MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium bovis AF2122/97

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 538287 538288 Mb0001 Mb0002 dnaA dnaN FALSE 0.066 528.000 0.328 1.000 Y NA
 538288 538289 Mb0002 Mb0003 dnaN recF TRUE 0.930 20.000 0.318 1.000 Y NA
 538289 538290 Mb0003 Mb0004 recF   TRUE 0.939 -3.000 0.099 NA   NA
 538290 538291 Mb0004 Mb0005   gyrB FALSE 0.127 126.000 0.022 NA   NA
 538291 538292 Mb0005 Mb0006 gyrB gyrA TRUE 0.965 35.000 0.306 0.001 Y NA
 538292 538293 Mb0006 Mb0007 gyrA   FALSE 0.183 96.000 0.009 NA   NA
 538293 538294 Mb0007 Mbt01   ileT FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 538294 538295 Mbt01 Mbt02 ileT alaT FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538298 538299 Mb0010c Mb0011c     FALSE 0.132 156.000 0.181 NA   NA
 538300 538301 Mb0012 Mb0013   trpG FALSE 0.409 37.000 0.098 NA   NA
 538302 538303 Mb0014c Mb0015c pknB pknA TRUE 0.998 -3.000 0.426 0.005 Y NA
 538303 538304 Mb0015c Mb0016c pknA pbpA TRUE 0.983 -3.000 0.574 1.000 N NA
 538304 538305 Mb0016c Mb0017c pbpA rodA TRUE 0.957 -3.000 0.250 1.000 N NA
 538305 538306 Mb0017c Mb0018c rodA ppp TRUE 0.930 -3.000 0.145 1.000 N NA
 538306 538307 Mb0018c Mb0019c ppp   TRUE 0.742 89.000 0.216 NA Y NA
 538307 538308 Mb0019c Mb0020c   TB39.8 FALSE 0.173 124.000 0.069 NA   NA
 538310 538311 Mb0021c Mb0022c   whiB5 FALSE 0.084 142.000 0.000 1.000   NA
 538312 538313 Mb0023 Mb0024     TRUE 0.987 -3.000 0.600 NA   NA
 538313 538314 Mb0024 Mb0025     FALSE 0.226 -258.000 0.000 NA   NA
 538314 538315 Mb0025 Mb0026     FALSE 0.188 38.000 0.000 NA   NA
 538315 538316 Mb0026 Mb0027     TRUE 0.706 115.000 1.000 NA   NA
 538316 538317 Mb0027 Mb0028     TRUE 0.763 38.000 0.600 NA   NA
 538317 538318 Mb0028 Mb0029     TRUE 0.963 8.000 0.800 NA   NA
 538318 538319 Mb0029 Mb0030     FALSE 0.011 238.000 0.000 NA   NA
 538319 538320 Mb0030 Mb0031     TRUE 0.805 70.000 1.000 NA   NA
 538320 538321 Mb0031 Mb0032     FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538321 538322 Mb0032 Mb0033   bioF2 FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 538322 538323 Mb0033 Mb0034 bioF2 acpA TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538323 538324 Mb0034 Mb0035 acpA   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538324 538325 Mb0035 Mb0036   fadD34 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538326 538327 Mb0037c Mb0038c     FALSE 0.427 48.000 0.174 NA   NA
 538329 538330 Mb0040c Mb0041c   mtc28 TRUE 0.781 82.000 0.875 NA   NA
 538332 538333 Mb0043c Mb0044c     FALSE 0.522 159.000 0.000 0.035 Y NA
 538333 538334 Mb0044c Mb0045c     FALSE 0.284 133.000 0.412 NA N NA
 538334 538335 Mb0045c Mb0046c     TRUE 0.725 16.000 0.235 NA   NA
 538335 538336 Mb0046c Mb0047c   ino1 FALSE 0.348 82.000 0.059 1.000   NA
 538336 538337 Mb0047c Mb0048c ino1   TRUE 0.629 61.000 0.608 NA N NA
 538337 538338 Mb0048c Mb0049c     FALSE 0.294 101.000 0.122 NA   NA
 538339 538340 Mb0050 Mb0051   ponA1 FALSE 0.013 419.000 0.200 NA   NA
 538340 538341 Mb0051 Mb0052 ponA1   TRUE 0.958 -3.000 0.204 NA   NA
 538341 538342 Mb0052 Mb0053     FALSE 0.396 32.000 0.061 NA   NA
 538342 538343 Mb0053 Mb0054   rpsF FALSE 0.020 219.000 0.002 NA   NA
 538343 538344 Mb0054 Mb0055 rpsF ssb FALSE 0.140 104.000 0.029 1.000 N NA
 538344 538345 Mb0055 Mb0056 ssb rpsR1 FALSE 0.220 42.000 0.030 1.000 N NA
 538345 538346 Mb0056 Mb0057 rpsR1 rplI TRUE 0.965 33.000 0.499 0.020 Y NA
 538346 538347 Mb0057 Mb0058 rplI   FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538347 538348 Mb0058 Mb0059   dnaB FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 538348 538349 Mb0059 Mb0060 dnaB   FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 538349 538350 Mb0060 Mb0061     TRUE 0.770 17.000 0.317 NA   NA
 538350 538351 Mb0061 Mb0062     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 538351 538352 Mb0062 Mb0063   celA1 FALSE 0.057 136.000 0.000 NA   NA
 538352 538353 Mb0063 Mb0064 celA1   FALSE 0.005 229.000 0.000 1.000 N NA
 538353 538354 Mb0064 Mb0065     FALSE 0.015 258.000 0.000 1.000   NA
 538354 538355 Mb0065 Mb0066     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 538356 538357 Mb0067c Mb0068c icd2   FALSE 0.037 118.000 0.000 1.000 N NA
 538359 538360 Mb0070c Mb0071c sdaA glyA2 TRUE 0.990 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 538361 538362 Mb0072 Mb0073     FALSE 0.001 431.000 0.000 1.000 N NA
 538362 538363 Mb0073 Mb0074     TRUE 0.996 3.000 1.000 1.000 Y NA
 538363 538364 Mb0074 Mb0075     FALSE 0.269 -63.000 0.000 NA   NA
 538364 538365 Mb0075 Mb0076     FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 538365 538366 Mb0076 Mb0077     FALSE 0.226 13.000 0.000 1.000 N NA
 538367 538368 Mb0078c Mb0079c     FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 538371 538372 Mb0082 Mb0083     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538372 538373 Mb0083 Mb0084     FALSE 0.199 95.000 0.000 1.000   NA
 538373 538374 Mb0084 Mb0085     TRUE 0.750 5.000 0.043 1.000 N NA
 538374 538375 Mb0085 Mb0086     TRUE 0.996 -3.000 0.085 0.007 Y NA
 538375 538376 Mb0086 Mb0087   hycD TRUE 0.994 0.000 0.398 1.000 Y NA
 538376 538377 Mb0087 Mb0088 hycD hycP TRUE 0.980 11.000 0.679 NA Y NA
 538377 538378 Mb0088 Mb0089 hycP hycQ TRUE 0.997 0.000 0.864 NA Y NA
 538378 538379 Mb0089 Mb0090 hycQ hycE TRUE 0.999 -3.000 0.659 0.007 Y NA
 538379 538380 Mb0090 Mb0091 hycE   FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 538380 538381 Mb0091 Mb0092     FALSE 0.037 157.000 0.000 NA   NA
 538381 538382 Mb0092 Mb0093     FALSE 0.069 129.000 0.000 NA   NA
 538382 538383 Mb0093 Mb0094   mtn FALSE 0.003 434.000 0.000 NA   NA
 538383 538384 Mb0094 Mb0095 mtn ctpA FALSE 0.028 132.000 0.000 1.000 N NA
 538385 538386 Mb0096c Mb0097c     FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 538386 538387 Mb0097c Mb0098c     FALSE 0.232 -229.000 0.000 NA   NA
 538388 538389 Mb0099 Mb0100 PPE1   FALSE 0.446 19.000 0.167 NA N NA
 538389 538390 Mb0100 Mb0101     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 538390 538391 Mb0101 Mb0102   fadD10 TRUE 0.954 5.000 0.444 NA   NA
 538391 538392 Mb0102 Mb0103 fadD10   TRUE 0.980 5.000 0.800 1.000   NA
 538392 538393 Mb0103 Mb0104   nrp TRUE 0.945 -18.000 0.364 0.012   NA
 538393 538394 Mb0104 Mb0105 nrp   FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 538399 538400 Mb0111c Mb0112c ctpI   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 538401 538402 Mb0113 Mb0114 PE_PGRS1   FALSE 0.115 148.000 0.091 NA   NA
 538402 538403 Mb0114 Mb0115     FALSE 0.042 181.000 0.000 1.000   NA
 538403 538404 Mb0115 Mb0116   gca FALSE 0.003 282.000 0.000 1.000 N NA
 538404 538405 Mb0116 Mb0117 gca gmhA FALSE 0.065 74.000 0.000 1.000 N NA
 538405 538406 Mb0117 Mb0118 gmhA   FALSE 0.102 32.000 0.000 1.000 N NA
 538406 538407 Mb0118 Mb0119     FALSE 0.071 151.000 0.000 1.000   NA
 538412 538413 Mb0124c Mb0125c fusA2b fusA2a TRUE 0.984 -3.000 0.009 0.008   NA
 538413 538414 Mb0125c Mb0126c fusA2a   FALSE 0.129 136.000 0.009 1.000   NA
 538415 538416 Mb0127 Mb0128     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538416 538417 Mb0128 Mb0129   PE_PGRS2 FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 538417 538418 Mb0129 Mb0130 PE_PGRS2 pepA FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538418 538419 Mb0130 Mb0131 pepA treS FALSE 0.103 109.000 0.013 1.000 N NA
 538419 538420 Mb0131 Mb0132 treS   TRUE 0.649 103.000 0.071 NA Y NA
 538420 538421 Mb0132 Mb0133     FALSE 0.346 68.000 0.136 NA   NA
 538424 538425 Mb0136c Mb0137c fadE1 fgd2 FALSE 0.448 42.000 0.286 NA N NA
 538426 538427 Mb0138 Mb0139-1     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 538427 538428 Mb0139-1 Mb0139-2     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 538428 538429 Mb0139-2 Mb0139-3     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 538429 538430 Mb0139-3 Mb0139-4     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538434 538435 Mb0143 Mb0144     TRUE 0.978 1.000 0.538 NA   NA
 538435 538436 Mb0144 Mb0145     FALSE 0.259 61.000 0.034 NA   NA
 538440 538441 Mb0149 Mb0150     FALSE 0.568 89.000 0.571 NA N NA
 538441 538442 Mb0150 Mb0151     TRUE 0.903 43.000 0.556 NA Y NA
 538442 538443 Mb0151 Mb0152     FALSE 0.485 95.000 0.444 NA N NA
 538443 538444 Mb0152 Mb0153     TRUE 0.760 75.000 0.875 1.000 N NA
 538444 538445 Mb0153 Mb0154     TRUE 0.956 7.000 0.700 1.000 N NA
 538446 538447 Mb0155c Mb0156c   PE1 FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 538447 538448 Mb0156c Mb0157c PE1 PE2 FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 538448 538449 Mb0157c Mb0158c PE2 ptbB FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 538449 538450 Mb0158c Mb0159c ptbB fadE2 TRUE 0.925 2.000 0.226 1.000 N NA
 538451 538452 Mb0160 Mb0161 pntAa pntAb TRUE 0.997 1.000 0.829 0.001   NA
 538452 538453 Mb0161 Mb0162 pntAb pntB TRUE 0.995 -3.000 0.321 0.001   NA
 538453 538454 Mb0162 Mb0163 pntB   FALSE 0.002 306.000 0.000 1.000 N NA
 538455 538456 Mb0164c Mb0165c PE3 PE4 FALSE 0.125 92.000 0.000 NA   NA
 538459 538460 Mb0168 Mb0169   TB18.5 FALSE 0.249 54.000 0.020 NA   NA
 538461 538462 Mb0170c Mb0171c     FALSE 0.241 -198.000 0.000 NA   NA
 538463 538464 Mb0172 Mb0173 fadD5 yrbE1A FALSE 0.145 204.000 0.000 NA Y NA
 538464 538465 Mb0173 Mb0174 yrbE1A yrbE1B TRUE 0.996 2.000 1.000 NA Y NA
 538465 538466 Mb0174 Mb0175 yrbE1B mce1A TRUE 0.994 5.000 1.000 NA Y NA
 538466 538467 Mb0175 Mb0176 mce1A mce1B TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 538467 538468 Mb0176 Mb0177 mce1B mce1C TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.008 Y NA
 538468 538469 Mb0177 Mb0178 mce1C mce1D TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.008 Y NA
 538469 538470 Mb0178 Mb0179 mce1D lprK TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 538470 538471 Mb0179 Mb0180 lprK mce1F TRUE 0.996 -6.000 0.800 0.008 Y NA
 538471 538472 Mb0180 Mb0181 mce1F   TRUE 0.598 36.000 0.286 NA   NA
 538472 538473 Mb0181 Mb0182     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 538473 538474 Mb0182 Mb0183     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538474 538475 Mb0183 Mb0184     TRUE 0.914 -33.000 1.000 NA   NA
 538476 538477 Mb0185c MbXXXXc lprO Mb0186c FALSE 0.538 80.000 0.333 NA   NA
 538477 538478 MbXXXXc Mb0187c Mb0186c   FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 538478 538479 Mb0187c Mb0188c   sigG FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 538480 538481 Mb0189 Mb0190     FALSE 0.359 42.000 0.068 NA   NA
 538481 538482 Mb0190 Mb0191     TRUE 0.987 -3.000 0.600 NA   NA
 538482 538483 Mb0191 Mb0192   bglS TRUE 0.601 45.000 0.273 1.000   NA
 538483 538484 Mb0192 Mb0193 bglS   FALSE 0.007 361.000 0.000 1.000   NA
 538484 538485 Mb0193 Mb0194     FALSE 0.080 119.000 0.000 NA   NA
 538487 538488 Mb0196 Mb0197     FALSE 0.193 128.000 0.125 NA   NA
 538488 538489 Mb0197 Mb0198     FALSE 0.570 77.000 0.375 NA   NA
 538491 538492 Mb0200 Mb0201     FALSE 0.001 438.000 0.000 1.000 N NA
 538492 538493 Mb0201 Mb0202     FALSE 0.415 113.000 0.000 0.059   NA
 538493 538494 Mb0202 Mb0203     TRUE 0.971 0.000 0.276 1.000   NA
 538496 538497 Mb0205 Mb0206     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538498 538499 Mb0207c Mb0208c   mmpL11 TRUE 0.992 -3.000 0.750 1.000   NA
 538503 538504 Mb0212c Mb0213c mmpL3   FALSE 0.428 66.000 0.217 NA   NA
 538504 538505 Mb0213c Mb0214c     TRUE 0.858 3.000 0.040 NA   NA
 538506 538507 Mb0215 Mb0216     TRUE 0.985 -3.000 0.529 NA   NA
 538507 538508 Mb0216 Mb0217   pckA FALSE 0.044 184.000 0.026 NA   NA
 538509 538510 Mb0218c Mb0219c nadR   TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538515 538516 Mb0224 Mb0225     TRUE 0.949 2.000 0.273 NA   NA
 538516 538517 Mb0225 Mb0226   lipC TRUE 0.805 10.000 0.182 NA   NA
 538517 538518 Mb0226 Mb0227 lipC   TRUE 0.842 44.000 1.000 NA   NA
 538519 538520 Mb0228c Mb0229c     FALSE 0.355 99.000 0.104 1.000   NA
 538522 538523 Mb0231c Mb0232c     TRUE 0.857 10.000 0.265 NA   NA
 538525 538526 Mb0234c Mb0235c   php TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538527 538528 Mb0236 Mb0237 fadE4   FALSE 0.210 135.000 0.250 1.000 N NA
 538528 538529 Mb0237 Mb0238   nrdB TRUE 0.972 -3.000 0.357 1.000 N NA
 538530 538531 Mb0239c Mb0240c gabD1   FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 538531 538532 Mb0240c Mb0241c     FALSE 0.364 35.000 0.053 NA   NA
 538532 538533 Mb0241c Mb0242c     TRUE 0.710 47.000 0.526 NA   NA
 538534 538535 Mb0243 Mb0244 lpqI   FALSE 0.328 76.000 0.185 1.000 N NA
 538535 538536 Mb0244 Mb0245     FALSE 0.144 62.000 0.000 NA   NA
 538536 538537 Mb0245 Mb0246     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 538538 538539 Mb0247c Mb0248c   fabG4 TRUE 0.972 11.000 0.412 1.000 Y NA
 538542 538543 Mb0251 Mb0252     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 538544 538545 Mb0253c Mb0254c     TRUE 0.999 1.000 0.826 0.004 Y NA
 538545 538546 Mb0254c Mb0255c     TRUE 0.860 31.000 0.860 NA   NA
 538546 538547 Mb0255c Mb0256c     FALSE 0.372 80.000 0.171 NA   NA
 538547 538548 Mb0256c Mb0257c   hsp FALSE 0.121 145.000 0.091 NA   NA
 538549 538550 Mb0258 Mb0259 nirB nirD TRUE 0.891 26.000 0.286 0.001 N NA
 538551 538552 Mb0260c Mb0261c cobU cobQ1 TRUE 0.839 25.000 0.031 1.000 Y NA
 538552 538553 Mb0261c Mb0262c cobQ1 PPE2 FALSE 0.030 19.000 0.000 NA N NA
 538555 538556 Mb0264c Mb0265c     FALSE 0.557 25.000 0.071 1.000   NA
 538556 538557 Mb0265c Mb0266c     TRUE 0.963 -3.000 0.173 1.000   NA
 538557 538558 Mb0266c Mb0267c   narK3 FALSE 0.009 100.000 0.000 NA N NA
 538558 538559 Mb0267c Mb0268c narK3 aac FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 538559 538560 Mb0268c Mb0269c aac   TRUE 0.757 10.000 0.101 NA   NA
 538560 538561 Mb0269c Mb0270c     TRUE 0.955 17.000 0.551 NA Y NA
 538561 538562 Mb0270c Mb0271c     FALSE 0.179 96.000 0.050 1.000 N NA
 538562 538563 Mb0271c Mb0272c   oplA FALSE 0.143 22.000 0.000 1.000 N NA
 538565 538566 Mb0274c Mb0275c     FALSE 0.011 65.000 0.000 NA N NA
 538568 538569 Mb0277c Mb0278c fadE6   FALSE 0.329 114.000 0.182 1.000   NA
 538569 538570 Mb0278c Mb0279c     TRUE 0.980 -3.000 0.333 1.000   NA
 538574 538575 Mb0283c Mb0284c   PE_PGRS3b FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 538575 538576 Mb0284c Mb0285c PE_PGRS3b PE_PGRS3a FALSE 0.247 -177.000 0.000 NA   NA
 538576 538577 Mb0285c Mb0286c PE_PGRS3a PE_PGRS3 FALSE 0.008 264.000 0.000 NA   NA
 11445243 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11587606 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11729998 538574   Mb0283c     FALSE NA 406.000 0.000 NA   NA
