MicrobesOnline Operon Predictions for Haemophilus somnus 2336

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6797235 6797236 HSM_0001 HSM_0002 dnaA   TRUE 0.994 12.000 0.328 1.000 Y NA
 6797236 6797237 HSM_0002 HSM_0003   recF TRUE 0.995 4.000 0.318 1.000 Y NA
 6797238 6797239 HSM_0004 HSM_0005     TRUE 0.959 13.000 0.087 NA   NA
 6797239 6797240 HSM_0005 HSM_0006   slmA TRUE 0.819 35.000 0.058 NA   NA
 6797240 6797241 HSM_0006 HSM_0007 slmA dut TRUE 0.943 0.000 0.060 1.000 N NA
 6797241 6797242 HSM_0007 HSM_0008 dut   TRUE 0.979 -3.000 0.201 1.000 N NA
 6797243 6797244 HSM_0009 HSM_0010 radC rpmB FALSE 0.011 221.000 0.002 1.000 N NA
 6797244 6797245 HSM_0010 HSM_0011 rpmB rpmG TRUE 0.996 12.000 0.332 0.028 Y NA
 6797245 6797246 HSM_0011 HSM_0012 rpmG   FALSE 0.231 106.000 0.034 1.000 N NA
 6797246 6797247 HSM_0012 HSM_0013     FALSE 0.098 92.000 0.000 1.000 N NA
 6797247 6797248 HSM_0013 HSM_0014   ilvM TRUE 0.999 4.000 0.943 0.001   NA
 6797248 6797249 HSM_0014 HSM_0015 ilvM   FALSE 0.369 66.000 0.000 1.000   NA
 6797249 6797250 HSM_0015 HSM_0016     FALSE 0.117 120.000 0.000 NA   NA
 6797250 6797251 HSM_0016 HSM_0017     TRUE 0.777 4.000 0.000 NA N NA
 6797251 6797252 HSM_0017 HSM_0018     TRUE 0.976 7.000 0.147 0.035 N NA
 6797253 6797254 HSM_0019 HSM_0020   cysE FALSE 0.462 44.000 0.000 1.000   NA
 6797254 6797255 HSM_0020 HSM_0021 cysE gpsA TRUE 0.992 2.000 0.429 1.000 N NA
 6797255 6797256 HSM_0021 HSM_0022 gpsA   TRUE 0.976 -85.000 0.206 1.000 N NA
 6797256 6797257 HSM_0022 HSM_0023     TRUE 0.968 11.000 0.158 NA N NA
 6797262 6797263 HSM_0028 HSM_0029     FALSE 0.022 217.000 0.000 NA   NA
 6797263 6797264 HSM_0029 HSM_0030   rpmF TRUE 0.994 18.000 0.599 NA   NA
 6797264 6797265 HSM_0030 HSM_0031 rpmF   FALSE 0.115 121.000 0.000 NA   NA
 6797265 6797266 HSM_0031 HSM_0032     TRUE 0.500 53.000 0.000 NA   NA
 6797266 6797267 HSM_0032 HSM_0033     TRUE 0.960 44.000 0.182 0.007 Y NA
 6797267 6797268 HSM_0033 HSM_0034   fabG TRUE 0.985 54.000 0.432 0.007 Y NA
 6797268 6797269 HSM_0034 HSM_0035 fabG acpP FALSE 0.459 255.000 0.321 0.007 Y NA
 6797269 6797270 HSM_0035 HSM_0036 acpP rplK FALSE 0.022 149.000 0.000 1.000 N NA
 6797270 6797271 HSM_0036 HSM_0037 rplK rplA TRUE 0.999 5.000 0.838 0.039 Y NA
 6797271 6797272 HSM_0037 HSM_0038 rplA rplJ FALSE 0.346 284.000 0.302 0.039 Y NA
 6797272 6797273 HSM_0038 HSM_0039 rplJ rplL TRUE 0.996 52.000 0.884 0.028 Y NA
 6797275 6797276 HSM_0041 HSM_0042     FALSE 0.047 114.000 0.000 1.000 N NA
 6797276 6797277 HSM_0042 HSM_0043     TRUE 0.973 -3.000 0.120 1.000   NA
 6797277 6797278 HSM_0043 HSM_0044     TRUE 0.964 10.000 0.118 1.000   NA
 6797281 6797282 HSM_0047 HSM_0048     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 6797284 6797285 HSM_0050 HSM_0051 ispH lspA TRUE 0.984 0.000 0.095 1.000 Y NA
 6797286 6797287 HSM_0052 HSM_0053     FALSE 0.043 170.000 0.000 NA   NA
 6797288 6797289 HSM_0054 HSM_0055 ileS   TRUE 0.767 19.000 0.000 NA   NA
 6797289 6797290 HSM_0055 HSM_0056     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6797290 6797291 HSM_0056 HSM_0057     TRUE 0.488 86.000 0.000 1.000 Y NA
 6797291 6797292 HSM_0057 HSM_0058     TRUE 0.821 53.000 0.104 NA   NA
 6797292 6797293 HSM_0058 HSM_0059     TRUE 0.998 3.000 0.704 NA   NA
 6797295 6797296 HSM_0061 HSM_0062 nusG secE TRUE 0.998 2.000 0.843 1.000 N NA
 6797296 6797297 HSM_0062 HSM_0063 secE   FALSE 0.028 176.000 0.009 1.000 N NA
 6797297 6797298 HSM_0063 HSM_R0001     FALSE 0.188 103.000 0.000 NA   NA
 6797298 6797299 HSM_R0001 HSM_R0002     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6797299 6797300 HSM_R0002 HSM_R0003     TRUE 0.527 43.000 0.000 NA   NA
 6797300 6797301 HSM_R0003 HSM_R0004     TRUE 0.592 32.000 0.000 NA   NA
 6797303 6797304 HSM_0065 HSM_0066   dnaE FALSE 0.012 182.000 0.000 1.000 N NA
 6797304 6797305 HSM_0066 HSM_0067 dnaE   FALSE 0.025 166.000 0.002 1.000 N NA
 6797305 6797306 HSM_0067 HSM_0068     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 6797307 6797308 HSM_0069 HSM_0070     TRUE 0.999 13.000 0.720 0.002 Y NA
 6797308 6797309 HSM_0070 HSM_0071     TRUE 0.999 13.000 0.886 0.002 Y NA
 6797312 6797313 HSM_0074 HSM_0075   pgk TRUE 0.776 92.000 0.056 0.010 Y NA
 6797315 6797316 HSM_0077 HSM_0078     FALSE 0.015 279.000 0.000 NA   NA
 6797316 6797317 HSM_0078 HSM_0079     TRUE 0.484 57.000 0.000 NA   NA
 6797317 6797318 HSM_0079 HSM_0080     TRUE 0.996 14.000 0.481 1.000 Y NA
 6797318 6797319 HSM_0080 HSM_0081     TRUE 0.999 -25.000 0.594 0.049 Y NA
 6797321 6797322 HSM_0083 HSM_0084     FALSE 0.017 184.000 0.000 NA N NA
 6797322 6797323 HSM_0084 HSM_0085     TRUE 0.930 47.000 0.158 NA Y NA
 6797324 6797325 HSM_0086 HSM_0087     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 6797325 6797326 HSM_0087 HSM_0088     TRUE 0.874 -31.000 0.000 NA   NA
 6797326 6797327 HSM_0088 HSM_0089     FALSE 0.051 160.000 0.000 NA   NA
 6797327 6797328 HSM_0089 HSM_0090     TRUE 0.988 21.000 0.337 1.000 Y NA
 6797328 6797329 HSM_0090 HSM_0091   rbsC TRUE 0.998 10.000 0.504 0.019 Y NA
 6797329 6797330 HSM_0091 HSM_0092 rbsC   TRUE 0.997 29.000 0.847 0.019 Y NA
 6797330 6797331 HSM_0092 HSM_0093     TRUE 0.933 84.000 0.347 1.000 Y NA
 6797331 6797332 HSM_0093 HSM_0094     TRUE 0.983 21.000 0.500 1.000 N NA
 6797333 6797334 HSM_0095 HSM_0096     TRUE 0.687 68.000 0.049 NA   NA
 6797335 6797336 HSM_0097 HSM_0098     TRUE 0.977 2.000 0.133 NA   NA
 6797338 6797339 HSM_0100 HSM_0101 pntA pntB TRUE 0.999 13.000 0.745 0.001 Y NA
 6797339 6797340 HSM_0101 HSM_0102 pntB   FALSE 0.137 81.000 0.000 1.000 N NA
 6797341 6797342 HSM_0103 HSM_0104 mglC   TRUE 0.999 17.000 0.905 0.019 Y NA
 6797342 6797343 HSM_0104 HSM_0105     TRUE 0.918 53.000 0.139 NA Y NA
 6797343 6797344 HSM_0105 HSM_0106     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 6797345 6797346 HSM_0108 HSM_0109     TRUE 0.988 19.000 0.370 0.003 N NA
 6797346 6797347 HSM_0109 HSM_0110   galM TRUE 0.990 -6.000 0.083 0.003 Y NA
 6797347 6797348 HSM_0110 HSM_0111 galM   FALSE 0.029 176.000 0.010 1.000 N NA
 6797348 6797349 HSM_0111 HSM_0112   lnt TRUE 0.995 -3.000 0.557 1.000 N NA
 6797350 6797351 HSM_0113 HSM_0114     FALSE 0.032 193.000 0.017 NA N NA
 6797353 6797354 HSM_0116 HSM_0117     FALSE 0.183 122.000 0.014 NA   NA
 6797355 6797356 HSM_0118 HSM_0119 rplU rpmA TRUE 0.997 21.000 0.667 0.027 Y NA
 6797356 6797357 HSM_0119 HSM_0120 rpmA   FALSE 0.089 136.000 0.004 1.000   NA
 6797357 6797358 HSM_0120 HSM_0121   obgE TRUE 0.874 10.000 0.006 1.000   NA
 6797360 6797361 HSM_0123 HSM_0124   artP FALSE 0.023 146.000 0.000 1.000 N NA
 6797361 6797362 HSM_0124 HSM_0125 artP   TRUE 0.945 18.000 0.032 1.000 Y NA
 6797362 6797363 HSM_0125 HSM_0126     TRUE 0.978 5.000 0.026 0.049 Y NA
 6797363 6797364 HSM_0126 HSM_0127   artM TRUE 0.999 11.000 0.714 0.049 Y NA
 6797366 6797367 HSM_0129 HSM_0130     TRUE 0.999 15.000 0.714 0.039 Y NA
 6797367 6797368 HSM_0130 HSM_0131     FALSE 0.008 375.000 0.000 1.000   NA
 6797368 6797369 HSM_0131 HSM_0132     TRUE 0.997 -3.000 0.593 1.000   NA
 6797369 6797370 HSM_0132 HSM_0133     TRUE 0.984 68.000 0.556 0.066 Y NA
 6797370 6797371 HSM_0133 HSM_0134   tolA TRUE 0.985 19.000 0.460 NA N NA
 6797371 6797372 HSM_0134 HSM_0135 tolA tolB TRUE 0.924 28.000 0.215 NA N NA
 6797372 6797373 HSM_0135 HSM_0136 tolB   TRUE 0.996 10.000 0.592 1.000   NA
 6797373 6797374 HSM_0136 HSM_R0005     FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 6797374 6797375 HSM_R0005 HSM_R0006     TRUE 0.655 26.000 0.000 NA   NA
 6797375 6797376 HSM_R0006 HSM_R0007     TRUE 0.655 26.000 0.000 NA   NA
 6797376 6797377 HSM_R0007 HSM_0137     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 6797377 6797378 HSM_0137 HSM_0138     TRUE 0.997 13.000 0.500 NA Y NA
 6797378 6797379 HSM_0138 HSM_0139     TRUE 0.996 3.000 0.545 NA   NA
 6797379 6797380 HSM_0139 HSM_0140     TRUE 0.999 -19.000 1.000 NA   NA
 6797380 6797381 HSM_0140 HSM_0141     TRUE 0.733 53.000 0.038 NA   NA
 6797381 6797382 HSM_0141 HSM_0142   ruvA TRUE 0.556 79.000 0.000 1.000 Y NA
 6797382 6797383 HSM_0142 HSM_0143 ruvA ruvB TRUE 0.999 11.000 0.549 0.003 Y NA
 6797384 6797385 HSM_0144 HSM_0145     TRUE 0.887 0.000 0.000 NA   NA
 6797385 6797386 HSM_0145 HSM_0146     TRUE 0.937 3.000 0.021 NA   NA
 6797387 6797388 HSM_0147 HSM_0148     FALSE 0.431 55.000 0.000 1.000   NA
 6797388 6797389 HSM_0148 HSM_0149     FALSE 0.076 138.000 0.000 NA   NA
 6797389 6797390 HSM_0149 HSM_0150     FALSE 0.023 214.000 0.000 NA   NA
 6797392 6797393 HSM_0152 HSM_0153     TRUE 0.773 54.000 0.126 1.000 N NA
 6797393 6797394 HSM_0153 HSM_0154     TRUE 0.897 79.000 0.424 1.000 N NA
 6797394 6797395 HSM_0154 HSM_0155     TRUE 0.908 77.000 0.448 1.000 N NA
 6797395 6797396 HSM_0155 HSM_0156     TRUE 0.613 166.000 0.359 0.003   NA
 6797396 6797397 HSM_0156 HSM_0157   hscB TRUE 0.994 13.000 0.500 1.000   NA
 6797397 6797398 HSM_0157 HSM_0158 hscB hscA TRUE 0.989 42.000 0.634 1.000 Y NA
 6797398 6797399 HSM_0158 HSM_0159 hscA   TRUE 0.997 12.000 0.794 1.000 N NA
 6797399 6797400 HSM_0159 HSM_0160     FALSE 0.029 135.000 0.000 1.000 N NA
 6797401 6797402 HSM_0161 HSM_0162 deoD   FALSE 0.181 133.000 0.000 1.000 Y NA
 6797403 6797404 HSM_0163 HSM_0164     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6797404 6797405 HSM_0164 HSM_0165   rpsP FALSE 0.018 181.000 0.002 1.000 N NA
 6797405 6797406 HSM_0165 HSM_0166 rpsP rimM TRUE 0.988 27.000 0.342 0.027 Y NA
 6797406 6797407 HSM_0166 HSM_0167 rimM trmD TRUE 0.990 54.000 0.672 1.000 Y NA
 6797407 6797408 HSM_0167 HSM_0168 trmD rplS TRUE 0.988 36.000 0.567 1.000 Y NA
 6797409 6797410 HSM_0169 HSM_0170     TRUE 0.556 37.000 0.000 NA   NA
 6797410 6797411 HSM_0170 HSM_0171     TRUE 0.668 9.000 0.000 1.000 N NA
 6797413 6797414 HSM_0173 HSM_0174     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 N NA
 6797414 6797415 HSM_0174 HSM_0175     FALSE 0.201 102.000 0.000 0.042 N NA
 6797417 6797418 HSM_0177 HSM_0178     TRUE 0.944 -24.000 0.030 NA   NA
 6797418 6797419 HSM_0178 HSM_0179     TRUE 0.701 66.000 0.049 NA   NA
 6797419 6797420 HSM_0179 HSM_0180     TRUE 0.834 54.000 0.119 NA   NA
 6797420 6797421 HSM_0180 HSM_0181     TRUE 0.981 10.000 0.196 NA   NA
 6797422 6797423 HSM_0182 HSM_0183 mobA   FALSE 0.119 119.000 0.000 NA   NA
 6797424 6797425 HSM_0184 HSM_0185     TRUE 0.706 22.000 0.000 NA   NA
 6797425 6797426 HSM_0185 HSM_0186     FALSE 0.008 484.000 0.000 NA   NA
 6797426 6797427 HSM_0186 HSM_0187   lipB TRUE 0.995 18.000 0.319 0.001 Y NA
 6797427 6797428 HSM_0187 HSM_0188 lipB   TRUE 0.984 9.000 0.219 NA   NA
 6797428 6797429 HSM_0188 HSM_0189     TRUE 0.491 55.000 0.000 NA   NA
 6797429 6797430 HSM_0189 HSM_0191     FALSE 0.229 95.000 0.000 NA   NA
 6797430 6797431 HSM_0191 HSM_0192     TRUE 0.551 43.000 0.014 NA N NA
 6797431 6797432 HSM_0192 HSM_0193     TRUE 0.668 23.000 0.016 1.000 N NA
 6797432 6797433 HSM_0193 HSM_0194     TRUE 0.878 17.000 0.013 NA   NA
 6797433 6797434 HSM_0194 HSM_0195     TRUE 0.979 20.000 0.307 NA   NA
 6797434 6797435 HSM_0195 HSM_0196     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 6797435 6797436 HSM_0196 HSM_0197     TRUE 0.999 -7.000 0.525 0.008 Y NA
 6797436 6797437 HSM_0197 HSM_0198     TRUE 0.999 5.000 0.857 1.000 Y NA
 6797437 6797438 HSM_0198 HSM_0199     TRUE 0.999 10.000 0.894 1.000 Y NA
 6797438 6797439 HSM_0199 HSM_0200     TRUE 0.565 106.000 0.045 NA Y NA
 6797439 6797440 HSM_0200 HSM_0201     TRUE 0.763 78.000 0.140 NA   NA
 6797442 6797443 HSM_0202 HSM_0203   engB FALSE 0.236 102.000 0.008 1.000   NA
 6797443 6797444 HSM_0203 HSM_0204 engB glmU TRUE 0.843 -79.000 0.000 1.000   NA
 6797445 6797446 HSM_0205 HSM_0206 anmK murQ TRUE 0.955 3.000 0.041 NA   NA
 6797446 6797447 HSM_0206 HSM_0207 murQ   FALSE 0.010 288.000 0.000 1.000   NA
 6797447 6797448 HSM_0207 HSM_0208     FALSE 0.012 267.000 0.000 1.000   NA
 6797450 6797451 HSM_0210 HSM_0211     TRUE 0.996 11.000 0.575 NA   NA
 6797451 6797452 HSM_0211 HSM_0212     TRUE 0.948 3.000 0.032 NA   NA
 6797452 6797453 HSM_0212 HSM_0213     FALSE 0.014 173.000 0.000 1.000 N NA
 6797454 6797455 HSM_0214 HSM_0215 clpX clpP TRUE 0.994 16.000 0.352 1.000 Y NA
 6797455 6797456 HSM_0215 HSM_0216 clpP tig TRUE 0.929 86.000 0.351 1.000 Y NA
 6797458 6797459 HSM_0218 HSM_0219     TRUE 0.922 70.000 0.349 1.000   NA
 6797462 6797463 HSM_R0009 HSM_0222     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 6797466 6797467 HSM_0225 HSM_0226     TRUE 0.998 -3.000 0.659 NA   NA
 6797467 6797468 HSM_0226 HSM_0227     TRUE 0.998 -7.000 0.568 0.006   NA
 6797468 6797469 HSM_0227 HSM_0228     TRUE 0.836 29.000 0.069 1.000   NA
 6797469 6797470 HSM_0228 HSM_0229     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 6797470 6797471 HSM_0229 HSM_0230     TRUE 0.873 -49.000 0.000 NA   NA
 6797472 6797473 HSM_0231 HSM_0232     TRUE 0.997 11.000 0.636 NA   NA
 6797473 6797474 HSM_0232 HSM_0233     TRUE 0.487 56.000 0.000 NA   NA
 6797475 6797476 HSM_0234 HSM_0235     TRUE 0.925 -3.000 0.000 0.071   NA
 6797476 6797477 HSM_0235 HSM_0236     TRUE 0.806 17.000 0.000 NA   NA
 6797477 6797478 HSM_0236 HSM_0237     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 6797478 6797479 HSM_0237 HSM_0238     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6797479 6797480 HSM_0238 HSM_0239     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6797480 6797481 HSM_0239 HSM_0240     FALSE 0.060 152.000 0.000 NA   NA
 6797481 6797482 HSM_0240 HSM_0241     FALSE 0.405 69.000 0.000 NA   NA
 6797482 6797483 HSM_0241 HSM_0242     TRUE 0.861 11.000 0.000 NA   NA
 6797483 6797484 HSM_0242 HSM_0243     FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 6797484 6797485 HSM_0243 HSM_0244     TRUE 0.874 -31.000 0.000 NA   NA
 6797487 6797488 HSM_0246 HSM_0247     FALSE 0.007 844.000 0.000 NA   NA
 6797488 6797489 HSM_0247 HSM_0248     TRUE 0.849 36.000 0.094 NA   NA
 6797490 6797491 HSM_0249 HSM_0250     TRUE 0.982 -7.000 0.172 NA   NA
 6797491 6797492 HSM_0250 HSM_0251     FALSE 0.002 640.000 0.000 1.000 N NA
 6797492 6797493 HSM_0251 HSM_0252     FALSE 0.349 67.000 0.010 1.000 N NA
 6797493 6797494 HSM_0252 HSM_0253     FALSE 0.161 94.000 0.006 1.000 N NA
 6797494 6797495 HSM_0253 HSM_0254     FALSE 0.183 110.000 0.002 NA   NA
 6797495 6797496 HSM_0254 HSM_0255   fabZ FALSE 0.310 83.000 0.000 NA   NA
 6797496 6797497 HSM_0255 HSM_0256 fabZ   TRUE 0.997 14.000 0.850 1.000 N NA
 6797497 6797498 HSM_0256 HSM_0257   lpxB TRUE 0.916 82.000 0.289 1.000 Y NA
 6797498 6797499 HSM_0257 HSM_0258 lpxB rnhB TRUE 0.976 1.000 0.186 1.000 N NA
 6797499 6797500 HSM_0258 HSM_0259 rnhB mogA FALSE 0.307 61.000 0.002 1.000 N NA
