MicrobesOnline Operon Predictions for Nitrosomonas europaea ATCC 19718

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 366750 366751 NE0001 NE0002 dnaA dnaN TRUE 0.830 201.000 0.328 1.000 Y NA
 366751 366752 NE0002 NE0003 dnaN gyrB TRUE 0.972 49.000 0.114 1.000 Y NA
 366752 366753 NE0003 NE0004 gyrB   TRUE 0.539 23.000 0.002 NA   NA
 366753 366754 NE0004 NE0005     TRUE 0.851 51.000 0.056 NA   NA
 366754 5437935 NE0005 RNA_36   tRNAGly3 FALSE 0.124 136.000 0.000 NA   NA
 5437935 5437936 RNA_36 RNA_37 tRNAGly3 tRNACys1 FALSE 0.257 92.000 0.000 NA   NA
 5437936 5437937 RNA_37 RNA_38 tRNACys1 tRNALeu4 TRUE 0.523 26.000 0.000 NA   NA
 5437937 366755 RNA_38 NE0006 tRNALeu4 fdxA FALSE 0.036 222.000 0.000 NA   NA
 366755 366756 NE0006 NE0007 fdxA   TRUE 0.989 44.000 0.667 NA   NA
 366757 366758 NE0008 NE0009 mfd   TRUE 0.544 27.000 0.002 NA   NA
 366758 366759 NE0009 NE0010   recJ TRUE 0.578 -28.000 0.005 NA   NA
 366759 366760 NE0010 NE0011 recJ cyp FALSE 0.149 144.000 0.002 1.000   NA
 366760 366761 NE0011 NE0012 cyp trpC FALSE 0.448 84.000 0.005 1.000   NA
 366761 366762 NE0012 NE0013 trpC trpD TRUE 0.997 2.000 0.293 1.000 Y NA
 366762 366763 NE0013 NE0014 trpD trpG TRUE 0.994 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 366764 366765 NE0015 NE0016 yfhK   TRUE 0.965 -3.000 0.044 1.000   NA
 366765 366766 NE0016 NE0017   yfhA TRUE 0.896 13.000 0.043 1.000   NA
 366767 366768 NE0018 NE0019   purL FALSE 0.318 126.000 0.011 1.000   NA
 366769 366770 NE0020 NE0021     FALSE 0.021 275.000 0.000 NA   NA
 366771 366772 NE0022 NE0023   xthA1 TRUE 0.797 19.000 0.010 1.000 N NA
 366774 366775 NE0025 NE0026   bioA TRUE 0.795 7.000 0.003 1.000   NA
 366776 366777 NE0027 NE0028 groES groEL TRUE 0.997 40.000 0.538 0.010 Y NA
 366777 366778 NE0028 NE0029 groEL   FALSE 0.231 151.000 0.006 1.000 N NA
 366778 5437938 NE0029 RNA_39   tRNALeu5 FALSE 0.078 166.000 0.000 NA   NA
 5437938 366779 RNA_39 NE0030 tRNALeu5 tig FALSE 0.290 86.000 0.000 NA   NA
 366779 366780 NE0030 NE0031 tig clpP,lopP TRUE 0.994 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 366780 366781 NE0031 NE0032 clpP,lopP clpX TRUE 0.989 61.000 0.352 1.000 Y NA
 366781 366782 NE0032 NE0033 clpX lon TRUE 0.928 111.000 0.201 1.000 Y NA
 366782 366783 NE0033 NE0034 lon   FALSE 0.018 355.000 0.000 1.000 N NA
 366783 366784 NE0034 NE0035     FALSE 0.029 293.000 0.000 1.000 N NA
 366785 366786 NE0036 NE0037   pcm TRUE 0.770 63.000 0.019 1.000 N NA
 366787 366788 NE0038 NE0039 thiC bacA TRUE 0.701 48.000 0.004 1.000 N NA
 366789 366790 NE0040 NE0041   ppiB TRUE 0.687 82.000 0.031 NA N NA
 366790 366791 NE0041 NE0042 ppiB ppiA TRUE 0.997 19.000 0.577 0.005 Y NA
 366793 366794 NE0044 NE0045   motB TRUE 0.745 6.000 0.000 NA   NA
 366794 366795 NE0045 NE0046 motB motA TRUE 0.970 40.000 0.097 1.000 Y NA
 366796 366797 NE0047 NE0048     FALSE 0.026 303.000 0.000 1.000 N NA
 366797 366798 NE0048 NE0049     TRUE 0.973 0.000 0.049 1.000 N NA
 366798 366799 NE0049 NE0050   sucC TRUE 0.931 -3.000 0.006 1.000 N NA
 366799 366800 NE0050 NE0051 sucC sucD TRUE 0.997 3.000 0.151 0.002 Y NA
 366800 366801 NE0051 NE0052 sucD   TRUE 0.542 19.000 0.000 NA   NA
 366801 366802 NE0052 NE0053     TRUE 0.542 19.000 0.000 NA   NA
 366802 5437939 NE0053 RNA_42   rrnA FALSE 0.009 400.000 0.000 NA   NA
 5437939 5437940 RNA_42 RNA_45 rrnA 16S_rRNA FALSE 0.328 -1977.000 0.000 NA   NA
 5437940 5437941 RNA_45 RNA_40 16S_rRNA tRNAIle1 FALSE 0.243 95.000 0.000 NA   NA
 5437941 5437942 RNA_40 RNA_41 tRNAIle1 tRNAAla2 TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 5437942 5437943 RNA_41 RNA_46 tRNAAla2 23S_rRNA FALSE 0.094 156.000 0.000 NA   NA
 5437943 5437944 RNA_46 RNA_44 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.381 70.000 0.000 NA   NA
 5437944 366803 RNA_44 NE0054 5S_rRNA   FALSE 0.007 476.000 0.000 NA   NA
 366803 366804 NE0054 NE0055   ispZ FALSE 0.441 119.000 0.005 0.056 N NA
 366804 366805 NE0055 NE0056 ispZ mutY TRUE 0.668 29.000 0.002 1.000 N NA
 366805 366806 NE0056 NE0057 mutY   TRUE 0.831 -7.000 0.003 1.000 N NA
 366807 366808 NE0058 NE0059     TRUE 0.770 19.000 0.007 1.000 N NA
 366808 366809 NE0059 NE0060   ptsN TRUE 0.988 -13.000 0.177 1.000 Y NA
 366809 366810 NE0060 NE0061 ptsN   TRUE 0.563 232.000 0.309 NA N NA
 366810 366811 NE0061 NE0062   rpoN1 TRUE 0.859 176.000 0.574 NA N NA
 366811 366812 NE0062 NE0063 rpoN1   TRUE 0.957 7.000 0.075 1.000   NA
 366812 366813 NE0063 NE0064     TRUE 0.986 35.000 0.543 NA   NA
 366813 366814 NE0064 NE0065     TRUE 0.979 57.000 0.459 NA   NA
 366815 366816 NE0066 NE0067 nadA   TRUE 0.929 0.000 0.011 NA   NA
 366816 366817 NE0067 NE0068     TRUE 0.992 -3.000 0.216 NA   NA
 366817 366818 NE0068 NE0069   pcnB FALSE 0.246 153.000 0.008 1.000 N NA
 366818 366819 NE0069 NE0070 pcnB   TRUE 0.994 -3.000 0.234 1.000 N NA
 366819 366820 NE0070 NE0071     TRUE 0.977 -3.000 0.063 1.000 N NA
 366820 366821 NE0071 NE0072   panB TRUE 0.972 1.000 0.055 1.000 N NA
 366821 366822 NE0072 NE0073 panB panC TRUE 0.996 24.000 0.395 0.001 Y NA
 366823 366824 NE0074 NE0075     TRUE 0.760 38.000 0.008 1.000 N NA
 366825 366826 NE0076 NE0077     TRUE 0.972 -3.000 0.059 1.000   NA
 366826 366827 NE0077 NE0078     TRUE 0.960 -3.000 0.034 1.000   NA
 366828 366829 NE0079 NE0080 fkpA   FALSE 0.179 143.000 0.000 1.000 N NA
 366829 366830 NE0080 NE0081     TRUE 0.516 100.000 0.023 1.000   NA
 366831 366832 NE0082 NE0083     TRUE 0.985 14.000 0.375 NA   NA
 366832 366833 NE0083 NE0084     FALSE 0.186 167.000 0.013 NA   NA
 366834 366835 NE0085 NE0086     TRUE 0.800 14.000 0.012 NA   NA
 366835 366836 NE0086 NE0087   purN TRUE 0.840 -3.000 0.002 NA   NA
 366836 366837 NE0087 NE0088 purN purM TRUE 0.953 12.000 0.002 0.003 Y NA
 366839 366840 NE0090 NE0091     FALSE 0.021 293.000 0.000 1.000   NA
 366840 366841 NE0091 NE0092     FALSE 0.043 205.000 0.000 NA   NA
 366841 366842 NE0092 NE0093     FALSE 0.006 486.000 0.000 NA   NA
 366842 366843 NE0093 NE0094   guaA FALSE 0.004 1449.000 0.000 1.000   NA
 366843 366844 NE0094 NE0095 guaA guaB TRUE 0.994 12.000 0.190 0.001 Y NA
 366844 366845 NE0095 NE0096 guaB   FALSE 0.188 114.000 0.002 NA   NA
 366845 366846 NE0096 NE0097     TRUE 0.812 46.000 0.032 NA   NA
 366846 366847 NE0097 NE0098     FALSE 0.444 134.000 0.045 1.000   NA
 366847 366848 NE0098 NE0099     FALSE 0.266 139.000 0.010 1.000   NA
 366848 366849 NE0099 NE0100     TRUE 0.777 29.000 0.015 1.000   NA
 366849 366850 NE0100 NE0101   hprA FALSE 0.091 167.000 0.000 1.000   NA
 366850 366851 NE0101 NE0102 hprA cyt_c552 FALSE 0.195 216.000 0.000 1.000 Y NA
 366851 366852 NE0102 NE0103 cyt_c552 yyaL TRUE 0.803 21.000 0.011 1.000 N NA
 366852 366853 NE0103 NE0104 yyaL   TRUE 0.801 22.000 0.011 1.000 N NA
 366854 366855 NE0105 NE0106 lgt   TRUE 0.675 20.000 0.003 NA N NA
 366855 366856 NE0106 NE0107     TRUE 0.999 0.000 0.922 NA Y NA
 366856 366857 NE0107 NE0108   dapE TRUE 0.704 51.000 0.005 1.000 N NA
 366858 366859 NE0109 NE0110     FALSE 0.004 948.000 0.000 NA   NA
 11459134 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8545.000 0.000 NA   NA
 11601497 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8545.000 0.000 NA   NA
 11743889 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8545.000 0.000 NA   NA
 11459135 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11601498 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11743890 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8566.000 0.000 NA   NA
 11459136 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8600.000 0.000 NA   NA
 11601499 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8600.000 0.000 NA   NA
 11743891 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8600.000 0.000 NA   NA
 11459137 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8636.000 0.000 NA   NA
 11601500 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8636.000 0.000 NA   NA
 11743892 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8636.000 0.000 NA   NA
 11459138 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8669.000 0.000 NA   NA
 11601501 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8669.000 0.000 NA   NA
 11743893 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8669.000 0.000 NA   NA
 11459139 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8705.000 0.000 NA   NA
 11601502 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8705.000 0.000 NA   NA
 11743894 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8705.000 0.000 NA   NA
 11459140 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8739.000 0.000 NA   NA
 11601503 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8739.000 0.000 NA   NA
 11743895 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8739.000 0.000 NA   NA
 11459141 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8775.000 0.000 NA   NA
 11601504 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8775.000 0.000 NA   NA
 11743896 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8775.000 0.000 NA   NA
 11459142 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8810.000 0.000 NA   NA
 11601505 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8810.000 0.000 NA   NA
 11743897 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8810.000 0.000 NA   NA
 11459143 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8846.000 0.000 NA   NA
 11601506 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8846.000 0.000 NA   NA
 11743898 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8846.000 0.000 NA   NA
 11459144 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8881.000 0.000 NA   NA
 11601507 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8881.000 0.000 NA   NA
 11743899 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8881.000 0.000 NA   NA
 11459145 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8917.000 0.000 NA   NA
 11601508 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8917.000 0.000 NA   NA
 11743900 366851   NE0102   cyt_c552 FALSE NA 8917.000 0.000 NA   NA
 11459146 366860   NE0111     FALSE NA 683.000 0.000 NA   NA
 11601509 366860   NE0111     FALSE NA 683.000 0.000 NA   NA
 11743901 366860   NE0111     FALSE NA 683.000 0.000 NA   NA
 11459147 366860   NE0111     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11601510 366860   NE0111     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11743902 366860   NE0111     FALSE NA 648.000 0.000 NA   NA
 11459148 366860   NE0111     FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11601511 366860   NE0111     FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11743903 366860   NE0111     FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11459149 366860   NE0111     FALSE NA 577.000 0.000 NA   NA
 11601512 366860   NE0111     FALSE NA 577.000 0.000 NA   NA
 11743904 366860   NE0111     FALSE NA 577.000 0.000 NA   NA
 11459150 366860   NE0111     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11601513 366860   NE0111     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11743905 366860   NE0111     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11459151 366860   NE0111     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11601514 366860   NE0111     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11743906 366860   NE0111     FALSE NA 506.000 0.000 NA   NA
 11459152 366860   NE0111     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11601515 366860   NE0111     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11743907 366860   NE0111     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 366859 366860 NE0110 NE0111     TRUE 0.975 34.000 0.133 NA Y NA
 366860 366861 NE0111 NE0112     TRUE 0.946 22.000 0.158 NA   NA
 366861 366862 NE0112 NE0113     TRUE 0.510 35.000 0.000 NA   NA
 366862 366863 NE0113 NE0114     FALSE 0.476 -25.000 0.000 NA   NA
 366863 366864 NE0114 NE0115     FALSE 0.024 257.000 0.000 NA   NA
 366864 366865 NE0115 NE0116     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 366865 366866 NE0116 NE0117     TRUE 0.994 -3.000 0.300 NA   NA
 366866 366867 NE0117 NE0118     TRUE 0.500 -22.000 0.000 NA   NA
 366867 366868 NE0118 NE0119     TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 366868 366869 NE0119 NE0120     TRUE 0.994 0.000 0.286 NA   NA
 366869 366870 NE0120 NE0121     TRUE 0.996 5.000 0.279 NA Y NA
 366870 366871 NE0121 NE0122     TRUE 0.975 64.000 0.453 NA   NA
 366871 366872 NE0122 NE0123     TRUE 0.966 83.000 0.525 NA   NA
 366872 2213802 NE0123 NE0124     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 2213802 366873 NE0124 NE0127     FALSE 0.134 131.000 0.000 NA   NA
 366873 366874 NE0127 NE0128     TRUE 0.989 1.000 0.167 NA N NA
 366874 366875 NE0128 NE0129     FALSE 0.006 526.000 0.000 NA   NA
 366875 366876 NE0129 NE0130     FALSE 0.171 115.000 0.000 NA   NA
 366876 366877 NE0130 NE0131     FALSE 0.100 152.000 0.000 NA   NA
 366877 366878 NE0131 NE0132   osmY TRUE 0.574 16.000 0.000 NA   NA
 366883 366884 NE0139 NE0140   rnhA TRUE 0.859 0.000 0.000 1.000   NA
 366884 366885 NE0140 NE0141 rnhA dnaQ TRUE 0.992 12.000 0.248 1.000 Y NA
 366887 366888 NE0143 NE0144   ndk FALSE 0.024 284.000 0.000 1.000   NA
 366888 366889 NE0144 NE0145 ndk   TRUE 0.846 94.000 0.156 1.000   NA
 366889 366890 NE0145 NE0146   pilF TRUE 0.910 44.000 0.086 1.000   NA
 366890 366891 NE0146 NE0147 pilF   TRUE 0.977 -10.000 0.204 NA   NA
 366891 366892 NE0147 NE0148     TRUE 0.964 35.000 0.233 NA   NA
 366892 366893 NE0148 NE0149     TRUE 0.797 -36.000 0.006 0.001   NA
 366893 366894 NE0149 NE0150   hisS TRUE 0.983 -7.000 0.207 1.000   NA
 366894 366895 NE0150 NE0151 hisS   TRUE 0.971 22.000 0.259 1.000   NA
 366895 366896 NE0151 NE0152     TRUE 0.997 -3.000 0.492 1.000   NA
 366896 366897 NE0152 NE0153     TRUE 0.956 52.000 0.203 1.000   NA
 366897 366898 NE0153 NE0154   tISRso8a FALSE 0.115 154.000 0.000 1.000   NA
 366898 366899 NE0154 NE0155 tISRso8a   TRUE 0.987 -33.000 0.667 1.000   NA
 366899 366900 NE0155 NE0156   mexE FALSE 0.009 561.000 0.000 1.000 N NA
