MicrobesOnline Operon Predictions for Pirellula sp. 1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 554028 554029 RB8 RB13     FALSE 0.184 195.000 0.000 NA   NA
 554031 554032 RB16 RB17     FALSE 0.074 -312.000 0.000 NA   NA
 554032 554033 RB17 RB18     FALSE 0.074 -312.000 0.000 NA   NA
 554033 554034 RB18 RB19     FALSE 0.084 -130.000 0.000 NA   NA
 554034 554035 RB19 RB20     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554036 554037 RB24 RB27     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554040 554041 RB33 RB34     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 554041 554042 RB34 RB35     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554042 554043 RB35 RB36     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554043 554044 RB36 RB37     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554046 554047 RB39 RB40     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 554047 554048 RB40 RB41     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 554048 554049 RB41 RB43     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 554049 554050 RB43 RB44     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554050 554051 RB44 RB45     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554051 554052 RB45 RB46     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 554052 554053 RB46 RB50     FALSE 0.184 213.000 0.000 NA   NA
 554053 554054 RB50 RB52     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 554054 554055 RB52 RB54     FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554055 554056 RB54 RB56     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 554056 554057 RB56 RB59     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554058 554059 RB60 RB61     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554059 554060 RB61 RB62     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554060 554061 RB62 RB66     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 554061 554062 RB66 RB68     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 554062 554063 RB68 RB71     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554063 554064 RB71 RB72     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554064 554065 RB72 RB73     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554065 554066 RB73 RB76     FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 554066 554067 RB76 RB77     FALSE 0.072 -528.000 0.000 NA   NA
 554067 554068 RB77 RB80     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554068 554069 RB80 RB81     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 554069 554070 RB81 RB82     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554072 554073 RB85 RB87     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554073 554074 RB87 RB88   phoD FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554074 554075 RB88 RB89 phoD   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554076 554077 RB92 RB93 phoD   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554077 554078 RB93 RB95     FALSE 0.185 176.000 0.000 NA   NA
 554078 554079 RB95 RB98     FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 554079 554080 RB98 RB100     FALSE 0.188 155.000 0.000 NA   NA
 554080 554081 RB100 RB101     FALSE 0.188 154.000 0.000 NA   NA
 554081 554082 RB101 RB104     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 554083 554084 RB105 RB107     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554085 554086 RB110 RB112     FALSE 0.184 236.000 0.000 NA   NA
 554086 554087 RB112 RB115     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554087 554088 RB115 RB117     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554088 554089 RB117 RB118     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554089 554090 RB118 RB120     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 554090 554091 RB120 RB123     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554091 554092 RB123 RB125     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554092 554093 RB125 RB127     FALSE 0.096 -84.000 0.000 NA   NA
 554093 554094 RB127 RB128   gspE TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554094 554095 RB128 RB129 gspE   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554097 554098 RB132 RB133     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554098 554099 RB133 RB135     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554100 554101 RB136 RB138     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554101 554102 RB138 RB140     TRUE 0.730 62.000 0.000 1.000 Y NA
 554103 554104 RB142 RB144     TRUE 0.930 -54.000 0.500 NA   NA
 554104 554105 RB144 RB146     TRUE 0.461 4.000 0.000 NA N NA
 554105 554106 RB146 RB148   secA TRUE 0.839 -3.000 0.000 0.096 N NA
 554106 554107 RB148 RB149 secA   TRUE 0.791 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 554108 554109 RB150 RB152     FALSE 0.079 -157.000 0.000 NA   NA
 554109 554110 RB152 RB154     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 554110 554111 RB154 RB159     TRUE 0.750 -3.000 0.000 0.096   NA
 554115 554116 RBt02 RB164     FALSE 0.192 119.000 0.000 NA   NA
 554118 554119 RB166 RB168     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554119 554120 RB168 RB170     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554120 554121 RB170 RB171     TRUE 0.832 3.000 0.000 0.070 Y NA
 554121 554122 RB171 RB172     TRUE 0.845 -10.000 0.000 0.070 Y NA
 554122 554123 RB172 RB174     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554123 554124 RB174 RB175     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554125 554126 RB177 RB180     FALSE 0.187 162.000 0.000 NA   NA
 554126 554127 RB180 RB182     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554127 554128 RB182 RB183     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 554131 554132 RB188 RB191     TRUE 0.988 0.000 0.154 0.096 N NA
 554133 554134 RB192 RB193     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554134 554135 RB193 RB195   oprO TRUE 0.954 99.000 1.000 NA   NA
 554137 554138 RB198 RB200     TRUE 0.781 164.000 0.000 0.031 Y NA
 554138 554139 RB200 RB201     TRUE 0.400 237.000 0.000 NA N NA
 554139 554140 RB201 RB202     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554140 554141 RB202 RB203     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 554141 554142 RB203 RB206     FALSE 0.185 179.000 0.000 NA   NA
 554142 554143 RB206 RB207     FALSE 0.191 134.000 0.000 NA   NA
 554143 554144 RB207 RB210     TRUE 0.984 -3.000 0.724 NA   NA
 554145 554146 RB213 RB218     TRUE 0.956 119.000 0.600 NA   NA
 554146 554147 RB218 RB220     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554148 554149 RB222 RB223     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 554149 554150 RB223 RB226     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 554153 554154 RB233 RB236     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554154 554155 RB236 RB241     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 554155 554156 RB241 RB244     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 554156 554157 RB244 RB246     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554158 554159 RB248 RB249     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554161 554162 RB251 RB252 hisS   TRUE 0.942 115.000 0.019 NA   NA
 554164 554165 RB257 RB259     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 554166 554167 RB262 RB264   rpsU FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554167 554168 RB264 RBt03 rpsU   FALSE 0.188 152.000 0.000 NA   NA
 554169 554170 RB268 RB269     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 554170 554171 RB269 RB271     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554173 554174 RB273 RB275     FALSE 0.197 90.000 0.000 NA   NA
 554175 554176 RB276 RB278     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554176 554177 RB278 RB279     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 554178 554179 RB280 RB281   groS FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554179 554180 RB281 RB282 groS   FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 554180 554181 RB282 RB283     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 554181 554182 RB283 RB284   dgt FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 554182 554183 RB284 RB285 dgt   FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554183 554184 RB285 RB287     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 554185 554186 RB286 RB289     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 554186 554187 RB289 RB291     TRUE 0.984 1.000 0.143 1.000 N NA
 554187 554188 RB291 RB293   mobA TRUE 0.811 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 554188 554189 RB293 RB295 mobA moeA TRUE 0.746 11.000 0.000 0.002 Y NA
 554190 554191 RB296 RB297   amtB FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 554191 554192 RB297 RB298 amtB   FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554193 554194 RB299 RB301 htrA mutY TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 554194 554195 RB301 RB303 mutY   FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 554195 554196 RB303 RB304     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 554196 554197 RB304 RB306     FALSE 0.184 233.000 0.000 NA   NA
 554198 554199 RB307 RB309   chlI TRUE 0.575 120.000 0.000 1.000 N NA
 554199 554200 RB309 RB313 chlI   FALSE 0.184 223.000 0.000 NA   NA
 554201 554202 RB314 RB316 fabD fabG TRUE 0.984 134.000 0.006 0.004 Y NA
 554202 554203 RB316 RB318 fabG acpP TRUE 0.984 139.000 0.008 0.004 Y NA
 554203 554204 RB318 RB319 acpP   FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 554204 554205 RB319 RB320   fabF TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554205 554206 RB320 RB321 fabF   TRUE 0.449 -55.000 0.000 1.000 N NA
 554208 554209 RB324 RB327     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554211 554212 RB331 RB334     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554213 554214 RB335 RB336     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 554217 554218 RB341 RB342   fkpA FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 554219 554220 RB343 RB344     TRUE 0.404 177.000 0.000 1.000   NA
 554220 554221 RB344 RB347     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554221 554222 RB347 RB348     FALSE 0.212 -132.000 0.000 NA N NA
 554226 554227 RB357 RB360 ubiE   TRUE 0.984 -3.000 0.347 NA   NA
 554227 554228 RB360 RB362     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554230 554231 RB365 RB367     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 554234 554235 RB370 RB372 nrtC nrtB TRUE 0.981 84.000 0.767 NA Y NA
 554235 554236 RB372 RB373 nrtB nrtC TRUE 0.995 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 554236 554237 RB373 RB374 nrtC nrtD TRUE 0.988 94.000 0.250 0.022 Y NA
 554237 554238 RB374 RB375 nrtD   FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554238 554239 RB375 RB377     FALSE 0.102 -75.000 0.000 NA   NA
 554239 554240 RB377 RB378   narB TRUE 0.989 -3.000 0.054 0.083   NA
 554240 554241 RB378 RB379 narB nirA TRUE 0.986 -7.000 0.039 0.083 N NA
 554241 554242 RB379 RB380 nirA cysJ TRUE 0.989 78.000 0.640 0.014 Y NA
 554242 554243 RB380 RB381 cysJ   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554243 554244 RB381 RB382     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 554245 554246 RB383 RB384   kptA FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554246 554247 RB384 RB386 kptA   FALSE 0.277 36.000 0.000 1.000   NA
 554248 554249 RB388 RB390     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554249 554250 RB390 RB392     TRUE 0.563 0.000 0.000 1.000   NA
 554251 554252 RB393 RB394     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 554253 554254 RB395 RB398     TRUE 0.947 53.000 0.667 NA   NA
 554257 554258 RB404 RB406     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 554260 554261 RB410 RB412 trpD   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 554261 554262 RB412 RB413     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554263 554264 RB417 RB418 iunH   FALSE 0.329 -46.000 0.000 1.000   NA
 554264 554265 RB418 RB419     TRUE 0.404 173.000 0.000 1.000   NA
 554265 554266 RB419 RB422   suhB TRUE 0.531 -36.000 0.000 1.000 N NA
 554266 554267 RB422 RB423 suhB   FALSE 0.372 -60.000 0.000 0.058   NA
 554269 554270 RB426 RB430     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 554270 554271 RB430 RB431     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 554271 554272 RB431 RB434     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554272 554273 RB434 RBt04     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554273 554274 RBt04 RB437     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 554274 554275 RB437 RB439     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 554275 554276 RB439 RB442     FALSE 0.190 141.000 0.000 NA   NA
 554276 554277 RB442 RB443     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554277 554278 RB443 RB444     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554279 554280 RB445 RB446     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554280 554281 RB446 RB448     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 554281 554282 RB448 RB449     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554282 554283 RB449 RB450     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 554284 554285 RB451 RB452     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 554285 554286 RB452 RB453     TRUE 0.984 -3.000 0.636 NA   NA
 554286 554287 RB453 RB454     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 554287 554288 RB454 RB457     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554288 554289 RB457 RB459     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554289 554290 RB459 RB460     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554290 554291 RB460 RB461     FALSE 0.307 13.000 0.000 1.000   NA
 554291 554292 RB461 RB463     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554292 554293 RB463 RB464     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 554294 554295 RB466 RB468     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 554295 554296 RB468 RB469     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554296 554297 RB469 RB470     FALSE 0.261 31.000 0.000 1.000   NA
 554297 554298 RB470 RB471     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554299 554300 RB472 RB473     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554301 554302 RB475 RB479     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554302 554303 RB479 RB481     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 554304 554305 RB483 RB484     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 554305 554306 RB484 RB485     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 554306 554307 RB485 RB486     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 554307 554308 RB486 RB488     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 554308 554309 RB488 RB490     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554309 554310 RB490 RB492     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 554310 554311 RB492 RB497     FALSE 0.396 59.000 0.000 1.000   NA
