MicrobesOnline Operon Predictions for Shewanella piezotolerans WP3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5432681 5432682 swp_0007 swp_tRNA1     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 5432682 5432683 swp_tRNA1 swp_tRNA2     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5432684 5432685 swp_0008 swp_0009     TRUE 0.737 172.000 0.481 NA   NA
 5432687 5432688 swp_0011 swp_0012     TRUE 0.779 118.000 0.221 1.000   NA
 5432688 5432689 swp_0012 swp_0013     FALSE 0.223 225.000 0.105 1.000 N NA
 5432689 5432690 swp_0013 swp_0014     TRUE 0.989 9.000 0.787 1.000   NA
 5432691 5432692 swp_0015 swp_0016     TRUE 0.969 20.000 0.328 1.000 Y NA
 5432692 5432693 swp_0016 swp_0017     TRUE 0.929 116.000 0.318 1.000 Y NA
 5432693 5432694 swp_0017 swp_0018     TRUE 0.978 17.000 0.249 0.005 Y NA
 5432694 5432695 swp_0018 swp_0019     FALSE 0.329 132.000 0.003 1.000 N NA
 5432696 5432697 swp_0020 swp_0021     TRUE 0.995 12.000 0.651 0.001 Y NA
 5432699 5432700 swp_0023 swp_0024     FALSE 0.008 266.000 0.000 1.000   NA
 5432700 5432701 swp_0024 swp_0025     FALSE 0.574 32.000 0.043 1.000   NA
 5432701 5432702 swp_0025 swp_0026     FALSE 0.078 148.000 0.012 NA   NA
 5432702 5432703 swp_0026 swp_0027     FALSE 0.171 33.000 0.012 NA   NA
 5432706 5432707 swp_0030 swp_0031     TRUE 0.924 21.000 0.400 NA   NA
 5432707 5432708 swp_0031 swp_0032     TRUE 0.896 10.000 0.105 NA   NA
 5432708 5432709 swp_0032 swp_0033     FALSE 0.141 250.000 0.158 NA   NA
 5432710 5432711 swp_0034 swp_0035     TRUE 0.983 19.000 0.607 1.000 Y NA
 5432712 5432713 swp_0036 swp_0037     FALSE 0.008 368.000 0.000 1.000 N NA
 5432713 5432714 swp_0037 swp_0038     TRUE 0.879 31.000 0.211 1.000 N NA
 5432714 5432715 swp_0038 swp_0039     TRUE 0.912 79.000 0.400 1.000 N NA
 5432715 5432716 swp_0039 swp_0040     TRUE 0.956 -3.000 0.118 0.074 N NA
 5432716 5432717 swp_0040 swp_0041     FALSE 0.554 28.000 0.000 0.030   NA
 5432717 5432718 swp_0041 swp_0042     FALSE 0.588 2.000 0.000 1.000   NA
 5432718 5432719 swp_0042 swp_0043     FALSE 0.434 -3.000 0.000 1.000   NA
 5432719 5432720 swp_0043 swp_0044     TRUE 0.980 8.000 0.483 NA   NA
 5432720 5432721 swp_0044 swp_0045     TRUE 0.990 4.000 0.724 NA   NA
 5432721 5432722 swp_0045 swp_0046     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5432722 5432723 swp_0046 swp_0047     TRUE 0.730 58.000 0.127 1.000   NA
 5432723 5432724 swp_0047 swp_0048     FALSE 0.548 180.000 0.202 1.000   NA
 5432724 5432725 swp_0048 swp_0049     TRUE 0.735 109.000 0.118 1.000 N NA
 5432728 5432729 swp_0052 swp_0053     TRUE 0.946 28.000 0.126 0.005 Y NA
 5432729 5432730 swp_0053 swp_0054     TRUE 0.953 8.000 0.122 1.000 N NA
 5432730 5432731 swp_0054 swp_0056     TRUE 0.991 0.000 0.305 1.000 Y NA
 5432731 5432732 swp_0056 swp_0057     TRUE 0.987 5.000 0.105 0.023 Y NA
 5432733 5432734 swp_0058 swp_0059     FALSE 0.523 60.000 0.043 1.000   NA
 5432734 5432735 swp_0059 swp_0060     TRUE 0.941 3.000 0.124 NA   NA
 5432737 5432738 swp_0062 swp_0063     TRUE 0.735 99.000 0.151 NA N NA
 5432738 5432739 swp_0063 swp_0064     TRUE 0.705 26.000 0.066 NA N NA
 5432741 5432742 swp_0066 swp_0067     FALSE 0.670 24.000 0.078 NA   NA
 5432744 5432745 swp_rRNA11 swp_0069     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5432745 5432746 swp_0069 swp_rRNA12     FALSE 8.13603512686146e-05 1309.000 0.000 NA   NA
 5432746 5432747 swp_rRNA12 swp_rRNA13     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5432748 5432749 swp_0070 swp_0071     FALSE 0.001 266.000 0.000 NA   NA
 5432751 5432752 swp_0073 swp_0075     TRUE 0.891 9.000 0.060 1.000   NA
 5432752 5432753 swp_0075 swp_0076     TRUE 0.750 34.000 0.036 0.051 N NA
 5432753 5432754 swp_0076 swp_0077     TRUE 0.973 2.000 0.170 1.000 N NA
 5432755 5432756 swp_0078 swp_0080     FALSE 0.239 225.000 0.158 NA N NA
 5432756 5432757 swp_0080 swp_0081     TRUE 0.975 5.000 0.206 1.000 N NA
 5432757 5432758 swp_0081 swp_0082     FALSE 0.136 133.000 0.017 NA   NA
 5432759 5432760 swp_0083 swp_0084     TRUE 0.920 16.000 0.194 1.000 N NA
 5432761 5432762 swp_0085 swp_0086     TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 5432762 5432763 swp_0086 swp_0087     TRUE 0.972 -3.000 0.463 NA   NA
 5432763 5432764 swp_0087 swp_0088     TRUE 0.870 -22.000 0.433 NA   NA
 5432764 5432765 swp_0088 swp_0089     TRUE 0.976 0.000 0.222 1.000 N NA
 5432766 5432767 swp_0090 swp_0091     FALSE 0.024 102.000 0.000 NA   NA
 5432768 5432769 swp_0092 swp_0093     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5432770 5432771 swp_0094 swp_0095     TRUE 0.805 1.000 0.000 1.000 N NA
 5432772 5432773 swp_0096 swp_0097     TRUE 0.938 15.000 0.220 1.000 N NA
 5432774 5432775 swp_0098 swp_0099     FALSE 0.000 867.000 0.000 NA   NA
 5432776 5432777 swp_0100 swp_0101     FALSE 0.025 266.000 0.014 NA N NA
 5432780 5432781 swp_0104 swp_0105     FALSE 0.000 367.000 0.000 NA   NA
 5432781 5432782 swp_0105 swp_0106     TRUE 0.926 62.000 0.271 NA Y NA
 5432782 5432783 swp_0106 swp_0108     TRUE 0.966 11.000 0.292 1.000   NA
 5432784 5432785 swp_0109 swp_0110     TRUE 0.766 21.000 0.053 1.000 N NA
 5432785 5432786 swp_0110 swp_0111     TRUE 0.947 -3.000 0.238 NA   NA
 5432786 5432787 swp_0111 swp_0112     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5432789 5432790 swp_0114 swp_0115     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5432790 5432791 swp_0115 swp_0116     FALSE 0.024 103.000 0.000 NA   NA
 5432792 5432793 swp_0117 swp_0118     FALSE 0.591 -28.000 0.125 NA   NA
 5432793 5432794 swp_0118 swp_0119     TRUE 0.688 69.000 0.132 NA   NA
 5432795 5432796 swp_0120 swp_0121     FALSE 0.002 243.000 0.000 NA   NA
 5432796 5432797 swp_0121 swp_0122     FALSE 0.051 19.000 0.000 NA   NA
 5432798 5432799 swp_0123 swp_0124     FALSE 0.001 317.000 0.000 NA   NA
 5432802 5432803 swp_0127 swp_0128     TRUE 0.967 -7.000 0.500 1.000 N NA
 5432803 5432804 swp_0128 swp_0129     TRUE 0.949 -10.000 0.667 NA   NA
 5432804 5432805 swp_0129 swp_0130     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5432807 5432808 swp_0132 swp_0133     FALSE 0.633 124.000 0.077 1.000 N NA
 5432808 5432809 swp_0133 swp_0134     TRUE 0.995 4.000 0.315 0.001 Y NA
 5432811 5432812 swp_0136 swp_0137     FALSE 0.000 391.000 0.000 NA   NA
 5432815 5432816 swp_0140 swp_0141     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5432816 5432817 swp_0141 swp_0142     FALSE 0.625 94.000 0.115 NA   NA
 5432819 5432820 swp_0144 swp_0145     TRUE 0.820 20.000 0.080 1.000 N NA
 5432820 5432821 swp_0145 swp_0146     TRUE 0.789 42.000 0.024 1.000 Y NA
 5432822 5432823 swp_0148 swp_0149     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5432823 5432824 swp_0149 swp_0150     FALSE 0.049 -9.000 0.000 NA   NA
 5432824 5432825 swp_0150 swp_0151     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5432825 5432826 swp_0151 swp_0152     TRUE 0.976 8.000 0.385 NA   NA
 5432827 5432828 swp_0153 swp_0154     FALSE 0.009 265.000 0.000 1.000   NA
 5432828 5432829 swp_0154 swp_0155     TRUE 0.905 162.000 0.333 0.061 Y NA
 5432829 5432830 swp_0155 swp_0156     FALSE 0.000 388.000 0.000 NA   NA
 5432830 5432831 swp_0156 swp_0157     FALSE 0.005 200.000 0.000 NA   NA
 5432833 5432834 swp_0159 swp_0160     TRUE 0.982 -3.000 0.706 NA   NA
 5432836 5432837 swp_0162 swp_0163     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5432837 5432838 swp_0163 swp_0164     FALSE 0.028 63.000 0.000 NA   NA
 5432838 5432839 swp_0164 swp_0165     FALSE 0.010 257.000 0.000 1.000   NA
 5432839 5432840 swp_0165 swp_0166     TRUE 0.986 15.000 0.323 0.004 Y NA
 5432842 5432843 swp_0168 swp_0169     FALSE 0.002 707.000 0.000 1.000 N NA
 5432844 5432845 swp_0170 swp_0171     TRUE 0.928 0.000 0.052 1.000 N NA
 5432847 5432848 swp_0173 swp_0174     TRUE 0.945 32.000 0.775 NA   NA
 5432850 5432851 swp_0176 swp_0177     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5432852 5432853 swp_0178 swp_0179     FALSE 0.077 204.000 0.000 1.000 N NA
 5432853 5432854 swp_0179 swp_0180     FALSE 0.096 317.000 0.000 0.018 Y NA
 5432854 5432855 swp_0180 swp_0181     TRUE 0.981 -3.000 0.684 NA   NA
 5432855 5432856 swp_0181 swp_0182     FALSE 0.003 228.000 0.000 NA   NA
 5432856 5432857 swp_0182 swp_0183     FALSE 0.107 245.000 0.048 1.000 N NA
 5432857 5432858 swp_0183 swp_0184     TRUE 0.895 16.000 0.140 1.000 N NA
 5432859 5432860 swp_0185 swp_0186     TRUE 0.977 85.000 0.575 0.006 Y NA
 5432860 5432861 swp_0186 swp_0187     TRUE 0.962 -85.000 0.776 0.006 Y NA
 5432861 5432862 swp_0187 swp_0188     TRUE 0.997 4.000 0.653 0.006 Y NA
 5432862 5432863 swp_0188 swp_0189     TRUE 0.979 65.000 0.599 0.006 Y NA
 5432863 5432864 swp_0189 swp_0190     TRUE 0.894 -37.000 0.425 0.006   NA
 5432864 5432865 swp_0190 swp_0191     TRUE 0.993 0.000 0.605 0.006   NA
 5432865 5432866 swp_0191 swp_0192     TRUE 0.977 -19.000 0.569 0.006 Y NA
 5432866 5432867 swp_0192 swp_0193     TRUE 0.984 15.000 0.461 1.000 Y NA
 5432867 5432868 swp_0193 swp_0194     TRUE 0.975 46.000 0.537 0.072 Y NA
 5432868 5432869 swp_0194 swp_0195     TRUE 0.997 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5432869 5432870 swp_0195 swp_0196     TRUE 0.985 10.000 0.649 1.000   NA
 5432870 5432871 swp_0196 swp_0197     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5432873 5432874 swp_0199 swp_0200     TRUE 0.925 32.000 0.373 1.000 N NA
 5432874 5432875 swp_0200 swp_0201     FALSE 0.170 101.000 0.017 NA   NA
 5432876 5432877 swp_0202 swp_0203     TRUE 0.962 0.000 0.214 NA   NA
 5432877 5432878 swp_0203 swp_0204     FALSE 0.145 206.000 0.025 1.000 N NA
 5432882 5432883 swp_0208 swp_0209     FALSE 0.000 623.000 0.000 NA   NA
 5432884 5432885 swp_rRNA14 swp_0210     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5432885 5432886 swp_0210 swp_rRNA15     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5432886 5432887 swp_rRNA15 swp_0211     FALSE 0.009 -783.000 0.000 NA   NA
 5432887 5432888 swp_0211 swp_rRNA16     FALSE 0.000 790.000 0.000 NA   NA
 5432891 5432892 swp_0214 swp_0215     TRUE 0.991 4.000 0.810 NA   NA
 5432892 5432893 swp_0215 swp_0216     FALSE 0.003 217.000 0.000 NA   NA
 5432895 5432896 swp_0218 swp_0219     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5432897 5432898 swp_0220 swp_0221     TRUE 0.929 29.000 0.556 NA   NA
 5432898 5432899 swp_0221 swp_0222     FALSE 0.001 326.000 0.000 NA   NA
 5432899 5432900 swp_0222 swp_0223     FALSE 0.010 165.000 0.000 NA   NA
 5432901 5432902 swp_0224 swp_0225     FALSE 0.049 20.000 0.000 NA   NA
 5432903 5432904 swp_0226 swp_0227     FALSE 0.113 11.000 0.000 NA   NA
 5432905 5432906 swp_0230 swp_0231     FALSE 0.461 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5432908 5432909 swp_0233 swp_0234     FALSE 0.387 104.000 0.045 NA   NA
 5432909 5432910 swp_0234 swp_0235     TRUE 0.975 14.000 0.750 NA   NA
 5432910 5432911 swp_0235 swp_0237     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   NA
 5432913 5432914 swp_0238 swp_0239     FALSE 0.452 17.000 0.026 NA   NA
 5432915 5432916 swp_0240 swp_0241     FALSE 0.158 45.000 0.000 1.000   NA
 5432917 5432918 swp_0242 swp_0243     TRUE 0.997 1.000 0.791 1.000 Y NA
 5432919 5432920 swp_0244 swp_0246     FALSE 0.565 144.000 0.017 NA Y NA
 5432920 5432921 swp_0246 swp_0247     FALSE 0.200 174.000 0.006 1.000 N NA
 5432921 5432922 swp_0247 swp_0248     FALSE 0.123 294.000 0.000 0.011 Y NA
 5432923 5432924 swp_0249 swp_0250     TRUE 0.983 18.000 0.587 1.000 Y NA
 5432924 5432925 swp_0250 swp_0251     FALSE 0.470 180.000 0.188 NA   NA
 5432926 5432927 swp_0252 swp_0253     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5432928 5432929 swp_0254 swp_0255     FALSE 0.584 69.000 0.081 NA   NA
 5432929 5432930 swp_0255 swp_0256     FALSE 0.552 92.000 0.081 NA   NA
 5432930 5432931 swp_0256 swp_0257     TRUE 0.759 118.000 0.157 1.000 N NA
 5432931 5432932 swp_0257 swp_0258     TRUE 0.699 134.000 0.000 0.065 Y NA
 5432938 5432939 swp_0264 swp_0265     TRUE 0.899 50.000 0.500 NA   NA
 5432939 5432940 swp_0265 swp_0266     FALSE 0.008 182.000 0.000 NA   NA
 5432940 5432941 swp_0266 swp_0267     FALSE 0.010 167.000 0.000 NA   NA
 5432941 5432942 swp_0267 swp_0268     FALSE 0.016 191.000 0.003 NA   NA
 5432943 5432944 swp_0269 swp_0270     FALSE 0.022 112.000 0.000 NA   NA
 5432945 5432946 swp_0271 swp_0272     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5432946 5432947 swp_0272 swp_0273     TRUE 0.955 2.000 0.167 NA   NA
 5432947 5432948 swp_0273 swp_0274     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5432948 5432949 swp_0274 swp_0275     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5432949 5432950 swp_0275 swp_0276     FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 5432950 5432951 swp_0276 swp_0277     FALSE 0.001 272.000 0.000 NA   NA
 5432951 5432952 swp_0277 swp_0278     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 5432952 5432953 swp_0278 swp_0279     TRUE 0.826 53.000 0.281 NA   NA
 5432954 5432955 swp_0280 swp_0281     TRUE 0.848 5.000 0.029 1.000   NA
 5432955 5432956 swp_0281 swp_0282     TRUE 0.988 0.000 0.692 NA   NA
 5432956 5432957 swp_0282 swp_0283     FALSE 0.004 303.000 0.009 NA   NA
 5432957 5432958 swp_0283 swp_0284     FALSE 0.405 -34.000 0.065 NA   NA
 5432959 5432960 swp_0286 swp_0288     FALSE 0.099 146.000 0.000 NA N NA
 5432960 5432961 swp_0288 swp_0289     TRUE 0.991 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 5432961 5432962 swp_0289 swp_0291     TRUE 0.946 73.000 0.397 NA Y NA
 5432962 5432963 swp_0291 swp_0292     TRUE 0.981 -7.000 0.514 NA Y NA
 5432963 5432964 swp_0292 swp_0293     TRUE 0.927 21.000 0.422 NA   NA
 5432964 5432965 swp_0293 swp_0294     TRUE 0.879 -12.000 0.297 NA   NA
 5432965 5432966 swp_0294 swp_0295     TRUE 0.940 -6.000 0.329 NA   NA
 5432966 5432967 swp_0295 swp_0296     TRUE 0.982 -3.000 0.732 NA   NA
 5432967 5432968 swp_0296 swp_0297     TRUE 0.976 -3.000 0.532 NA   NA
 5432968 5432969 swp_0297 swp_0298     TRUE 0.895 35.000 0.413 NA   NA
 5432969 5432970 swp_0298 swp_0299     TRUE 0.968 -3.000 0.333 1.000   NA
 5432970 5432971 swp_0299 swp_0300     TRUE 0.973 0.000 0.297 NA   NA
 5432971 5432972 swp_0300 swp_0302     TRUE 0.986 -3.000 0.368 NA Y NA
 5432974 5432975 swp_0303 swp_0304     TRUE 0.981 0.000 0.422 NA   NA
 5432975 5432976 swp_0304 swp_0305     TRUE 0.973 9.000 0.169 0.002   NA
 5432976 5432977 swp_0305 swp_0306     TRUE 0.958 -3.000 0.245 1.000   NA
 5432977 5432978 swp_0306 swp_0307     TRUE 0.962 -7.000 0.636 NA   NA
 5432978 5432979 swp_0307 swp_0308     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 5432979 5432980 swp_0308 swp_0309     FALSE 0.078 194.000 0.029 NA   NA
