MicrobesOnline Operon Predictions for Bradyrhizobium japonicum USDA 110

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 315212 315213 blr0001 blr0002     FALSE 0.117 56.000 0.000 NA   0.144
 315213 315214 blr0002 blr0003     FALSE 0.001 2066.000 0.000 NA   0.217
 315214 315215 blr0003 bsr0004     FALSE 0.008 557.000 0.000 NA   0.548
 315216 315217 bll0005 bll0006   nrdB FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   -0.443
 315217 315218 bll0006 bll0007 nrdB   TRUE 0.992 -18.000 0.161 0.000 Y 0.615
 315218 315219 bll0007 bll0008     FALSE 0.033 173.000 0.000 NA   0.089
 315219 315220 bll0008 bll0009     FALSE 0.052 274.000 0.000 NA   0.553
 315220 315221 bll0009 bll0010     FALSE 0.007 631.000 0.000 NA   0.550
 315221 315222 bll0010 bll0011     FALSE 0.163 129.000 0.000 NA   0.476
 315223 315224 blr0012 blr0013     FALSE 0.052 327.000 0.000 NA   0.734
 315225 315226 bll0014 bll0015     FALSE 0.301 -124.000 0.000 NA   0.342
 315226 315227 bll0015 bsl0016     TRUE 0.932 -3.000 0.000 NA   0.452
 315228 315229 blr0017 blr0018     TRUE 0.997 -3.000 0.262 0.067 Y NA
 315229 315230 blr0018 blr0019     FALSE 0.001 321.000 0.000 NA   -0.417
 315231 315232 bll0020 bll0021     FALSE 0.375 126.000 0.000 0.019   0.526
 315233 315234 bsr0022 blr0023     FALSE 0.082 157.000 0.000 NA   0.299
 315234 315235 blr0023 blr0024     FALSE 0.000 553.000 0.000 NA   -0.305
 315236 315237 bll0025 bll0026     FALSE 0.134 46.000 0.000 1.000   0.005
 315238 315239 bsr0027 blr0028     FALSE 0.002 515.000 0.000 NA   0.151
 315239 315240 blr0028 bsr0029     FALSE 0.063 97.000 0.000 NA   0.123
 315240 315241 bsr0029 blr0030     FALSE 0.011 93.000 0.000 NA   -0.415
 315242 315243 bll0031 bsl0032     TRUE 0.654 44.000 0.000 NA   0.945
 315244 315245 bsr0033 blr0034     FALSE 0.042 413.000 0.000 1.000   0.887
 315245 315246 blr0034 blr0035     TRUE 0.873 -3.000 0.000 NA   0.269
 315246 315247 blr0035 bsr0036     FALSE 0.009 119.000 0.000 NA   -0.250
 315247 315248 bsr0036 blr0037     TRUE 0.628 13.000 0.000 0.082   -0.035
 315248 315249 blr0037 bsr0038     FALSE 0.002 258.000 0.000 1.000   -0.732
 315249 315250 bsr0038 bsr0039     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   0.306
 315251 315252 bll0040 bsl0041     FALSE 0.252 109.000 0.000 NA   0.596
 315252 315253 bsl0041 bll0042     FALSE 0.020 425.000 0.000 NA   0.641
 315253 315254 bll0042 bll0043   traG TRUE 0.983 8.000 1.000 NA   -0.311
 315254 315255 bll0043 bll0044 traG   TRUE 0.983 -3.000 0.000 NA Y -0.430
 315255 315256 bll0044 bll0045     FALSE 0.050 334.000 0.000 NA   0.752
 315256 315257 bll0045 bll0046     TRUE 0.986 5.000 0.667 NA   0.184
 315257 315258 bll0046 bll0047   traF TRUE 0.885 35.000 0.667 NA   -0.094
 315258 315259 bll0047 bll0048 traF   TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   0.041
 315259 315260 bll0048 bsl0049     TRUE 0.969 -13.000 0.500 NA   -0.215
 315260 315261 bsl0049 bll0050     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000   0.036
 315261 315262 bll0050 bll0051   repA TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA N 0.386
 315262 315263 bll0051 bll0052 repA   TRUE 0.840 -148.000 0.333 NA   0.452
 315263 315264 bll0052 bll0053     FALSE 0.012 84.000 0.000 NA   -0.603
 315264 315265 bll0053 bsl0054     FALSE 0.196 211.000 0.000 NA   0.789
 315266 315267 bsr0055 blr0056     FALSE 0.007 164.000 0.000 NA   -0.209
 315274 315275 bll0063 bll0064     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   0.315
 315275 315276 bll0064 bll0065     FALSE 0.432 57.000 0.000 NA   0.647
 315276 315277 bll0065 bll0066     TRUE 0.660 128.000 0.500 NA   0.273
 315279 315280 bll0068 bll0069     TRUE 0.738 8.000 0.017 1.000   -0.222
 315280 315281 bll0069 bll0070     TRUE 0.982 -3.000 0.065 1.000   0.527
 315282 315283 bsr0071 blr0072     FALSE 0.462 76.000 0.000 NA   0.828
 315283 315284 blr0072 blr0073     TRUE 0.982 1.000 0.062 NA   0.805
 315284 315285 blr0073 blr0074     TRUE 0.882 -16.000 0.000 NA   0.722
 315286 315287 bll0075 bll0076     FALSE 0.431 116.000 0.000 NA   0.959
 315288 315289 blr0077 bsr0078     FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000   0.026
 315292 315293 bll0081 bll0082     FALSE 0.369 92.000 0.000 NA   0.738
 315293 315294 bll0082 bll0083     FALSE 0.007 166.000 0.000 NA   -0.215
 315296 315297 bll0085 bll0086     FALSE 0.056 128.000 0.000 NA   0.148
 315297 315298 bll0086 bll0087     FALSE 0.067 119.000 0.000 NA   0.177
 315298 315299 bll0087 bll0088     TRUE 0.992 0.000 0.405 1.000   0.522
 315299 315300 bll0088 bll0089     TRUE 0.980 0.000 0.282 1.000 N 0.065
 315300 315301 bll0089 bll0090     TRUE 0.999 -3.000 0.769 1.000 Y 0.037
 315301 315302 bll0090 bll0091     TRUE 0.990 11.000 0.702 NA Y 0.049
 315303 315304 blr0092 bsr0093     FALSE 0.455 128.000 0.238 NA   0.200
 315304 315305 bsr0093 blr0094     FALSE 0.067 64.000 0.000 NA   0.053
 315305 315306 blr0094 blr0095     FALSE 0.001 339.000 0.000 NA   -0.325
 315309 315310 bsl0098 bll0099   glt FALSE 0.010 103.000 0.000 NA   -0.359
 315310 315311 bll0099 bll0100 glt   FALSE 0.004 491.000 0.000 1.000 N 0.299
 315313 315314 bll0102 bll0104 gltI gltP TRUE 0.902 10.000 0.233 1.000 N 0.029
 315315 315316 blr0103 blr0105     FALSE 0.032 261.000 0.000 NA   0.350
 315316 315317 blr0105 blr0106     FALSE 0.000 548.000 0.000 NA   -0.245
 315317 315318 blr0106 blr0107     TRUE 0.991 -3.000 0.286 1.000 N 0.510
 315319 315320 bll0108 bll0109     TRUE 0.962 -34.000 0.300 1.000 N 0.845
 315322 315323 bll0111 bll0112     TRUE 0.990 -28.000 0.607 1.000 Y 0.165
 315323 315324 bll0112 bll0113     TRUE 0.740 112.000 0.130 1.000 Y 0.183
 315324 315325 bll0113 bll0114     FALSE 0.475 44.000 0.000 1.000   0.577
 315330 315331 blr0119 blr0120     TRUE 0.652 -45.000 0.000 0.008   -0.112
 315333 315334 blr0122 blr0123     TRUE 0.876 -45.000 0.250 NA   0.334
 315334 315335 blr0123 blr0124     TRUE 0.993 -7.000 1.000 NA   0.302
 315336 402927 bll0125 Bjat01   tRNA-Arg FALSE 0.008 130.000 0.000 NA   NA
 315337 315338 blr0126 bsr0127     FALSE 0.276 125.000 0.000 NA   0.676
 315339 315340 bll0128 bll0129     FALSE 0.022 47.000 0.000 NA   -0.291
 315340 315341 bll0129 bll0130     FALSE 0.480 29.000 0.000 NA   0.525
 315341 315342 bll0130 bll0131     FALSE 0.043 -63.000 0.000 NA N -0.367
 315342 315343 bll0131 bll0132     FALSE 0.270 97.000 0.000 NA   0.591
 315343 315344 bll0132 bll0133     FALSE 0.257 161.000 0.000 NA   0.711
 315344 315345 bll0133 bll0134     FALSE 0.045 275.000 0.000 NA   0.511
 315346 315347 blr0135 bsr0136     TRUE 0.863 48.000 0.500 NA   0.480
 315349 315350 blr0138 blr0139     TRUE 0.989 17.000 0.476 0.017 Y 0.593
 315350 315351 blr0139 blr0140     TRUE 0.983 18.000 0.636 1.000 Y 0.389
 315352 315353 bll0141 bll0142     FALSE 0.070 240.000 0.000 NA   0.516
 315353 315354 bll0142 bll0143     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   0.159
 315354 315355 bll0143 bll0144     TRUE 0.668 155.000 0.556 NA N 0.376
 315356 315357 blr0145 blr0146     TRUE 0.781 26.000 0.277 1.000   -0.222
 315357 315358 blr0146 blr0147   blr0147 FALSE 0.146 -922.000 0.000 1.000   0.035
 315360 315361 blr0149 blr0150 cyoA cyoB TRUE 0.996 12.000 0.915 0.019 Y 0.429
 315361 315362 blr0150 blr0151 cyoB cyoC TRUE 0.999 1.000 0.847 0.085 Y -0.018
 315362 315363 blr0151 blr0152 cyoC cyoD TRUE 0.999 -3.000 0.906 0.085 Y 0.482
 315363 315364 blr0152 blr0153 cyoD   TRUE 0.997 -3.000 0.849 NA   0.303
 315364 315365 blr0153 blr0154     TRUE 0.740 -55.000 0.188 NA   -0.343
 315365 315366 blr0154 blr0155     TRUE 0.995 -10.000 0.682 1.000 Y -0.455
 315367 315368 bll0156 bll0157     FALSE 0.325 147.000 0.012 1.000 N 0.602
 315368 315369 bll0157 bsl0158     FALSE 0.453 133.000 0.011 1.000 N 0.849
 315369 315370 bsl0158 bll0159   mgpS TRUE 0.799 49.000 0.116 1.000   0.860
 315370 315371 bll0159 bsl0160 mgpS   FALSE 0.046 371.000 0.000 NA   0.836
 315371 315372 bsl0160 bll0161     FALSE 0.215 219.000 0.000 NA   0.884
 315375 315376 blr0164 blr0165     FALSE 0.008 153.000 0.000 NA   -0.458
 315376 315377 blr0165 blr0166   ftsZ FALSE 0.359 90.000 0.000 1.000   0.664
 315378 315379 bll0167 bsl0168     FALSE 0.006 185.000 0.000 NA   -0.285
 315379 315380 bsl0168 bsl0169     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   0.302
 315380 315381 bsl0169 bsl0170     TRUE 0.957 -7.000 0.087 NA   0.541
 315382 315383 blr0171 blr0172     FALSE 0.145 60.000 0.000 NA   0.232
 315383 315384 blr0172 bsr0173     FALSE 0.059 180.000 0.000 NA   0.265
 315385 315386 bll0174 bll0175     FALSE 0.167 170.000 0.000 NA   0.557
 315386 315387 bll0175 bll0176     FALSE 0.148 151.000 0.000 NA   0.465
 315387 315388 bll0176 bll0177     FALSE 0.159 44.000 0.000 NA   0.182
 315388 315389 bll0177 bll0178   cobT TRUE 0.983 -3.000 0.260 NA   -0.019
 315389 315390 bll0178 bll0179 cobT   TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000   0.757
 315390 315391 bll0179 bll0180   cobS TRUE 0.935 4.000 0.000 1.000   0.681
 315397 315398 bll0186 bll0187   aroB FALSE 0.130 93.000 0.040 NA N -0.527
 315398 315399 bll0187 bll0188 aroB   TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y 0.432
 315400 315401 bsr0189 blr0190   xerD FALSE 0.467 18.000 0.043 NA   -0.696
 315401 315402 blr0190 blr0191 xerD accA FALSE 0.252 182.000 0.058 1.000 N 0.432
 315402 315403 blr0191 blr0192 accA   FALSE 0.006 411.000 0.003 NA   -0.318
 315404 315405 bll0193 bll0194     TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.029 Y 0.077
 315405 315406 bll0194 bll0195     TRUE 0.987 -52.000 1.000 1.000 Y -0.286
 315406 315407 bll0195 bll0196     TRUE 0.994 7.000 0.750 1.000 Y -0.338
 315407 315408 bll0196 bll0197     TRUE 0.997 5.000 1.000 1.000 Y -0.731
 315408 315409 bll0197 bll0198     TRUE 0.682 37.000 0.188 1.000 N 0.231
 315409 315410 bll0198 bll0199     FALSE 0.273 165.000 0.188 NA N -0.139
 315412 315413 bsl0201 bll0202     TRUE 0.527 3.000 0.000 NA   -0.007
 315413 315414 bll0202 bll0203     FALSE 0.184 5.000 0.000 NA   -0.168
 315414 315415 bll0203 bll0204   secA FALSE 0.008 393.000 0.000 1.000   0.208
 315416 315417 blr0205 blr0206   argJ FALSE 0.206 103.000 0.070 1.000 N -0.437
 315417 315418 blr0206 blr0207 argJ   TRUE 0.930 6.000 0.024 1.000 N 0.636
 315420 315421 blr0209 bsr0210 comF   FALSE 0.515 48.000 0.061 1.000   0.212
 315421 315422 bsr0210 blr0211     TRUE 0.985 -3.000 0.121 1.000   0.494
 315422 315423 blr0211 blr0212     TRUE 0.988 -3.000 0.022 NA   0.958
 315424 315425 bll0213 bll0214   ubiG FALSE 0.040 279.000 0.006 NA   0.195
 315425 315426 bll0214 bll0215 ubiG   TRUE 0.838 21.000 0.011 NA   0.946
 315427 315428 blr0216 blr0217 lysC ptsP FALSE 0.094 289.000 0.069 1.000 N 0.476
 315428 315429 blr0217 blr0218 ptsP prfA TRUE 0.653 59.000 0.034 0.028 N 0.514
 315429 315430 blr0218 blr0219 prfA hemK TRUE 0.998 -3.000 0.229 1.000 Y 0.833
 315430 315431 blr0219 blr0220 hemK   FALSE 0.042 464.000 0.021 NA   0.825
 315433 315434 blr0222 blr0223 gloB   FALSE 0.477 24.000 0.071 NA   -0.758
 315435 315436 bll0224 bll0225   phbB FALSE 0.203 169.000 0.080 NA   -0.018
 315436 315437 bll0225 bll0226 phbB atoB FALSE 0.369 251.000 0.071 1.000 Y 0.075
 315438 315439 blr0227 blr0228     FALSE 0.046 74.000 0.000 NA   0.012
 315444 315445 bll0233 bll0234     FALSE 0.078 68.000 0.000 NA   0.094
 315445 315446 bll0234 bll0235     TRUE 0.993 -3.000 0.588 NA   -0.170
 315446 315447 bll0235 bll0236     FALSE 0.462 27.000 0.000 NA   0.487
 315448 315449 blr0237 blr0238     TRUE 0.994 -3.000 0.471 1.000 N 0.481
 315449 315450 blr0238 blr0239     FALSE 0.360 -31.000 0.000 1.000 N 0.133
 315453 315454 bll0242 bll0243 recQ   FALSE 0.037 89.000 0.000 1.000 N 0.036
 315454 315455 bll0243 bll0244     TRUE 0.802 -22.000 0.000 1.000 N 0.587
 315455 315456 bll0244 bll0245   cysD TRUE 0.955 13.000 0.037 1.000 Y 0.477
 315456 315457 bll0245 bll0246 cysD bam FALSE 0.008 327.000 0.000 1.000 N 0.205
 315458 315459 bsr0247 blr0248     FALSE 0.016 108.000 0.000 NA   -0.088
 315459 315460 blr0248 blr0249     TRUE 0.949 -3.000 0.005 NA   0.301
 315461 315462 bll0250 bll0251 mocA   TRUE 0.933 11.000 0.158 1.000 N 0.692
 315463 315464 blr0252 blr0253     FALSE 0.019 259.000 0.000 NA   0.195
 315465 315466 bll0254 bsl0255     FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   0.048
 315466 315467 bsl0255 bll0256     TRUE 0.858 -3.000 0.000 NA   0.227
 315468 315469 blr0257 blr0258     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.031 Y 0.136
 315469 315470 blr0258 blr0259     TRUE 0.740 94.000 0.000 0.025 Y 0.415
 315470 315471 blr0259 blr0260     FALSE 0.033 154.000 0.000 NA   0.055
 315471 315472 blr0260 blr0261     FALSE 0.006 212.000 0.000 NA   -0.104
 315472 315473 blr0261 blr0262     FALSE 0.148 237.000 0.000 1.000 N 0.793
 315474 315475 bll0263 bll0264   mdcF FALSE 0.319 10.000 0.000 1.000   -0.127
 315475 315476 bll0264 bll0265 mdcF mdcB FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   -0.304
 315476 315477 bll0265 bll0266 mdcB mdcG TRUE 0.962 -3.000 0.068 1.000   -0.056
 315477 315478 bll0266 bll0267 mdcG mdcE TRUE 0.810 -25.000 0.085 NA   -0.128
 315478 315479 bll0267 bll0268 mdcE mdcD TRUE 0.983 -13.000 0.700 NA   0.191
 315479 315480 bll0268 bll0269 mdcD mdcC TRUE 0.712 72.000 0.438 NA   0.073
 315480 315481 bll0269 bll0270 mdcC mdcA TRUE 0.953 11.000 0.316 NA   0.593
 315481 315482 bll0270 bll0271 mdcA   TRUE 0.980 -3.000 0.000 1.000   0.858
 315482 315483 bll0271 bll0272     FALSE 0.394 98.000 0.000 NA   0.810
 315483 315484 bll0272 bsl0273     TRUE 0.861 8.000 0.000 NA   0.692
 315487 315488 blr0276 blr0277     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 N 0.811
 315488 315489 blr0277 blr0278     TRUE 0.850 -13.000 0.000 NA   0.575
 315489 315490 blr0278 blr0279     FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   0.512
 315493 315494 bll0282 bll0283     TRUE 0.998 3.000 0.556 0.084 Y 0.656
 315494 315495 bll0283 bll0284   mqo TRUE 0.655 20.000 0.020 1.000   0.331
 315495 315496 bll0284 bll0285 mqo   TRUE 0.756 43.000 0.099 NA   0.728
 315496 315497 bll0285 bll0286   fumC FALSE 0.458 74.000 0.003 NA   0.629
 315497 315498 bll0286 bll0287 fumC   FALSE 0.227 168.000 0.000 NA   0.678
 315498 315499 bll0287 bll0288     TRUE 0.676 19.000 0.000 NA   0.674
 315499 315500 bll0288 bll0289     TRUE 0.848 4.000 0.000 NA   0.428
 315500 315501 bll0289 bll0290     FALSE 0.058 344.000 0.000 NA   0.844
 315501 315502 bll0290 bll0291     FALSE 0.380 55.000 0.000 0.044 N 0.207
 315502 315503 bll0291 bll0292     TRUE 0.996 -3.000 0.719 0.084   -0.171
 315504 315505 blr0293 blr0294     FALSE 0.052 230.000 0.000 1.000   0.318
 315506 315507 bll0295 bsl0296     TRUE 0.534 70.000 0.000 NA   0.920
 315508 315509 blr0297 blr0298     FALSE 0.253 -37.000 0.000 NA   0.052
 315509 315510 blr0298 blr0299     FALSE 0.044 273.000 0.000 NA   0.496
