MicrobesOnline Operon Predictions for Porphyromonas gingivalis W83

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 561429 561430 PG0001 PG0002 dnaA   TRUE 0.922 13.000 0.000 1.000 N NA
 561433 561434 PG0005 PG0006     TRUE 0.993 53.000 0.286 1.000   NA
 561434 561435 PG0006 PGt01   tRNA-Asn-1 FALSE 0.093 179.000 0.000 NA   NA
 561435 561436 PGt01 PGt02 tRNA-Asn-1 tRNA-Asn-2 TRUE 0.879 23.000 0.000 NA   NA
 561436 561437 PGt02 PG0007 tRNA-Asn-2   FALSE 0.399 72.000 0.000 NA   NA
 561437 561438 PG0007 PG0008     FALSE 0.099 172.000 0.000 NA   NA
 561438 561439 PG0008 PG0009     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 561440 561441 PG0010 PG0011 clpC   FALSE 0.247 140.000 0.000 1.000 N NA
 561441 561442 PG0011 PG0012     TRUE 0.636 48.000 0.000 1.000 N NA
 561442 561443 PG0012 PG0013     TRUE 0.923 10.000 0.000 1.000 N NA
 561443 561444 PG0013 PG0016     FALSE 0.010 586.000 0.000 1.000 N NA
 561444 561445 PG0016 PG0017     TRUE 1.000 11.000 0.905 1.000 Y NA
 561445 561446 PG0017 PG0018     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 561446 561447 PG0018 PG0019     FALSE 0.166 146.000 0.000 NA   NA
 561447 561448 PG0019 PG0020     FALSE 0.114 185.000 0.000 1.000 N NA
 561449 561450 PG0021 PG0022     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000 N NA
 561451 561452 PG0024 PG0025     TRUE 0.977 69.000 0.092 1.000   NA
 561452 561453 PG0025 PG0026     TRUE 0.924 118.000 0.046 1.000   NA
 561453 561454 PG0026 PG0027     TRUE 0.991 76.000 0.373 1.000   NA
 561454 561455 PG0027 PG0028   ispF TRUE 0.995 7.000 0.023 1.000   NA
 561456 561457 PGt03 PG0030 tRNA-Gln-1   FALSE 0.030 262.000 0.000 NA   NA
 561458 561459 PG0031 PG0032     TRUE 0.541 48.000 0.000 NA   NA
 561459 561460 PG0032 PG0033     TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 561460 561461 PG0033 PG0034   trx FALSE 0.005 695.000 0.000 NA   NA
 561461 561462 PG0034 PG0035 trx dnaE TRUE 0.983 49.000 0.047 1.000 N NA
 561463 561464 PG0037 PG0039 rplS   FALSE 0.005 753.000 0.000 NA   NA
 561464 561465 PG0039 PG0040     FALSE 0.094 178.000 0.000 NA   NA
 561465 561466 PG0040 PG0041     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 561466 561467 PG0041 PG0042   glyA FALSE 0.027 314.000 0.000 1.000 N NA
 561467 561468 PG0042 PG0043 glyA nahA TRUE 0.799 157.000 0.020 1.000 N NA
 561468 561469 PG0043 PG0045 nahA htpG FALSE 0.008 660.000 0.000 1.000 N NA
 561470 561471 PG0046 PG0047 cdsA   TRUE 0.994 29.000 0.038 1.000   NA
 561471 561472 PG0047 PG0048     FALSE 0.070 204.000 0.000 0.051 N NA
 561472 561473 PG0048 PG0049     TRUE 0.888 19.000 0.000 NA   NA
 561474 561475 PG0050 PG0052     FALSE 0.004 1346.000 0.000 1.000 N NA
 561477 561478 PG0054 PG0055 recJ   TRUE 0.921 -3.000 0.000 NA N NA
 561478 561479 PG0055 PG0056     FALSE 0.213 131.000 0.000 NA   NA
 561479 561480 PG0056 PG0057   pncB TRUE 0.777 33.000 0.000 NA   NA
 561480 561481 PG0057 PG0058 pncB nadD TRUE 0.994 0.000 0.002 1.000 Y NA
 561481 561482 PG0058 PG0059 nadD   TRUE 0.987 14.000 0.002 NA   NA
 561482 561483 PG0059 PG0060     TRUE 0.999 7.000 0.222 NA   NA
 561483 561484 PG0060 PG0061   yngK-1 TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 561484 561485 PG0061 PG0062 yngK-1   TRUE 0.870 5.000 0.000 1.000   NA
 561486 561487 PG0063 PG0064     TRUE 1.000 18.000 0.500 1.000 N NA
 561487 561488 PG0064 PG0065     TRUE 1.000 20.000 0.500 1.000 N NA
 561488 561489 PG0065 PG0066     FALSE 0.379 77.000 0.000 NA   NA
 561491 561492 PG0069 PG0070   lpxA TRUE 0.995 5.000 0.013 NA N NA
 561492 561493 PG0070 PG0071 lpxA   TRUE 0.995 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 561493 561494 PG0071 PG0072   lpxD TRUE 0.998 -21.000 0.148 0.003 Y NA
 561494 561495 PG0072 PG0073 lpxD   TRUE 0.905 93.000 0.011 1.000 N NA
 561495 561496 PG0073 PG0074   prfA TRUE 0.997 17.000 0.034 1.000 N NA
 561496 561497 PG0074 PG0075 prfA   TRUE 0.994 25.000 0.016 1.000 N NA
 561497 561498 PG0075 PG0076     TRUE 0.968 -46.000 0.004 1.000 N NA
 561498 561499 PG0076 PG0078     FALSE 0.040 233.000 0.000 NA   NA
 561499 561500 PG0078 PG0079     TRUE 0.998 -27.000 0.429 NA   NA
 561500 561501 PG0079 PG0080     TRUE 0.812 31.000 0.000 NA   NA
 561502 561503 PG0081 PG0082     TRUE 0.438 62.000 0.000 NA   NA
 561503 561504 PG0082 PG0083     TRUE 0.891 6.000 0.000 NA   NA
 561504 561505 PG0083 PG0084   sda FALSE 0.323 95.000 0.000 NA   NA
 561505 561506 PG0084 PG0085 sda   FALSE 0.148 141.000 0.000 1.000   NA
 561507 561508 PG0086 PG0087     FALSE 0.227 146.000 0.000 1.000 N NA
 561509 561510 PG0088 PG0090     FALSE 0.003 1032.000 0.000 1.000   NA
 561511 561512 PG0091 PG0092     TRUE 0.997 59.000 0.917 NA   NA
 561512 561513 PG0092 PG0093     TRUE 0.998 45.000 0.833 NA   NA
 561513 561514 PG0093 PG0094     TRUE 0.998 50.000 0.667 1.000 N NA
 561514 561515 PG0094 PG0095   mutS FALSE 0.006 895.000 0.000 1.000 N NA
 561515 561516 PG0095 PG0097 mutS   FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 561516 561517 PG0097 PG0098     TRUE 0.686 -39.000 0.000 NA   NA
 561517 561518 PG0098 PG0099   pheT TRUE 0.765 -16.000 0.000 NA   NA
 561518 561519 PG0099 PG0100 pheT   FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 561520 561521 PG0101     Pg16SA TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 561521 561522   PG0102 Pg16SA   FALSE 0.265 113.000 0.000 NA   NA
 561522 561523 PG0102 PG0103     FALSE 0.223 129.000 0.000 NA   NA
 561523 561524 PG0103 PGt04   tRNA-Ile-1 TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 561524 561525 PGt04 PGt05 tRNA-Ile-1 tRNA-Ala-1 TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 561525 561526 PGt05   tRNA-Ala-1 Pg23SA FALSE 0.252 119.000 0.000 NA   NA
 561526 561527     Pg23SA Pg5SA FALSE 0.158 147.000 0.000 NA   NA
 561527 561528   PG0104 Pg5SA topB-1 FALSE 0.008 529.000 0.000 NA   NA
 561528 561529 PG0104 PG0106 topB-1   FALSE 0.004 1350.000 0.000 1.000 N NA
 561529 561530 PG0106 PG0108   epsD FALSE 0.100 247.000 0.000 1.000 Y NA
 561530 561531 PG0108 PG0109 epsD   TRUE 0.883 22.000 0.000 NA   NA
 561531 561532 PG0109 PG0110     TRUE 0.686 37.000 0.000 NA   NA
 561532 561533 PG0110 PG0111     TRUE 0.623 49.000 0.000 1.000 N NA
 561533 10692446 PG0111 PG0112     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 10692446 561534 PG0112 PG0113     TRUE 0.734 35.000 0.000 NA   NA
 561534 561535 PG0113 PG0114     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 561535 561536 PG0114 PG0115     FALSE 0.213 120.000 0.000 1.000   NA
 561536 561537 PG0115 PG0116     TRUE 0.802 -6.000 0.000 1.000   NA
 561537 561538 PG0116 PG0117     TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 561538 561539 PG0117 PG0118     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 561539 561540 PG0118 PG0119     TRUE 0.902 36.000 0.000 NA Y NA
 561540 561541 PG0119 PG0120   epsC TRUE 0.964 6.000 0.000 1.000 Y NA
 561541 561542 PG0120 PG0121 epsC hup-1 FALSE 0.035 304.000 0.000 NA N NA
 561542 561543 PG0121 PG0123 hup-1   FALSE 0.031 253.000 0.000 NA   NA
 561544 561545 PG0124 PG0125     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 561545 561546 PG0125 PG0126     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561547 561548 PG0127 PG0128 hemH   TRUE 0.870 7.000 0.000 1.000   NA
 561548 561549 PG0128 PG0129     TRUE 0.865 17.000 0.000 1.000   NA
 561552 561553 PG0133 PG0134   mgtE TRUE 0.866 19.000 0.000 1.000   NA
 561553 561554 PG0134 PG0135 mgtE ksgA TRUE 0.995 32.000 0.047 1.000 N NA
 561555 561556 PG0136 PG0137   pepD-1 TRUE 0.997 31.000 0.099 NA   NA
 561556 561557 PG0137 PG0138 pepD-1 fabD TRUE 0.818 115.000 0.003 1.000 N NA
 561558 561559 PG0139 PG0140     TRUE 0.999 10.000 0.299 NA   NA
 561559 561560 PG0140 PG0141   spo0J TRUE 0.998 20.000 0.098 NA   NA
 561560 561561 PG0141 PG0142 spo0J soj TRUE 1.000 8.000 0.827 1.000 N NA
 561561 561562 PG0142 PG0143 soj   FALSE 0.041 216.000 0.000 1.000   NA
 561562 561563 PG0143 PG0144     TRUE 0.999 18.000 0.364 NA   NA
 561565 561566 PG0146 PG0147     TRUE 1.000 13.000 0.641 NA   NA
 561566 561567 PG0147 PG0148     TRUE 0.998 -13.000 0.214 NA   NA
 561567 561568 PG0148 PG0149     TRUE 0.846 28.000 0.000 NA   NA
 561568 561569 PG0149 PG0150     TRUE 0.979 37.000 0.019 NA   NA
 561569 561570 PG0150 PG0151   ftsY TRUE 0.996 -3.000 0.028 1.000 N NA
 561570 561571 PG0151 PG0152 ftsY nspC TRUE 0.987 27.000 0.003 1.000 N NA
 561571 561572 PG0152 PG0153 nspC aspS TRUE 0.923 10.000 0.000 1.000 N NA
 561572 561573 PG0153 PG0155 aspS ribD FALSE 0.016 431.000 0.000 1.000 N NA
 561574 561575 PG0156 PG0157   recX TRUE 0.995 -3.000 0.038 1.000   NA
 561575 561576 PG0157 PG0158 recX   TRUE 0.982 -16.000 0.016 1.000   NA
 561577 561578 PG0159 PG0160 pepO   TRUE 0.888 19.000 0.000 NA   NA
 561578 561579 PG0160 PG0161     FALSE 0.085 182.000 0.000 NA   NA
 561579 561580 PG0161 PG0162     FALSE 0.340 89.000 0.000 NA   NA
 561580 561581 PG0162 PG0163   pfk FALSE 0.204 150.000 0.000 1.000 N NA
 561581 561582 PG0163 PG0164 pfk   FALSE 0.064 196.000 0.000 NA   NA
 561582 561583 PG0164 PG0165   hslR TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 561583 561584 PG0165 PG0166 hslR pth TRUE 0.998 6.000 0.024 1.000 Y NA
 561584 561585 PG0166 PG0167 pth rplY TRUE 0.989 142.000 0.496 0.052 Y NA
 561586 561587 PG0170 PG0171 metG   TRUE 0.874 30.000 0.000 1.000 N NA
 561587 561588 PG0171 PG0172     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 561589 561590 PG0173 PG0174     TRUE 0.980 71.000 0.117 1.000   NA
 10692447 561591 PG0176 PG0177     FALSE 0.238 126.000 0.000 NA   NA
 561591 10692448 PG0177 PG0178     FALSE 0.389 74.000 0.000 NA   NA
 10692448 561592 PG0178 PG0179     FALSE 0.365 80.000 0.000 NA   NA
 561592 561593 PG0179 PG0180     FALSE 0.021 298.000 0.000 NA   NA
 561593 561594 PG0180 PG0181     TRUE 0.891 9.000 0.000 NA   NA
 561594 561595 PG0181 PG0182     FALSE 0.158 147.000 0.000 NA   NA
 561595 561596 PG0182 PG0183     FALSE 0.063 197.000 0.000 NA   NA
 561596 561597 PG0183 PG0184     FALSE 0.014 359.000 0.000 NA   NA
 561597 561598 PG0184 PG0185   ragA FALSE 0.003 842.000 0.000 1.000   NA
 561598 561599 PG0185 PG0186 ragA ragB TRUE 0.999 30.000 0.500 1.000   NA
 561599 561600 PG0186 PG0188 ragB   FALSE 0.003 1017.000 0.000 1.000   NA
 561600 561601 PG0188 PG0189     TRUE 0.996 -13.000 0.095 1.000   NA
 561601 561602 PG0189 PG0190   uppS TRUE 0.834 78.000 0.002 1.000   NA
 561602 561603 PG0190 PG0191 uppS   TRUE 0.997 18.000 0.036 1.000 N NA
 561603 561604 PG0191 PG0192   ompH-1 TRUE 0.997 57.000 0.326 1.000 Y NA
 561604 561605 PG0192 PG0193 ompH-1 ompH-2 TRUE 0.999 35.000 0.505 0.016 Y NA
 561605 561606 PG0193 PG0194 ompH-2   FALSE 0.019 288.000 0.000 1.000   NA
 561606 561607 PG0194 PG0195     FALSE 0.041 216.000 0.000 1.000   NA
 561607 561608 PG0195 PG0196     FALSE 0.037 279.000 0.000 1.000 N NA
 561611 561612 PG0199 PG0200     TRUE 0.982 -16.000 0.014 NA   NA
 561612 561613 PG0200 PG0201   rnpA TRUE 1.000 6.000 0.540 NA   NA
 561613 561614 PG0201 PG0202 rnpA   TRUE 0.996 -3.000 0.028 1.000 N NA
 561614 561615 PG0202 PG0203     TRUE 0.987 -9.000 0.014 NA   NA
 561615 561616 PG0203 PG0204     TRUE 0.501 51.000 0.000 NA   NA
 561616 561617 PG0204 PG0205   prfC TRUE 0.891 6.000 0.000 NA   NA
 561619 561620 PG0210 PG0211   cbiGF TRUE 0.998 -3.000 0.045 0.013 Y NA
 561620 561621 PG0211 PG0212 cbiGF cobL TRUE 0.999 14.000 0.071 0.013 Y NA
 561621 561622 PG0212 PG0213 cobL   TRUE 0.997 -7.000 0.056 0.013 Y NA
 561623 561624 PG0214 PG0215     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561624 561625 PG0215 PG0216     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 561625 561626 PG0216 PG0217     TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 561626 561627 PG0217 PG0218     TRUE 0.650 -88.000 0.000 NA   NA
 561628 561629 PG0219 PG0221     TRUE 0.465 55.000 0.000 NA   NA
 561629 561630 PG0221 PG0222     FALSE 0.368 79.000 0.000 NA   NA
 561630 561631 PG0222 PG0223     FALSE 0.005 739.000 0.000 NA   NA
 561631 561632 PG0223 PG0224     TRUE 0.934 4.000 0.000 NA N NA
 561632 561633 PG0224 PG0225     FALSE 0.067 233.000 0.000 NA N NA
 561633 561634 PG0225 PG0226     FALSE 0.064 196.000 0.000 NA   NA
 561634 561635 PG0226 PG0227   radA TRUE 0.438 62.000 0.000 NA   NA
 561635 561636 PG0227 PG0228 radA   TRUE 0.943 46.000 0.002 1.000 N NA
 561637 561638 PG0229 PG0230     FALSE 0.298 102.000 0.000 NA   NA
 561638 561639 PG0230 PG0231     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561640 561641 PG0232 PG0234     FALSE 0.004 838.000 0.000 NA   NA
 561642 561643 PG0235 PG0236     FALSE 0.399 72.000 0.000 NA   NA
 561643 561644 PG0236 PG0237   ung TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 561645 561646 PG0240 PG0241     TRUE 0.453 267.000 0.029 NA   NA
 561646 561647 PG0241 PG0242     TRUE 0.930 45.000 0.002 NA   NA
 561647 561648 PG0242 PG0243     TRUE 0.992 16.000 0.010 NA   NA
 561648 561649 PG0243 PG0245     FALSE 0.018 321.000 0.000 NA   NA
 561649 561650 PG0245 PG0246     TRUE 0.973 165.000 0.593 NA   NA
 561650 561651 PG0246 PG0248     FALSE 0.028 269.000 0.000 NA   NA
 561651 561652 PG0248 PG0249     TRUE 0.407 97.000 0.000 1.000 N NA
 561652 561653 PG0249 PG0250     FALSE 0.281 107.000 0.000 NA   NA
 561654 561655 PG0253 PG0254     TRUE 0.998 47.000 0.759 NA   NA
 561655 561656 PG0254 PG0255   infB TRUE 0.991 96.000 0.342 1.000 N NA
 561656 561657 PG0255 PG0256 infB   TRUE 0.988 28.000 0.013 1.000   NA
 561657 561658 PG0256 PG0257     TRUE 0.986 34.000 0.025 1.000   NA
 561658 561659 PG0257 PG0258     TRUE 0.999 40.000 0.466 1.000 Y NA
 561659 561660 PG0258 PG0259     TRUE 1.000 7.000 0.482 1.000 Y NA
 561662 561663 PG0263 PG0264 tyrS   TRUE 0.989 20.000 0.004 NA   NA
 561665 561666 PG0267 PG0268 argS trmU TRUE 0.993 5.000 0.002 0.054 Y NA
 561666 561667 PG0268 PG0269 trmU xth TRUE 0.682 45.000 0.000 1.000 N NA
 561667 561668 PG0269 PG0270 xth oxyR TRUE 0.490 73.000 0.000 1.000 N NA
 561668 561669 PG0270 PG0271 oxyR ssb TRUE 0.598 51.000 0.000 1.000 N NA
 561669 561670 PG0271 PG0272 ssb   TRUE 0.957 87.000 0.049 NA   NA