 554311 554312 RB497 RB498     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554312 554313 RB498 RB500     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554313 554314 RB500 RB502     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554314 554315 RB502 RB505     FALSE 0.096 -84.000 0.000 NA   NA
 554315 554316 RB505 RB510     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554317 554318 RB512 RB514     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554318 554319 RB514 RB517     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 554325 554326 RB523 RB524     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 554326 554327 RB524 RB531     TRUE 0.402 213.000 0.000 1.000   NA
 554329 554330 RB534 RB535     FALSE 0.075 -225.000 0.000 NA   NA
 554330 554331 RB535 RB536   pdxJ TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554334 554335 RB539 RB541 cinA   FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 554335 554336 RB541 RB543     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 554336 554337 RB543 RB544     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 554337 554338 RB544 RB546     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554339 554340 RB548 RB549 glgB   FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554340 554341 RB549 RB550     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554342 554343 RB555 RB556     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 554343 554344 RB556 RB557     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 554345 554346 RB558 RB560     FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 554346 554347 RB560 RB562     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554347 554348 RB562 RB563     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 554348 554349 RB563 RB566     FALSE 0.183 257.000 0.000 NA   NA
 554349 554350 RB566 RB568     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554351 554352 RB569 RB573     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554352 554353 RB573 RB574     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 554354 554355 RB576 RB577     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 554355 554356 RB577 RB578     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554356 554357 RB578 RB580     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 554358 554359 RB583 RB588     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554359 554360 RB588 RB598     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554360 554361 RB598 RB601     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 554361 554362 RB601 RB605     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554362 554363 RB605 RB607     TRUE 0.758 56.000 0.000 0.093 Y NA
 554365 554366 RB612 RB614     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554366 554367 RB614 RB617     TRUE 0.494 322.000 0.000 0.080   NA
 554368 554369 RB621 RB624     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554369 554370 RB624 RB625     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 554371 554372 RB626 RB629     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554372 554373 RB629 RB631     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 554375 554376 RB637 RB638     FALSE 0.265 17.000 0.000 1.000   NA
 554376 554377 RB638 RB641     TRUE 0.411 140.000 0.000 1.000   NA
 554378 554379 RB645 RB651     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 554379 554380 RB651 RB655     FALSE 0.184 203.000 0.000 NA   NA
 554380 554381 RB655 RB658     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554383 554384 RB661 RB663     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554385 554386 RB666 RB668   pldB FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 554389 554390 RB674 RB675     TRUE 0.922 14.000 0.167 NA   NA
 554390 554391 RB675 RB678   rhaA TRUE 0.959 85.000 0.017 NA N NA
 554391 554392 RB678 RB679 rhaA   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554394 554395 RB681 RB683 fucA   TRUE 0.483 46.000 0.000 1.000 N NA
 554395 554396 RB683 RB684     TRUE 0.652 73.000 0.000 0.093 N NA
 554396 554397 RB684 RB686     TRUE 0.877 0.000 0.000 0.004 Y NA
 554397 554398 RB686 RB691     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554398 554399 RB691 RB693     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 554399 554400 RB693 RB695     FALSE 0.343 49.000 0.000 1.000   NA
 554400 554401 RB695 RB700   ramA TRUE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 554404 554405 RB704 RB706     TRUE 0.832 3.000 0.000 0.067 Y NA
 554406 554407 RB708 RB711     TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000 N NA
 554408 554409 RB713 RB714     FALSE 0.081 -139.000 0.000 NA   NA
 554409 554410 RB714 RB716     TRUE 0.891 -108.000 1.000 NA   NA
 554415 554416 RB724 RB728     TRUE 0.495 3.000 0.000 1.000   NA
 554418 554419 RB735 RB736     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 554421 554422 RB745 RB749     TRUE 0.403 180.000 0.000 1.000   NA
 554422 554423 RB749 RB751     FALSE 0.077 -187.000 0.000 NA   NA
 554424 554425 RB752 RB754     TRUE 0.954 165.000 0.500 NA   NA
 554426 554427 RB756 RB757     TRUE 0.749 -7.000 0.000 NA Y NA
 554427 554428 RB757 RB758     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554429 554430 RB760 RB763     TRUE 0.793 90.000 0.000 0.030 Y NA
 554430 554431 RB763 RB767     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554431 554432 RB767 RB772     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554432 554433 RB772 RB773     TRUE 0.560 -226.000 0.000 0.030 Y NA
 554433 554434 RB773 RB774     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554437 554438 RB778 RB779     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 554438 554439 RB779 RB782     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554439 554440 RB782 RB783     TRUE 0.924 13.000 0.107 NA   NA
 554442 554443 RB787 RB790     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554443 554444 RB790 RB791     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554445 554446 RB792 RB794     FALSE 0.183 241.000 0.000 NA   NA
 554446 554447 RB794 RB795     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 554448 554449 RB796 RBt05     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 554449 554450 RBt05 RBt06     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554450 554451 RBt06 RBt07     FALSE 0.183 420.000 0.000 NA   NA
 554451 554452 RBt07 RB800     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554452 554453 RB800 RBt08     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 554455 554456 RBt09 RBt10     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554456 554457 RBt10 RBt11     FALSE 0.192 121.000 0.000 NA   NA
 554457 554458 RBt11 RBt12     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554458 554459 RBt12 RBt13     FALSE 0.183 265.000 0.000 NA   NA
 554459 554460 RBt13 RB807     FALSE 0.183 306.000 0.000 NA   NA
 554460 554461 RB807 RB809     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 554461 554462 RB809 RB812     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554462 554463 RB812 RB813     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554464 554465 RB814 RB815     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.066 Y NA
 554467 554468 RB818 RB820     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554468 554469 RB820 RB821     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554470 554471 RB822 RB825     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 554472 554473 RB827 RB828     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 554473 554474 RB828 RB829     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 554475 554476 RB832 RB834     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554476 554477 RB834 RB835     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554477 554478 RB835 RB838     TRUE 0.616 -19.000 0.000 1.000 N NA
 554480 554481 RB841 RB842     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 554482 554483 RB844 RB850     TRUE 0.400 274.000 0.000 1.000   NA
 554486 554487 RB857 RB858     TRUE 0.984 -3.000 0.300 NA   NA
 554487 554488 RB858 RB861   tolQ TRUE 0.983 -3.000 0.125 NA   NA
 554491 554492 RB864 RB865     TRUE 0.954 133.000 0.286 NA   NA
 554494 554495 RB869 RB870     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 554497 554498 RB873 RB874     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 554499 554500 RB878 RB879 mtrA   FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554501 554502 RB880 RB883     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554502 554503 RB883 RBt14     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 554503 554504 RBt14 RB885     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554507 554508 RB895 RB896     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 554510 554511 RB898 RB900     TRUE 0.955 144.000 0.500 NA   NA
 554511 554512 RB900 RB905     TRUE 0.415 118.000 0.000 1.000   NA
 554512 554513 RB905 RB908     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 554513 554514 RB908 RB912     FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554515 554516 RB913 RB916     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 554516 554517 RB916 RB918     FALSE 0.184 235.000 0.000 NA   NA
 554519 554520 RB921 RB922     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554520 554521 RB922 RB923     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 554522 554523 RB924 RB925     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554523 554524 RB925 RB927     TRUE 0.517 102.000 0.000 0.065   NA
 554524 554525 RB927 RB930     FALSE 0.199 86.000 0.000 NA   NA
 554526 554527 RB931 RB932     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554528 554529 RB933 RB934     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554529 554530 RB934 RB936     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 554530 554531 RB936 RB938     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 554531 554532 RB938 RB940     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 554532 554533 RB940 RB941     FALSE 0.076 -205.000 0.000 NA   NA
 554533 554534 RB941 RB943     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554534 554535 RB943 RB945   lldP TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554537 554538 RB950 RB951     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 554542 554543 RB955 RB956     FALSE 0.072 -375.000 0.000 NA   NA
 554543 554544 RB956 RB957     TRUE 0.754 -3.000 0.000 0.065   NA
 554544 554545 RB957 RB962     TRUE 0.458 -37.000 0.000 0.065   NA
 554546 554547 RB963 RB964     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 554547 554548 RB964 RB965     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554549 554550 RB967 RB968     FALSE 0.076 -201.000 0.000 NA   NA
 554552 554553 RB971 RB973     TRUE 0.555 73.000 0.000 0.005   NA
 554554 554555 RB974 RB977   nagA FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 554555 554556 RB977 RB981 nagA   TRUE 0.996 -3.000 0.874 0.005 Y NA
 554556 554557 RB981 RB983     TRUE 0.403 185.000 0.000 1.000   NA
 554559 554560 RB990 RB993 tetA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554562 554563 RB997 RB1002 ogt   TRUE 0.401 61.000 0.000 1.000   NA
 554565 554566 RB1009 RB1010     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554566 554567 RB1010 RB1012     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 554570 554571 RB1021 RB1022     FALSE 0.379 55.000 0.000 NA N NA
 554571 554572 RB1022 RB1027     TRUE 0.561 264.000 0.000 1.000 N NA
 554573 554574 RB1029 RB1033     FALSE 0.184 193.000 0.000 NA   NA
 554574 554575 RB1033 RB1036     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554575 554576 RB1036 RB1039   serS FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 554578 554579 RB1043 RB1044     TRUE 0.956 70.000 0.769 NA   NA
 554579 554580 RB1044 RB1046   recG FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 554580 554581 RB1046 RB1047 recG   FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 554581 554582 RB1047 RB1048     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554582 554583 RB1048 RB1050     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 554583 554584 RB1050 RB1052     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 554585 554586 RB1056 RB1057     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554589 554590 RB1063 RB1065   glnB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554591 554592 RB1066 RB1072     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 554593 554594 RB1074 RB1077 rbsC   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554594 554595 RB1077 RB1079   adk FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 554595 554596 RB1079 RB1081 adk   TRUE 0.798 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 554603 554604 RB1097 RB1100   capC TRUE 0.984 -3.000 0.733 NA   NA
 554604 554605 RB1100 RB1103 capC capB TRUE 0.984 2.000 0.545 0.001   NA
 554606 554607 RB1104 RB1105     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554607 554608 RB1105 RB1106     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554609 554610 RB1107 RB1109     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 554612 554613 RB1118 RB1120     TRUE 0.419 101.000 0.000 1.000   NA
 554613 554614 RB1120 RB1122     FALSE 0.210 -135.000 0.000 NA N NA
 554614 554615 RB1122 RB1125     TRUE 0.654 80.000 0.000 NA Y NA
 554615 554616 RB1125 RB1129     FALSE 0.185 191.000 0.000 NA   NA
 554618 554619 RB1133 RB1134   ndhF FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554620 554621 RB1137 RB1138     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554622 554623 RB1140 RB1142     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 554628 554629 RB1147 RB1148   tadB TRUE 0.995 -3.000 0.238 1.000 Y NA
 554629 554630 RB1148 RB1149 tadB   TRUE 0.996 -3.000 0.190 0.013 Y NA
 554630 554631 RB1149 RB1153     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 554631 554632 RB1153 RB1154     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 554632 554633 RB1154 RB1155     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 554633 554634 RB1155 RB1156     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 554635 554636 RB1161 RB1164   exbD FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 554636 554637 RB1164 RB1165 exbD exbB TRUE 0.871 0.000 0.000 0.035 Y NA
 554637 554638 RB1165 RB1168 exbB   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554638 554639 RB1168 RB1170   degT FALSE 0.201 -168.000 0.000 1.000   NA
 554639 554640 RB1170 RB1172 degT   FALSE 0.183 264.000 0.000 NA   NA
 554642 554643 RB1175 RB1178     FALSE 0.184 223.000 0.000 NA   NA
 554644 554645 RB1179 RB1180     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 554645 554646 RB1180 RB1182     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 554646 554647 RB1182 RB1183     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 554648 554649 RB1184 RB1185     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554650 554651 RB1189 RB1190     TRUE 0.833 3.000 0.000 0.064 Y NA
 554652 554653 RB1191 RB1192     TRUE 0.924 15.000 0.667 NA   NA