 11445244 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11587607 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11729999 538574   Mb0283c     FALSE NA 427.000 0.000 NA   NA
 11445245 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11587608 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11730000 538574   Mb0283c     FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11445246 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11587609 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11730001 538574   Mb0283c     FALSE NA 475.000 0.000 NA   NA
 11445247 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11587610 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11730002 538574   Mb0283c     FALSE NA 529.000 0.000 NA   NA
 11445248 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11587611 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11730003 538574   Mb0283c     FALSE NA 550.000 0.000 NA   NA
 11445249 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11587612 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11730004 538574   Mb0283c     FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11445250 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11587613 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11730005 538574   Mb0283c     FALSE NA 604.000 0.000 NA   NA
 11445251 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11587614 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11730006 538574   Mb0283c     FALSE NA 628.000 0.000 NA   NA
 11445252 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11587615 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11730007 538574   Mb0283c     FALSE NA 649.000 0.000 NA   NA
 11445253 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11587616 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11730008 538574   Mb0283c     FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11445254 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11587617 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11730009 538574   Mb0283c     FALSE NA 697.000 0.000 NA   NA
 11445255 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11587618 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11730010 538574   Mb0283c     FALSE NA 733.000 0.000 NA   NA
 11445256 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11587619 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11730011 538574   Mb0283c     FALSE NA 754.000 0.000 NA   NA
 11445257 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11587620 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11730012 538574   Mb0283c     FALSE NA 781.000 0.000 NA   NA
 11445258 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11587621 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11730013 538574   Mb0283c     FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11445259 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11587622 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11730014 538574   Mb0283c     FALSE NA 829.000 0.000 NA   NA
 11445260 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11587623 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11730015 538574   Mb0283c     FALSE NA 850.000 0.000 NA   NA
 11445261 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11587624 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11730016 538574   Mb0283c     FALSE NA 874.000 0.000 NA   NA
 11445262 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11587625 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11730017 538574   Mb0283c     FALSE NA 895.000 0.000 NA   NA
 11445263 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11587626 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11730018 538574   Mb0283c     FALSE NA 928.000 0.000 NA   NA
 11445264 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11587627 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11730019 538574   Mb0283c     FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11445265 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11587628 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11730020 538574   Mb0283c     FALSE NA 1000.000 0.000 NA   NA
 11445266 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11587629 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11730021 538574   Mb0283c     FALSE NA 1021.000 0.000 NA   NA
 11445267 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11587630 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11730022 538574   Mb0283c     FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11445268 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11587631 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11730023 538574   Mb0283c     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11445269 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11587632 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11730024 538574   Mb0283c     FALSE NA 1108.000 0.000 NA   NA
 11445270 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11587633 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11730025 538574   Mb0283c     FALSE NA 1129.000 0.000 NA   NA
 11445271 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11587634 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11730026 538574   Mb0283c     FALSE NA 1156.000 0.000 NA   NA
 11445272 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11587635 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11730027 538574   Mb0283c     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11445273 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11587636 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11730028 538574   Mb0283c     FALSE NA 1198.000 0.000 NA   NA
 11445274 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11587637 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11730029 538574   Mb0283c     FALSE NA 1219.000 0.000 NA   NA
 11445275 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11587638 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11730030 538574   Mb0283c     FALSE NA 1246.000 0.000 NA   NA
 11445276 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11587639 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11730031 538574   Mb0283c     FALSE NA 1267.000 0.000 NA   NA
 11445277 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11587640 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 11730032 538574   Mb0283c     FALSE NA 1291.000 0.000 NA   NA
 538577 538578 Mb0286c Mb0287c PE_PGRS3 PE_PGRS4 FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 538579 538580 Mb0288 Mb0289 PPE3   TRUE 0.802 24.000 0.667 NA N NA
 538580 538581 Mb0289 Mb0290     FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 538581 538582 Mb0290 Mb0291     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538582 538583 Mb0291 Mb0292     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 538583 538584 Mb0292 Mb0293   PE5 TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 538584 538585 Mb0293 Mb0294 PE5 PPE4 TRUE 0.970 3.000 0.500 NA   NA
 538585 538586 Mb0294 Mb0295 PPE4 esxG FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 538586 538587 Mb0295 Mb0296 esxG esxH FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 538587 538588 Mb0296 Mb0297 esxH   FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 538588 538589 Mb0297 Mb0298     TRUE 0.809 47.000 0.818 NA   NA
 538589 538590 Mb0298 Mb0299     TRUE 0.986 -3.000 0.556 NA   NA
 538590 538591 Mb0299 Mb0300     TRUE 0.986 -3.000 0.556 NA   NA
 538594 538595 Mb0303c Mb0304c     TRUE 0.766 10.000 0.118 NA   NA
 538596 538597 Mb0305 Mb0306 PE_PGRS5   FALSE 0.081 143.000 0.000 1.000   NA
 538597 538598 Mb0306 Mb0307     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538598 538599 Mb0307 Mb0308     FALSE 0.165 48.000 0.000 NA   NA
 538599 538600 Mb0308 Mb0309     TRUE 0.982 -3.000 0.444 NA   NA
 538600 538601 Mb0309 Mb0310     FALSE 0.057 136.000 0.000 NA   NA
 538601 538602 Mb0310 Mb0311     TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 538603 538604 Mb0312c Mb0313c PPE5 PPE6 FALSE 0.324 144.000 0.000 NA Y NA
 538607 538608 Mb0316 Mb0317     FALSE 0.251 102.000 0.067 NA   NA
 538610 538611 Mb0319 Mb0320     FALSE 0.269 155.000 0.333 1.000   NA
 538611 538612 Mb0320 Mb0321     FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538614 538615 Mb0323 Mb0324     FALSE 0.490 49.000 0.286 1.000 N NA
 538616 538617 Mb0325c Mbt04 glpQ2 glyU FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 538617 538618 Mbt04 Mb0326c glyU   FALSE 0.215 31.000 0.000 NA   NA
 538619 538620 Mb0327 Mb0328 pcp   FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538620 538621 Mb0328 Mb0329   dcd FALSE 0.295 32.000 0.007 NA   NA
 538621 538622 Mb0329 Mb0330 dcd udgA FALSE 0.048 106.000 0.000 1.000 N NA
 538624 538625 Mb0332 Mb0333     TRUE 0.721 7.000 0.000 1.000   NA
 538628 538629 Mb0336c Mb0337c     FALSE 0.352 27.000 0.000 1.000   NA
 538630 538631 Mb0338 Mb0339     FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 538631 538632 Mb0339 Mb0340     TRUE 0.715 27.000 0.368 NA   NA
 538632 538633 Mb0340 Mb0341   rmlA TRUE 0.623 30.000 0.273 NA   NA
 538636 538637 Mb0344c Mb0345c aspC   FALSE 0.245 31.000 0.023 1.000 N NA
 538637 538638 Mb0345c Mb0346c     FALSE 0.155 109.000 0.057 1.000 N NA
 538639 538640 Mb0347 Mb0348   iniB FALSE 0.121 189.000 0.286 NA   NA
 538640 538641 Mb0348 Mb0349 iniB iniA TRUE 0.768 37.000 0.500 1.000   NA
 538641 538642 Mb0349 Mb0350 iniA iniC TRUE 0.996 -3.000 0.583 0.007   NA
 538646 538647 Mb0355 Mb0356     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538647 538648 Mb0356 Mb0357     TRUE 0.739 3.000 0.000 NA   NA
 538648 538649 Mb0357 Mb0358   dnaK FALSE 0.012 227.000 0.000 NA   NA
 538649 538650 Mb0358 Mb0359 dnaK grpE TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.005 Y NA
 538650 538651 Mb0359 Mb0360 grpE dnaJ1 TRUE 0.926 36.000 0.068 0.005 Y NA
 538651 538652 Mb0360 Mb0361 dnaJ1 hspR TRUE 0.894 0.000 0.074 1.000 N NA
 538653 538654 Mb0362c Mb0363c PPE8   FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 538654 538655 Mb0363c Mb0364c   purA TRUE 0.925 -3.000 0.052 NA   NA
 538656 538657 Mb0365 Mb0366     TRUE 0.619 11.000 0.020 NA   NA
 538659 538660 Mb0368 Mb0369   mgtE FALSE 0.013 222.000 0.000 NA   NA
 538663 538664 Mb0372c Mb0373c     TRUE 0.721 25.000 0.000 0.047   NA
 538664 538665 Mb0373c Mb0374c     FALSE 0.226 29.000 0.000 NA   NA
 538665 538666 Mb0374c Mb0375c     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 538666 538667 Mb0375c Mb0376c     TRUE 0.882 6.000 0.208 NA   NA
 538667 538668 Mb0376c Mb0377c     FALSE 0.415 101.000 0.250 NA   NA
 538668 538669 Mb0377c Mb0378c     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 538669 538670 Mb0378c Mb0379c     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 538670 538671 Mb0379c Mb0380c     TRUE 0.852 19.000 0.750 NA N NA
 538671 538672 Mb0380c Mb0381c     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.071 Y NA
 538672 538673 Mb0381c Mb0382c     TRUE 0.990 15.000 0.909 0.071 Y NA
 538673 538674 Mb0382c Mb0383c     FALSE 0.336 76.000 0.250 NA N NA
 538675 538676 Mb0384 Mb0385     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 538676 538677 Mb0385 Mb0386   secE2 FALSE 0.080 119.000 0.000 NA   NA
 538678 538679 Mb0387c Mb0388c     FALSE 0.250 96.000 0.055 NA   NA
 538679 538680 Mb0388c Mb0389c   pyrE FALSE 0.432 18.000 0.012 NA   NA
 538680 538681 Mb0389c Mb0390c pyrE   FALSE 0.197 81.000 0.006 NA   NA
 538681 538682 Mb0390c Mb0391c   clpB FALSE 0.080 141.000 0.009 NA   NA
 538683 538684 Mb0392 Mb0393     FALSE 0.182 104.000 0.000 1.000   NA
 538686 538687 Mb0395 Mb0396 purT   TRUE 0.715 -3.000 0.019 NA N NA
 538687 538688 Mb0396 Mb0397   metZ TRUE 0.871 -3.000 0.092 NA N NA
 538692 538693 Mb0401 Mb0402     TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 538693 538694 Mb0402 Mb0403     FALSE 0.139 74.000 0.000 NA   NA
 538695 538696 Mb0404c Mb0405c   lpqK TRUE 0.887 7.000 0.250 NA   NA
 538696 538697 Mb0405c Mb0406c lpqK fadE7 FALSE 0.313 10.000 0.000 1.000 N NA
 538699 538700 Mb0408c Mb0409c mmpL1b mmpL1a TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.055   NA
 538700 538701 Mb0409c Mb0410c mmpL1a mmpS1 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538702 538703 Mb0411 Mb0412 fadD30 pks6a TRUE 0.994 -3.000 1.000 1.000   NA
 538703 538704 Mb0412 Mb0413 pks6a pks6b TRUE 0.867 -13.000 0.000 0.011   NA
 538706 538707 Mb0415 Mb0416 fgd1 pta TRUE 0.730 -7.000 0.021 1.000   NA
 538707 538708 Mb0416 Mb0417 pta ackA TRUE 0.838 -7.000 0.185 1.000   NA
 538709 538710 Mb0418c Mb0419c pknG glnH TRUE 0.996 0.000 0.622 1.000 Y NA
 538710 538711 Mb0419c Mb0420c glnH   TRUE 0.990 0.000 0.895 NA   NA
 538714 538715 Mb0423 Mb0424 thiO thiS TRUE 0.985 -3.000 0.625 1.000 N NA
 538715 538716 Mb0424 Mb0425 thiS thiG TRUE 0.948 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 538716 538717 Mb0425 Mb0426 thiG lpqL FALSE 0.006 372.000 0.000 1.000   NA
 538717 538718 Mb0426 Mb0427 lpqL lpqM FALSE 0.543 88.000 0.000 0.031   NA
 538719 538720 Mb0428c Mb0429c     FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 538720 538721 Mb0429c Mb0430c   thiD TRUE 0.928 -3.000 0.059 NA   NA
 538721 538722 Mb0430c Mb0431c thiD thiC TRUE 0.931 27.000 0.015 0.006 Y NA
 538722 538723 Mb0431c Mb0432c thiC   FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 538723 538724 Mb0432c Mb0433c   ctpH TRUE 0.686 50.000 0.500 NA   NA
 538724 538725 Mb0433c Mb0434c ctpH   FALSE 0.498 52.000 0.250 NA   NA
 538725 538726 Mb0434c Mb0435c   xthA FALSE 0.031 201.000 0.015 NA   NA
 538726 538727 Mb0435c Mb0436c xthA   TRUE 0.888 3.000 0.088 NA   NA
 538727 538728 Mb0436c Mb0437c   def TRUE 0.980 0.000 0.488 NA   NA
 538729 538730 Mb0438 Mb0439     FALSE 0.501 32.000 0.176 NA   NA
 538730 538731 Mb0439 Mb0440   sodC TRUE 0.747 33.000 0.500 NA   NA
 538731 538732 Mb0440 Mb0441 sodC   TRUE 0.933 2.000 0.128 1.000   NA
 538732 538733 Mb0441 Mb0442     FALSE 0.300 60.000 0.010 1.000   NA
 538734 538735 Mb0443c Mb0444c   pssA TRUE 0.868 -3.000 0.025 1.000 N NA
 538735 538736 Mb0444c Mb0445c pssA psd TRUE 0.996 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 538736 538737 Mb0445c Mb0446c psd moeA2 FALSE 0.161 61.000 0.018 1.000 N NA
 538737 538738 Mb0446c Mb0447c moeA2   TRUE 0.695 19.000 0.188 1.000   NA
 538740 538741 Mb0449c Mb0450c   PPE10 FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 538743 538744 Mb0452c Mb0453c   sigK TRUE 0.804 44.000 0.778 NA   NA
 538744 538745 Mb0453c Mb0454c sigK   FALSE 0.406 49.000 0.065 1.000   NA
 538745 538746 Mb0454c Mb0455c   ufaA1 TRUE 0.818 9.000 0.081 1.000   NA