 366900 366901 NE0156 NE0157 mexE   TRUE 0.993 26.000 0.750 1.000 N NA
 366902 366903 NE0158 NE0159     TRUE 0.998 -3.000 0.545 0.053 N NA
 366903 366904 NE0159 NE0160     TRUE 0.996 -7.000 0.467 0.048 N NA
 366904 366905 NE0160 NE0161     TRUE 0.569 26.000 0.000 1.000   NA
 366905 366906 NE0161 NE0162     FALSE 0.007 500.000 0.000 1.000   NA
 366906 2213805 NE0162 NE0163   tISRso8a FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 2213805 2213806 NE0163 NE0164 tISRso8a   FALSE 0.496 50.000 0.000 NA   NA
 366907 366908 NE0165 NE0166     FALSE 0.023 261.000 0.000 NA   NA
 366909 366910 NE0167 NE0168     TRUE 0.704 -10.000 0.000 1.000   NA
 366910 366911 NE0168 NE0169   acrA,mtcA,lir TRUE 0.987 36.000 0.500 1.000 N NA
 366911 366912 NE0169 NE0170 acrA,mtcA,lir oprM TRUE 0.979 100.000 0.400 0.098 Y NA
 366912 366913 NE0170 NE0171 oprM   FALSE 0.098 287.000 0.000 NA Y NA
 366913 366914 NE0171 NE0172   pnp FALSE 0.082 187.000 0.000 NA N NA
 366914 366915 NE0172 NE0173 pnp rpsO TRUE 0.855 195.000 0.335 1.000 Y NA
 366916 366917 NE0174 NE0175     TRUE 0.937 36.000 0.111 1.000 N NA
 366917 366918 NE0175 NE0176     TRUE 0.951 16.000 0.111 1.000 N NA
 366918 366919 NE0176 NE0177     TRUE 0.901 14.000 0.040 1.000 N NA
 366919 366920 NE0177 NE0178   gpmA TRUE 0.861 47.000 0.040 1.000 N NA
 366921 366922 NE0179 NE0180   serS TRUE 0.546 47.000 0.003 NA   NA
 366922 366923 NE0180 NE0181 serS apt FALSE 0.063 216.000 0.000 1.000 N NA
 366923 366924 NE0181 NE0182 apt   FALSE 0.299 90.000 0.002 NA   NA
 366924 366925 NE0182 NE0183     FALSE 0.198 197.000 0.043 NA   NA
 366925 366926 NE0183 NE0184     FALSE 0.022 270.000 0.000 NA   NA
 366929 366930 NE0187 NE0188     FALSE 0.096 164.000 0.000 1.000   NA
 366931 366932 NE0189 NE0190     FALSE 0.190 118.000 0.000 1.000   NA
 366932 366933 NE0190 NE0191     TRUE 0.989 28.000 0.642 NA   NA
 366934 366935 NE0192 NE0193     TRUE 0.792 78.000 0.074 NA   NA
 366936 366937 NE0194 NE0195 dnaB rplI TRUE 0.703 108.000 0.074 1.000 N NA
 366937 366938 NE0195 NE0196 rplI rpsR TRUE 0.996 19.000 0.499 0.021 Y NA
 366938 366939 NE0196 NE0197 rpsR   TRUE 0.945 37.000 0.128 1.000 N NA
 366939 366940 NE0197 NE0198   rpsF TRUE 0.955 -16.000 0.122 1.000 N NA
 366941 366942 NE0199 NE0200   atpB TRUE 0.976 35.000 0.330 1.000   NA
 366942 366943 NE0200 NE0201 atpB atpE TRUE 0.997 43.000 0.557 0.005 Y NA
 366943 366944 NE0201 NE0202 atpE atpF TRUE 0.997 47.000 0.666 0.005 Y NA
 366944 366945 NE0202 NE0203 atpF atpH TRUE 0.998 1.000 0.242 0.005 Y NA
 366945 366946 NE0203 NE0204 atpH atpA TRUE 0.999 13.000 0.864 0.005 Y NA
 366946 366947 NE0204 NE0205 atpA atpG TRUE 0.999 4.000 0.846 0.005 Y NA
 366947 366948 NE0205 NE0206 atpG atpD TRUE 0.998 31.000 0.724 0.005 Y NA
 366948 366949 NE0206 NE0207 atpD atpC TRUE 0.998 29.000 0.837 0.005 Y NA
 366949 366950 NE0207 NE0208 atpC glmU FALSE 0.201 246.000 0.067 1.000 N NA
 366950 366951 NE0208 NE0209 glmU glmS TRUE 0.928 38.000 0.021 1.000 Y NA
 366951 366952 NE0209 NE0210 glmS   FALSE 0.140 136.000 0.002 NA   NA
 366952 366953 NE0210 NE0211   ruvC TRUE 0.993 -3.000 0.277 NA   NA
 366953 366954 NE0211 NE0212 ruvC ruvA TRUE 0.985 -3.000 0.006 0.013 Y NA
 366954 366955 NE0212 NE0213 ruvA ruvB TRUE 0.960 19.000 0.014 0.002 Y NA
 366955 366956 NE0213 NE0214 ruvB   TRUE 0.885 60.000 0.082 1.000   NA
 366956 366957 NE0214 NE0215   tolQ TRUE 0.998 -3.000 0.593 1.000   NA
 366957 366958 NE0215 NE0216 tolQ tolR TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.047 Y NA
 366958 366959 NE0216 NE0217 tolR tolA TRUE 0.764 22.000 0.015 NA   NA
 366959 366960 NE0217 NE0218 tolA tolB TRUE 0.707 38.000 0.010 NA   NA
 366960 366961 NE0218 NE0219 tolB pal TRUE 0.987 54.000 0.592 1.000   NA
 366961 366962 NE0219 NE0220 pal   TRUE 0.989 0.000 0.167 1.000   NA
 366962 366963 NE0220 NE0221     TRUE 0.515 103.000 0.026 1.000   NA
 366963 366964 NE0221 NE0222     TRUE 0.972 22.000 0.270 1.000   NA
 366968 366969 NE0226 NE0227 rpsU   TRUE 0.966 38.000 0.173 0.035   NA
 366969 366970 NE0227 NE0228     TRUE 0.870 82.000 0.137 1.000   NA
 366970 366971 NE0228 NE0229   rpoD TRUE 0.640 207.000 0.299 1.000 N NA
 366971 5437945 NE0229 RNA_19 rpoD tRNAMet2 FALSE 0.434 63.000 0.000 NA   NA
 5437945 366972 RNA_19 NE0230 tRNAMet2   FALSE 0.009 389.000 0.000 NA   NA
 366973 366974 NE0231 NE0232     FALSE 0.004 1343.000 0.000 NA   NA
 366974 366975 NE0232 NE0233     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 366975 366976 NE0233 NE0234     FALSE 0.015 309.000 0.000 NA   NA
 366976 366977 NE0234 NE0235   intF TRUE 0.618 -13.000 0.000 NA   NA
 366977 366978 NE0235 NE0236 intF ccrB FALSE 0.302 132.000 0.000 0.015   NA
 366978 366979 NE0236 NE0237 ccrB   TRUE 0.968 14.000 0.200 NA   NA
 366979 366980 NE0237 NE0238     FALSE 0.012 333.000 0.000 NA   NA
 366982 366983 NE0240 NE0241     FALSE 0.100 162.000 0.000 1.000   NA
 366984 366985 NE0242 NE0243     FALSE 0.128 134.000 0.000 NA   NA
 366987 366988 NE0245 NE0246     TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 366988 2213807 NE0246 NE0247     FALSE 0.190 108.000 0.000 NA   NA
 2213808 2213809 NE0248 NE0249 TRm2011-2C   TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 2213810 366989 NE0250 NE0251     FALSE 0.006 516.000 0.000 NA   NA
 366989 366990 NE0251 NE0252     FALSE 0.021 294.000 0.000 1.000   NA
 366990 366991 NE0252 NE0253     TRUE 0.989 54.000 0.667 1.000   NA
 366992 366993 NE0254 NE0255     FALSE 0.182 110.000 0.000 NA   NA
 366993 366994 NE0255 NE0256     FALSE 0.342 76.000 0.000 NA   NA
 366994 366995 NE0256 NE0257     FALSE 0.010 378.000 0.000 NA   NA
 366999 367000 NE0261 NE0262     TRUE 0.974 1.000 0.077 NA   NA
 367001 367002 NE0263 NE0264     TRUE 0.539 -19.000 0.000 NA   NA
 367002 367003 NE0264 NE0265     TRUE 0.528 22.000 0.000 NA   NA
 367003 367004 NE0265 NE0266     TRUE 0.526 23.000 0.000 NA   NA
 367004 367005 NE0266 NE0267     TRUE 0.609 79.000 0.019 NA   NA
 367006 2213811 NE0268 NE0269     FALSE 0.124 136.000 0.000 NA   NA
 2213811 367007 NE0269 NE0270     FALSE 0.088 159.000 0.000 NA   NA
 367007 367008 NE0270 NE0271     FALSE 0.010 382.000 0.000 NA   NA
 367008 367009 NE0271 NE0272     TRUE 0.966 0.000 0.000 NA Y NA
 367009 367010 NE0272 NE0273   cyc FALSE 0.076 193.000 0.000 NA N NA
 367011 367012 NE0274 NE0275   map FALSE 0.470 114.000 0.033 NA   NA
 367012 367013 NE0275 NE0276 map rph TRUE 0.826 68.000 0.003 1.000 Y NA
 367013 367014 NE0276 NE0277 rph   TRUE 0.974 38.000 0.262 1.000 N NA
 367014 367015 NE0277 NE0278     TRUE 0.968 37.000 0.218 1.000 N NA
 367015 367016 NE0278 NE0279   pcoA FALSE 0.128 172.000 0.002 1.000 N NA
 367016 367017 NE0279 NE0280 pcoA pcoB TRUE 0.998 -3.000 0.556 0.009 N NA
 367018 367019 NE0281 NE0282     TRUE 0.994 13.000 0.722 NA   NA
 367019 367020 NE0282 NE0283     FALSE 0.161 119.000 0.000 NA   NA
 367020 367021 NE0283 NE0284   thiG TRUE 0.882 29.000 0.060 1.000   NA
 367021 367022 NE0284 NE0285 thiG   TRUE 0.954 75.000 0.130 1.000 Y NA
 5437946 2213812 RNA_20 NE0290 tRNAGly1   FALSE 0.009 394.000 0.000 NA   NA
 2213812 2213813 NE0290 NE0291     FALSE 0.373 -123.000 0.000 NA   NA
 367027 367028 NE0292 NE0293     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 367029 367030 NE0294 NE0295     FALSE 0.254 116.000 0.000 1.000 N NA
 367030 367031 NE0295 NE0296     TRUE 0.949 -3.000 0.026 NA   NA
 367031 367032 NE0296 NE0297     TRUE 0.998 5.000 0.923 NA   NA
 367033 367034 NE0298 NE0299 pta   FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 367034 367035 NE0299 NE0300     TRUE 0.952 58.000 0.214 NA   NA
 367035 367036 NE0300 NE0301   flgA FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 367037 367038 NE0302 NE0303 flgB flgC,flaW,flaFIII TRUE 0.995 6.000 0.130 0.006 Y NA
 367038 367039 NE0303 NE0304 flgC,flaW,flaFIII flgD,flaV,FlaFIV TRUE 0.990 17.000 0.256 NA Y NA
 367039 367040 NE0304 NE0305 flgD,flaV,FlaFIV flgE TRUE 0.990 15.000 0.244 NA Y NA
 367040 367041 NE0305 NE0306 flgE flgF TRUE 0.997 40.000 0.520 0.006 Y NA
 367041 367042 NE0306 NE0307 flgF flgG TRUE 0.993 68.000 0.381 0.002 Y NA
 367042 367043 NE0307 NE0308 flgG flgH TRUE 0.996 38.000 0.463 0.010 Y NA
 367043 367044 NE0308 NE0309 flgH flgI TRUE 0.983 22.000 0.110 0.012 Y NA
 367044 367045 NE0309 NE0310 flgI flgJ TRUE 0.694 173.000 0.054 0.012 Y NA
 367045 367046 NE0310 NE0311 flgJ flgK TRUE 0.966 182.000 0.705 0.005 Y NA
 367046 367047 NE0311 NE0312 flgK flgL TRUE 0.980 29.000 0.080 0.002 Y NA
 367047 367048 NE0312 NE0313 flgL   TRUE 0.864 78.000 0.125 NA   NA
 367048 367049 NE0313 NE0314     FALSE 0.011 352.000 0.000 NA   NA
 367049 367050 NE0314 NE0315   mnxG TRUE 0.597 18.000 0.000 1.000   NA
 367051 367052 NE0316 NE0317     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 367053 367054 NE0318 NE0319     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 367054 367055 NE0319 NE0320     TRUE 0.954 21.000 0.182 NA   NA
 367055 367056 NE0320 NE0321     FALSE 0.053 203.000 0.000 1.000   NA
 367056 367057 NE0321 NE0322     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA N NA
 367057 367058 NE0322 NE0323     TRUE 0.565 89.000 0.013 NA N NA
 367059 367060 NE0324 NE0325 cbbA, fba, fda pykA1 TRUE 0.844 199.000 0.232 0.008 Y NA
 367060 367061 NE0325 NE0326 pykA1 cbbK, pgk TRUE 0.960 35.000 0.032 0.008 Y NA
 367061 367062 NE0326 NE0327 cbbK, pgk cbbG, gapA FALSE 0.216 307.000 0.015 0.008 Y NA
 367062 367063 NE0327 NE0328 cbbG, gapA cbbT, tkl TRUE 0.914 64.000 0.030 1.000 Y NA
 5437947 367064 RNA_21 NE0329 tRNASer2   FALSE 0.130 133.000 0.000 NA   NA
 367064 367065 NE0329 NE0330     TRUE 0.821 50.000 0.041 NA   NA
 367065 367066 NE0330 NE0331     TRUE 0.855 29.000 0.037 NA N NA
 367066 367067 NE0331 NE0332   gyrA FALSE 0.481 70.000 0.002 NA N NA
 367067 367068 NE0332 NE0333 gyrA serC TRUE 0.916 18.000 0.067 1.000 N NA
 367068 367069 NE0333 NE0334 serC   TRUE 0.994 -7.000 0.238 1.000 Y NA
 367069 367070 NE0334 NE0335   pheA TRUE 0.935 39.000 0.028 1.000 Y NA
 367070 367071 NE0335 NE0336 pheA hisC2 TRUE 0.970 41.000 0.098 1.000 Y NA
 367071 367072 NE0336 NE0337 hisC2 tyrA TRUE 0.984 23.000 0.198 1.000 Y NA
 367073 367074 NE0338 NE0339 sss   TRUE 0.993 -16.000 0.714 NA   NA
 367074 367075 NE0339 NE0340     FALSE 0.475 56.000 0.000 NA   NA
 367075 367076 NE0340 NE0341     FALSE 0.493 61.000 0.000 1.000   NA
 367076 367077 NE0341 NE0342     TRUE 0.823 -31.000 0.000 NA Y NA
 367077 367078 NE0342 NE0343     FALSE 0.007 657.000 0.000 NA N NA
 367078 367079 NE0343 NE0344   tctD TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 367079 367080 NE0344 NE0345 tctD   TRUE 0.929 88.000 0.250 1.000 N NA
 367080 367081 NE0345 NE0346     TRUE 0.999 2.000 1.000 1.000 N NA
 367081 367082 NE0346 NE0347   speE,ywhF FALSE 0.028 295.000 0.000 1.000 N NA
 367082 367083 NE0347 NE0348 speE,ywhF   TRUE 0.996 -3.000 0.160 1.000 Y NA
 367083 367084 NE0348 NE0349     FALSE 0.020 284.000 0.000 NA   NA
 367084 5437948 NE0349 RNA_18   tRNALeu2 FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 367085 367086 NE0350 NE0351 rnr   TRUE 0.968 24.000 0.147 0.023 N NA
 367087 367088 NE0352 NE0353 exbD1 exbB1 TRUE 0.996 0.000 0.111 0.046 Y NA
 367088 367089 NE0353 NE0354 exbB1   TRUE 0.987 1.000 0.082 0.017 N NA
 367089 367090 NE0354 NE0355   cafA FALSE 0.060 220.000 0.000 1.000 N NA
 367090 367091 NE0355 NE0356 cafA   TRUE 0.983 38.000 0.417 NA N NA
 367091 367092 NE0356 NE0357     TRUE 0.757 86.000 0.074 NA   NA
 367092 367093 NE0357 NE0358     TRUE 0.910 97.000 0.307 NA   NA
 367093 367094 NE0358 NE0359   nadD TRUE 0.992 -3.000 0.221 NA   NA
 367094 367095 NE0359 NE0360 nadD aceF TRUE 0.679 50.000 0.003 1.000 N NA
 367095 367096 NE0360 NE0361 aceF aceE TRUE 0.853 70.000 0.000 0.043 Y NA
 367096 367097 NE0361 NE0362 aceE folD TRUE 0.990 34.000 0.600 1.000 N NA
 367097 367098 NE0362 NE0363 folD   TRUE 0.894 153.000 0.600 NA   NA
 367099 367100 NE0364 NE0365 argS   TRUE 0.877 24.000 0.062 NA   NA
 367100 367101 NE0365 NE0366   dsbA TRUE 0.906 141.000 0.573 NA   NA
 367102 367103 NE0367 NE0368   spoT TRUE 0.542 19.000 0.000 NA   NA
 5437949 367104 RNA_22 NE0369 tRNALeu3   FALSE 0.011 362.000 0.000 NA   NA
 367105 367106 NE0370 NE0371 eryB   TRUE 0.991 8.000 0.158 1.000 Y NA
 367107 367108 NE0372 NE0373     TRUE 0.512 42.000 0.000 NA   NA
 367108 367109 NE0373 NE0374     TRUE 0.997 10.000 0.533 1.000 Y NA
 367109 367110 NE0374 NE0375     TRUE 0.993 0.000 0.217 1.000 N NA
 367111 367112 NE0376 NE0377     FALSE 0.052 232.000 0.000 1.000 N NA
 367112 367113 NE0377 NE0378     TRUE 0.977 38.000 0.320 NA N NA
 367113 367114 NE0378 NE0379   mucD FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 367114 5437950 NE0379 RNA_17 mucD tRNAVal3 FALSE 0.309 82.000 0.000 NA   NA
 367115 367116 NE0380 NE0381     FALSE 0.018 307.000 0.000 1.000   NA
 367117 367118 NE0382 NE0383 hsdR   TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA N NA
 367118 367119 NE0383 NE0384     TRUE 0.881 -3.000 0.000 NA N NA
 367119 367120 NE0384 NE0385   hsdM TRUE 0.990 -10.000 0.167 1.000 Y NA
 367120 367121 NE0385 NE0386 hsdM thdF FALSE 0.100 162.000 0.000 1.000   NA
 367121 367122 NE0386 NE0387 thdF   TRUE 0.969 59.000 0.221 0.051   NA
 367122 367123 NE0387 NE0388     TRUE 0.947 93.000 0.461 NA   NA
 367123 367124 NE0388 NE0389   rnpA TRUE 0.997 -3.000 0.540 NA   NA
 367124 367125 NE0389 NE0390 rnpA rpmH TRUE 0.992 40.000 0.787 1.000   NA
 367126 367127 NE0391 NE0392     TRUE 0.704 40.000 0.009 NA   NA
 367127 367128 NE0392 NE0393   proC TRUE 0.535 77.000 0.009 NA   NA
 367128 367129 NE0393 NE0394 proC   TRUE 0.811 58.000 0.039 1.000   NA
 367129 367130 NE0394 NE0395     TRUE 0.992 0.000 0.220 NA   NA
 367130 367131 NE0395 NE0396     FALSE 0.244 115.000 0.005 NA   NA
 367131 367132 NE0396 NE0397     TRUE 0.662 80.000 0.021 NA N NA
 367132 367133 NE0397 NE0398   zwf TRUE 0.994 -3.000 0.115 1.000 Y NA
 367133 5437951 NE0398 RNA_23 zwf tRNATyr1 FALSE 0.190 108.000 0.000 NA   NA
 5437951 5437952 RNA_23 RNA_24 tRNATyr1 tRNAGly2 FALSE 0.163 118.000 0.000 NA   NA
 5437952 5437953 RNA_24 RNA_25 tRNAGly2 tRNAThr1 TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 5437953 367134 RNA_25 NE0399 tRNAThr1 tuf2 FALSE 0.428 64.000 0.000 NA   NA