 554653 554654 RB1192 RB1193     FALSE 0.192 67.000 0.000 NA   NA
 554654 554655 RB1193 RB1194     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 554656 554657 RB1196 RB1198     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 554657 554658 RB1198 RB1199     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 554658 554659 RB1199 RB1200     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 554662 554663 RB1203 RB1204     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 554663 554664 RB1204 RB1205     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 554668 554669 RB1212 RB1213 mgtE efp TRUE 0.591 79.000 0.000 1.000 N NA
 554670 554671 RB1214 RB1216 kamA   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554671 554672 RB1216 RB1220   galM FALSE 0.184 235.000 0.000 NA   NA
 554672 554673 RB1220 RB1222 galM   FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 554673 554674 RB1222 RB1223     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554674 554675 RB1223 RB1224     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 554676 554677 RB1225 RB1230 dpp4   FALSE 0.150 -42.000 0.000 NA   NA
 554677 554678 RB1230 RB1231   lpd FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 554680 554681 RB1233 RB1235 rpsD   TRUE 0.400 297.000 0.000 1.000   NA
 554681 554682 RB1235 RB1237     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 554682 554683 RB1237 RB1238     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 554683 554684 RB1238 RB1239     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 554684 554685 RB1239 RB1240     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 554685 554686 RB1240 RB1246     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554687 554688 RB1248 RB1250     FALSE 0.193 114.000 0.000 NA   NA
 554688 554689 RB1250 RB1252     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 554689 554690 RB1252 RB1254     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 554691 554692 RB1255 RB1256     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 554692 554693 RB1256 RB1257     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554693 554694 RB1257 RB1258     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554695 554696 RB1259 RB1260     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554699 554700 RB1266 RB1269     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554701 554702 RB1270 RB1272     FALSE 0.395 59.000 0.000 NA N NA
 554702 554703 RB1272 RB1274     TRUE 0.631 198.000 0.000 0.087 N NA
 554704 554705 RB1275 RB1276     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554706 554707 RB1277 RB1279     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 554707 554708 RB1279 RB1281     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 554708 554709 RB1281 RB1284     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 554711 554712 RB1288 RB1289     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 554712 554713 RB1289 RB1291     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554715 554716 RB1297 RB1299     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 554716 554717 RB1299 RB1300     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 554719 554720 RB1302 RB1304     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554720 554721 RB1304 RB1305     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 554721 554722 RB1305 RB1308     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554722 554723 RB1308 RB1310     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 554723 554724 RB1310 RB1311     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554724 554725 RB1311 RB1316     FALSE 0.185 178.000 0.000 NA   NA
 554725 554726 RB1316 RB1317   leuA FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 554726 554727 RB1317 RB1319 leuA valS TRUE 0.970 84.000 0.013 1.000 N NA
 554727 554728 RB1319 RB1321 valS   TRUE 0.578 108.000 0.000 1.000 N NA
 554728 554729 RB1321 RB1322     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554730 554731 RB1323 RB1324     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 554732 554733 RB1325 RB1326     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554734 554735 RB1329 RB1331     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 554736 554737 RB1334 RB1336     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554738 554739 RB1337 RB1339     FALSE 0.123 -57.000 0.000 NA   NA
 554739 554740 RB1339 RB1341     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554741 554742 RB1342 RB1344 fliP fliQ TRUE 0.986 7.000 0.036 0.013 Y NA
 554742 554743 RB1344 RB1345 fliQ fliR TRUE 0.991 3.000 0.167 0.085 Y NA
 554743 554744 RB1345 RB1347 fliR flhB TRUE 0.993 -7.000 0.300 0.085 Y NA
 554744 554745 RB1347 RB1348 flhB   FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 554745 554746 RB1348 RB1350     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 554746 554747 RB1350 RB1352     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 554749 554750 RB1355 RB1356 nagB nagA TRUE 0.995 -3.000 0.389 1.000 Y NA
 554751 554752 RB1357 RB1358   glgC TRUE 0.520 52.000 0.000 1.000 N NA
 554753 554754 RB1359 RB1361     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 554754 554755 RB1361 RB1362     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 554756 554757 RB1363 RB1364 ald   FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554763 554764 RB1384 RB1386     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 554764 554765 RB1386 RB1389     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 554765 554766 RB1389 RB1390     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 554766 554767 RB1390 RB1391     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554767 554768 RB1391 RB1392   rpoD FALSE 0.230 -97.000 0.000 1.000   NA
 554768 554769 RB1392 RB1394 rpoD   FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554774 554775 RB1405 RB1408 outD   FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 554777 554778 RB1412 RB1413     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 554780 554781 RB1417 RB1420     FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 554782 554783 RB1422 RB1427     FALSE 0.185 177.000 0.000 NA   NA
 554783 554784 RB1427 RB1428     TRUE 0.983 -3.000 0.189 NA   NA
 554784 554785 RB1428 RB1430     TRUE 0.984 -3.000 0.474 NA   NA
 554785 554786 RB1430 RB1431     TRUE 0.978 -66.000 0.162 0.002 Y NA
 554786 554787 RB1431 RB1432     TRUE 0.996 -3.000 0.426 0.002 Y NA
 554787 554788 RB1432 RB1433     TRUE 0.992 -3.000 0.093 NA Y NA
 554788 554789 RB1433 RB1434     TRUE 0.993 -3.000 0.360 NA Y NA
 554789 554790 RB1434 RB1436     TRUE 0.993 -3.000 0.253 NA Y NA
 554790 554791 RB1436 RB1439     TRUE 0.976 14.000 0.655 1.000 Y NA
 554791 554792 RB1439 RB1442     TRUE 0.996 -3.000 0.254 0.040 Y NA
 554794 554795 RB1444 RB1446     FALSE 0.356 -70.000 0.000 0.027   NA
 554798 554799 RB1453 RB1454   araC FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 554799 554800 RB1454 RB1456 araC   TRUE 0.576 118.000 0.000 1.000 N NA
 554800 554801 RB1456 RB1457     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 554802 554803 RB1458 RB1461     TRUE 0.421 91.000 0.000 1.000   NA
 554803 554804 RB1461 RB1462     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554805 554806 RB1463 RB1464     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 554806 554807 RB1464 RB1467     TRUE 0.584 72.000 0.000 1.000 N NA
 554807 554808 RB1467 RB1470     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554808 554809 RB1470 RB1472     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554811 554812 RB1475 RB1476 arsB   FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554812 554813 RB1476 RB1477   atsA FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 554813 554814 RB1477 RB1478 atsA   FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 554816 554817 RB1481 RB1483     TRUE 0.456 -19.000 0.000 1.000   NA
 554817 554818 RB1483 RB1485   polB TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 554818 554819 RB1485 RB1487 polB   FALSE 0.262 32.000 0.000 1.000   NA
 554819 554820 RB1487 RB1488   trxB TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 554822 554823 RB1492 RB1493     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 554824 554825 RB1495 RB1499   moxR TRUE 0.984 -3.000 0.409 NA   NA
 554826 554827 RB1501 RB1502     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 554827 554828 RB1502 RB1503     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 554831 554832 RB1509 RB1511     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554832 554833 RB1511 RB1513     FALSE 0.095 -88.000 0.000 NA   NA
 554835 554836 RB1516 RB1517   lolD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554836 554837 RB1517 RB1518 lolD   FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 554837 554838 RB1518 RB1519     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554839 554840 RB1520 RB1522   gspG FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 554840 554841 RB1522 RB1523 gspG   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554841 554842 RB1523 RB1526     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 554844 554845 RB1529 RB1531 slr0309   TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 554846 554847 RB1532 RB1533 pknA   FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 554852 554853 RB1545 RB1549 gspD   FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 554853 554854 RB1549 RB1550     FALSE 0.103 -73.000 0.000 NA   NA
 554859 554860 RB1559 RB1561 pgaM rpe TRUE 0.995 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 554862 554863 RB1565 RB1566   comQ FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 554864 554865 RB1571 RB1572 dnlI   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554866 554867 RB1573 RB1574   sgbU FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 554868 554869 RB1577 RB1578 helX glnS FALSE 0.301 40.000 0.000 1.000   NA
 554870 554871 RB1579 RB1581     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554872 554873 RB1584 RB1586 hisD fabF TRUE 0.589 76.000 0.000 1.000 N NA
 554873 554874 RB1586 RB1588 fabF   TRUE 0.985 165.000 0.278 1.000 Y NA
 554874 554875 RB1588 RB1591   crtI TRUE 0.985 112.000 0.286 1.000 Y NA
 554875 554876 RB1591 RB1593 crtI icd TRUE 0.566 163.000 0.000 1.000 N NA
 554881 554882 RB1601 RB1602     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 554882 554883 RB1602 RB1603     FALSE 0.074 -283.000 0.000 NA   NA
 554883 554884 RB1603 RB1604     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554884 554885 RB1604 RB1606     TRUE 0.656 -48.000 0.000 1.000 Y NA
 554885 554886 RB1606 RB1608     TRUE 0.430 37.000 0.000 1.000 N NA
 554887 554888 RB1609 RB1610   aslA FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 554889 554890 RB1611 RB1617     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 554892 554893 RB1621 RB1624     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 554894 554895 RB1628 RB1629   glcK FALSE 0.193 115.000 0.000 NA   NA
 554895 554896 RB1629 RB1630 glcK lepA TRUE 0.952 48.000 0.003 1.000 N NA
 554896 554897 RB1630 RB1632 lepA   FALSE 0.184 217.000 0.000 NA   NA
 554901 554902 RB1637 RB1638     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 554903 554904 RB1639 RB1641     FALSE 0.349 -114.000 0.000 1.000 N NA
 554904 554905 RB1641 RB1644     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554905 554906 RB1644 RB1646     FALSE 0.176 57.000 0.000 NA   NA
 554906 554907 RB1646 RB1648     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 554910 554911 RB1651 RB1653   prnC FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 554912 554913 RB1656 RB1661     TRUE 0.401 254.000 0.000 1.000   NA
 554914 554915 RB1677 RB1680   czcB TRUE 0.985 -31.000 0.500 1.000 Y NA
 554917 554918 RB1685 RB1688     FALSE 0.117 -60.000 0.000 NA   NA
 554919 554920 RB1691 RB1695     FALSE 0.089 -103.000 0.000 NA   NA
 554920 554921 RB1695 RB1696     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 554921 554922 RB1696 RB1699     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 554922 554923 RB1699 RB1703     FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 554923 554924 RB1703 RB1704     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554925 554926 RB1705 RB1706   dnaA FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 554926 554927 RB1706 RB1708 dnaA dnaB TRUE 0.794 104.000 0.000 0.016 Y NA
 554928 554929 RB1709 RB1711     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 554929 554930 RB1711 RB1713     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554932 554933 RB1716 RB1717     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 554933 554934 RB1717 RB1721     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 554939 554940 RB1731 RB1732     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 554940 554941 RB1732 RB1734     TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 554943 554944 RB1739 RB1742   pyrK TRUE 0.429 82.000 0.000 NA N NA
 554945 554946 RB1743 RB1746     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 554946 554947 RB1746 RB1748     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 554947 554948 RB1748 RB1749     FALSE 0.081 -144.000 0.000 NA   NA
 554952 554953 RB1756 RB1758     TRUE 0.531 -9.000 0.000 1.000   NA
 554953 554954 RB1758 RB1759     TRUE 0.495 3.000 0.000 1.000   NA
 554954 554955 RB1759 RB1760     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 554955 554956 RB1760 RB1764     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 554956 554957 RB1764 RB1766     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554957 554958 RB1766 RB1767     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 554958 554959 RB1767 RB1771     FALSE 0.184 214.000 0.000 NA   NA
 554959 554960 RB1771 RB1773     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 554960 554961 RB1773 RB1775     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 554966 554967 RB1784 RB1785 ugdH   FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554969 554970 RB1789 RB1790   sigW TRUE 0.966 1.000 0.045 NA   NA
 554970 554971 RB1790 RB1792 sigW   FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 554971 554972 RB1792 RB1793     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 554972 554973 RB1793 RB1796     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 554973 554974 RB1796 RB1798   moxR FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 554974 554975 RB1798 RB1800 moxR   TRUE 0.971 -10.000 0.571 NA   NA
 554975 554976 RB1800 RB1802     TRUE 0.954 179.000 0.571 NA   NA
 554976 554977 RB1802 RB1805     TRUE 0.984 -3.000 0.571 NA   NA
 554978 554979 RB1809 RB1814     FALSE 0.192 126.000 0.000 NA   NA
 554980 554981 RB1819 RB1821 galE pknB TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 554983 554984 RB1827 RB1828     TRUE 0.916 32.000 0.500 NA   NA
 554986 554987 RB1831 RB1832 NqrA nqrB TRUE 0.988 6.000 0.088 0.002 Y NA
 554987 554988 RB1832 RB1833 nqrB nqrC TRUE 0.849 -13.000 0.000 0.002 Y NA
 554988 554989 RB1833 RB1835 nqrC nqrD TRUE 0.990 4.000 0.188 0.002 Y NA
 554989 554990 RB1835 RB1836 nqrD nqrE TRUE 0.991 4.000 0.240 0.002 Y NA
 554990 554991 RB1836 RB1837 nqrE nqrF TRUE 0.988 136.000 0.100 0.002 Y NA
