MicrobesOnline Operon Predictions for Photorhabdus luminescens TTO1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 547430 547431 plu0001 plu0002 dnaA dnaN TRUE 0.998 5.000 0.328 1.000 Y 0.855
 547431 547432 plu0002 plu0003 dnaN recF TRUE 0.994 22.000 0.318 1.000 Y 0.904
 547432 547433 plu0003 plu0004 recF gyrB TRUE 0.997 20.000 0.249 0.006 Y 0.564
 547433 547434 plu0004 plu0005 gyrB   FALSE 0.261 141.000 0.000 NA   0.126
 547435 547436 plu0006 plu0007   asd FALSE 0.203 167.000 0.000 1.000   -0.660
 547436 547437 plu0007 plu0008 asd ogrK FALSE 0.148 207.000 0.000 1.000   0.093
 547437 547438 plu0008 plu0009 ogrK   TRUE 0.917 77.000 0.500 NA   0.757
 547438 547439 plu0009 plu0010     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   0.272
 547439 547440 plu0010 plu0011     TRUE 0.963 3.000 0.000 NA   0.891
 547440 547441 plu0011 plu0012     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 547441 547442 plu0012 plu0013     TRUE 0.995 15.000 0.600 NA   NA
 547442 547443 plu0013 plu0014     TRUE 0.980 27.000 0.400 NA   0.987
 547443 547444 plu0014 plu0015     TRUE 0.998 11.000 0.667 NA   0.983
 547445 547446 plu0016 plu0017     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547446 547447 plu0017 plu0018     TRUE 0.922 16.000 0.000 NA   0.453
 547448 547449 plu0019 plu0020     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.935
 547449 547450 plu0020 plu0021     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.891
 547450 547451 plu0021 plu0022     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.951
 547451 547452 plu0022 plu0023     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   0.975
 547452 547453 plu0023 plu0024     TRUE 0.998 5.000 0.667 NA   0.997
 547453 547454 plu0024 plu0025     TRUE 0.963 0.000 0.000 NA   0.995
 547454 547455 plu0025 plu0026     FALSE 0.024 497.000 0.000 NA   0.985
 547455 547456 plu0026 plu0027     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 547459 547460 plu0030 plu0031     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547460 547461 plu0031 plu0032     TRUE 0.957 10.000 0.000 NA   0.896
 547462 547463 plu0033 plu0034     TRUE 0.676 48.000 0.000 NA   0.912
 547463 547464 plu0034 plu0035   rpmJ FALSE 0.028 415.000 0.000 NA   NA
 547464 547465 plu0035 plu0036 rpmJ rpmE TRUE 0.961 20.000 0.000 0.016   NA
 547465 547466 plu0036 plu0037 rpmE glmS FALSE 0.108 149.000 0.000 1.000 N -0.441
 547466 547467 plu0037 plu0038 glmS glmU TRUE 0.724 108.000 0.055 1.000 Y -0.082
 547467 547468 plu0038 plu0039 glmU atpC FALSE 0.189 129.000 0.067 1.000 N -0.151
 547468 547469 plu0039 plu0040 atpC atpD TRUE 0.999 22.000 0.837 0.003 Y -0.439
 547469 547470 plu0040 plu0041 atpD atpG TRUE 0.999 35.000 0.724 0.003 Y 0.954
 547470 547471 plu0041 plu0042 atpG atpA TRUE 0.997 59.000 0.846 0.003 Y 0.778
 547471 547472 plu0042 plu0043 atpA atpH TRUE 1.000 15.000 0.864 0.003 Y 0.559
 547472 547473 plu0043 plu0044 atpH atpF TRUE 0.998 13.000 0.242 0.003 Y 0.722
 547473 547474 plu0044 plu0045 atpF atpE TRUE 0.995 59.000 0.666 0.003 Y 0.795
 547474 547475 plu0045 plu0046 atpE atpB TRUE 0.993 54.000 0.557 0.003 Y 0.016
 547475 547476 plu0046 plu0047 atpB atpI TRUE 0.986 31.000 0.291 1.000 Y -0.075
 547476 547477 plu0047 plu0048 atpI gidB FALSE 0.004 611.000 0.005 1.000 N 0.927
 547477 547478 plu0048 plu0049 gidB gidA TRUE 0.991 14.000 0.466 1.000 N 0.383
 547478 547479 plu0049 plu0050 gidA mioC FALSE 0.020 381.000 0.000 1.000 N 0.571
 547479 547480 plu0050 plu0051 mioC asnC TRUE 0.550 92.000 0.165 1.000 N 0.567
 547482 547483 plu0053 plu0054     TRUE 0.996 5.000 0.443 NA   0.471
 547484 547485 plu0055 plu0056 rbsD rbsA TRUE 0.998 8.000 0.337 1.000 Y 0.932
 547485 547486 plu0056 plu0057 rbsA rbsC TRUE 0.999 7.000 0.504 1.000 Y 0.902
 547486 547487 plu0057 plu0058 rbsC rbsB TRUE 0.998 25.000 0.847 NA Y 0.785
 547487 547488 plu0058 plu0059 rbsB rbsK TRUE 0.960 64.000 0.347 NA Y 0.997
 547488 547489 plu0059 plu0060 rbsK rbsR TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 N 0.869
 547490 547491 plu0061 plu0062     TRUE 0.432 70.000 0.000 NA   -0.749
 547491 547492 plu0062 plu0063     TRUE 0.856 -19.000 0.000 NA   0.718
 547493 547494 plur001 plut001 16s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 547494 547495 plut001 plur002 tRNA-Glu 23s_rRNA FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 547495 547496 plur002 plur003 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.229 142.000 0.000 NA   NA
 547496 547497 plur003 plu0064 5s_rRNA   FALSE 0.174 171.000 0.000 NA   NA
 547497 547498 plu0064 plu0065     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 547498 547499 plu0065 plu0066     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 547499 547500 plu0066 plu0067     TRUE 0.841 -15.000 0.000 NA   NA
 547501 547502 plu0068 plu0069     TRUE 0.771 -84.000 0.000 NA   NA
 547502 547503 plu0069 plu0070     FALSE 0.073 316.000 0.000 NA   0.850
 547503 547504 plu0070 plu0071     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.803
 547504 547505 plu0071 plu0072     FALSE 0.110 249.000 0.000 NA   0.641
 547505 547506 plu0072 plu0073     TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   0.973
 547506 547507 plu0073 plu0074   acs TRUE 0.725 65.000 0.147 NA   0.944
 547508 547509 plu0075 plu0076 sodA   TRUE 0.536 119.000 0.129 1.000   0.703
 547509 547510 plu0076 plu0077     FALSE 0.045 385.000 0.000 1.000   0.430
 547510 547511 plu0077 plu0078     TRUE 0.984 -7.000 0.298 NA   NA
 547512 547513 plu0079 plu0080     TRUE 0.984 2.000 0.167 NA   -0.178
 547513 547514 plu0080 plu0081     TRUE 0.943 -31.000 0.200 NA   0.187
 547514 547515 plu0081 plu0082     TRUE 0.902 28.000 0.120 NA   0.437
 547517 547518 plu0084 plu0085 trpS gph TRUE 0.979 5.000 0.118 1.000   0.748
 547518 547519 plu0085 plu0086 gph rpe TRUE 0.951 -10.000 0.120 1.000   0.820
 547519 547520 plu0086 plu0087 rpe dam FALSE 0.322 61.000 0.040 1.000 N 0.654
 547520 547521 plu0087 plu0088 dam damX TRUE 0.788 85.000 0.234 NA   0.804
 547521 547522 plu0088 plu0089 damX aroB FALSE 0.070 293.000 0.022 NA   0.928
 547522 547523 plu0089 plu0090 aroB aroK TRUE 0.960 48.000 0.208 1.000 Y 0.721
 547523 547524 plu0090 plu0091 aroK   FALSE 0.247 370.000 0.319 1.000   0.292
 547524 547525 plu0091 plu0092     TRUE 0.897 -7.000 0.009 NA   0.930
 547525 547526 plu0092 plu0093     TRUE 0.957 -13.000 0.174 NA   0.653
 547526 547527 plu0093 plu0094     TRUE 0.999 0.000 0.870 NA   0.739
 547530 547531 plu0097 plu0098   hslR TRUE 0.396 68.000 0.010 1.000   0.056
 547531 547532 plu0098 plu0099 hslR hslO TRUE 0.912 23.000 0.140 1.000 N 0.920
 547532 547533 plu0099 plu0100 hslO pckA FALSE 0.053 240.000 0.048 1.000 N 0.222
 547535 547536 plu0102 plu0103     TRUE 0.997 0.000 0.206 1.000 Y 0.864
 547536 547537 plu0103 plu0104     TRUE 0.723 108.000 0.235 NA   -0.049
 547537 547538 plu0104 plu0105   pulA FALSE 0.011 704.000 0.000 NA   0.222
 547538 547539 plu0105 plu0106 pulA   FALSE 0.055 355.000 0.000 NA   0.708
 547539 547540 plu0106 plu0107     TRUE 0.573 52.000 0.033 NA   0.564
 547540 547541 plu0107 plu0108     TRUE 0.959 8.000 0.000 NA   0.855
 547541 547542 plu0108 plu0109     TRUE 0.948 -3.000 0.027 NA   0.803
 547544 547545 plu0111 plu0112 cynT cynS TRUE 0.954 28.000 0.000 1.000 Y 0.226
 547547 547548 plu0114 plu0115     TRUE 0.958 0.000 0.000 NA   -0.211
 547548 547549 plu0115 plu0116     FALSE 0.006 1853.000 0.000 NA   -0.361
 547549 547550 plu0116 plu0117     TRUE 0.760 25.000 0.000 1.000 N 0.887
 547554 547555 plu0121 plu0122 uspA gdhA FALSE 0.044 262.000 0.000 1.000 N 0.388
 547556 547557 plu0123 plu0124   opdA TRUE 0.973 7.000 0.098 NA   0.734
 547558 547559 plut002 plu0125 tRNA-SeC(p)   FALSE 0.181 167.000 0.000 NA   NA
 547559 547560 plu0125 plu0126     TRUE 0.522 63.000 0.000 NA   0.478
 547560 547561 plu0126 plu0127   ISPlu4G FALSE 0.144 189.000 0.000 NA   NA
 547562 547563 plu0128 plu0129     FALSE 0.218 148.000 0.000 NA   NA
 547563 547564 plu0129 plu0130     FALSE 0.085 252.000 0.000 NA   NA
 547565 547566 plu0131 plu0132     TRUE 0.794 33.000 0.000 NA   0.304
 547566 547567 plu0132 plu0133     FALSE 0.269 138.000 0.000 NA   0.162
 547567 547568 plu0133 plu0134     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   -0.937
 547568 547569 plu0134 plu0135     TRUE 0.476 75.000 0.000 NA   0.931
 547569 547570 plu0135 plu0136     FALSE 0.354 114.000 0.000 NA   0.441
 547570 547571 plu0136 plu0137     TRUE 0.397 88.000 0.000 NA   -0.584
 547571 547572 plu0137 plu0138     FALSE 0.333 106.000 0.000 NA   NA
 547574 547575 plu0140 plu0141     TRUE 0.990 44.000 1.000 NA   0.166
 547575 547576 plu0141 plu0142     TRUE 0.997 20.000 0.875 NA   0.278
 547576 547577 plu0142 plu0143     TRUE 0.920 22.000 0.000 0.067 N 0.912
 547577 547578 plu0143 plu0144     TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.001 Y 0.073
 547578 547579 plu0144 plu0145     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.067 N 0.155
 547579 547580 plu0145 plu0146     FALSE 0.312 58.000 0.000 1.000 N -0.237
 547580 547581 plu0146 plu0147     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 547581 547582 plu0147 plu0148     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547583 547584 plu0149 plu0150     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 547585 547586 plu0151 plu0152     TRUE 0.820 -19.000 0.000 NA   NA
 547586 547587 plu0152 plu0153     FALSE 0.021 539.000 0.000 NA   0.969
 547587 547588 plu0153 plu0154     TRUE 0.989 -3.000 0.222 NA   0.590
 547590 547591 plu0156 plu0157   cipB FALSE 0.007 936.000 0.000 NA   -0.524
 547591 547592 plu0157 plu0158 cipB   FALSE 0.012 764.000 0.000 NA   0.962
 547592 547593 plu0158 plu0159     TRUE 0.860 10.000 0.000 1.000 N NA
 547593 547594 plu0159 plu0160     TRUE 0.404 74.000 0.000 NA   NA
 547594 547595 plu0160 plu0161     FALSE 0.227 160.000 0.000 NA   0.371
 547595 547596 plu0161 plu0162     FALSE 0.040 373.000 0.000 1.000   NA
 547596 547597 plu0162 plu0163     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 547597 547598 plu0163 plu0164     FALSE 0.022 493.000 0.000 NA   0.092
 547598 547599 plu0164 plu0165     FALSE 0.262 438.000 0.000 0.002 Y 0.400
 547599 547600 plu0165 plu0166     TRUE 0.476 309.000 0.000 0.002 Y 0.600
 547600 547601 plu0166 plu0167     TRUE 0.901 93.000 0.000 0.002 Y 0.960
 547601 547602 plu0167 plu0168     FALSE 0.004 660.000 0.000 1.000 N -0.905
 547602 547603 plu0168 plu0169     FALSE 0.085 255.000 0.000 NA   NA
 547604 547605 plu0170 plu0171 uxuA uxuR TRUE 0.626 38.000 0.047 1.000 N 0.894
 547605 547606 plu0171 plu0172 uxuR   TRUE 0.545 119.000 0.200 1.000 N 0.826
 547607 547608 plu0173 plu0174     TRUE 0.996 28.000 0.588 NA Y 0.837
 547608 547609 plu0174 plu0175   uxuB TRUE 0.994 28.000 0.471 1.000 Y 0.115
 547609 547610 plu0175 plu0176 uxuB uxaC TRUE 0.999 -3.000 0.647 1.000 Y 0.859
 547610 547611 plu0176 plu0177 uxaC kdgK TRUE 0.995 -3.000 0.176 1.000 Y 0.252
 547611 547612 plu0177 plu0178 kdgK eda TRUE 0.982 15.000 0.000 1.000 Y 0.141
 547613 547614 plu0179 plu0180     TRUE 0.919 -9.000 0.000 1.000   0.721
 547615 547616 plu0181 plu0182   cpmA FALSE 0.008 777.000 0.000 NA   NA
 547616 547617 plu0182 plu0183 cpmA cpmB TRUE 0.985 3.000 0.222 1.000 N 0.910
 547617 547618 plu0183 plu0184 cpmB cpmC TRUE 0.985 14.000 0.222 1.000   0.996
 547618 547619 plu0184 plu0185 cpmC cpmD TRUE 0.954 77.000 0.667 1.000   0.904
 547619 547620 plu0185 plu0186 cpmD cpmE TRUE 0.997 -13.000 1.000 1.000   0.879
 547620 547621 plu0186 plu0187 cpmE cpmF TRUE 0.945 8.000 0.000 NA   NA
 547621 547622 plu0187 plu0188 cpmF cpmG TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 547622 547623 plu0188 plu0189 cpmG cpmH TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547628 547629 plu0194 plu0195 glpD glpR FALSE 0.100 241.000 0.104 1.000 N 0.340
 547629 547630 plu0195 plu0196 glpR glpG TRUE 0.976 18.000 0.190 1.000   0.920
 547630 547631 plu0196 plu0197 glpG glpE TRUE 0.995 9.000 0.405 1.000   0.304
 547631 547632 plu0197 plu0198 glpE   FALSE 0.250 131.000 0.025 1.000   -0.127
 547632 547633 plu0198 plu0199     TRUE 0.561 60.000 0.066 1.000   NA
 547634 547635 plu0200 plu0201     FALSE 0.312 112.000 0.000 NA   NA
 547637 547638 plu0203 plu0204   bioH FALSE 0.021 469.000 0.000 NA   NA
 547638 547639 plu0204 plu0205 bioH   TRUE 0.413 77.000 0.000 NA   -0.544
 547639 547640 plu0205 plu0206     TRUE 0.905 -7.000 0.000 NA   -0.952
 547641 547642 plu0207 plu0208   feoB TRUE 0.996 10.000 0.455 NA   0.461
 547642 547643 plu0208 plu0209 feoB feoA TRUE 0.936 53.000 0.177 1.000 Y 0.623
 547643 547644 plu0209 plu0210 feoA   FALSE 0.016 398.000 0.000 1.000 N 0.279
 547644 547645 plu0210 plu0211   greB FALSE 0.186 423.000 0.123 1.000 Y 0.529
 547646 547647 plu0212 plu0213 ompR envZ TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y -0.313
 547647 547648 plu0213 plu0214 envZ pstS FALSE 0.010 339.000 0.022 1.000 N -0.923
 547648 547649 plu0214 plu0215 pstS pstC TRUE 0.918 117.000 0.145 0.002 Y 0.634
 547649 547650 plu0215 plu0216 pstC pstA TRUE 1.000 2.000 0.537 0.002 Y -0.293
 547650 547651 plu0216 plu0217 pstA pstB TRUE 0.998 27.000 0.526 0.002 Y -0.441
 547651 547652 plu0217 plu0218 pstB phoU TRUE 0.996 15.000 0.317 NA Y 0.605
 547652 547653 plu0218 plu0219 phoU   FALSE 0.034 169.000 0.014 NA N -0.351
 547653 547654 plu0219 plu0220     TRUE 0.954 82.000 0.263 0.061 Y -0.287
 547654 547655 plu0220 plu0221     TRUE 0.999 2.000 0.282 0.018 Y 0.609
 547656 547657 plu0222 plu0223     FALSE 0.277 124.000 0.000 NA   -0.844
 547657 547658 plu0223 plu0224     FALSE 0.252 131.000 0.000 NA   -0.983
 547658 547659 plu0224 plu0225     TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 547659 547660 plu0225 plu0226     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 547663 547664 plu0229 plu0230   hemN FALSE 0.250 194.000 0.107 NA   0.404
 547666 547667 plu0232 plu0233     FALSE 0.160 179.000 0.000 NA   NA
 547667 547668 plu0233 plu0234   tnpA TRUE 0.936 24.000 0.000 0.096   -0.025
 547669 547670 plu0235 plu0236 glnG glnL TRUE 0.999 10.000 0.587 0.077 Y -0.111
 547670 547671 plu0236 plu0237 glnL glnA FALSE 0.139 154.000 0.053 1.000 N 0.549
 547673 547674 plu0239 plu0240     FALSE 0.011 1055.000 0.000 0.083 N 0.849
 547675 547676 plu0241 plu0242   dtd TRUE 0.655 44.000 0.010 1.000   0.901
 547676 547677 plu0242 plu0243 dtd   TRUE 0.512 73.000 0.065 1.000   0.067
 547678 547679 plu0244 plu0245     FALSE 0.189 171.000 0.000 NA   -0.255
 547682 547683 plu0248 plu0249 gltS   FALSE 0.096 244.000 0.000 NA   -0.734
 547683 547684 plu0249 plu0250     FALSE 0.013 644.000 0.000 NA   0.086
 547685 547686 plu0251 plu0252     TRUE 0.973 3.000 0.118 NA   NA
 547687 547688 plu0253 plu0254   relB FALSE 0.037 407.000 0.000 NA   0.535
