MicrobesOnline Operon Predictions for Chlamydia muridarum Nigg

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 370328 370329 TC0002 TC0003     TRUE 0.780 22.000 0.086 NA   NA
 370331 370332 TC0005 TC0006     TRUE 0.830 -52.000 0.005 1.000 N NA
 370333 370334 TC0007 TC0008     TRUE 0.993 8.000 0.542 0.006 Y NA
 370336 370337 TC0010 TC0011     FALSE 0.017 670.000 0.000 NA   NA
 370339 370340 TC0013 TC0014     TRUE 0.626 -21.000 0.000 1.000   NA
 370341 370342 TC0015 TC0016     TRUE 0.927 1.000 1.000 NA   NA
 370342 370343 TC0016 TC0017     TRUE 0.885 -9.000 0.429 NA   NA
 370343 370344 TC0017 TC0018     TRUE 0.768 3.000 0.006 NA   NA
 370344 370345 TC0018 TC0019   recA FALSE 0.173 219.000 0.000 1.000 N NA
 370345 370346 TC0019 TC0020 recA   FALSE 0.082 272.000 0.000 1.000   NA
 370346 370347 TC0020 TC0021     TRUE 0.901 -7.000 0.023 1.000   NA
 370347 370348 TC0021 TC0022     FALSE 0.302 66.000 0.008 NA   NA
 370349 370350 TC0023 TC0024     TRUE 0.827 7.000 0.009 NA   NA
 370350 370351 TC0024 TC0025   kdsA TRUE 0.829 -3.000 0.011 NA   NA
 370352 5441588 TC0026 tRNA-Arg-2     FALSE 0.167 -111.000 0.000 NA   NA
 5441588 370353 tRNA-Arg-2 TC0027     FALSE 0.027 106.000 0.000 NA   NA
 370353 370354 TC0027 TC0028     TRUE 0.919 10.000 1.000 NA   NA
 370354 10692486 TC0028 TC0029     FALSE 0.074 43.000 0.000 NA   NA
 10692486 370355 TC0029 TC0030     FALSE 0.030 99.000 0.000 NA   NA
 370356 370357 TC0031 TC0032 gyrA-1 gyrB-1 TRUE 0.989 15.000 0.110 0.006 Y NA
 370358 370359 TC0033 TC0034     FALSE 0.087 677.000 0.000 1.000   NA
 370359 370360 TC0034 TC0035     TRUE 0.898 4.000 0.146 NA   NA
 370360 370361 TC0035 TC0036     TRUE 0.564 45.000 0.171 NA   NA
 370361 370362 TC0036 TC0037     TRUE 0.786 27.000 0.857 NA   NA
 370362 370363 TC0037 TC0038     FALSE 0.142 26.000 0.000 NA   NA
 370363 370364 TC0038 TC0039     FALSE 0.287 13.000 0.000 NA   NA
 370364 370365 TC0039 TC0040   sctN TRUE 0.926 2.000 0.857 NA   NA
 370365 370366 TC0040 TC0041 sctN   TRUE 0.831 23.000 0.875 NA   NA
 370366 370367 TC0041 TC0042     TRUE 0.923 4.000 0.750 NA   NA
 370367 370368 TC0042 TC0043   sctQ TRUE 0.907 10.000 0.600 NA   NA
 370368 370369 TC0043 TC0044 sctQ   TRUE 0.520 130.000 0.583 1.000 N NA
 370369 370370 TC0044 TC0045   sctC FALSE 0.444 735.000 0.208 1.000 N NA
 370370 5441589 TC0045 tRNA-Thr-2 sctC   FALSE 0.020 133.000 0.000 NA   NA
 370371 370372 TC0046 TC0047     TRUE 0.930 -10.000 0.848 1.000   NA
 370372 5441590 TC0047 tRNA-Lys-1     FALSE 0.038 80.000 0.000 NA   NA
 5441590 5441591 tRNA-Lys-1 tRNA-Glu-1     FALSE 0.214 18.000 0.000 NA   NA
 5441591 370373 tRNA-Glu-1 TC0048   frr FALSE 0.028 102.000 0.000 NA   NA
 370373 370374 TC0048 TC0049 frr pyrH TRUE 0.961 -3.000 0.626 1.000 N NA
 370374 370375 TC0049 TC0050 pyrH tsf TRUE 0.940 16.000 0.416 1.000 N NA
 370375 370376 TC0050 TC0051 tsf rpsB TRUE 0.987 -3.000 0.748 1.000 Y NA
 370376 5441592 TC0051 tRNA-Gly-1 rpsB   FALSE 0.035 85.000 0.000 NA   NA
 5441592 370377 tRNA-Gly-1 TC0052   ompA FALSE 0.016 228.000 0.000 NA   NA
 370378 370379 TC0053 TC0054     FALSE 0.300 12.000 0.000 NA   NA
 370379 370380 TC0054 TC0055     TRUE 0.640 62.000 0.400 1.000   NA
 370380 370381 TC0055 TC0056     FALSE 0.084 349.000 0.000 1.000   NA
 370381 370382 TC0056 TC0057     TRUE 0.987 3.000 0.466 1.000 Y NA
 370382 370383 TC0057 TC0058     TRUE 0.987 4.000 0.482 1.000 Y NA
 370383 370384 TC0058 TC0059     TRUE 0.959 3.000 0.193 1.000 N NA
 370384 370385 TC0059 TC0060     FALSE 0.274 137.000 0.002 1.000 N NA
 370386 370387 TC0061 TC0062     TRUE 0.964 -7.000 0.250 0.005   NA
 370388 370389 TC0063 TC0064     TRUE 0.928 3.000 0.937 NA   NA
 370389 370390 TC0064 TC0065   pgk FALSE 0.188 130.000 0.005 1.000   NA
 370390 370391 TC0065 TC0066 pgk   FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 370391 370392 TC0066 TC0067     TRUE 0.885 13.000 0.333 NA   NA
 370392 370393 TC0067 TC0068     TRUE 0.493 80.000 1.000 NA   NA
 370394 370395 TC0069 TC0070 nth thdF TRUE 0.889 5.000 0.007 1.000   NA
 370395 370396 TC0070 TC0071 thdF   FALSE 0.028 102.000 0.000 NA   NA
 370397 370398 TC0072 TC0073 psd   FALSE 0.223 65.000 0.000 1.000   NA
 370398 370399 TC0073 TC0074   secA FALSE 0.082 257.000 0.000 1.000   NA
 370400 370401 TC0075 TC0076     FALSE 0.186 76.000 0.005 NA   NA
 370401 370402 TC0076 TC0077     FALSE 0.237 115.000 0.006 1.000   NA
 370402 370403 TC0077 TC0078   clpX TRUE 0.890 15.000 0.006 1.000 N NA
 370403 370404 TC0078 TC0079 clpX clpP-1 TRUE 0.992 10.000 0.352 0.008 Y NA
 370404 370405 TC0079 TC0080 clpP-1 tig TRUE 0.707 168.000 0.351 1.000 Y NA
 370405 5441593 TC0080 tRNA-Gly-2 tig   FALSE 0.053 63.000 0.000 NA   NA
 370406 370407 TC0081 TC0082   mreB TRUE 0.940 5.000 0.009 1.000 N NA
 370407 370408 TC0082 TC0083 mreB pckA TRUE 0.937 -3.000 0.011 1.000 N NA
 370408 370409 TC0083 TC0084 pckA   FALSE 0.260 111.000 0.026 NA   NA
 370409 370410 TC0084 TC0085     TRUE 0.763 29.000 1.000 NA   NA
 370411 370412 TC0086 TC0087     FALSE 0.373 136.000 0.375 1.000   NA
 370412 370413 TC0087 TC0088     TRUE 0.950 -3.000 0.044 1.000 N NA
 370413 370414 TC0088 TC0089     TRUE 0.814 17.000 0.044 NA   NA
 370414 370415 TC0089 TC0090     TRUE 0.893 -7.000 0.500 NA   NA
 370415 370416 TC0090 TC0091     TRUE 0.563 60.000 0.667 NA   NA
 370416 370417 TC0091 TC0092     TRUE 0.914 5.000 0.500 NA   NA
 370417 370418 TC0092 TC0093     FALSE 0.324 268.000 0.136 NA N NA
 370418 370419 TC0093 TC0094     TRUE 0.953 -3.000 0.138 1.000 N NA
 370419 370420 TC0094 TC0095   gpmA TRUE 0.900 -45.000 0.021 1.000 N NA
 10692487 370421 TC0096 TC0097     FALSE 0.028 104.000 0.000 NA   NA
 370421 370422 TC0097 TC0098     FALSE 0.258 15.000 0.000 NA   NA
 370423 370424 TC0099 TC0100     TRUE 0.841 45.000 0.078 0.068 N NA
 370424 370425 TC0100 TC0101     TRUE 0.723 24.000 0.026 NA   NA
 370425 370426 TC0101 TC0102   serS TRUE 0.590 39.000 0.057 NA   NA
 370427 370428 TC0103 TC0104 ribG ribA/B TRUE 0.796 118.000 0.007 0.006 Y NA
 370428 370429 TC0104 TC0105 ribA/B ribH TRUE 0.977 -31.000 0.006 0.006 Y NA
 370431 370432 TC0107 TC0108     FALSE 0.333 108.000 0.316 NA   NA