 554991 554992 RB1837 RB1838 nqrF   FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 554992 554993 RB1838 RB1839   apbE FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 554995 554996 RB1843 RB1845     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 554996 554997 RB1845 RB1849     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 554999 555000 RB1856 RB1858     FALSE 0.258 26.000 0.000 1.000   NA
 555000 555001 RB1858 RB1859     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 555001 555002 RB1859 RB1860     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555002 555003 RB1860 RB1862   gntR FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 555003 555004 RB1862 RB1866 gntR   TRUE 0.973 87.000 0.054 1.000 N NA
 555004 555005 RB1866 RB1868     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555005 555006 RB1868 RB1870     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555006 555007 RB1870 RB1872     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555008 555009 RB1874 RB1877     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555009 555010 RB1877 RB1878     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 555012 555013 RB1880 RB1883   gspA FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 555014 555015 RB1885 RB1887     FALSE 0.357 16.000 0.000 0.083   NA
 555015 555016 RB1887 RB1889     TRUE 0.401 236.000 0.000 1.000   NA
 555018 555019 RB1892 RB1893     TRUE 0.550 77.000 0.000 0.015   NA
 555023 555024 RB1898 RB1900 aroB   TRUE 0.579 105.000 0.000 1.000 N NA
 555024 555025 RB1900 RB1901     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555025 555026 RB1901 RB1902   nirB FALSE 0.086 -114.000 0.000 NA   NA
 555026 555027 RB1902 RB1903 nirB   TRUE 0.955 -55.000 0.300 0.072   NA
 555027 555028 RB1903 RB1908     TRUE 0.956 114.000 0.417 NA   NA
 555028 555029 RB1908 RB1909     TRUE 0.914 34.000 0.250 NA   NA
 555030 555031 RB1910 RB1912     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555031 555032 RB1912 RB1917     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555032 555033 RB1917 RB1920     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 555033 555034 RB1920 RB1922     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 555035 555036 RB1923 RB1924     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 555036 555037 RB1924 RB1930     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555039 555040 RB1932 RB1934     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 555040 555041 RB1934 RB1935     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 555041 555042 RB1935 RB1936     FALSE 0.090 -100.000 0.000 NA   NA
 555042 555043 RB1936 RB1937     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555046 555047 RB1946 RB1950     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555047 555048 RB1950 RB1954     TRUE 0.945 53.000 0.286 NA   NA
 555048 555049 RB1954 RB1958     FALSE 0.186 173.000 0.000 NA   NA
 555050 555051 RB1961 RBt17     FALSE 0.184 230.000 0.000 NA   NA
 555051 555052 RBt17 RB1964   rpoA FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 555052 555053 RB1964 RB1970 rpoA tgt TRUE 0.954 6.000 0.004 1.000   NA
 555054 555055 RB1972 RB1974     TRUE 0.984 -3.000 0.600 NA   NA
 555056 555057 RB1977 RB1979     FALSE 0.184 209.000 0.000 NA   NA
 555059 555060 RB1988 RB1991 gdhP   FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555060 555061 RB1991 RB1992     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555065 555066 RB1998 RB1999 ppdK   FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555066 555067 RB1999 RB2000     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555067 555068 RB2000 RB2001     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555068 555069 RB2001 RB2002     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555069 555070 RB2002 RB2003     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555070 555071 RB2003 RB2006     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555072 555073 RB2007 RB2008     FALSE 0.195 105.000 0.000 NA   NA
 555074 555075 RB2010 RB2011     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555077 555078 RB2013 RB2015 secA   FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555078 555079 RB2015 RB2016     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 555081 555082 RB2019 RB2020     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 555082 555083 RB2020 RB2021     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555084 555085 RB2022 RB2024   rpsA TRUE 0.414 126.000 0.000 1.000   NA
 555085 555086 RB2024 RB2027 rpsA   FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 555091 555092 RB2043 RB2044     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 555094 555095 RB2046 RB2050     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 555095 555096 RB2050 RB2051     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555098 555099 RB2053 RB2055     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 555099 555100 RB2055 RB2056     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555102 555103 RB2062 RB2066 degP   TRUE 0.976 -16.000 0.048 0.013   NA
 555103 555104 RB2066 RB2068     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555104 555105 RB2068 RB2071     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 555107 555108 RB2075 RB2077     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 555109 555110 RB2078 RB2080     FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 555112 555113 RB2082 RB2084 pltG   FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 555114 555115 RB2085 RB2086 betC   TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 555115 555116 RB2086 RB2088     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 555116 555117 RB2088 RB2090     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555118 555119 RB2091 RB2092     FALSE 0.324 12.000 0.000 1.000   NA
 555119 555120 RB2092 RB2096     FALSE 0.184 219.000 0.000 NA   NA
 555125 555126 RB2102 RB2103     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 555128 555129 RB2107 RB2110     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555129 555130 RB2110 RB2114   citB TRUE 0.585 87.000 0.000 1.000 N NA
 555130 555131 RB2114 RB2115 citB speE FALSE 0.260 18.000 0.000 1.000   NA
 555131 555132 RB2115 RB2116 speE   FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 555133 555134 RB2117 RB2118   gcpE TRUE 0.404 175.000 0.000 1.000   NA
 555136 555137 RB2121 RB2123     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555137 555138 RB2123 RB2125     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555139 555140 RBt18 RBt19     FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 555141 555142 RB2132 RB2135     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555143 555144 RB2136 RB2140     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555145 555146 RB2141 RB2142 rluA   TRUE 0.547 -33.000 0.000 1.000 N NA
 555146 555147 RB2142 RB2143   dxs TRUE 0.952 -45.000 0.004 1.000 N NA
 555147 555148 RB2143 RB2144 dxs ggpP TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 555148 555149 RB2144 RB2146 ggpP xseB TRUE 0.988 -3.000 0.005 1.000 N NA
 555149 555150 RB2146 RB2147 xseB   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555152 555153 RB2150 RB2152     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 555153 555154 RB2152 RB2154     TRUE 0.418 107.000 0.000 1.000   NA
 555154 555155 RB2154 RB2155     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555155 555156 RB2155 RB2156     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555156 555157 RB2156 RB2158     FALSE 0.110 -66.000 0.000 NA   NA
 555158 555159 RB2160 RB2162   pknH TRUE 0.528 53.000 0.000 1.000 N NA
 555160 555161 RB2163 RB2166     FALSE 0.184 221.000 0.000 NA   NA
 555162 555163 RB2168 RB2170     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555165 555166 RB2174 RB2175     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555166 555167 RB2175 RB2176     FALSE 0.079 -159.000 0.000 NA   NA
 555167 555168 RB2176 RB2178     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555168 555169 RB2178 RB2179     FALSE 0.183 303.000 0.000 NA   NA
 555169 555170 RB2179 RB2181     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555171 555172 RB2182 RB2185     FALSE 0.191 66.000 0.000 NA   NA
 555172 555173 RB2185 RB2186   InsA FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555174 555175 RB2187 RB2188     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 555175 555176 RB2188 RB2190     FALSE 0.185 177.000 0.000 NA   NA
 555176 555177 RB2190 RB2191     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 555177 555178 RB2191 RB2193     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555182 555183 RB2201 RB2202     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555184 555185 RB2203 RB2204     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555185 555186 RB2204 RB2205     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 555186 555187 RB2205 RB2206     FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 555187 555188 RB2206 RB2209     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555189 555190 RB2211 RB2212     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555196 555197 RB2226 RB2231     TRUE 0.913 29.000 0.300 NA   NA
 555197 555198 RB2231 RB2234     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555198 555199 RB2234 RB2235     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 555202 555203 RB2239 RB2242     FALSE 0.351 -69.000 0.000 0.049   NA
 555205 555206 RB2247 RB2251     FALSE 0.183 249.000 0.000 NA   NA
 555206 555207 RB2251 RB2252     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 555209 555210 RB2254 RB2255     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 555210 555211 RB2255 RB2258     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 555213 555214 RB2260 RB2261     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 555214 555215 RB2261 RB2262     FALSE 0.092 -96.000 0.000 NA   NA
 555216 555217 RB2263 RB2264     FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 555217 555218 RB2264 RB2265     FALSE 0.376 -85.000 0.000 1.000 N NA
 555219 555220 RB2268 RB2269 msrB   FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 555220 555221 RB2269 RB2272     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555221 555222 RB2272 RB2274     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 555222 555223 RB2274 RB2277     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555224 555225 RB2278 RB2279     FALSE 0.275 16.000 0.000 1.000   NA
 555227 555228 RB2281 RB2282     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555232 555233 RB2288 RB2290     FALSE 0.144 47.000 0.000 NA   NA
 555233 555234 RB2290 RB2291   parA FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 555234 555235 RB2291 RB2296 parA parB TRUE 0.986 -7.000 0.827 1.000 N NA
 555236 555237 RB2297 RB2298     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 555238 555239 RB2299 RB2302     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555239 555240 RB2302 RB2303   rpsH FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555240 555241 RB2303 RB2304 rpsH   TRUE 0.983 -3.000 0.174 NA   NA
 555241 555242 RB2304 RB2306     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555242 555243 RB2306 RB2308     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555243 555244 RB2308 RBt20     FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 555245 555246 RB2310 RB2312     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555248 555249 RB2316 RB2317     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 555251 555252 RB2320 RB2321     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555252 555253 RB2321 RB2326     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555255 555256 RB2328 RB2329     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555256 555257 RB2329 RB2330     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 555257 555258 RB2330 RB2331     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 555258 555259 RB2331 RB2334     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555261 555262 RB2336 RB2337     FALSE 0.185 184.000 0.000 NA   NA
 555264 555265 RB2339 RB2340     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 555265 555266 RB2340 RB2341     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555270 555271 RB2345 RB2346     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 555271 555272 RB2346 RB2349     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555273 555274 RB2350 RB2351     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555275 555276 RB2353 RB2355     FALSE 0.193 112.000 0.000 NA   NA
 555276 555277 RB2355 RB2357     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555279 555280 RB2359 RB2360     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555283 555284 RB2364 RB2365     TRUE 0.412 -28.000 0.000 1.000   NA
 555285 555286 RB2367 RB2369     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555286 555287 RB2369 RB2370     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 555287 555288 RB2370 RB2371     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555291 555292 RB2374 RB2375     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 555292 555293 RB2375 RB2377   atsA FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555293 555294 RB2377 RB2378 atsA   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555295 555296 RB2379 RB2381   ibeB FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 555298 555299 RB2383 RB2384 mexB   FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555299 555300 RB2384 RB2386   mexA FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555300 555301 RB2386 RB2391 mexA   FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555301 555302 RB2391 RB2394     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555303 555304 RB2395 RB2396   atoC FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 555309 555310 RB2403 RB2404 uxuB   TRUE 0.936 19.000 0.615 NA N NA
 555311 555312 RB2408 RB2412     FALSE 0.183 329.000 0.000 NA   NA
 555312 555313 RB2412 RB2414     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555313 555314 RB2414 RB2415     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 555315 555316 RB2416 RB2418     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 555317 555318 RB2420 RB2424     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555318 555319 RB2424 RB2425     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555320 555321 RB2426 RB2428     TRUE 0.953 114.000 1.000 NA   NA
 555321 555322 RB2428 RB2429   dnaK TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 555322 555323 RB2429 RB2431 dnaK   FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555325 555326 RB2434 RB2435     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555326 555327 RB2435 RB2436     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555327 555328 RB2436 RB2440     FALSE 0.184 240.000 0.000 NA   NA
 555328 555329 RB2440 RB2442     TRUE 0.401 253.000 0.000 1.000   NA