 315511 315512 bll0300 bll0301 ragD ragC TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N 0.807
 315512 315513 bll0301 bll0302 ragC rpoH3 FALSE 0.475 80.000 0.000 NA N 0.949
 315513 315514 bll0302 bll0303 rpoH3 ragB TRUE 0.566 61.000 0.000 1.000 N 0.919
 315514 315515 bll0303 bll0304 ragB ragA TRUE 0.996 10.000 0.818 1.000 Y 0.625
 315516 315517 blr0305 blr0306     FALSE 0.400 150.000 0.000 NA   0.996
 315519 315520 blr0308 blr0309     TRUE 0.925 80.000 0.542 0.080 Y -0.235
 315520 315521 blr0309 blr0310     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.099 Y 0.973
 315521 315522 blr0310 blr0311     TRUE 0.971 4.000 0.000 1.000 Y -0.030
 315522 315523 blr0311 blr0312     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.004 Y -0.197
 315525 315526 blr0314 blr0315 nosR nosZ TRUE 0.946 -3.000 0.064 1.000 N -0.258
 315526 315527 blr0315 blr0316 nosZ nosD TRUE 0.940 15.000 0.146 0.000 N 0.679
 315527 315528 blr0316 blr0317 nosD nosF TRUE 0.998 -3.000 0.963 1.000   0.461
 315528 315529 blr0317 blr0318 nosF nosY TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   0.469
 315529 315530 blr0318 blr0319 nosY nosL TRUE 0.993 -3.000 0.519 NA   0.052
 315530 315531 blr0319 blr0320 nosL nosX TRUE 0.928 12.000 0.464 NA N -0.120
 315533 315534 bll0322 bll0323 otsA otsB TRUE 0.621 212.000 0.000 0.001 Y 0.640
 315534 315535 bll0323 bll0324 otsB   TRUE 0.994 4.000 0.063 1.000 Y 0.858
 315537 315538 bll0326 bll0327     FALSE 0.248 284.000 0.000 0.010 Y 0.083
 315539 315540 blr0328 blr0329     TRUE 0.970 -3.000 0.118 NA   0.023
 315541 315542 bll0330 bll0331     TRUE 0.958 122.000 1.000 0.007 Y 0.102
 315542 315543 bll0331 bll0332     TRUE 0.952 139.000 0.667 1.000 Y 0.933
 315543 315544 bll0332 bll0333     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.084 N 0.996
 315544 315545 bll0333 bll0334     FALSE 0.060 374.000 0.000 1.000   0.952
 315546 315547 blr0335 blr0336     TRUE 0.933 85.000 0.125 0.003 Y 0.966
 315547 315548 blr0336 blr0337     TRUE 0.955 140.000 0.525 0.003 Y 0.835
 315548 315549 blr0337 blr0338   AMACR TRUE 0.743 152.000 0.068 1.000 Y 0.586
 315551 315552 blr0340 blr0341     FALSE 0.332 72.000 0.035 NA   0.207
 315553 315554 bll0342 bll0343 fah   TRUE 0.813 133.000 0.316 1.000 Y 0.236
 315554 315555 bll0343 bll0344     TRUE 0.866 -27.000 0.085 1.000   0.233
 315555 315556 bll0344 bsl0345     TRUE 0.701 24.000 0.081 NA   0.373
 315556 315557 bsl0345 bll0346     TRUE 0.970 9.000 0.681 NA   -0.376
 315560 315561 blr0349 bsr0350     FALSE 0.009 289.000 0.000 NA   0.098
 315563 315564 blr0352 blr0353     TRUE 0.652 5.000 0.000 1.000   0.072
 315564 315565 blr0353 blr0354     FALSE 0.016 67.000 0.000 1.000   -0.425
 315565 315566 blr0354 blr0355     FALSE 0.399 159.000 0.250 NA   0.022
 315566 315567 blr0355 blr0356     TRUE 0.994 0.000 0.857 NA   -0.310
 315569 315570 blr0358 blr0359     FALSE 0.047 249.000 0.015 NA   -0.069
 315570 315571 blr0359 blr0360     FALSE 0.037 397.000 0.000 NA   0.823
 315572 315573 bll0361 bll0362     FALSE 0.043 86.000 0.000 NA   0.024
 315573 315574 bll0362 bll0363     FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   0.086
 315575 315576 blr0364 blr0365   rps21 FALSE 0.002 280.000 0.000 1.000   -0.747
 315576 315577 blr0365 blr0366 rps21   TRUE 0.526 38.000 0.000 NA   0.661
 315577 315578 blr0366 blr0367     FALSE 0.007 160.000 0.000 NA   -0.195
 315578 315579 blr0367 blr0368     FALSE 0.000 755.000 0.000 1.000 N -0.334
 315579 315580 blr0368 blr0369     FALSE 0.012 452.000 0.000 NA   0.517
 315582 315583 blr0371 blr0372     TRUE 0.706 150.000 0.538 0.010   -0.692
 315583 315584 blr0372 blr0373     TRUE 0.578 104.000 0.108 1.000 N 0.754
 315585 315586 bll0374 bll0375     FALSE 0.331 0.000 0.000 NA   -0.514
 315588 315589 bll0377 bll0378   ilvD TRUE 0.813 100.000 0.600 NA N 0.660
 315589 315590 bll0378 bll0379 ilvD   TRUE 0.975 -3.000 0.222 1.000 N -0.574
 315590 315591 bll0379 bll0380     TRUE 0.990 13.000 0.500 1.000 Y 0.678
 315591 315592 bll0380 bll0381     TRUE 0.998 0.000 0.800 NA Y 0.240
 315595 315596 blr0384 blr0385     TRUE 0.980 -22.000 0.000 0.025 Y 0.727
 315597 315598 bll0386 bll0387     FALSE 0.007 170.000 0.000 NA   -0.336
 315598 315599 bll0387 bll0388     FALSE 0.423 -43.000 0.000 NA   0.292
 315599 315600 bll0388 bll0389     FALSE 0.169 142.000 0.000 NA   0.501
 315600 315601 bll0389 bll0390   cheR1 TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   0.538
 315601 315602 bll0390 bll0391 cheR1   TRUE 0.730 62.000 0.000 1.000 Y 0.387
 315602 315603 bll0391 bll0392   cheW TRUE 0.735 47.000 0.000 1.000 Y 0.098
 315603 315604 bll0392 bll0393 cheW   TRUE 0.761 82.000 0.014 0.010 Y -0.172
 315604 315605 bll0393 bll0394     FALSE 0.079 410.000 0.000 0.025 Y -0.734
 315606 315607 blr0395 blr0396     TRUE 0.619 109.000 0.000 0.010 Y -0.409
 315607 315608 blr0396 blr0397     FALSE 0.024 136.000 0.000 NA   -0.018
 315608 315609 blr0397 bsr0398     FALSE 0.011 98.000 0.000 NA   -0.308
 315611 315612 blr0400 blr0401     FALSE 0.022 245.000 0.000 NA   0.187
 315612 315613 blr0401 blr0402     FALSE 0.002 284.000 0.000 NA   -0.331
 315616 315617 bll0405 bll0406     TRUE 0.995 -3.000 0.589 NA   0.385
 315619 315620 bll0408 bll0409     FALSE 0.023 44.000 0.000 1.000   -0.384
 315622 315623 bll0411 bll0412     TRUE 0.991 -3.000 0.034 1.000 Y -0.177
 315623 315624 bll0412 bll0413     TRUE 0.984 3.000 0.034 NA Y 0.069
 315624 315625 bll0413 bll0414   leuB TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA N 0.849
 315625 315626 bll0414 bll0415 leuB leuD TRUE 0.986 -30.000 0.333 0.001 Y -0.561
 315626 315627 bll0415 bll0416 leuD leuC TRUE 0.992 1.000 0.020 0.001 Y -0.047
 315627 315628 bll0416 bll0417 leuC   FALSE 0.196 37.000 0.000 1.000 N 0.241
 315628 402925 bll0417 Bjat03   tRNA-Ser FALSE 0.007 163.000 0.000 NA   NA
 315631 315632 blr0420 bsr0421 rplU rpmA TRUE 0.971 98.000 0.667 0.009 Y 0.787
 315632 315633 bsr0421 blr0422 rpmA   TRUE 0.804 107.000 0.035 1.000 Y 0.757
 315635 315636 blr0424 blr0425   cgtA FALSE 0.059 115.000 0.000 1.000   0.000
 315636 315637 blr0425 blr0426 cgtA   FALSE 0.003 234.000 0.000 1.000   -0.491
 315639 315640 blr0428 blr0429 proB proA FALSE 0.449 249.000 0.065 0.001 Y -0.713
 315640 315641 blr0429 blr0430 proA nadD TRUE 0.528 42.000 0.170 1.000 N -0.630
 315641 315642 blr0430 bsr0431 nadD   FALSE 0.243 257.000 0.221 NA   0.522
 315642 315643 bsr0431 blr0432     TRUE 0.781 95.000 0.307 NA   0.898
 315643 315644 blr0432 blr0433     TRUE 0.810 34.000 0.067 NA   0.882
 315644 315645 blr0433 blr0434   ctpA TRUE 0.994 -3.000 0.408 NA N 0.639
 315645 315646 blr0434 blr0435 ctpA   FALSE 0.451 149.000 0.210 1.000   0.291
 315646 315647 blr0435 blr0436     TRUE 0.615 75.000 0.109 1.000   0.607
 315647 315648 blr0436 blr0437     TRUE 0.750 105.000 0.010 0.021 Y 0.257
 315649 315650 bll0438 bll0439   atpC FALSE 0.079 163.000 0.003 1.000 N -0.172
 315650 315651 bll0439 bll0440 atpC atpD TRUE 0.976 87.000 0.837 0.003 Y 0.606
 315651 315652 bll0440 bll0441 atpD atpG TRUE 0.978 83.000 0.724 0.003 Y 0.811
 315652 315653 bll0441 bll0442 atpG atpA TRUE 0.970 175.000 0.846 0.003 Y 0.924
 315653 315654 bll0442 bll0443 atpA atpH TRUE 0.999 0.000 0.864 0.003 Y 0.264
 315657 315658 blr0446 blr0447 xerC   FALSE 0.262 101.000 0.020 NA   0.305
 315659 315660 bll0448 bll0449   lpdA TRUE 0.597 35.000 0.021 NA   0.495
 315660 315661 bll0449 bll0450 lpdA scdh1 FALSE 0.255 57.000 0.023 1.000 N -0.183
 315661 315662 bll0450 bll0451 scdh1 sucB FALSE 0.189 54.000 0.013 1.000 N -0.382
 315662 315663 bll0451 bll0452 sucB sucA TRUE 0.879 160.000 0.667 1.000 Y 0.032
 315663 315664 bll0452 bll0453 sucA sucD TRUE 0.744 138.000 0.092 1.000 Y 0.495
 315664 315665 bll0453 bll0454 sucD   FALSE 0.387 35.000 0.039 NA   -0.245
 315665 315666 bll0454 bll0455   sucC TRUE 0.793 5.000 0.013 NA   -0.121
 315666 315667 bll0455 bll0456 sucC mdh FALSE 0.491 225.000 0.113 1.000 Y 0.124
 315667 315668 bll0456 bll0457 mdh   FALSE 0.063 263.000 0.032 NA   0.146
 315668 315669 bll0457 bll0458   ligT FALSE 0.207 103.000 0.021 NA   0.093
 315669 315670 bll0458 bll0459 ligT   FALSE 0.288 175.000 0.077 1.000 N 0.432
 315671 315672 blr0460 blr0461     TRUE 0.999 -3.000 0.626 NA Y 0.712
 315672 315673 blr0461 blr0462     FALSE 0.141 225.000 0.101 NA   0.034
 315673 315674 blr0462 blr0463     FALSE 0.103 229.000 0.069 1.000   -0.250
 315675 315676 bll0464 bll0465     FALSE 0.000 749.000 0.000 NA   -0.192
 315676 315677 bll0465 bll0466   acnA FALSE 0.055 221.000 0.038 NA   -0.851
 315678 315679 blr0467 blr0468 ccmA ccmB TRUE 0.578 311.000 0.503 0.002 Y -0.265
 315679 315680 blr0468 blr0469 ccmB ccmC TRUE 0.927 92.000 0.501 0.001 Y -0.263
 315680 315681 blr0469 bsr0470 ccmC ccmD TRUE 0.996 -3.000 0.501 1.000   0.597
 315681 315682 bsr0470 blr0471 ccmD ccmG TRUE 0.990 -3.000 0.172 1.000   0.643
 315683 315684 bll0472 bll0473     FALSE 0.239 128.000 0.050 1.000 N 0.186
 315685 315686 blr0474 blr0475     FALSE 0.007 164.000 0.000 NA   -0.694
 315687 315688 bll0476 bll04777   dapF TRUE 0.794 0.000 0.006 1.000 N NA
 315689 315690 blr0478 blr0479     TRUE 0.993 -3.000 0.235 NA   0.794
 315692 315693 blr0481 blr0482 ffh rpsP TRUE 0.608 86.000 0.361 1.000 N -0.067
 315693 315694 blr0482 blr0483 rpsP rimM TRUE 0.995 10.000 0.342 0.009 Y 0.905
 315696 315697 blr0485 blr0486   trmD FALSE 0.021 49.000 0.000 1.000 N -0.170
 315697 315698 blr0486 blr0487 trmD rplS TRUE 0.943 111.000 0.567 1.000 Y 0.799
 315698 315699 blr0487 blr0488 rplS leuC FALSE 0.088 328.000 0.008 1.000 N 0.815
 315705 315706 blr0494 blr0495   leuD TRUE 0.605 82.000 0.112 1.000   0.627
 315706 315707 blr0495 blr0496 leuD   FALSE 0.176 82.000 0.038 NA   -0.570
 315707 315708 blr0496 blr0497     FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   -0.557
 315709 315710 bll0498 bll0499   citE TRUE 0.596 4.000 0.000 1.000   -0.078
 315716 315717 bll0505 bll0506     TRUE 0.949 13.000 0.476 0.083   -0.176
 315717 315718 bll0506 bll0507     FALSE 0.243 183.000 0.000 1.000 N 0.781
 315718 315719 bll0507 bll0508     FALSE 0.006 314.000 0.000 1.000   -0.106
 315722 315723 blr0511 blr0512 gstR sdhC FALSE 0.024 418.000 0.000 1.000 N 0.707
 315723 315724 blr0512 blr0513 sdhC sdhD TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.000 Y -0.449
 315724 315725 blr0513 blr0514 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y 0.942
 315725 315726 blr0514 blr0515 sdhA sdhB TRUE 0.943 103.000 0.604 0.001 Y 0.278
 315726 315727 blr0515 blr0516 sdhB   FALSE 0.057 192.000 0.006 1.000 N -0.265
 315727 315728 blr0516 blr0517     TRUE 0.717 53.000 0.250 0.100   -0.197
 315728 315729 blr0517 blr0518     FALSE 0.118 208.000 0.000 NA   0.558
 315729 315730 blr0518 blr0519     FALSE 0.285 25.000 0.000 NA   0.271
 315730 315731 blr0519 bsr0520     FALSE 0.086 75.000 0.000 NA   0.144
 315731 315732 bsr0520 blr0521     FALSE 0.013 187.000 0.000 NA   -0.046
 315733 315734 bll0522 bll0523 argG   FALSE 0.231 94.000 0.005 1.000   0.153
 315734 315735 bll0523 bll0524     FALSE 0.261 106.000 0.100 NA   -0.338
 315735 315736 bll0524 bll0525     FALSE 0.072 167.000 0.008 NA   -0.350
 315736 315737 bll0525 bll0526     FALSE 0.345 195.000 0.012 NA   0.866
 315737 315738 bll0526 bll0527     FALSE 0.103 117.000 0.021 NA   -0.654
 315739 315740 blr0528 blr0529     FALSE 0.024 265.000 0.000 1.000   0.181
 315740 315741 blr0529 blr0530     TRUE 0.722 19.000 0.000 1.000   0.711
 315742 315743 bll0531 bll0532     FALSE 0.507 33.000 0.094 NA   -0.325
 315744 315745 blr0533 blr0534     FALSE 0.187 125.000 0.038 1.000   -0.247
 315747 315748 blr0536 blr0537     FALSE 0.039 331.000 0.069 1.000 N 0.123
 315748 315749 blr0537 blr0538     TRUE 0.955 -19.000 0.299 1.000   0.375
 315749 315750 blr0538 bsr0539     FALSE 0.007 261.000 0.000 NA   -0.009
 315750 315751 bsr0539 blr0540   typA FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   -0.281
 315751 315752 blr0540 blr0541 typA   FALSE 0.037 237.000 0.003 1.000 N -0.153
 315753 315754 bll0542 bll0543     FALSE 0.169 56.000 0.000 NA   0.270
 315754 315755 bll0543 bll0544     TRUE 0.881 0.000 0.014 NA   -0.246
 315755 315756 bll0544 bll0545     TRUE 0.963 5.000 0.375 NA   -0.525
 315756 315757 bll0545 bll0546     FALSE 0.395 -3.000 0.000 NA   -0.315
 315758 315759 blr0547 blr0548   ppa FALSE 0.423 179.000 0.048 1.000   0.774
 315760 315761 bll0549 bsl0550 folD   TRUE 0.894 2.000 0.029 NA   -0.154
 315761 315762 bsl0550 bsl0551     TRUE 0.737 85.000 0.220 NA   0.852
 315763 315764 bll0552 bll0553   guaA FALSE 0.207 100.000 0.048 1.000 N -0.171
 315764 315765 bll0553 bll0554 guaA   FALSE 0.240 130.000 0.057 1.000   -0.009
 315765 315766 bll0554 bll0555     FALSE 0.188 228.000 0.057 NA   0.513
 315766 315767 bll0555 bll0556     FALSE 0.136 225.000 0.051 NA   0.301
 315767 315768 bll0556 bll0557     TRUE 0.717 51.000 0.200 1.000 N 0.511
 315768 315769 bll0557 bll0558     TRUE 0.595 35.000 0.150 NA   -0.178
 315771 315772 bsl0560 bll0561     FALSE 0.058 166.000 0.000 NA   0.215
 315774 402924 bll0563 Bjat05   tRNA-Thr FALSE 0.007 168.000 0.000 NA   NA
 402924 315775 Bjat05 bll0564 tRNA-Thr   FALSE 0.010 100.000 0.000 NA   NA
 315775 315776 bll0564 bll0565     TRUE 0.780 37.000 0.108 NA   0.722
 315776 315777 bll0565 bll0566     FALSE 0.245 90.000 0.077 NA   -0.444
 315778 315779 blr0567 blr0568 gcp gpsA FALSE 0.199 189.000 0.070 1.000 N 0.243
 315779 315780 blr0568 blr0569 gpsA   FALSE 0.264 119.000 0.042 NA   0.260
 315784 315785 blr0573 blr0574     FALSE 0.028 433.000 0.000 NA   0.789
 315787 315788 blr0576 blr0577     FALSE 0.194 142.000 0.000 NA   0.549
 315790 315791 blr0579 blr0580 sun   TRUE 0.570 121.000 0.071 NA   0.880
 315791 315792 blr0580 blr0581   purH FALSE 0.361 168.000 0.068 NA   0.587
 315794 315795 blr0583 blr0584 ggt   FALSE 0.215 99.000 0.000 1.000 N 0.518
 315797 315798 blr0586 blr0587     FALSE 0.448 76.000 0.158 NA   0.019
 315798 315799 blr0587 blr0588     TRUE 0.543 37.000 0.120 1.000 N -0.149
 315799 315800 blr0588 blr0589     FALSE 0.010 120.000 0.000 1.000 N -0.083
 315801 315802 bll0590 bll0591     FALSE 0.175 190.000 0.036 1.000 N 0.325
 315802 315803 bll0591 bsl0592     TRUE 0.588 25.000 0.000 NA   0.628
 315803 315804 bsl0592 bll0593     FALSE 0.107 82.000 0.000 NA   0.238
 315804 402923 bll0593 Bjat06   tRNA-Gly FALSE 0.026 38.000 0.000 NA   NA
 315805 315806 blr0594 blr0595 trxA   TRUE 0.689 116.000 0.222 1.000   0.813
 315807 315808 bll0596 bll0597     FALSE 0.006 182.000 0.000 1.000 N -0.156
 315808 315809 bll0597 bll0598     FALSE 0.495 78.000 0.000 NA   0.909
 315809 315810 bll0598 bll0599     FALSE 0.203 151.000 0.000 NA   0.575
 315810 315811 bll0599 bll0600     FALSE 0.386 63.000 0.000 NA   0.623
 315812 315813 blr0601 bsr0602     FALSE 0.269 75.000 0.005 1.000   0.147
 315817 315818 blr0606 blr0607 glnK   TRUE 0.554 72.000 0.095 1.000   0.474
