518096 518097 CV2885 CV2886 flgE1 flgD1 TRUE 0.808 39.000 0.000 NA Y NA
 518097 518098 CV2886 CV2887 flgD1 flgC1 TRUE 0.837 69.000 0.081 NA Y NA
 518098 518099 CV2887 CV2888 flgC1 flgB TRUE 0.997 5.000 0.250 0.005 Y NA
 518101 518102 CV2890 CV2891   rtn FALSE 0.016 341.000 0.000 NA   NA
 518104 518105 CV2893 CV2894     FALSE 0.103 143.000 0.000 NA   NA
 518105 518106 CV2894 CV2895     TRUE 0.433 42.000 0.000 NA   NA
 518107 518108 CV2896 CV2897     TRUE 0.940 13.000 0.000 1.000 Y NA
 518108 518109 CV2897 CV2898     TRUE 0.931 68.000 0.185 0.052 Y NA
 518109 518110 CV2898 CV2899     TRUE 0.990 8.000 0.067 0.052 Y NA
 518114 518115 CV2903 CV2904     TRUE 0.963 -7.000 0.000 1.000   NA
 518115 518116 CV2904 CV2905     TRUE 0.598 26.000 0.000 1.000   NA
 518116 518117 CV2905 CV2906     FALSE 0.022 277.000 0.000 NA   NA
 518118 518119 CV2907 CV2908     FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 518123 518124 CV2911 CV2912     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 518124 518125 CV2912 CV2913   holC TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518125 518126 CV2913 CV2914 holC pepA TRUE 0.998 -13.000 0.494 1.000 N NA
 518127 518128 CV2915 CV2916     TRUE 0.993 13.000 0.631 0.052   NA
 518128 518129 CV2916 CV2917   glnD TRUE 0.941 2.000 0.004 1.000   NA
 518129 518130 CV2917 CV2918 glnD   FALSE 0.313 66.000 0.000 1.000 N NA
 518130 518131 CV2918 CV2919     FALSE 0.034 221.000 0.000 NA   NA
 518131 518132 CV2919 CV2920     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 518132 518133 CV2920 CV2921   maoC FALSE 0.262 74.000 0.000 1.000   NA
 518134 518135 CV2922 CV2923     FALSE 0.063 183.000 0.000 1.000 N NA
 518137 518138 CV2925 CV2926     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 518139 518140 CV2927 CV2928     TRUE 0.977 13.000 0.091 NA Y NA
 518140 518141 CV2928 CV2929   ispZ FALSE 0.346 61.000 0.000 1.000 N NA
 518141 518142 CV2929 CV2930 ispZ   TRUE 0.991 0.000 0.224 NA   NA
 518142 518143 CV2930 CV2931     TRUE 0.989 -3.000 0.103 NA   NA
 518143 518144 CV2931 CV2932     TRUE 0.923 21.000 0.162 NA N NA
 518144 518145 CV2932 CV2933     TRUE 0.879 28.000 0.027 0.003   NA
 518145 518146 CV2933 CV2934     FALSE 0.155 178.000 0.000 0.003   NA
 518149 518150 CV2937 CV2938     TRUE 0.978 6.000 0.169 1.000   NA
 518152 518153 CV2940 CV2941   hmsR TRUE 0.996 0.000 0.462 NA   NA
 518153 518154 CV2941 CV2942 hmsR hmsF TRUE 0.942 41.000 0.435 NA N NA
 518154 518155 CV2942 CV2943 hmsF hmsH TRUE 0.989 17.000 0.696 1.000   NA
 518156 518157 CV2944 CV2945     TRUE 0.535 58.000 0.000 0.052   NA
 518157 518158 CV2945 CV2946     TRUE 0.997 0.000 0.588 1.000 N NA
 518158 518159 CV2946 CV2947     FALSE 0.025 263.000 0.000 NA   NA
 518161 518162 CV2949 CV2950     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518163 518164 CV2951 CV2952     TRUE 0.845 17.000 0.000 0.011   NA
 518164 518165 CV2952 CV2953     FALSE 0.175 117.000 0.000 1.000   NA
 518168 518169 CV2956 CV2957 gntR gntV FALSE 0.160 128.000 0.000 1.000 N NA
 518169 518170 CV2957 CV2958 gntV dgoT TRUE 0.788 46.000 0.000 1.000 Y NA
 518171 518172 CV2959 CV2960   ntpA FALSE 0.112 139.000 0.000 NA   NA
 518172 518173 CV2960 CV2961 ntpA   TRUE 0.957 1.000 0.012 1.000 N NA
 518173 518174 CV2961 CV2962   aefA TRUE 0.925 10.000 0.020 1.000   NA
 518174 518175 CV2962 CV2963 aefA   TRUE 0.732 40.000 0.005 0.088   NA
 518175 518176 CV2963 CV2964   lolC TRUE 0.999 -7.000 0.620 0.060 N NA
 518176 518177 CV2964 CV2965 lolC   TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518177 518178 CV2965 CV2966     TRUE 0.868 20.000 0.057 NA   NA
 518179 518180 CV2967 CV2968     FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 518183 518184 CV2971 CV2972     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 518184 518185 CV2972 CV2973     TRUE 0.989 -3.000 0.106 NA   NA
 518185 518186 CV2973 CV2974   radA TRUE 0.880 4.000 0.000 1.000 N NA
 518186 518187 CV2974 CV2975 radA   FALSE 0.169 140.000 0.002 NA   NA
 518187 518188 CV2975 CV2976     TRUE 0.825 15.000 0.006 NA   NA
 518188 518189 CV2976 CV2977     TRUE 0.988 -3.000 0.019 0.024   NA
 518189 518190 CV2977 CV2978     TRUE 0.935 9.000 0.028 1.000   NA
 518190 518191 CV2978 CV2979     TRUE 0.906 56.000 0.020 0.000 Y NA
 518193 518194 CV2980 CV2981     FALSE 0.215 88.000 0.000 1.000   NA
 518194 518195 CV2981 CV2982     TRUE 0.999 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 518195 518196 CV2982 CV2983     TRUE 0.997 15.000 0.594 0.052 Y NA
 518197 518198 CV_tRNAAlaGGC2 CV_tRNAGluTTC4     TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 518198 518199 CV_tRNAGluTTC4 CV_tRNAAlaGGC3     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 518200 518201 CV2984 CV2985     TRUE 0.749 53.000 0.012 0.003   NA
 518201 518202 CV2985 CV2986     TRUE 0.998 0.000 0.585 0.002   NA
 518202 518203 CV2986 CV2987     TRUE 0.846 8.000 0.000 1.000   NA
 518203 518204 CV2987 CV2988   lafU FALSE 0.038 225.000 0.000 1.000 N NA
 518204 518205 CV2988 CV2989 lafU lafT TRUE 0.999 4.000 0.846 1.000 Y NA
 518205 518206 CV2989 CV2990 lafT fliA2 TRUE 0.982 17.000 0.500 1.000 N NA
 518206 518207 CV2990 CV2991 fliA2   TRUE 0.989 6.000 0.333 1.000   NA
 518207 518208 CV2991 CV2992     TRUE 0.954 23.000 0.296 1.000   NA
 518208 518209 CV2992 CV2993   fliS2 FALSE 0.134 352.000 0.000 0.003 Y NA
 518209 518210 CV2993 CV2994 fliS2 fliD TRUE 0.997 25.000 0.865 0.003 Y NA
 518210 518211 CV2994 CV2995 fliD   FALSE 0.219 86.000 0.000 1.000   NA
 518211 518212 CV2995 CV2996   fliI2 TRUE 0.982 -3.000 0.035 1.000   NA
 518212 518213 CV2996 CV2997 fliI2 fliH TRUE 0.999 4.000 0.816 1.000 Y NA
 518213 518214 CV2997 CV2998 fliH fliG2 TRUE 1.000 -3.000 0.789 0.005 Y NA
 518214 518215 CV2998 CV2999 fliG2 fliF2 TRUE 0.993 59.000 0.970 0.007 Y NA
 518215 518216 CV2999 CV3000 fliF2   TRUE 0.993 59.000 1.000 0.007 Y NA
 518217 518218 CV3001 CV3002     TRUE 0.991 16.000 0.778 NA   NA
 518218 518219 CV3002 CV3003   fliP TRUE 0.998 0.000 0.273 0.087 Y NA
 518219 518220 CV3003 CV3004 fliP fliQ2 TRUE 0.993 14.000 0.263 0.011 Y NA
 518220 518221 CV3004 CV3005 fliQ2 fliR2 TRUE 0.998 3.000 0.281 0.002 Y NA
 518221 518222 CV3005 CV3006 fliR2 flhB2 TRUE 1.000 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 518222 518223 CV3006 CV3007 flhB2 fhiA TRUE 0.495 375.000 0.333 0.011 Y NA
 518223 518224 CV3007 CV3008 fhiA   FALSE 0.021 312.000 0.000 1.000 N NA
 518225 518226 CV3009 CV3010     TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000   NA
 518226 518227 CV3010 CV3011   flaD FALSE 0.051 200.000 0.000 1.000   NA
 518228 518229 CV3012 CV3013   caiB FALSE 0.307 67.000 0.000 1.000 N NA
 518229 518230 CV3013 CV3014 caiB   FALSE 0.313 66.000 0.000 1.000 N NA
 518231 518232 CV3015 CV3016 scrR rbsB FALSE 0.046 199.000 0.000 NA N NA
 518232 518233 CV3016 CV3017 rbsB rbsC TRUE 0.985 60.000 0.847 NA Y NA
 518233 518234 CV3017 CV3018 rbsC rbsA TRUE 0.999 -3.000 0.358 1.000 Y NA
 518234 518235 CV3018 CV3019 rbsA rbsD TRUE 0.992 11.000 0.243 1.000 Y NA
 518235 518236 CV3019 CV3020 rbsD rbsK TRUE 0.993 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 518238 518239 CV3022 CV3023     FALSE 0.187 91.000 0.000 NA   NA
 518239 518240 CV3023 CV3024     FALSE 0.397 53.000 0.000 1.000 N NA
 518240 518241 CV3024 CV3025   cysM FALSE 0.245 77.000 0.000 1.000 N NA
 518241 518242 CV3025 CV3026 cysM lldP FALSE 0.114 144.000 0.000 1.000 N NA
 518242 518243 CV3026 CV3027 lldP   TRUE 0.637 127.000 0.029 1.000 Y NA
 518243 518244 CV3027 CV3028     TRUE 0.997 -3.000 0.043 0.009 Y NA
 518244 518245 CV3028 CV3029     TRUE 0.999 -3.000 0.639 0.001   NA
 518245 518246 CV3029 CV3030     TRUE 0.993 -3.000 0.194 NA   NA
 518246 518247 CV3030 CV3031     FALSE 0.017 324.000 0.000 NA N NA
 518247 518248 CV3031 CV3032   cheV3 FALSE 0.010 737.000 0.000 1.000 N NA
 518248 518249 CV3032 CV3033 cheV3   FALSE 0.117 136.000 0.000 NA   NA
 518249 518250 CV3033 CV3034     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 518251 518252 CV3035 CV3036     FALSE 0.053 185.000 0.000 NA   NA
 518252 518253 CV3036 CV3037   pdhR FALSE 0.052 187.000 0.000 NA   NA
 518254 518255 CV3038 CV3039 rfaD   TRUE 0.434 47.000 0.000 1.000   NA
 518255 518256 CV3039 CV3040   rfaE TRUE 0.608 25.000 0.000 1.000   NA
 518256 518257 CV3040 CV3041 rfaE ugd TRUE 0.539 96.000 0.000 1.000 Y NA
 518257 518258 CV3041 CV3042 ugd pyrF TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 518258 518259 CV3042 CV3043 pyrF   TRUE 0.533 62.000 0.012 1.000 N NA
 518259 518260 CV3043 CV3044     TRUE 0.842 58.000 0.229 NA   NA
 518260 518261 CV3044 CV3045   himD TRUE 0.455 137.000 0.129 NA   NA
 518261 518262 CV3045 CV3046 himD rpsA TRUE 0.985 8.000 0.292 1.000 N NA
 518262 518263 CV3046 CV3047 rpsA cmk TRUE 0.746 96.000 0.281 1.000 N NA
 518264 518265 CV3048 CV3049 aroA   FALSE 0.321 65.000 0.000 1.000   NA
 518265 518266 CV3049 CV3050   cybB FALSE 0.328 64.000 0.000 1.000   NA
 518268 518269 CV3052 CV3053 fruB fruK TRUE 0.998 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 518269 518270 CV3053 CV3054 fruK fruA TRUE 0.988 31.000 0.562 1.000 Y NA
 518270 518271 CV3054 CV3055 fruA   FALSE 0.050 201.000 0.000 1.000   NA
 518271 518272 CV3055 CV3056     TRUE 0.862 14.000 0.000 0.037   NA
 518273 518274 CV3057 CV3058     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA N NA
 518274 518275 CV3058 CV3059     TRUE 0.983 -16.000 0.000 0.052   NA
 518275 518276 CV3059 CV3060     FALSE 0.010 500.000 0.000 NA   NA
 518276 518277 CV3060 CV3061     TRUE 0.461 38.000 0.000 NA   NA
 518277 518278 CV3061 CV3062     FALSE 0.094 156.000 0.000 1.000 N NA
 518280 518281 CV3064 CV3065 znuA znuB TRUE 0.989 19.000 0.400 1.000 Y NA
 518281 518282 CV3065 CV3066 znuB znuC TRUE 0.999 0.000 0.465 0.068 Y NA
 518282 518283 CV3066 CV3067 znuC   FALSE 0.053 185.000 0.000 NA   NA
 518283 518284 CV3067 CV3068   zur TRUE 0.569 86.000 0.103 NA   NA
 518285 518286 CV3069 CV3070     TRUE 0.752 77.000 0.000 0.000 Y NA
 518289 518290 CV3073 CV3074     FALSE 0.421 44.000 0.000 NA   NA
 518290 518291 CV3074 CV3075     FALSE 0.338 57.000 0.000 NA   NA
 518291 518292 CV3075 CV3076     TRUE 0.455 39.000 0.000 NA   NA
 518292 518293 CV3076 CV3077     FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 518293 518294 CV3077 CV3078     FALSE 0.065 173.000 0.000 NA   NA
 518294 518295 CV3078 CV3079   radC FALSE 0.148 125.000 0.000 NA   NA
 518296 518297 CV3080 CV3081 dfp dut TRUE 0.847 54.000 0.201 1.000 N NA
 518297 518298 CV3081 CV3082 dut   FALSE 0.239 78.000 0.000 1.000 N NA
 518299 518300 CV3083 CV3084   gdhA FALSE 0.040 220.000 0.000 1.000 N NA
 518301 518302 CV3085 CV3086 aotJ hisQ2 TRUE 0.678 83.000 0.000 0.051 Y NA
 518302 518303 CV3086 CV3087 hisQ2 hisM2 TRUE 0.992 63.000 1.000 0.008 Y NA
