MicrobesOnline Operon Predictions for Hyphomonas neptunium ATCC 15444

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2210297 2210298 HNE_0001 HNE_0002     TRUE 0.965 -3.000 0.135 NA   NA
 2210298 2210299 HNE_0002 HNE_0003   aroE TRUE 0.968 -3.000 0.169 NA N NA
 2210299 2210300 HNE_0003 HNE_0004 aroE coaE TRUE 0.948 -3.000 0.078 1.000 N NA
 2210300 2210301 HNE_0004 HNE_0005 coaE dnaQ TRUE 0.956 -3.000 0.092 1.000 N NA
 2210303 2210304 HNE_0007 HNE_0008     TRUE 0.794 52.000 0.324 1.000   NA
 2210304 2210305 HNE_0008 HNE_0009     TRUE 0.975 6.000 0.332 NA   NA
 2210306 2210307 HNE_0010 HNE_0011     FALSE 0.306 139.000 0.087 NA   NA
 2210308 2210309 HNE_0012 HNE_0013     TRUE 0.538 67.000 0.141 NA   NA
 2210312 2210313 HNE_0016 HNE_0017 ppa   FALSE 0.076 110.000 0.000 1.000 N NA
 2210314 2210315 HNE_0018 HNE_0019     FALSE 0.446 67.000 0.080 1.000   NA
 2210315 2210316 HNE_0019 HNE_0020     TRUE 0.979 -3.000 0.286 NA   NA
 2210317 2210318 HNE_0021 HNE_0022     FALSE 0.272 30.000 0.000 NA   NA
 2210318 2210319 HNE_0022 HNE_0023     FALSE 0.212 38.000 0.000 NA   NA
 2210319 2210320 HNE_0023 HNE_0024     FALSE 0.364 20.000 0.000 NA   NA
 2210320 2210321 HNE_0024 HNE_0025     TRUE 0.781 15.000 0.031 NA   NA
 2210321 2210322 HNE_0025 HNE_0026     FALSE 0.024 211.000 0.000 NA   NA
 2210326 2210327 HNE_0030 HNE_0031     TRUE 0.867 -3.000 0.006 1.000 N NA
 2210327 2210328 HNE_0031 HNE_0032     FALSE 0.394 77.000 0.000 1.000 Y NA
 2210329 2210330 HNE_0033 HNE_0034     FALSE 0.068 116.000 0.000 NA   NA
 2210330 2210331 HNE_0034 HNE_0035     FALSE 0.065 99.000 0.000 NA N NA
 2210331 2210332 HNE_0035 HNE_0036   ffh FALSE 0.028 178.000 0.000 NA N NA
 2210332 2210333 HNE_0036 HNE_0037 ffh   TRUE 0.907 -3.000 0.023 1.000 N NA
 2210333 2210334 HNE_0037 HNE_0038   rpsP TRUE 0.588 41.000 0.050 1.000 N NA
 2210336 2210337 HNE_0040 HNE_0041   rimM TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 2210337 2210338 HNE_0041 HNE_0042 rimM   FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 2210340 2210341 HNE_0044 HNE_0045 kefC trmD FALSE 0.263 32.000 0.000 1.000 N NA
 2210341 2210342 HNE_0045 HNE_0046 trmD rplS TRUE 0.991 -13.000 0.567 1.000 Y NA
 2210342 2210343 HNE_0046 HNE_0047 rplS leuC1 FALSE 0.170 124.000 0.008 1.000 N NA
 2210343 2210344 HNE_0047 HNE_0048 leuC1 bioB FALSE 0.316 26.000 0.000 1.000 N NA
 2210344 2210345 HNE_0048 HNE_0049 bioB cysK FALSE 0.075 96.000 0.000 1.000 N NA
 2210345 2210346 HNE_0049 HNE_0050 cysK   FALSE 0.075 93.000 0.000 1.000 N NA
 2210346 2210347 HNE_0050 HNE_0051     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210347 2210348 HNE_0051 HNE_0052   leuD1 FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 2210348 2210349 HNE_0052 HNE_0053 leuD1   FALSE 0.063 123.000 0.000 NA   NA
 2210349 2210350 HNE_0053 HNE_0054     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA   NA
 2210350 2210351 HNE_0054 HNE_0055     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 2210351 2210352 HNE_0055 HNE_0056   leuB FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 2210352 2210353 HNE_0056 HNE_0057 leuB   FALSE 0.087 82.000 0.000 1.000   NA
 2210353 2210354 HNE_0057 HNE_0058     FALSE 0.153 55.000 0.000 1.000   NA
 2210354 2210355 HNE_0058 HNE_0059     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 2210363 2210364 HNE_0067 HNE_0068     FALSE 0.075 107.000 0.000 NA   NA
 2210364 2210365 HNE_0068 HNE_0069     FALSE 0.016 284.000 0.000 NA   NA
 2210366 2210367 HNE_0070 HNE_0071 hisA hisH TRUE 0.989 -3.000 0.070 0.005 Y NA
 2210371 2210372 HNE_0075 HNE_0076     TRUE 0.911 -3.000 0.026 NA   NA
 2210372 2210373 HNE_0076 HNE_0077     TRUE 0.675 5.000 0.000 NA   NA
 2210373 2210374 HNE_0077 HNE_0078   mclA FALSE 0.074 90.000 0.000 NA   NA
 2210377 2210378 HNE_0081 HNE_0082 aroK aroB TRUE 0.989 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 2210378 2210379 HNE_0082 HNE_0083 aroB   TRUE 0.651 29.000 0.040 NA N NA
 2210381 2210382 HNE_0085 HNE_0086     FALSE 0.011 415.000 0.000 NA   NA
 2210382 2210383 HNE_0086 HNE_0087     TRUE 0.964 12.000 0.400 NA   NA
 2210383 2210384 HNE_0087 HNE_0088     TRUE 0.550 54.000 0.000 NA Y NA
 2210384 2210385 HNE_0088 HNE_0089     TRUE 0.724 1.000 0.000 NA   NA
 2210385 2210386 HNE_0089 HNE_0090     FALSE 0.076 104.000 0.000 NA   NA
 2210388 2210389 HNE_0092 HNE_0093 gltD gltB TRUE 0.992 6.000 0.188 0.001 Y NA
 2210393 2210394 HNE_0097 HNE_0098     FALSE 0.535 87.000 0.016 1.000 Y NA
 2210394 2210395 HNE_0098 HNE_0099   baiB TRUE 0.708 35.000 0.000 1.000 Y NA
 2210395 2210396 HNE_0099 HNE_0100 baiB   FALSE 0.132 56.000 0.000 1.000 N NA
 2210397 2210398 HNE_0101 HNE_0102     FALSE 0.174 46.000 0.000 NA   NA
 2210399 2210400 HNE_0103 HNE_0104     TRUE 0.809 39.000 0.220 1.000 N NA
 2210400 2210401 HNE_0104 HNE_0105     TRUE 0.971 11.000 0.457 NA   NA
 2210401 2210402 HNE_0105 HNE_0106     TRUE 0.967 6.000 0.222 NA   NA
 2210402 2210403 HNE_0106 HNE_0107   lnt TRUE 0.964 7.000 0.213 1.000   NA
 2210403 2210404 HNE_0107 HNE_0108 lnt   FALSE 0.484 42.000 0.019 1.000   NA
 2210404 2210405 HNE_0108 HNE_0109   trmB FALSE 0.288 32.000 0.000 1.000   NA
 2210405 2210406 HNE_0109 HNE_0110 trmB   FALSE 0.034 186.000 0.000 1.000   NA
 2210406 2210407 HNE_0110 HNE_0111     FALSE 0.024 209.000 0.000 NA   NA
 2210407 2210408 HNE_0111 HNE_0112   nusA TRUE 0.990 -3.000 0.759 NA   NA
 2210408 2210409 HNE_0112 HNE_0113 nusA   TRUE 0.966 -25.000 0.075 NA Y NA
 2210409 2210410 HNE_0113 HNE_0114   infB TRUE 0.700 56.000 0.223 NA N NA
 2210410 2210411 HNE_0114 HNE_0115 infB rbfA TRUE 0.991 10.000 0.530 1.000 Y NA
 2210411 2210412 HNE_0115 HNE_0116 rbfA   FALSE 0.037 163.000 0.000 NA   NA
 2210412 2210413 HNE_0116 HNE_0117   truB FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 2210414 2210415 HNE_0118 HNE_0119     FALSE 0.009 648.000 0.000 NA   NA
 2210417 2210418 HNE_0121 HNE_0122     TRUE 0.984 -3.000 0.444 NA   NA
 2210418 2210419 HNE_0122 HNE_0123     TRUE 0.939 13.000 0.222 NA   NA
 2210419 2210420 HNE_0123 HNE_0124     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 2210420 2210421 HNE_0124 HNE_0125   bdhA FALSE 0.182 45.000 0.000 NA   NA
 2210422 2210423 HNE_0126 HNE_0127     TRUE 0.719 127.000 0.750 NA   NA
 2210423 2210424 HNE_0127 HNE_0128   pyrF TRUE 0.869 -3.000 0.004 1.000   NA
 2210424 2210425 HNE_0128 HNE_0129 pyrF adhA FALSE 0.043 153.000 0.000 1.000 N NA
 2210425 2210426 HNE_0129 HNE_0130 adhA   FALSE 0.050 139.000 0.000 NA   NA
 2210426 2210427 HNE_0130 HNE_0131     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA   NA
 2210428 2210429 HNE_0132 HNE_0133     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210430 2210431 HNE_0134 HNE_0135     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2210432 2210433 HNE_0136 HNE_0137 gcp   FALSE 0.224 36.000 0.000 NA   NA
 2210436 2210437 HNE_0140 HNE_0141     TRUE 0.542 -31.000 0.000 NA   NA
 2210437 2210438 HNE_0141 HNE_0142     FALSE 0.074 89.000 0.000 NA   NA
 2210438 2210439 HNE_0142 HNE_0143     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 2210439 2210440 HNE_0143 HNE_0144     FALSE 0.053 138.000 0.000 1.000 N NA
 2210440 2210441 HNE_0144 HNE_0145   ruvC FALSE 0.051 140.000 0.000 1.000 N NA
 2210441 2210442 HNE_0145 HNE_0146 ruvC ruvA TRUE 0.996 -3.000 0.451 0.009 Y NA
 2210442 2210443 HNE_0146 HNE_0147 ruvA ruvB TRUE 0.997 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 2210445 2210446 HNE_0149 HNE_0150     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210446 2210447 HNE_0150 HNE_0151   tolQ FALSE 0.017 318.000 0.000 1.000   NA
 2210447 2210448 HNE_0151 HNE_0152 tolQ   TRUE 0.923 13.000 0.000 0.057 Y NA
 2210448 2210449 HNE_0152 HNE_0153     FALSE 0.308 26.000 0.000 NA   NA
 2210449 2210450 HNE_0153 HNE_0154   tolB FALSE 0.388 41.000 0.005 NA   NA
 2210450 2210451 HNE_0154 HNE_0155 tolB   FALSE 0.408 233.000 0.592 1.000 N NA
 2210451 2210452 HNE_0155 HNE_0156     FALSE 0.532 115.000 0.199 1.000   NA
 2210452 2210453 HNE_0156 HNE_0157   tilS TRUE 0.923 -12.000 0.085 1.000   NA
 2210453 2210454 HNE_0157 HNE_0158 tilS ftsH TRUE 0.770 49.000 0.145 0.094 N NA
 2210454 2210455 HNE_0158 HNE_0159 ftsH   FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 2210455 2210456 HNE_0159 HNE_0160     FALSE 0.197 41.000 0.000 NA   NA
 2210456 2210457 HNE_0160 HNE_0161     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 2210458 2210459 HNE_0162 HNE_0163     FALSE 0.086 68.000 0.000 NA   NA
 2210461 2210462 HNE_0165 HNE_0166     FALSE 0.327 178.000 0.200 1.000 N NA
 2210462 2210463 HNE_0166 HNE_0167   fcs1 FALSE 0.495 82.000 0.000 0.098 Y NA
 2210463 2210464 HNE_0167 HNE_0168 fcs1 glmM FALSE 0.075 93.000 0.000 1.000 N NA
 2210464 2210465 HNE_0168 HNE_0169 glmM cysQ FALSE 0.339 24.000 0.000 1.000 N NA
 2210465 2210466 HNE_0169 HNE_0170 cysQ   FALSE 0.428 16.000 0.000 1.000 N NA
 2210466 2210467 HNE_0170 HNE_0171   ilvA FALSE 0.077 82.000 0.000 1.000 N NA
 2210467 2210468 HNE_0171 HNE_0172 ilvA   FALSE 0.199 46.000 0.000 1.000   NA
 2210468 2210469 HNE_0172 HNE_0173     FALSE 0.066 129.000 0.000 1.000   NA
 2210470 2210471 HNE_0174 HNE_0175 gbd   TRUE 0.588 10.000 0.000 1.000 N NA
 2210472 2210473 HNE_0176 HNE_0177     FALSE 0.075 82.000 0.000 NA   NA
 2210479 2210480 HNE_0183 HNE_0184     FALSE 0.081 70.000 0.000 NA   NA
 2210481 2210482 HNE_0185 HNE_0186     TRUE 0.970 9.000 0.336 NA   NA
 2210482 2210483 HNE_0186 HNE_0187     TRUE 0.995 -3.000 0.605 NA Y NA
 2210483 2210484 HNE_0187 HNE_0188     FALSE 0.156 49.000 0.000 NA   NA
 2210484 2210485 HNE_0188 HNE_0189     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210486 2210487 HNE_0190 HNE_0191 mscL ihfB FALSE 0.209 109.000 0.012 1.000 N NA
 2210487 2210488 HNE_0191 HNE_0192 ihfB rpsA TRUE 0.591 116.000 0.292 1.000 N NA
 2210488 2210489 HNE_0192 HNE_0193 rpsA cmk FALSE 0.494 142.000 0.281 1.000 N NA
 2210489 2210490 HNE_0193 HNE_0194 cmk   FALSE 0.116 61.000 0.000 1.000 N NA
 2210490 2210491 HNE_0194 HNE_0195   aroA FALSE 0.143 54.000 0.000 1.000 N NA
 2210492 1463948 HNE_0196 HNE_0197     FALSE 0.133 55.000 0.000 NA   NA
 1463948 2210493 HNE_0197 HNE_0198     FALSE 0.014 341.000 0.000 NA   NA
 2210493 2210494 HNE_0198 HNE_0199     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 2210494 2210495 HNE_0199 HNE_0200     TRUE 0.866 13.000 0.067 NA   NA
 2210495 2210496 HNE_0200 HNE_0201     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210496 2210497 HNE_0201 HNE_0202     FALSE 0.168 47.000 0.000 NA   NA
 2210497 2210498 HNE_0202 HNE_0203     FALSE 0.507 102.000 0.151 NA   NA
 2210498 2210499 HNE_0203 HNE_0204     TRUE 0.942 -13.000 0.144 NA   NA
 2210499 2210500 HNE_0204 HNE_0205     TRUE 0.707 94.000 0.543 NA   NA
 2210500 2210501 HNE_0205 HNE_0206   rpoN TRUE 0.674 19.000 0.009 1.000   NA
 2210502 2210503 HNE_0207 HNE_0208 rbsK   TRUE 0.672 -3.000 0.000 NA N NA
 2210503 2210504 HNE_0208 HNE_0209     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210506 2210507 HNE_0211 HNE_0212     TRUE 0.987 5.000 0.680 NA N NA
 2210507 2210508 HNE_0212 HNE_0213     TRUE 0.917 10.000 0.000 1.000 Y NA
 2210509 2210510 HNE_0214 HNE_0215     FALSE 0.164 209.000 0.000 1.000 Y NA
 2210510 2210511 HNE_0215 HNE_0216     TRUE 0.878 -49.000 0.057 1.000   NA
 2210513 2210514 HNE_0218 HNE_0219     TRUE 0.895 35.000 0.500 NA N NA
 2210514 2210515 HNE_0219 HNE_0220     FALSE 0.104 299.000 0.000 NA Y NA
 2210515 2210516 HNE_0220 HNE_0221     FALSE 0.087 88.000 0.000 1.000   NA
 2210516 2210517 HNE_0221 HNE_0222     FALSE 0.348 22.000 0.000 NA   NA
 2210518 1463975 HNE_0223 HNE_0224     FALSE 0.050 139.000 0.000 NA   NA
 2210520 2210521 HNE_0226 HNE_0227     TRUE 0.866 33.000 0.294 1.000 N NA
 2210521 2210522 HNE_0227 HNE_0228     FALSE 0.059 273.000 0.019 1.000 N NA
 2210525 1463983 HNE_0231 HNE_0232     FALSE 0.074 99.000 0.000 NA   NA
 1463983 2210526 HNE_0232 HNE_0233     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 2210526 2210527 HNE_0233 HNE_0234     FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 2210527 2210528 HNE_0234 HNE_0235     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 2210528 2210529 HNE_0235 HNE_0236     TRUE 0.990 5.000 0.917 NA   NA
 2210530 2210531 HNE_0237 HNE_0238     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210531 2210532 HNE_0238 HNE_0239     FALSE 0.046 145.000 0.000 NA   NA
 2210532 2210533 HNE_0239 HNE_0240     FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 2210533 2210534 HNE_0240 HNE_0241   fliL TRUE 0.931 5.000 0.062 NA   NA
 2210535 2210536 HNE_0242 HNE_0243 fliF   TRUE 0.606 -7.000 0.000 NA   NA
 2210536 2210537 HNE_0243 HNE_0244     FALSE 0.358 21.000 0.000 NA   NA
 2210537 2210538 HNE_0244 HNE_0245   fliP TRUE 0.990 -3.000 0.704 1.000   NA
 2210538 2210539 HNE_0245 HNE_0246 fliP   TRUE 0.983 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 2210540 2210541 HNE_0247 HNE_0248 flgI   TRUE 0.998 5.000 0.950 0.004 Y NA
 2210541 2210542 HNE_0248 HNE_0249   flgK TRUE 0.997 6.000 0.864 0.004 Y NA
 2210542 2210543 HNE_0249 HNE_0250 flgK flgE TRUE 0.989 27.000 0.955 0.004 Y NA
 2210543 2210544 HNE_0250 HNE_0251 flgE   TRUE 0.899 119.000 0.905 1.000 Y NA
 2210545 2210546 HNE_0252 HNE_0253     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA   NA
 2210546 2210547 HNE_0253 HNE_0254     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210547 2210548 HNE_0254 HNE_0255   flgF TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210548 2210549 HNE_0255 HNE_0256 flgF flgG TRUE 0.988 29.000 1.000 0.001 Y NA
 2210549 2210550 HNE_0256 HNE_0257 flgG flgA TRUE 0.991 5.000 1.000 NA   NA
 2210550 2210551 HNE_0257 HNE_0258 flgA flgH TRUE 0.920 -18.000 0.095 NA   NA
 2210551 2210552 HNE_0258 HNE_0259 flgH   FALSE 0.489 67.000 0.037 0.009   NA
 2210553 2210554 HNE_0260 HNE_0261     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 2210555 2210556 HNE_0262 HNE_0263     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210556 2210557 HNE_0263 HNE_0264     FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 2210557 2210558 HNE_0264 HNE_0265     FALSE 0.370 112.000 0.000 NA Y NA
 2210558 2210559 HNE_0265 HNE_0266     TRUE 0.955 0.000 0.000 NA Y NA
 2210559 2210560 HNE_0266 HNE_0267     TRUE 0.992 2.000 0.850 NA   NA
 2210562 2210563 HNE_0269 HNE_0270     TRUE 0.903 15.000 0.007 NA Y NA
 2210563 2210564 HNE_0270 HNE_0271   fliE TRUE 0.966 13.000 0.038 0.004 Y NA
 2210564 2210565 HNE_0271 HNE_0272 fliE fliQ TRUE 0.976 19.000 0.404 1.000 Y NA
 2210565 2210566 HNE_0272 HNE_0273 fliQ flhA TRUE 0.984 10.000 0.095 0.012 Y NA
 2210566 2210567 HNE_0273 HNE_0274 flhA   TRUE 0.910 42.000 0.200 1.000 Y NA
 2210567 2210568 HNE_0274 HNE_0275     TRUE 0.994 10.000 0.952 1.000 Y NA
 2210568 2210569 HNE_0275 HNE_0276     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210572 2210573 HNE_0279 HNE_0280     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA Y NA
 2210573 2210574 HNE_0280 HNE_0281     FALSE 0.009 475.000 0.000 NA N NA
 2210574 1464033 HNE_0281 HNE_0282     FALSE 0.011 423.000 0.000 NA   NA
 1464033 2210575 HNE_0282 HNE_0283     FALSE 0.009 714.000 0.000 NA   NA
 2210575 2210576 HNE_0283 HNE_0284     FALSE 0.010 566.000 0.000 NA   NA