 315818 315819 blr0607 blr0608     TRUE 0.771 -385.000 0.000 0.001   0.825
 315819 315820 blr0608 blr0609     FALSE 0.185 86.000 0.000 1.000   0.355
 315820 315821 blr0609 blr0610     TRUE 0.966 29.000 0.727 NA   0.959
 315821 315822 blr0610 blr06111   clpP FALSE 0.270 41.000 0.028 NA   NA
 315822 315823 blr06111 blr0612 clpP glnK FALSE 0.001 385.000 0.000 1.000 N NA
 315823 315824 blr0612 blr0613 glnK amtB TRUE 0.916 -46.000 0.197 1.000 N 0.769
 315824 315825 blr0613 blr0614 amtB   FALSE 0.017 215.000 0.000 1.000   -0.119
 315825 315826 blr0614 blr0615     FALSE 0.005 294.000 0.000 1.000   -0.181
 315826 315827 blr0615 blr0616   ftsK TRUE 0.784 10.000 0.081 1.000 N -0.211
 315827 315828 blr0616 blr0617 ftsK   FALSE 0.237 152.000 0.035 1.000 N 0.325
 315828 315829 blr0617 blr0618     FALSE 0.385 156.000 0.068 1.000 N 0.586
 315830 315831 bll0619 bll0620     TRUE 0.895 59.000 0.261 NA Y 0.372
 315832 315833 blr0621 blr0622     TRUE 0.917 7.000 0.024 NA   0.620
 315836 315837 bll0625 bll0626     FALSE 0.218 42.000 0.000 NA   0.286
 315838 315839 blr0627 blr0628 leuS   TRUE 0.933 -13.000 0.090 NA   0.500
 315839 315840 blr0628 blr0629     FALSE 0.236 111.000 0.097 NA   -0.509
 315841 315842 bll0630 bll0631 parB parA TRUE 0.864 117.000 0.827 1.000 N 0.647
 315842 315843 bll0631 bll0632 parA gidB TRUE 0.885 30.000 0.339 1.000 N 0.615
 315843 315844 bll0632 bll0633 gidB gidA TRUE 0.940 10.000 0.466 1.000 N -0.803
 315844 315845 bll0633 bll0634 gidA thdF FALSE 0.043 465.000 0.266 1.000   0.057
 315845 315846 bll0634 bll0635 thdF rho FALSE 0.048 315.000 0.050 1.000   0.138
 315846 315847 bll0635 bll0636 rho   FALSE 0.216 251.000 0.024 1.000   0.784
 315848 315849 blr0637 blr0638     TRUE 0.947 9.000 0.135 NA   0.724
 315849 315850 blr0638 blr0639   coaE TRUE 0.724 24.000 0.011 NA N 0.711
 315850 315851 blr0639 blr0640 coaE dnaQ TRUE 0.523 27.000 0.092 1.000 N -0.446
 315853 315854 blr0642 blr0643     TRUE 0.747 47.000 0.324 1.000   0.041
 315854 315855 blr0643 blr0644     TRUE 0.985 -3.000 0.332 NA   -0.324
 315856 315857 bll0645 bll0646   hslU FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   -0.347
 315857 315858 bll0646 bll0647 hslU   FALSE 0.494 53.000 0.007 NA   0.521
 315858 315859 bll0647 bll0648     TRUE 0.980 -3.000 0.103 NA   0.425
 315859 315860 bll0648 bll0649   hslV FALSE 0.291 182.000 0.000 1.000 N 0.885
 315861 315862 blr0650 blr0651 hisB   TRUE 0.624 65.000 0.041 NA   0.755
 315862 315863 blr0651 blr0652   hisH TRUE 0.995 -3.000 0.417 NA   0.659
 315863 315864 blr0652 blr0653 hisH hisA TRUE 0.998 -3.000 0.070 0.002 Y 0.843
 315864 315865 blr0653 blr0654 hisA hisF TRUE 0.992 11.000 0.433 0.002 Y 0.446
 315865 315866 blr0654 blr0655 hisF hisE TRUE 0.866 90.000 0.105 0.002 Y 0.420
 315866 315867 blr0655 blr0656 hisE panK TRUE 0.990 -3.000 0.086 1.000 N 0.894
 315868 315869 bll0657 bll0658     FALSE 0.158 68.000 0.000 NA   0.306
 315869 315870 bll0658 bll0659     FALSE 0.019 95.000 0.000 1.000   -0.294
 315870 315871 bll0659 bll0660     FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   -0.007
 315871 315872 bll0660 bll0661     FALSE 0.156 98.000 0.013 NA   -0.111
 315873 315874 bsr0662 blr0663     TRUE 0.571 79.000 0.333 NA   -0.463
 315875 315876 bll0664 bll0665 ctpF pilV TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N 0.656
 315876 315877 bll0665 bll0666 pilV   TRUE 0.952 57.000 1.000 NA N 0.853
 315877 315878 bll0666 bll0667   ctpC TRUE 0.965 11.000 0.000 NA Y 0.845
 315878 315879 bll0667 bll0668 ctpC gshB FALSE 0.026 354.000 0.000 NA N 0.618
 315879 315880 bll0668 bll0669 gshB   TRUE 0.813 11.000 0.064 1.000 N 0.275
 315880 315881 bll0669 bll0670     TRUE 0.953 -13.000 0.165 1.000   0.507
 315883 315884 bll0672 bll0673 hemN   TRUE 0.822 20.000 0.218 1.000 N 0.335
 315884 315885 bll0673 bll0674   rph TRUE 0.884 12.000 0.262 1.000 N -0.062
 315886 315887 blr0675 blr0676 hrcA grpE TRUE 0.614 98.000 0.120 NA N 0.830
 315888 315889 bll0677 bll0679 pncA   FALSE 0.002 265.000 0.000 NA   -0.278
 315890 315891 blr0678 blr0680 dnaK dnaJ TRUE 0.803 246.000 0.236 0.003 Y 0.938
 315891 315892 blr0680 blr0681 dnaJ pmtA TRUE 0.549 88.000 0.057 1.000 N 0.725
 315892 315893 blr0681 blr0682 pmtA   TRUE 0.697 58.000 0.154 NA   0.604
 315893 315894 blr0682 blr0683   pyrF TRUE 0.599 7.000 0.008 NA   -0.519
 315894 315895 blr0683 blr0684 pyrF   FALSE 0.256 120.000 0.044 NA   0.224
 315895 315896 blr0684 blr0685   dapB FALSE 0.242 82.000 0.010 NA   0.198
 315896 315897 blr0685 blr0686 dapB   TRUE 0.545 28.000 0.038 1.000 N 0.211
 315898 315899 bll0687 bll0688     FALSE 0.472 56.000 0.142 NA   -0.268
 315900 315901 blr0689 blr0690     FALSE 0.030 32.000 0.000 1.000 N -0.347
 315901 315902 blr0690 blr0691     TRUE 0.987 -13.000 0.700 1.000   0.443
 315903 315904 bll0692 bll0693     FALSE 0.014 88.000 0.000 1.000   -0.334
 315906 315907 bll0695 bll0696     FALSE 0.001 296.000 0.000 1.000 N -0.123
 315908 315909 blr0697 blr0698     TRUE 0.612 -3.000 0.000 1.000 N -0.012
 315910 315911 bll0699 bll0700 nikR   FALSE 0.031 209.000 0.000 1.000 N 0.186
 315915 315916 bll0704 bll0705   pheT FALSE 0.314 54.000 0.003 1.000   0.075
 315916 315917 bll0705 bll0706 pheT pheS TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.000 Y 0.462
 315917 315918 bll0706 bll0707 pheS rplT FALSE 0.155 597.000 0.202 1.000 Y 0.760
 315918 315919 bll0707 bsl0708 rplT rpmI TRUE 0.985 81.000 0.928 0.009 Y 0.885
 315922 315923 blr0711 blr0712     FALSE 0.024 141.000 0.000 NA   -0.014
 315924 315925 bll0713 bll0714     FALSE 0.136 7.000 0.000 NA   -0.151
 315925 315926 bll0714 bll0715     TRUE 0.928 -51.000 0.213 1.000 N 0.897
 315930 315931 blr0719 blr0720     FALSE 0.259 145.000 0.151 NA   -0.555
 315931 315932 blr0720 blr0721     TRUE 0.964 -3.000 0.144 NA   -0.602
 315932 315933 blr0721 blr0722     FALSE 0.408 222.000 0.543 NA   -0.399
 315933 315934 blr0722 blr0723   rpoN2 FALSE 0.442 92.000 0.011 1.000   0.613
 315934 315935 blr0723 blr0724 rpoN2   FALSE 0.430 157.000 0.070 NA N 0.726
 315935 315936 blr0724 blr0725   ptsN FALSE 0.471 223.000 0.353 NA N 0.662
 315939 315940 bsl0728 bll0729   hspH TRUE 0.960 52.000 0.955 NA   0.919
 315940 315941 bll0729 bll0730 hspH   FALSE 0.039 299.000 0.056 NA N 0.096
 315941 315942 bll0730 bll0731     TRUE 0.975 21.000 0.464 0.079 Y 0.066
 315942 315943 bll0731 bll0732     TRUE 0.998 0.000 0.559 0.079 Y -0.089
 315943 315944 bll0732 bll0733     TRUE 0.895 50.000 0.063 0.079 Y 0.435
 315944 315945 bll0733 bll0734     FALSE 0.043 373.000 0.214 1.000 N -0.410
 315945 315946 bll0734 bll0735     FALSE 0.251 179.000 0.067 1.000 N 0.379
 402922 315948 Bjat08 bll0737 tRNA-Ala   FALSE 0.010 100.000 0.000 NA   NA
 315949 315950 blr0738 blr0739 aroA cmk TRUE 0.990 -3.000 0.209 1.000 N 0.616
 315950 315951 blr0739 blr0740 cmk rpsA FALSE 0.406 225.000 0.281 1.000 N 0.622
 315951 315952 blr0740 blr0741 rpsA   FALSE 0.015 376.000 0.057 1.000 N -0.488
 315952 315953 blr0741 blr0742   ihfB FALSE 0.217 172.000 0.142 1.000 N -0.362
 315953 315954 blr0742 blr0743 ihfB   TRUE 0.706 72.000 0.085 NA   0.922
 315954 315955 blr0743 blr0744   trpF TRUE 0.637 67.000 0.017 NA   0.879
 315955 315956 blr0744 blr0745 trpF trpB TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.001 Y 0.858
 315956 315957 blr0745 blr0746 trpB trpA TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.000 Y 0.918
 315957 315958 blr0746 blr0747 trpA accD TRUE 0.645 113.000 0.232 1.000 N 0.710
 315958 315959 blr0747 blr0748 accD folC TRUE 0.987 -3.000 0.383 1.000 N -0.548
 315959 315960 blr0748 blr0749 folC   FALSE 0.097 135.000 0.009 1.000   -0.565
 315960 315961 blr0749 blr0750     FALSE 0.353 87.000 0.000 NA   0.696
 315962 315963 bll0751 bll0752 trxA   FALSE 0.498 68.000 0.173 1.000 N 0.064
 315963 315964 bll0752 bll0753     TRUE 0.991 -39.000 0.863 NA Y 0.197
 315964 315965 bll0753 bll0754   galF FALSE 0.172 311.000 0.196 NA N 0.754
 315965 315966 bll0754 bll0755 galF   FALSE 0.390 194.000 0.025 NA   0.933
 315966 315967 bll0755 bll0756     TRUE 0.582 88.000 0.026 NA   0.880
 315967 315968 bll0756 bll0757   bdfA TRUE 0.967 -3.000 0.015 NA   0.463
 315968 315969 bll0757 bll0758 bdfA dut FALSE 0.052 293.000 0.002 1.000 N 0.444
 315969 315970 bll0758 bll0759 dut dfp TRUE 0.975 -3.000 0.201 1.000 N -0.311
 315970 315971 bll0759 bll0760 dfp aarF FALSE 0.282 57.000 0.025 1.000   -0.344
 315971 315972 bll0760 bll0761 aarF ubiE TRUE 0.990 -3.000 0.115 1.000   0.769
 315974 315975 bll0763 bll0764     FALSE 0.010 247.000 0.000 1.000   -0.150
 315980 315981 blr0769 blr0770 fabA fabB TRUE 0.961 41.000 0.451 1.000 Y 0.562
 315981 315982 blr0770 blr0771 fabB fabI TRUE 0.796 136.000 0.265 1.000 Y 0.304
 315982 315983 blr0771 blr0772 fabI   FALSE 0.011 94.000 0.000 1.000   -0.443
 315984 315985 bll0773 bll0774     FALSE 0.432 116.000 0.000 NA   0.962
 315985 315986 bll0774 bll0775     TRUE 0.932 61.000 0.667 NA   0.983
 315986 315987 bll0775 bll0776     TRUE 0.770 83.000 0.286 NA   0.815
 315987 315988 bll0776 bll0777     TRUE 0.926 7.000 0.000 1.000   0.887
 315990 315991 bll0779 bsl0780 pnpA rpsO FALSE 0.323 463.000 0.335 1.000 Y 0.814
 315991 315992 bsl0780 bll0781 rpsO truB TRUE 0.995 3.000 0.211 1.000 Y 0.573
 315992 315993 bll0781 bll0782 truB rbfA TRUE 0.936 78.000 0.318 1.000 Y 0.867
 315993 315994 bll0782 bll0783 rbfA infB TRUE 0.935 154.000 0.530 1.000 Y 0.902
 315994 315995 bll0783 bll0784 infB   TRUE 0.759 72.000 0.223 NA N 0.859
 315995 315996 bll0784 bll0785   nusA TRUE 0.955 24.000 0.075 NA Y 0.913
 315996 315997 bll0785 bll0786 nusA   TRUE 0.996 3.000 0.759 NA   0.844
 315999 316000 bll0788 bll0789     TRUE 0.961 -3.000 0.006 1.000   0.357
 316000 316001 bll0789 bll0790     FALSE 0.259 87.000 0.000 1.000 N 0.555
 316001 316002 bll0790 bll0791   lnt FALSE 0.221 221.000 0.231 1.000 N -0.121
 316002 316003 bll0791 bll0792 lnt   TRUE 0.979 -3.000 0.213 NA   -0.108
 316003 316004 bll0792 bll0793     TRUE 0.966 -25.000 0.222 NA   0.893
 316004 316005 bll0793 bll0794   phoH TRUE 0.953 21.000 0.457 NA   0.899
 316005 316006 bll0794 bll0795 phoH   TRUE 0.762 65.000 0.220 1.000 N 0.759
 316006 316007 bll0795 bll0796     FALSE 0.356 192.000 0.008 1.000   0.839
 316007 316008 bll0796 bll0797   fur TRUE 0.985 1.000 0.082 1.000   0.839
 316008 316009 bll0797 bll0798 fur   TRUE 0.628 39.000 0.061 1.000   0.416
 316009 316010 bll0798 bll0799     TRUE 0.990 -3.000 0.209 1.000   0.542
 316010 316011 bll0799 bll0800     FALSE 0.486 200.000 0.061 1.000 Y -0.084
 316011 316012 bll0800 bll0801     FALSE 0.202 239.000 0.151 1.000   0.340
 316012 316013 bll0801 bll0802   trpS FALSE 0.348 70.000 0.042 1.000   0.065
 316013 316014 bll0802 bll0803 trpS   FALSE 0.376 93.000 0.078 1.000   0.201
 316017 316018 blr0806 blr0807     TRUE 0.742 190.000 0.889 NA   0.361
 316019 316020 bsl0808 bll0809     FALSE 0.271 193.000 0.000 NA   0.897
 316020 316021 bll0809 bsl0810     TRUE 0.810 17.000 0.000 NA   0.942
 316021 316022 bsl0810 bll0811     FALSE 0.070 148.000 0.000 NA   0.233
 316022 316023 bll0811 bll0812   purC FALSE 0.011 284.000 0.000 1.000 N 0.178
 316023 316024 bll0812 bll0813 purC   FALSE 0.126 94.000 0.016 NA   -0.424
 316025 316026 blr0814 blr0815     FALSE 0.001 317.000 0.000 1.000 N -0.318
 316029 316030 bll0818 bll0819     FALSE 0.040 143.000 0.000 NA   0.085
 316030 316031 bll0819 bll0820     FALSE 0.395 -3.000 0.000 NA   -0.205
 316031 316032 bll0820 bll0821     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   0.198
 316032 316033 bll0821 bll0822   murA FALSE 0.060 221.000 0.000 1.000 N 0.406
 316033 316034 bll0822 bll0823 murA gyrB FALSE 0.104 294.000 0.000 1.000 N 0.961
 316034 316035 bll0823 bll0824 gyrB   FALSE 0.002 282.000 0.000 NA   -0.746
 316035 316036 bll0824 bll0825     FALSE 0.099 141.000 0.000 NA   0.331
 316036 316037 bll0825 bll0826     FALSE 0.351 119.000 0.000 NA   0.795
 316037 316038 bll0826 bll0827   recF FALSE 0.039 86.000 0.000 NA   0.005
 316038 316039 bll0827 bll0828 recF   FALSE 0.141 92.000 0.004 1.000   -0.325
 316039 316040 bll0828 bll0829   dnaN FALSE 0.215 128.000 0.003 0.064   -0.667
 316040 316041 bll0829 bll0830 dnaN dnaA FALSE 0.427 387.000 0.328 1.000 Y 0.866
 316041 316042 bll0830 bll0831 dnaA   FALSE 0.274 198.000 0.000 NA   0.943
 316042 316043 bll0831 bsl0832   rpsT FALSE 0.008 713.000 0.000 NA   0.615
 316044 316045 blr0833 blr0834   msrA FALSE 0.445 145.000 0.032 NA   0.765
 316045 316046 blr0834 blr0835 msrA   FALSE 0.104 120.000 0.022 1.000 N -0.533
 316047 316048 bll0836 bll0837     FALSE 0.102 216.000 0.000 NA   0.531
 316048 316049 bll0837 bll0838     TRUE 0.624 161.000 0.600 NA   -0.109
 316049 316050 bll0838 bll0839     FALSE 0.128 26.000 0.000 NA   0.039
 316051 316052 blr0840 blr0841     TRUE 0.999 -3.000 0.920 0.082 Y 0.555
 316052 316053 blr0841 blr0842     FALSE 0.001 400.000 0.000 1.000 N -0.281
 316054 316055 bll0843 bll0844     FALSE 0.004 219.000 0.000 1.000 N -0.170
 316056 316057 blr0845 blr0846     FALSE 0.014 847.000 0.000 1.000   0.948
 316057 316058 blr0846 blr0847     TRUE 0.963 24.000 0.625 NA   0.936
 316058 316059 blr0847 blr0848     TRUE 0.767 22.000 0.000 NA   0.942
 316061 316062 blr0850 blr0851     TRUE 0.983 -16.000 0.609 NA   0.525
 316062 316063 blr0851 blr0852   uppS FALSE 0.363 31.000 0.013 1.000   -0.290
 316063 316064 blr0852 blr0853 uppS bchE FALSE 0.061 132.000 0.004 1.000 N -0.503
 316064 316065 blr0853 blr0854 bchE   FALSE 0.394 141.000 0.000 1.000   0.893
 316065 316066 blr0854 blr0855     FALSE 0.012 88.000 0.000 NA   -0.398
 316068 316069 blr0857 bsr0858     FALSE 0.004 828.000 0.000 NA   0.494
 316069 316070 bsr0858 bsr0859     FALSE 0.488 73.000 0.000 NA   0.853
 316070 316071 bsr0859 blr0860     TRUE 0.525 45.000 0.000 NA   0.708
 402921 316074 Bjat09 bll0863 tRNA-Arg   FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 316075 316076 blr0864 blr0865     TRUE 0.985 4.000 0.053 0.064   0.933
 316076 316077 blr0865 blr0866     FALSE 0.485 22.000 0.000 0.010   -0.511
 316077 316078 blr0866 blr0867     TRUE 0.994 0.000 0.821 NA   -0.395
 316078 316079 blr0867 blr0868     FALSE 0.006 930.000 0.000 NA   0.621
 316080 316081 bll0869 bll0870     FALSE 0.051 45.000 0.000 NA   -0.052
 316082 316083 blr0871 blr0872     FALSE 0.303 190.000 0.000 NA   0.964
 316084 316085 bll0873 bll0874   parB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.064   0.934
 316085 316086 bll0874 bll0875 parB   TRUE 0.998 -3.000 0.743 0.064 N 0.779
 316087 316088 blr0876 blr0877     FALSE 0.148 187.000 0.000 NA   0.567
 316089 316090 bll0878 bsl0879     FALSE 0.035 343.000 0.000 NA   0.633
 316090 316091 bsl0879 bll0880     FALSE 0.026 38.000 0.000 NA   -0.456
 316091 316092 bll0880 bll0881     FALSE 0.007 157.000 0.000 NA   -0.250
 316092 316093 bll0881 bll0882     FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   0.336