 518303 518304 CV3087 CV3088 hisM2 argR FALSE 0.142 133.000 0.000 1.000 N NA
 518305 518306 CV3089 CV3090     FALSE 0.010 489.000 0.000 NA   NA
 518308 518309 CV_rRNA5s5 CV_rRNA23s5 rRNA5S rRNA23S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 518309 518310 CV_rRNA23s5 CV_tRNAAlaTGC5 rRNA23S   FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 518310 518311 CV_tRNAAlaTGC5 CV_tRNAIleGAT5     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518311 518312 CV_tRNAIleGAT5 CV_rRNA16s5   rRNA16S FALSE 0.101 144.000 0.000 NA   NA
 518312 518313 CV_rRNA16s5 CV3092 rRNA16S   FALSE 0.011 441.000 0.000 NA   NA
 518313 518314 CV3092 CV3093   ilvA TRUE 0.449 45.000 0.000 1.000   NA
 518315 518316 CV3094 CV3095 dacC   TRUE 0.455 90.000 0.047 NA   NA
 518316 518317 CV3095 CV3096   lipB TRUE 0.955 17.000 0.219 NA   NA
 518317 518318 CV3096 CV3097 lipB lipA TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 518318 518319 CV3097 CV3098 lipA   FALSE 0.009 576.000 0.000 NA   NA
 518319 518320 CV3098 CV3099     FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 518320 518321 CV3099 CV3100   mgtA FALSE 0.019 301.000 0.000 NA   NA
 518321 518322 CV3100 CV3101 mgtA mdlC FALSE 0.019 328.000 0.000 1.000 N NA
 518322 518323 CV3101 CV3102 mdlC   TRUE 0.989 33.000 0.600 1.000 Y NA
 518324 518325 CV3103 CV3104     FALSE 0.093 157.000 0.000 1.000   NA
 518327 518328 CV3106 CV3107     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 518328 518329 CV3107 CV3108   terC FALSE 0.176 115.000 0.000 1.000 N NA
 518329 518330 CV3108 CV3109 terC htpX1 TRUE 0.575 57.000 0.014 1.000 N NA
 518331 518332 CV3110 CV3111 nhaR   FALSE 0.109 140.000 0.000 NA N NA
 518332 518333 CV3111 CV3112   pilV TRUE 0.992 -9.000 0.000 NA Y NA
 518333 518334 CV3112 CV3113 pilV pilW TRUE 0.989 27.000 0.571 NA Y NA
 518334 518335 CV3113 CV3114 pilW   TRUE 0.923 48.000 0.128 NA Y NA
 518335 518336 CV3114 CV3115     TRUE 0.949 36.000 0.154 NA Y NA
 518336 518337 CV3115 CV3116   pilE1 TRUE 0.900 19.000 0.000 NA Y NA
 518338 518339 CV3117 CV3118     FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 518339 518340 CV3118 CV3119   dsbC TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 518340 518341 CV3119 CV3120 dsbC visC TRUE 0.871 23.000 0.068 1.000 N NA
 518341 518342 CV3120 CV3121 visC ubiH TRUE 0.992 4.000 0.031 0.001 Y NA
 518342 518343 CV3121 CV3122 ubiH pepP TRUE 0.990 6.000 0.396 1.000 N NA
 518343 518344 CV3122 CV3123 pepP   FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 518344 518345 CV3123 CV3124   fliR1 FALSE 0.254 101.000 0.002 NA   NA
 518345 518346 CV3124 CV3125 fliR1 fliQ1 TRUE 0.999 0.000 0.400 0.002 Y NA
 518346 518347 CV3125 CV3126 fliQ1   TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 518347 518348 CV3126 CV3127     TRUE 0.860 6.000 0.000 1.000   NA
 518348 518349 CV3127 CV3128     TRUE 0.996 0.000 0.203 1.000 Y NA
 518349 518350 CV3128 CV3129   fliN TRUE 0.968 57.000 0.443 1.000 Y NA
 518350 518351 CV3129 CV3130 fliN fliM TRUE 1.000 -3.000 0.741 0.001 Y NA
 518351 518352 CV3130 CV3131 fliM fliL TRUE 0.987 8.000 0.012 0.001 Y NA
 518352 518353 CV3131 CV3132 fliL   FALSE 0.155 172.000 0.013 1.000   NA
 518353 518354 CV3132 CV3133     TRUE 0.933 54.000 0.317 0.007   NA
 518354 518355 CV3133 CV3134   fliI1 TRUE 0.817 76.000 0.016 0.009 Y NA
 518355 518356 CV3134 CV3135 fliI1 fliG1 FALSE 0.075 834.000 0.000 0.005 Y NA
 518356 518357 CV3135 CV3136 fliG1 fliF1 TRUE 0.999 -7.000 0.220 0.007 Y NA
 518357 518358 CV3136 CV3137 fliF1 fliE TRUE 0.920 54.000 0.051 0.007 Y NA
 518358 518359 CV3137 CV3138 fliE   TRUE 0.977 3.000 0.108 1.000 N NA
 518359 518360 CV3138 CV3139     TRUE 0.875 26.000 0.000 1.000 Y NA
 518360 518361 CV3139 CV3140     TRUE 0.762 52.000 0.000 1.000 Y NA
 518361 518362 CV3140 CV3141     TRUE 0.483 35.000 0.000 NA   NA
 518363 518364 CV3142 CV3143     FALSE 0.037 216.000 0.000 NA   NA
 518367 518368 CV3146 CV3147 hyuA   TRUE 0.992 -3.000 0.167 NA   NA
 518368 518369 CV3147 CV3148     TRUE 0.992 -10.000 0.100 NA   NA
 518376 518377 CV3155 CV3156     FALSE 0.163 105.000 0.000 NA   NA
 518377 518378 CV3156 CV3157     TRUE 0.483 35.000 0.000 NA   NA
 518378 518379 CV3157 CV3158     TRUE 0.995 5.000 0.625 NA   NA
 518382 518383 CV3161 CV3162     TRUE 0.985 -25.000 0.011 1.000 N NA
 518383 518384 CV3162 CV3163     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 518384 518385 CV3163 CV3164   tbpA TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 518386 518387 CV3165 CV3166     TRUE 0.985 11.000 0.389 NA   NA
 518393 518394 CV3172 CV3173     TRUE 0.965 -10.000 0.000 1.000   NA
 518394 518395 CV3173 CV3174     TRUE 0.893 32.000 0.173 NA   NA
 518395 518396 CV3174 CV3175     TRUE 0.999 -3.000 0.939 NA   NA
 518396 518397 CV3175 CV3176   pcp1 TRUE 0.975 13.000 0.300 NA   NA
 518398 518399 CV3177 CV3178   manC TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518399 518400 CV3178 CV3179 manC   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518400 518401 CV3179 CV3180   phhA FALSE 0.033 227.000 0.000 NA   NA
 518402 518403 CV3181 CV3182 lrp   FALSE 0.021 313.000 0.000 1.000   NA
 518405 518406 CV3184 CV3185     TRUE 0.936 36.000 0.015 0.003 Y NA
 518406 518407 CV3185 CV3186     TRUE 0.806 70.000 0.237 1.000   NA
 518410 518411 CV3189 CV3190 mesJ accA TRUE 0.981 2.000 0.123 1.000 N NA
 518412 518413 CV_tRNAValTAC2 CV_tRNAAspGTC2     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518413 518414 CV_tRNAAspGTC2 CV_tRNAValTAC3     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 518414 518415 CV_tRNAValTAC3 CV_tRNAAspGTC3     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518415 518416 CV_tRNAAspGTC3 CV_tRNAValTAC4     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 518416 518417 CV_tRNAValTAC4 CV_tRNAAspGTC4     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518417 518418 CV_tRNAAspGTC4 CV_tRNAValTAC5     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 518418 518419 CV_tRNAValTAC5 CV_tRNAAspGTC5     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518419 518420 CV_tRNAAspGTC5 CV_tRNAValCAC1     TRUE 0.543 28.000 0.000 NA   NA
 518420 518421 CV_tRNAValCAC1 CV_tRNAAspGTC6     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 518421 518422 CV_tRNAAspGTC6 CV_tRNAValCAC2     TRUE 0.543 28.000 0.000 NA   NA
 518422 518423 CV_tRNAValCAC2 CV_tRNAAspGTC7     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 518423 518424 CV_tRNAAspGTC7 CV3191     FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 518424 518425 CV3191 CV3192     TRUE 0.936 10.000 0.034 1.000   NA
 518426 518427 CV3193 CV3194 dsbH   FALSE 0.041 217.000 0.000 1.000   NA
 518427 518428 CV3194 CV3195   alkA FALSE 0.045 209.000 0.000 1.000   NA
 518428 518429 CV3195 CV3196 alkA alkB TRUE 0.970 4.000 0.000 NA Y NA
 518429 518430 CV3196 CV3197 alkB pmbA TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518431 518432 CV3198 CV3199   mog TRUE 0.984 0.000 0.117 NA   NA
 518432 518433 CV3199 CV3200 mog   TRUE 0.969 -3.000 0.006 NA   NA
 518433 518434 CV3200 CV3201     FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 518434 518435 CV3201 CV3202     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 518439 518440 CV3206 CV3207 cspD   FALSE 0.165 103.000 0.000 NA   NA
 518442 518443 CV3209 CV3210 osmB dgt FALSE 0.182 107.000 0.000 1.000   NA
 518443 518444 CV3210 CV3211 dgt gpmB TRUE 0.649 21.000 0.000 1.000 N NA
 518444 518445 CV3211 CV3212 gpmB trh1 FALSE 0.123 140.000 0.000 1.000 N NA
 518445 518446 CV3212 CV3213 trh1   FALSE 0.013 416.000 0.000 NA   NA
 518446 518447 CV3213 CV3214     FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 518447 518448 CV3214 CV3215     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 518448 518449 CV3215 CV3216     TRUE 0.991 -3.000 0.130 NA   NA
 518449 518450 CV3216 CV3217   copF FALSE 0.131 176.000 0.000 0.051 N NA
 518451 518452 CV3218 CV3219     FALSE 0.297 143.000 0.050 NA   NA
 518452 518453 CV3219 CV3220     FALSE 0.135 207.000 0.050 NA   NA
 518453 518454 CV3220 CV3221     TRUE 0.909 23.000 0.143 NA   NA
 518457 518458 CV3224 CV3225     TRUE 0.999 -3.000 0.722 NA   NA
 518458 518459 CV3225 CV3226   CFA TRUE 0.733 78.000 0.213 NA   NA
 518459 518460 CV3226 CV3227 CFA   TRUE 0.987 -7.000 0.033 1.000   NA
 518460 518461 CV3227 CV3228     TRUE 0.998 -3.000 0.533 NA   NA
 518461 518462 CV3228 CV3229     TRUE 0.958 -7.000 0.000 NA   NA
 518462 518463 CV3229 CV3230   blc TRUE 0.841 9.000 0.000 1.000   NA
 518463 518464 CV3230 CV3231 blc   FALSE 0.018 312.000 0.000 NA   NA
 518464 518465 CV3231 CV3232   GroES TRUE 0.666 170.000 0.533 NA   NA
 518465 518466 CV3232 CV3233 GroES groEL TRUE 0.995 30.000 0.733 0.006 Y NA
 518466 518467 CV3233 CV3234 groEL   FALSE 0.097 155.000 0.000 1.000   NA
 518468 518469 CV3235 CV3236     FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 518470 518471 CV3237 CV3238     TRUE 0.984 -15.000 0.000 0.025   NA
 518471 518472 CV3238 CV3239     FALSE 0.118 142.000 0.000 1.000   NA
 518472 518473 CV3239 CV3240   rhtC TRUE 0.734 87.000 0.229 1.000 N NA
 518473 518474 CV3240 CV3241 rhtC   TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 518474 518475 CV3241 CV3242     FALSE 0.159 112.000 0.000 NA   NA
 518475 518476 CV3242 CV3243   ebrB FALSE 0.164 104.000 0.000 NA   NA
 518480 518481 CV3247 CV3248     FALSE 0.058 179.000 0.000 NA   NA
 518482 518483 CV3249 CV3250 ocd tdcB TRUE 0.999 -13.000 0.316 1.000 Y NA
 518484 518485 CV3251 CV3252     FALSE 0.162 107.000 0.000 NA   NA
 518487 518488 CV3254 CV3255     FALSE 0.178 113.000 0.000 1.000   NA
 518488 518489 CV3255 CV3256     FALSE 0.031 248.000 0.000 1.000   NA
 518490 518491 CV3257 CV3258     TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000 N NA
 518492 518493 CV3259 CV3260     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 518493 518494 CV3260 CV3261     FALSE 0.377 56.000 0.000 1.000 N NA
 518494 518495 CV3261 CV3262     FALSE 0.172 157.000 0.000 0.051   NA
 518495 518496 CV3262 CV3263     TRUE 0.509 32.000 0.000 NA   NA
 518496 518497 CV3263 CV3264     TRUE 0.991 16.000 0.778 NA   NA
 518499 518500 CV3266 CV3267     FALSE 0.421 44.000 0.000 NA   NA
 518500 518501 CV3267 CV3268     TRUE 0.945 14.000 0.133 NA   NA
 518501 518502 CV3268 CV3269     TRUE 0.994 -10.000 0.133 NA   NA
 518503 518504 CV3270 CV3271   vioD TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 518504 518505 CV3271 CV3272 vioD vioC TRUE 0.981 0.000 0.000 NA Y NA
 518505 518506 CV3272 CV3273 vioC vioB TRUE 0.984 2.000 0.167 NA   NA
 518506 518507 CV3273 CV3274 vioB vioA TRUE 0.849 75.000 0.400 NA   NA
 518507 518508 CV3274 CV3275 vioA   FALSE 0.021 313.000 0.000 1.000   NA
 518508 518509 CV3275 CV3276     FALSE 0.034 223.000 0.000 NA   NA
 518509 518510 CV3276 CV3277     TRUE 0.852 32.000 0.107 NA   NA
