MicrobesOnline Operon Predictions for Coxiella burnetii RSA 493

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
221057	221058	CBU_0001	CBU_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.927	144.000	0.328	1.000	Y	NA
221058	221059	CBU_0002	CBU_0003	dnaN	recF	TRUE	0.998	5.000	0.318	1.000	Y	NA
221059	221060	CBU_0003	CBU_0004	recF	gyrB	TRUE	0.706	296.000	0.249	0.009	Y	NA
221060	221062	CBU_0004	CBU_0006	gyrB		FALSE	0.323	130.000	0.000	1.000	Y	NA
5437792	221063	CBU_0006a	CBU_0007			FALSE	0.048	139.000	0.000	NA		NA
221063	5437793	CBU_0007	CBU_0007a			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221064	5437794	CBU_0008	CBU_0008a			FALSE	0.074	102.000	0.000	NA		NA
5437794	221065	CBU_0008a	CBU_0009		dacB	TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
221065	221066	CBU_0009	CBU_0010	dacB	aroE	TRUE	0.810	-7.000	0.000	1.000	N	NA
221066	221067	CBU_0010	CBU_0011	aroE		FALSE	0.082	89.000	0.000	NA		NA
221068	221070	CBU_0012	CBU_0014			FALSE	0.015	267.000	0.000	NA		NA
221071	221072	CBU_0015	CBU_0016		xapA	TRUE	0.867	2.000	0.000	NA	N	NA
221072	221073	CBU_0016	CBU_0017	xapA	deoC	TRUE	0.991	-3.000	0.083	1.000	Y	NA
221073	221074	CBU_0017	CBU_0018	deoC		FALSE	0.082	84.000	0.000	NA		NA
221075	221076	CBU_0019	CBU_0020			TRUE	0.574	8.000	0.000	NA		NA
221077	221078	CBU_0021	CBU_0022			FALSE	0.019	238.000	0.000	NA		NA
221079	221080	CBU_0023	CBU_0024		csrA-1	FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
221080	221081	CBU_0024	CBU_0025	csrA-1		FALSE	0.080	96.000	0.000	NA		NA
221081	221082	CBU_0025	CBU_0026		rpiA	FALSE	0.042	147.000	0.000	NA		NA
221082	221083	CBU_0026	CBU_0027	rpiA		FALSE	0.145	142.000	0.000	1.000	N	NA
221083	5437795	CBU_0027	CBU_0027a			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
5437795	221084	CBU_0027a	CBU_0029			FALSE	0.344	-33.000	0.000	NA		NA
221084	221085	CBU_0029	CBU_0030			TRUE	0.870	-13.000	0.000	1.000	Y	NA
221085	221086	CBU_0030	CBU_0031			FALSE	0.084	99.000	0.000	1.000		NA
221088	221089	CBU_0033	CBU_0034			TRUE	0.938	4.000	0.014	1.000		NA
221089	221090	CBU_0034	CBU_0035			TRUE	0.978	23.000	0.405	1.000		NA
221090	221091	CBU_0035	CBU_0036			TRUE	0.999	-3.000	0.852	NA	Y	NA
221091	221092	CBU_0036	CBU_0037		fabA	TRUE	0.976	4.000	0.009	NA	Y	NA
221093	221094	CBU_0038	CBU_0039		prlC	FALSE	0.238	81.000	0.000	1.000	N	NA
5437797	221096	CBU_0040a	CBU_0041			FALSE	0.070	105.000	0.000	NA		NA
221096	221097	CBU_0041	CBU_0042		hemH	FALSE	0.078	99.000	0.000	NA		NA
221098	221099	CBU_0043	CBU_0044			FALSE	0.069	107.000	0.000	NA		NA
221100	2209955	CBU_0045	CBU_0046			FALSE	0.099	48.000	0.000	NA		NA
2209955	2209956	CBU_0046	CBU_0047			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
2209956	221101	CBU_0047	CBU_0048			FALSE	0.414	-16.000	0.000	NA		NA
221101	221102	CBU_0048	CBU_0049			FALSE	0.132	36.000	0.000	NA		NA
221102	221103	CBU_0049	CBU_0050			FALSE	0.027	193.000	0.000	NA		NA
221103	221104	CBU_0050	CBU_0051			FALSE	0.220	25.000	0.000	NA		NA
221106	221107	CBU_0053	CBU_0054			FALSE	0.084	70.000	0.000	NA		NA
221107	221108	CBU_0054	CBU_0055		ubiA	TRUE	0.995	-7.000	0.248	NA	Y	NA
221108	221109	CBU_0055	CBU_0056	ubiA		FALSE	0.199	112.000	0.000	1.000	N	NA
221109	221110	CBU_0056	CBU_0057			FALSE	0.099	48.000	0.000	NA		NA
221110	221111	CBU_0057	CBU_0058			FALSE	0.116	40.000	0.000	NA		NA
221111	221112	CBU_0058	CBU_0059			FALSE	0.366	-21.000	0.000	NA		NA
221112	221113	CBU_0059	CBU_0060			FALSE	0.046	142.000	0.000	NA		NA
221113	221115	CBU_0060	CBU_0062			FALSE	0.272	21.000	0.000	NA		NA
221117	221118	CBU_0064	CBU_0065	parE		FALSE	0.089	189.000	0.000	NA	N	NA
221118	5437798	CBU_0065	CBU_0065a			FALSE	0.093	51.000	0.000	NA		NA
221119	221120	CBU_0066	CBU_0067			FALSE	0.222	209.000	0.034	NA		NA
221120	221121	CBU_0067	CBU_0068			TRUE	0.964	-3.000	0.053	NA		NA
221121	5437799	CBU_0068	CBU_0068a			FALSE	0.082	88.000	0.000	NA		NA
221122	221125	CBU_0069	CBU_0072			FALSE	0.085	66.000	0.000	NA		NA
221126	221127	CBU_0073	CBU_0074			FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
221128	221129	CBU_0075	CBU_0076	ubiH	visC	TRUE	0.997	-13.000	0.474	0.002	Y	NA
221129	221130	CBU_0076	CBU_0077	visC		FALSE	0.064	115.000	0.000	NA		NA
221130	221132	CBU_0077	CBU_0079			FALSE	0.031	176.000	0.000	NA		NA
221132	221134	CBU_0079	CBU_0081		proS	FALSE	0.141	36.000	0.000	1.000		NA
221134	221136	CBU_0081	CBU_0083	proS		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221136	221137	CBU_0083	CBU_0084			FALSE	0.051	135.000	0.000	NA		NA
221137	221138	CBU_0084	CBU_0085			FALSE	0.018	254.000	0.000	1.000		NA
221138	221139	CBU_0085	CBU_0086			FALSE	0.524	11.000	0.000	1.000		NA
221139	221140	CBU_0086	CBU_0087			FALSE	0.428	15.000	0.000	0.069		NA
221140	2209957	CBU_0087	CBU_0088			FALSE	0.033	169.000	0.000	NA		NA
2209957	221141	CBU_0088	CBU_0089			FALSE	0.411	14.000	0.000	NA		NA
221141	5437800	CBU_0089	CBU_0089a			FALSE	0.058	122.000	0.000	NA		NA
5437800	221142	CBU_0089a	CBU_0090		tolB	FALSE	0.019	239.000	0.000	NA		NA
221142	221143	CBU_0090	CBU_0091	tolB		TRUE	0.997	10.000	0.592	1.000	N	NA
221143	221144	CBU_0091	CBU_0092		ybgF	TRUE	0.985	-13.000	0.278	1.000		NA
221144	221145	CBU_0092	CBU_0093	ybgF		TRUE	0.968	3.000	0.059	1.000		NA
221145	221146	CBU_0093	CBU_0094		clpB	FALSE	0.089	313.000	0.000	1.000	Y	NA
221146	221147	CBU_0094	CBU_0095	clpB		TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221148	5437801	CBU_0096	CBU_0095a	clS		TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
221149	221150	CBU_0097	CBU_0098	pssA	nadC	TRUE	0.874	0.000	0.000	1.000	N	NA
221150	5437802	CBU_0098	CBU_0098a	nadC		FALSE	0.388	15.000	0.000	NA		NA
2209958	2209959	CBU_tRNA-Glu-1	CBU_tRNA-Ala-1			FALSE	0.104	45.000	0.000	NA		NA
5437803	221151	CBU_0098b	CBU_0099		sixA	FALSE	0.517	-9.000	0.000	NA		NA
221151	221152	CBU_0099	CBU_0100	sixA		TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
221153	221154	CBU_0101	CBU_0102	nadB		FALSE	0.059	121.000	0.000	NA		NA
221154	221155	CBU_0102	CBU_0103			FALSE	0.139	35.000	0.000	NA		NA
221155	5437804	CBU_0103	CBU_0103a			FALSE	0.081	78.000	0.000	NA		NA
221156	221157	CBU_0106	CBU_0107			FALSE	0.012	306.000	0.000	NA		NA
221157	221158	CBU_0107	CBU_0108			TRUE	0.735	23.000	0.000	1.000	Y	NA
221158	221159	CBU_0108	CBU_0109			TRUE	0.881	12.000	0.000	NA	Y	NA
221161	221162	CBU_0111	CBU_0112	kbl	tdh	TRUE	0.972	42.000	0.547	1.000	N	NA
221164	221165	CBU_0114	CBU_0115		mraZ	FALSE	0.037	158.000	0.000	NA		NA
221165	221166	CBU_0115	CBU_0116	mraZ		TRUE	0.997	6.000	0.635	NA		NA
221166	221167	CBU_0116	CBU_0117		ftsL	TRUE	0.994	-3.000	0.227	1.000	N	NA
221167	221168	CBU_0117	CBU_0118	ftsL	pbpB	TRUE	0.986	-7.000	0.153	1.000	N	NA
221169	221171	CBU_0119	CBU_0121			FALSE	0.054	129.000	0.000	NA		NA
221172	221173	CBU_0122	CBU_0123		murE	FALSE	0.093	51.000	0.000	NA		NA
221173	221174	CBU_0123	CBU_0124	murE	murF	TRUE	0.999	-3.000	0.569	0.006	Y	NA
221174	221175	CBU_0124	CBU_0125	murF	mraY	TRUE	0.998	5.000	0.309	0.008	Y	NA
221175	221177	CBU_0125	CBU_0127	mraY		FALSE	0.032	172.000	0.000	NA		NA
221177	221178	CBU_0127	CBU_0128			FALSE	0.085	68.000	0.000	NA		NA
221178	221180	CBU_0128	CBU_0130			FALSE	0.060	119.000	0.000	NA		NA
221180	221181	CBU_0130	CBU_0131		murD	FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
221181	221182	CBU_0131	CBU_0132	murD	ftsW	TRUE	0.996	0.000	0.297	0.008	N	NA
221182	221183	CBU_0132	CBU_0133	ftsW		FALSE	0.091	52.000	0.000	NA		NA
221183	221185	CBU_0133	CBU_0135		murG	FALSE	0.095	50.000	0.000	NA		NA
221185	221186	CBU_0135	CBU_0136	murG	murC	TRUE	0.994	-13.000	0.283	1.000	Y	NA
221186	221187	CBU_0136	CBU_0137	murC	murB	TRUE	0.991	-7.000	0.136	0.008	Y	NA
221187	221188	CBU_0137	CBU_0138	murB	ftsQ	TRUE	0.991	0.000	0.070	NA	Y	NA
221190	221191	CBU_0140	CBU_0141	ftsA	ftsZ	TRUE	0.999	1.000	0.460	1.000	Y	NA
221191	221192	CBU_0141	CBU_0142	ftsZ	lpxC	TRUE	0.659	160.000	0.134	1.000	N	NA
221197	221198	CBU_0147	CBU_0148	secA	mutT	TRUE	0.972	-21.000	0.168	1.000	N	NA
221198	221199	CBU_0148	CBU_0149	mutT		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221200	221201	CBU_0150	CBU_0151			FALSE	0.220	25.000	0.000	NA		NA
221201	221202	CBU_0151	CBU_0152		coaE	FALSE	0.289	21.000	0.000	1.000		NA
221202	221203	CBU_0152	CBU_0153	coaE	pilD	TRUE	0.979	11.000	0.122	1.000	N	NA
221203	221204	CBU_0153	CBU_0154	pilD		TRUE	0.899	26.000	0.024	1.000	Y	NA
221204	221205	CBU_0154	CBU_0155		pilB	TRUE	0.998	-7.000	0.571	1.000	Y	NA
221205	221206	CBU_0155	CBU_0156	pilB	pilA	TRUE	0.998	-10.000	0.556	NA	Y	NA
5437806	221207	CBU_0156a	CBU_0157			FALSE	0.045	143.000	0.000	NA		NA
221207	221208	CBU_0157	CBU_0158			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221208	221209	CBU_0158	CBU_0159			TRUE	0.945	9.000	0.043	NA		NA
221209	5437807	CBU_0159	CBU_0159a			FALSE	0.414	-16.000	0.000	NA		NA
5437807	2209964	CBU_0159a	CBU_0161			FALSE	0.023	211.000	0.000	NA		NA
2209966	5437808	CBU_0164	CBU_0162b	cas1		FALSE	0.012	306.000	0.000	NA		NA
5437808	221211	CBU_0162b	CBU_0165			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
221211	221212	CBU_0165	CBU_0166			FALSE	0.504	11.000	0.000	NA		NA
221213	221214	CBU_0167	CBU_0168	pksH		FALSE	0.480	146.000	0.080	1.000		NA
221214	221215	CBU_0168	CBU_0169			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
221219	221220	CBU_0173	CBU_0174			FALSE	0.011	326.000	0.000	NA		NA
221221	221222	CBU_0175	CBU_0176			FALSE	0.092	65.000	0.000	1.000		NA
221223	221224	CBU_0177	CBU_0178			TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221224	221225	CBU_0178	CBU_0179			FALSE	0.276	47.000	0.000	NA	N	NA
221225	221226	CBU_0179	CBU_0180			TRUE	0.992	4.000	0.184	NA	N	NA
2209967	2209968	CBU_16SA	CBU_tRNA-Ile-1	rrsA		FALSE	0.028	189.000	0.000	NA		NA
2209968	2209969	CBU_tRNA-Ile-1	CBU_tRNA-Ala-2			TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
2209969	2209970	CBU_tRNA-Ala-2	CBU_23S		rrlA	FALSE	0.026	197.000	0.000	NA		NA
2209970	2209971	CBU_23S	CBU_2096	rrlA		FALSE	0.330	-1561.000	0.000	NA		NA
2209971	221228	CBU_2096	CBU_0182			FALSE	0.007	1321.000	0.000	NA		NA
221228	2209972	CBU_0182	CBU_5SB		rrfB	FALSE	0.007	1028.000	0.000	NA		NA
2209972	221229	CBU_5SB	CBU_0183	rrfB		FALSE	0.035	166.000	0.000	NA		NA
221230	221231	CBU_0184	CBU_0185			FALSE	0.116	40.000	0.000	NA		NA
221231	221233	CBU_0185	CBU_0187			FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
221233	221235	CBU_0187	CBU_0189			TRUE	0.660	1.000	0.000	NA		NA
221237	221239	CBU_0191	CBU_0193			FALSE	0.081	78.000	0.000	NA		NA
221241	221242	CBU_0195	CBU_0196	ampG		FALSE	0.082	87.000	0.000	NA		NA
221243	221244	CBU_0197	CBU_0198			TRUE	0.997	-3.000	0.575	NA		NA
221245	221246	CBU_0199	CBU_0200	coaA		TRUE	0.873	1.000	0.000	1.000	N	NA
221248	221251	CBU_0202	CBU_0205		gltX-1	FALSE	0.011	309.000	0.000	NA		NA
221251	221252	CBU_0205	CBU_0206	gltX-1		FALSE	0.085	62.000	0.000	NA		NA
221252	2209973	CBU_0206	CBU_tRNA-Thr-2			FALSE	0.069	107.000	0.000	NA		NA
2209973	221253	CBU_tRNA-Thr-2	CBU_0207			FALSE	0.085	68.000	0.000	NA		NA
221253	2209974	CBU_0207	CBU_0208			FALSE	0.011	334.000	0.000	NA		NA
2209974	221254	CBU_0208	CBU_0209			FALSE	0.095	50.000	0.000	NA		NA
221254	221255	CBU_0209	CBU_0210			FALSE	0.366	-21.000	0.000	NA		NA
221255	221256	CBU_0210	CBU_0211			FALSE	0.014	284.000	0.000	NA		NA
221261	5437810	CBU_0216	CBU_0217a			FALSE	0.033	169.000	0.000	NA		NA
5437810	221263	CBU_0217a	CBU_0218		cydA-1	FALSE	0.082	85.000	0.000	NA		NA
221263	5437811	CBU_0218	CBU_0218a	cydA-1		TRUE	0.564	9.000	0.000	NA		NA
5437811	221264	CBU_0218a	CBU_0220			FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
221264	221265	CBU_0220	CBU_0221			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221265	2209976	CBU_0221	CBU_tRNA-Tyr-1			FALSE	0.039	154.000	0.000	NA		NA
2209976	5437812	CBU_tRNA-Tyr-1	CBU_0221a			FALSE	0.139	35.000	0.000	NA		NA
5437812	2209977	CBU_0221a	CBU_tRNA-Gly-1			FALSE	0.371	-20.000	0.000	NA		NA
2209977	2209978	CBU_tRNA-Gly-1	CBU_tRNA-Thr-3			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
2209978	5437813	CBU_tRNA-Thr-3	CBU_0221b			FALSE	0.082	74.000	0.000	NA		NA
5437813	2209979	CBU_0221b	CBU_tRNA-Trp-1			FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
2209979	221268	CBU_tRNA-Trp-1	CBU_0224		secE	FALSE	0.110	42.000	0.000	NA		NA
221268	221269	CBU_0224	CBU_0225	secE	nusG	TRUE	0.992	25.000	0.843	1.000	N	NA
221269	221270	CBU_0225	CBU_0226	nusG	rplK	TRUE	0.957	125.000	0.681	1.000	N	NA
221270	221271	CBU_0226	CBU_0227	rplK	rplA	TRUE	0.999	0.000	0.838	0.045	Y	NA
221271	221272	CBU_0227	CBU_0228	rplA	rplJ	TRUE	0.803	254.000	0.302	0.045	Y	NA
221272	221273	CBU_0228	CBU_0229	rplJ	rplL	TRUE	0.992	34.000	0.884	0.034	Y	NA
221273	221274	CBU_0229	CBU_0230	rplL		FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
221274	221275	CBU_0230	CBU_0231		rpoB	FALSE	0.388	15.000	0.000	NA		NA
221275	221276	CBU_0231	CBU_0232	rpoB	rpoC	TRUE	0.921	269.000	0.851	0.002	Y	NA
221276	221277	CBU_0232	CBU_0233	rpoC	rpsL	FALSE	0.372	294.000	0.122	1.000	N	NA