 547688 547689 plu0254 plu0255 relB   TRUE 0.985 -10.000 0.444 NA N 0.959
 547689 547690 plu0255 plu0256     FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   -0.796
 547691 547692 plu0257 plu0258     TRUE 0.430 94.000 0.000 NA   1.000
 547692 547693 plu0258 plu0259   recG FALSE 0.013 656.000 0.000 NA   0.631
 547694 547695 plu0260 plu0261     FALSE 0.010 426.000 0.000 1.000 N -0.791
 547695 547696 plu0261 plu0262     TRUE 0.644 127.000 0.000 1.000 Y -0.258
 547696 547697 plu0262 plu0263     TRUE 0.756 38.000 0.000 1.000   -0.286
 547697 547698 plu0263 plu0264     TRUE 0.750 68.000 0.000 0.008   0.315
 547698 547699 plu0264 plu0265     TRUE 0.714 90.000 0.000 0.008   0.685
 547699 547700 plu0265 plu0266     TRUE 0.473 81.000 0.000 1.000   0.992
 547700 547701 plu0266 plu0267     TRUE 0.973 37.000 0.000 0.005 Y 0.514
 547701 547702 plu0267 plu0268     TRUE 0.503 184.000 0.000 1.000 Y 0.828
 547702 547703 plu0268 plu0269     FALSE 0.228 169.000 0.000 NA   0.848
 547703 547704 plu0269 plu0270     FALSE 0.311 132.000 0.000 NA   0.947
 547704 547705 plu0270 plu0271     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.434
 547706 547707 plu0272 plu0273 spoT rpoZ TRUE 0.994 18.000 0.291 1.000 Y -0.090
 547707 547708 plu0273 plu0274 rpoZ gmk TRUE 0.908 55.000 0.471 1.000 N -0.547
 547709 547710 plu0275 plu0276     FALSE 0.324 109.000 0.000 NA   NA
 547711 547712 plu0277 plu0278     FALSE 0.323 237.000 0.000 NA Y NA
 547712 547713 plu0278 plu0279     FALSE 0.012 767.000 0.000 NA   0.894
 547713 547714 plu0279 plu0280     FALSE 0.021 538.000 0.000 NA   0.978
 547716 547717 plu0282 plu0283     FALSE 0.009 978.000 0.000 NA   0.823
 547717 547718 plu0283 plu0284     FALSE 0.062 303.000 0.000 NA   NA
 547718 547719 plu0284 plu0285     TRUE 0.975 -3.000 0.143 NA   NA
 547723 547724 plu0289 plu0290     FALSE 0.015 547.000 0.000 NA   NA
 547724 547725 plu0290 plu0291   avtA FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 547725 547726 plu0291 plu0292 avtA tag FALSE 0.078 206.000 0.000 1.000 N 0.968
 547727 547728 plu0293 plu0294 glyQ glyS TRUE 1.000 10.000 0.651 0.001 Y 0.988
 547728 547729 plu0294 plu0295 glyS   FALSE 0.316 111.000 0.000 NA   NA
 547729 547730 plu0295 plut003   tRNA-Pro FALSE 0.194 160.000 0.000 NA   NA
 547731 547732 plu0296 plu0297     TRUE 0.942 86.000 0.625 NA   0.900
 547733 547734 plu0298 plu0299     TRUE 0.834 -21.000 0.000 1.000   -0.573
 547734 547735 plu0299 plu0300   dppA FALSE 0.018 603.000 0.000 1.000   0.796
 547735 547736 plu0300 plu0301 dppA dppB TRUE 0.852 119.000 0.087 0.046 Y 0.943
 547736 547737 plu0301 plu0302 dppB dppC TRUE 1.000 11.000 0.779 0.046 Y 0.904
 547737 547738 plu0302 plu0303 dppC dppD TRUE 0.999 13.000 0.560 1.000 Y 0.900
 547738 547739 plu0303 plu0304 dppD dppF TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.002 Y 0.993
 547739 547740 plu0304 plu0305 dppF   FALSE 0.061 357.000 0.000 1.000   0.903
 547740 547741 plu0305 plu0306     FALSE 0.274 179.000 0.083 1.000   0.975
 547742 547743 plu0307 plu0308     TRUE 0.595 56.000 0.043 1.000   0.989
 547747 547748 plu0312 plu0313 ISPlu5B   TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 547748 547749 plu0313 plu0314     TRUE 0.965 1.000 0.000 NA   0.865
 547751 547752 plu0316 plu0317 phlA phlB TRUE 0.950 66.000 0.600 NA   0.902
 547752 547753 plu0317 plu0318 phlB   FALSE 0.011 669.000 0.000 NA   -0.751
 547753 547754 plu0318 plu0319   ISPlu4F FALSE 0.087 250.000 0.000 NA   NA
 547755 547756 plu0320 plu0321     FALSE 0.028 420.000 0.000 NA   -0.652
 547756 547757 plu0321 plu0322     TRUE 0.800 28.000 0.000 NA   NA
 547757 547758 plu0322 plu0323     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 547759 547760 plu0324 plu0325     FALSE 0.013 599.000 0.000 NA   NA
 547762 547763 plu0327 plu0328   ISPlu11E FALSE 0.095 239.000 0.000 NA   NA
 547763 547764 plu0328 plu0329 ISPlu11E   FALSE 0.197 158.000 0.000 NA   NA
 547764 547765 plu0329 plu0330     FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 547765 547766 plu0330 plu0331     FALSE 0.011 624.000 0.000 NA   NA
 547766 547767 plu0331 plu0332     FALSE 0.060 306.000 0.000 NA   NA
 547767 547768 plu0332 plu0333     TRUE 0.963 2.000 0.000 NA   0.747
 547768 547769 plu0333 plu0334   ISPlu9K FALSE 0.031 397.000 0.000 NA   NA
 547769 547770 plu0334 plu0335 ISPlu9K   TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 547770 547771 plu0335 plu0336   pmt2 TRUE 0.802 96.000 0.312 NA   NA
 547771 547772 plu0336 plu0337 pmt2   TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 547773 547774 plu0338 plu0339 dcm vsr TRUE 0.992 8.000 0.016 0.094 Y 0.056
 547774 547775 plu0339 plu0340 vsr   FALSE 0.119 198.000 0.024 NA   -0.227
 547776 547777 plu0341 plu0342     FALSE 0.185 174.000 0.000 NA   -0.221
 547777 547778 plu0342 plu0343     FALSE 0.266 137.000 0.000 NA   -0.050
 547778 547779 plu0343 plu0344     FALSE 0.018 505.000 0.000 NA   NA
 547781 547782 plu0346 plu0347     FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 547782 547783 plu0347 plu0348     FALSE 0.021 471.000 0.000 NA   NA
 547783 547784 plu0348 plu0349     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 547786 547787 plu0351 plu0352     FALSE 0.014 568.000 0.000 NA   NA
 547787 547788 plu0352 plu0353     TRUE 0.954 0.000 0.000 NA   -0.781
 547788 547789 plu0353 plu0354     TRUE 0.991 22.000 0.500 NA   0.962
 547789 547790 plu0354 plu0355     TRUE 0.906 48.000 0.250 NA   0.976
 547790 547791 plu0355 plu0356     TRUE 0.899 22.000 0.000 NA   0.812
 547793 547794 plu0358 plu0359   pmt1 TRUE 0.392 80.000 0.000 NA   NA
 547794 547795 plu0359 plu0360 pmt1   TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 547795 547796 plu0360 plu0361     TRUE 0.998 6.000 0.711 NA   0.466
 547796 547797 plu0361 plu0362     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA   0.315
 547797 547798 plu0362 plu0363     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000   0.933
 547798 547799 plu0363 plu0364     TRUE 0.995 11.000 0.471 NA   0.293
 547799 547800 plu0364 plu0365     TRUE 0.998 0.000 0.673 NA   0.824
 547800 547801 plu0365 plu0366     TRUE 0.999 3.000 0.765 NA   0.326
 547801 547802 plu0366 plu0367     TRUE 0.999 0.000 0.862 NA   0.708
 547802 547803 plu0367 plu0368     TRUE 0.997 6.000 0.510 NA   0.816
 547803 547804 plu0368 plu0369     TRUE 0.992 36.000 0.863 NA   0.324
 547804 547805 plu0369 plu0370     TRUE 0.997 2.000 0.552 NA   0.470
 547805 547806 plu0370 plu0371     TRUE 0.998 7.000 0.627 NA   0.475
 547806 547807 plu0371 plu0372     TRUE 0.996 24.000 0.821 NA   0.866
 547808 547809 plu0373 plu0374     FALSE 0.012 639.000 0.000 NA   -0.501
 547809 547810 plu0374 plu0375   gor TRUE 0.574 96.000 0.100 1.000   0.856
 547810 547811 plu0375 plu0376 gor   FALSE 0.095 266.000 0.000 NA   0.352
 547811 547812 plu0376 plu0377     TRUE 0.967 -3.000 0.083 NA   0.653
 547813 547814 plu0378 plu0379 mobB mobA TRUE 0.996 -3.000 0.064 0.003 Y 0.985
 547815 547816 plu0380 plu0381   dsbA TRUE 0.936 21.000 0.111 NA   0.111
 547817 547818 plu0382 plu0383     TRUE 0.529 66.000 0.000 1.000   0.686
 547818 547819 plu0383 plu0384     TRUE 0.833 28.000 0.000 NA   0.498
 547820 547821 plu0385 plu0386 ISPlu10K polA FALSE 0.148 475.000 0.000 0.093 Y NA
 547822 547823 plu0387 plu0388     TRUE 0.933 15.000 0.000 NA   0.983
 547823 547824 plu0388 plu0389     FALSE 0.046 368.000 0.000 NA   0.267
 547824 547825 plu0389 plu0390   engB FALSE 0.023 473.000 0.000 NA   -0.268
 547828 547829 plu0393 plu0394 pabA argD TRUE 0.727 124.000 0.088 1.000 Y 0.610
 547832 547833 plu0397 plu0398 prkB   TRUE 0.982 19.000 0.303 NA   -0.889
 547833 547834 plu0398 plu0399     TRUE 0.989 0.000 0.222 NA   -0.860
 547835 547836 plu0400 plu0401 ISPlu6L   FALSE 0.388 96.000 0.000 1.000   NA
 547837 547838 plu0402 plu0403     TRUE 0.879 31.000 0.087 1.000   0.907
 547838 547839 plu0403 plu0404     FALSE 0.072 279.000 0.000 NA   -0.959
 547840 547841 plu0405 plu0406     TRUE 0.397 83.000 0.000 NA   -0.770
 547841 547842 plu0406 plu0407     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 547842 547843 plu0407 plu0408     TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 547843 547844 plu0408 plu0409     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547844 547845 plu0409 plu0410     FALSE 0.027 419.000 0.000 NA   NA
 547846 547847 plu0411 plu0412     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA   -0.404
 547847 547848 plu0412 plu0413     TRUE 0.952 6.000 0.000 NA   -0.266
 547848 547849 plu0413 plu0414     TRUE 0.716 43.000 0.000 NA   0.714
 547849 547850 plu0414 plu0415     TRUE 0.912 43.000 0.000 1.000 Y 0.528
 547850 547851 plu0415 plu0416     FALSE 0.225 330.000 0.000 1.000 Y 0.901
 547851 547852 plu0416 plu0417     TRUE 0.983 15.000 0.000 1.000 Y 0.993
 547852 547853 plu0417 plu0418     TRUE 0.826 124.000 0.000 0.008 Y 0.654
 547856 547857 plu0421 plu0422   slyD TRUE 0.868 89.000 0.370 NA   0.819
 547859 547860 plu0424 plu0425 fkpA   FALSE 0.387 282.000 0.310 NA   0.765
 547860 547861 plu0425 plu0426     TRUE 0.990 0.000 0.220 NA   0.386
 547861 547862 plu0426 plu0427     TRUE 0.999 10.000 0.790 NA Y 0.457
 547862 547863 plu0427 plu0428     TRUE 0.999 21.000 0.804 NA Y 0.239
 547863 547864 plu0428 plu0429   rpsL FALSE 0.179 137.000 0.058 NA N 0.855
 547864 547865 plu0429 plu0430 rpsL rpsG TRUE 0.989 98.000 0.620 0.003 Y 0.325
 547865 547866 plu0430 plu0431 rpsG fusA TRUE 0.976 81.000 0.579 1.000 Y 0.633
 547866 547867 plu0431 plu0432 fusA tufB TRUE 0.882 73.000 0.003 0.001 Y NA
 547867 547868 plu0432 plu0433 tufB secE FALSE 0.029 275.000 0.000 1.000 N NA
 547868 547869 plu0433 plu0434 secE nusG TRUE 0.998 2.000 0.843 1.000 N 0.925
 547869 547870 plu0434 plu0435 nusG rplK TRUE 0.825 162.000 0.681 1.000 N 0.265
 547870 547871 plu0435 plu0436 rplK rplA TRUE 1.000 4.000 0.838 0.020 Y 0.508
 547871 547872 plu0436 plu0437 rplA rplJ TRUE 0.729 317.000 0.302 0.020 Y 0.536
 547872 547873 plu0437 plu0438 rplJ rplL TRUE 0.996 64.000 0.884 0.015 Y 0.378
 547873 547874 plu0438 plu0439 rplL rpoB FALSE 0.197 340.000 0.223 1.000   -0.438
 547874 547875 plu0439 plu0440 rpoB rpoC TRUE 0.977 131.000 0.851 0.001   0.493
 547877 547878 plu0442 plu0443     TRUE 0.925 17.000 0.000 NA   0.883
 547878 547879 plu0443 plu0444     TRUE 0.556 124.000 0.000 0.048   0.973
 547881 547882 plu0446 plu0447     TRUE 0.950 13.000 0.000 1.000   0.812
 547882 547883 plu0447 plu0448     TRUE 0.965 0.000 0.000 1.000   0.625
 547883 547884 plu0448 plu0449     FALSE 0.026 482.000 0.000 NA   0.612
 547884 547885 plu0449 plu0450     TRUE 0.952 11.000 0.000 NA   0.736
 547885 547886 plu0450 plu0451     TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.952
 547886 547887 plu0451 plu0452     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.902
 547888 547889 plu0453 plu0454     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 547889 547890 plu0454 plu0455   malM TRUE 0.468 63.000 0.000 NA   NA
 547890 547891 plu0455 plu0456 malM lamB FALSE 0.131 249.000 0.057 1.000   0.660
 547891 547892 plu0456 plu0457 lamB malK TRUE 0.966 37.000 0.044 0.059 Y 0.817
 547893 547894 plu0458 plu0459 malE malF TRUE 0.675 122.000 0.040 1.000 Y 0.761
 547894 547895 plu0459 plu0460 malF malG TRUE 1.000 13.000 0.814 0.045 Y 0.650
 547897 547898 plu0462 plu0463     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 547898 547899 plu0463 plu0464     TRUE 0.997 17.000 0.800 NA   NA
 547899 547900 plu0464 plu0465     TRUE 0.983 35.000 0.600 NA   NA
 547900 547901 plu0465 plu0466     TRUE 0.981 38.000 0.600 NA   NA
 547901 547902 plu0466 plu0467     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 547903 547904 plu0468 plu0469 ISPlu10J malQ FALSE 0.002 1315.000 0.000 1.000 N NA
 547904 547905 plu0469 plu0470 malQ malP TRUE 0.994 10.000 0.039 0.017 Y 0.429
 547908 547909 plu0473 plu0474     TRUE 0.997 0.000 0.227 1.000 Y 0.601
 547909 547910 plu0474 plu0475     TRUE 0.987 5.000 0.182 1.000   0.664
 547910 547911 plu0475 plu0476     TRUE 0.898 72.000 0.400 1.000   0.964
 547911 547912 plu0476 plu0477     TRUE 0.922 15.000 0.033 NA   0.997
 547912 547913 plu0477 plu0478   ISPlu3Z FALSE 0.104 228.000 0.000 NA   NA
 547914 547915 plu0479 plu0480     FALSE 0.076 312.000 0.000 NA   0.862
 547915 547916 plu0480 plu0481   thiH FALSE 0.034 405.000 0.000 NA   -0.184
 547916 547917 plu0481 plu0482 thiH thiG TRUE 0.988 48.000 0.277 0.003 Y 0.896
 547917 547918 plu0482 plu0483 thiG thiS TRUE 0.986 2.000 0.008 1.000 Y -0.961
 547918 547919 plu0483 plu0484 thiS thiF TRUE 0.988 -3.000 0.057 1.000 Y -0.938
 547919 547920 plu0484 plu0485 thiF thiE TRUE 0.996 11.000 0.242 1.000 Y 0.971
 547920 547921 plu0485 plu0486 thiE thiC TRUE 0.988 -16.000 0.063 0.003 Y 0.928
 547921 547922 plu0486 plu0487 thiC   FALSE 0.039 300.000 0.000 1.000 N 0.761
 547923 547924 plu0488 plu0489 nudC hemE FALSE 0.199 113.000 0.040 1.000 N 0.970
 547924 547925 plu0489 plu0490 hemE nfi TRUE 0.890 5.000 0.028 1.000 N 0.981
 547925 547926 plu0490 plu0491 nfi   TRUE 0.538 77.000 0.086 NA   0.461
 547926 547927 plu0491 plu0492   dbhA TRUE 0.613 187.000 0.355 NA   -0.399
 547927 547928 plu0492 plu0493 dbhA   TRUE 0.995 6.000 0.375 NA   0.744
 547929 547930 plu0494 plu0495 purD purH TRUE 0.992 22.000 0.238 1.000 Y 0.985
 547931 547932 plur004 plut004 16s_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 547932 547933 plut004 plur005 tRNA-Glu 23s_rRNA FALSE 0.146 188.000 0.000 NA   NA
 547933 547934 plur005 plur006 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 547934 547935 plur006 plu0496 5s_rRNA gntR FALSE 0.006 1240.000 0.000 NA   NA
 547935 547936 plu0496 plu0497 gntR gntK FALSE 0.120 169.000 0.000 1.000 N 0.846
 547936 547937 plu0497 plu0498 gntK gntU TRUE 0.999 0.000 0.500 1.000 Y 0.934
 547938 547939 plu0499 plu0500     FALSE 0.136 211.000 0.000 NA   0.186
 547939 547940 plu0500 plu0501     TRUE 0.995 -13.000 0.440 0.014   0.894
 547940 547941 plu0501 plu0502     TRUE 0.974 -13.000 0.244 1.000   0.958
 547941 547942 plu0502 plu0503   bax FALSE 0.133 206.000 0.000 1.000   -0.922
 547942 547943 plu0503 plu0504 bax   FALSE 0.007 1268.000 0.000 1.000   -0.101
 547943 547944 plu0504 plu0505     TRUE 0.952 12.000 0.000 1.000   0.731
 547944 547945 plu0505 plu0506     TRUE 0.998 26.000 0.857 1.000 Y 0.619
 547945 547946 plu0506 plu0507     TRUE 0.979 68.000 0.571 1.000 Y 0.534
 547946 547947 plu0507 plu0508     FALSE 0.010 833.000 0.000 NA   0.720
 547947 547948 plu0508 plu0509     TRUE 0.998 -3.000 0.679 NA   0.687
 547948 547949 plu0509 plu0510     TRUE 0.991 0.000 0.227 NA   0.500
 547949 547950 plu0510 plu0511     TRUE 0.773 33.000 0.000 NA   -0.629
 547951 547952 plu0512 plu0513     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 547952 547953 plu0513 plu0514   tcaZ FALSE 0.011 629.000 0.000 NA   NA