 518510 518511 CV3277 CV3278     TRUE 0.922 20.000 0.147 NA   NA
 518511 518512 CV3278 CV3279     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA   NA
 518513 518514 CV3280 CV3281     TRUE 0.998 0.000 0.826 NA   NA
 518514 518515 CV3281 CV3282   acsA TRUE 0.490 76.000 0.032 1.000   NA
 518515 518516 CV3282 CV3283 acsA   FALSE 0.093 149.000 0.000 NA N NA
 518516 518517 CV3283 CV3284     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 518518 518519 CV3285 CV3286     FALSE 0.158 113.000 0.000 NA   NA
 518519 518520 CV3286 CV3287     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA   NA
 518520 518521 CV3287 CV3288   pcaC TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000   NA
 518524 518525 CV3291 CV3292   rnfE TRUE 0.588 27.000 0.000 1.000 N NA
 518525 518526 CV3292 CV3293 rnfE nth TRUE 0.985 -3.000 0.048 1.000 N NA
 518526 518527 CV3293 CV3294 nth htrA FALSE 0.230 129.000 0.002 1.000 N NA
 518527 518528 CV3294 CV3295 htrA   FALSE 0.172 119.000 0.000 1.000 N NA
 518529 518530 CV3296 CV3297     FALSE 0.023 276.000 0.000 NA   NA
 518530 518531 CV3297 CV3298   lamB FALSE 0.163 105.000 0.000 NA   NA
 518531 518532 CV3298 CV3299 lamB treC TRUE 0.513 105.000 0.000 1.000 Y NA
 518532 518533 CV3299 CV3300 treC treB TRUE 1.000 -7.000 0.650 1.000 Y NA
 518535 518536 CV3302 CV3303 treR   TRUE 0.669 88.000 0.000 0.046 Y NA
 518537 518538 CV3304 CV3305 aceB   FALSE 0.098 146.000 0.000 NA   NA
 518538 518539 CV3305 CV3306     FALSE 0.347 104.000 0.022 NA   NA
 518541 518542 CV3308 CV3309     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 518543 518544 CV3310 CV3311     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 518545 518546 CV3312 CV3313   hlfC TRUE 1.000 0.000 0.947 0.008 Y NA
 518546 518547 CV3313 CV3314 hlfC   TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.085 N NA
 518547 518548 CV3314 CV3315     TRUE 0.879 25.000 0.000 1.000 Y NA
 518548 518549 CV3315 CV3316     FALSE 0.016 383.000 0.000 1.000 N NA
 518549 518550 CV3316 CV3317     FALSE 0.023 292.000 0.000 1.000   NA
 518551 518552 CV3318 CV3319     FALSE 0.012 435.000 0.000 NA   NA
 518553 518554 CV3320 CV3321     FALSE 0.069 908.000 0.000 0.012 Y NA
 518554 518555 CV3321 CV3322     FALSE 0.065 173.000 0.000 NA   NA
 518555 518556 CV3322 CV3323   cbpD1 FALSE 0.027 250.000 0.000 NA   NA
 518556 518557 CV3323 CV3324 cbpD1   FALSE 0.275 72.000 0.000 1.000   NA
 518557 518558 CV3324 CV_tRNAGlyCCC     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA   NA
 518558 518559 CV_tRNAGlyCCC CV3325     FALSE 0.345 56.000 0.000 NA   NA
 518561 518562 CV3327 CV3328     TRUE 0.957 47.000 0.598 1.000   NA
 518562 518563 CV3328 CV3329     TRUE 0.998 -3.000 0.617 NA   NA
 518563 518564 CV3329 CV3330     TRUE 0.998 -10.000 0.459 NA   NA
 518564 518565 CV3330 CV3331     TRUE 0.998 -3.000 0.543 NA   NA
 518565 518566 CV3331 CV3332   rpoN TRUE 0.969 4.000 0.075 1.000   NA
 518566 518567 CV3332 CV3333 rpoN   TRUE 0.918 68.000 0.574 NA N NA
 518567 518568 CV3333 CV3334     TRUE 0.713 123.000 0.309 NA N NA
 518568 518569 CV3334 CV_3335     TRUE 0.998 -7.000 0.177 1.000 Y NA
 518569 518570 CV_3335 CV3336     TRUE 0.996 -19.000 0.194 NA   NA
 518570 518571 CV3336 CV3337   ubiX TRUE 0.509 53.000 0.004 NA   NA
 518571 518572 CV3337 CV3338 ubiX   TRUE 0.891 3.000 0.000 1.000 N NA
 518572 518573 CV3338 CV3339     FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000   NA
 518573 518574 CV3339 CV3340   hydH FALSE 0.207 140.000 0.000 0.085   NA
 518574 518575 CV3340 CV3341 hydH   TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 518576 518577 CV3342 CV3343   adk FALSE 0.069 176.000 0.000 1.000   NA
 518577 518578 CV3343 CV3344 adk kdsB TRUE 0.645 63.000 0.056 1.000 N NA
 518578 518579 CV3344 CV3345 kdsB   TRUE 0.995 -3.000 0.265 NA   NA
 518579 518580 CV3345 CV3346   lpxK TRUE 0.997 -10.000 0.263 NA   NA
 518580 518581 CV3346 CV3347 lpxK exdD TRUE 0.935 14.000 0.096 1.000 N NA
 518581 518582 CV3347 CV3348 exdD   TRUE 0.999 3.000 0.746 0.059 Y NA
 518582 518583 CV3348 CV3349     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 518586 518587 CV3352 CV3353 pgm   TRUE 0.928 22.000 0.170 1.000 N NA
 518587 518588 CV3353 CV3354   prc TRUE 0.958 44.000 0.408 0.023 N NA
 518588 518589 CV3354 CV3355 prc argA FALSE 0.111 146.000 0.000 1.000 N NA
 518589 518590 CV3355 CV3356 argA   TRUE 0.728 63.000 0.123 NA N NA
 518590 518591 CV3356 CV3357   ppK TRUE 0.446 71.000 0.013 NA N NA
 518591 518592 CV3357 CV3358 ppK   TRUE 0.913 5.000 0.004 NA   NA
 518592 518593 CV3358 CV3359     FALSE 0.160 110.000 0.000 NA   NA
 518593 518594 CV3359 CV3360     FALSE 0.215 88.000 0.000 1.000   NA
 518596 518597 CV3362 CV3363     FALSE 0.160 109.000 0.000 NA   NA
 518597 518598 CV3363 CV3364     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 518599 518600 CV3365 CV3366   frdD FALSE 0.026 257.000 0.000 NA   NA
 518600 518601 CV3366 CV3367 frdD frdC TRUE 1.000 -3.000 0.787 0.002 Y NA
 518601 518602 CV3367 CV3368 frdC frdB TRUE 0.999 -3.000 0.454 0.002 Y NA
 518602 518603 CV3368 CV3369 frdB frdA TRUE 0.999 -3.000 0.470 0.002 Y NA
 518603 518604 CV3369 CV3370 frdA dcuB TRUE 0.750 14.000 0.000 1.000   NA
 518604 518605 CV3370 CV3371 dcuB   FALSE 0.033 243.000 0.000 1.000   NA
 518606 518607 CV3372 CV3373 ppa   FALSE 0.099 145.000 0.000 NA   NA
 518609 518610 CV3375 CV3376 minC minD TRUE 0.990 21.000 0.466 1.000 Y NA
 518610 518611 CV3376 CV3377 minD minE TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 518611 518612 CV3377 CV3378 minE oxyR TRUE 0.929 4.000 0.008 NA N NA
 518612 518613 CV3378 CV3379 oxyR   FALSE 0.248 72.000 0.000 NA   NA
 518613 518614 CV3379 CV3380   dcp1 FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 518614 518615 CV3380 CV3381 dcp1 dcp2 TRUE 0.816 65.000 0.000 0.000 Y NA
 518615 518616 CV3381 CV3382 dcp2   FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 518616 518617 CV3382 CV3383     TRUE 0.744 13.000 0.000 NA   NA
 518618 518619 CV3384 CV3385 greB   TRUE 0.569 29.000 0.000 1.000 N NA
 518619 518620 CV3385 CV3386     TRUE 0.490 39.000 0.000 1.000 N NA
 518620 518621 CV3386 CV3387     TRUE 0.859 13.000 0.009 NA N NA
 518621 518622 CV3387 CV3388     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 518624 518625 CV3390 CV3391     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 518627 518628 CV3393 CV3394     FALSE 0.324 59.000 0.000 NA N NA
 518628 518629 CV3394 CV3395   cysB2 TRUE 0.933 62.000 0.133 0.012 Y NA
 518629 518630 CV3395 CV3396 cysB2   FALSE 0.181 108.000 0.000 1.000   NA
 518630 518631 CV3396 CV3397     FALSE 0.079 170.000 0.000 1.000   NA
 518634 518635 CV3400 CV3401     TRUE 0.543 28.000 0.000 NA   NA
 518635 518636 CV3401 CV3402   trmU FALSE 0.073 535.000 0.158 1.000 N NA
 518637 518638 CV3403 CV3404     TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 518640 518641 CV3406 CV3407     TRUE 0.891 3.000 0.000 1.000 N NA
 518643 518644 CV3409 CV3410 gltP pabC FALSE 0.094 156.000 0.000 1.000 N NA
 518644 518645 CV3410 CV3411 pabC pabB TRUE 0.993 0.000 0.069 1.000 Y NA
 518645 518646 CV3411 CV3412 pabB fabF TRUE 0.445 134.000 0.030 0.013 N NA
 518646 518647 CV3412 CV3413 fabF acpP TRUE 0.781 166.000 0.346 1.000 Y NA
 518647 518648 CV3413 CV3414 acpP fabG1 TRUE 0.954 75.000 0.321 0.003 Y NA
 518648 518649 CV3414 CV3415 fabG1 fabD TRUE 0.955 92.000 0.432 0.003 Y NA
 518649 518650 CV3415 CV3416 fabD fabH TRUE 0.876 126.000 0.182 0.003 Y NA
 518650 518651 CV3416 CV3417 fabH plsX TRUE 0.998 6.000 0.380 0.003 Y NA
 518651 518652 CV3417 CV3418 plsX rpmF TRUE 0.916 57.000 0.418 1.000 N NA
 518652 518653 CV3418 CV3419 rpmF   TRUE 0.953 48.000 0.599 NA   NA
 518654 518655 CV3420 CV3421     TRUE 0.989 -3.000 0.107 NA   NA
 518655 518656 CV3421 CV3422   pncB TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000   NA
 518659 518660 CV3425 CV3426     FALSE 0.017 370.000 0.000 1.000 N NA
 518660 518661 CV3426 CV3427     FALSE 0.030 258.000 0.000 1.000 N NA
 518661 518662 CV3427 CV3428   tehB FALSE 0.047 206.000 0.000 1.000   NA
 518662 518663 CV3428 CV3429 tehB gcvP FALSE 0.079 170.000 0.000 1.000   NA
 518663 518664 CV3429 CV3430 gcvP gcvH TRUE 0.881 93.000 0.249 1.000 Y NA
 518664 518665 CV3430 CV3431 gcvH gcvT TRUE 0.973 57.000 0.317 0.001 Y NA
 518665 518666 CV3431 CV3432 gcvT   FALSE 0.065 417.000 0.000 1.000 Y NA
 518666 518667 CV3432 CV3433     FALSE 0.024 287.000 0.000 1.000 N NA
 518669 518670 CV3435 CV3436   cheB3 TRUE 0.994 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 518670 518671 CV3436 CV3437 cheB3 cheR2 TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 518671 518672 CV3437 CV3438 cheR2   TRUE 0.988 21.000 0.400 1.000 Y NA
 518672 518673 CV3438 CV3439     FALSE 0.110 147.000 0.000 1.000   NA
 518673 518674 CV3439 CV3440     TRUE 0.604 22.000 0.000 NA   NA
 518674 518675 CV3440 CV3441   cheW2 FALSE 0.178 96.000 0.000 NA   NA
 518675 518676 CV3441 CV3442 cheW2 cheA TRUE 0.994 17.000 0.421 0.012 Y NA
 518676 518677 CV3442 CV3443 cheA cheY4 TRUE 0.986 28.000 0.444 1.000 Y NA
 518677 518678 CV3443 CV3444 cheY4   FALSE 0.052 470.000 0.000 NA Y NA
 518678 518679 CV3444 CV3445     TRUE 0.495 105.000 0.000 NA Y NA
 518680 518681 CV3446 CV3447 cheV2 cheV1 TRUE 0.994 40.000 0.778 0.014 Y NA
 518681 518682 CV3447 CV3448 cheV1 cheY3 TRUE 0.964 52.000 0.222 0.017 Y NA
 518682 518683 CV3448 CV3449 cheY3 cheZ TRUE 0.716 183.000 0.333 1.000 Y NA
 518683 518684 CV3449 CV3450 cheZ   TRUE 0.888 42.000 0.028 1.000 Y NA
 518684 518685 CV3450 CV3451     TRUE 0.946 16.000 0.009 NA Y NA
 518685 518686 CV3451 CV3452     TRUE 0.647 30.000 0.002 NA N NA
 518686 518687 CV3452 CV3453   rimI TRUE 0.994 -3.000 0.209 1.000   NA
 518687 518688 CV3453 CV3454 rimI   TRUE 0.989 -3.000 0.096 1.000   NA
 518689 518690 CV3455 CV3456 rpmG rpmB TRUE 0.984 35.000 0.332 0.009 Y NA
 518693 518694 CV3459 CV3460 eno   TRUE 0.986 5.000 0.241 1.000   NA
 518694 518695 CV3460 CV3461     FALSE 0.011 577.000 0.000 1.000 N NA
 518696 518697 CV3462 CV3463     TRUE 0.984 -7.000 0.020 NA   NA
 518698 518699 CV3464 CV3465 smpB guaA FALSE 0.014 424.000 0.000 1.000 N NA
 518699 518700 CV3465 CV3466 guaA   FALSE 0.025 281.000 0.000 1.000 N NA
 518700 518701 CV3466 CV3467   elaB FALSE 0.155 117.000 0.000 NA   NA
 518701 518702 CV3467 CV3468 elaB   TRUE 0.930 6.000 0.016 NA   NA
 518702 518703 CV3468 CV3469     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518705 518706 CV3471 CV3472     TRUE 0.966 2.000 0.045 NA   NA
 518706 518707 CV3472 CV3473     TRUE 0.964 0.000 0.021 NA   NA
 518710 518711 CV3476 CV3477 fumA   FALSE 0.035 236.000 0.000 1.000   NA
 518711 518712 CV3477 CV3478     FALSE 0.215 138.000 0.000 0.085   NA
 518712 518713 CV3478 CV3479     FALSE 0.020 568.000 0.000 0.085   NA