 561670 561671 PG0272 PG0273     TRUE 0.997 36.000 0.233 NA   NA
 561671 561672 PG0273 PG0274     TRUE 0.617 43.000 0.000 NA   NA
 561673 561674 PG0275 PG0276     FALSE 0.194 138.000 0.000 NA   NA
 561675 561676 PG0277 PG0278     TRUE 0.445 61.000 0.000 NA   NA
 561677 561678 PG0279 PG0280 maeB   FALSE 0.013 343.000 0.000 1.000   NA
 561678 561679 PG0280 PG0281     TRUE 0.828 22.000 0.000 0.087   NA
 561679 561680 PG0281 PG0282     FALSE 0.136 221.000 0.000 1.000 Y NA
 561680 561681 PG0282 PG0283     TRUE 0.988 80.000 0.174 1.000 N NA
 561682 561683 PG0285 PG0286     FALSE 0.137 153.000 0.000 NA   NA
 561683 561684 PG0286 PG0287     TRUE 0.957 83.000 0.046 NA   NA
 561684 561685 PG0287 PG0288     TRUE 0.995 57.000 0.484 NA   NA
 561685 561686 PG0288 PG0289     TRUE 0.997 -70.000 0.359 NA   NA
 561686 561687 PG0289 PG0290     TRUE 1.000 4.000 0.955 NA   NA
 561687 561688 PG0290 PG0291     TRUE 1.000 3.000 0.864 NA   NA
 561688 10692449 PG0291 PG0292     FALSE 0.069 194.000 0.000 NA   NA
 561689 561690 PG0293 PG0294     FALSE 0.006 600.000 0.000 NA   NA
 561690 561691 PG0294 PG0295   dprA TRUE 0.931 15.000 0.000 NA N NA
 561691 561692 PG0295 PG0296 dprA   TRUE 0.873 -7.000 0.000 1.000 N NA
 561692 561693 PG0296 PG0297     FALSE 0.021 300.000 0.000 NA   NA
 561694 561695 PG0300 PG0302     FALSE 0.014 357.000 0.000 NA   NA
 561695 561696 PG0302 PG0303     TRUE 0.999 10.000 0.098 NA N NA
 561696 561697 PG0303 PG0304     TRUE 0.998 36.000 0.215 0.015 Y NA
 561697 561698 PG0304 PG0305     TRUE 1.000 16.000 0.538 0.049 Y NA
 561698 561699 PG0305 PG0306     TRUE 1.000 27.000 0.571 0.049 Y NA
 561699 561700 PG0306 PG0307     TRUE 1.000 -3.000 0.362 0.049 Y NA
 561700 561701 PG0307 PG0308     TRUE 1.000 25.000 0.425 0.049 Y NA
 561702 561703 PG0309 PG0310 apbE   TRUE 1.000 -3.000 1.000 1.000 N NA
 561703 561704 PG0310 PG0311     TRUE 0.995 0.000 0.016 NA N NA
 561704 561705 PG0311 PG0312     TRUE 0.999 -3.000 0.179 NA   NA
 561706 561707 PG0313 PG0314   rplU TRUE 0.445 61.000 0.000 NA   NA
 561707 561708 PG0314 PG0315 rplU rpmA TRUE 1.000 28.000 0.667 0.033 Y NA
 561708 561709 PG0315 PG0316 rpmA serS TRUE 0.942 100.000 0.013 1.000 Y NA
 561711 561712 PG0319 PG0320     TRUE 0.999 32.000 0.500 NA   NA
 561712 561713 PG0320 PG0321     TRUE 0.700 151.000 0.008 NA   NA
 561713 561714 PG0321 PG0322     TRUE 0.898 29.000 0.000 NA N NA
 561715 561716 PG0323 PG0324   hutH FALSE 0.060 201.000 0.000 NA   NA
 561716 561717 PG0324 PG0325 hutH   TRUE 0.998 3.000 0.036 1.000 Y NA
 561717 561718 PG0325 PG0326     TRUE 0.871 25.000 0.000 NA   NA
 561718 561719 PG0326 PG0327     TRUE 0.654 -67.000 0.000 NA   NA
 561719 561720 PG0327 PG0328   hutI FALSE 0.283 94.000 0.000 1.000   NA
 561720 561721 PG0328 PG0329 hutI   TRUE 0.962 101.000 0.059 1.000 N NA
 561721 561722 PG0329 PG0330     TRUE 0.477 49.000 0.000 1.000   NA
 561723 561724 PG0332 PG0333 rho   FALSE 0.036 228.000 0.000 1.000   NA
 561725 561726 PG0334 PG0335   miaA-1 TRUE 0.621 53.000 0.000 NA N NA
 561726 561727 PG0335 PG0336 miaA-1   TRUE 0.999 17.000 0.168 NA   NA
 561727 561728 PG0336 PG0337     FALSE 0.352 85.000 0.000 NA   NA
 561729 561730 PG0338 PG0339     TRUE 1.000 5.000 1.000 NA   NA
 561730 561731 PG0339 PG0340     FALSE 0.010 459.000 0.000 NA   NA
 561732 561733 PG0343 PG0344 megL   FALSE 0.072 181.000 0.000 1.000   NA
 561733 561734 PG0344 PG0345     TRUE 0.891 3.000 0.000 NA   NA
 561735 561736 PG0346 PG0347   galE TRUE 0.869 10.000 0.000 1.000   NA
 561736 561737 PG0347 PG0348 galE recG TRUE 0.705 43.000 0.000 1.000 N NA
 561737 561738 PG0348 PG0349 recG   TRUE 0.866 18.000 0.000 1.000   NA
 561740 561741 PG0351 PG0352     FALSE 0.137 153.000 0.000 NA   NA
 561743 561744 PG0355 PG0356     TRUE 0.765 -16.000 0.000 NA   NA
 561744 561745 PG0356 PG0357   pyrB TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 561745 561746 PG0357 PG0358 pyrB pyrI TRUE 0.999 13.000 0.197 0.001 Y NA
 561746 561747 PG0358 PG0359 pyrI   TRUE 0.996 29.000 0.072 1.000   NA
 561747 561748 PG0359 PG0360     TRUE 0.605 44.000 0.000 NA   NA
 561748 561749 PG0360 PG0361     TRUE 0.991 22.000 0.010 NA   NA
 561749 561750 PG0361 PG0362     TRUE 0.645 -100.000 0.000 NA   NA
 561750 561751 PG0362 PG0363     TRUE 0.999 1.000 0.222 NA   NA
 561752 561753 PG0364 PG0365     TRUE 0.998 -3.000 0.161 1.000   NA
 561753 561754 PG0365 PG0366     TRUE 0.991 77.000 0.333 NA   NA
 561755 561756 PG0368 PG0369   coaD TRUE 0.992 31.000 0.021 1.000 N NA
 561756 561757 PG0369 PG0371 coaD   FALSE 0.013 372.000 0.000 NA   NA
 561757 561758 PG0371 PG0373     FALSE 0.007 561.000 0.000 NA   NA
 561760 561761 PG0375 PG0376 rplM rpsI TRUE 1.000 10.000 0.231 0.032 Y NA
 561761 561762 PG0376 PG0377 rpsI rpsB TRUE 0.959 135.000 0.060 0.042 Y NA
 561762 561763 PG0377 PG0378 rpsB tsf TRUE 0.994 139.000 0.748 1.000 Y NA
 561763 561764 PG0378 PG0380 tsf uvrB FALSE 0.019 374.000 0.000 1.000 N NA
 561766 561767 PG0382 PG0383     FALSE 0.253 103.000 0.000 1.000   NA
 561767 561768 PG0383 PG0384     TRUE 0.990 10.000 0.002 1.000 N NA
 561768 561769 PG0384 PG0385   rpsU FALSE 0.101 162.000 0.000 1.000   NA
 561769 561770 PG0385 PG0386 rpsU   TRUE 0.980 77.000 0.141 1.000   NA
 561770 561771 PG0386 PGt06   tRNA-Tyr-1 FALSE 0.181 140.000 0.000 NA   NA
 561771 561772 PGt06 PGt07 tRNA-Tyr-1 tRNA-Thr-1 TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 561772 561773 PGt07 PG0387 tRNA-Thr-1 tuf TRUE 0.418 68.000 0.000 NA   NA
 561773 561774 PG0387 PGt08 tuf tRNA-Trp-1 FALSE 0.404 71.000 0.000 NA   NA
 561774 561775 PGt08 PG0389 tRNA-Trp-1 nusG FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 561775 561776 PG0389 PG0390 nusG rplK TRUE 0.996 69.000 0.681 1.000 N NA
 561776 561777 PG0390 PG0391 rplK rplA TRUE 1.000 21.000 0.838 0.041 Y NA
 561777 561778 PG0391 PG0392 rplA rplJ TRUE 1.000 16.000 0.302 1.000 Y NA
 561778 561779 PG0392 PG0393 rplJ rplL TRUE 0.999 42.000 0.884 1.000 Y NA
 561779 561780 PG0393 PG0394 rplL rpoB TRUE 0.979 112.000 0.223 1.000   NA
 561780 561781 PG0394 PG0395 rpoB rpoC TRUE 0.996 66.000 0.851 0.001   NA
 561781 561782 PG0395 PG0396 rpoC   FALSE 0.035 288.000 0.000 1.000 N NA
 561783 561784 PG0397 PG0398   recF TRUE 0.998 14.000 0.089 NA   NA
 561784 561785 PG0398 PG0399 recF   TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561785 561786 PG0399 PG0400     TRUE 0.999 8.000 0.138 NA   NA
 561786 561787 PG0400 PG0401     FALSE 0.312 237.000 0.004 NA   NA
 561787 561788 PG0401 PG0403     TRUE 0.902 147.000 0.064 NA   NA
 561788 561789 PG0403 PG0404     TRUE 0.989 7.000 0.003 NA   NA
 561789 561790 PG0404 PG0408     FALSE 0.004 846.000 0.000 NA   NA
 561791 561792 PG0409 PG0410     FALSE 0.015 347.000 0.000 NA   NA
 561792 561793 PG0410 PG0411     TRUE 0.868 0.000 0.000 1.000   NA
 561794 561795 PG0412 PG0413 mutL   TRUE 0.991 -3.000 0.012 NA   NA
 561795 561796 PG0413 PG0414     TRUE 0.812 -9.000 0.000 NA   NA
 561796 561797 PG0414 PG0415     TRUE 0.438 62.000 0.000 NA   NA
 561797 561798 PG0415 PG0416   recQ-1 TRUE 0.982 37.000 0.018 1.000 N NA
 561798 561799 PG0416 PG0417 recQ-1 clpX TRUE 0.937 79.000 0.022 0.019 N NA
 561799 561800 PG0417 PG0418 clpX clpP TRUE 0.996 37.000 0.069 1.000 Y NA
 561800 561801 PG0418 PG0419 clpP   FALSE 0.013 373.000 0.000 NA   NA
 561801 561802 PG0419 PG0421     FALSE 0.043 229.000 0.000 NA   NA
 561802 561803 PG0421 PG0422     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 561804 561805 PG0423 PG0424     TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 561806 561807 PG0425 PG0426     FALSE 0.085 171.000 0.000 1.000   NA
 561807 561808 PG0426 PG0427     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 561808 561809 PG0427 PG0428     FALSE 0.052 212.000 0.000 NA   NA
 561810 561811 PG0429 PG0430     TRUE 1.000 27.000 0.832 0.004 Y NA
 561811 561812 PG0430 PG0431     TRUE 0.775 -15.000 0.000 NA   NA
 561813 561814 PG0432 PG0433     TRUE 0.996 4.000 0.028 NA   NA
 561814 561815 PG0433 PG0434     TRUE 0.622 38.000 0.000 1.000   NA
 561815 561816 PG0434 PG0435     FALSE 0.055 195.000 0.000 1.000   NA
 561816 561817 PG0435 PG0436     TRUE 0.964 10.000 0.000 1.000 Y NA
 561817 561818 PG0436 PG0437     TRUE 0.951 25.000 0.000 0.080 Y NA
 561819 561820 PG0438 PG0439     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561820 561821 PG0439 PG0441     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 561823 561824 PG0443 PG0444     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 561824 561825 PG0444 PG0445   pepT TRUE 0.994 17.000 0.019 NA   NA
 561825 561826 PG0445 PG0446 pepT thiF FALSE 0.291 130.000 0.000 1.000 N NA
 561826 561827 PG0446 PG0447 thiF   TRUE 0.559 56.000 0.000 1.000 N NA
 561827 561828 PG0447 PG0448     TRUE 0.995 -7.000 0.063 NA   NA
 561828 561829 PG0448 PG0449     TRUE 0.890 12.000 0.000 NA   NA
 561829 561830 PG0449 PG0450     TRUE 0.871 25.000 0.000 NA   NA
 561830 561831 PG0450 PG0451     TRUE 0.997 -3.000 0.070 NA   NA
 561831 561832 PG0451 PG0452     TRUE 0.971 107.000 0.134 NA   NA
 561832 561833 PG0452 PG0453     FALSE 0.023 290.000 0.000 NA   NA
 561833 561834 PG0453 PG0456     FALSE 0.003 1125.000 0.000 NA   NA
 561834 561835 PG0456 PG0457     TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 561836 561837 PG0458 PG0459     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 561839 561840 PG0461 PG0462     FALSE 0.185 130.000 0.000 1.000   NA
 561840 561841 PG0462 PG0463   folC TRUE 0.974 38.000 0.009 1.000 N NA
 561841 561842 PG0463 PG0464 folC purA TRUE 0.988 -3.000 0.002 1.000 N NA
 561842 561843 PG0464 PG0465 purA fur TRUE 0.883 29.000 0.000 1.000 N NA
 561843 561844 PG0465 PG0466 fur   FALSE 0.348 86.000 0.000 NA   NA
 561844 561845 PG0466 PG0468   manA FALSE 0.217 130.000 0.000 NA   NA
 561845 561846 PG0468 PG0469 manA   TRUE 0.879 23.000 0.000 NA   NA
 561846 561847 PG0469 PG0470     FALSE 0.368 79.000 0.000 NA   NA
 561848 561849 PG0471 PG0472     TRUE 0.785 -13.000 0.000 NA   NA
 561850 561851 PG0474 PG0475     TRUE 0.732 40.000 0.000 1.000 N NA
 561851 561852 PG0475 PG0476   yngK-2 TRUE 0.984 -3.000 0.002 1.000   NA
 561852 561853 PG0476 PG0477 yngK-2 panC TRUE 0.772 -10.000 0.000 1.000   NA
 561855 561856 PG0480 PG0481   kbl TRUE 0.542 113.000 0.000 1.000 Y NA
 561856 561857 PG0481 PG0482 kbl   TRUE 0.893 76.000 0.007 NA   NA
 561857 561858 PG0482 PG0483     TRUE 0.891 107.000 0.019 NA   NA
 561858 561859 PG0483 PG0484     TRUE 0.997 7.000 0.054 NA   NA
 561859 561860 PG0484 PG0485   yajC TRUE 0.925 128.000 0.047 NA   NA
 561860 561861 PG0485 PG0486 yajC ogt TRUE 0.491 83.000 0.000 NA N NA
 561861 561862 PG0486 PG0487 ogt   FALSE 0.052 342.000 0.000 1.000 Y NA
 561863 561864 PG0488 PG0489 ruvB   TRUE 0.955 47.000 0.016 1.000   NA
 561864 561865 PG0489 PG0490     TRUE 0.974 100.000 0.132 NA   NA
 561865 561866 PG0490 PG0491     TRUE 0.998 16.000 0.122 NA   NA
 561867 561868 PG0492 PG0493     FALSE 0.389 74.000 0.000 NA   NA
 561868 561869 PG0493 PG0494     FALSE 0.069 194.000 0.000 NA   NA
 561870 561871 PG0495 PG0496     FALSE 0.019 312.000 0.000 NA   NA
 561871 561872 PG0496 PG0497   mtn TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561872 561873 PG0497 PG0498 mtn luxS TRUE 0.998 25.000 0.076 1.000 N NA
 561873 561874 PG0498 PG0499 luxS   FALSE 0.030 262.000 0.000 NA   NA
 561874 561875 PG0499 PG0500   tgt FALSE 0.207 135.000 0.000 NA   NA
 561875 561876 PG0500 PG0501 tgt   TRUE 0.998 17.000 0.124 1.000   NA
 561876 561877 PG0501 PG0502   smpB TRUE 0.740 33.000 0.000 1.000   NA
 561877 561878 PG0502 PG0503 smpB dpp TRUE 0.955 40.000 0.002 1.000 N NA
 561878 561879 PG0503 PG0504 dpp lipA TRUE 0.920 103.000 0.021 1.000 N NA
 561879 561880 PG0504 PG0505 lipA   FALSE 0.265 113.000 0.000 NA   NA
 561880 561881 PG0505 PG0506   prtRII TRUE 0.888 18.000 0.000 NA   NA
 561881 561882 PG0506 PG0507 prtRII   FALSE 0.013 371.000 0.000 NA   NA
 561883 561884 PG0508 PG0509     TRUE 0.995 -10.000 0.045 1.000 N NA
 561884 561885 PG0509 PG0510     TRUE 0.887 17.000 0.000 NA   NA
 561885 561886 PG0510 PG0511     TRUE 0.979 36.000 0.016 NA   NA
 561886 561887 PG0511 PG0512   gmk TRUE 0.866 20.000 0.000 1.000   NA
 561887 561888 PG0512 PG0513 gmk   TRUE 0.998 33.000 0.276 NA   NA
 561888 561889 PG0513 PG0514   secA TRUE 0.842 92.000 0.003 NA   NA
 561889 561890 PG0514 PG0515 secA   TRUE 0.964 93.000 0.081 1.000   NA
 561890 561891 PG0515 PG0516     TRUE 0.997 -21.000 0.222 NA   NA
 561891 561892 PG0516 PG0517     TRUE 0.812 31.000 0.000 NA   NA
 561892 561893 PG0517 PG0518     FALSE 0.257 117.000 0.000 NA   NA
 561895 561896 PGt09 PG0520 tRNA-Ser-1 groEL FALSE 0.012 385.000 0.000 NA   NA
 561896 561897 PG0520 PG0521 groEL groES TRUE 0.954 253.000 0.774 0.011 Y NA
 561897 561898 PG0521 PG0522 groES miaA-2 FALSE 0.072 216.000 0.000 1.000 N NA
 561898 561899 PG0522 PG0523 miaA-2 guaB TRUE 0.988 -3.000 0.002 1.000 N NA
 561900 561901 PG0524 PG0525   pyrG FALSE 0.259 116.000 0.000 NA   NA
 561901 561902 PG0525 PG0526 pyrG   TRUE 0.947 128.000 0.064 1.000 N NA
 561902 561903 PG0526 PG0528     TRUE 0.866 91.000 0.003 1.000 N NA
 561903 561904 PG0528 PG0529   carA TRUE 0.996 34.000 0.041 1.000 Y NA
 561904 561905 PG0529 PG0530 carA carB TRUE 1.000 19.000 0.667 0.001 Y NA
 561906 561907 PG0531 PG0532 nadE   FALSE 0.274 110.000 0.000 NA   NA
 561908 561909 PGt10 PGt11 tRNA-Tyr-2 tRNA-Gly-1 TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 561909 561910 PGt11 PGt12 tRNA-Gly-1 tRNA-Leu-1 TRUE 0.887 17.000 0.000 NA   NA
 561910 561911 PGt12 PGt13 tRNA-Leu-1 tRNA-Gly-2 TRUE 0.528 49.000 0.000 NA   NA
 561911 561912 PGt13 PG0534 tRNA-Gly-2   FALSE 0.011 413.000 0.000 NA   NA
 561914 561915 PG0536 PG0537   pepD-2 TRUE 0.891 9.000 0.000 NA   NA
 561915 561916 PG0537 PG0538 pepD-2   FALSE 0.006 828.000 0.000 1.000 N NA
 561916 561917 PG0538 PG0539     TRUE 0.998 44.000 0.246 1.000 Y NA
 561917 561918 PG0539 PG0540     TRUE 1.000 -3.000 0.810 0.078 N NA
 561918 561919 PG0540 PG0541     TRUE 0.998 -15.000 0.333 NA   NA
 561921 561922 PG0543 PG0544     FALSE 0.060 192.000 0.000 1.000   NA
 561922 561923 PG0544 PG0545     TRUE 0.990 45.000 0.125 0.090   NA