 547954 547955 plu0515 plu0516 tcaC   TRUE 0.530 65.000 0.000 NA   0.908
 547958 547959 plu0519 plu0520   deoC FALSE 0.227 327.000 0.000 1.000 Y 0.792
 547959 547960 plu0520 plu0521 deoC deoB FALSE 0.197 200.000 0.028 0.050 N 0.916
 547960 547961 plu0521 plu0522 deoB deoD TRUE 0.844 83.000 0.414 1.000 N 0.819
 547962 547963 plu0523 plu0524     TRUE 0.994 18.000 0.133 0.022 Y 0.943
 547963 547964 plu0524 plu0525     FALSE 0.027 330.000 0.000 1.000 N 0.501
 547964 547965 plu0525 plu0526     TRUE 0.836 -39.000 0.000 NA   0.873
 547965 547966 plu0526 plu0527     FALSE 0.025 495.000 0.000 NA   0.983
 547966 547967 plu0527 plu0528     TRUE 0.961 4.000 0.000 NA   0.980
 547968 547969 plu0529 plu0530     TRUE 0.394 78.000 0.000 NA   NA
 547969 547970 plu0530 plu0531     FALSE 0.203 155.000 0.000 NA   NA
 547970 547971 plu0531 plu0532     TRUE 0.895 18.000 0.000 NA   NA
 547971 547972 plu0532 plu0533     FALSE 0.289 133.000 0.000 NA   0.425
 547973 547974 plu0534 plu0535     FALSE 0.099 237.000 0.000 NA   -0.887
 547974 547975 plu0535 plu0536     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 547975 547976 plu0536 plu0537     FALSE 0.183 165.000 0.000 NA   NA
 547976 547977 plu0537 plu0538     FALSE 0.051 335.000 0.000 NA   -0.555
 547977 547978 plu0538 plu0539     TRUE 0.944 -3.000 0.000 NA   -0.801
 547978 547979 plu0539 plu0540     FALSE 0.189 164.000 0.000 NA   -0.824
 547979 547980 plu0540 plu0541     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.811
 547980 547981 plu0541 plu0542     TRUE 0.422 70.000 0.000 NA   NA
 547981 547982 plu0542 plu0543     FALSE 0.015 552.000 0.000 NA   NA
 547982 547983 plu0543 plu0544     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.091 Y NA
 547984 547985 plu0545 plu0546     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 547986 547987 plu0547 plu0548     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 547987 547988 plu0548 plu0549     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 547988 547989 plu0549 plu0550   smp FALSE 0.010 737.000 0.000 NA   0.121
 547990 547991 plu0551 plu0552 serB radA FALSE 0.114 147.000 0.024 1.000 N 0.883
 547991 547992 plu0552 plu0553 radA nadR TRUE 0.811 14.000 0.021 1.000 N 0.663
 547992 547993 plu0553 plu0554 nadR   FALSE 0.006 681.000 0.000 1.000 N 0.730
 547995 547996 plu0556 plu0557 slt trpR TRUE 0.670 60.000 0.167 1.000 N 0.709
 548002 548003 plu0563 plu0564 thrA thrB TRUE 0.995 3.000 0.133 1.000 Y 0.966
 548003 548004 plu0564 plu0565 thrB thrC TRUE 0.997 4.000 0.233 1.000 Y 0.945
 548006 548007 plu0567 plu0568   talB FALSE 0.013 724.000 0.000 1.000   0.745
 548007 548008 plu0568 plu0569 talB mog FALSE 0.207 82.000 0.042 1.000 N -0.466
 548008 548009 plu0569 plu0570 mog   FALSE 0.106 138.000 0.000 1.000 N NA
 548009 548010 plu0570 plu0571     FALSE 0.027 436.000 0.000 1.000   NA
 548010 548011 plu0571 plu0572     TRUE 0.959 6.000 0.000 NA   0.972
 548011 548012 plu0572 plu0573   ISPlu6K TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548012 548013 plu0573 plu0574 ISPlu6K   TRUE 0.775 -60.000 0.000 NA   NA
 548013 548014 plu0574 plu0575   galT FALSE 0.036 409.000 0.000 NA   0.535
 548014 548015 plu0575 plu0576 galT galK TRUE 0.995 -7.000 0.370 0.001 N 0.839
 548015 548016 plu0576 plu0577 galK galM TRUE 0.982 33.000 0.051 0.001 Y 0.900
 548018 548019 plu0579 plu0580 dnaK dnaJ TRUE 0.951 114.000 0.236 0.004 Y 0.771
 548020 548021 plu0581 plu0582   bglB TRUE 0.691 29.000 0.000 1.000 N 0.990
 548021 548022 plu0582 plu0583 bglB bglF TRUE 0.790 76.000 0.000 1.000 Y 0.849
 548023 548024 plu0584 plu0585 bglG   TRUE 0.428 230.000 0.250 1.000   0.989
 548024 548025 plu0585 plu0586     FALSE 0.041 358.000 0.000 NA   NA
 548025 548026 plu0586 plu0587   nhaA FALSE 0.013 596.000 0.000 NA   NA
 548026 548027 plu0587 plu0588 nhaA nhaR FALSE 0.363 224.000 0.292 1.000 N 0.621
 548029 548030 plu0590 plu0591 ribF ileS TRUE 0.955 25.000 0.254 1.000 N 0.919
 548030 548031 plu0591 plu0592 ileS lspA TRUE 0.926 0.000 0.045 1.000 N 0.796
 548031 548032 plu0592 plu0593 lspA fkpB TRUE 0.973 6.000 0.154 1.000 N 0.843
 548032 548033 plu0593 plu0594 fkpB lytB TRUE 0.987 -19.000 0.626 1.000 N 0.493
 548036 548037 plu0597 plu0598     TRUE 0.994 -15.000 0.514 0.091   0.940
 548037 548038 plu0598 plu0599     TRUE 0.598 55.000 0.000 NA   0.942
 548038 548039 plu0599 plu0600     TRUE 0.991 -7.000 0.385 NA   0.955
 548040 548041 plu0601 plu0602   dapB FALSE 0.076 270.000 0.000 NA   NA
 548041 548042 plu0602 plu0603 dapB carA FALSE 0.102 436.000 0.034 1.000 Y -0.380
 548042 548043 plu0603 plu0604 carA carB TRUE 0.999 16.000 0.345 0.001 Y 0.802
 548046 548047 plu0607 plu0608 apaH apaG TRUE 0.987 3.000 0.267 NA N 0.209
 548047 548048 plu0608 plu0609 apaG ksgA TRUE 0.908 13.000 0.078 NA N 0.537
 548048 548049 plu0609 plu0610 ksgA pdxA TRUE 0.964 -7.000 0.197 1.000 N 0.800
 548049 548050 plu0610 plu0611 pdxA surA TRUE 0.989 -22.000 0.561 1.000   0.890
 548050 548051 plu0611 plu0612 surA imp TRUE 0.749 70.000 0.182 1.000   0.570
 548053 548054 plu0614 plu0615 rluA hepA TRUE 0.741 97.000 0.294 1.000 N 0.944
 548054 548055 plu0615 plu0616 hepA   FALSE 0.134 198.000 0.000 NA   NA
 548055 548056 plu0616 plu0617   thiQ FALSE 0.080 266.000 0.000 NA   NA
 548056 548057 plu0617 plu0618 thiQ thiP TRUE 0.994 -13.000 0.522 0.017 N 0.877
 548057 548058 plu0618 plu0619 thiP tbpA TRUE 0.994 -24.000 0.697 0.058 N 0.637
 548059 548060 plu0620 plu0621 nudH ptsP TRUE 0.855 10.000 0.012 1.000 N 0.880
 548060 548061 plu0621 plu0622 ptsP lgt FALSE 0.177 76.000 0.008 1.000 N 0.826
 548061 548062 plu0622 plu0623 lgt thyA TRUE 0.972 -3.000 0.164 1.000 N 0.860
 548062 548063 plu0623 plu0624 thyA   FALSE 0.328 128.000 0.000 NA   0.932
 548063 548064 plu0624 plu0625     TRUE 0.997 -3.000 0.556 NA   0.984
 548064 548065 plu0625 plu0626   ppdA FALSE 0.026 480.000 0.000 NA   0.691
 548065 548066 plu0626 plu0627 ppdA ppdB TRUE 0.854 168.000 0.368 NA Y -0.530
 548066 548067 plu0627 plu0628 ppdB   TRUE 0.994 6.000 0.373 NA   -0.774
 548067 548068 plu0628 plu0629   ppdC TRUE 0.993 -9.000 0.538 NA   -0.761
 548068 548069 plu0629 plu0630 ppdC recC TRUE 0.848 -7.000 0.076 NA N -0.733
 548069 548070 plu0630 plu0631 recC ptrA TRUE 0.914 16.000 0.092 1.000 N 0.918
 548070 548071 plu0631 plu0632 ptrA recB TRUE 0.946 -3.000 0.092 1.000 N 0.766
 548071 548072 plu0632 plu0633 recB recD TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y -0.068
 548072 548073 plu0633 plu0634 recD   FALSE 0.010 866.000 0.000 0.098 N -0.298
 548073 548074 plu0634 plu0635     TRUE 0.850 142.000 0.426 0.011 N 0.889
 548074 548075 plu0635 plu0636     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 548075 548076 plu0636 plu0637     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548076 548077 plu0637 plu0638     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548077 548078 plu0638 plu0639     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548078 548079 plu0639 plu0640     TRUE 0.492 59.000 0.000 NA   NA
 548079 548080 plu0640 plu0641     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548080 548081 plu0641 plu0642     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 548081 548082 plu0642 plu0643     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548085 548086 plu0646 plu0647     TRUE 0.998 -3.000 0.833 NA   NA
 548086 548087 plu0647 plut005   tRNA-Met FALSE 0.068 290.000 0.000 NA   NA
 548087 548088 plut005 plut006 tRNA-Met tRNA-Met TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 548088 548089 plut006 plut007 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.379 90.000 0.000 NA   NA
 548090 548091 plu0648 plu0649 mltA   FALSE 0.294 49.000 0.021 1.000 N 0.093
 548092 548093 plu0650 plu0651   csdA TRUE 0.982 21.000 0.122 0.002   0.585
 548094 548095 plu0652 plu0653 gcvA   TRUE 0.575 61.000 0.081 NA   -0.741
 548095 548096 plu0653 plu0654     TRUE 0.961 -7.000 0.144 NA   -0.334
 548096 548097 plu0654 plu0655   prtA FALSE 0.008 1185.000 0.000 NA   0.866
 548097 548098 plu0655 plu0656 prtA inh TRUE 0.690 55.000 0.095 1.000   0.377
 548098 548099 plu0656 plu0657 inh prtB TRUE 0.620 60.000 0.071 1.000   0.578
 548099 548100 plu0657 plu0658 prtB prtC TRUE 0.975 61.000 0.562 0.011   0.407
 548100 548101 plu0658 plu0659 prtC prtD TRUE 0.997 0.000 0.375 0.011 N 0.693
 548102 548103 plu0660 plu0661 xni   TRUE 0.743 64.000 0.178 NA   -0.480
 548103 548104 plu0661 plu0662     FALSE 0.354 123.000 0.079 NA   -0.703
 548105 548106 plu0663 plu0664 syd   FALSE 0.017 524.000 0.000 NA   -0.854
 548106 548107 plu0664 plu0665     TRUE 0.997 2.000 0.518 NA   -0.790
 548110 548111 plu0668 plu0669   dapD FALSE 0.115 215.000 0.035 NA   -0.139
 548111 548112 plu0669 plu0670 dapD glnD FALSE 0.192 172.000 0.097 1.000 N 0.935
 548112 548113 plu0670 plu0671 glnD map TRUE 0.541 138.000 0.243 1.000 N 0.658
 548114 548115 plu0672 plu0673 rpsB tsf TRUE 0.966 151.000 0.748 1.000 Y 0.857
 548115 548116 plu0673 plu0674 tsf pyrH TRUE 0.670 155.000 0.416 1.000 N 0.428
 548116 548117 plu0674 plu0675 pyrH frr TRUE 0.862 119.000 0.626 1.000 N -0.796
 548117 548118 plu0675 plu0676 frr dxr FALSE 0.024 267.000 0.032 1.000 N -0.873
 548118 548119 plu0676 plu0677 dxr uppS FALSE 0.378 215.000 0.025 1.000 Y 0.574
 548119 548120 plu0677 plu0678 uppS cdsA TRUE 0.998 10.000 0.400 1.000 Y 0.833
 548120 548121 plu0678 plu0679 cdsA ecfE TRUE 0.775 29.000 0.080 1.000 N 0.981
 548121 548122 plu0679 plu0680 ecfE yaeT TRUE 0.978 35.000 0.204 1.000 Y 0.936
 548122 548123 plu0680 plu0681 yaeT hlpA TRUE 0.935 111.000 0.354 1.000 Y 0.869
 548123 548124 plu0681 plu0682 hlpA lpxD TRUE 1.000 4.000 0.814 1.000 Y 0.963
 548124 548125 plu0682 plu0683 lpxD fabZ TRUE 0.861 163.000 0.796 1.000 N 0.595
 548125 548126 plu0683 plu0684 fabZ lpxA TRUE 0.998 4.000 0.850 1.000 N 0.557
 548126 548127 plu0684 plu0685 lpxA lpxB TRUE 0.994 20.000 0.289 1.000 Y 0.914
 548127 548128 plu0685 plu0686 lpxB rnhB TRUE 0.982 0.000 0.186 1.000 N 0.928
 548128 548129 plu0686 plu0687 rnhB dnaE TRUE 0.901 54.000 0.104 1.000 Y 0.936
 548129 548130 plu0687 plu0688 dnaE accA TRUE 0.944 14.000 0.122 1.000 N 0.911
 548130 548131 plu0688 plu0689 accA mesJ FALSE 0.067 339.000 0.123 1.000 N 0.879
 548134 548135 plu0692 plu0693 proS   FALSE 0.339 126.000 0.048 NA   0.958
 548135 548136 plu0693 plu0694   rcsF TRUE 0.989 -3.000 0.247 NA   0.341
 548136 548137 plu0694 plu0695 rcsF metQ TRUE 0.828 143.000 0.500 NA   0.643
 548137 548138 plu0695 plu0696 metQ metI TRUE 0.967 66.000 0.411 NA Y 0.853
 548138 548139 plu0696 plu0697 metI metN TRUE 0.998 -7.000 0.584 1.000 Y 0.880
 548140 548141 plu0698 plur007   16s_rRNA FALSE 0.034 385.000 0.000 NA   NA
 548141 548142 plur007 plut008 16s_rRNA tRNA-Ile TRUE 0.422 70.000 0.000 NA   NA
 548142 548143 plut008 plut009 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.249 133.000 0.000 NA   NA
 548143 548144 plut009 plur008 tRNA-Ala 23s_rRNA FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 548144 548145 plur008 plur009 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548145 548146 plur009 plut010 5s_rRNA tRNA-Asp FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 548146 548147 plut010 plu0699 tRNA-Asp   FALSE 0.234 140.000 0.000 NA   NA
 548151 548152 plu0703 plu0704 cysJ cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y 0.921
 548152 548153 plu0704 plu0705 cysI cysH TRUE 0.956 -3.000 0.116 1.000 N 0.838
 548154 548155 plu0706 plu0707     TRUE 0.982 -3.000 0.154 NA   0.980
 548156 548157 plu0708 plu0709 cysG cysD TRUE 0.998 10.000 0.417 1.000 Y 0.999
 548157 548158 plu0709 plu0710 cysD cysN TRUE 0.968 69.000 0.574 0.001 N 0.977
 548158 548159 plu0710 plu0711 cysN cysC TRUE 0.998 2.000 0.340 1.000 Y 0.920
 548159 548160 plu0711 plu0712 cysC   FALSE 0.044 147.000 0.013 1.000 N -0.881
 548160 548161 plu0712 plu0713   ispD TRUE 0.974 6.000 0.185 1.000 N -0.736
 548161 548162 plu0713 plu0714 ispD ispF TRUE 0.998 14.000 0.419 1.000 Y 0.743
 548162 548163 plu0714 plu0715 ispF   TRUE 0.986 4.000 0.173 1.000   0.699
 548163 548164 plu0715 plu0716   surE TRUE 0.962 -22.000 0.235 1.000   0.667
 548164 548165 plu0716 plu0717 surE pcm TRUE 0.992 -6.000 0.353 1.000   0.730
 548165 548166 plu0717 plu0718 pcm nlpD FALSE 0.073 152.000 0.030 1.000 N -0.649
 548166 548167 plu0718 plu0719 nlpD rpoS TRUE 0.627 52.000 0.142 1.000 N -0.727
 548168 548169 plu0720 plu0721 ISPlu3Y miaE FALSE 0.008 482.000 0.000 1.000 N NA
 548169 548170 plu0721 plu0722 miaE mutS TRUE 0.652 5.000 0.004 1.000 N -0.927
 548171 548172 plu0723 plu0724     TRUE 0.926 26.000 0.157 NA   NA
 548174 548175 plu0726 plu0727     TRUE 0.549 57.000 0.061 NA   -0.997
 548175 548176 plu0727 plu0728     FALSE 0.023 441.000 0.000 NA   -0.985
 548176 548177 plu0728 plu0729     FALSE 0.051 204.000 0.000 1.000 N -0.974
 548177 548178 plu0729 plu0730     FALSE 0.114 215.000 0.000 NA   NA
 548178 548179 plu0730 plu0731     FALSE 0.016 540.000 0.000 NA   NA
 548182 548183 plu0734 plu0735     FALSE 0.025 460.000 0.000 NA   -0.315
 548183 548184 plu0735 plu0736     FALSE 0.019 497.000 0.000 NA   -0.747
 548184 548185 plu0736 plu0737     FALSE 0.016 544.000 0.000 NA   -0.557
 548187 548188 plu0739 plu0740     TRUE 0.743 87.000 0.000 NA Y -0.336
 548188 548189 plu0740 plu0741     TRUE 0.986 -21.000 0.625 NA N 0.932
 548190 548191 plu0742 plu0743     FALSE 0.025 497.000 0.000 NA   0.751
 548191 548192 plu0743 plu0744     TRUE 0.480 85.000 0.000 1.000   0.832
 548192 548193 plu0744 plu0745     FALSE 0.024 522.000 0.000 1.000   0.703
 548193 548194 plu0745 plu0746     TRUE 0.986 15.000 0.263 NA   0.984
 548194 548195 plu0746 plu0747     TRUE 0.995 0.000 0.336 NA   0.856
 548195 548196 plu0747 plu0748     TRUE 0.980 21.000 0.276 NA   0.984
 548196 548197 plu0748 plu0749     TRUE 0.998 11.000 0.780 NA   0.955
 548197 548198 plu0749 plu0750     TRUE 0.977 -13.000 0.282 NA   0.980
 548198 548199 plu0750 plu0751     FALSE 0.021 544.000 0.000 NA   0.947
 548200 548201 plu0752 plu0753     FALSE 0.025 341.000 0.000 NA N 0.748
 548201 548202 plu0753 plu0754     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.822
 548202 548203 plu0754 plu0755     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   0.978
 548203 548204 plu0755 plu0756     FALSE 0.061 340.000 0.000 NA   0.794
 548204 548205 plu0756 plu0757     TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y 0.891
 548205 548206 plu0757 plu0758     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA N 0.708
 548206 548207 plu0758 plu0759     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA N 0.987
 548207 548208 plu0759 plu0760     TRUE 0.910 -3.000 0.000 1.000 N 0.805
 548208 548209 plu0760 plu0761     TRUE 0.725 26.000 0.000 1.000 N 0.996
 548209 548210 plu0761 plu0762     TRUE 0.956 5.000 0.105 1.000 N 0.964