 367134 367135 NE0399 NE0400 tuf2 rpsJ TRUE 0.987 62.000 0.318 1.000 Y NA
 367135 367136 NE0400 NE0401 rpsJ rplC TRUE 0.993 48.000 0.307 0.028 Y NA
 367136 367137 NE0401 NE0402 rplC rplD TRUE 0.996 21.000 0.486 0.020 Y NA
 367137 367138 NE0402 NE0403 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.020 Y NA
 367138 367139 NE0403 NE0404 rplW   TRUE 1.000 -3.000 0.849 0.023 Y NA
 367139 367140 NE0404 NE0405   rpsS TRUE 0.999 6.000 0.820 0.028 Y NA
 367140 367141 NE0405 NE0406 rpsS rplV TRUE 0.999 9.000 0.769 0.028 Y NA
 367141 367142 NE0406 NE0407 rplV rpsC TRUE 0.998 37.000 0.719 0.028 Y NA
 367142 367143 NE0407 NE0408 rpsC rplP TRUE 0.994 90.000 0.828 0.028 Y NA
 367143 367144 NE0408 NE0409 rplP rpmC TRUE 0.999 8.000 0.802 0.020 Y NA
 367144 367145 NE0409 NE0410 rpmC   TRUE 1.000 -3.000 0.828 0.020 Y NA
 367145 367146 NE0410 NE0411     TRUE 0.995 82.000 0.791 0.028 Y NA
 367146 367147 NE0411 NE0412   rplX TRUE 0.998 18.000 0.810 0.028 Y NA
 367147 367148 NE0412 NE0413 rplX   TRUE 0.998 15.000 0.758 0.020 Y NA
 367148 367149 NE0413 NE0414     TRUE 0.996 11.000 0.309 0.020 Y NA
 367149 367150 NE0414 NE0415   rpsH TRUE 0.987 73.000 0.295 0.020 Y NA
 367150 367151 NE0415 NE0416 rpsH rplF TRUE 0.999 12.000 0.808 0.020 Y NA
 367151 367152 NE0416 NE0417 rplF rplR TRUE 0.998 15.000 0.815 0.020 Y NA
 367152 367153 NE0417 NE0418 rplR rpsE TRUE 0.998 17.000 0.814 0.028 Y NA
 367153 367154 NE0418 NE0419 rpsE rpmD TRUE 0.999 6.000 0.789 0.028 Y NA
 367154 367155 NE0419 NE0420 rpmD   TRUE 0.999 2.000 0.653 0.004 Y NA
 367155 367156 NE0420 NE0421   secY TRUE 0.996 -10.000 0.730 1.000 N NA
 367156 367157 NE0421 NE0422 secY infA TRUE 0.962 8.000 0.083 1.000 N NA
 367157 367158 NE0422 NE0423 infA rpsM TRUE 0.685 189.000 0.075 0.023 Y NA
 367158 367159 NE0423 NE0424 rpsM rpsK TRUE 0.998 41.000 0.810 0.020 Y NA
 367159 367160 NE0424 NE0425 rpsK rpsD TRUE 0.997 15.000 0.509 0.028 Y NA
 367160 367161 NE0425 NE0426 rpsD rpoA TRUE 0.989 30.000 0.549 1.000 N NA
 367161 367162 NE0426 NE0427 rpoA   TRUE 0.996 -13.000 0.873 1.000 N NA
 367162 5437954 NE0427 RNA_26   tRNAThr2 FALSE 0.053 194.000 0.000 NA   NA
 367163 367164 NE0428 NE0429     TRUE 0.925 -16.000 0.086 NA   NA
 367165 367166 NE0430 NE0431 smpB   TRUE 0.972 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 367166 367167 NE0431 NE0432     FALSE 0.394 97.000 0.009 NA   NA
 367167 5437955 NE0432 RNA_48   ffs FALSE 0.185 109.000 0.000 NA   NA
 5437955 367168 RNA_48 NE0433 ffs dnaX FALSE 0.062 181.000 0.000 NA   NA
 367168 367169 NE0433 NE0434 dnaX   TRUE 0.984 17.000 0.411 NA   NA
 367169 367170 NE0434 NE0435     TRUE 0.502 56.000 0.002 NA   NA
 367172 367173 NE0437 NE0438     FALSE 0.013 415.000 0.000 1.000 N NA
 367174 367175 NE0439 NE0440 serB   FALSE 0.459 87.000 0.003 1.000 N NA
 367176 367177 NE0441 NE0442   holC TRUE 0.981 65.000 0.494 1.000 N NA
 367177 367178 NE0442 NE0443 holC   TRUE 0.501 73.000 0.006 NA   NA
 367178 367179 NE0443 NE0444   valS FALSE 0.129 137.000 0.002 NA   NA
 367179 367180 NE0444 NE0445 valS   FALSE 0.497 74.000 0.002 1.000 N NA
 367181 367182 NE0446 NE0447     FALSE 0.108 146.000 0.000 NA   NA
 367182 367183 NE0447 NE0448   Rh50 FALSE 0.137 161.000 0.000 1.000 N NA
 367183 367184 NE0448 NE0449 Rh50 murI FALSE 0.007 672.000 0.000 1.000 N NA
 367184 367185 NE0449 NE0450 murI int FALSE 0.244 119.000 0.000 1.000 N NA
 367185 367186 NE0450 NE0451 int   FALSE 0.045 611.000 0.000 0.032 Y NA
 367186 367187 NE0451 NE0452     TRUE 0.989 54.000 0.667 1.000   NA
 2213814 367188 NE0453 NE0454     FALSE 0.407 -64.000 0.000 NA   NA
 367191 367192 NE0457 NE0458   Plec1 FALSE 0.407 141.000 0.047 NA   NA
 367192 367193 NE0458 NE0459 Plec1 fliR TRUE 0.585 162.000 0.154 NA   NA
 367193 367194 NE0459 NE0460 fliR fliQ,flaQ TRUE 0.958 93.000 0.139 0.004 Y NA
 367194 367195 NE0460 NE0461 fliQ,flaQ fliP TRUE 0.998 16.000 0.827 0.012 Y NA
 367195 367196 NE0461 NE0462 fliP   TRUE 0.992 -10.000 0.203 1.000 Y NA
 367196 367197 NE0462 NE0463   fliN TRUE 0.994 27.000 0.443 1.000 Y NA
 367197 367198 NE0463 NE0464 fliN fliM TRUE 0.999 15.000 0.741 0.002 Y NA
 367198 367199 NE0464 NE0465 fliM fliL TRUE 0.986 13.000 0.076 0.002 Y NA
 367199 367200 NE0465 NE0466 fliL   FALSE 0.039 258.000 0.000 1.000 N NA
 367201 367202 NE0467 NE0468   rfaH FALSE 0.073 182.000 0.000 1.000   NA
 367202 367203 NE0468 NE0469 rfaH rmlB FALSE 0.020 334.000 0.000 1.000 N NA
 367203 2213815 NE0469 NE0470 rmlB   FALSE 0.018 289.000 0.000 NA   NA
 2213815 367204 NE0470 NE0471     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367204 367205 NE0471 NE0472     FALSE 0.135 130.000 0.000 NA   NA
 367205 367206 NE0472 NE0473     FALSE 0.078 166.000 0.000 NA   NA
 367206 367207 NE0473 NE0474     FALSE 0.059 185.000 0.000 NA   NA
 367207 367208 NE0474 NE0475     FALSE 0.106 147.000 0.000 NA   NA
 367208 367209 NE0475 NE0476     TRUE 0.979 -22.000 0.400 NA   NA
 367211 367212 NE0478 NE0479     TRUE 0.998 0.000 0.727 NA   NA
 367212 367213 NE0479 NE0480     FALSE 0.088 159.000 0.000 NA   NA
 367214 367215 NE0481 NE0482     TRUE 0.980 10.000 0.227 NA   NA
 367216 367217 NE0483 NE0484 wzt   TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 367217 367218 NE0484 NE0485     TRUE 0.512 42.000 0.000 NA   NA
 367218 367219 NE0485 NE0486   rffE,wecB,nfrC TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367219 367220 NE0486 NE0487 rffE,wecB,nfrC   TRUE 0.999 0.000 0.500 NA Y NA
 367221 367222 NE0488 NE0489   abiR TRUE 0.539 -19.000 0.000 NA   NA
 367222 367223 NE0489 NE0490 abiR   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 367223 367224 NE0490 NE0491     TRUE 0.962 13.000 0.157 NA   NA
 367224 367225 NE0491 NE0492     FALSE 0.019 288.000 0.000 NA   NA
 367225 367226 NE0492 NE0493     TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 367226 367227 NE0493 NE0494     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367227 367228 NE0494 NE0495     FALSE 0.025 254.000 0.000 NA   NA
 367229 367230 NE0496 NE0497     FALSE 0.010 364.000 0.000 NA   NA
 367230 367231 NE0497 NE0498   ntrR2 TRUE 0.966 -3.000 0.053 NA   NA
 367231 367232 NE0498 NE0499 ntrR2   TRUE 0.510 36.000 0.000 NA   NA
 367232 367233 NE0499 NE0500     TRUE 0.922 15.000 0.080 NA   NA
 367233 367234 NE0500 NE0501     TRUE 0.993 11.000 0.297 NA Y NA
 367234 367235 NE0501 NE0502   wbpM TRUE 0.978 9.000 0.069 NA Y NA
 367236 367237 NE0503 NE0504   glnA1 FALSE 0.353 156.000 0.048 NA   NA
 367237 367238 NE0504 NE0505 glnA1 rluD FALSE 0.067 211.000 0.000 1.000 N NA
 367239 5437956 NE0506 RNA_27   tRNAArg4 FALSE 0.337 77.000 0.000 NA   NA
 5437956 367240 RNA_27 NE0507 tRNAArg4 rdgC FALSE 0.105 148.000 0.000 NA   NA
 367241 367242 NE0508 NE0509   SCO1,SCOD1 TRUE 0.997 -3.000 0.556 NA   NA
 367242 367243 NE0509 NE0510 SCO1,SCOD1   TRUE 0.928 108.000 0.444 1.000   NA
 367247 367248 NE0514 NE0515   baeS TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 367251 367252 NE0518 NE0519     TRUE 0.934 -195.000 0.091 NA Y NA
 367255 367256 NE0522 NE0523     TRUE 0.864 -12.000 0.025 NA   NA
 367256 367257 NE0523 NE0524     FALSE 0.005 630.000 0.000 NA   NA
 367257 367258 NE0524 NE0525     TRUE 0.985 -3.000 0.074 0.042   NA
 367258 367259 NE0525 NE0526     FALSE 0.095 188.000 0.004 1.000   NA
 367260 367261 NE0527 NE0528   hflB TRUE 0.831 85.000 0.095 NA N NA
 367261 367262 NE0528 NE0529 hflB folP TRUE 0.967 69.000 0.325 1.000 N NA
 367262 367263 NE0529 NE0530 folP mrsA TRUE 0.700 181.000 0.260 1.000 N NA
 367263 367264 NE0530 NE0531 mrsA   FALSE 0.281 124.000 0.004 1.000 N NA
 367264 367265 NE0531 NE0532   cysG TRUE 0.766 90.000 0.067 1.000 N NA
 367265 367266 NE0532 NE0533 cysG   FALSE 0.229 124.000 0.000 1.000 N NA
 367266 367267 NE0533 NE0534     TRUE 0.992 -12.000 0.500 NA N NA
 367267 367268 NE0534 NE0535     FALSE 0.086 298.000 0.000 NA Y NA
 367268 367269 NE0535 NE0536     FALSE 0.253 93.000 0.000 NA   NA
 367269 367270 NE0536 NE0537     FALSE 0.006 483.000 0.000 NA   NA
 367270 367271 NE0537 NE0538     TRUE 0.574 16.000 0.000 NA   NA
 367271 367272 NE0538 NE0539   yegM FALSE 0.204 244.000 0.000 0.092 Y NA
 367272 367273 NE0539 NE0540 yegM   TRUE 0.990 -3.000 0.167 NA N NA
 367273 367274 NE0540 NE0541     FALSE 0.106 170.000 0.000 NA N NA
 367274 367275 NE0541 NE0542     FALSE 0.486 69.000 0.000 NA N NA
 367276 367277 NE0543 NE0544     TRUE 0.531 21.000 0.000 NA   NA
 367277 367278 NE0544 NE0545     FALSE 0.040 212.000 0.000 NA   NA
 367279 367280 NE0546 NE0547     FALSE 0.143 158.000 0.000 1.000 N NA
 367280 367281 NE0547 NE0548     TRUE 0.503 67.000 0.000 NA N NA
 367281 367282 NE0548 NE0549     FALSE 0.421 143.000 0.000 NA Y NA
 367282 367283 NE0549 NE0550     TRUE 0.822 3.000 0.000 1.000   NA
 367283 367284 NE0550 NE0551     FALSE 0.011 394.000 0.000 1.000   NA
 367284 367285 NE0551 NE0552     TRUE 0.989 -3.000 0.182 NA   NA
 367287 367288 NE0554 NE0555     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA N NA
 367288 367289 NE0555 NE0556     FALSE 0.180 217.000 0.000 NA Y NA
 367289 367290 NE0556 NE0557     FALSE 0.209 130.000 0.000 1.000 N NA
 367290 367291 NE0557 NE0558     FALSE 0.289 100.000 0.000 NA N NA
 367291 367292 NE0558 NE0559     FALSE 0.394 149.000 0.000 NA Y NA
 367292 367293 NE0559 NE0560     FALSE 0.019 321.000 0.000 NA N NA
 367293 367294 NE0560 NE0561     TRUE 0.934 -195.000 0.091 NA Y NA
 367294 367295 NE0561 NE0562     FALSE 0.374 78.000 0.000 1.000   NA
 367295 2213816 NE0562 NE0563     TRUE 0.679 9.000 0.000 NA   NA
 367296 367297 NE0564 NE0565     TRUE 0.755 42.000 0.000 0.008   NA
 367299 367300 NE0567 NE0568 dfrA,tmp thyB TRUE 0.989 -3.000 0.134 1.000 N NA
 367301 367302 NE0569 NE0570     TRUE 0.926 51.000 0.125 NA   NA
 367303 367304 NE0571 NE0572   cbl FALSE 0.014 310.000 0.000 NA   NA
 367304 367305 NE0572 NE0573 cbl   FALSE 0.351 95.000 0.000 1.000 N NA
 367305 367306 NE0573 NE0574     TRUE 0.956 -13.000 0.132 NA   NA
 367306 367307 NE0574 NE0575     TRUE 0.754 109.000 0.133 NA   NA
 367307 367308 NE0575 NE0576   cysA TRUE 0.896 0.000 0.000 1.000 N NA
 367308 367309 NE0576 NE0577 cysA cysW TRUE 0.999 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 367309 367310 NE0577 NE0578 cysW cysU TRUE 0.998 10.000 0.935 0.001 N NA
 367310 367311 NE0578 NE0579 cysU   TRUE 0.761 66.000 0.020 1.000 N NA
 367311 367312 NE0579 NE0580     TRUE 0.666 91.000 0.000 NA Y NA
 367312 367313 NE0580 NE0581     FALSE 0.097 154.000 0.000 NA   NA
 367313 367314 NE0581 NE0582   sbp1 FALSE 0.459 59.000 0.000 NA   NA
 367314 367315 NE0582 NE0583 sbp1   TRUE 0.976 29.000 0.333 NA   NA
 367318 367319 NE0586 NE0587     TRUE 0.998 3.000 0.904 1.000   NA
 367320 367321 NE0588 NE0589   ppc FALSE 0.041 254.000 0.000 1.000 N NA
 367322 367323 NE0590 NE0591 hemC hemD TRUE 0.991 31.000 0.205 0.003 Y NA
 367323 367324 NE0591 NE0592 hemD   TRUE 0.996 24.000 0.600 1.000 Y NA
 367324 367325 NE0592 NE0593   hemY TRUE 0.997 23.000 0.765 1.000 Y NA
 367327 367328 NE0595 NE0596   pilC TRUE 0.684 54.000 0.004 1.000 N NA
 367328 367329 NE0596 NE0597 pilC pilD TRUE 0.993 48.000 0.454 1.000 Y NA
 367329 367330 NE0597 NE0598 pilD   TRUE 0.984 3.000 0.122 1.000 N NA
 367330 367331 NE0598 NE0599     TRUE 0.921 41.000 0.110 NA   NA
 367333 367334 NE0601 NE0602     TRUE 0.765 5.000 0.000 NA   NA
 367334 367335 NE0602 NE0603     TRUE 0.765 5.000 0.000 NA   NA
 367335 367336 NE0603 NE0604     FALSE 0.067 176.000 0.000 NA   NA
 367336 367337 NE0604 NE0605     FALSE 0.042 207.000 0.000 NA   NA
 367337 367338 NE0605 NE0606   cah TRUE 0.993 32.000 1.000 NA   NA
 367338 367339 NE0606 NE0607 cah gcvT FALSE 0.010 521.000 0.000 1.000 N NA
 367339 367340 NE0607 NE0608 gcvT gcvH1 TRUE 0.990 73.000 0.317 0.002 Y NA
 367340 367341 NE0608 NE0609 gcvH1   TRUE 0.980 69.000 0.249 1.000 Y NA
 367341 367342 NE0609 NE0610     TRUE 0.991 70.000 0.316 0.001 Y NA
 367342 367343 NE0610 NE0611     TRUE 0.917 2.000 0.006 1.000 N NA
 367343 367344 NE0611 NE0612   plsC FALSE 0.283 140.000 0.007 1.000 N NA
 367345 367346 NE0613 NE0614     TRUE 0.757 7.000 0.000 1.000   NA
 367346 367347 NE0614 NE0615   omlA TRUE 0.973 -3.000 0.049 1.000 N NA
 367348 367349 NE0616 NE0617 fur1 oprC FALSE 0.041 456.000 0.000 1.000 Y NA
 367352 367353 NE0620 NE0621     TRUE 0.859 0.000 0.000 1.000   NA
 367355 367356 NE0623 NE0624   mrp TRUE 0.966 10.000 0.112 1.000 N NA
 367357 367358 NE0625 NE0626 metG1 pepN FALSE 0.234 122.000 0.000 1.000 N NA
 367358 367359 NE0626 NE0627 pepN   FALSE 0.008 644.000 0.000 1.000 N NA
 367359 2213817 NE0627 NE0628     FALSE 0.045 203.000 0.000 NA   NA
 2213817 2213818 NE0628 NE0629     TRUE 0.539 -19.000 0.000 NA   NA
 2213818 2213819 NE0629 NE0630     TRUE 0.619 13.000 0.000 NA   NA
 2213819 367360 NE0630 NE0631     FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 367360 367361 NE0631 NE0632     TRUE 0.996 -7.000 0.778 NA   NA
 367362 367363 NE0633 NE0634   cobO FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 367363 367364 NE0634 NE0635 cobO   TRUE 0.851 -13.000 0.024 NA   NA
 367364 367365 NE0635 NE0636     TRUE 0.948 10.000 0.091 NA   NA
 367365 367366 NE0636 NE0637   tatC FALSE 0.009 481.000 0.000 NA N NA
 367366 367367 NE0637 NE0638 tatC   TRUE 0.964 97.000 0.314 NA Y NA
 367367 367368 NE0638 NE0639     TRUE 0.967 85.000 0.157 0.009 Y NA
 367368 367369 NE0639 NE0640   hitA TRUE 0.927 19.000 0.080 1.000 N NA
 367369 367370 NE0640 NE0641 hitA hisE TRUE 0.978 2.000 0.079 1.000 N NA
 367370 367371 NE0641 NE0642 hisE hisI TRUE 0.997 -3.000 0.152 0.007 Y NA
 367371 367372 NE0642 NE0643 hisI hisF TRUE 0.956 157.000 0.430 0.007 Y NA
 367372 367373 NE0643 NE0644 hisF hisA TRUE 0.984 100.000 0.433 0.007 Y NA
 367373 367374 NE0644 NE0645 hisA hisH TRUE 0.974 69.000 0.120 0.007 Y NA
 367374 367375 NE0645 NE0646 hisH hisB TRUE 0.983 31.000 0.111 0.007 Y NA
 367375 367376 NE0646 NE0647 hisB hisC1 TRUE 0.994 36.000 0.341 0.007 Y NA
 367376 367377 NE0647 NE0648 hisC1   TRUE 0.600 40.000 0.004 NA   NA
 367380 367381 NE0651 NE0652 aroQ1 accB1 TRUE 0.625 201.000 0.254 1.000 N NA
 367381 367382 NE0652 NE0653 accB1 accC1 TRUE 0.989 70.000 0.275 0.002 Y NA