221277	221278	CBU_0233	CBU_0234	rpsL	rpsG	TRUE	0.998	13.000	0.620	0.006	Y	NA
221278	221279	CBU_0234	CBU_0235	rpsG	fusA	TRUE	0.998	10.000	0.579	1.000	Y	NA
221279	221280	CBU_0235	CBU_0236	fusA	tuf-2	TRUE	0.995	16.000	0.400	0.002	Y	NA
221280	221281	CBU_0236	CBU_0237	tuf-2	rpsJ	TRUE	0.887	181.000	0.318	1.000	Y	NA
221281	221282	CBU_0237	CBU_0238	rpsJ	rplC	TRUE	0.988	22.000	0.307	0.045	Y	NA
221282	221283	CBU_0238	CBU_0239	rplC	rplD	TRUE	0.999	-3.000	0.486	0.034	Y	NA
221283	221284	CBU_0239	CBU_0240	rplD	rplW	TRUE	0.999	-3.000	0.513	0.034	Y	NA
221284	221285	CBU_0240	CBU_0241	rplW	rplB	TRUE	0.997	20.000	0.849	0.029	Y	NA
221285	221286	CBU_0241	CBU_0242	rplB	rpsS	TRUE	0.998	13.000	0.820	0.045	Y	NA
221286	221287	CBU_0242	CBU_0243	rpsS	rplV	TRUE	0.999	0.000	0.769	0.045	Y	NA
221287	221288	CBU_0243	CBU_0244	rplV	rpsC	TRUE	0.999	0.000	0.719	0.045	Y	NA
221288	221289	CBU_0244	CBU_0245	rpsC	rplP	TRUE	0.998	12.000	0.828	0.045	Y	NA
221289	221290	CBU_0245	CBU_0246	rplP	rpmC	TRUE	0.999	1.000	0.802	0.034	Y	NA
221290	221291	CBU_0246	CBU_0247	rpmC	rpsQ	TRUE	0.999	11.000	0.828	0.034	Y	NA
221291	221292	CBU_0247	CBU_0248	rpsQ	rplN	TRUE	0.999	11.000	0.791	0.045	Y	NA
221292	221293	CBU_0248	CBU_0249	rplN	rplX	TRUE	0.998	12.000	0.810	0.045	Y	NA
221293	221294	CBU_0249	CBU_0250	rplX	rplE	TRUE	0.978	117.000	0.758	0.034	Y	NA
221294	221295	CBU_0250	CBU_0251	rplE	rpsN	TRUE	0.999	5.000	0.496	0.034	Y	NA
221295	221296	CBU_0251	CBU_0252	rpsN	rpsH	TRUE	0.998	-6.000	0.473	0.034	Y	NA
221296	221297	CBU_0252	CBU_0253	rpsH	rplF	TRUE	0.990	38.000	0.808	0.034	Y	NA
221297	221298	CBU_0253	CBU_0254	rplF	rplR	TRUE	0.999	0.000	0.815	0.034	Y	NA
221298	221299	CBU_0254	CBU_0255	rplR	rpsE	TRUE	0.998	12.000	0.814	0.045	Y	NA
221299	221300	CBU_0255	CBU_0256	rpsE		TRUE	0.999	4.000	0.789	0.045	Y	NA
221300	221301	CBU_0256	CBU_0257		rplO	TRUE	0.999	3.000	0.653	0.006	Y	NA
221301	221302	CBU_0257	CBU_0258	rplO	secY	TRUE	0.995	18.000	0.730	1.000	N	NA
221302	2209980	CBU_0258	CBU_2097	secY	rpmJ	TRUE	0.948	13.000	0.089	1.000		NA
2209980	221303	CBU_2097	CBU_0259	rpmJ		FALSE	0.047	140.000	0.000	NA		NA
221303	221304	CBU_0259	CBU_0260			TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
221304	221305	CBU_0260	CBU_0261		rpsK	TRUE	0.994	28.000	0.810	0.034	Y	NA
221305	221306	CBU_0261	CBU_0262	rpsK	rpsD	TRUE	0.997	13.000	0.509	0.045	Y	NA
221306	221307	CBU_0262	CBU_0263	rpsD	rpoA	TRUE	0.996	13.000	0.549	1.000	N	NA
221307	221308	CBU_0263	CBU_0264	rpoA	rplQ	TRUE	0.997	12.000	0.873	1.000	N	NA
221308	221309	CBU_0264	CBU_0265	rplQ		TRUE	0.867	3.000	0.000	1.000	N	NA
221309	221310	CBU_0265	CBU_0266			FALSE	0.082	87.000	0.000	NA		NA
221310	221314	CBU_0266	CBU_0270			FALSE	0.041	149.000	0.000	NA		NA
221315	221316	CBU_0271	CBU_0272	ssb		TRUE	0.770	50.000	0.075	1.000	N	NA
221316	221317	CBU_0272	CBU_0273			FALSE	0.082	85.000	0.000	NA		NA
221319	221320	CBU_0275	CBU_0276	hemE		FALSE	0.121	41.000	0.000	1.000		NA
221324	221325	CBU_0280	CBU_0281	dinP	katE	FALSE	0.091	71.000	0.000	1.000		NA
221327	221328	CBU_0283	CBU_0284			FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
221328	221329	CBU_0284	CBU_0285			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
221330	221331	CBU_0286	CBU_0287	pcnB	folK-2	TRUE	0.994	-3.000	0.234	1.000	N	NA
221331	221332	CBU_0287	CBU_0288	folK-2	coaD	TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
221332	221333	CBU_0288	CBU_0289	coaD		TRUE	0.936	15.000	0.088	1.000		NA
221334	221335	CBU_0290	CBU_0291	rpmG	rpmB	TRUE	0.991	11.000	0.332	0.034		NA
221335	2209982	CBU_0291	CBU_0292	rpmB		FALSE	0.081	94.000	0.000	NA		NA
2209982	5437815	CBU_0292	CBU_0291b			FALSE	0.220	25.000	0.000	NA		NA
221336	221337	CBU_0293	CBU_0294	dut		TRUE	0.922	-22.000	0.039	1.000	N	NA
221338	221339	CBU_0295	CBU_0296		pyrE	TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
221341	221342	CBU_0298	CBU_0299	murI	rph	TRUE	0.980	0.000	0.048	1.000	N	NA
221343	221344	CBU_0300	CBU_0301		gmk	TRUE	0.990	-7.000	0.276	1.000		NA
221344	221345	CBU_0301	CBU_0302	gmk	rpoZ	TRUE	0.955	78.000	0.471	1.000	N	NA
221345	221346	CBU_0302	CBU_0303	rpoZ	spoT	TRUE	0.957	54.000	0.291	1.000	Y	NA
221346	221347	CBU_0303	CBU_0304	spoT		TRUE	0.954	28.000	0.215	NA	N	NA
221347	221348	CBU_0304	CBU_0305		recG	TRUE	0.978	7.000	0.076	NA	N	NA
221348	221349	CBU_0305	CBU_0306	recG		FALSE	0.014	281.000	0.000	NA		NA
221349	221350	CBU_0306	CBU_0307			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
221352	221354	CBU_0309	CBU_0311	htpG		FALSE	0.017	262.000	0.000	1.000		NA
221356	221357	CBU_0313	CBU_0314			TRUE	0.770	137.000	0.233	1.000		NA
221358	221359	CBU_0315	CBU_0316			TRUE	0.776	15.000	0.003	1.000		NA
2209983	221363	CBU_0320	CBU_0321			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221364	221365	CBU_0322	CBU_0323			TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
221365	221366	CBU_0323	CBU_0324			TRUE	0.856	14.000	0.000	1.000	Y	NA
221369	221372	CBU_0327	CBU_0330		thiC	FALSE	0.080	97.000	0.000	NA		NA
221372	221373	CBU_0330	CBU_0331	thiC		TRUE	0.972	0.000	0.022	1.000	N	NA
221373	221374	CBU_0331	CBU_0332		thiS	TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221374	221375	CBU_0332	CBU_0333	thiS	thiG	TRUE	0.990	2.000	0.064	1.000	Y	NA
221375	221376	CBU_0333	CBU_0334	thiG	thiDE	TRUE	0.980	-3.000	0.012	0.005	Y	NA
221376	221377	CBU_0334	CBU_0335	thiDE		FALSE	0.087	78.000	0.000	1.000		NA
221378	221379	CBU_0336	CBU_0337	purH	fis	TRUE	0.961	-19.000	0.101	1.000	N	NA
221384	221385	CBU_0342	CBU_0343			FALSE	0.010	337.000	0.000	NA		NA
221385	221386	CBU_0343	CBU_0344			FALSE	0.081	95.000	0.000	NA		NA
5437819	221387	CBU_0344a	CBU_0346		xylB	FALSE	0.032	171.000	0.000	NA		NA
221387	221388	CBU_0346	CBU_0347	xylB		TRUE	0.932	5.000	0.000	1.000	Y	NA
221388	221390	CBU_0347	CBU_0349		gph	FALSE	0.121	41.000	0.000	1.000		NA
221390	221391	CBU_0349	CBU_0350	gph	ubiG	TRUE	0.989	-7.000	0.259	1.000		NA
221391	221392	CBU_0350	CBU_0351	ubiG		TRUE	0.729	-13.000	0.000	NA	N	NA
221392	221393	CBU_0351	CBU_0352			FALSE	0.279	46.000	0.000	NA	N	NA
221393	221394	CBU_0352	CBU_0353			FALSE	0.154	137.000	0.000	1.000	N	NA
221395	221396	CBU_0354	CBU_0355			FALSE	0.082	76.000	0.000	NA		NA
221396	221398	CBU_0355	CBU_0357			FALSE	0.051	135.000	0.000	NA		NA
221399	221401	CBU_0358	CBU_0360			FALSE	0.246	23.000	0.000	NA		NA
221401	221403	CBU_0360	CBU_0362			FALSE	0.046	142.000	0.000	NA		NA
221403	2209985	CBU_0362	CBU_0363			FALSE	0.332	-82.000	0.000	NA		NA
2209985	221404	CBU_0363	CBU_0364			FALSE	0.020	234.000	0.000	NA		NA
221406	221407	CBU_0366	CBU_0367		phoB	TRUE	0.996	-19.000	0.453	0.011	Y	NA
221409	221410	CBU_0369	CBU_0370			FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
221410	221411	CBU_0370	CBU_0371			FALSE	0.090	72.000	0.000	1.000		NA
221411	221412	CBU_0371	CBU_0372			FALSE	0.079	103.000	0.000	1.000		NA
221412	221413	CBU_0372	CBU_0373			FALSE	0.045	147.000	0.000	1.000		NA
221413	2209986	CBU_0373	CBU_0374			FALSE	0.414	-16.000	0.000	NA		NA
221414	221416	CBU_0375	CBU_0377			FALSE	0.016	260.000	0.000	NA		NA
221416	221417	CBU_0377	CBU_0378			FALSE	0.038	157.000	0.000	NA		NA
221418	221419	CBU_0379	CBU_0380	ampD		FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
2209987	221421	CBU_tRNA-Pro-1	CBU_0382		ispB	FALSE	0.085	65.000	0.000	NA		NA
221422	221423	CBU_0383	CBU_0384	tag		FALSE	0.110	277.000	0.000	1.000	Y	NA
5437821	221424	CBU_0384b	CBU_0385		rplU	FALSE	0.082	87.000	0.000	NA		NA
221424	221425	CBU_0385	CBU_0386	rplU	rpmA	TRUE	0.998	-10.000	0.667	0.033	Y	NA
221425	221426	CBU_0386	CBU_0387	rpmA		TRUE	0.802	165.000	0.335	1.000		NA
221426	221427	CBU_0387	CBU_0388			FALSE	0.076	100.000	0.000	NA		NA
221429	221430	CBU_0390	CBU_0391	mviN	ribF	TRUE	0.986	-3.000	0.169	1.000		NA
221431	221433	CBU_0392	CBU_0394			FALSE	0.081	95.000	0.000	NA		NA
221434	221435	CBU_0395	CBU_0396		ileS	FALSE	0.065	113.000	0.000	NA		NA
221435	221436	CBU_0396	CBU_0397	ileS	lspA	TRUE	0.990	3.000	0.147	1.000	N	NA
221436	221437	CBU_0397	CBU_0398	lspA		FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
221437	221439	CBU_0398	CBU_0400			FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
221439	5437822	CBU_0400	CBU_0400a			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
5437822	221441	CBU_0400a	CBU_0402			FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
221441	221442	CBU_0402	CBU_0403			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221442	221443	CBU_0403	CBU_0404			TRUE	0.604	6.000	0.000	NA		NA
221446	5437823	CBU_0407	CBU_0407a			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
5437823	221447	CBU_0407a	CBU_0409			FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
221447	221448	CBU_0409	CBU_0410			FALSE	0.015	276.000	0.000	NA		NA
2209989	221451	CBU_tRNA-Lys-1	CBU_0413			FALSE	0.034	168.000	0.000	NA		NA
221454	221455	CBU_0416	CBU_0417			FALSE	0.091	52.000	0.000	NA		NA
221456	221457	CBU_0418	CBU_0419			FALSE	0.218	103.000	0.000	1.000	N	NA
221457	221458	CBU_0419	CBU_0420			FALSE	0.081	78.000	0.000	NA		NA
221458	221460	CBU_0420	CBU_0422		panD	TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
221460	221461	CBU_0422	CBU_0423	panD	panC	TRUE	0.998	-6.000	0.342	1.000	Y	NA
221461	221462	CBU_0423	CBU_0424	panC	panB	TRUE	0.997	11.000	0.395	0.002	Y	NA
221462	221463	CBU_0424	CBU_0425	panB		FALSE	0.082	92.000	0.000	NA		NA
221463	221464	CBU_0425	CBU_0426			FALSE	0.018	247.000	0.000	NA		NA
5437824	5437825	CBU_0426a	CBU_0426b			FALSE	0.010	386.000	0.000	NA		NA
5437825	221466	CBU_0426b	CBU_0429			FALSE	0.414	-16.000	0.000	NA		NA
221466	221467	CBU_0429	CBU_0430		lysS	FALSE	0.057	132.000	0.000	1.000		NA
221469	221470	CBU_0432	CBU_0433			FALSE	0.092	67.000	0.000	1.000		NA
221471	5437826	CBU_0434	CBU_0434a			FALSE	0.078	99.000	0.000	NA		NA
5437826	221472	CBU_0434a	CBU_0435			FALSE	0.108	43.000	0.000	NA		NA
221472	221473	CBU_0435	CBU_0436			FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
221474	221476	CBU_0437	CBU_0439			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
221476	221477	CBU_0439	CBU_0440			FALSE	0.357	-22.000	0.000	NA		NA
221478	221479	CBU_0441	CBU_0442	ogt	rplS	TRUE	0.954	6.000	0.011	1.000	N	NA
221479	221480	CBU_0442	CBU_0443	rplS	trmD	TRUE	0.999	-3.000	0.567	1.000	Y	NA
221480	221481	CBU_0443	CBU_0444	trmD	rimM	TRUE	0.999	2.000	0.672	1.000	Y	NA
221481	221482	CBU_0444	CBU_0445	rimM	rpsP	TRUE	0.965	79.000	0.342	0.032	Y	NA
221485	2209991	CBU_0448	CBU_0449			TRUE	0.660	1.000	0.000	NA		NA
221487	221488	CBU_0451	CBU_0452			TRUE	0.995	-3.000	0.349	NA		NA
221488	221489	CBU_0452	CBU_0453		fimT	TRUE	0.867	2.000	0.000	NA	N	NA
221489	221490	CBU_0453	CBU_0454	fimT	adk	FALSE	0.354	35.000	0.000	NA	N	NA
221490	221491	CBU_0454	CBU_0455	adk		TRUE	0.588	34.000	0.013	1.000		NA
221492	221493	CBU_0456	CBU_0457			FALSE	0.043	146.000	0.000	NA		NA
221494	221495	CBU_0458	CBU_0459		rosB	FALSE	0.366	-21.000	0.000	NA		NA
221495	221496	CBU_0459	CBU_0460	rosB		TRUE	0.549	76.000	0.042	0.079		NA
221496	221497	CBU_0460	CBU_0461		pdhA	TRUE	0.569	45.000	0.028	1.000		NA
221497	221498	CBU_0461	CBU_0462	pdhA	pdhC	TRUE	0.908	66.000	0.167	0.061	Y	NA
221498	221499	CBU_0462	CBU_0463	pdhC	lpdA	TRUE	0.997	13.000	0.463	1.000	Y	NA
221500	221502	CBU_0465	CBU_0467			FALSE	0.007	575.000	0.000	NA		NA
221503	221504	CBU_0468	CBU_0469	xseB		FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
221504	221505	CBU_0469	CBU_0470			FALSE	0.101	47.000	0.000	NA		NA
221506	221507	CBU_0471	CBU_0472		recQ	FALSE	0.083	73.000	0.000	NA		NA
221507	221508	CBU_0472	CBU_0473	recQ		FALSE	0.441	65.000	0.000	1.000	Y	NA
221508	221509	CBU_0473	CBU_0474			FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
221509	221511	CBU_0474	CBU_0476			FALSE	0.008	482.000	0.000	NA		NA
221513	5437828	CBU_0478	CBU_0478a			FALSE	0.059	120.000	0.000	NA		NA
5437828	221514	CBU_0478a	CBU_0479		kdsB	TRUE	0.986	-10.000	0.265	NA		NA
221516	221517	CBU_0481	CBU_0482			TRUE	0.936	4.000	0.000	1.000	Y	NA
221517	221518	CBU_0482	CBU_0483			TRUE	0.945	0.000	0.000	0.035	Y	NA
221518	221519	CBU_0483	CBU_0484			TRUE	0.999	-3.000	0.714	0.014	Y	NA
221519	221520	CBU_0484	CBU_0485			FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
2209993	221522	CBU_0487	CBU_0488	rluC		FALSE	0.192	29.000	0.000	1.000		NA
221523	221524	CBU_0489	CBU_0490			FALSE	0.251	56.000	0.000	1.000	N	NA
221525	221526	CBU_0491	CBU_0492	rpmF	plsX	TRUE	0.997	8.000	0.418	1.000	N	NA
221526	221527	CBU_0492	CBU_0493	plsX	fabH	TRUE	0.998	-3.000	0.380	0.009	Y	NA
221527	221528	CBU_0493	CBU_0494	fabH	fabD	TRUE	0.909	101.000	0.182	0.009	Y	NA
221528	221529	CBU_0494	CBU_0495	fabD	fabG	TRUE	0.971	76.000	0.432	0.009	Y	NA
221529	221530	CBU_0495	CBU_0496	fabG	acpP	TRUE	0.963	68.000	0.321	0.009	Y	NA
221530	221531	CBU_0496	CBU_0497	acpP	fabF	TRUE	0.973	45.000	0.346	1.000	Y	NA
221531	221532	CBU_0497	CBU_0498	fabF		TRUE	0.917	10.000	0.019	NA		NA
221532	221533	CBU_0498	CBU_0499		tmk	TRUE	0.829	96.000	0.209	NA		NA