 6797500 6797501 HSM_0259 HSM_0260 mogA   TRUE 0.552 43.000 0.022 1.000 N NA
 6797501 6797502 HSM_0260 HSM_0261     TRUE 0.959 0.000 0.045 NA   NA
 6797505 6797506 HSM_0264 HSM_0265   mgsA TRUE 0.738 25.000 0.006 NA   NA
 6797506 6797507 HSM_0265 HSM_0266 mgsA   TRUE 0.714 65.000 0.055 NA   NA
 6797508 6797509 HSM_0267 HSM_0268     TRUE 0.787 34.000 0.000 NA Y NA
 6797509 6797510 HSM_0268 HSM_0269     TRUE 0.874 -31.000 0.000 NA   NA
 6797510 6797511 HSM_0269 HSM_0270     FALSE 0.165 107.000 0.000 NA   NA
 6797511 6797512 HSM_0270 HSM_0271     TRUE 0.749 20.000 0.000 NA   NA
 6797512 6797513 HSM_0271 HSM_0272     FALSE 0.064 149.000 0.000 NA   NA
 6797513 6797514 HSM_0272 HSM_0273     TRUE 0.876 -22.000 0.000 NA   NA
 6797514 6797515 HSM_0273 HSM_0274     FALSE 0.438 64.000 0.000 NA   NA
 6797515 6797516 HSM_0274 HSM_0275     TRUE 0.884 2.000 0.000 NA   NA
 6797516 6797517 HSM_0275 HSM_0276     FALSE 0.124 117.000 0.000 NA   NA
 6797518 6797519 HSM_R0010 HSM_R0011     TRUE 0.668 25.000 0.000 NA   NA
 6797519 6797520 HSM_R0011 HSM_R0012     TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 6797521 6797522 HSM_0277 HSM_0278     FALSE 0.058 165.000 0.008 1.000   NA
 6797523 6797524 HSM_0279 HSM_0280     TRUE 0.508 87.000 0.048 1.000   NA
 6797524 6797525 HSM_0280 HSM_0281   upp TRUE 0.661 102.000 0.101 1.000 Y NA
 6797525 6797526 HSM_0281 HSM_0282 upp   FALSE 0.059 140.000 0.000 1.000   NA
 6797526 6797527 HSM_0282 HSM_0283     FALSE 0.021 194.000 0.000 1.000   NA
 6797529 6797530 HSM_0285 HSM_0286     TRUE 0.978 22.000 0.238 1.000 Y NA
 6797533 6797534 HSM_0289 HSM_0290   engA FALSE 0.089 131.000 0.000 NA   NA
 6797534 6797535 HSM_0290 HSM_0291 engA   FALSE 0.035 168.000 0.000 1.000   NA
 6797535 6797536 HSM_0291 HSM_0292     FALSE 0.025 142.000 0.000 1.000 N NA
 6797537 6797538 HSM_0293 HSM_0294     TRUE 0.859 9.000 0.000 NA   NA
 6797539 6797540 HSM_0295 HSM_0296     FALSE 0.010 343.000 0.000 NA   NA
 6797540 6797541 HSM_0296 HSM_0297     FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 6797541 6797542 HSM_0297 HSM_0298     FALSE 0.443 63.000 0.000 NA   NA
 6797542 6797543 HSM_0298 HSM_0299     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA Y NA
 6797543 6797544 HSM_0299 HSM_0300     TRUE 0.909 18.000 0.000 NA Y NA
 6797544 6797545 HSM_0300 HSM_0301   queA FALSE 0.030 132.000 0.000 1.000 N NA
 6797545 6797546 HSM_0301 HSM_0302 queA tgt TRUE 0.985 45.000 0.360 0.001 Y NA
 6797546 6797547 HSM_0302 HSM_0303 tgt yajC FALSE 0.447 156.000 0.325 NA N NA
 6797547 6797548 HSM_0303 HSM_0304 yajC secD TRUE 0.901 32.000 0.045 NA Y NA
 6797548 6797549 HSM_0304 HSM_0305 secD secF TRUE 0.994 13.000 0.206 0.001 Y NA
 6797550 6797551 HSM_R0013 HSM_0306   secG TRUE 0.749 20.000 0.000 NA   NA
 6797551 6797552 HSM_0306 HSM_0307 secG   FALSE 0.056 138.000 0.008 1.000 N NA
 6797553 6797554 HSM_0308 HSM_0309   recR TRUE 0.974 63.000 0.604 NA   NA
 6797555 10692422 HSM_0310 HSM_0311     FALSE 0.028 192.000 0.000 NA   NA
 10692422 6797556 HSM_0311 HSM_0313     FALSE 0.076 138.000 0.000 NA   NA
 6797556 6797557 HSM_0313 HSM_0314   recX FALSE 0.161 102.000 0.000 1.000   NA
 6797557 6797558 HSM_0314 HSM_0315 recX recA TRUE 0.717 109.000 0.296 1.000   NA
 6797558 6797559 HSM_0315 HSM_0316 recA   FALSE 0.113 124.000 0.003 1.000   NA
 6797559 6797560 HSM_0316 HSM_0317     FALSE 0.015 243.000 0.000 1.000   NA
 6797560 6797561 HSM_0317 HSM_0318   psd TRUE 0.719 27.000 0.034 1.000 N NA
 6797567 6797568 HSM_0324 HSM_0325     TRUE 0.917 9.000 0.016 NA   NA
 6797569 6797570 HSM_0326 HSM_0327 rph djlA FALSE 0.095 93.000 0.000 1.000 N NA
 6797570 6797571 HSM_0327 HSM_0328 djlA   TRUE 0.888 5.000 0.025 1.000 N NA
 6797573 6797574 HSM_0330 HSM_0331     FALSE 0.358 94.000 0.037 NA N NA
 6797576 6797577 HSM_0333 HSM_0334     TRUE 0.948 1.000 0.037 1.000   NA
 6797577 6797578 HSM_0334 HSM_0335   xerD TRUE 0.905 -3.000 0.007 1.000   NA
 6797578 6797579 HSM_0335 HSM_0336 xerD   FALSE 0.153 110.000 0.000 NA   NA
 6797579 6797580 HSM_0336 HSM_0337     FALSE 0.056 156.000 0.000 NA   NA
 6797581 6797582 HSM_0338 HSM_0339     FALSE 0.008 516.000 0.000 NA   NA
 6797585 6797586 HSM_0342 HSM_0343   modB TRUE 0.999 6.000 0.627 0.001 Y NA
 6797586 6797587 HSM_0343 HSM_0344 modB   FALSE 0.077 101.000 0.000 1.000 N NA
 6797587 6797588 HSM_0344 HSM_0345     FALSE 0.127 115.000 0.000 NA   NA
 6797592 6797593 HSM_0349 HSM_0350 thrA   TRUE 0.982 13.000 0.133 1.000 Y NA
 6797593 6797594 HSM_0350 HSM_0351     TRUE 0.990 13.000 0.233 1.000 Y NA
 6797595 6797596 HSM_0352 HSM_0353     TRUE 0.946 17.000 0.156 1.000 N NA
 6797596 6797597 HSM_0353 HSM_0354     FALSE 0.009 422.000 0.000 NA   NA
 6797598 6797599 HSM_0355 HSM_0356     TRUE 0.906 3.000 0.029 1.000 N NA
 6797599 6797600 HSM_0356 HSM_0357     TRUE 0.896 3.000 0.024 1.000 N NA
 6797600 6797601 HSM_0357 HSM_0358     TRUE 0.750 16.000 0.007 1.000 N NA
 6797601 6797602 HSM_0358 HSM_0359   mepA TRUE 0.623 33.000 0.025 1.000 N NA
 6797602 6797603 HSM_0359 HSM_0360 mepA   TRUE 0.973 11.000 0.160 1.000   NA
 6797603 6797604 HSM_0360 HSM_0361     TRUE 0.899 24.000 0.049 0.077   NA
 6797604 6797605 HSM_0361 HSM_0362     FALSE 0.291 71.000 0.006 1.000 N NA
 6797605 6797606 HSM_0362 HSM_0363     TRUE 0.795 31.000 0.088 1.000 N NA
 6797606 6797607 HSM_0363 HSM_0364     FALSE 0.014 253.000 0.000 1.000   NA
 6797607 6797608 HSM_0364 HSM_0365     TRUE 0.826 31.000 0.067 1.000   NA
 6797609 6797610 HSM_0366 HSM_0367     FALSE 0.005 284.000 0.000 1.000 N NA
 6797610 6797611 HSM_0367 HSM_0368   dnaK TRUE 0.898 98.000 0.236 0.005 Y NA
 6797611 6797612 HSM_0368 HSM_0369 dnaK   FALSE 0.013 179.000 0.000 1.000 N NA
 6797612 6797613 HSM_0369 HSM_0370     TRUE 0.957 5.000 0.106 NA N NA
 6797613 6797614 HSM_0370 HSM_0371     TRUE 0.645 105.000 0.233 NA N NA
 6797614 6797615 HSM_0371 HSM_0372     TRUE 0.997 27.000 0.937 NA Y NA
 6797616 6797617 HSM_0373 HSM_0374     TRUE 0.882 10.000 0.008 1.000   NA
 6797617 6797618 HSM_0374 HSM_0375     FALSE 0.118 102.000 0.003 1.000 N NA
 6797618 6797619 HSM_0375 HSM_0376     TRUE 0.990 2.000 0.345 1.000 N NA
 6797620 6797621 HSM_0377 HSM_0378     FALSE 0.006 529.000 0.000 1.000   NA
 6797621 6797622 HSM_0378 HSM_0379     TRUE 0.658 57.000 0.022 NA   NA
 6797622 6797623 HSM_0379 HSM_0380     TRUE 0.806 17.000 0.000 NA   NA
 6797623 6797624 HSM_0380 HSM_0381     FALSE 0.014 172.000 0.000 1.000 N NA
 6797624 6797625 HSM_0381 HSM_0382   glyA FALSE 0.012 180.000 0.000 1.000 N NA
 6797625 6797626 HSM_0382 HSM_0383 glyA   FALSE 0.038 143.000 0.003 1.000 N NA
 6797626 6797627 HSM_0383 HSM_0384     TRUE 0.887 -3.000 0.002 1.000   NA
 6797627 6797628 HSM_0384 HSM_0385   purH TRUE 0.828 16.000 0.002 1.000   NA
 6797628 6797629 HSM_0385 HSM_0386 purH   FALSE 0.083 135.000 0.000 NA   NA
 6797629 6797630 HSM_0386 HSM_0387     TRUE 0.569 78.000 0.030 NA   NA
 6797631 6797632 HSM_0388 HSM_0389     TRUE 0.920 11.000 0.024 1.000   NA
 6797632 6797633 HSM_0389 HSM_0390     TRUE 0.934 10.000 0.038 1.000   NA
 6797633 6797634 HSM_0390 HSM_0391   thyA TRUE 0.966 7.000 0.164 1.000 N NA
 6797634 6797635 HSM_0391 HSM_0392 thyA   TRUE 0.882 22.000 0.007 1.000 Y NA
 6797637 6797638 HSM_0394 HSM_0395     FALSE 0.009 322.000 0.000 1.000   NA
 6797638 6797639 HSM_0395 HSM_0396     FALSE 0.371 76.000 0.000 NA   NA
 6797639 6797640 HSM_0396 HSM_0397   rfaD FALSE 0.470 60.000 0.000 NA   NA
 6797640 6797641 HSM_0397 HSM_0398 rfaD   TRUE 0.485 136.000 0.146 1.000 Y NA
 6797641 6797642 HSM_0398 HSM_0399     TRUE 0.995 2.000 0.205 0.003 Y NA
 6797645 6797646 HSM_0402 HSM_0403     TRUE 0.878 14.000 0.022 NA N NA
 6797646 6797647 HSM_0403 HSM_0404   rseB TRUE 0.998 8.000 0.609 NA Y NA
 6797647 6797648 HSM_0404 HSM_0405 rseB   TRUE 0.993 64.000 0.856 NA Y NA
 6797648 6797649 HSM_0405 HSM_0406     TRUE 0.986 33.000 0.705 NA N NA
 6797649 6797650 HSM_0406 HSM_0407     FALSE 0.286 106.000 0.019 NA   NA
 6797650 6797651 HSM_0407 HSM_0408     FALSE 0.040 174.000 0.000 NA   NA
 6797651 6797652 HSM_0408 HSM_0409     TRUE 0.901 48.000 0.118 1.000 Y NA
 6797652 6797653 HSM_0409 HSM_0410     TRUE 0.982 10.000 0.118 1.000 Y NA
 6797653 6797654 HSM_0410 HSM_0411     TRUE 0.994 26.000 0.667 1.000 Y NA
 6797654 6797655 HSM_0411 HSM_0412     TRUE 0.657 42.000 0.012 NA   NA
 6797655 6797656 HSM_0412 HSM_0413     TRUE 0.940 10.000 0.035 NA   NA
 6797657 6797658 HSM_0414 HSM_0415     TRUE 0.911 19.000 0.116 1.000 N NA
 6797660 6797661 HSM_0417 HSM_0418     TRUE 0.902 24.000 0.093 NA   NA
 6797663 6797664 HSM_0420 HSM_0421 tpiA   FALSE 0.143 98.000 0.005 1.000 N NA
 6797664 6797665 HSM_0421 HSM_0422   coaD TRUE 0.891 0.000 0.020 1.000 N NA
 6797665 6797666 HSM_0422 HSM_0423 coaD   FALSE 0.170 74.000 0.000 1.000 N NA
 6797668 6797669 HSM_0425 HSM_0426     TRUE 0.861 11.000 0.000 NA   NA
 6797669 6797670 HSM_0426 HSM_0427     FALSE 0.039 161.000 0.000 1.000   NA
 6797670 6797671 HSM_0427 HSM_0428     TRUE 0.521 84.000 0.043 1.000   NA
 6797671 6797672 HSM_0428 HSM_0429     FALSE 0.010 295.000 0.000 1.000   NA
 6797672 6797673 HSM_0429 HSM_0430     TRUE 0.631 87.000 0.000 0.018 Y NA
 6797673 6797674 HSM_0430 HSM_0431     TRUE 0.681 81.000 0.000 0.018 Y NA
 6797674 6797675 HSM_0431 HSM_0432     TRUE 0.929 38.000 0.061 0.018 Y NA
 6797675 6797676 HSM_0432 HSM_0433     FALSE 0.011 187.000 0.000 1.000 N NA
 6797676 6797677 HSM_0433 HSM_0434     TRUE 0.599 74.000 0.081 1.000 N NA
 6797677 6797678 HSM_0434 HSM_0435     TRUE 0.968 2.000 0.104 1.000   NA
 6797679 6797680 HSM_0436 HSM_0437   potE FALSE 0.121 118.000 0.000 NA   NA
 6797680 6797681 HSM_0437 HSM_0438 potE   TRUE 0.899 58.000 0.130 1.000 Y NA
 6797681 6797682 HSM_0438 HSM_0439     FALSE 0.015 281.000 0.000 NA   NA
 6797682 6797683 HSM_0439 HSM_0440     FALSE 0.045 167.000 0.000 NA   NA
 6797684 6797685 HSM_0441 HSM_0442     TRUE 0.979 12.000 0.202 1.000   NA
 6797685 6797686 HSM_0442 HSM_0443   hemG TRUE 0.993 0.000 0.455 1.000 N NA
 6797686 6797687 HSM_0443 HSM_R0014 hemG   FALSE 0.010 365.000 0.000 NA   NA
 6797687 6797688 HSM_R0014 HSM_R0015     FALSE 0.460 61.000 0.000 NA   NA
 6797688 6797689 HSM_R0015 HSM_R0016     FALSE 0.229 95.000 0.000 NA   NA
 6797689 6797690 HSM_R0016 HSM_R0017     FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 6797690 6797691 HSM_R0017 HSM_R0018     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6797691 6797692 HSM_R0018 HSM_0445     FALSE 0.009 421.000 0.000 NA   NA
 6797692 6797693 HSM_0445 HSM_0446     FALSE 0.039 175.000 0.000 NA   NA
 6797693 6797694 HSM_0446 HSM_0447     TRUE 0.885 -6.000 0.000 NA   NA
 6797694 6797695 HSM_0447 HSM_0448     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 6797698 6797699 HSM_0452 HSM_0453     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 6797699 6797700 HSM_0453 HSM_0454     TRUE 0.666 10.000 0.000 1.000 N NA
 6797700 6797701 HSM_0454 HSM_0455     TRUE 0.967 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 6797701 6797702 HSM_0455 HSM_0456     TRUE 0.937 1.000 0.053 1.000 N NA
 6797703 6797704 HSM_0457 HSM_0458     FALSE 0.013 175.000 0.000 1.000 N NA
 6797704 6797705 HSM_0458 HSM_0459     TRUE 0.987 2.000 0.294 1.000 N NA
 6797706 6797707 HSM_0460 HSM_0461     FALSE 0.449 59.000 0.015 1.000 N NA
 6797708 6797709 HSM_0462 HSM_0463     FALSE 0.018 160.000 0.000 1.000 N NA
 6797709 6797710 HSM_0463 HSM_0464     FALSE 0.444 62.000 0.018 1.000 N NA
 6797710 6797711 HSM_0464 HSM_0465   ksgA FALSE 0.426 76.000 0.028 1.000 N NA
 6797711 6797712 HSM_0465 HSM_0466 ksgA apaH TRUE 0.548 51.000 0.025 1.000 N NA
 6797712 6797713 HSM_0466 HSM_0467 apaH leuS FALSE 0.004 287.000 0.000 1.000 N NA
 6797713 6797714 HSM_0467 HSM_0468 leuS   TRUE 0.855 49.000 0.182 NA N NA
 6797714 6797715 HSM_0468 HSM_0469   holA TRUE 0.980 0.000 0.199 NA N NA
 6797715 6797716 HSM_0469 HSM_0470 holA   FALSE 0.035 127.000 0.000 1.000 N NA
 6797716 6797717 HSM_0470 HSM_0471   ftsX TRUE 0.982 10.000 0.121 1.000 Y NA
 6797717 6797718 HSM_0471 HSM_0472 ftsX   FALSE 0.076 127.000 0.010 1.000 N NA
 6797719 6797720 HSM_0473 HSM_0474     FALSE 0.010 189.000 0.000 1.000 N NA
 6797720 6797721 HSM_0474 HSM_0475     TRUE 0.976 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 6797721 6797722 HSM_0475 HSM_0476     TRUE 0.500 52.000 0.019 1.000 N NA
 6797722 6797723 HSM_0476 HSM_0477     TRUE 0.882 -10.000 0.000 NA   NA
 6797724 6797725 HSM_0478 HSM_0479     FALSE 0.059 153.000 0.000 NA   NA
 6797726 6797727 HSM_0480 HSM_0481     FALSE 0.169 123.000 0.011 NA   NA
 6797727 6797728 HSM_0481 HSM_0482   murB TRUE 0.902 16.000 0.019 NA   NA
 6797728 6797729 HSM_0482 HSM_0483 murB   TRUE 0.826 10.000 0.011 1.000 N NA
 6797730 6797731 HSM_0484 HSM_0485     TRUE 0.728 21.000 0.000 NA   NA
 6797731 6797732 HSM_0485 HSM_0486     TRUE 0.862 8.000 0.000 NA   NA
 6797732 6797733 HSM_0486 HSM_0487     TRUE 0.885 -6.000 0.000 NA   NA
 6797733 6797734 HSM_0487 HSM_0488     TRUE 0.521 44.000 0.000 NA   NA
 6797734 6797735 HSM_0488 HSM_0489     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 6797735 6797736 HSM_0489 HSM_0490     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6797736 6797737 HSM_0490 HSM_0492     FALSE 0.012 306.000 0.000 NA   NA
 6797737 6797738 HSM_0492 HSM_0493     TRUE 0.993 27.000 0.875 NA N NA
 6797738 6797739 HSM_0493 HSM_0494   napG TRUE 0.941 51.000 0.243 0.036   NA
 6797739 6797740 HSM_0494 HSM_0495 napG napH TRUE 0.999 0.000 0.795 0.036   NA
 6797740 6797741 HSM_0495 HSM_0496 napH   TRUE 0.996 -3.000 0.316 NA Y NA
 6797741 6797742 HSM_0496 HSM_0497     TRUE 0.996 15.000 0.490 NA Y NA
 6797743 6797744 HSM_0498 HSM_0499     FALSE 0.012 181.000 0.000 1.000 N NA
 6797744 6797745 HSM_0499 HSM_0500     TRUE 0.538 41.000 0.000 NA   NA
 6797745 6797746 HSM_0500 HSM_0501   surE TRUE 0.811 30.000 0.038 NA   NA
 6797746 6797747 HSM_0501 HSM_0502 surE truD TRUE 0.955 24.000 0.235 1.000   NA
 6797747 6797748 HSM_0502 HSM_0503 truD ispF TRUE 0.981 0.000 0.173 1.000   NA
 6797748 6797749 HSM_0503 HSM_0504 ispF   TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000 N NA
 6797749 6797750 HSM_0504 HSM_0505   ispD TRUE 0.681 6.000 0.000 1.000 N NA
 6797750 6797751 HSM_0505 HSM_0506 ispD ftsB TRUE 0.805 1.000 0.003 1.000 N NA
 6797751 6797752 HSM_0506 HSM_0507 ftsB greB TRUE 0.666 10.000 0.000 1.000 N NA
 6797753 6797754 HSM_0508 HSM_0509     FALSE 0.192 67.000 0.000 1.000 N NA
 6797755 6797756 HSM_0510 HSM_0511     TRUE 0.499 93.000 0.066 1.000   NA
 6797757 6797758 HSM_0512 HSM_0513     FALSE 0.087 132.000 0.000 NA   NA
 6797758 6797759 HSM_0513 HSM_0514   tmk TRUE 0.983 10.000 0.209 NA   NA
 6797759 6797760 HSM_0514 HSM_0515 tmk   TRUE 0.977 -76.000 0.211 1.000 N NA