 367382 367383 NE0653 NE0654 accC1 prmA TRUE 0.952 36.000 0.152 1.000 N NA
 367383 367384 NE0654 NE0655 prmA   TRUE 0.969 -3.000 0.058 NA   NA
 367385 367386 NE0656 NE0657 amiB   TRUE 0.971 -3.000 0.063 NA   NA
 367386 367387 NE0657 NE0658     TRUE 0.560 44.000 0.003 NA   NA
 367388 367389 NE0659 NE0660 metK ahcY TRUE 0.902 132.000 0.114 0.002 Y NA
 367389 367390 NE0660 NE0661 ahcY metF FALSE 0.398 171.000 0.061 1.000 N NA
 367390 367391 NE0661 NE0662 metF   FALSE 0.004 1678.000 0.000 1.000   NA
 367391 2213820 NE0662 NE0663   sbcB TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 2213820 2213821 NE0663 NE0664 sbcB   TRUE 0.500 -22.000 0.000 NA   NA
 367392 367393 NE0665 NE0666     FALSE 0.032 232.000 0.000 NA   NA
 367393 367394 NE0666 NE0667     TRUE 0.997 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 367394 367395 NE0667 NE0668     TRUE 0.967 13.000 0.143 1.000 N NA
 367395 367396 NE0668 NE0669     TRUE 0.996 -3.000 0.333 NA N NA
 367396 367397 NE0669 NE0670     TRUE 0.725 11.000 0.000 NA N NA
 367398 367399 NE0671 NE0672 sbcB   TRUE 0.859 0.000 0.000 1.000   NA
 367400 367401 NE0673 NE0674 glcf,gox glcE TRUE 0.990 4.000 0.057 0.026 Y NA
 367401 367402 NE0674 NE0675 glcE glcD TRUE 0.983 10.000 0.044 0.002 Y NA
 367402 367403 NE0675 NE0676 glcD   TRUE 0.884 -10.000 0.013 1.000 N NA
 367404 367405 NE0677 NE0678 rmlA rmlC TRUE 0.995 0.000 0.125 1.000 Y NA
 367405 367406 NE0678 NE0679 rmlC   TRUE 0.791 70.000 0.000 1.000 Y NA
 367406 367407 NE0679 NE0680   yrhG FALSE 0.421 84.000 0.000 1.000 N NA
 367408 367409 NE0681 NE0682     TRUE 0.993 -16.000 0.667 1.000   NA
 367409 367410 NE0682 NE0683   coxA2 TRUE 0.969 94.000 0.524 0.049   NA
 367410 367411 NE0683 NE0684 coxA2 coxB TRUE 0.998 45.000 0.750 0.003 Y NA
 367412 367413 NE0685 NE0686 leuC   TRUE 0.874 34.000 0.058 1.000   NA
 367413 367414 NE0686 NE0687   leuD TRUE 0.970 6.000 0.096 1.000   NA
 367414 367415 NE0687 NE0688 leuD leuB TRUE 0.998 -3.000 0.159 0.002 Y NA
 367415 367416 NE0688 NE0689 leuB asd TRUE 0.902 149.000 0.196 0.044 Y NA
 367416 367417 NE0689 NE0690 asd   FALSE 0.123 202.000 0.010 NA N NA
 367417 367418 NE0690 NE0691     FALSE 0.288 126.000 0.006 NA N NA
 367418 367419 NE0691 NE0692   trpF TRUE 0.939 57.000 0.139 1.000 N NA
 367419 367420 NE0692 NE0693 trpF trpB TRUE 0.996 -16.000 0.375 0.002 Y NA
 367420 367421 NE0693 NE0694 trpB trpA TRUE 0.995 53.000 0.344 0.001 Y NA
 367421 367422 NE0694 NE0695 trpA accD TRUE 0.991 4.000 0.232 1.000 N NA
 367422 367423 NE0695 NE0696 accD folC TRUE 0.860 150.000 0.383 1.000 N NA
 367423 367424 NE0696 NE0697 folC   TRUE 0.922 21.000 0.100 NA   NA
 367424 367425 NE0697 NE0698   cvpA TRUE 0.972 -3.000 0.066 NA   NA
 367425 367426 NE0698 NE0699 cvpA purF TRUE 0.887 105.000 0.262 1.000   NA
 367426 367427 NE0699 NE0700 purF metZ TRUE 0.961 17.000 0.153 1.000 N NA
 367427 367428 NE0700 NE0701 metZ ilvA TRUE 0.742 112.000 0.006 0.015 Y NA
 367429 367430 NE0702 NE0703     TRUE 0.998 0.000 0.679 NA   NA
 367430 367431 NE0703 NE0704     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 367431 367432 NE0704 NE0705     FALSE 0.421 65.000 0.000 NA   NA
 367432 367433 NE0705 NE0706     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367433 367434 NE0706 NE0707     TRUE 0.645 11.000 0.000 NA   NA
 367434 367435 NE0707 NE0708     TRUE 0.505 59.000 0.000 1.000   NA
 367435 367436 NE0708 NE0709     TRUE 0.992 54.000 0.667 0.100   NA
 367436 367437 NE0709 NE0710     FALSE 0.224 99.000 0.000 NA   NA
 367437 367438 NE0710 NE0711     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 367439 367440 NE0712 NE0713     TRUE 0.995 -3.000 0.366 NA   NA
 367440 367441 NE0713 NE0714     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 367441 367442 NE0714 NE0715     FALSE 0.301 84.000 0.000 NA   NA
 367442 367443 NE0715 NE0716     TRUE 0.966 0.000 0.000 NA Y NA
 367444 367445 NE0717 NE0718     FALSE 0.253 93.000 0.000 NA   NA
 367445 367446 NE0718 NE0719     FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 367446 367447 NE0719 NE0720     FALSE 0.317 107.000 0.003 1.000 N NA
 367451 367452 NE0724 NE0725     FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 367453 367454 NE0726 NE0727   pyrC FALSE 0.265 97.000 0.000 1.000   NA
 367455 367456 NE0728 NE0729     TRUE 0.999 0.000 0.833 1.000 Y NA
 367457 367458 NE0730 NE0731     FALSE 0.165 233.000 0.000 1.000 Y NA
 367459 367460 NE0732 NE0733 ybbB selD TRUE 0.984 -7.000 0.214 1.000   NA
 367461 367462 NE0734 NE0735 abcZ   FALSE 0.208 147.000 0.007 1.000   NA
 367462 367463 NE0735 NE0736     TRUE 0.998 34.000 0.688 0.016 Y NA
 367465 367466 NE0738 NE0739     TRUE 0.538 80.000 0.000 0.049   NA
 367466 367467 NE0739 NE0740     TRUE 0.574 16.000 0.000 NA   NA
 367467 367468 NE0740 NE0741     TRUE 0.990 13.000 0.500 NA   NA
 367468 367469 NE0741 NE0742     TRUE 0.856 52.000 0.000 1.000 Y NA
 2213822 367470 NE0743 NE0744     FALSE 0.034 226.000 0.000 NA   NA
 367470 367471 NE0744 NE0745     FALSE 0.066 189.000 0.000 1.000   NA
 2213823 2213824 NE0747 NE0748     TRUE 0.500 -22.000 0.000 NA   NA
 2213824 367473 NE0748 NE0749     FALSE 0.484 54.000 0.000 NA   NA
 2213825 367474 NE0750 NE0751   tnpR FALSE 0.008 417.000 0.000 NA   NA
 367476 367477 NE0754 NE0755     FALSE 0.100 152.000 0.000 NA   NA
 367477 367478 NE0755 NE0756     TRUE 0.996 -7.000 0.778 NA   NA
 367478 367479 NE0756 NE0757     TRUE 0.968 37.000 0.263 NA   NA
 367479 367480 NE0757 NE0758     TRUE 0.866 80.000 0.105 1.000 N NA
 367481 367482 NE0759 NE0760   nusA TRUE 0.990 53.000 0.759 NA   NA
 367482 367483 NE0760 NE0761 nusA   TRUE 0.940 95.000 0.342 1.000 N NA
 367483 367484 NE0761 NE0762   rbfA TRUE 0.994 51.000 0.530 1.000 Y NA
 367484 367485 NE0762 NE0763 rbfA   TRUE 0.963 101.000 0.318 1.000 Y NA
 367485 367486 NE0763 NE0764   ccmA TRUE 0.585 68.000 0.003 1.000 N NA
 367486 367487 NE0764 NE0765 ccmA ccmB TRUE 0.982 7.000 0.018 0.003 Y NA
 367487 367488 NE0765 NE0766 ccmB ccmC TRUE 0.827 105.000 0.010 0.001 Y NA
 367488 367489 NE0766 NE0767 ccmC ccmE TRUE 0.733 176.000 0.067 0.003 Y NA
 367489 367490 NE0767 NE0768 ccmE ccmF TRUE 0.949 42.000 0.010 0.003 Y NA
 367490 367491 NE0768 NE0769 ccmF ccmG TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 367491 367492 NE0769 NE0770 ccmG ccmH TRUE 0.998 8.000 0.571 NA Y NA
 367492 367493 NE0770 NE0771 ccmH cycH TRUE 0.999 -3.000 0.444 NA Y NA
 367493 367494 NE0771 NE0772 cycH bcp TRUE 0.875 31.000 0.002 1.000 Y NA
 367498 367499 NE0776 NE0777   TGL2 TRUE 0.556 35.000 0.000 1.000   NA
 367499 367500 NE0777 NE0778 TGL2 argA FALSE 0.278 95.000 0.000 1.000   NA
 367500 367501 NE0778 NE0779 argA   TRUE 0.791 24.000 0.022 NA   NA
 367502 367503 NE0780 NE0781     TRUE 0.881 -15.000 0.026 1.000 N NA
 367505 367506 NE0783 NE0784     TRUE 0.920 52.000 0.118 NA   NA
 367510 367511 NE0788 NE0789     TRUE 0.913 124.000 0.500 NA   NA
 367511 367512 NE0789 NE0790     TRUE 0.880 50.000 0.071 NA   NA
 367512 367513 NE0790 NE0791     TRUE 0.985 22.000 0.500 NA   NA
 367515 367516 NE0793 NE0794 ribD   FALSE 0.395 92.000 0.002 1.000 N NA
 367516 367517 NE0794 NE0795     TRUE 0.916 153.000 0.216 0.017 Y NA
 367517 367518 NE0795 NE0796     TRUE 0.989 3.000 0.189 1.000 N NA
 367520 367521 NE0798 NE0799     FALSE 0.277 88.000 0.000 NA   NA
 367521 367522 NE0799 NE0800     TRUE 0.825 50.000 0.042 NA   NA
 367522 367523 NE0800 NE0801     TRUE 0.699 19.000 0.007 NA   NA
 367523 367524 NE0801 NE0802     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.048   NA
 367524 367525 NE0802 NE0803     TRUE 0.913 2.000 0.009 1.000   NA
 367525 367526 NE0803 NE0804     TRUE 0.994 8.000 0.250 1.000 Y NA
 367526 367527 NE0804 NE0805     TRUE 0.993 15.000 0.694 NA   NA
 367527 367528 NE0805 NE0806     TRUE 0.807 53.000 0.035 NA   NA
 367530 367531 NE0808 NE0809 secA   FALSE 0.222 177.000 0.006 0.088 N NA
 367531 367532 NE0809 NE0810     TRUE 0.991 2.000 0.029 0.001 Y NA
 367532 367533 NE0810 NE0811   petC TRUE 1.000 -3.000 0.630 0.001 Y NA
 367533 367534 NE0811 NE0812 petC sspA TRUE 0.987 49.000 0.370 0.020 N NA
 367534 367535 NE0812 NE0813 sspA sspB TRUE 0.998 -3.000 0.831 NA   NA
 367535 5437958 NE0813 RNA_28 sspB tRNAThr3 TRUE 0.552 18.000 0.000 NA   NA
 367538 367539 NE0816 NE0817     FALSE 0.050 383.000 0.000 NA Y NA
 367539 367540 NE0817 NE0818     TRUE 0.967 96.000 0.625 NA N NA
 367540 367541 NE0818 NE0819     FALSE 0.026 249.000 0.000 NA   NA
 367541 367542 NE0819 NE0820     FALSE 0.034 226.000 0.000 NA   NA
 367542 367543 NE0820 NE0821     FALSE 0.207 103.000 0.000 NA   NA
 367543 367544 NE0821 NE0822     TRUE 0.909 -16.000 0.070 NA   NA
 367545 367546 NE0823 NE0824     FALSE 0.058 186.000 0.000 NA   NA
 367547 367548 NE0825 NE0826     TRUE 0.999 9.000 0.812 0.088 Y NA
 367548 367549 NE0826 NE0827     TRUE 0.999 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 367549 367550 NE0827 NE0828     TRUE 0.998 -3.000 0.636 1.000 N NA
 367550 367551 NE0828 NE0829     TRUE 0.696 21.000 0.007 NA   NA
 367552 367553 NE0830 NE0831     TRUE 0.748 63.000 0.023 1.000   NA
 367553 367554 NE0831 NE0832     TRUE 0.825 28.000 0.023 NA N NA
 367554 367555 NE0832 NE0833   hrpA TRUE 0.856 7.000 0.006 NA N NA
 367555 367556 NE0833 NE0834 hrpA   FALSE 0.217 165.000 0.000 0.004   NA
 367557 367558 NE0835 NE0836 tnpA tnpR TRUE 0.998 3.000 0.400 0.097 Y NA
 367558 367559 NE0836 NE0837 tnpR   TRUE 0.787 130.000 0.200 NA N NA
 367559 367560 NE0837 NE0838   merD FALSE 0.047 230.000 0.000 NA N NA
 367560 367561 NE0838 NE0839 merD merA TRUE 0.676 18.000 0.000 1.000 N NA
 367561 367562 NE0839 NE0840 merA merC TRUE 0.512 39.000 0.000 NA   NA
 367562 367563 NE0840 NE0841 merC merP TRUE 0.520 29.000 0.000 NA   NA
 367563 367564 NE0841 NE0842 merP merT TRUE 0.984 14.000 0.200 0.001   NA
 367565 367566 NE0843 NE0844 merR   FALSE 0.476 -25.000 0.000 NA   NA
 367566 367567 NE0844 NE0845     TRUE 0.998 3.000 0.882 NA   NA
 11459153 367567   NE0845     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11601516 367567   NE0845     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11743908 367567   NE0845     FALSE NA 181.000 0.000 NA   NA
 11459154 367567   NE0845     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11601517 367567   NE0845     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11743909 367567   NE0845     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11459155 367567   NE0845     FALSE NA 253.000 0.000 NA   NA
 11601518 367567   NE0845     FALSE NA 253.000 0.000 NA   NA
 11743910 367567   NE0845     FALSE NA 253.000 0.000 NA   NA
 11459156 367567   NE0845     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11601519 367567   NE0845     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11743911 367567   NE0845     FALSE NA 290.000 0.000 NA   NA
 11459157 367567   NE0845     FALSE NA 325.000 0.000 NA   NA
 11601520 367567   NE0845     FALSE NA 325.000 0.000 NA   NA
 11743912 367567   NE0845     FALSE NA 325.000 0.000 NA   NA
 11459158 367567   NE0845     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11601521 367567   NE0845     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11743913 367567   NE0845     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11459159 367567   NE0845     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11601522 367567   NE0845     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11743914 367567   NE0845     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11459160 367567   NE0845     FALSE NA 435.000 0.000 NA   NA
 11601523 367567   NE0845     FALSE NA 435.000 0.000 NA   NA
 11743915 367567   NE0845     FALSE NA 435.000 0.000 NA   NA
 11459161 367567   NE0845     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11601524 367567   NE0845     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11743916 367567   NE0845     FALSE NA 470.000 0.000 NA   NA
 11459162 367567   NE0845     FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11601525 367567   NE0845     FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11743917 367567   NE0845     FALSE NA 507.000 0.000 NA   NA
 11459163 367567   NE0845     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11601526 367567   NE0845     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11743918 367567   NE0845     FALSE NA 541.000 0.000 NA   NA
 11459164 367567   NE0845     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11601527 367567   NE0845     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11743919 367567   NE0845     FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11459165 367567   NE0845     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11601528 367567   NE0845     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11743920 367567   NE0845     FALSE NA 613.000 0.000 NA   NA
 11459166 367567   NE0845     FALSE NA 650.000 0.000 NA   NA
 11601529 367567   NE0845     FALSE NA 650.000 0.000 NA   NA
 11743921 367567   NE0845     FALSE NA 650.000 0.000 NA   NA
 11459167 367567   NE0845     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11601530 367567   NE0845     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11743922 367567   NE0845     FALSE NA 686.000 0.000 NA   NA
 11459168 367567   NE0845     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11601531 367567   NE0845     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11743923 367567   NE0845     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11459169 367567   NE0845     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11601532 367567   NE0845     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11743924 367567   NE0845     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 367568 367569 NE0846 NE0847     FALSE 0.139 128.000 0.000 NA   NA
 367569 367570 NE0847 NE0848     FALSE 0.214 120.000 0.000 NA N NA
 367570 367571 NE0848 NE0849     TRUE 0.730 56.000 0.015 NA   NA
 367571 367572 NE0849 NE0850     TRUE 0.807 16.000 0.018 NA   NA
 367574 367575 NE0852 NE0853 yvgQ yvgR TRUE 0.979 9.000 0.015 0.001 Y NA
 367575 367576 NE0853 NE0854 yvgR cysB FALSE 0.009 528.000 0.000 1.000 N NA