 5432980 5432981 swp_0309 swp_0310     TRUE 0.753 65.000 0.011 1.000 Y NA
 5432981 5432982 swp_0310 swp_0311     TRUE 0.970 38.000 0.378 0.031 Y NA
 5432982 5432983 swp_0311 swp_0313     FALSE 0.150 56.000 0.000 1.000   NA
 5432983 5432984 swp_0313 swp_0314     FALSE 0.128 109.000 0.000 1.000   NA
 5432984 5432985 swp_0314 swp_0315     FALSE 0.573 202.000 0.312 1.000 N NA
 5432985 5432986 swp_0315 swp_0317     FALSE 0.030 255.000 0.000 1.000 N NA
 5432986 5432987 swp_0317 swp_0318     TRUE 0.776 105.000 0.057 NA Y NA
 5432987 5432988 swp_0318 swp_0319     TRUE 0.830 46.000 0.215 NA N NA
 5432988 5432989 swp_0319 swp_0320     TRUE 0.979 14.000 0.291 1.000 Y NA
 5432989 5432990 swp_0320 swp_0321     TRUE 0.925 62.000 0.471 1.000 N NA
 5432991 5432992 swp_0322 swp_0323     TRUE 0.836 113.000 0.357 NA   NA
 5432992 5432993 swp_0323 swp_0324     FALSE 0.322 139.000 0.050 NA   NA
 5432993 5432994 swp_0324 swp_0325     FALSE 0.001 285.000 0.000 NA   NA
 5432998 5432999 swp_0329 swp_0330     FALSE 0.190 23.000 0.010 NA   NA
 5432999 5433000 swp_0330 swp_0331     FALSE 0.385 -3.000 0.010 NA   NA
 5433000 5433001 swp_0331 swp_0332     TRUE 0.837 -3.000 0.071 NA   NA
 5433003 5433004 swp_0334 swp_0335     FALSE 0.044 156.000 0.007 NA   NA
 5433005 5433006 swp_0336 swp_0337     FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 5433006 5433007 swp_0337 swp_0338     FALSE 0.067 15.000 0.000 NA   NA
 5433007 5433008 swp_0338 swp_0339     TRUE 0.995 6.000 0.333 0.004 Y NA
 5433008 5433009 swp_0339 swp_0340     FALSE 0.427 117.000 0.016 1.000 N NA
 5433012 5433013 swp_0343 swp_0344     FALSE 0.012 -75.000 0.000 NA   NA
 5433016 5433017 swp_0347 swp_0348     TRUE 0.977 15.000 0.933 NA   NA
 5433018 5433019 swp_0349 swp_0350     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5433020 5433021 swp_0352 swp_0353     FALSE 0.027 58.000 0.000 NA   NA
 5433022 5433023 swp_0354 swp_0355     TRUE 0.841 -3.000 0.074 NA   NA
 5433023 5433024 swp_0355 swp_0356     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5433026 5433027 swp_0358 swp_0359     FALSE 0.040 547.000 0.012 0.002 Y NA
 5433027 5433028 swp_0359 swp_0360     TRUE 0.993 -3.000 0.943 0.001   NA
 5433028 5433029 swp_0360 swp_0361     TRUE 0.968 5.000 0.205 1.000   NA
 5433029 5433030 swp_0361 swp_0362     FALSE 0.025 741.000 0.075 1.000 Y NA
 5433030 5433031 swp_0362 swp_0363     TRUE 0.927 20.000 0.106 1.000 Y NA
 5433031 5433032 swp_0363 swp_0364     FALSE 0.038 504.000 0.006 0.015 Y NA
 5433033 5433034 swp_0365 swp_0366     FALSE 0.028 72.000 0.000 NA   NA
 5433034 5433035 swp_0366 swp_0367     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5433036 5433037 swp_0368 swp_0369     FALSE 0.028 69.000 0.000 NA   NA
 5433037 5433038 swp_0369 swp_0370     FALSE 0.000 420.000 0.000 NA   NA
 5433039 5433040 swp_0371 swp_0372     FALSE 0.004 334.000 0.000 1.000   NA
 5433040 5433041 swp_0372 swp_0373     FALSE 0.633 83.000 0.078 1.000   NA
 5433043 5433044 swp_0375 swp_0376     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5433044 5433045 swp_0376 swp_0378     FALSE 0.056 186.000 0.017 NA   NA
 5433045 5433046 swp_0378 swp_0379     TRUE 0.982 15.000 1.000 NA N NA
 5433046 5433047 swp_0379 swp_0380     TRUE 0.853 16.000 0.121 1.000   NA
 5433050 5433051 swp_0383 swp_0384     TRUE 0.901 18.000 0.267 NA   NA
 5433052 5433053 swp_0385 swp_0386     TRUE 0.974 36.000 0.667 1.000 Y NA
 5433053 5433054 swp_0386 swp_0387     TRUE 0.992 3.000 0.889 NA   NA
 5433054 5433055 swp_0387 swp_0388     TRUE 0.991 8.000 1.000 NA   NA
 5433055 5433056 swp_0388 swp_0389     FALSE 0.008 380.000 0.000 1.000 N NA
 5433056 5433057 swp_0389 swp_0390     TRUE 0.981 9.000 0.514 NA   NA
 5433057 5433058 swp_0390 swp_0391     TRUE 0.862 19.000 0.200 NA   NA
 5433058 5433059 swp_0391 swp_0392     TRUE 0.995 -3.000 0.929 1.000 Y NA
 5433059 5433060 swp_0392 swp_0393     TRUE 0.912 30.000 0.230 0.011   NA
 5433060 5433061 swp_0393 swp_0394     TRUE 0.983 -3.000 0.447 0.069   NA
 5433061 5433062 swp_0394 swp_0395     FALSE 0.412 96.000 0.000 0.069   NA
 5433062 5433063 swp_0395 swp_0396     FALSE 0.009 259.000 0.000 1.000   NA
 5433063 5433064 swp_0396 swp_0397     FALSE 0.324 -223.000 0.000 0.002   NA
 5433064 5433065 swp_0397 swp_0398     FALSE 0.007 281.000 0.000 1.000   NA
 5433065 5433066 swp_0398 swp_0399     TRUE 0.996 0.000 0.765 1.000 Y NA
 5433066 5433067 swp_0399 swp_0400     TRUE 0.968 67.000 0.600 1.000 Y NA
 5433067 5433068 swp_0400 swp_0402     TRUE 0.990 10.000 0.205 0.002 Y NA
 5433071 5433072 swp_0405 swp_0406     FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 5433072 5433073 swp_0406 swp_0407     FALSE 0.315 6.000 0.002 NA   NA
 5433073 5433074 swp_0407 swp_0408     TRUE 0.920 84.000 0.104 0.002 Y NA
 5433074 5433075 swp_0408 swp_0409     TRUE 0.919 12.000 0.175 NA   NA
 5433075 5433076 swp_0409 swp_0410     TRUE 0.977 13.000 0.714 NA   NA
 5433076 5433077 swp_0410 swp_0411     TRUE 0.971 -3.000 0.367 1.000   NA
 5433078 5433079 swp_0412 swp_0413     FALSE 0.023 110.000 0.000 NA   NA
 5433079 5433080 swp_0413 swp_0414     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5433081 5433082 swp_0415 swp_0416     TRUE 0.924 10.000 0.152 NA   NA
 5433082 5433083 swp_0416 swp_0417     FALSE 0.000 411.000 0.000 NA   NA
 5433084 5433085 swp_0418 swp_0419     TRUE 0.982 3.000 0.389 NA   NA
 5433085 5433086 swp_0419 swp_0420     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5433086 5433087 swp_0420 swp_0421     FALSE 0.000 452.000 0.000 NA   NA
 5433087 5433088 swp_0421 swp_0422     TRUE 0.790 44.000 0.127 1.000 N NA
 5433088 5433089 swp_0422 swp_0423     TRUE 0.982 40.000 0.706 0.034 Y NA
 5433089 5433090 swp_0423 swp_0424     TRUE 0.820 95.000 0.190 1.000 N NA
 5433090 5433091 swp_0424 swp_0425     FALSE 0.003 612.000 0.000 1.000 N NA
 5433091 5433092 swp_0425 swp_0426     TRUE 0.893 18.000 0.161 1.000 N NA
 5433092 5433093 swp_0426 swp_0427     FALSE 0.667 152.000 0.042 1.000 Y NA
 5433094 5433095 swp_0428 swp_0429     TRUE 0.926 150.000 0.727 0.001   NA
 5433095 5433096 swp_0429 swp_0430     TRUE 0.869 84.000 0.034 0.003 Y NA
 5433096 5433097 swp_0430 swp_0431     TRUE 0.984 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 5433097 5433098 swp_0431 swp_0432     FALSE 0.379 136.000 0.019 1.000 N NA
 5433099 5433100 swp_0433 swp_0434     FALSE 0.016 504.000 0.087 1.000   NA
 5433101 5433102 swp_0435 swp_0436     TRUE 0.957 17.000 0.406 1.000 N NA
 5433102 5433103 swp_0436 swp_0437     FALSE 0.078 289.000 0.000 1.000 Y NA
 5433103 5433104 swp_0437 swp_0438     FALSE 0.108 318.000 0.000 0.002 Y NA
 5433105 5433106 swp_0439 swp_0440     FALSE 0.006 296.000 0.000 1.000   NA
 5433106 5433107 swp_0440 swp_0441     FALSE 0.504 129.000 0.038 1.000 N NA
 5433107 5433108 swp_0441 swp_0442     TRUE 0.927 -3.000 0.134 NA N NA
 5433108 5433109 swp_0442 swp_0443     TRUE 0.836 0.000 0.045 NA   NA
 5433111 5433112 swp_0445 swp_0447     TRUE 0.991 4.000 0.333 NA Y NA
 5433112 5433113 swp_0447 swp_0448     TRUE 0.989 7.000 0.174 0.011 Y NA
 5433113 5433114 swp_0448 swp_0449     FALSE 0.452 62.000 0.029 1.000   NA
 5433114 5433115 swp_0449 swp_0450     TRUE 0.975 -3.000 0.432 1.000   NA
 5433115 5433116 swp_0450 swp_0451     TRUE 0.924 12.000 0.145 1.000   NA
 5433118 5433119 swp_0453 swp_0454     FALSE 0.678 134.000 0.159 NA N NA
 5433122 5433123 swp_0457 swp_0458     TRUE 0.860 70.000 0.336 NA   NA
 5433123 5433124 swp_0458 swp_0459     FALSE 0.018 232.000 0.000 NA N NA
 5433125 5433126 swp_0460 swp_0461     TRUE 0.822 91.000 0.231 NA N NA
 5433126 5433127 swp_0461 swp_0462     FALSE 0.008 182.000 0.000 NA   NA
 5433127 5433128 swp_0462 swp_0463     FALSE 0.504 101.000 0.070 NA   NA
 5433128 5433129 swp_0463 swp_0464     TRUE 0.974 52.000 0.752 1.000 Y NA
 5433130 5433131 swp_0465 swp_0466     FALSE 0.022 116.000 0.000 NA   NA
 5433131 5433132 swp_0466 swp_0467     FALSE 0.185 2.000 0.000 NA   NA
 5433132 5433133 swp_0467 swp_0468     FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5433133 5433134 swp_0468 swp_0469     FALSE 7.71147771648894e-05 1516.000 0.000 NA   NA
 5433134 5433135 swp_0469 swp_0470     FALSE 0.001 318.000 0.000 NA   NA
 5433135 5433136 swp_0470 swp_0471     FALSE 0.027 80.000 0.000 NA   NA
 5433137 5433138 swp_0472 swp_0473     FALSE 0.000 481.000 0.000 NA   NA
 5433138 5433139 swp_0473 swp_0474     TRUE 0.797 11.000 0.052 NA   NA
 5433139 5433140 swp_0474 swp_0475     FALSE 0.630 126.000 0.036 0.098 N NA
 5433141 5433142 swp_0476 swp_0477     FALSE 0.053 123.000 0.004 NA   NA
 5433144 5433145 swp_0479 swp_0480     FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 5433145 5433146 swp_0480 swp_0481     FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 5433148 5433149 swp_0483 swp_0484     FALSE 0.073 214.000 0.040 NA   NA
 5433149 5433150 swp_0484 swp_0485     TRUE 0.981 0.000 0.433 NA   NA
 5433150 5433151 swp_0485 swp_0486     TRUE 0.973 -3.000 0.475 NA   NA
 5433151 5433152 swp_0486 swp_0487     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5433152 5433153 swp_0487 swp_0488     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5433153 5433154 swp_0488 swp_0489     TRUE 0.993 3.000 0.846 1.000   NA
 5433154 5433155 swp_0489 swp_0490     TRUE 0.943 -3.000 0.185 1.000   NA
 5433155 5433156 swp_0490 swp_0491     TRUE 0.889 18.000 0.197 1.000   NA
 5433156 5433157 swp_0491 swp_0492     TRUE 0.996 0.000 0.740 1.000 Y NA
 5433157 5433158 swp_0492 swp_0493     TRUE 0.819 22.000 0.169 NA   NA
 5433158 5433159 swp_0493 swp_0494     TRUE 0.933 78.000 0.789 NA   NA
 5433159 5433160 swp_0494 swp_0495     FALSE 0.028 72.000 0.000 NA   NA
 5433160 5433161 swp_0495 swp_0496     FALSE 0.038 27.000 0.000 NA   NA
 5433161 5433162 swp_0496 swp_0497     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5433162 5433163 swp_0497 swp_0498     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 5433163 5433164 swp_0498 swp_0500     TRUE 0.925 -10.000 0.433 NA   NA
 5433164 5433165 swp_0500 swp_0501     TRUE 0.991 0.000 0.871 NA   NA
 5433165 5433166 swp_0501 swp_0503     TRUE 0.939 -10.000 0.548 NA   NA
 5433166 5433167 swp_0503 swp_0504     TRUE 0.883 -7.000 0.200 NA   NA
 5433167 5433168 swp_0504 swp_0506     FALSE 0.016 194.000 0.005 NA   NA
 5433168 5433169 swp_0506 swp_0507     TRUE 0.951 40.000 0.689 1.000 N NA
 5433169 5433170 swp_0507 swp_0508     TRUE 0.995 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 5433170 5433171 swp_0508 swp_0509     TRUE 0.821 66.000 0.206 NA N NA
 5433171 5433172 swp_0509 swp_0510     TRUE 0.888 98.000 0.417 NA N NA
 5433172 5433173 swp_0510 swp_0511     TRUE 0.840 66.000 0.296 NA   NA
 5433173 5433174 swp_0511 swp_0512     TRUE 0.734 -76.000 0.358 NA   NA
 5433174 5433175 swp_0512 swp_0513     TRUE 0.786 110.000 0.259 NA   NA
 5433175 5433176 swp_0513 swp_0514     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5433176 5433177 swp_0514 swp_0515     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA   NA
 5433177 5433178 swp_0515 swp_0516     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5433178 5433179 swp_0516 swp_0517     TRUE 0.951 -10.000 0.464 1.000 N NA
 5433179 5433180 swp_0517 swp_0518     TRUE 0.978 26.000 0.729 NA Y NA
 5433180 5433181 swp_0518 swp_0519     TRUE 0.996 2.000 0.743 NA Y NA
 5433182 5433183 swp_0520 swp_0521     FALSE 0.325 149.000 0.058 NA   NA
 5433186 5433187 swp_0524 swp_0525     TRUE 0.749 51.000 0.103 1.000 N NA
 5433187 5433188 swp_0525 swp_0526     TRUE 0.706 119.000 0.114 1.000 N NA
 5433188 5433189 swp_0526 swp_0527     TRUE 0.922 79.000 0.689 NA   NA
 5433189 5433190 swp_0527 swp_0529     FALSE 0.194 -15.000 0.015 NA   NA
 5433193 5433194 swp_0532 swp_0534     FALSE 9.26593775540216e-05 1024.000 0.000 NA   NA
 5433194 5433195 swp_0534 swp_0535     FALSE 0.000 429.000 0.000 NA   NA
 5433195 5433196 swp_0535 swp_0536     TRUE 0.802 138.000 0.259 1.000 N NA
 5433196 5433197 swp_0536 swp_0537     TRUE 0.844 88.000 0.333 NA   NA
 5433206 5433207 swp_0546 swp_0547     FALSE 0.182 98.000 0.018 NA   NA
 5433209 5433210 swp_0548 swp_0551     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 5433214 5433215 swp_0555 swp_0556     TRUE 0.946 -16.000 0.887 NA   NA
 5433215 5433216 swp_0556 swp_0557     TRUE 0.966 82.000 0.604 1.000 Y NA
 5433218 5433219 swp_0559 swp_0560     TRUE 0.726 29.000 0.121 NA   NA
 5433220 5433221 swp_0561 swp_0562     TRUE 0.992 14.000 0.902 1.000 Y NA
 5433222 5433223 swp_0563 swp_0564     FALSE 0.283 118.000 0.033 NA   NA
 5433224 5433225 swp_0565 swp_0566     FALSE 0.467 127.000 0.077 NA   NA
 5433227 5433228 swp_0568 swp_0569     FALSE 0.008 179.000 0.000 NA   NA
 5433229 5433230 swp_0570 swp_0571     FALSE 0.402 128.000 0.058 NA   NA
 5433230 5433231 swp_0571 swp_0572     FALSE 0.015 144.000 0.000 NA   NA
 5433231 5433232 swp_0572 swp_0573     FALSE 0.017 135.000 0.000 NA   NA
 5433233 5433234 swp_0574 swp_0575     FALSE 0.000 413.000 0.000 NA   NA
 5433234 5433235 swp_0575 swp_0576     TRUE 0.814 44.000 0.238 NA   NA
 5433235 5433236 swp_0576 swp_0577     FALSE 0.005 193.000 0.000 NA   NA
 5433236 5433237 swp_0577 swp_0578     FALSE 0.639 122.000 0.111 NA N NA
 5433239 5433240 swp_0580 swp_0581     TRUE 0.903 3.000 0.070 NA   NA
 5433240 5433241 swp_0581 swp_0583     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5433242 5433243 swp_0582 swp_0584     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5433243 5433244 swp_0584 swp_0586     TRUE 0.974 96.000 0.631 0.096 Y NA
 5433247 5433248 swp_0589 swp_0590     FALSE 0.002 251.000 0.000 NA   NA
 5433253 5433254 swp_0595 swp_0596     FALSE 0.001 315.000 0.000 NA   NA
 5433254 5433255 swp_0596 swp_0597     FALSE 0.344 14.000 0.000 1.000   NA
 5433258 5433259 swp_0600 swp_0601     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5433259 5433260 swp_0601 swp_0602     FALSE 0.227 141.000 0.000 1.000 N NA
 5433261 5433262 swp_0603 swp_0604     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433262 5433263 swp_0604 swp_0605     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433263 5433264 swp_0605 swp_0607     TRUE 0.990 3.000 0.714 NA   NA
 5433265 5433266 swp_0608 swp_0609     FALSE 0.077 14.000 0.000 NA   NA
 5433268 5433269 swp_0611 swp_0612     FALSE 0.022 113.000 0.000 NA   NA
 5433269 5433270 swp_0612 swp_0613     FALSE 0.020 123.000 0.000 NA   NA
 5433270 5433271 swp_0613 swp_0614     FALSE 0.018 821.000 0.000 0.002 Y NA
 5433272 5433273 swp_0615 swp_0616     TRUE 0.946 -3.000 0.233 NA   NA
 5433273 5433274 swp_0616 swp_0617     FALSE 0.003 212.000 0.000 NA   NA
 5433277 5433278 swp_0620 swp_0621     FALSE 0.027 52.000 0.000 NA   NA