 6797760 6797761 HSM_0515 HSM_0516     TRUE 0.983 9.000 0.110 NA Y NA
 6797761 6797762 HSM_0516 HSM_0517     TRUE 0.744 28.000 0.013 NA   NA
 6797762 6797763 HSM_0517 HSM_0518     TRUE 0.757 61.000 0.069 NA   NA
 6797764 6797765 HSM_0519 HSM_0520     TRUE 0.706 22.000 0.000 NA   NA
 6797765 6797766 HSM_0520 HSM_0521     FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000   NA
 6797767 6797768 HSM_0522 HSM_0523     TRUE 0.980 10.000 0.188 NA   NA
 6797769 6797770 HSM_0524 HSM_0525 lysS   TRUE 0.905 77.000 0.162 0.062 Y NA
 6797771 6797772 HSM_0526 HSM_0527     TRUE 0.949 -7.000 0.082 1.000 N NA
 6797772 6797773 HSM_0527 HSM_0528     TRUE 0.507 49.000 0.000 NA   NA
 6797773 6797774 HSM_0528 HSM_0529     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6797774 6797775 HSM_0529 HSM_0530     FALSE 0.139 112.000 0.000 NA   NA
 6797775 6797776 HSM_0530 HSM_0531     FALSE 0.196 102.000 0.000 NA   NA
 6797776 6797777 HSM_0531 HSM_0532     TRUE 0.582 33.000 0.000 NA   NA
 6797778 6797779 HSM_0533 HSM_0534     FALSE 0.021 194.000 0.000 1.000   NA
 6797780 6797781 HSM_0535 HSM_0537     FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 6797781 6797782 HSM_0537 HSM_0538   nrdG TRUE 0.989 16.000 0.464 1.000 N NA
 6797783 6797784 HSM_0539 HSM_0540     FALSE 0.002 1595.000 0.000 1.000 N NA
 6797784 6797785 HSM_0540 HSM_0541     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 6797786 6797787 HSM_0542 HSM_0543     TRUE 0.997 -13.000 0.600 NA   NA
 6797787 6797788 HSM_0543 HSM_0544     TRUE 0.984 -3.000 0.200 1.000   NA
 6797788 6797789 HSM_0544 HSM_0545     TRUE 0.954 2.000 0.000 NA Y NA
 6797789 6797790 HSM_0545 HSM_0546   gmk FALSE 0.086 109.000 0.000 NA N NA
 6797790 6797791 HSM_0546 HSM_0547 gmk rpoZ TRUE 0.949 55.000 0.471 1.000 N NA
 6797791 6797792 HSM_0547 HSM_0548 rpoZ   TRUE 0.920 81.000 0.291 1.000 Y NA
 6797792 6797793 HSM_0548 HSM_0549     TRUE 0.974 0.000 0.034 1.000 Y NA
 6797793 6797794 HSM_0549 HSM_0550     FALSE 0.273 70.000 0.004 1.000 N NA
 6797794 6797795 HSM_0550 HSM_R0019     FALSE 0.009 379.000 0.000 NA   NA
 6797795 6797796 HSM_R0019 HSM_R0020     FALSE 0.460 61.000 0.000 NA   NA
 6797796 6797797 HSM_R0020 HSM_R0021     FALSE 0.229 95.000 0.000 NA   NA
 6797797 6797798 HSM_R0021 HSM_R0022     FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 6797798 6797799 HSM_R0022 HSM_R0023     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6797799 6797800 HSM_R0023 HSM_R0024     TRUE 0.484 57.000 0.000 NA   NA
 6797800 6797801 HSM_R0024 HSM_R0025     TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 6797801 6797802 HSM_R0025 HSM_R0026     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 6797802 6797803 HSM_R0026 HSM_0551     FALSE 0.008 544.000 0.000 NA   NA
 6797803 6797804 HSM_0551 HSM_0552     FALSE 0.015 238.000 0.000 1.000   NA
 6797804 6797805 HSM_0552 HSM_0553   rpoB FALSE 0.006 504.000 0.000 1.000   NA
 6797805 6797806 HSM_0553 HSM_0554 rpoB   TRUE 0.982 91.000 0.851 0.001   NA
 6797806 6797807 HSM_0554 HSM_0555     FALSE 0.025 337.000 0.000 1.000 Y NA
 6797807 6797808 HSM_0555 HSM_0556     FALSE 0.180 195.000 0.250 1.000 N NA
 6797808 6797809 HSM_0556 HSM_0557     TRUE 0.970 48.000 0.250 0.017 Y NA
 6797809 6797810 HSM_0557 HSM_0558     TRUE 0.996 0.000 0.231 0.017 Y NA
 6797810 6797811 HSM_0558 HSM_0559     TRUE 0.992 18.000 0.385 1.000 Y NA
 6797811 6797812 HSM_0559 HSM_0560     TRUE 0.982 0.000 0.081 1.000 Y NA
 6797812 6797813 HSM_0560 HSM_0561     TRUE 0.949 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6797814 6797815 HSM_0562 HSM_0563 hslU   TRUE 0.998 18.000 0.752 1.000 Y NA
 6797816 6797817 HSM_0564 HSM_0565 hemE   TRUE 0.868 17.000 0.010 NA   NA
 6797817 6797818 HSM_0565 HSM_0566     TRUE 0.532 159.000 0.355 NA   NA
 6797818 6797819 HSM_0566 HSM_0567     FALSE 0.073 162.000 0.037 1.000 N NA
 6797819 6797820 HSM_0567 HSM_0568     TRUE 0.968 26.000 0.412 1.000 N NA
 6797821 6797822 HSM_0569 HSM_0570     TRUE 0.956 36.000 0.205 NA Y NA
 6797822 6797823 HSM_0570 HSM_0571   metN TRUE 0.984 -10.000 0.112 1.000 Y NA
 6797825 6797826 HSM_0573 HSM_0574     FALSE 0.470 60.000 0.000 NA   NA
 6797826 6797827 HSM_0574 HSM_0576     FALSE 0.017 257.000 0.000 NA   NA
 6797827 6797828 HSM_0576 HSM_0577     TRUE 0.950 26.000 0.136 1.000 Y NA
 6797828 6797829 HSM_0577 HSM_0578     TRUE 0.539 128.000 0.290 NA N NA
 6797830 6797831 HSM_R0027 HSM_R0028     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6797831 6797832 HSM_R0028 HSM_R0029     FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 6797832 6797833 HSM_R0029 HSM_R0030     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6797834 6797835 HSM_0579 HSM_0580     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 6797835 6797836 HSM_0580 HSM_0581     TRUE 0.995 14.000 0.417 1.000 Y NA
 6797836 6797837 HSM_0581 HSM_0582     TRUE 0.994 -6.000 0.263 1.000 Y NA
 6797837 6797838 HSM_0582 HSM_0583   fucI TRUE 0.910 82.000 0.269 1.000 Y NA
 6797838 6797839 HSM_0583 HSM_0584 fucI   FALSE 0.069 196.000 0.000 NA Y NA
 6797839 6797840 HSM_0584 HSM_0585     FALSE 0.047 255.000 0.000 NA Y NA
 6797841 6797842 HSM_0586 HSM_0587     FALSE 0.025 140.000 0.000 1.000 N NA
 6797842 6797843 HSM_0587 HSM_0588     FALSE 0.098 92.000 0.000 1.000 N NA
 6797843 6797844 HSM_0588 HSM_0589     TRUE 0.966 2.000 0.088 1.000   NA
 6797846 6797847 HSM_0591 HSM_0592     FALSE 0.100 117.000 0.000 1.000   NA
 6797848 6797849 HSM_0593 HSM_0594     TRUE 0.614 29.000 0.000 NA   NA
 6797849 6797850 HSM_0594 HSM_0595     FALSE 0.008 486.000 0.000 NA   NA
 6797851 6797852 HSM_0596 HSM_0597     TRUE 0.960 0.000 0.062 1.000   NA
 6797852 6797853 HSM_0597 HSM_0598     TRUE 0.966 1.000 0.070 NA   NA
 6797855 6797856 HSM_0600 HSM_0602     TRUE 0.887 0.000 0.000 NA   NA
 6797858 6797859 HSM_0604 HSM_0605 rpsF   TRUE 0.961 -13.000 0.122 1.000 N NA
 6797859 6797860 HSM_0605 HSM_0606   rpsR TRUE 0.952 13.000 0.128 1.000 N NA
 6797860 6797861 HSM_0606 HSM_0607 rpsR rplI TRUE 0.996 19.000 0.499 0.024 Y NA
 6797861 6797862 HSM_0607 HSM_0608 rplI   FALSE 0.006 533.000 0.000 1.000   NA
 6797862 6797863 HSM_0608 HSM_0609     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 6797863 6797864 HSM_0609 HSM_0610     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6797864 6797865 HSM_0610 HSM_0611     FALSE 0.333 93.000 0.000 0.065   NA
 6797865 6797866 HSM_0611 HSM_0612     FALSE 0.006 569.000 0.000 1.000   NA
 6797866 6797867 HSM_0612 HSM_0613     FALSE 0.391 72.000 0.000 NA   NA
 6797867 6797868 HSM_0613 HSM_0614     TRUE 0.806 17.000 0.000 NA   NA
 6797868 6797869 HSM_0614 HSM_0615     TRUE 0.984 22.000 0.457 NA   NA
 6797869 6797870 HSM_0615 HSM_0616     TRUE 0.901 11.000 0.007 NA   NA
 6797870 6797871 HSM_0616 HSM_0617     TRUE 0.811 33.000 0.048 NA   NA
 6797871 6797872 HSM_0617 HSM_0618     FALSE 0.213 145.000 0.073 NA   NA
 6797872 6797873 HSM_0618 HSM_0619     FALSE 0.021 223.000 0.000 NA   NA
 6797873 6797874 HSM_0619 HSM_0620   mraW TRUE 0.892 112.000 0.635 NA   NA
 6797874 6797875 HSM_0620 HSM_0621 mraW   TRUE 0.983 0.000 0.227 1.000 N NA
 6797875 6797876 HSM_0621 HSM_0622     TRUE 0.775 25.000 0.044 1.000 N NA
 6797876 6797877 HSM_0622 HSM_0623   murE TRUE 0.950 16.000 0.022 1.000 Y NA
 6797877 6797878 HSM_0623 HSM_0624 murE   TRUE 0.982 81.000 0.569 0.004 Y NA
 6797878 6797879 HSM_0624 HSM_0625   mraY TRUE 0.997 -6.000 0.309 0.008 Y NA
 6797879 6797880 HSM_0625 HSM_0626 mraY murD TRUE 0.999 9.000 0.647 0.008 Y NA
 6797880 6797881 HSM_0626 HSM_0627 murD   TRUE 0.990 14.000 0.297 0.006 N NA
 6797881 6797882 HSM_0627 HSM_0628   murG TRUE 0.994 16.000 0.647 1.000 N NA
 6797882 6797883 HSM_0628 HSM_0629 murG murC TRUE 0.957 54.000 0.283 1.000 Y NA
 6797883 6797884 HSM_0629 HSM_0630 murC ddl TRUE 0.952 45.000 0.153 0.008 Y NA
 6797884 6797885 HSM_0630 HSM_0631 ddl   TRUE 0.997 1.000 0.372 NA Y NA
 6797885 6797886 HSM_0631 HSM_0632     TRUE 0.962 31.000 0.389 NA N NA
 6797886 6797887 HSM_0632 HSM_0633     TRUE 0.943 87.000 0.460 1.000 Y NA
 6797887 6797888 HSM_0633 HSM_0634   lpxC TRUE 0.808 41.000 0.134 1.000 N NA
 6797888 6797889 HSM_0634 HSM_0635 lpxC   FALSE 0.067 124.000 0.005 1.000 N NA
 6797891 6797892 HSM_0637 HSM_0638 rluD   TRUE 0.982 2.000 0.168 NA   NA
 6797893 6797894 HSM_0639 HSM_0640     TRUE 0.555 119.000 0.122 1.000 Y NA
 6797895 6797896 HSM_0641 HSM_0642     FALSE 0.006 513.000 0.000 1.000   NA
 6797896 6797897 HSM_0642 HSM_0643     TRUE 0.678 24.000 0.000 NA   NA
 6797898 6797899 HSM_0644 HSM_0645     FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 6797899 6797900 HSM_0645 HSM_0646     FALSE 0.028 192.000 0.000 NA   NA
 6797901 6797902 HSM_0647 HSM_0648     TRUE 0.961 4.000 0.083 1.000   NA
 6797902 6797903 HSM_0648 HSM_0649     FALSE 0.021 223.000 0.000 NA   NA
 6797903 6797904 HSM_0649 HSM_0650     TRUE 0.859 9.000 0.000 NA   NA
 6797904 6797905 HSM_0650 HSM_0651     FALSE 0.020 237.000 0.000 NA   NA
 6797905 6797906 HSM_0651 HSM_0652     FALSE 0.045 167.000 0.000 NA   NA
 6797906 6797907 HSM_0652 HSM_0653     FALSE 0.010 360.000 0.000 NA   NA
 6797907 6797908 HSM_0653 HSM_0654     FALSE 0.045 167.000 0.000 NA   NA
 6797908 6797909 HSM_0654 HSM_0655     FALSE 0.162 108.000 0.000 NA   NA
 6797909 6797910 HSM_0655 HSM_0656     FALSE 0.100 127.000 0.000 NA   NA
 6797910 6797911 HSM_0656 HSM_0657     TRUE 0.880 -13.000 0.000 NA   NA
 6797911 6797912 HSM_0657 HSM_0658     FALSE 0.470 60.000 0.000 NA   NA
 6797912 6797913 HSM_0658 HSM_0659     FALSE 0.033 185.000 0.000 NA   NA
 6797913 6797914 HSM_0659 HSM_0660     FALSE 0.310 83.000 0.000 NA   NA
 6797914 6797915 HSM_0660 HSM_0661     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 6797915 6797916 HSM_0661 HSM_0662     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6797916 6797917 HSM_0662 HSM_0663     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 6797917 6797918 HSM_0663 HSM_0664     TRUE 0.887 0.000 0.000 NA   NA
 6797918 6797919 HSM_0664 HSM_0665     TRUE 0.966 1.000 0.069 NA   NA
 6797919 6797920 HSM_0665 HSM_0666     TRUE 0.868 103.000 0.485 NA   NA
 6797920 6797921 HSM_0666 HSM_0667     TRUE 0.973 4.000 0.121 NA   NA
 6797921 6797922 HSM_0667 HSM_0668     TRUE 0.999 -13.000 1.000 NA   NA
 6797922 6797923 HSM_0668 HSM_0669     FALSE 0.061 574.000 0.200 NA   NA
 6797923 6797924 HSM_0669 HSM_0670     FALSE 0.049 261.000 0.045 NA   NA
 6797924 6797925 HSM_0670 HSM_0671     TRUE 0.960 5.000 0.068 NA   NA
 6797925 6797926 HSM_0671 HSM_0672     TRUE 0.952 44.000 0.333 NA   NA
 6797926 6797927 HSM_0672 HSM_0673     TRUE 0.986 3.000 0.207 NA   NA
 6797927 6797928 HSM_0673 HSM_0674     TRUE 0.995 -88.000 0.500 NA   NA
 6797928 6797929 HSM_0674 HSM_0675     TRUE 0.983 -3.000 0.176 NA   NA
 6797929 6797930 HSM_0675 HSM_0676     TRUE 0.991 -7.000 0.286 NA   NA
 6797930 6797931 HSM_0676 HSM_0677     TRUE 0.997 10.000 0.714 NA   NA
 6797931 6797932 HSM_0677 HSM_0678     TRUE 0.981 0.000 0.158 NA   NA
 6797932 6797933 HSM_0678 HSM_0679     FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 6797933 6797934 HSM_0679 HSM_0680     TRUE 0.977 3.000 0.136 NA   NA
 6797934 6797935 HSM_0680 HSM_0681     TRUE 0.978 -10.000 0.143 NA   NA
 6797935 6797936 HSM_0681 HSM_0682     TRUE 0.998 0.000 0.714 NA   NA
 6797936 6797937 HSM_0682 HSM_0683     TRUE 0.809 79.000 0.188 NA   NA
 6797937 6797938 HSM_0683 HSM_0684     TRUE 0.999 14.000 1.000 NA   NA
 6797938 6797939 HSM_0684 HSM_0685     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 6797939 6797940 HSM_0685 HSM_0686     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6797940 6797941 HSM_0686 HSM_0687     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 6797941 6797942 HSM_0687 HSM_0688     TRUE 0.985 -7.000 0.200 NA   NA
 6797942 6797943 HSM_0688 HSM_0689     FALSE 0.010 368.000 0.000 NA   NA
 6797943 6797944 HSM_0689 HSM_0690     TRUE 0.880 -13.000 0.000 NA   NA
 6797945 6797946 HSM_0691 HSM_0692     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6797946 6797947 HSM_0692 HSM_0693     FALSE 0.062 150.000 0.000 NA   NA
 6797947 6797948 HSM_0693 HSM_0694     TRUE 0.900 12.000 0.014 1.000   NA
 6797948 6797949 HSM_0694 HSM_0695     TRUE 0.999 10.000 0.870 0.042 Y NA
 6797949 6797950 HSM_0695 HSM_0696     TRUE 0.537 113.000 0.034 0.042 Y NA
 6797950 6797951 HSM_0696 HSM_0697     FALSE 0.183 159.000 0.000 0.042 Y NA
 6797952 6797953 HSM_0698 HSM_0699     TRUE 0.974 -10.000 0.000 0.004 Y NA
 6797954 6797955 HSM_0700 HSM_0701 ligA   FALSE 0.035 127.000 0.000 1.000 N NA
 6797955 6797956 HSM_0701 HSM_0702     TRUE 0.829 22.000 0.058 1.000 N NA
 6797956 6797957 HSM_0702 HSM_0703     TRUE 0.991 11.000 0.444 1.000 N NA
 6797958 6797959 HSM_0704 HSM_0705     FALSE 0.006 490.000 0.000 1.000   NA
 6797959 6797960 HSM_0705 HSM_0706     TRUE 0.921 22.000 0.113 NA   NA
 6797960 6797961 HSM_0706 HSM_0707     TRUE 0.995 -7.000 0.433 NA   NA
 6797966 6797967 HSM_0712 HSM_0713 ndk   TRUE 0.851 12.000 0.017 1.000 N NA
 6797967 6797968 HSM_0713 HSM_0714   leuD FALSE 0.300 110.000 0.000 1.000 Y NA
 6797968 6797969 HSM_0714 HSM_0715 leuD   TRUE 0.997 10.000 0.309 0.001 Y NA
 6797969 6797970 HSM_0715 HSM_0716     TRUE 0.912 100.000 0.275 0.002 Y NA
 6797970 6797971 HSM_0716 HSM_0717     TRUE 0.974 24.000 0.126 0.002 Y NA
 6797972 6797973 HSM_0718 HSM_0719     TRUE 0.999 -3.000 0.503 0.004 Y NA
 6797973 6797974 HSM_0719 HSM_0720     TRUE 0.990 47.000 0.501 0.002 Y NA
 6797974 6797975 HSM_0720 HSM_0721     TRUE 0.993 10.000 0.501 1.000 N NA
 6797975 6797976 HSM_0721 HSM_0722     TRUE 0.991 -3.000 0.344 1.000 N NA
 6797976 6797977 HSM_0722 HSM_0723     TRUE 0.995 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 6797977 6797978 HSM_0723 HSM_0724     TRUE 0.999 4.000 0.804 0.004 Y NA
 6797978 6797979 HSM_0724 HSM_0725     TRUE 0.998 -3.000 0.578 NA Y NA
 6797979 6797980 HSM_0725 HSM_0726     TRUE 0.999 4.000 0.727 NA Y NA
 6797980 6797981 HSM_0726 HSM_0727     TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000 N NA
 6797981 6797982 HSM_0727 HSM_0728     FALSE 0.233 87.000 0.000 1.000   NA
 6797982 6797983 HSM_0728 HSM_0729   ispG TRUE 0.984 7.000 0.233 1.000   NA
 6797983 6797984 HSM_0729 HSM_0730 ispG hisS TRUE 0.972 13.000 0.207 1.000 N NA
 6797984 6797985 HSM_0730 HSM_0731 hisS   TRUE 0.985 11.000 0.259 1.000   NA
 6797985 6797986 HSM_0731 HSM_0732     FALSE 0.422 58.000 0.000 1.000   NA
 6797987 6797988 HSM_0733 HSM_0734 proA   TRUE 0.891 10.000 0.005 NA   NA
 6797988 6797989 HSM_0734 HSM_0735     FALSE 0.050 161.000 0.000 NA   NA
 6797989 6797990 HSM_0735 HSM_0736     FALSE 0.305 62.000 0.003 1.000 N NA
 6797999 6798000 HSM_0745 HSM_0746   guaA FALSE 0.195 401.000 0.190 0.001 Y NA