 538746 538747 Mb0455c Mb0456c ufaA1   TRUE 0.931 -3.000 0.067 NA   NA
 538747 538748 Mb0456c Mb0457c     TRUE 0.752 60.000 0.722 NA   NA
 538748 538749 Mb0457c Mb0458c   mmpL4 FALSE 0.351 40.000 0.007 1.000   NA
 538749 538750 Mb0458c Mb0459c mmpL4 mmpS4 TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 538751 538752 Mb0460 Mb0461   PPE11 FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 538752 538753 Mb0461 Mb0462 PPE11   FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 538754 538755 Mb0463c Mb0464c   echA2 FALSE 0.255 68.000 0.039 NA   NA
 538755 538756 Mb0464c Mb0465c echA2   FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000   NA
 538756 538757 Mb0465c Mb0466c     FALSE 0.021 229.000 0.000 1.000   NA
 538758 538759 Mb0467 Mb0468     TRUE 0.890 0.000 0.021 NA   NA
 538759 538760 Mb0468 Mb0469     FALSE 0.271 60.000 0.042 NA   NA
 538760 538761 Mb0469 Mb0470     TRUE 0.856 38.000 1.000 NA   NA
 538761 538762 Mb0470 Mb0471   lpd FALSE 0.228 64.000 0.017 NA   NA
 538762 538763 Mb0471 Mb0472 lpd   TRUE 0.719 8.000 0.028 NA   NA
 538764 538765 Mb0473c Mb0474c     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 538766 538767 Mb0475 Mb0476   icl FALSE 0.003 275.000 0.000 1.000 N NA
 538767 538768 Mb0476 Mb0477 icl fadB2 FALSE 0.176 82.000 0.036 1.000 N NA
 538768 538769 Mb0477 Mb0478 fadB2 umaA1 FALSE 0.135 133.000 0.130 1.000 N NA
 538770 538771 Mb0479c Mb0480c pcaA   FALSE 0.081 143.000 0.000 1.000   NA
 538771 538772 Mb0480c Mb0481c     FALSE 0.264 -69.000 0.000 NA   NA
 538772 538773 Mb0481c Mb0482c     FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 538774 538775 Mb0483 Mb0484     FALSE 0.248 87.000 0.047 NA   NA
 538775 538776 Mb0484 Mb0485   hbhA FALSE 0.023 354.000 0.282 NA   NA
 538776 538777 Mb0485 Mb0486 hbhA   FALSE 0.364 112.000 0.270 NA   NA
 538777 538778 Mb0486 Mb0487     TRUE 0.873 5.000 0.143 NA   NA
 538778 538779 Mb0487 Mb0488   deoC TRUE 0.898 0.000 0.030 NA   NA
 538780 538781 Mb0489c Mb0490c     TRUE 0.938 -3.000 0.091 NA   NA
 538781 538782 Mb0490c Mb0491c     FALSE 0.387 33.000 0.061 NA   NA
 538783 538784 Mb0492 Mb0493 murB lprQ FALSE 0.259 62.000 0.036 NA   NA
 538786 538787 Mb0495 Mb0496     FALSE 0.191 48.000 0.082 NA N NA
 538787 538788 Mb0496 Mb0497     TRUE 0.985 -3.000 0.541 NA   NA
 538788 538789 Mb0497 Mb0498     FALSE 0.003 384.000 0.000 NA   NA
 538789 538790 Mb0498 Mb0499   gpm1 FALSE 0.063 157.000 0.000 1.000   NA
 538790 538791 Mb0499 Mb0500 gpm1 senX3 FALSE 0.083 174.000 0.196 1.000 N NA
 538791 538792 Mb0500 Mb0501 senX3 regX3 FALSE 0.136 358.000 0.437 1.000 Y NA
 538793 538794 Mb0502c Mb0503c     TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 538794 538795 Mb0503c Mb0504c     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 538798 538799 Mb0507 Mb0508     TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 538799 538800 Mb0508 Mb0509     TRUE 0.627 16.000 0.127 NA   NA
 538800 538801 Mb0509 Mb0510     TRUE 0.590 16.000 0.076 NA   NA
 538801 538802 Mb0510 Mb0511   proC TRUE 0.605 25.000 0.143 1.000   NA
 538802 538803 Mb0511 Mb0512 proC   FALSE 0.220 141.000 0.186 1.000   NA
 538803 538804 Mb0512 Mb0513   galE2 FALSE 0.010 307.000 0.000 1.000   NA
 538804 538805 Mb0513 Mb0514 galE2   TRUE 0.962 7.000 0.796 1.000 N NA
 538806 538807 Mb0515c Mb0516c cmaA2   TRUE 0.802 23.000 0.400 1.000   NA
 538807 538808 Mb0516c Mb0517c   serB1 FALSE 0.135 162.000 0.145 1.000   NA
 538809 538810 Mb0518 Mb0519 mmpS2 mmpL2 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538810 538811 Mb0519 Mb0520 mmpL2   TRUE 0.610 -7.000 0.007 NA   NA
 538811 538812 Mb0520 Mb0521   hemA FALSE 0.242 50.000 0.012 NA   NA
 538812 538813 Mb0521 Mb0523 hemA hemC TRUE 0.987 10.000 0.178 0.002 Y NA
 538813 538814 Mb0523 Mb0524 hemC hemD TRUE 0.936 33.000 0.044 0.002 Y NA
 538814 538815 Mb0524 Mb0525 hemD hemB TRUE 0.952 86.000 0.429 0.002 Y NA
 538815 538816 Mb0525 Mb0526 hemB   TRUE 0.589 13.000 0.039 NA   NA
 538816 538817 Mb0526 Mb0527     TRUE 0.978 -3.000 0.389 NA   NA
 538817 538818 Mb0527 Mb0528     FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 538820 538821 Mb0530 Mb0531     FALSE 0.290 132.000 0.333 1.000 N NA
 538823 538824 Mb0533 Mb0534     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 538824 538825 Mb0534 Mb0535   gabP FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 538827 538828 Mb0537 Mb0538 hemL   TRUE 0.913 0.000 0.204 NA N NA
 538828 538829 Mb0538 Mb0539     FALSE 0.275 15.000 0.035 NA N NA
 538829 538830 Mb0539 Mb0540   ccdA TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 538830 538831 Mb0540 Mb0541 ccdA   TRUE 0.804 33.000 0.131 NA Y NA
 538831 538832 Mb0541 Mb0542   ccsA TRUE 0.987 -3.000 0.082 NA Y NA
 538832 538833 Mb0542 Mb0543 ccsA   FALSE 0.543 42.000 0.308 1.000 N NA
 538833 538834 Mb0543 Mb0544     FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 538834 538835 Mb0544 Mb0545   PE_PGRS6a FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 538835 538836 Mb0545 Mb0546 PE_PGRS6a PE_PGRS6b FALSE 0.258 -94.000 0.000 NA   NA
 538837 538838 Mb0547c Mb0548c fabH menA FALSE 0.135 82.000 0.011 1.000 N NA
 538839 538840 Mb0549 Mb0550 pnp galE3 TRUE 0.833 -3.000 0.008 1.000 N NA
 538842 538843 Mb0552 Mb0553     FALSE 0.287 57.000 0.048 NA   NA
 538843 538844 Mb0553 Mb0554     TRUE 0.941 -3.000 0.109 NA   NA
 538845 538846 Mb0555c Mb0556c   menE FALSE 0.546 12.000 0.008 NA   NA
 538846 538847 Mb0556c Mb0557c menE   FALSE 0.234 69.000 0.024 NA   NA
 538847 538848 Mb0557c Mb0558c     FALSE 0.147 60.000 0.000 NA   NA
 538848 538849 Mb0558c Mb0559c   pitA TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538849 538850 Mb0559c Mb0560c pitA   FALSE 0.235 120.000 0.167 NA   NA
 538850 538851 Mb0560c Mb0561c     FALSE 0.303 63.000 0.069 NA   NA
 538851 538852 Mb0561c Mb0562c   menB FALSE 0.255 96.000 0.008 1.000   NA
 538852 538853 Mb0562c Mb0563c menB   FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 538853 538854 Mb0563c Mb0564c     FALSE 0.292 -33.000 0.000 NA   NA
 538854 538855 Mb0564c Mb0565c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538855 538856 Mb0565c Mb0566c   fadD8 FALSE 0.021 192.000 0.000 NA   NA
 538857 538858 Mb0567 Mb0568   menC TRUE 0.939 -3.000 0.028 1.000   NA
 538858 538859 Mb0568 Mb0569 menC bpoC TRUE 0.982 -3.000 0.038 0.045   NA
 538859 538860 Mb0569 Mb0570 bpoC menD FALSE 0.368 43.000 0.022 1.000   NA
 538860 538861 Mb0570 Mb0571 menD   TRUE 0.926 -3.000 0.055 NA   NA
 538861 538862 Mb0571 Mb0572   pimB FALSE 0.485 62.000 0.259 NA   NA
 538862 538863 Mb0572 Mb0573 pimB menH FALSE 0.338 17.000 0.013 1.000 N NA
 538864 538865 Mb0574c Mb0575c     FALSE 0.541 34.000 0.222 NA   NA
 538865 538866 Mb0575c Mb0576c     FALSE 0.305 25.000 0.029 1.000 N NA
 538867 538868 Mb0577 Mb0578 grcC1 htpX FALSE 0.161 101.000 0.042 1.000 N NA
 538869 538870 Mb0579c Mb0580c gpdA1   FALSE 0.289 61.000 0.133 1.000 N NA
 538870 538871 Mb0580c Mb0581c     FALSE 0.196 78.000 0.005 NA   NA
 538872 538873 Mbt05 Mb0582 tyrT   FALSE 0.064 132.000 0.000 NA   NA
 538873 538874 Mb0582 Mb0583   cyp135B1 FALSE 0.043 110.000 0.000 1.000 N NA
 538874 538875 Mb0583 Mb0584 cyp135B1   FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 538875 538876 Mb0584 Mb0585   nrdZ TRUE 0.667 26.000 0.286 NA   NA
 538877 538878 Mb0586c Mb0587c     FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 538878 538879 Mb0587c Mb0588c     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 538879 538880 Mb0588c Mb0589c     FALSE 0.070 10.000 0.000 NA N NA
 538880 538881 Mb0589c Mb0590c     FALSE 0.001 216.000 0.000 NA N NA
 538882 538883 Mb0591 Mb0592   TB27.3 TRUE 0.632 14.000 0.080 NA   NA
 538887 538888 Mb0596 Mb0597     TRUE 0.954 -3.000 0.182 NA   NA
 538892 538893 Mb0601 Mb0602   yrbE2A TRUE 0.714 -3.000 0.019 NA N NA
 538893 538894 Mb0602 Mb0603 yrbE2A yrbE2B TRUE 0.989 2.000 0.333 NA Y NA
 538894 538895 Mb0603 Mb0604 yrbE2B mce2A TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 538895 538896 Mb0604 Mb0605 mce2A mce2B TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.007 Y NA
 538896 538897 Mb0605 Mb0606 mce2B mce2C TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 538897 538898 Mb0606 Mb0607 mce2C mce2Da TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.007 Y NA
 538898 538899 Mb0607 Mb0608 mce2Da mce2Db FALSE 0.277 -52.000 0.000 NA   NA
 538899 538900 Mb0608 Mb0609 mce2Db lprL TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538900 538901 Mb0609 Mb0610 lprL mce2F FALSE 0.069 647.000 0.500 0.007   NA
 538902 538903 Mb0611c Mb0612c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538903 538904 Mb0612c Mb0613c     FALSE 0.024 183.000 0.000 NA   NA
 538904 538905 Mb0613c Mb0614c     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 538905 538906 Mb0614c Mb0615c     TRUE 0.979 -3.000 0.400 NA   NA
 538906 538907 Mb0615c Mb0616c     FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 538907 538908 Mb0616c Mb0617c     TRUE 0.580 114.000 0.000 0.001   NA
 538908 538909 Mb0617c Mb0618c   tcrA FALSE 0.268 44.000 0.000 1.000   NA
 538910 538911 Mb0619 Mb0620   lpqO FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 538911 538912 Mb0620 Mb0621 lpqO   FALSE 0.014 217.000 0.000 NA   NA
 538912 538913 Mb0621 Mb0622     TRUE 0.763 2.000 0.000 NA   NA
 538913 538914 Mb0622 Mb0623     FALSE 0.154 54.000 0.000 NA   NA
 538914 538915 Mb0623 Mb0624     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 538915 538916 Mb0624 Mb0625     TRUE 0.969 -3.000 0.273 NA   NA
 538916 538917 Mb0625 Mb0626     FALSE 0.273 -57.000 0.000 NA   NA
 538918 538919 Mb0627c Mb0628c     FALSE 0.157 52.000 0.000 NA   NA
 538922 538923 Mb0631 Mb0632     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538925 538926 Mb0634 Mb0635   galT FALSE 0.069 129.000 0.000 NA   NA
 538926 538927 Mb0635 Mb0636 galT galK TRUE 0.994 -3.000 0.370 0.001 N NA
 538927 538928 Mb0636 Mb0637 galK   FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 538928 538929 Mb0637 Mb0638     TRUE 0.867 11.000 0.333 NA   NA
 538929 538930 Mb0638 Mb0639     FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 538930 538931 Mb0639 Mb0640     TRUE 0.949 0.000 0.200 NA   NA
 538933 538934 Mb0642 Mb0643     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538935 538936 Mb0644c Mb0645c   recD FALSE 0.125 93.000 0.000 NA   NA
 538936 538937 Mb0645c Mb0646c recD recBb TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538937 538938 Mb0646c Mb0647c recBb recBa FALSE 0.253 -114.000 0.000 NA   NA
 538938 538939 Mb0647c Mb0648c recBa recC TRUE 0.999 0.000 0.542 0.001 Y NA
 538939 538940 Mb0648c Mb0649c recC echA3 FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000 N NA
 538940 538941 Mb0649c Mb0650c echA3   FALSE 0.331 49.000 0.067 NA   NA
 538941 538942 Mb0650c Mb0651c     FALSE 0.060 154.000 0.006 NA   NA
 538943 538944 Mb0652 Mbt06   thrT FALSE 0.067 130.000 0.000 NA   NA
 538944 538945 Mbt06 Mbt07 thrT metT FALSE 0.192 37.000 0.000 NA   NA
 538945 538946 Mbt07 Mb0653 metT rpmG2 FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 538946 538947 Mb0653 Mb0654 rpmG2   FALSE 0.339 51.000 0.079 NA   NA
 538947 538948 Mb0654 Mb0655     TRUE 0.936 -13.000 0.818 NA   NA
 538948 538949 Mb0655 Mb0656     TRUE 0.994 4.000 0.818 NA Y NA
 538949 538950 Mb0656 Mbt08   trpT FALSE 0.019 199.000 0.000 NA   NA
 538950 538951 Mbt08 Mb0657 trpT secE1 FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 538951 538952 Mb0657 Mb0658 secE1 nusG FALSE 0.196 32.000 0.006 1.000 N NA
 538952 538953 Mb0658 Mb0659 nusG rplK TRUE 0.728 52.000 0.681 1.000 N NA
 538953 538954 Mb0659 Mb0660 rplK rplA TRUE 0.968 67.000 0.838 0.023 Y NA
 538955 538956 Mb0661c Mb0662c mmaA4 mmaA3 TRUE 0.935 65.000 0.286 0.004 Y NA
 538956 538957 Mb0662c Mb0663c mmaA3 mmaA2 TRUE 0.891 148.000 0.667 0.004 Y NA
 538957 538958 Mb0663c Mb0664c mmaA2 mmaA1 TRUE 0.777 167.000 0.400 0.004 Y NA
 538958 538959 Mb0664c Mb0665c mmaA1 lipG TRUE 0.667 47.000 0.444 NA   NA
 538959 538960 Mb0665c Mb0666c lipG   TRUE 0.796 12.000 0.243 NA   NA
 538961 538962 Mb0667 Mb0668   fabD2 TRUE 0.993 -3.000 0.857 1.000   NA
 538962 538963 Mb0668 Mb0669 fabD2   TRUE 0.886 0.000 0.000 1.000   NA
 538963 538964 Mb0669 Mb0670   rplJ FALSE 0.002 331.000 0.000 1.000 N NA
 538964 538965 Mb0670 Mb0671 rplJ rplL TRUE 0.979 37.000 0.884 0.018 Y NA
 538967 538968 Mb0673 Mb0674   mkl FALSE 0.344 12.000 0.038 NA N NA
 538969 538970 Mb0675c Mb0676c     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 538970 538971 Mb0676c Mb0677c     FALSE 0.139 76.000 0.000 NA   NA
 538971 538972 Mb0677c Mb0678c     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 538972 538973 Mb0678c Mb0679c     FALSE 0.547 -13.000 0.000 1.000   NA
 538973 538974 Mb0679c Mb0680c     FALSE 0.095 110.000 0.000 NA   NA
 538974 538975 Mb0680c Mb0681c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538976 538977 Mb0682 Mb0683 atsD   FALSE 0.209 32.000 0.000 NA   NA
 538977 538978 Mb0683 Mb0684     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538978 538979 Mb0684 Mb0685     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 538979 538980 Mb0685 Mb0686   rpoB FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 538980 538981 Mb0686 Mb0687 rpoB rpoC TRUE 0.983 45.000 0.851 0.001 Y NA
 538983 538984 Mb0689 Mb0690 end lpqP FALSE 0.187 32.000 0.004 1.000 N NA
 538984 538985 Mb0690 Mb0691 lpqP fadE8 FALSE 0.244 60.000 0.071 1.000 N NA
 538985 538986 Mb0691 Mb0692 fadE8 echA4 TRUE 0.963 11.000 0.286 1.000 Y NA
 538986 538987 Mb0692 Mb0693 echA4   TRUE 0.917 3.000 0.292 NA N NA
 538987 538988 Mb0693 Mb0694   echA5 TRUE 0.865 -3.000 0.083 NA N NA
 538989 538990 Mb0695c Mb0696c mmpL5 mmpS5 TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 538992 538993 Mb0698c Mb0699c     TRUE 0.984 2.000 0.778 NA   NA
 538994 538995 Mb0700 Mb0701   rpsL FALSE 0.004 249.000 0.000 1.000 N NA
 538995 538996 Mb0701 Mb0702 rpsL rpsG TRUE 0.999 0.000 0.620 0.003 Y NA
 538996 538997 Mb0702 Mb0703 rpsG fusA1 TRUE 0.893 81.000 0.579 1.000 Y NA
 538997 538998 Mb0703 Mb0704 fusA1 tuf TRUE 0.626 231.000 0.400 0.001 Y NA
 538998 538999 Mb0704 Mb0705 tuf   FALSE 0.054 138.000 0.000 NA   NA
 538999 539000 Mb0705 Mb0706     FALSE 0.233 153.000 0.333 NA   NA
 539000 539001 Mb0706 Mb0707     TRUE 0.907 14.000 0.214 0.055   NA
 539002 539003 Mb0708c Mb0709c     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 539003 539004 Mb0709c Mb0710c     TRUE 0.937 -3.000 0.088 NA   NA
 539005 539006 Mb0711 Mb0712   pqqE TRUE 0.983 -3.000 0.484 NA   NA
 539006 539007 Mb0712 Mb0713 pqqE lldD1 TRUE 0.977 3.000 0.548 1.000   NA
 539007 539008 Mb0713 Mb0714 lldD1   FALSE 0.216 190.000 0.464 1.000   NA
 539008 539009 Mb0714 Mb0715     TRUE 0.656 49.000 0.440 NA   NA