 5433278 5433279 swp_0621 swp_0622     FALSE 0.012 -90.000 0.000 NA   NA
 5433279 5433280 swp_0622 swp_0623     FALSE 0.072 -6.000 0.000 NA   NA
 5433280 5433281 swp_0623 swp_0624     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5433281 5433282 swp_0624 swp_0625     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5433283 5433284 swp_0626 swp_0627     FALSE 0.019 125.000 0.000 NA   NA
 5433285 5433286 swp_0629 swp_0630     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 5433286 5433287 swp_0630 swp_0632     FALSE 9.9420542488163e-05 883.000 0.000 NA   NA
 5433287 5433288 swp_0632 swp_0634     TRUE 0.973 0.000 0.298 NA   NA
 5433289 5433290 swp_0635 swp_0636     FALSE 0.354 68.000 0.000 1.000 N NA
 5433291 5433292 swp_0637 swp_0638     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5433292 5433293 swp_0638 swp_0639     FALSE 9.54225261594458e-05 918.000 0.000 NA   NA
 5433293 5433294 swp_0639 swp_0640     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5433294 5433295 swp_0640 swp_0641     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433296 5433297 swp_0642 swp_0643     FALSE 0.031 36.000 0.000 NA   NA
 5433298 5433299 swp_0644 swp_0645     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5433299 5433300 swp_0645 swp_0647     FALSE 0.012 157.000 0.000 NA   NA
 5433300 5433301 swp_0647 swp_0648     FALSE 0.002 781.000 0.000 1.000 N NA
 5433301 5433302 swp_0648 swp_0649     TRUE 0.978 4.000 0.333 NA   NA
 5433302 5433303 swp_0649 swp_0650     TRUE 0.952 -3.000 0.267 NA   NA
 5433303 5433304 swp_0650 swp_0651     FALSE 0.028 60.000 0.000 NA   NA
 5433304 5433305 swp_0651 swp_0652     FALSE 0.001 300.000 0.000 NA   NA
 5433305 5433306 swp_0652 swp_0653     FALSE 0.000 659.000 0.000 NA   NA
 5433308 5433309 swp_0655 swp_0656     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5433311 5433312 swp_0658 swp_0659     TRUE 0.995 3.000 0.500 1.000 Y NA
 5433313 5433314 swp_0660 swp_0661     TRUE 0.988 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5433314 5433315 swp_0661 swp_0662     TRUE 0.805 54.000 0.200 1.000   NA
 5433315 5433316 swp_0662 swp_0663     FALSE 0.393 114.000 0.049 NA   NA
 5433317 5433318 swp_0664 swp_0665     FALSE 0.000 494.000 0.000 NA   NA
 5433319 5433320 swp_0666 swp_0667     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5433321 5433322 swp_0668 swp_0669     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   NA
 5433323 5433324 swp_0670 swp_0671     FALSE 0.056 218.000 0.000 1.000 N NA
 5433325 5433326 swp_0672 swp_0673     TRUE 0.705 134.000 0.140 1.000 N NA
 5433326 5433327 swp_0673 swp_0674     TRUE 0.795 -13.000 0.182 NA   NA
 5433327 5433328 swp_0674 swp_0675     FALSE 0.020 568.000 0.186 NA   NA
 5433328 5433329 swp_0675 swp_0676     TRUE 0.992 3.000 0.728 NA N NA
 5433329 5433330 swp_0676 swp_0677     TRUE 0.958 31.000 0.820 NA N NA
 5433330 5433331 swp_0677 swp_0678     FALSE 0.493 179.000 0.163 1.000   NA
 5433331 5433332 swp_0678 swp_0679     TRUE 0.976 -3.000 0.543 NA   NA
 5433332 5433333 swp_0679 swp_0680     TRUE 0.892 65.000 0.459 NA   NA
 5433333 5433334 swp_0680 swp_0681     TRUE 0.979 -3.000 0.617 NA   NA
 5433334 5433335 swp_0681 swp_0682     TRUE 0.990 2.000 0.598 1.000   NA
 5433335 5433336 swp_0682 swp_0683     TRUE 0.862 47.000 0.226 1.000 N NA
 5433337 5433338 swp_0684 swp_0685     TRUE 0.959 65.000 0.530 NA Y NA
 5433338 5433339 swp_0685 swp_0686     TRUE 0.910 71.000 0.562 NA   NA
 5433339 5433340 swp_0686 swp_0687     FALSE 0.597 18.000 0.045 NA   NA
 5433340 5433341 swp_0687 swp_0688     TRUE 0.896 0.000 0.076 NA   NA
 5433341 5433342 swp_0688 swp_0689     TRUE 0.984 2.000 0.453 NA   NA
 5433342 5433343 swp_0689 swp_0690     TRUE 0.904 22.000 0.258 NA N NA
 5433343 5433344 swp_0690 swp_0691     FALSE 0.013 321.000 0.000 1.000 N NA
 5433344 5433345 swp_0691 swp_0692     TRUE 0.979 -3.000 0.500 1.000   NA
 5433345 5433346 swp_0692 swp_0694     TRUE 0.689 192.000 0.625 NA   NA
 5433347 5433348 swp_0695 swp_0696     TRUE 0.949 128.000 0.310 0.002 Y NA
 5433351 5433352 swp_0698 swp_0699     FALSE 0.013 -61.000 0.000 NA   NA
 5433352 5433353 swp_0699 swp_0700     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5433353 5433354 swp_0700 swp_0701     FALSE 0.001 341.000 0.002 NA   NA
 5433354 5433355 swp_0701 swp_0702     TRUE 0.991 15.000 0.601 0.013 Y NA
 5433355 5433356 swp_0702 swp_0703     FALSE 0.001 772.000 0.012 NA   NA
 5433356 5433357 swp_0703 swp_0704     FALSE 0.467 67.000 0.051 NA   NA
 5433357 5433358 swp_0704 swp_0705     FALSE 0.070 205.000 0.013 1.000   NA
 5433358 5433359 swp_0705 swp_0706     FALSE 0.391 41.000 0.019 1.000   NA
 5433359 5433360 swp_0706 swp_0708     TRUE 0.980 1.000 0.147 0.021 N NA
 5433360 5433361 swp_0708 swp_0709     FALSE 0.067 209.000 0.000 1.000 N NA
 5433363 5433364 swp_0711 swp_0712     TRUE 0.950 9.000 0.122 1.000 N NA
 5433364 5433365 swp_0712 swp_0713     TRUE 0.935 12.000 0.128 1.000 N NA
 5433365 5433366 swp_0713 swp_0714     TRUE 0.981 28.000 0.499 0.013 Y NA
 5433367 5433368 swp_0715 swp_0716     FALSE 0.006 191.000 0.000 NA   NA
 5433368 5433369 swp_0716 swp_0717     FALSE 0.003 366.000 0.000 1.000   NA
 5433370 5433371 swp_0718 swp_0719     TRUE 0.876 104.000 0.317 1.000 N NA
 5433371 5433372 swp_0719 swp_0720     TRUE 0.830 38.000 0.208 1.000   NA
 5433374 5433375 swp_0722 swp_0723     TRUE 0.982 -16.000 0.750 0.061 Y NA
 5433375 5433376 swp_0723 swp_0724     FALSE 0.003 591.000 0.000 1.000 N NA
 5433376 5433377 swp_0724 swp_0725     TRUE 0.938 12.000 0.000 0.057 Y NA
 5433377 5433378 swp_0725 swp_0727     FALSE 0.446 53.000 0.000 0.057   NA
 5433378 5433379 swp_0727 swp_0728     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5433381 5433382 swp_0730 swp_0731     FALSE 0.003 225.000 0.000 NA   NA
 5433382 5433383 swp_0731 swp_0732     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5433387 5433388 swp_0736 swp_0738     TRUE 0.926 13.000 0.213 NA   NA
 5433388 5433389 swp_0738 swp_0739     TRUE 0.970 3.000 0.236 NA   NA
 5433390 5433391 swp_0740 swp_0741     TRUE 0.853 52.000 0.333 NA   NA
 5433394 5433395 swp_0745 swp_0746     FALSE 0.016 137.000 0.000 NA   NA
 5433395 5433396 swp_0746 swp_0747     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 5433396 5433397 swp_0747 swp_0748     TRUE 0.966 130.000 0.867 1.000 Y NA
 5433397 5433398 swp_0748 swp_0749     TRUE 0.991 10.000 0.867 1.000 N NA
 5433398 5433399 swp_0749 swp_0750     FALSE 0.150 236.000 0.135 NA   NA
 5433402 5433403 swp_0753 swp_0754     TRUE 0.925 112.000 0.846 NA   NA
 5433403 5433404 swp_0754 swp_0755     FALSE 0.585 81.000 0.087 NA   NA
 5433405 5433406 swp_0756 swp_0757     FALSE 0.015 144.000 0.000 NA   NA
 5433407 5433408 swp_0758 swp_0759     TRUE 0.767 134.000 0.303 NA   NA
 5433408 5433409 swp_0759 swp_0760     TRUE 0.963 0.000 0.222 NA   NA
 5433410 5433411 swp_0761 swp_0762     TRUE 0.946 39.000 0.886 NA   NA
 5433413 5433414 swp_0764 swp_0765     TRUE 0.979 7.000 0.443 NA   NA
 5433414 5433415 swp_0765 swp_0766     TRUE 0.885 61.000 0.433 NA   NA
 5433415 5433416 swp_0766 swp_0767     TRUE 0.907 30.000 0.427 NA   NA
 5433416 5433417 swp_0767 swp_0768     TRUE 0.791 47.000 0.217 NA   NA
 5433417 5433418 swp_0768 swp_0769     FALSE 0.610 43.000 0.037 1.000 N NA
 5433418 5433419 swp_0769 swp_0770     TRUE 0.885 0.000 0.023 1.000 N NA
 5433424 5433425 swp_0775 swp_0776     TRUE 0.812 27.000 0.145 NA N NA
 5433425 5433426 swp_0776 swp_0777     FALSE 0.280 52.000 0.026 NA   NA
 5433426 5433427 swp_0777 swp_0778     FALSE 0.487 8.000 0.011 NA   NA
 5433427 5433428 swp_0778 swp_0779     FALSE 0.570 -34.000 0.095 1.000   NA
 5433431 5433432 swp_0782 swp_0783     FALSE 0.012 200.000 0.003 NA   NA
 5433432 5433433 swp_0783 swp_0784     FALSE 0.658 77.000 0.118 NA   NA
 5433433 5433434 swp_0784 swp_0785     FALSE 0.661 -16.000 0.109 NA   NA
 5433434 5433435 swp_0785 swp_0786     TRUE 0.801 26.000 0.092 1.000 N NA
 5433435 5433436 swp_0786 swp_0787     TRUE 0.942 -7.000 0.188 0.093 N NA
 5433438 5433439 swp_0789 swp_0790     TRUE 0.835 21.000 0.141 1.000   NA
 5433439 5433440 swp_0790 swp_0791     TRUE 0.851 50.000 0.184 0.065   NA
 5433440 5433441 swp_0791 swp_0792     TRUE 0.998 3.000 0.947 0.012 Y NA
 5433441 5433442 swp_0792 swp_0793     FALSE 0.006 416.000 0.000 1.000 N NA
 5433442 5433443 swp_0793 swp_0794     TRUE 0.994 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5433443 5433444 swp_0794 swp_0795     TRUE 0.997 0.000 0.630 0.001 Y NA
 5433444 5433445 swp_0795 swp_0796     TRUE 0.870 110.000 0.370 NA N NA
 5433445 5433446 swp_0796 swp_0797     TRUE 0.990 0.000 0.831 NA   NA
 5433446 5433447 swp_0797 swp_0798     FALSE 0.055 211.000 0.029 NA   NA
 5433447 5433448 swp_0798 swp_0799     FALSE 0.037 469.000 0.038 1.000 Y NA
 5433450 5433451 swp_0802 swp_0803     FALSE 0.338 181.000 0.114 NA   NA
 5433453 5433454 swp_0805 swp_0806     TRUE 0.997 0.000 0.631 0.005 Y NA
 5433455 5433456 swp_0808 swp_0809     FALSE 0.006 416.000 0.000 1.000 N NA
 5433458 5433459 swp_0811 swp_0812     TRUE 0.828 87.000 0.233 NA N NA
 5433459 5433460 swp_0812 swp_0813     TRUE 0.983 25.000 0.937 NA Y NA
 5433462 5433463 swp_0815 swp_0816     TRUE 0.786 51.000 0.218 NA   NA
 5433463 5433464 swp_0816 swp_0817     TRUE 0.929 107.000 0.864 NA   NA
 5433464 5433465 swp_0817 swp_0818     TRUE 0.952 12.000 0.286 NA   NA
 5433465 5433466 swp_0818 swp_0819     TRUE 0.983 13.000 0.911 NA   NA
 5433466 5433467 swp_0819 swp_0820     FALSE 0.604 92.000 0.104 NA   NA
 5433467 5433468 swp_0820 swp_0821     FALSE 0.648 67.000 0.110 NA   NA
 5433468 5433469 swp_0821 swp_0822     TRUE 0.976 14.000 0.760 NA   NA
 5433470 5433471 swp_0823 swp_0824     FALSE 0.003 225.000 0.000 NA   NA
 5433471 5433472 swp_0824 swp_0825     FALSE 0.504 124.000 0.087 NA   NA
 5433472 5433473 swp_0825 swp_0826     FALSE 0.024 104.000 0.000 NA   NA
 5433473 5433474 swp_0826 swp_0827     FALSE 0.000 602.000 0.000 NA   NA
 5433474 5433475 swp_0827 swp_0828     FALSE 0.026 87.000 0.000 NA   NA
 5433476 5433477 swp_0829 swp_0830     FALSE 0.568 78.000 0.080 NA   NA
 5433477 5433478 swp_0830 swp_0831     TRUE 0.982 0.000 0.360 1.000   NA
 5433478 5433479 swp_0831 swp_0832     TRUE 0.727 130.000 0.194 1.000   NA
 5433479 5433480 swp_0832 swp_0833     FALSE 0.585 174.000 0.167 1.000 N NA
 5433480 5433481 swp_0833 swp_0834     FALSE 0.036 304.000 0.000 0.065 N NA
 5433483 5433484 swp_0836 swp_0837     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5433484 5433485 swp_0837 swp_0838     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 5433488 5433489 swp_0841 swp_0842     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5433491 5433492 swp_0844 swp_0845     TRUE 0.978 10.000 0.500 NA   NA
 5433493 5433494 swp_0846 swp_0847     FALSE 0.001 597.000 0.000 NA N NA
 5433494 5433495 swp_0847 swp_0848     TRUE 0.957 7.000 0.065 0.001   NA
 5433495 5433496 swp_0848 swp_0849     TRUE 0.996 1.000 0.829 0.001   NA
 5433497 5433498 swp_0851 swp_0853     TRUE 0.984 90.000 0.791 0.001 Y NA
 5433498 5433499 swp_0853 swp_0854     TRUE 0.881 -7.000 0.116 1.000 N NA
 5433499 5433500 swp_0854 swp_0855     FALSE 0.000 471.000 0.000 NA   NA
 5433500 5433501 swp_0855 swp_0856     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433503 5433504 swp_0858 swp_0859     TRUE 0.728 89.000 0.179 NA   NA
 5433504 5433505 swp_0859 swp_0860     TRUE 0.711 108.000 0.182 NA   NA
 5433507 5433508 swp_0862 swp_0863     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5433508 5433509 swp_0863 swp_0864     FALSE 0.181 21.000 0.008 NA   NA
 5433509 5433510 swp_0864 swp_0865     FALSE 0.001 321.000 0.000 NA   NA
 5433512 5433513 swp_0867 swp_0868     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 5433513 5433514 swp_0868 swp_0870     FALSE 0.001 292.000 0.000 NA   NA
 5433517 5433518 swp_0873 swp_0874     FALSE 0.374 133.000 0.056 NA   NA
 5433518 5433519 swp_0874 swp_0875     TRUE 0.890 24.000 0.302 NA   NA
 5433519 5433520 swp_0875 swp_0876     FALSE 0.001 263.000 0.000 NA   NA
 5433524 5433525 swp_0880 swp_0881     TRUE 0.935 19.000 0.120 1.000 Y NA
 5433525 5433526 swp_0881 swp_0882     TRUE 0.932 0.000 0.120 NA   NA
 5433526 5433527 swp_0882 swp_0883     TRUE 0.985 6.000 0.588 NA   NA
 5433527 5433528 swp_0883 swp_0884     FALSE 0.000 765.000 0.000 NA   NA
 5433531 5433532 swp_0887 swp_0888     TRUE 0.854 74.000 0.333 NA   NA
 5433532 5433533 swp_0888 swp_0889     FALSE 0.023 108.000 0.000 NA   NA
 5433534 5433535 swp_0890 swp_0891     TRUE 0.804 41.000 0.222 NA   NA
 5433536 5433537 swp_0892 swp_0893     TRUE 0.958 5.000 0.049 0.021 N NA
 5433537 5433538 swp_0893 swp_0894     FALSE 0.069 306.000 0.081 1.000 N NA
 5433538 5433539 swp_0894 swp_0896     FALSE 0.644 188.000 0.444 NA   NA
 5433539 5433540 swp_0896 swp_0897     FALSE 0.000 485.000 0.000 NA   NA
 5433541 5433542 swp_0898 swp_0899     FALSE 0.044 23.000 0.000 NA   NA
 5433542 5433543 swp_0899 swp_0901     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5433543 5433544 swp_0901 swp_0902     TRUE 0.985 -3.000 0.840 NA   NA
 5433546 5433547 swp_0904 swp_0905     FALSE 0.004 336.000 0.000 1.000   NA
 5433547 5433548 swp_0905 swp_0906     TRUE 0.791 27.000 0.089 1.000 N NA
 5433548 5433549 swp_0906 swp_0907     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA   NA
 5433549 5433550 swp_0907 swp_0908     FALSE 9.68327772615743e-05 913.000 0.000 NA   NA
 5433551 5433552 swp_0909 swp_0910     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5433552 5433553 swp_0910 swp_0911     TRUE 0.695 90.000 0.156 NA   NA
 5433553 5433554 swp_0911 swp_0912     TRUE 0.977 66.000 0.474 0.001 Y NA
 5433554 5433555 swp_0912 swp_0913     FALSE 0.032 274.000 0.004 1.000 N NA
 5433555 5433556 swp_0913 swp_0914     FALSE 0.194 503.000 0.317 0.001 Y NA
 5433556 5433557 swp_0914 swp_0915     TRUE 0.929 84.000 0.249 1.000 Y NA
 5433557 5433558 swp_0915 swp_0916     FALSE 0.000 538.000 0.000 NA   NA
 5433560 5433561 swp_0918 swp_0919     FALSE 0.001 271.000 0.000 NA   NA
 5433561 5433562 swp_0919 swp_0920     FALSE 0.000 441.000 0.000 NA   NA
 5433562 5433563 swp_0920 swp_0921     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5433563 5433564 swp_0921 swp_0922     FALSE 0.019 125.000 0.000 NA   NA
 5433568 5433569 swp_0926 swp_0927     FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 5433571 5433572 swp_0929 swp_0930     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 5433573 5433574 swp_0931 swp_0933     TRUE 0.803 -13.000 0.189 NA   NA
 5433574 5433575 swp_0933 swp_0934     TRUE 0.930 -10.000 0.474 NA   NA
 5433575 5433576 swp_0934 swp_0936     TRUE 0.986 -3.000 0.162 0.001 Y NA