 316093 316094 bll0882 bll0883     FALSE 0.197 153.000 0.050 1.000 N 0.056
 316094 316095 bll0883 bll0884     TRUE 0.994 -39.000 0.687 0.078 Y 0.576
 316095 316096 bll0884 bll0885     TRUE 0.999 -3.000 0.746 1.000 Y 0.595
 316096 316097 bll0885 bll0886     TRUE 0.999 -3.000 0.708 0.003 Y -0.107
 316097 316098 bll0886 bll0887     TRUE 0.859 179.000 0.750 NA Y -0.211
 316098 316099 bll0887 bll0888     TRUE 0.581 52.000 0.000 NA N 0.920
 316099 316100 bll0888 bll0889     FALSE 0.287 114.000 0.000 1.000 N 0.678
 316100 316101 bll0889 bll0890     FALSE 0.007 157.000 0.000 1.000 N -0.535
 316101 316102 bll0890 bll0891     FALSE 0.188 262.000 0.000 1.000 Y -0.223
 316102 316103 bll0891 bll0892     TRUE 0.808 190.000 0.176 1.000 Y 0.917
 316105 316106 bll0894 bll0895     FALSE 0.445 59.000 0.000 NA N 0.739
 316106 316107 bll0895 bll0896     FALSE 0.006 351.000 0.000 NA   0.126
 316107 316108 bll0896 bll0897     TRUE 0.853 -43.000 0.028 0.081   0.472
 316109 316110 blr0898 blr0899     FALSE 0.424 97.000 0.000 1.000   0.811
 316115 316116 bll0904 bll0905 regR regS TRUE 0.905 74.000 0.560 1.000 Y -0.590
 316117 316118 blr0906 blr0907 nodI   FALSE 0.174 239.000 0.000 0.098   0.656
 316118 316119 blr0907 blr0908     FALSE 0.340 123.000 0.188 1.000   -0.579
 316119 316120 blr0908 blr0909     FALSE 0.014 322.000 0.000 1.000   0.202
 316123 316124 bll0912 bll0913     TRUE 0.616 112.000 0.000 NA Y 0.488
 316124 316125 bll0913 bll0914     FALSE 0.072 191.000 0.017 NA   -0.320
 316128 316129 blr0917 blr0918     TRUE 0.975 100.000 0.795 0.078 Y 0.867
 316129 316130 blr0918 blr0919     TRUE 0.990 5.000 0.318 1.000 Y -0.154
 316130 316131 blr0919 blr0920     TRUE 0.919 -40.000 0.244 1.000 N 0.595
 316131 316132 blr0920 blr0921     FALSE 0.241 221.000 0.073 NA   0.575
 316132 316133 blr0921 bsr0922     FALSE 0.008 135.000 0.000 NA   -0.277
 316133 316134 bsr0922 blr0923     FALSE 0.102 -27.000 0.000 NA   -0.126
 316136 316137 blr0925 blr0926 pcaF   TRUE 0.570 96.000 0.086 1.000 N 0.739
 316137 316138 blr0926 blr0927   pcaH TRUE 0.711 85.000 0.000 0.001 Y -0.143
 316138 316139 blr0927 blr0928 pcaH pcaG TRUE 0.999 2.000 0.782 0.001 Y 0.125
 316139 316140 blr0928 blr0929 pcaG   FALSE 0.011 264.000 0.000 1.000 N 0.110
 316140 316141 blr0929 blr0930     FALSE 0.233 49.000 0.000 NA   0.341
 316142 316143 bll0931 bll0932     TRUE 0.984 5.000 0.700 1.000   -0.564
 316143 316144 bll0932 bll0933     TRUE 0.983 -7.000 0.206 1.000 N 0.880
 316145 316146 blr0934 blr0935     TRUE 0.717 35.000 0.016 NA   0.756
 316146 316147 blr0935 blr0936   gcpE TRUE 0.668 13.000 0.005 NA   0.277
 316147 316148 blr0936 blr0937 gcpE   FALSE 0.014 106.000 0.000 1.000 N -0.062
 316148 316149 blr0937 blr0938     FALSE 0.279 186.000 0.000 0.081   0.610
 316149 316150 blr0938 blr0939     FALSE 0.117 103.000 0.000 1.000   0.227
 316151 316152 bll0940 bll0941   bla FALSE 0.023 46.000 0.000 1.000 N -0.092
 316152 316153 bll0941 bll0942 bla   FALSE 0.207 42.000 0.000 NA   0.269
 316154 316155 blr0943 blr0944     FALSE 0.120 148.000 0.000 1.000   0.325
 316156 316157 bll0945 bll0946   ispA TRUE 0.876 8.000 0.085 NA   0.249
 316158 316159 blr0947 bsr0948 mtgA rpmF FALSE 0.145 169.000 0.016 1.000   -0.003
 316159 316160 bsr0948 blr0949 rpmF   TRUE 0.564 78.000 0.016 NA   0.812
 316163 316164 bll0952 bll0953     TRUE 0.595 5.000 0.000 NA   0.132
 316164 316165 bll0953 bll0954     FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   0.268
 316165 316166 bll0954 bll0955     FALSE 0.063 203.000 0.000 1.000   0.281
 316166 316167 bll0955 bll0956     FALSE 0.001 353.000 0.000 NA   -0.206
 316167 316168 bll0956 bll0957     FALSE 0.456 96.000 0.000 NA   0.925
 316168 316169 bll0957 bll0958   acd TRUE 0.909 65.000 0.520 1.000   0.938
 316170 316171 bsr0959 blr0960     FALSE 0.003 276.000 0.000 1.000   -0.290
 316171 316172 blr0960 blr0961     TRUE 0.704 19.000 0.034 1.000 N 0.441
 316174 316175 blr0963 blr0964     FALSE 0.505 54.000 0.130 1.000   -0.212
 316176 316177 bll0965 bll0966     TRUE 0.973 -10.000 0.310 0.024 N -0.030
 316178 316179 blr0967 blr0968     TRUE 0.910 147.000 0.367 1.000 Y 0.865
 316179 316180 blr0968 blr0969     TRUE 0.988 19.000 0.888 0.078 Y -0.218
 316180 316181 blr0969 blr0970     TRUE 0.724 119.000 0.639 1.000   0.049
 316181 316182 blr0970 blr0971     TRUE 0.967 13.000 0.600 0.028   0.047
 316182 316183 blr0971 blr0972     TRUE 0.879 29.000 0.312 1.000 N 0.622
 316183 316184 blr0972 blr0973     FALSE 0.000 534.000 0.000 1.000   -0.362
 316185 316186 bll0974 bll0975     FALSE 0.006 175.000 0.000 NA N -0.371
 316186 316187 bll0975 bll0976     FALSE 0.009 115.000 0.000 NA N -0.296
 316187 316188 bll0976 bll0977     TRUE 0.651 179.000 0.741 NA   -0.148
 316190 316191 bll0979 bll0980     FALSE 0.319 -100.000 0.046 NA N -0.568
 316192 316193 blr0981 blr0982     TRUE 0.683 248.000 0.070 0.007 Y 0.830
 316193 316194 blr0982 blr0983     TRUE 0.988 -3.000 0.105 1.000 N 0.731
 316194 316195 blr0983 blr0984     FALSE 0.450 187.000 0.222 1.000 N 0.577
 316195 316196 blr0984 blr0985     FALSE 0.204 220.000 0.161 1.000   0.008
 316196 316197 blr0985 blr0986   mccB FALSE 0.409 121.000 0.041 1.000   0.560
 316197 316198 blr0986 blr0987 mccB mccA TRUE 0.994 -3.000 0.184 1.000 Y -0.595
 316198 316199 blr0987 blr0988 mccA   FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   -0.468
 316200 316201 bll0989 bll0990     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003 Y 0.422
 316201 316202 bll0990 bll0991     TRUE 0.987 0.000 0.000 1.000 Y 0.390
 316202 316203 bll0991 bll0992     TRUE 0.812 93.000 0.104 0.096 Y 0.268
 316203 316204 bll0992 bll0993     TRUE 0.943 31.000 0.045 0.078 Y 0.680
 316204 316205 bll0993 bll0994     FALSE 0.069 319.000 0.000 1.000 N 0.840
 316205 316206 bll0994 bll0995     TRUE 0.901 19.000 0.444 1.000 N 0.246
 316207 316208 blr0996 blr0997     TRUE 0.998 -3.000 0.720 1.000 N 0.803
 316208 316209 blr0997 blr0998     FALSE 0.062 275.000 0.000 NA N 0.675
 316210 316211 bll0998 bll1000     TRUE 0.762 28.000 0.098 1.000   0.511
 316211 316212 bll1000 bll1001     TRUE 0.982 -10.000 0.627 1.000   -0.062
 316212 316213 bll1001 bll1002     TRUE 0.995 -3.000 0.680 1.000 N 0.191
 316215 316216 bll1004 bll1005     FALSE 0.170 192.000 0.057 1.000 N 0.198
 316216 316217 bll1005 bsl1006     FALSE 0.078 317.000 0.000 NA   0.885
 316217 316218 bsl1006 bll1007     FALSE 0.296 63.000 0.000 NA   0.501
 316218 316219 bll1007 bll1008     FALSE 0.001 293.000 0.000 NA   -0.545
 316219 316220 bll1008 bll1009   soxB TRUE 0.976 -3.000 0.227 NA   -0.694
 316220 316221 bll1009 bll1010 soxB   TRUE 0.729 24.000 0.182 NA   0.084
 316221 316222 bll1010 bll1011   soxA TRUE 0.985 -3.000 0.227 NA   0.298
 316222 316223 bll1011 bll1012 soxA soxZ TRUE 0.994 -3.000 0.318 1.000   0.611
 316223 316224 bll1012 bll1013 soxZ soxY TRUE 0.909 11.000 0.109 NA   0.592
 316224 316225 bll1013 bll1014 soxY soxX TRUE 0.840 26.000 0.281 NA   0.418
 316228 316229 blr1017 blr1018     TRUE 0.756 149.000 0.091 0.067 Y 0.264
 316230 316231 bll1019 bll1020     FALSE 0.372 91.000 0.045 1.000   0.338
 316232 316233 blr1021 blr1022     TRUE 0.963 124.000 0.808 0.016 Y 0.585
 316234 316235 bll1023 bll1024     FALSE 0.433 58.000 0.140 NA   -0.528
 316235 316236 bll1024 bll1025     FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   -0.806
 316236 316237 bll1025 bll1026     FALSE 0.023 68.000 0.000 NA   -0.098
 316237 316238 bll1026 bll1027     TRUE 0.927 31.000 0.286 1.000 Y -0.156
 316238 316239 bll1027 bll1028   carQ FALSE 0.000 485.000 0.000 1.000 N -0.538
 316239 316240 bll1028 bll1029 carQ   FALSE 0.109 448.000 0.150 1.000 Y -0.180
 316240 316241 bll1029 bll1030     TRUE 0.990 11.000 0.414 0.024 Y 0.273
 316241 316242 bll1030 bll1031     TRUE 0.990 -30.000 0.310 0.014 Y 0.474
 316242 316243 bll1031 bll1032     FALSE 0.255 97.000 0.000 1.000 N 0.576
 316244 316245 blr1033 blr1034     FALSE 0.004 206.000 0.000 1.000   -0.550
 316245 316246 blr1034 blr1035     FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   0.474
 316246 316247 blr1035 blr1036     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   0.495
 316247 316248 blr1036 blr1037     TRUE 0.777 270.000 0.556 0.078 Y 0.621
 316248 316249 blr1037 blr1038     TRUE 0.999 4.000 0.818 0.096 Y 0.537
 316249 316250 blr1038 blr1039     TRUE 0.829 95.000 0.818 1.000   0.150
 316250 316251 blr1039 bsr1040     TRUE 0.883 13.000 0.333 NA   -0.545
 316251 316252 bsr1040 blr1041     TRUE 0.757 26.000 0.054 NA   0.628
 316252 316253 blr1041 blr1042     TRUE 0.982 2.000 0.189 NA   0.597
 316253 316254 blr1042 blr1043     TRUE 0.949 -34.000 0.300 NA   0.629
 316255 316256 bll1044 bll1045     FALSE 0.184 208.000 0.000 1.000 N 0.754
 316259 316260 blr1048 blr1049   fdx TRUE 0.923 13.000 0.385 0.081 N -0.775
 316260 316261 blr1049 blr1050 fdx   TRUE 0.701 53.000 0.385 NA N -0.235
 316264 316265 bll1053 bll1054     TRUE 0.998 -3.000 0.200 1.000 Y 0.811
 316265 316266 bll1054 bll1055     TRUE 0.994 12.000 0.667 0.028 Y 0.439
 316266 316267 bll1055 bll1056     TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y 0.156
 316267 316268 bll1056 bll1057     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.078 Y 0.298
 316268 316269 bll1057 bll1058     TRUE 0.834 162.000 0.250 1.000 Y 0.662
 316269 316270 bll1058 bll1059   aroE TRUE 0.898 61.000 0.032 1.000 Y 0.904
 316270 316271 bll1059 bll1060 aroE   FALSE 0.457 145.000 0.053 1.000 N 0.745
 316271 316272 bll1060 bsl1061     FALSE 0.137 250.000 0.000 NA   0.811
 316273 316274 blr1062 blr1063     TRUE 0.630 72.000 0.154 1.000 N 0.584
 316274 316275 blr1063 blr1064     FALSE 0.001 533.000 0.000 1.000 N 0.041
 316275 316276 blr1064 blr1065     TRUE 0.996 -3.000 0.130 0.078 Y 0.295
 316276 316277 blr1065 blr1066     TRUE 0.985 -7.000 0.174 1.000 Y -0.489
 316277 316278 blr1066 blr1067     TRUE 0.998 -7.000 0.800 0.028 Y -0.109
 316279 316280 bll1068 bll1069     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   -0.519
 316280 316281 bll1069 bll1070     TRUE 0.723 137.000 0.444 1.000 N 0.661
 316282 316283 blr1071 blr1072     FALSE 0.030 39.000 0.000 NA   -0.117
 316284 316285 bll1073 bll1074     TRUE 0.538 -57.000 0.000 NA   0.481
 316285 316286 bll1074 bll1075     FALSE 0.092 59.000 0.000 1.000   -0.055
 316286 316287 bll1075 bll1076     FALSE 0.063 262.000 0.000 1.000   0.506
 316288 316289 blr1077 blr1078     TRUE 0.830 112.000 0.095 NA Y 0.797
 316289 316290 blr1078 blr1079     TRUE 0.536 22.000 0.042 NA   -0.031
 316290 316291 blr1079 blr1080     FALSE 0.138 70.000 0.000 NA   0.270
 316291 316292 blr1080 blr1081     TRUE 0.988 15.000 1.000 1.000   0.975
 316293 316294 bll1082 bll1083 kduD   FALSE 0.517 123.000 0.240 1.000   0.322
 316295 316296 blr1084 blr1085     TRUE 0.995 -3.000 0.846 NA   -0.647
 316296 316297 blr1085 blr1086     FALSE 0.008 140.000 0.000 NA   -0.309
 316297 316298 blr1086 blr1087     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   0.281
 316298 316299 blr1087 blr1088     FALSE 0.039 256.000 0.000 1.000   0.319
 316299 316300 blr1088 blr1089     FALSE 0.012 423.000 0.000 NA   0.474
 316300 316301 blr1089 blr1090   phoR TRUE 0.590 60.000 0.015 NA   0.715
 316301 316302 blr1090 blr1091 phoR pstS FALSE 0.086 133.000 0.019 1.000 N -0.567
 316302 316303 blr1091 blr1092 pstS pstC TRUE 0.923 121.000 0.178 0.001 Y 0.946
 316303 316304 blr1092 blr1093 pstC pstA TRUE 0.998 5.000 0.537 0.001 Y 0.810
 316304 316305 blr1093 blr1094 pstA pstB TRUE 0.999 -3.000 0.526 0.001 Y 0.844
 316305 316306 blr1094 blr1095 pstB phoU TRUE 0.983 12.000 0.126 NA Y 0.971
 316306 316307 blr1095 blr1096 phoU phoB TRUE 0.695 23.000 0.128 NA N 0.268
 316309 316310 blr1098 blr1099 argD argF TRUE 0.990 0.000 0.058 1.000 Y -0.028
 316310 316311 blr1099 blr1100 argF hslO FALSE 0.203 159.000 0.052 1.000 N 0.111
 316313 316314 blr1102 blr1103     TRUE 0.978 0.000 0.308 NA   -0.455
 316314 316315 blr1103 blr1104     TRUE 0.979 7.000 0.333 1.000   0.738
 316317 316318 blr1106 blr1107 dcd   FALSE 0.073 193.000 0.000 NA   0.365
 316318 316319 blr1107 blr1108     FALSE 0.039 348.000 0.000 NA   0.690
 316320 316321 bll1109 bll1110     FALSE 0.002 577.000 0.000 NA   0.140
 316321 316322 bll1110 bsl1111     FALSE 0.060 108.000 0.000 NA   0.131
 316322 316323 bsl1111 bll1112     FALSE 0.000 502.000 0.000 NA   -0.363
 316323 316324 bll1112 bll1113     TRUE 0.920 11.000 0.375 1.000 N -0.326
 316326 316327 blr1115 blr1116     TRUE 0.965 -3.000 0.077 1.000 N 0.132
 316327 316328 blr1116 blr1117     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.007   0.285
 316328 316329 blr1117 blr1118     FALSE 0.040 102.000 0.000 1.000   -0.143
 316329 316330 blr1118 blr1119   xylB TRUE 0.892 81.000 0.800 1.000 N 0.661
 316330 316331 blr1119 blr1120 xylB xylA TRUE 0.994 1.000 0.013 1.000 Y 0.724
 316331 316332 blr1120 blr1121 xylA   TRUE 0.896 13.000 0.010 1.000   0.876
 316332 316333 blr1121 blr1122     TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.005   0.231
 316333 316334 blr1122 blr1123     TRUE 0.772 83.000 0.081 NA Y 0.367
 316334 316335 blr1123 blr1124     FALSE 0.010 100.000 0.000 NA N 0.009
 316335 316336 blr1124 blr1125     TRUE 0.989 4.000 0.667 1.000   0.085
 316337 316338 bll1126 bll1127     FALSE 0.028 35.000 0.000 NA   -0.794
 316338 316339 bll1127 bll1128     FALSE 0.008 151.000 0.000 NA N -0.397
 316339 316340 bll1128 bll1129     TRUE 0.650 4.000 0.000 1.000   -0.012
 316341 316342 blr1130 blr1131     FALSE 0.102 330.000 0.286 NA   0.101
 316342 316343 blr1131 blr1132     FALSE 0.040 302.000 0.048 1.000   -0.125
 316343 316344 blr1132 blr1133   lysS FALSE 0.186 150.000 0.050 1.000 N -0.031
 316345 316346 bll1134 bll1135     FALSE 0.047 110.000 0.000 NA   0.081
 316348 316349 bll1137 bll1138 cah   TRUE 0.624 -33.000 0.045 1.000 N -0.554
 316350 316351 blr1139 blr1140   pyrD TRUE 0.988 -3.000 0.108 NA   0.698
 316352 316353 bll1141 bll1142 dinF   TRUE 0.861 2.000 0.009 1.000   -0.351
 316353 316354 bll1142 bll1143     TRUE 0.747 32.000 0.071 NA   0.638
 316354 316355 bll1143 bll1144     FALSE 0.169 161.000 0.000 NA   0.530
 316355 316356 bll1144 bll1145     TRUE 0.998 -3.000 0.751 1.000 N 0.880
 316357 316358 blr1146 blr1147     FALSE 0.321 72.000 0.081 NA   -0.251
 316358 316359 blr1147 blr1148   lhr FALSE 0.153 165.000 0.020 NA   0.111
 316359 316360 blr1148 blr1149 lhr   TRUE 0.940 15.000 0.460 1.000   0.405
 316362 316363 blr1151 blr1152     TRUE 0.927 13.000 0.250 NA   0.594
 316364 316365 bll1153 bll1154     TRUE 0.994 -3.000 0.274 NA   0.764
 316365 316366 bll1154 bll1155     FALSE 0.115 91.000 0.000 1.000   0.170
 316366 316367 bll1155 bll1156     FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   0.052
 316368 316369 blr1157 blr1158   acd FALSE 0.291 119.000 0.080 NA   0.131
 316369 316370 blr1158 blr1159 acd   TRUE 0.863 71.000 0.247 1.000 Y 0.234