 539009 539010 Mb0715 Mb0716     TRUE 0.981 2.000 0.667 NA   NA
 539010 539011 Mb0716 Mb0717     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 539011 539012 Mb0717 Mb0718     FALSE 0.165 48.000 0.000 NA   NA
 539012 539013 Mb0718 Mb0719     FALSE 0.023 185.000 0.000 NA   NA
 539013 539014 Mb0719 Mb0720   rpsJ FALSE 0.002 637.000 0.000 NA   NA
 539014 539015 Mb0720 Mb0721 rpsJ rplC TRUE 0.980 17.000 0.467 0.022 Y NA
 539015 539016 Mb0721 Mb0722 rplC rplD TRUE 0.997 0.000 0.361 0.017 Y NA
 539016 539017 Mb0722 Mb0723 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.513 0.017 Y NA
 539017 539018 Mb0723 Mb0724 rplW rplB TRUE 0.904 147.000 0.849 0.014 Y NA
 539018 539019 Mb0724 Mb0725 rplB rpsS TRUE 0.976 41.000 0.820 0.022 Y NA
 539019 539020 Mb0725 Mb0726 rpsS rplV TRUE 0.999 -3.000 0.769 0.022 Y NA
 539020 539021 Mb0726 Mb0727 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.022 Y NA
 539021 539022 Mb0727 Mb0728 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.022 Y NA
 539022 539023 Mb0728 Mb0729 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.017 Y NA
 539023 539024 Mb0729 Mb0730 rpmC rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.017 Y NA
 539024 539025 Mb0730 Mb0731 rpsQ atsAa FALSE 0.068 169.000 0.005 1.000   NA
 539025 539026 Mb0731 Mb0732 atsAa atsAb TRUE 0.955 7.000 0.000 0.001   NA
 539026 539027 Mb0732 Mb0733 atsAb   FALSE 0.513 48.000 0.250 NA   NA
 539027 539028 Mb0733 Mb0734     FALSE 0.074 301.000 0.600 NA   NA
 539028 539029 Mb0734 Mb0735   rplN FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 539029 539030 Mb0735 Mb0736 rplN rplX TRUE 0.998 1.000 0.810 0.022 Y NA
 539030 539031 Mb0736 Mb0737 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.017 Y NA
 539031 539032 Mb0737 Mb0738 rplE rpsN1 TRUE 0.996 5.000 0.496 0.017 Y NA
 539032 539033 Mb0738 Mb0739 rpsN1 rpsH TRUE 0.776 164.000 0.473 0.017 Y NA
 539033 539034 Mb0739 Mb0740 rpsH rplF TRUE 0.985 24.000 0.808 0.017 Y NA
 539034 539035 Mb0740 Mb0741 rplF rplR TRUE 0.998 3.000 0.815 0.017 Y NA
 539035 539036 Mb0741 Mb0742 rplR rpsE TRUE 0.987 20.000 0.814 0.022 Y NA
 539036 539037 Mb0742 Mb0743 rpsE rpmD TRUE 0.998 3.000 0.789 0.022 Y NA
 539037 539038 Mb0743 Mb0744 rpmD rplO TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 539038 539039 Mb0744 Mb0745 rplO sppA FALSE 0.099 33.000 0.000 1.000 N NA
 539040 539041 Mb0746c Mb0747c     TRUE 0.581 93.000 0.000 NA Y NA
 539041 539042 Mb0747c Mb0748c   fucA FALSE 0.001 203.000 0.000 NA N NA
 539042 539043 Mb0748c Mb0749c fucA serA2 TRUE 0.899 -3.000 0.058 1.000 N NA
 539044 539045 Mb0750 Mb0751 xylB   TRUE 0.645 13.000 0.018 1.000   NA
 539047 539048 Mb0753 Mb0754 secY adk TRUE 0.899 -3.000 0.057 1.000 N NA
 539048 539049 Mb0754 Mb0755 adk mapA TRUE 0.972 3.000 0.606 1.000 N NA
 539049 539050 Mb0755 Mb0756 mapA sigL FALSE 0.254 73.000 0.099 1.000 N NA
 539050 539051 Mb0756 Mb0757 sigL   TRUE 0.903 64.000 0.697 NA Y NA
 539051 539052 Mb0757 Mb0758     FALSE 0.067 315.000 0.065 NA Y NA
 539052 539053 Mb0758 Mb0759     FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 539053 539054 Mb0759 Mb0760     FALSE 0.017 205.000 0.000 NA   NA
 539054 539055 Mb0760 Mb0761     FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 539055 539056 Mb0761 Mb0762     FALSE 0.012 231.000 0.000 NA   NA
 539056 539057 Mb0762 Mb0763   PE_PGRS8 FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 539058 539059 Mb0764c Mb0765c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539060 539061 Mb0766 Mb0767   PE_PGRS9 FALSE 0.296 20.000 0.000 NA   NA
 539061 539062 Mb0767 Mb0768 PE_PGRS9 PE_PGRS10 FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 539062 539063 Mb0768 Mb0769 PE_PGRS10   FALSE 0.202 91.000 0.000 1.000   NA
 539063 539064 Mb0769 Mb0770     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 539067 539068 Mb0773c Mb0774c mmsB fadE9 TRUE 0.935 11.000 0.051 1.000 Y NA
 539068 539069 Mb0774c Mb0775c fadE9 mmsA TRUE 0.824 7.000 0.197 1.000 N NA
 539071 539072 Mb0777c Mb0778c PPE12   FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 539072 539073 Mb0778c Mbt09   thrV FALSE 0.086 115.000 0.000 NA   NA
 539073 539074 Mbt09 Mb0779c thrV   FALSE 0.230 28.000 0.000 NA   NA
 539075 539076 Mb0780 Mb0781 phoP phoR TRUE 0.971 45.000 0.824 0.052 Y NA
 539077 539078 Mb0782c Mb0783c     FALSE 0.221 109.000 0.014 1.000   NA
 539078 539079 Mb0783c Mb0784c   adhB TRUE 0.938 13.000 0.750 1.000   NA
 539079 539080 Mb0784c Mb0785c adhB   FALSE 0.546 99.000 0.400 NA   NA
 539080 539081 Mb0785c Mb0786c     TRUE 0.983 3.000 0.800 NA   NA
 539081 539082 Mb0786c Mb0787c   cyp51 TRUE 0.973 3.000 0.733 NA N NA
 539082 539083 Mb0787c Mb0788c cyp51   TRUE 0.962 0.000 0.212 1.000   NA
 539083 539084 Mb0788c Mb0789c   cyp123 TRUE 0.965 0.000 0.231 1.000   NA
 539084 539085 Mb0789c Mb0790c cyp123   TRUE 0.983 -3.000 0.571 1.000 N NA
 539086 539087 Mb0791 Mb0792 aldA   TRUE 0.830 31.000 0.812 1.000 N NA
 539087 539088 Mb0792 Mb0793     TRUE 0.859 98.000 0.480 1.000 Y NA
 539088 539089 Mb0793 Mb0794     TRUE 0.988 -3.000 0.560 1.000   NA
 539089 539090 Mb0794 Mb0795   purD TRUE 0.635 12.000 0.003 1.000   NA
 539091 539092 Mb0796c Mb0797c ggtA   FALSE 0.410 51.000 0.073 1.000   NA
 539095 539096 Mb0800 Mb0801 purB cyp126 TRUE 0.648 5.000 0.006 1.000 N NA
 539098 539099 Mb0803 Mb0804 purC ptrB TRUE 0.878 -3.000 0.035 1.000 N NA
 539101 539102 Mb0806 Mb0807     TRUE 0.631 16.000 0.048 1.000   NA
 539102 539103 Mb0807 Mb0808     TRUE 0.810 18.000 0.024 0.054   NA
 539105 539106 Mb0810 Mb0811     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 539106 539107 Mb0811 Mb0812   purQ TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 539108 539109 Mb0813c Mb0814c     FALSE 0.280 22.000 0.000 NA   NA
 539109 539110 Mb0814c Mb0815c     TRUE 0.933 -3.000 0.070 NA   NA
 539110 539111 Mb0815c Mb0816c     TRUE 0.943 -3.000 0.250 NA N NA
 539113 539114 Mb0818c Mb0819c     TRUE 0.840 -12.000 0.000 0.066   NA
 539116 539117 Mb0821c Mb0822c cfp29   TRUE 0.968 -3.000 0.267 NA   NA
 539118 539119 Mb0823 Mb0824 pepC   TRUE 0.615 12.000 0.038 NA   NA
 539121 539122 Mb0826 Mb0827 purL   TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 539122 539123 Mb0827 Mb0828     FALSE 0.127 121.000 0.000 1.000   NA
 539125 539126 Mb0830 Mb0831   purF FALSE 0.232 87.000 0.034 NA   NA
 539126 539127 Mb0831 Mb0832 purF purM TRUE 0.876 31.000 0.248 1.000 Y NA
 539128 539129 Mb0833c Mb0834c     FALSE 0.076 147.000 0.017 NA   NA
 539131 539132 Mb0836c Mb0837c   sseC2 FALSE 0.068 163.000 0.043 NA   NA
 539132 539133 Mb0837c Mb0838c sseC2 cysA2 TRUE 0.981 2.000 0.557 1.000   NA
 539133 539134 Mb0838c Mb0839c cysA2 thiX FALSE 0.011 293.000 0.000 1.000   NA
 539134 539135 Mb0839c Mb0840c thiX   TRUE 0.977 -3.000 0.371 NA   NA
 539136 539137 Mb0841 Mb0842     TRUE 0.966 -3.000 0.196 1.000   NA
 539137 539138 Mb0842 Mb0843   phoT FALSE 0.360 43.000 0.016 1.000   NA
 539139 539140 Mb0844c Mb0845c phoY2   TRUE 0.620 58.000 0.579 NA N NA
 539140 539141 Mb0845c Mb0846c     FALSE 0.008 166.000 0.005 NA N NA
 539141 539142 Mb0846c Mb0847c   desA1 FALSE 0.255 88.000 0.004 1.000   NA
 539142 539143 Mb0847c Mb0848c desA1   FALSE 0.260 162.000 0.375 1.000   NA
 539145 539146 Mb0850c Mb0851c     FALSE 0.071 58.000 0.000 1.000 N NA
 539147 539148 Mb0852 Mb0853     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539149 539150 Mb0854c Mbt10   lysT FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 539151 539152 Mbt11 Mbt12 gluT aspT FALSE 0.188 38.000 0.000 NA   NA
 539152 539153 Mbt12 Mbt13 aspT pheU FALSE 0.221 30.000 0.000 NA   NA
 539153 539154 Mbt13 Mb0855 pheU PE_PGRS12 FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 539154 539155 Mb0855 Mb0856 PE_PGRS12 PE_PGRS13 TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539158 539159 Mb0859c Mb0860c     FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 539160 539161 Mb0861 Mb0862 lpqR   FALSE 0.164 87.000 0.033 1.000 N NA
 539163 539164 Mb0864 Mb0865     FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 539164 539165 Mb0865 Mb0866     FALSE 0.518 -16.000 0.000 1.000   NA
 539169 539170 Mb0870 Mb0871 lpqS cysK2 FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539170 539171 Mb0871 Mb0872 cysK2   TRUE 0.984 0.000 0.500 1.000   NA
 539171 539172 Mb0872 Mb0873     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539176 539177 Mb0877 Mb0878   far TRUE 0.926 6.000 0.333 NA   NA
 539177 539178 Mb0878 Mb0879 far   FALSE 0.089 113.000 0.000 NA   NA
 539178 539179 Mb0879 Mb0880     FALSE 0.230 28.000 0.000 NA   NA
 539181 539182 Mb0882 Mb0883 fadA fadB TRUE 0.993 5.000 0.750 1.000 Y NA
 539183 539184 Mb0884c Mb0885c     FALSE 0.200 138.000 0.206 NA   NA
 539185 539186 Mb0886 Mb0888   moaC2 FALSE 0.201 84.000 0.012 NA   NA
 539186 539187 Mb0888 Mb0889 moaC2 mog TRUE 0.996 -3.000 0.016 0.005 Y NA
 539187 539188 Mb0889 Mb0890 mog moaE2 TRUE 0.996 -3.000 0.015 0.005 Y NA
 539189 539190 Mb0891c Mb0892c rpfA moaD2 FALSE 0.005 448.000 0.000 1.000   NA
 539190 539191 Mb0892c Mb0893c moaD2 moaA2 TRUE 0.990 4.000 0.410 1.000 Y NA
 539191 539192 Mb0893c Mb0894c moaA2   TRUE 0.911 -3.000 0.026 NA   NA
 539196 539197 Mb0898c Mb0899c     FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 539197 539198 Mb0899c Mb0900c     TRUE 0.981 -3.000 0.432 NA   NA
 539200 539201 Mb0902c Mb0903c PPE13   FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 539202 539203 Mb0904 Mb0905     TRUE 0.872 -3.000 0.029 1.000 N NA
 539203 539204 Mb0905 Mb0906     TRUE 0.935 -3.000 0.075 NA   NA
 539205 539206 Mb0907c Mb0908c   serC FALSE 0.148 157.000 0.214 NA   NA
 539207 539208 Mb0909 Mb0910   fprB TRUE 0.920 19.000 0.846 1.000   NA
 539211 539212 Mb0913c Mb0914c citA   FALSE 0.205 87.000 0.000 1.000   NA
 539212 539213 Mb0914c Mb0915c     TRUE 0.850 2.000 0.000 1.000   NA
 539216 539217 Mb0918 Mb0919     FALSE 0.138 77.000 0.000 NA   NA
 539217 539218 Mb0919 Mb0920   gltA2 FALSE 0.029 173.000 0.000 NA   NA
 539219 539220 Mb0921c Mb0922c     FALSE 0.480 26.000 0.091 NA   NA
 539221 539222 Mb0923 Mb0924 ompA   TRUE 0.807 13.000 0.286 NA   NA
 539222 539223 Mb0924 Mb0925     TRUE 0.986 0.000 0.667 NA   NA
 539224 539225 Mb0926c Mb0927c prrB prrA TRUE 0.967 11.000 0.333 1.000 Y NA
 539225 539226 Mb0927c Mb0928c prrA accD3 FALSE 0.029 131.000 0.000 1.000 N NA
 539227 539228 Mb0929 Mb0930 echA6   TRUE 0.921 6.000 0.314 NA   NA
 539228 539229 Mb0930 Mb0931     FALSE 0.234 123.000 0.171 NA   NA
 539229 539230 Mb0931 Mb0932   ctpE TRUE 0.923 -3.000 0.119 1.000 N NA
 539230 539231 Mb0932 Mb0933 ctpE   FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 539231 539232 Mb0933 Mb0934     TRUE 0.869 6.000 0.182 NA   NA
 539232 539233 Mb0934 Mb0935     FALSE 0.121 98.000 0.000 NA   NA
 539233 539234 Mb0935 Mb0936     FALSE 0.303 65.000 0.071 NA   NA
 539235 539236 Mb0937c Mb0938c     TRUE 0.951 2.000 0.417 NA N NA
 539236 539237 Mb0938c Mb0939c   PPE14 FALSE 0.010 93.000 0.000 NA N NA
 539237 539238 Mb0939c Mb0940c PPE14 PE7 FALSE 0.366 15.000 0.000 NA   NA
 539239 539240 Mb0941 Mb0942 betP   FALSE 0.007 343.000 0.000 1.000   NA
 539240 539241 Mb0942 Mb0943     TRUE 0.954 -3.000 0.091 1.000   NA
 539242 539243 Mbt14 Mb0944c argT   FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 539244 539245 Mb0945 Mb0946     TRUE 0.977 0.000 0.000 NA Y NA
 539246 539247 Mb0947c Mb0948c   mntH TRUE 0.875 1.000 0.029 NA   NA
 539247 539248 Mb0948c Mb0949c mntH   FALSE 0.295 77.000 0.014 1.000   NA
 539248 539249 Mb0949c Mb0950c     TRUE 0.718 54.000 0.500 1.000   NA
 539250 539251 Mb0951 Mb0952 pstS3 pstC2 TRUE 0.979 13.000 0.200 0.004 Y NA
 539251 539252 Mb0952 Mb0953 pstC2 pstA1 TRUE 0.996 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 539253 539254 Mb0954c Mb0955c pknDb pknDa TRUE 0.911 11.000 0.000 0.004   NA
 539254 539255 Mb0955c Mb0956c pknDa pstS2 TRUE 0.843 22.000 0.667 1.000 N NA
 539256 539257 Mb0957 Mb0958 pstBa pstBb FALSE 0.314 -25.000 0.000 NA   NA
 539257 539258 Mb0958 Mb0959 pstBb pstS1 TRUE 0.941 21.000 0.000 0.004 Y NA
 539258 539259 Mb0959 Mb0960 pstS1 pstC1 TRUE 0.979 60.000 1.000 0.004 Y NA
 539259 539260 Mb0960 Mb0961 pstC1 pstA2 TRUE 0.998 2.000 0.636 0.004 Y NA
 539262 539263 Mb0963 Mb0964     TRUE 0.886 -3.000 0.043 1.000 N NA
 539264 539265 Mb0965c Mb0966c     FALSE 0.369 85.000 0.182 NA   NA
 539268 539269 Mb0969 Mb0970     TRUE 0.866 6.000 0.082 1.000   NA
 539270 539271 Mb0971c Mb0972c pgi   FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 539271 539272 Mb0972c Mb0973c     FALSE 0.084 116.000 0.000 NA   NA
 539275 539276 Mb0976 Mb0977 sucC sucD TRUE 0.989 13.000 0.382 0.001 Y NA
 539278 539279 Mb0979 Mb0980     FALSE 0.506 40.000 0.218 NA   NA
 539279 539280 Mb0980 Mb0981   purN FALSE 0.167 116.000 0.044 NA   NA
 539280 539281 Mb0981 Mb0982 purN purH TRUE 0.992 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 539281 539282 Mb0982 Mb0983 purH   FALSE 0.088 107.000 0.002 1.000 N NA
 539282 539283 Mb0983 Mb0984     TRUE 0.948 -7.000 0.645 1.000   NA
 539283 539284 Mb0984 Mb0985     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 539284 539285 Mb0985 Mb0986     FALSE 0.045 146.000 0.000 NA   NA
 539286 539287 Mb0987c Mb0988c lprP   FALSE 0.024 183.000 0.000 NA   NA
 539287 539288 Mb0988c Mb0989c     FALSE 0.120 99.000 0.000 NA   NA
 539288 539289 Mb0989c Mb0990c     FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 539289 539290 Mb0990c Mb0991c     FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 539291 539292 Mb0992 Mb0993     FALSE 0.231 57.000 0.012 NA   NA
 539292 539293 Mb0993 Mb0994   ctpV TRUE 0.675 56.000 0.500 NA   NA
 539293 539294 Mb0994 Mb0995 ctpV   TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 539295 539296 Mb0996c Mb0997c echA7 fadE12 TRUE 0.990 0.000 0.203 1.000 Y NA
 539296 539297 Mb0997c Mb0998c fadE12 accA2 TRUE 0.998 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 539297 539298 Mb0998c Mb0999c accA2 accD2 TRUE 0.998 6.000 0.875 0.003 Y NA
 539298 539299 Mb0999c Mb1000c accD2 fadE13 TRUE 0.918 41.000 0.548 1.000 Y NA
 539299 539300 Mb1000c Mb1001c fadE13   TRUE 0.986 -3.000 0.562 NA   NA
 539302 539303 Mb1003c Mb1004c PE_PGRS17   FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 539306 539307 Mb1007 Mb1008 mprA mprB TRUE 0.999 0.000 0.655 0.008 Y NA
 539307 539308 Mb1008 Mb1009 mprB   TRUE 0.619 44.000 0.424 1.000 N NA
 539308 539309 Mb1009 Mb1010   moaB2 TRUE 0.972 0.000 0.423 1.000 N NA
 539311 539312 Mb1012 Mb1013     TRUE 0.774 -7.000 0.210 1.000 N NA
 539312 539313 Mb1013 Mb1014     TRUE 0.944 1.000 0.000 0.050 N NA
 539313 539314 Mb1014 Mb1015     TRUE 0.721 7.000 0.000 1.000   NA
 539315 539316 Mb1016c Mb1017c grcC2   FALSE 0.146 61.000 0.000 NA   NA
 539316 539317 Mb1017c Mb1018c     FALSE 0.229 73.000 0.022 NA   NA