 561925 561926 PG0547 PG0548     TRUE 0.898 189.000 0.185 1.000   NA
 561927 561928 PG0549 PG0553     FALSE 0.002 1295.000 0.000 1.000   NA
 561931 561932 PG0556 PG0557     TRUE 0.465 55.000 0.000 NA   NA
 561933 561934 PG0558 PG0559     TRUE 0.999 20.000 0.078 1.000 Y NA
 561938 561939 PG0563 PG0564     TRUE 0.735 -22.000 0.000 NA   NA
 561939 561940 PG0564 PG0565     FALSE 0.123 161.000 0.000 NA   NA
 561940 561941 PG0565 PG0566     FALSE 0.023 292.000 0.000 NA   NA
 561941 561942 PG0566 PG0568   efp-1 FALSE 0.006 558.000 0.000 1.000   NA
 561942 561943 PG0568 PG0569 efp-1   FALSE 0.211 132.000 0.000 NA   NA
 561946 561947 PG0573 PG0574 mraW   TRUE 0.991 0.000 0.008 NA   NA
 561947 561948 PG0574 PG0575     TRUE 0.998 10.000 0.098 NA   NA
 561948 561949 PG0575 PG0576   murE TRUE 1.000 17.000 0.717 1.000 Y NA
 561949 561950 PG0576 PG0577 murE mraY TRUE 0.999 15.000 0.069 0.007 Y NA
 561950 561951 PG0577 PG0578 mraY murD TRUE 1.000 24.000 0.647 0.007 Y NA
 561951 561952 PG0578 PG0579 murD   TRUE 0.998 12.000 0.085 1.000 N NA
 561952 561953 PG0579 PG0580   murG TRUE 0.999 -3.000 0.142 1.000 N NA
 561953 561954 PG0580 PG0581 murG murC TRUE 1.000 0.000 0.270 1.000 Y NA
 561954 561955 PG0581 PG0582 murC   TRUE 0.996 -6.000 0.065 NA   NA
 561955 561956 PG0582 PG0583   ftsA TRUE 0.986 49.000 0.086 NA   NA
 561956 561957 PG0583 PG0584 ftsA ftsz TRUE 1.000 3.000 0.460 1.000 Y NA
 561957 561958 PG0584 PG0585 ftsz   TRUE 0.992 32.000 0.040 1.000   NA
 561959 561960 PG0587 PG0588 yadS panB TRUE 0.492 52.000 0.000 NA   NA
 561960 561961 PG0588 PG0589 panB guaA TRUE 0.883 71.000 0.002 1.000 N NA
 561962 561963 PG0590 PG0591     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 561963 561964 PG0591 PG0592   rpmE FALSE 0.014 466.000 0.000 1.000 N NA
 561964 561965 PG0592 PG0593 rpmE htrA FALSE 0.069 217.000 0.000 1.000 N NA
 561965 561966 PG0593 PG0594 htrA rpoD TRUE 0.918 190.000 0.172 1.000 N NA
 561966 561967 PG0594 PG0595 rpoD rpsF TRUE 0.407 97.000 0.000 1.000 N NA
 561967 561968 PG0595 PG0596 rpsF rpsR TRUE 1.000 4.000 0.319 0.030 Y NA
 561968 561969 PG0596 PG0597 rpsR rplI TRUE 1.000 25.000 0.499 0.030 Y NA
 561969 561970 PG0597 PG0598 rplI   FALSE 0.022 276.000 0.000 1.000   NA
 561970 561971 PG0598 PG0599   ribBA TRUE 0.998 3.000 0.098 1.000   NA
 561971 561972 PG0599 PG0602 ribBA   FALSE 0.004 848.000 0.000 NA   NA
 561972 561973 PG0602 PG0603   cmk TRUE 0.991 30.000 0.021 NA   NA
 561973 561974 PG0603 PG0604 cmk ispH TRUE 0.998 -3.000 0.070 1.000 N NA
 561975 561976 PG0605 PG0606     TRUE 0.592 45.000 0.000 NA   NA
 561977 561978 PG0607 PG0608     TRUE 0.812 31.000 0.000 NA   NA
 561978 561979 PG0608 PG0609     FALSE 0.287 104.000 0.000 NA   NA
 561981 561982 PG0611 PG0612     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 561982 561983 PG0612 PG0613     TRUE 0.876 24.000 0.000 NA   NA
 561983 561984 PG0613 PG0614     TRUE 0.707 -28.000 0.000 NA   NA
 561984 561985 PG0614 PG0615   typA FALSE 0.056 206.000 0.000 NA   NA
 561985 561986 PG0615 PG0616 typA   FALSE 0.253 103.000 0.000 1.000   NA
 561986 561987 PG0616 PG0617     FALSE 0.338 90.000 0.000 NA   NA
 561987 561988 PG0617 PG0618     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 561988 561989 PG0618 PG0619     TRUE 0.986 166.000 0.551 1.000 Y NA
 561989 561990 PG0619 PG0620   lon FALSE 0.060 312.000 0.000 1.000 Y NA
 561990 561991 PG0620 PG0621 lon   TRUE 0.994 -3.000 0.023 NA   NA
 561991 561992 PG0621 PG0622     TRUE 1.000 -3.000 0.708 NA   NA
 561992 561993 PG0622 PG0623   tpiA TRUE 0.999 32.000 0.330 NA   NA
 561993 561994 PG0623 PG0624 tpiA   TRUE 0.989 62.000 0.191 NA   NA
 561994 561995 PG0624 PG0625   folE TRUE 0.999 4.000 0.296 NA   NA
 561995 561996 PG0625 PG0626 folE   FALSE 0.042 231.000 0.000 NA   NA
 561997 561998 PG0627 PG0628     FALSE 0.026 249.000 0.000 1.000   NA
 561998 561999 PG0628 PG0629   ppnK FALSE 0.402 59.000 0.000 1.000   NA
 562000 562001 PG0630 PG0631 pdxJ   TRUE 0.844 158.000 0.031 1.000 N NA
 562001 562002 PG0631 PG0632     TRUE 1.000 -3.000 0.773 0.035 Y NA
 562002 562003 PG0632 PG0633     TRUE 0.998 5.000 0.062 0.077 N NA
 562003 562004 PG0633 PG0634     TRUE 0.995 15.000 0.024 NA   NA
 562005 562006 PG0635 PG0636 prmA   TRUE 0.739 -66.000 0.000 1.000 N NA
 562006 562007 PG0636 PG0637   thiL TRUE 0.873 -7.000 0.000 1.000 N NA
 562007 562008 PG0637 PG0638 thiL lpxK TRUE 0.992 6.000 0.006 1.000 N NA
 562008 562009 PG0638 PG0639 lpxK sppA TRUE 0.995 30.000 0.042 1.000 N NA
 562009 10692450 PG0639 PG0644 sppA   FALSE 0.003 1742.000 0.000 NA   NA
 10692450 562010 PG0644 PG0645     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 562010 562011 PG0645 PG0646     FALSE 0.272 111.000 0.000 NA   NA
 562011 562012 PG0646 PG0647     TRUE 0.964 8.000 0.000 1.000 Y NA
 562012 562013 PG0647 PG0648     TRUE 0.957 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 562015 562016 PG0650 PG0651     FALSE 0.281 107.000 0.000 NA   NA
 562016 562017 PG0651 PGt14   tRNA-Leu-2 TRUE 0.856 27.000 0.000 NA   NA
 562017 562018 PGt14 PG0652 tRNA-Leu-2   FALSE 0.108 167.000 0.000 NA   NA
 562018 562019 PG0652 PG0653   serB TRUE 0.890 12.000 0.000 NA   NA
 562019 562020 PG0653 PG0654 serB   TRUE 0.451 59.000 0.000 NA   NA
 562022 562023 PG0656 PG0657 rpmH maf TRUE 0.438 62.000 0.000 NA   NA
 562023 562024 PG0657 PG0658 maf   TRUE 0.998 16.000 0.086 NA   NA
 562024 562025 PG0658 PG0659     TRUE 0.999 17.000 0.202 1.000   NA
 562025 562026 PG0659 PG0660     TRUE 0.988 -7.000 0.019 0.043   NA
 562026 562027 PG0660 PG0661     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562028 562029 PG0662 PG0664     FALSE 0.048 217.000 0.000 NA   NA
 562029 562030 PG0664 PG0665   lacZ-1 TRUE 0.508 47.000 0.000 1.000   NA
 562030 10692451 PG0665 PG0666 lacZ-1   FALSE 0.213 131.000 0.000 NA   NA
 10692451 562031 PG0666 PG0668     FALSE 0.003 1116.000 0.000 NA   NA
 562031 562032 PG0668 PG0669   fetB TRUE 1.000 29.000 0.917 1.000 N NA
 562032 562033 PG0669 PG0670 fetB   FALSE 0.336 118.000 0.000 1.000 N NA
 562033 562034 PG0670 PG0671     TRUE 1.000 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 562034 562035 PG0671 PG0672     TRUE 0.999 44.000 0.632 1.000 Y NA
 562036 562037 PG0674 PG0675 iorB iorA TRUE 0.999 27.000 0.100 0.001 Y NA
 562037 562038 PG0675 PG0676 iorA   FALSE 0.327 78.000 0.000 1.000   NA
 562039 562040 PG0677 PG0678 LYS1   TRUE 0.838 33.000 0.000 1.000 N NA
 562040 562041 PG0678 PG0679     FALSE 0.086 203.000 0.000 1.000 N NA
 562041 562042 PG0679 PG0680     TRUE 0.999 40.000 0.955 1.000 Y NA
 562044 562045 PG0682 PG0683     TRUE 0.908 33.000 0.000 0.076 Y NA
 562045 562046 PG0683 PG0684     TRUE 0.789 27.000 0.000 0.076   NA
 562046 562047 PG0684 PG0685     FALSE 0.286 93.000 0.000 1.000   NA
 562048 562049 PG0686 PG0687   sucD FALSE 0.009 484.000 0.000 NA   NA
 562049 562050 PG0687 PG0689 sucD 4hbD TRUE 0.856 195.000 0.054 0.046 Y NA
 562050 562051 PG0689 PG0690 4hbD abfT-1 TRUE 0.987 51.000 0.041 1.000 Y NA
 562051 562052 PG0690 PG0691 abfT-1   TRUE 1.000 6.000 0.400 1.000 N NA
 562052 562053 PG0691 PG0692   abfD TRUE 0.982 73.000 0.098 1.000 N NA
 562053 562054 PG0692 PG0694 abfD   FALSE 0.008 701.000 0.000 1.000 N NA
 562054 562055 PG0694 PG0695     TRUE 0.999 47.000 1.000 0.009 Y NA
 562055 562056 PG0695 PG0698     FALSE 0.020 306.000 0.000 NA   NA
 562056 562057 PG0698 PG0699   malP TRUE 0.796 32.000 0.000 NA   NA
 562057 562058 PG0699 PG0700 malP   FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 562059 562060 PG0701 PG0702 cobU   TRUE 0.993 53.000 0.104 1.000 Y NA
 562060 562061 PG0702 PG0703     TRUE 0.999 7.000 0.164 0.011 Y NA
 562061 562062 PG0703 PG0704     TRUE 0.999 2.000 0.102 1.000 N NA
 562062 562063 PG0704 PG0705   murI TRUE 0.536 62.000 0.000 1.000 N NA
 562063 562064 PG0705 PG0706 murI   TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562065 562066 PG0707 PG0708     FALSE 0.157 166.000 0.000 1.000 N NA
 562066 562067 PG0708 PG0709   fkpA TRUE 0.937 28.000 0.000 0.011 Y NA
 562067 562068 PG0709 PG0710 fkpA   TRUE 0.927 30.000 0.000 0.005 Y NA
 562070 562071 PG0712 PG0713   trpG TRUE 0.883 22.000 0.000 NA   NA
 562071 562072 PG0713 PG0714 trpG cutC FALSE 0.135 176.000 0.000 1.000 N NA
 562072 562073 PG0714 PG0715 cutC   TRUE 0.964 5.000 0.000 1.000 Y NA
 562073 562074 PG0715 PG0717     FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 562074 562075 PG0717 PG0718     TRUE 0.996 42.000 0.250 NA   NA
 562075 562076 PG0718 PG0719     TRUE 0.972 123.000 0.161 NA   NA
 562076 562077 PG0719 PG0720     TRUE 1.000 -3.000 0.969 1.000 Y NA
 562080 562081 PG0723 PG0724     TRUE 0.676 -46.000 0.000 NA   NA
 562081 562082 PG0724 PG0725     TRUE 0.959 85.000 0.064 1.000   NA
 562083 562084 PG0726 PG0727     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562084 562085 PG0727 PG0728     TRUE 0.577 46.000 0.000 NA   NA
 562085 562086 PG0728 PG0729   ddlA TRUE 0.996 19.000 0.033 1.000   NA
 562086 10692452 PG0729 PG0730 ddlA   TRUE 0.421 67.000 0.000 NA   NA
 10692452 562087 PG0730 PG0731     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 562088 562089 PG0732 PG0733   ribE FALSE 0.039 236.000 0.000 NA   NA
 562089 562090 PG0733 PG0734 ribE   TRUE 0.993 -3.000 0.012 1.000 N NA
 562090 562091 PG0734 PG0735     TRUE 0.549 59.000 0.000 1.000 N NA
 562091 562092 PG0735 PG0736   rnhB TRUE 0.992 11.000 0.004 1.000 N NA
 562092 562093 PG0736 PG0737 rnhB   TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 562093 562094 PG0737 PG0738     TRUE 0.995 -3.000 0.029 NA   NA
 562094 562095 PG0738 PG0739     TRUE 0.761 32.000 0.000 1.000   NA
 562095 562096 PG0739 PG0740     TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 562097 562098 PG0741 PG0742   pgaA TRUE 0.996 -16.000 0.120 NA   NA
 562098 562099 PG0742 PG0744 pgaA   FALSE 0.007 496.000 0.000 1.000   NA
 562099 562100 PG0744 PG0745     TRUE 0.446 85.000 0.000 1.000 N NA
 562100 562101 PG0745 PG0746     FALSE 0.182 156.000 0.000 1.000 N NA
 562101 562102 PG0746 PG0747     TRUE 1.000 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 562102 562103 PG0747 PG0749     FALSE 0.034 244.000 0.000 NA   NA
 562103 562104 PG0749 PGt15   tRNA-Arg-1 FALSE 0.133 155.000 0.000 NA   NA
 562104 562105 PGt15 PG0750 tRNA-Arg-1   TRUE 0.445 61.000 0.000 NA   NA
 562105 562106 PG0750 PG0751   porT FALSE 0.140 152.000 0.000 NA   NA
 562107 562108 PG0752 PG0753   prtQ TRUE 0.976 -16.000 0.002 1.000 N NA
 562108 562109 PG0753 PG0754 prtQ topA FALSE 0.007 735.000 0.000 1.000 N NA
 562109 10692453 PG0754 PG0755 topA   TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 562110 562111 PG0756 PG0757     TRUE 0.514 50.000 0.000 NA   NA
 562111 562112 PG0757 PG0758   dcp-1 FALSE 0.274 97.000 0.000 1.000   NA
 562112 562113 PG0758 PG0759 dcp-1   FALSE 0.327 78.000 0.000 1.000   NA
 562115 562116 PG0766 PG0767 pnpA malQ FALSE 0.117 152.000 0.000 1.000   NA
 562116 562117 PG0767 PG0768 malQ   FALSE 0.005 742.000 0.000 NA   NA
 562117 562118 PG0768 PG0769     FALSE 0.096 174.000 0.000 NA   NA
 562118 562119 PG0769 PG0770     TRUE 0.758 -18.000 0.000 NA   NA
 562120 562121 PG0771 PG0772     FALSE 0.078 188.000 0.000 NA   NA
 562121 562122 PG0772 PG0773     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562125 562126 PG0775 PG0776   etfA-1 TRUE 0.999 12.000 0.232 0.007 N NA
 562126 562127 PG0776 PG0777 etfA-1 etfB-1 TRUE 1.000 9.000 0.304 0.013 Y NA
 562127 562128 PG0777 PG0778 etfB-1   TRUE 0.856 91.000 0.002 1.000 N NA
 562128 562129 PG0778 PG0779     FALSE 0.034 231.000 0.000 1.000   NA
 562129 562130 PG0779 PG0780     TRUE 0.999 16.000 0.422 0.026   NA
 562130 562131 PG0780 PG0781     TRUE 0.999 36.000 0.667 NA   NA
 562131 562132 PG0781 PG0782     TRUE 0.999 9.000 0.309 NA   NA
 562132 562133 PG0782 PGt17   tRNA-Ser-2 TRUE 0.418 68.000 0.000 NA   NA
 562133 562134 PGt17 PG0783 tRNA-Ser-2   FALSE 0.071 193.000 0.000 NA   NA
 562134 562135 PG0783 PG0784     TRUE 0.972 47.000 0.017 NA N NA
 562135 562136 PG0784 PG0785     TRUE 0.683 171.000 0.011 1.000 N NA
 562136 562137 PG0785 PG0786     TRUE 0.735 -22.000 0.000 NA   NA
 562139 562140 PG0788 PG0789     TRUE 0.864 26.000 0.000 NA   NA
 562140 562141 PG0789 PG0790   obg TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 562141 562142 PG0790 PG0791 obg adk TRUE 0.993 10.000 0.019 1.000   NA
 562142 562143 PG0791 PG0792 adk hpt TRUE 0.999 1.000 0.044 1.000 Y NA
 562144 562145 PG0793 PG0794 fbp   TRUE 0.841 156.000 0.029 1.000 N NA
 562145 562146 PG0794 PG0795     TRUE 0.630 42.000 0.000 NA   NA
 562148 562149 PG0798 PG0799     FALSE 0.007 587.000 0.000 NA   NA
 562150 562151 PGt18 PG0800 tRNA-Gly-3   TRUE 0.425 66.000 0.000 NA   NA
 562151 562152 PG0800 PG0801     TRUE 0.738 -15.000 0.000 1.000   NA
 562152 562153 PG0801 PG0802   pdhD FALSE 0.008 659.000 0.000 1.000 N NA
 562153 562154 PG0802 PG0803 pdhD nagB TRUE 0.924 5.000 0.000 1.000 N NA
 562154 562155 PG0803 PG0804 nagB   TRUE 0.740 39.000 0.000 1.000 N NA
 562155 562156 PG0804 PG0805   lgt TRUE 0.981 34.000 0.006 1.000 N NA
 562156 562157 PG0805 PG0806 lgt   TRUE 0.967 37.000 0.010 1.000   NA
 562157 562158 PG0806 PG0807     TRUE 0.622 38.000 0.000 1.000   NA
 562158 562159 PG0807 PG0809     FALSE 0.017 340.000 0.000 NA   NA
 562159 562160 PG0809 PG0810     TRUE 0.995 -37.000 0.125 NA   NA
 562160 562161 PG0810 PG0811   ruvA TRUE 0.976 34.000 0.007 NA   NA
 562161 562162 PG0811 PG0814 ruvA   FALSE 0.003 2695.000 0.000 NA   NA
 562164 10692454 PG0816 PG0817     TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 562165 562166 PG0819 PG0820     TRUE 1.000 26.000 0.889 0.014 Y NA
 562166 562167 PG0820 PG0821     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562169 562170 PG0823 PG0824     TRUE 0.667 38.000 0.000 NA   NA
 562172 562173 PG0826 PG0827     TRUE 0.407 97.000 0.000 1.000 N NA
 562173 10692455 PG0827 PG0828     FALSE 0.024 286.000 0.000 NA   NA
 562176 562177 PG0832 PG0833     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 562177 562178 PG0833 PG0834     FALSE 0.011 425.000 0.000 NA   NA
 562180 562181 PG0838 PG0839     FALSE 0.008 438.000 0.000 1.000   NA