 2210576 2210577 HNE_0284 HNE_0285     TRUE 0.896 -43.000 0.017 0.009   NA
 2210577 2210578 HNE_0285 HNE_0286     FALSE 0.009 1340.000 0.000 1.000   NA
 2210578 2210579 HNE_0286 HNE_0287     TRUE 0.961 -3.000 0.113 NA   NA
 2210579 2210580 HNE_0287 HNE_0288     TRUE 0.606 -7.000 0.000 NA   NA
 2210581 2210582 HNE_0289 HNE_0290     TRUE 0.617 -6.000 0.000 NA   NA
 2210582 2210583 HNE_0290 HNE_0291     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 2210585 2210586 HNE_0293 HNE_0294 dusA   FALSE 0.030 187.000 0.000 1.000 N NA
 2210586 2210587 HNE_0294 HNE_0295     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210592 2210593 HNE_0300 HNE_0301   gshB FALSE 0.286 28.000 0.000 NA   NA
 2210593 2210594 HNE_0301 HNE_0302 gshB   FALSE 0.276 68.000 0.023 NA   NA
 2210595 2210596 HNE_0303 HNE_0304     TRUE 0.977 5.000 0.307 NA   NA
 2210596 2210597 HNE_0304 HNE_0305     FALSE 0.075 82.000 0.000 NA   NA
 2210599 2210600 HNE_0307 HNE_0308     FALSE 0.372 70.000 0.065 NA   NA
 2210600 2210601 HNE_0308 HNE_0309     FALSE 0.229 40.000 0.000 1.000   NA
 2210601 2210602 HNE_0309 HNE_0310   sucC FALSE 0.048 144.000 0.000 1.000 N NA
 2210602 2210603 HNE_0310 HNE_0311 sucC sucD TRUE 0.994 5.000 0.256 0.001 Y NA
 2210603 2210604 HNE_0311 HNE_0312 sucD sucA TRUE 0.560 150.000 0.092 1.000 Y NA
 2210604 2210605 HNE_0312 HNE_0313 sucA sucB TRUE 0.974 30.000 0.667 1.000 Y NA
 2210607 2210608 HNE_0315 HNE_0316     TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2210608 2210609 HNE_0316 HNE_0317     FALSE 0.073 92.000 0.000 NA   NA
 2210611 2210612 HNE_0319 HNE_0320     FALSE 0.075 83.000 0.000 NA   NA
 2210614 2210615 HNE_0322 HNE_0323 cysG   TRUE 0.975 -3.000 0.224 NA   NA
 2210615 2210616 HNE_0323 HNE_0324     TRUE 0.919 0.000 0.024 NA   NA
 2210616 2210617 HNE_0324 HNE_0325     TRUE 0.920 0.000 0.023 1.000 N NA
 2210617 2210618 HNE_0325 HNE_0326     TRUE 0.965 -13.000 0.309 NA   NA
 2210618 2210619 HNE_0326 HNE_0327   cysH TRUE 0.886 18.000 0.139 NA   NA
 2210620 2210621 HNE_0328 HNE_0329     FALSE 0.266 31.000 0.000 NA   NA
 2210621 2210622 HNE_0329 HNE_0330   rpoH FALSE 0.075 80.000 0.000 NA   NA
 2210622 2210623 HNE_0330 HNE_0331 rpoH   FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 2210623 2210624 HNE_0331 HNE_0332     FALSE 0.418 16.000 0.000 NA   NA
 2210624 2210625 HNE_0332 HNE_0333     FALSE 0.086 108.000 0.000 1.000   NA
 2210626 2210627 HNE_0334 HNE_0335     FALSE 0.406 17.000 0.000 NA   NA
 2210627 2210628 HNE_0335 HNE_0336     FALSE 0.195 72.000 0.000 0.096   NA
 2210628 2210629 HNE_0336 HNE_0337     FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 2210630 2210631 HNE_0338 HNE_0339     TRUE 0.991 -3.000 0.876 NA   NA
 2210631 2210632 HNE_0339 HNE_0340     TRUE 0.990 -3.000 0.816 NA   NA
 2210632 2210633 HNE_0340 HNE_0341     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210633 2210634 HNE_0341 HNE_0342     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210635 2210636 HNE_0343 HNE_0344     TRUE 0.968 10.000 0.346 NA   NA
 2210636 2210637 HNE_0344 HNE_0345     FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 2210637 2210638 HNE_0345 HNE_0346     FALSE 0.352 47.000 0.006 NA   NA
 2210638 2210639 HNE_0346 HNE_0347     FALSE 0.067 128.000 0.000 1.000   NA
 2210639 2210640 HNE_0347 HNE_0348     TRUE 0.936 -3.000 0.052 1.000   NA
 2210642 2210643 HNE_0350 HNE_0351 petA   TRUE 0.964 16.000 0.058 0.001 Y NA
 2210643 2210644 HNE_0351 HNE_0352     TRUE 0.986 26.000 0.630 0.001 Y NA
 2210644 2210645 HNE_0352 HNE_0353     FALSE 0.459 16.000 0.000 1.000   NA
 2210645 2210646 HNE_0353 HNE_0354   mtaP TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2210646 2210647 HNE_0354 HNE_0355 mtaP   FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 2210647 2210648 HNE_0355 HNE_0356     TRUE 0.544 -28.000 0.000 NA   NA
 2210649 2210650 HNE_0357 HNE_0358     FALSE 0.485 127.000 0.000 0.002 Y NA
 2210650 2210651 HNE_0358 HNE_0359     FALSE 0.257 219.000 0.000 0.002 Y NA
 2210652 2210653 HNE_0360 HNE_0361     FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 2210654 2210655 HNE_0362 HNE_0363 prs   FALSE 0.181 124.000 0.013 NA   NA
 2210659 2210660 HNE_0367 HNE_0368     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 2210662 2210663 HNE_0370 HNE_0371 recR   TRUE 0.695 124.000 0.604 NA   NA
 2210663 2210664 HNE_0371 HNE_0372   dnaX TRUE 0.945 17.000 0.411 NA   NA
 2210664 2210665 HNE_0372 HNE_0373 dnaX   FALSE 0.071 116.000 0.000 1.000 N NA
 2210665 2210666 HNE_0373 HNE_0374     FALSE 0.047 143.000 0.000 NA   NA
 2210666 2210667 HNE_0374 HNE_0375     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 2210669 2210670 HNE_0377 HNE_0378     FALSE 0.027 197.000 0.000 NA   NA
 2210671 2210672 HNE_0379 HNE_0380     FALSE 0.048 142.000 0.000 NA   NA
 2210672 2210673 HNE_0380 HNE_0381     FALSE 0.075 102.000 0.000 NA   NA
 2210673 2210674 HNE_0381 HNE_0382     FALSE 0.064 122.000 0.000 NA   NA
 2210675 2210676 HNE_0383 HNE_0384     FALSE 0.348 22.000 0.000 NA   NA
 2210677 2210678 HNE_0385 HNE_0386   ligA TRUE 0.977 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 2210681 2210682 HNE_0389 HNE_0390 lpxC ftsZ FALSE 0.159 283.000 0.134 1.000 N NA
 2210682 2210683 HNE_0390 HNE_0391 ftsZ ftsA TRUE 0.680 124.000 0.114 1.000 Y NA
 2210683 2210684 HNE_0391 HNE_0392 ftsA   TRUE 0.969 0.000 0.137 NA N NA
 2210684 2210685 HNE_0392 HNE_0393     TRUE 0.988 -12.000 0.372 NA Y NA
 2210686 2210687 HNE_0394 HNE_0395     FALSE 0.051 137.000 0.000 NA   NA
 2210687 2210688 HNE_0395 HNE_0396     TRUE 0.596 9.000 0.000 NA   NA
 2210689 2210690 HNE_0397 HNE_0398 murB   FALSE 0.087 85.000 0.000 1.000   NA
 2210693 2210694 HNE_0401 HNE_0402 hrpB dacB FALSE 0.357 22.000 0.000 1.000 N NA
 2210695 2210696 HNE_0403 HNE_0404     FALSE 0.034 170.000 0.000 NA   NA
 2210696 2210697 HNE_0404 HNE_0405     FALSE 0.077 99.000 0.000 1.000 N NA
 2210697 2210698 HNE_0405 HNE_0406     FALSE 0.073 113.000 0.000 1.000 N NA
 2210698 2210699 HNE_0406 HNE_0407     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2210699 2210700 HNE_0407 HNE_0408     TRUE 0.713 61.000 0.287 1.000 N NA
 2210700 2210701 HNE_0408 HNE_0409     TRUE 0.843 -7.000 0.016 NA   NA
 2210701 2210702 HNE_0409 HNE_0410     FALSE 0.235 115.000 0.024 NA   NA
 2210702 2210703 HNE_0410 HNE_0411     FALSE 0.075 78.000 0.000 NA   NA
 2210704 2210705 HNE_0412 HNE_0413 rpmH rnpA TRUE 0.922 38.000 0.787 1.000   NA
 2210705 2210706 HNE_0413 HNE_0414 rnpA   TRUE 0.606 55.000 0.105 1.000 N NA
 2210706 2210707 HNE_0414 HNE_0415     TRUE 0.969 4.000 0.082 0.060   NA
 2210707 2210708 HNE_0415 HNE_0416     FALSE 0.246 37.000 0.000 1.000   NA
 2210708 2210709 HNE_0416 HNE_0417     FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2210709 2210710 HNE_0417 HNE_0418   argB FALSE 0.105 63.000 0.000 NA   NA
 2210710 2210711 HNE_0418 HNE_0419 argB   TRUE 0.810 -25.000 0.012 1.000   NA
 2210711 2210712 HNE_0419 HNE_0420     TRUE 0.954 -3.000 0.041 0.095   NA
 2210712 2210713 HNE_0420 HNE_0421   dapD TRUE 0.834 18.000 0.071 1.000   NA
 2210713 2210714 HNE_0421 HNE_0422 dapD   FALSE 0.076 75.000 0.000 NA   NA
 2210714 2210715 HNE_0422 HNE_0423     FALSE 0.050 139.000 0.000 NA   NA
 2210717 2210718 HNE_0425 HNE_0426     TRUE 0.856 53.000 0.141 1.000 Y NA
 2210720 2210721 HNE_0428 HNE_0429 infC   FALSE 0.039 162.000 0.000 1.000 N NA
 2210721 2210722 HNE_0429 HNE_0430   rpmI FALSE 0.041 157.000 0.000 1.000 N NA
 2210722 2210723 HNE_0430 HNE_0431 rpmI rplT TRUE 0.963 59.000 0.928 0.017 Y NA
 2210723 2210724 HNE_0431 HNE_0432 rplT   FALSE 0.348 22.000 0.000 NA   NA
 2210724 2210725 HNE_0432 HNE_0433   pheS FALSE 0.053 134.000 0.000 NA   NA
 2210725 2210726 HNE_0433 HNE_0434 pheS   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210726 2210727 HNE_0434 HNE_0435   pheT TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210727 2210728 HNE_0435 HNE_0436 pheT   FALSE 0.357 25.000 0.000 1.000   NA
 2210728 2210729 HNE_0436 HNE_0437   dapB TRUE 0.644 -7.000 0.000 1.000   NA
 2210729 2210730 HNE_0437 HNE_0438 dapB   FALSE 0.077 100.000 0.000 1.000 N NA
 2210730 2210731 HNE_0438 HNE_0439     TRUE 0.996 0.000 0.261 0.002 Y NA
 2210732 2210733 HNE_0440 HNE_0441 leuA   FALSE 0.042 152.000 0.000 NA   NA
 2210733 2210734 HNE_0441 HNE_0442     FALSE 0.139 54.000 0.000 NA   NA
 2210738 2210739 HNE_0446 HNE_0447   ilvC FALSE 0.476 15.000 0.000 1.000   NA
 2210739 2210740 HNE_0447 HNE_0448 ilvC   FALSE 0.151 51.000 0.000 NA   NA
 2210740 2210741 HNE_0448 HNE_0449   ilvN TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210741 2210742 HNE_0449 HNE_0450 ilvN   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210742 2210743 HNE_0450 HNE_0451   ilvB FALSE 0.237 34.000 0.000 NA   NA
 2210743 2210744 HNE_0451 HNE_0452 ilvB miaA FALSE 0.088 248.000 0.038 1.000 N NA
 2210745 2210746 HNE_0453 HNE_0454 serB   TRUE 0.630 7.000 0.000 1.000 N NA
 2210747 2210748 HNE_0455 HNE_0456   pgsA FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 2210748 2210749 HNE_0456 HNE_0457 pgsA   FALSE 0.154 46.000 0.000 NA N NA
 2210749 2210750 HNE_0457 HNE_0458     TRUE 0.640 43.000 0.000 NA Y NA
 2210755 2210756 HNE_0463 HNE_0464 folA   FALSE 0.064 92.000 0.000 NA N NA
 2210757 2210758 HNE_0465 HNE_0466     FALSE 0.049 141.000 0.000 NA   NA
 2210758 2210759 HNE_0466 HNE_0467     FALSE 0.108 62.000 0.000 NA   NA
 2210759 2210760 HNE_0467 HNE_0468     FALSE 0.043 150.000 0.000 NA   NA
 2210761 2210762 HNE_0469 HNE_0470 hflK hflC TRUE 0.998 0.000 0.947 0.010 Y NA
 2210762 2210763 HNE_0470 HNE_0471 hflC   TRUE 0.932 19.000 0.348 NA   NA
 2210763 2210764 HNE_0471 HNE_0472     FALSE 0.505 101.000 0.150 NA   NA
 2210764 2210765 HNE_0472 HNE_0473     FALSE 0.019 258.000 0.000 1.000 N NA
 2210765 2210766 HNE_0473 HNE_0474     TRUE 0.983 -3.000 0.397 1.000 N NA
 2210766 2210767 HNE_0474 HNE_0475   ltaE TRUE 0.564 11.000 0.000 1.000 N NA
 2210768 2210769 HNE_0476 HNE_0477     FALSE 0.199 46.000 0.000 1.000   NA
 2210770 2210771 HNE_0478 HNE_0479     FALSE 0.008 1151.000 0.000 NA   NA
 2210772 2210773 HNE_0480 HNE_0481     TRUE 0.957 0.000 0.078 1.000   NA
 2210773 2210774 HNE_0481 HNE_0482     FALSE 0.025 230.000 0.000 1.000   NA
 2210774 2210775 HNE_0482 HNE_0483     FALSE 0.044 159.000 0.000 1.000   NA
 2210776 2210777 HNE_0484 HNE_0485     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 2210777 2210778 HNE_0485 HNE_0486     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210778 2210779 HNE_0486 HNE_0487     FALSE 0.496 14.000 0.000 1.000   NA
 2210779 2210780 HNE_0487 HNE_0488     FALSE 0.266 31.000 0.000 NA   NA
 2210781 2210782 HNE_0489 HNE_0490     FALSE 0.087 83.000 0.000 1.000   NA
 2210787 2210788 HNE_0495 HNE_0496     FALSE 0.108 62.000 0.000 NA   NA
 2210789 2210790 HNE_0497 HNE_0498     FALSE 0.073 124.000 0.000 1.000   NA
 2210791 2210792 HNE_0499 HNE_0500 flbT   TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210792 2210793 HNE_0500 HNE_0501     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 2210795 2210796 HNE_0503 HNE_0504 dksA   FALSE 0.010 400.000 0.000 NA N NA
 2210797 2210798 HNE_0505 HNE_0506     TRUE 0.546 -27.000 0.000 NA   NA
 2210800 2210801 HNE_0508 HNE_0509     TRUE 0.710 5.000 0.000 1.000   NA
 2210802 2210803 HNE_0510 HNE_0511     FALSE 0.055 131.000 0.000 NA   NA
 2210803 2210804 HNE_0511 HNE_0512   def TRUE 0.632 43.000 0.074 NA   NA
 2210804 2210805 HNE_0512 HNE_0513 def fmt TRUE 0.837 53.000 0.050 0.027 Y NA
 2210805 2210806 HNE_0513 HNE_0514 fmt   TRUE 0.883 0.000 0.004 1.000   NA
 2210806 2210807 HNE_0514 HNE_0515   truA FALSE 0.402 45.000 0.006 1.000   NA
 2210807 2210808 HNE_0515 HNE_0516 truA   FALSE 0.079 73.000 0.000 1.000 N NA
 2210808 2210809 HNE_0516 HNE_0517     FALSE 0.396 18.000 0.000 NA   NA
 2210809 2210810 HNE_0517 HNE_0518   glnD FALSE 0.156 49.000 0.000 NA   NA
 2210810 2210811 HNE_0518 HNE_0519 glnD mviN TRUE 0.804 24.000 0.081 1.000   NA
 2210811 2210812 HNE_0519 HNE_0520 mviN trpS TRUE 0.781 26.000 0.078 1.000   NA
 2210812 2210813 HNE_0520 HNE_0521 trpS   FALSE 0.013 357.000 0.000 NA   NA
 2210813 2210814 HNE_0521 HNE_0522     FALSE 0.148 52.000 0.000 NA   NA
 2210814 2210815 HNE_0522 HNE_0523     FALSE 0.136 139.000 0.007 1.000 N NA
 2210815 2210816 HNE_0523 HNE_0524     TRUE 0.764 10.000 0.002 1.000 N NA
 2210818 2210819 HNE_0526 HNE_0527 rimI   FALSE 0.088 76.000 0.000 1.000   NA
 2210819 2210820 HNE_0527 HNE_0528   fur FALSE 0.173 47.000 0.000 1.000 N NA
 2210821 2210822 HNE_0529 HNE_0530     FALSE 0.059 138.000 0.000 1.000   NA
 2210823 2210824 HNE_0531 HNE_0532 exsB   TRUE 0.979 -3.000 0.270 1.000   NA
 2210824 2210825 HNE_0532 HNE_0533     TRUE 0.921 -45.000 0.111 1.000 N NA
 2210825 2210826 HNE_0533 HNE_0534     FALSE 0.130 61.000 0.000 1.000   NA
 2210827 2210828 HNE_0535 HNE_0536     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 2210830 2210831 HNE_0538 HNE_0539     TRUE 0.884 -3.000 0.000 0.045   NA
 2210831 2210832 HNE_0539 HNE_0540     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 2210833 2210834 HNE_0541 HNE_0542 recQ   FALSE 0.025 211.000 0.000 1.000 N NA
 2210834 2210835 HNE_0542 HNE_0543     FALSE 0.077 79.000 0.000 1.000 N NA
 2210836 1464296 HNE_0544 HNE_0545     FALSE 0.128 56.000 0.000 NA   NA
 1464296 2210837 HNE_0545 HNE_0546     FALSE 0.120 59.000 0.000 NA   NA
 2210839 2210840 HNE_0548 HNE_0549 trxB   FALSE 0.077 108.000 0.000 1.000 N NA
 2210840 2210841 HNE_0549 HNE_0550     FALSE 0.010 519.000 0.000 NA   NA
 2210841 2210842 HNE_0550 HNE_0551     FALSE 0.012 390.000 0.000 NA   NA
 2210842 2210843 HNE_0551 HNE_0552   gyrB FALSE 0.053 134.000 0.000 NA   NA
 2210843 2210844 HNE_0552 HNE_0553 gyrB   FALSE 0.364 175.000 0.003 0.088 Y NA
 2210846 2210847 HNE_0555 HNE_0556 fghA   FALSE 0.009 743.000 0.000 NA   NA
 2210847 2210848 HNE_0556 HNE_0557     FALSE 0.049 141.000 0.000 NA   NA
 2210848 2210849 HNE_0557 HNE_0558     FALSE 0.338 23.000 0.000 NA   NA
 2210849 2210850 HNE_0558 HNE_0559     FALSE 0.256 32.000 0.000 NA   NA
 2210850 2210851 HNE_0559 HNE_0560     TRUE 0.765 0.000 0.000 1.000   NA
 2210851 2210852 HNE_0560 HNE_0561   recF FALSE 0.087 69.000 0.000 1.000 N NA
 2210852 2210853 HNE_0561 HNE_0562 recF   TRUE 0.659 7.000 0.000 1.000   NA
 2210853 2210854 HNE_0562 HNE_0563   dnaN FALSE 0.085 97.000 0.000 1.000   NA
 2210854 2210855 HNE_0563 HNE_0564 dnaN dnaA FALSE 0.197 184.000 0.000 1.000 Y NA
 2210855 2210856 HNE_0564 HNE_0565 dnaA rpsT FALSE 0.010 633.000 0.000 1.000 N NA
 2210856 2210857 HNE_0565 HNE_0566 rpsT   FALSE 0.198 118.000 0.016 1.000 N NA
 2210858 2210859 HNE_0567 HNE_0568     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210861 2210862 HNE_0570 HNE_0571     TRUE 0.956 -3.000 0.095 1.000 N NA
 2210865 2210866 HNE_0574 HNE_0575     FALSE 0.267 150.000 0.000 1.000 Y NA
 2210866 2210867 HNE_0575 HNE_0576     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210868 2210869 HNE_0577 HNE_0578 hisS   TRUE 0.977 -3.000 0.097 0.001 N NA
 2210869 2210870 HNE_0578 HNE_0579   hisG TRUE 0.991 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 2210870 2210871 HNE_0579 HNE_0580 hisG argD FALSE 0.087 408.000 0.000 1.000 Y NA