221533	221534	CBU_0499	CBU_0500	tmk	holB	TRUE	0.994	-3.000	0.211	1.000	N	NA
221534	221535	CBU_0500	CBU_0501	holB		FALSE	0.313	19.000	0.000	NA		NA
221535	221536	CBU_0501	CBU_0502			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
221537	221538	CBU_0503	CBU_0504	glnA		FALSE	0.240	163.000	0.000	1.000	Y	NA
221538	221539	CBU_0504	CBU_0505			FALSE	0.183	120.000	0.000	1.000	N	NA
5437829	221540	CBU_0505a	CBU_0506		recJ	FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
221541	221542	CBU_0507	CBU_0508			FALSE	0.024	209.000	0.000	NA		NA
221543	221544	CBU_0509	CBU_0510	trpR		FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
221544	5437830	CBU_0510	CBU_0510a			FALSE	0.032	171.000	0.000	NA		NA
2209994	2209995	CBU_0511	CBU_0512			FALSE	0.189	28.000	0.000	NA		NA
221545	221546	CBU_0513	CBU_0514			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
221546	5437831	CBU_0514	CBU_0514a			FALSE	0.017	254.000	0.000	NA		NA
5437831	221547	CBU_0514a	CBU_0515			FALSE	0.012	307.000	0.000	NA		NA
221547	221548	CBU_0515	CBU_0516			FALSE	0.079	98.000	0.000	NA		NA
5437832	2209996	CBU_0516a	CBU_tRNA-Asn-1			FALSE	0.010	353.000	0.000	NA		NA
2209996	221549	CBU_tRNA-Asn-1	CBU_0517		aspB	FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
221550	221551	CBU_0518	CBU_0519	uvrB		FALSE	0.085	60.000	0.000	NA		NA
221552	221553	CBU_0520	CBU_0521	leuA		TRUE	0.736	-13.000	0.000	1.000	N	NA
221554	5437833	CBU_0522	CBU_0522a			FALSE	0.026	196.000	0.000	NA		NA
221556	221557	CBU_0524	CBU_0525	gyrA	serC	TRUE	0.729	61.000	0.067	1.000	N	NA
221557	221558	CBU_0525	CBU_0526	serC	aroA	TRUE	0.982	6.000	0.033	1.000	Y	NA
221558	221559	CBU_0526	CBU_0527	aroA	cmk	TRUE	0.994	1.000	0.209	1.000	N	NA
221559	221560	CBU_0527	CBU_0528	cmk	rpsA	TRUE	0.876	132.000	0.281	1.000	N	NA
221560	221561	CBU_0528	CBU_0529	rpsA		FALSE	0.191	155.000	0.005	NA		NA
221561	221562	CBU_0529	CBU_0530			TRUE	0.997	-3.000	0.576	NA		NA
221562	221563	CBU_0530	CBU_0531		pyrF	TRUE	0.988	4.000	0.125	1.000	N	NA
221563	221564	CBU_0531	CBU_0532	pyrF		FALSE	0.504	63.000	0.024	1.000		NA
221564	221565	CBU_0532	CBU_0533		rfe	FALSE	0.025	212.000	0.000	1.000		NA
221569	221570	CBU_0537	CBU_0538			FALSE	0.033	169.000	0.000	NA		NA
221570	221571	CBU_0538	CBU_0539			FALSE	0.085	69.000	0.000	NA		NA
221571	221572	CBU_0539	CBU_0540			FALSE	0.097	179.000	0.000	1.000	N	NA
221572	221573	CBU_0540	CBU_0541		zipA	TRUE	0.729	55.000	0.115	0.014		NA
221573	221574	CBU_0541	CBU_0542	zipA	ligA	TRUE	0.980	1.000	0.106	1.000		NA
221574	221575	CBU_0542	CBU_0543	ligA		FALSE	0.020	231.000	0.000	NA		NA
221575	221576	CBU_0543	CBU_0544			FALSE	0.018	245.000	0.000	NA		NA
221576	221577	CBU_0544	CBU_0545		lemA	FALSE	0.085	59.000	0.000	NA		NA
221577	221578	CBU_0545	CBU_0546	lemA	htpX	TRUE	0.991	10.000	0.307	NA		NA
221579	221580	CBU_0547	CBU_0548			FALSE	0.384	-19.000	0.000	NA		NA
221580	221581	CBU_0548	CBU_0549		rodA	TRUE	0.769	80.000	0.096	NA	N	NA
221581	221582	CBU_0549	CBU_0550	rodA	pbpA	TRUE	0.791	43.000	0.073	1.000	N	NA
221582	2209997	CBU_0550	CBU_0551	pbpA		FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
2209997	221583	CBU_0551	CBU_0552			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
5437834	221586	CBU_0554a	CBU_0555			FALSE	0.081	94.000	0.000	NA		NA
221586	221587	CBU_0555	CBU_0556		nadD	FALSE	0.024	206.000	0.000	NA		NA
221587	221588	CBU_0556	CBU_0557	nadD	holA	TRUE	0.892	-19.000	0.010	1.000	N	NA
221588	221589	CBU_0557	CBU_0558	holA		TRUE	0.993	3.000	0.199	NA	N	NA
221589	221590	CBU_0558	CBU_0559		leuS	TRUE	0.985	-10.000	0.182	NA	N	NA
5437835	221592	CBU_0560a	CBU_0562			FALSE	0.009	392.000	0.000	NA		NA
221592	5437836	CBU_0562	CBU_0562a			FALSE	0.021	230.000	0.000	NA		NA
5437836	221593	CBU_0562a	CBU_0563			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
221593	221594	CBU_0563	CBU_0564		cutE	FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
221594	221595	CBU_0564	CBU_0565	cutE	corC	TRUE	0.997	-7.000	0.557	NA	N	NA
221595	221596	CBU_0565	CBU_0566	corC		FALSE	0.292	43.000	0.000	NA	N	NA
221596	221597	CBU_0566	CBU_0567			FALSE	0.086	56.000	0.000	NA		NA
221597	221598	CBU_0567	CBU_0568			TRUE	0.996	-3.000	0.457	NA		NA
221598	221599	CBU_0568	CBU_0569			TRUE	0.990	11.000	0.220	1.000	N	NA
221599	221600	CBU_0569	CBU_0570			TRUE	0.569	21.000	0.000	1.000	N	NA
221600	221601	CBU_0570	CBU_0571			FALSE	0.022	215.000	0.000	NA		NA
221602	221603	CBU_0572	CBU_0573			TRUE	0.806	10.000	0.000	1.000	N	NA
221603	221604	CBU_0573	CBU_0574			FALSE	0.059	545.000	0.000	1.000	Y	NA
221604	221606	CBU_0574	CBU_0576		yfcX	TRUE	0.934	51.000	0.200	1.000	Y	NA
221606	221607	CBU_0576	CBU_0577	yfcX		FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
221608	221609	CBU_0578	CBU_0579			TRUE	0.867	-13.000	0.000	NA	Y	NA
221612	221613	CBU_0582	CBU_0583			TRUE	0.994	3.000	0.216	NA	N	NA
221613	221614	CBU_0583	CBU_0584			FALSE	0.026	197.000	0.000	NA		NA
221616	221617	CBU_0586	CBU_0587			FALSE	0.290	45.000	0.000	1.000	N	NA
221617	221618	CBU_0587	CBU_0588		nadA	FALSE	0.238	80.000	0.000	1.000	N	NA
221618	221619	CBU_0588	CBU_0589	nadA		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA	N	NA
221619	221620	CBU_0589	CBU_0590			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221620	221621	CBU_0590	CBU_0591			TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
221621	221622	CBU_0591	CBU_0592			TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
221623	221626	CBU_0593	CBU_0596			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221628	221629	CBU_0598	CBU_0599	nudE	cysQ-1	TRUE	0.992	-10.000	0.373	1.000		NA
221629	221630	CBU_0599	CBU_0600	cysQ-1		FALSE	0.027	193.000	0.000	NA		NA
221637	221638	CBU_0607	CBU_0608	mvaD		TRUE	0.997	-7.000	0.312	0.003	Y	NA
221638	221639	CBU_0608	CBU_0609			TRUE	0.776	99.000	0.040	0.001	Y	NA
221639	221640	CBU_0609	CBU_0610			TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
221641	221642	CBU_0611	CBU_0612			TRUE	0.966	78.000	0.354	1.000	Y	NA
221642	221643	CBU_0612	CBU_0613		lpxD	TRUE	0.999	10.000	0.814	1.000	Y	NA
221643	221644	CBU_0613	CBU_0614	lpxD	fabZ	TRUE	0.999	-3.000	0.796	1.000	N	NA
221644	221645	CBU_0614	CBU_0615	fabZ	lpxA	TRUE	0.999	5.000	0.850	1.000	N	NA
221645	221646	CBU_0615	CBU_0616	lpxA		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221647	221648	CBU_0617	CBU_0618			TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
221648	221649	CBU_0618	CBU_0619			FALSE	0.086	56.000	0.000	NA		NA
221649	221650	CBU_0619	CBU_0620		lpxB	FALSE	0.037	158.000	0.000	NA		NA
221650	221651	CBU_0620	CBU_0621	lpxB		TRUE	0.932	-10.000	0.044	1.000		NA
221652	221653	CBU_0622	CBU_0623			TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
221653	221654	CBU_0623	CBU_0624			FALSE	0.076	100.000	0.000	NA		NA
221654	221655	CBU_0624	CBU_0625			FALSE	0.025	201.000	0.000	NA		NA
221655	221656	CBU_0625	CBU_0626			FALSE	0.068	109.000	0.000	NA		NA
221658	221659	CBU_0628	CBU_0629	ppa	putA	FALSE	0.353	119.000	0.000	1.000	Y	NA
221659	221660	CBU_0629	CBU_0630	putA	mip	FALSE	0.242	73.000	0.000	1.000	N	NA
221660	221661	CBU_0630	CBU_0631	mip	purL	FALSE	0.304	42.000	0.000	1.000	N	NA
221664	221665	CBU_0634	CBU_0635			FALSE	0.313	19.000	0.000	NA		NA
221665	221666	CBU_0635	CBU_0636			FALSE	0.108	43.000	0.000	NA		NA
221667	221668	CBU_0637	CBU_0638			FALSE	0.029	418.000	0.000	NA	N	NA
221668	221669	CBU_0638	CBU_0639			TRUE	0.999	0.000	0.556	0.057	Y	NA
221669	221670	CBU_0639	CBU_0640			TRUE	0.910	205.000	0.458	0.004	Y	NA
221670	221671	CBU_0640	CBU_0641			TRUE	0.980	-3.000	0.065	1.000	N	NA
221672	221673	CBU_0642	CBU_0643		ribD	TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221674	221675	CBU_0644	CBU_0645			TRUE	0.975	6.000	0.107	NA		NA
221676	221677	CBU_0646	CBU_0647	ribE	ribA	TRUE	0.749	41.000	0.009	1.000	Y	NA
221677	221678	CBU_0647	CBU_0648	ribA	ribH	TRUE	0.977	-3.000	0.008	0.003	Y	NA
221678	221679	CBU_0648	CBU_0649	ribH		TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221679	221680	CBU_0649	CBU_0650			FALSE	0.031	173.000	0.000	NA		NA
221680	221682	CBU_0650	CBU_0652			FALSE	0.147	34.000	0.000	NA		NA
221682	221684	CBU_0652	CBU_0654			FALSE	0.233	24.000	0.000	NA		NA
221686	221687	CBU_0656	CBU_0657		recR	TRUE	0.993	14.000	0.604	NA		NA
221687	221688	CBU_0657	CBU_0658	recR		TRUE	0.995	12.000	0.604	NA		NA
221688	221689	CBU_0658	CBU_0659		dnaZX	TRUE	0.908	110.000	0.411	NA		NA
221689	221690	CBU_0659	CBU_0660	dnaZX		TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
221690	2209999	CBU_0660	CBU_tRNA-Ser-1			FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
221691	221692	CBU_0661	CBU_0662			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
221692	221693	CBU_0662	CBU_0663			FALSE	0.158	32.000	0.000	NA		NA
221693	221694	CBU_0663	CBU_0664			FALSE	0.070	105.000	0.000	NA		NA
221694	221695	CBU_0664	CBU_0665			FALSE	0.082	92.000	0.000	NA		NA
221696	221697	CBU_0666	CBU_0667	dapE	dapD	TRUE	0.991	6.000	0.109	0.003	Y	NA
221697	221698	CBU_0667	CBU_0668	dapD		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221699	2210000	CBU_0669	CBU_tRNA-Pro-2			FALSE	0.093	51.000	0.000	NA		NA
2210000	221700	CBU_tRNA-Pro-2	CBU_0670		rhlE	FALSE	0.057	127.000	0.000	NA		NA
221700	2210001	CBU_0670	CBU_tRNA-Arg-1	rhlE		FALSE	0.048	139.000	0.000	NA		NA
2210001	2210002	CBU_tRNA-Arg-1	CBU_tRNA-His-1			FALSE	0.070	105.000	0.000	NA		NA
2210002	221701	CBU_tRNA-His-1	CBU_0671		rfbA	FALSE	0.158	32.000	0.000	NA		NA
221702	221703	CBU_0672	CBU_0673			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221703	221704	CBU_0673	CBU_0674			TRUE	0.954	-6.000	0.015	1.000	N	NA
221704	221705	CBU_0674	CBU_0675			TRUE	0.938	4.000	0.000	0.013	Y	NA
221706	221707	CBU_0676	CBU_0677			TRUE	0.992	-3.000	0.111	0.004	Y	NA
221707	221708	CBU_0677	CBU_0678			TRUE	0.979	-25.000	0.206	0.016	N	NA
221708	221709	CBU_0678	CBU_0679			TRUE	0.968	3.000	0.059	1.000		NA
221709	221710	CBU_0679	CBU_0680			TRUE	0.985	-15.000	0.286	0.037		NA
221710	221711	CBU_0680	CBU_0681			TRUE	0.996	-7.000	0.286	1.000	Y	NA
221711	221712	CBU_0681	CBU_0682			TRUE	0.972	3.000	0.069	1.000		NA
221714	221715	CBU_0684	CBU_0685			FALSE	0.008	445.000	0.000	NA		NA
221715	221716	CBU_0685	CBU_0686			FALSE	0.021	228.000	0.000	NA		NA
221716	221717	CBU_0686	CBU_0687			FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
221717	221718	CBU_0687	CBU_0688		wcaG	FALSE	0.010	380.000	0.000	NA		NA
221718	221719	CBU_0688	CBU_0689	wcaG	gmd	TRUE	0.914	-7.000	0.000	0.008	Y	NA
221719	221720	CBU_0689	CBU_0690	gmd		TRUE	0.915	9.000	0.000	NA	Y	NA
221720	221721	CBU_0690	CBU_0691			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221722	221723	CBU_0692	CBU_0693			TRUE	0.984	-3.000	0.026	0.004	Y	NA
221723	221724	CBU_0693	CBU_0694			FALSE	0.057	127.000	0.000	NA		NA
221724	221725	CBU_0694	CBU_0695			FALSE	0.085	62.000	0.000	NA		NA
221725	221726	CBU_0695	CBU_0696			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221726	221727	CBU_0696	CBU_0697			TRUE	0.642	31.000	0.000	0.013	Y	NA
221727	221728	CBU_0697	CBU_0698			FALSE	0.246	23.000	0.000	NA		NA
221730	221731	CBU_0700	CBU_0701		cysQ-2	TRUE	0.850	-18.000	0.000	1.000	Y	NA
221732	221733	CBU_0702	CBU_0703			TRUE	0.800	10.000	0.000	NA	N	NA
221733	221734	CBU_0703	CBU_0704		rfbI	TRUE	0.907	10.000	0.000	NA	Y	NA
221734	2210003	CBU_0704	CBU_tRNA-Lys-2	rfbI		FALSE	0.008	485.000	0.000	NA		NA
221735	221736	CBU_0705	CBU_0706			FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
221736	221737	CBU_0706	CBU_0707			FALSE	0.064	114.000	0.000	NA		NA
221738	221740	CBU_0709	CBU_0711			FALSE	0.012	308.000	0.000	NA		NA
221740	221741	CBU_0711	CBU_0712			FALSE	0.007	992.000	0.000	NA		NA
221741	221742	CBU_0712	CBU_0713			FALSE	0.248	59.000	0.000	1.000	N	NA
221742	221743	CBU_0713	CBU_0714			FALSE	0.095	50.000	0.000	NA		NA
5437839	221746	CBU_0716a	CBU_0718			FALSE	0.019	235.000	0.000	NA		NA
221746	221747	CBU_0718	CBU_0719			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221748	221749	CBU_0720	CBU_0721			TRUE	0.982	0.000	0.061	1.000	N	NA
221749	221750	CBU_0721	CBU_0722			TRUE	0.912	24.000	0.081	1.000	N	NA
221750	221752	CBU_0722	CBU_0724			FALSE	0.060	246.000	0.000	1.000	N	NA
221752	5437840	CBU_0724	CBU_0724a			FALSE	0.025	202.000	0.000	NA		NA
5437840	5437841	CBU_0724a	CBU_0724c			FALSE	0.090	53.000	0.000	NA		NA
221753	221754	CBU_0727	CBU_0728			TRUE	0.999	-3.000	0.556	NA	Y	NA
221754	221755	CBU_0728	CBU_0729			TRUE	0.970	-16.000	0.054	NA	Y	NA
221755	221756	CBU_0729	CBU_0730			TRUE	0.992	3.000	0.239	NA		NA
221757	221758	CBU_0731	CBU_0732			FALSE	0.073	103.000	0.000	NA		NA
221758	221760	CBU_0732	CBU_0734			FALSE	0.085	60.000	0.000	NA		NA
2210008	221763	CBU_tRNA-Leu-1	CBU_0737		tig	TRUE	0.574	8.000	0.000	NA		NA
221763	221764	CBU_0737	CBU_0738	tig	clpP	TRUE	0.997	10.000	0.351	1.000	Y	NA
221764	221765	CBU_0738	CBU_0739	clpP	clpX	TRUE	0.969	55.000	0.352	1.000	Y	NA
221765	221766	CBU_0739	CBU_0740	clpX	lon	TRUE	0.990	14.000	0.201	1.000	Y	NA
221766	221767	CBU_0740	CBU_0741	lon	pmbA	TRUE	0.564	9.000	0.000	NA		NA