 548210 548211 plu0762 plu0763     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   0.959
 548211 548212 plu0763 plu0764     TRUE 0.954 11.000 0.000 NA   0.900
 548212 548213 plu0764 plu0765     TRUE 0.964 2.000 0.000 NA   0.901
 548213 548214 plu0765 plu0766     FALSE 0.012 706.000 0.000 NA   0.605
 548214 548215 plu0766 plu0767     FALSE 0.144 200.000 0.000 NA   -0.221
 548215 548216 plu0767 plu0768   mrfI FALSE 0.007 1259.000 0.000 NA   0.021
 548217 548218 plu0769 plu0770 mrfA mrfB TRUE 0.891 84.000 0.000 0.008 Y 0.780
 548218 548219 plu0770 plu0771 mrfB mrfC TRUE 0.978 20.000 0.000 1.000 Y 0.858
 548219 548220 plu0771 plu0772 mrfC mrfD TRUE 0.930 124.000 0.400 1.000 Y 0.832
 548220 548221 plu0772 plu0773 mrfD mrfX TRUE 0.966 25.000 0.000 1.000 Y 0.805
 548221 548222 plu0773 plu0774 mrfX mrfE TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.008 Y 0.916
 548222 548223 plu0774 plu0775 mrfE mrfF TRUE 0.996 15.000 0.571 NA   0.949
 548223 548224 plu0775 plu0776 mrfF mrfG TRUE 0.995 12.000 0.429 NA   0.993
 548224 548225 plu0776 plu0777 mrfG mrfH TRUE 0.846 28.000 0.000 NA   0.869
 548225 548226 plu0777 plu0778 mrfH mrfJ TRUE 0.819 31.000 0.000 NA   0.981
 548226 548227 plu0778 plu0779 mrfJ   FALSE 0.011 847.000 0.000 1.000   0.898
 548227 548228 plu0779 plu0780     FALSE 0.379 118.000 0.000 1.000   0.950
 548228 548229 plu0780 plu0781     TRUE 0.957 0.000 0.000 1.000   NA
 548229 548230 plu0781 plu0782     TRUE 0.771 34.000 0.000 1.000   NA
 548230 548231 plu0782 plu0783     TRUE 0.980 31.000 0.000 0.005 Y 0.942
 548231 548232 plu0783 plu0784     TRUE 0.745 84.000 0.000 1.000 Y NA
 548232 548233 plu0784 plu0785     FALSE 0.221 147.000 0.000 NA   NA
 548233 548234 plu0785 plu0786     FALSE 0.054 324.000 0.000 NA   -0.560
 548234 548235 plu0786 plu0787     TRUE 0.440 102.000 0.000 1.000   0.856
 548235 548236 plu0787 plu0788     TRUE 0.968 0.000 0.000 1.000   0.898
 548236 548237 plu0788 plu0789     TRUE 0.795 34.000 0.000 1.000   0.100
 548237 548238 plu0789 plu0790     TRUE 0.979 31.000 0.000 0.005 Y 0.559
 548238 548239 plu0790 plu0791     TRUE 0.781 83.000 0.000 1.000 Y 0.946
 548239 548240 plu0791 plu0792     TRUE 0.449 93.000 0.000 NA   0.922
 548241 548242 plu0793 plu0794     TRUE 0.930 17.000 0.000 1.000   0.827
 548242 548243 plu0794 plu0795     FALSE 0.276 179.000 0.100 1.000   -0.035
 548243 548244 plu0795 plu0796     TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000   0.390
 548244 548245 plu0796 plu0797     TRUE 0.966 3.000 0.000 1.000   0.819
 548245 548246 plu0797 plu0798     FALSE 0.004 911.000 0.000 1.000 N 0.600
 548247 548248 plu0799 plu0800 tnaA mtr TRUE 0.747 111.000 0.077 1.000 Y 0.392
 548250 548251 plu0802 plu0803     FALSE 0.123 167.000 0.000 1.000 N 0.883
 548251 548252 plu0803 plu0804     FALSE 0.056 350.000 0.000 NA   0.659
 548252 548253 plu0804 plu0805   tccA3 FALSE 0.102 262.000 0.000 NA   0.670
 548253 548254 plu0805 plu0806 tccA3 tccB3 TRUE 0.655 49.000 0.000 NA   0.963
 548254 548255 plu0806 plu0807 tccB3   TRUE 0.417 102.000 0.000 NA   0.802
 548256 548257 plu0808 plu0809     TRUE 0.955 -3.000 0.000 NA   0.737
 548257 548258 plu0809 plu0810   afuC FALSE 0.233 154.000 0.000 NA   0.142
 548258 548259 plu0810 plu0811 afuC afuB TRUE 0.993 16.000 0.381 0.043 N 0.925
 548259 548260 plu0811 plu0812 afuB afuA TRUE 0.984 122.000 0.667 0.043 Y 0.943
 548260 548261 plu0812 plu0813 afuA uhpC TRUE 0.994 14.000 0.407 0.043 N 0.541
 548261 548262 plu0813 plu0814 uhpC uhpB TRUE 0.944 89.000 0.611 0.074 N 0.585
 548262 548263 plu0814 plu0815 uhpB uhpA TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.010 Y 0.919
 548265 548266 plu0817 plu0818     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 548266 548267 plu0818 plu0819     TRUE 0.982 37.000 0.600 NA   NA
 548267 548268 plu0819 plu0820     TRUE 0.997 17.000 0.800 NA   NA
 548268 548269 plu0820 plu0821     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 548269 548270 plu0821 plu0822     FALSE 0.012 603.000 0.000 NA   NA
 548270 548271 plu0822 plu0823     TRUE 0.391 81.000 0.000 NA   NA
 548271 548272 plu0823 plu0824     TRUE 0.811 27.000 0.000 NA   NA
 548272 548273 plu0824 plu0825     TRUE 0.998 5.000 0.800 NA   NA
 548273 548274 plu0825 plu0826     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 548275 548276 plu0827 plu0828     TRUE 0.485 60.000 0.000 NA   NA
 548276 548277 plu0828 plu0829     FALSE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 548277 548278 plu0829 plu0830     TRUE 0.791 34.000 0.000 1.000   -0.089
 548280 548281 plu0832 plu0833 agaR agaZ TRUE 0.973 36.000 0.182 1.000 Y 0.368
 548281 548282 plu0833 plu0834 agaZ agaS TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 N -0.935
 548282 548283 plu0834 plu0835 agaS agaV TRUE 0.942 -34.000 0.286 1.000 N -0.399
 548283 548284 plu0835 plu0836 agaV agaC TRUE 1.000 11.000 0.905 0.008 Y -0.449
 548284 548285 plu0836 plu0837 agaC agaD TRUE 0.994 -10.000 0.143 0.008 Y 0.557
 548285 548286 plu0837 plu0838 agaD   TRUE 0.986 23.000 0.000 0.008 Y -0.292
 548286 548287 plu0838 plu0839   gatY TRUE 0.987 10.000 0.000 1.000 Y -0.714
 548287 548288 plu0839 plu0840 gatY   TRUE 0.936 25.000 0.130 1.000   0.791
 548288 548289 plu0840 plu0841     TRUE 0.651 88.000 0.000 0.037   -0.479
 548290 548291 plu0842 plu0843 speD speE TRUE 0.965 39.000 0.162 1.000 Y 0.998
 548291 548292 plu0843 plu0844 speE   TRUE 0.823 113.000 0.354 NA   0.930
 548293 548294 plu0845 plu0846 cueO   FALSE 0.096 269.000 0.000 NA   0.581
 548294 548295 plu0846 plu0847     TRUE 0.959 7.000 0.000 NA   0.932
 548295 548296 plu0847 plu0848     FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   0.847
 548296 548297 plu0848 plu0849     FALSE 0.015 546.000 0.000 NA   NA
 548297 548298 plu0849 plu0850     TRUE 0.953 0.000 0.000 NA   NA
 548299 548300 plu0851 plu0852     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   0.582
 548300 548301 plu0852 plu0853     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.941
 548301 548302 plu0853 plu0854   ISPlu1F TRUE 0.827 -18.000 0.000 NA   NA
 548302 548303 plu0854 plu0855 ISPlu1F   TRUE 0.417 71.000 0.000 NA   NA
 548303 548304 plu0855 plu0856     TRUE 0.885 -10.000 0.000 NA   -0.722
 548304 548305 plu0856 plu0857     FALSE 0.206 160.000 0.000 NA   -0.503
 548305 548306 plu0857 plu0858     TRUE 0.921 14.000 0.000 NA   NA
 548307 548308 plu0859 plu0860     FALSE 0.019 370.000 0.000 1.000 N 0.152
 548308 548309 plu0860 plu0861     FALSE 0.117 221.000 0.000 1.000   NA
 548309 548310 plu0861 plu0862     TRUE 0.952 5.000 0.000 1.000   NA
 548310 548311 plu0862 plu0863     FALSE 0.253 140.000 0.000 NA   -0.224
 548311 548312 plu0863 plu0864     FALSE 0.047 335.000 0.000 NA   NA
 548313 548314 plu0865 plu0866     TRUE 0.980 11.000 0.154 NA   0.959
 548314 548315 plu0866 plu0867     FALSE 0.007 1520.000 0.000 NA   0.770
 548316 548317 plu0868 plu0869 yadG yadH TRUE 1.000 12.000 0.688 0.095 Y 0.945
 548318 548319 plu0870 plu0871 panD panC TRUE 0.958 68.000 0.342 1.000 Y 0.890
 548319 548320 plu0871 plu0872 panC panB TRUE 0.997 27.000 0.395 0.001 Y 0.951
 548320 548321 plu0872 plu0873 panB folK TRUE 0.859 71.000 0.117 1.000 Y 0.967
 548321 548322 plu0873 plu0874 folK pcnB TRUE 0.985 6.000 0.234 1.000 N 0.788
 548322 548323 plu0874 plu0875 pcnB   TRUE 0.974 28.000 0.131 1.000 Y 0.604
 548323 548324 plu0875 plu0876   dksA TRUE 0.766 63.000 0.231 1.000 N 0.910
 548324 548325 plu0876 plu0877 dksA sfsA FALSE 0.341 196.000 0.151 NA   0.921
 548325 548326 plu0877 plu0878 sfsA   FALSE 0.172 172.000 0.000 NA   NA
 548326 548327 plu0878 plu0879   cpmK TRUE 0.693 40.000 0.000 NA   NA
 548327 548328 plu0879 plu0880 cpmK cpmJ TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548328 548329 plu0880 plu0881 cpmJ cpmI TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 548330 548331 plu0882 plu0883 hrpB mrcB TRUE 0.542 94.000 0.158 1.000 N 0.709
 548331 548332 plu0883 plu0884 mrcB   FALSE 0.022 485.000 0.000 1.000   -0.824
 548332 548333 plu0884 plu0885     TRUE 0.965 0.000 0.000 NA   0.886
 548333 548334 plu0885 plu0886     TRUE 0.465 82.000 0.000 NA   0.810
 548334 548335 plu0886 plu0887     TRUE 0.439 97.000 0.000 NA   0.898
 548335 548336 plu0887 plu0888     TRUE 0.958 8.000 0.000 NA   0.769
 548336 548337 plu0888 plu0889     TRUE 0.499 58.000 0.000 NA   NA
 548337 548338 plu0889 plu0890     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 548338 548339 plu0890 plu0891     TRUE 0.530 65.000 0.000 NA   0.910
 548339 548340 plu0891 plu0892     TRUE 0.511 62.000 0.000 NA   0.083
 548340 548341 plu0892 plu0893     FALSE 0.095 262.000 0.000 NA   0.229
 548341 548342 plu0893 plu0894     FALSE 0.387 106.000 0.000 NA   0.548
 548342 548343 plu0894 plu0895     FALSE 0.283 128.000 0.000 NA   -0.353
 548343 548344 plu0895 plu0896     TRUE 0.965 -6.000 0.128 NA   0.547
 548344 548345 plu0896 plu0897     FALSE 0.011 793.000 0.000 NA   0.946
 548345 548346 plu0897 plu0898     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y 0.497
 548346 548347 plu0898 plu0899     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.001 Y 0.955
 548350 548351 plu0902 plu0903 hemL   TRUE 0.631 51.000 0.000 NA   0.804
 548353 548354 plu0905 plu0906 btuF mtnA FALSE 0.111 206.000 0.073 1.000 N 0.900
 548357 548358 plu0909 plu0910 rumA relA TRUE 0.658 42.000 0.082 1.000 N 0.742
 548358 548359 plu0910 plu0911 relA mazG TRUE 0.512 68.000 0.040 1.000   0.759
 548359 548360 plu0911 plu0912 mazG pyrG FALSE 0.112 222.000 0.025 1.000   0.352
 548360 548361 plu0912 plu0913 pyrG eno FALSE 0.368 74.000 0.068 1.000 N 0.907
 548361 548362 plu0913 plu0914 eno   FALSE 0.013 677.000 0.000 NA   0.691
 548362 548363 plu0914 plu0915     FALSE 0.115 191.000 0.019 NA   -0.566
 548363 548364 plu0915 plu0916     TRUE 0.854 23.000 0.019 1.000   0.224
 548364 548365 plu0916 plu0917     FALSE 0.016 560.000 0.000 1.000   NA
 548366 548367 plu0918 plu0919     TRUE 0.685 161.000 0.000 0.045 Y NA
 548367 548368 plu0919 plu0920     FALSE 0.334 322.000 0.000 0.045 Y NA
 548368 548369 plu0920 plu0921     FALSE 0.379 301.000 0.000 0.045 Y NA
 548369 548370 plu0921 plu0922     FALSE 0.342 318.000 0.000 0.045 Y NA
 548370 548371 plu0922 plu0923     FALSE 0.170 286.000 0.000 0.045   NA
 548371 548372 plu0923 plu0924     TRUE 0.393 162.000 0.000 0.045   NA
 548372 548373 plu0924 plu0925     TRUE 0.685 161.000 0.000 0.045 Y NA
 548376 548377 plu0928 plu0929     TRUE 0.992 -130.000 0.800 NA   -0.641
 548378 548379 plu0930 plu0931     FALSE 0.006 1007.000 0.000 NA   NA
 548380 548381 plu0932 plu0933     TRUE 0.999 6.000 1.000 NA   0.818
 548381 548382 plu0933 plu0934     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000   0.993
 548382 548383 plu0934 plu0935     TRUE 0.999 3.000 1.000 1.000   0.983
 548383 548384 plu0935 plu0936     TRUE 0.863 128.000 0.500 1.000   0.984
 548384 548385 plu0936 plu0937     TRUE 0.691 50.000 0.065 1.000   0.987
 548386 548387 plu0938 plu0939   mltD FALSE 0.014 649.000 0.000 NA   0.583
 548387 548388 plu0939 plu0940 mltD gloB TRUE 0.789 72.000 0.233 1.000   -0.595
 548391 548392 plu0943 plut011 dnaQ tRNA-Asp FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548393 548394 plu0944 plu0945     FALSE 0.016 573.000 0.000 1.000   -0.498
 548396 548397 plu0947 plu0948     FALSE 0.081 381.000 0.118 1.000   0.550
 548397 548398 plu0948 plu0949     TRUE 0.399 298.000 0.000 0.054 Y 0.128
 548399 548400 plu0950 plu0951     TRUE 0.781 38.000 0.000 1.000   0.632
 548400 548401 plu0951 plu0952     TRUE 0.955 9.000 0.000 NA   0.597
 548401 548402 plu0952 plu0953     TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548402 548403 plu0953 plu0954     TRUE 0.933 12.000 0.000 NA   NA
 548403 548404 plu0954 plu0955   epd FALSE 0.019 495.000 0.000 NA   -0.969
 548404 548405 plu0955 plu0956 epd pgk TRUE 0.910 84.000 0.070 0.005 Y 0.957
 548405 548406 plu0956 plu0957 pgk fba TRUE 0.918 63.000 0.056 0.005 Y -0.849
 548407 548408 plu0958 plu0959     TRUE 0.976 56.000 0.750 1.000   0.686
 548408 548409 plu0959 plu0960   tccC2 FALSE 0.025 463.000 0.000 NA   -0.159
 548409 548410 plu0960 plu0961 tccC2 tcdB1 FALSE 0.018 581.000 0.000 NA   0.770
 548410 548411 plu0961 plu0962 tcdB1 tcdA1 TRUE 0.624 53.000 0.000 1.000   0.984
 548413 548414 plu0964 plu0965 tccC5 tcdA4 FALSE 0.193 193.000 0.000 1.000   0.927
 548416 548417 plu0967 plu0968 tccC3 tchA FALSE 0.220 149.000 0.000 NA   -0.848
 548417 548418 plu0968 plu0969 tchA tcdB2 TRUE 0.544 53.000 0.000 NA   -0.870
 548418 548419 plu0969 plu0970 tcdB2 tcdA2 TRUE 0.601 57.000 0.000 1.000   0.819
 548419 548420 plu0970 plu0971 tcdA2 tcdA5 FALSE 0.022 473.000 0.000 NA   -0.519
 548422 548423 plu0973 plu0974   hpaC FALSE 0.023 470.000 0.000 1.000   NA
 548423 548424 plu0974 plu0975 hpaC hpaB TRUE 0.970 20.000 0.000 0.002   NA
 548424 548425 plu0975 plu0976 hpaB tccC4 FALSE 0.026 322.000 0.000 1.000 N 0.105
 548425 548426 plu0976 plu0977 tccC4   FALSE 0.032 268.000 0.000 1.000 N -0.841
 548426 548427 plu0977 plu0978     FALSE 0.009 725.000 0.000 NA   -0.903
 548427 548428 plu0978 plu0979     FALSE 0.013 612.000 0.000 NA   -0.624
 548428 548429 plu0979 plu0980   hpaA FALSE 0.033 438.000 0.000 NA   0.878
 548429 548430 plu0980 plu0981 hpaA hpaX TRUE 0.945 26.000 0.233 1.000 N 0.921
 548430 548431 plu0981 plu0982 hpaX hpaI TRUE 0.865 97.000 0.175 1.000 Y -0.466
 548431 548432 plu0982 plu0983 hpaI hpcG TRUE 0.992 12.000 0.439 1.000 N -0.254
 548432 548433 plu0983 plu0984 hpcG gabD TRUE 0.975 5.000 0.075 0.060 N 0.726
 548433 548434 plu0984 plu0985 gabD   TRUE 0.912 -10.000 0.136 1.000 N -0.268
 548434 548435 plu0985 plu0986   hpcD TRUE 0.871 3.000 0.039 1.000 N -0.716
 548435 548436 plu0986 plu0987 hpcD hpcB TRUE 0.990 14.000 0.330 1.000   0.026
 548436 548437 plu0987 plu0988 hpcB hpcC TRUE 0.894 65.000 0.378 1.000   -0.462
 548437 548438 plu0988 plu0989 hpcC hpaG2 TRUE 0.997 0.000 0.510 0.060 N -0.931
 548438 548439 plu0989 plu0990 hpaG2 hpaG1 TRUE 1.000 -3.000 0.618 0.001 Y 0.806
 548441 548442 plu0992 plu0993 ngrA phfB TRUE 0.496 46.000 0.000 1.000 N 0.981
 548442 548443 plu0993 plu0994 phfB phfA FALSE 0.111 408.000 0.000 0.007   0.992
 548443 548444 plu0994 plu0995 phfA phfD TRUE 0.850 28.000 0.000 1.000   0.987
 548444 548445 plu0995 plu0996 phfD phfC TRUE 0.990 6.000 0.000 1.000 Y 0.763
 548445 548446 plu0996 plu0997 phfC phfS TRUE 0.832 57.000 0.000 1.000 Y -0.614
 548447 548448 plu0998 plu0999     FALSE 0.018 546.000 0.000 NA   0.336
 548448 548449 plu0999 plu1000     TRUE 0.983 11.000 0.167 1.000   0.929
 548449 548450 plu1000 plu1001     TRUE 0.988 29.000 0.286 0.001   0.402
 548450 548451 plu1001 plu1002     FALSE 0.064 317.000 0.000 1.000   -0.368
 548451 548452 plu1002 plu1003     FALSE 0.155 125.000 0.000 1.000 N 0.136
 548452 548453 plu1003 plu1004     TRUE 0.627 35.000 0.000 1.000 N 0.612