 562181 562182 PG0839 PG0840     TRUE 0.694 -22.000 0.000 1.000   NA
 562183 562184 PG0841 PG0842     FALSE 0.203 136.000 0.000 NA   NA
 562184 562185 PG0842 PG0843     TRUE 0.999 -3.000 0.200 NA   NA
 562187 10692457 PGt19 PG0846 tRNA-Ser-3   FALSE 0.003 1367.000 0.000 NA   NA
 562189 562190 PG0848 PG0849     TRUE 0.999 -15.000 0.455 NA   NA
 562190 562191 PG0849 PG0850     TRUE 0.846 28.000 0.000 NA   NA
 562191 562192 PG0850 PG0851     TRUE 0.795 -12.000 0.000 NA   NA
 562193 562194 PG0853 PG0854     TRUE 0.890 1.000 0.000 NA   NA
 562196 562197 PG0856 PG0857     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 562197 562198 PG0857 PG0858     TRUE 0.999 -3.000 0.455 NA   NA
 562198 562199 PG0858 PG0859     TRUE 0.999 -10.000 0.636 NA   NA
 562199 562200 PG0859 PG0860     FALSE 0.352 85.000 0.000 NA   NA
 562200 562201 PG0860 PG0861     TRUE 0.425 54.000 0.000 1.000   NA
 562201 562202 PG0861 PG0862     TRUE 0.999 11.000 0.207 0.021   NA
 562203 562204 PG0864 PG0865     TRUE 0.570 97.000 0.000 0.084 Y NA
 562206 562207 PG0867 PG0868     TRUE 1.000 -3.000 1.000 NA   NA
 562207 562208 PG0868 PG0869     TRUE 0.999 -3.000 0.333 NA   NA
 562208 562209 PG0869 PG0870     FALSE 0.303 101.000 0.000 NA   NA
 562209 562210 PG0870 PG0871     FALSE 0.311 98.000 0.000 NA   NA
 562210 562211 PG0871 PG0872     TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 562211 562212 PG0872 PG0873     FALSE 0.004 905.000 0.000 NA   NA
 562212 562213 PG0873 PG0874     TRUE 0.984 102.000 0.250 NA   NA
 562213 562214 PG0874 PG0875     FALSE 0.246 89.000 0.000 0.083   NA
 562214 562215 PG0875 PG0876   thdF FALSE 0.027 246.000 0.000 1.000   NA
 562215 562216 PG0876 PG0877 thdF   TRUE 0.796 32.000 0.000 NA   NA
 562216 562217 PG0877 PG0879     FALSE 0.012 386.000 0.000 NA   NA
 562218 562219 PG0880 PG0881 bcp recA TRUE 0.996 21.000 0.022 1.000 N NA
 562219 562220 PG0881 PG0882 recA   FALSE 0.194 110.000 0.000 0.083   NA
 562220 562221 PG0882 PG0883     TRUE 0.999 -3.000 0.400 NA   NA
 562221 562222 PG0883 PG0884     TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA   NA
 562222 562223 PG0884 PG0885     TRUE 0.920 16.000 0.000 1.000 N NA
 562223 562224 PG0885 PG0886     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000 N NA
 562224 562225 PG0886 PG0888     FALSE 0.020 304.000 0.000 NA   NA
 562225 562226 PG0888 PG0889     TRUE 0.451 59.000 0.000 NA   NA
 562226 562227 PG0889 PG0890     TRUE 0.995 36.000 0.083 1.000 N NA
 562228 562229 PG0893 PG0894   radC FALSE 0.055 237.000 0.000 1.000 N NA
 562230 562231 PGt20 PG0896 tRNA-Met-1 lacZ-2 FALSE 0.026 277.000 0.000 NA   NA
 562232 562233 PG0897 PG0898     TRUE 0.983 87.000 0.194 1.000   NA
 562233 562234 PG0898 PG0899   cydB FALSE 0.133 147.000 0.000 1.000   NA
 562234 562235 PG0899 PG0900 cydB cydA TRUE 0.999 46.000 0.962 0.041 Y NA
 562235 562236 PG0900 PG0901 cydA   TRUE 1.000 26.000 0.887 NA   NA
 562236 562237 PG0901 PG0902     FALSE 0.083 183.000 0.000 NA   NA
 562237 562238 PG0902 PG0903     FALSE 0.199 127.000 0.000 1.000   NA
 562240 562241 PG0908 PG0909     TRUE 0.887 17.000 0.000 NA   NA
 562241 562242 PG0909 PG0910     TRUE 0.961 55.000 0.029 NA   NA
 562242 562243 PG0910 PG0912     FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 562243 562244 PG0912 PG0914     FALSE 0.015 348.000 0.000 NA   NA
 562246 562247 PGt21 PG0917 tRNA-Ala-2   TRUE 0.461 56.000 0.000 NA   NA
 562247 562248 PG0917 PG0918     TRUE 0.998 -34.000 0.500 NA   NA
 562248 562249 PG0918 PG0919   pyrC FALSE 0.108 167.000 0.000 NA   NA
 562249 562250 PG0919 PG0920 pyrC   TRUE 0.999 11.000 0.136 NA N NA
 562250 562251 PG0920 PG0922     FALSE 0.190 203.000 0.000 NA Y NA
 562251 562252 PG0922 PG0923   rbfA TRUE 0.997 28.000 0.067 1.000 N NA
 562252 562253 PG0923 PG0924 rbfA   TRUE 0.612 39.000 0.000 1.000   NA
 562253 562254 PG0924 PG0925   tmk TRUE 0.986 -3.000 0.004 1.000   NA
 562254 562255 PG0925 PG0926 tmk   FALSE 0.229 128.000 0.000 NA   NA
 562255 562256 PG0926 PG0927     TRUE 0.994 0.000 0.018 NA   NA
 562256 562257 PG0927 PG0928     TRUE 0.996 12.000 0.033 1.000   NA
 562257 562258 PG0928 PG0929     TRUE 0.528 49.000 0.000 NA   NA
 562258 562259 PG0929 PG0930     TRUE 1.000 4.000 0.667 NA   NA
 562259 10692458 PG0930 PG0931     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 562260 562261 PG0932 PG0933     FALSE 0.049 244.000 0.000 1.000 N NA
 562262 562263 PG0934 PG0935   ispE TRUE 0.810 -21.000 0.000 1.000 N NA
 562263 562264 PG0935 PG0936 ispE   TRUE 0.806 29.000 0.000 1.000   NA
 562264 562265 PG0936 PG0937     TRUE 0.998 21.000 0.125 NA   NA
 562265 562266 PG0937 PG0938     TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 10692459 562267 PG0940 PG0942     TRUE 0.425 66.000 0.000 NA   NA
 562267 562268 PG0942 PG0943     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 562269 562270 PG0945 PG0946     TRUE 1.000 5.000 0.619 NA   NA
 562270 562271 PG0946 PG0947     TRUE 0.993 3.000 0.018 1.000   NA
 562272 562273 PG0948 PG0949     TRUE 0.995 19.000 0.019 1.000 N NA
 562273 562274 PG0949 PG0950   gcvH FALSE 0.149 168.000 0.000 1.000 N NA
 562274 562275 PG0950 PG0951 gcvH purE TRUE 0.995 1.000 0.017 1.000 N NA
 562275 562276 PG0951 PG0952 purE ispG TRUE 0.765 174.000 0.023 1.000 N NA
 562276 562277 PG0952 PG0953 ispG dut TRUE 0.922 57.000 0.004 1.000 N NA
 562277 562278 PG0953 PG0954 dut   TRUE 0.995 28.000 0.028 1.000 N NA
 562278 562279 PG0954 PG0955     TRUE 0.995 -93.000 0.162 NA   NA
 562279 562280 PG0955 PG0956     TRUE 0.999 12.000 0.155 NA   NA
 562280 562281 PG0956 PG0957   ribF TRUE 0.852 -12.000 0.000 1.000 N NA
 562282 562283 PG0958 PG0959   mrp FALSE 0.005 653.000 0.000 1.000   NA
 562283 562284 PG0959 PG0960 mrp   TRUE 0.997 20.000 0.073 1.000   NA
 562284 562285 PG0960 PG0961     TRUE 0.541 48.000 0.000 NA   NA
 562285 562286 PG0961 PG0962   proS TRUE 0.465 55.000 0.000 NA   NA
 562286 562287 PG0962 PG0963 proS   FALSE 0.026 279.000 0.000 NA   NA
 562287 10692460 PG0963 PG0964     TRUE 0.421 67.000 0.000 NA   NA
 10692460 562288 PG0964 PG0965     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 562289 562290 PG0968 PGt22 mrr tRNA-Leu-3 FALSE 0.188 139.000 0.000 NA   NA
 562292 562293 PG0970 PG0971     FALSE 0.069 183.000 0.000 1.000   NA
 562293 562294 PG0971 PG0972     TRUE 0.995 7.000 0.025 NA   NA
 562294 562295 PG0972 PG0973     FALSE 0.058 204.000 0.000 NA   NA
 562295 562296 PG0973 PG0975     FALSE 0.006 802.000 0.000 1.000 N NA
 562296 562297 PG0975 PG0976     TRUE 0.981 50.000 0.055 0.098 N NA
 562297 562298 PG0976 PG0977   ubiE TRUE 0.992 32.000 0.025 1.000 N NA
 562298 562299 PG0977 PG0978 ubiE aroE TRUE 0.995 -3.000 0.020 1.000 N NA
 562299 562300 PG0978 PG0979 aroE   TRUE 0.702 -30.000 0.000 NA   NA
 562300 562301 PG0979 PG0980     TRUE 0.785 -13.000 0.000 NA   NA
 562301 562302 PG0980 PGt23   tRNA-Phe-1 FALSE 0.005 709.000 0.000 NA   NA
 562302 562303 PGt23 PG0982 tRNA-Phe-1   FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 562305 562306 PG0985 PG0986     TRUE 0.998 -10.000 0.154 NA   NA
 562306 562307 PG0986 PG0987     TRUE 0.886 16.000 0.000 NA   NA
 562308 562309 PG0989 PG0990 rplT rpmI TRUE 0.997 113.000 0.928 0.027 Y NA
 562309 562310 PG0990 PG0991 rpmI infC TRUE 0.997 78.000 0.652 1.000 Y NA
 562310 562311 PG0991 PG0992 infC thrS TRUE 0.981 104.000 0.080 1.000 Y NA
 562314 562315 PG0996 PG0997     FALSE 0.093 166.000 0.000 1.000   NA
 562315 562316 PG0997 PG0998     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562316 562317 PG0998 PG0999     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 562317 562318 PG0999 PG1000     TRUE 0.879 23.000 0.000 NA   NA
 562318 562319 PG1000 PG1001     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 562319 562320 PG1001 PG1002     TRUE 0.891 5.000 0.000 NA   NA
 562320 562321 PG1002 PG1003     FALSE 0.386 75.000 0.000 NA   NA
 562322 562323 PG1004 PG1005     FALSE 0.019 311.000 0.000 NA   NA
 562323 562324 PG1005 PG1006     TRUE 0.812 31.000 0.000 NA   NA
 562324 562325 PG1006 PG1007     TRUE 0.732 40.000 0.000 1.000 N NA
 562325 562326 PG1007 PG1008     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562326 562327 PG1008 PG1009     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562327 562328 PG1009 PG1010     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 562328 562329 PG1010 PG1012     FALSE 0.007 753.000 0.000 1.000 N NA
 562330 562331 PG1013 PG1014     FALSE 0.012 533.000 0.000 1.000 N NA
 562333 562334 PG1017 PG1018 ppdK   TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 562334 562335 PG1018 PG1019     TRUE 0.889 13.000 0.000 NA   NA
 562335 562336 PG1019 PG1020     TRUE 0.904 172.000 0.133 NA   NA
 562339 562340 PG1024 PG1025     FALSE 0.016 345.000 0.000 NA   NA
 562340 562341 PG1025 PG1026     TRUE 0.998 -52.000 0.714 NA   NA
 562343 562344 PG1028 PG1029     TRUE 0.432 64.000 0.000 NA   NA
 562344 562345 PG1029 PG1030     FALSE 0.170 144.000 0.000 NA   NA
 562347 562348 PG1032 PG1033     FALSE 0.118 163.000 0.000 NA   NA
 562348 562349 PG1033 PG1034     TRUE 1.000 19.000 0.482 NA Y NA
 562349 562350 PG1034 PG1035     TRUE 0.735 -22.000 0.000 NA   NA
 562350 562351 PG1035 PG1036   uvrA-1 FALSE 0.404 71.000 0.000 NA   NA
 562351 562352 PG1036 PG1037 uvrA-1   TRUE 0.981 26.000 0.002 1.000   NA
 562352 562353 PG1037 PG1038     TRUE 0.994 0.000 0.021 1.000   NA
 562354 562355 PG1039 PG1040     FALSE 0.009 433.000 0.000 1.000   NA
 562355 562356 PG1040 PG1041     TRUE 0.920 21.000 0.000 1.000 N NA
 562356 562357 PG1041 PG1042     TRUE 0.512 69.000 0.000 1.000 N NA
 562357 562358 PG1042 PG1043   feoB-1 TRUE 0.764 37.000 0.000 1.000 N NA
 562358 562359 PG1043 PG1044 feoB-1   TRUE 0.821 34.000 0.000 1.000 N NA
 562360 562361 PGt24 PG1048 tRNA-Thr-2   FALSE 0.071 193.000 0.000 NA   NA
 562361 562362 PG1048 PG1049     TRUE 0.999 41.000 0.827 NA N NA
 562362 562363 PG1049 PG1050     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562363 562364 PG1050 PG1051     TRUE 0.630 42.000 0.000 NA   NA
 562364 562365 PG1051 PG1052     TRUE 0.429 65.000 0.000 NA   NA
 562365 562366 PG1052 PG1053     TRUE 0.904 19.000 0.000 0.023 N NA
 562368 562369 PG1056 PG1057     TRUE 0.999 20.000 0.139 1.000 N NA
 562369 562370 PG1057 PG1058     TRUE 0.861 22.000 0.000 1.000   NA
 562374 562375 PG1063 PG1064     TRUE 0.976 52.000 0.057 1.000   NA
 562375 562376 PG1064 PG1065   pyrD TRUE 0.999 -18.000 0.592 1.000 N NA
 562376 562377 PG1065 PG1066 pyrD ctfA FALSE 0.040 271.000 0.000 1.000 N NA
 562377 562378 PG1066 PG1067 ctfA   TRUE 0.991 54.000 0.200 NA   NA
 562378 562379 PG1067 PG1068     TRUE 0.999 28.000 0.583 NA   NA
 562379 562380 PG1068 PG1069     TRUE 0.996 42.000 0.250 1.000   NA
 562380 562381 PG1069 PG1070   kamA TRUE 0.978 87.000 0.093 1.000 N NA
 562381 562382 PG1070 PG1071 kamA   TRUE 0.957 129.000 0.113 NA   NA
 562382 562383 PG1071 PG1072     TRUE 1.000 0.000 0.591 NA   NA
 562383 562384 PG1072 PG1073   kamD TRUE 0.999 28.000 0.406 1.000   NA
 562384 562385 PG1073 PG1074 kamD kamE TRUE 0.999 -3.000 0.788 0.001   NA
 562385 562386 PG1074 PG1075 kamE   TRUE 0.998 24.000 0.121 1.000   NA
 562386 562387 PG1075 PG1076   acdA TRUE 0.998 45.000 0.375 1.000 Y NA
 562387 562388 PG1076 PG1077 acdA etfB-2 TRUE 0.999 15.000 0.250 0.040 N NA
 562388 562389 PG1077 PG1078 etfB-2 etfA-2 TRUE 1.000 14.000 0.250 0.012 Y NA
 562389 562390 PG1078 PG1079 etfA-2   TRUE 0.968 104.000 0.081 1.000 N NA
 562390 562391 PG1079 PG1080     TRUE 0.998 47.000 0.486 1.000 Y NA
 562392 562393 PG1081 PG1082 ackA pta TRUE 0.999 46.000 0.605 1.000 Y NA
 562393 562394 PG1082 PG1083 pta   FALSE 0.044 210.000 0.000 1.000   NA
 562394 562395 PG1083 PG1084     TRUE 0.491 48.000 0.000 1.000   NA
 562396 562397 PG1085 PG1087     FALSE 0.014 354.000 0.000 NA   NA
 562398 562399 PG1088 PG1089   rprY FALSE 0.274 97.000 0.000 1.000   NA
 562400 562401 PG1091 PG1093     FALSE 0.276 109.000 0.000 NA   NA
 562401 562402 PG1093 PG1094   pgm TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 562402 562403 PG1094 PG1095 pgm   TRUE 0.932 84.000 0.017 1.000 N NA
 562403 562404 PG1095 PG1096     FALSE 0.048 217.000 0.000 NA   NA
 562404 562405 PG1096 PG1097     TRUE 0.996 36.000 0.164 NA   NA
 562406 562407 PG1098 PGt25   tRNA-Arg-2 TRUE 0.454 58.000 0.000 NA   NA
 562407 562408 PGt25 PGt26 tRNA-Arg-2 tRNA-Arg-3 TRUE 0.713 36.000 0.000 NA   NA
 562408 562409 PGt26 PG1099 tRNA-Arg-3   FALSE 0.323 95.000 0.000 NA   NA
 562409 562410 PG1099 PG1100     TRUE 0.999 -7.000 0.591 NA   NA
 562410 562411 PG1100 PG1101     TRUE 0.921 -3.000 0.000 NA N NA
 562411 562412 PG1101 PG1102     FALSE 0.010 391.000 0.000 1.000   NA
 562413 562414 PG1103 PG1104     TRUE 0.789 26.000 0.000 0.020   NA
 562415 562416 PG1105 PG1106 rpoN murF TRUE 0.990 -6.000 0.014 1.000 N NA
 562418 562419 PG1108 PG1109     FALSE 0.018 317.000 0.000 NA   NA
 562423 562424 PG1114 PG1115 panD ffh TRUE 0.871 77.000 0.002 1.000 N NA
 562424 562425 PG1115 PG1116 ffh folD TRUE 0.924 124.000 0.032 1.000 N NA
 562425 562426 PG1116 PG1117 folD   FALSE 0.109 189.000 0.000 1.000 N NA
 562429 10692463 PG1121 PG1122 asnS   TRUE 0.796 32.000 0.000 NA   NA
 10692463 562430 PG1122 PG1123   purB FALSE 0.005 665.000 0.000 NA   NA
 562430 562431 PG1123 PG1124 purB   FALSE 0.176 135.000 0.000 1.000   NA
 562431 562432 PG1124 PG1125     TRUE 0.990 35.000 0.040 NA   NA
 562432 562433 PG1125 PG1126   uraA TRUE 0.888 19.000 0.000 NA   NA
 562434 562435 PG1127 PG1128   xseA TRUE 0.652 47.000 0.000 1.000 N NA
 562435 562436 PG1128 PG1129 xseA nrd FALSE 0.037 279.000 0.000 1.000 N NA
 562436 562437 PG1129 PG1130 nrd   FALSE 0.253 103.000 0.000 1.000   NA
 562437 562438 PG1130 PG1132   valS FALSE 0.003 862.000 0.000 1.000   NA
 562438 562439 PG1132 PG1133 valS   TRUE 0.984 29.000 0.004 NA   NA
 562439 562440 PG1133 PGt27   tRNA-Thr-3 TRUE 0.445 61.000 0.000 NA   NA
 562440 562441 PGt27 PG1134 tRNA-Thr-3 trxB FALSE 0.069 194.000 0.000 NA   NA
 562441 562442 PG1134 PG1135 trxB   FALSE 0.012 569.000 0.000 NA N NA
 562443 562444 PG1136 PG1137   porS TRUE 0.992 -37.000 0.079 1.000   NA