221767	221768	CBU_0741	CBU_0742	pmbA		FALSE	0.082	84.000	0.000	NA		NA
221769	221770	CBU_0743	CBU_0744	ptsH		FALSE	0.404	-19.000	0.000	1.000		NA
221770	221771	CBU_0744	CBU_0745			TRUE	0.950	0.000	0.021	NA		NA
221771	221772	CBU_0745	CBU_0746			FALSE	0.335	99.000	0.006	NA		NA
221772	221773	CBU_0746	CBU_0747			TRUE	0.997	3.000	0.543	NA		NA
221773	221774	CBU_0747	CBU_0748			TRUE	0.940	50.000	0.459	NA		NA
221774	221775	CBU_0748	CBU_0749			TRUE	0.992	16.000	0.617	NA		NA
221775	221776	CBU_0749	CBU_0750			TRUE	0.997	2.000	0.598	1.000		NA
221777	221778	CBU_0751	CBU_0752	murA		FALSE	0.517	-9.000	0.000	NA		NA
221778	5437842	CBU_0752	CBU_0752a			FALSE	0.169	31.000	0.000	NA		NA
221779	221780	CBU_0753	CBU_0754			FALSE	0.272	48.000	0.000	NA	N	NA
221780	221781	CBU_0754	CBU_0755		htrA	TRUE	0.874	0.000	0.000	1.000	N	NA
221781	221782	CBU_0755	CBU_0756	htrA		FALSE	0.172	161.000	0.004	NA		NA
221782	2210009	CBU_0756	CBU_0757		rluD	TRUE	0.832	41.000	0.168	NA		NA
2210010	221784	CBU_0759	CBU_0760			FALSE	0.082	82.000	0.000	NA		NA
221785	221786	CBU_0761	CBU_0762			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
221786	221787	CBU_0762	CBU_0763			FALSE	0.272	21.000	0.000	NA		NA
221787	2210011	CBU_0763	CBU_0764			FALSE	0.272	21.000	0.000	NA		NA
2210011	2210012	CBU_0764	CBU_0765			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
2210013	221789	CBU_tRNA-Val-1	CBU_0767			FALSE	0.052	134.000	0.000	NA		NA
221789	221790	CBU_0767	CBU_0768			FALSE	0.009	412.000	0.000	NA		NA
221790	221791	CBU_0768	CBU_0769			FALSE	0.082	100.000	0.000	1.000		NA
221791	221792	CBU_0769	CBU_0770			FALSE	0.037	167.000	0.000	1.000		NA
221792	221793	CBU_0770	CBU_0771		prpB	FALSE	0.034	172.000	0.000	1.000		NA
221793	221794	CBU_0771	CBU_0772	prpB	prpC	TRUE	0.997	-7.000	0.502	1.000	N	NA
221794	221795	CBU_0772	CBU_0773	prpC		TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
221795	221796	CBU_0773	CBU_0774			FALSE	0.054	129.000	0.000	NA		NA
221796	221797	CBU_0774	CBU_0775			TRUE	0.922	7.000	0.000	NA	Y	NA
221797	221798	CBU_0775	CBU_0776			TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221798	221799	CBU_0776	CBU_0777			TRUE	0.998	-3.000	0.667	NA		NA
2210014	5437843	CBU_0778	CBU_0777c			FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
221801	221802	CBU_0780	CBU_0781			FALSE	0.085	65.000	0.000	NA		NA
221802	221803	CBU_0781	CBU_0782			FALSE	0.026	200.000	0.000	NA		NA
221804	221806	CBU_0784	CBU_0786			FALSE	0.015	270.000	0.000	NA		NA
221806	221807	CBU_0786	CBU_0787			FALSE	0.389	34.000	0.000	0.033	N	NA
221807	221808	CBU_0787	CBU_0788			TRUE	0.892	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
221808	221809	CBU_0788	CBU_0789			FALSE	0.191	116.000	0.000	1.000	N	NA
221809	221810	CBU_0789	CBU_0790			FALSE	0.017	250.000	0.000	NA		NA
221810	221812	CBU_0790	CBU_0792			FALSE	0.082	89.000	0.000	NA		NA
221813	221814	CBU_0793	CBU_0794			FALSE	0.101	47.000	0.000	NA		NA
221814	2210016	CBU_0794	CBU_tRNA-Leu-2			FALSE	0.011	319.000	0.000	NA		NA
2210016	221815	CBU_tRNA-Leu-2	CBU_0795		folE	FALSE	0.169	31.000	0.000	NA		NA
221815	221816	CBU_0795	CBU_0796	folE		TRUE	0.874	0.000	0.000	1.000	N	NA
221816	221817	CBU_0796	CBU_0797			TRUE	0.822	17.000	0.000	1.000	Y	NA
221817	221818	CBU_0797	CBU_0798			TRUE	0.998	1.000	0.600	1.000	N	NA
221819	221820	CBU_0799	CBU_0800			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221820	221821	CBU_0800	CBU_0801		rimI	TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221823	221824	CBU_0803	CBU_0804			TRUE	0.832	8.000	0.000	0.062	N	NA
221825	221826	CBU_0805	CBU_0806			FALSE	0.072	104.000	0.000	NA		NA
221829	221830	CBU_0809	CBU_0810			TRUE	0.995	-12.000	0.631	0.071		NA
221830	221831	CBU_0810	CBU_0811		prfC	TRUE	0.679	1.000	0.000	1.000		NA
221831	221832	CBU_0811	CBU_0812	prfC		TRUE	0.864	15.000	0.003	1.000	N	NA
221832	221833	CBU_0812	CBU_0813			FALSE	0.013	288.000	0.000	NA		NA
221833	221834	CBU_0813	CBU_0814			FALSE	0.010	383.000	0.000	NA		NA
221838	221839	CBU_0818	CBU_0819			FALSE	0.243	57.000	0.000	NA	N	NA
221839	221840	CBU_0819	CBU_0820			FALSE	0.082	74.000	0.000	NA		NA
221842	221843	CBU_0822	CBU_0823		sfcA	FALSE	0.009	446.000	0.000	1.000		NA
221843	221844	CBU_0823	CBU_0824	sfcA	purB	FALSE	0.451	28.000	0.000	1.000	N	NA
221845	221846	CBU_0825	CBU_0826			TRUE	0.736	-13.000	0.000	1.000	N	NA
221846	221847	CBU_0826	CBU_0827			TRUE	0.664	35.000	0.036	NA		NA
221847	221848	CBU_0827	CBU_0828			FALSE	0.081	77.000	0.000	NA		NA
221848	221849	CBU_0828	CBU_0829			TRUE	0.940	15.000	0.094	0.027		NA
221849	221850	CBU_0829	CBU_0830			TRUE	0.999	-3.000	0.511	1.000	Y	NA
221850	221851	CBU_0830	CBU_0831		asnB-1	TRUE	0.992	3.000	0.178	1.000	N	NA
221851	221852	CBU_0831	CBU_0832	asnB-1		TRUE	0.679	1.000	0.000	1.000		NA
221852	221853	CBU_0832	CBU_0833			FALSE	0.524	11.000	0.000	1.000		NA
221853	221854	CBU_0833	CBU_0834			TRUE	0.736	13.000	0.000	1.000	N	NA
221854	221855	CBU_0834	CBU_0835			TRUE	0.564	9.000	0.000	NA		NA
221855	221856	CBU_0835	CBU_0836			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
221856	221857	CBU_0836	CBU_0837			FALSE	0.388	15.000	0.000	NA		NA
221857	221858	CBU_0837	CBU_0838			FALSE	0.013	286.000	0.000	NA		NA
221858	221859	CBU_0838	CBU_0839			FALSE	0.317	136.000	0.000	0.015	Y	NA
221859	221860	CBU_0839	CBU_0840		asnB-2	TRUE	0.874	0.000	0.000	1.000	N	NA
221860	221861	CBU_0840	CBU_0841	asnB-2		TRUE	0.975	7.000	0.061	1.000	N	NA
221861	221862	CBU_0841	CBU_0842		wecB	FALSE	0.149	231.000	0.000	1.000	Y	NA
221862	221863	CBU_0842	CBU_0843	wecB		TRUE	0.896	11.000	0.000	1.000	Y	NA
221864	221865	CBU_0844	CBU_0845			TRUE	0.974	-12.000	0.046	1.000	Y	NA
221866	221867	CBU_0846	CBU_0847	ugd		TRUE	0.711	14.000	0.000	1.000	N	NA
221867	221868	CBU_0847	CBU_0848		pgi	TRUE	0.806	10.000	0.000	1.000	N	NA
221868	221869	CBU_0848	CBU_0849	pgi	galU	TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
221869	221870	CBU_0849	CBU_0850	galU		FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
221870	221871	CBU_0850	CBU_0851		rpsO	FALSE	0.016	256.000	0.000	NA		NA
221871	221872	CBU_0851	CBU_0852	rpsO	pnp	TRUE	0.997	11.000	0.335	1.000	Y	NA
221874	2210017	CBU_0854	CBU_0855			FALSE	0.101	47.000	0.000	NA		NA
2210017	221875	CBU_0855	CBU_0856			FALSE	0.400	-18.000	0.000	NA		NA
221875	221876	CBU_0856	CBU_0857		lpxK	TRUE	0.994	0.000	0.205	1.000	N	NA
221877	221878	CBU_0858	CBU_0859	nadE		TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
221879	221880	CBU_0860	CBU_0861			FALSE	0.082	88.000	0.000	NA		NA
221880	221882	CBU_0861	CBU_0863			FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
221882	221883	CBU_0863	CBU_0864		rpsF	FALSE	0.442	-13.000	0.000	NA		NA
221883	221884	CBU_0864	CBU_0865	rpsF	rpsR	TRUE	0.995	13.000	0.319	0.028	Y	NA
221884	221885	CBU_0865	CBU_0866	rpsR		TRUE	0.954	4.000	0.034	NA		NA
221885	221886	CBU_0866	CBU_0867		rplI	TRUE	0.913	12.000	0.034	NA		NA
221886	221887	CBU_0867	CBU_0868	rplI	dnaB	FALSE	0.358	249.000	0.074	1.000	N	NA
221887	221888	CBU_0868	CBU_0869	dnaB	alr	TRUE	0.973	-3.000	0.035	1.000	N	NA
221888	221889	CBU_0869	CBU_0870	alr		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
2210018	221890	CBU_0871	CBU_0872		udk	FALSE	0.081	81.000	0.000	NA		NA
221890	221891	CBU_0872	CBU_0873	udk		FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
221892	221893	CBU_0874	CBU_0875	aroC	asd	TRUE	0.870	13.000	0.000	1.000	Y	NA
221895	221896	CBU_0877	CBU_0878			FALSE	0.064	114.000	0.000	NA		NA
221896	221898	CBU_0878	CBU_0880			FALSE	0.081	95.000	0.000	NA		NA
221899	5437844	CBU_0881	CBU_0881a			FALSE	0.012	308.000	0.000	NA		NA
5437844	221900	CBU_0881a	CBU_0883			FALSE	0.009	392.000	0.000	NA		NA
221901	221902	CBU_0884	CBU_0885	bipA		FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
221902	221903	CBU_0885	CBU_0886		coaBC	FALSE	0.158	32.000	0.000	NA		NA
221903	5437845	CBU_0886	CBU_0886a	coaBC		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221904	221905	CBU_0888	CBU_0889		dsbA	TRUE	0.994	-3.000	0.308	NA		NA
221905	221906	CBU_0889	CBU_0890	dsbA		FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
221907	2210021	CBU_0891	CBU_0892		truA	TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
2210021	221908	CBU_0892	CBU_0893	truA	accD	TRUE	0.824	31.000	0.044	1.000	N	NA
221908	221909	CBU_0893	CBU_0894	accD	folC	TRUE	0.916	133.000	0.383	1.000	N	NA
221909	221910	CBU_0894	CBU_0895	folC	dedD	TRUE	0.976	-16.000	0.216	NA		NA
221910	221911	CBU_0895	CBU_0896	dedD	dedE	TRUE	0.714	68.000	0.116	NA		NA
221911	221912	CBU_0896	CBU_0897	dedE	purF	TRUE	0.990	9.000	0.262	1.000		NA
221912	221913	CBU_0897	CBU_0898	purF		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221913	221914	CBU_0898	CBU_0899			FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
221914	221915	CBU_0899	CBU_0900			FALSE	0.063	116.000	0.000	NA		NA
221915	221916	CBU_0900	CBU_0901			FALSE	0.013	289.000	0.000	NA		NA
221916	221919	CBU_0901	CBU_0904			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
221922	221923	CBU_0907	CBU_0908		ispZ	TRUE	0.991	3.000	0.224	NA		NA
221924	221925	CBU_0909	CBU_0910			FALSE	0.079	98.000	0.000	NA		NA
221926	221927	CBU_0911	CBU_0912		prpD	FALSE	0.013	294.000	0.000	NA		NA
221927	221928	CBU_0912	CBU_0913	prpD		TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
221928	221929	CBU_0913	CBU_0914			FALSE	0.019	239.000	0.000	NA		NA
221929	221930	CBU_0914	CBU_0915			TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
221931	2210022	CBU_0916	CBU_0917			FALSE	0.313	19.000	0.000	NA		NA
2210022	221932	CBU_0917	CBU_0918			FALSE	0.012	303.000	0.000	NA		NA
221933	221934	CBU_0920	CBU_0921			FALSE	0.169	31.000	0.000	NA		NA
221937	221938	CBU_0924	CBU_0925			TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
221938	221939	CBU_0925	CBU_0926		mmsB	FALSE	0.216	101.000	0.000	NA	N	NA
221939	221940	CBU_0926	CBU_0927	mmsB	mmsA	TRUE	0.965	10.000	0.043	0.001	N	NA
221940	221941	CBU_0927	CBU_0928	mmsA	pdxH	FALSE	0.399	32.000	0.000	1.000	N	NA
221941	221942	CBU_0928	CBU_0929	pdxH		FALSE	0.274	22.000	0.000	1.000		NA
221942	221943	CBU_0929	CBU_0930			FALSE	0.514	-10.000	0.000	1.000		NA
221943	221944	CBU_0930	CBU_0931		glpD	TRUE	0.714	-16.000	0.000	1.000	N	NA
221946	221947	CBU_0933	CBU_0934			TRUE	0.999	1.000	0.688	0.099	N	NA
221947	221948	CBU_0934	CBU_0935			TRUE	0.623	6.000	0.000	1.000		NA
221948	221949	CBU_0935	CBU_0936			FALSE	0.029	193.000	0.000	1.000		NA
2210025	221951	CBU_tRNA-Gly-2	CBU_0939			TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
221951	221952	CBU_0939	CBU_0940		mutY	TRUE	0.838	6.000	0.000	NA	N	NA
221952	221953	CBU_0940	CBU_0941	mutY		TRUE	0.990	-3.000	0.150	NA	N	NA
221955	2210026	CBU_0943	CBU_tRNA-Phe-1			FALSE	0.104	45.000	0.000	NA		NA
221956	221957	CBU_0944	CBU_0945			FALSE	0.018	241.000	0.000	NA		NA
221957	221958	CBU_0945	CBU_0946			FALSE	0.057	125.000	0.000	NA		NA
221958	5437847	CBU_0946	CBU_0946a			FALSE	0.009	389.000	0.000	NA		NA
221960	2210028	CBU_0949	CBU_0950			FALSE	0.085	61.000	0.000	NA		NA
2210028	2210029	CBU_0950	CBU_0951			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
2210029	221961	CBU_0951	CBU_0952			FALSE	0.022	217.000	0.000	NA		NA
221961	221962	CBU_0952	CBU_0953			FALSE	0.082	89.000	0.000	NA		NA
221962	221963	CBU_0953	CBU_0954			FALSE	0.341	37.000	0.000	1.000	N	NA
221963	221964	CBU_0954	CBU_0955			TRUE	0.617	19.000	0.000	1.000	N	NA
221964	221965	CBU_0955	CBU_0956			FALSE	0.049	137.000	0.000	NA		NA
2210030	221967	CBU_0958	CBU_0959			FALSE	0.139	35.000	0.000	NA		NA
221968	221969	CBU_0960	CBU_0961			TRUE	0.540	10.000	0.000	NA		NA
221970	221971	CBU_0962	CBU_0963		bcp	TRUE	0.680	0.000	0.000	1.000		NA
221972	5437848	CBU_0964	CBU_0964a			FALSE	0.014	285.000	0.000	NA		NA
5437848	221973	CBU_0964a	CBU_0965		cydA-2	TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
221973	221974	CBU_0965	CBU_0966	cydA-2	cydB	TRUE	0.999	-3.000	0.953	0.034	Y	NA
221974	221975	CBU_0966	CBU_0967	cydB	ybgT	TRUE	0.949	11.000	0.070	NA		NA
221979	221980	CBU_0971	CBU_0972	pyrD		TRUE	0.903	-3.000	0.003	NA		NA
221981	221982	CBU_0973	CBU_0974			TRUE	0.943	0.000	0.000	1.000	Y	NA
221982	221983	CBU_0974	CBU_0975			TRUE	0.706	25.000	0.000	1.000	Y	NA
221983	221984	CBU_0975	CBU_0976			TRUE	0.982	20.000	0.189	1.000	Y	NA
221984	221985	CBU_0976	CBU_0977			TRUE	0.996	2.000	0.205	0.052	Y	NA
221985	221986	CBU_0977	CBU_0978			FALSE	0.093	51.000	0.000	NA		NA
221987	221988	CBU_0979	CBU_0980			FALSE	0.082	90.000	0.000	NA		NA
221989	221990	CBU_0981	CBU_0982			FALSE	0.085	69.000	0.000	NA		NA
221990	2210031	CBU_0982	CBU_0983			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
2210031	221991	CBU_0983	CBU_0984			FALSE	0.414	-16.000	0.000	NA		NA
221991	221992	CBU_0984	CBU_0985			FALSE	0.180	29.000	0.000	NA		NA
221994	221995	CBU_0987	CBU_0988		ung	TRUE	0.855	4.000	0.000	NA	N	NA
2210032	222000	CBU_tRNA-Leu-3	CBU_0993		def	FALSE	0.177	30.000	0.000	NA		NA
222002	222003	CBU_0995	CBU_0996		ctaB	TRUE	0.968	-3.000	0.064	0.067		NA