 548453 548454 plu1004 plu1005     FALSE 0.385 55.000 0.000 1.000 N 0.618
 548456 548457 plu1007 plu1008     FALSE 0.013 591.000 0.000 NA   NA
 548457 548458 plu1008 plu1009     FALSE 0.320 110.000 0.000 NA   NA
 548459 548460 plu1010 plu1011     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548460 548461 plu1011 plu1012     TRUE 0.857 -16.000 0.000 NA   0.280
 548462 548463 plu1013 plu1014     FALSE 0.068 288.000 0.000 NA   NA
 548464 548465 plu1015 plu1016     FALSE 0.071 283.000 0.000 NA   NA
 548465 548466 plu1016 plu1017     FALSE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 548468 548469 plu1019 plu1020     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548469 548470 plu1020 plu1021     FALSE 0.246 134.000 0.000 NA   NA
 548471 548472 plu1022 plu1023     TRUE 0.776 55.000 0.000 0.017   NA
 548472 548473 plu1023 plu1024     TRUE 0.975 27.000 0.000 0.087 Y 0.218
 548473 548474 plu1024 plu1025     TRUE 0.824 -64.000 0.000 NA   0.918
 548474 548475 plu1025 plu1026     TRUE 0.570 50.000 0.000 NA   NA
 548475 548476 plu1026 plu1027     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548476 548477 plu1027 plu1028     FALSE 0.013 700.000 0.000 NA   0.944
 548477 548478 plu1028 plu1029     TRUE 0.394 78.000 0.000 NA   NA
 548478 548479 plu1029 plu1030     FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000 N NA
 548479 548480 plu1030 plu1031     TRUE 0.918 -7.000 0.100 1.000 N 0.934
 548480 548481 plu1031 plu1032     TRUE 0.995 -3.000 0.250 0.087   0.992
 548481 548482 plu1032 plu1033     TRUE 0.930 -7.000 0.040 1.000   0.882
 548482 548483 plu1033 plu1034     TRUE 0.463 64.000 0.000 NA   -0.892
 548483 548484 plu1034 plu1035     FALSE 0.136 229.000 0.000 NA   0.907
 548484 548485 plu1035 plu1036     FALSE 0.093 269.000 0.000 NA   0.424
 548485 548486 plu1036 plu1037     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   0.517
 548486 548487 plu1037 plu1038     FALSE 0.012 660.000 0.000 NA   0.174
 548487 548488 plu1038 plu1039     TRUE 0.448 74.000 0.000 NA   0.302
 548489 548490 plu1040 plu1041     FALSE 0.062 302.000 0.000 NA   NA
 548490 548491 plu1041 plu1042     TRUE 0.866 -13.000 0.000 NA   -0.431
 548491 548492 plu1042 plu1043     TRUE 0.944 13.000 0.000 NA   0.730
 548493 548494 plu1044 plu1045     FALSE 0.016 534.000 0.000 NA   NA
 548496 548497 plu1047 plu1048     TRUE 0.879 24.000 0.000 NA   0.728
 548497 548498 plu1048 plu1049   pilL FALSE 0.220 148.000 0.000 NA   -0.898
 548498 548499 plu1049 plu1050 pilL pilM TRUE 0.951 7.000 0.000 NA   -0.237
 548499 548500 plu1050 plu1051 pilM pilN TRUE 0.911 19.000 0.000 NA   0.558
 548500 548501 plu1051 plu1052 pilN pilO TRUE 0.881 24.000 0.000 NA   0.961
 548501 548502 plu1052 plu1053 pilO pilP TRUE 0.950 8.000 0.000 NA   -0.319
 548502 548503 plu1053 plu1054 pilP pilQ TRUE 0.940 14.000 0.000 NA   0.756
 548503 548504 plu1054 plu1055 pilQ pilR TRUE 0.981 -7.000 0.000 1.000 Y 0.561
 548504 548505 plu1055 plu1056 pilR pilS TRUE 0.965 69.000 0.800 NA   -0.321
 548505 548506 plu1056 plu1057 pilS pilU TRUE 0.960 1.000 0.000 NA   0.332
 548506 548507 plu1057 plu1058 pilU pilV TRUE 0.507 66.000 0.000 NA   0.637
 548507 548508 plu1058 plu1059 pilV   FALSE 0.042 357.000 0.000 NA   NA
 548508 548509 plu1059 plu1060     TRUE 0.917 -6.000 0.000 NA   NA
 548509 548510 plu1060 plu1061   IS_Pl3_3 TRUE 0.789 64.000 0.000 NA Y NA
 548510 548511 plu1061 plu1062 IS_Pl3_3   TRUE 0.763 33.000 0.000 NA   NA
 548511 548512 plu1062 plu1063     FALSE 0.108 221.000 0.000 NA   NA
 548513 548514 plu1064 plu1065     TRUE 0.965 3.000 0.061 NA   0.381
 548515 548516 plu1066 plu1067     FALSE 0.034 384.000 0.000 NA   NA
 548516 548517 plu1067 plu1068     TRUE 0.989 3.000 0.222 NA   -0.423
 548517 548518 plu1068 plu1069     TRUE 0.973 30.000 0.400 NA   -0.956
 548518 548519 plu1069 plu1070     TRUE 0.960 6.000 0.000 NA   0.883
 548519 548520 plu1070 plu1071     FALSE 0.380 104.000 0.000 NA   0.242
 548522 548523 plu1073 plu1074     TRUE 0.843 -19.000 0.000 NA   0.158
 548524 548525 plu1075 plu1076     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   -0.964
 548525 548526 plu1076 plu1077     TRUE 0.766 -120.000 0.000 NA   NA
 548527 548528 plu1078 plu1079     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 548528 548529 plu1079 plu1080     TRUE 0.745 40.000 0.000 NA   0.676
 548529 548530 plu1080 plu1081     TRUE 0.913 19.000 0.000 NA   0.678
 548530 548531 plu1081 plu1082     FALSE 0.014 650.000 0.000 NA   0.993
 548531 548532 plu1082 plu1083     TRUE 0.927 -10.000 0.105 NA   -0.975
 548532 548533 plu1083 plu1084     TRUE 0.854 -13.000 0.000 NA   -0.995
 548533 548534 plu1084 plu1085     TRUE 0.971 -3.000 0.125 NA   -0.949
 548534 548535 plu1085 plu1086     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.402
 548535 548536 plu1086 plu1087     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   -0.451
 548536 548537 plu1087 plu1088     TRUE 0.995 16.000 0.611 NA   -0.118
 548537 548538 plu1088 plu1089     TRUE 0.996 0.000 0.444 NA   -0.268
 548538 548539 plu1089 plu1090     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   -0.630
 548541 548542 plu1092 plu1093     TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548543 548544 plu1094 plu1095     TRUE 0.614 47.000 0.000 NA   NA
 548545 548546 plu1096 plu1097     FALSE 0.101 232.000 0.000 NA   NA
 548547 548548 plu1098 plu1099     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548548 548549 plu1099 plu1101     TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548549 548550 plu1101 plu1102     TRUE 0.782 -48.000 0.000 NA   NA
 548551 548552 plu1103 plu1104     TRUE 0.540 53.000 0.000 NA   NA
 548552 548553 plu1104 plu1105     TRUE 0.997 22.000 0.500 NA Y 0.004
 548553 548554 plu1105 plu1106     FALSE 0.051 244.000 0.000 1.000 N 0.344
 548556 548557 plu1108 plu1109     FALSE 0.249 133.000 0.000 NA   NA
 548557 548558 plu1109 plu1110     FALSE 0.157 181.000 0.000 NA   NA
 548558 548559 plu1110 plu1111     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA   0.958
 548559 548560 plu1111 plu1112     TRUE 0.784 -45.000 0.000 NA   NA
 548560 548561 plu1112 plu1113     FALSE 0.015 554.000 0.000 NA   NA
 548561 548562 plu1113 plu1114   ISPlu9H TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548562 548563 plu1114 plu1115 ISPlu9H   TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548566 548567 plu1118 plu1119     FALSE 0.149 186.000 0.000 NA   NA
 548567 548568 plu1119 plu1120     TRUE 0.933 12.000 0.000 NA   NA
 548568 548569 plu1120 plu1121     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548569 548570 plu1121 plu1122     FALSE 0.235 142.000 0.000 NA   -0.811
 548570 548571 plu1122 plu1123     TRUE 0.943 -3.000 0.000 NA   -0.879
 548571 548572 plu1123 plu1124     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548572 548573 plu1124 plu1125     FALSE 0.036 376.000 0.000 NA   NA
 548573 548574 plu1125 plu1126     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.085 Y NA
 548575 548576 plu1127 plu1128     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 548577 548578 plu1129 plu1130     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548578 548579 plu1130 plu1131     FALSE 0.022 465.000 0.000 NA   NA
 548579 548580 plu1131 plu1132     TRUE 0.427 75.000 0.000 NA   -0.221
 548580 548581 plu1132 plu1133     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   -0.697
 548581 548582 plu1133 plu1134     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548582 548583 plu1134 plu1135     FALSE 0.015 552.000 0.000 NA   NA
 548583 548584 plu1135 plu1136     TRUE 0.989 -13.000 0.147 0.085 Y NA
 548585 548586 plu1137 plu1138     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 548587 548588 plu1139 plu1140     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548588 548589 plu1140 plu1141     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548591 548592 plu1143 plu1144     TRUE 0.938 -13.000 0.147 NA   NA
 548592 548593 plu1144 plu1145     TRUE 0.739 36.000 0.000 NA   NA
 548594 548595 plu1146 plu1147     FALSE 0.357 99.000 0.000 NA   NA
 548596 548597 plu1148 plu1149     TRUE 0.944 9.000 0.000 NA   NA
 548597 548598 plu1149 plu1150     TRUE 0.862 49.000 0.000 NA Y NA
 548599 548600 plu1151 plu1152     FALSE 0.034 390.000 0.000 NA   -0.779
 548600 548601 plu1152 plu1153     FALSE 0.023 443.000 0.000 NA   NA
 548601 548602 plu1153 plu1154     TRUE 0.928 13.000 0.000 NA   NA
 548602 548603 plu1154 plu1155     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   0.269
 548603 548604 plu1155 plu1156     TRUE 0.997 0.000 0.500 NA   0.881
 548604 548605 plu1156 plu1157     TRUE 0.904 78.000 0.500 NA   -0.835
 548605 548606 plu1157 plu1158     TRUE 0.828 68.000 0.250 NA   0.985
 548606 548607 plu1158 plu1159     TRUE 0.767 100.000 0.250 NA   0.436
 548607 548608 plu1159 plu1160     TRUE 0.459 66.000 0.000 NA   -0.661
 548608 548609 plu1160 plu1161     FALSE 0.380 89.000 0.000 NA   NA
 548609 548610 plu1161 plu1162     FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548610 548611 plu1162 plu1163     FALSE 0.249 148.000 0.000 NA   0.222
 548611 548612 plu1163 plu1164     FALSE 0.246 134.000 0.000 NA   NA
 548612 548613 plu1164 plu1165     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 548613 548614 plu1165 plu1166     FALSE 0.370 95.000 0.000 NA   NA
 548615 548616 plut012 plu1167 tRNA-Phe mltC FALSE 0.192 161.000 0.000 NA   NA
 548616 548617 plu1167 plu1168 mltC   TRUE 0.475 64.000 0.128 NA N NA
 548617 548618 plu1168 plu1169   mutY TRUE 0.827 31.000 0.150 NA N NA
 548619 548620 plu1170 plu1171     TRUE 0.976 0.000 0.092 NA   0.817
 548620 548621 plu1171 plu1172     TRUE 0.612 80.000 0.123 NA   0.602
 548621 548622 plu1172 plu1173     TRUE 0.685 48.000 0.059 NA   0.483
 548622 548623 plu1173 plu1174     TRUE 0.557 118.000 0.148 NA   0.416
 548624 548625 plu1175 plu1176     FALSE 0.013 621.000 0.000 NA   -0.311
 548625 548626 plu1176 plu1177     TRUE 0.965 -7.000 0.218 1.000 N -0.101
 548626 548627 plu1177 plu1178     TRUE 0.804 27.000 0.005 1.000   0.975
 548627 548628 plu1178 plu1179   proC TRUE 0.966 19.000 0.152 1.000   0.953
 548628 548629 plu1179 plu1180 proC   TRUE 0.917 26.000 0.125 NA   0.378
 548631 548632 plu1182 plu1183     TRUE 0.988 1.000 0.263 NA N 0.596
 548632 548633 plu1183 plu1184   gshB FALSE 0.381 110.000 0.120 NA N 0.862
 548633 548634 plu1184 plu1185 gshB   TRUE 0.981 10.000 0.173 NA   -0.648
 548636 548637 plu1187 plu1188     TRUE 0.923 32.000 0.157 1.000   0.975
 548642 548643 plu1193 plu1194 lcpA   TRUE 0.615 150.000 0.229 1.000   0.676
 548645 548646 plu1196 plu1197 nqrA nqrB TRUE 1.000 5.000 0.854 0.002 Y 0.785
 548646 548647 plu1197 plu1198 nqrB nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.603 0.002 Y 0.905
 548647 548648 plu1198 plu1199 nqrC nqrD TRUE 0.998 -7.000 0.312 0.002 Y 0.994
 548648 548649 plu1199 plu1200 nqrD nqrE TRUE 0.998 9.000 0.188 0.002 Y -0.138
 548649 548650 plu1200 plu1201 nqrE nqrF TRUE 0.999 16.000 0.551 0.002 Y -0.178
 548650 548651 plu1201 plu1202 nqrF apbE TRUE 0.877 80.000 0.519 1.000 N -0.221
 548651 548652 plu1202 plu1203 apbE   TRUE 0.993 17.000 0.481 NA   0.497
 548653 548654 plu1204 plu1205     FALSE 0.176 170.000 0.000 NA   NA
 548654 548655 plu1205 plu1206     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   NA
 548655 548656 plu1206 plu1207     TRUE 0.499 58.000 0.000 NA   NA
 548656 548657 plu1207 plu1208     TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 548657 548658 plu1208 plu1209     TRUE 0.881 -10.000 0.000 NA   NA
 548659 548660 plu1210 plu1211     TRUE 0.956 -21.000 0.000 1.000 Y 0.063
 548660 548661 plu1211 plu1212     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.010 Y 0.343
 548661 548662 plu1212 plu1213     TRUE 0.995 3.000 0.000 0.010 Y -0.108
 548662 548663 plu1213 plu1214     TRUE 0.926 2.000 0.000 1.000 N 0.856
 548663 548664 plu1214 plu1215     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.008 Y -0.053
 548664 548665 plu1215 plu1216     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548665 548666 plu1216 plu1217     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548666 548667 plu1217 plu1218     TRUE 0.925 0.000 0.000 1.000 N 0.966
 548667 548668 plu1218 plu1219     TRUE 0.904 -3.000 0.000 1.000 N 0.667
 548668 548669 plu1219 plu1220     TRUE 0.987 10.000 0.000 1.000 Y -0.597
 548669 548670 plu1220 plu1221     FALSE 0.240 163.000 0.000 NA   0.893
 548670 548671 plu1221 plu1222   ISPlu13C FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 548672 548673 plu1223 plu1224     TRUE 0.931 -19.000 0.143 NA   0.984
 548675 548676 plu1226 plu1227     TRUE 0.995 13.000 0.520 NA   -0.921
 548676 548677 plu1227 plu1228     TRUE 0.976 -12.000 0.282 NA   -0.707
 548677 548678 plu1228 plu1229     TRUE 0.999 0.000 0.944 1.000   -0.492
 548678 548679 plu1229 plu1230     TRUE 0.998 13.000 0.623 0.058   0.629
 548679 548680 plu1230 plu1231     TRUE 0.994 24.000 0.660 1.000   0.991
 548680 548681 plu1231 plu1232     TRUE 0.993 30.000 0.791 NA   0.309
 548683 548684 plu1234 plu1235     FALSE 0.262 82.000 0.000 1.000 N 0.526
 548684 548685 plu1235 plu1236     FALSE 0.008 569.000 0.000 1.000 N 0.968
 548685 548686 plu1236 plu1237     TRUE 0.948 5.000 0.000 NA   NA
 548686 548687 plu1237 plu1238   hemR FALSE 0.037 373.000 0.000 NA   NA
 548690 548691 plu1241 plu1242 gpt   TRUE 0.927 15.000 0.060 NA   -0.852
 548691 548692 plu1242 plu1243   proB FALSE 0.176 198.000 0.000 NA   0.852
 548692 548693 plu1243 plu1244 proB proA TRUE 0.996 10.000 0.026 0.001 Y 0.918
 548693 548694 plu1244 plu1245 proA aroL FALSE 0.260 301.000 0.000 1.000 Y 0.413
 548694 548695 plu1245 plu1246 aroL aas FALSE 0.248 100.000 0.000 1.000 N 0.747
 548695 548696 plu1246 plu1247 aas   TRUE 0.968 13.000 0.124 NA   0.309
 548696 548697 plu1247 plu1248     TRUE 0.836 26.000 0.026 NA   0.938
 548697 548698 plu1248 plu1249   recA TRUE 0.412 123.000 0.082 NA   0.781
 548698 548699 plu1249 plu1250 recA alaS FALSE 0.058 391.000 0.054 0.090 N 0.854
 548699 548700 plu1250 plu1251 alaS csrA FALSE 0.019 247.000 0.020 1.000 N NA
 548700 548701 plu1251 plut013 csrA tRNA-Ser FALSE 0.033 391.000 0.000 NA   NA
 548701 548702 plut013 plut014 tRNA-Ser tRNA-Arg TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548702 548703 plut014 plut015 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.382 88.000 0.000 NA   NA
 548703 548704 plut015 plut016 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.383 87.000 0.000 NA   NA
 548704 548705 plut016 plu1252 tRNA-Arg gshA FALSE 0.055 316.000 0.000 NA   NA
 548705 548706 plu1252 plu1253 gshA luxS FALSE 0.170 153.000 0.087 1.000 N -0.545
 548707 548708 plu1254 plu1255     TRUE 0.780 130.000 0.349 NA   0.917