 316370 316371 blr1159 blr1160   fadB TRUE 0.968 21.000 0.562 1.000 Y -0.512
 316372 316373 bsl1161 bll1162   attY FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   -0.351
 316374 316375 blr1163 blr1164   gshA FALSE 0.356 97.000 0.082 1.000 N 0.270
 316375 316376 blr1164 blr1165 gshA   FALSE 0.368 114.000 0.057 1.000   0.401
 316377 316378 bll1166 bll1167   sipS TRUE 0.826 23.000 0.047 NA   0.819
 316378 316379 bll1167 bll1168 sipS tldD TRUE 0.982 -3.000 0.018 NA   0.737
 316379 316380 bll1168 bll1169 tldD   FALSE 0.292 90.000 0.037 NA   0.225
 316381 316382 blr1170 blr1171 coxB coxA TRUE 0.980 89.000 0.741 0.003 Y 0.937
 316382 316383 blr1171 blr1172 coxA coxE TRUE 0.844 61.000 0.153 0.066 N 0.965
 316383 316384 blr1172 bsr1173 coxE coxF TRUE 0.949 -3.000 0.033 NA   0.073
 316384 316385 bsr1173 blr1174 coxF coxG TRUE 0.866 6.000 0.046 NA   0.136
 316385 316386 blr1174 blr1175 coxG coxC TRUE 0.801 80.000 0.536 0.003 N -0.322
 316386 316387 blr1175 blr1176 coxC   FALSE 0.290 98.000 0.122 NA   -0.464
 316387 316388 blr1176 blr1177   shb1 TRUE 0.805 -177.000 0.220 NA   0.593
 316388 316389 blr1177 blr1178 shb1   FALSE 0.067 117.000 0.000 NA   0.174
 316391 316392 blr1180 blr1181 elmR thrC FALSE 0.007 537.000 0.000 1.000 N 0.485
 316392 316393 blr1181 blr1182 thrC mpp TRUE 0.985 -3.000 0.129 1.000   0.470
 316393 316394 blr1182 blr1183 mpp rimJ TRUE 0.869 40.000 0.674 1.000   -0.845
 316394 316395 blr1183 blr1184 rimJ   FALSE 0.504 132.000 0.120 NA   0.663
 316396 316397 bll1185 bll1186 atpB atpB' TRUE 0.999 6.000 0.863 0.003 Y 0.992
 316397 316398 bll1186 bsl1187 atpB' atpC TRUE 0.904 63.000 0.278 0.003   0.983
 316398 316399 bsl1187 bll1188 atpC atpA TRUE 0.959 54.000 0.628 0.003   0.956
 316399 316400 bll1188 bsl1189 atpA   TRUE 0.657 112.000 0.195 NA   0.817
 316401 316402 blr1190 blr1191     FALSE 0.111 9.000 0.000 NA   -0.311
 316402 316403 blr1191 blr1192     FALSE 0.145 100.000 0.015 NA   -0.188
 316407 316408 blr1196 blr1197 ohr   FALSE 0.355 37.000 0.000 1.000   0.376
 316408 316409 blr1197 blr1198     TRUE 0.621 73.000 0.087 NA   0.703
 316410 316411 bll1199 bll1200   hemA FALSE 0.067 300.000 0.133 1.000 N 0.036
 316413 316414 bll1202 bll1203     FALSE 0.214 220.000 0.214 1.000   -0.321
 316414 316415 bll1203 bll1204     FALSE 0.333 166.000 0.000 1.000 N 0.906
 316415 316416 bll1204 bll1205     FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   -0.388
 316418 316419 bll1207 bsl1208     FALSE 0.093 71.000 0.000 NA   0.146
 316419 316420 bsl1208 bll1209     FALSE 0.001 361.000 0.000 NA   -0.164
 316420 316421 bll1209 bll1210     TRUE 0.799 -114.000 0.353 1.000   -0.317
 316421 316422 bll1210 bll1211     TRUE 0.987 18.000 0.850 0.095 Y -0.722
 316422 316423 bll1211 bll1212     TRUE 0.866 200.000 0.800 0.077 Y -0.789
 316424 316425 blr1213 blr1214     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   0.152
 316425 316426 blr1214 blr1215     TRUE 0.882 33.000 0.500 NA   0.366
 316426 316427 blr1215 blr1216     FALSE 0.104 238.000 0.000 NA   0.640
 316429 316430 blr1218 blr1219     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   -0.555
 316432 316433 blr1221 blr1222 phnG phnH TRUE 0.998 -10.000 0.967 0.001 Y 0.003
 316433 316434 blr1222 blr1223 phnH phnI TRUE 0.999 2.000 0.960 0.001 Y -0.208
 316434 316435 blr1223 blr1224 phnI phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y 0.725
 316435 316436 blr1224 blr1225 phnJ phnK TRUE 0.999 -7.000 0.883 1.000 Y 0.833
 316436 316437 blr1225 blr1226 phnK phnL TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.027 Y 0.174
 316437 316438 blr1226 blr1227 phnL phnM TRUE 0.953 12.000 0.104 1.000 Y -0.088
 316438 316439 blr1227 blr1228 phnM gmk TRUE 0.990 -3.000 0.017 1.000 Y -0.278
 316439 316440 blr1228 blr1229 gmk   FALSE 0.064 27.000 0.000 1.000   -0.282
 316441 316442 bll1230 bll1231     FALSE 0.139 -15.000 0.000 NA   -0.412
 316443 316444 bsr1232 blr1233     TRUE 0.709 22.000 0.000 NA   0.792
 316445 316446 bll1234 bll1235   cysD TRUE 0.987 5.000 0.556 1.000   0.445
 316446 316447 bll1235 bll1236 cysD   FALSE 0.001 302.000 0.000 1.000 N -0.315
 316448 316449 blr1237 blr1238     TRUE 0.980 1.000 0.214 1.000   0.355
 316449 316450 blr1238 blr1239     FALSE 0.406 52.000 0.000 1.000   0.531
 316450 316451 blr1239 blr1240   hpcG TRUE 0.998 4.000 0.783 0.046 Y 0.201
 316451 316452 blr1240 blr1241 hpcG   FALSE 0.035 26.000 0.000 NA N -0.330
 316452 316453 blr1241 blr1242     TRUE 0.962 14.000 0.750 NA   0.250
 316454 316455 bll1243 bll1244     FALSE 0.034 172.000 0.000 1.000 N 0.119
 316456 316457 blr1245 blr1246     TRUE 0.976 13.000 0.714 0.018   0.116
 316457 316458 blr1246 blr1247     FALSE 0.053 181.000 0.000 NA   0.229
 316459 316460 blr1248 blr1249     TRUE 0.544 93.000 0.080 NA   0.671
 316460 316461 blr1249 blr1250     FALSE 0.314 125.000 0.000 NA   0.746
 316461 316462 blr1250 blr1251     TRUE 0.618 130.000 0.231 NA   0.711
 316464 316465 blr1253 blr1254     FALSE 0.509 -60.000 0.000 NA   0.469
 316465 316466 blr1254 blr1255     FALSE 0.079 73.000 0.000 NA   0.116
 316466 316467 blr1255 blr1256   hisD FALSE 0.155 277.000 0.096 NA   0.624
 316467 316468 blr1256 blr1257 hisD   TRUE 0.972 -3.000 0.157 NA   -0.156
 316468 316469 blr1257 blr1258     TRUE 0.986 7.000 0.768 NA   0.415
 316469 316470 blr1258 blr1259   maf FALSE 0.152 156.000 0.013 NA N 0.264
 316470 316471 blr1259 bsr1260 maf   FALSE 0.200 167.000 0.102 NA   -0.306
 316471 402880 bsr1260 Bjat12   tRNA-Phe FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 402880 316472 Bjat12 blr1261 tRNA-Phe   FALSE 0.013 77.000 0.000 NA   NA
 316472 316473 blr1261 blr1262     FALSE 0.091 168.000 0.000 NA   0.356
 316473 316474 blr1262 blr1263     FALSE 0.190 91.000 0.000 NA   0.443
 316474 316475 blr1263 blr1264     TRUE 0.640 -57.000 0.000 NA   0.609
 316475 316476 blr1264 blr1265     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA   0.875
 316476 316477 blr1265 blr1266     TRUE 0.693 33.000 0.000 1.000   0.857
 316477 316478 blr1266 blr1267     FALSE 0.089 281.000 0.000 NA   0.792
 316478 316479 blr1267 blr1268     FALSE 0.292 195.000 0.000 NA   0.977
 316479 316480 blr1268 blr1269     FALSE 0.015 486.000 0.000 NA   0.651
 316481 316482 bll1270 bll1271   mdcH FALSE 0.008 141.000 0.000 NA   -0.591
 316482 316483 bll1271 bll1272 mdcH mdcB TRUE 0.968 0.000 0.127 1.000 N 0.233
 316483 316484 bll1272 bll1273 mdcB mdcG TRUE 0.975 -3.000 0.102 1.000   0.195
 316484 316485 bll1273 bll1274 mdcG mdcE TRUE 0.961 -7.000 0.102 NA   0.562
 316485 316486 bll1274 bll1275 mdcE mdcD TRUE 0.985 -13.000 0.700 NA   0.312
 316486 316487 bll1275 bll1276 mdcD mdcA FALSE 0.017 325.000 0.000 1.000   0.310
 316488 316489 blr1277 blr1278 mdcL mdcM TRUE 0.996 -3.000 0.945 NA   -0.457
 316489 316490 blr1278 blr1279 mdcM   TRUE 0.986 1.000 0.145 NA   0.793
 316490 316491 blr1279 blr1280     FALSE 0.011 99.000 0.000 1.000 N -0.260
 316493 316494 blr1282 blr1283     FALSE 0.311 20.000 0.000 NA   0.246
 316494 316495 blr1283 blr1284     TRUE 0.930 11.000 0.214 1.000 N 0.552
 316496 316497 bll1285 bll1286     FALSE 0.008 129.000 0.000 NA   -0.577
 316497 316498 bll1286 bll1287     FALSE 0.008 144.000 0.000 NA   -0.329
 316499 316500 blr1288 blr1289     FALSE 0.129 227.000 0.000 NA   0.674
 316501 316502 bll1290 bll1291     FALSE 0.008 142.000 0.000 NA   -0.881
 316502 316503 bll1291 bll1292     FALSE 0.395 -3.000 0.000 NA   -0.475
 316503 316504 bll1292 bll1293   gctA TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y 0.755
 316504 316505 bll1293 bll1294 gctA   FALSE 0.434 34.000 0.000 1.000   0.455
 316505 316506 bll1294 bll1295     TRUE 0.665 16.000 0.000 1.000   0.542
 316506 316507 bll1295 bll1296     FALSE 0.084 285.000 0.031 NA N 0.564
 316508 316509 blr1297 blr1298     TRUE 0.704 57.000 0.308 NA   0.188
 316511 316512 blr1300 blr1301     TRUE 0.617 23.000 0.000 NA   0.645
 316512 316513 blr1301 blr1302     FALSE 0.500 217.000 0.588 NA   0.142
 316513 316514 blr1302 blr1303     TRUE 0.924 -39.000 0.433 NA   0.061
 316514 316515 blr1303 blr1304     FALSE 0.242 58.000 0.031 NA   -0.411
 316516 316517 bll1305 bll1306     FALSE 0.267 140.000 0.000 NA   0.687
 316518 316519 blr1307 blr1308     FALSE 0.080 231.000 0.000 0.013   -0.202
 316519 316520 blr1308 blr1309   acs FALSE 0.016 304.000 0.000 1.000   0.211
 316520 316521 blr1309 bsr1310 acs   FALSE 0.124 177.000 0.022 NA   -0.015
 316521 316522 bsr1310 blr1311     FALSE 0.399 163.000 0.028 NA   0.745
 316523 316524 bsl1312 bll1313     FALSE 0.007 160.000 0.000 NA   -0.436
 316525 316526 blr1314 blr1315   thrB TRUE 0.949 7.000 0.251 1.000   0.260
 316526 316527 blr1315 blr1316 thrB   TRUE 0.975 -3.000 0.104 1.000   0.183
 316528 316529 bll1317 bll1318     FALSE 0.306 109.000 0.017 1.000   0.394
 316529 316530 bll1318 bll1319   fadD TRUE 0.543 16.000 0.017 1.000   -0.216
 316530 316531 bll1319 bll1320 fadD   FALSE 0.263 194.000 0.125 1.000 N 0.350
 316531 316532 bll1320 bll1321   chvA FALSE 0.405 191.000 0.188 1.000 N 0.575
 316532 316533 bll1321 bll1322 chvA   FALSE 0.330 86.000 0.143 NA N -0.239
 316534 316535 blr1323 blr1324 his2   FALSE 0.484 67.000 0.021 NA   0.554
 316535 316536 blr1324 blr1325     FALSE 0.345 129.000 0.059 NA   0.461
 316536 316537 blr1325 blr1326   aspA FALSE 0.027 37.000 0.000 NA   -0.165
 316537 316538 blr1326 blr1327 aspA   FALSE 0.014 251.000 0.000 1.000   -0.054
 316538 316539 blr1327 blr1328     FALSE 0.054 231.000 0.040 NA   -0.550
 316541 316542 blr1330 blr1331     FALSE 0.007 639.000 0.000 NA   0.565
 316542 316543 blr1331 blr1332     FALSE 0.039 48.000 0.000 NA   -0.077
 316544 316545 bsl1333 bsl1334     FALSE 0.040 90.000 0.000 1.000   -0.171
 316545 316546 bsl1334 bll1335     FALSE 0.000 607.000 0.000 1.000   -0.339
 316546 316547 bll1335 bll1336     TRUE 0.998 -3.000 0.300 0.029 Y 0.334
 316547 316548 bll1336 bll1337     FALSE 0.387 107.000 0.000 NA   0.831
 316548 316549 bll1337 bll1338     FALSE 0.002 280.000 0.000 NA   -0.252
 316549 316550 bll1338 bll1339     TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA   0.778
 316550 402919 bll1339 Bjat13   tRNA-Leu FALSE 0.006 173.000 0.000 NA   NA
 316552 316553 bll1341 bll1342     FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   0.167
 316556 316557 blr1345 blr1346     TRUE 0.784 4.000 0.000 NA   0.315
 316557 316558 blr1346 blr1347     FALSE 0.175 45.000 0.000 NA   0.222
 316558 316559 blr1347 blr1348     TRUE 0.983 -3.000 0.231 NA   0.114
 316559 316560 blr1348 blr1349     FALSE 0.462 23.000 0.038 NA N -0.026
 316561 316562 bll1350 bll1351     FALSE 0.039 29.000 0.000 NA   -0.115
 316563 316564 blr1352 blr1353     FALSE 0.262 182.000 0.000 1.000   0.756
 316564 316565 blr1353 blr1354     TRUE 0.911 30.000 0.083 0.076 Y -0.046
 316565 316566 blr1354 blr1355     TRUE 0.992 -34.000 0.725 0.094 Y -0.153
 316566 316567 blr1355 blr1356     TRUE 0.988 0.000 0.055 1.000 Y -0.494
 316567 316568 blr1356 blr1357     TRUE 0.996 -3.000 0.055 0.003 Y 0.072
 316569 316570 bll1358 bll1359     FALSE 0.037 -81.000 0.000 1.000   -0.420
 316571 316572 blr1360 blr1361     FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   -0.341
 316573 316574 bll1362 bsl1363     FALSE 0.312 120.000 0.000 NA   0.725
 316575 316576 blr1364 blr1365   bgl TRUE 0.989 3.000 0.000 0.013 Y 0.376
 316577 316578 bll1366 bll1367     FALSE 0.100 10.000 0.000 NA   -0.243
 316578 316579 bll1367 bll1368     FALSE 0.449 -33.000 0.000 NA   0.213
 316579 316580 bll1368 bll1369     FALSE 0.024 42.000 0.000 NA   -0.170
 316580 316581 bll1369 bll1370     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   0.212
 316581 316582 bll1370 bll1371   alkA TRUE 0.944 -3.000 0.009 NA   0.206
 316583 316584 blr1372 blr1373 gltX   FALSE 0.364 73.000 0.022 0.096   -0.278
 316586 316587 blr1375 blr1376     TRUE 0.937 3.000 0.156 NA   -0.756
 316587 316588 blr1376 blr1377   etfS FALSE 0.210 126.000 0.028 1.000   0.041
 316588 316589 blr1377 blr1378 etfS etfL TRUE 0.998 0.000 0.242 0.021 Y 0.540
 316589 316590 blr1378 blr1379 etfL hbdA FALSE 0.346 208.000 0.092 1.000 N 0.730
 316592 316593 blr1381 bsr1382 argH   FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   -0.526
 316593 316594 bsr1382 blr1383   lysA FALSE 0.390 24.000 0.000 NA   0.383
 316595 316596 bll1384 bll1385   pcaC FALSE 0.444 81.000 0.132 1.000   0.085
 316597 316598 blr1386 blr1387     TRUE 0.765 -12.000 0.022 NA   -0.267
 316599 316600 bll1388 bll1389     TRUE 0.753 48.000 0.104 NA   0.762
 316601 316602 blr1390 blr1391 ftsE FtsX TRUE 0.988 -7.000 0.139 NA Y 0.301
 316602 316603 blr1391 blr1392 FtsX   TRUE 0.651 105.000 0.417 NA   0.269
 316603 316604 blr1392 blr1393   plsC TRUE 0.743 23.000 0.250 NA   -0.467
 316607 316608 bll1396 bll1397 tyrC hisC TRUE 0.995 -3.000 0.198 1.000 Y 0.090
 316608 316609 bll1397 bll1398 hisC   TRUE 0.942 33.000 0.084 1.000 Y 0.817
 316610 316611 blr1399 blr1400 metX   TRUE 0.992 -7.000 0.509 NA N 0.897
 316616 316617 bsl1405 bll1406     FALSE 0.012 90.000 0.000 NA   -0.684
 316617 316618 bll1406 bll1407     TRUE 0.945 -37.000 0.188 NA   0.896
 407781 402881 Bjar01 Bjat14 rrn16S tRNA-Ile FALSE 0.003 227.000 0.000 NA   NA
 402881 402882 Bjat14 Bjat15 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.029 34.000 0.000 NA   NA
 402882 407050 Bjat15 Bjar02 tRNA-Ala rrn23S FALSE 0.001 397.000 0.000 NA   NA
 407050 406803 Bjar02 Bjar03 rrn23S rrn5S FALSE 0.010 107.000 0.000 NA   NA
 406803 316619 Bjar03 blr1408 rrn5S   FALSE 0.000 739.000 0.000 NA   NA
 316619 316620 blr1408 blr1409     FALSE 0.252 100.000 0.000 NA   0.573
 316620 316621 blr1409 blr1410   glpK FALSE 0.087 252.000 0.000 1.000 N 0.639
 316621 316622 blr1410 blr1411 glpK   FALSE 0.031 243.000 0.004 1.000   -0.566
 316623 316624 bll1412 bll1413     TRUE 0.817 17.000 0.000 NA   0.969
 316625 316626 blr1414 blr1415     FALSE 0.159 132.000 0.000 1.000   0.414
 316627 316628 bll1416 bll1417     FALSE 0.010 359.000 0.000 NA   0.323
 316628 316629 bll1417 bll1418   metH FALSE 0.000 597.000 0.000 NA   -0.284
 316629 316630 bll1418 bll1419 metH metF TRUE 0.991 7.000 0.037 0.002 Y 0.741
 316632 316633 bll1421 bll1422 pheA kdsB TRUE 0.614 22.000 0.083 1.000 N -0.027
 316634 316635 blr1423 blr1424 cycM   FALSE 0.290 211.000 0.087 1.000 N 0.617
 316635 316636 blr1424 blr1425     TRUE 0.978 -141.000 0.391 0.076 Y 0.750
 316636 316637 blr1425 blr1426     TRUE 0.997 3.000 0.711 0.076   0.897
 316637 316638 blr1426 blr1427     TRUE 0.990 -42.000 0.882 0.076   0.864
 316638 316639 blr1427 blr1428     TRUE 0.868 50.000 0.744 1.000   -0.348
 316639 316640 blr1428 blr1429     FALSE 0.001 784.000 0.000 NA   0.106
 316641 316642 bll1430 bll1431     TRUE 0.974 -7.000 0.408 NA   -0.135
 316643 316644 bsr1432 blr1433     FALSE 0.004 204.000 0.000 NA   -0.435