222003	222004	CBU_0996	CBU_0997	ctaB		TRUE	0.564	9.000	0.000	NA		NA
222005	222006	CBU_0998	CBU_0999	purA	hflX	TRUE	0.667	21.000	0.002	0.013		NA
222006	222007	CBU_0999	CBU_1000	hflX		TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222007	222008	CBU_1000	CBU_1001			TRUE	0.998	-7.000	0.620	0.035	N	NA
222010	222011	CBU_1003	CBU_1004	bioD		TRUE	0.974	-3.000	0.004	0.003	Y	NA
222011	222012	CBU_1004	CBU_1005		bioH	TRUE	0.972	-10.000	0.163	NA		NA
222012	222013	CBU_1005	CBU_1006	bioH	bioF	TRUE	0.969	-6.000	0.092	NA		NA
222013	222014	CBU_1006	CBU_1007	bioF	bioB	TRUE	0.988	-13.000	0.168	1.000	Y	NA
222015	5437849	CBU_1008	CBU_1008a	bioA		TRUE	0.660	1.000	0.000	NA		NA
5437849	222016	CBU_1008a	CBU_1010			FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
222018	2210034	CBU_1012	CBU_tRNA-Cys-1			FALSE	0.023	210.000	0.000	NA		NA
2210034	2210035	CBU_tRNA-Cys-1	CBU_tRNA-Leu-4			FALSE	0.106	44.000	0.000	NA		NA
222020	222021	CBU_1014	CBU_1015			FALSE	0.008	465.000	0.000	NA		NA
222021	222022	CBU_1015	CBU_1016			FALSE	0.012	299.000	0.000	NA		NA
222022	222023	CBU_1016	CBU_1017			FALSE	0.064	115.000	0.000	NA		NA
222024	222025	CBU_1018	CBU_1019			FALSE	0.113	41.000	0.000	NA		NA
222025	222026	CBU_1019	CBU_1020			FALSE	0.017	252.000	0.000	NA		NA
222027	222028	CBU_1021	CBU_1022			TRUE	0.996	-7.000	0.600	NA		NA
222028	222029	CBU_1022	CBU_1023			FALSE	0.008	785.000	0.000	1.000		NA
222029	5437851	CBU_1023	CBU_1023a			TRUE	0.604	6.000	0.000	NA		NA
222034	5437852	CBU_1028	CBU_1028a			FALSE	0.082	86.000	0.000	NA		NA
222035	222036	CBU_1031	CBU_1032			FALSE	0.366	-21.000	0.000	NA		NA
2210038	222038	CBU_tRNA-Gly-3	CBU_1034		pgsA	FALSE	0.331	18.000	0.000	NA		NA
222039	2210039	CBU_1035	CBU_1036			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
2210039	5437853	CBU_1036	CBU_1035b			FALSE	0.335	-76.000	0.000	NA		NA
5437853	2210041	CBU_1035b	CBU_tRNA-Arg-2			FALSE	0.072	104.000	0.000	NA		NA
5437854	222040	CBU_1035d	CBU_1038	cyoD	cyoC	TRUE	0.998	-3.000	0.400	0.033	Y	NA
222040	222041	CBU_1038	CBU_1039	cyoC	cyoB	TRUE	0.997	-3.000	0.267	0.033	Y	NA
222041	222042	CBU_1039	CBU_1040	cyoB	cyoA	TRUE	0.983	20.000	0.200	0.002	Y	NA
222042	222043	CBU_1040	CBU_1041	cyoA		TRUE	0.574	8.000	0.000	NA		NA
222049	2210043	CBU_1048	CBU_tRNA-Ser-2			FALSE	0.019	239.000	0.000	NA		NA
2210043	222051	CBU_tRNA-Ser-2	CBU_1050		csrA-2	FALSE	0.014	280.000	0.000	NA		NA
222051	222052	CBU_1050	CBU_1051	csrA-2		TRUE	0.621	140.000	0.079	1.000	N	NA
222052	222053	CBU_1051	CBU_1052		alaS	TRUE	0.977	6.000	0.065	1.000	N	NA
222053	222054	CBU_1052	CBU_1053	alaS	recX	TRUE	0.964	-7.000	0.085	1.000		NA
222054	222055	CBU_1053	CBU_1054	recX	recA	TRUE	0.994	-3.000	0.296	1.000		NA
222055	222056	CBU_1054	CBU_1055	recA		FALSE	0.318	88.000	0.003	NA		NA
222057	222058	CBU_1056	CBU_1057	mutS		TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA	N	NA
222058	222059	CBU_1057	CBU_1058			FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
2210044	222060	CBU_1059	CBU_1060		scpB	TRUE	0.990	10.000	0.210	NA	N	NA
222060	222061	CBU_1060	CBU_1061	scpB	scpA	TRUE	0.972	5.000	0.083	NA		NA
5437856	222063	CBU_1061a	CBU_1063			FALSE	0.052	134.000	0.000	NA		NA
222064	222065	CBU_1064	CBU_1065			FALSE	0.189	28.000	0.000	NA		NA
5437857	222068	CBU_1067a	CBU_1069			FALSE	0.021	220.000	0.000	NA		NA
222071	222072	CBU_1072	CBU_1073	tgt		TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222073	222074	CBU_1074	CBU_1075			TRUE	0.950	-13.000	0.045	1.000	N	NA
222075	222076	CBU_1076	CBU_1077		nagZ	FALSE	0.247	67.000	0.000	1.000	N	NA
222076	222077	CBU_1077	CBU_1078	nagZ		TRUE	0.652	4.000	0.000	1.000		NA
222077	222078	CBU_1078	CBU_1079			TRUE	0.594	8.000	0.000	1.000		NA
222078	222079	CBU_1079	CBU_1080			FALSE	0.081	78.000	0.000	NA		NA
222079	222080	CBU_1080	CBU_1081			FALSE	0.083	73.000	0.000	NA		NA
222080	222081	CBU_1081	CBU_1082		miaA	FALSE	0.029	182.000	0.000	NA		NA
222081	222082	CBU_1082	CBU_1083	miaA	mutL	TRUE	0.992	4.000	0.188	0.094	N	NA
222082	222083	CBU_1083	CBU_1084	mutL		FALSE	0.254	61.000	0.000	0.094	N	NA
222083	222084	CBU_1084	CBU_1085			FALSE	0.332	38.000	0.000	1.000	N	NA
222086	222087	CBU_1087	CBU_1088			TRUE	0.951	14.000	0.118	NA		NA
222088	222089	CBU_1089	CBU_1090			FALSE	0.099	48.000	0.000	NA		NA
5437859	222090	CBU_1090a	CBU_1091		vacB	FALSE	0.033	170.000	0.000	NA		NA
222092	222093	CBU_1093	CBU_1094			TRUE	0.998	0.000	0.600	NA	N	NA
2210046	222094	CBU_tRNA-Arg-3	CBU_1095			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222094	222095	CBU_1095	CBU_1096		fumC	TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222095	5437860	CBU_1096	CBU_1096a	fumC		FALSE	0.085	67.000	0.000	NA		NA
5437860	222096	CBU_1096a	CBU_1097		aldC	FALSE	0.036	164.000	0.000	NA		NA
222097	222098	CBU_1098	CBU_1099		lepB-1	FALSE	0.050	136.000	0.000	NA		NA
222098	222099	CBU_1099	CBU_1100	lepB-1		TRUE	0.540	10.000	0.000	NA		NA
5437861	222100	CBU_1100a	CBU_1101			FALSE	0.015	269.000	0.000	NA		NA
222103	222104	CBU_1104	CBU_1105			FALSE	0.051	135.000	0.000	NA		NA
222106	222110	CBU_1107	CBU_1111			FALSE	0.085	68.000	0.000	NA		NA
222110	222111	CBU_1111	CBU_1112			TRUE	0.652	-30.000	0.000	1.000	N	NA
222111	222112	CBU_1112	CBU_1113			FALSE	0.034	168.000	0.000	NA		NA
222115	222116	CBU_1116	CBU_1117	ald	etfA	FALSE	0.449	29.000	0.000	0.032	N	NA
222116	222117	CBU_1117	CBU_1118	etfA	etfB	TRUE	0.939	-3.000	0.000	0.007	Y	NA
222117	222118	CBU_1118	CBU_1119	etfB		TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
222121	222122	CBU_1122	CBU_1123	enhA.3	cbpA	FALSE	0.040	152.000	0.000	NA		NA
222122	222123	CBU_1123	CBU_1124	cbpA		TRUE	0.994	3.000	0.286	NA		NA
222123	222124	CBU_1124	CBU_1125			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222126	222127	CBU_1127	CBU_1128			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
222127	222128	CBU_1128	CBU_1129		nifS	TRUE	0.918	7.000	0.011	1.000		NA
222128	222129	CBU_1129	CBU_1130	nifS		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222129	222130	CBU_1130	CBU_1131			FALSE	0.517	-9.000	0.000	NA		NA
222131	222132	CBU_1132	CBU_1133		suhB	TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222135	222136	CBU_1136	CBU_1137			TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
222136	222137	CBU_1137	CBU_1138			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222137	5437862	CBU_1138	CBU_1138a			FALSE	0.013	288.000	0.000	NA		NA
5437862	222138	CBU_1138a	CBU_1139			FALSE	0.084	72.000	0.000	NA		NA
222140	222141	CBU_1141	CBU_1142	secF	secD	TRUE	0.986	0.000	0.030	0.001	Y	NA
222141	222142	CBU_1142	CBU_1143	secD	yajC	TRUE	0.928	16.000	0.007	NA	Y	NA
222142	222143	CBU_1143	CBU_1144	yajC		FALSE	0.202	27.000	0.000	NA		NA
222145	222146	CBU_1147	CBU_1148	trmU	mfd	TRUE	0.767	12.000	0.000	0.092	N	NA
222146	222148	CBU_1148	CBU_1150	mfd		FALSE	0.047	141.000	0.000	NA		NA
222150	5437863	CBU_1152	CBU_1152a	trpE		FALSE	0.015	276.000	0.000	NA		NA
5437863	222151	CBU_1152a	CBU_1154		trpC	TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
222151	222152	CBU_1154	CBU_1155	trpC	trpBF	TRUE	0.915	-7.000	0.000	0.002	Y	NA
222152	222153	CBU_1155	CBU_1156	trpBF	trpA	TRUE	0.829	17.000	0.000	0.001	Y	NA
222155	222156	CBU_1158	CBU_1159			FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
222156	222157	CBU_1159	CBU_1160			FALSE	0.013	290.000	0.000	NA		NA
222157	222158	CBU_1160	CBU_1161			FALSE	0.085	69.000	0.000	NA		NA
222159	222161	CBU_1162	CBU_1164			FALSE	0.047	141.000	0.000	NA		NA
2210049	222165	CBU_tRNA-Arg-4	CBU_1168			FALSE	0.079	98.000	0.000	NA		NA
222165	222166	CBU_1168	CBU_1169			FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
222166	222167	CBU_1169	CBU_1170			FALSE	0.041	149.000	0.000	NA		NA
222168	2210050	CBU_1171	CBU_1172			FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
2210051	222170	CBU_1174	CBU_1175			TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
222173	222174	CBU_1178	CBU_1179			FALSE	0.108	43.000	0.000	NA		NA
222175	222176	CBU_1180	CBU_1181		thiI	FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
222176	222177	CBU_1181	CBU_1182	thiI	iscS	TRUE	0.997	1.000	0.349	1.000	N	NA
222179	222180	CBU_1184	CBU_1185		uvrC	FALSE	0.218	103.000	0.000	1.000	N	NA
222180	2210052	CBU_1185	CBU_tRNA-Ser-3	uvrC		FALSE	0.169	31.000	0.000	NA		NA
5437865	222182	CBU_1186b	CBU_1187			FALSE	0.022	218.000	0.000	NA		NA
222183	222184	CBU_1188	CBU_1189	serS		TRUE	0.746	76.000	0.078	0.091	N	NA
222184	222185	CBU_1189	CBU_1190		lolA	TRUE	0.977	-16.000	0.167	1.000	N	NA
222185	222186	CBU_1190	CBU_1191	lolA	ftsK	TRUE	0.992	12.000	0.305	1.000	N	NA
222188	222189	CBU_1193	CBU_1194	trxB		FALSE	0.211	26.000	0.000	NA		NA
222189	222190	CBU_1194	CBU_1195		infA	FALSE	0.085	62.000	0.000	NA		NA
222192	222193	CBU_1197	CBU_1198			FALSE	0.082	90.000	0.000	NA		NA
222193	222194	CBU_1198	CBU_1199			FALSE	0.147	34.000	0.000	NA		NA
222195	222196	CBU_1200	CBU_1201	icd	queA	FALSE	0.295	44.000	0.000	1.000	N	NA
222197	222198	CBU_1202	CBU_1203			FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
222198	222199	CBU_1203	CBU_1204			TRUE	0.859	4.000	0.000	1.000	N	NA
222201	222202	CBU_1206	CBU_1207			FALSE	0.331	18.000	0.000	NA		NA
222204	222205	CBU_1209	CBU_1210			FALSE	0.010	359.000	0.000	NA		NA
5437866	222208	CBU_1212a	CBU_1213			FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
222208	222209	CBU_1213	CBU_1214			FALSE	0.085	67.000	0.000	NA		NA
222210	5437867	CBU_1215	CBU_1216a			FALSE	0.050	136.000	0.000	NA		NA
222214	222215	CBU_1219	CBU_1220		purC	TRUE	0.660	1.000	0.000	NA		NA
222215	222216	CBU_1220	CBU_1221	purC		TRUE	0.933	0.000	0.009	NA		NA
222216	222217	CBU_1221	CBU_1222		dapA	TRUE	0.924	17.000	0.088	NA		NA
222217	222218	CBU_1222	CBU_1223	dapA	kdgK	FALSE	0.076	213.000	0.000	1.000	N	NA
5437869	222220	CBU_1224a	CBU_1225			FALSE	0.067	111.000	0.000	NA		NA
222220	222221	CBU_1225	CBU_1226			TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222222	222223	CBU_1227	CBU_1228	qseB		TRUE	0.994	-3.000	0.143	0.055	Y	NA
222223	222224	CBU_1228	CBU_1229			FALSE	0.021	230.000	0.000	NA		NA
222224	222225	CBU_1229	CBU_1230			TRUE	0.977	-3.000	0.098	NA		NA
222228	222229	CBU_1233	CBU_1234			FALSE	0.085	63.000	0.000	NA		NA
222229	222230	CBU_1234	CBU_1235		orn	FALSE	0.037	159.000	0.000	NA		NA
222230	222231	CBU_1235	CBU_1236	orn		FALSE	0.031	177.000	0.000	NA		NA
222232	222233	CBU_1237	CBU_1238			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222235	222236	CBU_1240	CBU_1241	gcp	mdh	TRUE	0.820	9.000	0.000	1.000	N	NA
222236	222237	CBU_1241	CBU_1242	mdh		FALSE	0.087	195.000	0.000	1.000	N	NA
222238	222239	CBU_1243	CBU_1244	xseA		TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222240	222242	CBU_1245	CBU_1247			FALSE	0.122	238.000	0.009	1.000		NA
222242	222243	CBU_1247	CBU_1248		hisS	TRUE	0.960	23.000	0.259	1.000		NA
222243	222244	CBU_1248	CBU_1249	hisS		TRUE	0.944	-3.000	0.021	1.000		NA
222244	222245	CBU_1249	CBU_1250			FALSE	0.049	137.000	0.000	NA		NA
222250	222251	CBU_1256	CBU_1257			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
222253	222254	CBU_1259	CBU_1260			FALSE	0.010	437.000	0.000	0.062		NA
222254	222255	CBU_1260	CBU_1261			FALSE	0.085	98.000	0.000	1.000		NA
222255	222256	CBU_1261	CBU_1262			TRUE	0.914	-3.000	0.007	NA		NA
222256	222257	CBU_1262	CBU_1263			FALSE	0.233	24.000	0.000	NA		NA
222257	222258	CBU_1263	CBU_1264			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
222258	222259	CBU_1264	CBU_1265		lipB	TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222259	222260	CBU_1265	CBU_1266	lipB	lipA	TRUE	0.993	-70.000	0.319	0.001	Y	NA
222260	222261	CBU_1266	CBU_1267	lipA		FALSE	0.413	111.000	0.003	1.000	N	NA
222261	5437870	CBU_1267	CBU_1267a		scvA	FALSE	0.106	44.000	0.000	NA		NA
222262	222263	CBU_1268	CBU_1269			TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
222264	2210055	CBU_1270	CBU_1271			FALSE	0.411	14.000	0.000	NA		NA
2210055	222265	CBU_1271	CBU_1272			FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
222267	222268	CBU_1274	CBU_1275		RspA	TRUE	0.575	-6.000	0.000	NA		NA
222268	222269	CBU_1275	CBU_1276	RspA		TRUE	0.958	31.000	0.333	0.047		NA
222270	222271	CBU_1277	CBU_1278	eda		TRUE	0.782	11.000	0.000	1.000	N	NA
222271	222272	CBU_1278	CBU_1279			FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
222272	5437872	CBU_1279	CBU_1279a			FALSE	0.102	46.000	0.000	NA		NA
222274	222275	CBU_1281	CBU_1282	carB	carA	TRUE	0.966	82.000	0.345	0.001	Y	NA
5437874	222276	CBU_1282a	CBU_1284			FALSE	0.070	106.000	0.000	NA		NA
222276	222277	CBU_1284	CBU_1285			TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222277	222278	CBU_1285	CBU_1286			FALSE	0.084	71.000	0.000	NA		NA
222279	222281	CBU_1287	CBU_1289		dnaJ	FALSE	0.076	100.000	0.000	NA		NA
222281	222282	CBU_1289	CBU_1290	dnaJ	dnaK	TRUE	0.895	143.000	0.236	0.005	Y	NA
222283	222284	CBU_1291	CBU_1292			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222285	222286	CBU_1293	CBU_1294	grpE		FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