 6798002 6798003 HSM_0748 HSM_0749     FALSE 0.043 159.000 0.000 1.000   NA
 6798003 6798004 HSM_0749 HSM_0750     TRUE 0.793 186.000 1.000 1.000   NA
 6798004 6798005 HSM_0750 HSM_0751     FALSE 0.004 310.000 0.000 1.000 N NA
 6798005 6798006 HSM_0751 HSM_0752     FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 6798006 6798007 HSM_0752 HSM_0753     TRUE 0.544 39.000 0.000 NA   NA
 6798008 6798009 HSM_R0031 HSM_0754   gltX FALSE 0.278 87.000 0.000 NA   NA
 6798010 6798011 HSM_R0032 HSM_R0033     TRUE 0.538 41.000 0.000 NA   NA
 6798011 6798012 HSM_R0033 HSM_R0034     FALSE 0.417 67.000 0.000 NA   NA
 6798012 6798013 HSM_R0034 HSM_0755     FALSE 0.029 190.000 0.000 NA   NA
 6798013 6798014 HSM_0755 HSM_0756     TRUE 0.988 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 6798014 6798015 HSM_0756 HSM_0757   coaE TRUE 0.635 20.000 0.005 1.000 N NA
 6798015 6798016 HSM_0757 HSM_0758 coaE   TRUE 0.944 -3.000 0.033 1.000   NA
 6798016 6798017 HSM_0758 HSM_0759     FALSE 0.040 173.000 0.000 NA   NA
 6798017 6798018 HSM_0759 HSM_0760     TRUE 0.627 28.000 0.000 NA   NA
 6798018 6798019 HSM_0760 HSM_0761     FALSE 0.010 236.000 0.000 NA N NA
 6798019 6798020 HSM_0761 HSM_0762     FALSE 0.012 204.000 0.000 NA N NA
 6798021 6798022 HSM_0763 HSM_0764     FALSE 0.285 137.000 0.071 0.006 N NA
 6798022 6798023 HSM_0764 HSM_0765   aspA FALSE 0.009 195.000 0.000 1.000 N NA
 6798024 6798025 HSM_0766 HSM_0767 groES groEL TRUE 0.992 31.000 0.631 1.000 Y NA
 6798025 6798026 HSM_0767 HSM_0768 groEL   FALSE 0.014 171.000 0.000 1.000 N NA
 6798026 6798027 HSM_0768 HSM_0769     FALSE 0.302 84.000 0.000 NA   NA
 6798027 6798028 HSM_0769 HSM_0770     TRUE 0.998 4.000 0.679 NA   NA
 6798028 6798029 HSM_0770 HSM_0771     TRUE 0.989 1.000 0.244 NA   NA
 6798035 6798036 HSM_0777 HSM_0778     FALSE 0.012 309.000 0.000 NA   NA
 6798037 6798038 HSM_0779 HSM_0780     TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 6798038 6798039 HSM_0780 HSM_0781     TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 6798039 6798040 HSM_0781 HSM_0782     TRUE 0.998 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 6798042 6798043 HSM_0784 HSM_0785     TRUE 0.478 81.000 0.053 1.000 N NA
 6798043 6798044 HSM_0785 HSM_0786     TRUE 0.998 4.000 0.400 0.002 Y NA
 6798044 6798045 HSM_0786 HSM_0787     TRUE 0.997 0.000 0.299 0.042 Y NA
 6798045 6798046 HSM_0787 HSM_0788     TRUE 0.750 138.000 0.299 0.042 Y NA
 6798046 6798047 HSM_0788 HSM_0789     FALSE 0.004 323.000 0.000 1.000 N NA
 6798047 6798048 HSM_0789 HSM_0790     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 6798048 6798049 HSM_0790 HSM_0791     TRUE 0.936 20.000 0.114 NA   NA
 6798049 6798050 HSM_0791 HSM_0792     TRUE 0.969 10.000 0.167 NA N NA
 6798050 6798051 HSM_0792 HSM_0793     TRUE 0.945 0.000 0.024 NA   NA
 6798052 6798053 HSM_0794 HSM_0796     FALSE 0.043 170.000 0.000 NA   NA
 6798053 6798054 HSM_0796 HSM_0797     TRUE 0.706 22.000 0.000 NA   NA
 6798054 6798055 HSM_0797 HSM_0798     FALSE 0.269 89.000 0.000 NA   NA
 6798055 6798056 HSM_0798 HSM_0799     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA   NA
 6798056 6798057 HSM_0799 HSM_0800     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 6798057 6798058 HSM_0800 HSM_0801     FALSE 0.048 163.000 0.000 NA   NA
 6798058 6798059 HSM_0801 HSM_0802     TRUE 0.993 11.000 0.389 NA   NA
 6798059 6798060 HSM_0802 HSM_0803   valS TRUE 0.568 47.000 0.002 NA   NA
 6798061 6798062 HSM_0804 HSM_0805 truA   FALSE 0.333 31.000 0.000 1.000 N NA
 6798062 6798063 HSM_0805 HSM_0806     FALSE 0.053 111.000 0.000 1.000 N NA
 6798064 6798065 HSM_0807 HSM_0808     TRUE 0.998 18.000 0.600 0.001 Y NA
 6798065 6798066 HSM_0808 HSM_0809     TRUE 0.987 11.000 0.174 1.000 Y NA
 6798066 6798067 HSM_0809 HSM_0810     TRUE 0.805 92.000 0.174 1.000 Y NA
 6798067 6798068 HSM_0810 HSM_0811     TRUE 0.800 28.000 0.000 1.000 Y NA
 6798068 6798069 HSM_0811 HSM_0812     FALSE 0.179 71.000 0.000 1.000 N NA
 6798070 6798071 HSM_0813 HSM_0814 znuA   FALSE 0.226 93.000 0.016 1.000 N NA
 6798071 6798072 HSM_0814 HSM_0815   mltA TRUE 0.879 0.000 0.016 1.000 N NA
 6798072 6798073 HSM_0815 HSM_0816 mltA   FALSE 0.005 273.000 0.000 1.000 N NA
 6798075 6798076 HSM_0818 HSM_0819     TRUE 0.991 -13.000 0.180 NA Y NA
 6798076 6798077 HSM_0819 HSM_0820     TRUE 0.979 -9.000 0.149 NA   NA
 6798077 6798078 HSM_0820 HSM_0821     FALSE 0.464 107.000 0.095 NA   NA
 6798078 6798079 HSM_0821 HSM_0822     TRUE 0.916 55.000 0.238 NA   NA
 6798079 6798080 HSM_0822 HSM_0823     TRUE 0.917 23.000 0.048 0.016   NA
 6798081 6798082 HSM_0824 HSM_0825     FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 6798082 6798083 HSM_0825 HSM_0826     TRUE 0.938 73.000 0.292 1.000 Y NA
 6798083 6798084 HSM_0826 HSM_0827   mtlR TRUE 0.831 75.000 0.230 NA N NA
 6798087 6798088 HSM_0832 HSM_0833     TRUE 0.870 11.000 0.022 1.000 N NA
 6798088 6798089 HSM_0833 HSM_0834     FALSE 0.335 80.000 0.000 NA   NA
 6798089 6798090 HSM_0834 HSM_0836     FALSE 0.036 181.000 0.000 NA   NA
 6798090 6798091 HSM_0836 HSM_0837     TRUE 0.970 11.000 0.187 1.000 N NA
 6798091 6798092 HSM_0837 HSM_0838   rnc FALSE 0.073 206.000 0.117 1.000 N NA
 6798092 6798093 HSM_0838 HSM_0839 rnc era TRUE 0.899 41.000 0.127 0.033   NA
 6798093 6798094 HSM_0839 HSM_0840 era gmhA TRUE 0.613 25.000 0.000 1.000   NA
 6798094 6798095 HSM_0840 HSM_0841 gmhA rpsU FALSE 0.011 185.000 0.000 1.000 N NA
 6798095 6798096 HSM_0841 HSM_0842 rpsU dnaG FALSE 0.102 161.000 0.067 1.000 N NA
 6798096 6798097 HSM_0842 HSM_0843 dnaG   TRUE 0.882 67.000 0.299 1.000 N NA
 6798097 6798098 HSM_0843 HSM_0844     FALSE 0.006 648.000 0.000 1.000   NA
 6798098 6798099 HSM_0844 HSM_0845     FALSE 0.009 386.000 0.000 NA   NA
 6798099 6798100 HSM_0845 HSM_0846   glyQ FALSE 0.071 113.000 0.000 NA N NA
 6798100 6798101 HSM_0846 HSM_0847 glyQ   TRUE 0.853 0.000 0.003 NA N NA
 6798101 6798102 HSM_0847 HSM_0848     FALSE 0.007 860.000 0.000 NA   NA
 6798102 6798103 HSM_0848 HSM_0849     FALSE 0.025 200.000 0.000 NA   NA
 6798105 6798106 HSM_R0035 HSM_R0036     TRUE 0.706 22.000 0.000 NA   NA
 6798106 6798107 HSM_R0036 HSM_R0037     TRUE 0.864 7.000 0.000 NA   NA
 6798107 6798108 HSM_R0037 HSM_R0038     FALSE 0.050 161.000 0.000 NA   NA
 6798108 6798109 HSM_R0038 HSM_R0039     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6798109 6798110 HSM_R0039 HSM_R0040     FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 6798110 6798111 HSM_R0040 HSM_R0041     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6798111 6798112 HSM_R0041 HSM_R0042     FALSE 0.460 61.000 0.000 NA   NA
 6798114 6798115 HSM_0852 HSM_0853     FALSE 0.022 219.000 0.000 NA   NA
 6798115 6798116 HSM_0853 HSM_0854     TRUE 0.975 80.000 0.775 NA   NA
 6798116 6798117 HSM_0854 HSM_0855     TRUE 0.955 7.000 0.075 1.000   NA
 6798118 6798119 HSM_0856 HSM_0857   aspS FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 6798122 6798123 HSM_R0043 HSM_R0044     TRUE 0.655 26.000 0.000 NA   NA
 6798124 6798125 HSM_0860 HSM_0861     FALSE 0.072 235.000 0.000 0.061 Y NA
 6798125 6798126 HSM_0861 HSM_0862     FALSE 0.012 307.000 0.000 NA   NA
 6798126 6798127 HSM_0862 HSM_0863     FALSE 0.460 61.000 0.000 NA   NA
 6798127 6798128 HSM_0863 HSM_0864     FALSE 0.009 319.000 0.000 1.000   NA
 6798128 6798129 HSM_0864 HSM_0865     FALSE 0.059 153.000 0.000 NA   NA
 6798129 6798130 HSM_0865 HSM_0866     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798130 6798131 HSM_0866 HSM_0867     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798131 6798132 HSM_0867 HSM_0868     FALSE 0.278 87.000 0.000 NA   NA
 6798132 6798133 HSM_0868 HSM_0869     FALSE 0.007 792.000 0.000 NA   NA
 6798134 6798135 HSM_0870 HSM_0871     FALSE 0.037 179.000 0.000 NA   NA
 6798136 6798137 HSM_0872 HSM_0873     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798137 6798138 HSM_0873 HSM_0874     FALSE 0.438 64.000 0.000 NA   NA
 6798138 6798139 HSM_0874 HSM_0875     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 6798139 6798140 HSM_0875 HSM_0876     FALSE 0.007 1059.000 0.000 NA   NA
 6798141 6798142 HSM_0877 HSM_0878     FALSE 0.009 417.000 0.000 NA   NA
 6798142 6798143 HSM_0878 HSM_0879     TRUE 0.995 2.000 0.429 NA   NA
 6798144 6798145 HSM_0880 HSM_0881     FALSE 0.222 97.000 0.000 NA   NA
 6798146 6798147 HSM_0882 HSM_0883     FALSE 0.059 153.000 0.000 NA   NA
 6798147 6798148 HSM_0883 HSM_0884     TRUE 0.882 -10.000 0.000 NA   NA
 6798148 6798149 HSM_0884 HSM_0885     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798149 6798150 HSM_0885 HSM_0886     TRUE 0.801 15.000 0.000 1.000   NA
 6798150 6798151 HSM_0886 HSM_0887     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 6798152 6798153 HSM_0888 HSM_0889     FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 6798153 6798154 HSM_0889 HSM_0890     TRUE 0.689 23.000 0.000 NA   NA
 6798157 6798158 HSM_0893 HSM_0894     TRUE 0.994 -10.000 0.375 NA   NA
 6798158 6798159 HSM_0894 HSM_0895     TRUE 0.993 -27.000 0.375 NA   NA
 6798159 6798160 HSM_0895 HSM_0896     FALSE 0.026 197.000 0.000 NA   NA
 6798160 6798161 HSM_0896 HSM_0897     TRUE 0.993 0.000 0.333 NA   NA
 6798161 6798162 HSM_0897 HSM_0898     TRUE 0.884 2.000 0.000 NA   NA
 6798162 6798163 HSM_0898 HSM_0899     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 6798163 6798164 HSM_0899 HSM_0900     FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 6798164 6798165 HSM_0900 HSM_0901     FALSE 0.007 775.000 0.000 NA   NA
 6798165 6798166 HSM_0901 HSM_0902     FALSE 0.400 70.000 0.000 NA   NA
 6798166 6798167 HSM_0902 HSM_0903     TRUE 0.884 2.000 0.000 NA   NA
 6798167 6798168 HSM_0903 HSM_0904     FALSE 0.016 263.000 0.000 NA   NA
 6798168 6798169 HSM_0904 HSM_0905     FALSE 0.294 85.000 0.000 NA   NA
 6798169 6798170 HSM_0905 HSM_0906     TRUE 0.969 78.000 0.667 NA   NA
 6798170 6798171 HSM_0906 HSM_0907     TRUE 0.972 26.000 0.333 NA   NA
 6798171 6798172 HSM_0907 HSM_0908     TRUE 0.938 62.000 0.333 NA   NA
 6798172 6798173 HSM_0908 HSM_0909     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 6798173 6798174 HSM_0909 HSM_0910     FALSE 0.016 264.000 0.000 NA   NA
 6798174 6798175 HSM_0910 HSM_0911     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6798176 6798177 HSM_0912 HSM_0913     TRUE 0.971 -16.000 0.108 NA   NA
 6798178 6798179 HSM_0914 HSM_0915     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6798179 6798180 HSM_0915 HSM_0916     FALSE 0.097 128.000 0.000 NA   NA
 6798180 6798181 HSM_0916 HSM_0917     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 6798181 6798182 HSM_0917 HSM_0918     TRUE 0.881 3.000 0.000 NA   NA
 6798182 6798183 HSM_0918 HSM_0919     TRUE 0.767 19.000 0.000 NA   NA
 6798183 6798184 HSM_0919 HSM_0920     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 6798184 6798185 HSM_0920 HSM_0921     FALSE 0.008 513.000 0.000 NA   NA
 6798186 6798187 HSM_0922 HSM_0923     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6798187 6798188 HSM_0923 HSM_0924     TRUE 0.481 58.000 0.000 NA   NA
 6798189 6798190 HSM_0925 HSM_0926     TRUE 0.666 10.000 0.000 1.000 N NA
 6798190 6798191 HSM_0926 HSM_0927     TRUE 0.605 113.000 0.292 1.000 N NA
 6798191 6798192 HSM_0927 HSM_0928     TRUE 0.982 -10.000 0.163 0.022 N NA
 6798192 6798193 HSM_0928 HSM_0929     TRUE 0.581 53.000 0.011 1.000   NA
 6798193 6798194 HSM_0929 HSM_0930     FALSE 0.233 139.000 0.092 1.000   NA
 6798195 6798196 HSM_0931 HSM_0932     TRUE 0.937 -60.000 0.000 0.005   NA
 6798196 6798197 HSM_0932 HSM_0933     FALSE 0.163 126.000 0.000 0.040   NA
 6798197 6798198 HSM_0933 HSM_0934     TRUE 0.998 4.000 0.469 0.016 Y NA
 6798198 6798199 HSM_0934 HSM_0935   xylF TRUE 0.988 60.000 0.518 0.016 Y NA
 6798200 6798201 HSM_0936 HSM_0937     TRUE 0.708 69.000 0.013 1.000 Y NA
 6798202 6798203 HSM_0938 HSM_0939     FALSE 0.010 288.000 0.000 1.000   NA
 6798203 6798204 HSM_0939 HSM_0940     TRUE 0.999 16.000 0.684 0.015 Y NA
 6798204 6798205 HSM_0940 HSM_0941     TRUE 0.998 12.000 0.667 1.000 Y NA
 6798205 6798206 HSM_0941 HSM_0942     TRUE 0.990 -10.000 0.111 0.040 Y NA
 6798206 6798207 HSM_0942 HSM_0943     TRUE 0.887 28.000 0.103 0.040 N NA
 6798208 6798209 HSM_0944 HSM_0945     TRUE 0.998 10.000 0.791 NA   NA
 6798210 6798211 HSM_0946 HSM_0947 grxA   FALSE 0.041 121.000 0.000 1.000 N NA
 6798211 6798212 HSM_0947 HSM_0948     FALSE 0.347 46.000 0.000 NA N NA
 6798212 6798213 HSM_0948 HSM_0949     TRUE 0.943 5.000 0.065 NA N NA
 6798213 6798214 HSM_0949 HSM_0950     TRUE 0.708 51.000 0.000 1.000 Y NA
 6798214 6798215 HSM_0950 HSM_0951     TRUE 0.574 56.000 0.006 NA   NA
 6798217 6798218 HSM_0953 HSM_R0045     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 6798218 6798219 HSM_R0045 HSM_R0046     TRUE 0.614 29.000 0.000 NA   NA
 6798219 6798220 HSM_R0046 HSM_0954     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6798222 6798223 HSM_0956 HSM_0957     TRUE 0.980 -3.000 0.150 NA   NA
 6798223 6798224 HSM_0957 HSM_0958     TRUE 0.985 58.000 0.755 NA   NA
 6798224 6798225 HSM_0958 HSM_0959     TRUE 0.999 15.000 0.939 0.010 Y NA
 6798225 6798226 HSM_0959 HSM_0960     TRUE 0.995 12.000 0.255 0.010 Y NA
 6798226 6798227 HSM_0960 HSM_0961     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 6798228 6798229 HSM_0962 HSM_0963     TRUE 0.865 59.000 0.020 0.013 Y NA
 6798229 6798230 HSM_0963 HSM_0964     TRUE 0.783 63.000 0.029 1.000 Y NA
 6798230 6798231 HSM_0964 HSM_0965     FALSE 0.007 236.000 0.000 1.000 N NA
 6798231 6798232 HSM_0965 HSM_0966     TRUE 0.995 22.000 0.900 NA N NA
 6798233 6798234 HSM_0967 HSM_0968     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 6798234 6798235 HSM_0968 HSM_0969     TRUE 0.993 6.000 0.281 1.000 Y NA
 10692424 6798239 HSM_0973 HSM_0975     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798239 6798240 HSM_0975 HSM_0976     FALSE 0.076 138.000 0.000 NA   NA
 6798240 6798241 HSM_0976 HSM_0977     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 6798241 6798242 HSM_0977 HSM_0978     TRUE 0.792 62.000 0.000 0.008 Y NA
 6798244 6798245 HSM_0980 HSM_0981 fbpC   TRUE 0.948 67.000 0.444 0.039 N NA
 6798245 6798246 HSM_0981 HSM_0982     TRUE 0.994 22.000 0.500 0.039 Y NA
 6798246 6798247 HSM_0982 HSM_0983     TRUE 0.946 28.000 0.074 0.039 Y NA
 6798248 6798249 HSM_0984 HSM_0985   dcd TRUE 0.952 10.000 0.010 1.000 Y NA
 6798249 6798250 HSM_0985 HSM_0986 dcd   TRUE 0.906 15.000 0.017 NA   NA
 6798250 6798251 HSM_0986 HSM_0987     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 6798251 6798252 HSM_0987 HSM_0988   adk FALSE 0.219 90.000 0.000 1.000   NA
 6798254 6798255 HSM_0990 HSM_0991 ppnK   TRUE 0.719 78.000 0.170 1.000 N NA