 539317 539318 Mb1018c Mb1019c     FALSE 0.257 74.000 0.041 NA   NA
 539319 539320 Mb1020 Mb1021 galU moeA1 FALSE 0.337 77.000 0.196 1.000 N NA
 539320 539321 Mb1021 Mb1022 moeA1 rimJ FALSE 0.567 63.000 0.427 1.000 N NA
 539321 539322 Mb1022 Mb1023 rimJ   FALSE 0.122 161.000 0.183 NA   NA
 539322 539323 Mb1023 Mbt15   alaV FALSE 0.158 51.000 0.000 NA   NA
 539323 539324 Mbt15 Mb1024 alaV   FALSE 0.002 710.000 0.000 NA   NA
 539324 539325 Mb1024 Mb1025     FALSE 0.264 24.000 0.000 NA   NA
 539325 539326 Mb1025 Mb1026     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 539331 539332 Mb1031c Mb1032c   pabB FALSE 0.200 74.000 0.006 NA   NA
 539335 539336 Mb1035 Mb1036 tatD rpfB FALSE 0.026 208.000 0.008 NA   NA
 539336 539337 Mb1036 Mb1037 rpfB ksgA FALSE 0.519 -27.000 0.008 1.000   NA
 539337 539338 Mb1037 Mb1038 ksgA ispE FALSE 0.212 86.000 0.068 1.000 N NA
 539338 539339 Mb1038 Mb1040 ispE   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539339 539340 Mb1040 Mb1041   pks16 FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 539341 539342 Mb1042c Mb1043c pth rplY TRUE 0.986 13.000 0.496 0.025 Y NA
 539342 539343 Mb1043c Mb1044c rplY lpqT FALSE 0.061 134.000 0.000 NA   NA
 539343 539344 Mb1044c Mb1045c lpqT prsA FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 539344 539345 Mb1045c Mb1046c prsA glmU FALSE 0.152 92.000 0.026 1.000 N NA
 539345 539346 Mb1046c Mbt16 glmU glnT FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539347 539348 Mb1047 Mb1048   mfd TRUE 0.852 59.000 0.013 0.050 Y NA
 539348 539349 Mb1048 Mb1049 mfd   TRUE 0.926 0.000 0.026 1.000   NA
 539349 539350 Mb1049 Mb1050   lpqU FALSE 0.127 88.000 0.000 NA   NA
 539350 539351 Mb1050 Mb1051 lpqU eno FALSE 0.048 97.000 0.012 NA N NA
 539351 539352 Mb1051 Mb1052 eno   TRUE 0.751 5.000 0.043 1.000 N NA
 539352 539353 Mb1052 Mb1053     TRUE 0.727 17.000 0.252 NA   NA
 539353 539354 Mb1053 Mb1054     TRUE 0.813 -9.000 0.243 NA   NA
 539355 539356 Mb1055c Mb1056c kdpE kdpD TRUE 0.995 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 539357 539358 Mb1057 Mb1058 kdpF kdpA TRUE 0.991 0.000 0.152 0.001   NA
 539358 539359 Mb1058 Mb1059 kdpA kdpB TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 539359 539360 Mb1059 Mb1060 kdpB kdpC TRUE 0.996 0.000 0.015 0.001 Y NA
 539361 539362 Mb1061c Mb1062c trcS trcR TRUE 0.993 8.000 0.556 0.050 Y NA
 539362 539363 Mb1062c Mb1063c trcR   FALSE 0.002 182.000 0.000 NA N NA
 539363 539364 Mb1063c Mb1064c     FALSE 0.139 68.000 0.000 NA   NA
 539364 539365 Mb1064c Mb1065c     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 539365 539366 Mb1065c Mb1066c   esxI FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 539366 539367 Mb1066c Mb1067c esxI esxJ FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 539367 539368 Mb1067c Mb1068c esxJ PPE15 FALSE 0.045 146.000 0.000 NA   NA
 539368 539369 Mb1068c Mb1069c PPE15 PE8 TRUE 0.722 77.000 0.667 NA   NA
 539369 539370 Mb1069c Mb1070c PE8   FALSE 0.001 1196.000 0.000 NA   NA
 539370 539371 Mb1070c Mb1071c     FALSE 0.297 -31.000 0.000 NA   NA
 539371 539372 Mb1071c Mb1072c     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 539373 539374 Mb1073 Mb1074     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539378 539379 Mb1078 Mb1079     FALSE 0.257 48.000 0.000 1.000   NA
 539383 539384 Mb1083 Mb1084     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539384 539385 Mb1084 Mbt17   leuX FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 539385 539386 Mbt17 Mb1085 leuX   FALSE 0.035 159.000 0.000 NA   NA
 539386 539387 Mb1085 Mb1086     FALSE 0.002 1004.000 0.000 NA   NA
 539387 539388 Mb1086 Mb1087   fadD14 FALSE 0.267 107.000 0.125 NA   NA
 539388 539389 Mb1087 Mb1088 fadD14   FALSE 0.555 76.000 0.286 1.000   NA
 539389 539390 Mb1088 Mb1089     FALSE 0.532 53.000 0.286 NA   NA
 539390 539391 Mb1089 Mb1090     TRUE 0.647 34.000 0.333 NA   NA
 539391 539392 Mb1090 Mb1091     TRUE 0.933 5.000 0.250 1.000   NA
 539393 539394 Mb1092c Mb1093c   lpqV FALSE 0.217 81.000 0.016 NA   NA
 539395 539396 Mb1094 Mb1095     TRUE 0.981 -3.000 0.429 NA   NA
 539397 539398 Mb1096c Mb1097c PE_PGRS19 PE_PGRS20 FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 539398 539399 Mb1097c Mb1098c PE_PGRS20   FALSE 0.004 362.000 0.000 NA   NA
 539399 539400 Mb1098c Mb1099c   echA8 TRUE 0.967 -3.000 0.259 NA   NA
 539400 539401 Mb1099c Mb1100c echA8 echA9 TRUE 0.977 12.000 0.128 0.007 Y NA
 539402 539403 Mb1101 Mb1102     FALSE 0.084 116.000 0.000 NA   NA
 539404 539405 Mb1103c Mb1104c fadA3   FALSE 0.073 53.000 0.000 1.000 N NA
 539406 539407 Mb1105 Mb1106 lipU cbs FALSE 0.167 57.000 0.017 1.000 N NA
 539407 539408 Mb1106 Mb1107 cbs pra FALSE 0.036 202.000 0.034 NA   NA
 539408 539409 Mb1107 Mb1108 pra metB FALSE 0.340 32.000 0.028 NA   NA
 539410 539411 Mb1109c Mb1110c greA   FALSE 0.110 186.000 0.250 NA   NA
 539412 539413 Mb1111 Mb1112 mca   TRUE 0.939 -3.000 0.099 NA   NA
 539413 539414 Mb1112 Mb1113     FALSE 0.532 -13.000 0.011 NA   NA
 539416 539417 Mb1115 Mb1116   PE_PGRS21 FALSE 0.026 177.000 0.000 NA   NA
 539417 539418 Mb1116 Mb1116A PE_PGRS21   FALSE 0.026 177.000 0.000 NA   NA
 539418 539419 Mb1116A Mb1117   PE9 FALSE 0.040 153.000 0.000 NA   NA
 539419 539420 Mb1117 Mb1118 PE9 PE10 FALSE 0.251 -121.000 0.000 NA   NA
 539420 539421 Mb1118 Mb1119 PE10 celA2a FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000   NA
 539421 539422 Mb1119 Mb1120 celA2a celA2b TRUE 0.878 -22.000 0.000 0.001   NA
 539422 539423 Mb1120 Mb1121 celA2b PE_PGRS22 FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 539425 539426 Mb1123 Mb1124 glyA1 desA2 FALSE 0.354 105.000 0.143 1.000   NA
 539426 539427 Mb1124 Mb1125 desA2 phoH2 FALSE 0.048 211.000 0.046 1.000   NA
 539427 539428 Mb1125 Mb1126 phoH2   FALSE 0.242 87.000 0.108 1.000 N NA
 539429 539430 Mb1127c Mb1128c   fum TRUE 0.902 -3.000 0.014 NA   NA
 539430 539431 Mb1128c Mb1129c fum   FALSE 0.338 31.000 0.071 1.000 N NA
 539433 539434 Mb1131c Mb1132c     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539434 539435 Mb1132c Mb1133c     TRUE 0.972 0.000 0.286 1.000   NA
 539436 539437 Mb1134 Mb1135     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 539438 539439 Mb1136c Mb1137c   xseB FALSE 0.507 10.000 0.009 1.000 N NA
 539439 539440 Mb1137c Mb1138c xseB xseA TRUE 0.991 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 539440 539441 Mb1138c Mb1139c xseA   TRUE 0.910 -3.000 0.024 NA   NA
 539444 539445 Mb1142 Mb1143     FALSE 0.127 88.000 0.000 NA   NA
 539445 539446 Mb1143 Mb1144     TRUE 0.989 -3.000 0.689 NA   NA
 539446 539447 Mb1144 Mb1145     FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539447 539448 Mb1145 Mb1146     FALSE 0.081 118.000 0.000 NA   NA
 539451 539452 Mb1149c Mb1150c     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 539452 539453 Mb1150c Mb1151c     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.005   NA
 539454 539455 Mb1152 Mb1153 zwf1 gnd2 TRUE 0.868 22.000 0.062 1.000 Y NA
 539457 539458 Mb1155 Mb1156 ephC   TRUE 0.843 5.000 0.070 NA   NA
 539459 539460 Mb1157c Mb1158c   ppdK TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 539460 539461 Mb1158c Mb1159c ppdK   FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539461 539462 Mb1159c Mb1160c     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 539463 539464 Mb1161 Mb1162   gltA1 TRUE 0.969 -3.000 0.216 1.000   NA
 539464 539465 Mb1162 Mb1163 gltA1   FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 539469 539470 Mb1167 Mb1168     FALSE 0.250 50.000 0.000 1.000   NA
 539471 539472 Mb1169c Mb1170c     FALSE 0.327 17.000 0.000 NA   NA
 539472 539473 Mb1170c Mb1171c     TRUE 0.964 -3.000 0.176 1.000   NA
 539475 539476 Mb1173c Mb1174c echA11 echA10 TRUE 0.647 143.000 0.000 0.007 Y NA
 539477 539478 Mb1175 Mb1176 mcr   TRUE 0.906 12.000 0.636 1.000 N NA
 539478 539479 Mb1176 Mb1177   mmpL13 FALSE 0.004 515.000 0.000 1.000   NA
 539479 539480 Mb1177 Mb1178 mmpL13   FALSE 0.200 133.000 0.080 1.000   NA
 539482 539483 Mb1180 Mb1181     FALSE 0.297 -31.000 0.000 NA   NA
 539486 539487 Mb1184c Mb1185c omt   TRUE 0.938 -3.000 0.091 NA   NA
 539488 539489 Mb1186 Mb1187     FALSE 0.005 434.000 0.000 1.000   NA
 539490 539491 Mb1188c Mb1189c     TRUE 0.860 8.000 0.222 NA   NA
 539494 539495 Mb1192 Mb1193 mutT2 narG FALSE 0.002 308.000 0.000 1.000 N NA
 539495 539496 Mb1193 Mb1194 narG narH TRUE 0.954 39.000 0.227 0.001 Y NA
 539496 539497 Mb1194 Mb1195 narH narJ TRUE 0.930 57.000 0.182 0.002 Y NA
 539497 539498 Mb1195 Mb1196 narJ narI TRUE 0.994 3.000 0.059 0.002 Y NA
 539498 539499 Mb1196 Mb1197 narI typA FALSE 0.245 22.000 0.002 1.000 N NA
 539499 539500 Mb1197 Mb1198 typA lpqW FALSE 0.144 98.000 0.025 1.000 N NA
 539501 539502 Mb1199c Mb1200c   PPE17b FALSE 0.139 75.000 0.000 NA   NA
 539502 539503 Mb1200c Mb1201c PPE17b PPE17a FALSE 0.281 -46.000 0.000 NA   NA
 539503 539504 Mb1201c Mb1202c PPE17a PE11 FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 539505 539506 Mb1203 Mb1204 mshB   FALSE 0.548 92.000 0.387 NA   NA
 539509 539510 Mb1207c Mb1208c   fadH FALSE 0.018 201.000 0.000 NA   NA
 539510 539511 Mb1208c Mb1209c fadH   TRUE 0.871 -3.000 0.093 NA N NA
 539512 539513 Mb1210 Mb1211 fdxC   FALSE 0.249 33.000 0.029 1.000 N NA
 539515 539516 Mb1213 Mb1214 pks3 papA3 FALSE 0.496 53.000 0.250 NA   NA
 539516 539517 Mb1214 Mb1215 papA3 mmpL10 TRUE 0.807 67.000 1.000 NA   NA
 539518 539519 Mb1216c Mb1217c   fadD21 FALSE 0.031 165.000 0.000 NA   NA
 539519 539520 Mb1217c Mb1218c fadD21   FALSE 0.208 177.000 0.000 NA Y NA
 539521 539522 Mb1219 Mb1220 rocA   TRUE 0.928 0.000 0.181 1.000 N NA
 539522 539523 Mb1220 Mb1221   sigI FALSE 0.063 82.000 0.000 1.000 N NA
 539523 539524 Mb1221 Mb1222 sigI   FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539524 539525 Mb1222 Mb1223     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 539525 539526 Mb1223 Mb1224     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 539526 539527 Mb1224 Mb1225   fadD36 TRUE 0.636 40.000 0.000 0.041   NA
 539529 539530 Mb1227 Mb1228 PE13 PPE18 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 539530 539531 Mb1228 Mb1229 PPE18 esxK FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 539531 539532 Mb1229 Mb1230 esxK esxL FALSE 0.158 51.000 0.000 NA   NA
 539537 539538 Mb1235c Mb1236c     FALSE 0.324 31.000 0.000 1.000   NA
 539539 539540 Mb1237 Mb1238   fadD6 FALSE 0.572 50.000 0.324 NA   NA
 539540 539541 Mb1238 Mb1239 fadD6 folP2 FALSE 0.317 66.000 0.172 1.000 N NA
 539541 539542 Mb1239 Mb1240 folP2   TRUE 0.945 -3.000 0.136 NA   NA
 539542 539543 Mb1240 Mb1241     FALSE 0.335 39.000 0.045 NA   NA
 539543 539544 Mb1241 Mb1242   tagA TRUE 0.900 -3.000 0.013 NA   NA
 539544 539545 Mb1242 Mb1243 tagA   FALSE 0.175 107.000 0.021 NA   NA
 539548 539549 Mb1246c Mb1247c PE14   FALSE 0.061 134.000 0.000 NA   NA
 539549 539550 Mb1247c Mb1248c     FALSE 0.531 28.000 0.080 1.000   NA
 539550 539551 Mb1248c Mb1249c     TRUE 0.621 9.000 0.111 NA N NA
 539551 539552 Mb1249c Mb1250c     TRUE 0.918 -3.000 0.185 NA N NA
 539552 539553 Mb1250c Mb1251c     TRUE 0.580 -10.000 0.000 1.000   NA
 539553 539554 Mb1251c Mb1252c     FALSE 0.084 142.000 0.000 1.000   NA
 539555 539556 Mb1253 Mb1254 sigE   FALSE 0.152 158.000 0.224 NA   NA
 539556 539557 Mb1254 Mb1255   htrA TRUE 0.697 69.000 0.607 NA   NA
 539557 539558 Mb1255 Mb1256 htrA tatB TRUE 0.928 2.000 0.242 1.000 N NA
 539559 539560 Mb1257c Mb1258c     FALSE 0.194 111.000 0.054 NA   NA
 539560 539561 Mb1258c Mb1259c     TRUE 0.985 -3.000 0.542 NA   NA
 539563 539564 Mb1261c Mb1262c mrp   TRUE 0.579 13.000 0.089 1.000 N NA
 539564 539565 Mb1262c Mb1263c     FALSE 0.207 125.000 0.139 NA   NA
 539565 539566 Mb1263c Mb1264c     TRUE 0.991 -3.000 0.806 NA   NA
 539566 539567 Mb1264c Mb1265c     FALSE 0.144 62.000 0.000 NA   NA
 539568 539569 Mb1266 Mb1267   lpqY TRUE 0.644 21.000 0.211 NA   NA
 539569 539570 Mb1267 Mb1268 lpqY sugA TRUE 0.997 -3.000 0.252 0.023 Y NA
 539570 539571 Mb1268 Mb1269 sugA sugB TRUE 0.997 5.000 0.723 0.023 Y NA
 539571 539572 Mb1269 Mb1270 sugB sugC TRUE 0.991 5.000 0.191 0.023 Y NA
 539574 539575 Mb1272 Mb1273 mdh   FALSE 0.139 76.000 0.000 NA   NA
 539575 539576 Mb1273 Mb1274     TRUE 0.991 -3.000 0.800 NA   NA
 539579 539580 Mb1277c Mb1278c     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 539580 539581 Mb1278c Mb1279c     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 539581 539582 Mb1279c Mb1280c   kgd FALSE 0.007 113.000 0.000 NA N NA
 539582 539583 Mb1280c Mb1281c kgd   FALSE 0.081 142.000 0.013 NA   NA
 539585 539586 Mb1283c Mb1284c   lprE FALSE 0.367 56.000 0.133 NA   NA
 539587 539588 Mb1285 Mb1286 deaD   TRUE 0.827 -3.000 0.006 1.000 N NA
 539589 539590 Mb1287c Mb1288c     TRUE 0.946 -3.000 0.143 NA   NA
 539591 539592 Mb1289 Mb1290     TRUE 0.580 2.000 0.016 NA N NA
 539592 539593 Mb1290 Mb1291     TRUE 0.860 -15.000 0.000 0.009   NA
 539594 539595 Mb1292c Mb1293c     TRUE 0.870 5.000 0.136 NA   NA
 539596 539597 Mb1294 Mb1295 amiB2   FALSE 0.065 75.000 0.000 1.000 N NA
 539597 539598 Mb1295 Mb1296     FALSE 0.029 173.000 0.000 NA   NA
 539599 539600 Mb1297c Mb1298c pknH embR FALSE 0.048 341.000 0.000 1.000 Y NA
 539600 539601 Mb1298c Mb1299c embR   FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000   NA
 539601 539602 Mb1299c Mb1300c     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 539602 539603 Mb1300c Mb1301c   lprA TRUE 0.734 61.000 0.667 NA   NA
 539603 539604 Mb1301c Mb1302c lprA   FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539604 539605 Mb1302c Mb1303c     FALSE 0.101 108.000 0.000 NA   NA
 539605 539606 Mb1303c Mb1304c     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 539607 539608 Mb1305 Mb1306 lprB lprC TRUE 0.989 -3.000 0.692 NA   NA
 539610 539611 Mb1308 Mb1309     TRUE 0.993 -3.000 0.312 NA Y NA
 539611 539612 Mb1309 Mb1310     FALSE 0.153 21.000 0.017 NA N NA
 539613 539614 Mb1311c Mb1312c oppA oppD TRUE 0.962 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 539614 539615 Mb1312c Mb1313c oppD oppC TRUE 0.994 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 539615 539616 Mb1313c Mb1314c oppC oppB TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.022 Y NA
 539617 539618 Mb1315 Mb1316   cysD FALSE 0.255 94.000 0.136 1.000 N NA
 539618 539619 Mb1316 Mb1317 cysD cysN TRUE 0.994 0.000 0.483 0.001 N NA
 539619 539620 Mb1317 Mb1318 cysN   FALSE 0.170 54.000 0.073 NA N NA
 539620 539621 Mb1318 Mb1319     FALSE 0.150 58.000 0.000 NA   NA
 539621 539622 Mb1319 Mb1320     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 539625 539626 Mb1323c Mbt18   argV FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 539627 539628 Mb1324 Mb1325 argS lysA TRUE 0.908 -3.000 0.071 1.000 N NA