 548709 548710 plu1256 plu1257 ffh rpsP TRUE 0.654 137.000 0.361 1.000 N -0.706
 548710 548711 plu1257 plu1258 rpsP rimM TRUE 0.998 19.000 0.342 0.013 Y -0.132
 548711 548712 plu1258 plu1259 rimM trmD TRUE 0.995 40.000 0.672 1.000 Y 0.444
 548712 548713 plu1259 plu1260 trmD rplS TRUE 0.979 65.000 0.567 1.000 Y 0.215
 548713 548714 plu1260 plu1261 rplS   FALSE 0.022 504.000 0.000 1.000   0.023
 548714 548715 plu1261 plu1262   aroF FALSE 0.020 547.000 0.000 1.000   0.523
 548715 548716 plu1262 plu1263 aroF tyrA TRUE 0.990 6.000 0.038 1.000 Y 0.875
 548717 548718 plu1264 plu1265   pheA FALSE 0.025 469.000 0.000 1.000   -0.667
 548718 548719 plu1265 plu1266 pheA   FALSE 0.021 270.000 0.015 NA N 0.502
 548719 548720 plu1266 plu1267     FALSE 0.061 288.000 0.004 NA   0.921
 548721 548722 plu1268 plu1269 rluD   TRUE 0.986 1.000 0.168 NA   0.325
 548722 548723 plu1269 plu1270   clpB FALSE 0.378 134.000 0.108 NA   -0.575
 548723 548724 plu1270 plur010 clpB 16s_rRNA FALSE 0.024 439.000 0.000 NA   NA
 548724 548725 plur010 plut017 16s_rRNA tRNA-Ile TRUE 0.429 69.000 0.000 NA   NA
 548725 548726 plut017 plut018 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.257 130.000 0.000 NA   NA
 548726 548727 plut018 plur011 tRNA-Ala 23s_rRNA FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 548727 548728 plur011 plur012 23s_rRNA 5s_rRNA FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548729 548730 plu1271 plu1272 pssA   TRUE 0.431 161.000 0.121 0.058 N 0.878
 548730 548731 plu1272 plu1273     TRUE 0.823 -19.000 0.000 NA   -0.861
 548733 548734 plu1275 plu1276 emrB emrA TRUE 0.997 15.000 0.875 1.000 N 0.576
 548734 548735 plu1276 plu1277 emrA mprA FALSE 0.101 234.000 0.107 1.000 N -0.113
 548735 548736 plu1277 plu1278 mprA   FALSE 0.324 130.000 0.065 NA   -0.162
 548736 548737 plu1278 plu1279     TRUE 0.999 -3.000 0.915 NA   0.748
 548737 548738 plu1279 plu1280     FALSE 0.203 126.000 0.060 NA N 0.811
 548738 548739 plu1280 plu1281   proX FALSE 0.164 376.000 0.174 0.040 N 0.877
 548739 548740 plu1281 plu1282 proX proW TRUE 0.992 70.000 0.695 0.040 Y 0.944
 548740 548741 plu1282 plu1283 proW proV TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.072 Y 0.934
 548741 548742 plu1283 plu1284 proV nrdF FALSE 0.007 598.000 0.000 1.000 N 0.481
 548742 548743 plu1284 plu1285 nrdF nrdE TRUE 0.996 21.000 0.190 0.001 Y -0.376
 548743 548744 plu1285 plu1286 nrdE nrdI TRUE 0.996 3.000 0.216 NA Y 0.012
 548744 548745 plu1286 plu1287 nrdI nrdH TRUE 0.993 8.000 0.440 NA N 0.057
 548746 548747 plu1288 plu1289 ogt cspE FALSE 0.031 216.000 0.027 1.000 N -0.880
 548748 548749 plu1290 plu1291 crcB lipA FALSE 0.059 140.000 0.004 1.000 N 0.238
 548749 548750 plu1291 plu1292 lipA lipB TRUE 0.971 111.000 0.319 0.001 Y 0.804
 548750 548751 plu1292 plu1293 lipB   TRUE 0.584 144.000 0.219 NA   0.224
 548751 548752 plu1293 plu1294   dacA FALSE 0.335 141.000 0.081 NA   0.366
 548752 548753 plu1294 plu1295 dacA rlpA TRUE 0.860 205.000 0.475 NA Y 0.758
 548753 548754 plu1295 plu1296 rlpA rodA TRUE 0.845 14.000 0.035 NA N 0.935
 548754 548755 plu1296 plu1297 rodA pbpA TRUE 0.915 9.000 0.046 1.000 N 0.925
 548755 548756 plu1297 plu1298 pbpA   TRUE 0.685 41.000 0.031 NA   0.313
 548756 548757 plu1298 plu1299     TRUE 0.993 3.000 0.307 NA   -0.099
 548757 548758 plu1299 plu1300   nadD FALSE 0.303 108.000 0.032 NA   -0.725
 548758 548759 plu1300 plu1301 nadD holA TRUE 0.758 -16.000 0.045 1.000 N 0.836
 548759 548760 plu1301 plu1302 holA rlpB TRUE 0.978 -3.000 0.199 NA N 0.937
 548760 548761 plu1302 plu1303 rlpB leuS TRUE 0.966 14.000 0.182 NA N 0.830
 548761 548762 plu1303 plu1304 leuS gltL FALSE 0.205 163.000 0.002 0.090 N 0.837
 548762 548763 plu1304 plu1305 gltL gltK TRUE 0.998 0.000 0.379 1.000 Y 0.977
 548763 548764 plu1305 plu1306 gltK gltJ TRUE 1.000 1.000 0.933 0.016 Y 0.988
 548764 548765 plu1306 plu1307 gltJ gltI TRUE 0.872 133.000 0.150 0.040 Y 0.975
 548765 548766 plu1307 plu1308 gltI lnt FALSE 0.009 563.000 0.000 1.000 N 0.881
 548766 548767 plu1308 plu1309 lnt corC TRUE 0.996 8.000 0.557 1.000 N 0.570
 548767 548768 plu1309 plu1310 corC   TRUE 0.676 73.000 0.150 NA   0.432
 548768 548769 plu1310 plu1311     TRUE 0.996 -3.000 0.457 NA   0.624
 548769 548770 plu1311 plu1312   miaB TRUE 0.970 16.000 0.220 1.000 N 0.952
 548772 548773 plut019 plut020 tRNA-Gln tRNA-Met TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 548773 548774 plut020 plut021 tRNA-Met tRNA-Gln TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 548774 548775 plut021 plut022 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.540 53.000 0.000 NA   NA
 548775 548776 plut022 plut023 tRNA-Gln tRNA-Leu TRUE 0.793 29.000 0.000 NA   NA
 548776 548777 plut023 plut024 tRNA-Leu tRNA-Met TRUE 0.947 6.000 0.000 NA   NA
 548777 548778 plut024 plu1315 tRNA-Met nagC FALSE 0.210 152.000 0.000 NA   NA
 548778 548779 plu1315 plu1316 nagC nagA TRUE 0.998 16.000 0.571 1.000 Y 0.812
 548779 548780 plu1316 plu1317 nagA nagB TRUE 0.990 85.000 0.557 0.001 Y 0.375
 548780 548781 plu1317 plu1318 nagB nagE FALSE 0.269 278.000 0.022 1.000 Y 0.725
 548784 548785 plu1321 plu1322     FALSE 0.025 1543.000 0.000 NA Y -0.402
 548785 548786 plu1322 plu1323     FALSE 0.006 618.000 0.000 1.000 N 0.044
 548786 548787 plu1323 plu1324   chb FALSE 0.049 694.000 0.000 1.000 Y 0.224
 548787 548788 plu1324 plu1325 chb dinJ FALSE 0.020 321.000 0.000 NA N -0.578
 548788 548789 plu1325 plu1326 dinJ   TRUE 0.980 -13.000 0.308 NA   0.972
 548790 548791 plu1327 plu1328 fur fldA FALSE 0.076 366.000 0.156 1.000 N 0.958
 548791 548792 plu1328 plu1329 fldA   TRUE 0.762 175.000 0.473 1.000   0.676
 548792 548793 plu1329 plu1330     TRUE 0.490 139.000 0.000 0.067   0.761
 548793 548794 plu1330 plu1331     FALSE 0.267 350.000 0.400 1.000 N 0.805
 548794 548795 plu1331 plu1332   rtxD TRUE 0.997 3.000 0.085 0.010 Y 0.723
 548795 548796 plu1332 plu1333 rtxD rtxB TRUE 0.992 -7.000 0.000 0.010 Y 0.751
 548797 548798 plu1334 plu1335   rtxC TRUE 0.997 22.000 0.846 NA   0.747
 548798 548799 plu1335 plu1336 rtxC   FALSE 0.295 118.000 0.000 NA   NA
 548799 548800 plu1336 plu1337     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 548800 548801 plu1337 plu1338   ISPlu2E FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 548801 548802 plu1338 plu1339 ISPlu2E   FALSE 0.013 600.000 0.000 NA   NA
 548802 548803 plu1339 plu1340     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 548803 548804 plu1340 plu1341     FALSE 0.020 551.000 0.000 NA   0.903
 548804 548805 plu1341 plu1342     FALSE 0.011 780.000 0.000 NA   0.604
 548805 548806 plu1342 plu1343     TRUE 0.824 -37.000 0.000 NA   0.495
 548806 548807 plu1343 plu1344     FALSE 0.009 720.000 0.000 NA   NA
 548807 548808 plu1344 plu1345   ISPlu11D FALSE 0.142 200.000 0.000 1.000   NA
 548809 548810 plu1346 plu1347     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   NA
 548810 548811 plu1347 plu1348     TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 548811 548812 plu1348 plu1349     FALSE 0.014 568.000 0.000 NA   NA
 548812 548813 plu1349 plu1350     TRUE 0.785 30.000 0.000 NA   NA
 548813 548814 plu1350 plu1351     TRUE 0.959 4.000 0.000 NA   0.606
 548814 548815 plu1351 plu1352     FALSE 0.079 274.000 0.000 NA   -0.600
 548815 548816 plu1352 plu1353     TRUE 0.605 48.000 0.000 NA   NA
 548816 548817 plu1353 plu1354     TRUE 0.679 41.000 0.000 NA   NA
 548817 548818 plu1354 plu1355     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   -0.522
 548818 548819 plu1355 plu1356     TRUE 0.828 -52.000 0.000 NA   0.940
 548819 548820 plu1356 plu1357     TRUE 0.868 22.000 0.000 NA   NA
 548820 548821 plu1357 plu1358     TRUE 0.764 -231.000 0.000 NA   NA
 548821 548822 plu1358 plu1359     FALSE 0.040 361.000 0.000 NA   NA
 548822 548823 plu1359 plu1360     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 548823 548824 plu1360 plu1361   ISPlu9G TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   NA
 548824 548825 plu1361 plu1362 ISPlu9G   TRUE 0.938 11.000 0.000 NA   NA
 548826 548827 plu1363 plu1364     FALSE 0.374 93.000 0.000 NA   NA
 548828 548829 plu1365 plu1366     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 548829 548830 plu1366 plu1367     FALSE 0.010 702.000 0.000 NA   NA
 548830 548831 plu1367 plu1368     TRUE 0.862 49.000 0.000 NA Y NA
 548832 548833 plu1369 plu1370     FALSE 0.008 1242.000 0.000 1.000   0.472
 548833 548834 plu1370 plu1371   pbpC TRUE 0.972 57.000 0.711 1.000   0.991
 548834 548835 plu1371 plu1372 pbpC ndk FALSE 0.027 220.000 0.008 1.000 N 0.241
 548835 548836 plu1372 plu1373 ndk   FALSE 0.364 183.000 0.156 1.000   0.007
 548836 548837 plu1373 plu1374     TRUE 0.406 117.000 0.067 1.000   0.306
 548837 548838 plu1374 plu1375     TRUE 0.559 122.000 0.153 1.000   0.425
 548838 548839 plu1375 plu1376   gcpE TRUE 0.806 74.000 0.233 1.000   0.779
 548839 548840 plu1376 plu1377 gcpE hisS TRUE 0.539 119.000 0.207 1.000 N 0.330
 548840 548841 plu1377 plu1378 hisS   TRUE 0.990 12.000 0.259 1.000   0.884
 548841 548842 plu1378 plu1379     TRUE 0.994 15.000 0.492 1.000   0.712
 548842 548843 plu1379 plu1380   engA FALSE 0.253 291.000 0.203 1.000   0.369
 548844 548845 plu1381 plu1382     FALSE 0.238 161.000 0.000 NA   0.980
 548845 548846 plu1382 plu1383   hemF FALSE 0.048 233.000 0.000 1.000 N -0.293
 548849 548850 plu1386 plu1387   cysP FALSE 0.047 368.000 0.000 NA   0.391
 548850 548851 plu1387 plu1388 cysP cysT TRUE 0.998 0.000 0.479 0.002 N 0.469
 548851 548852 plu1388 plu1389 cysT cysW TRUE 0.999 0.000 0.583 0.001 N -0.589
 548852 548853 plu1389 plu1390 cysW cysA TRUE 0.993 15.000 0.180 1.000 Y 0.727
 548853 548854 plu1390 plu1391 cysA cysM FALSE 0.170 139.000 0.049 1.000 N 0.823
 548855 548856 plu1392 plu1393 crr ptsI TRUE 0.965 49.000 0.114 0.006 Y 0.975
 548856 548857 plu1393 plu1394 ptsI ptsH TRUE 0.755 185.000 0.088 0.006 Y 0.933
 548857 548858 plu1394 plu1395 ptsH cysK FALSE 0.004 554.000 0.019 1.000 N -0.050
 548858 548859 plu1395 plu1396 cysK cysZ TRUE 0.771 115.000 0.122 1.000 Y -0.655
 548860 548861 plu1397 plu1398 zipA ligA FALSE 0.220 62.000 0.013 1.000 N 0.612
 548861 548862 plu1398 plu1399 ligA nupC FALSE 0.023 361.000 0.000 1.000 N 0.632
 548862 548863 plu1399 plu1400 nupC   FALSE 0.368 84.000 0.022 NA   0.263
 548864 548865 plut025 plut026 tRNA-Ala tRNA-Ala TRUE 0.507 57.000 0.000 NA   NA
 548865 548866 plut026 plu1401 tRNA-Ala gltX FALSE 0.036 377.000 0.000 NA   NA
 548867 548868 plut027 plut028 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.775 31.000 0.000 NA   NA
 548868 548869 plut028 plut029 tRNA-Val tRNA-Val TRUE 0.623 46.000 0.000 NA   NA
 548869 548870 plut029 plut030 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.645 44.000 0.000 NA   NA
 548870 548871 plut030 plut031 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.739 36.000 0.000 NA   NA
 548872 548873 plu1402 plu1403     TRUE 0.952 2.000 0.000 NA   NA
 548873 548874 plu1403 plu1404     TRUE 0.890 -9.000 0.000 NA   NA
 548875 548876 plut032 plu1405 tRNA-Lys glk FALSE 0.006 1018.000 0.000 NA   NA
 548876 548877 plu1405 plu1406 glk seqA FALSE 0.004 787.000 0.000 1.000 N 0.464
 548877 548878 plu1406 plu1407 seqA pgm TRUE 0.614 62.000 0.151 1.000 N 0.353
 548880 548881 plu1409 plu1410     TRUE 0.821 -34.000 0.000 1.000   -0.371
 548881 548882 plu1410 plu1411     TRUE 0.876 -13.000 0.000 NA   0.232
 548882 548883 plu1411 plu1412     FALSE 0.129 237.000 0.000 NA   0.852
 548883 548884 plu1412 plu1413     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.022 N 0.883
 548884 548885 plu1413 plu1414     TRUE 0.961 8.000 0.000 1.000   0.783
 548885 548886 plu1414 plu1415     FALSE 0.030 433.000 0.000 NA   0.304
 548887 548888 plu1416 plu1417 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y -0.126
 548888 548889 plu1417 plu1418 kdpD kdpC TRUE 0.975 9.000 0.100 0.071 N -0.104
 548889 548890 plu1418 plu1419 kdpC kdpB TRUE 1.000 12.000 0.877 0.001 Y -0.494
 548890 548891 plu1419 plu1420 kdpB kdpA TRUE 0.996 21.000 0.201 0.001 Y 0.093
 548891 548892 plu1420 plu1421 kdpA ISPlu3X FALSE 0.007 501.000 0.000 1.000 N NA
 548892 548893 plu1421 plu1422 ISPlu3X   FALSE 0.261 129.000 0.000 NA   NA
 548894 548895 plu1423 plu1424     TRUE 0.406 67.000 0.010 NA   0.597
 548897 548898 plu1426 plu1427 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001   0.992
 548898 548899 plu1427 plu1428 sdhD sdhA TRUE 1.000 1.000 0.705 0.002 Y 0.929
 548899 548900 plu1428 plu1429 sdhA sdhB TRUE 0.998 37.000 0.604 0.002 Y 0.584
 548900 548901 plu1429 plu1430 sdhB sucA FALSE 0.338 267.000 0.067 1.000 Y 0.178
 548901 548902 plu1430 plu1431 sucA sucB TRUE 0.999 15.000 0.667 1.000 Y 0.730
 548902 548903 plu1431 plu1432 sucB sucC TRUE 0.688 167.000 0.136 1.000 Y 0.789
 548903 548904 plu1432 plu1433 sucC sucD TRUE 1.000 3.000 0.806 0.001 Y 0.866
 548904 548905 plu1433 plu1434 sucD   FALSE 0.005 744.000 0.000 1.000 N 0.690
 548905 548906 plu1434 plu1435     TRUE 0.995 6.000 0.182 1.000 Y 0.123
 548906 548907 plu1435 plu1436     TRUE 0.889 49.000 0.000 1.000 Y 0.932
 548907 548908 plu1436 plu1437     TRUE 0.876 10.000 0.000 1.000 N -0.450
 548908 548909 plu1437 plu1438     TRUE 0.746 171.000 0.200 1.000 Y 0.361
 548909 548910 plu1438 plu1439     TRUE 0.892 33.000 0.143 NA   -0.374
 548910 548911 plu1439 plu1440     TRUE 0.749 40.000 0.000 NA   0.739
 548911 548912 plu1440 plu1441     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.034 N 0.675
 548912 548913 plu1441 plu1442     TRUE 0.526 58.000 0.000 NA   -0.208
 548913 548914 plu1442 plu1443     TRUE 0.735 42.000 0.000 NA   0.820
 548914 548915 plu1443 plu1444     TRUE 0.940 14.000 0.000 NA   0.803
 548915 548916 plu1444 plu1445     TRUE 0.951 11.000 0.000 NA   0.655
 548916 548917 plu1445 plu1446     TRUE 0.902 21.000 0.000 NA   0.640
 548918 548919 plu1447 plu1448     TRUE 0.771 -84.000 0.000 NA   NA
 548920 548921 plu1449 plu1450 cydA cydB TRUE 0.998 15.000 0.348 0.037 Y 0.979
 548921 548922 plu1450 plu1451 cydB   FALSE 0.017 546.000 0.000 1.000   -0.608
 548922 548923 plu1451 plu1452   tolQ TRUE 0.997 -3.000 0.593 1.000   -0.625
 548923 548924 plu1452 plu1453 tolQ tolR TRUE 0.999 15.000 0.556 0.052 Y 0.859
 548924 548925 plu1453 plu1454 tolR tolA TRUE 0.598 46.000 0.114 NA N -0.823
 548925 548926 plu1454 plu1455 tolA tolB FALSE 0.075 214.000 0.051 NA N 0.875
 548926 548927 plu1455 plu1456 tolB pal TRUE 0.964 43.000 0.592 1.000 N -0.152
 548927 548928 plu1456 plu1457 pal   TRUE 0.967 10.000 0.088 1.000   -0.132
 548928 548929 plu1457 plut033   tRNA-Lys FALSE 0.218 148.000 0.000 NA   NA
 548929 548930 plut033 plut034 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.747 35.000 0.000 NA   NA
 548930 548931 plut034 plut035 tRNA-Lys tRNA-Lys TRUE 0.720 38.000 0.000 NA   NA