 316645 316646 bll1434 bll1435 ctpI ctpH TRUE 0.997 10.000 0.818 0.012 Y 0.591
 316646 316647 bll1435 bll1436 ctpH ctpG TRUE 0.994 -28.000 0.618 1.000 Y 0.621
 316647 316648 bll1436 bll1437 ctpG ctpF TRUE 0.978 22.000 0.324 1.000 Y 0.820
 316648 316649 bll1437 bll1438 ctpF ctpE TRUE 0.988 -3.000 0.067 NA N 0.865
 316649 316650 bll1438 bll1439 ctpE ctpD TRUE 0.863 21.000 0.067 NA N 0.952
 316650 316651 bll1439 bll1440 ctpD ctpC TRUE 0.998 -3.000 0.250 NA Y 0.914
 316651 316652 bll1440 bll1441 ctpC ctpB TRUE 0.658 119.000 0.125 NA Y -0.491
 316652 316653 bll1441 bsl1442 ctpB ctpA FALSE 0.075 340.000 0.000 NA Y -0.556
 316654 316655 blr1443 blr1444     FALSE 0.517 155.000 0.125 NA   0.728
 316656 316657 bsl1445 bsl1446 cspA infA FALSE 0.049 277.000 0.000 1.000 N 0.555
 316657 316658 bsl1446 bll1447 infA rhlE TRUE 0.932 24.000 0.055 1.000 Y 0.593
 316659 316660 blr1448 blr1449     TRUE 0.952 88.000 0.654 NA Y 0.719
 316660 316661 blr1449 blr1450     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.076 Y 0.267
 316661 316662 blr1450 blr1451     TRUE 0.988 6.000 0.823 1.000   0.207
 316662 316663 blr1451 blr1452     TRUE 0.997 4.000 0.731 0.027   0.749
 316663 316664 blr1452 blr1453   ureD TRUE 0.641 33.000 0.221 1.000 N -0.595
 316664 316665 blr1453 blr1454 ureD ureA TRUE 0.932 25.000 0.664 0.003 N -0.595
 316665 316666 blr1454 blr1455 ureA ureB TRUE 0.946 113.000 0.595 0.001 Y 0.452
 316666 316667 blr1455 blr1456 ureB   TRUE 0.904 4.000 0.029 1.000   0.081
 316667 316668 blr1456 blr1457   ureC FALSE 0.480 35.000 0.019 1.000   0.156
 316668 316669 blr1457 bsr1458 ureC   FALSE 0.467 122.000 0.010 1.000   0.785
 316669 316670 bsr1458 blr1459   ureF FALSE 0.006 664.000 0.000 1.000   0.452
 316670 316671 blr1459 blr1460 ureF ureG TRUE 0.828 160.000 0.283 0.003 Y -0.061
 316671 316672 blr1460 blr1461 ureG   FALSE 0.083 299.000 0.010 NA N 0.697
 316673 316674 bll1462 bll1463     FALSE 0.165 110.000 0.000 NA N 0.509
 316674 316675 bll1463 bll1464     FALSE 0.414 64.000 0.000 NA   0.670
 316675 316676 bll1464 bll1465     FALSE 0.387 98.000 0.000 NA   0.797
 316676 316677 bll1465 bll1466     TRUE 0.797 52.000 0.182 NA   0.810
 316677 316678 bll1466 bll1467     TRUE 0.978 -3.000 0.000 NA   0.863
 316679 316680 blr1468 blr1469     TRUE 0.985 18.000 1.000 NA   0.976
 316681 316682 bll1470 bll1471     FALSE 0.287 263.000 0.000 0.010 Y -0.098
 316684 316685 bsl1473 bll1474   glcB FALSE 0.109 125.000 0.030 NA   -0.765
 316685 316686 bll1474 bll1475 glcB nodQ FALSE 0.030 398.000 0.000 1.000 N 0.753
 316686 316687 bll1475 bll1476 nodQ cysD TRUE 0.987 21.000 0.830 0.000 N 0.953
 316688 316689 blr1477 blr1478     TRUE 0.991 -3.000 0.082 NA   0.968
 316689 316690 blr1478 blr1479     TRUE 0.975 29.000 0.919 NA   0.956
 316690 316691 blr1479 blr1480     TRUE 0.984 -13.000 0.309 NA   0.985
 316691 316692 blr1480 blr1481   cysH TRUE 0.993 -3.000 0.139 NA   0.983
 316692 316693 blr1481 blr1482 cysH   TRUE 0.548 113.000 0.019 1.000 N 0.977
 316693 316694 blr1482 blr1483     TRUE 0.874 38.000 0.097 0.001 N 0.823
 316694 316695 blr1483 blr1484     TRUE 0.992 12.000 0.935 0.000 N 0.764
 316695 316696 blr1484 blr1485     TRUE 0.991 -10.000 0.070 1.000 Y 0.877
 316696 316697 blr1485 blr1486     TRUE 0.683 18.000 0.143 NA   -0.516
 316697 316698 blr1486 blr1487     TRUE 0.685 79.000 0.333 NA   0.386
 316698 316699 blr1487 blr1488   bdhA TRUE 0.977 2.000 0.167 1.000   0.457
 316700 316701 bll1489 bll1490     FALSE 0.155 189.000 0.000 0.065   0.191
 316701 316702 bll1490 bll1491     FALSE 0.150 220.000 0.081 NA   0.162
 316704 316705 bll1493 bll1494 tfdA bdhA TRUE 0.785 99.000 0.150 1.000 Y 0.320
 316706 316707 blr1495 blr1496     FALSE 0.014 73.000 0.000 NA   -0.127
 316708 316709 bll1497 bll1498     FALSE 0.182 182.000 0.115 NA   -0.408
 316713 316714 bll1502 bll1503   qor FALSE 0.352 182.000 0.143 1.000 N 0.472
 316715 316716 bsr1504 bsr1505     FALSE 0.002 254.000 0.000 NA   -0.492
 316716 316717 bsr1505 blr1506     FALSE 0.437 64.000 0.000 NA   0.707
 316720 316721 bll1509 bll1510   motB TRUE 0.989 0.000 0.236 1.000   0.604
 316721 316722 bll1510 bll1511 motB   TRUE 0.981 5.000 0.432 NA   0.440
 316723 316724 blr1512 blr1513     FALSE 0.102 114.000 0.000 NA   0.305
 316724 316725 blr1513 bsr1514     TRUE 0.666 38.000 0.000 NA   0.916
 316725 316726 bsr1514 blr1515   acrA FALSE 0.036 159.000 0.000 NA   0.082
 316726 316727 blr1515 blr1516 acrA acrB TRUE 0.989 7.000 0.600 1.000 N 0.862
 316728 316729 bll1517 bll1518 suhB   FALSE 0.451 98.000 0.026 1.000   0.605
 316729 316730 bll1518 bll1519     TRUE 0.871 9.000 0.181 1.000   -0.671
 316730 316731 bll1519 bll1520     FALSE 0.419 130.000 0.078 1.000 N 0.580
 316731 316732 bll1520 bll1521     FALSE 0.334 240.000 0.000 0.001 Y -0.676
 316732 316733 bll1521 bll1522   pgk TRUE 0.930 55.000 0.004 0.003 Y 0.877
 316733 316734 bll1522 bll1523 pgk gapA TRUE 0.858 140.000 0.011 0.003 Y 0.930
 316734 316735 bll1523 bll1524 gapA tktA TRUE 0.834 149.000 0.439 1.000 Y 0.057
 316736 316737 bsr1525 blr1526     TRUE 0.985 -3.000 0.068 NA   0.665
 316737 316738 blr1526 blr1527     FALSE 0.010 505.000 0.034 NA   0.049
 316738 316739 blr1527 blr1528     TRUE 0.936 -7.000 0.077 NA   0.352
 316740 316741 bll1529 bll1530     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.079 Y 0.719
 316741 316742 bll1530 bll1531     TRUE 0.998 -3.000 0.143 0.079 Y 0.608
 316742 316743 bll1531 bll1532     FALSE 0.008 595.000 0.000 1.000 N 0.570
 316743 316744 bll1532 bll1533     TRUE 0.858 120.000 0.333 0.010 Y -0.368
 316745 316746 blr1534 blr1535   ruvC FALSE 0.253 240.000 0.027 1.000   0.830
 316746 316747 blr1535 blr1536 ruvC ruvA TRUE 0.928 186.000 0.451 0.009 Y 0.910
 316747 316748 blr1536 blr1537 ruvA ruvB TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.001 Y 0.872
 316748 316749 blr1537 blr1538 ruvB   FALSE 0.011 94.000 0.000 NA   -0.424
 316749 316750 blr1538 blr1539     FALSE 0.012 86.000 0.000 NA   -0.175
 316751 316752 bll1540 bll1541     FALSE 0.004 205.000 0.000 NA   -0.595
 316753 316754 blr1542 blr1543     TRUE 0.987 -3.000 0.080 0.062   0.404
 316755 316756 bll1544 bll1545     FALSE 0.004 670.000 0.000 NA   0.408
 316757 316758 blr1546 bsr1547     FALSE 0.001 811.000 0.000 NA   0.203
 316758 316759 bsr1547 blr1548     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   0.291
 316761 316762 bsr1550 blr1551 pilA2   FALSE 0.099 41.000 0.000 NA N 0.203
 316762 316763 blr1551 blr1552   mauG FALSE 0.008 389.000 0.000 NA N 0.400
 316763 316764 blr1552 bsr1553 mauG   FALSE 0.008 285.000 0.000 NA   0.081
 316764 316765 bsr1553 blr1554     FALSE 0.162 -139.000 0.000 NA   0.131
 316768 316769 bll1557 bll1558     FALSE 0.007 345.000 0.000 NA   0.175
 316769 316770 bll1558 bll1559     FALSE 0.003 308.000 0.000 NA   -0.056
 316770 316771 bll1559 bll1560     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   -0.275
 316772 316773 bsr1561 bsr1562     FALSE 0.424 -13.000 0.000 NA   0.048
 316773 316774 bsr1562 blr1563     FALSE 0.005 841.000 0.000 NA   0.580
 316774 316775 blr1563 blr1564     TRUE 0.850 10.000 0.000 NA   0.737
 316776 316777 bll1565 bll1566     TRUE 0.747 -81.000 0.000 NA   0.927
 316777 316778 bll1566 bll1567     TRUE 0.937 -12.000 0.000 NA   0.940
 316778 316779 bll1567 bll1568     FALSE 0.032 455.000 0.000 NA   0.905
 316779 316780 bll1568 bll1569     FALSE 0.229 119.000 0.000 NA   0.574
 316780 316781 bll1569 bll1570     TRUE 0.934 3.000 0.000 NA   0.649
 316784 316785 blr1573 bsr1574     TRUE 0.990 -3.000 0.300 NA   0.420
 316785 316786 bsr1574 blr1575     TRUE 0.605 182.000 0.636 NA   0.031
 316787 316788 bll1576 bll1577     TRUE 0.757 -58.000 0.182 NA   0.000
 316789 316790 blr1578 blr1579     FALSE 0.134 41.000 0.000 NA   0.119
 316791 316792 bll1580 bll1581     FALSE 0.092 291.000 0.000 NA   0.850
 316792 316793 bll1581 bll1582     FALSE 0.090 288.000 0.000 NA   0.825
 316793 316794 bll1582 bll1583     FALSE 0.172 87.000 0.000 NA   0.399
 316794 316795 bll1583 bll1584     FALSE 0.004 511.000 0.000 1.000   0.216
 316795 316796 bll1584 bll1585     TRUE 0.653 -22.000 0.000 NA   0.360
 316796 316797 bll1585 bll1586     TRUE 0.897 -162.000 0.667 NA   0.188
 316797 316798 bll1586 bll1587     FALSE 0.000 562.000 0.000 NA   -0.174
 316802 316803 bll1591 bll1592     FALSE 0.343 73.000 0.000 NA   0.618
 316803 316804 bll1592 bll1593     FALSE 0.005 912.000 0.000 NA   0.565
 316804 316805 bll1593 bll1594     TRUE 0.771 1.000 0.000 NA   0.177
 316805 316806 bll1594 bll1595     FALSE 0.395 -3.000 0.000 NA   -0.145
 316806 316807 bll1595 bsl1596     FALSE 0.000 548.000 0.000 NA   -0.372
 316807 402918 bsl1596 Bjat16   tRNA-Met FALSE 0.014 72.000 0.000 NA   NA
 402918 316808 Bjat16 bsl1597 tRNA-Met   FALSE 0.010 107.000 0.000 NA   NA
 316808 316809 bsl1597 bsl1598     FALSE 0.264 96.000 0.000 NA   0.578
 316810 316811 bsr1599 blr1600     FALSE 0.020 382.000 0.000 NA   0.540
 316811 316812 blr1600 blr1601     TRUE 0.581 33.000 0.000 1.000 N 0.708
 316812 316813 blr1601 blr1602     TRUE 1.000 -3.000 0.889 0.075 Y 0.947
 316813 316814 blr1602 blr1603     TRUE 0.999 -3.000 0.533 0.092 Y 0.616
 316814 316815 blr1603 blr1604     TRUE 0.842 -156.000 0.267 1.000   0.572
 316817 316818 blr1606 bsr1607     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   0.562
 316819 316820 bll1608 bll1609     TRUE 0.999 -3.000 0.262 0.061 Y 0.840
 316821 316822 blr1610 blr1611     TRUE 0.900 -16.000 0.000 0.011   0.442
 316822 316823 blr1611 blr1612   ardC FALSE 0.006 1071.000 0.000 NA   0.688
 316823 316824 blr1612 blr1613 ardC   FALSE 0.288 127.000 0.000 NA N 0.761
 316824 316825 blr1613 blr1614     FALSE 0.172 210.000 0.000 NA   0.718
 316825 316826 blr1614 blr1615     TRUE 0.702 -21.000 0.000 NA   0.410
 316826 316827 blr1615 blr1616     FALSE 0.210 148.000 0.000 NA   0.585
 316827 316828 blr1616 blr1617   trbL FALSE 0.310 108.000 0.000 1.000 N 0.705
 316828 316829 blr1617 blr1618 trbL trbF TRUE 0.922 93.000 0.500 1.000 Y 0.517
 316829 316830 blr1618 blr1619 trbF trbG TRUE 0.963 75.000 1.000 NA Y 0.359
 316830 316831 blr1619 blr1620 trbG trbI TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y 0.656
 316831 316832 blr1620 bsr1621 trbI   TRUE 0.985 6.000 0.667 NA   0.332
 316832 316833 bsr1621 bsr1622     FALSE 0.320 49.000 0.000 NA   0.458
 316834 316835 bll1623 bsl1624     FALSE 0.001 2190.000 0.000 NA   0.281
 316836 316837 blr1625 blr1626     FALSE 0.163 151.000 0.000 NA   0.497
 316837 316838 blr1626 blr1627     TRUE 0.947 -42.000 0.395 0.001   -0.116
 316838 316839 blr1627 bsr1628     TRUE 0.940 -19.000 0.003 0.001   0.523
 316839 316840 bsr1628 blr1629     FALSE 0.001 780.000 0.000 NA   0.079
 316841 316842 bll1630 bll1631 nolK noeL TRUE 0.994 -28.000 0.286 0.012 Y 0.892
 316843 316844 blr1632 blr1633 nodM noeD FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   0.071
 316847 316848 bll1636 bsl1637     FALSE 0.229 30.000 0.000 NA   0.223
 316852 316853 bll1641 bll1642     TRUE 0.991 6.000 0.333 1.000 Y 0.274
 316853 316854 bll1642 bll1643     FALSE 0.118 129.000 0.000 1.000   0.303
 316855 316856 blr1644 blr1645     FALSE 0.000 940.000 0.000 NA N -0.260
 316856 316857 blr1645 bsr1646     TRUE 0.956 -31.000 0.000 NA Y 0.692
 316858 316859 bll1647 bll1648     FALSE 0.012 391.000 0.000 NA   0.414
 316860 316861 blr1649 blr1650     FALSE 0.458 29.000 0.000 NA   0.502
 316862 316863 bsl1651 bsl1652     FALSE 0.320 38.000 0.000 NA   0.404
 316866 316867 blr1655 blr1656     FALSE 0.009 289.000 0.000 1.000   -0.035
 316867 316868 blr1656 blr1657     FALSE 0.015 324.000 0.000 1.000   0.245
 316868 316869 blr1657 blr1658     FALSE 0.000 583.000 0.000 NA   -0.681
 316869 316870 blr1658 blr1659     FALSE 0.387 131.000 0.000 NA   0.917
 316872 316873 blr1661 bsr1662     FALSE 0.011 96.000 0.000 NA   NA
 316873 316874 bsr1662 blr1663     FALSE 0.001 427.000 0.000 NA   NA
 316874 316875 blr1663 blr1664     FALSE 0.339 17.000 0.000 NA   0.233
 316875 316876 blr1664 blr1665     TRUE 0.823 -10.000 0.000 NA   0.474
 316876 316877 blr1665 blr1666     FALSE 0.395 -3.000 0.000 NA   -0.259
 316877 316878 blr1666 blr1667     TRUE 0.903 -3.000 0.000 NA   0.347
 316879 316880 bll1668 bll1669     TRUE 0.949 3.000 0.080 1.000   0.175
 316881 316882 blr1670 blr1671     TRUE 0.984 -13.000 0.286 0.010   0.642
 316882 316883 blr1671 blr1672     TRUE 0.959 13.000 0.600 NA   0.378
 316883 316884 blr1672 blr1673     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   0.351
 402917 316885 Bjat17 bll1674 tRNA-Met   FALSE 0.009 123.000 0.000 NA   NA
 316885 316886 bll1674 bll1675     FALSE 0.017 113.000 0.000 NA   -0.076
 316887 316888 blr1676 bsr1677     FALSE 0.093 165.000 0.000 NA   0.352
 316890 316891 blr1679 blr1680     TRUE 0.985 -3.000 0.148 0.075   -0.027
 316891 316892 blr1680 blr1681     FALSE 0.082 166.000 0.000 NA N 0.406
 316892 316893 blr1681 bsr1682     TRUE 0.755 96.000 0.000 NA Y 0.825
 316893 316894 bsr1682 bsr1683     FALSE 0.000 473.000 0.000 NA   -0.818
 316895 316896 bll1684 bll1685     FALSE 0.261 3.000 0.000 NA   -0.203
 316898 316899 bll1687 bll1688     TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA   0.936
 316900 316901 blr1689 bsr1690     TRUE 0.969 -3.000 0.000 NA   0.718
 316901 316902 bsr1690 blr1691     FALSE 0.051 -51.000 0.000 NA   -0.526
 316902 316903 blr1691 blr1692     TRUE 0.987 6.000 0.333 1.000 Y -0.682
 316903 316904 blr1692 blr1693     FALSE 0.169 180.000 0.000 1.000   0.537
 316907 316908 bsl1696 bll1697     FALSE 0.000 1316.000 0.000 NA   -0.411
 316909 316910 blr1698 blr1699     TRUE 0.685 20.000 0.000 NA   0.708
 316910 316911 blr1699 blr1700     TRUE 0.681 54.000 0.000 NA Y 0.021
 316915 316916 blr1704 blr1705     FALSE 0.130 273.000 0.000 NA   0.949
 316916 316917 blr1705 blr1706     FALSE 0.001 350.000 0.000 1.000   NA
 316917 316918 blr1706 blr1707     TRUE 0.948 -39.000 0.667 1.000   NA
 316921 316922 bll1710 bll1711     TRUE 0.988 6.000 0.333 1.000 Y -0.246
 2209637 316925 bsl1713 bll1714   nodW TRUE 0.673 82.000 0.000 0.023 Y -0.341
 316925 316926 bll1714 bll1715 nodW nodV TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.028 Y 0.195
 316927 316928 blr1716 blr1717     TRUE 0.579 76.000 0.000 0.061   0.760
 316930 316931 blr1719 blr1720 modB hupS FALSE 0.001 646.000 0.000 1.000 N 0.049
 316931 316932 blr1720 blr1721 hupS hupL TRUE 0.996 14.000 0.611 0.001 Y 0.890
 316932 316933 blr1721 blr1722 hupL hupC TRUE 0.982 -37.000 0.355 0.077 Y -0.067
 316933 316934 blr1722 bsr1723 hupC hupD TRUE 0.736 35.000 0.177 1.000   0.352
 316934 316935 bsr1723 blr1724 hupD   TRUE 0.976 3.000 0.000 0.000   0.693
 316935 316936 blr1724 bsr1725   hupF TRUE 0.971 3.000 0.308 NA   -0.318
 316936 316937 bsr1725 blr1726 hupF   FALSE 0.006 181.000 0.000 NA   -0.442
 316937 316938 blr1726 blr1727   hupH FALSE 0.010 302.000 0.000 NA   0.163