 555329 555330 RB2442 RB2447     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555331 555332 RB2448 RB2451     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 555332 555333 RB2451 RB2454     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555333 555334 RB2454 RB2456     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555334 555335 RB2456 RB2457     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555336 555337 RB2459 RB2460     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555337 555338 RB2460 RB2461     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555339 555340 RB2462 RB2463     FALSE 0.187 158.000 0.000 NA   NA
 555345 555346 RB2469 RB2470     TRUE 0.951 -21.000 0.033 NA   NA
 555346 555347 RB2470 RB2471     TRUE 0.958 217.000 0.033 1.000   NA
 555347 555348 RB2471 RB2472     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 555348 555349 RB2472 RB2473     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555349 555350 RB2473 RB2474     FALSE 0.364 32.000 0.000 0.016   NA
 555354 555355 RB2479 RB2480     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555355 555356 RB2480 RB2482     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555356 555357 RB2482 RB2484     TRUE 0.769 -3.000 0.000 0.016   NA
 555357 555358 RB2484 RB2485     TRUE 0.659 -7.000 0.000 0.016   NA
 555358 555359 RB2485 RB2487     TRUE 0.509 -12.000 0.000 1.000   NA
 555359 555360 RB2487 RB2489     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 555360 555361 RB2489 RB2490     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 555361 555362 RB2490 RB2491     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555365 555366 RB2494 RB2495     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555369 555370 RB2498 RB2499     FALSE 0.394 8.000 0.000 1.000   NA
 555370 555371 RB2499 RB2500     TRUE 0.971 16.000 0.130 1.000 Y NA
 555371 555372 RB2500 RB2501     FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 555372 555373 RB2501 RB2502     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555373 555374 RB2502 RB2503     TRUE 0.499 -13.000 0.000 1.000   NA
 555375 555376 RB2505 RB2506     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555378 555379 RB2508 RB2509     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555379 555380 RB2509 RB2510     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555380 555381 RB2510 RB2511     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 555384 555385 RB2514 RB2515     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555386 555387 RB2516 RB2517     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555389 555390 RB2519 RB2520     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555394 555395 RB2529 RB2530     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555395 555396 RB2530 RB2532   nagB FALSE 0.254 23.000 0.000 1.000   NA
 555396 555397 RB2532 RB2533 nagB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555397 555398 RB2533 RB2534     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 555400 555401 RB2537 RB2543     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555403 555404 RB2547 RB2549   phyB TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 555404 555405 RB2549 RB2550 phyB   TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 555405 555406 RB2550 RB2551     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555406 555407 RB2551 RB2552   argC FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555407 555408 RB2552 RB2553 argC   FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 555410 555411 RB2557 RB2558     FALSE 0.340 24.000 0.000 0.056   NA
 555411 555412 RB2558 RB2559     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.056   NA
 555412 555413 RB2559 RB2560     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555414 555415 RB2562 RB2566   ldh TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555415 555416 RB2566 RB2568 ldh   TRUE 0.977 129.000 0.545 1.000 N NA
 555416 555417 RB2568 RB2571     TRUE 0.969 87.000 0.636 NA N NA
 555417 555418 RB2571 RB2574     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555418 555419 RB2574 RB2577     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 555419 555420 RB2577 RB2579   eutE TRUE 0.986 3.000 0.545 NA Y NA
 555420 555421 RB2579 RB2581 eutE eutN TRUE 0.977 54.000 0.500 NA Y NA
 555421 555422 RB2581 RB2582 eutN ackA TRUE 0.983 -19.000 0.500 NA Y NA
 555422 555423 RB2582 RB2585 ackA   TRUE 0.956 85.000 0.238 NA   NA
 555423 555424 RB2585 RB2586   eutM TRUE 0.955 71.000 0.238 NA   NA
 555424 555425 RB2586 RB2587 eutM   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555425 555426 RB2587 RB2588     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555426 555427 RB2588 RB2590     TRUE 0.988 -3.000 0.182 NA N NA
 555427 555428 RB2590 RB2591     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555428 555429 RB2591 RB2592     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555430 555431 RB2593 RB2596     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 555431 555432 RB2596 RB2602     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555433 555434 RB2603 RB2604     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555434 555435 RB2604 RB2605     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 555437 555438 RB2613 RB2618     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 555439 555440 RB2619 RB2620     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555440 555441 RB2620 RB2621     FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 555447 555448 RB2630 RB2632     TRUE 0.911 17.000 0.004 1.000   NA
 555449 555450 RB2634 RB2636     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555451 555452 RB2637 RB2638 rnhA glgB TRUE 0.949 61.000 0.003 1.000   NA
 555453 555454 RB2640 RB2642     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555458 555459 RB2651 RB2654     FALSE 0.355 -39.000 0.000 1.000   NA
 555459 555460 RB2654 RB2656     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 555460 555461 RB2656 RB2658   xylA FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 555464 555465 RB2661 RB2662 murB   TRUE 0.916 11.000 0.007 NA   NA
 555465 555466 RB2662 RB2663     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555466 555467 RB2663 RB2665     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 555468 555469 RB2667 RB2669     FALSE 0.077 -177.000 0.000 NA   NA
 555469 555470 RB2669 RB2671     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 555470 555471 RB2671 RB2673     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 555471 555472 RB2673 RB2675     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555472 555473 RB2675 RB2676   truA TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555475 555476 RB2680 RB2682     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 555479 555480 RB2686 RB2688     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555480 555481 RB2688 RB2690     TRUE 0.973 -7.000 0.400 NA   NA
 555481 555482 RB2690 RB2693     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555482 555483 RB2693 RB2697     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555484 555485 RB2700 RB2701     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555486 555487 RB2702 RB2704     FALSE 0.193 117.000 0.000 NA   NA
 555487 555488 RB2704 RB2705     FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 555488 555489 RB2705 RB2706     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555494 555495 RB2714 RB2717     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 555495 555496 RB2717 RB2718   dldH TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555498 555499 RB2720 RB2724     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555499 555500 RB2724 RB2725   lpxB FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 555501 555502 RB2726 RB2728     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 555502 555503 RB2728 RB2731     TRUE 0.962 -136.000 0.294 1.000 Y NA
 555503 555504 RB2731 RB2732     TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 555505 555506 RB2735 RB2737 g6pD   FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 555506 555507 RB2737 RB2739     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555507 555508 RB2739 RB2740     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555508 555509 RB2740 RB2741     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555510 555511 RB2743 RB2744     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555511 555512 RB2744 RB2745     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555512 555513 RB2745 RB2746   dapA FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555513 555514 RB2746 RB2747 dapA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555515 555516 RB2748 RB2749   ubiA TRUE 0.982 62.000 0.062 1.000 Y NA
 555516 555517 RB2749 RB2750 ubiA ubiX TRUE 0.972 14.000 0.091 1.000 Y NA
 555517 555518 RB2750 RB2752 ubiX ubiE TRUE 0.993 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 555519 555520 RB2754 RB2761     TRUE 0.400 265.000 0.000 1.000   NA
 555521 555522 RB2763 RB2764     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555522 555523 RB2764 RB2771     TRUE 0.412 134.000 0.000 1.000   NA
 555524 555525 RB2774 RB2780   greA TRUE 0.500 272.000 0.000 0.058   NA
 555525 555526 RB2780 RB2781 greA   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555526 555527 RB2781 RB2782     FALSE 0.114 36.000 0.000 NA   NA
 555528 555529 RB2784 RB2785     TRUE 0.983 -3.000 0.143 NA   NA
 555529 555530 RB2785 RB2788     TRUE 0.426 74.000 0.000 NA N NA
 555533 555534 RB2795 RB2797     FALSE 0.083 -133.000 0.000 NA   NA
 555539 555540 RB2807 RB2809     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 555540 555541 RB2809 RB2810     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555543 555544 RB2817 RB2818 6pgD   FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 555545 555546 RB2819 RB2822     FALSE 0.200 74.000 0.000 NA   NA
 555546 555547 RB2822 RB2825   ugpQ FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555549 555550 RB2828 RB2829     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555550 555551 RB2829 RB2830     FALSE 0.189 64.000 0.000 NA   NA
 555553 555554 RB2833 RB2837     FALSE 0.396 59.000 0.000 1.000   NA
 555554 555555 RB2837 RB2838     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555555 555556 RB2838 RB2839     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555556 555557 RB2839 RB2840     TRUE 0.403 181.000 0.000 1.000   NA
 555557 555558 RB2840 RB2842     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555558 555559 RB2842 RB2845     FALSE 0.115 -61.000 0.000 NA   NA
 555559 555560 RB2845 RB2848     TRUE 0.952 63.000 1.000 NA   NA
 555561 555562 RB2849 RB2850     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555566 555567 RB2855 RB2856     TRUE 0.439 -22.000 0.000 1.000   NA
 555570 555571 RB2864 RB2867     TRUE 0.954 62.000 0.500 NA   NA
 555571 555572 RB2867 RB2871     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555573 555574 RB2872 RB2874     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555575 555576 RB2875 RB2877     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555576 555577 RB2877 RB2878     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555579 555580 RB2883 RB2884   galE FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 555580 555581 RB2884 RB2885 galE   TRUE 0.951 -27.000 0.094 NA   NA
 555581 555582 RB2885 RB2886     TRUE 0.974 0.000 1.000 NA   NA
 555582 555583 RB2886 RB2889     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 555584 555585 RB2893 RB2894     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555585 555586 RB2894 RB2895     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.021 Y NA
 555587 555588 RB2897 RB2900     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555588 555589 RB2900 RB2901     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555589 555590 RB2901 RB2905     FALSE 0.183 340.000 0.000 NA   NA
 555590 555591 RB2905 RB2907     TRUE 0.911 44.000 0.009 NA   NA
 555591 555592 RB2907 RB2908     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555592 555593 RB2908 RB2910     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 555595 555596 RB2914 RB2917     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555598 555599 RB2922 RB2923     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555600 555601 RB2924 RB2926     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 555603 555604 RB2928 RB2929     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 555604 555605 RB2929 RB2930     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 555605 555606 RB2930 RB2931     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 555606 555607 RB2931 RB2932     FALSE 0.133 -51.000 0.000 NA   NA
 555607 555608 RB2932 RB2934     FALSE 0.182 516.000 0.000 NA   NA
 555608 555609 RB2934 RB2936     FALSE 0.191 133.000 0.000 NA   NA
 555609 555610 RB2936 RB2939     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 555613 555614 RB2943 RB2945     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555614 555615 RB2945 RB2946     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 555616 555617 RB2948 RB2949     FALSE 0.194 111.000 0.000 NA   NA
 555617 555618 RB2949 RB2950     FALSE 0.147 -43.000 0.000 NA   NA
 555618 555619 RB2950 RB2951     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555622 555623 RB2955 RB2956     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 555625 555626 RB2958 RB2960     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555628 555629 RB2963 RB2966     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555629 555630 RB2966 RB2968     TRUE 0.960 4.000 0.003 1.000   NA
 555630 555631 RB2968 RB2970     TRUE 0.405 170.000 0.000 1.000   NA
 555631 555632 RB2970 RB2971     FALSE 0.282 -60.000 0.000 NA N NA
 555632 555633 RB2971 RB2973     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 555634 555635 RB2974 RB2975 glnD glnB TRUE 0.524 10.000 0.000 1.000 N NA
 555635 555636 RB2975 RB2976 glnB   FALSE 0.267 34.000 0.000 1.000   NA
 555637 555638 RB2978 RB2979     FALSE 0.362 52.000 0.000 1.000   NA
 555641 555642 RB2983 RB2985     TRUE 0.561 263.000 0.000 1.000 N NA
 555642 555643 RB2985 RB2986     FALSE 0.394 23.000 0.000 1.000 N NA
 555643 555644 RB2986 RB2988     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA Y NA
 555644 555645 RB2988 RB2990     TRUE 0.965 7.000 0.163 NA N NA
 555645 555646 RB2990 RB2991     TRUE 0.461 4.000 0.000 NA N NA
 555646 555647 RB2991 RB2992     TRUE 0.417 -108.000 0.000 NA Y NA
 555647 555648 RB2992 RB2993     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555648 555649 RB2993 RB2995     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555649 555650 RB2995 RB2997     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555650 555651 RB2997 RB2998     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 555651 555652 RB2998 RB3001     TRUE 0.401 239.000 0.000 1.000   NA
 555654 555655 RB3005 RB3006     FALSE 0.192 120.000 0.000 NA   NA
 555656 555657 RB3009 RB3010   perA FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555660 555661 RB3014 RB3016     FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 555661 555662 RB3016 RB3020     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 555662 555663 RB3020 RB3023     FALSE 0.185 180.000 0.000 NA   NA