 367577 367578 NE0855 NE0856 cysH cysD TRUE 0.902 25.000 0.006 1.000 Y NA
 367578 367579 NE0856 NE0857 cysD cysN TRUE 0.979 56.000 0.211 0.001 N NA
 367579 367580 NE0857 NE0858 cysN   TRUE 0.669 88.000 0.029 1.000 N NA
 367580 367581 NE0858 NE0859   pntAa FALSE 0.475 121.000 0.007 0.025 N NA
 367581 367582 NE0859 NE0860 pntAa pntAb2 TRUE 0.995 56.000 0.829 0.001   NA
 367582 367583 NE0860 NE0861 pntAb2 pntB TRUE 0.967 1.000 0.011 0.001   NA
 367584 367585 NE0862 NE0863   bfr FALSE 0.075 180.000 0.000 1.000   NA
 367586 367587 NE0864 NE0865     TRUE 0.891 54.000 0.083 NA   NA
 367588 367589 NE0866 NE0867 purC purK TRUE 0.897 30.000 0.006 1.000 Y NA
 367589 367590 NE0867 NE0868 purK purE TRUE 0.996 -9.000 0.201 0.001 Y NA
 367591 367592 NE0869 NE0870 exbD2 sodB TRUE 0.541 77.000 0.004 1.000 N NA
 367592 367593 NE0870 NE0871 sodB hisG TRUE 0.775 10.000 0.002 1.000 N NA
 367593 367594 NE0871 NE0872 hisG hisD TRUE 0.993 21.000 0.254 0.006 Y NA
 367594 367595 NE0872 NE0873 hisD ubiH FALSE 0.330 114.000 0.004 1.000 N NA
 367595 367596 NE0873 NE0874 ubiH   FALSE 0.440 157.000 0.019 0.010 N NA
 367596 367597 NE0874 NE0875   fis TRUE 0.990 -3.000 0.161 1.000 N NA
 367597 367598 NE0875 NE0876 fis purH TRUE 0.966 9.000 0.101 1.000 N NA
 367598 367599 NE0876 NE0877 purH purD TRUE 0.997 2.000 0.238 1.000 Y NA
 367603 367604 NE0881 NE0882   surA TRUE 0.991 0.000 0.168 1.000 N NA
 367604 367605 NE0882 NE0883 surA pdxA TRUE 0.988 53.000 0.561 1.000 N NA
 367605 367606 NE0883 NE0884 pdxA ksgA TRUE 0.945 67.000 0.197 1.000 N NA
 367607 367608 NE0885 NE0886 ogt   FALSE 0.061 196.000 0.000 1.000   NA
 367609 367610 NE0887 NE0888     TRUE 0.793 3.000 0.000 NA   NA
 367610 367611 NE0888 NE0889     FALSE 0.421 65.000 0.000 NA   NA
 367611 367612 NE0889 NE0890     FALSE 0.321 80.000 0.000 NA   NA
 367612 367613 NE0890 NE0891     FALSE 0.009 383.000 0.000 NA   NA
 367613 367614 NE0891 NE0892     FALSE 0.464 58.000 0.000 NA   NA
 367614 367615 NE0892 NE0893     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367617 367618 NE0895 NE0896     FALSE 0.052 195.000 0.000 NA   NA
 367619 367620 NE0897 NE0898 efp   TRUE 0.812 74.000 0.074 NA   NA
 367622 367623 NE0900 NE0901     TRUE 0.879 28.000 0.065 NA   NA
 367625 367626 NE0903 NE0904     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.016 Y NA
 367629 367630 NE0907 NE0908 adhC1   TRUE 0.968 1.000 0.058 1.000   NA
 367632 367633 NE0910 NE0911   yliG FALSE 0.021 272.000 0.000 NA   NA
 367635 367636 NE0913 NE0914     TRUE 0.637 53.000 0.007 NA   NA
 367636 367637 NE0914 NE0915     TRUE 0.910 44.000 0.091 NA   NA
 367637 367638 NE0915 NE0916     TRUE 0.958 12.000 0.127 NA   NA
 367638 367639 NE0916 NE0917     FALSE 0.014 310.000 0.000 NA   NA
 367639 367640 NE0917 NE0918     TRUE 0.984 -3.000 0.117 NA   NA
 367640 367641 NE0918 NE0919     TRUE 0.573 114.000 0.061 NA   NA
 367641 367642 NE0919 NE0920     TRUE 0.998 -3.000 0.848 NA   NA
 367644 367645 NE0922 NE0923 cphA   TRUE 0.998 27.000 0.871 0.001 Y NA
 367646 367647 NE0924 NE0925 aniA   TRUE 0.877 19.000 0.050 1.000   NA
 367647 367648 NE0925 NE0926     TRUE 0.996 -3.000 0.300 0.016   NA
 367648 367649 NE0926 NE0927   pan1 TRUE 0.972 32.000 0.286 1.000   NA
 367651 367652 NE0929 NE0930     TRUE 0.997 2.000 0.575 NA   NA
 367653 367654 NE0931 NE0932     TRUE 0.841 17.000 0.026 1.000   NA
 367654 367655 NE0932 NE0933   uvrC TRUE 0.747 16.000 0.007 1.000   NA
 367656 367657 NE0934 NE0935     TRUE 0.929 -3.000 0.000 0.029   NA
 367657 2213827 NE0935 NE0936     FALSE 0.394 -78.000 0.000 NA   NA
 367658 367659 NE0937 NE0938     TRUE 0.998 -3.000 0.833 NA   NA
 367660 367661 NE0939 NE0940     FALSE 0.045 278.000 0.000 0.094   NA
 367661 367662 NE0940 NE0941     FALSE 0.004 704.000 0.000 NA   NA
 367662 367663 NE0941 NE0942     TRUE 0.962 85.000 0.500 NA   NA
 367663 367664 NE0942 NE0943   amoB1 TRUE 0.642 164.000 0.200 NA   NA
 367664 367665 NE0943 NE0944 amoB1 amoA1 TRUE 0.999 2.000 0.700 0.003   NA
 367665 367666 NE0944 NE0945 amoA1 amoC1 TRUE 0.857 164.000 0.333 0.003   NA
 367667 367668 NE0946 NE0947   cbbY TRUE 0.778 16.000 0.012 NA   NA
 367669 367670 NE0948 NE0949     FALSE 0.396 108.000 0.007 1.000 N NA
 367670 367671 NE0949 NE0950   surE TRUE 0.901 115.000 0.353 1.000   NA
 367671 5437959 NE0950 RNA_15 surE tRNAPro2 FALSE 0.072 172.000 0.000 NA   NA
 5437959 367672 RNA_15 NE0951 tRNAPro2   FALSE 0.126 135.000 0.000 NA   NA
 367672 367673 NE0951 NE0952   ihfA TRUE 0.986 -22.000 0.535 1.000   NA
 367673 367674 NE0952 NE0953 ihfA pheT TRUE 0.964 51.000 0.208 1.000 N NA
 367674 367675 NE0953 NE0954 pheT pheS TRUE 0.998 19.000 0.574 0.001 Y NA
 367675 367676 NE0954 NE0955 pheS rplT TRUE 0.975 69.000 0.202 1.000 Y NA
 367676 367677 NE0955 NE0956 rplT rpmI TRUE 0.999 12.000 0.928 0.018 Y NA
 367677 367678 NE0956 NE0957 rpmI infC TRUE 0.976 125.000 0.652 1.000 Y NA
 367678 367679 NE0957 NE0958 infC thrS TRUE 0.902 126.000 0.186 1.000 Y NA
 367679 367680 NE0958 NE0959 thrS cycX3 FALSE 0.024 311.000 0.000 1.000 N NA
 367680 367681 NE0959 NE0960 cycX3 cycA3 TRUE 0.996 3.000 0.500 NA   NA
 367681 367682 NE0960 NE0961 cycA3   TRUE 0.976 56.000 0.400 NA   NA
 367682 367683 NE0961 NE0962   hao2 TRUE 0.998 -3.000 0.615 NA   NA
 367685 367686 NE0964 NE0965 pilU pilT TRUE 0.955 17.000 0.012 0.017 Y NA
 367688 367689 NE0967 NE0968 fdx1 coaD TRUE 0.919 20.000 0.088 1.000   NA
 367689 367690 NE0968 NE0969 coaD   TRUE 0.992 -7.000 0.367 1.000 N NA
 367690 367691 NE0969 NE0970     TRUE 0.939 10.000 0.070 1.000   NA
 367692 367693 NE0971 NE0972 phnB   TRUE 0.515 31.000 0.000 NA   NA
 367693 367694 NE0972 NE0973     FALSE 0.069 175.000 0.000 NA   NA
 367695 367696 NE0974 NE0975     TRUE 0.996 0.000 0.167 NA Y NA
 367696 367697 NE0975 NE0976     FALSE 0.013 391.000 0.000 NA N NA
 367697 367698 NE0976 NE0977     TRUE 0.991 28.000 0.333 1.000 Y NA
 367698 367699 NE0977 NE0978     FALSE 0.073 327.000 0.000 1.000 Y NA
 367699 367700 NE0978 NE0979     FALSE 0.325 165.000 0.000 NA Y NA
 367700 367701 NE0979 NE0980     TRUE 0.810 6.000 0.000 NA N NA
 367701 367702 NE0980 NE0981     FALSE 0.015 396.000 0.000 1.000 N NA
 367703 367704 NE0982 NE0983     TRUE 0.991 16.000 0.635 NA   NA
 367704 367705 NE0983 NE0984   ftsL TRUE 0.994 -3.000 0.227 1.000 N NA
 367705 367706 NE0984 NE0985 ftsL ftsI TRUE 0.966 -3.000 0.032 1.000 N NA
 367706 367707 NE0985 NE0986 ftsI murE TRUE 0.983 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 367707 367708 NE0986 NE0987 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 367708 367709 NE0987 NE0988 murF mraY TRUE 0.983 87.000 0.309 0.007 Y NA
 367709 367710 NE0988 NE0989 mraY murD TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.007 Y NA
 367710 367711 NE0989 NE0990 murD ftsW TRUE 0.995 5.000 0.297 0.005 N NA
 367711 367712 NE0990 NE0991 ftsW murG TRUE 0.987 65.000 0.647 1.000 N NA
 367712 367713 NE0991 NE0992 murG murC TRUE 0.994 -10.000 0.283 1.000 Y NA
 367713 367714 NE0992 NE0993 murC   TRUE 0.991 11.000 0.136 0.007 Y NA
 367714 367715 NE0993 NE0994   ddlB TRUE 0.995 -3.000 0.074 0.007 Y NA
 367715 367716 NE0994 NE0995 ddlB ftsQ TRUE 0.978 87.000 0.372 NA Y NA
 367716 367717 NE0995 NE0996 ftsQ ftsA TRUE 0.996 -3.000 0.389 NA N NA
 367717 367718 NE0996 NE0997 ftsA ftsZ TRUE 0.989 70.000 0.460 1.000 Y NA
 367720 367721 NE0999 NE1000     TRUE 0.999 6.000 0.485 0.001 Y NA
 367721 367722 NE1000 NE1001   pstB TRUE 0.990 10.000 0.086 0.001 Y NA
 367724 367725 NE1003 NE1004     TRUE 0.694 41.000 0.008 NA   NA
 367726 367727 NE1005 NE1006 argB pilI FALSE 0.406 91.000 0.003 1.000 N NA
 367727 367728 NE1006 NE1007 pilI pilH TRUE 0.997 7.000 0.392 1.000 Y NA
 367729 367730 NE1008 NE1009     TRUE 0.801 45.000 0.029 NA   NA
 367731 367732 NE1010 NE1011 ctaB   FALSE 0.341 109.000 0.009 NA   NA
 367732 367733 NE1011 NE1012     TRUE 0.947 -25.000 0.195 NA   NA
 367733 367734 NE1012 NE1013   coxC TRUE 0.522 108.000 0.041 NA   NA
 367734 367735 NE1013 NE1014 coxC   TRUE 0.943 25.000 0.152 NA   NA
 367735 367736 NE1014 NE1015   ctaG TRUE 0.975 6.000 0.129 NA   NA
 367736 367737 NE1015 NE1016 ctaG coxA TRUE 0.860 126.000 0.268 1.000 N NA
 367737 367738 NE1016 NE1017 coxA coxB TRUE 0.998 55.000 0.741 0.003 Y NA
 367739 367740 NE1018 NE1019   copA FALSE 0.372 71.000 0.000 NA   NA
 367740 367741 NE1019 NE1020 copA   TRUE 0.984 -13.000 0.070 0.007 Y NA
 367741 367742 NE1020 NE1021   accA FALSE 0.173 155.000 0.003 1.000 N NA
 367742 367743 NE1021 NE1022 accA   TRUE 0.929 -31.000 0.123 1.000 N NA
 367743 367744 NE1022 NE1023   rfbD TRUE 0.605 56.000 0.000 1.000 N NA
 367745 367746 NE1024 NE1025     TRUE 0.800 29.000 0.012 1.000 N NA
 367746 367747 NE1025 NE1026     FALSE 0.113 155.000 0.000 1.000   NA
 367748 367749 NE1027 NE1028     TRUE 0.604 38.000 0.000 NA N NA
 367749 367750 NE1028 NE1029     FALSE 0.090 190.000 0.000 1.000 N NA
 367750 367751 NE1029 NE1030     TRUE 0.985 136.000 0.844 0.026 Y NA
 367751 367752 NE1030 NE1031     TRUE 0.971 8.000 0.070 0.026 N NA
 367752 367753 NE1031 NE1032     TRUE 0.526 23.000 0.000 NA   NA
 367755 367756 NE1034 NE1035 trxA rho FALSE 0.264 223.000 0.087 1.000   NA
 367756 367757 NE1035 NE1036 rho rpmE,rpL31 FALSE 0.233 280.000 0.115 1.000 N NA
 2213828 2213829 NE1037 NE1038     FALSE 0.386 -85.000 0.000 NA   NA
 2213829 2213830 NE1038 NE1039     FALSE 0.194 107.000 0.000 NA   NA
 2213830 2213831 NE1039 NE1040     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 2213831 367758 NE1040 NE1041     FALSE 0.218 100.000 0.000 NA   NA
 367758 367759 NE1041 NE1042     FALSE 0.016 300.000 0.000 NA   NA
 367759 367760 NE1042 NE1043     FALSE 0.368 72.000 0.000 NA   NA
 367760 367761 NE1043 NE1044   eno TRUE 0.994 -3.000 0.241 1.000 N NA
 367761 367762 NE1044 NE1045 eno pyrG FALSE 0.064 441.000 0.068 1.000 N NA
 367763 367764 NE1046 NE1047   sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 367764 367765 NE1047 NE1048 sdhD sdhA TRUE 0.999 2.000 0.705 0.002 Y NA
 367765 367766 NE1048 NE1049 sdhA   FALSE 0.309 82.000 0.000 NA   NA
 367766 367767 NE1049 NE1050     FALSE 0.462 -28.000 0.000 NA   NA
 367767 367768 NE1050 NE1051   ftsK TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367768 367769 NE1051 NE1052 ftsK   TRUE 0.922 60.000 0.130 1.000   NA
 367769 367770 NE1052 NE1053     TRUE 0.981 -7.000 0.167 1.000 N NA
 367770 367771 NE1053 NE1054   algI FALSE 0.179 133.000 0.000 NA N NA
 367771 367772 NE1054 NE1055 algI   TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 367773 367774 NE1056 NE1057 lolD   TRUE 0.997 -7.000 0.620 0.040 N NA
 367774 367775 NE1057 NE1058     FALSE 0.214 134.000 0.007 NA   NA
 2213832 367777 NE1060 NE1061     TRUE 0.645 11.000 0.000 NA   NA
 367777 2213833 NE1061 NE1062     FALSE 0.407 -64.000 0.000 NA   NA
 2213833 2213834 NE1062 NE1063     TRUE 0.539 -19.000 0.000 NA   NA
 2213834 367778 NE1063 NE1064     FALSE 0.108 146.000 0.000 NA   NA
 367778 367779 NE1064 NE1065     TRUE 0.986 -3.000 0.143 NA   NA
 367780 367781 NE1066 NE1067     TRUE 0.830 186.000 0.613 NA   NA
 2213835 2213836 NE1068 NE1069     TRUE 0.515 31.000 0.000 NA   NA
 2213836 367782 NE1069 NE1070     FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 367782 367783 NE1070 NE1071     TRUE 0.997 8.000 0.833 NA N NA
 367783 367784 NE1071 NE1072     FALSE 0.036 271.000 0.000 1.000 N NA
 367784 2213837 NE1072 NE1073     FALSE 0.007 475.000 0.000 NA   NA
 2213837 367785 NE1073 NE1074     FALSE 0.211 101.000 0.000 NA   NA
 367785 367786 NE1074 NE1075     TRUE 0.996 -3.000 0.417 NA   NA
 367786 367787 NE1075 NE1076     FALSE 0.329 86.000 0.000 1.000   NA
 367787 367788 NE1076 NE1077     TRUE 0.685 144.000 0.170 NA   NA
 367788 367789 NE1077 NE1078     FALSE 0.076 169.000 0.000 NA   NA
 367789 367790 NE1078 NE1079     TRUE 0.996 5.000 0.556 NA N NA
 367790 367791 NE1079 NE1080     FALSE 0.289 107.000 0.000 1.000 N NA
 367791 367792 NE1080 NE1081     TRUE 0.992 9.000 0.314 0.082 N NA
 367792 367793 NE1081 NE1082     TRUE 0.998 -6.000 0.943 0.082 N NA
 367793 367794 NE1082 NE1083     FALSE 0.087 160.000 0.000 NA   NA
 367794 367795 NE1083 NE1084     TRUE 0.993 2.000 0.300 NA   NA
 367795 367796 NE1084 NE1085     FALSE 0.218 100.000 0.000 NA   NA
 367796 367797 NE1085 NE1086     TRUE 0.552 59.000 0.000 NA N NA
 367797 367798 NE1086 NE1087   fpvA FALSE 0.033 284.000 0.000 1.000 N NA
 367798 367799 NE1087 NE1088 fpvA   FALSE 0.329 203.000 0.000 0.008 Y NA
 367799 367800 NE1088 NE1089     TRUE 0.649 124.000 0.000 0.008 Y NA
 367800 367801 NE1089 NE1090     FALSE 0.010 364.000 0.000 NA   NA
 367801 367802 NE1090 NE1091     TRUE 0.923 68.000 0.176 NA   NA
 367802 2213838 NE1091 NE1092     FALSE 0.008 426.000 0.000 NA   NA
 2213839 367804 NE1094 NE1095     FALSE 0.067 176.000 0.000 NA   NA
 367804 367805 NE1095 NE1096     TRUE 0.673 15.000 0.000 NA N NA
 367805 367806 NE1096 NE1097     FALSE 0.047 244.000 0.000 1.000 N NA
 367806 367807 NE1097 NE1098     TRUE 0.649 94.000 0.000 NA Y NA
 367807 367808 NE1098 NE1099     TRUE 0.982 14.000 0.286 NA N NA
 367809 367810 NE1100 NE1101     FALSE 0.315 81.000 0.000 NA   NA
 367810 367811 NE1101 NE1102     TRUE 0.989 25.000 0.571 NA N NA
 367812 367813 NE1103 NE1104     TRUE 0.997 -3.000 0.533 1.000   NA
 2213840 367814 NE1105 NE1106     TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 367814 367815 NE1106 NE1107     TRUE 0.966 0.000 0.000 NA Y NA
 367815 2213841 NE1107 NE1108     TRUE 0.580 -16.000 0.000 NA   NA
 2213841 367816 NE1108 NE1109     FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 367816 367817 NE1109 NE1110     TRUE 0.619 13.000 0.000 NA   NA
 367818 367819 NE1111 NE1112     TRUE 0.982 16.000 0.211 0.025 N NA
 367819 367820 NE1112 NE1113     TRUE 0.970 19.000 0.211 1.000 N NA
 367821 367822 NE1114 NE1115   oprN FALSE 0.444 80.000 0.000 1.000 N NA
 367822 367823 NE1115 NE1116 oprN   TRUE 0.938 -3.000 0.000 0.082 N NA
 367823 367824 NE1116 NE1117   yhiH TRUE 0.993 -3.000 0.195 0.082   NA
 367824 367825 NE1117 NE1118 yhiH   TRUE 0.997 3.000 0.500 0.007   NA
 367826 367827 NE1119 NE1120     TRUE 0.499 49.000 0.000 NA   NA
 367827 367828 NE1120 NE1121     TRUE 0.510 36.000 0.000 NA   NA