 316938 316939 blr1727 blr1728 hupH hupK FALSE 0.417 92.000 0.000 NA   0.824
 316939 316940 blr1728 bsr1729 hupK   FALSE 0.010 457.000 0.000 NA   0.479
 316940 316941 bsr1729 blr1730   hypA TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   0.232
 316941 316942 blr1730 blr1731 hypA hypB TRUE 0.986 0.000 0.000 0.003   0.876
 316942 316943 blr1731 blr1732 hypB   TRUE 0.737 -54.000 0.000 0.003   0.342
 316943 316944 blr1732 blr1733     FALSE 0.132 -16.000 0.000 1.000   NA
 316944 316945 blr1733 blr1734     TRUE 0.997 -3.000 0.262 0.060 Y NA
 316945 316946 blr1734 blr1735   hypF FALSE 0.002 284.000 0.000 1.000 N -0.266
 316946 316947 blr1735 blr1736 hypF hypD FALSE 0.160 -12.000 0.000 1.000 N -0.546
 316947 316948 blr1736 blr1737 hypD hypE TRUE 0.994 -3.000 0.085 1.000 Y 0.141
 316948 316949 blr1737 blr1738 hypE aldA FALSE 0.008 385.000 0.000 1.000 N 0.311
 316949 316950 blr1738 bsr1739 aldA   FALSE 0.004 539.000 0.000 0.077   -0.757
 316950 316951 bsr1739 blr1740     FALSE 0.361 144.000 0.000 1.000   0.825
 316952 316953 bll1741 bll1742     TRUE 0.997 -3.000 0.262 0.060 Y -0.124
 316954 316955 blr1743 blr1744 nifD nifK TRUE 0.989 66.000 0.902 0.001 Y 0.919
 316955 316956 blr1744 blr1745 nifK nifE TRUE 0.957 93.000 0.380 0.001 Y 0.829
 316956 316957 blr1745 blr1746 nifE nifN TRUE 0.996 10.000 0.475 0.001 Y 0.851
 316957 316958 blr1746 blr1747 nifN nifX TRUE 0.999 -3.000 0.663 0.001   0.962
 316958 316959 blr1747 blr1748 nifX   TRUE 0.978 7.000 0.309 NA   0.800
 316959 316960 blr1748 bsr1749     TRUE 0.877 53.000 0.486 NA   0.666
 316960 316961 bsr1749 bsr1750   fer3 TRUE 0.919 11.000 0.253 NA   0.327
 316963 316964 blr1752 blr1753     FALSE 0.008 599.000 0.000 NA   0.554
 316966 316967 blr1755 blr1756   nifS FALSE 0.001 324.000 0.000 1.000   -0.527
 316967 316968 blr1756 bsr1757 nifS fixU TRUE 0.987 -3.000 0.057 1.000 N 0.789
 316968 316969 bsr1757 bsr1758 fixU   FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   -0.023
 316969 316970 bsr1758 blr1759   nifB FALSE 0.250 88.000 0.000 NA   0.531
 316970 316971 blr1759 bsr1760 nifB frxA TRUE 0.841 11.000 0.061 1.000   0.320
 316971 316972 bsr1760 blr1761 frxA nifZ TRUE 0.974 2.000 0.015 1.000   0.742
 316974 316975 blr1763 bsr1764     FALSE 0.030 273.000 0.000 NA   0.388
 316975 316976 bsr1764 blr1765   fer2 FALSE 0.347 151.000 0.000 NA   0.855
 316977 316978 bll1766 bll1767     FALSE 0.032 363.000 0.000 1.000 N 0.674
 316979 316980 blr1768 blr1769   nifH FALSE 0.043 182.000 0.000 NA   0.172
 316980 316981 blr1769 blr1770 nifH nifQ TRUE 0.689 105.000 0.047 0.002   0.796
 316981 316982 blr1770 blr1771 nifQ nifW FALSE 0.009 655.000 0.000 0.002   0.030
 316984 316985 blr1773 blr1774 fixB fixC TRUE 0.987 12.000 0.491 0.077 Y 0.031
 316985 316986 blr1774 bsr1775 fixC fixX TRUE 0.980 39.000 0.461 0.077 Y 0.828
 316987 316988 bll1776 bll1777 ahpD ahpC TRUE 0.842 7.000 0.095 1.000   -0.812
 316988 316989 bll1777 bll1778 ahpC   FALSE 0.054 -48.000 0.000 NA   -0.535
 316989 316990 bll1778 bll1779     FALSE 0.174 121.000 0.000 NA   0.478
 316990 316991 bll1779 bll1780     FALSE 0.378 18.000 0.000 1.000 N 0.317
 316992 316993 blr1781 blr1782     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 316993 316994 blr1782 blr1783     TRUE 0.890 73.000 0.500 NA Y NA
 316994 316995 blr1783 bsr1784     FALSE 0.019 56.000 0.000 NA   NA
 316995 316996 bsr1784 blr1785     FALSE 0.003 565.000 0.000 NA   0.227
 316998 316999 blr1787 blr1788     FALSE 0.035 190.000 0.000 NA   0.143
 316999 317000 blr1788 blr1789     FALSE 0.120 8.000 0.000 NA   -0.156
 317001 317002 bll1790 bll1791     TRUE 0.589 55.000 0.000 NA   0.898
 317002 317003 bll1791 bll1792     FALSE 0.000 536.000 0.000 NA   -0.356
 317003 317004 bll1792 bll1793     TRUE 0.827 -88.000 0.000 0.004   0.840
 317004 317005 bll1793 bll1794     TRUE 0.996 0.000 0.598 0.004   0.381
 317005 317006 bll1794 bll1795     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.004   0.693
 317006 317007 bll1795 bll1796     FALSE 0.007 787.000 0.000 NA   0.633
 317007 317008 bll1796 bll1797     TRUE 0.796 -25.000 0.000 NA   0.587
 317008 317009 bll1797 bll1798     FALSE 0.246 21.000 0.000 NA   0.164
 317009 317010 bll1798 bll1799     FALSE 0.095 125.000 0.000 NA   0.302
 317010 317011 bll1799 bll1800   rhcV TRUE 0.544 31.000 0.071 1.000   -0.163
 317011 317012 bll1800 bll1801 rhcV   FALSE 0.111 10.000 0.000 1.000   -0.339
 317012 317013 bll1801 bll1802     FALSE 0.261 3.000 0.000 NA   -0.734
 317013 317014 bll1802 bll1803     TRUE 0.631 34.000 0.000 NA   0.791
 317014 317015 bll1803 bll1804     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   -0.126
 317015 317016 bll1804 bll1805     FALSE 0.065 98.000 0.000 NA   0.131
 317017 317018 blr1806 blr1807     FALSE 0.195 155.000 0.000 NA   0.567
 317021 317022 bll1810 bll1811   rhcC1 FALSE 0.028 281.000 0.000 1.000   0.331
 317023 317024 blr1812 blr1813 nolB rhcJ TRUE 0.992 9.000 1.000 NA   0.797
 317024 317025 blr1813 blr1814 rhcJ nolU TRUE 0.990 12.000 1.000 NA   0.887
 317025 317026 blr1814 blr1815 nolU nolV TRUE 0.995 -3.000 0.429 NA   0.643
 317026 317027 blr1815 blr1816 nolV rhcN TRUE 0.999 -3.000 0.429 1.000 Y 0.828
 317027 317028 blr1816 blr1817 rhcN   TRUE 0.989 -24.000 0.750 NA   0.806
 317028 317029 blr1817 blr1818   rhcQ TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   0.737
 317029 317030 blr1818 blr1819 rhcQ rhcR TRUE 0.999 -7.000 1.000 1.000 Y 0.703
 317030 317031 blr1819 bsr1820 rhcR rhcS TRUE 0.998 3.000 0.500 0.012 Y 0.611
 317031 317032 bsr1820 blr1821 rhcS rhcT TRUE 0.989 11.000 0.500 1.000 Y 0.409
 317032 317033 blr1821 blr1822 rhcT rhcU TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.063 Y 0.555
 317034 317035 bll1823 bll1824     TRUE 0.863 -382.000 0.000 NA Y 0.784
 317040 317041 blr1829 blr1830     FALSE 0.000 1004.000 0.000 NA   NA
 317041 317042 blr1830 bsr1831     FALSE 0.004 835.000 0.000 NA   0.475
 317044 317045 blr1833 blr1834     FALSE 0.012 83.000 0.000 NA   -0.392
 317045 317046 blr1834 blr1835     TRUE 0.987 6.000 0.333 1.000 Y NA
 317048 317049 blr1837 blr1838     FALSE 0.002 568.000 0.000 1.000   0.001
 317049 317050 blr1838 blr1839     TRUE 0.544 -52.000 0.000 NA   0.473
 317051 317052 bll1840 bll1841     FALSE 0.054 196.000 0.000 NA   0.297
 317052 317053 bll1841 bll1842   rhcC2 TRUE 0.953 11.000 0.275 NA N 0.736
 317053 317054 bll1842 bll1843 rhcC2 basR FALSE 0.219 189.000 0.075 1.000 N 0.317
 317054 317055 bll1843 bll1844 basR   FALSE 0.261 40.000 0.000 NA   0.336
 317055 317056 bll1844 bsl1845     FALSE 0.188 217.000 0.000 NA   0.793
 317056 317057 bsl1845 bll1846     FALSE 0.007 1201.000 0.000 NA   0.762
 317059 317060 bll1848 bsl1849     FALSE 0.003 566.000 0.000 NA   0.279
 317061 317062 blr1850 blr1851     FALSE 0.111 -22.000 0.000 NA   -0.364
 317062 317063 blr1851 blr1852     FALSE 0.010 185.000 0.000 NA   -0.078
 317063 317064 blr1852 blr1853     FALSE 0.015 551.000 0.000 1.000 N 0.747
 317064 317065 blr1853 blr1854     FALSE 0.027 427.000 0.000 NA   0.759
 317066 317067 bll1855 bsl1856     FALSE 0.008 143.000 0.000 NA   -0.208
 317067 317068 bsl1856 bsl1857     FALSE 0.105 78.000 0.000 NA   0.215
 317068 317069 bsl1857 bll1858     FALSE 0.125 234.000 0.000 NA   0.695
 317071 317072 bll1860 bll1861     TRUE 0.590 -150.000 0.000 NA   0.728
 317072 317073 bll1861 bll1862     FALSE 0.105 225.000 0.000 NA   0.581
 317076 317077 blr1865 blr1866     FALSE 0.210 20.000 0.000 NA   0.105
 317077 317078 blr1866 blr1867     FALSE 0.196 -279.000 0.000 NA   0.247
 317078 317079 blr1867 blr1868     FALSE 0.019 171.000 0.000 NA   -0.017
 317079 317080 blr1868 blr1869     FALSE 0.000 1094.000 0.000 NA   -0.662
 317081 317082 bsl1870 bsl1871     FALSE 0.013 517.000 0.000 NA   0.645
 317082 317083 bsl1871 bll1872     FALSE 0.047 330.000 0.000 NA   0.712
 317084 317085 blr1873 bsr1874     FALSE 0.482 96.000 0.000 NA Y NA
 317089 317090 bsr1878 blr1879     FALSE 0.004 1107.000 0.000 NA   0.544
 317090 317091 blr1879 blr1880     FALSE 0.005 1124.000 0.000 1.000   0.603
 317091 317092 blr1880 blr1881     FALSE 0.001 763.000 0.000 NA   0.038
 317092 317093 blr1881 blr1882     FALSE 0.049 261.000 0.000 NA   0.473
 317093 317094 blr1882 blr1883   rpoN1 FALSE 0.003 465.000 0.000 NA   0.168
 317096 317097 bsr1885 bsr1886     FALSE 0.030 32.000 0.000 NA   -0.512
 317097 317098 bsr1886 bsr1887     FALSE 0.000 808.000 0.000 NA   -0.600
 317098 317099 bsr1887 blr1888     FALSE 0.040 180.000 0.000 NA   0.145
 317099 317100 blr1888 blr1889     FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   -0.170
 317100 317101 blr1889 blr1890     TRUE 0.965 70.000 0.783 0.073 Y 0.239
 317101 317102 blr1890 blr1891     TRUE 0.993 13.000 0.950 0.073 Y -0.587
 317102 317103 blr1891 blr1892   rbsK TRUE 0.993 -3.000 0.100 1.000 Y -0.559
 317103 317104 blr1892 blr1893 rbsK fabG TRUE 0.968 -3.000 0.167 1.000 N -0.492
 317104 317105 blr1893 blr1894 fabG   TRUE 0.903 -7.000 0.021 0.098 N -0.166
 317105 317106 blr1894 blr1895     TRUE 0.988 0.000 0.021 1.000 Y -0.050
 317106 317107 blr1895 blr1896     FALSE 0.515 -46.000 0.000 0.092 N 0.033
 317108 317109 bll1897 bll1898     FALSE 0.042 329.000 0.000 1.000   0.612
 317109 317110 bll1898 bll1899     FALSE 0.124 114.000 0.000 1.000   0.283
 317110 317111 bll1899 bll1900     TRUE 0.958 -39.000 0.667 1.000   0.084
 317112 317113 blr1901 blr1902     FALSE 0.336 130.000 0.000 NA   0.808
 317113 317114 blr1902 bsr1903     FALSE 0.000 532.000 0.000 NA   -0.204
 317114 317115 bsr1903 blr1904     FALSE 0.000 627.000 0.000 NA   -0.688
 317115 317116 blr1904 blr1905     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   0.116
 317120 317121 bsr1909 bsr1910     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   0.610
 317121 317122 bsr1910 blr1911     FALSE 0.000 1530.000 0.000 NA   NA
 317122 317123 blr1911 blr1912     FALSE 0.049 18.000 0.000 NA   NA
 317123 317124 blr1912 blr1913     FALSE 0.004 421.000 0.000 NA   0.182
 317124 317125 blr1913 blr1914     TRUE 0.747 -256.000 0.000 NA Y 0.159
 317125 317126 blr1914 blr1915     FALSE 0.060 388.000 0.000 1.000 Y -0.388
 317126 317127 blr1915 blr1916     TRUE 0.671 124.000 0.000 1.000 Y 0.643
 317128 317129 bll1917 bll1918     FALSE 0.003 590.000 0.000 NA   0.321
 317129 317130 bll1918 bll1919     FALSE 0.304 48.000 0.000 NA   0.435
 317130 317131 bll1919 bll1920     FALSE 0.164 173.000 0.009 NA   0.316
 317131 317132 bll1920 bll1921     TRUE 0.948 3.000 0.000 NA   0.741
 317133 317134 blr1922 blr1923     TRUE 0.997 -3.000 0.262 0.060 Y NA
 317135 317136 bll1924 bll1925     FALSE 0.492 9.000 0.000 NA   0.176
 317136 317137 bll1925 bll1926     TRUE 0.931 8.000 0.230 NA   0.270
 317137 317138 bll1926 bll1927     FALSE 0.188 78.000 0.000 NA   0.400
 317138 317139 bll1927 bll1928     TRUE 0.622 -214.000 0.050 NA   0.500
 317139 317140 bll1928 bll1929     FALSE 0.325 163.000 0.000 NA   0.855
 317140 317141 bll1929 bll1930     FALSE 0.474 -187.000 0.000 NA   0.591
 317142 317143 blr1931 blr1932     FALSE 0.462 117.000 0.250 NA   0.063
 317143 317144 blr1932 blr1933     FALSE 0.000 786.000 0.000 1.000   -0.437
 317144 317145 blr1933 blr1934     FALSE 0.026 38.000 0.000 NA   -0.435
 317145 317146 blr1934 blr1935     TRUE 0.868 0.000 0.000 NA   0.330
 317146 317147 blr1935 blr1936     FALSE 0.016 331.000 0.000 NA   0.366
 317148 317149 bsl1937 bll1938     TRUE 0.694 -181.000 0.000 0.092   0.722
 317149 317150 bll1938 bsl1939     FALSE 0.295 58.000 0.000 0.092   0.013
 317150 317151 bsl1939 bll1940     FALSE 0.024 268.000 0.000 1.000   0.207
 317151 317152 bll1940 bsl1941     FALSE 0.152 -97.000 0.000 NA   0.089
 317152 317153 bsl1941 bll1942     FALSE 0.090 91.000 0.000 NA   0.204
 317153 317154 bll1942 bll1943     FALSE 0.028 402.000 0.000 NA   0.722
 317154 317155 bll1943 bll1944     FALSE 0.040 195.000 0.000 1.000   0.074
 317159 317160 bll1948 bll1949     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   -0.520
 317163 317164 blr1952 blr1953     FALSE 0.036 -84.000 0.000 NA   NA
 317164 317165 blr1953 blr1954     FALSE 0.000 451.000 0.000 NA   -0.258
 317165 317166 blr1954 blr1955     FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   -0.254
 317166 317167 blr1955 bsr1956     FALSE 0.000 801.000 0.000 NA   -0.573
 317170 317171 bll1959 bll1960     FALSE 0.174 141.000 0.000 0.059   -0.070
 317172 317173 blr1961 bsr1962     TRUE 0.784 -12.000 0.000 NA   0.424
 317179 317180 blr1968 blr1969     FALSE 0.268 -174.000 0.000 NA   0.330
 317180 317181 blr1969 blr1970     FALSE 0.002 255.000 0.000 NA   -0.180
 317181 317182 blr1970 blr1971     FALSE 0.025 370.000 0.000 NA   0.599
 317182 317183 blr1971 bsr1972     FALSE 0.156 206.000 0.000 1.000   0.615
 317184 317185 bll1973 bll1974     TRUE 0.690 -49.000 0.000 NA   0.644
 317186 317187 blr1975 bsr1976     TRUE 0.716 9.000 0.000 NA   0.442
 317188 317189 bll1977 bll1978     FALSE 0.009 701.000 0.000 NA   0.657
 317189 317190 bll1978 bll1979     FALSE 0.037 47.000 0.000 NA   -0.083
 317190 317191 bll1979 bll1980     TRUE 0.641 -237.000 0.000 NA   0.876
 317191 317192 bll1980 bll1981     FALSE 0.131 91.000 0.000 NA   0.325
 317193 317194 bsr1982 bsr1983     FALSE 0.115 -21.000 0.000 NA   -0.203
 317194 317195 bsr1983 blr1984     FALSE 0.012 83.000 0.000 NA   -0.144
 317196 317197 bll1985 bsl1986 hipA   TRUE 0.993 0.000 0.556 NA   0.340
 317197 317198 bsl1986 bsl1987     FALSE 0.487 55.000 0.000 NA   0.716
 317199 317200 blr1988 blr1989     TRUE 0.981 -10.000 0.667 NA   -0.250
 317200 317201 blr1989 blr1990     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   -0.230
 317201 317202 blr1990 blr1991     TRUE 0.911 3.000 0.000 0.091   0.192
 317202 317203 blr1991 blr1992     FALSE 0.001 488.000 0.000 NA   -0.055
 317203 317204 blr1992 blr1993     FALSE 0.003 718.000 0.000 NA   0.322
 317204 317205 blr1993 blr1994     FALSE 0.025 218.000 0.000 1.000   -0.008
 317205 317206 blr1994 blr1995     FALSE 0.000 1140.000 0.000 NA   -0.077
 317207 317208 bll1996 bll1997     TRUE 0.948 -39.000 0.667 1.000   NA
 317209 317210 blr1998 bsr1999     FALSE 0.002 1624.000 0.000 NA   0.356
 317213 317214 bll2002 bll2003     FALSE 0.392 132.000 0.000 NA   0.934
 317214 317215 bll2003 bll2004     TRUE 0.608 -88.000 0.000 NA   0.682
 317216 317217 bsr2005 blr2006     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   -0.326
 317221 317222 bsr2010 blr2011     TRUE 0.877 -28.000 0.000 NA   0.853
 317225 317226 bsl2014 bsl2015   nolZ FALSE 0.013 630.000 0.000 NA   0.773
 317226 317227 bsl2015 bll2016 nolZ nolY FALSE 0.148 107.000 0.000 NA   0.402
 317227 317228 bll2016 bll2017 nolY   FALSE 0.004 1063.000 0.000 NA   0.568
 317228 317229 bll2017 bll2018     FALSE 0.165 107.000 0.000 NA   0.439
 317229 317230 bll2018 bll2019   nolA FALSE 0.457 53.000 0.000 1.000   0.610
 317230 317231 bll2019 bsl2020 nolA   FALSE 0.056 192.000 0.000 NA   0.289