 555663 555664 RB3023 RB3029     FALSE 0.186 171.000 0.000 NA   NA
 555664 555665 RB3029 RB3031     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 555667 555668 RB3034 RB3036     TRUE 0.967 3.000 0.800 NA   NA
 555670 555671 RB3040 RB3042     FALSE 0.184 230.000 0.000 NA   NA
 555672 555673 RB3043 RB3044     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 555674 555675 RB3045 RB3047     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555677 555678 RB3050 RB3052     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555678 555679 RB3052 RB3053     FALSE 0.193 118.000 0.000 NA   NA
 555679 555680 RB3053 RB3055     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 555680 555681 RB3055 RB3056     FALSE 0.195 93.000 0.000 NA   NA
 555682 555683 RB3057 RB3059     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555684 555685 RB3060 RB3061     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555685 555686 RB3061 RB3062     FALSE 0.080 -150.000 0.000 NA   NA
 555688 555689 RB3064 RB3065     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555689 555690 RB3065 RB3067     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555691 555692 RB3068 RB3069     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 555693 555694 RB3070 RB3073     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 555694 555695 RB3073 RB3074     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 555695 555696 RB3074 RB3075     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 555696 555697 RB3075 RB3077     TRUE 0.531 61.000 0.000 0.006   NA
 555697 555698 RB3077 RB3097     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 555700 555701 RB3103 RB3107 dnaE   FALSE 0.186 170.000 0.000 NA   NA
 555702 555703 RB3109 RB3112 mauG   FALSE 0.186 169.000 0.000 NA   NA
 555704 555705 RB3114 RB3116     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 555705 555706 RB3116 RB3117     FALSE 0.112 35.000 0.000 NA   NA
 555706 555707 RB3117 RB3118     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555707 555708 RB3118 RB3119     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 555708 555709 RB3119 RB3123     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555709 555710 RB3123 RB3125     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 555712 555713 RB3128 RB3131     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555713 555714 RB3131 RB3132     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555719 555720 RB3142 RB3144     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 555720 555721 RB3144 RB3145     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.053   NA
 555721 555722 RB3145 RB3146     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555723 555724 RB3147 RB3148     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 555724 555725 RB3148 RB3149     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 555725 555726 RB3149 RB3151     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 555726 555727 RB3151 RB3152     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555727 555728 RB3152 RB3153     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555728 555729 RB3153 RB3154     FALSE 0.122 14.000 0.000 NA   NA
 555729 555730 RB3154 RB3155     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555731 555732 RB3157 RB3158     FALSE 0.227 -18.000 0.000 NA   NA
 555733 555734 RB3159 RB3160     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 555734 555735 RB3160 RB3164     FALSE 0.183 298.000 0.000 NA   NA
 555737 555738 RB3172 RB3174     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555738 555739 RB3174 RBt21     FALSE 0.102 21.000 0.000 NA   NA
 555739 555740 RBt21 RB3176     FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 555740 555741 RB3176 RB3177     FALSE 0.399 26.000 0.000 1.000 N NA
 555741 555742 RB3177 RB3179     FALSE 0.220 -109.000 0.000 1.000   NA
 555742 555743 RB3179 RB3185     TRUE 0.417 112.000 0.000 1.000   NA
 555745 555746 RB3190 RB3192     FALSE 0.106 18.000 0.000 NA   NA
 555748 555749 RB3194 RB3195   ctpA FALSE 0.185 181.000 0.000 NA   NA
 555751 555752 RB3197 RB3200     FALSE 0.133 42.000 0.000 NA   NA
 555752 555753 RB3200 RB3201     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 555753 555754 RB3201 RB3202     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 555758 555759 RB3208 RB3210     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 555759 555760 RB3210 RB3212     FALSE 0.078 -174.000 0.000 NA   NA
 555760 555761 RB3212 RB3213     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 555761 555762 RB3213 RB3217   speD TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555762 555763 RB3217 RB3221 speD   FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555766 555767 RB3228 RB3232     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 555768 555769 RB3233 RB3234     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555769 555770 RB3234 RB3236     FALSE 0.379 -82.000 0.000 1.000 N NA
 555770 555771 RB3236 RB3237     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555771 555772 RB3237 RB3239     TRUE 0.634 64.000 0.000 NA Y NA
 555774 555775 RB3242 RB3244     FALSE 0.089 -102.000 0.000 NA   NA
 555778 555779 RB3248 RB3251     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555780 555781 RB3252 RB3253     TRUE 0.974 0.000 0.833 NA   NA
 555782 555783 RB3255 RB3256 argJ   FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 555783 555784 RB3256 RB3257     FALSE 0.187 163.000 0.000 NA   NA
 555787 555788 RB3260 RB3261     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 555790 555791 RB3265 RB3266 gfo rluD TRUE 0.407 154.000 0.000 1.000   NA
 555791 555792 RB3266 RB3267 rluD   TRUE 0.425 86.000 0.000 1.000   NA
 555792 555793 RB3267 RB3268     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 555794 555795 RB3271 RB3272 pknB gyrB TRUE 0.750 -3.000 0.000 0.096   NA
 555798 555799 RB3277 RB3280     FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 555799 555800 RB3280 RB3281   hup TRUE 0.967 -9.000 0.061 NA   NA
 555800 555801 RB3281 RB3283 hup   FALSE 0.189 143.000 0.000 NA   NA
 555804 555805 RB3287 RB3291 cysA   FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 555805 555806 RB3291 RB3292   bioA FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555807 555808 RB3293 RB3295     FALSE 0.184 197.000 0.000 NA   NA
 555808 555809 RB3295 RB3298     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555809 555810 RB3298 RB3299     FALSE 0.191 128.000 0.000 NA   NA
 555810 555811 RB3299 RB3301     FALSE 0.190 139.000 0.000 NA   NA
 555811 555812 RB3301 RB3302     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 555812 555813 RB3302 RB3303     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 555813 555814 RB3303 RB3304     FALSE 0.141 -46.000 0.000 NA   NA
 555815 555816 RB3305 RB3309     TRUE 0.415 119.000 0.000 1.000   NA
 555816 555817 RB3309 RB3312     TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555818 555819 RB3313 RB3314   ftsH TRUE 0.412 -28.000 0.000 1.000   NA
 555820 555821 RB3317 RB3320     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 555822 555823 RB3321 RB3322     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 555823 555824 RB3322 RB3324     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555825 555826 RB3326 RB3327     FALSE 0.075 -268.000 0.000 NA   NA
 555826 555827 RB3327 RB3328     FALSE 0.097 -82.000 0.000 NA   NA
 555828 555829 RB3329 RB3330     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 555830 555831 RB3332 RB3333     FALSE 0.114 -63.000 0.000 NA   NA
 555832 555833 RB3337 RB3338   idh FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 555833 555834 RB3338 RB3340 idh   FALSE 0.372 -36.000 0.000 1.000   NA
 555834 555835 RB3340 RB3342     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555837 555838 RB3346 RB3348     FALSE 0.195 102.000 0.000 NA   NA
 555838 555839 RB3348 RB3349     TRUE 0.981 4.000 0.037 0.020 N NA
 555839 555840 RB3349 RB3352   nanA TRUE 0.891 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 555840 555841 RB3352 RB3353 nanA   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555842 555843 RB3354 RB3355     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555844 555845 RB3358 RB3359     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 555848 555849 RB3363 RB3365     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 555849 555850 RB3365 RB3366     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555853 555854 RB3370 RB3371     FALSE 0.109 -67.000 0.000 NA   NA
 555855 555856 RB3372 RB3373     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 555857 555858 RB3374 RB3375     FALSE 0.082 -135.000 0.000 NA   NA
 555860 555861 RB3379 RB3382     TRUE 0.632 -10.000 0.000 0.023   NA
 555861 555862 RB3382 RB3387     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 555865 555866 RB3393 RB3394     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555866 555867 RB3394 RB3395     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555867 555868 RB3395 RB3398     FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 555870 555871 RB3400 RB3402     FALSE 0.192 125.000 0.000 NA   NA
 555872 555873 RB3403 RB3404     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 555873 555874 RB3404 RB3405     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 555877 555878 RB3408 RB3410     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 555879 555880 RB3413 RB3416     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555880 555881 RB3416 RB3417     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555881 555882 RB3417 RB3418     TRUE 0.410 7.000 0.000 1.000   NA
 555882 555883 RB3418 RB3421   agrA FALSE 0.396 -31.000 0.000 1.000   NA
 555885 555886 RB3423 RB3424 aceF   TRUE 0.986 139.000 0.091 0.072 Y NA
 555888 555889 RB3427 RB3429 dcd   FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555890 555891 RB3430 RB3431   lon FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 555891 555892 RB3431 RB3433 lon   TRUE 0.400 320.000 0.000 1.000   NA
 555896 555897 RB3440 RB3441     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 555898 555899 RB3442 RB3446     TRUE 0.409 145.000 0.000 1.000   NA
 555899 555900 RB3446 RB3449     FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555900 555901 RB3449 RB3450     FALSE 0.085 -117.000 0.000 NA   NA
 555905 555906 RB3456 RB3459     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 555906 555907 RB3459 RB3462     TRUE 0.910 18.000 1.000 NA   NA
 555908 555909 RB3464 RB3465   gyrA FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555909 555910 RB3465 RB3466 gyrA gyrB TRUE 0.986 89.000 0.023 0.002 Y NA
 555914 555915 RB3473 RB3476     FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 555917 555918 RB3479 RB3482     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555918 555919 RB3482 RB3484     TRUE 0.983 82.000 0.030 1.000 Y NA
 555920 555921 RB3485 RB3487   melR FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 555924 555925 RB3491 RB3493 rbsD rbsB TRUE 0.947 25.000 0.015 NA Y NA
 555925 555926 RB3493 RB3495 rbsB   TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 555926 555927 RB3495 RB3496   rbsA TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 555927 555928 RB3496 RB3497 rbsA rbsC TRUE 0.991 -6.000 1.000 1.000 Y NA
 555928 555929 RB3497 RB3499 rbsC rbsK TRUE 0.810 2.000 0.000 1.000 Y NA
 555929 555930 RB3499 RB3500 rbsK   TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 555930 555931 RB3500 RB3501     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 555931 555932 RB3501 RB3504     FALSE 0.107 -69.000 0.000 NA   NA
 555932 555933 RB3504 RB3505     FALSE 0.130 13.000 0.000 NA   NA
 555934 555935 RB3506 RB3507     FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 555936 555937 RB3508 RB3509 galE2   FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 555937 555938 RB3509 RB3513     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555938 555939 RB3513 RB3514     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555939 555940 RB3514 RB3517     FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 555940 555941 RB3517 RB3521   arsR FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 555941 555942 RB3521 RB3522 arsR   FALSE 0.280 1.000 0.000 NA   NA
 555943 555944 RB3524 RB3525     FALSE 0.117 37.000 0.000 NA   NA
 555945 555946 RB3526 RB3527     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 555946 555947 RB3527 RB3532     TRUE 0.402 213.000 0.000 1.000   NA
 555948 555949 RB3534 RB3539     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 555949 555950 RB3539 RB3542     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 555952 555953 RB3546 RB3547     FALSE 0.175 -33.000 0.000 NA   NA
 555953 555954 RB3547 RB3548     FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 555956 555957 RB3550 RB3552     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 555958 555959 RB3555 RB3556 glcK gpi2 TRUE 0.654 44.000 0.000 1.000 Y NA
 555959 555960 RB3556 RB3557 gpi2   FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 555960 555961 RB3557 RB3559     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 555961 555962 RB3559 RB3562     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555962 555963 RB3562 RB3564     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555963 555964 RB3564 RB3565     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555964 555965 RB3565 RB3566     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555965 555966 RB3566 RB3567     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 555967 555968 RB3568 RB3569     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 555968 555969 RB3569 RB3570     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 555969 555970 RB3570 RB3571     FALSE 0.162 10.000 0.000 NA   NA
 555970 555971 RB3571 RB3574     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 555972 555973 RB3575 RB3577     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 555973 555974 RB3577 RB3579     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 555974 555975 RB3579 RB3582     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 555977 555978 RB3584 RB3585     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 555980 555981 RB3589 RB3591     TRUE 0.732 156.000 0.000 1.000 Y NA
 555981 555982 RB3591 RB3593     TRUE 0.911 -106.000 0.057 1.000   NA
 555982 555983 RB3593 RB3596   nifU TRUE 0.415 120.000 0.000 1.000   NA
 555983 555984 RB3596 RB3597 nifU   TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 N NA
 555984 555985 RB3597 RB3598   xseA TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 555985 555986 RB3598 RB3599 xseA kel FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 555987 555988 RB3600 RB3601     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 555988 555989 RB3601 RB3603     FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 555989 555990 RB3603 RB3605     FALSE 0.185 176.000 0.000 NA   NA
 555990 555991 RB3605 RB3606   fixL TRUE 0.916 -3.000 0.000 0.020 Y NA