 367828 367829 NE1121 NE1122     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 367830 367831 NE1123 NE1124     FALSE 0.033 245.000 0.000 1.000   NA
 367831 367832 NE1124 NE1125   fadD TRUE 0.871 43.000 0.043 1.000 N NA
 367832 367833 NE1125 NE1126 fadD   TRUE 0.995 -3.000 0.278 1.000 N NA
 367833 367834 NE1126 NE1127   asnB,asn FALSE 0.482 201.000 0.056 1.000 Y NA
 367834 367835 NE1127 NE1128 asnB,asn   FALSE 0.010 374.000 0.000 NA   NA
 367835 367836 NE1128 NE1129     TRUE 0.964 31.000 0.231 NA   NA
 367836 367837 NE1129 NE1130     TRUE 0.992 -7.000 0.458 NA   NA
 367837 2213842 NE1130 NE1131     TRUE 0.519 30.000 0.000 NA   NA
 367838 367839 NE1132 NE1133     TRUE 0.510 45.000 0.000 NA   NA
 2213843 367840 NE1134 NE1135     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367841 367842 NE1136 NE1137   holA TRUE 0.889 1.000 0.002 1.000 N NA
 367842 367843 NE1137 NE1138 holA rlpB TRUE 0.976 12.000 0.199 NA N NA
 367843 367844 NE1138 NE1139 rlpB leuS TRUE 0.964 18.000 0.182 NA N NA
 367845 367846 NE1140 NE1141 tsaA tgt TRUE 0.999 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 367846 367847 NE1141 NE1142 tgt   TRUE 0.977 35.000 0.325 NA N NA
 367847 367848 NE1142 NE1143     TRUE 0.930 75.000 0.083 NA Y NA
 367848 367849 NE1143 NE1144     TRUE 0.995 24.000 0.332 0.001 Y NA
 367849 367850 NE1144 NE1145     TRUE 0.667 59.000 0.010 NA   NA
 367850 367851 NE1145 NE1146     TRUE 0.885 50.000 0.074 NA   NA
 367852 367853 NE1147 NE1148   lspA TRUE 0.613 88.000 0.015 1.000 N NA
 367853 367854 NE1148 NE1149 lspA ileS TRUE 0.909 43.000 0.071 1.000 N NA
 367854 367855 NE1149 NE1150 ileS ribF TRUE 0.993 2.000 0.254 1.000 N NA
 367855 367856 NE1150 NE1151 ribF   FALSE 0.364 109.000 0.009 1.000   NA
 367857 367858 NE1152 NE1153 hbpA appB TRUE 0.997 18.000 0.619 0.025 Y NA
 367858 367859 NE1153 NE1154 appB   TRUE 0.597 134.000 0.048 0.081 N NA
 367859 367860 NE1154 NE1155     TRUE 0.862 48.000 0.041 1.000 N NA
 367860 367861 NE1155 NE1156     TRUE 0.993 2.000 0.286 1.000   NA
 367861 367862 NE1156 NE1157     TRUE 0.820 57.000 0.047 NA   NA
 367862 367863 NE1157 NE1158     TRUE 0.778 17.000 0.013 NA   NA
 367863 5437960 NE1158 RNA_29   tRNAMet3 FALSE 0.106 147.000 0.000 NA   NA
 367864 367865 NE1159 NE1160 xseB ispA TRUE 0.978 -10.000 0.177 1.000 N NA
 367865 367866 NE1160 NE1161 ispA dxs TRUE 0.985 58.000 0.246 1.000 Y NA
 367866 367867 NE1161 NE1162 dxs   TRUE 0.499 49.000 0.000 NA   NA
 367867 367868 NE1162 NE1163     FALSE 0.051 196.000 0.000 NA   NA
 367868 367869 NE1163 NE1164     FALSE 0.019 288.000 0.000 NA   NA
 367872 367873 NE1167 NE1168     TRUE 0.988 -3.000 0.122 1.000 N NA
 367873 367874 NE1168 NE1169   vacJ TRUE 0.724 125.000 0.118 1.000 N NA
 367874 367875 NE1169 NE1170 vacJ dfrA TRUE 0.854 53.000 0.000 1.000 Y NA
 367875 367876 NE1170 NE1171 dfrA exbB2 TRUE 0.523 69.000 0.000 1.000 N NA
 367877 367878 NE1172 NE1173 xseA   FALSE 0.041 209.000 0.000 NA   NA
 367878 367879 NE1173 NE1174     TRUE 0.647 41.000 0.006 NA   NA
 367879 367880 NE1174 NE1175   dsbB TRUE 0.871 7.000 0.006 1.000 N NA
 367880 367881 NE1175 NE1176 dsbB   TRUE 0.568 28.000 0.000 1.000   NA
 367881 2213844 NE1176 NE1177     FALSE 0.090 158.000 0.000 NA   NA
 367882 367883 NE1178 NE1179     FALSE 0.051 196.000 0.000 NA   NA
 367885 367886 NE1181 NE1182     TRUE 0.710 -7.000 0.000 NA   NA
 367886 367887 NE1182 NE1183     FALSE 0.024 255.000 0.000 NA   NA
 367887 367888 NE1183 NE1184   nlaB FALSE 0.063 194.000 0.000 1.000   NA
 367888 367889 NE1184 NE1185 nlaB   TRUE 0.995 0.000 0.310 1.000 N NA
 367889 367890 NE1185 NE1186   glyS TRUE 0.965 12.000 0.123 1.000 N NA
 367890 367891 NE1186 NE1187 glyS glyQ TRUE 1.000 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 367891 367892 NE1187 NE1188 glyQ lnt TRUE 0.938 2.000 0.011 1.000 N NA
 367892 367893 NE1188 NE1189 lnt   FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 367893 367894 NE1189 NE1190   fpvA FALSE 0.028 244.000 0.000 NA   NA
 367894 367895 NE1190 NE1191 fpvA   TRUE 0.793 162.000 0.154 NA Y NA
 367895 367896 NE1191 NE1192     TRUE 0.765 122.000 0.154 NA N NA
 367896 2213845 NE1192 NE1193     FALSE 0.010 366.000 0.000 NA   NA
 2213845 367897 NE1193 NE1194     FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 367897 367898 NE1194 NE1195     TRUE 0.998 -6.000 0.500 NA Y NA
 367898 367899 NE1195 NE1196     TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 367899 367900 NE1196 NE1197     TRUE 0.999 -3.000 0.643 NA Y NA
 367902 367903 NE1199 NE1200     FALSE 0.024 257.000 0.000 NA   NA
 367903 367904 NE1200 NE1201     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 367905 367906 NE1202 NE1203     FALSE 0.031 234.000 0.000 NA   NA
 367906 367907 NE1203 NE1204     FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 367908 367909 NE1205 NE1206     FALSE 0.250 117.000 0.000 1.000 N NA
 367910 367911 NE1207 NE1208     FALSE 0.013 363.000 0.000 1.000   NA
 367911 367912 NE1208 NE1209     TRUE 0.985 2.000 0.145 1.000   NA
 367912 367913 NE1209 NE1210     TRUE 0.989 -3.000 0.113 0.096   NA
 367913 367914 NE1210 NE1211     TRUE 0.997 7.000 0.609 0.007 N NA
 367914 367915 NE1211 NE1212     FALSE 0.042 250.000 0.000 1.000 N NA
 367915 367916 NE1212 NE1213   sps TRUE 0.983 8.000 0.194 1.000 N NA
 367916 367917 NE1213 NE1214 sps ss2 TRUE 0.979 70.000 0.141 0.001 Y NA
 367917 367918 NE1214 NE1215 ss2   FALSE 0.392 75.000 0.000 1.000   NA
 367920 367921 NE1217 NE1218   fecR TRUE 0.981 79.000 0.667 NA N NA
 2213847 367923 NE1221 NE1222     FALSE 0.370 -148.000 0.000 NA   NA
 367923 367924 NE1222 NE1223     FALSE 0.063 180.000 0.000 NA   NA
 367925 367926 NE1224 NE1225     TRUE 0.886 -19.000 0.065 NA   NA
 367929 367930 NE1228 NE1229   prfB FALSE 0.497 56.000 0.002 NA   NA
 367930 367931 NE1229 NE1230 prfB   FALSE 0.211 101.000 0.000 NA   NA
 367931 367932 NE1230 NE1231     TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 367932 367933 NE1231 NE1232     FALSE 0.023 265.000 0.000 NA   NA
 367933 367934 NE1232 NE1233     TRUE 0.990 -3.000 0.190 NA   NA
 367934 367935 NE1233 NE1234     TRUE 0.979 15.000 0.308 NA   NA
 367935 367936 NE1234 NE1235     TRUE 0.510 34.000 0.000 NA   NA
 367937 367938 NE1236 NE1237     TRUE 0.988 25.000 0.429 0.044   NA
 367939 367940 NE1238 NE1239   ALOX5 TRUE 0.521 56.000 0.000 1.000   NA
 367940 367941 NE1239 NE1240 ALOX5 Ptgs1,COX1,Cox-1,Pghs1 TRUE 0.985 36.000 0.500 1.000   NA
 367941 367942 NE1240 NE1241 Ptgs1,COX1,Cox-1,Pghs1   FALSE 0.087 171.000 0.000 1.000   NA
 367942 367943 NE1241 NE1242     TRUE 0.511 33.000 0.000 NA   NA
 367943 367944 NE1242 NE1243     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 367944 367945 NE1243 NE1244     TRUE 0.699 8.000 0.000 NA   NA
 367945 367946 NE1244 NE1245     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 367946 367947 NE1245 NE1246     FALSE 0.165 117.000 0.000 NA   NA
 367947 367948 NE1246 NE1247     FALSE 0.163 118.000 0.000 NA   NA
 2213848 367950 NE1249 NE1250     TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 367950 367951 NE1250 NE1251   pilJ TRUE 0.994 74.000 0.554 0.007 Y NA
 367951 367952 NE1251 NE1252 pilJ   FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 367952 367953 NE1252 NE1253     TRUE 0.793 3.000 0.000 NA   NA
 367953 367954 NE1253 NE1254     TRUE 0.765 5.000 0.000 NA   NA
 367954 367955 NE1254 NE1255     TRUE 0.520 29.000 0.000 NA   NA
 367955 367956 NE1255 NE1256     TRUE 0.912 55.000 0.000 0.004 Y NA
 367956 367957 NE1256 NE1257     TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 367957 367958 NE1257 NE1258     FALSE 0.005 1180.000 0.000 1.000   NA
 367958 367959 NE1258 NE1259     FALSE 0.368 72.000 0.000 NA   NA
 367960 367961 NE1260 NE1261     TRUE 0.992 54.000 0.667 0.089   NA
 367961 2213849 NE1261 NE1262     FALSE 0.239 96.000 0.000 NA   NA
 2213849 367962 NE1262 NE1263     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 367963 367964 NE1264 NE1265     FALSE 0.007 539.000 0.000 1.000   NA
 367964 367965 NE1265 NE1266     TRUE 0.535 53.000 0.000 1.000   NA
 367966 367967 NE1268 NE1269     FALSE 0.126 135.000 0.000 NA   NA
 367968 367969 NE1270 NE1271     TRUE 0.992 54.000 0.667 0.088   NA
 367969 2213851 NE1271 NE1272     TRUE 0.552 18.000 0.000 NA   NA
 367975 367976 NE1278 NE1279 lonA   TRUE 0.885 61.000 0.091 NA   NA
 367976 367977 NE1279 NE1280     FALSE 0.088 159.000 0.000 NA   NA
 367978 367979 NE1281 NE1282 purA   FALSE 0.389 234.000 0.161 1.000 N NA
 367979 367980 NE1282 NE1283     TRUE 0.861 76.000 0.117 NA   NA
 367980 367981 NE1283 NE1284     TRUE 0.886 119.000 0.348 NA   NA
 367981 367982 NE1284 NE1285     TRUE 1.000 0.000 0.947 0.012 Y NA
 367982 367983 NE1285 NE1286     TRUE 0.983 6.000 0.184 1.000   NA
 367983 367984 NE1286 NE1287   hfq TRUE 0.930 -10.000 0.058 1.000   NA
 367984 367985 NE1287 NE1288 hfq phoR FALSE 0.029 335.000 0.000 0.044   NA
 367985 367986 NE1288 NE1289 phoR   FALSE 0.305 83.000 0.000 NA   NA
 367986 367987 NE1289 NE1290   proB TRUE 0.608 48.000 0.005 NA   NA
 367987 367988 NE1290 NE1291 proB   TRUE 0.985 6.000 0.206 1.000   NA
 367988 367989 NE1291 NE1292   rpmA TRUE 0.862 132.000 0.335 1.000   NA
 367989 367990 NE1292 NE1293 rpmA rplU TRUE 0.998 13.000 0.667 0.017 Y NA
 367991 367992 NE1294 NE1295   gshB TRUE 0.985 0.000 0.120 1.000   NA
 367993 367994 NE1296 NE1297     FALSE 0.484 54.000 0.000 NA   NA
 367994 367995 NE1297 NE1298     TRUE 0.600 14.000 0.000 NA   NA
 367995 367996 NE1298 NE1299     FALSE 0.183 141.000 0.000 1.000 N NA
 367996 367997 NE1299 NE1300     FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 368001 368002 NE1304 NE1305     TRUE 0.986 13.000 0.385 NA   NA
 368002 368003 NE1305 NE1306     FALSE 0.139 128.000 0.000 NA   NA
 368003 368004 NE1306 NE1307     TRUE 0.995 -3.000 0.351 NA   NA
 368004 368005 NE1307 NE1308     FALSE 0.013 320.000 0.000 NA   NA
 368005 368006 NE1308 NE1309     FALSE 0.005 625.000 0.000 NA   NA
 368006 368007 NE1309 NE1310   hipA FALSE 0.007 439.000 0.000 NA   NA
 368007 368008 NE1310 NE1311 hipA   TRUE 0.983 -10.000 0.261 NA   NA
 368008 368009 NE1311 NE1312   cspD2 FALSE 0.005 680.000 0.000 1.000   NA
 368009 5437962 NE1312 RNA_13 cspD2 tRNAPhe1 FALSE 0.006 481.000 0.000 NA   NA
 5437962 5437963 RNA_13 RNA_12 tRNAPhe1 tRNAArg3 FALSE 0.440 62.000 0.000 NA   NA
 5437963 368010 RNA_12 NE1313 tRNAArg3   FALSE 0.039 213.000 0.000 NA   NA
 368010 368011 NE1313 NE1314     TRUE 0.997 25.000 0.682 1.000 Y NA
 368011 368012 NE1314 NE1315   ccp FALSE 0.219 127.000 0.000 1.000 N NA
 368012 368013 NE1315 NE1316 ccp   FALSE 0.382 104.000 0.005 1.000 N NA
 368014 368015 NE1317 NE1318 proS   TRUE 0.909 -12.000 0.053 NA   NA
 368016 368017 NE1319 NE1320   leuA1 FALSE 0.138 174.000 0.003 1.000 N NA
 368017 368018 NE1320 NE1321 leuA1 pssA FALSE 0.230 239.000 0.073 1.000 N NA
 368018 368019 NE1321 NE1322 pssA psd TRUE 0.994 30.000 0.466 1.000 Y NA
 368019 368020 NE1322 NE1323 psd ilvC TRUE 0.956 5.000 0.046 1.000 N NA
 368020 368021 NE1323 NE1324 ilvC ilvH TRUE 0.942 96.000 0.092 0.002 Y NA
 368021 368022 NE1324 NE1325 ilvH ilvI TRUE 0.999 5.000 0.371 0.001 Y NA
 368022 368023 NE1325 NE1326 ilvI tldD FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 368023 368024 NE1326 NE1327 tldD   TRUE 0.872 107.000 0.259 NA   NA
 368024 368025 NE1327 NE1328     TRUE 0.590 228.000 0.358 NA   NA
 368026 368027 NE1329 NE1330 glnE cti FALSE 0.089 170.000 0.000 1.000   NA
 368028 5437964 NE1331 RNA_11 ggt2 tRNAHis1 FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 5437964 5437965 RNA_11 RNA_10 tRNAHis1 tRNAArg2 FALSE 0.491 52.000 0.000 NA   NA
 5437965 5437966 RNA_10 RNA_9 tRNAArg2 tRNAPro1 TRUE 0.510 45.000 0.000 NA   NA
 5437966 368029 RNA_9 NE1332 tRNAPro1 rkpI FALSE 0.182 110.000 0.000 NA   NA
 368029 368030 NE1332 NE1333 rkpI hetN TRUE 0.993 -10.000 0.392 0.036   NA
 368030 368031 NE1333 NE1334 hetN   TRUE 0.837 -16.000 0.026 NA   NA
 368031 368032 NE1334 NE1335   ykvP TRUE 0.766 -21.000 0.017 NA   NA
 368032 368033 NE1335 NE1336 ykvP   FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 368033 368034 NE1336 NE1337     TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000   NA
 368034 368035 NE1337 NE1338     TRUE 0.512 42.000 0.000 NA   NA
 368035 368036 NE1338 NE1339     FALSE 0.005 592.000 0.000 NA   NA
 368036 368037 NE1339 NE1340     TRUE 0.528 22.000 0.000 NA   NA
 368037 368038 NE1340 NE1341     TRUE 0.508 46.000 0.000 NA   NA
 368038 368039 NE1341 NE1342     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 368039 368040 NE1342 NE1343   udg TRUE 0.896 -3.000 0.000 1.000 N NA
 368040 368041 NE1343 NE1344 udg   FALSE 0.005 567.000 0.000 NA   NA
 368041 368042 NE1344 NE1345     FALSE 0.011 350.000 0.000 NA   NA
 368042 368043 NE1345 NE1346     TRUE 0.993 3.000 0.326 NA   NA
 368044 368045 NE1347 NE1348     FALSE 0.367 -159.000 0.000 NA   NA
 368046 368047 NE1349 NE1350     TRUE 0.958 8.000 0.093 NA   NA
 368051 368052 NE1354 NE1355     FALSE 0.013 620.000 0.000 0.017   NA
 368052 368053 NE1355 NE1356     TRUE 0.990 -7.000 0.357 NA   NA
 368054 2213852 NE1357 NE1358     FALSE 0.060 184.000 0.000 NA   NA
 2213852 2213853 NE1358 NE1359     FALSE 0.363 -163.000 0.000 NA   NA
 368055 368056 NE1360 NE1361     TRUE 0.988 0.000 0.161 NA   NA
 368057 368058 NE1362 NE1363     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 368058 368059 NE1363 NE1364     TRUE 0.981 14.000 0.317 NA   NA
 368059 368060 NE1364 NE1365     FALSE 0.010 382.000 0.000 NA   NA
 368060 368061 NE1365 NE1366     FALSE 0.005 540.000 0.000 NA   NA
 368061 368062 NE1366 NE1367     FALSE 0.412 -63.000 0.000 NA   NA
 2213854 368063 NE1368 NE1369     FALSE 0.069 175.000 0.000 NA   NA
 368063 368064 NE1369 NE1370     TRUE 0.901 13.000 0.000 NA Y NA
 368065 368066 NE1371 NE1372     TRUE 0.995 -16.000 1.000 NA   NA
 368067 368068 NE1373 NE1374     TRUE 0.994 -13.000 0.800 NA   NA
 368069 368070 NE1375 NE1376     TRUE 0.539 -19.000 0.000 NA   NA
 368070 368071 NE1376 NE1377     TRUE 0.714 242.000 0.643 NA   NA
 368072 368073 NE1378 NE1379     FALSE 0.211 110.000 0.000 1.000   NA
 368073 368074 NE1379 NE1380     TRUE 0.765 5.000 0.000 NA   NA