 370432 370433 TC0108 TC0109     TRUE 0.478 68.000 0.316 NA   NA
 370434 370435 TC0110 TC0111     TRUE 0.906 -3.000 0.016 1.000   NA
 370435 370436 TC0111 TC0112     TRUE 0.915 4.000 0.016 1.000   NA
 370436 5441594 TC0112 tRNA-His-1     FALSE 0.017 169.000 0.000 NA   NA
 370437 407844 TC0113 TCrrnaB16S   rrs FALSE 0.039 79.000 0.000 NA   NA
 407844 407112 TCrrnaB16S TCrrnaB23S rrs rrl FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 2227593 370439 TCrrnaB5S TC0115     FALSE 0.021 123.000 0.000 NA   NA
 370440 370441 TC0116 TC0117     FALSE 0.236 142.000 0.007 NA N NA
 370441 10692488 TC0117 TC0118     FALSE 0.029 100.000 0.000 NA   NA
 10692488 370442 TC0118 TC0119   hctA FALSE 0.016 186.000 0.000 NA   NA
 370444 370445 TC0121 TC0122 hemY hemN TRUE 0.983 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 370445 370446 TC0122 TC0123 hemN hemE TRUE 0.984 -27.000 0.012 0.004 Y NA
 370446 370447 TC0123 TC0124 hemE trcF TRUE 0.860 20.000 0.006 1.000 N NA
 370447 370448 TC0124 TC0125 trcF alaS TRUE 0.875 -24.000 0.006 1.000 N NA
 370448 370449 TC0125 TC0126 alaS   FALSE 0.287 13.000 0.000 NA   NA
 2227594 407113 TCrrnaA16S TCrrnaA23S   rrl FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 407113 2227595 TCrrnaA23S TCrrnaA5S rrl   FALSE 0.024 115.000 0.000 NA   NA
 2227595 370450 TCrrnaA5S TC0131   tkt FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 370453 370454 TC0134 TC0135     TRUE 0.536 46.000 0.054 NA   NA
 370454 370455 TC0135 TC0136     FALSE 0.464 83.000 0.027 1.000   NA
 370455 5441595 TC0136 tRNA-Cys-1     FALSE 0.041 78.000 0.000 NA   NA
 370456 370457 TC0137 TC0138   mraY TRUE 0.835 115.000 0.018 0.010 Y NA
 370457 370458 TC0138 TC0139 mraY murD TRUE 0.987 -39.000 0.647 0.010 Y NA
 370458 370459 TC0139 TC0140 murD   TRUE 0.974 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 370459 370460 TC0140 TC0141     TRUE 0.908 -52.000 0.088 1.000 N NA
 370460 370461 TC0141 TC0142     TRUE 0.894 -91.000 0.037 1.000 N NA
 370461 370462 TC0142 TC0143   murC/ddlA TRUE 0.966 -85.000 0.270 1.000 Y NA
 370463 370464 TC0144 TC0145     FALSE 0.080 158.000 0.005 NA   NA
 370465 370466 TC0146 TC0147   miaA TRUE 0.625 79.000 0.040 1.000 N NA
 370468 370469 TC0149 TC0150     FALSE 0.017 444.000 0.000 NA   NA
 370469 370470 TC0150 TC0151   fabF TRUE 0.792 11.000 0.008 NA   NA
 370470 370471 TC0151 TC0152 fabF   TRUE 0.958 -3.000 0.333 1.000 N NA
 370475 370476 TC0156 TC0157     TRUE 0.989 8.000 0.032 0.058 Y NA
 370476 370477 TC0157 TC0158     TRUE 0.760 43.000 0.032 1.000 N NA
 370478 370479 TC0159 TC0160 priA   TRUE 0.652 -45.000 0.007 NA   NA
 370480 370481 TC0161 TC0162     FALSE 0.090 36.000 0.000 NA   NA
 370481 370482 TC0162 TC0163   lysS FALSE 0.038 80.000 0.000 NA   NA
 370483 370484 TC0164 TC0165 cysS   FALSE 0.021 121.000 0.000 NA   NA
 370486 370487 TC0167 TC0168 rnpA rpmH TRUE 0.935 13.000 0.787 1.000   NA
 370488 370489 TC0169 TC0170   rpsN TRUE 0.877 24.000 0.013 0.057   NA
 370492 370493 TC0173 TC0174 uvrC mutS TRUE 0.981 12.000 0.006 0.074 Y NA
 370494 370495 TC0175 TC0176 dnaG   FALSE 0.420 92.000 0.625 NA   NA
 370495 370496 TC0176 TC0177     FALSE 0.289 124.000 0.333 NA   NA
 370498 370499 TC0179 TC0180   pgsA FALSE 0.016 199.000 0.000 NA   NA
 5441596 370501 tRNA-Gln-1 TC0182   ctc FALSE 0.016 278.000 0.000 NA   NA
 370501 370502 TC0182 TC0183 ctc pth TRUE 0.991 8.000 0.496 0.089 Y NA
 370502 370503 TC0183 TC0184 pth rpsF TRUE 0.771 138.000 0.029 0.089 Y NA
 370503 370504 TC0184 TC0185 rpsF rpsR TRUE 0.985 17.000 0.319 0.056 Y NA
 370504 370505 TC0185 TC0186 rpsR rplI TRUE 0.982 21.000 0.499 0.056 Y NA
 370505 370506 TC0186 TC0187 rplI   TRUE 0.587 65.000 0.007 1.000 N NA
 370506 370507 TC0187 TC0188     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 370508 370509 TC0189 TC0190     FALSE 0.230 177.000 0.250 NA   NA
 370511 370512 TC0192 TC0193   cafA TRUE 0.908 10.000 0.019 1.000   NA
 370513 370514 TC0194 TC0195   rpmF FALSE 0.079 260.000 0.005 NA   NA
 370514 370515 TC0195 TC0196 rpmF plsX TRUE 0.860 30.000 0.418 1.000 N NA
 370515 370516 TC0196 TC0197 plsX pmpD FALSE 0.154 212.000 0.005 1.000   NA
 370519 370520 TC0200 TC0201     TRUE 0.859 20.000 1.000 NA   NA
 370521 370522 TC0202 TC0203   glmS TRUE 0.943 12.000 0.030 1.000 N NA
 370522 370523 TC0203 TC0204 glmS   FALSE 0.362 104.000 0.003 1.000 N NA
 370523 370524 TC0204 TC0205     TRUE 0.842 197.000 1.000 0.006 Y NA
 370524 370525 TC0205 TC0206     TRUE 0.613 40.000 0.250 NA   NA
 370527 370528 TC0208 TC0209 sucC sucD TRUE 0.991 15.000 0.467 0.003 Y NA
 370528 370529 TC0209 TC0210 sucD htrA FALSE 0.441 143.000 0.069 1.000 N NA
 370529 370530 TC0210 TC0211 htrA   FALSE 0.214 201.000 0.000 0.034   NA
 370531 370532 TC0212 TC0213     TRUE 0.847 4.000 0.011 NA   NA
 370533 370534 TC0214 TC0215 nrdA nrdB TRUE 0.971 34.000 0.564 0.003 Y NA
 370534 370535 TC0215 TC0216 nrdB   FALSE 0.209 266.000 0.008 1.000   NA
 370537 370538 TC0218 TC0219 murB   FALSE 0.393 119.000 0.008 1.000 N NA
 370538 370539 TC0219 TC0220     FALSE 0.019 135.000 0.000 NA   NA
 370540 370541 TC0221 TC0222 infC rpmI TRUE 0.979 -22.000 0.652 1.000 Y NA
 370541 370542 TC0222 TC0223 rpmI rplT TRUE 0.986 19.000 0.928 0.055 Y NA
 370542 370543 TC0223 TC0224 rplT pheS TRUE 0.985 7.000 0.202 1.000 Y NA
 370543 5441598 TC0224 tRNA-Ser-1 pheS   FALSE 0.339 1.000 0.000 NA   NA
 5441598 370544 tRNA-Ser-1 TC0225     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 370545 370546 TC0226 TC0227     TRUE 0.967 3.000 0.631 0.063   NA
 370547 370548 TC0228 TC0229     FALSE 0.456 138.000 0.145 1.000 N NA
 370549 370550 TC0230 TC0231 pnpA rpsO TRUE 0.952 28.000 0.335 1.000 Y NA
 370551 370552 TC0232 TC0233     TRUE 0.809 -10.000 0.013 NA   NA
 370553 370554 TC0234 TC0235     FALSE 0.327 135.000 1.000 NA   NA
 370554 370555 TC0235 TC0236     TRUE 0.896 15.000 1.000 NA   NA
 370555 370556 TC0236 TC0237     TRUE 0.763 29.000 1.000 NA   NA
 370557 370558 TC0238 TC0239     TRUE 0.847 19.000 0.571 NA   NA
 370559 370560 TC0240 TC0241 map   TRUE 0.629 67.000 0.429 NA N NA