 2210871 2210872 HNE_0580 HNE_0581 argD   FALSE 0.075 107.000 0.000 NA   NA
 2210872 2210873 HNE_0581 HNE_0582     FALSE 0.018 254.000 0.000 NA   NA
 2210876 2210877 HNE_0585 HNE_0586     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 2210882 2210883 HNE_0591 HNE_0592   argF FALSE 0.060 137.000 0.000 1.000   NA
 2210883 2210884 HNE_0592 HNE_0593 argF   FALSE 0.087 79.000 0.000 1.000   NA
 2210884 2210885 HNE_0593 HNE_0594   hslO FALSE 0.063 133.000 0.000 1.000   NA
 2210886 2210887 HNE_0595 HNE_0596     FALSE 0.075 101.000 0.000 NA   NA
 2210887 2210888 HNE_0596 HNE_0597     FALSE 0.328 59.000 0.018 NA   NA
 2210888 2210889 HNE_0597 HNE_0598     TRUE 0.625 99.000 0.018 0.098 Y NA
 2210889 2210890 HNE_0598 HNE_0599     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2210890 2210891 HNE_0599 HNE_0600     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2210892 2210893 HNE_0601 HNE_0602     FALSE 0.008 908.000 0.000 NA   NA
 2210896 2210897 HNE_0605 HNE_0606     TRUE 0.983 -3.000 0.080 NA Y NA
 2210898 2210899 HNE_0607 HNE_0608     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2210899 2210900 HNE_0608 HNE_0609     FALSE 0.122 58.000 0.000 NA   NA
 2210900 2210901 HNE_0609 HNE_0610     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000   NA
 2210901 2210902 HNE_0610 HNE_0611     FALSE 0.116 61.000 0.000 1.000 N NA
 2210907 2210908 HNE_0616 HNE_0617   ubiG TRUE 0.868 -3.000 0.004 1.000   NA
 2210909 2210910 HNE_0618 HNE_0619   ptsP TRUE 0.770 25.000 0.069 1.000 N NA
 2210910 2210911 HNE_0619 HNE_0620 ptsP   FALSE 0.335 100.000 0.060 NA   NA
 2210911 2210912 HNE_0620 HNE_0621   ispG TRUE 0.577 84.000 0.233 NA   NA
 2210913 2210914 HNE_0622 HNE_0623     TRUE 0.993 0.000 0.941 NA   NA
 2210915 2210916 HNE_0624 HNE_0625     FALSE 0.206 39.000 0.000 NA   NA
 2210916 2210917 HNE_0625 HNE_0626   prfA FALSE 0.180 67.000 0.002 NA   NA
 2210917 2210918 HNE_0626 HNE_0627 prfA   TRUE 0.855 -3.000 0.002 1.000   NA
 2210918 2210919 HNE_0627 HNE_0628     TRUE 0.765 0.000 0.000 1.000   NA
 2210919 2210920 HNE_0628 HNE_0629     TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2210920 2210921 HNE_0629 HNE_0630     FALSE 0.080 220.000 0.021 NA   NA
 2210921 2210922 HNE_0630 HNE_0631   clpB FALSE 0.079 184.000 0.006 NA   NA
 2210923 2210924 HNE_0632 HNE_0633     FALSE 0.152 146.000 0.000 0.006   NA
 2210925 2210926 HNE_0634 HNE_0635     FALSE 0.326 90.000 0.057 NA   NA
 2210926 2210927 HNE_0635 HNE_0636     TRUE 0.941 28.000 0.726 NA   NA
 2210927 2210928 HNE_0636 HNE_0637     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 2210928 2210929 HNE_0637 HNE_0638     FALSE 0.221 111.000 0.018 NA   NA
 2210929 2210930 HNE_0638 HNE_0639   cheY FALSE 0.302 89.000 0.045 NA   NA
 2210930 2210931 HNE_0639 HNE_0640 cheY cheR TRUE 0.796 70.000 0.208 1.000 Y NA
 2210931 2210932 HNE_0640 HNE_0641 cheR trmU FALSE 0.076 97.000 0.000 1.000 N NA
 2210933 2210934 HNE_0642 HNE_0643   greA TRUE 0.773 12.000 0.012 NA N NA
 2210934 2210935 HNE_0643 HNE_0644 greA carB TRUE 0.606 70.000 0.241 1.000 N NA
 2210936 2210937 HNE_0645 HNE_0646     FALSE 0.182 45.000 0.000 NA   NA
 2210937 2210938 HNE_0646 HNE_0647     FALSE 0.075 80.000 0.000 NA   NA
 2210939 2210940 HNE_0648 HNE_0649     FALSE 0.088 76.000 0.000 1.000   NA
 2210941 2210942 HNE_0650 HNE_0651     FALSE 0.013 375.000 0.000 1.000 N NA
 2210942 2210943 HNE_0651 HNE_0652     FALSE 0.077 100.000 0.000 1.000 N NA
 2210944 2210945 HNE_0653 HNE_0654     FALSE 0.075 78.000 0.000 NA   NA
 2210945 2210946 HNE_0654 HNE_0655     TRUE 0.917 -3.000 0.032 NA   NA
 2210947 2210948 HNE_0656 HNE_0657     TRUE 0.811 32.000 0.150 NA   NA
 2210952 2210953 HNE_0661 HNE_0662     TRUE 0.630 66.000 0.238 NA   NA
 2210954 2210955 HNE_0663 HNE_0664     FALSE 0.076 105.000 0.000 NA   NA
 2210958 2210959 HNE_0667 HNE_0668     FALSE 0.244 111.000 0.023 1.000 N NA
 2210959 2210960 HNE_0668 HNE_0669     TRUE 0.782 113.000 0.103 0.012 Y NA
 2210960 2210961 HNE_0669 HNE_0670     TRUE 0.573 8.000 0.000 NA N NA
 2210961 2210962 HNE_0670 HNE_0671     FALSE 0.346 19.000 0.000 NA N NA
 2210962 2210963 HNE_0671 HNE_0672     TRUE 0.969 30.000 0.562 1.000 Y NA
 2210965 2210966 HNE_0674 HNE_0675     TRUE 0.794 -109.000 0.014 1.000   NA
 2210966 2210967 HNE_0675 HNE_0676   ispE TRUE 0.898 14.000 0.107 1.000   NA
 2210967 2210968 HNE_0676 HNE_0677 ispE   TRUE 0.873 -3.000 0.007 1.000 N NA
 2210970 2210971 HNE_0679 HNE_0680     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2210971 2210972 HNE_0680 HNE_0681     TRUE 0.987 -3.000 0.525 1.000   NA
 2210972 2210973 HNE_0681 HNE_0682     FALSE 0.075 77.000 0.000 NA   NA
 2210973 2210974 HNE_0682 HNE_0683   glyQ FALSE 0.081 70.000 0.000 NA   NA
 2210974 2210975 HNE_0683 HNE_0684 glyQ   FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 2210975 2210976 HNE_0684 HNE_0685   glyS FALSE 0.072 95.000 0.000 NA   NA
 2210976 2210977 HNE_0685 HNE_0686 glyS ppdK FALSE 0.331 152.000 0.071 0.087 N NA
 2210977 2210978 HNE_0686 HNE_0687 ppdK   FALSE 0.013 367.000 0.000 1.000 N NA
 2210979 2210980 HNE_0688 HNE_0689   nadC FALSE 0.260 56.000 0.002 1.000 N NA
 2210980 2210981 HNE_0689 HNE_0690 nadC nadB TRUE 0.991 -3.000 0.223 1.000 Y NA
 2210981 2210982 HNE_0690 HNE_0691 nadB   TRUE 0.775 -16.000 0.006 NA   NA
 2210982 2210983 HNE_0691 HNE_0692   nadA FALSE 0.177 69.000 0.003 NA   NA
 2210983 2210984 HNE_0692 HNE_0693 nadA   FALSE 0.015 369.000 0.000 1.000   NA
 2210984 2210985 HNE_0693 HNE_0694     FALSE 0.224 41.000 0.000 1.000   NA
 2210985 2210986 HNE_0694 HNE_0695     FALSE 0.012 502.000 0.000 1.000   NA
 2210986 2210987 HNE_0695 HNE_0696   sodB FALSE 0.027 201.000 0.000 1.000 N NA
 2210988 2210989 HNE_0697 HNE_0698     FALSE 0.064 132.000 0.000 1.000   NA
 2210990 2210991 HNE_0699 HNE_0700   lpxK TRUE 0.978 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 2210991 2210992 HNE_0700 HNE_0701 lpxK kdtA TRUE 0.971 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 2210992 2210993 HNE_0701 HNE_0702 kdtA   TRUE 0.950 -3.000 0.082 NA   NA
 2210993 1464454 HNE_0702 HNE_0703     FALSE 0.224 36.000 0.000 NA   NA
 1464454 2210994 HNE_0703 HNE_0704   gph FALSE 0.009 714.000 0.000 NA   NA
 2210995 2210996 HNE_0705 HNE_0706 glmU rpiA TRUE 0.890 1.000 0.008 1.000 N NA
 2210996 2210997 HNE_0706 HNE_0707 rpiA gor FALSE 0.401 55.000 0.026 1.000 N NA
 2210999 2211000 HNE_0709 HNE_0710     FALSE 0.084 69.000 0.000 NA   NA
 2211000 2211001 HNE_0710 HNE_0711     FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 2211002 2211003 HNE_0712 HNE_0713 hup1   FALSE 0.255 100.000 0.025 NA   NA
 2211003 2211004 HNE_0713 HNE_0714     TRUE 0.942 4.000 0.069 NA   NA
 2211006 2211007 HNE_0716 HNE_0717   purF TRUE 0.843 22.000 0.100 1.000   NA
 2211007 2211008 HNE_0717 HNE_0718 purF   FALSE 0.068 116.000 0.000 NA   NA
 2211008 2211009 HNE_0718 HNE_0719     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2211009 2211010 HNE_0719 HNE_0720   radA TRUE 0.936 -7.000 0.094 1.000   NA
 2211011 2211012 HNE_0721 HNE_0722     FALSE 0.217 37.000 0.000 NA   NA
 2211013 2211014 HNE_0723 HNE_0724     TRUE 0.989 -3.000 0.178 NA Y NA
 2211014 2211015 HNE_0724 HNE_0725   alr1 TRUE 0.826 7.000 0.009 NA N NA
 2211015 2211016 HNE_0725 HNE_0726 alr1   FALSE 0.277 33.000 0.000 1.000   NA
 2211017 2211018 HNE_0727 HNE_0728     FALSE 0.503 86.000 0.150 NA   NA
 2211018 2211019 HNE_0728 HNE_0729     FALSE 0.454 94.000 0.115 NA   NA
 2211019 2211020 HNE_0729 HNE_0730     TRUE 0.995 0.000 0.254 0.058 Y NA
 2211020 2211021 HNE_0730 HNE_0731     TRUE 0.996 2.000 0.655 1.000 Y NA
 2211021 2211022 HNE_0731 HNE_0732     TRUE 0.977 -3.000 0.253 NA   NA
 2211022 2211023 HNE_0732 HNE_0733     TRUE 0.984 0.000 0.360 NA   NA
 2211023 2211024 HNE_0733 HNE_0734     TRUE 0.982 5.000 0.093 NA Y NA
 2211024 2211025 HNE_0734 HNE_0735     TRUE 0.966 39.000 0.426 0.008 Y NA
 2211025 2211026 HNE_0735 HNE_0736     TRUE 0.993 -3.000 0.162 0.003 Y NA
 2211026 2211027 HNE_0736 HNE_0737     TRUE 0.978 -3.000 0.263 NA   NA
 2211027 2211028 HNE_0737 HNE_0738     TRUE 0.956 0.000 0.081 NA   NA
 2211028 2211029 HNE_0738 HNE_0739     FALSE 0.137 171.000 0.027 1.000 N NA
 2211029 2211030 HNE_0739 HNE_0740     FALSE 0.266 148.000 0.080 NA   NA
 2211030 2211031 HNE_0740 HNE_0741     FALSE 0.075 102.000 0.000 NA   NA
 2211031 2211032 HNE_0741 HNE_0742     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211033 2211034 HNE_0743 HNE_0744     FALSE 0.074 88.000 0.000 NA   NA
 2211034 2211035 HNE_0744 HNE_0745     FALSE 0.205 87.000 0.011 NA   NA
 2211036 2211037 HNE_0746 HNE_0747     FALSE 0.073 92.000 0.000 NA   NA
 2211037 2211038 HNE_0747 HNE_0748     FALSE 0.266 31.000 0.000 NA   NA
 2211038 2211039 HNE_0748 HNE_0749     FALSE 0.073 98.000 0.000 NA   NA
 2211039 2211040 HNE_0749 HNE_0750     FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 2211040 2211041 HNE_0750 HNE_0751     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 2211041 2211042 HNE_0751 HNE_0752     FALSE 0.055 131.000 0.000 NA   NA
 2211043 2211044 HNE_0753 HNE_0754     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 2211044 2211045 HNE_0754 HNE_0755   rsuA FALSE 0.269 34.000 0.000 1.000   NA
 2211045 2211046 HNE_0755 HNE_0756 rsuA   TRUE 0.977 8.000 0.088 1.000 Y NA
 2211046 2211047 HNE_0756 HNE_0757     FALSE 0.111 62.000 0.000 1.000 N NA
 2211047 2211048 HNE_0757 HNE_0758     FALSE 0.366 117.000 0.000 1.000 Y NA
 2211049 2211050 HNE_0759 HNE_0760     TRUE 0.983 2.000 0.353 NA   NA
 2211051 2211052 HNE_0761 HNE_0762 dnaJ   FALSE 0.208 100.000 0.016 NA N NA
 2211053 2211054 HNE_0763 HNE_0764     TRUE 0.951 -10.000 0.165 1.000   NA
 2211054 2211055 HNE_0764 HNE_0765     FALSE 0.046 146.000 0.000 NA   NA
 2211055 2211056 HNE_0765 HNE_0766     TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 2211060 2211061 HNE_0770 HNE_0771   panB FALSE 0.335 57.000 0.017 NA   NA
 2211061 2211062 HNE_0771 HNE_0772 panB   FALSE 0.272 80.000 0.026 1.000   NA
 2211062 2211063 HNE_0772 HNE_0773     TRUE 0.970 -3.000 0.154 1.000   NA
 2211063 2211064 HNE_0773 HNE_0774   engA TRUE 0.727 53.000 0.203 1.000   NA
 2211065 2211066 HNE_0775 HNE_0776   cysNC FALSE 0.077 88.000 0.000 1.000 N NA
 2211066 2211067 HNE_0776 HNE_0777 cysNC cysD TRUE 0.987 0.000 0.203 0.001 N NA
 2211068 2211069 HNE_0778 HNE_0779 glmS rfbC TRUE 0.564 54.000 0.000 1.000 Y NA
 2211069 2211070 HNE_0779 HNE_0780 rfbC rfbD TRUE 0.950 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2211070 2211071 HNE_0780 HNE_0781 rfbD   FALSE 0.069 115.000 0.000 NA   NA
 2211076 2211077 HNE_0786 HNE_0787 metK purU FALSE 0.347 23.000 0.000 1.000 N NA
 2211077 2211078 HNE_0787 HNE_0788 purU ahcY FALSE 0.373 20.000 0.000 1.000 N NA
 2211078 2211079 HNE_0788 HNE_0789 ahcY rfbA FALSE 0.073 113.000 0.000 1.000 N NA
 2211079 2211080 HNE_0789 HNE_0790 rfbA rfbB FALSE 0.529 112.000 0.000 0.004 Y NA
 2211080 2211081 HNE_0790 HNE_0791 rfbB   TRUE 0.756 1.000 0.000 1.000   NA
 2211082 2211083 HNE_0792 HNE_0793   gmd FALSE 0.082 464.000 0.000 1.000 Y NA
 2211083 2211084 HNE_0793 HNE_0794 gmd   TRUE 0.821 33.000 0.000 0.008 Y NA
 2211084 2211085 HNE_0794 HNE_0795     FALSE 0.431 68.000 0.000 1.000 Y NA
 2211085 2211086 HNE_0795 HNE_0796     TRUE 0.996 -3.000 0.450 0.086 Y NA
 2211086 2211087 HNE_0796 HNE_0797     TRUE 0.968 -3.000 0.158 NA   NA
 2211088 2211089 HNE_0798 HNE_0799     FALSE 0.406 17.000 0.000 NA   NA
 2211089 2211090 HNE_0799 HNE_0800     TRUE 0.973 7.000 0.333 NA   NA
 2211090 2211091 HNE_0800 HNE_0801     FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 1464553 2211092 HNE_0802 HNE_0803     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211093 2211094 HNE_0804 HNE_0805     FALSE 0.010 556.000 0.000 NA   NA
 2211094 2211095 HNE_0805 HNE_0806   kdsA FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 2211102 2211103 HNE_0813 HNE_0814     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 2211104 2211105 HNE_0815 HNE_0816     TRUE 0.991 -3.000 0.875 NA N NA
 2211105 2211106 HNE_0816 HNE_0817     FALSE 0.067 121.000 0.000 1.000 N NA
 2211108 2211109 HNE_0819 HNE_0820     FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 2211110 2211111 HNE_0821 HNE_0822     FALSE 0.050 151.000 0.000 1.000   NA
 2211117 2211118 HNE_0828 HNE_0829 alkK   TRUE 0.596 9.000 0.000 NA   NA
 2211118 2211119 HNE_0829 HNE_0830     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2211120 2211121 HNE_0831 HNE_0832     FALSE 0.051 137.000 0.000 NA   NA
 2211121 2211122 HNE_0832 HNE_0833   csaA TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211122 2211123 HNE_0833 HNE_0834 csaA   TRUE 0.765 0.000 0.000 1.000   NA
 2211124 2211125 HNE_0835 HNE_0836     FALSE 0.075 76.000 0.000 NA   NA
 2211125 2211126 HNE_0836 HNE_0837     FALSE 0.075 107.000 0.000 NA   NA
 2211128 2211129 HNE_0839 HNE_0840     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA N NA
 2211129 2211130 HNE_0840 HNE_0841     FALSE 0.075 79.000 0.000 NA   NA
 2211130 2211131 HNE_0841 HNE_0842     FALSE 0.162 48.000 0.000 NA   NA
 2211131 2211132 HNE_0842 HNE_0843     FALSE 0.181 106.000 0.000 0.090 N NA
 2211132 2211133 HNE_0843 HNE_0844   ribF TRUE 0.889 0.000 0.007 1.000 N NA
 2211135 2211136 HNE_0845 HNE_0847     FALSE 0.016 273.000 0.000 NA   NA
 2211138 2211139 HNE_0849 HNE_0850 ileS lspA1 FALSE 0.300 92.000 0.045 1.000 N NA
 2211139 2211140 HNE_0850 HNE_0851 lspA1   TRUE 0.908 35.000 0.588 NA   NA
 2211140 2211141 HNE_0851 HNE_0852     TRUE 0.539 71.000 0.173 NA   NA
 2211141 2211142 HNE_0852 HNE_0853     TRUE 0.993 0.000 0.598 0.006   NA
 2211143 2211144 HNE_0854 HNE_0855     TRUE 0.954 0.000 0.070 1.000   NA
 2211146 2211147 HNE_0857 HNE_0858     FALSE 0.057 129.000 0.000 NA   NA
 2211147 2211148 HNE_0858 HNE_0859     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211148 2211149 HNE_0859 HNE_0860   tag TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211149 2211150 HNE_0860 HNE_0861 tag   TRUE 0.900 -7.000 0.047 1.000   NA
 2211151 2211152 HNE_0862 HNE_0863     FALSE 0.287 29.000 0.000 1.000 N NA
 2211152 2211153 HNE_0863 HNE_0864   fcs2 FALSE 0.065 123.000 0.000 1.000 N NA
 2211153 2211154 HNE_0864 HNE_0865 fcs2   FALSE 0.047 281.000 0.000 0.045 N NA
 2211155 2211156 HNE_0866 HNE_0867     FALSE 0.032 176.000 0.000 NA   NA
 2211156 2211157 HNE_0867 HNE_0868     TRUE 0.563 -15.000 0.000 NA   NA
 2211158 2211159 HNE_0869 HNE_0870     FALSE 0.013 348.000 0.000 NA   NA
 2211161 2211162 HNE_0872 HNE_0873 rpoZ   TRUE 0.988 9.000 0.291 1.000 Y NA
 2211162 2211163 HNE_0873 HNE_0874   pyrE TRUE 0.901 -10.000 0.062 1.000 N NA
 2211163 2211164 HNE_0874 HNE_0875 pyrE pdxJ TRUE 0.930 0.000 0.033 1.000 N NA
 2211164 2211165 HNE_0875 HNE_0876 pdxJ   TRUE 0.981 -3.000 0.326 1.000 N NA
 2211165 2211166 HNE_0876 HNE_0877   rnc FALSE 0.332 48.000 0.004 1.000 N NA
 2211166 2211167 HNE_0877 HNE_0878 rnc era TRUE 0.974 -3.000 0.098 0.036   NA
 2211167 2211168 HNE_0878 HNE_0879 era recO TRUE 0.873 7.000 0.021 1.000   NA
 2211171 2211172 HNE_0882 HNE_0883     FALSE 0.237 34.000 0.000 NA   NA
 2211175 2211176 HNE_0886 HNE_0887     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 2211176 2211177 HNE_0887 HNE_0888     FALSE 0.076 75.000 0.000 NA   NA