 368074 368075 NE1380 NE1381     TRUE 0.990 -3.000 0.200 NA   NA
 368075 368076 NE1381 NE1382   galU1 FALSE 0.005 921.000 0.000 1.000   NA
 368076 368077 NE1382 NE1383 galU1 galU1 TRUE 0.760 -28.000 0.000 0.001   NA
 368077 368078 NE1383 NE1384 galU1 kpsE FALSE 0.013 351.000 0.000 1.000   NA
 368078 368079 NE1384 NE1385 kpsE rkpS TRUE 0.996 -3.000 0.164 1.000 Y NA
 368079 368080 NE1385 NE1386 rkpS rkpT1 TRUE 0.973 77.000 0.182 0.092 Y NA
 368080 368081 NE1386 NE1387 rkpT1   TRUE 0.966 43.000 0.056 0.078 Y NA
 368081 368082 NE1387 NE1388   rkpG TRUE 0.899 27.000 0.059 1.000 N NA
 368082 368083 NE1388 NE1389 rkpG rkpA TRUE 0.991 -3.000 0.111 0.015 N NA
 2213856 2213857 NE1393 NE1394     TRUE 0.499 49.000 0.000 NA   NA
 2213858 2213859 NE1395 NE1396     FALSE 0.415 -48.000 0.000 NA   NA
 2213859 368086 NE1396 NE1397     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 368087 368088 NE1398 NE1399     TRUE 0.904 58.000 0.096 1.000   NA
 368088 368089 NE1399 NE1400   yeaZ TRUE 0.989 3.000 0.209 1.000   NA
 368089 368090 NE1400 NE1401 yeaZ ligT TRUE 0.675 -19.000 0.002 1.000 N NA
 368090 368091 NE1401 NE1402 ligT   TRUE 0.912 6.000 0.011 1.000 N NA
 368091 368092 NE1402 NE1403     FALSE 0.061 196.000 0.000 1.000   NA
 368093 368094 NE1404 NE1405     TRUE 0.989 -3.000 0.143 1.000 N NA
 368094 368095 NE1405 NE1406     TRUE 0.988 0.000 0.152 1.000   NA
 368095 368096 NE1406 NE1407     TRUE 0.581 86.000 0.017 1.000   NA
 368097 368098 NE1408 NE1409     TRUE 0.994 -3.000 0.071 0.077 Y NA
 368098 368099 NE1409 NE1410     TRUE 0.891 143.000 0.500 1.000   NA
 368101 368102 NE1412 NE1413   ftsX TRUE 0.638 37.000 0.000 1.000 N NA
 368102 368103 NE1413 NE1414 ftsX ftsE TRUE 0.986 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 368103 368104 NE1414 NE1415 ftsE pilA TRUE 0.942 29.000 0.117 1.000 N NA
 368105 368106 NE1416 NE1417   dadX FALSE 0.352 123.000 0.013 1.000   NA
 368107 368108 NE1418 NE1419     FALSE 0.300 157.000 0.033 NA   NA
 368108 368109 NE1419 NE1420     FALSE 0.325 114.000 0.010 NA   NA
 368111 368112 NE1422 NE1423 vacJ hemL FALSE 0.357 120.000 0.008 1.000 N NA
 368112 368113 NE1423 NE1424 hemL   TRUE 0.981 37.000 0.173 1.000 Y NA
 368113 368114 NE1424 NE1425   thiD TRUE 0.939 -16.000 0.000 0.004 Y NA
 368115 368116 NE1426 NE1427   gloA TRUE 0.952 0.000 0.014 1.000 N NA
 368116 368117 NE1427 NE1428 gloA   FALSE 0.022 267.000 0.000 NA   NA
 368118 368119 NE1429 NE1430     TRUE 0.958 33.000 0.184 NA N NA
 368121 368122 NE1432 NE1433   glyA TRUE 0.904 28.000 0.069 NA N NA
 368126 368127 NE1437 NE1438 argG argF TRUE 0.967 39.000 0.088 1.000 Y NA
 368127 368128 NE1438 NE1439 argF argD TRUE 0.678 165.000 0.074 1.000 Y NA
 368128 368129 NE1439 NE1440 argD   FALSE 0.065 178.000 0.000 NA   NA
 368129 368130 NE1440 NE1441     TRUE 0.962 46.000 0.222 NA   NA
 368130 368131 NE1441 NE1442     TRUE 0.990 0.000 0.200 NA   NA
 368131 368132 NE1442 NE1443   cysM TRUE 0.928 6.000 0.036 NA   NA
 368132 368133 NE1443 NE1444 cysM   FALSE 0.055 229.000 0.000 1.000 N NA
 368133 368134 NE1444 NE1445     FALSE 0.009 533.000 0.000 1.000 N NA
 368134 368135 NE1445 NE1446     TRUE 0.955 6.000 0.011 0.002 N NA
 368135 368136 NE1446 NE1447     TRUE 0.975 -3.000 0.055 1.000 N NA
 368136 368137 NE1447 NE1448     TRUE 0.961 4.000 0.049 1.000 N NA
 368137 368138 NE1448 NE1449   ycf16 TRUE 0.999 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 368138 368139 NE1449 NE1450 ycf16   TRUE 0.999 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 368139 368140 NE1450 NE1451     TRUE 0.659 22.000 0.006 NA   NA
 368140 368141 NE1451 NE1452     TRUE 0.773 25.000 0.017 NA   NA
 368141 368142 NE1452 NE1453     FALSE 0.026 291.000 0.000 NA N NA
 368142 368143 NE1453 NE1454     TRUE 0.993 60.000 0.535 1.000 Y NA
 368147 368148 NE1458 NE1459 xerD   FALSE 0.262 106.000 0.003 1.000   NA
 368150 368151 NE1461 NE1462   dut TRUE 0.797 -6.000 0.004 NA   NA
 368151 368152 NE1462 NE1463 dut dfp TRUE 0.977 -13.000 0.201 1.000 N NA
 368153 368154 NE1464 NE1465 radC rpmB TRUE 0.597 69.000 0.004 1.000 N NA
 368154 368155 NE1465 NE1466 rpmB rpmG TRUE 0.994 38.000 0.332 0.017 Y NA
 368156 368157 NE1467 NE1468   polA FALSE 0.181 144.000 0.002 1.000 N NA
 368158 368159 NE1469 NE1470     TRUE 0.892 60.000 0.095 NA   NA
 368159 368160 NE1470 NE1471   thrB TRUE 0.902 84.000 0.204 NA   NA
 368160 368161 NE1471 NE1472 thrB   TRUE 0.798 122.000 0.209 NA   NA
 368162 368163 NE1473 NE1474 uvrD cbbP, prk TRUE 0.778 61.000 0.007 0.092 N NA
 368163 368164 NE1474 NE1475 cbbP, prk   FALSE 0.417 117.000 0.011 1.000 N NA
 368164 368165 NE1475 NE1476   hemH TRUE 0.591 100.000 0.029 1.000 N NA
 368165 368166 NE1476 NE1477 hemH hrcA TRUE 0.886 25.000 0.048 1.000 N NA
 368167 368168 NE1478 NE1479   recN TRUE 0.984 6.000 0.170 1.000 N NA
 368169 368170 NE1480 NE1481     TRUE 0.893 -19.000 0.069 NA   NA
 368170 368171 NE1481 NE1482   argC FALSE 0.307 97.000 0.004 NA   NA
 368171 368172 NE1482 NE1483 argC rpsI FALSE 0.421 142.000 0.032 1.000 N NA
 368172 368173 NE1483 NE1484 rpsI rplM TRUE 0.998 12.000 0.601 0.017 Y NA
 368174 368175 NE1485 NE1486 dac   TRUE 0.984 24.000 0.390 1.000 N NA
 368175 368176 NE1486 NE1487     TRUE 0.968 10.000 0.155 NA   NA
 368176 368177 NE1487 NE1488   lipB FALSE 0.357 262.000 0.219 NA   NA
 368177 368178 NE1488 NE1489 lipB lipA TRUE 0.995 20.000 0.319 0.001 Y NA
 368180 368181 NE1491 NE1492     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 368181 368182 NE1492 NE1493     TRUE 0.997 2.000 0.667 NA   NA
 368182 368183 NE1493 NE1494     FALSE 0.007 480.000 0.000 NA   NA
 368183 368184 NE1494 NE1495   soj TRUE 0.994 0.000 0.308 NA   NA
 368184 368185 NE1495 NE1496 soj   TRUE 0.974 -3.000 0.066 1.000   NA
 5437967 368186 RNA_8 NE1497 tRNAArg1   FALSE 0.015 303.000 0.000 NA   NA
 368188 368189 NE1499 NE1500     TRUE 0.962 3.000 0.065 NA   NA
 368189 368190 NE1500 NE1501     TRUE 0.502 48.000 0.000 NA   NA
 368190 368191 NE1501 NE1502     TRUE 0.770 91.000 0.091 NA   NA
 368191 368192 NE1502 NE1503     TRUE 0.899 54.000 0.085 1.000   NA
 368193 368194 NE1504 NE1505   priA FALSE 0.317 86.000 0.002 NA   NA
 368195 368196 NE1506 NE1507     TRUE 0.859 58.000 0.062 1.000   NA
 368196 368197 NE1507 NE1508     TRUE 0.891 8.000 0.019 1.000   NA
 368198 368199 NE1509 NE1510     FALSE 0.199 141.000 0.007 NA   NA
 368200 368201 NE1511 NE1512 dsbC   TRUE 0.993 44.000 0.814 1.000 N NA
 368201 368202 NE1512 NE1513     FALSE 0.026 248.000 0.000 NA   NA
 368204 368205 NE1515 NE1516     TRUE 0.835 2.000 0.003 NA   NA
 368205 368206 NE1516 NE1517     TRUE 0.500 71.000 0.003 NA N NA
 368208 2213860 NE1519 NE1520     FALSE 0.006 514.000 0.000 NA   NA
 368209 368210 NE1521 NE1522     TRUE 0.786 -78.000 0.000 NA Y NA
 368210 368211 NE1522 NE1523     FALSE 0.018 416.000 0.000 0.085   NA
 368211 368212 NE1523 NE1524     FALSE 0.129 145.000 0.000 1.000   NA
 368212 368213 NE1524 NE1525     TRUE 0.981 4.000 0.150 NA   NA
 368213 368214 NE1525 NE1526     FALSE 0.041 211.000 0.000 NA   NA
 368215 368216 NE1527 NE1528     TRUE 0.992 70.000 0.588 1.000 Y NA
 368216 368217 NE1528 NE1529     FALSE 0.033 328.000 0.000 0.022   NA
 368217 368218 NE1529 NE1530     TRUE 0.992 -3.000 0.232 NA   NA
 368218 368219 NE1530 NE1531     FALSE 0.331 78.000 0.000 NA   NA
 368219 368220 NE1531 NE1532     FALSE 0.257 231.000 0.000 0.014 Y NA
 368220 368221 NE1532 NE1533     FALSE 0.026 302.000 0.000 1.000 N NA
 368221 368222 NE1533 NE1534     FALSE 0.057 188.000 0.000 NA   NA
 368222 368223 NE1534 NE1535     TRUE 0.767 197.000 0.522 NA   NA
 368223 368224 NE1535 NE1536     FALSE 0.208 111.000 0.000 1.000   NA
 368224 368225 NE1536 NE1537     TRUE 0.938 109.000 0.548 NA   NA
 368226 368227 NE1538 NE1539     FALSE 0.321 80.000 0.000 NA   NA
 368227 368228 NE1539 NE1540     FALSE 0.152 133.000 0.000 1.000   NA
 368228 368229 NE1540 NE1541     TRUE 0.662 120.000 0.015 NA Y NA
 368229 368230 NE1541 NE1542     FALSE 0.243 153.000 0.015 NA   NA
 368230 368231 NE1542 NE1543   Heph,sla TRUE 0.828 102.000 0.182 NA   NA
 368233 368234 NE1545 NE1546     TRUE 0.696 -21.000 0.008 NA   NA
 368236 368237 NE1548 NE1549     TRUE 0.994 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 368237 368238 NE1549 NE1550     FALSE 0.157 120.000 0.000 NA   NA
 368238 368239 NE1550 NE1551     TRUE 0.765 5.000 0.000 NA   NA
 368240 368241 NE1552 NE1553     TRUE 0.786 -78.000 0.000 NA Y NA
 2213861 368242 NE1554 NE1555     TRUE 0.515 31.000 0.000 NA   NA
 368242 368243 NE1555 NE1556     TRUE 0.526 23.000 0.000 NA   NA
 368243 368244 NE1556 NE1557     TRUE 0.600 14.000 0.000 NA   NA
 368244 368245 NE1557 NE1558     FALSE 0.440 62.000 0.000 NA   NA
 368245 368246 NE1558 NE1559     FALSE 0.337 77.000 0.000 NA   NA
 368246 368247 NE1559 NE1560     FALSE 0.277 88.000 0.000 NA   NA
 368247 368248 NE1560 NE1561     FALSE 0.224 99.000 0.000 NA   NA
 368248 368249 NE1561 NE1562     FALSE 0.092 157.000 0.000 NA   NA
 368249 368250 NE1562 NE1563     TRUE 0.990 -10.000 0.185 NA Y NA
 368250 368251 NE1563 NE1564     FALSE 0.469 57.000 0.000 NA   NA
 368251 368252 NE1564 NE1565     FALSE 0.017 295.000 0.000 NA   NA
 368252 368253 NE1565 NE1566     TRUE 0.961 2.000 0.056 NA   NA
 368254 368255 NE1567 NE1568 kduD   TRUE 0.994 -3.000 0.185 0.022   NA
 368255 368256 NE1568 NE1569   neuA1 TRUE 0.988 -3.000 0.144 1.000   NA
 368257 368258 NE1570 NE1571     TRUE 0.522 174.000 0.143 NA   NA
 368259 368260 NE1572 NE1573   apaG TRUE 0.763 11.000 0.006 NA   NA
 368261 368262 NE1574 NE1575     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 368262 368263 NE1575 NE1576     FALSE 0.060 183.000 0.000 NA   NA
 368264 368265 NE1577 NE1578     TRUE 0.998 -3.000 0.700 NA   NA
 368265 368266 NE1578 NE1579     FALSE 0.010 372.000 0.000 NA   NA
 368266 368267 NE1579 NE1580     TRUE 0.991 -15.000 0.429 0.084   NA
 368267 368268 NE1580 NE1581     FALSE 0.042 207.000 0.000 NA   NA
 368268 368269 NE1581 NE1582     TRUE 0.996 -3.000 0.429 NA   NA
 368270 368271 NE1583 NE1584     TRUE 0.917 -10.000 0.000 NA Y NA
 368272 368273 NE1585 NE1586     TRUE 0.934 -195.000 0.091 NA Y NA
 368273 368274 NE1586 NE1587     FALSE 0.098 175.000 0.000 NA N NA
 368274 368275 NE1587 NE1588     TRUE 0.947 17.000 0.136 NA   NA
 368275 368276 NE1588 NE1589     FALSE 0.004 1381.000 0.000 NA   NA
 368276 368277 NE1589 NE1590     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 368277 368278 NE1590 NE1591     FALSE 0.006 525.000 0.000 NA   NA
 368278 368279 NE1591 NE1592     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 368280 368281 NE1593 NE1594 hag   FALSE 0.309 171.000 0.000 NA Y NA
 368281 368282 NE1594 NE1595   fliD,flbC,flaV FALSE 0.337 163.000 0.000 NA Y NA
 368282 368283 NE1595 NE1596 fliD,flbC,flaV fliS TRUE 0.991 47.000 0.216 0.004 Y NA
 368283 368284 NE1596 NE1597 fliS   TRUE 0.995 -3.000 0.338 1.000   NA
 368284 368285 NE1597 NE1598     FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 368285 368286 NE1598 NE1599     TRUE 0.780 4.000 0.000 NA   NA
 368287 368288 NE1600 NE1601     FALSE 0.084 174.000 0.000 1.000   NA
 368288 368289 NE1601 NE1602     TRUE 0.995 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 368289 368290 NE1602 NE1603     TRUE 0.996 -6.000 0.300 NA Y NA
 368290 368291 NE1603 NE1604     TRUE 0.987 30.000 0.250 NA Y NA
 368291 368292 NE1604 NE1605     TRUE 0.913 113.000 0.429 NA   NA
 368292 368293 NE1605 NE1606     TRUE 0.973 81.000 0.600 NA   NA
 368293 368294 NE1606 NE1607     TRUE 0.983 -18.000 0.400 NA   NA
 368294 368295 NE1607 NE1608     TRUE 0.989 -22.000 0.667 NA   NA
 368295 368296 NE1608 NE1609     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 368296 368297 NE1609 NE1610     TRUE 0.998 0.000 0.375 1.000 Y NA
 368297 368298 NE1610 NE1611     TRUE 0.993 19.000 0.250 0.004 Y NA
 368299 368300 NE1612 NE1613 dapF   FALSE 0.232 127.000 0.002 1.000 N NA
 368301 368302 NE1614 NE1615 cca slt TRUE 0.924 9.000 0.034 1.000 N NA
 368302 368303 NE1615 NE1616 slt gdhA FALSE 0.133 198.000 0.008 1.000 N NA
 368304 2213862 NE1617 NE1618   fecR TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 2213862 2213863 NE1618 NE1619 fecR   TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 2213863 2213864 NE1619 NE1620     FALSE 0.007 473.000 0.000 NA   NA
 2213864 2213865 NE1620 NE1621     FALSE 0.064 179.000 0.000 NA   NA
 2213865 368305 NE1621 NE1622     FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 368306 368307 NE1623 NE1624 metH gltX FALSE 0.271 127.000 0.004 1.000 N NA
 368308 368309 NE1625 NE1626     TRUE 0.988 7.000 0.225 1.000 N NA
 368309 368310 NE1626 NE1627   aroE1 TRUE 0.886 34.000 0.054 1.000 N NA
 368310 368311 NE1627 NE1628 aroE1 mtgA TRUE 0.983 -3.000 0.107 1.000   NA
 368311 368312 NE1628 NE1629 mtgA   FALSE 0.119 174.000 0.006 NA   NA
 368312 368313 NE1629 NE1630     FALSE 0.059 185.000 0.000 NA   NA
 368313 368314 NE1630 NE1631     TRUE 0.966 0.000 0.000 NA Y NA
 368316 368317 NE1634 NE1635     TRUE 0.956 -7.000 0.086 NA   NA
 368317 368318 NE1635 NE1636     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 368318 368319 NE1636 NE1637     TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 368319 368320 NE1637 NE1638   czcA FALSE 0.011 350.000 0.000 NA   NA
 368320 368321 NE1638 NE1639 czcA czcB TRUE 0.976 105.000 1.000 1.000 N NA
 368321 368322 NE1639 NE1640 czcB czcC TRUE 0.998 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 368322 368323 NE1640 NE1641 czcC   TRUE 0.871 106.000 0.250 NA   NA
 368323 368324 NE1641 NE1642     FALSE 0.135 156.000 0.004 NA   NA
 368325 368326 NE1643 NE1644   rpmF TRUE 0.988 41.000 0.599 NA   NA
 368326 368327 NE1644 NE1645 rpmF plsX TRUE 0.983 51.000 0.418 1.000 N NA
 368327 368328 NE1645 NE1646 plsX fabH TRUE 0.998 9.000 0.380 0.005 Y NA
 368328 368329 NE1646 NE1647 fabH fabD TRUE 0.997 4.000 0.182 0.005 Y NA
 368329 368330 NE1647 NE1648 fabD fabG1 TRUE 0.995 56.000 0.432 0.005 Y NA
 368330 368331 NE1648 NE1649 fabG1   TRUE 0.930 168.000 0.321 0.005 Y NA
 368331 368332 NE1649 NE1650   fabF1 TRUE 0.991 34.000 0.346 1.000 Y NA
 368332 368333 NE1650 NE1651 fabF1   FALSE 0.343 128.000 0.019 NA   NA