 548931 548932 plut035 plut036 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548932 548933 plut036 plut037 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548933 548934 plut037 plut038 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548934 548935 plut038 plut039 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548935 548936 plut039 plut040 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548936 548937 plut040 plut041 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 548939 548940 plu1459 plu1460     FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 548940 548941 plu1460 plu1461     FALSE 0.029 410.000 0.000 NA   NA
 548941 548942 plu1461 plu1462     TRUE 0.952 -3.000 0.000 NA   0.381
 548942 548943 plu1462 plu1463     FALSE 0.036 406.000 0.000 NA   0.394
 548943 548944 plu1463 plu1464     FALSE 0.036 417.000 0.000 NA   0.978
 548945 548946 plu1465 plu1466     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 548946 548947 plu1466 plu1467     FALSE 0.059 307.000 0.000 NA   NA
 548948 548949 plu1468 plu1469 nadA pnuC TRUE 0.476 177.000 0.023 1.000 Y 0.589
 548949 548950 plu1469 plu1470 pnuC aroG FALSE 0.019 392.000 0.000 1.000 N 0.714
 548951 548952 plu1471 plu1472 gpmA   FALSE 0.170 160.000 0.009 NA   0.570
 548952 548953 plu1472 plu1473   modF FALSE 0.022 405.000 0.009 NA   -0.217
 548953 548954 plu1473 plu1474 modF modE FALSE 0.297 177.000 0.023 0.087   -0.526
 548955 548956 plu1475 plu1476   modA FALSE 0.048 374.000 0.072 NA   NA
 548956 548957 plu1476 plu1477 modA modB TRUE 0.982 137.000 0.627 0.001 Y -0.864
 548957 548958 plu1477 plu1478 modB modC TRUE 0.999 -6.000 0.537 0.001 Y 0.343
 548962 548963 plu1482 plu1483     TRUE 0.980 -7.000 0.250 NA   NA
 548965 548966 plu1485 plu1486 bioB bioF TRUE 0.998 0.000 0.168 0.002 Y 0.817
 548966 548967 plu1486 plu1487 bioF bioC TRUE 0.992 -16.000 0.133 0.002 Y 0.852
 548967 548968 plu1487 plu1488 bioC bioD TRUE 0.993 -7.000 0.054 0.002 Y 0.989
 548969 548970 plu1489 plu1490     TRUE 0.959 1.000 0.034 NA   0.742
 548971 548972 plu1491 plu1492 uvrB   FALSE 0.012 623.000 0.000 NA   NA
 548972 548973 plu1492 plu1493     TRUE 0.950 3.000 0.000 NA   NA
 548973 548974 plu1493 plu1494     TRUE 0.997 15.000 0.800 NA   NA
 548974 548975 plu1494 plu1495     TRUE 0.981 38.000 0.600 NA   NA
 548975 548976 plu1495 plu1496     TRUE 0.995 4.000 0.400 NA   NA
 548976 548977 plu1496 plu1497   ISPlu10H FALSE 0.026 421.000 0.000 NA   NA
 548979 548980 plu1499 plu1500 moaA moaC TRUE 0.969 40.000 0.039 0.003 Y 0.965
 548980 548981 plu1500 plu1501 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.003 Y 0.685
 548981 548982 plu1501 plu1502 moaD moaE TRUE 1.000 4.000 0.501 0.003 Y 0.658
 548982 548983 plu1502 plu1503 moaE   FALSE 0.154 183.000 0.025 NA   0.534
 548983 548984 plu1503 plu1504     FALSE 0.010 713.000 0.000 NA   -0.841
 548984 548985 plu1504 plu1505     FALSE 0.169 108.000 0.000 1.000 N -0.666
 548986 548987 plu1506 plu1507 ybhR ybhS TRUE 0.998 13.000 0.609 0.008 N -0.021
 548987 548988 plu1507 plu1508 ybhS ybhF TRUE 0.998 -3.000 0.547 0.087   0.958
 548988 548989 plu1508 plu1509 ybhF ybhG TRUE 0.997 10.000 0.545 1.000   0.962
 548989 548990 plu1509 plu1510 ybhG   TRUE 0.968 17.000 0.236 1.000 N -0.255
 548991 548992 plu1511 plu1512 rhlE   TRUE 0.990 4.000 0.033 1.000 Y 0.980
 548993 548994 plu1513 plu1514     TRUE 0.846 -18.000 0.000 NA   -0.026
 548994 548995 plu1514 plu1515     TRUE 0.930 27.000 0.143 1.000   0.990
 548995 548996 plu1515 plu1516     FALSE 0.063 309.000 0.000 1.000   -0.952
 548996 548997 plu1516 plu1517     FALSE 0.132 409.000 0.000 0.002   0.905
 548997 548998 plu1517 plu1518     FALSE 0.163 371.000 0.000 0.002   0.788
 548998 548999 plu1518 plu1519     FALSE 0.062 595.000 0.000 0.002   0.813
 548999 549000 plu1519 plu1520     FALSE 0.009 711.000 0.000 NA   NA
 549000 549001 plu1520 plu1521     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 549001 549002 plu1521 plu1522   sseA FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 549002 549003 plu1522 plu1523 sseA   TRUE 0.700 44.000 0.069 NA   NA
 549004 549005 plu1524 plu1525 dinG   TRUE 0.991 0.000 0.000 1.000 Y 0.985
 549006 549007 plu1526 plu1527   dkgB FALSE 0.183 263.000 0.116 1.000   0.911
 549009 549010 plu1529 plu1530     FALSE 0.276 72.000 0.000 1.000 N 0.452
 549010 549011 plu1530 plu1531     TRUE 0.923 17.000 0.000 NA   0.974
 549011 549012 plu1531 plu1532     TRUE 0.510 65.000 0.000 NA   0.548
 549012 549013 plu1532 plu1533     FALSE 0.035 405.000 0.000 1.000   -0.449
 549013 549014 plu1533 plu1534     FALSE 0.070 292.000 0.000 NA   -0.631
 549014 549015 plu1534 plu1535     FALSE 0.070 295.000 0.000 NA   -0.450
 549019 549020 plu1539 plu1540 moeB moeA TRUE 0.999 0.000 0.323 0.003 Y -0.990
 549020 549021 plu1540 plu1541 moeA   FALSE 0.069 222.000 0.000 1.000 N 0.952
 549022 549023 plu1542 plu1543   folE TRUE 0.495 194.000 0.250 NA   0.558
 549023 549024 plu1543 plu1544 folE   TRUE 0.982 46.000 0.719 NA   0.696
 549025 549026 plu1545 plu1546 sanA maeA FALSE 0.098 267.000 0.045 NA   0.623
 549026 549027 plu1546 plu1547 maeA cdd FALSE 0.038 251.000 0.022 1.000 N 0.776
 549027 549028 plu1547 plu1548 cdd   TRUE 0.458 142.000 0.198 1.000 N 0.826
 549028 549029 plu1548 plu1549     TRUE 0.995 3.000 0.340 1.000   0.489
 549030 549031 plu1550 plu1551     TRUE 0.857 23.000 0.000 NA   NA
 549035 549036 plu1555 plu1556 mrp udk FALSE 0.161 258.000 0.073 0.087 N 0.850
 549036 549037 plu1556 plu1557 udk dcd TRUE 0.895 54.000 0.098 1.000 Y 0.996
 549037 549038 plu1557 plu1558 dcd asmA FALSE 0.374 59.000 0.057 NA N 0.994
 549041 549042 plu1561 plu1562     FALSE 0.016 616.000 0.000 NA   0.800
 549044 549045 plu1564 plu1565 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y 0.995
 549045 549046 plu1565 plu1566 hisF hisA TRUE 0.998 -18.000 0.433 0.003 Y 0.994
 549046 549047 plu1566 plu1567 hisA hisH TRUE 0.999 6.000 0.210 0.003 Y 0.969
 549047 549048 plu1567 plu1568 hisH hisB TRUE 0.998 0.000 0.128 0.003 Y 0.991
 549048 549049 plu1568 plu1569 hisB hisD TRUE 0.996 0.000 0.010 0.003 Y 0.701
 549049 549050 plu1569 plu1570 hisD hisG TRUE 0.998 7.000 0.171 0.003 Y 0.416
 549054 549055 plu1574 plu1575     FALSE 0.016 588.000 0.000 NA   0.498
 549055 549056 plu1575 plu1576   cipA FALSE 0.007 1151.000 0.000 NA   0.506
 549058 549059 plu1578 plu1579 sdaC   FALSE 0.008 907.000 0.000 1.000   -0.604
 549059 549060 plu1579 plu1580     FALSE 0.253 131.000 0.000 NA   NA
 549060 549061 plu1580 plu1581   grxA FALSE 0.100 233.000 0.000 NA   NA
 549062 549063 plu1582 plu1583     TRUE 0.692 92.000 0.194 NA   -0.835
 549063 549064 plu1583 plu1584     TRUE 0.925 25.000 0.119 NA   0.827
 549065 549066 plu1585 plu1586 artM artQ TRUE 1.000 0.000 0.714 0.015 Y 0.835
 549066 549067 plu1586 plu1587 artQ artI TRUE 0.992 15.000 0.065 0.051 Y 0.991
 549067 549068 plu1587 plu1588 artI artP TRUE 0.981 20.000 0.081 1.000 Y 0.979
 549068 549069 plu1588 plu1589 artP   FALSE 0.081 304.000 0.000 NA   0.801
 549070 549071 plu1590 plu1591 macA macB TRUE 0.999 0.000 0.789 0.069 N 0.815
 549073 549074 plu1593 plu1594   clpA TRUE 0.985 33.000 0.596 NA   -0.687
 549075 549076 plu1595 plu1596 infA aat FALSE 0.052 157.000 0.020 1.000 N -0.717
 549076 549077 plu1596 plu1597 aat cydC TRUE 0.990 4.000 0.049 1.000 Y 0.617
 549077 549078 plu1597 plu1598 cydC cydD TRUE 1.000 3.000 0.631 0.008 Y -0.141
 549078 549079 plu1598 plu1599 cydD trxB TRUE 0.619 135.000 0.049 1.000 Y -0.409
 549080 549081 plu1600 plu1601 lrp ftsK TRUE 0.682 131.000 0.345 1.000 N 0.596
 549081 549082 plu1601 plu1602 ftsK lolA TRUE 0.399 219.000 0.305 1.000 N 0.806
 549082 549083 plu1602 plu1603 lolA   TRUE 0.974 8.000 0.167 1.000 N 0.739
 549083 549084 plu1603 plu1604   serS FALSE 0.184 232.000 0.078 0.087 N 0.403
 549087 549088 plu1607 plu1608     TRUE 0.707 39.000 0.000 NA   NA
 549088 549089 plu1608 plu1609   ISPlu1E FALSE 0.153 183.000 0.000 NA   NA
 549090 549091 plu1610 plu1611     FALSE 0.021 478.000 0.000 NA   NA
 549092 549093 plu1612 plu1613 pflA pflB FALSE 0.170 74.000 0.021 1.000 N 0.138
 549093 549094 plu1613 plu1614 pflB focA TRUE 0.675 56.000 0.172 1.000 N -0.436
 549094 549095 plu1614 plu1615 focA   FALSE 0.069 320.000 0.000 NA   0.736
 549096 549097 plu1616 plu1617 ansB   FALSE 0.205 170.000 0.000 1.000   -0.258
 549097 549098 plu1617 plu1618     TRUE 0.998 -3.000 0.650 1.000   -0.509
 549098 549099 plu1618 plu1619   serC FALSE 0.222 172.000 0.000 1.000   0.605
 549099 549100 plu1619 plu1620 serC aroA FALSE 0.293 250.000 0.033 1.000 Y -0.779
 549100 549101 plu1620 plu1621 aroA mssA FALSE 0.141 305.000 0.209 1.000 N -0.874
 549101 549102 plu1621 plu1622 mssA rpsA TRUE 0.459 182.000 0.281 1.000 N 0.944
 549102 549103 plu1622 plu1623 rpsA ihfB TRUE 0.767 66.000 0.292 1.000 N -0.916
 549103 549104 plu1623 plu1624 ihfB   FALSE 0.024 440.000 0.000 NA   NA
 549105 549106 plu1625 plu1626     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549106 549107 plu1626 plu1627     FALSE 0.018 511.000 0.000 NA   NA
 549107 549108 plu1627 plu1628     TRUE 0.961 5.000 0.000 NA   0.804
 549109 549110 plu1629 plu1630   msbA TRUE 0.892 39.000 0.075 0.067   -0.098
 549110 549111 plu1630 plu1631 msbA lpxK TRUE 0.979 -3.000 0.205 1.000 N 0.666
 549111 549112 plu1631 plu1632 lpxK   FALSE 0.006 555.000 0.000 1.000 N -0.428
 549112 549113 plu1632 plu1633     FALSE 0.021 379.000 0.004 NA   NA
 549113 549114 plu1633 plu1634   kdsB TRUE 0.990 4.000 0.265 NA   NA
 549116 549117 plu1636 plu1637 smtA mukF TRUE 0.987 11.000 0.325 NA N 0.082
 549117 549118 plu1637 plu1638 mukF mukE TRUE 0.995 8.000 0.196 NA Y 0.066
 549118 549119 plu1638 plu1639 mukE mukB TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.001 Y -0.627
 549119 549120 plu1639 plu1640 mukB   FALSE 0.061 308.000 0.000 NA   -0.763
 549122 549123 plu1642 plu1643     FALSE 0.221 147.000 0.000 NA   NA
 549123 549124 plu1643 plu1644     TRUE 0.634 45.000 0.000 NA   NA
 549125 549126 plu1645 plu1646   ISPlu6I TRUE 0.559 51.000 0.000 NA   NA
 549126 549127 plu1646 plu1647 ISPlu6I   TRUE 0.870 -12.000 0.000 NA   NA
 549127 549128 plu1647 plu1648     TRUE 0.587 49.000 0.000 NA   NA
 549128 549129 plu1648 plu1649     FALSE 0.024 519.000 0.000 NA   0.906
 549131 549132 plu1651 plu1652     FALSE 0.374 105.000 0.000 NA   0.171
 549132 549133 plu1652 plu1653     TRUE 0.881 24.000 0.000 NA   0.786
 549133 549134 plu1653 plu1654     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 549134 549135 plu1654 plu1655     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549135 549136 plu1655 plu1656     FALSE 0.365 110.000 0.000 1.000   -0.138
 549136 549137 plu1656 plu1657     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA   -0.304
 549137 549138 plu1657 plu1658     TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 549138 549139 plu1658 plu1659     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549139 549140 plu1659 plu1660     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549140 549141 plu1660 plu1661     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549141 549142 plu1661 plu1662     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549142 549143 plu1662 plu1663     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549143 549144 plu1663 plu1664     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549144 549145 plu1664 plu1665     TRUE 0.605 48.000 0.000 NA   -0.958
 549145 549146 plu1665 plu1666     TRUE 0.942 12.000 0.000 NA   0.062
 549146 549147 plu1666 plu1667     TRUE 0.966 54.000 0.667 NA   NA
 549147 549148 plu1667 plu1668     FALSE 0.014 565.000 0.000 NA   NA
 549148 549149 plu1668 plu1669     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 549149 549150 plu1669 plu1670     FALSE 0.351 101.000 0.000 NA   NA
 549150 549151 plu1670 plu1671     TRUE 0.953 1.000 0.000 NA   NA
 549151 549152 plu1671 plu1672     TRUE 0.478 74.000 0.000 NA   0.941
 549152 549153 plu1672 plu1673     FALSE 0.127 203.000 0.000 NA   NA
 549153 549154 plu1673 plu1674     FALSE 0.389 83.000 0.000 NA   NA
 549154 549155 plu1674 plu1675     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 549155 549156 plu1675 plu1676     TRUE 0.943 10.000 0.000 NA   -0.818
 549156 549157 plu1676 plu1677     TRUE 0.571 57.000 0.000 NA   0.698
 549157 549158 plu1677 plu1678     FALSE 0.254 143.000 0.000 1.000   -0.558
 549158 549159 plu1678 plu1679     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   -0.975
 549159 549160 plu1679 plu1680     TRUE 0.404 77.000 0.000 NA   -0.789
 549160 549161 plu1680 plu1681     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549161 549162 plu1681 plu1682     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549162 549163 plu1682 plu1683     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   -0.583
 549163 549164 plu1683 plu1684     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549164 549165 plu1684 plu1685     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549165 549166 plu1685 plu1686     TRUE 0.966 36.000 0.400 NA   NA
 549166 549167 plu1686 plu1687     TRUE 0.592 56.000 0.000 NA   0.825
 549167 549168 plu1687 plu1688     TRUE 0.935 12.000 0.000 NA   -0.836
 549168 549169 plu1688 plu1689     TRUE 0.852 176.000 0.667 NA   0.636
 549169 549170 plu1689 plu1690     FALSE 0.009 931.000 0.000 NA   0.700
 549170 549171 plu1690 plu1691     FALSE 0.144 192.000 0.000 NA   -0.861
 549171 549172 plu1691 plu1692     TRUE 0.459 81.000 0.000 NA   0.978
 549172 549173 plu1692 plu1693     TRUE 0.868 25.000 0.000 NA   0.736
 549173 549174 plu1693 plu1694     TRUE 0.955 10.000 0.000 NA   0.980
 549174 549175 plu1694 plu1695   ISPlu3W FALSE 0.160 179.000 0.000 NA   NA
 549175 549176 plu1695 plu1696 ISPlu3W   TRUE 0.592 50.000 0.000 1.000   NA
 549176 549177 plu1696 plu1697     FALSE 0.143 202.000 0.000 NA   -0.111
 549177 549178 plu1697 plu1698     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.901
 549178 549179 plu1698 plu1699     FALSE 0.363 97.000 0.000 NA   NA
 549179 549180 plu1699 plu1700     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 549180 549181 plu1700 plu1701     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   NA
 549181 549182 plu1701 plu1702     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549182 549183 plu1702 plu1703     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549183 549184 plu1703 plu1704     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549184 549185 plu1704 plu1705     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549185 549186 plu1705 plu1706     TRUE 0.639 49.000 0.000 NA   0.491
 549186 549187 plu1706 plu1707     TRUE 0.946 12.000 0.000 NA   0.469
 549187 549188 plu1707 plu1708     TRUE 0.966 54.000 0.667 NA   NA
 549190 549191 plu1710 plu1711     TRUE 0.904 -7.000 0.000 NA   NA
 549191 549192 plu1711 plu1712     FALSE 0.019 494.000 0.000 NA   NA