 2211178 2211179 HNE_0889 HNE_0890     FALSE 0.389 19.000 0.000 1.000 N NA
 2211179 2211180 HNE_0890 HNE_0891     TRUE 0.988 -10.000 0.333 NA Y NA
 2211180 2211181 HNE_0891 HNE_0892     TRUE 0.950 19.000 0.119 NA Y NA
 2211181 2211182 HNE_0892 HNE_0893   ate FALSE 0.226 71.000 0.014 1.000 N NA
 2211182 2211183 HNE_0893 HNE_0894 ate   FALSE 0.078 106.000 0.000 1.000 N NA
 2211184 2211185 HNE_0895 HNE_0896     TRUE 0.901 0.000 0.012 NA   NA
 2211185 2211186 HNE_0896 HNE_0897     FALSE 0.036 165.000 0.000 NA   NA
 2211187 2211188 HNE_0898 HNE_0899 hemB   FALSE 0.491 32.000 0.005 1.000   NA
 2211191 2211192 HNE_0902 HNE_0903     FALSE 0.089 73.000 0.000 1.000   NA
 2211192 2211193 HNE_0903 HNE_0904     FALSE 0.235 39.000 0.000 1.000   NA
 2211193 2211194 HNE_0904 HNE_0905     FALSE 0.187 83.000 0.000 0.066 N NA
 2211196 2211197 HNE_0907 HNE_0908     FALSE 0.231 36.000 0.000 1.000 N NA
 2211197 2211198 HNE_0908 HNE_0909     FALSE 0.022 251.000 0.000 1.000   NA
 2211198 2211199 HNE_0909 HNE_0910     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 2211199 2211200 HNE_0910 HNE_0911     FALSE 0.037 163.000 0.000 NA   NA
 2211202 2211203 HNE_0913 HNE_0914     FALSE 0.077 84.000 0.000 1.000 N NA
 2211204 2211205 HNE_0915 HNE_0916     FALSE 0.075 100.000 0.000 NA   NA
 2211207 2211208 HNE_0918 HNE_0919     FALSE 0.110 65.000 0.000 1.000   NA
 2211208 2211209 HNE_0919 HNE_0920   xseA FALSE 0.087 107.000 0.000 1.000   NA
 2211210 2211211 HNE_0921 HNE_0922   purD FALSE 0.097 69.000 0.000 1.000   NA
 2211212 2211213 HNE_0923 HNE_0924     FALSE 0.527 29.000 0.000 0.060 N NA
 2211217 2211218 HNE_0928 HNE_0929     FALSE 0.144 53.000 0.000 NA   NA
 2211219 2211220 HNE_0930 HNE_0931     FALSE 0.186 48.000 0.000 1.000   NA
 2211220 2211221 HNE_0931 HNE_0932     FALSE 0.182 45.000 0.000 NA   NA
 2211221 2211222 HNE_0932 HNE_0933     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211222 2211223 HNE_0933 HNE_0934     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 2211223 2211224 HNE_0934 HNE_0935     FALSE 0.073 124.000 0.000 1.000   NA
 2211225 2211226 HNE_0936 HNE_0937     FALSE 0.387 22.000 0.000 1.000   NA
 2211226 2211227 HNE_0937 HNE_0938     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2211227 2211228 HNE_0938 HNE_0939     FALSE 0.534 79.000 0.000 0.007 Y NA
 2211228 2211229 HNE_0939 HNE_0940     FALSE 0.245 34.000 0.000 1.000 N NA
 2211229 2211230 HNE_0940 HNE_0941     FALSE 0.357 25.000 0.000 1.000   NA
 2211231 2211232 HNE_0942 HNE_0943   motR TRUE 0.861 5.000 0.006 1.000   NA
 2211232 2211233 HNE_0943 HNE_0944 motR ctrA FALSE 0.055 134.000 0.000 1.000 N NA
 2211234 2211235 HNE_0945 HNE_0946 rnhA   FALSE 0.187 44.000 0.000 NA   NA
 2211235 2211236 HNE_0946 HNE_0947   thrB FALSE 0.084 69.000 0.000 NA   NA
 2211236 2211237 HNE_0947 HNE_0948 thrB   TRUE 0.564 12.000 0.000 1.000   NA
 2211237 2211238 HNE_0948 HNE_0949     TRUE 0.778 38.000 0.000 0.042 Y NA
 1464702 2211240 HNE_0951 HNE_0952     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211240 2211241 HNE_0952 HNE_0953   map1 FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2211242 2211243 HNE_0954 HNE_0955     TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2211243 2211244 HNE_0955 HNE_0956     FALSE 0.074 99.000 0.000 NA   NA
 2211244 2211245 HNE_0956 HNE_0957     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 2211247 2211248 HNE_0959 HNE_0960 bktB   FALSE 0.024 212.000 0.000 1.000 N NA
 2211249 2211250 HNE_0961 HNE_0962     FALSE 0.073 96.000 0.000 NA   NA
 2211250 1464714 HNE_0962 HNE_0963     FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2211252 2211253 HNE_0965 HNE_0966     FALSE 0.123 144.000 0.000 0.060 N NA
 2211256 2211257 HNE_0969 HNE_0970     FALSE 0.516 -103.000 0.000 NA   NA
 2211260 2211261 HNE_0973 HNE_0974     FALSE 0.025 204.000 0.000 NA   NA
 2211264 1464729 HNE_0977 HNE_0978 lon   FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 1464729 2211265 HNE_0978 HNE_0979     FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 2211265 2211266 HNE_0979 HNE_0980     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 2211267 2211268 HNE_0981 HNE_0982     FALSE 0.089 68.000 0.000 1.000 N NA
 2211270 2211271 HNE_0984 HNE_0985   dhlA FALSE 0.077 119.000 0.000 1.000   NA
 2211271 2211272 HNE_0985 HNE_0986 dhlA   FALSE 0.087 107.000 0.000 1.000   NA
 2211272 2211273 HNE_0986 HNE_0987     TRUE 0.683 5.000 0.000 1.000 N NA
 2211274 2211275 HNE_0988 HNE_0989     TRUE 0.981 5.000 0.400 NA   NA
 2211276 2211277 HNE_0990 HNE_0991 arsH arsC TRUE 0.960 -7.000 0.216 NA   NA
 2211277 2211278 HNE_0991 HNE_0992 arsC   TRUE 0.971 14.000 0.176 1.000 Y NA
 2211278 2211279 HNE_0992 HNE_0993     FALSE 0.082 71.000 0.000 1.000 N NA
 2211280 2211281 HNE_0994 HNE_0995     FALSE 0.192 42.000 0.000 NA   NA
 2211281 2211282 HNE_0995 HNE_0996     FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 2211283 2211284 HNE_0997 HNE_0998     TRUE 0.939 13.000 0.222 1.000 N NA
 2211284 2211285 HNE_0998 HNE_0999     FALSE 0.030 183.000 0.000 NA   NA
 2211285 1464751 HNE_0999 HNE_1000     FALSE 0.040 156.000 0.000 NA   NA
 2211286 2211287 HNE_1001 HNE_1002 crcB   TRUE 0.951 -3.000 0.083 1.000 N NA
 2211287 2211288 HNE_1002 HNE_1003     TRUE 0.984 3.000 0.389 1.000   NA
 2211288 2211289 HNE_1003 HNE_1004     FALSE 0.074 99.000 0.000 NA   NA
 2211289 2211290 HNE_1004 HNE_1005     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211290 2211291 HNE_1005 HNE_1006     FALSE 0.182 45.000 0.000 NA   NA
 2211291 2211292 HNE_1006 HNE_1007     FALSE 0.039 157.000 0.000 NA   NA
 2211292 2211293 HNE_1007 HNE_1008     FALSE 0.047 146.000 0.000 1.000 N NA
 2211293 2211294 HNE_1008 HNE_1009     FALSE 0.256 32.000 0.000 NA   NA
 2211294 2211295 HNE_1009 HNE_1010     FALSE 0.042 153.000 0.000 NA   NA
 2211295 2211296 HNE_1010 HNE_1011     FALSE 0.011 439.000 0.000 NA   NA
 2211296 2211297 HNE_1011 HNE_1012     TRUE 0.980 13.000 1.000 NA   NA
 2211299 2211300 HNE_1014 HNE_1015     TRUE 0.880 -84.000 0.067 NA   NA
 2211300 2211301 HNE_1015 HNE_1016     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 2211301 2211302 HNE_1016 HNE_1017     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211302 2211303 HNE_1017 HNE_1018     FALSE 0.279 29.000 0.000 NA   NA
 2211303 2211304 HNE_1018 HNE_1019     FALSE 0.435 15.000 0.000 NA   NA
 2211304 2211305 HNE_1019 HNE_1020     FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 2211306 1464773 HNE_1021 HNE_1022     FALSE 0.022 224.000 0.000 NA   NA
 2211308 2211309 HNE_1024 HNE_1025     FALSE 0.492 62.000 0.000 1.000 Y NA
 2211310 2211311 HNE_1026 HNE_1027     FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 2211311 2211312 HNE_1027 HNE_1028     FALSE 0.231 35.000 0.000 NA   NA
 2211312 2211313 HNE_1028 HNE_1029   clpS FALSE 0.174 99.000 0.005 NA   NA
 2211313 2211314 HNE_1029 HNE_1030 clpS clpA TRUE 0.821 58.000 0.596 NA   NA
 2211314 2211315 HNE_1030 HNE_1031 clpA   FALSE 0.056 133.000 0.000 1.000 N NA
 2211316 2211317 HNE_1032 HNE_1033     FALSE 0.197 41.000 0.000 NA   NA
 2211317 2211318 HNE_1033 HNE_1034   tldD FALSE 0.217 37.000 0.000 NA   NA
 2211318 2211319 HNE_1034 HNE_1035 tldD   FALSE 0.144 53.000 0.000 NA   NA
 2211322 2211323 HNE_1038 HNE_1039 coxB   TRUE 0.988 24.000 0.741 0.003 Y NA
 2211323 2211324 HNE_1039 HNE_1040   cyoE TRUE 0.604 111.000 0.153 0.055 N NA
 2211324 2211325 HNE_1040 HNE_1041 cyoE   TRUE 0.721 2.000 0.000 NA   NA
 2211325 2211326 HNE_1041 HNE_1042     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211326 2211327 HNE_1042 HNE_1043     TRUE 0.714 77.000 0.536 1.000 N NA
 2211327 2211328 HNE_1043 HNE_1044     FALSE 0.047 143.000 0.000 NA   NA
 2211328 2211329 HNE_1044 HNE_1045   thrC TRUE 0.876 -3.000 0.008 NA   NA
 2211329 2211330 HNE_1045 HNE_1046 thrC   TRUE 0.564 11.000 0.000 1.000 N NA
 2211330 2211331 HNE_1046 HNE_1047     FALSE 0.177 151.000 0.040 NA N NA
 2211331 2211332 HNE_1047 HNE_1048     TRUE 0.643 6.000 0.000 NA   NA
 2211333 2211334 HNE_1049 HNE_1050     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2211334 2211335 HNE_1050 HNE_1051     TRUE 0.962 6.000 0.182 NA   NA
 2211336 2211337 HNE_1052 HNE_1053     FALSE 0.389 152.000 0.017 1.000 Y NA
 2211337 2211338 HNE_1053 HNE_1054     TRUE 0.959 27.000 0.313 NA Y NA
 2211339 2211340 HNE_1055 HNE_1056     FALSE 0.105 63.000 0.000 NA   NA
 2211340 2211341 HNE_1056 HNE_1057     FALSE 0.025 207.000 0.000 1.000 N NA
 2211342 2211343 HNE_1058 HNE_1059     FALSE 0.036 181.000 0.000 1.000   NA
 2211343 2211344 HNE_1059 HNE_1060     FALSE 0.061 235.000 0.000 0.055   NA
 2211344 2211345 HNE_1060 HNE_1061     FALSE 0.396 18.000 0.000 NA   NA
 2211347 2211348 HNE_1064 HNE_1065   moaC1 TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2211348 2211349 HNE_1065 HNE_1066 moaC1 moaB1 TRUE 0.990 5.000 0.109 0.004 Y NA
 2211349 2211350 HNE_1066 HNE_1067 moaB1 moaE1 TRUE 0.976 7.000 0.018 0.004 Y NA
 2211350 2211351 HNE_1067 HNE_1068 moaE1   TRUE 0.994 5.000 0.501 1.000 Y NA
 2211351 2211352 HNE_1068 HNE_1069   moaA1 TRUE 0.950 4.000 0.000 1.000 Y NA
 2211352 2211353 HNE_1069 HNE_1070 moaA1   TRUE 0.571 -7.000 0.000 NA N NA
 2211353 2211354 HNE_1070 HNE_1071     TRUE 0.672 -3.000 0.000 NA N NA
 2211354 2211355 HNE_1071 HNE_1072     TRUE 0.998 4.000 0.917 0.001 Y NA
 2211355 2211356 HNE_1072 HNE_1073     TRUE 0.998 0.000 0.705 0.064 Y NA
 2211356 2211357 HNE_1073 HNE_1074     FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 2211357 2211358 HNE_1074 HNE_1075     FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 2211359 2211360 HNE_1076 HNE_1077     FALSE 0.033 172.000 0.000 NA   NA
 2211360 2211361 HNE_1077 HNE_1078   leuD2 TRUE 0.997 0.000 0.571 0.002 Y NA
 2211363 2211364 HNE_1080 HNE_1081     TRUE 0.853 16.000 0.000 1.000 Y NA
 2211364 2211365 HNE_1081 HNE_1082     FALSE 0.168 47.000 0.000 NA   NA
 2211367 2211368 HNE_1084 HNE_1085     FALSE 0.060 244.000 0.000 0.041   NA
 2211369 2211370 HNE_1086 HNE_1087     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211370 2211371 HNE_1087 HNE_1088     TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2211372 2211373 HNE_1089 HNE_1090     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211374 2211375 HNE_1091 HNE_1092     TRUE 0.843 4.000 0.002 NA   NA
 2211376 2211377 HNE_1093 HNE_1094     TRUE 0.977 11.000 0.600 NA   NA
 2211377 2211378 HNE_1094 HNE_1095     TRUE 0.983 -3.000 0.400 1.000 N NA
 2211378 2211379 HNE_1095 HNE_1096     FALSE 0.307 23.000 0.000 NA N NA
 2211379 2211380 HNE_1096 HNE_1097     FALSE 0.065 89.000 0.000 NA N NA
 2211380 2211381 HNE_1097 HNE_1098     TRUE 0.974 -58.000 0.600 1.000 N NA
 2211381 2211382 HNE_1098 HNE_1099     TRUE 0.963 36.000 0.600 1.000 Y NA
 2211382 2211383 HNE_1099 HNE_1100     TRUE 0.910 32.000 0.500 1.000 N NA
 2211383 2211384 HNE_1100 HNE_1101     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211386 2211387 HNE_1103 HNE_1104     TRUE 0.678 54.000 0.059 0.001   NA
 2211387 2211388 HNE_1104 HNE_1105     TRUE 0.670 53.000 0.133 1.000   NA
 2211388 2211389 HNE_1105 HNE_1106   gattA TRUE 0.914 -3.000 0.027 1.000 N NA
 2211390 2211391 HNE_1107 HNE_1108     TRUE 0.866 -3.000 0.000 0.087 N NA
 2211391 2211392 HNE_1108 HNE_1109     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.059 Y NA
 2211392 2211393 HNE_1109 HNE_1110     FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 2211393 2211394 HNE_1110 HNE_1111     FALSE 0.105 63.000 0.000 NA   NA
 2211396 2211397 HNE_1113 HNE_1114     TRUE 0.898 -3.000 0.000 0.008   NA
 2211397 2211398 HNE_1114 HNE_1115     TRUE 0.987 -16.000 0.667 0.008   NA
 2211398 2211399 HNE_1115 HNE_1116     TRUE 0.986 -3.000 0.500 1.000   NA
 2211401 2211402 HNE_1118 HNE_1119 rhlE   FALSE 0.117 264.000 0.000 NA Y NA
 2211403 2211404 HNE_1120 HNE_1121     FALSE 0.015 316.000 0.000 1.000 N NA
 2211404 2211405 HNE_1121 HNE_1122     FALSE 0.036 168.000 0.000 1.000 N NA
 2211405 2211406 HNE_1122 HNE_1123     FALSE 0.024 215.000 0.000 1.000 N NA
 2211406 1464875 HNE_1123 HNE_1124     FALSE 0.025 204.000 0.000 NA   NA
 1464875 2211407 HNE_1124 HNE_1125   hisC FALSE 0.174 46.000 0.000 NA   NA
 2211409 2211410 HNE_1127 HNE_1128     FALSE 0.108 62.000 0.000 NA   NA
 2211410 2211411 HNE_1128 HNE_1129     FALSE 0.066 103.000 0.000 NA N NA
 2211411 2211412 HNE_1129 HNE_1130   tgt FALSE 0.167 48.000 0.000 1.000 N NA
 2211414 2211415 HNE_1133 HNE_1134     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 2211419 2211420 HNE_1138 HNE_1139 pntB pntAB TRUE 0.977 3.000 0.087 0.001   NA
 2211420 2211421 HNE_1139 HNE_1140 pntAB pntAA TRUE 0.995 -3.000 0.829 0.001   NA
 2211422 2211423 HNE_1141 HNE_1142     FALSE 0.013 384.000 0.000 1.000 N NA
 2211423 2211424 HNE_1142 HNE_1143     FALSE 0.266 27.000 0.000 NA N NA
 2211424 2211425 HNE_1143 HNE_1144     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA Y NA
 2211425 2211426 HNE_1144 HNE_1145     TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 2211426 2211427 HNE_1145 HNE_1146     FALSE 0.162 48.000 0.000 NA   NA
 2211427 2211428 HNE_1146 HNE_1147   galU FALSE 0.075 84.000 0.000 NA   NA
 2211428 2211429 HNE_1147 HNE_1148 galU   FALSE 0.021 232.000 0.000 1.000 N NA
 2211429 2211430 HNE_1148 HNE_1149     FALSE 0.025 189.000 0.000 NA N NA
 2211430 2211431 HNE_1149 HNE_1150     TRUE 0.955 0.000 0.000 NA Y NA
 2211431 2211432 HNE_1150 HNE_1151     TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2211432 2211433 HNE_1151 HNE_1152     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211433 2211434 HNE_1152 HNE_1153     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA Y NA
 2211434 2211435 HNE_1153 HNE_1154     TRUE 0.954 48.000 0.750 1.000 Y NA
 2211435 2211436 HNE_1154 HNE_1155     TRUE 0.974 13.000 0.081 0.011 Y NA
 2211436 2211437 HNE_1155 HNE_1156   accA FALSE 0.188 45.000 0.000 1.000 N NA
 2211437 2211438 HNE_1156 HNE_1157 accA thiL TRUE 0.588 10.000 0.000 1.000 N NA
 2211438 2211439 HNE_1157 HNE_1158 thiL   FALSE 0.068 120.000 0.000 1.000 N NA
 2211441 2211442 HNE_1160 HNE_1161   plsX FALSE 0.187 106.000 0.007 NA   NA
 2211442 2211443 HNE_1161 HNE_1162 plsX fabH TRUE 0.971 33.000 0.380 0.004 Y NA
 2211443 2211444 HNE_1162 HNE_1163 fabH   TRUE 0.549 96.000 0.207 1.000 N NA
 2211444 2211445 HNE_1163 HNE_1164     TRUE 0.954 18.000 0.535 1.000   NA
 2211446 2211447 HNE_1166 HNE_1167 msrB2   FALSE 0.289 65.000 0.020 1.000 N NA
 2211447 2211448 HNE_1167 HNE_1168     TRUE 0.680 6.000 0.000 1.000   NA
 2211451 2211452 HNE_1171 HNE_1172     FALSE 0.517 -100.000 0.000 NA   NA
 2211452 2211453 HNE_1172 HNE_1173     FALSE 0.182 45.000 0.000 NA   NA
 2211453 2211454 HNE_1173 HNE_1174     FALSE 0.087 101.000 0.000 1.000   NA
 2211454 2211455 HNE_1174 HNE_1175     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211455 2211456 HNE_1175 HNE_1176   pnuC TRUE 0.983 -24.000 0.242 NA Y NA
 2211456 2211457 HNE_1176 HNE_1177 pnuC   FALSE 0.082 71.000 0.000 1.000 N NA
 2211458 2211459 HNE_1178 HNE_1179     FALSE 0.235 39.000 0.000 1.000   NA
 2211463 2211464 HNE_1183 HNE_1184     TRUE 0.967 5.000 0.000 0.011 Y NA