 562444 562445 PG1137 PG1138 porS porR TRUE 0.996 -3.000 0.045 1.000   NA
 562445 562446 PG1138 PG1139 porR   FALSE 0.075 180.000 0.000 1.000   NA
 562446 562447 PG1139 PG1140     FALSE 0.272 111.000 0.000 NA   NA
 562447 562448 PG1140 PG1141     TRUE 0.995 6.000 0.025 NA   NA
 562448 562449 PG1141 PG1142     FALSE 0.017 337.000 0.000 NA   NA
 562449 562450 PG1142 PG1143     FALSE 0.143 151.000 0.000 NA   NA
 562450 10692464 PG1143 PG1144     TRUE 0.605 44.000 0.000 NA   NA
 10692464 562451 PG1144 PG1145     FALSE 0.108 167.000 0.000 NA   NA
 562452 562453 PG1148 PG1149     FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 562453 562454 PG1149 PG1150     FALSE 0.199 137.000 0.000 NA   NA
 562454 562455 PG1150 PG1151     TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 562456 562457 PG1152 PG1153     TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 562457 562458 PG1153 PG1154     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 562459 562460 PG1155 PG1156     TRUE 0.727 -16.000 0.000 1.000   NA
 562461 562462 PG1159 PG1160 cbiB   TRUE 0.998 14.000 0.090 0.010 N NA
 562462 10692465 PG1160 PG1161     TRUE 0.822 -7.000 0.000 NA   NA
 10692465 562463 PG1161 PG1162     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562463 562464 PG1162 PG1163   cbiA TRUE 0.995 23.000 0.042 0.010   NA
 562464 562465 PG1163 PG1164 cbiA   FALSE 0.005 726.000 0.000 NA   NA
 562465 562466 PG1164 PG1165     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562466 562467 PG1165 PG1166     FALSE 0.393 73.000 0.000 NA   NA
 562470 562471 PG1170 PG1171     FALSE 0.030 320.000 0.000 NA N NA
 562471 562472 PG1171 PG1172     TRUE 0.997 78.000 0.508 NA Y NA
 562472 562473 PG1172 PG1173     TRUE 0.998 -24.000 0.508 0.002   NA
 562474 562475 PG1174 PG1175     FALSE 0.009 463.000 0.000 NA   NA
 562475 562476 PG1175 PG1176     TRUE 0.999 47.000 0.667 0.002 Y NA
 562476 562477 PG1176 PG1177     FALSE 0.204 150.000 0.000 1.000 N NA
 562477 562478 PG1177 PG1178     FALSE 0.087 181.000 0.000 NA   NA
 562478 562479 PG1178 PG1179     TRUE 1.000 4.000 0.857 NA   NA
 562479 562480 PG1179 PG1180     TRUE 0.995 78.000 0.714 NA   NA
 562480 562481 PG1180 PG1181     TRUE 0.592 41.000 0.000 1.000   NA
 562481 562482 PG1181 PG1184     FALSE 0.006 1080.000 0.000 NA N NA
 562482 562483 PG1184 PG1185     TRUE 0.883 22.000 0.000 NA   NA
 562483 562484 PG1185 PG1186     TRUE 0.542 -49.000 0.000 0.016   NA
 562485 562486 PG1189 PG1190   hprA FALSE 0.035 240.000 0.000 NA   NA
 562486 562487 PG1190 PG1195 hprA bioF-2 FALSE 0.012 914.000 0.000 1.000 Y NA
 562487 562488 PG1195 PG1196 bioF-2   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 562490 562491 PG1198 PG1199     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 562492 10692466 PG1200 PG1201     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 10692466 562493 PG1201 PG1202     FALSE 0.125 160.000 0.000 NA   NA
 562493 562494 PG1202 PG1203     FALSE 0.037 223.000 0.000 1.000   NA
 562496 562497 PG1206 PG1207     TRUE 0.822 -7.000 0.000 NA   NA
 562497 562498 PG1207 PG1208   dnaK TRUE 0.438 62.000 0.000 NA   NA
 562499 562500 PG1209 PG1210     TRUE 0.952 49.000 0.015 NA   NA
 562500 562501 PG1210 PG1211     TRUE 0.987 -30.000 0.043 1.000   NA
 562501 562502 PG1211 PG1212     TRUE 0.868 13.000 0.000 1.000   NA
 562502 562503 PG1212 PG1213   rnhA TRUE 0.818 28.000 0.000 1.000   NA
 562503 562504 PG1213 PG1214 rnhA   TRUE 0.991 -51.000 0.071 NA   NA
 562504 562505 PG1214 PG1215     FALSE 0.015 351.000 0.000 NA   NA
 562505 562506 PG1215 PG1216     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562506 562507 PG1216 PG1217     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 562507 562508 PG1217 PG1218     TRUE 0.998 30.000 0.172 NA   NA
 562508 562509 PG1218 PG1219     FALSE 0.027 276.000 0.000 NA   NA
 562509 562510 PG1219 PG1220     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 562510 562511 PG1220 PG1221     TRUE 0.834 10.000 0.000 0.040   NA
 562513 10692467 PG1223 PG1224     FALSE 0.039 235.000 0.000 NA   NA
 10692467 562514 PG1224 PG1225     TRUE 0.864 26.000 0.000 NA   NA
 562514 562515 PG1225 PG1226     TRUE 0.870 8.000 0.000 1.000   NA
 562516 562517 PG1229 PG1230     FALSE 0.278 108.000 0.000 NA   NA
 562517 562518 PG1230 PG1232   gdh FALSE 0.056 206.000 0.000 NA   NA
 562519 562520 PG1233 PG1234     FALSE 0.257 117.000 0.000 NA   NA
 562522 562523 PG1236 PG1237     TRUE 1.000 -3.000 0.793 NA   NA
 10692468 562524 PG1238 PG1239   fabG TRUE 0.605 44.000 0.000 NA   NA
 562524 562525 PG1239 PG1240 fabG   TRUE 0.989 84.000 0.204 1.000 N NA
 562525 562526 PG1240 PGt28   tRNA-Gln-2 FALSE 0.031 252.000 0.000 NA   NA
 562527 562528 PG1241 PG1242 lepA dnaB TRUE 0.969 35.000 0.002 1.000 N NA
 562528 562529 PG1242 PG1244 dnaB   FALSE 0.023 513.000 0.000 0.075 Y NA
 562529 562530 PG1244 PG1246   alaS FALSE 0.005 1180.000 0.000 1.000 N NA
 562530 562531 PG1246 PG1247 alaS aroB TRUE 0.991 15.000 0.003 1.000 N NA
 562531 562532 PG1247 PGt29 aroB tRNA-Pro-2 TRUE 0.713 36.000 0.000 NA   NA
 562533 562534 PG1248 PG1249     TRUE 0.931 15.000 0.000 NA N NA
 562534 562535 PG1249 PG1250     TRUE 0.879 23.000 0.000 NA   NA
 562537 562538 PG1252 PG1253   ligA TRUE 0.922 13.000 0.000 1.000 N NA
 562538 562539 PG1253 PG1254 ligA   TRUE 0.852 -12.000 0.000 1.000 N NA
 562539 562540 PG1254 PG1255   recR TRUE 0.924 7.000 0.000 1.000 N NA
 562540 562541 PG1255 PG1256 recR   TRUE 0.987 -3.000 0.002 1.000 N NA
 562541 562542 PG1256 PG1257     FALSE 0.061 199.000 0.000 NA   NA
 562542 562543 PG1257 PG1258   hup-2 TRUE 0.812 31.000 0.000 NA   NA
 562543 562544 PG1258 PG1259 hup-2 nrdG FALSE 0.353 112.000 0.000 1.000 N NA
 562544 562545 PG1259 PG1260 nrdG   TRUE 0.999 33.000 0.315 1.000 N NA
 562547 562548 PG1262     Pg5SB FALSE 0.005 739.000 0.000 NA   NA
 562548 562549     Pg5SB Pg23SB FALSE 0.158 147.000 0.000 NA   NA
 562549 562550   PGt30 Pg23SB tRNA-Ala-3 FALSE 0.252 119.000 0.000 NA   NA
 562550 562551 PGt30 PGt31 tRNA-Ala-3 tRNA-Ile-2 TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 562551 562552 PGt31 PG1264 tRNA-Ile-2   TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 562552 562553 PG1264 PG1265     FALSE 0.223 129.000 0.000 NA   NA
 562553 562554 PG1265     Pg16SB FALSE 0.265 113.000 0.000 NA   NA
 562554 562555   PG1266 Pg16SB   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 562556 562557 PG1267 PG1268     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 562558 562559 PG1269 PG1270 pruA   FALSE 0.333 77.000 0.000 1.000   NA
 562559 562560 PG1270 PG1271     TRUE 0.990 7.000 0.008 1.000   NA
 562560 562561 PG1271 PG1273     FALSE 0.035 239.000 0.000 NA   NA
 562562 562563 PG1274 PG1276 efp-2   FALSE 0.006 536.000 0.000 1.000   NA
 562563 562564 PG1276 PG1277     FALSE 0.017 303.000 0.000 1.000   NA
 562564 562565 PG1277 PG1278   serC FALSE 0.025 333.000 0.000 1.000 N NA
 562565 562566 PG1278 PG1279 serC   TRUE 0.993 101.000 0.238 1.000 Y NA
 562566 562567 PG1279 PG1280     TRUE 0.998 19.000 0.109 1.000   NA
 562567 562568 PG1280 PG1281     FALSE 0.233 127.000 0.000 NA   NA
 562568 562569 PG1281 PG1282     TRUE 0.991 24.000 0.011 NA   NA
 562569 562570 PG1282 PG1283     TRUE 0.926 63.000 0.016 1.000   NA
 562570 562571 PG1283 PG1285     FALSE 0.077 179.000 0.000 1.000   NA
 562573 562574 PG1288 PG1289 gmd fcl TRUE 0.926 -7.000 0.000 0.006 Y NA
 562574 562575 PG1289 PG1290 fcl ilvE FALSE 0.255 139.000 0.000 1.000 N NA
 562577 562578 PG1294 PG1296 feoB-2   FALSE 0.051 213.000 0.000 NA   NA
 562578 562579 PG1296 PG1297   rpsA FALSE 0.007 582.000 0.000 NA   NA
 562580 562581 PG1300 PG1301     TRUE 0.978 37.000 0.017 NA   NA
 562581 562582 PG1301 PG1302     TRUE 0.996 18.000 0.042 NA   NA
 562584 562585 PG1304 PG1305   gcvP FALSE 0.063 197.000 0.000 NA   NA
 562585 562586 PG1305 PG1306 gcvP   TRUE 0.994 5.000 0.021 1.000   NA
 562586 562587 PG1306 PG1307   gidB TRUE 0.993 -3.000 0.024 1.000   NA
 562587 562588 PG1307 PG1308 gidB   TRUE 0.974 34.000 0.005 NA   NA
 562589 562590 PG1310 PG1311     TRUE 0.690 -37.000 0.000 NA   NA
 562590 562591 PG1311 PG1312     TRUE 0.869 11.000 0.000 1.000   NA
 562591 562592 PG1312 PG1313     FALSE 0.006 809.000 0.000 1.000 N NA
 562592 562593 PG1313 PGt32   tRNA-Arg-4 FALSE 0.393 73.000 0.000 NA   NA
 562594 562595 PG1314 PG1315 aroC slyD TRUE 0.757 150.000 0.008 1.000 N NA
 562595 562596 PG1315 PG1316 slyD   TRUE 0.501 51.000 0.000 NA   NA
 562596 562597 PG1316 PG1317     TRUE 0.996 -27.000 0.143 NA   NA
 562597 562598 PG1317 PG1318     TRUE 0.988 48.000 0.095 NA   NA
 562602 562603 PG1324 PG1325 ruvC   TRUE 0.922 73.000 0.016 NA   NA
 562605 562606 PG1327 PG1328     TRUE 0.736 43.000 0.000 NA N NA
 562607 10692469 PG1330 PG1331 mscL   FALSE 0.013 379.000 0.000 NA   NA
 10692469 562608 PG1331 PG1332   pntB TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562609 562610 PG1333 PG1334     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562610 562611 PG1334 PG1335     TRUE 0.999 28.000 0.259 NA Y NA
 562612 562613 PG1337 PG1338 umuD umuC TRUE 0.870 8.000 0.000 1.000   NA
 562615 562616 PG1341 PG1342   murB TRUE 0.990 0.000 0.006 NA   NA
 562616 562617 PG1342 PG1343 murB lipB TRUE 0.996 27.000 0.056 1.000   NA
 562617 562618 PG1343 PG1345 lipB   FALSE 0.007 484.000 0.000 1.000   NA
 562618 562619 PG1345 PG1346     TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 562619 562620 PG1346 PG1347     FALSE 0.169 137.000 0.000 1.000   NA
 562620 562621 PG1347 PG1348     TRUE 0.984 28.000 0.005 1.000   NA
 562621 562622 PG1348 PG1350     FALSE 0.004 1377.000 0.000 1.000 N NA
 562623 562624 PG1351 PG1352     TRUE 0.982 -7.000 0.004 NA   NA
 562624 562625 PG1352 PG1353   pyrE TRUE 0.986 51.000 0.096 NA   NA
 562625 562626 PG1353 PG1354 pyrE   FALSE 0.234 111.000 0.000 1.000   NA
 562626 562627 PG1354 PG1355     TRUE 0.997 -3.000 0.082 1.000   NA
 562627 562628 PG1355 PG1356     TRUE 0.985 69.000 0.144 NA   NA
 562628 562629 PG1356 PG1357     FALSE 0.009 478.000 0.000 NA   NA
 562629 562630 PG1357 PG1358     FALSE 0.067 195.000 0.000 NA   NA
 562630 562631 PG1358 PG1359     FALSE 0.019 311.000 0.000 NA   NA
 562631 562632 PG1359 PG1360   purD TRUE 0.994 3.000 0.019 NA   NA
 562632 562633 PG1360 PG1361 purD   TRUE 0.994 -3.000 0.017 1.000 N NA
 562633 562634 PG1361 PG1362     TRUE 0.994 32.000 0.035 1.000 N NA
 562636 562637 PG1364 PG1365 dxr   TRUE 0.992 -3.000 0.008 1.000 N NA
 562637 562638 PG1365 PG1366   murA TRUE 0.996 7.000 0.024 1.000 N NA
 562638 562639 PG1366 PG1367 murA   TRUE 0.999 31.000 0.354 NA   NA
 562639 562640 PG1367 PG1368   pgi TRUE 0.990 20.000 0.005 NA   NA
 562640 562641 PG1368 PG1369 pgi gpsA TRUE 0.995 33.000 0.055 1.000 N NA
 562641 562642 PG1369 PG1370 gpsA lysS TRUE 0.954 86.000 0.034 1.000 N NA
 562642 562643 PG1370 PG1371 lysS   FALSE 0.327 123.000 0.000 1.000 N NA
 562643 562644 PG1371 PG1372     TRUE 0.906 71.000 0.011 1.000   NA
 562649 562650 PG1379 PG1380     TRUE 0.998 52.000 0.500 1.000 Y NA
 562650 562651 PG1380 PG1381     TRUE 1.000 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 562651 562652 PG1381 PG1382     TRUE 0.683 -40.000 0.000 NA   NA
 562652 562653 PG1382 PG1383     FALSE 0.061 199.000 0.000 NA   NA
 562654 562655 PG1385 PG1386   gyrA TRUE 0.988 34.000 0.031 1.000   NA
 562655 562656 PG1386 PG1387 gyrA   FALSE 0.081 184.000 0.000 NA   NA
 562656 562657 PG1387 PG1388     TRUE 0.686 37.000 0.000 NA   NA
 562657 562658 PG1388 PG1389     TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 562660 562661 PG1392 PG1393     TRUE 0.997 -10.000 0.161 1.000   NA
 562661 562662 PG1393 PG1394     TRUE 0.998 -7.000 0.220 1.000   NA
 562662 562663 PG1394 PG1395     TRUE 0.998 0.000 0.104 0.004   NA
 562663 562664 PG1395 PG1396   mreB TRUE 0.999 38.000 0.689 1.000 N NA
 562664 562665 PG1396 PG1397 mreB purH TRUE 0.960 103.000 0.059 1.000 N NA
 562667 562668 PG1401 PG1402     FALSE 0.052 253.000 0.000 NA N NA
 562668 562669 PG1402 PG1403     TRUE 0.899 210.000 0.270 NA   NA
 562669 562670 PG1403 PG1404     TRUE 0.999 32.000 0.817 0.035   NA
 562670 562671 PG1404 PG1405     TRUE 0.992 27.000 0.020 1.000   NA
 562671 562672 PG1405 PG1407     FALSE 0.008 443.000 0.000 1.000   NA
 562677 562678 PG1414 PG1416   fabK FALSE 0.009 433.000 0.000 1.000   NA
 562678 562679 PG1416 PG1417 fabK fumB FALSE 0.018 297.000 0.000 1.000   NA
 562679 562680 PG1417 PG1418 fumB dnaX FALSE 0.327 123.000 0.000 1.000 N NA
 562680 562681 PG1418 PG1419 dnaX   FALSE 0.241 125.000 0.000 NA   NA
 562681 562682 PG1419 PG1420     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 562683 562684 PG1421 PG1422   dacB FALSE 0.014 336.000 0.000 1.000   NA
 562684 562685 PG1422 PG1423 dacB   TRUE 0.743 -21.000 0.000 NA   NA
 562685 562686 PG1423 PG1424     TRUE 0.528 49.000 0.000 NA   NA
 562686 562687 PG1424 PG1426     FALSE 0.016 345.000 0.000 NA   NA
 562687 562688 PG1426 PG1427     FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 562688 562689 PG1427 PG1428   ribH FALSE 0.148 141.000 0.000 1.000   NA
 562689 562690 PG1428 PG1429 ribH   TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 562690 562691 PG1429 PG1430     TRUE 0.890 1.000 0.000 NA   NA
 562691 562692 PG1430 PG1431     FALSE 0.065 186.000 0.000 1.000   NA
 562692 562693 PG1431 PG1432     TRUE 0.712 65.000 0.000 1.000 Y NA
 562694 562695 PG1433 PG1434   ispD TRUE 0.964 -24.000 0.003 1.000   NA
 562695 562696 PG1434 PGt33 ispD tRNA-Asp-1 FALSE 0.043 229.000 0.000 NA   NA
 562696 562697 PGt33 PG1435 tRNA-Asp-1   FALSE 0.020 308.000 0.000 NA   NA
 562697 562698 PG1435 PG1436     FALSE 0.199 127.000 0.000 1.000   NA
 562699 562700 PG1439 PG1440     TRUE 0.805 -10.000 0.000 NA   NA
 562700 562701 PG1440 PG1441     FALSE 0.334 91.000 0.000 NA   NA
 562701 562702 PG1441 PG1442     FALSE 0.379 77.000 0.000 NA   NA
 10692470 562704 PG1445 PG1446     FALSE 0.024 286.000 0.000 NA   NA
 562704 562705 PG1446 PG1447     FALSE 0.275 136.000 0.000 1.000 N NA
 562707 562708 PG1449 PG1450     TRUE 0.667 38.000 0.000 NA   NA