 5433578 5433579 swp_0937 swp_0938     TRUE 0.974 0.000 0.093 NA Y NA
 5433579 5433580 swp_0938 swp_0939     TRUE 0.922 48.000 0.253 NA Y NA
 5433580 5433581 swp_0939 swp_0940     TRUE 0.993 -3.000 0.655 1.000 Y NA
 5433581 5433582 swp_0940 swp_0941     TRUE 0.982 -6.000 0.254 0.064 Y NA
 5433582 5433583 swp_0941 swp_0942     TRUE 0.704 82.000 0.154 NA   NA
 5433583 5433584 swp_0942 swp_0943     FALSE 0.000 861.000 0.000 NA   NA
 5433584 5433585 swp_0943 swp_0944     FALSE 0.000 553.000 0.000 NA   NA
 5433585 5433586 swp_0944 swp_0945     FALSE 0.000 371.000 0.000 NA   NA
 5433588 5433589 swp_0948 swp_0949     FALSE 0.000 552.000 0.000 NA   NA
 5433590 5433591 swp_0950 swp_0952     FALSE 0.028 63.000 0.000 NA   NA
 5433594 5433595 swp_0954 swp_0955     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433597 5433598 swp_0957 swp_0958     FALSE 0.000 611.000 0.000 NA   NA
 5433599 5433600 swp_0959 swp_0960     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5433600 5433601 swp_0960 swp_0961     FALSE 0.033 -15.000 0.000 NA   NA
 5433603 5433604 swp_0963 swp_0964     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   NA
 5433606 5433607 swp_0966 swp_0967     FALSE 0.001 294.000 0.000 NA   NA
 5433609 5433610 swp_0969 swp_0970     TRUE 0.825 31.000 0.133 1.000 N NA
 5433610 5433611 swp_0970 swp_0971     FALSE 0.556 143.000 0.000 1.000 Y NA
 5433611 5433612 swp_0971 swp_0972     FALSE 0.143 8.000 0.000 NA   NA
 5433612 5433613 swp_0972 swp_0974     FALSE 0.027 53.000 0.000 NA   NA
 5433615 5433616 swp_0976 swp_0977     FALSE 0.055 219.000 0.000 1.000 N NA
 5433617 5433618 swp_0978 swp_0979     FALSE 0.004 208.000 0.000 NA   NA
 5433620 5433621 swp_0981 swp_0982     FALSE 0.055 17.000 0.000 NA   NA
 5433621 5433622 swp_0982 swp_0983     FALSE 0.027 55.000 0.000 NA   NA
 5433622 5433623 swp_0983 swp_0984     TRUE 0.980 0.000 0.333 1.000   NA
 5433623 5433624 swp_0984 swp_0985     FALSE 0.003 224.000 0.000 NA   NA
 5433627 5433628 swp_0988 swp_0989     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433632 5433633 swp_0993 swp_0994     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA N NA
 5433633 5433634 swp_0994 swp_0995     TRUE 0.989 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 5433634 5433635 swp_0995 swp_0996     TRUE 0.880 55.000 0.281 1.000 N NA
 5433635 5433636 swp_0996 swp_0997     TRUE 0.982 0.000 0.049 0.005 Y NA
 5433636 5433637 swp_0997 swp_0998     TRUE 0.950 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 5433637 5433638 swp_0998 swp_0999     TRUE 0.821 117.000 0.079 1.000 Y NA
 5433638 5433639 swp_0999 swp_1000     TRUE 0.908 61.000 0.078 0.005 Y NA
 5433639 5433640 swp_1000 swp_1001     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5433640 5433641 swp_1001 swp_1002     TRUE 0.802 -12.000 0.176 NA   NA
 5433641 5433642 swp_1002 swp_1003     TRUE 0.952 0.000 0.176 NA   NA
 5433643 5433644 swp_1004 swp_1005     TRUE 0.946 5.000 0.157 NA   NA
 5433646 5433647 swp_1007 swp_1008     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433647 5433648 swp_1008 swp_1009     FALSE 0.288 -7.000 0.000 1.000   NA
 5433651 5433652 swp_1012 swp_1013     TRUE 0.941 10.000 0.191 NA   NA
 5433652 5433653 swp_1013 swp_1014     TRUE 0.847 2.000 0.043 NA   NA
 5433653 5433654 swp_1014 swp_1015     FALSE 0.024 97.000 0.000 NA   NA
 5433654 5433655 swp_1015 swp_1016     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 11435913 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11578276 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11720668 5433653   swp_1014     FALSE NA 131.000 0.000 NA   NA
 11435914 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11578277 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11720669 5433653   swp_1014     FALSE NA 158.000 0.000 NA   NA
 11435915 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11578278 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11720670 5433653   swp_1014     FALSE NA 191.000 0.000 NA   NA
 11435916 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11578279 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11720671 5433653   swp_1014     FALSE NA 218.000 0.000 NA   NA
 11435917 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 11578280 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 11720672 5433653   swp_1014     FALSE NA 251.000 0.000 NA   NA
 5433655 5433656 swp_1016 swp_1017     FALSE 0.000 599.000 0.000 NA   NA
 5433656 5433657 swp_1017 swp_1019     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 5433659 5433660 swp_1020 swp_1021     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5433660 5433661 swp_1021 swp_1022     FALSE 0.000 821.000 0.000 NA   NA
 5433661 5433662 swp_1022 swp_1023     FALSE 0.017 -34.000 0.000 NA   NA
 5433662 5433663 swp_1023 swp_1024     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5433663 5433664 swp_1024 swp_1025     FALSE 0.007 183.000 0.000 NA   NA
 5433664 5433665 swp_1025 swp_1026     FALSE 7.6199221387029e-05 1673.000 0.000 NA   NA
 5433666 5433667 swp_1027 swp_1028     TRUE 0.849 63.000 0.250 NA N NA
 5433671 5433672 swp_1032 swp_1033     FALSE 0.000 387.000 0.000 NA   NA
 5433672 5433673 swp_1033 swp_1034     TRUE 0.919 23.000 0.400 NA   NA
 5433673 5433674 swp_1034 swp_1035     TRUE 0.874 79.000 0.400 NA   NA
 5433675 5433676 swp_1036 swp_1037     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5433676 5433677 swp_1037 swp_1038     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433677 5433678 swp_1038 swp_1039     TRUE 0.956 19.000 0.667 NA   NA
 5433678 5433679 swp_1039 swp_1040     TRUE 0.966 17.000 0.765 NA   NA
 5433679 5433680 swp_1040 swp_1041     TRUE 0.780 170.000 0.478 NA N NA
 5433680 5433681 swp_1041 swp_1042     TRUE 0.986 -16.000 0.957 0.089 Y NA
 5433681 5433682 swp_1042 swp_1043     FALSE 0.020 123.000 0.000 NA   NA
 5433682 5433683 swp_1043 swp_1044     FALSE 0.034 32.000 0.000 NA   NA
 5433683 5433684 swp_1044 swp_1045     TRUE 0.986 0.000 0.371 1.000 N NA
 5433684 5433685 swp_1045 swp_1046     TRUE 0.987 -7.000 0.920 0.039 N NA
 5433687 5433688 swp_1048 swp_1050     FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 5433689 5433690 swp_1051 swp_1052     TRUE 0.966 22.000 0.667 1.000 N NA
 5433691 5433692 swp_1054 swp_1055     FALSE 0.288 182.000 0.091 NA   NA
 5433695 5433696 swp_1058 swp_1060     FALSE 0.606 -9.000 0.050 NA   NA
 5433701 5433702 swp_1064 swp_1065     FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000   NA
 5433702 5433703 swp_1065 swp_1066     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5433703 5433704 swp_1066 swp_1067     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5433704 5433705 swp_1067 swp_1068     FALSE 0.018 358.000 0.041 1.000   NA
 5433708 5433709 swp_1071 swp_1073     FALSE 7.89760462421098e-05 1425.000 0.000 NA   NA
 5433709 5433710 swp_1073 swp_1074     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5433715 5433716 swp_1079 swp_1080     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 5433717 5433718 swp_1081 swp_1082     FALSE 0.018 133.000 0.000 NA   NA
 5433718 5433719 swp_1082 swp_1083     TRUE 0.919 5.000 0.042 1.000 N NA
 5433722 5433723 swp_1086 swp_1087     FALSE 8.40592003937774e-05 1306.000 0.000 NA   NA
 5433723 5433724 swp_1087 swp_1088     TRUE 0.982 -3.000 0.714 NA   NA
 5433724 5433725 swp_1088 swp_1089     TRUE 0.889 -25.000 0.571 NA   NA
 5433725 5433726 swp_1089 swp_1090     TRUE 0.916 -10.000 0.385 NA   NA
 5433727 5433728 swp_1091 swp_1092     FALSE 0.263 18.000 0.013 NA   NA
 5433728 5433729 swp_1092 swp_1093     FALSE 0.023 209.000 0.000 1.000   NA
 5433730 5433731 swp_1094 swp_1095     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5433732 5433733 swp_1096 swp_1097     FALSE 0.018 132.000 0.000 NA   NA
 5433733 5433734 swp_1097 swp_1098     FALSE 0.000 823.000 0.000 NA   NA
 5433734 5433735 swp_1098 swp_1099     FALSE 0.000 396.000 0.000 NA   NA
 5433735 5433736 swp_1099 swp_1100     FALSE 0.007 282.000 0.000 1.000   NA
 5433736 5433737 swp_1100 swp_1101     FALSE 0.003 353.000 0.000 1.000   NA
 5433739 5433740 swp_1105 swp_1106     FALSE 0.000 454.000 0.000 NA   NA
 5433743 5433744 swp_1109 swp_1110     FALSE 0.007 395.000 0.000 1.000 N NA
 5433745 5433746 swp_1111 swp_1112     TRUE 0.857 118.000 0.299 1.000 N NA
 5433746 5433747 swp_1112 swp_1113     TRUE 0.710 105.000 0.137 1.000   NA
 5433747 5433748 swp_1113 swp_1114     TRUE 0.866 38.000 0.173 0.019   NA
 5433751 5433752 swp_1118 swp_1119     TRUE 0.995 1.000 0.500 1.000 Y NA
 5433752 5433753 swp_1119 swp_1120     TRUE 0.842 25.000 0.125 1.000 N NA
 5433753 5433754 swp_1120 swp_1121     FALSE 0.637 36.000 0.039 1.000 N NA
 5433754 5433755 swp_1121 swp_1122     FALSE 0.314 171.000 0.055 1.000   NA
 5433756 5433757 swp_1123 swp_1124     FALSE 0.002 234.000 0.000 NA   NA
 5433758 5433759 swp_1125 swp_1126     TRUE 0.974 0.000 0.311 NA   NA
 5433762 5433763 swp_1129 swp_1130     FALSE 0.588 29.000 0.021 1.000 N NA
 5433763 5433764 swp_1130 swp_1131     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA   NA
 5433764 5433765 swp_1131 swp_1132     TRUE 0.886 70.000 0.429 NA   NA
 5433768 5433769 swp_1135 swp_1136     FALSE 0.040 277.000 0.059 NA   NA
 5433770 5433771 swp_1137 swp_1138     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5433772 5433773 swp_1139 swp_1140     TRUE 0.933 -3.000 0.195 NA   NA
 5433773 5433774 swp_1140 swp_1141     FALSE 0.343 164.000 0.056 1.000   NA
 5433774 5433775 swp_1141 swp_1142     FALSE 0.447 71.000 0.029 1.000   NA
 5433775 5433776 swp_1142 swp_1143     FALSE 0.007 295.000 0.000 NA N NA
 5433776 5433777 swp_1143 swp_1144     FALSE 0.026 236.000 0.022 NA   NA
 5433779 5433780 swp_1145 swp_1147     FALSE 0.007 187.000 0.000 NA   NA
 5433781 5433782 swp_1148 swp_1149     FALSE 0.263 143.000 0.023 1.000   NA
 5433782 5433783 swp_1149 swp_1150     FALSE 0.239 35.000 0.019 NA   NA
 5433785 5433786 swp_1152 swp_1153     FALSE 0.000 638.000 0.000 NA   NA
 5433786 5433787 swp_1153 swp_1154     TRUE 0.859 37.000 0.244 NA N NA
 5433788 5433789 swp_1155 swp_1156     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5433789 5433790 swp_1156 swp_1158     TRUE 0.891 21.000 0.275 NA   NA
 5433790 5433791 swp_1158 swp_1159     FALSE 0.112 138.000 0.000 NA N NA
 5433791 5433792 swp_1159 swp_1160     FALSE 0.024 98.000 0.000 NA   NA
 5433794 5433795 swp_1162 swp_1163     FALSE 0.462 170.000 0.114 NA N NA
 5433795 5433796 swp_1163 swp_1164     FALSE 0.224 160.000 0.022 NA N NA
 5433796 5433797 swp_1164 swp_1165     FALSE 0.000 577.000 0.000 NA   NA
 5433797 5433798 swp_1165 swp_1166     FALSE 0.027 81.000 0.000 NA   NA
 5433798 5433799 swp_1166 swp_1167     FALSE 0.003 648.000 0.000 1.000 N NA
 5433799 5433800 swp_1167 swp_1168     TRUE 0.997 0.000 0.522 0.004 Y NA
 5433800 5433801 swp_1168 swp_1169     TRUE 0.984 -7.000 0.324 0.004 Y NA
 5433801 5433802 swp_1169 swp_1170     TRUE 0.994 0.000 0.312 0.004 Y NA
 5433802 5433803 swp_1170 swp_1171     TRUE 0.983 6.000 0.062 0.004 Y NA
 5433803 5433804 swp_1171 swp_1172     TRUE 0.946 48.000 0.188 0.004 Y NA
 5433804 5433805 swp_1172 swp_1173     TRUE 0.947 30.000 0.519 1.000 N NA
 5433805 5433806 swp_1173 swp_1174     TRUE 0.967 13.000 0.481 NA   NA
 5433806 5433807 swp_1174 swp_1175     FALSE 0.001 335.000 0.000 NA   NA
 5433807 5433808 swp_1175 swp_1176     TRUE 0.992 13.000 0.396 0.001 Y NA
 5433808 5433809 swp_1176 swp_1177     FALSE 0.001 286.000 0.000 NA   NA
 5433809 5433810 swp_1177 swp_1178     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 5433810 5433811 swp_1178 swp_1179     FALSE 0.123 216.000 0.026 1.000 N NA
 5433814 5433815 swp_1182 swp_1183     FALSE 0.023 -24.000 0.000 NA   NA
 5433816 5433817 swp_1184 swp_1185     FALSE 0.009 177.000 0.000 NA   NA
 5433817 5433818 swp_1185 swp_1186     FALSE 0.021 119.000 0.000 NA   NA
 5433818 5433819 swp_1186 swp_1187     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5433819 5433820 swp_1187 swp_1188     FALSE 0.000 674.000 0.000 NA   NA
 5433820 5433821 swp_1188 swp_1189     FALSE 0.021 118.000 0.000 NA   NA
 5433821 5433822 swp_1189 swp_1190     FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   NA
 5433822 5433823 swp_1190 swp_1191     FALSE 0.022 -25.000 0.000 NA   NA
 5433823 5433824 swp_1191 swp_1192     FALSE 0.004 209.000 0.000 NA   NA
 5433824 5433825 swp_1192 swp_1193     TRUE 0.963 -3.000 0.014 0.001 Y NA
 5433825 5433826 swp_1193 swp_1194     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5433828 5433829 swp_1196 swp_1197     TRUE 0.953 89.000 0.236 0.002 Y NA
 5433829 5433830 swp_1197 swp_1198     FALSE 0.414 187.000 0.011 1.000 Y NA
 5433830 5433831 swp_1198 swp_1199     TRUE 0.886 82.000 0.130 1.000 Y NA
 5433831 5433832 swp_1199 swp_1200     FALSE 0.481 65.000 0.013 1.000 N NA
 5433832 5433833 swp_1200 swp_1201     FALSE 0.389 203.000 0.034 1.000 Y NA
 5433833 5433834 swp_1201 swp_1202     TRUE 0.977 29.000 0.345 0.001 Y NA
 5433834 5433835 swp_1202 swp_1203     FALSE 0.110 350.000 0.241 1.000 N NA
 5433835 5433836 swp_1203 swp_1206     FALSE 0.056 143.000 0.007 NA   NA
 5433836 5433837 swp_1206 swp_1207     FALSE 0.043 309.000 0.099 NA   NA
 5433837 5433838 swp_1207 swp_1208     TRUE 0.996 2.000 0.366 0.001 Y NA
 5433840 5433841 swp_1210 swp_1211     TRUE 0.767 71.000 0.152 NA N NA
 5433841 5433842 swp_1211 swp_1212     TRUE 0.873 113.000 0.325 1.000 N NA
 5433842 5433843 swp_1212 swp_1213     TRUE 0.870 83.000 0.260 1.000 N NA
 5433843 5433844 swp_1213 swp_1214     FALSE 0.599 186.000 0.082 1.000 Y NA
 5433844 5433845 swp_1214 swp_1215     TRUE 0.975 3.000 0.184 1.000 N NA
 5433845 5433846 swp_1215 swp_1216     FALSE 0.000 569.000 0.000 NA   NA
 5433846 5433847 swp_1216 swp_1217     TRUE 0.949 28.000 0.759 NA   NA
 5433847 5433848 swp_1217 swp_1218     TRUE 0.927 27.000 0.342 1.000 N NA
 5433848 5433849 swp_1218 swp_1219     TRUE 0.965 68.000 0.530 1.000 Y NA
 5433849 5433850 swp_1219 swp_1220     TRUE 0.991 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5433850 5433851 swp_1220 swp_1221     TRUE 0.891 127.000 0.211 1.000 Y NA
 5433853 5433854 swp_1223 swp_1224     FALSE 0.195 206.000 0.071 1.000   NA
 5433854 5433855 swp_1224 swp_1225     FALSE 0.308 103.000 0.015 1.000   NA
 5433855 5433856 swp_1225 swp_1226     FALSE 0.046 232.000 0.015 NA N NA
 5433856 5433857 swp_1226 swp_1227     FALSE 0.248 178.000 0.040 NA N NA
 5433857 5433858 swp_1227 swp_1228     FALSE 0.011 340.000 0.000 1.000 N NA
 5433858 5433859 swp_1228 swp_1229     FALSE 0.004 513.000 0.000 1.000 N NA
 5433859 5433860 swp_1229 swp_1230     TRUE 0.852 164.000 0.286 1.000 Y NA
 5433860 5433861 swp_1230 swp_1231     FALSE 0.190 327.000 0.398 1.000 N NA