 2211464 2211465 HNE_1184 HNE_1185     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211465 2211466 HNE_1185 HNE_1186     FALSE 0.295 27.000 0.000 NA   NA
 2211466 2211467 HNE_1186 HNE_1187   eda FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 2211469 2211470 HNE_1189 HNE_1190     TRUE 0.872 6.000 0.000 0.003 N NA
 2211470 2211471 HNE_1190 HNE_1191     TRUE 0.596 9.000 0.000 NA   NA
 2211473 2211474 HNE_1193 HNE_1194     TRUE 0.717 62.000 0.300 1.000   NA
 2211474 2211475 HNE_1194 HNE_1195     FALSE 0.075 84.000 0.000 NA   NA
 2211475 2211476 HNE_1195 HNE_1196     FALSE 0.030 184.000 0.000 NA   NA
 2211476 2211477 HNE_1196 HNE_1197     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211477 2211478 HNE_1197 HNE_1198     TRUE 0.873 24.000 0.167 1.000   NA
 2211478 2211479 HNE_1198 HNE_1199     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 2211479 2211480 HNE_1199 HNE_1200   galE FALSE 0.072 111.000 0.000 NA   NA
 2211480 2211481 HNE_1200 HNE_1201 galE   TRUE 0.644 42.000 0.000 NA Y NA
 2211482 2211483 HNE_1202 HNE_1203     TRUE 0.759 81.000 0.708 NA   NA
 2211483 2211484 HNE_1203 HNE_1204     TRUE 0.974 -3.000 0.216 NA   NA
 2211484 2211485 HNE_1204 HNE_1205     TRUE 0.988 -3.000 0.648 NA   NA
 2211485 2211486 HNE_1205 HNE_1206     TRUE 0.927 -13.000 0.101 NA   NA
 2211486 2211487 HNE_1206 HNE_1207     TRUE 0.985 -3.000 0.467 NA   NA
 2211487 2211488 HNE_1207 HNE_1208     FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 2211489 2211490 HNE_1209 HNE_1210     FALSE 0.098 61.000 0.000 NA N NA
 2211491 2211492 HNE_1211 HNE_1212     FALSE 0.035 154.000 0.000 NA N NA
 2211492 2211493 HNE_1212 HNE_1213     TRUE 0.606 -7.000 0.000 NA   NA
 2211493 2211494 HNE_1213 HNE_1214     FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 2211494 2211495 HNE_1214 HNE_1215     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 2211495 2211496 HNE_1215 HNE_1216     TRUE 0.675 5.000 0.000 NA   NA
 2211496 2211497 HNE_1216 HNE_1217     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2211497 2211498 HNE_1217 HNE_1218     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 2211499 2211500 HNE_1219 HNE_1220     FALSE 0.033 189.000 0.000 1.000   NA
 2211500 2211501 HNE_1220 HNE_1221     FALSE 0.073 98.000 0.000 NA   NA
 2211503 2211504 HNE_1223 HNE_1224     FALSE 0.015 314.000 0.000 NA   NA
 2211505 2211506 HNE_1225 HNE_1226 ccoS   TRUE 0.996 -3.000 0.713 NA Y NA
 2211506 2211507 HNE_1226 HNE_1227     TRUE 0.990 -3.000 0.206 NA Y NA
 2211507 2211508 HNE_1227 HNE_1228   fixG TRUE 0.959 0.000 0.092 NA N NA
 2211508 2211509 HNE_1228 HNE_1229 fixG ccoP TRUE 0.992 -3.000 0.116 0.014 Y NA
 2211509 2211510 HNE_1229 HNE_1230 ccoP ccoQ TRUE 0.977 -7.000 0.217 0.003 N NA
 2211510 2211511 HNE_1230 HNE_1231 ccoQ ccoO TRUE 0.959 12.000 0.143 0.003 N NA
 2211511 2211512 HNE_1231 HNE_1232 ccoO ccoN TRUE 0.952 12.000 0.108 0.003 N NA
 2211513 2211514 HNE_1233 HNE_1234   fixL FALSE 0.076 74.000 0.000 NA   NA
 2211514 2211515 HNE_1234 HNE_1235 fixL fixJ TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.066 Y NA
 2211515 2211516 HNE_1235 HNE_1236 fixJ   TRUE 0.548 70.000 0.000 0.013 Y NA
 2211518 2211519 HNE_1238 HNE_1239 aceB aceA TRUE 0.819 45.000 0.054 1.000 Y NA
 2211519 2211520 HNE_1239 HNE_1240 aceA   FALSE 0.013 365.000 0.000 NA   NA
 2211522 2211523 HNE_1242 HNE_1243     FALSE 0.303 27.000 0.000 1.000 N NA
 2211524 2211525 HNE_1244 HNE_1245     TRUE 0.714 3.000 0.000 NA   NA
 2211528 2211529 HNE_1248 HNE_1249 bioF bioD TRUE 0.977 -18.000 0.128 1.000 Y NA
 2211529 2211530 HNE_1249 HNE_1250 bioD   FALSE 0.060 128.000 0.000 1.000 N NA
 2211531 2211532 HNE_1251 HNE_1252     TRUE 0.733 33.000 0.091 NA N NA
 2211532 2211533 HNE_1252 HNE_1253     TRUE 0.740 45.000 0.167 NA N NA
 2211533 2211534 HNE_1253 HNE_1254     FALSE 0.023 198.000 0.000 NA N NA
 2211534 2211535 HNE_1254 HNE_1255     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211535 2211536 HNE_1255 HNE_1256     TRUE 0.948 -55.000 0.227 NA   NA
 2211536 2211537 HNE_1256 HNE_1257     FALSE 0.510 112.000 0.182 NA N NA
 2211537 2211538 HNE_1257 HNE_1258     FALSE 0.068 119.000 0.000 1.000 N NA
 2211538 2211539 HNE_1258 HNE_1259     FALSE 0.013 368.000 0.000 1.000 N NA
 2211541 2211542 HNE_1261 HNE_1262     FALSE 0.017 263.000 0.000 NA   NA
 2211547 2211548 HNE_1267 HNE_1268     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA   NA
 2211548 2211549 HNE_1268 HNE_1269     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 2211549 2211550 HNE_1269 HNE_1270   mgtE FALSE 0.528 58.000 0.000 1.000 Y NA
 2211550 2211551 HNE_1270 HNE_1271 mgtE   FALSE 0.244 109.000 0.020 1.000   NA
 2211551 2211552 HNE_1271 HNE_1272   ivd2 FALSE 0.468 40.000 0.011 1.000   NA
 2211552 2211553 HNE_1272 HNE_1273 ivd2   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211554 2211555 HNE_1274 HNE_1275     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 2211555 2211556 HNE_1275 HNE_1276     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000   NA
 2211561 2211562 HNE_1281 HNE_1282     TRUE 0.853 16.000 0.000 1.000 Y NA
 2211564 2211565 HNE_1284 HNE_1285   mccA TRUE 0.544 -28.000 0.000 NA   NA
 2211566 2211567 HNE_1286 HNE_1287     FALSE 0.071 116.000 0.000 1.000 N NA
 2211571 2211572 HNE_1291 HNE_1292     FALSE 0.057 129.000 0.000 NA   NA
 2211573 2211574 HNE_1293 HNE_1294   amn FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 2211574 2211575 HNE_1294 HNE_1295 amn cdd TRUE 0.922 9.000 0.000 1.000 Y NA
 2211575 2211576 HNE_1295 HNE_1296 cdd   FALSE 0.077 85.000 0.000 1.000 N NA
 2211576 2211577 HNE_1296 HNE_1297     FALSE 0.058 128.000 0.000 NA   NA
 2211578 2211579 HNE_1298 HNE_1299     FALSE 0.008 1122.000 0.000 NA   NA
 2211579 2211580 HNE_1299 HNE_1300     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211580 2211581 HNE_1300 HNE_1301     FALSE 0.009 599.000 0.000 NA   NA
 2211582 2211583 HNE_1302 HNE_1303     FALSE 0.087 101.000 0.000 1.000   NA
 2211585 2211586 HNE_1305 HNE_1306     FALSE 0.299 31.000 0.000 1.000   NA
 2211586 2211587 HNE_1306 HNE_1307     TRUE 0.984 26.000 0.713 0.089 Y NA
 2211587 2211588 HNE_1307 HNE_1308     FALSE 0.261 78.000 0.023 1.000   NA
 2211588 2211589 HNE_1308 HNE_1309   ccmE FALSE 0.316 54.000 0.005 1.000   NA
 2211589 2211590 HNE_1309 HNE_1310 ccmE ccmF TRUE 0.984 -3.000 0.021 0.002 Y NA
 2211591 2211592 HNE_1311 HNE_1312     TRUE 0.971 34.000 0.733 1.000 Y NA
 2211592 2211593 HNE_1312 HNE_1313     TRUE 0.581 33.000 0.025 1.000 N NA
 2211593 2211594 HNE_1313 HNE_1314     FALSE 0.244 154.000 0.000 NA Y NA
 2211594 2211595 HNE_1314 HNE_1315     FALSE 0.139 54.000 0.000 NA   NA
 2211596 2211597 HNE_1316 HNE_1317 glnE   FALSE 0.199 46.000 0.000 1.000   NA
 2211597 2211598 HNE_1317 HNE_1318     FALSE 0.087 101.000 0.000 1.000   NA
 2211598 2211599 HNE_1318 HNE_1319     TRUE 0.939 -3.000 0.062 NA   NA
 2211599 2211600 HNE_1319 HNE_1320     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211601 2211602 HNE_1321 HNE_1322     TRUE 0.576 -36.000 0.000 1.000   NA
 2211604 2211605 HNE_1324 HNE_1325     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211605 2211606 HNE_1325 HNE_1326   mutB FALSE 0.364 20.000 0.000 NA   NA
 2211606 2211607 HNE_1326 HNE_1327 mutB mutA TRUE 0.995 -3.000 0.220 0.001 Y NA
 2211608 2211609 HNE_1328 HNE_1329     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 2211609 2211610 HNE_1329 HNE_1330     FALSE 0.018 294.000 0.000 1.000   NA
 2211610 2211611 HNE_1330 HNE_1331     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211612 2211613 HNE_1332 HNE_1333 map2   TRUE 0.985 -3.000 0.492 NA   NA
 2211614 2211615 HNE_1334 HNE_1335   glpK TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2211617 2211618 HNE_1337 HNE_1338     FALSE 0.154 127.000 0.000 0.089   NA
 2211618 2211619 HNE_1338 HNE_1339     FALSE 0.075 84.000 0.000 NA   NA
 2211619 2211620 HNE_1339 HNE_1340     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211621 2211622 HNE_1342 HNE_1343     TRUE 0.621 7.000 0.000 NA   NA
 2211622 2211623 HNE_1343 HNE_1344   murA FALSE 0.138 55.000 0.000 1.000 N NA
 2211623 2211624 HNE_1344 HNE_1345 murA   FALSE 0.480 95.000 0.138 NA   NA
 2211624 2211625 HNE_1345 HNE_1346   hisD FALSE 0.423 98.000 0.096 NA   NA
 2211625 2211626 HNE_1346 HNE_1347 hisD   TRUE 0.964 5.000 0.157 NA   NA
 2211629 2211630 HNE_1350 HNE_1351     FALSE 0.224 36.000 0.000 NA   NA
 2211630 2211631 HNE_1351 HNE_1352     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211632 2211633 HNE_1353 HNE_1354   infA FALSE 0.083 112.000 0.000 1.000   NA
 2211633 2211634 HNE_1354 HNE_1355 infA maf TRUE 0.964 6.000 0.207 NA N NA
 2211634 2211635 HNE_1355 HNE_1356 maf   FALSE 0.059 127.000 0.000 NA   NA
 2211636 2211637 HNE_1357 HNE_1358     FALSE 0.455 14.000 0.000 NA   NA
 2211638 2211639 HNE_1359 HNE_1360     FALSE 0.053 134.000 0.000 NA   NA
 2211639 2211640 HNE_1360 HNE_1361     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211640 2211641 HNE_1361 HNE_1362     FALSE 0.064 122.000 0.000 NA   NA
 2211641 2211642 HNE_1362 HNE_1363     FALSE 0.074 109.000 0.000 NA   NA
 2211642 2211643 HNE_1363 HNE_1364   pmbA FALSE 0.115 167.000 0.018 NA   NA
 2211643 2211644 HNE_1364 HNE_1365 pmbA   TRUE 0.845 29.000 0.182 NA   NA
 2211644 2211645 HNE_1365 HNE_1366     TRUE 0.746 -49.000 0.005 1.000 N NA
 2211646 2211647 HNE_1367 HNE_1368   ubiA FALSE 0.124 59.000 0.000 1.000 N NA
 2211649 2211650 HNE_1370 HNE_1371     FALSE 0.445 15.000 0.000 1.000 N NA
 2211653 2211654 HNE_1374 HNE_1375     FALSE 0.206 39.000 0.000 NA   NA
 2211654 2211655 HNE_1375 HNE_1376     FALSE 0.044 148.000 0.000 NA   NA
 2211656 2211657 HNE_1377 HNE_1378     FALSE 0.078 106.000 0.000 1.000 N NA
 2211661 2211662 HNE_1382 HNE_1383     FALSE 0.064 122.000 0.000 NA   NA
 2211662 2211663 HNE_1383 HNE_1384   lgt TRUE 0.970 -3.000 0.170 NA   NA
 2211664 2211665 HNE_1385 HNE_1386     FALSE 0.375 112.000 0.080 NA   NA
 2211665 2211666 HNE_1386 HNE_1387   proC TRUE 0.966 10.000 0.308 NA   NA
 2211666 2211667 HNE_1387 HNE_1388 proC   TRUE 0.783 21.000 0.062 NA   NA
 2211667 2211668 HNE_1388 HNE_1389     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211668 2211669 HNE_1389 HNE_1390     FALSE 0.022 250.000 0.000 1.000   NA
 2211669 2211670 HNE_1390 HNE_1391     FALSE 0.073 97.000 0.000 NA   NA
 2211670 2211671 HNE_1391 HNE_1392     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211671 2211672 HNE_1392 HNE_1393     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211672 2211673 HNE_1393 HNE_1394   fliN TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211673 2211674 HNE_1394 HNE_1395 fliN phhA FALSE 0.179 49.000 0.000 1.000   NA
 2211675 2211676 HNE_1396 HNE_1397 pth   TRUE 0.903 83.000 0.496 0.024 Y NA
 2211676 2211677 HNE_1397 HNE_1398     FALSE 0.036 167.000 0.000 1.000 N NA
 2211677 2211678 HNE_1398 HNE_1399     FALSE 0.081 114.000 0.000 1.000   NA
 2211679 2211680 HNE_1400 HNE_1401     TRUE 0.985 10.000 0.916 NA   NA
 2211680 2211681 HNE_1401 HNE_1402   acsA FALSE 0.081 114.000 0.000 1.000   NA
 2211681 2211682 HNE_1402 HNE_1403 acsA   FALSE 0.063 95.000 0.000 NA N NA
 2211683 2211684 HNE_1404 HNE_1405 chvG   TRUE 0.742 0.000 0.000 1.000 N NA
 2211686 2211687 HNE_1407 HNE_1408   chvI TRUE 0.568 -46.000 0.000 1.000   NA
 2211687 2211688 HNE_1408 HNE_1409 chvI   FALSE 0.050 142.000 0.000 1.000 N NA
 2211690 2211691 HNE_1411 HNE_1412 ilvD polA FALSE 0.062 126.000 0.000 1.000 N NA
 2211692 2211693 HNE_1413 HNE_1414     FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 2211693 2211694 HNE_1414 HNE_1415     FALSE 0.168 47.000 0.000 NA   NA
 2211694 2211695 HNE_1415 HNE_1416     FALSE 0.077 72.000 0.000 NA   NA
 2211695 2211696 HNE_1416 HNE_1417     FALSE 0.074 88.000 0.000 NA   NA
 2211697 2211698 HNE_1418 HNE_1419 metC   TRUE 0.930 5.000 0.060 1.000 N NA
 2211698 2211699 HNE_1419 HNE_1420     TRUE 0.926 0.000 0.027 1.000 N NA
 2211700 2211701 HNE_1421 HNE_1422     TRUE 0.684 19.000 0.017 NA   NA
 2211701 2211702 HNE_1422 HNE_1423     FALSE 0.061 136.000 0.000 1.000   NA
 2211704 2211705 HNE_1426 HNE_1427     FALSE 0.041 154.000 0.000 NA   NA
 2211709 2211710 HNE_1431 HNE_1432     TRUE 0.675 5.000 0.000 NA   NA
 2211710 2211711 HNE_1432 HNE_1433     TRUE 0.765 0.000 0.000 1.000   NA
 2211712 2211713 HNE_1434 HNE_1435   linC FALSE 0.016 274.000 0.000 NA   NA
 2211714 2211715 HNE_1436 HNE_1437     FALSE 0.035 167.000 0.000 NA   NA
 2211717 2211718 HNE_1439 HNE_1440     FALSE 0.348 22.000 0.000 NA   NA
 2211719 2211720 HNE_1441 HNE_1442     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211720 2211721 HNE_1442 HNE_1443     FALSE 0.036 164.000 0.000 NA   NA
 2211721 2211722 HNE_1443 HNE_1444     FALSE 0.010 569.000 0.000 NA   NA
 2211722 2211723 HNE_1444 HNE_1445     FALSE 0.064 121.000 0.000 NA   NA
 2211723 1465197 HNE_1445 HNE_1446     FALSE 0.532 -39.000 0.000 NA   NA
 1465197 2211724 HNE_1446 HNE_1447     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211727 2211728 HNE_1450 HNE_1451     TRUE 0.643 6.000 0.000 NA   NA
 2211730 2211731 HNE_1453 HNE_1454     FALSE 0.224 36.000 0.000 NA   NA
 2211731 2211732 HNE_1454 HNE_1455     TRUE 0.546 -27.000 0.000 NA   NA
 2211732 2211733 HNE_1455 HNE_1456     FALSE 0.013 343.000 0.000 NA   NA
 2211737 2211738 HNE_1460 HNE_1461     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211739 2211740 HNE_1462 HNE_1463     FALSE 0.122 58.000 0.000 NA   NA
 2211740 1465215 HNE_1463 HNE_1464     FALSE 0.081 70.000 0.000 NA   NA
 2211742 2211743 HNE_1466 HNE_1467     FALSE 0.068 119.000 0.000 1.000 N NA
 2211743 2211744 HNE_1467 HNE_1468     FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000 N NA
 2211746 2211747 HNE_1470 HNE_1471     FALSE 0.112 61.000 0.000 NA   NA
 2211747 2211748 HNE_1471 HNE_1472     TRUE 0.814 38.000 0.222 NA   NA
 2211748 2211749 HNE_1472 HNE_1473     TRUE 0.661 60.000 0.200 NA   NA
 2211749 2211750 HNE_1473 HNE_1474     FALSE 0.432 66.000 0.000 NA Y NA
 2211751 2211752 HNE_1475 HNE_1476   leuD TRUE 0.816 22.000 0.083 1.000 N NA
 2211752 2211753 HNE_1476 HNE_1477 leuD leuC2 TRUE 0.987 -10.000 0.116 0.002 Y NA
 2211755 2211756 HNE_1479 HNE_1480     FALSE 0.011 466.000 0.000 NA   NA
 2211756 2211757 HNE_1480 HNE_1481     FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 2211757 2211758 HNE_1481 HNE_1482     FALSE 0.022 219.000 0.000 NA   NA
 2211758 2211759 HNE_1482 HNE_1483     FALSE 0.018 258.000 0.000 NA   NA
 2211759 2211760 HNE_1483 HNE_1484   copB FALSE 0.130 252.000 0.000 1.000 Y NA
 2211760 2211761 HNE_1484 HNE_1485 copB   TRUE 0.994 0.000 0.667 0.004 N NA
 2211761 2211762 HNE_1485 HNE_1486     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA   NA
 2211764 2211765 HNE_1488 HNE_1489     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 2211766 2211767 HNE_1490 HNE_1491     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 2211768 2211769 HNE_1492 HNE_1493     TRUE 0.629 42.000 0.065 1.000   NA
 2211770 2211771 HNE_1494 HNE_1495     FALSE 0.097 980.000 0.000 0.048 Y NA
 2211771 2211772 HNE_1495 HNE_1496     FALSE 0.088 103.000 0.000 1.000   NA