 539628 539629 Mb1325 Mb1326 lysA thrA TRUE 0.977 4.000 0.071 1.000 Y NA
 539629 539630 Mb1326 Mb1327 thrA thrC TRUE 0.992 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 539630 539631 Mb1327 Mb1328 thrC thrB FALSE 0.256 218.000 0.221 1.000 Y NA
 539631 539632 Mb1328 Mb1329 thrB rho FALSE 0.038 257.000 0.000 0.084 N NA
 539632 539633 Mb1329 Mb1330 rho rpmE FALSE 0.088 151.000 0.115 1.000 N NA
 539633 539634 Mb1330 Mb1331 rpmE prfA TRUE 0.728 90.000 0.110 1.000 Y NA
 539634 539635 Mb1331 Mb1332 prfA hemK TRUE 0.989 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 539635 539636 Mb1332 Mb1333 hemK   TRUE 0.960 16.000 0.583 NA Y NA
 539636 539637 Mb1333 Mb1334   rfe FALSE 0.314 84.000 0.248 NA N NA
 539637 539638 Mb1334 Mb1335 rfe   FALSE 0.016 257.000 0.000 1.000   NA
 539638 539639 Mb1335 Mb1336   atpB TRUE 0.730 -7.000 0.021 1.000   NA
 539639 539640 Mb1336 Mb1337 atpB atpE TRUE 0.969 49.000 0.557 0.003 Y NA
 539640 539641 Mb1337 Mb1338 atpE atpF TRUE 0.930 31.000 0.012 0.003 Y NA
 539641 539642 Mb1338 Mb1339 atpF atpH TRUE 0.986 7.000 0.008 0.003 Y NA
 539642 539643 Mb1339 Mb1340 atpH atpA TRUE 0.981 45.000 0.864 0.003 Y NA
 539643 539644 Mb1340 Mb1341 atpA atpG TRUE 0.997 7.000 0.846 0.003 Y NA
 539644 539645 Mb1341 Mb1342 atpG atpD TRUE 0.979 40.000 0.724 0.003 Y NA
 539645 539646 Mb1342 Mb1343 atpD atpC TRUE 0.994 14.000 0.837 0.003 Y NA
 539646 539647 Mb1343 Mb1344 atpC   TRUE 0.754 8.000 0.054 NA   NA
 539648 539649 Mb1345c Mb1346c     TRUE 0.815 -25.000 0.000 0.009   NA
 539649 539650 Mb1346c Mb1347c     FALSE 0.053 166.000 0.000 1.000   NA
 539651 539652 Mb1348 Mbr01 murA rrs FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 539652 539653 Mbr01 Mbr02 rrs rrl FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 539653 539654 Mbr02 Mbr03 rrl rrf FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 539655 539656 Mb1349c Mb1350c ogt alkAb TRUE 0.990 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 539656 539657 Mb1350c Mb1351c alkAb alkAa TRUE 0.946 4.000 0.000 0.062   NA
 539657 539658 Mb1351c Mb1352c alkAa   FALSE 0.217 81.000 0.000 1.000   NA
 539658 539659 Mb1352c Mb1353c     TRUE 0.878 70.000 0.000 0.002 Y NA
 539659 539660 Mb1353c Mb1354c     TRUE 0.968 13.000 0.000 0.002 Y NA
 539661 539662 Mb1355 Mb1356     FALSE 0.552 23.000 0.141 NA   NA
 539664 539665 Mb1358 Mb1359 fadA4   FALSE 0.089 130.000 0.035 1.000 N NA
 539666 539667 Mb1360c Mb1361c PE_PGRS24 glgB FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 539667 539668 Mb1361c Mb1362c glgB glgE TRUE 0.988 8.000 0.159 0.004 Y NA
 539670 539671 Mb1364c Mb1365c dinG   FALSE 0.412 24.000 0.080 1.000 N NA
 539672 539673 Mb1366 Mb1367     TRUE 0.895 -40.000 0.823 NA   NA
 539673 539674 Mb1367 Mb1368     TRUE 0.582 17.000 0.093 NA   NA
 539674 539675 Mb1368 Mb1369     TRUE 0.742 8.000 0.044 NA   NA
 539675 539676 Mb1369 Mb1370     FALSE 0.528 22.000 0.093 NA   NA
 539676 539677 Mb1370 Mb1371   cysM TRUE 0.627 10.000 0.052 1.000 N NA
 539677 539678 Mb1371 Mb1372 cysM   TRUE 0.714 -9.000 0.032 1.000   NA
 539678 539679 Mb1372 Mb1373   murI TRUE 0.936 -3.000 0.024 1.000   NA
 539679 539680 Mb1373 Mb1374 murI   FALSE 0.508 27.000 0.054 1.000   NA
 539680 539681 Mb1374 Mb1375   rphA TRUE 0.616 17.000 0.053 1.000   NA
 539681 539682 Mb1375 Mb1376 rphA   FALSE 0.505 39.000 0.262 1.000 N NA
 539683 539684 Mb1377c Mb1378c   lprD TRUE 0.970 -3.000 0.286 NA   NA
 539685 539686 Mb1379 Mb1380   fadD33 TRUE 0.967 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 539686 539687 Mb1380 Mb1381 fadD33 fadE14 TRUE 0.990 0.000 0.200 1.000 Y NA
 539689 539690 Mbt19 Mb1383 leuW   FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 539690 539691 Mb1383 Mb1384     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.004 Y NA
 539691 539692 Mb1384 Mb1385   fabG2 FALSE 0.031 129.000 0.000 1.000 N NA
 539692 539693 Mb1385 Mb1386 fabG2   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539693 539694 Mb1386 Mb1387     FALSE 0.018 203.000 0.000 NA   NA
 539695 539696 Mb1388c Mb1389c     FALSE 0.153 20.000 0.000 1.000 N NA
 539696 539697 Mb1389c Mb1390c   moeY FALSE 0.337 9.000 0.000 1.000 N NA
 539697 539698 Mb1390c Mb1391c moeY   TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 539698 539699 Mb1391c Mb1392c     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 539700 539701 Mb1393 Mb1394     TRUE 0.626 82.000 0.000 0.005   NA
 539701 539702 Mb1394 Mb1395     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA N NA
 539703 539704 Mb1396c Mb1397c PPE19   FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 539704 539705 Mb1397c Mb1398c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539705 539706 Mb1398c Mb1399c     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 539706 539707 Mb1399c Mb1400c     FALSE 0.401 139.000 0.000 1.000 Y NA
 539710 539711 Mb1403 Mb1404 lprF   FALSE 0.020 196.000 0.000 NA   NA
 539711 539712 Mb1404 Mb1405     FALSE 0.214 -478.000 0.000 NA   NA
 539712 539713 Mb1405 Mb1406     TRUE 0.871 -3.000 0.028 1.000 N NA
 539713 539714 Mb1406 Mb1407     TRUE 0.749 6.000 0.000 1.000   NA
 539714 539715 Mb1407 Mb1408     FALSE 0.222 -334.000 0.000 NA   NA
 539717 539718 Mb1410 Mb1411     TRUE 0.970 -3.000 0.282 NA   NA
 539719 539720 Mb1412c Mb1413c     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 539721 539722 Mb1414 Mb1415 pyrR pyrB TRUE 0.993 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 539722 539723 Mb1415 Mb1416 pyrB pyrC TRUE 0.996 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 539723 539724 Mb1416 Mb1417 pyrC   TRUE 0.927 -3.000 0.057 NA   NA
 539724 539725 Mb1417 Mb1418   carA TRUE 0.924 -3.000 0.050 NA   NA
 539725 539726 Mb1418 Mb1419 carA carB TRUE 0.998 0.000 0.345 0.001 Y NA
 539726 539727 Mb1419 Mb1420 carB pyrF TRUE 0.989 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 539727 539728 Mb1420 Mb1421 pyrF PE15 FALSE 0.020 195.000 0.000 NA   NA
 539728 539729 Mb1421 Mb1422 PE15 PPE20 TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 539729 539730 Mb1422 Mb1423 PPE20 mihF FALSE 0.006 306.000 0.000 NA   NA
 539730 539731 Mb1423 Mb1424 mihF gmk FALSE 0.173 135.000 0.054 1.000   NA
 539731 539732 Mb1424 Mb1425 gmk rpoZ TRUE 0.592 66.000 0.471 1.000 N NA
 539732 539733 Mb1425 Mb1426 rpoZ dfp TRUE 0.625 16.000 0.192 1.000 N NA
 539733 539734 Mb1426 Mb1427 dfp metK FALSE 0.559 128.000 0.059 1.000 Y NA
 539735 539736 Mb1428c Mb1429c   cyp132 TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.061 N NA
 539738 539739 Mb1431c Mb1432c PE_PGRS25   FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 539739 539740 Mb1432c Mb1433c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539740 539741 Mb1433c Mb1434c   lipH FALSE 0.212 83.000 0.000 1.000   NA
 539741 539742 Mb1434c Mb1435c lipH lipI TRUE 0.955 25.000 0.250 0.023 Y NA
 539743 539744 Mb1436 Mb1437   priA FALSE 0.264 81.000 0.050 NA   NA
 539748 539749 Mb1441 Mb1442 fmt fmu TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 539749 539750 Mb1442 Mb1443 fmu rpe FALSE 0.361 25.000 0.056 1.000 N NA
 539750 539751 Mb1443 Mb1444 rpe ribG TRUE 0.871 -3.000 0.028 1.000 N NA
 539752 539753 Mb1445c Mb1446c   lprG TRUE 0.951 6.000 0.500 NA   NA
 539754 539755 Mb1447 Mb1448 ribC   FALSE 0.015 214.000 0.000 NA   NA
 539755 539756 Mb1448 Mb1449     FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 539756 539757 Mb1449 Mb1450   ribA2 FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539757 539758 Mb1450 Mb1451 ribA2 ribH TRUE 0.970 15.000 0.041 0.002 Y NA
 539758 539759 Mb1451 Mb1452 ribH   TRUE 0.901 -3.000 0.014 NA   NA
 539759 539760 Mb1452 Mb1453   lprH FALSE 0.533 25.000 0.143 NA   NA
 539760 539761 Mb1453 Mb1454 lprH   FALSE 0.025 180.000 0.000 NA   NA
 539761 539762 Mb1454 Mb1455   uvrC FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 539762 539763 Mb1455 Mb1456 uvrC   TRUE 0.934 -3.000 0.073 NA   NA
 539763 539764 Mb1456 Mb1457     TRUE 0.967 -3.000 0.259 NA   NA
 539764 539765 Mb1457 Mb1458   whiA TRUE 0.982 -3.000 0.470 NA   NA
 539768 539769 Mb1461c Mb1462c lipO fadD12 TRUE 0.997 0.000 0.857 1.000 Y NA
 539769 539770 Mb1462c Mb1463c fadD12   TRUE 0.990 4.000 0.429 1.000 Y NA
 539771 539772 Mb1464 Mb1465   PE16 FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539772 539773 Mb1465 Mb1466 PE16   FALSE 0.093 111.000 0.000 NA   NA
 539773 539774 Mb1466 Mb1467     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 539774 539775 Mb1467 Mb1468     FALSE 0.031 164.000 0.000 NA   NA
 539775 539776 Mb1468 Mb1469     TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 539778 539779 Mb1471 Mb1472 gap pgk TRUE 0.994 3.000 0.055 0.003 Y NA
 539779 539780 Mb1472 Mb1473 pgk tpi TRUE 0.989 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 539785 539786 Mb1478c Mb1479c     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 539786 539787 Mb1479c Mb1480c   devB FALSE 0.504 17.000 0.038 NA   NA
 539787 539788 Mb1480c Mb1481c devB opcA TRUE 0.990 -3.000 0.179 NA Y NA
 539788 539789 Mb1481c Mb1482c opcA zwf2 TRUE 0.739 53.000 0.104 NA Y NA
 539789 539790 Mb1482c Mb1483c zwf2 tal TRUE 0.989 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 539790 539791 Mb1483c Mb1484c tal tkt TRUE 0.897 17.000 0.090 1.000 Y NA
 539791 539792 Mb1484c Mb1485c tkt PE_PGRS27 FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 539798 539799 Mb1491c Mb1492c     FALSE 0.488 112.000 0.022 0.047   NA
 539799 539800 Mb1492c Mb1493c     TRUE 0.965 -3.000 0.186 1.000   NA
 539800 539801 Mb1493c Mb1494c     FALSE 0.503 103.000 0.357 NA   NA
 539802 539803 Mb1495 Mb1496     TRUE 0.919 -3.000 0.100 1.000 N NA
 539803 539804 Mb1496 Mb1497     TRUE 0.992 -3.000 0.266 0.001 N NA
 539804 539805 Mb1497 Mb1498     TRUE 0.996 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 539805 539806 Mb1498 Mb1499   csd TRUE 0.870 2.000 0.093 1.000 N NA
 539806 539807 Mb1499 Mb1500 csd   TRUE 0.956 -3.000 0.249 1.000 N NA
 539807 539808 Mb1500 Mb1501     TRUE 0.611 -25.000 0.152 NA   NA
 539809 539810 Mb1502c Mb1503c fadE15 PE_PGRS29 FALSE 0.353 107.000 0.222 NA   NA
 539811 539812 Mb1504 Mb1505 ctpD trxA FALSE 0.190 44.000 0.018 1.000 N NA
 539812 539813 Mb1505 Mb1506 trxA trxB1 TRUE 0.977 16.000 0.222 0.003 Y NA
 539813 539814 Mb1506 Mb1507 trxB1 echA12 TRUE 0.832 22.000 0.636 1.000 N NA
 539814 539815 Mb1507 Mb1508 echA12   FALSE 0.483 36.000 0.090 1.000   NA
 539815 539816 Mb1508 Mb1509     FALSE 0.361 97.000 0.191 NA   NA
 539817 539818 Mb1510c Mb1511c   acn TRUE 0.797 11.000 0.256 1.000 N NA
 539819 539820 Mb1512 Mb1513     FALSE 0.013 226.000 0.000 NA   NA
 539820 539821 Mb1513 Mb1514     TRUE 0.827 11.000 0.250 NA   NA
 539821 539822 Mb1514 Mb1515   moxR1 FALSE 0.149 139.000 0.120 NA   NA
 539822 539823 Mb1515 Mb1516 moxR1   TRUE 0.992 -3.000 0.920 NA   NA
 539823 539824 Mb1516 Mb1517     TRUE 0.945 11.000 0.760 NA   NA
 539826 539827 Mb1519 Mb1520 fabG1 inhA TRUE 0.884 19.000 0.078 1.000 Y NA
 539827 539828 Mb1520 Mb1521 inhA hemZ TRUE 0.704 6.000 0.038 1.000 N NA
 539830 539831 Mb1523 Mb1524     TRUE 0.899 22.000 0.259 NA Y NA
 539831 539832 Mb1524 Mb1525     TRUE 0.706 10.000 0.049 NA   NA
 539832 539833 Mb1525 Mb1526     FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 539833 539834 Mb1526 Mb1527     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 539836 539837 Mb1529 Mb1530 mutA mutB TRUE 0.996 1.000 0.115 0.001 Y NA
 539837 539838 Mb1530 Mb1531 mutB   FALSE 0.385 14.000 0.000 NA   NA
 539838 539839 Mb1531 Mb1532     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539839 539840 Mb1532 Mb1533     TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 539840 539841 Mb1533 Mb1534   lipL FALSE 0.157 53.000 0.011 1.000 N NA
 539842 539843 Mb1535c Mb1536c     FALSE 0.015 214.000 0.000 NA   NA
 539844 539845 Mb1537 Mb1538     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 539845 539846 Mb1538 Mb1539     TRUE 0.584 12.000 0.167 NA N NA
 539846 539847 Mb1539 Mb1540     FALSE 0.015 213.000 0.000 NA   NA
 539847 539848 Mb1540 Mb1541     FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 539849 539850 Mb1542c Mb1543c     FALSE 0.143 137.000 0.027 1.000   NA
 539851 539852 Mb1544 Mb1545     FALSE 0.542 9.000 0.000 NA   NA
 539852 539853 Mb1545 Mb1546     FALSE 0.067 130.000 0.000 NA   NA
 539853 539854 Mb1546 Mb1547     FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 539854 539855 Mb1547 Mb1548   fadD25 FALSE 0.001 234.000 0.000 NA N NA
 539857 539858 Mb1550 Mb1551     FALSE 0.108 30.000 0.000 1.000 N NA
 539858 539859 Mb1551 Mb1552   wbbL2 FALSE 0.167 47.000 0.000 NA   NA
 539860 539861 Mb1553c Mb1554c   pks5 FALSE 0.138 23.000 0.000 1.000 N NA
 539861 539862 Mb1554c Mb1555c pks5 papA4 FALSE 0.002 544.000 0.000 NA   NA
 539863 539864 Mb1556 Mb1557 fadD24 adh FALSE 0.037 117.000 0.000 1.000 N NA
 539864 539865 Mb1557 Mb1558 adh   TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 539867 539868 Mb1560 Mb1561     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 539868 539869 Mb1561 Mb1562     FALSE 0.002 565.000 0.000 NA   NA
 539869 539870 Mb1562 Mb1563   ileS FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 539870 539871 Mb1563 Mb1564 ileS dinX FALSE 0.021 197.000 0.014 1.000 N NA
 539873 539874 Mb1566 Mb1567 lspA   TRUE 0.653 -7.000 0.073 1.000 N NA
 539875 539876 Mb1568c Mb1569c lprI glbN FALSE 0.293 55.000 0.050 NA   NA
 539877 539878 Mb1570 Mb1571     TRUE 0.990 5.000 0.750 0.049   NA
 539878 539879 Mb1571 Mb1572     FALSE 0.280 22.000 0.000 NA   NA
 539879 539880 Mb1572 Mb1573     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 539880 539881 Mb1573 Mb1574   dnaE1 FALSE 0.194 68.000 0.003 NA   NA
 539883 539884 Mb1576 Mb1577 fadD11 plsB1 TRUE 0.954 14.000 0.333 1.000 Y NA
 539884 539885 Mb1577 Mb1578 plsB1 frdA FALSE 0.002 371.000 0.000 1.000 N NA
 539885 539886 Mb1578 Mb1579 frdA frdBC TRUE 0.997 3.000 0.470 0.003 Y NA
 539886 539887 Mb1579 Mb1580 frdBC frdD TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 539887 539888 Mb1580 Mb1581 frdD   FALSE 0.065 68.000 0.000 1.000 N NA
 539888 539889 Mb1581 Mb1582   mmpS6 FALSE 0.350 139.000 0.429 NA   NA
 539889 539890 Mb1582 Mb1583 mmpS6 mmpL6 TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 539890 539891 Mb1583 Mb1584 mmpL6   FALSE 0.515 10.000 0.000 NA   NA
 539891 539892 Mb1584 Mb1585   ilvA FALSE 0.333 35.000 0.033 NA   NA
 539892 539893 Mb1585 Mb1586 ilvA   FALSE 0.016 38.000 0.000 NA N NA
 539893 539894 Mb1586 Mb1587     TRUE 0.629 6.000 0.000 NA   NA
 539895 539896 Mb1588c Mb1589c treZ treYb TRUE 0.963 -7.000 0.263 0.004   NA
 539896 539897 Mb1589c Mb1590c treYb treYa TRUE 0.965 5.000 0.011 0.004   NA