222286	222287	CBU_1294	CBU_1295			TRUE	0.973	-10.000	0.167	NA		NA
222288	222289	CBU_1296	CBU_1297		recN	TRUE	0.990	5.000	0.170	1.000	N	NA
222290	222292	CBU_1298	CBU_1300			FALSE	0.043	146.000	0.000	NA		NA
222292	222293	CBU_1300	CBU_1301		fur	FALSE	0.504	11.000	0.000	NA		NA
222295	222296	CBU_1303	CBU_1304			TRUE	0.954	-3.000	0.035	NA		NA
222297	222298	CBU_1305	CBU_1306	smpB	msrA	TRUE	0.911	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
222300	2210057	CBU_1308	CBU_tmRNA		ssrA	FALSE	0.040	152.000	0.000	NA		NA
5437875	222301	CBU_1308a	CBU_1310	hetM		FALSE	0.017	254.000	0.000	NA		NA
222301	222302	CBU_1310	CBU_1311			FALSE	0.202	27.000	0.000	NA		NA
222304	222305	CBU_1313	CBU_1314			FALSE	0.024	209.000	0.000	NA		NA
222305	5437876	CBU_1314	CBU_1314a			FALSE	0.011	317.000	0.000	NA		NA
5437876	222306	CBU_1314a	CBU_1316			FALSE	0.020	233.000	0.000	NA		NA
222307	222308	CBU_1317	CBU_1318			FALSE	0.010	360.000	0.000	NA		NA
222308	2210060	CBU_1318	CBU_tRNA-Pro-3			FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
2210060	222309	CBU_tRNA-Pro-3	CBU_1319			FALSE	0.081	77.000	0.000	NA		NA
222309	222310	CBU_1319	CBU_1320		ihfA	TRUE	0.995	14.000	0.535	1.000	N	NA
222310	222311	CBU_1320	CBU_1321	ihfA	pheT	TRUE	0.993	5.000	0.208	1.000	N	NA
222311	222312	CBU_1321	CBU_1322	pheT	pheS	TRUE	0.999	0.000	0.574	0.001	Y	NA
222312	222313	CBU_1322	CBU_1323	pheS	rplT	TRUE	0.926	77.000	0.202	1.000	Y	NA
222314	222315	CBU_1324	CBU_1325	rpmI	infC	TRUE	0.997	-19.000	0.652	1.000	Y	NA
222315	222316	CBU_1325	CBU_1326	infC	thrS	TRUE	0.918	84.000	0.186	1.000	Y	NA
222319	2210061	CBU_1329	CBU_1330			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
222320	222321	CBU_1331	CBU_1332			FALSE	0.465	-12.000	0.000	NA		NA
222321	5437879	CBU_1332	CBU_1332a			FALSE	0.335	-76.000	0.000	NA		NA
5437879	222322	CBU_1332a	CBU_1333			FALSE	0.400	-18.000	0.000	NA		NA
222325	222326	CBU_1336	CBU_1337		dnaE	FALSE	0.206	109.000	0.000	1.000	N	NA
222326	222327	CBU_1337	CBU_1338	dnaE		TRUE	0.876	2.000	0.000	0.041	N	NA
222327	222328	CBU_1338	CBU_1339		rnhB	FALSE	0.134	147.000	0.000	1.000	N	NA
222328	222329	CBU_1339	CBU_1340	rnhB		FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
222329	222330	CBU_1340	CBU_1341		guaA	FALSE	0.442	-13.000	0.000	NA		NA
222330	222331	CBU_1341	CBU_1342	guaA	guaB	TRUE	0.953	37.000	0.190	0.001	Y	NA
222331	222332	CBU_1342	CBU_1343	guaB		FALSE	0.081	94.000	0.000	NA		NA
222334	222335	CBU_1345	CBU_1346			FALSE	0.128	251.000	0.000	1.000	Y	NA
222337	222338	CBU_1348	CBU_1349			FALSE	0.081	77.000	0.000	NA		NA
222339	222340	CBU_1350	CBU_1351	glmM	folP	TRUE	0.911	89.000	0.260	1.000	N	NA
222340	222341	CBU_1351	CBU_1352	folP	ftsH	TRUE	0.942	52.000	0.325	1.000	N	NA
222341	222342	CBU_1352	CBU_1353	ftsH	rrmJ	TRUE	0.868	20.000	0.019	NA	N	NA
222342	222343	CBU_1353	CBU_1354	rrmJ		FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
222343	222344	CBU_1354	CBU_1355			TRUE	0.992	2.000	0.235	NA		NA
222344	222345	CBU_1355	CBU_1356			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222345	222346	CBU_1356	CBU_1357		csdB	TRUE	0.932	-7.000	0.006	1.000	N	NA
222346	222347	CBU_1357	CBU_1358	csdB		TRUE	0.935	-7.000	0.007	1.000	N	NA
222347	222348	CBU_1358	CBU_1359			TRUE	0.999	-3.000	0.482	1.000	Y	NA
222348	222349	CBU_1359	CBU_1360		sufB	TRUE	0.992	24.000	0.466	1.000	Y	NA
222349	222350	CBU_1360	CBU_1361	sufB		TRUE	0.952	-19.000	0.078	NA	N	NA
222351	222352	CBU_1362	CBU_1363			TRUE	0.810	-7.000	0.000	1.000	N	NA
222352	222353	CBU_1363	CBU_1364			FALSE	0.085	66.000	0.000	NA		NA
222355	222356	CBU_1366	CBU_1367			FALSE	0.029	182.000	0.000	NA		NA
222359	222360	CBU_1370	CBU_1371			FALSE	0.027	193.000	0.000	NA		NA
222360	222361	CBU_1371	CBU_1372			FALSE	0.044	144.000	0.000	NA		NA
222362	222363	CBU_1373	CBU_1374	pabB		TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
222365	5437880	CBU_1376	CBU_1376a			FALSE	0.022	214.000	0.000	NA		NA
222367	5437881	CBU_1378	CBU_1379a			FALSE	0.007	1237.000	0.000	NA		NA
222369	222370	CBU_1380	CBU_1381		cdsA	FALSE	0.030	178.000	0.000	NA		NA
222370	222371	CBU_1381	CBU_1382	cdsA	uppS	TRUE	0.997	-10.000	0.400	1.000	Y	NA
222371	222372	CBU_1382	CBU_1383	uppS	frr	TRUE	0.997	-3.000	0.409	1.000	N	NA
222372	222373	CBU_1383	CBU_1384	frr	pyrH	TRUE	0.968	78.000	0.626	1.000	N	NA
222373	222374	CBU_1384	CBU_1385	pyrH	tsf	TRUE	0.998	0.000	0.416	1.000	N	NA
222374	222375	CBU_1385	CBU_1386	tsf	rpsB	TRUE	0.999	10.000	0.748	1.000	Y	NA
222376	222377	CBU_1387	CBU_1388		map	FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
2210063	2210064	CBU_1390	CBU_1391		comA	FALSE	0.189	28.000	0.000	NA		NA
5437882	2210065	CBU_1388d	CBU_1393			FALSE	0.014	281.000	0.000	NA		NA
222380	222381	CBU_1395	CBU_1396		sucD	TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222381	222382	CBU_1396	CBU_1397	sucD	sucC	TRUE	0.999	0.000	0.806	0.001	Y	NA
222382	222383	CBU_1397	CBU_1398	sucC	sucB	TRUE	0.696	202.000	0.136	1.000	Y	NA
222383	222384	CBU_1398	CBU_1399	sucB	sucA	TRUE	0.999	10.000	0.667	1.000	Y	NA
222384	222385	CBU_1399	CBU_1400	sucA	sdhB	TRUE	0.941	24.000	0.067	1.000	Y	NA
222385	222386	CBU_1400	CBU_1401	sdhB	sdhA	TRUE	0.999	7.000	0.604	0.002	Y	NA
222386	222387	CBU_1401	CBU_1402	sdhA	sdhD	TRUE	0.998	13.000	0.705	0.002	Y	NA
222387	222388	CBU_1402	CBU_1403	sdhD	sdhC	TRUE	0.997	-12.000	0.453	0.001	Y	NA
222388	222389	CBU_1403	CBU_1404	sdhC		FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
222390	222392	CBU_1406	CBU_1408			FALSE	0.095	50.000	0.000	NA		NA
222393	222394	CBU_1409	CBU_1410		gltA	FALSE	0.020	234.000	0.000	NA		NA
222394	222395	CBU_1410	CBU_1411	gltA		FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
222396	222397	CBU_1412	CBU_1413			FALSE	0.284	23.000	0.000	0.009		NA
222397	222398	CBU_1413	CBU_1414			FALSE	0.126	44.000	0.000	0.009		NA
222398	222399	CBU_1414	CBU_1415		thiL	FALSE	0.088	92.000	0.000	1.000		NA
222401	222402	CBU_1417	CBU_1418	nusB		TRUE	0.961	-10.000	0.012	NA	Y	NA
222402	222403	CBU_1418	CBU_1419			TRUE	0.972	0.000	0.024	NA	N	NA
222408	222409	CBU_1424	CBU_1425	hemB		TRUE	0.636	18.000	0.000	1.000	N	NA
222411	5437884	CBU_1427	CBU_1427a			FALSE	0.442	-13.000	0.000	NA		NA
222413	5437885	CBU_1429	CBU_1429a			FALSE	0.008	460.000	0.000	NA		NA
2210067	222414	CBU_1430	CBU_1431	truB	rbfA	TRUE	0.993	-22.000	0.318	1.000	Y	NA
222414	222415	CBU_1431	CBU_1432	rbfA	infB	TRUE	0.977	88.000	0.530	1.000	Y	NA
222415	222416	CBU_1432	CBU_1433	infB	nusA	TRUE	0.996	6.000	0.342	1.000	N	NA
222416	222417	CBU_1433	CBU_1434	nusA		TRUE	0.998	4.000	0.759	NA		NA
222417	2210068	CBU_1434	CBU_tRNA-Met-1			FALSE	0.085	61.000	0.000	NA		NA
2210068	222418	CBU_tRNA-Met-1	CBU_1435		nuoN	FALSE	0.018	241.000	0.000	NA		NA
222418	222419	CBU_1435	CBU_1436	nuoN	nuoM	TRUE	0.997	10.000	0.340	0.003	Y	NA
222419	222420	CBU_1436	CBU_1437	nuoM	nuoL	TRUE	0.995	5.000	0.175	0.003	Y	NA
222420	222421	CBU_1437	CBU_1438	nuoL	nuoK	TRUE	0.973	57.000	0.451	0.010	Y	NA
222421	222422	CBU_1438	CBU_1439	nuoK	nuoJ	TRUE	0.999	-3.000	0.484	0.005	Y	NA
222422	222423	CBU_1439	CBU_1440	nuoJ	nuoI	TRUE	0.996	14.000	0.442	0.010	Y	NA
222423	222424	CBU_1440	CBU_1441	nuoI	nuoH	TRUE	0.997	-18.000	0.500	0.010	Y	NA
222424	222425	CBU_1441	CBU_1442	nuoH	nuoG	TRUE	0.999	0.000	0.515	0.010	Y	NA
222425	222426	CBU_1442	CBU_1443	nuoG	nuoF	TRUE	0.961	111.000	0.395	0.010	Y	NA
222426	222427	CBU_1443	CBU_1444	nuoF	nuoE	TRUE	0.997	-10.000	0.343	0.009	Y	NA
222427	222428	CBU_1444	CBU_1445	nuoE	nuoD	TRUE	0.998	0.000	0.355	0.009	Y	NA
222428	222429	CBU_1445	CBU_1446	nuoD	nuoC	TRUE	0.998	-7.000	0.483	0.010	Y	NA
222429	222430	CBU_1446	CBU_1447	nuoC	nuoB	TRUE	0.997	10.000	0.328	0.005	Y	NA
222430	222431	CBU_1447	CBU_1448	nuoB	nuoA	TRUE	0.999	5.000	0.507	0.005	Y	NA
222431	2210069	CBU_1448	CBU_tRNA-Leu-5	nuoA		FALSE	0.026	200.000	0.000	NA		NA
2210069	222432	CBU_tRNA-Leu-5	CBU_1449		secG	TRUE	0.540	10.000	0.000	NA		NA
222432	222433	CBU_1449	CBU_1450	secG	tpiA	TRUE	0.980	-18.000	0.184	1.000	N	NA
222433	222434	CBU_1450	CBU_1451	tpiA		FALSE	0.008	805.000	0.000	1.000		NA
222434	222435	CBU_1451	CBU_1452			FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
222435	222440	CBU_1452	CBU_1457			FALSE	0.070	105.000	0.000	NA		NA
222443	222444	CBU_1460	CBU_1461			FALSE	0.007	506.000	0.000	NA		NA
222444	5437887	CBU_1461	CBU_1462a			FALSE	0.102	46.000	0.000	NA		NA
5437887	2210070	CBU_1462a	CBU_tRNA-Asp-1			FALSE	0.084	71.000	0.000	NA		NA
2210070	2210071	CBU_tRNA-Asp-1	CBU_tRNA-Val-2			FALSE	0.073	103.000	0.000	NA		NA
2210071	222446	CBU_tRNA-Val-2	CBU_1463			FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
222446	222447	CBU_1463	CBU_1464		hupB	TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222448	222449	CBU_1465	CBU_1466			TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
222450	222451	CBU_1467	CBU_1468	tldD		TRUE	0.579	71.000	0.050	NA		NA
222451	222452	CBU_1468	CBU_1469		mreD	TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
222452	222453	CBU_1469	CBU_1470	mreD	mreC	TRUE	0.999	6.000	0.550	0.004	Y	NA
222453	222454	CBU_1470	CBU_1471	mreC	mreB	TRUE	0.970	83.000	0.689	1.000	N	NA
222455	222456	CBU_1472	CBU_1473		gatC	FALSE	0.041	148.000	0.000	NA		NA
222456	222457	CBU_1473	CBU_1474	gatC	gatA	TRUE	0.999	4.000	0.643	0.002	Y	NA
222457	222458	CBU_1474	CBU_1475	gatA	gatB	TRUE	0.999	5.000	0.492	0.002	Y	NA
222460	222461	CBU_1477	CBU_1478		ahpD	TRUE	0.880	19.000	0.058	1.000		NA
222462	222463	CBU_1479	CBU_1480			FALSE	0.233	24.000	0.000	NA		NA
222463	222464	CBU_1480	CBU_1481			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222464	222465	CBU_1481	CBU_1482			FALSE	0.021	221.000	0.000	NA		NA
222465	222466	CBU_1482	CBU_1483			TRUE	0.998	0.000	0.330	NA	Y	NA
222470	222471	CBU_1487	CBU_1488	cysS	gltX-2	TRUE	0.971	-9.000	0.021	0.084	Y	NA
222473	222474	CBU_1490	CBU_1491	higA		TRUE	0.604	6.000	0.000	NA		NA
222475	222476	CBU_1492	CBU_1493			FALSE	0.011	328.000	0.000	NA		NA
222477	222478	CBU_1494	CBU_1495	pdxJ		FALSE	0.099	48.000	0.000	NA		NA
222478	222480	CBU_1495	CBU_1497			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222480	222481	CBU_1497	CBU_1498			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222481	222484	CBU_1498	CBU_1501		recO	FALSE	0.030	178.000	0.000	NA		NA
222484	222485	CBU_1501	CBU_1502	recO	era	TRUE	0.979	-3.000	0.109	1.000		NA
222485	222486	CBU_1502	CBU_1503	era		TRUE	0.983	-3.000	0.127	0.023		NA
222486	222487	CBU_1503	CBU_1504		lepB-2	TRUE	0.944	21.000	0.117	1.000	N	NA
222487	222488	CBU_1504	CBU_1505	lepB-2	lepA	TRUE	0.992	-3.000	0.187	1.000	N	NA
222488	222489	CBU_1505	CBU_1506	lepA		FALSE	0.054	136.000	0.000	1.000		NA
222489	222490	CBU_1506	CBU_1507			FALSE	0.372	17.000	0.000	1.000		NA
222490	222491	CBU_1507	CBU_1508			FALSE	0.262	23.000	0.000	1.000		NA
222491	222492	CBU_1508	CBU_1509		tilS	FALSE	0.087	78.000	0.000	1.000		NA
222492	222493	CBU_1509	CBU_1510	tilS	accA	TRUE	0.963	-24.000	0.123	1.000	N	NA
222495	222496	CBU_1512	CBU_1513			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222497	222498	CBU_1514	CBU_1515			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222498	222499	CBU_1515	CBU_1516			FALSE	0.036	164.000	0.000	NA		NA
222499	222500	CBU_1516	CBU_1517			FALSE	0.013	289.000	0.000	NA		NA
222501	222502	CBU_1518	CBU_1519	gpsA	secB	FALSE	0.527	69.000	0.008	1.000	N	NA
222502	222503	CBU_1519	CBU_1520	secB	grxC	TRUE	0.987	13.000	0.221	1.000	N	NA
222503	222504	CBU_1520	CBU_1521	grxC		TRUE	0.989	5.000	0.166	NA	N	NA
222504	222505	CBU_1521	CBU_1522			FALSE	0.095	50.000	0.000	NA		NA
222508	5437888	CBU_1525	CBU_1526a			FALSE	0.090	53.000	0.000	NA		NA
222512	222513	CBU_1529	CBU_1530			FALSE	0.085	67.000	0.000	NA		NA
222513	5437889	CBU_1530	CBU_1530a			FALSE	0.118	39.000	0.000	NA		NA
222519	222520	CBU_1536	CBU_1537	yibO		TRUE	0.991	4.000	0.170	1.000	N	NA
222520	222521	CBU_1537	CBU_1538			TRUE	0.997	-3.000	0.408	0.023	N	NA
222521	222522	CBU_1538	CBU_1539			FALSE	0.518	24.000	0.000	1.000	N	NA
222522	222523	CBU_1539	CBU_1540			FALSE	0.202	27.000	0.000	NA		NA
222523	222524	CBU_1540	CBU_1541			FALSE	0.147	34.000	0.000	NA		NA
222525	222526	CBU_1542	CBU_1543			FALSE	0.011	314.000	0.000	NA		NA
222526	222527	CBU_1543	CBU_1544			FALSE	0.062	117.000	0.000	NA		NA
222530	222531	CBU_1547	CBU_1548	thyA		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222531	222532	CBU_1548	CBU_1549		lgt	TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
222532	222533	CBU_1549	CBU_1550	lgt	ptsP	TRUE	0.568	55.000	0.011	1.000	N	NA
222533	222534	CBU_1550	CBU_1551	ptsP		TRUE	0.960	-19.000	0.097	1.000	N	NA
222534	222535	CBU_1551	CBU_1552			FALSE	0.089	54.000	0.000	NA		NA
5437890	222536	CBU_1552a	CBU_1553		nrdA	FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
222536	222537	CBU_1553	CBU_1554	nrdA	nrdB	TRUE	0.982	50.000	0.564	0.001	Y	NA
222537	222538	CBU_1554	CBU_1555	nrdB		FALSE	0.043	294.000	0.000	1.000	N	NA
222538	222539	CBU_1555	CBU_1556			FALSE	0.068	110.000	0.000	NA		NA