 562710 562711 PG1452 PG1453     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562711 562712 PG1453 PG1454     TRUE 1.000 26.000 0.889 0.012 Y NA
 10692471 562713 PG1456 PG1457     FALSE 0.298 102.000 0.000 NA   NA
 562713 562714 PG1457 PG1458     TRUE 0.856 27.000 0.000 NA   NA
 562716 562717 PG1460 PG1461     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562717 562718 PG1461 PG1462     TRUE 0.889 13.000 0.000 NA   NA
 562718 562719 PG1462 PG1463     TRUE 0.879 23.000 0.000 NA   NA
 562719 562720 PG1463 PG1465     FALSE 0.006 591.000 0.000 NA   NA
 562720 562721 PG1465 PG1466     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562721 562722 PG1466 PG1467     TRUE 0.931 15.000 0.000 NA N NA
 562724 562725 PG1470 PG1471     FALSE 0.090 180.000 0.000 NA   NA
 562725 562726 PG1471 PG1472     TRUE 0.734 35.000 0.000 NA   NA
 562727 562728 PG1473 PG1474     TRUE 0.889 13.000 0.000 NA   NA
 562728 562729 PG1474 PG1475     TRUE 0.832 -6.000 0.000 NA   NA
 562729 562730 PG1475 PG1476     TRUE 1.000 23.000 1.000 NA   NA
 562730 562731 PG1476 PG1477     TRUE 0.999 -10.000 0.667 NA   NA
 562731 562732 PG1477 PG1478     TRUE 1.000 -3.000 0.667 NA   NA
 562732 562733 PG1478 PG1479     TRUE 0.890 12.000 0.000 NA   NA
 562733 562734 PG1479 PG1480     TRUE 0.796 32.000 0.000 NA   NA
 562734 562735 PG1480 PG1481     TRUE 0.856 27.000 0.000 NA   NA
 562735 562736 PG1481 PG1482     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562736 562737 PG1482 PG1483     TRUE 1.000 4.000 0.667 NA   NA
 562737 562738 PG1483 PG1484     FALSE 0.074 190.000 0.000 NA   NA
 562738 562739 PG1484 PG1485     TRUE 0.891 5.000 0.000 NA   NA
 562739 562740 PG1485 PG1486     TRUE 0.999 -13.000 0.429 NA   NA
 562741 562742 PG1487 PG1488     TRUE 0.846 28.000 0.000 NA   NA
 562742 562743 PG1488 PG1489     TRUE 0.775 -15.000 0.000 NA   NA
 562743 562744 PG1489 PG1490     TRUE 0.999 2.000 0.333 NA   NA
 562744 562745 PG1490 PG1491     FALSE 0.018 317.000 0.000 NA   NA
 562745 562746 PG1491 PG1492     FALSE 0.316 97.000 0.000 NA   NA
 562746 562747 PG1492 PG1493     TRUE 0.887 17.000 0.000 NA   NA
 562747 562748 PG1493 PG1494     FALSE 0.012 383.000 0.000 NA   NA
 562748 562749 PG1494 PG1495   topB-2 FALSE 0.340 89.000 0.000 NA   NA
 562749 562750 PG1495 PG1496 topB-2   TRUE 0.891 6.000 0.000 NA   NA
 562750 562751 PG1496 PG1497     FALSE 0.009 468.000 0.000 NA   NA
 562751 562752 PG1497 PG1498     FALSE 0.303 101.000 0.000 NA   NA
 562752 562753 PG1498 PG1499     TRUE 0.676 -46.000 0.000 NA   NA
 562753 562754 PG1499 PG1500     FALSE 0.373 78.000 0.000 NA   NA
 562756 562757 PG1503 PG1504     TRUE 0.963 18.000 0.000 1.000 Y NA
 562757 562758 PG1504 PG1505     TRUE 0.478 64.000 0.000 0.034 N NA
 562758 562759 PG1505 PG1507     FALSE 0.008 499.000 0.000 NA   NA
 562759 562760 PG1507 PG1508     TRUE 0.890 11.000 0.000 NA   NA
 562760 562761 PG1508 PG1509     FALSE 0.358 83.000 0.000 NA   NA
 562765 562766 PG1513 PG1514     TRUE 0.920 15.000 0.000 1.000 N NA
 562766 562767 PG1514 PG1515     TRUE 0.760 -12.000 0.000 1.000   NA
 562767 562768 PG1515 PG1516     TRUE 0.623 -49.000 0.000 1.000   NA
 562770 562771 PG1521 PG1522     TRUE 0.998 -3.000 0.104 0.037 N NA
 562771 562772 PG1522 PG1523   menB TRUE 0.998 0.000 0.065 1.000 N NA
 562772 562773 PG1523 PG1524 menB menD TRUE 0.999 25.000 0.147 0.002 Y NA
 562773 562774 PG1524 PG1525 menD   TRUE 1.000 13.000 0.281 1.000 Y NA
 562774 562775 PG1525 PG1526     TRUE 0.557 67.000 0.000 NA N NA
 562775 562776 PG1526 PG1527     FALSE 0.064 196.000 0.000 NA   NA
 562777 562778 PG1528 PG1529     FALSE 0.233 127.000 0.000 NA   NA
 562778 562779 PG1529 PG1530     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562779 10692473 PG1530 PG1531     FALSE 0.181 140.000 0.000 NA   NA
 562780 562781 PG1532 PG1533     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562781 562782 PG1533 PG1534     TRUE 1.000 -3.000 0.667 NA   NA
 562782 562783 PG1534 PG1535     TRUE 0.870 3.000 0.000 1.000   NA
 562784 562785 PG1536 PG1537     TRUE 0.996 -25.000 0.155 NA   NA
 562785 562786 PG1537 PG1538     TRUE 0.987 108.000 0.398 NA   NA
 562786 10692474 PG1538 PG1539     TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 10692474 562787 PG1539 PG1540   queA TRUE 0.888 18.000 0.000 NA   NA
 562787 562788 PG1540 PG1541 queA folK TRUE 0.995 -3.000 0.023 1.000 N NA
 562788 562789 PG1541 PG1542 folK prtC TRUE 0.922 13.000 0.000 1.000 N NA
 562789 562790 PG1542 PG1543 prtC   TRUE 0.989 56.000 0.157 NA   NA
 562790 562791 PG1543 PG1544   yaaA FALSE 0.352 85.000 0.000 NA   NA
 562791 562792 PG1544 PG1545 yaaA sodB FALSE 0.164 138.000 0.000 1.000   NA
 562792 562793 PG1545 PG1546 sodB   TRUE 0.890 12.000 0.000 NA   NA
 562793 562794 PG1546 PG1547     TRUE 0.785 -13.000 0.000 NA   NA
 562794 562795 PG1547 PGt34   tRNA-Arg-5 TRUE 0.891 5.000 0.000 NA   NA
 562795 10692475 PGt34 PG1548 tRNA-Arg-5   FALSE 0.168 145.000 0.000 NA   NA
 562797 562798 PG1551 PG1552 hmuY hmuR TRUE 1.000 15.000 0.562 NA   NA
 562798 562799 PG1552 PG1553 hmuR   TRUE 0.996 37.000 0.188 1.000   NA
 562799 562800 PG1553 PG1554     TRUE 1.000 -3.000 0.750 NA   NA
 562800 562801 PG1554 PG1555     TRUE 0.997 70.000 1.000 NA   NA
 562801 562802 PG1555 PG1556     TRUE 1.000 6.000 1.000 NA   NA
 562803 562804 PG1559 PG1560 gcvT rfbB TRUE 0.483 75.000 0.000 1.000 N NA
 562804 562805 PG1560 PG1561 rfbB rfbD TRUE 0.999 7.000 0.200 0.004 Y NA
 562805 562806 PG1561 PG1562 rfbD rfbC TRUE 0.999 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 562806 562807 PG1562 PG1563 rfbC rfbA TRUE 0.962 15.000 0.000 1.000 Y NA
 562807 562808 PG1563 PG1564 rfbA   TRUE 0.537 115.000 0.000 1.000 Y NA
 562808 562809 PG1564 PG1565     TRUE 0.641 85.000 0.000 1.000 Y NA
 562809 562810 PG1565 PG1566   gltX TRUE 0.997 25.000 0.041 1.000 N NA
 562810 562811 PG1566 PG1570 gltX   FALSE 0.005 1181.000 0.000 NA N NA
 562811 562812 PG1570 PG1571     TRUE 0.992 -27.000 0.065 NA   NA
 562812 562813 PG1571 PG1572     FALSE 0.286 93.000 0.000 1.000   NA
 562813 562814 PG1572 PG1573     TRUE 0.992 65.000 0.333 1.000   NA
 562814 562815 PG1573 PG1574     FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 562816 562817 PG1576 PG1577 nadB nadC TRUE 0.997 47.000 0.223 0.003 Y NA
 562817 562818 PG1577 PG1578 nadC nadA TRUE 0.999 20.000 0.198 0.003 Y NA
 562818 562819 PG1578 PG1579 nadA   FALSE 0.262 101.000 0.000 1.000   NA
 562819 562820 PG1579 PG1580     TRUE 1.000 11.000 0.764 NA   NA
 562820 562821 PG1580 PG1581     TRUE 0.999 -3.000 0.541 NA   NA
 562821 562822 PG1581 PG1582   batA TRUE 0.999 -3.000 0.538 NA   NA
 562822 562823 PG1582 PG1583 batA batB TRUE 1.000 11.000 0.404 NA Y NA
 562823 562824 PG1583 PG1584 batB batC TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562824 562825 PG1584 PG1585 batC batD FALSE 0.087 181.000 0.000 NA   NA
 562825 562826 PG1585 PG1586 batD batE TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562826 562827 PG1586 PG1587 batE   TRUE 0.863 21.000 0.000 1.000   NA
 562828 562829 PG1588 PG1589   folP TRUE 0.986 61.000 0.133 NA   NA
 562830 562831 PG1591 PGt35   tRNA-His-1 FALSE 0.368 79.000 0.000 NA   NA
 562831 562832 PGt35 PG1592 tRNA-His-1   FALSE 0.050 216.000 0.000 NA   NA
 562832 562833 PG1592 PG1593   aroK TRUE 0.933 48.000 0.006 1.000   NA
 562834 562835 PG1594 PG1595   rpe TRUE 0.993 7.000 0.014 NA   NA
 562836 562837 PG1596 PG1597     TRUE 0.987 70.000 0.135 1.000 N NA
 562837 562838 PG1597 PG1598     TRUE 0.999 4.000 0.157 1.000 N NA
 562838 562839 PG1598 PG1599     TRUE 0.999 -3.000 0.423 NA   NA
 562840 562841 PG1600 PG1601     TRUE 0.693 35.000 0.000 1.000   NA
 562841 562842 PG1601 PG1602     TRUE 0.988 -28.000 0.036 NA   NA
 562843 562844 PG1603 PG1604     TRUE 0.977 -12.000 0.005 1.000   NA
 562844 562845 PG1604 PG1605   pepC FALSE 0.232 112.000 0.000 1.000   NA
 562846 562847 PG1606 PG1608   mmdB FALSE 0.003 1060.000 0.000 1.000   NA
 562847 562848 PG1608 PG1609 mmdB mmdC TRUE 0.999 5.000 0.222 1.000 N NA
 562848 562849 PG1609 PG1610 mmdC   TRUE 0.667 38.000 0.000 NA   NA
 562849 562850 PG1610 PG1611     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562850 562851 PG1611 PG1612   mmdA TRUE 0.998 25.000 0.162 1.000   NA
 562851 562852 PG1612 PG1613 mmdA   TRUE 0.954 99.000 0.067 1.000   NA
 562852 562853 PG1613 PG1614   frdB FALSE 0.034 232.000 0.000 1.000   NA
 562853 562854 PG1614 PG1615 frdB frdA TRUE 1.000 29.000 0.470 0.002 Y NA
 562854 562855 PG1615 PG1616 frdA   TRUE 0.999 31.000 0.598 0.002   NA
 562855 562856 PG1616 PG1617     TRUE 0.558 47.000 0.000 NA   NA
 562857 562858 PG1618 PG1619     TRUE 0.997 -21.000 0.163 NA   NA
 562859 562860 PG1620 PG1621     TRUE 0.994 -7.000 0.046 1.000   NA
 562860 562861 PG1621 PG1622     TRUE 0.976 -13.000 0.005 1.000   NA
 562861 562862 PG1622 PG1623     FALSE 0.396 61.000 0.000 1.000   NA
 562862 562863 PG1623 PG1624     FALSE 0.003 823.000 0.000 1.000   NA
 562864 562865 PG1625 PG1626     TRUE 0.957 104.000 0.074 NA   NA
 562865 562866 PG1626 PG1630     FALSE 0.003 1366.000 0.000 NA   NA
 562866 562867 PG1630 PG1632   galM FALSE 0.056 206.000 0.000 NA   NA
 562867 562868 PG1632 PG1633 galM galK TRUE 0.968 50.000 0.006 1.000 Y NA
 562869 562870 PG1634 PG1635     TRUE 0.425 66.000 0.000 NA   NA
 562870 562871 PG1635 PG1636     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 562871 562872 PG1636 PG1638     FALSE 0.083 204.000 0.000 1.000 N NA
 562872 562873 PG1638 PG1639     FALSE 0.238 126.000 0.000 NA   NA
 562873 562874 PG1639 PG1640   dinF TRUE 0.886 16.000 0.000 NA   NA
 562874 562875 PG1640 PG1641 dinF   TRUE 0.920 15.000 0.000 1.000 N NA
 562875 10692476 PG1641 PG1642     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 10692476 562876 PG1642 PG1644     FALSE 0.010 458.000 0.000 NA   NA
 562876 562877 PG1644 PG1645     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 562878 562879 PG1647 PG1648 cls   TRUE 0.516 68.000 0.000 1.000 N NA
 562881 562882 PG1651 PG1652     TRUE 0.829 27.000 0.000 1.000   NA
 562882 562883 PG1652 PG1653     TRUE 0.847 25.000 0.000 1.000   NA
 562883 562884 PG1653 PG1654     FALSE 0.320 80.000 0.000 1.000   NA
 562884 562885 PG1654 PG1655     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 562885 562886 PG1655 PG1656   mutA FALSE 0.133 155.000 0.000 NA   NA
 562886 562887 PG1656 PG1657 mutA mutB TRUE 0.999 29.000 0.115 0.001 Y NA
 562888 562889 PG1658 PG1659     FALSE 0.010 451.000 0.000 NA   NA
 562889 562890 PG1659 PG1660     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562891 562892 PG1661 PG1662     TRUE 0.751 -19.000 0.000 NA   NA
 562892 562893 PG1662 PG1663     TRUE 0.888 19.000 0.000 NA   NA
 562893 562894 PG1663 PG1664     TRUE 0.998 25.000 0.029 1.000 Y NA
 562894 562895 PG1664 PG1665     TRUE 0.999 23.000 0.083 0.060 Y NA
 562895 562896 PG1665 PG1666     TRUE 0.993 70.000 0.319 0.060 N NA
 562896 562897 PG1666 PG1667     TRUE 1.000 -3.000 0.528 1.000 Y NA
 562898 562899     Pg5SC Pg23SC FALSE 0.158 147.000 0.000 NA   NA
 562899 562900   PGt36 Pg23SC tRNA-Ala-4 FALSE 0.252 119.000 0.000 NA   NA
 562900 562901 PGt36 PGt37 tRNA-Ala-4 tRNA-Ile-3 TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 562901 562902 PGt37 PG1669 tRNA-Ile-3   TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 562902 562903 PG1669 PG1670     FALSE 0.223 129.000 0.000 NA   NA
 562903 562904 PG1670     Pg16SC FALSE 0.265 113.000 0.000 NA   NA
 562904 562905   PG1671 Pg16SC   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 562906 562907 PG1672 PG1673     FALSE 0.007 584.000 0.000 NA   NA
 562907 10692477 PG1673 PG1674     FALSE 0.233 127.000 0.000 NA   NA
 10692477 562908 PG1674 PG1675     FALSE 0.151 148.000 0.000 NA   NA
 562912 10692478 PG1679 PG1680     TRUE 0.713 36.000 0.000 NA   NA
 10692478 562913 PG1680 PG1681     FALSE 0.008 487.000 0.000 NA   NA
 562913 562914 PG1681 PG1682     TRUE 0.999 -3.000 0.153 1.000 Y NA
 562914 562915 PG1682 PG1683     TRUE 1.000 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 562915 562916 PG1683 PG1684     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562917 562918 PG1685 PG1687     FALSE 0.004 814.000 0.000 NA   NA
 562918 562919 PG1687 PG1688   greA TRUE 0.999 15.000 0.108 1.000 N NA
 562919 562920 PG1688 PG1690 greA   FALSE 0.015 485.000 0.000 NA N NA
 562920 562921 PG1690 PG1691     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 562921 562922 PG1691 PG1692     TRUE 0.987 30.000 0.012 NA   NA
 562922 562923 PG1692 PG1693     TRUE 0.997 -3.000 0.039 1.000 N NA
 562923 562924 PG1693 PG1694     TRUE 0.987 -3.000 0.003 NA   NA
 562925 562926 PG1695 PG1696     FALSE 0.016 342.000 0.000 NA   NA
 562926 562927 PG1696 PG1697     TRUE 1.000 10.000 0.542 NA   NA
 562928 562929 PG1701 PG1702   gyrB TRUE 0.984 -7.000 0.003 1.000 N NA
 562929 562930 PG1702 PG1703 gyrB   TRUE 0.405 58.000 0.000 1.000   NA
 562930 562931 PG1703 PG1704     TRUE 0.989 18.000 0.006 1.000   NA
 562931 10692479 PG1704 PG1705     TRUE 0.713 36.000 0.000 NA   NA
 10692479 562932 PG1705 PG1706     TRUE 0.887 20.000 0.000 NA   NA
 562932 562933 PG1706 PG1707     TRUE 0.994 21.000 0.021 NA   NA
 562934 562935 PG1709 PG1710     TRUE 0.475 54.000 0.000 NA   NA
 562936 562937 PG1711 PG1712     TRUE 0.672 67.000 0.000 0.033 Y NA
 562937 562938 PG1712 PG1713     TRUE 0.494 82.000 0.000 NA N NA
 562938 562939 PG1713 PG1714   pdxH TRUE 0.791 37.000 0.000 NA N NA
 562939 562940 PG1714 PG1715 pdxH   FALSE 0.003 901.000 0.000 1.000   NA
 562940 562941 PG1715 PG1718     FALSE 0.009 476.000 0.000 NA   NA
 562942 562943 PG1719 PG1720     TRUE 0.886 16.000 0.000 NA   NA
 562943 562944 PG1720 PG1721   vacB FALSE 0.181 140.000 0.000 NA   NA
 562946 562947 PGt38 PG1723 tRNA-Glu-1 rpsT TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 562947 562948 PG1723 PGt39 rpsT tRNA-Glu-2 TRUE 0.429 65.000 0.000 NA   NA
 562948 562949 PGt39 PG1724 tRNA-Glu-2 gcp FALSE 0.025 282.000 0.000 NA   NA
 562949 562950 PG1724 PG1725 gcp   TRUE 0.889 0.000 0.000 NA   NA
 562950 562951 PG1725 PG1726     TRUE 0.975 33.000 0.004 NA   NA
 562951 562952 PG1726 PG1727   yitL TRUE 0.891 10.000 0.000 NA   NA