 2211772 2211773 HNE_1496 HNE_1497     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 2211773 2211774 HNE_1497 HNE_1498     FALSE 0.128 56.000 0.000 NA   NA
 2211774 2211775 HNE_1498 HNE_1499     FALSE 0.084 69.000 0.000 NA   NA
 2211775 2211776 HNE_1499 HNE_1500     FALSE 0.435 15.000 0.000 NA   NA
 2211777 2211778 HNE_1501 HNE_1502     FALSE 0.197 41.000 0.000 NA   NA
 2211779 1465255 HNE_1503 HNE_1504     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 2211782 2211783 HNE_1507 HNE_1508     TRUE 0.975 0.000 0.000 0.012 Y NA
 2211783 2211784 HNE_1508 HNE_1509     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211785 2211786 HNE_1510 HNE_1511     TRUE 0.979 -3.000 0.003 0.006 Y NA
 2211786 2211787 HNE_1511 HNE_1512     TRUE 0.935 -9.000 0.102 1.000 N NA
 2211787 2211788 HNE_1512 HNE_1513   cobO TRUE 0.766 12.000 0.007 1.000 N NA
 2211788 2211789 HNE_1513 HNE_1514 cobO   FALSE 0.130 413.000 0.007 1.000 Y NA
 2211789 2211790 HNE_1514 HNE_1515     TRUE 0.906 10.000 0.069 1.000 N NA
 2211790 2211791 HNE_1515 HNE_1516     TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 2211791 2211792 HNE_1516 HNE_1517     TRUE 0.995 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 2211792 1465269 HNE_1517 HNE_1518     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 1465269 2211793 HNE_1518 HNE_1519   cobD TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211793 2211794 HNE_1519 HNE_1520 cobD   TRUE 0.989 -3.000 0.344 0.006 N NA
 2211795 2211796 HNE_1521 HNE_1522 cobU alkB FALSE 0.009 489.000 0.000 NA N NA
 2211796 2211797 HNE_1522 HNE_1523 alkB   FALSE 0.015 296.000 0.000 NA   NA
 2211797 2211798 HNE_1523 HNE_1524     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 2211799 1465277 HNE_1525 HNE_1526     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 1465277 2211800 HNE_1526 HNE_1527     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211800 2211801 HNE_1527 HNE_1528     TRUE 0.965 3.000 0.124 NA   NA
 2211802 2211803 HNE_1529 HNE_1530     TRUE 0.714 3.000 0.000 NA   NA
 2211806 2211807 HNE_1533 HNE_1534     TRUE 0.817 27.000 0.109 1.000   NA
 2211807 2211808 HNE_1534 HNE_1535     TRUE 0.974 0.000 0.085 0.077   NA
 2211808 2211809 HNE_1535 HNE_1536     TRUE 0.993 2.000 0.609 0.004 N NA
 2211809 2211810 HNE_1536 HNE_1537     TRUE 0.756 1.000 0.000 1.000   NA
 2211811 2211812 HNE_1538 HNE_1539     FALSE 0.039 157.000 0.000 NA   NA
 2211812 2211813 HNE_1539 HNE_1540     TRUE 0.966 -3.000 0.143 NA   NA
 2211814 2211815 HNE_1541 HNE_1542     FALSE 0.243 79.000 0.022 NA   NA
 2211815 2211816 HNE_1542 HNE_1543     FALSE 0.379 19.000 0.000 NA   NA
 2211817 2211818 HNE_1544 HNE_1545     TRUE 0.560 -16.000 0.000 NA   NA
 2211818 2211819 HNE_1545 HNE_1546     FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2211820 2211821 HNE_1547 HNE_1548     FALSE 0.212 38.000 0.000 NA   NA
 2211821 2211822 HNE_1548 HNE_1549     TRUE 0.618 10.000 0.000 1.000   NA
 2211822 2211823 HNE_1549 HNE_1550   moaE2 FALSE 0.446 17.000 0.000 1.000   NA
 2211823 2211824 HNE_1550 HNE_1551 moaE2 moaB2 TRUE 0.970 -13.000 0.018 0.004 Y NA
 2211824 2211825 HNE_1551 HNE_1552 moaB2 moaC2 TRUE 0.992 -3.000 0.109 0.004 Y NA
 2211825 2211826 HNE_1552 HNE_1553 moaC2 moeA1 TRUE 0.979 -3.000 0.003 0.004 Y NA
 2211826 2211827 HNE_1553 HNE_1554 moeA1   FALSE 0.274 31.000 0.000 1.000 N NA
 2211827 2211828 HNE_1554 HNE_1555     FALSE 0.050 142.000 0.000 1.000 N NA
 2211828 2211829 HNE_1555 HNE_1556     TRUE 0.620 22.000 0.012 NA N NA
 2211829 2211830 HNE_1556 HNE_1557   moaA2 FALSE 0.022 202.000 0.000 NA N NA
 2211832 2211833 HNE_1559 HNE_1560 narK narG FALSE 0.428 16.000 0.000 1.000 N NA
 2211833 2211834 HNE_1560 HNE_1561 narG narH TRUE 0.996 -3.000 0.405 0.001 Y NA
 2211834 2211835 HNE_1561 HNE_1562 narH narJ TRUE 0.995 10.000 0.625 0.001 Y NA
 2211835 2211836 HNE_1562 HNE_1563 narJ   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211836 2211837 HNE_1563 HNE_1564   narI FALSE 0.321 25.000 0.000 NA   NA
 2211837 2211838 HNE_1564 HNE_1565 narI   TRUE 0.977 -3.000 0.242 1.000 N NA
 2211838 2211839 HNE_1565 HNE_1566     TRUE 0.612 32.000 0.030 NA   NA
 2211839 2211840 HNE_1566 HNE_1567     TRUE 0.892 -3.000 0.016 NA   NA
 2211845 1465324 HNE_1572 HNE_1573     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 1465324 2211846 HNE_1573 HNE_1574   moeA2 FALSE 0.026 202.000 0.000 NA   NA
 2211847 2211848 HNE_1575 HNE_1576 otsA otsB TRUE 0.811 53.000 0.016 0.001 Y NA
 2211848 2211849 HNE_1576 HNE_1577 otsB   TRUE 0.990 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 2211850 2211851 HNE_1578 HNE_1579     FALSE 0.313 29.000 0.000 1.000   NA
 2211851 2211852 HNE_1579 HNE_1580     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2211852 2211853 HNE_1580 HNE_1581     TRUE 0.652 6.000 0.000 1.000 N NA
 2211855 2211856 HNE_1583 HNE_1584     FALSE 0.224 36.000 0.000 NA   NA
 2211856 2211857 HNE_1584 HNE_1585     FALSE 0.295 27.000 0.000 NA   NA
 2211858 2211859 HNE_1586 HNE_1587     TRUE 0.992 -3.000 0.631 0.052   NA
 2211859 2211860 HNE_1587 HNE_1588     TRUE 0.865 -3.000 0.004 1.000   NA
 2211860 2211861 HNE_1588 HNE_1589     TRUE 0.989 -3.000 0.694 NA   NA
 2211862 2211863 HNE_1590 HNE_1591   acpP1 TRUE 0.927 -10.000 0.091 1.000 N NA
 2211863 2211864 HNE_1591 HNE_1592 acpP1   TRUE 0.887 -34.000 0.064 1.000 N NA
 2211864 2211865 HNE_1592 HNE_1593     TRUE 0.901 19.000 0.096 0.041 N NA
 2211865 2211866 HNE_1593 HNE_1594     FALSE 0.031 199.000 0.000 1.000   NA
 1465346 2211867 HNE_1595 HNE_1596     FALSE 0.046 145.000 0.000 NA   NA
 2211871 1465352 HNE_1600 HNE_1601     FALSE 0.020 239.000 0.000 NA   NA
 1465352 2211872 HNE_1601 HNE_1602     FALSE 0.009 742.000 0.000 NA   NA
 2211873 2211874 HNE_1603 HNE_1604     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211874 2211875 HNE_1604 HNE_1605     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211877 2211878 HNE_1607 HNE_1608     FALSE 0.041 157.000 0.000 1.000 N NA
 2211878 2211879 HNE_1608 HNE_1609     TRUE 0.936 -3.000 0.057 NA   NA
 2211879 2211880 HNE_1609 HNE_1610     TRUE 0.904 -3.000 0.022 NA   NA
 2211880 2211881 HNE_1610 HNE_1611     FALSE 0.183 106.000 0.000 0.085 N NA
 2211881 2211882 HNE_1611 HNE_1612     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211882 2211883 HNE_1612 HNE_1613     FALSE 0.187 44.000 0.000 NA   NA
 2211884 2211885 HNE_1614 HNE_1615   ldh1 TRUE 0.606 -7.000 0.000 NA   NA
 2211886 2211887 HNE_1616 HNE_1617     FALSE 0.346 144.000 0.111 1.000   NA
 2211887 2211888 HNE_1617 HNE_1618     FALSE 0.013 387.000 0.000 1.000 N NA
 2211892 2211893 HNE_1622 HNE_1623     FALSE 0.435 15.000 0.000 NA   NA
 2211893 2211894 HNE_1623 HNE_1624   sodA FALSE 0.073 91.000 0.000 NA   NA
 2211894 2211895 HNE_1624 HNE_1625 sodA   FALSE 0.048 154.000 0.000 1.000   NA
 2211897 2211898 HNE_1627 HNE_1628     FALSE 0.065 131.000 0.000 1.000   NA
 2211899 2211900 HNE_1629 HNE_1630     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 2211901 2211902 HNE_1631 HNE_1632     TRUE 0.978 -34.000 0.667 1.000   NA
 2211903 2211904 HNE_1633 HNE_1634     TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2211904 2211905 HNE_1634 HNE_1635     TRUE 0.621 7.000 0.000 NA   NA
 2211905 2211906 HNE_1635 HNE_1636     FALSE 0.033 172.000 0.000 NA   NA
 2211906 2211907 HNE_1636 HNE_1637     FALSE 0.153 52.000 0.000 1.000 N NA
 2211909 2211910 HNE_1639 HNE_1640 ectA ectB TRUE 0.940 46.000 0.793 0.001   NA
 2211910 2211911 HNE_1640 HNE_1641 ectB estC TRUE 0.974 12.000 0.572 1.000   NA
 2211911 2211912 HNE_1641 HNE_1642 estC   TRUE 0.847 17.000 0.079 1.000   NA
 2211912 2211913 HNE_1642 HNE_1643     TRUE 0.927 2.000 0.036 1.000 N NA
 2211913 2211914 HNE_1643 HNE_1644     TRUE 0.680 6.000 0.000 1.000   NA
 2211914 2211915 HNE_1644 HNE_1645     TRUE 0.886 -3.000 0.000 0.038   NA
 2211915 2211916 HNE_1645 HNE_1646     FALSE 0.041 297.000 0.000 0.085 N NA
 2211916 2211917 HNE_1646 HNE_1647     TRUE 0.983 14.000 0.943 0.085 N NA
 2211917 2211918 HNE_1647 HNE_1648     TRUE 0.966 6.000 0.114 0.085 N NA
 2211918 2211919 HNE_1648 HNE_1649     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 2211919 2211920 HNE_1649 HNE_1650     TRUE 0.983 11.000 0.848 NA   NA
 2211920 2211921 HNE_1650 HNE_1651     TRUE 0.923 37.000 0.808 NA   NA
 2211921 2211922 HNE_1651 HNE_1652     TRUE 0.985 -3.000 0.462 1.000 N NA
 2211922 2211923 HNE_1652 HNE_1653     FALSE 0.154 186.000 0.056 1.000 N NA
 2211923 2211924 HNE_1653 HNE_1654   dld FALSE 0.039 162.000 0.000 1.000 N NA
 2211925 2211926 HNE_1655 HNE_1656     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 2211926 2211927 HNE_1656 HNE_1657     FALSE 0.070 114.000 0.000 NA   NA
 2211927 2211928 HNE_1657 HNE_1658   cydB TRUE 0.855 14.000 0.070 NA   NA
 2211928 2211929 HNE_1658 HNE_1659 cydB cydA TRUE 0.994 13.000 0.953 0.060 Y NA
 2211930 2211931 HNE_1660 HNE_1661     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.004 Y NA
 2211933 2211934 HNE_1663 HNE_1664     FALSE 0.279 29.000 0.000 NA   NA
 2211934 2211935 HNE_1664 HNE_1665     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2211935 2211936 HNE_1665 HNE_1666     FALSE 0.067 117.000 0.000 NA   NA
 2211937 2211938 HNE_1667 HNE_1668     FALSE 0.496 125.000 0.000 0.002 Y NA
 2211939 2211940 HNE_1669 HNE_1670     TRUE 0.990 -3.000 0.751 1.000 N NA
 2211940 2211941 HNE_1670 HNE_1671     FALSE 0.075 94.000 0.000 1.000 N NA
 2211942 2211943 HNE_1672 HNE_1673     FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 2211943 2211944 HNE_1673 HNE_1674     FALSE 0.048 142.000 0.000 NA   NA
 2211944 2211945 HNE_1674 HNE_1675     TRUE 0.625 -10.000 0.000 1.000   NA
 2211945 2211946 HNE_1675 HNE_1676   valS FALSE 0.139 121.000 0.002 1.000 N NA
 2211946 2211947 HNE_1676 HNE_1677 valS   FALSE 0.275 90.000 0.033 NA   NA
 2211947 2211948 HNE_1677 HNE_1678     FALSE 0.254 101.000 0.024 NA   NA
 2211948 2211949 HNE_1678 HNE_1679     FALSE 0.200 95.000 0.009 1.000 N NA
 1465431 2211950 HNE_1680 HNE_1681     FALSE 0.061 125.000 0.000 NA   NA
 2211950 1465433 HNE_1681 HNE_1682     FALSE 0.192 42.000 0.000 NA   NA
 2211951 2211952 HNE_1683 HNE_1684     FALSE 0.058 224.000 0.000 0.080 N NA
 2211952 2211953 HNE_1684 HNE_1685     TRUE 0.984 -3.000 0.440 NA   NA
 2211954 2211955 HNE_1686 HNE_1687     FALSE 0.011 499.000 0.000 NA   NA
 2211957 2211958 HNE_1689 HNE_1690 merT merP TRUE 0.908 61.000 0.833 0.001   NA
 2211958 2211959 HNE_1690 HNE_1691 merP merA FALSE 0.352 184.000 0.250 1.000 N NA
 2211960 2211961 HNE_1692 HNE_1693     TRUE 0.989 -3.000 0.667 NA   NA
 2211961 2211962 HNE_1693 HNE_1694     TRUE 0.990 -3.000 0.750 1.000 N NA
 2211962 2211963 HNE_1694 HNE_1695     TRUE 0.996 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 2211963 2211964 HNE_1695 HNE_1696     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA   NA
 2211965 2211966 HNE_1697 HNE_1698     FALSE 0.009 646.000 0.000 NA   NA
 2211966 2211967 HNE_1698 HNE_1699     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211968 2211969 HNE_1700 HNE_1701     FALSE 0.065 100.000 0.000 NA N NA
 2211969 2211970 HNE_1701 HNE_1702     FALSE 0.065 85.000 0.000 NA N NA
 2211970 2211971 HNE_1702 HNE_1703     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211971 2211972 HNE_1703 HNE_1704   copD TRUE 0.554 11.000 0.000 NA   NA
 2211972 2211973 HNE_1704 HNE_1705 copD copC TRUE 0.970 12.000 0.481 1.000   NA
 2211973 2211974 HNE_1705 HNE_1706 copC   FALSE 0.479 42.000 0.000 0.004   NA
 2211974 2211975 HNE_1706 HNE_1707     TRUE 0.979 15.000 0.667 0.004 N NA
 2211975 2211976 HNE_1707 HNE_1708     FALSE 0.084 69.000 0.000 NA   NA
 2211980 2211981 HNE_1712 HNE_1713   cadA TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2211981 2211982 HNE_1713 HNE_1714 cadA   TRUE 0.886 76.000 0.400 0.051 Y NA
 2211982 2211983 HNE_1714 HNE_1715     TRUE 0.956 27.000 1.000 1.000 N NA
 2211983 2211984 HNE_1715 HNE_1716     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 2211984 2211985 HNE_1716 HNE_1717     FALSE 0.087 78.000 0.000 1.000   NA
 2211985 2211986 HNE_1717 HNE_1718     FALSE 0.011 413.000 0.000 NA   NA
 2211986 2211987 HNE_1718 HNE_1719     FALSE 0.076 105.000 0.000 NA   NA
 2211987 2211988 HNE_1719 HNE_1720     FALSE 0.020 237.000 0.000 NA   NA
 2211988 2211989 HNE_1720 HNE_1721     TRUE 0.940 5.000 0.000 NA Y NA
 2211990 2211991 HNE_1722 HNE_1723     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2211991 2211992 HNE_1723 HNE_1724     TRUE 0.714 3.000 0.000 NA   NA
 2211992 2211993 HNE_1724 HNE_1725     FALSE 0.098 819.000 0.154 NA   NA
 2211995 2211996 HNE_1727 HNE_1728   lspA2 TRUE 0.868 -3.000 0.000 0.084 N NA
 2211997 1465481 HNE_1729 HNE_1730     FALSE 0.033 174.000 0.000 NA   NA
 1465481 2211998 HNE_1730 HNE_1731     FALSE 0.122 58.000 0.000 NA   NA
 2211998 2211999 HNE_1731 HNE_1732     TRUE 0.968 -3.000 0.154 NA   NA
 2211999 2212000 HNE_1732 HNE_1733   pgi TRUE 0.675 5.000 0.000 NA   NA
 1465487 2212003 HNE_1736 HNE_1737     FALSE 0.068 116.000 0.000 NA   NA
 2212003 2212004 HNE_1737 HNE_1738   zwf FALSE 0.390 90.000 0.000 1.000 Y NA
 2212004 2212005 HNE_1738 HNE_1739 zwf pgl TRUE 0.964 5.000 0.007 1.000 Y NA
 2212005 2212006 HNE_1739 HNE_1740 pgl edd TRUE 0.991 3.000 0.202 1.000 Y NA
 2212006 2212007 HNE_1740 HNE_1741 edd glk TRUE 0.969 4.000 0.008 1.000 Y NA
 2212007 2212008 HNE_1741 HNE_1742 glk nuoA FALSE 0.030 186.000 0.000 1.000 N NA
 2212008 2212009 HNE_1742 HNE_1743 nuoA nuoB TRUE 0.997 0.000 0.396 0.003 Y NA
 2212009 2212010 HNE_1743 HNE_1744 nuoB nuoC TRUE 0.989 12.000 0.262 0.003 Y NA
 2212010 2212011 HNE_1744 HNE_1745 nuoC nuoD TRUE 0.976 32.000 0.483 0.007 Y NA
 2212011 2212012 HNE_1745 HNE_1746 nuoD   TRUE 0.909 -3.000 0.021 1.000   NA
 2212012 2212013 HNE_1746 HNE_1747     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2212013 2212014 HNE_1747 HNE_1748   nuoE TRUE 0.694 1.000 0.000 NA N NA
 2212014 2212015 HNE_1748 HNE_1749 nuoE nuoF TRUE 0.996 4.000 0.343 0.006 Y NA
 2212015 2212016 HNE_1749 HNE_1750 nuoF   FALSE 0.496 14.000 0.000 1.000   NA
 2212016 2212017 HNE_1750 HNE_1751   nuoG TRUE 0.659 7.000 0.000 1.000   NA
 2212017 2212018 HNE_1751 HNE_1752 nuoG nuoH TRUE 0.994 10.000 0.515 0.007 Y NA
 2212018 2212019 HNE_1752 HNE_1753 nuoH nuoI TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 2212019 2212020 HNE_1753 HNE_1754 nuoI nuoJ TRUE 0.903 72.000 0.442 0.007 Y NA
 2212020 2212021 HNE_1754 HNE_1755 nuoJ nuoK TRUE 0.997 4.000 0.484 0.003 Y NA
 2212021 2212022 HNE_1755 HNE_1756 nuoK nuoL TRUE 0.994 8.000 0.451 0.007 Y NA
 2212022 2212023 HNE_1756 HNE_1757 nuoL nuoM TRUE 0.996 0.000 0.251 0.002 Y NA
 2212023 2212024 HNE_1757 HNE_1758 nuoM nuoN TRUE 0.996 5.000 0.453 0.002 Y NA
 2212024 2212025 HNE_1758 HNE_1759 nuoN   TRUE 0.964 -36.000 0.372 1.000 N NA
 2212025 2212026 HNE_1759 HNE_1760     TRUE 0.945 4.000 0.071 1.000 N NA
 2212026 2212027 HNE_1760 HNE_1761     TRUE 0.951 -3.000 0.080 1.000   NA
 2212027 2212028 HNE_1761 HNE_1762     TRUE 0.942 8.000 0.105 1.000   NA
 2212028 2212029 HNE_1762 HNE_1763     TRUE 0.974 0.000 0.172 NA   NA
 2212029 2212030 HNE_1763 HNE_1764   proS FALSE 0.345 48.000 0.006 NA   NA
 2212030 2212031 HNE_1764 HNE_1765 proS   TRUE 0.796 9.000 0.005 1.000 N NA