 370560 370561 TC0241 TC0242     TRUE 0.957 19.000 0.042 NA Y NA
 370561 370562 TC0242 TC0243     FALSE 0.297 156.000 0.020 NA N NA
 370564 370565 TC0245 TC0246     FALSE 0.016 293.000 0.000 NA   NA
 370566 370567 TC0247 TC0248     FALSE 0.436 113.000 0.400 1.000   NA
 370567 370568 TC0248 TC0249   lytB TRUE 0.494 98.000 0.400 1.000   NA
 370569 370570 TC0250 TC0251     TRUE 0.909 13.000 1.000 NA   NA
 370570 370571 TC0251 TC0252     TRUE 0.753 29.000 0.833 NA   NA
 370571 370572 TC0252 TC0253     TRUE 0.922 0.000 0.833 NA   NA
 5441599 370573 tRNA-Leu-1 TC0254     FALSE 0.030 99.000 0.000 NA   NA
 370575 370576 TC0256 TC0257   glgB TRUE 0.883 15.000 0.636 NA   NA
 370577 370578 TC0258 TC0259     FALSE 0.017 649.000 0.000 NA   NA
 370578 370579 TC0259 TC0260     FALSE 0.025 112.000 0.000 NA   NA
 370579 370580 TC0260 TC0261   pmpE/F-1 TRUE 0.583 79.000 0.667 1.000   NA
 370580 370581 TC0261 TC0262 pmpE/F-1 pmpE/F-2 TRUE 0.973 3.000 0.667 0.017   NA
 370582 370583 TC0263 TC0264 pmpG-1 pmpH TRUE 0.942 22.000 1.000 0.017   NA
 370583 370584 TC0264 TC0265 pmpH   FALSE 0.017 420.000 0.000 NA   NA
 370584 370585 TC0265 TC0266     FALSE 0.179 -69.000 0.000 NA   NA
 370589 370590 TC0270 TC0271   gatA TRUE 0.993 12.000 0.643 0.004 Y NA
 370590 370591 TC0271 TC0272 gatA gatB TRUE 0.994 2.000 0.492 0.004 Y NA
 370592 370593 TC0273 TC0274     FALSE 0.431 90.000 0.667 NA   NA
 370597 370598 TC0278 TC0279     FALSE 0.278 121.000 0.222 NA   NA
 370598 370599 TC0279 TC0280     TRUE 0.855 -3.000 0.018 NA   NA
 370600 370601 TC0281 TC0282 cydA cydB TRUE 0.991 12.000 0.622 0.022 Y NA
 370603 370604 TC0284 TC0285     FALSE 0.288 152.000 0.750 NA   NA
 370606 370607 TC0287 TC0288   ileS FALSE 0.017 632.000 0.000 NA   NA
 370608 370609 TC0289 TC0290     FALSE 0.238 187.000 0.333 NA   NA
 370610 370611 TC0291 TC0292 rpmE prfA TRUE 0.535 188.000 0.005 1.000 Y NA
 370611 370612 TC0292 TC0293 prfA   TRUE 0.969 -16.000 0.009 1.000 Y NA
 370612 370613 TC0293 TC0294   ffh TRUE 0.909 -3.000 0.005 1.000 N NA
 370613 370614 TC0294 TC0295 ffh rpsP TRUE 0.950 -9.000 0.361 1.000 N NA
 370614 370615 TC0295 TC0296 rpsP trmD TRUE 0.978 14.000 0.033 1.000 Y NA
 370615 370616 TC0296 TC0297 trmD rplS TRUE 0.964 25.000 0.567 1.000 Y NA
 370616 370617 TC0297 TC0298 rplS rnhB-2 TRUE 0.700 63.000 0.066 1.000 N NA
 370617 370618 TC0298 TC0299 rnhB-2 gmk TRUE 0.886 -9.000 0.003 1.000 N NA
 370618 370619 TC0299 TC0300 gmk   TRUE 0.657 -7.000 0.003 NA   NA
 370619 370620 TC0300 TC0301   metG TRUE 0.821 0.000 0.008 NA   NA
 370621 370622 TC0302 TC0303 recD   FALSE 0.081 250.000 0.000 1.000   NA
 370623 370624 TC0304 TC0305     FALSE 0.018 145.000 0.000 NA   NA
 370625 5441600 TC0306 tRNA-Asn-1     FALSE 0.016 217.000 0.000 NA   NA
 5441600 370626 tRNA-Asn-1 TC0307     FALSE 0.239 -20.000 0.000 NA   NA
 370626 370627 TC0307 TC0308     FALSE 0.184 -55.000 0.000 NA   NA
 370627 370628 TC0308 TC0309   dcd TRUE 0.745 22.000 0.021 NA   NA
 370629 370630 TC0310 TC0311 ruvB   TRUE 0.678 -34.000 0.007 NA   NA
 370631 370632 TC0312 TC0313     TRUE 0.559 77.000 0.261 1.000   NA
 370633 370634 TC0314 TC0315 ssb pepA FALSE 0.361 322.000 0.013 1.000 N NA
 370634 370635 TC0315 TC0316 pepA hctB FALSE 0.274 146.000 0.017 1.000   NA
 370635 370636 TC0316 TC0317 hctB   FALSE 0.327 149.000 0.006 0.055   NA
 370636 370637 TC0317 TC0318     FALSE 0.333 94.000 0.007 1.000   NA
 370637 370638 TC0318 TC0319     FALSE 0.294 89.000 0.014 NA   NA
 370639 370640 TC0320 TC0321     FALSE 0.352 106.000 0.400 NA   NA
 370640 370641 TC0321 TC0322     FALSE 0.076 138.000 0.002 NA   NA
 370641 370642 TC0322 TC0323     TRUE 0.776 -10.000 0.008 NA   NA
 370643 370644 TC0324 TC0325 sucA sucB TRUE 0.988 4.000 0.667 1.000 Y NA
 370645 370646 TC0326 TC0327   gcpE TRUE 0.822 9.000 0.009 NA   NA
 370646 370647 TC0327 TC0328 gcpE   FALSE 0.073 146.000 0.002 NA   NA
 370647 370648 TC0328 TC0329     FALSE 0.404 78.000 0.065 NA   NA
 370648 5441601 TC0329 tRNA-Pro-2     FALSE 0.079 41.000 0.000 NA   NA
 370649 370650 TC0330 TC0331     TRUE 0.501 108.000 0.025 1.000 N NA
 370650 370651 TC0331 TC0332   tyrS FALSE 0.337 158.000 0.008 1.000 N NA
 370651 370652 TC0332 TC0333 tyrS pgd TRUE 0.940 10.000 0.014 1.000 N NA
 370653 370654 TC0334 TC0335 lepA tlc-1 FALSE 0.235 185.000 0.002 1.000 N NA
 370654 370655 TC0335 TC0336 tlc-1   FALSE 0.016 347.000 0.000 NA   NA
 370655 370656 TC0336 TC0337     FALSE 0.019 140.000 0.000 NA   NA
 370657 370658 TC0338 TC0339     TRUE 0.985 -7.000 0.898 1.000 Y NA
 370658 370659 TC0339 TC0341     TRUE 0.981 1.000 0.012 1.000 Y NA
 370659 370660 TC0341 TC0342     TRUE 0.991 2.000 0.012 0.005 Y NA
 370660 370661 TC0342 TC0343   dxr TRUE 0.830 26.000 0.008 1.000 N NA
 370661 370662 TC0343 TC0344 dxr   FALSE 0.347 197.000 0.568 1.000   NA
 370663 370664 TC0345 TC0346     FALSE 0.107 159.000 0.006 NA   NA
 370664 370665 TC0346 TC0347   dnaN TRUE 0.986 0.000 0.318 1.000 Y NA
 370667 370668 TC0349 TC0350   folD TRUE 0.959 -99.000 0.025 1.000 Y NA
 370668 370669 TC0350 TC0351 folD   FALSE 0.293 118.000 0.011 1.000   NA
 370669 370670 TC0351 TC0352     FALSE 0.163 -216.000 0.000 NA   NA
 370671 370672 TC0353 TC0354     TRUE 0.546 56.000 0.333 NA   NA
 370672 370673 TC0354 TC0355     FALSE 0.387 94.000 0.333 NA   NA
 370673 370674 TC0355 TC0356     TRUE 0.920 -3.000 1.000 NA   NA
 370675 370676 TC0357 TC0358     FALSE 0.063 52.000 0.000 NA   NA
 370676 370677 TC0358 TC0359     FALSE 0.187 -52.000 0.000 NA   NA
 370677 370678 TC0359 TC0360     FALSE 0.192 -46.000 0.000 NA   NA
 370678 370679 TC0360 TC0361   rpmB FALSE 0.087 38.000 0.000 NA   NA
 370679 370680 TC0361 TC0362 rpmB malQ FALSE 0.274 149.000 0.005 1.000 N NA
 370680 370681 TC0362 TC0363 malQ sycE TRUE 0.944 5.000 0.600 1.000   NA
 370681 370682 TC0363 TC0364 sycE sctW TRUE 0.864 34.000 0.240 0.013   NA
 370682 370683 TC0364 TC0365 sctW sctV TRUE 0.881 18.000 0.188 1.000   NA
 370683 370684 TC0365 TC0366 sctV sctU TRUE 0.992 0.000 0.219 0.014 Y NA
 370686 370687 TC0368 TC0370 ribF rbfA FALSE 0.186 698.000 0.000 1.000 N NA
 370687 370688 TC0370 TC0371 rbfA infB TRUE 0.987 7.000 0.530 1.000 Y NA