 5433861 5433862 swp_1231 swp_1232     TRUE 0.903 103.000 0.414 1.000 N NA
 5433864 5433865 swp_1234 swp_1235     FALSE 0.005 267.000 0.007 NA   NA
 5433867 5433868 swp_1237 swp_1238     FALSE 0.007 411.000 0.000 1.000 N NA
 5433868 5433869 swp_1238 swp_1239     TRUE 0.977 13.000 0.222 1.000 Y NA
 5433869 5433870 swp_1239 swp_1240     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA N NA
 5433873 5433874 swp_1243 swp_1244     FALSE 0.171 131.000 0.022 NA   NA
 5433874 5433875 swp_1244 swp_1245     FALSE 0.577 160.000 0.200 NA   NA
 5433877 5433878 swp_1247 swp_1248     FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5433878 5433879 swp_1248 swp_1249     FALSE 0.028 48.000 0.000 NA   NA
 5433885 5433886 swp_1254 swp_1255     FALSE 0.607 30.000 0.046 1.000   NA
 5433886 5433887 swp_1255 swp_1256     FALSE 0.188 142.000 0.008 1.000   NA
 5433887 5433888 swp_1256 swp_1257     FALSE 0.003 367.000 0.000 1.000   NA
 5433890 5433891 swp_1259 swp_1260     TRUE 0.990 29.000 0.948 0.007 Y NA
 5433894 5433895 swp_1263 swp_1264     FALSE 0.228 183.000 0.023 1.000 N NA
 5433895 5433896 swp_1264 swp_1265     TRUE 0.971 70.000 0.453 0.027 Y NA
 5433896 5433897 swp_1265 swp_1267     FALSE 0.502 189.000 0.168 1.000 N NA
 5433900 5433901 swp_1271 swp_1272     FALSE 0.000 410.000 0.000 NA   NA
 5433901 5433902 swp_1272 swp_1273     FALSE 0.005 201.000 0.000 NA   NA
 5433902 5433903 swp_1273 swp_1274     FALSE 0.041 25.000 0.000 NA   NA
 5433904 5433905 swp_1275 swp_1276     FALSE 0.044 183.000 0.000 1.000   NA
 5433908 5433909 swp_1280 swp_1281     FALSE 0.011 162.000 0.000 NA   NA
 5433909 5433910 swp_1281 swp_1282     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5433913 5433914 swp_1285 swp_1286     FALSE 0.000 604.000 0.000 NA   NA
 5433914 5433915 swp_1286 swp_1287     TRUE 0.865 32.000 0.088 NA Y NA
 5433916 5433917 swp_1288 swp_1289     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5433919 5433920 swp_1291 swp_1292     TRUE 0.761 157.000 0.429 NA   NA
 5433920 5433921 swp_1292 swp_1294     TRUE 0.981 78.000 0.778 0.061 Y NA
 5433923 5433924 swp_1297 swp_1298     FALSE 0.049 241.000 0.043 NA   NA
 5433924 5433925 swp_1298 swp_1299     FALSE 0.000 409.000 0.000 NA   NA
 5433926 5433927 swp_1300 swp_1301     TRUE 0.988 10.000 0.667 1.000 N NA
 5433928 5433929 swp_1302 swp_1303     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 5433930 5433931 swp_1304 swp_1305     FALSE 0.021 117.000 0.000 NA   NA
 5433931 5433932 swp_1305 swp_1306     FALSE 0.022 115.000 0.000 NA   NA
 5433932 5433933 swp_1306 swp_1307     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 5433933 5433934 swp_1307 swp_1308     FALSE 0.000 684.000 0.000 NA   NA
 5433935 5433936 swp_1309 swp_1311     FALSE 0.028 73.000 0.000 NA   NA
 5433939 5433940 swp_1314 swp_1315     TRUE 0.989 4.000 0.118 0.003 Y NA
 5433940 5433941 swp_1315 swp_1316     TRUE 0.970 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 5433941 5433942 swp_1316 swp_1317     TRUE 0.953 56.000 0.394 1.000 Y NA
 5433942 5433943 swp_1317 swp_1318     TRUE 0.962 67.000 0.481 1.000 Y NA
 5433944 5433945 swp_1319 swp_1320     FALSE 0.025 95.000 0.000 NA   NA
 5433945 5433946 swp_1320 swp_1321     FALSE 0.000 606.000 0.000 NA   NA
 5433946 5433947 swp_1321 swp_1323     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 5433947 5433948 swp_1323 swp_1324     FALSE 0.001 273.000 0.000 NA   NA
 5433948 5433949 swp_1324 swp_1325     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5433953 5433954 swp_1329 swp_1330     TRUE 0.953 1.000 0.117 NA N NA
 5433954 5433955 swp_1330 swp_1331     FALSE 0.001 1025.000 0.000 1.000   NA
 5433955 5433956 swp_1331 swp_1332     TRUE 0.686 47.000 0.095 1.000   NA
 5433956 5433957 swp_1332 swp_1333     FALSE 0.007 186.000 0.000 NA   NA
 5433957 5433958 swp_1333 swp_1334     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5433958 5433959 swp_1334 swp_1335     FALSE 0.002 237.000 0.000 NA   NA
 5433960 5433961 swp_1336 swp_1337     FALSE 0.001 319.000 0.000 NA   NA
 5433961 5433962 swp_1337 swp_1338     FALSE 0.406 119.000 0.032 NA N NA
 5433962 5433963 swp_1338 swp_1339     TRUE 0.860 48.000 0.277 NA N NA
 5433963 5433964 swp_1339 swp_1340     TRUE 0.994 5.000 0.456 1.000 Y NA
 5433964 5433965 swp_1340 swp_1341     TRUE 0.729 148.000 0.065 1.000 Y NA
 5433965 5433966 swp_1341 swp_1342     TRUE 0.809 146.000 0.049 0.002 Y NA
 5433966 5433967 swp_1342 swp_1343     TRUE 0.960 15.000 0.347 1.000 N NA
 5433967 5433968 swp_1343 swp_1344     TRUE 0.757 145.000 0.225 1.000 N NA
 5433968 5433969 swp_1344 swp_1345     TRUE 0.960 -3.000 0.206 1.000 N NA
 5433970 5433971 swp_1346 swp_1347     FALSE 0.020 271.000 0.010 1.000   NA
 5433971 5433972 swp_1347 swp_1348     FALSE 0.018 -31.000 0.000 NA   NA
 5433974 5433975 swp_1350 swp_1351     FALSE 0.667 -10.000 0.075 NA   NA
 5433976 5433977 swp_1352 swp_1353     FALSE 0.363 139.000 0.018 1.000 N NA
 5433977 5433978 swp_1353 swp_1354     FALSE 0.342 55.000 0.015 1.000   NA
 5433978 5433979 swp_1354 swp_1355     FALSE 0.142 188.000 0.025 1.000   NA
 5433979 5433980 swp_1355 swp_1356     FALSE 0.599 130.000 0.068 1.000 N NA
 5433980 5433981 swp_1356 swp_1357     TRUE 0.866 52.000 0.241 1.000 N NA
 5433981 5433982 swp_1357 swp_1358     TRUE 0.863 31.000 0.185 1.000 N NA
 5433982 5433983 swp_1358 swp_1359     TRUE 0.955 55.000 0.419 1.000 Y NA
 5433983 5433984 swp_1359 swp_1360     TRUE 0.880 17.000 0.173 1.000   NA
 5433984 5433985 swp_1360 swp_1361     TRUE 0.972 0.000 0.235 1.000   NA
 5433985 5433986 swp_1361 swp_1362     TRUE 0.884 77.000 0.353 1.000   NA
 5433986 5433987 swp_1362 swp_1363     FALSE 0.568 49.000 0.030 1.000 N NA
 5433987 5433988 swp_1363 swp_1364     TRUE 0.816 77.000 0.169 1.000 N NA
 5433990 5433991 swp_1366 swp_1367     FALSE 0.071 322.000 0.054 0.086 N NA
 5433991 5433992 swp_1367 swp_1368     FALSE 0.009 475.000 0.020 1.000 N NA
 5433992 5433993 swp_1368 swp_1369     FALSE 0.001 1688.000 0.000 1.000 N NA
 5433993 5433994 swp_1369 swp_1370     FALSE 0.149 79.000 0.000 1.000   NA
 5433994 5433995 swp_1370 swp_1371     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433995 5433996 swp_1371 swp_1373     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5433998 5433999 swp_1374 swp_1375     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5433999 5434000 swp_1375 swp_1376     FALSE 0.044 -10.000 0.000 NA   NA
 5434002 5434003 swp_1378 swp_1379     TRUE 0.992 20.000 0.810 0.001 Y NA
 5434003 5434004 swp_1379 swp_1380     TRUE 0.998 9.000 0.976 0.001 Y NA
 5434004 5434005 swp_1380 swp_1381     FALSE 0.048 180.000 0.000 1.000   NA
 5434005 5434006 swp_1381 swp_1382     TRUE 0.993 11.000 1.000 0.009   NA
 5434006 5434007 swp_1382 swp_1383     FALSE 0.151 59.000 0.000 1.000   NA
 5434007 5434008 swp_1383 swp_1384     FALSE 0.026 -19.000 0.000 NA   NA
 5434009 5434010 swp_1385 swp_1386     TRUE 0.696 71.000 0.138 NA   NA
 5434011 5434012 swp_1387 swp_1388     FALSE 0.019 129.000 0.000 NA   NA
 5434012 5434013 swp_1388 swp_1389     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5434013 5434014 swp_1389 swp_1390     FALSE 0.160 243.000 0.127 1.000   NA
 5434014 5434015 swp_1390 swp_1392     TRUE 0.912 3.000 0.079 NA   NA
 5434015 5434016 swp_1392 swp_1393     FALSE 0.546 112.000 0.090 NA   NA
 5434016 5434017 swp_1393 swp_1394     FALSE 0.005 197.000 0.000 NA   NA
 5434019 5434020 swp_1396 swp_1397     FALSE 0.257 152.000 0.002 1.000 N NA
 5434020 5434021 swp_1397 swp_1398     TRUE 0.777 -7.000 0.092 NA   NA
 5434025 5434026 swp_1402 swp_1403     TRUE 0.743 -10.000 0.111 NA   NA
 5434026 5434027 swp_1403 swp_1404     FALSE 0.028 61.000 0.000 NA   NA
 5434027 5434028 swp_1404 swp_1405     TRUE 0.968 25.000 0.250 0.023 Y NA
 5434028 5434029 swp_1405 swp_1406     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 5434029 5434030 swp_1406 swp_1407     FALSE 0.027 79.000 0.000 NA   NA
 5434031 5434032 swp_1408 swp_1409     FALSE 0.002 238.000 0.000 NA   NA
 5434032 5434033 swp_1409 swp_1410     TRUE 0.966 12.000 0.400 NA   NA
 5434034 5434035 swp_1411 swp_1412     FALSE 0.637 20.000 0.016 1.000 N NA
 5434039 5434040 swp_1416 swp_1417     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5434040 5434041 swp_1417 swp_1418     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 5434041 5434042 swp_1418 swp_1419     FALSE 0.032 251.000 0.000 1.000 N NA
 5434042 5434043 swp_1419 swp_1420     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5434045 5434046 swp_1422 swp_1424     TRUE 0.997 3.000 0.480 0.003 Y NA
 5434048 5434049 swp_1425 swp_1426     TRUE 0.923 -37.000 0.273 0.052 Y NA
 5434049 5434050 swp_1426 swp_1427     TRUE 0.804 35.000 0.064 0.060 N NA
 5434050 5434051 swp_1427 swp_1428     FALSE 0.284 119.000 0.000 1.000 N NA
 5434053 5434054 swp_1430 swp_1431     TRUE 0.859 -3.000 0.086 NA   NA
 5434059 5434060 swp_1436 swp_1437     FALSE 0.491 67.000 0.056 NA   NA
 5434060 5434061 swp_1437 swp_1438     FALSE 0.002 230.000 0.000 NA   NA
 5434061 5434062 swp_1438 swp_1439     TRUE 0.865 -40.000 0.667 NA   NA
 5434062 5434063 swp_1439 swp_1440     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5434064 5434065 swp_1441 swp_1442     FALSE 0.078 183.000 0.022 NA   NA
 5434065 5434066 swp_1442 swp_1443     TRUE 0.761 120.000 0.250 NA   NA
 5434066 5434067 swp_1443 swp_1444     TRUE 0.989 2.000 0.333 0.011   NA
 5434068 5434069 swp_1445 swp_1446     FALSE 0.395 97.000 0.045 NA   NA
 5434070 5434071 swp_1447 swp_1448     FALSE 0.095 -43.000 0.014 NA   NA
 5434071 5434072 swp_1448 swp_1449     FALSE 0.616 60.000 0.067 1.000   NA
 5434072 5434073 swp_1449 swp_1450     TRUE 0.956 0.000 0.153 1.000   NA
 5434073 5434074 swp_1450 swp_1451     TRUE 0.889 23.000 0.233 1.000   NA
 5434074 5434075 swp_1451 swp_1452     TRUE 0.843 81.000 0.207 1.000 N NA
 5434075 5434076 swp_1452 swp_1453     TRUE 0.934 15.000 0.259 1.000   NA
 5434076 5434077 swp_1453 swp_1454     TRUE 0.976 12.000 0.492 1.000   NA
 5434077 5434078 swp_1454 swp_1455     TRUE 0.800 87.000 0.203 1.000   NA
 5434081 5434082 swp_1458 swp_1459     TRUE 0.986 9.000 0.740 NA   NA
 5434082 5434083 swp_1459 swp_1460     FALSE 0.077 14.000 0.000 NA   NA
 5434083 5434084 swp_1460 swp_1461     FALSE 0.102 12.000 0.000 NA   NA
 5434084 5434085 swp_1461 swp_1462     FALSE 0.003 407.000 0.000 NA N NA
 5434086 5434087 swp_1463 swp_1464     TRUE 0.930 123.000 0.190 0.001 Y NA
 5434087 5434088 swp_1464 swp_1465     TRUE 0.715 117.000 0.019 1.000 Y NA
 5434090 5434091 swp_1467 swp_1468     FALSE 0.000 555.000 0.000 NA   NA
 5434091 5434092 swp_1468 swp_1469     FALSE 0.000 530.000 0.000 NA   NA
 5434092 5434093 swp_1469 swp_1470     TRUE 0.991 16.000 0.750 0.051 Y NA
 5434093 5434094 swp_1470 swp_1471     TRUE 0.871 16.000 0.184 NA   NA
 5434094 5434095 swp_1471 swp_1472     FALSE 0.001 303.000 0.000 NA   NA
 5434096 5434097 swp_1473 swp_1474     FALSE 0.070 259.000 0.054 NA N NA
 5434097 5434098 swp_1474 swp_1475     TRUE 0.930 102.000 0.723 NA N NA
 5434099 5434100 swp_1476 swp_1477     TRUE 0.706 109.000 0.139 1.000   NA
 5434101 5434102 swp_1478 swp_1479     TRUE 0.785 -16.000 0.200 NA   NA
 5434105 5434106 swp_1482 swp_1483     FALSE 0.018 131.000 0.000 NA   NA
 5434106 5434107 swp_1483 swp_1485     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434107 5434108 swp_1485 swp_1486     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434110 5434111 swp_1487 swp_1488     FALSE 0.000 551.000 0.000 NA   NA
 5434111 5434112 swp_1488 swp_1489     FALSE 0.071 228.000 0.000 0.041   NA
 5434114 5434115 swp_1491 swp_1492     TRUE 0.910 1.000 0.078 NA   NA
 5434116 5434117 swp_1493 swp_1494     TRUE 0.930 46.000 0.361 0.004   NA
 5434117 5434118 swp_1494 swp_1495     TRUE 0.870 62.000 0.371 NA   NA
 5434119 5434120 swp_1496 swp_1497     TRUE 0.958 142.000 0.838 1.000 Y NA
 5434120 5434121 swp_1497 swp_1498     TRUE 0.836 176.000 0.309 1.000 Y NA
 5434121 5434122 swp_1498 swp_1499     TRUE 0.998 3.000 0.889 0.006 Y NA
 5434122 5434123 swp_1499 swp_1500     TRUE 0.969 25.000 0.478 NA Y NA
 5434123 5434124 swp_1500 swp_1501     TRUE 0.974 76.000 0.875 NA Y NA
 5434124 5434125 swp_1501 swp_1502     TRUE 0.898 193.000 0.594 0.006 Y NA
 5434125 5434126 swp_1502 swp_1503     TRUE 0.994 11.000 0.446 0.001 Y NA
 5434126 5434127 swp_1503 swp_1504     TRUE 0.986 73.000 0.909 0.009 Y NA
 5434127 5434128 swp_1504 swp_1505     TRUE 0.966 109.000 0.457 0.012 Y NA
 5434128 5434129 swp_1505 swp_1506     TRUE 0.976 30.000 0.405 0.012 Y NA
 5434129 5434130 swp_1506 swp_1507     TRUE 0.983 44.000 0.705 0.003 Y NA
 5434130 5434131 swp_1507 swp_1508     TRUE 0.953 34.000 0.182 0.002 Y NA
 5434131 5434132 swp_1508 swp_1509     FALSE 0.014 149.000 0.000 NA   NA
 5434132 5434133 swp_1509 swp_1510     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5434133 5434134 swp_1510 swp_1511     FALSE 0.031 589.000 0.000 0.001 Y NA
 5434134 5434135 swp_1511 swp_1512     FALSE 0.097 265.000 0.007 NA Y NA
 5434135 5434136 swp_1512 swp_1513     TRUE 0.843 98.000 0.117 NA Y NA
 5434136 5434137 swp_1513 swp_1514     FALSE 0.425 208.000 0.306 NA   NA
 5434137 5434138 swp_1514 swp_1515     TRUE 0.977 7.000 0.400 NA   NA
 5434138 5434139 swp_1515 swp_1516     FALSE 0.039 288.000 0.022 1.000 N NA
 5434139 5434140 swp_1516 swp_tRNA5     FALSE 0.000 408.000 0.000 NA   NA
 5434140 5434141 swp_tRNA5 swp_1517     FALSE 0.014 -48.000 0.000 NA   NA
 5434141 5434142 swp_1517 swp_tRNA6     FALSE 0.011 -208.000 0.000 NA   NA
 5434142 5434143 swp_tRNA6 swp_1518     FALSE 0.000 875.000 0.000 NA   NA
 5434143 5434144 swp_1518 swp_1519     FALSE 0.248 308.000 0.446 1.000 N NA
 5434144 5434145 swp_1519 swp_1520     TRUE 0.976 137.000 0.910 0.009 Y NA
 5434145 5434146 swp_1520 swp_1521     TRUE 0.949 -16.000 0.189 0.009 Y NA
 5434146 5434147 swp_1521 swp_1522     TRUE 0.995 0.000 0.320 0.006 Y NA
 5434147 5434148 swp_1522 swp_1523     TRUE 0.900 -31.000 0.248 1.000 Y NA
 5434148 5434149 swp_1523 swp_1524     TRUE 0.910 31.000 0.127 1.000 Y NA
 5434149 5434150 swp_1524 swp_1525     TRUE 0.818 159.000 0.317 0.009   NA
 5434150 5434151 swp_1525 swp_1526     TRUE 0.772 94.000 0.182 1.000   NA
 5434151 5434152 swp_1526 swp_1527     TRUE 0.957 56.000 0.241 0.002 Y NA
 5434152 5434153 swp_1527 swp_1529     TRUE 0.995 13.000 0.741 0.002 Y NA
 5434153 5434154 swp_1529 swp_1530     TRUE 0.989 12.000 0.443 1.000 Y NA
 5434154 5434155 swp_1530 swp_1531     TRUE 0.971 -3.000 0.122 1.000 Y NA
 5434155 5434156 swp_1531 swp_1532     TRUE 0.997 8.000 0.702 0.016 Y NA
 5434156 5434157 swp_1532 swp_1533     TRUE 0.983 68.000 0.719 0.004 Y NA
 5434157 5434158 swp_1533 swp_1534     TRUE 0.930 58.000 0.240 1.000 Y NA