 6798256 6798257 HSM_0992 HSM_0993     FALSE 0.005 328.000 0.000 NA N NA
 6798258 6798259 HSM_0994 HSM_0995     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 6798259 6798260 HSM_0995 HSM_0996   lpxK FALSE 0.043 119.000 0.000 1.000 N NA
 6798260 6798261 HSM_0996 HSM_0997 lpxK   TRUE 0.990 -3.000 0.263 NA   NA
 6798261 6798262 HSM_0997 HSM_0998     TRUE 0.985 15.000 0.265 NA   NA
 6798262 6798263 HSM_0998 HSM_0999   uvrC TRUE 0.911 -7.000 0.005 0.055 N NA
 6798264 6798265 HSM_1000 HSM_1001     FALSE 0.105 125.000 0.000 NA   NA
 6798265 6798266 HSM_1001 HSM_1002     TRUE 0.657 65.000 0.085 1.000 N NA
 6798266 6798267 HSM_1002 HSM_1003     FALSE 0.387 91.000 0.017 NA   NA
 6798267 6798268 HSM_1003 HSM_1004   mnmC TRUE 0.890 12.000 0.004 NA   NA
 6798269 6798270 HSM_1005 HSM_1006     FALSE 0.003 419.000 0.000 1.000 N NA
 6798271 6798272 HSM_R0047 HSM_1007     FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 6798273 6798274 HSM_1008 HSM_1009     FALSE 0.017 223.000 0.000 1.000   NA
 6798274 6798275 HSM_1009 HSM_1010     TRUE 0.776 105.000 0.121 0.006 Y NA
 6798275 6798276 HSM_1010 HSM_1011     TRUE 0.933 63.000 0.139 0.006 Y NA
 6798276 6798277 HSM_1011 HSM_1012   aceE FALSE 0.004 295.000 0.000 1.000 N NA
 6798277 6798278 HSM_1012 HSM_1013 aceE   TRUE 0.942 55.000 0.220 1.000 Y NA
 6798278 6798279 HSM_1013 HSM_1014     TRUE 0.950 84.000 0.463 1.000 Y NA
 6798281 6798282 HSM_1016 HSM_1017     FALSE 0.004 314.000 0.000 1.000 N NA
 6798283 6798284 HSM_1018 HSM_1019 tsf rpsB TRUE 0.934 123.000 0.748 1.000 Y NA
 6798284 6798285 HSM_1019 HSM_1020 rpsB   FALSE 0.006 255.000 0.000 1.000 N NA
 6798285 6798286 HSM_1020 HSM_1021     FALSE 0.004 292.000 0.000 1.000 N NA
 6798286 6798287 HSM_1021 HSM_1022     FALSE 0.011 286.000 0.000 1.000   NA
 6798287 6798288 HSM_1022 HSM_1023     FALSE 0.006 523.000 0.000 1.000   NA
 6798288 6798289 HSM_1023 HSM_1024     FALSE 0.212 91.000 0.000 1.000   NA
 6798291 6798292 HSM_1025 HSM_1026     FALSE 0.179 105.000 0.000 NA   NA
 6798292 6798293 HSM_1026 HSM_1027     TRUE 0.999 0.000 0.631 0.006 Y NA
 6798293 6798294 HSM_1027 HSM_1028     TRUE 0.811 66.000 0.049 1.000 Y NA
 6798294 6798295 HSM_1028 HSM_1029   pflA FALSE 0.199 129.000 0.000 1.000 Y NA
 6798296 6798297 HSM_1030 HSM_1031     TRUE 0.967 14.000 0.000 0.001 Y NA
 6798297 6798298 HSM_1031 HSM_1032     TRUE 0.931 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6798298 6798299 HSM_1032 HSM_1033     TRUE 0.910 24.000 0.000 0.006 Y NA
 6798299 6798300 HSM_1033 HSM_1034     TRUE 0.968 5.000 0.000 0.010 Y NA
 6798300 6798301 HSM_1034 HSM_1035     TRUE 0.641 14.000 0.000 1.000 N NA
 6798301 6798302 HSM_1035 HSM_1036     FALSE 0.242 55.000 0.000 1.000 N NA
 6798303 6798304 HSM_1037 HSM_1038     TRUE 0.999 -15.000 0.914 NA   NA
 6798304 6798305 HSM_1038 HSM_1039     TRUE 0.815 46.000 0.087 NA   NA
 6798305 6798306 HSM_1039 HSM_1040     TRUE 0.905 23.000 0.092 NA   NA
 6798306 6798307 HSM_1040 HSM_1041     FALSE 0.066 135.000 0.000 1.000   NA
 6798307 6798308 HSM_1041 HSM_1042     TRUE 0.586 95.000 0.172 1.000 N NA
 6798309 6798310 HSM_1043 HSM_1044     TRUE 0.962 0.000 0.051 NA   NA
 6798310 6798311 HSM_1044 HSM_1045     TRUE 0.929 7.000 0.022 NA   NA
 6798311 6798312 HSM_1045 HSM_1046     TRUE 0.614 29.000 0.000 NA   NA
 6798312 6798313 HSM_1046 HSM_1047   metF FALSE 0.024 211.000 0.000 NA   NA
 6798315 6798316 HSM_1049 HSM_1050 uvrA   FALSE 0.014 172.000 0.000 1.000 N NA
 6798316 6798317 HSM_1050 HSM_1051     TRUE 0.953 82.000 0.689 1.000 N NA
 6798317 6798318 HSM_1051 HSM_1052     TRUE 0.999 0.000 0.550 0.004 Y NA
 6798319 6798320 HSM_1053 HSM_1054     FALSE 0.439 72.000 0.018 NA N NA
 6798320 6798321 HSM_1054 HSM_1055   mazG TRUE 0.839 5.000 0.000 1.000   NA
 6798322 6798323 HSM_1056 HSM_1057     TRUE 0.878 -16.000 0.000 NA   NA
 6798323 6798324 HSM_1057 HSM_1058     TRUE 0.991 -13.000 0.300 NA   NA
 6798324 6798325 HSM_1058 HSM_1059     FALSE 0.010 345.000 0.000 NA   NA
 6798325 6798326 HSM_1059 HSM_1060   alaS FALSE 0.018 192.000 0.006 1.000 N NA
 6798326 6798327 HSM_1060 HSM_1061 alaS   FALSE 0.025 187.000 0.010 1.000 N NA
 6798327 6798328 HSM_1061 HSM_1062     TRUE 0.961 34.000 0.462 1.000 N NA
 6798328 6798329 HSM_1062 HSM_1063     TRUE 0.906 74.000 0.400 1.000 N NA
 6798330 6798331 HSM_1064 HSM_1065   aroB TRUE 0.835 7.000 0.011 1.000 N NA
 6798331 6798332 HSM_1065 HSM_1066 aroB aroK TRUE 0.979 20.000 0.208 1.000 Y NA
 6798332 6798333 HSM_1066 HSM_1067 aroK   FALSE 0.362 182.000 0.319 1.000   NA
 6798333 6798334 HSM_1067 HSM_1068     TRUE 0.824 16.000 0.000 NA   NA
 6798334 6798335 HSM_1068 HSM_1069     TRUE 0.970 4.000 0.105 NA   NA
 6798335 6798336 HSM_1069 HSM_1070     TRUE 0.964 4.000 0.079 NA   NA
 6798337 6798338 HSM_1071 HSM_1072     TRUE 0.625 60.000 0.017 NA   NA
 6798338 6798339 HSM_1072 HSM_1073     TRUE 0.615 90.000 0.100 NA   NA
 6798339 6798340 HSM_1073 HSM_1074   hfq FALSE 0.019 207.000 0.000 1.000   NA
 6798340 6798341 HSM_1074 HSM_1075 hfq   TRUE 0.888 3.000 0.003 1.000   NA
 6798348 6798349 HSM_1082 HSM_1083 srlR   TRUE 0.702 43.000 0.032 1.000   NA
 6798349 6798350 HSM_1083 HSM_1084     FALSE 0.376 75.000 0.000 NA   NA
 6798350 6798351 HSM_1084 HSM_1085     TRUE 0.859 55.000 0.197 NA N NA
 6798351 6798352 HSM_1085 HSM_1086     TRUE 0.898 47.000 0.260 1.000 N NA
 6798352 6798353 HSM_1086 HSM_1087     TRUE 0.959 61.000 0.214 0.007 Y NA
 6798353 6798354 HSM_1087 HSM_1088     TRUE 0.936 37.000 0.070 0.007 Y NA
 6798355 6798356 HSM_1089 HSM_1090     TRUE 0.592 32.000 0.000 NA   NA
 6798357 6798358 HSM_1091 HSM_1092     TRUE 0.993 27.000 0.474 0.002 Y NA
 6798358 6798359 HSM_1092 HSM_1093     TRUE 0.641 28.000 0.021 1.000 N NA
 6798359 6798360 HSM_1093 HSM_1094     FALSE 0.176 156.000 0.066 NA   NA
 6798361 6798362 HSM_1095 HSM_1096     FALSE 0.031 296.000 0.034 NA   NA
 6798364 6798365 HSM_1098 HSM_1099 serB   TRUE 0.879 17.000 0.014 NA   NA
 6798366 6798367 HSM_1100 HSM_1101     TRUE 0.998 0.000 0.733 0.073 N NA
 6798367 6798368 HSM_1101 HSM_1102     TRUE 1.000 2.000 1.000 0.053 Y NA
 6798368 6798369 HSM_1102 HSM_1103     FALSE 0.003 394.000 0.000 1.000 N NA
 6798370 6798371 HSM_1104 HSM_1105 rbn   TRUE 0.962 -3.000 0.069 1.000   NA
 6798372 6798373 HSM_1106 HSM_1107     TRUE 0.926 33.000 0.273 1.000 N NA
 6798373 6798374 HSM_1107 HSM_1108     TRUE 0.992 -19.000 0.385 NA N NA
 6798374 6798375 HSM_1108 HSM_1109     TRUE 0.983 16.000 0.154 NA Y NA
 6798375 6798376 HSM_1109 HSM_1110     TRUE 0.990 17.000 0.286 1.000 Y NA
 6798376 6798377 HSM_1110 HSM_1111     TRUE 0.806 46.000 0.143 1.000 N NA
 6798378 6798379 HSM_1112 HSM_1113     TRUE 0.957 55.000 0.286 1.000 Y NA
 6798379 6798380 HSM_1113 HSM_1114     FALSE 0.003 351.000 0.000 1.000 N NA
 6798380 6798381 HSM_1114 HSM_1115     FALSE 0.021 403.000 0.000 1.000 Y NA
 6798383 6798384 HSM_1117 HSM_1118     FALSE 0.320 107.000 0.000 1.000 Y NA
 6798384 6798385 HSM_1118 HSM_1119     FALSE 0.005 267.000 0.000 1.000 N NA
 6798385 6798386 HSM_1119 HSM_1120     TRUE 0.961 80.000 0.467 NA Y NA
 6798386 6798387 HSM_1120 HSM_1121     TRUE 0.998 2.000 0.600 NA Y NA
 6798387 6798388 HSM_1121 HSM_1122     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.002   NA
 6798393 6798394 HSM_R0049 HSM_1127     FALSE 0.248 92.000 0.000 NA   NA
 6798395 6798396 HSM_1128 HSM_R0050     FALSE 0.113 122.000 0.000 NA   NA
 6798396 6798397 HSM_R0050 HSM_R0051     TRUE 0.861 11.000 0.000 NA   NA
 6798397 6798398 HSM_R0051 HSM_R0052     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6798398 6798399 HSM_R0052 HSM_1129     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 6798400 6798401 HSM_1130 HSM_1131     TRUE 0.874 -31.000 0.000 NA   NA
 6798401 6798402 HSM_1131 HSM_1132     TRUE 0.767 19.000 0.000 NA   NA
 6798402 6798403 HSM_1132 HSM_1133     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798403 6798404 HSM_1133 HSM_1134     TRUE 0.824 16.000 0.000 NA   NA
 6798404 6798405 HSM_1134 HSM_1135     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 6798407 6798408 HSM_1137 HSM_1138     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 6798408 6798409 HSM_1138 HSM_1139     FALSE 0.025 205.000 0.000 NA   NA
 6798409 6798410 HSM_1139 HSM_1140     TRUE 0.981 28.000 0.500 NA   NA
 6798410 6798411 HSM_1140 HSM_1141     TRUE 0.985 11.000 0.222 NA   NA
 6798412 6798413 HSM_1142 HSM_1143     TRUE 0.998 0.000 0.681 NA   NA
 6798413 6798414 HSM_1143 HSM_1144     FALSE 0.023 215.000 0.000 NA   NA
 6798415 6798416 HSM_1145 HSM_1146     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6798417 6798418 HSM_1147 HSM_1148     TRUE 0.971 -16.000 0.108 NA   NA
 6798419 6798420 HSM_1149 HSM_1150     TRUE 0.971 46.000 0.500 NA   NA
 6798420 6798421 HSM_1150 HSM_1151     TRUE 0.996 -10.000 0.500 NA   NA
 6798421 6798422 HSM_1151 HSM_1152     TRUE 0.992 -16.000 0.333 NA   NA
 6798422 6798423 HSM_1152 HSM_1153     TRUE 0.988 0.000 0.222 NA   NA
 6798423 6798424 HSM_1153 HSM_1154     FALSE 0.023 214.000 0.000 NA   NA
 6798424 6798425 HSM_1154 HSM_1155     TRUE 0.880 -12.000 0.000 NA   NA
 6798425 6798426 HSM_1155 HSM_1156     FALSE 0.057 155.000 0.000 NA   NA
 6798426 6798427 HSM_1156 HSM_1157     FALSE 0.007 766.000 0.000 NA   NA
 6798427 6798428 HSM_1157 HSM_1158     TRUE 0.986 13.000 0.261 NA   NA
 6798428 6798429 HSM_1158 HSM_1159     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 6798429 6798430 HSM_1159 HSM_1160     TRUE 0.998 -16.000 0.667 NA   NA
 6798430 6798431 HSM_1160 HSM_1161     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6798431 6798432 HSM_1161 HSM_1162     TRUE 0.886 1.000 0.000 NA   NA
 6798432 6798433 HSM_1162 HSM_1163     TRUE 0.988 0.000 0.222 NA   NA
 6798433 6798434 HSM_1163 HSM_1164     FALSE 0.335 104.000 0.000 0.004   NA
 6798434 6798435 HSM_1164 HSM_1165     TRUE 0.987 12.000 0.286 1.000   NA
 6798435 6798436 HSM_1165 HSM_1166     TRUE 0.984 24.000 0.500 1.000   NA
 6798438 6798439 HSM_1168 HSM_1169     FALSE 0.015 243.000 0.000 1.000   NA
 6798439 6798440 HSM_1169 HSM_1170     TRUE 0.993 18.000 0.355 NA Y NA
 6798441 6798442 HSM_1171 HSM_1172 rrmJ   FALSE 0.286 131.000 0.152 1.000 N NA
 6798442 6798443 HSM_1172 HSM_1173     FALSE 0.005 333.000 0.000 NA N NA
 6798444 6798445 HSM_1174 HSM_1176     FALSE 0.391 72.000 0.000 NA   NA
 6798446 6798447 HSM_1177 HSM_1178     FALSE 0.009 377.000 0.000 NA   NA
 6798447 6798448 HSM_1178 HSM_1179     TRUE 0.878 -16.000 0.000 NA   NA
 6798448 6798449 HSM_1179 HSM_1181     FALSE 0.108 124.000 0.000 NA   NA
 6798449 6798450 HSM_1181 HSM_1182     FALSE 0.382 74.000 0.000 NA   NA
 6798450 6798451 HSM_1182 HSM_1183     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 6798453 6798454 HSM_1185 HSM_1186     FALSE 0.072 142.000 0.000 NA   NA
 6798454 6798455 HSM_1186 HSM_1187     FALSE 0.033 186.000 0.000 NA   NA
 6798455 6798456 HSM_1187 HSM_1188     FALSE 0.103 126.000 0.000 NA   NA
 6798456 6798457 HSM_1188 HSM_1189     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 6798459 6798460 HSM_1191 HSM_1192     TRUE 0.864 87.000 0.333 1.000   NA
 6798460 6798461 HSM_1192 HSM_1193     TRUE 0.496 54.000 0.000 NA   NA
 6798461 6798462 HSM_1193 HSM_1194     TRUE 0.876 -22.000 0.000 NA   NA
 6798462 6798463 HSM_1194 HSM_1196     FALSE 0.012 302.000 0.000 NA   NA
 6798463 6798464 HSM_1196 HSM_1197     TRUE 0.740 91.000 0.260 1.000 N NA
 6798464 6798465 HSM_1197 HSM_1198     TRUE 0.641 14.000 0.000 1.000 N NA
 6798465 6798466 HSM_1198 HSM_1199     TRUE 0.839 5.000 0.000 1.000   NA
 6798466 6798467 HSM_1199 HSM_1200     FALSE 0.078 128.000 0.000 1.000   NA
 6798467 6798468 HSM_1200 HSM_1201     TRUE 0.942 5.000 0.082 1.000 N NA
 6798468 6798469 HSM_1201 HSM_1202     FALSE 0.007 226.000 0.000 1.000 N NA
 6798469 6798470 HSM_1202 HSM_1203     FALSE 0.390 106.000 0.115 1.000 N NA
 6798471 6798472 HSM_1204 HSM_1205     TRUE 0.975 62.000 0.613 NA   NA
 6798472 6798473 HSM_1205 HSM_1206     TRUE 0.971 6.000 0.187 1.000 N NA
 6798473 6798474 HSM_1206 HSM_1207     TRUE 0.983 -3.000 0.172 NA   NA
 6798475 6798476 HSM_1208 HSM_1209     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6798476 6798477 HSM_1209 HSM_1210     TRUE 0.868 61.000 0.075 NA Y NA
 6798477 6798478 HSM_1210 HSM_1211     FALSE 0.340 48.000 0.000 NA N NA
 6798479 6798480 HSM_1212 HSM_1213     FALSE 0.007 479.000 0.000 1.000   NA
 6798480 6798481 HSM_1213 HSM_1214     FALSE 0.031 131.000 0.000 1.000 N NA
 6798481 6798482 HSM_1214 HSM_1215     TRUE 0.728 25.000 0.030 1.000 N NA
 6798483 6798484 HSM_1216 HSM_1217     TRUE 0.991 11.000 0.209 NA Y NA
 6798484 6798485 HSM_1217 HSM_1218     TRUE 0.995 2.000 0.464 NA   NA
 6798485 6798486 HSM_1218 HSM_1219   rplM FALSE 0.012 269.000 0.000 1.000   NA
 6798486 6798487 HSM_1219 HSM_1220 rplM rpsI TRUE 0.998 17.000 0.601 0.021 Y NA
 6798487 6798488 HSM_1220 HSM_1221 rpsI   FALSE 0.073 145.000 0.014 NA N NA
 6798488 6798489 HSM_1221 HSM_1222     TRUE 0.998 8.000 0.831 NA   NA
 6798493 6798494 HSM_1226 HSM_1227     FALSE 0.350 105.000 0.062 NA N NA
 6798494 6798495 HSM_1227 HSM_1228     TRUE 0.999 -3.000 0.864 NA Y NA
 6798495 6798496 HSM_1228 HSM_1229     TRUE 0.958 20.000 0.091 1.000 Y NA
 6798496 6798497 HSM_1229 HSM_1230     TRUE 0.785 80.000 0.083 1.000 Y NA
 6798497 6798498 HSM_1230 HSM_1231     TRUE 0.996 43.000 0.852 0.015 Y NA
 6798498 6798499 HSM_1231 HSM_1232     TRUE 0.993 38.000 0.741 NA Y NA
 6798499 6798500 HSM_1232 HSM_1233     TRUE 0.940 63.000 0.226 NA Y NA
 6798502 6798503 HSM_1235 HSM_1236     TRUE 0.994 9.000 0.227 0.015 Y NA
 6798503 6798504 HSM_1236 HSM_1237     FALSE 0.366 102.000 0.000 1.000 Y NA
 6798504 6798505 HSM_1237 HSM_1238   ulaD TRUE 0.995 11.000 0.333 1.000 Y NA
 6798505 6798506 HSM_1238 HSM_1239 ulaD   TRUE 0.967 17.000 0.080 1.000 Y NA
 6798506 6798507 HSM_1239 HSM_1240   sgbE TRUE 0.996 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 6798510 6798511 HSM_1243 HSM_1244     TRUE 0.844 20.000 0.023 1.000   NA
 6798511 6798512 HSM_1244 HSM_1245     TRUE 0.490 38.000 0.000 1.000   NA
 6798512 6798513 HSM_1245 HSM_1246     TRUE 0.728 21.000 0.000 NA   NA
 6798513 6798514 HSM_1246 HSM_1247     TRUE 0.668 25.000 0.000 NA   NA
 6798514 6798515 HSM_1247 HSM_1248     FALSE 0.423 94.000 0.000 1.000 Y NA
 6798515 6798516 HSM_1248 HSM_1249     TRUE 0.992 0.000 0.303 0.037 N NA
 6798516 6798517 HSM_1249 HSM_1250     TRUE 0.748 157.000 0.374 0.037 Y NA
 6798517 6798518 HSM_1250 HSM_1251     FALSE 0.010 191.000 0.000 1.000 N NA
 6798520 6798521 HSM_1253 HSM_1254 purU   TRUE 0.718 62.000 0.064 1.000   NA
 6798522 6798523 HSM_1255 HSM_1256     FALSE 0.055 125.000 0.000 NA N NA
 6798523 6798524 HSM_1256 HSM_1257     FALSE 0.006 589.000 0.000 1.000   NA