 370688 370689 TC0371 TC0372 infB nusA TRUE 0.924 -43.000 0.342 1.000 N NA
 370689 370690 TC0372 TC0373 nusA rpsA TRUE 0.488 123.000 0.006 0.041 N NA
 370691 370692 TC0374 TC0375   trxB FALSE 0.198 20.000 0.000 NA   NA
 370692 370693 TC0375 TC0376 trxB acpS TRUE 0.937 6.000 0.008 1.000 N NA
 370693 370694 TC0376 TC0377 acpS   FALSE 0.028 102.000 0.000 NA   NA
 370694 370695 TC0377 TC0378     FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 370695 370696 TC0378 TC0379     TRUE 0.653 33.000 0.009 1.000   NA
 370699 370700 TC0383 TC0384 mutY   TRUE 0.472 39.000 0.002 1.000   NA
 370701 370702 TC0385 TC0386   groEL-1 FALSE 0.295 124.000 0.400 NA   NA
 370702 370703 TC0386 TC0387 groEL-1 groES TRUE 0.961 39.000 0.412 0.013 Y NA
 370703 370704 TC0387 TC0388 groES pepF FALSE 0.428 171.000 0.188 1.000 N NA
 370705 370706 TC0389 TC0390 clpB   TRUE 0.885 10.000 0.009 1.000   NA
 370706 370707 TC0390 TC0391     FALSE 0.016 213.000 0.000 NA   NA
 370707 370708 TC0391 TC0392     FALSE 0.444 97.000 1.000 NA   NA
 370708 370709 TC0392 TC0393     TRUE 0.914 12.000 1.000 NA   NA
 370709 370710 TC0393 TC0394     TRUE 0.718 35.000 1.000 NA   NA
 370710 370711 TC0394 TC0395     FALSE 0.181 -64.000 0.000 NA   NA
 370713 370714 TC0397 TC0398 rpe efp-2 TRUE 0.901 -13.000 0.007 1.000 N NA
 370714 370715 TC0398 TC0399 efp-2 accB TRUE 0.946 13.000 0.120 1.000 N NA
 370715 370716 TC0399 TC0400 accB accC TRUE 0.991 4.000 0.011 0.003 Y NA
 370716 370717 TC0400 TC0401 accC rplM FALSE 0.174 189.000 0.000 1.000 N NA
 370717 370718 TC0401 TC0402 rplM rpsI TRUE 0.990 14.000 0.601 0.050 Y NA
 370719 370720 TC0403 TC0404   adk FALSE 0.444 87.000 0.014 NA N NA
 370721 370722 TC0405 TC0406     TRUE 0.987 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 370723 370724 TC0408 TC0409     TRUE 0.906 -3.000 0.017 1.000   NA
 370724 370725 TC0409 TC0410     FALSE 0.461 79.000 0.017 1.000   NA
 370726 370727 TC0411 TC0412     TRUE 0.578 50.000 0.333 NA   NA
 370727 370728 TC0412 TC0413     FALSE 0.183 100.000 0.007 NA   NA
 370728 370729 TC0413 TC0414     TRUE 0.679 12.000 0.004 NA   NA
 370729 370730 TC0414 TC0415     TRUE 0.866 -22.000 0.012 NA N NA
 370732 370733 TC0417 TC0418     FALSE 0.148 133.000 0.008 NA   NA
 370733 5441602 TC0418 tRNA-Thr-1     FALSE 0.065 51.000 0.000 NA   NA
 5441602 5441603 tRNA-Thr-1 tRNA-Tyr-1     FALSE 0.324 8.000 0.000 NA   NA
 5441603 370734 tRNA-Tyr-1 TC0419     FALSE 0.017 165.000 0.000 NA   NA
 370734 370735 TC0419 TC0420     TRUE 0.929 3.000 1.000 NA   NA
 370735 370736 TC0420 TC0421     TRUE 0.927 1.000 1.000 NA   NA
 370736 370737 TC0421 TC0422     FALSE 0.201 180.000 0.044 NA   NA
 370737 370738 TC0422 TC0423   lig TRUE 0.861 11.000 0.006 1.000   NA
 370738 370739 TC0423 TC0424 lig   FALSE 0.169 105.000 0.006 NA   NA
 370740 370741 TC0425 TC0426     FALSE 0.299 149.000 0.857 NA   NA
 370741 370742 TC0426 TC0427     FALSE 0.180 22.000 0.000 NA   NA
 370743 370744 TC0428 TC0429 rpmG   TRUE 0.658 26.000 0.006 1.000   NA
 370744 370745 TC0429 TC0430     TRUE 0.987 5.000 0.545 1.000 Y NA
 370746 370747 TC0431 TC0432     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 370747 370748 TC0432 TC0433     TRUE 0.619 581.000 0.000 0.027 Y NA
 370748 370749 TC0433 TC0434     TRUE 0.615 162.000 0.000 0.027 Y NA
 370749 370750 TC0434 TC0435     FALSE 0.016 210.000 0.000 NA   NA
 370750 370751 TC0435 TC0436     FALSE 0.224 17.000 0.000 NA   NA
 370752 370753 TC0437 TC0438     TRUE 0.836 21.000 0.000 0.004   NA
 370753 370754 TC0438 TC0439     FALSE 0.274 574.000 0.000 0.004   NA
 370754 370755 TC0439 TC0440     FALSE 0.085 439.000 0.000 1.000   NA
 370756 370757 TC0441 TC0442   guaA TRUE 0.959 15.000 0.003 1.000 Y NA
 370757 370758 TC0442 TC0443 guaA   TRUE 0.895 16.000 0.190 1.000   NA
 370761 370762 TC0446 TC0447     FALSE 0.176 182.000 0.000 1.000 N NA
 370763 370764 TC0448 TC0449     TRUE 0.980 0.000 0.308 NA Y NA
 370766 370767 TC0451 TC0452     TRUE 0.896 3.000 0.111 NA   NA
 370767 5441604 TC0452 tRNA-Ile-1     FALSE 0.123 28.000 0.000 NA   NA
 5441604 5441605 tRNA-Ile-1 tRNA-Ala-2     FALSE 0.340 5.000 0.000 NA   NA
 5441605 370768 tRNA-Ala-2 TC0453     FALSE 0.016 191.000 0.000 NA   NA
 370769 370770 TC0454 TC0455 kdsB pyrG TRUE 0.912 -24.000 0.018 1.000 N NA
 370770 370771 TC0455 TC0456 pyrG   TRUE 0.908 -7.000 0.006 1.000 N NA
 370771 370772 TC0456 TC0457   zwf FALSE 0.328 116.000 0.004 1.000 N NA
 370772 370773 TC0457 TC0458 zwf   TRUE 0.958 23.000 0.021 1.000 Y NA
 370774 370775 TC0459 TC0460   tmk TRUE 0.936 16.000 0.254 1.000 N NA
 370775 370776 TC0460 TC0461 tmk gyrA-2 TRUE 0.931 2.000 0.007 1.000 N NA
 370776 370777 TC0461 TC0462 gyrA-2 gyrB-2 TRUE 0.990 15.000 0.306 0.005 Y NA
 370777 370778 TC0462 TC0463 gyrB-2   TRUE 0.880 3.000 0.028 NA   NA
 370778 370779 TC0463 TC0464     FALSE 0.127 134.000 0.006 NA   NA
 370779 370780 TC0464 TC0465   tgt FALSE 0.017 435.000 0.000 NA   NA
 370780 370781 TC0465 TC0466 tgt mgtE FALSE 0.299 122.000 0.003 1.000 N NA
 370784 370785 TC0469 TC0470     FALSE 0.170 66.000 0.002 NA   NA
 370785 370786 TC0470 TC0471     TRUE 0.850 -42.000 0.006 1.000 N NA
 370786 370787 TC0471 TC0472     TRUE 0.847 114.000 0.091 0.022 Y NA
 370787 370788 TC0472 TC0473     TRUE 0.992 6.000 0.273 0.022 Y NA
 370788 370789 TC0473 TC0473.1     TRUE 0.953 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 370789 10692490 TC0473.1 TC0474     FALSE 0.342 2.000 0.000 NA   NA
 10692490 370790 TC0474 TC0475     FALSE 0.017 159.000 0.000 NA   NA
 370790 370791 TC0475 TC0476     TRUE 0.711 28.000 0.217 NA   NA
 370791 370792 TC0476 TC0477   pfkA-1 TRUE 0.913 20.000 0.088 1.000 N NA
 370792 370793 TC0477 TC0478 pfkA-1   TRUE 0.624 35.000 0.088 NA   NA
 370793 370794 TC0478 TC0479   pfkA-2 TRUE 0.887 -18.000 0.857 NA   NA
 5441606 5441607 tRNA-Met-1 tRNA-Met-2     FALSE 0.224 17.000 0.000 NA   NA
 5441607 370795 tRNA-Met-2 TC0480   kdtA FALSE 0.133 27.000 0.000 NA   NA
 370795 370796 TC0480 TC0481 kdtA leuS TRUE 0.918 0.000 0.006 1.000 N NA
 370798 370799 TC0483 TC0484     TRUE 0.736 20.000 0.012 NA   NA