 2212031 2212032 HNE_1765 HNE_1766     TRUE 0.893 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2212032 2212033 HNE_1766 HNE_1767   dnaE FALSE 0.174 80.000 0.005 1.000 N NA
 2212033 2212034 HNE_1767 HNE_1768 dnaE rpsB FALSE 0.139 140.000 0.009 1.000 N NA
 2212034 2212035 HNE_1768 HNE_1769 rpsB tsf TRUE 0.965 39.000 0.748 1.000 Y NA
 2212035 2212036 HNE_1769 HNE_1770 tsf pyrH TRUE 0.668 111.000 0.416 1.000 N NA
 2212036 2212037 HNE_1770 HNE_1771 pyrH frr TRUE 0.988 -3.000 0.626 1.000 N NA
 2212037 2212038 HNE_1771 HNE_1772 frr uppS TRUE 0.986 0.000 0.409 1.000 N NA
 2212038 2212039 HNE_1772 HNE_1773 uppS cdsA TRUE 0.995 0.000 0.400 1.000 Y NA
 2212039 2212040 HNE_1773 HNE_1774 cdsA dxr TRUE 0.990 7.000 0.372 1.000 Y NA
 2212040 2212041 HNE_1774 HNE_1775 dxr   TRUE 0.985 5.000 0.568 1.000 N NA
 2212041 2212042 HNE_1775 HNE_1776     TRUE 0.923 37.000 0.204 1.000 Y NA
 2212042 2212043 HNE_1776 HNE_1777     TRUE 0.915 33.000 0.123 1.000 Y NA
 2212043 2212044 HNE_1777 HNE_1778   lpxD TRUE 0.953 13.000 0.060 1.000 Y NA
 2212044 2212045 HNE_1778 HNE_1779 lpxD lpxA TRUE 0.754 40.000 0.005 1.000 Y NA
 2212045 2212046 HNE_1779 HNE_1780 lpxA   TRUE 0.988 2.000 0.552 NA   NA
 2212046 2212047 HNE_1780 HNE_1781   lpxB TRUE 0.970 -3.000 0.173 NA   NA
 2212048 2212049 HNE_1782 HNE_1783 gltA gltX1 TRUE 0.685 48.000 0.127 1.000 N NA
 2212049 2212050 HNE_1783 HNE_1784 gltX1   FALSE 0.015 304.000 0.000 NA   NA
 2212052 2212053 HNE_1786 HNE_1787 lexA trpC FALSE 0.263 67.000 0.018 1.000 N NA
 2212053 2212054 HNE_1787 HNE_1788 trpC trpD TRUE 0.993 3.000 0.293 1.000 Y NA
 2212054 2212055 HNE_1788 HNE_1789 trpD trpG TRUE 0.972 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 2212055 2212056 HNE_1789 HNE_1790 trpG trpE TRUE 0.986 -3.000 0.026 0.001 Y NA
 2212056 2212057 HNE_1790 HNE_1791 trpE   TRUE 0.947 -3.000 0.071 1.000   NA
 2212058 2212059 HNE_1792 HNE_1793 tpiA secG TRUE 0.535 81.000 0.184 1.000 N NA
 2212059 2212060 HNE_1793 HNE_1794 secG pyrG FALSE 0.485 64.000 0.083 1.000 N NA
 2212061 2212062 HNE_1795 HNE_1796     TRUE 0.938 -3.000 0.062 NA   NA
 2212062 2212063 HNE_1796 HNE_1797     TRUE 0.989 -3.000 0.722 NA   NA
 2212063 2212064 HNE_1797 HNE_1798     TRUE 0.912 -3.000 0.023 1.000   NA
 2212067 2212068 HNE_1801 HNE_1802     TRUE 0.969 -7.000 0.316 NA N NA
 2212068 2212069 HNE_1802 HNE_1803     FALSE 0.321 25.000 0.000 NA   NA
 2212069 2212070 HNE_1803 HNE_1804   guaB FALSE 0.121 63.000 0.000 1.000   NA
 2212074 2212075 HNE_1808 HNE_1809 guaA   FALSE 0.042 166.000 0.000 1.000   NA
 2212076 2212077 HNE_1810 HNE_1811     TRUE 0.966 -3.000 0.139 NA   NA
 2212077 2212078 HNE_1811 HNE_1812     TRUE 0.958 11.000 0.046 NA Y NA
 2212078 2212079 HNE_1812 HNE_1813   tmk TRUE 0.977 -3.000 0.254 1.000 N NA
 2212079 2212080 HNE_1813 HNE_1814 tmk   TRUE 0.936 -7.000 0.099 1.000 N NA
 2212080 2212081 HNE_1814 HNE_1815   rlpA FALSE 0.231 136.000 0.046 NA   NA
 1465567 2212082 HNE_1816 HNE_1817     FALSE 0.009 615.000 0.000 NA   NA
 2212082 2212083 HNE_1817 HNE_1818     FALSE 0.022 219.000 0.000 NA   NA
 2212083 1465570 HNE_1818 HNE_1819     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 1465570 2212084 HNE_1819 HNE_1820     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212084 2212085 HNE_1820 HNE_1821     FALSE 0.010 819.000 0.000 1.000   NA
 2212085 2212086 HNE_1821 HNE_1822     FALSE 0.187 44.000 0.000 NA   NA
 2212086 2212087 HNE_1822 HNE_1823   fidA FALSE 0.074 99.000 0.000 NA   NA
 2212088 2212089 HNE_1824 HNE_1825     FALSE 0.295 27.000 0.000 NA   NA
 2212089 2212090 HNE_1825 HNE_1826   mmsB TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2212090 2212091 HNE_1826 HNE_1827 mmsB   TRUE 0.954 2.000 0.000 1.000 Y NA
 2212091 2212092 HNE_1827 HNE_1828   mmsA1 TRUE 0.882 7.000 0.028 1.000 N NA
 2212092 1465580 HNE_1828 HNE_1829 mmsA1   FALSE 0.027 195.000 0.000 NA   NA
 2212093 2212094 HNE_1830 HNE_1831   metG FALSE 0.086 68.000 0.000 NA   NA
 2212094 2212095 HNE_1831 HNE_1832 metG   TRUE 0.710 5.000 0.000 1.000   NA
 2212096 2212097 HNE_1833 HNE_1834     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 2212097 2212098 HNE_1834 HNE_1835   fcs3 TRUE 0.564 11.000 0.000 1.000 N NA
 2212098 2212099 HNE_1835 HNE_1836 fcs3   FALSE 0.031 179.000 0.000 NA   NA
 2212099 2212100 HNE_1836 HNE_1837     FALSE 0.231 35.000 0.000 NA   NA
 2212100 2212101 HNE_1837 HNE_1838   dxs FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 2212101 2212102 HNE_1838 HNE_1839 dxs ispA TRUE 0.886 36.000 0.088 1.000 Y NA
 2212102 2212103 HNE_1839 HNE_1840 ispA xseB TRUE 0.693 32.000 0.062 1.000 N NA
 2212103 2212104 HNE_1840 HNE_1841 xseB   FALSE 0.197 72.000 0.009 NA N NA
 2212104 2212105 HNE_1841 HNE_1842   lepB FALSE 0.063 93.000 0.000 NA N NA
 2212105 2212106 HNE_1842 HNE_1843 lepB   FALSE 0.036 181.000 0.000 1.000   NA
 2212106 2212107 HNE_1843 HNE_1844     FALSE 0.148 56.000 0.000 1.000   NA
 2212107 2212108 HNE_1844 HNE_1845     FALSE 0.084 70.000 0.000 1.000 N NA
 2212109 2212110 HNE_1846 HNE_1847     TRUE 0.923 7.000 0.071 NA   NA
 2212110 2212111 HNE_1847 HNE_1848     FALSE 0.342 61.000 0.023 NA   NA
 2212112 2212113 HNE_1849 HNE_1850   cysE FALSE 0.421 93.000 0.097 NA   NA
 2212113 2212114 HNE_1850 HNE_1851 cysE   FALSE 0.067 73.000 0.000 NA N NA
 2212114 2212115 HNE_1851 HNE_1852     TRUE 0.959 19.000 0.723 NA N NA
 2212115 2212116 HNE_1852 HNE_1853     TRUE 0.883 -45.000 0.064 1.000 N NA
 2212118 2212119 HNE_1855 HNE_1856 folE1   TRUE 0.644 -7.000 0.000 1.000   NA
 2212120 2212121 HNE_1857 HNE_1858     TRUE 0.918 0.000 0.023 NA   NA
 2212121 2212122 HNE_1858 HNE_1859     FALSE 0.031 179.000 0.000 NA   NA
 2212124 2212125 HNE_1861 HNE_1862     FALSE 0.145 187.000 0.050 NA   NA
 2212125 2212126 HNE_1862 HNE_1863     TRUE 0.653 80.000 0.373 NA   NA
 2212126 2212127 HNE_1863 HNE_1864   gspC FALSE 0.098 238.000 0.043 1.000 N NA
 2212127 2212128 HNE_1864 HNE_1865 gspC gspD TRUE 0.995 -3.000 0.575 1.000 Y NA
 2212128 2212129 HNE_1865 HNE_1866 gspD gspE TRUE 0.994 8.000 0.776 1.000 Y NA
 2212129 2212130 HNE_1866 HNE_1867 gspE gspF TRUE 0.992 -13.000 0.653 1.000 Y NA
 2212130 2212131 HNE_1867 HNE_1868 gspF gspG1 TRUE 0.992 13.000 0.599 0.004 Y NA
 2212131 2212132 HNE_1868 HNE_1869 gspG1 gspH TRUE 0.985 9.000 0.425 0.004   NA
 2212132 2212133 HNE_1869 HNE_1870 gspH gspI TRUE 0.994 0.000 0.605 0.004   NA
 2212133 2212134 HNE_1870 HNE_1871 gspI gspJ TRUE 0.992 -3.000 0.569 0.004   NA
 2212134 2212135 HNE_1871 HNE_1872 gspJ gspK TRUE 0.994 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 2212135 2212136 HNE_1872 HNE_1873 gspK gspL TRUE 0.997 0.000 0.537 0.050 Y NA
 2212136 2212137 HNE_1873 HNE_1874 gspL gspM TRUE 0.996 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 2212137 2212138 HNE_1874 HNE_1875 gspM gspN TRUE 0.991 0.000 0.649 1.000   NA
 2212138 2212139 HNE_1875 HNE_1876 gspN   TRUE 0.919 -3.000 0.034 NA   NA
 2212140 2212141 HNE_1877 HNE_1878   sdaA FALSE 0.085 92.000 0.000 1.000   NA
 2212141 2212142 HNE_1878 HNE_1879 sdaA   FALSE 0.079 73.000 0.000 1.000 N NA
 2212142 2212143 HNE_1879 HNE_1880     FALSE 0.237 34.000 0.000 NA   NA
 2212145 2212146 HNE_1882 HNE_1883 trx addA TRUE 0.599 65.000 0.173 1.000   NA
 2212146 2212147 HNE_1883 HNE_1884 addA   TRUE 0.994 -7.000 0.863 NA Y NA
 2212147 2212148 HNE_1884 HNE_1885     TRUE 0.952 -10.000 0.196 NA N NA
 2212148 2212149 HNE_1885 HNE_1886     TRUE 0.988 -3.000 0.642 NA   NA
 2212149 2212150 HNE_1886 HNE_1887     TRUE 0.875 -16.000 0.047 NA   NA
 2212151 2212152 HNE_1888 HNE_1889   fdxB TRUE 0.671 18.000 0.000 0.058   NA
 2212152 2212153 HNE_1889 HNE_1890 fdxB   FALSE 0.046 135.000 0.000 NA N NA
 2212154 2212155 HNE_1891 HNE_1892 atpC atpD TRUE 0.995 12.000 0.837 0.003 Y NA
 2212155 2212156 HNE_1892 HNE_1893 atpD atpG TRUE 0.971 47.000 0.724 0.003 Y NA
 2212156 2212157 HNE_1893 HNE_1894 atpG atpA TRUE 0.982 36.000 0.846 0.003 Y NA
 2212157 2212158 HNE_1894 HNE_1895 atpA atpH TRUE 0.997 9.000 0.864 0.003 Y NA
 2212158 2212159 HNE_1895 HNE_1896 atpH priA FALSE 0.058 208.000 0.003 1.000 N NA
 2212159 2212160 HNE_1896 HNE_1897 priA   FALSE 0.135 60.000 0.000 1.000   NA
 2212161 2212162 HNE_1898 HNE_1899     FALSE 0.075 77.000 0.000 NA   NA
 2212162 2212163 HNE_1899 HNE_1900     TRUE 0.973 13.000 0.674 NA   NA
 2212166 2212167 HNE_1903 HNE_1904     FALSE 0.180 109.000 0.006 NA   NA
 2212172 2212173 HNE_1909 HNE_1910     FALSE 0.332 138.000 0.091 1.000   NA
 2212173 2212174 HNE_1910 HNE_1911   mrcA FALSE 0.082 113.000 0.000 1.000   NA
 2212174 2212175 HNE_1911 HNE_1912 mrcA prfB FALSE 0.289 94.000 0.041 1.000 N NA
 2212175 2212176 HNE_1912 HNE_1913 prfB   TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2212178 2212179 HNE_1915 HNE_1916     FALSE 0.079 71.000 0.000 NA   NA
 2212179 2212180 HNE_1916 HNE_1917   smc FALSE 0.428 16.000 0.000 1.000 N NA
 2212180 2212181 HNE_1917 HNE_1918 smc   FALSE 0.104 150.000 0.004 NA   NA
 2212181 2212182 HNE_1918 HNE_1919   atpB TRUE 0.908 6.000 0.046 NA   NA
 2212182 2212183 HNE_1919 HNE_1920 atpB atpE TRUE 0.812 117.000 0.628 0.003   NA
 2212183 2212184 HNE_1920 HNE_1921 atpE   TRUE 0.876 46.000 0.278 0.003   NA
 2212184 2212185 HNE_1921 HNE_1922     TRUE 0.998 0.000 0.863 0.001 Y NA
 2212188 2212189 HNE_1925 HNE_1926 secF secD1 TRUE 0.956 19.000 0.056 0.001 Y NA
 2212189 2212190 HNE_1926 HNE_1927 secD1 yajC TRUE 0.886 37.000 0.099 NA Y NA
 2212190 2212191 HNE_1927 HNE_1928 yajC pcm FALSE 0.066 106.000 0.000 NA N NA
 2212191 2212192 HNE_1928 HNE_1929 pcm surE TRUE 0.946 -12.000 0.147 1.000   NA
 2212192 2212193 HNE_1929 HNE_1930 surE serS TRUE 0.622 40.000 0.058 1.000   NA
 2212195 2212196 HNE_1932 HNE_1933 tatC tatA1 TRUE 0.995 -3.000 0.535 NA Y NA
 2212196 2212197 HNE_1933 HNE_1934 tatA1 tatA2 TRUE 0.977 26.000 0.353 0.006 Y NA
 2212198 2212199 HNE_1935 HNE_1936 xth   FALSE 0.308 26.000 0.000 NA   NA
 2212199 2212200 HNE_1936 HNE_1937   purQ FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 2212200 2212201 HNE_1937 HNE_1938 purQ add TRUE 0.950 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2212202 2212203 HNE_1939 HNE_1940     FALSE 0.069 115.000 0.000 NA   NA
 2212204 2212205 HNE_1941 HNE_1942   purL FALSE 0.269 34.000 0.000 1.000   NA
 2212206 2212207 HNE_1943 HNE_1944     FALSE 0.018 259.000 0.000 NA   NA
 2212207 2212208 HNE_1944 HNE_1945     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212209 2212210 HNE_1946 HNE_1947     FALSE 0.075 77.000 0.000 NA   NA
 2212212 2212213 HNE_1949 HNE_1950     FALSE 0.075 101.000 0.000 NA   NA
 2212213 2212214 HNE_1950 HNE_1951     FALSE 0.077 73.000 0.000 NA   NA
 2212216 2212217 HNE_1953 HNE_1954     FALSE 0.072 95.000 0.000 NA   NA
 2212218 2212219 HNE_1955 HNE_1956   rpsD FALSE 0.075 76.000 0.000 NA   NA
 2212221 2212222 HNE_1958 HNE_1959     FALSE 0.406 17.000 0.000 NA   NA
 2212222 2212223 HNE_1959 HNE_1960     FALSE 0.077 81.000 0.000 1.000 N NA
 2212224 2212225 HNE_1961 HNE_1962 groES groL TRUE 0.912 56.000 0.209 0.006 Y NA
 2212225 2212226 HNE_1962 HNE_1963 groL   FALSE 0.053 137.000 0.000 1.000 N NA
 2212227 2212228 HNE_1964 HNE_1965     TRUE 0.570 -13.000 0.000 NA   NA
 2212228 2212229 HNE_1965 HNE_1966     TRUE 0.728 54.000 0.226 NA   NA
 2212229 1465718 HNE_1966 HNE_1967     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA   NA
 1465718 2212230 HNE_1967 HNE_1968   recJ FALSE 0.075 79.000 0.000 NA   NA
 2212231 2212232 HNE_1969 HNE_1970 purB   FALSE 0.051 140.000 0.000 1.000 N NA
 2212232 2212233 HNE_1970 HNE_1971     TRUE 0.722 3.000 0.000 1.000 N NA
 2212233 2212234 HNE_1971 HNE_1972     FALSE 0.075 93.000 0.000 1.000 N NA
 2212234 2212235 HNE_1972 HNE_1973     FALSE 0.031 183.000 0.000 1.000 N NA
 2212236 2212237 HNE_1974 HNE_1975 lpdA1 pdhC TRUE 0.940 25.000 0.121 1.000 Y NA
 2212237 2212238 HNE_1975 HNE_1976 pdhC pdhB TRUE 0.993 0.000 0.254 1.000 Y NA
 2212238 2212239 HNE_1976 HNE_1977 pdhB pdhA TRUE 0.928 65.000 0.456 0.001 Y NA
 2212239 2212240 HNE_1977 HNE_1978 pdhA   FALSE 0.493 67.000 0.104 1.000 N NA
 2212240 2212241 HNE_1978 HNE_1979     FALSE 0.077 81.000 0.000 1.000 N NA
 2212241 2212242 HNE_1979 HNE_1980   eno FALSE 0.062 126.000 0.000 1.000 N NA
 2212242 2212243 HNE_1980 HNE_1981 eno rpmF FALSE 0.164 110.000 0.003 1.000 N NA
 2212243 2212244 HNE_1981 HNE_1982 rpmF   FALSE 0.010 404.000 0.000 NA N NA
 2212244 2212245 HNE_1982 HNE_1983     TRUE 0.951 0.000 0.074 NA N NA
 2212247 2212248 HNE_1985 HNE_1986 mfd   FALSE 0.237 157.000 0.078 NA   NA
 2212251 2212252 HNE_1989 HNE_1990     TRUE 0.973 -7.000 0.367 NA   NA
 2212252 2212253 HNE_1990 HNE_1991     FALSE 0.418 16.000 0.000 NA   NA
 2212254 2212255 HNE_1992 HNE_1993 maiA astB TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2212255 2212256 HNE_1993 HNE_1994 astB   TRUE 0.737 -3.000 0.000 1.000   NA
 2212256 2212257 HNE_1994 HNE_1995   astD TRUE 0.766 12.000 0.000 0.078   NA
 2212257 2212258 HNE_1995 HNE_1996 astD astA TRUE 0.991 0.000 0.727 1.000 N NA
 2212258 2212259 HNE_1996 HNE_1997 astA   TRUE 0.987 1.000 0.097 1.000 Y NA
 2212259 2212260 HNE_1997 HNE_1998     FALSE 0.030 185.000 0.000 1.000 N NA
 2212260 1465750 HNE_1998 HNE_1999     FALSE 0.010 558.000 0.000 NA   NA
 1465750 2212261 HNE_1999 HNE_2000   nusG FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 2212261 2212262 HNE_2000 HNE_2001 nusG secE TRUE 0.910 45.000 0.843 1.000 N NA
 2212262 2212263 HNE_2001 HNE_2002 secE   FALSE 0.040 144.000 0.000 NA N NA
 2212263 2212264 HNE_2002 HNE_2003     TRUE 0.678 37.000 0.000 NA Y NA
 2212266 2212267 HNE_2005 HNE_2006   hfq TRUE 0.945 8.000 0.115 1.000   NA
 2212267 2212268 HNE_2006 HNE_2007 hfq   TRUE 0.602 77.000 0.252 1.000   NA
 2212268 2212269 HNE_2007 HNE_2008   trkA TRUE 0.991 4.000 0.089 0.004 Y NA
 2212269 2212270 HNE_2008 HNE_2009 trkA ntrX TRUE 0.799 25.000 0.085 1.000 N NA
 2212270 2212271 HNE_2009 HNE_2010 ntrX ntrY TRUE 0.990 14.000 0.533 0.074 Y NA
 2212271 2212272 HNE_2010 HNE_2011 ntrY glnG TRUE 0.834 106.000 0.205 0.074 Y NA
 2212272 2212273 HNE_2011 HNE_2012 glnG glnL TRUE 0.993 6.000 0.297 0.060 Y NA
 2212273 2212274 HNE_2012 HNE_2013 glnL   TRUE 0.956 -3.000 0.094 1.000 N NA
 2212275 2212276 HNE_2014 HNE_2015 ispDF   FALSE 0.075 80.000 0.000 NA   NA
 2212276 2212277 HNE_2015 HNE_2016     FALSE 0.455 14.000 0.000 NA   NA
 2212277 2212278 HNE_2016 HNE_2017     FALSE 0.148 52.000 0.000 NA   NA
 2212278 2212279 HNE_2017 HNE_2018     FALSE 0.018 257.000 0.000 NA   NA
 2212280 2212281 HNE_2019 HNE_2020     FALSE 0.026 202.000 0.000 NA   NA
 2212281 2212282 HNE_2020 HNE_2021   lipA TRUE 0.947 4.000 0.081 NA N NA
 2212284 2212285 HNE_2023 HNE_2024 phaB   TRUE 0.804 23.000 0.000 1.000 Y NA
 2212288 2212289 HNE_2028 HNE_2029 phoB phoU TRUE 0.787 32.000 0.128 NA N NA
 2212289 2212290 HNE_2029 HNE_2030 phoU pstB TRUE 0.979 12.000 0.203 NA Y NA
 2212290 2212291 HNE_2030 HNE_2031 pstB pstA TRUE 0.997 0.000 0.402 0.001 Y NA
 2212291 2212292 HNE_2031 HNE_2032 pstA pstC TRUE 0.995 -7.000 0.485 0.001 Y NA
 2212293 2212294 HNE_2033 HNE_2034 hslV hslU TRUE 0.900 103.000 0.752 1.000 Y NA
 2212295 2212296 HNE_2035 HNE_2036     TRUE 0.784 -46.000 0.016 NA N NA
 2212298 2212299 HNE_2038 HNE_2039     TRUE 0.943 14.000 0.298 NA   NA