 562952 562953 PG1727 PG1728 yitL   FALSE 0.399 72.000 0.000 NA   NA
 562954 562955 PG1729 PG1730     TRUE 0.528 46.000 0.000 1.000   NA
 562955 562956 PG1730 PG1731   aroQ TRUE 0.868 101.000 0.014 1.000   NA
 562958 562959 PG1733 PG1734     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562959 562960 PG1734 PG1735     TRUE 0.652 -33.000 0.000 1.000   NA
 562960 10692480 PG1735 PG1737     TRUE 0.775 -15.000 0.000 NA   NA
 10692480 562961 PG1737 PG1738     TRUE 0.605 44.000 0.000 NA   NA
 562961 562962 PG1738 PG1739     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 562962 562963 PG1739 PG1741   aspA FALSE 0.158 147.000 0.000 NA   NA
 562965 562966 PG1743 PG1745 kdsA   FALSE 0.004 1087.000 0.000 0.014 N NA
 562966 562967 PG1745 PG1746     TRUE 0.480 76.000 0.000 1.000 N NA
 562967 562968 PG1746 PG1747     FALSE 0.208 148.000 0.000 1.000 N NA
 562968 562969 PG1747 PG1748   tkt TRUE 0.991 87.000 0.144 1.000 Y NA
 562970 562971 PG1750 PG1751     FALSE 0.269 137.000 0.000 1.000 N NA
 562971 562972 PG1751 PG1752     TRUE 0.765 -16.000 0.000 NA   NA
 562972 562973 PG1752 PG1753   selD TRUE 0.988 -3.000 0.005 NA   NA
 562973 562974 PG1753 PG1754 selD   TRUE 0.963 18.000 0.000 1.000 Y NA
 562975 562976 PG1755 PG1757 fbaB   FALSE 0.005 653.000 0.000 1.000   NA
 562977 562978 PG1758 PG1759 rpsO   FALSE 0.341 116.000 0.000 1.000 N NA
 562978 562979 PG1759 PG1760     TRUE 1.000 -10.000 0.509 1.000 Y NA
 562979 562980 PG1760 PG1761     TRUE 0.616 -52.000 0.000 1.000   NA
 562980 562981 PG1761 PG1762   secDF FALSE 0.039 218.000 0.000 1.000   NA
 562982 562983 PG1763 PG1764 rnc fabF TRUE 0.990 84.000 0.225 1.000 N NA
 562983 562984 PG1764 PG1765 fabF acpP TRUE 0.998 10.000 0.028 1.000 Y NA
 562985 562986 PG1766 PG1767 purN   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 562986 562987 PG1767 PG1768     TRUE 0.839 26.000 0.000 1.000   NA
 562987 562988 PG1768 PG1769     TRUE 0.891 5.000 0.000 NA   NA
 562988 562989 PG1769 PG1770     FALSE 0.014 354.000 0.000 NA   NA
 562989 562990 PG1770 PG1771   pheS FALSE 0.379 77.000 0.000 NA   NA
 562990 562991 PG1771 PG1772 pheS nth TRUE 0.991 19.000 0.004 1.000 N NA
 562991 562992 PG1772 PG1773 nth   TRUE 0.536 62.000 0.000 1.000 N NA
 562994 562995 PG1775 PG1776 grpE dnaJ TRUE 0.997 43.000 0.168 0.008 Y NA
 562995 562996 PG1776 PG1777 dnaJ   FALSE 0.348 86.000 0.000 NA   NA
 562996 562997 PG1777 PG1778     TRUE 0.996 29.000 0.058 NA   NA
 562997 562998 PG1778 PG1779     FALSE 0.361 82.000 0.000 NA   NA
 562998 562999 PG1779 PG1780   bioF-3 FALSE 0.014 368.000 0.000 NA   NA
 562999 563000 PG1780 PG1781 bioF-3 udk TRUE 0.551 50.000 0.000 0.014 N NA
 563000 563001 PG1781 PG1782 udk   TRUE 0.630 42.000 0.000 NA   NA
 563001 563002 PG1782 PG1783     TRUE 0.785 -13.000 0.000 NA   NA
 563002 563003 PG1783 PG1784     TRUE 0.795 -12.000 0.000 NA   NA
 563003 563004 PG1784 PGt40   tRNA-Val-1 FALSE 0.005 727.000 0.000 NA   NA
 563004 563005 PGt40 PGt41 tRNA-Val-1 tRNA-Val-2 TRUE 0.617 43.000 0.000 NA   NA
 563005 563006 PGt41 PG1786 tRNA-Val-2   FALSE 0.379 77.000 0.000 NA   NA
 563009 563010 PG1789 PG1790 dcp-2   TRUE 0.887 17.000 0.000 NA   NA
 563010 563011 PG1790 PG1791     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 563012 563013 PG1792 PG1793   glgB TRUE 0.996 -3.000 0.033 1.000 N NA
 563013 563014 PG1793 PG1794 glgB polA TRUE 0.610 50.000 0.000 1.000 N NA
 563018 563019 PG1799 PG1801     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 563019 563020 PG1801 PG1802     TRUE 1.000 4.000 0.667 NA   NA
 563020 563021 PG1802 PG1803   atpA TRUE 1.000 10.000 0.633 NA   NA
 563021 563022 PG1803 PG1804 atpA atpB TRUE 1.000 12.000 0.806 0.002 Y NA
 563022 563023 PG1804 PG1805 atpB atpD TRUE 1.000 16.000 0.903 0.002 Y NA
 563023 563024 PG1805 PG1806 atpD atpI TRUE 0.999 -3.000 0.270 0.003 Y NA
 563024 563025 PG1806 PG1807 atpI atpK TRUE 0.897 55.000 0.006 0.003   NA
 563026 563027 PG1808 PG1809 spoT   FALSE 0.047 248.000 0.000 1.000 N NA
 563027 563028 PG1809 PG1810     TRUE 1.000 29.000 0.797 0.003 Y NA
 563030 563031 PG1812 PG1813     TRUE 0.995 40.000 0.082 0.003 Y NA
 563031 563032 PG1813 PG1814   dnaG FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000 N NA
 563032 563033 PG1814 PG1815 dnaG kdsB TRUE 0.716 42.000 0.000 1.000 N NA
 563033 563034 PG1815 PG1816 kdsB   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 563034 563035 PG1816 PG1817     FALSE 0.023 269.000 0.000 1.000   NA
 563035 563036 PG1817 PG1818     TRUE 0.822 -7.000 0.000 NA   NA
 563036 563037 PG1818 PG1819     TRUE 0.672 -48.000 0.000 NA   NA
 563037 563038 PG1819 PG1820   nrfA TRUE 0.991 71.000 0.286 NA   NA
 563038 563039 PG1820 PG1821 nrfA nrfH TRUE 0.997 22.000 0.043 0.001 N NA
 563039 563040 PG1821 PGt42 nrfH tRNA-Lys-1 FALSE 0.007 565.000 0.000 NA   NA
 563042 563043 PG1824 PG1825 eno   FALSE 0.365 80.000 0.000 NA   NA
 563043 563044 PG1825 PG1826     TRUE 0.721 -25.000 0.000 NA   NA
 563046 563047 PG1828 PG1829     FALSE 0.102 171.000 0.000 NA   NA
 563047 563048 PG1829 PG1831   recQ-2 FALSE 0.007 475.000 0.000 1.000   NA
 563049 563050 PG1834 PG1835     TRUE 0.986 103.000 0.312 NA   NA
 563050 563051 PG1835 PG1836   nupG FALSE 0.293 103.000 0.000 NA   NA
 563051 563052 PG1836 PG1837 nupG   FALSE 0.006 559.000 0.000 1.000   NA
 563052 563053 PG1837 PG1840     FALSE 0.010 448.000 0.000 NA   NA
 563053 563054 PG1840 PG1841     FALSE 0.323 95.000 0.000 NA   NA
 563054 563055 PG1841 PG1842     TRUE 0.999 8.000 0.217 NA   NA
 563055 10692481 PG1842 PG1844     FALSE 0.010 448.000 0.000 NA   NA
 10692481 563056 PG1844 PG1846     FALSE 0.003 1161.000 0.000 NA   NA
 563057 563058 PG1847 PG1848     TRUE 0.994 26.000 0.004 NA Y NA
 563058 563059 PG1848 PG1849   recN TRUE 0.993 -3.000 0.015 1.000 N NA
 563059 563060 PG1849 PG1850 recN   TRUE 0.997 15.000 0.053 NA   NA
 563060 563061 PG1850 PG1851   coaBC TRUE 0.996 -3.000 0.051 NA   NA
 563061 563062 PG1851 PG1852 coaBC   TRUE 0.993 26.000 0.016 1.000 N NA
 563062 563063 PG1852 PG1853   dnaN TRUE 0.997 13.000 0.025 0.004 Y NA
 563063 563064 PG1853 PG1854 dnaN   FALSE 0.080 206.000 0.000 1.000 N NA
 563064 563065 PG1854 PG1855     TRUE 0.984 -40.000 0.022 1.000 N NA
 563065 563066 PG1855 PG1856     TRUE 0.998 8.000 0.056 1.000 N NA
 563066 563067 PG1856 PG1857     FALSE 0.362 81.000 0.000 NA   NA
 563067 563068 PG1857 PG1858     TRUE 0.967 165.000 0.462 NA   NA
 563068 563069 PG1858 PG1859     FALSE 0.255 139.000 0.000 1.000 N NA
 563069 563070 PG1859 PG1860     FALSE 0.029 240.000 0.000 1.000   NA
 563070 563071 PG1860 PG1861     FALSE 0.190 129.000 0.000 1.000   NA
 563071 563072 PG1861 PG1862     TRUE 0.889 13.000 0.000 NA   NA
 563072 563073 PG1862 PG1863     TRUE 0.890 1.000 0.000 NA   NA
 563073 563074 PG1863 PG1864     TRUE 0.822 -7.000 0.000 NA   NA
 563076 563077 PG1868 PG1869     TRUE 0.713 36.000 0.000 NA   NA
 563077 563078 PG1869 PG1870     TRUE 0.577 46.000 0.000 NA   NA
 563078 563079 PG1870 PG1871     TRUE 0.630 42.000 0.000 NA   NA
 563079 563080 PG1871 PG1872   hutU FALSE 0.393 73.000 0.000 NA   NA
 563080 563081 PG1872 PG1874 hutU   FALSE 0.024 342.000 0.000 1.000 N NA
 563081 563082 PG1874 PG1875     TRUE 0.974 -13.000 0.003 NA   NA
 563082 563083 PG1875 PG1876     TRUE 0.999 12.000 0.337 NA   NA
 563083 563084 PG1876 PG1877   nhaA TRUE 0.806 29.000 0.000 1.000   NA
 563085 563086 PG1878 PG1879 cysS   TRUE 0.451 51.000 0.000 1.000   NA
 563086 563087 PG1879 PG1880     TRUE 0.890 11.000 0.000 NA   NA
 563087 563088 PG1880 PG1881     TRUE 0.777 33.000 0.000 NA   NA
 563089 563090 PG1884 PG1885   ppk TRUE 0.490 73.000 0.000 1.000 N NA
 563090 563091 PG1885 PG1886 ppk hflX FALSE 0.098 164.000 0.000 1.000   NA
 563092 563093 PG1887 PG1888     TRUE 0.989 -3.000 0.008 1.000   NA
 563093 563094 PG1888 PG1889     FALSE 0.176 141.000 0.000 NA   NA
 563094 563095 PG1889 PG1890     FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 563095 563096 PG1890 PG1891     TRUE 0.432 64.000 0.000 NA   NA
 563096 563097 PG1891 PG1892     FALSE 0.003 1060.000 0.000 NA   NA
 563097 563098 PG1892 PG1893     FALSE 0.003 1149.000 0.000 NA   NA
 563098 563099 PG1893 PG1894     FALSE 0.008 544.000 0.000 NA   NA
 563099 563100 PG1894 PG1895     FALSE 0.006 607.000 0.000 NA   NA
 563100 563101 PG1895 PG1896   metK FALSE 0.011 426.000 0.000 NA   NA
 563102 563103 PG1897 PG1898     TRUE 0.998 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 563103 563104 PG1898 PG1899     TRUE 0.999 5.000 0.200 0.026 N NA
 563104 563105 PG1899 PG1900     FALSE 0.340 75.000 0.000 1.000   NA
 563105 563106 PG1900 PG1901   frr TRUE 0.915 85.000 0.020 1.000   NA
 563106 563107 PG1901 PG1902 frr pyrH TRUE 0.999 37.000 0.626 1.000 N NA
 563107 563108 PG1902 PG1903 pyrH   FALSE 0.314 83.000 0.000 1.000   NA
 563108 563109 PG1903 PG1904     FALSE 0.053 211.000 0.000 NA   NA
 563110 563111 PG1906 PG1908     FALSE 0.003 1303.000 0.000 NA   NA
 563112 563113 PG1910 PG1911 rplQ rpoA TRUE 1.000 6.000 0.873 1.000 N NA
 563113 563114 PG1911 PG1912 rpoA rpsD TRUE 1.000 13.000 0.549 1.000 N NA
 563114 563115 PG1912 PG1913 rpsD rpsK TRUE 0.985 160.000 0.509 0.029 Y NA
 563115 563116 PG1913 PG1914 rpsK rpsM TRUE 1.000 12.000 0.810 0.022 Y NA
 563116 563117 PG1914 PG1915 rpsM rpmJ TRUE 0.993 33.000 0.067 0.022   NA
 563117 563118 PG1915 PG1916 rpmJ infA TRUE 0.998 17.000 0.078 1.000   NA
 563118 563119 PG1916 PG1917 infA map TRUE 0.999 3.000 0.160 1.000 Y NA
 563119 563120 PG1917 PG1918 map secY TRUE 0.998 0.000 0.087 1.000 N NA
 563120 563121 PG1918 PG1919 secY rplO TRUE 1.000 5.000 0.730 1.000 N NA
 563121 563122 PG1919 PG1920 rplO rpmD TRUE 1.000 26.000 0.653 0.004 Y NA
 563122 563123 PG1920 PG1921 rpmD rpsE TRUE 1.000 20.000 0.789 0.029 Y NA
 563123 563124 PG1921 PG1922 rpsE rplR TRUE 1.000 6.000 0.814 0.029 Y NA
 563124 563125 PG1922 PG1923 rplR rplF TRUE 1.000 19.000 0.815 0.022 Y NA
 563125 563126 PG1923 PG1924 rplF rpsH TRUE 1.000 19.000 0.808 0.022 Y NA
 563126 563127 PG1924 PG1925 rpsH rpsN TRUE 0.997 51.000 0.295 0.022 Y NA
 563127 563128 PG1925 PG1926 rpsN rplE TRUE 1.000 2.000 0.309 0.022 Y NA
 563128 563129 PG1926 PG1927 rplE rplX TRUE 1.000 0.000 0.758 0.022 Y NA
 563129 563130 PG1927 PG1928 rplX rplN TRUE 1.000 23.000 0.810 0.029 Y NA
 563130 563131 PG1928 PG1929 rplN rpsQ TRUE 1.000 2.000 0.791 0.029 Y NA
 563131 563132 PG1929 PG1930 rpsQ rpmC TRUE 1.000 14.000 0.828 0.022   NA
 563132 563133 PG1930 PG1931 rpmC rplP TRUE 1.000 6.000 0.802 0.022   NA
 563133 563134 PG1931 PG1932 rplP rpsC TRUE 1.000 21.000 0.828 0.029 Y NA
 563134 563135 PG1932 PG1933 rpsC rplV TRUE 1.000 7.000 0.719 0.029 Y NA
 563135 563136 PG1933 PG1934 rplV rpsS TRUE 0.996 109.000 0.769 0.029 Y NA
 563136 563137 PG1934 PG1935 rpsS rplB TRUE 1.000 23.000 0.820 0.029 Y NA
 563137 563138 PG1935 PG1936 rplB rplW TRUE 1.000 7.000 0.849 0.016 Y NA
 563138 563139 PG1936 PG1937 rplW rplD TRUE 1.000 15.000 0.307 0.022 Y NA
 563139 563140 PG1937 PG1938 rplD rplC TRUE 1.000 0.000 0.544 0.022 Y NA
 563140 563141 PG1938 PG1939 rplC rpsJ TRUE 1.000 23.000 0.467 0.029 Y NA
 563141 563142 PG1939 PG1940 rpsJ fusA TRUE 0.999 16.000 0.075 1.000 Y NA
 563142 563143 PG1940 PG1941 fusA rpsG TRUE 0.999 13.000 0.077 1.000 Y NA
 563143 563144 PG1941 PG1942 rpsG rpsL TRUE 0.954 237.000 0.620 0.004 Y NA
 563144 563145 PG1942 PG1943 rpsL   FALSE 0.006 624.000 0.000 NA   NA
 563146 563147 PG1944 PG1945 aroA   TRUE 0.991 22.000 0.013 1.000   NA
 563147 563148 PG1945 PG1946     TRUE 0.997 -7.000 0.122 1.000   NA
 563148 563149 PG1946 PG1947     TRUE 0.987 -7.000 0.015 1.000   NA
 563149 563150 PG1947 PG1948     TRUE 0.847 25.000 0.000 1.000   NA
 563152 563153 PG1950 PG1951   glnS FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 563153 563154 PG1951 PG1952 glnS   TRUE 0.986 28.000 0.006 NA   NA
 563154 563155 PG1952 PG1953     TRUE 0.457 57.000 0.000 NA   NA
 563155 563156 PG1953 PG1954     TRUE 0.891 4.000 0.000 NA   NA
 563157 563158 PG1956 PG1959 abfT-2 rpmG FALSE 0.004 707.000 0.000 1.000   NA
 563158 563159 PG1959 PG1960 rpmG rpmB TRUE 0.999 19.000 0.332 0.022   NA
 563159 563160 PG1960 PG1961 rpmB   FALSE 0.065 223.000 0.000 1.000 N NA
 563161 563162 PG1963 PG1964     TRUE 0.993 -3.000 0.011 NA N NA
 563162 10692482 PG1964 PG1965     TRUE 0.870 -3.000 0.000 NA   NA
 563165 563166 PG1968 PG1969     TRUE 0.528 49.000 0.000 NA   NA
 563166 563167 PG1969 PG1970     TRUE 0.698 -31.000 0.000 NA   NA
 563171 563172 PG1977 PG1978     TRUE 0.825 30.000 0.000 NA   NA
 563174 563175 PG1980 PG1981   cas2-1 FALSE 0.003 1285.000 0.000 NA   NA
 11464649 563169   PG1974     FALSE NA 5215.000 0.000 NA   NA
 11607012 563169   PG1974     FALSE NA 5215.000 0.000 NA   NA
 11749404 563169   PG1974     FALSE NA 5215.000 0.000 NA   NA
 11464650 563169   PG1974     FALSE NA 5252.000 0.000 NA   NA
 11607013 563169   PG1974     FALSE NA 5252.000 0.000 NA   NA
 11749405 563169   PG1974     FALSE NA 5252.000 0.000 NA   NA
 11464651 563169   PG1974     FALSE NA 5286.000 0.000 NA   NA
 11607014 563169   PG1974     FALSE NA 5286.000 0.000 NA   NA
 11749406 563169   PG1974     FALSE NA 5286.000 0.000 NA   NA
 11464652 563169   PG1974     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11607015 563169   PG1974     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11749407 563169   PG1974     FALSE NA 5323.000 0.000 NA   NA
 11464653 563169   PG1974     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11607016 563169   PG1974     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11749408 563169   PG1974     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11464654 563169   PG1974     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11607017 563169   PG1974     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11749409 563169   PG1974     FALSE NA 5394.000 0.000 NA   NA
 11464655 563169   PG1974     FALSE NA 5430.000 0.000 NA   NA
 11607018 563169   PG1974     FALSE NA 5430.000 0.000 NA   NA
 11749410 563169   PG1974     FALSE NA 5430.000 0.000 NA   NA
 11464656 563169   PG1974     FALSE NA 5467.000 0.000 NA   NA