 370799 370800 TC0484 TC0485   rpiA TRUE 0.839 0.000 0.011 NA   NA
 370800 370801 TC0485 TC0486 rpiA   FALSE 0.129 96.000 0.003 NA   NA
 370802 370803 TC0487 TC0488 fbaB   TRUE 0.958 14.000 1.000 1.000 N NA
 370803 370804 TC0488 TC0489     TRUE 0.521 89.000 0.250 NA N NA
 370806 370807 TC0491 TC0492 surE ubiA FALSE 0.242 109.000 0.006 1.000   NA
 370807 370808 TC0492 TC0493 ubiA ubiX TRUE 0.982 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 370809 5441608 TC0494 tRNA-Asp-1     FALSE 0.159 24.000 0.000 NA   NA
 5441608 5441609 tRNA-Asp-1 tRNA-Val-2     FALSE 0.324 8.000 0.000 NA   NA
 5441609 370810 tRNA-Val-2 TC0495     FALSE 0.016 200.000 0.000 NA   NA
 370810 370811 TC0495 TC0496     FALSE 0.017 158.000 0.000 NA   NA
 370811 370812 TC0496 TC0497     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 370812 370813 TC0497 TC0498     FALSE 0.397 108.000 1.000 NA   NA
 370813 370814 TC0498 TC0499     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 370814 370815 TC0499 TC0500     FALSE 0.316 144.000 1.000 NA   NA
 370816 370817 TC0501 TC0502     FALSE 0.319 198.000 0.273 1.000   NA
 370817 370818 TC0502 TC0503   incB FALSE 0.397 86.000 0.273 NA   NA
 370818 370819 TC0503 TC0504 incB   TRUE 0.639 50.000 1.000 NA   NA
 370819 370820 TC0504 TC0505     FALSE 0.431 90.000 0.667 NA   NA
 370820 370821 TC0505 TC0506     TRUE 0.738 26.000 0.182 NA   NA
 370822 370823 TC0507 TC0508 acpP fabG TRUE 0.727 366.000 0.007 0.012 Y NA
 370823 370824 TC0508 TC0509 fabG fabD TRUE 0.990 -3.000 0.019 0.012 Y NA
 370824 370825 TC0509 TC0510 fabD fabH TRUE 0.981 17.000 0.009 0.012 Y NA
 370826 370827 TC0511 TC0512 recR   FALSE 0.255 414.000 0.003 1.000 N NA
 370827 370828 TC0512 TC0513     TRUE 0.858 71.000 0.175 1.000 Y NA
 370828 370829 TC0513 TC0514   lpxD TRUE 0.938 28.000 0.018 1.000 Y NA
 370831 370832 TC0516 TC0517 pdhA pdhB TRUE 0.992 -7.000 0.456 0.002 Y NA
 370832 370833 TC0517 TC0518 pdhB   TRUE 0.986 5.000 0.254 1.000 Y NA
 370836 370837 TC0521 TC0522 dnaA-1   TRUE 0.684 80.000 0.714 1.000 N NA
 370837 370838 TC0522 TC0523     FALSE 0.292 298.000 0.006 1.000 N NA
 370839 370840 TC0524 TC0525     TRUE 0.915 4.000 0.500 NA   NA
 370842 370843 TC0527 TC0528     TRUE 0.885 -10.000 0.545 NA   NA
 370844 370845 TC0529 TC0530     TRUE 0.953 6.000 0.041 1.000 N NA
 370846 370847 TC0531 TC0532     TRUE 0.731 25.000 0.050 NA   NA
 370847 370848 TC0532 TC0533     TRUE 0.869 -3.000 0.031 NA   NA
 370848 370849 TC0533 TC0534     TRUE 0.839 -7.000 0.019 NA   NA
 370850 370851 TC0535 TC0536   accA TRUE 0.889 -34.000 0.010 1.000 N NA
 370851 370852 TC0536 TC0537 accA   FALSE 0.158 133.000 0.008 NA   NA
 370852 370853 TC0537 TC0538     FALSE 0.280 118.000 0.182 NA   NA
 370853 370854 TC0538 TC0539     FALSE 0.173 221.000 0.000 1.000 N NA
 370854 370855 TC0539 TC0540   murE TRUE 0.955 -100.000 0.014 1.000 Y NA
 370857 370858 TC0542 TC0543     TRUE 0.807 -40.000 0.135 NA   NA
 370858 370859 TC0543 TC0544     TRUE 0.766 -7.000 0.007 NA   NA
 370860 370861 TC0545 TC0546     TRUE 0.901 7.000 0.286 NA   NA
 370861 370862 TC0546 TC0547   dnaA-2 FALSE 0.081 237.000 0.000 1.000   NA
 370862 370863 TC0547 TC0548 dnaA-2   TRUE 0.506 51.000 0.006 NA N NA
 370865 370866 TC0550 TC0551     TRUE 0.993 2.000 0.093 0.002 Y NA
 370866 370867 TC0551 TC0552     TRUE 0.987 -13.000 0.034 0.015 Y NA
 370867 370868 TC0552 TC0553     TRUE 0.991 4.000 0.034 0.015 Y NA
 370869 370870 TC0554 TC0556 gcvH   TRUE 0.848 27.000 0.857 1.000   NA
 370870 370871 TC0556 TC0557     FALSE 0.276 200.000 0.032 1.000   NA
 370871 370872 TC0557 TC0558     TRUE 0.975 5.000 0.032 0.025 N NA
 370876 370877 TC0562 TC0563     TRUE 0.521 57.000 0.231 NA   NA
 370877 370878 TC0563 TC0564     TRUE 0.989 -19.000 0.231 0.004 Y NA
 370878 370879 TC0564 TC0565   dut TRUE 0.938 2.000 0.008 1.000 N NA
 370879 370880 TC0565 TC0566 dut accD FALSE 0.419 114.000 0.008 1.000 N NA
 370880 370881 TC0566 TC0567 accD sod TRUE 0.574 74.000 0.009 1.000 N NA
 370881 370882 TC0567 TC0568 sod   FALSE 0.471 124.000 0.067 1.000 N NA
 370882 370883 TC0568 TC0569     FALSE 0.195 148.000 0.022 NA   NA
 370884 370885 TC0570 TC0571 rnc radA TRUE 0.845 -136.000 0.007 1.000 N NA
 370885 370886 TC0571 TC0572 radA   TRUE 0.891 -22.000 0.007 1.000 N NA
 370886 370887 TC0572 TC0573     FALSE 0.123 109.000 0.000 1.000   NA
 370887 370888 TC0573 TC0574     FALSE 0.258 15.000 0.000 NA   NA
 370889 370890 TC0575 TC0576   valS TRUE 0.895 15.000 0.006 1.000 N NA
 370890 370891 TC0576 TC0577 valS   FALSE 0.123 131.000 0.006 NA   NA
 370891 370892 TC0577 TC0578   atpK TRUE 0.743 -100.000 0.030 NA   NA
 370892 370893 TC0578 TC0579 atpK   TRUE 0.827 63.000 0.848 0.002   NA
 370893 370894 TC0579 TC0580   atpD TRUE 0.992 6.000 0.270 0.011 Y NA
 370894 370895 TC0580 TC0581 atpD atpB TRUE 0.991 -15.000 0.903 0.009 Y NA
 370895 370896 TC0581 TC0582 atpB atpA TRUE 0.994 3.000 0.806 0.009 Y NA
 370896 370897 TC0582 TC0583 atpA   TRUE 0.902 -6.000 0.633 NA   NA
 370897 370898 TC0583 TC0584     FALSE 0.271 170.000 0.667 NA   NA
 370900 370901 TC0586 TC0587   tal TRUE 0.772 27.000 0.667 NA   NA
 370901 370902 TC0587 TC0588 tal rpoC FALSE 0.376 111.000 0.006 1.000 N NA
 370902 370903 TC0588 TC0589 rpoC rpoB TRUE 0.984 25.000 0.851 0.002 Y NA
 370903 370904 TC0589 TC0590 rpoB rplL FALSE 0.433 345.000 0.223 1.000 N NA
 370904 370905 TC0590 TC0591 rplL rplJ TRUE 0.970 32.000 0.884 0.046 Y NA
 370905 370906 TC0591 TC0592 rplJ rplA TRUE 0.979 22.000 0.302 0.062 Y NA
 370906 370907 TC0592 TC0593 rplA rplK TRUE 0.981 23.000 0.838 0.062 Y NA
 370907 370908 TC0593 TC0594 rplK nusG TRUE 0.599 107.000 0.681 1.000 N NA
 370908 370909 TC0594 TC0595 nusG secE TRUE 0.968 4.000 0.843 1.000 N NA
 370909 5441610 TC0595 tRNA-Trp-1 secE   FALSE 0.109 30.000 0.000 NA   NA
 5441610 370910 tRNA-Trp-1 TC0596   tuf FALSE 0.061 54.000 0.000 NA   NA
 370910 5441611 TC0596 tRNA-Thr-3 tuf   FALSE 0.069 46.000 0.000 NA   NA
 5441611 370911 tRNA-Thr-3 TC0597   infA FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 370912 370913 TC0598 TC0599     TRUE 0.878 -3.000 0.054 NA   NA