 6798526 6798527 HSM_1259 HSM_1260     TRUE 0.985 -10.000 0.269 1.000 N NA
 6798527 6798528 HSM_1260 HSM_1261     FALSE 0.102 146.000 0.039 1.000 N NA
 6798528 6798529 HSM_1261 HSM_1262     FALSE 0.162 108.000 0.000 NA   NA
 6798529 6798530 HSM_1262 HSM_1263     FALSE 0.260 122.000 0.038 NA   NA
 6798530 6798531 HSM_1263 HSM_1264     FALSE 0.470 60.000 0.000 NA   NA
 6798531 6798532 HSM_1264 HSM_1266     FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 6798533 6798534 HSM_1267 HSM_1268     FALSE 0.171 85.000 0.000 NA N NA
 6798534 6798535 HSM_1268 HSM_1269     FALSE 0.003 364.000 0.000 1.000 N NA
 6798535 6798536 HSM_1269 HSM_1270   tnaA TRUE 0.951 66.000 0.308 1.000 Y NA
 6798536 6798537 HSM_1270 HSM_1271 tnaA   FALSE 0.009 322.000 0.000 1.000   NA
 6798537 6798538 HSM_1271 HSM_1272     TRUE 0.970 68.000 0.634 1.000   NA
 6798539 6798540 HSM_1273 HSM_1274     FALSE 0.133 113.000 0.000 NA   NA
 6798541 6798542 HSM_1275 HSM_1276     FALSE 0.311 268.000 0.240 0.030 Y NA
 6798542 6798543 HSM_1276 HSM_1277     FALSE 0.025 187.000 0.000 1.000   NA
 6798544 6798545 HSM_1278 HSM_1279   hemA FALSE 0.159 111.000 0.005 1.000   NA
 6798548 6798549 HSM_1282 HSM_1283   lolA TRUE 0.774 66.000 0.167 1.000 N NA
 6798550 6798551 HSM_1284 HSM_1285     FALSE 0.124 117.000 0.000 NA   NA
 6798553 6798554 HSM_1287 HSM_R0053     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 6798554 6798555 HSM_R0053 HSM_1288     FALSE 0.046 166.000 0.000 NA   NA
 6798555 6798556 HSM_1288 HSM_1289   nusA TRUE 0.997 15.000 0.759 NA   NA
 6798556 6798557 HSM_1289 HSM_1290 nusA infB TRUE 0.972 21.000 0.342 1.000 N NA
 6798557 6798558 HSM_1290 HSM_1291 infB rbfA TRUE 0.518 254.000 0.530 1.000 Y NA
 6798558 6798559 HSM_1291 HSM_1292 rbfA truB TRUE 0.994 13.000 0.318 1.000 Y NA
 6798560 6798561 HSM_1293 HSM_1294     FALSE 0.008 206.000 0.000 1.000 N NA
 6798561 6798562 HSM_1294 HSM_1295     TRUE 0.945 12.000 0.042 NA   NA
 6798562 6798563 HSM_1295 HSM_1296     TRUE 0.922 4.000 0.012 NA   NA
 6798564 6798565 HSM_1297 HSM_1298   glnD TRUE 0.878 58.000 0.243 1.000 N NA
 6798565 6798566 HSM_1298 HSM_1299 glnD ribH FALSE 0.149 79.000 0.000 1.000 N NA
 6798566 6798567 HSM_1299 HSM_1300 ribH nusB TRUE 0.988 9.000 0.347 1.000 N NA
 6798567 6798568 HSM_1300 HSM_1301 nusB   TRUE 0.973 15.000 0.225 1.000 N NA
 6798568 6798569 HSM_1301 HSM_1302     TRUE 0.973 10.000 0.206 1.000 N NA
 6798569 6798570 HSM_1302 HSM_1303     TRUE 0.866 13.000 0.024 1.000 N NA
 6798570 6798571 HSM_1303 HSM_1304     TRUE 0.912 19.000 0.007 1.000 Y NA
 6798571 6798572 HSM_1304 HSM_1305     FALSE 0.015 167.000 0.000 1.000 N NA
 6798572 6798573 HSM_1305 HSM_1306     TRUE 0.953 11.000 0.056 NA   NA
 6798574 6798575 HSM_1307 HSM_1308     FALSE 0.109 145.000 0.044 1.000 N NA
 6798575 6798576 HSM_1308 HSM_1309     FALSE 0.270 43.000 0.000 1.000 N NA
 6798576 6798577 HSM_1309 HSM_1310   trpA FALSE 0.056 110.000 0.000 1.000 N NA
 6798577 6798578 HSM_1310 HSM_1311 trpA   TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 6798578 6798579 HSM_1311 HSM_1312     TRUE 0.995 10.000 0.221 0.002 Y NA
 6798579 6798580 HSM_1312 HSM_1313   trpD TRUE 0.993 13.000 0.293 1.000 Y NA
 6798580 6798581 HSM_1313 HSM_1314 trpD   TRUE 0.886 45.000 0.083 1.000 Y NA
 6798581 6798582 HSM_1314 HSM_1315     TRUE 0.999 10.000 0.703 0.001 Y NA
 6798583 6798584 HSM_1316 HSM_1317     FALSE 0.042 184.000 0.027 1.000 N NA
 6798588 6798589 HSM_1321 HSM_1322     FALSE 0.317 82.000 0.000 NA   NA
 6798589 6798590 HSM_1322 HSM_1323     TRUE 0.930 1.000 0.013 NA   NA
 6798590 6798591 HSM_1323 HSM_1324     TRUE 0.998 0.000 0.688 0.097 N NA
 6798592 6798593 HSM_1325 HSM_1326   queF TRUE 0.956 13.000 0.079 NA   NA
 6798593 6798594 HSM_1326 HSM_1327 queF   TRUE 0.929 16.000 0.038 NA   NA
 6798595 6798596 HSM_1328 HSM_1329     TRUE 0.996 -15.000 0.518 NA   NA
 6798596 6798597 HSM_1329 HSM_1330     TRUE 0.858 27.000 0.058 NA   NA
 6798597 6798598 HSM_1330 HSM_1331     FALSE 0.127 150.000 0.024 NA   NA
 6798600 6798601 HSM_1333 HSM_1334     FALSE 0.090 95.000 0.000 1.000 N NA
 6798601 6798602 HSM_1334 HSM_1335     TRUE 0.867 15.000 0.003 NA   NA
 6798602 6798603 HSM_1335 HSM_1336   pheT TRUE 0.870 15.000 0.003 NA   NA
 6798603 6798604 HSM_1336 HSM_1337 pheT ihfA TRUE 0.979 3.000 0.208 1.000 N NA
 6798606 6798607 HSM_1339 HSM_1340     TRUE 0.892 67.000 0.143 NA Y NA
 6798607 6798608 HSM_1340 HSM_1341   mukB TRUE 0.999 0.000 0.750 0.001 Y NA
 6798608 6798609 HSM_1341 HSM_1342 mukB   FALSE 0.410 68.000 0.000 NA   NA
 6798609 6798610 HSM_1342 HSM_1344     TRUE 0.859 9.000 0.000 NA   NA
 6798610 6798611 HSM_1344 HSM_1345     TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 6798611 6798612 HSM_1345 HSM_1346     FALSE 0.153 110.000 0.000 NA   NA
 6798612 6798613 HSM_1346 HSM_1347     FALSE 0.153 110.000 0.000 NA   NA
 6798613 6798614 HSM_1347 HSM_1348     TRUE 0.527 43.000 0.000 NA   NA
 6798614 6798615 HSM_1348 HSM_1349     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 6798615 6798616 HSM_1349 HSM_1350   sbcB TRUE 0.527 43.000 0.000 NA   NA
 6798616 6798617 HSM_1350 HSM_1351 sbcB   FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 6798620 6798621 HSM_1354 HSM_1355 rplT rpmI TRUE 0.995 71.000 0.928 0.021 Y NA
 6798621 6798622 HSM_1355 HSM_1356 rpmI infC TRUE 0.957 99.000 0.652 1.000 Y NA
 6798623 6798624 HSM_1357 HSM_1358     TRUE 0.836 151.000 0.619 1.000 Y NA
 6798625 6798626 HSM_1359 HSM_1360     TRUE 0.991 -10.000 0.383 1.000 N NA
 6798626 6798627 HSM_1360 HSM_1361     FALSE 0.130 83.000 0.000 1.000 N NA
 6798627 6798628 HSM_1361 HSM_1362     FALSE 0.146 105.000 0.000 1.000   NA
 6798628 6798629 HSM_1362 HSM_1363   pepN FALSE 0.284 80.000 0.000 1.000   NA
 6798629 6798630 HSM_1363 HSM_1364 pepN   FALSE 0.059 109.000 0.000 1.000 N NA
 6798630 6798631 HSM_1364 HSM_1365   glgA TRUE 0.695 122.000 0.228 1.000 Y NA
 6798631 6798632 HSM_1365 HSM_1366 glgA glgC TRUE 0.964 49.000 0.307 1.000 Y NA
 6798632 6798633 HSM_1366 HSM_1367 glgC   TRUE 0.942 59.000 0.228 1.000 Y NA
 6798633 6798634 HSM_1367 HSM_1368     TRUE 0.966 26.000 0.098 0.002 Y NA
 6798634 6798635 HSM_1368 HSM_1369     TRUE 0.998 12.000 0.429 0.003 Y NA
 6798635 6798636 HSM_1369 HSM_1370     FALSE 0.259 110.000 0.019 NA   NA
 6798636 6798637 HSM_1370 HSM_1371     FALSE 0.262 90.000 0.000 NA   NA
 6798637 6798638 HSM_1371 HSM_1372     TRUE 0.861 0.000 0.000 1.000   NA
 6798638 6798639 HSM_1372 HSM_1373     FALSE 0.021 196.000 0.000 1.000   NA
 6798641 6798642 HSM_1375 HSM_1376     TRUE 0.999 -7.000 0.840 NA   NA
 6798642 6798643 HSM_1376 HSM_1377     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 6798644 6798645 HSM_1378 HSM_1379     TRUE 0.998 2.000 0.600 1.000 Y NA
 6798647 6798648 HSM_1381 HSM_1382     TRUE 0.959 16.000 0.177 1.000 N NA
 6798648 6798649 HSM_1382 HSM_1383     TRUE 0.964 33.000 0.246 1.000 Y NA
 6798649 6798650 HSM_1383 HSM_1384     FALSE 0.017 258.000 0.000 NA   NA
 6798650 6798651 HSM_1384 HSM_1385     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 6798655 6798656 HSM_1389 HSM_1390     TRUE 0.997 8.000 0.323 0.005 Y NA
 6798657 6798658 HSM_1391 HSM_1392     FALSE 0.008 213.000 0.000 1.000 N NA
 6798658 6798659 HSM_1392 HSM_1393     FALSE 0.005 281.000 0.000 1.000 N NA
 6798659 6798660 HSM_1393 HSM_1394     TRUE 0.931 -34.000 0.056 1.000 N NA
 6798660 6798661 HSM_1394 HSM_1395     TRUE 0.984 13.000 0.262 1.000   NA
 6798662 6798663 HSM_1396 HSM_1397     TRUE 0.970 5.000 0.133 1.000   NA
 6798663 6798664 HSM_1397 HSM_1398     FALSE 0.008 338.000 0.000 1.000   NA
 6798664 6798665 HSM_1398 HSM_1399     TRUE 0.999 17.000 0.700 0.001 Y NA
 6798666 6798667 HSM_1400 HSM_1401     FALSE 0.184 104.000 0.000 NA   NA
 6798667 6798668 HSM_1401 HSM_1402     TRUE 0.975 -3.000 0.118 NA   NA
 6798668 6798669 HSM_1402 HSM_1403   pdxA TRUE 0.829 11.000 0.000 1.000   NA
 6798670 6798671 HSM_1404 HSM_1405     TRUE 0.961 90.000 0.459 0.012 Y NA
 6798672 6798673 HSM_1406 HSM_1407     TRUE 0.999 0.000 0.688 0.002 Y NA
 6798673 6798674 HSM_1407 HSM_1408     FALSE 0.053 111.000 0.000 1.000 N NA
 6798674 6798675 HSM_1408 HSM_1409     FALSE 0.343 83.000 0.024 1.000 N NA
 6798676 6798677 HSM_1410 HSM_1411     FALSE 0.324 69.000 0.008 1.000 N NA
 6798677 6798678 HSM_1411 HSM_1412     FALSE 0.292 75.000 0.008 1.000 N NA
 6798679 6798680 HSM_1413 HSM_1414 pgi alr TRUE 0.744 28.000 0.045 1.000 N NA
 6798680 6798681 HSM_1414 HSM_1415 alr   TRUE 0.980 17.000 0.317 1.000 N NA
 6798681 6798682 HSM_1415 HSM_1416     FALSE 0.046 152.000 0.010 1.000 N NA
 6798682 6798683 HSM_1416 HSM_1417     FALSE 0.287 107.000 0.058 1.000 N NA
 6798683 6798684 HSM_1417 HSM_1418     TRUE 0.977 -3.000 0.125 0.050 N NA
 6798684 6798685 HSM_1418 HSM_1419     TRUE 0.952 21.000 0.175 0.050 N NA
 6798685 6798686 HSM_1419 HSM_1420     FALSE 0.097 170.000 0.080 1.000 N NA
 6798686 6798687 HSM_1420 HSM_1421     FALSE 0.112 112.000 0.011 1.000 N NA
 6798687 6798688 HSM_1421 HSM_1422     TRUE 0.952 14.000 0.089 1.000   NA
 6798688 6798689 HSM_1422 HSM_1423     TRUE 0.955 -16.000 0.059 1.000   NA
 6798689 6798690 HSM_1423 HSM_1424     TRUE 0.868 15.000 0.009 1.000   NA
 6798690 6798691 HSM_1424 HSM_1425   prfA TRUE 0.513 52.000 0.003 1.000   NA
 6798691 6798692 HSM_1425 HSM_1426 prfA   TRUE 0.490 38.000 0.000 1.000   NA
 6798692 6798693 HSM_1426 HSM_1427     FALSE 0.108 124.000 0.000 NA   NA
 6798693 6798694 HSM_1427 HSM_1428     TRUE 0.980 24.000 0.417 NA   NA
 6798694 6798695 HSM_1428 HSM_1429     TRUE 0.961 6.000 0.075 NA   NA
 6798697 6798698 HSM_1431 HSM_1432     TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 6798698 6798699 HSM_1432 HSM_1433     TRUE 0.908 54.000 0.136 1.000 Y NA
 6798699 6798700 HSM_1433 HSM_1434   sucA TRUE 0.971 89.000 0.667 1.000 Y NA
 6798701 6798702 HSM_1435 HSM_1436   nrdB FALSE 0.027 138.000 0.000 1.000 N NA
 6798702 6798703 HSM_1436 HSM_1437 nrdB   FALSE 0.458 66.000 0.023 1.000 N NA
 6798704 6798705 HSM_1438 HSM_1439     FALSE 0.013 178.000 0.000 1.000 N NA
 6798706 6798707 HSM_1440 HSM_1441     TRUE 0.989 -10.000 0.321 1.000 N NA
 6798707 6798708 HSM_1441 HSM_1442     TRUE 0.975 -3.000 0.116 NA   NA
 6798708 6798709 HSM_1442 HSM_1443     FALSE 0.007 609.000 0.000 NA   NA
 6798709 6798710 HSM_1443 HSM_1444     TRUE 0.873 -55.000 0.000 NA   NA
 6798710 6798711 HSM_1444 HSM_1445     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA N NA
 6798711 6798712 HSM_1445 HSM_1446     TRUE 0.998 -7.000 0.750 NA   NA
 6798714 6798715 HSM_1448 HSM_1449     FALSE 0.025 199.000 0.000 NA   NA
 6798715 6798716 HSM_1449 HSM_1450     TRUE 0.961 -10.000 0.075 1.000   NA
 6798717 6798718 HSM_1451 HSM_1452     TRUE 0.996 10.000 0.576 NA   NA
 6798718 6798719 HSM_1452 HSM_1453   ihfB TRUE 0.553 120.000 0.208 NA   NA
 6798719 6798720 HSM_1453 HSM_1454 ihfB rpsA TRUE 0.885 64.000 0.292 1.000 N NA
 6798720 6798721 HSM_1454 HSM_1455 rpsA   TRUE 0.854 73.000 0.281 1.000 N NA
 6798721 6798722 HSM_1455 HSM_1456   lpxD FALSE 0.249 53.000 0.000 1.000 N NA
 6798722 6798723 HSM_1456 HSM_1457 lpxD   TRUE 0.999 0.000 0.814 1.000 Y NA
 6798723 6798724 HSM_1457 HSM_1458     TRUE 0.904 97.000 0.354 1.000 Y NA
 6798724 6798725 HSM_1458 HSM_1459     TRUE 0.911 69.000 0.204 1.000 Y NA
 6798725 6798726 HSM_1459 HSM_1460     TRUE 0.935 9.000 0.080 1.000 N NA
 6798726 6798727 HSM_1460 HSM_1461     TRUE 0.995 13.000 0.400 1.000 Y NA
 6798727 6798728 HSM_1461 HSM_1462     FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 6798728 6798729 HSM_1462 HSM_1463     TRUE 0.884 2.000 0.000 NA   NA
 6798729 6798730 HSM_1463 HSM_1464   frr FALSE 0.472 71.000 0.032 1.000 N NA
 6798730 6798731 HSM_1464 HSM_1465 frr pyrH FALSE 0.246 54.000 0.000 1.000 N NA
 6798731 6798732 HSM_1465 HSM_1466 pyrH   FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 6798733 6798734 HSM_1467 HSM_1468     TRUE 0.562 79.000 0.031 NA   NA
 6798734 6798735 HSM_1468 HSM_1469     TRUE 0.829 47.000 0.168 1.000 N NA
 6798736 6798737 HSM_1470 HSM_1471     TRUE 0.638 47.000 0.012 NA   NA
 6798738 6798739 HSM_1472 HSM_1473     FALSE 0.261 103.000 0.008 NA   NA
 6798740 6798741 HSM_1474 HSM_1475   ipk TRUE 0.922 8.000 0.053 1.000 N NA
 6798741 6798742 HSM_1475 HSM_1476 ipk lolB TRUE 0.971 0.000 0.157 1.000 N NA
 6798743 6798744 HSM_1477 HSM_1478   greA FALSE 0.015 279.000 0.000 NA   NA
 6798745 6798746 HSM_1479 HSM_1480     FALSE 0.066 117.000 0.000 NA N NA
 6798747 6798748 HSM_1481 HSM_1482     TRUE 0.749 20.000 0.000 NA   NA
 6798748 6798749 HSM_1482 HSM_1483     TRUE 0.947 -3.000 0.026 NA   NA
 6798749 6798750 HSM_1483 HSM_1484     FALSE 0.007 601.000 0.000 NA   NA
 6798751 6798752 HSM_1485 HSM_1486     TRUE 0.827 32.000 0.009 1.000 Y NA
 6798752 6798753 HSM_1486 HSM_1487   thiP TRUE 0.997 -7.000 0.522 0.018 N NA
 6798753 6798754 HSM_1487 HSM_1488 thiP   TRUE 0.998 2.000 0.697 0.049 N NA
 6798754 6798755 HSM_1488 HSM_1489     FALSE 0.006 540.000 0.000 1.000   NA
 6798755 6798756 HSM_1489 HSM_1490     TRUE 0.928 25.000 0.154 NA   NA
 6798757 6798758 HSM_1491 HSM_1492     TRUE 0.781 48.000 0.059 NA   NA
 6798759 6798760 HSM_1493 HSM_1494     TRUE 0.977 1.000 0.128 NA   NA
 6798761 6798762 HSM_1495 HSM_1496     TRUE 0.999 0.000 0.790 0.029   NA
 6798763 6798764 HSM_1497 HSM_R0054     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 6798764 6798765 HSM_R0054 HSM_R0055     TRUE 0.512 47.000 0.000 NA   NA
 6798765 6798766 HSM_R0055 HSM_R0056     TRUE 0.627 28.000 0.000 NA   NA
 6798766 6798767 HSM_R0056 HSM_R0057     TRUE 0.866 6.000 0.000 NA   NA
 6798767 6798768 HSM_R0057 HSM_1498   rlmL FALSE 0.050 161.000 0.000 NA   NA
 6798768 6798769 HSM_1498 HSM_1499 rlmL   FALSE 0.261 46.000 0.000 1.000 N NA
 6798769 6798770 HSM_1499 HSM_1500     TRUE 0.969 10.000 0.075 0.061   NA
 6798771 6798772 HSM_1501 HSM_1502     FALSE 0.014 302.000 0.023 1.000 N NA
 6798772 6798773 HSM_1502 HSM_1503     TRUE 0.983 -3.000 0.234 1.000 N NA
 6798774 6798775 HSM_1504 HSM_1505 nagA nagB TRUE 0.999 13.000 0.557 0.001 Y NA
 6798775 6798776 HSM_1505 HSM_1506 nagB   FALSE 0.007 232.000 0.000 1.000 N NA
 6798776 6798777 HSM_1506 HSM_1507   moaD TRUE 0.999 1.000 0.501 0.005 Y NA
 6798777 6798778 HSM_1507 HSM_1508 moaD   TRUE 0.981 22.000 0.175 0.005 Y NA
 6798778 6798779 HSM_1508 HSM_1509   moaA TRUE 0.983 10.000 0.039 0.005 Y NA
 6798781 6798782 HSM_1511 HSM_1512 cysB   FALSE 0.213 62.000 0.000 1.000 N NA
 6798782 6798783 HSM_1512 HSM_1513     FALSE 0.075 102.000 0.000 1.000 N NA
 6798783 6798784 HSM_1513 HSM_1514     FALSE 0.152 143.000 0.000 1.000 Y NA
 6798785 6798786 HSM_1515 HSM_1516     TRUE 0.999 10.000 0.755 0.095 Y NA
 6798787 6798788 HSM_1517 HSM_1518     FALSE 0.051 172.000 0.028 1.000 N NA