 518715 518716 CV3481 CV3482 phrB   TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 518717 518718 CV3483 CV3484     TRUE 0.992 6.000 0.477 NA   NA
 518721 518722 CV3487 CV3488   hmpA TRUE 0.662 57.000 0.056 NA N NA
 518722 518723 CV3488 CV3489 hmpA   FALSE 0.110 147.000 0.000 1.000   NA
 518724 518725 CV3490 CV3491     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518728 518729 CV3494 CV3495 norB   FALSE 0.079 219.000 0.000 0.050   NA
 518731 518732 CV3497 CV3498     TRUE 0.987 12.000 0.462 1.000   NA
 518733 518734 CV3499 CV3500   nfsA FALSE 0.245 77.000 0.000 1.000 N NA
 518734 518735 CV3500 CV3501 nfsA nemA1 TRUE 0.909 29.000 0.000 0.023 Y NA
 518735 518736 CV3501 CV3502 nemA1 ptrB FALSE 0.021 306.000 0.000 1.000 N NA
 518736 518737 CV3502 CV3503 ptrB   FALSE 0.009 1114.000 0.000 1.000 N NA
 518737 518738 CV3503 CV3504     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 518739 518740 CV3505 CV3506     FALSE 0.050 192.000 0.000 NA   NA
 518741 518742 CV3507 CV3508     FALSE 0.054 302.000 0.021 1.000   NA
 518742 518743 CV3508 CV3509     TRUE 0.877 29.000 0.111 1.000 N NA
 518743 518744 CV3509 CV3510     FALSE 0.160 110.000 0.000 NA   NA
 518744 518745 CV3510 CV3511     FALSE 0.203 82.000 0.000 NA   NA
 518745 518746 CV3511 CV3512     FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 518746 518747 CV3512 CV3513     TRUE 0.697 56.000 0.070 NA   NA
 518747 518748 CV3513 CV3514     TRUE 0.996 -13.000 0.200 NA   NA
 518748 518749 CV3514 CV3515     TRUE 0.824 39.000 0.107 NA   NA
 518749 518750 CV3515 CV3516   serB FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   NA
 518750 518751 CV3516 CV3517 serB   TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 518756 518757 CV3522 CV_rRNA5s6   rRNA5S FALSE 0.036 217.000 0.000 NA   NA
 518757 518758 CV_rRNA5s6 CV_rRNA23s6 rRNA5S rRNA23S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 518758 518759 CV_rRNA23s6 CV_tRNAAlaTGC6 rRNA23S   FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 518759 518760 CV_tRNAAlaTGC6 CV_tRNAIleGAT6     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 518760 518761 CV_tRNAIleGAT6 CV_rRNA16s6   rRNA16S FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 518761 518762 CV_rRNA16s6 CV3523 rRNA16S   FALSE 0.012 439.000 0.000 NA   NA
 518763 518764 CV_tRNALeuCAG1 CV_tRNALeuCAG2     FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 518764 518765 CV_tRNALeuCAG2 CV_tRNALeuCAG3     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 518765 518766 CV_tRNALeuCAG3 CV_tRNALeuCAG4     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 518767 518768 CV3524 CV3525   acpA FALSE 0.104 150.000 0.000 1.000   NA
 518769 518770 CV3526 CV3527     FALSE 0.315 61.000 0.000 NA   NA
 518771 518772 CV3528 CV3529 purA2   TRUE 0.866 40.000 0.161 1.000 N NA
 518772 518773 CV3529 CV3530   hflC TRUE 0.439 99.000 0.045 1.000 N NA
 518773 518774 CV3530 CV3531 hflC   TRUE 1.000 -3.000 0.947 0.007 Y NA
 518774 518775 CV3531 CV3532   hflX TRUE 0.996 -13.000 0.184 1.000   NA
 518775 518776 CV3532 CV3533 hflX hfq TRUE 0.465 101.000 0.058 1.000   NA
 518776 518777 CV3533 CV3534 hfq   TRUE 0.447 90.000 0.036 1.000   NA
 518777 518778 CV3534 CV3535     TRUE 0.974 11.000 0.203 1.000   NA
 518778 518779 CV3535 CV3536     TRUE 0.993 5.000 0.492 1.000   NA
 518779 518780 CV3536 CV3537   hisS TRUE 0.960 18.000 0.259 1.000   NA
 518780 518781 CV3537 CV3538 hisS   TRUE 0.904 36.000 0.207 1.000 N NA
 518781 518782 CV3538 CV3539     TRUE 0.968 14.000 0.233 1.000   NA
 518782 518783 CV3539 CV3540     TRUE 0.986 3.000 0.204 1.000   NA
 518783 518784 CV3540 CV3541     TRUE 0.992 -33.000 0.086 1.000   NA
 518784 518785 CV3541 CV3542   ndk TRUE 0.750 67.000 0.156 1.000   NA
 518787 518788 CV3544 CV3545     FALSE 0.017 325.000 0.000 NA   NA
 518788 518789 CV3545 CV3546     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 518789 518790 CV3546 CV3547     FALSE 0.017 320.000 0.000 NA   NA
 518790 518791 CV3547 CV_tRNAGlnTTG1     FALSE 0.011 448.000 0.000 NA   NA
 518791 518792 CV_tRNAGlnTTG1 CV_tRNAThrCGT     FALSE 0.010 558.000 0.000 NA   NA
 518792 518793 CV_tRNAThrCGT CV_tRNAProCGG1     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 518793 518794 CV_tRNAProCGG1 CV_tRNAProCGG2     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 518795 518796 CV3548 CV3549 rdgC katE FALSE 0.027 270.000 0.000 1.000 N NA
 518796 518797 CV3549 CV3550 katE   FALSE 0.032 394.000 0.000 0.036   NA
 518798 518799 CV3551 CV3552 pydA   FALSE 0.100 153.000 0.000 1.000 N NA
 518799 518800 CV3552 CV3553   feoB TRUE 0.778 48.000 0.000 1.000 Y NA
 518801 518802 CV3554 CV3555 dcd   FALSE 0.027 271.000 0.000 1.000 N NA
 518803 518804 CV3556 CV3557     FALSE 0.159 111.000 0.000 NA   NA
 518804 518805 CV3557 CV3558     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 518805 518806 CV3558 CV3559     FALSE 0.180 95.000 0.000 NA   NA
 518806 518807 CV3559 CV3560     TRUE 0.961 0.000 0.014 NA   NA
 518807 518808 CV3560 CV3561   cysK FALSE 0.186 92.000 0.000 NA   NA
 518814 518815 CV3567 CV3568 lytB lspA TRUE 0.687 92.000 0.019 1.000 Y NA
 518815 518816 CV3568 CV3569 lspA ileS TRUE 0.738 52.000 0.071 1.000 N NA
 518816 518817 CV3569 CV3570 ileS ribF TRUE 0.995 -3.000 0.254 1.000 N NA
 518817 518818 CV3570 CV3571 ribF rmpM FALSE 0.252 133.000 0.009 1.000 N NA
 518818 518819 CV3571 CV3572 rmpM   FALSE 0.029 240.000 0.000 NA   NA
 518819 518820 CV3572 CV3573   cysI TRUE 0.900 11.000 0.014 NA   NA
 518820 518821 CV3573 CV3574 cysI cysH TRUE 0.588 44.000 0.003 1.000 N NA
 518823 518824 CV3576 CV3577 fabG2   FALSE 0.038 224.000 0.000 1.000   NA
 518825 518826 CV3578 CV3579 dapA   TRUE 0.931 27.000 0.041 NA Y NA
 518827 518828 CV3580 CV3581     FALSE 0.026 259.000 0.000 NA   NA
 518830 518831 CV3583 CV3584   hemK TRUE 0.881 4.000 0.000 1.000   NA
 518831 518832 CV3584 CV3585 hemK   TRUE 0.469 65.000 0.006 1.000 N NA
 518832 518833 CV3585 CV3586   mtgA FALSE 0.137 223.000 0.013 0.025   NA
 518833 518834 CV3586 CV3587 mtgA aroE TRUE 0.977 3.000 0.107 1.000   NA
 518834 518835 CV3587 CV3588 aroE   FALSE 0.139 172.000 0.011 NA N NA
 518836 518837 CV3589 CV3590 glnA   FALSE 0.347 132.000 0.048 NA   NA
 518837 518838 CV3590 CV3591   ntrB TRUE 0.515 124.000 0.122 NA   NA
 518838 518839 CV3591 CV3592 ntrB glnG TRUE 0.993 28.000 0.587 0.065 Y NA
 518839 518840 CV3592 CV3593 glnG   FALSE 0.219 86.000 0.000 1.000   NA
 518843 518844 CV3596 CV3597     FALSE 0.414 45.000 0.000 NA   NA
 518844 518845 CV3597 CV3598     TRUE 0.897 11.000 0.000 0.050 N NA
 518845 518846 CV3598 CV3599     TRUE 0.476 41.000 0.000 1.000   NA
 518846 518847 CV3599 CV3600   mhpT TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 518847 518848 CV3600 CV3601 mhpT   FALSE 0.175 117.000 0.000 1.000   NA
 518852 518853 CV3605 CV3606     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA N NA
 518853 518854 CV3606 CV3607     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 518855 518856 CV3608 CV3609 ubiA   FALSE 0.080 159.000 0.000 NA   NA
 518857 518858 CV3610 CV3611     TRUE 0.836 18.000 0.021 NA   NA
 518858 518859 CV3611 CV3612     FALSE 0.426 104.000 0.045 1.000   NA
 518859 518860 CV3612 CV3613     FALSE 0.043 215.000 0.000 1.000   NA
 518860 518861 CV3613 CV3614     TRUE 0.984 -3.000 0.045 1.000   NA
 518862 518863 CV3615 CV3616 purM purN TRUE 0.895 130.000 0.230 0.001 Y NA
 518863 518864 CV3616 CV3617 purN   TRUE 0.960 1.000 0.024 NA   NA
 518864 518865 CV3617 CV3618     TRUE 0.987 -10.000 0.033 NA   NA
 518865 518866 CV3618 CV3619     FALSE 0.207 139.000 0.008 NA N NA
 518866 518867 CV3619 CV3620     TRUE 0.494 69.000 0.015 1.000 N NA
 518867 518868 CV3620 CV3621   upp FALSE 0.132 169.000 0.004 1.000 N NA
 518868 518869 CV3621 CV3622 upp   FALSE 0.262 74.000 0.000 1.000   NA
 518869 518870 CV3622 CV3623     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518870 518871 CV3623 CV3624   uraA TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 518871 518872 CV3624 CV3625 uraA   FALSE 0.037 216.000 0.000 NA   NA
 518875 518876 CV3628 CV3629     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 518876 518877 CV3629 CV3630     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 518877 518878 CV3630 CV3631     FALSE 0.203 94.000 0.000 1.000 N NA
 518879 518880 CV3632 CV3633     FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 518880 518881 CV3633 CV3634     FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 518882 518883 CV3635 CV3636 dcuA   FALSE 0.217 87.000 0.000 1.000   NA
 518883 518884 CV3636 CV3637   rplI FALSE 0.203 94.000 0.000 1.000 N NA
 518884 518885 CV3637 CV3638 rplI rpsR TRUE 0.994 22.000 0.499 0.009 Y NA
 518885 518886 CV3638 CV3639 rpsR priB TRUE 0.973 6.000 0.128 1.000 N NA
 518886 518887 CV3639 CV3640 priB rpsF TRUE 0.921 19.000 0.122 1.000 N NA
 518887 518888 CV3640 CV3641 rpsF   FALSE 0.082 157.000 0.000 NA   NA
 518888 518889 CV3641 CV3642     FALSE 0.338 57.000 0.000 NA   NA
 518889 518890 CV3642 CV3643     FALSE 0.388 49.000 0.000 NA   NA
 518890 518891 CV3643 CV3644   suhB FALSE 0.152 130.000 0.000 1.000 N NA
 518892 518893 CV3645 CV3646     TRUE 0.516 56.000 0.007 NA   NA
 518895 518896 CV3648 CV3649 hemN   FALSE 0.079 170.000 0.000 1.000 N NA
 518899 518900 CV3652 CV3653 ugpQ ugpC TRUE 0.870 29.000 0.104 1.000 N NA
 518900 518901 CV3653 CV3654 ugpC   TRUE 0.992 14.000 0.272 0.049 Y NA
 518901 518902 CV3654 CV3655   ugpA TRUE 0.998 0.000 0.306 0.049 Y NA
 518902 518903 CV3655 CV3656 ugpA ugpB TRUE 0.989 58.000 0.793 0.049 Y NA
 518903 518904 CV3656 CV3657 ugpB cioB FALSE 0.069 176.000 0.000 1.000 N NA
 518904 518905 CV3657 CV3658 cioB cioA TRUE 1.000 -3.000 0.886 0.035 Y NA
 518905 518906 CV3658 CV3659 cioA   TRUE 0.996 -3.000 0.364 NA N NA
 518906 518907 CV3659 CV3660   ttuD FALSE 0.040 207.000 0.000 NA N NA
 518908 518909 CV3661 CV3662 mutS   FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 518915 518916 CV3668 CV3669   clpA TRUE 0.997 0.000 0.596 NA   NA
 518917 518918 CV3670 CV3671 xerD   TRUE 0.997 -13.000 0.046 1.000 Y NA
 518918 518919 CV3671 CV3672   rplS TRUE 0.439 73.000 0.011 1.000 N NA
 518919 518920 CV3672 CV3673 rplS trmD TRUE 0.998 4.000 0.567 1.000 Y NA
 518920 518921 CV3673 CV3674 trmD rimM TRUE 0.964 81.000 0.672 1.000 Y NA
 518921 518922 CV3674 CV3675 rimM rpsP TRUE 0.985 35.000 0.342 0.009 Y NA
 518922 518923 CV3675 CV3676 rpsP   FALSE 0.260 107.000 0.002 1.000 N NA
 518923 518924 CV3676 CV3677     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 518925 518926 CV3678 CV3679 nadA surE FALSE 0.259 116.000 0.003 1.000   NA
 518926 518927 CV3679 CV3680 surE pcm1 TRUE 0.998 -15.000 0.353 1.000   NA
 518927 518928 CV3680 CV3681 pcm1   FALSE 0.235 150.000 0.025 1.000 N NA
 518928 518929 CV3681 CV3682   rpoS TRUE 0.682 54.000 0.047 1.000 N NA