 549192 549193 plu1712 plu1713     FALSE 0.355 120.000 0.000 NA   0.908
 549193 549194 plu1713 plu1714     FALSE 0.058 339.000 0.000 NA   0.571
 549194 549195 plu1714 plu1715     FALSE 0.347 102.000 0.000 NA   NA
 549195 549196 plu1715 plu1716     TRUE 0.833 25.000 0.000 NA   NA
 549196 549197 plu1716 plu1717     TRUE 0.942 10.000 0.000 NA   NA
 549197 549198 plu1717 plu1718     TRUE 0.459 64.000 0.000 NA   NA
 549198 549199 plu1718 plu1719     FALSE 0.162 188.000 0.000 NA   -0.106
 549199 549200 plu1719 plu1720     TRUE 0.925 -7.000 0.000 NA   0.983
 549200 549201 plu1720 plu1721     TRUE 0.651 44.000 0.000 NA   -0.823
 549201 549202 plu1721 plu1722     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   -0.942
 549202 549203 plu1722 plu1723     TRUE 0.997 13.000 0.667 NA   0.766
 549203 549204 plu1723 plu1724     TRUE 0.957 -3.000 0.000 NA   0.859
 549204 549205 plu1724 plu1725     TRUE 0.856 -13.000 0.000 NA   NA
 549205 549206 plu1725 plu1726     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549206 549207 plu1726 plu1727     TRUE 0.992 14.000 0.400 NA   NA
 549207 549208 plu1727 plu1728     TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   0.034
 549208 549209 plu1728 plu1729     TRUE 0.947 12.000 0.000 NA   0.629
 549209 549210 plu1729 plu1730     TRUE 0.996 15.000 0.667 NA   NA
 549211 549212 plu1731 plu1732     FALSE 0.013 678.000 0.000 NA   0.969
 549212 549213 plu1732 plu1733     FALSE 0.245 158.000 0.000 NA   0.970
 549213 549214 plu1733 plu1734     TRUE 0.756 40.000 0.000 NA   0.862
 549214 549215 plu1734 plu1735     FALSE 0.367 117.000 0.000 NA   0.930
 549215 549216 plu1735 plu1736     TRUE 0.914 15.000 0.000 NA   NA
 549216 549217 plu1736 plu1737     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549217 549218 plu1737 plu1738     TRUE 0.958 5.000 0.000 NA   0.581
 549218 549219 plu1738 plu1739     TRUE 0.954 4.000 0.000 NA   -0.093
 549219 549220 plu1739 plu1740     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   0.926
 549220 549221 plu1740 plu1741     TRUE 0.995 22.000 0.714 NA   0.728
 549221 549222 plu1741 plu1742     TRUE 1.000 7.000 0.857 1.000 Y 0.924
 549224 549225 plu1744 plu1745     FALSE 0.068 320.000 0.000 NA   0.724
 549225 549226 plu1745 plu1746   ISPlu4D FALSE 0.342 103.000 0.000 NA   NA
 549226 549227 plu1746 plu1747 ISPlu4D   TRUE 0.614 47.000 0.000 NA   NA
 549227 549228 plu1747 plu1748     TRUE 0.439 93.000 0.000 NA   0.723
 549228 549229 plu1748 plu1749     TRUE 0.769 46.000 0.089 NA   0.828
 549230 549231 plu1750 plu1751 aspC ompN FALSE 0.056 222.000 0.000 1.000 N 0.139
 549231 549232 plu1751 plu1752 ompN   FALSE 0.163 506.000 0.000 0.038 Y 0.540
 549232 549233 plu1752 plu1753   asnS FALSE 0.022 337.000 0.000 1.000 N -0.174
 549233 549234 plu1753 plu1754 asnS pcnB FALSE 0.069 205.000 0.034 1.000 N 0.933
 549235 549236 plu1755 plu1756 pepN   FALSE 0.166 176.000 0.000 NA   NA
 549236 549237 plu1756 plu1757     FALSE 0.287 120.000 0.000 NA   NA
 549237 549238 plu1757 plu1758   pyrD TRUE 0.446 66.000 0.000 NA   NA
 549238 549239 plu1758 plu1759 pyrD   FALSE 0.090 317.000 0.081 NA   0.513
 549240 549241 plu1760 plu1761   ISPlu6H FALSE 0.298 122.000 0.000 1.000   NA
 549241 549242 plu1761 plu1762 ISPlu6H   FALSE 0.121 218.000 0.000 1.000   NA
 549242 549243 plu1762 plu1763     FALSE 0.098 278.000 0.000 1.000   0.646
 549244 549245 plu1764 plu1765   uup TRUE 0.967 6.000 0.061 1.000   0.714
 549245 549246 plu1765 plu1766 uup pqiA TRUE 0.453 90.000 0.054 NA   0.477
 549246 549247 plu1766 plu1767 pqiA pqiB TRUE 0.997 21.000 0.819 NA   0.263
 549247 549248 plu1767 plu1768 pqiB   TRUE 0.996 -3.000 0.531 NA   0.150
 549248 549249 plu1768 plu1769   rmf FALSE 0.090 247.000 0.000 NA   NA
 549252 549253 plu1772 plu1773 fabA   TRUE 0.727 84.000 0.290 1.000 N -0.523
 549255 549256 plu1775 plu1776 ompA sulA FALSE 0.004 685.000 0.000 1.000 N -0.780
 549261 549262 plu1781 plu1782     FALSE 0.008 812.000 0.000 NA   NA
 11410706 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11553069 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11695461 549257   plu1777     FALSE NA 6008.000 0.000 NA   NA
 11410707 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11553070 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11695462 549257   plu1777     FALSE NA 6036.000 0.000 NA   NA
 11410708 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11553071 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11695463 549257   plu1777     FALSE NA 6068.000 0.000 NA   NA
 11410709 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11553072 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11695464 549257   plu1777     FALSE NA 6096.000 0.000 NA   NA
 11410710 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11553073 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11695465 549257   plu1777     FALSE NA 6128.000 0.000 NA   NA
 11410711 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11553074 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11695466 549257   plu1777     FALSE NA 6156.000 0.000 NA   NA
 11410712 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11553075 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11695467 549257   plu1777     FALSE NA 6188.000 0.000 NA   NA
 11410713 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11553076 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11695468 549257   plu1777     FALSE NA 6216.000 0.000 NA   NA
 11410714 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11553077 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11695469 549257   plu1777     FALSE NA 6248.000 0.000 NA   NA
 11410715 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11553078 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11695470 549257   plu1777     FALSE NA 6276.000 0.000 NA   NA
 11410716 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11553079 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11695471 549257   plu1777     FALSE NA 6308.000 0.000 NA   NA
 11410717 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11553080 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11695472 549257   plu1777     FALSE NA 6336.000 0.000 NA   NA
 11410718 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 11553081 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 11695473 549257   plu1777     FALSE NA 6368.000 0.000 NA   NA
 549262 549263 plu1782 plu1783     FALSE 0.048 331.000 0.000 NA   NA
 11410719 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11553082 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11695474 549257   plu1777     FALSE NA 6396.000 0.000 NA   NA
 11410720 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11553083 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11695475 549257   plu1777     FALSE NA 6428.000 0.000 NA   NA
 11410721 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11553084 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11695476 549257   plu1777     FALSE NA 6456.000 0.000 NA   NA
 11410722 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11553085 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11695477 549257   plu1777     FALSE NA 6488.000 0.000 NA   NA
 11410723 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11553086 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11695478 549257   plu1777     FALSE NA 6516.000 0.000 NA   NA
 11410724 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11553087 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11695479 549257   plu1777     FALSE NA 6548.000 0.000 NA   NA
 11410725 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11553088 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11695480 549257   plu1777     FALSE NA 6576.000 0.000 NA   NA
 11410726 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11553089 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11695481 549257   plu1777     FALSE NA 6608.000 0.000 NA   NA
 11410727 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11553090 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11695482 549257   plu1777     FALSE NA 6636.000 0.000 NA   NA
 11410728 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11553091 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11695483 549257   plu1777     FALSE NA 6668.000 0.000 NA   NA
 11410729 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11553092 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11695484 549257   plu1777     FALSE NA 6696.000 0.000 NA   NA
 11410730 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11553093 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11695485 549257   plu1777     FALSE NA 6728.000 0.000 NA   NA
 11410731 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11553094 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11695486 549257   plu1777     FALSE NA 6756.000 0.000 NA   NA
 11410732 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11553095 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11695487 549257   plu1777     FALSE NA 6786.000 0.000 NA   NA
 11410733 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11553096 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11695488 549257   plu1777     FALSE NA 6814.000 0.000 NA   NA
 11410734 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11553097 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11695489 549257   plu1777     FALSE NA 6846.000 0.000 NA   NA
 11410735 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11553098 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11695490 549257   plu1777     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11410736 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11553099 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11695491 549257   plu1777     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11410737 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11553100 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11695492 549257   plu1777     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11410738 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11553101 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11695493 549257   plu1777     FALSE NA 6966.000 0.000 NA   NA
 11410739 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11553102 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11695494 549257   plu1777     FALSE NA 6994.000 0.000 NA   NA
 11410740 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11553103 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11695495 549257   plu1777     FALSE NA 7026.000 0.000 NA   NA
 11410741 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11553104 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11695496 549257   plu1777     FALSE NA 7054.000 0.000 NA   NA
 11410742 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11553105 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11695497 549257   plu1777     FALSE NA 7086.000 0.000 NA   NA
 11410743 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11553106 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11695498 549257   plu1777     FALSE NA 7114.000 0.000 NA   NA
 11410744 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11553107 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11695499 549257   plu1777     FALSE NA 7146.000 0.000 NA   NA
 11410745 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11553108 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11695500 549257   plu1777     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11410746 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11553109 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11695501 549257   plu1777     FALSE NA 7206.000 0.000 NA   NA
 11410747 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11553110 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11695502 549257   plu1777     FALSE NA 7234.000 0.000 NA   NA
 11410748 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11553111 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11695503 549257   plu1777     FALSE NA 7266.000 0.000 NA   NA
 11410749 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11553112 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11695504 549257   plu1777     FALSE NA 7294.000 0.000 NA   NA
 11410750 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11553113 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11695505 549257   plu1777     FALSE NA 7326.000 0.000 NA   NA
 11410751 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11553114 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11695506 549257   plu1777     FALSE NA 7354.000 0.000 NA   NA
 11410752 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11553115 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11695507 549257   plu1777     FALSE NA 7386.000 0.000 NA   NA
 11410753 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11553116 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11695508 549257   plu1777     FALSE NA 7414.000 0.000 NA   NA
 11410754 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 11553117 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 11695509 549257   plu1777     FALSE NA 7446.000 0.000 NA   NA
 549267 549268 plut042 plu1787 tRNA-Ser   FALSE 0.333 106.000 0.000 NA   NA
 549268 549269 plu1787 plu1788   ISPlu3V FALSE 0.008 798.000 0.000 NA   NA
 549269 549270 plu1788 plu1789 ISPlu3V   FALSE 0.125 204.000 0.000 NA   NA
 549270 549271 plu1789 plu1790     FALSE 0.009 758.000 0.000 NA   NA
 11410755 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11553118 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11695510 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1367.000 0.000 NA   NA
 11410756 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11553119 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11695511 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1394.000 0.000 NA   NA
 11410757 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11553120 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11695512 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1427.000 0.000 NA   NA
 11410758 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11553121 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11695513 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11410759 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11553122 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11695514 549269   plu1788   ISPlu3V FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 549271 549272 plu1790 plu1791     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 549272 549273 plu1791 plu1792     TRUE 0.389 94.000 0.000