 6798788 6798789 HSM_1518 HSM_1519     TRUE 0.774 36.000 0.091 1.000 N NA
 6798792 6798793 HSM_1522 HSM_1523     TRUE 0.655 26.000 0.000 NA   NA
 6798793 6798794 HSM_1523 HSM_1524     FALSE 0.046 166.000 0.000 NA   NA
 6798794 6798795 HSM_1524 HSM_1525     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 6798795 6798796 HSM_1525 HSM_1526     FALSE 0.019 246.000 0.000 NA   NA
 6798798 6798799 HSM_1528 HSM_1529     TRUE 0.919 17.000 0.076 NA N NA
 6798799 6798800 HSM_1529 HSM_1530     TRUE 0.476 59.000 0.000 NA   NA
 6798800 6798801 HSM_1530 HSM_1531   hemH TRUE 0.871 -159.000 0.000 NA   NA
 6798801 6798802 HSM_1531 HSM_1532 hemH   FALSE 0.024 143.000 0.000 1.000 N NA
 6798803 6798804 HSM_1533 HSM_1534     TRUE 0.676 20.000 0.008 1.000 N NA
 6798804 6798805 HSM_1534 HSM_1535   nrdR TRUE 0.987 3.000 0.277 NA N NA
 6798805 6798806 HSM_1535 HSM_1536 nrdR   FALSE 0.032 150.000 0.000 NA N NA
 6798806 6798807 HSM_1536 HSM_1537     TRUE 0.999 11.000 0.915 NA Y NA
 6798807 6798808 HSM_1537 HSM_1538     TRUE 0.917 8.000 0.035 NA N NA
 6798808 6798809 HSM_1538 HSM_1539     FALSE 0.028 137.000 0.000 1.000 N NA
 6798810 6798811 HSM_1540 HSM_1541     TRUE 0.914 22.000 0.118 1.000   NA
 6798813 6798814 HSM_1543 HSM_1544     TRUE 0.999 4.000 0.564 0.029 Y NA
 6798814 6798815 HSM_1544 HSM_1545     TRUE 0.998 4.000 0.537 0.029 Y NA
 6798815 6798816 HSM_1545 HSM_1546   rnfD TRUE 0.999 17.000 0.814 0.029 Y NA
 6798816 6798817 HSM_1546 HSM_1547 rnfD   TRUE 1.000 -3.000 0.924 0.029 Y NA
 6798817 6798818 HSM_1547 HSM_1548     TRUE 1.000 -3.000 0.908 0.029 Y NA
 6798818 6798819 HSM_1548 HSM_1549     TRUE 0.959 -3.000 0.109 1.000 N NA
 6798819 6798820 HSM_1549 HSM_1550     TRUE 0.602 35.000 0.005 1.000   NA
 6798820 6798821 HSM_1550 HSM_1551     TRUE 0.543 31.000 0.000 1.000   NA
 6798821 6798822 HSM_1551 HSM_1552     TRUE 0.936 -36.000 0.000 0.007   NA
 6798823 6798824 HSM_1553 HSM_1554     TRUE 0.998 -22.000 0.840 NA   NA
 6798825 6798826 HSM_1555 HSM_1556     TRUE 0.857 80.000 0.304 NA N NA
 6798826 6798827 HSM_1556 HSM_1557     TRUE 0.658 65.000 0.033 NA   NA
 6798827 6798828 HSM_1557 HSM_1558     TRUE 0.922 77.000 0.372 NA   NA
 6798828 6798829 HSM_1558 HSM_1559     TRUE 0.714 76.000 0.089 NA   NA
 6798829 6798830 HSM_1559 HSM_1560     FALSE 0.161 102.000 0.000 1.000   NA
 6798832 6798833 HSM_1562 HSM_R0058     FALSE 0.008 466.000 0.000 NA   NA
 6798833 6798834 HSM_R0058 HSM_1563     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 6798835 6798836 HSM_1564 HSM_1565     TRUE 0.971 -9.000 0.100 NA   NA
 6798837 6798838 HSM_1566 HSM_1567     TRUE 0.971 4.000 0.109 NA   NA
 6798838 6798839 HSM_1567 HSM_1568   mutL TRUE 0.926 16.000 0.092 1.000 N NA
 6798839 6798840 HSM_1568 HSM_1569 mutL miaA TRUE 0.984 -3.000 0.188 0.094 N NA
 6798840 6798841 HSM_1569 HSM_1570 miaA   FALSE 0.294 85.000 0.000 NA   NA
 6798841 6798842 HSM_1570 HSM_1571     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6798844 6798845 HSM_1573 HSM_1574   potA FALSE 0.018 159.000 0.000 1.000 N NA
 6798845 6798846 HSM_1574 HSM_1575 potA potB TRUE 0.999 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 6798846 6798847 HSM_1575 HSM_1576 potB potC TRUE 0.996 0.000 0.286 0.036 Y NA
 6798847 6798848 HSM_1576 HSM_1577 potC   FALSE 0.253 164.000 0.024 0.036 Y NA
 6798849 6798850 HSM_1578 HSM_1579     TRUE 0.710 3.000 0.000 1.000 N NA
 6798851 6798852 HSM_1580 HSM_1581     TRUE 0.578 51.000 0.004 NA   NA
 6798852 6798853 HSM_1581 HSM_1582     FALSE 0.103 126.000 0.000 NA   NA
 6798853 6798854 HSM_1582 HSM_1583     FALSE 0.293 37.000 0.000 1.000 N NA
 6798855 6798856 HSM_1584 HSM_1585     TRUE 0.965 20.000 0.258 NA N NA
 6798856 6798857 HSM_1585 HSM_1586     TRUE 0.993 13.000 0.453 NA   NA
 6798857 6798858 HSM_1586 HSM_1587     TRUE 0.942 52.000 0.308 NA   NA
 6798858 6798859 HSM_1587 HSM_1588     TRUE 0.914 36.000 0.188 NA   NA
 6798859 6798860 HSM_1588 HSM_1589     TRUE 0.983 32.000 0.562 NA   NA
 6798860 6798861 HSM_1589 HSM_1590     TRUE 0.998 -3.000 0.530 NA Y NA
 6798862 6798863 HSM_1591 HSM_1592     TRUE 0.995 -19.000 0.459 NA   NA
 6798863 6798864 HSM_1592 HSM_1593     TRUE 0.995 15.000 0.543 NA   NA
 6798864 6798865 HSM_1593 HSM_1594     TRUE 0.920 3.000 0.017 1.000   NA
 6798865 6798866 HSM_1594 HSM_1595     TRUE 0.983 3.000 0.186 NA   NA
 6798869 6798870 HSM_1598 HSM_1599     TRUE 0.998 4.000 0.800 NA   NA
 6798870 6798871 HSM_1599 HSM_1600     FALSE 0.041 172.000 0.000 NA   NA
 6798871 6798872 HSM_1600 HSM_1601     TRUE 0.971 12.000 0.146 1.000   NA
 6798872 6798873 HSM_1601 HSM_1602     TRUE 0.910 10.000 0.012 NA   NA
 6798873 6798874 HSM_1602 HSM_1603     TRUE 0.969 47.000 0.313 NA Y NA
 6798875 6798876 HSM_1604 HSM_1605     FALSE 0.197 189.000 0.254 1.000 N NA
 6798876 6798877 HSM_1605 HSM_1606     TRUE 0.972 61.000 0.275 0.002 Y NA
 6798877 6798878 HSM_1606 HSM_1607   panF FALSE 0.004 305.000 0.000 1.000 N NA
 6798878 6798879 HSM_1607 HSM_1608 panF prmA TRUE 0.927 1.000 0.041 1.000 N NA
 6798879 6798880 HSM_1608 HSM_1609 prmA   FALSE 0.150 187.000 0.042 1.000 Y NA
 6798880 6798881 HSM_1609 HSM_1610   fis TRUE 0.971 -6.000 0.161 1.000 N NA
 6798882 6798883 HSM_1611 HSM_1612     FALSE 0.344 214.000 0.171 0.003 Y NA
 6798883 6798884 HSM_1612 HSM_1613   eno FALSE 0.004 287.000 0.000 1.000 N NA
 6798885 6798886 HSM_1614 HSM_1615     TRUE 0.979 -7.000 0.104 0.053   NA
 6798886 6798887 HSM_1615 HSM_1616     TRUE 0.947 6.000 0.000 NA Y NA
 6798887 6798888 HSM_1616 HSM_1617     TRUE 0.495 90.000 0.000 NA Y NA
 6798888 6798889 HSM_1617 HSM_1618     TRUE 0.651 13.000 0.000 1.000 N NA
 6798889 6798890 HSM_1618 HSM_1619     FALSE 0.246 54.000 0.000 1.000 N NA
 6798890 6798891 HSM_1619 HSM_1620     FALSE 0.019 307.000 0.000 0.053   NA
 6798891 6798892 HSM_1620 HSM_1621     TRUE 0.796 22.000 0.000 0.053   NA
 6798893 6798894 HSM_1622 HSM_1623     FALSE 0.171 106.000 0.000 NA   NA
 6798897 6798898 HSM_1626 HSM_1627     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 6798898 6798899 HSM_1627 HSM_1628     FALSE 0.100 127.000 0.000 NA   NA
 6798899 6798900 HSM_1628 HSM_1629     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 6798900 6798901 HSM_1629 HSM_1630     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6798904 6798905 HSM_1633 HSM_1634     FALSE 0.007 661.000 0.000 NA   NA
 6798905 6798906 HSM_1634 HSM_1635     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798906 6798907 HSM_1635 HSM_1636     TRUE 0.881 3.000 0.000 NA   NA
 6798907 6798908 HSM_1636 HSM_1637     FALSE 0.410 68.000 0.000 NA   NA
 6798908 6798909 HSM_1637 HSM_1638     TRUE 0.869 5.000 0.000 NA   NA
 6798909 6798910 HSM_1638 HSM_1639     FALSE 0.007 917.000 0.000 NA   NA
 6798910 6798911 HSM_1639 HSM_1640     FALSE 0.012 311.000 0.000 NA   NA
 6798911 6798912 HSM_1640 HSM_1641     TRUE 0.859 9.000 0.000 NA   NA
 6798912 6798913 HSM_1641 HSM_1642     FALSE 0.062 150.000 0.000 NA   NA
 6798913 6798914 HSM_1642 HSM_1643     TRUE 0.884 2.000 0.000 NA   NA
 6798914 6798915 HSM_1643 HSM_1644     FALSE 0.013 295.000 0.000 NA   NA
 6798915 6798916 HSM_1644 HSM_1645     FALSE 0.018 252.000 0.000 NA   NA
 6798916 6798917 HSM_1645 HSM_1646     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 6798917 6798918 HSM_1646 HSM_1647     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 6798918 6798919 HSM_1647 HSM_1648     TRUE 0.824 16.000 0.000 NA   NA
 6798919 6798920 HSM_1648 HSM_1649     TRUE 0.887 0.000 0.000 NA   NA
 6798920 6798921 HSM_1649 HSM_1650     TRUE 0.943 39.000 0.286 NA   NA
 6798921 6798922 HSM_1650 HSM_1651     TRUE 0.869 5.000 0.000 NA   NA
 6798922 6798923 HSM_1651 HSM_1652     TRUE 0.874 -31.000 0.000 NA   NA
 6798923 6798924 HSM_1652 HSM_1653     TRUE 0.880 -12.000 0.000 NA   NA
 6798924 6798925 HSM_1653 HSM_1654     FALSE 0.008 465.000 0.000 NA   NA
 6798926 6798927 HSM_1655 HSM_1656     TRUE 0.971 9.000 0.145 1.000   NA
 6798927 6798928 HSM_1656 HSM_1657     TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 6798928 6798929 HSM_1657 HSM_1658     FALSE 0.146 105.000 0.000 1.000   NA
 6798929 6798930 HSM_1658 HSM_1659     TRUE 0.943 4.000 0.000 1.000 Y NA
 6798930 6798931 HSM_1659 HSM_1660     TRUE 0.956 -3.000 0.000 NA Y NA
 6798931 6798932 HSM_1660 HSM_1661     TRUE 0.493 66.000 0.021 NA N NA
 6798933 6798934 HSM_1662 HSM_1663 purT   TRUE 0.866 -22.000 0.016 1.000 N NA
 6798936 6798937 HSM_1665 HSM_1666     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 6798937 6798938 HSM_1666 HSM_1667     FALSE 0.009 420.000 0.000 NA   NA
 6798940 6798941 HSM_1669 HSM_1670     FALSE 0.079 137.000 0.000 NA   NA
 6798943 6798944 HSM_1672 HSM_1673     TRUE 0.886 1.000 0.000 NA   NA
 6798944 6798945 HSM_1673 HSM_1674     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 6798945 6798946 HSM_1674 HSM_1675     FALSE 0.047 165.000 0.000 NA   NA
 6798946 6798947 HSM_1675 HSM_1676     FALSE 0.008 533.000 0.000 NA   NA
 6798950 6798951 HSM_1679 HSM_1680     FALSE 0.042 399.000 0.000 0.006 Y NA
 6798952 6798953 HSM_1681 HSM_1682     FALSE 0.387 73.000 0.000 NA   NA
 6798953 6798954 HSM_1682 HSM_1683     FALSE 0.073 140.000 0.000 NA   NA
 6798954 6798955 HSM_1683 HSM_1684     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 6798955 6798956 HSM_1684 HSM_1685     FALSE 0.126 116.000 0.000 NA   NA
 6798956 6798957 HSM_1685 HSM_1686     FALSE 0.353 78.000 0.000 NA   NA
 6798957 6798958 HSM_1686 HSM_1687     FALSE 0.208 99.000 0.000 NA   NA
 6798958 6798959 HSM_1687 HSM_1688     TRUE 0.973 72.000 0.667 NA   NA
 6798960 6798961 HSM_1689 HSM_1690     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 6798961 6798962 HSM_1690 HSM_1691     TRUE 0.962 18.000 0.167 NA   NA
 6798962 6798963 HSM_1691 HSM_1692     TRUE 0.928 21.000 0.111 NA   NA
 6798963 6798964 HSM_1692 HSM_1693     FALSE 0.023 216.000 0.000 NA   NA
 6798964 6798965 HSM_1693 HSM_1694     TRUE 0.728 21.000 0.000 NA   NA
 6798966 6798967 HSM_1695 HSM_1696     TRUE 0.861 11.000 0.000 NA   NA
 6798967 6798968 HSM_1696 HSM_1697     TRUE 0.882 -10.000 0.000 NA   NA
 6798968 6798969 HSM_1697 HSM_1698     TRUE 0.977 0.000 0.125 NA   NA
 6798969 6798970 HSM_1698 HSM_1699     TRUE 0.992 3.000 0.312 NA   NA
 6798970 6798971 HSM_1699 HSM_1700     TRUE 0.999 13.000 1.000 NA   NA
 6798971 6798972 HSM_1700 HSM_1701     TRUE 0.987 12.000 0.263 NA   NA
 6798972 6798973 HSM_1701 HSM_1702     TRUE 0.990 0.000 0.263 NA   NA
 6798973 6798974 HSM_1702 HSM_1703     TRUE 0.997 4.000 0.600 NA   NA
 6798974 6798975 HSM_1703 HSM_1704     TRUE 0.986 23.000 0.500 NA   NA
 6798975 6798976 HSM_1704 HSM_1705     TRUE 0.837 15.000 0.000 NA   NA
 6798976 6798977 HSM_1705 HSM_1706     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 6798979 6798980 HSM_1708 HSM_1709     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 6798980 6798981 HSM_1709 HSM_1710     TRUE 0.997 -7.000 0.600 NA   NA
 6798981 6798982 HSM_1710 HSM_1711     TRUE 0.994 0.000 0.400 NA   NA
 6798982 6798983 HSM_1711 HSM_1712     TRUE 0.996 3.000 0.500 NA   NA
 6798983 6798984 HSM_1712 HSM_1713     TRUE 0.998 -21.000 0.667 NA   NA
 6798984 6798985 HSM_1713 HSM_1714     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 6798985 6798986 HSM_1714 HSM_1715     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 6798986 6798987 HSM_1715 HSM_1716     FALSE 0.133 113.000 0.000 NA   NA
 6798987 6798988 HSM_1716 HSM_1717     FALSE 0.335 80.000 0.000 NA   NA
 6798988 6798989 HSM_1717 HSM_1718     TRUE 0.655 26.000 0.000 NA   NA
 6798989 6798990 HSM_1718 HSM_1719     FALSE 0.171 106.000 0.000 NA   NA
 6798990 6798991 HSM_1719 HSM_1720     FALSE 0.007 818.000 0.000 NA   NA
 6798991 6798992 HSM_1720 HSM_1721     FALSE 0.051 160.000 0.000 NA   NA
 6798995 6798996 HSM_1724 HSM_1725     FALSE 0.035 182.000 0.000 NA   NA
 6798996 6798997 HSM_1725 HSM_1726     TRUE 0.994 15.000 0.500 NA   NA
 6799000 6799001 HSM_1729 HSM_1730     FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 6799001 6799002 HSM_1730 HSM_1731     FALSE 0.003 369.000 0.000 1.000 N NA
 6799002 6799003 HSM_1731 HSM_1732     FALSE 0.012 308.000 0.000 NA   NA
 6799007 6799008 HSM_1736 HSM_1737     FALSE 0.284 39.000 0.000 1.000 N NA
 6799008 6799009 HSM_1737 HSM_1738     TRUE 0.689 23.000 0.000 NA   NA
 6799009 6799010 HSM_1738 HSM_1739     FALSE 0.022 219.000 0.000 NA   NA
 6799010 6799011 HSM_1739 HSM_1740     FALSE 0.033 172.000 0.000 1.000   NA
 6799012 6799013 HSM_1741 HSM_1742     TRUE 0.740 39.000 0.029 NA   NA
 6799013 6799014 HSM_1742 HSM_1743     TRUE 0.556 37.000 0.000 NA   NA
 6799015 6799016 HSM_1744 HSM_1745     FALSE 0.002 593.000 0.000 1.000 N NA
 6799016 6799017 HSM_1745 HSM_1746     FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 6799017 6799018 HSM_1746 HSM_1747     TRUE 0.995 9.000 0.500 NA   NA
 6799018 6799019 HSM_1747 HSM_1748     FALSE 0.037 179.000 0.000 NA   NA
 6799019 6799020 HSM_1748 HSM_1749     FALSE 0.053 159.000 0.000 NA   NA
 6799020 6799021 HSM_1749 HSM_1750     TRUE 0.998 -7.000 0.667 NA   NA
 6799021 6799022 HSM_1750 HSM_1751     TRUE 0.986 9.000 0.200 0.051   NA
 6799022 6799023 HSM_1751 HSM_1752     TRUE 0.980 12.000 0.250 1.000 N NA
 6799023 6799024 HSM_1752 HSM_R0059     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6799024 6799025 HSM_R0059 HSM_1753     FALSE 0.019 240.000 0.000 NA   NA
 6799025 6799026 HSM_1753 HSM_1754     TRUE 0.997 13.000 0.631 0.057   NA
 6799027 6799028 HSM_1755 HSM_1756     FALSE 0.005 273.000 0.000 1.000 N NA
 6799029 6799030 HSM_1757 HSM_1758 glpC   TRUE 0.997 11.000 0.547 0.002 N NA
 6799030 6799031 HSM_1758 HSM_1759   glpA TRUE 0.998 -16.000 0.650 0.002 N NA
 6799032 6799033 HSM_1760 HSM_1761   glpQ TRUE 0.691 114.000 0.396 1.000 N NA
 6799034 6799035 HSM_1762 HSM_1763 ruvC   TRUE 0.586 129.000 0.277 NA   NA
 6799035 6799036 HSM_1763 HSM_1764   ntpA TRUE 0.952 2.000 0.035 NA   NA
 6799036 6799037 HSM_1764 HSM_1765 ntpA   FALSE 0.058 154.000 0.000 NA   NA
 6799037 6799038 HSM_1765 HSM_1766     TRUE 0.976 -7.000 0.124 NA   NA
 6799039 6799040 HSM_1767 HSM_1768     TRUE 0.904 67.000 0.184 1.000 Y NA
 6799040 6799041 HSM_1768 HSM_1769     FALSE 0.006 250.000 0.000 1.000 N NA
 6799041 6799042 HSM_1769 HSM_1770     TRUE 0.576 88.000 0.136 1.000 N NA
 6799043 6799044 HSM_1771 HSM_1772     TRUE 0.951 16.000 0.154 1.000 N NA
 6799046 6799047 HSM_1774 HSM_1775 uvrD   FALSE 0.065 148.000 0.000 NA   NA
 6799047 6799048 HSM_1775 HSM_1776     TRUE 0.960 -7.000 0.051 NA   NA
 6799051 6799052 HSM_1779 HSM_1780     FALSE 0.010 303.000 0.000 1.000   NA
 6799053 6799054 HSM_1781 HSM_1782 rimI   TRUE 0.970 4.000 0.121 1.000   NA
 6799054 6799055 HSM_1782 HSM_1783     FALSE 0.013 178.000 0.000 1.000 N NA