 518930 518931 CV3683 CV3684     TRUE 0.996 6.000 0.727 NA   NA
 518931 518932 CV3684 CV3685     TRUE 0.999 -16.000 0.739 NA   NA
 518933 518934 CV3686 CV3687 hda   TRUE 0.616 21.000 0.000 NA N NA
 518937 518938 CV3690 CV3691     FALSE 0.150 123.000 0.000 NA   NA
 518938 518939 CV3691 CV3692     FALSE 0.268 73.000 0.000 1.000   NA
 518939 518940 CV3692 CV3693   cheR3 FALSE 0.372 105.000 0.025 1.000 N NA
 518940 518941 CV3693 CV3694 cheR3   FALSE 0.403 68.000 0.003 NA   NA
 518941 518942 CV3694 CV3695   argC FALSE 0.222 154.000 0.031 NA   NA
 518942 518943 CV3695 CV3696 argC rpsI FALSE 0.326 132.000 0.032 1.000 N NA
 518943 518944 CV3696 CV3697 rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.009 Y NA
 518944 518945 CV3697 CV3698 rplM deoD FALSE 0.016 380.000 0.000 1.000 N NA
 518945 518946 CV3698 CV3699 deoD deoB TRUE 0.822 95.000 0.414 1.000 N NA
 518946 518947 CV3699 CV3700 deoB deoA TRUE 0.977 16.000 0.398 1.000 N NA
 518947 518948 CV3700 CV3701 deoA deoC TRUE 0.651 113.000 0.023 1.000 Y NA
 518948 518949 CV3701 CV3702 deoC relA FALSE 0.038 224.000 0.000 1.000 N NA
 518949 518950 CV3702 CV3703 relA mutY FALSE 0.298 92.000 0.002 1.000 N NA
 518950 518951 CV3703 CV3704 mutY   FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 518952 518953 CV3705 CV3706     FALSE 0.072 168.000 0.000 NA N NA
 518953 518954 CV3706 CV3707   dctA FALSE 0.106 141.000 0.000 NA N NA
 518954 518955 CV3707 CV3708 dctA   FALSE 0.170 122.000 0.000 1.000 N NA
 518958 518959 CV3711 CV3712     FALSE 0.153 120.000 0.000 NA   NA
 518959 518960 CV3712 CV3713     FALSE 0.345 56.000 0.000 NA   NA
 518961 518962 CV3714 CV3715   trpS2 FALSE 0.032 230.000 0.000 NA   NA
 518962 518963 CV3715 CV3716 trpS2   TRUE 0.553 31.000 0.000 1.000   NA
 518963 518964 CV3716 CV3717     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 518965 518966 CV3718 CV3719     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 518966 518967 CV3719 CV3720     TRUE 0.722 14.000 0.000 NA   NA
 518967 518968 CV3720 CV3721   pilZ TRUE 0.685 62.000 0.089 NA N NA
 518968 518969 CV3721 CV3722 pilZ holB TRUE 0.973 17.000 0.382 NA N NA
 518969 518970 CV3722 CV3723 holB tmk TRUE 0.991 0.000 0.211 1.000 N NA
 518970 518971 CV3723 CV3724 tmk   TRUE 0.994 -3.000 0.209 NA   NA
 518972 518973 CV3725 CV3726   modA FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 518973 518974 CV3726 CV3727 modA modB TRUE 1.000 -3.000 0.660 0.000 Y NA
 518974 518975 CV3727 CV3728 modB   TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 518975 518976 CV3728 CV3729     FALSE 0.082 157.000 0.000 NA   NA
 518976 518977 CV3729 CV3730     FALSE 0.231 80.000 0.000 1.000 N NA
 518977 518978 CV3730 CV3731     TRUE 0.981 10.000 0.250 1.000 N NA
 518979 518980 CV3732 CV3733     TRUE 0.461 38.000 0.000 NA   NA
 518980 518981 CV3733 CV3734     TRUE 0.999 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 518982 518983 CV3735 CV3736 tesA   FALSE 0.160 128.000 0.000 1.000 N NA
 518984 518985 CV3737 CV3738     TRUE 0.772 69.000 0.000 0.009 Y NA
 518985 518986 CV3738 CV3739     FALSE 0.129 138.000 0.000 1.000 N NA
 518986 518987 CV3739 CV3740   aspS FALSE 0.023 293.000 0.000 1.000 N NA
 518987 518988 CV3740 CV3741 aspS   TRUE 0.508 79.000 0.057 NA   NA
 518988 518989 CV3741 CV3742     TRUE 0.989 0.000 0.190 NA   NA
 518990 518991 CV3743 CV3744   ptb TRUE 0.898 11.000 0.000 0.049 N NA
 518991 518992 CV3744 CV3745 ptb   TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 518993 518994 CV3746 CV3747   rpsT FALSE 0.074 173.000 0.000 1.000 N NA
 518995 518996 CV3748 CV3749 mviN   TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 518996 518997 CV3749 CV3750     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 518998 518999 CV3751 CV3752 rluA   FALSE 0.225 76.000 0.000 NA   NA
 519000 519001 CV3753 CV3754     TRUE 0.702 17.000 0.000 1.000   NA
 519002 519003 CV3755 CV3756   lysR FALSE 0.014 423.000 0.000 1.000 N NA
 519007 519008 CV3760 CV3761     FALSE 0.164 104.000 0.000 NA   NA
 519008 519009 CV3761 CV_tRNAMetCAT2     FALSE 0.043 202.000 0.000 NA   NA
 519009 519010 CV_tRNAMetCAT2 CV3762   rpoD FALSE 0.183 93.000 0.000 NA   NA
 519010 519011 CV3762 CV3763 rpoD dnaG TRUE 0.798 78.000 0.299 1.000 N NA
 519011 519012 CV3763 CV3764 dnaG   TRUE 0.932 18.000 0.137 1.000   NA
 519012 519013 CV3764 CV3765   rpsU TRUE 0.721 111.000 0.173 0.014   NA
 519013 519014 CV3765 CV3766 rpsU thiG FALSE 0.139 163.000 0.003 1.000 N NA
 519014 519015 CV3766 CV3767 thiG   TRUE 0.926 49.000 0.130 1.000 Y NA
 519015 519016 CV3767 CV3768   spoT TRUE 0.972 -3.000 0.006 1.000 N NA
 519016 519017 CV3768 CV3769 spoT rpoZ TRUE 0.981 24.000 0.291 1.000 Y NA
 519017 519018 CV3769 CV3770 rpoZ gmk TRUE 0.862 81.000 0.471 1.000 N NA
 519019 519020 CV3771 CV3772   apt FALSE 0.356 82.000 0.006 1.000   NA
 519021 519022 CV3773 CV3774     TRUE 0.593 23.000 0.000 NA   NA
 519022 519023 CV3774 CV3775     TRUE 0.525 30.000 0.000 NA   NA
 519023 519024 CV3775 CV3776     TRUE 0.995 -3.000 0.261 NA   NA
 519024 519025 CV3776 CV3777     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 519026 519027 CV3778 CV3779     FALSE 0.241 73.000 0.000 NA   NA
 519028 519029 CV3780 CV3781 arcC arcB TRUE 0.533 148.000 0.033 1.000 Y NA
 519029 519030 CV3781 CV3782 arcB arcA TRUE 0.560 142.000 0.033 1.000 Y NA
 519030 519031 CV3782 CV3783 arcA arcD TRUE 0.640 72.000 0.000 1.000 Y NA
 519031 519032 CV3783 CV3784 arcD ubiB FALSE 0.010 814.000 0.000 1.000 N NA
 519033 519034 CV3785 CV3786     TRUE 0.649 38.000 0.006 1.000   NA
 519037 519038 CV3789 CV3790     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 519042 519043 CV3794 CV3795   glmM FALSE 0.096 147.000 0.000 NA   NA
 519043 519044 CV3795 CV3796 glmM folP TRUE 0.750 88.000 0.260 1.000 N NA
 519044 519045 CV3796 CV3797 folP hflB TRUE 0.763 101.000 0.325 1.000 N NA
 519045 519046 CV3797 CV3798 hflB ftsJ TRUE 0.565 82.000 0.095 NA N NA
 519048 519049 CV3800 CV3801   greA TRUE 0.760 48.000 0.089 NA   NA
 519049 519050 CV3801 CV3802 greA carB TRUE 0.577 143.000 0.241 1.000 N NA
 519050 519051 CV3802 CV3803 carB   TRUE 0.749 77.000 0.030 1.000 Y NA
 519051 519052 CV3803 CV3804   carA TRUE 0.961 15.000 0.026 1.000 Y NA
 519052 519053 CV3804 CV3805 carA gspN FALSE 0.049 203.000 0.000 1.000   NA
 519053 519054 CV3805 CV3806 gspN   FALSE 0.027 509.000 0.000 0.011   NA
 519054 519055 CV3806 CV3807   gspK TRUE 0.994 -22.000 0.051 0.049   NA
 519055 519056 CV3807 CV3808 gspK   TRUE 0.990 -3.000 0.114 NA   NA
 519056 519057 CV3808 CV3809   gspI TRUE 0.974 -3.000 0.012 NA   NA
 519057 519058 CV3809 CV3810 gspI gspH TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 519058 519059 CV3810 CV3811 gspH hofG TRUE 0.966 22.000 0.029 0.002 Y NA
 519059 519060 CV3811 CV3812 hofG hofF TRUE 0.972 85.000 0.599 0.002 Y NA
 519060 519061 CV3812 CV3813 hofF   TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 519061 519062 CV3813 CV3814     TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.002 Y NA
 519062 519063 CV3814 CV3815     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 519063 519064 CV3815 CV3816     FALSE 0.020 295.000 0.000 NA   NA
 519064 519065 CV3816 CV3817     FALSE 0.206 155.000 0.000 0.006 N NA
 519065 519066 CV3817 CV3818     TRUE 0.998 4.000 0.429 0.010 Y NA
 519069 519070 CV3821 CV3822     TRUE 0.985 -3.000 0.063 NA   NA
 519071 519072 CV3823 CV3824     TRUE 0.989 6.000 0.356 NA   NA
 519072 519073 CV3824 CV3825     TRUE 0.834 37.000 0.110 NA   NA
 519073 519074 CV3825 CV3826     TRUE 0.994 -15.000 0.122 1.000 N NA
 519074 519075 CV3826 CV3827   pilC TRUE 0.998 0.000 0.454 1.000 Y NA
 519075 519076 CV3827 CV3828 pilC pilB TRUE 0.926 126.000 0.362 0.011 Y NA
 519076 519077 CV3828 CV3829 pilB   FALSE 0.146 169.000 0.000 0.057 N NA
 519077 519078 CV3829 CV3830     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 519078 519079 CV3830 CV3831     FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 519079 519080 CV3831 CV3832     FALSE 0.295 69.000 0.000 1.000   NA
 519081 519082 CV3833 CV3834 ffh purB FALSE 0.068 177.000 0.000 1.000 N NA
 519082 519083 CV3834 CV3835 purB   FALSE 0.028 267.000 0.000 1.000   NA
 519083 519084 CV3835 CV3836     FALSE 0.018 360.000 0.000 1.000   NA
 519084 519085 CV3836 CV3837     TRUE 0.902 2.000 0.000 1.000 N NA
 519085 519086 CV3837 CV3838     TRUE 0.978 5.000 0.000 0.083 Y NA
 519086 519087 CV3838 CV3839   fdnG FALSE 0.025 279.000 0.000 1.000 N NA
 519087 519088 CV3839 CV3840 fdnG fdoH TRUE 0.999 13.000 1.000 0.001 Y NA
 519088 519089 CV3840 CV3841 fdoH fdoI TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 519089 519090 CV3841 CV3842 fdoI fdhE FALSE 0.017 318.000 0.000 NA N NA
 519090 519091 CV3842 CV3843 fdhE   FALSE 0.153 119.000 0.000 NA N NA
 519091 519092 CV3843 CV3844     TRUE 0.992 7.000 0.181 1.000 Y NA
 519095 519096 CV3847 CV3848 rph   TRUE 0.672 53.000 0.040 1.000 N NA
 519096 519097 CV3848 CV3849     TRUE 1.000 -3.000 0.829 1.000 Y NA
 519098 519099 CV3850 CV3851     FALSE 0.066 244.000 0.014 NA   NA
 519099 519100 CV3851 CV3852     FALSE 0.166 102.000 0.000 NA   NA
 519100 519101 CV3852 CV3853     FALSE 0.065 173.000 0.000 NA   NA
 519101 519102 CV3853 CV3854     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 519102 519103 CV3854 CV3855     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519103 519104 CV3855 CV3856     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519104 519105 CV3856 CV3857     FALSE 0.008 1235.000 0.000 NA   NA
 519105 519106 CV3857 CV3858     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519106 519107 CV3858 CV3859     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519107 519108 CV3859 CV3860     FALSE 0.120 135.000 0.000 NA   NA
 519108 519109 CV3860 CV3861     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 519109 519110 CV3861 CV3862     FALSE 0.393 48.000 0.000 NA   NA
 519110 519111 CV3862 CV3863     FALSE 0.018 317.000 0.000 NA   NA
 519111 519112 CV3863 CV3864     FALSE 0.028 246.000 0.000 NA   NA
 519115 519116 CV3867 CV3868     FALSE 0.155 117.000 0.000 NA   NA
 519118 519119 CV3870 CV3871     FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000   NA
 519119 519120 CV3871 CV3872     TRUE 0.997 -7.000 0.279 1.000   NA
 519120 519121 CV3872 CV3873     TRUE 0.980 -3.000 0.030 NA   NA
 519121 519122 CV3873 CV3874     FALSE 0.175 98.000 0.000 NA   NA
 519122 519123 CV3874 CV3875     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 519123 519124 CV3875 CV3876     TRUE 0.823 60.000 0.000 0.003 Y NA
 519124 519125 CV3876 CV3877   flaG TRUE 0.869 37.000 0.007 NA Y NA
 519125 519126 CV3877 CV3878 flaG fliC3 TRUE 0.593 76.000 0.000 NA Y NA
 519126 519127 CV3878 CV3879 fliC3 fliC1 FALSE 0.403 176.000 0.000 0.001 Y NA