 368333 368334 NE1651 NE1652     FALSE 0.261 91.000 0.000 NA   NA
 368335 368336 NE1653 NE1654     FALSE 0.112 193.000 0.009 NA   NA
 368336 368337 NE1654 NE1655     FALSE 0.445 68.000 0.003 NA   NA
 368337 368338 NE1655 NE1656     TRUE 0.984 -3.000 0.091 1.000 N NA
 368338 368339 NE1656 NE1657     TRUE 0.610 121.000 0.064 1.000 N NA
 368339 368340 NE1657 NE1658     TRUE 0.862 79.000 0.096 1.000 N NA
 368342 368343 NE1660 NE1661 greA carB TRUE 0.825 135.000 0.241 1.000 N NA
 368343 368344 NE1661 NE1662 carB carA TRUE 0.995 25.000 0.345 0.001 Y NA
 368344 368345 NE1662 NE1663 carA prlC FALSE 0.091 300.000 0.000 1.000 Y NA
 368345 368346 NE1663 NE1664 prlC pyrX FALSE 0.318 120.000 0.005 1.000 N NA
 368346 368347 NE1664 NE1665 pyrX pyrB TRUE 0.998 2.000 0.452 1.000 Y NA
 368347 368348 NE1665 NE1666 pyrB pyrR TRUE 0.914 136.000 0.247 1.000 Y NA
 368348 368349 NE1666 NE1667 pyrR   TRUE 0.958 -13.000 0.109 1.000 N NA
 368349 368350 NE1667 NE1668     TRUE 0.988 -7.000 0.263 NA N NA
 368350 368351 NE1668 NE1669     TRUE 0.911 -3.000 0.004 NA N NA
 368351 368352 NE1669 NE1670     TRUE 0.880 61.000 0.033 0.022 N NA
 368353 368354 NE1671 NE1672 rpsP   TRUE 0.994 29.000 0.342 0.016 Y NA
 368354 368355 NE1672 NE1673   trmB TRUE 0.998 11.000 0.672 1.000 Y NA
 368355 368356 NE1673 NE1674 trmB rplS TRUE 0.999 2.000 0.567 1.000 Y NA
 368356 368357 NE1674 NE1675 rplS   FALSE 0.065 192.000 0.000 1.000   NA
 368357 2213867 NE1675 NE1676     FALSE 0.117 141.000 0.000 NA   NA
 2213867 2213868 NE1676 NE1677     FALSE 0.402 -70.000 0.000 NA   NA
 368358 368359 NE1678 NE1679 yfgD   TRUE 0.660 10.000 0.000 NA   NA
 368359 368360 NE1679 NE1680     TRUE 0.766 72.000 0.053 NA   NA
 368360 368361 NE1680 NE1681     TRUE 0.638 59.000 0.008 NA   NA
 368361 368362 NE1681 NE1682     TRUE 0.688 31.000 0.008 NA   NA
 368362 368363 NE1682 NE1683     FALSE 0.104 149.000 0.000 NA   NA
 368363 368364 NE1683 NE1684     TRUE 0.745 6.000 0.000 NA   NA
 368364 368365 NE1684 NE1685     TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 368366 368367 NE1686 NE1687   hpaI2 TRUE 0.904 20.000 0.059 1.000 N NA
 368367 368368 NE1687 NE1688 hpaI2 serA TRUE 0.995 -3.000 0.273 1.000 N NA
 368368 368369 NE1688 NE1689 serA   TRUE 0.919 -7.000 0.022 1.000 N NA
 368369 368370 NE1689 NE1690     TRUE 0.939 -3.000 0.012 1.000   NA
 368370 368371 NE1690 NE1691     TRUE 0.739 -18.000 0.007 1.000   NA
 368371 368372 NE1691 NE1692     TRUE 0.683 25.000 0.007 NA   NA
 368373 368374 NE1693 NE1694     TRUE 0.713 61.000 0.017 NA   NA
 368375 368376 NE1695 NE1696     TRUE 0.792 81.000 0.067 NA N NA
 368377 368378 NE1697 NE1698 metY   FALSE 0.057 226.000 0.000 1.000 N NA
 368382 368383 NE1702 NE1703     FALSE 0.004 691.000 0.000 NA   NA
 368383 368384 NE1703 NE1704     TRUE 0.953 11.000 0.110 NA   NA
 368386 368387 NE1706 NE1707 slyD rnhB TRUE 0.750 15.000 0.003 1.000 N NA
 368387 368388 NE1707 NE1708 rnhB fabZ TRUE 0.703 22.000 0.003 1.000 N NA
 368388 368389 NE1708 NE1709 fabZ   TRUE 0.685 17.000 0.000 1.000 N NA
 368389 368390 NE1709 NE1710     TRUE 0.871 27.000 0.000 1.000 Y NA
 368390 368391 NE1710 NE1711     TRUE 0.996 3.000 0.204 1.000 Y NA
 368391 368392 NE1711 NE1712   dxr TRUE 0.990 27.000 0.568 1.000 N NA
 368392 368393 NE1712 NE1713 dxr cdsA TRUE 0.998 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 368393 368394 NE1713 NE1714 cdsA   TRUE 0.993 39.000 0.400 1.000 Y NA
 368394 368395 NE1714 NE1715   rrf TRUE 0.995 4.000 0.409 1.000 N NA
 368395 368396 NE1715 NE1716 rrf pyrH TRUE 0.662 106.000 0.058 1.000 N NA
 368396 368397 NE1716 NE1717 pyrH tsf FALSE 0.420 155.000 0.047 1.000 N NA
 368397 368398 NE1717 NE1718 tsf rpsB TRUE 0.993 75.000 0.748 1.000 Y NA
 368398 368399 NE1718 NE1719 rpsB   FALSE 0.057 226.000 0.000 1.000 N NA
 368399 368400 NE1719 NE1720     TRUE 0.859 68.000 0.080 1.000   NA
 368400 368401 NE1720 NE1721     TRUE 0.561 31.000 0.000 1.000   NA
 368401 368402 NE1721 NE1722     FALSE 0.148 245.000 0.000 1.000 Y NA
 368402 368403 NE1722 NE1723     FALSE 0.025 646.000 0.000 NA Y NA
 368404 368405 NE1724 NE1725     TRUE 0.963 58.000 0.281 NA   NA
 368405 368406 NE1725 NE1726     TRUE 0.963 -7.000 0.104 NA   NA
 368406 368407 NE1726 NE1727   trpS TRUE 0.907 73.000 0.158 1.000   NA
 368407 368408 NE1727 NE1728 trpS   TRUE 0.877 40.000 0.065 NA   NA
 368408 368409 NE1728 NE1729     TRUE 0.534 -34.000 0.004 NA   NA
 368409 368410 NE1729 NE1730   icd TRUE 0.781 13.000 0.005 NA N NA
 368412 368413 NE1732 NE1733   clpA TRUE 0.997 2.000 0.596 NA   NA
 368413 368414 NE1733 NE1734 clpA pyrE TRUE 0.666 19.000 0.000 1.000 N NA
 368414 368415 NE1734 NE1735 pyrE   FALSE 0.024 296.000 0.000 NA N NA
 368415 368416 NE1735 NE1736     TRUE 0.997 5.000 0.400 NA Y NA
 368416 368417 NE1736 NE1737   nrtD TRUE 0.996 -12.000 0.400 1.000 Y NA
 368417 368418 NE1737 NE1738 nrtD   FALSE 0.059 286.000 0.000 0.041 N NA
 368418 2213869 NE1738 NE1739   vsrD TRUE 0.535 20.000 0.000 NA   NA
 368421 368422 NE1743 NE1744 cbbI, ppi, rpiA phoU FALSE 0.353 145.000 0.024 NA N NA
 368422 368423 NE1744 NE1745 phoU ppx TRUE 0.949 25.000 0.050 NA Y NA
 368424 368425 NE1746 NE1747   pilY1 TRUE 0.992 18.000 0.346 NA Y NA
 368425 368426 NE1747 NE1748 pilY1   TRUE 0.956 14.000 0.038 NA Y NA
 368426 368427 NE1748 NE1749     TRUE 0.953 25.000 0.057 NA Y NA
 368427 368428 NE1749 NE1750     TRUE 0.992 15.000 0.667 NA   NA
 368428 368429 NE1750 NE1751     TRUE 0.979 -6.000 0.167 NA   NA
 368429 368430 NE1751 NE1752     FALSE 0.016 300.000 0.000 NA   NA
 368431 368432 NE1753 NE1754 lig   FALSE 0.163 154.000 0.002 1.000 N NA
 368432 368433 NE1754 NE1755     TRUE 0.921 -7.000 0.023 1.000 N NA
 368435 5437968 NE1757 RNA_30   tRNALys1 FALSE 0.469 57.000 0.000 NA   NA
 5437968 368436 RNA_30 NE1758 tRNALys1 dedA FALSE 0.108 146.000 0.000 NA   NA
 368439 368440 NE1761 NE1762   hptG FALSE 0.039 214.000 0.000 NA   NA
 368442 368443 NE1764 NE1765 nuoN nuoM TRUE 0.992 67.000 0.340 0.002 Y NA
 368443 368444 NE1765 NE1766 nuoM nuoL TRUE 0.973 86.000 0.175 0.002 Y NA
 368444 368445 NE1766 NE1767 nuoL nuoK TRUE 0.994 65.000 0.451 0.007 Y NA
 368445 368446 NE1767 NE1768 nuoK nuoJ TRUE 0.996 56.000 0.484 0.003 Y NA
 368446 368447 NE1768 NE1769 nuoJ nuoI TRUE 0.996 18.000 0.442 0.007 Y NA
 368447 368448 NE1769 NE1770 nuoI nuoH TRUE 0.997 14.000 0.500 0.007 Y NA
 368448 368449 NE1770 NE1771 nuoH nuoG TRUE 0.997 23.000 0.515 0.007 Y NA
 368449 368450 NE1771 NE1772 nuoG nuoF TRUE 0.993 63.000 0.395 0.007 Y NA
 368450 368451 NE1772 NE1773 nuoF nuoE TRUE 0.999 -3.000 0.343 0.007 Y NA
 368451 368452 NE1773 NE1774 nuoE nuoD TRUE 0.999 -3.000 0.355 0.007 Y NA
 368452 368453 NE1774 NE1775 nuoD nuoC TRUE 0.995 61.000 0.483 0.007 Y NA
 368453 368454 NE1775 NE1776 nuoC nuoB TRUE 0.996 13.000 0.328 0.003 Y NA
 368454 368455 NE1776 NE1777 nuoB nuoA TRUE 0.999 4.000 0.507 0.003 Y NA
 368455 5437969 NE1777 RNA_7 nuoA tRNALeu1 FALSE 0.394 69.000 0.000 NA   NA
 5437969 368456 RNA_7 NE1778 tRNALeu1 secG TRUE 0.510 37.000 0.000 NA   NA
 368456 368457 NE1778 NE1779 secG cbbJ, tpiA, tim TRUE 0.968 17.000 0.184 1.000 N NA
 368458 368459 NE1780 NE1781     TRUE 0.970 0.000 0.043 1.000 N NA
 368459 368460 NE1781 NE1782     TRUE 0.963 97.000 0.408 0.022 N NA
 368460 368461 NE1782 NE1783   thiF TRUE 0.920 31.000 0.082 1.000 N NA
 2213871 2213872 NE1786 NE1787     FALSE 0.469 57.000 0.000 NA   NA
 368464 368465 NE1788 NE1789     TRUE 0.934 -195.000 0.091 NA Y NA
 368465 368466 NE1789 NE1790     FALSE 0.096 155.000 0.000 NA   NA
 368467 368468 NE1791 NE1792     TRUE 0.793 157.000 0.333 NA   NA
 368468 368469 NE1792 NE1793     TRUE 0.893 67.000 0.118 NA   NA
 368469 368470 NE1793 NE1794     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 368470 368471 NE1794 NE1795     TRUE 0.875 49.000 0.062 1.000   NA
 368471 368472 NE1795 NE1796     TRUE 0.991 13.000 0.469 1.000 N NA
 368472 368473 NE1796 NE1797     TRUE 0.977 17.000 0.304 NA   NA
 368473 368474 NE1797 NE1798     TRUE 0.956 81.000 0.413 NA   NA
 368474 368475 NE1798 NE1799     TRUE 0.994 7.000 0.509 1.000   NA
 368475 368476 NE1799 NE1800     TRUE 0.946 108.000 0.557 1.000   NA
 368476 368477 NE1800 NE1801     TRUE 0.993 -3.000 0.229 1.000   NA
 368477 368478 NE1801 NE1802     TRUE 0.985 15.000 0.400 NA   NA
 368478 368479 NE1802 NE1803   yveL TRUE 0.997 0.000 0.514 NA   NA
 368479 368480 NE1803 NE1804 yveL   TRUE 0.987 41.000 0.500 1.000 N NA
 368480 368481 NE1804 NE1805   wza TRUE 0.997 43.000 0.633 0.073 Y NA
 368482 368483 NE1806 NE1807     FALSE 0.052 262.000 0.000 0.087   NA
 5437970 368485 RNA_31 NE1809 tRNASer3   FALSE 0.007 447.000 0.000 NA   NA
 368485 368486 NE1809 NE1810     FALSE 0.320 192.000 0.059 1.000 N NA
 368486 368487 NE1810 NE1811     TRUE 0.987 31.000 0.140 0.002 Y NA
 2213873 2213874 NE1812 NE1813     FALSE 0.171 115.000 0.000 NA   NA
 2213874 368488 NE1813 NE1814     FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 368489 368490 NE1815 NE1816     TRUE 0.992 54.000 0.667 0.081   NA
 368490 368491 NE1816 NE1817     FALSE 0.006 542.000 0.000 1.000   NA
 368491 368492 NE1817 NE1818     FALSE 0.430 -40.000 0.000 NA   NA
 2213875 2213876 NE1819 NE1820     TRUE 0.522 28.000 0.000 NA   NA
 368493 368494 NE1821 NE1822     TRUE 0.960 0.000 0.041 NA   NA
 368495 368496 NE1823 NE1824   pth TRUE 0.966 75.000 0.184 1.000 Y NA
 368496 368497 NE1824 NE1825 pth rplY TRUE 0.977 120.000 0.496 0.026 Y NA
 368497 368498 NE1825 NE1826 rplY   TRUE 0.933 57.000 0.122 1.000 N NA
 368498 5437971 NE1826 RNA_6   tRNAGln1 FALSE 0.253 93.000 0.000 NA   NA
 5437971 368499 RNA_6 NE1827 tRNAGln1 ipk TRUE 0.660 10.000 0.000 NA   NA
 368499 368500 NE1827 NE1828 ipk   TRUE 0.957 21.000 0.157 1.000 N NA
 368500 368501 NE1828 NE1829   minE FALSE 0.317 113.000 0.005 NA N NA
 368501 368502 NE1829 NE1830 minE minD TRUE 0.999 0.000 0.618 NA Y NA
 368502 368503 NE1830 NE1831 minD minC TRUE 0.994 26.000 0.466 1.000 Y NA
 368504 368505 NE1832 NE1833     TRUE 0.963 116.000 1.000 NA   NA
 368505 368506 NE1833 NE1834   trkA FALSE 0.021 274.000 0.000 NA   NA
 368506 368507 NE1834 NE1835 trkA   TRUE 0.999 10.000 1.000 0.003 Y NA
 368507 368508 NE1835 NE1836   pilG FALSE 0.244 119.000 0.000 1.000 N NA
 368508 368509 NE1836 NE1837 pilG   FALSE 0.304 97.000 0.000 NA N NA
 368509 368510 NE1837 NE1838   ubiA TRUE 0.975 74.000 0.248 NA Y NA
 368510 368511 NE1838 NE1839 ubiA   TRUE 0.835 71.000 0.007 1.000 Y NA
 368511 368512 NE1839 NE1840     FALSE 0.048 212.000 0.000 1.000   NA
 368515 368516 NE1845 NE1846     FALSE 0.006 599.000 0.000 1.000   NA
 368516 368517 NE1846 NE1847     TRUE 0.995 -37.000 0.667 1.000 Y NA
 368520 368521 NE1850 NE1851 recG   TRUE 0.910 31.000 0.076 NA N NA
 368524 368525 NE1854 NE1855 argH   TRUE 0.702 20.000 0.003 1.000 N NA
 368525 368526 NE1855 NE1856     FALSE 0.023 286.000 0.000 1.000   NA
 368526 368527 NE1856 NE1857   ygcA FALSE 0.421 65.000 0.000 NA   NA
 368527 368528 NE1857 NE1858 ygcA   FALSE 0.187 129.000 0.000 NA N NA
 368529 368530 NE1859 NE1860 cheB   TRUE 0.993 11.000 0.256 1.000 Y NA
 368530 368531 NE1860 NE1861   cheR TRUE 0.987 76.000 0.444 1.000 Y NA
 368531 368532 NE1861 NE1862 cheR   TRUE 0.835 -3.000 0.000 NA   NA
 368532 368533 NE1862 NE1863     TRUE 0.599 -15.000 0.000 NA   NA
 368533 368534 NE1863 NE1864     FALSE 0.286 223.000 0.000 0.006 Y NA
 368534 368535 NE1864 NE1865   cheW TRUE 0.993 74.000 0.500 0.006 Y NA
 368535 368536 NE1865 NE1866 cheW cheA TRUE 0.966 75.000 0.105 0.006 Y NA
 368537 368538 NE1867 NE1868     FALSE 0.476 89.000 0.010 NA   NA
 368538 368539 NE1868 NE1869   aarF TRUE 0.948 90.000 0.432 NA   NA
 368539 368540 NE1869 NE1870 aarF potA FALSE 0.195 116.000 0.000 1.000   NA
 368540 368541 NE1870 NE1871 potA potB TRUE 0.998 3.000 0.440 1.000 Y NA
 368541 368542 NE1871 NE1872 potB potC TRUE 0.979 10.000 0.040 0.022 Y NA
 368542 368543 NE1872 NE1873 potC potD TRUE 0.986 3.000 0.017 0.022 Y NA
 368543 368544 NE1873 NE1874 potD   TRUE 0.940 6.000 0.031 1.000 N NA
 368544 368545 NE1874 NE1875     FALSE 0.201 313.000 0.179 NA   NA
 368550 368551 NE1880 NE1881     FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 368552 368553 NE1882 NE1883     TRUE 0.978 -3.000 0.083 NA   NA
 368553 368554 NE1883 NE1884     TRUE 0.921 -7.000 0.041 NA   NA
 368554 368555 NE1884 NE1885     FALSE 0.469 57.000 0.000 NA   NA
 368556 368557 NE1886 NE1887 katA   TRUE 0.715 64.000 0.021 NA   NA
 368557 368558 NE1887 NE1888     TRUE 0.773 38.000 0.020 NA   NA
 368558 368559 NE1888 NE1889     TRUE 0.635 80.000 0.026 NA   NA
 368559 368560 NE1889 NE1890     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 368560 368561 NE1890 NE1891     TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 368561 368562 NE1891 NE1892   nadB1 FALSE 0.176 113.000 0.000 NA   NA
 368563 368564 NE1893 NE1894 ilvE   TRUE 0.964 27.000 0.223 NA   NA
 368564 368565 NE1894 NE1895     TRUE 0.631 65.000 0.010 NA   NA
 368565 368566 NE1895 NE1896   nadE TRUE 0.733 49.000 0.007 1.000 N NA
 368566 368567 NE1896 NE1897 nadE   TRUE 0.662 65.000 0.010 1.000   NA
 368567 368568 NE1897 NE1898     TRUE 0.706 75.000 0.010 0.072   NA
 368568 368569 NE1898 NE1899     TRUE 0.970 0.000 0.042 1.000 N NA
 368569 368570 NE1899 NE1900     TRUE 0.989 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 368570 368571 NE1900 NE1901     FALSE 0.015 396.000 0.000 1.000 N NA
 368571 368572 NE1901 NE1902     TRUE 0.996 0.000 0.095 0.007 Y NA
 368572 368573 NE1902 NE1903   phaD TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.007 Y NA
 368573 368574 NE1903 NE1904 phaD   TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 368574 368575 NE1904 NE1905     TRUE 1.000 -3.000 0.937 0.039 Y NA
 368575 368576 NE1905 NE1906     TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 368577 368578 NE1907 NE1908     FALSE 0.026 248.000 0.000 NA   NA
 368578 368579 NE1908 NE1909     FALSE 0.033 264.000 0.000 NA N NA
 368581 368582 NE1911 NE1912     TRUE 0.583 164.000 0.124 1.000 N NA
 368582 368583 NE1912 NE1913   prfA TRUE 0.997 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 368583 368584 NE1913 NE1914 prfA hemA TRUE 0.994 0.000 0.171