 6799055 6799056 HSM_1783 HSM_1784     FALSE 0.030 289.000 0.000 1.000 Y NA
 6799056 6799057 HSM_1784 HSM_1785     TRUE 1.000 0.000 0.947 0.011 Y NA
 6799057 6799058 HSM_1785 HSM_1786     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 6799058 6799059 HSM_1786 HSM_1787     FALSE 0.199 113.000 0.040 1.000 N NA
 6799059 6799060 HSM_1787 HSM_1788     TRUE 0.916 15.000 0.023 NA   NA
 6799060 6799061 HSM_1788 HSM_1789     TRUE 0.937 -3.000 0.017 NA   NA
 6799061 6799062 HSM_1789 HSM_1790     TRUE 0.890 16.000 0.013 NA   NA
 6799065 6799066 HSM_1793 HSM_1794     FALSE 0.007 653.000 0.000 NA   NA
 6799067 6799068 HSM_1795 HSM_1796     TRUE 0.999 12.000 0.804 NA Y NA
 6799068 6799069 HSM_1796 HSM_1797     TRUE 0.999 -3.000 0.790 NA Y NA
 6799069 6799070 HSM_1797 HSM_1798     TRUE 0.987 0.000 0.220 NA   NA
 6799070 6799071 HSM_1798 HSM_1799     TRUE 0.918 69.000 0.310 NA   NA
 6799073 6799074 HSM_1801 HSM_1802     TRUE 0.975 2.000 0.182 1.000 N NA
 6799074 6799075 HSM_1802 HSM_1803     TRUE 0.670 51.000 0.057 1.000 N NA
 6799076 6799077 HSM_1804 HSM_1805     TRUE 0.893 61.000 0.217 NA   NA
 6799078 6799079 HSM_1806 HSM_1807     TRUE 0.978 72.000 0.400 0.001 Y NA
 6799079 6799080 HSM_1807 HSM_1808     TRUE 0.961 90.000 0.579 1.000 Y NA
 6799080 6799081 HSM_1808 HSM_1809   rpsL TRUE 0.929 131.000 0.620 0.004 Y NA
 6799081 6799082 HSM_1809 HSM_1810 rpsL hslO FALSE 0.018 159.000 0.000 1.000 N NA
 6799082 6799083 HSM_1810 HSM_1811 hslO   TRUE 0.782 56.000 0.140 1.000 N NA
 6799084 6799085 HSM_1812 HSM_1813     TRUE 0.952 0.000 0.085 1.000 N NA
 6799085 6799086 HSM_1813 HSM_1814     TRUE 0.933 51.000 0.188 1.000 Y NA
 6799086 6799087 HSM_1814 HSM_1815     TRUE 0.582 33.000 0.000 NA   NA
 6799087 6799088 HSM_1815 HSM_1816     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6799088 6799089 HSM_1816 HSM_1817     FALSE 0.015 169.000 0.000 1.000 N NA
 6799089 6799090 HSM_1817 HSM_1818     TRUE 0.896 20.000 0.042 NA   NA
 6799091 6799092 HSM_1819 HSM_1820     TRUE 0.950 26.000 0.220 NA   NA
 6799092 6799093 HSM_1820 HSM_1821     TRUE 0.942 0.000 0.005 0.064   NA
 6799093 6799094 HSM_1821 HSM_1822     FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 6799094 6799095 HSM_1822 HSM_1823     FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 6799096 6799097 HSM_1824 HSM_1826     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 6799098 6799099 HSM_1827 HSM_1828   trmB TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 6799100 6799101 HSM_1829 HSM_1830     TRUE 0.968 3.000 0.150 1.000 N NA
 6799101 6799102 HSM_1830 HSM_1831   mltC TRUE 0.926 7.000 0.043 NA N NA
 6799102 6799103 HSM_1831 HSM_1832 mltC   FALSE 0.129 95.000 0.000 NA N NA
 6799105 6799106 HSM_1834 HSM_1835     TRUE 0.994 15.000 0.263 0.027 Y NA
 6799106 6799107 HSM_1835 HSM_1836   torD TRUE 0.982 -3.000 0.108 0.027   NA
 6799108 6799109 HSM_1837 HSM_1838 mnmA   TRUE 0.570 35.000 0.000 NA   NA
 6799109 6799110 HSM_1838 HSM_1839     TRUE 0.541 40.000 0.000 NA   NA
 6799110 6799111 HSM_1839 HSM_1840     TRUE 0.967 10.000 0.113 NA   NA
 6799111 6799112 HSM_1840 HSM_1841     TRUE 0.609 16.000 0.000 1.000 N NA
 6799112 6799113 HSM_1841 HSM_1842     FALSE 0.071 103.000 0.000 1.000 N NA
 6799113 6799114 HSM_1842 HSM_1843     TRUE 0.998 15.000 0.551 0.003 Y NA
 6799114 6799115 HSM_1843 HSM_1844     TRUE 0.994 4.000 0.188 0.003 Y NA
 6799115 6799116 HSM_1844 HSM_1845     TRUE 0.997 0.000 0.312 0.003 Y NA
 6799116 6799117 HSM_1845 HSM_1846     TRUE 0.999 -7.000 0.603 0.003 Y NA
 6799117 6799118 HSM_1846 HSM_1847     TRUE 1.000 3.000 0.854 0.003 Y NA
 6799118 6799119 HSM_1847 HSM_1848     FALSE 0.005 328.000 0.000 NA N NA
 6799119 6799120 HSM_1848 HSM_1849   atpC FALSE 0.015 189.000 0.000 NA N NA
 6799120 6799121 HSM_1849 HSM_1850 atpC   TRUE 0.996 43.000 0.837 0.004 Y NA
 6799121 6799122 HSM_1850 HSM_1851     TRUE 0.999 14.000 0.724 0.004 Y NA
 6799122 6799123 HSM_1851 HSM_1852     TRUE 0.998 24.000 0.846 0.004 Y NA
 6799123 6799124 HSM_1852 HSM_1853     TRUE 0.999 13.000 0.864 0.004 Y NA
 6799124 6799125 HSM_1853 HSM_1854     TRUE 0.994 14.000 0.242 0.004 Y NA
 6799125 6799126 HSM_1854 HSM_1855     TRUE 0.985 65.000 0.666 0.004   NA
 6799126 6799127 HSM_1855 HSM_1856     TRUE 0.942 99.000 0.557 0.004   NA
 6799127 6799128 HSM_1856 HSM_1857   gidB FALSE 0.003 512.000 0.000 1.000 N NA
 6799128 6799129 HSM_1857 HSM_1858 gidB   TRUE 0.993 0.000 0.466 1.000 N NA
 6799129 6799130 HSM_1858 HSM_1859     FALSE 0.003 380.000 0.000 1.000 N NA
 6799130 6799131 HSM_1859 HSM_1860     TRUE 0.706 67.000 0.057 NA   NA
 6799133 6799134 HSM_1862 HSM_1863   cyaY TRUE 0.926 0.000 0.030 NA N NA
 6799135 6799136 HSM_1864 HSM_1865     TRUE 0.899 22.000 0.071 NA   NA
 6799136 6799137 HSM_1865 HSM_1866     FALSE 0.013 264.000 0.000 1.000   NA
 6799139 6799140 HSM_R0060 HSM_R0061     FALSE 0.363 77.000 0.000 NA   NA
 6799140 6799141 HSM_R0061 HSM_R0062     FALSE 0.030 188.000 0.000 NA   NA
 6799141 6799142 HSM_R0062 HSM_R0063     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6799143 6799144 HSM_1868 HSM_1869     FALSE 0.041 277.000 0.000 NA Y NA
 6799145 6799146 HSM_1870 HSM_1871     TRUE 0.911 11.000 0.000 0.050   NA
 6799146 6799147 HSM_1871 HSM_1872     TRUE 0.875 4.000 0.000 NA   NA
 6799148 6799149 HSM_1874 HSM_1875     FALSE 0.009 377.000 0.000 NA   NA
 6799150 6799151 HSM_1876 HSM_1877     FALSE 0.310 83.000 0.000 NA   NA
 6799151 6799152 HSM_1877 HSM_1878     TRUE 0.999 -16.000 1.000 NA   NA
 6799153 6799154 HSM_1879 HSM_1880     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 6799154 6799155 HSM_1880 HSM_1881     TRUE 0.873 -40.000 0.000 NA   NA
 6799155 6799156 HSM_1881 HSM_1882     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 6799157 6799158 HSM_1883 HSM_1884     FALSE 0.032 187.000 0.000 NA   NA
 6799158 6799159 HSM_1884 HSM_1886     FALSE 0.084 134.000 0.000 NA   NA
 6799159 6799160 HSM_1886 HSM_1887     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 6799160 6799161 HSM_1887 HSM_1888     FALSE 0.008 460.000 0.000 NA   NA
 6799161 6799162 HSM_1888 HSM_1889     TRUE 0.997 -3.000 0.600 1.000   NA
 6799164 6799165 HSM_1891 HSM_1892     TRUE 0.956 11.000 0.083 1.000   NA
 6799165 6799166 HSM_1892 HSM_R0064     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 6799166 6799167 HSM_R0064 HSM_R0065     TRUE 0.864 7.000 0.000 NA   NA
 6799167 6799168 HSM_R0065 HSM_1893     FALSE 0.009 455.000 0.000 NA   NA
 6799171 6799172 HSM_1896 HSM_1897   aroE FALSE 0.030 133.000 0.000 1.000 N NA
 6799172 6799173 HSM_1897 HSM_1898 aroE   TRUE 0.954 4.000 0.087 NA N NA
 6799173 6799174 HSM_1898 HSM_1899     TRUE 0.971 -3.000 0.137 NA N NA
 6799175 6799176 HSM_1900 HSM_1901     TRUE 0.987 0.000 0.263 NA N NA
 6799178 6799179 HSM_1903 HSM_1904     TRUE 0.994 2.000 0.419 NA   NA
 6799179 6799180 HSM_1904 HSM_1905     TRUE 0.972 -3.000 0.096 NA   NA
 6799180 6799181 HSM_1905 HSM_1906     TRUE 0.994 3.000 0.265 1.000 Y NA
 6799181 6799182 HSM_1906 HSM_1907     TRUE 0.911 15.000 0.020 NA   NA
 6799182 6799183 HSM_1907 HSM_1908     TRUE 0.984 2.000 0.190 NA   NA
 6799183 6799184 HSM_1908 HSM_1909     FALSE 0.355 145.000 0.182 NA   NA
 6799184 6799185 HSM_1909 HSM_1910     TRUE 0.984 16.000 0.186 1.000 Y NA
 6799185 6799186 HSM_1910 HSM_1911     FALSE 0.002 609.000 0.000 1.000 N NA
 6799186 6799187 HSM_1911 HSM_1912     TRUE 0.978 -13.000 0.143 NA   NA
 6799189 6799190 HSM_1914 HSM_1915     TRUE 0.836 29.000 0.118 1.000 N NA
 6799190 6799191 HSM_1915 HSM_1916     TRUE 0.954 65.000 0.294 NA Y NA
 6799191 6799192 HSM_1916 HSM_1917     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 6799192 6799193 HSM_1917 HSM_1918     FALSE 0.011 187.000 0.000 1.000 N NA
 6799193 6799194 HSM_1918 HSM_1919     TRUE 0.991 -3.000 0.086 0.001 Y NA
 6799194 6799195 HSM_1919 HSM_1920     TRUE 0.951 -13.000 0.046 1.000   NA
 6799195 6799196 HSM_1920 HSM_1921     FALSE 0.247 126.000 0.055 1.000   NA
 6799196 6799197 HSM_1921 HSM_1922     FALSE 0.051 112.000 0.000 1.000 N NA
 6799197 6799198 HSM_1922 HSM_1923     FALSE 0.015 188.000 0.000 NA N NA
 6799198 6799199 HSM_1923 HSM_1924     TRUE 0.987 53.000 0.571 NA Y NA
 6799199 6799200 HSM_1924 HSM_1925     TRUE 0.999 -16.000 0.667 0.013 Y NA
 6799200 6799201 HSM_1925 HSM_1926     TRUE 1.000 3.000 1.000 0.013 Y NA
 6799201 6799202 HSM_1926 HSM_1927     TRUE 0.931 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6799205 6799206 HSM_1930 HSM_1931 mscL trkA FALSE 0.382 85.000 0.035 1.000 N NA
 6799206 6799207 HSM_1931 HSM_1932 trkA   TRUE 0.581 85.000 0.122 1.000 N NA
 6799207 6799208 HSM_1932 HSM_1933   fmt TRUE 0.995 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 6799208 6799209 HSM_1933 HSM_1934 fmt def TRUE 0.854 75.000 0.058 0.030 Y NA
 6799209 6799210 HSM_1934 HSM_1935 def   FALSE 0.011 187.000 0.000 1.000 N NA
 6799210 6799211 HSM_1935 HSM_1936   cyaA TRUE 0.925 15.000 0.082 1.000 N NA
 6799212 6799213 HSM_1937 HSM_1938 hemC   TRUE 0.993 15.000 0.205 0.002 Y NA
 6799213 6799214 HSM_1938 HSM_1939     TRUE 0.990 36.000 0.600 1.000 Y NA
 6799214 6799215 HSM_1939 HSM_1940     TRUE 0.982 15.000 0.144 1.000 Y NA
 6799216 6799217 HSM_1941 HSM_1942     FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000 N NA
 6799217 6799218 HSM_1942 HSM_1943     TRUE 0.796 33.000 0.100 1.000 N NA
 6799219 6799220 HSM_1944 HSM_1945     TRUE 0.999 9.000 0.818 1.000 Y NA
 6799220 6799221 HSM_1945 HSM_1946     TRUE 0.999 -3.000 0.788 0.013 Y NA
 6799221 6799222 HSM_1946 HSM_1947     TRUE 0.963 113.000 0.844 NA Y NA
 6799222 6799223 HSM_1947 HSM_1948     TRUE 0.976 19.000 0.156 NA Y NA
 6799223 6799224 HSM_1948 HSM_1949     TRUE 0.706 66.000 0.070 1.000   NA
 6799224 6799225 HSM_1949 HSM_1950     TRUE 0.900 -7.000 0.007 1.000   NA
 6799225 6799226 HSM_1950 HSM_1951     FALSE 0.006 262.000 0.000 1.000 N NA
 6799226 6799227 HSM_1951 HSM_1952   rplC TRUE 0.994 17.000 0.307 0.026 Y NA
 6799227 6799228 HSM_1952 HSM_1953 rplC rplD TRUE 0.997 16.000 0.486 0.019 Y NA
 6799228 6799229 HSM_1953 HSM_1954 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.019 Y NA
 6799229 6799230 HSM_1954 HSM_1955 rplW rplB TRUE 0.998 21.000 0.849 0.023 Y NA
 6799230 6799231 HSM_1955 HSM_1956 rplB rpsS TRUE 0.997 27.000 0.820 0.026 Y NA
 6799231 6799232 HSM_1956 HSM_1957 rpsS rplV TRUE 0.999 11.000 0.769 0.026 Y NA
 6799232 6799233 HSM_1957 HSM_1958 rplV rpsC TRUE 0.999 17.000 0.719 0.026 Y NA
 6799233 6799234 HSM_1958 HSM_1959 rpsC rplP TRUE 0.999 14.000 0.828 0.026 Y NA
 6799234 6799235 HSM_1959 HSM_1960 rplP   TRUE 0.983 0.000 0.029 0.026 Y NA
 6799235 6799236 HSM_1960 HSM_1961     TRUE 0.983 0.000 0.029 0.026 Y NA
 6799236 6799237 HSM_1961 HSM_1962     FALSE 0.009 197.000 0.000 1.000 N NA
 6799237 6799238 HSM_1962 HSM_1963   rplN FALSE 0.009 197.000 0.000 1.000 N NA
 6799238 6799239 HSM_1963 HSM_1964 rplN rplX TRUE 0.999 13.000 0.810 0.026 Y NA
 6799239 6799240 HSM_1964 HSM_1965 rplX rplE TRUE 0.999 18.000 0.758 0.019 Y NA
 6799240 6799241 HSM_1965 HSM_1966 rplE   TRUE 0.998 12.000 0.496 0.019 Y NA
 6799241 6799242 HSM_1966 HSM_1967   rpsH TRUE 0.989 37.000 0.473 0.019 Y NA
 6799242 6799243 HSM_1967 HSM_1968 rpsH rplF TRUE 0.999 17.000 0.808 0.019 Y NA
 6799243 6799244 HSM_1968 HSM_1969 rplF rplR TRUE 0.999 14.000 0.815 0.019 Y NA
 6799244 6799245 HSM_1969 HSM_1970 rplR rpsE TRUE 0.999 16.000 0.814 0.026 Y NA
 6799245 6799246 HSM_1970 HSM_1971 rpsE rpmD TRUE 0.999 4.000 0.789 0.026 Y NA
 6799246 6799247 HSM_1971 HSM_1972 rpmD rplO TRUE 0.999 5.000 0.653 0.003 Y NA
 6799247 6799248 HSM_1972 HSM_1973 rplO secY TRUE 0.997 8.000 0.730 1.000 N NA
 6799248 6799249 HSM_1973 HSM_1974 secY rpmJ TRUE 0.861 28.000 0.089 1.000   NA
 6799249 6799250 HSM_1974 HSM_1975 rpmJ rpsM TRUE 0.474 144.000 0.194 0.019   NA
 6799250 6799251 HSM_1975 HSM_1976 rpsM   TRUE 0.999 16.000 0.810 0.019 Y NA
 6799251 6799252 HSM_1976 HSM_1977   rpsD TRUE 0.993 30.000 0.509 0.026 Y NA
 6799252 6799253 HSM_1977 HSM_1978 rpsD   TRUE 0.974 33.000 0.549 1.000 N NA
 6799253 6799254 HSM_1978 HSM_1979   rplQ TRUE 0.988 42.000 0.873 1.000 N NA
 6799255 6799256 HSM_1980 HSM_1981     TRUE 0.971 5.000 0.137 1.000   NA
 6799256 6799257 HSM_1981 HSM_1982     FALSE 0.473 74.000 0.007 NA   NA
 6799258 6799259 HSM_1983 HSM_1984 ribB recO FALSE 0.007 231.000 0.000 1.000 N NA
 6799259 6799260 HSM_1984 HSM_1985 recO rumA TRUE 0.649 21.000 0.008 1.000 N NA
 6799260 6799261 HSM_1985 HSM_1986 rumA   TRUE 0.936 12.000 0.082 1.000 N NA
 6799261 6799262 HSM_1986 HSM_1987     TRUE 0.758 31.000 0.059 1.000 N NA
 6799264 6799265 HSM_1989 HSM_1990     TRUE 0.895 27.000 0.110 NA   NA
 6799265 6799266 HSM_1990 HSM_1991     TRUE 0.998 2.000 0.514 NA Y NA
 6799266 6799267 HSM_1991 HSM_1992   fabG TRUE 0.997 0.000 0.397 NA Y NA
 6799267 6799268 HSM_1992 HSM_1993 fabG   TRUE 0.973 64.000 0.486 1.000 Y NA
 6799268 6799269 HSM_1993 HSM_1994     FALSE 0.044 168.000 0.000 NA   NA
 6799269 6799270 HSM_1994 HSM_1995     TRUE 0.997 -24.000 0.636 NA   NA
 6799270 6799271 HSM_1995 HSM_1996     TRUE 0.949 4.000 0.047 1.000   NA
 6799271 6799272 HSM_1996 HSM_1997     TRUE 0.959 16.000 0.032 0.001   NA
 6799272 6799273 HSM_1997 HSM_1998     TRUE 0.649 85.000 0.019 NA Y NA
 6799273 6799274 HSM_1998 HSM_1999     TRUE 0.884 -7.000 0.000 NA   NA
 6799274 6799275 HSM_1999 HSM_2000     TRUE 0.998 -7.000 0.758 NA   NA
 6799275 6799276 HSM_2000 HSM_2001     TRUE 0.953 -3.000 0.034 NA   NA
 6799276 6799277 HSM_2001 HSM_2002     TRUE 0.954 -3.000 0.036 NA   NA
 6799277 6799278 HSM_2002 HSM_2003     TRUE 0.678 24.000 0.000 NA   NA
 6799278 6799279 HSM_2003 HSM_2004     FALSE 0.335 80.000 0.000 NA   NA
 6799279 6799280 HSM_2004 HSM_2005     TRUE 0.996 11.000 0.532 NA   NA
 6799280 6799281 HSM_2005 HSM_2006     TRUE 0.998 9.000 0.732 NA   NA
 6799282 6799283 HSM_2007 HSM_2008     TRUE 0.708 26.000 0.029 1.000 N NA
 6799283 6799284 HSM_2008 HSM_2009     FALSE 0.214 96.000 0.017 1.000 N NA
 6799284 6799285 HSM_2009 HSM_2010     TRUE 0.981 0.000 0.218 1.000 N NA
 6799285 6799286 HSM_2010 HSM_2011     FALSE 0.018 190.000 0.005 1.000 N NA
 6799286 6799287 HSM_2011 HSM_2012     FALSE 0.011 222.000 0.000 NA N NA
 6799287 6799288 HSM_2012 HSM_2013     FALSE 0.473 61.000 0.013 NA N NA
 6799288 6799289 HSM_2013 HSM_2014     FALSE 0.376 149.000 0.219 1.000   NA
 6799290 6799291 HSM_2015 HSM_2016     FALSE 0.020 153.000 0.000 1.000 N NA
 6799292 6799293 HSM_2017 HSM_2018 trmE   TRUE 0.841 86.000 0.221 0.055   NA
 6799293 6799294 HSM_2018 HSM_2019     TRUE 0.995 0.000 0.461 NA   NA
 6799294 6799295 HSM_2019 HSM_2020   rnpA TRUE 0.996 -36.000 0.540 NA   NA
 6799295 6799296 HSM_2020 HSM_2021 rnpA rpmH TRUE 0.997 15.000 0.787 1.000   NA