 519127 519128 CV3879 CV3880 fliC1   FALSE 0.069 176.000 0.000 1.000   NA
 519128 519129 CV3880 CV3881     FALSE 0.011 524.000 0.000 1.000   NA
 519131 519132 CV3883 CV3884   galE FALSE 0.008 1553.000 0.000 NA   NA
 519132 519133 CV3884 CV3885 galE   FALSE 0.165 103.000 0.000 NA   NA
 519133 519134 CV3885 CV3886     TRUE 0.968 40.000 0.667 NA   NA
 519134 519135 CV3886 CV3887     FALSE 0.056 194.000 0.000 1.000   NA
 519135 519136 CV3887 CV3888     TRUE 0.891 3.000 0.000 1.000   NA
 519136 519137 CV3888 CV3889   ilvB TRUE 0.972 4.000 0.000 1.000 Y NA
 519137 519138 CV3889 CV3890 ilvB   TRUE 0.475 99.000 0.059 1.000 N NA
 519138 519139 CV3890 CV3891   rfbH TRUE 0.979 12.000 0.018 0.024 Y NA
 519139 519140 CV3891 CV3892 rfbH rfbG TRUE 0.985 17.000 0.247 1.000 Y NA
 519140 519141 CV3892 CV3893 rfbG ddhA TRUE 0.999 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 519141 519142 CV3893 CV3894 ddhA   FALSE 0.027 271.000 0.000 1.000 N NA
 519143 519144 CV3895 CV3896     TRUE 0.850 58.000 0.046 NA Y NA
 519144 519145 CV3896 CV3897     TRUE 0.932 50.000 0.160 1.000 Y NA
 519145 519146 CV3897 CV3898     FALSE 0.044 796.000 0.000 1.000 Y NA
 519146 519147 CV3898 CV3899   fecE TRUE 0.999 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 519148 519149 CV3900 CV3901 hpT galU TRUE 0.567 60.000 0.018 1.000 N NA
 519149 519150 CV3901 CV3902 galU   FALSE 0.281 71.000 0.000 1.000   NA
 519150 519151 CV3902 CV3903   lig TRUE 0.789 12.000 0.000 1.000   NA
 519151 519152 CV3903 CV3904 lig   TRUE 0.906 9.000 0.005 1.000   NA
 519154 519155 CV3906 CV3907     TRUE 0.956 -6.000 0.000 NA   NA
 519155 519156 CV3907 CV3908     FALSE 0.047 198.000 0.000 NA N NA
 519157 519158 CV3909 CV3910     TRUE 0.978 11.000 0.263 NA N NA
 519158 519159 CV3910 CV3911     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 519160 519161 CV3912 CV3913     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 519161 519162 CV3913 CV3914     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 519162 519163 CV3914 CV3915     TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 519163 519164 CV3915 CV3916     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 519164 519165 CV3916 CV3917     TRUE 0.517 103.000 0.000 1.000 Y NA
 519165 519166 CV3917 CV3918     FALSE 0.125 221.000 0.050 1.000 N NA
 519168 519169 CV3920 CV3921   argB FALSE 0.284 99.000 0.003 1.000   NA
 519170 519171 CV3922 CV3923     TRUE 0.983 -3.000 0.042 1.000 N NA
 519171 519172 CV3923 CV3924     TRUE 0.991 11.000 0.583 NA N NA
 519172 519173 CV3924 CV3925   natC TRUE 0.985 -3.000 0.061 NA N NA
 519173 519174 CV3925 CV3926 natC goaG FALSE 0.065 181.000 0.000 1.000 N NA
 519174 519175 CV3926 CV3927 goaG gabD TRUE 0.875 70.000 0.400 1.000 N NA
 519175 519176 CV3927 CV3928 gabD   FALSE 0.182 94.000 0.000 NA   NA
 519177 519178 CV_rRNA5s7 CV_rRNA23s7 rRNA5S rRNA23S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 519178 519179 CV_rRNA23s7 CV_tRNAAlaTGC7 rRNA23S   FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 519179 519180 CV_tRNAAlaTGC7 CV_tRNAIleGAT7     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 519180 519181 CV_tRNAIleGAT7 CV_rRNA16s7   rRNA16S FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 519182 519183 CV3929 CV3930   nadB FALSE 0.120 135.000 0.000 NA   NA
 519183 519184 CV3930 CV3931 nadB   FALSE 0.020 315.000 0.000 1.000   NA
 519185 519186 CV3932 CV3933     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 519186 519187 CV3933 CV3934     TRUE 0.554 27.000 0.000 NA   NA
 519187 519188 CV3934 CV3935     FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 519189 519190 CV3936 CV3937     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 519190 519191 CV3937 CV3938     FALSE 0.038 213.000 0.000 NA   NA
 519191 519192 CV3938 CV3939     FALSE 0.023 274.000 0.000 NA   NA
 519193 519194 CV3940 CV3941     TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 519194 519195 CV3941 CV3942     TRUE 0.933 26.000 0.231 NA   NA
 519195 519196 CV3942 CV3943     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 519196 519197 CV3943 CV3944     FALSE 0.209 91.000 0.000 1.000 N NA
 519197 519198 CV3944 CV3945     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 519198 519199 CV3945 CV3946   FadH TRUE 0.860 6.000 0.000 1.000 N NA
 519199 519200 CV3946 CV3947 FadH   TRUE 0.898 11.000 0.000 0.049 N NA
 519200 519201 CV3947 CV3948     TRUE 0.655 70.000 0.000 1.000 Y NA
 519201 519202 CV3948 CV3949     TRUE 0.995 -7.000 0.000 0.013 Y NA
 519202 519203 CV3949 CV3950     TRUE 0.895 20.000 0.000 NA Y NA
 519203 519204 CV3950 CV3951     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 519204 519205 CV3951 CV3952     TRUE 0.638 22.000 0.000 1.000   NA
 519205 519206 CV3952 CV3953     TRUE 0.560 30.000 0.000 1.000   NA
 519206 519207 CV3953 CV3954   idsA FALSE 0.370 57.000 0.000 1.000 N NA
 519207 519208 CV3954 CV3955 idsA   FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 519208 519209 CV3955 CV3956     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519209 519210 CV3956 CV3957   araL TRUE 0.869 5.000 0.000 1.000 N NA
 519210 519211 CV3957 CV3958 araL ispA TRUE 0.811 11.000 0.000 1.000 N NA
 519211 519212 CV3958 CV3959 ispA   TRUE 0.448 45.000 0.000 1.000 N NA
 519212 519213 CV3959 CV3960     TRUE 0.869 5.000 0.000 1.000   NA
 519213 519214 CV3960 CV3961     TRUE 0.811 11.000 0.000 1.000   NA
 519216 519217 CV3963 CV3964     FALSE 0.008 967.000 0.000 NA   NA
 519217 519218 CV3964 CV3965     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 519218 519219 CV3965 CV3966     FALSE 0.422 49.000 0.000 1.000   NA
 519219 519220 CV3966 CV3967     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519220 519221 CV3967 CV3968     TRUE 0.962 -19.000 0.000 NA   NA
 519221 519222 CV3968 CV3969     TRUE 0.827 8.000 0.000 NA   NA
 519222 519223 CV3969 CV3970     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA   NA
 519223 519224 CV3970 CV3971     FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 519224 519225 CV3971 CV3972     TRUE 0.999 -12.000 1.000 NA   NA
 519225 519226 CV3972 CV3973     TRUE 0.979 46.000 1.000 NA   NA
 519226 519227 CV3973 CV3974     TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA   NA
 519227 519228 CV3974 CV3975     TRUE 0.704 15.000 0.000 NA   NA
 519228 519229 CV3975 CV3976     FALSE 0.160 109.000 0.000 NA   NA
 519229 519230 CV3976 CV3977     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 519230 519231 CV3977 CV3978     TRUE 0.543 70.000 0.042 NA   NA
 519231 519232 CV3978 CV3979     TRUE 0.999 -3.000 0.920 NA   NA
 519232 519233 CV3979 CV3980     FALSE 0.008 1075.000 0.000 NA   NA
 519233 519234 CV3980 CV3981     TRUE 0.829 29.000 0.067 NA   NA
 519235 519236 CV3982 CV3983     TRUE 0.968 47.000 0.769 NA   NA
 519236 519237 CV3983 CV3984     TRUE 0.994 8.000 0.649 NA   NA
 519237 519238 CV3984 CV3985     TRUE 0.980 -3.000 0.033 NA   NA
 519238 519239 CV3985 CV3986     TRUE 0.616 21.000 0.000 NA   NA
 519239 519240 CV3986 CV3987     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 519240 519241 CV3987 CV3988     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 519241 519242 CV3988 CV3989     FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 519242 519243 CV3989 CV3990     FALSE 0.215 78.000 0.000 NA   NA
 519243 519244 CV3990 CV3991     TRUE 0.564 26.000 0.000 NA   NA
 519245 519246 CV3992 CV3993 cyoE cyoD TRUE 0.958 12.000 0.064 0.049 N NA
 519246 519247 CV3993 CV3994 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.273 0.035 Y NA
 519247 519248 CV3994 CV3995 cyoC cyoB TRUE 0.991 16.000 0.258 0.035 Y NA
 519248 519249 CV3995 CV3996 cyoB cyoA TRUE 0.998 7.000 0.480 0.007 Y NA
 519249 519250 CV3996 CV3997 cyoA   FALSE 0.010 511.000 0.000 NA   NA
 519250 519251 CV3997 CV_tRNAMetCAT3     TRUE 0.468 37.000 0.000 NA   NA
 519251 519252 CV_tRNAMetCAT3 CV3998   dsbA FALSE 0.089 152.000 0.000 NA   NA
 519252 519253 CV3998 CV3999 dsbA   TRUE 0.968 32.000 0.573 NA   NA
 519253 519254 CV3999 CV4000     FALSE 0.284 66.000 0.000 NA N NA
 519254 519255 CV4000 CV4001     TRUE 0.914 6.000 0.007 NA   NA
 519256 519257 CV4002 CV4003 glnK amtB TRUE 0.917 28.000 0.189 1.000 N NA
 519258 519259 CV4004 CV4005 sspB sspA TRUE 0.996 10.000 0.831 NA   NA
 519259 519260 CV4005 CV4006 sspA petC TRUE 0.628 152.000 0.370 NA N NA
 519260 519261 CV4006 CV4007 petC petB TRUE 0.997 18.000 0.630 0.001 Y NA
 519261 519262 CV4007 CV4008 petB petA TRUE 0.979 15.000 0.029 0.001 Y NA
 519262 519263 CV4008 CV4009 petA   FALSE 0.308 115.000 0.013 NA   NA
 519264 519265 CV4010 CV4011 rmlB rfbD TRUE 0.999 -3.000 0.318 0.002 Y NA
 519265 519266 CV4011 CV4012 rfbD rfbA TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 519266 519267 CV4012 CV4013 rfbA rfbC TRUE 0.968 31.000 0.208 1.000 Y NA
 519268 519269 CV4014 CV4015 groEL1 groES1 TRUE 0.987 48.000 0.538 0.005 Y NA
 519269 519270 CV4015 CV4016 groES1 rfe FALSE 0.080 169.000 0.000 1.000 N NA
 519272 519273 CV4018 CV4019   wecC FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   NA
 519273 519274 CV4019 CV4020 wecC wecB TRUE 0.979 1.000 0.000 1.000 Y NA
 519274 519275 CV4020 CV4021 wecB   TRUE 0.977 2.000 0.000 1.000 Y NA
 519275 519276 CV4021 CV4022     TRUE 0.702 17.000 0.000 1.000   NA
 519276 519277 CV4022 CV4023     TRUE 0.995 -7.000 0.167 1.000   NA
 519277 519278 CV4023 CV4024   capH TRUE 0.910 1.000 0.000 1.000   NA
 519278 519279 CV4024 CV4025 capH   TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519279 519280 CV4025 CV4026     TRUE 0.990 -10.000 0.066 NA   NA
 519280 519281 CV4026 CV4027     FALSE 0.044 201.000 0.000 NA   NA
 519281 519282 CV4027 CV4028   neuA TRUE 0.655 18.000 0.000 NA   NA
 519282 519283 CV4028 CV4029 neuA   TRUE 0.584 24.000 0.000 NA   NA
 519283 519284 CV4029 CV4030     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519284 519285 CV4030 CV4031   neuB TRUE 0.987 3.000 0.027 1.000 Y NA
 519285 519286 CV4031 CV4032 neuB   TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 519286 519287 CV4032 CV4033   neuC TRUE 0.951 20.000 0.039 1.000 Y NA
 519287 519288 CV4033 CV4034 neuC   TRUE 0.998 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 519288 519289 CV4034 CV4035     TRUE 0.998 6.000 0.418 0.024 Y NA
 519289 519290 CV4035 CV4036     TRUE 0.962 -22.000 0.000 NA   NA
 519290 519291 CV4036 CV_4037   gltD TRUE 0.449 40.000 0.000 NA   NA
 519291 519292 CV_4037 CV4038 gltD gltB TRUE 0.953 67.000 0.214 0.000 Y NA
 519293 519294 CV4039 CV4040   adi FALSE 0.012 483.000 0.000 1.000 N NA
 519295 519296 CV4041 CV4042     FALSE 0.256 75.000 0.000 1.000 N NA
 519297 519298 CV4043 CV4044     TRUE 0.811 11.000 0.000 1.000 N NA
 519299 519300 CV4045 CV4046     TRUE 0.483 35.000 0.000 NA   NA
 519302 519303 CV4048 CV4049   metB FALSE 0.363 58.000 0.000 1.000   NA