 370914 370915 TC0600 TC0601     FALSE 0.016 182.000 0.000 NA   NA
 370916 370917 TC0602 TC0603   trpF FALSE 0.084 373.000 0.000 1.000   NA
 370918 370919 TC0604 TC0605 tpi xseA TRUE 0.917 13.000 0.007 1.000 N NA
 370919 370920 TC0605 TC0606 xseA xseB TRUE 0.962 -16.000 0.412 0.002   NA
 370920 370921 TC0606 TC0607 xseB   TRUE 0.796 7.000 0.007 NA   NA
 370921 370922 TC0607 TC0608   dxs TRUE 0.833 -3.000 0.011 NA   NA
 370922 370923 TC0608 TC0609 dxs pyk FALSE 0.327 116.000 0.004 1.000 N NA
 370923 370924 TC0609 TC0610 pyk uvrA TRUE 0.635 39.000 0.002 1.000 N NA
 370924 370925 TC0610 TC0611 uvrA dnaZ TRUE 0.611 99.000 0.000 1.000 Y NA
 370925 370926 TC0611 TC0612 dnaZ   TRUE 0.890 -7.000 0.411 NA   NA
 370927 370928 TC0613 TC0614 ptsI ptsH TRUE 0.992 1.000 0.026 0.005 Y NA
 370928 10692491 TC0614 TC0616 ptsH   FALSE 0.019 135.000 0.000 NA   NA
 370930 370931 TC0618 TC0619   dnaJ TRUE 0.833 35.000 0.333 1.000 N NA
 370931 370932 TC0619 TC0620 dnaJ rpsU TRUE 0.837 26.000 0.412 1.000   NA
 370932 370933 TC0620 TC0621 rpsU   FALSE 0.178 200.000 0.006 1.000   NA
 370933 370934 TC0621 TC0622     FALSE 0.074 43.000 0.000 NA   NA
 370935 370936 TC0623 TC0624     FALSE 0.201 118.000 0.012 NA   NA
 370936 370937 TC0624 TC0625     FALSE 0.016 271.000 0.000 NA   NA
 370937 370938 TC0625 TC0626     FALSE 0.370 63.000 0.004 1.000   NA
 370938 370939 TC0626 TC0627     TRUE 0.534 54.000 0.010 1.000   NA
 370939 370940 TC0627 TC0628   maf TRUE 0.582 33.000 0.017 NA   NA
 370940 370941 TC0628 TC0629 maf   TRUE 0.883 -18.000 0.017 NA N NA
 370941 370942 TC0629 TC0630     TRUE 0.910 7.000 0.500 NA   NA
 370943 370944 TC0631 TC0632   def FALSE 0.248 158.000 0.002 1.000 N NA
 370944 370945 TC0632 TC0633 def ksgA FALSE 0.451 251.000 0.000 1.000 Y NA
 370945 370946 TC0633 TC0634 ksgA   TRUE 0.796 15.000 0.005 1.000   NA
 370946 370947 TC0634 TC0635     FALSE 0.360 282.000 0.667 1.000   NA
 5441613 370948 tRNA-Ser-2 TC0636     FALSE 0.019 137.000 0.000 NA   NA
 370948 370949 TC0636 TC0637     TRUE 0.792 27.000 1.000 NA   NA
 370950 370951 TC0638 TC0639     FALSE 0.016 213.000 0.000 NA   NA
 370951 370952 TC0639 TC0640   dapA FALSE 0.178 146.000 0.014 NA   NA
 370952 370953 TC0640 TC0641 dapA lysC TRUE 0.981 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 370953 370954 TC0641 TC0642 lysC asd TRUE 0.979 -7.000 0.022 1.000 Y NA
 370954 370955 TC0642 TC0643 asd dapB TRUE 0.981 10.000 0.005 0.059 Y NA
 370955 370956 TC0643 TC0644 dapB   FALSE 0.016 206.000 0.000 NA   NA
 370957 370958 TC0645 TC0646 aroA aroK TRUE 0.943 -58.000 0.006 1.000 Y NA
 370958 370959 TC0646 TC0647 aroK aroC TRUE 0.968 -7.000 0.006 1.000 Y NA
 370959 370960 TC0647 TC0648 aroC aroB TRUE 0.992 -3.000 0.110 0.005 Y NA
 370960 370961 TC0648 TC0649 aroB   TRUE 0.982 -19.000 0.007 0.005 Y NA
 370961 370962 TC0649 TC0650     TRUE 0.584 43.000 0.214 NA   NA
 370962 370963 TC0650 TC0651     TRUE 0.556 52.000 0.300 NA   NA
 370963 370964 TC0651 TC0652     TRUE 0.599 70.000 0.429 1.000   NA
 370964 370965 TC0652 TC0653     TRUE 0.916 15.000 0.429 1.000   NA
 370965 370966 TC0653 TC0654     TRUE 0.622 171.000 0.011 1.000 Y NA
 370967 370968 TC0655 TC0656 mdh   FALSE 0.136 183.000 0.009 NA   NA
 370968 370969 TC0656 TC0657   pgi FALSE 0.334 100.000 0.133 NA   NA
 370969 370970 TC0657 TC0658 pgi hflX FALSE 0.211 107.000 0.002 1.000   NA
 370970 370971 TC0658 TC0659 hflX   TRUE 0.889 7.000 0.008 1.000   NA
 370971 370972 TC0659 TC0660     TRUE 0.596 29.000 0.005 1.000   NA
 370972 370973 TC0660 TC0661     TRUE 0.879 63.000 0.200 1.000 Y NA
 370975 370976 TC0663 TC0664     FALSE 0.262 54.000 0.000 1.000   NA
 370976 370977 TC0664 TC0665     TRUE 0.717 -48.000 0.011 NA   NA
 370980 370981 TC0668 TC0669     FALSE 0.254 100.000 0.012 NA   NA
 370981 370982 TC0669 TC0670     TRUE 0.864 12.000 0.037 NA   NA
 370984 370985 TC0672 TC0673 proS hcrA TRUE 0.553 74.000 0.007 1.000 N NA
 370985 370986 TC0673 TC0674 hcrA grpE TRUE 0.956 -3.000 0.286 1.000 N NA
 370986 370987 TC0674 TC0675 grpE dnaK TRUE 0.986 17.000 0.224 0.011 Y NA
 370987 370988 TC0675 TC0676 dnaK   FALSE 0.249 309.000 0.003 1.000 N NA
 370988 370989 TC0676 TC0677     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 370990 370991 TC0678 TC0679     FALSE 0.022 119.000 0.000 NA   NA
 370991 370992 TC0679 TC0680     TRUE 0.882 29.000 0.857 1.000 N NA
 370992 370993 TC0680 TC0681     TRUE 0.728 165.000 0.714 1.000 Y NA
 370993 370994 TC0681 TC0682   lpxK TRUE 0.940 -3.000 0.013 1.000 N NA
 370994 370995 TC0682 TC0683 lpxK   FALSE 0.262 196.000 0.006 1.000 N NA
 370995 370996 TC0683 TC0684     TRUE 0.861 -12.000 0.213 NA   NA
 370996 370997 TC0684 TC0685   ribE TRUE 0.771 -3.000 0.006 NA   NA
 370998 370999 TC0686 TC0687     TRUE 0.876 -10.000 0.009 NA N NA
 370999 371000 TC0687 TC0688   lspA TRUE 0.953 6.000 0.038 1.000 N NA
 371000 371001 TC0688 TC0689 lspA   FALSE 0.176 -76.000 0.000 NA   NA
 371001 371002 TC0689 TC0690     FALSE 0.206 -34.000 0.000 NA   NA
 371002 371003 TC0690 TC0691     FALSE 0.173 214.000 0.000 1.000 N NA
 371003 371004 TC0691 TC0692     TRUE 0.650 58.000 0.010 1.000 N NA
 371004 371005 TC0692 TC0693   pmpA FALSE 0.312 78.000 0.003 1.000   NA
 371005 371006 TC0693 TC0694 pmpA pmpB/C-1 TRUE 0.570 129.000 0.400 0.014   NA
 371006 371007 TC0694 TC0695 pmpB/C-1 pmpB/C-2 TRUE 0.558 179.000 1.000 0.014   NA
 371008 371009 TC0696 TC0697     TRUE 0.986 -3.000 0.509 1.000 Y NA
 371009 371010 TC0697 TC0698     TRUE 0.983 -9.000 0.616 1.000 Y NA
 371011 371012 TC0699 TC0700   rpmA TRUE 0.503 93.000 0.335 1.000   NA
 371012 371013 TC0700 TC0701 rpmA rplU TRUE 0.968 32.000 0.667 0.044 Y NA
 371013 5441615 TC0701 tRNA-Phe-1 rplU   FALSE 0.016 318.000 0.000 NA   NA
 371014 371015 TC0702 TC0703     FALSE 0.183 183.000 0.024 NA   NA
 371015 371016 TC0703 TC0704     TRUE 0.864 17.000 0.667 NA   NA
 371016 371017 TC0704 TC0705     TRUE 0.751 10.000 0.006 NA   NA
 371017 371018 TC0705 TC0706     FALSE 0.249 140.000 0.222 NA   NA
 371018 371019 TC0706 TC0707     FALSE 0.153 172.000 0.011 NA   NA
 371019 371020 TC0707 TC0708     FALSE 0.379 103.000 0.571 NA   NA