 555991 555992 RB3606 RB3607 fixL   FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 555992 555993 RB3607 RB3610     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 555994 555995 RB3611 RB3612     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 555995 555996 RB3612 RB3613     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 555997 555998 RB3614 RB3615 atoC atoS TRUE 0.983 -48.000 0.400 0.020 Y NA
 555998 555999 RB3615 RB3618 atoS   FALSE 0.186 165.000 0.000 NA   NA
 556000 556001 RB3621 RB3622   nhaA FALSE 0.156 51.000 0.000 NA   NA
 556003 556004 RB3624 RB3625     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 556005 556006 RB3626 RB3627     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556007 556008 RB3630 RB3632     FALSE 0.195 96.000 0.000 NA   NA
 556009 556010 RB3633 RB3634     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 556011 556012 RB3635 RB3639     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556012 556013 RB3639 RB3641     TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 556014 556015 RB3644 RB3645     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556017 556018 RB3647 RB3648     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 556019 556020 RB3650 RB3651     FALSE 0.085 -123.000 0.000 NA   NA
 556020 556021 RB3651 RB3653     FALSE 0.188 152.000 0.000 NA   NA
 556021 556022 RB3653 RB3654     FALSE 0.106 29.000 0.000 NA   NA
 556024 556025 RB3656 RB3657     FALSE 0.182 60.000 0.000 NA   NA
 556028 556029 RB3660 RB3661     FALSE 0.146 48.000 0.000 NA   NA
 556029 556030 RB3661 RB3662     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556030 556031 RB3662 RB3663     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 556033 556034 RB3665 RB3668     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556039 556040 RB3675 RB3678   apbE TRUE 0.403 188.000 0.000 1.000   NA
 556040 556041 RB3678 RB3680 apbE   FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 556041 556042 RB3680 RB3681     TRUE 0.971 -16.000 0.073 NA N NA
 556042 556043 RB3681 RB3682     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556043 556044 RB3682 RB3683     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 556045 556046 RB3684 RB3686     FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 556046 556047 RB3686 RB3688     FALSE 0.125 -55.000 0.000 NA   NA
 556047 556048 RB3688 RB3689     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 556048 556049 RB3689 RB3692     TRUE 0.978 85.000 0.667 1.000 N NA
 556049 556050 RB3692 RB3693     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556050 556051 RB3693 RB3694     FALSE 0.105 27.000 0.000 NA   NA
 556055 556056 RB3698 RB3700     TRUE 0.561 76.000 0.000 0.004   NA
 556057 556058 RB3701 RB3702     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556058 556059 RB3702 RB3703     FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 556061 556062 RB3706 RB3707 apbE   FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556062 556063 RB3707 RB3708   speA FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 556063 556064 RB3708 RB3710 speA   TRUE 0.422 90.000 0.000 1.000   NA
 556065 556066 RB3711 RB3713     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556066 556067 RB3713 RB3714   fabB TRUE 0.405 170.000 0.000 1.000   NA
 556067 556068 RB3714 RB3716 fabB   TRUE 0.584 88.000 0.000 1.000 N NA
 556068 556069 RB3716 RB3718     TRUE 0.574 129.000 0.000 1.000 N NA
 556069 556070 RB3718 RB3719     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556070 556071 RB3719 RB3723     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556074 556075 RB3730 RB3732     TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA Y NA
 556078 556079 RB3735 RB3739 panC   FALSE 0.202 80.000 0.000 NA   NA
 556079 556080 RB3739 RB3741     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556083 556084 RB3745 RB3746     FALSE 0.076 -207.000 0.000 NA   NA
 556086 556087 RB3750 RB3751 fliS   TRUE 0.417 35.000 0.000 1.000 N NA
 556087 556088 RB3751 RB3753     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556088 556089 RB3753 RB3755     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556090 556091 RB3758 RB3760     FALSE 0.187 164.000 0.000 NA   NA
 556092 556093 RB3762 RB3763 glpK glpA TRUE 0.988 66.000 0.086 0.000 Y NA
 556094 556095 RB3764 RB3765     FALSE 0.104 -72.000 0.000 NA   NA
 556096 556097 RB3767 RB3768 leuB   TRUE 0.506 50.000 0.000 1.000 N NA
 556097 556098 RB3768 RB3770     TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 556098 556099 RB3770 RB3771     FALSE 0.204 -24.000 0.000 NA   NA
 556099 556100 RB3771 RB3772     FALSE 0.093 -93.000 0.000 NA   NA
 556100 556101 RB3772 RB3773     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556101 556102 RB3773 RB3774     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556102 556103 RB3774 RB3775     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556103 556104 RB3775 RB3777     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 556105 556106 RB3779 RB3783     FALSE 0.086 -115.000 0.000 NA   NA
 556106 556107 RB3783 RB3784     FALSE 0.287 -7.000 0.000 NA   NA
 556107 556108 RB3784 RB3786     FALSE 0.183 367.000 0.000 NA   NA
 556108 556109 RB3786 RB3788     FALSE 0.191 -28.000 0.000 NA   NA
 556109 556110 RB3788 RB3789     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556111 556112 RB3790 RB3792     FALSE 0.193 115.000 0.000 NA   NA
 556112 556113 RB3792 RB3794     TRUE 0.495 217.000 0.000 0.092   NA
 556113 556114 RB3794 RB3800     FALSE 0.106 31.000 0.000 NA   NA
 556116 556117 RB3804 RB3808     TRUE 0.881 -168.000 0.833 NA   NA
 556118 556119 RB3809 RB3810     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556120 556121 RB3813 RB3814     FALSE 0.099 -78.000 0.000 NA   NA
 556121 556122 RB3814 RB3815     FALSE 0.191 127.000 0.000 NA   NA
 556122 556123 RB3815 RB3816     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556124 556125 RB3817 RB3818     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556125 556126 RB3818 RB3820   pss TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556126 556127 RB3820 RB3822 pss psd TRUE 0.981 -42.000 0.466 1.000 Y NA
 556130 556131 RB3828 RB3830     FALSE 0.342 11.000 0.000 1.000   NA
 556132 556133 RB3831 RB3832     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 556134 556135 RB3833 RB3835     FALSE 0.104 25.000 0.000 NA   NA
 556135 556136 RB3835 RB3836     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556136 556137 RB3836 RB3838     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556137 556138 RB3838 RB3840     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 556138 556139 RB3840 RB3841     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 556141 556142 RB3845 RB3846     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 556143 556144 RB3847 RB3848     FALSE 0.296 -6.000 0.000 NA   NA
 556147 556148 RB3854 RB3856     FALSE 0.188 148.000 0.000 NA   NA
 556150 556151 RB3860 RB3864     FALSE 0.184 212.000 0.000 NA   NA
 556151 556152 RB3864 RB3865     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 556155 556156 RB3868 RB3870     FALSE 0.073 -318.000 0.000 NA   NA
 556157 556158 RB3871 RB3873     FALSE 0.308 41.000 0.000 1.000   NA
 556158 556159 RB3873 RB3876   arsA TRUE 0.430 80.000 0.000 1.000   NA
 556160 556161 RB3877 RB3880 aslA   FALSE 0.183 245.000 0.000 NA   NA
 556161 556162 RB3880 RB3881     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556162 556163 RB3881 RB3882     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 556163 556164 RB3882 RB3883     FALSE 0.200 -25.000 0.000 NA   NA
 556165 556166 RB3884 RB3886 pyrH FRR TRUE 0.986 1.000 0.626 1.000 N NA
 556166 556167 RB3886 RB3888 FRR   TRUE 0.410 7.000 0.000 1.000   NA
 556168 556169 RB3890 RB3891   proC TRUE 0.932 51.000 0.043 NA   NA
 556169 556170 RB3891 RB3893 proC   TRUE 0.476 44.000 0.000 1.000 N NA
 556170 556171 RB3893 RB3895   inlE TRUE 0.673 -3.000 0.000 1.000   NA
 556171 556172 RB3895 RB3898 inlE PCP FALSE 0.349 50.000 0.000 1.000   NA
 556172 556173 RB3898 RB3899 PCP   FALSE 0.197 71.000 0.000 NA   NA
 556173 556174 RB3899 RB3902     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556174 556175 RB3902 RB3904     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556176 556177 RB3905 RB3906     FALSE 0.208 -22.000 0.000 NA   NA
 556178 556179 RB3908 RB3911     FALSE 0.183 254.000 0.000 NA   NA
 556181 556182 RB3915 RB3916 dpoL   FALSE 0.256 19.000 0.000 1.000   NA
 556182 556183 RB3916 RB3917     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556185 556186 RB3922 RB3923     FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556186 556187 RB3923 RB3924     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556187 556188 RB3924 RB3925     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556188 556189 RB3925 RB3926     FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 556191 556192 RB3929 RB3930     FALSE 0.080 -154.000 0.000 NA   NA
 556193 556194 RB3932 RB3933 tolQ   TRUE 0.994 0.000 0.667 0.027 Y NA
 556194 556195 RB3933 RB3934     TRUE 0.956 -57.000 0.333 0.019   NA
 556197 556198 RB3936 RB3938 trpG   TRUE 0.985 -3.000 0.013 1.000   NA
 556198 556199 RB3938 RB3940     TRUE 0.981 -3.000 0.058 NA   NA
 556201 556202 RB3944 RB3946     FALSE 0.138 44.000 0.000 NA   NA
 556202 556203 RB3946 RB3949     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556203 556204 RB3949 RB3950     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556205 556206 RB3951 RB3953     TRUE 0.981 -6.000 0.833 1.000   NA
 556206 556207 RB3953 RB3956   arsA TRUE 0.404 -30.000 0.000 1.000   NA
 556209 556210 RB3959 RB3960     TRUE 0.428 83.000 0.000 NA N NA
 556213 556214 RB3966 RB3967     TRUE 0.984 -3.000 0.217 NA   NA
 556216 556217 RB3971 RB3972     FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 556219 556220 RB3974 RB3975     FALSE 0.187 161.000 0.000 NA   NA
 556220 556221 RB3975 RB3979     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556221 556222 RB3979 RB3981     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 556222 556223 RB3981 RB3982     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 556225 556226 RB3985 RB3988     FALSE 0.194 106.000 0.000 NA   NA
 556226 556227 RB3988 RB3989     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 556227 556228 RB3989 RB3990     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556230 556231 RB3992 RB3993     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556231 556232 RB3993 RB3994     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556233 556234 RB3995 RB3997     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556234 556235 RB3997 RB3999     TRUE 0.954 15.000 0.667 0.049   NA
 556236 556237 RB4000 RB4001     FALSE 0.198 88.000 0.000 NA   NA
 556237 556238 RB4001 RB4002     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 556239 556240 RB4005 RB4007     FALSE 0.201 83.000 0.000 NA   NA
 556240 556241 RB4007 RB4008     FALSE 0.103 23.000 0.000 NA   NA
 556241 556242 RB4008 RB4011     FALSE 0.349 23.000 0.000 0.029   NA
 556242 556243 RB4011 RB4013   hrpB FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 556243 556244 RB4013 RB4014 hrpB   FALSE 0.128 -54.000 0.000 NA   NA
 556244 556245 RB4014 RB4015     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556246 556247 RB4017 RB4021 atsG   FALSE 0.187 160.000 0.000 NA   NA
 556247 556248 RB4021 RB4022   estB FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556248 556249 RB4022 RB4023 estB   TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556249 556250 RB4023 RB4024     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556250 556251 RB4024 RB4026     FALSE 0.189 146.000 0.000 NA   NA
 556251 556252 RB4026 RB4029     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 556253 556254 RB4031 RB4032 ppkA   FALSE 0.190 136.000 0.000 NA   NA
 556259 556260 RB4046 RB4048     FALSE 0.139 -48.000 0.000 NA   NA
 556261 556262 RB4051 RB4053     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556262 556263 RB4053 RB4054     FALSE 0.166 -36.000 0.000 NA   NA
 556263 556264 RB4054 RB4059     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556264 556265 RB4059 RB4060     FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556268 556269 RB4069 RB4071 moaA   FALSE 0.149 49.000 0.000 NA   NA
 556269 556270 RB4071 RB4073     TRUE 0.934 -34.000 0.023 NA   NA
 556270 556271 RB4073 RB4077     FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 556271 556272 RB4077 RB4079     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556272 556273 RB4079 RB4081   moxR TRUE 0.981 -3.000 0.056 NA   NA
 556273 556274 RB4081 RBt23 moxR   FALSE 0.195 98.000 0.000 NA   NA
 556274 556275 RBt23 RB4083     FALSE 0.194 69.000 0.000 NA   NA
 556275 556276 RB4083 RB4084     FALSE 0.106 30.000 0.000 NA   NA
 556276 556277 RB4084 RB4087     FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556277 556278 RB4087 RB4090     FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 556278 556279 RB4090 RB4091   ydcC TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556279 556280 RB4091 RB4093 ydcC   FALSE 0.187 157.000 0.000 NA   NA
 556280 556281 RB4093 RB4094     FALSE 0.184 61.000 0.000 NA   NA
 556281 556282 RB4094 RB4097     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556282 556283 RB4097 RB4099     TRUE 0.545 -7.000 0.000 1.000   NA
 556283 556284 RB4099 RB4100     FALSE 0.196 91.000 0.000 NA   NA
 556284 556285 RB4100 RB4104     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556285 556286 RB4104 RB4105   radC FALSE 0.138 12.000 0.000 NA   NA
 556291 556292 RB4111 RB4112     FALSE 0.156 -39.000 0.000 NA   NA
 556292 556293 RB4112 RB4113   ydcC FALSE 0.190 138.000 0.000 NA   NA
 556295 556296 RB4115 RB4116   blaR FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000   NA
 556296 556297 RB4116 RB4118 blaR blaI TRUE 0.990 3.000 0.667 1.000 Y NA
 556298 556299 RB4121 RB4123     FALSE 0.195 103.000 0.000 NA   NA
 556299 556300 RB4123 RB4127     FALSE 0.184 227.000 0.000 NA   NA
 556300 556301 RB4127 RB4128     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556301 556302 RB4128 RB4129     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556302 556303 RB4129 RB4131   yjjN FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556305 556306 RB4136 RB4137 phoB hydH TRUE 0.964 -94.000 0.120 1.000 Y NA
 556306 556307 RB4137 RB4142 hydH   FALSE 0.149 11.000 0.000 NA   NA
 556307 556308 RB4142 RB4143   gatA FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 556311 556312 RB4149 RB4150     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556312 556313 RB4150 RB4151     FALSE 0.258 -12.000 0.000 NA   NA
 556314 556315 RB4152 RB4155     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556315 556316 RB4155 RB4156     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556316 556317 RB4156 RB4160     TRUE 0.983 -3.000 0.170 NA   NA
 556317 556318 RB4160 RB4161   malQ TRUE 0.578 110.000 0.000 1.000 N NA
 556320 556321 RB4165 RB4166 algU   FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 556322 556323 RB4167 RB4172     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 556324 556325 RB4173 RB4174 ftsY   TRUE 0.585 6.000 0.000 1.000 N NA
 556329 556330 RB4182 RB4185     FALSE 0.202 78.000 0.000 NA   NA