 11607019 563169   PG1974     FALSE NA 5467.000 0.000 NA   NA
 11749411 563169   PG1974     FALSE NA 5467.000 0.000 NA   NA
 11464657 563169   PG1974     FALSE NA 5501.000 0.000 NA   NA
 11607020 563169   PG1974     FALSE NA 5501.000 0.000 NA   NA
 11749412 563169   PG1974     FALSE NA 5501.000 0.000 NA   NA
 11464658 563169   PG1974     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11607021 563169   PG1974     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11749413 563169   PG1974     FALSE NA 5538.000 0.000 NA   NA
 11464659 563169   PG1974     FALSE NA 5576.000 0.000 NA   NA
 11607022 563169   PG1974     FALSE NA 5576.000 0.000 NA   NA
 11749414 563169   PG1974     FALSE NA 5576.000 0.000 NA   NA
 11464660 563169   PG1974     FALSE NA 5613.000 0.000 NA   NA
 11607023 563169   PG1974     FALSE NA 5613.000 0.000 NA   NA
 11749415 563169   PG1974     FALSE NA 5613.000 0.000 NA   NA
 11464661 563169   PG1974     FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11607024 563169   PG1974     FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11749416 563169   PG1974     FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11464662 563169   PG1974     FALSE NA 5687.000 0.000 NA   NA
 11607025 563169   PG1974     FALSE NA 5687.000 0.000 NA   NA
 11749417 563169   PG1974     FALSE NA 5687.000 0.000 NA   NA
 11464663 563169   PG1974     FALSE NA 5723.000 0.000 NA   NA
 11607026 563169   PG1974     FALSE NA 5723.000 0.000 NA   NA
 11749418 563169   PG1974     FALSE NA 5723.000 0.000 NA   NA
 563175 563176 PG1981 PG1982 cas2-1   TRUE 0.963 20.000 0.000 1.000 Y NA
 563176 563177 PG1982 PG1983     TRUE 0.749 61.000 0.000 NA Y NA
 563177 563178 PG1983 PG1984     TRUE 0.998 -3.000 0.103 NA   NA
 563178 563179 PG1984 PG1985     TRUE 0.997 -3.000 0.064 NA   NA
 563179 563180 PG1985 PG1986     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 563180 563181 PG1986 PG1987     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 563181 563182 PG1987 PG1988     TRUE 0.822 -7.000 0.000 NA   NA
 563182 563183 PG1988 PG1989     TRUE 0.886 16.000 0.000 NA   NA
 563184 563185 PG1992 PG1993 gidA uvrC TRUE 0.978 34.000 0.004 1.000 N NA
 563185 563186 PG1993 PG1994 uvrC dtd TRUE 0.994 7.000 0.017 0.035 N NA
 563186 563187 PG1994 PG1995 dtd   TRUE 0.997 5.000 0.047 NA   NA
 563187 563188 PG1995 PG1996   deoC TRUE 0.996 -13.000 0.106 NA   NA
 563188 563189 PG1996 PG1997 deoC   TRUE 0.640 41.000 0.000 NA   NA
 563190 563191 PG1998 PG1999     FALSE 0.135 154.000 0.000 NA   NA
 563191 563192 PG1999 PG2000     TRUE 0.999 21.000 0.203 NA   NA
 563192 563193 PG2000 PG2001   lepB TRUE 0.999 -10.000 0.193 0.001 Y NA
 563193 563194 PG2001 PG2002 lepB dapB TRUE 0.998 16.000 0.081 1.000 N NA
 563194 563195 PG2002 PG2003 dapB dgt TRUE 0.543 61.000 0.000 1.000 N NA
 563195 563196 PG2003 PG2004 dgt   FALSE 0.170 144.000 0.000 NA   NA
 563197 563198 PG2006 PG2008     FALSE 0.022 297.000 0.000 NA   NA
 563198 563199 PG2008 PG2009     FALSE 0.010 570.000 0.000 1.000 N NA
 563199 563200 PG2009 PG2010     FALSE 0.148 169.000 0.000 1.000 N NA
 11464664 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11607027 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11749419 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1761.000 0.000 NA   NA
 11464665 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11607028 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11749420 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1725.000 0.000 NA   NA
 11464666 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1695.000 0.000 NA   NA
 11607029 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1695.000 0.000 NA   NA
 11749421 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1695.000 0.000 NA   NA
 11464667 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1660.000 0.000 NA   NA
 11607030 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1660.000 0.000 NA   NA
 11749422 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1660.000 0.000 NA   NA
 11464668 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11607031 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11749423 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11464669 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1595.000 0.000 NA   NA
 11607032 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1595.000 0.000 NA   NA
 11749424 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1595.000 0.000 NA   NA
 11464670 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11607033 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11749425 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11464671 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11607034 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11749426 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1530.000 0.000 NA   NA
 11464672 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11607035 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11749427 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1500.000 0.000 NA   NA
 11464673 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1463.000 0.000 NA   NA
 11607036 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1463.000 0.000 NA   NA
 11749428 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1463.000 0.000 NA   NA
 11464674 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11607037 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11749429 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1433.000 0.000 NA   NA
 11464675 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1396.000 0.000 NA   NA
 11607038 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1396.000 0.000 NA   NA
 11749430 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1396.000 0.000 NA   NA
 11464676 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11607039 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11749431 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1366.000 0.000 NA   NA
 11464677 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11607040 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11749432 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1329.000 0.000 NA   NA
 11464678 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11607041 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11749433 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1299.000 0.000 NA   NA
 11464679 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11607042 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11749434 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11464680 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11607043 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11749435 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1233.000 0.000 NA   NA
 11464681 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11607044 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11749436 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1199.000 0.000 NA   NA
 11464682 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11607045 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11749437 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1169.000 0.000 NA   NA
 11464683 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11607046 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11749438 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11464684 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1104.000 0.000 NA   NA
 11607047 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1104.000 0.000 NA   NA
 11749439 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1104.000 0.000 NA   NA
 11464685 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11607048 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11749440 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1067.000 0.000 NA   NA
 11464686 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1037.000 0.000 NA   NA
 11607049 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1037.000 0.000 NA   NA
 11749441 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1037.000 0.000 NA   NA
 11464687 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11607050 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11749442 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 1002.000 0.000 NA   NA
 11464688 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11607051 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11749443 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11464689 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11607052 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11749444 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 936.000 0.000 NA   NA
 11464690 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 906.000 0.000 NA   NA
 11607053 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 906.000 0.000 NA   NA
 11749445 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 906.000 0.000 NA   NA
 11464691 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 869.000 0.000 NA   NA
 11607054 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 869.000 0.000 NA   NA
 11749446 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 869.000 0.000 NA   NA
 11464692 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 839.000 0.000 NA   NA
 11607055 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 839.000 0.000 NA   NA
 11749447 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 839.000 0.000 NA   NA
 11464693 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11607056 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11749448 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11464694 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 772.000 0.000 NA   NA
 11607057 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 772.000 0.000 NA   NA
 11749449 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 772.000 0.000 NA   NA
 11464695 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 735.000 0.000 NA   NA
 11607058 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 735.000 0.000 NA   NA
 11749450 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 735.000 0.000 NA   NA
 11464696 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11607059 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11749451 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11464697 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11607060 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11749452 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 670.000 0.000 NA   NA
 11464698 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11607061 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11749453 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 640.000 0.000 NA   NA
 11464699 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11607062 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11749454 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11464700 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11607063 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11749455 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 575.000 0.000 NA   NA
 11464701 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11607064 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11749456 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 539.000 0.000 NA   NA
 11464702 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11607065 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11749457 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 509.000 0.000 NA   NA
 11464703 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 473.000 0.000 NA   NA
 11607066 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 473.000 0.000 NA   NA
 11749458 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 473.000 0.000 NA   NA
 11464704 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 443.000 0.000 NA   NA
 11607067 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 443.000 0.000 NA   NA
 11749459 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 443.000 0.000 NA   NA
 11464705 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11607068 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11749460 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 407.000 0.000 NA   NA
 11464706 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 377.000 0.000 NA   NA
 11607069 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 377.000 0.000 NA   NA
 11749461 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 377.000 0.000 NA   NA
 11464707 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 342.000 0.000 NA   NA
 11607070 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 342.000 0.000 NA   NA
 11749462 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 342.000 0.000 NA   NA
 11464708 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 312.000 0.000 NA   NA
 11607071 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 312.000 0.000 NA   NA
 11749463 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 312.000 0.000 NA   NA
 11464709 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 277.000 0.000 NA   NA
 11607072 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 277.000 0.000 NA   NA
 11749464 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 277.000 0.000 NA   NA
 11464710 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11607073 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 11749465 563201   PG2013   cas2-2 FALSE NA 247.000 0.000 NA   NA
 563201 563202 PG2013 PG2014 cas2-2 cas1 TRUE 0.999 0.000 0.065 NA Y NA
 563202 563203 PG2014 PG2015 cas1 cas4 TRUE 0.999 -3.000 0.143 NA Y NA
 563203 563204 PG2015 PG2016 cas4 cas3 TRUE 0.999 20.000 0.143 NA   NA
 563204 563205 PG2016 PG2017 cas3   TRUE 0.996 -25.000 0.143 NA   NA
 563205 563206 PG2017 PG2018     TRUE 1.000 11.000 0.667 NA   NA
 563206 563207 PG2018 PG2019