222539	222541	CBU_1556	CBU_1558			FALSE	0.009	387.000	0.000	NA		NA
222541	222542	CBU_1558	CBU_1559			TRUE	0.988	-3.000	0.190	NA		NA
222542	5437891	CBU_1559	CBU_1559a			FALSE	0.033	169.000	0.000	NA		NA
5437891	222543	CBU_1559a	CBU_1560			FALSE	0.097	49.000	0.000	NA		NA
222543	222544	CBU_1560	CBU_1561			FALSE	0.082	83.000	0.000	NA		NA
222548	222549	CBU_1565	CBU_1566	aspS		TRUE	0.880	16.000	0.039	NA		NA
222549	222550	CBU_1566	CBU_1567		ruvC	TRUE	0.844	115.000	0.277	NA		NA
222550	222551	CBU_1567	CBU_1568	ruvC	ruvA	TRUE	0.999	-3.000	0.451	0.014	Y	NA
222551	222552	CBU_1568	CBU_1569	ruvA		FALSE	0.076	100.000	0.000	NA		NA
222552	222553	CBU_1569	CBU_1570		ruvB	FALSE	0.068	110.000	0.000	NA		NA
222553	5437892	CBU_1570	CBU_1570a	ruvB		FALSE	0.082	86.000	0.000	NA		NA
222556	222557	CBU_1573	CBU_1574		tolQ	FALSE	0.248	76.000	0.000	0.030	N	NA
222557	222558	CBU_1574	CBU_1575	tolQ	tolR	TRUE	0.996	-22.000	0.556	0.030	Y	NA
222558	222559	CBU_1575	CBU_1576	tolR		FALSE	0.045	143.000	0.000	NA		NA
222560	222561	CBU_1577	CBU_1578			TRUE	0.667	3.000	0.000	1.000		NA
222562	222563	CBU_1579	CBU_1580			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222563	222564	CBU_1580	CBU_1581			FALSE	0.009	411.000	0.000	NA		NA
222565	222566	CBU_1582	CBU_1583			TRUE	0.999	-7.000	0.614	1.000	Y	NA
222566	222567	CBU_1583	CBU_1584			TRUE	0.999	-3.000	0.644	0.057	Y	NA
222567	222568	CBU_1584	CBU_1585			TRUE	0.999	-3.000	0.810	1.000	Y	NA
222568	222569	CBU_1585	CBU_1586			TRUE	0.999	-3.000	0.896	0.009	Y	NA
222569	222570	CBU_1586	CBU_1587			TRUE	0.997	-3.000	0.500	NA		NA
222570	222571	CBU_1587	CBU_1588			TRUE	0.997	-3.000	0.493	NA		NA
222571	222572	CBU_1588	CBU_1589			FALSE	0.059	121.000	0.000	NA		NA
222573	5437894	CBU_1590	CBU_1590a			FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
222576	222577	CBU_1593	CBU_1594	rpsU		TRUE	0.909	28.000	0.173	0.037		NA
222577	222578	CBU_1594	CBU_1595		dnaG	TRUE	0.810	41.000	0.137	1.000		NA
222578	222579	CBU_1595	CBU_1596	dnaG	rpoD	TRUE	0.897	120.000	0.299	1.000	N	NA
2210072	222583	CBU_tRNA-Met-2	CBU_1600			FALSE	0.085	65.000	0.000	NA		NA
222584	222585	CBU_1601	CBU_1602		rimK	TRUE	0.969	-3.000	0.023	1.000	N	NA
222585	222586	CBU_1602	CBU_1603	rimK		TRUE	0.951	3.000	0.023	1.000		NA
222586	222587	CBU_1603	CBU_1604			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
2210073	222589	CBU_1606	CBU_1607			FALSE	0.152	33.000	0.000	NA		NA
222589	222590	CBU_1607	CBU_1608			FALSE	0.010	339.000	0.000	NA		NA
222590	222594	CBU_1608	CBU_1612			FALSE	0.029	182.000	0.000	NA		NA
222594	222595	CBU_1612	CBU_1613			FALSE	0.072	104.000	0.000	NA		NA
222595	222596	CBU_1613	CBU_1614			FALSE	0.152	33.000	0.000	NA		NA
222596	222597	CBU_1614	CBU_1615			FALSE	0.061	118.000	0.000	NA		NA
222597	222599	CBU_1615	CBU_1617			FALSE	0.139	35.000	0.000	NA		NA
222600	222601	CBU_1618	CBU_1619			FALSE	0.086	57.000	0.000	NA		NA
222601	222603	CBU_1619	CBU_1621			FALSE	0.022	218.000	0.000	NA		NA
222604	222605	CBU_1622	CBU_1623			TRUE	0.874	73.000	0.267	NA		NA
222605	222606	CBU_1623	CBU_1624			FALSE	0.441	13.000	0.000	NA		NA
222606	222607	CBU_1624	CBU_1625			FALSE	0.081	94.000	0.000	NA		NA
222607	222608	CBU_1625	CBU_1626			FALSE	0.084	71.000	0.000	NA		NA
222608	222609	CBU_1626	CBU_1627		icmE	TRUE	0.972	18.000	0.250	NA		NA
222609	222610	CBU_1627	CBU_1628	icmE	icmK	TRUE	0.982	-13.000	0.250	NA		NA
222610	222611	CBU_1628	CBU_1629	icmK		TRUE	0.997	11.000	1.000	NA		NA
222611	222612	CBU_1629	CBU_1630			TRUE	0.657	2.000	0.000	NA		NA
222612	222613	CBU_1630	CBU_1631		icmN	TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
222613	222614	CBU_1631	CBU_1632	icmN		TRUE	0.560	10.000	0.000	1.000		NA
222614	222615	CBU_1632	CBU_1633			TRUE	0.980	-24.000	0.308	NA		NA
222615	222616	CBU_1633	CBU_1634			TRUE	0.997	1.000	0.500	NA		NA
222616	5437896	CBU_1634	CBU_1634a			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222618	222620	CBU_1636	CBU_1638			FALSE	0.082	85.000	0.000	NA		NA
222620	222621	CBU_1638	CBU_1639			FALSE	0.066	112.000	0.000	NA		NA
222623	222624	CBU_1641	CBU_1642			TRUE	0.996	0.000	0.400	NA		NA
222624	222625	CBU_1642	CBU_1643		dotD	FALSE	0.038	157.000	0.000	NA		NA
222625	222626	CBU_1643	CBU_1644	dotD	dotC	TRUE	0.998	3.000	0.667	NA		NA
222626	222627	CBU_1644	CBU_1645	dotC	dotB	TRUE	0.945	38.000	0.364	NA		NA
222627	222628	CBU_1645	CBU_1646	dotB		TRUE	0.632	7.000	0.000	0.029		NA
222629	222630	CBU_1647	CBU_1648		dotaA	FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
222630	222631	CBU_1648	CBU_1649	dotaA	icmV	TRUE	0.998	-3.000	0.750	NA		NA
222632	222633	CBU_1650	CBU_1651			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222633	222634	CBU_1651	CBU_1652			FALSE	0.371	16.000	0.000	NA		NA
222634	222635	CBU_1652	CBU_1653			FALSE	0.082	88.000	0.000	NA		NA
222635	5437899	CBU_1653	CBU_1653a			FALSE	0.025	201.000	0.000	NA		NA
222637	222638	CBU_1655	CBU_1656	rfaE		TRUE	0.574	8.000	0.000	NA		NA
222638	222639	CBU_1656	CBU_1657			FALSE	0.035	167.000	0.000	NA		NA
222639	222640	CBU_1657	CBU_1658			FALSE	0.513	41.000	0.000	NA	Y	NA
222641	222642	CBU_1659	CBU_1660			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222643	222644	CBU_1661	CBU_1662	rfaF		TRUE	0.983	4.000	0.138	NA		NA
222644	222645	CBU_1662	CBU_1663			FALSE	0.085	61.000	0.000	NA		NA
222647	222648	CBU_1665	CBU_1666			FALSE	0.116	40.000	0.000	NA		NA
222648	222651	CBU_1666	CBU_1669		rpoS	FALSE	0.017	248.000	0.000	NA		NA
222651	222652	CBU_1669	CBU_1670	rpoS		FALSE	0.500	80.000	0.027	1.000		NA
222652	222653	CBU_1670	CBU_1671		surE	TRUE	0.947	2.000	0.018	1.000		NA
222653	222655	CBU_1671	CBU_1673	surE		FALSE	0.091	69.000	0.000	1.000		NA
222655	222656	CBU_1673	CBU_1674		eno	TRUE	0.993	7.000	0.241	1.000	N	NA
222656	222657	CBU_1674	CBU_1675	eno	kdsA	TRUE	0.660	157.000	0.125	1.000	N	NA
222658	222659	CBU_1676	CBU_1677			FALSE	0.084	70.000	0.000	NA		NA
222660	222661	CBU_1678	CBU_1679	speG		FALSE	0.030	178.000	0.000	NA		NA
222663	222664	CBU_1681	CBU_1682		pyrG	FALSE	0.113	41.000	0.000	NA		NA
222664	222665	CBU_1682	CBU_1683	pyrG		FALSE	0.139	35.000	0.000	NA		NA
222666	222667	CBU_1684	CBU_1685			FALSE	0.082	75.000	0.000	NA		NA
222667	222668	CBU_1685	CBU_1686			FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
2210074	222669	CBU_1687	CBU_1688			FALSE	0.039	154.000	0.000	NA		NA
222669	222670	CBU_1688	CBU_1689			TRUE	0.988	0.000	0.112	1.000	N	NA
222672	222673	CBU_1691	CBU_1692			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
222676	222677	CBU_1695	CBU_1696	metG		TRUE	0.947	-7.000	0.014	1.000	N	NA
222677	222678	CBU_1696	CBU_1697		nth	TRUE	0.951	-13.000	0.048	1.000	N	NA
222679	222680	CBU_1698	CBU_1699			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222684	222685	CBU_1703	CBU_1704	pyrC	rnt	TRUE	0.959	-13.000	0.068	1.000	N	NA
222686	222687	CBU_1705	CBU_1706			FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
222687	222688	CBU_1706	CBU_1707			FALSE	0.123	38.000	0.000	NA		NA
222689	222690	CBU_1708	CBU_1709	sodB	dapB	TRUE	0.871	2.000	0.000	1.000	N	NA
222690	222691	CBU_1709	CBU_1710	dapB		TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222691	222692	CBU_1710	CBU_1711			FALSE	0.037	159.000	0.000	NA		NA
222692	222693	CBU_1711	CBU_1712			FALSE	0.353	17.000	0.000	NA		NA
222694	222695	CBU_1713	CBU_1714			TRUE	0.961	68.000	0.316	0.001	Y	NA
222695	222696	CBU_1714	CBU_1715		gcvH	TRUE	0.997	3.000	0.249	1.000	Y	NA
222696	222697	CBU_1715	CBU_1716	gcvH	gcvT	TRUE	0.996	11.000	0.317	0.002	Y	NA
5437905	222699	CBU_1716b	CBU_1718		groEL	FALSE	0.082	84.000	0.000	NA		NA
222699	222700	CBU_1718	CBU_1719	groEL	groES	TRUE	0.673	28.000	0.000	0.007	Y	NA
222701	222702	CBU_1720	CBU_1721	acnA		FALSE	0.524	11.000	0.000	1.000		NA
222705	5437906	CBU_1724	CBU_1724a			FALSE	0.008	433.000	0.000	NA		NA
222706	222707	CBU_1725	CBU_1726	accB	accC	TRUE	0.997	7.000	0.275	0.002	Y	NA
222708	222709	CBU_1727	CBU_1728	arcB		TRUE	0.810	-7.000	0.000	1.000	N	NA
222709	222710	CBU_1728	CBU_1729		hemF	TRUE	0.577	35.000	0.000	1.000	Y	NA
222710	222711	CBU_1729	CBU_1730	hemF		FALSE	0.088	90.000	0.000	1.000		NA
2210075	222712	CBU_1731	CBU_1732			TRUE	0.662	0.000	0.000	NA		NA
222712	222713	CBU_1732	CBU_1733			FALSE	0.045	143.000	0.000	NA		NA
222714	222715	CBU_1734	CBU_1735			TRUE	0.987	3.000	0.174	NA		NA
222716	222717	CBU_1736	CBU_1737	purM	purN	TRUE	0.997	-3.000	0.230	0.002	Y	NA
222717	222718	CBU_1737	CBU_1738	purN	hipB	FALSE	0.240	86.000	0.000	1.000	N	NA
222719	222720	CBU_1739	CBU_1740			FALSE	0.082	82.000	0.000	NA		NA
222721	222722	CBU_1741	CBU_1742			TRUE	0.811	50.000	0.172	NA		NA
222722	222723	CBU_1742	CBU_1743		gmhA	TRUE	0.991	6.000	0.187	1.000	N	NA
222723	222724	CBU_1743	CBU_1744	gmhA		TRUE	0.998	0.000	0.613	NA		NA
222725	222726	CBU_1745	CBU_1746		sspB	FALSE	0.082	88.000	0.000	NA		NA
222726	222727	CBU_1746	CBU_1747	sspB	sspA	TRUE	0.998	2.000	0.831	NA		NA
222727	222728	CBU_1747	CBU_1748	sspA	rpsI	TRUE	0.745	31.000	0.014	NA	N	NA
222728	222729	CBU_1748	CBU_1749	rpsI	rplM	TRUE	0.996	19.000	0.601	0.022	Y	NA
5437907	222731	CBU_1749a	CBU_1751			FALSE	0.010	386.000	0.000	NA		NA
222731	222732	CBU_1751	CBU_1752			FALSE	0.132	36.000	0.000	NA		NA
222732	222733	CBU_1752	CBU_1753			FALSE	0.082	74.000	0.000	NA		NA
222734	222735	CBU_1754	CBU_1755			TRUE	0.540	10.000	0.000	NA		NA
222741	222742	CBU_1761	CBU_1762			FALSE	0.096	54.000	0.000	1.000		NA
222745	222746	CBU_1765	CBU_1766		feoB	TRUE	0.997	0.000	0.455	NA		NA
222746	222747	CBU_1766	CBU_1767	feoB	feoA	TRUE	0.997	1.000	0.229	1.000	Y	NA
222747	222748	CBU_1767	CBU_1768	feoA		FALSE	0.085	62.000	0.000	NA		NA
222748	222749	CBU_1768	CBU_1769			FALSE	0.085	63.000	0.000	NA		NA
222749	222750	CBU_1769	CBU_1770			FALSE	0.077	104.000	0.000	1.000		NA
222750	222751	CBU_1770	CBU_1771			TRUE	0.985	98.000	1.000	1.000	Y	NA
222751	222752	CBU_1771	CBU_1772			FALSE	0.021	235.000	0.000	1.000		NA
222754	222755	CBU_1774	CBU_1775			FALSE	0.032	171.000	0.000	NA		NA
222757	222758	CBU_1777	CBU_1778		fbaA	FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
222761	222762	CBU_1781	CBU_1782	pyk	pgk	TRUE	0.939	-13.000	0.002	0.006	Y	NA
222762	222763	CBU_1782	CBU_1783	pgk	gap	TRUE	0.732	72.000	0.017	0.006	Y	NA
222763	222764	CBU_1783	CBU_1784	gap	tkt	TRUE	0.953	15.000	0.022	1.000	Y	NA
5437911	222766	CBU_1785a	CBU_1786			FALSE	0.083	73.000	0.000	NA		NA
222767	222768	CBU_1787	CBU_1788	glmS		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222768	5437912	CBU_1788	CBU_1788a			FALSE	0.038	157.000	0.000	NA		NA
222775	222776	CBU_1796	CBU_1797			TRUE	0.846	5.000	0.000	NA	N	NA
222776	222777	CBU_1797	CBU_1798			FALSE	0.162	129.000	0.000	NA	N	NA
222777	5437914	CBU_1798	CBU_1799a			FALSE	0.083	73.000	0.000	NA		NA
222778	222779	CBU_1799	CBU_1800			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222779	222780	CBU_1800	CBU_1801			TRUE	0.564	9.000	0.000	NA		NA
222780	222781	CBU_1801	CBU_1802			FALSE	0.233	24.000	0.000	NA		NA
222782	222783	CBU_1803	CBU_1804			FALSE	0.313	19.000	0.000	NA		NA
222783	222784	CBU_1804	CBU_1805			TRUE	0.860	14.000	0.000	0.010	Y	NA
222785	5437915	CBU_1806	CBU_1806a			FALSE	0.008	441.000	0.000	NA		NA
5437915	222787	CBU_1806a	CBU_1808			FALSE	0.011	333.000	0.000	NA		NA
222787	222788	CBU_1808	CBU_1809			TRUE	0.976	-10.000	0.044	1.000	Y	NA
222788	222789	CBU_1809	CBU_1810			TRUE	0.966	-7.000	0.044	1.000	N	NA
222789	222790	CBU_1810	CBU_1811			TRUE	0.940	3.000	0.000	1.000	Y	NA
222791	222792	CBU_1812	CBU_1813			FALSE	0.384	-19.000	0.000	NA		NA
222792	222793	CBU_1813	CBU_1814			FALSE	0.128	37.000	0.000	NA		NA
222795	222796	CBU_1816	CBU_1817	efp		TRUE	0.990	5.000	0.082	0.036	Y	NA
222796	222797	CBU_1817	CBU_1818			FALSE	0.021	221.000	0.000	NA		NA
222797	222798	CBU_1818	CBU_1819			FALSE	0.090	53.000	0.000	NA		NA
222799	222800	CBU_1820	CBU_1821			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222800	222801	CBU_1821	CBU_1822		sodC	FALSE	0.068	116.000	0.000	1.000		NA
222808	2210077	CBU_1829	CBU_tRNA-Gln-1			FALSE	0.081	79.000	0.000	NA		NA
2210077	222809	CBU_tRNA-Gln-1	CBU_1830		prsA	FALSE	0.258	22.000	0.000	NA		NA
222809	222810	CBU_1830	CBU_1831	prsA		TRUE	0.618	5.000	0.000	NA		NA
222810	5437916	CBU_1831	CBU_1831a			FALSE	0.007	539.000	0.000	NA		NA
222814	222815	CBU_1835	CBU_1836			TRUE	0.993	2.000	0.200	NA	N	NA
222815	222816	CBU_1836	CBU_1837			TRUE	0.704	14.000	0.000	NA	N	NA
222816	222817	CBU_1837	CBU_1838		rfbC	TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
222817	222818	CBU_1838	CBU_1839	rfbC		TRUE	0.560	10.000	0.000	1.000		NA
222819	222820	CBU_1840	CBU_1841		pth	TRUE	0.998	7.000	0.496	0.035	Y	NA
222820	222821	CBU_1841	CBU_1842	pth		TRUE	0.956	33.000	0.184	1.000	Y	NA
222821	222822	CBU_1842	CBU_1843			TRUE	0.633	4.000	0.000	NA		NA
222822	2210078	CBU_1843	CBU_tRNA-Met-3			FALSE	0.085	66.000	0.000	NA		NA
2210078	5437917	CBU_tRNA-Met-3	CBU_1843a			FALSE	0.041	149.000	0.000	NA		NA
5437917	2210079	CBU_1843a	CBU_1844			FALSE	0.078	99.000	0.000	NA		NA