 2212299 2212300 HNE_2039 HNE_2040   nth FALSE 0.121 63.000 0.000 1.000   NA
 2212301 2212302 HNE_2041 HNE_2042     FALSE 0.035 167.000 0.000 NA   NA
 2212302 2212303 HNE_2042 HNE_2043     FALSE 0.234 65.000 0.000 0.058 N NA
 2212303 2212304 HNE_2043 HNE_2044     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 2212305 2212306 HNE_2045 HNE_2046   scpB FALSE 0.257 28.000 0.000 NA N NA
 2212306 2212307 HNE_2046 HNE_2047 scpB scpA TRUE 0.977 -13.000 0.570 NA   NA
 2212307 2212308 HNE_2047 HNE_2048 scpA nagZ TRUE 0.959 -3.000 0.103 NA   NA
 2212308 2212309 HNE_2048 HNE_2049 nagZ   TRUE 0.866 4.000 0.006 NA   NA
 2212309 2212310 HNE_2049 HNE_2050     FALSE 0.201 104.000 0.009 NA   NA
 2212311 2212312 HNE_2051 HNE_2052     FALSE 0.015 315.000 0.000 NA   NA
 2212312 2212313 HNE_2052 HNE_2053     FALSE 0.068 116.000 0.000 NA   NA
 2212314 2212315 HNE_2054 HNE_2055 nusB ribH TRUE 0.984 0.000 0.347 1.000 N NA
 2212315 2212316 HNE_2055 HNE_2056 ribH ribAB TRUE 0.982 2.000 0.005 0.002 Y NA
 2212316 2212317 HNE_2056 HNE_2057 ribAB ribE TRUE 0.966 4.000 0.005 1.000 Y NA
 2212317 2212318 HNE_2057 HNE_2058 ribE   TRUE 0.978 19.000 0.456 1.000 Y NA
 2212318 2212319 HNE_2058 HNE_2059   nrdR TRUE 0.977 -3.000 0.277 NA N NA
 2212319 2212320 HNE_2059 HNE_2060 nrdR glyA TRUE 0.838 7.000 0.015 NA N NA
 2212322 2212323 HNE_2062 HNE_2063 hemA   FALSE 0.076 97.000 0.000 1.000 N NA
 2212324 2212325 HNE_2064 HNE_2065 ppnK   FALSE 0.299 80.000 0.044 NA   NA
 2212328 2212329 HNE_2068 HNE_2069   tig FALSE 0.040 155.000 0.000 NA   NA
 2212330 2212331 HNE_2070 HNE_2071     TRUE 0.941 -3.000 0.015 0.049   NA
 2212331 2212332 HNE_2071 HNE_2072   algI FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 2212332 2212333 HNE_2072 HNE_2073 algI   TRUE 0.938 -37.000 0.167 NA   NA
 2212333 2212334 HNE_2073 HNE_2074   acpP2 FALSE 0.348 22.000 0.000 NA   NA
 2212334 2212335 HNE_2074 HNE_2075 acpP2   FALSE 0.186 48.000 0.000 1.000   NA
 2212335 2212336 HNE_2075 HNE_2076     TRUE 0.980 33.000 0.769 0.077 Y NA
 1465829 2212338 HNE_2078 HNE_2079     FALSE 0.075 100.000 0.000 NA   NA
 2212339 2212340 HNE_2080 HNE_2081     TRUE 0.951 8.000 0.008 NA Y NA
 2212340 2212341 HNE_2081 HNE_2082     TRUE 0.672 -3.000 0.000 NA N NA
 2212342 2212343 HNE_2083 HNE_2084 glnB glnA TRUE 0.745 80.000 0.145 1.000 Y NA
 2212343 2212344 HNE_2084 HNE_2085 glnA   FALSE 0.087 87.000 0.000 1.000   NA
 2212345 2212346 HNE_2086 HNE_2087 clpX clpP TRUE 0.795 127.000 0.352 1.000 Y NA
 2212346 2212347 HNE_2087 HNE_2088 clpP   FALSE 0.057 119.000 0.000 NA N NA
 2212347 2212348 HNE_2088 HNE_2089     TRUE 0.913 10.000 0.000 NA Y NA
 2212349 2212350 HNE_2090 HNE_2091     FALSE 0.151 51.000 0.000 NA   NA
 2212351 2212352 HNE_2092 HNE_2093     FALSE 0.023 198.000 0.000 NA N NA
 2212352 2212353 HNE_2093 HNE_2094     TRUE 0.971 30.000 0.323 0.010 Y NA
 2212353 2212354 HNE_2094 HNE_2095     FALSE 0.202 129.000 0.024 1.000 N NA
 2212355 2212356 HNE_2096 HNE_2097     TRUE 0.875 6.000 0.021 NA   NA
 2212359 2212360 HNE_2100 HNE_2101     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212360 2212361 HNE_2101 HNE_2102     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 2212361 2212362 HNE_2102 HNE_2103   metF TRUE 0.987 4.000 0.044 0.001 Y NA
 2212362 2212363 HNE_2103 HNE_2104 metF   TRUE 0.969 -3.000 0.160 1.000 N NA
 2212364 2212365 HNE_2105 HNE_2106     TRUE 0.558 32.000 0.021 NA N NA
 2212368 2212369 HNE_2109 HNE_2110     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 2212369 2212370 HNE_2110 HNE_2111     TRUE 0.962 -3.000 0.060 0.037 N NA
 2212370 2212371 HNE_2111 HNE_2112     TRUE 0.807 65.000 0.720 1.000 N NA
 2212372 2212373 HNE_2113 HNE_2114     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 2212375 2212376 HNE_2116 HNE_2117     TRUE 0.884 18.000 0.122 1.000   NA
 2212376 2212377 HNE_2117 HNE_2118     TRUE 0.975 -3.000 0.214 1.000   NA
 2212378 2212379 HNE_2119 HNE_2120     FALSE 0.082 113.000 0.000 1.000   NA
 2212379 2212380 HNE_2120 HNE_2121     FALSE 0.023 243.000 0.000 1.000   NA
 2212382 2212383 HNE_2123 HNE_2124     TRUE 0.986 5.000 0.050 0.001 Y NA
 2212383 2212384 HNE_2124 HNE_2125     TRUE 0.944 -3.000 0.064 1.000   NA
 2212384 2212385 HNE_2125 HNE_2126     TRUE 0.970 -3.000 0.165 1.000   NA
 2212385 2212386 HNE_2126 HNE_2127     TRUE 0.969 -3.000 0.161 NA   NA
 2212387 2212388 HNE_2128 HNE_2129     FALSE 0.518 11.000 0.000 NA N NA
 2212388 2212389 HNE_2129 HNE_2130     FALSE 0.088 64.000 0.000 NA N NA
 2212389 2212390 HNE_2130 HNE_2131     FALSE 0.469 122.000 0.000 0.045 Y NA
 2212392 2212393 HNE_2133 HNE_2134     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2212393 2212394 HNE_2134 HNE_2135     TRUE 0.746 3.000 0.000 1.000   NA
 2212394 2212395 HNE_2135 HNE_2136     TRUE 0.885 2.000 0.000 0.077   NA
 2212395 2212396 HNE_2136 HNE_2137     TRUE 0.932 12.000 0.000 0.077 Y NA
 2212396 2212397 HNE_2137 HNE_2138     FALSE 0.164 204.000 0.000 NA Y NA
 2212398 2212399 HNE_2139 HNE_2140     TRUE 0.675 5.000 0.000 NA   NA
 2212399 2212400 HNE_2140 HNE_2141     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212400 2212401 HNE_2141 HNE_2142     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2212406 2212407 HNE_2147 HNE_2148   dprA TRUE 0.947 -3.000 0.070 1.000   NA
 2212407 2212408 HNE_2148 HNE_2149 dprA   FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 2212408 2212409 HNE_2149 HNE_2150     FALSE 0.347 142.000 0.112 1.000 N NA
 2212409 2212410 HNE_2150 HNE_2151   pdxA TRUE 0.847 52.000 0.561 1.000 N NA
 2212410 2212411 HNE_2151 HNE_2152 pdxA ksgA TRUE 0.972 -3.000 0.197 1.000 N NA
 2212412 2212413 HNE_2153 HNE_2154     TRUE 0.964 -10.000 0.276 NA   NA
 2212413 2212414 HNE_2154 HNE_2155     TRUE 0.946 0.000 0.060 NA   NA
 2212414 2212415 HNE_2155 HNE_2156   fabF FALSE 0.203 226.000 0.134 NA   NA
 2212415 2212416 HNE_2156 HNE_2157 fabF acpP3 TRUE 0.959 15.000 0.106 1.000 Y NA
 2212416 2212417 HNE_2157 HNE_2158 acpP3 fabG TRUE 0.876 113.000 0.321 0.004 Y NA
 2212417 2212418 HNE_2158 HNE_2159 fabG   TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2212418 2212419 HNE_2159 HNE_2160   fabD TRUE 0.714 3.000 0.000 NA   NA
 2212420 2212421 HNE_2161 HNE_2162 rpsF rpsR TRUE 0.980 21.000 0.319 0.014 Y NA
 2212421 2212422 HNE_2162 HNE_2163 rpsR rplI TRUE 0.991 13.000 0.499 0.014 Y NA
 2212422 2212423 HNE_2163 HNE_2164 rplI dnaB FALSE 0.163 172.000 0.048 1.000 N NA
 2212424 2212425 HNE_2165 HNE_2166     FALSE 0.286 28.000 0.000 NA   NA
 2212426 2212427 HNE_2167 HNE_2168     FALSE 0.450 13.000 0.000 NA N NA
 2212428 2212429 HNE_2169 HNE_2170 cobQ   FALSE 0.073 98.000 0.000 NA   NA
 2212429 2212430 HNE_2170 HNE_2171     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 2212430 2212431 HNE_2171 HNE_2172     TRUE 0.538 -34.000 0.000 NA   NA
 2212431 2212432 HNE_2172 HNE_2173     TRUE 0.969 -3.000 0.167 NA   NA
 2212432 2212433 HNE_2173 HNE_2174     TRUE 0.913 12.000 0.100 NA   NA
 2212433 1465926 HNE_2174 HNE_2175     FALSE 0.010 554.000 0.000 NA   NA
 1465926 2212434 HNE_2175 HNE_2176   mmsA2 FALSE 0.037 161.000 0.000 NA   NA
 2212434 2212435 HNE_2176 HNE_2177 mmsA2   FALSE 0.153 55.000 0.000 1.000   NA
 2212437 2212438 HNE_2179 HNE_2180     FALSE 0.045 147.000 0.000 NA   NA
 2212439 2212440 HNE_2181 HNE_2182   iolC FALSE 0.183 143.000 0.029 1.000 N NA
 2212440 2212441 HNE_2182 HNE_2183 iolC iolD TRUE 0.710 19.000 0.021 1.000 N NA
 2212441 2212442 HNE_2183 HNE_2184 iolD iolE TRUE 0.970 13.000 0.600 1.000 N NA
 2212442 2212443 HNE_2184 HNE_2185 iolE iolB TRUE 0.958 -7.000 0.019 1.000 Y NA
 2212443 2212444 HNE_2185 HNE_2186 iolB   FALSE 0.100 68.000 0.000 1.000   NA
 2212444 2212445 HNE_2186 HNE_2187     FALSE 0.009 1397.000 0.000 1.000   NA
 2212445 2212446 HNE_2187 HNE_2188     FALSE 0.290 60.000 0.000 0.037 N NA
 2212446 2212447 HNE_2188 HNE_2189     TRUE 0.998 -3.000 0.793 0.001 Y NA
 2212448 2212449 HNE_2190 HNE_2191     TRUE 0.882 54.000 0.853 1.000 N NA
 2212449 2212450 HNE_2191 HNE_2192     FALSE 0.181 198.000 0.000 1.000 Y NA
 2212451 2212452 HNE_2193 HNE_2194     TRUE 0.977 -3.000 0.250 1.000 N NA
 2212453 2212454 HNE_2195 HNE_2196     FALSE 0.054 133.000 0.000 NA   NA
 2212454 2212455 HNE_2196 HNE_2197     FALSE 0.075 101.000 0.000 NA   NA
 2212455 2212456 HNE_2197 HNE_2198     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 2212456 2212457 HNE_2198 HNE_2199     FALSE 0.051 138.000 0.000 NA   NA
 2212458 2212459 HNE_2200 HNE_2201     TRUE 0.814 -22.000 0.000 0.012   NA
 2212459 2212460 HNE_2201 HNE_2202     FALSE 0.292 60.000 0.000 0.057   NA
 2212461 2212462 HNE_2203 HNE_2204     FALSE 0.081 114.000 0.000 1.000   NA
 2212462 2212463 HNE_2204 HNE_2205     FALSE 0.293 58.000 0.000 0.052 N NA
 2212465 2212466 HNE_2207 HNE_2208     TRUE 0.563 31.000 0.000 0.006 N NA
 2212466 2212467 HNE_2208 HNE_2209     FALSE 0.021 260.000 0.000 1.000   NA
 2212468 2212469 HNE_2210 HNE_2211     TRUE 0.699 36.000 0.000 1.000 Y NA
 2212469 2212470 HNE_2211 HNE_2212     FALSE 0.106 66.000 0.000 1.000   NA
 2212471 2212472 HNE_2213 HNE_2214     FALSE 0.075 87.000 0.000 NA   NA
 2212472 2212473 HNE_2214 HNE_2215     FALSE 0.321 25.000 0.000 NA   NA
 2212475 2212476 HNE_2217 HNE_2218     FALSE 0.095 65.000 0.000 NA   NA
 2212477 2212478 HNE_2219 HNE_2220     TRUE 0.554 142.000 0.400 1.000 N NA
 2212479 2212480 HNE_2221 HNE_2222     FALSE 0.024 218.000 0.000 1.000 N NA
 2212481 2212482 HNE_2223 HNE_2224     FALSE 0.020 212.000 0.000 NA N NA
 2212485 2212486 HNE_2227 HNE_2228     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 2212488 2212489 HNE_2230 HNE_2231 cobA   TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212489 2212490 HNE_2231 HNE_2232     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 2212490 2212491 HNE_2232 HNE_2233   nasT TRUE 0.984 -3.000 0.466 NA N NA
 2212492 2212493 HNE_2234 HNE_2235 nirB nirD TRUE 0.992 -3.000 0.539 0.001 N NA
 2212493 2212494 HNE_2235 HNE_2236 nirD fnt TRUE 0.929 15.000 0.030 1.000 Y NA
 2212494 2212495 HNE_2236 HNE_2237 fnt   TRUE 0.971 6.000 0.275 1.000 N NA
 1465989 2212496 HNE_2238 HNE_2239     FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2212496 2212497 HNE_2239 HNE_2240     TRUE 0.586 -10.000 0.000 NA   NA
 2212497 2212498 HNE_2240 HNE_2241     FALSE 0.406 81.000 0.091 NA N NA
 2212499 2212500 HNE_2242 HNE_2243     FALSE 0.086 90.000 0.000 1.000   NA
 2212501 2212502 HNE_2244 HNE_2245 pepA   FALSE 0.079 116.000 0.000 1.000   NA
 2212502 2212503 HNE_2245 HNE_2246   thiG TRUE 0.659 7.000 0.000 1.000   NA
 2212503 2212504 HNE_2246 HNE_2247 thiG thiS TRUE 0.689 125.000 0.130 1.000 Y NA
 2212505 2212506 HNE_2248 HNE_2249 aroQ accB TRUE 0.930 3.000 0.042 1.000 N NA
 2212506 2212507 HNE_2249 HNE_2250 accB accC TRUE 0.994 2.000 0.153 0.001 Y NA
 2212507 2212508 HNE_2250 HNE_2251 accC aat TRUE 0.596 58.000 0.114 1.000 N NA
 2212509 2212510 HNE_2252 HNE_2253     TRUE 0.960 -3.000 0.108 NA   NA
 2212510 2212511 HNE_2253 HNE_2254     TRUE 0.957 -7.000 0.199 NA   NA
 2212512 2212513 HNE_2255 HNE_2256     FALSE 0.037 163.000 0.000 NA   NA
 2212516 2212517 HNE_2259 HNE_2260   ppk TRUE 0.988 -3.000 0.149 NA Y NA
 2212517 2212518 HNE_2260 HNE_2261 ppk   TRUE 0.819 29.000 0.134 1.000 N NA
 2212518 2212519 HNE_2261 HNE_2262     TRUE 0.922 -3.000 0.038 NA   NA
 2212520 2212521 HNE_2263 HNE_2264 purM purN TRUE 0.995 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 2212521 2212522 HNE_2264 HNE_2265 purN   FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 2212522 2212523 HNE_2265 HNE_2266     TRUE 0.703 -3.000 0.000 NA   NA
 2212524 2212525 HNE_2267 HNE_2268     TRUE 0.734 0.000 0.000 NA   NA
 2212525 2212526 HNE_2268 HNE_2269   ndk FALSE 0.017 266.000 0.000 NA   NA
 2212527 2212528 HNE_2270 HNE_2271     FALSE 0.015 320.000 0.000 1.000 N NA
 2212529 2212530 HNE_2272 HNE_2273     TRUE 0.580 102.000 0.230 1.000 N NA
 2212531 2212532 HNE_2274 HNE_2275     TRUE 0.993 0.000 0.631 0.048   NA
 2212532 2212533 HNE_2275 HNE_2276   topA FALSE 0.092 71.000 0.000 1.000   NA
 2212533 2212534 HNE_2276 HNE_2277 topA   FALSE 0.091 66.000 0.000 NA   NA
 2212536 2212537 HNE_2279 HNE_2280   rnr FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2212537 2212538 HNE_2280 HNE_2281 rnr   FALSE 0.203 105.000 0.007 1.000   NA
 2212538 2212539 HNE_2281 HNE_2282   rpmG FALSE 0.116 157.000 0.008 1.000   NA
 2212540 2212541 HNE_2283 HNE_2284   pleD FALSE 0.272 62.000 0.000 0.036 N NA
 2212541 2212542 HNE_2284 HNE_2285 pleD   TRUE 0.996 -3.000 0.461 0.011 Y NA
 2212543 2212544 HNE_2286 HNE_2287     FALSE 0.113 56.000 0.000 NA N NA
 2212544 2212545 HNE_2287 HNE_2288     TRUE 0.982 9.000 0.696 NA N NA
 2212545 2212546 HNE_2288 HNE_2289     TRUE 0.954 12.000 0.280 NA   NA
 2212546 2212547 HNE_2289 HNE_2290     TRUE 0.944 9.000 0.131 NA   NA
 2212548 2212549 HNE_2291 HNE_2292 gatB   FALSE 0.072 93.000 0.000 NA   NA
 2212549 2212550 HNE_2292 HNE_2293   gatA FALSE 0.531 -40.000 0.000 NA   NA
 2212551 2212552 HNE_2294 HNE_2295     FALSE 0.133 55.000 0.000 NA   NA
 2212552 2212553 HNE_2295 HNE_2296     FALSE 0.179 49.000 0.000 1.000   NA
 2212553 2212554 HNE_2296 HNE_2298     FALSE 0.067 117.000 0.000 NA   NA
 2212555 2212556 HNE_2297 HNE_2299   gatC FALSE 0.067 117.000 0.000 NA   NA
 2212557 2212558 HNE_2300 HNE_2301     TRUE 0.901 -3.000 0.017 1.000   NA
 2212558 2212559 HNE_2301 HNE_2302   pyrB FALSE 0.269 56.000 0.002 1.000   NA
 2212559 2212560 HNE_2302 HNE_2303 pyrB   TRUE 0.994 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 2212560 2212561 HNE_2303 HNE_2304     TRUE 0.709 4.000 0.000 1.000 N NA
 2212561 2212562 HNE_2304 HNE_2305     FALSE 0.075 81.000 0.000 NA   NA
 2212562 2212563 HNE_2305 HNE_2306     TRUE 0.966 -21.000 0.364 NA   NA
 2212563 2212564 HNE_2306 HNE_2307     FALSE 0.135 60.000 0.000 1.000   NA
 2212564 2212565 HNE_2307 HNE_2308     FALSE 0.036 181.000 0.000 1.000   NA
 2212566 2212567 HNE_2309 HNE_2310 glpX hom TRUE 0.639 53.000 0.112 1.000 N NA
 2212567 2212568 HNE_2310 HNE_2311 hom   FALSE 0.312 515.000 0.202 1.000 Y NA
 2212568 2212569 HNE_2311 HNE_2312     TRUE 0.608 8.000 0.000 NA   NA
 2212571 2212572 HNE_2314 HNE_2315 argC rpsI FALSE 0.313 86.000 0.049 1.000 N NA
 2212572 2212573 HNE_2315 HNE_2316 rpsI rplM TRUE 0.991 8.000 0.231 0.014 Y NA
 2212579 2212580 HNE_2322 HNE_2323     FALSE 0.014 324.000 0.000 1.000 N NA
 2212580 2212581 HNE_2323 HNE_2324     FALSE 0.450 13.000 0.000 NA N NA
 2212583 2212584 HNE_2326 HNE_2327     FALSE 0.031 180.000 0.000 NA   NA
 2212584 2212585 HNE_2327 HNE_2328     FALSE 0.125 57.000 0.000 NA   NA
 2212585 2212586 HNE_2328 HNE_2329     FALSE 0.254 81.000 0.024 1.000 N NA
 2212587 2212588 HNE_2330 HNE_2331     FALSE 0.117 60.000 0.000 NA   NA
 2212588 2212589 HNE_2331 HNE_2332     TRUE 0.711 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2212589 2212590 HNE_2332 HNE_2333   pruA FALSE 0.357 22.000 0.000 1.000 N NA
 2212590 2212591 HNE_2333 HNE_2334 pruA   TRUE 0.742 0.000 0.000 1.000 N NA
 2212592 2212593 HNE_2335 HNE_2336     FALSE 0.012 531.000 0.000 1.000   NA
 2212593 2212594 HNE_2336 HNE_2337     TRUE 0.923 -3.000 0.033 1.000   NA
 2212594 2212595 HNE_2337 HNE_2338     TRUE 0.701 4.000 0.000 NA   NA
 2212595 2212596 HNE_2338 HNE_2339