 371020 371021 TC0708 TC0709     TRUE 0.896 14.000 0.714 NA   NA
 371021 371022 TC0709 TC0710     TRUE 0.861 -31.000 0.027 1.000   NA
 371022 371023 TC0710 TC0711     TRUE 0.832 -27.000 0.205 NA   NA
 371023 371024 TC0711 TC0712   ubiE TRUE 0.655 -73.000 0.008 NA   NA
 371025 371026 TC0713 TC0714   dapF FALSE 0.264 79.000 0.008 NA   NA
 371026 371027 TC0714 TC0715 dapF clpP-2 TRUE 0.856 -31.000 0.006 1.000 N NA
 371027 371028 TC0715 TC0716 clpP-2 glyA TRUE 0.954 0.000 0.051 1.000 N NA
 371029 371030 TC0717 TC0718     TRUE 0.478 74.000 0.003 1.000 N NA
 371031 371032 TC0719 TC0720   rpsJ TRUE 0.876 16.000 0.006 1.000 N NA
 371032 371033 TC0720 TC0721 rpsJ fusA TRUE 0.976 8.000 0.007 1.000 Y NA
 371033 371034 TC0721 TC0722 fusA rpsG TRUE 0.883 42.000 0.008 1.000 Y NA
 371034 371035 TC0722 TC0723 rpsG rpsL TRUE 0.941 50.000 0.029 0.009 Y NA
 371036 371037 TC0724 TC0725     FALSE 0.195 153.000 0.025 NA   NA
 371038 371039 TC0726 TC0727 srp   FALSE 0.310 183.000 0.200 1.000   NA
 371039 371040 TC0727 TC0728   omp3B TRUE 0.589 148.000 0.600 0.002   NA
 371042 371043 TC0730 TC0731 gltX euo FALSE 0.081 250.000 0.000 1.000   NA
 371043 371044 TC0731 TC0732 euo recJ FALSE 0.086 462.000 0.000 1.000   NA
 371044 371045 TC0732 TC0733 recJ   FALSE 0.385 118.000 0.007 1.000 N NA
 371045 371046 TC0733 TC0734     FALSE 0.017 402.000 0.000 NA   NA
 371047 371048 TC0735 TC0736 uppS   TRUE 0.986 6.000 0.400 1.000 Y NA
 371048 371049 TC0736 TC0737   cmk TRUE 0.931 -3.000 0.008 1.000 N NA
 371049 371050 TC0737 TC0738 cmk   TRUE 0.931 -3.000 0.008 1.000 N NA
 371050 371051 TC0738 TC0739   argS TRUE 0.889 15.000 0.006 1.000 N NA
 371054 371055 TC0742 TC0743     FALSE 0.140 177.000 0.002 1.000   NA
 371055 10692492 TC0743 TC0744     FALSE 0.317 -3.000 0.000 NA   NA
 371056 371057 TC0745 TC0746     TRUE 0.640 58.000 0.316 1.000   NA
 371057 371058 TC0746 TC0747     TRUE 0.867 -10.000 0.010 1.000   NA
 371060 5441616 TC0750 tRNA-Leu-2     FALSE 0.020 127.000 0.000 NA   NA
 5441616 371061 tRNA-Leu-2 TC0751     FALSE 0.037 82.000 0.000 NA   NA
 371061 371062 TC0751 TC0752     TRUE 0.824 -22.000 0.057 NA   NA
 371062 371063 TC0752 TC0753     TRUE 0.941 43.000 0.019 0.016 Y NA
 371063 5441617 TC0753 tRNA-Arg-3     FALSE 0.050 65.000 0.000 NA   NA
 5441617 371064 tRNA-Arg-3 TC0754     FALSE 0.056 59.000 0.000 NA   NA
 371064 371065 TC0754 TC0755     TRUE 0.676 -30.000 0.007 NA   NA
 371066 5441618 TC0756 tRNA-Leu-3     FALSE 0.028 102.000 0.000 NA   NA
 371067 371068 TC0757 TC0758     TRUE 0.801 7.000 0.007 NA   NA
 371070 371071 TC0760 TC0761 pheT   TRUE 0.764 -3.000 0.006 NA   NA
 371071 371072 TC0761 TC0762     TRUE 0.873 10.000 0.038 NA   NA
 371073 371074 TC0763 TC0764     TRUE 0.993 2.000 0.400 0.020 Y NA
 371074 371075 TC0764 TC0765     TRUE 0.988 -18.000 0.318 0.020 Y NA
 371075 371076 TC0765 TC0766     FALSE 0.016 270.000 0.000 NA   NA
 371076 371077 TC0766 TC0767     FALSE 0.016 183.000 0.000 NA   NA
 371077 371078 TC0767 TC0768     FALSE 0.254 -15.000 0.000 NA   NA
 371078 371079 TC0768 TC0769     FALSE 0.239 16.000 0.000 NA   NA
 371081 371082 TC0771 TC0772   hemH FALSE 0.175 145.000 0.005 1.000   NA
 371082 371083 TC0772 TC0773 hemH   TRUE 0.829 27.000 0.011 1.000 N NA
 371083 371084 TC0773 TC0774     TRUE 0.609 49.000 0.005 1.000 N NA
 371084 371085 TC0774 TC0775     TRUE 0.880 -3.000 0.008 1.000   NA
 371085 371086 TC0775 TC0776   glgC TRUE 0.491 83.000 0.070 1.000   NA
 371088 371089 TC0778 TC0779 rho   FALSE 0.404 132.000 0.013 1.000 N NA
 371089 371090 TC0779 TC0780   polA TRUE 0.935 -15.000 0.068 1.000 N NA
 371090 371091 TC0780 TC0781 polA   TRUE 0.898 14.000 0.006 1.000 N NA
 371091 371092 TC0781 TC0782   tlc-2 FALSE 0.372 142.000 0.011 1.000 N NA
 371092 371093 TC0782 TC0783 tlc-2   FALSE 0.311 210.000 0.000 0.049 N NA
 371093 5441619 TC0783 tRNA-Ser-4     FALSE 0.017 168.000 0.000 NA   NA
 371094 371095 TC0784 TC0785 dnaB gidA FALSE 0.175 264.000 0.000 1.000 N NA
 371095 371096 TC0785 TC0786 gidA   TRUE 0.911 -10.000 0.008 1.000 N NA
 371097 371098 TC0787 TC0788 ndk ruvA FALSE 0.300 146.000 0.006 1.000 N NA
 371098 371099 TC0788 TC0789 ruvA ruvC TRUE 0.985 20.000 0.451 0.015 Y NA
 371099 371100 TC0789 TC0790 ruvC   FALSE 0.158 104.000 0.006 NA   NA
 371100 5441620 TC0790 tRNA-Leu-4     FALSE 0.036 84.000 0.000 NA   NA
 5441620 371101 tRNA-Leu-4 TC0791     FALSE 0.022 119.000 0.000 NA   NA
 371101 371102 TC0791 TC0792   gap TRUE 0.880 11.000 0.128 NA   NA
 371102 371103 TC0792 TC0793 gap rplQ TRUE 0.659 41.000 0.006 1.000 N NA
 371103 371104 TC0793 TC0794 rplQ rpoA TRUE 0.965 9.000 0.873 1.000 N NA
 371104 371105 TC0794 TC0795 rpoA rpsK TRUE 0.930 -30.000 0.308 1.000 N NA
 371105 371106 TC0795 TC0796 rpsK rpsM TRUE 0.984 22.000 0.810 0.042 Y NA
 371106 371107 TC0796 TC0797 rpsM secY TRUE 0.671 56.000 0.011 1.000 N NA
 371107 371108 TC0797 TC0798 secY rplO TRUE 0.918 23.000 0.730 1.000 N NA
 371108 371109 TC0798 TC0799 rplO rpsE TRUE 0.988 -7.000 0.148 0.058 Y NA
 371109 371110 TC0799 TC0800 rpsE rplR TRUE 0.989 15.000 0.814 0.058 Y NA
 371110 371111 TC0800 TC0801 rplR rplF TRUE 0.984 22.000 0.815 0.042 Y NA
 371111 371112 TC0801 TC0802 rplF rpsH TRUE 0.975 28.000 0.808 0.042 Y NA
 371112 371113 TC0802 TC0803 rpsH rplE TRUE 0.983 18.000 0.059 0.042 Y NA
 371113 371114 TC0803 TC0804 rplE rplX TRUE 0.993 2.000 0.758 0.042 Y NA
 371114 371115 TC0804 TC0805 rplX rplN TRUE 0.990 13.000 0.810 0.058 Y NA
 371115 371116 TC0805 TC0806 rplN rpsQ TRUE 0.987 17.000 0.791 0.058 Y NA
 371116 371117 TC0806 TC0807 rpsQ rpmC TRUE 0.964 -7.000 0.828 0.042   NA
 371117 371118 TC0807 TC0808 rpmC rplP TRUE 0.972 2.000 0.802 0.042   NA
 371118 371119 TC0808 TC0809 rplP rpsC TRUE 0.966 33.000 0.828 0.058 Y NA
 371119 371120 TC0809 TC0810 rpsC rplV TRUE 0.991 11.000 0.719 0.058 Y NA
 371120 371121 TC0810 TC0811 rplV rpsS TRUE 0.985 19.000 0.769 0.058 Y NA
 371121 371122 TC0811 TC0812 rpsS rplB TRUE 0.992 6.000 0.820 0.058 Y NA
 371122 371123 TC0812 TC0813 rplB rplW TRUE 0.982 24.000 0.849 0.034 Y NA
 371123 371124 TC0813 TC0814 rplW rplD TRUE 0.982 16.000 0.013 0.042 Y NA