 317231 317232 bsl2020 bll2021   nodD2 FALSE 0.000 605.000 0.000 NA   -0.108
 317235 317236 blr2024 blr2025 nodY nodA FALSE 0.024 42.000 0.000 NA   -0.630
 317236 317237 blr2025 blr2026 nodA nodB TRUE 0.965 -3.000 0.121 1.000   -0.532
 317237 317238 blr2026 blr2027 nodB nodC TRUE 0.861 15.000 0.120 1.000 N 0.561
 317238 317239 blr2027 blr2028 nodC nodS TRUE 0.752 29.000 0.048 1.000   0.624
 317239 317240 blr2028 blr2029 nodS nodU TRUE 0.967 14.000 0.700 1.000   0.413
 317240 317241 blr2029 blr2030 nodU nodI TRUE 0.930 2.000 0.000 1.000 N 0.596
 317241 317242 blr2030 blr2031 nodI nodJ TRUE 0.996 4.000 0.643 0.001 N 0.743
 317242 317243 blr2031 bsr2032 nodJ nolM TRUE 0.548 33.000 0.000 NA   0.646
 317243 317244 bsr2032 blr2033 nolM nolN TRUE 0.551 38.000 0.000 NA   0.702
 317244 317245 blr2033 blr2034 nolN nolO TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   0.414
 317245 317246 blr2034 blr2035 nolO nodZ FALSE 0.156 166.000 0.000 1.000   0.466
 317246 317247 blr2035 blr2036 nodZ fixR FALSE 0.000 729.000 0.000 1.000   -0.711
 317247 317248 blr2036 blr2037 fixR nifA FALSE 0.006 184.000 0.000 1.000 N -0.627
 317248 317249 blr2037 blr2038 nifA fixA FALSE 0.009 518.000 0.000 1.000 N 0.536
 317249 317250 blr2038 blr2039 fixA   FALSE 0.178 133.000 0.000 NA   0.513
 317252 317253 blr2041 blr2042     TRUE 0.916 -15.000 0.000 1.000   0.809
 317253 317254 blr2042 blr2043     FALSE 0.001 301.000 0.000 1.000   NA
 317254 317255 blr2043 blr2044     FALSE 0.024 43.000 0.000 NA   NA
 317256 317257 bll2045 bll2046     FALSE 0.034 28.000 0.000 NA   -0.434
 317257 317258 bll2046 bll2047     FALSE 0.014 351.000 0.000 NA   0.371
 317258 317259 bll2047 bsl2048     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   0.301
 317259 317260 bsl2048 bll2049   trpD FALSE 0.178 192.000 0.000 NA   0.660
 317260 317261 bll2049 bsl2050 trpD   FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   0.196
 317262 317263 bsr2051 blr2052     FALSE 0.000 1509.000 0.000 NA   -0.022
 317263 317264 blr2052 blr2053     FALSE 0.067 126.000 0.000 1.000   0.069
 317264 317265 blr2053 blr2054     TRUE 0.972 -22.000 0.444 0.059   0.079
 317265 317266 blr2054 blr2055     FALSE 0.019 478.000 0.000 NA   0.711
 317266 317267 blr2055 blr2056     TRUE 0.528 -322.000 0.000 NA   0.698
 317267 317268 blr2056 blr2057     FALSE 0.000 1082.000 0.000 NA   -0.424
 317268 317269 blr2057 blr2058     FALSE 0.011 611.000 0.000 NA   0.681
 317270 317271 bll2059 bll2060 groEL3 groES3 TRUE 0.870 83.000 0.000 0.005 Y 0.917
 317272 317273 bsr2061 blr2062   noeI FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   0.089
 317274 317275 bll2063 bsl2064 nrgC   FALSE 0.001 1222.000 0.000 NA   0.067
 317275 317276 bsl2064 bll2065   icfA FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   -0.106
 317276 317277 bll2065 bll2066 icfA   TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 N 0.758
 317277 317278 bll2066 bll2067   nfeC FALSE 0.000 1060.000 0.000 NA   -0.045
 317279 317280 blr2068 blr2069 (EC 2.1.1.14)   FALSE 0.429 108.000 0.000 NA   0.926
 317282 317283 blr2071 bsr2072     FALSE 0.007 797.000 0.000 NA   0.631
 317283 317284 bsr2072 blr2073     FALSE 0.000 2142.000 0.000 NA   0.002
 317284 317285 blr2073 blr2074     FALSE 0.343 103.000 0.000 NA   0.738
 317287 317288 blr2076 blr2077     FALSE 0.001 345.000 0.000 1.000   NA
 317288 317289 blr2077 blr2078     TRUE 0.985 -3.000 0.021 0.014   0.464
 317289 317290 blr2078 blr2079     TRUE 0.807 48.000 0.016 0.001   0.773
 317290 317291 blr2079 blr2080   rtxC TRUE 0.693 32.000 0.021 1.000   0.601
 317291 317292 blr2080 blr2081 rtxC   TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   0.437
 317292 317293 blr2081 blr2082     FALSE 0.291 53.000 0.000 1.000   0.376
 317293 317294 blr2082 blr2083     TRUE 0.841 -3.000 0.000 1.000   0.066
 317294 317295 blr2083 blr2084     TRUE 0.896 0.000 0.000 1.000   0.330
 317296 317297 bll2085 bsl2086     FALSE 0.006 280.000 0.000 NA   0.018
 317297 317298 bsl2086 bll2087     FALSE 0.000 671.000 0.000 NA   -0.198
 317299 317300 bsr2088 blr2089     TRUE 0.972 -3.000 0.000 NA   0.759
 317300 317301 blr2089 blr2090     FALSE 0.003 237.000 0.000 NA   -0.495
 317302 317303 bll2091 bll2092 pabA pabB TRUE 0.960 30.000 0.054 0.000 Y 0.732
 317303 317304 bll2092 bll2093 pabB   FALSE 0.110 139.000 0.000 NA   0.361
 317304 317305 bll2093 bll2094     FALSE 0.086 136.000 0.000 NA   0.289
 317306 317307 blr2095 blr2096 bioB panD TRUE 0.909 50.000 0.003 1.000 Y 0.982
 317307 317308 blr2096 blr2097 panD bioF TRUE 0.665 77.000 0.000 1.000 Y 0.336
 317308 317309 blr2097 blr2098 bioF bioD TRUE 0.997 -3.000 0.176 1.000 Y 0.505
 317309 317310 blr2098 blr2099 bioD bioA TRUE 0.998 -3.000 0.124 0.000 Y 0.764
 317310 317311 blr2099 blr2100 bioA   FALSE 0.003 895.000 0.000 NA   0.403
 317311 317312 blr2100 blr2101   panB TRUE 0.539 17.000 0.000 NA   0.456
 317312 317313 blr2101 blr2102 panB panC TRUE 0.996 4.000 0.395 0.001 Y -0.489
 317313 317314 blr2102 blr2103 panC   FALSE 0.070 13.000 0.000 NA   -0.228
 317316 317317 bsr2105 blr2106   ectC FALSE 0.001 733.000 0.000 NA   -0.006
 317321 317322 bsr2110 bsr2111     TRUE 0.687 -31.000 0.000 NA   0.474
 317324 317325 blr2113 blr2114     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA   0.987
 317325 317326 blr2114 blr2115     TRUE 0.861 13.000 0.000 NA   0.971
 317327 317328 bll2116 bll2117     TRUE 0.999 -3.000 0.262 0.059 Y 0.714
 317329 317330 blr2118 blr2119     TRUE 0.649 46.000 0.000 NA   0.958
 317331 317332 bsl2120 bll2121 cspA   FALSE 0.008 136.000 0.000 NA   -0.296
 317333 317334 blr2122 blr2123     FALSE 0.003 496.000 0.000 NA   0.158
 317334 317335 blr2123 blr2124     TRUE 0.912 -3.000 0.000 NA   0.374
 317336 317337 bll2125 bll2126     FALSE 0.218 194.000 0.000 NA   0.767
 317340 317341 bsr2129 blr2130     FALSE 0.010 110.000 0.000 NA   -0.809
 317341 317342 blr2130 blr2131     FALSE 0.029 317.000 0.000 1.000   0.450
 317342 317343 blr2131 blr2132     TRUE 0.959 -3.000 0.000 NA   0.607
 317343 317344 blr2132 blr2133     TRUE 0.821 -34.000 0.000 NA   0.747
 317344 317345 blr2133 blr2134     TRUE 0.756 25.000 0.000 NA   0.975
 317345 317346 blr2134 blr2135     TRUE 0.974 2.000 0.005 NA   0.831
 317346 317347 blr2135 blr2136     TRUE 0.744 20.000 0.000 1.000 N 0.836
 317348 317349 bll2137 bll2138     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.008   0.773
 317349 317350 bll2138 bll2139     FALSE 0.484 187.000 0.000 0.059 Y -0.109
 317352 317353 bll2141 bll2142     FALSE 0.020 112.000 0.000 NA   -0.059
 317354 317355 blr2143 blr2144   CYP112 TRUE 0.710 17.000 0.000 0.007   0.252
 317355 317356 blr2144 blr2145 CYP112 CYP114 TRUE 0.940 95.000 0.667 0.007 Y -0.164
 317356 317357 blr2145 blr2146 CYP114   TRUE 0.695 297.000 0.500 1.000 Y 0.847
 317357 317358 blr2146 blr2147   CYP117 TRUE 0.999 0.000 0.750 1.000 Y 0.566
 317358 317359 blr2147 blr2148 CYP117 fpps FALSE 0.378 146.000 0.024 1.000 N 0.664
 317359 317360 blr2148 blr2149 fpps   TRUE 0.813 -70.000 0.012 1.000   0.816
 317360 317361 blr2149 blr2150     TRUE 0.995 -3.000 0.462 NA   0.586
 317361 317362 blr2150 bsr2151     TRUE 0.602 20.000 0.000 NA   0.581
 317362 317363 bsr2151 bsr2152     TRUE 0.886 -15.000 0.000 NA   0.716
 317363 317364 bsr2152 blr2153     FALSE 0.000 752.000 0.000 1.000   -0.519
 317365 317366 bll2154 bll2155     FALSE 0.241 127.000 0.000 NA   0.619
 317367 317368 blr2156 blr2157     FALSE 0.128 266.000 0.000 NA   0.880
 317369 317370 bll2158 bll2159     FALSE 0.019 56.000 0.000 NA   -0.442
 317370 317371 bll2159 bll2160     TRUE 0.888 73.000 0.500 NA Y -0.681
 317371 317372 bll2160 bll2161     TRUE 0.990 -3.000 0.000 NA Y 0.450
 317372 317373 bll2161 bll2162     FALSE 0.002 352.000 0.000 NA   -0.055
 317373 317374 bll2162 bll2163     FALSE 0.284 7.000 0.000 NA   -0.037
 317375 317376 bsr2164 blr2165     FALSE 0.011 466.000 0.000 NA   0.522
 317378 317379 blr2167 blr2168     TRUE 0.868 25.000 0.275 1.000 N 0.573
 317379 317380 blr2168 blr2169     TRUE 0.996 -45.000 0.812 0.001 Y 0.786
 317380 317381 blr2169 blr2170     TRUE 0.806 152.000 0.115 1.000 Y 0.734
 317381 317382 blr2170 blr2171     TRUE 0.999 -3.000 0.583 1.000 Y 0.670
 317383 317384 bll2172 bll2173     FALSE 0.416 35.000 0.000 NA   0.498
 317386 317387 bsl2175 bll2176     TRUE 0.602 25.000 0.000 NA   0.647
 317388 317389 blr2177 blr2178     TRUE 0.994 -13.000 0.304 0.090 Y 0.570
 317392 317393 bsl2181 bsl2182     FALSE 0.044 53.000 0.000 NA   -0.052
 317393 317394 bsl2182 bsl2183     FALSE 0.000 646.000 0.000 NA   -0.692
 317394 317395 bsl2183 bll2184     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   -0.461
 317395 317396 bll2184 bll2185     TRUE 0.569 45.000 0.000 NA   0.777
 317396 317397 bll2185 bll2186     FALSE 0.003 226.000 0.000 NA   -0.718
 317397 317398 bll2186 bll2187     TRUE 0.948 -3.000 0.057 NA   -0.176
 317398 402916 bll2187 Bjat18   tRNA-Val FALSE 0.001 298.000 0.000 NA   NA
 402916 317399 Bjat18 bll2188 tRNA-Val   FALSE 0.007 159.000 0.000 NA   NA
 317399 317400 bll2188 bll2189     FALSE 0.279 120.000 0.000 NA   0.664
 317400 317401 bll2189 bll2190     FALSE 0.028 619.000 0.048 1.000   0.755
 317402 317403 blr2191 blr2192   cheA FALSE 0.437 198.000 0.085 NA   0.908
 317403 317404 blr2192 blr2193 cheA cheW TRUE 0.899 82.000 0.014 0.009 Y 0.917
 317404 317405 blr2193 blr2194 cheW cheY TRUE 0.960 74.000 0.500 1.000 Y 0.896
 317405 317406 blr2194 blr2195 cheY cheB TRUE 0.836 76.000 0.085 0.002 Y -0.084
 317406 317407 blr2195 blr2196 cheB cheR TRUE 0.995 -3.000 0.155 1.000 Y 0.030
 317407 317408 blr2196 blr2197 cheR   FALSE 0.002 262.000 0.000 NA   -0.280
 317409 317410 bll2198 bll2199     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   0.002
 317410 317411 bll2199 bll2200     FALSE 0.298 169.000 0.016 NA   0.607
 317412 317413 blr2201 blr2202 fliI   FALSE 0.248 122.000 0.067 1.000   -0.142
 317413 317414 blr2202 blr2203     FALSE 0.330 183.000 0.025 1.000   0.658
 317414 317415 blr2203 blr2204     FALSE 0.030 1481.000 0.000 0.068 Y 0.446
 317415 317416 blr2204 blr2205     FALSE 0.176 117.000 0.000 1.000 N 0.484
 317417 317418 bsl2206 bll2207   flhA FALSE 0.001 295.000 0.000 NA   -0.228
 317418 317419 bll2207 bll2208 flhA   FALSE 0.007 228.000 0.000 NA   -0.065
 317419 317420 bll2208 bll2209   copC TRUE 0.994 5.000 0.667 NA   0.979
 317420 317421 bll2209 bll2210 copC copA TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.003 N 0.887
 317421 317422 bll2210 bll2211 copA copB TRUE 0.976 14.000 0.600 1.000 N 0.905
 317422 317423 bll2211 bsl2212 copB   TRUE 0.977 10.000 0.333 NA   0.985
 317423 317424 bsl2212 bll2213     TRUE 0.901 78.000 0.667 NA   0.869
 317426 317427 bll2215 bll2216     FALSE 0.341 67.000 0.000 NA   0.579
 317428 317429 blr2217 blr2218     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.074 Y 0.246
 317429 317430 blr2218 blr2219     TRUE 0.998 -7.000 0.818 0.001 Y -0.029
 317432 317433 blr2221 blr2222 bioA dadA FALSE 0.015 71.000 0.000 1.000 N -0.729
 317435 317436 blr2224 blr2225     TRUE 0.857 29.000 0.000 0.072 Y 0.085
 317436 317437 blr2225 blr2226     TRUE 0.999 -3.000 0.867 1.000 Y 0.806
 317437 317438 blr2226 blr2227     TRUE 0.925 13.000 0.000 1.000 Y 0.415
 317439 317440 bll2228 bll2229     FALSE 0.079 56.000 0.000 1.000   -0.115
 317441 317442 blr2230 blr2231     TRUE 0.798 -43.000 0.000 NA   0.820
 317442 317443 blr2231 blr2232     FALSE 0.195 193.000 0.000 NA   0.710
 317443 317444 blr2232 blr2233     TRUE 0.889 -64.000 0.094 NA Y -0.754
 317444 317445 blr2233 blr2234   aph FALSE 0.273 126.000 0.000 NA N 0.732
 317446 317447 bll2235 bll2236     TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N 0.048
 317447 317448 bll2236 bll2237     FALSE 0.000 530.000 0.000 1.000 N -0.275
 317449 317450 blr2238 blr2239     TRUE 0.996 2.000 1.000 1.000   0.438
 317450 317451 blr2239 blr2240     FALSE 0.371 75.000 0.000 NA   0.671
 317453 317454 blr2242 blr2243     FALSE 0.011 625.000 0.000 NA   0.708
 317455 317456 bll2244 bsl2245     FALSE 0.198 160.000 0.000 NA   0.589
 317457 317458 blr2246 blr2247     FALSE 0.013 298.000 0.000 1.000   0.115
 317458 317459 blr2247 blr2248     FALSE 0.001 428.000 0.000 NA   -0.184
 317460 317461 bll2249 bll2250 ubiE   FALSE 0.008 138.000 0.000 NA   -0.497
 317461 317462 bll2250 bll2251     FALSE 0.035 26.000 0.000 NA   -0.180
 317462 317463 bll2251 bll2252     TRUE 0.586 12.000 0.000 1.000   0.315
 317463 317464 bll2252 bll2253     FALSE 0.225 4.000 0.000 NA   -0.493
 317465 317466 blr2254 blr2255     TRUE 0.755 -61.000 0.000 NA   0.862
 317466 317467 blr2255 blr2256     TRUE 0.878 -28.000 0.000 NA   0.858
 317467 317468 blr2256 blr2257   aroE FALSE 0.001 306.000 0.000 1.000 N -0.465
 317468 317469 blr2257 blr2258 aroE   FALSE 0.441 22.000 0.000 1.000   0.353
 317469 317470 blr2258 blr2259     TRUE 0.766 -57.000 0.000 NA   0.846
 317472 317473 blr2261 blr2262     TRUE 0.893 -6.000 0.000 NA   0.527
 317473 317474 blr2262 blr2263     FALSE 0.084 56.000 0.000 NA   0.071
 317474 317475 blr2263 blr2264     FALSE 0.213 32.000 0.000 NA   0.210
 317475 317476 blr2264 blr2265     FALSE 0.015 195.000 0.000 NA   -0.016
 317480 317481 blr2269 blr2270     TRUE 0.966 62.000 0.450 0.004 Y 0.638
 317481 317482 blr2270 blr2271     TRUE 0.998 -3.000 0.344 0.004 Y -0.586
 317482 317483 blr2271 blr2272     FALSE 0.127 138.000 0.000 0.088 N 0.012
 317485 317486 blr2274 blr2275     TRUE 0.531 163.000 0.000 0.097 Y -0.019
 317486 317487 blr2275 blr2276     FALSE 0.128 71.000 0.000 1.000   0.127
 317487 317488 blr2276 blr2277     TRUE 0.531 -84.000 0.000 1.000   0.509
 317488 317489 blr2277 blr2278     FALSE 0.434 183.000 0.000 1.000 Y 0.205
 317489 317490 blr2278 blr2279     TRUE 0.981 3.000 0.154 1.000 N 0.719
 317490 317491 blr2279 blr2280     TRUE 0.639 37.000 0.118 1.000 N 0.318
 317491 317492 blr2280 blr2281     FALSE 0.179 -81.000 0.000 1.000   -0.048
 317496 317497 blr2285 blr2286     FALSE 0.138 255.000 0.000 NA   0.845
 317497 317498 blr2286 blr2287     TRUE 0.751 18.000 0.000 NA   0.798
 317498 317499 blr2287 blr2288     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.015 Y 0.676
 317499 317500 blr2288 blr2289     FALSE 0.007 330.000 0.000 NA   0.142
 317500 317501 blr2289 blr2290     FALSE 0.000 711.000 0.000 NA   -0.464
 317502 317503 bll2291 bll2292   petE TRUE 0.640 46.000 0.000 NA   0.933
 317503 317504 bll2292 bll2293 petE   TRUE 0.870 16.000 0.000 0.003   0.740
 317504 317505 bll2293 bll2294   papA FALSE 0.351 177.000 0.000 1.000   0.943
 317505 317506 bll2294 bll2295 papA   FALSE 0.031 324.000 0.000 NA   0.539
 317506 317507 bll2295 bll2296     TRUE 0.623 -208.000 0.000 NA   0.828
 317507 317508 bll2296 bll2297   polE FALSE 0.018 58.000 0.000 NA   -0.317
 317509 317510 blr2298 blr2299     FALSE 0.115 -157.000 0.000 NA   0.065