 539897 539898 Mb1590c Mb1591c treYa treX TRUE 0.975 4.000 0.061 0.004   NA
 539898 539899 Mb1591c Mb1592c treX   FALSE 0.301 39.000 0.073 1.000 N NA
 539899 539900 Mb1592c Mb1593c     FALSE 0.441 99.000 0.400 NA N NA
 539900 539901 Mb1593c Mb1594c     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 539902 539903 Mb1595 Mb1596 bioA bioF1 TRUE 0.997 -3.000 0.033 0.001 Y NA
 539903 539904 Mb1596 Mb1597 bioF1 bioD TRUE 0.998 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 539904 539905 Mb1597 Mb1598 bioD   TRUE 0.930 0.000 0.036 1.000   NA
 539907 539908 Mb1599 Mb1600     FALSE 0.017 206.000 0.000 NA   NA
 539908 539909 Mb1600 Mb1601     FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 539910 539911 Mb1602c Mb1603c     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 539911 539912 Mb1603c Mb1604c     FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 539912 539913 Mb1604c Mb1605c     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 539913 539914 Mb1605c Mb1606c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539914 539915 Mb1606c Mb1607c     FALSE 0.385 14.000 0.000 NA   NA
 539915 539916 Mb1607c Mb1608c     FALSE 0.020 196.000 0.000 NA   NA
 539916 539917 Mb1608c Mb1609c     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 539917 539918 Mb1609c Mb1610c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539918 539919 Mb1610c Mb1611c     FALSE 0.153 56.000 0.000 NA   NA
 539919 539920 Mb1611c Mb1612c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 539920 539921 Mb1612c Mb1613c     FALSE 0.220 -343.000 0.000 NA   NA
 539921 539922 Mb1613c Mb1614c     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 539923 539924 Mb1615 Mb1616 bioB   TRUE 0.884 1.000 0.041 NA   NA
 539924 539925 Mb1616 Mb1617     TRUE 0.977 -3.000 0.361 NA   NA
 539926 539927 Mb1618c Mb1619c     FALSE 0.050 257.000 0.273 NA   NA
 539928 539929 Mb1620 Mb1621 nadA nadB TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 539929 539930 Mb1621 Mb1622 nadB nadC TRUE 0.997 0.000 0.223 0.003 Y NA
 539930 539931 Mb1622 Mb1623 nadC   FALSE 0.254 49.000 0.000 1.000   NA
 539933 539934 Mb1625 Mb1626 hisD hisC1 TRUE 0.997 -3.000 0.112 0.003 Y NA
 539934 539935 Mb1626 Mb1627 hisC1 hisB TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 539935 539936 Mb1627 Mb1628 hisB hisH TRUE 0.997 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 539936 539937 Mb1628 Mb1629 hisH hisA TRUE 0.993 10.000 0.491 0.003 Y NA
 539937 539938 Mb1629 Mb1630 hisA impA TRUE 0.856 8.000 0.266 1.000 N NA
 539938 539939 Mb1630 Mb1631 impA hisF TRUE 0.790 2.000 0.021 1.000 N NA
 539939 539940 Mb1631 Mb1632 hisF hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 539940 539941 Mb1632 Mb1633 hisI chaA FALSE 0.021 181.000 0.002 1.000 N NA
 539943 539944 Mb1635 Mb1636 trpE   TRUE 0.930 -10.000 0.690 NA   NA
 539944 539945 Mb1636 Mb1637   trpC FALSE 0.274 90.000 0.070 NA   NA
 539945 539946 Mb1637 Mb1638 trpC trpB TRUE 0.914 69.000 0.070 0.001 Y NA
 539946 539947 Mb1638 Mb1639 trpB trpA TRUE 0.997 0.000 0.153 0.001 Y NA
 539947 539948 Mb1639 Mb1640 trpA lgt TRUE 0.816 0.000 0.011 1.000 N NA
 539948 539949 Mb1640 Mb1641 lgt   FALSE 0.002 676.000 0.000 NA   NA
 539949 539950 Mb1641 Mb1642     TRUE 0.703 -10.000 0.111 NA   NA
 539950 539951 Mb1642 Mb1643   pykA FALSE 0.301 108.000 0.083 1.000   NA
 539951 539952 Mb1643 Mb1644 pykA tesB1 TRUE 0.895 8.000 0.361 1.000 N NA
 539952 539953 Mb1644 Mb1645 tesB1   FALSE 0.444 58.000 0.214 NA   NA
 539954 539955 Mb1646c Mb1647c cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 539955 539956 Mb1647c Mb1648c cydD cydB TRUE 0.745 87.000 0.151 1.000 Y NA
 539956 539957 Mb1648c Mb1649c cydB cydA TRUE 0.981 30.000 0.925 0.046 Y NA
 539957 539958 Mb1649c Mb1650c cydA   FALSE 0.232 111.000 0.104 NA   NA
 539958 539959 Mb1650c Mb1651c   cya FALSE 0.526 29.000 0.176 NA   NA
 539959 539960 Mb1651c Mbt20 cya leuV FALSE 0.046 145.000 0.000 NA   NA
 539962 539963 Mb1653c Mb1654c     TRUE 0.992 -3.000 0.850 NA   NA
 539964 539965 Mb1655 Mb1656 polA rpsA FALSE 0.029 163.000 0.005 1.000 N NA
 539965 539966 Mb1656 Mb1657 rpsA coaE FALSE 0.280 26.000 0.024 1.000 N NA
 539968 539969 Mb1659 Mb1660 uvrB   TRUE 0.927 -3.000 0.006 1.000   NA
 539974 539975 Mb1665c Mb1666c     FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 539975 539976 Mb1666c Mb1667c   lysX FALSE 0.297 59.000 0.057 NA   NA
 539977 539978 Mb1668 Mb1669 infC rpmI TRUE 0.919 50.000 0.652 1.000 Y NA
 539978 539979 Mb1669 Mb1670 rpmI rplT TRUE 0.973 62.000 0.928 0.015 Y NA
 539979 539980 Mb1670 Mb1671 rplT tsnR TRUE 0.920 33.000 0.057 0.012 Y NA
 539982 539983 Mb1673 Mb1674 PE17   FALSE 0.348 78.000 0.143 NA   NA
 539983 539984 Mb1674 Mb1675     TRUE 0.869 7.000 0.214 NA   NA
 539984 539985 Mb1675 Mb1676   pheS FALSE 0.028 196.000 0.002 NA   NA
 539985 539986 Mb1676 Mb1677 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.001 Y NA
 539988 539989 Mb1680 Mb1681 argC argJ TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 539989 539990 Mb1681 Mb1682 argJ argB TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.002 Y NA
 539990 539991 Mb1682 Mb1683 argB argD TRUE 0.990 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 539991 539992 Mb1683 Mb1684 argD argF TRUE 0.990 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 539992 539993 Mb1684 Mb1685 argF argR TRUE 0.915 -3.000 0.088 1.000 N NA
 539993 539994 Mb1685 Mb1686 argR argG TRUE 0.656 9.000 0.054 1.000 N NA
 539994 539995 Mb1686 Mb1687 argG argH TRUE 0.818 80.000 0.278 1.000 Y NA
 539995 539996 Mb1687 Mb1688 argH pks10 FALSE 0.085 109.000 0.003 1.000 N NA
 539996 539997 Mb1688 Mb1689 pks10 pks7 TRUE 0.971 83.000 1.000 0.018 Y NA
 539997 539998 Mb1689 Mb1690 pks7 pks8 TRUE 0.990 20.000 1.000 0.009 Y NA
 539998 539999 Mb1690 Mb1691 pks8 pks17 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.009 Y NA
 539999 540000 Mb1691 Mb1692 pks17 pks9 TRUE 0.985 6.000 0.000 0.005 Y NA
 540000 540001 Mb1692 Mb1693 pks9 pks11 TRUE 0.886 147.000 0.750 0.018 Y NA
 540002 540003 Mb1694c Mb1695c cyp139   TRUE 0.585 15.000 0.008 1.000   NA
 540004 540005 Mb1696 Mb1697     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 540005 540006 Mb1697 Mb1698     FALSE 0.566 8.000 0.000 NA   NA
 540007 540008 Mb1699c Mb1700c     FALSE 0.010 93.000 0.000 NA N NA
 540008 540009 Mb1700c Mb1701c     FALSE 0.021 28.000 0.000 NA N NA
 540009 540010 Mb1701c Mb1702c     FALSE 0.024 325.000 0.000 0.026 N NA
 540011 540012 Mb1703 Mb1704   dsbF TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.003   NA
 540012 540013 Mb1704 Mb1705 dsbF   FALSE 0.117 101.000 0.000 NA   NA
 540013 540014 Mb1705 Mb1706   fadE16 TRUE 0.902 0.000 0.037 NA   NA
 540014 540015 Mb1706 Mb1707 fadE16   TRUE 0.759 9.000 0.222 NA N NA
 540015 540016 Mb1707 Mb1708   moeX TRUE 0.922 -3.000 0.047 NA   NA
 540016 540017 Mb1708 Mb1709 moeX   FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 540017 540018 Mb1709 Mb1710     FALSE 0.014 218.000 0.000 NA   NA
 540018 540019 Mb1710 Mb1710A     TRUE 0.627 -7.000 0.013 NA   NA
 540020 540021 Mb1711c Mb1712c     TRUE 0.972 2.000 0.400 1.000   NA
 540021 540022 Mb1712c Mb1713c     TRUE 0.861 72.000 0.089 0.080 Y NA
 540023 540024 Mb1714 Mb1715   tyrS TRUE 0.578 12.000 0.067 1.000 N NA
 540024 540025 Mb1715 Mb1716 tyrS lprJ FALSE 0.002 617.000 0.000 NA   NA
 540025 540026 Mb1716 Mb1717 lprJ   FALSE 0.185 39.000 0.000 NA   NA
 540026 540027 Mb1717 Mb1718     TRUE 0.987 -3.000 0.500 1.000   NA
 540027 540028 Mb1718 Mb1719     TRUE 0.953 -3.000 0.083 1.000   NA
 540028 540029 Mb1719 Mb1720   tlyA TRUE 0.772 8.000 0.014 1.000   NA
 540029 540030 Mb1720 Mb1721 tlyA ppnK TRUE 0.910 0.000 0.120 1.000 N NA
 540030 540031 Mb1721 Mb1722 ppnK recN FALSE 0.566 14.000 0.094 1.000 N NA
 540031 540032 Mb1722 Mb1723 recN   TRUE 0.577 96.000 0.049 0.080   NA
 540032 540033 Mb1723 Mb1724     TRUE 0.886 22.000 0.798 NA   NA
 540033 540034 Mb1724 Mb1725   pyrG FALSE 0.087 140.000 0.014 NA   NA
 540034 540035 Mb1725 Mb1726 pyrG   TRUE 0.770 -7.000 0.055 1.000   NA
 540035 540036 Mb1726 Mb1727     TRUE 0.949 -3.000 0.063 1.000   NA
 540037 540038 Mb1728c Mb1729c     FALSE 0.002 555.000 0.000 NA   NA
 540038 540039 Mb1729c Mb1730c   cycA FALSE 0.224 65.000 0.000 1.000   NA
 540039 540040 Mb1730c Mb1731c cycA PPE22 FALSE 0.015 41.000 0.000 NA N NA
 540040 540041 Mb1731c Mb1732c PPE22 PPE23 TRUE 0.684 40.000 0.000 NA Y NA
 540041 540042 Mb1732c Mb1733c PPE23   FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 540043 540044 Mb1734 Mb1735     FALSE 0.162 18.000 0.000 1.000 N NA
 540044 540045 Mb1735 Mb1736     TRUE 0.931 -3.000 0.065 NA   NA
 540045 540046 Mb1736 Mb1737     TRUE 0.986 -3.000 0.570 NA   NA
 540046 540047 Mb1737 Mb1738     TRUE 0.935 -3.000 0.224 NA N NA
 540047 540048 Mb1738 Mb1739   cmk TRUE 0.885 -3.000 0.042 1.000 N NA
 540048 540049 Mb1739 Mb1740 cmk engA TRUE 0.986 -3.000 0.060 0.014   NA
 540049 540050 Mb1740 Mb1741 engA   FALSE 0.048 174.000 0.000 1.000   NA
 540050 540051 Mb1741 Mb1742   fadB3a TRUE 0.934 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 540051 540052 Mb1742 Mb1743 fadB3a fadB3b TRUE 0.719 58.000 0.000 0.001   NA
 540052 540053 Mb1743 Mb1744 fadB3b   TRUE 0.894 3.000 0.105 NA   NA
 540053 540054 Mb1744 Mb1745     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540054 540055 Mb1745 Mb1746     FALSE 0.156 53.000 0.000 NA   NA
 540055 540056 Mb1746 Mb1748     FALSE 0.028 208.000 0.000 1.000   NA
 540056 540057 Mb1748 Mbt21   proT FALSE 0.021 193.000 0.000 NA   NA
 540058 540059 Mb1749c Mb1750c     TRUE 0.951 -3.000 0.167 NA   NA
 540060 540061 Mb1751 Mb1752     TRUE 0.924 -3.000 0.121 1.000 N NA
 540062 540063 Mb1753c Mb1754c     FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 540064 540065 Mb1755 Mb1756     FALSE 0.204 33.000 0.000 NA   NA
 540066 540067 Mb1757c Mb1758c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540067 540068 Mb1758c Mb1759c     FALSE 0.002 180.000 0.000 NA N NA
 540070 540071 Mb1761c Mb1762c     FALSE 0.142 64.000 0.000 NA   NA
 540071 540072 Mb1762c Mb1763c     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 540072 540073 Mb1763c Mb1764c     FALSE 0.013 275.000 0.000 1.000   NA
 540073 540074 Mb1764c Mb1765c   narX FALSE 0.005 440.000 0.000 1.000   NA
 540074 540075 Mb1765c Mb1766c narX narK2 TRUE 0.695 -3.000 0.000 1.000 N NA
 540078 540079 Mb1769 Mb1770     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540079 540080 Mb1770 Mb1771     FALSE 0.136 81.000 0.000 NA   NA
 540080 540081 Mb1771 Mb1772   pknE FALSE 0.124 94.000 0.000 NA   NA
 540082 540083 Mb1773c Mb1774c   idi FALSE 0.139 71.000 0.000 NA   NA
 540084 540085 Mb1775 Mb1776 pknF   FALSE 0.421 62.000 0.000 0.080 N NA
 540085 540086 Mb1776 Mb1777     FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 540087 540088 Mb1778c Mb1779c   fadD1 FALSE 0.131 84.000 0.000 NA   NA
 540089 540090 Mb1780 Mb1781     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 540091 540092 Mb1782c Mb1783c PPE24   FALSE 0.017 204.000 0.000 NA   NA
 540092 540093 Mb1783c Mb1784c   plcD FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 540093 540094 Mb1784c Mb1785c plcD   FALSE 0.469 129.000 0.000 1.000 Y NA
 540095 540096 Mb1786 Mb1787   mmpL14 FALSE 0.032 201.000 0.000 1.000   NA
 540096 540097 Mb1787 Mb1788 mmpL14 cut1 FALSE 0.009 321.000 0.000 1.000   NA
 540098 540099 Mb1789c Mb1790c wag22b wag22a TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540101 540102 Mb1792c Mb1793c     TRUE 0.991 0.000 1.000 NA   NA
 540102 540103 Mb1793c Mb1794c     FALSE 0.002 1018.000 0.000 NA   NA
 540103 540104 Mb1794c Mb1795c     FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 540105 540106 Mb1795A Mb1796     FALSE 0.139 68.000 0.000 NA   NA
 540106 540107 Mb1796 Mb1797   PE_PGRS31 FALSE 0.066 181.000 0.087 NA   NA
 540107 540108 Mb1797 Mb1798 PE_PGRS31   FALSE 0.071 156.000 0.025 NA   NA
 540108 540109 Mb1798 Mb1799     TRUE 0.698 8.000 0.016 NA   NA
 540109 540110 Mb1799 Mb1800     TRUE 0.934 -3.000 0.016 1.000   NA
 540110 540111 Mb1800 Mb1801     FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 540113 540114 Mb1803 Mb1804     TRUE 0.924 0.000 0.080 NA   NA
 540117 540118 Mb1807c Mb1808c     FALSE 0.038 156.000 0.000 NA   NA
 540121 540122 Mb1811 Mb1812     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540124 540125 Mb1814 Mb1815   PPE25 FALSE 0.001 270.000 0.000 NA N NA
 540125 540126 Mb1815 Mb1816 PPE25 PE18 FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 540126 540127 Mb1816 Mb1817 PE18 PPE26 TRUE 0.910 14.000 0.667 NA   NA
 540127 540128 Mb1817 Mb1818 PPE26 PPE27 FALSE 0.025 454.000 0.000 NA Y NA
 540128 540129 Mb1818 Mb1819 PPE27 PE19 FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 540129 540130 Mb1819 Mb1820 PE19 esxM FALSE 0.047 144.000 0.000 NA   NA
 540130 540131 Mb1820 Mb1821 esxM esxN TRUE 0.752 51.000 0.667 NA   NA
 540131 540132 Mb1821 Mb1822 esxN   TRUE 0.582 88.000 0.429 NA   NA
 540132 540133 Mb1822 Mb1823     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 540133 540134 Mb1823 Mb1824     TRUE 0.927 -22.000 1.000 NA   NA
 540134 540135 Mb1824 Mb1825     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540135 540136 Mb1825 Mb1826     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 540136 540137 Mb1826 Mb1827   lppT FALSE 0.002 627.000 0.000 NA   NA
 540137 540138 Mb1827 Mb1828 lppT PPE28 FALSE 0.114 103.000 0.000 NA   NA
 540138 540139 Mb1828 Mb1829 PPE28 PPE29 FALSE 0.020 581.000 0.000 NA Y NA
 540139 540140 Mb1829 Mb1830 PPE29 PPE30 FALSE 0.491 112.000 0.000 NA Y NA
 540141 540142 Mb1831c Mb1832c PE_PGRS32b PE_PGRS32a FALSE 0.200 34.000 0.000 NA   NA
 540142 540143 Mb1832c Mb1833c PE_PGRS32a   FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   NA
 540143 540144 Mb1833c Mb1834c     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 540145 540146 Mb1835 Mb1836 PE20 PPE31 FALSE 0.236 27.000 0.000 NA   NA
 540146 540147 Mb1836 Mb1837 PPE31 PPE32 FALSE 0.044 324.000 0.000 NA Y NA
 540147 540148 Mb1837 Mb1838 PPE32 PPE33a FALSE 0.524 132.000 0.667 NA   NA
 540148 540149 Mb1838 Mb1839 PPE33a PPE33b TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540149 540150 Mb1839 Mb1840 PPE33b   FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 540150 540151 Mb1840 Mb1841   mgtC FALSE 0.066 154.000 0.014 NA   NA
 540152 540153 Mb1842c Mb1843c     FALSE 0.005 322.000 0.000 NA   NA
 540154 540155 Mb1844 Mb1845 erg3   FALSE 0.213 105.000 0.045 NA   NA
 540155 540156 Mb1845 Mb1846     FALSE 0.227 63.000 0.000 1.000   NA
 540156 540157 Mb1846 Mb1847     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 540157 540158 Mb1847 Mb1848     FALSE 0.139 74.000 0.000 NA   NA