 371124 371125 TC0814 TC0815 rplD rplC TRUE 0.989 9.000 0.020 0.042 Y NA
 371125 371126 TC0815 TC0816 rplC   FALSE 0.017 431.000 0.000 NA   NA
 371126 371127 TC0816 TC0817   fmt FALSE 0.120 117.000 0.006 NA   NA
 371127 371128 TC0817 TC0818 fmt lpxA TRUE 0.901 -13.000 0.007 1.000 N NA
 371128 371129 TC0818 TC0819 lpxA fabZ TRUE 0.946 12.000 0.048 1.000 N NA
 371129 371130 TC0819 TC0820 fabZ lpxC TRUE 0.938 -3.000 0.012 1.000 N NA
 371130 371131 TC0820 TC0821 lpxC   TRUE 0.783 86.000 0.012 1.000 Y NA
 371131 371132 TC0821 TC0822     TRUE 0.584 67.000 0.072 NA N NA
 371132 371133 TC0822 TC0823     FALSE 0.359 134.000 0.072 NA N NA
 371133 371134 TC0823 TC0824     TRUE 0.802 4.000 0.007 NA   NA
 371134 371135 TC0824 TC0825     TRUE 0.755 -21.000 0.010 NA   NA
 5441621 371136 tRNA-Leu-5 TC0826   trxA FALSE 0.016 173.000 0.000 NA   NA
 371137 371138 TC0827 TC0828   mip TRUE 0.910 16.000 0.011 1.000 N NA
 371138 371139 TC0828 TC0829 mip aspS FALSE 0.466 80.000 0.006 1.000 N NA
 371139 371140 TC0829 TC0830 aspS hisS TRUE 0.980 -19.000 0.009 0.055 Y NA
 371141 371142 TC0831 TC0832   dnaE TRUE 0.909 14.000 0.007 1.000 N NA
 371142 371143 TC0832 TC0833 dnaE upp FALSE 0.238 115.000 0.000 1.000 N NA
 371145 371146 TC0835 TC0836     TRUE 0.913 10.000 0.750 NA   NA
 371146 371147 TC0836 TC0837     TRUE 0.867 -31.000 0.875 NA   NA
 371149 371150 TC0839 TC0840     FALSE 0.294 130.000 0.455 NA   NA
 371150 371151 TC0840 TC0841     TRUE 0.860 -3.000 0.020 NA   NA
 371151 371152 TC0841 TC0842     FALSE 0.246 148.000 0.008 NA N NA
 371152 371153 TC0842 TC0843     TRUE 0.472 160.000 0.545 1.000 N NA
 371153 371154 TC0843 TC0844     FALSE 0.261 179.000 0.600 NA   NA
 371154 371155 TC0844 TC0845     FALSE 0.162 -267.000 0.000 NA   NA
 371155 371156 TC0845 TC0846     FALSE 0.159 24.000 0.000 NA   NA
 371156 371157 TC0846 TC0847   lipA TRUE 0.933 -3.000 0.009 1.000 N NA
 371157 371158 TC0847 TC0848 lipA sctJ FALSE 0.337 114.000 0.004 1.000 N NA
 371158 371159 TC0848 TC0849 sctJ   TRUE 0.925 1.000 0.875 NA   NA
 371159 371160 TC0849 TC0850   sctL FALSE 0.254 233.000 0.556 NA   NA
 371160 371161 TC0850 TC0851 sctL sctR TRUE 0.984 13.000 0.700 1.000 Y NA
 371161 371162 TC0851 TC0852 sctR sctS TRUE 0.992 12.000 0.700 0.012 Y NA
 371162 371163 TC0852 TC0853 sctS sctT TRUE 0.988 7.000 0.875 1.000 Y NA
 371164 371165 TC0854 TC0855     FALSE 0.457 91.000 1.000 NA   NA
 371165 371166 TC0855 TC0856     TRUE 0.918 6.000 0.667 NA   NA
 371166 371167 TC0856 TC0857     TRUE 0.883 -15.000 0.667 NA   NA
 371167 371168 TC0857 TC0858     TRUE 0.912 9.000 0.667 NA   NA
 371168 371169 TC0858 TC0859   gspF TRUE 0.963 16.000 0.030 NA Y NA
 371169 371170 TC0859 TC0860 gspF gspE TRUE 0.976 15.000 0.035 1.000 Y NA
 371170 371171 TC0860 TC0861 gspE gspD TRUE 0.981 -13.000 0.467 1.000 Y NA
 371171 371172 TC0861 TC0862 gspD   TRUE 0.913 1.000 0.467 NA   NA
 371172 371173 TC0862 TC0863   pepP FALSE 0.198 125.000 0.014 NA   NA
 371173 371174 TC0863 TC0864 pepP mutL TRUE 0.926 10.000 0.007 1.000 N NA
 371175 371176 TC0865 TC0866 sycD   TRUE 0.729 28.000 0.333 NA   NA
 371176 371177 TC0866 TC0867     TRUE 0.700 37.000 0.857 NA   NA
 371177 371178 TC0867 TC0868     TRUE 0.898 31.000 0.750 0.011   NA
 371180 371181 TC0870 TC0871 thrS   FALSE 0.408 469.000 0.035 1.000 N NA
 371181 371182 TC0871 TC0872     TRUE 0.926 5.000 0.875 NA   NA
 371182 371183 TC0872 TC0873     TRUE 0.861 -31.000 0.750 NA   NA
 371183 371184 TC0873 TC0874   trpS FALSE 0.200 175.000 0.039 NA   NA
 371184 371185 TC0874 TC0875 trpS uvrB TRUE 0.953 -3.000 0.006 0.054 N NA
 371185 371186 TC0875 TC0876 uvrB eno FALSE 0.286 158.000 0.006 1.000 N NA
 371186 371187 TC0876 TC0877 eno   FALSE 0.334 121.000 0.006 1.000 N NA
 371187 371188 TC0877 TC0878     TRUE 0.888 117.000 0.750 0.002 Y NA
 371189 371190 TC0879 TC0880   sdhB FALSE 0.394 66.000 0.019 NA   NA
 371190 371191 TC0880 TC0881 sdhB sdhA TRUE 0.992 10.000 0.231 0.003 Y NA
 371191 371192 TC0881 TC0882 sdhA   TRUE 0.993 0.000 0.179 0.003 Y NA
 371192 371193 TC0882 TC0883     FALSE 0.226 145.000 0.007 NA N NA
 371193 371194 TC0883 TC0884     FALSE 0.396 85.000 0.008 NA N NA
 371195 371196 TC0885 TC0886     TRUE 0.992 -3.000 0.583 0.031 Y NA
 371196 371197 TC0886 TC0887     TRUE 0.915 3.000 0.500 NA   NA
 371197 371198 TC0887 TC0888     TRUE 0.897 14.000 0.750 NA   NA
 371198 371199 TC0888 TC0889     TRUE 0.931 -45.000 0.750 1.000 N NA
 371199 371200 TC0889 TC0890     TRUE 0.928 -10.000 0.750 1.000   NA
 371200 371201 TC0890 TC0891     TRUE 0.517 71.000 0.750 NA   NA
 371202 5441622 TC0892 tRNA-Arg-1     FALSE 0.159 24.000 0.000 NA   NA
 5441622 371203 tRNA-Arg-1 TC0893   groEL-2 FALSE 0.026 108.000 0.000 NA   NA
 371203 371204 TC0893 TC0894 groEL-2   FALSE 0.415 78.000 0.128 NA   NA
 371206 371207 TC0896 TC0897   ung TRUE 0.886 -3.000 0.140 NA   NA
 371208 371209 TC0898 TC0899 pcrA   TRUE 0.948 4.000 0.015 1.000 N NA
 371210 371211 TC0900 TC0901     TRUE 0.828 -21.000 0.055 NA   NA
 371211 371212 TC0901 TC0902   folA TRUE 0.780 -28.000 0.017 NA   NA
 371212 371213 TC0902 TC0903 folA folK/P TRUE 0.980 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 371213 371214 TC0903 TC0904 folK/P   TRUE 0.982 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 371214 371215 TC0904 TC0905   rpoD TRUE 0.866 26.000 0.030 1.000 N NA
 371215 371216 TC0905 TC0906 rpoD   FALSE 0.298 150.000 0.857 NA   NA
 371217 371218 TC0907 TC0908 rpsT   FALSE 0.074 222.000 0.004 NA   NA
 371221 10692493 TC0911 TC0912     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 10692493 371222 TC0912 TC0913     FALSE 0.016 198.000 0.000 NA   NA
 371226 371227 TC0917 TC0918     TRUE 0.612 56.000 0.054 1.000   NA
 371227 371228 TC0918 TC0919     TRUE 0.924 12.000 0.250 1.000   NA
 371229 5441623 TC0920 tRNA-Pro-1     FALSE 0.031 97.000 0.000 NA   NA
 48700 48701 TCA03 TCA04     FALSE 0.017 1194.000 0.000 NA   NA
 48701 48702 TCA04 TCA05     TRUE 0.528 69.000 0.800 NA   NA
 48702 48703 TCA05 TCA06     TRUE 0.869 17.000 0.750 NA   NA
 48703 48704 TCA06 TCA07     TRUE 0.914 -3.000 0.750 NA   NA
 48704 48698 TCA07 TCA01     FALSE 0.016 237.000 0.000 NA   NA