 519304 519305 CV4050 CV4051     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519306 519307 CV4052 CV4053     TRUE 0.977 72.000 0.625 0.056 Y NA
 519307 519308 CV4053 CV4054     FALSE 0.142 168.000 0.000 0.081 N NA
 519308 519309 CV4054 CV4055     FALSE 0.427 48.000 0.000 1.000 N NA
 519309 519310 CV4055 CV4056   pth TRUE 0.901 69.000 0.184 1.000 Y NA
 519310 519311 CV4056 CV4057 pth rplY TRUE 0.957 93.000 0.496 0.014 Y NA
 519311 519312 CV4057 CV4058 rplY prsA TRUE 0.750 61.000 0.122 1.000 N NA
 519312 519313 CV4058 CV_tRNAGlnTTG2 prsA   FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 519313 519314 CV_tRNAGlnTTG2 CV4059   ispE TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 519314 519315 CV4059 CV4060 ispE   TRUE 0.831 49.000 0.157 1.000 N NA
 519315 519316 CV4060 CV4061     TRUE 0.983 -3.000 0.038 1.000 N NA
 519317 519318 CV4062 CV4063 mutM plsC TRUE 0.569 46.000 0.003 1.000 N NA
 519319 519320 CV4064 CV4065     TRUE 0.998 -3.000 0.440 0.009   NA
 519320 519321 CV4065 CV4066     TRUE 0.959 17.000 0.244 NA   NA
 519321 519322 CV4066 CV4067   apaH FALSE 0.196 86.000 0.000 NA   NA
 519326 519327 CV4070 CV4071     FALSE 0.078 161.000 0.000 NA   NA
 519327 519328 CV4071 CV4072     FALSE 0.019 306.000 0.000 NA   NA
 519328 519329 CV4072 CV4073   recD FALSE 0.181 108.000 0.000 1.000   NA
 519329 519330 CV4073 CV4074 recD   FALSE 0.204 94.000 0.000 1.000   NA
 519330 519331 CV4074 CV4075     TRUE 0.671 17.000 0.000 NA   NA
 519331 519332 CV4075 CV4076   recB FALSE 0.372 52.000 0.000 NA   NA
 519332 519333 CV4076 CV4077 recB recC TRUE 1.000 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 519334 519335 CV4078 CV4079     FALSE 0.175 98.000 0.000 NA   NA
 519335 519336 CV4079 CV4080     TRUE 0.981 0.000 0.000 NA Y NA
 519336 519337 CV4080 CV4081     TRUE 0.999 -3.000 0.368 NA Y NA
 519337 519338 CV4081 CV4082     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519338 519339 CV4082 CV4083     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519339 519340 CV4083 CV4084     FALSE 0.048 197.000 0.000 NA   NA
 519340 519341 CV4084 CV4085     TRUE 0.998 22.000 0.948 0.003 Y NA
 519341 519342 CV4085 CV4086     TRUE 0.992 0.000 0.235 1.000 N NA
 519342 519343 CV4086 CV4087     FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000 N NA
 519345 519346 CV4089 CV4090   cviR FALSE 0.052 187.000 0.000 NA   NA
 519349 519350 CV4093 CV4094     FALSE 0.230 75.000 0.000 NA   NA
 519350 519351 CV4094 CV4095     TRUE 0.910 11.000 0.023 NA N NA
 519352 519353 CV4096 CV4097     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519354 519355 CV_rRNA5s8 CV_rRNA23s8 rRNA5S rRNA23S TRUE 0.898 1.000 0.000 NA   NA
 519355 519356 CV_rRNA23s8 CV_tRNAAlaTGC8 rRNA23S   FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 519356 519357 CV_tRNAAlaTGC8 CV_tRNAIleGAT8     FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 519357 519358 CV_tRNAIleGAT8 CV_rRNA16s8   rRNA16S FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 519360 519361 CV4099 CV4100 potD potC FALSE 0.412 163.000 0.000 0.048 Y NA
 519361 519362 CV4100 CV4101 potC potB TRUE 0.972 17.000 0.040 0.048 Y NA
 519362 519363 CV4101 CV4102 potB potA TRUE 0.996 10.000 0.440 1.000 Y NA
 519363 519364 CV4102 CV4103 potA ompW FALSE 0.013 459.000 0.000 1.000 N NA
 519366 519367 CV4105 CV4106     FALSE 0.273 68.000 0.000 NA   NA
 519367 519368 CV4106 CV4107     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 519370 519371 CV4109 CV4110     FALSE 0.253 71.000 0.000 NA   NA
 519373 519374 CV4112 CV4113 aspA   FALSE 0.343 147.000 0.077 1.000 N NA
 519376 519377 CV4115 CV4116     TRUE 0.891 3.000 0.000 1.000   NA
 519377 519378 CV4116 CV4117     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519378 519379 CV4117 CV4118   spsC TRUE 0.939 72.000 0.382 NA Y NA
 519379 519380 CV4118 CV4119 spsC   TRUE 0.571 153.000 0.065 1.000 Y NA
 519380 519381 CV4119 CV4120     TRUE 0.721 129.000 0.024 0.013 Y NA
 519383 519384 CV4122 CV4123   wzx TRUE 0.859 12.000 0.002 1.000   NA
 519384 519385 CV4123 CV4124 wzx   TRUE 0.956 5.000 0.045 1.000   NA
 519385 519386 CV4124 CV4125     TRUE 0.709 103.000 0.048 1.000 Y NA
 519386 519387 CV4125 CV4126     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519387 519388 CV4126 CV4127     TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 519388 519389 CV4127 CV4128     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519389 519390 CV4128 CV4129   udg TRUE 0.689 16.000 0.000 NA   NA
 519390 519391 CV4129 CV4130 udg   FALSE 0.034 237.000 0.000 1.000 N NA
 519391 519392 CV4130 CV4131     TRUE 0.915 5.000 0.005 NA N NA
 519392 519393 CV4131 CV4132     FALSE 0.407 85.000 0.025 NA N NA
 519394 519395 CV4133 CV_tRNAMetCAT4     FALSE 0.192 88.000 0.000 NA   NA
 519395 519396 CV_tRNAMetCAT4 CV_tRNAMetCAT5     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 519396 519397 CV_tRNAMetCAT5 CV4134     FALSE 0.145 126.000 0.000 NA   NA
 519397 519398 CV4134 CV4135     TRUE 0.877 3.000 0.000 NA   NA
 519400 519401 CV4137 CV4138     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 519402 519403 CV4139 CV4140     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519403 519404 CV4140 CV4141     FALSE 0.159 112.000 0.000 NA   NA
 519404 519405 CV4141 CV4142   hoxX FALSE 0.176 115.000 0.000 1.000 N NA
 519405 519406 CV4142 CV4143 hoxX   FALSE 0.175 116.000 0.000 1.000 N NA
 519407 519408 CV4144 CV4145     TRUE 0.989 -13.000 0.041 1.000   NA
 519408 519409 CV4145 CV4146   rluB FALSE 0.288 70.000 0.000 1.000 N NA
 519409 519410 CV4146 CV4147 rluB   FALSE 0.051 200.000 0.000 1.000 N NA
 519410 519411 CV4147 CV4148     FALSE 0.220 77.000 0.000 NA   NA
 519411 519412 CV4148 CV4149     TRUE 0.509 32.000 0.000 NA   NA
 519412 519413 CV4149 CV4150     FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 519413 519414 CV4150 CV4151     FALSE 0.009 599.000 0.000 NA   NA
 519414 519415 CV4151 CV4152     TRUE 0.998 -19.000 0.457 NA   NA
 519415 519416 CV4152 CV4153   corC TRUE 0.978 4.000 0.150 NA   NA
 519416 519417 CV4153 CV4154 corC lnt TRUE 0.852 5.000 0.000 NA N NA
 519418 519419 CV4155 CV4156     FALSE 0.369 176.000 0.000 0.012 Y NA
 519420 519421 CV4157 CV4158     TRUE 0.528 34.000 0.000 1.000   NA
 519422 519423 CV4159 CV4160 rplQ rpoA TRUE 0.988 25.000 0.873 1.000 N NA
 519423 519424 CV4160 CV4161 rpoA rpsD TRUE 0.976 24.000 0.549 1.000 N NA
 519424 519425 CV4161 CV4162 rpsD rpsK TRUE 0.995 19.000 0.509 0.012 Y NA
 519425 519426 CV4162 CV4163 rpsK rpsM TRUE 0.998 18.000 0.810 0.009 Y NA
 519426 519427 CV4163 CV4164 rpsM rpmJ TRUE 0.841 71.000 0.194 0.009   NA
 519427 519428 CV4164 CV_4165 rpmJ infA TRUE 0.835 38.000 0.104 1.000   NA
 519428 519429 CV_4165 CV4166 infA secY TRUE 0.877 24.000 0.083 1.000 N NA
 519429 519430 CV4166 CV4167 secY rplO TRUE 0.993 12.000 0.730 1.000 N NA
 519430 519431 CV4167 CV4168 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.001 Y NA
 519431 519432 CV4168 CV4169 rpmD rpsE TRUE 1.000 -7.000 0.789 0.012 Y NA
 519432 519433 CV4169 CV4170 rpsE rplR TRUE 0.998 14.000 0.814 0.012 Y NA
 519433 519434 CV4170 CV4171 rplR rplF TRUE 0.998 14.000 0.815 0.009 Y NA
 519434 519435 CV4171 CV4172 rplF rpsH TRUE 0.999 10.000 0.808 0.009 Y NA
 519435 519436 CV4172 CV4173 rpsH rpsN TRUE 0.993 16.000 0.295 0.009 Y NA
 519436 519437 CV4173 CV4174 rpsN rplE TRUE 0.997 5.000 0.309 0.009 Y NA
 519437 519438 CV4174 CV4175 rplE rplX TRUE 0.999 10.000 0.758 0.009 Y NA
 519438 519439 CV4175 CV4176 rplX rplN TRUE 0.999 12.000 0.810 0.012 Y NA
 519439 519440 CV4176 CV4177 rplN rpsQ TRUE 0.890 210.000 0.791 0.012 Y NA
 519440 519441 CV4177 CV4178 rpsQ rpmC TRUE 0.999 2.000 0.828 0.009   NA
 519441 519442 CV4178 CV4179 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009   NA
 519442 519443 CV4179 CV4180 rplP rpsC TRUE 1.000 -16.000 0.828 0.012 Y NA
 519443 519444 CV4180 CV4181 rpsC rplV TRUE 0.998 11.000 0.719 0.012 Y NA
 519444 519445 CV4181 CV4182 rplV rpsS TRUE 0.999 10.000 0.769 0.012 Y NA
 519445 519446 CV4182 CV4183 rpsS rplB TRUE 0.999 7.000 0.820 0.012 Y NA
 519446 519447 CV4183 CV4184 rplB rplW TRUE 0.999 12.000 0.849 0.011 Y NA
 519447 519448 CV4184 CV4185 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 519448 519449 CV4185 CV4186 rplD rplC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.009 Y NA
 519449 519450 CV4186 CV4187 rplC rpsJ TRUE 0.841 158.000 0.307 0.012 Y NA
 519450 519451 CV4187 CV4188 rpsJ tufA TRUE 0.933 18.000 0.003 1.000 Y NA
 519451 519452 CV4188 CV4189 tufA fusA TRUE 0.990 73.000 1.000 0.001 Y NA
 519452 519453 CV4189 CV4190 fusA rpsG TRUE 0.897 28.000 0.003 1.000 Y NA
 519453 519454 CV4190 CV4191 rpsG rpsL TRUE 0.966 113.000 0.620 0.002 Y NA
 519454 519455 CV4191 CV4192 rpsL rpoC FALSE 0.341 165.000 0.122 1.000 N NA
 519455 519456 CV4192 CV4193 rpoC rpoB TRUE 0.981 58.000 0.851 0.001   NA
 519456 519457 CV4193 CV4194 rpoB rplL TRUE 0.510 155.000 0.223 1.000   NA
 519457 519458 CV4194 CV4195 rplL rplJ TRUE 0.993 37.000 0.884 1.000 Y NA
 519458 519459 CV4195 CV_tRNAThrGGT1 rplJ   FALSE 0.194 87.000 0.000 NA   NA
 519459 519460 CV_tRNAThrGGT1 CV4196   rplA FALSE 0.057 180.000 0.000 NA   NA
 519460 519461 CV4196 CV4197 rplA rplK TRUE 0.999 2.000 0.838 0.012 Y NA
 519461 519462 CV4197 CV4198 rplK nusG TRUE 0.892 101.000 0.681 1.000 N NA
 519462 519463 CV4198 CV4199 nusG secE TRUE 0.998 0.000 0.843 1.000 N NA
 519463 519464 CV4199 CV_tRNATrpCCA secE   FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 519464 519465 CV_tRNATrpCCA CV4200   tufB TRUE 0.789 11.000 0.000 NA   NA
 519465 519466 CV4200 CV_tRNAThrGGT2 tufB   TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 519466 519467 CV_tRNAThrGGT2 CV_tRNAGlyTCC     TRUE 0.574 25.000 0.000 NA   NA
 519467 519468 CV_tRNAGlyTCC CV_tRNATyrGTA2     FALSE 0.364 53.000 0.000 NA   NA
 519468 519469 CV_tRNATyrGTA2 CV4201   fdx1 FALSE 0.109 140.000 0.000 NA   NA
 519469 519470 CV4201 CV4202 fdx1   FALSE 0.313 110.000 0.010 1.000   NA
 519471 519472 CV4203 CV4204 ftsY ftsE TRUE 0.811 61.000 0.117 0.062 N NA
 519472 519473 CV4204 CV4205 ftsE ftsX TRUE 0.994 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 519473 519474 CV4205 CV4206 ftsX rpoH FALSE 0.283 129.000 0.011 1.000 N NA
 519475 519476 CV4207 CV4208     TRUE 0.530 93.000 0.000 NA Y NA
 519476 519477 CV4208 CV4209   pilE2 FALSE 0.131 131.000 0.000 NA N NA
 519478 519479 CV4210 CV4211 bioA   FALSE 0.077 163.000 0.000 NA   NA
 519479 519480 CV4211 CV4212   proB TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 519480 519481 CV4212 CV4213 proB potF1 TRUE 0.546 94.000 0.000 1.000 Y NA
 519482 519483 CV4214 CV4215   ruvB FALSE 0.010 564.000 0.000 NA   NA
 519484 519485 CV4216 CV4217 ribB   TRUE 0.946 12.000 0.000 1.000 Y NA