 5434158 5434159 swp_1534 swp_1535     FALSE 0.526 250.000 0.205 0.016 Y NA
 5434159 5434160 swp_1535 swp_1536     TRUE 0.915 42.000 0.178 1.000 Y NA
 5434160 5434161 swp_1536 swp_1537     TRUE 0.929 -13.000 0.241 0.014 N NA
 5434161 5434162 swp_1537 swp_1538     TRUE 0.966 -7.000 0.482 1.000 N NA
 5434162 5434163 swp_1538 swp_1539     TRUE 0.850 54.000 0.145 0.082 N NA
 5434163 5434164 swp_1539 swp_1540     TRUE 0.978 14.000 0.284 1.000 Y NA
 5434164 5434165 swp_1540 swp_1541     TRUE 0.982 14.000 0.341 1.000 Y NA
 5434165 5434166 swp_1541 swp_1542     TRUE 0.958 94.000 0.327 0.012 Y NA
 5434166 5434167 swp_1542 swp_1543     TRUE 0.815 -7.000 0.119 NA   NA
 5434167 5434168 swp_1543 swp_1544     FALSE 0.591 64.000 0.085 NA   NA
 5434168 5434169 swp_1544 swp_1545     TRUE 0.928 -16.000 0.454 1.000 N NA
 5434171 5434172 swp_1548 swp_1549     TRUE 0.824 167.000 0.743 NA   NA
 5434173 5434174 swp_1550 swp_1551     TRUE 0.786 84.000 0.224 NA   NA
 5434175 5434176 swp_1552 swp_1553     FALSE 0.156 103.000 0.000 NA N NA
 5434176 5434177 swp_1553 swp_1554     TRUE 0.762 13.000 0.000 0.023   NA
 5434179 5434180 swp_1556 swp_1557     FALSE 0.002 768.000 0.000 1.000 N NA
 5434180 5434181 swp_1557 swp_1558     FALSE 0.377 264.000 0.219 1.000 Y NA
 5434181 5434182 swp_1558 swp_1559     FALSE 0.186 225.000 0.015 NA Y NA
 5434182 5434183 swp_1559 swp_1560     FALSE 0.634 2.000 0.000 NA N NA
 5434183 5434184 swp_1560 swp_1561     FALSE 0.355 -10.000 0.023 NA   NA
 5434184 5434185 swp_1561 swp_1562     FALSE 0.653 39.000 0.105 NA   NA
 5434185 5434186 swp_1562 swp_1563     TRUE 0.955 13.000 0.229 1.000 N NA
 5434186 5434187 swp_1563 swp_1564     TRUE 0.834 35.000 0.091 0.060 N NA
 5434187 5434188 swp_1564 swp_1565     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434188 5434189 swp_1565 swp_1566     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5434189 5434190 swp_1566 swp_1567     FALSE 0.185 2.000 0.000 NA   NA
 5434190 5434191 swp_1567 swp_1568     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5434191 5434192 swp_1568 swp_1569     FALSE 0.175 4.000 0.000 NA   NA
 5434192 5434193 swp_1569 swp_1570     FALSE 0.166 5.000 0.000 NA   NA
 5434195 5434196 swp_1572 swp_1573     TRUE 0.934 51.000 0.556 1.000 N NA
 5434196 5434197 swp_1573 swp_1574     TRUE 0.933 115.000 0.700 1.000 N NA
 5434197 5434198 swp_1574 swp_1575     FALSE 0.044 349.000 0.000 1.000 Y NA
 5434198 5434199 swp_1575 swp_1576     TRUE 0.925 47.000 0.212 1.000 Y NA
 5434199 5434200 swp_1576 swp_1577     FALSE 0.149 7.000 0.000 NA   NA
 5434200 5434201 swp_1577 swp_1578     FALSE 0.026 84.000 0.000 NA   NA
 5434201 5434202 swp_1578 swp_1579     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434202 5434203 swp_1579 swp_1580     FALSE 0.000 498.000 0.000 NA   NA
 5434203 5434204 swp_1580 swp_1582     FALSE 0.023 109.000 0.000 NA   NA
 5434204 5434205 swp_1582 swp_1584     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434207 5434208 swp_1585 swp_1586     TRUE 0.948 0.000 0.022 NA Y NA
 5434208 5434209 swp_1586 swp_1588     FALSE 0.352 64.000 0.000 1.000 N NA
 5434209 5434210 swp_1588 swp_1589     FALSE 0.498 181.000 0.043 0.002 N NA
 5434210 5434211 swp_1589 swp_1591     TRUE 0.895 50.000 0.143 1.000 Y NA
 5434213 5434214 swp_1592 swp_1593     TRUE 0.841 11.000 0.070 NA   NA
 5434216 5434217 swp_1595 swp_1596     FALSE 0.000 374.000 0.000 NA   NA
 5434218 5434219 swp_tRNA87 swp_tRNA86     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5434219 5434220 swp_tRNA86 swp_tRNA85     FALSE 0.037 28.000 0.000 NA   NA
 5434220 5434221 swp_tRNA85 swp_tRNA84     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5434221 5434222 swp_tRNA84 swp_tRNA83     FALSE 0.030 40.000 0.000 NA   NA
 5434223 5434224 swp_1597 swp_1598     FALSE 8.53129621025371e-05 1233.000 0.000 NA   NA
 5434224 5434225 swp_1598 swp_1599     FALSE 0.013 323.000 0.000 1.000 N NA
 5434226 5434227 swp_1600 swp_tRNA82     FALSE 0.012 -93.000 0.000 NA   NA
 5434227 5434228 swp_tRNA82 swp_tRNA81     FALSE 0.028 71.000 0.000 NA   NA
 5434228 5434229 swp_tRNA81 swp_tRNA80     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5434231 5434232 swp_1602 swp_1604     TRUE 0.991 0.000 0.167 0.001 Y NA
 5434232 5434233 swp_1604 swp_1605     TRUE 0.911 96.000 0.208 1.000 Y NA
 5434233 5434234 swp_1605 swp_1606     TRUE 0.984 10.000 0.130 0.012 Y NA
 5434234 5434235 swp_1606 swp_1607     FALSE 0.001 310.000 0.000 NA   NA
 5434237 5434238 swp_1609 swp_1610     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 5434238 5434239 swp_1610 swp_1611     TRUE 0.875 -45.000 0.750 NA   NA
 5434239 5434240 swp_1611 swp_1612     TRUE 0.976 26.000 0.688 NA Y NA
 5434240 5434241 swp_1612 swp_1613     TRUE 0.907 26.000 0.250 1.000 N NA
 5434241 5434242 swp_1613 swp_1614     FALSE 0.038 364.000 0.000 1.000 Y NA
 5434242 5434243 swp_1614 swp_1615     TRUE 0.969 32.000 0.500 1.000 Y NA
 5434244 5434245 swp_1616 swp_1617     FALSE 0.599 0.000 0.000 NA N NA
 5434245 5434246 swp_1617 swp_1618     FALSE 0.332 212.000 0.000 0.022 Y NA
 5434246 5434247 swp_1618 swp_1620     TRUE 0.779 94.000 0.147 1.000 N NA
 5434250 5434251 swp_1622 swp_1623     FALSE 0.003 223.000 0.000 NA   NA
 5434251 5434252 swp_1623 swp_1625     TRUE 0.901 66.000 0.500 NA   NA
 5434252 5434253 swp_1625 swp_1626     TRUE 0.907 106.000 0.667 NA   NA
 5434253 5434254 swp_1626 swp_1627     TRUE 0.957 32.000 1.000 NA   NA
 5434254 5434255 swp_1627 swp_1628     TRUE 0.940 45.000 0.833 NA   NA
 5434255 5434256 swp_1628 swp_1630     TRUE 0.941 38.000 0.800 NA   NA
 5434256 5434257 swp_1630 swp_1631     FALSE 0.001 282.000 0.000 NA   NA
 5434257 5434258 swp_1631 swp_1632     FALSE 0.001 1448.000 0.000 1.000 N NA
 5434258 5434259 swp_1632 swp_1633     FALSE 0.311 104.000 0.000 1.000 N NA
 5434259 5434260 swp_1633 swp_1634     TRUE 0.849 120.000 0.120 1.000 Y NA
 5434261 5434262 swp_1635 swp_1636     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   NA
 5434262 5434263 swp_1636 swp_1637     TRUE 0.704 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5434263 5434264 swp_1637 swp_1638     TRUE 0.954 75.000 0.231 0.003 Y NA
 5434264 5434265 swp_1638 swp_1639     FALSE 0.356 46.000 0.000 1.000 N NA
 5434265 5434266 swp_1639 swp_1640     FALSE 0.641 91.000 0.056 1.000 N NA
 5434266 5434267 swp_1640 swp_1641     FALSE 0.504 56.000 0.060 NA   NA
 5434270 5434271 swp_1644 swp_1645     FALSE 0.289 166.000 0.067 NA   NA
 5434271 5434272 swp_1645 swp_1647     FALSE 0.600 58.000 0.062 1.000   NA
 5434272 5434273 swp_1647 swp_1649     TRUE 0.895 47.000 0.136 1.000 Y NA
 5434274 5434275 swp_1650 swp_1651     TRUE 0.827 98.000 0.203 1.000 N NA
 5434275 5434276 swp_1651 swp_1652     FALSE 0.015 365.000 0.012 1.000 N NA
 5434276 5434277 swp_1652 swp_1653     FALSE 0.031 253.000 0.000 1.000 N NA
 5434277 5434278 swp_1653 swp_1654     TRUE 0.921 90.000 0.495 1.000 N NA
 5434281 5434282 swp_1658 swp_1659     FALSE 0.033 33.000 0.000 NA   NA
 5434282 5434283 swp_1659 swp_1660     FALSE 0.000 616.000 0.000 NA   NA
 5434286 5434287 swp_1663 swp_1664     TRUE 0.932 -42.000 0.275 0.001 Y NA
 5434287 5434288 swp_1664 swp_1665     TRUE 0.875 130.000 0.186 1.000 Y NA
 5434288 5434289 swp_1665 swp_1666     TRUE 0.801 54.000 0.153 1.000 N NA
 5434289 5434290 swp_1666 swp_1667     TRUE 0.932 28.000 0.375 1.000 N NA
 5434290 5434291 swp_1667 swp_1668     TRUE 0.805 79.000 0.158 1.000 N NA
 5434291 5434292 swp_1668 swp_1669     FALSE 0.293 190.000 0.053 1.000 N NA
 5434295 5434296 swp_1672 swp_1673     FALSE 0.045 225.000 0.032 NA   NA
 5434297 5434298 swp_1675 swp_1676     FALSE 0.065 140.000 0.008 NA   NA
 5434298 5434299 swp_1676 swp_1677     TRUE 0.897 182.000 0.360 0.001 Y NA
 5434299 5434300 swp_1677 swp_1678     TRUE 0.900 31.000 0.325 NA N NA
 5434300 5434301 swp_1678 swp_1679     TRUE 0.750 36.000 0.021 NA Y NA
 5434301 5434302 swp_1679 swp_1680     TRUE 0.975 13.000 0.090 0.001 Y NA
 5434304 5434305 swp_1681 swp_1683     TRUE 0.923 0.000 0.105 NA   NA
 5434305 5434306 swp_1683 swp_1684     TRUE 0.776 46.000 0.158 NA N NA
 5434306 5434307 swp_1684 swp_1685     FALSE 0.541 119.000 0.066 1.000   NA
 5434310 5434311 swp_1689 swp_tRNA79     FALSE 0.000 360.000 0.000 NA   NA
 5434311 5434312 swp_tRNA79 swp_1690     FALSE 0.038 -12.000 0.000 NA   NA
 5434312 5434313 swp_1690 swp_tRNA78     FALSE 0.010 -437.000 0.000 NA   NA
 5434313 5434314 swp_tRNA78 swp_tRNA77     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 5434314 5434315 swp_tRNA77 swp_tRNA76     FALSE 0.029 45.000 0.000 NA   NA
 5434315 5434316 swp_tRNA76 swp_tRNA75     FALSE 0.028 50.000 0.000 NA   NA
 5434316 5434317 swp_tRNA75 swp_tRNA74     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 5434317 5434318 swp_tRNA74 swp_tRNA73     FALSE 0.184 3.000 0.000 NA   NA
 5434319 5434320 swp_1691 swp_1692     TRUE 0.925 16.000 0.208 1.000 N NA
 5434320 5434321 swp_1692 swp_1693     FALSE 0.561 197.000 0.271 1.000 N NA
 5434321 5434322 swp_1693 swp_1694     TRUE 0.913 85.000 0.424 1.000 N NA
 5434322 5434323 swp_1694 swp_1695     TRUE 0.926 41.000 0.448 1.000 N NA
 5434323 5434324 swp_1695 swp_1697     TRUE 0.971 15.000 0.359 0.002   NA
 5434324 5434325 swp_1697 swp_1698     TRUE 0.955 18.000 0.500 1.000   NA
 5434325 5434326 swp_1698 swp_1699     TRUE 0.969 73.000 0.634 1.000 Y NA
 5434326 5434327 swp_1699 swp_1700     TRUE 0.991 9.000 0.794 1.000 N NA
 5434329 5434330 swp_1702 swp_1703     FALSE 0.028 199.000 0.012 NA   NA
 5434330 5434331 swp_1703 swp_1704     FALSE 0.008 216.000 0.002 NA   NA
 5434331 5434332 swp_1704 swp_1705     FALSE 0.001 1487.000 0.000 1.000 N NA
 5434333 5434334 swp_1706 swp_1707     FALSE 0.281 89.000 0.008 1.000   NA
 5434335 5434336 swp_1708 swp_1709     TRUE 0.839 121.000 0.406 NA   NA
 5434336 5434337 swp_1709 swp_1710     TRUE 0.991 0.000 0.914 NA   NA
 5434337 5434338 swp_1710 swp_1711     TRUE 0.719 63.000 0.157 NA   NA
 5434338 5434339 swp_1711 swp_1713     TRUE 0.761 72.000 0.189 NA   NA
 5434341 5434342 swp_1714 swp_1715     FALSE 0.030 -16.000 0.000 NA   NA
 5434342 5434343 swp_1715 swp_1716     FALSE 0.554 152.000 0.088 1.000 N NA
 5434343 5434344 swp_1716 swp_1717     TRUE 0.862 101.000 0.411 NA   NA
 5434345 5434346 swp_1718 swp_1719     TRUE 0.833 101.000 0.273 1.000   NA
 5434346 5434347 swp_1719 swp_1720     TRUE 0.986 72.000 1.000 0.026 Y NA
 5434348 5434349 swp_1721 swp_1722     TRUE 0.801 82.000 0.200 1.000   NA
 5434349 5434350 swp_1722 swp_1723     TRUE 0.970 20.000 1.000 NA   NA
 5434350 5434351 swp_1723 swp_1725     TRUE 0.991 2.000 0.750 NA   NA
 5434351 5434352 swp_1725 swp_1726     TRUE 0.974 -6.000 0.750 NA   NA
 5434352 5434353 swp_1726 swp_1728     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5434355 5434356 swp_1729 swp_1730     FALSE 0.015 142.000 0.000 NA   NA
 5434356 5434357 swp_1730 swp_1731     FALSE 0.001 288.000 0.000 NA   NA
 5434357 5434358 swp_1731 swp_1732     FALSE 0.293 172.000 0.028 1.000 N NA
 5434358 5434359 swp_1732 swp_1734     FALSE 0.666 134.000 0.017 1.000 Y NA
 5434359 5434360 swp_1734 swp_1735     FALSE 0.253 189.000 0.038 1.000 N NA
 5434360 5434361 swp_1735 swp_1736     FALSE 0.057 350.000 0.113 1.000 N NA
 5434361 5434362 swp_1736 swp_1737     FALSE 0.106 253.000 0.056 1.000 N NA
 5434362 5434363 swp_1737 swp_1738     FALSE 0.626 47.000 0.069 1.000   NA
 5434373 5434374 swp_1749 swp_1750     FALSE 0.005 458.000 0.000 1.000 N NA
 5434374 5434375 swp_1750 swp_1751     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5434375 5434376 swp_1751 swp_1753     FALSE 0.026 186.000 0.007 NA   NA
 5434377 5434378 swp_1754 swp_1755     FALSE 0.607 30.000 0.071 NA   NA
 5434378 5434379 swp_1755 swp_1756     FALSE 0.372 87.000 0.039 NA   NA
 5434380 5434381 swp_1757 swp_1758     FALSE 0.156 6.000 0.000 NA   NA
 5434381 5434382 swp_1758 swp_1759     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434382 5434383 swp_1759 swp_1760     TRUE 0.813 -34.000 0.175 0.046 N NA
 5434383 5434384 swp_1760 swp_1761     FALSE 0.024 -22.000 0.000 NA   NA
 5434384 5434385 swp_1761 swp_1762     FALSE 0.035 -13.000 0.000 NA   NA
 5434387 5434388 swp_1764 swp_1765     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   NA
 5434388 5434389 swp_1765 swp_1766     FALSE 0.028 74.000 0.000 NA   NA
 5434389 5434390 swp_1766 swp_1767     FALSE 0.134 99.000 0.000 1.000   NA
 5434392 5434393 swp_1770 swp_1771     FALSE 0.016 140.000 0.000 NA   NA
 5434393 5434394 swp_1771 swp_1772     FALSE 0.029 199.000 0.000 1.000   NA
 5434395 5434396 swp_1773 swp_1775     TRUE 0.737 82.000 0.179 NA   NA
 5434397 5434398 swp_1776 swp_1777     FALSE 0.008 178.000 0.000 NA   NA
 5434398 5434399 swp_1777 swp_1778     FALSE 0.507 102.000 0.048 1.000   NA
 5434399 5434400 swp_1778 swp_tRNA7     FALSE 0.009 -634.000 0.000 NA   NA
 5434400 5434401 swp_tRNA7 swp_tRNA8     FALSE 0.125 10.000 0.000 NA   NA
 5434401 5434402 swp_tRNA8 swp_tRNA9     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434404 5434405 swp_1781 swp_1782     FALSE 0.271 120.000 0.032 NA   NA
 5434405 5434406 swp_1782 swp_1783     TRUE 0.982 0.000 0.302 1.000 N NA
 5434406 5434407 swp_1783 swp_1784     TRUE 0.978 -3.000 0.465 NA N NA
 5434407 5434408 swp_1784 swp_tRNA10     FALSE 0.009 -1502.000 0.000 NA   NA
 5434412 5434413 swp_1788 swp_1789     FALSE 0.013 153.000 0.000 NA   NA
 5434413 5434414 swp_1789 swp_1790     TRUE 0.941 33.000 0.744 NA   NA
 5434414 5434415 swp_1790 swp_1791     TRUE 0.957 -10.000 0.769 NA   NA
 5434415 5434416 swp_1791 swp_1792     TRUE 0.943 51.000 0.774 1.000   NA
 5434416 5434417 swp_1792 swp_1793     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5434417 5434418 swp_1793 swp_1794     FALSE 0.006 192.000 0.000 NA   NA
 5434418 5434419 swp_1794 swp_1795     FALSE 0.000 640.000 0.000 NA   NA
 5434419 5434420 swp_1795 swp_1796     FALSE 0.073 -46.000 0.011 NA   NA
 5434420 5434421 swp_1796 swp_1797     FALSE 0.548 3.000 0.011 NA   NA
 5434421 5434422 swp_1797 swp_1798     TRUE 0.892 13.000 0.150 NA   NA
 5434423 5434424 swp_1799 swp_1800     FALSE 0.149 79.000 0.000 1.000   NA
 5434429 5434430 swp_1806 swp_1807     FALSE 0.018 130.000 0.000 NA   NA
 5434430 5434431 swp_1807 swp_1808     FALSE 0.661 36.000 0.104 NA   NA
 5434432 5434433 swp_1809 swp_1810     FALSE 0.003 374.000 0.000 1.000   NA
 5434433 5434434 swp_1810 swp_1811     FALSE 0.000 423.000 0.000 NA   NA
 5434434 5434435 swp_1811 swp_1812     FALSE 0.001 334.000 0.000 NA   NA
 5434435 5434436 swp_1812 swp_1813     TRUE 0.861 79.000 0.087 1.000 Y NA
 5434437 5434438 swp_1814 swp_1815     TRUE 0.989 -3.000 0.263 0.026 Y NA
 5434439 5434440 swp_1816 swp_1817     FALSE 0.001 1265.000 0.000 1.000   NA