 540159 540160 Mb1849c Mb1850c PE_PGRS33   FALSE 0.059 135.000 0.000 NA   NA
 540161 540162 Mb1851 Mb1852 ilvG secA2 FALSE 0.532 15.000 0.082 1.000 N NA
 540162 540163 Mb1852 Mb1853 secA2 pgsA2 FALSE 0.027 197.000 0.038 1.000 N NA
 540163 540164 Mb1853 Mb1854 pgsA2   TRUE 0.752 -7.000 0.114 NA   NA
 540164 540165 Mb1854 Mb1855     TRUE 0.725 29.000 0.409 NA   NA
 540165 540166 Mb1855 Mb1856     TRUE 0.814 17.000 0.409 NA   NA
 540166 540167 Mb1856 Mb1857   gcvH TRUE 0.693 38.000 0.434 NA   NA
 540167 540168 Mb1857 Mb1858 gcvH cfp17 FALSE 0.031 240.000 0.242 NA N NA
 540168 540169 Mb1858 Mb1859 cfp17   TRUE 0.985 -3.000 0.707 NA N NA
 540169 540170 Mb1859 Mb1860     FALSE 0.217 119.000 0.133 NA   NA
 540170 540171 Mb1860 Mb1861     FALSE 0.014 292.000 0.043 NA   NA
 540171 540172 Mb1861 Mb1862     FALSE 0.265 53.000 0.028 NA   NA
 540172 540173 Mb1862 Mb1863   gcvB FALSE 0.221 49.000 0.002 NA   NA
 540176 540177 Mb1866c Mb1867c     FALSE 0.347 16.000 0.000 NA   NA
 540177 540178 Mb1867c Mb1868c   glcB FALSE 0.192 120.000 0.089 NA   NA
 540178 540179 Mb1868c Mb1869c glcB   FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 540179 540180 Mb1869c Mb1870c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540180 540181 Mb1870c Mb1871c   PE_PGRS34 FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 540181 540182 Mb1871c Mb1872c PE_PGRS34   FALSE 0.032 163.000 0.000 NA   NA
 540182 540183 Mb1872c Mb1873c     TRUE 0.996 0.000 0.815 0.038   NA
 540183 540184 Mb1873c Mb1874c   guaB1 FALSE 0.208 174.000 0.038 0.096   NA
 540184 540185 Mb1874c Mb1875c guaB1 gnd1 FALSE 0.243 -634.000 0.023 1.000 N NA
 540185 540186 Mb1875c Mb1876c gnd1   FALSE 0.147 90.000 0.023 1.000 N NA
 540186 540187 Mb1876c Mb1877c     TRUE 0.917 15.000 0.850 1.000 N NA
 540188 540189 Mb1878 Mb1879   ureA FALSE 0.341 49.000 0.222 NA N NA
 540189 540190 Mb1879 Mb1880 ureA ureB TRUE 0.997 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 540190 540191 Mb1880 Mb1881 ureB ureC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.001 Y NA
 540191 540192 Mb1881 Mb1882 ureC ureF TRUE 0.983 0.000 0.061 0.002 N NA
 540192 540193 Mb1882 Mb1883 ureF ureG TRUE 0.992 11.000 0.439 0.002 Y NA
 540193 540194 Mb1883 Mb1884 ureG ureD TRUE 0.956 8.000 0.032 0.002   NA
 540195 540196 Mb1885c Mb1886c ndh   TRUE 0.716 141.000 0.500 1.000 Y NA
 540196 540197 Mb1886c Mb1887c     TRUE 0.716 39.000 0.571 1.000 N NA
 540198 540199 Mb1888 Mb1889 modA modB TRUE 0.998 3.000 0.578 0.001 Y NA
 540199 540200 Mb1889 Mb1890 modB modC TRUE 0.955 7.000 0.018 1.000 Y NA
 540200 540201 Mb1890 Mb1891 modC apa FALSE 0.377 53.000 0.052 1.000   NA
 540201 540202 Mb1891 Mb1892 apa   FALSE 0.017 452.000 0.238 1.000   NA
 540202 540203 Mb1892 Mb1893   adhA FALSE 0.460 75.000 0.189 1.000   NA
 540204 540205 Mb1894c Mb1895c     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 540205 540206 Mb1895c Mb1896c     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 540207 540208 Mb1897 Mb1898     FALSE 0.016 288.000 0.143 1.000 N NA
 540208 540209 Mb1898 Mb1899     FALSE 0.324 99.000 0.214 1.000 N NA
 540210 540211 Mb1900c Mb1901c     FALSE 0.222 67.000 0.000 1.000   NA
 540211 540212 Mb1901c Mb1902c     FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 540212 540213 Mb1902c Mb1903c   lldD2 FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 540214 540215 Mb1904 Mb1905     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 540215 540216 Mb1905 Mb1906     TRUE 0.782 11.000 0.188 NA   NA
 540216 540217 Mb1906 Mb1907   bfrA FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000   NA
 540217 540218 Mb1907 Mb1908 bfrA   FALSE 0.395 85.000 0.135 1.000   NA
 540218 540219 Mb1908 Mb1909     TRUE 0.672 -685.000 0.000 0.045   NA
 540219 540220 Mb1909 Mb1910   glnA3 FALSE 0.242 55.000 0.000 1.000   NA
 540220 540221 Mb1910 Mb1911 glnA3   TRUE 0.966 3.000 0.364 1.000   NA
 540222 540223 Mb1912c Mb1913c cyp140 lppE FALSE 0.525 50.000 0.273 NA   NA
 540223 540224 Mb1913c Mb1914c lppE   FALSE 0.364 41.000 0.070 NA   NA
 540224 540225 Mb1914c Mb1915c     FALSE 0.463 28.000 0.093 NA   NA
 540225 540226 Mb1915c Mb1916c   rpfC TRUE 0.652 39.000 0.375 NA   NA
 540226 540227 Mb1916c Mb1917c rpfC   TRUE 0.670 12.000 0.018 1.000   NA
 540227 540228 Mb1917c Mb1918c   fbpB FALSE 0.447 18.000 0.018 NA   NA
 540230 540231 Mb1920c Mb1921c     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 540231 540232 Mb1921c Mb1922c     FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 540232 540233 Mb1922c Mb1923c     FALSE 0.149 59.000 0.000 NA   NA
 540234 540235 Mb1924 Mb1925     TRUE 0.780 17.000 0.333 NA   NA
 540235 540236 Mb1925 Mb1926     TRUE 0.898 10.000 0.375 NA   NA
 540238 540239 Mb1928 Mb1929     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.018   NA
 540240 540241 Mb1931c Mb1932c     FALSE 0.328 5.000 0.004 NA N NA
 540243 540244 Mb1934c Mb1935c lppD lipJ TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 540247 540248 Mb1938 Mb1939     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 540249 540250 Mb1940c Mb1941c aao   FALSE 0.486 30.000 0.143 NA   NA
 540250 540251 Mb1941c Mb1942c     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 540251 540252 Mb1942c Mb1943c   katG TRUE 0.596 7.000 0.000 NA   NA
 540252 540253 Mb1943c Mb1944c katG furA TRUE 0.794 38.000 0.057 1.000 Y NA
 540253 540254 Mb1944c Mb1945c furA   FALSE 0.109 105.000 0.000 NA   NA
 540254 540255 Mb1945c Mb1946c   lppC FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540255 540256 Mb1946c Mb1947c lppC fadB5 FALSE 0.119 100.000 0.000 NA   NA
 540260 540261 Mb1951c Mb1952c PPE34 PPE35b FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 540261 540262 Mb1952c Mb1953c PPE35b PPE35a FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540262 540263 Mb1953c Mb1954c PPE35a   FALSE 0.003 449.000 0.000 NA   NA
 540266 540267 Mb1957 Mb1958   lipD TRUE 0.988 -9.000 0.333 0.004 Y NA
 540272 540273 Mb1963c Mb1964c     FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 540273 540274 Mb1964c Mb1965c     FALSE 0.431 12.000 0.000 NA   NA
 540274 540275 Mb1965c Mb1966c     FALSE 0.311 18.000 0.000 NA   NA
 540277 540278 Mb1968c Mb1969c fadE18 fadE17 TRUE 0.998 2.000 0.800 0.011 Y NA
 540278 540279 Mb1969c Mb1970c fadE17 echA13 TRUE 0.969 15.000 0.600 1.000 Y NA
 540280 540281 Mb1971 Mb1972     TRUE 0.991 3.000 0.500 NA Y NA
 540281 540282 Mb1972 Mb1973   ephB TRUE 0.958 12.000 1.000 1.000   NA
 540282 540283 Mb1973 Mb1974 ephB   TRUE 0.980 -3.000 0.333 1.000   NA
 540283 540284 Mb1974 Mb1975   ribA1 FALSE 0.479 -223.000 0.036 1.000   NA
 540284 540285 Mb1975 Mb1976 ribA1   TRUE 0.879 -3.000 0.036 1.000 N NA
 540286 540287 Mb1977c Mb1978c     TRUE 0.990 -3.000 0.750 NA   NA
 540287 540288 Mb1978c Mb1979c     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540292 540293 Mb1983c Mb1984c     FALSE 0.472 11.000 0.000 NA   NA
 540293 540294 Mb1984c Mb1985c     FALSE 0.289 21.000 0.000 NA   NA
 540294 540295 Mb1985c Mb1986c     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540296 540297 Mb1987 Mb1988     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540299 540300 Mb1990 Mb1991     FALSE 0.177 42.000 0.000 NA   NA
 540300 540301 Mb1991 Mb1992     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 540302 540303 Mb1993c Mb1994c     FALSE 0.162 49.000 0.000 NA   NA
 540303 540304 Mb1994c Mb1995c     TRUE 0.978 -3.000 0.385 NA   NA
 540306 540307 Mb1997c Mb1998c     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 540308 540309 Mb1999 Mb2000 yrbE3A   FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540310 540311 Mb2001c Mb2002c   mpt64 FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 540311 540312 Mb2002c Mb2003c mpt64 nrdF1 FALSE 0.021 191.000 0.000 NA   NA
 540312 540313 Mb2003c Mb2004c nrdF1   FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 540315 540316 Mb2006c Mb2007c cfp21   FALSE 0.005 430.000 0.000 1.000   NA
 540317 540318 Mb2008 Mb2009     FALSE 0.005 416.000 0.000 1.000   NA
 540318 540319 Mb2009 Mb2010     FALSE 0.022 226.000 0.000 1.000   NA
 540320 540321 Mb2011c Mb2012c     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 540321 540322 Mb2012c Mb2013c     FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 540322 540323 Mb2013c Mb2014c     FALSE 0.127 89.000 0.000 NA   NA
 540323 540324 Mb2014c Mb2015c   ctpG FALSE 0.002 342.000 0.000 1.000 N NA
 540324 540325 Mb2015c Mb2016c ctpG   TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540325 540326 Mb2016c Mb2017c     FALSE 0.156 53.000 0.000 NA   NA
 540327 540328 Mb2018 Mb2019     FALSE 0.123 96.000 0.000 NA   NA
 540328 540329 Mb2019 Mb2020   ctpF FALSE 0.008 202.000 0.000 1.000 N NA
 540330 540331 Mb2021c Mb2022c     FALSE 0.057 95.000 0.000 1.000 N NA
 540332 540333 Mb2023 Mb2024     TRUE 0.766 10.000 0.118 NA   NA
 540333 540334 Mb2024 Mb2025   fabG3 TRUE 0.657 76.000 0.000 1.000 Y NA
 540335 540336 Mb2026c Mb2027c     FALSE 0.237 58.000 0.000 1.000   NA
 540336 540337 Mb2027c Mb2028c     FALSE 0.406 22.000 0.000 1.000   NA
 540339 540340 Mb2030c Mb2031c fdxA   FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000   NA
 540341 540342 Mb2032 Mb2033     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540344 540345 Mb2035 Mb2036     FALSE 0.002 704.000 0.000 NA   NA
 540345 540346 Mb2036 Mb2037     TRUE 0.795 -46.000 0.000 0.008   NA
 540348 540349 Mb2039 Mb2040     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540349 540350 Mb2040 Mb2041     FALSE 0.010 242.000 0.000 NA   NA
 540350 540351 Mb2041 Mb2042     TRUE 0.833 -10.000 0.294 NA   NA
 540352 540353 Mb2043c Mb2044c     FALSE 0.130 85.000 0.000 NA   NA
 540353 540354 Mb2044c Mb2045c     TRUE 0.907 9.000 0.375 NA   NA
 540354 540355 Mb2045c Mb2046c     FALSE 0.255 25.000 0.000 NA   NA
 540355 540356 Mb2046c Mb2047c     FALSE 0.035 160.000 0.000 NA   NA
 540356 540357 Mb2047c Mb2048c     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 540357 540358 Mb2048c Mb2049c     FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 540358 540359 Mb2049c Mb2050c     FALSE 0.004 508.000 0.000 1.000   NA
 540359 540360 Mb2050c Mb2051c     FALSE 0.039 115.000 0.000 1.000 N NA
 540360 540361 Mb2051c Mb2052c     TRUE 0.726 40.000 0.000 1.000 Y NA
 540361 540362 Mb2052c Mb2053c     TRUE 0.670 61.000 0.000 1.000 Y NA
 540362 540363 Mb2053c Mb2054c   pfkB FALSE 0.272 -3.000 0.000 NA N NA
 540363 540364 Mb2054c Mb2055c pfkB   FALSE 0.525 17.000 0.050 NA   NA
 540364 540365 Mb2055c Mb2056c     TRUE 0.871 -15.000 0.000 0.006   NA
 540365 540366 Mb2056c Mb2057c   hspX TRUE 0.832 12.000 0.300 NA   NA
 540369 540370 Mb2060 Mb2061     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 540370 540371 Mb2061 Mb2062     TRUE 0.948 -3.000 0.150 NA   NA
 540372 540373 Mb2063c Mb2064c     TRUE 0.975 2.000 0.444 1.000   NA
 540373 540374 Mb2064c Mb2065c     TRUE 0.994 3.000 0.211 0.020 Y NA
 540374 540375 Mb2065c Mb2066c     TRUE 0.975 -13.000 0.211 0.020 Y NA
 540375 540376 Mb2066c Mb2067c     TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.020 Y NA
 540376 540377 Mb2067c Mb2068c     TRUE 0.758 38.000 0.118 0.027   NA
 540377 540378 Mb2068c Mb2069c   pncA TRUE 0.913 0.000 0.005 1.000   NA
 540378 540379 Mb2069c Mb2070c pncA   FALSE 0.180 41.000 0.000 NA   NA
 540379 540380 Mb2070c Mb2071c   lipT FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 540382 540383 Mb2073c Mb2074c   pks12 TRUE 0.978 5.000 1.000 1.000 N NA
 540383 540384 Mb2074c Mb2075c pks12   FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 540386 540387 Mb2077c Mb2078c ppm1   FALSE 0.376 158.000 0.041 0.003   NA
 540387 540388 Mb2078c Mb2079c     TRUE 0.861 5.000 0.037 1.000   NA
 540390 540391 Mb2081c Mb2082c rpsR2 rpsN2 TRUE 0.993 1.000 0.024 0.015 Y NA
 540391 540392 Mb2082c Mb2083c rpsN2 rpmG1 TRUE 0.993 2.000 0.052 0.015 Y NA
 540392 540393 Mb2083c Mb2084c rpmG1 rpmB2 TRUE 0.997 0.000 0.332 0.015 Y NA
 540394 540395 Mb2085 Mb2086     FALSE 0.327 -430.000 0.000 1.000   NA
 540396 540397 Mb2087c Mb2088c   cobN FALSE 0.323 84.000 0.045 1.000   NA
 540398 540399 Mb2089 Mb2090   cobG FALSE 0.006 387.000 0.000 1.000   NA
 540399 540400 Mb2090 Mb2091 cobG cobH TRUE 0.823 10.000 0.255 1.000 N NA
 540400 540401 Mb2091 Mb2092 cobH cobI TRUE 0.996 -3.000 0.096 0.008 Y NA
 540402 540403 Mb2093c Mb2094c   blaC FALSE 0.482 16.000 0.000 1.000   NA
 540405 540406 Mb2096c Mb2097c cobK cobM TRUE 0.921 37.000 0.076 0.008 Y NA
 540406 540407 Mb2097c Mb2098c cobM cobLb TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.008 Y NA
 540407 540408 Mb2098c Mb2099c cobLb cobLa TRUE 0.843 -58.000 0.000 0.001   NA
 540408 540409 Mb2099c Mb2100c cobLa   FALSE 0.220 75.000 0.000 1.000   NA
 540409 540410 Mb2100c Mb2101c     FALSE 0.036 158.000 0.000 NA   NA
 540410 540411 Mb2101c Mb2102c     FALSE 0.197 35.000 0.000 NA   NA
 540411 540412 Mb2102c Mb2103c     TRUE 0.781 1.000 0.000 NA   NA
 540413 540414 Mb2104 Mb2105     TRUE 0.872 -18.000 0.500 NA   NA
 540414 540415 Mb2105 Mb2106   lppJ FALSE 0.360 -19.000 0.000 NA   NA
 540417 540418 Mb2108 Mb2109     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 540418 540419 Mb2109 Mb2110     FALSE 0.499 -7.000 0.000 NA   NA
 540419 540420 Mb2110 Mb2111     FALSE 0.245 -180.000 0.000 NA   NA
 540420 540421 Mb2111 Mb2112     FALSE 0.133 83.000 0.000 NA   NA
 540421 540422 Mb2112 Mb2113     FALSE 0.348 -21.000 0.000 NA   NA
 540422 540423 Mb2113 Mb2114     FALSE 0.138 78.000 0.000 NA   NA
 540423 540424 Mb2114 Mb2115   pknJ FALSE 0.022 187.000 0.000 NA   NA
 540427 540428 Mb2118c Mb2119c   helY FALSE 0.391 42.000 0.105 NA   NA
 540428 540429 Mb2119c Mb2120c helY tatC FALSE 0.261 49.000 0.166 NA N NA
 540429 540430 Mb2120c Mb2121c tatC tatA TRUE 0.860 17.000 0.031 NA Y NA
 540430 540431 Mb2121c Mb2122c tatA   FALSE 0.181 68.000 0.110 NA N NA
 540431 540432 Mb2122c Mb2123c     TRUE 0.997 -3.000 0.767 NA Y NA
 540432 540433 Mb2123c Mb2124c     TRUE 0.827 9.000 0.188 NA   NA
 540433 540434 Mb2124c Mb2125c   PE_PGRS36 FALSE 0.157 52.000 0.000 NA   NA
 540435 540436 Mb2126 Mb2127   helZ FALSE 0.032 199.000 0.000 1.000   NA
 540436 540437 Mb2127 Mb2128 helZ   FALSE 0.391 110.000 0.222 1.000   NA
 540438 540439 Mb2129c Mb2130c     TRUE 0.960 7.000 0.667 NA   NA
 540440 540441 Mb2131 Mb2132 PE22 PPE36 TRUE 0.822 56.000 1.000 NA   NA
 540442 540443 Mb2133c Mb2134c prcA prcB TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.001 Y NA
 540443 540444 Mb2134c Mb2135c prcB   TRUE 0.985 -3.000 0.512 NA   NA
 540444 540445 Mb2135c Mb2136c     TRUE 0.628 113.000 0.706 NA   NA
 540446 540447 Mb2137 Mb2138     TRUE 0.790 11.000 0.200 NA   NA
 540449 540450 Mb2140 Mb2141 lppK   TRUE 0.722 8.000 0.030 NA   NA
 540453 540454 Mb2144c Mb2145c   hisG FALSE 0.