 519485 519486 CV4217 CV4218     FALSE 0.219 86.000 0.000 1.000 N NA
 519486 519487 CV4218 CV4219     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519487 519488 CV4219 CV4220     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 519488 519489 CV4220 CV4221     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 519490 519491 CV4222 CV4223   ruvA FALSE 0.388 54.000 0.000 1.000 N NA
 519493 519494 CV4225 CV4226 ruvC   TRUE 0.968 -3.000 0.002 1.000 N NA
 519494 519495 CV4226 CV4227     TRUE 0.765 12.000 0.000 NA   NA
 519495 519496 CV4227 CV4228     TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 519497 519498 CV4229 CV4230 IMP surA TRUE 0.960 13.000 0.168 1.000 N NA
 519498 519499 CV4230 CV4231 surA pdxA TRUE 0.997 0.000 0.561 1.000 N NA
 519500 519501 CV4232 CV4233     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519501 519502 CV4233 CV4234     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519503 519504 CV4235 CV4236     FALSE 0.281 71.000 0.000 1.000   NA
 519504 519505 CV4236 CV4237     FALSE 0.136 135.000 0.000 1.000   NA
 519505 519506 CV4237 CV4238     TRUE 0.441 41.000 0.000 NA   NA
 519506 519507 CV4238 CV4239     FALSE 0.071 169.000 0.000 NA   NA
 519508 519509 CV4240 CV4241     FALSE 0.024 270.000 0.000 NA   NA
 519509 519510 CV4241 CV4242     FALSE 0.123 134.000 0.000 NA   NA
 519514 519515 CV4246 CV4247   exoA TRUE 0.910 0.000 0.000 NA   NA
 519516 519517 CV4248 CV4249 pyrE   TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519518 519519 CV4250 CV_tRNALysTTT1     FALSE 0.048 195.000 0.000 NA   NA
 519519 519520 CV_tRNALysTTT1 CV_tRNALysCTT1     TRUE 0.455 39.000 0.000 NA   NA
 519520 519521 CV_tRNALysCTT1 CV_tRNALysTTT2     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 519521 519522 CV_tRNALysTTT2 CV_tRNALysCTT2     TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 519522 519523 CV_tRNALysCTT2 CV_tRNALysTTT3     TRUE 0.461 38.000 0.000 NA   NA
 519523 519524 CV_tRNALysTTT3 CV4251   cutA FALSE 0.131 131.000 0.000 NA   NA
 519525 519526 CV4252 CV4253   dps FALSE 0.017 367.000 0.000 1.000   NA
 519526 519527 CV4253 CV4254 dps   FALSE 0.211 90.000 0.000 1.000 N NA
 519527 519528 CV4254 CV4255     TRUE 0.859 15.000 0.018 NA   NA
 519528 519529 CV4255 CV4256     TRUE 0.818 32.000 0.069 NA   NA
 519529 519530 CV4256 CV4257     TRUE 0.812 30.000 0.048 1.000   NA
 519531 519532 CV4258 CV4259 moeB   FALSE 0.221 141.000 0.010 1.000 N NA
 519532 519533 CV4259 CV4260   atoS TRUE 0.997 0.000 0.171 0.062 Y NA
 519533 519534 CV4260 CV4261 atoS   TRUE 0.998 0.000 0.810 NA   NA
 519534 519535 CV4261 CV4262     TRUE 0.967 5.000 0.094 NA   NA
 519535 519536 CV4262 CV4263   htpX2 TRUE 0.651 67.000 0.075 1.000 N NA
 519536 519537 CV4263 CV4264 htpX2 fmt TRUE 0.685 43.000 0.021 1.000 N NA
 519537 519538 CV4264 CV4265 fmt def TRUE 0.889 75.000 0.105 0.013 Y NA
 519539 519540 CV4266 CV4267   smf TRUE 0.982 -3.000 0.033 1.000   NA
 519540 519541 CV4267 CV4268 smf smg TRUE 0.872 30.000 0.124 NA   NA
 519541 519542 CV4268 CV4269 smg topA FALSE 0.246 151.000 0.040 NA   NA
 519544 519545 CV4271 CV4272     FALSE 0.161 108.000 0.000 NA   NA
 519546 519547 CV4273 CV4274   dgkA FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 519547 519548 CV4274 CV4275 dgkA gshB FALSE 0.245 77.000 0.000 1.000 N NA
 519548 519549 CV4275 CV4276 gshB   TRUE 0.920 19.000 0.120 1.000   NA
 519549 519550 CV4276 CV4277     FALSE 0.268 73.000 0.000 1.000   NA
 519550 519551 CV4277 CV4278     FALSE 0.313 156.000 0.000 NA Y NA
 519553 519554 CV4280 CV4281   secA FALSE 0.024 269.000 0.000 NA   NA
 519555 519556 CV4282 CV4283 phoD   FALSE 0.054 493.000 0.000 1.000 Y NA
 519556 519557 CV4283 CV4284     TRUE 0.953 11.000 0.000 1.000 Y NA
 519557 519558 CV4284 CV4285     FALSE 0.056 182.000 0.000 NA   NA
 519558 519559 CV4285 CV4286     FALSE 0.164 104.000 0.000 NA   NA
 519559 519560 CV4286 CV4287     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 519560 519561 CV4287 CV4288     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 519561 519562 CV4288 CV4289   proA FALSE 0.208 92.000 0.000 1.000 N NA
 519562 519563 CV4289 CV4290 proA   FALSE 0.208 92.000 0.000 1.000 N NA
 519564 519565 CV4291 CV4292 catF   TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 N NA
 519565 519566 CV4292 CV4293   hetM TRUE 0.852 70.000 0.333 1.000 N NA
 519567 519568 CV4294 CV4295     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 519568 519569 CV4295 CV4296     FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 519569 519570 CV4296 CV4297   trg FALSE 0.139 129.000 0.000 NA   NA
 519570 519571 CV4297 CV4298 trg   FALSE 0.048 204.000 0.000 1.000 N NA
 519575 519576 CV4302 CV4303 betT   TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 519576 519577 CV4303 CV4304     FALSE 0.062 175.000 0.000 NA   NA
 519578 519579 CV4305 CV4306   preP FALSE 0.055 273.000 0.000 0.021 N NA
 519579 519580 CV4306 CV4307 preP   FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 519580 519581 CV4307 CV4308     TRUE 0.889 2.000 0.000 NA   NA
 519581 519582 CV4308 CV4309     TRUE 0.861 29.000 0.000 1.000 Y NA
 519582 519583 CV4309 CV4310     TRUE 0.770 13.000 0.000 1.000   NA
 519587 519588 CV4314 CV4315   cdh FALSE 0.158 112.000 0.000 NA N NA
 519588 519589 CV4315 CV4316 cdh   FALSE 0.049 194.000 0.000 NA   NA
 519590 519591 CV4317 CV4318   luxE TRUE 0.560 30.000 0.000 1.000 N NA
 519591 519592 CV4318 CV4319 luxE   TRUE 0.997 2.000 0.158 0.000 Y NA
 519592 519593 CV4319 CV4320     TRUE 0.964 43.000 0.273 1.000 Y NA
 519593 519594 CV4320 CV4321     TRUE 0.999 -3.000 0.545 0.047   NA
 519595 519596 CV4322 CV4323     TRUE 0.475 36.000 0.000 NA   NA
 519596 519597 CV4323 CV4324     FALSE 0.026 255.000 0.000 NA   NA
 519597 519598 CV4324 CV4325   oppF FALSE 0.163 105.000 0.000 NA   NA
 519598 519599 CV4325 CV4326 oppF oppD TRUE 1.000 -7.000 0.420 0.001 Y NA
 519599 519600 CV4326 CV4327 oppD oppC TRUE 0.991 24.000 0.554 1.000 Y NA
 519600 519601 CV4327 CV4328 oppC oppB TRUE 0.998 13.000 0.870 0.047 Y NA
 519601 519602 CV4328 CV4329 oppB   TRUE 0.791 135.000 0.123 0.047 Y NA
 519602 519603 CV4329 CV4330   pyrC FALSE 0.014 422.000 0.000 1.000 N NA
 519603 519604 CV4330 CV4331 pyrC   TRUE 0.856 13.000 0.004 1.000 N NA
 519605 519606 CV4332 CV4333     TRUE 0.834 15.000 0.009 NA   NA
 519606 519607 CV4333 CV4334     FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 519608 519609 CV4335 CV4336 moaC   TRUE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 519609 519610 CV4336 CV4337   lpxC TRUE 0.852 5.000 0.000 NA   NA
 519610 519611 CV4337 CV4338 lpxC ftsZ TRUE 0.574 110.000 0.134 1.000 N NA
 519611 519612 CV4338 CV4339 ftsZ ftsA TRUE 0.921 106.000 0.460 1.000 Y NA
 519612 519613 CV4339 CV4340 ftsA ftsQ TRUE 0.923 47.000 0.389 NA N NA
 519613 519614 CV4340 CV4341 ftsQ ddlB TRUE 0.999 -10.000 0.372 NA Y NA
 519614 519615 CV4341 CV4342 ddlB murC TRUE 0.957 50.000 0.153 0.003 Y NA
 519615 519616 CV4342 CV4343 murC murG TRUE 0.969 38.000 0.283 1.000 Y NA
 519616 519617 CV4343 CV4344 murG ftsW TRUE 0.995 6.000 0.647 1.000 N NA
 519617 519618 CV4344 CV4345 ftsW murD TRUE 0.998 -3.000 0.297 0.002 N NA
 519618 519619 CV4345 CV4346 murD mraY TRUE 0.998 11.000 0.647 0.003 Y NA
 519619 519620 CV4346 CV4347 mraY murF TRUE 0.998 2.000 0.309 0.003 Y NA
 519620 519621 CV4347 CV4348 murF murE TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 519621 519622 CV4348 CV4349 murE ftsI TRUE 0.979 5.000 0.008 1.000 Y NA
 519622 519623 CV4349 CV4350 ftsI   TRUE 0.963 0.000 0.012 1.000 N NA
 519623 519624 CV4350 CV4351     TRUE 0.995 -3.000 0.227 1.000 N NA
 519624 519625 CV4351 CV4352     TRUE 0.998 -3.000 0.635 NA   NA
 519627 519628 CV4354 CV4355 gatB gatA TRUE 0.905 161.000 0.492 0.001 Y NA
 519628 519629 CV4355 CV4356 gatA gatC TRUE 0.976 83.000 0.643 0.001 Y NA
 519630 519631 CV4357 CV4358 mreB mreC TRUE 0.949 62.000 0.689 1.000 N NA
 519631 519632 CV4358 CV4359 mreC mreD TRUE 0.998 7.000 0.550 0.001 Y NA
 519632 519633 CV4359 CV4360 mreD mrdA TRUE 0.977 15.000 0.108 1.000 Y NA
 519633 519634 CV4360 CV4361 mrdA mrdB TRUE 0.777 44.000 0.073 1.000 N NA
 519634 519635 CV4361 CV4362 mrdB pqqL FALSE 0.109 147.000 0.000 1.000 N NA
 519636 519637 CV_4363 CV4364 dinP   FALSE 0.009 668.000 0.000 NA   NA
 519638 519639 CV4365 CV4366   araC FALSE 0.297 64.000 0.000 NA N NA
 519639 519640 CV4366 CV4367 araC   FALSE 0.176 97.000 0.000 NA N NA
 519640 519641 CV4367 CV4368     TRUE 0.995 -3.000 0.254 NA   NA
 519642 519643 CV4369 CV4370   aroP FALSE 0.039 221.000 0.000 1.000   NA
 519645 519646 CV4372 CV4373     FALSE 0.056 182.000 0.000 NA N NA
 519646 519647 CV4373 CV4374     FALSE 0.221 85.000 0.000 1.000   NA
 519647 519648 CV4374 CV4375   paiA TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 519648 519649 CV4375 CV4376 paiA bioC TRUE 0.518 35.000 0.000 1.000   NA
 519649 519650 CV4376 CV4377 bioC bioH TRUE 0.992 -3.000 0.046 0.001   NA
 519650 519651 CV4377 CV4378 bioH   TRUE 0.610 70.000 0.065 1.000   NA
 519651 519652 CV4378 CV4379     TRUE 0.965 -10.000 0.000 1.000   NA
 519652 519653 CV4379 CV4380   bioF FALSE 0.174 117.000 0.000 1.000 N NA
 519653 519654 CV4380 CV4381 bioF bioB TRUE 0.887 109.000 0.168 0.001 Y NA
 519655 519656 CV4382 CV4383 comF   TRUE 0.749 41.000 0.045 1.000   NA
 519656 519657 CV4383 CV4384   rlpA TRUE 0.640 38.000 0.008 NA N NA
 519659 519660 CV4386 CV4387 cyc   TRUE 0.610 117.000 0.186 NA N NA
 519660 519661 CV4387 CV4388   nrfE TRUE 0.998 0.000 0.399 NA Y NA
 519661 519662 CV4388 CV4389 nrfE   FALSE 0.157 129.000 0.000 1.000   NA
 519662 519663 CV4389 CV4390     TRUE 0.456 44.000 0.000 1.000   NA
 519663 519664 CV4390 CV4391     FALSE 0.098 146.000 0.000 NA   NA
 519664 519665 CV4391 CV4392     FALSE 0.101 144.000 0.000 NA   NA
 519665 519666 CV4392 CV4393     TRUE 0.801 20.000 0.000 0.047 N NA
 519666 519667 CV4393 CV4394     TRUE 0.992 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 519667 519668 CV4394 CV4395     TRUE 0.999 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 519669 519670 CV4396 CV4397     TRUE 0.999 3.000 1.000 1.000 Y NA
 519670 519671 CV4397 CV4398   macA TRUE 0.989 -3.000 0.096 1.000 N NA
 519671 519672 CV4398 CV4399 macA   TRUE 0.959 7.000 0.082 NA   NA
 519672 519673 CV4399 CV4400     TRUE 0.959 -9.000 0.000 NA   NA
 519673 519674 CV4400 CV4401     FALSE 0.014 385.000 0.000 NA   NA
 519674 519675 CV4401 CV4402     FALSE 0.187 91.000 0.000 NA   NA
 519675 519676 CV4402 CV4403   thdF FALSE 0.016 334.000 0.000 NA   NA
 519676 519677 CV4403 CV4404 thdF yidC TRUE 0.761 107.000 0.221 0.047   NA
 519677 519678 CV4404 CV4405 yidC   TRUE 0.974 20.000 0.461 NA   NA
 519678 519679 CV4405 CV4406   rnpA TRUE 0.998 -3.000 0.540 NA   NA
 519679 519680 CV4406 CV4407 rnpA rpmH TRUE 0.997 5.000 0.787 1.000   NA