2210079	222823	CBU_1844	CBU_1845			FALSE	0.074	102.000	0.000	NA		NA
222824	222825	CBU_1846	CBU_1847			FALSE	0.061	118.000	0.000	NA		NA
5437918	5437919	CBU_1847a	CBU_1847b			FALSE	0.085	69.000	0.000	NA		NA
222826	222827	CBU_1849	CBU_1850			FALSE	0.022	218.000	0.000	NA		NA
222828	222829	CBU_1851	CBU_1852			TRUE	0.547	-7.000	0.000	NA		NA
222830	222831	CBU_1853	CBU_1854			FALSE	0.082	83.000	0.000	NA		NA
222831	222832	CBU_1854	CBU_1855		pilF	FALSE	0.009	392.000	0.000	NA		NA
222832	222833	CBU_1855	CBU_1856	pilF		FALSE	0.215	27.000	0.000	1.000		NA
222833	222834	CBU_1856	CBU_1857			FALSE	0.105	49.000	0.000	1.000		NA
222834	222835	CBU_1857	CBU_1858			FALSE	0.066	118.000	0.000	1.000		NA
222835	222836	CBU_1858	CBU_1859		oppB	TRUE	0.999	11.000	0.738	0.023	Y	NA
222836	222837	CBU_1859	CBU_1860	oppB	oppA	FALSE	0.254	25.000	0.000	0.023		NA
222840	222841	CBU_1863	CBU_1864			FALSE	0.016	264.000	0.000	NA		NA
222841	222842	CBU_1864	CBU_1865			FALSE	0.272	21.000	0.000	NA		NA
222842	222843	CBU_1865	CBU_1866		parC	TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222846	222847	CBU_1869	CBU_1870			FALSE	0.013	287.000	0.000	NA		NA
222848	222849	CBU_1871	CBU_1872	pabA	rpe	TRUE	0.688	-19.000	0.000	1.000	N	NA
222849	222850	CBU_1872	CBU_1873	rpe	djlA	TRUE	0.953	0.000	0.003	1.000	N	NA
222851	222852	CBU_1874	CBU_1875		gshB	TRUE	0.739	54.000	0.120	1.000		NA
222852	222853	CBU_1875	CBU_1876	gshB		FALSE	0.009	407.000	0.000	NA		NA
222854	222855	CBU_1877	CBU_1878			FALSE	0.043	145.000	0.000	NA		NA
222856	222857	CBU_1879	CBU_1880			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222859	222860	CBU_1882	CBU_1883	hemL		TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
222860	222861	CBU_1883	CBU_1884			TRUE	0.649	3.000	0.000	NA		NA
222863	222864	CBU_1886	CBU_1887		ponA	TRUE	0.540	10.000	0.000	NA		NA
222865	222866	CBU_1888	CBU_1889		pilN	TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222866	222867	CBU_1889	CBU_1890	pilN		FALSE	0.037	158.000	0.000	NA		NA
222867	222868	CBU_1890	CBU_1891		pilQ	FALSE	0.384	-19.000	0.000	NA		NA
222868	222869	CBU_1891	CBU_1892	pilQ	aroK	TRUE	0.981	-67.000	0.319	1.000		NA
222869	222870	CBU_1892	CBU_1893	aroK	aroB	TRUE	0.996	-3.000	0.208	1.000	Y	NA
222871	5437921	CBU_1894	CBU_1894a			FALSE	0.246	23.000	0.000	NA		NA
5437923	222876	CBU_1896b	CBU_1899			FALSE	0.091	52.000	0.000	NA		NA
222876	222878	CBU_1899	CBU_1901			FALSE	0.126	496.000	0.070	1.000		NA
222878	222879	CBU_1901	CBU_1902			TRUE	0.998	0.000	0.598	0.005		NA
222880	222881	CBU_1903	CBU_1904	ftsY	ftsE	TRUE	0.985	7.000	0.117	1.000	N	NA
222881	222882	CBU_1904	CBU_1905	ftsE	ftsX	TRUE	0.993	-3.000	0.121	1.000	Y	NA
222882	222883	CBU_1905	CBU_1906	ftsX		FALSE	0.110	42.000	0.000	NA		NA
222884	222885	CBU_1907	CBU_1908			FALSE	0.169	31.000	0.000	NA		NA
222886	222887	CBU_1909	CBU_1910	rpoH	com1	FALSE	0.486	26.000	0.000	1.000	N	NA
222890	222891	CBU_1913	CBU_1914	glyQ	glyS	TRUE	0.999	-6.000	0.651	0.001	Y	NA
222891	222892	CBU_1914	CBU_1915	glyS	sun	TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
222894	222895	CBU_1917	CBU_1918	rpmH	rnpA	TRUE	0.998	-3.000	0.787	1.000		NA
222895	222896	CBU_1918	CBU_1919	rnpA		TRUE	0.965	36.000	0.540	NA		NA
222896	222897	CBU_1919	CBU_1920			TRUE	0.996	4.000	0.461	NA		NA
222897	222898	CBU_1920	CBU_1921			FALSE	0.043	145.000	0.000	NA		NA
222898	222899	CBU_1921	CBU_1922		trmE	FALSE	0.028	185.000	0.000	NA		NA
222899	222901	CBU_1922	CBU_1924	trmE	gidA	FALSE	0.468	313.000	0.266	1.000		NA
222901	222902	CBU_1924	CBU_1925	gidA	gidB	TRUE	0.978	32.000	0.466	1.000	N	NA
222902	222903	CBU_1925	CBU_1926	gidB	soj	TRUE	0.996	7.000	0.339	1.000	N	NA
222903	222904	CBU_1926	CBU_1927	soj	parB	TRUE	0.998	-9.000	0.827	1.000	N	NA
222904	222905	CBU_1927	CBU_1928	parB		TRUE	0.806	10.000	0.000	1.000	N	NA
222905	222906	CBU_1928	CBU_1929			FALSE	0.462	-13.000	0.000	1.000		NA
222906	222907	CBU_1929	CBU_1930			FALSE	0.091	52.000	0.000	NA		NA
222907	5437924	CBU_1930	CBU_1930a			FALSE	0.082	82.000	0.000	NA		NA
5437924	222908	CBU_1930a	CBU_1931			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
222910	222911	CBU_1933	CBU_1934			TRUE	0.654	-3.000	0.000	1.000		NA
222911	5437925	CBU_1934	CBU_1934a			FALSE	0.085	63.000	0.000	NA		NA
222913	2210081	CBU_1936	CBU_1937			FALSE	0.014	277.000	0.000	NA		NA
222914	222915	CBU_1938	CBU_1939	atpI	atpB	TRUE	0.998	1.000	0.291	0.004	Y	NA
222915	222916	CBU_1939	CBU_1940	atpB	atpE	TRUE	0.990	18.000	0.557	0.004		NA
222916	222917	CBU_1940	CBU_1941	atpE	atpF	TRUE	0.932	129.000	0.666	0.004		NA
222917	222918	CBU_1941	CBU_1942	atpF	atpH	TRUE	0.997	0.000	0.242	0.004	Y	NA
222918	222919	CBU_1942	CBU_1943	atpH	atpA	TRUE	0.999	8.000	0.864	0.004	Y	NA
222919	222920	CBU_1943	CBU_1944	atpA	atpG	TRUE	0.984	99.000	0.846	0.004	Y	NA
222920	222921	CBU_1944	CBU_1945	atpG	atpD	TRUE	0.990	36.000	0.724	0.004	Y	NA
222921	222922	CBU_1945	CBU_1946	atpD	atpC	TRUE	0.978	124.000	0.837	0.004	Y	NA
222922	222923	CBU_1946	CBU_1947	atpC	glmU	TRUE	0.930	19.000	0.067	1.000	N	NA
222923	5437926	CBU_1947	CBU_1947a	glmU		FALSE	0.015	267.000	0.000	NA		NA
5437926	222924	CBU_1947a	CBU_1948			FALSE	0.292	20.000	0.000	NA		NA
222924	2210082	CBU_1948	CBU_1949			FALSE	0.055	128.000	0.000	NA		NA
222926	222927	CBU_1951	CBU_1952			FALSE	0.085	66.000	0.000	NA		NA
222928	222929	CBU_1953	CBU_1954			FALSE	0.019	238.000	0.000	NA		NA
222930	222931	CBU_1955	CBU_1956	pntAA	pntAB	TRUE	0.737	383.000	0.829	0.001		NA
222931	222932	CBU_1956	CBU_1957	pntAB	pntB	TRUE	0.995	-3.000	0.321	0.001		NA
222932	222933	CBU_1957	CBU_1958	pntB		FALSE	0.202	27.000	0.000	NA		NA
222939	222940	CBU_1964	CBU_1965	hemK	prfA	TRUE	0.997	3.000	0.229	0.035	Y	NA
222940	222941	CBU_1965	CBU_1966	prfA	hemA	TRUE	0.991	-3.000	0.171	0.035	N	NA
222943	222944	CBU_1968	CBU_1969	folB	dksA	FALSE	0.295	44.000	0.000	1.000	N	NA
222944	222945	CBU_1969	CBU_1970	dksA	dapF	FALSE	0.145	142.000	0.000	1.000	N	NA
222945	222946	CBU_1970	CBU_1971	dapF		FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
222946	222947	CBU_1971	CBU_1972			FALSE	0.025	201.000	0.000	NA		NA
222947	222948	CBU_1972	CBU_1973			FALSE	0.388	15.000	0.000	NA		NA
222949	222950	CBU_1974	CBU_1975			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222951	222952	CBU_1976	CBU_1977			TRUE	0.997	6.000	0.642	NA		NA
222953	222955	CBU_1978	CBU_1980	ostA		TRUE	0.958	6.000	0.014	1.000	N	NA
222955	222956	CBU_1980	CBU_1981		pdxA	TRUE	0.998	0.000	0.561	1.000	N	NA
222956	222957	CBU_1981	CBU_1982	pdxA	ksgA	TRUE	0.764	152.000	0.197	1.000	N	NA
222957	222958	CBU_1982	CBU_1983	ksgA	uspA	FALSE	0.198	113.000	0.000	1.000	N	NA
222958	222959	CBU_1983	CBU_1984	uspA		FALSE	0.033	169.000	0.000	NA		NA
222959	222960	CBU_1984	CBU_1985			FALSE	0.104	45.000	0.000	NA		NA
222960	222961	CBU_1985	CBU_1986			FALSE	0.092	64.000	0.000	1.000		NA
222961	222962	CBU_1986	CBU_1987		apaH	FALSE	0.462	13.000	0.000	1.000		NA
222962	5437929	CBU_1987	CBU_1987a	apaH		FALSE	0.041	149.000	0.000	NA		NA
5437929	5437930	CBU_1987a	CBU_1987b			FALSE	0.082	86.000	0.000	NA		NA
222966	222967	CBU_1991	CBU_1992			TRUE	0.963	0.000	0.042	NA		NA
222968	222969	CBU_1993	CBU_1994	folA		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222971	222972	CBU_1996	CBU_1997		fmt	TRUE	0.736	13.000	0.000	1.000	N	NA
222973	222974	CBU_1998	CBU_1999		smg	TRUE	0.981	-3.000	0.124	NA		NA
222974	222975	CBU_1999	CBU_2000	smg	topA	TRUE	0.959	3.000	0.040	NA		NA
222977	222978	CBU_2002	CBU_2003	purE		TRUE	0.970	3.000	0.023	NA	N	NA
222978	5437932	CBU_2003	CBU_2003a			FALSE	0.008	443.000	0.000	NA		NA
222979	222980	CBU_2004	CBU_2005			TRUE	0.827	8.000	0.000	1.000	N	NA
222980	222981	CBU_2005	CBU_2006			TRUE	0.937	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
222981	222982	CBU_2006	CBU_2007			FALSE	0.097	49.000	0.000	NA		NA
222983	222984	CBU_2008	CBU_2009	argS		TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222984	222985	CBU_2009	CBU_2010			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
222985	222986	CBU_2010	CBU_2011		hslV	FALSE	0.027	191.000	0.000	NA		NA
222986	222987	CBU_2011	CBU_2012	hslV	hslU	TRUE	0.995	25.000	0.752	1.000	Y	NA
222990	222991	CBU_2016	CBU_2017		ubiE	FALSE	0.081	80.000	0.000	NA		NA
222991	222992	CBU_2017	CBU_2018	ubiE		TRUE	0.985	0.000	0.145	1.000		NA
222992	222993	CBU_2018	CBU_2019			TRUE	0.996	-3.000	0.432	1.000		NA
222994	222995	CBU_2020	CBU_2021			FALSE	0.085	62.000	0.000	NA		NA
222995	2210084	CBU_2021	CBU_2022			FALSE	0.097	49.000	0.000	NA		NA
2210084	222996	CBU_2022	CBU_2023			TRUE	0.589	7.000	0.000	NA		NA
222997	222998	CBU_2024	CBU_2025		metC	FALSE	0.438	79.000	0.000	0.009	Y	NA
222999	223000	CBU_2026	CBU_2027			FALSE	0.097	49.000	0.000	NA		NA
223000	223001	CBU_2027	CBU_2028			FALSE	0.024	209.000	0.000	NA		NA
223001	223002	CBU_2028	CBU_2029			FALSE	0.081	94.000	0.000	NA		NA
223003	223004	CBU_2030	CBU_2031	metK	ahcY	TRUE	0.993	2.000	0.114	0.001	Y	NA
223004	223005	CBU_2031	CBU_2032	ahcY		FALSE	0.471	27.000	0.000	1.000	N	NA
223010	2210085	CBU_2037	CBU_2039			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
2210085	223012	CBU_2039	CBU_2040			TRUE	0.635	-3.000	0.000	NA		NA
223012	223013	CBU_2040	CBU_2041			FALSE	0.225	26.000	0.000	1.000		NA
223013	223014	CBU_2041	CBU_2042			TRUE	0.685	-3.000	0.000	0.001		NA
223014	223015	CBU_2042	CBU_2044			FALSE	0.010	338.000	0.000	NA		NA
223017	223018	CBU_2046	CBU_2047		metF	FALSE	0.081	79.000	0.000	NA		NA
223018	223019	CBU_2047	CBU_2048	metF	metE	TRUE	0.926	18.000	0.009	0.001	Y	NA
223019	223020	CBU_2048	CBU_2049	metE	trpS	FALSE	0.094	185.000	0.000	1.000	N	NA
223020	223021	CBU_2049	CBU_2050	trpS		FALSE	0.158	32.000	0.000	NA		NA
223021	5437934	CBU_2050	CBU_2051a			FALSE	0.057	127.000	0.000	NA		NA
5437934	223023	CBU_2051a	CBU_2052			FALSE	0.085	64.000	0.000	NA		NA
223025	223026	CBU_2054	CBU_2055	uvrD		TRUE	0.860	-3.000	0.000	1.000	N	NA
223027	223028	CBU_2056	CBU_2057			FALSE	0.028	189.000	0.000	NA		NA
223028	223029	CBU_2057	CBU_2058			FALSE	0.009	418.000	0.000	NA		NA
223029	223030	CBU_2058	CBU_2059			FALSE	0.030	178.000	0.000	NA		NA
223030	223032	CBU_2059	CBU_2061			FALSE	0.048	138.000	0.000	NA		NA
223036	2210087	CBU_2065	CBU_2066			FALSE	0.384	-19.000	0.000	NA		NA
2210087	223037	CBU_2066	CBU_2067			FALSE	0.473	12.000	0.000	NA		NA
223037	223038	CBU_2067	CBU_2068			TRUE	0.998	-61.000	1.000	0.022	Y	NA
223038	223039	CBU_2068	CBU_2069			FALSE	0.343	141.000	0.004	1.000	N	NA
223039	223040	CBU_2069	CBU_2070			TRUE	0.658	17.000	0.000	1.000	N	NA
223041	223042	CBU_2071	CBU_2072			FALSE	0.021	220.000	0.000	NA		NA
223042	223043	CBU_2072	CBU_2073			FALSE	0.132	36.000	0.000	NA		NA
223043	223044	CBU_2073	CBU_2074		hemC	TRUE	0.714	-16.000	0.000	1.000	N	NA
223044	223045	CBU_2074	CBU_2075	hemC	aroD	TRUE	0.874	0.000	0.000	1.000	N	NA
223045	223046	CBU_2075	CBU_2076	aroD		TRUE	0.560	10.000	0.000	1.000		NA
223046	223047	CBU_2076	CBU_2077		hemD	FALSE	0.514	-10.000	0.000	1.000		NA
223049	223050	CBU_2079	CBU_2080			FALSE	0.081	81.000	0.000	NA		NA
223050	223051	CBU_2080	CBU_2081		hemY	TRUE	0.999	5.000	0.765	1.000	Y	NA
223051	223052	CBU_2081	CBU_2082	hemY		TRUE	0.863	3.000	0.000	NA	N	NA
223052	223053	CBU_2082	CBU_2083		queC	FALSE	0.331	18.000	0.000	NA		NA
223053	223054	CBU_2083	CBU_2084	queC		FALSE	0.015	276.000	0.000	NA		NA
223054	223055	CBU_2084	CBU_2085			TRUE	0.935	12.000	0.059	NA		NA
223056	223057	CBU_2086	CBU_2087	rho	trx	FALSE	0.416	176.000	0.087	1.000		NA
223059	223060	CBU_2089	CBU_2090		proC	TRUE	0.984	-3.000	0.152	1.000		NA
223060	223061	CBU_2090	CBU_2091	proC		TRUE	0.984	-3.000	0.158	NA		NA
223061	223062	CBU_2091	CBU_2092		pckA	FALSE	0.493	-10.000	0.000	NA		NA
223063	223064	CBU_2093	CBU_2094	algH		TRUE	0.993	-7.000	0.263	NA	N	NA
223064	223065	CBU_2094	CBU_2095		pyrB	TRUE	0.954	-7.000	0.022	1.000	N	NA
2209918	2209920	CBUA0001	CBUA0003			FALSE	0.056	134.000	0.000	1.000		NA
2209920	2209921	CBUA0003	CBUA0005			FALSE	0.008	593.000	0.000	1.000		NA
2209921	2209922	CBUA0005	CBUA0006			FALSE	0.016	255.000	0.000	NA		NA
2209924	5437789	CBUA0008	CBUA0008b			FALSE	0.015	271.000	0.000	NA		NA
2209928	2209929	CBUA0013	CBUA0014			FALSE	0.009	387.000	0.000	NA		NA
2209929	2209930	CBUA0014	CBUA0015			FALSE	0.008	456.000	0.000	NA		NA
2209930	2209931	CBUA0015	CBUA0016			FALSE	0.233	24.000	0.000	NA		NA
2209935	2209936	CBUA0020	CBUA0021			FALSE	0.202	27.000	0.000	NA		NA
2209942	5437790	CBUA0027	CBUA0028			TRUE	0.997	0.000	0.500	NA		NA
5437790	2209944	CBUA0028	CBUA0029			FALSE	0.082	87.000	0.000	NA		NA
2209945	2209946	CBUA0031	CBUA0032			TRUE	0.884	-10.000	0.012	NA		NA
2209946	2209947	CBUA0032	CBUA0033			FALSE	0.028	190.000	0.000	NA		NA
2209948	2209949	CBUA0034	CBUA0036			FALSE	0.007	930.000	0.000	NA		NA
2209950	2209951	CBUA0037	CBUA0038			TRUE	0.996	-7.000	0.444	1.000	N	NA
2209951	2209952	CBUA0038	CBUA0039			TRUE	0.752	57.000	0.133	1.000		NA
2209952	2209953	CBUA0039	CBUA0040			FALSE	0.088	55.000	0.000	NA		NA
2209953	2209918	CBUA0040	CBUA0001			FALSE	0.008	494.000	0.000	NA		NA