 5434440 5434441 swp_1817 swp_1818     TRUE 0.993 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5434444 5434445 swp_1821 swp_1822     FALSE 0.000 806.000 0.000 NA   NA
 5434447 5434448 swp_1824 swp_1825     FALSE 0.003 635.000 0.000 1.000 N NA
 5434450 5434451 swp_1827 swp_1828     TRUE 0.952 -10.000 0.593 1.000   NA
 5434451 5434452 swp_1828 swp_1829     TRUE 0.996 0.000 0.556 0.046 Y NA
 5434452 5434453 swp_1829 swp_1830     TRUE 0.964 0.000 0.183 NA N NA
 5434453 5434454 swp_1830 swp_1831     TRUE 0.913 10.000 0.089 NA N NA
 5434454 5434455 swp_1831 swp_1832     TRUE 0.959 24.000 0.592 1.000 N NA
 5434455 5434456 swp_1832 swp_1833     TRUE 0.904 23.000 0.278 1.000   NA
 5434456 5434457 swp_1833 swp_1834     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434457 5434458 swp_1834 swp_1835     FALSE 7.48444236493404e-05 1949.000 0.000 NA   NA
 5434459 5434460 swp_1836 swp_1838     FALSE 0.208 225.000 0.092 1.000 N NA
 5434460 5434461 swp_1838 swp_1840     TRUE 0.709 46.000 0.000 1.000 Y NA
 5434463 5434464 swp_1842 swp_tRNA72     FALSE 0.009 -951.000 0.000 NA   NA
 5434468 5434469 swp_1846 swp_1847     FALSE 0.071 219.000 0.022 NA N NA
 5434471 5434472 swp_1849 swp_1850     FALSE 0.041 366.000 0.165 NA   NA
 5434473 5434474 swp_1851 swp_1852     FALSE 0.517 141.000 0.055 1.000 N NA
 5434474 5434475 swp_1852 swp_1853     FALSE 0.566 81.000 0.080 NA   NA
 5434475 5434476 swp_1853 swp_1854     FALSE 0.328 156.000 0.068 NA   NA
 5434476 5434477 swp_1854 swp_1855     FALSE 0.526 39.000 0.059 NA   NA
 5434478 5434479 swp_1856 swp_1857     FALSE 0.343 156.000 0.074 NA   NA
 5434480 5434481 swp_1858 swp_1859     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA   NA
 5434482 5434483 swp_1860 swp_1861     FALSE 0.122 93.000 0.011 NA   NA
 5434483 5434484 swp_1861 swp_1862     FALSE 0.670 30.000 0.093 NA   NA
 5434484 5434485 swp_1862 swp_1863     TRUE 0.956 4.000 0.180 NA   NA
 5434485 5434486 swp_1863 swp_1865     FALSE 0.450 193.000 0.158 1.000 N NA
 5434489 5434490 swp_1867 swp_1868     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5434492 5434493 swp_1870 swp_1871     TRUE 0.922 37.000 0.596 NA   NA
 5434494 5434495 swp_1872 swp_1873     FALSE 0.663 114.000 0.078 1.000 N NA
 5434495 5434496 swp_1873 swp_1874     TRUE 0.956 107.000 0.285 0.001 Y NA
 5434498 5434499 swp_1877 swp_1878     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434503 5434504 swp_1883 swp_1884     FALSE 0.000 383.000 0.000 NA   NA
 5434506 5434507 swp_1886 swp_1887     TRUE 0.933 -19.000 0.330 NA Y NA
 5434508 5434509 swp_1888 swp_1889     FALSE 0.001 304.000 0.000 NA   NA
 5434509 5434510 swp_1889 swp_1890     FALSE 0.039 26.000 0.000 NA   NA
 5434511 5434512 swp_1891 swp_1892     FALSE 0.020 122.000 0.000 NA   NA
 5434513 5434514 swp_1893 swp_1894     FALSE 0.000 635.000 0.000 NA   NA
 5434514 5434515 swp_1894 swp_1896     TRUE 0.690 104.000 0.164 NA   NA
 5434517 5434518 swp_1898 swp_1899     TRUE 0.981 -3.000 0.571 1.000   NA
 5434518 5434519 swp_1899 swp_1900     TRUE 0.984 10.000 0.700 NA   NA
 5434520 5434521 swp_1901 swp_1902     TRUE 0.685 17.000 0.062 NA   NA
 5434521 5434522 swp_1902 swp_1903     TRUE 0.964 0.000 0.224 NA   NA
 5434522 5434523 swp_1903 swp_1904     FALSE 0.012 155.000 0.000 NA   NA
 5434523 5434524 swp_1904 swp_1905     FALSE 0.000 372.000 0.000 NA   NA
 5434525 5434526 swp_1906 swp_1907     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5434528 5434529 swp_1909 swp_1910     FALSE 0.516 73.000 0.000 0.009   NA
 5434529 5434530 swp_1910 swp_1911     FALSE 0.005 641.000 0.000 0.009   NA
 5434533 5434534 swp_1914 swp_1915     FALSE 0.029 43.000 0.000 NA   NA
 5434536 5434537 swp_1918 swp_1919     TRUE 0.994 -7.000 0.947 0.001 Y NA
 5434537 5434538 swp_1919 swp_1920     TRUE 0.947 106.000 0.221 0.001 Y NA
 5434538 5434539 swp_1920 swp_1921     TRUE 0.940 53.000 0.293 1.000 Y NA
 5434539 5434540 swp_1921 swp_1922     TRUE 0.979 -3.000 0.083 0.001 Y NA
 5434540 5434541 swp_1922 swp_1923     TRUE 0.996 -3.000 0.703 0.001 Y NA
 5434544 5434545 swp_1926 swp_1927     FALSE 0.383 84.000 0.040 NA   NA
 5434545 5434546 swp_1927 swp_1928     TRUE 0.827 13.000 0.083 NA   NA
 5434546 5434547 swp_1928 swp_1929     TRUE 0.912 -7.000 0.210 NA N NA
 5434551 5434552 swp_1934 swp_1935     FALSE 0.467 135.000 0.036 1.000 N NA
 5434553 5434554 swp_1936 swp_1937     TRUE 0.933 103.000 0.900 NA   NA
 5434555 5434556 swp_tRNA11 swp_tRNA12     FALSE 0.023 106.000 0.000 NA   NA
 5434557 5434558 swp_1938 swp_1939     FALSE 0.000 358.000 0.000 NA   NA
 5434558 5434559 swp_1939 swp_1940     FALSE 0.148 114.000 0.016 NA   NA
 5434560 5434561 swp_1941 swp_1942     TRUE 0.977 -9.000 0.535 NA Y NA
 5434563 5434564 swp_1944 swp_1945     TRUE 0.968 6.000 0.262 NA   NA
 5434565 5434566 swp_1946 swp_1947     FALSE 9.10374569595507e-05 1053.000 0.000 NA   NA
 5434566 5434567 swp_1947 swp_1948     FALSE 0.000 466.000 0.000 NA   NA
 5434567 5434568 swp_1948 swp_1949     TRUE 0.754 99.000 0.171 1.000   NA
 5434570 5434571 swp_1951 swp_1952     TRUE 0.743 67.000 0.092 1.000 N NA
 5434571 5434572 swp_1952 swp_1953     FALSE 0.009 552.000 0.080 NA   NA
 5434576 5434577 swp_1957 swp_1958     FALSE 0.016 561.000 0.000 1.000 Y NA
 5434577 5434578 swp_1958 swp_1959     FALSE 0.640 119.000 0.111 1.000   NA
 5434581 5434582 swp_1962 swp_1963     FALSE 0.405 177.000 0.136 NA   NA
 5434583 5434584 swp_1964 swp_1965     FALSE 0.155 167.000 0.015 1.000   NA
 5434585 5434586 swp_1966 swp_1967     TRUE 0.865 141.000 0.115 0.010 Y NA
 5434586 5434587 swp_1967 swp_1968     TRUE 0.753 78.000 0.106 1.000 N NA
 5434587 5434588 swp_1968 swp_1969     FALSE 0.031 191.000 0.011 NA   NA
 5434588 5434589 swp_1969 swp_1970     FALSE 0.003 724.000 0.037 NA   NA
 5434589 5434590 swp_1970 swp_1971     FALSE 0.017 334.000 0.026 NA N NA
 5434590 5434591 swp_1971 swp_1972     FALSE 0.389 16.000 0.020 NA   NA
 5434591 5434592 swp_1972 swp_1973     FALSE 0.001 269.000 0.000 NA   NA
 5434592 5434593 swp_1973 swp_1974     TRUE 0.953 32.000 0.916 NA   NA
 5434593 5434594 swp_1974 swp_1975     FALSE 0.285 151.000 0.031 1.000   NA
 5434594 5434595 swp_1975 swp_1976     TRUE 0.987 6.000 0.447 1.000 N NA
 5434596 5434597 swp_1977 swp_1978     TRUE 0.746 22.000 0.077 1.000   NA
 5434599 5434600 swp_1980 swp_1981     TRUE 0.882 98.000 0.324 1.000 N NA
 5434600 5434601 swp_1981 swp_1982     TRUE 0.909 108.000 0.462 1.000 N NA
 5434601 5434602 swp_1982 swp_1983     TRUE 0.842 42.000 0.186 1.000 N NA
 5434602 5434603 swp_1983 swp_1984     TRUE 0.744 78.000 0.142 1.000   NA
 5434604 5434605 swp_1985 swp_1986     TRUE 0.951 25.000 0.229 1.000 Y NA
 5434607 5434608 swp_1987 swp_1989     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5434608 5434609 swp_1989 swp_rRNA17     FALSE 0.000 767.000 0.000 NA   NA
 5434609 5434610 swp_rRNA17 swp_1990     FALSE 0.010 -597.000 0.000 NA   NA
 5434610 5434611 swp_1990 swp_rRNA18     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5434611 5434612 swp_rRNA18 swp_rRNA19     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA   NA
 5434612 5434613 swp_rRNA19 swp_1991     FALSE 7.66557543652881e-05 1567.000 0.000 NA   NA
 5434613 5434614 swp_1991 swp_1992     FALSE 0.321 95.000 0.000 1.000 N NA
 5434614 5434615 swp_1992 swp_1993     TRUE 0.979 2.000 0.211 1.000 N NA
 5434617 5434618 swp_1995 swp_1996     FALSE 0.026 291.000 0.002 1.000 N NA
 5434618 5434619 swp_1996 swp_1997     TRUE 0.881 10.000 0.037 1.000 N NA
 5434619 5434620 swp_1997 swp_1998     TRUE 0.923 127.000 0.681 1.000 N NA
 5434620 5434621 swp_1998 swp_1999     TRUE 0.998 5.000 0.838 0.014 Y NA
 5434621 5434622 swp_1999 swp_2000     FALSE 0.519 271.000 0.302 0.014 Y NA
 5434622 5434623 swp_2000 swp_2002     TRUE 0.985 57.000 0.884 0.011 Y NA
 5434623 5434624 swp_2002 swp_2003     FALSE 0.258 241.000 0.223 1.000   NA
 5434624 5434625 swp_2003 swp_2004     TRUE 0.967 86.000 0.851 0.001   NA
 5434625 5434626 swp_2004 swp_2005     FALSE 0.432 190.000 0.122 1.000 N NA
 5434626 5434627 swp_2005 swp_2006     TRUE 0.979 82.000 0.620 0.002 Y NA
 5434627 5434628 swp_2006 swp_2007     TRUE 0.967 76.000 0.579 1.000 Y NA
 5434628 5434629 swp_2007 swp_2008     TRUE 0.970 86.000 0.400 0.002 Y NA
 5434631 5434632 swp_2010 swp_2011     TRUE 0.895 105.000 0.307 0.014   NA
 5434632 5434633 swp_2011 swp_2012     TRUE 0.986 18.000 0.486 0.011 Y NA
 5434633 5434634 swp_2012 swp_2013     TRUE 0.994 -3.000 0.513 0.011 Y NA
 5434634 5434635 swp_2013 swp_2014     TRUE 0.992 17.000 0.849 0.014 Y NA
 5434635 5434636 swp_2014 swp_2015     TRUE 0.996 12.000 0.820 0.014 Y NA
 5434636 5434637 swp_2015 swp_2016     TRUE 0.992 16.000 0.769 0.014 Y NA
 5434637 5434638 swp_2016 swp_2017     TRUE 0.996 10.000 0.719 0.014 Y NA
 5434638 5434639 swp_2017 swp_2018     TRUE 0.996 12.000 0.828 0.014 Y NA
 5434639 5434640 swp_2018 swp_2019     TRUE 0.998 0.000 0.802 0.011 Y NA
 5434640 5434641 swp_2019 swp_2020     TRUE 0.998 0.000 0.828 0.011 Y NA
 5434641 5434642 swp_2020 swp_2021     TRUE 0.939 182.000 0.791 0.014 Y NA
 5434642 5434643 swp_2021 swp_2022     TRUE 0.996 12.000 0.810 0.014 Y NA
 5434643 5434644 swp_2022 swp_2023     TRUE 0.995 13.000 0.758 0.011 Y NA
 5434644 5434645 swp_2023 swp_2024     TRUE 0.994 11.000 0.496 0.011 Y NA
 5434645 5434646 swp_2024 swp_2025     TRUE 0.982 25.000 0.473 0.011 Y NA
 5434646 5434647 swp_2025 swp_2026     TRUE 0.996 11.000 0.808 0.011 Y NA
 5434647 5434648 swp_2026 swp_2027     TRUE 0.996 11.000 0.815 0.011 Y NA
 5434648 5434649 swp_2027 swp_2028     TRUE 0.994 14.000 0.814 0.014 Y NA
 5434649 5434650 swp_2028 swp_2029     TRUE 0.997 7.000 0.789 0.014 Y NA
 5434650 5434651 swp_2029 swp_2030     TRUE 0.998 2.000 0.653 0.002 Y NA
 5434651 5434652 swp_2030 swp_2031     TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 5434652 5434653 swp_2031 swp_2032     TRUE 0.757 24.000 0.089 1.000   NA
 5434653 5434654 swp_2032 swp_2033     TRUE 0.839 116.000 0.194 0.011   NA
 5434654 5434655 swp_2033 swp_2034     TRUE 0.994 15.000 0.810 0.011 Y NA
 5434655 5434656 swp_2034 swp_2035     TRUE 0.978 37.000 0.509 0.014 Y NA
 5434656 5434657 swp_2035 swp_2036     TRUE 0.955 25.000 0.549 1.000 N NA
 5434657 5434658 swp_2036 swp_2037     TRUE 0.961 40.000 0.873 1.000 N NA
 5434658 5434659 swp_2037 swp_2038     FALSE 0.036 30.000 0.000 NA   NA
 5434660 5434661 swp_2039 swp_2040     TRUE 0.984 0.000 0.344 1.000 N NA
 5434661 5434662 swp_2040 swp_2041     TRUE 0.989 0.000 0.501 1.000 N NA
 5434662 5434663 swp_2041 swp_2042     TRUE 0.984 2.000 0.036 0.001 Y NA
 5434663 5434664 swp_2042 swp_2043     TRUE 0.976 10.000 0.050 0.003 Y NA
 5434667 5434668 swp_2046 swp_2047     TRUE 0.964 16.000 0.108 0.003 Y NA
 5434668 5434669 swp_2047 swp_2048     TRUE 0.966 -3.000 0.127 NA Y NA
 5434669 5434670 swp_2048 swp_2049     TRUE 0.994 -3.000 0.846 NA Y NA
 5434670 5434671 swp_2049 swp_rRNA20     FALSE 0.000 641.000 0.000 NA   NA
 5434671 5434672 swp_rRNA20 swp_2050     FALSE 0.010 -598.000 0.000 NA   NA
 5434672 5434673 swp_2050 swp_rRNA21     FALSE 8.2577076166971e-05 1307.000 0.000 NA   NA
 5434673 5434674 swp_rRNA21 swp_rRNA22     FALSE 0.003 220.000 0.000 NA   NA
 5434674 5434675 swp_rRNA22 swp_2051     FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 5434676 5434677 swp_2052 swp_2053     TRUE 0.796 0.000 0.036 NA   NA
 5434677 5434678 swp_2053 swp_2054     FALSE 0.400 168.000 0.053 1.000 N NA
 5434679 5434680 swp_2055 swp_2056     TRUE 0.958 18.000 0.097 0.002 Y NA
 5434680 5434681 swp_2056 swp_2057     TRUE 0.975 12.000 0.171 1.000 Y NA
 5434681 5434682 swp_2057 swp_2058     TRUE 0.777 56.000 0.025 1.000 Y NA
 5434682 5434683 swp_2058 swp_2059     TRUE 0.936 79.000 0.278 1.000 Y NA
 5434685 5434686 swp_2061 swp_2062     TRUE 0.973 -12.000 0.616 NA Y NA
 5434686 5434687 swp_2062 swp_2063     TRUE 0.993 -3.000 0.770 NA Y NA
 5434687 5434688 swp_2063 swp_2064     TRUE 0.992 -3.000 0.680 NA Y NA
 5434688 5434689 swp_2064 swp_2065     TRUE 0.995 6.000 0.668 NA Y NA
 5434689 5434690 swp_2065 swp_2066     FALSE 0.341 252.000 0.319 1.000 N NA
 5434690 5434691 swp_2066 swp_2067     TRUE 0.989 4.000 0.208 1.000 Y NA
 5434691 5434692 swp_2067 swp_2068     FALSE 0.153 149.000 0.003 1.000   NA
 5434692 5434693 swp_2068 swp_2069     FALSE 0.460 53.000 0.032 1.000   NA
 5434694 5434695 swp_2070 swp_2071     TRUE 0.971 9.000 0.346 NA   NA
 5434696 5434697 swp_2072 swp_2073     TRUE 0.950 4.000 0.120 1.000   NA
 5434697 5434698 swp_2073 swp_2074     TRUE 0.768 30.000 0.118 1.000   NA
 5434701 5434702 swp_2078 swp_2079     TRUE 0.914 60.000 0.613 NA   NA
 5434702 5434703 swp_2079 swp_2080     TRUE 0.835 62.000 0.187 1.000 N NA
 5434703 5434704 swp_2080 swp_2081     TRUE 0.713 95.000 0.172 NA   NA
 5434705 5434706 swp_2082 swp_2083     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5434706 5434707 swp_2083 swp_2084     FALSE 0.001 896.000 0.000 1.000   NA
 5434707 5434708 swp_2084 swp_2085     TRUE 0.956 21.000 0.600 1.000   NA
 5434708 5434709 swp_2085 swp_tRNA13     FALSE 0.009 -1202.000 0.000 NA   NA
 5434709 5434710 swp_tRNA13 swp_tRNA14     FALSE 0.045 22.000 0.000 NA   NA
 5434710 5434711 swp_tRNA14 swp_tRNA15     FALSE 0.033 33.000 0.000 NA   NA
 5434711 5434712 swp_tRNA15 swp_tRNA16     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   NA
 5434712 5434713 swp_tRNA16 swp_tRNA17     FALSE 0.035 31.000 0.000 NA   NA
 5434713 5434714 swp_tRNA17 swp_tRNA18     FALSE 0.047 21.000 0.000 NA   NA
 5434714 5434715 swp_tRNA18 swp_tRNA19     FALSE 0.135 9.000 0.000 NA   NA
 5434715 5434716 swp_tRNA19 swp_2086     FALSE 0.000 509.000 0.000 NA   NA
 5434716 5434717 swp_2086 swp_2088     FALSE 0.002 229.000 0.000 NA   NA
 5434721 5434722 swp_2092 swp_2093     FALSE 0.158 211.000 0.000 0.016 N NA
 5434722 5434723 swp_2093 swp_2094     FALSE 0.138 93.000 0.000 1.000   NA
 5434723 5434724 swp_2094 swp_2095     FALSE 0.042 24.000 0.000 NA   NA
 5434724 5434725 swp_2095 swp_2096     FALSE 0.009 174.000 0.000 NA   NA
 5434725 5434726 swp_2096 swp_2097     FALSE 0.093 326.000 0.211 1.000   NA
 5434726 5434727 swp_2097 swp_2098     FALSE 0.028 70.000 0.000 NA   NA
 5434727 5434728 swp_2098 swp_2099     FALSE 0.038 -12.000 0.000 NA   NA
 5434728 5434729 swp_2099 swp_2100     TRUE 0.989 -6.000 0.650 1.000 Y NA
 5434729 5434730 swp_2100 swp_2101     TRUE 0.981 0.000 0.118 1.000 Y NA
 5434730 5434731 swp_2101 swp_2102     FALSE 0.028 75.000 0.000 NA   NA
 5434734 5434735 swp_2105 swp_2106     TRUE 0.911 110.000 0.714 NA   NA
 5434735 5434736 swp_2106 swp_2107     FALSE 0.010 169.000 0.000 NA   NA
 5434736 5434737 swp_2107 swp_2108     FALSE 0.352 -54.000 0.068 NA   NA