 556331 556332 RB4186 RB4193 ppkA   FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556335 556336 RB4195 RB4196     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556337 556338 RB4197 RB4199     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556338 556339 RB4199 RB4201     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556339 556340 RB4201 RB4203     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 556340 556341 RB4203 RB4204     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556342 556343 RB4205 RB4206     FALSE 0.139 45.000 0.000 NA   NA
 556343 556344 RB4206 RB4208     FALSE 0.127 40.000 0.000 NA   NA
 556344 556345 RB4208 RB4210     FALSE 0.195 94.000 0.000 NA   NA
 556348 556349 RB4215 RB4216     FALSE 0.264 2.000 0.000 NA   NA
 556350 556351 RB4217 RB4218     FALSE 0.078 -166.000 0.000 NA   NA
 556355 556356 RB4223 RB4224   dinP TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556356 556357 RB4224 RB4227 dinP   FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 556357 556358 RB4227 RB4228     FALSE 0.120 -58.000 0.000 NA   NA
 556359 556360 RB4229 RB4230     TRUE 0.918 -66.000 0.354 NA   NA
 556362 556363 RB4233 RB4239     FALSE 0.096 -85.000 0.000 NA   NA
 556363 556364 RB4239 RB4241     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556365 556366 RB4243 RB4245     FALSE 0.180 59.000 0.000 NA   NA
 556366 556367 RB4245 RB4247   hrpA FALSE 0.152 -40.000 0.000 NA   NA
 556367 556368 RB4247 RB4248 hrpA   FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556368 556369 RB4248 RB4250     FALSE 0.107 33.000 0.000 NA   NA
 556370 556371 RB4251 RB4252     FALSE 0.144 -45.000 0.000 NA   NA
 556371 556372 RB4252 RB4255     FALSE 0.185 -30.000 0.000 NA   NA
 556375 556376 RB4259 RB4260     FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556377 556378 RB4262 RB4264     FALSE 0.174 56.000 0.000 NA   NA
 556380 556381 RB4267 RB4269     TRUE 0.410 64.000 0.000 1.000   NA
 556381 556382 RB4269 RB4270     TRUE 0.418 69.000 0.000 1.000   NA
 556382 556383 RB4270 RB4271     FALSE 0.263 -69.000 0.000 1.000   NA
 556383 556384 RB4271 RB4272     TRUE 0.499 -13.000 0.000 1.000   NA
 556384 556385 RB4272 RB4273     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556385 556386 RB4273 RB4275     TRUE 0.918 34.000 0.500 NA   NA
 556387 556388 RB4276 RB4277     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556389 556390 RB4278 RB4282     TRUE 0.412 132.000 0.000 1.000   NA
 556390 556391 RB4282 RB4283     TRUE 0.418 69.000 0.000 1.000   NA
 556393 556394 RB4285 RB4286     TRUE 0.461 4.000 0.000 1.000   NA
 556394 556395 RB4286 RB4288     TRUE 0.432 15.000 0.000 1.000 N NA
 556395 556396 RB4288 RB4289     FALSE 0.199 6.000 0.000 NA   NA
 556396 556397 RB4289 RB4292     FALSE 0.171 55.000 0.000 NA   NA
 556397 556398 RB4292 RB4293     FALSE 0.263 33.000 0.000 1.000   NA
 556398 556399 RB4293 RB4294     TRUE 0.428 75.000 0.000 1.000   NA
 556399 556400 RB4294 RB4296     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 556403 556404 RB4299 RB4300     TRUE 0.835 3.000 0.000 0.048 Y NA
 556406 556407 RB4302 RB4303     FALSE 0.130 -52.000 0.000 NA   NA
 556408 556409 RB4304 RB4305     FALSE 0.190 65.000 0.000 NA   NA
 556409 556410 RB4305 RB4306     TRUE 0.419 97.000 0.000 1.000   NA
 556410 556411 RB4306 RB4308     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 556411 556412 RB4308 RB4309     FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 556412 556413 RB4309 RB4310     TRUE 0.987 0.000 0.810 1.000 N NA
 556413 556414 RB4310 RB4311     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556414 556415 RB4311 RB4314     TRUE 0.894 30.000 0.033 NA   NA
 556415 556416 RB4314 RB4317     FALSE 0.396 -31.000 0.000 1.000   NA
 556417 556418 RB4320 RB4322     FALSE 0.183 255.000 0.000 NA   NA
 556422 556423 RB4333 RB4336     TRUE 0.988 -3.000 0.158 1.000   NA
 556423 556424 RB4336 RB4337     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556425 556426 RB4338 RB4340     FALSE 0.194 108.000 0.000 NA   NA
 556430 556431 RB4348 RB4349     FALSE 0.079 -156.000 0.000 NA   NA
 556433 556434 RB4352 RB4353     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556434 556435 RB4353 RB4354     FALSE 0.123 39.000 0.000 NA   NA
 556435 556436 RB4354 RB4356     FALSE 0.185 185.000 0.000 NA   NA
 556438 556439 RB4358 RB4360     FALSE 0.191 131.000 0.000 NA   NA
 556439 556440 RB4360 RB4361     FALSE 0.118 15.000 0.000 NA   NA
 556440 556441 RB4361 RB4362     FALSE 0.172 9.000 0.000 NA   NA
 556441 556442 RB4362 RB4364     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556442 556443 RB4364 RB4366     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556443 556444 RB4366 RB4369     FALSE 0.190 140.000 0.000 NA   NA
 556444 556445 RB4369 RB4371     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 556445 556446 RB4371 RB4373     FALSE 0.106 28.000 0.000 NA   NA
 556446 556447 RB4373 RB4375     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 556447 556448 RB4375 RB4376   katA TRUE 0.407 159.000 0.000 1.000   NA
 556448 556449 RB4376 RB4377 katA   FALSE 0.198 87.000 0.000 NA   NA
 556449 556450 RB4377 RB4378     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556450 556451 RB4378 RB4381     FALSE 0.183 276.000 0.000 NA   NA
 556451 556452 RB4381 RB4382     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556452 556453 RB4382 RB4383     TRUE 0.882 -154.000 0.231 NA   NA
 556453 556454 RB4383 RB4386     TRUE 0.983 -3.000 0.152 NA   NA
 556454 556455 RB4386 RB4389     FALSE 0.275 -9.000 0.000 NA   NA
 556455 556456 RB4389 RB4390     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556457 556458 RB4392 RB4393     FALSE 0.141 46.000 0.000 NA   NA
 556458 556459 RB4393 RB4394     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556459 556460 RB4394 RB4395     FALSE 0.200 85.000 0.000 NA   NA
 556460 556461 RB4395 RB4396     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556461 556462 RB4396 RB4397     FALSE 0.197 89.000 0.000 NA   NA
 556463 556464 RB4398 RB4399     FALSE 0.266 -10.000 0.000 NA   NA
 556464 556465 RB4399 RB4400     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 556466 556467 RB4402 RB4404     FALSE 0.120 38.000 0.000 NA   NA
 556470 556471 RB4408 RB4410     FALSE 0.136 43.000 0.000 NA   NA
 556471 556472 RB4410 RB4414     TRUE 0.975 0.000 0.538 NA   NA
 556472 556473 RB4414 RB4416     TRUE 0.969 -12.000 0.542 NA   NA
 556473 556474 RB4416 RB4417     TRUE 0.996 -3.000 0.792 0.002 Y NA
 556476 556477 RB4420 RB4422     FALSE 0.106 32.000 0.000 NA   NA
 556477 556478 RB4422 RB4423     TRUE 0.696 -7.000 0.000 1.000 N NA
 556483 556484 RB4429 RB4432     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556484 556485 RB4432 RB4433     TRUE 0.656 69.000 0.000 0.040 N NA
 556485 556486 RB4433 RB4436     TRUE 0.414 124.000 0.000 1.000   NA
 556486 556487 RB4436 RB4438     TRUE 0.407 155.000 0.000 1.000   NA
 556487 556488 RB4438 RB4440     TRUE 0.408 153.000 0.000 1.000   NA
 556491 556492 RB4448 RB4451     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556493 556494 RB4452 RB4454   FliC FALSE 0.250 -13.000 0.000 NA   NA
 556496 556497 RB4456 RB4457     FALSE 0.077 -186.000 0.000 NA   NA
 556498 556499 RB4458 RB4459     FALSE 0.302 0.000 0.000 NA   NA
 556499 556500 RB4459 RB4460     FALSE 0.136 -49.000 0.000 NA   NA
 556500 556501 RB4460 RB4461     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556501 556502 RB4461 RB4462     FALSE 0.087 -109.000 0.000 NA   NA
 556502 556503 RB4462 RB4464     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556503 556504 RB4464 RB4465     FALSE 0.113 16.000 0.000 NA   NA
 556505 556506 RB4466 RB4467     FALSE 0.109 34.000 0.000 NA   NA
 556507 556508 RB4468 RB4470     FALSE 0.187 63.000 0.000 NA   NA
 556508 556509 RB4470 RB4473     FALSE 0.191 132.000 0.000 NA   NA
 556510 556511 RB4474 RB4476     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 556511 556512 RB4476 RB4477     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556512 556513 RB4477 RB4478     FALSE 0.196 -27.000 0.000 NA   NA
 556513 556514 RB4478 RB4480     TRUE 0.957 6.000 0.333 NA   NA
 556516 556517 RB4484 RB4485     TRUE 0.424 87.000 0.000 1.000   NA
 556517 556518 RB4485 RB4487   ntrC TRUE 0.422 89.000 0.000 1.000   NA
 556518 556519 RB4487 RB4489 ntrC   FALSE 0.235 -16.000 0.000 NA   NA
 556520 556521 RB4492 RB4493     FALSE 0.242 -15.000 0.000 NA   NA
 556523 556524 RB4498 RB4499     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556525 556526 RB4500 RB4502     FALSE 0.201 84.000 0.000 NA   NA
 556526 556527 RB4502 RB4504     FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 556527 556528 RB4504 RB4505     FALSE 0.202 81.000 0.000 NA   NA
 556528 556529 RB4505 RB4506     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556529 556530 RB4506 RB4508   cheY TRUE 0.460 -52.000 0.000 1.000 N NA
 556532 556533 RB4511 RB4512     FALSE 0.103 24.000 0.000 NA   NA
 556534 556535 RB4513 RB4514     FALSE 0.369 53.000 0.000 1.000   NA
 556536 556537 RB4517 RB4519     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556537 556538 RB4519 RB4522     FALSE 0.189 145.000 0.000 NA   NA
 556538 556539 RB4522 RB4526     FALSE 0.201 76.000 0.000 NA   NA
 556539 556540 RB4526 RB4527     FALSE 0.112 -64.000 0.000 NA   NA
 556541 556542 RB4528 RB4529     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556542 556543 RB4529 RB4530   czcA TRUE 0.958 76.000 0.400 NA   NA
 556543 556544 RB4530 RB4532 czcA   TRUE 0.965 60.000 0.800 NA N NA
 556546 556547 RB4538 RB4540   czcC FALSE 0.189 147.000 0.000 NA   NA
 556547 556548 RB4540 RB4542 czcC   FALSE 0.183 247.000 0.000 NA   NA
 556548 556549 RB4542 RB4544     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556549 556550 RB4544 RB4547     FALSE 0.189 144.000 0.000 NA   NA
 556553 556554 RB4552 RB4553     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 556554 556555 RB4553 RB4554     FALSE 0.130 41.000 0.000 NA   NA
 556557 556558 RB4556 RB4557     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 556560 556561 RB4561 RB4564   sglT TRUE 0.585 73.000 0.000 1.000 N NA
 556562 556563 RB4567 RB4571 chd1   TRUE 0.411 139.000 0.000 1.000   NA
 556563 556564 RB4571 RB4572     FALSE 0.179 8.000 0.000 NA   NA
 556566 556567 RB4576 RB4577   asnB TRUE 0.422 71.000 0.000 1.000   NA
 556567 556568 RB4577 RB4578 asnB   FALSE 0.199 73.000 0.000 NA   NA
 556568 556569 RB4578 RB4579     TRUE 0.984 -3.000 0.222 NA   NA
 556569 556570 RB4579 RB4580     TRUE 0.983 -3.000 0.182 NA   NA
 556570 556571 RB4580 RB4582     TRUE 0.988 -3.000 0.172 1.000   NA
 556571 556572 RB4582 RB4583   cdS TRUE 0.966 107.000 0.004 1.000 N NA
 556572 556573 RB4583 RB4586 cdS TPX TRUE 0.581 92.000 0.000 1.000 N NA
 556573 556574 RB4586 RB4589 TPX   FALSE 0.195 99.000 0.000 NA   NA
 556574 556575 RB4589 RB4590     FALSE 0.188 151.000 0.000 NA   NA
 556576 556577 RB4591 RB4593 recO   FALSE 0.399 60.000 0.000 1.000   NA
 556577 556578 RB4593 RB4595     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556580 556581 RB4598 RB4601     FALSE 0.160 52.000 0.000 NA   NA
 556582 556583 RB4603 RB4605   dapA FALSE 0.194 110.000 0.000 NA   NA
 556583 556584 RB4605 RB4606 dapA   FALSE 0.382 9.000 0.000 1.000   NA
 556584 556585 RB4606 RB4607     FALSE 0.203 79.000 0.000 NA   NA
 556585 556586 RB4607 RB4608     FALSE 0.213 -21.000 0.000 NA   NA
 556588 556589 RB4610 RB4611 ruvA nusB TRUE 0.797 -3.000 0.000 1.000 N NA
 556589 556590 RB4611 RB4613 nusB   FALSE 0.192 122.000 0.000 NA   NA
 556590 556591 RB4613 RB4614     FALSE 0.220 -19.000 0.000 NA   NA
 556592 556593 RB4616 RB4619     FALSE 0.195 95.000 0.000 NA   NA
 556594 556595 RB4621 RB4626     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556595 556596 RB4626 RB4627     FALSE 0.223 4.000 0.000 NA   NA
 556596 556597 RB4627 RB4629     FALSE 0.201 75.000 0.000 NA   NA
 556597 556598 RB4629 RB4631     FALSE 0.195 97.000 0.000 NA   NA
 556599 556600 RB4632 RB4633   secD TRUE 0.920 37.000 0.006 NA N NA
 556602 556603 RB4638 RB4639 aslA   FALSE 0.189 7.000 0.000 NA   NA
 556604 556605 RB4640 RB4641     FALSE 0.074 -285.000 0.000 NA   NA
 556606 556607 RB4642 RB4643     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556607 556608 RB4643 RB4644     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556609 556610 RB4645 RB4646   cox3 FALSE 0.103 20.000 0.000 NA   NA
 556612 556613 RB4649 RB4650     FALSE 0.189 142.000 0.000 NA   NA
 556613 556614 RB4650 RB4651     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556616 556617 RB4653 RB4654     TRUE 0.673 -3.000 0.000 NA N NA
 556619 556620 RB4658 RB4659     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556623 556624 RB4662 RB4663     FALSE 0.171 -34.000 0.000 NA   NA
 556625 556626 RB4667 RB4670     FALSE 0.188 149.000 0.000 NA   NA
 556626 556627 RB4670 RB4673   ruvC FALSE 0.168 54.000 0.000 NA   NA
 556627 556628 RB4673 RB4675 ruvC cysS TRUE 0.972 -18.000 0.005 1.000 N NA
 556628 556629 RB4675 RB4676 cysS   FALSE 0.161 -37.000 0.000 NA   NA
 556630 556631 RB4678 RB4679     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 556631 556632 RB4679 RB4681     FALSE 0.184 193.000 0.000 NA   NA
 556632 556633 RB4681 RB4682     FALSE 0.191 129.000 0.000 NA   NA
 556635 556636 RB4691 RB4692     FALSE 0.180 -31.000 0.000 NA   NA
 556636 556637 RB4692 RB4694     FALSE 0.097 -81.000 0.000 NA   NA
 556637 556638 RB4694 RB4697     FALSE 0.205 5.000 0.000 NA   NA
 556638 556639 RB4697 RB4698     FALSE 0.185 62.000 0.000 NA   NA
 556640 556641 RB4699 RB4702     TRUE 0.413 128.000 0.000 1.000   NA
 556642 556643 RB4703 RB4704     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556644 556645 RB4705 RB4707     FALSE 0.104 26.000 0.000 NA   NA
 556645 556646 RB4707 RB4709     FALSE 0.101 -76.000 0.000 NA   NA
 556647 556648 RB4711 RB4712     FALSE 0.187 156.000 0.000 NA   NA
 556648 556649 RB4712 RB4713     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 556649 556650 RB4713 RB4714     TRUE 0.931 43.000 0.190 NA   NA
 556650 556651 RB4714 RB4715     TRUE 0.931 -45.000 0.095 NA   NA
 556651 556652 RB4715 RB4716     TRUE 0.876 -192.000 1.000 NA   NA
 556656 556657 RB4723 RB4724     FALSE 0.102 22.000 0.000 NA   NA
 556657 556658 RB4724 RB4725     FALSE 0.301 40.000 0.000 1.000   NA
 556658 556659 RB4725 RB4727     FALSE 0.183 260.000 0.000 NA   NA
 556660 556661 RB4728 RB4729     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556663 556664 RB4732 RB4735     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 556665 556666 RB4736 RB4737   fbaB FALSE 0.184 200.000 0.000 NA   NA
 556667 556668 RB4738 RB4739     FALSE 0.267 34.000 0.000 1.000   NA
 556670 556671 RB4741 RB4742     TRUE 0.401 251.000 0.000 1.000   NA
 556671 556672 RB4742 RB4744     TRUE 0.692 15.000 0.000 0.002 Y NA
 556672 556673 RB4744 RB4746     TRUE 0.409 -3.000 0.000 NA   NA
 556678 556679 RB4753 RB4754     FALSE 0.084 -124.000 0.000 NA   NA
 556679 556680 RB4754 RB4756     FALSE 0.104 19.000 0.000 NA   NA
 556680 556681 RB4756 RB4757     FALSE 0.108 17.000 0.000 NA   NA
 556681 556682 RB4757 RB4758   atoS FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 556682 556683 RB4758 RB4759 atoS   TRUE 0.600 -124.000 0.000 0.010 Y NA
 556683 556684 RB4759 RB4760     TRUE 0.917 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 556685