 5434737 5434738 swp_2108 swp_2109     TRUE 0.777 95.000 0.227 NA   NA
 5434738 5434739 swp_2109 swp_2110     TRUE 0.763 16.000 0.056 NA N NA
 5434740 5434741 swp_2111 swp_2112     FALSE 0.524 60.000 0.043 1.000   NA
 5434741 5434742 swp_2112 swp_2114     TRUE 0.797 -3.000 0.034 1.000   NA
 5434747 5434748 swp_2119 swp_2120     FALSE 0.004 211.000 0.000 NA   NA
 5434751 5434752 swp_2123 swp_2124     FALSE 0.018 337.000 0.000 0.039   NA
 5434756 5434757 swp_2128 swp_2129     FALSE 0.007 242.000 0.006 NA   NA
 5434757 5434758 swp_2129 swp_2131     FALSE 0.197 86.000 0.019 NA   NA
 5434759 5434760 swp_2132 swp_2133     FALSE 0.045 273.000 0.000 0.007   NA
 5434760 5434761 swp_2133 swp_2134     FALSE 0.000 750.000 0.000 NA   NA
 5434761 5434762 swp_2134 swp_2135     FALSE 0.001 297.000 0.000 NA   NA
 5434764 5434765 swp_2137 swp_2138     TRUE 0.816 114.000 0.208 1.000 N NA
 5434765 5434766 swp_2138 swp_2139     TRUE 0.748 143.000 0.208 1.000 N NA
 5434766 5434767 swp_2139 swp_2141     TRUE 0.940 135.000 0.857 0.048   NA
 5434767 5434768 swp_2141 swp_2142     TRUE 0.995 0.000 1.000 0.048   NA
 5434768 5434769 swp_2142 swp_2143     TRUE 0.997 11.000 1.000 0.048 Y NA
 5434769 5434770 swp_2143 swp_2144     FALSE 0.077 204.000 0.000 1.000 N NA
 5434771 5434772 swp_2145 swp_2146     TRUE 0.995 10.000 0.833 1.000 Y NA
 5434772 5434773 swp_2146 swp_2147     FALSE 0.027 77.000 0.000 NA   NA
 5434775 5434776 swp_2148 swp_2150     FALSE 0.318 135.000 0.045 NA   NA
 5434777 5434778 swp_2151 swp_2152     FALSE 0.472 150.000 0.116 NA   NA
 5434778 5434779 swp_2152 swp_2153     TRUE 0.681 110.000 0.163 NA   NA
 5434779 5434780 swp_2153 swp_2154     FALSE 0.010 166.000 0.000 NA   NA
 5434781 5434782 swp_2155 swp_2156     TRUE 0.992 3.000 0.818 NA   NA
 5434782 5434783 swp_2156 swp_2157     TRUE 0.959 3.000 0.182 NA   NA
 5434784 5434785 swp_2158 swp_2159     TRUE 0.746 52.000 0.182 NA   NA
 5434785 5434786 swp_2159 swp_2160     TRUE 0.936 9.000 0.167 NA   NA
 5434786 5434787 swp_2160 swp_2161     FALSE 0.163 100.000 0.016 NA   NA
 5434787 5434788 swp_2161 swp_2162     FALSE 0.148 168.000 0.032 NA   NA
 5434788 5434789 swp_2162 swp_2163     TRUE 0.935 -10.000 0.500 NA   NA
 5434789 5434790 swp_2163 swp_2164     TRUE 0.962 24.000 0.909 NA   NA
 5434790 5434791 swp_2164 swp_2165     TRUE 0.805 161.000 0.588 NA   NA
 5434791 5434792 swp_2165 swp_2166     TRUE 0.951 -13.000 0.824 NA   NA
 5434792 5434793 swp_2166 swp_2167     FALSE 0.133 101.000 0.000 1.000   NA
 5434793 5434794 swp_2167 swp_2168     FALSE 0.473 10.000 0.000 1.000   NA
 5434794 5434795 swp_2168 swp_2169     TRUE 0.855 14.000 0.057 1.000 N NA
 5434795 5434796 swp_2169 swp_2170     TRUE 0.976 13.000 0.143 0.076 Y NA
 5434796 5434797 swp_2170 swp_2171     FALSE 0.001 289.000 0.000 NA   NA
 5434798 5434799 swp_2172 swp_2173     FALSE 0.000 440.000 0.000 NA   NA
 5434799 5434800 swp_2173 swp_2174     FALSE 0.522 67.000 0.062 NA   NA
 5434800 5434801 swp_2174 swp_2175     FALSE 0.312 156.000 0.062 NA   NA
 5434801 5434802 swp_2175 swp_2176     FALSE 0.000 369.000 0.000 NA   NA
 5434806 5434807 swp_2180 swp_2182     FALSE 0.000 456.000 0.000 NA   NA
 5434807 5434808 swp_2182 swp_2183     TRUE 0.986 24.000 0.923 1.000 Y NA
 5434810 5434811 swp_2185 swp_2186     TRUE 0.910 -3.000 0.147 NA   NA
 5434812 5434813 swp_2187 swp_2188     FALSE 0.437 192.000 0.000 0.047 Y NA
 5434814 5434815 swp_2189 swp_2190     FALSE 0.003 214.000 0.000 NA   NA
 5434815 5434816 swp_2190 swp_2191     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA   NA
 5434816 5434817 swp_2191 swp_2192     FALSE 0.002 247.000 0.000 NA   NA
 5434817 5434818 swp_2192 swp_2193     FALSE 0.003 353.000 0.000 1.000   NA
 5434819 5434820 swp_2194 swp_2195     FALSE 0.031 202.000 0.014 NA   NA
 5434821 5434822 swp_2196 swp_2197     TRUE 0.706 117.000 0.108 1.000 N NA
 5434823 5434824 swp_2198 swp_2199     FALSE 0.192 220.000 0.067 1.000 N NA
 5434824 5434825 swp_2199 swp_2200     FALSE 0.487 142.000 0.048 1.000 N NA
 5434825 5434826 swp_2200 swp_2201     FALSE 0.647 97.000 0.060 1.000 N NA
 5434826 5434827 swp_2201 swp_2202     TRUE 0.959 -3.000 0.201 1.000 N NA
 5434828 5434829 swp_2203 swp_2204     FALSE 0.369 129.000 0.011 1.000 N NA
 5434829 5434830 swp_2204 swp_2205     TRUE 0.994 7.000 0.332 0.011 Y NA
 5434832 5434833 swp_2207 swp_2208     FALSE 0.290 79.000 0.027 NA   NA
 5434834 5434835 swp_2209 swp_2210     FALSE 0.228 196.000 0.099 NA   NA
 5434837 5434838 swp_2212 swp_tRNA71     FALSE 0.000 510.000 0.000 NA   NA
 5434839 5434840 swp_2213 swp_2214     TRUE 0.925 95.000 0.126 0.001 Y NA
 5434840 5434841 swp_2214 swp_2215     TRUE 0.995 3.000 0.275 0.001 Y NA
 5434841 5434842 swp_2215 swp_2216     TRUE 0.991 12.000 0.309 0.001 Y NA
 5434842 5434843 swp_2216 swp_2217     FALSE 0.004 511.000 0.000 1.000 N NA
 5434843 5434844 swp_2217 swp_2218     FALSE 0.127 222.000 0.086 NA   NA
 5434844 5434845 swp_2218 swp_2219     FALSE 0.457 11.000 0.013 NA   NA
 5434847 5434848 swp_2221 swp_2222     TRUE 0.934 31.000 0.635 NA   NA
 5434848 5434849 swp_2222 swp_2224     TRUE 0.971 9.000 0.227 1.000 N NA
 5434849 5434850 swp_2224 swp_2225     TRUE 0.952 -3.000 0.173 1.000 N NA
 5434850 5434851 swp_2225 swp_2226     TRUE 0.977 0.000 0.083 1.000 Y NA
 5434851 5434852 swp_2226 swp_2227     TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5434852 5434853 swp_2227 swp_2228     TRUE 0.995 0.000 0.309 0.003 Y NA
 5434853 5434854 swp_2228 swp_2229     TRUE 0.981 63.000 0.647 0.003 Y NA
 5434854 5434855 swp_2229 swp_2230     TRUE 0.967 -7.000 0.297 0.003 N NA
 5434855 5434856 swp_2230 swp_2231     TRUE 0.985 12.000 0.647 1.000 N NA
 5434856 5434857 swp_2231 swp_2232     TRUE 0.992 2.000 0.283 1.000 Y NA
 5434857 5434858 swp_2232 swp_2233     TRUE 0.851 106.000 0.134 NA Y NA
 5434858 5434859 swp_2233 swp_2234     TRUE 0.985 4.000 0.389 NA N NA
 5434859 5434860 swp_2234 swp_2235     TRUE 0.967 32.000 0.460 1.000 Y NA
 5434860 5434861 swp_2235 swp_2236     FALSE 0.528 178.000 0.134 1.000 N NA
 5434863 5434864 swp_2238 swp_2239     TRUE 0.704 60.000 0.111 1.000   NA
 5434864 5434865 swp_2239 swp_rRNA23     FALSE 0.000 841.000 0.000 NA   NA
 5434865 5434866 swp_rRNA23 swp_2240     FALSE 0.010 -598.000 0.000 NA   NA
 5434866 5434867 swp_2240 swp_rRNA24     FALSE 8.40592003937774e-05 1306.000 0.000 NA   NA
 5434867 5434868 swp_rRNA24 swp_rRNA25     FALSE 0.009 172.000 0.000 NA   NA
 5434869 5434870 swp_2241 swp_2242     FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5434871 5434872 swp_2243 swp_2244     FALSE 0.593 106.000 0.106 NA   NA
 5434873 5434874 swp_2245 swp_2246     TRUE 0.684 103.000 0.158 NA   NA
 5434876 5434877 swp_2248 swp_2249     TRUE 0.988 -9.000 0.940 1.000 Y NA
 5434877 5434878 swp_2249 swp_2250     FALSE 0.019 127.000 0.000 NA   NA
 5434879 5434880 swp_2251 swp_2252     TRUE 0.996 4.000 0.690 1.000 Y NA
 5434880 5434881 swp_2252 swp_2253     TRUE 0.985 -7.000 0.696 NA Y NA
 5434881 5434882 swp_2253 swp_2254     FALSE 0.109 -3.000 0.000 NA   NA
 5434883 5434884 swp_2256 swp_2257     FALSE 0.001 300.000 0.000 NA   NA
 5434885 5434886 swp_2258 swp_2259     TRUE 0.972 -3.000 0.072 0.078 Y NA
 5434895 5434896 swp_2270 swp_2271     TRUE 0.814 85.000 0.267 NA   NA
 5434897 5434898 swp_2272 swp_2273     FALSE 0.000 597.000 0.000 NA   NA
 5434898 5434899 swp_2273 swp_2274     TRUE 0.776 16.000 0.094 NA   NA
 5434901 5434902 swp_2276 swp_2277     TRUE 0.777 34.000 0.075 0.055   NA
 5434902 5434903 swp_2277 swp_2278     TRUE 0.977 1.000 0.205 1.000 N NA
 5434903 5434904 swp_2278 swp_2279     TRUE 0.970 5.000 0.263 NA   NA
 5434908 5434909 swp_2283 swp_2284     FALSE 0.049 254.000 0.000 0.038   NA
 5434909 5434910 swp_2284 swp_2285     FALSE 0.128 58.000 0.010 NA   NA
 5434910 5434911 swp_2285 swp_2286     TRUE 0.953 -7.000 0.500 NA   NA
 5434911 5434912 swp_2286 swp_2287     TRUE 0.852 90.000 0.353 NA   NA
 5434912 5434913 swp_2287 swp_2288     TRUE 0.897 9.000 0.096 NA   NA
 5434913 5434914 swp_2288 swp_2289     FALSE 0.463 180.000 0.184 NA   NA
 5434914 5434915 swp_2289 swp_2290     TRUE 0.700 122.000 0.115 1.000 N NA
 5434916 5434917 swp_2291 swp_2292     TRUE 0.995 3.000 0.618 NA Y NA
 5434917 5434918 swp_2292 swp_2293     TRUE 0.972 26.000 0.466 1.000 Y NA
 5434919 5434920 swp_2294 swp_2295     TRUE 0.889 32.000 0.363 NA   NA
 5434920 5434921 swp_2295 swp_2296     FALSE 0.008 550.000 0.069 NA   NA
 5434922 5434923 swp_2297 swp_2298     TRUE 0.820 91.000 0.233 1.000   NA
 5434924 5434925 swp_2299 swp_2300     TRUE 0.799 17.000 0.084 1.000   NA
 5434927 5434928 swp_2303 swp_2304     TRUE 0.879 11.000 0.098 NA   NA
 5434929 5434930 swp_2305 swp_2306     FALSE 0.000 636.000 0.000 NA   NA
 5434930 5434931 swp_2306 swp_2307     FALSE 0.021 119.000 0.000 NA   NA
 5434932 5434933 swp_2308 swp_2309     TRUE 0.989 2.000 0.538 NA N NA
 5434933 5434934 swp_2309 swp_2310     FALSE 0.000 463.000 0.000 NA   NA
 5434934 5434935 swp_2310 swp_2311     FALSE 0.026 88.000 0.000 NA   NA
 5434938 5434939 swp_2314 swp_2315     TRUE 0.833 32.000 0.000 0.021 Y NA
 5434939 5434940 swp_2315 swp_2316     FALSE 0.026 83.000 0.000 NA   NA
 5434940 5434941 swp_2316 swp_2317     FALSE 0.027 52.000 0.000 NA   NA
 5434941 5434942 swp_2317 swp_2318     FALSE 0.666 33.000 0.102 NA   NA
 5434945 5434946 swp_2321 swp_2323     FALSE 0.004 210.000 0.000 NA   NA
 5434948 5434949 swp_2324 swp_2325     TRUE 0.992 0.000 0.864 1.000   NA
 5434949 5434950 swp_2325 swp_2326     FALSE 0.565 64.000 0.077 NA   NA
 5434950 5434951 swp_2326 swp_2327     FALSE 0.002 245.000 0.000 NA   NA
 5434953 5434954 swp_2329 swp_2330     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 5434954 5434955 swp_2330 swp_2331     TRUE 0.980 3.000 0.022 0.004 Y NA
 5434955 5434956 swp_2331 swp_2332     TRUE 0.988 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5434956 5434957 swp_2332 swp_2333     FALSE 0.012 -73.000 0.000 NA   NA
 5434957 5434958 swp_2333 swp_2334     FALSE 0.089 13.000 0.000 NA   NA
 5434958 5434959 swp_2334 swp_2335     TRUE 0.980 3.000 0.087 1.000 Y NA
 5434959 5434960 swp_2335 swp_2336     TRUE 0.964 37.000 0.277 0.004 Y NA
 5434960 5434961 swp_2336 swp_2337     FALSE 0.138 93.000 0.000 1.000   NA
 5434963 5434964 swp_2339 swp_2340     FALSE 0.020 -28.000 0.000 NA   NA
 5434965 5434966 swp_2341 swp_2342     TRUE 0.920 0.000 0.103 NA   NA
 5434968 5434969 swp_2344 swp_2345     FALSE 0.089 -40.000 0.000 1.000   NA
 5434969 5434970 swp_2345 swp_2346     TRUE 0.993 2.000 0.923 NA   NA
 5434970 5434971 swp_2346 swp_2347     TRUE 0.881 15.000 0.179 NA   NA
 5434971 5434972 swp_2347 swp_2348     FALSE 0.555 35.000 0.039 NA N NA
 5434972 5434973 swp_2348 swp_2349     TRUE 0.967 -3.000 0.315 NA N NA
 5434974 5434975 swp_2350 swp_2351     FALSE 0.029 293.000 0.011 1.000 N NA
 5434975 5434976 swp_2351 swp_2352     FALSE 0.344 108.000 0.039 NA   NA
 5434976 5434977 swp_2352 swp_2353     TRUE 0.969 6.000 0.277 NA   NA
 5434977 5434978 swp_2353 swp_2354     TRUE 0.993 -3.000 0.451 0.007 Y NA
 5434978 5434979 swp_2354 swp_2355     TRUE 0.996 10.000 0.549 0.001 Y NA
 5434980 5434981 swp_2356 swp_2357     FALSE 0.000 492.000 0.000 NA   NA
 5434982 5434983 swp_2358 swp_2359     FALSE 0.343 189.000 0.143 NA   NA
 5434983 5434984 swp_2359 swp_2360     FALSE 0.640 63.000 0.107 NA   NA
 5434984 5434985 swp_2360 swp_2361     TRUE 0.892 87.000 0.500 NA   NA
 5434985 5434986 swp_2361 swp_2362     FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 5434987 5434988 swp_2363 swp_2364     FALSE 0.017 348.000 0.013 1.000 N NA
 5434988 5434989 swp_2364 swp_2365     TRUE 0.763 64.000 0.109 1.000 N NA
 5434989 5434990 swp_2365 swp_2366     TRUE 0.993 -7.000 0.908 0.047 Y NA
 5434990 5434991 swp_2366 swp_2367     TRUE 0.984 81.000 0.924 0.047 Y NA
 5434991 5434992 swp_2367 swp_2369     TRUE 0.998 4.000 0.814 0.047 Y NA
 5434992 5434993 swp_2369 swp_2370     TRUE 0.990 -6.000 0.537 0.047 Y NA
 5434993 5434994 swp_2370 swp_2371     TRUE 0.997 3.000 0.564 0.047 Y NA
 5434994 5434995 swp_2371 swp_2372     TRUE 0.712 107.000 0.102 1.000 N NA
 5434997 5434998 swp_2374 swp_tRNA70     FALSE 0.012 -99.000 0.000 NA   NA
 5434998 5434999 swp_tRNA70 swp_tRNA69     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5434999 5435000 swp_tRNA69 swp_tRNA68     FALSE 0.031 38.000 0.000 NA   NA
 5435000 5435001 swp_tRNA68 swp_2375     FALSE 0.002 253.000 0.000 NA   NA
 5435004 5435005 swp_tRNA20 swp_tRNA21     FALSE 0.027 82.000 0.000 NA   NA
 5435005 5435006 swp_tRNA21 swp_tRNA22     FALSE 0.002 239.000 0.000 NA   NA
 5435006 5435007 swp_tRNA22 swp_tRNA23     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435007 5435008 swp_tRNA23 swp_tRNA24     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435008 5435009 swp_tRNA24 swp_tRNA25     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA   NA
 5435009 5435010 swp_tRNA25 swp_2378     FALSE 0.013 -64.000 0.000 NA   NA
 5435010 5435011 swp_2378 swp_tRNA26     FALSE 0.011 -178.000 0.000 NA   NA
 5435011 5435012 swp_tRNA26 swp_tRNA27     FALSE 0.031 37.000 0.000 NA   NA
 5435012 5435013 swp_tRNA27 swp_2379     FALSE 0.028 66.000 0.000 NA   NA
 5435013 5435014 swp_2379 swp_2380     TRUE 0.788 135.000 0.344 NA   NA
 5435018 5435019 swp_2385 swp_2386     TRUE 0.940 6.000 0.112 1.000   NA
 5435019 5435020 swp_2386 swp_2387     FALSE 0.000 395.000 0.000 NA   NA
 5435021 5435022 swp_2388 swp_2389     FALSE 0.473 185.000 0.129 1.000 N NA
 5435023 5435024 swp_2390 swp_2391     TRUE 0.979 10.000 0.163 1.000 Y NA
 5435024 5435025 swp_2391 swp_2392     TRUE 0.983 10.000 0.202 1.000 Y NA
 5435025 5435026 swp_2392 swp_2393     TRUE 0.978 22.000 0.523 1.000 Y NA
 5435030 5435031 swp_2397 swp_2398     FALSE 0.001 840.000 0.000 1.000   NA
 5435031 5435032 swp_2398 swp_2399     TRUE 0.900 106.000 0.500 1.000   NA
 5435034 5435035 swp_2401 swp_2402     TRUE 0.988 5.000 0.667 NA   NA
 5435035 5435036 swp_2402 swp_2403     FALSE 0.164 0.000 0.000 NA   NA
 5435036 5435037 swp_2403 swp_2404     FALSE 0.060 -7.000 0.000 NA   NA
 5435037 5435038 swp_2404 swp_2405     TRUE 0.986 0.000 0.600 NA   NA
 5435038 5435039 swp_2405 swp_2406     FALSE 0.060 16.000 0.000 NA   NA
 5435040 5435041 swp_2407 swp_2408     FALSE 0.032 35.000 0.000 NA   NA
 5435043 5435044 swp_2410 swp_2411     FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 5435044 5435045 swp_2411 swp_2412     FALSE 0.016 228.000 0.000 1.000   NA
 5435045 5435046 swp_2412 swp_2413     FALSE 0.005 193.000 0.000 NA   NA
 5435046 5435047 swp_2413 swp_2414     FALSE 0.007 187.000 0.000 NA   NA
 5435047 5435048 swp_2414 swp_2415     FALSE 0.115 121.000 0.000 1.000   NA
 5435048 5435049 swp_2415 swp_2416     TRUE 0.991 -7.000 0.667 0.024 Y NA
 </